View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1740_high_141 (Length: 249)

Name: NF1740_high_141
Description: NF1740
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1740_high_141
NF1740_high_141
[»] chr7 (47 HSPs)
chr7 (16-185)||(4501195-4501363)
chr7 (22-182)||(19277235-19277395)
chr7 (16-185)||(982885-983054)
chr7 (16-185)||(21326840-21327009)
chr7 (16-185)||(27521407-27521576)
chr7 (16-160)||(48539117-48539261)
chr7 (16-179)||(24527525-24527688)
chr7 (19-185)||(32584539-32584706)
chr7 (14-177)||(43856808-43856971)
chr7 (16-165)||(45613864-45614013)
chr7 (17-181)||(22197924-22198087)
chr7 (17-181)||(22239734-22239897)
chr7 (16-180)||(30216065-30216229)
chr7 (19-185)||(10905057-10905222)
chr7 (17-184)||(42295187-42295354)
chr7 (20-185)||(40726482-40726647)
chr7 (16-180)||(5825209-5825373)
chr7 (16-185)||(28517289-28517458)
chr7 (22-178)||(25186945-25187096)
chr7 (16-142)||(5972261-5972387)
chr7 (17-157)||(36558898-36559037)
chr7 (14-180)||(9281138-9281309)
chr7 (14-180)||(9292109-9292280)
chr7 (17-120)||(41117837-41117940)
chr7 (20-157)||(6634993-6635130)
chr7 (17-182)||(34772719-34772883)
chr7 (83-180)||(2904368-2904465)
chr7 (19-175)||(23792951-23793107)
chr7 (77-175)||(47679122-47679220)
chr7 (183-247)||(4501544-4501608)
chr7 (16-103)||(23037481-23037568)
chr7 (59-165)||(10032193-10032299)
chr7 (22-96)||(44525927-44526001)
chr7 (196-249)||(45613597-45613650)
chr7 (17-65)||(45003019-45003067)
chr7 (122-185)||(3676681-3676744)
chr7 (183-249)||(47679411-47679477)
chr7 (138-179)||(26770455-26770496)
chr7 (189-245)||(24527882-24527938)
chr7 (19-55)||(45974731-45974767)
chr7 (16-59)||(27027758-27027801)
chr7 (124-178)||(4879547-4879601)
chr7 (183-249)||(28517042-28517108)
chr7 (75-180)||(47251789-47251893)
chr7 (189-249)||(983241-983301)
chr7 (190-242)||(3676933-3676985)
chr7 (191-247)||(10905397-10905453)
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (16-185)||(53785645-53785814)
chr3 (16-185)||(39583231-39583400)
chr3 (44-181)||(52741518-52741655)
chr3 (16-185)||(32546731-32546900)
chr3 (21-185)||(44198708-44198872)
chr3 (20-179)||(37133007-37133166)
chr3 (16-185)||(26772694-26772863)
chr3 (24-180)||(26856769-26856925)
chr3 (16-180)||(38670887-38671051)
chr3 (20-184)||(54508386-54508551)
chr3 (17-177)||(38978809-38978969)
chr3 (17-184)||(3443315-3443482)
chr3 (16-159)||(5338582-5338722)
chr3 (17-173)||(38145993-38146149)
chr3 (19-175)||(52411903-52412059)
chr3 (19-178)||(7900797-7900956)
chr3 (17-185)||(7502013-7502180)
chr3 (17-185)||(46940772-46940943)
chr3 (44-180)||(51234580-51234716)
chr3 (17-180)||(13582447-13582609)
chr3 (14-179)||(21552598-21552766)
chr3 (20-181)||(49017907-49018064)
chr3 (21-181)||(37992274-37992433)
chr3 (25-104)||(44781-44860)
chr3 (14-179)||(4472996-4473160)
chr3 (17-179)||(25324966-25325130)
chr3 (16-92)||(4763888-4763963)
chr3 (190-249)||(29862090-29862149)
chr3 (80-179)||(3376748-3376848)
chr3 (183-249)||(53785995-53786061)
chr3 (17-94)||(25094665-25094742)
chr3 (19-91)||(464977-465049)
chr3 (189-249)||(39582984-39583044)
chr3 (20-164)||(43123085-43123229)
chr3 (189-249)||(52741266-52741326)
chr3 (183-249)||(35236414-35236480)
chr3 (54-98)||(4669086-4669130)
chr3 (122-180)||(13772491-13772549)
chr3 (21-78)||(3643092-3643149)
chr3 (17-62)||(4669788-4669833)
chr3 (17-94)||(42206004-42206081)
chr3 (196-249)||(49018262-49018315)
[»] chr8 (46 HSPs)
chr8 (16-185)||(38815230-38815399)
chr8 (19-184)||(24124967-24125132)
chr8 (16-185)||(6592512-6592680)
chr8 (14-185)||(3187904-3188074)
chr8 (51-185)||(500199-500332)
chr8 (37-185)||(35739988-35740136)
chr8 (16-179)||(6618221-6618383)
chr8 (16-185)||(39434603-39434772)
chr8 (16-129)||(22589395-22589507)
chr8 (16-157)||(37514157-37514298)
chr8 (19-175)||(25021826-25021982)
chr8 (16-110)||(3821160-3821254)
chr8 (71-185)||(8882319-8882432)
chr8 (18-179)||(28196130-28196291)
chr8 (14-185)||(4073468-4073640)
chr8 (16-110)||(18804549-18804642)
chr8 (71-180)||(8619805-8619914)
chr8 (27-185)||(39671173-39671332)
chr8 (47-185)||(8115779-8115916)
chr8 (18-144)||(43823927-43824053)
chr8 (17-150)||(3825572-3825705)
chr8 (49-150)||(3863286-3863387)
chr8 (17-102)||(9259377-9259462)
chr8 (49-110)||(40223480-40223541)
chr8 (17-180)||(8540384-8540550)
chr8 (19-185)||(4699810-4699973)
chr8 (118-180)||(10189581-10189643)
chr8 (62-162)||(6120947-6121045)
chr8 (27-159)||(36004069-36004201)
chr8 (183-249)||(37517375-37517441)
chr8 (183-249)||(39434953-39435019)
chr8 (196-249)||(500526-500579)
chr8 (17-65)||(24451057-24451105)
chr8 (122-174)||(42922140-42922192)
chr8 (16-103)||(121805-121892)
chr8 (16-65)||(42659163-42659212)
chr8 (16-56)||(8882280-8882320)
chr8 (189-249)||(24125320-24125380)
chr8 (23-185)||(10556295-10556456)
chr8 (71-153)||(27715339-27715421)
chr8 (80-157)||(4097373-4097450)
chr8 (20-109)||(5329680-5329769)
chr8 (70-171)||(43421302-43421403)
chr8 (117-173)||(10950673-10950729)
chr8 (117-173)||(10958678-10958734)
chr8 (16-52)||(24320273-24320309)
[»] chr2 (37 HSPs)
chr2 (22-185)||(4413068-4413231)
chr2 (16-185)||(17344574-17344743)
chr2 (16-185)||(41867910-41868079)
chr2 (20-185)||(18744956-18745121)
chr2 (22-185)||(9685417-9685580)
chr2 (16-185)||(19161785-19161954)
chr2 (16-186)||(44686352-44686526)
chr2 (14-136)||(13413285-13413407)
chr2 (20-181)||(28224940-28225101)
chr2 (38-180)||(34814826-34814967)
chr2 (38-159)||(20142753-20142874)
chr2 (19-185)||(5532360-5532524)
chr2 (20-165)||(2886637-2886781)
chr2 (17-185)||(16351843-16352014)
chr2 (17-185)||(7760848-7761015)
chr2 (17-165)||(32029108-32029256)
chr2 (19-185)||(23484940-23485104)
chr2 (44-185)||(2888480-2888621)
chr2 (17-185)||(27502299-27502467)
chr2 (17-185)||(13147099-13147270)
chr2 (20-160)||(3825666-3825806)
chr2 (21-179)||(33612555-33612711)
chr2 (15-184)||(44720257-44720427)
chr2 (71-179)||(11921218-11921326)
chr2 (190-249)||(4412821-4412880)
chr2 (183-249)||(17344924-17344990)
chr2 (189-249)||(20142495-20142555)
chr2 (14-90)||(44684955-44685031)
chr2 (75-181)||(29808070-29808175)
chr2 (52-185)||(3968411-3968544)
chr2 (38-103)||(8036566-8036633)
chr2 (190-249)||(41867663-41867722)
chr2 (191-241)||(44686712-44686762)
chr2 (190-249)||(9685170-9685229)
chr2 (138-184)||(1296053-1296099)
chr2 (183-249)||(27502647-27502713)
chr2 (196-249)||(18744709-18744762)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (25-185)||(6279-6439)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (16-185)||(22346831-22347000)
chr1 (26-184)||(21472949-21473107)
chr1 (44-185)||(29169795-29169936)
chr1 (16-185)||(45659650-45659817)
chr1 (24-185)||(28041129-28041290)
chr1 (17-185)||(34644503-34644671)
chr1 (20-175)||(20259809-20259964)
chr1 (20-185)||(2898642-2898810)
chr1 (16-185)||(31737325-31737493)
chr1 (17-185)||(2764416-2764584)
chr1 (16-158)||(24177540-24177682)
chr1 (16-180)||(4861996-4862160)
chr1 (15-175)||(38731544-38731704)
chr1 (98-185)||(19035465-19035552)
chr1 (71-185)||(50314626-50314740)
chr1 (14-151)||(47459616-47459753)
chr1 (52-183)||(42919832-42919962)
chr1 (18-178)||(18616162-18616322)
chr1 (17-164)||(7213187-7213335)
chr1 (20-185)||(50161419-50161591)
chr1 (38-165)||(37932239-37932366)
chr1 (80-185)||(16500034-16500139)
chr1 (118-180)||(15584912-15584974)
chr1 (111-185)||(36486917-36486991)
chr1 (189-249)||(28040882-28040942)
chr1 (183-247)||(34644852-34644916)
chr1 (44-96)||(35387747-35387799)
chr1 (30-77)||(868513-868560)
chr1 (183-245)||(29169553-29169615)
chr1 (20-162)||(35550100-35550242)
chr1 (132-185)||(23043929-23043982)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (16-185)||(33186-33355)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (16-185)||(959517-959685)
chr6 (16-185)||(4206598-4206767)
chr6 (16-185)||(4165924-4166093)
chr6 (45-180)||(45684-45819)
chr6 (16-185)||(17249307-17249476)
chr6 (16-181)||(34304432-34304597)
chr6 (17-185)||(33220713-33220881)
chr6 (19-182)||(29338084-29338247)
chr6 (18-185)||(28625869-28626036)
chr6 (16-181)||(34554283-34554447)
chr6 (17-185)||(357719-357886)
chr6 (48-184)||(34415404-34415540)
chr6 (17-180)||(24016274-24016437)
chr6 (17-96)||(32115655-32115734)
chr6 (21-179)||(3714858-3715016)
chr6 (183-249)||(32115975-32116041)
chr6 (61-169)||(26225597-26225705)
chr6 (16-67)||(3137367-3137418)
chr6 (17-164)||(13398205-13398352)
chr6 (183-249)||(357472-357538)
chr6 (24-95)||(31703561-31703632)
chr6 (125-185)||(34168913-34168973)
chr6 (32-174)||(22985873-22986015)
chr6 (32-174)||(23802379-23802521)
chr6 (14-180)||(28008994-28009160)
chr6 (189-249)||(45424-45484)
chr6 (190-249)||(4206351-4206410)
chr6 (85-185)||(6225077-6225177)
chr6 (117-185)||(28543412-28543480)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (16-184)||(103042-103209)
[»] chr5 (43 HSPs)
chr5 (16-185)||(32269799-32269968)
chr5 (19-185)||(42921637-42921802)
chr5 (20-185)||(37873640-37873805)
chr5 (17-185)||(13166912-13167080)
chr5 (14-185)||(35310382-35310553)
chr5 (20-185)||(15292028-15292192)
chr5 (14-155)||(22188687-22188828)
chr5 (17-185)||(33692057-33692224)
chr5 (16-185)||(25663034-25663203)
chr5 (17-181)||(38875576-38875739)
chr5 (17-183)||(34335274-34335440)
chr5 (71-185)||(43129525-43129639)
chr5 (16-164)||(430538-430686)
chr5 (25-185)||(26212585-26212745)
chr5 (19-185)||(27336634-27336798)
chr5 (38-178)||(14423643-14423776)
chr5 (49-162)||(14723269-14723382)
chr5 (45-180)||(8100517-8100652)
chr5 (87-180)||(35455963-35456056)
chr5 (16-88)||(2566194-2566266)
chr5 (45-152)||(41343473-41343581)
chr5 (17-174)||(19260241-19260396)
chr5 (61-180)||(43115464-43115583)
chr5 (107-181)||(32230513-32230587)
chr5 (183-249)||(38446452-38446518)
chr5 (112-185)||(3114165-3114238)
chr5 (45-159)||(7716146-7716261)
chr5 (133-180)||(8858969-8859016)
chr5 (17-76)||(23023532-23023591)
chr5 (188-249)||(433583-433644)
chr5 (122-185)||(14436542-14436602)
chr5 (71-174)||(27294429-27294528)
chr5 (16-102)||(15809985-15810069)
chr5 (16-159)||(15832998-15833138)
chr5 (131-179)||(7143757-7143805)
chr5 (190-249)||(3113920-3113979)
chr5 (47-98)||(23423960-23424011)
chr5 (183-249)||(6534318-6534384)
chr5 (132-178)||(9829361-9829407)
chr5 (183-245)||(13166669-13166731)
chr5 (14-76)||(24113509-24113571)
chr5 (183-249)||(26212338-26212403)
chr5 (69-113)||(8087547-8087591)
[»] chr4 (52 HSPs)
chr4 (17-181)||(600698-600862)
chr4 (14-180)||(56462113-56462279)
chr4 (14-185)||(53619520-53619691)
chr4 (16-182)||(53170448-53170609)
chr4 (20-180)||(25504235-25504395)
chr4 (16-185)||(34107696-34107867)
chr4 (14-184)||(132319-132489)
chr4 (16-185)||(26521425-26521593)
chr4 (17-185)||(50000927-50001096)
chr4 (19-166)||(7536592-7536739)
chr4 (22-179)||(6865828-6865984)
chr4 (63-172)||(50483211-50483320)
chr4 (17-161)||(3329933-3330077)
chr4 (16-110)||(16955396-16955490)
chr4 (17-185)||(55933464-55933630)
chr4 (22-185)||(30940741-30940897)
chr4 (16-149)||(38535607-38535740)
chr4 (17-103)||(4419200-4419286)
chr4 (31-165)||(46440911-46441045)
chr4 (19-186)||(54190857-54191019)
chr4 (75-165)||(11562893-11562983)
chr4 (16-185)||(23255649-23255809)
chr4 (17-179)||(46391323-46391482)
chr4 (17-180)||(48656917-48657085)
chr4 (52-186)||(43849349-43849483)
chr4 (44-181)||(50462952-50463089)
chr4 (14-102)||(42455692-42455780)
chr4 (62-162)||(53098403-53098503)
chr4 (16-131)||(39001333-39001448)
chr4 (58-144)||(747812-747898)
chr4 (71-185)||(31847078-31847192)
chr4 (76-185)||(12918374-12918483)
chr4 (106-181)||(16957568-16957643)
chr4 (58-144)||(712636-712722)
chr4 (183-249)||(26521774-26521840)
chr4 (16-96)||(50464387-50464467)
chr4 (190-249)||(3330243-3330302)
chr4 (23-78)||(8738148-8738203)
chr4 (20-185)||(28739845-28740011)
chr4 (30-185)||(45386063-45386218)
chr4 (17-67)||(18981659-18981708)
chr4 (118-180)||(45760841-45760903)
chr4 (127-180)||(12053460-12053513)
chr4 (183-247)||(16957822-16957886)
chr4 (122-170)||(24719976-24720024)
chr4 (132-180)||(28883158-28883206)
chr4 (15-61)||(22449812-22449858)
chr4 (19-97)||(34213559-34213636)
chr4 (183-249)||(34952457-34952523)
chr4 (190-249)||(25504586-25504646)
chr4 (22-102)||(32312796-32312876)
chr4 (16-88)||(45661627-45661699)
[»] scaffold0470 (1 HSPs)
scaffold0470 (16-179)||(7539-7701)
[»] scaffold1768 (1 HSPs)
scaffold1768 (16-185)||(186-355)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (48-184)||(10329-10468)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (14-174)||(49349-49505)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (52-183)||(18369-18499)
[»] scaffold0493 (1 HSPs)
scaffold0493 (71-178)||(8525-8632)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (116-184)||(47542-47610)
[»] scaffold0119 (2 HSPs)
scaffold0119 (138-184)||(16192-16238)
scaffold0119 (47-129)||(16073-16154)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 47)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Original strand, 4501195 - 4501363
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4501195 ctcgtaaacacaacattcatgaatctaggagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctagaaaac 4501294  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4501295 c-aaagtgtcaaaagcaaattatataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccac 4501363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 182
Target Start/End: Original strand, 19277235 - 19277395
Alignment:
Q  22 aacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaa 121  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||     
T  19277235 aacacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccgaaag 19277334  T
Q  122 tgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggc 182  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19277335 tgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggc 19277395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Original strand, 982885 - 983054
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  982885 ctcgtgaacacaacattcatggacatagaagacatgacattgatatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggccaacaacctctggtgctagaaaac 982984  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  982985 cgaaagtatcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgatttctcatgtttggccac 983054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21327009 - 21326840
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||     
T  21327009 ctcgtgaacacaacattcatggacctaggagacataacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtaaaaggtcaacagcctctggtgctaggaaat 21326910  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21326909 cgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccac 21326840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Original strand, 27521407 - 27521576
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  27521407 ctcgtaaacacaacattcatagacttaggagacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaaac 27521506  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    | ||| ||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27521507 caaaagtgtcaaaagtaaattgtataaatgcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgaccac 27521576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 160
Target Start/End: Original strand, 48539117 - 48539261
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||    
T  48539117 ctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttggactctatgtagacgatcaacagcctctggtgctagaaaac 48539216  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcag 160  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48539217 cgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcag 48539261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 179
Target Start/End: Original strand, 24527525 - 24527688
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||| || |||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||| ||||    
T  24527525 ctcgtgaatacaacattcatggaccaaggagaaatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaaccgcctctcgtgctaggaaac 24527624  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 179  Q
     |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24527625 tgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 24527688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 32584539 - 32584706
Alignment:
Q  19 gtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttg-aactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccg 117  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||      
T  32584539 gtaaacacaacattcatcgatctatgagacataacattgatatgcatgatcttttggaactctatctagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaacat 32584638  T
Q  118 aaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    ||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32584639 aaagtgtcaaaagcaaatggtgtaaaagcatcttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgaccac 32584706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 43856808 - 43856971
Alignment:
Q  14 ttctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaa 113  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  43856808 ttctcgtaaacataacattcatggacctaggagtcatgacattgttgtgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgttaggaa 43856907  T
Q  114 accgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgt 177  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  43856908 accaaaaatgtcaaaagcaaattgtataaacgcatgttgattgtcaaaacacgctttctcatgt 43856971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 45614013 - 45613864
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || | ||||    
T  45614013 ctcgtaaacacaacattcatggacctaggagatttgacattgttatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggctaacagcctctggtgcttggaaac 45613914  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacac 165  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45613913 cgaaagtgtcaaaatcaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacac 45613864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Original strand, 22197924 - 22198087
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  22197924 tcgtaaacacaacattcattgacctaggagacatgacgttgctat-cataaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaaacc 22198022  T
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgg 181  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||    
T  22198023 gaaagtgacaaaagcaaatggtataaaaacatgttgattgttggaacacactttctcatgtttgg 22198087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 22239897 - 22239734
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  22239897 tcgtaaacacaacattcattgacctaggagacatgacgttgctat-cataaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaaacc 22239799  T
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgg 181  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||    
T  22239798 gaaagtgacaaaagcaaatggtataaaaacatgttgattgttggaacacactttctcatgtttgg 22239734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 30216229 - 30216065
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| | |||| ||||    
T  30216229 ctcgtgaacacaacattcatagacctaggagatatgacattgctatgcatgaccatttgaactttatgtggaagatcaacaaactctgatgctaggaaac 30216130  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 180  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  30216129 cgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaacatgttgattgtcaaaacacgctttctcatatttg 30216065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 10905057 - 10905222
Alignment:
Q  19 gtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccga 118  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||| |    
T  10905057 gtaaacacgacattcatggacctaggagacatgacattgttatgcatggctctttgaactctatgtagaaggtcaacatactctggtgctaggcaaccaa 10905156  T
Q  119 aaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    || ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  10905157 aagtgtcaaaagcaaatggtat-aaagcatgttgagtgtcagaacactttttctcatatttggccac 10905222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 42295354 - 42295187
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||    
T  42295354 tcgtaaacacaagattcatggacctaggagacatgacaatgttatgcatgatattttgaacgctatgtagaaggtcaacaacccctggtgttaggaaacc 42295255  T
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggcca 184  Q
    |||| | | |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  42295254 gaaagtataaaaaacaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaagaagctttcttatgtttggcca 42295187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 40726647 - 40726482
Alignment:
Q  20 taaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||  ||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |||||    
T  40726647 taaacacaacattcatggatctaggagacatagcattgttatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctatgaagccgaa 40726548  T
Q  120 aatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    | |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  40726547 agtgtcaaaaacaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacacattttattatgtttggccac 40726482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 180
Target Start/End: Original strand, 5825209 - 5825373
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |    
