View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17395_high_7 (Length: 333)

Name: NF17395_high_7
Description: NF17395
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17395_high_7
NF17395_high_7
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (18-322)||(26297432-26297736)
chr7 (18-322)||(26250832-26251136)
chr7 (18-322)||(26242384-26242688)
chr7 (137-316)||(26223525-26223704)
chr7 (21-322)||(26191252-26191553)
chr7 (137-316)||(26203887-26204066)
chr7 (21-317)||(19103406-19103702)
chr7 (18-317)||(26179075-26179374)
chr7 (124-314)||(26128562-26128752)
chr7 (124-314)||(26155198-26155388)
chr7 (138-314)||(26087776-26087952)
chr7 (138-314)||(26111564-26111740)
chr7 (242-317)||(26301803-26301878)
chr7 (243-316)||(26207428-26207501)
chr7 (139-201)||(26301904-26301966)
chr7 (21-86)||(26155426-26155491)
chr7 (21-78)||(26204125-26204182)
chr7 (21-78)||(26223763-26223820)
chr7 (21-86)||(26128790-26128855)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (124-314)||(44903245-44903435)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 18 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 26297736 - 26297432
Alignment:
Q  18 tcaagttcatgaaaactgttgtatagtgatccatagcttctttccgctgattcatacattggttcaaaaatggccgtcatagcattgttttccctttccc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26297736 tcaagttcatgaaaactgttgtatagtgacccatagcttctttccgctgattcatacattggttcaaaaatggccgtcatagcgttgttttccctttccc 26297637  T
Q  118 aattatgaagctgcagacatgtcatctcaatggtatgaggtaaacaaggaattgtaaatttctgtgtttcagaaactaaattataatggggtttatattt 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26297636 aattatgaagctgcagacgtgtcatctcaatggtatgaggtaaacaaggaattgtaaatttctgtgtttcagaaactaaattataatggggtttatattt 26297537  T
Q  218 tctaacaaaataaattgcacaataggagaagtagcttgagctgtaaaagtgaatccttggaatgtttagttttgcagctgattctacagtccaaggatac 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  26297536 tctaacaaaataaattgcacaataggagaagtagcttgagctgtaaaagtcaatccttggaatgtttagttttgcagctgattccacagtccaagggtat 26297437  T
Q  318 ttcat 322  Q
    |||||    
T  26297436 ttcat 26297432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 18 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 26251136 - 26250832
Alignment:
Q  18 tcaagttcatgaaaactgttgtatagtgatccatagcttctttccgctgattcatacattggttcaaaaatggccgtcatagcattgttttccctttccc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  26251136 tcaagttcatgaaaactgttgtatagtgacccatagcttctttctgctgattcatacattggttcaaaaatggccttcatagcattgttttccaattccc 26251037  T
Q  118 aattatgaagctgcagacatgtcatctcaatggtatgaggtaaacaaggaattgtaaatttctgtgtttcagaaactaaattataatggggtttatattt 217  Q
    ||| |  ||| ||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26251036 aatcacaaagttgctgacgggtcatctcaattgtatgaggtaaacaaggaattgtaaatttctgtgtatcagaaactaaattataatggggtttatattt 26250937  T
Q  218 tctaacaaaataaattgcacaataggagaagtagcttgagctgtaaaagtgaatccttggaatgtttagttttgcagctgattctacagtccaaggatac 317  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26250936 tctaacaaaataaattgcacattcggagaagtagcttgagctgcaaaagtaaatccttggaatgtttagttttgcagctgattctacagtccaaggatac 26250837  T
Q  318 ttcat 322  Q
    |||||    
T  26250836 ttcat 26250832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 18 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 26242688 - 26242384
Alignment:
Q  18 tcaagttcatgaaaactgttgtatagtgatccatagcttctttccgctgattcatacattggttcaaaaatggccgtcatagcattgttttccctttccc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26242688 tcaagttcatgaaaactgttgtatagtgacccatagcttctttccgctgatacataatttggttcaaaaatggccgtcataacattggtttccctttccc 26242589  T
Q  118 aattatgaagctgcagacatgtcatctcaatggtatgaggtaaacaaggaattgtaaatttctgtgtttcagaaactaaattataatggggtttatattt 217  Q
