View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1740_high_33 (Length: 506)

Name: NF1740_high_33
Description: NF1740
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1740_high_33
NF1740_high_33
[»] chr8 (48 HSPs)
chr8 (118-488)||(37960676-37961059)
chr8 (1-277)||(27932286-27932563)
chr8 (1-267)||(29108770-29109037)
chr8 (1-279)||(1012491-1012770)
chr8 (1-311)||(17469129-17469427)
chr8 (1-305)||(20399465-20399770)
chr8 (1-306)||(24568813-24569116)
chr8 (34-305)||(32302966-32303239)
chr8 (1-279)||(43113562-43113840)
chr8 (1-259)||(24869980-24870238)
chr8 (1-254)||(34139321-34139573)
chr8 (34-305)||(24927855-24928127)
chr8 (1-254)||(45235938-45236192)
chr8 (1-305)||(17220590-17220892)
chr8 (1-306)||(1063380-1063692)
chr8 (1-305)||(36131839-36132130)
chr8 (8-198)||(14186205-14186391)
chr8 (89-305)||(40248281-40248497)
chr8 (1-254)||(39445537-39445782)
chr8 (5-296)||(4230649-4230930)
chr8 (69-305)||(11254925-11255153)
chr8 (161-301)||(5858566-5858706)
chr8 (34-205)||(34776972-34777144)
chr8 (5-306)||(2075743-2076045)
chr8 (108-212)||(9642354-9642458)
chr8 (103-222)||(8545342-8545461)
chr8 (40-144)||(28977185-28977290)
chr8 (1-234)||(34021352-34021583)
chr8 (1-97)||(35215378-35215474)
chr8 (103-268)||(30481368-30481533)
chr8 (153-307)||(35215562-35215715)
chr8 (130-255)||(27777158-27777283)
chr8 (124-254)||(14687396-14687526)
chr8 (128-301)||(17084027-17084194)
chr8 (153-254)||(6388477-6388578)
chr8 (108-253)||(27056517-27056662)
chr8 (102-254)||(14155507-14155659)
chr8 (138-274)||(29416128-29416263)
chr8 (102-235)||(9475992-9476126)
chr8 (136-253)||(10297467-10297584)
chr8 (136-253)||(15068550-15068666)
chr8 (136-184)||(2075867-2075915)
chr8 (102-233)||(29918582-29918713)
chr8 (102-204)||(30904021-30904123)
chr8 (102-200)||(39379595-39379692)
chr8 (104-205)||(5700333-5700434)
chr8 (7-104)||(29089589-29089685)
chr8 (1-61)||(40248502-40248562)
[»] chr4 (69 HSPs)
chr4 (1-306)||(26564711-26565016)
chr4 (1-301)||(6481950-6482251)
chr4 (5-307)||(11027955-11028259)
chr4 (1-308)||(7985034-7985337)
chr4 (1-305)||(31752335-31752640)
chr4 (5-305)||(47550264-47550565)
chr4 (1-217)||(1724309-1724525)
chr4 (34-279)||(21423773-21424019)
chr4 (1-305)||(19534335-19534633)
chr4 (34-305)||(55826534-55826807)
chr4 (34-301)||(7608882-7609150)
chr4 (34-307)||(31918467-31918742)
chr4 (34-305)||(5902531-5902797)
chr4 (34-308)||(11122777-11123052)
chr4 (34-305)||(6382183-6382456)
chr4 (34-305)||(44317446-44317719)
chr4 (2-280)||(39375160-39375437)
chr4 (1-306)||(37349003-37349297)
chr4 (1-305)||(39046832-39047136)
chr4 (34-305)||(43893140-43893411)
chr4 (1-215)||(12825462-12825676)
chr4 (1-233)||(47239368-47239601)
chr4 (1-264)||(37107291-37107553)
chr4 (1-305)||(48459360-48459665)
chr4 (1-305)||(42299670-42299972)
chr4 (119-305)||(15987173-15987359)
chr4 (1-205)||(32585367-32585573)
chr4 (1-189)||(9230164-9230350)
chr4 (1-148)||(13770523-13770670)
chr4 (1-205)||(32596195-32596399)
chr4 (1-212)||(39188395-39188605)
chr4 (1-116)||(425703-425818)
chr4 (1-137)||(42774640-42774777)
chr4 (1-87)||(29755459-29755545)
chr4 (103-274)||(19882998-19883169)
chr4 (126-223)||(4741209-4741306)
chr4 (108-253)||(10302071-10302216)
chr4 (1-164)||(28695194-28695357)
chr4 (180-277)||(12505479-12505577)
chr4 (70-144)||(13015323-13015397)
chr4 (153-254)||(39086189-39086290)
chr4 (102-274)||(21956756-21956928)
chr4 (164-252)||(43309526-43309614)
chr4 (153-254)||(30672993-30673094)
chr4 (102-211)||(36306766-36306875)
chr4 (158-306)||(7334107-7334254)
chr4 (102-302)||(8843719-8843918)
chr4 (102-302)||(8856683-8856882)
chr4 (128-212)||(29527819-29527903)
chr4 (153-243)||(35304489-35304579)
chr4 (136-253)||(3737791-3737908)
chr4 (102-215)||(16575093-16575206)
chr4 (153-253)||(41914959-41915059)
chr4 (2-84)||(15987372-15987455)
chr4 (130-233)||(25941147-25941250)
chr4 (89-175)||(53906346-53906432)
chr4 (130-223)||(14605918-14606011)
chr4 (128-217)||(47103745-47103834)
chr4 (1-106)||(4766422-4766529)
chr4 (128-212)||(21544586-21544670)
chr4 (118-205)||(33516082-33516170)
chr4 (130-253)||(1866512-1866635)
chr4 (153-304)||(33615241-33615392)
chr4 (177-275)||(1724211-1724308)
chr4 (102-212)||(25298837-25298947)
chr4 (174-223)||(4737895-4737944)
chr4 (129-242)||(37246853-37246965)
chr4 (128-212)||(30266334-30266418)
chr4 (128-212)||(30285770-30285854)
[»] chr7 (67 HSPs)
chr7 (1-305)||(27850242-27850540)
chr7 (1-279)||(5376964-5377242)
chr7 (5-307)||(16866051-16866354)
chr7 (1-254)||(12980255-12980509)
chr7 (34-307)||(21702570-21702844)
chr7 (1-305)||(17885343-17885648)
chr7 (5-304)||(7779890-7780190)
chr7 (1-212)||(3920417-3920628)
chr7 (1-212)||(18825875-18826086)
chr7 (5-305)||(17851736-17852035)
chr7 (1-306)||(37182153-37182458)
chr7 (5-305)||(30650513-30650814)
chr7 (34-305)||(35074380-35074653)
chr7 (1-305)||(41741360-41741664)
chr7 (1-200)||(46127198-46127394)
chr7 (1-306)||(38139701-38140008)
chr7 (40-302)||(18125141-18125404)
chr7 (34-307)||(45885673-45885947)
chr7 (1-305)||(2630484-2630788)
chr7 (1-277)||(39455953-39456228)
chr7 (1-296)||(16078892-16079187)
chr7 (1-254)||(39316873-39317127)
chr7 (40-308)||(24753092-24753349)
chr7 (5-212)||(26622834-26623041)
chr7 (70-277)||(38152835-38153041)
chr7 (1-277)||(45379984-45380261)
chr7 (1-305)||(24425260-24425551)
chr7 (1-253)||(25782876-25783121)
chr7 (69-306)||(3226855-3227092)
chr7 (1-279)||(37579141-37579418)
chr7 (89-304)||(10072433-10072648)
chr7 (1-311)||(41103531-41103839)
chr7 (40-215)||(16811647-16811822)
chr7 (1-277)||(44734297-44734572)
chr7 (34-305)||(25905539-25905811)
chr7 (1-205)||(25979927-25980132)
chr7 (12-212)||(26004477-26004675)
chr7 (1-254)||(5916037-5916280)
chr7 (1-277)||(44985856-44986113)
chr7 (79-254)||(43507402-43507577)
chr7 (34-168)||(44658496-44658631)
chr7 (43-191)||(44794052-44794200)
chr7 (1-148)||(23328488-23328636)
chr7 (5-305)||(45708781-45709073)
chr7 (1-303)||(37195921-37196213)
chr7 (102-274)||(3157063-3157234)
chr7 (111-253)||(27063127-27063269)
chr7 (108-253)||(8906551-8906696)
chr7 (118-205)||(33841074-33841161)
chr7 (102-266)||(11472664-11472825)
chr7 (118-217)||(10995832-10995931)
chr7 (128-254)||(37103088-37103214)
chr7 (108-253)||(5565269-5565414)
chr7 (128-212)||(31426014-31426098)
chr7 (153-233)||(42908023-42908103)
chr7 (124-305)||(37218005-37218188)
chr7 (136-253)||(27063348-27063465)
chr7 (128-217)||(32546198-32546287)
chr7 (118-212)||(23475266-23475360)
chr7 (123-233)||(27896457-27896567)
chr7 (84-214)||(3274684-3274810)
chr7 (128-233)||(22973394-22973499)
chr7 (173-253)||(30839095-30839176)
chr7 (1-61)||(26004675-26004735)
chr7 (128-253)||(44845095-44845222)
chr7 (128-223)||(18683980-18684075)
chr7 (118-205)||(19440020-19440107)
[»] chr3 (51 HSPs)
chr3 (1-296)||(34119532-34119825)
chr3 (1-305)||(42758248-42758552)
chr3 (1-306)||(4557214-4557519)
chr3 (1-305)||(19111609-19111912)
chr3 (1-304)||(54317018-54317321)
chr3 (1-305)||(4015954-4016258)
chr3 (4-307)||(48390725-48391028)
chr3 (5-307)||(49579941-49580244)
chr3 (34-306)||(39655182-39655455)
chr3 (5-305)||(39728548-39728849)
chr3 (34-279)||(44953371-44953617)
chr3 (1-302)||(34025827-34026129)
chr3 (1-255)||(53631778-53632032)
chr3 (40-307)||(29284248-29284516)
chr3 (34-305)||(7469688-7469960)
chr3 (5-306)||(44639152-44639453)
chr3 (1-265)||(20086882-20087135)
chr3 (5-234)||(44172503-44172733)
chr3 (5-234)||(44179203-44179433)
chr3 (1-308)||(22535748-22536056)
chr3 (1-305)||(43582451-43582755)
chr3 (34-305)||(44252653-44252925)
chr3 (40-307)||(52572521-52572789)
chr3 (2-304)||(830884-831179)
chr3 (34-254)||(44106755-44106974)
chr3 (5-276)||(52198031-52198304)
chr3 (1-309)||(6738311-6738609)
chr3 (4-265)||(29842184-29842445)
chr3 (34-212)||(49025587-49025765)
chr3 (1-280)||(41936954-41937216)
chr3 (1-146)||(30682695-30682840)
chr3 (5-306)||(17146063-17146361)
chr3 (1-254)||(34154291-34154541)
chr3 (5-205)||(10823706-10823904)
chr3 (1-184)||(31126826-31127009)
chr3 (1-254)||(23580701-23580954)
chr3 (34-254)||(23154026-23154245)
chr3 (96-308)||(48305548-48305760)
chr3 (118-308)||(23546855-23547039)
chr3 (74-297)||(23910170-23910385)
chr3 (110-274)||(3414478-3414638)
chr3 (123-254)||(10043243-10043374)
chr3 (120-237)||(30616259-30616376)
chr3 (102-254)||(42243362-42243514)
chr3 (157-256)||(38347596-38347695)
chr3 (176-305)||(10371183-10371318)
chr3 (103-223)||(30904808-30904927)
chr3 (167-302)||(27252605-27252738)
chr3 (102-243)||(4553165-4553306)
chr3 (34-106)||(23547081-23547154)
chr3 (1-101)||(48306650-48306751)
[»] chr1 (57 HSPs)
chr1 (1-302)||(19572425-19572726)
chr1 (1-307)||(9982798-9983104)
chr1 (1-305)||(12494885-12495189)
chr1 (1-305)||(34673192-34673496)
chr1 (1-301)||(44615389-44615690)
chr1 (1-301)||(44792879-44793180)
chr1 (1-305)||(17134821-17135126)
chr1 (40-304)||(34610986-34611251)
chr1 (1-275)||(18354020-18354295)
chr1 (1-254)||(29871246-29871499)
chr1 (40-305)||(36187130-36187396)
chr1 (5-278)||(24236698-24236972)
chr1 (1-308)||(42707744-42708045)
chr1 (5-305)||(51421736-51422037)
chr1 (5-305)||(29936294-29936601)
chr1 (1-305)||(16433089-16433375)
chr1 (40-308)||(49250680-49250949)
chr1 (69-309)||(23490677-23490917)
chr1 (34-305)||(28297840-28298125)
chr1 (1-223)||(17091951-17092174)
chr1 (5-305)||(24710736-24711026)
chr1 (1-254)||(40087425-40087678)
chr1 (1-305)||(45866096-45866400)
chr1 (1-305)||(5180919-5181218)
chr1 (4-307)||(16408823-16409122)
chr1 (1-223)||(35936821-35937031)
chr1 (1-168)||(49741054-49741221)
chr1 (1-204)||(50426672-50426870)
chr1 (1-205)||(3627995-3628202)
chr1 (1-304)||(42439581-42439885)
chr1 (1-170)||(23966746-23966917)
chr1 (1-205)||(34060035-34060234)
chr1 (1-205)||(44632151-44632350)
chr1 (69-168)||(13390356-13390455)
chr1 (1-277)||(39616177-39616443)
chr1 (172-305)||(23968625-23968758)
chr1 (108-252)||(34085217-34085361)
chr1 (158-252)||(33293494-33293588)
chr1 (40-127)||(2514681-2514769)
chr1 (118-254)||(10778528-10778664)
chr1 (128-253)||(35069851-35069976)
chr1 (179-306)||(13020646-13020773)
chr1 (128-223)||(16237296-16237391)
chr1 (102-212)||(39219234-39219344)
chr1 (103-215)||(48125683-48125795)
chr1 (158-253)||(19003628-19003723)
chr1 (214-305)||(20774654-20774745)
chr1 (104-223)||(41476944-41477063)
chr1 (69-142)||(20774575-20774649)
chr1 (137-215)||(38686673-38686751)
chr1 (180-243)||(2514811-2514875)
chr1 (178-254)||(13798290-13798366)
chr1 (118-266)||(16903515-16903663)
chr1 (129-223)||(12718764-12718858)
chr1 (1-86)||(13020562-13020648)
chr1 (153-234)||(36617387-36617469)
chr1 (185-277)||(13390456-13390547)
[»] chr5 (61 HSPs)
chr5 (1-308)||(4582992-4583300)
chr5 (40-305)||(4920738-4921004)
chr5 (5-308)||(40517683-40517987)
chr5 (1-306)||(15890080-15890385)
chr5 (1-277)||(17853232-17853507)
chr5 (34-305)||(5908599-5908871)
chr5 (1-305)||(12447255-12447546)
chr5 (40-296)||(12866471-12866729)
chr5 (1-305)||(18206891-18207196)
chr5 (1-254)||(2412688-2412941)
chr5 (9-305)||(30996477-30996773)
chr5 (1-307)||(6155829-6156134)
chr5 (1-295)||(12834495-12834791)
chr5 (34-301)||(22694817-22695084)
chr5 (1-191)||(35194014-35194204)
chr5 (5-305)||(42987391-42987691)
chr5 (1-301)||(29245866-29246167)
chr5 (1-305)||(35311696-35311991)
chr5 (1-212)||(38006473-38006684)
chr5 (1-306)||(13401914-13402218)
chr5 (1-146)||(3573098-3573243)
chr5 (1-205)||(2985021-2985225)
chr5 (1-169)||(30115357-30115525)
chr5 (34-277)||(6092468-6092701)
chr5 (153-305)||(33727912-33728064)
chr5 (1-184)||(1218630-1218812)
chr5 (42-302)||(20973410-20973660)
chr5 (1-148)||(27088420-27088566)
chr5 (1-306)||(6369569-6369874)
chr5 (1-200)||(8453389-8453587)
chr5 (1-205)||(27302746-27302948)
chr5 (1-191)||(28045528-28045719)
chr5 (108-305)||(10127062-10127252)
chr5 (102-252)||(38972897-38973047)
chr5 (102-305)||(16311204-16311407)
chr5 (69-215)||(15564578-15564724)
chr5 (1-145)||(42717703-42717847)
chr5 (1-147)||(3564797-3564943)
chr5 (102-216)||(6810133-6810247)
chr5 (1-130)||(33862270-33862398)
chr5 (131-253)||(28568984-28569106)
chr5 (102-199)||(17153144-17153241)
chr5 (128-215)||(12773822-12773909)
chr5 (102-252)||(40187621-40187770)
chr5 (52-145)||(33420402-33420494)
chr5 (102-238)||(27900379-27900515)
chr5 (175-243)||(39422394-39422462)
chr5 (128-215)||(12712558-12712645)
chr5 (128-254)||(2681217-2681343)
chr5 (136-211)||(10822531-10822606)
chr5 (102-148)||(7350475-7350521)
chr5 (103-205)||(8020591-8020693)
chr5 (102-212)||(32574942-32575052)
chr5 (180-253)||(43523801-43523874)
chr5 (136-223)||(23044984-23045071)
chr5 (102-204)||(12457492-12457594)
chr5 (180-253)||(18116480-18116553)
chr5 (154-274)||(24207711-24207830)
chr5 (103-254)||(29664947-29665095)
chr5 (163-203)||(30116816-30116856)
chr5 (229-301)||(38006396-38006468)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (1-305)||(33267-33577)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (1-305)||(19104747-19105055)
chr2 (40-301)||(24414046-24414308)
chr2 (5-305)||(13830614-13830914)
chr2 (34-309)||(30846852-30847129)
chr2 (1-305)||(31942095-31942400)
chr2 (34-308)||(36128013-36128289)
chr2 (1-254)||(7314609-7314863)
chr2 (24-305)||(8915848-8916129)
chr2 (1-302)||(45256697-45256999)
chr2 (1-305)||(6027811-6028104)
chr2 (1-305)||(37106573-37106871)
chr2 (1-267)||(45115432-45115701)
chr2 (34-307)||(10208339-10208612)
chr2 (40-308)||(37999396-37999659)
chr2 (1-205)||(13705371-13705576)
chr2 (34-305)||(9632293-9632565)
chr2 (5-305)||(42797911-42798200)
chr2 (1-276)||(12193766-12194042)
chr2 (1-205)||(14540660-14540860)
chr2 (3-277)||(44746047-44746322)
chr2 (5-305)||(10920523-10920817)
chr2 (136-276)||(37472698-37472838)
chr2 (179-304)||(18106029-18106155)
chr2 (1-191)||(16226761-16226941)
chr2 (128-233)||(38342501-38342606)
chr2 (102-259)||(13531925-13532081)
chr2 (5-143)||(18106162-18106301)
chr2 (111-233)||(35248367-35248489)
chr2 (108-253)||(15546726-15546871)
chr2 (136-253)||(24051586-24051703)
chr2 (1-87)||(37472857-37472944)
chr2 (174-267)||(12341648-12341741)
chr2 (128-205)||(14331529-14331606)
chr2 (120-217)||(22900788-22900885)
chr2 (104-205)||(25210355-25210456)
chr2 (102-205)||(35965311-35965413)
chr2 (112-233)||(30978913-30979032)
chr2 (128-205)||(43371555-43371632)
chr2 (102-217)||(40359320-40359435)
chr2 (167-254)||(40734545-40734632)
chr2 (128-233)||(44057884-44057990)
chr2 (102-187)||(4961479-4961564)
chr2 (112-212)||(18485634-18485734)
chr2 (153-253)||(26755767-26755867)
[»] chr6 (42 HSPs)
chr6 (1-306)||(2367199-2367505)
chr6 (40-301)||(32853756-32854018)
chr6 (12-309)||(12678000-12678297)
chr6 (34-296)||(5863302-5863565)
chr6 (1-305)||(24602778-24603070)
chr6 (1-212)||(7393890-7394101)
chr6 (1-212)||(14505960-14506171)
chr6 (5-305)||(12141262-12141563)
chr6 (34-305)||(3483833-3484105)
chr6 (1-267)||(30816131-30816398)
chr6 (89-305)||(32532502-32532718)
chr6 (40-306)||(27534596-27534863)
chr6 (5-305)||(10142428-10142729)
chr6 (34-306)||(24225604-24225883)
chr6 (34-277)||(27738678-27738922)
chr6 (5-304)||(10187991-10188284)
chr6 (1-148)||(14032430-14032577)
chr6 (40-278)||(11762358-11762596)
chr6 (69-308)||(12309514-12309759)
chr6 (1-279)||(14254832-14255109)
chr6 (70-254)||(32053031-32053209)
chr6 (118-254)||(15498315-15498451)
chr6 (110-243)||(29341239-29341372)
chr6 (157-306)||(30986283-30986432)
chr6 (102-217)||(20349039-20349154)
chr6 (124-205)||(14410865-14410946)
chr6 (1-87)||(14410961-14411047)
chr6 (103-246)||(256461-256604)
chr6 (102-254)||(1947753-1947904)
chr6 (138-254)||(9442441-9442556)
chr6 (131-223)||(28079688-28079780)
chr6 (131-253)||(9458667-9458789)
chr6 (102-305)||(32959836-32960026)
chr6 (1-94)||(14245121-14245214)
chr6 (102-205)||(13769047-13769150)
chr6 (158-305)||(31496465-31496612)
chr6 (158-305)||(31501851-31501998)
chr6 (128-217)||(18908894-18908983)
chr6 (229-301)||(14410782-14410853)
chr6 (142-233)||(9458873-9458964)
chr6 (130-212)||(29199888-29199970)
chr6 (167-223)||(19367049-19367105)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (1-308)||(14649-14956)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-279)||(90471-90743)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (1-205)||(197337-197541)
[»] scaffold0519 (1 HSPs)
scaffold0519 (69-305)||(10240-10468)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (1-189)||(36030-36216)
[»] scaffold0027 (2 HSPs)
scaffold0027 (1-133)||(6280-6412)
scaffold0027 (172-305)||(7742-7874)
[»] scaffold0189 (1 HSPs)
scaffold0189 (1-198)||(4130-4329)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (1-224)||(33457-33691)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (128-239)||(2970-3081)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (180-277)||(14900-14998)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (172-301)||(14098-14226)
scaffold0014 (1-65)||(14295-14359)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (128-253)||(67750-67875)
scaffold0008 (128-253)||(75593-75718)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (112-233)||(128103-128224)
scaffold0013 (118-186)||(105498-105566)
[»] scaffold0795 (1 HSPs)
scaffold0795 (172-308)||(269-404)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (102-214)||(20740-20852)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (130-223)||(211367-211460)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (118-253)||(70086-70222)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 48)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 118 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 37961059 - 37960676
Alignment:
Q  118 catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcata 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37961059 catttgggacgggtttgggtatgagttcggggtgtgtacctatatacctgttacctgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaacccaaactcata 37960960  T
Q  218 tccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaat----ttcatc 313  Q
     ||||| | | |||||||||  |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||| ||||||||||| |    | ||||    
T  37960959 cccaaacctagtcaaaacgggaaaaacccatcaaattaggttcggttcgggtgggtaactacggatatgagttttgatgtcatgcctacttccatccatc 37960860  T
Q  314 catagtttgttgaacaaatat---tgctatagtgctattgctaatgtctcatccaacatctc------caacgtatgatgtgttccacttcctcagccac 404  Q
    ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37960859 catagttggttgaacaaatatttctgctatagtgctattgctaatgtctcatccaacatctccaacggcaacgtatgatgcgttccacttcctcagccac 37960760  T
Q  405 ttgtcacagcttgagagaggtgatgaaatttccccatccctatggaatatgaagtaccatttataaagtttttaccaaggaaat 488  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37960759 tcgtcacagcttgagagaggtgatgaaatttccccatccctatggaatatgaagtaccatttataaagtttttaccaaggaaat 37960676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 27932286 - 27932563
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27932286 tttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 27932385  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  27932386 acataaaataattttttacatttgggacggatatgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttactcgtcccatacccgtgttttgaaatcgg 27932485  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacc 277  Q
    |||||| ||| || |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||    
T  27932486 ggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaacc 27932563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 29109037 - 29108770
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29109037 tttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccttcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataatatgacatatca 29108938  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  29108937 acataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtgggtacatatatacccgttacccgtcccatacccatgttttaaaatcgg 29108838  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgg 267  Q
    | |||| ||| || |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||    
T  29108837 gaaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgg 29108770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 1012491 - 1012770
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  1012491 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtactttttataacacagcaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 1012590  T
Q  101 cataaatta--attttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcg 198  Q
    |||||| ||   |||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||| ||| ||||||||||| | || ||||||||||    
T  1012591 cataaagtagttttttttgcattcgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccattacccgtcccatactcatg-ttttaaatcg 1012689  T
Q  199 gggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccac 279  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||| |||||||||| | || | |||||||||||||||||    
T  1012690 gggaaaacccaaactcatacccaaactcaatcaaaacgaggaaaacccgtcaaattgggtttgattcgggtgggtaaccac 1012770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 17469129 - 17469427
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||| |||| ||||| | ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17469129 tttaaaattttttagacccattgatttagtttctcctttaaatatcaatggtagcttttataacaaggcaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 17469228  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17469229 cataaagtagttttctgcagttgggacgggtttgggtatgggtttggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggg 17469328  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
    ||||| ||||||            ||| ||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||   ||| |||||||||| |||    
T  17469329 gaaaacccaaac------------ccagtcaaaacggggaaaatccgtcaaattgggtttggttcgggtgggtaactacgggtatgggttttgttgccat 17469416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 20399465 - 20399770
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatc-aaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||  ||| ||||||| |||  ||||||    
T  20399465 tttaacatttgttagaccgattgatttggttggtcctttaaatatcaatgctagtttttataacacgacaattatataaaaaaaataacatggtatatca 20399564  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||| || |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  20399565 acataaaataattttttgcattcgggacgggtttgggaatgggttcggggtgggtatctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgg 20399664  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
     ||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||| | || |||||| | ||||||||||   ||| |||||||||| ||    
T  20399665 agaaaacccaaacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaactcgtcaaattgggtttggttcgagcgggtaaccacgggtattggttttgttgcca 20399764  T
Q  300 tgccta 305  Q
    ||||||    
T  20399765 tgccta 20399770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 24568813 - 24569116
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24568813 tttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttataacacatcaattatcaaacaaaataac-tgacatatcaa 24568911  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| || |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| || | ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  24568912 cataaagtagttttctccattcgggacggatttgagtatgggttcggggtggatacctatatacccgctacctgtcccatacccatgttgtgaaatcggg 24569011  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
     |||| ||| || |||| | ||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| | | ||| ||||| |||  |||||||||||||    
T  24569012 aaaaatccatacccatacctaaacccaatc-aaacggggaaaacccgtcaaattaggtttggttcggatagataatcacatgtatgtgttttgttgtcat 24569110  T
Q  301 gcctaa 306  Q
    ||||||    
T  24569111 gcctaa 24569116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 305
Target Start/End: Original strand, 32302966 - 32303239
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctg-catttgggacgggt 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||||    
T  32302966 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaatagtttttttacatttgggacgggt 32303065  T
Q  132 ttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatca 231  Q
    ||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| |||    
T  32303066 ttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtca 32303165  T
Q  232 aaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | || | |||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||    
T  32303166 aaacggggaaaacccgtcaaattgggtttgtttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgccta 32303239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 43113840 - 43113562
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  43113840 tttaacatttgttataccgattgatttagttgctccttcaaatatcaatgatagtttttataacacgacaattatctaacaaaataacataacatatcaa 43113741  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    ||| || || ||||||||||| | ||||| |||| ||||| ||||||| || |||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  43113740 catgaagtagttttctgcattcgagacggatttgggtatgagttcggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatgcccgtgttttgaaatcggg 43113641  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccac 279  Q
     |||| |||| ||||||  |||| ||| ||||| | | ||||| |||| ||||| | || |||||||||||||||||||    
T  43113640 aaaaacccaatctcatacgcaaacccagtcaaagcagggaaaacccgttaaattgggtttggttcgggtgggtaaccac 43113562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24870238 - 24869980
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |  ||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  24870238 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagttttattaacatgacaattatcaaacaaattaacatgacatatcaa 24870139  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||| || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24870138 cataaagtaattttttacatttgggacgggtttaggtatgggctcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcacatacccgtgttttaaaatcggg 24870039  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagatt 259  Q
    |||||  || |  |||| |||||| || |||||||||  |||| |||||||||| ||||    
T  24870038 gaaaactcatagccatacccaaattcagtcaaaacgggaaaaacccgtcaaattggatt 24869980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 34139321 - 34139573
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||   ||||||    
T  34139321 tttaacatttgttagaccgattgatttgtttactcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggtctatcaa 34139420  T
Q  101 cataaattaa-ttttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    |||||| ||| |||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||| || |||| |||||||| ||||   |||| ||| |||||||||||||||||    
T  34139421 cataaagtaatttttttgcattcgggacgggtttgggtat-ggttcggggtgggtacctatatacctgttacatgtcctatatccgtgtttttaaatcgg 34139519  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    || |||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||  ||||| ||||||||||    
T  34139520 gg-aaaaccaaacacatacccaaacccagtcaaaacgaggaaaacccgtcaaatt 34139573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 305
Target Start/End: Original strand, 24927855 - 24928127
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| || | | ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  24927855 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaagatgacaattatcaaacaaaataacataacatatccacataaagtagttttttacatttgggacgggtt 24927954  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||  | ||| ||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||||    
T  24927955 tgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtctcatacccgtgtttcgagatcagggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaa 24928054  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | || |||||||| |||||||| |   ||| |||||||||| ||||||||    
T  24928055 aacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgcgggtatgggttttgttgccatgccta 24928127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 45235938 - 45236192
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  45235938 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacataacatatca 45236037  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  |||||||||||| || |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  45236038 acataaattaattttttacatttgggacgggtatggatatgggttcggggtgggtacctatatacccattacccgtcccatacccgtgttttgaaatcag 45236137  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    ||||||  || || ||||  ||||  || ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  45236138 ggaaaactcatacccatactcaaactcagtcaaaacggggaaaacccgtcaaatt 45236192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 17220590 - 17220892
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17220590 tttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccttcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 17220689  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| |||| || | |||||||||||||| ||     ||||||||| || |||| |||||| || | |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  17220690 acataaagtaatcttttacatttgggacgggtatg-----gggttcggggtgggtacctatataaccatcatccatcccatacccgtgttttgaaatcgg 17220784  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaac--cacatatataggttttgttgt 297  Q
    |||||| ||| || |||| |||||  || |||||| || ||||| |||||||||| |||| |||||| | |||||||  | |   |||||||||||||||    
T  17220785 ggaaaatccatacccatacccaaactcagtcaaaatggggaaaacccgtcaaattggatttggttcgtgcgggtaaccgcgcgggtataggttttgttgt 17220884  T
Q  298 catgccta 305  Q
    ||||||||    
T  17220885 catgccta 17220892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 1063380 - 1063692
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  || || |||||||||||||| || |||| |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1063380 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcgtttaaatatcaatggtaatttttatcaacatgacaattatcaaacaaaataacaagacatatca 1063479  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | || |||||| || |||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  1063480 acataaagtaattttttacacttgggatggatttgggtatgagttcggggtgggtacttatatacccgttaaccgtcccatacccgtgttttgaaatcgg 1063579  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcat------atccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttg 293  Q
    | |||| ||| || |||      | ||| | ||| ||||||||| ||||| |||||||||  | || |||||||| ||||||||||   |||  ||||||    
T  1063580 gaaaaacccatacccatacccacacccacacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaatcgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgagttttg 1063679  T
Q  294 ttgtcatgcctaa 306  Q
    ||| |||||||||    
T  1063680 ttgccatgcctaa 1063692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 36132130 - 36131839
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||  | ||| |||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  36132130 tttaacatttgtttgaccgattaatttaattgcttctttaaattttaatggtaatttttataacacggcaattatcaaacaaaataacatgacatat-aa 36132032  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| ||  ||| | ||| ||| ||| || |||||||| |||||||| |||| |||    
T  36132031 cataaaataactttctgcattcgggacggatttgtgtatgagttcggggtggatacctgtatgccctttacccatcccatactcgtgttttgaaataggg 36131932  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
    |||||  |||||            |||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||    
T  36131931 gaaaactcaaac------------ccaatcaaaacggaaaaaatccatcaaattaggtttggttcgggtgggtaaccacggatatgaattttgttgtcat 36131844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 198
Target Start/End: Original strand, 14186205 - 14186391
Alignment:
Q  8 tttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaat 107  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    ||||||| |  |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  14186205 tttgttagaccaattgatttagttactcctttaaatatcaatggtagtt----taacacgactgttatcaaacaaaataacatggcatattaacataaat 14186300  T
Q  108 taattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcg 198  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  14186301 taattttctacattcaggacgggtttgggtatgggttcagggtgagtacctatatatccgttacccatcccatacccgtgttttgaaatcg 14186391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 40248497 - 40248281
Alignment:
Q  89 atgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgt 188  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40248497 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggatatgggtatgggttcgggatgggtacctatatacccgttatccgtctcatacccgtgt 40248398  T
Q  189 ttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatatagg 288  Q
    ||| |||||||||||||   | || |||| ||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| | || ||||| || | |||||| |   ||| ||    
T  40248397 tttgaaatcggggaaaacatatacccatacccaaacccagtcaaaacgggaaaaacccgtcaaattgggtttggttcaggcgagtaaccgcgggtatggg 40248298  T
Q  289 ttttgttgtcatgccta 305  Q
    |||||||||||| ||||    
T  40248297 ttttgttgtcataccta 40248281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 39445782 - 39445537
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||  || || ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  39445782 tttaacatttgttagacggaatgatttaattgatcatt-aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatct 39445684  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||        ||| | |||||||||||||| || ||||| ||||||| || |||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  39445683 acat--------tttttacatttgggacgggtatgggtatgagttcggggtgggtacctataaacccgttacctgtcccatacccgtgttttgaaatcgg 39445592  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    | |||| ||| || |||| ||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  39445591 gaaaaacccatacccatacccaaacctagtcaaaacggggaaaatccgtcaaatt 39445537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 4230930 - 4230649
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || |  |||||||||    
T  4230930 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataatgtatcaacat 4230831  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||           || |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  4230830 aaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggt-----------acctatatacccgttactcgtcccatacctgtgttttgagatcggggaa 4230742  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttg 296  Q
    || ||| || |||| ||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||| | || |||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||    
T  4230741 aacccatacccatacccaaacccagtcaaaatggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacatgtatggattttgttg 4230649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 69 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 11255153 - 11254925
Alignment:
Q  69 caattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgt 168  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||   || |||| |||||||| ||    
T  11255153 caattatcaaacaaaataacat-acatatcaacacaaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcgtagtgggtacctatatacctgt 11255055  T
Q  169 tatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcggg 268  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||     |||| ||||| | | |||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||     
T  11255054 tatccgtcccatacccgtgtttggaaagcggg--aaaacc-----catacccaaacctagtcaaaacggaaaaaacccgtcaaattggatttggttcgga 11254962  T
Q  269 tgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
      ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  11254961 caggtaaccgcatgtatgggttttgttgtcatgccta 11254925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 161 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5858706 - 5858566
Alignment:
Q  161 atacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattc 260  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||     
T  5858706 atacccgttacccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggaaaaacccaaacccatacccaaacccaatcaaaacggggaaaacccgtcaaattggattt 5858607  T
Q  261 ggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatg 301  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||| | |||||||| ||||    
T  5858606 ggttcgggtaggtaaccacaggtatggattttgttgccatg 5858566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 205
Target Start/End: Original strand, 34776972 - 34777144
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| || ||    
T  34776972 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacattgcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataattttttacatttgggatggatt 34777071  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaa 205  Q
    || ||||||||||||| || |||| || ||||| ||||  ||| ||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  34777072 tgggtatgggttcggggtgggtacctaaatacctgttactcgttccatacccgtgttttgagatcgggaaaaa 34777144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 2076045 - 2075743
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  2076045 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 2075946  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcggg--atgagtacttatatacccgttatccg-tcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||  ||||  | | |||  ||  |||||     |||  ||||||||| |||||| | ||||||    
T  2075945 aaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatggg-acgggtaacgggtatataggtaccc--accccgaacccatacccatgttttgagatcggg 2075849  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
     |||| ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||  ||||  ||||||||| |||    
T  2075848 aaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggagaaaatccgtcaaattgggtttggttcaggcgggtaaccacggatatgagttttgttgccat 2075749  T
Q  301 gcctaa 306  Q
    ||||||    
T  2075748 gcctaa 2075743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9642458 - 9642354
Alignment:
Q  108 taattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaac 207  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  9642458 taattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcgggatggatatatataaccccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaacc 9642359  T
Q  208 caaac 212  Q
    |||||    
T  9642358 caaac 9642354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8545461 - 8545342
Alignment:
Q  103 taaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggga 202  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||  ||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  8545461 taaattgattttctacatttgggacgagtttgagtatgggttcggggtgggtatctatatccccgttactcgttccatacccgtgttttgaaatcggaga 8545362  T
Q  203 aaaaccaaactcatatccaa 222  Q
    ||| ||||||| ||| ||||    
T  8545361 aaacccaaacttatacccaa 8545342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 28977290 - 28977185
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagta 138  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||| ||     
T  28977290 aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtg 28977191  T
Q  139 tgggtt 144  Q
    ||||||    
T  28977190 tgggtt 28977185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 34021352 - 34021583
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||  ||  ||||| |||||||||| |||||| |||||  | | ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  34021352 tttaacatttgttagattaattgatttcgttgctcctttaaatatcaatagtagtttttatataatgacaattatcaaacaaaataacat-acatatcaa 34021450  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| | ||||||||||||  ||||| || || |||| |||| ||| || |||| ||||| || ||||  ||| ||||| |||| |||| |||||| |    
T  34021451 cataaa-tgattttctgcattcaggacgagtctgtgtattggtttggggtgtgtacctatattcctgttactcgttccatatccgtattttaaaatcgtg 34021549  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaa 234  Q
    |||||   |||||||||  |||| ||||| ||||    
T  34021550 gaaaacttaaactcatactcaaacccaataaaaa 34021583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 35215378 - 35215474
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatat 97  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  35215378 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctccattaaatatcaagggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggcatat 35215474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 103 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 30481533 - 30481368
Alignment:
Q  103 taaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggga 202  Q
    |||||||||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||||| | | |||  |||| ||||| ||| |||| ||||| || |    
