View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17387_high_1_N (Length: 662)

Name: NF17387_high_1_N
Description: NF17387
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17387_high_1_N
NF17387_high_1_N
[»] chr6 (111 HSPs)
chr6 (9-633)||(19704531-19705163)
chr6 (9-633)||(2628850-2629477)
chr6 (9-633)||(30966925-30967551)
chr6 (9-633)||(30034567-30035194)
chr6 (9-633)||(12195478-12196102)
chr6 (9-633)||(26932527-26933156)
chr6 (9-375)||(14507140-14507505)
chr6 (14-379)||(28241290-28241655)
chr6 (9-375)||(20915321-20915688)
chr6 (9-375)||(4816195-4816575)
chr6 (9-373)||(14458731-14459093)
chr6 (30-375)||(11983014-11983359)
chr6 (9-379)||(1230213-1230583)
chr6 (334-633)||(18317753-18318051)
chr6 (43-633)||(17011781-17012357)
chr6 (30-379)||(26064961-26065310)
chr6 (30-379)||(26084930-26085279)
chr6 (30-375)||(9019910-9020255)
chr6 (30-375)||(13057178-13057524)
chr6 (55-633)||(22857962-22858534)
chr6 (43-259)||(5273214-5273431)
chr6 (37-400)||(15532674-15533036)
chr6 (30-334)||(3629850-3630159)
chr6 (30-375)||(15541125-15541470)
chr6 (34-334)||(3390398-3390705)
chr6 (30-287)||(13039825-13040084)
chr6 (32-375)||(3631926-3632268)
chr6 (30-374)||(32279982-32280326)
chr6 (30-334)||(25477293-25477611)
chr6 (32-375)||(30728811-30729158)
chr6 (88-375)||(15530166-15530452)
chr6 (434-633)||(5275727-5275926)
chr6 (30-333)||(3233710-3234025)
chr6 (27-227)||(26066106-26066307)
chr6 (27-227)||(29754691-29754892)
chr6 (27-227)||(33308988-33309188)
chr6 (250-627)||(17852275-17852650)
chr6 (27-227)||(26068377-26068578)
chr6 (27-227)||(33311257-33311457)
chr6 (43-334)||(15719673-15719960)
chr6 (32-375)||(24338435-24338778)
chr6 (150-375)||(19227514-19227738)
chr6 (30-238)||(1069703-1069913)
chr6 (30-325)||(12161543-12161841)
chr6 (30-281)||(14466399-14466653)
chr6 (69-375)||(3027876-3028180)
chr6 (30-242)||(12186056-12186271)
chr6 (55-287)||(16455434-16455666)
chr6 (43-263)||(15367129-15367348)
chr6 (110-334)||(22490658-22490889)
chr6 (369-633)||(20526548-20526800)
chr6 (43-243)||(26945258-26945462)
chr6 (43-241)||(19696556-19696758)
chr6 (43-183)||(15346522-15346663)
chr6 (85-241)||(20526922-20527080)
chr6 (469-555)||(30445318-30445404)
chr6 (43-240)||(28037723-28037927)
chr6 (234-375)||(1072067-1072207)
chr6 (30-127)||(10584227-10584325)
chr6 (70-226)||(12911471-12911629)
chr6 (70-226)||(12937219-12937376)
chr6 (166-241)||(11138423-11138499)
chr6 (43-241)||(25078555-25078755)
chr6 (43-163)||(25465588-25465710)
chr6 (114-241)||(7542452-7542581)
chr6 (231-375)||(32447502-32447646)
chr6 (29-226)||(13878727-13878923)
chr6 (29-226)||(16785919-16786115)
chr6 (213-375)||(15346375-15346524)
chr6 (69-226)||(13883475-13883631)
chr6 (259-375)||(8995463-8995578)
chr6 (469-555)||(30443111-30443195)
chr6 (164-218)||(5165936-5165989)
chr6 (164-226)||(26887345-26887406)
chr6 (164-226)||(31248835-31248896)
chr6 (164-226)||(35201447-35201508)
chr6 (164-226)||(3577636-3577696)
chr6 (164-223)||(17036058-17036116)
chr6 (164-223)||(17694972-17695030)
chr6 (45-108)||(31936591-31936654)
chr6 (230-373)||(13870608-13870749)
chr6 (45-109)||(5757507-5757571)
chr6 (45-109)||(10077194-10077258)
chr6 (69-182)||(30445699-30445815)
chr6 (164-219)||(12166267-12166321)
chr6 (164-223)||(22351973-22352031)
chr6 (45-108)||(31979517-31979580)
chr6 (166-223)||(19701985-19702041)
chr6 (164-220)||(25941650-25941704)
chr6 (326-375)||(26066309-26066358)
chr6 (326-375)||(26068580-26068629)
chr6 (143-223)||(26643179-26643259)
chr6 (143-223)||(26749145-26749225)
chr6 (326-375)||(29754977-29755026)
chr6 (42-110)||(35201324-35201393)
chr6 (45-109)||(5572270-5572334)
chr6 (164-223)||(13467585-13467642)
chr6 (45-109)||(21356040-21356104)
chr6 (45-109)||(22709022-22709086)
chr6 (43-218)||(11262596-11262776)
chr6 (578-621)||(12158532-12158575)
chr6 (164-223)||(22342922-22342980)
chr6 (164-223)||(33215830-33215888)
chr6 (55-108)||(24436001-24436054)
chr6 (69-110)||(25941785-25941826)
chr6 (43-110)||(13467465-13467532)
chr6 (45-109)||(22963704-22963767)
chr6 (45-109)||(23824626-23824689)
chr6 (45-89)||(26954286-26954330)
chr6 (580-625)||(30443022-30443069)
chr6 (45-89)||(33211185-33211229)
[»] chr1 (155 HSPs)
chr1 (9-662)||(31735487-31736142)
chr1 (9-633)||(15294800-15295437)
chr1 (30-633)||(47905958-47906564)
chr1 (30-662)||(27336927-27337559)
chr1 (7-633)||(24325349-24325980)
chr1 (26-633)||(9463227-9463838)
chr1 (26-633)||(9459400-9460011)
chr1 (30-633)||(27339118-27339728)
chr1 (9-633)||(39931764-39932389)
chr1 (30-633)||(17324623-17325225)
chr1 (85-603)||(21948230-21948751)
chr1 (20-523)||(46431683-46432207)
chr1 (30-633)||(28998240-28998842)
chr1 (30-633)||(29003956-29004558)
chr1 (30-630)||(2949219-2949810)
chr1 (102-633)||(48664854-48665400)
chr1 (26-513)||(2510308-2510801)
chr1 (9-375)||(28840627-28840994)
chr1 (9-375)||(51749988-51750354)
chr1 (9-374)||(10399794-10400159)
chr1 (9-375)||(28842442-28842809)
chr1 (9-375)||(47179658-47180028)
chr1 (26-373)||(20302410-20302756)
chr1 (9-375)||(13761786-13762151)
chr1 (9-375)||(16226116-16226483)
chr1 (9-375)||(51752314-51752678)
chr1 (9-375)||(47177307-47177677)
chr1 (15-379)||(2617461-2617825)
chr1 (32-368)||(6822971-6823306)
chr1 (30-375)||(12302492-12302842)
chr1 (9-375)||(20291406-20291771)
chr1 (30-375)||(15823495-15823840)
chr1 (30-405)||(6995687-6996063)
chr1 (35-375)||(13215030-13215375)
chr1 (30-379)||(39462464-39462813)
chr1 (30-375)||(38925468-38925810)
chr1 (30-375)||(41646869-41647214)
chr1 (37-287)||(50307540-50307792)
chr1 (30-333)||(16428638-16428948)
chr1 (30-379)||(14097956-14098306)
chr1 (30-381)||(25127808-25128167)
chr1 (30-334)||(50078807-50079118)
chr1 (30-375)||(50076659-50077004)
chr1 (30-375)||(11457462-11457807)
chr1 (30-374)||(18307059-18307403)
chr1 (30-373)||(17186114-17186458)
chr1 (9-256)||(16231630-16231878)
chr1 (30-334)||(18839571-18839882)
chr1 (30-375)||(25251261-25251607)
chr1 (30-375)||(28207055-28207398)
chr1 (9-231)||(51757623-51757845)
chr1 (30-336)||(4131362-4131678)
chr1 (30-287)||(9241072-9241331)
chr1 (30-334)||(31425002-31425316)
chr1 (32-371)||(3579606-3579946)
chr1 (30-334)||(31489899-31490206)
chr1 (43-227)||(23785935-23786120)
chr1 (30-287)||(40133980-40134239)
chr1 (43-283)||(17324103-17324345)
chr1 (30-283)||(50248557-50248813)
chr1 (30-331)||(6756514-6756822)
chr1 (30-334)||(17318877-17319181)
chr1 (34-375)||(14183581-14183918)
chr1 (127-368)||(6823840-6824088)
chr1 (450-633)||(6115532-6115716)
chr1 (30-238)||(16429042-16429252)
chr1 (30-277)||(16432440-16432690)
chr1 (32-256)||(25248540-25248766)
chr1 (47-375)||(47451597-47451919)
chr1 (43-400)||(42922157-42922513)
chr1 (445-633)||(45693834-45694022)
chr1 (135-501)||(26520206-26520580)
chr1 (34-334)||(31422851-31423171)
chr1 (443-633)||(4131690-4131880)
chr1 (69-287)||(15669419-15669636)
chr1 (51-375)||(49495218-49495531)
chr1 (30-182)||(23816027-23816180)
chr1 (30-243)||(6115089-6115304)
chr1 (43-334)||(8347271-8347566)
chr1 (447-662)||(6997187-6997395)
chr1 (71-375)||(18800600-18800901)
chr1 (437-597)||(6996067-6996221)
chr1 (43-424)||(13125456-13125838)
chr1 (9-119)||(13358778-13358888)
chr1 (67-241)||(155788-155963)
chr1 (43-287)||(8349050-8349294)
chr1 (520-633)||(46432521-46432634)
chr1 (482-633)||(16561133-16561284)
chr1 (55-425)||(16561367-16561738)
chr1 (43-241)||(30738626-30738830)
chr1 (43-281)||(27916539-27916779)
chr1 (469-555)||(11693580-11693666)
chr1 (353-496)||(6115395-6115541)
chr1 (43-241)||(26613238-26613440)
chr1 (55-243)||(30790412-30790602)
chr1 (469-555)||(13785662-13785748)
chr1 (352-552)||(14352759-14352946)
chr1 (43-223)||(21353346-21353525)
chr1 (164-263)||(28279326-28279424)
chr1 (166-241)||(26332613-26332688)
chr1 (376-552)||(10115572-10115738)
chr1 (164-241)||(14353047-14353126)
chr1 (43-151)||(15916562-15916673)
chr1 (164-226)||(4144804-4144865)
chr1 (15-71)||(13447245-13447301)
chr1 (86-237)||(43104245-43104400)
chr1 (164-226)||(2232597-2232658)
chr1 (164-226)||(14997040-14997101)
chr1 (302-375)||(16231550-16231617)
chr1 (505-555)||(32260833-32260883)
chr1 (576-625)||(32260746-32260795)
chr1 (164-223)||(2401342-2401400)
chr1 (164-223)||(9526469-9526527)
chr1 (164-223)||(25134074-25134132)
chr1 (516-562)||(13112047-13112093)
chr1 (199-281)||(26332719-26332798)
chr1 (45-109)||(13598402-13598466)
chr1 (45-109)||(16124545-16124609)
chr1 (45-109)||(37069774-37069838)
chr1 (45-109)||(47703965-47704029)
chr1 (135-241)||(49959129-49959237)
chr1 (164-223)||(9521718-9521776)
chr1 (45-108)||(19072932-19072995)
chr1 (45-108)||(19120822-19120885)
chr1 (303-374)||(26613503-26613571)
chr1 (45-108)||(32889443-32889506)
chr1 (45-108)||(47098854-47098917)
chr1 (165-223)||(2393404-2393461)
chr1 (301-370)||(25248778-25248841)
chr1 (48-109)||(29651818-29651879)
chr1 (302-334)||(6115344-6115376)
chr1 (45-109)||(9476265-9476329)
chr1 (45-105)||(26644930-26644990)
chr1 (356-420)||(32260950-32261014)
chr1 (578-625)||(11693706-11693753)
chr1 (164-226)||(13785392-13785455)
chr1 (377-408)||(13785580-13785611)
chr1 (45-108)||(47102871-47102934)
chr1 (29-106)||(2232710-2232787)
chr1 (48-106)||(3281715-3281773)
chr1 (29-110)||(9526582-9526663)
chr1 (576-625)||(13785786-13785835)
chr1 (342-375)||(23783500-23783533)
chr1 (45-89)||(834167-834211)
chr1 (45-89)||(3847121-3847165)
chr1 (585-625)||(10115466-10115506)
chr1 (43-129)||(13127686-13127774)
chr1 (351-379)||(13449856-13449884)
chr1 (45-109)||(27104401-27104465)
chr1 (45-89)||(28220226-28220270)
chr1 (45-89)||(28265554-28265598)
chr1 (164-227)||(37990772-37990836)
chr1 (45-89)||(40122196-40122240)
chr1 (45-89)||(49918474-49918518)
chr1 (45-89)||(50167175-50167219)
[»] chr3 (191 HSPs)
chr3 (9-633)||(4103858-4104481)
chr3 (9-633)||(746424-747053)
chr3 (9-660)||(457925-458580)
chr3 (26-633)||(25533109-25533720)
chr3 (9-633)||(455575-456203)
chr3 (9-633)||(10621491-10622125)
chr3 (30-633)||(1313084-1313683)
chr3 (30-662)||(53915479-53916109)
chr3 (30-633)||(42989954-42990578)
chr3 (30-630)||(53917647-53918245)
chr3 (30-633)||(51943044-51943644)
chr3 (30-662)||(42991926-42992544)
chr3 (9-375)||(38889968-38890335)
chr3 (9-375)||(10084351-10084721)
chr3 (30-379)||(4308264-4308613)
chr3 (30-633)||(27635641-27636210)
chr3 (9-375)||(5191582-5191946)
chr3 (26-375)||(3859457-3859805)
chr3 (9-379)||(51726969-51727338)
chr3 (27-379)||(50493924-50494276)
chr3 (9-375)||(5522589-5522943)
chr3 (30-379)||(9604590-9604944)
chr3 (30-379)||(43228216-43228565)
chr3 (9-287)||(1321495-1321774)
chr3 (9-375)||(6063407-6063776)
chr3 (211-633)||(41848806-41849244)
chr3 (30-375)||(11170333-11170678)
chr3 (20-338)||(25388866-25389189)
chr3 (43-379)||(43226011-43226346)
chr3 (30-369)||(18099153-18099493)
chr3 (9-375)||(10955989-10956355)
chr3 (30-379)||(27101164-27101517)
chr3 (9-375)||(10191274-10191641)
chr3 (9-375)||(6065757-6066125)
chr3 (88-425)||(6561689-6562028)
chr3 (30-375)||(18096883-18097229)
chr3 (9-375)||(10958285-10958651)
chr3 (9-375)||(22114267-22114633)
chr3 (9-287)||(28412992-28413273)
chr3 (26-281)||(7606567-7606822)
chr3 (30-375)||(45882868-45883214)
chr3 (9-338)||(38210330-38210666)
chr3 (30-338)||(30005801-30006115)
chr3 (30-375)||(1626666-1627011)
chr3 (30-334)||(28101985-28102295)
chr3 (9-375)||(26720477-26720842)
chr3 (30-334)||(43423446-43423756)
chr3 (30-379)||(24979632-24979982)
chr3 (30-334)||(3314648-3314959)
chr3 (30-375)||(43421398-43421743)
chr3 (30-375)||(18162593-18162937)
chr3 (30-375)||(12267958-12268294)
chr3 (30-242)||(5886261-5886472)
chr3 (30-242)||(5899734-5899945)
chr3 (30-292)||(6484370-6484634)
chr3 (38-334)||(5926755-5927057)
chr3 (30-334)||(36011791-36012101)
chr3 (30-375)||(47148878-47149228)
chr3 (30-375)||(32264021-32264371)
chr3 (30-375)||(880434-880780)
chr3 (30-375)||(48361654-48361998)
chr3 (85-338)||(29956646-29956905)
chr3 (143-375)||(35777350-35777582)
chr3 (30-287)||(53468436-53468697)
chr3 (30-277)||(51674749-51674997)
chr3 (9-239)||(11168165-11168396)
chr3 (55-379)||(35917952-35918281)
chr3 (30-379)||(32219020-32219359)
chr3 (30-252)||(25688143-25688367)
chr3 (30-287)||(39715485-39715739)
chr3 (45-277)||(53591210-53591442)
chr3 (55-334)||(889781-890064)
chr3 (30-400)||(23633363-23633727)
chr3 (30-375)||(28761410-28761756)
chr3 (30-282)||(4666535-4666788)
chr3 (30-287)||(15780887-15781153)
chr3 (32-287)||(54691559-54691815)
chr3 (30-255)||(6231849-6232074)
chr3 (148-334)||(28100143-28100334)
chr3 (69-334)||(31151312-31151579)
chr3 (30-334)||(17795234-17795533)
chr3 (30-334)||(19103674-19103973)
chr3 (57-334)||(13420195-13420465)
chr3 (43-327)||(561770-562058)
chr3 (143-287)||(28181038-28181182)
chr3 (55-326)||(36871308-36871583)
chr3 (55-287)||(25635400-25635631)
chr3 (155-334)||(28137415-28137588)
chr3 (30-225)||(3306839-3307034)
chr3 (57-400)||(53597144-53597485)
chr3 (135-334)||(23636991-23637191)
chr3 (44-241)||(1620457-1620657)
chr3 (30-176)||(47701654-47701801)
chr3 (135-287)||(1673991-1674140)
chr3 (92-281)||(54884177-54884367)
chr3 (235-372)||(11163082-11163218)
chr3 (26-111)||(35919094-35919179)
chr3 (163-259)||(4560401-4560497)
chr3 (30-120)||(41849243-41849333)
chr3 (43-197)||(24181486-24181643)
chr3 (9-111)||(53894018-53894121)
chr3 (43-241)||(14634436-14634638)
chr3 (199-330)||(25633899-25634024)
chr3 (469-552)||(11066346-11066429)
chr3 (69-223)||(29913980-29914132)
chr3 (576-633)||(6561615-6561672)
chr3 (199-287)||(24177295-24177380)
chr3 (480-552)||(54287487-54287559)
chr3 (301-375)||(1321370-1321438)
chr3 (164-241)||(11066652-11066731)
chr3 (349-424)||(11072825-11072900)
chr3 (167-281)||(13419904-13420015)
chr3 (43-160)||(25634030-25634149)
chr3 (69-241)||(7768632-7768806)
chr3 (69-226)||(10094100-10094256)
chr3 (485-550)||(53974011-53974077)
chr3 (301-375)||(6719357-6719439)
chr3 (164-223)||(27762107-27762165)
chr3 (69-226)||(10100117-10100273)
chr3 (164-226)||(10201075-10201136)
chr3 (485-555)||(11072731-11072801)
chr3 (164-226)||(16462203-16462264)
chr3 (164-226)||(22626105-22626166)
chr3 (164-226)||(47883003-47883064)
chr3 (29-223)||(54193229-54193423)
chr3 (69-223)||(10897008-10897162)
chr3 (303-375)||(15780789-15780855)
chr3 (48-109)||(48438221-48438282)
chr3 (45-109)||(1736324-1736388)
chr3 (45-109)||(16264354-16264418)
chr3 (45-109)||(18552902-18552966)
chr3 (45-109)||(30709809-30709873)
chr3 (45-109)||(32143325-32143389)
chr3 (43-223)||(47878169-47878350)
chr3 (325-379)||(27101540-27101592)
chr3 (164-218)||(4535622-4535675)
chr3 (69-226)||(6303310-6303466)
chr3 (164-226)||(10208121-10208182)
chr3 (164-214)||(11007633-11007683)
chr3 (164-226)||(16996875-16996936)
chr3 (69-226)||(27544273-27544429)
chr3 (29-223)||(54188512-54188705)
chr3 (342-379)||(25690651-25690688)
chr3 (249-375)||(47701798-47701923)
chr3 (576-625)||(53974148-53974197)
chr3 (45-109)||(8370505-8370569)
chr3 (45-109)||(27974971-27975035)
chr3 (45-109)||(27986465-27986529)
chr3 (201-263)||(31021300-31021361)
chr3 (45-108)||(1417510-1417573)
chr3 (164-223)||(20031439-20031497)
chr3 (45-108)||(25795785-25795848)
chr3 (340-379)||(53896489-53896528)
chr3 (250-334)||(6231413-6231502)
chr3 (350-424)||(11066469-11066543)
chr3 (579-625)||(11072644-11072690)
chr3 (69-226)||(5858546-5858701)
chr3 (214-259)||(7606828-7606873)
chr3 (69-110)||(10200980-10201021)
chr3 (30-83)||(42992607-42992660)
chr3 (301-334)||(51675015-51675048)
chr3 (178-226)||(7418064-7418112)
chr3 (164-241)||(11073007-11073084)
chr3 (69-226)||(11079517-11079674)
chr3 (45-109)||(21711227-21711291)
chr3 (45-89)||(30236249-30236293)
chr3 (45-109)||(33386685-33386749)
chr3 (166-226)||(38002869-38002928)
chr3 (45-109)||(39040011-39040075)
chr3 (302-400)||(1618916-1619012)
chr3 (508-555)||(5535882-5535929)
chr3 (164-223)||(10595155-10595213)
chr3 (340-379)||(29956589-29956628)
chr3 (340-379)||(30005744-30005783)
chr3 (45-108)||(37466295-37466358)
chr3 (27-210)||(46966630-46966816)
chr3 (302-375)||(3306728-3306795)
chr3 (188-222)||(10949404-10949438)
chr3 (164-218)||(13893470-13893523)
chr3 (29-110)||(22625969-22626050)
chr3 (357-395)||(53973898-53973936)
chr3 (69-110)||(10208026-10208067)
chr3 (69-110)||(10612803-10612844)
chr3 (164-241)||(26763021-26763101)
chr3 (69-110)||(48390327-48390368)
chr3 (45-109)||(26298992-26299056)
chr3 (45-109)||(27452962-27453026)
chr3 (45-89)||(40913417-40913461)
chr3 (45-89)||(44331669-44331713)
chr3 (45-89)||(46173481-46173525)
chr3 (45-89)||(51398938-51398982)
[»] chr8 (113 HSPs)
chr8 (14-633)||(608472-609101)
chr8 (9-633)||(28283185-28283811)
chr8 (9-630)||(15808967-15809589)
chr8 (14-633)||(43529873-43530481)
chr8 (26-633)||(3873752-3874364)
chr8 (30-662)||(41384466-41385094)
chr8 (30-633)||(41382421-41383012)
chr8 (9-424)||(32339260-32339680)
chr8 (9-375)||(27829302-27829667)
chr8 (9-375)||(27826991-27827356)
chr8 (9-379)||(22684617-22685000)
chr8 (26-424)||(24873164-24873567)
chr8 (9-375)||(18810713-18811078)
chr8 (9-375)||(4424023-4424389)
chr8 (9-375)||(44720848-44721214)
chr8 (9-375)||(18812898-18813252)
chr8 (30-375)||(14807756-14808111)
chr8 (29-338)||(43079639-43079953)
chr8 (27-338)||(43082009-43082326)
chr8 (30-375)||(28251552-28251897)
chr8 (30-375)||(15072715-15073061)
chr8 (34-334)||(27911055-27911359)
chr8 (34-334)||(27957474-27957778)
chr8 (32-334)||(27106884-27107192)
chr8 (30-394)||(14419175-14419541)
chr8 (30-287)||(30480488-30480746)
chr8 (30-334)||(1225206-1225517)
chr8 (31-334)||(15068021-15068330)
chr8 (30-334)||(25952561-25952871)
chr8 (38-375)||(13858477-13858814)
chr8 (30-333)||(36865579-36865887)
chr8 (43-375)||(21482327-21482648)
chr8 (29-334)||(5372160-5372472)
chr8 (30-287)||(15956053-15956308)
chr8 (55-334)||(21480554-21480828)
chr8 (135-375)||(14477281-14477520)
chr8 (477-633)||(32339096-32339252)
chr8 (163-375)||(33541507-33541718)
chr8 (30-283)||(15185699-15185949)
chr8 (43-287)||(3005628-3005871)
chr8 (43-400)||(31162192-31162550)
chr8 (43-244)||(31035252-31035458)
chr8 (109-256)||(181622-181772)
chr8 (303-484)||(181434-181608)
chr8 (183-334)||(5622877-5623033)
chr8 (216-375)||(35872555-35872708)
chr8 (43-241)||(31578274-31578476)
chr8 (202-375)||(26775206-26775378)
chr8 (518-633)||(3265635-3265750)
chr8 (161-287)||(37214317-37214434)
chr8 (164-281)||(31573847-31573961)
chr8 (30-129)||(33541395-33541494)
chr8 (199-375)||(2468261-2468428)
chr8 (43-173)||(2468127-2468259)
chr8 (32-100)||(37214251-37214319)
chr8 (55-226)||(6376141-6376315)
chr8 (141-226)||(13985176-13985262)
chr8 (301-375)||(12517286-12517356)
chr8 (69-241)||(17847661-17847830)
chr8 (301-375)||(3886180-3886248)
chr8 (29-226)||(16757253-16757449)
chr8 (469-555)||(11701364-11701447)
chr8 (29-111)||(14477519-14477602)
chr8 (29-226)||(28327908-28328104)
chr8 (164-226)||(9021228-9021289)
chr8 (165-241)||(13985933-13986011)
chr8 (164-226)||(16752643-16752704)
chr8 (164-226)||(28895502-28895563)
chr8 (164-226)||(30423212-30423274)
chr8 (207-287)||(31035161-31035238)
chr8 (29-223)||(25684646-25684839)
chr8 (164-223)||(590797-590855)
chr8 (481-552)||(13986214-13986285)
chr8 (45-108)||(19752424-19752487)
chr8 (164-223)||(33032657-33032715)
chr8 (164-241)||(3895957-3896035)
chr8 (164-226)||(4812608-4812669)
chr8 (164-226)||(28332631-28332692)
chr8 (166-223)||(29554908-29554964)
chr8 (45-109)||(4696625-4696689)
chr8 (45-109)||(9765848-9765912)
chr8 (45-109)||(19175783-19175847)
chr8 (45-109)||(26403259-26403323)
chr8 (45-109)||(31071258-31071322)
chr8 (164-241)||(33839043-33839120)
chr8 (164-223)||(3276347-3276405)
chr8 (164-226)||(2267144-2267205)
chr8 (579-625)||(13986328-13986374)
chr8 (188-226)||(17799568-17799606)
chr8 (29-110)||(28890881-28890962)
chr8 (42-110)||(4812485-4812554)
chr8 (69-110)||(29554810-29554851)
chr8 (85-157)||(35872480-35872553)
chr8 (301-334)||(37214472-37214505)
chr8 (45-109)||(7412345-7412409)
chr8 (581-625)||(11701435-11701479)
chr8 (45-109)||(23799606-23799670)
chr8 (164-226)||(15949534-15949596)
chr8 (30-68)||(35872438-35872476)
chr8 (189-241)||(11701102-11701155)
chr8 (27-75)||(28228668-28228717)
chr8 (55-108)||(28307575-28307628)
chr8 (576-625)||(30679208-30679256)
chr8 (45-89)||(1345371-1345415)
chr8 (45-109)||(5702512-5702576)
chr8 (45-109)||(6127225-6127289)
chr8 (45-89)||(10930199-10930243)
chr8 (45-89)||(15212910-15212954)
chr8 (190-226)||(21033870-21033906)
chr8 (175-223)||(23179692-23179740)
chr8 (45-89)||(27811402-27811446)
chr8 (45-89)||(33352274-33352318)
chr8 (45-89)||(40321204-40321248)
[»] chr7 (153 HSPs)
chr7 (9-662)||(20299128-20299785)
chr7 (7-662)||(7469984-7470648)
chr7 (7-633)||(7471942-7472572)
chr7 (9-633)||(38393685-38394311)
chr7 (14-633)||(1849667-1850301)
chr7 (9-633)||(3035417-3036049)
chr7 (14-662)||(28487222-28487873)
chr7 (20-630)||(20625739-20626351)
chr7 (20-630)||(20629630-20630242)
chr7 (20-630)||(20642049-20642661)
chr7 (9-633)||(7351615-7352244)
chr7 (27-662)||(7349259-7349894)
chr7 (26-662)||(31155892-31156527)
chr7 (9-633)||(18345239-18345866)
chr7 (14-633)||(28485263-28485885)
chr7 (99-633)||(11756927-11757465)
chr7 (30-633)||(42330982-42331591)
chr7 (30-633)||(21989855-21990454)
chr7 (9-531)||(20297163-20297687)
chr7 (30-633)||(37412110-37412714)
chr7 (30-563)||(13099459-13099993)
chr7 (9-555)||(43253481-43254035)
chr7 (30-627)||(24258166-24258772)
chr7 (9-379)||(48457604-48457978)
chr7 (9-375)||(40836707-40837072)
chr7 (14-375)||(1049264-1049625)
chr7 (9-369)||(3878540-3878902)
chr7 (9-338)||(1046888-1047223)
chr7 (303-662)||(7092439-7092795)
chr7 (303-633)||(7094686-7095013)
chr7 (7-375)||(25542490-25542855)
chr7 (9-379)||(40946279-40946653)
chr7 (9-375)||(35588-35954)
chr7 (9-375)||(44523-44889)
chr7 (30-334)||(44724573-44724883)
chr7 (30-424)||(443504-443900)
chr7 (326-633)||(1606173-1606478)
chr7 (43-375)||(27306228-27306559)
chr7 (326-662)||(38395959-38396294)
chr7 (9-263)||(7092177-7092431)
chr7 (30-334)||(20137094-20137404)
chr7 (30-375)||(31435031-31435377)
chr7 (30-334)||(21592128-21592438)
chr7 (30-334)||(4295919-4296230)
chr7 (30-375)||(9680773-9681124)
chr7 (9-255)||(38396713-38396959)
chr7 (30-330)||(24748592-24748899)
chr7 (9-263)||(7094424-7094678)
chr7 (30-334)||(11355252-11355562)
chr7 (32-375)||(9679013-9679361)
chr7 (30-334)||(21680021-21680334)
chr7 (43-334)||(21678060-21678357)
chr7 (30-334)||(39145971-39146282)
chr7 (364-633)||(21470614-21470881)
chr7 (435-633)||(47865330-47865528)
chr7 (43-227)||(2935374-2935559)
chr7 (64-287)||(27832651-27832876)
chr7 (30-287)||(42223203-42223462)
chr7 (27-227)||(22137184-22137384)
chr7 (27-227)||(40552211-40552411)
chr7 (27-227)||(22108173-22108373)
chr7 (27-227)||(40549933-40550133)
chr7 (43-227)||(1606486-1606670)
chr7 (102-375)||(25276100-25276374)
chr7 (27-227)||(9027176-9027376)
chr7 (43-287)||(24813495-24813738)
chr7 (306-633)||(3676999-3677301)
chr7 (55-373)||(24817362-24817677)
chr7 (141-334)||(26804563-26804764)
chr7 (43-400)||(7188476-7188832)
chr7 (78-400)||(20091580-20091897)
chr7 (85-334)||(22828672-22828928)
chr7 (135-375)||(22251641-22251872)
chr7 (55-334)||(24465543-24465816)
chr7 (487-633)||(443328-443474)
chr7 (186-375)||(22392432-22392608)
chr7 (215-375)||(18567572-18567731)
chr7 (30-179)||(22393876-22394027)
chr7 (469-632)||(40281824-40281989)
chr7 (43-241)||(6332311-6332513)
chr7 (55-200)||(26295580-26295727)
chr7 (43-241)||(11081598-11081802)
chr7 (165-241)||(16297146-16297222)
chr7 (9-97)||(11759364-11759452)
chr7 (51-272)||(6048932-6049157)
chr7 (133-238)||(40281466-40281572)
chr7 (164-241)||(11084467-11084544)
chr7 (69-226)||(25351353-25351508)
chr7 (69-242)||(2120881-2121056)
chr7 (57-185)||(6046641-6046772)
chr7 (110-203)||(6348912-6349006)
chr7 (29-226)||(7069780-7069976)
chr7 (29-226)||(25405393-25405589)
chr7 (164-241)||(26210631-26210710)
chr7 (69-226)||(3320076-3320232)
chr7 (69-226)||(3324824-3324980)
chr7 (469-555)||(12310442-12310528)
chr7 (164-226)||(21369642-21369703)
chr7 (43-240)||(13290471-13290672)
chr7 (69-226)||(25357047-25357202)
chr7 (69-226)||(25410130-25410287)
chr7 (356-424)||(40281688-40281756)
chr7 (69-226)||(7074787-7074943)
chr7 (164-226)||(42006663-42006724)
chr7 (576-625)||(20297108-20297157)
chr7 (185-263)||(12310157-12310234)
chr7 (30-82)||(26804762-26804814)
chr7 (45-108)||(9190038-9190101)
chr7 (45-108)||(20284093-20284156)
chr7 (164-223)||(30246973-30247031)
chr7 (164-223)||(44512646-44512704)
chr7 (27-217)||(6067180-6067373)
chr7 (164-226)||(8378625-8378686)
chr7 (366-424)||(10691025-10691083)
chr7 (164-226)||(15541116-15541177)
chr7 (577-625)||(10690684-10690732)
chr7 (45-109)||(21983288-21983352)
chr7 (175-223)||(44143997-44144045)
chr7 (45-109)||(46516339-46516403)
chr7 (45-108)||(2580394-2580457)
chr7 (508-555)||(12484976-12485023)
chr7 (508-555)||(12506407-12506454)
chr7 (164-223)||(34546984-34547042)
chr7 (581-627)||(43254023-43254069)
chr7 (48-109)||(55955-56015)
chr7 (460-541)||(10690773-10690854)
chr7 (45-109)||(2647725-2647789)
chr7 (45-109)||(4796696-4796760)
chr7 (45-89)||(12097867-12097911)
chr7 (335-375)||(22108120-22108160)
chr7 (335-375)||(22137131-22137171)
chr7 (45-109)||(29159807-29159871)
chr7 (45-109)||(35960820-35960884)
chr7 (335-375)||(40549880-40549920)
chr7 (335-375)||(40552158-40552198)
chr7 (45-108)||(9185195-9185258)
chr7 (508-555)||(12657600-12657647)
chr7 (45-108)||(28617255-28617318)
chr7 (45-108)||(33332480-33332543)
chr7 (29-110)||(8378489-8378570)
chr7 (69-110)||(7464544-7464585)
chr7 (185-226)||(8260584-8260625)
chr7 (342-375)||(9027401-9027434)
chr7 (30-83)||(25276381-25276434)
chr7 (69-110)||(34546905-34546946)
chr7 (301-338)||(38396306-38396343)
chr7 (69-110)||(44010775-44010816)
chr7 (45-89)||(2759197-2759241)
chr7 (343-375)||(2935312-2935344)
chr7 (27-75)||(14653852-14653900)
chr7 (45-89)||(27347941-27347985)
chr7 (45-89)||(36146408-36146452)
chr7 (45-89)||(41317434-41317478)
[»] chr5 (138 HSPs)
chr5 (9-662)||(27912192-27912851)
chr5 (9-633)||(25803709-25804339)
chr5 (30-635)||(18511197-18511802)
chr5 (9-662)||(18468671-18469324)
chr5 (26-639)||(27910131-27910748)
chr5 (30-662)||(18509303-18509934)
chr5 (9-633)||(15551927-15552561)
chr5 (26-615)||(10586549-10587130)
chr5 (9-555)||(18466453-18466999)
chr5 (30-633)||(26097423-26098025)
chr5 (31-633)||(18596328-18596939)
chr5 (172-662)||(26098379-26098868)
chr5 (26-375)||(2174868-2175216)
chr5 (26-375)||(38882054-38882403)
chr5 (9-375)||(25921437-25921803)
chr5 (9-379)||(10529062-10529433)
chr5 (9-338)||(34477017-34477353)
chr5 (9-338)||(34479382-34479718)
chr5 (7-375)||(4236578-4236945)
chr5 (30-379)||(39854429-39854777)
chr5 (27-375)||(31545029-31545377)
chr5 (30-379)||(6745006-6745362)
chr5 (9-375)||(21684416-21684791)
chr5 (9-375)||(31179337-31179701)
chr5 (29-375)||(31542684-31543029)
chr5 (34-502)||(40221340-40221813)
chr5 (30-379)||(6747249-6747598)
chr5 (30-370)||(16776112-16776451)
chr5 (30-375)||(21947976-21948320)
chr5 (30-375)||(2818320-2818666)
chr5 (30-375)||(25904052-25904397)
chr5 (30-375)||(1189592-1189944)
chr5 (326-633)||(3373322-3373628)
chr5 (17-256)||(4410090-4410329)
chr5 (30-375)||(10474308-10474653)
chr5 (30-287)||(658341-658596)
chr5 (30-375)||(16092184-16092534)
chr5 (36-375)||(17072832-17073172)
chr5 (30-334)||(31472597-31472908)
chr5 (30-334)||(24126840-24127150)
chr5 (30-375)||(36402313-36402658)
chr5 (26-247)||(39798123-39798345)
chr5 (30-277)||(695924-696172)
chr5 (30-244)||(20505828-20506041)
chr5 (30-276)||(2954463-2954710)
chr5 (43-374)||(37705778-37706109)
chr5 (30-287)||(17818477-17818733)
chr5 (27-227)||(10749796-10749996)
chr5 (30-334)||(39397978-39398287)
chr5 (30-334)||(6756478-6756786)
chr5 (30-256)||(41585729-41585956)
chr5 (30-375)||(31465974-31466308)
chr5 (27-227)||(23665140-23665340)
chr5 (27-227)||(23793247-23793447)
chr5 (55-423)||(6661194-6661560)
chr5 (27-227)||(15354557-15354757)
chr5 (30-375)||(12555908-12556253)
chr5 (27-227)||(3373119-3373320)
chr5 (27-227)||(10757273-10757472)
chr5 (27-227)||(15356833-15357033)
chr5 (27-227)||(38960114-38960314)
chr5 (30-261)||(2723964-2724187)
chr5 (27-220)||(23741841-23742034)
chr5 (30-334)||(21288748-21289055)
chr5 (102-334)||(34530722-34530961)
chr5 (161-375)||(20044959-20045172)
chr5 (165-375)||(20042999-20043208)
chr5 (452-633)||(21288531-21288713)
chr5 (350-555)||(15143262-15143461)
chr5 (35-242)||(36208656-36208865)
chr5 (483-628)||(17415748-17415893)
chr5 (30-242)||(9020299-9020514)
chr5 (30-331)||(20053834-20054131)
chr5 (56-281)||(17413176-17413402)
chr5 (43-227)||(23667415-23667599)
chr5 (69-241)||(15143547-15143722)
chr5 (301-379)||(4410002-4410078)
chr5 (85-241)||(2144602-2144763)
chr5 (69-223)||(4897828-4897985)
chr5 (531-633)||(6661929-6662031)
chr5 (30-129)||(26098273-26098373)
chr5 (109-197)||(42770936-42771025)
chr5 (303-424)||(41585970-41586086)
chr5 (155-244)||(42770847-42770934)
chr5 (29-226)||(1170811-1171007)
chr5 (247-375)||(20507665-20507792)
chr5 (164-281)||(4754198-4754312)
chr5 (29-226)||(35385437-35385634)
chr5 (576-633)||(40221284-40221341)
chr5 (43-226)||(15445264-15445453)
chr5 (581-633)||(18466413-18466465)
chr5 (30-92)||(20043222-20043284)
chr5 (164-226)||(31782578-31782639)
chr5 (581-630)||(15143225-15143274)
chr5 (166-241)||(34033691-34033768)
chr5 (97-241)||(35430259-35430408)
chr5 (69-221)||(25445501-25445653)
chr5 (164-223)||(25452498-25452556)
chr5 (169-227)||(29748443-29748502)
chr5 (164-226)||(2298122-2298183)
chr5 (164-226)||(10627364-10627425)
chr5 (69-223)||(22672837-22672991)
chr5 (45-109)||(9353361-9353425)
chr5 (164-227)||(32520533-32520597)
chr5 (45-109)||(36932379-36932443)
chr5 (164-223)||(28786407-28786465)
chr5 (45-108)||(28832263-28832326)
chr5 (164-226)||(1240428-1240489)
chr5 (29-110)||(2297986-2298067)
chr5 (333-375)||(15354770-15354812)
chr5 (333-375)||(15357046-15357088)
chr5 (45-110)||(11917000-11917065)
chr5 (165-226)||(16093413-16093473)
chr5 (45-109)||(10281755-10281819)
chr5 (45-109)||(15464536-15464600)
chr5 (45-109)||(17003989-17004053)
chr5 (335-375)||(23665087-23665127)
chr5 (335-375)||(23667362-23667402)
chr5 (335-375)||(23793460-23793500)
chr5 (164-223)||(11962554-11962612)
chr5 (164-241)||(15224889-15224968)
chr5 (164-223)||(17841370-17841428)
chr5 (469-511)||(6661594-6661636)
chr5 (164-218)||(26406594-26406647)
chr5 (302-368)||(4897674-4897742)
chr5 (367-424)||(5778979-5779036)
chr5 (576-625)||(5779168-5779217)
chr5 (45-82)||(8565946-8565983)
chr5 (166-226)||(13295835-13295896)
chr5 (342-375)||(38960339-38960372)
chr5 (69-110)||(42238376-42238417)
chr5 (343-375)||(10757213-10757245)
chr5 (45-109)||(12084204-12084268)
chr5 (45-109)||(19588750-19588814)
chr5 (45-89)||(19806487-19806531)
chr5 (335-375)||(23742055-23742095)
chr5 (482-555)||(32520241-32520316)
chr5 (45-89)||(32636948-32636992)
[»] chr4 (178 HSPs)
chr4 (9-662)||(22132355-22133014)
chr4 (26-633)||(24347961-24348570)
chr4 (27-633)||(44599820-44600426)
chr4 (30-633)||(17662230-17662824)
chr4 (9-633)||(22134582-22135217)
chr4 (20-659)||(14787406-14788045)
chr4 (49-633)||(56030191-56030770)
chr4 (9-379)||(8631383-8631757)
chr4 (9-375)||(38409202-38409573)
chr4 (9-424)||(18709127-18709551)
chr4 (9-375)||(11434958-11435323)
chr4 (9-375)||(22044355-22044720)
chr4 (9-375)||(22046650-22047015)
chr4 (30-528)||(19322547-19323043)
chr4 (9-375)||(11008532-11008900)
chr4 (9-375)||(37089336-37089704)
chr4 (26-375)||(11006218-11006571)
chr4 (9-375)||(51015249-51015614)
chr4 (9-379)||(2484837-2485207)
chr4 (9-375)||(18847156-18847521)
chr4 (25-375)||(9148254-9148605)
chr4 (30-379)||(40637073-40637422)
chr4 (9-375)||(7941322-7941692)
chr4 (9-375)||(31849563-31849929)
chr4 (26-375)||(5198423-5198772)
chr4 (9-379)||(14633319-14633687)
chr4 (9-379)||(6764838-6765213)
chr4 (32-375)||(24888799-24889142)
chr4 (9-375)||(9174110-9174476)
chr4 (9-375)||(9176438-9176804)
chr4 (15-287)||(26085947-26086219)
chr4 (55-460)||(47210762-47211160)
chr4 (20-375)||(16934118-16934473)
chr4 (14-504)||(53405001-53405497)
chr4 (9-338)||(22780336-22780672)
chr4 (9-338)||(22782701-22783037)
chr4 (30-375)||(22802719-22803064)
chr4 (7-379)||(47868400-47868772)
chr4 (30-375)||(22800847-22801192)
chr4 (20-375)||(16931764-16932119)
chr4 (32-375)||(48486322-48486665)
chr4 (241-659)||(5100719-5101133)
chr4 (30-375)||(24878992-24879338)
chr4 (30-372)||(36921478-36921822)
chr4 (30-375)||(40091400-40091745)
chr4 (26-375)||(47274730-47275077)
chr4 (30-375)||(24880454-24880800)
chr4 (30-334)||(38928162-38928473)
chr4 (30-375)||(36919569-36919917)
chr4 (30-334)||(33415473-33415782)
chr4 (30-375)||(19095885-19096231)
chr4 (104-375)||(5637524-5637799)
chr4 (30-334)||(12395830-12396140)
chr4 (30-334)||(12400792-12401102)
chr4 (30-375)||(36378295-36378641)
chr4 (30-375)||(619433-619777)
chr4 (30-374)||(16453313-16453658)
chr4 (30-334)||(37313050-37313361)
chr4 (65-375)||(13543957-13544272)
chr4 (102-375)||(3824627-3824903)
chr4 (30-287)||(36380439-36380698)
chr4 (43-264)||(16455354-16455577)
chr4 (352-619)||(30136331-30136596)
chr4 (55-375)||(41997495-41997815)
chr4 (9-182)||(5635440-5635614)
chr4 (9-183)||(11437557-11437731)
chr4 (43-375)||(18537471-18537801)
chr4 (55-633)||(10112628-10113194)
chr4 (30-229)||(13547302-13547502)
chr4 (30-287)||(27499135-27499390)
chr4 (30-235)||(2891433-2891640)
chr4 (30-200)||(4215483-4215654)
chr4 (43-323)||(18409345-18409631)
chr4 (43-287)||(18534829-18535073)
chr4 (43-287)||(38890222-38890466)
chr4 (149-334)||(3937314-3937504)
chr4 (70-375)||(8756276-8756580)
chr4 (43-242)||(12102221-12102424)
chr4 (485-633)||(47211158-47211306)
chr4 (159-286)||(6132963-6133090)
chr4 (394-633)||(38890478-38890699)
chr4 (135-379)||(52942550-52942781)
chr4 (79-633)||(9022062-9022605)
chr4 (30-287)||(30136642-30136898)
chr4 (43-226)||(16185832-16186018)
chr4 (43-241)||(28453818-28454019)
chr4 (52-243)||(15032554-15032748)
chr4 (216-375)||(24446756-24446909)
chr4 (43-281)||(9863805-9864048)
chr4 (45-238)||(3982175-3982374)
chr4 (30-176)||(5101130-5101276)
chr4 (85-242)||(31983567-31983727)
chr4 (30-241)||(25357772-25357991)
chr4 (481-633)||(9863501-9863650)
chr4 (30-129)||(47563010-47563109)
chr4 (352-555)||(54928982-54929180)
chr4 (57-241)||(47150904-47151092)
chr4 (476-555)||(10979676-10979755)
chr4 (216-375)||(38270158-38270316)
chr4 (86-241)||(40998990-40999148)
chr4 (576-633)||(14789512-14789569)
chr4 (30-226)||(5336765-5336964)
chr4 (69-226)||(11853549-11853705)
chr4 (20-110)||(14789405-14789495)
chr4 (45-109)||(5269220-5269284)
chr4 (30-110)||(6133105-6133185)
chr4 (164-223)||(16489352-16489410)
chr4 (534-633)||(19322410-19322510)
chr4 (164-223)||(25699752-25699810)
chr4 (164-226)||(4570094-4570155)
chr4 (164-226)||(7050378-7050439)
chr4 (43-139)||(26557823-26557921)
chr4 (469-625)||(38209098-38209259)
chr4 (114-241)||(54906722-54906852)
chr4 (69-223)||(31300427-31300580)
chr4 (30-83)||(52942473-52942526)
chr4 (45-109)||(10047383-10047447)
chr4 (184-263)||(10114443-10114520)
chr4 (45-109)||(39245998-39246062)
chr4 (164-223)||(4556180-4556238)
chr4 (164-223)||(4558314-4558372)
chr4 (164-223)||(8529270-8529328)
chr4 (164-223)||(15316961-15317019)
chr4 (164-223)||(18586969-18587027)
chr4 (493-552)||(29609838-29609897)
chr4 (164-226)||(55822265-55822326)
chr4 (45-109)||(5143263-5143327)
chr4 (38-129)||(49088819-49088911)
chr4 (260-333)||(2891356-2891434)
chr4 (504-555)||(5516701-5516752)
chr4 (164-223)||(15831144-15831202)
chr4 (164-223)||(16689061-16689119)
chr4 (164-227)||(29609591-29609654)
chr4 (46-109)||(36315258-36315321)
chr4 (46-109)||(36329467-36329530)
chr4 (164-223)||(47566496-47566554)
chr4 (30-80)||(3937259-3937309)
chr4 (168-226)||(16638827-16638884)
chr4 (302-375)||(25357640-25357713)
chr4 (154-192)||(38270120-38270158)
chr4 (69-110)||(18587082-18587123)
chr4 (136-240)||(22295294-22295399)
chr4 (85-157)||(24446681-24446754)
chr4 (51-108)||(34495853-34495910)
chr4 (165-220)||(3760105-3760161)
chr4 (45-109)||(5396700-5396764)
chr4 (350-386)||(9863700-9863736)
chr4 (365-424)||(29609767-29609823)
chr4 (45-109)||(31985663-31985726)
chr4 (45-109)||(38152468-38152532)
chr4 (45-97)||(54867188-54867239)
chr4 (188-223)||(4884877-4884912)
chr4 (46-109)||(6743444-6743507)
chr4 (516-555)||(14647175-14647214)
chr4 (586-621)||(29609948-29609983)
chr4 (353-420)||(32274204-32274271)
chr4 (43-226)||(36771396-36771580)
chr4 (43-159)||(3578669-3578786)
chr4 (30-68)||(24446639-24446677)
chr4 (350-408)||(38208986-38209044)
chr4 (576-625)||(54929220-54929267)
chr4 (69-110)||(4556085-4556126)
chr4 (185-226)||(4874620-4874661)
chr4 (69-110)||(4884990-4885031)
chr4 (166-241)||(5516367-5516444)
chr4 (69-110)||(8529383-8529424)
chr4 (43-118)||(10114576-10114653)
chr4 (69-110)||(15831257-15831298)
chr4 (303-336)||(16455323-16455356)
chr4 (69-110)||(36769595-36769636)
chr4 (579-619)||(5516793-5516833)
chr4 (45-89)||(12739550-12739594)
chr4 (43-110)||(15312432-15312500)
chr4 (45-109)||(16630709-16630773)
chr4 (45-109)||(25862051-25862115)
chr4 (45-89)||(26175636-26175680)
chr4 (45-89)||(36463389-36463433)
chr4 (45-89)||(48893638-48893682)
[»] chr2 (136 HSPs)
chr2 (9-633)||(23452201-23452827)
chr2 (27-662)||(35215568-35216211)
chr2 (26-633)||(42452451-42453054)
chr2 (27-633)||(35217945-35218563)
chr2 (30-633)||(42923494-42924092)
chr2 (9-375)||(27104724-27105088)
chr2 (9-375)||(13910009-13910374)
chr2 (14-380)||(19501980-19502346)
chr2 (15-375)||(19504316-19504675)
chr2 (27-375)||(42064440-42064788)
chr2 (26-379)||(45279965-45280319)
chr2 (15-375)||(24162193-24162542)
chr2 (30-334)||(19007600-19007910)
chr2 (30-375)||(21520678-21521025)
chr2 (30-375)||(6264133-6264475)
chr2 (30-375)||(22287321-22287666)
chr2 (30-375)||(40032038-40032388)
chr2 (30-257)||(43623565-43623793)
chr2 (30-334)||(11739544-11739855)
chr2 (30-375)||(6258802-6259145)
chr2 (30-334)||(28196597-28196905)
chr2 (26-227)||(36558845-36559047)
chr2 (27-227)||(36561123-36561324)
chr2 (30-249)||(5375331-5375550)
chr2 (30-334)||(17848403-17848710)
chr2 (30-334)||(34979562-34979874)
chr2 (30-334)||(17849077-17849387)
chr2 (30-287)||(44289052-44289311)
chr2 (30-375)||(18800298-18800632)
chr2 (68-338)||(45239000-45239275)
chr2 (9-227)||(45332144-45332364)
chr2 (30-375)||(3022088-3022442)
chr2 (350-633)||(27583631-27583905)
chr2 (30-334)||(14837233-14837538)
chr2 (135-375)||(15539566-15539805)
chr2 (43-334)||(11578105-11578399)
chr2 (30-334)||(22874102-22874401)
chr2 (30-287)||(28459175-28459433)
chr2 (43-375)||(31732774-31733095)
chr2 (30-186)||(22407439-22407596)
chr2 (43-287)||(17897243-17897485)
chr2 (55-287)||(20146617-20146849)
chr2 (469-625)||(28568584-28568740)
chr2 (43-243)||(40699429-40699633)
chr2 (48-173)||(7462950-7463077)
chr2 (142-335)||(38020161-38020349)
chr2 (30-241)||(35107351-35107566)
chr2 (202-375)||(22163106-22163277)
chr2 (359-555)||(15693669-15693858)
chr2 (43-375)||(37962939-37963257)
chr2 (30-163)||(22707736-22707872)
chr2 (30-129)||(22163007-22163106)
chr2 (246-379)||(5377631-5377767)
chr2 (226-375)||(22407591-22407739)
chr2 (157-256)||(38414194-38414291)
chr2 (110-281)||(43139395-43139564)
chr2 (115-263)||(27136195-27136343)
chr2 (505-633)||(27136367-27136503)
chr2 (69-241)||(17921754-17921927)
chr2 (30-164)||(23870951-23871086)
chr2 (110-226)||(20589763-20589881)
chr2 (540-628)||(34575608-34575696)
chr2 (469-554)||(7502638-7502723)
chr2 (43-223)||(17943540-17943719)
chr2 (29-226)||(2740941-2741137)
chr2 (484-555)||(39286971-39287042)
chr2 (164-226)||(28458949-28459011)
chr2 (166-242)||(26345661-26345738)
chr2 (110-242)||(15693958-15694094)
chr2 (184-240)||(27583479-27583535)
chr2 (29-226)||(2736205-2736401)
chr2 (29-226)||(17462436-17462632)
chr2 (476-555)||(41304806-41304884)
chr2 (434-530)||(34575528-34575617)
chr2 (477-555)||(41303457-41303535)
chr2 (32-227)||(10942497-10942696)
chr2 (32-227)||(10948366-10948565)
chr2 (164-241)||(34575230-34575308)
chr2 (29-226)||(39686983-39687179)
chr2 (357-424)||(41304696-41304763)
chr2 (164-226)||(20054886-20054947)
chr2 (164-226)||(22712637-22712698)
chr2 (164-226)||(22717346-22717407)
chr2 (164-226)||(45567409-45567470)
chr2 (166-241)||(7502975-7503052)
chr2 (69-223)||(27517664-27517818)
chr2 (576-625)||(28568346-28568395)
chr2 (45-109)||(14699036-14699100)
chr2 (136-241)||(30720703-30720811)
chr2 (166-281)||(35028595-35028707)
chr2 (164-223)||(12781342-12781400)
chr2 (164-223)||(17932637-17932695)
chr2 (164-223)||(30478997-30479055)
chr2 (79-226)||(33603994-33604143)
chr2 (45-109)||(8390179-8390243)
chr2 (45-109)||(13569332-13569396)
chr2 (45-109)||(20522224-20522288)
chr2 (45-109)||(39482935-39482999)
chr2 (164-223)||(37170873-37170931)
chr2 (166-220)||(41303155-41303210)
chr2 (45-107)||(1345572-1345634)
chr2 (579-625)||(15693583-15693629)
chr2 (164-217)||(27248021-27248075)
chr2 (164-226)||(39680045-39680106)
chr2 (350-420)||(41303341-41303411)
chr2 (29-110)||(45679838-45679919)
chr2 (69-110)||(33670992-33671033)
chr2 (45-110)||(34682362-34682427)
chr2 (45-109)||(10445473-10445537)
chr2 (43-110)||(12781219-12781287)
chr2 (45-89)||(17057369-17057413)
chr2 (45-89)||(17085352-17085396)
chr2 (45-109)||(28259206-28259270)
chr2 (178-226)||(38190997-38191045)
chr2 (30-69)||(15539514-15539553)
chr2 (45-108)||(31056048-31056111)
chr2 (353-424)||(7502762-7502835)
chr2 (188-226)||(20050166-20050204)
chr2 (55-109)||(33118150-33118204)
chr2 (576-625)||(41303573-41303623)
chr2 (326-375)||(20589586-20589635)
chr2 (69-110)||(30479110-30479151)
chr2 (190-223)||(33674551-33674584)
chr2 (342-375)||(36559072-36559105)
chr2 (342-375)||(36561349-36561382)
chr2 (69-110)||(39680160-39680201)
chr2 (326-375)||(40699235-40699284)
chr2 (166-226)||(45158308-45158369)
chr2 (342-375)||(45332389-45332422)
chr2 (45-89)||(723744-723788)
chr2 (45-89)||(11067429-11067473)
chr2 (45-89)||(33162450-33162494)
chr2 (45-109)||(33528650-33528714)
chr2 (45-89)||(34139770-34139814)
chr2 (45-89)||(39284960-39285004)
chr2 (45-109)||(42039698-42039762)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (30-633)||(11458-12059)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (85-633)||(1737-2289)
[»] scaffold0005 (5 HSPs)
scaffold0005 (20-659)||(51685-52324)
scaffold0005 (9-379)||(183605-183973)
scaffold0005 (576-633)||(50161-50218)
scaffold0005 (20-110)||(50235-50325)
scaffold0005 (516-555)||(170076-170115)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (30-633)||(78885-79488)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (9-372)||(69256-69622)
scaffold0025 (228-375)||(73207-73357)
scaffold0025 (217-265)||(73160-73208)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (14-379)||(41452-41817)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (27-375)||(6157-6505)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (9-375)||(2838-3203)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (9-375)||(29119-29494)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (17-265)||(1425-1673)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (26-366)||(1-348)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (26-375)||(3955-4302)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (43-368)||(14380-14707)
scaffold0131 (55-375)||(14977-15297)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (34-334)||(79852-80158)
scaffold0004 (164-226)||(188363-188424)
[»] scaffold0468 (2 HSPs)
scaffold0468 (43-492)||(1639-2080)
scaffold0468 (520-633)||(2070-2183)
[»] scaffold0140 (5 HSPs)
scaffold0140 (27-227)||(22221-22421)
scaffold0140 (27-227)||(24496-24696)
scaffold0140 (45-109)||(8448-8512)
scaffold0140 (342-375)||(22168-22201)
scaffold0140 (342-375)||(24443-24476)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (30-287)||(85275-85534)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (43-400)||(15818-16174)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (57-425)||(4722-5089)
scaffold0133 (487-640)||(4541-4694)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (152-322)||(35644-35819)
scaffold0011 (30-110)||(35817-35897)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (43-287)||(16647-16891)
[»] scaffold1674 (2 HSPs)
scaffold1674 (541-662)||(1-122)
scaffold1674 (9-79)||(1415-1485)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (211-379)||(993-1165)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (51-226)||(57433-57613)
scaffold0008 (482-552)||(57836-57905)
scaffold0008 (352-425)||(57740-57813)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (27-99)||(4661-4733)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (164-226)||(224819-224880)
scaffold0006 (45-109)||(5687-5751)
scaffold0006 (45-109)||(2496-2560)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (164-223)||(16328-16386)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (29-110)||(3055-3136)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (69-223)||(17011-17165)
[»] scaffold0087 (1 HSPs)
scaffold0087 (45-109)||(43990-44054)
[»] scaffold0533 (1 HSPs)
scaffold0533 (484-531)||(1971-2018)
[»] scaffold0474 (1 HSPs)
scaffold0474 (576-625)||(10443-10492)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (48-108)||(10736-10796)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (45-89)||(20415-20459)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 466; Significance: 0; HSPs: 111)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 633
Target Start/End: Original strand, 19704531 - 19705163
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  19704531 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 19704630  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaa--agtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagag 206  Q
    ||||||||||| ||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704631 tatgatgagtaccgttacaaagagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagag 19704730  T
Q  207 act-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg--- 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||       
T  19704731 actccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaactctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttg 19704829  T
Q  301 -ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaatataactcataaatttggaa 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704830 cctttctaaacccttgtttcagccccctccatctctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaatataactcataaatttggaa 19704929  T
Q  400 cgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaa 499  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704930 cgaatatcacacttaagatacgtttcttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaa 19705029  T
Q  500 atcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaata 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||    
T  19705030 atcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaata 19705129  T
Q  600 ttcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19705130 ttcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 19705163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 633
Target Start/End: Original strand, 2628850 - 2629477
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2628850 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 2628949  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2628950 tatgatgagtaccgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataaattctccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 2629049  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ct 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||    
T  2629050 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccttaaaacctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcct 2629148  T
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacg 401  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||     
T  2629149 ttctaaacccttgtttcag-cccctctatctctctctcaaagtttaacatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactaataaatttggaaca 2629247  T
Q  402 aatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 501  Q
    ||||  |||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629248 aatactacactgaagatacgttt--ttttttcctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 2629345  T
Q  502 cgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatatt 601  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  2629346 cgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatatt 2629445  T
Q  602 cttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629446 cttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 2629477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 30967551 - 30966925
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  30967551 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagctctccgatccacta 30967452  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||    
T  30967451 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtttcagcctcttcccgtaaccaagaga 30967352  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||   |||||    |    
T  30967351 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccatagttttgttgttgtc 30967253  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  30967252 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctct--caaagtttagcct-atacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 30967156  T
Q  401 gaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaa 500  Q
     |||| |||||||||||| |||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  30967155 aaataccacactgaagattcgttt--tttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcgctttcaaaatatatttgcattaaa 30967058  T
Q  501 tcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatat 600  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||    
T  30967057 tcgttcttcatacaatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaataaatcttttatatttttagcaacaatat 30966958  T
Q  601 tcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    ||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30966957 tctccatccatcaaatttggagtcatactacaa 30966925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 633
Target Start/End: Original strand, 30034567 - 30035194
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  30034567 gagaagaacacaaagaagataataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacccagtctgggggagagagcagccctccgatccgcta 30034666  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||  ||    
T  30034667 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccttaaccaattga 30034766  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttg-c 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||     | ||||| |    
T  30034767 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ctctaattttgttgttgcc 30034865  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaac 400  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||   |||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  30034866 tttctaaacccttgttttagctccctctatctctct--taaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 30034963  T
Q  401 gaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaa 500  Q
     ||||||||| |||||||||||||         |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30034964 aaatatcacattgaagatacgttt--ttattttctccttcagtgaaagaatatctgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcattaaa 30035061  T
Q  501 tcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatat 600  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||    
T  30035062 tcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtctataaatatatttttagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatat 30035161  T
Q  601 tcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  30035162 tctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 30035194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 633
Target Start/End: Original strand, 12195478 - 12196102
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatga-gaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccact 107  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||   | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12195478 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaacttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccact 12195577  T
Q  108 atatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12195578 atatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgattaattctactcaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 12195677  T
Q  208 ct-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc 301  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||     | ||||||    
T  12195678 ctccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgc 12195776  T
Q  302 -tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaa 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  12195777 ttttctaaacccttgtttcagccccctctatct------caaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaa 12195870  T
Q  400 cgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaa 499  Q
    | |||| |||||||||||| |||||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12195871 caaataccacactgaagattcgttt--tttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaa 12195968  T
Q  500 atcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaata 599  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       ||||||||||||||||||||||||    
T  12195969 atcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaata 12196068  T
Q  600 ttcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    |||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12196069 ttctccatccatcaatttttgagtcatactacaa 12196102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 633
Target Start/End: Original strand, 26932527 - 26933156
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagta-tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccact 107  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  26932527 gagaagaacacaaaga--agaagaacacaaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatccact 26932624  T
Q  108 atatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26932625 atatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagaga 26932724  T
Q  208 ct-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc 301  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||     | | ||||    
T  26932725 ctccaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgcttctaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttattgc 26932823  T
Q  302 -tttctaaacccttgtttcagccccctcta--tctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttgg 397  Q
     ||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  26932824 ttttctaagcccttgtttcaaccccctctatctctctctctcaaagtttgctatgaaacaaggtctatatttatagtgaaagtataacccataaatttgg 26932923  T
Q  398 aacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatc 497  Q
    ||| |||| |||||||||||| |||||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26932924 aacaaataccacactgaagattcgttt---ttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatc 26933020  T
Q  498 aaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaa 597  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||       ||||||||||||||||||||||    
T  26933021 aaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataataatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaa 26933120  T
Q  598 tattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  26933121 tattctccatccatcaatttttgagtcatactacaa 26933156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 14507140 - 14507505
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  14507140 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcacta 14507239  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  14507240 tatgataagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 14507339  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ct 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||    
T  14507340 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcct 14507438  T
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14507439 ttctaaacccttgttttagccccctctatct------caaagtttgctctaatacaaggtctatatttatagt 14507505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 14 - 379
Target Start/End: Original strand, 28241290 - 28241655
Alignment:
Q  14 gaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatga 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28241290 gaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatga 28241389  T
Q  114 tgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaa 212  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28241390 tgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctaccgaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaa 28241489  T
Q  213 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttct 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||    
T  28241490 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttct 28241588  T
Q  307 aaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241589 aaacccttgtttcagccccctctatctct------aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 28241655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 20915321 - 20915688
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  20915321 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaga-gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 20915419  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20915420 tatgatgagtaccgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccgaagtcccaatctcttctcgtaaccaagagac 20915519  T
Q  209 t-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcc----ctagctgttg-ct 302  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     | | ||||| ||    
T  20915520 tccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcct 20915619  T
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || || || |||||||||||||||||||||||||    
T  20915620 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc---aatttagc-ctgatacaaggtctatatttatagt 20915688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 4816195 - 4816575
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  4816195 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 4816294  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  4816295 tatgatgagtaccgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagaga 4816394  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagct-----gttgc- 301  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |     |||||     
T  4816395 ctcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcc 4816493  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgc--------aaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        |||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  4816494 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagt 4816575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 14458731 - 14459093
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14458731 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgatccacta 14458830  T
Q  109 tatgatgagtaacgttac-aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14458831 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaga 14458930  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |    
T  14458931 ctcaatcctaatagtgtttcccaag--gaatcagccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcc 14459027  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttata 373  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14459028 tttctaaacccttatttcagccccctctatct------caaagtttgctctgatacaaggtctatatttata 14459093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 11983014 - 11983359
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983014 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 11983113  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983114 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 11983213  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||| || ||||||||||    
T  11983214 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaagcctttgtttcagc 11983312  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983313 cccctctatct------ccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 11983359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 1230213 - 1230583
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  1230213 gagaagaacacaatgaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccacta 1230312  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||    
T  1230313 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttccaataaccaagaga 1230412  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |    
T  1230413 gtcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcc 1230511  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230512 tttctaaacccttgtttcaaccctctctatct------caaagtttgctatgatacaaggtctatatttatagtgaaa 1230583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 334 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 18318051 - 18317753
Alignment:
Q  334 ctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnn 432  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||            
T  18318051 ctctctcaaagtttgctatgaaacaaggtctatatttatagtgaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactgaagatacgttt--tttttt 18317954  T
Q  433 nctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttat 532  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18317953 tctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacgatacaaaaatatatttat 18317854  T
Q  533 tgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactaca 632  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18317853 tgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccttcaaattttgagtcatactaca 18317754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 43 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 17012357 - 17011781
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatat-gatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaa 139  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||  | | ||  | ||| |||||  |||||||||| ||||||| | || |||||    
T  17012357 atttgtttacctagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagatgatctctatgttcc-ctataacgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 17012259  T
Q  140 cgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 239  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  17012258 tgagttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagcatcaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatattgtttcagaaggtgaatc 17012159  T
Q  240 aacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagct-gttgctt---tctaaacccttgt-ttcagccccctctatctc 334  Q
    ||||    |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||| |||||| | |||| ||   ||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  17012158 aacctc--aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaa-ccctagtttgttgtttacttctaaacccttttattcagacccctctatctc 17012063  T
Q  335 tctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaatataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnc 434  Q
          || |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||              
T  17012062 ------aaggtttactccgatacaaggtctatatttatagagaaatataactcataaatttggaacgaacatcactctgaagatacgttttt-------- 17011977  T
Q  435 tccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattg 534  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  17011976 tttttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccatcatacggtacaaaaatatatttattg 17011877  T
Q  535 tccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||   ||         |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17011876 tccataaatatattttctacacaaaata---tttaaaacaaacttttatatttttagcaataatattcttcatccatcaaattttaagtcatactacaa 17011781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 30 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 26065310 - 26064961
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  26065310 agaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatataacgagtaacgttacaaa 26065212  T
Q  130 gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 229  Q
    | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065211 gagaagtcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 26065112  T
Q  230 aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagcc 323  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| | ||||   |||||    | |||||||||||||||||||||    
T  26065111 aaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgt---ttccaaagagacaaactctatacaaa-ctctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagcc 26065016  T
Q  324 ccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    ||||||||||||||| |||    | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065015 ccctctatctctctc-caagaaatactgtgatacaaggtctatatttatagtgaaa 26064961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 30 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 26085279 - 26084930
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  26085279 agaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatataacgagtaacgttacaaa 26085181  T
Q  130 gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 229  Q
    | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26085180 gagaagtcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 26085081  T
Q  230 aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagcc 323  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| | ||||   |||||    | |||||||||||||||||||||    
T  26085080 aaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgt---ttccaaagagacaaactctatacaaa-ctctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagcc 26084985  T
Q  324 ccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    ||||||||||||||| |||    | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26084984 ccctctatctctctc-caagaaatactgtgatacaaggtctatatttatagtgaaa 26084930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9020255 - 9019910
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  9020255 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccccccgtttcactatatgatgagtaactttacaaa 9020156  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9020155 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcctataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 9020056  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||| |||    
T  9020055 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgattgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagc 9019957  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||      ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  9019956 cccctctatctctc------agtttactctgatacaagatctatatttatagt 9019910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13057524 - 13057178
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13057524 agaacacaaaagaatttgttgaccgagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagtagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaa 13057425  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13057424 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttc 13057325  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgtt----gctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||     |||||||||||||||||||||    
T  13057324 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttcttgcctttctaaacccttgtttcag 13057226  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||      ||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  13057225 ccccctctatct------caaggtttacactgatacaatgtctatatttatagt 13057178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 55 - 633
Target Start/End: Original strand, 22857962 - 22858534
Alignment:
Q  55 agttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaac-gggttacaaga 151  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||||  |||||||||||    
T  22857962 agttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaagatatatcaaaagggttacaaga 22858061  T
Q  152 ataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaac 250  Q
    || ||||| |   ||||| |||||| |||||| ||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    |||    
T  22858062 attagtcttcaaacctaaatctacctaaagtctcaatctcttcttgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaatc--tcaac 22858159  T
Q  251 cctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag-----ctgttgctttctaaacccttgttt--cagccccctctatctctctcgcaaa 343  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||| ||  |||||| ||||||      ||||   ||||||||||||||||    |  | ||||||||||||| ||||    
T  22858160 cctagtgtttgttaccaagaga-aaattc--tacaaa-ccctagtttttgtgttagcttctaaacccttgttttctggttctctctatctctctcacaaa 22858255  T
Q  344 gtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaatataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagt 443  Q
      ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||        |||||||| |    
T  22858256 --ttcatctgatacaaggtttatatttatagagaaatataactcataaatttggaacgtatatcacgttgaagatacgtttc-tttttttctccttcaat 22858352  T
Q  444 gaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaat 543  Q
    |||||||||||||||| |||        |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22858353 gaaagaatatttgcatcaaa--------attccctttcaaaatatatttgcatctaatcttctttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaat 22858444  T
Q  544 atattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    |||||||||||||||| ||| |||        |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22858445 atattttcagcacaaagtatatttaaaacaaatcttttatatttttattaacaatattcttcatccatcaaattttgagtcatactacaa 22858534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 43 - 259
Target Start/End: Original strand, 5273214 - 5273431
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgg 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||    
T  5273214 atttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactataagatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgg 5273313  T
Q  143 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273314 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 5273413  T
Q  242 cccacaaaccctagtgtt 259  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5273414 cccacaaaccctagtgtt 5273431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 37 - 400
Target Start/End: Original strand, 15532674 - 15533036
Alignment:
Q  37 aaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaa 135  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| | || |    
T  15532674 aaaagaatttgttgacctagttcagtcaaaattgacctagtctaggg-atagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagata 15532772  T
Q  136 tcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15532773 tcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtg 15532872  T
Q  236 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccccctct 329  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532873 aatcaaccctcaaaccctattgtttgttccaaagaaacaaactttatacaaa-ccctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcagccccctct 15532971  T
Q  330 atctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaac 400  Q
    ||||      ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||    
T  15532972 atct------caaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactta-aaatttggaac 15533036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Original strand, 3629850 - 3630159
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||||| || |||||| |||||||    
T  3629850 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggg-agagagcagccctcagtttcactatattattagtaactttacaaa 3629948  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3629949 agagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcc 3630048  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||  |||||||||    
T  3630049 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgctaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaaccgatgtttcagc 3630147  T
Q  323 cccctctatctc 334  Q
    ||||||||||||    
T  3630148 cccctctatctc 3630159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 15541125 - 15541470
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||  || | | ||||||||||||| |||| |||||||    
T  15541125 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattaacctagtctggaggagagagcagctttctgtttcactatatgatgaataactttacaaa 15541224  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15541225 agagatatcaatgggttacaagaatacgtctcccgcctaatcctacccaaagtcccaatctcttctcgtgaccaagagactcaattctaatagtgtttcc 15541324  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgtt----gctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||     ||||||||||||||||||||||    
T  15541325 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgtttttgcctttctaaacccttgtttcagc 15541423  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||      ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15541424 cccctctatct------caaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 15541470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 34 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3390705 - 3390398
Alignment:
Q  34 cacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gt 131  Q
    |||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| ||||||| |     
T  3390705 cacaaaagaatttgttgacccaatttggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactgtaatgatgagtaactttacaaaaga 3390606  T
Q  132 gaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 231  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390605 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 3390506  T
Q  232 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagcccc 325  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  3390505 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagaaaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccc 3390407  T
Q  326 ctctatctc 334  Q
     ||||||||    
T  3390406 gtctatctc 3390398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 30 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13040084 - 13039825
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13040084 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaa 13039985  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  13039984 aagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacgcaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttt 13039885  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13039884 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa 13039825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 32 - 375
Target Start/End: Original strand, 3631926 - 3632268
Alignment:
Q  32 aacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa- 129  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||     
T  3631926 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg--acagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaa 3632023  T
Q  130 gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 229  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3632024 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtaacaaagagactcaatcctaatagtgtttccc 3632123  T
Q  230 aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagcc 323  Q
    ||| |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||| |     
T  3632124 aagatgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaact 3632222  T
Q  324 ccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||      ||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  3632223 ccctctatct------caaggtttacactgatacaatgtctatatttatagt 3632268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 30 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 32280326 - 32279982
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatat-gatgagtaacgttacaa 128  Q
    ||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  32280326 agaacacaagagaattttttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttttactataacgatgagtaactttacaa 32280227  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32280226 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctgaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 32280127  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||| ||||||||||||||||    
T  32280126 ccaaggtgaatcaaccctcaaacccaagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaa-ccctagatttgttgttgcctttttaaacccttgtttcag 32280028  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatag 374  Q
     |||||||||||      | |||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  32280027 -cccctctatct------ccaagtttactatgatacaaggtctatatatatag 32279982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 25477611 - 25477293
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacg------ 122  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||          
T  25477611 agaatacaaaagaatttgttgacccatttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaacgagtaac 25477512  T
Q  123 -ttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaata 220  Q
     ||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  25477511 gttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaata 25477412  T
Q  221 gtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaaccctt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||   |||||    ||||||||||||||    
T  25477411 gtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatataaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt 25477313  T
Q  315 gtttcagccccctctatctc 334  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  25477312 gtttcagccccctctatctc 25477293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 32 - 375
Target Start/End: Original strand, 30728811 - 30729158
Alignment:
Q  32 aacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-g 130  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| ||||||| |    
T  30728811 aacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccttccgttccactataatatgagtaactttacaaaag 30728910  T
Q  131 tgaaa----tcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
     ||||    |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30728911 agaaagatatcaatgagttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccagcctcttcccgtaaccaagagagtcaatcctaatagtgttt 30729010  T
Q  227 cccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcc----ctagctgttg-ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     | | ||||| ||||| | |||||||||||||    
T  30729011 cccaaggtgaatcaaccctcaaatcctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacccaagttttgttgttgtctttcgatacccttgtttcag 30729110  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||      ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30729111 ccccctctatct------caaggtttactctgatacaagatctatatttatagt 30729158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 88 - 375
Target Start/End: Original strand, 15530166 - 15530452
Alignment:
Q  88 gagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaa 186  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  15530166 gagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgg-ttacaagaataagtctcccgcctaattcaacccaaagcctcaa 15530264  T
Q  187 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaa 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15530265 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaa 15530364  T
Q  287 agccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    | ||||||   |||||    | |||||| |||||| |||||||||||||||||| |      ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15530365 a-ccctagttttgttgttgccattctaagcccttgcttcagccccctctatctccc------agtttactctgatacaaggtctatatttatagt 15530452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 434 - 633
Target Start/End: Original strand, 5275727 - 5275926
Alignment:
Q  434 ctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttatt 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5275727 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttatt 5275826  T
Q  534 gtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  5275827 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaataaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 5275926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 30 - 333
Target Start/End: Original strand, 3233710 - 3234025
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacc-----tagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtt 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||      ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||    
T  3233710 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcagttcggtcaaaattgacctagtgtgggggagagagcagccctccgtttcactatacggtgagtaacgtt 3233809  T
Q  125 ac-aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    || |||| ||  |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3233810 acaaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 3233909  T
Q  224 tttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgt 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| || |||   |||||    ||||||||| ||||||    
T  3233910 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttaccaaagagacaaactatatacaaa-ccttagttttgttgttgtctttctaaatccttgt 3234008  T
Q  317 ttcagccccctctatct 333  Q
    |||||||||||||||||    
T  3234009 ttcagccccctctatct 3234025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Original strand, 26066106 - 26066307
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 126  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26066106 agaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatttgataagtaacgttac 26066205  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtt 225  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26066206 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 26066305  T
Q  226 tc 227  Q
    ||    
T  26066306 tc 26066307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Original strand, 29754691 - 29754892
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 126  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29754691 agaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 29754790  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtt 225  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29754791 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacctaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 29754890  T
Q  226 tc 227  Q
    ||    
T  29754891 tc 29754892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33309188 - 33308988
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 126  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33309188 agaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 33309089  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtt 225  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33309088 aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 33308990  T
Q  226 tc 227  Q
    ||    
T  33308989 tc 33308988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 250 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 17852650 - 17852275
Alignment:
Q  250 ccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagct-----gttg-ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaa 343  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |     |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||      ||     
T  17852650 ccctagtgtttgttcgaaagagacaaactctatacaaa-ctctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctc------aag 17852558  T
Q  344 gtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcag 442  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||         ||| |||||    
T  17852557 gtttactctgattcaaagtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacac-gaagatacttttttttttcttctctttcag 17852459  T
Q  443 tgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaa 542  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  17852458 tgaaataatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatagttcttcataaggtacaaaaatatatttattgtccataaa 17852359  T
Q  543 tatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagca--acaatattcttcttccatcaaattttgagtcata 627  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||       ||||||||||||||||||  |||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  17852358 tatattttcagcataaaata--tttgaaacaaatcttttatatttttagcaacacaatattctccat-catcaaattttgagtcata 17852275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Original strand, 26068377 - 26068578
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 126  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26068377 agaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagcaacgttac 26068476  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtt 225  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26068477 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaagcaagagactccaatcctaatagtgtt 26068576  T
Q  226 tc 227  Q
    ||    
T  26068577 tc 26068578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33311457 - 33311257
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 126  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33311457 agaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaaagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 33311358  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtt 225  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33311357 aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 33311259  T
Q  226 tc 227  Q
    ||    
T  33311258 tc 33311257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 43 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15719960 - 15719673
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggt-agagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaa 139  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||| | ||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||| | || |||||    
T  15719960 atttgtttaccaagttcggtccaaattgacctagtatggggggaaagagcaactctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 15719861  T
Q  140 cgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 239  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15719860 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatc 15719761  T
Q  240 aacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagctgttgctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 334  Q
    ||| |   |||||||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15719760 aactc---aaccctagtgtttgttgccaaaag-caaactctatacaaa-ccctag--tttgatttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 15719673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 32 - 375
Target Start/End: Original strand, 24338435 - 24338778
Alignment:
Q  32 aacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa- 129  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||     
T  24338435 aacacaaaaatatttgtttacctagttcggtccaaattgacatagtctgggg--gagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaa 24338532  T
Q  130 gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 229  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  24338533 gagatatcaatgggttacaagaataagtcttctgactaattctacccaaagtcttaatctctttccataaccaaaagactcaatcttaatagtgttttcc 24338632  T
Q  230 aaggtgaatcaacccacaaa-ccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| | |||| ||||||| ||| |||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||||||    
T  24338633 aaggtaaatcaaccctcaaacccctagtgtttgttgctaagacacaaactttatgcaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 24338731  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||      ||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  24338732 cccctctatct------caaggtttacactgatacaatgtctatatttatagt 24338778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 150 - 375
Target Start/End: Original strand, 19227514 - 19227738
Alignment:
Q  150 gaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaa 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227514 gaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaa 19227613  T
Q  250 ccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaa 343  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||| |||||||| |||||      ||||    
T  19227614 ccctagtgtttgatccaaaaagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttgagccccctttatct------caaa 19227706  T
Q  344 gtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19227707 gtttgctctgatacaagatctatatttatagt 19227738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 238
Target Start/End: Original strand, 1069703 - 1069913
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||| ||||||    
T  1069703 agaacataaaagaatttgttgattcagttcggtccaaattgacctagtatggggaagagagcagccctccgtttctctataatgatgagtaaccttacaa 1069802  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1069803 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 1069902  T
Q  228 ccaaggtgaat 238  Q
    |||||||||||    
T  1069903 ccaaggtgaat 1069913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 325
Target Start/End: Original strand, 12161543 - 12161841
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||| |||  |  ||||||||||||||||| |||||||    
T  12161543 agaacacaaaataatttgttgattcagttcggtccaaattaacctagtttaggg-agagaacagccatccattttactatatgatgagtaaccttacaaa 12161641  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  12161642 agagatatcaatgggttacaagaataaatctcccacttaattatacctaaagtctcaatctcttcccgtaaccaatagactcgatcttaatagtgtttcc 12161741  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc-tttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||     | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  12161742 caacgtgaaacaaccctcaaaccctagtgtttgttcc--agagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcatttctaaacccttgtttcagc 12161838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 14466653 - 14466399
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||| | |||| | ||||||| |||||| |||| ||||||    
T  14466653 agaacacaagagaatttgctgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaacagcagtcatccggttcactataatgatgaataaccttacaa 14466554  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14466553 aagagatatcaatgagttacaagaatatgtctctcgcctaattctactcaaactcccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 14466454  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccac-aaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactcta 281  Q
    ||||| |||||||| || | ||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  14466453 ccaagatgaatcaatcctcaaaaccctagtgtttgttgccaatagacaaactcta 14466399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 69 - 375
Target Start/End: Original strand, 3027876 - 3028180
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggt-agagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcc 165  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||| ||||||||| ||||| ||||| |||    
T  3027876 tgacctagtctggggggaaagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataaatctccagcc 3027975  T
Q  166 taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcc 265  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |    
T  3027976 taattctactcaaagtctcaatctcttcacgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgc 3028073  T
Q  266 gaagagacaaactctatacaaagccctag----ctgttgctttctaaacccttg-tttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaag 360  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||||     |||||| ||| ||||||||| |||||||||| | |||||      ||  |||| || |||||||||    
T  3028074 caagag-caaactctatacaaa-ccctagttttgtgttgccttccaaacccttgttttcagccccttttatct------catggtttactttgatacaag 3028165  T
Q  361 gtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||    
T  3028166 gtctatatttatagt 3028180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 242
Target Start/End: Original strand, 12186056 - 12186271
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12186056 agaacacaaaataatttgtttacccagttcggttcaaattgacctagtccgaggcagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaa 12186155  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    | | || ||||| | |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  12186156 aagagatatcaatgagttacaagaataagtctccaaacctaattgtacccaaagtctcaatctcttcccgtgaacaagagactcaatcctaatagtgttt 12186255  T
Q  227 cccaaggtgaatcaac 242  Q
    ||||||||||||||||    
T  12186256 cccaaggtgaatcaac 12186271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 55 - 287
Target Start/End: Original strand, 16455434 - 16455666
Alignment:
Q  55 agttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaaga 151  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| | || ||||| |||||||||||    
T  16455434 agttcggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaaagggttacaaga 16455533  T
Q  152 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacc 251  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16455534 ataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgagcaagagacttaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaa-ccac-aacc 16455631  T
Q  252 ctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    |||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  16455632 ctagtgttcgttgccaagaga-aaactctgtacaaa 16455666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15367348 - 15367129
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggt-agagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaa-agtgaaatcaac 140  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||| |||||| || || || ||     
T  15367348 atttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagagcagccttccgtttcactatatgatgaataactttacaatagagatattaat 15367249  T
Q  141 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15367248 gggttacaagaataagtctcccgattaattttacccaaagtttcaatctcttcccgcgacgaagagactcaatcctaagagtgtttcccaaggtgaatca 15367149  T
Q  241 acccacaaaccctagtgtttgtt 263  Q
    ||||   ||||||||||||||||    
T  15367148 accc---aaccctagtgtttgtt 15367129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 110 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22490889 - 22490658
Alignment:
Q  110 atgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    |||||||||||  ||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22490889 atgatgagtaatcttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcataattctacccaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagac 22490790  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ct 302  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||    || |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||   |||||    ||    
T  22490789 tcaatcctaatagtgtttcgcaaggtgtatacctcctcaaaccctagtgtttgttccaaagaggcaaactatatacaaa-ccctagttttgttgttgcct 22490691  T
Q  303 ttc-taaacccttgtttcagccccctctatctc 334  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22490690 ttcaaaaacccttgtttcagccccctctatctc 22490658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 369 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 20526800 - 20526548
Alignment:
Q  369 ttatagtgaaatataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatat 468  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||        || |  ||| ||||||||| |||||| |||         
T  20526800 ttatagagaaatataacttgtaaatttggaacgaatatcacattgaagatgcgtttctttttttccttcc-cagggaaagaatacttgcatcaaa----- 20526707  T
Q  469 aatattccctttcaaaa-tatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatcttt 567  Q
      ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  20526706 --tattctctttcaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatgta-----cataaatatattttcagcataaaatatattt 20526614  T
Q  568 gnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    |       ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20526613 gaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcacccatcaaattttgagtcatactacaa 20526548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 26945462 - 26945258
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaa 139  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||  |||| || |||||||  |||||| ||||| || || |||||| ||||||||||| ||||||| | || |||||    
T  26945462 atttgtttacccagttcggtccaaacctgacataatctgggggggagagctgcccttcgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 26945363  T
Q  140 cgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 238  Q
     | ||||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  26945362 tgagttacaaaaataagtctacaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgact 26945263  T
Q  239 caacc 243  Q
    |||||    
T  26945262 caacc 26945258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19696758 - 19696556
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaa 139  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||  || | ||||||||| |||||| |||| ||||||| | || |||||    
T  19696758 atttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggagagagagcagctatctgttccactataatgatgaataactttacaaaagagatatcaa 19696659  T
Q  140 cgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 238  Q
     || |||||||||||||||| |   |||||||||| |||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19696658 aggattacaagaataagtcttcaaacctaattctaaccaaagtctcaatctctttcagtgacaaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaat 19696559  T
Q  239 caa 241  Q
    |||    
T  19696558 caa 19696556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15346663 - 15346522
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaa-agtgaaatcaacg 141  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| |    
T  15346663 atttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctttccgtttcactatatgatgaataactttacaatagagatatcaatg 15346564  T
Q  142 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcc 183  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||    
T  15346563 ggttacaagaataagtcttccgcttaattttactcaaagtcc 15346522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20527080 - 20526922
Alignment:
Q  85 agagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtc 182  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||| || |||||  |||||||||||| ||||| |   |||||||||||| ||||||    
T  20527080 agagagcagctctccgttccactataatgatgaataactttacaaagagatatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattctaccaaaagtc 20526981  T
Q  183 ccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 241  Q
      |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20526980 ttaatctcttcttgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 20526922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 469 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 30445404 - 30445318
Alignment:
Q  469 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 555  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30445404 aatattcctttttaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatatggtacaaaaatatatttattgttcataaatatattttcagca 30445318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 240
Target Start/End: Original strand, 28037723 - 28037927
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccga---tccactat-atgatgagtaacgttacaaa-gtgaaat 136  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||| | ||    |||||||| |||||||||||| ||||||| | || ||    
T  28037723 atttgtttacccagctcggtccaaaactgacctagactgggggagagagcagcctttcgtccgtccactattatgatgagtaactttacaaaagagatat 28037822  T
Q  137 caacgggttacaagaataag-tctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 235  Q
    ||| |||||||||||||||| | |    ||||||||||||||||||| |||||| || |||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28037823 caaagggttacaagaataagattttaaacctaattctacccaaagtctcaatctatttccgtgaacaagggactcaatcctaacagtgtttcccaaggtg 28037922  T
Q  236 aatca 240  Q
    |||||    
T  28037923 aatca 28037927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 234 - 375
Target Start/End: Original strand, 1072067 - 1072207
Alignment:
Q  234 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccccct 327  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||   |||||    |||||||||||||||||||||| || |    
T  1072067 tgaatcaactcacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-cactagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagctcctt 1072165  T
Q  328 ctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||      |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1072166 ctatct------caaagtttactctgatacaatgtctatatttatagt 1072207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 10584325 - 10584227
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttaca 127  Q
    |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||    
T  10584325 agaacacaaaaaaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttaca 10584227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 226
Target Start/End: Original strand, 12911471 - 12911629
Alignment:
Q  70 gacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtc-tcccgccta 167  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||  |||||||||||| || | ||   ||||    
T  12911471 gacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaagagatattaaatggttacaagaattagccttcaaaccta 12911570  T
Q  168 attctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    | |||||| |||||| |||||| ||  ||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  12911571 actctaccaaaagtctcaatctattatcgtgactaagagactcaatcttaatagtgttt 12911629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 226
Target Start/End: Original strand, 12937219 - 12937376
Alignment:
Q  70 gacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtc-tcccgccta 167  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||  |||||||||||| || | ||   ||||    
T  12937219 gacctagtctgggg-agagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaagagatattaaatggttacaagaattagccttcaaaccta 12937317  T
Q  168 attctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    |||||||| |||||  |||||| ||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  12937318 attctaccaaaagtttcaatctattctcgtgactaagagactcaatcttaatagtgttt 12937376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11138499 - 11138423
Alignment:
Q  166 taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 241  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11138499 taattctacctaaagtccccatctcttcccgtgaccaagtgactcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 11138423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 241
Target Start/End: Original strand, 25078555 - 25078755
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaa 139  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| | |||||||| |||||  ||| ||||| |||||| |||||| || ||| ||||||| ||||||| | || |||||    
T  25078555 atttgtttacccagttcggtccaatactgacctagactggga-agaaagcagtcctccgttccactgtaatgacgagtaactttacaaaagagatatcaa 25078653  T
Q  140 cgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 238  Q
     ||||||||||||||||||| |   |||||||||||  ||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||    
T  25078654 agggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacttaaa-tctcaatctctttccgtgaccaagagactcaatcttaacggtgtttaccaaggtgaat 25078752  T
Q  239 caa 241  Q
    |||    
T  25078753 caa 25078755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 163
Target Start/End: Original strand, 25465588 - 25465710
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaac 140  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| | |||| |||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||     
T  25465588 atttgtttacccagttcggtccaatactgacatagtatgggagagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaactttacaaagagatatcaaa 25465687  T
Q  141 gggttacaagaataagtctcccg 163  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  25465688 ggggtacaagaataagtctcccg 25465710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 241
Target Start/End: Original strand, 7542452 - 7542581
Alignment:
Q  114 tgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaa-tctcttcccgtaaccaagagactca 211  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||| |   |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  7542452 tgagtaactttacaaagagatatcaaagggttacaaaaattagtcttcaaacctaattctatccaaattcccaaatctcttcccgtgaccaagagactca 7542551  T
Q  212 atcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 241  Q
    ||| |||||||||||| | | |||||||||    
T  7542552 atcataatagtgtttctccaagtgaatcaa 7542581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 375
Target Start/End: Original strand, 32447502 - 32447646
Alignment:
Q  231 aggtgaatcaacccacaaacc-ctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagcc 323  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||||||    
T  32447502 aggtgaatcaaccctcaaaactctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 32447600  T
Q  324 ccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||      ||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  32447601 ccctctatct------caaggtttactctgatacaaagcctatatttatagt 32447646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13878923 - 13878727
Alignment:
Q  29 aagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tga-tgagtaacgtta 125  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | |||    
T  13878923 aagaacacaaga-tatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttcttta 13878825  T
Q  126 caaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 224  Q
    ||||| || |   | | ||| ||||||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13878824 caaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgt 13878729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16786115 - 16785919
Alignment:
Q  29 aagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tga-tgagtaacgtta 125  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | |||    
T  16786115 aagaacacaaga-tatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttcttta 16786017  T
Q  126 caaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 224  Q
    ||||| || |   | | ||| ||||||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16786016 caaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgt 16785921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15346524 - 15346375
Alignment:
Q  213 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagctgttgctttctaaaccc 312  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||| |||| | |||||||| ||||||   |||  ||||||||||    
T  15346524 tcctaagagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaattttatacaaa-ccctag--tttgaattctaaaccc 15346432  T
Q  313 ttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||| |||||||||||||||||      ||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  15346431 ttggttcagccccctctatct------caaggtttacactgatacaatgtctatatttatagt 15346375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13883631 - 13883475
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagtga-aatcaacgggttacaagaataagtctcccg-c 164  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | |||||||| || ||| ||    || ||||||| ||||| |   |    
T  13883631 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaagagataatgaa----tttcaagaatcagtcttcaaac 13883536  T
Q  165 ctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13883535 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13883475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 8995578 - 8995463
Alignment:
Q  259 ttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagct-----gttgc-tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctct 352  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |     ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||      ||||| ||||    
T  8995578 ttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctctc------agtttactct 8995486  T
Q  353 gatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  8995485 gatacaagatctatatttatagt 8995463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 469 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 30443195 - 30443111
Alignment:
Q  469 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 555  Q
    |||||| | ||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  30443195 aatatttcttttaaaaatacatttgcatcaaatcttcctttatacggtacaaacatatatt--ttgtccataaatatattttcagca 30443111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 218
Target Start/End: Original strand, 5165936 - 5165989
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 218  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5165936 cctaattctacccaa-gtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaa 5165989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 26887345 - 26887406
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26887345 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 26887406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 31248835 - 31248896
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31248835 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 31248896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 35201447 - 35201508
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35201447 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 35201508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 3577636 - 3577696
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3577636 cctaattctacc--aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3577696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17036116 - 17036058
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17036116 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17036058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Original strand, 17694972 - 17695030
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17694972 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17695030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 108
Target Start/End: Original strand, 31936591 - 31936654
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||    
T  31936591 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagagagcagctctccaatccacta 31936654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 373
Target Start/End: Original strand, 13870608 - 13870749
Alignment:
Q  230 aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagcc 323  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||| ||| ||||||   |||||    |||||||||||||| |||||| |    
T  13870608 aaggtgaatcaaccctcaaacccaagtgtttgttgccaagagacaaactttatataaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcag-c 13870705  T
Q  324 ccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttata 373  Q
    ||||||||||      ||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  13870706 ccctctatct------caaggtttgctctgatacaaagcctatatttata 13870749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 5757571 - 5757507
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  5757571 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 5757507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 10077258 - 10077194
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| | ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  10077258 ttgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 10077194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 30445815 - 30445699
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cc 165  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||| ||||||||||||| ||||| |   ||    
T  30445815 tgacctagtatggtggagagagcagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaattagtcttcaaacc 30445716  T
Q  166 taattctacccaaagtc 182  Q
    |||||||||||||||||    
T  30445715 taattctacccaaagtc 30445699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 219
Target Start/End: Original strand, 12166267 - 12166321
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaat 219  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12166267 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaat 12166321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Original strand, 22351973 - 22352031
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    |||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22351973 cctaattctacccaaa-tctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 22352031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 108
Target Start/End: Original strand, 31979517 - 31979580
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31979517 ttgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatccacta 31979580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 223
Target Start/End: Original strand, 19701985 - 19702041
Alignment:
Q  166 taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19701985 taattctacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 19702041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25941704 - 25941650
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaata 220  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25941704 cctaattctacc--aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaata 25941650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 375
Target Start/End: Original strand, 26066309 - 26066358
Alignment:
Q  326 ctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26066309 ctctatctcaatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 26066358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 375
Target Start/End: Original strand, 26068580 - 26068629
Alignment:
Q  326 ctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26068580 ctctatctcaatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 26068629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26643259 - 26643179
Alignment:
Q  143 gttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||   |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  26643259 gttacaagaattagtcttccaacctaattctacccaa-gtcccagcatcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 26643179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26749225 - 26749145
Alignment:
Q  143 gttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||   |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  26749225 gttacaagaattagtcttccaacctaattctacccaa-gtcccagcatcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 26749145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 375
Target Start/End: Original strand, 29754977 - 29755026
Alignment:
Q  326 ctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29754977 ctctctctctctctcagagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 29755026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 110
Target Start/End: Original strand, 35201324 - 35201393
Alignment:
Q  42 tatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    |||||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  35201324 tatttgtttacccagttcggtctaataatgacctagtcttggggagagagcagctctccgatccactata 35201393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 5572334 - 5572270
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| | ||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  5572334 ttgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactat 5572270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Original strand, 13467585 - 13467642
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||||  ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13467585 cctaattctacc--aagtcacagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 13467642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Original strand, 21356040 - 21356104
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||| |||| |||||||||    
T  21356040 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactat 21356104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Original strand, 22709022 - 22709086
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||| ||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  22709022 ttgttgacctagttcggttcaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 22709086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11262776 - 11262596
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaac 140  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||  ||||| | || |||| ||||||||  | |||||||| || |||||     
T  11262776 atttgtttaccccgttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagttctccgttacaatataatgatgagtttctttacaaagagatatcaaa 11262677  T
Q  141 ggg---ttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 218  Q
     ||   ||| |||||| ||||| |   |||||||||||| ||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11262676 aggaggttataagaattagtcttcaaacctaattctacctaaa-tctcaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaa 11262596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 578 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 12158575 - 12158532
Alignment:
Q  578 ttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttga 621  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  12158575 ttttatatttttagcaacaatcttcttcattcatcaaattttga 12158532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Original strand, 22342922 - 22342980
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    |||||| ||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22342922 cctaatactacccaaa-tcccagcctcttcccgtgaccaagagacgcaatcctaatagtg 22342980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33215888 - 33215830
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    |||||||||| |||| ||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33215888 cctaattctatccaa-gtcccagcctcttgccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 33215830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 24436054 - 24436001
Alignment:
Q  55 agttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24436054 agttcgatccaatatgacctactctaggggagagagcagccctccgatccacta 24436001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 25941826 - 25941785
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  25941826 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 25941785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 110
Target Start/End: Original strand, 13467465 - 13467532
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  13467465 atttgtttacctagttcggtctaatcatgacctagtctgggg-agagagcagctctccgttccactata 13467532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Original strand, 22963704 - 22963767
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22963704 ttgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggg-agagagcagccctccaatccactat 22963767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 23824689 - 23824626
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  23824689 ttgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggg-agagagcagccctccaatccactat 23824626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Original strand, 26954286 - 26954330
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||    
T  26954286 ttgttgacctagttcggtccaacttgacctactttgggggagaga 26954330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 580 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 30443069 - 30443022
Alignment:
Q  580 ttatatttttagcaacaatattcttcttccatc--aaattttgagtca 625  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  30443069 ttatatttttaacaacaatattcttcatccatcataaattttgagtca 30443022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Original strand, 33211185 - 33211229
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  33211185 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgggggagaga 33211229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 426; Significance: 0; HSPs: 155)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 662
Target Start/End: Original strand, 31735487 - 31736142
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31735487 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 31735586  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31735587 tatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaga 31735686  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |    
T  31735687 ctcaaccttaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcc 31735785  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaac 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  31735786 tttctaaacccttgttttagccccctctatctcatt--caaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 31735883  T
Q  401 gaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaa 500  Q
     |||| ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735884 aaataccacactgaagatacgttt---ttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaa 31735980  T
Q  501 tcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatat 600  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||    
T  31735981 tcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatat 31736080  T
Q  601 tcttcttccatcaaattttgagtcatactacaaaattctcaaccttgactccaaattagtga 662  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31736081 tctccttccatcaaattttgagtcatactacaacattctccaccttgactctaaattagtga 31736142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 633
Target Start/End: Original strand, 15294800 - 15295437
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  15294800 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcacta 15294899  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15294900 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataaatctcccacctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagaga 15294999  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |    
T  15295000 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcc 15295098  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctcta--------tctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaa-atataactcataaa 392  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15295099 tttctaaacccttgtttcagccctctctatctctctctctctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaa 15295198  T
Q  393 tttggaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatattt 492  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15295199 ttaggaacgaataccacactgaagatacattt--tttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcgctttcaaaatatattt 15295296  T
Q  493 gcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagc 592  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||    
T  15295297 gcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagc 15295396  T
Q  593 aacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15295397 aacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 15295437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 47906564 - 47905958
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47906564 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccaagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgttacaaa 47906465  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47906464 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttct 47906365  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||   |||||    | ||||||||||||||||||||    
T  47906364 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccatagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagc 47906266  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacg 421  Q
    |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  47906265 cccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatact 47906166  T
Q  422 tttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaa 521  Q
    |||         |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47906165 ttt----tttttctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaa 47906070  T
Q  522 aatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttga 621  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  47906069 aatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttga 47905970  T
Q  622 gtcatactacaa 633  Q
    ||||||||||||    
T  47905969 gtcatactacaa 47905958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 662
Target Start/End: Original strand, 27336927 - 27337559
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27336927 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 27337026  T
Q  130 gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 229  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27337027 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaagagacccaatcctaatagtgtttccc 27337126  T
Q  230 aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagcc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||||||    
T  27337127 aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaa-tctata-aaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 27337224  T
Q  324 ccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgt 422  Q
    ||||||||||||||  ||||||||   || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||    
T  27337225 ccctctatctctct--caaagtttagcctaatacaaggtctatatttatagtaaaagtataacgcataaatttggaacaaataccacatcgaagatacgt 27337322  T
Q  423 ttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaa 522  Q
    ||          ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27337323 tt---ttttttttccttcagttaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaa 27337419  T
Q  523 atatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgag 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||    
T  27337420 atatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttatatatttttagcaacaatattccccatccatcaaatttggag 27337519  T
Q  623 tcatactacaaaattctcaaccttgactccaaattagtga 662  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27337520 tcatactacaacattctccaccttgactctaaattagtga 27337559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 24325980 - 24325349
Alignment:
Q  7 gtgagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccac 106  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  24325980 gtgagaagaacacaaagaagaaaaggacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcaaaattgacttagtctgggggagagagcagccattcgattcac 24325881  T
Q  107 tatatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaaga 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  24325880 tatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaaga 24325781  T
Q  206 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg--- 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||       
T  24325780 gactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttg 24325682  T
Q  301 -ctttctaaacccttgtttcagccccctcta--tctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttg 396  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24325681 cctttct-aacccttgtttcagccccctctatctctctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttg 24325583  T
Q  397 gaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcat 496  Q
    |||| |||| |||||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24325582 gaacaaataccacactaaagatacattt---ttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcactttcaaaatatatttgcat 24325486  T
Q  497 caaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaaca 596  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||||||||||||||    
T  24325485 caaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaaca 24325386  T
Q  597 atattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  24325385 atattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 24325349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 633
Target Start/End: Original strand, 9463227 - 9463838
Alignment:
Q  26 gagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 125  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  9463227 gagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgtta 9463326  T
Q  126 caaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac-tcaatcctaatagtgt 224  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9463327 caaagagaaatcaatgggttacaaggataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgt 9463426  T
Q  225 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgttt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||    
T  9463427 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgttttctcctaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 9463525  T
Q  319 cagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaaga 417  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  9463526 cagccccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacaatgaaga 9463625  T
Q  418 tacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgata 517  Q
    |||||||         |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  9463626 tacgttt---ttttttctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcattaaattgttcttcatacgata 9463722  T
Q  518 caaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaatt 617  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  9463723 taaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatt 9463822  T
Q  618 ttgagtcatactacaa 633  Q
    ||||||||||||||||    
T  9463823 ttgagtcatactacaa 9463838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 633
Target Start/End: Original strand, 9459400 - 9460011
Alignment:
Q  26 gagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 125  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  9459400 gagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgtta 9459499  T
Q  126 caaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac-tcaatcctaatagtgt 224  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9459500 caaagagaaatcaatgggttacaaggataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgt 9459599  T
Q  225 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgttt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||    
T  9459600 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgttttctcctaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgactttctaaacccttgttt 9459698  T
Q  319 cagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaaga 417  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  9459699 cagccccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacaatgaaga 9459798  T
Q  418 tacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgata 517  Q
    |||||||         |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||    
T  9459799 tacgttt---ttttttctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcattaaattgttcttcatacggta 9459895  T
Q  518 caaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaatt 617  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  9459896 taaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatt 9459995  T
Q  618 ttgagtcatactacaa 633  Q
    ||||||||||||||||    
T  9459996 ttgagtcatactacaa 9460011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 633
Target Start/End: Original strand, 27339118 - 27339728
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27339118 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagatcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 27339217  T
Q  130 gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 229  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27339218 gagaaatcaatgggttacaagaataagtcgcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaactaagagactcaatcgtaatagtatttccc 27339317  T
Q  230 aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag-----ctgttg-ctttctaaacccttgtttcagcc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||      ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27339318 aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttattgttgcctttctaagcccttgtttcagcc 27339416  T
Q  324 ccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgt 422  Q
    ||||||||||||||  ||||||||   || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  27339417 ccctctatctctct--caaagtttagcctaatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacg- 27339513  T
Q  423 ttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaa 522  Q
    |||         ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27339514 ttcttttttttttccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaa 27339613  T
Q  523 atatatttattgtccataa----atatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattt 618  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  27339614 atatatttattgtccataaatatatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccgtcaaattt 27339713  T
Q  619 tgagtcatactacaa 633  Q
     ||||||||||||||    
T  27339714 ggagtcatactacaa 27339728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 39932389 - 39931764
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggta-gagagcagccctccgatccact 107  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  39932389 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtatgggggaagagagcagccctccgttccact 39932290  T
Q  108 atatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagag 206  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  39932289 atatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagtctcttcccgtaaccaagag 39932190  T
Q  207 actcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg---- 300  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||        
T  39932189 attcaatcctaatagtgtttcccaaggttaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgc 39932091  T
Q  301 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaa-atataactcataaatttggaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  39932090 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct----caaagttttgtctcatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaa 39931995  T
Q  400 cgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaa 499  Q
    ||||||  |||||||||||||||||         |||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39931994 cgaatactacactgaagatacgttt---ttttttctccttcaataaaagaatatttgcatcaaaagtataatattccctttcaaaatatatttgcatcaa 39931898  T
Q  500 atcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaata 599  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||||||||||    
T  39931897 atcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaata 39931798  T
Q  600 ttcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  39931797 ttctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 39931764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 633
Target Start/End: Original strand, 17324623 - 17325225
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17324623 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 17324722  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324723 agagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 17324822  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccc----tagctgttg-ctttctaaacccttgtttcagcc 323  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||    | | ||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  17324823 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccatagagacaaactctatacaaaccccagttttgttgttgccattctaaacccttgttttagcc 17324922  T
Q  324 ccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgt 422  Q
    |||| ||||| ||     | |||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17324923 ccctgtatct-tc-----aggtttactctggttcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaatatcaccctgaagatacgt 17325016  T
Q  423 ttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaa 522  Q
    ||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  17325017 tt--tttttttctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattcccttgcaaaatatatttgcatcaaatcgtttttcatacggtacaaaa 17325114  T
Q  523 atatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgag 622  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  17325115 atatatttattgtccataaatatattttcaactcaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgag 17325214  T
Q  623 tcatactacaa 633  Q
    |||||||||||    
T  17325215 tcatactacaa 17325225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 85 - 603
Target Start/End: Original strand, 21948230 - 21948751
Alignment:
Q  85 agagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcc 183  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948230 agagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcc 21948329  T
Q  184 caatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctata 283  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21948330 cagcgtcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt-ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctata 21948428  T
Q  284 caaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtga 377  Q
    |||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |    
T  21948429 caaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctct--caaagtttagtatgatacaaggtctatatttatagtaa 21948525  T
Q  378 a-atataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattcc 476  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||         ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21948526 acatataactcataaatttggaacgaataccacactgaagatacgttt-tttttttcctccttctgtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcc 21948624  T
Q  477 ctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnnt 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |    
T  21948625 ctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaat 21948724  T
Q  577 cttttatatttttagcaacaatattct 603  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  21948725 cttttatatttttagcaacaatattct 21948751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 20 - 523
Target Start/End: Original strand, 46431683 - 46432207
Alignment:
Q  20 aaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggt--agagagcagccctccgatccactatatgatgag 117  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431683 aaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggggagagagcagccctccgatccactatatgatgag 46431782  T
Q  118 taacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatccta 217  Q
    || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431783 tatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccatcctcttcccgtaaccaagagactcaatccta 46431882  T
Q  218 atagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttg-ctttctaaacc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     | ||||| |||||||||||    
T  46431883 atagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctacttttgttgttgcctttctaaacc 46431981  T
Q  312 cttgtttcagcccc---------------ctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaattt 395  Q
    ||||||||||||||               |||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  46431982 cttgtttcagcccccatctctctctctctctctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaattt 46432081  T
Q  396 ggaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgca 495  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46432082 ggaacaaataccacagtgaagatacgttt--tttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgca 46432179  T
Q  496 tcaaatcgtccttcatacgatacaaaaa 523  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46432180 tcaaatcgttcttcatacgatacaaaaa 46432207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 30 - 633
Target Start/End: Original strand, 28998240 - 28998842
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | | ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  28998240 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttcaccatatgatgagtaacgttgcaaa 28998339  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | ||  |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998340 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 28998439  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||| ||||||   |||||    | ||||||||||||||||||||    
T  28998440 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattcgcaaaagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagc 28998538  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacg 421  Q
    | |||||||||      |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  28998539 ctcctctatct------caaagtttactctgattcaaagtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactaaatatacg 28998632  T
Q  422 tttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaa 521  Q
     ||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| ||||||    
T  28998633 gtt--tttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatatttcttcgtacggtacaaa 28998730  T
Q  522 aatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttga 621  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  28998731 aatgtatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttga 28998830  T
Q  622 gtcatactacaa 633  Q
    ||||||||||||    
T  28998831 gtcatactacaa 28998842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 30 - 633
Target Start/End: Original strand, 29003956 - 29004558
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | | ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  29003956 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttcaccatatgatgagtaacgttgcaaa 29004055  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | ||  |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004056 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 29004155  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||| ||||||   |||||    | ||||||||||||||||||||    
T  29004156 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattcgcaaaagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagc 29004254  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacg 421  Q
    | |||||||||      |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  29004255 ctcctctatct------caaagtttactctgattcaaagtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactaaatatacg 29004348  T
Q  422 tttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaa 521  Q
     ||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| ||||||    
T  29004349 gtt--tttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatatttcttcgtacggtacaaa 29004446  T
Q  522 aatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttga 621  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  29004447 aatgtatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttga 29004546  T
Q  622 gtcatactacaa 633  Q
    ||||||||||||    
T  29004547 gtcatactacaa 29004558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 30 - 630
Target Start/End: Original strand, 2949219 - 2949810
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  2949219 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcggggg-agagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 2949317  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | ||  |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2949318 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctattctcgtaaacaagagactcaatcctaatagtgtttcc 2949417  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||   |||||    | ||||||||||||||||||||    
T  2949418 caaggtgaatcaaccatcaacccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa-ctctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagc 2949516  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacg 421  Q
    |||||||||||      ||| |||| ||| ||| |||  ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |      ||||||||    
T  2949517 cccctctatct------caaggttttctcggattcaatatctatatttattgtaaaagtataactcataaatttggaacgaatacc------aagatacg 2949604  T
Q  422 tttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaa 521  Q
    |||         || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  2949605 ttt--tttttttct-cttcagtgaaagaatatttgtatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacaatacaaa 2949701  T
Q  522 aatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttga 621  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2949702 aatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatgaaattttga 2949801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 102 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 48665400 - 48664854
Alignment:
Q  102 tccactatatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccg-taa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  48665400 tccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccggtaa 48665301  T
Q  200 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagct--- 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |       
T  48665300 ccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatataaa-ccctagttttg 48665202  T
Q  297 --gttgc-tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaa 392  Q
      ||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||| ||  || |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  48665201 ttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccctccccctctatcttaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaa 48665102  T
Q  393 tttggaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctc-------cttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaa 485  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||          |        ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48665101 tttggaacaaatactacactgaagatacgttttttttttttttttttctttcttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaa 48665002  T
Q  486 tatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatat 585  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||||||||    
T  48665001 tatatgtgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatat 48664902  T
Q  586 ttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  48664901 ttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 48664854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 26 - 513
Target Start/End: Original strand, 2510308 - 2510801
Alignment:
Q  26 gagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||    
T  2510308 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacttta 2510407  T
Q  126 caa-agtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 224  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2510408 caagagagaaatcaatgggttacaagaataagtctct-gcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgt 2510506  T
Q  225 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagct-----gttg-ctttctaaacccttgttt 318  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |     |||| |||| |||||||||||||    
T  2510507 ttccaaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgtggttgcctttataaacccttgttt 2510605  T
Q  319 cagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaaga 417  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  2510606 cagccccctctatctctct--caaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaaaa 2510703  T
Q  418 tacg--tttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatac 513  Q
    ||||  |||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2510704 tacgttttttttctttccctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatac 2510801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 28840994 - 28840627
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28840994 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 28840895  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  28840894 tatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 28840795  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ct 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||    
T  28840794 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgtttcct 28840696  T
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840695 ttctaaacccttgtttcatccccctgtatctct----caaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 28840627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 51750354 - 51749988
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51750354 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 51750255  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  51750254 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaga 51750155  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |    
T  51750154 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcc 51750056  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750055 tttctaaacccttgtttcagccccctctatct------ccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 51749988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 9 - 374
Target Start/End: Original strand, 10399794 - 10400159
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10399794 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 10399893  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399894 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccgaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 10399993  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |    
T  10399994 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgtc 10400092  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatag 374  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |      ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10400093 attctaaacccttgtttcagccccctctatctccc------agtttgctctgatacaaggtctatatttatag 10400159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 28842809 - 28842442
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||    
T  28842809 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaatagaatttgttgacctagttctgtccaaattgacctagtctgggggagagattagccctccgttccacta 28842710  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||    
T  28842709 tatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaatagac 28842610  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ct 302  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||    
T  28842609 tcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcct 28842511  T
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28842510 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctct----caaagtttgctctgatacaaggtttatatttatagt 28842442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 47180028 - 47179658
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatga-gaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccact 107  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  47180028 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggg-agagagcagccctccaatccact 47179930  T
Q  108 atatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47179929 atatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 47179830  T
Q  208 ct-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc 301  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||     | ||||||    
T  47179829 ctccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgcttgctcctaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgc 47179731  T
Q  302 -tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47179730 ttttctaaacccttgtttcagccccctctatctctct--caaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 47179658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 26 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20302756 - 20302410
Alignment:
Q  26 gagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20302756 gagaagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagtagtcctccgatccactatctgatgagtatcgtta 20302657  T
Q  126 caaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 225  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20302656 caaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtt 20302557  T
Q  226 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttc 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||    
T  20302556 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 20302458  T
Q  320 agccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttata 373  Q
    ||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20302457 agccccctctatct------caaagtttgctctgatacaaggtctatatttata 20302410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13762151 - 13761786
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  13762151 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagaagccctccggtccacta 13762052  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  13762051 tatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagactcttcccgtaaccaagagac 13761952  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ct 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||    
T  13761951 tcaatcctaatagtgttttccaagttgaatcaacccccaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttatgttgttgcct 13761853  T
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13761852 ttctaaacccttgtttcagccctctctatct------ccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 13761786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16226483 - 16226116
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatga-gaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccact 107  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16226483 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccact 16226384  T
Q  108 atatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16226383 atatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 16226284  T
Q  208 ct-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc 301  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     | ||||||    
T  16226283 ctccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgc 16226185  T
Q  302 -tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
     ||||||||||||||||| || |||||||||||      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16226184 ttttctaaacccttgttttagacccctctatct------caaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 16226116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 51752678 - 51752314
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  51752678 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 51752579  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  51752578 tatggtgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagac 51752479  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgtt-gct 302  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     | ||||  ||    
T  51752478 tcaat-ctaatagtgtttcacaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactctatac-aagccctaattttgttgttacct 51752381  T
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51752380 ttctaaactcttgtttcagccccctctatct------ccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 51752314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 47177677 - 47177307
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatga-gaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccact 107  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  47177677 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcgatccaatctgacctagtctgggg-agagagcagccctccaatccact 47177579  T
Q  108 atatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47177578 atatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 47177479  T
Q  208 ct-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc 301  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||     | ||||||    
T  47177478 ctcccatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgcttgctcctaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgc 47177380  T
Q  302 -tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47177379 ttttctaaacccttgtttcagccccctctatctctct--caaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 47177307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 2617825 - 2617461
Alignment:
Q  15 aacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgat 114  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||  |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2617825 aacacaatgaagagaaaaacacaaaataatttattgactcagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactatatgat 2617726  T
Q  115 gagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaat 213  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  2617725 gagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaat 2617626  T
Q  214 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttcta 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||    
T  2617625 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgtctttcta 2617527  T
Q  308 aacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    |||||||||||||||| |||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2617526 aacccttgtttcagcctcctctatct------caaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 2617461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 32 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 6823306 - 6822971
Alignment:
Q  32 aacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-g 130  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  6823306 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaag 6823207  T
Q  131 tgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 230  Q
     |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6823206 agaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtatttccca 6823107  T
Q  231 aggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccc 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  6823106 aggtgaatcaacccacaaaccctagt-tttgttcctaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 6823009  T
Q  325 cctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatat 368  Q
    |||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823008 cctctatct------caaagtttgctctgatacaaggtctatat 6822971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 12302492 - 12302842
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  12302492 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 12302591  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | ||  |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302592 agagatgtcaatgagttataagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 12302691  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc-tttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||     | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  12302692 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttaccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcatttctaaacccttgtttcagc 12302790  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgc-tctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||  ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  12302791 cccctctatctctct--caaggtttacatctgatacaaggtctatatttatagt 12302842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20291771 - 20291406
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  20291771 gagaagaacacaaagaagagaagaacaaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtgtgggggagagaacaaccctccgatccacta 20291672  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  20291671 tatgatgagaatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccgtgaccaagagac 20291572  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||    
T  20291571 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacttagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcct 20291473  T
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||      |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20291472 ttctaaacccttgtttcatctccctctatct------caaaatttgctctaatacaaggtctatatttatagt 20291406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15823840 - 15823495
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaa- 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||     
T  15823840 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaat 15823741  T
Q  129 agtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15823740 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatattaatagtgtttcc 15823641  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||||||    
T  15823640 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 15823542  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||| |||||||      |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15823541 cccctttatctct------aagtttactttgatacaaggtctatatttatagt 15823495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 30 - 405
Target Start/End: Original strand, 6995687 - 6996063
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  6995687 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttataaa 6995786  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | ||  |||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6995787 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtatcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcc 6995886  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||| ||||||| ||    
T  6995887 caaggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaaccgttgtttcggc 6995985  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaata 405  Q
    |||||||||||      |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6995986 cccctctatct------caagatttactctgattcaaggtctatatttataataaaagtataactcataaatttggaacgaata 6996063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 35 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13215375 - 13215030
Alignment:
Q  35 acaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtg 132  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| | |    
T  13215375 acaaaagaatttgttgacgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaaatttacaaaagag 13215276  T
Q  133 aaa----tcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
    |||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13215275 aaaaatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 13215176  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||||||    
T  13215175 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 13215077  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||      |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13215076 cccctctatct------caaaatttactctgatacaaggtctatatttatagt 13215030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 30 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 39462813 - 39462464
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| || ||||    
T  39462813 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactatatgatgaataacttttcaaa 39462714  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39462713 agagatatcaaagggttacaagaataattctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 39462614  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc-tttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     | | |||| |||||||||| ||||||||||    
T  39462613 caaggtgaatcaaccctaaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgtttttgcatttctaaacctttgtttcagc 39462515  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    |  ||||||||      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39462514 cttctctatct------caaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 39462464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 38925468 - 38925810
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||||||||||    
T  38925468 agaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgttttactat--gatgagtaacgttacaaa 38925564  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38925565 agagatatcaatgggttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttc 38925664  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||| ||| |||||||||||    
T  38925665 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctgaactcttgtttcagc 38925763  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38925764 cccctctatct------caaagtttactctgatacaaggtctatatttatagt 38925810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41647214 - 41646869
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  41647214 agaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctgatggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 41647115  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41647114 agagatatcaatgagttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtcgcaatctcttcccgtaaccaagtgactcaatcctaatagtgtttcc 41647015  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||   ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||| |||||||    
T  41647014 caaggtgaatcaaccataaaaaccaagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcagc 41646916  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41646915 cccctctatct------caaagtttactctgatacaaggtctatatttatagt 41646869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 37 - 287
Target Start/End: Original strand, 50307540 - 50307792
Alignment:
Q  37 aaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaa 135  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||      
T  50307540 aaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatg 50307639  T
Q  136 tcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 235  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50307640 tcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 50307739  T
Q  236 aatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  50307740 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaa 50307792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 30 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 16428948 - 16428638
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||| ||||||    
T  16428948 agaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactaaaatgatgagtaaccttacaa 16428849  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16428848 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttt 16428749  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||||    
T  16428748 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgttgtcaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 16428650  T
Q  322 ccccctctatct 333  Q
    ||||||||||||    
T  16428649 ccccctctatct 16428638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 30 - 379
Target Start/End: Original strand, 14097956 - 14098306
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtt-acaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14097956 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgtgggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaa 14098055  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14098056 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagctctaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttt 14098155  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagct-----gttg-ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |     |||| |||| |||||| |||||||||    
T  14098156 ccaaggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgtagttgcctttttaaaccattgtttcag 14098254  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
     |||||||||||      ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14098255 tcccctctatct------caaagtttagtttgatacaaggtctatatttatagtgaaa 14098306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 30 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 25128167 - 25127808
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | || |||| ||||||||||| ||||||    
T  25128167 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcctaattgacctagtatgggagagagagcagccctccgtttcaatataatgatgagtaaccttacaa 25128068  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25128067 aagagatatcaatgaattacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatccaaatagtgtttc 25127968  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||||    
T  25127967 acaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttccaagacacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 25127869  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgc-tctgatacaaggtctatatttatagtgaaata 381  Q
     |||||||||||||||| ||| |||| | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25127868 gcccctctatctctctctcaaggtttacatctaatacaaggtttatatttatagagaaata 25127808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Original strand, 50078807 - 50079118
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  50078807 agaacacaaaagaatttgtttaccaaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgttccactataatgatgaataactttacaa 50078906  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  50078907 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttt 50079006  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||||    
T  50079007 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatgcaaa-ccctagttttgttgctgtctttctaaacccttgtttcag 50079105  T
Q  322 ccccctctatctc 334  Q
    |||||||||||||    
T  50079106 ccccctctatctc 50079118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 50076659 - 50077004
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  50076659 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctgggg-agagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacaa 50076757  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50076758 aagagatatcaatggattacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaattcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 50076857  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||   |||||    ||||||||| |||||||||||    
T  50076858 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactttatacaaa-ccctagttttgttgttgtctttctaaatccttgtttcag 50076956  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||  |||||||      ||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  50076957 ccctttctatct------caaggtttacactgatacaatgtctatatttatagt 50077004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 11457462 - 11457807
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  11457462 agaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagacatccgtttcactatatgatgagtaactttacaaa 11457561  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11457562 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaacccccaatctcttcgcgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 11457661  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||| ||||||||||    
T  11457662 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtaattgttgccaagaatcaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgtctttctaaaccattgtttcagc 11457760  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||      ||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  11457761 cccctctatct------caaggtttacactgatacaatgtctatatttatagt 11457807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 30 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18307403 - 18307059
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18307403 agaacacaaaagaatttgttgactccgttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccatccgtttcactataatgatgagtaactttacaa 18307305  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18307304 aagagatatcaatgcgtcacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 18307205  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||||    
T  18307204 ccgaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 18307106  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatag 374  Q
    ||||||||||||      ||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  18307105 ccccctctatct------caaggtttacactgatacaatgtctatatttatag 18307059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 30 - 373
Target Start/End: Original strand, 17186114 - 17186458
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  17186114 agaacacaaaagaatttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcactccgttccattataatgatgagtaactttacaa 17186213  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || || || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17186214 aagagatattaatgggttacaagaataagtctcccttctaattctacccaaagttcaaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctgatagtgtttc 17186313  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||| ||||||    
T  17186314 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgctaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcag 17186412  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttata 373  Q
    ||||||||||||      ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17186413 ccccctctatct------caaggtttgctctgatacaaaatctatatttata 17186458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16231878 - 16231630
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatga-gaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccact 107  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16231878 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacc-agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccact 16231780  T
Q  108 atatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16231779 atatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaggctcaatctcttcccgtaaccaagaga 16231680  T
Q  208 ct-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt 256  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16231679 ctccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt 16231630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18839882 - 18839571
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18839882 agaacacgaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaaccttacaa 18839783  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839782 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcattctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 18839683  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||   |||||    || ||||||||||||||||||    
T  18839682 ccaaggtgaatcaaccctaaaaccctactgtttgttccaaagagataaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctatctaaacccttgtttcag 18839584  T
Q  322 ccccctctatctc 334  Q
    |||||||||||||    
T  18839583 ccccctctatctc 18839571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 25251261 - 25251607
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| | | ||||||| |||| |||||| ||||||    
T  25251261 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtattggggagagagcaaccctctgtttcactataatgataagtaaccttacaa 25251360  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | |  | ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25251361 aagatatatcaatgggttacaagaataagttttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccgagagactcaatcctaatagtgtttc 25251460  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||   |||||    ||||||||||| |||||||||    
T  25251461 ctaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttcgaagagacaaacgttatacaaa-ccctagttttgttgttgtctttctaaacctttgtttcag 25251559  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||      ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  25251560 ccccctctatct------caaggtttactctgatacaaagtctatatttatagt 25251607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 28207055 - 28207398
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||    
T  28207055 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactat--gatgagtaacgttacaaa 28207152  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | ||  |||| | |||||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28207153 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcgtaattatattcaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagacacaatcctaatagtgtttcc 28207252  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||||||    
T  28207253 caaggtgaataaactctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttacacaaa-ccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagc 28207351  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||      ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  28207352 cccctctatct------caaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 28207398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 51757845 - 51757623
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  51757845 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 51757746  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  51757745 tatggtgagtatcgttacaaagagaaatcgataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagac 51757646  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  51757645 tcaatcctaatagtgtttcccaa 51757623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 30 - 336
Target Start/End: Original strand, 4131362 - 4131678
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4131362 agaacacaaaagaatttgttgacatagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaa 4131461  T
Q  129 a-gtgaaa----tcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    | | ||||    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4131462 aagagaaagatatcaatgggttacaagaataagtttctcgcctaattctacccaaagtcc-agcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 4131560  T
Q  224 tttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtt 317  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    | ||||||| |||||||    
T  4131561 tttcccaaggtaaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgccattctaaatccttgtt 4131659  T
Q  318 tcagccccctctatctctc 336  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4131660 tcagccccctctatctctc 4131678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 287
Target Start/End: Original strand, 9241072 - 9241331
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9241072 agaacaaaaaagaatttgtttccccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaa 9241171  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  9241172 aagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaataatgtttt 9241271  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9241272 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaa 9241331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Original strand, 31425002 - 31425316
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31425002 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggg-agagagcagccttccgtttcactataatgatgagtaaccttacaa 31425100  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagag---actcaatcctaatagtgt 224  Q
    | | || ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  31425101 aagagatatcaatgagttacaagaataagcctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagatcactcaatcctaatagtgt 31425200  T
Q  225 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtt 317  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||    
T  31425201 tttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagatacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 31425299  T
Q  318 tcagccccctctatctc 334  Q
    |||||||||| ||||||    
T  31425300 tcagccccctttatctc 31425316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 371
Target Start/End: Original strand, 3579606 - 3579946
Alignment:
Q  32 aacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-g 130  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  | |||| | ||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  3579606 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcaatcatccgtttcacta-atgatgagtaactttacaaaag 3579704  T
Q  131 tgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 230  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  3579705 agatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagccccaatctctttccgtaatcaagagactcaatcctaattgtgtttccta 3579804  T
Q  231 aggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccc 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||| |||||||||||||||||    
T  3579805 aggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgctgcctttctgaacccttgtttcagccc 3579903  T
Q  325 cctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatattta 371  Q
    ||     |||| || |||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  3579904 cc----cctctatctcaaattttacgctgatacaaggtctatattta 3579946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31490206 - 31489899
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||||    
T  31490206 agaacacaaaagaatttgttgatctagttcagtccaaattgacctagtctggggg-gagagcagccctccgtttcaccatatgatgaataaccttacaaa 31490108  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  31490107 agagatatcaatgagttacaagaataagtcttccgcctaattctatccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagaaattcaatcctaatagtgtttcc 31490008  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||| |    
T  31490007 caaggtgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaa--ctatacaaa-ccctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcaac 31489911  T
Q  323 cccctctatctc 334  Q
    ||||||||||||    
T  31489910 cccctctatctc 31489899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 43 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23786120 - 23785935
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgg 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  23786120 atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgg 23786021  T
Q  143 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23786020 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23785935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 40134239 - 40133980
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  40134239 agaacacaaaagaatttgtttacctagtccggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccatccgtttcactataatgatgagtaactttacaa 40134140  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  40134139 aagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaaacctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctagtagtatttc 40134040  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  40134039 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaattctatacaaa 40133980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 43 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17324345 - 17324103
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaac 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| |||| | ||||||| |||||| |||| ||||||| | || |||||     
T  17324345 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtcatggggagagaccagccttccgtttcactataatgatgaataaccttacaaaagagatatcaat 17324246  T
Q  141 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324245 gggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagttccaatctcttcccatattcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 17324146  T
Q  241 acccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctata 283  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  17324145 accctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctata 17324103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 283
Target Start/End: Original strand, 50248557 - 50248813
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagag--cagccctccgatccactatatgatgagtaacgttaca 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||  || || || | | |||||||||||||||||| |||||    
T  50248557 agaacacaaaagaatttgttgacccaattcggaccaaattgacctagtctaggggagagagaacaaccatctgtttcactatatgatgagtaaccttaca 50248656  T
Q  128 aa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    || | ||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50248657 aaagagatgtcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtctcgatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 50248756  T
Q  227 cccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctata 283  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50248757 cccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctata 50248813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6756822 - 6756514
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggt-agagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttaca 127  Q
    |||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| | |||| | ||||||| ||||||||||| |||||    
T  6756822 agaacagaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaactgacctagtctggggggagagagcagtcttccgtttcactataatgatgagtaactttaca 6756723  T
Q  128 aa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    || | || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  6756722 aaagagatatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttctcgtaatca--agactcaatcctaatagtgttt 6756625  T
Q  227 cccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttc 319  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||| ||||||||||    
T  6756624 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaagcccttgtttc 6756526  T
Q  320 agccccctctat 331  Q
    || |||||||||    
T  6756525 agtcccctctat 6756514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17319181 - 17318877
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| | ||||    
T  17319181 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggg-agagagcagccctccgttttactataatgatgagtaacttaacaa 17319083  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      ||||||    
T  17319082 aagagatatcaataagttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctgttcccgtaaccaagagactcaatcc------tgtttc 17318989  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||||    
T  17318988 ccaaggtgaatcaaccttccaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctaaacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 17318890  T
Q  322 ccccctctatctc 334  Q
    |||||||||||||    
T  17318889 ccccctctatctc 17318877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 34 - 375
Target Start/End: Original strand, 14183581 - 14183918
Alignment:
Q  34 cacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-g 130  Q
    |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  14183581 cacaaaaaaatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaag 14183680  T
Q  131 tgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 230  Q
     || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  14183681 agatatcaatgggttgcaagaataagtcttccgcctaattctacccaaaattctaatctcttcccgtaaccaagagactcaattataatagtgttttcca 14183780  T
Q  231 aggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag---ctgttgctttctaaacccttgtttcagccccct 327  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| ||||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  14183781 aggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caacctctatacaaa-ccctagtttgtgttgcattctaaacccttgtttcagccctct 14183876  T
Q  328 ctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||      ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14183877 ctatct------caaggtttactctgatacatggtctatatttatagt 14183918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 127 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 6824088 - 6823840
Alignment:
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaacc-------aagagactcaatcctaat 219  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||| |||||| ||||    
T  6824088 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctgccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaacccgtaaccaagagattcaatcgtaat 6823989  T
Q  220 agtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaaccct 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||    
T  6823988 agtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaaccct 6823890  T
Q  314 tgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatat 368  Q
    |||||||||||||     |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823889 tgtttcagccccc-----ctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatat 6823840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 450 - 633
Target Start/End: Original strand, 6115532 - 6115716
Alignment:
Q  450 atatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattt 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115532 atatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtcattcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattt 6115631  T
Q  550 tcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaa-ttttgagtcatactacaa 633  Q
    |||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  6115632 tcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttttgagtcatcctacaa 6115716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16429252 - 16429042
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||| ||||||    
T  16429252 agaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcgctataatgatgagtaaccttacaa 16429153  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16429152 aagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaattcccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttc 16429053  T
Q  228 ccaaggtgaat 238  Q
    ||||| |||||    
T  16429052 ccaagttgaat 16429042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16432690 - 16432440
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtct-ggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttaca 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| | ||||||| ||||||||||| |||||    
T  16432690 agaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagtccgccgtttcactataatgatgagtaacattaca 16432591  T
Q  128 aa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    || | || ||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16432590 aaagagatatcaatgggttacaagaataattgtcccgcataattctacccaaagtttcaatctcttcccataaccaagagattcaatcctaataatgttt 16432491  T
Q  227 cccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaac 277  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  16432490 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtcgccaagagacaaac 16432440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 32 - 256
Target Start/End: Original strand, 25248540 - 25248766
Alignment:
Q  32 aacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa- 129  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||| | ||||||| | ||||||||| |||||||     
T  25248540 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagggagcagtcctccgtttcactataattatgagtaaccttacaaaa 25248639  T
Q  130 gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 229  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  25248640 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcctgtaaccgagagacttaatcctaatagtgttttcc 25248739  T
Q  230 aaggtgaatcaacccacaaaccctagt 256  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  25248740 aaggtgaatcaaccctcaaaccctagt 25248766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 47 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 47451919 - 47451597
Alignment:
Q  47 gttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggtt 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | | || | |||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| | |||    
T  47451919 gttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtcattcgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagtt 47451820  T
Q  146 acaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccca 245  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | || ||||||||||||     
T  47451819 acaagaaaaagtttcccgcctaattttacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa------acactaatgtgaatcaaccct 47451726  T
Q  246 caaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcg 339  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    | ||| |||||||||||| ||||||||||||||          
T  47451725 caaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgccattccaaacccttgtttaagccccctctatct------ 47451633  T
Q  340 caaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47451632 caaagtttactctgatacaaggtctatatttatagt 47451597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 43 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 42922513 - 42922157
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaa 139  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||||||| | || |||||    
T  42922513 atttgtttacccagttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtcctccgttccactctaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 42922414  T
Q  140 cgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 239  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  42922413 tgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcgcaaggtgaatc 42922314  T
Q  240 aacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag-----ctgttgctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 334  Q
    ||||    |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| ||||||      |||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  42922313 aacc--tcaaccctagtgtttgttgctaggag-caaactctatacaaa-ccctagttttcttgttgacttctaaacccttatttcaaccccctctatct- 42922219  T
Q  335 tctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaac 400  Q
          || |||| |||||||||||  |||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||    
T  42922218 -----taaggtttactctgatacaaaatctatatttatagtaaaagtatccctcataaatttggaac 42922157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 445 - 633
Target Start/End: Original strand, 45693834 - 45694022
Alignment:
Q  445 aaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaata 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45693834 aaagaatatttgcataaaaaatatattattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaata 45693933  T
Q  545 tattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    |||||| |||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  45693934 tatttttagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgaatcatagtacaa 45694022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 135 - 501
Target Start/End: Original strand, 26520206 - 26520580
Alignment:
Q  135 atcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaac------caagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26520206 atcaatgggttacaagaataagtttccaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgactgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc 26520305  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagct-----gttgctttctaaacccttgttt-cag 321  Q
    ||||||||||||||||    || | ||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||||| |     ||||  ||||||||| |||||| |||    
T  26520306 ccaaggtgaatcaacctc--aatcttagtgtttgttgccaagag-caaactctatagaaa-ccctagttttcttgttgacttctaaaccgttgttttcag 26520401  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaatataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacg 421  Q
    |||||     |||| || ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26520402 ccccc-----ctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagagaaatataacttataaatttggaacgaatatcacactgaagataca 26520496  T
Q  422 tttc----nnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 501  Q
    ||||            || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26520497 tttcttttgtttttttcttcttcggtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 26520580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 334
Target Start/End: Original strand, 31422851 - 31423171
Alignment:
Q  34 cacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccac------------tata-tgatgagtaa 120  Q
    |||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | | |||            |||| ||||||||||    
T  31422851 cacaaaagaatttgttcacccagctcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctctgtttcaccctctctttcactataatgatgagtaa 31422950  T
Q  121 cgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaat 219  Q
    | ||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31422951 ccttacaaaagagatgtcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaattctaat 31423050  T
Q  220 agtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgttt-gttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaaccc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||| ||||||   |||||    ||||||||||||    
T  31423051 agtgtttcccaaggtgaatcaactttcaaaccctagtgtttaatgccaaagagacaaactctatataaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 31423149  T
Q  313 ttgtttcagccccctctatctc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  31423150 ttgtttcagccccctctatctc 31423171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 443 - 633
Target Start/End: Original strand, 4131690 - 4131880
Alignment:
Q  443 tgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatattta-ttgtccataa 541  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4131690 tgaaagaatatttgcatcaaaa-tataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttatttgtccataa 4131788  T
Q  542 atatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  4131789 atatatgttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 4131880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 69 - 287
Target Start/End: Original strand, 15669419 - 15669636
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa-agtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcct 166  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | |||| | || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15669419 tgacctagtctcggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtagctttacgagagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct 15669518  T
Q  167 aattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccg 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |     
T  15669519 aattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgcc 15669616  T
Q  267 aagagacaaactctatacaaa 287  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  15669617 aagag-caaactttatacaaa 15669636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 51 - 375
Target Start/End: Original strand, 49495218 - 49495531
Alignment:
Q  51 acctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttaca 148  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||  |||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||| ||||||||    
T  49495218 acctagttcggtctaaattgacatagtcttggggagagataagcccttcgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttaca 49495317  T
Q  149 agaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaa 248  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |   |    
T  49495318 agaatgagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttaccgtgaccaaaagactcaattttattagtgtttcccaaggtgaatcaactc---a 49495414  T
Q  249 accctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagctgttgctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttg 348  Q
    ||| ||||||||||| | ||||| |||||| ||| |||| ||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||      ||| ||||     
T  49495415 accatagtgtttgttgccaagag-caaactatatgcaaa-ccctag--tttgatttataaacccttgtttcagccccctctatct------caaggttta 49495504  T
Q  349 ctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  49495505 ctctgatacaaagtctatatttatagt 49495531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 23816180 - 23816027
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  23816180 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcatccctccgatccattatatgatgagtaacgttacaaa 23816081  T
Q  129 agtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 182  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23816080 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 23816027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 243
Target Start/End: Original strand, 6115089 - 6115304
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||| ||||||||||  ||||||    
T  6115089 agaacacaaaataatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcattccgtttcactataatgatgagtaattttacaa 6115188  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  6115189 aagagatatcaattggttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcatgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttt 6115288  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacc 243  Q
     |||||||||||||||    
T  6115289 tcaaggtgaatcaacc 6115304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 334
Target Start/End: Original strand, 8347271 - 8347566
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaa 139  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| | || |||||    
T  8347271 atttgtttcccttgttcggtccaaaactgacctagtctaggggaaagagcatccctccgttccactataataatgagtaactttacaaaagagatatcaa 8347370  T
Q  140 cgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 239  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  8347371 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcataatagtgtttcctaaggtgaatc 8347470  T
Q  240 aacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag-----ctgttgctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 334  Q
    ||||  | |||| | ||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| ||||||      |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8347471 aacc--ctaaccttggtgtttgttgccaagag-caatctctatacaaa-ccctagttttcttgttgacttctaaacccttgtttcaaccccctctatctc 8347566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 447 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 6997395 - 6997187
Alignment:
Q  447 agaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatata 546  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||      ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6997395 agaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaa------tttgcatcaaatcgttcttcatacggtataaaaatatatttattgtccataa-tata 6997303  T
Q  547 ttttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaaaattctcaacctt 646  Q
    |||| |||||||||||| ||||       ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  6997302 tttttagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaataatattctccatccatcaaattttgagtcatactataacattctccacctt 6997203  T
Q  647 gactccaaattagtga 662  Q
    ||||| ||||||||||    
T  6997202 gactctaaattagtga 6997187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 375
Target Start/End: Original strand, 18800600 - 18800901
Alignment:
Q  71 acctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaa 168  Q
    ||||||| ||||| |||||||||  ||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18800600 acctagtttgggggagagagcagttctccgcttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggatacaagaataagtgtcccgcctaa 18800699  T
Q  169 ttctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaa 268  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | ||||||||| |||||  | ||    
T  18800700 ttctacccaaagttcaaatctctacccgtgacctagagactcaatcctaatagtgtttctcagggtgaatcaacc--ccaaccctagtatttgtggccaa 18800797  T
Q  269 gagacaaactctatacaaagccctag-----ctgttgctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtc 363  Q
    ||| ||||||||||||||| || |||      |||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||||      ||| |||| |||||||||||||||    
T  18800798 gag-caaactctatacaaa-ccgtagttttcttgttgacttctaaacctttgtttcagccccttgtatct------caaggtttactctgatacaaggtc 18800889  T
Q  364 tatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||    
T  18800890 tatatttatagt 18800901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 437 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 6996221 - 6996067
Alignment:
Q  437 cttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtc 536  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||      ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6996221 cttcagtgaaagaatatttgcaacaaaaatataatattccctttcaa------tttacatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatgtattgtc 6996128  T
Q  537 cataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaa 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||||||||    
T  6996127 cataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaagtcttttatatttttagcaacaa 6996067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 424
Target Start/End: Original strand, 13125456 - 13125838
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaa 139  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||  ||||  ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || |||||    
T  13125456 atttgtttacctagttcggtcctatactgacctagtaagggggggagagcaactctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 13125555  T
Q  140 cgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 238  Q
     ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  13125556 agggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccttgaccaagagcctcaatcctaacagcgtttcccaatgtgaat 13125655  T
Q  239 caacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag-----ctgttgctttctaaacccttgtttcagccccctctatct 333  Q
    |||||    |||||||||||||||  | ||||| |||||||||||| || ||||||      |||||  |||| ||||||||||||||||||      ||    
T  13125656 caacc--tcaaccctagtgtttgtcgccaagag-caaactctataccaaaccctagtttccttgttggcttcttaacccttgtttcagcccc------ct 13125746  T
Q  334 ctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaatataa--ctcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgttt 424  Q
     |||| |||  ||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||  |||| ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||||||    
T  13125747 ttctctcaagttttactctgatacaaggtttctatttatagagaaataaaaccctca-aaattaggaacaaatctcacgctgaaaatacgttt 13125838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 13358888 - 13358778
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13358888 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 13358789  T
Q  109 tatgatgagta 119  Q
    ||||| |||||    
T  13358788 tatgaagagta 13358778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 155963 - 155788
Alignment:
Q  67 attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-c 164  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || | |||  |||||||||||| | ||| |   |    
T  155963 attgacctagtttgggg-agagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaagagataacaaaaggttacaagaattactcttcaaac 155865  T
Q  165 ctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 241  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  155864 ctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 155788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 287
Target Start/End: Original strand, 8349050 - 8349294
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaa 139  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||  |||| |||||| ||| ||||| || |||||   ||||||||| ||||||||||| | ||||| | || | |||    
T  8349050 atttgtttacccagttcggtctaaaactgacatagtcttggggagagaacaaccctctattccactataatgatgagtaacttaacaaaagagataccaa 8349149  T
Q  140 cgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 239  Q
     | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8349150 tgagttacaagaataagtcacccgcctaattctacctaaagtcctaatctcttcccgtgaccatcaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaata 8349249  T
Q  240 aacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    ||||  | |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  8349250 aacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaa 8349294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 520 - 633
Target Start/End: Original strand, 46432521 - 46432634
Alignment:
Q  520 aaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaatttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  46432521 aaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttt 46432620  T
Q  620 gagtcatactacaa 633  Q
    ||||||||||||||    
T  46432621 gagtcatactacaa 46432634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 482 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 16561284 - 16561133
Alignment:
Q  482 aaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntctttt 581  Q
    ||||||||||||  ||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||       | ||||    
T  16561284 aaaatatatttgtttcaaatattccttcatacggtacaaaaagatatttattgtcaataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatatttt 16561185  T
Q  582 atatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||    
T  16561184 atatttttagcaacaatattcttcatccaacaaattttgaatcatacaacaa 16561133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16561738 - 16561367
Alignment:
Q  55 agttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaaga 151  Q
    |||||||||||| | |||||||||||  || |||||||| ||||  | |||||| || ||||||||||| ||||||| | || ||||| |||||||||||    
T  16561738 agttcggtccaatactgacctagtctatgggagagagcaaccctttgttccactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaaga 16561639  T
Q  152 ataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaac 250  Q
    |||||||| |   |||| |||||||||||||| |||||| || ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  16561638 ataagtcttcaaacctatttctacccaaagtctcaatctatttccgtggccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aac 16561542  T
Q  251 cctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta----gctgttgctttctaaacccttg-tttcagccccctctatctctctcgcaaagt 345  Q
    ||||| || |    |  ||||| || ||||||   || |||||    | ||||  ||||||| |||||| |||||| || ||||| ||||||| ||| ||    
T  16561541 cctagagtctcccgcttagaga-aacctctat---aaaccctagtttgttgtttgtttctaatcccttgttttcag-cctctctacctctctctcaaggt 16561447  T
Q  346 ttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaatataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtttc 425  Q
    ||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  16561446 ttcatctgatataaggtttatatttatagagaaatataactcataaatttgaaacggatatcacgctgaagataagtttc 16561367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 43 - 241
Target Start/End: Original strand, 30738626 - 30738830
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata---tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatc 137  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||  |||||||| ||||||| | |||||||   ||||||||||| ||||||| | || |||    
T  30738626 atttgtttaccaagtttggtccaatactgacctagtatgggtgagagagcatccctccgtttcactataatatgatgagtaactttacaaaagagacatc 30738725  T
Q  138 aacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 236  Q
    || ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30738726 aaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaaatcccaatctcttcctatgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtga 30738825  T
Q  237 atcaa 241  Q
    |||||    
T  30738826 atcaa 30738830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 43 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 27916779 - 27916539
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatat-gatgagtaacgttacaaagtgaaatcaac 140  Q
    ||||||| ||| | |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||| || |||||     
T  27916779 atttgtttacccaattcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataacgatgagtaactttacaaagagatatcaaa 27916680  T
Q  141 g--ggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 237  Q
    |  ||||| |||||| ||||| |   |||||||| |||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  27916679 gaaggttaaaagaattagtcttcaaacctaattccacccaaagtcacaatctcttcatgtgaccaagagactcaattctaatagtgttttccaaggtgaa 27916580  T
Q  238 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactcta 281  Q
    ||||    | |||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  27916579 tcaa--ttccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactcta 27916539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 469 - 555
Target Start/End: Original strand, 11693580 - 11693666
Alignment:
Q  469 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 555  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11693580 aatattccctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 11693666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 353 - 496
Target Start/End: Original strand, 6115395 - 6115541
Alignment:
Q  353 gatacaaggtctatatttatagtgaaatataac--tcataaatttggaacgaatatcacactgaa---gatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaa 447  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||         |||||||| |||||    
T  6115395 gatacaaggtctatatttatagagaaatataacgctcataaatttggaacgaatatcacactaatagtgatacgttt--tttttttctccttcaatgaaa 6115492  T
Q  448 gaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcat 496  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115493 gaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcat 6115541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 241
Target Start/End: Original strand, 26613238 - 26613440
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaa 139  Q
    ||||||| ||| ||||||||| || | ||||||| ||||||| |||||| ||| ||| | ||||||||| |||| |||||| || |||| | || |||||    
T  26613238 atttgtttacccagttcggtcaaatactgacctaatctgggggagagagaagctctctgttccactataatgattagtaactttccaaaagagatatcaa 26613337  T
Q  140 cgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 238  Q
     ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26613338 agggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagcctcaatctcttcctgtgaccaagtgactcaatccgaatagtgtttcccaaggtgaat 26613437  T
Q  239 caa 241  Q
    |||    
T  26613438 caa 26613440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 243
