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Alignment Overview

Query: NF1740_low_36 (Length: 506)

Name: NF1740_low_36
Description: NF1740
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1740_low_36
NF1740_low_36
[»] chr8 (48 HSPs)
chr8 (118-488)||(37960676-37961059)
chr8 (1-277)||(27932286-27932563)
chr8 (1-267)||(29108770-29109037)
chr8 (1-279)||(1012491-1012770)
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chr8 (1-305)||(20399465-20399770)
chr8 (1-306)||(24568813-24569116)
chr8 (34-305)||(32302966-32303239)
chr8 (1-279)||(43113562-43113840)
chr8 (1-259)||(24869980-24870238)
chr8 (1-254)||(34139321-34139573)
chr8 (34-305)||(24927855-24928127)
chr8 (1-254)||(45235938-45236192)
chr8 (1-305)||(17220590-17220892)
chr8 (1-306)||(1063380-1063692)
chr8 (1-305)||(36131839-36132130)
chr8 (8-198)||(14186205-14186391)
chr8 (89-305)||(40248281-40248497)
chr8 (1-254)||(39445537-39445782)
chr8 (5-296)||(4230649-4230930)
chr8 (69-305)||(11254925-11255153)
chr8 (161-301)||(5858566-5858706)
chr8 (34-205)||(34776972-34777144)
chr8 (5-306)||(2075743-2076045)
chr8 (108-212)||(9642354-9642458)
chr8 (103-222)||(8545342-8545461)
chr8 (40-144)||(28977185-28977290)
chr8 (1-234)||(34021352-34021583)
chr8 (1-97)||(35215378-35215474)
chr8 (103-268)||(30481368-30481533)
chr8 (153-307)||(35215562-35215715)
chr8 (130-255)||(27777158-27777283)
chr8 (124-254)||(14687396-14687526)
chr8 (128-301)||(17084027-17084194)
chr8 (153-254)||(6388477-6388578)
chr8 (108-253)||(27056517-27056662)
chr8 (102-254)||(14155507-14155659)
chr8 (138-274)||(29416128-29416263)
chr8 (102-235)||(9475992-9476126)
chr8 (136-253)||(10297467-10297584)
chr8 (136-253)||(15068550-15068666)
chr8 (136-184)||(2075867-2075915)
chr8 (102-233)||(29918582-29918713)
chr8 (102-204)||(30904021-30904123)
chr8 (102-200)||(39379595-39379692)
chr8 (104-205)||(5700333-5700434)
chr8 (7-104)||(29089589-29089685)
chr8 (1-61)||(40248502-40248562)
[»] chr4 (69 HSPs)
chr4 (1-306)||(26564711-26565016)
chr4 (1-301)||(6481950-6482251)
chr4 (5-307)||(11027955-11028259)
chr4 (1-308)||(7985034-7985337)
chr4 (1-305)||(31752335-31752640)
chr4 (5-305)||(47550264-47550565)
chr4 (1-217)||(1724309-1724525)
chr4 (34-279)||(21423773-21424019)
chr4 (1-305)||(19534335-19534633)
chr4 (34-305)||(55826534-55826807)
chr4 (34-301)||(7608882-7609150)
chr4 (34-307)||(31918467-31918742)
chr4 (34-305)||(5902531-5902797)
chr4 (34-308)||(11122777-11123052)
chr4 (34-305)||(6382183-6382456)
chr4 (34-305)||(44317446-44317719)
chr4 (2-280)||(39375160-39375437)
chr4 (1-306)||(37349003-37349297)
chr4 (1-305)||(39046832-39047136)
chr4 (34-305)||(43893140-43893411)
chr4 (1-215)||(12825462-12825676)
chr4 (1-233)||(47239368-47239601)
chr4 (1-264)||(37107291-37107553)
chr4 (1-305)||(48459360-48459665)
chr4 (1-305)||(42299670-42299972)
chr4 (119-305)||(15987173-15987359)
chr4 (1-205)||(32585367-32585573)
chr4 (1-189)||(9230164-9230350)
chr4 (1-148)||(13770523-13770670)
chr4 (1-205)||(32596195-32596399)
chr4 (1-212)||(39188395-39188605)
chr4 (1-116)||(425703-425818)
chr4 (1-137)||(42774640-42774777)
chr4 (1-87)||(29755459-29755545)
chr4 (103-274)||(19882998-19883169)
chr4 (126-223)||(4741209-4741306)
chr4 (108-253)||(10302071-10302216)
chr4 (1-164)||(28695194-28695357)
chr4 (180-277)||(12505479-12505577)
chr4 (70-144)||(13015323-13015397)
chr4 (153-254)||(39086189-39086290)
chr4 (102-274)||(21956756-21956928)
chr4 (164-252)||(43309526-43309614)
chr4 (153-254)||(30672993-30673094)
chr4 (102-211)||(36306766-36306875)
chr4 (158-306)||(7334107-7334254)
chr4 (102-302)||(8843719-8843918)
chr4 (102-302)||(8856683-8856882)
chr4 (128-212)||(29527819-29527903)
chr4 (153-243)||(35304489-35304579)
chr4 (136-253)||(3737791-3737908)
chr4 (102-215)||(16575093-16575206)
chr4 (153-253)||(41914959-41915059)
chr4 (2-84)||(15987372-15987455)
chr4 (130-233)||(25941147-25941250)
chr4 (89-175)||(53906346-53906432)
chr4 (130-223)||(14605918-14606011)
chr4 (128-217)||(47103745-47103834)
chr4 (1-106)||(4766422-4766529)
chr4 (128-212)||(21544586-21544670)
chr4 (118-205)||(33516082-33516170)
chr4 (130-253)||(1866512-1866635)
chr4 (153-304)||(33615241-33615392)
chr4 (177-275)||(1724211-1724308)
chr4 (102-212)||(25298837-25298947)
chr4 (174-223)||(4737895-4737944)
chr4 (129-242)||(37246853-37246965)
chr4 (128-212)||(30266334-30266418)
chr4 (128-212)||(30285770-30285854)
[»] chr7 (67 HSPs)
chr7 (1-305)||(27850242-27850540)
chr7 (1-279)||(5376964-5377242)
chr7 (5-307)||(16866051-16866354)
chr7 (1-254)||(12980255-12980509)
chr7 (34-307)||(21702570-21702844)
chr7 (1-305)||(17885343-17885648)
chr7 (5-304)||(7779890-7780190)
chr7 (1-212)||(3920417-3920628)
chr7 (1-212)||(18825875-18826086)
chr7 (5-305)||(17851736-17852035)
chr7 (1-306)||(37182153-37182458)
chr7 (5-305)||(30650513-30650814)
chr7 (34-305)||(35074380-35074653)
chr7 (1-305)||(41741360-41741664)
chr7 (1-200)||(46127198-46127394)
chr7 (1-306)||(38139701-38140008)
chr7 (40-302)||(18125141-18125404)
chr7 (34-307)||(45885673-45885947)
chr7 (1-305)||(2630484-2630788)
chr7 (1-277)||(39455953-39456228)
chr7 (1-296)||(16078892-16079187)
chr7 (1-254)||(39316873-39317127)
chr7 (40-308)||(24753092-24753349)
chr7 (5-212)||(26622834-26623041)
chr7 (70-277)||(38152835-38153041)
chr7 (1-277)||(45379984-45380261)
chr7 (1-305)||(24425260-24425551)
chr7 (1-253)||(25782876-25783121)
chr7 (69-306)||(3226855-3227092)
chr7 (1-279)||(37579141-37579418)
chr7 (89-304)||(10072433-10072648)
chr7 (1-311)||(41103531-41103839)
chr7 (40-215)||(16811647-16811822)
chr7 (1-277)||(44734297-44734572)
chr7 (34-305)||(25905539-25905811)
chr7 (1-205)||(25979927-25980132)
chr7 (12-212)||(26004477-26004675)
chr7 (1-254)||(5916037-5916280)
chr7 (1-277)||(44985856-44986113)
chr7 (79-254)||(43507402-43507577)
chr7 (34-168)||(44658496-44658631)
chr7 (43-191)||(44794052-44794200)
chr7 (1-148)||(23328488-23328636)
chr7 (5-305)||(45708781-45709073)
chr7 (1-303)||(37195921-37196213)
chr7 (102-274)||(3157063-3157234)
chr7 (111-253)||(27063127-27063269)
chr7 (108-253)||(8906551-8906696)
chr7 (118-205)||(33841074-33841161)
chr7 (102-266)||(11472664-11472825)
chr7 (118-217)||(10995832-10995931)
chr7 (128-254)||(37103088-37103214)
chr7 (108-253)||(5565269-5565414)
chr7 (128-212)||(31426014-31426098)
chr7 (153-233)||(42908023-42908103)
chr7 (124-305)||(37218005-37218188)
chr7 (136-253)||(27063348-27063465)
chr7 (128-217)||(32546198-32546287)
chr7 (118-212)||(23475266-23475360)
chr7 (123-233)||(27896457-27896567)
chr7 (84-214)||(3274684-3274810)
chr7 (128-233)||(22973394-22973499)
chr7 (173-253)||(30839095-30839176)
chr7 (1-61)||(26004675-26004735)
chr7 (128-253)||(44845095-44845222)
chr7 (128-223)||(18683980-18684075)
chr7 (118-205)||(19440020-19440107)
[»] chr3 (51 HSPs)
chr3 (1-296)||(34119532-34119825)
chr3 (1-305)||(42758248-42758552)
chr3 (1-306)||(4557214-4557519)
chr3 (1-305)||(19111609-19111912)
chr3 (1-304)||(54317018-54317321)
chr3 (1-305)||(4015954-4016258)
chr3 (4-307)||(48390725-48391028)
chr3 (5-307)||(49579941-49580244)
chr3 (34-306)||(39655182-39655455)
chr3 (5-305)||(39728548-39728849)
chr3 (34-279)||(44953371-44953617)
chr3 (1-302)||(34025827-34026129)
chr3 (1-255)||(53631778-53632032)
chr3 (40-307)||(29284248-29284516)
chr3 (34-305)||(7469688-7469960)
chr3 (5-306)||(44639152-44639453)
chr3 (1-265)||(20086882-20087135)
chr3 (5-234)||(44172503-44172733)
chr3 (5-234)||(44179203-44179433)
chr3 (1-308)||(22535748-22536056)
chr3 (1-305)||(43582451-43582755)
chr3 (34-305)||(44252653-44252925)
chr3 (40-307)||(52572521-52572789)
chr3 (2-304)||(830884-831179)
chr3 (34-254)||(44106755-44106974)
chr3 (5-276)||(52198031-52198304)
chr3 (1-309)||(6738311-6738609)
chr3 (4-265)||(29842184-29842445)
chr3 (34-212)||(49025587-49025765)
chr3 (1-280)||(41936954-41937216)
chr3 (1-146)||(30682695-30682840)
chr3 (5-306)||(17146063-17146361)
chr3 (1-254)||(34154291-34154541)
chr3 (5-205)||(10823706-10823904)
chr3 (1-184)||(31126826-31127009)
chr3 (1-254)||(23580701-23580954)
chr3 (34-254)||(23154026-23154245)
chr3 (96-308)||(48305548-48305760)
chr3 (118-308)||(23546855-23547039)
chr3 (74-297)||(23910170-23910385)
chr3 (110-274)||(3414478-3414638)
chr3 (123-254)||(10043243-10043374)
chr3 (120-237)||(30616259-30616376)
chr3 (102-254)||(42243362-42243514)
chr3 (157-256)||(38347596-38347695)
chr3 (176-305)||(10371183-10371318)
chr3 (103-223)||(30904808-30904927)
chr3 (167-302)||(27252605-27252738)
chr3 (102-243)||(4553165-4553306)
chr3 (34-106)||(23547081-23547154)
chr3 (1-101)||(48306650-48306751)
[»] chr1 (57 HSPs)
chr1 (1-302)||(19572425-19572726)
chr1 (1-307)||(9982798-9983104)
chr1 (1-305)||(12494885-12495189)
chr1 (1-305)||(34673192-34673496)
chr1 (1-301)||(44615389-44615690)
chr1 (1-301)||(44792879-44793180)
chr1 (1-305)||(17134821-17135126)
chr1 (40-304)||(34610986-34611251)
chr1 (1-275)||(18354020-18354295)
chr1 (1-254)||(29871246-29871499)
chr1 (40-305)||(36187130-36187396)
chr1 (5-278)||(24236698-24236972)
chr1 (1-308)||(42707744-42708045)
chr1 (5-305)||(51421736-51422037)
chr1 (5-305)||(29936294-29936601)
chr1 (1-305)||(16433089-16433375)
chr1 (40-308)||(49250680-49250949)
chr1 (69-309)||(23490677-23490917)
chr1 (34-305)||(28297840-28298125)
chr1 (1-223)||(17091951-17092174)
chr1 (5-305)||(24710736-24711026)
chr1 (1-254)||(40087425-40087678)
chr1 (1-305)||(45866096-45866400)
chr1 (1-305)||(5180919-5181218)
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[»] chr5 (61 HSPs)
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[»] chr6 (42 HSPs)
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[»] scaffold0008 (2 HSPs)
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[»] scaffold0013 (2 HSPs)
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[»] scaffold0795 (1 HSPs)
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[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (118-253)||(70086-70222)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 48)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 118 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 37961059 - 37960676
Alignment:
Q  118 catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcata 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37961059 catttgggacgggtttgggtatgagttcggggtgtgtacctatatacctgttacctgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaacccaaactcata 37960960  T
Q  218 tccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaat----ttcatc 313  Q
     ||||| | | |||||||||  |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||| ||||||||||| |    | ||||    
T  37960959 cccaaacctagtcaaaacgggaaaaacccatcaaattaggttcggttcgggtgggtaactacggatatgagttttgatgtcatgcctacttccatccatc 37960860  T
Q  314 catagtttgttgaacaaatat---tgctatagtgctattgctaatgtctcatccaacatctc------caacgtatgatgtgttccacttcctcagccac 404  Q
    ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37960859 catagttggttgaacaaatatttctgctatagtgctattgctaatgtctcatccaacatctccaacggcaacgtatgatgcgttccacttcctcagccac 37960760  T
Q  405 ttgtcacagcttgagagaggtgatgaaatttccccatccctatggaatatgaagtaccatttataaagtttttaccaaggaaat 488  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37960759 tcgtcacagcttgagagaggtgatgaaatttccccatccctatggaatatgaagtaccatttataaagtttttaccaaggaaat 37960676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 27932286 - 27932563
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27932286 tttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 27932385  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  27932386 acataaaataattttttacatttgggacggatatgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttactcgtcccatacccgtgttttgaaatcgg 27932485  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacc 277  Q
    |||||| ||| || |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||    
T  27932486 ggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaacc 27932563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 29109037 - 29108770
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29109037 tttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccttcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataatatgacatatca 29108938  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  29108937 acataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtgggtacatatatacccgttacccgtcccatacccatgttttaaaatcgg 29108838  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgg 267  Q
    | |||| ||| || |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||    
T  29108837 gaaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgg 29108770  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 1012491 - 1012770
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
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T  1012491 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtactttttataacacagcaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 1012590  T
Q  101 cataaatta--attttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcg 198  Q
    |||||| ||   |||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||| ||| ||||||||||| | || ||||||||||    
T  1012591 cataaagtagttttttttgcattcgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccattacccgtcccatactcatg-ttttaaatcg 1012689  T
Q  199 gggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccac 279  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||| |||||||||| | || | |||||||||||||||||    
T  1012690 gggaaaacccaaactcatacccaaactcaatcaaaacgaggaaaacccgtcaaattgggtttgattcgggtgggtaaccac 1012770  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 17469129 - 17469427
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||| |||| ||||| | ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17469129 tttaaaattttttagacccattgatttagtttctcctttaaatatcaatggtagcttttataacaaggcaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 17469228  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17469229 cataaagtagttttctgcagttgggacgggtttgggtatgggtttggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggg 17469328  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
    ||||| ||||||            ||| ||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||   ||| |||||||||| |||    
T  17469329 gaaaacccaaac------------ccagtcaaaacggggaaaatccgtcaaattgggtttggttcgggtgggtaactacgggtatgggttttgttgccat 17469416  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 20399465 - 20399770
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatc-aaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||  ||| ||||||| |||  ||||||    
T  20399465 tttaacatttgttagaccgattgatttggttggtcctttaaatatcaatgctagtttttataacacgacaattatataaaaaaaataacatggtatatca 20399564  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||| || |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  20399565 acataaaataattttttgcattcgggacgggtttgggaatgggttcggggtgggtatctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgg 20399664  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
     ||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||| | || |||||| | ||||||||||   ||| |||||||||| ||    
T  20399665 agaaaacccaaacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaactcgtcaaattgggtttggttcgagcgggtaaccacgggtattggttttgttgcca 20399764  T
Q  300 tgccta 305  Q
    ||||||    
T  20399765 tgccta 20399770  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 24568813 - 24569116
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24568813 tttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttataacacatcaattatcaaacaaaataac-tgacatatcaa 24568911  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| || |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| || | ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  24568912 cataaagtagttttctccattcgggacggatttgagtatgggttcggggtggatacctatatacccgctacctgtcccatacccatgttgtgaaatcggg 24569011  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
     |||| ||| || |||| | ||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| | | ||| ||||| |||  |||||||||||||    
T  24569012 aaaaatccatacccatacctaaacccaatc-aaacggggaaaacccgtcaaattaggtttggttcggatagataatcacatgtatgtgttttgttgtcat 24569110  T
Q  301 gcctaa 306  Q
    ||||||    
T  24569111 gcctaa 24569116  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 305
Target Start/End: Original strand, 32302966 - 32303239
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctg-catttgggacgggt 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||||    
T  32302966 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaatagtttttttacatttgggacgggt 32303065  T
Q  132 ttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatca 231  Q
    ||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| |||    
T  32303066 ttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtca 32303165  T
Q  232 aaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | || | |||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||    
T  32303166 aaacggggaaaacccgtcaaattgggtttgtttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgccta 32303239  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 43113840 - 43113562
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  43113840 tttaacatttgttataccgattgatttagttgctccttcaaatatcaatgatagtttttataacacgacaattatctaacaaaataacataacatatcaa 43113741  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    ||| || || ||||||||||| | ||||| |||| ||||| ||||||| || |||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  43113740 catgaagtagttttctgcattcgagacggatttgggtatgagttcggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatgcccgtgttttgaaatcggg 43113641  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccac 279  Q
     |||| |||| ||||||  |||| ||| ||||| | | ||||| |||| ||||| | || |||||||||||||||||||    
T  43113640 aaaaacccaatctcatacgcaaacccagtcaaagcagggaaaacccgttaaattgggtttggttcgggtgggtaaccac 43113562  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24870238 - 24869980
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |  ||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  24870238 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagttttattaacatgacaattatcaaacaaattaacatgacatatcaa 24870139  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||| || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24870138 cataaagtaattttttacatttgggacgggtttaggtatgggctcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcacatacccgtgttttaaaatcggg 24870039  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagatt 259  Q
    |||||  || |  |||| |||||| || |||||||||  |||| |||||||||| ||||    
T  24870038 gaaaactcatagccatacccaaattcagtcaaaacgggaaaaacccgtcaaattggatt 24869980  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 34139321 - 34139573
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||   ||||||    
T  34139321 tttaacatttgttagaccgattgatttgtttactcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggtctatcaa 34139420  T
Q  101 cataaattaa-ttttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    |||||| ||| |||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||| || |||| |||||||| ||||   |||| ||| |||||||||||||||||    
T  34139421 cataaagtaatttttttgcattcgggacgggtttgggtat-ggttcggggtgggtacctatatacctgttacatgtcctatatccgtgtttttaaatcgg 34139519  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    || |||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||  ||||| ||||||||||    
T  34139520 gg-aaaaccaaacacatacccaaacccagtcaaaacgaggaaaacccgtcaaatt 34139573  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 305
Target Start/End: Original strand, 24927855 - 24928127
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| || | | ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  24927855 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaagatgacaattatcaaacaaaataacataacatatccacataaagtagttttttacatttgggacgggtt 24927954  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||  | ||| ||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||||    
T  24927955 tgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtctcatacccgtgtttcgagatcagggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaa 24928054  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | || |||||||| |||||||| |   ||| |||||||||| ||||||||    
T  24928055 aacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgcgggtatgggttttgttgccatgccta 24928127  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 45235938 - 45236192
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  45235938 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacataacatatca 45236037  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  |||||||||||| || |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  45236038 acataaattaattttttacatttgggacgggtatggatatgggttcggggtgggtacctatatacccattacccgtcccatacccgtgttttgaaatcag 45236137  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    ||||||  || || ||||  ||||  || ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  45236138 ggaaaactcatacccatactcaaactcagtcaaaacggggaaaacccgtcaaatt 45236192  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 17220590 - 17220892
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17220590 tttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccttcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 17220689  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| |||| || | |||||||||||||| ||     ||||||||| || |||| |||||| || | |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  17220690 acataaagtaatcttttacatttgggacgggtatg-----gggttcggggtgggtacctatataaccatcatccatcccatacccgtgttttgaaatcgg 17220784  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaac--cacatatataggttttgttgt 297  Q
    |||||| ||| || |||| |||||  || |||||| || ||||| |||||||||| |||| |||||| | |||||||  | |   |||||||||||||||    
T  17220785 ggaaaatccatacccatacccaaactcagtcaaaatggggaaaacccgtcaaattggatttggttcgtgcgggtaaccgcgcgggtataggttttgttgt 17220884  T
Q  298 catgccta 305  Q
    ||||||||    
T  17220885 catgccta 17220892  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 1063380 - 1063692
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  || || |||||||||||||| || |||| |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1063380 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcgtttaaatatcaatggtaatttttatcaacatgacaattatcaaacaaaataacaagacatatca 1063479  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | || |||||| || |||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  1063480 acataaagtaattttttacacttgggatggatttgggtatgagttcggggtgggtacttatatacccgttaaccgtcccatacccgtgttttgaaatcgg 1063579  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcat------atccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttg 293  Q
    | |||| ||| || |||      | ||| | ||| ||||||||| ||||| |||||||||  | || |||||||| ||||||||||   |||  ||||||    
T  1063580 gaaaaacccatacccatacccacacccacacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaatcgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgagttttg 1063679  T
Q  294 ttgtcatgcctaa 306  Q
    ||| |||||||||    
T  1063680 ttgccatgcctaa 1063692  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 36132130 - 36131839
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||  | ||| |||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  36132130 tttaacatttgtttgaccgattaatttaattgcttctttaaattttaatggtaatttttataacacggcaattatcaaacaaaataacatgacatat-aa 36132032  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| ||  ||| | ||| ||| ||| || |||||||| |||||||| |||| |||    
T  36132031 cataaaataactttctgcattcgggacggatttgtgtatgagttcggggtggatacctgtatgccctttacccatcccatactcgtgttttgaaataggg 36131932  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
    |||||  |||||            |||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||    
T  36131931 gaaaactcaaac------------ccaatcaaaacggaaaaaatccatcaaattaggtttggttcgggtgggtaaccacggatatgaattttgttgtcat 36131844  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 198
Target Start/End: Original strand, 14186205 - 14186391
Alignment:
Q  8 tttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaat 107  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    ||||||| |  |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  14186205 tttgttagaccaattgatttagttactcctttaaatatcaatggtagtt----taacacgactgttatcaaacaaaataacatggcatattaacataaat 14186300  T
Q  108 taattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcg 198  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  14186301 taattttctacattcaggacgggtttgggtatgggttcagggtgagtacctatatatccgttacccatcccatacccgtgttttgaaatcg 14186391  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 40248497 - 40248281
Alignment:
Q  89 atgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgt 188  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40248497 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggatatgggtatgggttcgggatgggtacctatatacccgttatccgtctcatacccgtgt 40248398  T
Q  189 ttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatatagg 288  Q
    ||| |||||||||||||   | || |||| ||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| | || ||||| || | |||||| |   ||| ||    
T  40248397 tttgaaatcggggaaaacatatacccatacccaaacccagtcaaaacgggaaaaacccgtcaaattgggtttggttcaggcgagtaaccgcgggtatggg 40248298  T
Q  289 ttttgttgtcatgccta 305  Q
    |||||||||||| ||||    
T  40248297 ttttgttgtcataccta 40248281  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 39445782 - 39445537
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||  || || ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  39445782 tttaacatttgttagacggaatgatttaattgatcatt-aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatct 39445684  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||        ||| | |||||||||||||| || ||||| ||||||| || |||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  39445683 acat--------tttttacatttgggacgggtatgggtatgagttcggggtgggtacctataaacccgttacctgtcccatacccgtgttttgaaatcgg 39445592  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    | |||| ||| || |||| ||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  39445591 gaaaaacccatacccatacccaaacctagtcaaaacggggaaaatccgtcaaatt 39445537  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 4230930 - 4230649
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || |  |||||||||    
T  4230930 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataatgtatcaacat 4230831  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||           || |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  4230830 aaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggt-----------acctatatacccgttactcgtcccatacctgtgttttgagatcggggaa 4230742  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttg 296  Q
    || ||| || |||| ||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||| | || |||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||    
T  4230741 aacccatacccatacccaaacccagtcaaaatggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacatgtatggattttgttg 4230649  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 69 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 11255153 - 11254925
Alignment:
Q  69 caattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgt 168  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||   || |||| |||||||| ||    
T  11255153 caattatcaaacaaaataacat-acatatcaacacaaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcgtagtgggtacctatatacctgt 11255055  T
Q  169 tatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcggg 268  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||     |||| ||||| | | |||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||     
T  11255054 tatccgtcccatacccgtgtttggaaagcggg--aaaacc-----catacccaaacctagtcaaaacggaaaaaacccgtcaaattggatttggttcgga 11254962  T
Q  269 tgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
      ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  11254961 caggtaaccgcatgtatgggttttgttgtcatgccta 11254925  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 161 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5858706 - 5858566
Alignment:
Q  161 atacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattc 260  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||     
T  5858706 atacccgttacccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggaaaaacccaaacccatacccaaacccaatcaaaacggggaaaacccgtcaaattggattt 5858607  T
Q  261 ggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatg 301  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||| | |||||||| ||||    
T  5858606 ggttcgggtaggtaaccacaggtatggattttgttgccatg 5858566  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 205
Target Start/End: Original strand, 34776972 - 34777144
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| || ||    
T  34776972 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacattgcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataattttttacatttgggatggatt 34777071  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaa 205  Q
    || ||||||||||||| || |||| || ||||| ||||  ||| ||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  34777072 tgggtatgggttcggggtgggtacctaaatacctgttactcgttccatacccgtgttttgagatcgggaaaaa 34777144  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 2076045 - 2075743
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  2076045 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 2075946  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcggg--atgagtacttatatacccgttatccg-tcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||  ||||  | | |||  ||  |||||     |||  ||||||||| |||||| | ||||||    
T  2075945 aaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatggg-acgggtaacgggtatataggtaccc--accccgaacccatacccatgttttgagatcggg 2075849  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
     |||| ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||  ||||  ||||||||| |||    
T  2075848 aaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggagaaaatccgtcaaattgggtttggttcaggcgggtaaccacggatatgagttttgttgccat 2075749  T
Q  301 gcctaa 306  Q
    ||||||    
T  2075748 gcctaa 2075743  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9642458 - 9642354
Alignment:
Q  108 taattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaac 207  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  9642458 taattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcgggatggatatatataaccccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaacc 9642359  T
Q  208 caaac 212  Q
    |||||    
T  9642358 caaac 9642354  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8545461 - 8545342
Alignment:
Q  103 taaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggga 202  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||  ||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  8545461 taaattgattttctacatttgggacgagtttgagtatgggttcggggtgggtatctatatccccgttactcgttccatacccgtgttttgaaatcggaga 8545362  T
Q  203 aaaaccaaactcatatccaa 222  Q
    ||| ||||||| ||| ||||    
T  8545361 aaacccaaacttatacccaa 8545342  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 28977290 - 28977185
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagta 138  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||| ||     
T  28977290 aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtg 28977191  T
Q  139 tgggtt 144  Q
    ||||||    
T  28977190 tgggtt 28977185  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 34021352 - 34021583
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||  ||  ||||| |||||||||| |||||| |||||  | | ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  34021352 tttaacatttgttagattaattgatttcgttgctcctttaaatatcaatagtagtttttatataatgacaattatcaaacaaaataacat-acatatcaa 34021450  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| | ||||||||||||  ||||| || || |||| |||| ||| || |||| ||||| || ||||  ||| ||||| |||| |||| |||||| |    
T  34021451 cataaa-tgattttctgcattcaggacgagtctgtgtattggtttggggtgtgtacctatattcctgttactcgttccatatccgtattttaaaatcgtg 34021549  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaa 234  Q
    |||||   |||||||||  |||| ||||| ||||    
T  34021550 gaaaacttaaactcatactcaaacccaataaaaa 34021583  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 35215378 - 35215474
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatat 97  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  35215378 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctccattaaatatcaagggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggcatat 35215474  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 103 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 30481533 - 30481368
Alignment:
Q  103 taaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggga 202  Q
    |||||||||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||||| | | |||  |||| ||||| ||| |||| ||||| || |    
T  30481533 taaattaattttttacattcgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatcctcattactcgtctcatactcgtattttgaaatcaggaa 30481434  T
Q  203 aaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcggg 268  Q
    ||| |||||||||||  |||| ||||||||||| | |||||||| |||| |||| || ||||||||    
T  30481433 aaacccaaactcatactcaaacccaatcaaaacagggaaaatccatcaatttaggtttggttcggg 30481368  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 307
Target Start/End: Original strand, 35215562 - 35215715
Alignment:
Q  153 gtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaa 252  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| ||  |||||||||  |||| | ||||||    
T  35215562 gtacctatatactcgttacccgtctcatacccgtgttttgaaatc-gggaaaacccaaaatcatacccaaacccggtcaaaacgggaaaaaccggtcaaa 35215660  T
Q  253 ttagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaat 307  Q
    || | || || ||||  ||||||||||  |||| ||||||||||  |||||||||    
T  35215661 ttgggtttgggtcggacgggtaaccacggatatgggttttgttgctatgcctaat 35215715  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27777283 - 27777158
Alignment:
Q  130 gtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaat 229  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||| | |||  | |||| | ||||| |||| ||||||| |||||||| ||||  ||||| |||| ||||| ||| |    
T  27777283 gtttgggtatgggttcggggtgggtacctgtatctctgttacctgtcccgtacctgtgttttgaaatcgggaaaaactcaaacacatacccaaacccagt 27777184  T
Q  230 caaaacggagaaaatccgtcaaatta 255  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  27777183 caaaacggagaaaacccgtcaaatta 27777158  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 124 - 254
Target Start/End: Original strand, 14687396 - 14687526
Alignment:
Q  124 ggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaa 223  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||| ||||| || |||   ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||  |||| |||||    
T  14687396 ggacgagtttgggtatgggttcggggtggatacatatatccctgtttctcgtcccatacctgtgttttgaaatcggggaaaacccaaatccatacccaaa 14687495  T
Q  224 tccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
     |||||||||  || ||||| ||| ||||||    
T  14687496 cccaatcaaagtggggaaaacccgccaaatt 14687526  T