T  5825209 ctcgtaaacacaacatccatagacctaggagacataacattgctatgcataaccctttcgactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggatgc 5825308  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 180  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  || |||||||||    
T  5825309 cgaaagtgtcaaaagtaaatggtataaaaacatgttgattgtcataacacgcattgtcatgtttg 5825373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 28517458 - 28517289
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||   ||||| | |||| ||      
T  28517458 ctcgtaaacacaacattcatggacttaggagacataacattgttatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaactgtctctgatgctaggaagt 28517359  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  28517358 caaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaacatgttgattgtctaaacacgctttctcatgtttggccac 28517289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 25187096 - 25186945
Alignment:
Q  22 aacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaa 121  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||       
T  25187096 aacacaacattcatggatctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatatagaaggtcaacaacctctagtgttcggaaaccga--- 25187000  T
Q  122 tgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtt 178  Q
      ||||||||||||| || |||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  25186999 --tcaaaagcaaatggtagaaaaacatgttgattatcggaacacgctttctcatgtt 25186945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 5972387 - 5972261
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||  |||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  5972387 ctcgtaaacacaacattcatagatctgggagaaatgacattactatgcatgacattttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatactagaaaaa 5972288  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataa 142  Q
     ||||||||||||| |||||| |||||    
T  5972287 tgaaaatgtcaaaaacaaatggtataa 5972261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 36559037 - 36558898
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||  ||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||| || | |||| ||||||||||    
T  36559037 tcgtaaacacaacattcatggacctataagacatgatatttatatgcatgaccattt-aactctatggagaaagtcaacgacttttggtgctagaaaacc 36558939  T
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgt 157  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  36558938 aaaaatgtcaaatgcaaattatataaaaacatgttgattgt 36558898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 9281309 - 9281138
Alignment:
Q  14 ttctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgc-----atgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtact 108  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| || || ||| |||||||||| | |||     |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  9281309 ttctcctaaacacaacattaatggacttaagagtcatgacattgttgtgctgtacatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacatctggtgct 9281210  T
Q  109 agaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 180  Q
    || || |  |||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  9281209 aggaagcaaaaaatgtcaaatccaaatagtataaaagcatgttgattgttagaacacgctttctcatgtttg 9281138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 9292280 - 9292109
Alignment:
Q  14 ttctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgc-----atgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtact 108  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| || || ||| |||||||||| | |||     |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  9292280 ttctcctaaacacaacattaatggacttaagagtcatgacattgttgtgctgtacatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacatctggtgct 9292181  T
Q  109 agaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 180  Q
    || || |  |||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  9292180 aggaagcaaaaaatgtcaaatccaaatagtataaaagcatgttgattgttagaacacgctttctcatgtttg 9292109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 41117940 - 41117837
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||    
T  41117940 tcgtgaacacaacattcatggacctaggaaacatgacattgctatgcatgatcttttaaactctatgtagaaggttaacaacatctggtgttaggaaacc 41117841  T
Q  117 gaaa 120  Q
    ||||    
T  41117840 gaaa 41117837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 6635130 - 6634993
Alignment:
Q  20 taaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaa 119  Q
    ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||   ||| || | || ||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  6635130 taaacacaacatttatggatctaggagacatgacattgttatgcaagattattttaattttacgtagaaggtcaacaacctctgatgctaaaaaatcgaa 6635031  T
Q  120 aatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgt 157  Q
    | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6635030 actgtcaaaagcaaatgatataaaaatatgttgattgt 6634993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 34772719 - 34772883
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||  | |||  |||      
T  34772719 tcgtaaacacaatattcatggacctagaaaacatgacattgatatgcatgactttttgaagtttatgtagaaggtcaacaacctctaat-ctaagaaatt 34772817  T
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggc 182  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| ||||||  |||||||| ||||||    
T  34772818 gaaagtttcaaaagcaaatggtataaaaacatattaattgtccgaacacactttctcatatttggc 34772883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 180
Target Start/End: Original strand, 2904368 - 2904465
Alignment:
Q  83 gtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 180  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| || || || |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  2904368 gtagaaggtcaacaacctctagtgctaggaagccaaacatgtcacaaacaaatgatataaaatcatgttgattgtcggaacatgctttctcatgtttg 2904465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 175
Target Start/End: Original strand, 23792951 - 23793107
Alignment:
Q  19 gtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccga 118  Q
    |||||||||| ||| ||  ||||| ||||||| ||||| ||||| |||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||  ||| | |    
T  23792951 gtaaacacaagatttatagacctaggagacattacattactatgtatgatcctttgaactgtatttagaaggtcaacaacctgtggtgctaagaaaacaa 23793050  T
Q  119 aaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcat 175  Q
    || |||||||   || ||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  23793051 aagtgtcaaacataattgatatagaagcatgttgattgtcaaaacatattttctcat 23793107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 175
Target Start/End: Original strand, 47679122 - 47679220
Alignment:
Q  77 ctctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcat 175  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||    
T  47679122 ctctatttagaaggtcaacaacctgtgatgctaggaaaccgaaaatgtcaaacgcaaatagtataaaagtatattgattgtgagaacacactttctcat 47679220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 247
Target Start/End: Original strand, 4501544 - 4501608
Alignment:
Q  183 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaa 247  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  4501544 cacaagcacctctttcttcattgatactcccgcctatctgaatatatcaaaaagtacatccctaa 4501608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 103
Target Start/End: Original strand, 23037481 - 23037568
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  23037481 ctcgtaaacacaaaattcatagacctaagagaaatgacattgctatgcataaccctttgaaccctacgtagatggtcaacaacctctg 23037568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 10032299 - 10032193
Alignment:
Q  59 tatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtc 158  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||  | |||  || | |||||| ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||    
T  10032299 tatgcatgatcctttgaactctatgtagaaggttaacaacatctaatgctaagaagctgaaaatatcaaaagcaaatagtataaaaacatattgattgtc 10032200  T
Q  159 agaacac 165  Q
    |||||||    
T  10032199 agaacac 10032193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 96
Target Start/End: Original strand, 44525927 - 44526001
Alignment:
Q  22 aacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaaca 96  Q
    ||||||||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44525927 aacacaacattcatggatataggagacatgacattgttatgcatattcttttgaactccatgtagaaggtcaaca 44526001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45613650 - 45613597
Alignment:
Q  196 ttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  45613650 ttcttcactgatactcctgcccgtctgaatatatcaaaaagtacatccctaaca 45613597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 45003067 - 45003019
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcat 65  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  45003067 tcgtaaacacaacattcatggtcctatgagacataacattgctatgcat 45003019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 185
Target Start/End: Original strand, 3676681 - 3676744
Alignment:
Q  122 tgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  3676681 tgtcaaaagcaaatggtataaaagcatattgatagtaagaacacgctttctgatgtttgaccac 3676744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 249
Target Start/End: Original strand, 47679411 - 47679477
Alignment:
Q  183 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  47679411 cacacgcgactccttcttcactgatacccccgcccgcctgaatatatcaaaaagtacatccctaaca 47679477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 179
Target Start/End: Original strand, 26770455 - 26770496
Alignment:
Q  138 tataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 179  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26770455 tataaaagcatatagattgtcagaacacgttttctcatgttt 26770496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 245
Target Start/End: Original strand, 24527882 - 24527938
Alignment:
Q  189 cgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccct 245  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  24527882 cgcctccttcttcactgatattcctgccagtctgaatatatcaaaaagtacatccct 24527938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 45974767 - 45974731
Alignment:
Q  19 gtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacat 55  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45974767 gtaaacacaacattcatgaacctaggagacatgacat 45974731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 27027801 - 27027758
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgct 59  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27027801 ctcgtgaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgct 27027758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 4879601 - 4879547
Alignment:
Q  124 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtt 178  Q
    ||||| |||||||| ||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4879601 tcaaacgcaaatgacataaaaatattttgattgttagaacacgttttctcatgtt 4879547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28517108 - 28517042
Alignment:
Q  183 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  |  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  28517108 cacaggcgcctccttcttcaccgatgctcccgctcgcctgaatatatcaaaaagtacatccctaaca 28517042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 47251893 - 47251789
Alignment:
Q  75 aactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctca 174  Q
    ||||||||||| || ||||||   ||||| | |||| ||  |||||||||||||| |||||  ||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||    
T  47251893 aactctatgtaaaatgtcaaccgtctctgatgctaggaagtcgaaaatgtcaaaaacaaatt-tataaaagcatgaggattgtgagaacatgttttctca 47251795  T
Q  175 tgtttg 180  Q
    | ||||    
T  47251794 tatttg 47251789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 249
Target Start/End: Original strand, 983241 - 983301
Alignment:
Q  189 cgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| | || | |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  983241 cgcctccttcttcactgataatcccgtcagtctgaatatatctaaaagtaaatccctaaca 983301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 242
Target Start/End: Original strand, 3676933 - 3676985
Alignment:
Q  190 gcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatc 242  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  3676933 gcctccttcttcattgatattcccgcccgtctgaatatatcaaaaagtacatc 3676985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 247
Target Start/End: Original strand, 10905397 - 10905453
Alignment:
Q  191 cctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaa 247  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||| |||||    
T  10905397 cctccttcttcactgatactcccgccttcctggatatatcaaaaagtacattcctaa 10905453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Original strand, 53785645 - 53785814
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  53785645 ctcgtaaacataacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaac 53785744  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  53785745 cgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcgtgtttggccac 53785814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 39583400 - 39583231
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||| ||||    
T  39583400 ctcgtaaacacgacattcatgaacctaggagacatgacattgctatgcatgaccctttgaactctatgcagaaggtcaacaacctatgatgctaggaaac 39583301  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39583300 cgaaagtgtcgaaaacaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccac 39583231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 52741655 - 52741518
Alignment:
Q  44 gagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  52741655 gagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaa 52741556  T
Q  144 agcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52741555 agcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttgg 52741518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Original strand, 32546731 - 32546900
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||    
T  32546731 ctcgtgaacacaacattcatggacctaggagacatgacattactatgcatgactttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctttggtgctaggaaac 32546830  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
     |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32546831 tgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagtatgttgattgtccgaacacgctttctcatgtttggccac 32546900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 44198708 - 44198872
Alignment:
Q  21 aaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||  |||||||||    
T  44198708 aaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcataaccttctgaactctatgtagaaggtcaacagcctcgggtgttaagaaaccgaaa 44198807  T
Q  121 atgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44198808 gtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattctcagaacacgctttctcatgtttggccac 44198872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 37133166 - 37133007
Alignment:
Q  20 taaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaa 119  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  37133166 taaacacaacattcattaacttaggagacatgacattgctatgcatgacctttagaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaagaaaccgaa 37133067  T
Q  120 aatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 179  Q
    | ||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37133066 agtgtaaaaaacaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacacgctttctcatgttt 37133007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Original strand, 26772694 - 26772863
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| | | |||| ||||||| ||||||||||||  |||||| | |||| || |    
T  26772694 ctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacataacattgttatgcataatcctttgtactctatatagaaggtcaactgcctctgatgctaggaagc 26772793  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26772794 caaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctgatgtttggccac 26772863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 26856925 - 26856769
Alignment:
Q  24 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 123  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||| ||| |||||  |    
T  26856925 cacaacattcataaacctaggagacatgacattgctatgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacagtctctagtgctaggaaatcgaaagcg 26856826  T
Q  124 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 180  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  26856825 tcaaaagcagatggtataaaagcatgttgattgtcacaacacgctttatcatatttg 26856769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 38671051 - 38670887
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttga-actctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaa 114  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||     
T  38671051 ctcgtacacacaacattcatggacctaggagacataacattgctatgcat-aactctttagactctatgtagaaggtcatccgcctctgatgctagaaag 38670953  T
Q  115 ccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 180  Q
    || ||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38670952 ccaaaagtgtcaaaaacaaattgtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttg 38670887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 54508551 - 54508386
Alignment:
Q  20 taaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||| |||| |||| || |||||| | |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  54508551 taaacacaacattcatggacctagcagatatgatattgttacgcatgatcctttgtaccttatgcagaaggtcaacaacctctggtgctagaaaatcaaa 54508452  T
Q  120 aatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacg-ttttctcatgtttggcca 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  54508451 aatgtcaaaagcaaatgatataaaaacatgttaattgtcagaacaagtttttctcatgtttagcca 54508386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 38978969 - 38978809
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||||    
T  38978969 tcgtaaacacaacattgataaacctatgagacatgacattgttatgcatcaccttttgaactatatgtagaaggtcaacggcctcaggtgctaggaaacc 38978870  T
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgt 177  Q
     ||| |||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||||| || |||||||| |||||    
T  38978869 aaaagtgtcaaaaacaaatagtataaaaacatattgattgtcaaaatacgttttcacatgt 38978809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3443482 - 3443315
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    |||||||||||||||||||  |  || |||||| |||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||     
T  3443482 tcgtaaacacaacattcatagatttaggagacaagacattcctacgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctagtgctaggaaact 3443383  T
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggcca 184  Q
    |||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||    
T  3443382 gaaagtgtcaacagaaaatggtataaaagcatgttgattgttagaatacactttttcatgtttggcca 3443315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 159
Target Start/End: Original strand, 5338582 - 5338722
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||| || |    
T  5338582 ctcgtaaacacaacattcg---acctatgagacaagacattgctacgcatgaccttttgaactctatgtagaatgtcaacaatctctagtgctaggaagc 5338678  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtca 159  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  5338679 cgaaagtgtcaaaagcaaattgtataaaagcatgttgactgtca 5338722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Original strand, 38145993 - 38146149
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||| ||  |    
T  38145993 tcgtaaacacaacgttcatggacctaggagacatgacattgttatgcatgaccctttgaactctaagtagaatgtaaacaacctctggtgctaggaagtc 38146092  T
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctc 173  Q
     ||| ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  38146093 aaaagtgtcaaatgtaaatggtataaaaacatgttgattgtcaaaacacgttgtctc 38146149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 52412059 - 52411903
Alignment:
Q  19 gtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccga 118  Q
    |||||||||| ||| |||   ||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||| | ||    
T  52412059 gtaaacacaatatttatgggtctaggagacatgacattgttatgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacgacatctagtgttagaaagctga 52411960  T
Q  119 aaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcat 175  Q
    || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  52411959 aagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgtcagaacacgctctctcat 52411903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Original strand, 7900797 - 7900956
Alignment:
Q  19 gtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccga 118  Q
    ||||||| || ||| ||| ||||| || |||| ||||||||||| || | | ||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||    
T  7900797 gtaaacaaaatattgatggacctaggaaacataacattgctatgtataatccttcaaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccga 7900896  T
Q  119 aaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtt 178  Q
    || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  7900897 aagtgtcaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaaaacgctttctcatgtt 7900956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 7502180 - 7502013
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    ||||||||| || ||||||| | ||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  7502180 tcgtaaacataatattcatggatctatgagtcatgacattgttgtgcatgaccctttaaactct--gtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaacc 7502083  T