Target Start/End: Original strand, 30790412 - 30790602
Alignment:
Q  55 agttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaaga 151  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||| |||||||||||    
T  30790412 agttcggtccaaaactgacctagtctggga-agagagcagtcatccattccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaga 30790510  T
Q  152 ataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 243  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  30790511 ataagtctccaaacctaattctacacaaagtctccatctcttcgcgtaaccaaaagactc-atcctaacagtgtttcccaaggtaaatcaacc 30790602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 469 - 555
Target Start/End: Original strand, 13785662 - 13785748
Alignment:
Q  469 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 555  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  13785662 aatattccttttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacgatacaaaaatatatttactatctataaatatattttcagca 13785748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 352 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 14352946 - 14352759
Alignment:
Q  352 tgatacaaggtctatatttatagtgaaatataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtg-aaagaa 450  Q
    ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||          |||||||  | |||  |    
T  14352946 tgatacatgatctgtatttatagagaaatataactcgtaaatttggaacaaatatcacgctgaagatacgttt-------tcttccttcaacgcaaaata 14352854  T
Q  451 tatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatatttt 550  Q
    ||||||||| |       |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  14352853 tatttgcatca-------aatattccctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatttactattcataaatatatttt 14352761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 223
Target Start/End: Original strand, 21353346 - 21353525
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaac 140  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| || ||  |     
T  21353346 atttgtttacccagttcggtctaaagatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatgagtttctttacaaagagatattga- 21353444  T
Q  141 gggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
      ||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21353445 --gttacaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 21353525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 28279424 - 28279326
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |  | |||||||||||||||    
T  28279424 cctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagaagctcaatcctaatagtgtttctccaaggggaatcaatc--ccaaccctagtgtttgt 28279327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 166 - 241
Target Start/End: Original strand, 26332613 - 26332688
Alignment:
Q  166 taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 241  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26332613 taattctacacaaagtctcaatctcttctcgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatcaa 26332688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 376 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 10115738 - 10115572
Alignment:
Q  376 gaaatataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtg-aaagaatatttgcataaaaaatataatatt 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||         ||| ||||||| ||| ||||||||||| |||       ||||    
T  10115738 gaaatataactcataaatttggaacggatatcacgctgaagatatgttt--ttttttcctcattcagtgcaaaaaatatttgcatcaaa-------tatt 10115648  T
Q  475 ccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 552  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||  | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10115647 ccgtttaaaaatatatttgcatcaaatattccttcatacgggataaaa--atatttattgtccataaatatattttca 10115572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14353126 - 14353047
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 241  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14353126 cctaattctacccaaagtctcgaatctctttccgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 14353047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 15916673 - 15916562
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaa-ttgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgtta-caaagtgaaatcaa 139  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||  |||| || |||||    
T  15916673 atttgtttacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgacgagtaactttataaaagagatatcaa 15916574  T
Q  140 cgggttacaaga 151  Q
     |||||||||||    
T  15916573 tgggttacaaga 15916562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 4144804 - 4144865
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4144804 cctaattctacccaa-gtcccagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 4144865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 71
Target Start/End: Original strand, 13447245 - 13447301
Alignment:
Q  15 aacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattga 71  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13447245 aacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattga 13447301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 43104400 - 43104245
Alignment:
Q  86 gagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataag-tctcccg-cctaattctacccaaagt 181  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||| |||||||||||| ||  ||| |   ||||||||||||||||||    
T  43104400 gagagcatctctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaaaaaaatcttcaaacctaattctacccaaagt 43104301  T
Q  182 cccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 237  Q
      |||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  43104300 ttcaatgtcttcctgtgaccaaaagactcaattctaatagtgttttccaaggtgaa 43104245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2232658 - 2232597
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2232658 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2232597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14997101 - 14997040
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14997101 cctaattctacccaa-gtctcaatctcttccagtaaccaagagactcaatcctaacagtgttt 14997040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16231617 - 16231550
Alignment:
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16231617 tttctagacccttgtttcagccccctctatctc------aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 16231550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 505 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 32260883 - 32260833
Alignment:
Q  505 ccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 555  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32260883 ccttcatacggtacaaaaatatatttattgttcataaatatattttcagca 32260833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 576 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 32260795 - 32260746
Alignment:
Q  576 tcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtca 625  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  32260795 tcttttatatttttagcaacaatcttcttcatccatcaaattttgagtca 32260746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Original strand, 2401342 - 2401400
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2401342 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 2401400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9526527 - 9526469
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9526527 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 9526469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25134132 - 25134074
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25134132 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 25134074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 516 - 562
Target Start/End: Original strand, 13112047 - 13112093
Alignment:
Q  516 tacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaata 562  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13112047 tacaaaaatatatttattgtccatgaatatattttcagcataaaata 13112093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 281
Target Start/End: Original strand, 26332719 - 26332798
Alignment:
Q  199 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactcta 281  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  26332719 accaagagactaaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatcaaacc-caaa-cctagtgtttgttgccaagag-caaactcta 26332798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Original strand, 13598402 - 13598466
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  13598402 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactat 13598466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 16124609 - 16124545
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16124609 ttgttgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 16124545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Original strand, 37069774 - 37069838
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  37069774 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccgatccactat 37069838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 47704029 - 47703965
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  47704029 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 47703965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 49959237 - 49959129
Alignment:
Q  135 atcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaag 232  Q
    ||||| |||||| |||||| ||| ||   ||||||| || |||||||| | ||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  49959237 atcaaagggttaaaagaatcagtttcaaacctaattttatccaaagtctcgaatctcttctcatgaccaagagactcattcctaatagtgtttctccaag 49959138  T
Q  233 gtgaatcaa 241  Q
    |||||||||    
T  49959137 gtgaatcaa 49959129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9521776 - 9521718
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  9521776 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtg 9521718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 108
Target Start/End: Original strand, 19072932 - 19072995
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  19072932 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccacta 19072995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 108
Target Start/End: Original strand, 19120822 - 19120885
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  19120822 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccacta 19120885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 303 - 374
Target Start/End: Original strand, 26613503 - 26613571
Alignment:
Q  303 ttctaaacccttgttt-cagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatag 374  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    || ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26613503 ttctaaacccttgttttcagccccctctatctctc----aaggtttcatctgatacaaggtctatatttatag 26613571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 108
Target Start/End: Original strand, 32889443 - 32889506
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||    
T  32889443 ttgttgatctagttcggtccaatatgacctagtctgggggatagagcagctctccaatccacta 32889506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 47098917 - 47098854
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  47098917 ttgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagagagcagccctccaatccacta 47098854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 223
Target Start/End: Original strand, 2393404 - 2393461
Alignment:
Q  165 ctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    |||||||||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2393404 ctaattctacccaa-gtcccagactattcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 2393461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 370
Target Start/End: Original strand, 25248778 - 25248841
Alignment:
Q  301 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatattt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      ||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25248778 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatct------caaggtttactctgatacaaagtctatattt 25248841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 109
Target Start/End: Original strand, 29651818 - 29651879
Alignment:
Q  48 ttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  29651818 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactccaatccactat 29651879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 334
Target Start/End: Original strand, 6115344 - 6115376
Alignment:
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115344 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 6115376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Original strand, 9476265 - 9476329
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  9476265 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactat 9476329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 26644990 - 26644930
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatcca 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  26644990 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 26644930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 32261014 - 32260950
Alignment:
Q  356 acaaggtctatatttatagtgaaatataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatac 420  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| || ||||| |||| ||||    
T  32261014 acaagatctatatttatagagaaatataactcgtaaatttgaaacggatgtcacattgaatatac 32260950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 578 - 625
Target Start/End: Original strand, 11693706 - 11693753
Alignment:
Q  578 ttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtca 625  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  11693706 ttttataattttagcaataatcttcttcatccatcaaattttgagtca 11693753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 13785392 - 13785455
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||   || ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  13785392 cctaattctacccaaagtcccgaatctctttttgtgaccaagaaactcaatcctaattgtgttt 13785455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 408
Target Start/End: Original strand, 13785580 - 13785611
Alignment:
Q  377 aaatataactcataaatttggaacgaatatca 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13785580 aaatataactcataaatttggaacgaatatca 13785611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 47102934 - 47102871
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  47102934 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccatccaatccacta 47102871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 2232787 - 2232710
Alignment:
Q  29 aagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccac 106  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  2232787 aagaacacaaga-tatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccac 2232710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 48 - 106
Target Start/End: Original strand, 3281715 - 3281773
Alignment:
Q  48 ttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccac 106  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  3281715 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccac 3281773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 9526663 - 9526582
Alignment:
Q  29 aagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  9526663 aagaacacaaga-tatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 9526582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 576 - 625
Target Start/End: Original strand, 13785786 - 13785835
Alignment:
Q  576 tcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtca 625  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  13785786 tctttcatatttttagcgacaatattctccatccatcaatttttgagtca 13785835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 23783533 - 23783500
Alignment:
Q  342 aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23783533 aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 23783500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Original strand, 834167 - 834211
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  834167 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgggggagaga 834211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Original strand, 3847121 - 3847165
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  3847121 ttgttgaccaagttcggtccaacttgacctaatctggggaagaga 3847165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 585 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 10115506 - 10115466
Alignment:
Q  585 tttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtca 625  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  10115506 ttttttgcaacaatattcttaatccatcaaattttgagtca 10115466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 129
Target Start/End: Original strand, 13127686 - 13127774
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| | | ||||||||||| | |||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| |||||||    
T  13127686 atttgtttacccggttcggtccaatactaacctagtctggaggagagagcagctctccgttctactataatgatgagtaactttacaaa 13127774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 351 - 379
Target Start/End: Original strand, 13449856 - 13449884
Alignment:
Q  351 ctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13449856 ctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 13449884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 27104465 - 27104401
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||  ||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  27104465 ttgttgacacagttcggtccaatataacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 27104401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Original strand, 28220226 - 28220270
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  28220226 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 28220270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Original strand, 28265554 - 28265598
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  28265554 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 28265598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 37990836 - 37990772
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  37990836 cctaattctacccaaaatttcgaatctcttctcgtgatcaagagactcaattctaatagtgtttc 37990772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Original strand, 40122196 - 40122240
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||    
T  40122196 ttgttgacctagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 40122240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 49918518 - 49918474
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||    
T  49918518 ttgttgacctagttcggtccaacttgacctaatttgggggagaga 49918474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Original strand, 50167175 - 50167219
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||    
T  50167175 ttgttgacctagttcggtccaacttgagctaatctgggggagaga 50167219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 422; Significance: 0; HSPs: 191)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 633
Target Start/End: Original strand, 4103858 - 4104481
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  4103858 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccgatccacta 4103957  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4103958 tatgatgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 4104057  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ct 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||||    ||    
T  4104058 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaagctctatacaaa-ccctagttttgttgttgcct 4104156  T
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacg 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||     
T  4104157 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctct--caaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaaca 4104254  T
Q  402 aatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 501  Q
    |||| ||||||   |||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104255 aataccacact---gatacgttt--tttttttctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 4104349  T
Q  502 cgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatatt 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  4104350 cgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcataaagtatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatatt 4104449  T
Q  602 cttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104450 cttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 4104481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 747053 - 746424
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatga-gaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccact 107  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  747053 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccgatccact 746954  T
Q  108 atatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746953 atatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 746854  T
Q  208 ct-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc 301  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||     | ||||||    
T  746853 ctccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgc 746755  T
Q  302 -tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaa 399  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  746754 ttttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaa 746655  T
Q  400 cgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaa 499  Q
    | |||| ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746654 caaataccacactgaagatacgttt---ttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaa 746558  T
Q  500 atcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaata 599  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||||||||||    
T  746557 atcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaata 746458  T
Q  600 ttcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  746457 ttctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 746424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 458580 - 457925
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatga-gaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccact 107  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  458580 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaacctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccact 458481  T
Q  108 atatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458480 atatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 458381  T
Q  208 ct-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg---- 300  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||        
T  458380 ctccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgc 458282  T
Q  301 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  458281 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctct--caaggtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaa 458184  T
Q  400 cgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaa 499  Q
    | |||| ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458183 caaataccacactgaagatacgttt--tttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaa 458086  T
Q  500 atcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaata 599  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||||||||||    
T  458085 atcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccacaaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaata 457986  T
Q  600 ttcttcttccatcaaattttgagtcatactacaaaattctcaaccttgactccaaattagt 660  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  457985 ttccccatccatcaaattttgagtcatactacaacattctccaccttgactctaaattagt 457925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 25533720 - 25533109
Alignment:
Q  26 gagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533720 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 25533621  T
Q  126 caaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 224  Q
    |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25533620 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgt 25533521  T
Q  225 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgttt 318  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||    
T  25533520 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 25533422  T
Q  319 cagccccctcta--tctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaa 415  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  25533421 cagccccctctatctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttagaacaaatatcacactgaa 25533322  T
Q  416 gatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacga 515  Q
    |||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25533321 gatacgttt-----ttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacga 25533227  T
Q  516 tacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaa 615  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  25533226 tacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcaaaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaa 25533127  T
Q  616 ttttgagtcatactacaa 633  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25533126 ttttgagtcatactacaa 25533109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 456203 - 455575
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatga-gaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccact 107  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  456203 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaacccgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccact 456104  T
Q  108 atatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456103 atatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 456004  T
Q  208 ct-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg---- 300  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||        
T  456003 ctccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgc 455905  T
Q  301 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  455904 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctct--caaggtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaa 455807  T
Q  400 cgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaa 499  Q
    | |||| | ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455806 caaataccgcactgaagatacgttt--tttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaa 455709  T
Q  500 atcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaata 599  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||||||||||    
T  455708 atcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccacaaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaata 455609  T
Q  600 ttcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  455608 ttccccatccatcaaattttgagtcatactacaa 455575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 633
Target Start/End: Original strand, 10621491 - 10622125
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatga-gaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccact 107  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  10621491 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgagctagtctgggggagagagcagccctccaatccact 10621590  T
Q  108 atatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621591 atatgatgagtaccgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 10621690  T
Q  208 ct-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc 301  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||     | ||||||    
T  10621691 ctccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgc 10621789  T
Q  302 -tttctaaacccttgtttcagccccctcta------tctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaat 393  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||      |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10621790 ttttctaaacccttgtttcagcaccctctatctctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaat 10621889  T
Q  394 ttggaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttg 493  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621890 ttggaacaaataccacactgaagatacgttt----tttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttg 10621985  T
Q  494 catcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagca 593  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||       ||||||||||||||||||    
T  10621986 catcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatatcttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagca 10622085  T
Q  594 acaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  10622086 acaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 10622125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 1313683 - 1313084
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  1313683 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 1313584  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1313583 agagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttcc 1313484  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    | || |||| ||||||||||||    
T  1313483 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgccattgtaaa-ccttgtttcagc 1313386  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacg 421  Q
    |||||||||||      ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  1313385 cccctctatct------caaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaatatcacactaaagatact 1313292  T
Q  422 tttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaa 521  Q
    |||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  1313291 ttt----tttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaga 1313196  T
Q  522 aatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttga 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||       || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1313195 aatatatttattgtccataaatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcatttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttga 1313096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 662
Target Start/End: Original strand, 53915479 - 53916109
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  53915479 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtcaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactaaatgatgagtaacattacaaa 53915578  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  53915579 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaataatgtttca 53915678  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||   |||||    | | ||||||||||||||||||    
T  53915679 caaggtaaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaaatctatacaaa-ccctagttttgttgttgtcatcctaaacccttgtttcagc 53915777  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacg 421  Q
    |||||||||||       || |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  53915778 cccctctatct------taaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactcaagatacg 53915871  T
Q  422 tttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaa 521  Q
    |||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  53915872 ttt---ttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaa 53915968  T
Q  522 aatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttga 621  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  53915969 aatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccctcaaattttga 53916068  T
Q  622 gtcatactacaaaattctcaaccttgactccaaattagtga 662  Q
    |||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||||||    
T  53916069 gtcatactacaacattcttcgccttgactctaaattagtga 53916109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 42990578 - 42989954
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  42990578 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcaccatatgatgagtaacgttacaaa 42990479  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990478 agagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 42990379  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||||||    
T  42990378 caaggtgaatcaaccctcaaaacctaatgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 42990280  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagt-ttgctc---------------tgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaata 405  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  |||               |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  42990279 cccctctatctctctctcaaagtctctctctctcaaagtttagcatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaata 42990180  T
Q  406 tcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtc 505  Q
     |||||||||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  42990179 ccacactgaagatacattt--tttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtt 42990082  T
Q  506 cttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttc 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||       | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  42990081 cttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatactttcagcaaaaaatatatttgaaacaaattttttatatttttagcaacaatattctcc 42989982  T
Q  606 ttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  42989981 atccatcaaattttgagtcatactacaa 42989954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 630
Target Start/End: Original strand, 53917647 - 53918245
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  53917647 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaa 53917746  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917747 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 53917846  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    | ||||||||| ||||||||||    
T  53917847 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgtcattctaaaccattgtttcagc 53917945  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacg 421  Q
    |||||| ||||      ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  53917946 cccctccatct------caaggtttaatctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttgaaacgaataccacactgaagatacg 53918039  T
Q  422 tttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaa 521  Q
    |||         |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  53918040 ttt---ttttttctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtaaaaa 53918136  T
Q  522 aatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttga 621  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  53918137 aatatatttattgtccataaatatatgttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttga 53918236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 51943644 - 51943044
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  51943644 agaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 51943545  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | ||  |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51943544 agagacgtcaatgagttacaagaa-aagtctcccgcctaattctacctaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 51943446  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||| ||||||||||    
T  51943445 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtttcagc 51943347  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacg 421  Q
     ||||||||||      | | |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51943346 accctctatct------ccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataaatcataaatttggaacgaataccacactgaagatacg 51943253  T
Q  422 tttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaa 521  Q
    |||         |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  51943252 ttt---ttctttctccttcaatgaaagaatatttacatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacggtacaaa 51943156  T
Q  522 aatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttga 621  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51943155 aatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 51943056  T
Q  622 gtcatactacaa 633  Q
    ||||||||||||    
T  51943055 gtcatactacaa 51943044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 30 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 42992544 - 42991926
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  42992544 agaacacaaaaaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgattcactatatgatgactaacgttacaaa 42992445  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | |||||||| | |||||||||||||               ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42992444 agagaaatcaatgagttacaagaataa---------------ctacccaaagtcc-actctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttct 42992361  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagct-----gttgc-tttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |     ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  42992360 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagc 42992262  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacg 421  Q
    |||||||||||||||   |||||||    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  42992261 cccctctatctctctt--aaagtttagcatgatacaaggtatatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaattaatattacactgaagatacg 42992164  T
Q  422 tttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaa 521  Q
    |||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  42992163 ttt---ttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacaatacaaa 42992067  T
Q  522 aatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttga 621  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  42992066 aatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaaccttttatatttttaacaacaatattctccatccatcaaattttga 42991967  T
Q  622 gtcatactacaaaattctcaaccttgactccaaattagtga 662  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||    
T  42991966 gtcatactacaacattcttcaccttgactctaaattagtga 42991926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 38890335 - 38889968
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38890335 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgatccacta 38890236  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890235 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 38890136  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttg-c 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     | ||||| |    
T  38890135 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctaattttgttgttgcc 38890037  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  38890036 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctct--caaagtttgct---atacaaggtctatatttatagt 38889968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 10084351 - 10084721
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10084351 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctccgatccacta 10084450  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10084451 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaacgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaga 10084550  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgtt----gc 301  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||     |    
T  10084551 ctcgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttattgcc 10084649  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10084650 tttctaaacccttgttccagccccctctatctctct--caaagtttgctccgatacaaggtctatatttatagt 10084721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 30 - 379
Target Start/End: Original strand, 4308264 - 4308613
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308264 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 4308363  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308364 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 4308463  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||||||    
T  4308464 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 4308562  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308563 cccctctatct------caaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 4308613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 30 - 633
Target Start/End: Original strand, 27635641 - 27636210
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  27635641 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 27635740  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | ||  |||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||            |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27635741 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattttacccaaag------------cccgtaaccaagagactcaatcttaatattgtttcc 27635828  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagctgt------tgctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    ||                   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |      ||| ||||||||||||||||||||    
T  27635829 ca-------------------ccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgtttgcattctaaacccttgtttcagc 27635908  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa--tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatac 420  Q
    ||||||||||||      || |||| |||| || |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27635909 cccctctatctc------aaggtttactctaattcaaggtctatatttgtagtaaaaaatataactcataaatttggaacgaataccacactgaagatac 27636002  T
Q  421 gtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaa 520  Q
     |||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27636003 attt-----ttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaa 27636097  T
Q  521 aaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttg 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  27636098 aaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaactaatattttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttta 27636197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 5191946 - 5191582
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  5191946 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagaacagccctctgatccacta 5191848  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5191847 tatgatgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaatgagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 5191748  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ct 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||    
T  5191747 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcct 5191649  T
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||      | |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5191648 ttctaaacccttgtttcagccccctctatct------ccaagtttgcttagatacaaggtctatatttatagt 5191582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3859805 - 3859457
Alignment:
Q  26 gagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  3859805 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctacgatccactatatgatgagtattgtta 3859706  T
Q  126 caaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 225  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859705 caaagagaaatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 3859606  T
Q  226 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||    
T  3859605 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 3859507  T
Q  320 agccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859506 agccccctctatct------ccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 3859457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 51726969 - 51727338
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  51726969 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccacta 51727068  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||    
T  51727069 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttaccgtaaccaagaga 51727168  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||   |||||    |    
T  51727169 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccc-agtgtttgttccaaagagacaaactctatacata-ccctagttttgttgttgcc 51727266  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51727267 tttctaaacccttgtttcagccccctttatct------caaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 51727338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 27 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 50494276 - 50493924
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 126  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  50494276 agaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac 50494177  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtt 225  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50494176 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatcccttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 50494077  T
Q  226 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc-tttctaaacccttgtttc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     | |||||| ||||||||||||||||||    
T  50494076 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttc 50493978  T
Q  320 agccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    |||||||||||||||||      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50493977 agccccctctatctctc------agtttgctttgatacaaggtctatatttatagtgaaa 50493924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 5522589 - 5522943
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  5522589 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccctccgatccacta 5522688  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5522689 tatgatgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 5522788  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagctgttg-ctttcta 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||          | | ||||| |||||||    
T  5522789 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaatcaacccacaaacccgagtgtttgttccgaagagacaaacccta-------gttttgttgttgcctttcta 5522881  T
Q  308 aacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522882 aacccttgtttcagccccctctatct------ccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 5522943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 30 - 379
Target Start/End: Original strand, 9604590 - 9604944
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9604590 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 9604689  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9604690 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaacctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 9604789  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcc----ctagctgttg-ctttctaaacccttgtttcagcc 323  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||     | | ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  9604790 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttctttcaaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaa-ccttgtttcagcc 9604888  T
Q  324 ccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9604889 ccctctatctctctctcagagttttctctaatacaaggtctatatttatagtgaaa 9604944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 30 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 43228565 - 43228216
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43228565 agaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 43228466  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43228465 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 43228366  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||   |||||    |||||||||| |||||||||||    
T  43228365 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-cgctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagc 43228267  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    |||||||||||      | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43228266 cccctctatct------ccaagtttgctctgatacaatgtctatatttatagtgaaa 43228216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 9 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1321774 - 1321495
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1321774 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 1321675  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  1321674 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagaga 1321575  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1321574 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa 1321495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 6063407 - 6063776
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatg-agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccact 107  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  6063407 gagaagaacacaaagaaggagaagaacacaaagaaatttgtggacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccact 6063506  T
Q  108 atatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6063507 atatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 6063606  T
Q  208 ct-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg---- 300  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||   |||||        
T  6063607 ctccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaaaagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgc 6063705  T
Q  301 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6063706 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct----caaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 6063776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 211 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 41849244 - 41848806
Alignment:
Q  211 aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagct-----gttgct-tt 304  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |     |||| | ||    
T  41849244 aatcctaatagagtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgttatt 41849146  T
Q  305 ctaaacccttgtttcagccccctctatct----ctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  41849145 ctaaacccttgtttcagccccctctatctatctctctctcaaagtttagcctgatacaatgtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaa 41849046  T
Q  400 cgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnn------ctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttg 493  Q
    | |||| ||||||||||||||||||               ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41849045 caaataccacactgaagatacgttttttttttttttttttctctttcagttaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccttttcaaaatatatttg 41848946  T
Q  494 catcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagca 593  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||||    
T  41848945 catcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagca 41848846  T
Q  594 acaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  41848845 acaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 41848806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 11170678 - 11170333
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11170678 agaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 11170579  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11170578 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagacactcaatcctaatagtgtttcc 11170479  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||||||    
T  11170478 caaggtgaatcaatccgcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 11170380  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11170379 cccctctatct------caaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 11170333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 20 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 25389189 - 25388866
Alignment:
Q  20 aaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagta 119  Q
    ||||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25389189 aaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagta 25389090  T
Q  120 acgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaa 218  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25389089 acgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaatatgtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaa 25388990  T
Q  219 tagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc-tttctaaaccc 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     | |||||| |||||||||||    
T  25388989 tagtgttt-ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcttttctaaaccc 25388892  T
Q  313 ttgtttcagccccctctatctctctc 338  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||    
T  25388891 ttgtttcagctctctctctctctctc 25388866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 43 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 43226346 - 43226011
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacg 141  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  43226346 atttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 43226247  T
Q  142 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226246 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 43226147  T
Q  242 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 335  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  | |||   |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  43226146 cccacaaaccctagtgtttgttccaacgagacaaactctatacaaa--cgtagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct-- 43226051  T
Q  336 ctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
        | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43226050 ----ccaagtttgctctgatacaatgtctatatttatagtgaaa 43226011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 30 - 369
Target Start/End: Original strand, 18099153 - 18099493
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18099153 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccatattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaatgttacaaa 18099252  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099253 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 18099352  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    | ||||||||||||||||||||    
T  18099353 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagc 18099451  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatt 369  Q
    ||||||||||||||     |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18099452 cccctctatctctc-----aagtttactctgatacaaggtctatatt 18099493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 10955989 - 10956355
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  10955989 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggtggagagagcagccctccgttccacta 10956088  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  10956089 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagaga 10956188  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |    
T  10956189 ctcaatcctaataatgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcc 10956287  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||     | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10956288 attctaaacccttgtttcagccccctctatct-tc-----atgtttactctgatacaaggtctatatttatagt 10956355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 30 - 379
Target Start/End: Original strand, 27101164 - 27101517
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27101164 agaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctattctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttgcaaa 27101263  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101264 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccattctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 27101363  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||||||    
T  27101364 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 27101462  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    | ||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101463 ctcctctatctctatctcaa--tttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 27101517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 10191274 - 10191641
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  10191274 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaata--atttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttagggagagagcagccctccgatccacta 10191371  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||    
T  10191372 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatgaacgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtcc-agcctcttcctgtaaccaagaga 10191470  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgtt----gc 301  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||   ||||     |    
T  10191471 ctcgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctata-aaaaccctagttttgttattgcc 10191569  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10191570 tttctaaacccttgttccagccccctttatctctct--caaagtttgctccgatacaaggtctatatttatagt 10191641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 6065757 - 6066125
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatg-agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccact 107  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||   ||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  6065757 gagaagaacacaaagaaggagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttctgtccaatctgacctagtctaggggagagagcagccatccaatccact 6065856  T
Q  108 atatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6065857 atatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 6065956  T
Q  208 ct-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg---- 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||        
T  6065957 ctccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaaatctatacaaa-ccctagttttgttgttgc 6066055  T
Q  301 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||     |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6066056 ctttctaaacccttgtttcagccccc-----ctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 6066125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 88 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 6562028 - 6561689
Alignment:
Q  88 gagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa--gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc 184  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||  | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6562028 gagcagccctccgctccactataatgatgagttaccttacaaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc 6561929  T
Q  185 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatac 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6561928 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccccagtgtttgttccaaagagacaaactctatac 6561829  T
Q  285 aaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaa 378  Q
    ||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||      ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6561828 aaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct------caaggtttactctgatacaaggtctatatttatagagaa 6561736  T
Q  379 atataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtttc 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6561735 atataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtttc 6561689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 18096883 - 18097229
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18096883 agaacacaaaagaattcgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagctctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 18096982  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18096983 agggaaatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 18097082  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    | |||||||||||||||| |||    
T  18097083 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttgagc 18097181  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||     |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  18097182 cccctctatctctc-----aagtttactatgatacaaggtctatatttatagt 18097229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 10958285 - 10958651
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  10958285 gagaagaacacaaagaagagaagaacataaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccacta 10958384  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||| |||||||||||    
T  10958385 tatgaagagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtgtcagcctcttcccataaccaagaga 10958484  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |    
T  10958485 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcc 10958583  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |      | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10958584 attctaaacccttgtttcagccccctctatcttt------atgtttactctgatacaaggtctatatttatagt 10958651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 22114267 - 22114633
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || | || ||||| ||||| || ||||||||| || ||    
T  22114267 gagaagaacacaaaaaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttactttgtttgggggagagatcatccctccgattcatta 22114366  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  22114367 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccagcctcttcccgtaaccaagaga 22114466  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgtt----gc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||     |    
T  22114467 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgtttttgcc 22114565  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114566 tttctaaacccttgtttcagccccttctatct------ccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 22114633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 287
Target Start/End: Original strand, 28412992 - 28413273
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatga-gaagaacacaaaagta-tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccac 106  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28412992 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaaagaaatttgttgacctaattcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccac 28413091  T
Q  107 tatatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagag 206  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28413092 tatatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagag 28413191  T
Q  207 ac-tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28413192 acttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 28413273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 26 - 281
Target Start/End: Original strand, 7606567 - 7606822
Alignment:
Q  26 gagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7606567 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgacgagtaacgtta 7606666  T
Q  126 caaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 225  Q
    ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606667 caaatagaaatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 7606766  T
Q  226 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactcta 281  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606767 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactcta 7606822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 45883214 - 45882868
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtct-ggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45883214 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctagggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaa 45883115  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45883114 aagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 45883015  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||||    
T  45883014 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccttattgtttgttccaaagagacaaaatctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 45882916  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||      || ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  45882915 ccccctctatct------catagtttactatgatacaaggtctatatttatagt 45882868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 38210666 - 38210330
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgag-aagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccact 107  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  38210666 gagaagaacacaaagaagaggaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagctctccaatccact 38210567  T
Q  108 atatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38210566 atatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagaga 38210467  T
Q  208 ct-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc 301  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||     | ||||||    
T  38210466 ctccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagataaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgc 38210368  T
Q  302 -tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc 338  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38210367 ttttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc 38210330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 30 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 30006115 - 30005801
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30006115 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctaatctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 30006016  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30006015 agagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcc 30005916  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||||||    
T  30005915 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 30005817  T
Q  323 cccctctatctctctc 338  Q
    ||||||||||||||||    
T  30005816 cccctctatctctctc 30005801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 1626666 - 1627011
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  1626666 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatcgacctagtctgggcgagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 1626765  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1626766 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccaatctctccccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttc 1626865  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||||||    
T  1626866 caaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttccaaagagataaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 1626964  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||      ||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  1626965 cccctctatct------caaggtttacactgatacaatgtctatatttatagt 1627011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Original strand, 28101985 - 28102295
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  28101985 agaacacaaaagaatttgttgacctagtttggtccaaattgacctagctttggggagagagcagccatccgttccactatatgataagtaactttacaaa 28102084  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28102085 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagcgtttcc 28102184  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||||||    
T  28102185 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 28102283  T
Q  323 cccctctatctc 334  Q
    ||||||||||||    
T  28102284 cccctctatctc 28102295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26720842 - 26720477
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | |||| |||||||    
T  26720842 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttggtgacccagttcggtccaaattgacctaatctaggggagagagcagtcatccgttccacta 26720743  T
Q  109 tatgatgagtaacgttac-aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  26720742 tatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaaagggttaaaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaaa 26720643  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||   |||||    |    
T  26720642 ctcaatcctaatagt-taacccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcc 26720545  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26720544 tttctaaacccttatttcagccccctctatct------ccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 26720477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Original strand, 43423446 - 43423756
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  43423446 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctcagggagagagcagctctcagtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 43423545  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43423546 agagatatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 43423645  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||||||    
T  43423646 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 43423744  T
Q  323 cccctctatctc 334  Q
    ||||||| ||||    
T  43423745 cccctctttctc 43423756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 30 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24979982 - 24979632
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtt-acaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24979982 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaa 24979883  T
Q  129 agt-gaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    |   || || ||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24979882 aaaagatattaatttgttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtatttc 24979783  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||||    
T  24979782 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcag 24979684  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    ||||||||||||      |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24979683 ccccctctatct------caaagtttactctgatacaaggtatatatttatagtgaaa 24979632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3314959 - 3314648
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||  ||||||    
T  3314959 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgaataattttacaa 3314860  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3314859 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 3314760  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||| ||||||    
T  3314759 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttacctttctaaacccttatttcag 3314661  T
Q  322 ccccctctatctc 334  Q
    |||||||||||||    
T  3314660 ccccctctatctc 3314648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 43421398 - 43421743
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  43421398 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 43421497  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43421498 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaatccccaatcttttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcc 43421597  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||| |    
T  43421598 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaacactatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaac 43421696  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||| |||||||      ||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  43421697 cccttctatct------caaggtttacactgatacaatgtctatatttatagt 43421743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18162937 - 18162593
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtt-acaa 128  Q
    |||||||||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18162937 agaacacaaaaaaatttgttgacacagttcg-tccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaa 18162839  T
Q  129 agtgaa-atcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18162838 aataaatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 18162739  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||||     
T  18162738 ccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgttcaaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca- 18162641  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgctc-tgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
      ||||||||||      | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18162640 -tccctctatct------ccaagtttactcatgatacaaggtctatatttatagt 18162593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 12267958 - 12268294
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  12267958 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 12268057  T
Q  130 gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 229  Q
               | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12268058 a----------gagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccg 12268147  T
Q  230 aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaagccctagctgttg-------ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| | |||       |||||||||| ||||||||||    
T  12268148 aaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagtttttgttgttgtctttctaaactcttgtttcag 12268246  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    | ||||||||||      |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  12268247 ctccctctatct------caaagtttactctgatacaagttctatatttatagt 12268294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 30 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5886472 - 5886261
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5886472 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtttcaaa 5886373  T
Q  130 gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 229  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  5886372 gacaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgttt-cc 5886274  T
Q  230 aaggtgaatcaac 242  Q
    |||||||||||||    
T  5886273 aaggtgaatcaac 5886261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 30 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5899945 - 5899734
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5899945 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttgcaaa 5899846  T
Q  130 gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 229  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  5899845 gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatcacttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgttt-cc 5899747  T
Q  230 aaggtgaatcaac 242  Q
    |||||||||||||    
T  5899746 aaggtgaatcaac 5899734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 30 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 6484634 - 6484370
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  6484634 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaa 6484535  T
Q  130 gt-gaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
       || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6484534 aaagatatcaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaaaccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaaacctaatagtgtttcc 6484435  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaagccct 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||  || |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6484434 caaggtgaatcaaccctcaaaccccggtatttgttgccgaagagacaaactctacacaaacccct 6484370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 38 - 334
Target Start/End: Original strand, 5926755 - 5927057
Alignment:
Q  38 aaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaat 136  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| | || ||||||||||||||| ||||||| |  | ||    
T  5926755 aaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagtcatccgtttcattatatgatgagtaaccttacaaaagatatat 5926854  T
Q  137 caacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 236  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5926855 aaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggcga 5926954  T
Q  237 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc-tttctaaacccttgtttcagccccctcta 330  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||     | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5926955 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaa-ctctagttttgttgttgcatttctaaacccttgtttcagccctctcta 5927053  T
Q  331 tctc 334  Q
    ||||    
T  5927054 tctc 5927057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 36012101 - 36011791
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36012101 agaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgaagaagagagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 36012002  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  36012001 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccaactaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagatattcaatcctaatagtgtttcc 36011902  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagct--gttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||| |  ||||    ||||||||| ||||||||||||    
T  36011901 caacgtgaatcaaccctcaaaccatagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaa-ccttagtttcgttgttgtctttctaaatccttgtttcagc 36011803  T
Q  323 cccctctatctc 334  Q
    ||||| ||||||    
T  36011802 cccctttatctc 36011791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 47148878 - 47149228
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  47148878 agaacacagaataatttgttgacctagttcgggccaaattgacatagtctgggggagagagcagtcctctgtttcactatatgatgagtaacgatacaaa 47148977  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  47148978 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagacccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt-c 47149076  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttg-ttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||||    
T  47149077 caaggtgaatcaaccatcaaatcccagtgtttgtttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 47149175  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgc-tctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||| ||  ||| |  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  47149176 ccccctctatctccct--caaggcctacatctgatacaaggtctatatttatagt 47149228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 32264021 - 32264371
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  32264021 agaacacaaaagaatt-gttgatccagtttggtccaaatagacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaa 32264119  T
Q  129 a--gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    |  | || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32264120 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagttccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgttt 32264219  T
Q  227 cccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttca 320  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||   |||||    |||||||||||||||||| |    
T  32264220 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ctttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttga 32264318  T
Q  321 gccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||      ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32264319 gccccctctatctcaaagttaa--tttactctgatacaaggtctatatttatagt 32264371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 880434 - 880780
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||| |||||||    
T  880434 agaacacaaaagaatttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccattttactatatgatgagtaactttacaaa 880533  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  880534 agagatatcaatgggttacaagaataactctcccgtctaattctacccaaagccccaatctctttccgtaaccaagagactcaatgctaatagtgtttcc 880633  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||   |||||    | |||||||| ||||||||||    
T  880634 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacgaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgccattctaaactcttgtttcag 880732  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
     |||||||||||      ||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  880733 acccctctatct------caaggtttacactgatacaatgtctatatttatagt 880780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 48361654 - 48361998
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  48361654 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttttactatattatgagtaacgttgcaaa 48361753  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | ||  |||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48361754 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagccccaatctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttcc 48361853  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    | ||||||| ||||||||||||    
T  48361854 caatgtgaatcaaccctcaaaccctagtttttgttcccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgtcattctaaa-ccttgtttcagc 48361951  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||| |||||      |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  48361952 cccctgtatct------caaagtttactatgatacaaggtctatatttatagt 48361998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 29956905 - 29956646
Alignment:
Q  85 agagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcc 183  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29956905 agagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcc 29956806  T
Q  184 caatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctata 283  Q
    ||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  29956805 cagcctcttctcgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctaatgtttgttccaaagagacaaactctata 29956706  T
Q  284 caaagcccta-----gctgttg-ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc 338  Q
    |||| |||||     | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29956705 caaa-ccctaattttgttgttgaatttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc 29956646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 143 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 35777582 - 35777350
Alignment:
Q  143 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35777582 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 35777483  T
Q  242 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc-tttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  35777482 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatct-- 35777386  T
Q  336 ctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
        ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  35777385 ----caaagtttgctttgatacaatgtctatatttatagt 35777350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 30 - 287
Target Start/End: Original strand, 53468436 - 53468697
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagt--ctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttac 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||   |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  53468436 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtctggggggtagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttac 53468535  T
Q  127 aaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 225  Q
    ||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53468536 aaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccaatctctccccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtt 53468635  T
Q  226 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  53468636 tcccaaggtgaatcaatgctcaaaccctagtgtttcttccaaagagacaaactctatacaaa 53468697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Original strand, 51674749 - 51674997
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||    
T  51674749 agaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctggtatgggggagagagcagccctccatttcagtatatgatgagtaacattacaaa 51674848  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51674849 agagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaatcccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttc 51674948  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaac 277  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  51674949 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagggacaaac 51674997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 11168396 - 11168165
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  11168396 gagaagaacaaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgaccaagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccaata 11168297  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |    
T  11168296 tatgataagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaattcccagcctcttcccgtaaccaagaca 11168197  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11168196 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 11168165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 55 - 379
Target Start/End: Original strand, 35917952 - 35918281
Alignment:
Q  55 agttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaat 153  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  35917952 agttcggtctaaattgacc-agtctgagggagagagcagctctccgttccactatataatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaat 35918050  T
Q  154 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 253  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||    
T  35918051 aagtctccctcctatttctacccaaattcccagtctcttctcgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcgcaaggtgaatcaaccctcaaactct 35918150  T
Q  254 a------gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgca 341  Q
    |      ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||      ||    
T  35918151 agtgtttgtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct------ca 35918243  T
Q  342 aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35918244 aaatttgctatgatacaaggtctatatttatagtgaaa 35918281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 32219359 - 32219020
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtt-acaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  32219359 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggagagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaa 32219260  T
Q  129 agt-gaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    |   || ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32219259 aaaagatatcaatgggttacaaaaataagtcttccgcctaattctgcccaaagtcccaatctcttcccgcaaccaagagactcaatcctgatagtgtttc 32219160  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagctgttg-ctttctaaacccttgtttcagccccc 326  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||          | | ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  32219159 ccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttacaaagagacaaactcta-------gttttgttgttgcctttctgaacccttgtttcagccccc 32219067  T
Q  327 tctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    |||||||      ||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  32219066 tctatct------caaagtttagtcagatacaaggtctatatttatactgaaa 32219020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 252
Target Start/End: Original strand, 25688143 - 25688367
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtt-acaa 128  Q
    |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||    
T  25688143 agaacacaaaagaactttttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgcgtaacgtttacaa 25688242  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688243 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 25688342  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccc 252  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  25688343 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccc 25688367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 39715739 - 39715485
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aa 128  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||| || || | | |||  ||||||||||||| |||| ||    
T  39715739 agaacacaaaagaatttgttgacctagtttggtccaaaatgatctagtatgggg--gagagcaaccatctgtttcac--tatgatgagtaactttacaaa 39715644  T
Q  129 agtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
    || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39715643 agagatatcaatgggttgcaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttct 39715544  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  39715543 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttcaaatagacaaactctatacaaa 39715485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 45 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 53591442 - 53591210
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacggg 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||     
T  53591442 ttgttgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggg-agagagcatcccttcgtttcactatatgatgagtaacgttacaaatgagatatcaatgga 53591344  T
Q  144 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 243  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  53591343 ttagaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatccaaatctattctcgtaaccaagagactcaattcgaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 53591244  T
Q  244 cacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaac 277  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  53591243 ctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaac 53591210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 55 - 334
Target Start/End: Original strand, 889781 - 890064
Alignment:
Q  55 agttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| | || ||||  |||||||||||||    
T  889781 agttcggtccaaattgacctagtctgcgggagaaatcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcagtgggttacaagaat 889880  T
Q  154 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 253  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  889881 aactctcctgcctaattctacccaaagccccaa-ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccatcaaacccc 889979  T
Q  254 agtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaagccctagctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 334  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||| | |||    | ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  889980 agtgtttgttgccaaatagacaaactctatacaaa-ccctaggttttgttgccattctaaacccttgtttcagcttcctctatctc 890064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 23633727 - 23633363
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  23633727 agaacacaaaagaatttgtttacccatttcggtctaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccttttcactataatgatgagtaactttacaa 23633629  T
Q  129 agtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
    || || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23633628 agagatatcatcgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 23633529  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag-----ctgttgctttctaaacccttgtttcagcc 323  Q
    |  ||| ||||||||  | |||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| ||||||      |||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  23633528 c--ggtaaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaacactatacaaa-ccctagttttcttgttggcttctaaatccttgttttagcc 23633435  T
Q  324 ccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaac 400  Q
    | ||||||||      ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||| |||||||    
T  23633434 ctctctatct------caaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaac 23633363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 28761410 - 28761756
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaa-ttgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttaca 127  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| |||||    
T  28761410 agaaaacaaaagaatttgtttacccagttcgatccaaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcactataatgatgagtaactttaca 28761509  T
Q  128 aa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    || | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28761510 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtatcccgcctaattctacctaaagtctcaatatcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28761609  T
Q  227 cccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttca 320  Q
     ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| | ||||| |||||| |||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||||    
T  28761610 tccaaggtgaatcaactctcaaacccttgtgtttgttgccaagag-caaactatatacaaa-ccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttca 28761707  T
Q  321 gccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
     ||||||||||||      ||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  28761708 accccctctatct------caaggtttactctgatgcaaagtctatatttatagt 28761756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4666788 - 4666535
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4666788 agaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggg---agagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaa 4666692  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataag--tctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 225  Q
    | | || ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4666691 aagagatatcaatggattacaagaataaggatctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaacctagagactcaatcataatagtgtt 4666592  T
Q  226 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctat 282  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||||| ||||    
T  4666591 tcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtctgttgtcaagagacaaaccctat 4666535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15781153 - 15780887
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcag---ccctccgatccactata-tgatgagtaacgtta 125  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||   |||| || ||||||||| |||| | |||| |||    
T  15781153 agaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcaggcgcccttcgttccactataatgataaataacttta 15781054  T
Q  126 caaa-gtgaaat----caacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaata 220  Q
    |||| | |||||    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15781053 caaaagagaaatatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctaccgaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcgtaata 15780954  T
Q  221 gtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15780953 gtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaa 15780887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 32 - 287
Target Start/End: Original strand, 54691559 - 54691815
Alignment:
Q  32 aacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-g 130  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  54691559 aacataaaagaatttgtcgacctagttcagttcaaattgacatagtctaggggagagagcagccctccgtttaactatatgatgggtaacgttacaaaag 54691658  T
Q  131 tgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 230  Q
     || ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  54691659 agatatcaatgaaatacaagaataagtctcccgcctaattcaactcaaagccctaatctcttcccataaccaaaaaattcaatcctaatagtgtttccca 54691758  T
Q  231 aggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  54691759 aggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaa 54691815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 6232074 - 6231849
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||| || ||| || ||||||||| | ||||||    
T  6232074 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatcggggggagacagcagccctccgttc-actgtaatgatgagtagctttacaa 6231976  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6231975 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa-tcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaacactaatagtgtttc 6231877  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 255  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6231876 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 6231849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 148 - 334
Target Start/End: Original strand, 28100143 - 28100334
Alignment:
Q  148 aagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccaca 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  28100143 aagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagcgttttccaaggtgaatcaaccctca 28100242  T
Q  248 aaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc-tttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 334  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28100243 aaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 28100334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 69 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31151579 - 31151312
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatga-tgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcct 166  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | |||||||| ||||||| | || ||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  31151579 tgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataacaatgagtaactttacaaaagagatatca--gggttacaagaataagtcacccgcct 31151482  T
Q  167 aattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccg 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||| |     
T  31151481 aattctacccaaagtcccaatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctggtgtttgttgcc 31151384  T
Q  267 aagagacaaactctatacaaagccctag-----ctgttgctttctaaacccttg-tttcagccccctctatctc 334  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||      ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31151383 aagag-caaactctatacaaa-ccctagttttcttgttgatttctaaacccttgttttcagccccctctatctc 31151312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17795533 - 17795234
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| | || |||| ||||||||||| ||||||    
T  17795533 agaacacaagagaatttgtttacctaattcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagccttccgtttcattataatgatgagtaactttacaa 17795434  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17795433 aagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttc 17795334  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagctgttgctttctaaacccttgtttcagccccct 327  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||| | || || ||||||||||||| | | ||||   ||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  17795333 ccaaagtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaaaag-caaactctatacaga-ctctag--tttgatttctaaacccttgtttcaaccccat 17795241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19103973 - 19103674
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| | || |||| ||||||||||| ||||||    
T  19103973 agaacacaagagaatttgtttacctaattcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagccttccgtttcattataatgatgagtaactttacaa 19103874  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19103873 aagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttc 19103774  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagctgttgctttctaaacccttgtttcagccccct 327  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||| | || || ||||||||||||| | | ||||   ||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  19103773 ccaaagtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaaaag-caaactctatacaga-ctctag--tttgatttctaaacccttgtttcaaccccat 19103681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 57 - 334
Target Start/End: Original strand, 13420195 - 13420465
Alignment:
Q  57 ttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaat 153  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||| ||||||| | || ||||| | |||||||||||    
T  13420195 ttcggtccaaaactgacctagtctggtg-agagagcagctctccgttccattataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaat 13420293  T
Q  154 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  13420294 aagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaactc---aaccct 13420390  T
Q  254 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagctgttgctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 334  Q
    |||||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13420391 agtgtttgttgcctagaga-aaactctatacaaa-ccctag--tttgatt--taaacccttgtttcagcctcctatatctc 13420465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 43 - 327
Target Start/End: Original strand, 561770 - 562058
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctgg-ggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagt-gaaatca 138  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||   || ||||    
T  561770 atttgtttacccggttcggtccaaaactgacctagtctggagggagagagcagcccttcgttccactataatgatgagtaactttacaaaaaagatatca 561869  T
Q  139 acgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 238  Q
    | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  561870 atgacttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtctcaatctcttcacgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaatgtgaat 561969  T
Q  239 caacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag----ctgttgctttctaaacccttgtttcagccccct 327  Q
    |||||    |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||     |||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  561970 caacc--tgaaccctagtgtttgttgccaagaga-aaactctatacaaa-ccctagtttcatgttgacttctaaacccttgtttcaaccccct 562058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28181182 - 28181038
Alignment:
Q  143 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 242  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28181182 gttataagaatacgtctcccgcctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaatagactcaatcctaatggtgtttcccaaagtgaatcaac 28181083  T
Q  243 ccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    || |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28181082 cctcaaatcccagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa 28181038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 326
Target Start/End: Original strand, 36871308 - 36871583
Alignment:
Q  55 agttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaa 152  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||| || | ||| ||||| ||||||    
T  36871308 agttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgattaactttacaaagagataacaaagggttgcaagaa 36871407  T
Q  153 taagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacc 251  Q
    ||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |  | ||||    
T  36871408 taagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgaccaagagactcaatcttaacagtgttttccaaggtgaatcaatc--ctaacc 36871505  T
Q  252 ctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag-----ctgttgctttctaaacccttgtttcagccccc 326  Q
    || ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||      |||||  || |||||||||||||||||||||    
T  36871506 ctggtgtttgttgccaagag-caaactctatac-aagccctagttttcttgttggcttgtaaacccttgtttcagccccc 36871583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 25635631 - 25635400
Alignment:
Q  55 agttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagt-gaaatcaacgggttacaagaa 152  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |  ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| ||||||||||| ||||||| | || ||||| ||||||||||||    
T  25635631 agtttggtccaaattggcctagccgaggggagagagcaaccctctgtttcaccataatgatgagtaactttacaaaatagatatcaatgggttacaagaa 25635532  T
Q  153 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |  | |||||    
T  25635531 taagtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaaccaatc--ccaaccc 25635434  T
Q  253 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||    
T  25635433 tagtgtttgttgccaagag-caaactatatacaaa 25635400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 155 - 334
Target Start/End: Original strand, 28137415 - 28137588
Alignment:
Q  155 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 254  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  28137415 agtcttccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagacttcatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaacccta 28137514  T
Q  255 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagctgttgc-tttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 334  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||          | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28137515 gtgtttgttcccaagagacaaactctagtt-------ttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 28137588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3307034 - 3306839
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| || |||  | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3307034 agaacacaaaagaatttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtctagg--agagagcaaccatccttttcactataatgatgagtaactttacaa 3306937  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 225  Q
    | | || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3306936 aagagatatcaatgggttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaaactccaatatctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 3306839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 57 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 53597485 - 53597144
Alignment:
Q  57 ttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagtgaa-atcaacgggttacaagaat 153  Q
    |||||||||| | ||||||||| || || |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||   || |||||||||||||||||||    
T  53597485 ttcggtccaatactgacctagtttgtgggagagagcaaccctccattccactataatgatgagtaactttacaaaagaaatatcaacgggttacaagaat 53597386  T
Q  154 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 253  Q
    |||||||  |||||||||||| |||| || |||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||    
T  53597385 aagtctcttgcctaattctactcaaaatctcaatctattctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa--cttcaaccct 53597288  T
Q  254 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag-----ctgttgctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttg 348  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||| || ||||||      |||||  || |||||||||||||||  |||||||||||      ||| ||||     
T  53597287 agtgtttgttgccaagaga-aaactctatac-aacccctagttttcttgttgacttataaacccttgtttca-tcccctctatct------caaggttta 53597197  T
Q  349 ctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||| |||||||    
T  53597196 ctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaac 53597144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 135 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23637191 - 23636991
Alignment:
Q  135 atcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23637191 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctaatatcttcccatgaacaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggt 23637092  T
Q  235 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag-----ctgttgctttctaaacccttgtttcagccccctct 329  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||| ||||||      |||||  |||||||||||||||| |||| |||||    
