View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17402_high_38 (Length: 319)

Name: NF17402_high_38
Description: NF17402
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17402_high_38
NF17402_high_38
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (1-198)||(16566327-16566524)
chr6 (1-198)||(188984-189181)
chr6 (1-198)||(17684476-17684673)
chr6 (1-198)||(17691447-17691644)
chr6 (1-198)||(25537166-25537363)
chr6 (1-198)||(11651726-11651923)
chr6 (1-198)||(29308893-29309090)
chr6 (1-198)||(29315853-29316050)
chr6 (1-198)||(27381259-27381456)
chr6 (1-198)||(27471642-27471839)
chr6 (1-198)||(13359276-13359473)
chr6 (1-162)||(20553594-20553755)
chr6 (8-182)||(8509941-8510116)
chr6 (237-291)||(17691683-17691737)
chr6 (244-293)||(27381502-27381551)
chr6 (244-293)||(27471885-27471934)
chr6 (237-293)||(29308798-29308854)
chr6 (237-293)||(29315758-29315814)
chr6 (7-178)||(27925772-27925948)
chr6 (1-163)||(17850502-17850663)
chr6 (237-293)||(17684712-17684768)
chr6 (239-293)||(11651630-11651684)
chr6 (237-293)||(25537405-25537461)
chr6 (139-194)||(31258065-31258120)
chr6 (237-285)||(13359512-13359560)
chr6 (237-285)||(16566563-16566611)
chr6 (237-295)||(189221-189282)
chr6 (120-185)||(22259925-22259990)
chr6 (86-163)||(28605854-28605931)
[»] scaffold0234 (4 HSPs)
scaffold0234 (1-198)||(2328-2525)
scaffold0234 (1-198)||(11219-11416)
scaffold0234 (237-293)||(2564-2620)
scaffold0234 (237-293)||(11455-11511)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (1-198)||(5532-5729)
scaffold0063 (237-285)||(5444-5492)
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (1-198)||(4426611-4426807)
chr4 (1-198)||(5707323-5707520)
chr4 (1-198)||(19926767-19926964)
chr4 (1-198)||(5713951-5714148)
chr4 (1-198)||(26970466-26970663)
chr4 (1-198)||(28393141-28393338)
chr4 (1-198)||(55612686-55612883)
chr4 (1-195)||(868603-868797)
chr4 (3-189)||(8845215-8845401)
chr4 (3-189)||(8858179-8858365)
chr4 (1-198)||(18262215-18262412)
chr4 (1-198)||(26963643-26963840)
chr4 (1-198)||(10621340-10621537)
chr4 (1-198)||(10628419-10628616)
chr4 (1-198)||(18269071-18269273)
chr4 (86-198)||(12357139-12357251)
chr4 (2-193)||(20311299-20311491)
chr4 (1-195)||(10677562-10677753)
chr4 (1-195)||(10891202-10891393)
chr4 (1-195)||(35223576-35223760)
chr4 (1-195)||(5668132-5668327)
chr4 (56-198)||(5616216-5616358)
chr4 (237-294)||(19927003-19927060)
chr4 (237-293)||(5713856-5713912)
chr4 (237-293)||(26963548-26963604)
chr4 (237-293)||(26970371-26970427)
chr4 (237-293)||(5707228-5707284)
chr4 (237-293)||(10621576-10621632)
chr4 (237-293)||(12357044-12357100)
chr4 (237-291)||(868507-868561)
chr4 (2-175)||(21454145-21454319)
chr4 (237-294)||(17142372-17142429)
chr4 (237-293)||(10628655-10628711)
chr4 (237-293)||(55612594-55612650)
chr4 (237-295)||(4426847-4426905)
chr4 (239-293)||(28393380-28393434)
chr4 (237-293)||(18268976-18269032)
chr4 (85-152)||(39074278-39074346)
chr4 (237-286)||(55992680-55992729)
chr4 (5-64)||(39074211-39074270)
chr4 (237-278)||(5668371-5668412)
chr4 (237-285)||(8845118-8845166)
chr4 (237-285)||(8858082-8858130)
chr4 (237-277)||(18262136-18262176)
[»] chr3 (53 HSPs)
chr3 (1-198)||(13211305-13211502)
chr3 (1-198)||(18522666-18522863)
chr3 (1-195)||(17781125-17781319)
chr3 (1-198)||(6110067-6110264)
chr3 (1-198)||(10572599-10572796)
chr3 (1-198)||(16482490-16482687)
chr3 (1-198)||(18519981-18520175)
chr3 (1-195)||(10579362-10579556)
chr3 (1-195)||(15600891-15601085)
chr3 (1-195)||(15607436-15607630)
chr3 (1-198)||(17200191-17200388)
chr3 (1-195)||(19089752-19089946)
chr3 (1-198)||(13248610-13248807)
chr3 (1-198)||(13516814-13517011)
chr3 (1-195)||(15357593-15357787)
chr3 (1-195)||(32056907-32057101)
chr3 (15-198)||(8490491-8490674)
chr3 (40-198)||(18640792-18640950)
chr3 (1-195)||(1647528-1647726)
chr3 (1-182)||(15342226-15342407)
chr3 (2-195)||(29924977-29925170)
chr3 (2-195)||(29974130-29974323)
chr3 (13-198)||(16200129-16200313)
chr3 (13-198)||(16200435-16200619)
chr3 (1-194)||(24253395-24253589)
chr3 (1-95)||(17136465-17136559)
chr3 (137-198)||(18534759-18534820)
chr3 (237-293)||(6109972-6110028)
chr3 (237-293)||(8490396-8490452)
chr3 (237-293)||(13248515-13248571)
chr3 (237-293)||(13211211-13211267)
chr3 (237-293)||(18640989-18641045)
chr3 (244-293)||(10579604-10579653)
chr3 (237-293)||(17136137-17136193)
chr3 (154-198)||(18510925-18510969)
chr3 (244-293)||(10572841-10572890)
chr3 (237-293)||(15607672-15607729)
chr3 (244-293)||(17200434-17200483)
chr3 (237-293)||(15351237-15351293)
chr3 (237-293)||(15357829-15357885)
chr3 (237-293)||(16482727-16482782)
chr3 (237-293)||(18519885-18519941)
chr3 (237-294)||(1647768-1647825)
chr3 (237-293)||(15601127-15601184)
chr3 (237-293)||(13516719-13516775)
chr3 (249-293)||(17781370-17781414)
chr3 (249-293)||(19089997-19090041)
chr3 (237-293)||(32057144-32057200)
chr3 (237-293)||(18510829-18510885)
chr3 (237-293)||(18522570-18522626)
chr3 (237-285)||(18534671-18534719)
chr3 (237-293)||(29924879-29924935)
chr3 (237-293)||(29974032-29974088)
[»] chr1 (26 HSPs)
chr1 (1-198)||(18252033-18252230)
chr1 (1-198)||(21171240-21171437)
chr1 (1-198)||(27131416-27131613)
chr1 (1-198)||(27310584-27310781)
chr1 (1-198)||(16359042-16359239)
chr1 (9-198)||(18532529-18532718)
chr1 (1-195)||(36816640-36816834)
chr1 (1-198)||(3855926-3856123)
chr1 (1-195)||(22657228-22657423)
chr1 (1-195)||(27277564-27277756)
chr1 (2-167)||(12014292-12014457)
chr1 (54-167)||(12006599-12006712)
chr1 (237-294)||(18251935-18251992)
chr1 (237-294)||(18532757-18532814)
chr1 (3-189)||(9917927-9918106)
chr1 (237-293)||(27310821-27310877)
chr1 (237-293)||(16359280-16359336)
chr1 (126-195)||(30720625-30720694)
chr1 (237-293)||(21171479-21171535)
chr1 (244-293)||(22657472-22657521)
chr1 (244-285)||(36816885-36816926)
chr1 (99-171)||(3403248-3403320)
chr1 (99-171)||(3443499-3443571)
chr1 (237-293)||(3856164-3856220)
chr1 (237-293)||(27131652-27131704)
chr1 (237-293)||(27277800-27277856)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (1-195)||(24642655-24642849)
chr8 (2-195)||(6094129-6094322)
chr8 (1-196)||(21940670-21940865)
chr8 (1-198)||(28554886-28555083)
chr8 (1-198)||(22171492-22171687)
chr8 (68-195)||(24636860-24636987)
chr8 (1-189)||(38232384-38232570)
chr8 (2-180)||(2375027-2375203)
chr8 (237-294)||(22070107-22070164)
chr8 (237-293)||(21940573-21940629)
chr8 (244-293)||(24642556-24642605)
chr8 (237-293)||(6094031-6094087)
chr8 (237-293)||(22171396-22171452)
chr8 (237-293)||(28554791-28554847)
chr8 (100-163)||(10920234-10920297)
chr8 (101-171)||(32872948-32873019)
chr8 (49-97)||(30200270-30200318)
chr8 (256-293)||(24636605-24636642)
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (1-198)||(15152446-15152643)
chr7 (1-198)||(29327787-29327984)
chr7 (1-198)||(11536069-11536266)
chr7 (1-198)||(18561010-18561207)
chr7 (1-196)||(11542987-11543182)
chr7 (1-198)||(12750829-12751026)
chr7 (1-198)||(15148145-15148342)
chr7 (1-195)||(12738542-12738736)
chr7 (2-198)||(18257850-18258046)
chr7 (13-195)||(13392157-13392338)
chr7 (5-179)||(2364917-2365090)
chr7 (108-195)||(39111819-39111905)
chr7 (237-294)||(2653275-2653332)
chr7 (8-168)||(7396221-7396382)
chr7 (237-294)||(12738442-12738499)
chr7 (237-293)||(11543223-11543279)
chr7 (237-293)||(11536305-11536361)
chr7 (237-293)||(12750733-12750789)
chr7 (237-293)||(15152350-15152406)
chr7 (238-293)||(29327690-29327745)
chr7 (237-293)||(15148049-15148105)
chr7 (66-127)||(3132748-3132809)
chr7 (238-293)||(13392030-13392085)
chr7 (86-151)||(10234179-10234244)
chr7 (237-293)||(18258087-18258143)
chr7 (169-198)||(2653207-2653236)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (1-198)||(24695473-24695670)
chr5 (1-195)||(18569870-18570064)
chr5 (1-198)||(19714505-19714702)
chr5 (1-195)||(19707225-19707419)
chr5 (1-195)||(22547023-22547217)
chr5 (7-196)||(27347491-27347679)
chr5 (16-197)||(17285754-17285935)
chr5 (99-195)||(39537968-39538064)
chr5 (16-197)||(17298907-17299088)
chr5 (1-135)||(18807041-18807175)
chr5 (64-195)||(31886537-31886668)
chr5 (237-293)||(24695709-24695765)
chr5 (237-293)||(19714742-19714798)
chr5 (1-88)||(39538701-39538788)
chr5 (237-293)||(19707462-19707518)
chr5 (237-293)||(27347722-27347778)
chr5 (85-175)||(33477389-33477479)
chr5 (237-285)||(18570108-18570156)
chr5 (238-293)||(39537870-39537925)
chr5 (76-151)||(11479420-11479496)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (9-195)||(21330263-21330449)
chr2 (1-182)||(18796525-18796706)
chr2 (3-194)||(18619812-18620002)
chr2 (56-195)||(19692598-19692737)
chr2 (1-136)||(20977957-20978092)
chr2 (237-294)||(21330493-21330550)
chr2 (1-167)||(36270199-36270366)
chr2 (9-167)||(18822115-18822275)
chr2 (10-165)||(36802664-36802820)
chr2 (8-159)||(24471642-24471792)
chr2 (237-293)||(19692773-19692829)
[»] scaffold0390 (4 HSPs)
scaffold0390 (1-198)||(6941-7138)
scaffold0390 (1-198)||(13957-14154)
scaffold0390 (237-293)||(7177-7233)
scaffold0390 (237-293)||(14193-14249)
[»] scaffold0433 (2 HSPs)
scaffold0433 (1-194)||(7114-7307)
scaffold0433 (237-293)||(7015-7071)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (1-198)||(18291-18488)
scaffold0220 (237-293)||(18196-18252)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (1-195)||(25997-26191)
scaffold0186 (238-293)||(26231-26286)
[»] scaffold0657 (2 HSPs)
scaffold0657 (1-195)||(999-1193)
scaffold0657 (237-294)||(900-957)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (22-198)||(230369-230544)
scaffold0008 (237-293)||(230584-230640)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (137-195)||(8446-8504)
scaffold0176 (237-293)||(8546-8602)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (237-293)||(23769-23825)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (245-293)||(16523-16571)
[»] scaffold0705 (1 HSPs)
scaffold0705 (237-293)||(41-97)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (237-293)||(8944-9000)
[»] scaffold0767 (1 HSPs)
scaffold0767 (257-298)||(1-42)
[»] scaffold0565 (2 HSPs)
scaffold0565 (237-291)||(10202-10256)
scaffold0565 (151-182)||(10127-10158)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (50-172)||(92194-92317)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (244-293)||(5878-5927)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 16566327 - 16566524
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16566327 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaacgggg 16566426  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566427 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 16566524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 188984 - 189181
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  188984 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacaaatactttaagaatagtttccttatgtttaatgggg 189083  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189084 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 189181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 17684476 - 17684673
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17684476 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaacgggg 17684575  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684576 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 17684673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 17691447 - 17691644
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  17691447 gtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcactaaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaatgggg 17691546  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17691547 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaagaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 17691644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 25537166 - 25537363
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25537166 gtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaatagtttccttatgtttaacgggg 25537265  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537266 tctcacaataaagttatacttaatgttccattaaacggactaattattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 25537363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 11651923 - 11651726
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  11651923 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactactgatacttttagaatagtttccttatttttaatgggg 11651824  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11651823 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattttagggactttattattttgaaacaaatcaaaatcaataaagaaatgcct 11651726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29309090 - 29308893