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatat-aaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
     ||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  7502082 aaaaatgtcaaaagaaaatggtataaaaaacatgttgattgttcgaacacgctttctcatgtttgaccac 7502013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 46940943 - 46940772
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaa---ggtcaacaacctctggtactagaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||| | ||||||||||||||||||   |||||| |  || |||| |||| |     
T  46940943 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagtcatgacattgtcgtgcatgatcctttgaactctatgtagaagctggtcaatagtctatggtgctaggac 46940844  T
Q  114 accgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
      | ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  46940843 gtcaaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattgtcggaacatgttttctaatgtttggccac 46940772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Original strand, 51234580 - 51234716
Alignment:
Q  44 gagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaa 143  Q
    ||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||  ||||| ||||||    
T  51234580 gagacataacattgttatgcataaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctagaaagtcgaaagtgtcaaaaataaatggtataaa 51234679  T
Q  144 agcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 180  Q
    ||||||||| |||||| |||| | ||| |||||||||    
T  51234680 agcatgttggttgtcataacatgctttttcatgtttg 51234716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 13582447 - 13582609
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    |||| |||| ||| |    
T  13582447 tcgtaaacacaacattcatggtcctaggagacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctctgtagaaggtcaacaattgttggtgctaggaaatc 13582546  T
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 180  Q
     ||| ||| |||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  13582547 aaaagtgt-aaaaacaaatggtataaaaacacgttgattgtcagaacacactttcttatgtttg 13582609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 179
Target Start/End: Original strand, 21552598 - 21552766
Alignment:
Q  14 ttctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacat----tgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtacta 109  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||    
T  21552598 ttcttgtaaacacaacattcatggacctaggagatatgatattacgtactatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagtctctgatgcta 21552697  T
Q  110 gaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 179  Q
    | |||| |||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||    
T  21552698 ggaaactgaaaatgtcaaaaataaatggtat-aaagcatgttgattgtcataatacattttcccatgttt 21552766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 181
Target Start/End: Original strand, 49017907 - 49018064
Alignment:
Q  20 taaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaa 119  Q
    ||||||||||||||||  |||||    ||||||||||  ||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  49017907 taaacacaacattcattgaccta----acatgacatttatatgcatgaccttttgaactttacgtagaagatcaacaacctcgggtgctaggaaaccgaa 49018002  T
Q  120 aatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgg 181  Q
    | ||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  49018003 agtgtaaaaaaaaaatggtataaaaacatgttgattgttagaacacactttctcatgtttgg 49018064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Original strand, 37992274 - 37992433
Alignment:
Q  21 aaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaa 120  Q
    |||||||||||||||| || || ||| ||||||||| || ||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  || || |||    
T  37992274 aaacacaacattcatgcacgtacgagtcatgacattactgtgcatgaccctt-gaactctttgtagaaggtcaacaacctctagtgctatgaagccaaaa 37992372  T
Q  121 atgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgg 181  Q
       ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  37992373 ccatcaaaagtaaatgatataaaatcatgttgattgtcagaacatgcttcctcatgtttgg 37992433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 104
Target Start/End: Original strand, 44781 - 44860
Alignment:
Q  25 acaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgg 104  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44781 acaacattcatggacctaggaaacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctgg 44860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 179
Target Start/End: Original strand, 4472996 - 4473160
Alignment:
Q  14 ttctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaa 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||||| |||||||||||| || ||  |||||| |||| ||    
T  4472996 ttctcgtaaacacaatattcatagacctaggagacatgaaattgctatgcatgattctttgaactttatgtagaaggttaagaa-ttctggtgctaggaa 4473094  T
Q  114 accgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 179  Q
     |||||| |||||||| |||||  ||||||| ||| ||||| || |||||||| ||| ||||||||    
T  4473095 gccgaaagtgtcaaaaacaaatagtataaaaacatattgatggttagaacacgctttttcatgttt 4473160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 25324966 - 25325130
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    |||||| ||||| ||||||| |  || || || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||| |    
T  25324966 tcgtaagcacaatattcatggatttaggaaacttgacattgctatgcatgatcatttgaactctatgtagaaggtcaacaatctatggtgctaggaaatc 25325065  T
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagc--atgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 179  Q
    |||| |||  |||||||||| ||||||| |  |||||||||| || || ||||||| | ||||||    
T  25325066 gaaagtgttgaaagcaaatggtataaaaacatatgttgattgccaaaatacgttttataatgttt 25325130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 4763963 - 4763888
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtc 92  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  4763963 ctcgtaaacacaacattcatggacc-aggagacatgacattgctatgcataaccttttgaactctatgtagaaggtc 4763888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 249
Target Start/End: Original strand, 29862090 - 29862149
Alignment:
Q  190 gcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  29862090 gcctctttcttcactaatactcccgcctgcctgaatatatcaaaaagtacatccctaaca 29862149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3376848 - 3376748
Alignment:
Q  80 tatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatata-aaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||| |||||||||||||| | || |||  ||||||||||| |||| | ||||| |||||||    
T  3376848 tatgtagaaggtcaacaacctctagtgctaggaaaccaaaaaagtcaaaagcaaatggtctataaaatatgttgattgtgagaatatgttttatcatgtt 3376749  T
Q  179 t 179  Q
    |    
T  3376748 t 3376748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 249
Target Start/End: Original strand, 53785995 - 53786061
Alignment:
Q  183 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  53785995 cacatgcgcttccttcttcactgatactcctgcccgtctgaatatatcaaaaagtacatccctaaca 53786061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 25094742 - 25094665
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaa 94  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||  ||| || |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  25094742 tcgtgaacacaacattcatggacttaaaagatattacattgctatgcatgaccatttgaactatatgtagaaggtcaa 25094665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 465049 - 464977
Alignment:
Q  19 gtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggt 91  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||| |||||||||  || |||||| ||||||||||||    
T  465049 gtaaacacaacattcatgaatctatgaaacataatattgttatgcatgactttatgaactatatgtagaaggt 464977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39583044 - 39582984
Alignment:
Q  189 cgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  39583044 cgcctccttcttcactgatactcccgccttattaagtatataaaaaattacatccctaaca 39582984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 164
Target Start/End: Original strand, 43123085 - 43123229
Alignment:
Q  20 taaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaa 119  Q
    ||||||||| ||| ||  |||||| |||||| | ||| ||||||| || | |||||||| | ||||||| |||||||| || |||| |||||||| | ||    
T  43123085 taaacacaatatttattgacctataagacataatatttctatgcacgaccctttgaactttttgtagaaagtcaacaaactatggtgctagaaaatcaaa 43123184  T
Q  120 aatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaaca 164  Q
    | ||||||  | ||||  ||||| | |||||||||||||||||||    
T  43123185 agtgtcaatcgtaaatagtataacaacatgttgattgtcagaaca 43123229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 52741326 - 52741266
Alignment:
Q  189 cgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  52741326 cgcctccttcttcactgatattcccgcccgtctgaatatatcaaaaattacatccctaaca 52741266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 249
Target Start/End: Original strand, 35236414 - 35236480
Alignment:
Q  183 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  35236414 cacatgcgcctccttcttcactcatactcccgcccgcctaaatatataaaaaagtacatccttaaca 35236480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 4669130 - 4669086
Alignment:
Q  54 attgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaac 98  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4669130 attgttatgcatgatcttctgaactctatgtagaaggtcaacaac 4669086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 180
Target Start/End: Original strand, 13772491 - 13772549
Alignment:
Q  122 tgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 180  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  13772491 tgtcaaacgcaaatggtataaaagtgtgttgattgatggaacacgttttctcatgtttg 13772549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 78
Target Start/End: Original strand, 3643092 - 3643149
Alignment:
Q  21 aaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaact 78  Q
    |||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  3643092 aaacacaacattcatggacctaaaaaacatgacattgttatgcatgatcctttgaact 3643149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 4669833 - 4669788
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatg 62  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  4669833 tcgtaaacacaacattcatggaccaaggagacatgacattgttatg 4669788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 94
Target Start/End: Original strand, 42206004 - 42206081
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaa 94  Q
    ||||||||||||| || ||| | ||| || |||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||    
T  42206004 tcgtaaacacaacgtttatggatctaggatacattacatttctatgcatgaccatttaaactctatgtagaatgtcaa 42206081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 196 - 249
Target Start/End: Original strand, 49018262 - 49018315
Alignment:
Q  196 ttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    |||||||| |||||||| ||| || | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  49018262 ttcttcaccgatactcctgcccgtctgaatatatcaaaaagcacatccctaaca 49018315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 46)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Original strand, 38815230 - 38815399
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |    
T  38815230 ctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaccctctggtgctaggaagc 38815329  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
     |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38815330 ggaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccac 38815399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Original strand, 24124967 - 24125132
Alignment:
Q  19 gtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccga 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| | |    
T  24124967 gtaaacacaacattcatggacctatgagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactttatgtagaaggccaacaacctctggtgctaggaaatcaa 24125066  T
Q  119 aaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggcca 184  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  24125067 aattgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagagcacgctttctcatgtttggcca 24125132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Original strand, 6592512 - 6592680
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  6592512 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacatta-tatgcatgaccttttgaactctatgcagaaggtcaacaacctctggagctaggaaac 6592610  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
     |||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  6592611 tgaaagtgtcaaaagcaaatggtttaaaatcatgttgattgtgagaacacgctttctcatgtttggccac 6592680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 185
Target Start/End: Original strand, 3187904 - 3188074
Alignment:
Q  14 ttctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||    
T  3187904 ttctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacataacattgctatgcataaccctttga-ctctatgtagaaggttaacaacctctgatgctaggaa 3188002  T
Q  114 accgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
     |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  3188003 gccgaaagtttcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgcttcctcatgttttgccac 3188074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 51 - 185
Target Start/End: Original strand, 500199 - 500332
Alignment:
Q  51 gacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgt 150  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  500199 gacattgatatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggccaaca-cctctcatactaggaaaccgaaaatgtcaaaagtaaatggtataaaagcatgt 500297  T
Q  151 tgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  500298 tgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 500332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 35740136 - 35739988
Alignment:
Q  37 aacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatg 136  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| |||||||||| |||     
T  35740136 aacctaggggacatgacattgttatgcatgactttttgaactctatgtagaaggtcaacaatctctggtgctaggaaactgaaagtgtcaaaagctaatt 35740037  T
Q  137 atataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  35740036 gtataaaaacatgttgattgtcagaacccgctttctcatgtttggccac 35739988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 179
Target Start/End: Original strand, 6618221 - 6618383
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||  |||| ||||    
T  6618221 ctcgtaaacataacattcatggacctatgagacatgacatta-tatgcatgaccttttgaacgctatgcaaaaggtcaacaatctctggagctaggaaac 6618319  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 179  Q
     |||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  6618320 tgaaagtgtcaaaagcaaatggtttaaaatcatgttgattgtgagaacacgctttctcatgttt 6618383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Original strand, 39434603 - 39434772
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||| ||||   |||||| | |||| ||      
T  39434603 ctcgtaaacacaacattcatggatctaagagacattacattgatatgcataaccctttggactctatgtagaagatcaaatgcctctgatgctaggaagt 39434702  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    | ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39434703 caaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccac 39434772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 22589507 - 22589395
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||    
T  22589507 ctcgtgaacacaacattcatagacctatgagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgta-aaagtcaacagcctctggtgctaggaaac 22589409  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaa 129  Q
    ||||| ||||||||    
T  22589408 cgaaagtgtcaaaa 22589395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 157
Target Start/End: Original strand, 37514157 - 37514298
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||     
T  37514157 ctcgtgaatacaacattcatggacctaagagacgtaacattgatatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggcgctaggaaat 37514256  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgt 157  Q
     |||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  37514257 tgaaagtgtcaaaagcaaatagtataaacgcatgttgattgt 37514298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 25021982 - 25021826
Alignment:
Q  19 gtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccga 118  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| | ||||||| | |||||||| | ||| || ||||||||||||||||| |||| || || |    
T  25021982 gtaaacacaacattcctggacctaggagatatgacattgttgtgcatgaccctttgaactttgtgtggatggtcaacaacctctggtgctaggaagccaa 25021883  T
Q  119 aaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcat 175  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  25021882 aaatgtcaaaagaaaatggtataaaaacatgttgattgtgagaacacactttctcat 25021826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 110
Target Start/End: Original strand, 3821160 - 3821254
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactag 110  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3821160 ctcgtaaacataacatttatgaacctaggagacatgacattgctatgcattaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggttctag 3821254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 185
Target Start/End: Original strand, 8882319 - 8882432
Alignment:
Q  71 tttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgtttt 170  Q
    ||||||||||||||  | | ||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  8882319 tttgaactctatgtgaatgttcaacaacctctggtgctagaaaactgaaagt-tcaaaaacaaatggtttaaaagcatattgattgtcagaacacgcttt 8882417  T
Q  171 ctcatgtttggccac 185  Q
    |||||||||||||||    
T  8882418 ctcatgtttggccac 8882432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 179
Target Start/End: Original strand, 28196130 - 28196291
Alignment:
Q  18 cgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccg 117  Q
    |||||||||||||| | || | ||| |||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||| ||  |     
T  28196130 cgtaaacacaacatccgtggatctaggagacatgacattgttgtgcatgatcctttgaactctacgtagatggtcaacaacctatggtgctaggaagaca 28196229  T
Q  118 aaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 179  Q
    ||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||    
T  28196230 aaagtgtcaaaaacaaatggtataaaaacatgtttattatcataacacactttctcatgttt 28196291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 185
Target Start/End: Original strand, 4073468 - 4073640
Alignment:
Q  14 ttctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||  || |||||||||||||||||||||    ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4073468 ttctcgtaaacacaacattcacggatcttggaaacatgacattgctatgcatgactcattgatttctctgtagaaggtcaacaacctctggtactaaaaa 4073567  T
Q  114 -accgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
       | ||| ||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||||    
T  4073568 tggcaaaagtgtcaaatgcaaattgtataaaatcatgttgattggtaaaacacgttttctcttgtttgaccac 4073640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 110
Target Start/End: Original strand, 18804549 - 18804642
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactag 110  Q
    |||||||||| |||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18804549 ctcgtaaacaaaacactc-tgaacctaggagtcatgacattgttatgcatgaccttttgaaatctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctag 18804642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 180
Target Start/End: Original strand, 8619805 - 8619914
Alignment:
Q  71 tttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgtttt 170  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||| || ||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| |||    
T  8619805 tttgagctctatgtcgaaagtcaacaacctctggtgttagaaagccaaaaatgttaaaaacaaatggtataaaagcacgttgattgtcaaaatacgcttt 8619904  T
Q  171 ctcatgtttg 180  Q
     |||||||||    
T  8619905 ttcatgtttg 8619914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 39671332 - 39671173
Alignment:
Q  27 aacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgt-c 125  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||  ||| ||||| | ||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||      
T  39671332 aacattcatggatctaggagacatgacatttttattcatgacccttttaactctacgtaaaaggttaacaacctctggtgctaggaagccgaaaatgtaa 39671233  T
Q  126 aaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    ||||  ||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||    
T  39671232 aaaaataaattgtataaaaacatgttaattgtcaaaacacgctttctctggtttggccac 39671173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 185
Target Start/End: Original strand, 8115779 - 8115916
Alignment:
Q  47 acatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagc 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||  |  || |||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||     
T  8115779 acatgacattgcaatgcatgatcctttgaactttatgtagaaggtcaacaacctctcat-ttaaaaaaccaaaagtgtcaaatgcaaatggtataaaagt 8115877  T
Q  147 atgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    || |||||| | |||||| | ||||| | ||||| ||||    
T  8115878 atattgattattagaacaagatttcttacgtttgaccac 8115916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Original strand, 43823927 - 43824053
Alignment:
Q  18 cgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccg 117  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||| | |||||  | | || || ||     
T  43823927 cgtaaacacaacattaatggatctcggagacatgacattgctatgcatgaccatttgaactctatgtgaaaggtcaatagcctctaatgcaaggaagcca 43824026  T
Q  118 aaaatgtcaaaagcaaatgatataaaa 144  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  43824027 aaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 43824053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 150
Target Start/End: Original strand, 3825572 - 3825705
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| |   |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||| || ||    
T  3825572 tcgtaaacacaatattcatggatctatgaaacatgacgttgctatgcattactctttgaattctgtgtagaaggtcaacaacctatggttctaggaagcc 3825671  T
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgt 150  Q
     ||  ||||| | |||||||  ||||||||||||    
T  3825672 aaaggtgtcacatgcaaatggaataaaagcatgt 3825705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 150
Target Start/End: Original strand, 3863286 - 3863387
Alignment:
Q  49 atgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcat 148  Q
    ||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || || ||| ||||| | |||||||  ||||||||||    
T  3863286 atgacattgctatgcactaccctttgaactctatgtagaaggtcaataacctctggtcctaggaagccaaaagtgtcacatgcaaatggaataaaagcat 3863385  T
Q  149 gt 150  Q
    ||    
T  3863386 gt 3863387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 9259462 - 9259377
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctct 102  Q
    ||||||| |||||||||||| || || || | |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9259462 tcgtaaatacaacattcatggacttaggatatatgacattgctatgcatgagtctgtgaactctatgtagaaggtcaacaacctct 9259377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 40223541 - 40223480
Alignment:
Q  49 atgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactag 110  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  40223541 atgacattgttatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctccggtgctag 40223480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 8540550 - 8540384
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctat---gtagaaggtcaacaacctctggtactagaaa 113  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||  | ||||||||||| || |||||| | |||||||| |||   |||||| |||||||||||||| |  ||||||    
T  8540550 tcgtaaacacaacatttatgaaaatagaaaacatgacattgttaagcatgaccctttgaactttattatgtagaaagtcaacaacctctgatgttagaaa 8540451  T
Q  114 accgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 180  Q
       |||| ||||||| ||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  8540450 gttgaaagtgtcaaatgcagatgacataaaaacatgtcgattgttagaacacattttctaatgtttg 8540384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 4699810 - 4699973
Alignment:
Q  19 gtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccga 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||| | |||||||| |||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||  || || |    
T  4699810 gtaaacacaacattcatggacctaggtgacataatattgctattcatg-acctttgaactttatatagaaggtcaacagcctctggtgctatgaagccaa 4699908  T
Q  119 aaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    || ||| || | |||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||||  || ||||||||||||||    
T  4699909 aagtgttaaca-caaatggtgtaaaaacatgttaattgtgagaacacg-cttatcatgtttggccac 4699973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 180
Target Start/End: Original strand, 10189581 - 10189643
Alignment:
Q  118 aaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  10189581 aaaatgtcaaatgcaaatgatataaaaacatgttgattgtcagaacatgctttctcttgtttg 10189643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 162
Target Start/End: Original strand, 6120947 - 6121045
Alignment:
Q  62 gcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcaga 161  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||  || ||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  6120947 gcatgaccttttgaactctttgtaggagatcaacgacctttggtactagaaaaccaaaagtgtcaaa--cacatgctataaaaacatgttgattgtgaga 6121044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 159
Target Start/End: Original strand, 36004069 - 36004201
Alignment:
Q  27 aacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtca 126  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |  ||| ||| ||||| | ||  |||||| | |||| |||||||||||||||||  ||| ||  | |||||||||    
T  36004069 aacattcatggacctatgagacataatgttgttatccatgacccttgaaactctttttagatggtcaacaacctctggtgataggaagtcaaaaatgtca 36004168  T
Q  127 aaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtca 159  Q
    || | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  36004169 aatgtaaatggtataaaaacatgttgattgtca 36004201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 249
Target Start/End: Original strand, 37517375 - 37517441
Alignment:
Q  183 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  37517375 cacaggcgcctccttcttcgctgatatttccgcctgtctgaatatatcaaaaagtacatccctaaca 37517441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 249
Target Start/End: Original strand, 39434953 - 39435019
Alignment:
Q  183 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  39434953 cacaggcgcctccttcttcactgatactcccgctcgcctgaatatatcaaaaagtacatccctaaca 39435019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 249
Target Start/End: Original strand, 500526 - 500579
Alignment:
Q  196 ttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  500526 ttcttcactgatactctcgcatgtctgaatatatcaaaaagtacatccctaaca 500579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 65
Target Start/End: Original strand, 24451057 - 24451105
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcat 65  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24451057 tcgtgaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcat 24451105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 42922192 - 42922140
Alignment:
Q  122 tgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctca 174  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  42922192 tgtcaaaggcaaatgatttaaaagcattttgattgtcaaaacacgttttctca 42922140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 121892 - 121805
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctg 103  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||   |||||||||||| ||||||||| ||||| |||| | ||||||| |||||||| |||||    
T  121892 ctcgtaaacacaacatccatggacttagatgacatgacattgatatgcatgatcttttaaactttgtgtagaatgtcaacaatctctg 121805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 65
Target Start/End: Original strand, 42659163 - 42659212
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcat 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  42659163 ctcgtaaacacaacattcatgaacctagaagacataatattgctatgcat 42659212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Original strand, 8882280 - 8882320
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacatt 56  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  8882280 ctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacatgacatt 8882320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 249
Target Start/End: Original strand, 24125320 - 24125380
Alignment:
Q  189 cgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    |||||| | ||||||| || |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24125320 cgcctcctacttcactaatgctcctgcccgtctaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 24125380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 10556456 - 10556295
Alignment:
Q  23 acacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaat 122  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||| | |||||||    |||||||||||| ||||  |||||   |||| || |||| ||  |  || |    
T  10556456 acacaacattcatgaac-tatgagccacgacattgttttgcatgactcattgaactctatgcagaatatcaactgtctctagtgctaggaagtcataagt 10556358  T
Q  123 gtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    ||||||  ||| | |||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  10556357 gtcaaatacaatttatataaaaacatgttgattttcagaatatgttttctcatgtttgaccac 10556295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 153
Target Start/End: Original strand, 27715339 - 27715421
Alignment:
Q  71 tttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttga 153  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| | || |||||| || |  ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  27715339 tttgaactctttttagaaggtcaacaacttatgatactaggaagctaaaaatatcaaacgtaaatggtataaaagcatgttga 27715421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 4097450 - 4097373
Alignment:
Q  80 tatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgt 157  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||  | ||||| ||||| | |||| ||||||||  |||||||||||    
T  4097450 tatgtagaaagtcaacaacctctgatgctagaaaggcaaaaatttcaaatgtaaatcatataaaaatatgttgattgt 4097373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 5329769 - 5329680
Alignment:
Q  20 taaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtacta 109  Q
    ||||||||||||| ||  || || ||||||||| |||| | | ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  5329769 taaacacaacattgatagacataggagacatgatattgttgtccatgaccctttgaactcaatgcagaaggtcaacaatctctagtacta 5329680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 43421403 - 43421302
Alignment:
Q  70 ttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttt 169  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| || || | ||| ||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||| |||||| |||||| |  |||||||    
T  43421403 ttttgagctctttttagaaggtcaataatctttagtattagaaaaccaaaagtgtcaaacaaaaatgatataaaaacatgttaattgtcggtgcacgttt 43421304  T
Q  170 tc 171  Q
    ||    
T  43421303 tc 43421302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 10950729 - 10950673
Alignment:
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctc 173  Q
    |||| ||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10950729 gaaagtgtcaaatgtaaatggtataaaagtatgttaattgttagaacacgttttctc 10950673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 10958734 - 10958678
Alignment:
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctc 173  Q
    |||| ||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10958734 gaaagtgtcaaatgtaaatggtataaaagtatgttaattgttagaacacgttttctc 10958678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 52
Target Start/End: Original strand, 24320273 - 24320309
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatga 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24320273 ctcgtaaacacaacattcatgaaccaatgagtcatga 24320309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 37)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4413231 - 4413068
Alignment:
Q  22 aacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaa 121  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||     
T  4413231 aacacaacattcatggacctaggagacatgactttgctatgcatgaccttttgaaccctatgtagaaggtcaacaatctctggtgctaggaaaccgaaag 4413132  T
Q  122 tgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4413131 tgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccac 4413068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Original strand, 17344574 - 17344743
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||    
T  17344574 ctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctatggtgctaggaaac 17344673  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
     |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  17344674 tgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtgaaaacacgttttctcgtgtttggccac 17344743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 41868079 - 41867910
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |    
T  41868079 ctcgtaaacacaacattcatggacctgggagacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaggaacc 41867980  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  41867979 cgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacatgctttctcatgtttgaccac 41867910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18745121 - 18744956
Alignment:
Q  20 taaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaa 119  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  18745121 taaacacaacattcatagacctaggaaatatgacattgctatgcatgatcttttgaactctatgtagaaggccaacagcctatggtgctagaaaatcgaa 18745022  T
Q  120 aatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  18745021 aatgtcaaaagcaaatggtataaaagtatgttgattgtcagaacacgctttctcgtgtttggccac 18744956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 9685580 - 9685417
Alignment:
Q  22 aacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaa 121  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||||| | |||     
T  9685580 aacacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatccatgaccttttgaactctatatagaaggtccacagcctctagtgctagaaaatcaaaag 9685481  T
Q  122 tgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9685480 tgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttttcatgtttggccac 9685417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 19161954 - 19161785
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    |||| |||||||  ||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | || ||||| ||  || |||||    
T  19161954 ctcgaaaacacactattcattgacctaggagacatgacattgatatgcatgaccttttgaactctatgtaaaaggtaagcagcctctagtgttacaaaac 19161855  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  19161854 cgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacacgctttttcatgtttgcccac 19161785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 186
Target Start/End: Original strand, 44686352 - 44686526
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| | |||| || |    
T  44686352 ctcgtaaacacaacattcacggacctaggagacataacattgctatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaaactctgatgctaggaagc 44686451  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatg----ttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccaca 186  Q
    ||||| |||||||||| ||  |||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44686452 cgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccaca 44686526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Original strand, 13413285 - 13413407
Alignment:
Q  14 ttctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaa 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||    
T  13413285 ttctcataaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctgctgcttgaaa 13413384  T
Q  114 accgaaaatgtcaaaagcaaatg 136  Q
    ||||||| |||||||| ||||||    
T  13413385 accgaaagtgtcaaaaacaaatg 13413407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 181
Target Start/End: Original strand, 28224940 - 28225101
Alignment:
Q  20 taaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaa 119  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||  |||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||| || |||||    
T  28224940 taaacacaacattcattgacctaggagacataatattgtcatgcataatcctttggactctatgtagaaggtcaacaacctctgaagctaggaagccgaa 28225039  T
Q  120 aatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgg 181  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  28225040 agtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaatacgctttctcatatttgg 28225101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 34814967 - 34814826
Alignment:
Q  38 acctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatga 137  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||| || |||||| |||| ||||||||||     
T  34814967 acctaagagacataacattgttatgcatgaccatttgaactctatgtagaaggtcaacagtctctggtgttaggaa-ccgaaagtgtcgaaagcaaatgg 34814869  T
Q  138 tataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34814868 tataaaagcatattgattgtcagaacacgctttctcatgtttg 34814826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 20142874 - 20142753
Alignment:
Q  38 acctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatga 137  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||| ||| ||||||||| |||||     
T  20142874 acctaggagacatgacattgttatgtatgaccttttgaactctatgtataaggtcaacaacctttgatgctagaaaaccaaaagtgtcaaaagaaaatgg 20142775  T
Q  138 tataaaagcatgttgattgtca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20142774 tataaaagcatgttgattgtca 20142753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 5532360 - 5532524
Alignment:
Q  19 gtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccga 118  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| || |  |    
T  5532360 gtaaacaca-cattcatgaacttaggagtcatggcattgttgtgcatgaccctttgaactctatgtagaagctcaacaacctatggtgctaggaagct-a 5532457  T
Q  119 aaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    || ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  5532458 aagtgtcaaaagtaaatagtataaaagcatgttgattgtcacaacacgttttctcatgtttgaccac 5532524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 2886781 - 2886637
Alignment:
Q  20 taaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaa 119  Q
    ||||||||||||| ||| ||| | |||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| | || | ||||||||    
T  2886781 taaacacaacatttatggacc-acgagatatgatattgctatgcatgctcttttgaactctatgtaaaagatcaacagcctctgatgcttggaaaccgaa 2886683  T
Q  120 aatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacac 165  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2886682 aatatcaaaaacaaatgatataaaaacatgttgattgtcagaacac 2886637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16352014 - 16351843
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || | | ||    
T  16352014 tcgtaaacataatattcatgtacctaagagacatgacattgttgtgcatgaccatttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgataaagagcc 16351915  T
Q  117 ---gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
        |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16351914 aaacaaaatgtcaaaagcaaacaatataaaattatgttgattgtgagaacacattttctcatgtttgaccac 16351843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 7761015 - 7760848
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    |||||| |||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  7761015 tcgtaagcacatcattcttgaacttatgagacatcacattgctacgcatgatcctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgatagaaaacc 7760916  T
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
     ||  |||| || ||||||  ||  |||  ||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  7760915 aaaggtgtctaatgcaaatcgtaagaaaatatg-tgattgttagatcacgttttctcatgattggccac 7760848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 32029256 - 32029108
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||    | | || |     
T  32029256 tcgtaaacacgatattcatgatcctataagacatgacattgttatggatgactctttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctgaagttgggaagct 32029157  T
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacac 165  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  32029156 gaaagtgtcaaaaacaaatgatatgaaagcatgttgattgtctgaacac 32029108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23485104 - 23484940
Alignment:
Q  19 gtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccga 118  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||    | |||||| |||| |||| ||    
T  23485104 gtaaacacaacgttcatggacctaggagacatagcattgttatgcatgatcttttgaactctatgtaagaagtcattgtc-tctggtgctaggaaacaga 23485006  T
Q  119 aaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  23485005 ag-tgtcaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacatgctttctcatatttggccac 23484940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 185
Target Start/End: Original strand, 2888480 - 2888621
Alignment:
Q  44 gagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaa 143  Q
    |||| ||||||||| | |||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||  ||| || || ||| ||||| || | |||| ||||||    
T  2888480 gagatatgacattgttgtgcatgacattttgaaccttgtgtagaaggtcaacaacctcttgtgttaggaagccaaaagtgtcataaacgaatggtataaa 2888579  T
Q  144 agcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2888580 aacatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgtccac 2888621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Original strand, 27502299 - 27502467
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||||||||| | | |||| | |||||||||||||||||||   | || | |||| ||  |    
T  27502299 tcgtaaacacaacattcatagatctaggagacatgatattgctatgcataaccctttggattctatgtagaaggtcaacagtatatgatgctaggaagtc 27502398  T
Q  117 gaaaatgtc-aaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    |||| |||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27502399 gaaagtgtcaaaaagcaattg-tataaaagcatgttgtttgtcggaacacgttttctcatgtttgaccac 27502467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 13147270 - 13147099
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||  ||||| ||||||| | |||| || | |||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  13147270 tcgtaaatacaatattcatgaacttagaagacaagacattgttgtgcacgaccctttgtactatatgaagaaggtcaacaatctctggtgttagaaaacc 13147171  T
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagc---atgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