T  23637091 aaatcaacc--caaaccctagtgtttgttgccaagag-cagactctatacaaa-ccctagttttcttgttggcttctaaacccttgttttagcctcctct 23636996  T
Q  330 atctc 334  Q
    |||||    
T  23636995 atctc 23636991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 241
Target Start/End: Original strand, 1620457 - 1620657
Alignment:
Q  44 tttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacg 141  Q
    |||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||| |    
T  1620457 tttgttcacctagtttggtccaatactgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaagtttacaaagagatatcaaag 1620556  T
Q  142 ggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 240  Q
    |||||||||||  || || |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1620557 ggttacaagaactagccttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaaaagacctaatcctaatagtgttttccaaggtgaatca 1620656  T
Q  241 a 241  Q
    |    
T  1620657 a 1620657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 176
Target Start/End: Original strand, 47701654 - 47701801
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aa 128  Q
    ||||| |||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||    
T  47701654 agaacgcaaaagaatttgttgatccagttcgatccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 47701753  T
Q  129 agtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccc 176  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47701754 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccc 47701801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 135 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1674140 - 1673991
Alignment:
Q  135 atcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 234  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1674140 atcaaagggttacacgaataagtctcccgtctatttctacccaaagtcccaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccatggt 1674041  T
Q  235 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    ||||||| |  | |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||    
T  1674040 gaatcaatc--ctaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactatatacaaa 1673991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 92 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 54884367 - 54884177
Alignment:
Q  92 agccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatct 189  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || |||||  | |||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||||||    
T  54884367 agccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatagattacaa-aataagtctccctcctaattctattcaaagtttcaatct 54884269  T
Q  190 cttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactcta 281  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  54884268 ctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaagatgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttccaaagaaacaaactcta 54884177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 235 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 11163218 - 11163082
Alignment:
Q  235 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccccctc 328  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11163218 gaatcaatccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 11163120  T
Q  329 tatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttat 372  Q
    |||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11163119 tatct------caaagtttgctctgatacaaggtctatatttat 11163082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 111
Target Start/End: Original strand, 35919094 - 35919179
Alignment:
Q  26 gagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatat 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  35919094 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatat 35919179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 259
Target Start/End: Original strand, 4560401 - 4560497
Alignment:
Q  163 gcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtt 259  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4560401 gcctaattctacccaaagctccaatctcttccggtaaccaacaggctcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt 4560497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 41849333 - 41849243
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaa 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  41849333 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaa 41849243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 43 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24181643 - 24181486
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagtgaa-atcaa 139  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||   || |||||    
T  24181643 atttgtttacccaattcggtccaaaactgacctagtttggaggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagaaatatcaa 24181544  T
Q  140 cgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgt 197  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24181543 tgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagtcccaatcttttcccgt 24181486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 111
Target Start/End: Original strand, 53894018 - 53894121
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatga-gaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccact 107  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  53894018 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccaat 53894117  T
Q  108 atat 111  Q
    ||||    
T  53894118 atat 53894121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 241
Target Start/End: Original strand, 14634436 - 14634638
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaa 139  Q
    ||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||  |  ||||  |||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | || |||||    
T  14634436 atttgtttacctagttcggtctaatactaacctagtctgctgatgagattagccatccgttccactattatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 14634535  T
Q  140 cgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 238  Q
     || |||||||||| ||||| |   |||||| |||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14634536 aggtttacaagaatcagtcttcaaacctaatgctacccaaagtctcaatctcttctcgtgactaagagacacaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 14634635  T
Q  239 caa 241  Q
    |||    
T  14634636 caa 14634638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 199 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 25634024 - 25633899
Alignment:
Q  199 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagctgt 298  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  | | |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||   |    
T  25634024 accaagagactcaatcctaataatgtctcccaaggtgaatcaatc--ccagccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaa-ccctag--tt 25633931  T
Q  299 tgctttctaaacccttgtttcagccccctcta 330  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25633930 tgatttctaaaaccttgtttcagccccctcta 25633899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 469 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 11066429 - 11066346
Alignment:
Q  469 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 552  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11066429 aatattctctttaaaaatatatttgcatcaaatattccttcatatggtaaaaaaatatatttattgtccataaatgtattttca 11066346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 69 - 223
Target Start/End: Original strand, 29913980 - 29914132
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cct 166  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||  | |||||||| || ||  |   ||||||||||| ||||| |   |||    
T  29913980 tgacctagtctgggggagagagcagctcttcgatccactataatgatgagtttctttacaaagagatattga---gttacaagaatcagtcttcaaacct 29914076  T
Q  167 aattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29914077 aattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 29914132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 576 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 6561672 - 6561615
Alignment:
Q  576 tcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6561672 tcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaatttcgagtcatactacaa 6561615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 199 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24177380 - 24177295
Alignment:
Q  199 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  24177380 accaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacc--ccaaccttagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaa 24177295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 480 - 552
Target Start/End: Original strand, 54287487 - 54287559
Alignment:
Q  480 tcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 552  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  54287487 tcaaaatatatttgcatcaaatattccttcatacagtacaaaaatgtatttattatccataaatatattttca 54287559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 301 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 1321438 - 1321370
Alignment:
Q  301 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1321438 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatct------caaagtttgctctgatacaaagtctatatttatagt 1321370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11066731 - 11066652
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11066731 cctaattctacccaaagtcccgaatctcttcccgtgatcaaaagattcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 11066652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 349 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 11072900 - 11072825
Alignment:
Q  349 ctctgatacaaggtctatatttatagtgaaatataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgttt 424  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  11072900 ctctgatacaagatctttatttatagagaaatataactcacaaatttggaacggatatcacgctgaagatatgttt 11072825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 13420015 - 13419904
Alignment:
Q  167 aattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccg 266  Q
    ||||||||||||| |   |||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||| |     
T  13420015 aattctacccaaaatttgaatctctttccgtgaccaagagacttgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgcc 13419918  T
Q  267 aagagacaaactcta 281  Q
    ||||| |||||||||    
T  13419917 aagag-caaactcta 13419904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 25634149 - 25634030
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttac-aaagtgaaatcaac 140  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||| | || | |||||| |||||||||||| |||| |||| || |||||     
T  25634149 atttgtttacctagttcggtgcaaattgtcctagtctggtggagagagcagccattcgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 25634050  T
Q  141 gggttacaagaataagtctc 160  Q
    || |||||||||||||||||    
T  25634049 ggattacaagaataagtctc 25634030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7768806 - 7768632
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cct 166  Q
    ||||||||| ||||| || ||| | |||| || ||||||||| | ||||||||| ||||||||  | || ||  |||||||||||| ||||| |   |||    
T  7768806 tgacctagtatgggggagggagtaacccttcgttccactataataatgagtaactttacaaaggtatattaaaaggttacaagaattagtcttcaaacct 7768707  T
Q  167 aattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 241  Q
    |||||||| |||||| ||||| |   ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7768706 aattctactcaaagttccaattttagcccgtgagcaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 7768632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 226
Target Start/End: Original strand, 10094100 - 10094256
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cc 165  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | |||||||| || |   | | ||| ||||||| ||||| |   ||    
T  10094100 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacc 10094196  T
Q  166 taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10094197 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10094256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 485 - 550
Target Start/End: Original strand, 53974011 - 53974077
Alignment:
Q  485 atatatttgcatcaaatcgtcctt-catacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatatttt 550  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53974011 atatatttgcatcaaatcttcctttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatatttt 53974077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 301 - 375
Target Start/End: Original strand, 6719357 - 6719439
Alignment:
Q  301 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgc--------aaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6719357 ctttctaaacccttatttcagccccctctatctctctctctctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 6719439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Original strand, 27762107 - 27762165
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27762107 cctaattctacccaa-gtcccaacctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 27762165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 226
Target Start/End: Original strand, 10100117 - 10100273
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cc 165  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | |||||||| || |   | | ||| ||||||| ||||| |   ||    
T  10100117 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacc 10100213  T
Q  166 taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10100214 taattttacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10100273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 10201075 - 10201136
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10201075 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10201136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 485 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 11072801 - 11072731
Alignment:
Q  485 atatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 555  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  11072801 atatatttgcatcaaatcttccgtaatacggtacaaaaatctatttgttgtccataaatgtattttcagca 11072731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16462264 - 16462203
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16462264 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16462203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 22626105 - 22626166
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626105 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22626166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 47883003 - 47883064
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47883003 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 47883064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 54193423 - 54193229
Alignment:
Q  29 aagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgat--gagtaacgtt 124  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||  | ||  | ||    
T  54193423 aagaacacaaga-tatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatatgggtttcttt 54193325  T
Q  125 acaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    |||||| || ||  |   ||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54193324 acaaagagatattga---gttacaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 54193229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10897162 - 10897008
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-c 164  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||  | |||||||| || ||  |   ||||||||||| ||||| |   |    
T  10897162 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatatgagtttctttacaaagagatattga---gttacaagaatcagtcttcaaac 10897066  T
Q  165 ctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  10897065 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagaatcaatcctaatagtg 10897008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15780855 - 15780789
Alignment:
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||      | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15780855 ttctaaacccttgtttcagccccctctatct------ccaagtttactctgatacaaggtctatatttatagt 15780789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 109
Target Start/End: Original strand, 48438221 - 48438282
Alignment:
Q  48 ttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  48438221 ttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 48438282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 1736388 - 1736324
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  1736388 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 1736324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Original strand, 16264354 - 16264418
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  16264354 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 16264418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 18552966 - 18552902
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18552966 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 18552902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 30709873 - 30709809
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  30709873 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 30709809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Original strand, 32143325 - 32143389
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  32143325 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 32143389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 43 - 223
Target Start/End: Original strand, 47878169 - 47878350
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagtgaaatca 138  Q
    ||||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||  | |||||||| || ||      
T  47878169 atttgtttacccagttcggtctaataatgacctagtctggaggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttacaaagagatattg 47878268  T
Q  139 acgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    |   ||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47878269 a---gttacaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 47878350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 379
Target Start/End: Original strand, 27101540 - 27101592
Alignment:
Q  325 cctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101540 cctctatctctctctcaa--tttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 27101592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4535675 - 4535622
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 218  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4535675 cctaattctacccaat-tcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 4535622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6303466 - 6303310
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cc 165  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | |||||||| || |   | | ||| ||||||| ||||| |   ||    
T  6303466 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacc 6303370  T
Q  166 taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||| | ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6303369 taactatacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 6303310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 10208121 - 10208182
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10208121 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcgtaatagtgttt 10208182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 214
Target Start/End: Original strand, 11007633 - 11007683
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatc 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11007633 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtgaccaagagactcaatc 11007683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16996936 - 16996875
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16996936 cctaattctacccaaa-tcccaatttctttccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 16996875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27544429 - 27544273
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat-atg-atgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtc-tcccgcc 165  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  | |||||||| ||    || | ||| ||||||| |||| ||   ||    
T  27544429 tgacctagtctgagggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaagaga---taatgagtttcaagaatcagtcttcaaacc 27544333  T
Q  166 taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27544332 taattctaccc-aagttccacgctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 27544273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 54188705 - 54188512
Alignment:
Q  29 aagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgat--gagtaacgtt 124  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||  | ||    
T  54188705 aagaacacaaga-tatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggg-agagagcagctctccgatccactataatgatatgagtttcttt 54188608  T
Q  125 acaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    |||||| || ||  |   ||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  54188607 acaaagagatattga---gttacaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaattctaatagtg 54188512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 379
Target Start/End: Original strand, 25690651 - 25690688
Alignment:
Q  342 aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25690651 aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 25690688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 249 - 375
Target Start/End: Original strand, 47701798 - 47701923
Alignment:
Q  249 accctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagct-----gttgc-tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaa 342  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |     ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||      |||    
T  47701798 accctggtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctttatct------caa 47701890  T
Q  343 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
     |||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  47701891 ggtttacactgatacaatgtctatatttatagt 47701923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 576 - 625
Target Start/End: Original strand, 53974148 - 53974197
Alignment:
Q  576 tcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtca 625  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  53974148 tcttttatatttttaacaacaacattcttcatccatcaaattttgagtca 53974197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 8370569 - 8370505
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  8370569 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 8370505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 27975035 - 27974971
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  27975035 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 27974971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 27986529 - 27986465
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  27986529 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 27986465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 31021300 - 31021361
Alignment:
Q  201 caagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  31021300 caagagactcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgtt 31021361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 1417573 - 1417510
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  1417573 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatccctccaatccacta 1417510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Original strand, 20031439 - 20031497
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20031439 cctaattttacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 20031497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 108
Target Start/End: Original strand, 25795785 - 25795848
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||| ||||    
T  25795785 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatctacta 25795848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 340 - 379
Target Start/End: Original strand, 53896489 - 53896528
Alignment:
Q  340 caaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53896489 caaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtgaaa 53896528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6231502 - 6231413
Alignment:
Q  250 ccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 334  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6231502 ccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagcccgctctatctc 6231413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 11066543 - 11066469
Alignment:
Q  350 tctgatacaaggtctatatttatagtgaaatataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgttt 424  Q
    ||||||||||| | | ||||||||| |||| | |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  11066543 tctgatacaagatttgtatttatagagaaagagaactcacaaatttggaacggatatcacgctgaagatatgttt 11066469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 579 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 11072690 - 11072644
Alignment:
Q  579 tttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtca 625  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  11072690 tttatattttttgcaacaatcttcttcatccatcaaattttgagtca 11072644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5858701 - 5858546
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-c 164  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||  | |||||||| || ||  |   ||||||||||| ||||| |   |    
T  5858701 tgacctagtctgggggagagagcagctctctgatccactataatgatatgagtttctttacaaagagatattga---gttacaagaatcagtcttcaaac 5858605  T
Q  165 ctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  5858604 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaaga--ctcaatcctaatagtgttt 5858546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 259
Target Start/End: Original strand, 7606828 - 7606873
Alignment:
Q  214 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  7606828 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctactgtt 7606873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 110
Target Start/End: Original strand, 10200980 - 10201021
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  10200980 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 10201021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 42992660 - 42992607
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggg 83  Q
    |||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42992660 agaatacaaaagaattttttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggg 42992607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 334
Target Start/End: Original strand, 51675015 - 51675048
Alignment:
Q  301 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51675015 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 51675048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7418112 - 7418064
Alignment:
Q  178 aagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  7418112 aagtcccaatctcttcccgtgaccaatagactcaatcataatggtgttt 7418064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11073084 - 11073007
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaa-tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 241  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||  |||||||| | ||||||||||||    
T  11073084 cctaattctacctaaagtcccaaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcata--agtgtttctcgaaggtgaatcaa 11073007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11079674 - 11079517
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-c 164  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||  | |||||||| || ||  |   ||||||||||| ||||| |   |    
T  11079674 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttacaaagagatattga---gttacaagaatcagtcttcaaac 11079578  T
Q  165 ctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||| || ||||||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  11079577 ctaattctacctaa-gtcccagccttttcccgtgaccaagagactcaatcctgatagtgttt 11079517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Original strand, 21711227 - 21711291
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||  |||||||||    
T  21711227 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcaaatccactat 21711291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 30236293 - 30236249
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  30236293 ttgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 30236249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 33386749 - 33386685
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  33386749 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 33386685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 38002928 - 38002869
Alignment:
Q  166 taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  38002928 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaaacctaatggtgttt 38002869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 39040075 - 39040011
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| || | |||| |||||||||    
T  39040075 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctggggaagagaacaactctccaatccactat 39040011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 400
Target Start/End: Original strand, 1618916 - 1619012
Alignment:
Q  302 tttctaaacccttgttt-cagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaa 399  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    || |||| || || ||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||||    
T  1618916 tttctaaacccttgttttcagccccctctgtctctc----aaggtttactatggtacaaggtctatatttatagtcaaagtatccctcataaaattggaa 1619011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 508 - 555
Target Start/End: Original strand, 5535882 - 5535929
Alignment:
Q  508 tcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 555  Q
    |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  5535882 tcatacgatacaaatatatcttttctgtccataaatatattttcagca 5535929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Original strand, 10595155 - 10595213
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  10595155 cctaattctacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagagacttaatcctaatagtg 10595213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 29956628 - 29956589
Alignment:
Q  340 caaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  29956628 caaagtttgctctaatacaaagtctatatttatagtgaaa 29956589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 30005783 - 30005744
Alignment:
Q  340 caaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  30005783 caaagtttgctctaatacaaagtctatatttatagtgaaa 30005744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 108
Target Start/End: Original strand, 37466295 - 37466358
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  37466295 ttgttgacacagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagccctccaatccacta 37466358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 210
Target Start/End: Original strand, 46966630 - 46966816
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgtt 124  Q
    |||||||| |||||  ||||||| | | | ||| |||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||  | ||    
T  46966630 agaagaacgcaaaataatttgtttatccaattcagtccaatattgacctactctgggg-agagggcagctctctgttccactataatgatgagtttcttt 46966728  T
Q  125 acaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactc 210  Q
    |||||| || |||||  |||||||| ||| ||||| |   ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||    
T  46966729 acaaagagatatcaaatggttacaataattagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccgaatctttttccgtgagcaagagactc 46966816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 302 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3306795 - 3306728
Alignment:
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||      | |||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  3306795 tttctaaacccttgtttcagccccctatatctct------aggtttacactgatacaatgtctatatttatagt 3306728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 222
Target Start/End: Original strand, 10949404 - 10949438
Alignment:
Q  188 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 222  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10949404 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagt 10949438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13893523 - 13893470
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 218  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  13893523 cctaattttacccaa-gtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaattctaa 13893470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 110
Target Start/End: Original strand, 22625969 - 22626050
Alignment:
Q  29 aagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  22625969 aagaacacaaga-tatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagttctccgatccactata 22626050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 357 - 395
Target Start/End: Original strand, 53973898 - 53973936
Alignment:
Q  357 caaggtctatatttatagtgaaatataactcataaattt 395  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53973898 caagatctatatttatagagaaatataactcataaattt 53973936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 110
Target Start/End: Original strand, 10208026 - 10208067
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  10208026 tgacctagtctgcgggagagagcagctctccgatccactata 10208067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 110
Target Start/End: Original strand, 10612803 - 10612844
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  10612803 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 10612844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26763101 - 26763021
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt--cccaaggtgaatcaa 241  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||   ||||||||||||||    
T  26763101 cctaattctacccgaagtctcgaatttcttcccataaccaagagactttatcctaataatgttttgtccaaggtgaatcaa 26763021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 110
Target Start/End: Original strand, 48390327 - 48390368
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  48390327 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 48390368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Original strand, 26298992 - 26299056
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| |||||||| |||  |||| || ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  26298992 ttgttgacccagttcggttcaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatctactat 26299056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Original strand, 27452962 - 27453026
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||  ||||||| || |||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  27452962 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatccgggggagagagcagctctccaatccactat 27453026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 40913461 - 40913417
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  40913461 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 40913417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 44331713 - 44331669
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  44331713 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 44331669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 46173525 - 46173481
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  46173525 ttgttgatctagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 46173481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 51398982 - 51398938
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  51398982 ttgttgaccaagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 51398938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 415; Significance: 0; HSPs: 113)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 609101 - 608472
Alignment:
Q  14 gaacacaaagatgagaagaacacaaaa-gtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatg 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  609101 gaacacaaagaagagaagaacacaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatg 609002  T
Q  113 atgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactca 211  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  609001 atgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactca 608902  T
Q  212 atcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc-tttc 305  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     | |||||| ||||    
T  608901 atcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctaattttgttgttgcatttc 608803  T
Q  306 taaacccttgtttcagccccctcta--tctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaatataactcataaatttggaacgaa 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  608802 taaacccttgtttcagccccctctatctctctctctcaaagtttgctatgatataaggtctatatttacagtgaaatataactcataaatttggaacaaa 608703  T
Q  404 tatcacactgaagatacgtt-tcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatc 502  Q
    |||||||| ||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  608702 tatcacaccgaagatacgttcttttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcataaaatatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatc 608603  T
Q  503 gtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattc 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  608602 gtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattc 608503  T
Q  603 ttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  608502 ttcttccatcaaattttgagtgatactacaa 608472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 633
Target Start/End: Original strand, 28283185 - 28283811
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28283185 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccacta 28283283  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  28283284 tatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttgcaagaataagtctaccacctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagat 28283383  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ct 302  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||   |||||    |     
T  28283384 tcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagtcaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcca 28283482  T
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacg 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||     
T  28283483 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaaca 28283582  T
Q  402 aatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 501  Q
    ||||| |||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28283583 aatattacactgaagatacgttt---ttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcactttcaaaatatatttgcatcaaat 28283679  T
Q  502 cgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatatt 601  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||||| ||||||    
T  28283680 cgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaaaaatatt 28283779  T
Q  602 cttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  28283780 ctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 28283811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 15809589 - 15808967
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15809589 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctctgatccacta 15809490  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  15809489 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtttcttcccgtaaccaagaga 15809390  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||   |||||    |    
T  15809389 ctcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcc-aaaagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcc 15809292  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  15809291 tttctaaacccttgtttcagccccctttatctctct--caaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 15809194  T
Q  401 gaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaa 500  Q
     |||| ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809193 aaataccacactgaagatacgttt---ttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaa 15809097  T
Q  501 tcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatat 600  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||    
T  15809096 tcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatat 15808997  T
Q  601 tcttcttccatcaaattttgagtcatacta 630  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15808996 tctccatccatcaaattttgagtcatacta 15808967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 43530481 - 43529873
Alignment:
Q  14 gaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatga 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43530481 gaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggagagacagcagccctccgatccactatatga 43530382  T
Q  114 tgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaa 212  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  43530381 tgagtagcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaggaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccgagagactcaa 43530282  T
Q  213 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagctgttgc-tttctaaacc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||         | |||||| ||||||||||    
T  43530281 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctacac---------gttgttgcttttctaaacc 43530191  T
Q  312 cttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcaca 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  43530190 cttgtttcagccccctctatctctct--caaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaataaataccaca 43530093  T
Q  411 ctgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttca 510  Q
    |||||||||| |||         ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43530092 ctgaagatactttt---ttttttctccttcagtgaaagaatattagcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttca 43529996  T
Q  511 tacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttcca 610  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  43529995 tacaatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatcca 43529896  T
Q  611 tcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  43529895 tcaaattttgagtcatactacaa 43529873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 3874364 - 3873752
Alignment:
Q  26 gagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3874364 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 3874265  T
Q  126 caaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 224  Q
    |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3874264 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgt 3874165  T
Q  225 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgttt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||   |||||    ||||||||||||||||||    
T  3874164 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ctttagttttgttgttgtctttctaaacccttgttt 3874066  T
Q  319 cagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaaga 417  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  3874065 cagcccccgctatctctct--caaagtttagcctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacaccgaaga 3873968  T
Q  418 tacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcg-tccttcatacgat 516  Q
    || ||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3873967 tatgttt-ttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtttcttcatacgat 3873869  T
Q  517 acaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaat 616  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3873868 acaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaat 3873769  T
Q  617 tttgagtcatactacaa 633  Q
    |||||||||||||||||    
T  3873768 tttgagtcatactacaa 3873752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 30 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 41385094 - 41384466
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  41385094 agaacagaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 41384995  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | ||  |||| | |||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41384994 agagatgtcaatgagttacaagaaaaattctcccacctaattctacctaaagctccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatggtgtttcc 41384895  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttg-ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     | ||||| | |||||||||||||||||||     
T  41384894 caaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa-ccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgtttcag- 41384797  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacg 421  Q
    |||||||||||      |||  ||| || |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41384796 cccctctatct------caatttttactttgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactgaagatacg 41384703  T
Q  422 tttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaa 521  Q
    |||          ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  41384702 ttt---ttttttttccttcaatgaaagaatatttgcat-aaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaa 41384607  T
Q  522 aatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttga 621  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |       |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  41384606 aatatatttattgtccataaatatattttcagtataaaatatattcgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttga 41384507  T
Q  622 gtcatactacaaaattctcaaccttgactccaaattagtga 662  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  41384506 gtcatactacaacattctccaccttgactctaaattagtga 41384466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 30 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 41383012 - 41382421
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  41383012 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 41382913  T
Q  129 agtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
    || ||  |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||             
T  41382912 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataat--------- 41382822  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttg-ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
      ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||     | ||||| | |||||||||||||||| |||    
T  41382821 --aggtgaaacaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaattctatacaaa-ccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgttttagc 41382725  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacg 421  Q
    ||| |||||||      ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41382724 cccatctatct------caaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactgaagatacg 41382631  T
Q  422 tttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaa 521  Q
    |||         ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  41382630 ttt--tttttttctcattcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatatttcctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttgttcatacggtacaaa 41382533  T
Q  522 aatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttga 621  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |       ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  41382532 aatatatttattgtccataaatatattttcagtataaaatatattcgaaacaaatcttttatatttttaacaacaatattctccatccatcaaattttga 41382433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 9 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 32339680 - 32339260
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32339680 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttaacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 32339581  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32339580 tatgatgagtatcgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagaga 32339481  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |    
T  32339480 ctcaatcctaatagtgtttaccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcc 32339382  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  32339381 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctct--caaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 32339284  T
Q  401 gaatatcacactgaagatacgttt 424  Q
     |||| ||||||||||||||||||    
T  32339283 aaataccacactgaagatacgttt 32339260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27829667 - 27829302
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27829667 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 27829568  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27829567 tatgatgagtattgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaggtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 27829468  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ct 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||    
T  27829467 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcct 27829369  T
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||      | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27829368 ttctaaacccttgtttcagccccctctatct------ccaagtttgctctgatacaaggcctatatttatagt 27829302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27827356 - 27826991
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27827356 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 27827257  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  27827256 tatgatgagtattgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaggtcccagcctcttcctgtaaccaagagac 27827157  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ct 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||    
T  27827156 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcct 27827058  T
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||      | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27827057 ttctaaacccttgtttcagccccctctatct------ccaagtttgctctgatacaaggcctatatttatagt 27826991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 22684617 - 22685000
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22684617 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgttccacta 22684716  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaa-agtgaaatcaac---gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaag 204  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22684717 tatgatgagtaacgttacaatagagaaatcaatattgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaag 22684816  T
Q  205 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg-- 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||   |||||      
T  22684817 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttccaaaaagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgtt 22684915  T
Q  301 --ctttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22684916 gtctttctaaacccttgtttcagcctcctctatctctctctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 22685000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 26 - 424
Target Start/End: Original strand, 24873164 - 24873567
Alignment:
Q  26 gagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 125  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||  | ||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  24873164 gagaagaacacagaa--atttgttgactcaattcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgtta 24873261  T
Q  126 caaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgt 224  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24873262 caaagagaaatcaatcggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgt 24873361  T
Q  225 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgttt 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||    
T  24873362 ttccaaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 24873460  T
Q  319 cagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaaga 417  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  24873461 cagccccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaatacaacactgaaga 24873560  T
Q  418 tacgttt 424  Q
    |||||||    
T  24873561 tacgttt 24873567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18811078 - 18810713
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18811078 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccacta 18810979  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  18810978 tatgatgagtattgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctattcccgtaaccaagagac 18810879  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ct 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||    
T  18810878 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttcgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcct 18810780  T
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||      | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18810779 ttctaaacccttgtttcagccccctctatct------ccaagtttgctctgatacaagatctatatttatagt 18810713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4424389 - 4424023
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4424389 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgatccacta 4424290  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    |||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4424289 tatgatgagtaatgttacaaaagataaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagaga 4424190  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||    |    
T  4424189 ctcaatcctaatagtgtttcccacggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttcgaagcgacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcc 4424091  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4424090 tttctaaatccttgtttcagccccctctatct------caaagtttgctctgatacaaggtctgtatttatagt 4424023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 44721214 - 44720848
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||    
T  44721214 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagctctccaatccacta 44721115  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  44721114 tatgatgagtaccgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 44721015  T
Q  209 tcaatcctaatagtg-tttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagc----cctagctgttg-ct 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |      | | ||||| ||    
T  44721014 tcaatcctaatagtgttttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacagactctatacaaaacatagttttgttgttgcct 44720915  T
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  44720914 ttctaaacccttgtttcagccccctctatct------caaagtttgctttgatataaggtctatatttatagt 44720848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18813252 - 18812898
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18813252 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctaatatgggggagagagcagccctccaatccacta 18813153  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||    
T  18813152 tatgatgagtattgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtacccaagagac 18813053  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagctgttg-ctttcta 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          | | ||||| |||||||    
T  18813052 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactcta-------gttttgttgttgcctttcta 18812960  T
Q  308 aacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||| |||||||||      | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18812959 aacccttgtttcagcctcctctatct------ccaagtttgctctgatacaagatctatatttatagt 18812898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 14808111 - 14807756
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagag----------cagccctccgatccactatatgatgagta 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||          |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14808111 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagta 14808012  T
Q  120 acgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 218  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14808011 acgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 14807912  T
Q  219 tagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaaccc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||    
T  14807911 tagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 14807813  T
Q  313 ttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807812 ttgtttcagccccctctatct------caaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 14807756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 29 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 43079953 - 43079639
Alignment:
Q  29 aagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  43079953 aagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaa 43079854  T
Q  129 agtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 227  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43079853 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 43079754  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc-tttctaaacccttgtttcag 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  43079753 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcag 43079655  T
Q  322 ccccctctatctctctc 338  Q
    ||||| |||||||||||    
T  43079654 ccccc-ctatctctctc 43079639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 27 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 43082326 - 43082009
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 126  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  43082326 agaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac 43082227  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtt 225  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  43082226 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctgatagtgtt 43082127  T
Q  226 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc-tttctaaacccttgtttc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     | |||||| ||||||||||||||||||    
T  43082126 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccttagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttc 43082028  T
Q  320 agccccctctatctctctc 338  Q
    |||||||||||||||||||    
T  43082027 agccccctctatctctctc 43082009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 28251552 - 28251897
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28251552 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacattacaaa 28251651  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251652 agagaaatcaatgggttataagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 28251751  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    | |||||||||||||||||| |    
T  28251752 caaggtgaatcaacccacaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcaac 28251850  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    || ||||||||      |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  28251851 ccactctatct------caaagtttactatgatacaaggtctatatttatagt 28251897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15073061 - 15072715
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15073061 agaacacaaaataatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactgtatgatgagtaacgttacaaa 15072962  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatc-tcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
     | || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15072961 agagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaaccctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttt 15072862  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||   |||||    |||||||||||||||||||||    
T  15072861 ccaaggtgaatcaaccctaaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccatagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 15072763  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||      ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15072762 ccccctctatct------caaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 15072715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 34 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27911359 - 27911055
Alignment:
Q  34 cacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaa-agtg 132  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||| || |    
T  27911359 cacaaaagaattttttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggg-agagagcaaccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaatagag 27911261  T
Q  133 aaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 232  Q
    | ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27911260 atatcaatgagttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 27911161  T
Q  233 gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgctttctaaacccttgtttcagccccct 327  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||     | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27911160 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgccttctaaacccttgtttcagccccct 27911062  T
Q  328 ctatctc 334  Q
    |||||||    
T  27911061 ctatctc 27911055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 34 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27957778 - 27957474
Alignment:
Q  34 cacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaa-agtg 132  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||| || |    
T  27957778 cacaaaagaattttttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggg-agagagcaaccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaatagag 27957680  T
Q  133 aaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 232  Q
    | ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27957679 atatcaatgagttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 27957580  T
Q  233 gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgctttctaaacccttgtttcagccccct 327  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||     | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27957579 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgccttctaaacccttgtttcagccccct 27957481  T
Q  328 ctatctc 334  Q
    |||||||    
T  27957480 ctatctc 27957474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 32 - 334
Target Start/End: Original strand, 27106884 - 27107192
Alignment:
Q  32 aacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-g 130  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |    
T  27106884 aacacaaaataatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggaggagatagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccctacaaaag 27106983  T
Q  131 tgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 230  Q
     || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27106984 agatatctatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 27107083  T
Q  231 aggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccc 324  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  27107084 aggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 27107182  T
Q  325 cctctatctc 334  Q
    ||||||||||    
T  27107183 cctctatctc 27107192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 30 - 394
Target Start/End: Original strand, 14419175 - 14419541
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14419175 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcactataatgatgagtaaccttacaa 14419274  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | |  | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14419275 aagacatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttc 14419374  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag-----ctgttg-ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||      ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14419375 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccccaatgtttgctcccaagagacaaactctatacaaa-ccctagtttttttgttgcctttctaaacccttgtttcag 14419473  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatt 394  Q
    ||||||||||||      ||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  14419474 ccccctctatct------caaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatcactcataaatt 14419541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 30 - 287
Target Start/End: Original strand, 30480488 - 30480746
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  30480488 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccatttcactatatgatgactaacgttacaaa 30480587  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30480588 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 30480687  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30480688 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa 30480746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1225517 - 1225206
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  1225517 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgagggagagagcggccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 1225418  T
Q  130 gtgaaat--caacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
      || ||  ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1225417 aagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 1225318  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||||    
T  1225317 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccgtagtgtttgttccaaagagacaaactctttacaaa-ccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcag 1225219  T
Q  322 ccccctctatctc 334  Q
    |||||||||||||    
T  1225218 ccccctctatctc 1225206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 31 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15068330 - 15068021
Alignment:
Q  31 gaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa- 129  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  15068330 gaacacaaaagaatttgttggcccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccattatatgatgagtaacgttacaaaa 15068231  T
Q  130 gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 229  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  15068230 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaacctctttccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtatttccc 15068131  T
Q  230 aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcc----ctagctgttg-ctttctaaacccttgtttcagccc 324  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     | | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15068130 aaggtgaattaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctggttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 15068031  T
Q  325 cctctatctc 334  Q
    | ||||||||    
T  15068030 cttctatctc 15068021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 25952871 - 25952561
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  25952871 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatttacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaa 25952772  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  25952771 aagagatatcaatgagttacaagaataagtcttctgcctaattctacccaatgtctcaatttcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatattgtttt 25952672  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttg-ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||||       ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25952671 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactatatacaa--ccctaattttattgttgcctttctaaacccttgtttcag 25952574  T
Q  322 ccccctctatctc 334  Q
    |||||||||||||    
T  25952573 ccccctctatctc 25952561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 38 - 375
Target Start/End: Original strand, 13858477 - 13858814
Alignment:
Q  38 aaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaa 135  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||| | || |    
T  13858477 aaagaatttgtttacccagttctgtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagata 13858576  T
Q  136 tcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 235  Q
    | || ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13858577 t-aatgggctgcaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 13858675  T
Q  236 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccccctct 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13858676 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgtcaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcatccccctct 13858774  T
Q  330 atctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||      ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13858775 atct------caaggtttactctgatacaaagtctatatttatagt 13858814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 36865887 - 36865579
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtct-ggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttaca 127  Q
    ||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||| | ||||||| ||||||||||| |||||    
T  36865887 agaacacaagagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagcattccgtttcactataatgatgagtaactttaca 36865788  T
Q  128 aa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    || | || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||    
T  36865787 aaagagatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtga---agagactcaatcctaatagtgttt 36865691  T
Q  227 cccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttca 320  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||||    
T  36865690 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctaatgtttgttgccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 36865592  T
Q  321 gccccctctatct 333  Q
    |||||||||||||    
T  36865591 gccccctctatct 36865579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 43 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 21482648 - 21482327
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaac 140  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |  |||| ||||||||||| ||||||| | || |||||     
T  21482648 atttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttctttataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 21482549  T
Q  141 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 240  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  21482548 gggttacaagaataagtcactcgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgactca 21482449  T
Q  241 acccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagctgttgctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgc 340  Q
    ||||   |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||| ||||||   ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||      |    
T  21482448 accc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaa-ccctag--tttgatttctaaacccttgtttcagtccactctatct------c 21482362  T
Q  341 aaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  21482361 aaagtttactctgatacaaattctatatttatagt 21482327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 29 - 334
Target Start/End: Original strand, 5372160 - 5372472
Alignment:
Q  29 aagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggt-agagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttac 126  Q
    ||||||| ||||  |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  5372160 aagaacagaaaataatttattgactcagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagtaaccctccgtttcactataatgatgagtaaccttac 5372259  T
Q  127 aaagt-gaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 225  Q
    |||   || ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5372260 aaaaaagatatcaatgagttacaagaataagtctgccgcctaattatactcaaagtcccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtt 5372359  T
Q  226 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttg-ctttctaaacccttgtttc 319  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||     | ||||| |||||||||||||||||||    
T  5372360 tcccaaggtgaattaaccctcaaaccctagtgtttgtttccaagagacaaactctatataaa-ccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 5372458  T
Q  320 agccccctctatctc 334  Q
    || ||||||||||||    
T  5372459 ag-cccctctatctc 5372472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 30 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15956308 - 15956053
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || |||||| | ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15956308 agaatacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctaatctgagggagagagaaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaa 15956209  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  15956208 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaaaagattcaatcctaacagtgtttc 15956109  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  15956108 ccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaa 15956053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 55 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21480828 - 21480554
Alignment:
Q  55 agttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaa 152  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||| ||||||||||||    
T  21480828 agttcgttccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaa 21480729  T
Q  153 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 252  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   || ||    
T  21480728 taagtcacccgcctaattctaccaaaaaccccaatatcttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaacc 21480632  T
Q  253 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagctgttgctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 334  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||| ||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21480631 tagtgtttgttgccaagag-caaactccatacaaa-ccctag--tttgatttctaaacccttgtttcagccccatctatctc 21480554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 135 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 14477520 - 14477281
Alignment:
Q  135 atcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 234  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14477520 atcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagcgtttcccaaggt 14477421  T
Q  235 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccccctc 328  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  14477420 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactttatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccctc 14477322  T
Q  329 tatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||      ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  14477321 tatct------caaggtttgctctgatacaaagcctatatttatagt 14477281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 477 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 32339252 - 32339096
Alignment:
Q  477 ctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnnt 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |    
T  32339252 ctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaat 32339153  T
Q  577 cttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  32339152 cttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 32339096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 163 - 375
Target Start/End: Original strand, 33541507 - 33541718
Alignment:
Q  163 gcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgt 262  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33541507 gcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgt 33541606  T
Q  263 tccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgata 356  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||      ||| |||| | ||||||    
T  33541607 tccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct------caatgtttacactgata 33541699  T
Q  357 caaggtctatatttatagt 375  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  33541700 caatgtctatatttatagt 33541718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 283
Target Start/End: Original strand, 15185699 - 15185949
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgtt-aca 127  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| | |||||| |||||||||||| || | |    
T  15185699 agaacaaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagaacagtcctccgtttcactataatgatgagtaaccttaaaa 15185798  T
Q  128 aagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaacca--agagactcaatcctaatagtgtt 225  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  15185799 aagagatatcaatgggttacaagaataggtctctcgcctaattctaccca-------aatctcttcccgtaaccaagagagactcaattctaatagtgtt 15185891  T
Q  226 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctata 283  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  15185892 ttacaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactttata 15185949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 43 - 287
Target Start/End: Original strand, 3005628 - 3005871
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaa 139  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| | || |||||    
T  3005628 atttgtttacccagttcggtccaaaactgacctggtctgggggagagagcacccctccgttccactataatgatgagcaactttacaaaagagatatcaa 3005727  T
Q  140 cgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 239  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  3005728 tggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgaccaagagactcaatgctaatagtgttttccaaagtgaatc 3005827  T
Q  240 aacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    || ||   ||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||||    
T  3005828 aatcc---aaccctattgtttgttgttaagag-caaactctatacaaa 3005871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 31162550 - 31162192
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggt--agagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatc 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||   |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  ||||||| | || |||    
T  31162550 atttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatc 31162451  T
Q  138 aacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 237  Q
    || | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31162450 aatgagttacaagaataagtcttccacctaattctacccaaagtcccaatctcttccggtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 31162351  T
Q  238 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagctgttgc---tttctaaacccttg-tttcagccccctctatct 333  Q
    ||||||  | |||  ||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||  |  |  ||||||   |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||    
T  31162350 tcaacc--ctaacgttagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaacactaatttgttgcttgtttctaaacctttgtttttagccccctctttct 31162254  T
Q  334 ctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaac 400  Q
          ||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||| |||||||    
T  31162253 ------caaggtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaac 31162192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 43 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 31035458 - 31035252
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaa-attgaccta--gtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagtgaaatca 138  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| | |||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||    
T  31035458 atttgtttacccagttcggtccaatactgacctatagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaagagatatca 31035359  T
Q  139 acgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 237  Q
    | ||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  31035358 aagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacctaaagtctcaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcataacggtgtttcccaaggtgaa 31035259  T
Q  238 tcaaccc 244  Q
    |||||||    
T  31035258 tcaaccc 31035252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 109 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 181772 - 181622
Alignment:
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcc--cgtaaccaagag 206  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||    
T  181772 tatgatgagtaactttacaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccattctcttcccgcgtaactaagag 181673  T
Q  207 actcaatcct-aatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt 256  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  181672 acttaatcctaaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagt 181622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 303 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 181608 - 181434
Alignment:
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacg 401  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||      |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  181608 ttctaagcccttgtttcagccccctctatctc------aaagtttagtctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacg 181515  T
Q  402 aatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaa 484  Q
    |||| ||||||||||||||||||         |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  181514 aataccacactgaagatacgttt--ttttcttctcctttagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaa 181434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 183 - 334
Target Start/End: Original strand, 5622877 - 5623033
Alignment:
Q  183 ccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctat 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  5622877 ccaatctcttcccgtaatcaagagactcaatccaaataatgtttccaaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaatagacaaactctat 5622976  T
Q  283 acaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 334  Q
    ||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5622977 acaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 5623033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 216 - 375
Target Start/End: Original strand, 35872555 - 35872708
Alignment:
Q  216 taatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagctgttg-ctttctaaaccctt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  35872555 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttcgtttccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttgttgcctttctaaaccctt 35872653  T
Q  315 gtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||||||      ||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  35872654 gtttcagccccctctatct------caaggtttacactgatacaatgtctatatttatagt 35872708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 241
Target Start/End: Original strand, 31578274 - 31578476
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaa 139  Q
    ||||||| ||| |||||||||| | | ||||||||||| ||| |||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || |||||    
T  31578274 atttgtttacccagttcggtcctatactgacctagtctaggggagagagcagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 31578373  T
Q  140 cgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 238  Q
      |||||||||||| ||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  31578374 aaggttacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcataacagtgtttcccaaggtgaat 31578473  T
Q  239 caa 241  Q
    |||    
T  31578474 caa 31578476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 202 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26775378 - 26775206
Alignment:
Q  202 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgtt 299  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||   ||||    
T  26775378 aagagactcaattctaatagtgttttccaaggtgaattaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactatatacaaa-ccctagtattgtt 26775280  T
Q  300 g----ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |    |||||||||||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  26775279 gttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct------caaggtttgctctgatacaaagcctatatttatagt 26775206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 518 - 633
Target Start/End: Original strand, 3265635 - 3265750
Alignment:
Q  518 caaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaatt 617  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3265635 caaacatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatt 3265734  T
Q  618 ttgagtcatactacaa 633  Q
    ||||||||||||||||    
T  3265735 ttgagtcatactacaa 3265750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 161 - 287
Target Start/End: Original strand, 37214317 - 37214434
Alignment:
Q  161 ccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgttt 260  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37214317 ccgcctaattctacccaaagttccaatcgcttcccgtaaccaagagactcaat---------gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 37214407  T
Q  261 gttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  37214408 gttccaaagagacaaactctatacaaa 37214434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 164 - 281
Target Start/End: Original strand, 31573847 - 31573961
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt 263  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  | |||| |||||||||||    
T  31573847 cctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccatagtgtttgtt 31573944  T
Q  264 ccgaagagacaaactcta 281  Q
     | |||||| ||||||||    
T  31573945 gccaagaga-aaactcta 31573961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 129
Target Start/End: Original strand, 33541395 - 33541494
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  33541395 agaacacaaaagaaatttttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccttccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 33541494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 199 - 375
Target Start/End: Original strand, 2468261 - 2468428
Alignment:
Q  199 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctataca---aagccctagc 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |   || || |||     
T  2468261 accaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtatttgttgccaagag-caaactctatatatacaaaccgtag- 2468355  T
Q  296 tgttgctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
      ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||      |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  2468356 -tttgatttctaaatccttgtttcagctccctctatct------caaagtttactttgatacaaggtctatatttatagt 2468428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 43 - 173
Target Start/End: Original strand, 2468127 - 2468259
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttac-aaagtgaaatcaac 140  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||   | |||||| |||||||||||| |||| |||| || |||||     
T  2468127 atttgtttacctagttctgtccaaattgacctaatctgggagagagagcagccctctatttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 2468226  T
Q  141 gggttacaagaataagtctcccgcctaattcta 173  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2468227 gggctacaagaataagtctcccgtctaattcta 2468259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 100
Target Start/End: Original strand, 37214251 - 37214319
Alignment:
Q  32 aacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37214251 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccatccg 37214319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6376315 - 6376141
Alignment:
Q  55 agttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaa 152  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||    
T  6376315 agttcggtccaatactgacctagtctgagggagagagcagccttctgttccactataatgatgagtaactttacaaagagatatcaaaaggtaacaagaa 6376216  T
Q  153 taagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    | ||||| |   |||||||||||  |||||| ||||||||||  || |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  6376215 ttagtcttcaaacctaattctacataaagtctcaatctcttcatgtgaccaagagactcaatcttaacagtgttt 6376141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 141 - 226
Target Start/End: Original strand, 13985176 - 13985262
Alignment:
Q  141 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13985176 gggttacaagaatcagtttcaaacctaattctacccaaagtcccgaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13985262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 301 - 375
Target Start/End: Original strand, 12517286 - 12517356
Alignment:
Q  301 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12517286 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct----caaagtttgctctgatacaaggtatatatatatagt 12517356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17847830 - 17847661
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cct 166  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  |||| |    ||||||| | || ||||| || |||||||||| ||||| |   |||    
T  17847830 tgacctagtctgggggagagagcagccctccattccactata--atgatt----ttacaaaagagatatcaaagg-ttacaagaattagtcttcaaacct 17847738  T
Q  167 aattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc--ccaaggtgaatcaa 241  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  17847737 aattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagattcaatcctaatagtgtttcgttcaaggtgaatcaa 17847661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 301 - 375
Target Start/End: Original strand, 3886180 - 3886248
Alignment:
Q  301 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3886180 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatct------caaagtttgctctgatacaaagtctatatttatagt 3886248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Original strand, 16757253 - 16757449
Alignment:
Q  29 aagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tga-tgagtaacgtta 125  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | |||    
T  16757253 aagaacacaaga-tatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttcttta 16757351  T
Q  126 caaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 224  Q
    ||||| || |   | | ||| ||||||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16757352 caaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgt 16757447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 469 - 555
Target Start/End: Original strand, 11701364 - 11701447
Alignment:
Q  469 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 555  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||   ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11701364 aatattccctttaaaaatatatttacatcaattcttcc---atacggtacaaaaatatatttactgaccataaatatattttcagca 11701447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 14477602 - 14477519
Alignment:
Q  29 aagaacacaaaagtatttgttgacct-agttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatat 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| | ||||||||    
T  14477602 aagaacacaaaagaatttgttgaccgcagttcgatccaaattgacctagtctggggtaaagagtagccatccgtttcactatat 14477519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28328104 - 28327908
Alignment:
Q  29 aagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tga-tgagtaacgtta 125  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||  | |||    
T  28328104 aagaacacaaga-tatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgaatgagtttcttta 28328006  T
Q  126 caaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 224  Q
    ||||| || |   | | ||| ||||||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28328005 caaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgt 28327910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 9021228 - 9021289
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9021228 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 9021289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Original strand, 13985933 - 13986011
Alignment:
Q  165 ctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 241  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13985933 ctaattatacccaaagtcccgaatctcttcccgtgattaagagtctcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 13986011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 16752643 - 16752704
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16752643 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16752704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28895563 - 28895502
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28895563 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28895502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30423274 - 30423212
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  30423274 cctaattctatccaaagttccaatctcttcccgcgaccaagagactcaatcctaaaagtgttt 30423212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31035238 - 31035161
Alignment:
Q  207 actcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  31035238 actcaatcctaatggtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaa 31035161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25684839 - 25684646
Alignment:
Q  29 aagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tga-tgagtaacgtta 125  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | |||    
T  25684839 aagaacacaaga-tatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttcttta 25684741  T
Q  126 caaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||| || |   | | ||| ||||||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  25684740 caaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtccctgtctcttcccgtgaccaagagattcaatcctaatagtg 25684646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 590855 - 590797
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  590855 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 590797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 481 - 552
Target Start/End: Original strand, 13986214 - 13986285
Alignment:
Q  481 caaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 552  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||    
T  13986214 caaaatatatttgcatcaaatcttctttcatgcggtacaaaaatttattaactatccataaatatattttca 13986285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 19752487 - 19752424
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  19752487 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagctctccaatccacta 19752424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33032715 - 33032657
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33032715 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 33032657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3896035 - 3895957
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 241  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||    
T  3896035 cctaattatactcaaagtcccaatttcttcccgtgacgaagagactcaatcgcaatagtgtttctccaaagtgaatcaa 3895957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 4812608 - 4812669
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4812608 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaaaagactcaatcctaatagtgttt 4812669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28332692 - 28332631
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28332692 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28332631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 223
Target Start/End: Original strand, 29554908 - 29554964
Alignment:
Q  166 taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29554908 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 29554964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 4696689 - 4696625
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  4696689 ttgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 4696625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 9765912 - 9765848
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  9765912 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 9765848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 19175847 - 19175783
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||| | |||| |||||||||    
T  19175847 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactat 19175783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 26403323 - 26403259
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  26403323 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 26403259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 31071322 - 31071258
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  31071322 ttgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 31071258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 241
Target Start/End: Original strand, 33839043 - 33839120
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 241  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  33839043 cctaattctacccaaagtcttgaatctcttcctg--accaagagactcaatcctaatagtgtttcttcaaggtgaatcaa 33839120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3276405 - 3276347
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  3276405 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtg 3276347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 2267144 - 2267205
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2267144 cctaattctacccaa-gtcctaatctcttcatgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 2267205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 579 - 625
Target Start/End: Original strand, 13986328 - 13986374
Alignment:
Q  579 tttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtca 625  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  13986328 tttatatttttagcaacaatcttcttcatccataaaattttgagtca 13986374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 226
Target Start/End: Original strand, 17799568 - 17799606
Alignment:
Q  188 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17799568 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 17799606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 28890962 - 28890881
Alignment:
Q  29 aagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  28890962 aagaacacaaga-tatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 28890881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 110
Target Start/End: Original strand, 4812485 - 4812554
Alignment:
Q  42 tatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    |||||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  4812485 tatttgtttacccagttcggtctaattatgacctagtcttggggagagagcagctctccgatccactata 4812554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 110
Target Start/End: Original strand, 29554810 - 29554851
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  29554810 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 29554851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 157
Target Start/End: Original strand, 35872480 - 35872553
Alignment:
Q  85 agagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagt 157  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||| || |||||| |||||||    
T  35872480 agagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggcttacaaaaataagt 35872553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 334
Target Start/End: Original strand, 37214472 - 37214505
Alignment:
Q  301 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37214472 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 37214505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Original strand, 7412345 - 7412409
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  7412345 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactat 7412409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 581 - 625
Target Start/End: Original strand, 11701435 - 11701479
Alignment:
Q  581 tatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtca 625  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  11701435 tatattttcagcaacaatcttcttcgtccatcaaattttgagtca 11701479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 23799670 - 23799606
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  23799670 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccctccaatccactat 23799606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15949596 - 15949534
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  15949596 cctaattttacccaa-gtcccgaatctcttcccgtgaccaagagactatatcctaatagtgttt 15949534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 68
Target Start/End: Original strand, 35872438 - 35872476
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaat 68  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35872438 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat 35872476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 241
Target Start/End: Original strand, 11701102 - 11701155
Alignment:
Q  189 tcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 241  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||    
T  11701102 tcttcccgtgaccaagagactcaattctaataatgtttcttcaaggtgaatcaa 11701155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 28228717 - 28228668
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaa-attgaccta 75  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  28228717 agaagaacacaaaagaatgtgtttacctagttcggtccaatattgaccta 28228668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 108
Target Start/End: Original strand, 28307575 - 28307628
Alignment:
Q  55 agttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  28307575 agttcggtccaaaatgacctactctggggatgagagcagctctccaatccacta 28307628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 576 - 625
Target Start/End: Original strand, 30679208 - 30679256
Alignment:
Q  576 tcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtca 625  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  30679208 tcttttttatttttaccaaca-tattcttcatccatcaaattttgagtca 30679256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Original strand, 1345371 - 1345415
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||    
T  1345371 ttgttgacctagttcggtctaacttgacctactctgggggagaga 1345415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 5702576 - 5702512
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||| |||||| |||| ||||    
T  5702576 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcatccctccaatcccctat 5702512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Original strand, 6127225 - 6127289
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  6127225 ttgttgactcagttcggtccaatatgacctaatttggggaagagagcagctctccaatccactat 6127289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Original strand, 10930199 - 10930243
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  10930199 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 10930243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 15212954 - 15212910
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  15212954 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 15212910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 190 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21033906 - 21033870
Alignment:
Q  190 cttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21033906 cttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 21033870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Original strand, 23179692 - 23179740
Alignment:
Q  175 ccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    |||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23179692 ccaaagtcacagcctcttccggtgaccaagagactcaatcctaatagtg 23179740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 27811446 - 27811402
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  27811446 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 27811402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 33352318 - 33352274
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  33352318 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 33352274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 40321248 - 40321204
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  40321248 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 40321204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 412; Significance: 0; HSPs: 153)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 20299785 - 20299128
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  20299785 gagaagaacacaaaggagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccctccgatccacta 20299686  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20299685 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaga 20299586  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccac-aaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg---- 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||        
T  20299585 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgt 20299487  T
Q  301 ctttctaaa-cccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttgga 398  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  20299486 cattctaaaccccttgtttcagccccctctatctctct--caaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatatgga 20299389  T
Q  399 acgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatca 498  Q
    || |||| ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299388 acaaataccacactgaagatacgttt---ttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatca 20299292  T
Q  499 aatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaat 598  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||    
T  20299291 aatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaataaatcttttatatttttagcaacaat 20299192  T
Q  599 attcttcttccatcaaattttgagtcatactacaaaattctcaaccttgactccaaattagtga 662  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20299191 attctccatccatcaaattttgagtcatactacaacattctccaccttgactctaaattagtga 20299128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 662
Target Start/End: Original strand, 7469984 - 7470648
Alignment:
Q  7 gtgagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccac 106  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  7469984 gtgagaagaacacaaataagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagggagcagccctccgatccac 7470083  T
Q  107 tatatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaaga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  7470084 tatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaaga 7470183  T
Q  206 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg--- 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||   |||||       
T  7470184 gactcaatcctaatagtgtttcacaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaa-ccctagttttgttgttg 7470282  T
Q  301 -ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaa-atataactcataaatttgga 398  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  7470283 cctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctct--caaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttgga 7470380  T