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||     
T  29309090 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggc 29308991  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29308990 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 29308893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29316050 - 29315853
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||     
T  29316050 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggc 29315951  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29315950 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 29315853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 27381259 - 27381456
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  27381259 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactatggatactttgagaatagtttccatatgtttaatgggg 27381358  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381359 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 27381456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 27471642 - 27471839
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  27471642 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactatggatactttgagaatagtttccatatgtttaatgggg 27471741  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471742 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 27471839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 13359276 - 13359473
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||| ||| |||||||||| || ||||||||| | || || ||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| || |    
T  13359276 gtctatccatataatagtctctacgctttaatgttgtcccatttcacaataaaggttgactacggatactttaaaaataatgtttttatgtttaatggag 13359375  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    | |||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  13359376 tttcacgattaagttatacttaatgctccattaagcgaactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaataaataaataaatgcct 13359473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 20553594 - 20553755
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||||||||  ||||||||||  |||||||  || ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||| |||     
T  20553594 gtctaccaacataaaaatctttatgctttaattttatctcacttcacaataaaaattcactacggatgctttaagaataatattcttatatttaatggga 20553693  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttatt 162  Q
    |||||| |||||||  |||||||| || |||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  20553694 tctcacgattaagtcgtacttaatatttcattaaacggactagctatcctagagactttatt 20553755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 8510116 - 8509941
Alignment:
Q  8 cacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg-tctcac 106  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||   |||||||||| |||||  ||||||||| ||||   |||| || ||||| |||| |||||     
T  8510116 cacataatagtctttatgttttaatgctatctcatttcataataaagcttaactacatatactttaataatatcatcctcatatttaatgggggtctcat 8510017  T
Q  107 aattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 182  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8510016 aattaagtcgtacataatgttccatcaaatagactaattattctatagactttattattttaaaacaaaataaaat 8509941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 237 - 291
Target Start/End: Original strand, 17691683 - 17691737
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 291  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691683 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 17691737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 244 - 293
Target Start/End: Original strand, 27381502 - 27381551
Alignment:
Q  244 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381502 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 27381551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 244 - 293
Target Start/End: Original strand, 27471885 - 27471934
Alignment:
Q  244 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471885 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 27471934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29308854 - 29308798
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29308854 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 29308798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29315814 - 29315758
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29315814 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 29315758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27925948 - 27925772
Alignment:
Q  7 ccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggtctcac 106  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||| |||  |||||   ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||  |||||| || |||||||    
T  27925948 ccacataatagtctttgtgcttcaatgctataccacttccaaataaagtttgactagagatactttaagaataattttctttagtttaatggagtctcac 27925849  T
Q  107 aattaagt--tatactta---atgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaaca 178  Q
     |||||||   | |||||   ||||||| ||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27925848 gattaagtcacacacttaattatgttccgttaaacatactagttattctaaggactttattattttgaaacaaaaca 27925772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 17850502 - 17850663
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| | ||||  ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||| | |||||  ||     
T  17850502 gtctacccatataatagtctatatacttgaatgttatttgacttcacaa-aaagcttgactatggataatttaagaatagtgtccttgtttttaattgga 17850600  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttatta 163  Q
    | ||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||  |||| ||||| ||||||||||||||    
T  17850601 tatcacaattaagtcttacataatgttccaacaaacaaactagctattatagggactttatta 17850663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 17684712 - 17684768
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684712 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctattagggcttattccaaca 17684768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11651684 - 11651630
Alignment:
Q  239 tgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11651684 tgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 11651630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 25537405 - 25537461
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25537405 catgatacaaagccaaactcagtcaatatagattggctattagggcttaatccaaca 25537461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 194
Target Start/End: Original strand, 31258065 - 31258120
Alignment:
Q  139 actaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaat 194  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31258065 actaattattttagagactttattattttgaaacaaaacaaaagcaataaagaaat 31258120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Original strand, 13359512 - 13359560
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  13359512 catgatacaaagtcaaacccaatgaatatagattggctattaggactta 13359560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Original strand, 16566563 - 16566611
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16566563 catgatacaaagtcaaactcaatcaacatagattggctattagggctta 16566611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 295
Target Start/End: Original strand, 189221 - 189282
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaata---tagattggctattagggcttattccaacatt 295  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  189221 catgatacaaagccaaacccaatcaatatactagattgattattagggcttactccaacatt 189282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 185
Target Start/End: Original strand, 22259925 - 22259990
Alignment:
Q  120 ttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaa 185  Q
    ||||||||  |||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22259925 ttaatgttatattaaatggactagttattttagggagtttattattttgcaacataacaaaatcaa 22259990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 28605931 - 28605854
Alignment:
Q  86 ttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttatta 163  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||| | |||||| || |||||||||  | ||||||||||||  |||||||||    
T  28605931 ttatctttaacgaggtctcacaatttagtcacacttaaagtcccattaaacaaaataactattctagatactttatta 28605854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 4)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 2328 - 2525
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  2328 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 2427  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2428 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 2525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 11219 - 11416
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  11219 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 11318  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11319 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 11416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 2564 - 2620
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2564 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 2620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 11455 - 11511
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11455 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 11511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5729 - 5532
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5729 gtctacccacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacatatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 5630  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5629 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaaataaatcaataaagaaatgcct 5532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 5492 - 5444
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5492 catgatacaaagccaaacccaaacaatatagattggctattagggctta 5444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 4426611 - 4426807
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  4426611 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtt-ccttatgtttaacgggg 4426709  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426710 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 4426807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5707520 - 5707323
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5707520 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 5707421  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707420 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 5707323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 19926767 - 19926964
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  19926767 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 19926866  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926867 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 19926964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5714148 - 5713951
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5714148 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 5714049  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714048 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatgggctaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 5713951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 26970663 - 26970466
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  26970663 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 26970564  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970563 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 26970466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 28393141 - 28393338
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28393141 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttccttatgtttaatgggg 28393240  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28393241 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattttagggactttattattttgaaacaaatcaaaatcaataaagaaatgcct 28393338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 55612883 - 55612686
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||    
T  55612883 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagagtagtttccttatgtttaatgggg 55612784  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612783 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 55612686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 868797 - 868603
