View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17402_high_44 (Length: 301)

Name: NF17402_high_44
Description: NF17402
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17402_high_44
NF17402_high_44
[»] chr1 (129 HSPs)
chr1 (15-293)||(28840716-28840994)
chr1 (15-293)||(51750075-51750354)
chr1 (15-293)||(10399794-10400073)
chr1 (15-282)||(46431683-46431952)
chr1 (15-293)||(31735487-31735766)
chr1 (15-293)||(28842531-28842809)
chr1 (15-293)||(15294800-15295079)
chr1 (15-293)||(13761873-13762151)
chr1 (15-293)||(16226203-16226483)
chr1 (15-276)||(20302495-20302756)
chr1 (15-272)||(27339118-27339375)
chr1 (16-293)||(51752402-51752678)
chr1 (15-272)||(17324623-17324881)
chr1 (26-272)||(27336927-27337173)
chr1 (15-272)||(47906306-47906564)
chr1 (15-293)||(20291493-20291771)
chr1 (15-270)||(6823051-6823306)
chr1 (15-293)||(47179749-47180028)
chr1 (15-295)||(24325699-24325980)
chr1 (15-276)||(9459400-9459662)
chr1 (15-276)||(9463227-9463489)
chr1 (15-272)||(15823582-15823840)
chr1 (15-287)||(2617552-2617825)
chr1 (15-293)||(39932109-39932389)
chr1 (15-272)||(12302492-12302750)
chr1 (15-293)||(47177398-47177677)
chr1 (15-265)||(50307540-50307792)
chr1 (15-276)||(2510308-2510569)
chr1 (15-272)||(39462555-39462813)
chr1 (15-272)||(6995687-6995945)
chr1 (15-267)||(13215117-13215375)
chr1 (15-272)||(38925468-38925723)
chr1 (15-272)||(50076659-50076917)
chr1 (46-293)||(16231630-16231878)
chr1 (15-272)||(14097956-14098215)
chr1 (15-272)||(16428689-16428948)
chr1 (71-293)||(51757623-51757845)
chr1 (15-272)||(50078807-50079066)
chr1 (15-272)||(2949219-2949476)
chr1 (15-272)||(11457462-11457720)
chr1 (15-272)||(41646956-41647214)
chr1 (15-272)||(9241072-9241331)
chr1 (15-272)||(17186114-17186373)
chr1 (15-272)||(18307145-18307403)
chr1 (15-272)||(18839623-18839882)
chr1 (15-217)||(21948230-21948432)
chr1 (15-272)||(4131362-4131624)
chr1 (15-272)||(28998240-28998498)
chr1 (15-272)||(29003956-29004214)
chr1 (15-270)||(3579606-3579861)
chr1 (15-272)||(25127908-25128167)
chr1 (15-272)||(25251261-25251520)
chr1 (75-259)||(23785935-23786120)
chr1 (15-272)||(31425002-31425264)
chr1 (24-272)||(31489958-31490206)
chr1 (15-272)||(40133980-40134239)
chr1 (19-259)||(17324103-17324345)
chr1 (19-272)||(50248557-50248813)
chr1 (15-272)||(28207055-28207311)
chr1 (15-272)||(6756563-6756822)
chr1 (19-200)||(48665217-48665400)
chr1 (64-272)||(16429042-16429252)
chr1 (25-272)||(16432440-16432690)
chr1 (46-270)||(25248540-25248766)
chr1 (15-272)||(17318929-17319181)
chr1 (15-233)||(15669419-15669636)
chr1 (15-259)||(42922269-42922513)
chr1 (15-175)||(6823921-6824088)
chr1 (15-268)||(14183581-14183834)
chr1 (15-255)||(47451684-47451919)
chr1 (120-272)||(23816027-23816180)
chr1 (59-272)||(6115089-6115304)
chr1 (19-268)||(31422851-31423115)
chr1 (58-259)||(8347271-8347475)
chr1 (60-251)||(49495218-49495411)
chr1 (15-231)||(18800600-18800815)
chr1 (183-293)||(13358778-13358888)
chr1 (61-235)||(155788-155963)
chr1 (15-259)||(8349050-8349294)
chr1 (8-259)||(13125456-13125708)
chr1 (61-259)||(30738626-30738830)
chr1 (21-259)||(27916539-27916779)
chr1 (57-247)||(16561544-16561738)
chr1 (61-259)||(26613238-26613440)
chr1 (59-247)||(30790412-30790602)
chr1 (59-167)||(26520206-26520321)
chr1 (79-259)||(21353346-21353525)
chr1 (39-138)||(28279326-28279424)
chr1 (61-136)||(26332613-26332688)
chr1 (61-138)||(14353047-14353126)
chr1 (151-259)||(15916562-15916673)
chr1 (76-138)||(4144804-4144865)
chr1 (231-287)||(13447245-13447301)
chr1 (65-216)||(43104245-43104400)
chr1 (76-138)||(2232597-2232658)
chr1 (76-138)||(14997040-14997101)
chr1 (79-138)||(2401342-2401400)
chr1 (79-138)||(9526469-9526527)
chr1 (79-138)||(25134074-25134132)
chr1 (21-103)||(26332719-26332798)
chr1 (193-257)||(13598402-13598466)
chr1 (193-257)||(16124545-16124609)
chr1 (193-257)||(37069774-37069838)
chr1 (193-257)||(47703965-47704029)
chr1 (61-167)||(49959129-49959237)
chr1 (79-138)||(9521718-9521776)
chr1 (194-257)||(19072932-19072995)
chr1 (194-257)||(19120822-19120885)
chr1 (194-257)||(32889443-32889506)
chr1 (194-257)||(47098854-47098917)
chr1 (79-137)||(2393404-2393461)
chr1 (193-254)||(29651818-29651879)
chr1 (193-257)||(9476265-9476329)
chr1 (197-257)||(26644930-26644990)
chr1 (76-138)||(13785392-13785455)
chr1 (194-257)||(47102871-47102934)
chr1 (196-273)||(2232710-2232787)
chr1 (196-254)||(3281715-3281773)
chr1 (192-273)||(9526582-9526663)
chr1 (213-257)||(834167-834211)
chr1 (213-257)||(3847121-3847165)
chr1 (173-259)||(13127686-13127774)
chr1 (193-257)||(27104401-27104465)
chr1 (213-257)||(28220226-28220270)
chr1 (213-257)||(28265554-28265598)
chr1 (75-138)||(37990772-37990836)
chr1 (213-257)||(40122196-40122240)
chr1 (213-257)||(49918474-49918518)
chr1 (213-257)||(50167175-50167219)
[»] chr4 (156 HSPs)
chr4 (15-293)||(8631383-8631662)
chr4 (15-293)||(22046650-22046928)
chr4 (15-293)||(22044355-22044633)
chr4 (15-293)||(2484837-2485115)
chr4 (15-293)||(11435045-11435323)
chr4 (15-293)||(37089336-37089614)
chr4 (15-293)||(38409295-38409573)
chr4 (15-293)||(51015336-51015614)
chr4 (15-293)||(11008532-11008809)
chr4 (15-293)||(18847243-18847521)
chr4 (15-276)||(11006218-11006480)
chr4 (15-287)||(26085947-26086219)
chr4 (15-293)||(14633409-14633687)
chr4 (15-293)||(31849563-31849842)
chr4 (15-277)||(9148343-9148605)
chr4 (15-276)||(24348308-24348570)
chr4 (15-272)||(40637164-40637422)
chr4 (15-275)||(44599820-44600081)
chr4 (15-293)||(22132355-22132633)
chr4 (15-293)||(22780336-22780616)
chr4 (15-293)||(22782701-22782981)
chr4 (15-293)||(7941411-7941692)
chr4 (25-272)||(17662230-17662478)
chr4 (15-293)||(9174110-9174389)
chr4 (15-293)||(9176438-9176717)
chr4 (15-293)||(18709127-18709406)
chr4 (15-276)||(5198510-5198772)
chr4 (15-293)||(22134582-22134858)
chr4 (15-282)||(16934118-16934386)
chr4 (16-270)||(24888887-24889142)
chr4 (15-272)||(22800847-22801105)
chr4 (15-272)||(22802719-22802977)
chr4 (15-295)||(47868491-47868772)
chr4 (15-293)||(6764929-6765213)
chr4 (15-282)||(16931764-16932032)
chr4 (15-272)||(24880541-24880800)
chr4 (15-270)||(48486409-48486665)
chr4 (15-272)||(24879079-24879338)
chr4 (15-272)||(38928162-38928421)
chr4 (15-272)||(36921478-36921737)
chr4 (16-272)||(40091400-40091657)
chr4 (15-272)||(12395830-12396088)
chr4 (15-276)||(47274817-47275077)
chr4 (15-272)||(19095972-19096231)
chr4 (15-272)||(12400792-12401050)
chr4 (15-272)||(33415473-33415730)
chr4 (15-272)||(36378382-36378641)
chr4 (15-272)||(36919569-36919828)
chr4 (15-282)||(14787406-14787674)
chr4 (15-272)||(16453399-16453658)
chr4 (15-272)||(36380439-36380698)
chr4 (15-272)||(37313050-37313309)
chr4 (15-247)||(47210762-47210983)
chr4 (15-253)||(56030534-56030770)
chr4 (15-272)||(619433-619690)
chr4 (15-200)||(3824627-3824813)
chr4 (15-272)||(19322786-19323043)
chr4 (15-198)||(5637524-5637708)
chr4 (15-237)||(13544049-13544272)
chr4 (38-259)||(16455354-16455577)
chr4 (120-293)||(5635440-5635614)
chr4 (119-293)||(11437557-11437731)
chr4 (15-247)||(41997582-41997815)
chr4 (15-288)||(53405220-53405497)
chr4 (73-272)||(13547302-13547502)
chr4 (15-259)||(18537471-18537715)
chr4 (15-272)||(27499135-27499390)
chr4 (67-272)||(2891433-2891640)
chr4 (102-272)||(4215483-4215654)
chr4 (15-259)||(18534829-18535073)
chr4 (15-259)||(38890222-38890466)
chr4 (15-259)||(18409345-18409590)
chr4 (60-259)||(12102221-12102424)
chr4 (15-153)||(3937314-3937452)
chr4 (15-232)||(8756276-8756493)
chr4 (16-143)||(6132963-6133090)
chr4 (15-272)||(30136642-30136898)
chr4 (76-259)||(16185832-16186018)
chr4 (61-259)||(28453818-28454019)
chr4 (15-167)||(52942550-52942689)
chr4 (59-250)||(15032554-15032748)
chr4 (21-259)||(9863805-9864048)
chr4 (64-257)||(3982175-3982374)
chr4 (126-272)||(5101130-5101276)
chr4 (60-217)||(31983567-31983727)
chr4 (61-272)||(25357772-25357991)
chr4 (21-247)||(10112966-10113194)
chr4 (173-272)||(47563010-47563109)
chr4 (61-245)||(47150904-47151092)
chr4 (1-86)||(24446756-24446840)
chr4 (61-216)||(40998990-40999148)
chr4 (61-223)||(9022438-9022605)
chr4 (76-272)||(5336765-5336964)
chr4 (15-86)||(38270158-38270229)
chr4 (76-233)||(11853549-11853705)
chr4 (192-282)||(14789405-14789495)
chr4 (193-257)||(5269220-5269284)
chr4 (192-272)||(6133105-6133185)
chr4 (79-138)||(16489352-16489410)
chr4 (79-138)||(25699752-25699810)
chr4 (76-138)||(4570094-4570155)
chr4 (76-138)||(7050378-7050439)
chr4 (163-259)||(26557823-26557921)
chr4 (61-188)||(54906722-54906852)
chr4 (79-233)||(31300427-31300580)
chr4 (219-272)||(52942473-52942526)
chr4 (193-257)||(10047383-10047447)
chr4 (39-118)||(10114443-10114520)
chr4 (193-257)||(39245998-39246062)
chr4 (79-138)||(4556180-4556238)
chr4 (79-138)||(4558314-4558372)
chr4 (79-138)||(8529270-8529328)
chr4 (79-138)||(15316961-15317019)
chr4 (79-138)||(18586969-18587027)
chr4 (76-138)||(55822265-55822326)
chr4 (193-257)||(5143263-5143327)
chr4 (173-264)||(49088819-49088911)
chr4 (79-138)||(15831144-15831202)
chr4 (79-138)||(16689061-16689119)
chr4 (75-138)||(29609591-29609654)
chr4 (193-256)||(36315258-36315321)
chr4 (193-256)||(36329467-36329530)
chr4 (79-138)||(47566496-47566554)
chr4 (222-272)||(3937259-3937309)
chr4 (15-61)||(5101087-5101133)
chr4 (76-134)||(16638827-16638884)
chr4 (110-148)||(38270120-38270158)
chr4 (192-233)||(18587082-18587123)
chr4 (62-166)||(22295294-22295399)
chr4 (145-217)||(24446681-24446754)
chr4 (194-251)||(34495853-34495910)
chr4 (82-137)||(3760105-3760161)
chr4 (193-257)||(5396700-5396764)
chr4 (193-257)||(31985663-31985726)
chr4 (193-257)||(38152468-38152532)
chr4 (205-257)||(54867188-54867239)
chr4 (79-114)||(4884877-4884912)
chr4 (193-256)||(6743444-6743507)
chr4 (76-259)||(36771396-36771580)
chr4 (143-259)||(3578669-3578786)
chr4 (234-272)||(24446639-24446677)
chr4 (192-233)||(4556085-4556126)
chr4 (76-117)||(4874620-4874661)
chr4 (192-233)||(4884990-4885031)
chr4 (61-136)||(5516367-5516444)
chr4 (192-233)||(8529383-8529424)
chr4 (184-259)||(10114576-10114653)
chr4 (192-233)||(15831257-15831298)
chr4 (192-233)||(36769595-36769636)
chr4 (213-257)||(12739550-12739594)
chr4 (192-259)||(15312432-15312500)
chr4 (193-257)||(16630709-16630773)
chr4 (193-257)||(25862051-25862115)
chr4 (213-257)||(26175636-26175680)
chr4 (213-257)||(36463389-36463433)
chr4 (213-257)||(48893638-48893682)
[»] chr3 (169 HSPs)
chr3 (15-293)||(38890056-38890335)
chr3 (15-293)||(4103858-4104136)
chr3 (15-293)||(1321495-1321774)
chr3 (15-293)||(5191669-5191946)
chr3 (15-293)||(10084351-10084630)
chr3 (25-293)||(5522589-5522857)
chr3 (15-282)||(25388922-25389189)
chr3 (15-276)||(3859544-3859805)
chr3 (15-272)||(4308264-4308522)
chr3 (15-272)||(43228307-43228565)
chr3 (15-293)||(28412992-28413273)
chr3 (15-293)||(746773-747053)
chr3 (21-276)||(7606567-7606822)
chr3 (17-293)||(51726969-51727245)
chr3 (15-293)||(458300-458580)
chr3 (15-293)||(10955989-10956268)
chr3 (15-272)||(1313425-1313683)
chr3 (15-259)||(43226101-43226346)
chr3 (15-275)||(50494015-50494276)
chr3 (15-293)||(455923-456203)
chr3 (15-293)||(10621491-10621771)
chr3 (15-272)||(9604590-9604848)
chr3 (15-272)||(18099153-18099411)
chr3 (15-276)||(25533458-25533720)
chr3 (15-293)||(10958285-10958564)
chr3 (15-272)||(18096883-18097141)
chr3 (15-272)||(42990320-42990578)
chr3 (15-272)||(53917647-53917905)
chr3 (15-293)||(6063407-6063687)
chr3 (15-293)||(6065757-6066037)
chr3 (15-293)||(22114267-22114546)
chr3 (15-272)||(11170420-11170678)
chr3 (19-293)||(10191274-10191546)
chr3 (15-293)||(38210386-38210666)
chr3 (15-272)||(45882955-45883214)
chr3 (15-272)||(30005857-30006115)
chr3 (15-272)||(1626666-1626924)
chr3 (15-272)||(27101164-27101422)
chr3 (15-272)||(28101985-28102243)
chr3 (15-272)||(43423446-43423704)
chr3 (15-272)||(3314700-3314959)
chr3 (15-272)||(43421398-43421656)
chr3 (15-272)||(53915479-53915737)
chr3 (15-272)||(18162679-18162937)
chr3 (15-293)||(26720564-26720842)
chr3 (60-272)||(5886261-5886472)
chr3 (60-272)||(5899734-5899945)
chr3 (10-272)||(6484370-6484634)
chr3 (15-272)||(36011843-36012101)
chr3 (15-272)||(51943387-51943644)
chr3 (15-264)||(5926755-5927005)
chr3 (15-272)||(32264021-32264280)
chr3 (15-272)||(880434-880693)
chr3 (15-272)||(12267958-12268206)
chr3 (15-272)||(24979723-24979982)
chr3 (15-272)||(53468436-53468697)
chr3 (25-272)||(51674749-51674997)
chr3 (63-293)||(11168165-11168396)
chr3 (15-272)||(48361654-48361912)
chr3 (15-272)||(47148878-47149136)
chr3 (21-272)||(32219106-32219359)
chr3 (50-272)||(25688143-25688367)
chr3 (15-272)||(39715485-39715739)
chr3 (15-217)||(29956702-29956905)
chr3 (15-214)||(6561826-6562028)
chr3 (25-257)||(53591210-53591442)
chr3 (15-159)||(35777437-35777582)
chr3 (20-272)||(4666535-4666788)
chr3 (15-272)||(15780887-15781153)
chr3 (15-247)||(889781-890014)
chr3 (15-272)||(23633475-23633727)
chr3 (15-270)||(54691559-54691815)
chr3 (47-272)||(6231849-6232074)
chr3 (15-272)||(28761410-28761669)
chr3 (15-247)||(35917952-35918190)
chr3 (15-272)||(42992302-42992544)
chr3 (17-272)||(17795280-17795533)
chr3 (17-272)||(19103720-19103973)
chr3 (15-233)||(31151364-31151579)
chr3 (15-154)||(28100143-28100282)
chr3 (15-245)||(13420195-13420423)
chr3 (15-159)||(28181038-28181182)
chr3 (15-259)||(561770-562015)
chr3 (16-247)||(36871308-36871539)
chr3 (21-147)||(28137415-28137541)
chr3 (72-272)||(27635641-27635830)
chr3 (15-247)||(25635400-25635631)
chr3 (77-272)||(3306839-3307034)
chr3 (15-167)||(23637042-23637191)
chr3 (16-245)||(53597256-53597485)
chr3 (61-258)||(1620457-1620657)
chr3 (126-272)||(47701654-47701801)
chr3 (15-167)||(1673991-1674140)
chr3 (21-210)||(54884177-54884367)
chr3 (191-276)||(35919094-35919179)
chr3 (43-139)||(4560401-4560497)
chr3 (182-272)||(41849243-41849333)
chr3 (105-259)||(24181486-24181643)
chr3 (15-91)||(41849168-41849244)
chr3 (191-293)||(53894018-53894121)
chr3 (61-259)||(14634436-14634638)
chr3 (79-233)||(29913980-29914132)
chr3 (15-103)||(24177295-24177380)
chr3 (61-138)||(11066652-11066731)
chr3 (21-135)||(13419904-13420015)
chr3 (142-259)||(25634030-25634149)
chr3 (61-233)||(7768632-7768806)
chr3 (76-233)||(10094100-10094256)
chr3 (15-67)||(11163166-11163218)
chr3 (79-138)||(27762107-27762165)
chr3 (76-233)||(10100117-10100273)
chr3 (76-138)||(10201075-10201136)
chr3 (76-138)||(16462203-16462264)
chr3 (76-138)||(22626105-22626166)
chr3 (76-138)||(47883003-47883064)
chr3 (79-273)||(54193229-54193423)
chr3 (79-233)||(10897008-10897162)
chr3 (15-103)||(25633939-25634024)
chr3 (193-254)||(48438221-48438282)
chr3 (193-257)||(1736324-1736388)
chr3 (193-257)||(16264354-16264418)
chr3 (193-257)||(18552902-18552966)
chr3 (193-257)||(30709809-30709873)
chr3 (193-257)||(32143325-32143389)
chr3 (79-259)||(47878169-47878350)
chr3 (84-138)||(4535622-4535675)
chr3 (76-233)||(6303310-6303466)
chr3 (76-138)||(10208121-10208182)
chr3 (88-138)||(11007633-11007683)
chr3 (76-138)||(16996875-16996936)
chr3 (76-233)||(27544273-27544429)
chr3 (79-273)||(54188512-54188705)
chr3 (193-257)||(8370505-8370569)
chr3 (193-257)||(27974971-27975035)
chr3 (193-257)||(27986465-27986529)
chr3 (39-101)||(31021300-31021361)
chr3 (194-257)||(1417510-1417573)
chr3 (79-138)||(20031439-20031497)
chr3 (194-257)||(25795785-25795848)
chr3 (15-53)||(27635830-27635868)
chr3 (76-233)||(5858546-5858701)
chr3 (43-88)||(7606828-7606873)
chr3 (192-233)||(10200980-10201021)
chr3 (219-272)||(42992607-42992660)
chr3 (76-124)||(7418064-7418112)
chr3 (61-138)||(11073007-11073084)
chr3 (76-233)||(11079517-11079674)
chr3 (193-257)||(21711227-21711291)
chr3 (213-257)||(30236249-30236293)
chr3 (193-257)||(33386685-33386749)
chr3 (76-136)||(38002869-38002928)
chr3 (193-257)||(39040011-39040075)
chr3 (79-138)||(10595155-10595213)
chr3 (194-257)||(37466295-37466358)
chr3 (92-275)||(46966630-46966816)
chr3 (80-114)||(10949404-10949438)
chr3 (84-138)||(13893470-13893523)
chr3 (192-273)||(22625969-22626050)
chr3 (15-52)||(6231465-6231502)
chr3 (192-233)||(10208026-10208067)
chr3 (192-233)||(10612803-10612844)
chr3 (61-138)||(26763021-26763101)
chr3 (192-233)||(48390327-48390368)
chr3 (193-257)||(26298992-26299056)
chr3 (193-257)||(27452962-27453026)
chr3 (213-257)||(40913417-40913461)
chr3 (213-257)||(44331669-44331713)
chr3 (213-257)||(46173481-46173525)
chr3 (213-257)||(51398938-51398982)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (15-293)||(69256-69534)
scaffold0025 (15-74)||(73207-73266)
scaffold0025 (37-85)||(73160-73208)
[»] chr7 (127 HSPs)
chr7 (15-293)||(38394032-38394311)
chr7 (15-293)||(40836707-40836985)
chr7 (15-293)||(1046888-1047167)
chr7 (15-293)||(48457699-48457978)
chr7 (15-288)||(1049264-1049538)
chr7 (15-295)||(7469984-7470265)
chr7 (15-295)||(7471942-7472223)
chr7 (15-293)||(20299505-20299785)
chr7 (15-288)||(1850027-1850301)
chr7 (15-295)||(25542576-25542855)
chr7 (15-293)||(3878623-3878902)
chr7 (15-293)||(20297408-20297687)
chr7 (15-272)||(44724625-44724883)
chr7 (19-293)||(3035771-3036049)
chr7 (15-282)||(20626084-20626351)
chr7 (15-282)||(20629975-20630242)
chr7 (15-282)||(20642394-20642661)
chr7 (12-293)||(7351615-7351898)
chr7 (15-293)||(40946374-40946653)
chr7 (15-288)||(28487599-28487873)
chr7 (39-293)||(7092177-7092431)
chr7 (15-293)||(18345587-18345866)
chr7 (15-293)||(35675-35954)
chr7 (15-276)||(31155892-31156154)
chr7 (15-293)||(44610-44889)
chr7 (15-272)||(20137094-20137352)
chr7 (15-293)||(43253481-43253759)
chr7 (15-288)||(28485612-28485885)
chr7 (47-293)||(38396713-38396959)
chr7 (15-272)||(13099459-13099719)
chr7 (15-275)||(7349259-7349516)
chr7 (15-272)||(443641-443900)
chr7 (39-293)||(7094424-7094678)
chr7 (15-272)||(21592128-21592386)
chr7 (15-272)||(21990196-21990454)
chr7 (15-272)||(42330982-42331242)
chr7 (15-272)||(4295919-4296178)
chr7 (19-259)||(27306228-27306469)
chr7 (15-272)||(24748640-24748899)
chr7 (15-272)||(31435031-31435290)
chr7 (15-272)||(9680865-9681124)
chr7 (15-272)||(11355304-11355562)
chr7 (15-270)||(9679105-9679361)
chr7 (15-272)||(21680073-21680334)
chr7 (15-272)||(37412110-37412371)
chr7 (15-272)||(39145971-39146230)
chr7 (15-203)||(11757275-11757465)
chr7 (75-259)||(2935374-2935559)
chr7 (15-259)||(21678112-21678357)
chr7 (15-238)||(27832651-27832876)
chr7 (15-272)||(42223203-42223462)
chr7 (75-275)||(22137184-22137384)
chr7 (75-275)||(40552211-40552411)
chr7 (75-275)||(22108173-22108373)
chr7 (75-275)||(40549933-40550133)
chr7 (75-259)||(1606486-1606670)
chr7 (15-272)||(24258509-24258772)
chr7 (75-275)||(9027176-9027376)
chr7 (15-200)||(25276187-25276374)
chr7 (15-259)||(24813495-24813738)
chr7 (15-247)||(24817362-24817593)
chr7 (15-161)||(26804615-26804764)
chr7 (58-224)||(20091580-20091745)
chr7 (15-259)||(7188588-7188832)
chr7 (15-217)||(22828672-22828876)
chr7 (15-167)||(22251641-22251785)
chr7 (15-247)||(24465587-24465816)
chr7 (123-272)||(22393876-22394027)
chr7 (61-259)||(6332311-6332513)
chr7 (102-247)||(26295580-26295727)
chr7 (61-259)||(11081598-11081802)
chr7 (61-137)||(16297146-16297222)
chr7 (205-293)||(11759364-11759452)
chr7 (15-87)||(18567659-18567731)
chr7 (39-116)||(22392534-22392608)
chr7 (30-251)||(6048932-6049157)
chr7 (64-169)||(40281466-40281572)
chr7 (61-138)||(11084467-11084544)
chr7 (76-233)||(25351353-25351508)
chr7 (60-233)||(2120881-2121056)
chr7 (117-245)||(6046641-6046772)
chr7 (99-192)||(6348912-6349006)
chr7 (76-273)||(7069780-7069976)
chr7 (76-273)||(25405393-25405589)
chr7 (61-138)||(26210631-26210710)
chr7 (76-233)||(3320076-3320232)
chr7 (76-233)||(3324824-3324980)
chr7 (76-138)||(21369642-21369703)
chr7 (62-259)||(13290471-13290672)
chr7 (76-233)||(25357047-25357202)
chr7 (76-233)||(25410130-25410287)
chr7 (76-233)||(7074787-7074943)
chr7 (76-138)||(42006663-42006724)
chr7 (39-117)||(12310157-12310234)
chr7 (220-272)||(26804762-26804814)
chr7 (194-257)||(9190038-9190101)
chr7 (194-257)||(20284093-20284156)
chr7 (79-138)||(30246973-30247031)
chr7 (79-138)||(44512646-44512704)
chr7 (85-275)||(6067180-6067373)
chr7 (76-138)||(8378625-8378686)
chr7 (76-138)||(15541116-15541177)
chr7 (193-257)||(21983288-21983352)
chr7 (79-127)||(44143997-44144045)
chr7 (193-257)||(46516339-46516403)
chr7 (194-257)||(2580394-2580457)
chr7 (79-138)||(34546984-34547042)
chr7 (193-254)||(55955-56015)
chr7 (193-257)||(2647725-2647789)
chr7 (193-257)||(4796696-4796760)
chr7 (213-257)||(12097867-12097911)
chr7 (193-257)||(29159807-29159871)
chr7 (193-257)||(35960820-35960884)
chr7 (194-257)||(9185195-9185258)
chr7 (194-257)||(28617255-28617318)
chr7 (194-257)||(33332480-33332543)
chr7 (192-273)||(8378489-8378570)
chr7 (192-233)||(7464544-7464585)
chr7 (76-117)||(8260584-8260625)
chr7 (219-272)||(25276381-25276434)
chr7 (192-233)||(34546905-34546946)
chr7 (192-233)||(44010775-44010816)
chr7 (213-257)||(2759197-2759241)
chr7 (227-275)||(14653852-14653900)
chr7 (213-257)||(27347941-27347985)
chr7 (213-257)||(36146408-36146452)
chr7 (213-257)||(41317434-41317478)
[»] chr8 (102 HSPs)
chr8 (15-293)||(27829389-27829667)
chr8 (15-293)||(32339401-32339680)
chr8 (15-276)||(3874102-3874364)
chr8 (15-293)||(27827078-27827356)
chr8 (21-293)||(18812980-18813252)
chr8 (15-293)||(15809311-15809589)
chr8 (15-293)||(18810800-18811078)
chr8 (15-293)||(28283185-28283462)
chr8 (15-288)||(608826-609101)
chr8 (15-293)||(4424110-4424389)
chr8 (15-293)||(44720935-44721214)
chr8 (15-273)||(43079694-43079953)
chr8 (15-293)||(22684617-22684899)
chr8 (15-272)||(28251552-28251810)
chr8 (15-275)||(43082065-43082326)
chr8 (21-288)||(43530213-43530481)
chr8 (15-272)||(30480488-30480746)
chr8 (15-272)||(14807843-14808111)
chr8 (15-271)||(15068073-15068330)
chr8 (15-270)||(27106884-27107140)
chr8 (15-272)||(15072802-15073061)
chr8 (15-268)||(27911106-27911359)
chr8 (15-268)||(27957525-27957778)
chr8 (15-272)||(1225258-1225517)
chr8 (15-276)||(24873164-24873424)
chr8 (15-272)||(14419175-14419434)
chr8 (15-272)||(41384836-41385094)
chr8 (16-272)||(25952613-25952871)
chr8 (15-272)||(41382765-41383012)
chr8 (15-264)||(13858477-13858727)
chr8 (15-272)||(36865630-36865887)
chr8 (15-272)||(15956053-15956308)
chr8 (19-273)||(5372160-5372417)
chr8 (15-259)||(21482406-21482648)
chr8 (15-167)||(14477368-14477520)
chr8 (15-247)||(21480598-21480828)
chr8 (19-272)||(15185699-15185949)
chr8 (15-259)||(3005628-3005871)
chr8 (58-259)||(31162344-31162550)
chr8 (15-139)||(33541507-33541631)
chr8 (58-259)||(31035252-31035458)
chr8 (46-193)||(181622-181772)
chr8 (61-259)||(31578274-31578476)
chr8 (15-141)||(37214317-37214434)
chr8 (15-119)||(5622877-5622981)
chr8 (21-138)||(31573847-31573961)
chr8 (15-100)||(26775293-26775378)
chr8 (173-272)||(33541395-33541494)
chr8 (1-86)||(35872555-35872639)
chr8 (129-259)||(2468127-2468259)
chr8 (202-270)||(37214251-37214319)
chr8 (76-247)||(6376141-6376315)
chr8 (76-161)||(13985176-13985262)
chr8 (61-233)||(17847661-17847830)
chr8 (76-273)||(16757253-16757449)
chr8 (19-103)||(2468261-2468341)
chr8 (191-273)||(14477519-14477602)
chr8 (76-273)||(28327908-28328104)
chr8 (76-138)||(9021228-9021289)
chr8 (61-137)||(13985933-13986011)
chr8 (76-138)||(16752643-16752704)
chr8 (76-138)||(28895502-28895563)
chr8 (76-138)||(30423212-30423274)
chr8 (15-95)||(31035161-31035238)
chr8 (79-273)||(25684646-25684839)
chr8 (79-138)||(590797-590855)
chr8 (194-257)||(19752424-19752487)
chr8 (79-138)||(33032657-33032715)
chr8 (61-138)||(3895957-3896035)
chr8 (76-138)||(4812608-4812669)
chr8 (76-138)||(28332631-28332692)
chr8 (79-136)||(29554908-29554964)
chr8 (193-257)||(4696625-4696689)
chr8 (193-257)||(9765848-9765912)
chr8 (193-257)||(19175783-19175847)
chr8 (193-257)||(26403259-26403323)
chr8 (193-257)||(31071258-31071322)
chr8 (61-138)||(33839043-33839120)
chr8 (79-138)||(3276347-3276405)
chr8 (76-138)||(2267144-2267205)
chr8 (76-114)||(17799568-17799606)
chr8 (192-273)||(28890881-28890962)
chr8 (192-260)||(4812485-4812554)
chr8 (192-233)||(29554810-29554851)
chr8 (145-217)||(35872480-35872553)
chr8 (193-257)||(7412345-7412409)
chr8 (193-257)||(23799606-23799670)
chr8 (76-138)||(15949534-15949596)
chr8 (234-272)||(35872438-35872476)
chr8 (61-113)||(11701102-11701155)
chr8 (227-275)||(28228668-28228717)
chr8 (194-247)||(28307575-28307628)
chr8 (213-257)||(1345371-1345415)
chr8 (193-257)||(5702512-5702576)
chr8 (193-257)||(6127225-6127289)
chr8 (213-257)||(10930199-10930243)
chr8 (213-257)||(15212910-15212954)
chr8 (76-112)||(21033870-21033906)
chr8 (79-127)||(23179692-23179740)
chr8 (213-257)||(27811402-27811446)
chr8 (213-257)||(33352274-33352318)
chr8 (213-257)||(40321204-40321248)
[»] chr6 (100 HSPs)
chr6 (15-293)||(14507140-14507418)
chr6 (15-293)||(4816195-4816474)
chr6 (15-293)||(20915321-20915599)
chr6 (15-288)||(28241290-28241564)
chr6 (15-293)||(30967272-30967551)
chr6 (15-293)||(2628850-2629128)
chr6 (15-272)||(11983014-11983272)
chr6 (15-293)||(19704531-19704812)
chr6 (15-293)||(14458731-14459008)
chr6 (15-293)||(30034567-30034846)
chr6 (15-293)||(1230213-1230492)
chr6 (15-272)||(13057265-13057524)
chr6 (15-272)||(26065057-26065310)
chr6 (15-272)||(26085026-26085279)
chr6 (15-293)||(26932527-26932805)
chr6 (15-293)||(12195478-12195758)
chr6 (15-272)||(9019997-9020255)
chr6 (43-259)||(5273214-5273431)
chr6 (15-272)||(13039825-13040084)
chr6 (15-272)||(3629850-3630107)
chr6 (15-272)||(32280067-32280326)
chr6 (15-268)||(3390450-3390705)
chr6 (15-270)||(3631926-3632181)
chr6 (15-272)||(15541125-15541383)
chr6 (19-272)||(25477349-25477611)
chr6 (15-265)||(15532674-15532924)
chr6 (15-270)||(30728811-30729071)
chr6 (75-275)||(26066106-26066307)
chr6 (15-272)||(3233710-3233974)
chr6 (15-214)||(15530166-15530365)
chr6 (75-275)||(29754691-29754892)
chr6 (75-275)||(33308988-33309188)
chr6 (75-275)||(26068377-26068578)
chr6 (75-275)||(33311257-33311457)
chr6 (64-272)||(1069703-1069913)
chr6 (15-270)||(24338435-24338691)
chr6 (15-259)||(15719717-15719960)
chr6 (21-272)||(14466399-14466653)
chr6 (15-152)||(19227514-19227651)
chr6 (15-272)||(12161543-12161798)
chr6 (60-272)||(12186056-12186271)
chr6 (15-247)||(16455434-16455666)
chr6 (15-233)||(3027876-3028094)
chr6 (39-259)||(15367129-15367348)
chr6 (15-192)||(22490711-22490889)
chr6 (59-259)||(26945258-26945462)
chr6 (61-247)||(22857962-22858152)
chr6 (15-259)||(17012114-17012357)
chr6 (61-259)||(19696556-19696758)
chr6 (119-259)||(15346522-15346663)
chr6 (61-217)||(20526922-20527080)
chr6 (62-259)||(28037723-28037927)
chr6 (175-272)||(10584227-10584325)
chr6 (76-232)||(12911471-12911629)
chr6 (76-232)||(12937219-12937376)
chr6 (61-136)||(11138423-11138499)
chr6 (61-259)||(25078555-25078755)
chr6 (139-259)||(25465588-25465710)
chr6 (61-188)||(7542452-7542581)
chr6 (76-273)||(13878727-13878923)
chr6 (76-273)||(16785919-16786115)
chr6 (15-68)||(1072067-1072120)
chr6 (76-233)||(13883475-13883631)
chr6 (84-138)||(5165936-5165989)
chr6 (76-138)||(26887345-26887406)
chr6 (76-138)||(31248835-31248896)
chr6 (76-138)||(35201447-35201508)
chr6 (76-138)||(3577636-3577696)
chr6 (79-138)||(17036058-17036116)
chr6 (79-138)||(17694972-17695030)
chr6 (194-257)||(31936591-31936654)
chr6 (193-257)||(5757507-5757571)
chr6 (193-257)||(10077194-10077258)
chr6 (120-233)||(30445699-30445815)
chr6 (83-138)||(12166267-12166321)
chr6 (79-138)||(22351973-22352031)
chr6 (194-257)||(31979517-31979580)
chr6 (19-72)||(13870608-13870661)
chr6 (79-136)||(19701985-19702041)
chr6 (82-138)||(25941650-25941704)
chr6 (79-159)||(26643179-26643259)
chr6 (79-159)||(26749145-26749225)
chr6 (15-71)||(32447502-32447559)
chr6 (192-260)||(35201324-35201393)
chr6 (193-257)||(5572270-5572334)
chr6 (79-138)||(13467585-13467642)
chr6 (39-89)||(15346477-15346524)
chr6 (193-257)||(21356040-21356104)
chr6 (193-257)||(22709022-22709086)
chr6 (84-259)||(11262596-11262776)
chr6 (79-138)||(22342922-22342980)
chr6 (79-138)||(33215830-33215888)
chr6 (15-52)||(17852613-17852650)
chr6 (194-247)||(24436001-24436054)
chr6 (192-233)||(25941785-25941826)
chr6 (192-259)||(13467465-13467532)
chr6 (193-257)||(22963704-22963767)
chr6 (193-257)||(23824626-23824689)
chr6 (213-257)||(26954286-26954330)
chr6 (213-257)||(33211185-33211229)
[»] chr2 (115 HSPs)
chr2 (15-293)||(27104811-27105088)
chr2 (15-293)||(13910009-13910287)
chr2 (15-288)||(19501980-19502254)
chr2 (15-293)||(23452201-23452480)
chr2 (15-287)||(19504316-19504588)
chr2 (15-275)||(42064527-42064788)
chr2 (15-276)||(45279965-45280227)
chr2 (19-275)||(35217945-35218202)
chr2 (15-276)||(42452795-42453054)
chr2 (15-272)||(19007652-19007910)
chr2 (15-275)||(35215568-35215829)
chr2 (15-287)||(24162193-24162455)
chr2 (15-272)||(42923494-42923752)
chr2 (16-272)||(21520678-21520935)
chr2 (45-272)||(43623565-43623793)
chr2 (15-272)||(22287321-22287579)
chr2 (15-272)||(6264133-6264392)
chr2 (15-272)||(6258802-6259058)
chr2 (15-272)||(11739544-11739803)
chr2 (75-276)||(36558845-36559047)
chr2 (15-272)||(40032038-40032301)
chr2 (75-275)||(36561123-36561324)
chr2 (53-272)||(5375331-5375550)
chr2 (15-272)||(28196649-28196905)
chr2 (15-272)||(17848455-17848710)
chr2 (15-272)||(34979562-34979822)
chr2 (15-272)||(44289052-44289311)
chr2 (18-272)||(17849132-17849387)
chr2 (75-293)||(45332144-45332364)
chr2 (15-272)||(3022175-3022442)
chr2 (15-272)||(14837285-14837538)
chr2 (39-234)||(45239000-45239196)
chr2 (15-167)||(15539566-15539718)
chr2 (15-272)||(28459175-28459433)
chr2 (6-272)||(18800298-18800561)
chr2 (15-259)||(11578105-11578348)
chr2 (15-259)||(31732774-31733008)
chr2 (116-272)||(22407439-22407596)
chr2 (15-272)||(22874146-22874401)
chr2 (15-247)||(20146617-20146849)
chr2 (15-259)||(17897243-17897485)
chr2 (59-259)||(40699429-40699633)
chr2 (129-254)||(7462950-7463077)
chr2 (61-272)||(35107351-35107566)
chr2 (139-272)||(22707736-22707872)
chr2 (173-272)||(22163007-22163106)
chr2 (15-160)||(38020214-38020349)
chr2 (46-145)||(38414194-38414291)
chr2 (21-192)||(43139395-43139564)
chr2 (39-187)||(27136195-27136343)
chr2 (15-100)||(22163106-22163190)
chr2 (60-259)||(37962939-37963137)
chr2 (61-233)||(17921754-17921927)
chr2 (138-272)||(23870951-23871086)
chr2 (76-192)||(20589763-20589881)
chr2 (79-259)||(17943540-17943719)
chr2 (15-76)||(22407591-22407652)
chr2 (76-273)||(2740941-2741137)
chr2 (76-138)||(28458949-28459011)
chr2 (60-136)||(26345661-26345738)
chr2 (60-192)||(15693958-15694094)
chr2 (62-118)||(27583479-27583535)
chr2 (76-273)||(2736205-2736401)
chr2 (76-273)||(17462436-17462632)
chr2 (75-270)||(10942497-10942696)
chr2 (75-270)||(10948366-10948565)
chr2 (61-138)||(34575230-34575308)
chr2 (76-273)||(39686983-39687179)
chr2 (76-138)||(20054886-20054947)
chr2 (76-138)||(22712637-22712698)
chr2 (76-138)||(22717346-22717407)
chr2 (76-138)||(45567409-45567470)
chr2 (61-136)||(7502975-7503052)
chr2 (79-233)||(27517664-27517818)
chr2 (193-257)||(14699036-14699100)
chr2 (61-166)||(30720703-30720811)
chr2 (21-136)||(35028595-35028707)
chr2 (79-138)||(12781342-12781400)
chr2 (79-138)||(17932637-17932695)
chr2 (79-138)||(30478997-30479055)
chr2 (76-223)||(33603994-33604143)
chr2 (193-257)||(8390179-8390243)
chr2 (193-257)||(13569332-13569396)
chr2 (193-257)||(20522224-20522288)
chr2 (193-257)||(39482935-39482999)
chr2 (79-138)||(37170873-37170931)
chr2 (82-136)||(41303155-41303210)
chr2 (195-257)||(1345572-1345634)
chr2 (85-138)||(27248021-27248075)
chr2 (76-138)||(39680045-39680106)
chr2 (192-273)||(45679838-45679919)
chr2 (15-56)||(5377631-5377672)
chr2 (192-233)||(33670992-33671033)
chr2 (192-257)||(34682362-34682427)
chr2 (193-257)||(10445473-10445537)
chr2 (192-259)||(12781219-12781287)
chr2 (213-257)||(17057369-17057413)
chr2 (213-257)||(17085352-17085396)
chr2 (193-257)||(28259206-28259270)
chr2 (76-124)||(38190997-38191045)
chr2 (233-272)||(15539514-15539553)
chr2 (194-257)||(31056048-31056111)
chr2 (76-114)||(20050166-20050204)
chr2 (193-247)||(33118150-33118204)
chr2 (192-233)||(30479110-30479151)
chr2 (79-112)||(33674551-33674584)
chr2 (192-233)||(39680160-39680201)
chr2 (76-136)||(45158308-45158369)
chr2 (213-257)||(723744-723788)
chr2 (213-257)||(11067429-11067473)
chr2 (213-257)||(33162450-33162494)
chr2 (193-257)||(33528650-33528714)
chr2 (213-257)||(34139770-34139814)
chr2 (213-257)||(39284960-39285004)
chr2 (193-257)||(42039698-42039762)
[»] chr5 (115 HSPs)
chr5 (15-276)||(2174955-2175216)
chr5 (15-276)||(38882142-38882403)
chr5 (15-293)||(34477017-34477297)
chr5 (15-293)||(34479382-34479662)
chr5 (15-295)||(4236665-4236945)
chr5 (19-293)||(10529062-10529338)
chr5 (15-293)||(25804061-25804339)
chr5 (15-293)||(25921437-25921716)
chr5 (15-272)||(18511197-18511455)
chr5 (15-272)||(6745105-6745362)
chr5 (15-293)||(21684416-21684694)
chr5 (15-275)||(31545116-31545377)
chr5 (15-293)||(31179337-31179614)
chr5 (15-272)||(39854519-39854777)
chr5 (15-293)||(15552281-15552561)
chr5 (15-293)||(18466720-18466999)
chr5 (15-273)||(31542771-31543029)
chr5 (15-272)||(16776194-16776451)
chr5 (15-272)||(21948062-21948320)
chr5 (15-293)||(27912572-27912851)
chr5 (15-272)||(18509303-18509561)
chr5 (15-276)||(27910486-27910748)
chr5 (15-272)||(6747342-6747598)
chr5 (21-276)||(10586873-10587130)
chr5 (46-285)||(4410090-4410329)
chr5 (16-272)||(25904140-25904397)
chr5 (15-272)||(658341-658596)
chr5 (15-293)||(18469047-18469324)
chr5 (15-268)||(40221558-40221813)
chr5 (15-272)||(10474308-10474566)
chr5 (15-272)||(1189592-1189852)
chr5 (15-272)||(2818320-2818579)
chr5 (15-272)||(24126892-24127150)
chr5 (15-272)||(31472597-31472856)
chr5 (15-271)||(18596681-18596939)
chr5 (55-276)||(39798123-39798345)
chr5 (25-272)||(695924-696172)
chr5 (58-272)||(20505828-20506041)
chr5 (26-272)||(2954463-2954710)
chr5 (15-272)||(16092184-16092443)
chr5 (15-272)||(36402313-36402571)
chr5 (15-266)||(17072919-17073172)
chr5 (15-272)||(17818477-17818733)
chr5 (15-272)||(26097769-26098025)
chr5 (75-275)||(10749796-10749996)
chr5 (15-259)||(37705778-37706023)
chr5 (15-272)||(6756530-6756786)
chr5 (15-272)||(39397978-39398236)
chr5 (46-272)||(41585729-41585956)
chr5 (75-275)||(23665140-23665340)
chr5 (75-275)||(23793247-23793447)
chr5 (75-275)||(15354557-15354757)
chr5 (15-272)||(31465974-31466221)
chr5 (75-275)||(3373119-3373320)
chr5 (75-275)||(10757273-10757472)
chr5 (75-275)||(15356833-15357033)
chr5 (75-275)||(38960114-38960314)
chr5 (41-272)||(2723964-2724187)
chr5 (82-275)||(23741841-23742034)
chr5 (15-272)||(21288800-21289055)
chr5 (15-272)||(12555908-12556166)
chr5 (15-200)||(34530722-34530909)
chr5 (15-141)||(20045046-20045172)
chr5 (17-247)||(6661194-6661424)
chr5 (15-137)||(20043086-20043208)
chr5 (60-267)||(36208656-36208865)
chr5 (60-272)||(9020299-9020514)
chr5 (21-246)||(17413176-17413402)
chr5 (39-272)||(20053905-20054131)
chr5 (15-130)||(26098379-26098494)
chr5 (75-259)||(23667415-23667599)
chr5 (61-233)||(15143547-15143722)
chr5 (61-217)||(2144602-2144763)
chr5 (79-233)||(4897828-4897985)
chr5 (173-272)||(26098273-26098373)
chr5 (105-193)||(42770936-42771025)
chr5 (58-147)||(42770847-42770934)
chr5 (76-273)||(1170811-1171007)
chr5 (21-138)||(4754198-4754312)
chr5 (76-273)||(35385437-35385634)
chr5 (76-259)||(15445264-15445453)
chr5 (210-272)||(20043222-20043284)
chr5 (76-138)||(31782578-31782639)
chr5 (61-136)||(34033691-34033768)
chr5 (61-205)||(35430259-35430408)
chr5 (81-233)||(25445501-25445653)
chr5 (79-138)||(25452498-25452556)
chr5 (75-133)||(29748443-29748502)
chr5 (76-138)||(2298122-2298183)
chr5 (76-138)||(10627364-10627425)
chr5 (79-233)||(22672837-22672991)
chr5 (193-257)||(9353361-9353425)
chr5 (75-138)||(32520533-32520597)
chr5 (193-257)||(36932379-36932443)
chr5 (79-138)||(28786407-28786465)
chr5 (194-257)||(28832263-28832326)
chr5 (76-138)||(1240428-1240489)
chr5 (192-273)||(2297986-2298067)
chr5 (192-257)||(11917000-11917065)
chr5 (76-137)||(16093413-16093473)
chr5 (193-257)||(10281755-10281819)
chr5 (193-257)||(15464536-15464600)
chr5 (193-257)||(17003989-17004053)
chr5 (15-55)||(20507665-20507705)
chr5 (79-138)||(11962554-11962612)
chr5 (61-138)||(15224889-15224968)
chr5 (79-138)||(17841370-17841428)
chr5 (84-138)||(26406594-26406647)
chr5 (220-257)||(8565946-8565983)
chr5 (76-136)||(13295835-13295896)
chr5 (192-233)||(42238376-42238417)
chr5 (193-257)||(12084204-12084268)
chr5 (193-257)||(19588750-19588814)
chr5 (213-257)||(19806487-19806531)
chr5 (213-257)||(32636948-32636992)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (15-288)||(41452-41726)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (37-285)||(1425-1673)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (15-293)||(183605-183883)
scaffold0005 (15-282)||(52056-52324)
scaffold0005 (192-282)||(50235-50325)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (15-275)||(6244-6505)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (15-293)||(29216-29494)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (15-293)||(2925-3203)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (15-272)||(11458-11716)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (15-276)||(86-348)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (15-272)||(79230-79488)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (15-259)||(14380-14625)
scaffold0131 (19-247)||(15068-15297)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (15-276)||(4042-4302)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (15-268)||(79904-80158)
scaffold0004 (76-138)||(188363-188424)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (75-275)||(22221-22421)
scaffold0140 (75-275)||(24496-24696)
scaffold0140 (193-257)||(8448-8512)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (15-217)||(2087-2289)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (15-272)||(85275-85534)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (15-259)||(15818-16062)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (39-259)||(1639-1860)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (15-150)||(35684-35819)
scaffold0011 (192-272)||(35817-35897)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (15-259)||(16647-16891)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (61-245)||(4901-5089)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (203-275)||(4661-4733)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (76-251)||(57433-57613)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (223-293)||(1415-1485)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (76-138)||(224819-224880)
scaffold0006 (193-257)||(5687-5751)
scaffold0006 (193-257)||(2496-2560)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (79-138)||(16328-16386)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (192-273)||(3055-3136)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (79-233)||(17011-17165)
[»] scaffold0087 (1 HSPs)
scaffold0087 (193-257)||(43990-44054)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (194-254)||(10736-10796)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (213-257)||(20415-20459)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 129)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 28840716 - 28840994
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840716 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 28840815  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840816 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 28840915  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28840916 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 28840994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 51750075 - 51750354
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750075 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 51750174  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750175 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 51750274  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  51750275 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 51750354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10400073 - 10399794
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10400073 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 10399974  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399973 attgggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 10399874  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10399873 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 10399794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 46431952 - 46431683
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431952 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 46431853  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431852 gatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctc 46431753  T
Q  215 tct--accccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatcttt 282  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  46431752 tctcccccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcttt 46431683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 31735766 - 31735487
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  31735766 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaaggttgagtctcttggttacgggaagag 31735667  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735666 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgct 31735567  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31735566 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 31735487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 28842531 - 28842809
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28842531 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagag 28842630  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  28842631 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctaatc 28842730  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28842731 tctcccccagactaggtcaatttggacagaactaggtcaacaaattctattgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 28842809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15295079 - 15294800
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15295079 tttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 15294980  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15294979 gttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgct 15294880  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15294879 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 15294800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 13761873 - 13762151
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13761873 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 13761972  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  13761973 tctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggaccggagggcttctc 13762072  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  13762073 tctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 13762151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 16226203 - 16226483
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16226203 tttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 16226302  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16226303 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 16226402  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  16226403 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 16226483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 276
Target Start/End: Original strand, 20302495 - 20302756
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20302495 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagag 20302594  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  20302595 actaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcagatagtggatcggaggactactc 20302694  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 276  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20302695 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 20302756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 27339375 - 27339118
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  27339375 tttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattacgattgagtctcttagttacgggaagag 27339276  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27339275 gctgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgatc 27339176  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27339175 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 27339118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 293
Target Start/End: Original strand, 51752402 - 51752678
Alignment:
Q  16 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  51752402 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactattag-attgagtctcttggttacgggaagagg 51752500  T
Q  116 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 215  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  51752501 ctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctct 51752600  T
Q  216 ctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  51752601 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 51752678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17324881 - 17324623
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324881 tttgtatagagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 17324782  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  17324781 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 17324682  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17324681 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 17324623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 26 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 27337173 - 27336927
Alignment:
Q  26 tttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttt 125  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  27337173 tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgggtctcttggttacgggaagaggctgtgacttt 27337074  T
Q  126 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccaga 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27337073 gggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaga 27336974  T
Q  226 ctaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27336973 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27336927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 47906306 - 47906564
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906306 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 47906405  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47906406 attggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgct 47906505  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  47906506 ctctcccccagacttggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 47906564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 20291493 - 20291771
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20291493 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 20291592  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  20291593 actaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgattctcatcatatagtggatcggagggttgttc 20291692  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20291693 tctcccccacactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttttgttcttctcttctttgtgttcttctc 20291771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 270
Target Start/End: Original strand, 6823051 - 6823306
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6823051 tttgtatagagtttgtctcttaggaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttatgggaagag 6823149  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823150 attggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgct 6823249  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgtt 270  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6823250 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 6823306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 47179749 - 47180028
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47179749 tttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 47179848  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47179849 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 47179948  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  47179949 ctct-ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 47180028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 295
Target Start/End: Original strand, 24325699 - 24325980
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24325699 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 24325798  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  24325799 gctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcgaatggctgct 24325898  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctcac 295  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||    
T  24325899 ctctcccccagactaagtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtccttttcttctttgtgttcttctcac 24325980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 9459662 - 9459400
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9459662 tttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaaga 9459563  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9459562 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgct 9459463  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 276  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||    
T  9459462 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctc 9459400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 9463489 - 9463227
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9463489 tttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaaga 9463390  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9463389 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgct 9463290  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 276  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||    
T  9463289 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctc 9463227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 15823582 - 15823840
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15823582 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatattgagtctcttggttacgggaagag 15823681  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15823682 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgct 15823781  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15823782 ctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 15823840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 287
Target Start/End: Original strand, 2617552 - 2617825
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2617552 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 2617651  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2617652 gctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 2617751  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgtt 287  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||  ||||||||| ||||| || |||||||    
T  2617752 ctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattattttgtgtttttctcttcattgtgtt 2617825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 39932109 - 39932389
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39932109 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattaaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagag 39932208  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39932209 actgagactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggagggctgct 39932308  T
Q  214 ctc-taccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  39932309 ctcttcccccatactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 39932389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12302750 - 12302492
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302750 tttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 12302651  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||  || | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  12302650 attgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 12302551  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12302550 ctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 12302492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 47177398 - 47177677
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  47177398 tttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatgggagtctcttggttacgggaaga 47177497  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47177498 gattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 47177597  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  47177598 ctct-ccccagactaggtcagattggatcgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 47177677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 50307792 - 50307540
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50307792 tttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 50307693  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  50307692 gattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgc 50307593  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatactttt 265  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  50307592 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 50307540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 2510569 - 2510308
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2510569 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagag 2510470  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  2510469 atttggactttgggtagaattaggc-agagacttattcttgtaacccattgatttctctcttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatggctgct 2510371  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 276  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2510370 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 2510308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 39462555 - 39462813
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39462555 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 39462654  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || | |||| || |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  39462655 attgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgatatctcttttgaaaagttattcatcatatagtgaaacggagagctgct 39462754  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  39462755 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 39462813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6995945 - 6995687
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6995945 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagag 6995846  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||  || | ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  6995845 attggggctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcattgacatctcttttataacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 6995746  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6995745 ctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 6995687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 267
Target Start/End: Original strand, 13215117 - 13215375
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13215117 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 13215216  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttga----tttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggaggg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||| | |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  13215217 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatttttctcttttgtaaatttactcatcattatagtggaacggaggg 13215316  T
Q  209 ctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgt 267  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  13215317 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgtcaacaaattcttttgt 13215375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 38925723 - 38925468
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38925723 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 38925624  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||  |||||  | ||||||||||||    
T  38925623 attgagactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtaaaacggagggctgct 38925526  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  38925525 ctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttct 38925468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 50076917 - 50076659
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50076917 tttgtataaagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 50076818  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||    
T  50076817 attgggaatttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgc 50076718  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  50076717 tctct-ccccagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 50076659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 46 - 293
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231878
Alignment:
Q  46 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggag 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggag 16231729  T
Q  145 acttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccga 244  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  16231730 acttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccga 16231829  T
Q  245 actaggtcaacaaatacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  16231830 act-ggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 16231878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14098215 - 14097956
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14098215 tttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 14098116  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgt-aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  14098115 attagagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgc 14098016  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14098015 tctctcccacaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14097956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 16428689 - 16428948
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16428689 tttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 16428788  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  16428789 attgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattttagtgaaacggagggctgc 16428888  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  16428889 tctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttct 16428948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 71 - 293
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757845
Alignment:
Q  71 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttc 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  51757623 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgatttc 51757722  T
Q  171 gctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgtt 270  Q
     |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51757723 tctttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgtt 51757822  T
Q  271 cttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||||| ||||||||||| ||||    
T  51757823 cttctcttctttgtgttcttctc 51757845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 50079066 - 50078807
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50079066 tttgcatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagag 50078967  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||| |||||| ||||||||| | || ||||||    
T  50078966 atttggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatggctgc 50078867  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||    
T  50078866 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaatttggtaaacaaattcttttgtgttct 50078807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 2949476 - 2949219
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  2949476 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgtttacgagaatag 2949377  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||  || | |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  2949376 attggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgct 2949277  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  2949276 ctct-cccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2949219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11457720 - 11457462
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||  |||| | |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  11457720 tttgtatagagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgcgaagag 11457621  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||    
T  11457620 attgggggtttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatgtctgct 11457521  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11457520 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 11457462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 41646956 - 41647214
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41646956 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagag 41647055  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  41647056 attgcgactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 41647155  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| |  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  41647156 ctctccatcagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttct 41647214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 9241331 - 9241072
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9241331 tttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattattaggattgagtctcttggttacgagaagag 9241232  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  9241231 attggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgc 9241132  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||    
T  9241131 tctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactggggaaacaaattcttttttgttct 9241072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17186373 - 17186114
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17186373 tttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagag 17186274  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || || || | ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| |||||    
T  17186273 atttgaactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattataatggaacggagtgctgc 17186174  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||    
T  17186173 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattcttttgtgttct 17186114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 18307145 - 18307403
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18307145 tttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 18307244  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||    
T  18307245 attggggctttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgc 18307344  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  18307345 tctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaacggagtcaacaaattcttttgtgttct 18307403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 18839623 - 18839882
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18839623 tttgtatagagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagag 18839722  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||||    
T  18839723 aatgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgc 18839822  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  18839823 tctttcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttcgtgttct 18839882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21948432 - 21948230
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21948432 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagac 21948334  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21948333 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 21948234  T
Q  214 ctct 217  Q
    ||||    
T  21948233 ctct 21948230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4131624 - 4131362
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4131624 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagag 4131525  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttga----tttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggaggg 208  Q
      | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  4131524 gct-ggactttgggtagaattaggcgagaaacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaggg 4131426  T
Q  209 ctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4131425 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactatgtcaacaaattcttttgtgttct 4131362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28998498 - 28998240