T  30481533 taaattaattttttacattcgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatcctcattactcgtctcatactcgtattttgaaatcaggaa 30481434  T
Q  203 aaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcggg 268  Q
    ||| |||||||||||  |||| ||||||||||| | |||||||| |||| |||| || ||||||||    
T  30481433 aaacccaaactcatactcaaacccaatcaaaacagggaaaatccatcaatttaggtttggttcggg 30481368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 307
Target Start/End: Original strand, 35215562 - 35215715
Alignment:
Q  153 gtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaa 252  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| ||  |||||||||  |||| | ||||||    
T  35215562 gtacctatatactcgttacccgtctcatacccgtgttttgaaatc-gggaaaacccaaaatcatacccaaacccggtcaaaacgggaaaaaccggtcaaa 35215660  T
Q  253 ttagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaat 307  Q
    || | || || ||||  ||||||||||  |||| ||||||||||  |||||||||    
T  35215661 ttgggtttgggtcggacgggtaaccacggatatgggttttgttgctatgcctaat 35215715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27777283 - 27777158
Alignment:
Q  130 gtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaat 229  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||| | |||  | |||| | ||||| |||| ||||||| |||||||| ||||  ||||| |||| ||||| ||| |    
T  27777283 gtttgggtatgggttcggggtgggtacctgtatctctgttacctgtcccgtacctgtgttttgaaatcgggaaaaactcaaacacatacccaaacccagt 27777184  T
Q  230 caaaacggagaaaatccgtcaaatta 255  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  27777183 caaaacggagaaaacccgtcaaatta 27777158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 124 - 254
Target Start/End: Original strand, 14687396 - 14687526
Alignment:
Q  124 ggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaa 223  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||| ||||| || |||   ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||  |||| |||||    
T  14687396 ggacgagtttgggtatgggttcggggtggatacatatatccctgtttctcgtcccatacctgtgttttgaaatcggggaaaacccaaatccatacccaaa 14687495  T
Q  224 tccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
     |||||||||  || ||||| ||| ||||||    
T  14687496 cccaatcaaagtggggaaaacccgccaaatt 14687526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 17084194 - 17084027
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatcca 227  Q
    |||||||  |||| ||||||| || |||  ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| |||||      || ||| |||    
T  17084194 gggtttggatatgagttcggggtgggtatctatatccccgttacccgtctcgtacccgtgttttaaaatcggagaaaacccaaa------tcaaaaccca 17084101  T
Q  228 atcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatg 301  Q
     ||||| ||| ||||| ||||||| ||  ||| |||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||    
T  17084100 gtcaaagcggggaaaacccgtcaacttgaatttggttcgggtgggtacccacaagtatgggttttgttgtcatg 17084027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 6388578 - 6388477
Alignment:
Q  153 gtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaa 252  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||   |||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||| |||||  || ||||||||||||||  ||||||||    
T  6388578 gtacctatatccccgttacccgtcttgtacccgtgttttaaaatcggggaagacccaaacccatacccaaactcagtcaaaacggagaaagcccgtcaaa 6388479  T
Q  253 tt 254  Q
    ||    
T  6388478 tt 6388477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27056662 - 27056517
Alignment:
Q  108 taattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaac 207  Q
    ||||||| | ||||||||||| || || ||||||||||||| || |||  ||||  ||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||||| |||| |    
T  27056662 taattttttacatttgggacgagtatgtgtatgggttcggggtgggtagatataaccccgttacccgtcccatacctgtactttgaaatcgggaaaaacc 27056563  T
Q  208 caaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    ||||| |||| ||||| |||  |||| ||  ||||| |||||||||    
T  27056562 caaacccataaccaaacccagccaaagcgaggaaaacccgtcaaat 27056517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 254
Target Start/End: Original strand, 14155507 - 14155659
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||  || ||| ||  ||  ||||| | ||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||     
T  14155507 ataaattgattttctacatttaggatgggtttgggtatgaatttggggtggataaatatatcctcgttacccatcttatacccgtgttttgaaatcggga 14155606  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||| ||| | ||| ||||| ||||||||||    
T  14155607 aaaacccaaactcatacccaaacccagtcataccggggaaaacccgtcaaatt 14155659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 29416263 - 29416128
Alignment:
Q  138 atgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgg 237  Q
    ||||||||||| || |||| ||||| | ||||| || |||  ||| |||||||| |||| | | ||||  |||||||||| |||||  || |||||||||    
T  29416263 atgggttcggggtgggtacatatatcctcgttacccatcctttactcgtgtttt-aaatagagaaaaagtcaaactcatacccaaactcagtcaaaacgg 29416165  T
Q  238 agaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggta 274  Q
     ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  29416164 ggaaaacccgtcaaattggatttggttcgggtgggta 29416128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9476126 - 9475992
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatc-ggg 200  Q
    |||| |||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||| | || ||| |||||| |||||||   ||||| || |||| |||| ||||| |||    
T  9476126 ataatttaattttctacattcgggatgggtttgggtatgggttcgaggtgggtatttatatccccgttacttgtcccgtatccgttttttgaaatcgggg 9476027  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaac 235  Q
    ||||| ||| |  ||||||||||| ||||| ||||    
T  9476026 gaaaatccatatccatatccaaattcaatcgaaac 9475992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 253
Target Start/End: Original strand, 10297467 - 10297584
Alignment:
Q  136 gtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaac 235  Q
    |||||||||| || |  |||| ||||| ||||||| | ||||| | ||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||| |    
T  10297467 gtatgggttcagggtaggtacatatatccccgttacctgtcccgtccccgtattttgaaatcggggaaaacccaaattcacatccaaacccaataaaatc 10297566  T
Q  236 ggagaaaatccgtcaaat 253  Q
     | ||||| |||||||||    
T  10297567 agggaaaacccgtcaaat 10297584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15068666 - 15068550
Alignment:
Q  136 gtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaac 235  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||| | ||||| ||||||| |||| ||||||||||||| || ||| |||| ||| | ||| ||||| |    
T  15068666 gtatgggttcggggtggatacatatat-cccgttacctgtcccgtacccgtattttgaaatcggggaaaacccgaacccatacccagacccagtcaaatc 15068568  T
Q  236 ggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    || ||||| |||||||||    
T  15068567 ggggaaaacccgtcaaat 15068550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 184
Target Start/End: Original strand, 2075867 - 2075915
Alignment:
Q  136 gtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccataccc 184  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2075867 gtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccataccc 2075915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 233
Target Start/End: Original strand, 29918582 - 29918713
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||| |||||    |||| |||| |  |||  ||||||| ||||||||     
T  29918582 ataaattgattttttacatttgggacgggtttgtgtatggtttcggggtgggtacatatatctttgttacccgttctgtacatgtgttttgaaatcggga 29918681  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaa 233  Q
    ||||  |||||||||| ||||| ||| |||||    
T  29918682 aaaactcaaactcatacccaaaaccagtcaaa 29918713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 204
Target Start/End: Original strand, 30904021 - 30904123
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||| | |||| ||||||||  ||| || ||||||||||  || ||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||    
T  30904021 ataaattgattttctacattcgggactgatttgggtatgggtatggggtgggtacttatatctccattacccgtctcgtacccgtgttttgaaatcgagg 30904120  T
Q  202 aaa 204  Q
    |||    
T  30904121 aaa 30904123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 39379692 - 39379595
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    ||||||| |||| || |||| |||||| ||||||||||| ||||||| || |||||| ||| | | ||| ||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  39379692 ataaattgatttactacattcgggacgagtttgagtatgagttcggg-tgggtacttttatcctcattacccgtcccgtacccgtgttttgagatcggg 39379595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 205
Target Start/End: Original strand, 5700333 - 5700434
Alignment:
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||||||||||| | |||| |||| || |||| ||||||||||| | || |||  ||||| ||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||| ||    
T  5700333 aaattaattttatacattcgggatggatttgggtatgggttcgaggtgggtatctatatccccgttaccagtctcatacctgtgttttgaaatcgggaaa 5700432  T
Q  204 aa 205  Q
    ||    
T  5700433 aa 5700434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 104
Target Start/End: Original strand, 29089589 - 29089685
Alignment:
Q  7 atttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacata 104  Q
    |||||||||| | ||| ||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||   |||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  29089589 atttgttagacccattaatttagttgctcctttaaatatcaatgatagttttaataacacaataattatcaaacaaaataacat-acataccaacata 29089685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 40248562 - 40248502
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat 61  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  40248562 tttaacatttgttagactgaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttat 40248502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 69)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 26564711 - 26565016
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26564711 tttaacatttgtttgaccgattgatttagttgttccgttaaatatcaatgatagtttttataacacggcagttatcaaacaaactaacatgacatatcaa 26564810  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26564811 cataaagtagttttctgcatttgggacgggtttgggtatggtttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgcgttttgaaatcggg 26564910  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
    ||||   |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||   ||| |||||||||| |||    
T  26564911 gaaagctcaaactcatacccaaacccagtcaaaacgaagaaaatccgtcaaattggatttggttcgggtgggtaaccacgggtatgggttttgttgccat 26565010  T
Q  301 gcctaa 306  Q
    ||||||    
T  26565011 gcctaa 26565016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 6482251 - 6481950
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  6482251 tttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaatgttagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 6482152  T
Q  101 cataaattaattttct-gcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
     |||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  6482151 tataaattagtttttttgcatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatataccctttactcgtcccatacccgtgtttttaaattgg 6482052  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   || | ||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||    
T  6482051 ggaaaacccaaacccatacccaaacccaatcaaaacagagaaaatccgtcaaattgagtttgattcgggtggataaccacgggtataggttttgttgcca 6481952  T
Q  300 tg 301  Q
    ||    
T  6481951 tg 6481950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Original strand, 11027955 - 11028259
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| |||||| ||| |||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  11027955 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatataaatagtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaatat 11028054  T
Q  104 aaattaattttctg-catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggga 202  Q
    ||| ||||||| |  |||||||||| |||||| ||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  11028055 aaagtaatttttttacatttgggacaggtttgggtatgagttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcgggga 11028154  T
Q  203 aaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgc 302  Q
    ||| ||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||    
T  11028155 aaacccatacccatacccaaatccagtcaaaacggagaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggtgggtaaccacgtgtatgggttttgttgccatgc 11028254  T
Q  303 ctaat 307  Q
    |||||    
T  11028255 ctaat 11028259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7985337 - 7985034
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttatt-ataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||  || || ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  7985337 tttaacatttgttagaccaattgatttagttgctcatttaaatatcaacggtagttttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacttatca 7985238  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  7985237 acataaaatacttttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcgggatgagtac----atacatgttatccgtcccatacccatgttttgaaatcgg 7985142  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
     ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||   ||||| |||||||||| | || ||||| || || |||||||| ||||  ||||||||| ||    
T  7985141 agaaaatccaaacttatacccaaacccaatcaaaaccaggaaaacccgtcaaattgggtttggttcaggcggataaccaca-atatgagttttgttgaca 7985043  T
Q  300 tgcctaatt 308  Q
    |||||||||    
T  7985042 tgcctaatt 7985034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 31752335 - 31752640
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||||| ||  || || |||||||| || ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31752335 tttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcattgttagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 31752434  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||| || | || ||||||| |||||  |||| |||||||||||||| |||||||    
T  31752435 acataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtgggaacctatatactcgttactcgtctcatacccgtgttttgaaatcgg 31752534  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||| |||| | |||||| |||||||| |   ||| |||||||||||||    
T  31752535 ggaaaacccatacccatatccaaacccaatcaaaacggtaaaaacccgtcaaattggatttgattcgggcgggtaaccgcgggtatgggttttgttgtca 31752634  T
Q  300 tgccta 305  Q
    ||||||    
T  31752635 tgccta 31752640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 47550565 - 47550264
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  47550565 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 47550466  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  47550465 aaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaa 47550366  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    ||  || ||  ||| ||||| ||| |||||| || ||||||||| ||||||   || |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||    
T  47550365 aactcatacctatacccaaacccagtcaaaatggggaaaatccgccaaattgagtttggttcgggcgggtaaccacatgtatgggttttgtttccatgcc 47550266  T
Q  304 ta 305  Q
    ||    
T  47550265 ta 47550264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1724525 - 1724309
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  1724525 tttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttataacacatcaattatctaacaaaataacatgacatatcaa 1724426  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  1724425 cataaagtagttttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatataaccgttacccgtcccatacccatgttttgaaatcggg 1724326  T
Q  201 gaaaaaccaaactcata 217  Q
    ||||| |||||| ||||    
T  1724325 gaaaacccaaacccata 1724309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 34 - 279
Target Start/End: Original strand, 21423773 - 21424019
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  21423773 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataatataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtt 21423872  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||  | || |||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||||    
T  21423873 tgtgtatgggtttggggtgggtacctatatacccgttacccgtctcatacccgtgtttcgagattggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaa 21423972  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccac 279  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  21423973 aacgggaaaaatccgtcaaattggatttggttcgggcgggtaaccac 21424019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 19534335 - 19534633
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19534335 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttagatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 19534434  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||||| |||| | |||||||||| ||||| ||||| | || |||| |||||||| |||| |||||||||||||   |||| |||||||     
T  19534435 cataaaataattttctacattcgtgacgggtttgggtatgagttcgaggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccagattttaaaatcgga 19534534  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
    ||      ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||   ||||| |||  |||| |||||| ||| |||    
T  19534535 ga------aaactcatacccaaacccaatgaaaacggagaaaacccgtcaaattggatttggtttggacaggtaatcacggatattggtttttttgccat 19534628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 55826807 - 55826534
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctg-catttgggacgggt 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||||    
T  55826807 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacgtgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggt 55826708  T
Q  132 ttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatca 231  Q
    |||  |||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||    
T  55826707 ttggatatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacctgtgtttcgagatcggggaaaacccatactcatatccaaacccagtca 55826608  T
Q  232 aaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||    
T  55826607 aaacagggaaaatccgtcaaattggatttggttcggacgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgccta 55826534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 301
Target Start/End: Original strand, 7608882 - 7609150
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| |||||||||||  |||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | || |||| | |||||||||||||||    
T  7608882 tcctttaaatatcaatgacagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacatagagtagttttttacatttgggacgggtt 7608981  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| || |||| ||||||||| ||||    
T  7608982 tgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaacccatacccatacccaaatccagtcaa 7609081  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatg 301  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||||    
T  7609082 aacggggaaaacccgtcaaattgggtttagttcgggtgggtaaccacgagtatgggttttgttgccatg 7609150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 34 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 31918742 - 31918467
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctg-catttgggacgggt 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||||    
T  31918742 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggt 31918643  T
Q  132 ttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatca 231  Q
    ||| ||||||||||||| || |||  ||||||||| |||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||    
T  31918642 ttgggtatgggttcggggtgggtaactatatacccattactcgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaacccatactcatacccaaacccagtca 31918543  T
Q  232 aaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaat 307  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | || ||||||||  |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||    
T  31918542 aaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcaggtaaccacggatatgggttttgttgccatgcctaat 31918467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 5902797 - 5902531
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  5902797 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataagataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtt 5902698  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||      |||| |||| ||||| ||| ||||    
T  5902697 tgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcgggga------aaacccatacccaaacccagtcaa 5902604  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    ||||| ||||| ||||||||||   || |||||||| ||||||||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  5902603 aacggggaaaacccgtcaaattgagtttggttcgggcgggtaaccacgggtataggttttgttgccatgccta 5902531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11123052 - 11122777
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||| |||| | ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  11123052 tcctttaaatatcaatggtactttttattaacatgacaattataaaacaaaataacaaaacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtt 11122953  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||| || |||| |||||  || ||||    
T  11122952 tgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggagaaaacccatacccatacccaaactcagtcaa 11122853  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaatt 308  Q
    |||||| |||||||||||||||   || |||||||| ||||||||||   |||  ||||||||| |||||||||||    
T  11122852 aacggaaaaaatccgtcaaattgagtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgagttttgttgccatgcctaatt 11122777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 34 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6382456 - 6382183
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctg-catttgggacgggt 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||||    
T  6382456 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaatagtttttttacatttgggacgggt 6382357  T
Q  132 ttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatca 231  Q
    ||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||| || |||| ||||| ||| |||    
T  6382356 ttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggagaaaacccatacccatacccaaacccagtca 6382257  T
Q  232 aaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    || ||| ||||| |||||||||| | || | |||||| ||||||||||   ||| |||||| ||| ||||||||    
T  6382256 aagcggggaaaacccgtcaaattgggtttgattcgggcgggtaaccacgggtatgggttttattgccatgccta 6382183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 34 - 305
Target Start/End: Original strand, 44317446 - 44317719
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctg-catttgggacgggt 131  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||||    
T  44317446 tcctttaaatatcaatcgtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggt 44317545  T
Q  132 ttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatca 231  Q
    ||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| |||    
T  44317546 ttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtca 44317645  T
Q  232 aaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    |||||| |||||||||||||||| | || | |||||| | ||||||||   ||| |||||||||| | ||||||    
T  44317646 aaacggggaaaatccgtcaaattgggtttgattcgggcgagtaaccacgggtatgggttttgttgccttgccta 44317719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 280
Target Start/End: Original strand, 39375160 - 39375437
Alignment:
Q  2 ttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaac 101  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  39375160 ttaacatttgttcgattgatttatttagttgttcctttaaatattagtggtagtttttataacacggcaattatcaaacaaaataacatgac--atcaac 39375257  T
Q  102 ataaattaa-ttttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
     |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||  ||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  39375258 gtaaagtaatttttttgcaattgggacgggtttgagtatgtgattggggtggatatctatatacccgttacccgtcctatacccgtattttgaaatcggg 39375357  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccaca 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || ||||||  |  |||| ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||    
T  39375358 gaaaagccaaactcatatccaaactcagtcaaaataggaaaaacccgtcaaattgaatttggttcgggcgggtaaccaca 39375437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 37349003 - 37349297
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  37349003 tttaagatttgttagaccgattaatttagttgctcctttaaatatcaacggtagtttttataacgcgagaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 37349102  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||  ||| ||||||||| |           |||||||||||| ||||||||    
T  37349103 cataaaataattttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcagggtggatacctatatacccat-----------tacccgtgttttgaaatcggg 37349191  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
    |||||  |||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||||| | || |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||| |||    
T  37349192 gaaaactcaaactcatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacctgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccat 37349291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 39046832 - 39047136
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  39046832 tttaacatttgttagacggaatgatttagttaatcctttaaatatcaacggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acatatca 39046930  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||||| ||  || |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||  |||| ||    
T  39046931 acataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggtttggagtgggtacctatatacccgttacatgtcccatacccgtgtttggaaattgg 39047030  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||| || ||||  ||||| || ||||||||||||||| || ||||||| | || | |||||  ||||||||    ||||||||||||||| ||    
T  39047031 ggaaaacccatacccatactcaaattcagtcaaaacggagaaaacccatcaaattgggtttgattcggacgggtaaccgtggatataggttttgttgcca 39047130  T
Q  300 tgccta 305  Q
    ||||||    
T  39047131 tgccta 39047136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 305
Target Start/End: Original strand, 43893140 - 43893411
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  43893140 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtt 43893239  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    || |||||  |||||| ||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||| || |||| ||||| ||| ||||    
T  43893240 tgggtatgaattcggggtggatacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcgggg-aaacccatacccatacccaaacccagtcaa 43893338  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | || || ||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||    
T  43893339 aacggggaaaacccgtcaaattgggtttggctcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgccta 43893411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12825676 - 12825462
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||| |||| ||||| | ||||||||| ||  ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  12825676 tttaatatttattagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaattttagtttttataacacgataattatcaaacaaaataacatgatatatcaa 12825577  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||| |||||| |||| ||||| || || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12825576 cataaagtaattttctgcactcgggacaggtttgggtataggttcagggtgggtacgtatatatccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggg 12825477  T
Q  201 gaaaaaccaaactca 215  Q
    ||||| |||||||||    
T  12825476 gaaaacccaaactca 12825462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 47239601 - 47239368
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||| || ||  | ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47239601 tttaacatttgataaatgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 47239502  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||| ||| || |||||||||| || || | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  47239501 acataaaataattttttacatttgggacaggtatgggtatgggttcagggtgggaacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttaaaatcgg 47239402  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaa 233  Q
      |||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  47239401 aaaaaatccatacccatatccaaatccaatcaaa 47239368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 37107291 - 37107553
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||| ||  | ||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37107291 tttaatatttgtcagaccgattgatttagttgcttctttaaataccaatggtagtttttataacatggcaattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 37107390  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||    |||  ||||   |||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  37107391 cataaagtaattttctgcattcgggatatattttggtataaattcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaat-tgg 37107489  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggtt 264  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||| |||||| ||  |||| ||||||||||| ||| ||||    
T  37107490 gaaaacccaaactcatacacaaacccagtcaaaatgggaaaaacccgtcaaattaaatttggtt 37107553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 48459360 - 48459665
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    |||||||||| |||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  48459360 tttaacattttttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatca 48459459  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||| |||| || ||||||||||||| || |||| |||||||| |||| |||| |||||||| |||||| |||||||    
T  48459460 acataaagtaattttttacatttgggatgggtatgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgttccatacccatgttttgaaatcgg 48459559  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||| |  ||||  ||||||||||||||| ||  |||| || ||||||| | || | |||||  |||||||| |  |||| | |||||||| ||    
T  48459560 ggaaaacccatatccatactcaaatccaatcaaaatgggaaaaacccatcaaatttggtttgattcggacgggtaaccgcggatatggattttgttgcca 48459659  T
Q  300 tgccta 305  Q
    ||||||    
T  48459660 tgccta 48459665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 42299670 - 42299972
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  |  ||||||| ||  || || |||||||||  |||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  42299670 tttaacatttgttagagaggatgatttagttgctcatttaaatatcaacagtagtttttattaacaagacaattatcaaacaaaataacatggcatatca 42299769  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| || |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  42299770 acataaagtactttt-tatatttgggacgtgtttgagtatgggttcagggtgggtacctatatacccgttacccgtcc-atacc-gtgttttgaaatcgg 42299866  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||| || |||| | |||  || ||||| |||| |||| ||||||||||   || ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||    
T  42299867 ggaaaatccatacccatacctaaactcagtcaaaccggaaaaaacccgtcaaattgagtttggttcggatgggtaaccgcatatatgaattttgttgtca 42299966  T
Q  300 tgccta 305  Q
    ||||||    
T  42299967 tgccta 42299972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 119 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15987359 - 15987173
Alignment:
Q  119 atttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatat 218  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||  || || ||||     
T  15987359 atttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtatctatatacccgttacccatcccatacccgtgttttaaaatctgggaaaactcatacccatac 15987260  T
Q  219 ccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||| |  || | |||||||||| ||||||||    
T  15987259 ccaaacccaatcaaaatggagaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggtgggtaaccgcgaatgtgggttttgttgccatgccta 15987173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 32585367 - 32585573
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggt-agttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatc 98  Q
    ||||||| ||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||| | |||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||     
T  32585367 tttaacaattgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgattagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacaagacatata 32585466  T
Q  99 aacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcg 198  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||| || || |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  32585467 aacataaagtaagtttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcagggtgggtacctatatacccgttacctgtcccatacccgtgttttgaaatcg 32585566  T
Q  199 gggaaaa 205  Q
    | |||||    
T  32585567 gagaaaa 32585573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 9230164 - 9230350
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaatta--ttccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatc 98  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||     
T  9230164 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacagttatcaaacaaaataacatgacatatt 9230263  T
Q  99 aacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtt 189  Q
    |    |   |||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9230264 a----atggtaattttctgcattcgggacgggtttggttatgagtttgggatggatacctatatactcgttatccgtcctatacccgtgtt 9230350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 13770670 - 13770523
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  13770670 tttaacatttgtttgaccgattgatttagttgctccttcaaatattaatggtcgtttttataacacggtaattatcaaacaaaataacatggcttattaa 13770571  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcggg 148  Q
    |||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  13770570 cataaaatagttttatgcattcgggacgggtttgagtatgagttcggg 13770523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 32596399 - 32596195
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||| ||||||||||   | ||||||| || |||||| |||||| |||| ||||| |||||||| | |||||||||||| |||| | |||  |||||||    
T  32596399 tttaaaatttgttagacttaatgatttagttgttccttcaaatattaatgctagtttttataacatgacaattatcaaaccaaatgacatggtatatcaa 32596300  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||||| |||| | |||  ||||| ||||| ||| | | || | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32596299 cataaaataattttctacattcgagacaagtttgggtatgagtttgaggtggggacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggg 32596200  T
Q  201 gaaaa 205  Q
    |||||    
T  32596199 gaaaa 32596195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 39188395 - 39188605
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||||| |||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39188395 tttaacatttgttagaacgattgatttagttttttctttaaatataaatggtagttttt-taacacgacagttatcaaacaaaataacatgacatatcaa 39188493  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgtta-tccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||  |||||| |||||| |||| | |||||   ||||||| ||| || |||| |||||| ||||||  |||| |||||  |||||||| ||||| |    
T  39188494 cataaaacaattttatgcattcgggatgagtttggacatgggtttggggtg-gtacctatatatccgttaccccgttccatagacgtgttttaaaatcag 39188592  T
Q  200 ggaaaaaccaaac 212  Q
    |||||| ||||||    
T  39188593 ggaaaacccaaac 39188605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 425703 - 425818
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  425703 tttaagatttgttagaccgattgatttagttgttcttttaaatatcaatggtagtttttataacatgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 425802  T
Q  101 cataaattaattttct 116  Q
    |||||| |||||||||    
T  425803 cataaagtaattttct 425818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 42774640 - 42774777
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42774640 tttaacatttgttagaaggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 42774739  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagt 137  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| |||||||| |||||    
T  42774740 acataaagtaattttttacattttggacgggtatgagt 42774777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 29755545 - 29755459
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataa 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29755545 tttaacatttgttagatcgattgatttagttacttctttaaatatcaatggtagtgtttataacacggtaattatcaaacaaaataa 29755459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19883169 - 19882998
Alignment:
Q  103 taaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggga 202  Q
    |||||| ||||| | |||| |||||| ||||| |||| |||||||| ||  ||| ||||| ||||||| || |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  19883169 taaattgattttatacattcgggacgagtttgtgtatcggttcggggtggatacctatatccccgttacccttcccgtatccgtgttttaaaatcgggga 19883070  T
Q  203 aaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggta 274  Q
    ||| |||||||||||  |||| ||||||||| |||  |||| |||||||||| | || |||||||| |||||    
T  19883069 aaacccaaactcatactcaaacccaatcaaagcgggaaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggta 19882998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4741306 - 4741209
Alignment:
Q  126 acgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaa 223  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  4741306 acgggtttttgtatgggttcggggtgggtacttatatccctgttatccgtcccatacccatgttttaaaatcgaggaaaactcaaactcatatccaaa 4741209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 253
Target Start/End: Original strand, 10302071 - 10302216
Alignment:
Q  108 taattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaac 207  Q
    ||||||| | |||||||||||| | || ||||||||||||| || |||| ||||  ||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| |    
T  10302071 taattttttacatttgggacggatatgggtatgggttcggggtgggtacatataaccccgttacccgtctcatacccgtactttgaaatcggggaaaacc 10302170  T
Q  208 caaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
     |||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  10302171 taaacccatacccaaacccaatcaaaacggggaaaacccatcaaat 10302216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 28695357 - 28695194
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||| ||  ||||| |||||| |||| ||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||| ||  ||||||||    
T  28695357 tttaacatttgttaaaccgaatgatttagttgctcctttaaatattaatgatagtttttataacgtgacaattatcaaataaaataacattgcatatcaa 28695258  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatac 164  Q
    ||||||  ||||| ||  ||||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  28695257 cataaagcaatttcctatatttgagacgagtttgggtatgagttcggggtgagtacctatatac 28695194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12505577 - 12505479
Alignment:
Q  180 tacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatcc-aaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacc 277  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  12505577 tacccgtgttttgaaatcggggaaaacccaaactcataccctaaacccaatcaaagcggagaaaacccgtcaatttaaatttggttcgggagggtaacc 12505479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 70 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13015397 - 13015323
Alignment:
Q  70 aattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggtt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||    
T  13015397 aattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacattcgagacgggtttgagtatgggtt 13015323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 254
Target Start/End: Original strand, 39086189 - 39086290
Alignment:
Q  153 gtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaa 252  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| ||  |||| |||| | ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39086189 gtacctatatccccgttacccgtaccgcacccatgttgtgaaatcggagaaaactcaaactcatatccaaacccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaa 39086288  T
Q  253 tt 254  Q
    ||    
T  39086289 tt 39086290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21956928 - 21956756
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||||| |||| |  ||| ||||| ||||||||||||| || | || ||||| |||||||  | | || |||||||||||| |||||||      
T  21956928 ataaattgattttctacattcgtaacgagtttgggtatgggttcggggtgggcacctatatccccgttactcattccgtacccgtgttttaaaatcggaa 21956829  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggta 274  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||| |||| |||||||| |||||    
T  21956828 aaaacccaaactcatacccaaatccaattaaaatgggaaaaacctgtcaaatttgatttggttcgggcgggta 21956756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 252
Target Start/End: Original strand, 43309526 - 43309614
Alignment:
Q  164 cccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaa 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  43309526 cccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgggaaaaacccaaactcatactcaaacccagtcaaagcggagaaaacccgtcaaa 43309614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 254