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  868797 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaacgggg 868698  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868697 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 868603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8845401 - 8845215
Alignment:
Q  3 ctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggtc 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  8845401 ctacccacataatagtctctatgctttaatgatatccgacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaacgggatc 8845302  T
Q  103 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845301 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 8845215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8858365 - 8858179
Alignment:
Q  3 ctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggtc 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  8858365 ctacccacataatagtctctatgctttaatgatatccgacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaacgggatc 8858266  T
Q  103 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858265 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 8858179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18262412 - 18262215
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18262412 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaacgggg 18262313  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18262312 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacgaaacaaaatcaataaagaaatgcct 18262215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 26963840 - 26963643
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  26963840 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 26963741  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963740 tctcacaattaagttatatttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 26963643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 10621340 - 10621537
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||     
T  10621340 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggc 10621439  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621440 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattccagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 10621537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 10628419 - 10628616
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||     
T  10628419 gtctacctacataatagtctctatgctttaataatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggc 10628518  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628519 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattccagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 10628616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18269273 - 18269071
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18269273 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaacgggg 18269174  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaac-----aaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  18269173 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 18269074  T
Q  196 cct 198  Q
    |||    
T  18269073 cct 18269071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 86 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12357251 - 12357139
Alignment:
Q  86 ttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaa 185  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12357251 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaa 12357152  T
Q  186 taaagaaatgcct 198  Q
    |||||||||||||    
T  12357151 taaagaaatgcct 12357139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20311491 - 20311299
Alignment:
Q  2 tctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggt 101  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||  ||||||||| || | | ||||||||||||| |||||    
T  20311491 tctacccacaaaatagtctctatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgacaacaaatactttaaaaacagtgtccttatgtttaatggggt 20311392  T
Q  102 ctcacaattaagttata-cttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||  | |||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20311391 ctcacaattaagttataccttaatgctccattgaacatattaactattataagtactttattattttaaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 20311299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 10677562 - 10677753
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||     
T  10677562 gtctacccacataatagtctatatactttaatgttatctca--tttcactaaagcttgactacggatactttaagaataatatcatttcgtttaatggg- 10677658  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||| | ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10677659 tctcgcgattaagtcatacttaatgctccattatacagactaattattttaggggctttattttattgaaacaaaagaaaatcaataaaaaaatg 10677753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 10891202 - 10891393
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||     
T  10891202 gtctacccacataatagtctatatactttaatgttatctca--tttcactaaagcttgactacggatactttaagaataatatcatttcgtttaatggg- 10891298  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||| | ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10891299 tctcgcgattaagtcatacttaatgctccattatacagactaattattttaggggctttattttattgaaacaaaagaaaatcaataaaaaaatg 10891393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 35223760 - 35223576
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||| |||       
T  35223760 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgttatccttttttacaataaagcttgactacgaatactttaagaataatgtcctttcgttttacg--- 35223664  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
           ||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  35223663 -------attaagtcacacttaatgctccattaaacagactaattattctagggactttattattttaaaacaaaacaaaatcaacaaagaaatg 35223576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 5668132 - 5668327
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggata--ctttaagaataatttccttatgtttaacgg 98  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||  ||  |||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| |||||   ||||| ||    
T  5668132 gtctatccacataatagtctctatgatttaatgttatctcttttcacaataaagcttgactacaaatatactttaagaataatgtcctttcatttaatgg 5668231  T
Q  99 ggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    | |||||| ||||| | | |||||||| |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5668232 g-tctcacgattaaatcacacttaatgctccattaaatagactaattattctagagactttattattttgaaacaaaacaaaatcaacaaagaaatg 5668327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5616358 - 5616216
Alignment:
Q  56 ttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggga 155  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| |||||  ||| ||| | |||||||||||||  |||  |||||| |||| |||| |    
T  5616358 ttgacaacggatactttaagaataatgtcctctagtttaacgggatctcatgatttagtcagacttaatgttccaagaaatagactaattattttaggaa 5616259  T
Q  156 ctttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5616258 ctttattattttgaaacaaaacaaaatgaataaagaaatgcct 5616216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Original strand, 19927003 - 19927060
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19927003 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 19927060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5713912 - 5713856
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713912 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 5713856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 26963604 - 26963548
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963604 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 26963548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 26970427 - 26970371
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970427 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 26970371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5707284 - 5707228
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707284 catgatacaaagccaaacacaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 5707228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 10621576 - 10621632
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621576 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 10621632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 12357100 - 12357044
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12357100 catgatacaaagccaaatccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 12357044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 237 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 868561 - 868507
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 291  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  868561 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggtttattccaa 868507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 175
Target Start/End: Original strand, 21454145 - 21454319
Alignment:
Q  2 tctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggt 101  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| ||| || ||||||| ||  |||||||| |||||||  |||| ||||| |||||| || ||||  |||| |||||    
T  21454145 tctactcacataataatctttatgcattattgttatctcatttcacaataaagtttgactatagatattttaaaaataatgtcattataattaatggggt 21454244  T
Q  102 ctcacaattaagttatactt-aatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaa 175  Q
    ||||  ||||||| | | || ||||||||||||| |  ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  21454245 ctcaatattaagtcacattttaatgttccattaatcaaactaactattctaagaactttattactttgaaacaaa 21454319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Original strand, 17142372 - 17142429
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17142372 catgatacaaagtcaaacccaatcaatatagattggctattagggctttttccaacat 17142429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 10628655 - 10628711
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628655 catgatacaaagtcaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 10628711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 55612650 - 55612594
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  55612650 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggttattagggcttattctaaca 55612594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 295
Target Start/End: Original strand, 4426847 - 4426905
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatt 295  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4426847 catgatacagagccaaacccaatcaatatagattggctattaggacttactccaacatt 4426905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 293
Target Start/End: Original strand, 28393380 - 28393434
Alignment:
Q  239 tgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28393380 tgatacaaagtcaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 28393434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18269032 - 18268976
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18269032 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctatttgggcttattccaaca 18268976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 152
Target Start/End: Original strand, 39074278 - 39074346
Alignment:
Q  85 cttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttcca-ttaaacggactaactattctag 152  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  39074278 cttatgtttaatggggtctcatgattaagtcatacttaatgttcaatttaaacggactaattattctag 39074346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 55992729 - 55992680
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttat 286  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  55992729 catgatacaaagtcaaacccaatcaatacaaattggctattagggcttat 55992680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 64
Target Start/End: Original strand, 39074211 - 39074270
Alignment:
Q  5 acccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacg 64  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||    
T  39074211 acccacgtaatagtctccatgctttaatgatatctcacttcacaataaagtatgactacg 39074270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 5668371 - 5668412
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctatta 278  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5668371 catgatacaaaaccaaacacaatcaatatagattggctatta 5668412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8845166 - 8845118
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8845166 catgatacaaagtcaaactcaatcaacatagattggctattaggactta 8845118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8858130 - 8858082
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8858130 catgatacaaagtcaaactcaatcaacatagattggctattaggactta 8858082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18262176 - 18262136