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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 17084194 - 17084027
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatcca 227  Q
    |||||||  |||| ||||||| || |||  ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| |||||      || ||| |||    
T  17084194 gggtttggatatgagttcggggtgggtatctatatccccgttacccgtctcgtacccgtgttttaaaatcggagaaaacccaaa------tcaaaaccca 17084101  T
Q  228 atcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatg 301  Q
     ||||| ||| ||||| ||||||| ||  ||| |||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||    
T  17084100 gtcaaagcggggaaaacccgtcaacttgaatttggttcgggtgggtacccacaagtatgggttttgttgtcatg 17084027  T

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Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 6388578 - 6388477
Alignment:
Q  153 gtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaa 252  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||   |||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||| |||||  || ||||||||||||||  ||||||||    
T  6388578 gtacctatatccccgttacccgtcttgtacccgtgttttaaaatcggggaagacccaaacccatacccaaactcagtcaaaacggagaaagcccgtcaaa 6388479  T
Q  253 tt 254  Q
    ||    
T  6388478 tt 6388477  T

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Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27056662 - 27056517
Alignment:
Q  108 taattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaac 207  Q
    ||||||| | ||||||||||| || || ||||||||||||| || |||  ||||  ||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||||| |||| |    
T  27056662 taattttttacatttgggacgagtatgtgtatgggttcggggtgggtagatataaccccgttacccgtcccatacctgtactttgaaatcgggaaaaacc 27056563  T
Q  208 caaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    ||||| |||| ||||| |||  |||| ||  ||||| |||||||||    
T  27056562 caaacccataaccaaacccagccaaagcgaggaaaacccgtcaaat 27056517  T

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Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 254
Target Start/End: Original strand, 14155507 - 14155659
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||  || ||| ||  ||  ||||| | ||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||     
T  14155507 ataaattgattttctacatttaggatgggtttgggtatgaatttggggtggataaatatatcctcgttacccatcttatacccgtgttttgaaatcggga 14155606  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||| ||| | ||| ||||| ||||||||||    
T  14155607 aaaacccaaactcatacccaaacccagtcataccggggaaaacccgtcaaatt 14155659  T

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Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 29416263 - 29416128
Alignment:
Q  138 atgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgg 237  Q
    ||||||||||| || |||| ||||| | ||||| || |||  ||| |||||||| |||| | | ||||  |||||||||| |||||  || |||||||||    
T  29416263 atgggttcggggtgggtacatatatcctcgttacccatcctttactcgtgtttt-aaatagagaaaaagtcaaactcatacccaaactcagtcaaaacgg 29416165  T
Q  238 agaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggta 274  Q
     ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  29416164 ggaaaacccgtcaaattggatttggttcgggtgggta 29416128  T

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Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9476126 - 9475992
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatc-ggg 200  Q
    |||| |||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||| | || ||| |||||| |||||||   ||||| || |||| |||| ||||| |||    
T  9476126 ataatttaattttctacattcgggatgggtttgggtatgggttcgaggtgggtatttatatccccgttacttgtcccgtatccgttttttgaaatcgggg 9476027  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaac 235  Q
    ||||| ||| |  ||||||||||| ||||| ||||    
T  9476026 gaaaatccatatccatatccaaattcaatcgaaac 9475992  T

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Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 253
Target Start/End: Original strand, 10297467 - 10297584
Alignment:
Q  136 gtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaac 235  Q
    |||||||||| || |  |||| ||||| ||||||| | ||||| | ||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||| |    
T  10297467 gtatgggttcagggtaggtacatatatccccgttacctgtcccgtccccgtattttgaaatcggggaaaacccaaattcacatccaaacccaataaaatc 10297566  T
Q  236 ggagaaaatccgtcaaat 253  Q
     | ||||| |||||||||    
T  10297567 agggaaaacccgtcaaat 10297584  T

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Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15068666 - 15068550
Alignment:
Q  136 gtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaac 235  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||| | ||||| ||||||| |||| ||||||||||||| || ||| |||| ||| | ||| ||||| |    
T  15068666 gtatgggttcggggtggatacatatat-cccgttacctgtcccgtacccgtattttgaaatcggggaaaacccgaacccatacccagacccagtcaaatc 15068568  T
Q  236 ggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    || ||||| |||||||||    
T  15068567 ggggaaaacccgtcaaat 15068550  T

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Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 184
Target Start/End: Original strand, 2075867 - 2075915
Alignment:
Q  136 gtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccataccc 184  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2075867 gtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccataccc 2075915  T

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Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 233
Target Start/End: Original strand, 29918582 - 29918713
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||| |||||    |||| |||| |  |||  ||||||| ||||||||     
T  29918582 ataaattgattttttacatttgggacgggtttgtgtatggtttcggggtgggtacatatatctttgttacccgttctgtacatgtgttttgaaatcggga 29918681  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaa 233  Q
    ||||  |||||||||| ||||| ||| |||||    
T  29918682 aaaactcaaactcatacccaaaaccagtcaaa 29918713  T

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Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 204
Target Start/End: Original strand, 30904021 - 30904123
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||| | |||| ||||||||  ||| || ||||||||||  || ||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||    
T  30904021 ataaattgattttctacattcgggactgatttgggtatgggtatggggtgggtacttatatctccattacccgtctcgtacccgtgttttgaaatcgagg 30904120  T
Q  202 aaa 204  Q
    |||    
T  30904121 aaa 30904123  T

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Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 39379692 - 39379595
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    ||||||| |||| || |||| |||||| ||||||||||| ||||||| || |||||| ||| | | ||| ||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  39379692 ataaattgatttactacattcgggacgagtttgagtatgagttcggg-tgggtacttttatcctcattacccgtcccgtacccgtgttttgagatcggg 39379595  T

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Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 205
Target Start/End: Original strand, 5700333 - 5700434
Alignment:
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||||||||||| | |||| |||| || |||| ||||||||||| | || |||  ||||| ||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||| ||    
T  5700333 aaattaattttatacattcgggatggatttgggtatgggttcgaggtgggtatctatatccccgttaccagtctcatacctgtgttttgaaatcgggaaa 5700432  T
Q  204 aa 205  Q
    ||    
T  5700433 aa 5700434  T

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Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 104
Target Start/End: Original strand, 29089589 - 29089685
Alignment:
Q  7 atttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacata 104  Q
    |||||||||| | ||| ||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||   |||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  29089589 atttgttagacccattaatttagttgctcctttaaatatcaatgatagttttaataacacaataattatcaaacaaaataacat-acataccaacata 29089685  T

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Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 40248562 - 40248502
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat 61  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  40248562 tttaacatttgttagactgaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttat 40248502  T

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Target: chr4 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 69)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 26564711 - 26565016
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26564711 tttaacatttgtttgaccgattgatttagttgttccgttaaatatcaatgatagtttttataacacggcagttatcaaacaaactaacatgacatatcaa 26564810  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26564811 cataaagtagttttctgcatttgggacgggtttgggtatggtttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgcgttttgaaatcggg 26564910  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
    ||||   |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||   ||| |||||||||| |||    
T  26564911 gaaagctcaaactcatacccaaacccagtcaaaacgaagaaaatccgtcaaattggatttggttcgggtgggtaaccacgggtatgggttttgttgccat 26565010  T
Q  301 gcctaa 306  Q
    ||||||    
T  26565011 gcctaa 26565016  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 6482251 - 6481950
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  6482251 tttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaatgttagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 6482152  T
Q  101 cataaattaattttct-gcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
     |||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  6482151 tataaattagtttttttgcatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatataccctttactcgtcccatacccgtgtttttaaattgg 6482052  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   || | ||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||    
T  6482051 ggaaaacccaaacccatacccaaacccaatcaaaacagagaaaatccgtcaaattgagtttgattcgggtggataaccacgggtataggttttgttgcca 6481952  T
Q  300 tg 301  Q
    ||    
T  6481951 tg 6481950  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Original strand, 11027955 - 11028259
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| |||||| ||| |||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  11027955 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatataaatagtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaatat 11028054  T
Q  104 aaattaattttctg-catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggga 202  Q
    ||| ||||||| |  |||||||||| |||||| ||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  11028055 aaagtaatttttttacatttgggacaggtttgggtatgagttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcgggga 11028154  T
Q  203 aaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgc 302  Q
    ||| ||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||    
T  11028155 aaacccatacccatacccaaatccagtcaaaacggagaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggtgggtaaccacgtgtatgggttttgttgccatgc 11028254  T
Q  303 ctaat 307  Q
    |||||    
T  11028255 ctaat 11028259  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7985337 - 7985034
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttatt-ataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||  || || ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  7985337 tttaacatttgttagaccaattgatttagttgctcatttaaatatcaacggtagttttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacttatca 7985238  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  7985237 acataaaatacttttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcgggatgagtac----atacatgttatccgtcccatacccatgttttgaaatcgg 7985142  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
     ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||   ||||| |||||||||| | || ||||| || || |||||||| ||||  ||||||||| ||    
T  7985141 agaaaatccaaacttatacccaaacccaatcaaaaccaggaaaacccgtcaaattgggtttggttcaggcggataaccaca-atatgagttttgttgaca 7985043  T
Q  300 tgcctaatt 308  Q
    |||||||||    
T  7985042 tgcctaatt 7985034  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 31752335 - 31752640
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||||| ||  || || |||||||| || ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31752335 tttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcattgttagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 31752434  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||| || | || ||||||| |||||  |||| |||||||||||||| |||||||    
T  31752435 acataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtgggaacctatatactcgttactcgtctcatacccgtgttttgaaatcgg 31752534  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||| |||| | |||||| |||||||| |   ||| |||||||||||||    
T  31752535 ggaaaacccatacccatatccaaacccaatcaaaacggtaaaaacccgtcaaattggatttgattcgggcgggtaaccgcgggtatgggttttgttgtca 31752634  T
Q  300 tgccta 305  Q
    ||||||    
T  31752635 tgccta 31752640  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 47550565 - 47550264
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  47550565 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 47550466  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  47550465 aaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaa 47550366  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    ||  || ||  ||| ||||| ||| |||||| || ||||||||| ||||||   || |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||    
T  47550365 aactcatacctatacccaaacccagtcaaaatggggaaaatccgccaaattgagtttggttcgggcgggtaaccacatgtatgggttttgtttccatgcc 47550266  T
Q  304 ta 305  Q
    ||    
T  47550265 ta 47550264  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1724525 - 1724309
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  1724525 tttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttataacacatcaattatctaacaaaataacatgacatatcaa 1724426  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  1724425 cataaagtagttttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatataaccgttacccgtcccatacccatgttttgaaatcggg 1724326  T
Q  201 gaaaaaccaaactcata 217  Q
    ||||| |||||| ||||    
T  1724325 gaaaacccaaacccata 1724309  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 34 - 279
Target Start/End: Original strand, 21423773 - 21424019
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  21423773 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataatataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtt 21423872  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||  | || |||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||||    
T  21423873 tgtgtatgggtttggggtgggtacctatatacccgttacccgtctcatacccgtgtttcgagattggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaa 21423972  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccac 279  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  21423973 aacgggaaaaatccgtcaaattggatttggttcgggcgggtaaccac 21424019  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 19534335 - 19534633
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19534335 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttagatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 19534434  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||||| |||| | |||||||||| ||||| ||||| | || |||| |||||||| |||| |||||||||||||   |||| |||||||     
T  19534435 cataaaataattttctacattcgtgacgggtttgggtatgagttcgaggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccagattttaaaatcgga 19534534  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
    ||      ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||   ||||| |||  |||| |||||| ||| |||    
T  19534535 ga------aaactcatacccaaacccaatgaaaacggagaaaacccgtcaaattggatttggtttggacaggtaatcacggatattggtttttttgccat 19534628  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 55826807 - 55826534
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctg-catttgggacgggt 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||||    
T  55826807 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacgtgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggt 55826708  T
Q  132 ttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatca 231  Q
    |||  |||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||    
T  55826707 ttggatatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacctgtgtttcgagatcggggaaaacccatactcatatccaaacccagtca 55826608  T
Q  232 aaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||    
T  55826607 aaacagggaaaatccgtcaaattggatttggttcggacgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgccta 55826534  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 301
Target Start/End: Original strand, 7608882 - 7609150
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| |||||||||||  |||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | || |||| | |||||||||||||||    
T  7608882 tcctttaaatatcaatgacagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacatagagtagttttttacatttgggacgggtt 7608981  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| || |||| ||||||||| ||||    
T  7608982 tgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaacccatacccatacccaaatccagtcaa 7609081  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatg 301  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||||    
T  7609082 aacggggaaaacccgtcaaattgggtttagttcgggtgggtaaccacgagtatgggttttgttgccatg 7609150  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 34 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 31918742 - 31918467
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctg-catttgggacgggt 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||||    
T  31918742 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggt 31918643  T
Q  132 ttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatca 231  Q
    ||| ||||||||||||| || |||  ||||||||| |||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||    
T  31918642 ttgggtatgggttcggggtgggtaactatatacccattactcgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaacccatactcatacccaaacccagtca 31918543  T
Q  232 aaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaat 307  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | || ||||||||  |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||    
T  31918542 aaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcaggtaaccacggatatgggttttgttgccatgcctaat 31918467  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 5902797 - 5902531
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  5902797 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataagataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtt 5902698  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||      |||| |||| ||||| ||| ||||    
T  5902697 tgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcgggga------aaacccatacccaaacccagtcaa 5902604  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    ||||| ||||| ||||||||||   || |||||||| ||||||||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  5902603 aacggggaaaacccgtcaaattgagtttggttcgggcgggtaaccacgggtataggttttgttgccatgccta 5902531  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11123052 - 11122777
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||| |||| | ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  11123052 tcctttaaatatcaatggtactttttattaacatgacaattataaaacaaaataacaaaacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtt 11122953  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||| || |||| |||||  || ||||    
T  11122952 tgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggagaaaacccatacccatacccaaactcagtcaa 11122853  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaatt 308  Q
    |||||| |||||||||||||||   || |||||||| ||||||||||   |||  ||||||||| |||||||||||    
T  11122852 aacggaaaaaatccgtcaaattgagtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgagttttgttgccatgcctaatt 11122777  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 34 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6382456 - 6382183
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctg-catttgggacgggt 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||||    
T  6382456 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaatagtttttttacatttgggacgggt 6382357  T
Q  132 ttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatca 231  Q
    ||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||| || |||| ||||| ||| |||    
T  6382356 ttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggagaaaacccatacccatacccaaacccagtca 6382257  T
Q  232 aaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    || ||| ||||| |||||||||| | || | |||||| ||||||||||   ||| |||||| ||| ||||||||    
T  6382256 aagcggggaaaacccgtcaaattgggtttgattcgggcgggtaaccacgggtatgggttttattgccatgccta 6382183  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 34 - 305
Target Start/End: Original strand, 44317446 - 44317719
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctg-catttgggacgggt 131  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||||    
T  44317446 tcctttaaatatcaatcgtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggt 44317545  T
Q  132 ttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatca 231  Q
    ||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| |||    
T  44317546 ttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtca 44317645  T
Q  232 aaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    |||||| |||||||||||||||| | || | |||||| | ||||||||   ||| |||||||||| | ||||||    
T  44317646 aaacggggaaaatccgtcaaattgggtttgattcgggcgagtaaccacgggtatgggttttgttgccttgccta 44317719  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 280
Target Start/End: Original strand, 39375160 - 39375437
Alignment:
Q  2 ttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaac 101  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  39375160 ttaacatttgttcgattgatttatttagttgttcctttaaatattagtggtagtttttataacacggcaattatcaaacaaaataacatgac--atcaac 39375257  T
Q  102 ataaattaa-ttttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
     |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||  ||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  39375258 gtaaagtaatttttttgcaattgggacgggtttgagtatgtgattggggtggatatctatatacccgttacccgtcctatacccgtattttgaaatcggg 39375357  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccaca 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || ||||||  |  |||| ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||    
T  39375358 gaaaagccaaactcatatccaaactcagtcaaaataggaaaaacccgtcaaattgaatttggttcgggcgggtaaccaca 39375437  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 37349003 - 37349297
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  37349003 tttaagatttgttagaccgattaatttagttgctcctttaaatatcaacggtagtttttataacgcgagaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 37349102  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||  ||| ||||||||| |           |||||||||||| ||||||||    
T  37349103 cataaaataattttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcagggtggatacctatatacccat-----------tacccgtgttttgaaatcggg 37349191  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
    |||||  |||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||||| | || |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||| |||    
T  37349192 gaaaactcaaactcatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacctgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccat 37349291  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 39046832 - 39047136
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  39046832 tttaacatttgttagacggaatgatttagttaatcctttaaatatcaacggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acatatca 39046930  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||||| ||  || |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||  |||| ||    
T  39046931 acataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggtttggagtgggtacctatatacccgttacatgtcccatacccgtgtttggaaattgg 39047030  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||| || ||||  ||||| || ||||||||||||||| || ||||||| | || | |||||  ||||||||    ||||||||||||||| ||    
T  39047031 ggaaaacccatacccatactcaaattcagtcaaaacggagaaaacccatcaaattgggtttgattcggacgggtaaccgtggatataggttttgttgcca 39047130  T
Q  300 tgccta 305  Q
    ||||||    
T  39047131 tgccta 39047136  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 305
Target Start/End: Original strand, 43893140 - 43893411
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  43893140 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtt 43893239  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    || |||||  |||||| ||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||| || |||| ||||| ||| ||||    
T  43893240 tgggtatgaattcggggtggatacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcgggg-aaacccatacccatacccaaacccagtcaa 43893338  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | || || ||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||    
T  43893339 aacggggaaaacccgtcaaattgggtttggctcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgccta 43893411  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12825676 - 12825462
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||| |||| ||||| | ||||||||| ||  ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  12825676 tttaatatttattagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaattttagtttttataacacgataattatcaaacaaaataacatgatatatcaa 12825577  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||| |||||| |||| ||||| || || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12825576 cataaagtaattttctgcactcgggacaggtttgggtataggttcagggtgggtacgtatatatccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggg 12825477  T
Q  201 gaaaaaccaaactca 215  Q
    ||||| |||||||||    
T  12825476 gaaaacccaaactca 12825462  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 47239601 - 47239368
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||| || ||  | ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47239601 tttaacatttgataaatgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 47239502  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||| ||| || |||||||||| || || | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  47239501 acataaaataattttttacatttgggacaggtatgggtatgggttcagggtgggaacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttaaaatcgg 47239402  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaa 233  Q
      |||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  47239401 aaaaaatccatacccatatccaaatccaatcaaa 47239368  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 37107291 - 37107553
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||| ||  | ||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37107291 tttaatatttgtcagaccgattgatttagttgcttctttaaataccaatggtagtttttataacatggcaattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 37107390  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||    |||  ||||   |||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  37107391 cataaagtaattttctgcattcgggatatattttggtataaattcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaat-tgg 37107489  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggtt 264  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||| |||||| ||  |||| ||||||||||| ||| ||||    
T  37107490 gaaaacccaaactcatacacaaacccagtcaaaatgggaaaaacccgtcaaattaaatttggtt 37107553  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 48459360 - 48459665
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    |||||||||| |||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  48459360 tttaacattttttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatca 48459459  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||| |||| || ||||||||||||| || |||| |||||||| |||| |||| |||||||| |||||| |||||||    
T  48459460 acataaagtaattttttacatttgggatgggtatgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgttccatacccatgttttgaaatcgg 48459559  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||| |  ||||  ||||||||||||||| ||  |||| || ||||||| | || | |||||  |||||||| |  |||| | |||||||| ||    
T  48459560 ggaaaacccatatccatactcaaatccaatcaaaatgggaaaaacccatcaaatttggtttgattcggacgggtaaccgcggatatggattttgttgcca 48459659  T
Q  300 tgccta 305  Q
    ||||||    
T  48459660 tgccta 48459665  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 42299670 - 42299972
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  |  ||||||| ||  || || |||||||||  |||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  42299670 tttaacatttgttagagaggatgatttagttgctcatttaaatatcaacagtagtttttattaacaagacaattatcaaacaaaataacatggcatatca 42299769  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| || |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  42299770 acataaagtactttt-tatatttgggacgtgtttgagtatgggttcagggtgggtacctatatacccgttacccgtcc-atacc-gtgttttgaaatcgg 42299866  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||| || |||| | |||  || ||||| |||| |||| ||||||||||   || ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||    
T  42299867 ggaaaatccatacccatacctaaactcagtcaaaccggaaaaaacccgtcaaattgagtttggttcggatgggtaaccgcatatatgaattttgttgtca 42299966  T
Q  300 tgccta 305  Q
    ||||||    
T  42299967 tgccta 42299972  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 119 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15987359 - 15987173
Alignment:
Q  119 atttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatat 218  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||  || || ||||     
T  15987359 atttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtatctatatacccgttacccatcccatacccgtgttttaaaatctgggaaaactcatacccatac 15987260  T
Q  219 ccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||| |  || | |||||||||| ||||||||    
T  15987259 ccaaacccaatcaaaatggagaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggtgggtaaccgcgaatgtgggttttgttgccatgccta 15987173  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 32585367 - 32585573
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggt-agttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatc 98  Q
    ||||||| ||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||| | |||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||     
T  32585367 tttaacaattgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgattagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacaagacatata 32585466  T
Q  99 aacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcg 198  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||| || || |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  32585467 aacataaagtaagtttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcagggtgggtacctatatacccgttacctgtcccatacccgtgttttgaaatcg 32585566  T
Q  199 gggaaaa 205  Q
    | |||||    
T  32585567 gagaaaa 32585573  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 9230164 - 9230350
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaatta--ttccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatc 98  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||     
T  9230164 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacagttatcaaacaaaataacatgacatatt 9230263  T
Q  99 aacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtt 189  Q
    |    |   |||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9230264 a----atggtaattttctgcattcgggacgggtttggttatgagtttgggatggatacctatatactcgttatccgtcctatacccgtgtt 9230350  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 13770670 - 13770523
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  13770670 tttaacatttgtttgaccgattgatttagttgctccttcaaatattaatggtcgtttttataacacggtaattatcaaacaaaataacatggcttattaa 13770571  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcggg 148  Q
    |||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  13770570 cataaaatagttttatgcattcgggacgggtttgagtatgagttcggg 13770523  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 32596399 - 32596195
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||| ||||||||||   | ||||||| || |||||| |||||| |||| ||||| |||||||| | |||||||||||| |||| | |||  |||||||    
T  32596399 tttaaaatttgttagacttaatgatttagttgttccttcaaatattaatgctagtttttataacatgacaattatcaaaccaaatgacatggtatatcaa 32596300  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||||| |||| | |||  ||||| ||||| ||| | | || | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32596299 cataaaataattttctacattcgagacaagtttgggtatgagtttgaggtggggacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggg 32596200  T
Q  201 gaaaa 205  Q
    |||||    
T  32596199 gaaaa 32596195  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 39188395 - 39188605
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||||| |||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39188395 tttaacatttgttagaacgattgatttagttttttctttaaatataaatggtagttttt-taacacgacagttatcaaacaaaataacatgacatatcaa 39188493  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgtta-tccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||  |||||| |||||| |||| | |||||   ||||||| ||| || |||| |||||| ||||||  |||| |||||  |||||||| ||||| |    
T  39188494 cataaaacaattttatgcattcgggatgagtttggacatgggtttggggtg-gtacctatatatccgttaccccgttccatagacgtgttttaaaatcag 39188592  T
Q  200 ggaaaaaccaaac 212  Q
    |||||| ||||||    
T  39188593 ggaaaacccaaac 39188605  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 425703 - 425818
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  425703 tttaagatttgttagaccgattgatttagttgttcttttaaatatcaatggtagtttttataacatgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 425802  T
Q  101 cataaattaattttct 116  Q
    |||||| |||||||||    
T  425803 cataaagtaattttct 425818  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 42774640 - 42774777
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42774640 tttaacatttgttagaaggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 42774739  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagt 137  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| |||||||| |||||    
T  42774740 acataaagtaattttttacattttggacgggtatgagt 42774777  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 29755545 - 29755459
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataa 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29755545 tttaacatttgttagatcgattgatttagttacttctttaaatatcaatggtagtgtttataacacggtaattatcaaacaaaataa 29755459  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19883169 - 19882998
Alignment:
Q  103 taaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggga 202  Q
    |||||| ||||| | |||| |||||| ||||| |||| |||||||| ||  ||| ||||| ||||||| || |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  19883169 taaattgattttatacattcgggacgagtttgtgtatcggttcggggtggatacctatatccccgttacccttcccgtatccgtgttttaaaatcgggga 19883070  T
Q  203 aaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggta 274  Q
    ||| |||||||||||  |||| ||||||||| |||  |||| |||||||||| | || |||||||| |||||    
T  19883069 aaacccaaactcatactcaaacccaatcaaagcgggaaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggta 19882998  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4741306 - 4741209
Alignment:
Q  126 acgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaa 223  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  4741306 acgggtttttgtatgggttcggggtgggtacttatatccctgttatccgtcccatacccatgttttaaaatcgaggaaaactcaaactcatatccaaa 4741209  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 253
Target Start/End: Original strand, 10302071 - 10302216
Alignment:
Q  108 taattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaac 207  Q
    ||||||| | |||||||||||| | || ||||||||||||| || |||| ||||  ||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| |    
T  10302071 taattttttacatttgggacggatatgggtatgggttcggggtgggtacatataaccccgttacccgtctcatacccgtactttgaaatcggggaaaacc 10302170  T
Q  208 caaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
     |||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  10302171 taaacccatacccaaacccaatcaaaacggggaaaacccatcaaat 10302216  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 28695357 - 28695194
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||| ||  ||||| |||||| |||| ||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||| ||  ||||||||    
T  28695357 tttaacatttgttaaaccgaatgatttagttgctcctttaaatattaatgatagtttttataacgtgacaattatcaaataaaataacattgcatatcaa 28695258  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatac 164  Q
    ||||||  ||||| ||  ||||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  28695257 cataaagcaatttcctatatttgagacgagtttgggtatgagttcggggtgagtacctatatac 28695194  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12505577 - 12505479
Alignment:
Q  180 tacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatcc-aaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacc 277  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  12505577 tacccgtgttttgaaatcggggaaaacccaaactcataccctaaacccaatcaaagcggagaaaacccgtcaatttaaatttggttcgggagggtaacc 12505479  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 70 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13015397 - 13015323
Alignment:
Q  70 aattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggtt 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||    
T  13015397 aattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacattcgagacgggtttgagtatgggtt 13015323  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 254
Target Start/End: Original strand, 39086189 - 39086290
Alignment:
Q  153 gtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaa 252  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| ||  |||| |||| | ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39086189 gtacctatatccccgttacccgtaccgcacccatgttgtgaaatcggagaaaactcaaactcatatccaaacccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaa 39086288  T
Q  253 tt 254  Q
    ||    
T  39086289 tt 39086290  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21956928 - 21956756
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||||| |||| |  ||| ||||| ||||||||||||| || | || ||||| |||||||  | | || |||||||||||| |||||||      
T  21956928 ataaattgattttctacattcgtaacgagtttgggtatgggttcggggtgggcacctatatccccgttactcattccgtacccgtgttttaaaatcggaa 21956829  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggta 274  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||| |||| |||||||| |||||    
T  21956828 aaaacccaaactcatacccaaatccaattaaaatgggaaaaacctgtcaaatttgatttggttcgggcgggta 21956756  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 252
Target Start/End: Original strand, 43309526 - 43309614
Alignment:
Q  164 cccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaa 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  43309526 cccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgggaaaaacccaaactcatactcaaacccagtcaaagcggagaaaacccgtcaaa 43309614  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 254
Target Start/End: Original strand, 30672993 - 30673094
Alignment:
Q  153 gtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaa 252  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | | ||||| ||||||||    
T  30672993 gtacatatatccccattatccgtcccgtacccgtattttaaaatcggagaaaatccaaactcatacccaaacccaatcaaatcagggaaaacccgtcaaa 30673092  T
Q  253 tt 254  Q
    ||    
T  30673093 tt 30673094  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 211
Target Start/End: Original strand, 36306766 - 36306875
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| | | |||||| |  |||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  36306766 ataaattgattttctacattcgggacgggtttgagtgtagcttcgggttaggtacctatatccccgttaaccgtctcatacccgtgttttgaaatcggag 36306865  T
Q  202 aaaaaccaaa 211  Q
    |||| |||||    
T  36306866 aaaatccaaa 36306875  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7334254 - 7334107
Alignment:
Q  158 tatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattaga 257  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||| ||||| |||  |||| ||||||||||||     
T  7334254 tatatccccattatccgtcccgtacc-gtgttttgaaatcggggaaaatccaaatccatacccaaacccagtcaaagcgggaaaaacccgtcaaattagg 7334156  T
Q  258 ttcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaa 306  Q
    || ||||| || || || || ||  ||| |||||||||| |||||||||    
T  7334155 tttggttcaggcggatacccgcaagtatgggttttgttgccatgcctaa 7334107  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 8843918 - 8843719
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||| ||||||| || |||  ||||| |||| || |||||||  ||| ||||||| ||||||||     
T  8843918 ataaattaattttctacattcacgacgggtttgggtatgagttcggg-tgggtatctatatccccgctacccgtcccgcacctgtgttttaaaatcggga 8843820  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatg 301  Q
    ||||  ||||| |||||||||| ||| ||||| |   ||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||  || || ||| |||  ||||||||||||||    
T  8843819 aaaattcaaacacatatccaaacccagtcaaagcacggaaaacccgtcaaatttaatttggttcggatgaatacccgcatgtatgagttttgttgtcatg 8843720  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 8856882 - 8856683
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||| ||||||| || |||  ||||| |||| || |||||||  ||| ||||||| ||||||||     
T  8856882 ataaattaattttctacattcacgacgggtttgggtatgagttcggg-tgggtatctatatccccgctacccgtcccgcacctgtgttttaaaatcggga 8856784  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatg 301  Q
    ||||  ||||| |||||||||| ||| ||||| |   ||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||  || || ||| |||  ||||||||||||||    
T  8856783 aaaattcaaacacatatccaaacccagtcaaagcacggaaaacccgtcaaatttaatttggttcggatgaatacccgcatgtatgagttttgttgtcatg 8856684  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 212
Target Start/End: Original strand, 29527819 - 29527903
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaac 212  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||| | ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  29527819 gggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccccgttacccgtcacgtacccgtattttgaaatcggggaaaacccaaac 29527903  T