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28998498 tttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagag 28998399  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||  || | |||| ||||||||||||||||| ||| | | ||||| || |    
T  28998398 attggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgtt 28998299  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28998298 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28998240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 29004214 - 29003956
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29004214 tttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagag 29004115  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||  || | |||| ||||||||||||||||| ||| | | ||||| || |    
T  29004114 attggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgtt 29004015  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  29004014 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 29003956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 3579861 - 3579606
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3579861 tttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggattgagtctcttgattacggaaagag 3579762  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||||||||| ||||| | |||| |  ||||    
T  3579761 attggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat-tagtgaaacggatgattgct 3579663  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgtt 270  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3579662 ctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 3579606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 25127908 - 25128167
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25127908 tttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactatttggattgagtctcttggttacgggaagag 25128007  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || | ||||||| ||||||||||| |||| || | |||||||||||    
T  25128008 attgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaattcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacggagggctgc 25128107  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||||  |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25128108 tctctctcccatactaggtcaattaggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 25128167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25251520 - 25251261
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25251520 tttgtataacgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagag 25251421  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||| |||||| |||| ||||||| | | ||||| |||    
T  25251420 attgggactttgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcattatagtgaaacagagggttgc 25251321  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25251320 tctctccccaatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 25251261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Original strand, 23785935 - 23786120
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct 173  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  23785935 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 23786034  T
Q  174 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  23786035 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 23786120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31425264 - 31425002
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt---ctcttggttacggga 110  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |    
T  31425264 tttgtatagagtttgtatctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaa 31425165  T
Q  111 agagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggaggg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||    
T  31425164 agagattgggactttgggtagaattaggcgggaggcttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaagg 31425065  T
Q  209 ctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31425064 ctgctctct-ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 31425002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 24 - 272
Target Start/End: Original strand, 31489958 - 31490206
Alignment:
Q  24 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 123  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  31489958 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgagact 31490057  T
Q  124 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctacccc 222  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| || | ||||||| |||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||    
T  31490058 ttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcatatggtgaaacggagggctgctctc-ccccc 31490156  T
Q  223 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  31490157 agactaggtcaatttggactgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 31490206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 40133980 - 40134239
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40133980 tttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactactaggattgagtctcttggtcacgggaagag 40134079  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||    
T  40134080 attgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgc 40134179  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  40134180 tctctcccccaaactaggtcaatttggaccggactaggtaaacaaattcttttgtgttct 40134239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 17324103 - 17324345
Alignment:
Q  19 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 118  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  17324103 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattg 17324202  T
Q  119 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 216  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||| |||||| ||||||| | |||| ||||| ||||    
T  17324203 gaactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtctc 17324302  T
Q  217 taccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324303 tccccatgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 17324345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 50248813 - 50248557
Alignment:
Q  19 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  50248813 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcg 50248714  T
Q  119 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg--ctct 215  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||| |||||||||||||||||| | | || || ||  ||||    
T  50248713 agactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagatggttgttctct 50248614  T
Q  216 ctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    || ||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  50248613 ctcccctagactaggtcaatttggtccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 50248557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28207311 - 28207055
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28207311 tttgtgtaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggttacaggaagag 28207212  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||| |||||  || ||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||  || | ||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  28207211 attggggctttgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacggagggctgct 28207114  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28207113 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28207055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 6756563 - 6756822
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||    
T  6756563 tttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct--tgattacgagaaga 6756660  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| | |||    
T  6756661 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaagactg 6756760  T
Q  212 ctctct-accccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||    
T  6756761 ctctctccccccagactaggtcagtttggaccgaactggatcaacaaattcttttctgttct 6756822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 200
Target Start/End: Original strand, 48665217 - 48665400
Alignment:
Q  19 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta-cgggaagagatt 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  48665217 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttaccgggaagaggct 48665316  T
Q  118 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtgga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48665317 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 48665400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 64 - 272
Target Start/End: Original strand, 16429042 - 16429252
Alignment:
Q  64 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgt 163  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16429042 attcaacttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccat 16429141  T
Q  164 tgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatac 261  Q
    |||| || | ||||||| ||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  16429142 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattc 16429241  T
Q  262 ttttgtgttct 272  Q
    |||||||||||    
T  16429242 ttttgtgttct 16429252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 272
Target Start/End: Original strand, 16432440 - 16432690
Alignment:
Q  25 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 124  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  16432440 gtttgtctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactt 16432539  T
Q  125 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctacccc 222  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| || ||||||||| ||||    
T  16432540 tgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctctctccccc 16432639  T
Q  223 -agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16432640 aagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 16432690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 46 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248540
Alignment:
Q  46 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggaga 25248667  T
Q  146 cttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccg 243  Q
    |||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||| | ||||||| | |||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  25248666 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtcaatttggaccg 25248567  T
Q  244 aactaggtcaacaaatacttttgtgtt 270  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25248566 aactgggtcaacaaattcttttgtgtt 25248540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 17318929 - 17319181
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17318929 tttgtttagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcaccttgggaaaca------ggattgagtctcttggttacgggaacag 17319022  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| || | ||||| | ||||||||||| ||||||  | |||||||||||    
T  17319023 attgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacttattgatatctcttttgttaagttactcatcattatagtaaaacggagggctgc 17319122  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17319123 tctct-ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 17319181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15669636 - 15669419
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15669636 tttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 15669540  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct-ttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || | |||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  15669539 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtggaacggatggctgc 15669440  T
Q  213 tctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||| ||| |||||||||||    
T  15669439 tctctccccgagactaggtca 15669419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 259
Target Start/End: Original strand, 42922269 - 42922513
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42922269 tttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggttga--ggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 42922365  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| || |||||| |||||| ||||    
T  42922366 attgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgc 42922465  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||||| |||| |||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||    
T  42922466 tctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaat 42922513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 175
Target Start/End: Original strand, 6823921 - 6824088
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt-------ggttacg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||       |||||||    
T  6823921 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattacgattgaatctcttggttacgggttacg 6824020  T
Q  108 ggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgcttt 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  6824021 ggaagagattggggctttgggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 6824088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 14183834 - 14183581
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  14183834 tttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattataattgagtctcttggttacgggaagag 14183738  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  14183737 attagaattttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgc 14183638  T
Q  213 tctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtg 268  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||  |||||||    
T  14183637 tctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatttttttgtg 14183581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 255
Target Start/End: Original strand, 47451684 - 47451919
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47451684 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattagtgt------ttaggattgagtctcttggttacgggaagag 47451777  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| | ||||  || | |||||||||||||||||||||||||| | || | | |||||    
T  47451778 attggggctttgggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaatgactgct 47451877  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaac 255  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47451878 ctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 47451919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 120 - 272
Target Start/End: Original strand, 23816027 - 23816180
Alignment:
Q  120 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctcta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||     
T  23816027 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatggatcggagggatgctctctc 23816126  T
Q  219 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  23816127 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 23816180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6115304 - 6115089
Alignment:
Q  59 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 158  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6115304 ggttgattcaccttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaa 6115205  T
Q  159 cccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaca 256  Q
    ||  ||||| || | |||||||  |||||||||| ||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6115204 ccaattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaaca 6115105  T
Q  257 aatacttttgtgttct 272  Q
    |||  |||||||||||    
T  6115104 aattattttgtgttct 6115089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31423115 - 31422851
Alignment:
Q  19 tatagagtttgtctcttcggaac-aaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 117  Q
    ||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31423115 tatagagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagatt 31423016  T
Q  118 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tata------------gtggatcg 203  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||| ||||||||||| ||||            ||| | |     
T  31423015 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaagagagggtgaaaca 31422916  T
Q  204 gagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtg 268  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||    
T  31422915 gagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgagctgggtgaacaaattcttttgtg 31422851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 58 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8347475 - 8347271
Alignment:
Q  58 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 157  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8347475 gggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttgatcacgggaagagattgagactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgta 8347376  T
Q  158 acccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaa 254  Q
    |||| ||||| || | ||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||  |||||||||||| |||  ||    
T  8347375 acccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtggaacggagggatgctctttcccctagactaggtcagttttggaccgaacaagggaaa 8347276  T
Q  255 caaat 259  Q
    |||||    
T  8347275 caaat 8347271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 60 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 49495411 - 49495218
Alignment:
Q  60 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 159  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49495411 gttgattcaccttgggaaacactaataaaattgagtcttttggtcacggtaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaac 49495312  T
Q  160 ccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggt 251  Q
    || ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  49495311 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaagggcttatctctccccaagactatgtcaatttagaccgaactaggt 49495218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18800815 - 18800600
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  18800815 tttgtatagagtttg-ctcttggccacaaatactagggttgg--ggttgattcaccctgagaaacactattaggattgagtctctaggtcacgggtagag 18800719  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||  ||||    
T  18800718 atttgaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtatcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaagcggagaactgc 18800619  T
Q  213 tctctaccccagactaggt 231  Q
    ||||| ||||| |||||||    
T  18800618 tctctcccccaaactaggt 18800600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 183 - 293
Target Start/End: Original strand, 13358778 - 13358888
Alignment:
Q  183 tactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatcttt 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  13358778 tactcttcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcttt 13358877  T
Q  283 gtgttcatctc 293  Q
    |||||| ||||    
T  13358878 gtgttcttctc 13358888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 235
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155963
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   | ||| | |||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaac 155887  T
Q  160 ccgttgatttcgctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat 235  Q
    |  ||| | || |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  155888 cttttgttatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctct-ccccaaactaggtcaat 155963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8349294 - 8349050
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  8349294 tttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggtttattcaccttgggaaacactattaggattgagtttgatggtcacgggaagag 8349198  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| | || | ||||| | ||||||||||| |||||||||   ||||| ||     
T  8349197 attaggactttaggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaactcattggtatctcttttgttaagttactcatcattatagtggaatagagggttgt 8349098  T
Q  213 tctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||||| ||| |||||| ||||  ||| ||||||||| ||| |||||||    
T  8349097 tctctccccaagactatgtcagttttagaccgaactgggtaaacaaat 8349050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13125708 - 13125456
Alignment:
Q  8 ctagggctttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg 107  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| | |    
T  13125708 ctagggtttggtatagagtttg-ctcttggcgacaaacactagggttga--ggttgattcacattgggaaacgctgttaggattgaggctcttggtcaag 13125612  T
Q  108 ggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  13125611 ggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgg 13125512  T
Q  205 agggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    || | |||||||  ||||  ||||||||| | | |||||||||||||| |||||||    
T  13125511 agagttgctctcccccccttactaggtcagtataggaccgaactaggtaaacaaat 13125456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 30738830 - 30738626
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  30738830 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 30738731  T
Q  160 ccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca---tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaa 254  Q
    || ||||| || | ||||||| |||||||||||   ||||||| | ||||||| ||||||||  |||| ||||||||| | ||||||| |||| ||| ||    
T  30738730 cctttgatgtctcttttgtaaagttactcatcatattatagtgaaacggagggatgctctctcacccatactaggtcagtattggaccaaacttggtaaa 30738631  T
Q  255 caaat 259  Q
    |||||    
T  30738630 caaat 30738626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 27916539 - 27916779
Alignment:
Q  21 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 120  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||| |    
T  27916539 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggaa--ttgattcaccttggaaaacactattagaattgagtctcttggtcacatgaagagattgtg 27916635  T
Q  121 actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc--cgttgatttcgctttgtaacgttactcatc-atatagtggatcggagggctgctctc 216  Q
    ||||||||| ||||||||   | ||||| |||||| |||||  | ||||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  27916636 actttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaaccttctttgatatctctttgtaaagttactcatcgttatagtggaacggagggctgctctc 27916735  T
Q  217 taccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    | ||||||||||||||| | |||||||||| | ||| |||||||    
T  27916736 tcccccagactaggtcagtattggaccgaattgggtaaacaaat 27916779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 247
Target Start/End: Original strand, 16561544 - 16561738
Alignment:
Q  57 tgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || |||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||    
T  16561544 tgggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttg 16561643  T
Q  156 taacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaact 247  Q
    |||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| || |||||| |  |||| |||||||| ||  ||||||||||| | ||||||||||||    
T  16561644 taaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacaaagggttgctctctcccatagactaggtcagtattggaccgaact 16561738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613238
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  26613440 ttgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 26613341  T
Q  160 ccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaaca 256  Q
    || ||||| || | |||| || |||||| |||| ||||||||| | ||| ||| |||||| ||||||| ||||||| | || ||||||||| ||| ||||    
T  26613340 cctttgatatctcttttggaaagttactaatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagattaggtcagtatttgaccgaactgggtaaaca 26613241  T
Q  257 aat 259  Q
    |||    
T  26613240 aat 26613238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 59 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 30790602 - 30790412
Alignment:
Q  59 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  30790602 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 30790504  T
Q  158 acccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaact 247  Q
    |||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30790503 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaact 30790412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 59 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 26520321 - 26520206
Alignment:
Q  59 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg------gttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttatt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||    
T  26520321 ggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacagtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggaaacttatt 26520222  T
Q  152 cttgtaacccgttgat 167  Q
    |||||||||| |||||    
T  26520221 cttgtaacccattgat 26520206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21353525 - 21353346
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||||   |  || || ||||||    
T  21353525 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac---tcaatatctctttgt 21353430  T
Q  178 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    || |  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||    
T  21353429 aaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatctttagaccgaactgggtaaacaaat 21353346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 138
Target Start/End: Original strand, 28279326 - 28279424
Alignment:
Q  39 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattag 137  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28279326 aacaaacactagggttgg--gattgattccccttggagaaacactattaggattgagcttcttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattag 28279423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332613
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaatta 136  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaatta 26332613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 138
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353126
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggatttagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattagg 14353126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 259
Target Start/End: Original strand, 15916562 - 15916673
Alignment:
Q  151 tcttgtaacccgttgatttcgctttg-taacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaa-tttggaccgaact 247  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||  ||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15916562 tcttgtaacccattgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaact 15916661  T
Q  248 aggtcaacaaat 259  Q
     ||| |||||||    
T  15916662 gggtaaacaaat 15916673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 4144865 - 4144804
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  4144865 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 4144804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13447301 - 13447245
Alignment:
Q  231 tcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgtt 287  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13447301 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgtt 13447245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 216
Target Start/End: Original strand, 43104245 - 43104400
Alignment:
Q  65 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggaga-cttattcttgtaacccg 162  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||| ||||  ||||||||||||||||||   | |||  || ||||||||||||     
T  43104245 ttcaccttggaaaacactattagaattgagtcttttggtcacaggaagacattgaaactttgggtagaattaggtttgaagatttttttcttgtaaccct 43104344  T
Q  163 ttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 216  Q
    ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||    
T  43104345 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagatgctctc 43104400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Original strand, 2232597 - 2232658
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  2232597 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2232658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Original strand, 14997040 - 14997101
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14997040 aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagagattgagac-ttgggtagaattagg 14997101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 2401400 - 2401342
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  2401400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2401342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Original strand, 9526469 - 9526527
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  9526469 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9526527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Original strand, 25134074 - 25134132
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  25134074 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25134132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 26332798 - 26332719
Alignment:
Q  21 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 103  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26332798 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggtttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggt 26332719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13598466 - 13598402
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  13598466 atagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13598402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 16124545 - 16124609
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  16124545 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 16124609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 37069838 - 37069774
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  37069838 atagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 37069774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 47703965 - 47704029
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  47703965 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47704029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 167
Target Start/End: Original strand, 49959129 - 49959237
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 158  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||| | |||||||| || |||||||   || ||| |||||| |||    
T  49959129 ttgattcaccttggagaaacactattaggaatgagtctcttggtcatgagaagagattcgagactttggataaaattaggtttgaaactgattcttttaa 49959228  T
Q  159 cccgttgat 167  Q
    ||| |||||    
T  49959229 ccctttgat 49959237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Original strand, 9521718 - 9521776
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  9521718 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9521776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 19072995 - 19072932
Alignment:
Q  194 tagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  19072995 tagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 19072932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 19120885 - 19120822
Alignment:
Q  194 tagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  19120885 tagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 19120822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 32889506 - 32889443
Alignment:
Q  194 tagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    |||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  32889506 tagtggattggagagctgctctatcccccagactaggtcatattggaccgaactagatcaacaa 32889443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 257
Target Start/End: Original strand, 47098854 - 47098917
Alignment:
Q  194 tagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||  |||||||||||| |||||||||    
T  47098854 tagtggattggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47098917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 2393461 - 2393404
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattag 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||||||||||||||    
T  2393461 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagtctgggac-ttgggtagaattag 2393404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29651879 - 29651818
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaa 254  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||    
T  29651879 atagtggattggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 29651818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 9476329 - 9476265
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  9476329 atagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9476265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 257
Target Start/End: Original strand, 26644930 - 26644990
Alignment:
Q  197 tggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  26644930 tggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 26644990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 13785455 - 13785392
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||   |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13785455 aaacacaattaggattgagtttcttggtcacaaaaagagattcgggactttgggtagaattagg 13785392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 257
Target Start/End: Original strand, 47102871 - 47102934
Alignment:
Q  194 tagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  47102871 tagtggattggatggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47102934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 273
Target Start/End: Original strand, 2232710 - 2232787
Alignment:
Q  196 gtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||    
T  2232710 gtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaata-tcttgtgttctt 2232787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3281773 - 3281715
Alignment:
Q  196 gtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaa 254  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||    
T  3281773 gtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 3281715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 273
Target Start/End: Original strand, 9526582 - 9526663
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||    
T  9526582 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaata-tcttgtgttctt 9526663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 834211 - 834167
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  834211 tctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 834167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 3847165 - 3847121
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  3847165 tctcttccccagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaacaa 3847121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13127774 - 13127686
Alignment:
Q  173 tttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| | ||||||||||| | | |||||||||||  ||| |||||||    
T  13127774 tttgtaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcctccagactaggttagtattggaccgaaccgggtaaacaaat 13127686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 27104401 - 27104465
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||||  ||||||||    
T  27104401 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggttatattggaccgaactgtgtcaacaa 27104465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 28220270 - 28220226
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  28220270 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28220226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 28265598 - 28265554
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  28265598 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28265554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 138
Target Start/End: Original strand, 37990772 - 37990836
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  37990772 gaaacactattagaattgagtctcttgatcacgagaagagattcgaaattttgggtagaattagg 37990836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 40122240 - 40122196
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40122240 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 40122196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Original strand, 49918474 - 49918518
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49918474 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 49918518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 50167219 - 50167175
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  50167219 tctctcccccagattagctcaagttggaccgaactaggtcaacaa 50167175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 156)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 8631662 - 8631383
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631662 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 8631563  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631562 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 8631463  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8631462 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 8631383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22046928 - 22046650
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046928 tttgtatagagtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 22046829  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046828 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 22046729  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  22046728 tctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttttgttcttctc 22046650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22044633 - 22044355
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044633 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 22044534  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044533 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 22044434  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  22044433 tctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttttgttcttctc 22044355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 2485115 - 2484837
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2485115 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 2485016  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2485015 gctgggactttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 2484916  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2484915 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 2484837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 11435045 - 11435323
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11435045 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcctggttaccggaagag 11435144  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435145 tctaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 11435244  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  11435245 tctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttccttgtgttcttctc 11435323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 37089614 - 37089336
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37089614 tttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagag 37089515  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37089514 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctc 37089415  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  37089414 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 37089336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 38409295 - 38409573
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38409295 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 38409394  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38409395 gctgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctc 38409494  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  38409495 tctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgagttcttctcttctttttgttcttctc 38409573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 51015336 - 51015614
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015336 tttgtatagtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 51015435  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51015436 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggaggtctgctc 51015535  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  51015536 tctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 51015614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11008809 - 11008532
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11008809 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 11008710  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11008709 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc--tttgtaatggtactcatcatatagtggattggagggctgct 11008612  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11008611 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 11008532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 18847243 - 18847521
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  18847243 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagcattggagtctcttggttacgggaaga 18847342  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18847343 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgct 18847442  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  18847443 ctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctgttctttgtgttcttctc 18847521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 11006480 - 11006218
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11006480 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 11006381  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006380 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaatggtactcatcatatagtggatcggagggctgct 11006281  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 276  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  11006280 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttcttctc 11006218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 15 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26086219 - 26085947
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26086219 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 26086120  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26086119 attggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggaaggctgctc 26086020  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgtt 287  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  26086019 tctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgtt 26085947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 14633409 - 14633687
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14633409 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagag 14633507  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  14633508 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 14633607  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14633608 ctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 14633687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 31849842 - 31849563
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt-gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31849842 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgcttacgggaaga 31849743  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31849742 ggctgagactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgct 31849643  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31849642 ctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 31849563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 277
Target Start/End: Original strand, 9148343 - 9148605
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148343 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 9148442  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9148443 gctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctc 9148542  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctca 277  Q
    ||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9148543 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctca 9148605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 276
Target Start/End: Original strand, 24348308 - 24348570
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348308 tttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 24348407  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348408 gctgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 24348507  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 276  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24348508 ctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 24348570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 40637164 - 40637422
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40637164 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagag 40637263  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  40637264 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgct 40637363  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  40637364 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 40637422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 44600081 - 44599820
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44600081 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 44599982  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44599981 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 44599882  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct 275  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  44599881 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttct 44599820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22132633 - 22132355
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132633 tttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 22132535  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22132534 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctc 22132435  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa-tacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| || |||||||| ||||||||||| ||||    
T  22132434 tctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttggtcttcttctcttctttgtgttcttctc 22132355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22780616 - 22780336
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22780616 tttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaaga 22780517  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22780516 gattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgct 22780417  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  22780416 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 22780336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22782981 - 22782701
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22782981 tttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaaga 22782882  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22782881 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgct 22782782  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  22782781 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 22782701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 7941411 - 7941692
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaa--cactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 112  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7941411 tttgtatagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaag 7941510  T
Q  113 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg 211  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7941511 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctg 7941610  T
Q  212 ctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  7941611 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttttcttctttgtgttcttctc 7941692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 25 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17662478 - 17662230
Alignment:
Q  25 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 124  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17662478 gtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactt 17662379  T
Q  125 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctacccca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17662378 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 17662279  T
Q  224 gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17662278 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 17662230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 9174389 - 9174110
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9174389 tttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaaga 9174290  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  9174289 gattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgtt 9174190  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9174189 ctctgccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 9174110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 9176717 - 9176438
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9176717 tttgtataaagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 9176618  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9176617 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgct 9176518  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  9176517 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagagtcaacaaatttctttgtgttattctcttctttgtgttcttctc 9176438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18709406 - 18709127
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18709406 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagttgattcaccttgggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagag 18709307  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  18709306 attgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggactgctc 18709207  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  18709206 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 18709127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 276
Target Start/End: Original strand, 5198510 - 5198772
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5198510 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagag 5198609  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5198610 attggggctttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgct 5198709  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 276  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  5198710 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttcttctc 5198772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22134858 - 22134582
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  22134858 tttgtatagagtttgtctcttca-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaaag 22134760  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22134759 gctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctc 22134660  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  22134659 tct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtcttcttctcttctttgtgttcttctc 22134582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16934386 - 16934118
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16934386 tttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 16934287  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16934286 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 16934187  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatcttt 282  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  16934186 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctcttcttt 16934118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 270
Target Start/End: Original strand, 24888887 - 24889142
Alignment:
Q  16 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24888887 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 24888986  T
Q  116 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24888987 ctaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtggaacggagggctgctc 24889086  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgtt 270  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24889087 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 24889142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22801105 - 22800847
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22801105 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagag 22801006  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22801005 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgct 22800906  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22800905 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22800847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22802977 - 22802719
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802977 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 22802878  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  22802877 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtggaacggagggtttct 22802778  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22802777 ctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 22802719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 295
Target Start/End: Original strand, 47868491 - 47868772
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47868491 tttgtatagagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 47868590  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  47868591 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatggctgct 47868690  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctcac 295  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  47868691 ctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttattctcttctttgtgttcttctcac 47868772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 6764929 - 6765213
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttc-----ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 109  Q
    |||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  6764929 tttgtatagagtttgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttatggg 6765028  T
Q  110 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggaggg 208  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6765029 aagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggaggg 6765128  T
Q  209 ctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  6765129 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcttggtgttcttctc 6765213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16932032 - 16931764
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16932032 tttgtatagagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 16931933  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16931932 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 16931833  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatcttt 282  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  16931832 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctcttcttt 16931764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 24880541 - 24880800
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880541 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 24880640  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgt-aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  24880641 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgc 24880740  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  24880741 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttct 24880800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 270
Target Start/End: Original strand, 48486409 - 48486665
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48486409 tttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 48486508  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || | |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  48486509 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgaaatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgct 48486608  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgtt 270  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||    
T  48486609 ctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattattttgtgtt 48486665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 24879079 - 24879338
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879079 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 24879178  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgt-aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||| |||| ||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  24879179 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgatacacatcatatagtgaaacggagggctgc 24879278  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  24879279 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttct 24879338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 38928421 - 38928162
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38928421 tttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaa 38928322  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || | |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  38928321 gattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtaaaacggagggctgc 38928222  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  38928221 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 38928162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 36921737 - 36921478
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 113  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36921737 tttgtatatagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 36921638  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  36921637 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgc 36921538  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  36921537 tctctcccccagactagttaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 36921478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 40091657 - 40091400
Alignment:
Q  16 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 115  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  40091657 ttgtttagagtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagg 40091558  T
Q  116 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  40091557 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctc 40091458  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  40091457 tctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 40091400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12396088 - 12395830
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396088 tttgtatagagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 12395989  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  12395988 attgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgct 12395889  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||    
T  12395888 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttct 12395830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 276
Target Start/End: Original strand, 47274817 - 47275077
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47274817 tttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaa 47274915  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  47274916 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 47275015  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 276  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47275016 ctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 47275077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 19095972 - 19096231
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19095972 tttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 19096071  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||    
T  19096072 gattagagctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtgaaacggagagctgc 19096171  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19096172 tctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 19096231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12401050 - 12400792
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12401050 tttgtatagagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagag 12400951  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  12400950 attgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgct 12400851  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||    
T  12400850 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttct 12400792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 33415730 - 33415473
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  33415730 tttgtatagagtttgtctctt-ggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatcgagtctcttggttacgggaagag 33415632  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  33415631 attgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 33415532  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  33415531 ctctccctcaggctaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 33415473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 36378382 - 36378641
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  36378382 tttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttagttacgggaagag 36378481  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct-ttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| || || |||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  36378482 attgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctcttgtgaagttactcatcattatagtggaacggagggctgc 36378581  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||    
T  36378582 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattattttgtgttct 36378641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 36919828 - 36919569
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 113  Q
    |||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36919828 tttggataaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 36919729  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||   || ||||||    
T  36919728 ggctgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttattcatcatatagtggaatagatggctgc 36919629  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  36919628 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 36919569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14787674 - 14787406
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14787674 tttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 14787575  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg-- 211  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||  || | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||      
T  14787574 attgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 14787475  T
Q  212 ctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatcttt 282  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  14787474 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaat--tcttgtgttcttctcttcttt 14787406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 16453399 - 16453658
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16453399 tttgtacaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagag 16453498  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | | || || |||    
T  16453499 attgggactttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggttgc 16453598  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||| ||||||||||||    
T  16453599 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgccaaaaaattcttttgtgttct 16453658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 36380439 - 36380698
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | || || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  36380439 tttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggttaccggaagag 36380538  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |  | ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| |||||    
T  36380539 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagtggaactgagtgctgc 36380638  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  36380639 tctctcccccagactaggtcaatttggagcgaactgggtaaacaaattcttttgtgttct 36380698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 37313309 - 37313050
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37313309 tttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagag 37313210  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  37313209 attgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgc 37313110  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||| ||||||| ||||    