Target Start/End: Original strand, 30672993 - 30673094
Alignment:
Q  153 gtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaa 252  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | | ||||| ||||||||    
T  30672993 gtacatatatccccattatccgtcccgtacccgtattttaaaatcggagaaaatccaaactcatacccaaacccaatcaaatcagggaaaacccgtcaaa 30673092  T
Q  253 tt 254  Q
    ||    
T  30673093 tt 30673094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 211
Target Start/End: Original strand, 36306766 - 36306875
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| | | |||||| |  |||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  36306766 ataaattgattttctacattcgggacgggtttgagtgtagcttcgggttaggtacctatatccccgttaaccgtctcatacccgtgttttgaaatcggag 36306865  T
Q  202 aaaaaccaaa 211  Q
    |||| |||||    
T  36306866 aaaatccaaa 36306875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7334254 - 7334107
Alignment:
Q  158 tatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattaga 257  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||| ||||| |||  |||| ||||||||||||     
T  7334254 tatatccccattatccgtcccgtacc-gtgttttgaaatcggggaaaatccaaatccatacccaaacccagtcaaagcgggaaaaacccgtcaaattagg 7334156  T
Q  258 ttcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaa 306  Q
    || ||||| || || || || ||  ||| |||||||||| |||||||||    
T  7334155 tttggttcaggcggatacccgcaagtatgggttttgttgccatgcctaa 7334107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 8843918 - 8843719
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||| ||||||| || |||  ||||| |||| || |||||||  ||| ||||||| ||||||||     
T  8843918 ataaattaattttctacattcacgacgggtttgggtatgagttcggg-tgggtatctatatccccgctacccgtcccgcacctgtgttttaaaatcggga 8843820  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatg 301  Q
    ||||  ||||| |||||||||| ||| ||||| |   ||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||  || || ||| |||  ||||||||||||||    
T  8843819 aaaattcaaacacatatccaaacccagtcaaagcacggaaaacccgtcaaatttaatttggttcggatgaatacccgcatgtatgagttttgttgtcatg 8843720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 8856882 - 8856683
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||| ||||||| || |||  ||||| |||| || |||||||  ||| ||||||| ||||||||     
T  8856882 ataaattaattttctacattcacgacgggtttgggtatgagttcggg-tgggtatctatatccccgctacccgtcccgcacctgtgttttaaaatcggga 8856784  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatg 301  Q
    ||||  ||||| |||||||||| ||| ||||| |   ||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||  || || ||| |||  ||||||||||||||    
T  8856783 aaaattcaaacacatatccaaacccagtcaaagcacggaaaacccgtcaaatttaatttggttcggatgaatacccgcatgtatgagttttgttgtcatg 8856684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 212
Target Start/End: Original strand, 29527819 - 29527903
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaac 212  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||| | ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  29527819 gggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccccgttacccgtcacgtacccgtattttgaaatcggggaaaacccaaac 29527903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 153 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 35304579 - 35304489
Alignment:
Q  153 gtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaa 243  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||| |||   |||||| ||||  | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35304579 gtacctatatccccgttacccgtcccgtacttatgttttaaaattagagaaaacccaaacccatatccaaatccaatcaaaacggagaaaa 35304489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 253
Target Start/End: Original strand, 3737791 - 3737908
Alignment:
Q  136 gtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaac 235  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||  | ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||| || ||| || | | ||| | | ||||| |    
T  3737791 gtatgggttcgggatgggtacatataacctcgttacccgtcccatacccgtgttttgaaattgggaaaaaccctaacccacacctaaaccaagtcaaagc 3737890  T
Q  236 ggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  3737891 ggaaaaaatccgtcaaat 3737908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 215
Target Start/End: Original strand, 16575093 - 16575206
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||||||||| | |||||  |||| ||||| |||| |||||||  || |||||||||| | |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||    
T  16575093 ataaattaattttttacatttaagacgagtttgggtataggttcggagtgggtacttatatcctcgttatccatcccgtacccgcgttttaaaatcgagg 16575192  T
Q  202 aaaaaccaaactca 215  Q
    || | |||||||||    
T  16575193 aatacccaaactca 16575206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 41915059 - 41914959
Alignment:
Q  153 gtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaa 252  Q
    |||| ||||| ||||||| || |||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||| || || ||| ||||| ||| |||||||| |||||    
T  41915059 gtacatatatccccgttacccttcccgtacccatattttgaaatcggggaaaacccaaactcatacccgaacccagtcaaatcggggaaaatccatcaaa 41914960  T
Q  253 t 253  Q
    |    
T  41914959 t 41914959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 15987455 - 15987372
Alignment:
Q  2 ttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttatta-taacacggcaattatcaaacaaaa 84  Q
    |||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  15987455 ttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaa 15987372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 233
Target Start/End: Original strand, 25941147 - 25941250
Alignment:
Q  130 gtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaat 229  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||| ||| | ||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||  ||||| | |||    
T  25941147 gtttgggtatgggttcggggtgggtacctatcttcccgttacctgtcccgtacccgtgttttgaaatcgggaaaaacccaaacacatgcccaaaccaaat 25941246  T
Q  230 caaa 233  Q
    ||||    
T  25941247 caaa 25941250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 53906432 - 53906346
Alignment:
Q  89 atgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgt 175  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||| ||||   |||||||||||| || |||| |||||||| |||| ||||    
T  53906432 atgacatatcaacatgaagtaattttttacatttgggacgagtttagatatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgt 53906346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14606011 - 14605918
Alignment:
Q  130 gtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaa 223  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||| ||||| || |||| ||||| | ||||||| |||| ||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  14606011 gtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccctgttacccgtctcgtacccgtattttgaaatcggagaaaacccaaacccatacccaaa 14605918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 217
Target Start/End: Original strand, 47103745 - 47103834
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcata 217  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||| ||||| | ||||| ||| ||| ||||||| |||| |||| |||||||| |||||| ||||    
T  47103745 gggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccgcgttacccgccccgtacccgtattttgaaattggggaaaacccaaacccata 47103834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 4766529 - 4766422
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttatta--taacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatc 98  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| ||   ||||| | ||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  4766529 tttaacatttgttagaggtaatgatttagtttatcctttaaatatcaatgatagttttttattaacatgacaattatcaaataaaataacataacatatc 4766430  T
Q  99 aacataaa 106  Q
    ||||||||    
T  4766429 aacataaa 4766422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 212
Target Start/End: Original strand, 21544586 - 21544670
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaac 212  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||| ||||| ||| ||| | ||||| ||||||| |||| |||||||| |||| ||||||    
T  21544586 gggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccccattacctgtcccgtacccgtattttgaaatcgggaaaaatccaaac 21544670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 33516170 - 33516082
Alignment:
Q  118 catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgt-ttttaaatcggggaaaa 205  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||| || |||||||||| || |||| || || | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  33516170 catttgagacgggtttgggtataggttcggggtgggtacttatatccctgttacccatctcgtacccgtgttttttaaatcggagaaaa 33516082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1866635 - 1866512
Alignment:
Q  130 gtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaat 229  Q
    ||||| ||||||||||||| ||  ||| ||||| | | ||| ||||| | ||||||| |||| |||||||| |||| ||| ||||||| ||| | | | |    
T  1866635 gtttgggtatgggttcggggtggatacatatatccgcattacccgtctcgtacccgtattttgaaatcgggaaaaacccatactcatacccagacctagt 1866536  T
Q  230 caaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    |||| ||| |||||||||||||||    
T  1866535 caaatcggggaaaatccgtcaaat 1866512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 33615392 - 33615241
Alignment:
Q  153 gtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaa 252  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||||   |||| |||| ||||| |||||| || | |  |||||| ||||||    
T  33615392 gtacctatatccccgttacccgtcccatacctgttttattaaatcgaggaaaacttaaacccatacccaaacccaatctaagcaggtaaaatctgtcaaa 33615293  T
Q  253 ttagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcct 304  Q
    |  | || ||||||| |||||| || |  |||| ||||| ||||||||||||    
T  33615292 tcgggtttggttcggatgggtacccgcggatatgggtttagttgtcatgcct 33615241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1724308 - 1724211
Alignment:
Q  177 ccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaa 275  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| ||| |||||  |||||||||   || |||||||||||||||    
T  1724308 ccatacccatgttttgaaatcgggaaaaacccaaacccatacccaaacccagtcaaa-cggggaaaacacgtcaaattgagtttggttcgggtgggtaa 1724211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25298947 - 25298837
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||   |  ||||| ||| ||| || |||| |||||||||||| ||||| ||     
T  25298947 ataaattgattttcaacatttggtacgggtttgggtatgggttcggggtggacagctatatccccattacccatcccgtacccgtgttttgaaatccgga 25298848  T
Q  202 aaaaaccaaac 212  Q
    |||| ||||||    
T  25298847 aaaacccaaac 25298837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4737944 - 4737895
Alignment:
Q  174 gtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaa 223  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  4737944 gtcccatacccatgttttaaaatcgaggaaaacccaaactcatattcaaa 4737895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 242
Target Start/End: Original strand, 37246853 - 37246965
Alignment:
Q  129 ggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaa 228  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||    |||||  ||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||| ||||| | |     
T  37246853 ggtttgtgtatgagttcgagatgagtacatatatctttgttattagtctcgtacccgtgttttaaaatcgaggaaaatccaaacacatacccaaa-ctag 37246951  T
Q  229 tcaaaacggagaaa 242  Q
    ||||||||||||||    
T  37246952 tcaaaacggagaaa 37246965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30266418 - 30266334
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaac 212  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||| || | |||||||  |||||||||||    
T  30266418 gggtttgggtatgggttcggggtggatacatatatccccgttacccgtcctgtacccgtattatgaaatcggaaaaaaaccaaac 30266334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 212
Target Start/End: Original strand, 30285770 - 30285854
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaac 212  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||| || | |||||||  |||||||||||    
T  30285770 gggtttgggtatgggttcggggtggatacatatatccccgttacccgtcctgtacccgtattatgaaatcggaaaaaaaccaaac 30285854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 67)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 27850540 - 27850242
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27850540 tttaacatttgttagatcgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgaaagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcat 27850441  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27850440 cgtaaagtaattttctacattcgggacgggtttgggtatgggttcgggatgggtacctatacacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggg 27850341  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
    ||      |||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||| |||    
T  27850340 ga------aaacccatacccaaacccaatcaaaacggggaaaaaccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacggatatgagttttgttgccat 27850247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 5376964 - 5377242
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  5376964 tttaacatttgttaaaccgattgatttagttgctcctttaaatatcattggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaattacatgatatatcaa 5377063  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| || |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5377064 cataaagtaattttctgcattcgggacagatttgggtatgggttcggggtgggtacctatataccctttacccgtcccatacctgtgttttgaaatcggg 5377163  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccac 279  Q
    ||||| |||||||||||  |||  |||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| | | |||||||||    
T  5377164 gaaaacccaaactcatactcaaccccaatcaaaacgggaaaaatccgttaaattagatttggttcagataggtaaccac 5377242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Original strand, 16866051 - 16866354
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||| || || ||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16866051 acatttgttagacaaaatgatttagttaatcatttaaatatcaatgatagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 16866150  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16866151 aaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttactcgtcccatacccgtgttttgagatcggggaa 16866250  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| || |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||    
T  16866251 aacccatacccataaccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacggatatgagttttgttgccatgcc 16866350  T
Q  304 taat 307  Q
    ||||    
T  16866351 taat 16866354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 12980255 - 12980509
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  12980255 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacacgaaaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 12980354  T
Q  101 cataaattaattttct-gcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    |||||| || |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  12980355 cataaaatattttttttgcatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccattacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgg 12980454  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    |||||| | |||| |||| ||||| ||| |||||| || ||||| |||| |||||    
T  12980455 ggaaaaccaaaacccatacccaaacccagtcaaaatggggaaaacccgttaaatt 12980509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 307
Target Start/End: Original strand, 21702570 - 21702844
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  21702570 tcctttaaatataaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtt 21702669  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
     | ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||    
T  21702670 ggggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaacccatactcatacccaaacccagtcaa 21702769  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaat 307  Q
    |||||  ||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||    
T  21702770 aacgggaaaaatccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacggatatgggttttgttgccatgcctaat 21702844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 17885343 - 17885648
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattata-acacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17885343 tttaacatttgatagatggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattgacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 17885442  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||| |  | || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17885443 acataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggttggaacctatatacccgttacccgtcccatacccatgttttaaaatcgg 17885542  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||| || ||||| |||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | || ||||||||  |||||||||   ||| |||||||||| ||    
T  17885543 ggaaaacccatacccatattcaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcaggtaaccacgggtatgggttttgttgcca 17885642  T
Q  300 tgccta 305  Q
    ||||||    
T  17885643 tgccta 17885648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 7779890 - 7780190
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  7779890 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 7779989  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||| ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  7779990 aaaataaatttttacatttgggacgggtttgggtataggttcggggtgggtacctatatacccattatccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaa 7780089  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| || |||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||   ||| |||||||||| ||||||    
T  7780090 aacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaatccgtcaaattgagtttggttcggatgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcc 7780189  T
Q  304 t 304  Q
    |    
T  7780190 t 7780190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 3920417 - 3920628
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3920417 tttaacatttgttagaccgattcatttagttgttcctttaaatatcaatggtagtttttataacatggcaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 3920516  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| | |||| ||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  3920517 cataaaataattttctacattcgggacagttttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttatccgtcccataccagtgttttgaaatcggg 3920616  T
Q  201 gaaaaaccaaac 212  Q
    ||||| ||||||    
T  3920617 gaaaacccaaac 3920628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18826086 - 18825875
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| || | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  18826086 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcttttatatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 18825987  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    | |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18825986 cgtaaaataattttctgtatttgggatgggtttgggtacgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggg 18825887  T
Q  201 gaaaaaccaaac 212  Q
    ||||| ||||||    
T  18825886 gaaaacccaaac 18825875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Original strand, 17851736 - 17852035
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    |||||| ||||||  | ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  17851736 acatttattagataaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 17851835  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| || |||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||  || | |||||||||    
T  17851836 aaagtagttttttacatttgggatgggtttgggtatgggttcgggatgggtacctatatatccgttacccgtcccatacccgtg--ttaagatcggggaa 17851933  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||    
T  17851934 aacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggagaaaatccatcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacaagtatgggttttgttgccatgcc 17852033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 37182153 - 37182458
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37182153 tttaacatttgttagacacaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 37182252  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||  ||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||    
T  37182253 acataagataattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcgg-atgagtacctatatacccgctacccgtcccatacccgtgttttgaattcgg 37182351  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
     ||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   || | |||||| |||||||| |  |||| |||||||||| ||    
T  37182352 agaaaacccatactcatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgagtttgattcgggcgggtaaccgcggatatgggttttgttgcca 37182451  T
Q  300 tgcctaa 306  Q
     ||||||    
T  37182452 cgcctaa 37182458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Original strand, 30650513 - 30650814
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  30650513 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 30650612  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  30650613 aaagtaattttttacatttgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagattggggaa 30650712  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    ||  || || |||| | ||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||   |||  ||||||||| ||||||    
T  30650713 aactcatacccatacctaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgagttttgttgacatgcc 30650812  T
Q  304 ta 305  Q
    ||    
T  30650813 ta 30650814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 34 - 305
Target Start/End: Original strand, 35074380 - 35074653
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctg-catttgggacgggt 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||||    
T  35074380 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggt 35074479  T
Q  132 ttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatca 231  Q
    ||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| |||    
T  35074480 ttgggtatgggttcgggttgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttaagatcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtca 35074579  T
Q  232 aaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    |||||| ||||| ||||| |||| | || |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||    
T  35074580 aaacggggaaaacccgtctaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgccta 35074653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 41741664 - 41741360
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41741664 tttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccgttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 41741565  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
      ||||| ||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  41741564 gtataaagtaattttttacatttgggacgggtatgaatatgggttcggg-tgggtacctacatacccgttatccgtctcatacccgtgttttgaaatcgg 41741466  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||| | |||| || |||||  | ||||||| | || |||||||| |||||||| || |||| |||||||||| ||    
T  41741465 ggaaaacccatactcatacccaaatccagtaaaaatggggaaaactcatcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgcaaatatgggttttgttgcca 41741366  T
Q  300 tgccta 305  Q
    ||||||    
T  41741365 tgccta 41741360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 46127394 - 46127198
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||       
T  46127394 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcctttaaatatcaatggtagttattataacacgacaatgatcaaacaaaataacatgacatat--- 46127298  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46127297 cataaaataattttctgcatttgggacgggtttgagtatgagatcggtgtgggtacctatacacctgttatccgtcccatacccgtgattttaaatcggg 46127198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 38140008 - 38139701
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38140008 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 38139909  T
Q  100 acataaattaattttctg-catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcg 198  Q
    | ||||| ||||||| |  |||||| ||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| |||| |    
T  38139908 atataaaataatttttttacatttgagacgggtttggttatgggttcggggtgggtacttatatactcattacccgtcccatactcgtgttttgaaattg 38139809  T
Q  199 gggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtc 298  Q
    ||||||| ||| || |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| | || |||||||| |||||||| |  |||| |||||| ||| |    
T  38139808 gggaaaacccatacccatatccaaacccagtcaaaacggggaaaatccatcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgcggatatgggttttcttgcc 38139709  T
Q  299 atgcctaa 306  Q
    ||||||||    
T  38139708 atgcctaa 38139701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18125404 - 18125141
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagta 138  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||| |||    
T  18125404 aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggta 18125305  T
Q  139 tgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgga 238  Q
    || ||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||| |||| ||| |||||||  |||| ||| |||||||||     
T  18125304 tgcgttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcgggaaaaacccatactcatacacaaacccagtcaaaacggg 18125205  T
Q  239 gaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgc 302  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||  ||||   ||||||||||||||    
T  18125204 gaaaacccgtcaaattggatttggttcgggcgagtaaccacggatatgaattttgttgtcatgc 18125141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 34 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 45885947 - 45885673
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||    
T  45885947 tcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggatt 45885848  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    |  ||||||||||||| || |||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||  || || |||| ||||| ||| ||||    
T  45885847 ttggtatgggttcggggtgggtacctatatacttgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaactcatacccatacccaaacccagtcaa 45885748  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaat 307  Q
    ||||||||||| |||| ||||| | || |||||| | ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||||    
T  45885747 aacggagaaaacccgttaaattgggtttggttcgagcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcctaat 45885673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 2630788 - 2630484
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||  || || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  2630788 tttaacatttgatagaccgattgatttagttgctcatttaaatatcaatggtagtttttataatacggcaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 2630689  T
Q  101 cataaatta-attttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    |||||| ||  |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||  ||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||    
T  2630688 cataaagtagtttttttgcattcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtatctatatacccgtcacccgtcccatacccatg-ttttaaatcgg 2630590  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| |||||| |||| ||||| ||| | |||| ||  ||||  ||||||||| | || |||| |||| |||| |||    ||| |||||||||||||    
T  2630589 ggaaaacccaaacccatacccaaacccagtaaaaatgggtaaaacacgtcaaattgggtttggtttgggtaggtatccatgggtatcggttttgttgtca 2630490  T
Q  300 tgccta 305  Q
    ||||||    
T  2630489 tgccta 2630484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 39456228 - 39455953
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataac-acggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||  |||||  ||||||||||||| || |||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39456228 tttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccttccaatatcaatggtaatttttattaccatggcaattatcaaacaaaataacatgacatatca 39456129  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  39456128 acataaagtaatttt-tacatttgggacgggtatgagtatgg-ttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccatgttttgaaatcgg 39456031  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacc 277  Q
    |||||| ||| |  |||| ||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||| | || |||||||| ||||||||    
T  39456030 ggaaaacccatatccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaactcgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaacc 39455953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Original strand, 16078892 - 16079187
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16078892 tttaacattttttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaagggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 16078991  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    | |||| |||||||||| |||   |||| ||||| |||| |||| ||| || | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||     
T  16078992 cgtaaagtaattttctgtattcatgacgagtttgggtataggtttggggtgggcacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcgga 16079091  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttg 296  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||  || ||||||| || ||||  ||||||||||| || | |||||| ||||||||||   ||| ||||||||||    
T  16079092 gaaaacccaaacttatacccaaactcagtcaaaaccgaaaaaactcgtcaaattaggtttgcttcgggcgggtaaccacgagtatgggttttgttg 16079187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 39316873 - 39317127
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | |||||||||   ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39316873 tttaacatttgttagacgtaatgatttaatcgatccttcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 39316972  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||| ||||| | || ||||| |||| |||||  ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||     
T  39316973 acataaaataattttttacatttgagacggatatgggtatgagttcaggatggatacatatatacccgctacccgtcccatacccgtgttttgaaatcga 39317072  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    ||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39317073 ggaaaactcatactcatatccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaatt 39317127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 308
Target Start/End: Original strand, 24753092 - 24753349
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagta 138  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  24753092 aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggta 24753191  T
Q  139 tgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgga 238  Q
    |||||           || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||| || |||||||||| ||| ||||||||||    
T  24753192 tgggt-----------acctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggg-aaaacccatacccatatccaaacccagtcaaaacgga 24753279  T
Q  239 gaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaatt 308  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||   ||| |||||||||| |||||||||||    
T  24753280 gaaaatccgtcaaattgaatttggttcggacgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcctaatt 24753349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 26622834 - 26623041
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacata 104  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26622834 acatttgtttgaccaattgatttaattgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacacaacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacata 26622933  T
Q  105 aattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaa 204  Q
    || ||||||| |||||| |  ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26622934 aaataattttttgcattcgaaacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccattacccatcccatacccgtgttttgaaatcagggaaa 26623033  T
Q  205 aaccaaac 212  Q
    | ||||||    
T  26623034 acccaaac 26623041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 70 - 277
Target Start/End: Original strand, 38152835 - 38153041
Alignment:
Q  70 aattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgtt 169  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||| |||||    
T  38152835 aattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttaggtatgggttcggggtgggtacctatatagccgtt 38152934  T
Q  170 atccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggt 269  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   || ||||||||     
T  38152935 atccgttccatacccatgttttgaaatcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacgg-gaaaatccgtcaaattgagtttggttcgggc 38153033  T
Q  270 gggtaacc 277  Q
    ||||||||    
T  38153034 gggtaacc 38153041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 45379984 - 45380261
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  45379984 tttaacatttgttagacgaactgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatgtca 45380083  T
Q  100 acataaattaattttctg-catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcg 198  Q
    ||||||| ||||||| |  ||||||||||| ||||  ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  45380084 acataaagtaatttttttacatttgggacgagtttaggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtattttgaaatcg 45380183  T
Q  199 gggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacc 277  Q
    || |||| ||| || |||||||||| ||| ||||||| | ||||| |||||||||| | || |||||||  ||||||||    
T  45380184 ggaaaaacccatacccatatccaaacccagtcaaaacagggaaaa-ccgtcaaattgggtttggttcggacgggtaacc 45380261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 24425260 - 24425551
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  24425260 tttaacatttgttagaccggttgatttatttgt-cctttaaatatcaatggtagtttttataacacgataattatcaaacagaataacatggcatatcaa 24425358  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||| | ||||||| ||||||||| |||||||||   ||||| || || || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |     
T  24425359 catatagtaattttatgcatttggaacgggtttggaaatggggtcagggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcaga 24425458  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
    ||||            || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||  ||||||||| | |||  ||||||||| |||    
T  24425459 gaaa------------attcaaacccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattgggtttggttcgggctggtaaccacgtgtatgagttttgttgccat 24425546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25783121 - 25782876
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||| |||| ||| | ||||||||||| ||  ||||| ||||||  ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  25783121 tttaatatttattataccgattgatttagttgctcctttaaatattgatgatagtttttataacactgcaattatcaaacaaaataatatgagatattaa 25783022  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| |||  ||||| ||||||| || |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||     
T  25783021 cataaagtaattttctgcattcgggacggattttggtatgagttcggggtgggtacctatatacccattatccgtctcatacccgtgttttataatcgga 25782922  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    ||||| |||||||       ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25782921 gaaaacccaaact-------aaacccaatcaaaacggagaaaatccgacaaat 25782876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 3227092 - 3226855
Alignment:
Q  69 caattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgt 168  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | || |||||||||||||||| || |||| ||||| || ||    
T  3227092 caattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggatgtgtatgagtatgggttcggggtgggtacctatattcctgt 3226993  T
Q  169 tatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcggg 268  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||  ||||  || | ||||||  |||||||||||||||| | || |||||||     
T  3226992 tacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaacccatacccatactcaaactcagttaaaacgaggaaaatccgtcaaattgggtttggttcgga 3226893  T
Q  269 tgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaa 306  Q
     |||||||| ||| ||| | |||||||| |||||||||    
T  3226892 cgggtaaccgcatgtatggattttgttgccatgcctaa 3226855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 37579141 - 37579418
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||  || || ||||||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||| |||    
T  37579141 tttaacatttgttagatggattgatttagttgctcatttaaatatcaatgataatttttataacatgacaattatcaaacaaaataacatggcatagcaa 37579240  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgt-cccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||| |||||||| || |||| ||||||||||||| || | |||||  ||||||||  |||||||    
T  37579241 cataaagtaattttctgcatttgagacagctttgggtataggttcggggtgggtacctatatacccgttacccttacccat--ccgtgtttcgaaatcgg 37579338  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccac 279  Q
    | |||| |||||| |||| ||||| | | ||||||||| ||||| ||||| |||| | || |||||||| ||||||||||    
T  37579339 gaaaaatccaaacccatacccaaacctagtcaaaacggggaaaacccgtctaattgggtttggttcgggcgggtaaccac 37579418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 89 - 304
Target Start/End: Original strand, 10072433 - 10072648
Alignment:
Q  89 atgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgt 188  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  10072433 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgttccatacccgtgt 10072532  T
Q  189 ttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatatagg 288  Q
    ||| ||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||| |||||||| |   ||| ||    
T  10072533 tttgaaatcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgcgggtatggg 10072632  T
Q  289 ttttgttgtcatgcct 304  Q
    |||||||| |||||||    
T  10072633 ttttgttgccatgcct 10072648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 41103531 - 41103839
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatca---atggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacata 96  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||   |||||| ||  ||| |||| | ||||||||||||||||||| | || |||    
T  41103531 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcatcaatggtaatttgtattaacatgacaattatcaaacaaaataacaagagata 41103630  T
Q  97 tcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaat 196  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  41103631 tcaacataaaataattttttacatttaggacgggtttatgtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttaaccgtcccatacccgtgttttgaaat 41103730  T
Q  197 cggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttg 296  Q
    ||||||      |||| |||| ||| | ||| |||||||||  ||||||||||||||  |||| |||||| | |||||||||||  |||  |||||||||    
T  41103731 cgggga------aaacccatacccacacccagtcaaaacgggaaaaatccgtcaaatcggatttggttcgcgcgggtaaccacaggtatgagttttgttg 41103824  T
Q  297 tcatgcctaatttca 311  Q
     |||  |||||||||    
T  41103825 ccatttctaatttca 41103839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Original strand, 16811647 - 16811822
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagta 138  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||| |||    
T  16811647 aaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataatatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggctttgggta 16811746  T
Q  139 tgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactca 215  Q
    |||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  16811747 tgggttcggg-tgggtatctatatacccattatccgtctcatacccgtgttttgagatcggggaaaatccaaactca 16811822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 44734572 - 44734297
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||| ||||||||||   | ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  44734572 tttaatatttgttagacgtaatgatttaattgatccttcaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaataaaataacatgacatatca 44734473  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||| | || ||||||||||||| || |||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||     
T  44734472 acataaagtaattttttacatttgggacggatatgtgtatgggttcggggtgggtacctatatacccattaccggtcccatacccgtgttttgaaatcga 44734373  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacc 277  Q
    | ||||  || || |||  ||||| ||| ||||||  | ||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||    
T  44734372 gaaaaacacatacacattcccaaacccagtcaaaa--gggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaacc 44734297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 305
Target Start/End: Original strand, 25905539 - 25905811