     ||| |||||||| |||||| |||||||     ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13147170 aaaagtgtcaaaatcaaatggtataaaaagtatatgctgattgtcagaacacgctttctcatgtttgaccac 13147099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 160
Target Start/End: Original strand, 3825666 - 3825806
Alignment:
Q  20 taaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaa 119  Q
    ||||||||||||| |||  ||||  |||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||||||||| || | |||| |||  |||    
T  3825666 taaacacaacatttatggtcctagaagacatgacattgctatgcatgattctttgaactcgatgttgaaggtcaacaacctttgatgctaggaaattgaa 3825765  T
Q  120 aatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcag 160  Q
    | ||||  |||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  3825766 agtgtctgaagcaaatgaaataaaaacatgtagattgtcag 3825806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 33612711 - 33612555
Alignment:
Q  21 aaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||   || | | |||||||  ||||||| |||||||||||| |||  ||| || || |||    
T  33612711 aaacacaacattcatggacctaggggacaagacattgctatgagcgaccctctgaactc--tgtagaatgtcaacaacctccggtgttaggaagccaaaa 33612614  T
Q  121 atgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 179  Q
     |||||||  |||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33612613 gtgtcaaatacaaattgtataaaatcatgttgattgtcaaaacacgttttctcatgttt 33612555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 184
Target Start/End: Original strand, 44720257 - 44720427
Alignment:
Q  15 tctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaa 114  Q
    |||||||||||||  ||| ||| |||||||||| |  | |||| ||||||||| | |||||||| |||||| || || |||||||||||||  ||| ||     
T  44720257 tctcgtaaacacattatttatggacctatgagataaaatattgttatgcatgatcctttgaactttatgtaaaaagtgaacaacctctggtgttaggaag 44720356  T
Q  115 ccgaaaa-tgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggcca 184  Q
    |  |||| ||| |||  |||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  44720357 caaaaaaatgttaaattcaaacggtataaaaacatgttgattgtcataacacgttttttcatgtttggcca 44720427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11921326 - 11921218
Alignment:
Q  71 tttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgtttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || || ||| ||||||  |||| | | |||| |||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11921326 tttgaactctatgtagaaggtcaacagtctatgataccagaaaattgaaagtataaaaaacaaacggtataaaaatatgttgattgtcagaacacgtttt 11921227  T
Q  171 ctcatgttt 179  Q
    || ||||||    
T  11921226 ctaatgttt 11921218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4412880 - 4412821
Alignment:
Q  190 gcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4412880 gcctccttcttcactgatattcccgcccgtttgaatatatcaaaaagtacatccctaaca 4412821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 249
Target Start/End: Original strand, 17344924 - 17344990
Alignment:
Q  183 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  17344924 cacaggcgcctccttcttcactgatactcctgcccgtctgaatatatcaaaaagtacatccctaaca 17344990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20142555 - 20142495
Alignment:
Q  189 cgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  20142555 cgcctccttcttcactgatattcccgcccgtctgaatatatcaaaaagtacatccctaaca 20142495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 44685031 - 44684955
Alignment:
Q  14 ttctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaagg 90  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||| | |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  44685031 ttctcataaacacaacattcatggacttataagacataatattgttatgcatgaccctttgaactctatgtagaagg 44684955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 181
Target Start/End: Original strand, 29808070 - 29808175
Alignment:
Q  75 aactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctca 174  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | | |||| |||   | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||| | |||||    
T  29808070 aactctatgtaaaaggtcaacaacctccgatgctaggaaataaataatgtgaaaagcaaatggtataaaa-catgttgattgttataacacgctgtctca 29808168  T
Q  175 tgtttgg 181  Q
    |||||||    
T  29808169 tgtttgg 29808175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 3968544 - 3968411
Alignment:
Q  52 acattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgtt 151  Q
    |||||| ||||| ||| | |||||||| | | |||||||| ||||| ||| | |||||  ||  | ||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||    
T  3968544 acattgttatgcgtgatcctttgaactttttatagaaggttaacaaactcagatactatgaagtcaaaaatgtcaaacgcaaattgtataaaagcatatt 3968445  T
Q  152 gattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||| ||||    
T  3968444 gattgtcaaaacatgttttctcatatttgaccac 3968411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 8036633 - 8036566
Alignment:
Q  38 acctatgagacatgacattgctat--gcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctg 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |||  |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8036633 acctaggagacatgacattgatatatgcataaacctttgaactctatgtaaaaggtcaacaacctctg 8036566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 41867722 - 41867663
Alignment:
Q  190 gcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  41867722 gcctccttcttcactgatattcccgcccgtatgaatatatcaaaaagaacatccctaaca 41867663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 191 - 241
Target Start/End: Original strand, 44686712 - 44686762
Alignment:
Q  191 cctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacat 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  44686712 cctccttcttcactgatactcccgcccgtctgaatatatcaaaaagtacat 44686762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9685229 - 9685170
Alignment:
Q  190 gcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  9685229 gcctccttcttcactaatacttccgcccgtctgaatatatcgaaaagtacatccctaaca 9685170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 1296099 - 1296053
Alignment:
Q  138 tataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggcca 184  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1296099 tataaaaacatgtttattgtcagaacatattttctcatgtttggcca 1296053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 249
Target Start/End: Original strand, 27502647 - 27502713
Alignment:
Q  183 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  27502647 cacaggcgcctccttcttcagtgatactcccgctcacttgaatatatcaaaaagtacatctctaaca 27502713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 196 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18744762 - 18744709
Alignment:
Q  196 ttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    ||||| ||||||||||| ||| || | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18744762 ttctttactgatactcctgcccgtctgaatatatcaaaaagtatatccctaaca 18744709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 185
Target Start/End: Original strand, 6279 - 6439
Alignment:
Q  25 acaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgt 124  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||| |||    
T  6279 acaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaggaaactgaaagtgt 6378  T
Q  125 caaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6379 caaaagcaaatggtatagaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccac 6439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Original strand, 22346831 - 22347000
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22346831 ctcgtgaacacaacattcataaacctaggagacatgacatttctatgcatgaccttttgaactctgtgtagaaggtcaacaacctctgctactaggaaac 22346930  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22346931 cgaaagtgtcaaaagcaaaaggtataaacgcatgttgattgtcagaacacgctttctcatatttggccac 22347000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 184
Target Start/End: Original strand, 21472949 - 21473107
Alignment:
Q  26 caacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtc 125  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| | || ||||    
T  21472949 caacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaggaaactgcaagtgtc 21473048  T
Q  126 aaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggcca 184  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21473049 aaaagcaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggcca 21473107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 29169936 - 29169795
Alignment:
Q  44 gagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaa 143  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29169936 gagacatgacattgctgtgcatgaccttttgaactctatgtagaaggttaacaacctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaa 29169837  T
Q  144 agcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29169836 agcatgttgattgtcagaacacgttttctcgtgtttggccac 29169795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 45659817 - 45659650
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||  ||| |||     
T  45659817 ctcgtaaacacgacatttattgacctaggagacatgacattgctatgcatgatcttttgaactctat--agaaggtcaacagcctctggtgataggaaat 45659720  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  45659719 cgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcgtgtttggccac 45659650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 28041290 - 28041129
Alignment:
Q  24 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatg 123  Q
    ||||||||||||| || ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  28041290 cacaacattcatggacttagaggacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaaccgcctctggtgctaggaaaccgaaagtg 28041191  T
Q  124 tcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  28041190 tcaaaagcaaatggtataaaaacctgttgattgtcagaacacactttctcatgtttggccac 28041129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Original strand, 34644503 - 34644671
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||    
T  34644503 tcgtaaacacaacattcatggacctaggagacataacattgatatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagcc 34644602  T
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34644603 gaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaagcatgtaggttgtcagaacacgctttctcatgtttggccac 34644671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 20259964 - 20259809
Alignment:
Q  20 taaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaa 119  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  20259964 taaacacaacatttattaacttatgagacatgacattactatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaagaaaccgaa 20259865  T
Q  120 aatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcat 175  Q
    | |||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20259864 agtgtcaacaataaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacacgctttctcat 20259809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 185
Target Start/End: Original strand, 2898642 - 2898810
Alignment:
Q  20 taaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaa 119  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  2898642 taaacacaacattcatgatcgtatgagacatgatattgttatgcatgatcttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccgaa 2898741  T
Q  120 aatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacg----ttttctcatgtttggccac 185  Q
    | | ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  2898742 agtatcaaaagcaaatggtataaaaac-tattgattgtcagaacacgctcactttctcatgtttggccac 2898810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 31737493 - 31737325
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||||||||| | ||||||| | ||| || |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||  | ||||||||     
T  31737493 ctcgtaaacacta-attcatggatctaggaaacataacattgatatgcatgaccttttgaactctatgtagaatgtcaatagcctctaatgctagaaaat 31737395  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  31737394 cgaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaatatgttttctcatgtttggccac 31737325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Original strand, 2764416 - 2764584
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||| | ||||| | | |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||| || |     
T  2764416 tcgtaaacacaacatttatggacctaagagacataacattgatttgcataaccctttggactttatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagct 2764515  T
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    |||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2764516 gaaagtgtcaaaagaaaatggcataaaagcatgttgattgtcggaacacgttttctcatgtttgaccac 2764584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 24177682 - 24177540
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||| ||||    
T  24177682 ctcgtgaacacaacattcatggacctaggagatatgacattgctatgcatgactttttgaactctatgtagaaggtaaacagcctctgatgctaggaaac 24177583  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtc 158  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||    
T  24177582 cgaaactgtcaaaaacaaatggtataaaaatatgttgattgtc 24177540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 4862160 - 4861996
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||| | ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||| |||     
T  4862160 ctcgtaatcacaacattcatggatctaagggacgtgacattgttatgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacttttggtgttaggaaat 4862061  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 180  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  4862060 cgaaagtgtcaaaagcaaattgtataaaagtatgttgcttgtcagaagacgctttctcatgtttg 4861996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 175
Target Start/End: Original strand, 38731544 - 38731704
Alignment:
Q  15 tctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaa 114  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||     
T  38731544 tctcgtaaacacaatattcatggacctaggagtcatgacattattgtgcatgaccctttgaactctatgtagaaggttaacaacctctggtgctaagaag 38731643  T
Q  115 ccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcat 175  Q
    || ||| | ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38731644 ccaaaagtttcaaaagcaaattgtataaaagtatgttgattgtcagaacacgctttctcat 38731704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 98 - 185
Target Start/End: Original strand, 19035465 - 19035552
Alignment:
Q  98 cctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19035465 cctctggtgctaggaaaccgtaagtgtcaaaagtaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccac 19035552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 50314740 - 50314626
Alignment:
Q  71 tttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgtttt 170  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||| |||   ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  50314740 tttgaactctatgtagaaagtcaacaacatcttgtgttaggaaataaaaaatgtcaaaagtaaatggtataaaagcatgttgattgtgagaacaagtttt 50314641  T
Q  171 ctcatgtttggccac 185  Q
     ||||||||| ||||    
T  50314640 gtcatgtttgaccac 50314626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 151
Target Start/End: Original strand, 47459616 - 47459753
Alignment:
Q  14 ttctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  || || ||||||| ||||||||||||||   | |||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||    
T  47459616 ttctcgtaaacacaacatttatagacttaggagacataacattgctatgcatattcctttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatactaggaa 47459715  T
Q  114 accgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgtt 151  Q
     || ||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  47459716 gccaaaagtatcaaaagcaaatggtataaaaacatgtt 47459753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 183
Target Start/End: Original strand, 42919832 - 42919962
Alignment:
Q  52 acattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgtt 151  Q
    |||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  | || | ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  42919832 acattgctctgcatgaccctttaaactctatgtagaaggttaacaatctctactgcttggaaatcaaaagtgtcaaaagcagatgacataaaaacatgtt 42919931  T
Q  152 gattgtcagaacacgttttctcatgtttggcc 183  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  42919932 gattgtgagaacacg-tttctcatgtttggcc 42919962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18616322 - 18616162
Alignment:
Q  18 cgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccg 117  Q
    |||||| |||| ||| ||| ||||| || |||| | |||||||||||||| | |||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||  ||    
T  18616322 cgtaaatacaatatttatggacctaagatacataatattgctatgcatgaccctttgaattatatgtagaatgtcaacagcctcgggtgctagaaagtcg 18616223  T
Q  118 aaaatgtcaaaagcaaatgatataaaa-gcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtt 178  Q
    ||| ||| |||| |||||| |||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18616222 aaagtgttaaaaacaaatggtataaaacacatgttgattatc-gaacacgttttctcatgtt 18616162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 164
Target Start/End: Original strand, 7213187 - 7213335
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||  |||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||  ||||  | |||| |||||    
T  7213187 tcgtgaacacaacattcatggacctagaagacatgacattattatgcatgacattttgaactttatgcagaagctcaacagtctctaatgctaggaaacc 7213286  T
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatat-aaaagcatgttgattgtcagaaca 164  Q
    |||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  7213287 gaaagtgtcaaaaataaatgatataaaaaacatgttaattatcagaaca 7213335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 50161591 - 50161419
Alignment:
Q  20 taaacacaacattcatgaacctatgag-----acatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaa 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |     ||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||  |     
T  50161591 taaacacaacattcatggacctatgtgtcgtaacatg-cattgctctgcatgatcctttgaactctatgtagaatgtcatcaacctttggtgctagggag 50161493  T
Q  115 ccgaaaatgtc---aaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    || ||| | |    ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  50161492 ccaaaagtatataaaaaaaaaaatgatataaaagcatgttgattgtgagaacacgctttctcatgtttgtccac 50161419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 37932366 - 37932239
Alignment:
Q  38 acctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatga 137  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||| |||| || |||||| ||| ||||   ||| |    
T  37932366 acctatgagacatgacattactatgcacgaatgtttaaactcaatatagaatgtcaacatcctctggtgctaggaagccgaaagtgtaaaaaaataataa 37932267  T
Q  138 tataaaagcatgttgattgtcagaacac 165  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||    
T  37932266 tgtaaaaacacgttgattgtcagaacac 37932239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 185
Target Start/End: Original strand, 16500034 - 16500139
Alignment:
Q  80 tatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 179  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||| ||  | ||| ||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||| || |||    
T  16500034 tatgtagaaggtcaacagcctctaatgctaggaagtcaaaagtgtcaaaagcaaatagtataaaggcatgttaattgttagaacatgttttcttatattt 16500133  T
Q  180 ggccac 185  Q
    ||||||    
T  16500134 ggccac 16500139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 180
Target Start/End: Original strand, 15584912 - 15584974
Alignment:
Q  118 aaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 180  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  15584912 aaaatgtcaaacgcaaatggtatagaaacatgttgattgtcagaatacgttttccaatgtttg 15584974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 111 - 185
Target Start/End: Original strand, 36486917 - 36486991
Alignment:
Q  111 aaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  || |||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||    
T  36486917 aaaaccaaaagtgtcaaaagcaaattatataaaaagatattgattgtcaaaacacgctttctcatatttgaccac 36486991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28040942 - 28040882
Alignment:
Q  189 cgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||  || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28040942 cgcctccttcttcactgatattctcgcacgtctaaatatatcaaaaggtacatccctaaca 28040882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 247
Target Start/End: Original strand, 34644852 - 34644916
Alignment:
Q  183 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaa 247  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||    
T  34644852 cacacgcgcttccttcttcactgatactcccgccctcctgaatatatcaaaaagtacatccctaa 34644916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 35387799 - 35387747
Alignment:
Q  44 gagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaaca 96  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  35387799 gagacatgacattgatatgcatgtccctttgaactctatgtagaagatcaaca 35387747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 868560 - 868513
Alignment:
Q  30 attcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaac 77  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  868560 attcatggacttaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaac 868513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29169615 - 29169553
Alignment:
Q  183 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccct 245  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||  ||| || | ||||||||||||| |||||||||    