T  37313109 tctttcccccagactatgtcaatttggaccaaattggatcaacaaattcttttgttttct 37313050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 47210983 - 47210762
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47210983 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg------------ttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagag 47210896  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47210895 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgct 47210796  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaact 247  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  47210795 ctctcccccaaactagatcaatttggaccgaact 47210762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Original strand, 56030534 - 56030770
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  56030534 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagag 56030633  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttg--atttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  |||||  |||||||||||| ||||||||   || | |||||||||||    
T  56030634 attggagctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatttc-ttttgtaacgttattcatcata---tgaaacggagggctgc 56030729  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtca 253  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  56030730 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 56030770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 619690 - 619433
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  619690 tttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgactgtcttggttaagggaagag 619591  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||    
T  619590 attgggtctttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgct 619491  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  619490 ctct-cccctaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 619433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 3824813 - 3824627
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3824813 tttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagag 3824714  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtgga 200  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824713 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 3824627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 19322786 - 19323043
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19322786 tttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 19322882  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  19322883 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggatgc 19322982  T
Q  213 tctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| | | ||||||| |||| |||||||    
T  19322983 tctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaattctttagtgttct 19323043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5637708 - 5637524
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637708 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 5637609  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtg 198  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  5637608 gctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 5637524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 13544049 - 13544272
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13544049 tttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaaga 13544147  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||    
T  13544148 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgc 13544247  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaattt 237  Q
    |||||  ||||||||||||||||||    
T  13544248 tctctttcccagactaggtcaattt 13544272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 38 - 259
Target Start/End: Original strand, 16455354 - 16455577
Alignment:
Q  38 gaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattag 137  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16455354 gaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattag 16455453  T
Q  138 gcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat 235  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| || | ||||||| ||||||| ||| ||||||| | |||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16455454 gcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaat 16455553  T
Q  236 ttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  16455554 ttggaccgaactgggtcaacaaat 16455577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 120 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5635614 - 5635440
Alignment:
Q  120 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctcta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5635614 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 5635515  T
Q  219 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5635514 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 5635440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 119 - 293
Target Start/End: Original strand, 11437557 - 11437731
Alignment:
Q  119 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctcta 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11437557 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 11437656  T
Q  219 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  11437657 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttccttgtgttcttctc 11437731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Original strand, 41997582 - 41997815
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  41997582 tttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaaaag 41997681  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || || | ||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||| ||    
T  41997682 attgagattttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcatcatagtgaaacggagggccgc 41997781  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaact 247  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41997782 tctct-ccccagactaggttaatttggaccgaact 41997815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 288
Target Start/End: Original strand, 53405220 - 53405497
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  53405220 tttgtatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggaaagag 53405318  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggaga------cttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagg 207  Q
      || |||||| |||||||||| ||||||||      |||||||||||||||| |||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||| | |||     
T  53405319 gctgagactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttctcttttgaaacgatactcatcatatagtggaacagaga 53405418  T
Q  208 gctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttc 288  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  53405419 gctgctctc--ccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttttgttcttctcttctttgtgttc 53405497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 73 - 272
Target Start/End: Original strand, 13547302 - 13547502
Alignment:
Q  73 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |  |    
T  13547302 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatc 13547401  T
Q  173 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 271  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  13547402 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgttc 13547501  T
Q  272 t 272  Q
    |    
T  13547502 t 13547502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18537715 - 18537471
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18537715 tttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaccactagggttgg--ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 18537619  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  18537618 attgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgc 18537519  T
Q  213 tctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||||| ||||| | |||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||    
T  18537518 tctctcccccataataggtcattttttgaccgaactgggtaaacaaat 18537471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 27499135 - 27499390
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  27499135 tttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacgataagag 27499234  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   | || || | ||||||| ||||||||||| |||| || | || ||||||||    
T  27499235 attgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaacc---taatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacgaagggctgc 27499331  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27499332 tct-ttccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27499390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 67 - 272
Target Start/End: Original strand, 2891433 - 2891640
Alignment:
Q  67 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttga 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  2891433 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattga 2891532  T
Q  167 tttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttt 264  Q
    | || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2891533 tatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccccagactagtacaacttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 2891632  T
Q  265 tgtgttct 272  Q
    ||||||||    
T  2891633 tgtgttct 2891640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215654
Alignment:
Q  102 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgcttt-gtaacgttactcatcatatagtgga 200  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 4215582  T
Q  201 tcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4215583 acggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4215654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18535073 - 18534829
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18535073 tttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagag 18534977  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||   ||||||| | ||||||||| ||||||| |||    
T  18534976 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaactactcataattatagtggaacggaggggtgc 18534877  T
Q  213 tctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||  ||| |||||||    
T  18534876 tctcccccccagactaggtaagttttggaccgaacagggtaaacaaat 18534829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 38890466 - 38890222
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| |  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  38890466 tttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagag 38890370  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  38890369 attgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgc 38890270  T
Q  213 tctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||||| ||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||||||    
T  38890269 tctctccccaagattaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaat 38890222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18409590 - 18409345
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  18409590 tttgtatagagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcgggaacactattaggattgagtctcttagttataggaagag 18409491  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||| ||||| ||||||| | | ||| | |||    
T  18409490 attgagacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa-gttacccatcattatagtgaaacagagagttgc 18409392  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||    
T  18409391 tctctccctcagactaggtcaatttggattgaactgggtaaacaaat 18409345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 60 - 259
Target Start/End: Original strand, 12102221 - 12102424
Alignment:
Q  60 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  12102221 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 12102320  T
Q  159 cccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaac 255  Q
    |||  |||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  12102321 cccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaactaggtaaac 12102420  T
Q  256 aaat 259  Q
    ||||    
T  12102421 aaat 12102424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 3937452 - 3937314
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  3937452 tttgtatagagtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattggaattgagtctcttggttacaggaagag 3937353  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattct 153  Q
    |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3937352 attgaggctttgggtagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8756493 - 8756276
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt-ggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  8756493 tttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtctctttggtcacgggaaga 8756397  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctg 211  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || | ||||||| |||||| |||| ||||||||| |||| || ||    
T  8756396 gattgagactttgagtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactaatcattatagtggaacggatggttg 8756297  T
Q  212 ctctctaccccagactaggtc 232  Q
    |||||| | ||||||||||||    
T  8756296 ctctctcctccagactaggtc 8756276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 143
Target Start/End: Original strand, 6132963 - 6133090
Alignment:
Q  16 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 115  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6132963 ttgtatagagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 6133062  T
Q  116 ttgggactttgggtagaattaggcggga 143  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6133063 ttgagactttgggtagaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 30136642 - 30136898
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||| |||||     
T  30136642 tttgtatagagttta-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaagaa 30136738  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | | ||| || | ||||||| |||| |||||| ||||||| | | || ||||||    
T  30136739 attgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagttaatcatcattatagtgaaacagatggctgc 30136838  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| | | | ||||||||||||||||||||| | | | ||||||| ||||||||||||    
T  30136839 tctctcctcaatactaggtcaatttggaccgaattggataaacaaattcttttgtgttct 30136898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16186018 - 16185832
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||||| |  |||    
T  16186018 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatctt 16185919  T
Q  175 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||    
T  16185918 tgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaat 16185832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 259
Target Start/End: Original strand, 28453818 - 28454019
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 160  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||| |    
T  28453818 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggaccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaac 28453917  T
Q  161 cgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
      ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  || |||||| ||||||||||||| | | |||||||||||| ||| |||||    
T  28453918 ttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactactctctcccccagactaggttagtattggaccgaactgggtaaacaa 28454017  T
Q  258 at 259  Q
    ||    
T  28454018 at 28454019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 52942689 - 52942550
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  52942689 tttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg----- 52942595  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgat 167  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52942594 --------tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 52942550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15032748 - 15032554
Alignment:
Q  59 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 158  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15032748 ggttgattcatatttggaaacactattaggattgagtctcttggacacgagaaaagatttggacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaa 15032649  T
Q  159 cccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactagg 250  Q
    ||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| || |||||| || || |||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  15032648 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacgaagagctgctctctcccccaaactaggtcagtattggaccgaactagg 15032554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 9863805 - 9864048
Alignment:
Q  21 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 120  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||| |||| |  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  9863805 tagagtttgt-tcttggcaacaaacactaaggttgg--gtttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtcacgggaagagattgag 9863901  T
Q  121 actttgggtagaatt-aggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatca----tatagtggatcggagggctgctct 215  Q
    ||||||||||||||| ||   | ||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||| |||||||||||    ||||||||| ||||| ||||||||    
T  9863902 actttgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctctttgtaaagttactcatcatcattatagtggaacggagagctgctct 9864001  T
Q  216 ct--accccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||   |||||||||| |||| | |||||||||||| ||| |||||||    
T  9864002 ctcccccccagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacaaat 9864048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 3982374 - 3982175
Alignment:
Q  64 attcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga-ttgggactttgggtagaatt-aggcgggagacttattcttgtaacc 160  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||   | ||||| |||||||||||     
T  3982374 attcaccttggagaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaaca 3982275  T
Q  161 cgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    | ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||| | ||||||||||| |||| |||||    
T  3982274 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcatactaggtcactattggaccgaacaaggtaaacaa 3982175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 126 - 272
Target Start/End: Original strand, 5101130 - 5101276
Alignment:
Q  126 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccag 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||| ||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||| ||||||    
T  5101130 gggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatcatatagtaaaacggagggctgctatct-ccccag 5101228  T
Q  225 actaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  5101229 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5101276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983567
Alignment:
Q  60 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaa 31983628  T
Q  159 cccgttgatttc-gctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct 217  Q
    ||| ||||| ||   |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  31983627 ccctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctct 31983567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 272
Target Start/End: Original strand, 25357772 - 25357991
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgg----gtagaatt-aggcgggagacttattcttg 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     ||||||| ||   | |||||||||||||    
T  25357772 ttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttg 25357871  T
Q  156 taacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtc 252  Q
    |||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| |||||| || ||||  |||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| |||| |||     
T  25357872 taaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatagctgctctctcccctagactaggtcagtattggacctaactgggta 25357971  T
Q  253 aacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||||||  || ||||||||    
T  25357972 aacaaatttttgtgtgttct 25357991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 247
Target Start/End: Original strand, 10112966 - 10113194
Alignment:
Q  21 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-gggaagagattgg 119  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  10112966 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattag 10113062  T
Q  120 gactttgggtagaattag-gcgggagacttattcttgtaacc-cgttgatttcgctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 216  Q
    ||||||||||||||||||    | ||||| ||||||||||||   ||||| || |||||||| |||||| |||| |||||||||  |||| |||||||||    
T  10113063 gactttgggtagaattagatttgaagactaattcttgtaacctttttgatatctctttgtaatgttactaatcattatagtggaatggagagctgctctc 10113162  T
Q  217 taccccagactaggtcaat-ttggaccgaact 247  Q
    | ||| ||||||||| | | ||||||||||||    
T  10113163 tccccaagactaggttagtattggaccgaact 10113194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 173 - 272
Target Start/End: Original strand, 47563010 - 47563109
Alignment:
Q  173 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  47563010 tttgtaaggttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccttgactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 47563109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 47151092 - 47150904
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 159  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  47151092 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 47150993  T
Q  160 ccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaa 245  Q
    || ||||| || | ||| ||| ||| ||||||| ||||||||| | ||  | || | ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  47150992 cctttgatatctcttttctaaagttgctcatcattatagtggaacagatagatgttatctcccctagactaggtcaatattggaccgaa 47150904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 24446840 - 24446756
Alignment:
Q  1 gcaacagctagggctttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatta 86  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24446840 gcaacaactaggg-tttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 24446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40999148 - 40998990
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 159  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||   |||||||   | |||||||    
T  40999148 ttgattcacctaggaaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatcgagactttgggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaac 40999049  T
Q  160 ccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatc-atatagtggatcggagggctgctctc 216  Q
    || ||||| || | ||||||| ||||||||||  ||||||||| | ||||| |||||||    
T  40999048 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagtggaacagagggatgctctc 40998990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 223
Target Start/End: Original strand, 9022438 - 9022605
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 158  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| || | ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  9022438 ttgattcaccttggagaaacagtattaggatagaatttcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattaggtttgaagactaattcttgtaa 9022537  T
Q  159 c--ccgttgatttcgctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctacccca 223  Q
    |  |  ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||| |||||    
T  9022538 cctctattgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacaaagggctgctctctccccca 9022605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 76 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 5336964 - 5336765
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||| ||  | || || |||    
T  5336964 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctcttatatctctt 5336866  T
Q  175 tgt-aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 271  Q
    ||| || |  | |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||| | | ||||||||| |||||| |||||   | ||||||| |||||||||||    
T  5336865 tgtaaaagaaattcatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctatagtaggtcaatattggactgaactgattaaacaaattcttttgtgttc 5336766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 38270229 - 38270158
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatta 86  Q
    ||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38270229 tttgtgtagagtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 11853549 - 11853705
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| | |   | || |||    
T  11853549 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 11853644  T
Q  175 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  11853645 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 11853705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14789495 - 14789405
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctcta--ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatcttt 282  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  14789495 tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat--tcttgtgttcttctcttcttt 14789405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 5269220 - 5269284
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5269220 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5269284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 272
Target Start/End: Original strand, 6133105 - 6133185
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  6133105 tatagtggaacggatgactgctctctcacccagactaggtcaatttggatcgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 6133185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Original strand, 16489352 - 16489410
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  16489352 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 16489410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Original strand, 25699752 - 25699810
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25699752 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggacttt-ggtagaattagg 25699810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Original strand, 4570094 - 4570155
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4570094 aaacactattaggatcgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 4570155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 7050439 - 7050378
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  7050439 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 7050378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 259
Target Start/End: Original strand, 26557823 - 26557921
Alignment:
Q  163 ttgatttcgctttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  26557823 ttgatatctctttgtaaagttactcatcgttatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaagtcagtattggaccgaactaggtaaacaaat 26557921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Original strand, 54906722 - 54906852
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 157  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||   |||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  54906722 ttgattcaccatggagaaacactattagaattgagtctcttggtcactggaagagattcaagactttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 54906821  T
Q  158 acccgttgatttcgctttgtaacgttactca 188  Q
    || | ||||| || |||||||| ||||||||    
T  54906822 actctttgatatctctttgtaaagttactca 54906852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 31300427 - 31300580
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||||   |  || || ||||||    
T  31300427 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac---tcaatatctctttgt 31300522  T
Q  178 aacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31300523 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtca 31300580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 219 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 52942526 - 52942473
Alignment:
Q  219 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  52942526 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttct 52942473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 10047447 - 10047383
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  10047447 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10047383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 118
Target Start/End: Original strand, 10114443 - 10114520
Alignment:
Q  39 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 118  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  10114443 aacaaacactagggttgg--gattgattcactttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgataagagattg 10114520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 39246062 - 39245998
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  39246062 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 39245998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 4556238 - 4556180
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  4556238 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 4556180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Original strand, 4558314 - 4558372
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  4558314 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 4558372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Original strand, 8529270 - 8529328
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  8529270 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 8529328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Original strand, 15316961 - 15317019
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  15316961 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 15317019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Original strand, 18586969 - 18587027
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  18586969 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 18587027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Original strand, 55822265 - 55822326
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  55822265 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 55822326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 5143327 - 5143263
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||| | |||| |||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5143327 atagtgggttggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5143263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 264
Target Start/End: Original strand, 49088819 - 49088911
Alignment:
Q  173 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctacccc-agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttt 264  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| | | |||  || |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  49088819 tttgtaatgttagtcatcatatagtgaaacagagaactactctctccccccagactaggtcaatttgggccgaactgggtcaacaaattcttt 49088911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Original strand, 15831144 - 15831202
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  15831144 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgcgtagaattagg 15831202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 16689119 - 16689061
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16689119 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16689061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 29609654 - 29609591
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  29609654 gaaacactattagaattgagtctcttgatcacggcaagagattgagacttcgagtagaattagg 29609591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 256
Target Start/End: Original strand, 36315258 - 36315321
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaca 256  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  36315258 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 36315321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 256
Target Start/End: Original strand, 36329467 - 36329530
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaca 256  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  36329467 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 36329530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Original strand, 47566496 - 47566554
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  47566496 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagact-ggaatttgggtagaattagg 47566554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3937309 - 3937259
Alignment:
Q  222 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  3937309 cagactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcatttgtgttct 3937259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 61
Target Start/End: Original strand, 5101087 - 5101133
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 61  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  5101087 tttgtatagagtttgtcactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 134
Target Start/End: Original strand, 16638827 - 16638884
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaat 134  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16638827 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagac-ttgggtagaat 16638884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 38270158 - 38270120
Alignment:
Q  110 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagactt 148  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270158 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagactt 38270120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 233
Target Start/End: Original strand, 18587082 - 18587123
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  18587082 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 18587123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 166
Target Start/End: Original strand, 22295294 - 22295399
Alignment:
Q  62 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaatta-ggcgggagacttattcttgtaacc 160  Q
    ||||||||||| | ||||| | |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||||| ||| ||||| ||  | |||||||||| |||||||    
T  22295294 tgattcaccttagtaaacattgttaggatttagtctcttggtcacggaaagagattgaaactttgagtataattagggttgaagacttattcctgtaacc 22295393  T
Q  161 cgttga 166  Q
    | ||||    
T  22295394 ctttga 22295399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446681
Alignment:
Q  145 acttattcttgtaacccgttgatttcgcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 217  Q
    ||||||| |||||| || ||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 24446681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 251
Target Start/End: Original strand, 34495853 - 34495910
Alignment:
Q  194 tagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggt 251  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  34495853 tagtggattggagggctgctctctcccccagagtaagtcatgttggaccgaactaggt 34495910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Original strand, 3760105 - 3760161
Alignment:
Q  82 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaga-ttgggactttgggtagaattag 137  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  3760105 tattaggattgagtctcttggtcacggaaagagatttagcactttgggtagaattag 3760161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 5396700 - 5396764
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  5396700 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5396764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 31985663 - 31985726
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  31985663 atagtggattggagagctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31985726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 38152468 - 38152532
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| || ||||  |||||||||||| |||||||||    
T  38152468 atagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 38152532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 54867239 - 54867188
Alignment:
Q  205 agggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  54867239 agggctgctctct-ccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 54867188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 114
Target Start/End: Original strand, 4884877 - 4884912
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4884877 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 4884912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 256
Target Start/End: Original strand, 6743444 - 6743507
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaca 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||  ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  6743444 atagtggattggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 6743507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Original strand, 36771396 - 36771580
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||||   |  || || |||    
T  36771396 aaacactattatgattgagtctcttggtcatgggaagaggctgtgac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac---tcaatatctctt 36771491  T
Q  175 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||||| |  ||||  |||| ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  36771492 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctacgccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaat 36771580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3578786 - 3578669
Alignment:
Q  143 agacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttgga 240  Q
    ||||| |||||||||||   ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||  |||| |||| ||||| |||||||||||| || | || ||    
T  3578786 agactaattcttgtaacattttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagagctg-tctctcccccagactaggccagtattaga 3578688  T
Q  241 ccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||||||| ||| |||||||    
T  3578687 ccgaactgggtaaacaaat 3578669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24446677 - 24446639
Alignment:
Q  234 atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24446677 atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 24446639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4556126 - 4556085
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  4556126 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 4556085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 4874661 - 4874620
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 117  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  4874661 aaacactattaagatagagtctcttggtcacgggaagagatt 4874620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 233
Target Start/End: Original strand, 4884990 - 4885031
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  4884990 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 4885031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 5516444 - 5516367
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaatta 136  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  5516444 ttgattcatcttggagaaacaccattaggtttgggtctcttgctcacgggaagagattcgagactttgcgtagaatta 5516367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 233
Target Start/End: Original strand, 8529383 - 8529424
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  8529383 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 8529424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 259
Target Start/End: Original strand, 10114576 - 10114653
Alignment:
Q  184 actcatcat-atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||||||||| ||||| || || || |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||    
T  10114576 actcatcattatagttgaacgaagagctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattaggtaaacaaat 10114653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 233
Target Start/End: Original strand, 15831257 - 15831298
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  15831257 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 15831298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 233
Target Start/End: Original strand, 36769595 - 36769636
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  36769595 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 36769636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12739594 - 12739550
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12739594 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12739550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 259
Target Start/End: Original strand, 15312432 - 15312500
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  15312432 tatagtggaacggagagctggtctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaat 15312500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 16630709 - 16630773
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| | ||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16630709 atagtggattggagagctgttctctcctccagattatgtcatattggaccgaactaggtcaacaa 16630773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 25862051 - 25862115
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||| | |||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  25862051 atagtggattggagggccgctctcttccccatattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 25862115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 26175680 - 26175636
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26175680 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 26175636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 36463433 - 36463389
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  36463433 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 36463389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 48893682 - 48893638
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  48893682 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 48893638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 169)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 38890056 - 38890335
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890056 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 38890155  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890156 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 38890255  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  38890256 ctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 38890335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 4104136 - 4103858
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104136 tttgtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 4104037  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4104036 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgcta 4103937  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4103936 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 4103858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 1321495 - 1321774
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1321495 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagag 1321594  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321595 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 1321694  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1321695 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 1321774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 5191669 - 5191946
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191669 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 5191768  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  5191769 gctgggactttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcagagggctgttc 5191868  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5191869 tct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 5191946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10084630 - 10084351
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10084630 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagag 10084531  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10084530 gctgggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 10084431  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10084430 ctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 10084351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5522857 - 5522589
Alignment:
Q  25 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5522857 gtttgtctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 5522758  T
Q  125 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccag 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  5522757 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccgcag 5522658  T
Q  225 actaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5522657 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 5522589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 15 - 282
Target Start/End: Original strand, 25388922 - 25389189
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25388922 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 25389020  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25389021 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 25389120  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatcttt 282  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  25389121 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctcttcttt 25389189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 15 - 276
Target Start/End: Original strand, 3859544 - 3859805
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859544 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 3859643  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3859644 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcgtagggctgctc 3859743  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 276  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3859744 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 3859805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4308522 - 4308264
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308522 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 4308423  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4308422 gttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 4308323  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4308322 ctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4308264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 43228307 - 43228565
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43228307 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 43228406  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43228407 gctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 43228506  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  43228507 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttct 43228565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 28413273 - 28412992
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28413273 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaaga 28413174  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28413173 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 28413074  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa-tacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  28413073 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaattaggtcaacaaatttcttttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 28412992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 746773 - 747053
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  746773 tttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 746872  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  746873 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggaggactgct 746972  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  746973 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 747053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 21 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606567
Alignment:
Q  21 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 7606723  T
Q  121 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctacc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7606722 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctatttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctccc 7606623  T
Q  221 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7606622 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 7606567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 51727245 - 51726969
Alignment:
Q  17 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  51727245 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggtaagaggc 51727147  T
Q  117 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  51727146 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctct 51727047  T
Q  216 ctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  51727046 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 51726969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 458300 - 458580
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  458300 tttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 458399  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  458400 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 458499  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  458500 ctctcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 458580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10956268 - 10955989
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956268 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagag 10956169  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10956168 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 10956069  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10956068 ctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 10955989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 1313425 - 1313683
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1313425 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagag 1313524  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1313525 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 1313624  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1313625 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1313683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 259
Target Start/End: Original strand, 43226101 - 43226346
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226101 tttgtatagagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 43226200  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226201 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 43226300  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43226301 ctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 43226346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 275
Target Start/End: Original strand, 50494015 - 50494276
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  50494015 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagg 50494114  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50494115 gattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 50494214  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct 275  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  50494215 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttct 50494276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 455923 - 456203
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  455923 tttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 456022  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  456023 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 456122  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  456123 ctctcccccagactaggtcgggttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 456203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10621771 - 10621491
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10621771 tttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 10621672  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10621671 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgct 10621572  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  10621571 ctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 10621491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 9604848 - 9604590
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9604848 tttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagag 9604749  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9604748 gttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 9604649  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9604648 ctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 9604590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18099411 - 18099153
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099411 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 18099312  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18099311 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgct 18099212  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  18099211 ctctcccctagactaggtcaatatggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 18099153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 276
Target Start/End: Original strand, 25533458 - 25533720
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25533458 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagag 25533557  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533558 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 25533657  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 276  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25533658 ctctcccctagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 25533720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10958564 - 10958285
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10958564 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagag 10958465  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  10958464 gctgacactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcttcatatagtggaacggagggctgct 10958365  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10958364 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttatgttcttctcttctttgtgttcttctc 10958285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18097141 - 18096883
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18097141 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 18097042  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  18097041 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttcccttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgct 18096942  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  18096941 ctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacgaattcttttgtgttct 18096883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 42990320 - 42990578
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990320 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 42990419  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  42990420 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatggtgaatcggagggctgct 42990519  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  42990520 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 42990578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 53917905 - 53917647
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917905 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 53917806  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  53917805 attgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 53917706  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  53917705 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 53917647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 6063687 - 6063407
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6063687 tttgtatagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 6063588  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6063587 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 6063488  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct-catctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||   ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  6063487 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaaatttctttgtgttcttctccttctttgtgttcttctc 6063407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 6066037 - 6065757
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6066037 tttgtatagattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 6065938  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  6065937 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggatggctgct 6065838  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct-catctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||| |||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  6065837 ctctcccctagactaggtcagattggacagaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctccttctttgtgttcttctc 6065757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22114546 - 22114267
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114546 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 22114447  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |    
T  22114446 gctgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcggagggatgat 22114347  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||| || | || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  22114346 ctctcccccaaacaaagtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttttttgtgttcttctc 22114267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 11170420 - 11170678
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11170420 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagag 11170519  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11170520 gctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 11170619  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  11170620 ctctcccccagactaggtcaatttgggccgaactgggtcaacaaattcttttgttttct 11170678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10191546 - 10191274
Alignment:
Q  19 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |     
T  10191546 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacaggaagaggct- 10191448  T
Q  119 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 217  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10191447 ggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttcatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 10191348  T
Q  218 accccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
     ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10191347 ccctaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat--tattgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 10191274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 38210386 - 38210666
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38210386 tttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 38210485  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  38210486 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagagctgct 38210585  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt-ctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  38210586 ctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcctcttctttgtgttcttctc 38210666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 45882955 - 45883214
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45882955 tttgtatagattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 45883054  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45883055 gttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 45883154  T
Q  214 ctctacccc-agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  45883155 ctctccccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 45883214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 30005857 - 30006115
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  30005857 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagag 30005956  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30005957 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 30006056  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  30006057 ctctcccctagattagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 30006115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1626924 - 1626666
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1626924 tttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggggagag 1626825  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1626824 attgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 1626725  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1626724 ctctcgcccagactaggtcgatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 1626666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 27101422 - 27101164
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27101422 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagag 27101323  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27101322 aatgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgcaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgct 27101223  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  27101222 ctctcccccagaataggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttct 27101164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28102243 - 28101985
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28102243 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagag 28102144  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  28102143 attggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttacttatcatatagtggaacggatggctgct 28102044  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28102043 ctctccccaaagctaggtcaatttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 28101985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 43423704 - 43423446
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43423704 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 43423605  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||    
T  43423604 attggggctttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaactgagagctgct 43423505  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  43423504 ctctccctgagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 43423446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 3314700 - 3314959
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3314700 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagag 3314799  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||  ||| |||||| ||||||| | |||||||||||    
T  3314800 attggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattattcatcattatagtgaaacggagggctgc 3314899  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  3314900 tctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3314959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 43421656 - 43421398
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  43421656 tttgtatagtgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaaaag 43421557  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||    
T  43421556 attggggatttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatggctgct 43421457  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  43421456 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 43421398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 53915737 - 53915479
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53915737 tttgtatagattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgtgaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagag 53915638  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  53915637 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatttagtgaaacggagggctgct 53915538  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  53915537 ctctcccccagactaggtcaattttgactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 53915479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 18162679 - 18162937
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18162679 tttgtatagagtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 18162778  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgat-ttcgctttgt-aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18162779 attgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatttattttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgc 18162878  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||  |||||||||||    