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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 153 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 35304579 - 35304489
Alignment:
Q  153 gtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaa 243  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||| |||   |||||| ||||  | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35304579 gtacctatatccccgttacccgtcccgtacttatgttttaaaattagagaaaacccaaacccatatccaaatccaatcaaaacggagaaaa 35304489  T

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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 253
Target Start/End: Original strand, 3737791 - 3737908
Alignment:
Q  136 gtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaac 235  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||  | ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||| || ||| || | | ||| | | ||||| |    
T  3737791 gtatgggttcgggatgggtacatataacctcgttacccgtcccatacccgtgttttgaaattgggaaaaaccctaacccacacctaaaccaagtcaaagc 3737890  T
Q  236 ggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  3737891 ggaaaaaatccgtcaaat 3737908  T

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Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 215
Target Start/End: Original strand, 16575093 - 16575206
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||||||||| | |||||  |||| ||||| |||| |||||||  || |||||||||| | |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||    
T  16575093 ataaattaattttttacatttaagacgagtttgggtataggttcggagtgggtacttatatcctcgttatccatcccgtacccgcgttttaaaatcgagg 16575192  T
Q  202 aaaaaccaaactca 215  Q
    || | |||||||||    
T  16575193 aatacccaaactca 16575206  T

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Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 41915059 - 41914959
Alignment:
Q  153 gtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaa 252  Q
    |||| ||||| ||||||| || |||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||| || || ||| ||||| ||| |||||||| |||||    
T  41915059 gtacatatatccccgttacccttcccgtacccatattttgaaatcggggaaaacccaaactcatacccgaacccagtcaaatcggggaaaatccatcaaa 41914960  T
Q  253 t 253  Q
    |    
T  41914959 t 41914959  T

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Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 15987455 - 15987372
Alignment:
Q  2 ttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttatta-taacacggcaattatcaaacaaaa 84  Q
    |||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  15987455 ttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaa 15987372  T

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Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 233
Target Start/End: Original strand, 25941147 - 25941250
Alignment:
Q  130 gtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaat 229  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||| ||| | ||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||  ||||| | |||    
T  25941147 gtttgggtatgggttcggggtgggtacctatcttcccgttacctgtcccgtacccgtgttttgaaatcgggaaaaacccaaacacatgcccaaaccaaat 25941246  T
Q  230 caaa 233  Q
    ||||    
T  25941247 caaa 25941250  T

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Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 53906432 - 53906346
Alignment:
Q  89 atgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgt 175  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||| ||||   |||||||||||| || |||| |||||||| |||| ||||    
T  53906432 atgacatatcaacatgaagtaattttttacatttgggacgagtttagatatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgt 53906346  T

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Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14606011 - 14605918
Alignment:
Q  130 gtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaa 223  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||| ||||| || |||| ||||| | ||||||| |||| ||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  14606011 gtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccctgttacccgtctcgtacccgtattttgaaatcggagaaaacccaaacccatacccaaa 14605918  T

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Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 217
Target Start/End: Original strand, 47103745 - 47103834
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcata 217  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||| ||||| | ||||| ||| ||| ||||||| |||| |||| |||||||| |||||| ||||    
T  47103745 gggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccgcgttacccgccccgtacccgtattttgaaattggggaaaacccaaacccata 47103834  T

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Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 4766529 - 4766422
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttatta--taacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatc 98  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| ||   ||||| | ||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  4766529 tttaacatttgttagaggtaatgatttagtttatcctttaaatatcaatgatagttttttattaacatgacaattatcaaataaaataacataacatatc 4766430  T
Q  99 aacataaa 106  Q
    ||||||||    
T  4766429 aacataaa 4766422  T

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Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 212
Target Start/End: Original strand, 21544586 - 21544670
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaac 212  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||| ||||| ||| ||| | ||||| ||||||| |||| |||||||| |||| ||||||    
T  21544586 gggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccccattacctgtcccgtacccgtattttgaaatcgggaaaaatccaaac 21544670  T

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Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 33516170 - 33516082
Alignment:
Q  118 catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgt-ttttaaatcggggaaaa 205  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||| || |||||||||| || |||| || || | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  33516170 catttgagacgggtttgggtataggttcggggtgggtacttatatccctgttacccatctcgtacccgtgttttttaaatcggagaaaa 33516082  T

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Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1866635 - 1866512
Alignment:
Q  130 gtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaat 229  Q
    ||||| ||||||||||||| ||  ||| ||||| | | ||| ||||| | ||||||| |||| |||||||| |||| ||| ||||||| ||| | | | |    
T  1866635 gtttgggtatgggttcggggtggatacatatatccgcattacccgtctcgtacccgtattttgaaatcgggaaaaacccatactcatacccagacctagt 1866536  T
Q  230 caaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    |||| ||| |||||||||||||||    
T  1866535 caaatcggggaaaatccgtcaaat 1866512  T

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Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 33615392 - 33615241
Alignment:
Q  153 gtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaa 252  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||||   |||| |||| ||||| |||||| || | |  |||||| ||||||    
T  33615392 gtacctatatccccgttacccgtcccatacctgttttattaaatcgaggaaaacttaaacccatacccaaacccaatctaagcaggtaaaatctgtcaaa 33615293  T
Q  253 ttagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcct 304  Q
    |  | || ||||||| |||||| || |  |||| ||||| ||||||||||||    
T  33615292 tcgggtttggttcggatgggtacccgcggatatgggtttagttgtcatgcct 33615241  T

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Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1724308 - 1724211
Alignment:
Q  177 ccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaa 275  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| ||| |||||  |||||||||   || |||||||||||||||    
T  1724308 ccatacccatgttttgaaatcgggaaaaacccaaacccatacccaaacccagtcaaa-cggggaaaacacgtcaaattgagtttggttcgggtgggtaa 1724211  T

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Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25298947 - 25298837
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||   |  ||||| ||| ||| || |||| |||||||||||| ||||| ||     
T  25298947 ataaattgattttcaacatttggtacgggtttgggtatgggttcggggtggacagctatatccccattacccatcccgtacccgtgttttgaaatccgga 25298848  T
Q  202 aaaaaccaaac 212  Q
    |||| ||||||    
T  25298847 aaaacccaaac 25298837  T

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Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4737944 - 4737895
Alignment:
Q  174 gtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaa 223  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  4737944 gtcccatacccatgttttaaaatcgaggaaaacccaaactcatattcaaa 4737895  T

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Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 242
Target Start/End: Original strand, 37246853 - 37246965
Alignment:
Q  129 ggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaa 228  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||    |||||  ||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||| ||||| | |     
T  37246853 ggtttgtgtatgagttcgagatgagtacatatatctttgttattagtctcgtacccgtgttttaaaatcgaggaaaatccaaacacatacccaaa-ctag 37246951  T
Q  229 tcaaaacggagaaa 242  Q
    ||||||||||||||    
T  37246952 tcaaaacggagaaa 37246965  T

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Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30266418 - 30266334
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaac 212  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||| || | |||||||  |||||||||||    
T  30266418 gggtttgggtatgggttcggggtggatacatatatccccgttacccgtcctgtacccgtattatgaaatcggaaaaaaaccaaac 30266334  T

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Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 212
Target Start/End: Original strand, 30285770 - 30285854
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaac 212  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||| || | |||||||  |||||||||||    
T  30285770 gggtttgggtatgggttcggggtggatacatatatccccgttacccgtcctgtacccgtattatgaaatcggaaaaaaaccaaac 30285854  T

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Target: chr7 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 67)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 27850540 - 27850242
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27850540 tttaacatttgttagatcgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgaaagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcat 27850441  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27850440 cgtaaagtaattttctacattcgggacgggtttgggtatgggttcgggatgggtacctatacacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggg 27850341  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
    ||      |||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||| |||    
T  27850340 ga------aaacccatacccaaacccaatcaaaacggggaaaaaccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacggatatgagttttgttgccat 27850247  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 5376964 - 5377242
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  5376964 tttaacatttgttaaaccgattgatttagttgctcctttaaatatcattggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaattacatgatatatcaa 5377063  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| || |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5377064 cataaagtaattttctgcattcgggacagatttgggtatgggttcggggtgggtacctatataccctttacccgtcccatacctgtgttttgaaatcggg 5377163  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccac 279  Q
    ||||| |||||||||||  |||  |||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| | | |||||||||    
T  5377164 gaaaacccaaactcatactcaaccccaatcaaaacgggaaaaatccgttaaattagatttggttcagataggtaaccac 5377242  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Original strand, 16866051 - 16866354
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||| || || ||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16866051 acatttgttagacaaaatgatttagttaatcatttaaatatcaatgatagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 16866150  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16866151 aaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttactcgtcccatacccgtgttttgagatcggggaa 16866250  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| || |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||    
T  16866251 aacccatacccataaccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacggatatgagttttgttgccatgcc 16866350  T
Q  304 taat 307  Q
    ||||    
T  16866351 taat 16866354  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 12980255 - 12980509
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  12980255 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacacgaaaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 12980354  T
Q  101 cataaattaattttct-gcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    |||||| || |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  12980355 cataaaatattttttttgcatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccattacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgg 12980454  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    |||||| | |||| |||| ||||| ||| |||||| || ||||| |||| |||||    
T  12980455 ggaaaaccaaaacccatacccaaacccagtcaaaatggggaaaacccgttaaatt 12980509  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 307
Target Start/End: Original strand, 21702570 - 21702844
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  21702570 tcctttaaatataaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtt 21702669  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
     | ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||    
T  21702670 ggggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaacccatactcatacccaaacccagtcaa 21702769  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaat 307  Q
    |||||  ||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||    
T  21702770 aacgggaaaaatccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacggatatgggttttgttgccatgcctaat 21702844  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 17885343 - 17885648
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattata-acacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17885343 tttaacatttgatagatggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattgacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 17885442  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||| |  | || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17885443 acataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggttggaacctatatacccgttacccgtcccatacccatgttttaaaatcgg 17885542  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||| || ||||| |||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | || ||||||||  |||||||||   ||| |||||||||| ||    
T  17885543 ggaaaacccatacccatattcaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcaggtaaccacgggtatgggttttgttgcca 17885642  T
Q  300 tgccta 305  Q
    ||||||    
T  17885643 tgccta 17885648  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 7779890 - 7780190
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  7779890 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 7779989  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||| ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  7779990 aaaataaatttttacatttgggacgggtttgggtataggttcggggtgggtacctatatacccattatccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaa 7780089  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| || |||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||   ||| |||||||||| ||||||    
T  7780090 aacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaatccgtcaaattgagtttggttcggatgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcc 7780189  T
Q  304 t 304  Q
    |    
T  7780190 t 7780190  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 3920417 - 3920628
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3920417 tttaacatttgttagaccgattcatttagttgttcctttaaatatcaatggtagtttttataacatggcaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 3920516  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| | |||| ||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  3920517 cataaaataattttctacattcgggacagttttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttatccgtcccataccagtgttttgaaatcggg 3920616  T
Q  201 gaaaaaccaaac 212  Q
    ||||| ||||||    
T  3920617 gaaaacccaaac 3920628  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18826086 - 18825875
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| || | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  18826086 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcttttatatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 18825987  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    | |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18825986 cgtaaaataattttctgtatttgggatgggtttgggtacgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggg 18825887  T
Q  201 gaaaaaccaaac 212  Q
    ||||| ||||||    
T  18825886 gaaaacccaaac 18825875  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Original strand, 17851736 - 17852035
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    |||||| ||||||  | ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  17851736 acatttattagataaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 17851835  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| || |||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||  || | |||||||||    
T  17851836 aaagtagttttttacatttgggatgggtttgggtatgggttcgggatgggtacctatatatccgttacccgtcccatacccgtg--ttaagatcggggaa 17851933  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||    
T  17851934 aacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggagaaaatccatcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacaagtatgggttttgttgccatgcc 17852033  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 37182153 - 37182458
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37182153 tttaacatttgttagacacaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 37182252  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||  ||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||    
T  37182253 acataagataattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcgg-atgagtacctatatacccgctacccgtcccatacccgtgttttgaattcgg 37182351  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
     ||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   || | |||||| |||||||| |  |||| |||||||||| ||    
T  37182352 agaaaacccatactcatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgagtttgattcgggcgggtaaccgcggatatgggttttgttgcca 37182451  T
Q  300 tgcctaa 306  Q
     ||||||    
T  37182452 cgcctaa 37182458  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Original strand, 30650513 - 30650814
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  30650513 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 30650612  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  30650613 aaagtaattttttacatttgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagattggggaa 30650712  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    ||  || || |||| | ||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||   |||  ||||||||| ||||||    
T  30650713 aactcatacccatacctaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgagttttgttgacatgcc 30650812  T
Q  304 ta 305  Q
    ||    
T  30650813 ta 30650814  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 34 - 305
Target Start/End: Original strand, 35074380 - 35074653
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctg-catttgggacgggt 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||||    
T  35074380 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggt 35074479  T
Q  132 ttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatca 231  Q
    ||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| |||    
T  35074480 ttgggtatgggttcgggttgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttaagatcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtca 35074579  T
Q  232 aaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    |||||| ||||| ||||| |||| | || |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||    
T  35074580 aaacggggaaaacccgtctaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgccta 35074653  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 41741664 - 41741360
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41741664 tttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccgttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 41741565  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
      ||||| ||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  41741564 gtataaagtaattttttacatttgggacgggtatgaatatgggttcggg-tgggtacctacatacccgttatccgtctcatacccgtgttttgaaatcgg 41741466  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||| | |||| || |||||  | ||||||| | || |||||||| |||||||| || |||| |||||||||| ||    
T  41741465 ggaaaacccatactcatacccaaatccagtaaaaatggggaaaactcatcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgcaaatatgggttttgttgcca 41741366  T
Q  300 tgccta 305  Q
    ||||||    
T  41741365 tgccta 41741360  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 46127394 - 46127198
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||       
T  46127394 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcctttaaatatcaatggtagttattataacacgacaatgatcaaacaaaataacatgacatat--- 46127298  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46127297 cataaaataattttctgcatttgggacgggtttgagtatgagatcggtgtgggtacctatacacctgttatccgtcccatacccgtgattttaaatcggg 46127198  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 38140008 - 38139701
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38140008 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 38139909  T
Q  100 acataaattaattttctg-catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcg 198  Q
    | ||||| ||||||| |  |||||| ||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| |||| |    
T  38139908 atataaaataatttttttacatttgagacgggtttggttatgggttcggggtgggtacttatatactcattacccgtcccatactcgtgttttgaaattg 38139809  T
Q  199 gggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtc 298  Q
    ||||||| ||| || |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| | || |||||||| |||||||| |  |||| |||||| ||| |    
T  38139808 gggaaaacccatacccatatccaaacccagtcaaaacggggaaaatccatcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgcggatatgggttttcttgcc 38139709  T
Q  299 atgcctaa 306  Q
    ||||||||    
T  38139708 atgcctaa 38139701  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18125404 - 18125141
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagta 138  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||| |||    
T  18125404 aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggta 18125305  T
Q  139 tgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgga 238  Q
    || ||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||| |||| ||| |||||||  |||| ||| |||||||||     
T  18125304 tgcgttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcgggaaaaacccatactcatacacaaacccagtcaaaacggg 18125205  T
Q  239 gaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgc 302  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||  ||||   ||||||||||||||    
T  18125204 gaaaacccgtcaaattggatttggttcgggcgagtaaccacggatatgaattttgttgtcatgc 18125141  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 34 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 45885947 - 45885673
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||    
T  45885947 tcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggatt 45885848  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    |  ||||||||||||| || |||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||  || || |||| ||||| ||| ||||    
T  45885847 ttggtatgggttcggggtgggtacctatatacttgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaactcatacccatacccaaacccagtcaa 45885748  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaat 307  Q
    ||||||||||| |||| ||||| | || |||||| | ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||||    
T  45885747 aacggagaaaacccgttaaattgggtttggttcgagcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcctaat 45885673  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 2630788 - 2630484
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||  || || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  2630788 tttaacatttgatagaccgattgatttagttgctcatttaaatatcaatggtagtttttataatacggcaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 2630689  T
Q  101 cataaatta-attttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    |||||| ||  |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||  ||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||    
T  2630688 cataaagtagtttttttgcattcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtatctatatacccgtcacccgtcccatacccatg-ttttaaatcgg 2630590  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| |||||| |||| ||||| ||| | |||| ||  ||||  ||||||||| | || |||| |||| |||| |||    ||| |||||||||||||    
T  2630589 ggaaaacccaaacccatacccaaacccagtaaaaatgggtaaaacacgtcaaattgggtttggtttgggtaggtatccatgggtatcggttttgttgtca 2630490  T
Q  300 tgccta 305  Q
    ||||||    
T  2630489 tgccta 2630484  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 39456228 - 39455953
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataac-acggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||  |||||  ||||||||||||| || |||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39456228 tttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccttccaatatcaatggtaatttttattaccatggcaattatcaaacaaaataacatgacatatca 39456129  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  39456128 acataaagtaatttt-tacatttgggacgggtatgagtatgg-ttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccatgttttgaaatcgg 39456031  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacc 277  Q
    |||||| ||| |  |||| ||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||| | || |||||||| ||||||||    
T  39456030 ggaaaacccatatccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaactcgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaacc 39455953  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Original strand, 16078892 - 16079187
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16078892 tttaacattttttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaagggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 16078991  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    | |||| |||||||||| |||   |||| ||||| |||| |||| ||| || | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||     
T  16078992 cgtaaagtaattttctgtattcatgacgagtttgggtataggtttggggtgggcacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcgga 16079091  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttg 296  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||  || ||||||| || ||||  ||||||||||| || | |||||| ||||||||||   ||| ||||||||||    
T  16079092 gaaaacccaaacttatacccaaactcagtcaaaaccgaaaaaactcgtcaaattaggtttgcttcgggcgggtaaccacgagtatgggttttgttg 16079187  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 39316873 - 39317127
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | |||||||||   ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39316873 tttaacatttgttagacgtaatgatttaatcgatccttcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 39316972  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||| ||||| | || ||||| |||| |||||  ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||     
T  39316973 acataaaataattttttacatttgagacggatatgggtatgagttcaggatggatacatatatacccgctacccgtcccatacccgtgttttgaaatcga 39317072  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    ||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39317073 ggaaaactcatactcatatccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaatt 39317127  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 308
Target Start/End: Original strand, 24753092 - 24753349
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagta 138  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  24753092 aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggta 24753191  T
Q  139 tgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgga 238  Q
    |||||           || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||| || |||||||||| ||| ||||||||||    
T  24753192 tgggt-----------acctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggg-aaaacccatacccatatccaaacccagtcaaaacgga 24753279  T
Q  239 gaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaatt 308  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||   ||| |||||||||| |||||||||||    
T  24753280 gaaaatccgtcaaattgaatttggttcggacgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcctaatt 24753349  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 26622834 - 26623041
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacata 104  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26622834 acatttgtttgaccaattgatttaattgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacacaacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacata 26622933  T
Q  105 aattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaa 204  Q
    || ||||||| |||||| |  ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26622934 aaataattttttgcattcgaaacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccattacccatcccatacccgtgttttgaaatcagggaaa 26623033  T
Q  205 aaccaaac 212  Q
    | ||||||    
T  26623034 acccaaac 26623041  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 70 - 277
Target Start/End: Original strand, 38152835 - 38153041
Alignment:
Q  70 aattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgtt 169  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||| |||||    
T  38152835 aattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttaggtatgggttcggggtgggtacctatatagccgtt 38152934  T
Q  170 atccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggt 269  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   || ||||||||     
T  38152935 atccgttccatacccatgttttgaaatcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacgg-gaaaatccgtcaaattgagtttggttcgggc 38153033  T
Q  270 gggtaacc 277  Q
    ||||||||    
T  38153034 gggtaacc 38153041  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 45379984 - 45380261
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  45379984 tttaacatttgttagacgaactgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatgtca 45380083  T
Q  100 acataaattaattttctg-catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcg 198  Q
    ||||||| ||||||| |  ||||||||||| ||||  ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  45380084 acataaagtaatttttttacatttgggacgagtttaggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtattttgaaatcg 45380183  T
Q  199 gggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacc 277  Q
    || |||| ||| || |||||||||| ||| ||||||| | ||||| |||||||||| | || |||||||  ||||||||    
T  45380184 ggaaaaacccatacccatatccaaacccagtcaaaacagggaaaa-ccgtcaaattgggtttggttcggacgggtaacc 45380261  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 24425260 - 24425551
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  24425260 tttaacatttgttagaccggttgatttatttgt-cctttaaatatcaatggtagtttttataacacgataattatcaaacagaataacatggcatatcaa 24425358  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||| | ||||||| ||||||||| |||||||||   ||||| || || || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |     
T  24425359 catatagtaattttatgcatttggaacgggtttggaaatggggtcagggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcaga 24425458  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
    ||||            || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||  ||||||||| | |||  ||||||||| |||    
T  24425459 gaaa------------attcaaacccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattgggtttggttcgggctggtaaccacgtgtatgagttttgttgccat 24425546  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25783121 - 25782876
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||| |||| ||| | ||||||||||| ||  ||||| ||||||  ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  25783121 tttaatatttattataccgattgatttagttgctcctttaaatattgatgatagtttttataacactgcaattatcaaacaaaataatatgagatattaa 25783022  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| |||  ||||| ||||||| || |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||     
T  25783021 cataaagtaattttctgcattcgggacggattttggtatgagttcggggtgggtacctatatacccattatccgtctcatacccgtgttttataatcgga 25782922  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    ||||| |||||||       ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25782921 gaaaacccaaact-------aaacccaatcaaaacggagaaaatccgacaaat 25782876  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 3227092 - 3226855
Alignment:
Q  69 caattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgt 168  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | || |||||||||||||||| || |||| ||||| || ||    
T  3227092 caattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggatgtgtatgagtatgggttcggggtgggtacctatattcctgt 3226993  T
Q  169 tatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcggg 268  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||  ||||  || | ||||||  |||||||||||||||| | || |||||||     
T  3226992 tacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaacccatacccatactcaaactcagttaaaacgaggaaaatccgtcaaattgggtttggttcgga 3226893  T
Q  269 tgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaa 306  Q
     |||||||| ||| ||| | |||||||| |||||||||    
T  3226892 cgggtaaccgcatgtatggattttgttgccatgcctaa 3226855  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 37579141 - 37579418
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||  || || ||||||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||| |||    
T  37579141 tttaacatttgttagatggattgatttagttgctcatttaaatatcaatgataatttttataacatgacaattatcaaacaaaataacatggcatagcaa 37579240  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgt-cccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||| |||||||| || |||| ||||||||||||| || | |||||  ||||||||  |||||||    
T  37579241 cataaagtaattttctgcatttgagacagctttgggtataggttcggggtgggtacctatatacccgttacccttacccat--ccgtgtttcgaaatcgg 37579338  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccac 279  Q
    | |||| |||||| |||| ||||| | | ||||||||| ||||| ||||| |||| | || |||||||| ||||||||||    
T  37579339 gaaaaatccaaacccatacccaaacctagtcaaaacggggaaaacccgtctaattgggtttggttcgggcgggtaaccac 37579418  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 89 - 304
Target Start/End: Original strand, 10072433 - 10072648
Alignment:
Q  89 atgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgt 188  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  10072433 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgttccatacccgtgt 10072532  T
Q  189 ttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatatagg 288  Q
    ||| ||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||| |||||||| |   ||| ||    
T  10072533 tttgaaatcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgcgggtatggg 10072632  T
Q  289 ttttgttgtcatgcct 304  Q
    |||||||| |||||||    
T  10072633 ttttgttgccatgcct 10072648  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 41103531 - 41103839
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatca---atggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacata 96  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||   |||||| ||  ||| |||| | ||||||||||||||||||| | || |||    
T  41103531 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcatcaatggtaatttgtattaacatgacaattatcaaacaaaataacaagagata 41103630  T
Q  97 tcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaat 196  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  41103631 tcaacataaaataattttttacatttaggacgggtttatgtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttaaccgtcccatacccgtgttttgaaat 41103730  T
Q  197 cggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttg 296  Q
    ||||||      |||| |||| ||| | ||| |||||||||  ||||||||||||||  |||| |||||| | |||||||||||  |||  |||||||||    
T  41103731 cgggga------aaacccatacccacacccagtcaaaacgggaaaaatccgtcaaatcggatttggttcgcgcgggtaaccacaggtatgagttttgttg 41103824  T
Q  297 tcatgcctaatttca 311  Q
     |||  |||||||||    
T  41103825 ccatttctaatttca 41103839  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Original strand, 16811647 - 16811822
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagta 138  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||| |||    
T  16811647 aaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataatatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggctttgggta 16811746  T
Q  139 tgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactca 215  Q
    |||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  16811747 tgggttcggg-tgggtatctatatacccattatccgtctcatacccgtgttttgagatcggggaaaatccaaactca 16811822  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 44734572 - 44734297
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||| ||||||||||   | ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  44734572 tttaatatttgttagacgtaatgatttaattgatccttcaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaataaaataacatgacatatca 44734473  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||| | || ||||||||||||| || |||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||     
T  44734472 acataaagtaattttttacatttgggacggatatgtgtatgggttcggggtgggtacctatatacccattaccggtcccatacccgtgttttgaaatcga 44734373  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacc 277  Q
    | ||||  || || |||  ||||| ||| ||||||  | ||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||    
T  44734372 gaaaaacacatacacattcccaaacccagtcaaaa--gggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaacc 44734297  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 305
Target Start/End: Original strand, 25905539 - 25905811
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgg-gt 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||  ||    
T  25905539 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgatgt 25905638  T
Q  132 ttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatca 231  Q
    ||| ||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| || |||| ||||| ||| |||    
T  25905639 ttgggtatgagttcggggtg-gtacctatgtacccgttacccgtcccatacctgtgttttgagattggggaaaacccatacccatacccaaacccagtca 25905737  T
Q  232 aaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    ||| || ||||| | |||||||| | ||  ||||| | ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||    
T  25905738 aaaaggggaaaacctgtcaaattgggtttagttcgagcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgccta 25905811  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 25980132 - 25979927
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||| ||||| |||||||||||  |||| |||| |||| |  |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  25980132 tttaacatttgttagacggaatgatttatttaatcctttaaatatcaatgtaagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatttca 25980033  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||| | || |||| ||||| ||| ||| || |||| |||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  25980032 acataaaataattttttacatttggaaaggatttgggtatgagtttggggtgggtacatatatatccgttacccgtctcatacctgtgttttgaaatcgg 25979933  T
Q  200 ggaaaa 205  Q
    ||||||    
T  25979932 ggaaaa 25979927  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26004675 - 26004477
Alignment:
Q  12 ttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaat 111  Q
    ||||| ||||||||||| |   ||||| ||||||||||| ||||| |||||| | | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  26004675 ttagaccgattgatttagtcgctcctttaaatatcaatgatagtttttataagaagacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacataaagtaat 26004576  T
Q  112 tttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaa 211  Q
    |||||||||| ||| || |||   ||||||||||||| || |||  |||||||| |||| |||||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||    
T  26004575 tttctgcattcggggcgagtt--ggtatgggttcggggtgggtatctatatacctgttacccgtcccatacccaagttttgaaatcgaggaaaacccaaa 26004478  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5916280 - 5916037
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||     |||||  |    
T  5916280 tttaacatttgttagaccgattgattgatttactcctttaaatatcaatggtagttttgataacacagcaattatcaaacaaaataa----gcatattga 5916185  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||   |||| |||| |||||||| ||||||| ||||||  |||||     ||| ||| |||||||| |||||||     
T  5916184 cataaaataattttatgaatttgggacaaatttgggtattggttcggggtgagtacatatata-tcgtta-----cccgtactcgtgttttgaaatcgga 5916091  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    ||||| ||||| |||||| |||| || ||||||  | |||||||||||||||||    
T  5916090 gaaaatccaaattcatattcaaacccgatcaaattgaagaaaatccgtcaaatt 5916037  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 44986113 - 44985856
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttatta-taacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  44986113 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acatatca 44986015  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||      ||||| ||||||  || ||| ||||||||||||           |||||||| ||| |||||||    
T  44986014 acataaa-taattttttacatttgggacgg------gtatgagttcggagtgggtatttatatacccgt-----------tacccgtg-tttgaaatcgg 44985934  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacc 277  Q
     ||||| ||| |  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  44985933 agaaaacccatatccatacccaaacccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagatttggttcggatgggtaacc 44985856  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 254
Target Start/End: Original strand, 43507402 - 43507577
Alignment:
Q  79 acaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtccc 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |  |||||||||| || || || | ||||||||||||| ||||| |    
T  43507402 acaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgagtataggtatgggttcagggtgggtgcctatatacccgttacccgtctc 43507501  T
Q  179 atacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||||| || |||||||    
T  43507502 atacccatgttttgaaatcggggaaaacccatacttatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccatcaaatt 43507577  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 44658631 - 44658496
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| | ||||||| |||||||    
T  44658631 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaatatttttttacatttggtacgggtt 44658532  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgt 168  Q
    || |||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  44658531 tgggtatgggttcgggataggtacctatatacccgt 44658496  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 44794200 - 44794052
Alignment:
Q  43 tatcaatggtagttatta-taacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgg 141  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||| ||||||    
T  44794200 tatcaatggtagtttttagtaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataattttttacatttgggacaggtttgggtatgg 44794101  T
Q  142 gttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttt 191  Q
    ||||||| || |||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44794100 gttcggggtgggtacct-tatactcgttacccgtctcatacccgtgtttt 44794052  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 23328488 - 23328636
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  23328488 tttagcatttattagaccgattgatttagttattcctttaaatatcaatgataatttttatagcacgacaattatcaaacaaaataacaagacatgtcaa 23328587  T
Q  101 cat-aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcggg 148  Q
    ||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  23328588 cataaaaataattttctccattcgggacgggtttgggtataggatcggg 23328636  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 45709073 - 45708781
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| |||||||||||||| || |||| || | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45709073 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtaatttttattaatatgacaattatcaaacaaaataatataacatatcaacat 45708974  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| || ||| |   |||| ||||||||||  ||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||| ||     
T  45708973 aaagtattttac---attttggacgggtttaggtatgagttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtccaatacccgtgttttgagatcggaga- 45708878  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
         |||| |||| | ||| ||| ||||||||  |||||||  ||||||| |||| | |||||| || ||| ||| |||||  ||||||||| ||||||    
T  45708877 -----aaacccataccaaaacccagtcaaaacgaggaaaatctatcaaattggatttgattcgggcggataatcacgtatatgagttttgttgccatgcc 45708783  T