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgg-gt 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||  ||    
T  25905539 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgatgt 25905638  T
Q  132 ttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatca 231  Q
    ||| ||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| || |||| ||||| ||| |||    
T  25905639 ttgggtatgagttcggggtg-gtacctatgtacccgttacccgtcccatacctgtgttttgagattggggaaaacccatacccatacccaaacccagtca 25905737  T
Q  232 aaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    ||| || ||||| | |||||||| | ||  ||||| | ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||    
T  25905738 aaaaggggaaaacctgtcaaattgggtttagttcgagcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgccta 25905811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 25980132 - 25979927
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||| ||||| |||||||||||  |||| |||| |||| |  |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  25980132 tttaacatttgttagacggaatgatttatttaatcctttaaatatcaatgtaagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatttca 25980033  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||| | || |||| ||||| ||| ||| || |||| |||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  25980032 acataaaataattttttacatttggaaaggatttgggtatgagtttggggtgggtacatatatatccgttacccgtctcatacctgtgttttgaaatcgg 25979933  T
Q  200 ggaaaa 205  Q
    ||||||    
T  25979932 ggaaaa 25979927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26004675 - 26004477
Alignment:
Q  12 ttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaat 111  Q
    ||||| ||||||||||| |   ||||| ||||||||||| ||||| |||||| | | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  26004675 ttagaccgattgatttagtcgctcctttaaatatcaatgatagtttttataagaagacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacataaagtaat 26004576  T
Q  112 tttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaa 211  Q
    |||||||||| ||| || |||   ||||||||||||| || |||  |||||||| |||| |||||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||    
T  26004575 tttctgcattcggggcgagtt--ggtatgggttcggggtgggtatctatatacctgttacccgtcccatacccaagttttgaaatcgaggaaaacccaaa 26004478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5916280 - 5916037
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||     |||||  |    
T  5916280 tttaacatttgttagaccgattgattgatttactcctttaaatatcaatggtagttttgataacacagcaattatcaaacaaaataa----gcatattga 5916185  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||   |||| |||| |||||||| ||||||| ||||||  |||||     ||| ||| |||||||| |||||||     
T  5916184 cataaaataattttatgaatttgggacaaatttgggtattggttcggggtgagtacatatata-tcgtta-----cccgtactcgtgttttgaaatcgga 5916091  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    ||||| ||||| |||||| |||| || ||||||  | |||||||||||||||||    
T  5916090 gaaaatccaaattcatattcaaacccgatcaaattgaagaaaatccgtcaaatt 5916037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 44986113 - 44985856
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttatta-taacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  44986113 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acatatca 44986015  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||      ||||| ||||||  || ||| ||||||||||||           |||||||| ||| |||||||    
T  44986014 acataaa-taattttttacatttgggacgg------gtatgagttcggagtgggtatttatatacccgt-----------tacccgtg-tttgaaatcgg 44985934  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacc 277  Q
     ||||| ||| |  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  44985933 agaaaacccatatccatacccaaacccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagatttggttcggatgggtaacc 44985856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 254
Target Start/End: Original strand, 43507402 - 43507577
Alignment:
Q  79 acaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtccc 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |  |||||||||| || || || | ||||||||||||| ||||| |    
T  43507402 acaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgagtataggtatgggttcagggtgggtgcctatatacccgttacccgtctc 43507501  T
Q  179 atacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||||| || |||||||    
T  43507502 atacccatgttttgaaatcggggaaaacccatacttatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccatcaaatt 43507577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 44658631 - 44658496
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| | ||||||| |||||||    
T  44658631 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaatatttttttacatttggtacgggtt 44658532  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgt 168  Q
    || |||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  44658531 tgggtatgggttcgggataggtacctatatacccgt 44658496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 44794200 - 44794052
Alignment:
Q  43 tatcaatggtagttatta-taacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgg 141  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||| ||||||    
T  44794200 tatcaatggtagtttttagtaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataattttttacatttgggacaggtttgggtatgg 44794101  T
Q  142 gttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttt 191  Q
    ||||||| || |||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44794100 gttcggggtgggtacct-tatactcgttacccgtctcatacccgtgtttt 44794052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 23328488 - 23328636
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  23328488 tttagcatttattagaccgattgatttagttattcctttaaatatcaatgataatttttatagcacgacaattatcaaacaaaataacaagacatgtcaa 23328587  T
Q  101 cat-aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcggg 148  Q
    ||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  23328588 cataaaaataattttctccattcgggacgggtttgggtataggatcggg 23328636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 45709073 - 45708781
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| |||||||||||||| || |||| || | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45709073 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtaatttttattaatatgacaattatcaaacaaaataatataacatatcaacat 45708974  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| || ||| |   |||| ||||||||||  ||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||| ||     
T  45708973 aaagtattttac---attttggacgggtttaggtatgagttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtccaatacccgtgttttgagatcggaga- 45708878  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
         |||| |||| | ||| ||| ||||||||  |||||||  ||||||| |||| | |||||| || ||| ||| |||||  ||||||||| ||||||    
T  45708877 -----aaacccataccaaaacccagtcaaaacgaggaaaatctatcaaattggatttgattcgggcggataatcacgtatatgagttttgttgccatgcc 45708783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 37196213 - 37195921
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  || || | ||||||||||||||| |||| |||| | || |||||||||||||||| || ||||||||    
T  37196213 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttatatatcaatggtagtttttattaacatgacagttatcaaacaaaataacataacatatca 37196114  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||  |||||||||| |||||| |||||| || |||  ||||||||| |           |||| ||||||| |||||||    
T  37196113 acataaagtaattttttacatttatgacgggtttgggtatggattcggggtgggtagctatatacccat-----------tacctgtgttttgaaatcgg 37196025  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||| || |||| ||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||   || |||| ||| || |||||||   ||| | |||||||||||    
T  37196024 ggaaaatccatacccatacccaaacctaatcaaaacagggaaaatccgtcaaattgagtttggtttgggcggataaccacgggtatggattttgttgtca 37195925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 274
Target Start/End: Original strand, 3157063 - 3157234
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||| |||||||  || |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  3157063 ataaattgattttctatgtttgggacgggtttgggtataggttcggtgtgggtacctatatccccgttatccgtcccatacccatattttgaaatcgggg 3157162  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggta 274  Q
    |||| | |||| |||| ||||| | | ||||| ||| ||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  3157163 aaaacctaaacccatacccaaaccaagtcaaagcggggaaaa-ccgacaaattaggtttggttcgggcgggta 3157234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 253
Target Start/End: Original strand, 27063127 - 27063269
Alignment:
Q  111 ttttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaa 210  Q
    |||||| |||| |||  ||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||||  |||    
T  27063127 ttttctacattcgggtagggtttgggtatgagttcggggtgagtacatatatccccgttatccgtcctgtacccgtattttgaaatcgaggaaaactcaa 27063226  T
Q  211 actcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||| | | |||||||||||||||    
T  27063227 actcatacccaaacccagtcaaatcagggaaaatccgtcaaat 27063269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8906696 - 8906551
Alignment:
Q  108 taattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaac 207  Q
    ||||||| | ||||||| || ||| ||  |||||||||||| || |||| ||||  |||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||| |||||      
T  8906696 taattttttacatttggaacaggtatggatatgggttcggggtgggtacatataaccccgttattcgtctcatactcgtgttttgaaatcggagaaaact 8906597  T
Q  208 caaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  8906596 caaacccatacccaaatccaatcaaagcggagaaaacccgtcaaat 8906551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 205
Target Start/End: Original strand, 33841074 - 33841161
Alignment:
Q  118 catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaa 205  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||  |  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33841074 catttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgagtacatataaccatgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaa 33841161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11472825 - 11472664
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||| || ||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||  |||||| ||||||||     
T  11472825 ataaattgattttct-catttgggacggatttgggtatgagttcagg-tgagtacctatattcccgttatccatcttatacctctgttttgaaatcggga 11472728  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcg 266  Q
    ||||  |||||||||| | ||||||||| |||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11472727 aaaactcaaactcataccaaaatccaattaaaagggt-aaaacccgtcaaattaaattcggttcg 11472664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10995931 - 10995832
Alignment:
Q  118 catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcata 217  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||||| || |||  ||||  || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  10995931 catttggaacgggtatgggtatgggttcggggtgggtatatataaccctgttacccgtcccatacccgtgtcttgaaatcggggaaaacccaaactcata 10995832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 37103214 - 37103088
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatcca 227  Q
    |||||||  |||| |||||||||| || | ||||| | ||||| || |||| ||||||| |||| ||||| || ||||  |||||| ||||||||| |||    
T  37103214 gggtttggatatgtgttcgggatgggtgcatatatcctcgttacccttcccgtacccgtattttgaaatcaggaaaaacacaaacttatatccaaaccca 37103115  T
Q  228 atcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  37103114 atcaaatcggagaagatccgtcaaatt 37103088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5565414 - 5565269
Alignment:
Q  108 taattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaac 207  Q
    ||||||| | ||||||||| | || || ||||||||| ||| || |||| ||||  ||||||| || ||||||| ||||  ||| ||||| ||||||| |    
T  5565414 taattttttacatttgggatgtgtatgggtatgggttaggggtgggtacatataaccccgttacccatcccatatccgtactttgaaatcagggaaaacc 5565315  T
Q  208 caaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    |||||  ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  5565314 caaacctataaccaaatccagtcaaagcggggaaaatccgtcaaat 5565269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 212
Target Start/End: Original strand, 31426014 - 31426098
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaac 212  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||  ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  31426014 gggtttgggtatgcgttcggggtggatacatatatccccgttacccgtctcatacccgtatttttaaatcggggaaaacccaaac 31426098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 42908103 - 42908023
Alignment:
Q  153 gtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaa 233  Q
    |||| ||||| ||| ||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  42908103 gtacatatatccccattacccgtcccgtacccgtattttgaaatcggggaaaacccaaactcatacccaaacccaatcaaa 42908023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 305
Target Start/End: Original strand, 37218005 - 37218188
Alignment:
Q  124 ggacgggtttgag-tatgggttcgggatgagtacttatataccc-gttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatcca 221  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||| |  |||||||||| ||| |||| ||||||| |||| ||||||| |||| ||  ||||  |||||||||| |||    
T  37218005 ggacgggtttggggtatgagttcgggcttggtacttatatcccccgttacccgtcccgtacctgtgttttgaaataggataaaactcaaactcataccca 37218104  T
Q  222 aatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    || ||| ||||||||| ||||| || |||||||   || |||||||||||||| || |   |||  ||||||||||||||||||    
T  37218105 aacccagtcaaaacggggaaaacccatcaaattgagtttggttcgggtgggtatccgctggtatgagttttgttgtcatgccta 37218188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 253
Target Start/End: Original strand, 27063348 - 27063465
Alignment:
Q  136 gtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaac 235  Q
    ||||| ||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||| | | || |||| ||||| ||| |||||      
T  27063348 gtatgagttcggggtgggtacatatattcccgttacccgtcccgtacccgtattattaaatcggggaaaaccgagacccatacccaaacccagtcaaatt 27063447  T
Q  236 ggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    ||  ||||||||||||||    
T  27063448 gggaaaaatccgtcaaat 27063465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 217
Target Start/End: Original strand, 32546198 - 32546287
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcata 217  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||| || ||||||| |||| |||||||| |||| |||||| ||||    
T  32546198 gggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccccgttacccgttccgtacccgtattttgaaatcgggaaaaatccaaacccata 32546287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23475360 - 23475266
Alignment:
Q  118 catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaac 212  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||   || |||| ||||| ||| ||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  23475360 cattcgggacgggtttgggtatgggttcgaagtgggtacatatatccccattacccatcccaaacccgtgttttgaaatcgggaaaaacccaaac 23475266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27896567 - 27896457
Alignment:
Q  123 gggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaa 222  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||| |  || | ||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| |||||| |||| ||||    
T  27896567 gggacgggtatgggtatgagttcggggttggtgcatataaccccgttacccgtcccatacccatgttttgaaataagggaaaacccaaacccatacccaa 27896468  T
Q  223 atccaatcaaa 233  Q
    | |||||||||    
T  27896467 acccaatcaaa 27896457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3274810 - 3274684
Alignment:
Q  84 ataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacc 183  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||    |||||||||| | ||  |||  ||||||| |||||  | ||||||||    
T  3274810 ataacatgacatatcaacataatgtaattttctacattcgggacgggtt----tatgggttcgaggtggctacgaatatacctgttatttggcccatacc 3274715  T
Q  184 cgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactc 214  Q
     ||||||| |||||| | |||| ||||||||    
T  3274714 agtgttttaaaatcgagaaaaacccaaactc 3274684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Original strand, 22973394 - 22973499
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatcca 227  Q
    ||||||| ||||||||||| | || ||||  |||| ||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||| |||| ||||| |||    
T  22973394 gggtttgggtatgggttcgaggtgggtacagatatccccattacccgtcccgtacccgtattttgaaatcgtggaaaacccaaacccatacccaaaccca 22973493  T
Q  228 atcaaa 233  Q
     |||||    
T  22973494 gtcaaa 22973499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 30839176 - 30839095
Alignment:
Q  173 cgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgg-agaaaatccgtcaaat 253  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||| ||||| ||| |||||| |||||||||    
T  30839176 cgtcccatacccgtattttgaaatcagggaaaactcaaactcatacccaaacccagtcaaatcggaagaaaacccgtcaaat 30839095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 26004735 - 26004675
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat 61  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |   ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  26004735 tttaacatttgttagaccgattgatttagtcgctcctttaaatatcaatggtagtttttat 26004675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 44845222 - 44845095
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatcca 227  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||  ||||| | | ||| ||||||| ||||||| || | ||||||||||||| |||||| |||| | |||  ||    
T  44845222 gggtttgtgtatgggttcggggtgggtaaatatatcctcattaaccgtcccgtacccgtattatgaaatcggggaaaacccaaacccataccaaaactca 44845123  T
Q  228 atcaaaacgg--agaaaatccgtcaaat 253  Q
     |||||||||  | ||||||||||||||    
T  44845122 gtcaaaacggaaaaaaaatccgtcaaat 44845095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 223
Target Start/End: Original strand, 18683980 - 18684075
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaa 223  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||  ||| ||||| || |||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| || ||| |||| |||||    
T  18683980 gggtttgggtatgggttcgaggtggatacatatatccctgttacccgtcccgtacccgtattttgaaatcggggaaaacccgaacccatacccaaa 18684075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19440107 - 19440020
Alignment:
Q  118 catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaa 205  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||   || |||| ||||| ||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  19440107 cattcgggacgggtttgggtatgggttcgaagtgggtacatatatccccattacccatcccaaacccgtgttttcaaatcagggaaaa 19440020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 51)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Original strand, 34119532 - 34119825
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||  || ||  |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  34119532 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcatttcaatatcaatgttagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataat--ggcatatcaa 34119629  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  34119630 cacaaagtagttttctgcatttgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttatccgtctcatacccgtgttttaaaatcggg 34119729  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttg 296  Q
     ||||  |||||||||| ||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  34119730 aaaaactcaaactcatacccaaacccaatcaaaatggggaaaacccgtcaaattagatttggttcgggtggttaaccacatggatgggttttgttg 34119825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 42758248 - 42758552
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  42758248 tttaacatttgttagaccggttgatttaattgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacatggcaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 42758347  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  42758348 cataaagtaattttcttcgttcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgcatacctatatacctgttacccgtcccatacctgtgttttgaaatcggg 42758447  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||| | || || ||||| ||||||||||   ||| |||||||||| |||    
T  42758448 ggaaacccaaactcatacccaaacccagttaaaacggggaaaatccgtcaaattgggtttggatcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccat 42758547  T
Q  301 gccta 305  Q
    |||||    
T  42758548 gccta 42758552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4557519 - 4557214
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4557519 tttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttataacacatcaattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 4557420  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||  | |||| ||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  4557419 cataaagtaattttctgcattcgggatagatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatactcgttacccgtcccatacccatgttttgaaaacggg 4557320  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||    
T  4557319 gaaaacccaaacccatacccaaacccagtcaaaacgggaaaaacccgtcaaattgggttttgttcgggtgggtaaccacgggtatgagttttgttgtcat 4557220  T
Q  301 gcctaa 306  Q
    ||||||    
T  4557219 gcctaa 4557214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 19111609 - 19111912
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  19111609 tttaacatttgttataccaattgatttagttactcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgaaaattatcaaacaaaataacatgacatat-aa 19111707  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| | |||||||  || || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  19111708 cataaagtaattttctacattttgtacgggtttgggcatgggtttagggtgggtacttatatacccgttatccatcccgtacccgtgttttgaaatcggg 19111807  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
     ||||  |||||||||| ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  19111808 aaaaactcaaactcatacccaaacccaatcaaaaagggaaaaatccgtcaaattggatttggtttaggtgagtaaccacggatatgagttttgttgtcat 19111907  T
Q  301 gccta 305  Q
    |||||    
T  19111908 gccta 19111912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 54317018 - 54317321
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||    |||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  54317018 tttaacatttgttagacatgttgatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttataacacggcaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 54317117  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  54317118 cataaagtaattttcttcgtttgggacgggtttgggaatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcctatacttgtgttttgaaatcggg 54317217  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
    |||||  ||||| ||||  |||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||  |||| | |||||||| |||    
T  54317218 gaaaactcaaacacatactcaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattggatttggttcgggcgggtaaccacggatatggattttgttgccat 54317317  T
Q  301 gcct 304  Q
    ||||    
T  54317318 gcct 54317321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 4016258 - 4015954
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||| ||||||| || |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4016258 tttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcgatagtagtttttataacacatcaattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 4016159  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||  || ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4016158 cataaggtagttttctgcattcgggacgagtttgggtatgggttcggagtgggtacctatatacccgttatccgtcccatacccatgttttgaaatcggg 4016059  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt-agattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| | | |||||||||  |||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||    
T  4016058 gaaaacccaaacccatacccaaacctagtcaaaacgggaaaaacccgtcaaattgagtttc-gttcgggtgggtaaccacgggtatgggttttgttgcca 4015960  T
Q  300 tgccta 305  Q
    ||||||    
T  4015959 tgccta 4015954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 48391028 - 48390725
Alignment:
Q  4 aacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    |||||||||||||  || ||||||| ||  || || ||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48391028 aacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatggtagtttttttaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacat 48390929  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | | || ||||||||| || |||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48390928 aaagtaattttttacgttcgggacgggtatgggtatgggttcaggatgggtacctatattcccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaa 48390829  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| || |||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||   |||||||| |   ||| |||||||||| ||||||    
T  48390828 aacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaatccgtcaaattggatttggttcgaacgggtaaccgcgggtatgggttttgttgccatgcc 48390729  T
Q  304 taat 307  Q
    ||||    
T  48390728 taat 48390725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Original strand, 49579941 - 49580244
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  49579941 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaatcatcaaacaaaataacataacatatcaatat 49580040  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  49580041 aaagtaattttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcgaggtgggtacctatatactcgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaa 49580140  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| || |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||| || |||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  49580141 aacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattggatttggttcgggcggataaccacgggtatgggttttgttgtcatgcc 49580240  T
Q  304 taat 307  Q
    ||||    
T  49580241 taat 49580244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 39655455 - 39655182
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| | |||||| ||||||||    
T  39655455 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgagacgggtt 39655356  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    || ||||||||| ||| || |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||| ||||| ||||||||    
T  39655355 tgggtatgggtttggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccatacccatacccaaacccaatcaa 39655256  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaa 306  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||| |||||||||    
T  39655255 aacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcctaa 39655182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Original strand, 39728548 - 39728849
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||| || || ||||||||||| ||||| |||| ||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  39728548 acatttgttagacaaaatgatttagttaatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacagaacaattatcaaacaaaataacattacatatcaacat 39728647  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| | |||| ||||    
T  39728648 aaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttacccatcccatacccgtattttgagatcgaggaa 39728747  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || | | ||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||    
T  39728748 aacctatactcatacccaaacccagtcaaaacggggaaaatccgtcaaattggatttggttcggacgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcc 39728847  T
Q  304 ta 305  Q
    ||    
T  39728848 ta 39728849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 34 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 44953617 - 44953371
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  44953617 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtt 44953518  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || || | ||||| ||| ||||    
T  44953517 tgagtatgagttcggggtgagtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccatacccaaacccaaacccagtcaa 44953418  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccac 279  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | || |||||| | ||||||||||    
T  44953417 aacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgagcgggtaaccac 44953371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 34025827 - 34026129
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||| ||  ||||| |||||||||||||| || |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34025827 tttaacatttgatagatggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtaatttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 34025926  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||||| ||   || ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  34025927 acataaaataattttttacatttgggacgggtatgggtatgagttcggggtggaaacctatatactcgttacccgtcccatacctgtgttttgaaatcgg 34026026  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||| || |||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| | || |||||||| |||||||| |   ||| |||||||||| ||    
T  34026027 ggaaaacccatacccatatccaaacccagtcaaaacgggaaaaaaccgtcaaattggttttggttcgggagggtaaccgcgggtatgggttttgttgcca 34026126  T
Q  300 tgc 302  Q
    |||    
T  34026127 tgc 34026129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 53631778 - 53632032
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  53631778 tttatcatttgttagaccgatcgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacacggcaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 53631877  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| |||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||  ||    
T  53631878 cataaagtaattttctagattcgggacgagtttgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtctcatacacgtgttttaaaatttgg 53631977  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatta 255  Q
    |||||  ||||| |||| | | | ||| ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  53631978 gaaaactcaaacccatacctatacccattcaaaacgaggaaaacccgtcaaatta 53632032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 40 - 307
Target Start/End: Original strand, 29284248 - 29284516
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagta 138  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| | ||| ||||||||||||| |||    
T  29284248 aaatattaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacatctgggacgggtttgggta 29284347  T
Q  139 tgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgga 238  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||| |||| ||| || |||| ||||| ||| ||||||||||    
T  29284348 tgggttcgggctgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcgggaaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacgga 29284447  T
Q  239 gaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaat 307  Q
    ||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||   |||  ||||||||| ||||||||||    
T  29284448 gaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgagttttgttgccatgcctaat 29284516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 7469960 - 7469688
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| || | | ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| || | || | |||||||||||||||    
T  7469960 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaagatgacaattatcaaacaaaataacataacatatccacataaagtagtgttttacatttgggacgggtt 7469861  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||||    
T  7469860 tgtgtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcagggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaa 7469761  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||    
T  7469760 aacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgccta 7469688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 306
Target Start/End: Original strand, 44639152 - 44639453
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    |||||||||||||  || |||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  44639152 acatttgttagataaat-gatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 44639250  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||  |||||    
T  44639251 aaaataattttttacatttggaacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatatgggaa 44639350  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| || |||| ||||| ||| |||||| || ||||| | |||||||| | ||  ||||||  ||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||    
T  44639351 aacccatacccatacccaaacccagtcaaaatggggaaaaccagtcaaattgggtttcgttcggacgggtaaccacggatatgagttttgttgccatgcc 44639450  T
Q  304 taa 306  Q
    |||    
T  44639451 taa 44639453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 20086882 - 20087135
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20086882 tttaacatttgttagatggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaagcaaaataacatgacatatca 20086981  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||| ||||||||| |           |||||||||||| |||||||    
T  20086982 acataaaataattttttacatttgggacgggtatgagta-gggttcggggtgggtacctatatacccat-----------tacccgtgttttgaaatcgg 20087069  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttc 265  Q
    |||||| ||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  20087070 ggaaaacccatacccatatccaaacccagtcaaaacggagaaaatccgtcaaattggatttggttc 20087135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 44172503 - 44172733
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  44172503 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcagtggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 44172602  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  44172603 aaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaa 44172702  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaa 234  Q
    || ||| || ||||  |||| ||| ||||||    
T  44172703 aacccatacccatactcaaacccagtcaaaa 44172733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 44179203 - 44179433
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  44179203 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcagtggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 44179302  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  44179303 aaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaa 44179402  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaa 234  Q
    || ||| || ||||  |||| ||| ||||||    
T  44179403 aacccatacccatactcaaacccagtcaaaa 44179433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22536056 - 22535748
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22536056 tttaacatttgttagacagaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 22535957  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| ||||| || || ||||||||||||| || || | | ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  22535956 acataaaataattttttacatttaggacgagtatgtgtatgggttcggggtgggtgcctgtatacccgttacccgtcccatatccgtgttttgaaattgg 22535857  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    ||||||  || || |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| || |||||||   || |||||||| || ||||| |   ||| |||||||||| ||    
T  22535856 ggaaaactcatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccatcaaattgagtttggttcgggcggataaccgcgggtatgggttttgttgcca 22535757  T
Q  300 tgcctaatt 308  Q
    ||| |||||    
T  22535756 tgcataatt 22535748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 43582451 - 43582755
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattata-acacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||| ||  ||| | ||||||||||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43582451 tttaacatttgttagacgtaatgatttagttgatccgttaaatatcaatggtagtttttatttacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 43582550  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    | ||||| ||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  43582551 atataaagtaattttttacatttgggacgggtatgaatatgggttcggg-tgggtacctacatacacgttacccgtctcatacccgtgttttgaaatcgg 43582649  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    ||||||  || || ||||  |||| ||| | ||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| |||||||| |  |||| ||||||||||  |    
T  43582650 ggaaaactcatacacatactcaaacccagtaaaaacggagaaaacccatcaaattggatttggttcgggcgggtaaccgcggatatgggttttgttgcaa 43582749  T
Q  300 tgccta 305  Q
    ||||||    
T  43582750 tgccta 43582755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 305
Target Start/End: Original strand, 44252653 - 44252925
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||||    
T  44252653 tcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttatatttgggacgggtt 44252752  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    || ||||||||||||| || |||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||||    
T  44252753 tgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacacgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaa 44252852  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | || | |||||  ||||||||||   ||| | |||||||| ||||||||    
T  44252853 aacggggaaaacccgtcaaatttggtttgattcggacgggtaaccacgggtatggattttgttgccatgccta 44252925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 40 - 307
Target Start/End: Original strand, 52572521 - 52572789
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagta 138  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  52572521 aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatattaacataaagtaattttttacatttgggacgggcttgagta 52572620  T
Q  139 tgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgga 238  Q
    ||| |||||| || || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||  || || |||| ||||| ||| |||||| ||     
T  52572621 tggattcggggtgggtccctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcgaggaaaactcatacccatacccaaacccagtcaaaatggg 52572720  T
Q  239 gaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaat 307  Q
    ||||| | ||||||||   || |||||||| || |||||||   ||| |||||||||| ||||||||||    
T  52572721 gaaaacctgtcaaattgagtttggttcgggcggataaccacgggtatgggttttgttgccatgcctaat 52572789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 304
Target Start/End: Original strand, 830884 - 831179
Alignment:
Q  2 ttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaac 101  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||    
T  830884 ttaacattttttagaccaattgatttagtttctccttaaaatatcaatgatagtttttataagacggcaattatcaaacaaaataacatagcatattaac 830983  T
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||| || || ||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||    
T  830984 ataaagtaattttctgcattcgggacgaatttgggtatgggttcagggtgggtac-catatactcgttatccgtctcatacccgtgttttgaaaac-ggg 831081  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatg 301  Q
    ||| |||     |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| ||| ||||||||||  ||||  ||||||||||| ||    
T  831082 aaatacc-----catacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaatttggtttggtttgggcgggtaaccacggatatgagttttgttgtcttg 831176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 44106974 - 44106755
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  44106974 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatattaacataaagtaattttttacatttgggacgggtt 44106875  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    |||||||||||||||| |   ||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||| | || |||| ||||||| ||||||| ||||| ||| ||||    
T  44106874 tgagtatgggttcggggtagatacctatatatccgttacgcgtcccatacccgtgttttaagattgggg-aaaaccatactcatacccaaacccagtcaa 44106776  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    ||||| ||||| ||||||||||    
T  44106775 aacggggaaaa-ccgtcaaatt 44106755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 276
Target Start/End: Original strand, 52198031 - 52198304
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataat-atgacatatcaaca 102  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||  ||  |||||||||     
T  52198031 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataaacatagcatatcaacg 52198130  T
Q  103 taaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggga 202  Q
    |||| ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||| |    
T  52198131 taaagtaattttttacatttggaacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacctgtgttttgagatcgggaa 52198230  T
Q  203 aaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaac 276  Q
    ||| ||| || |||| ||||| ||| ||||||| || |||| |||||||||||| || |||| ||| |||||||    
T  52198231 aaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacagaaaaaacccgtcaaattaggtttggtttgggcgggtaac 52198304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 6738609 - 6738311