T  18162879 tctctcccccagactaggtcaatttgga-cgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttct 18162937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 26720564 - 26720842
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26720564 tttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtta-actattaggattgagtttcttggttacgggaagag 26720662  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||    
T  26720663 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatgactgct 26720762  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26720763 ctctcccctagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaccaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 26720842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 60 - 272
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886472
Alignment:
Q  60 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 159  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886261 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5886359  T
Q  160 ccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5886360 ccattgatttgtctttgaaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 5886459  T
Q  260 acttttgtgttct 272  Q
     ||||||||||||    
T  5886460 tcttttgtgttct 5886472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 60 - 272
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899945
Alignment:
Q  60 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 159  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5899734 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5899832  T
Q  160 ccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5899833 ccattgatttctctttgcaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 5899932  T
Q  260 acttttgtgttct 272  Q
     ||||||||||||    
T  5899933 tcttttgtgttct 5899945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 272
Target Start/End: Original strand, 6484370 - 6484634
Alignment:
Q  10 agggctttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6484370 aggggtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacgg 6484469  T
Q  109 gaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttc-gctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagg 207  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  6484470 gaagagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagg 6484569  T
Q  208 gctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  6484570 gctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6484634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 36011843 - 36012101
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  36011843 tttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgggaaacactattaggattgaatatcttggttacgggaagag 36011942  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  36011943 attgtgactttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgct 36012042  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  36012043 ctcttcttcagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttct 36012101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 51943387 - 51943644
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51943387 tttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagag 51943486  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||  || | |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  51943487 attggggctttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattgacgtctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgct 51943585  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  51943586 ctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttct 51943644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5927005 - 5926755
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5927005 tttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 5926906  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |  | ||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||    
T  5926905 attgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatatcttttgtaaggttactcatcatataatgaaacggatgactgct 5926806  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttt 264  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5926805 ctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 5926755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 32264280 - 32264021
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32264280 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagag 32264181  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc--tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctg 211  Q
      ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  32264180 gctggaactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctg 32264081  T
Q  212 ctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  32264080 ctctctcccccagactaggtctatttggaccaaactggatcaac-aattcttttgtgttct 32264021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 880693 - 880434
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  880693 tttgtatagagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcattgagtctcttggttacggaaaga 880594  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||  |  ||||||||||    
T  880593 gattggggctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtaaaatggagggctgc 880494  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  880493 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttct 880434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12268206 - 12267958
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12268206 tttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 12268107  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |           |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  12268106 gattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc----------ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgct 12268017  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12268016 ctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 12267958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 24979723 - 24979982
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24979723 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacggaaagag 24979822  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttc-gctttgt-aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   || || ||   ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  24979823 attgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacaaattaatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgc 24979922  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24979923 tctctcccccaaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 24979982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 53468697 - 53468436
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  53468697 tttgtatagagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacggggagag 53468598  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  53468597 attgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgc 53468498  T
Q  213 tctctaccccag--actaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||   ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  53468497 tctaccccccagacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 53468436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 25 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 51674997 - 51674749
Alignment:
Q  25 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 124  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  51674997 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggattt 51674898  T
Q  125 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctacccca 223  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||| ||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| |||||    
T  51674897 tggatagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatactgaaatggagggctgctctctccccca 51674798  T
Q  224 gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  51674797 taccaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 51674749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 63 - 293
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168396
Alignment:
Q  63 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccg 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 11168264  T
Q  163 ttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatac 261  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  11168265 ttgatttctcttttgtaacgttacttatcatatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaacttggtcaacaaattc 11168364  T
Q  262 ttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  11168365 ttttgtgttcttctcttctttttgttcttctc 11168396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 48361912 - 48361654
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48361912 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagag 48361813  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||  || | |||| |||||||||||| |||||||  | ||||| ||||||    
T  48361812 attggggcttttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcataatatagtaaaacggagagctgct 48361713  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  48361712 ctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 48361654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 47149136 - 47148878
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaa-caaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47149136 tttgtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttgattcaccttgg-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaaga 47149038  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||||||||| | | |||| ||||    
T  47149037 gattgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtatcgttactcatcatatagtgaaacagaggactgc 47148938  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  47148937 tctctcccccagactatgtcaatttggcccgaactaggtcaacaaattattctgtgttct 47148878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 272
Target Start/End: Original strand, 32219106 - 32219359
Alignment:
Q  21 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 120  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32219106 tagagtttgtctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttgcgggaagagattggg 32219205  T
Q  121 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttc-gctttgt-aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctcta 218  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||   ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||     
T  32219206 actttgggcagaattaggcggaagacttatttttgtaacccattgatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctc 32219305  T
Q  219 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
     ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  32219306 tcccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 32219359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 50 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688143
Alignment:
Q  50 gggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagactta 149  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 25688268  T
Q  150 ttcttgtaacccgttgatttcgc-tttgt-aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaact 247  Q
    |||||||||||| ||||| || | ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688267 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 25688168  T
Q  248 aggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
     |||||| || | ||||||||||||    
T  25688167 gggtcaaaaagttcttttgtgttct 25688143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 39715485 - 39715739
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39715485 tttgtatagagtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 39715584  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||| |||| |||||||||||||  ||| | | || || ||||    
T  39715585 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcata--gtgaaacagatggttgct 39715682  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||  ||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39715683 ctc--ccccatactagatcattttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 39715739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Original strand, 29956702 - 29956905
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  29956702 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagag 29956801  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29956802 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 29956901  T
Q  214 ctct 217  Q
    ||||    
T  29956902 ctct 29956905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 214
Target Start/End: Original strand, 6561826 - 6562028
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6561826 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 6561925  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc--tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |  ||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6561926 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttttgtaaggtaactcatcattatagtggagcggagggctg 6562025  T
Q  212 ctc 214  Q
    |||    
T  6562026 ctc 6562028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 257
Target Start/End: Original strand, 53591210 - 53591442
Alignment:
Q  25 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 124  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||    
T  53591210 gtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttggttacgagaatagatttggattt 53591309  T
Q  125 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctacccca 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||| |||||    
T  53591310 tgggtagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctcatttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggatgctctct-cccca 53591408  T
Q  224 gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53591409 gactaggtcaatttggatcgaactaggtcaacaa 53591442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 159
Target Start/End: Original strand, 35777437 - 35777582
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35777437 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 35777536  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35777537 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 35777582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 272
Target Start/End: Original strand, 4666535 - 4666788
Alignment:
Q  20 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 119  Q
    |||| |||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  4666535 atagggtttgtctcttgacaacagacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattga 4666634  T
Q  120 gactttgggtagaattaggcgggaga--cttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  4666635 gactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct 4666734  T
Q  216 ctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  4666735 ---ccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttct 4666788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 15780887 - 15781153
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15780887 tttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaagag 15780986  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttg----atttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggaggg 208  Q
      || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    ||||| | ||||||| |||| | |||| ||||||||| || ||||    
T  15780987 gctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatatttctcttttgtaaagttatttatcattatagtggaacgaaggg 15781086  T
Q  209 ---ctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
       ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  15781087 cgcctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttct 15781153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 890014 - 889781
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 113  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  890014 tttgtatagagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 889915  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 212  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||     
T  889914 g-ttggggctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctga 889816  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaact 247  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  889815 tttctcccgcagactaggtcaatttggaccgaact 889781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 23633475 - 23633727
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23633475 tttgtatagtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgatttacc--gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 23633569  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||||||    
T  23633570 attgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtgaaaaggagggctgct 23633669  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||    
T  23633670 ctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaaatgggtaaacaaattcttttgtgttct 23633727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 54691815 - 54691559
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||    
T  54691815 tttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaattttttggttatgggaagag 54691716  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||   | ||||| || | ||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  54691715 attagggctttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctcttttgtaacgttacccatcatatagttaaacggagggctgct 54691616  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgtt 270  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  54691615 ctctcccctagactatgtcaatttgaactgaactaggtcgacaaattcttttatgtt 54691559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 47 - 272
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6232074
Alignment:
Q  47 ctagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac 146  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcgggagac 6231947  T
Q  147 ttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccga 244  Q
    ||||||||||||||| ||||| || | ||||||| | ||||||||| || ||| || |||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  6231948 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagctactcatcattacagt-gaacggagggctgctgtctccccccgattaggtcaatttggaccga 6232046  T
Q  245 actaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  6232047 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 6232074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28761669 - 28761410
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||| |||||| ||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  28761669 tttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagat 28761571  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| ||||    
T  28761570 attgagactttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaggactgc 28761471  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaa-tttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||||||| ||||    
T  28761470 tctctcccccagactaggtcaattttggatcgaactgggtaaacaaattcttttgttttct 28761410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 35918190 - 35917952
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacac------tagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||      ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  35918190 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgcgaaacactattagaattgagtctcttggttacga 35918091  T
Q  109 gaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagg 207  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  35918090 gaagagactgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcattatatagtggaacggaga 35917991  T
Q  208 gctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaact 247  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||    
T  35917990 gctgctctctccctcagact-ggtcaatttagaccgaact 35917952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 42992302 - 42992544
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42992302 tttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagag 42992401  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    | | |||||||||||||               ||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  42992402 agt-ggactttgggtag---------------ttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaatcggggggctgct 42992485  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  42992486 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttttttgtgttct 42992544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Original strand, 17795280 - 17795533
Alignment:
Q  17 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 116  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17795280 tgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagat 17795375  T
Q  117 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 214  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| |||| || | |||| ||||||||    
T  17795376 tgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctc 17795475  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| || |||||||||    
T  17795476 tctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttct 17795533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Original strand, 19103720 - 19103973
Alignment:
Q  17 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 116  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  19103720 tgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagat 19103815  T
Q  117 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 214  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| |||| || | |||| ||||||||    
T  19103816 tgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctc 19103915  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| || |||||||||    
T  19103916 tctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttct 19103973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 233
Target Start/End: Original strand, 31151364 - 31151579
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  31151364 tttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaag 31151460  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactca-tcatatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| || | ||||||| |||||||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  31151461 attgggactttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc--tgatatctcttttgtaaagttactcattgttatagtggaacggagggctgc 31151558  T
Q  213 tctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  31151559 tctctcccccagactaggtca 31151579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 28100282 - 28100143
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28100282 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacgctattaggattgagtcttttggttacgggaagag 28100183  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 154  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28100182 attggggctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13420423 - 13420195
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13420423 tttgtatagagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 13420328  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || | ||||||| ||||||||| | |||| |||| ||||| |||||    
T  13420327 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcattattataatggaacggagagctgc 13420228  T
Q  213 tctctaccccagactaggtca-atttggaccgaa 245  Q
    ||||| | |||||||||||||  |||||||||||    
T  13420227 tctct-caccagactaggtcagttttggaccgaa 13420195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 159
Target Start/End: Original strand, 28181038 - 28181182
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28181038 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccattaggattgagtctattggttacgggaagag 28181137  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 159  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28181138 attgggactttggatagaattaggcgggagacgtattcttataac 28181182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 562015 - 561770
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  562015 tttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttca--ggttgattcacattgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgtgaagag 561919  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttc-gctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||| ||   ||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  561918 attgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgatatcttttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgc 561819  T
Q  213 tctctacc-ccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||    
T  561818 tctctccctccagactaggtcagttttggaccgaaccgggtaaacaaat 561770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 36871539 - 36871308
Alignment:
Q  16 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 115  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |  | |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  36871539 ttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttag--gattgattcaccttggaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacggaaagaga 36871443  T
Q  116 ttgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||| | || |||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  36871442 ttgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttatctctttgtaaagttaatcatcattatagtggaacggagggctgct 36871343  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaact 247  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  36871342 ctctcccccagactaggtcagtattggaccgaact 36871308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 28137541 - 28137415
Alignment:
Q  21 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 120  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28137541 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggg 28137442  T
Q  121 actttgggtagaattaggcgggagact 147  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  28137441 gctttgggtagaattaggcggaagact 28137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 27635830 - 27635641
Alignment:
Q  72 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcg 171  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||            ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||  ||     
T  27635830 tgggaaacaatattaagattgagtctcttggttacggg------------ctttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatct 27635743  T
Q  172 cttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgtt 270  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27635742 cttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 27635643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Original strand, 25635400 - 25635631
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25635400 tttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgggaagag 25635496  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttc-gctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||| ||||||||||| ||| ||| | | ||||| |||    
T  25635497 attgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcattatggtgaaacagagggttgc 25635596  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaact 247  Q
    ||||| |||  | ||||| ||||||||||| ||||    
T  25635597 tctctcccctcggctaggccaatttggaccaaact 25635631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 77 - 272
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3307034
Alignment:
Q  77 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-ttt 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || | |||    
T  3306839 aacactattaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctttt 3306938  T
Q  176 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |  ||| || ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3306939 gtaaagttactcatcattatagtgaaaaggatggttgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttct 3307034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Original strand, 23637042 - 23637191
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||     
T  23637042 tttgtatagagtctg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgatttaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgttcatgggaagat 23637138  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgat 167  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23637139 attaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 23637191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 245
Target Start/End: Original strand, 53597256 - 53597485
Alignment:
Q  16 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 115  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||    
T  53597256 ttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaataga 53597352  T
Q  116 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgat-ttcgctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  53597353 ttgagattttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagggttgct 53597452  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaa 245  Q
    |||| || || ||||||||| | ||||||||||    
T  53597453 ctctcccacaaactaggtcagtattggaccgaa 53597485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 1620657 - 1620457
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | || ||  ||||||||||    
T  1620657 ttgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaac 1620558  T
Q  160 ccgttgatttcgctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    || ||||| || ||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||    
T  1620557 cctttgatatctctttgtaaacttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcagtattggaccaaactaggtgaacaa 1620458  T
Q  258 a 258  Q
    |    
T  1620457 a 1620457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 126 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 47701801 - 47701654
Alignment:
Q  126 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccag 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  47701801 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccag 47701702  T
Q  225 actaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    | |||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||| |||||    
T  47701701 attaggtcaatttggatcgaactggatcaacaaattcttttgcgttct 47701654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Original strand, 1673991 - 1674140
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1673991 tttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttag--gattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagag 1674087  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgat 167  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1674088 attgggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgat 1674140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Original strand, 54884177 - 54884367
Alignment:
Q  21 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 120  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||      
T  54884177 tagagtttgtttctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatcttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaa 54884276  T
Q  121 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggct 210  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||| |  ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  54884277 actttgaatagaattaggagggagacttatt-ttgtaatctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggct 54884367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 35919179 - 35919094
Alignment:
Q  191 atatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 276  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35919179 atatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 35919094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 4560497 - 4560401
Alignment:
Q  43 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggc 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4560497 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagattggagctttgggtagaattaggc 4560401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 182 - 272
Target Start/End: Original strand, 41849243 - 41849333
Alignment:
Q  182 ttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  41849243 ttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 41849333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 259
Target Start/End: Original strand, 24181486 - 24181643
Alignment:
Q  105 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgat-ttcgctttgtaacgttactcatca-tatagtggatc 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  24181486 acgggaaaagattgggactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 24181585  T
Q  203 ggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||| | ||||||||| | ||| |||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||    
T  24181586 ggatgactgctctctcctccaaactaggtcagttttggaccgaattgggtaaacaaat 24181643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 91
Target Start/End: Original strand, 41849168 - 41849244
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 91  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41849168 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaactctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 191 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 53894121 - 53894018
Alignment:
Q  191 atatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttca 289  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||     
T  53894121 atatattggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttctttgtgttct 53894022  T
Q  290 tctc 293  Q
    ||||    
T  53894021 tctc 53894018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14634638 - 14634436
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||   | ||||| ||||||||||     
T  14634638 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagcattaggtttgaagactgattcttgtaaa 14634539  T
Q  160 ccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaaca 256  Q
    || ||||| || | ||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||  ||||  |  |||||||||| | | || ||||||||||||| ||||    
T  14634538 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggaacggatggctaatctcatcagcagactaggttagtattagaccgaactaggtaaaca 14634439  T
Q  257 aat 259  Q
    |||    
T  14634438 aat 14634436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29914132 - 29913980
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||||   |  || || ||||||    
T  29914132 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac---tcaatatctctttgt 29914037  T
Q  178 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    || |  |||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  29914036 aaagaaactcatcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtca 29913980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 103
Target Start/End: Original strand, 24177295 - 24177380
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 103  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24177295 tttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 138
Target Start/End: Original strand, 11066652 - 11066731
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11066652 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgaatcttttgatcacgggaagagattcgggactttgggtagaattagg 11066731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 13419904 - 13420015
Alignment:
Q  21 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 120  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||       
T  13419904 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggatcaagtctcttggtcacggaaagagattcaa 13420000  T
Q  121 actttgggtagaatt 135  Q
    | |||||||||||||    
T  13420001 attttgggtagaatt 13420015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 259
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634149
Alignment:
Q  142 gagacttattcttgtaacccgttgatttcgcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttgg 239  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||| |||| |||||||||||| |||||| | || | ||||||||||| | |||||||||| |||||||     
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctctctccaccagactaggacaatttgc 25634129  T
Q  240 accgaactaggtcaacaaat 259  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  25634130 accgaactaggtaaacaaat 25634149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 233
Target Start/End: Original strand, 7768632 - 7768806
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||   | ||||| |||||| |||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  7768632 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgctcacgggctaaaattggaactttgagtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 7768731  T
Q  160 ccgttgatttcgctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    |  || || |  |||||||| ||||||||| | ||||||||| || |||| | ||| || ||||| |||||||||    
T  7768732 cttttaatatacctttgtaaagttactcattattatagtggaacgaagggttactccctcccccatactaggtca 7768806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10094256 - 10094100
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| | |   | || |||    
T  10094256 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 10094161  T
Q  175 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  10094160 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 10094100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 67
Target Start/End: Original strand, 11163166 - 11163218
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattc 67  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11163166 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtggattgattc 11163218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27762107
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27762165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 27762107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10100273 - 10100117
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| |||||||   | ||||| ||||||| ||| | |   | || |||    
T  10100273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 10100178  T
Q  175 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  10100177 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 10100117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 10201136 - 10201075
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  10201136 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10201075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Original strand, 16462203 - 16462264
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16462203 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16462264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 22626166 - 22626105
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  22626166 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22626105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 47883064 - 47883003
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  47883064 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 47883003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Original strand, 54193229 - 54193423
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||||   |  || || ||||||    
T  54193229 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac---tcaatatctctttgt 54193324  T
Q  178 aacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    || |  || |  |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||    
T  54193325 aaagaaacccatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaata-tcttgtgttctt 54193423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 10897008 - 10897162
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgt 177  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||||   |  || || ||||||    
T  10897008 cactattaggattgattctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac---tcaatatctctttgt 10897103  T
Q  178 aacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  10897104 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 10897162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 103
Target Start/End: Original strand, 25633939 - 25634024
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 103  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| | |  | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25633939 tttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggctgg--gattgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggt 25634024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 48438282 - 48438221
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaa 254  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  48438282 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaa 48438221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 1736324 - 1736388
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  1736324 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1736388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16264418 - 16264354
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16264418 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 16264354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 18552902 - 18552966
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  18552902 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 18552966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 30709809 - 30709873
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  30709809 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 30709873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 32143389 - 32143325
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32143389 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 32143325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 47878350 - 47878169
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||||   |  || || ||||||    
T  47878350 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac---tcaatatctctttgt 47878255  T
Q  178 aacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| | || ||||||||| ||| |||||||    
T  47878254 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaat 47878169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 138
Target Start/End: Original strand, 4535622 - 4535675
Alignment:
Q  84 ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  4535622 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggga-attgggtagaattagg 4535675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 6303310 - 6303466
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| | |||||   | ||||| ||||||| ||| | |   | || |||    
T  6303310 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtatagttaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 6303405  T
Q  175 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  6303406 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 6303466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 10208182 - 10208121
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  10208182 aaacactattacgattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10208121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 11007683 - 11007633
Alignment:
Q  88 gattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11007683 gattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 11007633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Original strand, 16996875 - 16996936
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16996875 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacggaaagaaattggga-tttgggtagaattagg 16996936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 27544273 - 27544429
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| | ||    || |||    
T  27544273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagcgtggaactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctctt 27544368  T
Q  175 tgtaacgttactcat-cat-atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||| |  |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  27544369 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccctcagactaggtca 27544429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Original strand, 54188512 - 54188705
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgt 177  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||||   |  || || ||||||    
T  54188512 cactattagaattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac---tcaatatctctttgt 54188607  T
Q  178 aacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||    
T  54188608 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctct-ccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaata-tcttgtgttctt 54188705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 8370505 - 8370569
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  8370505 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8370569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 27974971 - 27975035
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  27974971 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27975035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 27986465 - 27986529
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  27986465 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27986529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 31021361 - 31021300
Alignment:
Q  39 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttg 101  Q
    |||||||||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31021361 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttggagaaacactattaggattgagtctcttg 31021300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 257
Target Start/End: Original strand, 1417510 - 1417573
Alignment:
Q  194 tagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  1417510 tagtggattggagggatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1417573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 20031497 - 20031439
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| |||||||    
T  20031497 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 20031439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 25795848 - 25795785
Alignment:
Q  194 tagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    |||| ||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25795848 tagtagattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 25795785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 27635868 - 27635830
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 53  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27635868 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggt 27635830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 5858546 - 5858701
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||||   |  || || |||    
T  5858546 aaacactattaggattgag--tcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac---tcaatatctctt 5858639  T
Q  175 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||| |  ||||  |||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  5858640 tgtaaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtca 5858701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 7606873 - 7606828
Alignment:
Q  43 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 88  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606873 aacagtaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 7606828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10201021 - 10200980
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  10201021 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 10200980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 272
Target Start/End: Original strand, 42992607 - 42992660
Alignment:
Q  219 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||    
T  42992607 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaaaaaattcttttgtattct 42992660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 124
Target Start/End: Original strand, 7418064 - 7418112
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 124  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  7418064 aaacaccattatgattgagtctattggtcacgggaagagattgggactt 7418112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 138
Target Start/End: Original strand, 11073007 - 11073084
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga-ttgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||| | ||||||||  || |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  11073007 ttgattcaccttcgagaaacact--tatgattgagtctcttggtcacgagaagagatttgggactttaggtagaattagg 11073084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 11079517 - 11079674
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| || ||||||||||||   | ||||| |||||||||||   |  || || |||    
T  11079517 aaacactatcaggattgagtctcttggtcacgggaaaaggctgggac-ttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac---tcaatatctctt 11079612  T
Q  175 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  11079613 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 11079674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21711291 - 21711227
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  21711291 atagtggatttgagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21711227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Original strand, 30236249 - 30236293
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30236249 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 30236293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 33386685 - 33386749
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  33386685 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 33386749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 136
Target Start/End: Original strand, 38002869 - 38002928
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaatta 136  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  38002869 aaacaccattaggtttgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaatta 38002928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 39040011 - 39040075
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| | || ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  39040011 atagtggattggagagttgttctcttccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 39040075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 10595213 - 10595155
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  10595213 cactattaggattaagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 10595155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 37466358 - 37466295
Alignment:
Q  194 tagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  37466358 tagtggattggagggctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgtgtcaacaa 37466295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 92 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 46966816 - 46966630
Alignment:
Q  92 gagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcat 189  Q
    |||||||||| | |||| || ||||| |||||||||||||||||||||   | ||||| ||| ||||||||  ||||| || |||||||| |  ||||||    
T  46966816 gagtctcttgctcacggaaaaagattcgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattattgtaaccatttgatatctctttgtaaagaaactcat 46966717  T
Q  190 ca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct 275  Q
    || ||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| | | | |||||||  ||||| ||||||||    
T  46966716 cattatagtggaacagagagctgccctct-ccccagagtaggtcaatattggactgaattggataaacaaattattttgcgttcttct 46966630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 10949438 - 10949404
Alignment:
Q  80 actattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10949438 actattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 10949404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 138
Target Start/End: Original strand, 13893470 - 13893523
Alignment:
Q  84 ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  13893470 ttagaattgagtctcttggtcacgggaagagattgagac-ttgggtaaaattagg 13893523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22626050 - 22625969
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||    
T  22626050 tatagtggatcggagaactgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaata-tcttgtgttctt 22625969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 52
Target Start/End: Original strand, 6231465 - 6231502
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggg 52  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  6231465 tttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10208067 - 10208026
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  10208067 tatagtggatcggagagctgctctctcccgcagactaggtca 10208026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10612844 - 10612803
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  10612844 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 10612803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 138
Target Start/End: Original strand, 26763021 - 26763101
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttggg--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||   ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  26763021 ttgattcaccttggacaaaacattattaggataaagtctcttggttatgggaagaaattcgagacttcgggtagaattagg 26763101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 48390368 - 48390327
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  48390368 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 48390327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 26299056 - 26298992
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  26299056 atagtagattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 26298992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27453026 - 27452962
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||| || |||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  27453026 atagtggattggagagctgctctctcccccggattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 27452962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Original strand, 40913417 - 40913461
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  40913417 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40913461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Original strand, 44331669 - 44331713
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  44331669 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 44331713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Original strand, 46173481 - 46173525
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  46173481 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactagatcaacaa 46173525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Original strand, 51398938 - 51398982
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  51398938 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaacaa 51398982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 69534 - 69256
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69534 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 69435  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  69434 gttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctc 69335  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  69334 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 69256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 73266 - 73207
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg 74  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  73266 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 73207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 73208 - 73160
Alignment:
Q  37 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 85  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  73208 ggaaaaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 73160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 127)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 38394032 - 38394311
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394032 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 38394131  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394132 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 38394231  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  38394232 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 38394311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 40836985 - 40836707
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40836985 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 40836886  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40836885 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctc 40836786  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  40836785 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttttgttcttctc 40836707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 1047167 - 1046888
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047167 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 1047068  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1047067 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctc 1046968  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtg-ttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  1046967 tctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttttttctcttctttgtgttcttctc 1046888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 48457699 - 48457978
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457699 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 48457798  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48457799 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 48457898  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  48457899 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 48457978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 1049538 - 1049264
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049538 tttgtatagagtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagag 1049439  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1049438 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctc 1049339  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtg-ttcttctcatctttgtgttc 288  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  1049338 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttttttctcttctttgtgttc 1049264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 15 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7470265 - 7469984
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470265 tttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 7470166  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470165 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 7470066  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctcac 295  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  7470065 ccctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttatttgtgttcttctcac 7469984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 15 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7472223 - 7471942
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472223 tttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 7472124  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7472123 gctggaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgct 7472024  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctcac 295  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  7472023 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttatttgtgttcttctcac 7471942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 20299505 - 20299785
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt-gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299505 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 20299604  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20299605 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggttgc 20299704  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  20299705 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctctcctttgtgttcttctc 20299785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 288
Target Start/End: Original strand, 1850027 - 1850301
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1850027 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtttcttgcttacgggaagag 1850126  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1850127 gctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 1850226  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttc 288  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1850227 ctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttc 1850301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 15 - 295
Target Start/End: Original strand, 25542576 - 25542855
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25542576 tttgtatagagtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaagactattaggattgagtctcttggttacaggaagag 25542674  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25542675 actgggactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctc 25542774  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctcac 295  Q
    ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  25542775 tctcccctagactaggttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtttttctcttctttgtgttcttctcac 25542855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 3878623 - 3878902
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878623 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 3878722  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878723 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 3878822  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3878823 ctctcccccagactatgttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 3878902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 20297408 - 20297687
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297408 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 20297507  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20297508 attggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgct 20297607  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20297608 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttcttctcctctttgtgttcttctc 20297687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 44724625 - 44724883
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44724625 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagag 44724724  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44724725 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 44724824  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  44724825 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 44724883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 293
Target Start/End: Original strand, 3035771 - 3036049
Alignment:
Q  19 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga---ga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |     
T  3035771 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagagg 3035870  T
Q  116 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3035871 ctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgcaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctc 3035970  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  3035971 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcctctcttctttgtgttcttctc 3036049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 282
Target Start/End: Original strand, 20626084 - 20626351
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20626084 tttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 20626183  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20626184 gctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 20626283  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatcttt 282  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20626284 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctcatcttt 20626351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 282
Target Start/End: Original strand, 20629975 - 20630242