Q  399 acgaatatcacactgaagatacg----tttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgc 494  Q
    ||||||| |||||||||||||||    |||         |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470381 acgaataccacactgaagatacgtttttttttttcttttctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgc 7470480  T
Q  495 atcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaa 594  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       | |||||||||||||||||    
T  7470481 atcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatgttttatatttttagcaa 7470580  T
Q  595 caatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaaaattctcaaccttgactccaaattagtga 662  Q
     |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  7470581 taatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacattctccaccttgactctaaatttgtga 7470648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 633
Target Start/End: Original strand, 7471942 - 7472572
Alignment:
Q  7 gtgagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccac 106  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7471942 gtgagaagaacacaaataagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgatccac 7472041  T
Q  107 tatatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaaga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  7472042 tatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagttccagcctcttcccgtaaccaaga 7472141  T
Q  206 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||     | |||||    
T  7472142 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaa-ccctagttttgttgttg 7472240  T
Q  301 c-tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaa-atataactcataaatttgga 398  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  7472241 cttttctaaacccttgtttcagccccctctatctctct--caaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttgga 7472338  T
Q  399 acgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatca 498  Q
    || |||| ||||||||||||||||||         |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472339 acaaataccacactgaagatacgttt-ttttttttctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatca 7472437  T
Q  499 aatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaat 598  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||    
T  7472438 aatcgttcttcatatgatacaataatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaat 7472537  T
Q  599 attcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  7472538 attctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 7472572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 38394311 - 38393685
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38394311 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 38394212  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  38394211 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaga 38394112  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |    
T  38394111 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcc 38394013  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  38394012 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctct--caaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 38393915  T
Q  401 gaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaa 500  Q
     |||| |||||||||||||||||          | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38393914 aaataccacactgaagatacgtt---attttttcaccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataacattccctttcaaaatatatttgcatcaaa 38393818  T
Q  501 tcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatat 600  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||       |||| ||||||||||||||||||||    
T  38393817 tcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaataaattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttatatatttttagcaacaatat 38393718  T
Q  601 tcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    ||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  38393717 tctccatccatcaaatttagaatcatactacaa 38393685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 1850301 - 1849667
Alignment:
Q  14 gaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatga 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1850301 gaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactatatga 1850202  T
Q  114 tgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaa 212  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||    
T  1850201 tgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccagcctcttcccgtaagcaagaaactcaa 1850102  T
Q  213 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag-----ctgttg-ctttct 306  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||      ||||| ||||||    
T  1850101 tcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa-ccctagtttttttgttgcctttct 1850003  T
Q  307 aaacccttgtttcagccccctcta----------tctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaattt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||          |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  1850002 aaacccttgtttcagccccctctatctctctctctctctctctcaaagtttgctatgaaacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaattt 1849903  T
Q  396 ggaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgca 495  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||         |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1849902 ggaacaaataccacactgaagattcgttt--tttttttctccttcagtgaaagaatatctgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgca 1849805  T
Q  496 tcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaac 595  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||||||    
T  1849804 tcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaac 1849705  T
Q  596 aatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1849704 aatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 1849667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 3036049 - 3035417
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3036049 gagaagaacacaaagaagagaggaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 3035950  T
Q  109 tatgatgagtaacgttac-aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatc---tcttcccgtaaccaag 204  Q
    ||||||||||| |||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||    
T  3035949 tatgatgagtatcgttgcaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccagcctcttcttcccgtaaccaag 3035850  T
Q  205 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg-- 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   |||||      
T  3035849 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctata-aaaaccctagttttgttgtt 3035751  T
Q  301 --ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttgg 397  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  3035750 gcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctct--caaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttgg 3035653  T
Q  398 aacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatc 497  Q
    ||| |||| || |||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035652 aacaaataccatactgaagatacgttttttttctttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatc 3035553  T
Q  498 aaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaa 597  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||||||||    
T  3035552 aaatcattcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaa 3035453  T
Q  598 tattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  3035452 tattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 3035417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 28487873 - 28487222
Alignment:
Q  14 gaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatga 113  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  28487873 gaacacaaagaaaagaagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccctctgattcactatatga 28487774  T
Q  114 tgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaa 212  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28487773 tgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaa 28487674  T
Q  213 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttct 306  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||   |||||    ||||||    
T  28487673 tcctaatagtgtttccaaaggtgaatcaacccacgaaccctagtgttagtttcgaagagacaaactctatacaaa-ctctagttttgttgttacctttct 28487575  T
Q  307 aaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaata 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  28487574 aaacccttgtttcagccccctctatctctct--caaagtttagcctgatacatggtctatatttataggaaaagtataactcataaatttagaacaaata 28487477  T
Q  406 tcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtc 505  Q
     ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  28487476 ccacactgaagatacgttt--tttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcatt 28487379  T
Q  506 cttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttc 605  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28487378 cttcatacgatacaaaattatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaagcaaatcttttatatttttagcaacaatattctcc 28487279  T
Q  606 ttccatcaaattttgagtcatactacaaaattctcaaccttgactccaaattagtga 662  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  28487278 atccatcaaattttgagtcatactacaacattctccaccttgactctaaattagtga 28487222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 20626351 - 20625739
Alignment:
Q  20 aaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagta 119  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20626351 aaagatgaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagta 20626253  T
Q  120 acgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 218  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20626252 acgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 20626153  T
Q  219 tagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaaccc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||    
T  20626152 tagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 20626054  T
Q  313 ttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaa-atataactcataaatttggaacgaatatcacac 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20626053 ttgtttcagccccctctatctctct--caaagtttagtctgatagaaggtctatatttataataaacatataactcataaatttggaacgaataccacac 20625956  T
Q  412 tgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcat 511  Q
    |||||||||||||         |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20625955 tgaagatacgttt--ttttttgctccttcagtgaaaaaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgtatcaaatcgttcttcat 20625858  T
Q  512 acgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccat 611  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  20625857 acgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccat 20625758  T
Q  612 caaattttgagtcatacta 630  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20625757 caaattttgagtcatacta 20625739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 20630242 - 20629630
Alignment:
Q  20 aaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagta 119  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630242 aaagatgaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagta 20630144  T
Q  120 acgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 218  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630143 acgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 20630044  T
Q  219 tagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaaccc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||    
T  20630043 tagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 20629945  T
Q  313 ttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaa-atataactcataaatttggaacgaatatcacac 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20629944 ttgtttcagccccctctatctctct--caaagtttagtctgatagaaggtctatatttataataaacatataactcataaatttggaacgaataccacac 20629847  T
Q  412 tgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcat 511  Q
    |||||||||||||         |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20629846 tgaagatacgttt--ttttttgctccttcagtgaaaaaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgtatcaaatcgttcttcat 20629749  T
Q  512 acgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccat 611  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  20629748 acgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccat 20629649  T
Q  612 caaattttgagtcatacta 630  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20629648 caaattttgagtcatacta 20629630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 20642661 - 20642049
Alignment:
Q  20 aaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagta 119  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642661 aaagatgaga-gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagta 20642563  T
Q  120 acgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 218  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642562 acgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 20642463  T
Q  219 tagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaaccc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||    
T  20642462 tagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaaccc 20642364  T
Q  313 ttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaa-atataactcataaatttggaacgaatatcacac 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20642363 ttgtttcagccccctctatctctct--caaagtttagtctgatagaaggtctatatttataataaacatataactcataaatttggaacgaataccacac 20642266  T
Q  412 tgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcat 511  Q
    |||||||||||||         |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20642265 tgaagatacgttt--ttttttgctccttcagtgaaaaaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgtatcaaatcgttcttcat 20642168  T
Q  512 acgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccat 611  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  20642167 acgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccat 20642068  T
Q  612 caaattttgagtcatacta 630  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20642067 caaattttgagtcatacta 20642049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 633
Target Start/End: Original strand, 7351615 - 7352244
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatga-gaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccact 107  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  7351615 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatccact 7351714  T
Q  108 atatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7351715 atatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 7351814  T
Q  208 ct-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcc----ctagctgttg-c 301  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||     | | ||||| |    
T  7351815 ctccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaagcctagttttgttgttgcc 7351914  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7351915 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtttatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 7352014  T
Q  401 gaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaa 500  Q
     |||||||||||||||||||||||         ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7352015 aaatatcacactgaagatacgttt---ttttttctcattcagtgaaagaatatttgcctcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaa 7352111  T
Q  501 tcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatat 600  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||||||||||||||||||    
T  7352112 tcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatat 7352211  T
Q  601 tcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    ||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  7352212 tctccatccatcaatttttgagtcatactacaa 7352244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 662
Target Start/End: Original strand, 7349259 - 7349894
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 126  Q
    |||||||||||||   ||||||||||    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  7349259 agaagaacacaaagaaatttgttgac----ttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac 7349354  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtt 225  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7349355 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 7349454  T
Q  226 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||| ||||||    
T  7349455 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccctgtttc 7349553  T
Q  320 agccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagat 418  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7349554 agccccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaatatcacactgaagat 7349653  T
Q  419 acgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatac 518  Q
    ||||||         ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  7349654 acgttt---ttttttctcattcagtgaaagaatatttgcctcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatac 7349750  T
Q  519 aaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  7349751 aaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaatttt 7349850  T
Q  619 tgagtcatactacaaaattctcaaccttgactccaaattagtga 662  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  7349851 tgagtcatactacaacattctccaccttgactctaaattagtga 7349894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 662
Target Start/End: Original strand, 31155892 - 31156527
Alignment:
Q  26 gagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 125  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  31155892 gagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactataggatgagtaccgtta 31155991  T
Q  126 caaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgt 224  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  31155992 caaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtacccaagagactccaatcctaatagtgt 31156091  T
Q  225 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgttt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||    
T  31156092 ttcccaaggtgaatcaacccacaaatcctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 31156190  T
Q  319 cagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaaga 417  Q
    |||||||||||||||      ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  31156191 cagccccctctatct------caaagtttgccttgatacaagctctatatttatagtaaaagtatagctcataaatttggaacaaataccacactgaaga 31156284  T
Q  418 tacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgata 517  Q
    | |||||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31156285 ttcgttt--tttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 31156382  T
Q  518 caaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaatt 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  31156383 caaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaattt 31156482  T
Q  618 ttgagtcatactacaaaattctcaaccttgactccaaattagtga 662  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31156483 ttgagtcatactacaacattctccaccttgactctaaattagtga 31156527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 18345866 - 18345239
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18345866 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacagccctccgatccacta 18345767  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||    
T  18345766 tatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcacgtaaccaagaga 18345667  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |    
T  18345666 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtatttgttgcaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcc 18345568  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaac 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18345567 tttctaaacccttgtttcaaccccctctatctccct--caaagttcagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 18345470  T
Q  401 gaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaa 500  Q
     |||| ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18345469 aaataccacactgaagatacgttt--tttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccatttcaaaatatatttgcatcaaa 18345372  T
Q  501 tcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatat 600  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||    
T  18345371 tcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtcaataaatatatttttagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatat 18345272  T
Q  601 tcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18345271 tctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 18345239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 28485885 - 28485263
Alignment:
Q  14 gaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatga 113  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| || |||||||    
T  28485885 gaacacaaagaagagaataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagg-agagagcaaccctctgattcattatatga 28485787  T
Q  114 tgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaa 212  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28485786 tgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggattacaagaataaatctcccgcctaattatactcaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaa 28485687  T
Q  213 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttct 306  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||    
T  28485686 tcctaatagtgtttccaaaggtgaatcaacccgcaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttct 28485588  T
Q  307 aaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaata 405  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  28485587 aaacccttgtttcaaccccttctatctctct--caaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaata 28485490  T
Q  406 tcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtc 505  Q
     |||||||||||||||| |         ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28485489 ccacactgaagatacgtgt-tttttttcctccttcggtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtt 28485391  T
Q  506 cttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttc 605  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485390 cttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatattttatatttttagcaacaatattcttc 28485291  T
Q  606 ttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||    
T  28485290 atccatcaaattttgaatcatactacaa 28485263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 99 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 11757465 - 11756927
Alignment:
Q  99 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11757465 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgt 11757366  T
Q  198 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaa-ccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagct 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  11757365 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa-ccctagtt 11757267  T
Q  297 -----gttg-ctttctaaaccc-ttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactca 388  Q
         |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11757266 ttgttgttgtcattctaaaccccttgtttcagccccctctatctctctc--aaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactca 11757169  T
Q  389 taaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatat 488  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757168 taaatttggaacaaataccacactgaagatacgttt---ttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatat 11757072  T
Q  489 atttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttt 588  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||    
T  11757071 atttgcatcaaatagttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 11756972  T
Q  589 tagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  11756971 tagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 11756927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 633
Target Start/End: Original strand, 42330982 - 42331591
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||    
T  42330982 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagaatagccctccgtttcactatataatgagtaactttacaaa 42331081  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgt--aaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
     | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42331082 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 42331181  T
Q  227 cccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttca 320  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||   |||||    | ||||||||||||||||||    
T  42331182 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaa-ccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttca 42331280  T
Q  321 gccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagata 419  Q
    |||||||||||||      ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  42331281 gccccctctatct------caaagtttagtctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactaaagata 42331374  T
Q  420 cg---tttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgat 516  Q
    ||   |||         |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  42331375 cgtttttttttttctttctccttcaatgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggt 42331474  T
Q  517 acaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaat 616  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  42331475 acaaaaatatacttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttaaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcattcatcaaat 42331574  T
Q  617 tttgagtcatactacaa 633  Q
    ||| |||||||||||||    
T  42331575 tttaagtcatactacaa 42331591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 30 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 21990454 - 21989855
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21990454 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 21990355  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  21990354 agagatatcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctactcaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttct 21990255  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagc----cctagctgttg-ctttctaaacccttgtttcagcc 323  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      | | ||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  21990254 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcatagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcag-c 21990156  T
Q  324 ccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgt 422  Q
    ||||||||||      | | |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21990155 ccctctatct------ccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaattataactcataaatttggaacgaataccacacagaagatacgt 21990062  T
Q  423 ttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaa 522  Q
    ||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  21990061 tt--ttttttcctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaa 21989964  T
Q  523 atatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgag 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |    
T  21989963 atatatttattgtccataaatatattttca--acacaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttggg 21989866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 9 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 20297687 - 20297163
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  20297687 gagaagaacacaaagaggagaagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 20297588  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20297587 tatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctatttctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagaga 20297488  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag-----ctgttg-c 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||      ||||| |    
T  20297487 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctactgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttattgttgcc 20297389  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaac 400  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  20297388 attctaaacccttgtttcagccccctctatctctct--caaagtttagcctgatacaaggtccatatttttagtaaaagtataactcgtaaatttggaac 20297291  T
Q  401 gaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaa 500  Q
     |||| ||||||||||||||||||         ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297290 aaataccacactgaagatacgttt---ttttttctccttcggtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaa 20297194  T
Q  501 tcgtccttcatacgatacaaaaatatattta 531  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20297193 tcgttcttcatacgatacaaaaatatattta 20297163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 30 - 633
Target Start/End: Original strand, 37412110 - 37412714
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  37412110 agaacacaaaagaatttattgatccagttcggtccaaattgacccagtctaggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaaccttacaa 37412209  T
Q  129 a--gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    |  | || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412210 aaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 37412309  T
Q  227 cccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttc 319  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    | |||||||||||||||||    
T  37412310 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgctaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttc 37412408  T
Q  320 agccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt-gaaatataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagat 418  Q
    |||||||| |||||      | | |||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37412409 agccccctatatct------ccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaaatataactcataaatttggaacgaataacacactgaagat 37412502  T
Q  419 acgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatac 518  Q
    ||||||         ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  37412503 acgttt---ttttttctccttcagtggaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacgttac 37412599  T
Q  519 aaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattt 618  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  37412600 ataattatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattt 37412699  T
Q  619 tgagtcatactacaa 633  Q
    |||||||||||||||    
T  37412700 tgagtcatactacaa 37412714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 30 - 563
Target Start/End: Original strand, 13099459 - 13099993
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13099459 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaa 13099558  T
Q  129 a--gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    |  | || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13099559 aaagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgttt 13099658  T
Q  227 cccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttca 320  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    | ||||||||||||||||||    
T  13099659 cccaaggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttca 13099757  T
Q  321 gccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagata 419  Q
     ||||||||||||      ||| |||| || |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13099758 accccctctatct------caaggtttactttgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactgaagata 13099851  T
Q  420 cgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgataca 519  Q
    |||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||     
T  13099852 cgttt--tttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgtatcaaatcgttcttcatacggtacg 13099949  T
Q  520 aaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099950 aaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatat 13099993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 9 - 555
Target Start/End: Original strand, 43253481 - 43254035
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  43253481 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtctaaattgacctagtctgagggagagagcagccctctgatccacta 43253580  T
Q  109 tatgatgagtaacgttac-aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||| |||||||    
T  43253581 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtctcagcctctttccgtaatcaagaga 43253680  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |    
T  43253681 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaa-cctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgtc 43253778  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccc--tctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttgga 398  Q
     ||||||| |||||||||||||| |  ||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  43253779 attctaaaaccttgtttcagccctctttctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttgga 43253878  T
Q  399 acgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatca 498  Q
    || |||| ||||| |||||||| ||          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43253879 acaaataccacaccgaagatactttcttattttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatca 43253978  T
Q  499 aatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 555  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43253979 aatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatatttttagca 43254035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 30 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 24258772 - 24258166
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtattt-gttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata----tgatgagtaacgtt 124  Q
    |||||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||| ||    
T  24258772 agaacacaaaagaattttgttcatctaattcggtccaaattgacctagtctgaaagagagagcagccctccgttccactataataatgatgagtaacttt 24258673  T
Q  125 acaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||| | || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24258672 acaaaagagatatcaatgggttacaagaataagttttccgcctaattctatccaaagtctcaatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 24258573  T
Q  224 tttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc-tttctaaacccttgtt 317  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||     | |||||| ||||||||||||||||    
T  24258572 ttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccatagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaa-ccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtt 24258474  T
Q  318 tcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaatataactcataaatttggaacgaatatcacac--tgaa 415  Q
    |||||||||||||||||      || |||| |||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  24258473 tcagccccctctatctc------aatgtttactctgatacaaaacctatatttatagagaaatataactcataaatttggaacgaatatcacacactgaa 24258380  T
Q  416 gatacgtttcnnnnnnnn---ctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcata 512  Q
    ||||| ||||           |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24258379 gatacatttctttatttttttctccttcagtgaaagaatatttacatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaa-tcgtccttcata 24258281  T
Q  513 cgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatc 612  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24258280 ctgtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatc 24258181  T
Q  613 aaattttgagtcata 627  Q
    |||||||||||||||    
T  24258180 aaattttgagtcata 24258166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 48457978 - 48457604
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  48457978 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccacta 48457879  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  48457878 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaga 48457779  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |    
T  48457778 ctcaatcctaatagtgtttccctaggtgaatgaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcc 48457680  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457679 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctct--caaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 48457604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 40836707 - 40837072
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40836707 gagaagaacaaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 40836806  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  40836807 tatgatgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagac 40836906  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ct 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||    
T  40836907 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcct 40837005  T
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40837006 ttctaaacccttctttcagccccctcaatctc-----caaa-tttgctctgatacaaggtctatatttatagt 40837072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 375
Target Start/End: Original strand, 1049264 - 1049625
Alignment:
Q  14 gaacacaaagatgagaagaa-cacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatg 112  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1049264 gaacacaaagaagagaaaaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatg 1049363  T
Q  113 atgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaa 212  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1049364 atgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaa 1049463  T
Q  213 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttct 306  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||    
T  1049464 tcctgatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttattccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttct 1049562  T
Q  307 aaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1049563 aaacccttgtttcagccccctctatct------caaagtttgctctaatacaaggtctatatttatagt 1049625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 9 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 3878902 - 3878540
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3878902 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattaacatagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 3878803  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  3878802 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagaga 3878703  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |    
T  3878702 ctcaatcctaatagtgtttaccaaggtgaatcaacccacaagccctagcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgtc 3878604  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatt 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878603 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctct----caaagtttgctctgatacaaggtctatatt 3878540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Original strand, 1046888 - 1047223
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaa-cacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccact 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  1046888 gagaagaacacaaagaagagaaaaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcagccctccaatccact 1046987  T
Q  108 atatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1046988 atatgatgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaga 1047087  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc- 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     | ||||||     
T  1047088 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgct 1047186  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc 338  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1047187 tttctaaacccctgtttcagccccctctatctctctc 1047223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 303 - 662
Target Start/End: Original strand, 7092439 - 7092795
Alignment:
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaa-atataactcataaatttggaacg 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  7092439 ttctaaacccttgtttcagccccctccatctctctc--aaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttggaacg 7092536  T
Q  402 aatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 501  Q
    |||| ||||||||||||||  ||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7092537 aataccacactgaagatacaatt--ttttttcctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 7092634  T
Q  502 cgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatatt 601  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  7092635 cgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatatcttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatatt 7092734  T
Q  602 cttcttccatcaaattttgagtcatactacaaaattctcaaccttgactccaaattagtga 662  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  7092735 ctccatccatcaaattttgagtcatactacaacattctccaccttgactctaaattagtga 7092795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 303 - 633
Target Start/End: Original strand, 7094686 - 7095013
Alignment:
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaa-atataactcataaatttggaacg 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  7094686 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc--aaagtttgctctgatacaaggtctatatttataataaacatataactcataaatttggaacg 7094783  T
Q  402 aatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 501  Q
    |||| ||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7094784 aataccacactgaagatacgttt--ttttttcctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatatttcctttcaaaatatatttgcatcaaat 7094881  T
Q  502 cgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatatt 601  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  7094882 cgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatatt 7094981  T
Q  602 cttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  7094982 ctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 7095013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25542855 - 25542490
Alignment:
Q  7 gtgagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccac 106  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  25542855 gtgagaagaacacaaagaagagaaaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagctctccgatccac 25542756  T
Q  107 tatatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagag 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  25542755 tatatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagag 25542656  T
Q  207 actcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg---- 300  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||        
T  25542655 actcaatcctaatagtcttt-ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgttttttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttac 25542558  T
Q  301 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25542557 ctttctaaacctttgtttcag-cccctctatct------caaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 25542490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 40946653 - 40946279
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  40946653 gagaagaacacaaagaaaagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccacta 40946554  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  40946553 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaactaagaga 40946454  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |    
T  40946453 ctcaatcctaatagtgttttccaaagtaaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttctaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcc 40946355  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  40946354 tttctaaacccttgtttcagccccctctgtccctct--caaagtttgctatgaaacaaggtttatatttatagtgaaa 40946279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 35954 - 35588
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||||    
T  35954 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaaaaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaaagcagctctccgttccacta 35855  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  35854 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaga 35755  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||    |    
T  35754 ctcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctacacaaa-ccctagttttgttgttgtc 35656  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35655 tttctgaacccttgtttcagccccctctatct------caaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 35588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 44889 - 44523
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| |||||||    
T  44889 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaagcagctatccgttccacta 44790  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  44789 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacataattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaaaaga 44690  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||    |    
T  44689 ctcaatcataatagtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctacacaaa-ccctagttttgttgttgcc 44591  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44590 tttctaaacccttgtttcagccccctctatct------caaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 44523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 44724883 - 44724573
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724883 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 44724784  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724783 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 44724684  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||||||    
T  44724683 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 44724585  T
Q  323 cccctctatctc 334  Q
    ||||| ||||||    
T  44724584 cccctatatctc 44724573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 30 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 443900 - 443504
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggt-agagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||    
T  443900 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcgggggggagagagcagcccttcgtttcactatatgatgagtaacgttataa 443801  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  443800 aagagatatcaatggattacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtttc 443701  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    | ||||||||| |||||| ||    
T  443700 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgccattctaaaccattgttttag 443602  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatac 420  Q
    | ||||||||||      ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  443601 ctccctctatct------caaggtttactctgattcaaagtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaattccacactgaagatac 443508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 326 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 1606478 - 1606173
Alignment:
Q  326 ctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgttt 424  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  1606478 ctctatctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagattcgttt 1606379  T
Q  425 cnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaat 524  Q
             |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1606378 ---ttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaat 1606282  T
Q  525 atatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtc 624  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1606281 atatttattgtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtc 1606182  T
Q  625 atactacaa 633  Q
    |||||||||    
T  1606181 atactacaa 1606173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 43 - 375
Target Start/End: Original strand, 27306228 - 27306559
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacg 141  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |    
T  27306228 atttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg 27306327  T
Q  142 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 241  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27306328 ggttgcaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 27306427  T
Q  242 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 335  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  27306428 ccctcaaaccctagtttttgttccaaagagacaaactctat--aaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct-- 27306523  T
Q  336 ctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27306524 ----caaagtttactctgatacaaggtctatatttatagt 27306559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 326 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 38396294 - 38395959
Alignment:
Q  326 ctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgttt 424  Q
    |||| |||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  38396294 ctctctctctctctcaaaatttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacaccgaagatacgttt 38396195  T
Q  425 cnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaat 524  Q
             |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38396194 --tttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaat 38396097  T
Q  525 atatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtc 624  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  38396096 atatttattgtacataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttggagtc 38395997  T
Q  625 atactacaaaattctcaaccttgactccaaattagtga 662  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  38395996 atactacaacattctccaccttgactctaaattagtga 38395959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 263
Target Start/End: Original strand, 7092177 - 7092431
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  7092177 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgattcacta 7092275  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7092276 tatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagaga 7092375  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt 263  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7092376 ctcaatcctaatagtatttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt 7092431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Original strand, 20137094 - 20137404
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20137094 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaa 20137192  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  20137193 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaagagactcaatcttaatagtgtttc 20137292  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||   |||||    |||||||||||||||||||||    
T  20137293 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaa-ctctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 20137391  T
Q  322 ccccctctatctc 334  Q
    |||||||||||||    
T  20137392 ccccctctatctc 20137404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 31435031 - 31435377
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31435031 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaa 31435130  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435131 aagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccacctaattctacccaaagttccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 31435230  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||||    
T  31435231 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 31435329  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||| |||||||      |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31435330 ccccttctatct------caaagtttactctgatacaagatctatatttatagt 31435377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Original strand, 21592128 - 21592438
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  21592128 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 21592227  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | ||  |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |    
T  21592228 agagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcgcgtaaccaagagactaaatcctaatagtgcttgc 21592327  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcc----ctagctgttgc-tttctaaacccttgtttcagcc 323  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     | | |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  21592328 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcctacttttgttgttgcatttctaaacctttgtttcagcc 21592427  T
Q  324 ccctctatctc 334  Q
    |||||||||||    
T  21592428 ccctctatctc 21592438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Original strand, 4295919 - 4296230
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  4295919 agaacacaaaagaatttgttcacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagatagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 4296018  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | ||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4296019 agagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 4296118  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    | |||||||||||||||||||    
T  4296119 caaggtgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcag 4296217  T
Q  322 ccccctctatctc 334  Q
    |||||||||||||    
T  4296218 ccccctctatctc 4296230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9681124 - 9680773
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||    
T  9681124 agaacacaaaaaaatttattgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccatttcactatatgatgagtaactttacaaa 9681025  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     |  | ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9681024 agatatatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 9680925  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||   |||||    | ||||||||||||||||||     
T  9680924 cgaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaa-ccatagttttgttgttgcccttctaaacccttgtttcaa 9680826  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgc-tctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  9680825 ccccctctatctctct--caaggtttacatctgatacaaggtctatatttatagt 9680773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 38396959 - 38396713
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  38396959 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagaagccctccgatccacta 38396860  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  38396859 tatgatgagtaaagttacaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 38396760  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctag 255  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38396759 tcgatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaacctag 38396713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 30 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 24748899 - 24748592
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24748899 agaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctaatctggaggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaa 24748800  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24748799 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccggaaccaagagactcaatcgtaatagtgtttc 24748700  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag-----ctgttg-ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||      ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24748699 ccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttattgttgtctttctaaacccttgtttcag 24748601  T
Q  322 ccccctcta 330  Q
    |||||||||    
T  24748600 ccccctcta 24748592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 263
Target Start/End: Original strand, 7094424 - 7094678
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  7094424 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttattgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcacta 7094523  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  7094524 tatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaattaagaga 7094623  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  7094624 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta-tgtttgtt 7094678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 11355562 - 11355252
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11355562 agaacataaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctaggggagagagcagctctctgttccactatatgatgagaaacgttacaaa 11355463  T
Q  130 gt-gaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
       || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11355462 aaagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 11355363  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||||||    
T  11355362 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattgccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 11355264  T
Q  323 cccctctatctc 334  Q
    ||||||||||||    
T  11355263 cccctctatctc 11355252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9679361 - 9679013
Alignment:
Q  32 aacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-g 130  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  9679361 aacacaaaagaatttgttgacccagtctggtccaaattgacctagtctgggaaagagagcagtactccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaag 9679262  T
Q  131 tgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 230  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9679261 agatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 9679162  T
Q  231 aggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagcc 323  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    | ||||| | |||||||||||||    
T  9679161 aggtgaatcaatcctcaaa-cctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgtcattctagatccttgtttcagcc 9679064  T
Q  324 ccctctatctctctcgcaaagtttgc-tctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9679063 ccctctatctctct--caaagtttacatctgatacaagatctatatttatagt 9679013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21680334 - 21680021
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctag---ttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| | | |||||||||||||||||| ||||    
T  21680334 agaacaaaaaagtatttgttgacccagcagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagctctctgtttcactatatgatgagtaaccttac 21680235  T
Q  127 aaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 225  Q
    ||| | || ||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680234 aaaagagatatcattgggttacaagaataaatctcccgtctaattctacccaaagtcccaatctcttccggtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 21680135  T
Q  226 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttc 319  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||    
T  21680134 tcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttaccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 21680036  T
Q  320 agccccctctatctc 334  Q
    |||||||||||||||    
T  21680035 agccccctctatctc 21680021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 43 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21678357 - 21678060
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacg 141  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| | | | ||||||||||| |||||| ||||||| |  | ||||| |    
T  21678357 atttgttgtcccagttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagcccactgtttcactatatgataagtaaccttacaaaagatatatcaatg 21678258  T
Q  142 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 241  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678257 ggttacaagaatacgtctcccgcctaatgctacccaaagtcccaatatcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 21678158  T
Q  242 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttg-ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 334  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678157 ccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgatgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 21678060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Original strand, 39145971 - 39146282
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| | |||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  39145971 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttagggaaaagagcagccccccgtttcactataatgatgagtaaccttacaa 39146070  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  39146071 aagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttt 39146170  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    || ||||||||||||||||||    
T  39146171 ccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgtctatctaaacccttgtttcag 39146269  T
Q  322 ccccctctatctc 334  Q
    ||||||| |||||    
T  39146270 ccccctccatctc 39146282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 364 - 633
Target Start/End: Original strand, 21470614 - 21470881
Alignment:
Q  364 tatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaa 462  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21470614 tatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacaccgaagatacgttt---ttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaa 21470710  T
Q  463 aaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaata 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21470711 aaatataatattccctttcaaaatatattcgcatcaaatcgttcttcatacgatataaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaata 21470810  T
Q  563 tctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    | ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||    
T  21470811 tatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttggagtcaaactacaa 21470881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 435 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 47865528 - 47865330
Alignment:
Q  435 tccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattg 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47865528 tccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattg 47865429  T
Q  535 tccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  47865428 tccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttggagtcatactacaa 47865330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 43 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2935559 - 2935374
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgg 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  2935559 atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgg 2935460  T
Q  143 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2935459 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 2935374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 64 - 287
Target Start/End: Original strand, 27832651 - 27832876
Alignment:
Q  64 caaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttaca-aagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcc 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||| ||||||||||| ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27832651 caaattgacctagtctgggggagagagaagccctccatttcactataatgatgagtaactttacagaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcc 27832750  T
Q  162 cgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttg 261  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  27832751 cgcctaattttacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtatg 27832850  T
Q  262 ttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    || | |||||||||||||||||||||    
T  27832851 ttgccaagagacaaactctatacaaa 27832876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 42223462 - 42223203
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  42223462 agaaaacaaaagaatttgttgacccagttcgatcaaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccatttcactatatgatgagtaacgttacaaa 42223363  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || |||||  |||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42223362 agagatatcaataggtttcaagaataagttttccgcctaattctatccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttc 42223263  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  42223262 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaa 42223203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22137384 - 22137184
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 126  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22137384 agaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 22137285  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtt 225  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22137284 aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 22137186  T
Q  226 tc 227  Q
    ||    
T  22137185 tc 22137184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 40552411 - 40552211
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 126  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40552411 agaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 40552312  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtt 225  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40552311 aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 40552213  T
Q  226 tc 227  Q
    ||    
T  40552212 tc 40552211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22108373 - 22108173
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 126  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22108373 agaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 22108274  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtt 225  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22108273 aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 22108175  T
Q  226 tc 227  Q
    ||    
T  22108174 tc 22108173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 40550133 - 40549933
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 126  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40550133 agaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 40550034  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtt 225  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40550033 aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 40549935  T
Q  226 tc 227  Q
    ||    
T  40549934 tc 40549933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 43 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1606670 - 1606486
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgg 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  1606670 atttgttgacccagttcggtccaatctgatctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgg 1606571  T
Q  143 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1606570 gttacaagaat-agtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 1606486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 102 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25276374 - 25276100
Alignment:
Q  102 tccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaa 199  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25276374 tccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggtttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaa 25276275  T
Q  200 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||   ||    
T  25276274 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttg 25276176  T
Q  298 ttg----ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||    |||||||||   |||||| ||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  25276175 ttgttgcctttctaaattattgttttagccccctctatct------caaagtttgctctgatacaaagcatatatttatagt 25276100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Original strand, 9027176 - 9027376
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 126  Q
    ||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  9027176 agaagaacacatagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcctatccactatttgatgagtaacgttac 9027275  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtt 225  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9027276 aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 9027374  T
Q  226 tc 227  Q
    ||    
T  9027375 tc 9027376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 43 - 287
Target Start/End: Original strand, 24813495 - 24813738
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagt-gaaatcaa 139  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||  || || ||    
T  24813495 atttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagaaagcagccatccgctccactataatgatgagtaactttacaaaggagatataaa 24813594  T
Q  140 cgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 239  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24813595 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatcacttcccgtcaccaagagactcaatcctaatagtgcttcccaaggtgaatc 24813694  T
Q  240 aacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    |||||   ||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||    
T  24813695 aaccc---aaccctagtgtttcttgccaagag-caaactctatacaaa 24813738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 306 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 3677301 - 3676999
Alignment:
Q  306 taaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaat-ataactcataaatttggaacgaat 404  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||       |||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3677301 taaacccttgtttcagcccc-tctatctcc------aagtttactctgattcaagatctatatttatagtaaaaacataactcataaatttggaacgaat 3677209  T
Q  405 atcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgt 504  Q
    ||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3677208 atcacactgaagatacgttttttttttctctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgt 3677109  T
Q  505 ccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattctt 604  Q
     ||||||||| |||||||||||                   |||||||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||||||||||||||     
T  3677108 tcttcatacggtacaaaaatat-------------------attttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctc 3677028  T
Q  605 cttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  3677027 catctatcaaattttgagtcatactacaa 3676999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 55 - 373
Target Start/End: Original strand, 24817362 - 24817677
Alignment:
Q  55 agttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaaga 151  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||| | |||||||||    
T  24817362 agttcggtccaaaactgacctagtatgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagacatcaatgagttacaaga 24817461  T
Q  152 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||   ||||    
T  24817462 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatactgctttccaaggtgaatcaaccc---aacc 24817558  T
Q  252 ctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag-----ctgttgctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtt 346  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||      |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||      ||| |||    
T  24817559 ctagtgtttgttgcaaagag-caaactctatacaaa-ccctagttctcttgttgacttctaaacccttgtttcag-cccctctatct------caaggtt 24817649  T
Q  347 tgc-tctgatacaaggtctatatttata 373  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||    
T  24817650 tacatctgatacaaggtctatatttata 24817677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 141 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26804764 - 26804563
Alignment:
Q  141 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804764 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 26804665  T
Q  241 acccacaaacc---ctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccccctctat 331  Q
    |||| ||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804664 accctcaaaccctactagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 26804566  T
Q  332 ctc 334  Q
    |||    
T  26804565 ctc 26804563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 7188832 - 7188476
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagtgaa-atcaa 139  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||  |||| ||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||| |||||||   || |||||    
T  7188832 atttgtttacctagttcagtccaaaactgacatagactggggaagagagcagccttccgttccactataatgatgaataactttacaaaagaaatatcaa 7188733  T
Q  140 cgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 239  Q
     |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7188732 tgggttataaaaataagtctcccgcttaattctacccaaagtctcaatctattcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatc 7188633  T
Q  240 aacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 334  Q
    ||||  | |||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||       |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7188632 aacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaaccctatacaaa-ccctatttttattgttgacttctaaacccttgtttcagccccctctatct- 7188538  T
Q  335 tctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaac 400  Q
         ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||| |||||||    
T  7188537 -----caaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaac 7188476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 78 - 400
Target Start/End: Original strand, 20091580 - 20091897
Alignment:
Q  78 ctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccc 176  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20091580 ctgggggagagagcagccctccgttccactat--gatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccc 20091677  T
Q  177 aaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaa 276  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| | |||||| | || || ||||    
T  20091678 aaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagatttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctaatctttgttgccaatag-caaa 20091774  T
Q  277 ctctatacaaagccctag----ctgttgctttctaaacccttg-tttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatattta 371  Q
    ||||||||||| ||||||     |||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||      ||| |||| |||||||| || |||||||||||    
T  20091775 ctctatacaaa-ccctagttttgtgttgcctccgaaacccttgttttcagccccctctatct------caaggtttactctgataaaaagtctatattta 20091867  T
Q  372 tagtgaaa-tataactcataaatttggaac 400  Q
    |||| ||| |||  |||||||| |||||||    
T  20091868 tagtaaaagtatccctcataaaattggaac 20091897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 85 - 334
Target Start/End: Original strand, 22828672 - 22828928
Alignment:
Q  85 agagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 182  Q
    |||||||||||||| | | ||||||| | ||||||||  ||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22828672 agagagcagccctctgtttcactataataatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 22828771  T
Q  183 ccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctat 282  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||    
T  22828772 tcaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgttttctaatctgaatcaaccatcaaactctagtgtttgttttcaagagataaactctat 22828871  T
Q  283 acaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 334  Q
    ||||| || |||   |||||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22828872 acaaa-ccttagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagccccctctatctc 22828928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 135 - 375
Target Start/End: Original strand, 22251641 - 22251872
Alignment:
Q  135 atcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||    
T  22251641 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatccta--------tcccaaggt 22251732  T
Q  235 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccccctc 328  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||   |||||    |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22251733 gaatcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaa-ctctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagcctcctc 22251831  T
Q  329 tatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||      |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  22251832 tatct------caaagtttactctgattcaaggtttatatttatagt 22251872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 24465816 - 24465543
Alignment:
Q  55 agttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaa 152  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||| | || |||| ||||||||| | ||||||| |  | ||||| | |||| |||||    
T  24465816 agttcggttcatattgatctagtctgggggagagagcagtcacccgtttcattataatgatgagta-ctttacaaaagacatatcaatgagttaaaagaa 24465718  T
Q  153 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 252  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |   |||||    
T  24465717 taaatctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatattgtttcccaaggtgaatcaattc---aaccc 24465621  T
Q  253 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagctgttgctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 334  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| ||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24465620 tagtgtttgttgccaagag-caaacgctatacaaa-ccctag--tttgatttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 24465543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 487 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 443474 - 443328
Alignment:
Q  487 atatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatt 586  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||    
T  443474 atatttgcatcaaattgttcttcagacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatt 443375  T
Q  587 tttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  443374 tttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 443328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 186 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22392608 - 22392432
Alignment:
Q  186 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctataca 285  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | || || |||| ||||||||    
T  22392608 atctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaatag-caaattctataca 22392513  T
Q  286 aagccctagctgttgctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    || ||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22392512 aa-ccctag--tttgatttataaacccttgtttcagccccctctatct------caaagtttactctgatacaaggtctatatttatagt 22392432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 215 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18567731 - 18567572
Alignment:
Q  215 ctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||    
T  18567731 ctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaa 18567633  T
Q  309 acccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||||| |||||||      |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18567632 acccttgtttcagccccttctatct------caaagtttactctgatacaagatctatatttatagt 18567572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22394027 - 22393876
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22394027 agaacacaaaagaatttgtttacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagagaacaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaa 22393928  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 179  Q
    | | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22393927 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 22393876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 469 - 632
Target Start/End: Original strand, 40281824 - 40281989
Alignment:
Q  469 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttg 568  Q
    |||||||| ||| |||||||||  | |||||||  || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  40281824 aatattccttttaaaaatatatccgtatcaaatattctttcatacggtacaaaaatatatttattttccataaatatattttcaacacaaaatatatttg 40281923  T
Q  569 nnnnnnntcttttatatttttagcaacaa--tattcttcttccatcaaattttgagtcatactaca 632  Q
           | ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40281924 aaacaaatattttatatttttagcaacaaattcttcttcatccatcaaattttgagtcatactaca 40281989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6332513 - 6332311
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaa 139  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| ||| | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||    
T  6332513 atttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctaggggagagaacagtcttccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatattaa 6332414  T
Q  140 cgggttacaagaataagtctccc-gcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 238  Q
     ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| ||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||    
T  6332413 agggttacaagaataagtcttcaagcctaattctacctaaagtctcaatctcttcttgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttttccaaactgaat 6332314  T
Q  239 caa 241  Q
    |||    
T  6332313 caa 6332311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26295727 - 26295580
Alignment:
Q  55 agttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaa 152  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||| ||||||||||||    
T  26295727 agttcagtccaaattgacctagtctggaggagagagcagtcatctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaa 26295628  T
Q  153 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaac 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  26295627 taagtctctcgcctaattctacccaaagtcacaatcgcttcctgtaac 26295580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 43 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11081802 - 11081598
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatat-gatgagtaacgttaca-aagtgaaatcaa 139  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||| | ||  |||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  11081802 atttgtttacccagttcggtccaatattgacctagtctgggggagagagcaaccatccgttccattttaaagatgagtaactttacacaagagatatcaa 11081703  T
Q  140 c--gggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 236  Q
       ||||||||||||| ||||| |   ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11081702 aaagggttacaagaattagtcttcaaacctaattttacacaaaatcctaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaagtga 11081603  T
Q  237 atcaa 241  Q
    |||||    
T  11081602 atcaa 11081598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Original strand, 16297146 - 16297222
Alignment:
Q  165 ctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 241  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16297146 ctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 16297222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 11759452 - 11759364
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccct 97  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11759452 gagaagaacacaaaggagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccct 11759364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 51 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6049157 - 6048932
Alignment:
Q  51 acctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatat---gatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggtta 146  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||| |||||   |||||| | ||||| ||||||||||   |||||||||| |||||||| || ||||| ||||||    
T  6049157 acctagttcggtccattactgagctagtatggggggaagagcaactctccgttccactatataatgatgagtaactttacaaagggatatcaaagggtta 6049058  T
Q  147 caagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaaccc 244  Q
     ||||||| |||| |   |||||||||| |||||||| |||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  6049057 taagaatacgtcttcaaacctaattctatccaaagtctcaatatcttctcgtgaccaagagattcaatcctaatagtgtttcttcaaggtgaatcaatcc 6048958  T
Q  245 acaaaccctagtgtttgttccgaagaga 272  Q
     |||| ||||||||||||| | ||||||    
T  6048957 -caaa-cctagtgtttgttgccaagaga 6048932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 238
Target Start/End: Original strand, 40281466 - 40281572
Alignment:
Q  133 aaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  40281466 aaatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattccaccaaaagtctcaatctcttcccgtgaccaacagactcaatcctaacggtgtttcccaa 40281565  T
Q  232 ggtgaat 238  Q
    |||||||    
T  40281566 ggtgaat 40281572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11084544 - 11084467
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 241  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11084544 cctaattttacccaaagttcgaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaatcaa 11084467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 69 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25351508 - 25351353
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cct 166  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| || ||  |   ||||||||||| ||||| |   |||    
T  25351508 tgacctagtctgggggagagaacagctctccgatccactataatgatgagtttctttacaaagagatattga---gttacaagaatcagtcttcaaacct 25351412  T
Q  167 aattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25351411 aattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25351353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 69 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 2121056 - 2120881
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-c 164  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||  | |||||||| || ||  |   ||||||||||| ||||| |   |    
T  2121056 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatatgagtttctttacaaagagatattga---gttacaagaatcagtcttcaaac 2120960  T
Q  165 ctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt--cccaaggtgaatcaac 242  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  2120959 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttgtccaaggtgaatcaac 2120881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 6046772 - 6046641
Alignment:
Q  57 ttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaata 154  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| || |  ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  6046772 ttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagctcttcattccactataatgatgagtaactttacaaagagatatcaaaggtttacaagaata 6046673  T
Q  155 agtc-tcccgcctaattctacccaaagtccca 185  Q
    |||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  6046672 agtcttcaaacctaattctacccaaagtccca 6046641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6349006 - 6348912
Alignment:
Q  110 atgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaa 203  Q
    |||||||||||  ||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  6349006 atgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaataataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatcttttcccgtgaccaa 6348912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7069976 - 7069780
Alignment:
Q  29 aagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tga-tgagtaacgtta 125  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||| |||||  | |||    
T  7069976 aagaacacaaaa-tatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctcttcgatccactataatgaatgagtttcttta 7069878  T
Q  126 caaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 224  Q
    ||||| || |   | | ||| ||||||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7069877 caaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgt 7069782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25405589 - 25405393
Alignment:
Q  29 aagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tga-tgagtaacgtta 125  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | |||    
T  25405589 aagaacacaaga-tatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttcttta 25405491  T
Q  126 caaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 224  Q
    ||||| || |   | | ||| ||||||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25405490 caaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgt 25405395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26210710 - 26210631
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 241  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26210710 cctaattctaccgaaagtcccgaatctctttccgttaccaagagactcaatcctaatagtatttctccaaggtgaatcaa 26210631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 226
Target Start/End: Original strand, 3320076 - 3320232
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cc 165  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | |||||||| || |   | | ||| ||||||| ||||| |   ||    
T  3320076 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacc 3320172  T
Q  166 taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3320173 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3320232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 226
Target Start/End: Original strand, 3324824 - 3324980
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cc 165  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | |||||||| || |   | | ||| ||||||| ||||| |   ||    
T  3324824 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacc 3324920  T
Q  166 taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3324921 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3324980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 469 - 555
Target Start/End: Original strand, 12310442 - 12310528
Alignment:
Q  469 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 555  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||    
T  12310442 aatattccttttaaaaatatatttacatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatattaactgtccttaagtataatttcagca 12310528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21369703 - 21369642
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21369703 cctaattttacccaa-gtcccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 21369642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 240
Target Start/End: Original strand, 13290471 - 13290672
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaac 140  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||| || |||| | ||| ||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||     
T  13290471 atttgtttacccagttcggtccaatactgaccaagtctgagggagagtgtagctctctgttccgctataatgatgagtaactttacaaagagatatcaaa 13290570  T
Q  141 gggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaat 238  Q
     |||||||||||| | ||| |   |||||||||||||| ||| | ||| |||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  13290571 aggttacaagaattattcttcaaacctaattctacccagagttctaatatcttcctgtgaccaagagactaaattctaatagtgtttctcgaaggtgaat 13290670  T
Q  239 ca 240  Q
    ||    
T  13290671 ca 13290672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25357202 - 25357047
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cct 166  Q
    ||||||||||||||| ||||| || | || |||||||||||| ||||||||  | |||||||| || ||  |   ||||||||||| ||||| |   |||    
T  25357202 tgacctagtctgggggagagatcatctcttcgatccactataatgatgagtttctttacaaagagatattga---gttacaagaatcagtcttcaaacct 25357106  T
Q  167 aattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25357105 aattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25357047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25410287 - 25410130
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-c 164  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||  | |||||||| || ||  |   ||||||||||| ||||| |   |    
T  25410287 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttacaaagagatattga---gttacaagaatcagtcttcaaac 25410191  T
Q  165 ctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25410190 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25410130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 356 - 424
Target Start/End: Original strand, 40281688 - 40281756
Alignment:
Q  356 acaaggtctatatttatagtgaaatataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgttt 424  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  40281688 acaaggtttatatttataaagaaatataactcataaatttggaacagatatcacgctgaagatacgttt 40281756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7074943 - 7074787
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat-atg-atgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtc-tcccgcc 165  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||  | |||||||| ||    || | ||| ||||||| |||| ||   ||    
T  7074943 tgacctagtctgggggagagtgcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaagaga---taatgagtttcaagaatcagtcttcaaacc 7074847  T
Q  166 taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7074846 taattctaccc-aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7074787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42006724 - 42006663
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42006724 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 42006663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 576 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 20297157 - 20297108
Alignment:
Q  576 tcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtca 625  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20297157 tcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtca 20297108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 263
Target Start/End: Original strand, 12310157 - 12310234
Alignment:
Q  185 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt-cccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  12310157 aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttgttcaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgtt 12310234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 26804814 - 26804762
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggg 82  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26804814 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctggg 26804762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 9190101 - 9190038
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  9190101 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccacta 9190038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 108
Target Start/End: Original strand, 20284093 - 20284156
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  20284093 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccacta 20284156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30247031 - 30246973
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30247031 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 30246973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Original strand, 44512646 - 44512704
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44512646 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 44512704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 217
Target Start/End: Original strand, 6067180 - 6067373
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgtt 124  Q
    |||||||||| | || ||||||| ||| ||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| | ||||||| ||| ||||  | ||    
T  6067180 agaagaacacgagagaatttgtttacccagtccggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagctctccgtttcactataatgacgagttccttt 6067279  T
Q  125 -acaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatccta 217  Q
     |||||| || ||||  || |||||||||| ||||| |   |||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6067280 tacaaagagatatcagaggattacaagaattagtcttcaaacctaattctatc-aaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactaaatccta 6067373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 8378625 - 8378686
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8378625 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttt 8378686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 10691083 - 10691025
Alignment:
Q  366 tatttatagtgaaatataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgttt 424  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  10691083 tatttatagagaaatataactcatgaatttggaacagatatcacaccgaagatacgttt 10691025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 15541116 - 15541177
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15541116 cctaattatacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 15541177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 577 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 10690732 - 10690684
Alignment:
Q  577 cttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtca 625  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  10690732 cttttatatttttagcaacaatcttctccctccatcaaattttgagtca 10690684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Original strand, 21983288 - 21983352
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  21983288 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 21983352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Original strand, 44143997 - 44144045
Alignment:
Q  175 ccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44143997 ccaaagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 44144045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 46516403 - 46516339
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  46516403 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactat 46516339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 108
Target Start/End: Original strand, 2580394 - 2580457
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  2580394 ttgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccacta 2580457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 508 - 555
Target Start/End: Original strand, 12484976 - 12485023
Alignment:
Q  508 tcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 555  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  12484976 tcatacgatacaaaaatatatttgctatccataaatatattttcagca 12485023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 508 - 555
Target Start/End: Original strand, 12506407 - 12506454
Alignment:
Q  508 tcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 555  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  12506407 tcatacgatacaaaaatatatttgctatccataaatatattttcagca 12506454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Original strand, 34546984 - 34547042
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34546984 cctaattttacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 34547042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 581 - 627
Target Start/End: Original strand, 43254023 - 43254069
Alignment:
Q  581 tatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcata 627  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  43254023 tatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagacata 43254069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 109
Target Start/End: Original strand, 55955 - 56015
Alignment:
Q  48 ttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  55955 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctccaatccactat 56015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 460 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 10690854 - 10690773
Alignment:
Q  460 aaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataa 541  Q
    |||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||  ||| | | |||||||||||||||||||| |||||    
T  10690854 aaaatataaaatattccttttaaaaatatatttgcatcaaatattctgtcacatggtacaaaaatatatttattgtacataa 10690773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 2647789 - 2647725
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| | ||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  2647789 ttgttgacccaattcggcccaatatgacctattctgggggagagagcagccctccaatccactat 2647725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 4796760 - 4796696
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||    
T  4796760 ttgttaacccagttcggtccaaaatgacctaatctgggggagaaagcagccctcaaatccactat 4796696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Original strand, 12097867 - 12097911
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  12097867 ttgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 12097911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22108160 - 22108120
Alignment:
Q  335 tctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22108160 tctctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 22108120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22137171 - 22137131
Alignment:
Q  335 tctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22137171 tctctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 22137131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Original strand, 29159807 - 29159871
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  29159807 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactat 29159871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Original strand, 35960820 - 35960884
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  35960820 ttgttgaccgagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaaaccactat 35960884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 40549920 - 40549880
Alignment:
Q  335 tctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40549920 tctctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 40549880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 40552198 - 40552158
Alignment:
Q  335 tctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40552198 tctctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 40552158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 9185258 - 9185195
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||    
T  9185258 ttgttgacccagttcggtccaatataacctagtctgggggagagagaagctctccaatccacta 9185195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 508 - 555
Target Start/End: Original strand, 12657600 - 12657647
Alignment:
Q  508 tcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 555  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  12657600 tcatacgatacaaaaatatatttgctatccatgaatatattttcagca 12657647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 28617318 - 28617255
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    ||||| ||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  28617318 ttgtttacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcagctctccaatccacta 28617255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 33332543 - 33332480
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    ||||||||| |||||| || ||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  33332543 ttgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccacta 33332480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 110
Target Start/End: Original strand, 8378489 - 8378570
Alignment:
Q  29 aagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  8378489 aagaacacaaga-tatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcaactctccgatccactata 8378570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 110
Target Start/End: Original strand, 7464544 - 7464585
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  7464544 tgacctagtctggggaagagagcagctctccgttccactata 7464585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8260625 - 8260584
Alignment:
Q  185 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  8260625 aatctcttcccgtgaccaagacactcaatcctaatagggttt 8260584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 375
Target Start/End: Original strand, 9027401 - 9027434
Alignment:
Q  342 aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9027401 aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 9027434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 25276434 - 25276381
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggg 83  Q
    |||||||||||| ||||||| | | ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  25276434 agaacacaaaagaatttgtttaaccagttcggtccatattgacttagtctgggg 25276381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 110
Target Start/End: Original strand, 34546905 - 34546946
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  34546905 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 34546946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 38396343 - 38396306
Alignment:
Q  301 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  38396343 ctttctaaacccttgtttcagccccctccctctctctc 38396306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 110
Target Start/End: Original strand, 44010775 - 44010816
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  44010775 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 44010816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Original strand, 2759197 - 2759241
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  2759197 ttgttgaccaagttcggtccaacttgacctaatctggggaagaga 2759241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2935344 - 2935312
Alignment:
Q  343 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2935344 agtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 2935312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 27 - 75
Target Start/End: Original strand, 14653852 - 14653900
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgaccta 75  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  14653852 agaagaacacaacaatatttgtttacctagttcagtctaaattgaccta 14653900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 27347985 - 27347941
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  27347985 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 27347941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Original strand, 36146408 - 36146452
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||    
T  36146408 ttgttgacctagttcggtccaacttgacctaatatgggggagaga 36146452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Original strand, 41317434 - 41317478
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  41317434 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 41317478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 405; Significance: 0; HSPs: 138)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 27912851 - 27912192
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||    
T  27912851 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagttctctgttccacta 27912752  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||    
T  27912751 tatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcacgtaaccaagaga 27912652  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |    