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    |||||||| |||||||   | ||||||||||  |||||  |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6738609 tttaacatctgttagacataatgatttaattgatccttccaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacatgacatatca 6738510  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||| || ||| || |||| |||||||||||           |||||||||||| |||||||    
T  6738509 acataaagtaattttttacatttgggacgggtatgagtatggatttggggtgggtacctatatacccgt-----------tacccgtgttttgaaatcgg 6738421  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||| || |||| ||||| ||| |||||||||  |||| | |||||||| | || |||||||| |||||||| |   ||| |||||| ||| ||    
T  6738420 ggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacgggaaaaacctgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgcgggtatgggttttattgcca 6738321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Original strand, 29842184 - 29842445
Alignment:
Q  4 aacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaaca 102  Q
    |||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  29842184 aacatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacaaatcaaca 29842283  T
Q  103 taaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggga 202  Q
    |||| ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  29842284 taaagtaattttttacatttgagacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatattcccgttaccagtcccatacccgtgttttaaaatcggg-a 29842382  T
Q  203 aaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttc 265  Q
    ||| ||| ||  ||| ||||| ||||||  |||    |||| ||||||||||||||| |||||    
T  29842383 aaacccatacctatacccaaacccaatccgaacatgaaaaacccgtcaaattagatttggttc 29842445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 212
Target Start/End: Original strand, 49025587 - 49025765
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  49025587 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacataacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacacaaagtaattttttacatttgggacgggtt 49025686  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaac 212  Q
    || |||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  49025687 tgggtatgggttc-ggatgtgtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccaaac 49025765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 41937216 - 41936954
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||  |||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41937216 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcatttcaatatcaatgttagtctttataacacgacaattatcaaacaaaataatatgacatgtcaa 41937117  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    || ||| || ||||||||||||| |||| |||||           || |||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  41937116 cacaaagtagttttctgcatttgagacgagtttg-----------ggtatgagtatctatatacccgttatccgtctcatactcgtgttttaaaatcggg 41937028  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccaca 280  Q
    ||||| ||| |||      |||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| | ||||| ||| ||||||||    
T  41937027 gaaaacccatact------caaacccaatcaaaacgaggaaaatccatcaaatttgatttgattcggatggttaaccaca 41936954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 30682695 - 30682840
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30682695 tttaacatttgttagaacgaatgatttaattgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacatgaccattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 30682794  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcg 146  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  30682795 cataaagtaattttctacattcaggacgggtttgagtataggttcg 30682840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17146361 - 17146063
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  17146361 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 17146262  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||| | |||| |||| |||||||| |||||| | || ||  ||    
T  17146261 aaagtaattttttacatttgggaagggtttgtgtatgggttcggggtggatacctatataactgttacccgttccatacccatgttttgagattggaaaa 17146162  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| || |||| ||||||    ||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||| ||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17146161 aacccatacccatacccaaat---gtcaaaacgg-ggaaacccgtcaaattggatttggtttggacgggtgaccacatatatgggttttattgtcatgcc 17146066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 34154291 - 34154541
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||| ||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||     |||||||    
T  34154291 tttaatatttgttagacataatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataa-----catatca 34154385  T
Q  100 acataaattaattttctg-catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcg 198  Q
    ||||||| ||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||| || |||| ||||| |  |||| ||||  ||||||| |||||| ||||||    
T  34154386 acataaagtaatttttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtgggtacctatattcttgttacccgtttcatacccatgttttgaaatcg 34154485  T
Q  199 gggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    |||||||  || || |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  34154486 gggaaaacacatacccatatccaaacccagtcaaaacggggaaaatccgtcaaatt 34154541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10823904 - 10823706
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  10823904 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 10823805  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | |||||||||  |||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||| |||    
T  10823804 aaagtaattttttacatttgggagaggtttgggtatgggttcgg---gggtacttatatacccgttatcaatctcatacccgtgttttgagatcggagaa 10823708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 31127009 - 31126826
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||  |||||  |||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  31127009 tttaacatttgttagactgattgatttagttgctcctttcaatatcaatgttagtttttataatacgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 31126910  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccataccc 184  Q
    || ||  || |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||  ||| |||||||  |||| |||||||||||||    
T  31126909 cacaatgtagttttctgcatttgggacgagtttgggtatgagttcggggtggatacctatatacatgttacccgtcccataccc 31126826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 23580701 - 23580954
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23580701 tttaacatttgttatacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatagtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acatatca 23580799  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||   || || ||||||||||||  || |||| ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||| ||    
T  23580800 acataaaataattttttacatttgggataagtgtgggtatgggttcggagtgggtacctatatacccgttacccgtttcatactcgtgttttgaaattgg 23580899  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    ||||||  || || |||| ||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||    
T  23580900 ggaaaactcatacccatacccaaacccagtcaaaacgggaaaaacccgtcaaatt 23580954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23154245 - 23154026
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||  |||     
T  23154245 tcctttaaatatcaacggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acatatcaacataaagtaattttttacatttgggataggta 23154147  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    |||||||||||||||  || |||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| || |||| |||||  || | ||    
T  23154146 tgagtatgggttcggagtgggtacctatatactcgttacccgttccatacccgtg-tttgaaatcggggaaaacccatacccatacccaaactcagttaa 23154048  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    |||||  |||| ||||||||||    
T  23154047 aacgggaaaaacccgtcaaatt 23154026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 48305760 - 48305548
Alignment:
Q  96 atcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaa 195  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| |||| |||||||| || |||| |||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||    
T  48305760 atcaacataaagtaattttttacatttggaacgggtttgggtataggttcggggtgggtacctatatacccgatactcgttccatacccgtgttttgaaa 48305661  T
Q  196 tcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgtt 295  Q
    | ||||||||  || || |||| ||||| ||| |||||| || ||||| |||||| ||| | || ||||||||||||||||| |   ||| | |||||||    
T  48305660 ttggggaaaactcatacccataaccaaacccagtcaaaatggggaaaacccgtcagattgggtttggttcgggtgggtaaccgcgggtatggattttgtt 48305561  T
Q  296 gtcatgcctaatt 308  Q
    |||||| ||||||    
T  48305560 gtcatgtctaatt 48305548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 23547039 - 23546855
Alignment:
Q  118 catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcata 217  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||      |||| ||||    
T  23547039 catttgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcgggga------aaacccata 23546946  T
Q  218 tccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaatt 308  Q
     ||||| ||| ||||||||| ||||| |||| ||||| | || |||||  | ||||||||||   ||| |||||||||| |||||||||||    
T  23546945 cccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgttaaattgggtttggttcatgcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcctaatt 23546855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23910385 - 23910170
Alignment:
Q  74 atcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccg-ttatc 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  || ||     |||||   ||  |||||||||| | | |    
T  23910385 atcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaattttctacattcgggacgggtttaggtgtg-----gggat--cta--tatatacccgataacc 23910295  T
Q  173 cgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtggg 272  Q
    | || |||| ||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||  |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||   ||    
T  23910294 catctcatatccgtgttttgaaatcgaggaaaactcaaactcatacacaaacccagtcaaaacggaaaaaatccgtcaaattgaattcgattcggacagg 23910195  T
Q  273 taaccacatatataggttttgttgt 297  Q
    |||||||   ||| |||||||||||    
T  23910194 taaccacgagtatgggttttgttgt 23910170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3414638 - 3414478
Alignment:
Q  110 attttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaacca 209  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    || ||||||| | ||||| ||| |||||||  |||||||| ||||  ||    
T  3414638 attttctacattaggtacgggtttgagtatggattcgggatgagtac----atccccgttacctgtcccgtactcgtgtttgaaaatcgggaaaaactca 3414543  T
Q  210 aactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggta 274  Q
    ||| |||| ||||| ||||||||| ||| ||||| |  || |||| | || ||||||||||||||    
T  3414542 aacccataaccaaacccaatcaaagcggggaaaacctatcgaattgggtttggttcgggtgggta 3414478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10043374 - 10043243
Alignment:
Q  123 gggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaa 222  Q
    |||| |||| || ||||||||||||| || || | ||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||||| |||| ||||    
T  10043374 gggatgggtatgggtatgggttcggggtgggtgcatataaccccgttacccgtcccatacccatgttttgaaaccagggaaaacccaaacccatacccaa 10043275  T
Q  223 atccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    | ||| |||||  |||||||| ||||||||||    
T  10043274 acccagtcaaagtggagaaaacccgtcaaatt 10043243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30616376 - 30616259
Alignment:
Q  120 tttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatc 219  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||  | ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||      
T  30616376 tttgggacgggtatgggtatgggttcggggtggttatatataacctcgttacccgtcccatatccgtgttttgaaatcggggaaaacccaaacccatact 30616277  T
Q  220 caaatccaatcaaaacgg 237  Q
    ||||| || |||||||||    
T  30616276 caaattcagtcaaaacgg 30616259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 254
Target Start/End: Original strand, 42243362 - 42243514
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||  || ||| ||  ||  ||||| | ||||| || || ||||||||||| || ||||||||     
T  42243362 ataaattgattttctacatttaggatgggtttgggtatgaatttggggtggataaatatatcctcgttacccatctcatacccgtgtattgaaatcggga 42243461  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  42243462 aaaacccaaactcatacccaaacccagtcaaaccggggaaaacccgtcaaatt 42243514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 256
Target Start/End: Original strand, 38347596 - 38347695
Alignment:
Q  157 ttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattag 256  Q
    |||||| | ||||| || || ||||| | |||||| |||||| | ||||  |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38347596 ttatattctcgttacccatctcatactcatgttttgaaatcgagaaaaacgcaaacttatatccaaagccaattaaaacggagaaaatccgtcaaattag 38347695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 10371318 - 10371183
Alignment:
Q  176 cccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaa------tcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggt 269  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||      ||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||| |     
T  10371318 cccatacccgtgttttgagattggggaaaatccatactcatacccaaacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgagc 10371219  T
Q  270 gggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    ||||||||||   | | |||||||||||||||||||    
T  10371218 gggtaaccacgggtctgggttttgttgtcatgccta 10371183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30904927 - 30904808
Alignment:
Q  103 taaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggga 202  Q
    |||||| |||| || |||| | ||||| |||| ||||||||||||| || |||| ||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| |  |    
T  30904927 taaattgatttcctacattcgagacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatccccgt-acccgtcccgtacccgtgttttgaaatcagaaa 30904829  T
Q  203 aaaaccaaactcatatccaaa 223  Q
    ||| ||||||||||| |||||    
T  30904828 aaagccaaactcatacccaaa 30904808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 302
Target Start/End: Original strand, 27252605 - 27252738
Alignment:
Q  167 gttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcg 266  Q
    |||||||||||| ||||| |||||  |||| || |||||  |||||||||| ||||| ||||||||| | || |||| |||||||||||||||  |||||    
T  27252605 gttatccgtcccgtacccatgtttg-aaattggagaaaactcaaactcatacccaaacccaatcaaatccgataaaacccgtcaaattagatttagttcg 27252703  T
Q  267 ggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgc 302  Q
    ||  |||| || |||| || |||||||||| |||||    
T  27252704 gg-cggtaccctcatacatgggttttgttggcatgc 27252738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 243
Target Start/End: Original strand, 4553165 - 4553306
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||  ||| |||| ||  |||| |||||| ||||||||     
T  4553165 ataaattgattttttacattcgagacgggtttgagtatgggttcggggtgtgtatttatatccctattacccgttccgcacccatgttttgaaatcggga 4553264  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaa 243  Q
    ||||  ||||| |||| | ||  ||| ||||| |||||||||    
T  4553265 aaaactcaaacgcatacctaagcccagtcaaagcggagaaaa 4553306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 23547154 - 23547081
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaa 106  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  23547154 tcctttaaatataaatgctagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatattaacataaa 23547081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 48306751 - 48306650
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||| ||||||||||  || ||||||| ||  | ||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  48306751 tttaatatttgttagacggaatgatttagttgatactttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaattaacatgacaaatca 48306652  T
Q  100 ac 101  Q
    ||    
T  48306651 ac 48306650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 57)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 19572726 - 19572425
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||  ||||| || |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19572726 tttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccttcaa-tatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacatgacatatca 19572628  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  19572627 acataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacctgtcccatacccgtgttttgaaatcgg 19572528  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    | |||| ||| || |||| ||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||| ||    
T  19572527 gaaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaatggggaaaacccgtcaaattaggtttggttcgggcgggtaaccacaagtatgggttttgttgcca 19572428  T
Q  300 tgc 302  Q
    |||    
T  19572427 tgc 19572425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 9983104 - 9982798
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||  |||||||||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  9983104 tttaacatttgttagaccgattaatttagttgctcctttgaatatcaatggtagttttgataacatgagaattatcaaacaaaataacatgatatattaa 9983005  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| || |||||| |||||||||| |||| |||    
T  9983004 cataaagtaattttctgcattcgggatgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatactcgttacccatcccattcccgtgttttgaaattggg 9982905  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
    |||||  |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||||   |||  ||||||||| |||    
T  9982904 gaaaattcaaactcatacccaaacccagtcaaaacggagaaaatccatcaaattggatttggttcgggagagtaaccacgggtatgagttttgttgccat 9982805  T
Q  301 gcctaat 307  Q
    |||||||    
T  9982804 gcctaat 9982798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 12494885 - 12495189
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  12494885 tttaacatttgttagaccgataaatttagttgctcctttaaatatcagtggtagtttttataacacgccaattataaaacaaaataacatgtcatgtcaa 12494984  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||| | || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  12494985 catatagtagttttctacatttgggacgggtttgggtatgggttcgaggtgggtacctatatacccgttacacgtcccatatccgtgttttgaaatcggg 12495084  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
     |||| | |||| |||| | ||| ||| |||||  || |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||||    
T  12495085 aaaaaccaaaacccataccgaaacccagtcaaagtggggaaaatccgtcaaattggatttggttcaggtgggtaaccacatgtatgaattttgttgtcat 12495184  T
Q  301 gccta 305  Q
    |||||    
T  12495185 gccta 12495189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 34673496 - 34673192
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  34673496 tttaacatttgttagaccggttgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacacggcaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 34673397  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| || |||||| | || || || |||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||    
T  34673396 cataaagtagttttcttcgttcggaacaggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttaccagtctcatacccgtgttttgaaattggg 34673297  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
     |||| |||||| |||| ||||| ||| | |||| || |||||||||| ||||| | || |||||||| |||||| |||   |||  |||||||||||||    
T  34673296 aaaaacccaaacccatacccaaacccagttaaaatggggaaaatccgttaaattgggtttggttcgggcgggtaatcactggtatgagttttgttgtcat 34673197  T
Q  301 gccta 305  Q
    |||||    
T  34673196 gccta 34673192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 44615690 - 44615389
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  44615690 tttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaataatagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 44615591  T
Q  101 cataaattaattttct-gcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
     ||||| || |||| | | |||||||||||||||| ||||| ||| ||| || |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  44615590 gataaagtagtttttttggatttgggacgggtttgggtatgagtttggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgtttttaaatcag 44615491  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||   || |||  ||||||||||||||   ||| |||||||||| ||    
T  44615490 ggaaaacccaaactcatacccaaacccagtcaaaacgggaaaaacccgtcaaattgagtttggtctgggtgggtaaccacgggtatgggttttgttgcca 44615391  T
Q  300 tg 301  Q
    ||    
T  44615390 tg 44615389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 44792879 - 44793180
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  44792879 tttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaataatagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 44792978  T
Q  101 cataaattaattttct-gcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
     ||||| || |||| | | |||||||||||||||| ||||| ||| ||| || |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  44792979 gataaagtagtttttttggatttgggacgggtttgggtatgagtttggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgtttttaaatcag 44793078  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||   || |||  ||||||||||||||   ||| |||||||||| ||    
T  44793079 ggaaaacccaaactcatacccaaacccagtcaaaacgggaaaaacccgtcaaattgagtttggtctgggtgggtaaccacgggtatgggttttgttgcca 44793178  T
Q  300 tg 301  Q
    ||    
T  44793179 tg 44793180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 17134821 - 17135126
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17134821 tttaacatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 17134920  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcggg-atgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcg 198  Q
    ||||||| ||||||| | ||| ||||||| || || ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17134921 acataaagtaattttttacatatgggacgagtatgggtatgggttcggggatg-gtacctatatacccgttacccgtctcatacccgtgttttgaaatcg 17135019  T
Q  199 gggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtc 298  Q
    ||||||| ||| || || | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||| |   ||| |||||||||| |    
T  17135020 gggaaaacccatacccacacccaaacccagtcaaaacagagaaaatccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgcgggtatgggttttgttgcc 17135119  T
Q  299 atgccta 305  Q
    |||||||    
T  17135120 atgccta 17135126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 304
Target Start/End: Original strand, 34610986 - 34611251
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagta 138  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | || | ||||||||||||||||| |||    
T  34610986 aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataatataacatatcaacataaagtagtattttacatttgggacgggtttgggta 34611085  T
Q  139 tgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgga 238  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||   |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||| || |||| |||||| ||||||||||||     
T  34611086 tgggttcggggtgagtacctatatacacgttacatgtcccatacccgtgttttgagatcgggaaaaacccatacccatacccaaattcaatcaaaacggg 34611185  T
Q  239 gaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcct 304  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||| || ||||||||||   ||| | ||||||||||||||||    
T  34611186 gaaaacccgtcaaattggatttggttcaggcgggtaaccacgggtatggattttgttgtcatgcct 34611251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18354295 - 18354020
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||||| ||  || || ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18354295 tttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 18354196  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||| || || |||| |||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18354195 acataaaataattttttacatttgggacgagtatgggtatcggttcggggtgggaacttatatacccgttacccgtcccatacccatgttttgaaatcgg 18354096  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaa 275  Q
    |||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||||  |||| ||||||||||  ||| |||||||| ||||||    
T  18354095 ggaaaacccatacccatattcaaatccagtcaaaacgggaaaaacccgtcaaattgaatttggttcgggcgggtaa 18354020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29871499 - 29871246
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29871499 tttaatatttgttagaccgattgatgtagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacatgggaattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 29871400  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| || || |||| |||||||| |||| | ||||||||||| |||||| |||||||     
T  29871399 cataaaataattttctacattcgggacgggtttgggtatgagttcagggtgggtacctatataccagttacctgtcccatacccatgttttgaaatcgga 29871300  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    ||||| ||||||||||| |||||   | ||||||||  ||||| ||||||||||    
T  29871299 gaaaacccaaactcatacccaaacttagtcaaaacgaggaaaacccgtcaaatt 29871246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 36187396 - 36187130
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagta 138  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||| |||    
T  36187396 aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataactttttacatttgggacgggtttgggta 36187297  T
Q  139 tgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgga 238  Q
    ||||||| || || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| |||||||||     
T  36187296 tgggttcagggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggg 36187197  T
Q  239 gaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    ||||| ||| ||||||   || |||||||| ||||||| ||   ||| |||||||||| ||||||||    
T  36187196 gaaaacccgccaaattgagtttggttcgggcgggtaacgacgggtatgggttttgttgccatgccta 36187130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24236972 - 24236698
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  24236972 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 24236873  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  24236872 aaaataattttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttccccgttccatacccgtgttttgagatcggggaa 24236773  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacca 278  Q
    || ||| || |||| | ||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||   || |||||||| |||||||||    
T  24236772 aacccatacccatacctaaacccagtcaaaacgggaaaaacccgtcaaattgagtttggttcgggcgggtaacca 24236698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 42708045 - 42707744
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    |||||||| |||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42708045 tttaacatctgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 42707946  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  42707945 acataaaataattttttacatttgggacgg------gtatgggttcggg-tgagtacttatattcccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgg 42707853  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
     |||||  || ||||||| ||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||  ||| ||  || |||||||   ||| |||||||||| ||    
T  42707852 agaaaactcatactcatacccaaacccagtcaaaatgggaaaaatccgtcaaattaaatttagtttggacggataaccacgattatgggttttgttgcca 42707753  T
Q  300 tgcctaatt 308  Q
    | |||||||    
T  42707752 tacctaatt 42707744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Original strand, 51421736 - 51422037
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  51421736 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatagcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 51421835  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    | | ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  51421836 agagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatacatgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcgggaaa 51421935  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| || |||| ||||| ||| |||||| || ||||| || ||||||| | || |||||||| ||||||||||  |||| | |||| ||| ||||||    
T  51421936 aacccatacccatacccaaacccagtcaaaatggggaaaacccatcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacggatatggattttattgccatgcc 51422035  T
Q  304 ta 305  Q
    ||    
T  51422036 ta 51422037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Original strand, 29936294 - 29936601
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||    
T  29936294 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattataaaaaaaaataacattacatatcaacat 29936393  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  29936394 aaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtattttgagatcggggaa 29936493  T
Q  204 a------aaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgt 297  Q
    |      | ||| ||||||| |||||   | ||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||    
T  29936494 aacccatacccatactcatacccaaacttagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgt 29936593  T
Q  298 catgccta 305  Q
    ||||||||    
T  29936594 catgccta 29936601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16433375 - 16433089
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16433375 tttaatatttgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataatac---aattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 16433279  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||   | |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  16433278 cataaagtaattttctgcatttggggtgggtttgggtatgggttcgg---gggtacctatatatccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgga 16433182  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
    |||||  |||||            |||||||||| || ||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||| |||    
T  16433181 gaaaactcaaac------------ccaatcaaaatggggaaaatccgtcaaattgagtttggttcggatgggtaaccacggatataggttttattgccat 16433094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 40 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 49250949 - 49250680
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagta 138  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||| |||    
T  49250949 aaatatcaatgatagtttttatcaacatgacaattatcaaacaaaatagcataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggta 49250850  T
Q  139 tgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgga 238  Q
    |||||||| | ||  ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||  || || |||| ||||| ||| ||||||||||    
T  49250849 tgggttcgaggtggatacctatatacccattacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaactcatacccatacccaaacccagtcaaaacgga 49250750  T
Q  239 gaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaatt 308  Q
    ||||| ||||||||||  ||| |||||||| || |||||||   |||   ||||||||||||||||||||    
T  49250749 gaaaacccgtcaaattgaatttggttcgggcggataaccacgggtatgaattttgttgtcatgcctaatt 49250680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 69 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 23490917 - 23490677
Alignment:
Q  69 caattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgt 168  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  23490917 caattatcaaacaaaataacataacatatccacataaattagttttttacatttgggacgggttttggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgt 23490818  T
Q  169 tatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcggg 268  Q
    || |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||||||| |  |||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  23490817 tacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacaggaaaaacccgtcaaattggatttggttcggg 23490718  T
Q  269 tgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaattt 309  Q
     ||||||| |    ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23490717 cgggtaactatgagtatgggttttgttgccatgcctaattt 23490677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 305
Target Start/End: Original strand, 28297840 - 28298125
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctg-catttgggacgggt 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||||    
T  28297840 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaatagtttttttacatttgggacgggt 28297939  T
Q  132 ttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaa------------aaccaaactcatatc 219  Q
    ||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||            | ||| || |||| |    
T  28297940 ttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaactcatacccatacccatacccatacc 28298039  T
Q  220 caaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||    
T  28298040 caaatccaatcaaaacagggaaaacccgtcaaattggatttggttcgggtgggtaaccacggatatgagttttgttgacatgccta 28298125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17092174 - 17091951
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17092174 tttaacatttattagatggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 17092075  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||||| ||||| | |||||||||||||  ||||||||||| ||||| | |||||||    
T  17092074 acataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggcatgggttcggggtgagtgcctatatacccgttacgcgtcccatacctgtgttataaaatcgg 17091975  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaa 223  Q
    ||||||  || |||||||||||||    
T  17091974 ggaaaactcatactcatatccaaa 17091951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Original strand, 24710736 - 24711026
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || |  |||||||||    
T  24710736 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataatgtatcaacat 24710835  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||           || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  24710836 aaagtaattttttacatttgggacgggtttgagtatgggt-----------acctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaa 24710924  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||| ||||||||||| ||| |||   | | |||||||||||||||||    
T  24710925 aacccatactcatatccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgaatttggttcgggtggataatcacgggtgtgggttttgttgtcatgcc 24711024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 40087678 - 40087425
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  40087678 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgatatatca 40087579  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||||| |||||||  | ||||||||| ||| |||| ||||||    
T  40087578 acataaagtaattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggtacctatattcccgttactcatcccatacctgtg-ttttgaatcgg 40087480  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    ||||||  || || |||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  40087479 ggaaaactcatacccatacccaaactcagtcaaaacggggaaaatccgtcaaatt 40087425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 45866400 - 45866096
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45866400 tttaacatttgttagacagaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 45866301  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||| |||| || ||||| ||| ||| || |||| ||||||| | ||| | ||| |||||||||||||| |||||||    
T  45866300 acataaagtaattttttacatttgggatgggtatgggtatgagtttggggtgggtacctatatactcattacctgtctcatacccgtgttttgaaatcgg 45866201  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||| || |||| ||||| | | |||||| |||||||| ||||||| |||| || || ||||| |||||||| |   ||| |||||||||| ||    
T  45866200 ggaaaacccatacccatacccaaacctagtcaaaa-ggagaaaacccgtcaatttaggtttggctcgggcgggtaaccgcgagtatgggttttgttgcca 45866102  T
Q  300 tgccta 305  Q
    ||||||    
T  45866101 tgccta 45866096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 5180919 - 5181218
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||| ||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5180919 tttaaaatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 5181018  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||| ||||||      ||||||| ||| || || | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  5181019 acataaaataattttttacatttggaacgggt------atgggtttggggtgggtgcctatatacccgttacccgtcccatacccgtattttgaaatcgg 5181112  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||| || |||| | ||| ||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||| |||||||| |||||||| |   ||| |||||||||| ||    
T  5181113 ggaaaacccatacccatacctaaacccagtcaaaatggggaaaacccgtcaaattgaatttggttcgggcgggtaaccgcgggtatgggttttgttgcca 5181212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 307
Target Start/End: Original strand, 16408823 - 16409122
Alignment:
Q  4 aacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaaca 102  Q
    |||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||    ||    
T  16408823 aacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacata----ca 16408918  T
Q  103 taaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggga 202  Q
    |||| ||||||| | |||||||  |||||||   |||||||||||| |  |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16408919 taaagtaattttttacatttggagcgggtttagctatgggttcggggtcggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgttttgaaattgggga 16409018  T
Q  203 aaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgc 302  Q
    ||| ||| || |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | || | |||| | ||||||||   | ||| ||||||||||||||||    
T  16409019 aaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttgattcgag-gggtaaccgtgtgtatgggttttgttgtcatgc 16409117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 35937031 - 35936821
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35937031 tttaacatttgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttgtaacacggaaattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 35936932  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||||| ||||   |||||||||            ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  35936931 cataaagtaattttctacattcatgacgggttt------------ggggtgggtacctatatacccgttatccgtcccatactcgtgatttgaaatcggg 35936844  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaa 223  Q
    ||||| ||||||||||| |||||    
T  35936843 gaaaacccaaactcatacccaaa 35936821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 49741221 - 49741054
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||| ||  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  49741221 tttaacatttgttaaaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttataacacatcaattatcaaacaaaataacataacatattaa 49741122  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgt 168  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  49741121 cataaagtagttttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgt 49741054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 50426870 - 50426672
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    |||||||||||| |||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50426870 tttaacatttgtaagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 50426771  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||| ||| | ||||||||||||      ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  50426770 acataaagtaaatttttacatttgggacgg------gtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttatccgtctcatacccgtgttttgaaatcag 50426677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3628202 - 3627995
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||| ||  ||| | |||||| |||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3628202 tttaacatttgttagacgtaatgatttagttgatccgttaaatattaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 3628103  T
Q  100 acataaattaattttctg--catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatc 197  Q
    ||||||| ||||||| |   |||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  3628102 acataaagtaattttttttacatttgggactggaatgagtatgggttcggggtgggtacctacatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatc 3628003  T
Q  198 ggggaaaa 205  Q
    ||||||||    
T  3628002 ggggaaaa 3627995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 42439885 - 42439581
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  42439885 tttaacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatca 42439786  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||| | |||||  |||||||||||| || |||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||| | |||||    
T  42439785 acataaagtaattttttacatttgggatgagtttggatatgggttcggggtgggtacctatatacccgttactcgtcccatacccatgttttgagatcgg 42439686  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
      ||||  || || |||| |||||  || |||||| ||| |||||  ||||||||   || |||||||| || |||||||  |||| | |||||||| ||    