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629975 tttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 20630074  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630075 gctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 20630174  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatcttt 282  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20630175 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctcatcttt 20630242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 282
Target Start/End: Original strand, 20642394 - 20642661
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642394 tttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 20642493  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642494 gctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 20642593  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatcttt 282  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20642594 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctcatcttt 20642661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 7351898 - 7351615
Alignment:
Q  12 ggctttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacggga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7351898 ggctttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggga 7351799  T
Q  111 agagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  7351798 agagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggct 7351699  T
Q  211 gctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  7351698 gctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 7351615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 40946374 - 40946653
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40946374 tttgtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgatttactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagag 40946473  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40946474 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcgaagggctgct 40946573  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  40946574 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttcttttctttgtgttcttctc 40946653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 288
Target Start/End: Original strand, 28487599 - 28487873
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28487599 tttgtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagag 28487698  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  28487699 attggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcagagggttgct 28487798  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttc 288  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  28487799 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttcttcttttctttgtgttc 28487873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 39 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 7092431 - 7092177
Alignment:
Q  39 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7092431 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7092332  T
Q  139 cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaattt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7092331 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaattt 7092233  T
Q  238 ggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7092232 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 7092177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 18345587 - 18345866
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18345587 tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 18345686  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18345687 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgtt 18345786  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18345787 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 18345866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 35675 - 35954
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35675 tttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 35774  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  35775 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgct 35874  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
     ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  35875 ttctcccctagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatttttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 35954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 31156154 - 31155892
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31156154 tttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgggtacgggaaga 31156055  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  31156054 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcctatagtggattggagggctgct 31155955  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 276  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||    
T  31155954 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctc 31155892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 44610 - 44889
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  44610 tttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtcttttggttacgggaagag 44709  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
     ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  44710 gttgggactttgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatagctgct 44809  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  44810 ttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 44889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20137352 - 20137094
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  20137352 tttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttgattacgggaagag 20137253  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  20137252 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgc 20137153  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  20137152 tctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 20137094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 43253759 - 43253481
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  43253759 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacggaaagag 43253661  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43253660 gctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgct 43253561  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  43253560 ctctccctcagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 43253481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 288
Target Start/End: Original strand, 28485612 - 28485885
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28485612 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagag 28485711  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||    
T  28485712 attggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcagagggttgct 28485811  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttc 288  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28485812 ctct-cctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttattctcttctttgtgttc 28485885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 47 - 293
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396959
Alignment:
Q  47 ctagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagac 38396812  T
Q  147 ttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaac 246  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  38396813 ttatttttgtaacccattgatttctctttgtaactttactcatcatatagtggatcggagggcttctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaac 38396912  T
Q  247 taggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  38396913 tgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 38396959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 13099719 - 13099459
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13099719 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagag 13099620  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc--tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctg 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |  ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  13099619 attggggctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctg 13099520  T
Q  212 ctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13099519 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13099459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7349516 - 7349259
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7349516 tttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 7349417  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7349416 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 7349317  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct 275  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||    ||||||||||   |||||||||||||    
T  7349316 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaa----gtcaacaaatttctttgtgttcttct 7349259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 443641 - 443900
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  443641 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagag 443740  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || | ||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  443741 attgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctcttttataacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgct 443840  T
Q  214 ctct-accccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  443841 ctctcccccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 443900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 39 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 7094678 - 7094424
Alignment:
Q  39 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7094678 aacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7094580  T
Q  139 cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaattt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7094579 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaattt 7094480  T
Q  238 ggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7094479 ggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 7094424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21592386 - 21592128
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21592386 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggcaagcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagag 21592287  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||  || | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  21592286 attgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 21592187  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21592186 ctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 21592128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 21990196 - 21990454
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21990196 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagag 21990295  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21990296 attgaggctttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgct 21990395  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21990396 ctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 21990454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 42331242 - 42330982
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt--acgggaag 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  42331242 tttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacacgggaag 42331143  T
Q  113 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||     
T  42331142 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattatatagtgaaacggagggcta 42331043  T
Q  212 ctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  42331042 ttctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 42330982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4296178 - 4295919
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4296178 tttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 4296079  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || | |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  4296078 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgc 4295979  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  4295978 tatctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtgaacaaattcttttgtgttct 4295919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27306469 - 27306228
Alignment:
Q  19 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  27306469 tatagagtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 27306370  T
Q  119 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27306369 ggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctct 27306270  T
Q  218 accccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27306269 cccctagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaat 27306228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 24748640 - 24748899
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24748640 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattacgattgagtctcttggttccgggaagag 24748739  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  24748740 attgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgc 24748839  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  24748840 tctctcctccagattaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttct 24748899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31435290 - 31435031
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435290 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 31435191  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
      ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  31435190 gctggaactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgc 31435091  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31435090 tctctcccccaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 31435031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 9680865 - 9681124
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9680865 tttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 9680964  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |  | ||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  9680965 gattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgc 9681064  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  9681065 tctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgttct 9681124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 11355304 - 11355562
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11355304 tttgtatagagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagag 11355403  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttc-gctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  11355404 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaacgtttctcatcatatagtggaacagagagctgct 11355503  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  11355504 ctctcccctagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttatgttct 11355562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 270
Target Start/End: Original strand, 9679105 - 9679361
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9679105 tttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaaga 9679203  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||    
T  9679204 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgc 9679303  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgtt 270  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9679304 tctctttcccagactaggtcaatttggaccagactgggtcaacaaattcttttgtgtt 9679361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 21680073 - 21680334
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21680073 tttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagag 21680172  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | | ||| ||||||    
T  21680173 attgggactttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagagctgct 21680272  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaa---ctaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||||||| ||||||    
T  21680273 ctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactgctgggtcaacaaatacttttttgttct 21680334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 37412371 - 37412110
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 113  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37412371 tttgtatagagtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaaga 37412272  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc--tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggct 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |  ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  37412271 gactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggatggct 37412172  T
Q  211 gctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||    
T  37412171 gctctctcccctagactgggtcaatttggaccgaactggatcaataaattcttttgtgttct 37412110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 39146230 - 39145971
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39146230 tttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 39146131  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| |||||||    
T  39146130 attggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggggggctgc 39146031  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||| | ||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  39146030 tcttttccctaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 39145971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Original strand, 11757275 - 11757465
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt-gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757275 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 11757374  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcg 203  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757375 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcg 11757465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Original strand, 2935374 - 2935559
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct 173  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  2935374 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 2935473  T
Q  174 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  2935474 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 2935559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 259
Target Start/End: Original strand, 21678112 - 21678357
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  21678112 tttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagat 21678211  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  | ||||||| |||||| ||||||||||| | | | ||||||||    
T  21678212 attgggactttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcatatagtgaaacagtgggctgct 21678311  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  21678312 ctctcccctagactaggttaatttggaccgaactgggacaacaaat 21678357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27832876 - 27832651
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27832876 tttgtatagagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 27832777  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctt-tgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||| |    
T  27832776 attgagactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttctgtaaagttactcatcattatagtgaaatggagggcttc 27832677  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttg 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27832676 tctctcccccagactaggtcaatttg 27832651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 42223203 - 42223462
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42223203 tttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 42223302  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||    
T  42223303 gattggagctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggatggctgc 42223402  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  42223403 tctctcccccatactaggtcaattttgatcgaactgggtcaacaaattcttttgttttct 42223462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 75 - 275
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137384
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct 173  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  22137184 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22137282  T
Q  174 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  22137283 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 22137382  T
Q  274 ct 275  Q
    ||    
T  22137383 ct 22137384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 75 - 275
Target Start/End: Original strand, 40552211 - 40552411
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct 173  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  40552211 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40552309  T
Q  174 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  40552310 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 40552409  T
Q  274 ct 275  Q
    ||    
T  40552410 ct 40552411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 75 - 275
Target Start/End: Original strand, 22108173 - 22108373
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct 173  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  22108173 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22108271  T
Q  174 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  22108272 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 22108371  T
Q  274 ct 275  Q
    ||    
T  22108372 ct 22108373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 75 - 275
Target Start/End: Original strand, 40549933 - 40550133
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct 173  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  40549933 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40550031  T
Q  174 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  40550032 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 40550131  T
Q  274 ct 275  Q
    ||    
T  40550132 ct 40550133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Original strand, 1606486 - 1606670
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct 173  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  1606486 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 1606584  T
Q  174 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  1606585 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcagattggaccgaactgggtcaacaaat 1606670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 24258509 - 24258772
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24258509 tttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaag 24258608  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca----tatagtggatcggagggc 209  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||||||||    ||||||||| ||||||||    
T  24258609 attgagactttggatagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattatagtggaacggagggc 24258708  T
Q  210 tgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaac-aaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||    
T  24258709 tgctctctctttcagactaggtcaatttggaccgaattagatgaacaaaattcttttgtgttct 24258772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 75 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9027376 - 9027176
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct 173  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  9027376 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 9027278  T
Q  174 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   | |||||||||    
T  9027277 ttgtaacgttactcatcaaatagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctatgtgttctt 9027178  T
Q  274 ct 275  Q
    ||    
T  9027177 ct 9027176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 200
Target Start/End: Original strand, 25276187 - 25276374
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25276187 tttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 25276286  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtgga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25276287 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 25276374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24813738 - 24813495
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  24813738 tttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtctcttggtgacgggaagtg 24813643  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttc-gctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  24813642 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattatagtggagcggatggctgc 24813543  T
Q  213 tctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||    
T  24813542 tttctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaat 24813495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24817593 - 24817362
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24817593 tttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggaaagcagtattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 24817498  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  24817497 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgc 24817398  T
Q  213 tctctaccccagactaggtca-atttggaccgaact 247  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  24817397 tctctcccccatactaggtcagttttggaccgaact 24817362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 161
Target Start/End: Original strand, 26804615 - 26804764
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag---ggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26804615 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaa 26804714  T
Q  112 gagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 161  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804715 gaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 26804764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 58 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20091745 - 20091580
Alignment:
Q  58 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20091745 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaatctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 20091646  T
Q  158 acccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccag 224  Q
    |||| ||||| || | ||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20091645 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatc--atagtggaacggagggctgctctctcccccag 20091580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 259
Target Start/End: Original strand, 7188588 - 7188832
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  7188588 tttgtatagggtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaatag 7188684  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgat-ttcgctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||| ||   ||||||| |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  7188685 attgagactttgggtagaattaagcgggagacttatttttataacccattgatatttcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacggaaggctgc 7188784  T
Q  213 tctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||||| |||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||| |||||||    
T  7188785 tctcttccccagtctatgtcagttttggactgaactaggtaaacaaat 7188832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22828876 - 22828672
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||  ||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22828876 tttgtatagagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagattagaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagag 22828777  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||  |||||||| | ||||||| | | |||||||||    
T  22828776 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcattattatagtgaaacagagggctgc 22828677  T
Q  213 tctct 217  Q
    |||||    
T  22828676 tctct 22828672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22251785 - 22251641
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251785 tttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga--------taggattgagtctcttggttacgggaagag 22251694  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgat 167  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22251693 attgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 22251641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Original strand, 24465587 - 24465816
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  24465587 tttgtatagcgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gaattgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtcatgggaagag 24465682  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| | ||||| |  | ||||||| | ||||||||| |||| || | |||  | ||||    
T  24465683 attgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaactcattgatatgtcttttgtaaag-tactcatcattataatgaaacgggtgactgc 24465781  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaact 247  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  24465782 tctctcccccagactagatcaatatgaaccgaact 24465816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 272
Target Start/End: Original strand, 22393876 - 22394027
Alignment:
Q  123 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctacc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| || ||||| ||    
T  22393876 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctctccc 22393975  T
Q  221 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  22393976 ctagactaggtcaatttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttct 22394027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 259
Target Start/End: Original strand, 6332311 - 6332513
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaac 159  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  6332311 ttgattcagtttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaac 6332410  T
Q  160 ccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaaca 256  Q
    || || || || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||    
T  6332411 cctttaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaagactgttctctcccctagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 6332510  T
Q  257 aat 259  Q
    |||    
T  6332511 aat 6332513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 247
Target Start/End: Original strand, 26295580 - 26295727
Alignment:
Q  102 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtgg 199  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| |||||||     
T  26295580 gttacaggaagcgattgtgactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtga 26295679  T
Q  200 atcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaact 247  Q
    | | || | ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  26295680 aacagatgactgctctctcctccagactaggtcaatttggactgaact 26295727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 259
Target Start/End: Original strand, 11081598 - 11081802
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 159  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||   | ||||| |||||||||||    
T  11081598 ttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaac 11081697  T
Q  160 cc--gttgatttcgctt-tgtaacgttactcatc-atatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaa 254  Q
    ||   ||||| || ||| ||||| ||||||||||  || | |||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  11081698 cctttttgatatctcttgtgtaaagttactcatctttaaaatggaacggatggttgctctctcccccagactaggtcaatattggaccgaactgggtaaa 11081797  T
Q  255 caaat 259  Q
    |||||    
T  11081798 caaat 11081802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297146
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattag 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattag 16297146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 205 - 293
Target Start/End: Original strand, 11759364 - 11759452
Alignment:
Q  205 agggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  11759364 agggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctctcctttgtgttcttctc 11759452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 87
Target Start/End: Original strand, 18567659 - 18567731
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattag 87  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18567659 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 18567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 116
Target Start/End: Original strand, 22392534 - 22392608
Alignment:
Q  39 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 116  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22392534 aacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagat 22392608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 251
Target Start/End: Original strand, 6048932 - 6049157
Alignment:
Q  30 tctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggg 128  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||     
T  6048932 tctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggattgattcaccttgaagaaacactattaggattgaatctcttggtcacgagaagatattgagactttgga 6049029  T
Q  129 tagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatc---atatagtggatcggagggctgctctctaccccag 224  Q
    ||||||||||   | |||| ||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||||||||   |||||||||| ||||| | ||||||   |||||     
T  6049030 tagaattaggtttgaagacgtattcttataaccctttgatatccctttgtaaagttactcatcattatatagtggaacggagagttgctcttccccccat 6049129  T
Q  225 actaggtcaat-ttggaccgaactaggt 251  Q
    ||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  6049130 actagctcagtaatggaccgaactaggt 6049157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 40281572 - 40281466
Alignment:
Q  64 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccg 162  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||   | |||||||||||||||||||     
T  40281572 attcaccttgggaaacaccgttaggattgagtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccct 40281473  T
Q  163 ttgattt 169  Q
    |||||||    
T  40281472 ttgattt 40281466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 138
Target Start/End: Original strand, 11084467 - 11084544
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  11084467 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattcgaactttgggtaaaattagg 11084544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 25351353 - 25351508
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||||   |  || || |||    
T  25351353 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac---tcaatatctctt 25351448  T
Q  175 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||| |  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  25351449 tgtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgttctctcccccagactaggtca 25351508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Original strand, 2120881 - 2121056
Alignment:
Q  60 gttgattcaccttggg--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 156  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||    
T  2120881 gttgattcaccttggacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgt 2120979  T
Q  157 aacccgttgatttcgctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    |||   |  || || |||||||| |  ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  2120980 aac---tcaatatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 2121056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 245
Target Start/End: Original strand, 6046641 - 6046772
Alignment:
Q  117 tgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||  | || |||||||    
T  6046641 tgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaacctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaatgaagagctgctc 6046740  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaa 245  Q
    ||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  6046741 tctcccccagactaggtcagtattggaccgaa 6046772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 192
Target Start/End: Original strand, 6348912 - 6349006
Alignment:
Q  99 ttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcat 192  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || | |||||||  |||||||||||    
T  6348912 ttggtcacgggaaaagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcat 6349006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 273
Target Start/End: Original strand, 7069780 - 7069976
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| | |   | || |||    
T  7069780 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 7069875  T
Q  175 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 271  Q
    ||||| |  ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  7069876 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaata-ttttgtgttc 7069974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 273
Target Start/End: Original strand, 25405393 - 25405589
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| | |   | || |||    
T  25405393 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 25405488  T
Q  175 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 271  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||    
T  25405489 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaata-tcttgtgttc 25405587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 138
Target Start/End: Original strand, 26210631 - 26210710
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26210631 ttgattcaccttggagaaatactattaggattgagtctcttggtaacggaaagagattcgggactttcggtagaattagg 26210710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3320232 - 3320076
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| | |   | || |||    
T  3320232 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 3320137  T
Q  175 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  3320136 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 3320076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3324980 - 3324824
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| | |   | || |||    
T  3324980 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 3324885  T
Q  175 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  3324884 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 3324824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Original strand, 21369642 - 21369703
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  21369642 aaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggac-ttgggtaaaattagg 21369703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13290672 - 13290471
Alignment:
Q  62 tgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 159  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||| ||| | ||| ||||||||||||||   | ||| | |||||||||||    
T  13290672 tgattcaccttcgagaaacactattagaatttagtctcttggtcacaggaagatattagaactctgggtagaattaggtttgaagaataattcttgtaac 13290573  T
Q  160 ccgttgatttcgctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    |  ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||| ||| | |||| || |||||| ||||| | |||||||||||| ||| |||||    
T  13290572 cttttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagcggaacagagagctacactctccctcagacttggtcagtattggaccgaactgggtaaacaa 13290473  T
Q  258 at 259  Q
    ||    
T  13290472 at 13290471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 25357047 - 25357202
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||||   |  || || |||    
T  25357047 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac---tcaatatctctt 25357142  T
Q  175 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||| |  |||||||| |||||||||||| || | || ||||| |||||||||||||||    
T  25357143 tgtaaagaaactcatcattatagtggatcgaagagatgatctctcccccagactaggtca 25357202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 25410130 - 25410287
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||||   |  || || |||    
T  25410130 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac---tcaatatctctt 25410225  T
Q  175 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  25410226 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 25410287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 7074787 - 7074943
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| | ||    || |||    
T  7074787 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctctt 7074882  T
Q  175 tgtaacgttactcat-cat-atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||| |  |||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  7074883 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgcactctcccccagactaggtca 7074943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Original strand, 42006663 - 42006724
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  42006663 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 42006724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 12310234 - 12310157
Alignment:
Q  39 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 117  Q
    |||||||||||||||| |  | |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12310234 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgaacaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 12310157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 272
Target Start/End: Original strand, 26804762 - 26804814
Alignment:
Q  220 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  26804762 cccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 26804814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 257
Target Start/End: Original strand, 9190038 - 9190101
Alignment:
Q  194 tagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  9190038 tagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9190101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20284156 - 20284093
Alignment:
Q  194 tagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  20284156 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20284093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Original strand, 30246973 - 30247031
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  30246973 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 30247031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 44512704 - 44512646
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  44512704 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 44512646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 6067373 - 6067180
Alignment:
Q  85 taggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgt-aacgt 182  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||   | ||||| |||||||||| ||  |||| || |||||| || |     
T  6067373 taggatttagtctcttggtcacgggaagagattgagacttt-gatagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctctgatatctctttgtaaaagg 6067275  T
Q  183 tactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct 275  Q
     |||| ||| ||||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||| ||| ||||||| || | ||||||||||    
T  6067274 aactcgtcattatagtgaaacggagagctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccggactgggtaaacaaattctctcgtgttcttct 6067180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 8378686 - 8378625
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  8378686 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 8378625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 15541177 - 15541116
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| |||||||    
T  15541177 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtataattagg 15541116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21983352 - 21983288
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  21983352 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21983288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 44144045 - 44143997
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  44144045 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg 44143997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 46516339 - 46516403
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  46516339 atagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 46516403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 2580457 - 2580394
Alignment:
Q  194 tagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||    
T  2580457 tagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 2580394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 34547042 - 34546984
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| |||||||    
T  34547042 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 34546984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 56015 - 55955
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaa 254  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||    
T  56015 atagtggattggagggctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 55955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 2647725 - 2647789
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||| ||||| | |||||||||    
T  2647725 atagtggattggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgggccgaattgggtcaacaa 2647789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 4796696 - 4796760
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    |||||||||  |||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  4796696 atagtggatttgagggctgctttctcccccagattaggtcattttggaccgaactgggttaacaa 4796760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12097911 - 12097867
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12097911 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 12097867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29159871 - 29159807
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  29159871 atagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 29159807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 35960884 - 35960820
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  35960884 atagtggtttggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactcggtcaacaa 35960820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 257
Target Start/End: Original strand, 9185195 - 9185258
Alignment:
Q  194 tagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    |||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  9185195 tagtggattggagagcttctctctcccccagactaggttatattggaccgaactgggtcaacaa 9185258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 257
Target Start/End: Original strand, 28617255 - 28617318
Alignment:
Q  194 tagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| ||| |||||    
T  28617255 tagtggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaa 28617318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 257
Target Start/End: Original strand, 33332480 - 33332543
Alignment:
Q  194 tagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  || || |||||| |||||||||    
T  33332480 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaa 33332543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8378570 - 8378489
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||    
T  8378570 tatagtggatcggagagttgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaata-tcttgtgttctt 8378489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7464585 - 7464544
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  7464585 tatagtggaacggagagctgctctcttccccagactaggtca 7464544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 117
Target Start/End: Original strand, 8260584 - 8260625
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 117  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8260584 aaaccctattaggattgagtgtcttggtcacgggaagagatt 8260625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 272
Target Start/End: Original strand, 25276381 - 25276434
Alignment:
Q  219 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||    
T  25276381 ccccagactaagtcaatatggaccgaactggttaaacaaattcttttgtgttct 25276434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34546946 - 34546905
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  34546946 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 34546905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 44010816 - 44010775
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  44010816 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 44010775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 2759241 - 2759197
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  2759241 tctcttccccagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaacaa 2759197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14653900 - 14653852
Alignment:
Q  227 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct 275  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  14653900 taggtcaatttagactgaactaggtaaacaaatattgttgtgttcttct 14653852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Original strand, 27347941 - 27347985
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27347941 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 27347985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 36146452 - 36146408
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36146452 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 36146408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 41317478 - 41317434
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  41317478 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 41317434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 102)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 27829389 - 27829667
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829389 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 27829488  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829489 gctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctc 27829588  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27829589 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 27829667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 32339401 - 32339680
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339401 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 32339500  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339501 attggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgct 32339600  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  32339601 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggttaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 32339680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 276
Target Start/End: Original strand, 3874102 - 3874364
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3874102 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagag 3874201  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3874202 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 3874301  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 276  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3874302 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 3874364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 27827078 - 27827356
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27827078 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagag 27827177  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827178 gctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctc 27827277  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27827278 tctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 27827356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 21 - 293
Target Start/End: Original strand, 18812980 - 18813252
Alignment:
Q  21 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |    
T  18812980 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgggtacgggaagaggctgtg 18813079  T
Q  121 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctacc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  18813080 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 18813179  T
Q  221 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18813180 ccatattaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 18813252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 15809311 - 15809589
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15809311 tttgtatagagtttgtctttt-ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaa 15809409  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15809410 actaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgct 15809509  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15809510 ctcttccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 15809589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 18810800 - 18811078
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18810800 tttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaatag 18810899  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18810900 gctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggattggagggctgctc 18810999  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18811000 tctcccccagattaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 18811078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 28283462 - 28283185
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28283462 tttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagag 28283363  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283362 attggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 28283263  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28283262 tct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 28283185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 15 - 288
Target Start/End: Original strand, 608826 - 609101
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  608826 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagag 608925  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608926 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 609025  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatac-ttttgtgttcttctcatctttgtgttc 288  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  609026 ctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttttgtgttcttctcttctttgtgttc 609101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 4424110 - 4424389
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4424110 tttgtatagagtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 4424209  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4424210 attggagctttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttatcttttgtaacattactcatcatatagtggatcagagggctgct 4424309  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4424310 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 4424389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 44720935 - 44721214
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa-cactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44720935 tttgtatagagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 44721034  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  44721035 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagagctgct 44721134  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  44721135 ctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 44721214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Original strand, 43079694 - 43079953
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43079694 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 43079793  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43079794 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 43079893  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||    
T  43079894 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 43079953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22684899 - 22684617
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22684899 tttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 22684800  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc---gttgatttcgct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggct 210  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22684799 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccaatattgatttctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggct 22684700  T
Q  211 gctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22684699 gctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 22684617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28251810 - 28251552
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251810 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 28251711  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251710 gctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 28251611  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28251610 ctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28251552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 275
Target Start/End: Original strand, 43082065 - 43082326
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43082065 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaaga 43082164  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43082165 gattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 43082264  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct 275  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||    
T  43082265 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 43082326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 43530213 - 43530481
Alignment:
Q  21 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  43530213 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggctggg 43530312  T
Q  121 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctac 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  43530313 actttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccattgatttctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctgtctct 43530412  T
Q  220 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttc 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  43530413 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttc 43530481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 30480746 - 30480488
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30480746 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 30480647  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||    
T  30480646 attgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaaatggatggctgct 30480547  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  30480546 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 30480488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 14807843 - 14808111
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807843 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 14807942  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg-- 211  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  14807943 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 14808042  T
Q  212 --------ctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
            |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14808043 ctctccccctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14808111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 15068073 - 15068330
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15068073 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaatactattaggattgagtcttttggttacggaaagag 15068172  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15068173 gttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatataatggaacggagggctgct 15068272  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 271  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  15068273 ctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggccaacaaattcttttgtgttc 15068330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 27107140 - 27106884
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27107140 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 27107041  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || | ||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  27107040 attgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctcttttgtagggttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 27106941  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgtt 270  Q
     ||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||    
T  27106940 atctcctccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgtt 27106884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 15072802 - 15073061
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga- 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  15072802 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagag 15072901  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 212  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  15072902 ggttgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatacagtggaacggagggctgc 15073001  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  15073002 tctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 15073061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 268
Target Start/End: Original strand, 27911106 - 27911359
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27911106 tttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 27911205  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| || || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  27911206 attgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgct 27911305  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtg 268  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  27911306 ctct-ccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattcttttgtg 27911359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 268
Target Start/End: Original strand, 27957525 - 27957778
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27957525 tttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 27957624  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| || || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  27957625 attgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgct 27957724  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtg 268  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  27957725 ctct-ccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattcttttgtg 27957778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 1225258 - 1225517
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1225258 tttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 1225357  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttg--atttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||  || ||  |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||    
T  1225358 attggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggccgc 1225457  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1225458 tctctccctcatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 1225517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 24873424 - 24873164
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24873424 tttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaaga 24873325  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24873324 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 24873225  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 276  Q
    |||| ||||| |||||||||  |||||||||| |  ||||||||||  || ||||||||||||    
T  24873224 ctctcccccatactaggtcagattggaccgaattgagtcaacaaat--ttctgtgttcttctc 24873164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14419434 - 14419175
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14419434 tttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagag 14419335  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |  | ||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||||    
T  14419334 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatgtcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggctgc 14419235  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14419234 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14419175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 41384836 - 41385094
