View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17426_low_8 (Length: 242)

Name: NF17426_low_8
Description: NF17426
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17426_low_8
NF17426_low_8
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-236)||(32067-32302)
[»] chr7 (74 HSPs)
chr7 (1-234)||(40443393-40443627)
chr7 (1-236)||(27847716-27847951)
chr7 (23-236)||(12698831-12699048)
chr7 (23-236)||(9509189-9509405)
chr7 (1-236)||(10589039-10589276)
chr7 (20-236)||(26211995-26212215)
chr7 (24-233)||(18456319-18456530)
chr7 (20-236)||(16386149-16386369)
chr7 (4-236)||(38227481-38227715)
chr7 (23-233)||(3564269-3564482)
chr7 (73-236)||(13647325-13647491)
chr7 (119-233)||(48273392-48273508)
chr7 (166-236)||(16495402-16495473)
chr7 (166-236)||(28505348-28505419)
chr7 (166-236)||(34200786-34200857)
chr7 (67-233)||(16213684-16213852)
chr7 (73-233)||(456321-456483)
chr7 (73-233)||(11972496-11972658)
chr7 (73-233)||(14949122-14949284)
chr7 (73-233)||(15376713-15376875)
chr7 (73-233)||(16232520-16232682)
chr7 (61-232)||(17138006-17138177)
chr7 (73-233)||(18640272-18640434)
chr7 (73-233)||(20385123-20385285)
chr7 (73-233)||(21189595-21189757)
chr7 (73-233)||(32125491-32125653)
chr7 (73-233)||(41522917-41523079)
chr7 (73-233)||(41525379-41525541)
chr7 (73-232)||(11393287-11393448)
chr7 (62-232)||(12187019-12187189)
chr7 (73-236)||(18430709-18430874)
chr7 (87-217)||(24275187-24275318)
chr7 (73-233)||(24702238-24702400)
chr7 (73-233)||(27216860-27217022)
chr7 (166-236)||(67745-67816)
chr7 (138-233)||(16410059-16410155)
chr7 (73-233)||(24704688-24704847)
chr7 (73-233)||(44116509-44116671)
chr7 (166-236)||(11996077-11996148)
chr7 (175-233)||(3386333-3386391)
chr7 (138-233)||(13869346-13869442)
chr7 (118-187)||(2530139-2530208)
chr7 (183-236)||(15754955-15755008)
chr7 (166-232)||(811181-811248)
chr7 (61-217)||(2280062-2280221)
chr7 (174-217)||(15144096-15144139)
chr7 (117-236)||(16219717-16219835)
chr7 (73-233)||(17061915-17062077)
chr7 (166-232)||(18005650-18005717)
chr7 (166-232)||(44014182-44014249)
chr7 (166-236)||(47831807-47831878)
chr7 (179-233)||(20110556-20110610)
chr7 (168-217)||(18154894-18154943)
chr7 (175-233)||(13831373-13831431)
chr7 (169-236)||(22072913-22072981)
chr7 (119-217)||(16056347-16056446)
chr7 (166-220)||(18203828-18203882)
chr7 (138-217)||(38898443-38898523)
chr7 (175-220)||(12756775-12756820)
chr7 (166-217)||(1868045-1868097)
chr7 (166-217)||(14044765-14044817)
chr7 (166-217)||(14354795-14354847)
chr7 (172-232)||(19649546-19649606)
chr7 (166-236)||(19486794-19486865)
chr7 (166-220)||(20220238-20220293)
chr7 (173-235)||(2832499-2832561)
chr7 (160-217)||(12901342-12901400)
chr7 (168-221)||(11661287-11661340)
chr7 (166-214)||(12255843-12255892)
chr7 (168-209)||(15211484-15211525)
chr7 (168-221)||(18607468-18607521)
chr7 (173-209)||(9446216-9446252)
chr7 (173-209)||(20569654-20569690)
chr7 (169-221)||(42461964-42462016)
[»] chr5 (77 HSPs)
chr5 (1-236)||(21292853-21293090)
chr5 (23-236)||(23390401-23390617)
chr5 (23-236)||(8286747-8286964)
chr5 (20-236)||(22075018-22075238)
chr5 (4-236)||(24493569-24493803)
chr5 (23-236)||(25421532-25421748)
chr5 (72-236)||(21808343-21808510)
chr5 (4-236)||(13025311-13025545)
chr5 (4-236)||(13095495-13095729)
chr5 (72-236)||(21729018-21729185)
chr5 (23-236)||(9077952-9078168)
chr5 (23-216)||(25431414-25431610)
chr5 (23-233)||(24529223-24529436)
chr5 (23-236)||(1096467-1096683)
chr5 (61-229)||(37723910-37724080)
chr5 (138-236)||(21997555-21997655)
chr5 (61-232)||(22032323-22032492)
chr5 (64-187)||(18356364-18356488)
chr5 (63-217)||(18418599-18418753)
chr5 (166-236)||(19660885-19660956)
chr5 (166-236)||(36314577-36314648)
chr5 (64-187)||(20910745-20910869)
chr5 (73-233)||(264768-264930)
chr5 (73-233)||(39363384-39363546)
chr5 (74-233)||(10732941-10733102)
chr5 (119-233)||(22412187-22412302)
chr5 (62-136)||(23572180-23572254)
chr5 (120-220)||(20026942-20027046)
chr5 (61-232)||(18769947-18770118)
chr5 (73-233)||(20909012-20909174)
chr5 (73-233)||(29329934-29330096)
chr5 (73-233)||(42245365-42245527)
chr5 (166-236)||(21329547-21329618)
chr5 (138-217)||(20902075-20902155)
chr5 (20-101)||(22107275-22107357)
chr5 (138-233)||(39245136-39245232)
chr5 (73-233)||(29345980-29346142)
chr5 (72-220)||(22144065-22144216)
chr5 (166-232)||(22959582-22959649)
chr5 (138-233)||(2154680-2154776)
chr5 (175-233)||(11581303-11581361)
chr5 (175-233)||(20918052-20918110)
chr5 (73-233)||(36154783-36154942)
chr5 (73-233)||(29348453-29348615)
chr5 (73-233)||(29350926-29351088)
chr5 (73-233)||(32027393-32027555)
chr5 (138-230)||(18319100-18319193)
chr5 (166-236)||(21502206-21502277)
chr5 (166-232)||(21565546-21565613)
chr5 (138-233)||(10775742-10775838)
chr5 (138-233)||(31061068-31061164)
chr5 (138-233)||(38619434-38619530)
chr5 (167-220)||(26740697-26740750)
chr5 (167-215)||(26732884-26732932)
chr5 (181-232)||(23064512-23064563)
chr5 (168-221)||(23469818-23469871)
chr5 (168-217)||(26704090-26704139)
chr5 (168-217)||(26973823-26973872)
chr5 (166-217)||(26012085-26012137)
chr5 (166-236)||(19668898-19668969)
chr5 (179-233)||(20806850-20806904)
chr5 (23-100)||(21986052-21986130)
chr5 (168-220)||(21328268-21328320)
chr5 (166-220)||(22178271-22178326)
chr5 (24-79)||(22412333-22412388)
chr5 (190-220)||(27989004-27989034)
chr5 (168-221)||(15796434-15796487)
chr5 (168-209)||(20805575-20805616)
chr5 (168-213)||(21731514-21731559)
chr5 (168-213)||(21809634-21809679)
chr5 (168-209)||(21873277-21873318)
chr5 (191-236)||(40725853-40725898)
chr5 (169-209)||(20766997-20767037)
chr5 (168-220)||(23201372-23201424)
chr5 (168-232)||(23501408-23501472)
chr5 (173-209)||(26680605-26680641)
chr5 (173-209)||(26952212-26952248)
[»] chr8 (72 HSPs)
chr8 (1-236)||(45130881-45131117)
chr8 (1-236)||(31971257-31971493)
chr8 (1-236)||(16199529-16199765)
chr8 (3-236)||(21918885-21919121)
chr8 (23-236)||(21389358-21389571)
chr8 (23-236)||(21395888-21396101)
chr8 (23-236)||(21790381-21790594)
chr8 (23-236)||(20536208-20536424)
chr8 (36-236)||(21778697-21778897)
chr8 (23-236)||(18818314-18818530)
chr8 (23-236)||(18879142-18879352)
chr8 (23-236)||(22626736-22626951)
chr8 (4-236)||(21923814-21924049)
chr8 (23-236)||(7372778-7372986)
chr8 (23-236)||(23406379-23406597)
chr8 (23-235)||(28648949-28649164)
chr8 (23-236)||(16092246-16092463)
chr8 (23-236)||(22875065-22875281)
chr8 (23-239)||(6759255-6759472)
chr8 (23-235)||(23648554-23648769)
chr8 (166-236)||(5866324-5866395)
chr8 (73-233)||(14409444-14409606)
chr8 (166-236)||(17140916-17140987)
chr8 (166-236)||(21490995-21491066)
chr8 (73-233)||(1484402-1484564)
chr8 (73-233)||(5853292-5853454)
chr8 (73-233)||(20403227-20403389)
chr8 (73-233)||(22001753-22001915)
chr8 (73-233)||(4542373-4542535)
chr8 (87-217)||(16413331-16413462)
chr8 (73-233)||(41598188-41598350)
chr8 (166-236)||(6520368-6520439)
chr8 (119-217)||(26219733-26219831)
chr8 (119-233)||(26225295-26225409)
chr8 (166-236)||(38855301-38855372)
chr8 (166-236)||(23760894-23760962)
chr8 (20-100)||(25363042-25363123)
chr8 (73-233)||(4483281-4483442)
chr8 (73-233)||(15203231-15203393)
chr8 (73-233)||(20046195-20046357)
chr8 (175-233)||(19896265-19896323)
chr8 (186-236)||(21249384-21249434)
chr8 (186-236)||(21255222-21255272)
chr8 (166-217)||(983456-983508)
chr8 (117-234)||(18678102-18678221)
chr8 (138-220)||(19801448-19801530)
chr8 (138-217)||(15070574-15070654)
chr8 (138-217)||(45290761-45290841)
chr8 (179-239)||(19937114-19937174)
chr8 (117-234)||(32121734-32121853)
chr8 (61-229)||(13508028-13508199)
chr8 (166-236)||(17612160-17612231)
chr8 (166-220)||(24353036-24353091)
chr8 (166-232)||(26355748-26355815)
chr8 (166-220)||(37116363-37116418)
chr8 (61-220)||(20498578-20498740)
chr8 (168-221)||(20502154-20502207)
chr8 (166-217)||(21285616-21285668)
chr8 (166-220)||(17267044-17267099)
chr8 (166-220)||(19154937-19154992)
chr8 (166-221)||(22525573-22525628)
chr8 (168-229)||(13597669-13597731)
chr8 (179-233)||(25484376-25484430)
chr8 (73-233)||(14823774-14823935)
chr8 (168-232)||(17353996-17354060)
chr8 (166-220)||(17439557-17439612)
chr8 (119-235)||(26223917-26224034)
chr8 (169-220)||(28397566-28397617)
chr8 (169-217)||(21673723-21673772)
chr8 (173-209)||(20533467-20533503)
chr8 (168-220)||(22995859-22995911)
chr8 (173-221)||(27941665-27941713)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (1-236)||(13497-13733)
[»] chr2 (71 HSPs)
chr2 (1-236)||(37999-38235)
chr2 (1-236)||(20309108-20309343)
chr2 (23-236)||(23285865-23286077)
chr2 (23-236)||(22731139-22731355)
chr2 (20-236)||(23654288-23654507)
chr2 (23-236)||(22738085-22738300)
chr2 (23-236)||(23076442-23076658)
chr2 (23-236)||(23060513-23060728)
chr2 (20-233)||(298716-298933)
chr2 (4-236)||(22337115-22337350)
chr2 (119-236)||(23103399-23103516)
chr2 (23-236)||(23660023-23660238)
chr2 (73-233)||(22105412-22105575)
chr2 (73-230)||(21155060-21155219)
chr2 (160-236)||(8946657-8946733)
chr2 (73-233)||(18808943-18809105)
chr2 (73-233)||(23130862-23131024)
chr2 (73-233)||(23133329-23133491)
chr2 (73-233)||(23709532-23709694)
chr2 (73-233)||(23712013-23712175)
chr2 (73-233)||(26505379-26505541)
chr2 (73-233)||(26507857-26508019)
chr2 (73-233)||(34402522-34402684)
chr2 (73-233)||(39682313-39682475)
chr2 (173-236)||(23040247-23040310)
chr2 (166-235)||(22134257-22134326)
chr2 (87-233)||(23135590-23135737)
chr2 (61-232)||(40622151-40622327)
chr2 (73-233)||(571397-571559)
chr2 (73-233)||(6725995-6726157)
chr2 (73-217)||(24367790-24367936)
chr2 (166-236)||(23071999-23072070)
chr2 (61-217)||(23708562-23708721)
chr2 (87-235)||(32214936-32215085)
chr2 (73-233)||(24898195-24898358)
chr2 (73-233)||(24900678-24900841)
chr2 (73-233)||(24903155-24903318)
chr2 (73-233)||(24905632-24905795)
chr2 (73-233)||(24908107-24908270)
chr2 (73-233)||(32039498-32039660)
chr2 (176-233)||(28577099-28577156)
chr2 (175-231)||(43137301-43137357)
chr2 (73-233)||(45029854-45030016)
chr2 (166-232)||(7679589-7679656)
chr2 (166-236)||(19671830-19671901)
chr2 (166-221)||(23287378-23287433)
chr2 (175-230)||(24643054-24643109)
chr2 (138-233)||(24529595-24529691)
chr2 (167-221)||(26392397-26392451)
chr2 (166-231)||(28405981-28406047)
chr2 (181-233)||(38967374-38967426)
chr2 (166-220)||(23207293-23207348)
chr2 (166-232)||(25175854-25175921)
chr2 (117-217)||(25616204-25616306)
chr2 (166-217)||(18786953-18787005)
chr2 (4-84)||(27753730-27753810)
chr2 (119-220)||(7735-7838)
chr2 (166-220)||(20520243-20520298)
chr2 (117-209)||(22799126-22799220)
chr2 (168-221)||(9241941-9241994)
chr2 (168-219)||(32451981-32452033)
chr2 (166-220)||(22413188-22413243)
chr2 (166-220)||(23004764-23004819)
chr2 (168-215)||(23038048-23038095)
chr2 (166-220)||(25108903-25108958)
chr2 (119-220)||(24697607-24697712)
chr2 (168-221)||(21073545-21073598)
chr2 (173-209)||(24655396-24655432)
chr2 (173-209)||(24869903-24869939)
chr2 (173-209)||(25961592-25961628)
chr2 (169-221)||(34136955-34137007)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (1-236)||(4712-4949)
scaffold0358 (1-162)||(12-173)
[»] chr4 (70 HSPs)
chr4 (1-236)||(14053185-14053422)
chr4 (1-236)||(12902757-12902995)
chr4 (20-236)||(7088877-7089096)
chr4 (1-236)||(17046487-17046722)
chr4 (4-234)||(22636437-22636669)
chr4 (4-236)||(44052829-44053064)
chr4 (20-229)||(23374261-23374473)
chr4 (61-236)||(7798774-7798952)
chr4 (27-236)||(16270145-16270356)
chr4 (23-233)||(16377428-16377639)
chr4 (4-236)||(7893703-7893935)
chr4 (4-236)||(16239856-16240090)
chr4 (24-231)||(14038653-14038863)
chr4 (117-236)||(52873367-52873488)
chr4 (67-236)||(6899891-6900062)
chr4 (160-236)||(3096293-3096369)
chr4 (73-234)||(22353835-22353999)
chr4 (73-233)||(18215274-18215436)
chr4 (73-233)||(44928879-44929042)
chr4 (19-110)||(3096772-3096863)
chr4 (166-236)||(15551817-15551888)
chr4 (119-233)||(54798756-54798872)
chr4 (73-233)||(12307-12469)
chr4 (73-233)||(15118352-15118514)
chr4 (62-150)||(15121747-15121834)
chr4 (73-233)||(44615288-44615450)
chr4 (73-233)||(52312510-52312672)
chr4 (67-233)||(1837503-1837671)
chr4 (119-233)||(14280316-14280431)
chr4 (87-233)||(23803280-23803427)
chr4 (64-187)||(43256106-43256230)
chr4 (73-233)||(44773087-44773249)
chr4 (73-233)||(50222339-50222501)
chr4 (87-239)||(19242693-19242846)
chr4 (61-220)||(13794-13956)
chr4 (138-233)||(51463934-51464030)
chr4 (87-233)||(3515007-3515154)
chr4 (87-233)||(18239434-18239581)
chr4 (138-235)||(19618238-19618336)
chr4 (87-233)||(12610950-12611090)
chr4 (166-232)||(12774011-12774078)
chr4 (166-236)||(39706338-39706409)
chr4 (175-233)||(7641286-7641344)
chr4 (120-217)||(12288211-12288312)
chr4 (138-217)||(15355391-15355471)
chr4 (61-217)||(52243137-52243298)
chr4 (138-236)||(15367690-15367789)
chr4 (138-236)||(15370018-15370117)
chr4 (138-236)||(15371202-15371301)
chr4 (138-236)||(15373483-15373582)
chr4 (138-236)||(15402703-15402802)
chr4 (25-100)||(17047979-17048055)
chr4 (73-233)||(44102214-44102376)
chr4 (119-217)||(8574871-8574969)
chr4 (140-236)||(16223532-16223629)
chr4 (166-232)||(8846360-8846427)
chr4 (138-217)||(14970773-14970853)
chr4 (172-217)||(43198611-43198657)
chr4 (175-220)||(21815689-21815734)
chr4 (168-219)||(6190479-6190531)
chr4 (166-221)||(17333292-17333347)
chr4 (166-220)||(46640506-46640561)
chr4 (166-220)||(53082202-53082257)
chr4 (168-209)||(16348716-16348757)
chr4 (168-209)||(16357004-16357045)
chr4 (168-221)||(24047352-24047405)
chr4 (168-221)||(26045346-26045399)
chr4 (168-221)||(26050527-26050580)
chr4 (173-209)||(11250619-11250655)
chr4 (173-209)||(15353365-15353401)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (1-236)||(15348-15584)
scaffold0114 (62-232)||(7295-7465)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (4-236)||(10312-10544)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (1-236)||(16282-16517)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (1-236)||(935-1170)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (1-236)||(1289-1524)
scaffold0106 (1-236)||(7266-7501)
scaffold0106 (168-233)||(15291-15356)
[»] chr1 (57 HSPs)
chr1 (20-236)||(27250631-27250850)
chr1 (1-236)||(38801274-38801508)
chr1 (20-236)||(21026680-21026899)
chr1 (23-235)||(50210118-50210333)
chr1 (23-233)||(34509783-34509996)
chr1 (35-236)||(22532269-22532473)
chr1 (23-161)||(22354477-22354616)
chr1 (23-235)||(20135188-20135403)
chr1 (73-236)||(45574842-45575008)
chr1 (138-236)||(20847175-20847275)
chr1 (25-235)||(22468604-22468816)
chr1 (73-233)||(31612313-31612475)
chr1 (64-187)||(33797570-33797694)
chr1 (73-233)||(13988866-13989028)
chr1 (73-233)||(21923291-21923453)
chr1 (166-236)||(14295601-14295672)
chr1 (23-100)||(48603652-48603730)
chr1 (87-233)||(23593750-23593897)
chr1 (73-233)||(21475087-21475249)
chr1 (168-235)||(20454606-20454673)
chr1 (73-233)||(29298137-29298298)
chr1 (73-233)||(29776688-29776850)
chr1 (138-234)||(21840766-21840863)
chr1 (119-220)||(21896258-21896361)
chr1 (166-232)||(22921919-22921986)
chr1 (73-233)||(433012-433172)
chr1 (61-220)||(21861513-21861675)
chr1 (179-236)||(13212970-13213027)
chr1 (4-127)||(22356060-22356185)
chr1 (4-127)||(22357746-22357871)
chr1 (166-236)||(33681010-33681078)
chr1 (136-233)||(16275428-16275526)
chr1 (181-239)||(21342090-21342148)
chr1 (175-233)||(21707167-21707225)
chr1 (175-233)||(21711709-21711767)
chr1 (141-239)||(15860078-15860177)
chr1 (175-235)||(16361915-16361975)
chr1 (166-217)||(16758668-16758720)
chr1 (166-217)||(20918623-20918675)
chr1 (181-233)||(21346961-21347013)
chr1 (168-232)||(21714546-21714610)
chr1 (166-217)||(21754064-21754116)
chr1 (138-220)||(35261099-35261183)
chr1 (166-220)||(50614167-50614222)
chr1 (166-220)||(50621995-50622050)
chr1 (169-236)||(22237630-22237695)
chr1 (168-220)||(16368338-16368391)
chr1 (166-236)||(52928020-52928088)
chr1 (166-232)||(20248283-20248350)
chr1 (166-221)||(21533923-21533978)
chr1 (166-220)||(41050086-41050141)
chr1 (168-232)||(42865266-42865330)
chr1 (175-217)||(22123171-22123214)
chr1 (173-235)||(24783150-24783212)
chr1 (167-220)||(50686627-50686681)
chr1 (168-221)||(20438046-20438099)
chr1 (138-215)||(40389172-40389250)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (29-236)||(46995-47202)
[»] chr3 (92 HSPs)
chr3 (4-236)||(20698322-20698556)
chr3 (4-236)||(13442274-13442509)
chr3 (4-236)||(17487856-17488091)
chr3 (20-236)||(12399209-12399428)
chr3 (4-236)||(17499338-17499573)
chr3 (23-217)||(14576738-14576934)
chr3 (23-236)||(14972854-14973070)
chr3 (23-236)||(23083266-23083482)
chr3 (23-236)||(26686887-26687103)
chr3 (23-236)||(43840932-43841148)
chr3 (24-233)||(24153115-24153326)
chr3 (23-236)||(18438534-18438750)
chr3 (4-217)||(14572608-14572823)
chr3 (23-236)||(11424668-11424880)
chr3 (23-236)||(25476290-25476506)
chr3 (23-217)||(42386429-42386627)
chr3 (23-233)||(40213626-40213838)
chr3 (73-233)||(9707607-9707769)
chr3 (73-233)||(29172583-29172745)
chr3 (73-236)||(43550478-43550644)
chr3 (73-233)||(7781347-7781509)
chr3 (73-233)||(17463178-17463340)
chr3 (73-233)||(34159326-34159488)
chr3 (73-233)||(45606907-45607069)
chr3 (73-233)||(55476491-55476653)
chr3 (166-236)||(13210377-13210448)
chr3 (119-233)||(36166598-36166712)
chr3 (23-100)||(14179570-14179648)
chr3 (138-233)||(17672626-17672722)
chr3 (87-233)||(28848626-28848773)
chr3 (73-233)||(8899094-8899256)
chr3 (73-233)||(16454281-16454443)
chr3 (73-217)||(38961891-38962037)
chr3 (166-232)||(49668126-49668193)
chr3 (73-220)||(53070653-53070802)
chr3 (121-233)||(55500942-55501055)
chr3 (138-233)||(6469200-6469296)
chr3 (68-232)||(856140-856304)
chr3 (73-233)||(13151790-13151953)
chr3 (73-233)||(13154255-13154418)
chr3 (166-236)||(15470927-15470995)
chr3 (20-100)||(16796685-16796766)
chr3 (73-233)||(10247723-10247885)
chr3 (73-233)||(17446655-17446816)
chr3 (166-232)||(9512924-9512991)
chr3 (166-232)||(9520899-9520966)
chr3 (166-232)||(12174309-12174376)
chr3 (119-217)||(21618465-21618563)
chr3 (138-233)||(12119791-12119887)
chr3 (87-234)||(13544024-13544172)
chr3 (138-233)||(15412429-15412525)
chr3 (175-233)||(15977515-15977573)
chr3 (73-231)||(16282811-16282971)
chr3 (175-233)||(17737236-17737294)
chr3 (87-217)||(12567576-12567707)
chr3 (87-217)||(50242838-50242969)
chr3 (61-220)||(52523670-52523834)
chr3 (166-217)||(32307696-32307748)
chr3 (166-236)||(14234487-14234558)
chr3 (166-232)||(16103784-16103851)
chr3 (179-233)||(8499518-8499572)
chr3 (179-233)||(10556985-10557039)
chr3 (61-236)||(24340666-24340844)
chr3 (172-233)||(28194693-28194755)
chr3 (138-233)||(44494809-44494905)
chr3 (73-231)||(41123892-41124049)
chr3 (180-233)||(45577947-45578000)
chr3 (169-232)||(16097332-16097396)
chr3 (166-233)||(27165250-27165318)
chr3 (117-234)||(46822267-46822386)
chr3 (166-221)||(13919344-13919399)
chr3 (166-220)||(22110402-22110457)
chr3 (166-220)||(43925974-43926029)
chr3 (63-217)||(30029859-30030015)
chr3 (168-232)||(15878104-15878168)
chr3 (168-232)||(23077530-23077594)
chr3 (166-232)||(37251218-37251283)
chr3 (166-233)||(53301601-53301669)
chr3 (118-234)||(12511059-12511177)
chr3 (173-235)||(14665398-14665460)
chr3 (168-220)||(606378-606431)
chr3 (169-221)||(9577640-9577691)
chr3 (168-220)||(15246034-15246086)
chr3 (166-217)||(23274706-23274758)
chr3 (166-217)||(1644724-1644775)
chr3 (166-236)||(37642315-37642386)
chr3 (166-219)||(12377938-12377992)
chr3 (173-235)||(14668554-14668616)
chr3 (168-209)||(11298580-11298621)
chr3 (168-209)||(14878569-14878610)
chr3 (173-209)||(3389994-3390030)
chr3 (168-220)||(17525211-17525263)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (4-236)||(13211-13446)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-236)||(51582-51817)
[»] chr6 (70 HSPs)
chr6 (4-236)||(20360846-20361081)
chr6 (4-236)||(16920519-16920751)
chr6 (64-236)||(35245586-35245758)
chr6 (19-236)||(22831503-22831722)
chr6 (4-236)||(20638169-20638404)
chr6 (1-224)||(11185517-11185740)
chr6 (24-236)||(29060540-29060755)
chr6 (72-236)||(16496244-16496411)
chr6 (23-236)||(17287701-17287917)
chr6 (23-236)||(19303446-19303661)
chr6 (23-236)||(22780132-22780348)
chr6 (23-236)||(25629260-25629476)
chr6 (72-236)||(20076700-20076863)
chr6 (25-236)||(20593773-20593987)
chr6 (23-235)||(18409732-18409947)
chr6 (64-187)||(27415887-27416011)
chr6 (138-233)||(25656629-25656725)
chr6 (73-233)||(12742317-12742479)
chr6 (73-233)||(18334592-18334754)
chr6 (73-233)||(19005046-19005208)
chr6 (73-233)||(19858919-19859081)
chr6 (73-233)||(22782227-22782389)
chr6 (73-233)||(24422547-24422709)
chr6 (73-233)||(33861794-33861956)
chr6 (73-233)||(33864278-33864440)
chr6 (87-233)||(1540926-1541073)
chr6 (87-233)||(25754809-25754956)
chr6 (73-233)||(1595549-1595711)
chr6 (73-233)||(2291180-2291342)
chr6 (73-233)||(8055029-8055191)
chr6 (73-233)||(26924640-26924802)
chr6 (73-220)||(18456732-18456881)
chr6 (166-236)||(27333268-27333339)
chr6 (166-236)||(27394008-27394079)
chr6 (166-236)||(28496521-28496592)
chr6 (166-236)||(29808932-29809003)
chr6 (87-235)||(30676725-30676874)
chr6 (175-236)||(25714417-25714478)
chr6 (87-220)||(18461892-18462026)
chr6 (87-235)||(34963371-34963520)
chr6 (138-217)||(25688518-25688598)
chr6 (183-236)||(1561303-1561356)
chr6 (175-220)||(18821904-18821949)
chr6 (61-217)||(25644339-25644499)
chr6 (138-230)||(16448593-16448686)
chr6 (166-221)||(33443062-33443117)
chr6 (175-233)||(3852121-3852179)
chr6 (175-233)||(20556996-20557054)
chr6 (166-217)||(9098564-9098616)
chr6 (166-232)||(19652199-19652266)
chr6 (61-217)||(20109157-20109318)
chr6 (189-236)||(22080799-22080846)
chr6 (117-234)||(19847995-19848114)
chr6 (168-232)||(19873120-19873184)
chr6 (172-217)||(19668390-19668436)
chr6 (149-232)||(22432249-22432334)
chr6 (149-232)||(22438799-22438884)
chr6 (191-236)||(8227587-8227632)
chr6 (168-221)||(18453197-18453250)
chr6 (171-232)||(19862978-19863039)
chr6 (168-209)||(21766718-21766759)
chr6 (166-218)||(23076748-23076801)
chr6 (166-218)||(35008166-35008219)
chr6 (166-213)||(4185871-4185919)
chr6 (112-209)||(15041545-15041644)
chr6 (166-236)||(23019408-23019477)
chr6 (168-213)||(16493169-16493214)
chr6 (168-221)||(23838189-23838242)
chr6 (173-209)||(18907134-18907170)
chr6 (173-209)||(19790837-19790873)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (20-236)||(951-1169)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (20-236)||(167881-168099)
scaffold0011 (4-236)||(51913-52148)
scaffold0011 (168-220)||(38204-38256)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (23-236)||(1851-2067)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (29-236)||(4849-5059)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (23-236)||(3470-3686)
scaffold0292 (23-236)||(343-558)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (21-233)||(5034-5246)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (1-236)||(1952-2190)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (23-217)||(24206-24405)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (4-236)||(6007-6245)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (4-236)||(38761-38995)
scaffold0145 (27-236)||(32942-33153)
scaffold0145 (138-238)||(9744-9845)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (23-236)||(3056-3271)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (23-236)||(8438-8650)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (23-234)||(39479-39692)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (23-234)||(75120-75333)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (23-235)||(17120-17337)
scaffold0056 (175-220)||(79388-79433)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (23-229)||(25970-26179)
scaffold0122 (119-233)||(44709-44825)
scaffold0122 (23-86)||(33400-33463)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (35-235)||(3103-3306)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (23-236)||(25896-26111)
scaffold0026 (23-236)||(39858-40073)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (23-233)||(22886-23098)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (23-236)||(20910-21127)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (61-236)||(32901-33077)
scaffold0120 (61-236)||(45928-46104)
scaffold0120 (28-236)||(16113-16323)
scaffold0120 (175-236)||(17389-17450)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (4-236)||(8479-8710)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (23-236)||(16505-16721)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (23-233)||(339855-340065)
scaffold0003 (64-187)||(71350-71474)
scaffold0003 (73-233)||(158450-158612)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (23-236)||(39913-40128)
scaffold0080 (119-220)||(19885-19990)
scaffold0080 (168-209)||(18708-18749)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (23-236)||(4508-4723)
scaffold0228 (23-236)||(12090-12305)
scaffold0228 (23-236)||(22042-22257)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (100-236)||(28414-28552)
scaffold0046 (166-236)||(11292-11363)
scaffold0046 (166-236)||(1997-2068)
scaffold0046 (183-236)||(4552-4605)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (121-236)||(11447-11564)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (23-148)||(124675-124801)
scaffold0021 (61-235)||(174767-174943)
scaffold0021 (167-236)||(121766-121835)
scaffold0021 (160-220)||(136413-136474)
scaffold0021 (160-220)||(145121-145182)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (23-184)||(13144-13308)
scaffold0175 (161-236)||(34123-34199)
scaffold0175 (180-236)||(273-329)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (21-177)||(6669-6828)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (61-220)||(26840-26999)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (64-187)||(15362-15486)
scaffold0107 (168-221)||(36195-36248)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (166-236)||(1119-1190)
scaffold0184 (173-209)||(4284-4320)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (166-236)||(119875-119946)
scaffold0023 (73-233)||(94411-94573)
scaffold0023 (87-233)||(44454-44602)
scaffold0023 (87-217)||(17455-17586)
scaffold0023 (166-232)||(100378-100445)
scaffold0023 (166-232)||(40224-40291)
scaffold0023 (166-232)||(101503-101570)
scaffold0023 (117-232)||(38479-38596)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (68-232)||(1881-2045)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (23-155)||(27913-28046)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (73-233)||(20747-20909)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (61-232)||(21749-21920)
scaffold0210 (61-232)||(29641-29812)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (73-233)||(37821-37983)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (73-233)||(136680-136842)
scaffold0028 (73-233)||(139149-139311)
scaffold0028 (73-233)||(144087-144249)
scaffold0028 (73-233)||(134211-134373)
scaffold0028 (73-233)||(141618-141780)
scaffold0028 (173-232)||(132662-132722)
scaffold0028 (166-217)||(62217-62269)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (61-215)||(4545-4702)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (62-136)||(12859-12933)
scaffold0029 (87-216)||(11305-11435)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (20-100)||(1052-1133)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (87-233)||(13392-13539)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (73-220)||(20379-20527)
scaffold0031 (72-236)||(128751-128917)
scaffold0031 (168-232)||(65851-65915)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (73-233)||(13947-14109)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (119-220)||(1048-1151)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (166-236)||(6535-6606)
scaffold0621 (61-217)||(8485-8646)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (170-236)||(4888-4954)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (138-233)||(85646-85742)
scaffold0001 (166-232)||(160688-160755)
scaffold0001 (87-217)||(501100-501231)
scaffold0001 (168-220)||(497442-497494)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (87-217)||(4710-4841)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (87-233)||(82072-82219)
scaffold0037 (166-236)||(22720-22788)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (73-233)||(16784-16946)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (73-233)||(40400-40562)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (166-232)||(2856-2923)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (138-234)||(10772-10869)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (166-236)||(6611-6682)
scaffold0333 (166-236)||(13991-14062)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (159-233)||(15664-15739)
scaffold0261 (168-232)||(1339-1403)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (166-236)||(6173-6244)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (166-232)||(19268-19335)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (119-233)||(116430-116544)
scaffold0022 (166-220)||(129021-129075)
scaffold0022 (168-220)||(78338-78391)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (166-236)||(15827-15898)
scaffold0020 (169-217)||(178913-178961)
scaffold0020 (168-221)||(142596-142649)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (123-230)||(4300-4408)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (138-217)||(29948-30028)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (175-220)||(11979-12024)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (23-162)||(3434-3575)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (166-236)||(23933-24001)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (165-232)||(14746-14814)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (166-220)||(6828-6883)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (166-236)||(1084-1155)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (119-220)||(12584-12687)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (175-234)||(9241-9300)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (166-232)||(2695-2762)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (175-233)||(106-164)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (138-233)||(4214-4310)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (61-220)||(53492-53654)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (138-233)||(161156-161252)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (166-236)||(10591-10659)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (166-232)||(28819-28887)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (166-217)||(1101-1153)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (175-235)||(12353-12413)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (166-217)||(5662-5714)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (168-232)||(23843-23907)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (20-80)||(3640-3700)
scaffold0165 (20-80)||(7704-7764)
scaffold0165 (61-217)||(27692-27851)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (120-236)||(12942-13057)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (166-217)||(129924-129976)
scaffold0010 (160-220)||(60760-60821)
scaffold0010 (169-221)||(662-714)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (166-236)||(11464-11535)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (119-220)||(13144-13247)
scaffold0357 (166-220)||(2677-2732)
scaffold0357 (166-217)||(16150-16202)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (159-217)||(8117-8176)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (166-232)||(45842-45909)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (166-236)||(38306-38377)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (61-236)||(17970-18148)
scaffold0247 (179-217)||(2237-2275)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (168-220)||(566-619)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (73-233)||(12064-12220)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (183-232)||(32102-32151)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (166-215)||(206575-206624)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (169-236)||(12766-12834)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (168-232)||(10575-10639)
scaffold0297 (172-232)||(15736-15796)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (166-217)||(25125-25177)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (166-233)||(38752-38820)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (166-217)||(32555-32607)
scaffold0034 (189-219)||(51957-51987)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (168-232)||(69794-69858)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (166-232)||(133-200)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (166-220)||(6334-6389)
scaffold0420 (190-220)||(13813-13843)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (169-232)||(36454-36517)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (138-230)||(1347-1440)
scaffold0101 (168-232)||(9016-9080)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (117-232)||(4804-4921)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (168-232)||(19980-20044)
scaffold0139 (166-213)||(38339-38387)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (168-220)||(7447-7499)
scaffold0111 (168-220)||(14566-14618)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (169-221)||(3272-3324)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (23-79)||(10323-10379)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (166-217)||(10546-10598)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (166-221)||(17517-17572)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (166-220)||(2691-2746)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (169-220)||(30347-30398)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (166-220)||(97021-97076)