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Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 37196213 - 37195921
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  || || | ||||||||||||||| |||| |||| | || |||||||||||||||| || ||||||||    
T  37196213 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttatatatcaatggtagtttttattaacatgacagttatcaaacaaaataacataacatatca 37196114  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||  |||||||||| |||||| |||||| || |||  ||||||||| |           |||| ||||||| |||||||    
T  37196113 acataaagtaattttttacatttatgacgggtttgggtatggattcggggtgggtagctatatacccat-----------tacctgtgttttgaaatcgg 37196025  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||| || |||| ||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||   || |||| ||| || |||||||   ||| | |||||||||||    
T  37196024 ggaaaatccatacccatacccaaacctaatcaaaacagggaaaatccgtcaaattgagtttggtttgggcggataaccacgggtatggattttgttgtca 37195925  T

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Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 274
Target Start/End: Original strand, 3157063 - 3157234
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||| |||||||  || |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  3157063 ataaattgattttctatgtttgggacgggtttgggtataggttcggtgtgggtacctatatccccgttatccgtcccatacccatattttgaaatcgggg 3157162  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggta 274  Q
    |||| | |||| |||| ||||| | | ||||| ||| ||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  3157163 aaaacctaaacccatacccaaaccaagtcaaagcggggaaaa-ccgacaaattaggtttggttcgggcgggta 3157234  T

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Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 253
Target Start/End: Original strand, 27063127 - 27063269
Alignment:
Q  111 ttttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaa 210  Q
    |||||| |||| |||  ||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||||  |||    
T  27063127 ttttctacattcgggtagggtttgggtatgagttcggggtgagtacatatatccccgttatccgtcctgtacccgtattttgaaatcgaggaaaactcaa 27063226  T
Q  211 actcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||| | | |||||||||||||||    
T  27063227 actcatacccaaacccagtcaaatcagggaaaatccgtcaaat 27063269  T

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Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8906696 - 8906551
Alignment:
Q  108 taattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaac 207  Q
    ||||||| | ||||||| || ||| ||  |||||||||||| || |||| ||||  |||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||| |||||      
T  8906696 taattttttacatttggaacaggtatggatatgggttcggggtgggtacatataaccccgttattcgtctcatactcgtgttttgaaatcggagaaaact 8906597  T
Q  208 caaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  8906596 caaacccatacccaaatccaatcaaagcggagaaaacccgtcaaat 8906551  T

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Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 205
Target Start/End: Original strand, 33841074 - 33841161
Alignment:
Q  118 catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaa 205  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||  |  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33841074 catttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgagtacatataaccatgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaa 33841161  T

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Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11472825 - 11472664
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||| || ||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||  |||||| ||||||||     
T  11472825 ataaattgattttct-catttgggacggatttgggtatgagttcagg-tgagtacctatattcccgttatccatcttatacctctgttttgaaatcggga 11472728  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcg 266  Q
    ||||  |||||||||| | ||||||||| |||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11472727 aaaactcaaactcataccaaaatccaattaaaagggt-aaaacccgtcaaattaaattcggttcg 11472664  T

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Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10995931 - 10995832
Alignment:
Q  118 catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcata 217  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||||| || |||  ||||  || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  10995931 catttggaacgggtatgggtatgggttcggggtgggtatatataaccctgttacccgtcccatacccgtgtcttgaaatcggggaaaacccaaactcata 10995832  T

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Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 37103214 - 37103088
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatcca 227  Q
    |||||||  |||| |||||||||| || | ||||| | ||||| || |||| ||||||| |||| ||||| || ||||  |||||| ||||||||| |||    
T  37103214 gggtttggatatgtgttcgggatgggtgcatatatcctcgttacccttcccgtacccgtattttgaaatcaggaaaaacacaaacttatatccaaaccca 37103115  T
Q  228 atcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  37103114 atcaaatcggagaagatccgtcaaatt 37103088  T

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Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5565414 - 5565269
Alignment:
Q  108 taattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaac 207  Q
    ||||||| | ||||||||| | || || ||||||||| ||| || |||| ||||  ||||||| || ||||||| ||||  ||| ||||| ||||||| |    
T  5565414 taattttttacatttgggatgtgtatgggtatgggttaggggtgggtacatataaccccgttacccatcccatatccgtactttgaaatcagggaaaacc 5565315  T
Q  208 caaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    |||||  ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  5565314 caaacctataaccaaatccagtcaaagcggggaaaatccgtcaaat 5565269  T

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Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 212
Target Start/End: Original strand, 31426014 - 31426098
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaac 212  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||  ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  31426014 gggtttgggtatgcgttcggggtggatacatatatccccgttacccgtctcatacccgtatttttaaatcggggaaaacccaaac 31426098  T

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Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 42908103 - 42908023
Alignment:
Q  153 gtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaa 233  Q
    |||| ||||| ||| ||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  42908103 gtacatatatccccattacccgtcccgtacccgtattttgaaatcggggaaaacccaaactcatacccaaacccaatcaaa 42908023  T

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Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 305
Target Start/End: Original strand, 37218005 - 37218188
Alignment:
Q  124 ggacgggtttgag-tatgggttcgggatgagtacttatataccc-gttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatcca 221  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||| |  |||||||||| ||| |||| ||||||| |||| ||||||| |||| ||  ||||  |||||||||| |||    
T  37218005 ggacgggtttggggtatgagttcgggcttggtacttatatcccccgttacccgtcccgtacctgtgttttgaaataggataaaactcaaactcataccca 37218104  T
Q  222 aatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    || ||| ||||||||| ||||| || |||||||   || |||||||||||||| || |   |||  ||||||||||||||||||    
T  37218105 aacccagtcaaaacggggaaaacccatcaaattgagtttggttcgggtgggtatccgctggtatgagttttgttgtcatgccta 37218188  T

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Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 253
Target Start/End: Original strand, 27063348 - 27063465
Alignment:
Q  136 gtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaac 235  Q
    ||||| ||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||| | | || |||| ||||| ||| |||||      
T  27063348 gtatgagttcggggtgggtacatatattcccgttacccgtcccgtacccgtattattaaatcggggaaaaccgagacccatacccaaacccagtcaaatt 27063447  T
Q  236 ggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    ||  ||||||||||||||    
T  27063448 gggaaaaatccgtcaaat 27063465  T

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Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 217
Target Start/End: Original strand, 32546198 - 32546287
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcata 217  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||| || ||||||| |||| |||||||| |||| |||||| ||||    
T  32546198 gggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccccgttacccgttccgtacccgtattttgaaatcgggaaaaatccaaacccata 32546287  T

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Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23475360 - 23475266
Alignment:
Q  118 catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaac 212  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||   || |||| ||||| ||| ||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  23475360 cattcgggacgggtttgggtatgggttcgaagtgggtacatatatccccattacccatcccaaacccgtgttttgaaatcgggaaaaacccaaac 23475266  T

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Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27896567 - 27896457
Alignment:
Q  123 gggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaa 222  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||| |  || | ||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| |||||| |||| ||||    
T  27896567 gggacgggtatgggtatgagttcggggttggtgcatataaccccgttacccgtcccatacccatgttttgaaataagggaaaacccaaacccatacccaa 27896468  T
Q  223 atccaatcaaa 233  Q
    | |||||||||    
T  27896467 acccaatcaaa 27896457  T

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Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3274810 - 3274684
Alignment:
Q  84 ataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacc 183  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||    |||||||||| | ||  |||  ||||||| |||||  | ||||||||    
T  3274810 ataacatgacatatcaacataatgtaattttctacattcgggacgggtt----tatgggttcgaggtggctacgaatatacctgttatttggcccatacc 3274715  T
Q  184 cgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactc 214  Q
     ||||||| |||||| | |||| ||||||||    
T  3274714 agtgttttaaaatcgagaaaaacccaaactc 3274684  T

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Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Original strand, 22973394 - 22973499
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatcca 227  Q
    ||||||| ||||||||||| | || ||||  |||| ||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||| |||| ||||| |||    
T  22973394 gggtttgggtatgggttcgaggtgggtacagatatccccattacccgtcccgtacccgtattttgaaatcgtggaaaacccaaacccatacccaaaccca 22973493  T
Q  228 atcaaa 233  Q
     |||||    
T  22973494 gtcaaa 22973499  T

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Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 30839176 - 30839095
Alignment:
Q  173 cgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgg-agaaaatccgtcaaat 253  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||| ||||| ||| |||||| |||||||||    
T  30839176 cgtcccatacccgtattttgaaatcagggaaaactcaaactcatacccaaacccagtcaaatcggaagaaaacccgtcaaat 30839095  T

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Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 26004735 - 26004675
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat 61  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |   ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  26004735 tttaacatttgttagaccgattgatttagtcgctcctttaaatatcaatggtagtttttat 26004675  T

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Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 44845222 - 44845095
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatcca 227  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||  ||||| | | ||| ||||||| ||||||| || | ||||||||||||| |||||| |||| | |||  ||    
T  44845222 gggtttgtgtatgggttcggggtgggtaaatatatcctcattaaccgtcccgtacccgtattatgaaatcggggaaaacccaaacccataccaaaactca 44845123  T
Q  228 atcaaaacgg--agaaaatccgtcaaat 253  Q
     |||||||||  | ||||||||||||||    
T  44845122 gtcaaaacggaaaaaaaatccgtcaaat 44845095  T

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Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 223
Target Start/End: Original strand, 18683980 - 18684075
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaa 223  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||  ||| ||||| || |||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| || ||| |||| |||||    
T  18683980 gggtttgggtatgggttcgaggtggatacatatatccctgttacccgtcccgtacccgtattttgaaatcggggaaaacccgaacccatacccaaa 18684075  T

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Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19440107 - 19440020
Alignment:
Q  118 catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaa 205  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||   || |||| ||||| ||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  19440107 cattcgggacgggtttgggtatgggttcgaagtgggtacatatatccccattacccatcccaaacccgtgttttcaaatcagggaaaa 19440020  T

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Target: chr3 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 51)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Original strand, 34119532 - 34119825
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||  || ||  |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  34119532 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcatttcaatatcaatgttagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataat--ggcatatcaa 34119629  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  34119630 cacaaagtagttttctgcatttgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttatccgtctcatacccgtgttttaaaatcggg 34119729  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttg 296  Q
     ||||  |||||||||| ||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  34119730 aaaaactcaaactcatacccaaacccaatcaaaatggggaaaacccgtcaaattagatttggttcgggtggttaaccacatggatgggttttgttg 34119825  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 42758248 - 42758552
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  42758248 tttaacatttgttagaccggttgatttaattgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacatggcaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 42758347  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  42758348 cataaagtaattttcttcgttcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgcatacctatatacctgttacccgtcccatacctgtgttttgaaatcggg 42758447  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||| | || || ||||| ||||||||||   ||| |||||||||| |||    
T  42758448 ggaaacccaaactcatacccaaacccagttaaaacggggaaaatccgtcaaattgggtttggatcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccat 42758547  T
Q  301 gccta 305  Q
    |||||    
T  42758548 gccta 42758552  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4557519 - 4557214
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4557519 tttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttataacacatcaattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 4557420  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||  | |||| ||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  4557419 cataaagtaattttctgcattcgggatagatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatactcgttacccgtcccatacccatgttttgaaaacggg 4557320  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||    
T  4557319 gaaaacccaaacccatacccaaacccagtcaaaacgggaaaaacccgtcaaattgggttttgttcgggtgggtaaccacgggtatgagttttgttgtcat 4557220  T
Q  301 gcctaa 306  Q
    ||||||    
T  4557219 gcctaa 4557214  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 19111609 - 19111912
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  19111609 tttaacatttgttataccaattgatttagttactcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgaaaattatcaaacaaaataacatgacatat-aa 19111707  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| | |||||||  || || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  19111708 cataaagtaattttctacattttgtacgggtttgggcatgggtttagggtgggtacttatatacccgttatccatcccgtacccgtgttttgaaatcggg 19111807  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
     ||||  |||||||||| ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  19111808 aaaaactcaaactcatacccaaacccaatcaaaaagggaaaaatccgtcaaattggatttggtttaggtgagtaaccacggatatgagttttgttgtcat 19111907  T
Q  301 gccta 305  Q
    |||||    
T  19111908 gccta 19111912  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 54317018 - 54317321
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||    |||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  54317018 tttaacatttgttagacatgttgatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttataacacggcaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 54317117  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  54317118 cataaagtaattttcttcgtttgggacgggtttgggaatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcctatacttgtgttttgaaatcggg 54317217  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
    |||||  ||||| ||||  |||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||  |||| | |||||||| |||    
T  54317218 gaaaactcaaacacatactcaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattggatttggttcgggcgggtaaccacggatatggattttgttgccat 54317317  T
Q  301 gcct 304  Q
    ||||    
T  54317318 gcct 54317321  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 4016258 - 4015954
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||| ||||||| || |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4016258 tttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcgatagtagtttttataacacatcaattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 4016159  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||  || ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4016158 cataaggtagttttctgcattcgggacgagtttgggtatgggttcggagtgggtacctatatacccgttatccgtcccatacccatgttttgaaatcggg 4016059  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt-agattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| | | |||||||||  |||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||    
T  4016058 gaaaacccaaacccatacccaaacctagtcaaaacgggaaaaacccgtcaaattgagtttc-gttcgggtgggtaaccacgggtatgggttttgttgcca 4015960  T
Q  300 tgccta 305  Q
    ||||||    
T  4015959 tgccta 4015954  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 48391028 - 48390725
Alignment:
Q  4 aacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    |||||||||||||  || ||||||| ||  || || ||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48391028 aacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatggtagtttttttaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacat 48390929  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | | || ||||||||| || |||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48390928 aaagtaattttttacgttcgggacgggtatgggtatgggttcaggatgggtacctatattcccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaa 48390829  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| || |||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||   |||||||| |   ||| |||||||||| ||||||    
T  48390828 aacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaatccgtcaaattggatttggttcgaacgggtaaccgcgggtatgggttttgttgccatgcc 48390729  T
Q  304 taat 307  Q
    ||||    
T  48390728 taat 48390725  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Original strand, 49579941 - 49580244
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  49579941 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaatcatcaaacaaaataacataacatatcaatat 49580040  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  49580041 aaagtaattttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcgaggtgggtacctatatactcgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaa 49580140  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| || |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||| || |||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  49580141 aacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattggatttggttcgggcggataaccacgggtatgggttttgttgtcatgcc 49580240  T
Q  304 taat 307  Q
    ||||    
T  49580241 taat 49580244  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 39655455 - 39655182
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| | |||||| ||||||||    
T  39655455 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgagacgggtt 39655356  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    || ||||||||| ||| || |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||| ||||| ||||||||    
T  39655355 tgggtatgggtttggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccatacccatacccaaacccaatcaa 39655256  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaa 306  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||| |||||||||    
T  39655255 aacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcctaa 39655182  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Original strand, 39728548 - 39728849
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||| || || ||||||||||| ||||| |||| ||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  39728548 acatttgttagacaaaatgatttagttaatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacagaacaattatcaaacaaaataacattacatatcaacat 39728647  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| | |||| ||||    
T  39728648 aaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttacccatcccatacccgtattttgagatcgaggaa 39728747  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || | | ||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||    
T  39728748 aacctatactcatacccaaacccagtcaaaacggggaaaatccgtcaaattggatttggttcggacgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcc 39728847  T
Q  304 ta 305  Q
    ||    
T  39728848 ta 39728849  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 34 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 44953617 - 44953371
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  44953617 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtt 44953518  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || || | ||||| ||| ||||    
T  44953517 tgagtatgagttcggggtgagtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccatacccaaacccaaacccagtcaa 44953418  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccac 279  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | || |||||| | ||||||||||    
T  44953417 aacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgagcgggtaaccac 44953371  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 34025827 - 34026129
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||| ||  ||||| |||||||||||||| || |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34025827 tttaacatttgatagatggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtaatttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 34025926  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||||| ||   || ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  34025927 acataaaataattttttacatttgggacgggtatgggtatgagttcggggtggaaacctatatactcgttacccgtcccatacctgtgttttgaaatcgg 34026026  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||| || |||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| | || |||||||| |||||||| |   ||| |||||||||| ||    
T  34026027 ggaaaacccatacccatatccaaacccagtcaaaacgggaaaaaaccgtcaaattggttttggttcgggagggtaaccgcgggtatgggttttgttgcca 34026126  T
Q  300 tgc 302  Q
    |||    
T  34026127 tgc 34026129  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 53631778 - 53632032
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  53631778 tttatcatttgttagaccgatcgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacacggcaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 53631877  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| |||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||  ||    
T  53631878 cataaagtaattttctagattcgggacgagtttgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtctcatacacgtgttttaaaatttgg 53631977  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatta 255  Q
    |||||  ||||| |||| | | | ||| ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  53631978 gaaaactcaaacccatacctatacccattcaaaacgaggaaaacccgtcaaatta 53632032  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 40 - 307
Target Start/End: Original strand, 29284248 - 29284516
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagta 138  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| | ||| ||||||||||||| |||    
T  29284248 aaatattaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacatctgggacgggtttgggta 29284347  T
Q  139 tgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgga 238  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||| |||| ||| || |||| ||||| ||| ||||||||||    
T  29284348 tgggttcgggctgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcgggaaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacgga 29284447  T
Q  239 gaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaat 307  Q
    ||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||   |||  ||||||||| ||||||||||    
T  29284448 gaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgagttttgttgccatgcctaat 29284516  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 7469960 - 7469688
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| || | | ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| || | || | |||||||||||||||    
T  7469960 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaagatgacaattatcaaacaaaataacataacatatccacataaagtagtgttttacatttgggacgggtt 7469861  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||||    
T  7469860 tgtgtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcagggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaa 7469761  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||    
T  7469760 aacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgccta 7469688  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 306
Target Start/End: Original strand, 44639152 - 44639453
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    |||||||||||||  || |||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  44639152 acatttgttagataaat-gatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 44639250  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||  |||||    
T  44639251 aaaataattttttacatttggaacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatatgggaa 44639350  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| || |||| ||||| ||| |||||| || ||||| | |||||||| | ||  ||||||  ||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||    
T  44639351 aacccatacccatacccaaacccagtcaaaatggggaaaaccagtcaaattgggtttcgttcggacgggtaaccacggatatgagttttgttgccatgcc 44639450  T
Q  304 taa 306  Q
    |||    
T  44639451 taa 44639453  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 20086882 - 20087135
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20086882 tttaacatttgttagatggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaagcaaaataacatgacatatca 20086981  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||| ||||||||| |           |||||||||||| |||||||    
T  20086982 acataaaataattttttacatttgggacgggtatgagta-gggttcggggtgggtacctatatacccat-----------tacccgtgttttgaaatcgg 20087069  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttc 265  Q
    |||||| ||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  20087070 ggaaaacccatacccatatccaaacccagtcaaaacggagaaaatccgtcaaattggatttggttc 20087135  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 44172503 - 44172733
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  44172503 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcagtggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 44172602  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  44172603 aaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaa 44172702  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaa 234  Q
    || ||| || ||||  |||| ||| ||||||    
T  44172703 aacccatacccatactcaaacccagtcaaaa 44172733  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 44179203 - 44179433
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  44179203 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcagtggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 44179302  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  44179303 aaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaa 44179402  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaa 234  Q
    || ||| || ||||  |||| ||| ||||||    
T  44179403 aacccatacccatactcaaacccagtcaaaa 44179433  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22536056 - 22535748
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22536056 tttaacatttgttagacagaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 22535957  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| ||||| || || ||||||||||||| || || | | ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  22535956 acataaaataattttttacatttaggacgagtatgtgtatgggttcggggtgggtgcctgtatacccgttacccgtcccatatccgtgttttgaaattgg 22535857  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    ||||||  || || |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| || |||||||   || |||||||| || ||||| |   ||| |||||||||| ||    
T  22535856 ggaaaactcatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccatcaaattgagtttggttcgggcggataaccgcgggtatgggttttgttgcca 22535757  T
Q  300 tgcctaatt 308  Q
    ||| |||||    
T  22535756 tgcataatt 22535748  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 43582451 - 43582755
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattata-acacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||| ||  ||| | ||||||||||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43582451 tttaacatttgttagacgtaatgatttagttgatccgttaaatatcaatggtagtttttatttacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 43582550  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    | ||||| ||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  43582551 atataaagtaattttttacatttgggacgggtatgaatatgggttcggg-tgggtacctacatacacgttacccgtctcatacccgtgttttgaaatcgg 43582649  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    ||||||  || || ||||  |||| ||| | ||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| |||||||| |  |||| ||||||||||  |    
T  43582650 ggaaaactcatacacatactcaaacccagtaaaaacggagaaaacccatcaaattggatttggttcgggcgggtaaccgcggatatgggttttgttgcaa 43582749  T
Q  300 tgccta 305  Q
    ||||||    
T  43582750 tgccta 43582755  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 305
Target Start/End: Original strand, 44252653 - 44252925
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||||    
T  44252653 tcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttatatttgggacgggtt 44252752  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    || ||||||||||||| || |||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||||    
T  44252753 tgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacacgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaa 44252852  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | || | |||||  ||||||||||   ||| | |||||||| ||||||||    
T  44252853 aacggggaaaacccgtcaaatttggtttgattcggacgggtaaccacgggtatggattttgttgccatgccta 44252925  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 40 - 307
Target Start/End: Original strand, 52572521 - 52572789
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagta 138  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  52572521 aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatattaacataaagtaattttttacatttgggacgggcttgagta 52572620  T
Q  139 tgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgga 238  Q
    ||| |||||| || || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||  || || |||| ||||| ||| |||||| ||     
T  52572621 tggattcggggtgggtccctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcgaggaaaactcatacccatacccaaacccagtcaaaatggg 52572720  T
Q  239 gaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaat 307  Q
    ||||| | ||||||||   || |||||||| || |||||||   ||| |||||||||| ||||||||||    
T  52572721 gaaaacctgtcaaattgagtttggttcgggcggataaccacgggtatgggttttgttgccatgcctaat 52572789  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 304
Target Start/End: Original strand, 830884 - 831179
Alignment:
Q  2 ttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaac 101  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||    
T  830884 ttaacattttttagaccaattgatttagtttctccttaaaatatcaatgatagtttttataagacggcaattatcaaacaaaataacatagcatattaac 830983  T
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||| || || ||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||    
T  830984 ataaagtaattttctgcattcgggacgaatttgggtatgggttcagggtgggtac-catatactcgttatccgtctcatacccgtgttttgaaaac-ggg 831081  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatg 301  Q
    ||| |||     |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| ||| ||||||||||  ||||  ||||||||||| ||    
T  831082 aaatacc-----catacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaatttggtttggtttgggcgggtaaccacggatatgagttttgttgtcttg 831176  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 44106974 - 44106755
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  44106974 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatattaacataaagtaattttttacatttgggacgggtt 44106875  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    |||||||||||||||| |   ||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||| | || |||| ||||||| ||||||| ||||| ||| ||||    
T  44106874 tgagtatgggttcggggtagatacctatatatccgttacgcgtcccatacccgtgttttaagattgggg-aaaaccatactcatacccaaacccagtcaa 44106776  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    ||||| ||||| ||||||||||    
T  44106775 aacggggaaaa-ccgtcaaatt 44106755  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 276
Target Start/End: Original strand, 52198031 - 52198304
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataat-atgacatatcaaca 102  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||  ||  |||||||||     
T  52198031 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataaacatagcatatcaacg 52198130  T
Q  103 taaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggga 202  Q
    |||| ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||| |    
T  52198131 taaagtaattttttacatttggaacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacctgtgttttgagatcgggaa 52198230  T
Q  203 aaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaac 276  Q
    ||| ||| || |||| ||||| ||| ||||||| || |||| |||||||||||| || |||| ||| |||||||    
T  52198231 aaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacagaaaaaacccgtcaaattaggtttggtttgggcgggtaac 52198304  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 6738609 - 6738311
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    |||||||| |||||||   | ||||||||||  |||||  |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6738609 tttaacatctgttagacataatgatttaattgatccttccaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacatgacatatca 6738510  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||| || ||| || |||| |||||||||||           |||||||||||| |||||||    
T  6738509 acataaagtaattttttacatttgggacgggtatgagtatggatttggggtgggtacctatatacccgt-----------tacccgtgttttgaaatcgg 6738421  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||| || |||| ||||| ||| |||||||||  |||| | |||||||| | || |||||||| |||||||| |   ||| |||||| ||| ||    
T  6738420 ggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacgggaaaaacctgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgcgggtatgggttttattgcca 6738321  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Original strand, 29842184 - 29842445
Alignment:
Q  4 aacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaaca 102  Q
    |||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  29842184 aacatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacaaatcaaca 29842283  T
Q  103 taaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggga 202  Q
    |||| ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  29842284 taaagtaattttttacatttgagacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatattcccgttaccagtcccatacccgtgttttaaaatcggg-a 29842382  T
Q  203 aaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttc 265  Q
    ||| ||| ||  ||| ||||| ||||||  |||    |||| ||||||||||||||| |||||    
T  29842383 aaacccatacctatacccaaacccaatccgaacatgaaaaacccgtcaaattagatttggttc 29842445  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 212
Target Start/End: Original strand, 49025587 - 49025765
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  49025587 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacataacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacacaaagtaattttttacatttgggacgggtt 49025686  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaac 212  Q
    || |||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  49025687 tgggtatgggttc-ggatgtgtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccaaac 49025765  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 41937216 - 41936954
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||  |||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41937216 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcatttcaatatcaatgttagtctttataacacgacaattatcaaacaaaataatatgacatgtcaa 41937117  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    || ||| || ||||||||||||| |||| |||||           || |||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  41937116 cacaaagtagttttctgcatttgagacgagtttg-----------ggtatgagtatctatatacccgttatccgtctcatactcgtgttttaaaatcggg 41937028  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccaca 280  Q
    ||||| ||| |||      |||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| | ||||| ||| ||||||||    
T  41937027 gaaaacccatact------caaacccaatcaaaacgaggaaaatccatcaaatttgatttgattcggatggttaaccaca 41936954  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 30682695 - 30682840
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30682695 tttaacatttgttagaacgaatgatttaattgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacatgaccattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 30682794  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcg 146  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  30682795 cataaagtaattttctacattcaggacgggtttgagtataggttcg 30682840  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17146361 - 17146063
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  17146361 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 17146262  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||| | |||| |||| |||||||| |||||| | || ||  ||    
T  17146261 aaagtaattttttacatttgggaagggtttgtgtatgggttcggggtggatacctatataactgttacccgttccatacccatgttttgagattggaaaa 17146162  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| || |||| ||||||    ||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||| ||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17146161 aacccatacccatacccaaat---gtcaaaacgg-ggaaacccgtcaaattggatttggtttggacgggtgaccacatatatgggttttattgtcatgcc 17146066  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 34154291 - 34154541
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||| ||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||     |||||||    
T  34154291 tttaatatttgttagacataatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataa-----catatca 34154385  T
Q  100 acataaattaattttctg-catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcg 198  Q
    ||||||| ||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||| || |||| ||||| |  |||| ||||  ||||||| |||||| ||||||    
T  34154386 acataaagtaatttttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtgggtacctatattcttgttacccgtttcatacccatgttttgaaatcg 34154485  T
Q  199 gggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    |||||||  || || |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  34154486 gggaaaacacatacccatatccaaacccagtcaaaacggggaaaatccgtcaaatt 34154541  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10823904 - 10823706
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  10823904 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 10823805  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | |||||||||  |||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||| |||    
T  10823804 aaagtaattttttacatttgggagaggtttgggtatgggttcgg---gggtacttatatacccgttatcaatctcatacccgtgttttgagatcggagaa 10823708  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 31127009 - 31126826
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||  |||||  |||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  31127009 tttaacatttgttagactgattgatttagttgctcctttcaatatcaatgttagtttttataatacgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 31126910  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccataccc 184  Q
    || ||  || |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||  ||| |||||||  |||| |||||||||||||    
T  31126909 cacaatgtagttttctgcatttgggacgagtttgggtatgagttcggggtggatacctatatacatgttacccgtcccataccc 31126826  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 23580701 - 23580954
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23580701 tttaacatttgttatacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatagtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acatatca 23580799  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||   || || ||||||||||||  || |||| ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||| ||    
T  23580800 acataaaataattttttacatttgggataagtgtgggtatgggttcggagtgggtacctatatacccgttacccgtttcatactcgtgttttgaaattgg 23580899  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    ||||||  || || |||| ||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||    
T  23580900 ggaaaactcatacccatacccaaacccagtcaaaacgggaaaaacccgtcaaatt 23580954  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23154245 - 23154026
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||  |||     
T  23154245 tcctttaaatatcaacggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acatatcaacataaagtaattttttacatttgggataggta 23154147  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    |||||||||||||||  || |||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| || |||| |||||  || | ||    
T  23154146 tgagtatgggttcggagtgggtacctatatactcgttacccgttccatacccgtg-tttgaaatcggggaaaacccatacccatacccaaactcagttaa 23154048  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    |||||  |||| ||||||||||    
T  23154047 aacgggaaaaacccgtcaaatt 23154026  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 48305760 - 48305548
Alignment:
Q  96 atcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaa 195  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| |||| |||||||| || |||| |||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||    
T  48305760 atcaacataaagtaattttttacatttggaacgggtttgggtataggttcggggtgggtacctatatacccgatactcgttccatacccgtgttttgaaa 48305661  T
Q  196 tcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgtt 295  Q
    | ||||||||  || || |||| ||||| ||| |||||| || ||||| |||||| ||| | || ||||||||||||||||| |   ||| | |||||||    
T  48305660 ttggggaaaactcatacccataaccaaacccagtcaaaatggggaaaacccgtcagattgggtttggttcgggtgggtaaccgcgggtatggattttgtt 48305561  T
Q  296 gtcatgcctaatt 308  Q
    |||||| ||||||    
T  48305560 gtcatgtctaatt 48305548  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 23547039 - 23546855
Alignment:
Q  118 catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcata 217  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||      |||| ||||    
T  23547039 catttgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcgggga------aaacccata 23546946  T
Q  218 tccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaatt 308  Q
     ||||| ||| ||||||||| ||||| |||| ||||| | || |||||  | ||||||||||   ||| |||||||||| |||||||||||    
T  23546945 cccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgttaaattgggtttggttcatgcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcctaatt 23546855  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23910385 - 23910170
Alignment:
Q  74 atcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccg-ttatc 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  || ||     |||||   ||  |||||||||| | | |    
T  23910385 atcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaattttctacattcgggacgggtttaggtgtg-----gggat--cta--tatatacccgataacc 23910295  T
Q  173 cgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtggg 272  Q
    | || |||| ||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||  |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||   ||    
T  23910294 catctcatatccgtgttttgaaatcgaggaaaactcaaactcatacacaaacccagtcaaaacggaaaaaatccgtcaaattgaattcgattcggacagg 23910195  T
Q  273 taaccacatatataggttttgttgt 297  Q
    |||||||   ||| |||||||||||    
T  23910194 taaccacgagtatgggttttgttgt 23910170  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3414638 - 3414478
Alignment:
Q  110 attttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaacca 209  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    || ||||||| | ||||| ||| |||||||  |||||||| ||||  ||    
T  3414638 attttctacattaggtacgggtttgagtatggattcgggatgagtac----atccccgttacctgtcccgtactcgtgtttgaaaatcgggaaaaactca 3414543  T
Q  210 aactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggta 274  Q
    ||| |||| ||||| ||||||||| ||| ||||| |  || |||| | || ||||||||||||||    
T  3414542 aacccataaccaaacccaatcaaagcggggaaaacctatcgaattgggtttggttcgggtgggta 3414478  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10043374 - 10043243
Alignment:
Q  123 gggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaa 222  Q
    |||| |||| || ||||||||||||| || || | ||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||||| |||| ||||    
T  10043374 gggatgggtatgggtatgggttcggggtgggtgcatataaccccgttacccgtcccatacccatgttttgaaaccagggaaaacccaaacccatacccaa 10043275  T
Q  223 atccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    | ||| |||||  |||||||| ||||||||||    
T  10043274 acccagtcaaagtggagaaaacccgtcaaatt 10043243  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30616376 - 30616259
Alignment:
Q  120 tttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatc 219  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||  | ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||      
T  30616376 tttgggacgggtatgggtatgggttcggggtggttatatataacctcgttacccgtcccatatccgtgttttgaaatcggggaaaacccaaacccatact 30616277  T
Q  220 caaatccaatcaaaacgg 237  Q
    ||||| || |||||||||    
T  30616276 caaattcagtcaaaacgg 30616259  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 254
Target Start/End: Original strand, 42243362 - 42243514
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||  || ||| ||  ||  ||||| | ||||| || || ||||||||||| || ||||||||     
T  42243362 ataaattgattttctacatttaggatgggtttgggtatgaatttggggtggataaatatatcctcgttacccatctcatacccgtgtattgaaatcggga 42243461  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  42243462 aaaacccaaactcatacccaaacccagtcaaaccggggaaaacccgtcaaatt 42243514  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 256
Target Start/End: Original strand, 38347596 - 38347695
Alignment:
Q  157 ttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattag 256  Q
    |||||| | ||||| || || ||||| | |||||| |||||| | ||||  |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38347596 ttatattctcgttacccatctcatactcatgttttgaaatcgagaaaaacgcaaacttatatccaaagccaattaaaacggagaaaatccgtcaaattag 38347695  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 10371318 - 10371183
Alignment:
Q  176 cccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaa------tcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggt 269  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||      ||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||| |     
T  10371318 cccatacccgtgttttgagattggggaaaatccatactcatacccaaacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgagc 10371219  T
Q  270 gggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    ||||||||||   | | |||||||||||||||||||    
T  10371218 gggtaaccacgggtctgggttttgttgtcatgccta 10371183  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30904927 - 30904808
Alignment:
Q  103 taaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggga 202  Q
    |||||| |||| || |||| | ||||| |||| ||||||||||||| || |||| ||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| |  |    
T  30904927 taaattgatttcctacattcgagacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatccccgt-acccgtcccgtacccgtgttttgaaatcagaaa 30904829  T
Q  203 aaaaccaaactcatatccaaa 223  Q
    ||| ||||||||||| |||||    
T  30904828 aaagccaaactcatacccaaa 30904808  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 302
Target Start/End: Original strand, 27252605 - 27252738
Alignment:
Q  167 gttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcg 266  Q
    |||||||||||| ||||| |||||  |||| || |||||  |||||||||| ||||| ||||||||| | || |||| |||||||||||||||  |||||    
T  27252605 gttatccgtcccgtacccatgtttg-aaattggagaaaactcaaactcatacccaaacccaatcaaatccgataaaacccgtcaaattagatttagttcg 27252703  T
Q  267 ggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgc 302  Q
    ||  |||| || |||| || |||||||||| |||||    
T  27252704 gg-cggtaccctcatacatgggttttgttggcatgc 27252738  T