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41384836 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagag 41384935  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||  |||| |||||||||||| |||||| || |||||||||| | ||||  || | |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  41384936 attggagctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgct 41385035  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  41385036 ctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttctgttct 41385094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Original strand, 25952613 - 25952871
Alignment:
Q  16 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  25952613 ttgtatatagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaa 25952712  T
Q  116 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| || | |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25952713 ttgagacattgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgct 25952812  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25952813 ctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 25952871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 41382765 - 41383012
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||           |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41382765 tttgtatagaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacct-----------attatgattgagtctcttggttacgggaagag 41382853  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||  || |||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  41382854 attggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgct 41382953  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41382954 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 41383012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13858727 - 13858477
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13858727 tttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagag 13858628  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || || || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||||    
T  13858627 attggggctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt-atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgc 13858529  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttt 264  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||    
T  13858528 tctctcccccagactaggtcaatttggacagaactgggtaaacaaattcttt 13858477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 36865630 - 36865887
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||    
T  36865630 tttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct---tcacgggaagag 36865726  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||  |||||    
T  36865727 attggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaatgctgc 36865826  T
Q  213 tctctacccc-agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  36865827 tctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattctcttgtgttct 36865887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 15956053 - 15956308
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  15956053 tttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaagag 15956148  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| | |    
T  15956149 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggtttc 15956248  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  15956249 tctctccctcagattaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtattct 15956308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5372417 - 5372160
Alignment:
Q  19 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 118  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5372417 tatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattg 5372318  T
Q  119 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttc-gctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 216  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| | |||||    
T  5372317 ggactttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttactctc 5372218  T
Q  217 t-accccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||  |||| |||||||    
T  5372217 tccccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattattttctgttctt 5372160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 259
Target Start/End: Original strand, 21482406 - 21482648
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  21482406 tttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttatgggaagag 21482501  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||  | | |||||||||||    
T  21482502 attggggctttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataaagaaacggagggctgc 21482601  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21482602 tctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaat 21482648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Original strand, 14477368 - 14477520
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14477368 tttgtataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagag 14477467  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgat 167  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14477468 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgat 14477520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Original strand, 21480598 - 21480828
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  21480598 tttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactaggttt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagat 21480693  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||||    
T  21480694 attggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgc 21480793  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaact 247  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21480794 tctctcccccagactaggtcaatttggaacgaact 21480828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15185949 - 15185699
Alignment:
Q  19 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct--tggttacgggaagagat 116  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15185949 tataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtaaaacactattagaattgagtctctcttggttacgggaagagat 15185850  T
Q  117 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgt-aacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctc 214  Q
    |       |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | || |||||||||||| |||||| | |||||| ||| ||    
T  15185849 t-------tgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctcttttttaaggttactcatcattatagtgaaacggaggactgttc 15185757  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  15185756 tctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttttgttct 15185699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3005871 - 3005628
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||| |||||   |||||||| |||||||   || ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  3005871 tttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaatagggtt---ggattgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaagag 3005776  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  3005775 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggaggggtgc 3005676  T
Q  213 tctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| |||||||    
T  3005675 tctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaat 3005628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 58 - 259
Target Start/End: Original strand, 31162344 - 31162550
Alignment:
Q  58 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  31162344 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaccggaagagattgggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgta 31162443  T
Q  158 acccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct--accccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtc 252  Q
    || | ||||| || | |||||||  |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||| |||     
T  31162444 actcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccccagactaggtcagtattggaccgaactgggta 31162543  T
Q  253 aacaaat 259  Q
    |||||||    
T  31162544 aacaaat 31162550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 33541631 - 33541507
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33541631 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagag 33541532  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggc 139  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  33541531 attgggacttttggtagaattaggc 33541507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 58 - 259
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035458
Alignment:
Q  58 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgt 31035351  T
Q  157 aacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagac--taggtcaat-ttggaccgaactaggtc 252  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| | |||||||||||| |||     
T  31035352 aaccctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactataggtcagtattggaccgaactgggta 31035451  T
Q  253 aacaaat 259  Q
    |||||||    
T  31035452 aacaaat 31035458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 46 - 193
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181772
Alignment:
Q  46 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt-aggattgagtctcttggttacg--ggaagagattgggactttgggtagaattaggcggg 142  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgga 181721  T
Q  143 agacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcata 193  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  181722 agacttattcttgtaacccattgatatctctttgtaaagttactcatcata 181772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578274
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 31578377  T
Q  160 ccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaaca 256  Q
    |  ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| ||| ||||||||||| | | |||||||||| ||| ||||    
T  31578376 cttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagactaggtcagtataggaccgaactgggtaaaca 31578277  T
Q  257 aat 259  Q
    |||    
T  31578276 aat 31578274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 37214434 - 37214317
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||| |    
T  37214434 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaac---------attgagtctcttggttacgggaagcg 37214344  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgg 141  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  37214343 attggaactttgggtagaattaggcgg 37214317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 5622981 - 5622877
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5622981 tttgtatagagtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctttggaaacattatttggattgagtctcttgattacgggaagag 5622882  T
Q  115 attgg 119  Q
    |||||    
T  5622881 attgg 5622877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 31573961 - 31573847
Alignment:
Q  21 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 120  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  31573961 tagagttt-tctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgag 31573865  T
Q  121 actttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31573864 actttgggtagaattagg 31573847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Original strand, 26775293 - 26775378
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  26775293 tttgtatatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaaacactattagaattgagtctctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 173 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 33541494 - 33541395
Alignment:
Q  173 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||    
T  33541494 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaaaaatttcttttgtgttct 33541395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 35872639 - 35872555
Alignment:
Q  1 gcaacagctagggctttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatta 86  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35872639 gcaacaactaggg-tttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 35872555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 129 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2468127
Alignment:
Q  129 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctaccccagac 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||| |||| |||||||||||| |||||| |   ||||||||||||||  ||||||     
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccagat 2468160  T
Q  227 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  2468159 taggtcaatttggacagaactaggtaaacaaat 2468127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 202 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 37214319 - 37214251
Alignment:
Q  202 cggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgtt 270  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  37214319 cggatggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 37214251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 247
Target Start/End: Original strand, 6376141 - 6376315
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||  |||||||||||   | ||||| |||||||| |||  ||||| || |||    
T  6376141 aaacactgttaagattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttatgtagaattaggtttgaagactaattcttgttaccttttgatatctctt 6376240  T
Q  175 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaact 247  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||    
T  6376241 tgtaaagttactcatcattatagtggaacagaaggctgctctctccctcagactaggtcagtattggaccgaact 6376315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 76 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 13985262 - 13985176
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  13985262 aaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaaactgattcttgtaaccc 13985176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 233
Target Start/End: Original strand, 17847661 - 17847830
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgg--gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 157  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  17847661 ttgattcaccttgaacgaaacactattaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 17847760  T
Q  158 acccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    | || ||||| || | |||||||    | ||||  |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17847761 a-cctttgatatctcttttgtaa----aatcat--tatagtggaatggagggctgctctctcccccagactaggtca 17847830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16757449 - 16757253
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| | |   | || |||    
T  16757449 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 16757354  T
Q  175 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 271  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||    
T  16757353 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaata-tcttgtgttc 16757255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 2468341 - 2468261
Alignment:
Q  19 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 103  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2468341 tatagagtttg-ctcttggcaacaaatactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 273
Target Start/End: Original strand, 14477519 - 14477602
Alignment:
Q  191 atatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaact-aggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    |||||||| | |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  14477519 atatagtgaaacggatggctactctttaccccagactaggtcaatttggatcgaactgcggtcaacaaattcttttgtgttctt 14477602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 273
Target Start/End: Original strand, 28327908 - 28328104
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| | |   | || |||    
T  28327908 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 28328003  T
Q  175 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 271  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||    
T  28328004 tgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaata-tcttgtgttc 28328102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 9021289 - 9021228
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  9021289 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9021228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 13986011 - 13985933
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattag 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  13986011 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagactcttaatcacgggaagagattcgggactttgggtataattag 13985933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 16752704 - 16752643
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16752704 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16752643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Original strand, 28895502 - 28895563
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  28895502 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28895563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Original strand, 30423212 - 30423274
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  30423212 aaacacttttaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattggaactttggatagaattagg 30423274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 95
Target Start/End: Original strand, 31035161 - 31035238
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 95  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31035161 tttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacaccattaggattgagt 31035238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Original strand, 25684646 - 25684839
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgt 177  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| | |   | || ||||||    
T  25684646 cactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagacagggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctttgt 25684741  T
Q  178 aacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    || |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||    
T  25684742 aaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaata-tcttgtgttctt 25684839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Original strand, 590797 - 590855
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  590797 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 590855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 257
Target Start/End: Original strand, 19752424 - 19752487
Alignment:
Q  194 tagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19752424 tagtggattggagagctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19752487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Original strand, 33032657 - 33032715
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  33032657 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 33032715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 138
Target Start/End: Original strand, 3895957 - 3896035
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  3895957 ttgattcactttggagaaacactattgcgattgagtctcttcgtcacgggaagaaattgggactttgagtataattagg 3896035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 4812669 - 4812608
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  4812669 aaacactattaggattgagtcttttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 4812608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Original strand, 28332631 - 28332692
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  28332631 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28332692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 29554964 - 29554908
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaatta 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  29554964 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaatta 29554908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 4696625 - 4696689
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| |||||| |||||||||    
T  4696625 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaa 4696689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 9765848 - 9765912
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  9765848 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9765912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 19175783 - 19175847
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| | |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19175783 atagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19175847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 26403259 - 26403323
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  26403259 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 26403323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 31071258 - 31071322
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  31071258 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaa 31071322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 33839120 - 33839043
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  33839120 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggt--caggaagagattcaagactttgggtagaattagg 33839043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Original strand, 3276347 - 3276405
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  3276347 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3276405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 2267205 - 2267144
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  2267205 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattaggac-ttgggtagaattagg 2267144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 17799606 - 17799568
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17799606 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 17799568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 273
Target Start/End: Original strand, 28890881 - 28890962
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||    
T  28890881 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaata-tcttgtgttctt 28890962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4812554 - 4812485
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaata 260  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| | || ||||||||| ||| ||||||||    
T  4812554 tatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcataattagaccgaactgggtaaacaaata 4812485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29554851 - 29554810
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  29554851 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 29554810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872480
Alignment:
Q  145 acttattcttgtaacccgttgatttcgcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 217  Q
    ||||||| |||||| || ||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 35872480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 7412409 - 7412345
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  7412409 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 7412345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 23799606 - 23799670
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  23799606 atagtggattggagggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 23799670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Original strand, 15949534 - 15949596
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  15949534 aaacactattaggatatagtctcttggtcacgggaagagattcgggac-ttgggtaaaattagg 15949596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 35872476 - 35872438
Alignment:
Q  234 atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  35872476 atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 35872438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 11701155 - 11701102
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 113  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  11701155 ttgattcaccttgaagaaacattattagaattgagtctcttggtcacgggaaga 11701102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 275
Target Start/End: Original strand, 28228668 - 28228717
Alignment:
Q  227 taggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct 275  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  28228668 taggtcaatattggaccgaactaggtaaacacattcttttgtgttcttct 28228717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28307628 - 28307575
Alignment:
Q  194 tagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaact 247  Q
    |||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28307628 tagtggattggagagctgctctcatccccagagtaggtcattttggaccgaact 28307575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1345415 - 1345371
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  1345415 tctctcccccagagtaggtcaagttagaccgaactaggtcaacaa 1345371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 5702512 - 5702576
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    |||| |||| |||||| |||||||| ||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  5702512 ataggggattggagggatgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5702576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 6127289 - 6127225
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||| | |||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  6127289 atagtggattggagagctgctctcttccccaaattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 6127225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 10930243 - 10930199
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  10930243 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 10930199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Original strand, 15212910 - 15212954
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15212910 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 15212954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 112
Target Start/End: Original strand, 21033870 - 21033906
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21033870 aaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaag 21033906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 23179740 - 23179692
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || ||||||||    
T  23179740 cactattaggattgagtctcttggtcaccggaagaggctgtgactttgg 23179692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Original strand, 27811402 - 27811446
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27811402 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 27811446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Original strand, 33352274 - 33352318
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33352274 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 33352318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Original strand, 40321204 - 40321248
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  40321204 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40321248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 100)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 14507418 - 14507140
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507418 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 14507319  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14507318 gctgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatacttatcatatagtgaatcggagggctgctc 14507219  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14507218 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 14507140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 4816474 - 4816195
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816474 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 4816375  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4816374 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgct 4816275  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4816274 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 4816195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20915599 - 20915321
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20915599 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgagaaga 20915500  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20915499 gattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgct 20915400  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20915399 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc-tctgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 20915321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 28241564 - 28241290
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241564 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 28241465  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28241464 gctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgct 28241365  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttc 288  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28241364 ctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttc 28241290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 30967272 - 30967551
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967272 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 30967371  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30967372 gctgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgct 30967471  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30967472 ctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 30967551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 2629128 - 2628850
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629128 tttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 2629029  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629028 attgggactttgggtagaattaggcggagaatttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggatcggagggctgctc 2628929  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2628928 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 2628850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11983272 - 11983014
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983272 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 11983173  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983172 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 11983073  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11983072 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11983014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 19704812 - 19704531
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19704812 tttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 19704713  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct--ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19704712 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctg 19704613  T
Q  212 ctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19704612 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 19704531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 14459008 - 14458731
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14459008 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgattc--cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 14458911  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14458910 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgct 14458811  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14458810 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 14458731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 30034846 - 30034567
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  30034846 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcaattggttaagggaagag 30034747  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30034746 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagcggatcggagggctgct 30034647  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  30034646 ctctcccccagactgggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttattatcttctttgtgttcttctc 30034567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 1230492 - 1230213
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  1230492 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttattggaagag 1230393  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  1230392 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgct 1230293  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  1230292 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcattgtgttcttctc 1230213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 13057265 - 13057524
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13057265 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagag 13057364  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |    
T  13057365 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctac 13057464  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13057465 tctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactcggtcaacaaattcttttgtgttct 13057524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 26065057 - 26065310
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065057 tttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 26065153  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  26065154 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctctttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctc 26065253  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  26065254 tct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 26065310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 26085026 - 26085279
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26085026 tttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 26085122  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  26085123 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctctttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctc 26085222  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  26085223 tct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 26085279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 26932805 - 26932527
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26932805 tttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 26932706  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26932705 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgct 26932606  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa-tacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  26932605 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttcttttgtgttcttct--tctttgtgttcttctc 26932527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 12195758 - 12195478
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12195758 tttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 12195659  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12195658 gattgggactttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 12195559  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |   |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  12195558 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaagtttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 12195478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 9019997 - 9020255
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  9019997 tttgtatagagtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttataggaagag 9020096  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  9020097 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggggggctgct 9020196  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  9020197 ctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 9020255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 43 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273214
Alignment:
Q  43 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 5273332  T
Q  142 gagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggac 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5273331 gagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggac 5273232  T
Q  242 cgaactaggtcaacaaat 259  Q
    |||||| |||||||||||    
T  5273231 cgaactgggtcaacaaat 5273214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 13039825 - 13040084
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13039825 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagag 13039924  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  13039925 attgagactttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgc 13040024  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13040025 tctctcccctagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13040084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3630107 - 3629850
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3630107 tttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagag 3630008  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||| || |||||||| | | ||||||||||    
T  3630007 attggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactaataatatagtgaaactgagggctgct 3629908  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  3629907 ctct-ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3629850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 32280067 - 32280326
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32280067 tttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 32280166  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatc-atatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||  ||||||  | |||||||||||    
T  32280167 attgggacttcaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagtaaaacggagggctgc 32280266  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||    
T  32280267 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaaaaaattctcttgtgttct 32280326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 268
Target Start/End: Original strand, 3390450 - 3390705
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  3390450 tttgtatagagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagag 3390549  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| || |||| | |||||||||||    
T  3390550 attggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtgaaacggagggctgc 3390649  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtg 268  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||    
T  3390650 tctctcccccatactaggtcaatttggaccaaattgggtcaacaaattcttttgtg 3390705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 3632181 - 3631926
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  3632181 tttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctttgttacggaaagag 3632082  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  3632081 attgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgc 3631982  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgtt 270  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3631981 tctgt--cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 3631926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15541383 - 15541125
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15541383 tttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggtcacgagaagag 15541284  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||| ||||||||||||| | | ||  ||||||    
T  15541283 attgggactttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatatagtgaaacagaaagctgct 15541184  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| | ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15541183 ctctcctccagactaggttaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 15541125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Original strand, 25477349 - 25477611
Alignment:
Q  19 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  25477349 tatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattg 25477448  T
Q  119 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaa-------cgttactcatca-tatagtggatcggagggc 209  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||       |||||||||||| ||||||| | | ||||||    
T  25477449 gggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcgttactcatcattatagtgaaacagagggc 25477548  T
Q  210 tgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||    
T  25477549 tgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaaatgggtcaacaaattcttttgtattct 25477611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15532924 - 15532674
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15532924 tttgtataaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagag 15532825  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15532824 attgggacttttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 15532725  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatactttt 265  Q
    || | ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15532724 ctat-ccctagactaggtcaattttgactgaactaggtcaacaaattctttt 15532674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 30729071 - 30728811
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30729071 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttacgggaagag 30728972  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttga----tttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 209  Q
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||    |||| | ||||||| |||||||||  ||||||||| |||| |||    
T  30728971 gctggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctttctcttttgtaaagttactcatattatagtggaacggaaggc 30728872  T
Q  210 tgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgtt 270  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30728871 tgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 30728811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 75 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26066307 - 26066106
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct 173  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  26066307 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26066208  T
Q  174 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||    
T  26066207 ttgtaacgttacttatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 26066108  T
Q  274 ct 275  Q
    ||    
T  26066107 ct 26066106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3233974 - 3233710
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 113  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3233974 tttgtatatagtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 3233875  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||  || |||| ||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||    
T  3233874 gattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcaccgtatagtgaaacggagggctgc 3233775  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaacta-----ggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||      ||||||||||| ||||||||||||    
T  3233774 tctctcccccacactaggtcaattttgaccgaactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3233710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15530365 - 15530166
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15530365 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 15530266  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15530265 attgaggctttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 15530167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 75 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 29754892 - 29754691
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct 173  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  29754892 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctct 29754793  T
Q  174 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  29754792 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 29754693  T
Q  274 ct 275  Q
    ||    
T  29754692 ct 29754691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 75 - 275
Target Start/End: Original strand, 33308988 - 33309188
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct 173  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  33308988 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 33309086  T
Q  174 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||    
T  33309087 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 33309186  T
Q  274 ct 275  Q
    ||    
T  33309187 ct 33309188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 75 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26068578 - 26068377
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct 173  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  26068578 gaaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26068479  T
Q  174 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||    
T  26068478 ttgtaacgttgctcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 26068379  T
Q  274 ct 275  Q
    ||    
T  26068378 ct 26068377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 75 - 275
Target Start/End: Original strand, 33311257 - 33311457
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct 173  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  33311257 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 33311355  T
Q  174 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||    
T  33311356 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 33311455  T
Q  274 ct 275  Q
    ||    
T  33311456 ct 33311457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 64 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069703
Alignment:
Q  64 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 1069814  T
Q  164 tgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatac 261  Q
    |||| || | ||||||| ||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||| |    
T  1069813 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtcaatttggaccgaactgaatcaacaaattc 1069714  T
Q  262 ttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||    
T  1069713 ttttatgttct 1069703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 24338691 - 24338435
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggg-tttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 113  Q
    |||| ||| ||||||| |||| | |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||    
T  24338691 tttgcataaagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacactattaagattgagtcttttggttatggaaaga 24338592  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctg 211  Q
    ||||  |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  24338591 gattaagactttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctg 24338492  T
Q  212 ctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgtt 270  Q
    |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24338491 ctctc--ccccagactatgtcaatttggaccgaactaggtaaacaaatatttttgtgtt 24338435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 259
Target Start/End: Original strand, 15719717 - 15719960
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||   | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15719717 tttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagag 15719812  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||| | |||    
T  15719813 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagagttgc 15719912  T
Q  213 tctct-accccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15719913 tctttccccccatactaggtcaatttggaccgaacttggtaaacaaat 15719960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 272
Target Start/End: Original strand, 14466399 - 14466653
Alignment:
Q  21 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt-gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 119  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14466399 tagagtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgg 14466498  T
Q  120 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct 217  Q
    || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| || | ||||||| |||| |||||| ||||||| | |||| | ||||| | |    
T  14466499 gagtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaccggatgactgctgttt 14466598  T
Q  218 accccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||    
T  14466599 cccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcagcaaattctcttgtgttct 14466653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 19227651 - 19227514
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227651 tttgtatagagtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 19227552  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 152  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227551 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12161798 - 12161543
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12161798 tttgtatagagtttgtctct--ggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaaacactattaagatcgagtctattggttacgggaagag 12161701  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||| |||||| |||| ||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||  |  ||| ||||| |    
T  12161700 attgagactttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtaaaatggatggctgtt 12161601  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||| | ||||||| |||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||    
T  12161600 ctct-ccctaaactaggttaatttggaccgaactgaatcaacaaattattttgtgttct 12161543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 60 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186056
Alignment:
Q  60 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaa 12186172  T
Q  159 cccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaca 256  Q
    | | ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  12186171 ctcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctgcctcggactaggtcaatttgaaccgaactgggtaaaca 12186072  T
Q  257 aatacttttgtgttct 272  Q
    |||  |||||||||||    
T  12186071 aattattttgtgttct 12186056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16455666 - 16455434
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||| |||||    
T  16455666 tttgtacagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt-gtgg-ttgattcaccttgggaaacactgttaggattaagtctcttgctcacggaaagag 16455570  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || | |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16455569 attgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgc 16455470  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaact 247  Q
    ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  16455469 tctctcccccatactaggtcagtattggaccgaact 16455434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3028094 - 3027876
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  3028094 tttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgtgaagag 3027998  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  3027997 attgagactttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgc 3027898  T
Q  213 tctct-accccagactaggtca 233  Q
    ||| |  |||||||||||||||    
T  3027897 tctttccccccagactaggtca 3027876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 39 - 259
Target Start/End: Original strand, 15367129 - 15367348
Alignment:
Q  39 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||||| |||||      
T  15367129 aacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcgggaagagattgaaactttgggtaaaattaat 15367225  T
Q  139 cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-accccagactaggtcaatt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || || || |||||| |||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15367226 cgggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctctccccagactaggtcaatt 15367325  T
Q  237 tggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||||||||||| ||| |||||||    
T  15367326 tggaccgaactgggtaaacaaat 15367348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Original strand, 22490711 - 22490889
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22490711 tttgtatatagtttgcctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacaccttgcgaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagag 22490810  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcat 192  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||  |||||||||||    
T  22490811 attgggactttgggtagaattatgcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcat 22490889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 59 - 259
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945462
Alignment:
Q  59 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 157  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgta 26945357  T
Q  158 acccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaa 254  Q
    || | ||||| || | ||||||| ||||||||||| |||||| || || ||||| ||||||  ||||||| || ||||  ||||||||||||| ||| ||    
T  26945358 actcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacgaagggcagctctcccccccagattatgtcaggtttggaccgaactgggtaaa 26945457  T
Q  255 caaat 259  Q
    |||||    
T  26945458 caaat 26945462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22858152 - 22857962
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||| |||||   | ||||| |||||||||||    
T  22858152 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagatttaggtttgaagactaattcttgtaac 22858053  T
Q  160 cc-gttgatttcgctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaact 247  Q
    ||  ||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22858052 ccttttgatatatctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaact 22857962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 259
Target Start/End: Original strand, 17012114 - 17012357
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17012114 tttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--ggttgattcaccttctgaaacaatattaggattgagtctcttggtcacgagaagag 17012210  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatc-atatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || | ||||||| ||||||||||  ||||| ||| |  || | |      
T  17012211 attgatgcttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatag-ggaacatagagatca 17012309  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  17012310 tctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactaggtaaacaaat 17012357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 259
Target Start/End: Original strand, 19696556 - 19696758
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||| |||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||     
T  19696556 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctctttgtcactgaaagagattgagactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaat 19696655  T
Q  160 ccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaaca 256  Q
    || ||||| || | ||||||| |||| |||||| ||||||||| | ||  ||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||    
T  19696656 cctttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatagctgctctctctcccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 19696755  T
Q  257 aat 259  Q
    |||    
T  19696756 aat 19696758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 259
Target Start/End: Original strand, 15346522 - 15346663
Alignment:
Q  119 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 217  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || |||||| |||| ||||||||||||| | ||||  ||||||||||    
T  15346522 ggactttgagtaaaattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaagctgctctct 15346621  T
Q  218 accccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15346622 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaat 15346663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 217
Target Start/End: Original strand, 20526922 - 20527080
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  |||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  20526922 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaagaagagattaagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 20527021  T
Q  160 ccgttgatttcgctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct 217  Q
    |  ||||| || |||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20527022 cttttgatatctctttgtaaagttattcatcattatagtggaacggagagctgctctct 20527080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037723
Alignment:
Q  62 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga-cttattcttgtaacc 160  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| || |||||| |||||||||||||||||||    | | |||||||||||||||    
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaacc 28037828  T
Q  161 cgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcat-atagtgga---tcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaa 254  Q
    | ||||| || | ||||||| |||||||||||| ||||||||    || | ||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| || ||| ||    
T  28037827 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggacggacgaaaggctgctctctcccccagtctaggtcagttttggaccgagctgggtaaa 28037728  T
Q  255 caaat 259  Q
    |||||    
T  28037727 caaat 28037723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Original strand, 10584227 - 10584325
Alignment:
Q  175 tgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||    
T  10584227 tgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttct 10584325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12911629 - 12911471
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||  || |||||| |||||| |||||| |||||   || | || ||||||||||||  || || || |||    
T  12911629 aaacactattaagattgagtctcttagtcacgataatagattgagacttttggtagagttaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctctt 12911530  T
Q  175 tgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtc 232  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12911529 tgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtc 12911471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12937376 - 12937219
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||   || | || ||||||||||||  || || || |||    
T  12937376 aaacactattaagattgagtctcttagtcacgagaatagattgaaacttttggtagaattaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctctt 12937277  T
Q  175 tgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtc 232  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12937276 tgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtc 12937219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 136
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138499
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaatta 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaatta 11138499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25078755 - 25078555
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 159  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||  |||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  25078755 ttgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgaga-tttaagtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 25078657  T
Q  160 ccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaaca 256  Q
    || ||||| || | ||||||| ||||||| ||| || |||||| |||||| ||||| |||  ||||| |||||||| | |||||||||||| ||| ||||    
T  25078656 cctttgatatctcttttgtaaagttactcgtcattacagtggaacggaggactgctttct-tcccagtctaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 25078558  T
Q  257 aat 259  Q
    |||    
T  25078557 aat 25078555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25465710 - 25465588
Alignment:
Q  139 cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-t 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||  |||| |||| |||| | |    
T  25465710 cgggagacttattcttgtacccctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcagtat 25465611  T
Q  237 tggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||||||||||| ||| |||||||    
T  25465610 tggaccgaactgggtaaacaaat 25465588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 7542581 - 7542452
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga-ttgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 158  Q
    ||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||   | ||||| ||| ||||||    
T  7542581 ttgattcacttggagaaacactattatgattgagtctcttggtcacgggaagagatttgggaatttggatagaattaggtttgaagactaatttttgtaa 7542482  T
Q  159 cccgttgatttcgctttgtaacgttactca 188  Q
    ||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  7542481 ccctttgatatctctttgtaaagttactca 7542452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 273
Target Start/End: Original strand, 13878727 - 13878923
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| | |   | || |||    
T  13878727 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 13878822  T
Q  175 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 271  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||    
T  13878823 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaata-tcttgtgttc 13878921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 273
Target Start/End: Original strand, 16785919 - 16786115
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| | |   | || |||    
T  16785919 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 16786014  T
Q  175 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 271  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||    
T  16786015 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaata-tcttgtgttc 16786113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 1072120 - 1072067
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattca 68  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1072120 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgagttgattca 1072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 13883475 - 13883631
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatt-tcgct 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||    || ||| || ||    
T  13883475 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaa----ttcattatctct 13883569  T
Q  174 ttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    |||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  13883570 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 13883631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 5165989 - 5165936
Alignment:
Q  84 ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5165989 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattagg 5165936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 26887406 - 26887345
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  26887406 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 26887345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 31248896 - 31248835
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  31248896 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 31248835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 35201508 - 35201447
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  35201508 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 35201447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 3577696 - 3577636
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  3577696 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 3577636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Original strand, 17036058 - 17036116
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17036058 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17036116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 17695030 - 17694972
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17695030 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17694972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 31936654 - 31936591
Alignment:
Q  194 tagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    |||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31936654 tagtggattggagagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 31936591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 5757507 - 5757571
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  5757507 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5757571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 10077194 - 10077258
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||    
T  10077194 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 10077258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 120 - 233
Target Start/End: Original strand, 30445699 - 30445815
Alignment:
Q  120 gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 216  Q
    |||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||    