T  27912651 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctattatttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcc 27912553  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaac 400  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27912552 tttctaaacccttgtttcagcaccctctatctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 27912453  T
Q  401 gaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaa 500  Q
     |||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912452 aaatatcacactgaagatacgttt-ttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaa 27912354  T
Q  501 tcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatat 600  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||    
T  27912353 tcgtttttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatat 27912254  T
Q  601 tcttcttccatcaaattttgagtcatactacaaaattctcaaccttgactccaaattagtga 662  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27912253 tctccatccatcaaattttgagtcatactacaacattctccaccttgactctaaattagtga 27912192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 25804339 - 25803709
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  25804339 gagaagaacacaaagaagacaagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgttccacta 25804241  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  25804240 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttctcgtaaccaagaga 25804141  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |    
T  25804140 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcc 25804042  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttg 396  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||    |||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  25804041 attctaaacccttgtttgagccccctctatctctctctctctcaaatttagc-ctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttg 25803943  T
Q  397 gaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcat 496  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25803942 gaacaaatattacactgaagatacgttt---ttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcat 25803846  T
Q  497 caaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaaca 596  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||    
T  25803845 caaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaaca 25803746  T
Q  597 atattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  25803745 atattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 25803709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 635
Target Start/End: Original strand, 18511197 - 18511802
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  18511197 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaa 18511296  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511297 agagatatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 18511396  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    | ||||||||||||||||||||    
T  18511397 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagc 18511495  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaa-atataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacg 421  Q
    |||||||||||||    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18511496 cccctctatctct----caaagtttagtctgatacaaggtctatatttatattaaacatataactcataaatttggaacgaataccacactaaagatacg 18511591  T
Q  422 tttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaa 521  Q
    |||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18511592 ttt---ttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatatttcctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaa 18511688  T
Q  522 aatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttga 621  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18511689 aatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatattcgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 18511788  T
Q  622 gtcatactacaaaa 635  Q
    ||||||||||||||    
T  18511789 gtcatactacaaaa 18511802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 18469324 - 18468671
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||    
T  18469324 gagaagaacacaaagaagagaagaacgcaaaagaatttgttaatccagttcggtccaaattgacctagtctggg--agagagcagctcttcgttccacta 18469227  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
     |||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18469226 gatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaga 18469127  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |    
T  18469126 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcc 18469028  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18469027 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctct--caaagtttatcatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 18468930  T
Q  401 gaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaa 500  Q
     |||| |||||||||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18468929 aaataccacactgaagatactttt---tattttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaa 18468833  T
Q  501 tcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatat 600  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||||| |||||    
T  18468832 tcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaaaaatat 18468733  T
Q  601 tcttcttccatcaaattttgagtcatactacaaaattctcaaccttgactccaaattagtga 662  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18468732 tctccatccatcaaattttgagtcatactacaacattctccaccttgactctaaattagtga 18468671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 27910748 - 27910131
Alignment:
Q  26 gagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  27910748 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagctctccgttccattatatgatgagtatcgtta 27910649  T
Q  126 caaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 224  Q
    |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27910648 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgt 27910549  T
Q  225 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgctttctaaacccttgtttc 319  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     | |||||| || | || |||||||||    
T  27910548 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttttaaaccttgtttc 27910450  T
Q  320 agccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagat 418  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27910449 agcccccgctatctctctctcaaagtttaacctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagat 27910350  T
Q  419 acgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatac 518  Q
    || |||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27910349 actttt--tttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacaatac 27910252  T
Q  519 aaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattt 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  27910251 aaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaataatattctccatccatcaaattt 27910152  T
Q  619 tgagtcatactacaaaattct 639  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  27910151 tgagtcatactacaacattct 27910131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 662
Target Start/End: Original strand, 18509303 - 18509934
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  18509303 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagcccaccgtttcactatatgatgagtaactttacaaa 18509402  T
Q  130 gt-gaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18509403 atagatatcaacgagttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccattctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 18509502  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    | |||||||||||||||||||     
T  18509503 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcag- 18509600  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaa-atataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacg 421  Q
    |||||||||||||    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  18509601 cccctctatctct----caaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaacatataactcataaatttgggatgaataccacactgaagatacg 18509696  T
Q  422 tttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaa 521  Q
    |||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  18509697 ttt---ttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacggtacaaa 18509793  T
Q  522 aatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttga 621  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |       |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18509794 aatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatattcgaaataaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttga 18509893  T
Q  622 gtcatactacaaaattctcaaccttgactccaaattagtga 662  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||||    
T  18509894 gtcatactacaccattctccaccttgactttaaattagtga 18509934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 15552561 - 15551927
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatga-gaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccact 107  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15552561 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccact 15552462  T
Q  108 atatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15552461 atatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaagaga 15552362  T
Q  208 ct-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc 301  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||     | ||||||    
T  15552361 ctccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagataaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgc 15552263  T
Q  302 -tttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaattt 395  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15552262 ttttctaaacccttgtttcagtcccctctatctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaattt 15552163  T
Q  396 ggaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgca 495  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15552162 ggaacaaataccacgctgaagatacgttt--tttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatgtcatattccctttcaaaatatatttgca 15552065  T
Q  496 tcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaac 595  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||       ||||||||||||||||||||    
T  15552064 tcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatatcttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaac 15551965  T
Q  596 aatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15551964 aatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 15551927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 10587130 - 10586549
Alignment:
Q  26 gagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggt-agagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtt 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10587130 gagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtt 10587031  T
Q  125 acaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 224  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  10587030 acaaagagaaatcaatgggttaaaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctctttccgtaagcaagagactgaatcctaatagtgt 10586931  T
Q  225 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaagccctagctgttg-ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||          | | ||||| | |||||||||||||||||||     
T  10586930 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctatcgtttgttcccaaagagacaaactcta-------gttttgttgttgccattctaaacccttgtttcag- 10586839  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacg 421  Q
    |||||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  10586838 cccctctatctctct--caaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacg 10586741  T
Q  422 tttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaa 521  Q
    |||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10586740 ttt--tttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaa 10586643  T
Q  522 aatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaa 615  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  10586642 aatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattccccatccatcaaa 10586549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 18466999 - 18466453
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||    
T  18466999 gagaagaacacaaagaagagaagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccatta 18466900  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18466899 tatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctttccgtaaccaagaga 18466800  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||   |||||    |    
T  18466799 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatccaaa-ccctagttttgttgttgcc 18466701  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt-gaaatataactcataaatttggaac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18466700 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctct--caaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaaatataactcataaatttggaac 18466603  T
Q  401 gaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaa 500  Q
     |||| |||||||||||||| |||         |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466602 aaataccacactgaagatactttt-----ttttctcctttagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaa 18466508  T
Q  501 tcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 555  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18466507 tcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatatttttagca 18466453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 30 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 26098025 - 26097423
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26098025 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctggaggagagagcagcc-tctgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 26097927  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  26097926 agagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcattttcccgtaaccaagagactcattcctaatagtgttt-c 26097828  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||   |||||    | ||||||||| || |||||||    
T  26097827 caaggtgaatcaaccctctaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatccaaa-ccctagttttgttgttgccattctaaacctttatttcagc 26097729  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacg 421  Q
    |||||||||||      |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  26097728 cccctctatct------caaagtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactgaagataca 26097635  T
Q  422 tttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccct--ttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgataca 519  Q
    |||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  26097634 ttt--ttttttcctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataacatttccttcttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtaca 26097537  T
Q  520 aaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaatttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||       | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  26097536 aaaatatatttattgtccataaatatattttcagtacaaaatatatttgaaacaaattttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttt 26097437  T
Q  620 gagtcatactacaa 633  Q
    ||||||||||||||    
T  26097436 gagtcatactacaa 26097423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 31 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 18596939 - 18596328
Alignment:
Q  31 gaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18596939 gaacacaaaagaatctgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa 18596840  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  18596839 agagatatcaatgagttacaaaaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaacagtgttttc 18596740  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttgctttc--taaacccttgtttcagccc 324  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||| | ||  || ||||||||||||||||    
T  18596739 caaggtgaatcaaccctcaaaccatattgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgtctttatacccttgtttcagccc 18596641  T
Q  325 cctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtt 423  Q
    ||||||      || ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18596640 cctcta------tcccaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactgaagatacgtt 18596547  T
Q  424 tcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaa 523  Q
    |         |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  18596546 t--tttttttctccttcagtgatagaatatttgtatcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacggtacaaaaa 18596449  T
Q  524 -----------tatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatc 612  Q
               ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18596448 tatatttatggtatatttattgtccataaatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatc 18596349  T
Q  613 aaattttgagtcatactacaa 633  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  18596348 aaattttgagtcatagtacaa 18596328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 172 - 662
Target Start/End: Original strand, 26098379 - 26098868
Alignment:
Q  172 tacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagag 271  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  26098379 tacccaaaaccccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttgtcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagag 26098478  T
Q  272 acaaactctatacaaagccctagc-----tgttgct-ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtcta 365  Q
    |||||||||||||||| ||||||      ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||       | |||| ||||||| |||||||||    
T  26098479 acaaactctatacaaa-ccctagtcttcttgttgccattctaaacccttatttcagccccctctatctcc------aggtttactctgattcaaggtcta 26098571  T
Q  366 tatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaa 464  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||         |||||||| ||||||||| |||| || ||||    
T  26098572 tatttatagtaaaagtataactcataaaattggaacgaataccacattgaagatacgttt-ttttatttctccttcaatgaaagaatttttgtatcaaaa 26098670  T
Q  465 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatc 564  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26098671 atataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatata 26098770  T
Q  565 tttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaaaattctcaaccttgactccaaattagtga 662  Q
    ||||       ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  26098771 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaataatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacattctccaccttgactctaaattagtga 26098868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2175216 - 2174868
Alignment:
Q  26 gagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2175216 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgataagtaacgtta 2175117  T
Q  126 caaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 225  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2175116 caaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtt 2175017  T
Q  226 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||    
T  2175016 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 2174918  T
Q  320 agccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||      | |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  2174917 agccccctctatct------ccaagtttgctctgatacaaggcctgtatttatagt 2174868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 38882403 - 38882054
Alignment:
Q  26 gagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882403 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 38882304  T
Q  126 caaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 225  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882303 caaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 38882204  T
Q  226 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||    
T  38882203 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttcgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 38882105  T
Q  320 agccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||     |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882104 agccccc-----ctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 38882054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 25921437 - 25921803
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  25921437 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccacta 25921536  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25921537 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccagagtcccagcctcttcccgtaaccaagaga 25921636  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |    
T  25921637 ctcaatcctaatagtgtttcacaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgtc 25921735  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921736 tttctaaacccttgtttcagccccctctatct------caaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 25921803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 10529062 - 10529433
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaa-gtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccact 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  10529062 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccttccgattcact 10529161  T
Q  108 atatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagag 206  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10529162 atatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagag 10529261  T
Q  207 actcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcc----ctagctgttg-c 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||     | | ||||| |    
T  10529262 actcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctataaaaatcctagttttgttgttgcc 10529361  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10529362 tttctaaacccttgtttcaacccactctatct------caaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 10529433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Original strand, 34477017 - 34477353
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34477017 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 34477116  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcc-cgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477117 tatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 34477216  T
Q  208 ct-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg---- 300  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||        
T  34477217 ctccaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgc 34477315  T
Q  301 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477316 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc 34477353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Original strand, 34479382 - 34479718
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34479382 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 34479481  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcc-cgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  34479482 tatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagaga 34479581  T
Q  208 ct-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg---- 300  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||        
T  34479582 ctccaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgc 34479680  T
Q  301 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34479681 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc 34479718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 7 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4236945 - 4236578
Alignment:
Q  7 gtgagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccac 106  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4236945 gtgagaagaacacaaataagagaagaacacaaaagaatttattgacc-agttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgatccac 4236847  T
Q  107 tatatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaaga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4236846 tatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaaga 4236747  T
Q  206 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg--- 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||       
T  4236746 gactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttg 4236648  T
Q  301 -ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| |||||      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4236647 cctttctaaactcttgtttcagccccctttatct------ccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 4236578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 30 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 39854777 - 39854429
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39854777 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgatctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtagcgttacaaa 39854678  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39854677 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccagtctcttcccgtaaccatgagactcaatcctaatagtgtttcc 39854578  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||||     
T  39854577 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag- 39854480  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854479 cccctctatct------caaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 39854429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 27 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31545377 - 31545029
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 126  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  31545377 agaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtactgttac 31545278  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtt 225  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31545277 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatttcttcccgtaaccaagagactctaatcctaatagtgtt 31545178  T
Q  226 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||    
T  31545177 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 31545079  T
Q  320 agccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||| |||||      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31545078 agccccctttatct------caaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 31545029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 30 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 6745362 - 6745006
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745362 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 6745263  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745262 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 6745163  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc-tttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||     | |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  6745162 caaggtgaatcaaccctcaaa-cctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaa-ccctagttttgttgttgcttttctaaacacttgtttcagc 6745065  T
Q  323 cccctcta--tctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    ||||| ||  |||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745064 cccctttatctctctctctctctctttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 6745006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 21684416 - 21684791
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21684416 gagaagaacacaaaaaagagaagaacacaaacgaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 21684515  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21684516 tatgatgagtattgttacaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcctgcctaattctactcaaagccccaacctcttcccgtaaccaagagac 21684615  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ct 302  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||    
T  21684616 tcaatcctaatagtgtatcccaaggcgaatcaacccataaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcct 21684714  T
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  21684715 ttttaaacccttgtttcagccccctctatctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagt 21684791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 31179337 - 31179701
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31179337 gagaagaacacaaagaagagaagaacacagaa--atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 31179434  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31179435 tatgatgagtttcgttacaaagagaaatgaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 31179534  T
Q  209 t-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |    
T  31179535 tccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcc 31179633  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31179634 tttctaaacccttgtttcagctccctctatct------caaagtttgctttgatacaatgtctatatttatagt 31179701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31543029 - 31542684
Alignment:
Q  29 aagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  31543029 aagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtactgttacaa 31542930  T
Q  129 agtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttc 227  Q
    || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31542929 agagaaatcaatgggtt-cgagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 31542831  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||||    
T  31542830 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 31542732  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31542731 ccccctctatct------caaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 31542684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 34 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 40221813 - 40221340
Alignment:
Q  34 cacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gt 131  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |     
T  40221813 cacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaaga 40221714  T
Q  132 gaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 231  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40221713 gatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaa 40221614  T
Q  232 ggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagcccc 325  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    | |||||||||||||||||||||||    
T  40221613 ggtgaatcaaccctcaaatcctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagcccc 40221515  T
Q  326 ctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaatataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtt-- 423  Q
    ||||||||      ||| |||| ||||||  ||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||      
T  40221514 ctctatct------caaggtttactctgagtcaatgtctatatttatagt-aaaagtaactcataaatttagaacggatatcacactgaagatacgtttt 40221422  T
Q  424 ---tcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatc 502  Q
       |         ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  40221421 ttgttttttccttctcctgcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccttttcaaaatatatttgaaacaaatc 40221340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 30 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 6747598 - 6747249
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6747598 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagagagagagcagccctccgatccactatatgacgagtaacgttacaaa 6747499  T
Q  130 gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 229  Q
      |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6747498 aagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 6747399  T
Q  230 aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc-tttctaaacccttgtttcagcc 323  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||| | |||||||| | |||     | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6747398 aaggtgaatcaaccctcaaa-cctagtgtttgtttcaaagagacaaattttatacaaa-ctctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagcc 6747301  T
Q  324 ccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    |||||||||||| || |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6747300 ccctctatctctttctc----tttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 6747249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 30 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16776451 - 16776112
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16776451 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggggagatagcagccctccgatccactatatgataagtaacgttacaaa 16776352  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16776351 agagaaatcaatgg-ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 16776253  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||| |||||||||||||||||    
T  16776252 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttattccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttgtaaacccttgtttcagc 16776154  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatattt 370  Q
    |||||||||||      |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16776153 cccctctatct------caaagtttgctcagatacaaggtctatattt 16776112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 21948320 - 21947976
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  21948320 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 21948221  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948220 agagatatcaaggggttacaagaataagtctcccgcctaattccacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 21948121  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||||     
T  21948120 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcag- 21948023  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||      |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21948022 cccctctatct------caaaatttactctgatacaaggtctatatttatagt 21947976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 2818320 - 2818666
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  2818320 agaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 2818419  T
Q  129 agtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
    || ||  |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  2818420 agagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagccttttcccgtaaccaagagactcaatcgtaatagtgttttc 2818519  T
Q  229 caaggtgaatc-aacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||   |||||    |||||||||||||||||||||    
T  2818520 caaggtgaatcaaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccatagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcag 2818618  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2818619 ccccctctatct------caaagtttactctgatacaaggtctatatttatagt 2818666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25904397 - 25904052
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaa- 128  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| | ||||||||||| |||||||||||||     
T  25904397 agaacacaaaataatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgtttcactatatgataagtaacgttacaat 25904298  T
Q  129 agtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
    || || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25904297 agagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattatactcaaagccctaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 25904198  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||   |||||    ||||||||||||||||||||||    
T  25904197 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatac-aatccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagc 25904099  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||      ||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  25904098 cccctctatct------caaggtttacactgatacaatgtctatatttatagt 25904052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 1189592 - 1189944
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggg-gtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttaca 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||    
T  1189592 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggaggagagagcatccctccgttccactataattatgagtaaccttaca 1189691  T
Q  128 aa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    || | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1189692 aaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt 1189791  T
Q  227 cccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttca 320  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||   |||||    |||||||||| |||||||||    
T  1189792 cccaaagtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccgtagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttca 1189890  T
Q  321 gccccctctatctctctcgcaaagtttgc-tctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  1189891 gccccctctatctctct--caaggtttacatctgatacaaggtctatatttatagt 1189944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 326 - 633
Target Start/End: Original strand, 3373322 - 3373628
Alignment:
Q  326 ctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgttt 424  Q
    |||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  3373322 ctctatctcaatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgttt 3373421  T
Q  425 cnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaat 524  Q
             |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3373422 --tttttttctccttcagtgaaaaaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaat 3373519  T
Q  525 atatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtc 624  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  3373520 atatttattgtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattctgagtc 3373619  T
Q  625 atactacaa 633  Q
    |||||||||    
T  3373620 atactacaa 3373628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4410329 - 4410090
Alignment:
Q  17 cacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatga 116  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  4410329 cacaaagtagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactatatgatga 4410230  T
Q  117 gtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcct 216  Q
    ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410229 gtatcgttacaaagagaaatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcct 4410130  T
Q  217 aatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410129 aatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt 4410090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 10474308 - 10474653
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||| |||    
T  10474308 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttagaaa 10474407  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  10474408 agagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccaatctcttcctgtaaccaagagattcaatcttaatagtgtttcc 10474507  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||| ||||||||||||    
T  10474508 caaggtgtatcaaccctcaaaccccagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagatttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagc 10474606  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||| |      ||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  10474607 cccctctattt------caaggtttacactgatacaatgtctatatttatagt 10474653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 30 - 287
Target Start/End: Original strand, 658341 - 658596
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  658341 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg---agagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 658437  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  658438 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttct 658537  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  658538 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaa 658596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 16092184 - 16092534
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| | | |||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16092184 agaacacaaaagaatttgttgatccagttcagtctaaattgacctagtctagaggagagagcaaccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaa 16092283  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092284 aagagatctcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 16092383  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttg-ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||     | ||||| ||||||||||||||||||||     
T  16092384 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcaaagagacagactctatacaaa-ccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaa 16092482  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgc-tctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||| |   |||||| | |||||||||| |||||||||| ||||    
T  16092483 ccccctctatctctcac---aagtttacatctgatacaaagtctatatttctagt 16092534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 36 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 17073172 - 17072832
Alignment:
Q  36 caaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtga 133  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||| | ||    
T  17073172 caaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccgagtctgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaaccttacaaaagaga 17073073  T
Q  134 aatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagg 233  Q
     ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17073072 tatcaatgagttacaagaataagtcttccgcctaattctatcgaaagccccaatctcttcccctaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaagg 17072973  T
Q  234 tgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccccct 327  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  17072972 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccct 17072874  T
Q  328 ctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||      ||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  17072873 ctatct------caaggtttacactgatacaatgtctatatttatagt 17072832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Original strand, 31472597 - 31472908
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31472597 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaa 31472696  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| |||||| ||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31472697 aagagatatcaatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 31472796  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||| ||    
T  31472797 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttag 31472895  T
Q  322 ccccctctatctc 334  Q
    |||||||||||||    
T  31472896 ccccctctatctc 31472908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 24127150 - 24126840
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  24127150 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 24127051  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24127050 agagatatcaatgagttacaagaataagtctatcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcc 24126951  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||| |||||| |  ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||| |||||||||||    
T  24126950 caaggtcaatcaatcttcaaaccctagtatttgttgacaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgtctttctaaactcttgtttcagc 24126852  T
Q  323 cccctctatctc 334  Q
    ||| ||||||||    
T  24126851 cccatctatctc 24126840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 36402313 - 36402658
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  36402313 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcgatctaaattgacctagtctgggggagagagcagacatctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 36402412  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| || |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  36402413 agagatatcaatggattacaataataagtctccagcctaattttacccaaagttccaatctcctcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtattttc 36402512  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagct-----gttg-ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |      ||| | ||||||||||||||||||||    
T  36402513 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagtttcgtgattgtcattctaaacccttgtttcagc 36402611  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||      ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  36402612 cccctctatct------caacgtttactctgatataaggtctatatttatagt 36402658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 39798345 - 39798123
Alignment:
Q  26 gagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  39798345 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactatacgatgagtatcatta 39798246  T
Q  126 caaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 224  Q
     ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798245 taaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 39798146  T
Q  225 ttcccaaggtgaatcaacccaca 247  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  39798145 ttcccaaggtgaatcaacccaca 39798123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 696172 - 695924
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||||    
T  696172 agaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgaataactttacaa 696073  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  696072 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt- 695974  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaac 277  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  695973 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagatacaaac 695924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 244
Target Start/End: Original strand, 20505828 - 20506041
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  20505828 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg--gagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 20505925  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20505926 agagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 20506025  T
Q  229 caaggtgaatcaaccc 244  Q
    ||||||||||||||||    
T  20506026 caaggtgaatcaaccc 20506041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 2954710 - 2954463
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  2954710 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcaaaattgacctagtttgggggagagagcatccctccgcttcactatatgatgagtaactttacaaa 2954611  T
Q  130 gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 229  Q
    | || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2954610 gagatatcaatgggttacaagaatacgtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttctcgtaactaagagactcaatcctaatagtgttttcc 2954511  T
Q  230 aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccgaagagacaaa 276  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  2954510 aaagtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaa 2954463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 43 - 374
Target Start/End: Original strand, 37705778 - 37706109
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| | || | |||||||||||||||||| ||||||| | || ||||| |    
T  37705778 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaatagccattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 37705877  T
Q  142 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37705878 ggttacaagaataagtctcccacctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 37705977  T
Q  242 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagct-----gttg-ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 335  Q
    ||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||| |     |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||      
T  37705978 ccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaagtctatacaaa-ccctagatttgtcgttgcctttctaaacctttatttcagccccctctatct-- 37706074  T
Q  336 ctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatag 374  Q
        ||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  37706075 ----caaggtttacactgatacaatgtctatatttatag 37706109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 287
Target Start/End: Original strand, 17818477 - 17818733
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  17818477 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagaga--agccctctgttccactgtatgatgagtaactttacaaa 17818574  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  17818575 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcagtcttaatagtgtttcc 17818674  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17818675 caaggtaaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttccaaagagacgaactctatacaaa 17818733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10749996 - 10749796
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 126  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10749996 agaagaacacaaa-gaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 10749898  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtt 225  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10749897 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 10749798  T
Q  226 tc 227  Q
    ||    
T  10749797 tc 10749796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Original strand, 39397978 - 39398287
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |  ||||||| ||  ||||||| |||||    
T  39397978 agaacacaaaagaatgttttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgtgggagagagcagccatccgttttactatataattggtaacgtcacaaa 39398077  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39398078 agagatatcaatgggttacaagaataagtctactgcctaattctacccaaagttccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 39398177  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||||    
T  39398178 caaggtgaatcaaccctcaaa-cctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 39398275  T
Q  322 ccccctctatctc 334  Q
     ||||||||||||    
T  39398276 -cccctctatctc 39398287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6756786 - 6756478
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  6756786 agaacacaaaagattttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctc-gtttcactataatgatgtgtaaccttacaa 6756688  T
Q  129 agt-gaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    |   || ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6756687 aaaagatatcaatg--ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttc 6756590  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||   |||||    ||||||||||| |||||||||    
T  6756589 ccaaggagaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccttagttttgttgttgcctttctaaaccattgtttcag 6756491  T
Q  322 ccccctctatctc 334  Q
    | |||||||||||    
T  6756490 ctccctctatctc 6756478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 256
Target Start/End: Original strand, 41585729 - 41585956
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  41585729 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacattacaaa 41585828  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41585829 agagatatcaatgacttacaaaaataagtctcctgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtagccaagagactcaatcctactagtgtttcc 41585928  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagt 256  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41585929 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagt 41585956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 31465974 - 31466308
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||          |||||||||||||| |||||||    
T  31465974 agaatacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgaactagtctgggggtgagagcagccct----------atatgatgagtaactttacaaa 31466063  T
Q  130 gt-gaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  31466064 atagatatcaatgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatactgtttct 31466162  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagct-----gttgc-tttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |     ||| | ||| |||||| ||||||||||    
T  31466163 caaggtgaatcaaccgtcaaaccctggtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgtcgttacttttttaaacctttgtttcagc 31466261  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||| | |||||      ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31466262 cccttttatct------caaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 31466308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23665340 - 23665140
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 126  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23665340 agaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 23665241  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtt 225  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23665240 aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 23665142  T
Q  226 tc 227  Q
    ||    
T  23665141 tc 23665140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Original strand, 23793247 - 23793447
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 126  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23793247 agaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 23793346  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtt 225  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23793347 aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 23793445  T
Q  226 tc 227  Q
    ||    
T  23793446 tc 23793447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 55 - 423
Target Start/End: Original strand, 6661194 - 6661560
Alignment:
Q  55 agttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaaga 151  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| | |||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||| | || ||||| |||||||||||    
T  6661194 agttcggtccaaatctgacctagtctgagggagagagcagtcatccgttccactataattatgagcaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaga 6661293  T
Q  152 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacc 251  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||     
T  6661294 ataagtctcctgcctaattgtacccaaaatctcaatttcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccatggtgaatcaacc--ccaact 6661391  T
Q  252 ctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtt 346  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||||||| | |||||       |||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||      ||| |||    
T  6661392 ctagtgtttgttgccaaga-acaaactctatacata-ccctaattttcttgttgacttctaaacccttgtttcaaccctctctatct------caaggtt 6661483  T
Q  347 tgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaatataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtt 423  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||    
T  6661484 tactctgatacaaggtctatatttatagtgaaatataactcataaatttgaaacggatataacactgaagatgcgtt 6661560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Original strand, 15354557 - 15354757
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 126  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  15354557 agaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttaatgagtaacgttac 15354656  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtt 225  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15354657 aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 15354755  T
Q  226 tc 227  Q
    ||    
T  15354756 tc 15354757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 12555908 - 12556253
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| | | || || ||||||||||||||||||    
T  12555908 agaacacaaaagaatttattgacccagttcagtccaaattgaactagtatgggggagatagcagccctccgtttcgctttaagatgagtaacgttacaaa 12556007  T
Q  130 gtgaaat--caacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
      || ||  ||| | |||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12556008 aagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcttgtctaattctaccaaaactcc-aatctcttcccgtagccaagagacacaatcctaatagtgtttc 12556106  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||   |||||    | |||||||||||| ||||||    
T  12556107 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa-ctctagttttgttgttgtcattctaaacccttatttcag 12556205  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12556206 ccccctctatct------caaagtttactctgatacaaggtctatatttatagt 12556253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Original strand, 3373119 - 3373320
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 126  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  3373119 agaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatccactatatgatgagtttcgttac 3373218  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac-tcaatcctaatagtgtt 225  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  3373219 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaagagacttcaatcctaatagtgtt 3373318  T
Q  226 tc 227  Q
    ||    
T  3373319 tc 3373320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10757472 - 10757273
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 126  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10757472 agaagaacacaaa-gaatttgttgacccagttcggtctaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 10757374  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtt 225  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10757373 aaagaaaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctt-ccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 10757275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Original strand, 15356833 - 15357033
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 126  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  15356833 agaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtccgggggagagagcagccctccgatccactatttaatgagtaacgttac 15356932  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtt 225  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15356933 aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 15357031  T
Q  226 tc 227  Q
    ||    
T  15357032 tc 15357033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Original strand, 38960114 - 38960314
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 126  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38960114 agaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtttgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 38960213  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtt 225  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38960214 aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtctcccgtctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 38960312  T
Q  226 tc 227  Q
    ||    
T  38960313 tc 38960314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 2724187 - 2723964
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||| ||    
T  2724187 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaatcttacaaa 2724088  T
Q  129 agtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
    || || ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2724087 agagatatcaatgggttacaagaataaatcacccgcctaattcta---------ccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatggtgtttcc 2723997  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttg 261  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  2723996 caaggtgaatcatccctcaaaccctagtgtttg 2723964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Original strand, 23741841 - 23742034
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 126  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23741841 agaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 23741940  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaata 220  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23741941 aaagagaaatcaatgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttctcgtaatcaagagactccaatcctaata 23742034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21289055 - 21288748
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21289055 agaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataagatgagtaacgttacaaa 21288956  T
Q  130 gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 229  Q
       | || |    |||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  21288955 ---agatga----gttacaagaaaaaatctcccgcttaattctatccaaagtcctaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgttt-tc 21288864  T
Q  230 aaggtgaatcaacccaca------aaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgct-ttctaaacccttgtt 317  Q
    ||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||       ||||||| |||||||||||| ||    
T  21288863 aaggtgaatcaaccctcaaaccctaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctatttttattgttgctattctaaacccttatt 21288765  T
Q  318 tcagccccctctatctc 334  Q
    ||| |||||||||||||    
T  21288764 tcaaccccctctatctc 21288748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 334
Target Start/End: Original strand, 34530722 - 34530961
Alignment:
Q  102 tccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaa 199  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||| | || ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  34530722 tccactataatgatgagcaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataaatctcccgcctaattctactcaaagtcctaatctcttcccgtag 34530821  T
Q  200 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----g 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||     |    
T  34530822 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttg 34530920  T
Q  295 ctgttgc-tttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 334  Q
     |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34530921 ttgttgcatttctaaacacttgtttcagccccctctatctc 34530961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 161 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20045172 - 20044959
Alignment:
Q  161 ccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgttt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20045172 ccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccggaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 20045073  T
Q  261 gttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgcttt-ctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctga 354  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| |||||     | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||      ||| |||||||||||    
T  20045072 gttgccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgctttcctaaacccttgtttcagccccctctgtct------caaggtttgctctga 20044980  T
Q  355 tacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||| | |||||||||||||    
T  20044979 tacaaagcctatatttatagt 20044959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 165 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20043208 - 20042999
Alignment:
Q  165 ctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttc 264  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  20043208 ctaattctatccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttt 20043109  T
Q  265 cgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgataca 358  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||      ||| ||||||| |||||||    
T  20043108 ccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacacttgtttcagccccctctatct------caaggtttgctatgataca 20043016  T
Q  359 aggtctatatttatagt 375  Q
    | | |||||||||||||    
T  20043015 aagcctatatttatagt 20042999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 452 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 21288713 - 21288531
Alignment:
Q  452 atttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgata-caaaaatatatttattgtccataaatatatttt 550  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21288713 atttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcataaaatcgttcttcatacggtaccgaaaatatatttattgtccataaatatatttt 21288614  T
Q  551 cagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    ||||||||||||| |||        |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21288613 cagcacaaaatatattttaaacaaatcttttttatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagttatactacaa 21288531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 350 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 15143461 - 15143262
Alignment:
Q  350 tctgatacaaggtctatatttatagtgaaatataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnc-tccttcagtgaaag 448  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||        | | ||||||||||||    
T  15143461 tctgatacaaggtctatatttatagagaaatataactcataaatttgtaacggatatcacgctgaagatacgtttcttttttccccttcttcagtgaaag 15143362  T
Q  449 aatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatatt 548  Q
    ||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15143361 aatatttgcatcaaa-------tattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatatggtacaaaaatgtatttattgtccataaatatatt 15143269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 35 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 36208865 - 36208656
Alignment:
Q  35 acaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtg 132  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| | |    
T  36208865 acaaaagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtatggggaa-agagcagcccgccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagag 36208767  T
Q  133 aaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 231  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  36208766 atatcaatgggttacaagaataagtctacaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgttaccaagagactcaatcttagtaatgtttcccaa 36208667  T
Q  232 ggtgaatcaac 242  Q
    |||||||||||    
T  36208666 ggtgaatcaac 36208656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 483 - 628
Target Start/End: Original strand, 17415748 - 17415893
Alignment:
Q  483 aaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntctttta 582  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||       |||||||    
T  17415748 aaatatatttgcatcaaattttccttcatacagtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcaaaaaatatatttgaaacaaatctttta 17415847  T
Q  583 tatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatac 628  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17415848 tatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgagtcatac 17415893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9020514 - 9020299
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaatt-gacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttaca 127  Q
    |||||||||||| ||| ||| | | |||||||||||||   |||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  9020514 agaacacaaaagaattggtttatccagttcggtccaaaacagacctaatttggaggagagagcagccatccgatccactataatgatgagtaattttaca 9020415  T
Q  128 aa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    || | || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  9020414 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagctccaatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcttaatagtgttt 9020315  T
Q  227 cccaaggtgaatcaac 242  Q
     |||||||||||||||    
T  9020314 tccaaggtgaatcaac 9020299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20054131 - 20053834
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttaca 127  Q
    |||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||| |||||    
T  20054131 agaacacaaaagaatttgtttacgcagttcggtccaaaactgacctagtatggaggagagagcagccttccgttctactataatgatgagtaactttaca 20054032  T
Q  128 aagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    ||  || || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20054031 aaa-gagat-atcgggttacaagaataagtctcccacctaattctacttaaagtcccaatctcca-----aaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 20053939  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag-----ctgttgctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    ||||||||||||||||    |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||| ||| | ||||      |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20053938 ccaaggtgaatcaacc--tcaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatataaa-ctctagtttttgtgttgccttctaaacccttgtttcagc 20053843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 56 - 281
Target Start/End: Original strand, 17413176 - 17413402
Alignment:
Q  56 gttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaa 152  Q
    ||||||||||| | ||||| | ||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||| ||||||||||||    
T  17413176 gttcggtccaacactgaccaactctgggggagagagcatccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaa 17413275  T
Q  153 taagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacc 251  Q
    ||||| | |   |||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||    
T  17413276 taagttttcaaacctaattctacctaaagtctcaatctcttcccttgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaacc 17413373  T
Q  252 ctagtgtttgttccgaagagacaaactcta 281  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  17413374 ctagtgtttgttgccaagag-caaactcta 17413402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 43 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23667599 - 23667415
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgg 142  Q
    |||||||| || ||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  23667599 atttgttggcccagttcggtccaatctgtcctagtctggggaagagagcagccctccgatccattatttgatgagtgacgttacaaagagaaatcaatgg 23667500  T
Q  143 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 227  Q
    ||| |||| || ||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||| | |||| ||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  23667499 gttgcaagcat-agtttttcgcctaattctttccaaagtcccaatctctttctgtaagcaagagagtccaatccttatagtgtttc 23667415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15143722 - 15143547
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cc 165  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||| | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||| |   ||    
T  15143722 tgacctagtctaggggagaaagcagctccccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacc 15143623  T
Q  166 taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 241  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  15143622 taattctacccaaaatccaaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgcttccaaaggtgaatcaa 15143547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 301 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4410078 - 4410002
Alignment:
Q  301 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410078 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc--aaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 4410002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 241
Target Start/End: Original strand, 2144602 - 2144763
Alignment:
Q  85 agagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacg-ggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagt 181  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||   |||||||||||| ||||| |   |||||||| |||||||||    
T  2144602 agagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaagagatataaaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattccacccaaagt 2144701  T
Q  182 ccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 241  Q
    ||  ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2144702 cctgaatctcttcccgcgaccaagagactccatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 2144763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 69 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4897985 - 4897828
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa-agtgaaatcaacgggttacaagaataagtctccc-gcc 165  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||| | | ||| ||||| ||||||||||| |||||| || || |||||  |||||||||||| ||||| |  |||    
T  4897985 tgacctagtatgggggagaaagcagcccactgttccgctataatgatgagtaactttacaatagagatatcaaatggttacaagaatcagtcttcaagcc 4897886  T
Q  166 taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  4897885 taattctacccaaagtcacaatctcttcccgtgaccaagatactcaatcctaacagtg 4897828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 531 - 633
Target Start/End: Original strand, 6661929 - 6662031
Alignment:
Q  531 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatacta 630  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||       | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  6661929 attgtccataaatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatattttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaagttttaagtcatacta 6662028  T
Q  631 caa 633  Q
    |||    
T  6662029 caa 6662031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 129
Target Start/End: Original strand, 26098273 - 26098373
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtct-ggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  26098273 agaacataaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtatggggggagagagcagccctccgtttcaccatatgatgagtaacgttacaa 26098372  T
Q  129 a 129  Q
    |    
T  26098373 a 26098373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 42771025 - 42770936
Alignment:
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgt 197  Q
    ||||||||||||| ||||||| | || |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42771025 tatgatgagtaactttacaaaagagatatcaataggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgt 42770936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 303 - 424
Target Start/End: Original strand, 41585970 - 41586086
Alignment:
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacg 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||      || |||| |||||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41585970 ttctaaacccttgtttcagccccctttatctc------aaggtttactctgatacaaaacctatatttatagtaaaagtataactcatagatttggaacg 41586063  T
Q  402 aatatcacactgaagatacgttt 424  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  41586064 aataccagactgaagatacgttt 41586086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 155 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 42770934 - 42770847
Alignment:
Q  155 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 244  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| |||||    
T  42770934 agtctctcgtctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcagtcctaata--gtttcccatggtgaatgaaccc 42770847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1171007 - 1170811
Alignment:
Q  29 aagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tga-tgagtaacgtta 125  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | |||    
T  1171007 aagaacacaaga-tatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttcttta 1170909  T
Q  126 caaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 224  Q
    ||||| || |   | | ||| ||||||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1170908 caaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgt 1170813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 247 - 375
Target Start/End: Original strand, 20507665 - 20507792
Alignment:
Q  247 aaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagct-----gttgc-tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgc 340  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  |     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      |    
T  20507665 aaacccttgtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccttaatttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct------c 20507757  T
Q  341 aaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20507758 aaagtttactctgatacaagatctatatttatagt 20507792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 4754312 - 4754198
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt 263  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |    ||||||||||||||||    
T  4754312 cctaattctatccaaagtcacaatctcttccagtgaccaagaggctcaattctaatagtgtttttcaaggtgaatcaatc--tcaaccctagtgtttgtt 4754215  T
Q  264 ccgaagagacaaactcta 281  Q
     | ||||| |||||||||    
T  4754214 gccaagag-caaactcta 4754198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Original strand, 35385437 - 35385634
Alignment:
Q  29 aagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgat--gagtaacgtt 124  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||  | ||    
T  35385437 aagaacacaaga-tatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatatgagtttcttt 35385535  T
Q  125 acaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    |||||| || |   | | ||| ||||||| ||||| |   |||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35385536 acaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattctacc-aaagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 35385631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 576 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 40221341 - 40221284
Alignment:
Q  576 tcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  40221341 tcttttatatttttagcaacaatattcttcatcaattaaattttgagtcatactacaa 40221284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 226
Target Start/End: Original strand, 15445264 - 15445453
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttac-aaagtgaaatcaa 139  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||| || |||||    
T  15445264 atttgtttacccagttcagtccaatactgacctagtctggga-agagagcagcccttcgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 15445362  T
Q  140 cgggttacaagaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgt---aaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
     ||||||||||||| | || ||   ||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||     ||||||||||||||||||| |||||||    
T  15445363 agggttacaagaatcattcttcaaacctaattctactcaaagtctcaatctcttcatgtggccgccaagagactcaatcctaacagtgttt 15445453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 581 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 18466465 - 18466413
Alignment:
Q  581 tatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18466465 tatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 18466413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 20043284 - 20043222
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagca 92  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20043284 agaacacaaaagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgtgggagagagca 20043222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 31782578 - 31782639
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  31782578 cctaattctacccaat-tcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 31782639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 581 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 15143274 - 15143225
Alignment:
Q  581 tatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatacta 630  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15143274 tatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 15143225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 241
Target Start/End: Original strand, 34033691 - 34033768
Alignment:
Q  166 taattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 241  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  34033691 taattctacccaaaatcctgaatctcttcccgcgaccaagagactcaatcctaatagtgtttctccaaggtaaatcaa 34033768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 35430408 - 35430259
Alignment:
Q  97 tccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacggg-ttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtccc-aatctctt 192  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||  |  |||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  35430408 tccgttccactataatgatgagtaactttacaaagagatatcaaaagaattacaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaaagacccgaatctctt 35430309  T
Q  193 cccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 241  Q
    |||   |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  35430308 ccctagaccaagagactcaattgtaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 35430259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25445653 - 25445501
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-c 164  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||  | |||||||| || ||  |   || |||||||| ||||| |   |    
T  25445653 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatatgagtttctttacaaagagatattga---gtaacaagaatcagtcttcaaac 25445557  T
Q  165 ctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatag 221  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25445556 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatag 25445501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25452556 - 25452498
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25452556 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 25452498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29748502 - 29748443
Alignment:
Q  169 ttctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29748502 ttctacccaaagtcccgaatctattcccgtgaccaagagactcaatcctattagtgtttc 29748443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 2298122 - 2298183
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2298122 cctaattctacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2298183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10627425 - 10627364
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  10627425 cctaattctacccta-gtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 10627364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22672991 - 22672837
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat-atg--atgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtc-tcccgc 164  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||  | |||||||| || ||    | ||||||||||| |||| ||   |    
T  22672991 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatatgagtttctttacaaagagatat---tgagttacaagaatcagtcttcaaac 22672895  T
Q  165 ctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    |||||||||||| ||||| ||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22672894 ctaattctaccc-aagtctcagcctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 22672837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 9353425 - 9353361
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  9353425 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 9353361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 32520597 - 32520533
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  32520597 cctaattctacccaaagtcatgaatctcttcccgtaatcgagagactcaatcttaatagtgtttc 32520533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 36932443 - 36932379
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  36932443 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 36932379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28786465 - 28786407
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||| ||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28786465 cctaattctgcccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 28786407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 108
Target Start/End: Original strand, 28832263 - 28832326
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  28832263 ttgttgacccggttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccacta 28832326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1240489 - 1240428
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  1240489 cctaattctacccaaa-tcccagcctcttcccgtgcctaagagactcaatcctaatagtgttt 1240428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 110
Target Start/End: Original strand, 2297986 - 2298067
Alignment:
Q  29 aagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  2297986 aagaacacaaga-tatttgtttacctagttcggtctaatgatgacctagtctgggggggagagcagctctccgatccactata 2298067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 375
Target Start/End: Original strand, 15354770 - 15354812
Alignment:
Q  333 tctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15354770 tctctcccaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 15354812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 375
Target Start/End: Original strand, 15357046 - 15357088
Alignment:
Q  333 tctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15357046 tctctcccaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 15357088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 11917065 - 11917000
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  11917065 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactata 11917000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 16093413 - 16093473
Alignment:
Q  165 ctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||| || ||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16093413 ctaattctacctaa-gtcccagacttttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16093473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Original strand, 10281755 - 10281819
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||  ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  10281755 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagctctccaatccactat 10281819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Original strand, 15464536 - 15464600
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||| ||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  15464536 ttgttgacccagttcggtccaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 15464600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 17004053 - 17003989
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| || | |||||||||    
T  17004053 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctcttcaatccactat 17003989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 23665127 - 23665087
Alignment:
Q  335 tctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23665127 tctctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 23665087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 23667402 - 23667362
Alignment:
Q  335 tctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23667402 tctctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 23667362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 375
Target Start/End: Original strand, 23793460 - 23793500
Alignment:
Q  335 tctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23793460 tctctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 23793500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Original strand, 11962554 - 11962612
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  11962554 cctaattctacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagagacacaatcctaatagtg 11962612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 241
Target Start/End: Original strand, 15224889 - 15224968
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 241  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||||||| | ||||| |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15224889 cctaattttacccaaagtctcgaatctcttcccatgaccaaaagactttatcctaatagtgtttcttcaaggtgaatcaa 15224968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Original strand, 17841370 - 17841428
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||||||| || |||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17841370 cctaattctacccaa-gttccagcctcttcccgtgacctagagactcaatcctaatagtg 17841428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 469 - 511
Target Start/End: Original strand, 6661594 - 6661636
Alignment:
Q  469 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  6661594 aatattccctttcaaaatatatttacttcaaatcttccttcat 6661636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 218
Target Start/End: Original strand, 26406594 - 26406647
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 218  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  26406594 cctaattctactcaa-gtctcaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaa 26406647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 4897742 - 4897674
Alignment:
Q  302 tttctaaacccttgtttcag--ccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatat 368  Q
    ||||||||||||||||||||  | | |||| |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  4897742 tttctaaacccttgtttcagctctctctctctctctctctcaaggtttactctgatgcaaggtctatat 4897674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 424
Target Start/End: Original strand, 5778979 - 5779036
Alignment:
Q  367 atttatagtgaaatataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgttt 424  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||    
T  5778979 atttatagagaaatataattcataaatttaaaacggatatcacgttgaagatacgttt 5779036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 576 - 625
Target Start/End: Original strand, 5779168 - 5779217
Alignment:
Q  576 tcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtca 625  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||| |||||    
T  5779168 tcttttatatttttagcaataatcttcttcatctatcaaattttaagtca 5779217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 82
Target Start/End: Original strand, 8565946 - 8565983
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggg 82  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8565946 ttgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctggg 8565983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13295896 - 13295835
Alignment:
Q  166 taattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||  || | |||||||||||||||||| |||||||    
T  13295896 taattctacccaaagtctcgaatctcttcatgtgatcaagagactcaatcctaaaagtgttt 13295835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 375
Target Start/End: Original strand, 38960339 - 38960372
Alignment:
Q  342 aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38960339 aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 38960372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 42238417 - 42238376
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  42238417 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 42238376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10757245 - 10757213
Alignment:
Q  343 agtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10757245 agtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 10757213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 12084268 - 12084204
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| |||||||||||   ||||||| | ||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  12084268 ttgttgacccagttcggtccactatgacctaatatggggcagagagcagctctccaatccactat 12084204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Original strand, 19588750 - 19588814
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||| ||| |||  || ||||||||||||||| |||||||||    
T  19588750 ttgttgacccagttcggtccaatatgaactaatcttagggagagagcagccctccaatccactat 19588814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 19806531 - 19806487
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  19806531 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 19806487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 335 - 375
Target Start/End: Original strand, 23742055 - 23742095
Alignment:
Q  335 tctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23742055 tctctcaaagtttgctttgacacaaggtctatatttatagt 23742095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 482 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 32520316 - 32520241
Alignment:
Q  482 aaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatata--tttattgtccataaatatattttcagca 555  Q
    ||||||| ||||||||||||  | |||| |||| ||||||||||||  |||| | | |||||||||||||||||||    
T  32520316 aaaatatgtttgcatcaaatttttcttcgtacggtacaaaaatatatttttactctacataaatatattttcagca 32520241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 32636992 - 32636948
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  32636992 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 32636948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 400; Significance: 0; HSPs: 178)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 662
Target Start/End: Original strand, 22132355 - 22133014
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagta-tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccact 107  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22132355 gagaagaacacaaagaagagaagaagaccaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccaatccact 22132454  T
Q  108 atatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22132455 atatgatgagtaccgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaga 22132554  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcc----ctagctgttg-ct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     | | ||||| ||    
T  22132555 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-cgaagagacaaactctatacaaacccaagttttgttgttgcct 22132653  T
Q  303 ttctaaacccttgtttcagcccc---ctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttgga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22132654 ttctaaacccttgtttcagcccctctatctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttgga 22132753  T
Q  399 acgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatca 498  Q
    || |||| ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132754 acaaataccacactgaagatacgttt---ttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatca 22132850  T
Q  499 aatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaat 598  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||    
T  22132851 aatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaat 22132950  T
Q  599 attcttcttccatcaaattttgagtcatactacaaaattctcaaccttgactccaaattagtga 662  Q
    ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22132951 attctccatccatcaaattttgaatcatactacaacattctccaccttgactccaaatttgtga 22133014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 24348570 - 24347961
Alignment:
Q  26 gagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348570 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 24348471  T
Q  126 caaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 224  Q
    |||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348470 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 24348371  T
Q  225 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgttt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||   |||||    ||||||||||||||||||    
T  24348370 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaa-ccttagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 24348272  T
Q  319 cagccccctctatctctctcgcaaagttt-gctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaag 416  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  24348271 cagccccctctatctctct--caaagtttagct-tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacattgaag 24348175  T
Q  417 atacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgat 516  Q
    |||| |||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  24348174 atactttt--tttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacaat 24348077  T
Q  517 acaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaat 616  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24348076 acaaaaatatatttattgtccataaatatattttc-gcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaat 24347978  T
Q  617 tttgagtcatactacaa 633  Q
    |||||||||||||||||    
T  24347977 tttgagtcatactacaa 24347961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 633
Target Start/End: Original strand, 44599820 - 44600426
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 126  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  44599820 agaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac 44599919  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtt 225  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44599920 aaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 44600019  T
Q  226 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc-tttctaaacccttgtttc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     | |||||| ||||||||||||||||||    
T  44600020 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttc 44600118  T
Q  320 agccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagat 418  Q
    ||||||||||||||      ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  44600119 agccccctctatct------caaagtttgctttaatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttgaaacaaataccacactgaagat 44600212  T
Q  419 acgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatac 518  Q
     |||||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44600213 tcgttt-tttttttcctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcccttttaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatac 44600311  T
Q  519 aaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  44600312 aaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaatttt 44600411  T
Q  619 tgagtcatactacaa 633  Q
    |||||||||||||||    
T  44600412 tgagtcatactacaa 44600426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 633
Target Start/End: Original strand, 17662230 - 17662824
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662230 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 17662329  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662330 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 17662429  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagctgttg-ctttctaaacccttgtttcagccccct 327  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||          | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17662430 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaacccta-------gttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccct 17662522  T
Q  328 ctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtttcn 426  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||      
T  17662523 ctatctctct--caaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatactttt-- 17662618  T
Q  427 nnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatat 526  Q
           |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  17662619 -ttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcgtacggtacaaaaatat 17662717  T
Q  527 atttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcat 626  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||    
T  17662718 atttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttaaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttgtagtcat 17662817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 633
Target Start/End: Original strand, 22134582 - 22135217
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22134582 gagaagaacacaaagaagagaagaagacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccaatccacta 22134680  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||| ||||||||||||    
T  22134681 tatgatgagtaccgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaatgtcccagccttttcccataaccaagagac 22134780  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||    
T  22134781 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-tgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcct 22134878  T
Q  303 ttctaaacccttgtttcagcccc---------ctctatctctctcgcaaagttt-gctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataa 391  Q
    |||||||||||||||||||||||         |||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22134879 ttctaaacccttgtttcagcccctctatctctctctctctctctctcaaagtttagct-tgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataa 22134977  T
Q  392 atttggaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatt 491  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134978 atttggaacaaataccacactgaagatacgttt--tttttttctccttcagtgaaagaatatttgaatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatt 22135075  T
Q  492 tgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttag 591  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||    
T  22135076 tgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttag 22135175  T
Q  592 caacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22135176 caacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 22135217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 659
Target Start/End: Original strand, 14787406 - 14788045
Alignment:
Q  20 aaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagag--cagccctccgatccactatatgatgag 117  Q
    ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| | ||||||||||||||    
T  14787406 aaagaagagaagaacacaaga--atttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactatatgatgag 14787503  T
Q  118 taacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcct 216  Q
    |||||||||||| | ||  |||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14787504 taacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccacctaattctatccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcct 14787603  T
Q  217 aatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||   |||||    | ||||||||    
T  14787604 aatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgttccaaaaagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgccattctaaac 14787702  T
Q  311 ccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcac 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14787703 ccttgtttcagccccctctatctct----caaagtttagtatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccac 14787798  T
Q  410 actgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttc 509  Q
    |||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  14787799 actgaagatacgttt---ttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttt 14787895  T
Q  510 atacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttcc 609  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||       ||||||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  14787896 atacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcaccacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacattattctccatcc 14787995  T
Q  610 atcaaattttgagtcatactacaaaattctcaaccttgactccaaattag 659  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  14787996 atcaaattttgagtcatactacaacattctccaccttgactctaaattag 14788045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 49 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 56030770 - 56030191
Alignment:
Q  49 tgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaagtgaaat--caacgggtta 146  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||   |||||||| ||||||||||||  |||||  ||| | ||||    
T  56030770 tgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttca---tatgatgaataacgttacaaaa-gaaatgtcaatgagtta 56030675  T
Q  147 caagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccac 246  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  56030674 caagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctc 56030575  T
Q  247 aaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagct-----gttg-ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgc 340  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |     |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||          
T  56030574 aaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaa-ctctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccttctatctc------ 56030482  T
Q  341 aaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctcctt 439  Q
    || |||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||         ||||||    
T  56030481 aaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaaatataactcataaatttggaaagaataccacaccgaagatactttt---ttttttctcctt 56030385  T
Q  440 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 539  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  56030384 cagtgaaagaatatttgcaccaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccat 56030285  T
Q  540 aaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  56030284 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 56030191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 8631383 - 8631757
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8631383 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 8631482  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8631483 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaga 8631582  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |    
T  8631583 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcc 8631681  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8631682 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctct--caaagtttgctttgatacaaagtctatatttatagtgaaa 8631757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 38409573 - 38409202
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38409573 gagaagaacaaaaagaagagaagaactcaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccacta 38409474  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  38409473 tatgatgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 38409374  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ct 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||    
T  38409373 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcct 38409275  T
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38409274 ttttaaaccattgtttcagccccctctatctccctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 38409202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 424
Target Start/End: Original strand, 18709127 - 18709551
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatga-gaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccact 107  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  18709127 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccaatccact 18709226  T
Q  108 atatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18709227 atatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcgcaatctcttcccgtaaccaagaga 18709326  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |    
T  18709327 ctcaaccctaatagtgtttcccaaggtgaatcaactcacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcc 18709425  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctcta--tctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttgga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||   || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18709426 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctctcaaagtttagcctaatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttgga 18709525  T
Q  399 acgaatatcacactgaagatacgttt 424  Q
    || |||| ||||||||||||||||||    
T  18709526 acaaataccacactgaagatacgttt 18709551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 11435323 - 11434958