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Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 243
Target Start/End: Original strand, 4553165 - 4553306
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||  ||| |||| ||  |||| |||||| ||||||||     
T  4553165 ataaattgattttttacattcgagacgggtttgagtatgggttcggggtgtgtatttatatccctattacccgttccgcacccatgttttgaaatcggga 4553264  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaa 243  Q
    ||||  ||||| |||| | ||  ||| ||||| |||||||||    
T  4553265 aaaactcaaacgcatacctaagcccagtcaaagcggagaaaa 4553306  T

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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 23547154 - 23547081
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaa 106  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  23547154 tcctttaaatataaatgctagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatattaacataaa 23547081  T

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Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 48306751 - 48306650
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||| ||||||||||  || ||||||| ||  | ||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  48306751 tttaatatttgttagacggaatgatttagttgatactttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaattaacatgacaaatca 48306652  T
Q  100 ac 101  Q
    ||    
T  48306651 ac 48306650  T

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Target: chr1 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 57)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 19572726 - 19572425
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||  ||||| || |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19572726 tttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccttcaa-tatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacatgacatatca 19572628  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  19572627 acataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacctgtcccatacccgtgttttgaaatcgg 19572528  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    | |||| ||| || |||| ||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||| ||    
T  19572527 gaaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaatggggaaaacccgtcaaattaggtttggttcgggcgggtaaccacaagtatgggttttgttgcca 19572428  T
Q  300 tgc 302  Q
    |||    
T  19572427 tgc 19572425  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 9983104 - 9982798
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||  |||||||||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  9983104 tttaacatttgttagaccgattaatttagttgctcctttgaatatcaatggtagttttgataacatgagaattatcaaacaaaataacatgatatattaa 9983005  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| || |||||| |||||||||| |||| |||    
T  9983004 cataaagtaattttctgcattcgggatgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatactcgttacccatcccattcccgtgttttgaaattggg 9982905  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
    |||||  |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||||   |||  ||||||||| |||    
T  9982904 gaaaattcaaactcatacccaaacccagtcaaaacggagaaaatccatcaaattggatttggttcgggagagtaaccacgggtatgagttttgttgccat 9982805  T
Q  301 gcctaat 307  Q
    |||||||    
T  9982804 gcctaat 9982798  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 12494885 - 12495189
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  12494885 tttaacatttgttagaccgataaatttagttgctcctttaaatatcagtggtagtttttataacacgccaattataaaacaaaataacatgtcatgtcaa 12494984  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||| | || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  12494985 catatagtagttttctacatttgggacgggtttgggtatgggttcgaggtgggtacctatatacccgttacacgtcccatatccgtgttttgaaatcggg 12495084  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
     |||| | |||| |||| | ||| ||| |||||  || |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||||    
T  12495085 aaaaaccaaaacccataccgaaacccagtcaaagtggggaaaatccgtcaaattggatttggttcaggtgggtaaccacatgtatgaattttgttgtcat 12495184  T
Q  301 gccta 305  Q
    |||||    
T  12495185 gccta 12495189  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 34673496 - 34673192
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  34673496 tttaacatttgttagaccggttgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacacggcaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 34673397  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| || |||||| | || || || |||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||    
T  34673396 cataaagtagttttcttcgttcggaacaggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttaccagtctcatacccgtgttttgaaattggg 34673297  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
     |||| |||||| |||| ||||| ||| | |||| || |||||||||| ||||| | || |||||||| |||||| |||   |||  |||||||||||||    
T  34673296 aaaaacccaaacccatacccaaacccagttaaaatggggaaaatccgttaaattgggtttggttcgggcgggtaatcactggtatgagttttgttgtcat 34673197  T
Q  301 gccta 305  Q
    |||||    
T  34673196 gccta 34673192  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 44615690 - 44615389
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  44615690 tttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaataatagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 44615591  T
Q  101 cataaattaattttct-gcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
     ||||| || |||| | | |||||||||||||||| ||||| ||| ||| || |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  44615590 gataaagtagtttttttggatttgggacgggtttgggtatgagtttggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgtttttaaatcag 44615491  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||   || |||  ||||||||||||||   ||| |||||||||| ||    
T  44615490 ggaaaacccaaactcatacccaaacccagtcaaaacgggaaaaacccgtcaaattgagtttggtctgggtgggtaaccacgggtatgggttttgttgcca 44615391  T
Q  300 tg 301  Q
    ||    
T  44615390 tg 44615389  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 44792879 - 44793180
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  44792879 tttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaataatagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 44792978  T
Q  101 cataaattaattttct-gcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
     ||||| || |||| | | |||||||||||||||| ||||| ||| ||| || |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  44792979 gataaagtagtttttttggatttgggacgggtttgggtatgagtttggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgtttttaaatcag 44793078  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||   || |||  ||||||||||||||   ||| |||||||||| ||    
T  44793079 ggaaaacccaaactcatacccaaacccagtcaaaacgggaaaaacccgtcaaattgagtttggtctgggtgggtaaccacgggtatgggttttgttgcca 44793178  T
Q  300 tg 301  Q
    ||    
T  44793179 tg 44793180  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 17134821 - 17135126
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17134821 tttaacatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 17134920  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcggg-atgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcg 198  Q
    ||||||| ||||||| | ||| ||||||| || || ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17134921 acataaagtaattttttacatatgggacgagtatgggtatgggttcggggatg-gtacctatatacccgttacccgtctcatacccgtgttttgaaatcg 17135019  T
Q  199 gggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtc 298  Q
    ||||||| ||| || || | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||| |   ||| |||||||||| |    
T  17135020 gggaaaacccatacccacacccaaacccagtcaaaacagagaaaatccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgcgggtatgggttttgttgcc 17135119  T
Q  299 atgccta 305  Q
    |||||||    
T  17135120 atgccta 17135126  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 304
Target Start/End: Original strand, 34610986 - 34611251
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagta 138  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | || | ||||||||||||||||| |||    
T  34610986 aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataatataacatatcaacataaagtagtattttacatttgggacgggtttgggta 34611085  T
Q  139 tgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgga 238  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||   |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||| || |||| |||||| ||||||||||||     
T  34611086 tgggttcggggtgagtacctatatacacgttacatgtcccatacccgtgttttgagatcgggaaaaacccatacccatacccaaattcaatcaaaacggg 34611185  T
Q  239 gaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcct 304  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||| || ||||||||||   ||| | ||||||||||||||||    
T  34611186 gaaaacccgtcaaattggatttggttcaggcgggtaaccacgggtatggattttgttgtcatgcct 34611251  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18354295 - 18354020
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||||| ||  || || ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18354295 tttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 18354196  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||| || || |||| |||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18354195 acataaaataattttttacatttgggacgagtatgggtatcggttcggggtgggaacttatatacccgttacccgtcccatacccatgttttgaaatcgg 18354096  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaa 275  Q
    |||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||||  |||| ||||||||||  ||| |||||||| ||||||    
T  18354095 ggaaaacccatacccatattcaaatccagtcaaaacgggaaaaacccgtcaaattgaatttggttcgggcgggtaa 18354020  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29871499 - 29871246
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29871499 tttaatatttgttagaccgattgatgtagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacatgggaattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 29871400  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| || || |||| |||||||| |||| | ||||||||||| |||||| |||||||     
T  29871399 cataaaataattttctacattcgggacgggtttgggtatgagttcagggtgggtacctatataccagttacctgtcccatacccatgttttgaaatcgga 29871300  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    ||||| ||||||||||| |||||   | ||||||||  ||||| ||||||||||    
T  29871299 gaaaacccaaactcatacccaaacttagtcaaaacgaggaaaacccgtcaaatt 29871246  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 36187396 - 36187130
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagta 138  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||| |||    
T  36187396 aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataactttttacatttgggacgggtttgggta 36187297  T
Q  139 tgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgga 238  Q
    ||||||| || || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| |||||||||     
T  36187296 tgggttcagggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggg 36187197  T
Q  239 gaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    ||||| ||| ||||||   || |||||||| ||||||| ||   ||| |||||||||| ||||||||    
T  36187196 gaaaacccgccaaattgagtttggttcgggcgggtaacgacgggtatgggttttgttgccatgccta 36187130  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24236972 - 24236698
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  24236972 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 24236873  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  24236872 aaaataattttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttccccgttccatacccgtgttttgagatcggggaa 24236773  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacca 278  Q
    || ||| || |||| | ||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||   || |||||||| |||||||||    
T  24236772 aacccatacccatacctaaacccagtcaaaacgggaaaaacccgtcaaattgagtttggttcgggcgggtaacca 24236698  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 42708045 - 42707744
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    |||||||| |||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42708045 tttaacatctgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 42707946  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  42707945 acataaaataattttttacatttgggacgg------gtatgggttcggg-tgagtacttatattcccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgg 42707853  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
     |||||  || ||||||| ||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||  ||| ||  || |||||||   ||| |||||||||| ||    
T  42707852 agaaaactcatactcatacccaaacccagtcaaaatgggaaaaatccgtcaaattaaatttagtttggacggataaccacgattatgggttttgttgcca 42707753  T
Q  300 tgcctaatt 308  Q
    | |||||||    
T  42707752 tacctaatt 42707744  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Original strand, 51421736 - 51422037
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  51421736 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatagcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 51421835  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    | | ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  51421836 agagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatacatgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcgggaaa 51421935  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| || |||| ||||| ||| |||||| || ||||| || ||||||| | || |||||||| ||||||||||  |||| | |||| ||| ||||||    
T  51421936 aacccatacccatacccaaacccagtcaaaatggggaaaacccatcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacggatatggattttattgccatgcc 51422035  T
Q  304 ta 305  Q
    ||    
T  51422036 ta 51422037  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Original strand, 29936294 - 29936601
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||    
T  29936294 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattataaaaaaaaataacattacatatcaacat 29936393  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  29936394 aaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtattttgagatcggggaa 29936493  T
Q  204 a------aaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgt 297  Q
    |      | ||| ||||||| |||||   | ||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||    
T  29936494 aacccatacccatactcatacccaaacttagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgt 29936593  T
Q  298 catgccta 305  Q
    ||||||||    
T  29936594 catgccta 29936601  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16433375 - 16433089
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16433375 tttaatatttgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataatac---aattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 16433279  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||   | |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  16433278 cataaagtaattttctgcatttggggtgggtttgggtatgggttcgg---gggtacctatatatccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgga 16433182  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
    |||||  |||||            |||||||||| || ||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||| |||    
T  16433181 gaaaactcaaac------------ccaatcaaaatggggaaaatccgtcaaattgagtttggttcggatgggtaaccacggatataggttttattgccat 16433094  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 40 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 49250949 - 49250680
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagta 138  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||| |||    
T  49250949 aaatatcaatgatagtttttatcaacatgacaattatcaaacaaaatagcataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggta 49250850  T
Q  139 tgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgga 238  Q
    |||||||| | ||  ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||  || || |||| ||||| ||| ||||||||||    
T  49250849 tgggttcgaggtggatacctatatacccattacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaactcatacccatacccaaacccagtcaaaacgga 49250750  T
Q  239 gaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaatt 308  Q
    ||||| ||||||||||  ||| |||||||| || |||||||   |||   ||||||||||||||||||||    
T  49250749 gaaaacccgtcaaattgaatttggttcgggcggataaccacgggtatgaattttgttgtcatgcctaatt 49250680  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 69 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 23490917 - 23490677
Alignment:
Q  69 caattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgt 168  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  23490917 caattatcaaacaaaataacataacatatccacataaattagttttttacatttgggacgggttttggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgt 23490818  T
Q  169 tatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcggg 268  Q
    || |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||||||| |  |||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  23490817 tacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacaggaaaaacccgtcaaattggatttggttcggg 23490718  T
Q  269 tgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaattt 309  Q
     ||||||| |    ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23490717 cgggtaactatgagtatgggttttgttgccatgcctaattt 23490677  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 305
Target Start/End: Original strand, 28297840 - 28298125
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctg-catttgggacgggt 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||||    
T  28297840 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaatagtttttttacatttgggacgggt 28297939  T
Q  132 ttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaa------------aaccaaactcatatc 219  Q
    ||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||            | ||| || |||| |    
T  28297940 ttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaactcatacccatacccatacccatacc 28298039  T
Q  220 caaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||    
T  28298040 caaatccaatcaaaacagggaaaacccgtcaaattggatttggttcgggtgggtaaccacggatatgagttttgttgacatgccta 28298125  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17092174 - 17091951
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17092174 tttaacatttattagatggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 17092075  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||||| ||||| | |||||||||||||  ||||||||||| ||||| | |||||||    
T  17092074 acataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggcatgggttcggggtgagtgcctatatacccgttacgcgtcccatacctgtgttataaaatcgg 17091975  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaa 223  Q
    ||||||  || |||||||||||||    
T  17091974 ggaaaactcatactcatatccaaa 17091951  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Original strand, 24710736 - 24711026
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || |  |||||||||    
T  24710736 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataatgtatcaacat 24710835  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||           || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  24710836 aaagtaattttttacatttgggacgggtttgagtatgggt-----------acctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaa 24710924  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||| ||||||||||| ||| |||   | | |||||||||||||||||    
T  24710925 aacccatactcatatccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgaatttggttcgggtggataatcacgggtgtgggttttgttgtcatgcc 24711024  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 40087678 - 40087425
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  40087678 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgatatatca 40087579  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||||| |||||||  | ||||||||| ||| |||| ||||||    
T  40087578 acataaagtaattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggtacctatattcccgttactcatcccatacctgtg-ttttgaatcgg 40087480  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    ||||||  || || |||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  40087479 ggaaaactcatacccatacccaaactcagtcaaaacggggaaaatccgtcaaatt 40087425  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 45866400 - 45866096
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45866400 tttaacatttgttagacagaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 45866301  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||| |||| || ||||| ||| ||| || |||| ||||||| | ||| | ||| |||||||||||||| |||||||    
T  45866300 acataaagtaattttttacatttgggatgggtatgggtatgagtttggggtgggtacctatatactcattacctgtctcatacccgtgttttgaaatcgg 45866201  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||| || |||| ||||| | | |||||| |||||||| ||||||| |||| || || ||||| |||||||| |   ||| |||||||||| ||    
T  45866200 ggaaaacccatacccatacccaaacctagtcaaaa-ggagaaaacccgtcaatttaggtttggctcgggcgggtaaccgcgagtatgggttttgttgcca 45866102  T
Q  300 tgccta 305  Q
    ||||||    
T  45866101 tgccta 45866096  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 5180919 - 5181218
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||| ||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5180919 tttaaaatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 5181018  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||| ||||||      ||||||| ||| || || | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  5181019 acataaaataattttttacatttggaacgggt------atgggtttggggtgggtgcctatatacccgttacccgtcccatacccgtattttgaaatcgg 5181112  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||| || |||| | ||| ||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||| |||||||| |||||||| |   ||| |||||||||| ||    
T  5181113 ggaaaacccatacccatacctaaacccagtcaaaatggggaaaacccgtcaaattgaatttggttcgggcgggtaaccgcgggtatgggttttgttgcca 5181212  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 307
Target Start/End: Original strand, 16408823 - 16409122
Alignment:
Q  4 aacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaaca 102  Q
    |||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||    ||    
T  16408823 aacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacata----ca 16408918  T
Q  103 taaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggga 202  Q
    |||| ||||||| | |||||||  |||||||   |||||||||||| |  |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16408919 taaagtaattttttacatttggagcgggtttagctatgggttcggggtcggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgttttgaaattgggga 16409018  T
Q  203 aaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgc 302  Q
    ||| ||| || |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | || | |||| | ||||||||   | ||| ||||||||||||||||    
T  16409019 aaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttgattcgag-gggtaaccgtgtgtatgggttttgttgtcatgc 16409117  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 35937031 - 35936821
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35937031 tttaacatttgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttgtaacacggaaattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 35936932  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||||| ||||   |||||||||            ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  35936931 cataaagtaattttctacattcatgacgggttt------------ggggtgggtacctatatacccgttatccgtcccatactcgtgatttgaaatcggg 35936844  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaa 223  Q
    ||||| ||||||||||| |||||    
T  35936843 gaaaacccaaactcatacccaaa 35936821  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 49741221 - 49741054
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||| ||  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  49741221 tttaacatttgttaaaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttataacacatcaattatcaaacaaaataacataacatattaa 49741122  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgt 168  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  49741121 cataaagtagttttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgt 49741054  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 50426870 - 50426672
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    |||||||||||| |||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50426870 tttaacatttgtaagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 50426771  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||| ||| | ||||||||||||      ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  50426770 acataaagtaaatttttacatttgggacgg------gtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttatccgtctcatacccgtgttttgaaatcag 50426677  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3628202 - 3627995
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||| ||  ||| | |||||| |||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3628202 tttaacatttgttagacgtaatgatttagttgatccgttaaatattaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 3628103  T
Q  100 acataaattaattttctg--catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatc 197  Q
    ||||||| ||||||| |   |||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  3628102 acataaagtaattttttttacatttgggactggaatgagtatgggttcggggtgggtacctacatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatc 3628003  T
Q  198 ggggaaaa 205  Q
    ||||||||    
T  3628002 ggggaaaa 3627995  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 42439885 - 42439581
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  42439885 tttaacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatca 42439786  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||| | |||||  |||||||||||| || |||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||| | |||||    
T  42439785 acataaagtaattttttacatttgggatgagtttggatatgggttcggggtgggtacctatatacccgttactcgtcccatacccatgttttgagatcgg 42439686  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
      ||||  || || |||| |||||  || |||||| ||| |||||  ||||||||   || |||||||| || |||||||  |||| | |||||||| ||    
T  42439685 aaaaaattcatacccatacccaaactcagtcaaaatggaaaaaatttgtcaaattgagtttggttcgggcggataaccacgaatatggattttgttgcca 42439586  T
Q  300 tgcct 304  Q
    |||||    
T  42439585 tgcct 42439581  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 23966746 - 23966917
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataa-cacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||  | ||| |||||||||| |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23966746 tttaacatttgttagatggaatgatttagttgatactttaaatatcaatagtagtttttataaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatca 23966845  T
Q  100 acataaattaattttctg-catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgtta 170  Q
    ||||||| ||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  23966846 acataaagtaatttttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgtta 23966917  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 34060234 - 34060035
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttatta-taacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  34060234 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggttgtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acatatca 34060136  T
Q  100 acataaattaa-ttttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcg 198  Q
    ||||||| ||| |||| | || |||||||||      ||||||||||||  || |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34060135 acataaagtaatttttttacaattgggacgg------gtatgggttcggagtgggtacctatatacctgttatccgtctcatacccgtgttttgaaatcg 34060042  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 44632350 - 44632151
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  44632350 tttaacatttgttagacctattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacacgacaattgtcaaacaaaataatatggcatatcaa 44632251  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |      ||||||||  ||||| ||||| |||||  ||||| |||  | ||  |||  ||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  44632250 c-----gtaattttcgacatttaggacgagtttggatatggattcacggtggatacccatacacctgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgga 44632156  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 168
Target Start/End: Original strand, 13390356 - 13390455
Alignment:
Q  69 caattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgt 168  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||||| || |||| |||||||||||    
T  13390356 caattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgagttcggggtgggtacctatatacccgt 13390455  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 39616177 - 39616443
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    |||||||| |||||||  || |||||||| |  || || |||||||||||||| || |||| |||| |  ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  39616177 tttaacatctgttagacggaatgatttaactgatcatttaaatatcaatggtaatttttattaacatgataattagcaaacaaaataacatgacatatca 39616276  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||           || | |||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  39616277 acataaaataattttttacatttgggacgggtatgggtatgg-----------gtgcctatatacttgttacccgtcctatacccgtgttttgaaatagg 39616365  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacc 277  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||  || ||||||||| |||||  |||||||||   || |||||||| ||||||||    
T  39616366 ggaaaacccatactcatacccaaactcagtcaaaacggggaaaactcgtcaaattgagtttggttcgggcgggtaacc 39616443  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 172 - 305
Target Start/End: Original strand, 23968625 - 23968758
Alignment:
Q  172 ccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgg 271  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| || |||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||| | || |||||||| ||    
T  23968625 ccgtcccatacccgtgttttgaaaccggggaaaacccatacccatacccaaacccaatcaaaatggggaaaatccgtcaaattgggtttggttcgggcgg 23968724  T
Q  272 gtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    |||||| |   ||| |||||||||| ||||||||    
T  23968725 gtaaccgcgggtatgggttttgttgccatgccta 23968758  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 252
Target Start/End: Original strand, 34085217 - 34085361
Alignment:
Q  108 taattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaac 207  Q
    ||||||| | ||||| ||||| || || ||||||||||||| || |||| ||||  ||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||| |    
T  34085217 taattttttacatttaggacgagtatgggtatgggttcggggtgggtacatataaccccgttacccatcccatactcgtgttttgaaatcgggaaaaacc 34085316  T
Q  208 caaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaa 252  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  34085317 caaactcatatcctaacccagtcaaagcggagaaaacccgtcaaa 34085361  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 33293588 - 33293494
Alignment:
Q  158 tatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaa 252  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  33293588 tatatccccattacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgggaaaaacccaaactcatacccaaacccaatcaaaacggaaaaaattcgtcaaa 33293494  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 127
Target Start/End: Original strand, 2514681 - 2514769
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacat-atcaacataaattaattttctgcatttgggac 127  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  2514681 aaatatcaatggtagtttttattacacggcaattatcaaacaaaataacatgacatgttcaacataaaataattttatgcattcgggac 2514769  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10778664 - 10778528
Alignment:
Q  118 catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcata 217  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||  ||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |||||||||    
T  10778664 catttgagacgggtatgagtatgggttcggggtggatatctataaccccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgggaaaaacttaaactcata 10778565  T
Q  218 tccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
     ||||| ||| ||||| |||| |||| ||||||||||    
T  10778564 cccaaacccagtcaaagcggaaaaaacccgtcaaatt 10778528  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 35069976 - 35069851
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatcca 227  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || |||| |||||   ||||||| || | |||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  35069976 gggtttgagtatgggttcggggtgggtacatatatccctgttacccgtcttgtacccgtattatgaaatcggggaaaactcaaactcatacccaaatcca 35069877  T
Q  228 atcaaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
     |||||  ||||||| ||||||||||    
T  35069876 gtcaaattggagaaactccgtcaaat 35069851  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 179 - 306
Target Start/End: Original strand, 13020646 - 13020773
Alignment:
Q  179 atacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacca 278  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| |||| |||||||||| |||||| |||   || |||||||   |||||||     
T  13020646 atactcgtgttttgaaatcggggaaaacccatacccataaccaaacccagtcaagacggagaaaacccgtcagattgagtttggttcggacaggtaaccg 13020745  T
Q  279 catatataggttttgttgtcatgcctaa 306  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  13020746 cagatataggttttgttgtcatgcctaa 13020773  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16237391 - 16237296
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaa 223  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||| | ||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16237391 gggtttgggtatgggttcggggttagtacatatatcctcgttacccgtcccttacccgtattttgaaatcggggaaaacccaaattcatatccaaa 16237296  T