T  30445699 gactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctc 30445798  T
Q  217 taccccagactaggtca 233  Q
    | | ||| |||||||||    
T  30445799 tccaccatactaggtca 30445815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 12166321 - 12166267
Alignment:
Q  83 attaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  12166321 attaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 12166267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 22352031 - 22351973
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || || ||||||||||||||||    
T  22352031 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgaga-tttgggtagaattagg 22351973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 31979580 - 31979517
Alignment:
Q  194 tagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||  |||||||||||| |||||||||    
T  31979580 tagtggattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31979517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 13870661 - 13870608
Alignment:
Q  19 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 72  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13870661 tataaagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcacctt 13870608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19702041 - 19701985
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaatta 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  19702041 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaatta 19701985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 25941650 - 25941704
Alignment:
Q  82 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  25941650 tattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 25941704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 159
Target Start/End: Original strand, 26643179 - 26643259
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||   |||||| |||||||||||||||  || ||||| |||||||||||    
T  26643179 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggac-ttgggtagaattaggttggaagactaattcttgtaac 26643259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 159
Target Start/End: Original strand, 26749145 - 26749225
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||   |||||| |||||||||||||||  || ||||| |||||||||||    
T  26749145 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggac-ttgggtagaattaggttggaagactaattcttgtaac 26749225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 32447559 - 32447502
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag-ggtttgtgggttgattcacct 71  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  32447559 tttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattcacct 32447502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 35201393 - 35201324
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaata 260  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| | || ||||||||| ||| ||||||||    
T  35201393 tatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaata 35201324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 5572270 - 5572334
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||  |||||||||| | |||||||||    
T  5572270 atagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 5572334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 13467642 - 13467585
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||  ||||||||||||    
T  13467642 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgtgactt--ggtagaattagg 13467585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 89
Target Start/End: Original strand, 15346477 - 15346524
Alignment:
Q  39 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga 89  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15346477 aacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttagga 15346524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21356104 - 21356040
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  21356104 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21356040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22709086 - 22709022
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||| |||  ||| ||||||||||||||||||    
T  22709086 atagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattgaaccgaactaggtcaacaa 22709022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 259
Target Start/End: Original strand, 11262596 - 11262776
Alignment:
Q  84 ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa---cccgttgatttcgctttgtaa 179  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||||||   | ||||| |||||| |||   ||  ||||| || ||||||||    
T  11262596 ttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgaga-tttaggtagaattaggtttgaagactaattcttataacctccttttgatatctctttgtaa 11262694  T
Q  180 cgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
     |  |||||||| |||| || | |||||  ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||  ||| |||||||    
T  11262695 agaaactcatcattatattgtaacggagaactgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaacggggtaaacaaat 11262776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 22342980 - 22342922
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||    
T  22342980 cactattaggattgcgtctcttggtcacgggaagaggctggga-tttgggtagtattagg 22342922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Original strand, 33215830 - 33215888
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| |||| ||||||||||    
T  33215830 cactattaggattgagtctcttggtcacggcaagaggctgggac-ttggatagaattagg 33215888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 52
Target Start/End: Original strand, 17852613 - 17852650
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggg 52  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17852613 tttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactaggg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 247
Target Start/End: Original strand, 24436001 - 24436054
Alignment:
Q  194 tagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaact 247  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||  ||||| ||||||    
T  24436001 tagtggatcggagggctgctctctcccctagagtaggtcatattggatcgaact 24436054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 233
Target Start/End: Original strand, 25941785 - 25941826
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  25941785 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 25941826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13467532 - 13467465
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  13467532 tatagtggaacggagagctgctctct-ccccagactaggtcatgattagaccgaactaggtaaacaaat 13467465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22963767 - 22963704
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  22963767 atagtggattggagggctgctctct-ccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaa 22963704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 23824626 - 23824689
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  23824626 atagtggattggagggctgctctct-ccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaa 23824689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 26954330 - 26954286
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26954330 tctctcccccaaagtaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 26954286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 33211229 - 33211185
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33211229 tctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 33211185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 115)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 27104811 - 27105088
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104811 tttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 27104909  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104910 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacattactcatcatatagtggatcggagggctgctc 27105009  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27105010 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 27105088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13910287 - 13910009
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910287 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagag 13910188  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13910187 actggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcagatggctgctc 13910088  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  13910087 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 13910009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 19502254 - 19501980
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19502254 tttgtgtagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 19502155  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19502154 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcgaagggctgct 19502055  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttc 288  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19502054 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttc 19501980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23452480 - 23452201
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452480 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 23452381  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23452380 gctgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgct 23452281  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23452280 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 23452201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 19504588 - 19504316
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19504588 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg-aagag 19504490  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504489 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgct 19504390  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgtt 287  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19504389 atctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgtt 19504316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 275
Target Start/End: Original strand, 42064527 - 42064788
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064527 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 42064626  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064627 gctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctc 42064726  T
Q  215 tctaccccagactaggtc-aatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct 275  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  42064727 tctcccccagactaggtcaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 42064788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 45280227 - 45279965
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45280227 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 45280128  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45280127 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 45280028  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 276  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45280027 ctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 45279965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 35218202 - 35217945
Alignment:
Q  19 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagatt 117  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35218202 tatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt 35218103  T
Q  118 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 217  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35218102 gggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccgttgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 35218003  T
Q  218 accccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct 275  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  35218002 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttct 35217945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 276
Target Start/End: Original strand, 42452795 - 42453054
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||| |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452795 tttgtataaagtttgtctct--gtaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 42452892  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452893 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 42452992  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 276  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42452993 ctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 42453054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 19007652 - 19007910
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19007652 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtttcttggttatgggaagag 19007751  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  19007752 attggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgct 19007851  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19007852 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 19007910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 35215829 - 35215568
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35215829 tttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 35215730  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35215729 gtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 35215630  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct 275  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  35215629 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttct 35215568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24162455 - 24162193
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |            
T  24162455 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttgc-------- 24162364  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24162363 --tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaatgctactcatcatatagtggattggatggctgctc 24162266  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgtt 287  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24162265 tctcccccggactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgtt 24162193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 42923752 - 42923494
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42923752 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagag 42923653  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  42923652 attggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcatatagtgaaacggagggctgct 42923553  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  42923552 ctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 42923494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21520935 - 21520678
Alignment:
Q  16 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  21520935 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagg 21520836  T
Q  116 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  21520835 ctaggactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctc 21520736  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  21520735 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactttgtcaacaaattcttttgtgttct 21520678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 45 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 43623793 - 43623565
Alignment:
Q  45 cactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggag 144  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43623793 cactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggag 43623694  T
Q  145 acttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccg 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43623693 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccg 43623594  T
Q  244 aactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43623593 aactaggtcaacaaattcttttgtgttct 43623565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22287579 - 22287321
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22287579 tttgtatagagtctgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggattgagtctcttagttacgggaagag 22287480  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  22287479 attgacacttcgggtagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggagggctgct 22287380  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22287379 ctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22287321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6264392 - 6264133
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||    
T  6264392 tttgtatagagtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgataaaag 6264293  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  6264292 attggggctttggatagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgc 6264193  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  6264192 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6264133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6259058 - 6258802
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  6259058 tttgtatagagtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga--ag 6258961  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||| | ||||||| | |||||||||||    
T  6258960 attggggctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtgaaacggagggctgc 6258861  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  6258860 tctct-ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6258802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11739803 - 11739544
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  11739803 tttgtatggagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttataggaagag 11739704  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| || | |||| || ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||    
T  11739703 attgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctcttttgaaaggttactcatcattatagtggaacggatgactgc 11739604  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11739603 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11739544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 75 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 36559047 - 36558845
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct 173  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  36559047 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 36558948  T
Q  174 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  36558947 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 36558848  T
Q  274 ctc 276  Q
    |||    
T  36558847 ctc 36558845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 40032301 - 40032038
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40032301 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagag 40032202  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttga----tttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggaggg 208  Q
     || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    |||| | |||| || ||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  40032201 gttaggactttgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgcaaagttactcatcattatagtgaaacggaggg 40032102  T
Q  209 ctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  40032101 ccgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtattct 40032038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 75 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 36561324 - 36561123
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct 173  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  36561324 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 36561225  T
Q  174 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  36561224 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 36561125  T
Q  274 ct 275  Q
    ||    
T  36561124 ct 36561123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 53 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375331
Alignment:
Q  53 tttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 152  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5375550 tttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg-agacttattc 5375452  T
Q  153 ttgtaacccgttgatttcgcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggt 251  Q
    ||||||||| ||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5375451 ttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 5375352  T
Q  252 caacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  5375351 caacaaattcttttgtgttct 5375331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 28196649 - 28196905
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28196649 tttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagag 28196748  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| || | |||||||| ||||||||||||||||| | || | |||||||    
T  28196749 attgaggctttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacgaatggctgct 28196848  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28196849 ctctcccccagactaggtcaatt--gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28196905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 17848455 - 17848710
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17848455 tttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 17848554  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||    
T  17848555 gattgaggctttgggtaga---aggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgc 17848650  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17848651 tctctcccccatactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 17848710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 34979822 - 34979562
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34979822 tttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagag 34979723  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || | ||||||| ||| ||||||| ||||||||| || |||||| |    
T  34979722 attcggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctcttttgtaaggttcctcatcattatagtggaacgaagggctac 34979623  T
Q  213 tct-ctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||| |  ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  34979622 tctccccccccaaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 34979562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 44289311 - 44289052
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44289311 tttgtatagagtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagag 44289212  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||||||||| ||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||| || | |||||||  |||||||||| ||||||| | | || || |||    
T  44289211 attgggacttagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaagattactcatcattatagtgaaacagatggttgc 44289112  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  44289111 tctttcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 44289052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 17849132 - 17849387
Alignment:
Q  18 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 117  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17849132 gtatagagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggtaagagatt 17849231  T
Q  118 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctct 215  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||    
T  17849232 gagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacgg-gggctgctct 17849330  T
Q  216 ctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    || || || |||||||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17849331 ctcccacatactaggtcaatttggacaagactgggtcaacaaattcttttgtgttct 17849387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 75 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 45332364 - 45332144
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct 173  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  45332364 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctct 45332265  T
Q  174 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    |||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  45332264 ttgtaaaggtactcatcatatagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttctt 45332165  T
Q  274 c-tcatctttgtgttcatctc 293  Q
    | || ||||||||||| ||||    
T  45332164 cttcttctttgtgttcttctc 45332144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 3022175 - 3022442
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3022175 tttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagag 3022274  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatca----------tatagtggatcgg 204  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||| ||| |||||||||||          |||| || | | |    
T  3022275 attgaggttttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctttataaagttactcatcattatcatcgttataatgaaacag 3022374  T
Q  205 agggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  3022375 atggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3022442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 14837285 - 14837538
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||    
T  14837285 tttgtacatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg------gaagag 14837378  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| || |||| |||| |||||||||||| |||||| | |||| || |||    
T  14837379 attgagactttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggatggatgc 14837478  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  14837479 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttct 14837538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 39 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45239196 - 45239000
Alignment:
Q  39 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |    
T  45239196 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggtttttggtagaattaag 45239097  T
Q  139 cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaa 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45239096 cgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaa 45239000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15539718 - 15539566
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15539718 tttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttacgggaagag 15539619  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgat 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15539618 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 15539566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28459433 - 28459175
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28459433 tttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 28459334  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
     ||||| |||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || | ||| ||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |    
T  28459333 tttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttttaaagttactcatcattatagtgaaacggagggcttc 28459234  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  28459233 tctcta-cctagactaggtcaatttggatcgaactagataaacaaattcttttgtgttct 28459175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18800561 - 18800298
Alignment:
Q  6 agctagggctttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 105  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18800561 agctaggg-tttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtca 18800467  T
Q  106 cgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcg 203  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||| ||| ||||||| | ||    
T  18800466 caggaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcattatagtgaaacg 18800367  T
Q  204 gagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||  |||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  18800366 gagggctactctct-ccccagaccaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttct 18800298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11578348 - 11578105
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||| ||| |||||| | |||||||  ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11578348 tttgtatagaatttttctcttggcaacaaac--tagggttgg--ggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 11578253  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || | ||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  11578252 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtcgaacggagggctgc 11578153  T
Q  213 tctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||| | ||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  11578152 tctttcccccagactagatcagttttagaccgaactaggtaaacaaat 11578105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 31733008 - 31732774
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||              
T  31733008 tttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtt---------- 31732919  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||    
T  31732918 --tgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattgtgaaacggaggactgc 31732821  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  31732820 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtaaacaaat 31732774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 116 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22407596 - 22407439
Alignment:
Q  116 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22407596 ttgggacttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 22407497  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22407496 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 22407439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 22874146 - 22874401
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22874146 tttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gggttgattcaccttggaaaacagtattaggattgagtctcttagtcacgggaagag 22874241  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| | |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||| |||||    
T  22874242 attgaggctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaactgagagctgc 22874341  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| || |||||||||    
T  22874342 tctctccctcatactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattctcttgtgttct 22874401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20146849 - 20146617
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20146849 tttgtatagagtttgcc-cttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacaatagtaggattgagtctcttggtcacgggaaaag 20146753  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  20146752 attgagattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgc 20146653  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaact 247  Q
    ||||| || ||||||| |||| | ||||||||||||    
T  20146652 tctctccctcagactaagtcagtattggaccgaact 20146617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 17897485 - 17897243
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||    
T  17897485 tttgtatagagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaaaag 17897390  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttc-gctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||| ||||||||||| |||||| || |||| ||||||    
T  17897389 attgagattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatggctgc 17897290  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||| ||| |||||||    
T  17897289 tctct-ccccagactaggtcagtattggtccgaactgggtaaacaaat 17897243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 259
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699633
Alignment:
Q  59 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 40699528  T
Q  158 acccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaa 254  Q
    | || ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  40699529 atcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtcagtattagaccgaactaggtaaa 40699628  T
Q  255 caaat 259  Q
    |||||    
T  40699629 caaat 40699633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 129 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462950
Alignment:
Q  129 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagact 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccattatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 7462978  T
Q  228 aggtcaa-tttggaccgaactaggtcaa 254  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  7462977 aggtcaattttggaccgaactgggtcaa 7462950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 61 - 272
Target Start/End: Original strand, 35107351 - 35107566
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattag--gcgggagacttattcttgtaa 158  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||     | ||||||||||||||||    
T  35107351 ttgattcaccttgagaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaa 35107450  T
Q  159 cccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaac 255  Q
     || ||| | || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| || || |||||  |||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||    
T  35107451 -cctttgttatctcttttgtaatgttactcatcattatagtggaacggatggttgttctctttcccagactaggtcagtattggaccgaaataggtaaac 35107549  T
Q  256 aaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| |||||||||||    
T  35107550 aaatatttttgtgttct 35107566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22707872 - 22707736
Alignment:
Q  139 cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccc--cagactaggtcaat 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||    
T  22707872 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtcaat 22707773  T
Q  236 ttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22707772 ttggactgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 22707736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 173 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22163106 - 22163007
Alignment:
Q  173 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22163106 tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22163007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 160
Target Start/End: Original strand, 38020214 - 38020349
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||               
T  38020214 tttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccatggtaaacactattaggattgagtctcttggt----------- 38020302  T
Q  115 att-gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 160  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38020303 attgggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 38020349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 46 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414194
Alignment:
Q  46 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga 145  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcac-ggaaaagattgggacttttggtagaattaggcgggaga 38414194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 192
Target Start/End: Original strand, 43139395 - 43139564
Alignment:
Q  21 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 120  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  43139395 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcatcttgggaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgag 43139491  T
Q  121 actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcat 192  Q
    ||||| |||||||||||| |   ||||| ||| ||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  43139492 actttaggtagaattaggtctaaagactaattattgtaaccttttgatttctctttgtaaagttactcatcat 43139564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27136343 - 27136195
Alignment:
Q  39 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  27136343 aacaaacactagggttgg--ggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaagaaattgggactttgagtagaattagg 27136246  T
Q  139 -cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactc 187  Q
       ||||||||||||||||||| | ||||| || | ||||||| |||||||    
T  27136245 tttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactc 27136195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 22163190 - 22163106
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22163190 tttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagg-ttgagtctctt 22163106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 37963137 - 37962939
Alignment:
Q  60 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  37963137 gttgattccccttagaaaacattattgagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaat 37963038  T
Q  160 ccgttgatttcgctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 258  Q
    || |||||||   ||||||| |||| |||||| ||||||| | | | || ||| |||||  |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  37963037 ccattgattt--ttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacagtggactgatctctctcccacactaggttaatttggaccgaactgggtaaacaaa 37962940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 233
Target Start/End: Original strand, 17921754 - 17921927
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 157  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||     | ||| ||||||| |    
T  17921754 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggttttaaaactgattcttgca 17921853  T
Q  158 acccgttgatttcgcttt-gtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    |||| ||||||   ||||  ||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17921854 accctttgatt---ctttcataaagttagtcatcattatagtggaacggagggctgctctcta-cccagactaggtca 17921927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 138 - 272
Target Start/End: Original strand, 23870951 - 23871086
Alignment:
Q  138 gcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatt 236  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || || || |||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  23870951 gcggcagacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctcccttagattaggtcaatt 23871050  T
Q  237 tggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23871051 tggatcaaactaggtcaacaaattcttttgagttct 23871086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 76 - 192
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589881
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-t 173  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| ||||| || | |    
T  20589763 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctctt 20589862  T
Q  174 ttgtaacgttactcatcat 192  Q
    |||| | ||||||||||||    
T  20589863 ttgtgaagttactcatcat 20589881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 259
Target Start/End: Original strand, 17943540 - 17943719
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||||   |  || || ||||||    
T  17943540 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac---tcaatatctctttgt 17943635  T
Q  178 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    || |  |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  17943636 aaagaaactcatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaat 17943719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 22407652 - 22407591
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggga 76  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22407652 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 22407591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 273
Target Start/End: Original strand, 2740941 - 2741137
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||     ||||| ||||||| ||| | |   | || |||    
T  2740941 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattaggtttaaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 2741036  T
Q  175 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 271  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  2741037 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaata-tcttgtgttc 2741135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 28459011 - 28458949
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28459011 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattagg 28458949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 136
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345738
Alignment:
Q  60 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaatta 136  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaatta 26345738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 192
Target Start/End: Original strand, 15693958 - 15694094
Alignment:
Q  60 gttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga-ttgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 156  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||    
T  15693958 gttgattcaccgtggagaaacactattaggataaagtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 15694057  T
Q  157 aacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcat 192  Q
    ||||  ||||| || | ||||||| ||||||||||||    
T  15694058 aaccttttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15694094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 27583535 - 27583479
Alignment:
Q  62 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27583535 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattg 27583479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 273
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736401
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| | |   | || |||    
T  2736205 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 2736300  T
Q  175 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 271  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||    
T  2736301 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaata-tcttgtgttc 2736399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 273
Target Start/End: Original strand, 17462436 - 17462632
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| | |   | || |||    
T  17462436 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcct---tatctctt 17462531  T
Q  175 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 271  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||    
T  17462532 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaata-tcttgtgttc 17462630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 75 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 10942696 - 10942497
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccgttgatttcgc 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |   || || | ||||||||||||| ||    || |    
T  10942696 gaaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaattatgtttgaggattgattcttgtaacccttttgaatc-c 10942598  T
Q  173 tttgtaacgttactcatca--tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgt 269  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||||||| || || |||| | ||| ||| ||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  10942597 tttgtaaaattactcatcaattatagtggaacgaagagctggtgtctcccctagagtaggtcagtattggaccgaactaggtaaacaaattctcttgtgt 10942498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 75 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 10948565 - 10948366
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccgttgatttcgc 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |   || || | ||||||||||||| ||    || |    
T  10948565 gaaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaattatgtttgaggattgattcttgtaacccttttgaatc-c 10948467  T
Q  173 tttgtaacgttactcatca--tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgt 269  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||||||| || || |||| | ||| ||| ||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  10948466 tttgtaaaattactcatcaattatagtggaacgaagagctggtgtctcccctagagtaggtcagtattggaccgaactaggtaaacaaattctcttgtgt 10948367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 34575308 - 34575230
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34575308 ttgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtctcgggaa-agattcgggactttgggtagaattagg 34575230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 273
Target Start/End: Original strand, 39686983 - 39687179
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| | |   | || |||    
T  39686983 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 39687078  T
Q  175 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 271  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||    
T  39687079 tgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaata-tcttgtgttc 39687177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 20054947 - 20054886
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  20054947 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 20054886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 22712698 - 22712637
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  22712698 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22712637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 22717407 - 22717346
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  22717407 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22717346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Original strand, 45567409 - 45567470
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  45567409 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 45567470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 136
Target Start/End: Original strand, 7502975 - 7503052
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga-ttgggactttgggtagaatta 136  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7502975 ttgatccaccttggagaaacactattaggattgagtatcttggtcaagggaagagatttgagactttgggtagaatta 7503052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27517818 - 27517664
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||||   |  || || ||||||    
T  27517818 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac---tcaatatctctttgt 27517723  T
Q  178 aacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  27517722 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 27517664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 14699036 - 14699100
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  14699036 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 14699100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 30720811 - 30720703
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 157  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  30720811 ttgattcatcttggagaaacactattaggattgagtctctttggcacgagaagagattcgtgactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 30720712  T
Q  158 acccgttga 166  Q
    |||| ||||    
T  30720711 accctttga 30720703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Original strand, 35028595 - 35028707
Alignment:
Q  21 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 120  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    | ||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||      
T  35028595 tagagtttg-ctcttggtaacaaacactagggttga--gattgattcgcattggaaaacactattatgattgagtctcttgatcacgagaagagattgac 35028691  T
Q  121 actttgggtagaatta 136  Q
    ||||||||||||||||    
T  35028692 actttgggtagaatta 35028707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 12781400 - 12781342
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  12781400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 12781342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Original strand, 17932637 - 17932695
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17932637 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17932695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Original strand, 30478997 - 30479055
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  30478997 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 30479055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 223
Target Start/End: Original strand, 33603994 - 33604143
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||||| || |||||||||   | ||||| |||||| |||||  ||||| |  |||    
T  33603994 aaacactattataattgagtcttttggtcatgggaagtgattgagactttaggaagaattaggtttgaagactaattcttctaaccttttgatatatctt 33604093  T
Q  175 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctacccca 223  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| |||||    
T  33604094 tgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccca 33604143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 8390179 - 8390243
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  8390179 atagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaacaa 8390243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13569396 - 13569332
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  13569396 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13569332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20522288 - 20522224
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  20522288 atagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20522224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 39482999 - 39482935
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  39482999 atagtggattggaggcctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 39482935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 37170931 - 37170873
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  37170931 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 37170873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 41303210 - 41303155
Alignment:
Q  82 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaatta 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41303210 tattaggattaagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaatta 41303155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 257
Target Start/End: Original strand, 1345572 - 1345634
Alignment:
Q  195 agtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  1345572 agtggatcggagaggtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1345634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 27248075 - 27248021
Alignment:
Q  85 taggattgagtctcttggttacgggaagagat-tgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  27248075 taggattgagtctcttggtcacgggaagagatccaggactttgggtagaattagg 27248021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Original strand, 39680045 - 39680106
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  39680045 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 39680106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 273
Target Start/End: Original strand, 45679838 - 45679919
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||    
T  45679838 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaata-tcttgtgttctt 45679919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 5377672 - 5377631
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttg 56  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5377672 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttg 5377631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33671033 - 33670992
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  33671033 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 33670992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 257
Target Start/End: Original strand, 34682362 - 34682427
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||| || ||||  |||||||||||| |||||||||    
T  34682362 tatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 34682427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 10445473 - 10445537
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  10445473 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 10445537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12781287 - 12781219
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  12781287 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaat 12781219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17057413 - 17057369
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17057413 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17057369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17085396 - 17085352
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17085396 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17085352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 28259206 - 28259270
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  28259206 atagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 28259270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 124
Target Start/End: Original strand, 38190997 - 38191045
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 124  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  38190997 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 38191045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15539553 - 15539514
Alignment:
Q  233 aatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15539553 aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 15539514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 31056111 - 31056048
Alignment:
Q  194 tagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  31056111 tagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattgaaccgaactaggtcaacaa 31056048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 20050204 - 20050166
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  20050204 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagag 20050166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 33118204 - 33118150
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaact 247  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||  ||||||||||||    
T  33118204 atagtggattggagggctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaact 33118150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 233
Target Start/End: Original strand, 30479110 - 30479151
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  30479110 tatagtagatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 30479151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 33674584 - 33674551
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaag 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33674584 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 33674551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 233
Target Start/End: Original strand, 39680160 - 39680201
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  39680160 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 39680201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 136
Target Start/End: Original strand, 45158308 - 45158369
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaatta 136  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  45158308 aaacactgttaggatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaatta 45158369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 723788 - 723744
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  723788 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 723744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Original strand, 11067429 - 11067473
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11067429 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactcggtcaacaa 11067473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 33162494 - 33162450
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33162494 tctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 33162450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 33528650 - 33528714
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||  |||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  33528650 atagtggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 33528714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 34139814 - 34139770
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  34139814 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 34139770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Original strand, 39284960 - 39285004
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  39284960 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 39285004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 42039698 - 42039762
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| || |||| |||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  42039698 atagtggattagagagctgctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactagatcaacaa 42039762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 115)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 15 - 276
Target Start/End: Original strand, 2174955 - 2175216
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2174955 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagag 2175054  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2175055 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctc 2175154  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 276  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2175155 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 2175216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 15 - 276
Target Start/End: Original strand, 38882142 - 38882403
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882142 tttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 38882241  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882242 gctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 38882341  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 276  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38882342 tctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 38882403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 34477297 - 34477017
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34477297 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacgggaaga 34477198  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477197 gattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 34477098  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  34477097 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 34477017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 34479662 - 34479382
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34479662 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacaggaaga 34479563  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34479562 gattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 34479463  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  34479462 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 34479382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 15 - 295
Target Start/End: Original strand, 4236665 - 4236945
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4236665 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 4236764  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4236765 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 4236864  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctcac 295  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  4236865 ctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaact-ggtcaataaattcttttgtgttcttctcttatttgtgttcttctcac 4236945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10529338 - 10529062
Alignment:
Q  19 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10529338 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 10529239  T
Q  119 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 217  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10529238 gggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggaaggctgctctct 10529139  T
Q  218 accccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatac-ttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10529138 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 10529062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 25804061 - 25804339
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25804061 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagag 25804160  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25804161 attggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 25804260  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  25804261 ctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttcttgtcttctttgtgttcttctc 25804339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 25921716 - 25921437
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921716 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 25921617  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25921616 gctgggactctgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgct 25921517  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25921516 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 25921437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18511455 - 18511197
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511455 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 18511356  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18511355 attgggactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 18511256  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18511255 ctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 18511197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 6745105 - 6745362
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745105 tttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 6745203  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745204 gttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 6745303  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  6745304 ctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6745362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 21684694 - 21684416
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21684694 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 21684595  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
     ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21684594 gttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctc 21684495  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  21684494 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcgtttgtgttcttctcttttttgtgttcttctc 21684416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 275
Target Start/End: Original strand, 31545116 - 31545377
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31545116 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattagagtctcttggttacgggaaga 31545215  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31545216 aattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacagtactcatcatatagtggattggagggctgct 31545315  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct 275  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||    
T  31545316 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 31545377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 31179614 - 31179337
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31179614 tttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 31179515  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31179514 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 31179415  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31179414 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat--ttctgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 31179337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 39854519 - 39854777
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39854519 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcatggttacgggaagag 39854618  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854619 actggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgct 39854718  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39854719 ctctcccccagactagatcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 39854777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 15552281 - 15552561
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15552281 tttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgattacgggaaga 15552380  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15552381 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 15552480  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  15552481 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 15552561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 18466720 - 18466999