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctatt 277  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18262176 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctatt 18262136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 53)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13211502 - 13211305
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  13211502 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 13211403  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211402 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 13211305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18522863 - 18522666
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18522863 gtctacctacataatagtctctatgcttaaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaatgggg 18522764  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522763 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 18522666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 17781125 - 17781319
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  17781125 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 17781224  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781225 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 17781319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6110264 - 6110067
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  6110264 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 6110165  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110164 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 6110067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 10572599 - 10572796
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  10572599 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 10572698  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572699 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 10572796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 16482490 - 16482687
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||    
T  16482490 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagagtagtttccttatgtttaatgggg 16482589  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482590 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 16482687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18520175 - 18519981
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18520175 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggat---ttaagaatagtttccttatgtttaacgggg 18520079  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520078 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 18519981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 10579362 - 10579556
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  10579362 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 10579461  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579462 tctcacaattaagttatacttaatgttccatttaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 10579556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 15600891 - 15601085
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15600891 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 15600990  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600991 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 15601085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 15607436 - 15607630
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15607436 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 15607535  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607536 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 15607630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 17200191 - 17200388
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  17200191 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcacacatctcaataaagcttaactacggatactttaagaatagtttcattatgtttaaagggg 17200290  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200291 tatcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 17200388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 19089752 - 19089946
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  19089752 gtctacctacataatagtctctatgatttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttcattatgtttaaagggg 19089851  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089852 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactaatctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 19089946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13248807 - 13248610
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  13248807 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgttatcccacttctcaacaaagcttgactacgaatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 13248708  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248707 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 13248610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13517011 - 13516814
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13517011 gtctacccacataatagtctctgtgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatcgtttccttatgtttaacgggg 13516912  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13516911 tctcacaattaagttatacttaatgttccatgaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 13516814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 15357593 - 15357787
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||    
T  15357593 gtctacctacataatagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgtttaatgggg 15357692  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357693 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactaatctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 15357787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 32056907 - 32057101
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  32056907 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagtttgactacggacactttaagaatagtttctttatgtttaacgggg 32057006  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32057007 tcttacaataaagttatacttgatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 32057101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 8490674 - 8490491
Alignment:
Q  15 tagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggtctcacaattaagt 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8490674 tagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagt 8490575  T
Q  115 tatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490574 tatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 8490491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 40 - 198
Target Start/End: Original strand, 18640792 - 18640950
Alignment:
Q  40 cacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgga 139  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18640792 cacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatgga 18640891  T
Q  140 ctaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640892 ctaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 18640950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 1647528 - 1647726
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  1647528 gtctatccacataatagtctctatgctttaattatatcccttttctcaataaagcttgattacggatactttaaaaatagtttccttatgtttaacgggg 1647627  T
Q  101 tctcacaattaagtta----tacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1647628 tctcacaattaagttaattatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 1647726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 15342226 - 15342407
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||    
T  15342226 gtctacctacataatagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgtttaatgggg 15342325  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342326 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgaacaaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 15342407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29925170 - 29924977
Alignment:
Q  2 tctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggt 101  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  29925170 tctatccacataatagcctccatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgactacatatattttaagaataatgtccttatatttaatggggt 29925071  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29925070 ctcacaattaaattatacttaataatccattaaacggactaactattttaggggctttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 29924977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29974323 - 29974130
Alignment:
Q  2 tctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggt 101  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  29974323 tctatccacataatagcctccatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgactacatatattttaagaataatgtccttatatttaatggggt 29974224  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29974223 ctcacaattaaattatacttaataatccattaaacggactaactattttaggggctttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 29974130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16200313 - 16200129
Alignment:
Q  13 aatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggtctcacaattaa 112  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16200313 aatagtctccatgctttaatgatatcccacttcacaataaatcttgactacgaatactttaagaataatgtccttatgtttaatggggtctcacaattaa 16200214  T
Q  113 gttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||    
T  16200213 gttatacataatgttccattaaacgaactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaataaaa-caacgaagaaatgcct 16200129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16200619 - 16200435
Alignment:
Q  13 aatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggtctcacaattaa 112  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||    
T  16200619 aatagtcttcatgctttaatgacatcccacttcacaataaatcttgactacgaatactttaagaataatgtccttatgtttattggagtctcacaattaa 16200520  T
Q  113 gttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||    
T  16200519 gttatacataatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaataaaa-caacgaagaaatgcct 16200435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 24253395 - 24253589
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||  |||||||||||||| | ||||||||||| | ||||    
T  24253395 gtctaccgacataatagtctctatgctttaatgttacctcactttacaataaattttgaccacatatactttaagaatagtgtccttatgtttgatgggg 24253494  T
Q  101 -tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaat 194  Q
     |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24253495 atctcacgattaagtcatacttaatgttccatcaaacgaacgagctattctaaggactttattattttgaagtaaaacaaaatcaataaagaaat 24253589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 17136559 - 17136465
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaa 95  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17136559 gtctacccacataatagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaa 17136465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 137 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18534820 - 18534759
Alignment:
Q  137 ggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18534820 ggactaactattctatggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 18534759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 6110028 - 6109972
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110028 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 6109972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 8490452 - 8490396
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490452 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 8490396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13248571 - 13248515
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248571 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 13248515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13211267 - 13211211
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211267 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 13211211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 18640989 - 18641045
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640989 catgatacaaagccaaacacaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 18641045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 244 - 293
Target Start/End: Original strand, 10579604 - 10579653
Alignment:
Q  244 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579604 caaagtcaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 10579653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 17136193 - 17136137