scaffold0006 (166-220)||(106299-106354)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (171-209)||(4999-5037)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (191-220)||(1874-1903)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (168-221)||(3882-3935)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (168-209)||(44104-44145)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (168-209)||(193029-193070)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (168-232)||(6095-6159)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (168-220)||(8906-8957)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (173-209)||(7328-7364)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (169-209)||(16402-16442)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (168-220)||(57834-57885)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (168-232)||(18236-18300)


Alignment Details
Target: scaffold0113 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32302 - 32067
Alignment:
Q  1 aggattaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32302 aggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttga 32203  T
Q  101 agaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32202 agaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 32103  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32102 gcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 74)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40443627 - 40443393
Alignment:
Q  1 aggattaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40443627 aggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttga 40443528  T
Q  101 agaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  40443527 agaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagc 40443428  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 234  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40443427 tgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 27847716 - 27847951
Alignment:
Q  1 aggattaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttga 100  Q
    |||||||||||||||   |||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27847716 aggattaagacttaataatgagattaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatgtttatgcattacttga 27847815  T
Q  101 agaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagc 199  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  27847816 agaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatactg-ttgtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagc 27847914  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27847915 tgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12699048 - 12698831
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  12699048 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 12698949  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgt---ttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 218  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12698948 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 12698849  T
Q  219 tgttgaagatgatgatgt 236  Q
    || |||||||||||||||    
T  12698848 tgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9509405 - 9509189
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  9509405 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 9509306  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtt--tgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9509305 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 9509206  T
Q  220 gttgaagatgatgatgt 236  Q
    | |||||||||||||||    
T  9509205 gatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10589276 - 10589039
Alignment:
Q  1 aggattaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttga 100  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10589276 aggattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattgcttga 10589177  T
Q  101 agaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 198  Q
    |||||||||| | |   ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10589176 agaatatttgaacattgaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaag 10589077  T
Q  199 ctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  10589076 ctgcatgagtcgatctaagttgtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26212215 - 26211995
Alignment:
Q  20 gaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgtataccta 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||  ||    
T  26212215 gaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattta 26212116  T
Q  119 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 216  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26212115 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaa 26212016  T
Q  217 gatgttgaag-atgatgatgt 236  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  26212015 gttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 233
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456530
Alignment:
Q  24 ttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagat 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 18456418  T
Q  123 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18456518  T
Q  222 tgaagatgatga 233  Q
    | ||||||||||    
T  18456519 ttaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Original strand, 16386149 - 16386369
Alignment:
Q  20 gaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgtataccta 118  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  | | |||| |||  ||    
T  16386149 gaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattgtttgaatattta 16386248  T
Q  119 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 215  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||| |||  ||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16386249 agatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 16386348  T
Q  216 agatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  16386349 agttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 38227715 - 38227481
Alignment:
Q  4 attaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaag 102  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||| | | |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | | | ||||| ||||||    
T  38227715 attaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagatatttaagatatgttgatgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaattgaag 38227616  T
Q  103 aatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 201  Q
     ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38227615 tataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctg 38227516  T
Q  202 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  38227515 catgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 3564269 - 3564482
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  3564269 gttaattataacctatgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 3564368  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    ||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||  |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3564369 tgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 3564468  T
Q  220 gttgaagatgatga 233  Q
    | ||||||||||||    
T  3564469 gatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13647491 - 13647325
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtt--tact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||| |   ||||    
T  13647491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 13647392  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13647391 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 48273508 - 48273392
Alignment:
Q  119 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 216  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48273508 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaa 48273409  T
Q  217 gatgttgaagatgatga 233  Q
    | || | ||||||||||    
T  48273408 gttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16495473 - 16495402
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495473 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 28505348 - 28505419
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28505348 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34200857 - 34200786
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34200857 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16213852 - 16213684
Alignment:
Q  67 ttatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--g 163  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||||||||  |||| || |||  ||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  |||||  |    
T  16213852 ttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttg 16213753  T
Q  164 tttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16213752 tatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 456483 - 456321
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  456483 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 456384  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  456383 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11972658 - 11972496
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  11972658 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11972559  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  11972558 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 14949122 - 14949284
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  14949122 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14949221  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  14949222 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 15376713 - 15376875
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  15376713 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15376812  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15376813 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16232682 - 16232520
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  16232682 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16232583  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16232582 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 232
Target Start/End: Original strand, 17138006 - 17138177
Alignment:
Q  61 tgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattat-gtcatactg 159  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  | ||  |     
T  17138006 tgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattatcatgattgtt 17138104  T
Q  160 tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
     ||||   |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  17138105 gttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 17138177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18640434 - 18640272
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  18640434 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18640335  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18640334 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 20385123 - 20385285
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  20385123 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20385222  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20385223 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 21189595 - 21189757
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  21189595 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21189694  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21189695 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32125653 - 32125491
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  32125653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32125554  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  32125553 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41523079 - 41522917
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  41523079 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41522980  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  41522979 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41525541 - 41525379
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  41525541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41525442  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  41525441 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 232
Target Start/End: Original strand, 11393287 - 11393448
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  11393287 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11393386  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  11393387 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12187189 - 12187019
Alignment:
Q  62 gttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattat-gtcatactgt 160  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  | ||  |      
T  12187189 gttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattatcatgattgtaa 12187091  T
Q  161 ttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||   |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  12187090 ttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 12187019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18430874 - 18430709
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgttta--ct 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| | ||  ||    
T  18430874 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 18430775  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  18430774 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24275318 - 24275187
Alignment:
Q  87 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 184  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || |||||| | ||||||||||    
T  24275318 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 24275220  T
Q  185 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275219 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24275187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24702400 - 24702238
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  |||||  || ||||    
T  24702400 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 24702301  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24702300 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27217022 - 27216860
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  27217022 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27216923  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  27216922 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 67816 - 67745
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  67816 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16410155 - 16410059
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16410155 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24704847 - 24704688
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtttactgc 171  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||| |  | ||||| |||||     
T  24704847 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgtt-tttgtatactgt 24704749  T
Q  172 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24704748 -tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 44116671 - 44116509
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  |||||  || ||||    
T  44116671 tgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 44116572  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44116571 gc-tgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 11996077 - 11996148
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11996077 tactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 175 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3386391 - 3386333
Alignment:
Q  175 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3386391 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13869442 - 13869346
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13869442 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Original strand, 2530139 - 2530208
Alignment:
Q  118 aagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctgttgtt 187  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  2530139 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtatgttgcctatgttgctgttgtt 2530208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 236
Target Start/End: Original strand, 15754955 - 15755008
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15754955 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Original strand, 811181 - 811248
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  811181 tactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 217
Target Start/End: Original strand, 2280062 - 2280221
Alignment:
Q  61 tgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg 159  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || |||| |||| |||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||| |||| |||    
T  2280062 tgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctg 2280161  T
Q  160 ttt-gtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||| |  |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2280162 ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 2280221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 174 - 217
Target Start/End: Original strand, 15144096 - 15144139
Alignment:
Q  174 atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144096 atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15144139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 236
Target Start/End: Original strand, 16219717 - 16219835
Alignment:
Q  117 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg-tttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 214  Q
    |||||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||  || ||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16219717 taagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtct 16219816  T
Q  215 aagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||   |||||||||||||||||    
T  16219817 aa---gttgaagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 17061915 - 17062077
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactg 170  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |  |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| || ||| || |||||    
T  17061915 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctattttgtatactg 17062014  T
Q  171 cctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17062015 ctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18005717 - 18005650
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  18005717 tactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44014249 - 44014182
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  44014249 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 47831878 - 47831807
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  47831878 tactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20110610 - 20110556
Alignment:
Q  179 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20110610 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 18154894 - 18154943
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18154894 ctgcctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 18154943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13831431 - 13831373
Alignment:
Q  175 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  13831431 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22072981 - 22072913
Alignment:
Q  169 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || | |||||||||||||    
T  22072981 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16056446 - 16056347
Alignment:
Q  119 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| ||||  ||||||  || || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16056446 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaag 16056347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18203882 - 18203828
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18203882 tactgtctatgttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatctaagatg 18203828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 217
Target Start/End: Original strand, 38898443 - 38898523
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgtttgttta--ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||  |||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38898443 ttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgc-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 38898523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 220
Target Start/End: Original strand, 12756775 - 12756820
Alignment:
Q  175 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  12756775 tgttgctgttgttatttaactaaactgctcgagtcggtctaagatg 12756820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 217
Target Start/End: Original strand, 1868045 - 1868097
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868045 tactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1868097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044765
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 14044765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354795
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 14354795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 232
Target Start/End: Original strand, 19649546 - 19649606
Alignment:
Q  172 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19649546 ctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 19486794 - 19486865
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  19486794 tactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Original strand, 20220238 - 20220293
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20220238 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaagatg 20220293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 235
Target Start/End: Original strand, 2832499 - 2832561
Alignment:
Q  173 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 235  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  2832499 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 2832561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12901400 - 12901342
Alignment:
Q  160 tttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12901400 tttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 12901342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11661340 - 11661287
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||| | || | ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11661340 ctgcctatgttgctgttgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtataagatgt 11661287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 166 - 214
Target Start/End: Original strand, 12255843 - 12255892
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 214  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255843 tactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15211525 - 15211484
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 209  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15211525 ctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 15211484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18607521 - 18607468
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||| | || | ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18607521 ctgcctatgttgctgttgtaaattgattaagctgaatgtgtcggtctaagatgt 18607468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 209
Target Start/End: Original strand, 9446216 - 9446252
Alignment:
Q  173 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9446216 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 9446252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 209
Target Start/End: Original strand, 20569654 - 20569690
Alignment:
Q  173 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20569654 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 20569690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 42462016 - 42461964
Alignment:
Q  169 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||   |||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  42462016 tgcctatgttgctgttgtatattaattaagatgcatgtgtcggtctaagatgt 42461964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 77)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 21292853 - 21293090
Alignment:
Q  1 aggattaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttga 100  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21292853 aggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttga 21292952  T
Q  101 agaatatttgtatacctaagatgttgatgaa-ttgaa-attgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21292953 agaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaatattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 21293052  T
Q  199 ctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21293053 ctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Original strand, 23390401 - 23390617
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  23390401 gttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 23390500  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23390501 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23390600  T
Q  220 gttgaagatgatgatgt 236  Q
    | |||||||||||||||    
T  23390601 gatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Original strand, 8286747 - 8286964
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||  ||  |||||    
T  8286747 gttaattatattatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaaga 8286846  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtt---tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 218  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8286847 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 8286946  T
Q  219 tgttgaagatgatgatgt 236  Q
    || |||||||||||||||    
T  8286947 tgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22075238 - 22075018
Alignment:
Q  20 gaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgtataccta 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||  ||    
T  22075238 gaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattta 22075139  T
Q  119 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 216  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22075138 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatgagtcggtctaa 22075039  T
Q  217 gatgttgaag-atgatgatgt 236  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  22075038 gttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24493803 - 24493569
Alignment:
Q  4 attaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaag 102  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  24493803 attaagacttaataatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttgaag 24493704  T
Q  103 aatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 201  Q
     ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  24493703 tataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattgttacttaaccaagctg 24493604  T
Q  202 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24493603 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25421748 - 25421532
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||  || | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  25421748 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 25421649  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    || || ||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25421648 tgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 25421549  T
Q  220 gttgaagatgatgatgt 236  Q
    | |||||||||||||||    
T  25421548 gatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 72 - 236
Target Start/End: Original strand, 21808343 - 21808510
Alignment:
Q  72 atgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg--tttgtttac 168  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||| |||    
T  21808343 atgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21808442  T
Q  169 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21808443 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13025545 - 13025311
Alignment:
Q  4 attaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaag 102  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| ||||||    
T  13025545 attaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaag 13025446  T
Q  103 aatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 201  Q
     ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||| | |||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13025445 tataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctg 13025346  T
Q  202 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13025345 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13095729 - 13095495
Alignment:
Q  4 attaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaag 102  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| ||||||    
T  13095729 attaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaag 13095630  T
Q  103 aatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 201  Q
     ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||| | |||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13095629 tataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctg 13095530  T
Q  202 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13095529 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 236
Target Start/End: Original strand, 21729018 - 21729185
Alignment:
Q  72 atgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg--tttgtttac 168  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||| |||    
T  21729018 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21729117  T
Q  169 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21729118 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9078168 - 9077952
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||   ||||||  | |||    
T  9078168 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgaga 9078069  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  9078068 tgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagtt 9077969  T
Q  220 gttgaagatgatgatgt 236  Q
    | |||||||||||||||    
T  9077968 gatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25431610 - 25431414
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||  || | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| | |  |||||    
T  25431610 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaaga 25431511  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 216  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25431510 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24529436 - 24529223
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||   ||||||  |||||    
T  24529436 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaaga 24529337  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||  |||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24529336 tgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 24529237  T
Q  220 gttgaagatgatga 233  Q
    | ||||||||||||    
T  24529236 gatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1096683 - 1096467
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| ||||||  || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  1096683 gttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgaga 1096584  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtt--tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||||||||||| ||  ||||| |   |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1096583 tgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 1096484  T
Q  220 gttgaagatgatgatgt 236  Q
    | |||||||| ||||||    
T  1096483 gatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37724080 - 37723910
Alignment:
Q  61 tgttgattatgatgtgatataatgttta--tgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatact 158  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||   || ||   | ||||||||||||||| || ||||||| || ||||||| ||    
T  37724080 tgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgct 37723981  T
Q  159 gtttgtttactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 229  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37723980 gtt-gtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaagatg 37723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 138 - 236
Target Start/End: Original strand, 21997555 - 21997655
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||  |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21997555 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 21997654  T
Q  236 t 236  Q
    |    
T  21997655 t 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22032492 - 22032323
Alignment:
Q  61 tgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcat-actg 159  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  |||| | ||    
T  22032492 tgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgattg 22032396  T
Q  160 tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    |||||   |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  22032395 tttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 22032323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18356488 - 18356364
Alignment:
Q  64 tgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt 162  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  18356488 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctgttt 18356389  T
Q  163 gtttactgcctatgttgctgttgtt 187  Q
    || | ||||||||||||||||||||    
T  18356388 gtatgctgcctatgttgctgttgtt 18356364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18418753 - 18418599
Alignment:
Q  63 ttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtt 161  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||  |  ||| |||  |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  18418753 ttgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaatat-taagatgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctgtt 18418656  T
Q  162 tgtttactgcctatgttgctgttgtta-tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  18418655 tgtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaag 18418599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 19660885 - 19660956
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19660885 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 36314648 - 36314577