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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 212
Target Start/End: Original strand, 39219234 - 39219344
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||||| || |||| | ||| |||||||   || || |||||||||||| |||||||||    
T  39219234 ataaattaattttctacatttagaacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacatgtatccccgttacttgttccgtacccgtgttttaaaatcgggg 39219333  T
Q  202 aaaaaccaaac 212  Q
    |||| ||||||    
T  39219334 aaaacccaaac 39219344  T

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Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 48125795 - 48125683
Alignment:
Q  103 taaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggga 202  Q
    |||||| ||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||||| ||  ||| ||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| || |    
T  48125795 taaattgattttctacattcgcgacgagtttgggtatgggttcggggtggatacctatatcctcgttacccgtcccgtacccgtgttttaaaatcaggaa 48125696  T
Q  203 aaaaccaaactca 215  Q
    ||| |||||||||    
T  48125695 aaatccaaactca 48125683  T

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Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19003723 - 19003628
Alignment:
Q  158 tatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| || ||| |||| ||||| | | ||||| ||| ||||| |||||||||    
T  19003723 tatatccccgttatccgtcccatacccgtattttgtaatcggggaaaacccgaacccatacccaaacctagtcaaatcggggaaaacccgtcaaat 19003628  T

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Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 305
Target Start/End: Original strand, 20774654 - 20774745
Alignment:
Q  214 catatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||    
T  20774654 catacccaaacccagtcaaaacggggaaaatccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgagtatgggttttgttgccatgccta 20774745  T

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Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41477063 - 41476944
Alignment:
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||| | ||||||||||||| ||| ||| ||||  |||||   ||    
T  41477063 aaattgattttctgctttcgggacgggtttgggtatggattcggggtgggtacatatatccacgttatccgtcccgtactcgtattttccaatcgaaaaa 41476964  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaa 223  Q
    || |||||||||||| ||||    
T  41476963 aacccaaactcatattcaaa 41476944  T

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Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 142
Target Start/End: Original strand, 20774575 - 20774649
Alignment:
Q  69 caattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaatta-attttctgcatttgggacgggtttgagtatggg 142  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  |||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  20774575 caattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggtttgggtatggg 20774649  T

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Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 215
Target Start/End: Original strand, 38686673 - 38686751
Alignment:
Q  137 tatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactca 215  Q
    |||||||||||| || |||| ||||  |  ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  38686673 tatgggttcggggtgggtacatataaccatgttattcgtcccatacccgtattttaaaatcggggaaaatccaaactca 38686751  T

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Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 243
Target Start/End: Original strand, 2514811 - 2514875
Alignment:
Q  180 tacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcata-tccaaatccaatcaaaacggagaaaa 243  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||    
T  2514811 tacccgtgttttgaaattggggaaaacccaaactcataccccaaacccaatcaaaacggggaaaa 2514875  T

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Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 254
Target Start/End: Original strand, 13798290 - 13798366
Alignment:
Q  178 catacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| ||| | ||| ||||| |||| |||||    
T  13798290 catacccgtgttttgaaatcgggaaaaacccaaactcatacccaaacccagtcataccggggaaaacccgttaaatt 13798366  T

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Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 266
Target Start/End: Original strand, 16903515 - 16903663
Alignment:
Q  118 catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcata 217  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||||| ||| ||| |  |||| ||| |||||||| |||| ||| |||| | |||| |||     
T  16903515 cattcgggacgggtttgggtatgagttcggggtgggtacctatatccccattacctatcccgtactcgtgttttaaaattgggaaaaatctaaacccatg 16903614  T
Q  218 tccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcg 266  Q
     ||||| |||||||||  |  ||||||||||||| || |||| ||||||    
T  16903615 cccaaacccaatcaaagtgaggaaaatccgtcaacttggatttggttcg 16903663  T

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Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12718858 - 12718764
Alignment:
Q  129 ggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaa 223  Q
    |||||| |||||||||| || || |||| |||||  |||||| ||||| | ||| ||| || | ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12718858 ggtttgggtatgggttcagggtgggtacatatatttccgttacccgtctcgtacacgtattatgaaatcggggaaaatccaaactcatacccaaa 12718764  T

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Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 13020562 - 13020648
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttatta-taacacggcaattatcaaacaaaata 86  Q
    ||||| ||||||||||  || ||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  13020562 tttaatatttgttagacggaatgatttagttgatactttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 13020648  T

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Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 234
Target Start/End: Original strand, 36617387 - 36617469
Alignment:
Q  153 gtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgttttt-aaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaa 234  Q
    |||| ||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  36617387 gtacctatattctcgttattcgtcccgtacccatgtttttgaaatcgtggaaaactcaaactcatatctaaacccaatcaaaa 36617469  T

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Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 185 - 277
Target Start/End: Original strand, 13390456 - 13390547
Alignment:
Q  185 gtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacc 277  Q
    ||||||| |||||||||||||  || || |||| ||||| ||| ||||||||| | ||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||    
T  13390456 gtgttttgaaatcggggaaaattcatacccatacccaaacccagtcaaaacgg-ggaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaacc 13390547  T

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Target: chr5 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 61)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 4582992 - 4583300
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4582992 tttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 4583091  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||||| ||| || | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  4583092 acataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggtttggggtgggaacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgg 4583191  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||    ||||  ||||||||| ||    
T  4583192 ggaaaacccatacccatatccaaacccaatcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgtggatatgagttttgttgcca 4583291  T
Q  300 tgcctaatt 308  Q
    |||||||||    
T  4583292 tgcctaatt 4583300  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 40 - 305
Target Start/End: Original strand, 4920738 - 4921004
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagta 138  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  4920738 aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggta 4920837  T
Q  139 tgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgga 238  Q
    |||||||||| ||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||||||||||    
T  4920838 tgggttcggggtggatacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccatacccataaccaaacccagtcaaaacgga 4920937  T
Q  239 gaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    ||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||    
T  4920938 gaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgccta 4921004  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 308
Target Start/End: Original strand, 40517683 - 40517987
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  40517683 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 40517782  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||   |||||||||    
T  40517783 aaaataattttttacctttgggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtaactatatacccgttacccatcccatacccgtgttttgggatcggggaa 40517882  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| || |||| ||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||    
T  40517883 aacccatacccatacccaaacccagtcaaaacgggaaaaatccgtcaaattgaatttggttcaggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcc 40517982  T
Q  304 taatt 308  Q
    |||||    
T  40517983 taatt 40517987  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 15890080 - 15890385
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| | || || | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15890080 tttaacatttgttagacgtaattatttaattgatccttcaaatatcaatggtagttttcattaatatgacaattatcaaataaaataacatgacatatca 15890179  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  15890180 acataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggg-tgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgg 15890278  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
     ||||| ||| || |||| ||||| | | |||||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||| |   ||| |||||||||||||    
T  15890279 agaaaacccatacacatagccaaacctagtcaaaacgggaaaaacccgtcaaattggatttggttcgggcgggtaaccgcgagtatgggttttgttgtca 15890378  T
Q  300 tgcctaa 306  Q
    |||||||    
T  15890379 tgcctaa 15890385  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17853507 - 17853232
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17853507 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acatatca 17853409  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||  || |||  |||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  17853408 acataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggagtgggtatctatatatccgttacccgtcccatacccgtg-tttgaaatcgg 17853310  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacc 277  Q
    |||||| ||| |  |||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  17853309 ggaaaacccatatccatacccaaacccaatcaaaacggggaaaacccgtcaaattaggtttggttcaggtgggtaacc 17853232  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 5908871 - 5908599
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  5908871 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtt 5908772  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    || ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||  || || |||| ||||| ||||||||    
T  5908771 tgggtatgggtttggggtgtgtacatatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaactcatacccatacccaaacccaatcaa 5908672  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    || || ||||| |||||||||| | || |||||||| || |||||||   ||| | |||||||| ||||||||    
T  5908671 aatggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcggataaccacgggtatggattttgttgccatgccta 5908599  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 12447255 - 12447546
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  12447255 tttaacatttgttagatcgattgatttaactgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatattaa 12447354  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| || ||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||| || |||| ||||||||| ||| | |||||||||| |||||||  ||||  |    
T  12447355 cataaagtagttttctatatttgggacgggtttgggtataggttcggggtgggtacctatatacccattacctgtcccatacctgtgttttacaatcaag 12447454  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
    ||||| ||||||            ||| |||||| || |||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||   ||| |||||||||| |||    
T  12447455 gaaaacccaaac------------ccagtcaaaatggggaaa-tccgtcaaattgggtttggttcgggtgggtaaccacgggtatgggttttgttgccat 12447541  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 12866729 - 12866471
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatat-gacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagt 137  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||    
T  12866729 aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatagacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggt 12866630  T
Q  138 atgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgg 237  Q
    ||||||||| | || |||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||  || || |||| ||||| ||| |||||| ||    
T  12866629 atgggttcgcggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccatgttttgaaatcggagaaaactcatacccatacccaaacccagtcaaaatgg 12866530  T
Q  238 agaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttg 296  Q
     ||||| |||||||||| |||| |||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12866529 ggaaaacccgtcaaattggatttggttcggacgggtaaccacatgtatgggttttgttg 12866471  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 18206891 - 18207196
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaa-ttatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  18206891 tttaatatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcattagtagtttttataacacggcaaattattaaacaaaataacatggcatatca 18206990  T
Q  100 acata-aattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcg 198  Q
    ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||| |||| | ||||||||| || ||||| ||||||    
T  18206991 acatagaagtaattttctacattcgggacgggtttgaatatgggttcggg-tgggtacctatatacctgttacctgtcccatacacgagttttgaaatcg 18207089  T
Q  199 gggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtc 298  Q
     |||||| ||||||||||  ||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| | || |||| ||||||||||||||   |||  ||||||||| |    
T  18207090 aggaaaacccaaactcatgcccaaacccagtcaaaacgggaaaaacacgtcaaattgggtttggtttgggtgggtaaccacgggtatgagttttgttgcc 18207189  T
Q  299 atgccta 305  Q
    |||||||    
T  18207190 atgccta 18207196  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 2412941 - 2412688
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||  ||||| |||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2412941 tttaatatttgttagaccgattaatttagttgctcctttaaatatcaattgtagtttttatgacacaacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 2412842  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
     ||||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||    
T  2412841 tataaagtaattttctgcatacgggacgagtttgggtattggttcaggatgggtacatatatacccgttatttatcccatacccgtgttttgaaattggg 2412742  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
     ||||  ||||| |||| |||||  ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2412741 aaaaattcaaacccatacccaaactcaatcaaaatggggaaaatccgtcaaatt 2412688  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 305
Target Start/End: Original strand, 30996477 - 30996773
Alignment:
Q  9 ttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaat 107  Q
    ||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||     
T  30996477 ttgttagacggaatgatttatttgatcctttaaatatcaacggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacttaaag 30996576  T
Q  108 taattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaac 207  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| || || ||||||| || |||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |    
T  30996577 taattttttacatttgggacgggtttgggtgtgtgttcggggtgggtacctatatacccgttacctgtcccatactcgtgttttaaaatcggagaaaacc 30996676  T
Q  208 caaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    || ||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||  || |||||  | |||| |||||||||| ||||||||    
T  30996677 catactcatacccaaacccagtcaaaacgg-gaaaatccgtcaaattgggtttggttcggacggataaccgtagatatgggttttgttgccatgccta 30996773  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 6156134 - 6155829
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataac-acggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||| || || |||| || | | ||||||||||||||||||| ||| ||||| |    
T  6156134 tttaacatttgttagacggaatgatttatttgctcctttaaatatcaatgatattttttattaccatgacaattatcaaacaaaataacatgtcatataa 6156035  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||| ||||||||||||| || |||| ||||||||  ||| | |||| ||||||||||||| |||||||    
T  6156034 acataaagtaattttcaacatttgtgacggttttgggtatgggttcggggtgggtacatatatacc--ttacctgtcctatacccgtgttttgaaatcgg 6155937  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| |||||| |||| ||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||||| |||| ||| ||||||| ||||| ||  |||  ||||||||| ||    
T  6155936 ggaaaacccaaacacatacccaaacccagtcaaaacgaagaaaacccgttaaatttgatttggtacgggtggataaccgcaggtatgagttttgttgcca 6155837  T
Q  300 tgcctaat 307  Q
    ||||||||    
T  6155836 tgcctaat 6155829  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12834791 - 12834495
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatat-gacatatc 98  Q
    ||||||||||||||||   |  |||||||||  || || ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12834791 tttaacatttgttagacgtaacgatttaattgatcattcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatagacatatc 12834692  T
Q  99 aacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcg 198  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||| |  |||| |||||||| |||| |||||||||| || |||||| |||| |    
T  12834691 aacataaattaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtaggtacctatatacctgttacccgtcccatatccatgttttgaaattg 12834592  T
Q  199 gggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgtt 295  Q
    | ||||| ||| || |||| ||||| ||| |||||| || ||||| ||||||||||   || |||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  12834591 gagaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaatggggaaaacccgtcaaattgagtttggttcggacgggtaaccacatgtatgggttttgtt 12834495  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22695084 - 22694817
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  22695084 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacattacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtt 22694985  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    || ||||||||||||| || |||| | |||||||||||  |||||||||||||| |||| | ||||||| ||| ||| || |||| ||||| ||| | ||    
T  22694984 tgggtatgggttcggggtgggtacctctatacccgttagtcgtcccatacccgtattttgagatcgggg-aaacccatacccatacccaaacccagttaa 22694886  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatg 301  Q
    |||||  ||| ||||||||||| | || |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||    
T  22694885 aacgggaaaattccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatg 22694817  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35194204 - 35194014
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||    
T  35194204 tttaacattttttagaccaattgatttagtttattctttaaatatcaatggtagtttttataacacagcaattatcaaacaaaataacatagcatattaa 35194105  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttt 191  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35194104 cataaagtaattttctacattcgggacgggtttgagtatgagtttggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttt 35194014  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 42987691 - 42987391
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  42987691 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 42987592  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  42987591 aaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcgggatgggtacctatatatccgttacacgtcccatacccgtgttttgagatcggggaa 42987492  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| || | || |||||  || |||||||||  |||| ||| ||||||  ||| |||||||  || | |||||  |||| |||||||||| ||||||    
T  42987491 aatccatacccgtacccaaactcagtcaaaacgggaaaaacccgccaaattgaatttggttcggacggat-accacgaatatgggttttgttgccatgcc 42987393  T
Q  304 ta 305  Q
    ||    
T  42987392 ta 42987391  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 29246167 - 29245866
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaatt-attccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatc 98  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||| |||| || ||||||||||||||||  |||| ||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  29246167 tttaacatttgttagacggaatgatttaattgattcatt-aaatatcaatggtagtgtttattaacataacaattatcaaacaaaataacatgacatacc 29246069  T
Q  99 aacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcg 198  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||| |||| || ||||||||| ||| || |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  29246068 aacataaaataattttttacatttgggatgggtatgggtatgggtttggggtgggtacctatatacatgttattcgtcccatacccgtgttttgaaatcg 29245969  T
Q  199 gggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtc 298  Q
    | |||||  || || |||| ||||| | | ||||||||| ||||| ||||||||||   || |||||||| |||||||| |   ||| ||||||||||||    
T  29245968 gagaaaactcatacccatacccaaacctagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgagtttggttcgggcgggtaaccgcgggtatgggttttgttgtc 29245869  T
Q  299 atg 301  Q
    |||    
T  29245868 atg 29245866  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 35311696 - 35311991
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  35311696 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acatatca 35311794  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||  || |||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  35311795 acataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggagtgggtacctatatatctgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgg 35311894  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
             | |  |||| |||||  || |||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||| |||||||| |  ||||  ||||| ||||||    
T  35311895 ---------atatccatacccaaactcagtcaaaacggaaaaaatccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgcggatatgagttttattgtca 35311985  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38006684 - 38006473
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  38006684 tttaacaattgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatgacatattaa 38006585  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||| || |||| |||||| | ||||  |||||||||||||| |||| |||| |||    
T  38006584 cataaattaattttcaacattcgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatatctgttacgcgtcccatacccgtattttgaaattggg 38006485  T
Q  201 gaaaaaccaaac 212  Q
    ||||| ||||||    
T  38006484 gaaaacccaaac 38006473  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13402218 - 13401914
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13402218 tttaacatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatagtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acatatca 13402120  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| |  || |||||||||  || |||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||    
T  13402119 acataaagtaattttttacatttgggacgggtatcggt-tgggttcggagtgggtacctaaatacccgttacccgttccatacccgtgtttgaaaatcgg 13402021  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    | ||||  || || |||| ||||| | | |||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||| |||||||| |   ||| |||||||||| ||    
T  13402020 gaaaaactcatacccatacccaaacctagtcaaaacggaaaaaatccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgcgggtatgggttttgttgcca 13401921  T
Q  300 tgcctaa 306  Q
    |||||||    
T  13401920 tgcctaa 13401914  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 3573098 - 3573243
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  3573098 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttgaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacagaataacatgacatatcaa 3573197  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcg 146  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  3573198 cataaaataattttctacattcgggaggggtttgagtatgggttcg 3573243  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 2985021 - 2985225
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2985021 tttaatatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacacaacaattatcaaataaaataacatgacatatcaa 2985120  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
     ||||| |||||||||  ||| | ||| | |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||| || |||||||     
T  2985121 tataaaataattttctatattcgagacagatttgggtatggtttcgggatgagtacctatatacccgttacccgtcccaaacccatgtcttgaaatcgga 2985220  T
Q  201 gaaaa 205  Q
    |||||    
T  2985221 gaaaa 2985225  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 30115357 - 30115525
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||| ||  ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  30115357 tttaacatttgttagactgatcgatttagttgctcctttaaatataaatggtggtttttataacacggcaattatcaaacaaaataacatagcatatcaa 30115456  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgtt 169  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  30115457 cataaaataattttatgcattcgggacgggtttgaatatgggttcgggatgggtaccaatatacccgtt 30115525  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6092701 - 6092468
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||    
T  6092701 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacattgcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggatt 6092602  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    || ||||||||||||| || |||| |||||||||||           |||||||||||| | |||||| |||| ||| || |||| ||||| ||||||||    
T  6092601 tgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgt-----------tacccgtgttttgagatcgggaaaaacccatacccatacccaaacccaatcaa 6092513  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacc 277  Q
    ||||| ||||| |||| |||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  6092512 aacggggaaaacccgttaaattgaatttggttcgggcgggtaacc 6092468  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 153 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 33728064 - 33727912
Alignment:
Q  153 gtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaa 252  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33728064 gtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaatccatacccatatccaaacccaatcaaaacggggaaaatccgtcaaa 33727965  T
Q  253 ttagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    || | || |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||    
T  33727964 ttgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgccta 33727912  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 1218630 - 1218812
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  1218630 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttttaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acaaatcaa 1218728  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccataccc 184  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||  || |||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  1218729 cataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggagtgggtacctatatacccgttacctgtcccataccc 1218812  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 20973660 - 20973410
Alignment:
Q  42 atatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatg 140  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||           ||||    
T  20973660 atatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataccatgacatatcaacataaagtaattttttacatttggg-----------tatg 20973572  T
Q  141 ggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggaga 240  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||||||||| ||    
T  20973571 ggttcggggtgggtacctatatacccgttacccatcccatacccgtgtttgaaaatcggggaaaacccatacccataaccaaacccagtcaaaacgggga 20973472  T
Q  241 aaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgc 302  Q
    ||| |||||| | | | || |||||||| |||||||| |   ||| |||||||||| |||||    
T  20973471 aaacccgtcagaatgggtttggttcgggcgggtaaccgcgggtatgggttttgttgccatgc 20973410  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 27088566 - 27088420
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27088566 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacataacaattatcaaacaaaataacat-acatatcaa 27088468  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcggg 148  Q
    |||||| ||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  27088467 cataaaataattttctacattcgagacgggtttgggtatgggttcggg 27088420  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 6369569 - 6369874
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  || || ||| ||||| ||||||| | || |||| |  |||||||||||||||||| | |||  ||||    
T  6369569 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttaaacatcaacggtagttttcattaacatgataattatcaaacaaaataacacgacgcatca 6369668  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| || |||||||| ||| |||| ||||| |    
T  6369669 acataaagtaattttttacattttggacgggttaaagtatgggttcggggtgggtacatatatacacgtta-ccctcccatactcgtattttgaaatcag 6369767  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    ||||||  || || |||  |||||  |||||||||||   |||| |||||||||||| || |||||| | ||||||||| | ||||  ||||||||||||    
T  6369768 ggaaaactcatacccatgcccaaactcaatcaaaacgagaaaaaaccgtcaaattaggtttggttcgagcgggtaaccataaatatgagttttgttgtca 6369867  T
Q  300 tgcctaa 306  Q
    |||||||    
T  6369868 tgcctaa 6369874  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 8453587 - 8453389
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| | ||||||| ||||||||||  | ||||||| ||    
T  8453587 tttaacatttgtttgaccgaatgatttagttactcctttaaatatcaatggtaatttttataacatgacaattattaaacaaaata--acgacatattaa 8453490  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacg-ggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||  || ||| || |||| |||||| | |||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  8453489 cataaactaattttctacatttgggacgagttttgagtatgactttggggtgtgtacctatatatctgttacccatcccatacccgtgttttgaaatcgg 8453390  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27302948 - 27302746
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||  || ||  ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  27302948 tttaacatttgttagatggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtacgtagta--acatgacaattatcaaacaaaataacatgacatattaa 27302851  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||| | | ||||||||| || ||| ||||| |||||| || |||| ||||||   |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  27302850 cataaagtaattttttacgtttgggacgtgtatgactatggattcggggtgggtacctatatatttgttatccgtctcatatccgtgttttgaaatcggg 27302751  T
Q  201 gaaaa 205  Q
    |||||    
T  27302750 gaaaa 27302746  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 28045528 - 28045719
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat--aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatc 98  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||  ||||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28045528 tttaacatttgttagacgtaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttatttaacataacaattataaaacaaaataacatgacatatc 28045627  T
Q  99 aacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttt 191  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  28045628 aacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggg-tgggtacctatatacccgttacccgtcccatattcgtgtttt 28045719  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 305
Target Start/End: Original strand, 10127062 - 10127252
Alignment:
Q  108 taattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaac 207  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||       |||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  10127062 taattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgt-------cccatacccgtgttttgagatcggggaaaacc 10127154  T
Q  208 caaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    || || |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||| || |||||||   ||| | |||||||||||||||||    
T  10127155 catacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattggatttggttcgggcggataaccacgggtatggattttgttgtcatgccta 10127252  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 252
Target Start/End: Original strand, 38972897 - 38973047
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |  |||||||||| |||||| ||||||||     
T  38972897 ataaattgattttatgcatttgagatgggtttgagtatgggttcggggtgggtacctatattcccgttacctatcccatacccatgttttgaaatcggga 38972996  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaa 252  Q
    |||| ||||||||||| | ||| ||| ||||||||| ||||| | ||||||    
T  38972997 aaaacccaaactcatacctaaacccagtcaaaacggggaaaacctgtcaaa 38973047  T

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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16311407 - 16311204
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||||  |||| | ||| ||||||| |||||||||||| || |||| ||||| || |||||||||| | ||| |||||||| |||||||      
T  16311407 ataaattgattttcaacattcgagacaggtttgaatatgggttcggggtgggtacctatatccctgttatccgtctcgtactcgtgttttgaaatcggaa 16311308  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatg 301  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||||||||||| || ||||| || ||||| || |  ||||  |||||||||| |||    
T  16311307 aaaactcaaactcatatccaaacccaatcaaagcgggaaaaaaccgtcaaattaggtttggttcaggcgggtacccgcggatatgagttttgttgttatg 16311208  T
Q  302 ccta 305  Q
    ||||    
T  16311207 ccta 16311204  T

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Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 215
Target Start/End: Original strand, 15564578 - 15564724
Alignment:
Q  69 caattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgt 168  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||    
T  15564578 caattttcaaaaaaaataacatgacatatcaatgtaaagtaattttctacattcgggacgagtttgagtatgagttcgggatgaatacagatatacccgt 15564677  T
Q  169 tatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactca 215  Q
    || || |||||||| | | | || |||||||| |||| |||||||||    
T  15564678 tacccatcccatacgcatttcttgaaatcgggaaaaacccaaactca 15564724  T

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Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 42717847 - 42717703
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatc-aaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| ||| |||    
T  42717847 tttaacatttgttagaccggttgatttagtttctcctttaaatatcaatgatagtttttataacacgacaattatcaaaacaaaatatcatggcatgtca 42717748  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttc 145  Q
    |||| || ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||    
T  42717747 acat-aagtaattttctgcattcaggacggatttgagcatgggttc 42717703  T

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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 3564943 - 3564797
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3564943 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acatatca 3564845  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgg 147  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||| |||||| ||  |||||||||||    
T  3564844 acataaagtaattttttacatttggaacgggtatggatatgggttcgg 3564797  T

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Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 216
Target Start/End: Original strand, 6810133 - 6810247
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||| || |||||||||| | |||||||||    
T  6810133 ataaattgattttcaccattcgggatgggtttgggtatgggttcggggtgagtacttatatcctcgttacccgttccgtacccgtgttctaaaatcgggg 6810232  T
Q  202 aaaaaccaaactcat 216  Q
    |||| ||||||||||    
T  6810233 aaaacccaaactcat 6810247  T

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Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 33862398 - 33862270
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||| ||  || || |||||||||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  33862398 tttaacatttgttagccc-attgatttagttggtcatttaaatatcaatcgtagtttttacaacatgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 33862300  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacggg 130  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  33862299 cataaaatagttttctgcattcgggacggg 33862270  T

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Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 131 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28569106 - 28568984
Alignment:
Q  131 tttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatc 230  Q
    |||| ||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||    
T  28569106 tttgggtatgggttcggggtgggtacctatatccccgttacccgtcccgtacccgcattttgaaatcggggaaaatccaaactcatacccaaacccagtc 28569007  T
Q  231 aaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    ||| | | ||||| |||||||||    
T  28569006 aaatcagggaaaacccgtcaaat 28568984  T

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Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 199
Target Start/End: Original strand, 17153144 - 17153241
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    |||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  17153144 ataaattgattttctacattcgggacgggtttgggtatgggtttgggatgagtacatatatcatagttatccgtcccgtacccatgttttaaaatcgg 17153241  T

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Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12773909 - 12773822
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactca 215  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||| |||||  |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  12773909 gggtttgagtatgggttcgaggtgggtacatatatctccgttatccgtcccgtacccgtattttgaaatcggagaaaacccaaactca 12773822  T