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17136193 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 17136137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18510969 - 18510925
Alignment:
Q  154 gactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18510969 gactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 18510925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 293
Target Start/End: Original strand, 10572841 - 10572890
Alignment:
Q  244 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10572841 caaagtcaaacccaatcaatataggttggctattagggcttattccaaca 10572890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 15607672 - 15607729
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaa-tatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607672 catgatacaaagccaaacccaataaaatatagattggctattagggcttattccaaca 15607729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 293
Target Start/End: Original strand, 17200434 - 17200483
Alignment:
Q  244 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17200434 caaagccaaacccaatcaacatagattggctattagggcttactccaaca 17200483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 15351237 - 15351293
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15351237 catgatacaaagccaaaatcaatcattatagattggctattagggcttattccaaca 15351293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 15357829 - 15357885
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357829 catgatacaaagccaaaatcaatcattatagattggctattagggcttattccaaca 15357885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 16482727 - 16482782
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16482727 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattgg-tattagggcttattctaaca 16482782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18519941 - 18519885
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18519941 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattaggacttactccaaca 18519885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Original strand, 1647768 - 1647825
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  1647768 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagaccagctattagggcttactccaacat 1647825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 15601127 - 15601184
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaa-tatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15601127 catgatacaaatccaaacccaataaaatatagattggctattagggcttattccaaca 15601184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13516775 - 13516719
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13516775 catgatacacagccaaactcaatcaacatagattggctattagggcttactccaaca 13516719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 293
Target Start/End: Original strand, 17781370 - 17781414
Alignment:
Q  249 ccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17781370 ccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 17781414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 293
Target Start/End: Original strand, 19089997 - 19090041
Alignment:
Q  249 ccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19089997 ccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 19090041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 32057144 - 32057200
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32057144 catgatacaaagtcaaacccaatcaacatagattggctattagagcttactccaaca 32057200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18510885 - 18510829
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18510885 catgatacaaaatcaaactcaatcaatatagattggatattagggcttactccaaca 18510829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18522626 - 18522570
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18522626 catgatacaaaatcaaactcaatcaatatagattggatattagggcttactccaaca 18522570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 18534719 - 18534671
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18534719 catgatacaaaaccaaactcaatcaatatagattgactattagggctta 18534671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29924935 - 29924879
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  29924935 catgatacaatgtcaaactcaatcaatatagatcgactattagggcttactccaaca 29924879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29974088 - 29974032
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  29974088 catgatacaatgtcaaactcaatcaatatagatcgactattagggcttactccaaca 29974032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 26)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18252230 - 18252033
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18252230 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 18252131  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252130 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 18252033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 21171240 - 21171437
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21171240 gtctacccacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgttcaacgggg 21171339  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171340 tctcacaattaagttatatttaatgttccatgaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 21171437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 27131416 - 27131613
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  27131416 gtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacaaatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 27131515  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131516 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 27131613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 27310584 - 27310781
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||    
T  27310584 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactactgatactttaagaatagtttccttatgttcaacgtgg 27310683  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310684 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 27310781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 16359042 - 16359239
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16359042 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatattccatttctcaataaagcttgactagggttactttaagaatagtttccttatgtttaacgggg 16359141  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359142 tctcacaattaagttattcttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 16359239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 198
Target Start/End: Original strand, 18532529 - 18532718
Alignment:
Q  9 acataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggtctcacaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18532529 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 18532628  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532629 ttaagttatacttaatgttccattaaacgaactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 18532718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 36816640 - 36816834
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  36816640 gtctatccacataatagtctctatgctttaatggtatcccacttctcaataaagcttgactatggatactttaagaataatgtccttatgtttaacggag 36816739  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816740 tctcacaattaatttatacttaatgttccattaaacagacgaactattctagggacttcattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 36816834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 3855926 - 3856123
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  3855926 gtctacccacgtaatagtctccatgctttaataatatcccacttcacaataaagtttgactacaaatattttaagaataatgtccttatgtttaatgggg 3856025  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  3856026 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgggctaactattctagggactttgttattttgaaacaaaacaaaataaacaaagaaatgcct 3856123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 22657228 - 22657423
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||  || |||||||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  22657228 gtctatccacatgatagtctctatgctttaatgatatctcatttcagaataaagcttgactagagacactttaagaattgtgtccttatgtttaaagggg 22657327  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaac-aaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22657328 tctcacaattaagttatatttaatgttccattaaacagactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaaatcaataaagaaatg 22657423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 27277564 - 27277756
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||   ||    
T  27277564 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgttatcccttttcacaataaagcctgactacggatactttaagaataatgtcatttcggttaa-aagg 27277662  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||| | ||||||| | || ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27277663 tctcgcgattaagtcacac-taatgctccgttaaatggactaattattctagggacgttattattttgaaacaaaacaaaaacaacaaagaaatg 27277756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 167
Target Start/End: Original strand, 12014292 - 12014457
Alignment:
Q  2 tctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggt 101  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||  |||| | |||  || |||||||| |||||||||  |||||||||||  || |||||||||| ||| |    
T  12014292 tctacccacataatggtctttacgctttaatcgtatccctcttcacactaaagcttaactacggatgttttaagaataacatcattatgtttaatgggat 12014391  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattatttt 167  Q
    || || ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  12014392 ctaacgattaatttacacttaatattccattaaacggactatgtattctagtgactttattatttt 12014457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 167
Target Start/End: Original strand, 12006599 - 12006712
Alignment:
Q  54 gcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagg 153  Q
    ||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||  | ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12006599 gcttgactacgaatgttttaataataatgtccttatgtttcatggggtctcacgattaaggcacacttaatattccattaaatagactaactattctagg 12006698  T
Q  154 gactttattatttt 167  Q
    ||||||||||||||    
T  12006699 gactttattatttt 12006712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18251992 - 18251935
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18251992 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 18251935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Original strand, 18532757 - 18532814
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532757 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 18532814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 9917927 - 9918106
Alignment:
Q  3 ctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggtc 102  Q
    ||||| ||||| || ||| ||||||| |||| |||| |||||  ||||||||||| ||||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||  || ||    
T  9917927 ctaccgacatagtattctctatgcttcaatgctatcccacttaacaataaagcttaactatagatattttaagaataatgtccttatatttaa-tggatc 9918025  T
Q  103 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 189  Q
    ||   || |||||||||||||||||| |||||||  |||||       || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9918026 tcgtgatcaagttatacttaatgttcgattaaacaaactaa------aagtgactttattattttgtaacaaaacaaaatcaataaa 9918106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 27310821 - 27310877
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27310821 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 27310877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 16359280 - 16359336
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16359280 catgatacaaatcctaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 16359336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 195
Target Start/End: Original strand, 30720625 - 30720694
Alignment:
Q  126 ttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||    
T  30720625 ttccattaaacgaactaattattccaggaactttattattttaaaacaaaataaaaccaataaaaaaatg 30720694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 21171479 - 21171535
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21171479 catgatacaaagccaaactcaatccatatagattggctattagagcttactccaaca 21171535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 293
Target Start/End: Original strand, 22657472 - 22657521
Alignment:
Q  244 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  22657472 caaagccaaactcaatcaatatatattggctattaaggcttactccaaca 22657521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 285
Target Start/End: Original strand, 36816885 - 36816926
Alignment:
Q  244 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36816885 caaagccaaacccaatcaatatagattgaatattagggctta 36816926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 3403320 - 3403248
Alignment:
Q  99 ggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaa 171  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  3403320 ggtctcacatttaagtcacacttaatattccattaatcagactaactattttatagactttattactttgaaa 3403248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 171
Target Start/End: Original strand, 3443499 - 3443571
Alignment:
Q  99 ggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaa 171  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  3443499 ggtctcacatttaagtcacacttaatattccattaatcagactaactattttatagactttattactttgaaa 3443571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 3856164 - 3856220
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||    
T  3856164 catgatacaaagtcaaacccaatcaagatggattggctattagggcctactccaaca 3856220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 27131652 - 27131704
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131652 catgatacaaagccaaacccaac----atagattggctattagggcttattccaaca 27131704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 27277800 - 27277856
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27277800 catgatacaaagtcaaacataattaacatagattggctattagggcttactccaaca 27277856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24642849 - 24642655
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24642849 gtctacccacataatagtctctatactttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaatagtttccttatgtttaacgggg 24642750  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642749 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaacaattctagggactttatgattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 24642655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6094322 - 6094129
Alignment:
Q  2 tctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggt 101  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  6094322 tctacccatataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaaaaatagtttccttatgtttaacggggt 6094223  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094222 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 6094129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 21940865 - 21940670
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21940865 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 21940766  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940765 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgc 21940670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28555083 - 28554886
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||    
T  28555083 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 28554984  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28554983 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattttaggtattttattattttgaaactaaacaaaatcaataaagaaatgcct 28554886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22171687 - 22171492
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||| ||||    
T  22171687 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttc--tatgtttaatgggg 22171590  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  22171589 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaataaaacaaaatcaataaggaaatgcct 22171492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 68 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24636987 - 24636860
Alignment:
Q  68 actttaagaataatttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattatttt 167  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24636987 actttaagaatagtttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaaaggactaactattctagggactttattatttt 24636888  T
Q  168 gaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24636887 gaaacaaaacaaaatcaagaaagaaatg 24636860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 38232384 - 38232570
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||   ||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||| | |  ||| |||||| || |    
T  38232384 gtctacccacaaaatagtttttatgctttaagactatctcactttacaataaagtttgactacaaatactttaagaatactatt-ttacgtttaatggag 38232482  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 189  Q
    | |||  |||||||||||| |||   |  ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38232483 tgtcatgattaagttatacctaaaaatttattaaacagactaactattctagaga-tttattattttgaaataaaacaaaatcaataaa 38232570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 2375203 - 2375027
Alignment:
Q  2 tctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggt 101  Q
    ||||||||| |||||||  |||| |||||||| |||||||||   ||||||| | |||||||  ||||||||| |||||| | | ||||||||| ||| |    
T  2375203 tctacccacttaatagttcatatactttaatgttatctcactcg-caataaatcgtgactacatatactttaaaaataatattcgtatgtttaatgggtt 2375105  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaa 180  Q
     |||  ||||||| ||  | ||||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2375104 -tcatgattaagtcatcataaatgttccattaaattgactaattattatagggagtttattattttgaaacaaaacaaa 2375027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22070164 - 22070107
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22070164 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 22070107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 21940629 - 21940573
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940629 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 21940573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 244 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 24642605 - 24642556
Alignment:
Q  244 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24642605 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 24642556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 6094087 - 6094031
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6094087 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 6094031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22171452 - 22171396
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171452 catgatacaaaatcaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 22171396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 28554847 - 28554791
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28554847 catgatacaaagccaaacccaatcaacaaagattggctattagggcttactccaaca 28554791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 10920297 - 10920234
Alignment:
Q  100 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttatta 163  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||    
T  10920297 gtctcacgattaactcatacttaatgttccattaaacagactaattattctaggaattttatta 10920234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 171
Target Start/End: Original strand, 32872948 - 32873019
Alignment:
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccat-taaacggactaactattctagggactttattattttgaaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||  ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  32872948 tctcacaattaagtcatacttaatgttctatataaatggatgaactattataaggactttattattttgaaa 32873019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 97
Target Start/End: Original strand, 30200270 - 30200318
Alignment:
Q  49 ataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacg 97  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  30200270 ataaaggttgactacgtatactttaagaataatatccttatttttaacg 30200318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 24636642 - 24636605
Alignment:
Q  256 caatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24636642 caatcaatatagattggctattatggcttactccaaca 24636605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15152643 - 15152446
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15152643 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccgtatgtttaacgggg 15152544  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15152543 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaactcaataaagaaatgcct 15152446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29327984 - 29327787
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  29327984 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 29327885  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327884 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaactgactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 29327787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 11536069 - 11536266
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||    
T  11536069 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgtttaatgggg 11536168  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11536169 tctcacaattaagttgtacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 11536266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18561207 - 18561010
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18561207 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacctctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttcctaatgtttaacgggg 18561108  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561107 tctcacagttaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 18561010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 11542987 - 11543182
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||    
T  11542987 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgtttaatgggg 11543086  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgc 196  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11543087 tctgacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgc 11543182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12751026 - 12750829
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  12751026 gtctatccacataatagtctctatgctttaatgatatccaacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttctttatgtttaacgagg 12750927  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12750926 tctcacaattaagttatacttaatgtttcattaaacggactaactattctagggactttattactttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 12750829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15148342 - 15148145
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15148342 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttccttatgtttaacgggg 15148243  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15148242 tctcacaattaagttatacttaatgttcaatcaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaactcaataaagaaatgcct 15148145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 12738736 - 12738542
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  12738736 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttccttatgtttaacaagg 12738637  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12738636 tctcacaattaagttataattaatgtttcattaaacaaactaactattctagggactttattattttgaaacaaaataaaatcaataaagaaatg 12738542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Original strand, 18257850 - 18258046
Alignment:
Q  2 tctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggt 101  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||| || ||||  ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  18257850 tctatccacataatagtctttatgcattattgttatcctacttaacaaaaaaacttgactacggatactttaagaataatgtccttgtgtttaatggggt 18257949  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18257950 ctcacaattaagtcatacttaatgttccattaaacagactaattattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 18258046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13392338 - 13392157
Alignment:
Q  13 aatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggtctcacaattaa 112  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||| |  ||  |||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||   ||||| ||| |||||| |||||    
T  13392338 aatagtctctatgttttaatgttatcccttttcacaataaagtttgactattgatactttaagaataatgtcctttcatttaatggg-tctcacgattaa 13392240  T
Q  113 gttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    || | |||||||| |||||||| | |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  13392239 gtcacacttaatgctccattaagcagactaattgttctaggaactttattattttgaaacaaaacaaagtcaacaaagaaatg 13392157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2365090 - 2364917
Alignment:
Q  5 acccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggtctc 104  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| ||  |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| || ||  |||||| ||| ||||    