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314648 tactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 187
Target Start/End: Original strand, 20910745 - 20910869
Alignment:
Q  64 tgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtt 161  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20910745 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatgttcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtt 20910843  T
Q  162 tgtttactgcctatgttgctgttgtt 187  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||    
T  20910844 tgtatgctgtctatgttgctgttgtt 20910869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 264768 - 264930
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  264768 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 264867  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  264868 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 39363546 - 39363384
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  39363546 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39363447  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39363446 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Original strand, 10732941 - 10733102
Alignment:
Q  74 gtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactg 170  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || |||||    
T  10732941 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 10733040  T
Q  171 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10733041 t-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22412302 - 22412187
Alignment:
Q  119 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22412302 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttatcgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 22412203  T
Q  218 atgttgaagatgatga 233  Q
     || | ||||||||||    
T  22412202 ttgattaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23572254 - 23572180
Alignment:
Q  62 gttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaa 136  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23572254 gttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa 23572180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 220
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027046
Alignment:
Q  120 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcat--actgttt-gtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 215  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20027041  T
Q  216 agatg 220  Q
    |||||    
T  20027042 agatg 20027046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 232
Target Start/End: Original strand, 18769947 - 18770118
Alignment:
Q  61 tgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattat-gtcatactg 159  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  | ||  |     
T  18769947 tgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattatcatgattgtt 18770045  T
Q  160 tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
     ||||   |||||||||||||| ||||||||  || ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  18770046 gttgtaatctgcctatgttgctattgttattcgaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 18770118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20909174 - 20909012
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  20909174 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20909075  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20909074 gt-tgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29330096 - 29329934
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  |||||  || ||||    
T  29330096 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 29329997  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29329996 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 42245365 - 42245527
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  42245365 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 42245464  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  42245465 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 21329547 - 21329618
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21329547 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 217
Target Start/End: Original strand, 20902075 - 20902155
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902075 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20902155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 101
Target Start/End: Original strand, 22107275 - 22107357
Alignment:
Q  20 gaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgt-ttatgcattacttgaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22107275 gaggttaattataatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcattacttgaa 22107357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 39245232 - 39245136
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39245232 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29346142 - 29345980
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  29346142 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29346043  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29346042 gt-tgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22144216 - 22144065
Alignment:
Q  72 atgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttact 169  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || ||   | |||||||| ||| ||| |||||||||| |||| ||||  ||||| |  ||||    
T  22144216 atgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatact 22144117  T
Q  170 gcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144116 acctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 22144065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Original strand, 22959582 - 22959649
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  22959582 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Original strand, 2154680 - 2154776
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  2154680 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 175 - 233
Target Start/End: Original strand, 11581303 - 11581361
Alignment:
Q  175 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  11581303 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 175 - 233
Target Start/End: Original strand, 20918052 - 20918110
Alignment:
Q  175 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20918052 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 36154783 - 36154942
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  36154783 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 36154882  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||   ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  36154883 gc---tgt-gttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29348615 - 29348453
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  29348615 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29348516  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29348515 gt-tgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29351088 - 29350926
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  29351088 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29350989  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29350988 gt-tgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32027555 - 32027393
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  32027555 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32027456  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  32027455 gt-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 230
Target Start/End: Original strand, 18319100 - 18319193
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  18319100 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 21502206 - 21502277
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21502206 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21565613 - 21565546
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  21565613 tactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Original strand, 10775742 - 10775838
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||| | |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10775742 ttgatattattatgtcatgctggttttatatactgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31061164 - 31061068
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||| | | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  31061164 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 38619530 - 38619434
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38619530 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740750
Alignment:
Q  167 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 26740750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 215
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732932
Alignment:
Q  167 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 215  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26732932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 181 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23064563 - 23064512
Alignment:
Q  181 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  23064563 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23469871 - 23469818
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23469871 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 23469818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26704139 - 26704090
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26704139 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 26704090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26973872 - 26973823
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26973872 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 26973823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 217
Target Start/End: Original strand, 26012085 - 26012137
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26012085 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26012137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19668969 - 19668898
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  19668969 tactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 233
Target Start/End: Original strand, 20806850 - 20806904
Alignment:
Q  179 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  20806850 gctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 100
Target Start/End: Original strand, 21986052 - 21986130
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttga 100  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||| | |||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  21986052 gttaactataatttgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgaatatgaggtgataaaatgttatatgcattacttga 21986130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 220
Target Start/End: Original strand, 21328268 - 21328320
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21328268 ctgcctatgttgctgctgtctattaattaagctgcatgagtcggtctaagatg 21328320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Original strand, 22178271 - 22178326
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |||||||||||||| |||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22178271 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22178326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412333
Alignment:
Q  24 ttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgata 79  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcata 22412333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 220
Target Start/End: Original strand, 27989004 - 27989034
Alignment:
Q  190 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27989004 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 27989034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15796487 - 15796434
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    |||||||||||||||||  |  || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15796487 ctgcctatgttgctgtttattattgattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 15796434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20805616 - 20805575
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 209  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20805616 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 20805575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 213
Target Start/End: Original strand, 21731514 - 21731559
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 213  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  21731514 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 21731559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 213
Target Start/End: Original strand, 21809634 - 21809679
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 213  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  21809634 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 21809679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21873318 - 21873277
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 209  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21873318 ctgcctatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtc 21873277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 191 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 40725898 - 40725853
Alignment:
Q  191 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  40725898 taactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20767037 - 20766997
Alignment:
Q  169 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 209  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20767037 tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 20766997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23201424 - 23201372
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||    
T  23201424 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatg 23201372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 232
Target Start/End: Original strand, 23501408 - 23501472
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    |||||| || |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  23501408 ctgcctgtgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 23501472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26680641 - 26680605
Alignment:
Q  173 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26680641 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26680605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26952248 - 26952212
Alignment:
Q  173 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26952248 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26952212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 72)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 45130881 - 45131117
Alignment:
Q  1 aggattaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttga 100  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45130881 aggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttga 45130980  T
Q  101 agaatatttgtatacctaagatgttgatgaa-ttgaaattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagc 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45130981 agaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagc 45131080  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45131081 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31971493 - 31971257
Alignment:
Q  1 aggattaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31971493 aggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttga 31971394  T
Q  101 agaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg-tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagc 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31971393 agaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagc 31971294  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31971293 tgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 16199529 - 16199765
Alignment:
Q  1 aggattaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16199529 aggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtttatgcattacttga 16199628  T
Q  101 agaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16199629 agaatatttgtatacctaagatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagc 16199728  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16199729 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 236
Target Start/End: Original strand, 21918885 - 21919121
Alignment:
Q  3 gattaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaag 102  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| ||| |||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21918885 gattaagacttaacgatgaggttaattacgatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaag 21918984  T
Q  103 aat-atttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagc 199  Q
    ||| ||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21918985 aattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagc 21919084  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21919085 tgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Original strand, 21389358 - 21389571
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagat 122  Q
    ||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21389358 gttaattgtaatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 21389457  T
Q  123 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389458 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 21389556  T
Q  222 tgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||    
T  21389557 tgaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Original strand, 21395888 - 21396101
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagat 122  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21395888 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 21395987  T
Q  123 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21395988 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg-ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 21396086  T
Q  222 tgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||    
T  21396087 tgaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Original strand, 21790381 - 21790594
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagat 122  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21790381 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 21790480  T
Q  123 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790481 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg-ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 21790579  T
Q  222 tgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||    
T  21790580 tgaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20536424 - 20536208
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  20536424 gttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 20536325  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20536324 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20536225  T
Q  220 gttgaagatgatgatgt 236  Q
    | |||||||||||||||    
T  20536224 gatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778897
Alignment:
Q  36 tgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattga 135  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattga 21778796  T
Q  136 aattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 234  Q
    | ||||||| |||||||||| ||| |||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778797 atttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 21778895  T
Q  235 gt 236  Q
    ||    
T  21778896 gt 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Original strand, 18818314 - 18818530
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  18818314 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 18818413  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    || || ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18818414 tgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18818513  T
Q  220 gttgaagatgatgatgt 236  Q
    | |||||||||||||||    
T  18818514 gatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Original strand, 18879142 - 18879352
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  18879142 gttaactataatctgtgaagctg-ataagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 18879240  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||   |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  18879241 tgttgatgaattgcaattgatattattatg---ttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18879337  T
Q  222 tgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||    
T  18879338 tgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22626951 - 22626736
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  22626951 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaaga 22626852  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22626851 tgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 22626752  T
Q  221 ttgaagatgatgatgt 236  Q
     |||||||||||||||    
T  22626751 atgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Original strand, 21923814 - 21924049
Alignment:
Q  4 attaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaag 102  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||  | |||| ||| | ||||||||||||||    
T  21923814 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattacttgaag 21923913  T
Q  103 aatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgttta--ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 200  Q
     ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||  ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923914 tataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 21924013  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21924014 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7372986 - 7372778
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagat 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||    
T  7372986 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa-------gcattacttgaagtataattgaatatttaagat 7372894  T
Q  123 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    | || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7372893 gatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 7372794  T
Q  221 ttgaagatgatgatgt 236  Q
     |||||||||||||||    
T  7372793 atgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23406597 - 23406379
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| | |||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  23406597 gttaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 23406498  T
Q  122 tgtt--gatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    || |  | ||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406497 tgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 23406398  T
Q  218 atgttgaagatgatgatgt 236  Q
     || |||||||||||||||    
T  23406397 ttgatgaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 28648949 - 28649164
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||   ||||||  |||||    
T  28648949 gttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaaga 28649048  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28649049 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28649148  T
Q  220 gttgaagatgatgatg 235  Q
    | ||||||||||||||    
T  28649149 gatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Original strand, 16092246 - 16092463
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtat-aagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaag 120  Q
    |||||||||||| || |||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||  ||   ||||||  | ||    
T  16092246 gttaattataatatgcgaagttgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgag 16092345  T
Q  121 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 218  Q
    |||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16092346 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 16092445  T
Q  219 tgttgaagatgatgatgt 236  Q
    || |||||||||||||||    
T  16092446 tgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22875281 - 22875065
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtat-aagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaag 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||   ||||||  | ||    
T  22875281 gttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgag 22875182  T
Q  121 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  22875181 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaatt 22875082  T
Q  220 gttgaagatgatgatgt 236  Q
    | |||||||||||||||    
T  22875081 gatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6759472 - 6759255
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtat-aagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaag 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||   ||||||  | ||    
T  6759472 gttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgag 6759373  T
Q  121 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 218  Q
    |||||||    ||| | ||||||||||||||||||  |||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6759372 atgttgac---ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 6759276  T
Q  219 tgttgaagatgatgatgtcca 239  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  6759275 tgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23648769 - 23648554
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |  ||| |||  |||||    
T  23648769 gttaattataatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaga 23648670  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgt--ttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    ||||| || |||| || |||||||||||||||||  |||  ||||   |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  23648669 tgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtt 23648570  T
Q  220 gttgaagatgatgatg 235  Q
    | | |||||| |||||    
T  23648569 gattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 5866324 - 5866395
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866324 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 14409444 - 14409606
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  14409444 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14409543  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  14409544 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17140987 - 17140916
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17140987 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21491066 - 21490995
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21491066 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1484564 - 1484402
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  1484564 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 1484465  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  1484464 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 5853292 - 5853454
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  5853292 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 5853391  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  5853392 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20403389 - 20403227
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  20403389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20403290  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20403289 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22001915 - 22001753
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  22001915 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22001816  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22001815 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 4542373 - 4542535
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgttta-ctg 170  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||| | || ||     
T  4542373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatctt 4542472  T
Q  171 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4542473 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 217
Target Start/End: Original strand, 16413331 - 16413462
Alignment:
Q  87 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 184  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || |||||| | ||||||||||    
T  16413331 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 16413429  T
Q  185 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413430 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16413462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41598350 - 41598188
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  41598350 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41598251  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
     | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  41598250 ac-tgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6520439 - 6520368
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6520439 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26219831 - 26219733
Alignment:
Q  119 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219831 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactattttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 26219733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Original strand, 26225295 - 26225409
Alignment:
Q  119 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225295 agatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgttttgtatattgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 26225393  T
Q  218 atgttgaagatgatga 233  Q
     || | ||||||||||    
T  26225394 ttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 38855301 - 38855372
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  38855301 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 23760894 - 23760962
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23760894 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 100
Target Start/End: Original strand, 25363042 - 25363123
Alignment:
Q  20 gaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  25363042 gaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtggtataatgttttatgcattacttga 25363123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4483442 - 4483281
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  4483442 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 4483343  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4483342 gt-tgtgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 15203231 - 15203393
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||  | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  15203231 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15203330  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  15203331 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 20046195 - 20046357
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |  |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  |||||  || ||||    
T  20046195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 20046294  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20046295 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 175 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19896323 - 19896265
Alignment:
Q  175 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19896323 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 186 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249384
Alignment:
Q  186 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 186 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255222
Alignment:
Q  186 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 166 - 217
Target Start/End: Original strand, 983456 - 983508
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983456 tactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 983508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 234
Target Start/End: Original strand, 18678102 - 18678221
Alignment:
Q  117 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgttta--ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 214  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| | |||||  | ||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18678102 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtct 18678201  T
Q  215 aagatgttgaagatgatgat 234  Q
    ||| || | |||||| ||||    
T  18678202 aagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 19801448 - 19801530
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || |||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19801448 ttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagatg 19801530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15070654 - 15070574
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070654 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15070574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 217
Target Start/End: Original strand, 45290761 - 45290841
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290761 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45290841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 239
Target Start/End: Original strand, 19937114 - 19937174
Alignment:
Q  179 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||    
T  19937114 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 32121853 - 32121734
Alignment:
Q  117 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgttta--ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 214  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| | |||||  | ||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  32121853 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattct 32121754  T
Q  215 aagatgttgaagatgatgat 234  Q
    ||| || | |||||| ||||    
T  32121753 aagttgattaagatgttgat 32121734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 61 - 229
Target Start/End: Original strand, 13508028 - 13508199
Alignment:
Q  61 tgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg 159  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| | | |||   | ||||||||||| ||||  ||    