T  29169615 cacaggcgcctccttcttcactgatactcatgcccgtctgaatatatcaaaaaatacatccct 29169553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 35550242 - 35550100
Alignment:
Q  20 taaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaa 119  Q
    ||||||||||||| || ||| || | ||||| |||||| ||| ||||| | ||| |||||| | ||||||| ||||||||| | || |||| || || |     
T  35550242 taaacacaacattaataaacataagggacataacattgttatacatgatcctttaaactctttttagaaggccaacaacctatagtgctaggaagccaag 35550143  T
Q  120 aatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaa 162  Q
    | ||||||| | |||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  35550142 agtgtcaaacgtaaataatatagaattatgttgattgtcagaa 35550100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 185
Target Start/End: Original strand, 23043929 - 23043982
Alignment:
Q  132 aaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  23043929 aaatggtataaaagcatgttgattgtgagtacttgttttctcatatttggccac 23043982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Original strand, 33186 - 33355
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  33186 ctcgtaaacacgacgttcatggacctaggagacataaaattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgttaggaaac 33285  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  33286 cgaaaatgtcaaaagtaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttagccac 33355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Original strand, 959517 - 959685
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  959517 ctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacacaacattgctatgcatgaccttttgaact-tacgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaac 959615  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  959616 cgaaaatgtcaaaaacaaatggtataaagacatgttgattgtcagaacacgttttctcatggttagccac 959685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4206767 - 4206598
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||||||||| | ||||||  ||||| | ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  4206767 ctcgtaaacactatattcattgacctaggtgacatgacattgtcatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaacc 4206668  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4206667 cgaaagtgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttcattgtcagaacacgctttctcatgtttagccac 4206598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4166093 - 4165924
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||||||||| | ||| ||  ||||| | ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  4166093 ctcgtaaacactatatttattgacctaggtgacatgacattgtcatgcatgaccttttaaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaacc 4165994  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4165993 cgaaagtgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttagccac 4165924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 45819 - 45684
Alignment:
Q  45 agacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaa 144  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||  ||||||    
T  45819 agacataacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaagaaaccgaaagtgtcaaaaacaaatggaataaaa 45720  T
Q  145 gcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45719 gcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 45684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17249476 - 17249307
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||| | | |||| ||||||||||||||||||||  |||||| | |||| || |    
T  17249476 ctcgtaaacacaacattcatgaacttaggagacataacattgctatacataatcctttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctaggaagc 17249377  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  17249376 caaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacactttctcatgtttggccac 17249307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 181
Target Start/End: Original strand, 34304432 - 34304597
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaact-tttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaa 114  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||| | |||| ||     
T  34304432 ctcgtaaatacaacattcatagacctatgagacatgatattgctatgcat-aactctttggactctatgtagaaggtcaacatcatctgatgctaggaag 34304530  T
Q  115 ccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgg 181  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34304531 cccaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttgg 34304597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 33220881 - 33220713
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  |||||  |||||||||||||| | | |||| ||| |||||||||||||||||||||| | | |||| || ||    
T  33220881 tcgtaaacgcaacattcatggacctagaagacacaacattgctatgcataaccctttggactatatgtagaaggtcaacaacctcggatgctaggaagcc 33220782  T
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  33220781 gaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcaacacacgctttctcatgtttggccac 33220713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 29338247 - 29338084
Alignment:
Q  19 gtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccga 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||||||| | |||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||| ||  |      
T  29338247 gtaaacacaacattcatggacctaggagtcatgacattgatgtgcatgaccctttgaaccatatgtagaaggtcaacgatctctggtgctaggaagtcag 29338148  T
Q  119 aaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggc 182  Q
    || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29338147 aagtgtcaaaagcaaatggtataagagcatgttgattgttagaacacgttttctcatgtttggc 29338084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 28625869 - 28626036
Alignment:
Q  18 cgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccg 117  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||  |    
T  28625869 cgtaaacacaacattcatagacctatgagatatgacat-gttatgcatgaccttttgaactttatgtagaagctcaacaacctctggtgctaggaaattg 28625967  T
Q  118 aaaatgtcaaaagcaaatgatat-aaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    ||| ||| |||| |||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  28625968 aaagtgtaaaaaacaaatggtataaaaaaaatgttgattgtcagaacacgttttctcgtgtttagccac 28626036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 34554447 - 34554283
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | | |||||| |||| || |    
T  34554447 ctcgtaaacacaaaattcatga-cttacgagacatgatattgctatacatgaccttttaaactctatgtagaaagtcaatagcatctggtgctaggaagc 34554349  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgg 181  Q
    ||||  ||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  34554348 cgaatgtgtcaaaagtaaatggtataaaaacatcttgattatcagaacacgctttctcatgtttgg 34554283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 357886 - 357719
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||| | | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||  |  ||| ||| |    
T  357886 tcgtaaacacaacattcatggacctaggagagataacattgctatgcttaatcatttggactctatgtagaaggtcatcaacctctaatgttaggaaa-c 357788  T
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
     ||| ||| |||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  357787 aaaagtgttaaaaacaaaggttataaaagcatgttcattgtcagaacacgctttctcatgtttggccac 357719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 184
Target Start/End: Original strand, 34415404 - 34415540
Alignment:
Q  48 catgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagca 147  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  | | ||||  ||| ||||| ||| |||||||| ||||||  |||||||||    
T  34415404 catgacattgctatgcatgaccatttgaactctatatagaaggtcaactgcatttggtgttaggaaacctaaagtgtcaaaaacaaatggcataaaagca 34415503  T
Q  148 tgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggcca 184  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  34415504 tgttgattgtcagaacacactttctcatgtttcgcca 34415540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 24016274 - 24016437
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    ||||||||| || ||| ||| || || |||||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||||| ||  |||||||| |||||| |||| |||||    
T  24016274 tcgtaaacataatatttatgtacttaggagacatgacattcttgtgcatgaccctttgaactctatgtaaaaaatcaacaacatctggtgctaggaaacc 24016373  T
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 180  Q
     ||| | |||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  24016374 aaaactatcaatagcaaatggtataaaaacatgttgattgtgagaacaagctttctcatgtttg 24016437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 96
Target Start/End: Original strand, 32115655 - 32115734
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaaca 96  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  32115655 tcgtaaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctttgtagaaggtcaaca 32115734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 3714858 - 3715016
Alignment:
Q  21 aaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaa 120  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||| |||| |  || |||| |||  ||  | |||    
T  3714858 aaacacaacattcatggatttatgagacatgacattgttgtgcatgattctttaaactctatgtagaagatcaagagtctttggtgctaagaagtcaaaa 3714957  T
Q  121 atgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 179  Q
     |||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3714958 gtgtcaaaaacagatgatataaaaacatgttaattgtgagaacacgttttctcatgttt 3715016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 249
Target Start/End: Original strand, 32115975 - 32116041
Alignment:
Q  183 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32115975 cacatgcgcctctttcttcactgatactcccgcccgtcaaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 32116041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26225705 - 26225597
Alignment:
Q  61 tgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcag 160  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || ||||||| || |||||||||||   || || || ||||||||||||||||||||    
T  26225705 tgcatgagcctttgaactctatgttgaaggccaacaacatctagtgctagaaagccaaaaatgtcaaacataactggtaaaaaagcatgttgattgtcag 26225606  T
Q  161 aacacgttt 169  Q
    |||| ||||    
T  26225605 aacatgttt 26225597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 3137418 - 3137367
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatga 67  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3137418 ctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatga 3137367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 13398352 - 13398205
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||  || | |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||| ||  |    
T  13398352 tcgtaaacacaacatttatgcatctagaagtcgtgacattgttatgcatcatcttttgaactctatgtagaatgtcaacaacttctgatgttaggaagtc 13398253  T
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaaca 164  Q
     ||||| ||||||| ||||  |||||||  |||||||||||| |||||    
T  13398252 aaaaatatcaaaagtaaatagtataaaaatatgttgattgtcggaaca 13398205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 357538 - 357472
Alignment:
Q  183 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  357538 cacaagggcctccttcttcactgatactcccgcccgcctgaatatatcaaaaagtacatccctaaca 357472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 31703632 - 31703561
Alignment:
Q  24 cacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaac 95  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  31703632 cacaatattcatgaaccaatgagacatgatattgatgtgcatgatcatttaaactctatgtagaaggtcaac 31703561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 185
Target Start/End: Original strand, 34168913 - 34168973
Alignment:
Q  125 caaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||| | ||||||||||||||||||    
T  34168913 caaaagcaaatggtataaaagcatgttgcttgtccaaacatgctttctcatgtttggccac 34168973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 32 - 174
Target Start/End: Original strand, 22985873 - 22986015
Alignment:
Q  32 tcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagc 131  Q
    ||||||||||| |||| || |||| |||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| || |  |||  | || |||||||||||  |    
T  22985873 tcatgaacctaagagatataacatggctatgtatgaccttttggactctatatagaaggtaaacaacctatgatgttaggtagccaaaaatgtcaaacac 22985972  T
Q  132 aaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctca 174  Q
    || |  |||||||| | |||||||| || |||| |||||||||    
T  22985973 aagtagtataaaagtacgttgattgccataacatgttttctca 22986015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 32 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23802521 - 23802379
Alignment:
Q  32 tcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagc 131  Q
    ||||||||||| |||| || |||| |||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| || |  |||  | || |||||||||||  |    
T  23802521 tcatgaacctaagagatataacatggctatgtatgaccttttggactctatatagaaggtaaacaacctatgatgttaggtagccaaaaatgtcaaacac 23802422  T
Q  132 aaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctca 174  Q
    || |  |||||||| | |||||||| || |||| |||||||||    
T  23802421 aagtagtataaaagtacgttgattgccataacatgttttctca 23802379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 28009160 - 28008994
Alignment:
Q  14 ttctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaa 113  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| ||||| ||| |||||||||| | || |||| | |||||||| |||  |||||||||||||| | ||||  |   ||    
T  28009160 ttctggtaaagacaacgttcatggacctaggagtcatgacattgttgtgtatgaccctttgaactatatacagaaggtcaacaacttttggtgtt---aa 28009064  T
Q  114 accgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagca---tgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 180  Q
     || ||| ||||||||||||||| ||||||| ||   | |||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  28009063 gccaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaccatattcttgattgttagaacaagctttctcatgtttg 28008994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45484 - 45424
Alignment:
Q  189 cgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  45484 cgcctccttcttaactgatattcccgcccgtcagaatatatcaaaaagtacatccctaaca 45424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4206410 - 4206351
Alignment:
Q  190 gcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |  || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  4206410 gcctccttcttcactgatattcccacacgtctgaatatatcaaaaagtacatccctaaca 4206351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 185
Target Start/End: Original strand, 6225077 - 6225177
Alignment:
Q  85 agaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggcca 184  Q
    |||||||||| | | ||||||  ||||||  | ||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||    
T  6225077 agaaggtcaagagcatctggtgatagaaaggcaaaagtgtcaaacacaaatgacatataagcatgttgattgtcacaacaaaatttctcatgtttgacca 6225176  T
Q  185 c 185  Q
    |    
T  6225177 c 6225177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 185
Target Start/End: Original strand, 28543412 - 28543480
Alignment:
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    |||| |||||||| |||||  ||||| |||||  ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  28543412 gaaagtgtcaaaatcaaatagtataagagcatagtgattttcaaaacacgatttctcatgtttggccac 28543480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Original strand, 103042 - 103209
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  103042 ctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacacgacattgttatgcatgaccttttgagctcgatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaggaaac 103141  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggcca 184  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  103142 cgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcag-acacgctttctcgtgtttggcca 103209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 32269968 - 32269799
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || |||| |||     
T  32269968 ctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaacttcatgcagaaggtcaacaacctctagtgctaggaaat 32269869  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  32269868 cgaaagtatcaaaagcaaatggtataaaagcgtgttgattgtcagaacacactttctcatgtttgaccac 32269799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 42921637 - 42921802
Alignment:
Q  19 gtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccga 118  Q
    |||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  42921637 gtaaacacaatatt-atggacttaggagacatgacattgttatgcatgaccttctgaactctatgtagaaggccaacaacctctggtgctaggaaaccga 42921735  T
Q  119 aaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  42921736 aagtgtcataagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcgtgtttgaccac 42921802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 37873805 - 37873640
Alignment:
Q  20 taaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaa 119  Q
    ||||||||||||||||  |||||  || |||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||    
T  37873805 taaacacaacattcatagacctagaagtcatgacattgttctgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaagccaaa 37873706  T
Q  120 aatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37873705 agtgtcaaaagcaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccac 37873640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 13167080 - 13166912
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||  ||||| | |||| || ||    
T  13167080 tcgtaaacccaacattcatggacctaggagacataccattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaacagtctctgatgctaggaagcc 13166981  T
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  13166980 gaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttagccac 13166912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 185
Target Start/End: Original strand, 35310382 - 35310553
Alignment:
Q  14 ttctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||  | | |||| |||||||||||||||| |||| |||||| | | || ||    
T  35310382 ttctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacataacattgatatgcaaaaccctttggactctatgtagaaggttaacagcctctgatgccaggaa 35310481  T
Q  114 accgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
     |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  35310482 gccgaaagtgtcaaaagcagatggtataaaagcatgttgattgtcagaacatgctttctcatgtttggccac 35310553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15292192 - 15292028
Alignment:
Q  20 taaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaa 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||||| || |||||||||  ||    
T  15292192 taaacacaacattcatggacctaggagatgtgacattgctatgcatgaccttttgaacttt-tgtagaagatcaataacctctagtgctagaaaactaaa 15292094  T
Q  120 aatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    | ||| |||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15292093 agtgtaaaaaacaaattgtataaaaacatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 15292028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22188828 - 22188687
Alignment:
Q  14 ttctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  22188828 ttctcgtaaacacaacattcatgaatctaggagacatgatattgttatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaaaaa 22188729  T
Q  114 accgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgatt 155  Q
    | ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  22188728 atcgaaagtgtcaaaaacaaatagtataaaatcatgttgatt 22188687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 33692224 - 33692057
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | | |||| || ||||||||||||||||||  ||||| | |||  || ||    
T  33692224 tcgtaaacagaacattcatgaacctatgagacataacattgttatgcat-accctttggacactatgtagaaggtcaacagtctctgatgctaagaagcc 33692126  T
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  33692125 gaaagtgtcaaaagcaaatggtacaaaagcatgttgattgtcataacacgttttgtcatgtttggccac 33692057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 25663203 - 25663034
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||| |||||||| |||| | |||| || |    
T  25663203 ctcgtaaactcaacattcatggacctaggggacataacattgatatgcataaccctttggactctatgtagaagatcaacaacttctgatgctaggaagc 25663104  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
     |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25663103 tgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaacatgttgattatcagaacacgctttctcatgtttggccac 25663034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Original strand, 38875576 - 38875739
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||| || |     
T  38875576 tcgtaaacacaacat-cattgacctaggagacaagacattgttatgcatgaccttttgaactctacgtagaaggtcagcagcctctggtgctaggaagct 38875674  T
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgg 181  Q
    |||| |||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  38875675 gaaagtgtcaaaaacaaatggtacaaaaacatgttgattgtcagaacacactttctcatgtttgg 38875739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 183
Target Start/End: Original strand, 34335274 - 34335440
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    |||||||||||| ||| |||   ||| ||||||||| |||| || |||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||  |    
T  34335274 tcgtaaacacaatatttatgggtctaggagacatgagattgttacgcatgatccgttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgtcagaaagtc 34335373  T