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11435323 gagaagaacacaaggaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccacta 11435224  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||    
T  11435223 tatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagactcttccggtaaccaggagac 11435124  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ct 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||    
T  11435123 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcct 11435025  T
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435024 ttctaaacccttgtttcagccccctctatct------ccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 11434958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 22044355 - 22044720
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22044355 gagaagaacaaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccacta 22044454  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22044455 tatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 22044554  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ct 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||    
T  22044555 tcaatcctaatagtgtttcccaaggggaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcct 22044653  T
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||      | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22044654 ttctaaacccttgtttcagccccctctatct------ccaagtttgctctgatacaaggcctatatttatagt 22044720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 22046650 - 22047015
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22046650 gagaagaacaaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccacta 22046749  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22046750 tatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 22046849  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||    
T  22046850 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaaaagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcct 22046948  T
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||      | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22046949 ttctaaacccttgtttcagccccctctatct------ccaagtttgctccgatacaaggcctatatttatagt 22047015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 30 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 19323043 - 19322547
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttaca 127  Q
    ||||||| |||| ||||||| | | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  19323043 agaacactaaagaatttgtttatccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcatccctccgttccactataatgatgagtaactttaca 19322944  T
Q  128 aa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    || | || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19322943 aaagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 19322844  T
Q  227 cccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag-----ctgttgctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||      |||||  ||||||||||||||||||     
T  19322843 cccaaggtgaatcaacc--caaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaa-ccctagttttcttgttgacttctaaacccttgtttcat 19322748  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaatataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacg 421  Q
    ||||||||||||      ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  19322747 ccccctctatct------caaggtttactctgatacaagatctatatttatagatgaatataactcataaatttggaatgaatatcacattgaagataca 19322654  T
Q  422 tttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaa 521  Q
    ||||        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  19322653 tttcttttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtcctttatacagtacaaa 19322554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 11008532 - 11008900
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  11008532 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 11008631  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    ||||||||||| | |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  11008632 tatgatgagtaccattacaaa--gaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 11008729  T
Q  209 t-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |    
T  11008730 tccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcc 11008828  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | || |||||||||||||||||||||||||    
T  11008829 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctctcaaa-atagc-ctgatacaaggtctatatttatagt 11008900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 37089336 - 37089704
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  37089336 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccacta 37089435  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  37089436 tatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaatcaagagac 37089535  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |     
T  37089536 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcca 37089634  T
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  37089635 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc---aagtttagcctgatacaaggtctatatttatagt 37089704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Original strand, 11006218 - 11006571
Alignment:
Q  26 gagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  11006218 gagaagaacacaaaagaatttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaccatta 11006317  T
Q  126 caaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgt 224  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11006318 caaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgt 11006417  T
Q  225 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgttt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||    
T  11006418 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 11006516  T
Q  319 cagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  11006517 cagccccctctatctctctctcaaa--atagtctgatacaaggtctatatttatagt 11006571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 51015614 - 51015249
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  51015614 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagacctccgatccacta 51015515  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  51015514 tatgatgagtattgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 51015415  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ct 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||    ||    
T  51015414 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaacactatacaaa-ccctagttttgttgttgcct 51015316  T
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||      | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51015315 ttctaaacccttgtttcagccccctctatct------ccaagtttgctctgatacaaagtctatatttatagt 51015249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 2484837 - 2485207
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2484837 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaggaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 2484936  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2484937 tatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctatctctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 2485036  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ct 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||    
T  2485037 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccagaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcct 2485135  T
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    |||||||||||||||| ||||||||     |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2485136 ttctaaacccttgttttagccccct-----tctagctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 2485207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18847521 - 18847156
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18847521 gagaagaacacaaagaacagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccaatccacta 18847423  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18847422 tatgatgagtaccgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 18847323  T
Q  209 t-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |    
T  18847322 tccaatgctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaactctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcc 18847224  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||      ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18847223 tttctaaacccttgtttcaaccccctctatct------caaagtttgttttgatacaaggtctatatttatagt 18847156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 25 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9148605 - 9148254
Alignment:
Q  25 tgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtt 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9148605 tgagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgtt 9148506  T
Q  125 acaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 224  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148505 acaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 9148406  T
Q  225 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcc----ctagctgttg-ctttctaaacccttgtttc 319  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     | | ||||| ||||||||||||||| |||    
T  9148405 ttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgcttc 9148306  T
Q  320 agccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9148305 agccccctctatctct----caaagtttgctctgatacaaggcctatatttatagt 9148254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 30 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 40637422 - 40637073
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637422 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 40637323  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40637322 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttcc 40637223  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||||||    
T  40637222 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 40637124  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    |||||||||||      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637123 cccctctatct------ccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 40637073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 7941692 - 7941322
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  7941692 gagaagaacacaaagaagaaaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 7941593  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  7941592 tatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagaga 7941493  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtg--tttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg--- 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||       
T  7941492 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgcatttgctcgtaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttg 7941394  T
Q  301 -ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7941393 cctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctcccg----gtttgctctgatacaacgtctatatttatagt 7941322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 31849563 - 31849929
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31849563 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 31849662  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||    
T  31849663 tatgatgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaagcaagagac 31849762  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccac-aaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |    
T  31849763 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaaccttagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcc 31849861  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  31849862 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctc-ct-----agtttgctctgatacaagacctatatttctagt 31849929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 5198772 - 5198423
Alignment:
Q  26 gagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  5198772 gagaagaacacaaaagaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgtta 5198673  T
Q  126 caaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 224  Q
    |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5198672 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacacaaagccccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgt 5198573  T
Q  225 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcc----ctagctgttg-ctttctaaacccttgtttc 319  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     | | ||||| |||||||||||||||||||    
T  5198572 ttcccaaagtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 5198473  T
Q  320 agccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5198472 agccccctctatct------caaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 5198423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 14633687 - 14633319
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||    
T  14633687 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgtttcacta 14633588  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14633587 tatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcc-gtaaccaagaga 14633489  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||   |||||    |    
T  14633488 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ctctagttttgttgttgcc 14633390  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14633389 tttctaaacctttgtttcag-cccttctatct------caaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 14633319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 6765213 - 6764838
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  6765213 gagaagaacaccaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 6765114  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  6765113 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagaga 6765014  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcc-----gaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||      ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    
T  6765013 ctcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaactaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttg 6764915  T
Q  301 ----ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
        ||||||||||||||||||||||||| |||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6764914 ttgcctttctaaacccttgtttcagccccttctatct------caaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 6764838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 32 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24889142 - 24888799
Alignment:
Q  32 aacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-g 130  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  24889142 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgataagtaacgttacaaaag 24889043  T
Q  131 tgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 230  Q
     || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24889042 agatatcaatgggttacatgaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 24888943  T
Q  231 aggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccc 324  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||   |||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  24888942 aggtgaatcaaccctcaaagcctagtgtttgttccaaagagacaaactctatac-aatccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 24888844  T
Q  325 cctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24888843 cctctatctct------aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 24888799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 9174110 - 9174476
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  9174110 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggcagagaacagccctccaatccacta 9174209  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9174210 tatgatgagtaccgttacaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagac 9174309  T
Q  209 -tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc- 301  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||     | ||||||     
T  9174310 ttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaactcacgaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgct 9174408  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||      | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9174409 tttctaaacccttgtttcagccccctctatct------ccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 9174476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 9176438 - 9176804
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  9176438 gagaagaacacaaagaagagaataacacaaagaaatttgttgactctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 9176537  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9176538 tatgatgagtaccgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagac 9176637  T
Q  209 t-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc- 301  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||     | ||||||     
T  9176638 tccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgcttgctcctaagagacaaactttatacaaa-ccctagttttgttgttgct 9176736  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||      | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9176737 tttctaaacccttgtttcagccccctctatct------ccaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 9176804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 15 - 287
Target Start/End: Original strand, 26085947 - 26086219
Alignment:
Q  15 aacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgat 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26085947 aacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccttccgatccactatatgat 26086046  T
Q  115 gagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatc 214  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26086047 gagtatcgttacaaagagaaaacaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatc 26086146  T
Q  215 ctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26086147 ctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa 26086219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 55 - 460
Target Start/End: Original strand, 47210762 - 47211160
Alignment:
Q  55 agttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaat 153  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  47210762 agttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaat 47210861  T
Q  154 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||    
T  47210862 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa------------cacaaaccct 47210949  T
Q  254 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagttt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  47210950 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctccctctcaaagttt 47211048  T
Q  348 gctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaa 446  Q
       ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||         |||||||||||||    
T  47211049 agcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacactgaagatacgttt--tttttttctccttcagtgaa 47211146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 20 - 375
Target Start/End: Original strand, 16934118 - 16934473
Alignment:
Q  20 aaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagta 119  Q
    ||||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  16934118 aaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtt 16934217  T
Q  120 acgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaa 218  Q
     |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16934218 tcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaa 16934317  T
Q  219 tagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc-tttctaaaccc 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||     | |||||| |||||||||||    
T  16934318 tagtgtttctcaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcttttctaaaccc 16934416  T
Q  313 ttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||| ||||||||||||||||      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16934417 ttgtatcagccccctctatct------caaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 16934473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 53405497 - 53405001
Alignment:
Q  14 gaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatga 113  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  53405497 gaacacaaagaagagaagaacaaaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggg--gagagcagctctctgttccactatatga 53405400  T
Q  114 tgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataag------tctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagag 206  Q
    |||||| |||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||      |||||||| |||||||||| |||||| ||  ||||| |||||||||||||    
T  53405399 tgagtatcgtttcaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagaataagtctcccgcttaattctacctaaagtctcagcctctttccgtaaccaagag 53405300  T
Q  207 actcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg---- 300  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||        
T  53405299 actcaatcttaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaacctagt-tttgttctaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgc 53405202  T
Q  301 ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  53405201 ctttctaaacccttgtttcag-cccctctatctctct--caaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaa 53405105  T
Q  400 cgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaa 499  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||         |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  53405104 caaataccacactgaaaatacgttt-ttttttttctcctttagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatttttcctttcaaaatatatttgcatcaa 53405006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Original strand, 22780336 - 22780672
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatga-gaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccact 107  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22780336 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccact 22780435  T
Q  108 atatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780436 atatgatgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 22780535  T
Q  208 ct-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc 301  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||     | ||||||    
T  22780536 ctccaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgc 22780634  T
Q  302 -tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc 338  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22780635 ttttctaaacccctgtttcagccccctctatctctctc 22780672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Original strand, 22782701 - 22783037
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatga-gaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccact 107  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22782701 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgatccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccact 22782800  T
Q  108 atatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782801 atatgatgagtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 22782900  T
Q  208 ct-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc 301  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||     | ||||||    
T  22782901 ctccaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgc 22782999  T
Q  302 -tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc 338  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22783000 ttttctaaacccctgtttcagccccctctatctctctc 22783037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 22802719 - 22803064
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22802719 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagaaaccctccgttccactatatgatgagtaacattacaaa 22802818  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802819 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 22802918  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    | ||||||||||||||||||||    
T  22802919 caaggtgaatcaaccctcaaaccctaatgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagc 22803017  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22803018 cccctctatct------caaagtttactctgatacaaggtctatatttatagt 22803064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 47868772 - 47868400
Alignment:
Q  7 gtgagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccac 106  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  47868772 gtgagaagaacacaaagaagagaataacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgttccac 47868673  T
Q  107 tatatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaaga 205  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  47868672 tatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaaga 47868573  T
Q  206 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg--- 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||   |||||       
T  47868572 gactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaggagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttg 47868474  T
Q  301 -ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
     |||||||||||||| ||||||||| ||||||||      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47868473 cctttctaaacccttctttcagccctctctatct------ccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 47868400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 22800847 - 22801192
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22800847 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 22800946  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22800947 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgttttc 22801046  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||   |||||    | ||||||||||||||||||||    
T  22801047 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ctctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagc 22801145  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22801146 cccctctatct------caaagtttactctgatacaaggtctatatttatagt 22801192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 20 - 375
Target Start/End: Original strand, 16931764 - 16932119
Alignment:
Q  20 aaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagta 119  Q
    ||||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  16931764 aaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtt 16931863  T
Q  120 acgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaa 218  Q
     |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16931864 tcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaa 16931963  T
Q  219 tagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc-tttctaaaccc 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||     | |||||| |||||||||||    
T  16931964 tagtgtttctcaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacagactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcttttctaaaccc 16932062  T
Q  313 ttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||| ||||||||||||||||      ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16932063 ttgtatcagccccctctatct------caaagtttgctttgatacaaggtttatatttatagt 16932119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 32 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 48486665 - 48486322
Alignment:
Q  32 aacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-g 130  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  48486665 aacacaaaataatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaag 48486566  T
Q  131 tgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 230  Q
     ||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48486565 agatttcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 48486466  T
Q  231 aggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccc 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||   |||||    | ||||||||||||||||||||||    
T  48486465 aggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagataaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccc 48486367  T
Q  325 cctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48486366 cctctatct------caaagtttactctgatacaaggtctatatttatagt 48486322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 241 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 5101133 - 5100719
Alignment:
Q  241 acccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagct-----gttg-ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 334  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |     |||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  5101133 accctcaaaccctagtgtttgttccaaagtgacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgtcattctaaacctttgtttcagtcccctctatctc 5101035  T
Q  335 tctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnn 433  Q
          || |||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||             
T  5101034 ------aaggtttaccctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccagattgaagatacgttt----ttttt 5100945  T
Q  434 ctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttatt 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  5100944 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttgtt 5100845  T
Q  534 gtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||        |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  5100844 gtccataaatatattttcagcacaaaatatatttaaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 5100745  T
Q  634 aattctcaaccttgactccaaattag 659  Q
     |||||| |||||||||| |||||||    
T  5100744 cattctccaccttgactctaaattag 5100719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24879338 - 24878992
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtt-acaa 128  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| ||||    
T  24879338 agaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgtgtatcgtttacaa 24879239  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879238 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 24879139  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||| |||||||    
T  24879138 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctggtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgtctttctaaaccctagtttcag 24879040  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||      | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24879039 ccccctctatct------ccaagtttactcggatacaaggtctatatttatagt 24878992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 30 - 372
Target Start/End: Original strand, 36921478 - 36921822
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36921478 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttaactagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 36921577  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36921578 agagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 36921677  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||   |||||    |||||||| |||||||||||     
T  36921678 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactatatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaagcccttgtttca- 36921775  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttat 372  Q
    ||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36921776 ccccctctatctct----caaagtttactctgatacaaggtctatatttat 36921822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 40091400 - 40091745
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||    
T  40091400 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacattacaaa 40091499  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40091500 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcc 40091599  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||   |||||    ||||||||||||||||||||||    
T  40091600 caaggtgaatcaaccctcaaaccatagtgtttgttccaaagagacaaactctaaac-aatccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagc 40091698  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||      |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  40091699 cccctctatct------caaagtttactttgatacaaggtctatatttatagt 40091745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 47275077 - 47274730
Alignment:
Q  26 gagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  47275077 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacttta 47274979  T
Q  126 caaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 224  Q
    |||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47274978 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 47274879  T
Q  225 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgttt 318  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||    
T  47274878 ttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgttagttccaaagagacaaact-tatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 47274781  T
Q  319 cagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||      ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  47274780 cagccccctctatct------caaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 47274730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24880800 - 24880454
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtt-acaa 128  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||    
T  24880800 agaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgcgtaacgtttacaa 24880701  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880700 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 24880601  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||| ||||  |    
T  24880600 ccaaggtgaaccaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaaccctagtttacg 24880502  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||      | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24880501 ccccctctatct------ccaagtttactccgatacaaggtctatatttatagt 24880454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Original strand, 38928162 - 38928473
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  38928162 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttttactatatgatgagtaacgttacaaa 38928261  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | ||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38928262 agagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatcttttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 38928361  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||| ||||||||||    
T  38928362 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcag 38928460  T
Q  322 ccccctctatctc 334  Q
    |||||||||||||    
T  38928461 ccccctctatctc 38928473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 36919569 - 36919917
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36919569 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccatctattccactatatgatgaataacgttacaaa 36919668  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36919669 agagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 36919768  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||||    
T  36919769 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactttatccaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 36919867  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||| ||||| |    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36919868 ccccctatatctat----caaagtttactctgatacaaggtctatatttatagt 36919917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Original strand, 33415473 - 33415782
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  33415473 agaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagcctgagggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaa 33415572  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  33415573 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcgatcttaatagtgtttcc 33415672  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||||||    
T  33415673 caaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgttcc-aagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcagc 33415770  T
Q  323 cccctctatctc 334  Q
    ||||||||||||    
T  33415771 cccctctatctc 33415782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 19096231 - 19095885
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19096231 agaacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactatatgataagtaacgttacaaa 19096132  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19096131 agagatatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagctctaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttca 19096032  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttg-ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||     | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  19096031 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaa-ccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgtttcag 19095933  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||      ||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  19095932 ccccctctatct------caaggtttacactgatacaatgtctatatttatagt 19095885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 104 - 375
Target Start/End: Original strand, 5637524 - 5637799
Alignment:
Q  104 cactatatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaacca 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5637524 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaacca 5637623  T
Q  203 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    
T  5637624 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttg 5637722  T
Q  301 ----ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5637723 ttgcctttctaaactcttgtttcagccccctctatctctct--caaagtttgctcttatacaaggtctatatttatagt 5637799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Original strand, 12395830 - 12396140
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  12395830 agaacacaaaagagtttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 12395929  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12395930 agagatatcaatgggttacaacaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 12396029  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||| ||||||||||||    
T  12396030 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttggctagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagc 12396128  T
Q  323 cccctctatctc 334  Q
    ||| ||||||||    
T  12396129 cccatctatctc 12396140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Original strand, 12400792 - 12401102
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  12400792 agaacacaaaagagtttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa 12400891  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12400892 agagatatcaatgggttacaacaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcc 12400991  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||| ||||||||||||    
T  12400992 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttggccagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagc 12401090  T
Q  323 cccctctatctc 334  Q
    ||| ||||||||    
T  12401091 cccatctatctc 12401102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 36378641 - 36378295
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  36378641 agaacacaaaataatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaacttcacaa 36378542  T
Q  129 -agtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
     || || ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  36378541 gagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaagagacttaatcctaatagtgtttt 36378442  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||||    
T  36378441 ccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 36378343  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||| |||||||      ||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  36378342 ccccgtctatct------caaggtttattctgatacaaagtctatatttatagt 36378295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 619433 - 619777
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  619433 agaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagttagggg-agagagcagtcatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 619531  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  619532 agagatatcaatgggttataagaataattttcccgcctaattctacccaaagacccaatctcttcccttaaccaagacagtcaatcctaatagtgtttcc 619631  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||   |||||    |||| |||||||||||||||||    
T  619632 caaggtaaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatgcaaa-ccctagttttgttgttgtctttataaacccttgtttcagc 619730  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  619731 cccctctatct------caaagtttactctgatacaaggtctatatttatagt 619777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 30 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16453658 - 16453313
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| |||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || | | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16453658 agaacacaaaagaattttttggcgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccatctgtttcactataatgatgagtaaccttacaa 16453559  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16453558 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaatactacccaaagtcccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 16453459  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| | ||||   |||||    |||| ||||||||||||||||    
T  16453458 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttgtacaaa-ctctagttttgttgttgcctttttaaacccttgtttcag 16453360  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatag 374  Q
    |||||||||||||||       |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  16453359 ccccctctatctctc------ggtttgctctgatacaaagcctatatttatag 16453313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Original strand, 37313050 - 37313361
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | | || ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  37313050 agaaaacaaaagaatttgttgatccaatttggtccaaattgacatagtctgggggaaagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaa 37313149  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37313150 aagagatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 37313249  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttg-ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
     |||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||     | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  37313250 tcaaggtgaatcaactctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatgcaaa-ccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 37313348  T
Q  322 ccccctctatctc 334  Q
    |||||||||||||    
T  37313349 ccccctctatctc 37313361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 65 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13544272 - 13543957
Alignment:
Q  65 aaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg 163  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13544272 aaattgacctagtctgggaaagagagcagtactccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccg 13544173  T
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  13544172 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaa-cctagtgtttgtt 13544074  T
Q  264 -ccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgc-tctgat 355  Q
     || ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||    
T  13544073 gccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgtcattctagatccttgtttcagccccctctatctctct--caaagtttacatctgat 13543977  T
Q  356 acaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  13543976 acaagatctatatttatagt 13543957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 102 - 375
Target Start/End: Original strand, 3824627 - 3824903
Alignment:
Q  102 tccactatatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3824627 tccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaac 3824726  T
Q  201 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gc 295  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||     |     
T  3824727 caatagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttagttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgt 3824825  T
Q  296 tgttgc-tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaag-tttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||   | |||||||||||||||||||||||||||    
T  3824826 tgttgcttttctaaacc--tgtttcagccccctctatctctct--caaagaaatactctgatacaaggtctatatttatagt 3824903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 36380698 - 36380439
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  36380698 agaacacaaaagaatttgtttacccagttcgctccaaattgacctagtctgggggagagagcagcactcagttccactataatgatgagtaactttacaa 36380599  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | |  | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36380598 aagatatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttccggtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttc 36380499  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || || || | |||||||||||||||||||||    
T  36380498 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctaatggtttttgccaagagacaaactctatacaaa 36380439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 43 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16455577 - 16455354
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaac 140  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| | ||||||| ||| ||||||| ||||||| | || |||||     
T  16455577 atttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgtttcactataatgacgagtaaccttacaaaagagatatcaat 16455478  T
Q  141 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 240  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16455477 gagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 16455378  T
Q  241 acccacaaaccctagtgtttgttc 264  Q
    |||  |||||||||||||||||||    
T  16455377 accatcaaaccctagtgtttgttc 16455354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 352 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 30136596 - 30136331
Alignment:
Q  352 tgatacaaggtctatatttatagtgaaatataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaat 451  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||         |||||||| |||||||||    
T  30136596 tgatactaggtatatatttatagagaaatataactaataaatttagaacgaatatcacactgaagatacgttt--tttttttctccttcaatgaaagaat 30136499  T
Q  452 atttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttc 551  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30136498 atttgaatcaaaaatataatattctcttttaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacagtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttc 30136399  T
Q  552 agcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaatttt 619  Q
    ||||||| |||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  30136398 agcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccattcatcaaatttt 30136331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 55 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41997815 - 41997495
Alignment:
Q  55 agttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaa 152  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||| | || || || ||||||||||||    
T  41997815 agttcggtccaaattaacctagtctgggg-agagagcggccctccgtttcactatgatgatgagtaactttacaaaagagatattaaagggttacaagaa 41997717  T
Q  153 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 252  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  41997716 taagtctcccacctaattctacccaaaatctcaatcttttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccc 41997617  T
Q  253 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtt 346  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||   |||||    |||||| ||| |||||||||||||||| |||||      ||| |||    
T  41997616 tagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaa-ctctagttttgttgtttcctttctgaacacttgtttcagccccctttatct------caaggtt 41997524  T
Q  347 tgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  41997523 tactctgatacaaagtctatatttatagt 41997495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Original strand, 5635440 - 5635614
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5635440 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 5635539  T
Q  109 tatgatgagtaacgttac-aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 182  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5635540 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 5635614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 11437731 - 11437557
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11437731 gagaagaacacaaggaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccacta 11437632  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcc 183  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11437631 tatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcc 11437557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 43 - 375
Target Start/End: Original strand, 18537471 - 18537801
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaa 139  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||  ||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || |||||    
T  18537471 atttgtttacccagttcggtcaaaaaatgacctattatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 18537570  T
Q  140 cgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 239  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18537571 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatc 18537670  T
Q  240 aacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta----gctgttgctttctaaacccttg-tttcagccccctctatctc 334  Q
    ||||  | |||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||    | ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  18537671 aacc--ccaaccctagtggttgttgccaagag-caaactctatacaaa-ccctagtttgttgtttgtttctaaacccttgttttcagccccctctatct- 18537765  T
Q  335 tctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
         ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18537766 -----caatgtttactctgatacaagatctatatttatagt 18537801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 55 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 10113194 - 10112628
Alignment:
Q  55 agttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacg-ggttacaaga 151  Q
    |||||||||||| | | ||||||||| ||| |||||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||| |||||||| || |||||   ||||||||||    
T  10113194 agttcggtccaatactaacctagtcttggggagagagcagctctccattccactataatgattagtaacattacaaagagatatcaaaaaggttacaaga 10113095  T
Q  152 ataagtctcccgc-ctaattctacccaaagtcccaatctcttccc-gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaa 249  Q
    || ||||| |    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |    ||    
T  10113094 attagtcttcaaatctaattctacccaaagtcctaatctcttccccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcctaaggtgaatcaatctc--aa 10112997  T
Q  250 ccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagct-----gttgctttctaaacccttgttt-cagccccctctatctctctcgcaaa 343  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||  |||| |||||| |     ||||  |||||||||||||||| || | ||||||    ||||||  |     
T  10112996 ccctagtgtttgttgccaagag-caaactcta--caaa-ccctagtttttgtgttggcttctaaacccttgttttcaactccctct----ctctcg--ag 10112907  T
Q  344 gtttgc-tctgatacaaggtctatatttatagtgaaa--tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttc 440  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||||   |||  |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||         ||||||     
T  10112906 gtttacatctgatacaatgtctatatttataaaaaaaaatataactcataaatttggaacggatttcacgctgaagatacattt--tttttttctccttt 10112809  T
Q  441 agtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccata 540  Q
    ||||||| ||||||||||| |||       ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10112808 agtgaaataatatttgcatcaaa-------tattctctttcaaa-tatatttacatcaaatcttccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccata 10112717  T
Q  541 aatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||    
T  10112716 aatatagtttcagcacaaaatatatttgaaac----cttttatatttttagcaacaatattcttcattcaacaaattttaagtcatactacaa 10112628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13547502 - 13547302
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||    
T  13547502 agaacacaaaaaaatttattgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccatttcactatatgatgagtaactttacaaa 13547403  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     |  | ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13547402 agatatatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 13547303  T
Q  229 c 229  Q
    |    
T  13547302 c 13547302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27499390 - 27499135
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || | || |||| ||||||||||| ||||||    
T  27499390 agaacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggggaa-agagcagcccttcgtttcaatataatgatgagtaaccttacaa 27499292  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || || |   |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27499291 aagagatatta---ggttacaaaaataagtctcccgcctaattatacccaaagcctcaatctcttatcgtaaccaatagactcaatcctaatagtgtttc 27499195  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
     || | ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  27499194 tcaggatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaa 27499135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2891640 - 2891433
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  2891640 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaagttgtactagtctgggggagagagcagtcatctgtttcactataatgatgagtaaccttacaa 2891541  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2891540 aagagatatcaatgggttacaagaacaagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 2891441  T
Q  228 ccaaggtg 235  Q
    ||||||||    
T  2891440 ccaaggtg 2891433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 4215654 - 4215483
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4215654 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 4215555  T
Q  129 agtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaac 200  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  4215554 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcacaacctcttcccgtaac 4215483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 43 - 323
Target Start/End: Original strand, 18409345 - 18409631
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaac 140  Q
    ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| | | ||||||| ||||| ||||| ||||||| | || |||||     
T  18409345 atttgtttacccagttcaatccaaattgacctagtctgagggagagagcaactctctgtttcactataatgatgggtaac-ttacaaaagagatatcaat 18409443  T
Q  141 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 240  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  18409444 gggttacaagaataaatctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcctataactaagagactcaatcctaatagtgttcccgaaggttaatca 18409543  T
Q  241 acccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagcc 323  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||||||    
T  18409544 accctcaaaccctagtgtttgttgccaagtgacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcc 18409631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 43 - 287
Target Start/End: Original strand, 18534829 - 18535073
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaa 139  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||   ||||||| | || |||||    
T  18534829 atttgtttaccctgttcggtccaaaacttacctagtctgggggggagagcacccctccgttccactataattatgagtagttttacaaaagagatatcaa 18534928  T
Q  140 cgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 239  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18534929 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatc 18535028  T
Q  240 aacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    ||||  | |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  18535029 aacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaa 18535073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 43 - 287
Target Start/End: Original strand, 38890222 - 38890466
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaa 139  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || |||||    
T  38890222 atttgtttacccagttcggtccaaaactgacctaatcttggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 38890321  T
Q  140 cgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 239  Q
     ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  38890322 tgggttacaagaataagtctcccttctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaatatgaatc 38890421  T
Q  240 aacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    ||||  | ||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  38890422 aacc--ccaaccctaatgtttgttgccaagag-caaactctatacaaa 38890466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 149 - 334
Target Start/End: Original strand, 3937314 - 3937504
Alignment:
Q  149 agaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaa 248  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3937314 agaataagtctcccacctaattctacccaaagcctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaattccaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaa 3937413  T
Q  249 accctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag-----ctgttg-ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 334  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||      ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3937414 accctagtgtttgttcccaagaaacaaactctatacaaa-ctctagtttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagctccctctatctc 3937504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 70 - 375
Target Start/End: Original strand, 8756276 - 8756580
Alignment:
Q  70 gacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgccta 167  Q
    |||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| | || ||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  8756276 gacctagtctggaggagagagcaaccatccgttccactataatgattagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgtcta 8756375  T
Q  168 attctacccaaagtcccaatctcttcccgtaacc-aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccg 266  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |     
T  8756376 attctactcaaagtctcaatctcttcccgtgaccaaagagactcaatcctagtagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgcc 8756473  T
Q  267 aagagacaaactctatacaaagcc----ctagctgttgctttctaaacccttg-tttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaagg 361  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||     |   |||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||      ||| |||| |||||||||||||    
T  8756474 aagag-caaactctatacaaatcctaattttcttgttgacttctaaacccttgttttcagccccttctatct------caaggtttactctgatacaagg 8756566  T
Q  362 tctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||    
T  8756567 tctatatttatagt 8756580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12102424 - 12102221
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaa 139  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||     
T  12102424 atttgtttacctagttcggtccaaaactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcag 12102325  T
Q  140 cgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 238  Q
     |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12102324 tgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagttccaatcttttcccatgaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 12102225  T
Q  239 caac 242  Q
    ||||    
T  12102224 caac 12102221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 485 - 633
Target Start/End: Original strand, 47211158 - 47211306
Alignment:
Q  485 atatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttata 584  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||       |||||||||    
T  47211158 atatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttgagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttata 47211257  T
Q  585 tttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  47211258 tttttagcaacaatattctccatccatcaaattttaagtcatactacaa 47211306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 159 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 6133090 - 6132963
Alignment:
Q  159 tcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6133090 tcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccagggtgactcaaccctcaaaccctagtgt 6132991  T
Q  259 ttgttccgaagagacaaactctatacaa 286  Q
    ||||| | || |||||||||||||||||    
T  6132990 ttgttgccaatagacaaactctatacaa 6132963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 394 - 633
Target Start/End: Original strand, 38890478 - 38890699
Alignment:
Q  394 ttggaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatatt-ccctttcaaaatatattt 492  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||        |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38890478 ttggaacgaatatcacattgaagatacatttcttttttt-ctcctttagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatatttccctttcaaaatatattt 38890576  T
Q  493 gcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagc 592  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||                |||||||||||||||||    
T  38890577 gcatcaaatcgtccttcatacaatacaaaaatatatttattgtccataaatatatttgaa--acaaa----------------tcttttatatttttagc 38890658  T
Q  593 aacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  38890659 aacaatattctccatccatcaaattttgagtcatgctacaa 38890699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 135 - 379
Target Start/End: Original strand, 52942550 - 52942781
Alignment:
Q  135 atcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942550 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa-------------cccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 52942636  T
Q  235 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccccctc 328  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52942637 gaatcaatcctcaaaccctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cccctc 52942734  T
Q  329 tatctctctcgcaaagtttgctctg--atacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    |||||      ||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  52942735 tatct------caaagtttagtctgatatacaaggtctatatttatagtgaaa 52942781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 9022605 - 9022062
Alignment:
Q  79 tggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgg--gttacaagaataagtctcccg-cctaattctac 174  Q
    ||||| |||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||  |  ||||||||||| ||||| |   |||||||| ||    
T  9022605 tgggggagagagcagccctttgttccactataatgatgagtaactttacaaagagatatcaatagaggttacaagaattagtcttcaaacctaattcaac 9022506  T
Q  175 ccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagac 273  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| | || ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||   |||| ||||||||||| | ||||||     
T  9022505 ccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagaaattctatcctaatactgtttctccaaggtgaatcaatccc--aaccatagtgtttgttgccaagaga- 9022409  T
Q  274 aaactctatacaaagccctagct-----gttgctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatat 368  Q
      | ||| |||||| |||||| |     ||||  ||||||||||||||||     | ||||| | |||||    |  ||  ||||||||||||| |||||    
T  9022408 --attctctacaaa-ccctagttttgatgttgacttctaaacccttgttttctgactctcta-cactctc----atcttcatctgatacaaggtttatat 9022317  T
Q  369 ttatagtgaaatataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatat 468  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||  ||||||||| |||          ||||| ||||||||||||||||||| |||         
T  9022316 ttatagagaaatataacacataaatttggaatggatatcacgttgaagatacatttttttttat--tcctttagtgaaagaatatttgcatcaaa----- 9022224  T
Q  469 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttg 568  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9022223 --tattcccttttaaaatatatttgcatcaaatctttcttcatacggtagaaaaatatatttattgt-cataaatatattttcagcaaaaaatatatttg 9022127  T
Q  569 nnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
           || |||||||||| | ||||||||||  || ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  9022126 aaacaaatcatttatattttcaacaacaatatttctcatccataaaattttgaatcatactacaa 9022062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 30136898 - 30136642
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||| | | | ||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||| || | | ||||||| |||||| |||| ||||||    
T  30136898 agaacacaaaagaatttgtttatccaattcggtccaaattgacctagtattgaggagagagcagccatctgtttcactataatgatgattaactttacaa 30136799  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||| | | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||| ||||| || |||||||||    
T  30136798 aagagatatcgatgagtcacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcacaatttcttctcgtgaccaagagacccaatcatagtagtgtttc 30136699  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||    
T  30136698 ccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-taaactctatacaaa 30136642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 43 - 226
Target Start/End: Original strand, 16185832 - 16186018
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaac 140  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||||     
T  16185832 atttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaagatatatcaaa 16185931  T
Q  141 gggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16185932 gggttgcaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 16186018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28454019 - 28453818
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaa 139  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| | | ||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || |||||    
T  28454019 atttgtttacccagttcggtccaatactaacctagtctgggggagagagtagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 28453920  T
Q  140 cgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 239  Q
      | |||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28453919 aagtttacaagaattagtcttcaacctaattctacccaaggtccaaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatc 28453820  T
Q  240 aa 241  Q
    ||    
T  28453819 aa 28453818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 243
Target Start/End: Original strand, 15032554 - 15032748
Alignment:
Q  52 cctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttaca 148  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||| || || |||||| || ||||||||||| ||||||| | || ||||| ||||||||    
T  15032554 cctagttcggtccaatactgacctagtttgggggagagagcagctcttcgttccactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttaca 15032653  T
Q  149 agaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 243  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  15032654 agaataaatctcccgcctaattctaccaaaagtccaaatcttttctcgtgtccaagagactcaatcctaatagtgtttccaaatatgaatcaacc 15032748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 216 - 375
Target Start/End: Original strand, 24446756 - 24446909
Alignment:
Q  216 taatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagctgttg-ctttctaaaccctt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24446756 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttcgtttccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttgttgcctttctaaaccctt 24446854  T
Q  315 gtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||||||      ||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  24446855 gtttcagccccctctatct------caaggtttacactgatacaatgtctatatttatagt 24446909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 9864048 - 9863805
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggt--agagagcagccctccgatccactata----tgatgagtaacgttacaaagtgaaa 135  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| | |||| ||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||    ||||||||||| |||||||| || |    
T  9864048 atttgtttacccagttcggtccaatactgacttagtctgggggggagagagcagctctccgttccactataatgatgatgagtaactttacaaagagata 9863949  T
Q  136 tcaacgggttacaagaataagtctcccgcct-aattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 234  Q
    ||||  |||||||||||| ||||| |   || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9863948 tcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacttaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaaaagactcaatcctaatagggtttcccaaggt 9863849  T
Q  235 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactcta 281  Q
    ||||||| |  | |||| ||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  9863848 gaatcaaac--ccaaccttagtgtttgttgccaaga-acaaactcta 9863805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 3982175 - 3982374
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacg 141  Q
    ||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||| |    
T  3982175 ttgtttaccttgttcggtccaatagtgacctagtatgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaag 3982274  T
Q  142 ggttacaagaataagtctcccgcct-aattctacccaaagtcccaa-tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaat 238  Q
     ||||||||||| ||||| |   || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3982275 tgttacaagaatcagtcttcaaacttaattctacccaaagtcccaaatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaat 3982374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5101276 - 5101130
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||| ||    
T  5101276 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agatagcagccctccgttttactatatgatgagtaaatttacaaa 5101178  T
Q  129 agtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccc 176  Q
    ||  | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  5101177 agacatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaagtctaccc 5101130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 85 - 242
Target Start/End: Original strand, 31983567 - 31983727
Alignment:
Q  85 agagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagt-gaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagt 181  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||   || ||||| ||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||    
T  31983567 agagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaaaagatatcaaagggttacaaaaataagtcttcaaacctaattctacccaaagt 31983666  T
Q  182 cccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 242  Q
    | |||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31983667 ctcaatctcttcccatgaccaagagacttaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 31983727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25357991 - 25357772
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttaca 127  Q
    |||||||| ||  ||||||| ||| |||| ||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||  |||| || |||||| ||||||||||| |||||    
T  25357991 agaacacacaaaaatttgtttacccagttaggtccaatactgacctagtctaggggagagagcagctatccgttctactataatgatgagtaactttaca 25357892  T
Q  128 aa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcct-aattctac----ccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatag 221  Q
    || | || ||||| ||||||||||||||||||| |   || |||||||     ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  25357891 aaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacttaattctatatatccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatag 25357792  T
Q  222 tgtttcccaaggtgaatcaa 241  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  25357791 tatttcccaaggtgaatcaa 25357772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 481 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 9863650 - 9863501
Alignment:
Q  481 caaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttt 580  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||       || ||    
T  9863650 caaaatatatttgcatcaaatcttccttcatgc---acaaaaatatatttattgttcataaatatatttttagcacaaaatatgtttgaaacaaatcatt 9863554  T
Q  581 tatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  9863553 tatatttttagtaacaatatatttcatccaacaaattttgagtcatattacaa 9863501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 47563109 - 47563010
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||    
T  47563109 agaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcaaggggagagagcagccctccgtttcactataagatgagtaaccttacaaa 47563010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 352 - 555
Target Start/End: Original strand, 54928982 - 54929180
Alignment:
Q  352 tgatacaaggtctatatttatagtgaaatataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnc-tccttcagtgaaaga- 449  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||        | || |||||   || |     
T  54928982 tgatacaaggtttatagttatagagaaatataactcgtaaatttgaaacgaatatcacgctgaagatgcgtttcctttttttcctcattcagcataaaat 54929081  T
Q  450 atatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattt 549  Q
    |||||||||| |||       ||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54929082 atatttgcatcaaa-------tattcctattaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatattttttgtccataaatatattt 54929174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 57 - 241
Target Start/End: Original strand, 47150904 - 47151092
Alignment:
Q  57 ttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaat 153  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| ||| | || |  || | ||||||||| ||||||| ||| ||| ||| | || ||||| |||||||||||||    
T  47150904 ttcggtccaatattgacctagtctaggggagataacatctatctgttccactataatgatgagcaactttagaaaagagatatcaaagggttacaagaat 47151003  T
Q  154 aagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 241  Q
    |||||| |   |||||||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47151004 aagtcttcaaacctaattctacccaaattctcaatctcttcatgtgaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaa 47151092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 476 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 10979755 - 10979676
Alignment:
Q  476 cctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 555  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10979755 cctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacagcacaaaaatatatttgttgtccataaatatattttcagca 10979676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 216 - 375
Target Start/End: Original strand, 38270158 - 38270316
Alignment:
Q  216 taatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaa 309  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| ||||||   |||||    |||||||||    
T  38270158 taatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaaagacaaactctacacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaa 38270256  T
Q  310 cccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||| | |||||||      ||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  38270257 cccttgtttcagcctcttctatct------caaggtttacactgatacaatgtctatatttatagt 38270316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 40998990 - 40999148
Alignment:
Q  86 gagagcagccctccgatccactatat-gatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtc 182  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||  |||||||||| ||||||| | || ||||| ||||||||| |   |||||||   |||||||||||||||||||    
T  40998990 gagagcatccctctgttccactataacgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaaaacacagtctccaaacctaattctacccaaagtc 40999089  T
Q  183 ccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 241  Q
     | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  40999090 tcgatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgttttcctaggtgaatcaa 40999148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 576 - 633
Target Start/End: Original strand, 14789512 - 14789569
Alignment:
Q  576 tcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14789512 tcttttatatttttagcaacattattcttcatccatcaaattttgagtcatactacaa 14789569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 226
Target Start/End: Original strand, 5336765 - 5336964
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgtt-ac 126  Q
    |||||||||||| ||||||| |   ||||| |||||| ||||||||| | | ||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |  | || ||    
T  5336765 agaacacaaaagaatttgtttaatcagttcagtccaatattgacctactataggggagagagcagctctccgttccactataatgatgaatttcttttac 5336864  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 225  Q
    |||| || || |  || |||||||||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  5336865 aaagagatataagaggattacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgtt 5336963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11853705 - 11853549
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tga-tgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cc 165  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | |||||||| || |   | | ||| ||||||| ||||| |   ||    
T  11853705 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttctttacaaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacc 11853609  T
Q  166 taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11853608 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 11853549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 110
Target Start/End: Original strand, 14789405 - 14789495
Alignment:
Q  20 aaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggg--tagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||||    
T  14789405 aaagaagagaagaacacaaga--atttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactata 14789495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 5269284 - 5269220
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  5269284 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 5269220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 6133185 - 6133105
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||| |||||||||    
T  6133185 agaacacaaaagaatttgttgacccaattcgatccaaattgacctagtctgggtgagagagcagtcatccgttccactata 6133105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16489410 - 16489352
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16489410 cctaattctacccaa-gtcccagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 16489352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 534 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 19322510 - 19322410
Alignment:
Q  534 gtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaa-tattcttcttccatcaaattttgagtcatactaca 632  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||        ||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  19322510 gtccataaatatattttcagtataaaatatatttaaaacaaatcttttatatttttagcaaaaaatattctccatccatcaaattttgagtcatactaca 19322411  T
Q  633 a 633  Q
    |    
T  19322410 a 19322410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25699810 - 25699752
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25699810 cctaattctacc-aaagtcccagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 25699752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4570155 - 4570094
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4570155 cctaattctacccaa-gtcccaacctcttcccgtgaccaagagactcgatcctaatagtgttt 4570094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 7050378 - 7050439
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7050378 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7050439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 26557921 - 26557823
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaa 139  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||| |||||||| || |||||    
T  26557921 atttgtttacctagttcggtccaatactgacttagtctgggggagagagcagctctccgttccactataacgatgagtaactttacaaagagatatcaa 26557823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 469 - 625
Target Start/End: Original strand, 38209098 - 38209259
Alignment:
Q  469 aatattccctttcaaa-atatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatt--tattgtc--cataaatatattttcagcacaaaatat 563  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||  |||| ||  ||  ||| |  ||  ||||||||||||    
T  38209098 aatattccttttcaaatatatatttgcatcaaatcttccttcatacagtacaaaaatatatttatattttcaacaacaatcttcttgaagcacaaaatat 38209197  T
Q  564 ctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtca 625  Q
     |||        ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38209198 atttaaaacaaatcttttatatttttaacaacaatatttttcatccatcaaattttgagtca 38209259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 54906852 - 54906722
Alignment:
Q  114 tgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactca 211  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| | ||||||||||| ||||| |   |||||||||||| ||||||   |||||||||| || |||||||||||||    
T  54906852 tgagtaactttacaaagagatatcaaagagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctacctaaagtcttgaatctcttccagtgaccaagagactca 54906753  T
Q  212 atcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 241  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  54906752 attctaatagtgtttctccatggtgaatcaa 54906722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31300580 - 31300427
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-c 164  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||  | |||||||| || ||  |   ||||||||||| ||||| |   |    
T  31300580 tgacctagtctgggg-agagagcagccctccgttccactataatgatatgagtttctttacaaagagatattga---gttacaagaatcagtcttcaaac 31300485  T
Q  165 ctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31300484 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 31300427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Original strand, 52942473 - 52942526
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggg 83  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942473 agaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggg 52942526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Original strand, 10047383 - 10047447
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  10047383 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 10047447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 10114520 - 10114443
Alignment:
Q  184 caatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt 263  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  10114520 caatctcttatcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaagtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgtt 10114443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Original strand, 39245998 - 39246062
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  39245998 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 39246062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Original strand, 4556180 - 4556238
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4556180 cctaattctacc-aaagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 4556238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4558372 - 4558314
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4558372 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 4558314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8529328 - 8529270
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8529328 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 8529270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15317019 - 15316961
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15317019 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 15316961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18587027 - 18586969
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18587027 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 18586969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 493 - 552
Target Start/End: Original strand, 29609838 - 29609897
Alignment:
Q  493 gcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 552  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  29609838 gcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatttactcttcataaatatattttca 29609897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 55822326 - 55822265
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55822326 cctaattctacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 55822265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Original strand, 5143263 - 5143327
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  5143263 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaacccactat 5143327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 49088911 - 49088819
Alignment:
Q  38 aaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtct-ggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||  ||| | | ||||||||||||| |||| |||||||    
T  49088911 aaagaatttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctggggggagagagtagttctctgtttcactatatgatgactaacattacaaa 49088819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 260 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 2891434 - 2891356
Alignment:
Q  260 tgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagct-----gttgc-tttctaaacccttgtttcagccccctctatct 333  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2891434 tgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct 2891356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 504 - 555
Target Start/End: Original strand, 5516701 - 5516752
Alignment:
Q  504 tccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 555  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  5516701 tccttcatacgataaaaaaatatatttattatctataaatatatttttagca 5516752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15831202 - 15831144
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||| ||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15831202 cctaattctacgcaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 15831144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Original strand, 16689061 - 16689119
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16689061 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 16689119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 227
Target Start/End: Original strand, 29609591 - 29609654
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  29609591 cctaattctactcgaagtctcaatctcttgccgtgatcaagagactcaattctaatagtgtttc 29609654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 36315321 - 36315258
Alignment:
Q  46 tgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  36315321 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 36315258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 36329530 - 36329467
Alignment:
Q  46 tgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  36329530 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 36329467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 47566554 - 47566496
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  47566554 cctaattctacccaaattcc-agtctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 47566496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 80
Target Start/End: Original strand, 3937259 - 3937309
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctg 80  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  3937259 agaacacaaatgaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtctg 3937309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16638884 - 16638827
Alignment:
Q  168 attctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16638884 attctacccaa-gtctcaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 16638827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25357713 - 25357640
Alignment:
Q  302 tttctaaacccttgttt-cagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  25357713 tttctaaacccttgttttcagcccc-tctcactctctctcaaggtttactttgatacaaggtctatatttatagt 25357640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 192
Target Start/End: Original strand, 38270120 - 38270158
Alignment:
Q  154 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38270120 aagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctctt 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 18587123 - 18587082
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  18587123 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 18587082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22295399 - 22295294
Alignment:
Q  136 tcaacgggttacaagaataagtctcccgcc-taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 234  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |  || ||||| ||| ||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| | ||||| | |||||    
T  22295399 tcaaagggttacaggaataagtcttcaaccctaattatactcaaagtttcaatctctttccgtgaccaagagactaaatcctaacaatgtttactaaggt 22295300  T
Q  235 gaatca 240  Q
    ||||||    
T  22295299 gaatca 22295294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 157
Target Start/End: Original strand, 24446681 - 24446754
Alignment:
Q  85 agagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagt 157  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||| || |||||| |||||||    
T  24446681 agagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggcttacaaaaataagt 24446754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 34495910 - 34495853
Alignment:
Q  51 acctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    ||||||||||||||||  |||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  34495910 acctagttcggtccaacatgacttactctgggggagagagcagccctccaatccacta 34495853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3760161 - 3760105
Alignment:
Q  165 ctaattctacccaaagtcccaa-tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaata 220  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  3760161 ctaattctacccaaagtgctaaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaata 3760105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 5396764 - 5396700
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||| |||| |||||||||    
T  5396764 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactat 5396700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 350 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 9863736 - 9863700
Alignment:
Q  350 tctgatacaaggtctatatttatagtgaaatataact 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9863736 tctgatacaaggtctatatttatagagaaatataact 9863700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 365 - 424
Target Start/End: Original strand, 29609767 - 29609823
Alignment:
Q  365 atatttatagtgaaatataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgttt 424  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29609767 atatttatagagaaata--actcataaatttggaacgaatatcacgctg-agatacgttt 29609823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 31985726 - 31985663
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  31985726 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactat 31985663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 38152532 - 38152468
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||| || ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  38152532 ttgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactat 38152468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 97
Target Start/End: Original strand, 54867188 - 54867239
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccct 97  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54867188 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggg-agagagcagccct 54867239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4884912 - 4884877
Alignment:
Q  188 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4884912 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 4884877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 6743507 - 6743444
Alignment:
Q  46 tgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||| |||  || ||||||||||||||| |||||||||    
T  6743507 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcagccctccaatccactat 6743444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 516 - 555
Target Start/End: Original strand, 14647175 - 14647214
Alignment:
Q  516 tacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 555  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  14647175 tacaaaaatatatttgttgtccatgaatatattttcagca 14647214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 621
Target Start/End: Original strand, 29609948 - 29609983
Alignment:
Q  586 ttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttga 621  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29609948 ttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 29609983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 420
Target Start/End: Original strand, 32274204 - 32274271
Alignment:
Q  353 gatacaaggtctatatttatagtgaaatataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatac 420  Q
    |||||||| ||| ||||||||   ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  32274204 gatacaagatctgtatttatataaaaatataactcgtaaacttggaacggatatcacactaaagatac 32274271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36771580 - 36771396
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagtgaaatca 138  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||| ||||  ||||  | |||||||| || ||      
T  36771580 atttgtttacctagttcggtctaatgatgacctagtctggcgtagagagcagctctctgttccactataatgatatgagtttctttacaaagagatattg 36771481  T
Q  139 acgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    |   ||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||| ||| ||  |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  36771480 a---gttacaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcacagcctcttcccatgaccaagagactcaatcataatagtgttt 36771396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 43 - 159
Target Start/End: Original strand, 3578669 - 3578786
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaac 140  Q
    ||||||| ||| ||||||||| || | || |||||||||||| ||||| |||| ||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||     
T  3578669 atttgtttacccagttcggtctaatactggcctagtctgggggagaga-cagctctccattccactataatgatgagtaactttacaaagagatatcaaa 3578767  T
Q  141 gggttacaagaataagtct 159  Q
      ||||||||||| |||||    
T  3578768 atgttacaagaattagtct 3578786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 68
Target Start/End: Original strand, 24446639 - 24446677
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaat 68  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24446639 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat 24446677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 350 - 408
Target Start/End: Original strand, 38208986 - 38209044
Alignment:
Q  350 tctgatacaaggtctatatttatagtgaaatataactcataaatttggaacgaatatca 408  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  38208986 tctgatacaaagtttatatttataaagaaatataactcataaatctggaatggatatca 38209044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 576 - 625
Target Start/End: Original strand, 54929220 - 54929267
Alignment:
Q  576 tcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtca 625  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  54929220 tcttttatatttttagcaacaatattat--ttccatcaaattttaagtca 54929267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 110
Target Start/End: Original strand, 4556085 - 4556126
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  4556085 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 4556126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 226
Target Start/End: Original strand, 4874620 - 4874661
Alignment:
Q  185 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4874620 aatctcttcccgtgaccaagagactctatcttaatagtgttt 4874661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 4885031 - 4884990
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  4885031 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 4884990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 241
Target Start/End: Original strand, 5516367 - 5516444
Alignment:
Q  166 taattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 241  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  5516367 taattctacgcaaagtctcgaatctcttcccgtgagcaagagacccaaacctaatggtgtttctccaagatgaatcaa 5516444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 8529424 - 8529383
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  8529424 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 8529383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 10114653 - 10114576
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat-atgatgagt 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| || || || ||||| |||||||||    
T  10114653 atttgtttacctaattcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagctcttcgttcaactataatgatgagt 10114576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 15831298 - 15831257
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  15831298 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 15831257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16455356 - 16455323
Alignment:
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctc 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16455356 ttctaaacccttgtttcagccccctttatctctc 16455323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 36769636 - 36769595
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  36769636 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 36769595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 579 - 619
Target Start/End: Original strand, 5516793 - 5516833
Alignment:
Q  579 tttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaatttt 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  5516793 tttatatttttagcaacaatattctccattcatcaaatttt 5516833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Original strand, 12739550 - 12739594
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  12739550 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 12739594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 15312500 - 15312432
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||    
T  15312500 atttgtttacctagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagaccagctctccgttccactata 15312432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 16630773 - 16630709
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| | ||||| |||| |||| |||||||||    
T  16630773 ttgttgacctagttcggtccaatatgacataatctggaggagagaacagctctccaatccactat 16630709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 25862115 - 25862051
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||||||| | ||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  25862115 ttgttgactcagttcggtccaatatgacctaatatggggaagagagcggccctccaatccactat 25862051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Original strand, 26175636 - 26175680
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  26175636 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 26175680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Original strand, 36463389 - 36463433
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  36463389 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 36463433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Original strand, 48893638 - 48893682
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  48893638 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 48893682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 136)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 633
Target Start/End: Original strand, 23452201 - 23452827
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  23452201 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccacta 23452300  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23452301 tatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctatccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaga 23452400  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |    
T  23452401 ctcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcc 23452499  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23452500 tttctaaacccttgtttcagccccctctgtctctct--caaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaac 23452597  T
Q  401 gaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaa 500  Q
     |||| |||||||||| ||| |||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452598 aaataccacactgaaggtactttt---ttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaa 23452694  T
Q  501 tcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatat 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||    
T  23452695 tcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatttattttcagcataaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatat 23452794  T
Q  601 tcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  23452795 tctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 23452827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 662
Target Start/End: Original strand, 35215568 - 35216211
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 126  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  35215568 agaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac 35215667  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtt 225  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35215668 aaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaaactcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 35215767  T
Q  226 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc-tttctaaacccttgtttc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||     | |||||| ||||||||||||||||||    
T  35215768 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttc 35215866  T
Q  320 agccccctcta----tctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactga 414  Q
    |||||||||||    |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  35215867 agccccctctatctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacaaataccacaccga 35215966  T
Q  415 agatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacg 514  Q
    |||| | |||         |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  35215967 agattcattt---ttttttctccttcagtgaaagaatatctgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacg 35216063  T
Q  515 atacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaa 614  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35216064 atacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaa 35216163  T
Q  615 attttgagtcatactacaaaattctcaaccttgactccaaattagtga 662  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  35216164 attttgagtcatactacaacattctccaccttgactctaaattagtga 35216211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 42453054 - 42452451
Alignment:
Q  26 gagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42453054 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 42452956  T
Q  126 caaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 224  Q
    |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452955 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 42452856  T
Q  225 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgttt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| | ||||   |||||    ||||||||||||||||||    
T  42452855 ttcccaaggtgaatcaacccacaaactctagtgtttgttac--agagacaaactttatacaaa-ctctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 42452759  T
Q  319 cagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaaga 417  Q
    |||||||||||||||      | |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  42452758 cagccccctctatct------ccaagtttgctctgatacaatgtctatatttataataaaagtataactcataaatttggaacaaataccacaccgaaga 42452665  T
Q  418 tacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgata 517  Q
    ||| |||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42452664 tacattt--tttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgata 42452567  T
Q  518 caaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaatt 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42452566 caaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaatt 42452467  T
Q  618 ttgagtcatactacaa 633  Q
    || |||||||||||||    
T  42452466 ttaagtcatactacaa 42452451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 633
Target Start/End: Original strand, 35217945 - 35218563
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 126  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  35217945 agaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttac 35218044  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtt 225  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35218045 aaagagaaatcaacgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 35218144  T
Q  226 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc-tttctaaacccttgtttc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||     | |||||| ||||||||||||||||||    
T  35218145 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatataaa-ccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttc 35218243  T
Q  320 agccccctcta--------tctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcaca 410  Q
    |||||||||||        |||||||| ||||||||   || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  35218244 agccccctctatctctctctctctctctcaaagtttagccttatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggagcaaataccaca 35218343  T
Q  411 ctgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttca 510  Q
    |||||||| |||||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  35218344 ctgaagattcgttt---ttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttta 35218440  T
Q  511 tacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttcca 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35218441 tacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatcca 35218540  T
Q  611 tcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  35218541 tcaaattttgagtcatactacaa 35218563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 633