T  13508028 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg 13508127  T
Q  160 tt-tgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 229  Q
    || ||  || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13508128 ttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 17612160 - 17612231
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  17612160 tactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24353091 - 24353036
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353091 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 24353036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Original strand, 26355748 - 26355815
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  26355748 tactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 37116418 - 37116363
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116418 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 37116363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20498740 - 20498578
Alignment:
Q  61 tgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg 159  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || ||| |||||||||||  |||| || ||   | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||| ||     
T  20498740 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgcta 20498641  T
Q  160 tttgtt-tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |||    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20498640 ttttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 20498578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 20502154 - 20502207
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20502154 ctgcctatgttgctgttgtatgttaattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 20502207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21285668 - 21285616
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21285668 tactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaag 21285616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Original strand, 17267044 - 17267099
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267044 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 17267099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Original strand, 19154937 - 19154992
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19154937 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 19154992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22525628 - 22525573
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    ||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22525628 tactgcctaagttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 22525573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 229
Target Start/End: Original strand, 13597669 - 13597731
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 229  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13597669 ctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 233
Target Start/End: Original strand, 25484376 - 25484430
Alignment:
Q  179 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || | ||||||||||    
T  25484376 gctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14823935 - 14823774
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  14823935 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14823836  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||  || | ||||||||||    
T  14823835 gt-tgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaagatgatga 14823774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 232
Target Start/End: Original strand, 17353996 - 17354060
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  17353996 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 17354060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Original strand, 17439557 - 17439612
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17439557 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaagatg 17439612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26224034 - 26223917
Alignment:
Q  119 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 216  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| || |||  || || ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  26224034 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatattgctt-tattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaa 26223936  T
Q  217 gatgttgaagatgatgatg 235  Q
    | || | |||||| |||||    
T  26223935 gttgattaagatgttgatg 26223917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28397617 - 28397566
Alignment:
Q  169 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28397617 tgcctatgttgttgttgtctattaattaagctgcatgagtcggtctaagatg 28397566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21673772 - 21673723
Alignment:
Q  169 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21673772 tgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaag 21673723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 209
Target Start/End: Original strand, 20533467 - 20533503
Alignment:
Q  173 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 209  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20533467 tatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtc 20533503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22995911 - 22995859
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |||||||||||||||||||    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22995911 ctgcctatgttgctgttgtctagtaattaagctgtatgagtcggtctaagatg 22995859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 221
Target Start/End: Original strand, 27941665 - 27941713
Alignment:
Q  173 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    |||||||||||||| | || | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27941665 tatgttgctgttgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtctaagatgt 27941713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13733 - 13497
Alignment:
Q  1 aggattaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13733 aggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttga 13634  T
Q  101 agaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg-tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagc 199  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13633 agaatgtttgtatacataagatgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagc 13534  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13533 tgcatgagtcggtctaagttgttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 71)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 37999 - 38235
Alignment:
Q  1 aggattaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttga 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37999 aggattaagacttaacaatgaggttaattataatctctgaagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttga 38098  T
Q  101 agaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg-tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagc 199  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38099 agaatgtttgtatacataagatgatgatgaatcgaaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagc 38198  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38199 tgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20309343 - 20309108
Alignment:
Q  1 aggattaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttga 100  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20309343 aggattaagacttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttga 20309244  T
Q  101 agaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgct-gttgttatttaactaagc 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20309243 agaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagc 20309145  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309144 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23286077 - 23285865
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||  |||||    
T  23286077 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaaga 23285978  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  23285977 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtc--tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 23285880  T
Q  222 tgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||    
T  23285879 tgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Original strand, 22731139 - 22731355
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  ||| |    
T  22731139 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaata 22731238  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgttta--ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  22731239 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaactt 22731338  T
Q  220 gttgaagatgatgatgt 236  Q
    | |||||||||||||||    
T  22731339 gatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Original strand, 23654288 - 23654507
Alignment:
Q  20 gaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgtataccta 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||  ||    
T  23654288 gaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatattta 23654387  T
Q  119 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgt--ttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  |||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654388 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23654487  T
Q  217 gatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  23654488 gttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Original strand, 22738085 - 22738300
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  22738085 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 22738184  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22738185 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22738283  T
Q  220 gttgaagatgatgatgt 236  Q
    | | |||||||||||||    
T  22738284 gatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23076658 - 23076442
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  23076658 gttaattataatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 23076559  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    | ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  23076558 tattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtg 23076459  T
Q  220 gttgaagatgatgatgt 236  Q
    | |||||||||||||||    
T  23076458 gatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23060728 - 23060513
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||  |||  |||||    
T  23060728 gttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaaga 23060630  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23060629 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23060530  T
Q  220 gttgaagatgatgatgt 236  Q
    | |||||||||||||||    
T  23060529 gatgaagatgatgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 298716 - 298933
Alignment:
Q  20 gaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgtataccta 118  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||| |||  ||    
T  298716 gaggttaactataatatgtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattta 298815  T
Q  119 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 215  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298816 agatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 298915  T
Q  216 agatgttgaagatgatga 233  Q
    || || | ||||||||||    
T  298916 agttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22337350 - 22337115
Alignment:
Q  4 attaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaag 102  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||     
T  22337350 attaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaat 22337251  T
Q  103 aatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgttta--ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 200  Q
     ||   ||||||  | |||||||| ||  ||| | |||||||||||||||||| |||||| | ||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22337250 tatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgttgttatttaactaagct 22337151  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22337150 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 119 - 236
Target Start/End: Original strand, 23103399 - 23103516
Alignment:
Q  119 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 218  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23103399 agatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 23103498  T
Q  219 tgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23103499 tgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23660238 - 23660023
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||  ||| |||  |||||    
T  23660238 gttaattataatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaaga 23660139  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  23660138 tgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctgttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttg 23660039  T
Q  221 ttgaagatgatgatgt 236  Q
     |||||||||||||||    
T  23660038 atgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22105575 - 22105412
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtt--tact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||| |   ||||    
T  22105575 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 22105476  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22105475 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 230
Target Start/End: Original strand, 21155060 - 21155219
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  21155060 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21155159  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 230  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  21155160 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 160 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8946733 - 8946657
Alignment:
Q  160 tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8946733 tttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18809105 - 18808943
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  18809105 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18809006  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18809005 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23131024 - 23130862
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  23131024 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23130925  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23130924 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23133491 - 23133329
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  23133491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23133392  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23133391 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 23709532 - 23709694
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  23709532 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23709631  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23709632 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 23712013 - 23712175
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  23712013 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23712112  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23712113 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26505541 - 26505379
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| || |||  || ||||    
T  26505541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26505442  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26505441 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26508019 - 26507857
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| || |||  || ||||    
T  26508019 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26507920  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26507919 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 34402522 - 34402684
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  34402522 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34402621  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  34402622 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 39682475 - 39682313
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  39682475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39682376  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39682375 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 173 - 236
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040310
Alignment:
Q  173 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 166 - 235
Target Start/End: Original strand, 22134257 - 22134326
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 235  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  22134257 tactgcctatgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23135737 - 23135590
Alignment:
Q  87 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 184  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || |||||  | ||||||||||    
T  23135737 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23135639  T
Q  185 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23135638 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 232
Target Start/End: Original strand, 40622151 - 40622327
Alignment:
Q  61 tgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatt-----tgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattat-gtca 154  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  | |    
T  40622151 tgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtactgtatacataagatgttgatgaattg-aattgatataattatcatga 40622249  T
Q  155 tactgtttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    |  |  ||||   ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  40622250 ttgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 40622327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 571559 - 571397
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || | |  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  571559 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 571460  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  571459 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6726157 - 6725995
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||  | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  6726157 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6726058  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  6726057 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24367936 - 24367790
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  24367936 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24367837  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367836 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24367790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 23071999 - 23072070
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23071999 tactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 217
Target Start/End: Original strand, 23708562 - 23708721
Alignment:
Q  61 tgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg 159  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||| ||   | |||||| ||||| ||| |||||||||| |||| ||||  ||    
T  23708562 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttg 23708661  T
Q  160 ttt-gtttactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||| |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23708662 ttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaag 23708721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 235
Target Start/End: Original strand, 32214936 - 32215085
Alignment:
Q  87 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 184  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || |||||| | ||||| ||||    
T  32214936 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt 32215034  T
Q  185 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  32215035 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 24898195 - 24898358
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  24898195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24898294  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24898295 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 24900678 - 24900841
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  24900678 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24900777  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24900778 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 24903155 - 24903318
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  24903155 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24903254  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24903255 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 24905632 - 24905795
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  24905632 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24905731  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24905732 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 24908107 - 24908270
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  24908107 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24908206  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24908207 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 32039498 - 32039660
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  32039498 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32039597  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  32039598 gt-tgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28577156 - 28577099
Alignment:
Q  176 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28577156 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43137357 - 43137301
Alignment:
Q  175 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  43137357 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 45029854 - 45030016
Alignment:
Q  73 tgtgatataa-tgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  |||||  || || |    
T  45029854 tgtgatataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 45029953  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45029954 gt-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7679656 - 7679589
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||    
T  7679656 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19671901 - 19671830
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  19671901 tactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287378
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 23287378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 230
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643109
Alignment:
Q  175 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  24643054 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Original strand, 24529595 - 24529691
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||  | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24529595 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactga-tgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392397
Alignment:
Q  167 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 26392397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28406047 - 28405981
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  28406047 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 38967426 - 38967374
Alignment:
Q  181 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38967426 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23207348 - 23207293
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207348 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 23207293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25175921 - 25175854
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||    
T  25175921 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25616306 - 25616204
Alignment:
Q  117 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgttta--ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 214  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| | |||||  | ||  ||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25616306 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaatttaactaagttgcatgagtcagtct 25616207  T
Q  215 aag 217  Q
    |||    
T  25616206 aag 25616204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 217
Target Start/End: Original strand, 18786953 - 18787005
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786953 tactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18787005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 27753810 - 27753730
Alignment:
Q  4 attaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatg 84  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  27753810 attaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 27753730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 220
Target Start/End: Original strand, 7735 - 7838
Alignment:
Q  119 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 216  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||  ||||| |  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || ||||||    
T  7735 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaa 7834  T
Q  217 gatg 220  Q
    ||||    
T  7835 gatg 7838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Original strand, 20520243 - 20520298
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520243 tactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20520298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 209
Target Start/End: Original strand, 22799126 - 22799220
Alignment:
Q  117 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtt--tgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 209  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||  ||||  |||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22799126 taagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgatgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 22799220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9241994 - 9241941
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||| | || | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  9241994 ctgcctatgttgctgttgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtctaagatgt 9241941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 219
Target Start/End: Original strand, 32451981 - 32452033
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32451981 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaagat 32452033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Original strand, 22413188 - 22413243
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |||||||||||||| |||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22413188 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22413243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23004819 - 23004764
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23004819 tactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 23004764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23038095 - 23038048
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 215  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23038095 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtccgtcta 23038048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25108958 - 25108903
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25108958 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaagatg 25108903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 220
Target Start/End: Original strand, 24697607 - 24697712
Alignment:
Q  119 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcat--actgtttgtt-tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 214  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||| |||| ||||  |||||||| | ||||||||| |||| |||| |||  ||||||| | |||||||||||||||    
T  24697607 agatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgtttgatgtactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtct 24697706  T
Q  215 aagatg 220  Q
    ||||||    
T  24697707 aagatg 24697712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 21073545 - 21073598
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    |||| |||||||||||||| | || | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21073545 ctgcatatgttgctgttgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtctaagatgt 21073598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 209
Target Start/End: Original strand, 24655396 - 24655432
Alignment:
Q  173 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24655396 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 24655432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24869939 - 24869903
Alignment:
Q  173 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24869939 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 24869903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 209
Target Start/End: Original strand, 25961592 - 25961628
Alignment:
Q  173 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25961592 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 25961628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34137007 - 34136955
Alignment:
Q  169 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  34137007 tgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaaaatgt 34136955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4949 - 4712
Alignment:
Q  1 aggattaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttga 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4949 aggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttga 4850  T
Q  101 agaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 198  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |  ||||||||| |||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4849 agaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaag 4750  T
Q  199 ctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4749 ctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 173 - 12
Alignment:
Q  1 aggattaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttga 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  173 aggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttga 74  T
Q  101 agaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt 162  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |  ||||||||| ||||||    
T  73 agaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgttt 12  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 70)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 14053185 - 14053422
Alignment:
Q  1 aggattaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttga 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14053185 aggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttga 14053284  T
Q  101 agaatatttgtatacctaag-atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaag 198  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  14053285 agaatatttgtatgcataagaatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaag 14053384  T
Q  199 ctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14053385 ttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12902995 - 12902757
Alignment:
Q  1 aggattaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttg 99  Q
    |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12902995 aggattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttg 12902896  T
Q  100 aagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaa 197  Q
    || |||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902895 aataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaa 12902796  T
Q  198 gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12902795 gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7089096 - 7088877
Alignment:
Q  20 gaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgtataccta 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||  ||    
T  7089096 gaggttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgta 7088997  T
Q  119 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088996 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 7088897  T
Q  217 gatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    | || |||||||||||||||    
T  7088896 gttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17046722 - 17046487
Alignment:
Q  1 aggattaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttga 100  Q
    |||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17046722 aggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattacttga 17046623  T
Q  101 agaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagc 199  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || || | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17046622 agaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg-ttctatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagc 17046524  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046523 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22636669 - 22636437
Alignment:
Q  4 attaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaag 102  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22636669 attaagacttaacgaggatgttaattataatctgtgaagctgt-taagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaag 22636571  T
Q  103 aatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 200  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22636570 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgttgttatttaactaagct 22636471  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 234  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  22636470 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 44053064 - 44052829
Alignment:
Q  4 attaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaag 102  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  44053064 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaag 44052965  T