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18466720 tttggatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagag 18466819  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  18466820 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgct 18466919  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  18466920 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttcttctcttctttgtgttcttctc 18466999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Original strand, 31542771 - 31543029
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31542771 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 31542870  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31542871 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttctctttgtaacagtactcatcatatagtggattggagggctgct 31542969  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||    
T  31542970 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 31543029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 16776194 - 16776451
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16776194 tttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 16776293  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16776294 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatttctcttttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgct 16776392  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
     ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16776393 atctcccccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 16776451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 21948062 - 21948320
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21948062 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagag 21948161  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  21948162 gctgggactttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 21948261  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21948262 ctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 21948320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 27912572 - 27912851
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27912572 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 27912671  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| | |||  |||||    
T  27912672 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacagagaactgct 27912771  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27912772 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 27912851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18509561 - 18509303
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18509561 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 18509462  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttc-gctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  18509461 aatgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatctattttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggtgggctgct 18509362  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18509361 ctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 18509303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 276
Target Start/End: Original strand, 27910486 - 27910748
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27910486 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagag 27910585  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  27910586 gctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgct 27910685  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 276  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27910686 ctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 27910748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 6747342 - 6747598
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6747342 tttgtataaaatttgtctctttgaaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 6747440  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6747441 actgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctttttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctc 6747540  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  6747541 tctctctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6747598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 276
Target Start/End: Original strand, 10586873 - 10587130
Alignment:
Q  21 tagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 119  Q
    ||||||||||||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||     
T  10586873 tagagtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattcagtctcttgcttacggaaagagattga 10586972  T
Q  120 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-a 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  10586973 gactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 10587072  T
Q  219 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10587073 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 10587130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 46 - 285
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410329
Alignment:
Q  46 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 4410189  T
Q  146 cttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaa 245  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  4410190 cttattcttgtaacctattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 4410289  T
Q  246 ctaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtg 285  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  4410290 ctgggtcaacaaattcttttgtgttcttctctactttgtg 4410329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Original strand, 25904140 - 25904397
Alignment:
Q  16 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25904140 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 25904239  T
Q  116 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
    || || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || || ||||||||||||| ||||||||||| | |||| | ||||||    
T  25904240 ttagggctttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctattgtaacgttacttatcatatagtgaaacggatgactgctc 25904339  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25904340 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattattttgtgttct 25904397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 658596 - 658341
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  658596 tttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagag 658497  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  658496 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgct 658397  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  658396 ct---ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 658341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 18469047 - 18469324
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18469047 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 18469146  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  18469147 gctgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatctagtggaacgaagagctgct 18469246  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18469247 ctct--cccagactaggtcaatttggaccgaactggattaacaaattcttttgcgttcttctcttctttgtgttcttctc 18469324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 268
Target Start/End: Original strand, 40221558 - 40221813
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40221558 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagag 40221657  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  40221658 attgggacttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgc 40221757  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtg 268  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  40221758 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtg 40221813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10474566 - 10474308
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  10474566 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacactattaagattgaatctcttggttacaggaagag 10474467  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||| ||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  10474466 attgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttctaaggttactcatcatatagtgaaacggatggctgct 10474367  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10474366 ctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 10474308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1189852 - 1189592
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  1189852 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacaggaagag 1189753  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| |||    
T  1189752 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtggaacggagggatgc 1189653  T
Q  213 tctctac-cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1189652 tctctcctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1189592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 2818579 - 2818320
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt-gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  2818579 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaaaa 2818480  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||  || |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  2818479 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggaggactgc 2818380  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  2818379 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 2818320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 24126892 - 24127150
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24126892 tttgtatagagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagag 24126991  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  24126992 attgggactttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 24127091  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24127092 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 24127150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31472856 - 31472597
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31472856 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 31472757  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  | | ||||| |||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| |||    
T  31472756 attgggacttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgc 31472657  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31472656 tctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 31472597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 18596681 - 18596939
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18596681 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagag 18596780  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  18596781 attgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgc 18596880  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 271  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  18596881 tctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacagattcttttgtgttc 18596939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 55 - 276
Target Start/End: Original strand, 39798123 - 39798345
Alignment:
Q  55 tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798123 tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 39798222  T
Q  155 gtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtca 253  Q
    ||||||| |||||||| | ||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  39798223 gtaacccattgatttctcttttataatgatactcatcgtatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggatcgaactgggtca 39798322  T
Q  254 acaaatacttttgtgttcttctc 276  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  39798323 acaaattcttttgtgttcttctc 39798345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 272
Target Start/End: Original strand, 695924 - 696172
Alignment:
Q  25 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 124  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  695924 gtttgtatctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 696022  T
Q  125 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctacccc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  696023 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctccccc 696122  T
Q  223 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  696123 agacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 696172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 58 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20506041 - 20505828
Alignment:
Q  58 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20506041 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 20505942  T
Q  158 acccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaca 256  Q
    || | ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20505941 acacattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc--ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 20505844  T
Q  257 aatacttttgtgttct 272  Q
    ||| ||||||||||||    
T  20505843 aattcttttgtgttct 20505828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 272
Target Start/End: Original strand, 2954463 - 2954710
Alignment:
Q  26 tttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 124  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  2954463 tttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactt 2954562  T
Q  125 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccag 224  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||     
T  2954563 tgggtagaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctctttgtaaagttactcatcatatagtgaagcggagggatgctctctcccccaa 2954662  T
Q  225 actaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  2954663 actaggtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2954710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 16092443 - 16092184
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092443 tttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 16092344  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| |||    
T  16092343 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgagatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttgc 16092244  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| | | ||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  16092243 tctctcctctagactaggtcaatttagactgaactggatcaacaaattcttttgtgttct 16092184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 36402571 - 36402313
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  36402571 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggattgaatctcttggttacgggaggag 36402472  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| | | || | |||||    
T  36402471 attggaactttgggtaaaattaggctggagacttattattgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatgtctgct 36402372  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36402371 ctctcccccagactaggtcaatttagatcgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 36402313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 266
Target Start/End: Original strand, 17072919 - 17073172
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17072919 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttaggggaagag 17073018  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||||    
T  17073019 attggggctttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgc 17073118  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttg 266  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17073119 tctctcccccagactcggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 17073172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17818733 - 17818477
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17818733 tttgtatagagttcgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactattaagactgagtctcttggttacgggaagag 17818634  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||  |    
T  17818633 attgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatacagtggaacagagggct--t 17818536  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17818535 ctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 17818477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 26097769 - 26098025
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  26097769 tttggatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcaccttgg-aaacactattaggaatgagtctcttggttacgggaaaat 26097867  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  26097868 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacaga-ggctgct 26097966  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  26097967 ctctcctccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 26098025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 75 - 275
Target Start/End: Original strand, 10749796 - 10749996
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct 173  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  10749796 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 10749895  T
Q  174 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  10749896 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc-tttgtgttctt 10749994  T
Q  274 ct 275  Q
    ||    
T  10749995 ct 10749996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 37706023 - 37705778
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37706023 tttgtatagactttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 37705924  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || | ||||  |    
T  37705923 attagggttttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatggctatt 37705824  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37705823 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 37705778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 6756530 - 6756786
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6756530 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagag 6756629  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttc-gctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||   ||||||| ||||| ||||| ||||||| | | |||||||||    
T  6756630 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa--cattgatatcttttttgtaaggttacacatcattatagtgaaac-gagggctgc 6756726  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||    
T  6756727 tctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatcttttgtgttct 6756786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 39398236 - 39397978
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39398236 tttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaaga 39398138  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||| |||||||  || |||||||  | |||| ||||||    
T  39398137 gattggaactttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtgacgttaccaattatatagtaaaacggatggctgc 39398038  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  39398037 tctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaaacattcttttgtgttct 39397978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 46 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585729
Alignment:
Q  46 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggaga 41585857  T
Q  146 cttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccga 244  Q
    |||||| ||||||  | ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  41585856 cttatttttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccga 41585757  T
Q  245 actaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  41585756 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 41585729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 75 - 275
Target Start/End: Original strand, 23665140 - 23665340
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct 173  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  23665140 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23665238  T
Q  174 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  23665239 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 23665338  T
Q  274 ct 275  Q
    ||    
T  23665339 ct 23665340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 75 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23793447 - 23793247
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct 173  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  23793447 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23793349  T
Q  174 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  23793348 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 23793249  T
Q  274 ct 275  Q
    ||    
T  23793248 ct 23793247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 75 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15354757 - 15354557
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct 173  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  15354757 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15354659  T
Q  174 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  15354658 ttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 15354559  T
Q  274 ct 275  Q
    ||    
T  15354558 ct 15354557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31466221 - 31465974
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31466221 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggattgagtctcttggttacgggaagag 31466122  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttc-gctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||   ||||||| ||||||||||||||          |||||||||    
T  31466121 atttggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcatat----------agggctgct 31466033  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  31466032 ctcacccccagactagttcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtattct 31465974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 75 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 3373320 - 3373119
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct 173  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  3373320 gaaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 3373221  T
Q  174 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||    
T  3373220 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 3373121  T
Q  274 ct 275  Q
    ||    
T  3373120 ct 3373119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 75 - 275
Target Start/End: Original strand, 10757273 - 10757472
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct 173  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  10757273 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttct 10757371  T
Q  174 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  10757372 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattagaccgaactgggtcaacaaattc-tttgtgttctt 10757470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 75 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15357033 - 15356833
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct 173  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  15357033 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15356935  T
Q  174 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  15356934 ttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 15356835  T
Q  274 ct 275  Q
    ||    
T  15356834 ct 15356833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 75 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 38960314 - 38960114
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct 173  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  38960314 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 38960216  T
Q  174 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||    
T  38960215 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 38960116  T
Q  274 ct 275  Q
    ||    
T  38960115 ct 38960114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 272
Target Start/End: Original strand, 2723964 - 2724187
Alignment:
Q  41 caaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg 140  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||    
T  2723964 caaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg---------tagaattaggcg 2724054  T
Q  141 ggagacttattcttgtaacccgttgatttcgcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttgg 239  Q
    || || ||||||||||||||| ||||| || |||| ||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2724055 ggtgatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgg 2724154  T
Q  240 accgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  2724155 accgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2724187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 82 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23742034 - 23741841
Alignment:
Q  82 tattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaac 180  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  23742034 tattaggattggagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctttgtaac 23741936  T
Q  181 gttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  23741935 gttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttct 23741841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 21288800 - 21289055
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtt------tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg 108  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21288800 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcaccttga-aaacactattaggattgagtatcttggttacgg 21288898  T
Q  109 gaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggaggg 208  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||    | || |   |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  21288899 gaagagattaggactttggatagaattaagcgggagattttttcttgtaac----tcatct---tttgtaacgttactcatcttatagtgaaacggaggg 21288991  T
Q  209 ctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  21288992 ctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttct 21289055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12556166 - 12555908
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  12556166 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggctacgggaagag 12556067  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttg--atttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||| |  ||||||| |||||||||| | |||  || ||  |||||||||||||||||| || || | | |||||||||||    
T  12556066 att-ggagttttggtagaattagacaagagactttttcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcttaaagcgaaacggagggctgc 12555968  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    | ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  12555967 tatctcccccatactagttcaatttggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 12555908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 34530909 - 34530722
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34530909 tttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggctacgggaagag 34530810  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtgga 200  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| || | ||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  34530809 attaggactttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtgga 34530722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 141
Target Start/End: Original strand, 20045046 - 20045172
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20045046 tttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttccgggaagag 20045145  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgg 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  20045146 attgggactttgggtagaattaggcgg 20045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6661424 - 6661194
Alignment:
Q  17 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 116  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  6661424 tgtatagagtttgt-tcttggcaacaaacactagagttgg--ggttgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaaat 6661328  T
Q  117 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 214  Q
    || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||    
T  6661327 tgagattttgggtacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttgctcataattatagtggaacggatgactgctc 6661228  T
Q  215 tctaccccagactaggtca-atttggaccgaact 247  Q
    ||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6661227 tctccctcagactaggtcagatttggaccgaact 6661194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 20043086 - 20043208
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20043086 tttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 20043185  T
Q  115 attgggactttgggtagaattag 137  Q
    |||| |||||||| |||||||||    
T  20043186 attgagactttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 60 - 267
Target Start/End: Original strand, 36208656 - 36208865
Alignment:
Q  60 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 158  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  36208656 gttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaa 36208755  T
Q  159 cccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaca 256  Q
    ||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  36208756 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctct-ttccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtaaaca 36208854  T
Q  257 aatacttttgt 267  Q
    ||| |||||||    
T  36208855 aattcttttgt 36208865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 272
Target Start/End: Original strand, 9020299 - 9020514
Alignment:
Q  60 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 159  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9020299 gttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttggtcacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaac 9020398  T
Q  160 ccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtc-aatttggaccgaactaggtcaaca 256  Q
    || ||||| || | |||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||   ||||||||||||| | | |||     
T  9020399 ccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggatcggatggctgctctctcctccaaattaggtctgttttggaccgaactggataaacc 9020498  T
Q  257 aatacttttgtgttct 272  Q
    ||| ||||||||||||    
T  9020499 aattcttttgtgttct 9020514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17413402 - 17413176
Alignment:
Q  21 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 120  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  17413402 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgag 17413306  T
Q  121 actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct 217  Q
    ||||| ||||||||||||   | | ||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  17413305 actttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctct 17413206  T
Q  218 accccagactaggtcaat-ttggaccgaac 246  Q
     ||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  17413205 cccccagagttggtcagtgttggaccgaac 17413176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 272
Target Start/End: Original strand, 20053905 - 20054131
Alignment:
Q  39 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||  |||||||||||    
T  20053905 aacaaacactagggttga--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt-----tggagattgggactttaagtagaattagg 20053997  T
Q  139 cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-att 236  Q
     ||||||||||||||||||||||| | || ||  ||||||| ||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| | ||| |||||||||  ||    
T  20053998 tgggagacttattcttgtaacccgat-atctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggaaggctgctctctcctccatactaggtcagttt 20054095  T
Q  237 tggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||||||||||  || ||||||| ||||||||||||    
T  20054096 tggaccgaactgcgtaaacaaattcttttgtgttct 20054131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 26098494 - 26098379
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  26098494 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgacaaacactattatgattgagtctcttggttacggaaagag 26098395  T
Q  115 attgggactttgggta 130  Q
    ||||||  ||||||||    
T  26098394 attggggttttgggta 26098379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Original strand, 23667415 - 23667599
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct 173  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| |||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||  | ||| || |||| ||||| |||||||| ||    
T  23667415 gaaacactataaggattggactctcttgcttacagaaagagattgggactttggaaagaattaggcgaaaaact-atgcttgcaacccattgatttctct 23667513  T
Q  174 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||| || ||||||||    
T  23667514 ttgtaacgtcactcatcaaataatggatcggagggctgctctcttccccagactaggacagattggaccgaactgggccaacaaat 23667599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 61 - 233
Target Start/End: Original strand, 15143547 - 15143722
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 159  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  15143547 ttgattcacctttggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 15143646  T
Q  160 ccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    || ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| | |||||| ||| ||| |||||||||||    
T  15143647 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtca 15143722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2144763 - 2144602
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||   | ||||| |||||||||    
T  2144763 ttgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtcgcgggaagagattcaggactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttgta 2144664  T
Q  158 acc-cgttgatttcgctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct 217  Q
    |||   || || || |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2144663 accttttttatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctct 2144602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4897985
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct-ttg 176  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||  ||||| || || |||    
T  4897828 cactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattg 4897927  T
Q  177 taacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| | | |||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  4897928 taaagttactcatcattatagcggaacagtgggctgctttctcccccatactaggtca 4897985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 173 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26098373 - 26098273
Alignment:
Q  173 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctacccc-agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 271  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||    
T  26098373 tttgtaacgttactcatcatatggtgaaacggagggctgctctctccccccatactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttatgttc 26098274  T
Q  272 t 272  Q
    |    
T  26098273 t 26098273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 193
Target Start/End: Original strand, 42770936 - 42771025
Alignment:
Q  105 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcata 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || | ||||||| |||||||||||||    
T  42770936 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 42771025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 58 - 147
Target Start/End: Original strand, 42770847 - 42770934
Alignment:
Q  58 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact 147  Q
    ||||| ||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  42770847 gggttcattcaccatgggaaac--tattaggactgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgagagact 42770934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 273
Target Start/End: Original strand, 1170811 - 1171007
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| | |   | || |||    
T  1170811 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 1170906  T
Q  175 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 271  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||    
T  1170907 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaata-tcttgtgttc 1171005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 138
Target Start/End: Original strand, 4754198 - 4754312
Alignment:
Q  21 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 120  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    | |||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  4754198 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcaccttgaaaaacactattagaattgagcctcttggtcactggaagagattgtg 4754294  T
Q  121 actttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  4754295 actttggatagaattagg 4754312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 35385634 - 35385437
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| | |   | || |||    
T  35385634 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 35385539  T
Q  175 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgtt 270  Q
    ||||| |  ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||| | |||||||    
T  35385538 tgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaata-tcttgtgtt 35385440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15445453 - 15445264
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggtt---acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccgttgatttcg 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||     ||  |||||||||| ||||||| |||||||||||   || || | ||||||||||||| ||||| ||     
T  15445453 aaacactgttaggattgagtctcttggcggccacatgaagagattgagactttgagtagaattaggtttgaagaatgattcttgtaaccctttgatatct 15445354  T
Q  172 cttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| | |||||| ||||| ||| |||||||    
T  15445353 cttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctct-tcccagactaggtcagtattggactgaactgggtaaacaaat 15445264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 272
Target Start/End: Original strand, 20043222 - 20043284
Alignment:
Q  210 tgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  20043222 tgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttttgtgttct 20043284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 31782639 - 31782578
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31782639 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggga-attgggtagaattagg 31782578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 34033768 - 34033691
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaatta 136  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  34033768 ttgatttaccttggagaaacactattaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattcaggattttgggtagaatta 34033691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 205
Target Start/End: Original strand, 35430259 - 35430408
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  35430259 ttgattcaccttggagaaacactattacaattgagtctcttggtctagggaagagattcgggtctttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 35430358  T
Q  158 a-cccgttgatttcgctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcgga 205  Q
    |  |  ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  35430359 attcttttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacgga 35430408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 233
Target Start/End: Original strand, 25445501 - 25445653
Alignment:
Q  81 ctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||| ||   |  || || ||||||||    
T  25445501 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgttac---tcaatatctctttgtaa 25445596  T
Q  180 cgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
     |  ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  25445597 agaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 25445653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Original strand, 25452498 - 25452556
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  25452498 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25452556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 133
Target Start/End: Original strand, 29748443 - 29748502
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaa 133  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29748443 gaaacactaataggattgagtctcttggtcacgggaatagattcgggactttgggtagaa 29748502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 2298183 - 2298122
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  2298183 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 2298122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Original strand, 10627364 - 10627425
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  10627364 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagac-tagggtagaattagg 10627425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 22672837 - 22672991
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| |    || || ||||||    
T  22672837 cactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 22672932  T
Q  178 aacgttactcat--cat-atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    || |  ||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  22672933 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 22672991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 9353361 - 9353425
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  9353361 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9353425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 75 - 138
Target Start/End: Original strand, 32520533 - 32520597
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  32520533 gaaacactattaagattgagtctctcgattacgggaagagattcatgactttgggtagaattagg 32520597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 36932379 - 36932443
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  36932379 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 36932443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Original strand, 28786407 - 28786465
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  28786407 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggcagaattagg 28786465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 28832326 - 28832263
Alignment:
Q  194 tagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  28832326 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaaccgggtcaacaa 28832263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Original strand, 1240428 - 1240489
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  1240428 aaacactattaggattgagtctcttaggcacgggaagaggctggga-tttgggtagaattagg 1240489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2298067 - 2297986
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  2298067 tatagtggatcggagagctgctctcccccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaata-tcttgtgttctt 2297986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 257
Target Start/End: Original strand, 11917000 - 11917065
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  11917000 tatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 11917065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16093473 - 16093413
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattag 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| || |||||||||||    
T  16093473 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagtctgggac-ttaggtagaattag 16093413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 10281819 - 10281755
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  10281819 atagtggattggagagctgctctctcccccagatcaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10281755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15464600 - 15464536
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||| |||  |||||||||||| |||||||||    
T  15464600 atagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaa 15464536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 17003989 - 17004053
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| | || |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  17003989 atagtggattgaagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 17004053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 20507705 - 20507665
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 55  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20507705 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacaagggttt 20507665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 11962612 - 11962554
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  11962612 cactattaggattgtgtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 11962554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 15224968 - 15224889
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  15224968 ttgattcaccttgaagaaacactattaggataaagtcttttggtcatgggaagagattcgagactttgggtaaaattagg 15224889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 17841428 - 17841370
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  17841428 cactattaggattgagtctctaggtcacgggaagaggctggaac-ttgggtagaattagg 17841370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 26406647 - 26406594
Alignment:
Q  84 ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  26406647 ttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagac-ttgagtagaattagg 26406594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8565983 - 8565946
Alignment:
Q  220 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8565983 cccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 8565946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 136
Target Start/End: Original strand, 13295835 - 13295896
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaatta 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13295835 aaacacttttaggattgagtctcttgatcacatgaagagattcgagactttgggtagaatta 13295896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 233
Target Start/End: Original strand, 42238376 - 42238417
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  42238376 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 42238417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 12084204 - 12084268
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||| | |||||||   ||||||||||| |||||||||    
T  12084204 atagtggattggagagctgctctctgccccatattaggtcatagtggaccgaactgggtcaacaa 12084268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 19588814 - 19588750
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||  ||| ||| |||  |||||||||||| |||||||||    
T  19588814 atagtggattggagggctgctctctccctaagattagttcatattggaccgaactgggtcaacaa 19588750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Original strand, 19806487 - 19806531
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  19806487 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 19806531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Original strand, 32636948 - 32636992
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  32636948 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 32636992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 41726 - 41452
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41726 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 41627  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41626 gctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgct 41527  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttc 288  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41526 ctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttc 41452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 37 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 1673 - 1425
Alignment:
Q  37 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaatta 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1673 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 1574  T
Q  137 ggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1573 ggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatt 1474  T
Q  237 tggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtg 285  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  1473 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 1425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 183883 - 183605
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  183883 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagag 183785  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  183784 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 183685  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  183684 ctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 183605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 282
Target Start/End: Original strand, 52056 - 52324
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52056 tttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 52155  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg-- 211  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||  || | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||      
T  52156 attgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 52255  T
Q  212 ctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatcttt 282  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  52256 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaat--tcttgtgttcttctcttcttt 52324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 282
Target Start/End: Original strand, 50235 - 50325
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctcta--ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatcttt 282  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  50235 tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggacctaactgggtcaacaaat--tcttgtgttcttctcttcttt 50325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 275
Target Start/End: Original strand, 6244 - 6505
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6244 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaaga 6343  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6344 gattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgct 6443  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct 275  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||    
T  6444 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgagtcaacaaatttctttgtgttcttct 6505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 29216 - 29494
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29216 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 29315  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
     ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316 gttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctc 29415  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  29416 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcgtttgtgttcttctcttttttgtgttcttctc 29494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 2925 - 3203
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2925 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagag 3024  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 214  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  3025 gcttggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgcta 3124  T
Q  215 tctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3125 tctccccgagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatattttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 3203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11716 - 11458
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11716 tttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 11617  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  11616 attgggactttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagagctgct 11517  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  11516 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttct 11458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 276
Target Start/End: Original strand, 86 - 348
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  86 tttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgtgaaga 185  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  186 gattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 285  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 276  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||    
T  286 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctc 348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 79230 - 79488
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79230 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 79329  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  79330 gctgagaatttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 79429  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||    
T  79430 ctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgttct 79488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14625 - 14380
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14625 tttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagag 14526  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14525 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 14426  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14425 ctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 14380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 15068 - 15297
Alignment:
Q  19 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 118  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  15068 tataaagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattc 15167  T
Q  119 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 217  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  15168 agactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtggaacggaaggctgctgtct 15267  T
Q  218 accccagactaggtcaatttggaccgaact 247  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15268 cccccatgctaggtcaatttggaccgaact 15297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 276
Target Start/End: Original strand, 4042 - 4302
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4042 tttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaa 4140  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  4141 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 4240  T
Q  214 ctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 276  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4241 ctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 4302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 268
Target Start/End: Original strand, 79904 - 80158
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  79904 tttgtatagagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaaga 80003  T
Q  114 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 212  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| | ||||  || | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  80004 gattggggctttgggtag-attaggcaggagacttattcctgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgc 80102  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtg 268  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  80103 tctctcccccagactaggtcaatttggattgaactgggtcaacaaattcttttgtg 80158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 188424 - 188363
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  188424 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 188363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 75 - 275
Target Start/End: Original strand, 22221 - 22421
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct 173  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| ||    
T  22221 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 22319  T
Q  174 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  22320 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 22419  T
Q  274 ct 275  Q
    ||    
T  22420 ct 22421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 75 - 275
Target Start/End: Original strand, 24496 - 24696
Alignment:
Q  75 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgct 173  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| ||    
T  24496 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 24594  T
Q  174 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  24595 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 24694  T
Q  274 ct 275  Q
    ||    
T  24695 ct 24696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 8448 - 8512
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  8448 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Original strand, 2087 - 2289
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2087 tttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaag 2185  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  2186 gctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattaatttctcttttgtaacgttcctcatcatatagtgaatcggagggctact 2285  T
Q  214 ctct 217  Q
    ||||    
T  2286 ctct 2289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 85275 - 85534
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  85275 tttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaaacactactaggattgagtcttttggttacgagaagag 85374  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgcttt-gtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||    
T  85375 attgtgactttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttcgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgc 85474  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  85475 tctctcccccagactaggtcaatttgaactgaaccaggtaaacaaattcttttgtgttct 85534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16062 - 15818
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16062 tttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggttga--ggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 15966  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| || |||||| |||||| ||||    
T  15965 attgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgc 15866  T
Q  213 tctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||||| |||| |||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||    
T  15865 tctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaat 15818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 39 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1860 - 1639
Alignment:
Q  39 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1860 aacaaacactagggtt-gtgg-ttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 1763  T
Q  139 cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-at 235  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||  |    
T  1762 cgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgtagggctgctctctcccccatactaggtcagtt 1663  T
Q  236 ttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    || ||||||||| ||| |||||||    
T  1662 tttgaccgaactgggtaaacaaat 1639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 150
Target Start/End: Original strand, 35684 - 35819
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35684 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagag 35783  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 150  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35784 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 272
Target Start/End: Original strand, 35817 - 35897
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 272  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||    
T  35817 tatagtggaacggagggctgctctcttccttagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattattttgtgttct 35897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16891 - 16647
Alignment:
Q  15 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16891 tttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttggtgacgggaagag 16795  T
Q  115 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||  |  |||| |      
T  16794 attgagactttgggtagaattaggccagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgggacaaagggttta 16695  T
Q  213 tctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaat 259  Q
    ||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| |||||||    
T  16694 tctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaat 16647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 245
Target Start/End: Original strand, 4901 - 5089
Alignment:
Q  61 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 160  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4901 ttgattcatgttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagcttttggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 5000  T
Q  161 cgttgatttcgc--tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaa 245  Q
    | ||||| || |  ||||||| | ||||||||| ||||||||| |  ||  ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  5001 cattgatatctctttttgtaaagatactcatcattatagtggaacatagaactgctctctgccccagactaggtcagtattggaccgaa 5089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 203 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4733 - 4661
Alignment:
Q  203 ggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct 275  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||| ||||    
T  4733 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgttgttct 4661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 76 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 57613 - 57433
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttc-gc 172  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||| |||||||||||| ||||||||   | |||  |||||||||||||| ||||| ||       
T  57613 aaacactattaggattgaatctcttggtcattggaagagattcgggactttgggtggaattaggtttgaagatctattcttgtaaccctttgatatctat 57514  T
Q  173 tttgtaacgttactca-tcatatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaat-ttggaccgaactaggt 251  Q
    ||||||| |||||||| | ||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  57513 tttgtaaagttactcattaatataatggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcagtattggacggaactaggt 57433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1415
Alignment:
Q  223 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  1485 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtccttttcttctttgtgttcttctc 1415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 138
Target Start/End: Original strand, 224819 - 224880
Alignment:
Q  76 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  224819 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 224880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 5751 - 5687
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  5751 atagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 2560 - 2496
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||  ||||| |||||| |||||||||    
T  2560 atagtggattggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattggagcgaactgggtcaacaa 2496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Original strand, 16328 - 16386
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16328 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 3136 - 3055
Alignment:
Q  192 tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 273  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||    
T  3136 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaata-tcttgtgttctt 3055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17165 - 17011
Alignment:
Q  79 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccgttgatttcgctttgt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |||   ||  | || ||||||    
T  17165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaagctaggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaac---ttattatctctttgt 17070  T
Q  178 aacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtca 233  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  17069 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 17011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 43990 - 44054
Alignment:
Q  193 atagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||| |||  |||||||||||| |||||||||    
T  43990 atagtggattggagagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaactgggtcaacaa 44054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10796 - 10736
Alignment:
Q  194 tagtggatcggagggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaa 254  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||| | |||||||  |||||||||||| ||||||    
T  10796 tagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 10736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20459 - 20415
Alignment:
Q  213 tctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20459 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 20415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University