T  2365090 acccacatgatagtctctatgttttaatgttatctcatttcacaataagg-ttgactacgaatattttaagaataatgtcatttagtttaatgggttctc 2364992  T
Q  105 acaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 179  Q
    || ||||||  | |||||||||||||||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  2364991 acgattaagccacacttaatgttccattagaaagactaattattctagagactttattattttgaaacataacaa 2364917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 39111905 - 39111819
Alignment:
Q  108 attaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  39111905 attaagtcgtacttaatgtttcattaaacggactcgctattctagggactttatt-ttttgaaataaaacaaaattaataaagaaatg 39111819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Original strand, 2653275 - 2653332
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2653275 catgatacaaagccaatcccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 2653332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 7396382 - 7396221
Alignment:
Q  8 cacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggtctcaca 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||   |||  | ||  || ||| ||||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||      
T  7396382 cacataatagtctctatgctttaatatcatcgtatttcacactaaggcttgactacatatgttttaagaataattttcttatgtttaatagggtctcaag 7396283  T
Q  108 attaagttatacttaatgttcca-ttaaacggactaactattctagggactttattattttg 168  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  7396282 attaagtcatacttaatgttccatttaaatgaactaactattctagcgacatttttattttg 7396221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12738499 - 12738442
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12738499 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaacat 12738442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 11543223 - 11543279
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11543223 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 11543279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 11536305 - 11536361
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11536305 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagagtggctattagggcttattccaaca 11536361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 12750789 - 12750733
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12750789 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattagctattagggcttactccaaca 12750733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15152406 - 15152350
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15152406 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 15152350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29327745 - 29327690
Alignment:
Q  238 atgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29327745 atgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 29327690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15148105 - 15148049
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15148105 catgatacaaaaccaaacccaattaatatagattggctattagggcttactccaaca 15148049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 3132809 - 3132748
Alignment:
Q  66 atactttaagaataatttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgtt 127  Q
    ||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3132809 atactttcataataatgaccttatgtttaatggggtctcacaattaagttacacttaatgtt 3132748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13392085 - 13392030
Alignment:
Q  238 atgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  13392085 atgatacaaagtcaaacacaatcaatatagattggatattagggcttactccaaca 13392030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 10234244 - 10234179
Alignment:
Q  86 ttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattcta 151  Q
    |||||||||| ||  |||||  ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  10234244 ttatgtttaatggaatctcatgattaagttatatttaatggttcattaaacggactaactattcta 10234179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 18258087 - 18258143
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18258087 catgatacaaggccaaaaccaatcaatctagattggctatcagggcttactccaaca 18258143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 198
Target Start/End: Original strand, 2653207 - 2653236
Alignment:
Q  169 aaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2653207 aaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 2653236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 24695473 - 24695670
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||    
T  24695473 gtctacctacataatagtctctatgctttattgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 24695572  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695573 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 24695670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 18569870 - 18570064
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18569870 gtctaccaacataatagtctttatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagagtagtttccttatgtttaacgggg 18569969  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569970 tctcacaattaagttatacttaatgttcaattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 18570064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 19714505 - 19714702
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19714505 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgacttcggatattttaagaatagattccttatgtttaacgggg 19714604  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19714605 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattactttgaaataaaacaaaatcaataaagaaatgcct 19714702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 19707225 - 19707419
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19707225 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgacttcggatattttaagaatagattccttatgtttaacgggg 19707324  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19707325 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaactgactaactattctagggactttattactttgaaataaaacaaaatcaataaagaaatg 19707419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 22547023 - 22547217
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||| |||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||  |||||||| |||||| || ||||||||| |||||| ||| ||| ||||| | |     
T  22547023 gtctatccacataatagtctctatattttaatgttatctcacttcacaataaagtttgactgcgaatactttaaaaataatgtccatatatttaatgaga 22547122  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  22547123 tctcacgattaagttatacttaatgttccattaaaccgactaactattatagcggttttattattttaaaataaaacaaaatgaataaataaatg 22547217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 196
Target Start/End: Original strand, 27347491 - 27347679
Alignment:
Q  7 ccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggtctcac 106  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |  ||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||| ||| ||||||    
T  27347491 ccacaaaatagtctctatgctttaatgttatcccttttcacaataaagcttgactacatatactttaagaataatgtcctttcgtttaatggg-tctcac 27347589  T
Q  107 aattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgc 196  Q
     ||||||| | |||||||| |||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27347590 gattaagtcacacttaatgctccattaaacagattaattattctaaggactttattattttgaatcaaaacaaaatcaacaaagaaatgc 27347679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 197
Target Start/End: Original strand, 17285754 - 17285935
Alignment:
Q  16 agtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggtctcacaattaagtt 115  Q
    |||||||||||||||||  |||| || ||  |||||||| | ||||| | |||||||||||||||| || ||  |||||   |||| |||| |||||||     
T  17285754 agtctatatgctttaatactatcccaattcacaataaagatcgactatgaatactttaagaataatgtcatttagtttactagggtttcacgattaagtc 17285853  T
Q  116 atacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 197  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17285854 acacttaatgttccattaaacagactaactattctctggagattattattttgaaacataacaaaatcaataaataaatgcc 17285935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 39538064 - 39537968
Alignment:
Q  99 ggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39538064 ggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgaaccaactattctaaggacttaaccattttgaaacaaaacaaaatcattaaagaaatg 39537968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 197
Target Start/End: Original strand, 17298907 - 17299088
Alignment:
Q  16 agtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggtctcacaattaagtt 115  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||  |||||||| | ||||| | |||||||||||||||| || ||  |||||   |||| |||| |||||||     
T  17298907 agtctatatgctttaatactatcccacttaacaataaagatcgactatgaatactttaagaataatgtcatttagtttactagggtttcacgattaagtc 17299006  T
Q  116 atacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 197  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17299007 gcacttaatgttccattaatcggactaactattctctggatattattatttataaacataacaaaatcaataaataaatgcc 17299088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 18807041 - 18807175
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttcc-ttatgtttaacggg 99  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||  |||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||     
T  18807041 gtctacccgcataatagtctctatgctttattgttatcttacttcacaataacgcttgactatagatactttaagaataatgtccattat-tttaatggt 18807139  T
Q  100 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaa 135  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18807140 gtctcacgattaagtcacacttaatgttccattaaa 18807175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 31886668 - 31886537
Alignment:
Q  64 ggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttatta 163  Q
    |||| ||||||||||| | | |||||  |||| || ||||||| |||||||  ||||| |||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||||||    
T  31886668 ggattctttaagaatattgttcttataattaatggagtctcacgattaagtcgtacttgatgttcaattaaatgaactaattattctaaggactttatta 31886569  T
Q  164 ttttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31886568 atttgaaacaaaacaaaatcactaaagaaatg 31886537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 24695709 - 24695765
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695709 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 24695765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 19714742 - 19714798
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19714742 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 19714798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 39538788 - 39538701
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttcctta 88  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||| |||||||||| | ||||||    
T  39538788 gtctacccacataatagtcttcatgctttaatgatatcccacttcacaataaagcttaactatggatattttaagaatagtgtcctta 39538701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 19707462 - 19707518
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19707462 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 19707518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 27347722 - 27347778
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27347722 catgatacaaagccaaacgcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 27347778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 175
Target Start/End: Original strand, 33477389 - 33477479
Alignment:
Q  85 cttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaa 175  Q
    |||||| |||| | |||||||| ||||  | | |||||||| |||||||| | | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  33477389 cttatgattaatgaggtctcacgattagatcacacttaatgatccattaatcagcctaactattgtaaggactttattattttgaaacaaa 33477479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Original strand, 18570108 - 18570156
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  18570108 catgatacaaagccaaacccaattaatatagattagctattagagctta 18570156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 39537925 - 39537870
Alignment:
Q  238 atgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||| |||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39537925 atgatacaaagctaaactcagtcaacatagattggctattagggcttaatccaaca 39537870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 11479496 - 11479420
Alignment:
Q  76 aataatttccttatgtttaacg-gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattcta 151  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||| | ||||||| || ||||||||  ||||| |||||||    
T  11479496 aataatatccttatgtttaatgagggtctcacaatcaagtcacacttaatatttcattaaacacactaattattcta 11479420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Original strand, 21330263 - 21330449
Alignment:
Q  9 acataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggtctcacaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21330263 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 21330362  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330363 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 21330449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 18796706 - 18796525
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| || | ||    
T  18796706 gtctacccacataatagtctcaatgctttaatgatataccacttcacaataaagcttgactacagataatttaagaataatatccttatgttaaaagagg 18796607  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18796606 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttgttattttgaaacaaaacaaaat 18796525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18620002 - 18619812
Alignment:
Q  3 ctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||    
T  18620002 ctacccacataatagtctatatgctttaatattatcccttttcacaataaagtttgaccacagatactttaagaataatatccttttgtttaatggg-tc 18619904  T
Q  103 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaat 194  Q
    ||| |||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18619903 tcataattaagtcacacttaatgctccattaaacagactaattattatagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaacaaagaaat 18619812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 56 - 195
Target Start/End: Original strand, 19692598 - 19692737
Alignment:
Q  56 ttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggga 155  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| | | |||||  ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19692598 ttgactaaggatactttaagaataatttcctttagtttaatgagatctcatgattaagtcaggcttaatgttccattaaacagactaattattctaggga 19692697  T
Q  156 ctttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19692698 cttcattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 19692737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 20978092 - 20977957
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  20978092 gtctatccacataatagtctctatgctttagtgatatctcacttcacattaaagcttgactacggatgttttaagaataatttccttatttttaatggga 20977993  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaac 136  Q
    |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  20977992 tctcatgattaaattattcttaatgttccattaaac 20977957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Original strand, 21330493 - 21330550
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330493 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 21330550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 36270366 - 36270199
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||| | |||  || |||||||||| |||||||  |||||||||| | || || ||||||| |  |    
T  36270366 gtctacccacacaatagtctttatactttaatgttatccctcttcacactaaagcttgattacggatgttttaagaatagtgtcattgtgtttaatgatg 36270267  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttcca-ttaaacggactaactattctagggactttattatttt 167  Q
    |||||| ||||||| | ||||||  || || ||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36270266 tctcacgattaagtcacacttaacatttcatttaagtaaactaactattctagggactttattatttt 36270199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18822275 - 18822115
Alignment:
Q  9 acataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggtctcacaa 108  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||   | |||||||||| |||  ||  |||||||||| | ||||| ||||||| || ||||||| |    
T  18822275 acataataatctatctgctttaatgatatcccacttcaaactaaagcttgattacatatgttttaagaatagtgtccttgtgtttaatggtgtctcacga 18822176  T
Q  109 ttaagttatacttaa-tgttcca-ttaaacggactaactattctagggactttattatttt 167  Q
    |||||  | |||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  18822175 ttaagccacacttaatttttccatttaaacgaactaacaattctatagactttattatttt 18822115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 165
Target Start/End: Original strand, 36802664 - 36802820
Alignment:
Q  10 cataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggtctcacaat 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| || | || ||||| |||||||  |||||||||||| || || ||||||| |   |||  ||||    
T  36802664 cataataatctatatgctttaatgttatcccactttacactgaatcttgattacggatgttttaagaataatgtcattgtgtttaatgatatcttgcaat 36802763  T
Q  110 taagttatacttaatgttcca-ttaaacggactaactattctagggactttattatt 165  Q
    ||||| | | ||||| ||||| ||||||| | ||||||||| | |||||||||||||    
T  36802764 taagtaacatttaatattccatttaaacgaattaactattcaaaggactttattatt 36802820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 159
Target Start/End: Original strand, 24471642 - 24471792
Alignment:
Q  8 cacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggtctcaca 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||  |||| || |||  || |||||||| ||||||||| | |||||||  || |  ||||||||    
T  24471642 cacataatagtctttatgctttagtgttatcccactttaaaatagagtttgtgtatggatacttaaagaataatgttcttatgtcaaatgatgtctcaca 24471741  T
Q  108 attaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggacttt 159  Q
    ||||||| | || |||||  | ||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  24471742 attaagtcacacataatg-gctattaaaccgactaaatattttagggacttt 24471792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 19692773 - 19692829
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19692773 catgatacaaaaccaaacctaataaatacagattggctattaaggcttactccaaca 19692829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 4)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 6941 - 7138
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||    
T  6941 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaataggg 7040  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7041 tctcacagttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 7138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 13957 - 14154
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  13957 gtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 14056  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14057 tctcacagttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattgtagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 14154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 7177 - 7233
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7177 catgatacaaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 7233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 14193 - 14249
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14193 catgatacaaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 14249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 7307 - 7114
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||    
T  7307 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 7208  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7207 tctcacaattaagttatacttaatgttctattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaat 7114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 7071 - 7015
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7071 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 7015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18488 - 18291
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18488 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 18389  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388 tctcacaattaagttatacttaatgttcaattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 18291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18252 - 18196
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 18196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 25997 - 26191
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  25997 gtctacctacataatagtcgctatgctttaatgatatcccacttttcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 26096  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26097 tctcacaattaagttatatttaatgttccattaaatggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 26191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Original strand, 26231 - 26286
Alignment:
Q  238 atgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26231 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattgactattagggcttattccaaca 26286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 1193 - 999
Alignment:
Q  1 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||    
T  1193 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttctttatgtttaatgggg 1094  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1093 tctcacaattaagttatacttaatgtttcattaaacggactaactattttagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 957 - 900
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  957 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Original strand, 230369 - 230544
Alignment:
Q  22 tatgctttaatgatatctcacttttcaataaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatactt 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  230369 tatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacaaatactttaagaatggtttccttatgtttaa-ggggtctcacaattaagttatactt 230467  T
Q  122 aatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230468 aatgttccattaaacggactaactattataagaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 230544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 230584 - 230640
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  230584 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattattgcttactccaaca 230640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 195
Target Start/End: Original strand, 8446 - 8504
Alignment:
Q  137 ggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8446 ggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 8504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 8546 - 8602
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8546 catgatacaaagccgaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 8602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 23769 - 23825
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23769 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 23825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16571 - 16523
Alignment:
Q  245 aaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16571 aaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 16523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0705 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0705
Description:

Target: scaffold0705; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 41 - 97
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41 catgatacaaagccaaaatcaatcattatagattggctattagggcttattccaaca 97  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 9000 - 8944
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9000 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctatttgggcttattccaaca 8944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0767
Description:

Target: scaffold0767; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 298
Target Start/End: Original strand, 1 - 42
Alignment:
Q  257 aatcaatatagattggctattagggcttattccaacattggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1 aatcaatatagattggctattagggcttattccaacagtggt 42  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 291
Target Start/End: Original strand, 10202 - 10256
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 291  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10202 catgatacaaagtcaaactcaatcaatatagattggctattagagcttactccaa 10256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 182
Target Start/End: Original strand, 10127 - 10158
Alignment:
Q  151 agggactttattattttgaaacaaaacaaaat 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10127 agggactttattattttgaaacaaaacaaaat 10158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 92317 - 92194
Alignment:
Q  50 taaagcttgactacggatactttaagaataatttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttcca-ttaaacggactaactatt 148  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||  | |  ||||||  |  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||    
T  92317 taaagcttgactacgaatgttttaagaataatgccttgctgtttattgctgtctcacgattaagttatacttaatgttccatttaaaataactagatatt 92218  T
Q  149 ctagggactttattattttgaaac 172  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||    
T  92217 ctagagactttattactttaaaac 92194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5927 - 5878
Alignment:
Q  244 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  5927 caaagtcaaactcaatcaatatagattggctattatgacttactccaaca 5878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University