Q  103 aatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 200  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  44052964 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgttgttatttaactgagct 44052865  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  44052864 gcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Original strand, 23374261 - 23374473
Alignment:
Q  20 gaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgtataccta 118  Q
    |||||||| |||||||| ||||| | | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||  ||    
T  23374261 gaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattta 23374360  T
Q  119 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 216  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23374361 agatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaa 23374460  T
Q  217 gatgttgaagatg 229  Q
    | |||||||||||    
T  23374461 gttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 61 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7798952 - 7798774
Alignment:
Q  61 tgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg 159  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  7798952 tgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcatgctg 7798853  T
Q  160 ttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7798852 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 27 - 236
Target Start/End: Original strand, 16270145 - 16270356
Alignment:
Q  27 attataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgtt 125  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||    
T  16270145 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgtt 16270244  T
Q  126 gatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 224  Q
    | | | ||| | |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||    
T  16270245 gttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatga 16270344  T
Q  225 agatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||    
T  16270345 agatgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 16377428 - 16377639
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||  || | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  16377428 gttaattataatctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 16377527  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  16377528 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16377627  T
Q  222 tgaagatgatga 233  Q
    ||||||| ||||    
T  16377628 tgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7893935 - 7893703
Alignment:
Q  4 attaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaag 102  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||   || |||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||    
T  7893935 attaagacttaacgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgt---tgctgattatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaag 7893839  T
Q  103 aatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 200  Q
     ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7893838 tataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagct 7893739  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  7893738 gcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Original strand, 16239856 - 16240090
Alignment:
Q  4 attaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaag 102  Q
    ||||||||||||   ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||    
T  16239856 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaag 16239955  T
Q  103 aatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 201  Q
     ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||    
T  16239956 tataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgctattgttatttaattaagttg 16240055  T
Q  202 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  16240056 catgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14038863 - 14038653
Alignment:
Q  24 ttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagat 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||   ||||||  | ||||    
T  14038863 ttaattataatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagat 14038764  T
Q  123 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |||| ||| ||| | |||||||||||||| |||  |||||  || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  14038763 gttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 14038664  T
Q  221 ttgaagatgat 231  Q
     ||||||||||    
T  14038663 atgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 117 - 236
Target Start/End: Original strand, 52873367 - 52873488
Alignment:
Q  117 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 214  Q
    ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873367 taagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 52873466  T
Q  215 aagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||| || |||||||||||||||    
T  52873467 aagttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899891
Alignment:
Q  67 ttatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gt 164  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||  ||  ||||| ||    
T  6900062 ttatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttgt 6899963  T
Q  165 ttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6899962 atactgcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 160 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3096369 - 3096293
Alignment:
Q  160 tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3096369 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22353999 - 22353835
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgttta--ct 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||  |  |  ||    
T  22353999 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatct 22353900  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22353899 gcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 18215274 - 18215436
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  18215274 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18215373  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18215374 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 44928879 - 44929042
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||  ||| ||| | |||| ||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  44928879 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 44928978  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44928979 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 3096863 - 3096772
Alignment:
Q  19 tgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttg 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3096863 tgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatgtttatgcattacttgaagaatatttg 3096772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15551888 - 15551817
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15551888 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Original strand, 54798756 - 54798872
Alignment:
Q  119 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 216  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54798756 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaa 54798855  T
Q  217 gatgttgaagatgatga 233  Q
    | || | ||||||||||    
T  54798856 gttgattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 12307 - 12469
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  12307 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12406  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12407 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 15118352 - 15118514
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  15118352 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15118451  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15118452 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 150
Target Start/End: Original strand, 15121747 - 15121834
Alignment:
Q  62 gttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattat 150  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15121747 gttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattgatataattat 15121834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 44615450 - 44615288
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgt--ttgtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||  |||| ||||    
T  44615450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 44615351  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44615350 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 52312672 - 52312510
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  52312672 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 52312573  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  52312572 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Original strand, 1837503 - 1837671
Alignment:
Q  67 ttatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--g 163  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||| |||||||||||||| ||||||  |    
T  1837503 ttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttg 1837602  T
Q  164 tttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    | |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  1837603 tatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14280431 - 14280316
Alignment:
Q  119 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 216  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  |||||  || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280431 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 14280333  T
Q  217 gatgttgaagatgatga 233  Q
    | || | ||||||||||    
T  14280332 gttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Original strand, 23803280 - 23803427
Alignment:
Q  87 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 184  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || |||| | | ||||||||||    
T  23803280 tatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt 23803378  T
Q  185 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23803379 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 187
Target Start/End: Original strand, 43256106 - 43256230
Alignment:
Q  64 tgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaat-atttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtt 161  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  43256106 tgattataatgtgatataatattatatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 43256204  T
Q  162 tgtttactgcctatgttgctgttgtt 187  Q
     || | ||||||||||||||||||||    
T  43256205 ggtatgctgcctatgttgctgttgtt 43256230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 44773087 - 44773249
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  || | || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  44773087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44773186  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44773187 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 50222339 - 50222501
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || || |    
T  50222339 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataat 50222438  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  50222439 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19242846 - 19242693
Alignment:
Q  87 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 184  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || |||||  | ||| ||||||    
T  19242846 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt 19242748  T
Q  185 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||    
T  19242747 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 220
Target Start/End: Original strand, 13794 - 13956
Alignment:
Q  61 tgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg 159  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || ||| |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||  ||    
T  13794 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg 13893  T
Q  160 ttt-gtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13894 ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 13956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Original strand, 51463934 - 51464030
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  51463934 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3515154 - 3515007
Alignment:
Q  87 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 184  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||| | ||||||  || |||||| | ||||||||||    
T  3515154 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 3515056  T
Q  185 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3515055 gttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Original strand, 18239434 - 18239581
Alignment:
Q  87 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 184  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || |||||  | || |||||||    
T  18239434 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt 18239532  T
Q  185 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18239533 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 235
Target Start/End: Original strand, 19618238 - 19618336
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||  |||||  || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  19618238 ttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12611090 - 12610950
Alignment:
Q  87 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctgttgt 186  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||| | |      | ||||||||||||    
T  12611090 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgt------tgtgttgctgttgt 12610997  T
Q  187 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12610996 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12774078 - 12774011
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12774078 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 39706338 - 39706409
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  39706338 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 175 - 233
Target Start/End: Original strand, 7641286 - 7641344
Alignment:
Q  175 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  7641286 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Original strand, 12288211 - 12288312
Alignment:
Q  120 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcat--actg-tttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 215  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||| |||| ||||  |||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288211 gatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 12288310  T
Q  216 ag 217  Q
    ||    
T  12288311 ag 12288312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 217
Target Start/End: Original strand, 15355391 - 15355471
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355391 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15355471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 217
Target Start/End: Original strand, 52243137 - 52243298
Alignment:
Q  61 tgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcat--ac 157  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||| |  |||| || ||   | |||||||| ||||||  | |||||||| |||| ||||  ||    
T  52243137 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaac 52243236  T
Q  158 tg-tttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243237 tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52243298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15367789 - 15367690
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||    
T  15367789 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15367691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15370117 - 15370018
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||    
T  15370117 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15370019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15371301 - 15371202
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||    
T  15371301 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15371203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15373582 - 15373483
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||    
T  15373582 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15373484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15402802 - 15402703
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||    
T  15402802 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15402704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 100
Target Start/End: Original strand, 17047979 - 17048055
Alignment:
Q  25 taattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttga 100  Q
    |||||| || |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17047979 taattacaacctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 17048055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 44102376 - 44102214
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| | | ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  44102376 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44102277  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
     | | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44102276 ac-tgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 217
Target Start/End: Original strand, 8574871 - 8574969
Alignment:
Q  119 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||  ||||| || |||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574871 agatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8574969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16223629 - 16223532
Alignment:
Q  140 gatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||| ||||||  || |||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  16223629 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8846427 - 8846360
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||| |||||||    
T  8846427 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 217
Target Start/End: Original strand, 14970773 - 14970853
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || || ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14970773 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgc-tgttttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 14970853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 217
Target Start/End: Original strand, 43198611 - 43198657
Alignment:
Q  172 ctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198611 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43198657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 220
Target Start/End: Original strand, 21815689 - 21815734
Alignment:
Q  175 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21815689 tgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatg 21815734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6190531 - 6190479
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190531 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 6190479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17333347 - 17333292
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17333347 tactgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagtctatgatgt 17333292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Original strand, 46640506 - 46640561
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640506 tactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 46640561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Original strand, 53082202 - 53082257
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082202 tactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 53082257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 209
Target Start/End: Original strand, 16348716 - 16348757
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 209  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16348716 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16348757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 209
Target Start/End: Original strand, 16357004 - 16357045
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 209  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16357004 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16357045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 24047352 - 24047405
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||| | || | |||||||||||  ||||||||||||||    
T  24047352 ctgcctatgttgctgttgtaaattgattaagctgcatgtatcggtctaagatgt 24047405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 26045346 - 26045399
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    |||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26045346 ctgcctattttgctgttgtatattaactaagctgcatgatccggtctaagatgt 26045399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 26050527 - 26050580
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    |||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26050527 ctgcctattttgctgttgtatattaactaagctgcatgatccggtctaagatgt 26050580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 209
Target Start/End: Original strand, 11250619 - 11250655
Alignment:
Q  173 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11250619 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 11250655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 209
Target Start/End: Original strand, 15353365 - 15353401
Alignment:
Q  173 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15353365 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 15353401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 15348 - 15584
Alignment:
Q  1 aggattaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttga 100  Q
    |||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15348 aggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatatttatgcattacttga 15447  T
Q  101 agaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg-tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagc 199  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15448 agaatatttttatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaagc 15547  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15548 tgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7465 - 7295
Alignment:
Q  62 gttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattat-gtcatactgt 160  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  | ||  |      
T  7465 gttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaatttg-tataattatcatgattgttg 7367  T
Q  161 ttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||   |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  7366 ttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Original strand, 10312 - 10544
Alignment:
Q  4 attaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaaga 103  Q
    ||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10312 attaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaaga 10411  T
Q  104 atatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgc 202  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  10412 atatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgc 10510  T
Q  203 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10511 atgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16517 - 16282
Alignment:
Q  1 aggattaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttga 100  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16517 aggattaagacttaataatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttga 16418  T
Q  101 agaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagc 199  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16417 agaatgtttgtatacataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagc 16319  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16318 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 935 - 1170
Alignment:
Q  1 aggattaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttga 100  Q
    ||||||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  935 aggattaagtcttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttga 1034  T
Q  101 agaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagc 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||| |||||||||||||| || || ||| ||||||||||    
T  1035 agaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatg-ttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagc 1133  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1134 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1524 - 1289
Alignment:
Q  1 aggattaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttga 100  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1524 aggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttga 1425  T
Q  101 agaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagc 199  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1424 agaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatg-ttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagc 1326  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1325 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7501 - 7266
Alignment:
Q  1 aggattaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttga 100  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7501 aggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttga 7402  T
Q  101 agaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagc 199  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||  || |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  7401 agaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttg-ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagc 7303  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7302 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 233
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15356
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 57)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Original strand, 27250631 - 27250850
Alignment:
Q  20 gaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgtataccta 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||  ||    
T  27250631 gaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatattta 27250730  T
Q  119 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250731 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 27250830  T
Q  217 gatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  27250831 gttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 38801274 - 38801508
Alignment:
Q  1 aggattaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttga 100  Q
    |||||||||||||||   |||| |||| |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38801274 aggattaagacttaataatgagattaactataatttgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatgtttatgcattacttga 38801373  T
Q  101 agaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagc 199  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38801374 agaataattgtatatataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcttgctg-ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagc 38801472  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38801473 tgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21026899 - 21026680
Alignment:
Q  20 gaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgtataccta 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||  ||    
T  21026899 gaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattta 21026800  T
Q  119 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 216  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026799 agatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21026700  T
Q  217 gatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    | |||||| |||||||||||    
T  21026699 gttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 50210118 - 50210333
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttat-gcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||   ||||||| | |||    
T  50210118 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgaga 50210217  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50210218 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 50210317  T
Q  220 gttgaagatgatgatg 235  Q
    | ||||||||||||||    
T  50210318 gatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34509996 - 34509783
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||   ||||||  |||||    
T  34509996 gttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaaga 34509897  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34509896 tgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34509797  T
Q  220 gttgaagatgatga 233  Q
    | ||||||||||||    
T  34509796 gatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 35 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22532473 - 22532269
Alignment:
Q  35 ctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaatt 133  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||   || |||  |||||||||| ||||||    
T  22532473 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaatt 22532374  T
Q  134 gaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 231  Q
    | ||| |||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  22532373 gcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgat 22532274  T
Q  232 gatgt 236  Q
    |||||    
T  22532273 gatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Original strand, 22354477 - 22354616
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  22354477 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaaga 22354576  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtt 161  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  22354577 tgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20135403 - 20135188
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||| |||| |||||    
T  20135403 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagttttattgaatacttaaga 20135304  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgt--ttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    ||||| ||||||| |  |||||||||||||||||  |||  ||||   ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  20135303 tgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagtt 20135204  T
Q  220 gttgaagatgatgatg 235  Q
    | | |||||| |||||    
T  20135203 gattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 236
Target Start/End: Original strand, 45574842 - 45575008
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtt--tact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |  |||  | ||| |||| ||| ||| | ||| |||||||||||||| |||||| |   ||||    
T  45574842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatact 45574941  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45574942 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 138 - 236
Target Start/End: Original strand, 20847175 - 20847275
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 235  Q
    |||||||  ||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20847175 ttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 20847274  T
Q  236 t 236  Q
    |    
T  20847275 t 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 22468604 - 22468816
Alignment:
Q  25 taattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatg 123  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||  | |||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   ||  ||| |||  |||||||    
T  22468604 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgta-attatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatg 22468702  T
Q  124 ttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgttta--ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||  | ||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||     
T  22468703 ttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 22468802  T
Q  222 tgaagatgatgatg 235  Q
    | |||||| |||||    
T  22468803 ttaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31612475 - 31612313
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || ||| || |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  31612475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 31612376  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  31612375 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 33797694 - 33797570
Alignment:
Q  64 tgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtt 161  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  33797694 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 33797596  T
Q  162 tgtttactgcctatgttgctgttgtt 187  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||    
T  33797595 tgtatgctgcatatgttgctgttgtt 33797570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13989028 - 13988866
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  13989028 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13988929  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13988928 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 21923291 - 21923453
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  21923291 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21923390  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21923391 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 14295601 - 14295672
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14295601 tactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 48603730 - 48603652
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttga 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48603730 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 48603652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Original strand, 23593750 - 23593897
Alignment:
Q  87 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 184  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || |||||  | ||||||||||    
T  23593750 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23593848  T
Q  185 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23593849 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 21475087 - 21475249