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Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 40187770 - 40187621
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||| ||| ||| ||| ||| |||||  |||||| ||||| |  ||||||||||| |||| ||||    
T  40187770 ataaattaattttctatattcgggacgagtttgggtatgagtttggg-tgaatacctatatctccgttacccgtctcgcacccgtgttttgaaattgggg 40187672  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaa 252  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||| ||||| ||  ||||| ||||||||    
T  40187671 aaaacccaaactcatttccaaacccagtcaaagcgaggaaaacccgtcaaa 40187621  T

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Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 33420494 - 33420402
Alignment:
Q  52 tagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttc 145  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||    
T  33420494 tagtttttataacacgacaattatcaaataaaataacatgacatatcaatataaaat-attttctacattcaagacgggtttgggtatgggttc 33420402  T

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Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27900515 - 27900379
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||| | |||| ||| ||| |||| ||||||||||| |||| |||| ||||| | | ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  27900515 ataaattgattttatacattcggggcggatttgggtatgggttcgagatgggtacctatatccacattacccgtcccatacccatgttttgaaatcggga 27900416  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgga 238  Q
    ||||  |||||  ||||||||| ||||| | ||||||    
T  27900415 aaaactcaaacctatatccaaacccaattataacgga 27900379  T

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Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 243
Target Start/End: Original strand, 39422394 - 39422462
Alignment:
Q  175 tcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaa 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  39422394 tcccatacccgtgttttgaaatcgagaaaaacccaaactcatatccaaacccaatcaaagcggggaaaa 39422462  T

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Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12712645 - 12712558
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactca 215  Q
    ||||||| ||||||||||| | || |||| |||||  |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  12712645 gggtttgggtatgggttcgaggtgggtacatatatctccgttatccgtcccgtacccgtattttgaaatcggagaaaacccaaactca 12712558  T

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Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 254
Target Start/End: Original strand, 2681217 - 2681343
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatcca 227  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  |||| |||| ||| ||| || |||| |||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||  ||    
T  2681217 gggtttgggtatgggttcggggtggatactcatatccccattacccatcccgtacctgtattttgaaatcggggaaaacccaaactcatgcccaaactca 2681316  T
Q  228 atcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
     ||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  2681317 gtcaaatcggggaaaacccgtcaaatt 2681343  T

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Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10822606 - 10822531
Alignment:
Q  136 gtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaa 211  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  10822606 gtatgggttcggggtgggtacatataaccccgttacccgtcctatacccgtgttttgaaatcggagaaaacccaaa 10822531  T

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Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 7350521 - 7350475
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcggg 148  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  7350521 ataaattaattttctacatttgagacgggtttaagtatgggttcggg 7350475  T

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Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 205
Target Start/End: Original strand, 8020591 - 8020693
Alignment:
Q  103 taaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggga 202  Q
    |||||| ||||||| ||||  | ||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| || |||| || | |  |||||||||||| ||||||||||    
T  8020591 taaattgattttctacattcagaacgggtttgcgtatgagttcgagatgagtacctatatccctgttacccattcagtacccgtgttttgaaatcgggga 8020690  T
Q  203 aaa 205  Q
    |||    
T  8020691 aaa 8020693  T

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Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32575052 - 32574942
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| || |||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||||| |||| ||||| |  |||| || |||| || | ||||||| |||||||||    
T  32575052 ataaattgatattctacattcggggcgggtttgggtttgggttcgggatgggtacatatatccatgttacccatcccgtatctgtgttttgaaatcgggg 32574953  T
Q  202 aaaaaccaaac 212  Q
    |||| ||||||    
T  32574952 aaaacccaaac 32574942  T

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Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 180 - 253
Target Start/End: Original strand, 43523801 - 43523874
Alignment:
Q  180 tacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||  || ||||| |||  ||||||||||||||    
T  43523801 tacccgtattttgaaatcggggaaaacccaaactcatacccaaactcagtcaaatcgggaaaaatccgtcaaat 43523874  T

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Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23045071 - 23044984
Alignment:
Q  136 gtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaa 223  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||  |||||| || |||| ||||||| |||| ||||||||||||| | |||| |||| |||||    
T  23045071 gtatgggttcggggtgggtacatatatctccgttacccatcccgtacccgtattttgaaatcggggaaaacctaaacccatacccaaa 23044984  T

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Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 204
Target Start/End: Original strand, 12457492 - 12457594
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||  ||||||    |||| | ||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  12457492 ataaattgattttctacattcgggacgggtttgggtatgagttcggagtgagtgtttatatctatgttacctgtcccatacccgtattttgaaatcgagg 12457591  T
Q  202 aaa 204  Q
    |||    
T  12457592 aaa 12457594  T

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Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18116553 - 18116480
Alignment:
Q  180 tacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||  || ||||| |||  ||||||||||||||    
T  18116553 tacccgtattttgaaatcggagaaaacccaaactcatacccaaactcagtcaaatcgggaaaaatccgtcaaat 18116480  T

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Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 274
Target Start/End: Original strand, 24207711 - 24207830
Alignment:
Q  154 tacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaa- 252  Q
    ||||||||| || ||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||  ||||| |||| |||||  |||||||| ||| |||||  |||||||     
T  24207711 tacttatatccctgttattcgttcgatacctgtgttttgaaatcggggaaaactcaaacccatacccaaactcaatcaaagcgg-gaaaaatcgtcaaac 24207809  T
Q  253 ttagattcggttcgggtgggta 274  Q
    |||| || ||||||||||||||    
T  24207810 ttag-tttggttcgggtgggta 24207830  T

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Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 103 - 254
Target Start/End: Original strand, 29664947 - 29665095
Alignment:
Q  103 taaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggga 202  Q
    |||||| ||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||   || |||| ||||| ||||||| || ||   |||||||||||| |||||  |||    
T  29664947 taaattgattttgtacattcgggacgggtttgggtatgagttcgaagtgggtacctatatccccgttacccatcatgtacccgtgttttgaaatc--gga 29665044  T
Q  203 aaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
     || |||||||||||  ||||  |||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  29665045 gaacccaaactcatacacaaactcaatcaaagcgga-aaaacccgtcaaatt 29665095  T

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Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 203
Target Start/End: Original strand, 30116816 - 30116856
Alignment:
Q  163 acccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30116816 acccgttaaccgtcccatactcgtgttttgaaatcggggaa 30116856  T

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Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 38006468 - 38006396
Alignment:
Q  229 tcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatg 301  Q
    |||||| |||||||| |||||||||  |||| |||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  38006468 tcaaaatggagaaaacccgtcaaatcggatttggttagggcgggtaacaacaggtataggttttgttgccatg 38006396  T

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Target: scaffold0036 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 33267 - 33577
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||| |||||||||  |||||| |||||||||||| ||| ||| ||||    
T  33267 tttaacaattgttagaccgattgatttagttgttcctttaaatatcaatcgtagtttttataacacaacaattaccaaacaaaataacatggcatgtcaa 33366  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33367 cataaagtagttttctgcattcgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggg 33466  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatcca------atcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgt 294  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| |||      ||||||||||  |||| ||||||||||   ||  |||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  33467 gaaaacccaaacccatacccaaacccaaacccgatcaaaacgggtaaaacccgtcaaattgagtttagttcaggtgggtaaccacggatataggttttgt 33566  T
Q  295 tgtcatgccta 305  Q
    || ||||||||    
T  33567 tgccatgccta 33577  T

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Target: chr2 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19105055 - 19104747
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||  || || ||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||    
T  19105055 tttaacatttgttagaccgatcgatttagttgctcttttaaatatcgatagtagtttttataacacggcaattattaaacaaaataacatgacacgtcaa 19104956  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccata----cccgtgtttttaaat 196  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||  ||| |||||||||||||  | |||||||    |||||||||  ||||    
T  19104955 cataaagtaattttctgcattcgggacgggtttgagtatggattcgaggtggatacctatatacccgttacacatcccatacaggcccgtgtttggaaat 19104856  T
Q  197 cggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttg 296  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||||| | || | ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19104855 cggggaaaacccaaactcatacccaaacccaatcaaaacggaaaaaacccatcaaattgggtttgattcggattggtaaccacatgtataggttttgttg 19104756  T
Q  297 tcatgccta 305  Q
     ||||||||    
T  19104755 ccatgccta 19104747  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24414308 - 24414046
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagta 138  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||| |||    
T  24414308 aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggta 24414209  T
Q  139 tgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgga 238  Q
    |||||||||| || |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| | | || |||| ||||| |||||||||||||     
T  24414208 tgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaaccgatacccatacccaaacccaatcaaaacggg 24414109  T
Q  239 gaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatg 301  Q
    ||||| |||||||||| | || |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||| ||||    
T  24414108 gaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacaggtatgggttttgttgccatg 24414046  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Original strand, 13830614 - 13830914
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattata-acacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  13830614 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttatttacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 13830713  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  13830714 aaagtaattttttacatttgggacaggtttgagtatgggttcggggtgggtacttatatacccgtta-ccgtcccatacccgtgttttgagatcgaggaa 13830812  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| || |||| ||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||| ||    
T  13830813 aacccatacccatacccaaacccagtcaaaatggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgtcatacc 13830912  T
Q  304 ta 305  Q
    ||    
T  13830913 ta 13830914  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 34 - 309
Target Start/End: Original strand, 30846852 - 30847129
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctg-catttgggacgggt 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| |  || |||||||||||    
T  30846852 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttttacaattgggacgggt 30846951  T
Q  132 ttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatca 231  Q
    ||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| |||    
T  30846952 ttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtca 30847051  T
Q  232 aaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaattt 309  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  30847052 aaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcctaattt 30847129  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 31942400 - 31942095
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  31942400 tttaacatttgttagaccgactgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcag 31942301  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgttttt-aaatcgg 199  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||| ||| || ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  31942300 cataaagtagttttctgcatttgtgacaggtttggttatgggtttggggtgggtacttatatacctgttacccgtctcatacccgtgtttttgaaatcga 31942201  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    ||| || |||||| |||||||||| ||| ||||| |||  |||| || |||||||   || |||| ||| ||||||||||   ||| |||||||||||||    
T  31942200 ggataacccaaacccatatccaaacccagtcaaagcgggaaaaacccatcaaattgagtttggtttgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgtca 31942101  T
Q  300 tgccta 305  Q
    | ||||    
T  31942100 taccta 31942095  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 36128289 - 36128013
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctg-catttgggacgggt 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||||    
T  36128289 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggt 36128190  T
Q  132 ttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatca 231  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||  | ||||||||||   || || |||| ||||| ||| |||    
T  36128189 ttgggtatgggttcggggtgagtacctatatacccgttacccatcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaccacatacccatacccaaacccagtca 36128090  T
Q  232 aaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaatt 308  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || |||||||  | ||||||||   ||| |||||||||| |||||||||||    
T  36128089 aaacggggaaaatccgtcaaattaggtttggttcggacgagtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcctaatt 36128013  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 7314863 - 7314609
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| |  | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  7314863 tttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgatatttatcaaacaaaataacatgacatatca 7314764  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  7314763 acataaaataattttttacatttgggacgggtgtgggtatgggttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtcccatactcgtattttaaaatcgg 7314664  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    |||||| ||| || |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  7314663 ggaaaacccatacccatatccaaacccagtcaaaacggggaaaatccgtcaaatt 7314609  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 8916129 - 8915848
Alignment:
Q  24 atttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcattt 122  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  8916129 atttagttaatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataattttttacattt 8916030  T
Q  123 gggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||| | ||||| ||| || |||||||||    
T  8916029 gggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgttttgagatc-gagaaaacccatacccatatccaa 8915931  T
Q  223 atccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    |  || |||||||||  |||||||||||||||  ||| | || ||| || ||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||    
T  8915930 actcagtcaaaacgggaaaaatccgtcaaattgaatttgatttgggcggataaccacaggtatgggttttgttgccataccta 8915848  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 45256697 - 45256999
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| |||||||||||||| || |||| |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  45256697 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtaatttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacaagacatatca 45256796  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    | ||||| ||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  45256797 aaataaagtaattttttacatttgggacgggtttaggtatgggttcggggtgggtacttatatacccattaaccgtctcatacccgtgttttgaaatcgg 45256896  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    ||||||  || ||||||||||| | ||| |||||||||  ||||||| | ||||  |||| ||||| |  |  |||||||| |||| | |||||||||||    
T  45256897 ggaaaactcatactcatatccacacccagtcaaaacgggaaaaatccattaaatctgatttggttcagacgactaaccacagatatggattttgttgtca 45256996  T
Q  300 tgc 302  Q
    |||    
T  45256997 tgc 45256999  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6028104 - 6027811
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttatt-ataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  6028104 tttaacatttgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagttttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggcttatca 6028005  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| || |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||| |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  6028004 acataaaatacttttctgcattcaggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgtctcatacccatgttttaaaatcgg 6027905  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||||||            ||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||| || |||||||   ||| |||||||||||||    
T  6027904 ggaaaacccaaac------------ccaatcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcggataaccacgagtatgggttttgttgtca 6027817  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 37106573 - 37106871
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  37106573 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-atatatca 37106671  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||      ||||||||||  || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  37106672 acataaagtaattttttacatttgggacgggt------atgggttcggagtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgg 37106765  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||| || |||| |||||  || ||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||| |||||||| |   |||  ||||||||||||    
T  37106766 ggaaaacccatacccatacccaaactcagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgcgagtatgagttttgttgtca 37106865  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 45115432 - 45115701
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    |||||||||| |||||   | ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45115432 tttaacatttattagacaaaatgatttaattgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 45115531  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||  ||||||| | ||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||     
T  45115532 acataatgtaattttttacatttgggatgggtttaactatgggttcgggatgggtacctatatacctgttacccgtctcatacccgtgttttgaaatcga 45115631  T
Q  200 ggaaaaacc--aaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgg 267  Q
    ||||||  |  | || |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  45115632 ggaaaactcatatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattggatttggttcgg 45115701  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 10208612 - 10208339
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| | |||||||||| ||||    
T  10208612 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatattaacataaagtaattttttacatttgggactggtt 10208513  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    |||||||||||||||| |  |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||| | || |||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||||    
T  10208512 tgagtatgggttcggggtaggtacctatatatccattacccgtcccatacccgtgttttaagattggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaa 10208413  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaat 307  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  || |||||||| || ||| |||   |||  ||||||||| ||||||||||    
T  10208412 aacggggaaaa-ccgtcaaattaactttggttcgggcggataatcacgggtatgagttttgttgccatgcctaat 10208339  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 308
Target Start/End: Original strand, 37999396 - 37999659
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagta 138  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  37999396 aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggta 37999495  T
Q  139 tgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgga 238  Q
    || ||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||      |||| |||| ||| | ||| |||||| ||     
T  37999496 tgagttcggggtgggtacttatatacccgttacccgtctcatacccgtgttttgagatcgggga------aaacccatacccatacccagtcaaaatggg 37999589  T
Q  239 gaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaatt 308  Q
    | ||| ||||||||||  ||| |||||||| |  |||||||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  37999590 ggaaacccgtcaaattgaatttggttcgggcgactaaccacggatatgggttttgttgccatgcctaatt 37999659  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 13705576 - 13705371
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13705576 tttaacatttgttatacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 13705477  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| |||||||   ||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||    
T  13705476 acataaagtaatttttcacatttgggacgggtttaggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacctgtctcatacccgtgttttgaaatcgg 13705377  T
Q  200 ggaaaa 205  Q
    ||||||    
T  13705376 ggaaaa 13705371  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 305
Target Start/End: Original strand, 9632293 - 9632565
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  9632293 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattataaaaaaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtt 9632392  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    || ||||||||||||| ||  ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| || ||||  |||| ||| ||||    
T  9632393 tgggtatgggttcggggtggatacctatatacccattacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaacccatacccatactcaaacccattcaa 9632492  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    |||||  |||| ||||||||||   || |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||    
T  9632493 aacgggaaaaacccgtcaaattgagtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgccta 9632565  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 42798200 - 42797911
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  42798200 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 42798101  T
Q  104 aaattaattttctg-catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggga 202  Q
    ||| ||||||| |  |||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||      |||||    
T  42798100 aaagtaatttttttacatttgggacaggtttgtgtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttacccgtctcatacccgtgtttt------gggga 42798007  T
Q  203 aaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgc 302  Q
    ||| ||| |||      |||| ||| ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||| |||||    
T  42798006 aaatccatact------caaacccagtcaaaacaga-aaaacccgtcaaattagatttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgc 42797914  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 12194042 - 12193766
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||  || |||| || ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12194042 tttaacatttgttagacggaatgatgtagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatca 12193943  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||  ||||| |||| | || |||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  12193942 acataaagtaattttttacatttgggacgggtatggatatggattcgaggtgggtatctatatacccattacccgtcccatacccgtgttctgaaatcgg 12193843  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaa-cggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaac 276  Q
    | ||||  || ||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| |||||||||| | || || |||||||||||||    
T  12193842 gaaaaacacatactcatacccaaacccagtcaaaatcgga-aaaacccgtcaaattgggtttggctcgggtgggtaac 12193766  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 14540660 - 14540860
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||  ||||| |||||||    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14540660 tttaacatttgttagactgattgatttagttgctcctttaaatatc----gtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 14540755  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||||| | || ||||||| ||||||||||| ||| |  || || | ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14540756 cataaagtaattttctacgttcgggacggatttgagtatggattccgagtgggtgcctatatacccgttacctgtctcatacccgtgttttgaaatcggg 14540855  T
Q  201 gaaaa 205  Q
    |||||    
T  14540856 gaaaa 14540860  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 44746322 - 44746047
Alignment:
Q  3 taacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataac-acggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaac 101  Q
    ||||||||||||||  || | ||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |   |||| |||||| ||||||| ||| ||||||||     
T  44746322 taacatttgttagacggaataatttatttgctcctttaaatatcaatgatagtttttataaccattacaatgatcaaataaaataacatggcatatcaag 44746223  T
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |   || |||| ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  44746222 ataaagtgattttctacatttgggacgggtttgagtatgagtttgaagtgggtacatatatacccattacccgtcccatattcgtgttttgaaatcgggg 44746123  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacc 277  Q
    |||| |||||  |||| |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| | || ||| |||||||||||||    
T  44746122 aaaacccaaatccatacccaaactcaatcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggtacgggtgggtaacc 44746047  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Original strand, 10920523 - 10920817
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  10920523 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 10920622  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||  ||| ||||       |||||||||||||| |||||||| | |||||  ||    
T  10920623 aaagtaattttttacatttgggacggatttgggtatgggttcggggtggatacctata-------tatccgtcccatactcgtgttttgagatcggaaaa 10920715  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| || |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |  ||||||| |||| |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||    
T  10920716 aatccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacctatcaaattggatttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcc 10920815  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 37472838 - 37472698
Alignment:
Q  136 gtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaac 235  Q
    |||||||||||   || |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||||    
T  37472838 gtatgggttcgaagtgggtacctaaatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaatccatactcatacccaaacccagtcaaaac 37472739  T
Q  236 ggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaac 276  Q
    || ||||| ||||||||||   || |||||||| |||||||    
T  37472738 ggggaaaacccgtcaaattgagtttggttcgggcgggtaac 37472698  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 179 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 18106155 - 18106029
Alignment:
Q  179 atacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattaga-ttcggttcgggtgggtaacc 277  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| | || || | |||||| ||||||||    
T  18106155 atacccgtgttttgagatcggggaaaacccatacccatatccaaacccagtcaaaacggggaaaatccgtcaaaattgagtttgattcgggcgggtaacc 18106056  T
Q  278 acatatataggttttgttgtcatgcct 304  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||    
T  18106055 acatatatgagttttgttgtcatgcct 18106029  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16226941 - 16226761
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| ||  |  || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  16226941 tttaacatttcttagaccaattgatttagttgctaatttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaataaaataacatgacaaatcaa 16226842  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttt 191  Q
    ||| || | | ||||||||||  | ||||||||| |||||          |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16226841 catgaagt-agtttctgcattccgaacgggtttgggtatg---------agagtacctatatacccgttacccgtcccatacccttgtttt 16226761  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 38342606 - 38342501
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatcca 227  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||| || |||| |||| |||||||||||||  ||||| |||||||||| |||    
T  38342606 gggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccccgttacccgtcccgtatccgtattttaaaatcggggaaaactcaaacccatatccaaaccca 38342507  T
Q  228 atcaaa 233  Q
    ||||||    
T  38342506 atcaaa 38342501  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 259
Target Start/End: Original strand, 13531925 - 13532081
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||| | ||||| |  |||  || || |||||| || ||  ||    
T  13531925 ataaattgattttctacatgtggggcgggtttgagtgtgggttcggggtgaatacatatatcctcgttacctatccagtatccatgttttgaa-tcatgg 13532023  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagatt 259  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  13532024 aaaattcaaactcatacccaaatccaataaaagcagagaaaatccgtcaaattagatt 13532081  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 18106301 - 18106162
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || |  |||||||||    
T  18106301 acatttgttagacaaaatgatttaattgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataatgtatcaacat 18106202  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggt 143  Q
    ||| ||||||| | ||||||| || |||| | ||||||||    
T  18106201 aaaataattttttacatttggaacaggttcgggtatgggt 18106162  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 35248489 - 35248367
Alignment:
Q  111 ttttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaa 210  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||| || |||| | ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    
T  35248489 ttttctacattcaggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctttatcccctttacccgtcccatacccgtgttttgtaatcgtggaaaacccaa 35248390  T
Q  211 actcatatccaaatccaatcaaa 233  Q
    || | || |||||  ||||||||    
T  35248389 acccgtacccaaactcaatcaaa 35248367  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 253
Target Start/End: Original strand, 15546726 - 15546871
Alignment:
Q  108 taattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaac 207  Q
    ||||||| | ||||||||| |||| || |||||||||| || || |||  ||||  |  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  15546726 taattttttacatttgggaagggtatgggtatgggttcagggtgggtatatataaccatgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaacc 15546825  T
Q  208 caaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    ||||| |||  ||| ||||| ||||| ||| |||||  ||||||||    
T  15546826 caaacccatgcccagatccagtcaaagcggggaaaactcgtcaaat 15546871  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24051703 - 24051586
Alignment:
Q  136 gtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaac 235  Q
    ||||||||||||| |  |||| ||||| || |||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||  |||||| |||| ||||| ||||| ||| |    
T  24051703 gtatgggttcggggtaggtacatatatccctgttacccgtcccatactcgtattttaaaatcggagaaatcccaaacccatacccaaacccaattaaatc 24051604  T
Q  236 ggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  24051603 ggagaaaatccatcaaat 24051586  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 37472944 - 37472857
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttatta-taacacggcaattatcaaacaaaataa 87  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  37472944 tttaacatttgttagacagaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataa 37472857  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 267
Target Start/End: Original strand, 12341648 - 12341741
Alignment:
Q  174 gtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgg 267  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| || |||| |||||  || ||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||    
T  12341648 gtcccatacctgtgttttgaaatcggggaaaacccatacccatacccaaactcagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgg 12341741  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 205
Target Start/End: Original strand, 14331529 - 14331606
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaa 205  Q
    ||||||| ||||||||||||  || |||| ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  14331529 gggtttgggtatgggttcggagtgggtacatatatccccgttacccgtcccatacctgtatttttaaataggggaaaa 14331606  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Original strand, 22900788 - 22900885
Alignment:
Q  120 tttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcata 217  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||| || |||  ||||  |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||    
T  22900788 tttgggacgggtatgggtatgagttcggggtgggtatatataaccccgttactcgtcccatacccgtgttttgaaatcgggaaaaacccaaacccata 22900885  T

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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 205
Target Start/End: Original strand, 25210355 - 25210456
Alignment:
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||||| ||||||| |||| |||| ||||||  ||||||||| ||| || |||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  25210355 aaattgattttctacattcgggaggggttttggtatgggtttggggtgggtacatatatcctcgttacccgtcccatacccgtgttttaaagtcgggaaa 25210454  T
Q  204 aa 205  Q
    ||    
T  25210455 aa 25210456  T

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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 205
Target Start/End: Original strand, 35965311 - 35965413
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||  || |||| | ||| ||| |||  | | ||||||||||||||| |||||||||    
T  35965311 ataaattgattttctacattcgggacgggtttgggtatgggttcggagtgggtacatgtatccccattacacat-ccatacccgtgttttgaaatcgggg 35965409  T
Q  202 aaaa 205  Q
    ||||    
T  35965410 aaaa 35965413  T

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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 233
Target Start/End: Original strand, 30978913 - 30979032
Alignment:
Q  112 tttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaa 211  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||  ||| ||||| | ||||||||   || ||||||| |||| |||||||| |||| |||||    
T  30978913 tttctacatttgggtagggtttgggtatgggttcggggtggatacatatatcctcgttatcct--ccgtacccgtattttgaaatcgggaaaaacccaaa 30979010  T
Q  212 ctcatatccaaatccaatcaaa 233  Q
    ||||||| |||| ||| |||||    
T  30979011 ctcatattcaaacccagtcaaa 30979032  T

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Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 205
Target Start/End: Original strand, 43371555 - 43371632
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaa 205  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| || |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  43371555 gggtttgggtatgagtttggggtgggtacatatatccccgttacccgtcccgtacccgtattttaaaatcggggaaaa 43371632  T

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Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 217
Target Start/End: Original strand, 40359320 - 40359435
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||| | |||||| ||  |||||||||||  ||||| |||| |||| ||||| || ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||     
T  40359320 ataaattgattttttacatttgagagaggtttgagtattagttcgagatgggtacctatatccctgttatccatctcataccggtgttctaaaatcggga 40359419  T
Q  202 aaaaaccaaactcata 217  Q
    |||| | |||||||||    
T  40359420 aaaacctaaactcata 40359435  T

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Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 40734632 - 40734545
Alignment:
Q  167 gttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  ||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  40734632 gttacccgtctcatacccgtgtttgaaaatcgctgaaaacccaaattcatacccaaaccaaatcaaagcggataaaacccgtcaaatt 40734545  T

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Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Original strand, 44057884 - 44057990
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttc-gggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatcc 226  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||| ||||||| |||| || |||| ||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||    
T  44057884 gggtttgggtatgggttcgggggtgggtacatatatccccattacccgtcccgtaccggtattttgaaatcagggaaaatccaaactcgtacccaaaccc 44057983  T
Q  227 aatcaaa 233  Q
    | |||||    
T  44057984 agtcaaa 44057990  T

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Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4961564 - 4961479
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtg 187  Q
    ||||||| |||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||||| | || |||| ||||| || ||||  |||||||||||||||    
T  4961564 ataaattcattttctatattcgggacgagtttgggtatgggttcgaggtgtgtacctatatccctgttacacgtcccatacccgtg 4961479  T

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Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 112 - 212
Target Start/End: Original strand, 18485634 - 18485734
Alignment:
Q  112 tttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaa 211  Q
    ||||||||||||||   |||||| |||||||||| || || |||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||| |||| |||||| ||| || |||||    
T  18485634 tttctgcatttgggtaaggtttgggtatgggttcagggtgggtacatatatccccgttacccgtactgtacccgtattttaaaatcgaggataacccaaa 18485733  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  18485734 c 18485734  T

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Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 153 - 253
Target Start/End: Original strand, 26755767 - 26755867
Alignment:
Q  153 gtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaa 252  Q
    |||| ||||| |||||||  ||||| |||||| | |||| ||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||| |||  |||| ||||||||    
T  26755767 gtacatatatccccgttaatcgtccgatacccatattttaaaatcgaagaaaacccaaactcatacccaaacccagtcaaatcgggaaaaacccgtcaaa 26755866  T
Q  253 t 253  Q
    |    
T  26755867 t 26755867  T