T  42439685 aaaaaattcatacccatacccaaactcagtcaaaatggaaaaaatttgtcaaattgagtttggttcgggcggataaccacgaatatggattttgttgcca 42439586  T
Q  300 tgcct 304  Q
    |||||    
T  42439585 tgcct 42439581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 23966746 - 23966917
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataa-cacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||  | ||| |||||||||| |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23966746 tttaacatttgttagatggaatgatttagttgatactttaaatatcaatagtagtttttataaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatca 23966845  T
Q  100 acataaattaattttctg-catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgtta 170  Q
    ||||||| ||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  23966846 acataaagtaatttttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgtta 23966917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 34060234 - 34060035
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttatta-taacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  34060234 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggttgtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acatatca 34060136  T
Q  100 acataaattaa-ttttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcg 198  Q
    ||||||| ||| |||| | || |||||||||      ||||||||||||  || |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34060135 acataaagtaatttttttacaattgggacgg------gtatgggttcggagtgggtacctatatacctgttatccgtctcatacccgtgttttgaaatcg 34060042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 44632350 - 44632151
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  44632350 tttaacatttgttagacctattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacacgacaattgtcaaacaaaataatatggcatatcaa 44632251  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |      ||||||||  ||||| ||||| |||||  ||||| |||  | ||  |||  ||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  44632250 c-----gtaattttcgacatttaggacgagtttggatatggattcacggtggatacccatacacctgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgga 44632156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 168
Target Start/End: Original strand, 13390356 - 13390455
Alignment:
Q  69 caattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgt 168  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||||| || |||| |||||||||||    
T  13390356 caattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgagttcggggtgggtacctatatacccgt 13390455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 39616177 - 39616443
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    |||||||| |||||||  || |||||||| |  || || |||||||||||||| || |||| |||| |  ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  39616177 tttaacatctgttagacggaatgatttaactgatcatttaaatatcaatggtaatttttattaacatgataattagcaaacaaaataacatgacatatca 39616276  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||           || | |||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  39616277 acataaaataattttttacatttgggacgggtatgggtatgg-----------gtgcctatatacttgttacccgtcctatacccgtgttttgaaatagg 39616365  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacc 277  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||  || ||||||||| |||||  |||||||||   || |||||||| ||||||||    
T  39616366 ggaaaacccatactcatacccaaactcagtcaaaacggggaaaactcgtcaaattgagtttggttcgggcgggtaacc 39616443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 172 - 305
Target Start/End: Original strand, 23968625 - 23968758
Alignment:
Q  172 ccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgg 271  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| || |||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||| | || |||||||| ||    
T  23968625 ccgtcccatacccgtgttttgaaaccggggaaaacccatacccatacccaaacccaatcaaaatggggaaaatccgtcaaattgggtttggttcgggcgg 23968724  T
Q  272 gtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    |||||| |   ||| |||||||||| ||||||||    
T  23968725 gtaaccgcgggtatgggttttgttgccatgccta 23968758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 252
Target Start/End: Original strand, 34085217 - 34085361
Alignment:
Q  108 taattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaac 207  Q
    ||||||| | ||||| ||||| || || ||||||||||||| || |||| ||||  ||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||| |    
T  34085217 taattttttacatttaggacgagtatgggtatgggttcggggtgggtacatataaccccgttacccatcccatactcgtgttttgaaatcgggaaaaacc 34085316  T
Q  208 caaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaa 252  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  34085317 caaactcatatcctaacccagtcaaagcggagaaaacccgtcaaa 34085361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 33293588 - 33293494
Alignment:
Q  158 tatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaa 252  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  33293588 tatatccccattacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgggaaaaacccaaactcatacccaaacccaatcaaaacggaaaaaattcgtcaaa 33293494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 127
Target Start/End: Original strand, 2514681 - 2514769
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacat-atcaacataaattaattttctgcatttgggac 127  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  2514681 aaatatcaatggtagtttttattacacggcaattatcaaacaaaataacatgacatgttcaacataaaataattttatgcattcgggac 2514769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10778664 - 10778528
Alignment:
Q  118 catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcata 217  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||  ||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |||||||||    
T  10778664 catttgagacgggtatgagtatgggttcggggtggatatctataaccccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgggaaaaacttaaactcata 10778565  T
Q  218 tccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
     ||||| ||| ||||| |||| |||| ||||||||||    
T  10778564 cccaaacccagtcaaagcggaaaaaacccgtcaaatt 10778528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 35069976 - 35069851
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatcca 227  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || |||| |||||   ||||||| || | |||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  35069976 gggtttgagtatgggttcggggtgggtacatatatccctgttacccgtcttgtacccgtattatgaaatcggggaaaactcaaactcatacccaaatcca 35069877  T
Q  228 atcaaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
     |||||  ||||||| ||||||||||    
T  35069876 gtcaaattggagaaactccgtcaaat 35069851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 179 - 306
Target Start/End: Original strand, 13020646 - 13020773
Alignment:
Q  179 atacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacca 278  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| |||| |||||||||| |||||| |||   || |||||||   |||||||     
T  13020646 atactcgtgttttgaaatcggggaaaacccatacccataaccaaacccagtcaagacggagaaaacccgtcagattgagtttggttcggacaggtaaccg 13020745  T
Q  279 catatataggttttgttgtcatgcctaa 306  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  13020746 cagatataggttttgttgtcatgcctaa 13020773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16237391 - 16237296
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaa 223  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||| | ||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16237391 gggtttgggtatgggttcggggttagtacatatatcctcgttacccgtcccttacccgtattttgaaatcggggaaaacccaaattcatatccaaa 16237296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 212
Target Start/End: Original strand, 39219234 - 39219344
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||||| || |||| | ||| |||||||   || || |||||||||||| |||||||||    
T  39219234 ataaattaattttctacatttagaacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacatgtatccccgttacttgttccgtacccgtgttttaaaatcgggg 39219333  T
Q  202 aaaaaccaaac 212  Q
    |||| ||||||    
T  39219334 aaaacccaaac 39219344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 48125795 - 48125683
Alignment:
Q  103 taaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggga 202  Q
    |||||| ||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||||| ||  ||| ||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| || |    
T  48125795 taaattgattttctacattcgcgacgagtttgggtatgggttcggggtggatacctatatcctcgttacccgtcccgtacccgtgttttaaaatcaggaa 48125696  T
Q  203 aaaaccaaactca 215  Q
    ||| |||||||||    
T  48125695 aaatccaaactca 48125683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19003723 - 19003628
Alignment:
Q  158 tatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| || ||| |||| ||||| | | ||||| ||| ||||| |||||||||    
T  19003723 tatatccccgttatccgtcccatacccgtattttgtaatcggggaaaacccgaacccatacccaaacctagtcaaatcggggaaaacccgtcaaat 19003628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 305
Target Start/End: Original strand, 20774654 - 20774745
Alignment:
Q  214 catatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||    
T  20774654 catacccaaacccagtcaaaacggggaaaatccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgagtatgggttttgttgccatgccta 20774745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41477063 - 41476944
Alignment:
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||| | ||||||||||||| ||| ||| ||||  |||||   ||    
T  41477063 aaattgattttctgctttcgggacgggtttgggtatggattcggggtgggtacatatatccacgttatccgtcccgtactcgtattttccaatcgaaaaa 41476964  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaa 223  Q
    || |||||||||||| ||||    
T  41476963 aacccaaactcatattcaaa 41476944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 142
Target Start/End: Original strand, 20774575 - 20774649
Alignment:
Q  69 caattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaatta-attttctgcatttgggacgggtttgagtatggg 142  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  |||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  20774575 caattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggtttgggtatggg 20774649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 215
Target Start/End: Original strand, 38686673 - 38686751
Alignment:
Q  137 tatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactca 215  Q
    |||||||||||| || |||| ||||  |  ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  38686673 tatgggttcggggtgggtacatataaccatgttattcgtcccatacccgtattttaaaatcggggaaaatccaaactca 38686751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 243
Target Start/End: Original strand, 2514811 - 2514875
Alignment:
Q  180 tacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcata-tccaaatccaatcaaaacggagaaaa 243  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||    
T  2514811 tacccgtgttttgaaattggggaaaacccaaactcataccccaaacccaatcaaaacggggaaaa 2514875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 254
Target Start/End: Original strand, 13798290 - 13798366
Alignment:
Q  178 catacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| ||| | ||| ||||| |||| |||||    
T  13798290 catacccgtgttttgaaatcgggaaaaacccaaactcatacccaaacccagtcataccggggaaaacccgttaaatt 13798366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 266
Target Start/End: Original strand, 16903515 - 16903663
Alignment:
Q  118 catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcata 217  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||||| ||| ||| |  |||| ||| |||||||| |||| ||| |||| | |||| |||     
T  16903515 cattcgggacgggtttgggtatgagttcggggtgggtacctatatccccattacctatcccgtactcgtgttttaaaattgggaaaaatctaaacccatg 16903614  T
Q  218 tccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcg 266  Q
     ||||| |||||||||  |  ||||||||||||| || |||| ||||||    
T  16903615 cccaaacccaatcaaagtgaggaaaatccgtcaacttggatttggttcg 16903663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12718858 - 12718764
Alignment:
Q  129 ggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaa 223  Q
    |||||| |||||||||| || || |||| |||||  |||||| ||||| | ||| ||| || | ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12718858 ggtttgggtatgggttcagggtgggtacatatatttccgttacccgtctcgtacacgtattatgaaatcggggaaaatccaaactcatacccaaa 12718764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 13020562 - 13020648
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttatta-taacacggcaattatcaaacaaaata 86  Q
    ||||| ||||||||||  || ||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  13020562 tttaatatttgttagacggaatgatttagttgatactttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 13020648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 234
Target Start/End: Original strand, 36617387 - 36617469
Alignment:
Q  153 gtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgttttt-aaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaa 234  Q
    |||| ||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  36617387 gtacctatattctcgttattcgtcccgtacccatgtttttgaaatcgtggaaaactcaaactcatatctaaacccaatcaaaa 36617469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 185 - 277
Target Start/End: Original strand, 13390456 - 13390547
Alignment:
Q  185 gtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacc 277  Q
    ||||||| |||||||||||||  || || |||| ||||| ||| ||||||||| | ||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||    
T  13390456 gtgttttgaaatcggggaaaattcatacccatacccaaacccagtcaaaacgg-ggaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaacc 13390547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 61)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 4582992 - 4583300
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4582992 tttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 4583091  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||||| ||| || | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  4583092 acataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggtttggggtgggaacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgg 4583191  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||    ||||  ||||||||| ||    
T  4583192 ggaaaacccatacccatatccaaacccaatcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgtggatatgagttttgttgcca 4583291  T
Q  300 tgcctaatt 308  Q
    |||||||||    
T  4583292 tgcctaatt 4583300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 40 - 305
Target Start/End: Original strand, 4920738 - 4921004
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagta 138  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  4920738 aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggta 4920837  T
Q  139 tgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgga 238  Q
    |||||||||| ||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||||||||||    
T  4920838 tgggttcggggtggatacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccatacccataaccaaacccagtcaaaacgga 4920937  T
Q  239 gaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    ||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||    
T  4920938 gaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgccta 4921004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 308
Target Start/End: Original strand, 40517683 - 40517987
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  40517683 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 40517782  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||   |||||||||    
T  40517783 aaaataattttttacctttgggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtaactatatacccgttacccatcccatacccgtgttttgggatcggggaa 40517882  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| || |||| ||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||    
T  40517883 aacccatacccatacccaaacccagtcaaaacgggaaaaatccgtcaaattgaatttggttcaggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcc 40517982  T
Q  304 taatt 308  Q
    |||||    
T  40517983 taatt 40517987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 15890080 - 15890385
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| | || || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15890080 tttaacatttgttagacgtaattatttaattgatccttcaaatatcaatggtagttttcattaatatgacaattatcaaataaaataacatgacatatca 15890179  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  15890180 acataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggg-tgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgg 15890278  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
     ||||| ||| || |||| ||||| | | |||||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||| |   ||| |||||||||||||    
T  15890279 agaaaacccatacacatagccaaacctagtcaaaacgggaaaaacccgtcaaattggatttggttcgggcgggtaaccgcgagtatgggttttgttgtca 15890378  T
Q  300 tgcctaa 306  Q
    |||||||    
T  15890379 tgcctaa 15890385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17853507 - 17853232
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17853507 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acatatca 17853409  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||  || |||  |||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  17853408 acataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggagtgggtatctatatatccgttacccgtcccatacccgtg-tttgaaatcgg 17853310  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacc 277  Q
    |||||| ||| |  |||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  17853309 ggaaaacccatatccatacccaaacccaatcaaaacggggaaaacccgtcaaattaggtttggttcaggtgggtaacc 17853232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 5908871 - 5908599
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  5908871 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtt 5908772  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||  || || |||| ||||| ||||||||    
T  5908771 tgggtatgggtttggggtgtgtacatatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaactcatacccatacccaaacccaatcaa 5908672  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    || || ||||| |||||||||| | || |||||||| || |||||||   ||| | |||||||| ||||||||    
T  5908671 aatggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcggataaccacgggtatggattttgttgccatgccta 5908599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 12447255 - 12447546
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  12447255 tttaacatttgttagatcgattgatttaactgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatattaa 12447354  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| || ||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||| || |||| ||||||||| ||| | |||||||||| |||||||  ||||  |    
T  12447355 cataaagtagttttctatatttgggacgggtttgggtataggttcggggtgggtacctatatacccattacctgtcccatacctgtgttttacaatcaag 12447454  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
    ||||| ||||||            ||| |||||| || |||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||   ||| |||||||||| |||    
T  12447455 gaaaacccaaac------------ccagtcaaaatggggaaa-tccgtcaaattgggtttggttcgggtgggtaaccacgggtatgggttttgttgccat 12447541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 12866729 - 12866471
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatat-gacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagt 137  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||    
T  12866729 aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatagacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggt 12866630  T
Q  138 atgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgg 237  Q
    ||||||||| | || |||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||  || || |||| ||||| ||| |||||| ||    
T  12866629 atgggttcgcggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccatgttttgaaatcggagaaaactcatacccatacccaaacccagtcaaaatgg 12866530  T
Q  238 agaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttg 296  Q
     ||||| |||||||||| |||| |||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12866529 ggaaaacccgtcaaattggatttggttcggacgggtaaccacatgtatgggttttgttg 12866471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 18206891 - 18207196
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaa-ttatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  18206891 tttaatatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcattagtagtttttataacacggcaaattattaaacaaaataacatggcatatca 18206990  T
Q  100 acata-aattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcg 198  Q
    ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||| |||| | ||||||||| || ||||| ||||||    
T  18206991 acatagaagtaattttctacattcgggacgggtttgaatatgggttcggg-tgggtacctatatacctgttacctgtcccatacacgagttttgaaatcg 18207089  T
Q  199 gggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtc 298  Q
     |||||| ||||||||||  ||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| | || |||| ||||||||||||||   |||  ||||||||| |    
T  18207090 aggaaaacccaaactcatgcccaaacccagtcaaaacgggaaaaacacgtcaaattgggtttggtttgggtgggtaaccacgggtatgagttttgttgcc 18207189  T
Q  299 atgccta 305  Q
    |||||||    
T  18207190 atgccta 18207196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 2412941 - 2412688
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||  ||||| |||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2412941 tttaatatttgttagaccgattaatttagttgctcctttaaatatcaattgtagtttttatgacacaacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 2412842  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
     ||||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||    
T  2412841 tataaagtaattttctgcatacgggacgagtttgggtattggttcaggatgggtacatatatacccgttatttatcccatacccgtgttttgaaattggg 2412742  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
     ||||  ||||| |||| |||||  ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2412741 aaaaattcaaacccatacccaaactcaatcaaaatggggaaaatccgtcaaatt 2412688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 305
Target Start/End: Original strand, 30996477 - 30996773
Alignment:
Q  9 ttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaat 107  Q
    ||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||     
T  30996477 ttgttagacggaatgatttatttgatcctttaaatatcaacggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacttaaag 30996576  T
Q  108 taattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaac 207  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| || || ||||||| || |||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |    
T  30996577 taattttttacatttgggacgggtttgggtgtgtgttcggggtgggtacctatatacccgttacctgtcccatactcgtgttttaaaatcggagaaaacc 30996676  T
Q  208 caaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    || ||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||  || |||||  | |||| |||||||||| ||||||||    
T  30996677 catactcatacccaaacccagtcaaaacgg-gaaaatccgtcaaattgggtttggttcggacggataaccgtagatatgggttttgttgccatgccta 30996773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 6156134 - 6155829
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataac-acggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||| || || |||| || | | ||||||||||||||||||| ||| ||||| |    
T  6156134 tttaacatttgttagacggaatgatttatttgctcctttaaatatcaatgatattttttattaccatgacaattatcaaacaaaataacatgtcatataa 6156035  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||| ||||||||||||| || |||| ||||||||  ||| | |||| ||||||||||||| |||||||    
T  6156034 acataaagtaattttcaacatttgtgacggttttgggtatgggttcggggtgggtacatatatacc--ttacctgtcctatacccgtgttttgaaatcgg 6155937  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| |||||| |||| ||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||||| |||| ||| ||||||| ||||| ||  |||  ||||||||| ||    
T  6155936 ggaaaacccaaacacatacccaaacccagtcaaaacgaagaaaacccgttaaatttgatttggtacgggtggataaccgcaggtatgagttttgttgcca 6155837  T
Q  300 tgcctaat 307  Q
    ||||||||    
T  6155836 tgcctaat 6155829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12834791 - 12834495
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatat-gacatatc 98  Q
    ||||||||||||||||   |  |||||||||  || || ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12834791 tttaacatttgttagacgtaacgatttaattgatcattcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatagacatatc 12834692  T
Q  99 aacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcg 198  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||| |  |||| |||||||| |||| |||||||||| || |||||| |||| |    
T  12834691 aacataaattaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtaggtacctatatacctgttacccgtcccatatccatgttttgaaattg 12834592  T
Q  199 gggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgtt 295  Q
    | ||||| ||| || |||| ||||| ||| |||||| || ||||| ||||||||||   || |||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  12834591 gagaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaatggggaaaacccgtcaaattgagtttggttcggacgggtaaccacatgtatgggttttgtt 12834495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22695084 - 22694817
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  22695084 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacattacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtt 22694985  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    || ||||||||||||| || |||| | |||||||||||  |||||||||||||| |||| | ||||||| ||| ||| || |||| ||||| ||| | ||    
T  22694984 tgggtatgggttcggggtgggtacctctatacccgttagtcgtcccatacccgtattttgagatcgggg-aaacccatacccatacccaaacccagttaa 22694886  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatg 301  Q
    |||||  ||| ||||||||||| | || |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||    
T  22694885 aacgggaaaattccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatg 22694817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35194204 - 35194014
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||    
T  35194204 tttaacattttttagaccaattgatttagtttattctttaaatatcaatggtagtttttataacacagcaattatcaaacaaaataacatagcatattaa 35194105  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttt 191  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35194104 cataaagtaattttctacattcgggacgggtttgagtatgagtttggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttt 35194014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 42987691 - 42987391
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  42987691 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 42987592  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  42987591 aaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcgggatgggtacctatatatccgttacacgtcccatacccgtgttttgagatcggggaa 42987492  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| || | || |||||  || |||||||||  |||| ||| ||||||  ||| |||||||  || | |||||  |||| |||||||||| ||||||    
T  42987491 aatccatacccgtacccaaactcagtcaaaacgggaaaaacccgccaaattgaatttggttcggacggat-accacgaatatgggttttgttgccatgcc 42987393  T
Q  304 ta 305  Q
    ||    
T  42987392 ta 42987391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 29246167 - 29245866
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaatt-attccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatc 98  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||| |||| || ||||||||||||||||  |||| ||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  29246167 tttaacatttgttagacggaatgatttaattgattcatt-aaatatcaatggtagtgtttattaacataacaattatcaaacaaaataacatgacatacc 29246069  T
Q  99 aacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcg 198  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||| |||| || ||||||||| ||| || |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  29246068 aacataaaataattttttacatttgggatgggtatgggtatgggtttggggtgggtacctatatacatgttattcgtcccatacccgtgttttgaaatcg 29245969  T
Q  199 gggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtc 298  Q
    | |||||  || || |||| ||||| | | ||||||||| ||||| ||||||||||   || |||||||| |||||||| |   ||| ||||||||||||    
T  29245968 gagaaaactcatacccatacccaaacctagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgagtttggttcgggcgggtaaccgcgggtatgggttttgttgtc 29245869  T
Q  299 atg 301  Q
    |||    
T  29245868 atg 29245866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 35311696 - 35311991
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  35311696 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acatatca 35311794  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||  || |||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  35311795 acataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggagtgggtacctatatatctgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgg 35311894  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
             | |  |||| |||||  || |||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||| |||||||| |  ||||  ||||| ||||||    
T  35311895 ---------atatccatacccaaactcagtcaaaacggaaaaaatccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgcggatatgagttttattgtca 35311985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38006684 - 38006473
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  38006684 tttaacaattgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatgacatattaa 38006585  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||| || |||| |||||| | ||||  |||||||||||||| |||| |||| |||    
T  38006584 cataaattaattttcaacattcgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatatctgttacgcgtcccatacccgtattttgaaattggg 38006485  T
Q  201 gaaaaaccaaac 212  Q
    ||||| ||||||    
T  38006484 gaaaacccaaac 38006473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13402218 - 13401914
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13402218 tttaacatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatagtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acatatca 13402120  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| |  || |||||||||  || |||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||    
T  13402119 acataaagtaattttttacatttgggacgggtatcggt-tgggttcggagtgggtacctaaatacccgttacccgttccatacccgtgtttgaaaatcgg 13402021  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    | ||||  || || |||| ||||| | | |||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||| |||||||| |   ||| |||||||||| ||    
T  13402020 gaaaaactcatacccatacccaaacctagtcaaaacggaaaaaatccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgcgggtatgggttttgttgcca 13401921  T
Q  300 tgcctaa 306  Q
    |||||||    
T  13401920 tgcctaa 13401914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 3573098 - 3573243
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  3573098 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttgaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacagaataacatgacatatcaa 3573197  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcg 146  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  3573198 cataaaataattttctacattcgggaggggtttgagtatgggttcg 3573243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 2985021 - 2985225
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2985021 tttaatatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacacaacaattatcaaataaaataacatgacatatcaa 2985120  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
     ||||| |||||||||  ||| | ||| | |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||| || |||||||     
T  2985121 tataaaataattttctatattcgagacagatttgggtatggtttcgggatgagtacctatatacccgttacccgtcccaaacccatgtcttgaaatcgga 2985220  T
Q  201 gaaaa 205  Q
    |||||    
T  2985221 gaaaa 2985225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 30115357 - 30115525
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||| ||  ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  30115357 tttaacatttgttagactgatcgatttagttgctcctttaaatataaatggtggtttttataacacggcaattatcaaacaaaataacatagcatatcaa 30115456  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgtt 169  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  30115457 cataaaataattttatgcattcgggacgggtttgaatatgggttcgggatgggtaccaatatacccgtt 30115525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6092701 - 6092468
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||    
T  6092701 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacattgcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggatt 6092602  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    || ||||||||||||| || |||| |||||||||||           |||||||||||| | |||||| |||| ||| || |||| ||||| ||||||||    
T  6092601 tgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgt-----------tacccgtgttttgagatcgggaaaaacccatacccatacccaaacccaatcaa 6092513  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacc 277  Q
    ||||| ||||| |||| |||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  6092512 aacggggaaaacccgttaaattgaatttggttcgggcgggtaacc 6092468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 153 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 33728064 - 33727912
Alignment:
Q  153 gtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaa 252  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33728064 gtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaatccatacccatatccaaacccaatcaaaacggggaaaatccgtcaaa 33727965  T
Q  253 ttagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    || | || |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||    
T  33727964 ttgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgccta 33727912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 1218630 - 1218812
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  1218630 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttttaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acaaatcaa 1218728  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccataccc 184  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||  || |||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  1218729 cataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggagtgggtacctatatacccgttacctgtcccataccc 1218812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 20973660 - 20973410
Alignment:
Q  42 atatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatg 140  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||           ||||    
T  20973660 atatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataccatgacatatcaacataaagtaattttttacatttggg-----------tatg 20973572  T
Q  141 ggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggaga 240  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||||||||| ||    
T  20973571 ggttcggggtgggtacctatatacccgttacccatcccatacccgtgtttgaaaatcggggaaaacccatacccataaccaaacccagtcaaaacgggga 20973472  T
Q  241 aaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgc 302  Q
    ||| |||||| | | | || |||||||| |||||||| |   ||| |||||||||| |||||    
T  20973471 aaacccgtcagaatgggtttggttcgggcgggtaaccgcgggtatgggttttgttgccatgc 20973410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 27088566 - 27088420
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27088566 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacataacaattatcaaacaaaataacat-acatatcaa 27088468  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcggg 148  Q
    |||||| ||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  27088467 cataaaataattttctacattcgagacgggtttgggtatgggttcggg 27088420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 6369569 - 6369874
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  || || ||| ||||| ||||||| | || |||| |  |||||||||||||||||| | |||  ||||    
T  6369569 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaacatcaacggtagttttcattaacatgataattatcaaacaaaataacacgacgcatca 6369668  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| || |||||||| ||| |||| ||||| |    
T  6369669 acataaagtaattttttacattttggacgggttaaagtatgggttcggggtgggtacatatatacacgtta-ccctcccatactcgtattttgaaatcag 6369767  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    ||||||  || || |||  |||||  |||||||||||   |||| |||||||||||| || |||||| | ||||||||| | ||||  ||||||||||||    
T  6369768 ggaaaactcatacccatgcccaaactcaatcaaaacgagaaaaaaccgtcaaattaggtttggttcgagcgggtaaccataaatatgagttttgttgtca 6369867  T
Q  300 tgcctaa 306  Q
    |||||||    
T  6369868 tgcctaa 6369874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 8453587 - 8453389
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| | ||||||| ||||||||||  | ||||||| ||    
T  8453587 tttaacatttgtttgaccgaatgatttagttactcctttaaatatcaatggtaatttttataacatgacaattattaaacaaaata--acgacatattaa 8453490  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacg-ggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||  || ||| || |||| |||||| | |||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  8453489 cataaactaattttctacatttgggacgagttttgagtatgactttggggtgtgtacctatatatctgttacccatcccatacccgtgttttgaaatcgg 8453390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27302948 - 27302746
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||  || ||  ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  27302948 tttaacatttgttagatggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtacgtagta--acatgacaattatcaaacaaaataacatgacatattaa 27302851  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||| | | ||||||||| || ||| ||||| |||||| || |||| ||||||   |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  27302850 cataaagtaattttttacgtttgggacgtgtatgactatggattcggggtgggtacctatatatttgttatccgtctcatatccgtgttttgaaatcggg 27302751  T
Q  201 gaaaa 205  Q
    |||||    
T  27302750 gaaaa 27302746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 28045528 - 28045719
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat--aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatc 98  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||  ||||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28045528 tttaacatttgttagacgtaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttatttaacataacaattataaaacaaaataacatgacatatc 28045627  T
Q  99 aacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttt 191  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  28045628 aacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggg-tgggtacctatatacccgttacccgtcccatattcgtgtttt 28045719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 305
Target Start/End: Original strand, 10127062 - 10127252
Alignment:
Q  108 taattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaac 207  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||       |||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  10127062 taattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgt-------cccatacccgtgttttgagatcggggaaaacc 10127154  T
Q  208 caaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    || || |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||| || |||||||   ||| | |||||||||||||||||    
T  10127155 catacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattggatttggttcgggcggataaccacgggtatggattttgttgtcatgccta 10127252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 252
Target Start/End: Original strand, 38972897 - 38973047
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |  |||||||||| |||||| ||||||||     
T  38972897 ataaattgattttatgcatttgagatgggtttgagtatgggttcggggtgggtacctatattcccgttacctatcccatacccatgttttgaaatcggga 38972996  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaa 252  Q
    |||| ||||||||||| | ||| ||| ||||||||| ||||| | ||||||    
T  38972997 aaaacccaaactcatacctaaacccagtcaaaacggggaaaacctgtcaaa 38973047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16311407 - 16311204
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||||  |||| | ||| ||||||| |||||||||||| || |||| ||||| || |||||||||| | ||| |||||||| |||||||      
T  16311407 ataaattgattttcaacattcgagacaggtttgaatatgggttcggggtgggtacctatatccctgttatccgtctcgtactcgtgttttgaaatcggaa 16311308  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatg 301  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||||||||||| || ||||| || ||||| || |  ||||  |||||||||| |||    
T  16311307 aaaactcaaactcatatccaaacccaatcaaagcgggaaaaaaccgtcaaattaggtttggttcaggcgggtacccgcggatatgagttttgttgttatg 16311208  T
Q  302 ccta 305  Q
    ||||    
T  16311207 ccta 16311204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 215
Target Start/End: Original strand, 15564578 - 15564724
Alignment:
Q  69 caattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgt 168  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||    
T  15564578 caattttcaaaaaaaataacatgacatatcaatgtaaagtaattttctacattcgggacgagtttgagtatgagttcgggatgaatacagatatacccgt 15564677  T
Q  169 tatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactca 215  Q
    || || |||||||| | | | || |||||||| |||| |||||||||    
T  15564678 tacccatcccatacgcatttcttgaaatcgggaaaaacccaaactca 15564724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 42717847 - 42717703
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatc-aaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| ||| |||    
T  42717847 tttaacatttgttagaccggttgatttagtttctcctttaaatatcaatgatagtttttataacacgacaattatcaaaacaaaatatcatggcatgtca 42717748  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttc 145  Q
    |||| || ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||    
T  42717747 acat-aagtaattttctgcattcaggacggatttgagcatgggttc 42717703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 3564943 - 3564797
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3564943 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acatatca 3564845  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgg 147  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||| |||||| ||  |||||||||||    
T  3564844 acataaagtaattttttacatttggaacgggtatggatatgggttcgg 3564797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 216
Target Start/End: Original strand, 6810133 - 6810247
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||| || |||||||||| | |||||||||    
T  6810133 ataaattgattttcaccattcgggatgggtttgggtatgggttcggggtgagtacttatatcctcgttacccgttccgtacccgtgttctaaaatcgggg 6810232  T
Q  202 aaaaaccaaactcat 216  Q
    |||| ||||||||||    
T  6810233 aaaacccaaactcat 6810247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 33862398 - 33862270
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||| ||  || || |||||||||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  33862398 tttaacatttgttagccc-attgatttagttggtcatttaaatatcaatcgtagtttttacaacatgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 33862300  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacggg 130  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  33862299 cataaaatagttttctgcattcgggacggg 33862270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 131 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28569106 - 28568984
Alignment:
Q  131 tttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatc 230  Q
    |||| ||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||    
T  28569106 tttgggtatgggttcggggtgggtacctatatccccgttacccgtcccgtacccgcattttgaaatcggggaaaatccaaactcatacccaaacccagtc 28569007  T
Q  231 aaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    ||| | | ||||| |||||||||    
T  28569006 aaatcagggaaaacccgtcaaat 28568984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 199
Target Start/End: Original strand, 17153144 - 17153241
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    |||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  17153144 ataaattgattttctacattcgggacgggtttgggtatgggtttgggatgagtacatatatcatagttatccgtcccgtacccatgttttaaaatcgg 17153241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12773909 - 12773822
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactca 215  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||| |||||  |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  12773909 gggtttgagtatgggttcgaggtgggtacatatatctccgttatccgtcccgtacccgtattttgaaatcggagaaaacccaaactca 12773822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 40187770 - 40187621
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||| ||| ||| ||| ||| |||||  |||||| ||||| |  ||||||||||| |||| ||||    
T  40187770 ataaattaattttctatattcgggacgagtttgggtatgagtttggg-tgaatacctatatctccgttacccgtctcgcacccgtgttttgaaattgggg 40187672  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaa 252  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||| ||||| ||  ||||| ||||||||    
T  40187671 aaaacccaaactcatttccaaacccagtcaaagcgaggaaaacccgtcaaa 40187621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 33420494 - 33420402
Alignment:
Q  52 tagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttc 145  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||    
T  33420494 tagtttttataacacgacaattatcaaataaaataacatgacatatcaatataaaat-attttctacattcaagacgggtttgggtatgggttc 33420402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27900515 - 27900379
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||| | |||| ||| ||| |||| ||||||||||| |||| |||| ||||| | | ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  27900515 ataaattgattttatacattcggggcggatttgggtatgggttcgagatgggtacctatatccacattacccgtcccatacccatgttttgaaatcggga 27900416  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgga 238  Q
    ||||  |||||  ||||||||| ||||| | ||||||    
T  27900415 aaaactcaaacctatatccaaacccaattataacgga 27900379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 243
Target Start/End: Original strand, 39422394 - 39422462
Alignment:
Q  175 tcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaa 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  39422394 tcccatacccgtgttttgaaatcgagaaaaacccaaactcatatccaaacccaatcaaagcggggaaaa 39422462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12712645 - 12712558
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactca 215  Q
    ||||||| ||||||||||| | || |||| |||||  |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  12712645 gggtttgggtatgggttcgaggtgggtacatatatctccgttatccgtcccgtacccgtattttgaaatcggagaaaacccaaactca 12712558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 254
Target Start/End: Original strand, 2681217 - 2681343
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatcca 227  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  |||| |||| ||| ||| || |||| |||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||  ||    
T  2681217 gggtttgggtatgggttcggggtggatactcatatccccattacccatcccgtacctgtattttgaaatcggggaaaacccaaactcatgcccaaactca 2681316  T
Q  228 atcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
     ||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  2681317 gtcaaatcggggaaaacccgtcaaatt 2681343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10822606 - 10822531
Alignment:
Q  136 gtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaa 211  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  10822606 gtatgggttcggggtgggtacatataaccccgttacccgtcctatacccgtgttttgaaatcggagaaaacccaaa 10822531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 7350521 - 7350475
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcggg 148  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  7350521 ataaattaattttctacatttgagacgggtttaagtatgggttcggg 7350475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 205
Target Start/End: Original strand, 8020591 - 8020693
Alignment:
Q  103 taaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggga 202  Q
    |||||| ||||||| ||||  | ||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| || |||| || | |  |||||||||||| ||||||||||    
T  8020591 taaattgattttctacattcagaacgggtttgcgtatgagttcgagatgagtacctatatccctgttacccattcagtacccgtgttttgaaatcgggga 8020690  T
Q  203 aaa 205  Q
    |||    
T  8020691 aaa 8020693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32575052 - 32574942
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| || |||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||||| |||| ||||| |  |||| || |||| || | ||||||| |||||||||    
T  32575052 ataaattgatattctacattcggggcgggtttgggtttgggttcgggatgggtacatatatccatgttacccatcccgtatctgtgttttgaaatcgggg 32574953  T
Q  202 aaaaaccaaac 212  Q
    |||| ||||||    
T  32574952 aaaacccaaac 32574942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 180 - 253
Target Start/End: Original strand, 43523801 - 43523874
Alignment:
Q  180 tacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||  || ||||| |||  ||||||||||||||    
T  43523801 tacccgtattttgaaatcggggaaaacccaaactcatacccaaactcagtcaaatcgggaaaaatccgtcaaat 43523874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23045071 - 23044984
Alignment:
Q  136 gtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaa 223  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||  |||||| || |||| ||||||| |||| ||||||||||||| | |||| |||| |||||    
T  23045071 gtatgggttcggggtgggtacatatatctccgttacccatcccgtacccgtattttgaaatcggggaaaacctaaacccatacccaaa 23044984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 204
Target Start/End: Original strand, 12457492 - 12457594
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||  ||||||    |||| | ||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  12457492 ataaattgattttctacattcgggacgggtttgggtatgagttcggagtgagtgtttatatctatgttacctgtcccatacccgtattttgaaatcgagg 12457591  T
Q  202 aaa 204  Q
    |||    
T  12457592 aaa 12457594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18116553 - 18116480
Alignment:
Q  180 tacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||  || ||||| |||  ||||||||||||||    
T  18116553 tacccgtattttgaaatcggagaaaacccaaactcatacccaaactcagtcaaatcgggaaaaatccgtcaaat 18116480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 274
Target Start/End: Original strand, 24207711 - 24207830
Alignment:
Q  154 tacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaa- 252  Q
    ||||||||| || ||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||  ||||| |||| |||||  |||||||| ||| |||||  |||||||     
T  24207711 tacttatatccctgttattcgttcgatacctgtgttttgaaatcggggaaaactcaaacccatacccaaactcaatcaaagcgg-gaaaaatcgtcaaac 24207809  T
Q  253 ttagattcggttcgggtgggta 274  Q
    |||| || ||||||||||||||    
T  24207810 ttag-tttggttcgggtgggta 24207830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 103 - 254
Target Start/End: Original strand, 29664947 - 29665095
Alignment:
Q  103 taaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggga 202  Q
    |||||| ||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||   || |||| ||||| ||||||| || ||   |||||||||||| |||||  |||    
T  29664947 taaattgattttgtacattcgggacgggtttgggtatgagttcgaagtgggtacctatatccccgttacccatcatgtacccgtgttttgaaatc--gga 29665044  T
Q  203 aaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
     || |||||||||||  ||||  |||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  29665045 gaacccaaactcatacacaaactcaatcaaagcgga-aaaacccgtcaaatt 29665095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 203
Target Start/End: Original strand, 30116816 - 30116856
Alignment:
Q  163 acccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30116816 acccgttaaccgtcccatactcgtgttttgaaatcggggaa 30116856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 38006468 - 38006396
Alignment:
Q  229 tcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatg 301  Q
    |||||| |||||||| |||||||||  |||| |||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  38006468 tcaaaatggagaaaacccgtcaaatcggatttggttagggcgggtaacaacaggtataggttttgttgccatg 38006396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 33267 - 33577
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||| |||||||||  |||||| |||||||||||| ||| ||| ||||    
T  33267 tttaacaattgttagaccgattgatttagttgttcctttaaatatcaatcgtagtttttataacacaacaattaccaaacaaaataacatggcatgtcaa 33366  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33367 cataaagtagttttctgcattcgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggg 33466  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatcca------atcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgt 294  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| |||      ||||||||||  |||| ||||||||||   ||  |||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  33467 gaaaacccaaacccatacccaaacccaaacccgatcaaaacgggtaaaacccgtcaaattgagtttagttcaggtgggtaaccacggatataggttttgt 33566  T
Q  295 tgtcatgccta 305  Q
    || ||||||||    
T  33567 tgccatgccta 33577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19105055 - 19104747
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||  || || ||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||    
T  19105055 tttaacatttgttagaccgatcgatttagttgctcttttaaatatcgatagtagtttttataacacggcaattattaaacaaaataacatgacacgtcaa 19104956  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccata----cccgtgtttttaaat 196  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||  ||| |||||||||||||  | |||||||    |||||||||  ||||    
T  19104955 cataaagtaattttctgcattcgggacgggtttgagtatggattcgaggtggatacctatatacccgttacacatcccatacaggcccgtgtttggaaat 19104856  T
Q  197 cggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttg 296  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||||| | || | ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19104855 cggggaaaacccaaactcatacccaaacccaatcaaaacggaaaaaacccatcaaattgggtttgattcggattggtaaccacatgtataggttttgttg 19104756  T
Q  297 tcatgccta 305  Q
     ||||||||    
T  19104755 ccatgccta 19104747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24414308 - 24414046
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagta 138  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||| |||    
T  24414308 aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggta 24414209  T
Q  139 tgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgga 238  Q
    |||||||||| || |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| | | || |||| ||||| |||||||||||||     
T  24414208 tgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaaccgatacccatacccaaacccaatcaaaacggg 24414109  T
Q  239 gaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatg 301  Q
    ||||| |||||||||| | || |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||| ||||    
T  24414108 gaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacaggtatgggttttgttgccatg 24414046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Original strand, 13830614 - 13830914
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattata-acacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  13830614 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttatttacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 13830713  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  13830714 aaagtaattttttacatttgggacaggtttgagtatgggttcggggtgggtacttatatacccgtta-ccgtcccatacccgtgttttgagatcgaggaa 13830812  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| || |||| ||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||| ||    
T  13830813 aacccatacccatacccaaacccagtcaaaatggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgtcatacc 13830912  T
Q  304 ta 305  Q
    ||    
T  13830913 ta 13830914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 34 - 309
Target Start/End: Original strand, 30846852 - 30847129
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctg-catttgggacgggt 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| |  || |||||||||||    
T  30846852 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttttacaattgggacgggt 30846951  T
Q  132 ttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatca 231  Q
    ||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| |||    
T  30846952 ttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtca 30847051  T
Q  232 aaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaattt 309  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  30847052 aaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcctaattt 30847129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 31942400 - 31942095
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  31942400 tttaacatttgttagaccgactgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcag 31942301  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgttttt-aaatcgg 199  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||| ||| || ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  31942300 cataaagtagttttctgcatttgtgacaggtttggttatgggtttggggtgggtacttatatacctgttacccgtctcatacccgtgtttttgaaatcga 31942201  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    ||| || |||||| |||||||||| ||| ||||| |||  |||| || |||||||   || |||| ||| ||||||||||   ||| |||||||||||||    
T  31942200 ggataacccaaacccatatccaaacccagtcaaagcgggaaaaacccatcaaattgagtttggtttgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgtca 31942101  T
Q  300 tgccta 305  Q
    | ||||    
T  31942100 taccta 31942095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 36128289 - 36128013
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctg-catttgggacgggt 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||||    
T  36128289 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggt 36128190  T
Q  132 ttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatca 231  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||  | ||||||||||   || || |||| ||||| ||| |||    
T  36128189 ttgggtatgggttcggggtgagtacctatatacccgttacccatcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaccacatacccatacccaaacccagtca 36128090  T
Q  232 aaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaatt 308  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || |||||||  | ||||||||   ||| |||||||||| |||||||||||    
T  36128089 aaacggggaaaatccgtcaaattaggtttggttcggacgagtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcctaatt 36128013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 7314863 - 7314609
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| |  | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  7314863 tttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgatatttatcaaacaaaataacatgacatatca 7314764  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  7314763 acataaaataattttttacatttgggacgggtgtgggtatgggttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtcccatactcgtattttaaaatcgg 7314664  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    |||||| ||| || |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  7314663 ggaaaacccatacccatatccaaacccagtcaaaacggggaaaatccgtcaaatt 7314609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 8916129 - 8915848
Alignment:
Q  24 atttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcattt 122  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  8916129 atttagttaatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataattttttacattt 8916030  T
Q  123 gggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||| | ||||| ||| || |||||||||    
T  8916029 gggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgttttgagatc-gagaaaacccatacccatatccaa 8915931  T
Q  223 atccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    |  || |||||||||  |||||||||||||||  ||| | || ||| || ||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||    
T  8915930 actcagtcaaaacgggaaaaatccgtcaaattgaatttgatttgggcggataaccacaggtatgggttttgttgccataccta 8915848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 45256697 - 45256999
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| |||||||||||||| || |||| |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  45256697 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtaatttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacaagacatatca 45256796  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    | ||||| ||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  45256797 aaataaagtaattttttacatttgggacgggtttaggtatgggttcggggtgggtacttatatacccattaaccgtctcatacccgtgttttgaaatcgg 45256896  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    ||||||  || ||||||||||| | ||| |||||||||  ||||||| | ||||  |||| ||||| |  |  |||||||| |||| | |||||||||||    
T  45256897 ggaaaactcatactcatatccacacccagtcaaaacgggaaaaatccattaaatctgatttggttcagacgactaaccacagatatggattttgttgtca 45256996  T
Q  300 tgc 302  Q
    |||    
T  45256997 tgc 45256999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6028104 - 6027811
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttatt-ataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  6028104 tttaacatttgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagttttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggcttatca 6028005  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| || |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||| |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  6028004 acataaaatacttttctgcattcaggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgtctcatacccatgttttaaaatcgg 6027905  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||||||            ||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||| || |||||||   ||| |||||||||||||    
T  6027904 ggaaaacccaaac------------ccaatcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcggataaccacgagtatgggttttgttgtca 6027817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 37106573 - 37106871
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  37106573 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-atatatca 37106671  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||      ||||||||||  || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  37106672 acataaagtaattttttacatttgggacgggt------atgggttcggagtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgg 37106765  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||| || |||| |||||  || ||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||| |||||||| |   |||  ||||||||||||    
T  37106766 ggaaaacccatacccatacccaaactcagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgcgagtatgagttttgttgtca 37106865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 45115432 - 45115701
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    |||||||||| |||||   | ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45115432 tttaacatttattagacaaaatgatttaattgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 45115531  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||  ||||||| | ||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||     
T  45115532 acataatgtaattttttacatttgggatgggtttaactatgggttcgggatgggtacctatatacctgttacccgtctcatacccgtgttttgaaatcga 45115631  T
Q  200 ggaaaaacc--aaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgg 267  Q
    ||||||  |  | || |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  45115632 ggaaaactcatatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattggatttggttcgg 45115701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 10208612 - 10208339
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| | |||||||||| ||||    
T  10208612 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatattaacataaagtaattttttacatttgggactggtt 10208513  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    |||||||||||||||| |  |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||| | || |||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||||    
T  10208512 tgagtatgggttcggggtaggtacctatatatccattacccgtcccatacccgtgttttaagattggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaa 10208413  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaat 307  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  || |||||||| || ||| |||   |||  ||||||||| ||||||||||    
T  10208412 aacggggaaaa-ccgtcaaattaactttggttcgggcggataatcacgggtatgagttttgttgccatgcctaat 10208339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 308
Target Start/End: Original strand, 37999396 - 37999659
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagta 138  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  37999396 aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggta 37999495  T
Q  139 tgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgga 238  Q
    || ||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||      |||| |||| ||| | ||| |||||| ||     
T  37999496 tgagttcggggtgggtacttatatacccgttacccgtctcatacccgtgttttgagatcgggga------aaacccatacccatacccagtcaaaatggg 37999589  T
Q  239 gaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaatt 308  Q
    | ||| ||||||||||  ||| |||||||| |  |||||||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  37999590 ggaaacccgtcaaattgaatttggttcgggcgactaaccacggatatgggttttgttgccatgcctaatt 37999659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 13705576 - 13705371
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13705576 tttaacatttgttatacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 13705477  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| |||||||   ||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||    
T  13705476 acataaagtaatttttcacatttgggacgggtttaggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacctgtctcatacccgtgttttgaaatcgg 13705377  T
Q  200 ggaaaa 205  Q
    ||||||    
T  13705376 ggaaaa 13705371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 305
Target Start/End: Original strand, 9632293 - 9632565
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  9632293 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattataaaaaaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtt 9632392  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    || ||||||||||||| ||  ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| || ||||  |||| ||| ||||    
T  9632393 tgggtatgggttcggggtggatacctatatacccattacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaacccatacccatactcaaacccattcaa 9632492  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    |||||  |||| ||||||||||   || |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||    
T  9632493 aacgggaaaaacccgtcaaattgagtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgccta 9632565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 42798200 - 42797911
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  42798200 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 42798101  T
Q  104 aaattaattttctg-catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggga 202  Q
    ||| ||||||| |  |||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||      |||||    
T  42798100 aaagtaatttttttacatttgggacaggtttgtgtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttacccgtctcatacccgtgtttt------gggga 42798007  T
Q  203 aaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgc 302  Q
    ||| ||| |||      |||| ||| ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||| |||||    
T  42798006 aaatccatact------caaacccagtcaaaacaga-aaaacccgtcaaattagatttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgc 42797914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 12194042 - 12193766
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || |||| || ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12194042 tttaacatttgttagacggaatgatgtagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 12193943  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||  ||||| |||| | || |||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  12193942 acataaagtaattttttacatttgggacgggtatggatatggattcgaggtgggtatctatatacccattacccgtcccatacccgtgttctgaaatcgg 12193843  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaa-cggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaac 276  Q
    | ||||  || ||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| |||||||||| | || || |||||||||||||    
T  12193842 gaaaaacacatactcatacccaaacccagtcaaaatcgga-aaaacccgtcaaattgggtttggctcgggtgggtaac 12193766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 14540660 - 14540860
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||  ||||| |||||||    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14540660 tttaacatttgttagactgattgatttagttgctcctttaaatatc----gtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 14540755  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||||| | || ||||||| ||||||||||| ||| |  || || | ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14540756 cataaagtaattttctacgttcgggacggatttgagtatggattccgagtgggtgcctatatacccgttacctgtctcatacccgtgttttgaaatcggg 14540855  T
Q  201 gaaaa 205  Q
    |||||    
T  14540856 gaaaa 14540860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 44746322 - 44746047
Alignment:
Q  3 taacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataac-acggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaac 101  Q
    ||||||||||||||  || | ||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |   |||| |||||| ||||||| ||| ||||||||     
T  44746322 taacatttgttagacggaataatttatttgctcctttaaatatcaatgatagtttttataaccattacaatgatcaaataaaataacatggcatatcaag 44746223  T
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |   || |||| ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  44746222 ataaagtgattttctacatttgggacgggtttgagtatgagtttgaagtgggtacatatatacccattacccgtcccatattcgtgttttgaaatcgggg 44746123  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacc 277  Q
    |||| |||||  |||| |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| | || ||| |||||||||||||    
T  44746122 aaaacccaaatccatacccaaactcaatcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggtacgggtgggtaacc 44746047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Original strand, 10920523 - 10920817
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  10920523 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 10920622  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||  ||| ||||       |||||||||||||| |||||||| | |||||  ||    
T  10920623 aaagtaattttttacatttgggacggatttgggtatgggttcggggtggatacctata-------tatccgtcccatactcgtgttttgagatcggaaaa 10920715  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| || |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |  ||||||| |||| |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||    
T  10920716 aatccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacctatcaaattggatttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcc 10920815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 37472838 - 37472698
Alignment:
Q  136 gtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaac 235  Q
    |||||||||||   || |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||||    
T  37472838 gtatgggttcgaagtgggtacctaaatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaatccatactcatacccaaacccagtcaaaac 37472739  T
Q  236 ggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaac 276  Q
    || ||||| ||||||||||   || |||||||| |||||||    
T  37472738 ggggaaaacccgtcaaattgagtttggttcgggcgggtaac 37472698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 179 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 18106155 - 18106029
Alignment:
Q  179 atacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattaga-ttcggttcgggtgggtaacc 277  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| | || || | |||||| ||||||||    
T  18106155 atacccgtgttttgagatcggggaaaacccatacccatatccaaacccagtcaaaacggggaaaatccgtcaaaattgagtttgattcgggcgggtaacc 18106056  T
Q  278 acatatataggttttgttgtcatgcct 304  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||    
T  18106055 acatatatgagttttgttgtcatgcct 18106029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16226941 - 16226761
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| ||  |  || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  16226941 tttaacatttcttagaccaattgatttagttgctaatttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaataaaataacatgacaaatcaa 16226842  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttt 191  Q
    ||| || | | ||||||||||  | ||||||||| |||||          |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16226841 catgaagt-agtttctgcattccgaacgggtttgggtatg---------agagtacctatatacccgttacccgtcccatacccttgtttt 16226761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 38342606 - 38342501
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatcca 227  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||| || |||| |||| |||||||||||||  ||||| |||||||||| |||    
T  38342606 gggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccccgttacccgtcccgtatccgtattttaaaatcggggaaaactcaaacccatatccaaaccca 38342507  T
Q  228 atcaaa 233  Q
    ||||||    
T  38342506 atcaaa 38342501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 259
Target Start/End: Original strand, 13531925 - 13532081
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||| | ||||| |  |||  || || |||||| || ||  ||    
T  13531925 ataaattgattttctacatgtggggcgggtttgagtgtgggttcggggtgaatacatatatcctcgttacctatccagtatccatgttttgaa-tcatgg 13532023  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagatt 259  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  13532024 aaaattcaaactcatacccaaatccaataaaagcagagaaaatccgtcaaattagatt 13532081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 18106301 - 18106162
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || |  |||||||||    
T  18106301 acatttgttagacaaaatgatttaattgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataatgtatcaacat 18106202  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggt 143  Q
    ||| ||||||| | ||||||| || |||| | ||||||||    
T  18106201 aaaataattttttacatttggaacaggttcgggtatgggt 18106162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 35248489 - 35248367
Alignment:
Q  111 ttttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaa 210  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||| || |||| | ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    
T  35248489 ttttctacattcaggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctttatcccctttacccgtcccatacccgtgttttgtaatcgtggaaaacccaa 35248390  T
Q  211 actcatatccaaatccaatcaaa 233  Q
    || | || |||||  ||||||||    
T  35248389 acccgtacccaaactcaatcaaa 35248367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 253
Target Start/End: Original strand, 15546726 - 15546871
Alignment:
Q  108 taattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaac 207  Q
    ||||||| | ||||||||| |||| || |||||||||| || || |||  ||||  |  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  15546726 taattttttacatttgggaagggtatgggtatgggttcagggtgggtatatataaccatgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaacc 15546825  T
Q  208 caaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    ||||| |||  ||| ||||| ||||| ||| |||||  ||||||||    
T  15546826 caaacccatgcccagatccagtcaaagcggggaaaactcgtcaaat 15546871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24051703 - 24051586
Alignment:
Q  136 gtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaac 235  Q
    ||||||||||||| |  |||| ||||| || |||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||  |||||| |||| ||||| ||||| ||| |    
T  24051703 gtatgggttcggggtaggtacatatatccctgttacccgtcccatactcgtattttaaaatcggagaaatcccaaacccatacccaaacccaattaaatc 24051604  T
Q  236 ggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  24051603 ggagaaaatccatcaaat 24051586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 37472944 - 37472857
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttatta-taacacggcaattatcaaacaaaataa 87  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  37472944 tttaacatttgttagacagaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataa 37472857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 267
Target Start/End: Original strand, 12341648 - 12341741
Alignment:
Q  174 gtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgg 267  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| || |||| |||||  || ||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||    
T  12341648 gtcccatacctgtgttttgaaatcggggaaaacccatacccatacccaaactcagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgg 12341741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 205
Target Start/End: Original strand, 14331529 - 14331606
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaa 205  Q
    ||||||| ||||||||||||  || |||| ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  14331529 gggtttgggtatgggttcggagtgggtacatatatccccgttacccgtcccatacctgtatttttaaataggggaaaa 14331606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Original strand, 22900788 - 22900885
Alignment:
Q  120 tttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcata 217  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||| || |||  ||||  |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||    
T  22900788 tttgggacgggtatgggtatgagttcggggtgggtatatataaccccgttactcgtcccatacccgtgttttgaaatcgggaaaaacccaaacccata 22900885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 205
Target Start/End: Original strand, 25210355 - 25210456
Alignment:
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||||| ||||||| |||| |||| ||||||  ||||||||| ||| || |||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  25210355 aaattgattttctacattcgggaggggttttggtatgggtttggggtgggtacatatatcctcgttacccgtcccatacccgtgttttaaagtcgggaaa 25210454  T
Q  204 aa 205  Q
    ||    
T  25210455 aa 25210456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 205
Target Start/End: Original strand, 35965311 - 35965413
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||  || |||| | ||| ||| |||  | | ||||||||||||||| |||||||||    
T  35965311 ataaattgattttctacattcgggacgggtttgggtatgggttcggagtgggtacatgtatccccattacacat-ccatacccgtgttttgaaatcgggg 35965409  T
Q  202 aaaa 205  Q
    ||||    
T  35965410 aaaa 35965413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 233
Target Start/End: Original strand, 30978913 - 30979032
Alignment:
Q  112 tttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaa 211  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||  ||| ||||| | ||||||||   || ||||||| |||| |||||||| |||| |||||    
T  30978913 tttctacatttgggtagggtttgggtatgggttcggggtggatacatatatcctcgttatcct--ccgtacccgtattttgaaatcgggaaaaacccaaa 30979010  T
Q  212 ctcatatccaaatccaatcaaa 233  Q
    ||||||| |||| ||| |||||    
T  30979011 ctcatattcaaacccagtcaaa 30979032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 205
Target Start/End: Original strand, 43371555 - 43371632
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaa 205  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| || |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  43371555 gggtttgggtatgagtttggggtgggtacatatatccccgttacccgtcccgtacccgtattttaaaatcggggaaaa 43371632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 217
Target Start/End: Original strand, 40359320 - 40359435
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||| | |||||| ||  |||||||||||  ||||| |||| |||| ||||| || ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||     
T  40359320 ataaattgattttttacatttgagagaggtttgagtattagttcgagatgggtacctatatccctgttatccatctcataccggtgttctaaaatcggga 40359419  T
Q  202 aaaaaccaaactcata 217  Q
    |||| | |||||||||    
T  40359420 aaaacctaaactcata 40359435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 40734632 - 40734545
Alignment:
Q  167 gttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  ||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  40734632 gttacccgtctcatacccgtgtttgaaaatcgctgaaaacccaaattcatacccaaaccaaatcaaagcggataaaacccgtcaaatt 40734545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Original strand, 44057884 - 44057990
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttc-gggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatcc 226  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||| ||||||| |||| || |||| ||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||    
T  44057884 gggtttgggtatgggttcgggggtgggtacatatatccccattacccgtcccgtaccggtattttgaaatcagggaaaatccaaactcgtacccaaaccc 44057983  T
Q  227 aatcaaa 233  Q
    | |||||    
T  44057984 agtcaaa 44057990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4961564 - 4961479
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtg 187  Q
    ||||||| |||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||||| | || |||| ||||| || ||||  |||||||||||||||    
T  4961564 ataaattcattttctatattcgggacgagtttgggtatgggttcgaggtgtgtacctatatccctgttacacgtcccatacccgtg 4961479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 112 - 212
Target Start/End: Original strand, 18485634 - 18485734
Alignment:
Q  112 tttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaa 211  Q
    ||||||||||||||   |||||| |||||||||| || || |||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||| |||| |||||| ||| || |||||    