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  21475087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21475186  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  21475187 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 168 - 235
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29298298 - 29298137
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||| |||| ||||||  || ||||    
T  29298298 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatact 29298200  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29298199 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29776850 - 29776688
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  | |||  || ||||    
T  29776850 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatact 29776751  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29776750 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21840863 - 21840766
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 234  Q
    ||||||||||||||||||  |||||  || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  21840863 ttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 220
Target Start/End: Original strand, 21896258 - 21896361
Alignment:
Q  119 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 216  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21896258 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 21896357  T
Q  217 gatg 220  Q
    ||||    
T  21896358 gatg 21896361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Original strand, 22921919 - 22921986
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22921919 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 433172 - 433012
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg--tttgtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||| |  ||  ||||| ||||    
T  433172 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatact 433073  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  433072 gcctgtgttgc---cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 220
Target Start/End: Original strand, 21861513 - 21861675
Alignment:
Q  61 tgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg 159  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || ||| |||||||||||  |||| || ||   | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||| |||    
T  21861513 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg 21861612  T
Q  160 ttt-gtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21861613 ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaagatg 21861675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 179 - 236
Target Start/End: Original strand, 13212970 - 13213027
Alignment:
Q  179 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  13212970 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 127
Target Start/End: Original strand, 22356060 - 22356185
Alignment:
Q  4 attaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttg-ttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaa 101  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| | | |||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22356060 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaa 22356159  T
Q  102 gaatatttgtatacctaagatgttga 127  Q
    |||| |||| |||  || ||||||||    
T  22356160 gaatgtttgaatatttatgatgttga 22356185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 127
Target Start/End: Original strand, 22357746 - 22357871
Alignment:
Q  4 attaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttg-ttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaa 101  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| | | |||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22357746 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaa 22357845  T
Q  102 gaatatttgtatacctaagatgttga 127  Q
    |||| |||| |||  || ||||||||    
T  22357846 gaatgtttgaatatttatgatgttga 22357871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33681078 - 33681010
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  33681078 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 233
Target Start/End: Original strand, 16275428 - 16275526
Alignment:
Q  136 aattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  || |||||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16275428 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21342148 - 21342090
Alignment:
Q  181 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||    
T  21342148 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21707225 - 21707167
Alignment:
Q  175 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21707225 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21711767 - 21711709
Alignment:
Q  175 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21711767 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 239
Target Start/End: Original strand, 15860078 - 15860177
Alignment:
Q  141 atattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcc 238  Q
    |||||||||||||||  |||||  || |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| ||||    
T  15860078 atattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcc 15860176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16361975 - 16361915
Alignment:
Q  175 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 235  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  16361975 tgttgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16758720 - 16758668
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16758720 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 16758668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20918675 - 20918623
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918675 tactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20918623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21347013 - 21346961
Alignment:
Q  181 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21347013 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21714610 - 21714546
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  21714610 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21754116 - 21754064
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754116 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21754064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Original strand, 35261099 - 35261183
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |||||||| |||| |||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261099 ttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 35261183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Original strand, 50614167 - 50614222
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614167 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 50614222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Original strand, 50621995 - 50622050
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621995 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 50622050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22237695 - 22237630
Alignment:
Q  169 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  22237695 tgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 220
Target Start/End: Original strand, 16368338 - 16368391
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368338 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 16368391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 52928020 - 52928088
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  52928020 tactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatggtgatgt 52928088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20248350 - 20248283
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  20248350 tactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 221
Target Start/End: Original strand, 21533923 - 21533978
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    |||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21533923 tactgcgtatgttgttgttgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 21533978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Original strand, 41050086 - 41050141
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41050086 tactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 41050141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 232
Target Start/End: Original strand, 42865266 - 42865330
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  42865266 ctgcatatgttgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 42865330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 217
Target Start/End: Original strand, 22123171 - 22123214
Alignment:
Q  175 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123171 tgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22123214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 235
Target Start/End: Original strand, 24783150 - 24783212
Alignment:
Q  173 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 235  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||    
T  24783150 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatg 24783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 50686681 - 50686627
Alignment:
Q  167 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50686681 actgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaagatg 50686627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 20438046 - 20438099
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||| | || | ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  20438046 ctgcctatgttgctgttgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtttaagatgt 20438099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 40389250 - 40389172
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||  | ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  40389250 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactga-tgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtcta 40389172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 29 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 47202 - 46995
Alignment:
Q  29 tataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgat 128  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47202 tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgtttatgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttgat 47103  T
Q  129 gaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47102 gaattgaaattgatattattatgtcatgctg-ctgtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaaga 47004  T
Q  228 tgatgatgt 236  Q
    |||||||||    
T  47003 tgatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 92)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Original strand, 20698322 - 20698556
Alignment:
Q  4 attaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaaga 103  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||  ||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698322 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaaga 20698421  T
Q  104 atatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 201  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698422 atatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 20698521  T
Q  202 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20698522 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13442509 - 13442274
Alignment:
Q  4 attaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaag 102  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13442509 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaag 13442410  T
Q  103 aatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 200  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13442409 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgttgttatttaactaagct 13442310  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13442309 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17488091 - 17487856
Alignment:
Q  4 attaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaag 102  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17488091 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaag 17487992  T
Q  103 aatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 200  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17487991 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaactaagct 17487892  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17487891 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12399428 - 12399209
Alignment:
Q  20 gaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgt-ttatgcattacttgaagaatatttgtataccta 118  Q
    |||||||| |||||||||||||| | | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||| |||  ||    
T  12399428 gaggttaactataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgagaattatttgaatattta 12399329  T
Q  119 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 216  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399328 agatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 12399229  T
Q  217 gatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  12399228 gttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17499573 - 17499338
Alignment:
Q  4 attaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaag 102  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17499573 attaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattacttgaag 17499474  T
Q  103 aatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 200  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17499473 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaactaagct 17499374  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17499373 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 217
Target Start/End: Original strand, 14576738 - 14576934
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  14576738 gttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 14576837  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtt-tgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14576838 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtttatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaag 14576934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14973070 - 14972854
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  14973070 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgaga 14972971  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14972970 tgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14972871  T
Q  220 gttgaagatgatgatgt 236  Q
    | |||||||||||||||    
T  14972870 gatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Original strand, 23083266 - 23083482
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| | | ||| |||  |||||    
T  23083266 gttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaaga 23083365  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23083366 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23083465  T
Q  220 gttgaagatgatgatgt 236  Q
    | |||||||||||||||    
T  23083466 gatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26687103 - 26686887
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | | |||  |||||    
T  26687103 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaaga 26687004  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    || || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26687003 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26686904  T
Q  220 gttgaagatgatgatgt 236  Q
    |  ||||||||||||||    
T  26686903 gaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 43841148 - 43840932
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  43841148 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 43841049  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    || || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  43841048 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagtt 43840949  T
Q  220 gttgaagatgatgatgt 236  Q
    | ||||||| |||||||    
T  43840948 gatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 233
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153326
Alignment:
Q  24 ttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagat 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| ||| |||  ||||||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagat 24153214  T
Q  123 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 24153314  T
Q  222 tgaagatgatga 233  Q
    | ||||||||||    
T  24153315 ttaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18438750 - 18438534
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||   ||||||   ||||    
T  18438750 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaaga 18438651  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  18438650 tgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 18438551  T
Q  220 gttgaagatgatgatgt 236  Q
    | |||||||||||||||    
T  18438550 gatgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14572823 - 14572608
Alignment:
Q  4 attaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatg-cattacttgaag 102  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||    
T  14572823 attaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatttgtttatgttgtttatgatgtgatataatgtttttttcattatttgaag 14572724  T
Q  103 aatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 201  Q
     ||| ||| |||  |||||||||| ||| |   |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572723 tataattgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctg 14572624  T
Q  202 catgagtcggtctaag 217  Q
    ||||||||||||||||    
T  14572623 catgagtcggtctaag 14572608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Original strand, 11424668 - 11424880
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||   || |||  | |||    
T  11424668 gttaattttaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgaga 11424767  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |||||||   |||  ||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  11424768 tgttgat---ttgctattgatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 11424864  T
Q  221 ttgaagatgatgatgt 236  Q
     |||||||||||||||    
T  11424865 atgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Original strand, 25476290 - 25476506
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| | || |||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||   ||||||| | |||    
T  25476290 gttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgaga 25476389  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  25476390 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 25476489  T
Q  220 gttgaagatgatgatgt 236  Q
    | |||||||||||||||    
T  25476490 gatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 42386627 - 42386429
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtat-aagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaag 120  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | ||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||   || |||  | ||    
T  42386627 gttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgttttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgag 42386528  T
Q  121 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||| ||| ||| | |||||||| ||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42386527 atgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaag 42386429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 40213626 - 40213838
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  ||   ||||||  | |||    
T  40213626 gttaattataatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgaga 40213725  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  |||||  || |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  40213726 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgc-tgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 40213824  T
Q  220 gttgaagatgatga 233  Q
    | | ||||||||||    
T  40213825 gattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 9707607 - 9707769
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  9707607 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 9707706  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  9707707 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 29172583 - 29172745
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  29172583 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29172682  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29172683 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 236
Target Start/End: Original strand, 43550478 - 43550644
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtt--tact 169  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| |   ||||    
T  43550478 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatact 43550577  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43550578 gcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 7781347 - 7781509
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  7781347 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7781446  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  7781447 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17463340 - 17463178
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  17463340 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17463241  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17463240 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34159488 - 34159326
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  34159488 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34159389  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  34159388 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 45606907 - 45607069
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  45606907 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 45607006  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45607007 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 55476653 - 55476491
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  55476653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 55476554  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  55476553 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 13210377 - 13210448
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13210377 tactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 36166712 - 36166598
Alignment:
Q  119 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||| || |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166712 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 36166614  T
Q  218 atgttgaagatgatga 233  Q
     || | ||||||||||    
T  36166613 ttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 14179648 - 14179570
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttga 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14179648 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 14179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17672722 - 17672626
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17672722 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Original strand, 28848626 - 28848773
Alignment:
Q  87 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 184  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || |||||  | ||||||||||    
T  28848626 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 28848724  T
Q  185 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28848725 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8899256 - 8899094
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  8899256 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8899157  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  8899156 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 16454281 - 16454443
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  16454281 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16454380  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16454381 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 217
Target Start/End: Original strand, 38961891 - 38962037
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  38961891 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 38961990  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961991 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 38962037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Original strand, 49668126 - 49668193
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  49668126 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Original strand, 53070653 - 53070802
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||| |  |||||  || ||||    
T  53070653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatact 53070752  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070753 gt-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 53070802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  121 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 218  Q
    |||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 55500957  T
Q  219 tgttgaagatgatga 233  Q
    || | ||||||||||    
T  55500956 tgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Original strand, 6469200 - 6469296
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  6469200 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 856304 - 856140
Alignment:
Q  68 tatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattat-gtcatactgtttgttt 166  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||  | ||  |  ||||      
T  856304 tatgatgtattataatgtttatgtattacttgaagattaattgtatacataagatgttgttgaattg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaa 856206  T
Q  167 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
     |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  856205 tctgcctatgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 13151790 - 13151953
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  13151790 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13151889  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13151890 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 13154255 - 13154418
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  13154255 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13154354  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13154355 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15470995 - 15470927
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  15470995 tactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 16796766 - 16796685
Alignment:
Q  20 gaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttga 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16796766 gaggctaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 16796685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 10247723 - 10247885
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  10247723 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 10247822  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10247823 gt-tgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 17446655 - 17446816
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  17446655 tgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17446754  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  17446755 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9512991 - 9512924
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9512991 tactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9520966 - 9520899
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9520966 tactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Original strand, 12174309 - 12174376
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12174309 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21618563 - 21618465
Alignment:
Q  119 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||| || |||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618563 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21618465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Original strand, 12119791 - 12119887
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12119791 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13544172 - 13544024
Alignment:
Q  87 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 184  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  |||||  || || ||| | ||||||||||    
T  13544172 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt 13544074  T
Q  185 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  13544073 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15412525 - 15412429
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15412525 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 175 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15977573 - 15977515
Alignment:
Q  175 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15977573 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 231
Target Start/End: Original strand, 16282811 - 16282971
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |  ||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  16282811 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16282910  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 231  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  16282911 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 175 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17737294 - 17737236
Alignment:
Q  175 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17737294 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12567707 - 12567576
Alignment:
Q  87 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 184  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  |||||  || || ||| | ||||||||||    
T  12567707 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt 12567609  T
Q  185 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567608 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12567576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 50242969 - 50242838
Alignment:
Q  87 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 184  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  |||||  || |||| | | ||||||||||    
T  50242969 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt 50242871  T
Q  185 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242870 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 50242838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 220
Target Start/End: Original strand, 52523670 - 52523834
Alignment:
Q  61 tgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcat--ac 157  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || ||   | |||||||| ||| ||| | | |||||| |||| ||||  ||    
T  52523670 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaac 52523769  T
Q  158 tgttt-gtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523770 tgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 52523834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 166 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 32307748 - 32307696
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307748 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 32307696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14234558 - 14234487
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || | |||||||||||||    
T  14234558 tactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16103851 - 16103784
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16103851 tactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8499572 - 8499518
Alignment:
Q  179 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  8499572 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10557039 - 10556985
Alignment:
Q  179 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10557039 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 236
Target Start/End: Original strand, 24340666 - 24340844
Alignment:
Q  61 tgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg 159  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| | | |||   | ||||||||||| ||||  ||    
T  24340666 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg 24340765  T
Q  160 tt-tgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    || ||  |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  24340766 ttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  172 ctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 44494905 - 44494809
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||||||||||||||| || ||||||  || |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  44494905 ttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41124049 - 41123892
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  41124049 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41123950  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 231  Q
    |    |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  41123949 g----ttgtgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 233
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45578000
Alignment:
Q  180 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16097396 - 16097332
Alignment:
Q  169 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16097396 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27165318 - 27165250
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  27165318 tactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 46822386 - 46822267
Alignment:
Q  117 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgttta--ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 214  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |  ||||  | ||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  46822386 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtct 46822287  T
Q  215 aagatgttgaagatgatgat 234  Q
    ||| || | |||||| ||||    
T  46822286 aagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919344