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggcc 183  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34335374 gaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattgtcaggacacgctttctcatgtttggcc 34335440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 71 - 185
Target Start/End: Original strand, 43129525 - 43129639
Alignment:
Q  71 tttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgtttt 170  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43129525 tttgaactctctgtagaaggtcaaaaacatctggtgttaggaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatggtagaaaaacatgttgattgtcagaacacgtttt 43129624  T
Q  171 ctcatgtttggccac 185  Q
    |||||||||| ||||    
T  43129625 ctcatgtttgaccac 43129639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 164
Target Start/End: Original strand, 430538 - 430686
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| | | |||| | ||||||||||||||||||  |||||| | |||  ||      
T  430538 ctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacataacattactatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctatgaaga 430637  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaaca 164  Q
    | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  430638 caaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaaca 430686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 26212745 - 26212585
Alignment:
Q  25 acaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgt 124  Q
    |||||||||||| || || ||||||| | ||||| || |||||  |||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||  |||| ||||  ||    
T  26212745 acaacattcatggacttaggagacataatattgccatacatgacattttgaactctatgtagaaggttaatagcctctggtgctaagaaactgaaagggt 26212646  T
Q  125 caaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  26212645 aaaaaacaaatggtataaaagcatgttgatcgtcagaatacgctttctcatgtttggccac 26212585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 27336634 - 27336798
Alignment:
Q  19 gtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccga 118  Q
    ||||| |||||||||||| || || ||||||| |||||||||| ||| | | |||   |||||||||||||||||||  |||||| | |||| || ||      
T  27336634 gtaaaaacaacattcatggacttaggagacataacattgctatacataaccatttt--ctctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctaggaagccac 27336731  T
Q  119 aaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27336732 aagtgtcaaaagcaaatggtataaaagtatgttgattgtcagaacacgatttctcatgtttgaccac 27336798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 178
Target Start/End: Original strand, 14423643 - 14423776
Alignment:
Q  38 acctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatga 137  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| || | |||   |||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |    |||| |||||||||||||||     
T  14423643 acctaagagacatgacattgttatgaattacctt---aactctatgtagaaggtcaacagcctctgatgctagga----gaaagtgtcaaaagcaaatgg 14423735  T
Q  138 tataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14423736 tataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtt 14423776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 14723382 - 14723269
Alignment:
Q  49 atgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcat 148  Q
    |||| |||| |||||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14723382 atgatattgttatgcatgacattttgaactttaagtataaggtcaacaacctctgatgctaaaaaaccaaaagtgtaaaaaacaaatgatataaaagcat 14723283  T
Q  149 gttgattgtcagaa 162  Q
    ||||||||||||||    
T  14723282 gttgattgtcagaa 14723269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Original strand, 8100517 - 8100652
Alignment:
Q  45 agacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaa 144  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||   || ||   |||| ||||| || |||||| |||||||    
T  8100517 agacatgacattgatatgcatgaatctttaaactctacgtagaaggtcaacaacctctagtggaaggaagttgaaagtgtcacaaacaaatggtataaaa 8100616  T
Q  145 gcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 180  Q
    ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8100617 gcatgtaaattgtcacaacacgttttctcatgtttg 8100652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 180
Target Start/End: Original strand, 35455963 - 35456056
Alignment:
Q  87 aaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 180  Q
    |||||||||| |||||||| |||| || || ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  35455963 aaggtcaacatcctctggtgctaggaagccaaaattgtcaaaagcaaaaggtataaaagcatgttgattgttagaacacgctttctcatgtttg 35456056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 2566266 - 2566194
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaa 88  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2566266 ctcgtaaacacaacattgatggatctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaa 2566194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 41343581 - 41343473
Alignment:
Q  45 agacatgacattgctatgcatgaacttttgaactct-atgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaa 143  Q
    |||||||| |||| ||||||||| | |||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||    
T  41343581 agacatgatattgttatgcatgatcctttgaactattatgtagaaggccaacaacctctggtgctagaaaaccgaatatgtcgaaaacaaatggtataaa 41343482  T
Q  144 agcatgttg 152  Q
    |||| ||||    
T  41343481 agcacgttg 41343473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 174
Target Start/End: Original strand, 19260241 - 19260396
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||| |||||| |||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||  |||||    
T  19260241 tcgtaaacataacattcatgaatatataagacattacattgttatgtatgaccctttgaactctaagtagaaggtcaataacctttagtactaagaaacc 19260340  T
Q  117 gaaaatgtcaaa-agcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctca 174  Q
       | | ||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  19260341 ---actatcaaacacaaaatgatataaaaacatgttgattgttcgaacacgctttctca 19260396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 43115583 - 43115464
Alignment:
Q  61 tgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcag 160  Q
    ||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||  ||  |  || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  43115583 tgcatgatcatttaaactctacgtagaaggtcaacaatctctggtgttacgaagtcagaagtgtcaaaagcaaatgctatgaaagcatgttgattgtcaa 43115484  T
Q  161 aacacgttttctcatgtttg 180  Q
    |||||| |||||||| ||||    
T  43115483 aacacgctttctcatatttg 43115464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 32230587 - 32230513
Alignment:
Q  107 ctagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgg 181  Q
    |||||||||| ||| |||| || ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32230587 ctagaaaaccaaaagtgtcgaacgcagatggtataaaagcttgttgattgtcagaacacattttctcatgtttgg 32230513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 249
Target Start/End: Original strand, 38446452 - 38446518
Alignment:
Q  183 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  38446452 cacatgcgcctccttcttcactgatactcccgcccgcctgaatatatcaaaaagtacatccctaaca 38446518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 3114238 - 3114165
Alignment:
Q  112 aaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3114238 aaaccaaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaaacatgttgactgtcagaacatgctttctcatgtttggccac 3114165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Original strand, 7716146 - 7716261
Alignment:
Q  45 agacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaa-gcaaatgatataaa 143  Q
    |||||||| |||| ||||||| | | |||||||| |||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| |    
T  7716146 agacatgatattgttatgcataatcctttgaactttatgtaaaagaccaacaacctctggtgctagaaaaccaaaagtgtcaaaacgcaaatggtataga 7716245  T
Q  144 agcatgttgattgtca 159  Q
    | ||| |||| |||||    
T  7716246 aacatattgaatgtca 7716261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 180
Target Start/End: Original strand, 8858969 - 8859016
Alignment:
Q  133 aatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 180  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8858969 aatgatataaaaacatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttg 8859016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 76
Target Start/End: Original strand, 23023532 - 23023591
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaa 76  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23023532 tcgtaaacacaacattcatcgacctaggagacatgacattgatatgcatgaccttttgaa 23023591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 249
Target Start/End: Original strand, 433583 - 433644
Alignment:
Q  188 gcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  433583 gcgcctctttcttcaccgatattcccgcccgtctgaatatatcaaatagtacatccctaaca 433644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 185
Target Start/End: Original strand, 14436542 - 14436602
Alignment:
Q  122 tgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14436542 tgtcaaaaacaaatgatataaaaacatgttgatt---agaacacgttttttcatgtttggccac 14436602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 174
Target Start/End: Original strand, 27294429 - 27294528
Alignment:
Q  71 tttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgtttt 170  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |  ||||||  || ||||||  |||||||||  ||||||||||| |||||||||     
T  27294429 tttgaactatatgtagaaggtcaacaacctctggtgctagaaagac--aaatgtgcaacgcaaatagtataaaagc--gttgattgtcacaacacgtttc 27294524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 102
Target Start/End: Original strand, 15809985 - 15810069
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaac-ttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctct 102  Q
    ||||| ||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  15809985 ctcgtgaacacgacattcatgggcctaggagacatgacattgctatacatgaccattttgaactctatat---aggtcaacaacctct 15810069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 159
Target Start/End: Original strand, 15832998 - 15833138
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||||   |||||||| |||||| |||| ||      
T  15832998 ctcgtgaacacgacattcatgaatctaggagacgtgacattgttatacatgaccatttgaactctatataga---tcaacaacatctggtgctaggaagt 15833094  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtca 159  Q
    | ||| ||||||| | |||||  ||||||  || ||||||||||    
T  15833095 caaaagtgtcaaacgtaaatggaataaaaatatcttgattgtca 15833138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 179
Target Start/End: Original strand, 7143757 - 7143805
Alignment:
Q  131 caaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 179  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  7143757 caaatcatataaaaacatgttgattgttaaaacacgttttctcatgttt 7143805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3113979 - 3113920
Alignment:
Q  190 gcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  3113979 gcctccttcttcactgatactcccgcccagctgaatatatcaaaaaggacatccctaaca 3113920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 23424011 - 23423960
Alignment:
Q  47 acatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaac 98  Q
    |||||||||||| ||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23424011 acatgacattgcaatgaatgatcctttgaaatctatgtagaaggtcaacaac 23423960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6534384 - 6534318
Alignment:
Q  183 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  6534384 cacatgcgtctctttcttcattgatactcccgcccacctaaatatatcaaaaagtatatccttaaca 6534318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9829407 - 9829361
Alignment:
Q  132 aaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtt 178  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  9829407 aaatggtataaaagcatgttgattgtcaaaacacattttatcatgtt 9829361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13166731 - 13166669
Alignment:
Q  183 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccct 245  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||||||||||||||||    
T  13166731 cacaggcgcttccttcttcactgatacttccgcccgcctgaatatatcaaaaagtacatccct 13166669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 76
Target Start/End: Original strand, 24113509 - 24113571
Alignment:
Q  14 ttctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaa 76  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  24113509 ttcttgtaaaaacaacattcatggacctagaagacatgacattgttatgcatgatcatttgaa 24113571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26212403 - 26212338
Alignment:
Q  183 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||  | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  26212403 cacaggcgcctccttcttcactgatattcccaccc-tctgaatatatcaaaaagtacatccctaaca 26212338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 8087591 - 8087547
Alignment:
Q  69 cttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaa 113  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  8087591 cttttgaactctttgtagaaggtcaacaaccgctgataatagaaa 8087547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 52)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 600862 - 600698
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  600862 tcgtaaacacagcattaatggacctaggagacatgacatagttatacatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgttaggaaacc 600763  T
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgg 181  Q
    |||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  600762 gaaagtgacaaaagcaaatggtataaaagcatgttaattgttagaacacgttttctcatgtttgg 600698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 56462279 - 56462113
Alignment:
Q  14 ttctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  56462279 ttctcgtaaacacaacatttatggacttaggagacatgacattgtcatgcatgatcctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaa 56462180  T
Q  114 accgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 180  Q
    ||| ||| |||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  56462179 accaaaagtgtctaaaacaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacacgctttatcatgtttg 56462113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 185
Target Start/End: Original strand, 53619520 - 53619691
Alignment:
Q  14 ttctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||  |||||| | |||| ||    
T  53619520 ttctcgtaaacacaacattcatggacctaagagacataacattgttatgcataaccctttagactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctaggaa 53619619  T
Q  114 accgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
      | ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53619620 gtcaaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 53619691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Original strand, 53170448 - 53170609
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctat--gagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaa 113  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  53170448 ctcgtgaacacaacattcatga-cctataggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctagcaa 53170546  T
Q  114 accgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggc 182  Q
    ||||||| ||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  53170547 accgaaagtgtcaaaagcaaat------caagcatgttgactgtcagaacacgctttctcatgtttggc 53170609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 180
Target Start/End: Original strand, 25504235 - 25504395
Alignment:
Q  20 taaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaa 119  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  |||| || |||| ||||| ||    
T  25504235 taaacacaatattcatggacctatgagacatgacattactatgcatgaccttttaaactctatttaaaaggtcaacagtctctagtgctaggaaaccaaa 25504334  T
Q  120 aatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 180  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25504335 aatgtcaaaagcaaacggtataaaaacatgtcgattgttagaacacgttttctcatgtttg 25504395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 34107867 - 34107696
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||     
T  34107867 ctcgtgaacacaacattcatggatctaggagacataacattgttatgcatgactttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaggaaat 34107768  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcaga--acacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  34107767 cgaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaaacatgttgattatctgaacacacgttttctcatgtttggccac 34107696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 184
Target Start/End: Original strand, 132319 - 132489
Alignment:
Q  14 ttctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaa 113  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| | ||| |||||| ||||||| |||||||| ||||| || ||| ||    
T  132319 ttcttgtaaacacaacaatcatgaacctaaaagacatgacattgttatgcttgaccctttaaactctgtgtagaatgtcaacaatctctgatattaggaa 132418  T
Q  114 accgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggcca 184  Q
    ||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  132419 accgaaagtgtaaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgatttctcatgttttgcca 132489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Original strand, 26521425 - 26521593
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| || |||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  26521425 ctcgtaaacacaacat-catgggcctaggatacatgacattgctacgcatgaccctttgaactgtatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaggaaac 26521523  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    | ||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  26521524 caaaagtgttgaaagcatatgatataaaagcatgttgattgtcataacacgttttttcatgtttagccac 26521593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 50001096 - 50000927
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||| ||||||| |||||||||||||| | | |||| ||| ||||||||||||||||  |||||| | ||||||| ||    
T  50001096 tcgtaaacacaacatttatggatctaggagacataacattgctatgcataaccctttggactatatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagaaagcc 50000997  T
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgata-taaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
     ||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  50000996 aaaagtgtcaaaagcaaattgtattaaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttgaccac 50000927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 7536739 - 7536592
Alignment:
Q  19 gtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccga 118  Q
    ||||||| |||||||||| | ||| ||||||| | ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  7536739 gtaaacataacattcatggatctacgagacataaaattgctatgcacgatcatttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaactga 7536640  T
Q  119 aaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacg 166  Q
    || |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7536639 aattgtcaaaaacaaattgtataaaaacatgttgattgtcaaaacacg 7536592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 6865984 - 6865828
Alignment:
Q  22 aacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaa 121  Q
    |||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| || |||  || |  |||     
T  6865984 aacagaacattcatgatc-taggagacatgacattgctatgcattaccctttgaactctatgtaaaaggttaacaacatctagtgctatgaagctcaaag 6865886  T
Q  122 tgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  6865885 tgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgatagtcagaacacgttttctcgtgttt 6865828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 63 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 50483320 - 50483211
Alignment:
Q  63 catgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaa 162  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  50483320 catgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcgaaagcaaatggtataaaatcatgttgattgtcagaa 50483221  T
Q  163 cacgttttct 172  Q
     ||| |||||    
T  50483220 gacgctttct 50483211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 3329933 - 3330077
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||  |||||| | |||| || ||    
T  3329933 tcgtaaacacagcattcatggacctaggagacataacattgctatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctaggaagcc 3330032  T
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcaga 161  Q
     ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3330033 aaaagtgtcaaaagcaaatagtataaaagcatgttgattgtcaga 3330077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 110
Target Start/End: Original strand, 16955396 - 16955490
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactag 110  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16955396 ctcgtaaacacaacattcatgggcctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcagcaacctctggtgctag 16955490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 55933630 - 55933464
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||| | |||| |||| || | | |||| |||||||||||||||||||||||||  | | |||| ||  |    
T  55933630 tcgtaaacacaacattcacggacctaggagacataatattgttatgtataaccctttggactctatgtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtc 55933533  T
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  55933532 gaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgttagaacaaactttctcatgtttggccac 55933464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 30940897 - 30940741
Alignment:
Q  22 aacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaa 121  Q