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Target: chr6 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 2367199 - 2367505
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||     
T  2367199 tttaacatttgttagacaaaatgatttagtttatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcc 2367298  T
Q  100 acataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgg 199  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  2367299 acataaagtaattttttccatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcgg 2367398  T
Q  200 ggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    |||||| ||| || |||| ||||| | | |||||||||  |||| || ||||||| | || |||||||  ||||||||||  |||| |||||||||| ||    
T  2367399 ggaaaacccatacccatacccaaacctagtcaaaacgggaaaaacccatcaaattgggtttggttcggacgggtaaccacggatatgggttttgttgcca 2367498  T
Q  300 tgcctaa 306  Q
    |||||||    
T  2367499 tgcctaa 2367505  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 40 - 301
Target Start/End: Original strand, 32853756 - 32854018
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagta 138  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  32853756 aaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggta 32853855  T
Q  139 tgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgga 238  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||||||||||    
T  32853856 tgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccatacccataaccaaacccagtcaaaacgga 32853955  T
Q  239 gaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatg 301  Q
    ||||| |||||||||| | || |||||||  || |||||||   ||| |||||||||| ||||    
T  32853956 gaaaacccgtcaaattgggtttggttcggtcggataaccacgggtatgggttttgttgccatg 32854018  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 12678297 - 12678000
Alignment:
Q  12 ttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaat 111  Q
    ||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  12678297 ttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgataatttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaatataaaataat 12678198  T
Q  112 tttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaa 211  Q
    |||||  ||| |||||||||||| |||||||||| || || |||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||  ||||    
T  12678197 tttctcaattcgggacgggtttgggtatgggttcagggtgggtacctatataccctttacccgtcccatacctgtgtcttgaaatcggggaaaacgcaaa 12678098  T
Q  212 ctcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaattt 309  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| | ||| |  ||| || ||||| |||||||||||||   ||| || |||| || ||||||||||||    
T  12678097 ctcatacccaaacccagtcaaaacggcgaaaacctgtcgagataggtttggttcaggtgggtaaccacggttatgggatttgctgccatgcctaattt 12678000  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 34 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5863565 - 5863302
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  5863565 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaatatttttttacatttgggacgggtt 5863466  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    || ||||||||||| | || |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||||    
T  5863465 tgggtatgggttcgaggtgggtatctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaa 5863366  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttg 296  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | || ||||||||  |||||||||   ||| ||||||||||    
T  5863365 aacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcaggtaaccacgggtatgggttttgttg 5863302  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24603070 - 24602778
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  24603070 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgtcaattatcaaacaaaataacatggcacatcaa 24602971  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||||| |||| | || ||||||| ||||||||||||| || |||  |||||||| |||| ||||| ||||||| |||||| ||||| ||    
T  24602970 cataaagtaattttctacattcgtgatgggtttgggtatgggttcggggtgggtatctatatacctgttacccgtcacatacccatgttttgaaatctgg 24602871  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt-agattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtca 299  Q
    ||||| ||||||            ||| ||||||| | ||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||    
T  24602870 gaaaacccaaac------------ccagtcaaaacagggaaaaaccgtcaaattgagtttc-gttcgggtgggtaaccacgtgtatggattttgttgtca 24602784  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7394101 - 7393890
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  7394101 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcctttaaatatcaatgttagtttttataacacggtaattatcaaacaaaataatatgatataccaa 7394002  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||| ||| ||||||  ||| | ||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| ||||||||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  7394001 cataaaataaatttatgcattcaggatgagtttgagtatgggttcggggtggatacctatatacccattatccgtctcttactcgtgttttgaaatcggg 7393902  T
Q  201 gaaaaaccaaac 212  Q
    ||||| ||||||    
T  7393901 gaaaatccaaac 7393890  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 14505960 - 14506171
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||  |||||  |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14505960 tttaacatttgttagactgattgatttagttgctcctttcaatatcaatgttagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacgtgacatatcaa 14506059  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| || ||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14506060 cacaaagtagttttctgcatttgggacgggtttaagtatgggttcggggtgggtacctaaatacttgttacccgtcccatacctgtgttttgaaatcggg 14506159  T
Q  201 gaaaaaccaaac 212  Q
    ||||| ||||||    
T  14506160 gaaaacccaaac 14506171  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Original strand, 12141262 - 12141563
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| || | | ||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  12141262 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgttagtttttattaagatgacaattatcaaacaaaataacataacgtatcaacat 12141361  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||| | || ||||||    
T  12141362 aaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgtcacccgtcccatatccgtgttttgagattggggaa 12141461  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| || | || ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||| |||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||    
T  12141462 aacccatacccgtacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgaatttggttcgggcgggtaaccataggtatgggttttgttgccatgcc 12141561  T
Q  304 ta 305  Q
    ||    
T  12141562 ta 12141563  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 3484105 - 3483833
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| || | | ||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  3484105 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaagatgacaattatgaaacaaaataacataacatatccacataaagtagttttttacatttgggacgggtt 3484006  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||||    
T  3484005 tgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccatcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaacccatacacatacccaaacccagtcaa 3483906  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | || |||||||| |||||||||    ||| |||||||||| ||||||||    
T  3483905 aacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccatgagtatgggttttgttgccatgccta 3483833  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 30816131 - 30816398
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |  ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  30816131 tttaacatttgttagaccgattgatttaggtgctcctttaaatgtcaatggtagtttttataacacggcaattatccaacaaaataacatcacatatcaa 30816230  T
Q  101 cataaatta---attttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatc 197  Q
    |||||| ||    |||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||| || || | ||||||||| ||| || |||||||||||||  ||||||      
T  30816231 cataaagtagtttttttttgcattcgggacgggtttggatatgggttcggggtgggttcctatatacccattacccatcccatacccgtg--tttaaaat 30816328  T
Q  198 ggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgg 267  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| | || |||||||    
T  30816329 ggggaaaactcaaacccatatccaaacccaatcaaaacggggaaaatccatcaaattgggtttggttcgg 30816398  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 89 - 305
Target Start/End: Original strand, 32532502 - 32532718
Alignment:
Q  89 atgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgt 188  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  32532502 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccattacccgtcccatacccgtgt 32532601  T
Q  189 ttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatatagg 288  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||||||  |||| ||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| | || ||| || ||||| || |||| |     
T  32532602 tttgaaatcggggaaaacccatactcatactcaaacccaatgaaaacggaaaaaacccgtcaaattggatttgatttgggcggataaccgcagatatgga 32532701  T
Q  289 ttttgttgtcatgccta 305  Q
    |||||||||||||||||    
T  32532702 ttttgttgtcatgccta 32532718  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 306
Target Start/End: Original strand, 27534596 - 27534863
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagta 138  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||| |||    
T  27534596 aaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggta 27534695  T
Q  139 tgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgga 238  Q
    ||| |||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||  || || |||| ||||| |||||||||||||     
T  27534696 tggattcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaactcatacccatacccaaacccaatcaaaacggg 27534795  T
Q  239 gaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaa 306  Q
    ||||| ||||||||||   || |||||||  || |||||||   ||| |||||||||| |||||||||    
T  27534796 gaaaacccgtcaaattgagtttggttcggacggttaaccacgggtatgggttttgttgccatgcctaa 27534863  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 10142729 - 10142428
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  10142729 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 10142630  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | |||||||||| |||||| ||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  10142629 aaaataattttttacatttgggacaggtttgggtatgagttcggggtgggtacctatatacccgttacctgtcccatacccgttttttgagatcggggaa 10142530  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| || |||| ||||| ||| ||||||||  ||||| ||| ||||||   || |||||| | || ||||||||  ||| |||||||||| ||||||    
T  10142529 aacccatacccatacccaaacccagtcaaaacgaggaaaacccgccaaattgagtttggttcgagcggataaccacaagtatgggttttgttgccatgcc 10142430  T
Q  304 ta 305  Q
    ||    
T  10142429 ta 10142428  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 306
Target Start/End: Original strand, 24225604 - 24225883
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  24225604 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtt 24225703  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcat------atccaaatcc 226  Q
    || | ||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||| || |||      | ||||| ||    
T  24225704 tgggcatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatatccgtgttttgagatcggggaaaatccatacccatacccaaacccaaaccc 24225803  T
Q  227 aatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaa 306  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||  ||| |||||||  |||||||||    |||  |||||||||||||||||||    
T  24225804 aatcaaaacggggaaaacctgtcaaattgaatttggttcggacgggtaaccatgggtatgagttttgttgtcatgcctaa 24225883  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 277
Target Start/End: Original strand, 27738678 - 27738922
Alignment:
Q  34 tccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  27738678 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcatacaaaataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtt 27738777  T
Q  133 tgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaa 232  Q
    || ||||||||||||| || |||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||| | ||| ||| ||||    
T  27738778 tgggtatgggttcggggtgggtacatatatatctgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaacccatacccatacctaaacccagtcaa 27738877  T
Q  233 aacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacc 277  Q
    |||||  |||| || |||||||  ||| ||||||||  |||||||    
T  27738878 aacgggaaaaacccatcaaattgaatttggttcgggcaggtaacc 27738922  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 10188284 - 10187991
Alignment:
Q  5 acatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacat 103  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||||| || | ||||||||||    
T  10188284 acatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcgaacaaaataacataatatatcaacat 10188185  T
Q  104 aaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaa 203  Q
    ||| ||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||       |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  10188184 aaaataattttttacatttgggatgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatac-------ccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaa 10188092  T
Q  204 aaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcc 303  Q
    || ||| || |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||    
T  10188091 aacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcc 10187992  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 14032430 - 14032577
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14032430 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacacaacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 14032529  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcggg 148  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14032530 cataaagtaattttatgcatttgggacgggtttgggtatgggttcggg 14032577  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 278
Target Start/End: Original strand, 11762358 - 11762596
Alignment:
Q  40 aaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtat 139  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  11762358 aaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatataacaaaataacatggcatatcaacataaagtaattttctacatttgggatgggtttgggtat 11762457  T
Q  140 gggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggag 239  Q
    | ||||||| ||   || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| |||| | |||  |||||||||| ||| | |||| || |    
T  11762458 gagttcggggtggacacctatatacccgttacccgtcccatacccttgtttagaaatcgggaaaaacctaaatccatatccaaacccagtaaaaatgggg 11762557  T
Q  240 aaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacca 278  Q
    |||| |||||||||| ||||  ||||||| | |||||||    
T  11762558 aaaacccgtcaaattggattgtgttcgggcgagtaacca 11762596  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 69 - 308
Target Start/End: Original strand, 12309514 - 12309759
Alignment:
Q  69 caattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgt 168  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||| |||||||| ||    
T  12309514 caattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatcggttcggggtgggtacatatatacctgt 12309613  T
Q  169 tatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaa------tcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcgg 262  Q
    || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||||      |||||| || |||||  ||||||||| | |  ||    
T  12309614 tacccgttccatacccgtgttttgaaatcagggaatacccatacccatacccaaacccaaacccagtcaaaatggggaaaactcgtcaaattgggtctgg 12309713  T
Q  263 ttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaatt 308  Q
    |||||| |||||||| |   ||| || |||||||||||||||||||    
T  12309714 ttcgggcgggtaaccgcgggtatggggtttgttgtcatgcctaatt 12309759  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 14254832 - 14255109
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||   ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  14254832 tttaacatttattagaccgaatgatttaatcgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacacatcaaatttcaaacaaaataacatgacatatcaa 14254931  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| | ||| | |||||||||||||  |||| ||||||||||  | || |||| |||||  ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| |     
T  14254932 cataaagttattatttgcatttgggacgaatttgggtatgggttcatggtgggtacctatatttccgttacacgtcccatacccgtg-tttgaaatcaga 14255030  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccac 279  Q
    |||||  ||||| |||| ||||| ||| ||||||||  ||||||| |||||| | | || | |||| ||||||||||||    
T  14255031 gaaaactcaaacccatacccaaacccagtcaaaacgaggaaaatctgtcaaaatgggtttgattcgagtgggtaaccac 14255109  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 254
Target Start/End: Original strand, 32053031 - 32053209
Alignment:
Q  70 aattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgtt 169  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||    
T  32053031 aattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtatttttttacattttggacgggtttgggtatgggtttggggtgggtacatatatacccgtt 32053130  T
Q  170 atccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    | |||||||||| || |||||| ||||||||||      |||| |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32053131 acccgtcccatatccatgttttgaaatcgggga------aaacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaatt 32053209  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 254
Target Start/End: Original strand, 15498315 - 15498451
Alignment:
Q  118 catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcata 217  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||    
T  15498315 catttgggacgggtttgggtgtgggttcgggatgggtacctatatacccattacctgtctcatacccgtgttttgaaatcggggaaaacccatatccata 15498414  T
Q  218 tccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
     ||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  15498415 cccaaacccattcaaaacggagaaaacccgttaaatt 15498451  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 243
Target Start/End: Original strand, 29341239 - 29341372
Alignment:
Q  110 attttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaacca 209  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||||  |||||| ||||| ||| ||| |||||  |||||||| |||| |||    
T  29341239 attttctacattcgggacgggtttgggtatgagtttgggatgggtacctatatctccgttacccgtctcatgcccatgtttgaaaatcgggaaaaaccca 29341338  T
Q  210 aactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaa 243  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29341339 aactcatatccaaacccaatcaaaacggagaaaa 29341372  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 157 - 306
Target Start/End: Original strand, 30986283 - 30986432
Alignment:
Q  157 ttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattag 256  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||| |||||  || ||||||||| ||||| ||||||||||      
T  30986283 ttatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccatacccatacccaaactcagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattga 30986382  T
Q  257 attcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaa 306  Q
     || |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||| |||||||||    
T  30986383 gtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcctaa 30986432  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 217
Target Start/End: Original strand, 20349039 - 20349154
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||| ||||||| || |||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20349039 ataaattaattttttacatttgcaacggatttgggtatgagttcggggtgggtacctatatccccgttactcgtcccatacccgtgttttgaaatcgggg 20349138  T
Q  202 aaaaaccaaactcata 217  Q
    |||| |||||||||||    
T  20349139 aaaatccaaactcata 20349154  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14410946 - 14410865
Alignment:
Q  124 ggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaa 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14410946 ggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatctgggaaaa 14410865  T

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Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 14411047 - 14410961
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataa 87  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14411047 tttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaatgatggtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 14410961  T

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Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 256604 - 256461
Alignment:
Q  103 taaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggga 202  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||| ||||| | ||||| |||||| ||||||||||    
T  256604 taaattgattttctacatttaggaggggtttgggtatgggtttggggtgggtacctatatgcccattacccgtctcgtacccatgttttgaaatcgggga 256505  T
Q  203 aaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatcc 246  Q
    |||  |||||||||| |||||  ||| |||| ||| ||||||||    
T  256504 aaactcaaactcatacccaaacacaaccaaagcggggaaaatcc 256461  T

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Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 1947904 - 1947753
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||| ||| ||  ||| ||||| |||||  | | ||| |    
T  1947904 ataaattgattttctacatttggaacgagtttgagtatgggtttgagatgagtacatatat-cccattacccaccccgtacccctgtttcgatagcggtg 1947806  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaatt 254  Q
    |||| ||||||||||  || || ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  1947805 aaaacccaaactcattcccgaacccagtcaaaacgaagaaaatccgtcaaatt 1947753  T

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Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 254
Target Start/End: Original strand, 9442441 - 9442556
Alignment:
Q  138 atgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacgg 237  Q
    ||||||||||  || |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| || |||| ||||| ||| |||||||||    
T  9442441 atgggttcggagtgggtacctctatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgggaaaatcccatacccatacccaaa-ccagtcaaaacgg 9442539  T
Q  238 agaaaatccgtcaaatt 254  Q
     ||||| ||||||||||    
T  9442540 ggaaaacccgtcaaatt 9442556  T

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Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28079780 - 28079688
Alignment:
Q  131 tttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaa 223  Q
    |||| ||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  28079780 tttgggtatgggttcggggtgggtacctatatccccgttacccgtcccgtacccatgttttgaaatcggggaaaacccaaacccatacccaaa 28079688  T

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Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 253
Target Start/End: Original strand, 9458667 - 9458789
Alignment:
Q  131 tttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatc 230  Q
    |||| ||||| ||||| | || |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |||| |||||||   |||||||||| ||||| ||| ||    
T  9458667 tttgggtatgagttcgaggtgggtacatatatccccgttatctgtcccgtacccgtattttgaaattggggaaatctcaaactcatacccaaacccagtc 9458766  T
Q  231 aaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
    ||| ||| |||||||||||||||    
T  9458767 aaatcggggaaaatccgtcaaat 9458789  T

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Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 305
Target Start/End: Original strand, 32959836 - 32960026
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||| |||| || |||||||||||| ||||  |||    
T  32959836 ataaattgattttctacatttatgacggatttg-gtatgggttcggggtggatacctatatccccgttacccgttccgtacccgtgttttgaaattaggg 32959934  T
Q  202 aaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatg 301  Q
    |||| ||||||            ||||||||||||  |||||||||||||||||| || | |||||||||||| || ||| |||  ||| ||||||||||    
T  32959935 aaaacccaaac------------ccaatcaaaacgaggaaaatccgtcaaattaggtttgattcgggtgggtacccgcatgtatgagttatgttgtcatg 32960022  T

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Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 14245121 - 14245214
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgaca 94  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| |   ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  14245121 tttaacatttattagaccgaatgatttagtcgctcctttaaatattaatggtagtttttataacacgacaattttcaaacaaaataacatgaca 14245214  T

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Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 205
Target Start/End: Original strand, 13769047 - 13769150
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||| || || |||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  13769047 ataaattgattttctacattcaggacgggtttggatatgggttctgggtgggtacctatatgtccgttacccgtcccatacccatgttttgaagtcgggg 13769146  T
Q  202 aaaa 205  Q
    ||||    
T  13769147 aaaa 13769150  T

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Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 305
Target Start/End: Original strand, 31496465 - 31496612
Alignment:
Q  158 tatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattaga 257  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| |||||  | |||||||||||  || || |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||       
T  31496465 tatatacccgtcccccgtcccatacccatgtttcgagatcggggaaaactcatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgag 31496564  T
Q  258 ttcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    || |||| ||  ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||    
T  31496565 tttggtttggacgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgccta 31496612  T

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Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 305
Target Start/End: Original strand, 31501851 - 31501998
Alignment:
Q  158 tatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattaga 257  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| |||||  | |||||||||||  || || |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||       
T  31501851 tatatacccgtcccccgtcccatacccatgtttcgagatcggggaaaactcatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgag 31501950  T
Q  258 ttcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    || |||| ||  ||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||    
T  31501951 tttggtttggacgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgccta 31501998  T

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Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 217
Target Start/End: Original strand, 18908894 - 18908983
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcata 217  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| || |||| ||||| |  |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  18908894 gggtttgggtatgagtttggggtgggtacatatatccttgttacccgtcccatatccgtattttgaaatcggggaaaacccaaactcata 18908983  T

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Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14410853 - 14410782
Alignment:
Q  229 tcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcatg 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||  | || |||||||||||||||    
T  14410853 tcaaaacgg-gaaaatccgtcaaattagatttggtttggacgggtaaccacggacatgggttttgttgtcatg 14410782  T

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Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Original strand, 9458873 - 9458964
Alignment:
Q  142 gttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaa 233  Q
    ||||||| || |||| ||||| ||||||| || |||| ||||||| || ||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| |||||    
T  9458873 gttcggggtgggtacatatattcccgttacccatcccgtacccgtattattaaatcggggaaaacccagacccatacccaaacccagtcaaa 9458964  T

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Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29199970 - 29199888
Alignment:
Q  130 gtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaac 212  Q
    ||||| ||||||||||||| |   ||| ||||| || |||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  29199970 gtttgggtatgggttcggggtagatacatatatccctgttacccgtcccgtacccgtattttgaaatcggggaaaatccaaac 29199888  T

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Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 19367049 - 19367105
Alignment:
Q  167 gttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaa 223  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||| || ||||||||||    
T  19367049 gttacccgtctcatacccgtgttttaaaattggggaaaatccatacccatatccaaa 19367105  T

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Target: scaffold0294 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 14649 - 14956
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14649 tttaacatttgttaaaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttacaacacaataattatcaaacaaaataatatatcatatcaa 14748  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    ||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||  | || |||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||| |||||||     
T  14749 cattaaataattttctacatttgggacgagtttgggtatgtgttcaaggtgggtacctatatacccattatccgtcccatgcatgtgttttgaaatcgga 14848  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccacatatataggttttgttgtcat 300  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| || |||  ||||||||||| ||| |||| |||  ||||| ||| |||||    ||||||| |||    
T  14849 gaaaacccaaactcatacccaaatccagtgaaaactgaaaaaccccgtcaaattaaatttggtttgggcaggtaaacacttatatgaaatttgttgccat 14948  T
Q  301 gcctaatt 308  Q
    ||||||||    
T  14949 gcctaatt 14956  T

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Target: scaffold0022 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 90471 - 90743
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||  ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  90471 tttaatatttgttagaccgattgatttatttgctcctttaaatatcaatggttgttttaataacacatcaattattaaacaaaataacatggcatatcaa 90570  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||  |||| |||||||||||||  | ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  90571 cataaaataattttctgcattcaggacgaatttgtgtatgggttcggggagggtaccaatatacccgttaaccgtctcatacccgtgttttgaaatcggg 90670  T
Q  201 gaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaaccac 279  Q
    ||      |||| |||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||  ||||||| ||||||||||    
T  90671 ga------aaacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaatccgtcaaattgagtttagttcgggcgggtaaccac 90743  T

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Target: scaffold0007 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 197541 - 197337
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  197541 tttaatatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacaaggtaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 197442  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggg 200  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||  || |||| ||||| || ||||   ||| |||| ||||||||| |||| |||    
T  197441 cataaagtaattttctgcattcgggacgggtttgggtatagattcggtttgggtacctatatgcctgttacttgtctcatatccgtgttttgaaataggg 197342  T
Q  201 gaaaa 205  Q
     ||||    
T  197341 aaaaa 197337  T

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Target: scaffold0519 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0519
Description:

Target: scaffold0519; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 69 - 305
Target Start/End: Original strand, 10240 - 10468
Alignment:
Q  69 caattatcaaacaaaataatatgacatatcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgt 168  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||   || |||| |||||||| ||    
T  10240 caattatcaaacaaaataacat-acatatcaacacaaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcgtagtgggtacctatatacctgt 10338  T
Q  169 tatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcggg 268  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||     |||| ||||| | | |||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||     
T  10339 tatccgtcccatacccgtgtttggaaagcggg--aaaacc-----catacccaaacctagtcaaaacggaaaaaacccgtcaaattggatttggttcgga 10431  T
Q  269 tgggtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
      ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10432 caggtaaccgcatgtatgggttttgttgtcatgccta 10468  T

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Target: scaffold0135 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 36030 - 36216
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaatta--ttccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatc 98  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||     
T  36030 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacagttatcaaacaaaataacatgacatatt 36129  T
Q  99 aacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtt 189  Q
    |    |   |||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  36130 a----atggtaattttctgcattcgggacgggtttggttatgagtttgggatggatacctatatactcgttatccgtcctatacccgtgtt 36216  T

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Target: scaffold0027 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 6280 - 6412
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||| || ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  6280 tttaacatttgttagatcgattgatttagttgctcctttaaatttcaatggtaatttttatagcacgacaactatcaaacaaaataacatggcatatcaa 6379  T
Q  101 cataaattaattttctgcatttgggacgggttt 133  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  6380 cataaagtaactttctgcatttgagacgggttt 6412  T

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Target: scaffold0027; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 305
Target Start/End: Original strand, 7742 - 7874
Alignment:
Q  172 ccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgg 271  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| | || | |||| |||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||    
T  7742 ccgtctcatacccgtgttttgaaattggagaaaatctaa-cacatacccaaactcaatcaaaacggggaaaacccgtcaaattaaatttagttcgggtgg 7840  T
Q  272 gtaaccacatatataggttttgttgtcatgccta 305  Q
    ||||||||   ||| | |||||||| ||||||||    
T  7841 gtaaccacgggtatggattttgttggcatgccta 7874  T

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Target: scaffold0189 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:

Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 4130 - 4329
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattat-aacacggcaattatcaaacaaaataatatgacatatca 99  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4130 tttaacatttgttagatggaatgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 4229  T
Q  100 acataaatta-attttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcg 198  Q
    ||||||| ||  |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| |   || ||||  |||||| ||||| | ||| |||||||||||||| ||||||    
T  4230 acataaagtattttttttacatttgggacgagtttgggtatgggtttgaagtgggtacaaatatactcgttaccagtctcatacccgtgttttgaaatcg 4329  T

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Target: scaffold0097 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 33457 - 33691
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataacacggcaattatcaaa-ca---aaataatatgacata 96  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||   |||||| ||| ||||    
T  33457 tttaatatttgttacaccgactgatttaattgcttctttaaatatcaatggtagtttttataacacgaaaattatcaaatcaaataaataacatggcata 33556  T
Q  97 tcaacataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtactt------atatacccgttatccgtcccatacccgtg-tt 189  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||| ||||      ||||||  |||| ||||| |||||||||| ||    
T  33557 tcatcataaagtagttttctgcatttgtgacgggtttggttatgggtttggggtgaggacttatatacatatacatgttacccgtctcatacccgtgttt 33656  T
Q  190 tttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaat 224  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||    
T  33657 tttaaatcggagaaaacccaaacctatatccaaat 33691  T

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Target: scaffold0184 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Original strand, 2970 - 3081
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatcca 227  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || |||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  2970 gggtttgagtatgggttcggggtgggtacatatatcccagttatccgtcctgtacccgtattttgaaatcggggaaaacccaaactcatacccaaaccca 3069  T
Q  228 atcaaaacggag 239  Q
     ||||| |||||    
T  3070 gtcaaatcggag 3081  T

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Target: scaffold0157 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 277
Target Start/End: Original strand, 14900 - 14998
Alignment:
Q  180 tacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatcc-aaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgggtaacc 277  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  14900 tacccgtgttttgaaatcggggaaaacccaaactcataccctaaacccaatcaaagcggagaaaacccgtcaatttaaatttggttcgggagggtaacc 14998  T

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Target: scaffold0014 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14226 - 14098
Alignment:
Q  172 ccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgg 271  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||| |||| ||||||||  |||| |||||||||| | || |||| ||||||    
T  14226 ccgttccatacccgtgtttt-aaatcggggaaaactcaaactcatacccaaacccaaacaaaacgggaaaaacccgtcaaattgggtttggtttgggtgg 14128  T
Q  272 gtaaccacatatataggttttgttgtcatg 301  Q
    ||||||||   |||  ||||||||||||||    
T  14127 gtaaccacgagtatgagttttgttgtcatg 14098  T

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Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 14359 - 14295
Alignment:
Q  1 tttaacatttgttagatcgattgatttaattattccttgaaatatcaatggtagttattataaca 65  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14359 tttaacatttgttagaccgattgatttaattgttcctttaaatatcaatggtagtttttataaca 14295  T

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Target: scaffold0008 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 253
Target Start/End: Original strand, 67750 - 67875
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatcca 227  Q
    ||||||| |||| || ||||| || |||| ||||| ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||  |||| |||    
T  67750 gggtttgggtataggctcggggtgggtacatatatccccgttatccgtcccgtatccgtattttaaaatcggggaaaatccaaacccatactcaaaccca 67849  T
Q  228 atcaaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
     ||||| ||| ||||| | |||||||    
T  67850 gtcaaatcggggaaaacctgtcaaat 67875  T

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Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 253
Target Start/End: Original strand, 75593 - 75718
Alignment:
Q  128 gggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatcca 227  Q
    ||||||| |||| || ||||| || |||| ||||| ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||  |||| |||    
T  75593 gggtttgggtataggctcggggtgggtacatatatccccgttatccgtcccgtatccgtattttaaaatcggggaaaatccaaacccatactcaaaccca 75692  T
Q  228 atcaaaacggagaaaatccgtcaaat 253  Q
     ||||| ||| ||||| | |||||||    
T  75693 gtcaaatcggggaaaacctgtcaaat 75718  T

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Target: scaffold0013 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 128224 - 128103
Alignment:
Q  112 tttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaa 211  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| || |||| ||||| ||| ||| ||||||| ||||||| || | |||| ||  |||| |||||    
T  128224 tttctacatttgggtagggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccccattacccgtcccgtacccgtattatgaaattggaaaaaacccaaa 128125  T
Q  212 ctcatatccaaatccaatcaaa 233  Q
    ||||||  |||| |||||||||    
T  128124 ctcatactcaaacccaatcaaa 128103  T

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Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 105566 - 105498
Alignment:
Q  118 catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgt 186  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||| || |||| ||||| || |||| ||||||| |||||||    
T  105566 catttgggtagggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccctgttacccgtcccgtacccgt 105498  T

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Target: scaffold0795 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0795
Description:

Target: scaffold0795; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 308
Target Start/End: Original strand, 269 - 404
Alignment:
Q  172 ccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaatccaatcaaaacggagaaaatccgtcaaattagattcggttcgggtgg 271  Q
    |||||||||||||||||||| | || | ||||||   | || |||| |||||  || ||||||||||||||| ||||||| | || || ||||| || ||    
T  269 ccgtcccatacccgtgttttgagattgaggaaaactgatacccatacccaaactcagtcaaaacggagaaaacccgtcaattgagttt-ggttctggcgg 367  T
Q  272 gtaaccacatatataggttttgttgtcatgcctaatt 308  Q
    |||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  368 gtaatcacggatatgggttttgttgtcatgcctaatt 404  T

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Target: scaffold0198 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20852 - 20740
Alignment:
Q  102 ataaattaattttctgcatttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggg 201  Q
    ||||||| ||||| | |||| || ||||||||||||||||||||| | ||  || |||||| ||| ||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||     
T  20852 ataaattgattttttacattcggaacgggtttgagtatgggttcgaggtggatatttatatccccattacccgtctcatactcgagttttgaaatcggga 20753  T
Q  202 aaaaaccaaactc 214  Q
    |||| ||||||||    
T  20752 aaaatccaaactc 20740  T

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Target: scaffold0005 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 223
Target Start/End: Original strand, 211367 - 211460
Alignment:
Q  130 gtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcatatccaaa 223  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||| ||||| || |||| ||||| | ||||||| |||| ||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  211367 gtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccctgttacccgtctcgtacccgtattttgaaatcggagaaaacccaaacccatacccaaa 211460  T

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Target: scaffold0059 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 253
Target Start/End: Original strand, 70086 - 70222
Alignment:
Q  118 catttgggacgggtttgagtatgggttcgggatgagtacttatatacccgttatccgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaaaccaaactcata 217  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||| ||| || |||| ||||| | ||||| ||||||| ||||||| || | ||||| || |||| |||||||||||    
T  70086 catttgggtagggtttgggtatgggtttggggtgggtacatatatcctcgttacccgtcccgtacccgtattatgaaatcaggaaaaatccaaactcata 70185  T
Q  218 tccaaatccaatcaaaacgg-agaaaatccgtcaaat 253  Q
      |||| | ||| ||| ||| | ||||||||||||||    
T  70186 ctcaaaccaaattaaatcggaaaaaaatccgtcaaat 70222  T

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