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 13919344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Original strand, 22110402 - 22110457
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110402 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 22110457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 43926029 - 43925974
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926029 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 43925974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 30030015 - 30029859
Alignment:
Q  63 ttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgt- 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||  |  ||| |||  ||||| |||| ||||||| || ||||||| ||||||||| ||||     
T  30030015 ttgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaatatttaagacgttg-tgaattgcaaatgatattcttatgtcatgctgtt 30029917  T
Q  161 -ttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
     ||||   ||| ||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  30029916 gttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaag 30029859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 232
Target Start/End: Original strand, 15878104 - 15878168
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  15878104 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 232
Target Start/End: Original strand, 23077530 - 23077594
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | ||||||| | |||||||||    
T  23077530 ctgcctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 23077594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Original strand, 37251218 - 37251283
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  37251218 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaagatg--gaagatgatg 37251283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 233
Target Start/End: Original strand, 53301601 - 53301669
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  53301601 tactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12511177 - 12511059
Alignment:
Q  118 aagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgttta--ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 215  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |  ||||  | ||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  12511177 aagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattcta 12511078  T
Q  216 agatgttgaagatgatgat 234  Q
    || || | |||||| ||||    
T  12511077 agttgattaagatgttgat 12511059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 173 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14665460 - 14665398
Alignment:
Q  173 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 235  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  14665460 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 220
Target Start/End: Original strand, 606378 - 606431
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  606378 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataagatg 606431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9577691 - 9577640
Alignment:
Q  169 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9577691 tgcctatgttgctgttgt-atataaataagctgcatgagtcggtctatgatgt 9577640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15246086 - 15246034
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15246086 ctgcctatgttgctgttgtctattaattaaactgcatgagtcggtctaagatg 15246034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23274758 - 23274706
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23274758 tactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaag 23274706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 217
Target Start/End: Original strand, 1644724 - 1644775
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||    
T  1644724 tactgcctatgttgttgttgttatttaactaagcaacataagttggtctaag 1644775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 37642315 - 37642386
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  37642315 tactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12377992 - 12377938
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    |||||||||||||||||||  | | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12377992 tactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaagat 12377938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14668616 - 14668554
Alignment:
Q  173 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 235  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  14668616 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14668554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 209
Target Start/End: Original strand, 11298580 - 11298621
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 209  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11298580 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 11298621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 209
Target Start/End: Original strand, 14878569 - 14878610
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 209  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  14878569 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 14878610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 209
Target Start/End: Original strand, 3389994 - 3390030
Alignment:
Q  173 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3389994 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 3390030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 220
Target Start/End: Original strand, 17525211 - 17525263
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||    
T  17525211 ctgcctatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatg 17525263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13446 - 13211
Alignment:
Q  4 attaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaag 102  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13446 attaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaag 13347  T
Q  103 aatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 200  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13346 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 13247  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  13246 gcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 51817 - 51582
Alignment:
Q  1 aggattaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttga 100  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  51817 aggattaagacttaagagtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgtttatgcatttcttga 51718  T
Q  101 agaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagc 199  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||  || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51717 aggatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagc 51619  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51618 tgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 70)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Original strand, 20360846 - 20361081
Alignment:
Q  4 attaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaag 102  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20360846 attaagacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaag 20360945  T
Q  103 aatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 200  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20360946 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 20361045  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||| |||||| || |||| ||||||||||    
T  20361046 gcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Original strand, 16920519 - 16920751
Alignment:
Q  4 attaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaaga 103  Q
    ||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16920519 attaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggtataatgtttatgcattacttgaaga 16920618  T
Q  104 atatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgc 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||  || |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16920619 atatttgtatacataagatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatg-ttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgc 16920717  T
Q  203 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16920718 atgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 64 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245586
Alignment:
Q  64 tgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttg 163  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttg 35245660  T
Q  164 tttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    | |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245659 tatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22831722 - 22831503
Alignment:
Q  19 tgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatac--c 116  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  22831722 tgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatc 22831623  T
Q  117 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |  |||   | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831622 taagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcat-gtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22831524  T
Q  216 agatgttgaagatgatgatgt 236  Q
      |||||||||||||||||||    
T  22831523 ctatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Original strand, 20638169 - 20638404
Alignment:
Q  4 attaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaag 102  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  20638169 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaag 20638268  T
Q  103 aatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 200  Q
    ||| |||| |||   ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20638269 aatgtttgaatattaaagatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagct 20638368  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  20638369 gcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11185740 - 11185517
Alignment:
Q  1 aggattaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttga 100  Q
    |||||||||||||||   |||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11185740 aggattaagacttaatagtgaggttaaccgtaatctgtgaagatgaataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagtttatgcattacttga 11185641  T
Q  101 agaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagc 199  Q
    ||||| |||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||  || ||||  |||||  |||||| || |||||||||||||||||    
T  11185640 agaatgtttgtatacaaaagatgctgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttg-ttgtacactgcacatgttgttgtttgttatttaactaagc 11185542  T
Q  200 tgcatgagtcggtctaagatgttga 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11185541 tgcatgagtcggtctaagatgttga 11185517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29060755 - 29060540
Alignment:
Q  24 ttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagat 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||  ||   ||||||| | ||||    
T  29060755 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgagatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagat 29060656  T
Q  123 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29060655 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctg 29060556  T
Q  221 ttgaagatgatgatgt 236  Q
     |||||||||||||||    
T  29060555 atgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16496411 - 16496244
Alignment:
Q  72 atgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg--tttgtttac 168  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||| |||    
T  16496411 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 16496312  T
Q  169 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16496311 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Original strand, 17287701 - 17287917
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| |  |||||||||| | ||| |||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  17287701 gttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 17287800  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgt--ttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    || || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17287801 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 17287900  T
Q  220 gttgaagatgatgatgt 236  Q
    | | |||||||||||||    
T  17287901 gattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Original strand, 19303446 - 19303661
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  19303446 gttaattataatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgaga 19303545  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19303546 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 19303645  T
Q  221 ttgaagatgatgatgt 236  Q
     |||||||||||||||    
T  19303646 atgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Original strand, 22780132 - 22780348
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgttta-tgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  22780132 gttaatcataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 22780231  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    || || ||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||  || || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  22780232 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 22780331  T
Q  220 gttgaagatgatgatgt 236  Q
    | |||||||||||||||    
T  22780332 gatgaagatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Original strand, 25629260 - 25629476
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  25629260 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 25629359  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    ||||| ||| ||| | |||||||| ||||||||| ||||||  || |||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25629360 tgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 25629459  T
Q  220 gttgaagatgatgatgt 236  Q
    | |||||||||||||||    
T  25629460 gatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20076863 - 20076700
Alignment:
Q  72 atgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttact 169  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||| ||   ||||||||||||   ||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20076863 atgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttact 20076767  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20076766 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20593987 - 20593773
Alignment:
Q  25 taattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatg 123  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||   ||  |||||||  | |||||    
T  20593987 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatg 20593888  T
Q  124 ttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    ||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||     
T  20593887 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttga 20593788  T
Q  222 tgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||    
T  20593787 tgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 18409732 - 18409947
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||  ||   || ||   | |||    
T  18409732 gttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgaga 18409831  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  |||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  18409832 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagtt 18409931  T
Q  220 gttgaagatgatgatg 235  Q
    | ||||||||||||||    
T  18409932 gatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 187
Target Start/End: Original strand, 27415887 - 27416011
Alignment:
Q  64 tgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtt 161  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  27415887 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtt 27415985  T
Q  162 tgtttactgcctatgttgctgttgtt 187  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||    
T  27415986 tgtatgctgcctatgttgctgttgtt 27416011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25656725 - 25656629
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  25656725 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12742479 - 12742317
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  12742479 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12742380  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12742379 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 18334592 - 18334754
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  18334592 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18334691  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18334692 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19005208 - 19005046
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  19005208 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19005109  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19005108 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 19858919 - 19859081
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  19858919 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19859018  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19859019 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22782389 - 22782227
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  || | || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  22782389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22782290  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22782289 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24422709 - 24422547
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  24422709 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24422610  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24422609 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33861956 - 33861794
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  33861956 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33861857  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  33861856 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33864440 - 33864278
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  33864440 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33864341  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  33864340 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Original strand, 1540926 - 1541073
Alignment:
Q  87 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 184  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||  || |||||  | ||||||||||    
T  1540926 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 1541024  T
Q  185 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  1541025 gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25754956 - 25754809
Alignment:
Q  87 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 184  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || |||| | | ||||||||||    
T  25754956 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt 25754858  T
Q  185 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  25754857 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1595711 - 1595549
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||  |||||  || ||||    
T  1595711 tgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 1595612  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  1595611 gt-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 2291180 - 2291342
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  |||||  || ||||    
T  2291180 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 2291279  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  2291280 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8055191 - 8055029
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  8055191 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8055092  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  8055091 tt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 26924640 - 26924802
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  26924640 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26924739  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26924740 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18456881 - 18456732
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  18456881 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18456782  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456781 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18456732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 27333268 - 27333339
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27333268 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 27394008 - 27394079
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27394008 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 28496521 - 28496592
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28496521 tactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 29808932 - 29809003
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29808932 tactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 235
Target Start/End: Original strand, 30676725 - 30676874
Alignment:
Q  87 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 184  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||| |||| ||||||  || |||||| | ||||||||||    
T  30676725 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 30676823  T
Q  185 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  30676824 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 175 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  175 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18462026 - 18461892
Alignment:
Q  87 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 184  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||   | ||||||||||    
T  18462026 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 18461928  T
Q  185 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461927 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18461892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34963520 - 34963371
Alignment:
Q  87 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 184  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || |||||  | ||||||||||    
T  34963520 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 34963422  T
Q  185 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 235  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  34963421 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25688598 - 25688518
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25688598 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaag 25688518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1561356 - 1561303
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1561356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 220
Target Start/End: Original strand, 18821904 - 18821949
Alignment:
Q  175 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821904 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18821949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25644499 - 25644339
Alignment:
Q  61 tgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg 159  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||  |||| || ||   | |||||||||||| ||  | |||||||| |||| |||  |||    
T  25644499 tgttgtttttgatgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctg 25644400  T
Q  160 tttgtt--tactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||| |   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644399 tttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 25644339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 230
Target Start/End: Original strand, 16448593 - 16448686
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  16448593 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33443117 - 33443062
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33443117 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 33443062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 233
Target Start/End: Original strand, 3852121 - 3852179
Alignment:
Q  175 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3852121 tgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 233
Target Start/End: Original strand, 20556996 - 20557054
Alignment:
Q  175 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  20556996 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 217
Target Start/End: Original strand, 9098564 - 9098616
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098564 tactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 9098616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19652266 - 19652199
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19652266 tactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 61 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20109318 - 20109157
Alignment:
Q  61 tgttgattatgatgtgatataatgtt---tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatac 157  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||   ||| |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| | ||      
T  20109318 tgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgt 20109219  T
Q  158 tgttt-gtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20109218 tgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20109157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 189 - 236
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  189 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 234
Target Start/End: Original strand, 19847995 - 19848114
Alignment:
Q  117 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgttta--ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 214  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||  | |||||  | ||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19847995 taagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtgttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtct 19848094  T
Q  215 aagatgttgaagatgatgat 234  Q
    ||| || | |||||| ||||    
T  19848095 aagttgattaagatgttgat 19848114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19873184 - 19873120
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19873184 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19668436 - 19668390
Alignment:
Q  172 ctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668436 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 19668390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 149 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22432334 - 22432249
Alignment:
Q  149 atgtcatactgtt--tgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    |||||||||||||  |||  |||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  22432334 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22432249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 149 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22438884 - 22438799
Alignment:
Q  149 atgtcatactgtt--tgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    |||||||||||||  |||  |||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  22438884 atgtcatactgttgttgtaaactgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22438799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 236
Target Start/End: Original strand, 8227587 - 8227632
Alignment:
Q  191 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  8227587 taactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18453250 - 18453197
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18453250 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcataagtcggtctaagatgt 18453197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19863039 - 19862978
Alignment:
Q  171 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19863039 cctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21766759 - 21766718
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 209  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21766759 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 21766718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076748
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 218  Q
    |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076801 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 23076748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 35008219 - 35008166
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 218  Q
    |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008219 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 35008166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 213
Target Start/End: Original strand, 4185871 - 4185919
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 213  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4185871 tactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4185919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 209
Target Start/End: Original strand, 15041545 - 15041644
Alignment:
Q  112 atacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtt--tgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 209  Q
    |||| |||||||||  ||||||| | |||||||||| ||||||| |||||  |||   ||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15041545 atacttaagatgttattgaattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatgagtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23019477 - 23019408
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  23019477 tactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaagatg--aaagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16493214 - 16493169
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 213  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  16493214 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 16493169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23838242 - 23838189
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||| | || | ||||||||||| | |||||||||||||    
T  23838242 ctgcctatgttgctgttgtaaattgattaagctgcatgtgacggtctaagatgt 23838189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18907170 - 18907134
Alignment:
Q  173 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 209  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18907170 tatgctgctattgttatttaactaagctgcatgagtc 18907134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 209
Target Start/End: Original strand, 19790837 - 19790873
Alignment:
Q  173 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19790837 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 19790873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Original strand, 951 - 1169
Alignment:
Q  20 gaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaa 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||    
T  951 gaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaa 1050  T
Q  120 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatac--tgtttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1051 gatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1150  T
Q  218 atgttgaagatgatgatgt 236  Q
     ||||||||||||||||||    
T  1151 ttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Original strand, 167881 - 168099
Alignment:
Q  20 gaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaa 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||    
T  167881 gaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaa 167980  T
Q  120 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatac--tgtttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  167981 gatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 168080  T
Q  218 atgttgaagatgatgatgt 236  Q
     ||||||||||||||||||    
T  168081 ttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 52148 - 51913
Alignment:
Q  4 attaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaag 102  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  52148 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaag 52049  T
Q  103 aatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 200  Q
     ||| ||| |||  ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52048 tataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 51949  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  51948 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 220
Target Start/End: Original strand, 38204 - 38256
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  38204 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaagatg 38256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2067 - 1851
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  2067 gttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 1968  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1967 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 1868  T
Q  220 gttgaagatgatgatgt 236  Q
    | |||||||||||||||    
T  1867 gatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5059 - 4849
Alignment:
Q  29 tataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttga 127  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||| ||||||||||     
T  5059 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgt 4960  T
Q  128 tgaattgaaattgatattattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa 225  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  4959 tgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 4860  T
Q  226 gatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||    
T  4859 gatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3686 - 3470
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  3686 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 3587  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  3586 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 3487  T
Q  220 gttgaagatgatgatgt 236  Q
    | |||||||||||||||    
T  3486 gatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 558 - 343