    | | |  ||| || ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26242588 agtcacaaagttgaagacgggtcatctcaactgtatgaggtaaacaaggaattgtaaatttctgtgtatcagaaactaaattataatggggtttatattt 26242489  T
Q  218 tctaacaaaataaattgcacaataggagaagtagcttgagctgtaaaagtgaatccttggaatgtttagttttgcagctgattctacagtccaaggatac 317  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26242488 tctaacaaaataaattccacagtcggagaagtagcttgagctgcaaaagtgaatccttggaatatttagttttgcagctgattccacagtccaaggatac 26242389  T
Q  318 ttcat 322  Q
     ||||    
T  26242388 atcat 26242384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 137 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26223704 - 26223525
Alignment:
Q  137 tgtcatctcaatggtatgaggtaaacaaggaattgtaaatttctgtgtttcagaaactaaattataatggggtttatattttctaacaaaataaattgca 236  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  |||||    
T  26223704 tgtcatctcaattgtatgaggcaaacaaggaacagtaaatttctgtgtatcagaaactaaattatcatgaggtctatactttctaacaaaatagcttgca 26223605  T
Q  237 caataggagaagtagcttgagctgtaaaagtgaatccttggaatgtttagttttgcagctgattctacagtccaaggata 316  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26223604 caattggagaagtagcttgagctgtaaaagtaaatccttggaatgtttagttttgcagctgattcaactgtccaaggata 26223525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 26191553 - 26191252
Alignment:
Q  21 agttcatgaaaactgttgtatagtgatccatagcttctttccgctgattcatacattggttcaaaaatggccgtcatagcattgttttccctttcccaat 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||  ||| ||   || ||| |||||||||  |||||    
T  26191553 agttcatgaaaactattgtatagtgtgccatagcttttttcctctgattcataaattggttcaaaataggctgtggcaggattcttttcccttaaccaat 26191454  T
Q  121 tatgaagctgcagacatgtcatctcaatggtatgaggtaaacaaggaattgtaaatttctgtgtttcagaaactaaattataatggggtttatattttct 220  Q
     | ||| |||||||   |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||  |||||||  |    
T  26191453 caggaatctgcagaggggtcatctcaatggtatgaggaaaactaggaatagtaaatttctgtgtatcagaaactaaattatcatgaggcctatatttcat 26191354  T
Q  221 aacaaaataaattgcacaataggagaagtagcttgagctgtaaaagtgaatccttggaatgtttagttttgcagctgattctacagtccaaggatacttc 320  Q
     | ||||| ||  |||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||    
T  26191353 gataaaatgaaaggcacagctggagaagtaacttgagctataaaagtgaatccttggaatgtttagttttgcagctgcttccactgtccaaggatacatc 26191254  T
Q  321 at 322  Q
    ||    
T  26191253 at 26191252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 137 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26204066 - 26203887
Alignment:
Q  137 tgtcatctcaatggtatgaggtaaacaaggaattgtaaatttctgtgtttcagaaactaaattataatggggtttatattttctaacaaaataaattgca 236  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  | |||    
T  26204066 tgtcatctcaattgtatgaggcaaacaaggaacggtaaatttctgtgtatcagaaactaaattatcatgaggtctatactttctaacaaaatagctcgca 26203967  T
Q  237 caataggagaagtagcttgagctgtaaaagtgaatccttggaatgtttagttttgcagctgattctacagtccaaggata 316  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26203966 caattggagaagtagcttgagctgtaaaagtaaatccttggaatgtttagttttgcagctgattcaactgtccaaggata 26203887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 317
Target Start/End: Original strand, 19103406 - 19103702
Alignment:
Q  21 agttcatgaaaactgttgtatagtgatccatagcttctttccgctgattcatacattggttcaaaaatggccgtcatagcattgttttccctttcccaat 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||  ||| || | || ||| |||   |||  |||||    
T  19103406 agttcatgaaaactattgtatagtgttccataacttcttttctctgattcaaacattggttcaaaataggcagtgacagaattctttgttcttaaccaat 19103505  T
Q  121 tatgaagctgcagacatgtcatctcaatggtatgaggtaaacaaggaattgtaaatttctgtgtttcagaaactaaattataatggggtttatattttct 220  Q
     | |||||||||||   |||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||| |||| ||  |    
T  19103506 caggaagctgcagaggagtcatctcaatggtatgaggcaaaccaggaaccgtaaatttctgcgtatcagaaactaaattattatgaggtctatacttcat 19103605  T