T  18485634 tttctgcatttgggtaaggtttgggtatgggttcagggtgggtacatatatccccgttacccgtactgtacccgtattttaaaatcgaggataacccaaa 18485733  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  18485734 c 18485734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 153 - 253
Target Start/End: Original strand, 26755767 - 26755867
Alignment:
Q  153 gtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaa 252  Q
    |||| ||||| |||||||  ||||| |||||| | |||| ||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||| |||  |||| ||||||||    
T  26755767 gtacatatatccccgttaatcgtccgatacccatattttaaaatcgaagaaaacccaaactcatacccaaacccagtcaaatcgggaaaaacccgtcaaa 26755866  T
Q  253 t 253  Q
    |    
T  26755867 t 26755867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 2367199 - 2367505
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||     
T  2367199 tttaacatttgttagacaaaatgatttagtttatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcc 2367298  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  2367299 acataaagtaattttttccatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcgg 2367398  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||| || |||| ||||| | | |||||||||  |||| || ||||||| | || |||||||  ||||||||||  |||| |||||||||| ||    
T  2367399 ggaaaacccatacccatacccaaacctagtcaaaacgggaaaaacccatcaaattgggtttggttcggacgggtaaccacggatatgggttttgttgcca 2367498  T
Q  300 tgcctaa 306  Q
    |||||||    
T  2367499 tgcctaa 2367505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 40 - 301
Target Start/End: Original strand, 32853756 - 32854018
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagta 138  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  32853756 aaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggta 32853855  T
Q  139 tgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgga 238  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||||||||||    
T  32853856 tgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccatacccataaccaaacccagtcaaaacgga 32853955  T
Q  239 gaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatg 301  Q
    ||||| |||||||||| | || |||||||  || |||||||   ||| |||||||||| ||||    
T  32853956 gaaaacccgtcaaattgggtttggttcggtcggataaccacgggtatgggttttgttgccatg 32854018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 12678297 - 12678000
Alignment:
Q  12 ttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaat 111  Q
    ||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  12678297 ttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgataatttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaatataaaataat 12678198  T
Q  112 tttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaa 211  Q
    |||||  ||| |||||||||||| |||||||||| || || |||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||  ||||    
T  12678197 tttctcaattcgggacgggtttgggtatgggttcagggtgggtacctatataccctttacccgtcccatacctgtgtcttgaaatcggggaaaacgcaaa 12678098  T
Q  212 ctcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaattt 309  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| | ||| |  ||| || ||||| |||||||||||||   ||| || |||| || ||||||||||||    
T  12678097 ctcatacccaaacccagtcaaaacggcgaaaacctgtcgagataggtttggttcaggtgggtaaccacggttatgggatttgctgccatgcctaattt 12678000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 34 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5863565 - 5863302
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  5863565 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaatatttttttacatttgggacgggtt 5863466  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    || ||||||||||| | || |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||||    
T  5863465 tgggtatgggttcgaggtgggtatctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaa 5863366  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttg 296  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | || ||||||||  |||||||||   ||| ||||||||||    
T  5863365 aacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcaggtaaccacgggtatgggttttgttg 5863302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24603070 - 24602778
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  24603070 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgtcaattatcaaacaaaataacatggcacatcaa 24602971  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||||| |||| | || ||||||| ||||||||||||| || |||  |||||||| |||| ||||| ||||||| |||||| ||||| ||    
T  24602970 cataaagtaattttctacattcgtgatgggtttgggtatgggttcggggtgggtatctatatacctgttacccgtcacatacccatgttttgaaatctgg 24602871  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt-agattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    ||||| ||||||            ||| ||||||| | ||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||    
T  24602870 gaaaacccaaac------------ccagtcaaaacagggaaaaaccgtcaaattgagtttc-gttcgggtgggtaaccacgtgtatggattttgttgtca 24602784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7394101 - 7393890
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  7394101 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcctttaaatatcaatgttagtttttataacacggtaattatcaaacaaaataatatgatataccaa 7394002  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||| ||| ||||||  ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| ||||||||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  7394001 cataaaataaatttatgcattcaggatgagtttgagtatgggttcggggtggatacctatatacccattatccgtctcttactcgtgttttgaaatcggg 7393902  T
Q  201 gaaaaaccaaac 212  Q
    ||||| ||||||    
T  7393901 gaaaatccaaac 7393890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 14505960 - 14506171
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||  |||||  |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14505960 tttaacatttgttagactgattgatttagttgctcctttcaatatcaatgttagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacgtgacatatcaa 14506059  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| || ||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14506060 cacaaagtagttttctgcatttgggacgggtttaagtatgggttcggggtgggtacctaaatacttgttacccgtcccatacctgtgttttgaaatcggg 14506159  T
Q  201 gaaaaaccaaac 212  Q
    ||||| ||||||    
T  14506160 gaaaacccaaac 14506171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Original strand, 12141262 - 12141563
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| || | | ||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  12141262 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgttagtttttattaagatgacaattatcaaacaaaataacataacgtatcaacat 12141361  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||| | || ||||||    
T  12141362 aaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgtcacccgtcccatatccgtgttttgagattggggaa 12141461  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| || | || ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||| |||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||    
T  12141462 aacccatacccgtacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgaatttggttcgggcgggtaaccataggtatgggttttgttgccatgcc 12141561  T
Q  304 ta 305  Q
    ||    
T  12141562 ta 12141563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 3484105 - 3483833
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| || | | ||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  3484105 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaagatgacaattatgaaacaaaataacataacatatccacataaagtagttttttacatttgggacgggtt 3484006  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||||    
T  3484005 tgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccatcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaacccatacacatacccaaacccagtcaa 3483906  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | || |||||||| |||||||||    ||| |||||||||| ||||||||    
T  3483905 aacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccatgagtatgggttttgttgccatgccta 3483833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 30816131 - 30816398
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |  ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  30816131 tttaacatttgttagaccgattgatttaggtgctcctttaaatgtcaatggtagtttttataacacggcaattatccaacaaaataacatcacatatcaa 30816230  T
Q  101 cataaatta---attttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatc 197  Q
    |||||| ||    |||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||| || || | ||||||||| ||| || |||||||||||||  ||||||      
T  30816231 cataaagtagtttttttttgcattcgggacgggtttggatatgggttcggggtgggttcctatatacccattacccatcccatacccgtg--tttaaaat 30816328  T
Q  198 ggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgg 267  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| | || |||||||    
T  30816329 ggggaaaactcaaacccatatccaaacccaatcaaaacggggaaaatccatcaaattgggtttggttcgg 30816398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 89 - 305
Target Start/End: Original strand, 32532502 - 32532718
Alignment:
Q  89 atgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgt 188  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  32532502 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccattacccgtcccatacccgtgt 32532601  T
Q  189 ttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatatagg 288  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||||||  |||| ||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| | || ||| || ||||| || |||| |     
T  32532602 tttgaaatcggggaaaacccatactcatactcaaacccaatgaaaacggaaaaaacccgtcaaattggatttgatttgggcggataaccgcagatatgga 32532701  T
Q  289 ttttgttgtcatgccta 305  Q
    |||||||||||||||||    
T  32532702 ttttgttgtcatgccta 32532718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 306
Target Start/End: Original strand, 27534596 - 27534863
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagta 138  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||| |||    
T  27534596 aaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggta 27534695  T
Q  139 tgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgga 238  Q
    ||| |||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||  || || |||| ||||| |||||||||||||     
T  27534696 tggattcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaactcatacccatacccaaacccaatcaaaacggg 27534795  T
Q  239 gaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaa 306  Q
    ||||| ||||||||||   || |||||||  || |||||||   ||| |||||||||| |||||||||    
T  27534796 gaaaacccgtcaaattgagtttggttcggacggttaaccacgggtatgggttttgttgccatgcctaa 27534863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 10142729 - 10142428
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  10142729 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 10142630  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | |||||||||| |||||| ||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  10142629 aaaataattttttacatttgggacaggtttgggtatgagttcggggtgggtacctatatacccgttacctgtcccatacccgttttttgagatcggggaa 10142530  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| || |||| ||||| ||| ||||||||  ||||| ||| ||||||   || |||||| | || ||||||||  ||| |||||||||| ||||||    
T  10142529 aacccatacccatacccaaacccagtcaaaacgaggaaaacccgccaaattgagtttggttcgagcggataaccacaagtatgggttttgttgccatgcc 10142430  T
Q  304 ta 305  Q
    ||    
T  10142429 ta 10142428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Original strand, 24225604 - 24225883
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  24225604 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtt 24225703  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcat------atccaaatcc 226  Q
    || | ||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||| || |||      | ||||| ||    
T  24225704 tgggcatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatatccgtgttttgagatcggggaaaatccatacccatacccaaacccaaaccc 24225803  T
Q  227 aatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaa 306  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||  ||| |||||||  |||||||||    |||  |||||||||||||||||||    
T  24225804 aatcaaaacggggaaaacctgtcaaattgaatttggttcggacgggtaaccatgggtatgagttttgttgtcatgcctaa 24225883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 277
Target Start/End: Original strand, 27738678 - 27738922
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  27738678 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcatacaaaataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtt 27738777  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    || ||||||||||||| || |||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||| | ||| ||| ||||    
T  27738778 tgggtatgggttcggggtgggtacatatatatctgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaacccatacccatacctaaacccagtcaa 27738877  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacc 277  Q
    |||||  |||| || |||||||  ||| ||||||||  |||||||    
T  27738878 aacgggaaaaacccatcaaattgaatttggttcgggcaggtaacc 27738922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 10188284 - 10187991
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||| || | ||||||||||    
T  10188284 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcgaacaaaataacataatatatcaacat 10188185  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||       |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  10188184 aaaataattttttacatttgggatgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatac-------ccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaa 10188092  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| || |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||    
T  10188091 aacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcc 10187992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 14032430 - 14032577
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14032430 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacacaacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 14032529  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcggg 148  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14032530 cataaagtaattttatgcatttgggacgggtttgggtatgggttcggg 14032577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 278
Target Start/End: Original strand, 11762358 - 11762596
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtat 139  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  11762358 aaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatataacaaaataacatggcatatcaacataaagtaattttctacatttgggatgggtttgggtat 11762457  T
Q  140 gggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggag 239  Q
    | ||||||| ||   || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| |||| | |||  |||||||||| ||| | |||| || |    
T  11762458 gagttcggggtggacacctatatacccgttacccgtcccatacccttgtttagaaatcgggaaaaacctaaatccatatccaaacccagtaaaaatgggg 11762557  T
Q  240 aaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacca 278  Q
    |||| |||||||||| ||||  ||||||| | |||||||    
T  11762558 aaaacccgtcaaattggattgtgttcgggcgagtaacca 11762596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Original strand, 12309514 - 12309759
Alignment:
Q  69 caattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgt 168  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||| |||||||| ||    
T  12309514 caattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatcggttcggggtgggtacatatatacctgt 12309613  T
Q  169 tatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaa------tcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcgg 262  Q
    || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||||      |||||| || |||||  ||||||||| | |  ||    
T  12309614 tacccgttccatacccgtgttttgaaatcagggaatacccatacccatacccaaacccaaacccagtcaaaatggggaaaactcgtcaaattgggtctgg 12309713  T
Q  263 ttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaatt 308  Q
    |||||| |||||||| |   ||| || |||||||||||||||||||    
T  12309714 ttcgggcgggtaaccgcgggtatggggtttgttgtcatgcctaatt 12309759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 14254832 - 14255109
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||   ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  14254832 tttaacatttattagaccgaatgatttaatcgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacacatcaaatttcaaacaaaataacatgacatatcaa 14254931  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| | ||| | |||||||||||||  |||| ||||||||||  | || |||| |||||  ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| |     
T  14254932 cataaagttattatttgcatttgggacgaatttgggtatgggttcatggtgggtacctatatttccgttacacgtcccatacccgtg-tttgaaatcaga 14255030  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccac 279  Q
    |||||  ||||| |||| ||||| ||| ||||||||  ||||||| |||||| | | || | |||| ||||||||||||    
T  14255031 gaaaactcaaacccatacccaaacccagtcaaaacgaggaaaatctgtcaaaatgggtttgattcgagtgggtaaccac 14255109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 254
Target Start/End: Original strand, 32053031 - 32053209
Alignment:
Q  70 aattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgtt 169  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||    
T  32053031 aattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtatttttttacattttggacgggtttgggtatgggtttggggtgggtacatatatacccgtt 32053130  T
Q  170 atccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    | |||||||||| || |||||| ||||||||||      |||| |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32053131 acccgtcccatatccatgttttgaaatcgggga------aaacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaatt 32053209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 254
Target Start/End: Original strand, 15498315 - 15498451
Alignment:
Q  118 catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcata 217  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||    
T  15498315 catttgggacgggtttgggtgtgggttcgggatgggtacctatatacccattacctgtctcatacccgtgttttgaaatcggggaaaacccatatccata 15498414  T
Q  218 tccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
     ||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  15498415 cccaaacccattcaaaacggagaaaacccgttaaatt 15498451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 243
Target Start/End: Original strand, 29341239 - 29341372
Alignment:
Q  110 attttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaacca 209  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||||  |||||| ||||| ||| ||| |||||  |||||||| |||| |||    
T  29341239 attttctacattcgggacgggtttgggtatgagtttgggatgggtacctatatctccgttacccgtctcatgcccatgtttgaaaatcgggaaaaaccca 29341338  T
Q  210 aactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaa 243  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29341339 aactcatatccaaacccaatcaaaacggagaaaa 29341372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 157 - 306
Target Start/End: Original strand, 30986283 - 30986432
Alignment:
Q  157 ttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattag 256  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||| |||||  || ||||||||| ||||| ||||||||||      
T  30986283 ttatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccatacccatacccaaactcagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattga 30986382  T
Q  257 attcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaa 306  Q
     || |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||| |||||||||    
T  30986383 gtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcctaa 30986432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 217
Target Start/End: Original strand, 20349039 - 20349154
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||| ||||||| || |||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20349039 ataaattaattttttacatttgcaacggatttgggtatgagttcggggtgggtacctatatccccgttactcgtcccatacccgtgttttgaaatcgggg 20349138  T
Q  202 aaaaaccaaactcata 217  Q
    |||| |||||||||||    
T  20349139 aaaatccaaactcata 20349154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14410946 - 14410865
Alignment:
Q  124 ggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaa 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14410946 ggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatctgggaaaa 14410865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 14411047 - 14410961
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataa 87  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14411047 tttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaatgatggtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 14410961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 256604 - 256461
Alignment:
Q  103 taaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggga 202  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||| ||||| | ||||| |||||| ||||||||||    
T  256604 taaattgattttctacatttaggaggggtttgggtatgggtttggggtgggtacctatatgcccattacccgtctcgtacccatgttttgaaatcgggga 256505  T
Q  203 aaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatcc 246  Q
    |||  |||||||||| |||||  ||| |||| ||| ||||||||    
T  256504 aaactcaaactcatacccaaacacaaccaaagcggggaaaatcc 256461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 1947904 - 1947753
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||| ||| ||  ||| ||||| |||||  | | ||| |    
T  1947904 ataaattgattttctacatttggaacgagtttgagtatgggtttgagatgagtacatatat-cccattacccaccccgtacccctgtttcgatagcggtg 1947806  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    |||| ||||||||||  || || ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  1947805 aaaacccaaactcattcccgaacccagtcaaaacgaagaaaatccgtcaaatt 1947753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 254
Target Start/End: Original strand, 9442441 - 9442556
Alignment:
Q  138 atgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgg 237  Q
    ||||||||||  || |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| || |||| ||||| ||| |||||||||    
T  9442441 atgggttcggagtgggtacctctatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgggaaaatcccatacccatacccaaa-ccagtcaaaacgg 9442539  T
Q  238 agaaaatccgtcaaatt 254  Q
     ||||| ||||||||||    
T  9442540 ggaaaacccgtcaaatt 9442556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28079780 - 28079688
Alignment:
Q  131 tttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaa 223  Q
    |||| ||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  28079780 tttgggtatgggttcggggtgggtacctatatccccgttacccgtcccgtacccatgttttgaaatcggggaaaacccaaacccatacccaaa 28079688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 253
Target Start/End: Original strand, 9458667 - 9458789
Alignment:
Q  131 tttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatc 230  Q
    |||| ||||| ||||| | || |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |||| |||||||   |||||||||| ||||| ||| ||    
T  9458667 tttgggtatgagttcgaggtgggtacatatatccccgttatctgtcccgtacccgtattttgaaattggggaaatctcaaactcatacccaaacccagtc 9458766  T
Q  231 aaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    ||| ||| |||||||||||||||    
T  9458767 aaatcggggaaaatccgtcaaat 9458789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 305
Target Start/End: Original strand, 32959836 - 32960026
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||| |||| || |||||||||||| ||||  |||    
T  32959836 ataaattgattttctacatttatgacggatttg-gtatgggttcggggtggatacctatatccccgttacccgttccgtacccgtgttttgaaattaggg 32959934  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatg 301  Q
    |||| ||||||            ||||||||||||  |||||||||||||||||| || | |||||||||||| || ||| |||  ||| ||||||||||    
T  32959935 aaaacccaaac------------ccaatcaaaacgaggaaaatccgtcaaattaggtttgattcgggtgggtacccgcatgtatgagttatgttgtcatg 32960022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 14245121 - 14245214
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgaca 94  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| |   ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  14245121 tttaacatttattagaccgaatgatttagtcgctcctttaaatattaatggtagtttttataacacgacaattttcaaacaaaataacatgaca 14245214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 205
Target Start/End: Original strand, 13769047 - 13769150
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||| || || |||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  13769047 ataaattgattttctacattcaggacgggtttggatatgggttctgggtgggtacctatatgtccgttacccgtcccatacccatgttttgaagtcgggg 13769146  T
Q  202 aaaa 205  Q
    ||||    
T  13769147 aaaa 13769150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 305
Target Start/End: Original strand, 31496465 - 31496612
Alignment:
Q  158 tatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattaga 257  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| |||||  | |||||||||||  || || |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||       
T  31496465 tatatacccgtcccccgtcccatacccatgtttcgagatcggggaaaactcatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgag 31496564  T
Q  258 ttcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    || |||| ||  ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||    
T  31496565 tttggtttggacgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgccta 31496612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 305
Target Start/End: Original strand, 31501851 - 31501998
Alignment:
Q  158 tatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattaga 257  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| |||||  | |||||||||||  || || |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||       
T  31501851 tatatacccgtcccccgtcccatacccatgtttcgagatcggggaaaactcatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgag 31501950  T
Q  258 ttcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    || |||| ||  ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||    
T  31501951 tttggtttggacgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgccta 31501998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 217
Target Start/End: Original strand, 18908894 - 18908983
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcata 217  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| || |||| ||||| |  |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  18908894 gggtttgggtatgagtttggggtgggtacatatatccttgttacccgtcccatatccgtattttgaaatcggggaaaacccaaactcata 18908983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14410853 - 14410782
Alignment:
Q  229 tcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatg 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||  | || |||||||||||||||    
T  14410853 tcaaaacgg-gaaaatccgtcaaattagatttggtttggacgggtaaccacggacatgggttttgttgtcatg 14410782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Original strand, 9458873 - 9458964
Alignment:
Q  142 gttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaa 233  Q
    ||||||| || |||| ||||| ||||||| || |||| ||||||| || ||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| |||||    
T  9458873 gttcggggtgggtacatatattcccgttacccatcccgtacccgtattattaaatcggggaaaacccagacccatacccaaacccagtcaaa 9458964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29199970 - 29199888
Alignment:
Q  130 gtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaac 212  Q
    ||||| ||||||||||||| |   ||| ||||| || |||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  29199970 gtttgggtatgggttcggggtagatacatatatccctgttacccgtcccgtacccgtattttgaaatcggggaaaatccaaac 29199888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 19367049 - 19367105
Alignment:
Q  167 gttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaa 223  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||| || ||||||||||    
T  19367049 gttacccgtctcatacccgtgttttaaaattggggaaaatccatacccatatccaaa 19367105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 14649 - 14956
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14649 tttaacatttgttaaaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttacaacacaataattatcaaacaaaataatatatcatatcaa 14748  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    ||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||  | || |||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||| |||||||     
T  14749 cattaaataattttctacatttgggacgagtttgggtatgtgttcaaggtgggtacctatatacccattatccgtcccatgcatgtgttttgaaatcgga 14848  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| || |||  ||||||||||| ||| |||| |||  ||||| ||| |||||    ||||||| |||    
T  14849 gaaaacccaaactcatacccaaatccagtgaaaactgaaaaaccccgtcaaattaaatttggtttgggcaggtaaacacttatatgaaatttgttgccat 14948  T
Q  301 gcctaatt 308  Q
    ||||||||    
T  14949 gcctaatt 14956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 90471 - 90743
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||  ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  90471 tttaatatttgttagaccgattgatttatttgctcctttaaatatcaatggttgttttaataacacatcaattattaaacaaaataacatggcatatcaa 90570  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||  |||| |||||||||||||  | ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  90571 cataaaataattttctgcattcaggacgaatttgtgtatgggttcggggagggtaccaatatacccgttaaccgtctcatacccgtgttttgaaatcggg 90670  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccac 279  Q
    ||      |||| |||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||  ||||||| ||||||||||    
T  90671 ga------aaacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaatccgtcaaattgagtttagttcgggcgggtaaccac 90743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 197541 - 197337
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  197541 tttaatatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacaaggtaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 197442  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||  || |||| ||||| || ||||   ||| |||| ||||||||| |||| |||    
T  197441 cataaagtaattttctgcattcgggacgggtttgggtatagattcggtttgggtacctatatgcctgttacttgtctcatatccgtgttttgaaataggg 197342  T
Q  201 gaaaa 205  Q
     ||||    
T  197341 aaaaa 197337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0519 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0519
Description:

Target: scaffold0519; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 69 - 305
Target Start/End: Original strand, 10240 - 10468
Alignment:
Q  69 caattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgt 168  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||   || |||| |||||||| ||    
T  10240 caattatcaaacaaaataacat-acatatcaacacaaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcgtagtgggtacctatatacctgt 10338  T
Q  169 tatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcggg 268  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||     |||| ||||| | | |||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||     
T  10339 tatccgtcccatacccgtgtttggaaagcggg--aaaacc-----catacccaaacctagtcaaaacggaaaaaacccgtcaaattggatttggttcgga 10431  T
Q  269 tgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
      ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10432 caggtaaccgcatgtatgggttttgttgtcatgccta 10468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 36030 - 36216
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaatta--ttccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatc 98  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||     
T  36030 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacagttatcaaacaaaataacatgacatatt 36129  T
Q  99 aacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtt 189  Q
    |    |   |||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  36130 a----atggtaattttctgcattcgggacgggtttggttatgagtttgggatggatacctatatactcgttatccgtcctatacccgtgtt 36216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 6280 - 6412
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||| || ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  6280 tttaacatttgttagatcgattgatttagttgctcctttaaatttcaatggtaatttttatagcacgacaactatcaaacaaaataacatggcatatcaa 6379  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggttt 133  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  6380 cataaagtaactttctgcatttgagacgggttt 6412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 305
Target Start/End: Original strand, 7742 - 7874
Alignment:
Q  172 ccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgg 271  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| | || | |||| |||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||    
T  7742 ccgtctcatacccgtgttttgaaattggagaaaatctaa-cacatacccaaactcaatcaaaacggggaaaacccgtcaaattaaatttagttcgggtgg 7840  T
Q  272 gtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    ||||||||   ||| | |||||||| ||||||||    
T  7841 gtaaccacgggtatggattttgttggcatgccta 7874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:

Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 4130 - 4329
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4130 tttaacatttgttagatggaatgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 4229  T
Q  100 acataaatta-attttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcg 198  Q
    ||||||| ||  |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| |   || ||||  |||||| ||||| | ||| |||||||||||||| ||||||    
T  4230 acataaagtattttttttacatttgggacgagtttgggtatgggtttgaagtgggtacaaatatactcgttaccagtctcatacccgtgttttgaaatcg 4329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 33457 - 33691
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaa-ca---aaataatatgacata 96  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||   |||||| ||| ||||    
T  33457 tttaatatttgttacaccgactgatttaattgcttctttaaatatcaatggtagtttttataacacgaaaattatcaaatcaaataaataacatggcata 33556  T
Q  97 tcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtactt------atatacccgttatccgtcccatacccgtg-tt 189  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||| ||||      ||||||  |||| ||||| |||||||||| ||    
T  33557 tcatcataaagtagttttctgcatttgtgacgggtttggttatgggtttggggtgaggacttatatacatatacatgttacccgtctcatacccgtgttt 33656  T
Q  190 tttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaat 224  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||    
T  33657 tttaaatcggagaaaacccaaacctatatccaaat 33691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Original strand, 2970 - 3081
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatcca 227  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || |||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  2970 gggtttgagtatgggttcggggtgggtacatatatcccagttatccgtcctgtacccgtattttgaaatcggggaaaacccaaactcatacccaaaccca 3069  T
Q  228 atcaaaacggag 239  Q
     ||||| |||||    
T  3070 gtcaaatcggag 3081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 277
Target Start/End: Original strand, 14900 - 14998
Alignment:
Q  180 tacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatcc-aaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacc 277  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  14900 tacccgtgttttgaaatcggggaaaacccaaactcataccctaaacccaatcaaagcggagaaaacccgtcaatttaaatttggttcgggagggtaacc 14998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14226 - 14098
Alignment:
Q  172 ccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgg 271  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||| |||| ||||||||  |||| |||||||||| | || |||| ||||||    
T  14226 ccgttccatacccgtgtttt-aaatcggggaaaactcaaactcatacccaaacccaaacaaaacgggaaaaacccgtcaaattgggtttggtttgggtgg 14128  T
Q  272 gtaaccacatatataggttttgttgtcatg 301  Q
    ||||||||   |||  ||||||||||||||    
T  14127 gtaaccacgagtatgagttttgttgtcatg 14098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 14359 - 14295
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataaca 65  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14359 tttaacatttgttagaccgattgatttaattgttcctttaaatatcaatggtagtttttataaca 14295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 253
Target Start/End: Original strand, 67750 - 67875
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatcca 227  Q
    ||||||| |||| || ||||| || |||| ||||| ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||  |||| |||    
T  67750 gggtttgggtataggctcggggtgggtacatatatccccgttatccgtcccgtatccgtattttaaaatcggggaaaatccaaacccatactcaaaccca 67849  T
Q  228 atcaaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
     ||||| ||| ||||| | |||||||    
T  67850 gtcaaatcggggaaaacctgtcaaat 67875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 253
Target Start/End: Original strand, 75593 - 75718
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatcca 227  Q
    ||||||| |||| || ||||| || |||| ||||| ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||  |||| |||    
T  75593 gggtttgggtataggctcggggtgggtacatatatccccgttatccgtcccgtatccgtattttaaaatcggggaaaatccaaacccatactcaaaccca 75692  T
Q  228 atcaaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
     ||||| ||| ||||| | |||||||    
T  75693 gtcaaatcggggaaaacctgtcaaat 75718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 128224 - 128103
Alignment:
Q  112 tttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaa 211  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| || |||| ||||| ||| ||| ||||||| ||||||| || | |||| ||  |||| |||||    
T  128224 tttctacatttgggtagggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccccattacccgtcccgtacccgtattatgaaattggaaaaaacccaaa 128125  T
Q  212 ctcatatccaaatccaatcaaa 233  Q
    ||||||  |||| |||||||||    
T  128124 ctcatactcaaacccaatcaaa 128103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 105566 - 105498
Alignment:
Q  118 catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgt 186  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||| || |||| ||||| || |||| ||||||| |||||||    
T  105566 catttgggtagggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccctgttacccgtcccgtacccgt 105498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0795 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0795
Description:

Target: scaffold0795; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 308
Target Start/End: Original strand, 269 - 404
Alignment:
Q  172 ccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgg 271  Q
    |||||||||||||||||||| | || | ||||||   | || |||| |||||  || ||||||||||||||| ||||||| | || || ||||| || ||    
T  269 ccgtcccatacccgtgttttgagattgaggaaaactgatacccatacccaaactcagtcaaaacggagaaaacccgtcaattgagttt-ggttctggcgg 367  T
Q  272 gtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaatt 308  Q
    |||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  368 gtaatcacggatatgggttttgttgtcatgcctaatt 404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20852 - 20740
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||| | |||| || ||||||||||||||||||||| | ||  || |||||| ||| ||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||     
T  20852 ataaattgattttttacattcggaacgggtttgagtatgggttcgaggtggatatttatatccccattacccgtctcatactcgagttttgaaatcggga 20753  T
Q  202 aaaaaccaaactc 214  Q
    |||| ||||||||    
T  20752 aaaatccaaactc 20740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 223
Target Start/End: Original strand, 211367 - 211460
Alignment:
Q  130 gtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaa 223  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||| ||||| || |||| ||||| | ||||||| |||| ||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  211367 gtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccctgttacccgtctcgtacccgtattttgaaatcggagaaaacccaaacccatacccaaa 211460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 253
Target Start/End: Original strand, 70086 - 70222
Alignment:
Q  118 catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcata 217  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||| ||| || |||| ||||| | ||||| ||||||| ||||||| || | ||||| || |||| |||||||||||    
T  70086 catttgggtagggtttgggtatgggtttggggtgggtacatatatcctcgttacccgtcccgtacccgtattatgaaatcaggaaaaatccaaactcata 70185  T
Q  218 tccaaatccaatcaaaacgg-agaaaatccgtcaaat 253  Q
      |||| | ||| ||| ||| | ||||||||||||||    
T  70186 ctcaaaccaaattaaatcggaaaaaaatccgtcaaat 70222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University