Target Start/End: Original strand, 42923494 - 42924092
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||    
T  42923494 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgtttcactatatgacgagtaactttacaaa 42923593  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42923594 agagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgttttc 42923693  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcc----ctagctgttg-ctttctaaacccttgtttcagcc 323  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     | | ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  42923694 caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagcc 42923793  T
Q  324 ccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgt 422  Q
     |||||||||||    ||| |||| || |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||| |    
T  42923794 tcctctatctct----caaggtttactatgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaa---cac-ctgaagatactt 42923885  T
Q  423 ttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaa 522  Q
     |         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  42923886 at----ttgttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatatttcttttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaa 42923981  T
Q  523 atatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgag 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  42923982 atatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgag 42924081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27105088 - 27104724
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27105088 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 27104989  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27104988 tatgatgagtaatgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagac 27104889  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||    
T  27104888 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt-tttgtttcgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcct 27104791  T
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27104790 ttctgaacccttgtttcagccccctctatct------caaagttttctctgatacaaggtctatatttatagt 27104724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 13910009 - 13910374
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  13910009 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgatccacta 13910108  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  13910109 tatgatgagtattgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccagtctcttcccgtaaccaagagac 13910208  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ct 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||    
T  13910209 tcaatcctaatattgtttcccaaggtgaatcaacccataaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcct 13910307  T
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910308 ttctaaacccttgtttcagccccctctatct------ccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 13910374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 380
Target Start/End: Original strand, 19501980 - 19502346
Alignment:
Q  14 gaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatga 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19501980 gaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactatatga 19502079  T
Q  114 tgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaa 212  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  19502080 tgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaa 19502179  T
Q  213 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttct 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||    ||||||    
T  19502180 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctacacaaa-ccctagttttgttgttgcctttct 19502278  T
Q  307 aaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaat 380  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||      | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19502279 aaactcttgtttcagccccctttatct------ccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaat 19502346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 15 - 375
Target Start/End: Original strand, 19504316 - 19504675
Alignment:
Q  15 aacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgat 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19504316 aacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccgatccactatatgat 19504415  T
Q  115 gagtaacgttac-aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaat 213  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19504416 gagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctt-ccgtaaccaagagactcaat 19504514  T
Q  214 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttcta 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||    
T  19504515 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccaacaaacccttgtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttcta 19504613  T
Q  308 aacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504614 aacccttgtttcagccccctctatct------ccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 19504675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 27 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 42064788 - 42064440
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaatt-gacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 125  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  42064788 agaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgtta 42064689  T
Q  126 caaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 225  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064688 caaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 42064589  T
Q  226 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||    
T  42064588 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 42064490  T
Q  320 agccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||| ||||||||||      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064489 agctccctctatct------ccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 42064440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 26 - 379
Target Start/End: Original strand, 45279965 - 45280319
Alignment:
Q  26 gagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45279965 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 45280064  T
Q  126 caaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 224  Q
    |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45280065 caaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 45280164  T
Q  225 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc--tttctaaacccttgtt 317  Q
     ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     | ||||||  ||||||||||||||||    
T  45280165 atcccaaggtgaatcaaccctctaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgctttttctaaacccttgtt 45280263  T
Q  318 tcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    ||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45280264 tcagccccctctatct------caaagtttgctctgatacaaggtatatatttatagtgaaa 45280319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 375
Target Start/End: Original strand, 24162193 - 24162542
Alignment:
Q  15 aacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgat 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24162193 aacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtccgggggagagagcagccatccaatccactatatgat 24162292  T
Q  115 gagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatc 214  Q
    ||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||    
T  24162293 gagtagcattacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca----------gcaaccaagagactcaatc 24162382  T
Q  215 ctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaa 308  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||    
T  24162383 ttaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaa 24162481  T
Q  309 acccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24162482 acccttgtttcagccccctctatct------caaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 24162542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19007910 - 19007600
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  19007910 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 19007811  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19007810 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagaaactcaattctaatagtgtttcc 19007711  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttg-ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||     | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19007710 caaggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccataattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 19007612  T
Q  323 cccctctatctc 334  Q
    ||||||||||||    
T  19007611 cccctctatctc 19007600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 21520678 - 21521025
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  21520678 agaacacaaaagaatttgttgacaaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 21520777  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21520778 agagatatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 21520877  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||   |||||    ||||||||||||||||||||||    
T  21520878 taaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatac-aagccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 21520976  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||| |||||||||    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  21520977 cccatctatctct----caaagtttagtctgatacaaggtttatatttatagt 21521025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 6264133 - 6264475
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  6264133 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaa 6264232  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6264233 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctatccaaagccccaatcttttatcgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttc 6264332  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagctgttg-ctttctaaacccttgtttcagccccc 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || | | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6264333 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtaccaaagagacaaactctatacaaaccctttgttgttgcctttctaaacctttgtttcagccccc 6264432  T
Q  327 tctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||      ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6264433 tctatct------caaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 6264475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 22287321 - 22287666
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22287321 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatatgatgagtaacgttacaaa 22287420  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  22287421 agagatatcaacgggttacaagaataagtctcccgcccaattctacccgaagtgtcaatctcttcccgtaactaagagactcaatcctaataccgtttcc 22287520  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||||||    
T  22287521 caaggtgaatcaaccctcaaaccctaatgtttgttccaaagagacagactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 22287619  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||| |||||      |||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  22287620 cccctatatct------caaagtttactttaatacaaggtctatatttatagt 22287666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 40032038 - 40032388
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| || |||    
T  40032038 agaatacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcggccctccgtttcactataatgatgagtaactttgcaa 40032137  T
Q  129 a-gtgaaa----tcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    | | ||||    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032138 aagagaaagatatcaatgggttacaagaataagtctcacgcctaattctacccaaagtcctaacctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 40032237  T
Q  224 tttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtt 317  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||    
T  40032238 tttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 40032336  T
Q  318 tcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40032337 tcagccccctctatct------caaagtttactctgatacaaggtctatatttatagt 40032388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 30 - 257
Target Start/End: Original strand, 43623565 - 43623793
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43623565 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 43623664  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43623665 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatattgtttcc 43623764  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtg 257  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  43623765 caaggtgaatcaaccctcaaaacctagtg 43623793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Original strand, 11739544 - 11739855
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| || |||    
T  11739544 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaacctttcaa 11739643  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11739644 aagagatatcaatggattccaagaataattctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcctataaccaagagaatcaatcctaatagtgtttc 11739743  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttg-ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||     | ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  11739744 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagcgtttgttccaaagagacaaactccatacaaa-ccctaattttgttgttgtctttctaaacccttgttccag 11739842  T
Q  322 ccccctctatctc 334  Q
    |||||||||||||    
T  11739843 ccccctctatctc 11739855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 6258802 - 6259145
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||| ||||||    
T  6258802 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggg-agagagcagccctccgtttcactataataatgagtaactttacaa 6258900  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6258901 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagccccaatct--tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 6258998  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag-----ctgttg-ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||      ||||| |||||||||| |||||||||     
T  6258999 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattccaaatagacaaactctatacaaa-ccctagttttattgttgcctttctaaactcttgtttcat 6259097  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    || |||||||||      ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  6259098 cctcctctatct------caaagtttagtctaatacaaggtctatatttatagt 6259145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28196905 - 28196597
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| | || | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28196905 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtc--aattgacctagtctgggggagagagcagccattcgtttcactatatgatgagtaatgttacaaa 28196808  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28196807 agagatatcaatgggttacaagaataaatcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 28196708  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||| ||||||||||    
T  28196707 caaggtgaatcaacccttaaaccctaatgtttgttgccaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtttcagc 28196609  T
Q  323 cccctctatctc 334  Q
    ||||||||||||    
T  28196608 cccctctatctc 28196597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 227
Target Start/End: Original strand, 36558845 - 36559047
Alignment:
Q  26 gagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 125  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36558845 gagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgtta 36558944  T
Q  126 caaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgt 224  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36558945 caaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgt 36559044  T
Q  225 ttc 227  Q
    |||    
T  36559045 ttc 36559047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Original strand, 36561123 - 36561324
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 126  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36561123 agaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 36561222  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtt 225  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36561223 aaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 36561322  T
Q  226 tc 227  Q
    ||    
T  36561323 tc 36561324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 30 - 249
Target Start/End: Original strand, 5375331 - 5375550
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  5375331 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaatgttacaaa 5375430  T
Q  129 agtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5375431 agagatatcaatgggttacaagaataagtct-ccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 5375529  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaa 249  Q
     ||||||||||||||| ||||    
T  5375530 taaggtgaatcaaccctcaaa 5375550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17848710 - 17848403
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17848710 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtcatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 17848611  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | || ||||| || |||||||||||||||||||||||   ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17848610 agagatatcaatgg-ttacaagaataagtctcccgcct---tctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 17848515  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||| |||| ||    
T  17848514 caaagtgaatcaaccctcaaacccaagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgtctttctaaaccctcgtttgag 17848416  T
Q  322 ccccctctatctc 334  Q
    |||||||||||||    
T  17848415 ccccctctatctc 17848403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Original strand, 34979562 - 34979874
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtag-agagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttaca 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||  | |||| |||||| || ||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  34979562 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttggggggggagagtagcccttcgttccactataatgatgaggaaccttaca 34979661  T
Q  128 aa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    || | || || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34979662 aaagagatataaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctaccgaaagtccgaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgttt 34979761  T
Q  227 cccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagctgtt------gctttctaaacccttgtttca 320  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| | ||       |||||||||| |||||||||    
T  34979762 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaa-ccctagtttttttgttacctttctaaacgcttgtttca 34979860  T
Q  321 gccccctctatctc 334  Q
    ||||||||||||||    
T  34979861 gccccctctatctc 34979874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17849387 - 17849077
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17849387 agaacacaaaagaatttgttgacccagtcttgtccaaattgacctagtatgtgggagagagcagccc-ccgtttcactataatgatgagtaaccttacaa 17849289  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17849288 aagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttaccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttc 17849189  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| || | ||||   |||||    |||||||||||||||||||||    
T  17849188 tcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttcttccaaagaggcaaactctatacgaa-ctctagttttgttgttatctttctaaacccttgtttcag 17849090  T
Q  322 ccccctctatctc 334  Q
    |||||||||||||    
T  17849089 ccccctctatctc 17849077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 287
Target Start/End: Original strand, 44289052 - 44289311
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| || || | | ||||||| ||||||||||  ||||||    
T  44289052 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggaaagagcaaccatctgtttcactataatgatgagtaatcttacaa 44289151  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44289152 aagagatatcaacgggttacaagaataagttttccacttaattctaccctaagtcccaatctcttcccgtaaccaagtgactcaatcctaatagtgtttc 44289251  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  44289252 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacagactctatacaaa 44289311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 18800298 - 18800632
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttaca 127  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||  |||||| |||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||||| |||||    
T  18800298 agaacacaaaagaatttgtttacccagtttggtccaaaactgacctggtctgggg-agagagtagccctccgtttcactataatgacgagtaactttaca 18800396  T
Q  128 aa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    || | || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18800397 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 18800496  T
Q  227 cccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagctgttgctttctaaacccttgtttcagccccc 326  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18800497 cccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caacctctatacaaa-ccctagc--ttgatttctaaacccttgtttcagccccc 18800589  T
Q  327 tctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    | |||||      | | |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  18800590 tatatct------ccatgtttaccctgatacaaggtctatatttatagt 18800632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 68 - 338
Target Start/End: Original strand, 45239000 - 45239275
Alignment:
Q  68 ttgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcct 166  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  45239000 ttgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtatcccgctt 45239099  T
Q  167 aattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccg 266  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  45239100 aattctaccaaaaaccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc 45239199  T
Q  267 aagagacaaactctatacaaagccctag--ctgtt----gctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctc 338  Q
    || ||| ||| |||||||||| ||||||   ||||     ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  45239200 aa-agagaaagtctatacaaa-ccctagttttgtttttgtctttctaaatcattgtttcagccccctctatctctctc 45239275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 227
Target Start/End: Original strand, 45332144 - 45332364
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatga-gaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccact 107  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  45332144 gagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaattcact 45332243  T
Q  108 atatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45332244 atatgatgagtacctttacaaagagaaatcaatgggttacaataataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctaatctcttcccgtaaccaagaga 45332343  T
Q  208 ct-caatcctaatagtgtttc 227  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  45332344 ctccaatcctaatagtgtttc 45332364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3022442 - 3022088
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata----------tgatgagta 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | | || ||||          |||||||||    
T  3022442 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcattataacgatgataatgatgagta 3022343  T
Q  120 acgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaat 219  Q
    || ||| |||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3022342 actttataaagagatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaaacctcaatctcttccggtaaccaagagactcaatcctaat 3022243  T
Q  220 agtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaaccct 313  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||   |||||    |||| ||||||||    
T  3022242 agtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaaccgtagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaa-ctctagttttgttgttgcctttataaaccct 3022144  T
Q  314 tgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||| ||| |||||      ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3022143 tgtttcagcctcctatatct------caaggtttactctgatacaaagtctatatttatagt 3022088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 350 - 633
Target Start/End: Original strand, 27583631 - 27583905
Alignment:
Q  350 tctgatacaaggtctatatttatagtgaaatataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaaga 449  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||        ||||||||||||||||    
T  27583631 tctgatacaagatctatatttatagagaaatataactcataaatttggaacggatatcacgctgaagatacatttctttttt--ctccttcagtgaaaga 27583728  T
Q  450 atatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattt 549  Q
    |||||||||| |||       |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27583729 atatttgcatcaaa-------tattccttttcaaaatatatttgcatcaaatattccttcatatggtataaaaatatatttattgttcataaatatatct 27583821  T
Q  550 tcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    |||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27583822 tcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaaatttgagtcatactacaa 27583905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14837538 - 14837233
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat-atgatgagtaacgttac-a 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| | |||||| |||||||||||| |||| |    
T  14837538 agaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcatccatccgtttcactataatgatgagtaaccttacaa 14837439  T
Q  128 aagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    ||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14837438 aagagatatcaatgagttacaagaataagtcccccgcctaattctacttaaagtctcaatctcttc------ccaagagactcaatcctaatagtgtttc 14837345  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||   |||||    |||| | ||||||||||||||    
T  14837344 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactatgtacaaa-ccctagttttgttgttgtcttttttaacccttgtttcag 14837246  T
Q  322 ccccctctatctc 334  Q
    | |||||||||||    
T  14837245 ctccctctatctc 14837233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 135 - 375
Target Start/End: Original strand, 15539566 - 15539805
Alignment:
Q  135 atcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15539566 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagaatcaatcctaatagtgtttcccaaggt 15539665  T
Q  235 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttg-ctttctaaacccttgtttcagccccctc 328  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||     | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||     
T  15539666 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaa-ccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgtttcaacccccta 15539764  T
Q  329 tatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||      ||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  15539765 tatct------caaggtttacactgatacaatgtctatatttatagt 15539805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 43 - 334
Target Start/End: Original strand, 11578105 - 11578399
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaa 139  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||||||| | |||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||| | || |||||    
T  11578105 atttgtttacctagttcggtctaaaactgatctagtctgggggaaagagcagccctccgttcgactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaa 11578204  T
Q  140 cgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 239  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11578205 tgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccgaggtgaatc 11578304  T
Q  240 aacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag-----ctgttgctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 334  Q
    ||||  | |||||||  ||||||| | |||||| ||| |||||||||| ||||||      |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11578305 aacc--ccaacccta--gtttgttgccaagagaaaaattctatacaaa-ccctagtttttttgttgacttctaaacccttgtttcagcccactctatctc 11578399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22874401 - 22874102
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    ||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22874401 agaacacaagagaatttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtatgagggagagagcagctctcagtttcactataatgatgagtaactttacaa 22874302  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||     
T  22874301 aagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccacctaattctaccgaaagcctcaatctcttcccgtgactaagagactcaatcctaatactgtttt 22874202  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagctgttgctttctaaacccttgtttcagccccct 327  Q
    |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22874201 ccaaggtgaatcaaccc---aaccatagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaa-ccctag--tttgatttctaaacccttgtttcagccccct 22874109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 287
Target Start/End: Original strand, 28459175 - 28459433
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  28459175 agaacacaaaagaatttgtttatctagttcgatccaaattgacctagtctagg-tagagagaagccctccgtttcactataatgatgagtaactttaaaa 28459273  T
Q  129 a-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    | | || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28459274 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattatacctgaagccccaaactcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttg 28459373  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  28459374 ccaaggtgaatccaccctcaaatcctagtttttgttgccaagagacaagctctatacaaa 28459433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 43 - 375
Target Start/End: Original strand, 31732774 - 31733095
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaac 140  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||| ||| ||||||||||| ||||||| | || |||||     
T  31732774 atttgtttacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcacaataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 31732873  T
Q  141 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  31732874 gggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtccca------------aaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaacgtgaatca 31732961  T
Q  241 acccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 334  Q
    |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||   |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31732962 accctcaaaccttagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaa-ctctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct- 31733059  T
Q  335 tctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
         ||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  31733060 -----caatgtttactctgttacaaagtctatatttatagt 31733095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Original strand, 22407439 - 22407596
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  22407439 agaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 22407538  T
Q  129 agtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaa 186  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22407539 agagatatcaatgggttacaagaataagtctcccccctaattctaccaaaagtcccaa 22407596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 43 - 287
Target Start/End: Original strand, 17897243 - 17897485
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagt-gaaatcaa 139  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||| ||||||| | || |||||    
T  17897243 atttgtttacccagttcggaccaatactgacctagtctgggg-agagagcagccatccgttctactataatgatgagtaactttacaaaatagatatcaa 17897341  T
Q  140 cgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 239  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17897342 agggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaaatctcaatcttttctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 17897441  T
Q  240 aacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    ||  | |||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17897442 aa-tctcaa--cctagtgtttgttgcgaagag-caaactctatacaaa 17897485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 287
Target Start/End: Original strand, 20146617 - 20146849
Alignment:
Q  55 agttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaaga 151  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||| | |||||||||    
T  20146617 agttcggtccaatactgacttagtctgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagagttacaaga 20146716  T
Q  152 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |  | ||||    
T  20146717 ataagtctcccgcctaattctacccaaaatctcaatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctactattgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaacc 20146814  T
Q  252 ctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
     ||||||||||| | ||| | |||||||||||||||    
T  20146815 atagtgtttgttgccaag-ggcaaactctatacaaa 20146849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 469 - 625
Target Start/End: Original strand, 28568584 - 28568740
Alignment:
Q  469 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttg 568  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  28568584 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcttccttcacacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcaaaacaaaatatatttg 28568683  T
Q  569 nnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtca 625  Q
           ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28568684 aaacaaatcttttatagttttagcaacaatattcttcatctatcaaattttgagtca 28568740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 43 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 40699633 - 40699429
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaa 139  Q
    ||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || |||||    
T  40699633 atttgtttacctagttcggtctaatactgacctagtctgggggaaagagcatccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 40699534  T
Q  140 cgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 238  Q
     || |||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40699533 aggattacaaaaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 40699434  T
Q  239 caacc 243  Q
    |||||    
T  40699433 caacc 40699429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 173
Target Start/End: Original strand, 7462950 - 7463077
Alignment:
Q  48 ttgacctagttcggtccaaa-ttgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagtgaaatcaacgggtt 145  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  7462950 ttgacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatataatgggtaacgttacaaaagagaaatcaatgagtt 7463049  T
Q  146 acaagaataagtctcccgcctaattcta 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7463050 acaagaataagtctcccgcctaattcta 7463077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 142 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 38020349 - 38020161
Alignment:
Q  142 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 240  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||           |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  38020349 ggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccccaat-----------accaagagactcaatcctaatagtgtttaccatggtgaatca 38020261  T
Q  241 acccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 334  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38020260 accctcaaaccctagtgtttgtttccaagagacaaactctacacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 38020162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 35107566 - 35107351
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttaca 127  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||  ||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  35107566 agaacacaaaaatatttgtttacctatttcggtccaatactgacctagtctgggaaagagaacaaccatccgttccactataatgatgagtaacattaca 35107467  T
Q  128 aa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgc--ctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 224  Q
    || | || | ||| || |||||||||||||||| |     |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  35107466 aaagagataacaaagg-ttacaagaataagtcttcaaaatctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgt 35107368  T
Q  225 ttcccaaggtgaatcaa 241  Q
    ||| |||||||||||||    
T  35107367 ttctcaaggtgaatcaa 35107351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 202 - 375
Target Start/End: Original strand, 22163106 - 22163277
Alignment:
Q  202 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta--gctgtt 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||    
T  22163106 aagagactcaa-cctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaa-ccctagtgttgtt 22163203  T
Q  300 g----ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||      |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  22163204 gttgcctttctaaatccttgtttcagccccctctatct------caaagtttacactgatacaatgtctatatttatagt 22163277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 359 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 15693858 - 15693669
Alignment:
Q  359 aggtctatatttatagtgaaatataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaaga-atatttgc 457  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||        |||||||||   || | ||||||||    
T  15693858 aggtttatatttatagagaaatataactcataaatttagaacggatatcacgctgaagatacgtttcttttttt-ctccttcagcacaaaatatatttgc 15693760  T
Q  458 ataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 555  Q
    || |||       ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15693759 atcaaa-------tatcccctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatttattgcccataaatatattttcagca 15693669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 43 - 375
Target Start/End: Original strand, 37962939 - 37963257
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacg 141  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||| || | | | ||||||| |||||| |||| |||||||   ||||||| |    
T  37962939 atttgtttacccagttcggtccaaattaacctagtgtgggagagagatcagtccactgtttcactataatgatgaataactttacaaaa--aaatcaatg 37963036  T
Q  142 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 241  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||  || ||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| |||||||    
T  37963037 gattacaagaataagtctctcgtctaattctacccaaagcctcaatctcttcaggtgaccaagagactcaatctcaataatgttttctaaggggaatcaa 37963136  T
Q  242 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagctgttgctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgca 341  Q
    | |   |||| | |||||||||   ||||| |||||| || ||||| ||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      ||    
T  37963137 cac---aaccatggtgtttgttgtcaagag-caaactatacacaaa-ccctag--tttgatttctaaacccttgtttcagccccctctatct------ca 37963223  T
Q  342 aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    | |||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  37963224 aggtttactcttatacaaagtctatatttatagt 37963257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 163
Target Start/End: Original strand, 22707736 - 22707872
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctg--gggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac- 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||     
T  22707736 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcagtccaaattgacctagtctggaggagagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaaccttaca 22707835  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg 163  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22707836 aaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccg 22707872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 129
Target Start/End: Original strand, 22163007 - 22163106
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22163007 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaa 22163106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 246 - 379
Target Start/End: Original strand, 5377631 - 5377767
Alignment:
Q  246 caaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctagct-----gttgc-tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcg 339  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |     ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  5377631 caaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagtcccctctatctctctc- 5377728  T
Q  340 caaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5377729 -aaagtttgctctgaaacaaggtctatatttatagtgaaa 5377767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 226 - 375
Target Start/End: Original strand, 22407591 - 22407739
Alignment:
Q  226 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttc 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||    
T  22407591 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttc 22407689  T
Q  320 agccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||| |||| |||||      || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22407690 agcaccctatatct------cacagtttactctgatacaaggtctatatttatagt 22407739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 157 - 256
Target Start/End: Original strand, 38414194 - 38414291
Alignment:
Q  157 tctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt 256  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  38414194 tctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatcttttcc-gtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa-cctcaaaccctagt 38414291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 43139564 - 43139395
Alignment:
Q  110 atgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||| ||| |||||   | |||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  43139564 atgatgagtaactttacaaagagaaatcaaaaggttacaataattagtctttagacctaattctacctaaagtctcaatatcttcccgtgaccaagagac 43139465  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactcta 281  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  43139464 tcaatcctaataatgtttcccaagatgaatcaatc--tcaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactcta 43139395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 263
Target Start/End: Original strand, 27136195 - 27136343
Alignment:
Q  115 gagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaa 212  Q
    ||||||| ||||||| | || ||||| | |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||    
T  27136195 gagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctccaaacctaattctactcaaagtcccaatttctttccgtgaccaagagattcaa 27136294  T
Q  213 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt 263  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  27136295 tcctaatagtgttttccaagatgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgtt 27136343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 505 - 633
Target Start/End: Original strand, 27136367 - 27136503
Alignment:
Q  505 ccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattt--------tcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaaca 596  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||        ||| |||||||||| ||||       |||||||||||||||||| ||    
T  27136367 ccttcatacggtacaaaaatatatttattttccataaatatatttatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcacca 27136466  T
Q  597 atattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27136467 atattcttcatccatcaaattttgagtcatactacaa 27136503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17921927 - 17921754
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttac-aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cc 165  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||  ||||   |||||| ||||| ||||||| ||| |     ||    
T  17921927 tgacctagtctggg-tagagagcagccctccgttccactataatgatgactaactttatgaaag---aatcaaagggttgcaagaatcagttttaaaacc 17921832  T
Q  166 taattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17921831 taattctacccaaagtcccgaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcttcaaggtgaatcaa 17921754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 23871086 - 23870951
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aa 128  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||  || |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||    
T  23871086 agaactcaaaagaatttgttgacctagtttgatccaaattgacctaatctaagggagagagcaaccctccgtttcactatatgatgagtaaccttactaa 23870987  T
Q  129 agtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgc 164  Q
    || || || || ||||||||||||||||||| ||||    
T  23870986 agagatattaatgggttacaagaataagtctgccgc 23870951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20589881 - 20589763
Alignment:
Q  110 atgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    |||||||||||| | ||||| | || ||||| |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20589881 atgatgagtaacttcacaaaagagatatcaatgggttaaaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagaga 20589782  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  20589781 ctcaatcctaacagtgttt 20589763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 540 - 628
Target Start/End: Original strand, 34575608 - 34575696
Alignment:
Q  540 aaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatac 628  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||        |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34575608 aaatatattttcagcacaaaatatatttagaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgagtcatac 34575696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 469 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 7502723 - 7502638
Alignment:
Q  469 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagc 554  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  7502723 aatatttcctttaaaaatatatttgcatcaaatcttctgtcatacaatacaaaaatatttttattgttcataaatatattttcagc 7502638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17943719 - 17943540
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaac 140  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||  | |||||||| || ||  |     
T  17943719 atttgtttacctagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctctgatccactataatgatgagtttctttacaaagagatattga- 17943621  T
Q  141 gggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
      ||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17943620 --gttacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17943540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2741137 - 2740941
Alignment:
Q  29 aagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tga-tgagtaacgtta 125  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | |||    
T  2741137 aagaacacaaga-tatttgtttacctagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttcttta 2741039  T
Q  126 caaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 224  Q
    ||||| || |   | | ||| ||||||| |||||     ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2741038 caaagagata---atgagtttcaagaatcagtctttaaacctaattctacccaa-gtcccaacctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgt 2740943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 484 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 39287042 - 39286971
Alignment:
Q  484 aatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 555  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39287042 aatatatttgcatcaaatcttcattcatatggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttaagca 39286971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 28458949 - 28459011
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28458949 cctaattctacccaaagtcccaatatctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28459011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26345738 - 26345661
Alignment:
Q  166 taattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 242  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  26345738 taattctacccaaagtctcgaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttgctaaggtgaatcaac 26345661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15694094 - 15693958
Alignment:
Q  110 atgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaa-tctcttcccgtaaccaagag 206  Q
    |||||||||||| ||||||| | || |||||  |||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  15694094 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaaatctcttcctgtgaccaagag 15693995  T
Q  207 actcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaac 242  Q
    |||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15693994 actttatcctaatagtgtttctccacggtgaatcaac 15693958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 240
Target Start/End: Original strand, 27583479 - 27583535
Alignment:
Q  184 caatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 240  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27583479 caatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatca 27583535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2736401 - 2736205
Alignment:
Q  29 aagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tga-tgagtaacgtta 125  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | |||    
T  2736401 aagaacacaaga-tatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttcttta 2736303  T
Q  126 caaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 224  Q
    ||||| || |   | | ||| ||||||| ||||| |   |||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2736302 caaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattctacc-aaagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgt 2736207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17462632 - 17462436
Alignment:
Q  29 aagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tga-tgagtaacgtta 125  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | |||    
T  17462632 aagaacacaaga-tatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgaatgagtttcttta 17462534  T
Q  126 caaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 224  Q
    ||||| || |   | | ||| ||||||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17462533 caaagagata---aggagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgt 17462438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 476 - 555
Target Start/End: Original strand, 41304806 - 41304884
Alignment:
Q  476 cctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 555  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  41304806 cctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatatg-tacaaaaatatatttactatccataaatatattgtcagca 41304884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 434 - 530
Target Start/End: Original strand, 34575528 - 34575617
Alignment:
Q  434 ctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatattt 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | |||||||||||||||    
T  34575528 ctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaa-------tattccctttcaaaatatatttgcatcaaattttcctttatatggtacaaaaatatattt 34575617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 477 - 555
Target Start/End: Original strand, 41303457 - 41303535
Alignment:
Q  477 ctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 555  Q
    |||| |||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41303457 ctttaaaaatatatttgaatcaattcttccttcacacggtacaaaattatatttactgtccataaatatattttcagca 41303535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 227
Target Start/End: Original strand, 10942497 - 10942696
Alignment:
Q  32 aacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata--tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| ||| ||| | |||| || || |||||||||  ||||||||||  ||||||    
T  10942497 aacacaagagaatttgtttacctagttcggtccaatactgacctactctaggggagacaccagctcttcgttccactataattgatgagtaattttacaa 10942596  T
Q  129 agtgaaatcaacgggttacaagaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    || ||    || ||||||||||||| | || ||   | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  10942597 ag-gattcaaaagggttacaagaatcaatcctcaaacataattctacccaaagtcccgaatttcttcccgtgacaaagagactcaatcctaatagtgttt 10942695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 227
Target Start/End: Original strand, 10948366 - 10948565
Alignment:
Q  32 aacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata--tgatgagtaacgttacaa 128  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| ||| ||| | |||| || || |||||||||  ||||||||||  ||||||    
T  10948366 aacacaagagaatttgtttacctagttcggtccaatactgacctactctaggggagacaccagctcttcgttccactataattgatgagtaattttacaa 10948465  T
Q  129 agtgaaatcaacgggttacaagaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    || ||    || ||||||||||||| | || ||   | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  10948466 ag-gattcaaaagggttacaagaatcaatcctcaaacataattctacccaaagtcccgaatttcttcccgtgacaaagagactcaatcctaatagtgttt 10948564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 241
Target Start/End: Original strand, 34575230 - 34575308
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34575230 cctaattctacccaaagtcccgaatct-ttcccgagaccaagagactccatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 34575308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39687179 - 39686983
Alignment:
Q  29 aagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tga-tgagtaacgtta 125  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||  | |||    
T  39687179 aagaacacaaga-tatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgaatgagtttcttta 39687081  T
Q  126 caaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 224  Q
    ||||| || |   | | ||| ||||||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39687080 caaagagata---atgagtttcaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgt 39686985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 357 - 424
Target Start/End: Original strand, 41304696 - 41304763
Alignment:
Q  357 caaggtctatatttatagtgaaatataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgttt 424  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  41304696 caagatctgtatttatagagaaatataactcataaatttggaatggatatcacgctgaagatacgttt 41304763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 20054886 - 20054947
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20054886 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 20054947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 22712637 - 22712698
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22712637 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22712698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 22717346 - 22717407
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22717346 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22717407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 45567470 - 45567409
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45567470 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 45567409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7503052 - 7502975
Alignment:
Q  166 taattctacccaaagtcccaa-tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 241  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7503052 taattctacccaaagtctcaaatctcttcccttgaccaagatactcaatcctaatagtgtttctccaaggtggatcaa 7502975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 223
Target Start/End: Original strand, 27517664 - 27517818
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-c 164  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||  | |||||||| || ||  |   ||||||||||| ||||| |   |    
T  27517664 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactataatgatatgagtttctttacaaagagatattga---gttacaagaatcagtcttcaaac 27517760  T
Q  165 ctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27517761 ctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 27517818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 576 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 28568395 - 28568346
Alignment:
Q  576 tcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtca 625  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28568395 tcttttatatttttaacaacaatattcttcatccatcaaattttgagtca 28568346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 14699100 - 14699036
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  14699100 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 14699036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 241
Target Start/End: Original strand, 30720703 - 30720811
Alignment:
Q  136 tcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaag 232  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30720703 tcaaagggttacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtcacgaatctcttctcgtgccaaagagactcaatcctaatagtgtttctccaag 30720802  T
Q  233 gtgaatcaa 241  Q
     ||||||||    
T  30720803 atgaatcaa 30720811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 35028707 - 35028595
Alignment:
Q  166 taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcc 265  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||| |    |||||||||||||||| |    
T  35028707 taattctacccaaagtgtcaatctcttctcgtgatcaagagactcaatcataatagtgttttccaatgcgaatcaatc--tcaaccctagtgtttgttac 35028610  T
Q  266 gaagagacaaactcta 281  Q
     ||||| |||||||||    
T  35028609 caagag-caaactcta 35028595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Original strand, 12781342 - 12781400
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12781342 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 12781400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17932695 - 17932637
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17932695 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17932637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30479055 - 30478997
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  30479055 cctaattctacccaa-gtcccagtctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtg 30478997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 33604143 - 33603994
Alignment:
Q  79 tggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctaccc 176  Q
    ||||| ||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||||  ||||| |||||| ||||| |   ||||||||| ||     
T  33604143 tgggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacaaagatatatcaaaaggttagaagaattagtcttcaaacctaattcttcct 33604044  T
Q  177 aaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    |||||| ||||| |||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||    
T  33604043 aaagtctcaatcacttcccatgaccaaaagactcaattataatagtgttt 33603994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 8390243 - 8390179
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  8390243 ttgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactat 8390179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Original strand, 13569332 - 13569396
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  13569332 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 13569396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Original strand, 20522224 - 20522288
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  20522224 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactat 20522288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Original strand, 39482935 - 39482999
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  39482935 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcaggcctccaatccactat 39482999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Original strand, 37170873 - 37170931
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  37170873 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtg 37170931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Original strand, 41303155 - 41303210
Alignment:
Q  166 taattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaata 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  41303155 taattctacccaaagtcccgaatctcttcctgtgaccaagagacttaatcctaata 41303210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 1345634 - 1345572
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccact 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  1345634 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacctctccgatccact 1345572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 579 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 15693629 - 15693583
Alignment:
Q  579 tttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtca 625  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  15693629 tttatatttttagcaacaatattattcatccatcaaattttaagtca 15693583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 217
Target Start/End: Original strand, 27248021 - 27248075
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtccca-atctcttcccgtaaccaagagactcaatccta 217  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27248021 cctaattctacccaaagtcctggatctcttcccgtgaccaagagactcaatccta 27248075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39680106 - 39680045
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39680106 cctaattctacccaa-gtctcagcctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 39680045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 420
Target Start/End: Original strand, 41303341 - 41303411
Alignment:
Q  350 tctgatacaaggtctatatttatagtgaaatataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatac 420  Q
    ||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||| |||||    
T  41303341 tctgatacaagatatttatttatagagaaatataactcgtaaatttggaatggatatcacgctgatgatac 41303411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 45679919 - 45679838
Alignment:
Q  29 aagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  45679919 aagaacacaaga-tatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 45679838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 110
Target Start/End: Original strand, 33670992 - 33671033
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  33670992 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 33671033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 34682427 - 34682362
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||| || ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  34682427 ttgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactata 34682362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 10445537 - 10445473
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  10445537 ttgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 10445473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 110
Target Start/End: Original strand, 12781219 - 12781287
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  12781219 atttgtttacctagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 12781287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Original strand, 17057369 - 17057413
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  17057369 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagaga 17057413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Original strand, 17085352 - 17085396
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  17085352 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagaga 17085396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 28259270 - 28259206
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  28259270 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactat 28259206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 38191045 - 38190997
Alignment:
Q  178 aagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  38191045 aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttt 38190997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 15539514 - 15539553
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaatt 69  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15539514 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatt 15539553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 108
Target Start/End: Original strand, 31056048 - 31056111
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||| ||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  31056048 ttgttgacctagttcggttcaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccacta 31056111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 353 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 7502835 - 7502762
Alignment:
Q  353 gatacaaggtctatatttatagtgaaatata--actcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgttt 424  Q
    |||||| | ||| ||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  7502835 gatacatgatctgtatttatagagaaatatataactcgtaaatttggaatggatatcacgctgaagatacgttt 7502762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 226
Target Start/End: Original strand, 20050166 - 20050204
Alignment:
Q  188 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20050166 ctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 20050204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 109
Target Start/End: Original strand, 33118150 - 33118204
Alignment:
Q  55 agttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  33118150 agttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagccctccaatccactat 33118204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 576 - 625
Target Start/End: Original strand, 41303573 - 41303623
Alignment:
Q  576 tcttttatatttt-tagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtca 625  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  41303573 tcttttatattttttagcaacaatcttcttcatccatcaaattctgagtca 41303623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20589635 - 20589586
Alignment:
Q  326 ctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||| |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20589635 ctctctctctctctcaaggtttcatctgatacaaggtctatatttatagt 20589586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 30479151 - 30479110
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  30479151 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatctactata 30479110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 223
Target Start/End: Original strand, 33674551 - 33674584
Alignment:
Q  190 cttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33674551 cttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 33674584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 375
Target Start/End: Original strand, 36559072 - 36559105
Alignment:
Q  342 aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36559072 aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 36559105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 375
Target Start/End: Original strand, 36561349 - 36561382
Alignment:
Q  342 aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36561349 aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 36561382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 39680201 - 39680160
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  39680201 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactata 39680160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 40699284 - 40699235
Alignment:
Q  326 ctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||| |||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  40699284 ctctctctctctctcaaggtttactctgatgcaaggtctatatttatagt 40699235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 45158369 - 45158308
Alignment:
Q  166 taattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||    
T  45158369 taattctactcaaagtcctgaatctcttcccgtgaccaagagactatatcctaacagtgttt 45158308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 375
Target Start/End: Original strand, 45332389 - 45332422
Alignment:
Q  342 aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45332389 aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 45332422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Original strand, 723744 - 723788
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  723744 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 723788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 11067473 - 11067429
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  11067473 ttgttgaccgagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 11067429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Original strand, 33162450 - 33162494
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||    
T  33162450 ttgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctaggggagaga 33162494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 33528714 - 33528650
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| | ||||  |||||||| |||||| |||||||||    
T  33528714 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccactat 33528650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Original strand, 34139770 - 34139814
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  34139770 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 34139814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 39285004 - 39284960
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  39285004 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 39284960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 42039762 - 42039698
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||| || |||||||||| |||  |||||||||    
T  42039762 ttgttgatctagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagcagctctctaatccactat 42039698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 633
Target Start/End: Original strand, 11458 - 12059
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11458 agaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactatatgatgagtaacgttacaaa 11557  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11558 agagaaatcaatgggttacaagaataagtatcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 11657  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    | ||||||| || |||||||||    
T  11658 caaggaaaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcgaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgtcattctaaatccctgtttcagc 11756  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacg 421  Q
    |||||||||||      | | |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11757 cccctctatct------ccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccacactgaagatacg 11850  T
Q  422 tttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaa 521  Q
    |||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  11851 ttt---ttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaa 11947  T
Q  522 aatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttga 621  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  11948 aatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaattttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttga 12047  T
Q  622 gtcatactacaa 633  Q
     |||||||||||    
T  12048 atcatactacaa 12059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 85 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 2289 - 1737
Alignment:
Q  85 agagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcc 183  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2289 agagagtagccctccgattcactatatgatgaggaacgttacaaaagagaaattaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaagtcc 2190  T
Q  184 caatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctata 283  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  2189 cagccttttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt-tttattccgaagagacaaactctgta 2091  T
Q  284 caaagccctagct-----gttgc-tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtga 377  Q
    |||| |||||| |     ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  2090 caaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctatatctttctctcaaagtttgctatgaaacaaggtctatatttatagtga 1992  T
Q  378 aa-tataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattcc 476  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1991 aagtataacttataaatttggaacgaataccacactgaagatacgttt--tttttttctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattcc 1894  T
Q  477 ctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnnt 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |    
T  1893 ctttcaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaat 1794  T
Q  577 cttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1793 cttttatatttttagcaacaatattcttcttccttcaaattttgagtcatactacaa 1737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 52324 - 51685
Alignment:
Q  20 aaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagag--cagccctccgatccactatatgatgag 117  Q
    ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| | ||||||||||||||    
T  52324 aaagaagagaagaacacaaga--atttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactatatgatgag 52227  T
Q  118 taacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcct 216  Q
    |||||||||||| | ||  |||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52226 taacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccacctaattctatccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcct 52127  T
Q  217 aatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||   |||||    | ||||||||    
T  52126 aatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgttccaaaaagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgccattctaaac 52028  T
Q  311 ccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaacgaatatcac 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52027 ccttgtttcagccccctctatctct----caaagtttagtatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtataactcataaatttggaacgaataccac 51932  T
Q  410 actgaagatacgtttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttc 509  Q
    |||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  51931 actgaagatacgttt---ttttttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttt 51835  T
Q  510 atacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttcc 609  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||       ||||||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  51834 atacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcaccacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacattattctccatcc 51735  T
Q  610 atcaaattttgagtcatactacaaaattctcaaccttgactccaaattag 659  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  51734 atcaaattttgagtcatactacaacattctccaccttgactctaaattag 51685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 9 - 379
Target Start/End: Original strand, 183605 - 183973
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||    
T  183605 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgtttcacta 183704  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 207  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  183705 tatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcc-gtaaccaagaga 183803  T
Q  208 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----c 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||   |||||    |    
T  183804 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ctctagttttgttgttgcc 183902  T
Q  302 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183903 tttctaaacctttgtttcag-cccttctatct------caaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 183973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 576 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 50218 - 50161
Alignment:
Q  576 tcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaa 633  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50218 tcttttatatttttagcaacattattcttcatccatcaaattttgagtcatactacaa 50161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 50325 - 50235
Alignment:
Q  20 aaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggg--tagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||||    
T  50325 aaagaagagaagaacacaaga--atttgttgacccagttaggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactata 50235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 516 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 170115 - 170076
Alignment:
Q  516 tacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 555  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  170115 tacaaaaatatatttgttgtccatgaatatattttcagca 170076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 340; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 79488 - 78885
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa 129  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  79488 agaacacaaaataatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa 79389  T
Q  130 -gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 228  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79388 agagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaattctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc 79289  T
Q  229 caaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||| |||    
T  79288 caaggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagc 79190  T
Q  323 cccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaa-atataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacg 421  Q
    |||||||||||      |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  79189 cccctctatct------caagttttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaggtataactcataaatttggaacgaataccacactgaagataca 79096  T
Q  422 tttcnnnnnnnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaa 521  Q
    |||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  79095 ttt-tttttttcctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacagtacaaa 78997  T
Q  522 aatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttga 621  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  78996 aatatatttattatccataaatatatttttagcagaaaatatatttgagacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttaa 78897  T
Q  622 gtcatactacaa 633  Q
    ||||||||||||    
T  78896 gtcatactacaa 78885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 9 - 372
Target Start/End: Original strand, 69256 - 69622
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  69256 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccacta 69355  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  69356 tatgatgagtaacgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagac 69455  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||    
T  69456 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcct 69554  T
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttat 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  69555 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctct--caaagtttgctctgatataaggtctatatttat 69622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 228 - 375
Target Start/End: Original strand, 73207 - 73357
Alignment:
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcag 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    |||||||||||||||||||||    
T  73207 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagatttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag 73305  T
Q  322 ccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  73306 ccccctctatctctct--caaagtttcctttgatacacggtctatatttatagt 73357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 217 - 265
Target Start/End: Original strand, 73160 - 73208
Alignment:
Q  217 aatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcc 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  73160 aatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttttttcc 73208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 14 - 379
Target Start/End: Original strand, 41452 - 41817
Alignment:
Q  14 gaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatga 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41452 gaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatga 41551  T
Q  114 tgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaa 212  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  41552 tgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctaccgaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaa 41651  T
Q  213 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttct 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||    
T  41652 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttct 41750  T
Q  307 aaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41751 aaacccttgtttcagccccctctatctct------aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 41817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 27 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 6505 - 6157
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 126  Q
    |||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6505 agaagaacacaaagaaatttgttgactcagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 6406  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac-tcaatcctaatagtgtt 225  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6405 aaagagaaatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtt 6306  T
Q  226 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag-----ctgttgc-tttctaaacccttgtttc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      |||||| ||||||||||||||||||    
T  6305 tcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttattgttgcttttctaaacccttgtttc 6207  T
Q  320 agccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6206 agccccctctatct------caaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 6157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3203 - 2838
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  3203 gagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaatattttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctcggggagatagcagccctccaatccacta 3104  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||    
T  3103 tatgatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccaagcctcttcccataaccaagagac 3004  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ct 302  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||    
T  3003 tcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcct 2905  T
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2904 ttctaaacccttgtttcagccccctctatct------caaagtttgctctgatacaagttctatatttatagt 2838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 29494 - 29119
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29494 gagaagaacacaaaaaagagaagaacacaaacgaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccacta 29395  T
Q  109 tatgatgagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 208  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29394 tatgatgagtattgttacaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcctgcctaattctactcaaagccccaacctcttcccgtaaccaagagac 29295  T
Q  209 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ct 302  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||    
T  29294 tcaatcctaatagtgtatcccaaggcgaatcaacccataaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcct 29196  T
Q  303 ttctaaacccttgtttcagccccctcta----tctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  29195 ttttaaacccttgtttcagccccctctatctctctctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagt 29119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 1425 - 1673
Alignment:
Q  17 cacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatga 116  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1425 cacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatga 1524  T
Q  117 gtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcct 216  Q
    ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1525 gtatcgttacaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcct 1624  T
Q  217 aatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcc 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1625 aatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcc 1673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 26 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 348 - 1
Alignment:
Q  26 gagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 125  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  348 gagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgtta 249  T
Q  126 caaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgt 224  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  248 caaagagaaatcaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcacgtaaccaagagactccaatcctaatagtgt 149  T
Q  225 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagcccta-----gctgttgc-tttctaaacccttgttt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     | |||||| |||||||||||||||||    
T  148 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgttt 50  T
Q  319 cagccccctctatctctctcgcaaag-tttgctctgatacaaggtctat 366  Q
    |||||||||||||||||||| |||||   | ||||||||||||||||||    
T  49 cagccccctctatctctctctcaaagaaatactctgatacaaggtctat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 26 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4302 - 3955
Alignment:
Q  26 gagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtta 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  4302 gagaagaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacttta 4204  T
Q  126 caaa-gtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 224  Q
    |||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4203 caaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgt 4104  T
Q  225 ttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgttt 318  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||    
T  4103 ttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgttagttccaaagagacaaact-tatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 4006  T
Q  319 cagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    |||||||||||||||      ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4005 cagccccctctatct------caaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagt 3955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 43 - 368
Target Start/End: Original strand, 14380 - 14707
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacg 141  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |    
T  14380 atttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatg 14479  T
Q  142 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14480 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 14579  T
Q  242 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 335  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  14580 ccctcaaaccctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgtctttctaaaccattgtttcatccccctctatctct 14678  T
Q  336 ctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatat 368  Q
        ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  14679 ----caaagtttgctctaaaacaaggtctatat 14707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 55 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15297 - 14977
Alignment:
Q  55 agttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaacgggttacaagaat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||| |||||||||||||    
T  15297 agttcggtccaaattgacctagcatgggggagacagcagccttccgttccactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 15198  T
Q  154 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 253  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15197 aagtctcccgcataattctacccaaagtctgaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaactct 15098  T
Q  254 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagttt 347  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||   |||||    ||||||||| | |||||||||||||||||||||      ||||||||    
T  15097 agtgtttgttccaaagagacaaactttata-aaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatcattgtttcagccccctctatct------caaagttt 15005  T
Q  348 gctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15004 gctctgatacaaggtctatatttatagt 14977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 165; Significance: 6e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 34 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 80158 - 79852
Alignment:
Q  34 cacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gtg 132  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  80158 cacaaaagaatttgttgacccagttcaatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagag 80059  T
Q  133 aaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 232  Q
    |  |||| | |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  80058 atgtcaatgagttacaggaataagtctcctgcctaat-ctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaag 79960  T
Q  233 gtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccgaagagacaaactctatacaaagccctag-----ctgttg-ctttctaaacccttgtttcagcccc 325  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||      ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  79959 gtgaatcaaccctcaaaccctaatttttgttgccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttattgttgtctttctaaacccttgtttcagcccc 79861  T
Q  326 ctctatctc 334  Q
    |||||||||    
T  79860 ctctatctc 79852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 188363 - 188424
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  188363 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 188424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 43 - 492
Target Start/End: Original strand, 1639 - 2080
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaa 139  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || |||||    
T  1639 atttgtttacccagttcggtcaaaaactgacctagtatgggggagagagcagccctacgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 1738  T
Q  140 cgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 239  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1739 tgggttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcctaattgtgtttcccaaggtgaatc 1838  T
Q  240 aacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag-----ctgttgctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 334  Q
    || |||| ||||||||||||||||          |||||||||||||| ||||||      |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1839 aa-ccac-aaccctagtgtttgtt---------gaaactctatacaaa-ccctagttttcttgttgacttctaaacccttgtttcagccacctctatctc 1926  T
Q  335 tctcgcaaagtttgc-tctgatacaaggtctatatttatagtgaaatataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtttc---nnnnn 430  Q
    |      | |||| | ||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||            
T  1927 t------aggtttacatctgatacaaggtctatatt--tagagaaatgtaactcgtaaatttggaatggatatcacgctgaagataggtttccttttttt 2018  T
Q  431 nnnctccttcagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatattt 492  Q
       |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2019 tttctccttcagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaaaatatattt 2080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 520 - 633
Target Start/End: Original strand, 2070 - 2183
Alignment:
Q  520 aaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaatttt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  2070 aaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttt 2169  T
Q  620 gagtcatactacaa 633  Q
    ||||||||||||||    
T  2170 gagtcatactacaa 2183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 5)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22421 - 22221
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 126  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22421 agaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 22322  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtt 225  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22321 aaagagaaatcaatgagttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 22223  T
Q  226 tc 227  Q
    ||    
T  22222 tc 22221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24696 - 24496
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac 126  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24696 agaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac 24597  T
Q  127 aaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtt 225  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24596 aaagagaaatcaatgagttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtt 24498  T
Q  226 tc 227  Q
    ||    
T  24497 tc 24496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 8512 - 8448
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  8512 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactat 8448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22201 - 22168
Alignment:
Q  342 aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22201 aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 22168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24476 - 24443
Alignment:
Q  342 aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagt 375  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24476 aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagt 24443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 140; Significance: 5e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 85534 - 85275
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttac-a 127  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  85534 agaacacaaaagaatttgtttacctggttcagttcaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacga 85435  T
Q  128 aagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 227  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  85434 aagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctgattctactcaaagtcacaatctcttctcgtaaccaaaagactcaatcctagtagtgtttt 85335  T
Q  228 ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  85334 ccaaggtgaatcaaccctcaaactttagtgtttgttgctaagagacaaactctatacaaa 85275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 43 - 400
Target Start/End: Original strand, 15818 - 16174
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaa 139  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||||||| | || |||||    
T  15818 atttgtttacccagttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtcctccgttccactctaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 15917  T
Q  140 cgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 239  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  15918 tgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcgcaaggtgaatc 16017  T
Q  240 aacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag-----ctgttgctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 334  Q
    ||||    |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| ||||||      |||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  16018 aacc--tcaaccctagtgtttgttgctaggag-caaactctatacaaa-ccctagttttcttgttgacttctaaacccttatttcaaccccctctatct- 16112  T
Q  335 tctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa-tataactcataaatttggaac 400  Q
          || |||| |||||||||||  |||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||    
T  16113 -----taaggtttactctgatacaaaatctatatttatagtaaaagtatccctcataaatttggaac 16174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 57 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 5089 - 4722
Alignment:
Q  57 ttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa--gtgaaatcaacgggttacaagaa 152  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||  ||  | ||||||||| ||||||||| | |||||||  | || ||||| ||||||||| ||    
T  5089 ttcggtccaatactgacctagtctggggcagagagcagttctatgttccactataatgatgagtatctttacaaaaagagatatcaatgggttacaaaaa 4990  T
Q  153 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    ||| |    
T  4989 taagtctcccgcctaattctaccaaaagcttcaatctcttctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaacatgaatcaaac--tcaactc 4892  T
Q  253 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag-ctgttgct---ttctaaa-cccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagttt 347  Q
    ||||||||||| |  ||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||||   ||||||| || || |||||| |||||||||||      ||| ||||    
T  4891 tagtgtttgttgctgagaga-aaacgctatataaa-ccctagtttgttgcttacttctaaatcctttttttcagacccctctatct------caaggttt 4800  T
Q  348 gctctgatacaaggtctatatttatagtgaaatataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtttc 425  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4799 actctgatacaaggtctatatttatagagaaatataactcataaatttgaaacgaatatcacactgaagatacgtttc 4722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 487 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 4694 - 4541
Alignment:
Q  487 atatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatt 586  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |       |||||||||||    
T  4694 atatttgcatcaaattgtccttcatacagtacaaaaatatatatattgtccataaatatattttcagcacgaaatatattcgaaacaaatcttttatatt 4595  T
Q  587 tttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaaaattctc 640  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  4594 tttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgagttatactgcaacattctc 4541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 152 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 35819 - 35644
Alignment:
Q  152 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  35819 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttccctaggtgaattaaccctcaaacc 35720  T
Q  252 ctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaagccctag--ctgttg----ctttctaaacccttgtttcagc 322  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    ||||||||||||||||||||||    
T  35719 ctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 35644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 35897 - 35817
Alignment:
Q  30 agaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    |||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||    
T  35897 agaacacaaaataatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctaaggaagagagcagccctccgttccactata 35817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 287
Target Start/End: Original strand, 16647 - 16891
Alignment:
Q  43 atttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaa-gtgaaatcaa 139  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||  |||||| |||||||| |||||  | ||||  |  |||||||| ||||||||||| ||||||| | || |||||    
T  16647 atttgtttacccagttcggtccaaaactgacctggtctgggggagagataaaccctttgtcccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 16746  T
Q  140 cgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 239  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16747 tgggttacaagaataagtctctggcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtcaccaagtgactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatc 16846  T
Q  240 aacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaa 287  Q
    || |  | |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  16847 aatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaa 16891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 541 - 662
Target Start/End: Original strand, 1 - 122
Alignment:
Q  541 aatatattttcagcacaaaatatctttgnnnnnnntcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaaaattctc 640  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1 aatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacattctc 100  T
Q  641 aaccttgactccaaattagtga 662  Q
     |||||||||| ||||||||||    
T  101 caccttgactctaaattagtga 122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 79
Target Start/End: Original strand, 1415 - 1485
Alignment:
Q  9 gagatgaacacaaagatgagaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtct 79  Q
    |||| ||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1415 gagaagaacacaaagaagaaaaggacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 1485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 211 - 379
Target Start/End: Original strand, 993 - 1165
Alignment:
Q  211 aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaa-----gagacaaactctatacaaagccctagct-----gttg 300  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||| |||||||| | || | ||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||| |||||| |     ||||    
T  993 aatcctaaaagtatttcgcaaggtggatcaaccctccaaacgtagtgtttgttccaaactaaagagacaaactctatacaaa-ccctagttttgttgttg 1091  T
Q  301 c-tttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcgcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 379  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1092 cctttctaaacccttgtttcagccccttctatctc------aaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaa 1165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 226
Target Start/End: Original strand, 57433 - 57613
Alignment:
Q  51 acctagttcggtccaa-attgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactatatga-tgagtaacgttacaaagt-gaaatcaacgggttac 147  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||| ||||| | |||||||| ||||||| | || ||||| |||||||    
T  57433 acctagttccgtccaatactgacctagtctgggggagagagcagctctctgttccattatattaatgagtaactttacaaaatagatatcaaagggttac 57532  T
Q  148 aagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    |||||||  ||| |   |||||||| |||||||||||| ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  57533 aagaatagatcttcaaacctaattccacccaaagtcccgaatctcttccaatgaccaagagattcaatcctaatagtgttt 57613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 482 - 552
Target Start/End: Original strand, 57836 - 57905
Alignment:
Q  482 aaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 552  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  57836 aaaatatatttgcatcaaattttc-ttcatacggtacaaaaatatatttattgttcatacatatattttca 57905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 425
Target Start/End: Original strand, 57740 - 57813
Alignment:
Q  352 tgatacaaggtctatatttatagtgaaatataactcataaatttggaacgaatatcacactgaagatacgtttc 425  Q
    ||||||||| | | ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||| | |||| || |||||||||||||||    
T  57740 tgatacaagatatgtatttctagagaaatataattcacaaatttggaatggatattacgctgaagatacgtttc 57813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 99
Target Start/End: Original strand, 4661 - 4733
Alignment:
Q  27 agaagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctcc 99  Q
    |||| |||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4661 agaacaacacaaaggaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 4733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 224880 - 224819
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  224880 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 224819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Original strand, 5687 - 5751
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  5687 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactat 5751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Original strand, 2496 - 2560
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  2496 ttgttgacccagttcgctccaatatgacctaatctgggggagacagcagccctccaatccactat 2560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16386 - 16328
Alignment:
Q  164 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16386 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 16328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 110
Target Start/End: Original strand, 3055 - 3136
Alignment:
Q  29 aagaacacaaaagtatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata 110  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  3055 aagaacacaaga-tatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactata 3136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 223
Target Start/End: Original strand, 17011 - 17165
Alignment:
Q  69 tgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactata-tgat--gagtaacgttacaaagtgaaatcaacgggttacaagaataagtctcccg-c 164  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||  | |||||||| || |  ||   ||| ||||||| ||||| |   |    
T  17011 tgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatatgagtttctttacaaagagataataa---gtttcaagaatcagtcttcaaac 17107  T
Q  165 ctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 223  Q
    |||||||||||||| |||| |   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17108 ctaattctacccaa-gtcctagcttcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 44054 - 43990
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccactat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||| ||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  44054 ttgttgacccagttcggtccaatatgatctattctgggggagagagcagctctccaatccactat 43990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0533 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:

Target: scaffold0533; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 484 - 531
Target Start/End: Original strand, 1971 - 2018
Alignment:
Q  484 aatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatattta 531  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1971 aatatatttgtatcaaatattccttcatatgatacaaaaatatattta 2018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0474 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0474
Description:

Target: scaffold0474; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 576 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 10492 - 10443
Alignment:
Q  576 tcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtca 625  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  10492 tcttttatatttttaacaacaatcttttttatccatcaaattttgagtca 10443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 48 - 108
Target Start/End: Original strand, 10736 - 10796
Alignment:
Q  48 ttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccctccgatccacta 108  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  10736 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccacta 10796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 89
Target Start/End: Original strand, 20415 - 20459
Alignment:
Q  45 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggtagaga 89  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  20415 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 20459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University