Q  221 aacaaaataaattgcacaataggagaagtagcttgagctgtaaaagtgaatccttggaatgtttagttttgcagctgattctacagtccaaggatac 317  Q
     | |||||  |   |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||| ||| || ||||||| ||||    
T  19103606 gataaaatggaaaacacagttggagaagtagcttgagctgtaatagtgaattcttggaatacctagttttgcagctgcttcgacggtccaagcatac 19103702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 26179374 - 26179075
Alignment:
Q  18 tcaagttcatgaaaactgttgtatagtgatccatagcttctttccgctgattcatacattggttcaaaaatggccgtcatagcattgttttccctttccc 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||  ||| |    || ||| ||| |   |  ||    
T  26179374 tcaagttcatgaaaactattgtatagtgttccataacttcttttctctgattcaaacattggttcaaaataggcagcggcaggattctttgcatgtaacc 26179275  T
Q  118 aattatgaagctgcagacatgtcatctcaatggtatgaggtaaacaaggaattgtaaatttctgtgtttcagaaactaaattataatggggtttatattt 217  Q
    ||| | |||| ||||||   ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| |||| ||    
T  26179274 aatcaggaagttgcagaggagtcatctcaattgtatgaggaaaacaaggaattgtaaatttctgtgtatcagaaactaaattatcatttggtctatactt 26179175  T
Q  218 tctaacaaaataaattgcacaataggagaagtagcttgagctgtaaaagtgaatccttggaatgtttagttttgcagctgattctacagtccaaggatac 317  Q
      | |  |||| |    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||   |||||||||||||| ||| || ||||| ||||||    
T  26179174 catgatcaaatgagcaacacaattggagaagtagcttgagctgtaataatgaattcttggaatacctagttttgcagctgcttccactgtccacggatac 26179075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 124 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26128752 - 26128562
Alignment:
Q  124 gaagctgcagacatgtcatctcaatggtatgaggtaaacaaggaattgtaaatttctgtgtttcagaaactaaattataatggggtttatattttctaac 223  Q
    |||||||||||   ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| |||| ||  | |     
T  26128752 gaagctgcagaggagtcatctcaattgtatgaggcaaaccaggaattgtaaatttctgtgtatcagaaactaaattatcatttggtctatacttcatgat 26128653  T
Q  224 aaaataaattgcacaataggagaagtagcttgagctgtaaaagtgaatccttggaatgtttagttttgcagctgattctacagtccaagga 314  Q
    |||||    |||||| | |||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||   |||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  26128652 aaaatgttctgcacagttggagaagtagcttgagctgttataatgaattcttggaatacctagttttgcagctgcttcgaccgtccaagga 26128562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26155388 - 26155198
Alignment:
Q  124 gaagctgcagacatgtcatctcaatggtatgaggtaaacaaggaattgtaaatttctgtgtttcagaaactaaattataatggggtttatattttctaac 223  Q
    |||||||||||   ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||| ||  | |     
T  26155388 gaagctgcagaggagtcatttcaattgtatgaggcaaaccaggaattgtaaatttgtgtgtatcagaaactaaattatcatgaggtctatacttcatgat 26155289  T
Q  224 aaaataaattgcacaataggagaagtagcttgagctgtaaaagtgaatccttggaatgtttagttttgcagctgattctacagtccaagga 314  Q
     |||| |   ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||   |||| ||||||||| ||| || |||||||||    
T  26155288 caaatgagcagcacaattggagaagtagcttgagctgtaataatgaattcttggaatacctagtcttgcagctgcttcgaccgtccaagga 26155198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26087952 - 26087776
Alignment:
Q  138 gtcatctcaatggtatgaggtaaacaaggaattgtaaatttctgtgtttcagaaactaaattataatggggtttatattttctaacaaaataaattgcac 237  Q
    ||||||||||| | |||||| || | |||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||| |||| ||  | | |||||    |||||    
T  26087952 gtcatctcaattgaatgagggaatccaggaacagtaaatttctgtgtatcagaaaccaaattatcatgaggtctatacttcatgataaaatgttctgcac 26087853  T
Q  238 aataggagaagtagcttgagctgtaaaagtgaatccttggaatgtttagttttgcagctgattctacagtccaagga 314  Q
    | | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  26087852 agttggagaagtagcttgagctgtaatagtgaattcttggaatacctagttttgcagctgcttcgaccgtccaagga 26087776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26111740 - 26111564