    ||||||||||||||  ||||| || | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||      || |||| ||| |||| ||| |||||     
T  30940897 aacacaacattcatagacctaggatatatgacattgttatgcatgaccttttgaactctatgtagaa------cagcctcaggtgctaggaaatcgaaag 30940804  T
Q  122 tgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  30940803 tgtcaaaagcaa-tggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttgaccac 30940741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 38535740 - 38535607
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||      
T  38535740 ctcgtaaacacaacatccatggacctataagacatgacattgctatgcatgactctttgaactctatgtagagggtgaacaacctctggtgctaggaagt 38535641  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatg 149  Q
    | ||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  38535640 caaaagtgtcaaatgcaaatggtataagagcatg 38535607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 103
Target Start/End: Original strand, 4419200 - 4419286
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctg 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4419200 tcgtaaacacaacattcatggacctaggagacataacattgttatgcataaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctg 4419286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 46441045 - 46440911
Alignment:
Q  31 ttcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaag 130  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | | |||| |||||||||||||||||| || | |||| | |||| || |||||| |||||||||    
T  46441045 ttcatgaacctatgagacatagcattgctatgcacaaccctttggactctatgtagaaggtcagcagcttctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaag 46440946  T
Q  131 caaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacac 165  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| |||||||    
T  46440945 caaatgatataaaaacgtgttaattgttagaacac 46440911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 54191019 - 54190857
Alignment:
Q  19 gtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccga 118  Q
    ||||| |||| ||| ||| || || ||| |||||||||| ||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  | |    
T  54191019 gtaaatacaatatttatggacttaagagtcatgacattgttatgcatggccctttgaactctatgtggaaggtcaacaacctctgatactagaaagtcaa 54190920  T
Q  119 aaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccaca 186  Q
    || ||||||||||||     |||||| |||||  |||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  54190919 aagtgtcaaaagcaa-----ataaaaacatgtaaattgtcagaatatgttttctcatgtttgaccaca 54190857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 165
Target Start/End: Original strand, 11562893 - 11562983
Alignment:
Q  75 aactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacac 165  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||  ||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11562893 aactcaatgtagaagatcaacaacctcgagtgttagaaaaccgaaaatgtctaaagtaaatgatataaaagcatgttgattgtccgaacac 11562983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Original strand, 23255649 - 23255809
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||||||||||| ||||||| || || ||||||| |||||| ||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||  ||| || | |||  ||      
T  23255649 ctcgtaaacacaatattcatggacttaggagacataacattgttatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaactgcctatgatgctaagaa-- 23255746  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
           ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23255747 -------gtcaaaaacaaatggtataaaagcatgttaattgtcagaacacgctttctcatgtttggccac 23255809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 46391482 - 46391323
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaacc 116  Q
    ||||||| |||||||||||| |  || |||||||||||||| |  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |  ||| ||| |    
T  46391482 tcgtaaatacaacattcatggatttaggagacatgacattgtt--gcatgatcttttgaactttatgtagaaggtcaacaacctctactgataggaaatc 46391385  T
Q  117 gaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 179  Q
    |||||||| | |||| |||| ||||||| |||||||  ||| |||||| |||||||| |||||    
T  46391384 gaaaatgttacaagc-aatggtataaaaacatgttggctgtgagaacatgttttctcgtgttt 46391323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 48657085 - 48656917
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtag----aaggtcaacaacctctggt-actaga 111  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| | | |||| |||||||||||    ||||||||||||||||  |  |||      
T  48657085 tcgtaaacacaacattcatagacctatgagacataacattgctatgcataatcatttggactctatgtagaaggaaggtcaacaacctctaatcgctaag 48656986  T
Q  112 aaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 180  Q
    ||  ||||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||| || |||||  |||||||||||||    
T  48656985 aagtcgaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaaacattttgattgacataacacactttctcatgtttg 48656917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 52 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 43849483 - 43849349
Alignment:
Q  52 acattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgtt 151  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||| || ||||||| |||| |||| || || ||| |||||||  |||||  ||||||||||||||    
T  43849483 acattgttatgcatgaccatttgaactctttgtagaagatccacaacctttggttctaggaagccaaaagtgtcaaacacaaatagtataaaagcatgtt 43849384  T
Q  152 gattgtcagaacacgttttctcatgtttggccaca 186  Q
    | || || ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  43849383 ggttatctgaacacgctttctcgtgtttggccaca 43849349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 50463089 - 50462952
Alignment:
Q  44 gagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaa 143  Q
    |||||||| ||||| ||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||   || ||| | ||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  50463089 gagacatggcattgttatgcatggccctttaaactctacgtagaaggtcaacagtctctggtgtaaggaaatcaaaagtgtcaaaagcaaatggtatgaa 50462990  T
Q  144 agcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgg 181  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||    
T  50462989 agcatgttgattgtcggaagacactttctcatgtttgg 50462952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 42455780 - 42455692
Alignment:
Q  14 ttctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctct 102  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42455780 ttctcgtaaaaacaacattcatggacctagaaaacatgacattgttatccatgatcatttgaactctatgtagaaggttaacaacctct 42455692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 162
Target Start/End: Original strand, 53098403 - 53098503
Alignment:
Q  62 gcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcaga 161  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||| ||| | |  |||| ||||||||||||||||    
T  53098403 gcatgaccatttgaactctatgtagaaggttaacaacctctgatgctaggaaaccaaaaatgtcaaaaggaaacggttcaaaaacatgttgattgtcaga 53098502  T
Q  162 a 162  Q
    |    
T  53098503 a 53098503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 131
Target Start/End: Original strand, 39001333 - 39001448
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| ||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||  |||||| | |||| || |    
T  39001333 ctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacacaacattgttatgcataatcctttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatcctaggaagc 39001432  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagc 131  Q
    | ||| ||||||||||    
T  39001433 caaaagtgtcaaaagc 39001448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 747898 - 747812
Alignment:
Q  58 ctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaa 144  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  747898 ctatgcatgaccttttaaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatattaagaaaccagaaatatcaaaagcaaatggtataaaa 747812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 185
Target Start/End: Original strand, 31847078 - 31847192
Alignment:
Q  71 tttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgtttt 170  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | |||| | |||| || || ||| ||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||| | |||    
T  31847078 tttggactctatgtagaaggtcaaccgcttctgatgctaggaagccaaaagtgtcaaaagcaaatggtaaaaaaacatgttgactgtcagaacatggttt 31847177  T
Q  171 ctcatgtttggccac 185  Q
    |||||||||| ||||    
T  31847178 ctcatgtttgaccac 31847192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12918483 - 12918374
Alignment:
Q  76 actctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcat 175  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| ||  ||||| ||||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  12918483 actctatctagaaggtcaacaatctctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagtaaatagtataaaagtgtgttgattgtcagaacacgatttcttat 12918384  T
Q  176 gtttggccac 185  Q
    ||||| ||||    
T  12918383 gtttgaccac 12918374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 181
Target Start/End: Original strand, 16957568 - 16957643
Alignment:
Q  106 actagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgg 181  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||    
T  16957568 actagaaaactgaaagtgtcaaaagcaaatggtatataagcatgttgattatcagagcacactttctcatgtttgg 16957643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 712722 - 712636
Alignment:
Q  58 ctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaa 144  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||  |||||  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  712722 ctatgcatgaccttttaaactctatgtagaaggacaacaacctctgatattaagaaaccagaaatatcaaaagcaaatggtataaaa 712636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 249
Target Start/End: Original strand, 26521774 - 26521840
Alignment:
Q  183 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26521774 cacatgcgcctcattcttcaatgatactctcgtccgtctaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 26521840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 50464467 - 50464387
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaaca 96  Q
    ||||||||||||||||||||  |  |  |||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  50464467 ctcgtaaacacaacattcatatatttgggagacatgacattgttatgcatgaccctttaaactctacgtagaaggtcaaca 50464387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 249
Target Start/End: Original strand, 3330243 - 3330302
Alignment:
Q  190 gcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  3330243 gcctccttcttcactgatactcccgctcgcctgaatatatcaaaaagtacatccctaaca 3330302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 78
Target Start/End: Original strand, 8738148 - 8738203
Alignment:
Q  23 acacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaact 78  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| | ||||||||    
T  8738148 acacaacattcatgaacctaagagacatgacatttttatgcatgagcctttgaact 8738203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 185
Target Start/End: Original strand, 28739845 - 28740011
Alignment:
Q  20 taaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgca-tgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccga 118  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||| |||||| || ||  |||||||||||||| |||||||||||| | ||||  ||| ||  |||    
T  28739845 taaacacaacatttatggacctaggagacataacattgttatgcattgcac-gttgaactctatgtaaaaggtcaacaacttgtggtgttaggaagtcga 28739943  T
Q  119 aaatgtcaaaagcaaatgatataaaa-gcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    || |||||||   ||||| |||||||  |||||| | ||||| |||||  |||||| |||||||||||    
T  28739944 aagtgtcaaacataaatggtataaaacacatgttaactgtcacaacacaatttctcgtgtttggccac 28740011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 45386218 - 45386063
Alignment:
Q  30 attcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaa 129  Q
    ||||||| || || ||||||  |||||| ||||||||| | |||||| | || ||||||||| ||  |||||| || ||||||| || ||| | |||||     
T  45386218 attcatggacttaagagacacaacattgttatgcatgaccctttgaattttaggtagaaggttaatgacctcttgtgctagaaagccaaaagtttcaaat 45386119  T
Q  130 gcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    | ||||| |||||||  |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  45386118 gtaaatggtataaaaagaaattgattgtcagaacacgctttcttatgtttgaccac 45386063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 18981708 - 18981659
Alignment:
Q  17 tcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatga 67  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18981708 tcgtaaacacaacattcatggaccta-gagacatgacattactatgcatga 18981659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 45760903 - 45760841
Alignment:
Q  118 aaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 180  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  45760903 aaaatgtcaaatgcaaaagatataaaaatatgttgattgtcaaaacacgctttctcatctttg 45760841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 180
Target Start/End: Original strand, 12053460 - 12053513
Alignment:
Q  127 aaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 180  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12053460 aaagcaaatgatataaaaacgttttgattgttagaacacgatttctcatgtttg 12053513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 247
Target Start/End: Original strand, 16957822 - 16957886
Alignment:
Q  183 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaa 247  Q
    |||| ||||||| | | ||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  16957822 cacaggcgcctcctacctcactgatactcctgcccgtctgaatatatcaaaaagtacatccctaa 16957886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 170
Target Start/End: Original strand, 24719976 - 24720024
Alignment:
Q  122 tgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgtttt 170  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  24719976 tgtcaaacacaaatgatataaaaacatgttgattgtcagaacgcgtttt 24720024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 28883206 - 28883158
Alignment:
Q  132 aaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttg 180  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  28883206 aaatgatataaaaacatgttggttgttcgaacacgttttctcatgtttg 28883158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 22449858 - 22449812
Alignment:
Q  15 tctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctat 61  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||    
T  22449858 tctcgtaaacacaacattcatggatctataagatatgacattgctat 22449812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 97
Target Start/End: Original strand, 34213559 - 34213636
Alignment:
Q  19 gtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaa 97  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||| |  |||||| || |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  34213559 gtaaacacaacattcatggaactaggagagac-acattgttaggcatgaccctttgaactctatctagaaggtcaacaa 34213636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 249
Target Start/End: Original strand, 34952457 - 34952523
Alignment:
Q  183 cacaagcgcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatcaaaaagtacatccctaaca 249  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||  ||||||||||||    
T  34952457 cacatgcgcctccttcttcactgatactctcgcccgccttaatatatcaaaaatgacatccctaaca 34952523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 249
Target Start/End: Original strand, 25504586 - 25504646
Alignment:
Q  190 gcctctttcttcactgatactcccgcctgtttaaatatatc-aaaaagtacatccctaaca 249  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  25504586 gcctcgttcttcactgatgctctcgcccgtttgaatatatcaaaaaagtacatctctaaca 25504646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 32312876 - 32312796
Alignment:
Q  22 aacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctct 102  Q
    ||||||||||||||  | |||  |||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||    
T  32312876 aacacaacattcatagatctagaagacactacattgttatgcatgaccttttgaactctttgtataagatcaacgacctct 32312796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 88
Target Start/End: Original strand, 45661627 - 45661699
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaa 88  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||| | || |||| | |||||||| |||||||||    
T  45661627 ctcgtaaacacaatattcatggacctacgagttatgacattgttgtgtatgaccctttgaactttatgtagaa 45661699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0470 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0470
Description:

Target: scaffold0470; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 179
Target Start/End: Original strand, 7539 - 7701
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||  |||| ||||    
T  7539 ctcgtaaacataacattcatggacctatgagacatgacatta-tatgcatgaccttttgaacgctatgcaaaaggtcaacaatctctggagctaggaaac 7637  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgttt 179  Q
     |||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  7638 tgaaagtgtcaaaagcaaatggtttaaaatcatgttgattgtgagaacacgctttctcatgttt 7701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1768 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1768
Description:

Target: scaffold1768; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 355 - 186
Alignment:
Q  16 ctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaac 115  Q
    |||||||||||||| |||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  355 ctcgtaaacacaacgttcatcgatctaggagacatgacattgctatgtatgactttttgaactttatgcagaaggtcaacaacctttggtactagaaaac 256  T
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccac 185  Q
    | ||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |  | ||||||||||||||||    
T  255 caaaagtgtcaaacacaaatggtataaaagcatgttgatggtcataacccactgtctcatgtttggccac 186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 48 - 184
Target Start/End: Original strand, 10329 - 10468
Alignment:
Q  48 catgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagca 147  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||  || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10329 catgacattgttatgcatggccctttcaactctat-tagaaggtcaacaacctctggtgctaggaagccacaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagca 10427  T
Q  148 tg----ttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggcca 184  Q
    ||    |||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  10428 tgttgattgattgtcagaacacgcattatcatgtttggcca 10468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 174
Target Start/End: Original strand, 49349 - 49505
Alignment:
Q  14 ttctcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaa 113  Q
    |||||||||| || ||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||    |  |||||| ||||  ||  ||    
T  49349 ttctcgtaaatactacattcatggacataagagacatgacattgttatgcatgatcctttgaactctatgttga----cctcaacctttggtgttaagaa 49444  T
Q  114 accgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctca 174  Q
      ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  49445 gtcgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcacgttgattgtcagaacacgatttctca 49505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 18499 - 18369
Alignment:
Q  52 acattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgtt 151  Q
    |||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  | || | ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  18499 acattgctctgcatgaccctttaaactctatgtagaaggttaacaatctctactgcttggaaatcaaaagtgtcaaaagcagatgacataaaaacatgtt 18400  T
Q  152 gattgtcagaacacgttttctcatgtttggcc 183  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18399 gattgtgagaacacg-tttctcatgtttggcc 18369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0493 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0493
Description:

Target: scaffold0493; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 8632 - 8525
Alignment:
Q  71 tttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgtttt 170  Q
    |||||||||| || ||||| |  ||||||||| || |||| ||||| ||| ||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  8632 tttgaactctttgcagaagattcacaacctctagtgctaggaaaccaaaagtgttaaacgcaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacatgtttt 8533  T
Q  171 ctcatgtt 178  Q
    ||||||||    
T  8532 ctcatgtt 8525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 47610 - 47542
Alignment:
Q  116 cgaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggcca 184  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47610 cgaaagtgttaaaagcaaatggtataaaaatatgttaactgtcagaacacattttctcatgtttggcca 47542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 138 - 184
Target Start/End: Original strand, 16192 - 16238
Alignment:
Q  138 tataaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggcca 184  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16192 tataaaaacatgtttattgtcagaacatgttttctcatgtttggcca 16238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 129
Target Start/End: Original strand, 16073 - 16154
Alignment:
Q  47 acatgacattgctatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtactagaaaaccgaaaatgtcaaaa 129  Q
    |||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| ||||| ||| ||| ||||    
T  16073 acatgatattactatgcatgaccctttgaactctatgtagaaagtcaataacct-tggtgctaggaaaccaaaagtgtaaaaa 16154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University