Alignment:
Q  138 gtcatctcaatggtatgaggtaaacaaggaattgtaaatttctgtgtttcagaaactaaattataatggggtttatattttctaacaaaataaattgcac 237  Q
    ||||||||||| | |||||| || | |||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||| |||| ||  | | |||||    |||||    
T  26111740 gtcatctcaattgaatgagggaatccaggaacagtaaatttctgtgtatcagaaaccaaattatcatgaggtctatacttcatgataaaatgttctgcac 26111641  T
Q  238 aataggagaagtagcttgagctgtaaaagtgaatccttggaatgtttagttttgcagctgattctacagtccaagga 314  Q
    | | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  26111640 agttggagaagtagcttgagctgtaatagtgaattcttggaatacctagttttgcagctgcttcgaccgtccaagga 26111564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 242 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 26301878 - 26301803
Alignment:
Q  242 ggagaagtagcttgagctgtaaaagtgaatccttggaatgtttagttttgcagctgattctacagtccaaggatac 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  26301878 ggagaagtagcttgagctgtaaaagtacatcctcggaatgttcagttttgaagctgattcaactgtccaaggatac 26301803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26207501 - 26207428
Alignment:
Q  243 gagaagtagcttgagctgtaaaagtgaatccttggaatgtttagttttgcagctgattctacagtccaaggata 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  26207501 gagaagtagcttgagctgtaatagtaaagccttggaatgccgagttttgcagctgattccactgtccatggata 26207428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26301966 - 26301904
Alignment:
Q  139 tcatctcaatggtatgaggtaaacaaggaattgtaaatttctgtgtttcagaaactaaattat 201  Q
    |||||||||| |||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  26301966 tcatctcaattgtatgaggcaaaccagcaatagtaaatttctgtgtatcagaaaccaaattat 26301904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 26155491 - 26155426
Alignment:
Q  21 agttcatgaaaactgttgtatagtgatccatagcttctttccgctgattcatacattggttcaaaa 86  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |  ||||||||| |||| |||||||    
T  26155491 agttcatgaaaactattgtatagtgttccataacttcttttctgtgattcataaattgcttcaaaa 26155426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 26204182 - 26204125
Alignment:
Q  21 agttcatgaaaactgttgtatagtgatccatagcttctttccgctgattcatacattg 78  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||||||    
T  26204182 agttcatgaaaactattgtatagtgttccaaagcttcttttctctgattcaaacattg 26204125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 26223820 - 26223763
Alignment:
Q  21 agttcatgaaaactgttgtatagtgatccatagcttctttccgctgattcatacattg 78  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||||||    
T  26223820 agttcatgaaaactattgtatagtgttccaaagcttcttttctctgattcaaacattg 26223763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 26128855 - 26128790
Alignment:
Q  21 agttcatgaaaactgttgtatagtgatccatagcttctttccgctgattcatacattggttcaaaa 86  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||| |  ||||||||| |||| |||||||    
T  26128855 agttcatgaaaactattgcatagtgttccataacttcttttctgtgattcataaattgcttcaaaa 26128790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 124 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 44903435 - 44903245
Alignment:
Q  124 gaagctgcagacatgtcatctcaatggtatgaggtaaacaaggaattgtaaatttctgtgtttcagaaactaaattataatggggtttatattttctaac 223  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| || ||| ||| |||| ||||||||    
T  44903435 gaagctgcagacggctcatctcaatggtatgaggcaaacaaggaatagtaaacttctgtgtatcagaaactaaatgatcatgaggtctatactttctaac 44903336  T
Q  224 aaaataaattgcacaataggagaagtagcttgagctgtaaaagtgaatccttggaatgtttagttttgcagctgattctacagtccaagga 314  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| | | || ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44903335 aaaataacatgcacaattggagaagtagcttgagctgtaataataaagcctaggaatgcttagttttgcagctgattccacagtccaagga 44903245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University