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||| | ||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | | |||  |||||    
T  558 gttaattataatatatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaaga 459  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||| ||| ||  |||||||||||||| ||||| || ||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  458 tgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctattttgtatactgcctatgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcg 359  T
Q  221 ttgaagatgatgatgt 236  Q
     | |||||||||||||    
T  358 ataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 233
Target Start/End: Original strand, 5034 - 5246
Alignment:
Q  21 aggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaag 120  Q
    |||||||||||||| ||||||  || |||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  5034 aggttaattataatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattacttgaagaatgtttgtatacataag 5133  T
Q  121 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || |||| || | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5134 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatg-ttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 5232  T
Q  220 gttgaagatgatga 233  Q
    ||||||||||||||    
T  5233 gttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2190 - 1952
Alignment:
Q  1 aggattaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttg 99  Q
    |||||||||||||||   | |||||| | ||||| ||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  2190 aggattaagacttaatgataaggttattaataatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatataatgttttatgcattacttg 2091  T
Q  100 aagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaa 197  Q
    || ||| |||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  ||  ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  2090 aataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgttgttaattaactaa 1991  T
Q  198 gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1990 gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 217
Target Start/End: Original strand, 24206 - 24405
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttga-ttatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaag 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  24206 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaag 24305  T
Q  121 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgt---ttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24306 atgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Original strand, 6007 - 6245
Alignment:
Q  4 attaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaag 102  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  6007 attaagacttaatgatgatgttaattataaaatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaag 6106  T
Q  103 aatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg--tttgtttactgccta---tgttgctgttgttatttaactaa 197  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||  ||||| |||| ||||   ||||| |||||||||||||||||    
T  6107 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaa 6206  T
Q  198 gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6207 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 38995 - 38761
Alignment:
Q  4 attaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaag 102  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  38995 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaag 38896  T
Q  103 aatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 201  Q
     ||| ||| |||  |||||||||| | | ||| | |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  38895 tataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctg 38796  T
Q  202 catgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  38795 catgactcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 27 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33153 - 32942
Alignment:
Q  27 attataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgtt 125  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||    
T  33153 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgtt 33054  T
Q  126 gatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 224  Q
    | | | ||| | |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||    
T  33053 gttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatga 32954  T
Q  225 agatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||    
T  32953 agatgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9845 - 9744
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |    
T  9845 ttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag 9747  T
Q  236 tcc 238  Q
    |||    
T  9746 tcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Original strand, 3056 - 3271
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||  || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  3056 gttaattataacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 3155  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3156 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 3255  T
Q  221 ttgaagatgatgatgt 236  Q
     |||||||||||||||    
T  3256 atgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Original strand, 8438 - 8650
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  8438 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 8537  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtt-tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    || || ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8538 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgatactgcctatgttgctgtt---atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 8634  T
Q  221 ttgaagatgatgatgt 236  Q
     |||||||||||||||    
T  8635 atgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 39692 - 39479
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  39692 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 39593  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39592 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 39493  T
Q  221 ttgaagatgatgat 234  Q
     |||||| ||||||    
T  39492 atgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 234
Target Start/End: Original strand, 75120 - 75333
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  75120 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 75219  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  75220 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 75319  T
Q  221 ttgaagatgatgat 234  Q
     |||||| ||||||    
T  75320 atgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 17120 - 17337
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttat-gcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||   ||||||| | |||    
T  17120 gttaattataatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgaga 17219  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgttt----actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17220 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 17319  T
Q  218 atgttgaagatgatgatg 235  Q
     || ||||||||||||||    
T  17320 ttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 220
Target Start/End: Original strand, 79388 - 79433
Alignment:
Q  175 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79388 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 79433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 229
Target Start/End: Original strand, 25970 - 26179
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttat-gcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||   ||||||| | |||    
T  25970 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgaga 26069  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
     |||| ||||||  | |||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26070 cgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26169  T
Q  220 gttgaagatg 229  Q
    | ||||||||    
T  26170 gatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Original strand, 44709 - 44825
Alignment:
Q  119 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 216  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44709 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 44808  T
Q  217 gatgttgaagatgatga 233  Q
    | || | ||||||||||    
T  44809 gttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 86
Target Start/End: Original strand, 33400 - 33463
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt 86  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| ||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  33400 gttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgtt 33463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 235
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3306
Alignment:
Q  35 ctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttat-gcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaatt 133  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||||||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  134 gaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 231  Q
      | ||||||||||||| |||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 3302  T
Q  232 gatg 235  Q
    ||||    
T  3303 gatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26111 - 25896
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgttta-tgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||  || | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  | |||    
T  26111 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgaga 26012  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||| | | ||| | ||||||||||||||||||  | ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  26011 tgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttg 25912  T
Q  221 ttgaagatgatgatgt 236  Q
     ||||||| |||||||    
T  25911 atgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 40073 - 39858
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgttta-tgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||  || | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  | |||    
T  40073 gttaattataatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgaga 39974  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||| | | ||| | ||||||||||||||||||  | ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  39973 tgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttg 39874  T
Q  221 ttgaagatgatgatgt 236  Q
     |||||||||||||||    
T  39873 atgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23098 - 22886
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  23098 gttatttataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 22999  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22998 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgg-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22900  T
Q  220 gttgaagatgatga 233  Q
    | | ||||||||||    
T  22899 gattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21127 - 20910
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||  |||||    
T  21127 gttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaatatataaga 21028  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 218  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||  ||||  || |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||     
T  21027 tgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagt 20928  T
Q  219 tgttgaagatgatgatgt 236  Q
     |||||||||| ||||||    
T  20927 cgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 236
Target Start/End: Original strand, 32901 - 33077
Alignment:
Q  61 tgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg 159  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||| | | |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  32901 tgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 32999  T
Q  160 ttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33000 ttttgtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 46104 - 45928
Alignment:
Q  61 tgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg 159  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||| | | |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  46104 tgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 46006  T
Q  160 ttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  46005 ttttgtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16323 - 16113
Alignment:
Q  28 ttataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttg 126  Q
    ||||||||||||||| ||| | | | |||| | ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||   ||   ||||||| | ||||| ||    
T  16323 ttataatctgtgaagctgtttta-agatgttgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatg 16225  T
Q  127 atgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 224  Q
     ||  ||| | |||||||||| || || | ||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  16224 ttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 16125  T
Q  225 agatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||    
T  16124 agatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 175 - 236
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17450
Alignment:
Q  175 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17389 tgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8710 - 8479
Alignment:
Q  4 attaagacttaactctgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaag 102  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||| ||||||||||| ||| || ||| ||| | |||||||||||||||    ||||||| | ||||||||||||||    
T  8710 attaagacttaatgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattacttgaag 8615  T
Q  103 aatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 200  Q
     | | ||| ||   |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  8614 tacacttgaatgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaaccaagct 8515  T
Q  201 gcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8514 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Original strand, 16505 - 16721
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||   ||||||| | |||    
T  16505 gttaattatagtctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgaga 16604  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    || || ||| ||  | |||||||||||||||||| ||||||  || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  16605 tgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaatt 16704  T
Q  220 gttgaagatgatgatgt 236  Q
    | |||||||||||||||    
T  16705 gatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 339855 - 340065
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||   ||||||| | |||    
T  339855 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgaga 339954  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg-tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  339955 tgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttg-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 340052  T
Q  221 ttgaagatgatga 233  Q
      |||||||||||    
T  340053 acgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 71474 - 71350
Alignment:
Q  64 tgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtt 161  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  71474 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtt 71376  T
Q  162 tgtttactgcctatgttgctgttgtt 187  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||    
T  71375 tgtatgctgcctatgttgctgttgtt 71350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 158450 - 158612
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  158450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 158549  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  158550 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 40128 - 39913
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||| | | || ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |   |||  |||||    
T  40128 gttaattataatctgtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaaga 40029  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||  |||  || | ||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  40028 tgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttg 39929  T
Q  221 ttgaagatgatgatgt 236  Q
     |||||||||||||||    
T  39928 atgaagatgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 220
Target Start/End: Original strand, 19885 - 19990
Alignment:
Q  119 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcat--actgtttgtt-tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 214  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||| |||| ||||  |||||||  | ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  19885 agatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtct 19984  T
Q  215 aagatg 220  Q
    ||||||    
T  19985 aagatg 19990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 209
Target Start/End: Original strand, 18708 - 18749
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 209  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18708 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 18749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4723 - 4508
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  4723 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 4624  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| |||  ||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  4623 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagtt 4525  T
Q  220 gttgaagatgatgatgt 236  Q
    | |||| ||||| ||||    
T  4524 gatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12305 - 12090
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  12305 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 12206  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| |||  ||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  12205 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagtt 12107  T
Q  220 gttgaagatgatgatgt 236  Q
    | |||| ||||| ||||    
T  12106 gatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22257 - 22042
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  22257 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 22158  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| |||  ||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  22157 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagtt 22059  T
Q  220 gttgaagatgatgatgt 236  Q
    | |||| ||||| ||||    
T  22058 gatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28552 - 28414
Alignment:
Q  100 aagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaa 197  Q
    ||||| ||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28552 aagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaa 28453  T
Q  198 gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28452 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11363 - 11292
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11363 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2068 - 1997
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2068 tactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4552
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 236
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11564
Alignment:
Q  121 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 11546  T
Q  219 tgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||| |||||    
T  11547 tgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 124801 - 124675
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |    
T  124801 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaa 124702  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattatt 148  Q
     |||||||||||| |||||||||||||    
T  124701 cgttgatgaattgcaattgatattatt 124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 174943 - 174767
Alignment:
Q  61 tgttgattatgatgtgatataatgttta--tgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatact 158  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||  ||   || ||   | |||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| ||    
T  174943 tgttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgct 174844  T
Q  159 gtttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 235  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  174843 gtt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 167 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  167 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 220
Target Start/End: Original strand, 136413 - 136474
Alignment:
Q  160 tttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  136413 tttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 136474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 220
Target Start/End: Original strand, 145121 - 145182
Alignment:
Q  160 tttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  145121 tttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 145182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13308 - 13144
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  13308 gttaattataatctgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 13209  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgttgctgtt 184  Q
    || || ||| ||| |||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  13208 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 161 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34199 - 34123
Alignment:
Q  161 ttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34199 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 273
Alignment:
Q  180 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 6828 - 6669
Alignment:
Q  21 aggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaa 119  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||| |||  |||    
T  6828 aggttatttataatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaa 6729  T
Q  120 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgt 177  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||    
T  6728 gatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26999 - 26840
Alignment:
Q  61 tgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattat-gtcatactg 159  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  | ||  |     
T  26999 tgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg-aattgatataattatcatgattgtt 26901  T
Q  160 tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
     ||||   ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||    
T  26900 gttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagatgcatgagtcgatataagatg 26840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 187
Target Start/End: Original strand, 15362 - 15486
Alignment:
Q  64 tgattatgatgtgatataatgttt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtt 161  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15362 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtt 15460  T
Q  162 tgtttactgcctatgttgctgttgtt 187  Q
    ||| | |||||||||||| |||||||    
T  15461 tgtatgctgcctatgttgatgttgtt 15486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36248 - 36195
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    |||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36248 ctgcctatgttgttgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 36195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 1119 - 1190
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1119 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 209
Target Start/End: Original strand, 4284 - 4320
Alignment:
Q  173 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4284 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 4320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 119946 - 119875
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  119946 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 94573 - 94411
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  94573 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 94474  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  94473 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 44602 - 44454
Alignment:
Q  87 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtttgtt---tactgcctatgttgctgt 183  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||| ||   |||||  | |||||||||    
T  44602 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt-tgtgttgctgt 44504  T
Q  184 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44503 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 217
Target Start/End: Original strand, 17455 - 17586
Alignment:
Q  87 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 184  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || |||||| | ||||||| ||    
T  17455 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctatt 17553  T
Q  185 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17554 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 17586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 100445 - 100378
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  100445 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Original strand, 40224 - 40291
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  40224 tactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 101570 - 101503
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  101570 tactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 232
Target Start/End: Original strand, 38479 - 38596
Alignment:
Q  117 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtt--tgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 214  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||  | |||||  ||||  |||   ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |    
T  38479 taagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtcatgttgttgttgtgatctgtctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatat 38578  T
Q  215 aagatgttgaagatgatg 232  Q
    |||||| | |||||||||    
T  38579 aagatgattaagatgatg 38596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 68 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2045 - 1881
Alignment:
Q  68 tatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattat-gtcatactgtttgttt 166  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  | ||  |  ||||      
T  2045 tatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattatcatgattgttgttgtaa 1947  T
Q  167 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
     |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  1946 tctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28046 - 27913
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaaga 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  28046 gttaattataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 27947  T
Q  122 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcat 155  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  27946 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 27913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20909 - 20747
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  20909 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20810  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20809 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 232
Target Start/End: Original strand, 21749 - 21920
Alignment:
Q  61 tgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattat-gtcatactg 159  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  | ||  |     
T  21749 tgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattatcatgattgtt 21847  T
Q  160 tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
     ||||   ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  21848 gttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 21920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 232
Target Start/End: Original strand, 29641 - 29812
Alignment:
Q  61 tgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattat-gtcatactg 159  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  | ||  |     
T  29641 tgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattatcatgattgtt 29739  T
Q  160 tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
     ||||   ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  29740 gttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 29812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37983 - 37821
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  37983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 37884  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  37883 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 136842 - 136680
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgt--ttgtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||  |||| ||||    
T  136842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 136743  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  136742 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 139311 - 139149
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgt--ttgtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||  |||| ||||    
T  139311 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 139212  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  139211 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 144249 - 144087
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgt--ttgtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||  |||| ||||    
T  144249 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 144150  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  144149 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 134373 - 134211
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgt--ttgtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||  |||| ||||    
T  134373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 134274  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  134273 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 141780 - 141618
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgt--ttgtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||  |||| ||||    
T  141780 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 141681  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  141680 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 132722 - 132662
Alignment:
Q  173 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  132722 tatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 62269 - 62217
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  62269 tactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaag 62217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 4702 - 4545
Alignment:
Q  61 tgttgattatgatgtgatataatgt-ttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg 159  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  || |||  |||||||||| ||||||  | |||||||||| || || | |||    
T  4702 tgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctg 4603  T
Q  160 tt--tgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 215  Q
     |  ||  ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4602 ctgttgcatactgcctatgctgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12933 - 12859
Alignment:
Q  62 gttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaa 136  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12933 gttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa 12859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11435 - 11305
Alignment:
Q  87 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 184  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || |||||| | ||||||||||    
T  11435 tatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 11337  T
Q  185 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11336 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 11305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 1133 - 1052
Alignment:
Q  20 gaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1133 gaggctaattataatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13539 - 13392
Alignment:
Q  87 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 184  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || |||||  | ||||||||||    
T  13539 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13441  T
Q  185 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13440 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Original strand, 20379 - 20527
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactg 170  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| || |||||    
T  20379 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactg 20478  T
Q  171 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20479 a-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 128917 - 128751
Alignment:
Q  72 atgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg-tttgtttact 169  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||| ||| |||  |    
T  128917 atgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttttttt 128818  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
       | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || | |||||||||||||    
T  128817 ttttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 232
Target Start/End: Original strand, 65851 - 65915
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||  |||||| | |||||||||    
T  65851 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtaggtaaaagatgatcaagatgatg 65915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14109 - 13947
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  14109 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14010  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  14009 gt-tgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1151 - 1048
Alignment:
Q  119 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 216  Q
    |||||||||||| | | | |||||||| |||| |||| |||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1151 agatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1052  T
Q  217 gatg 220  Q
    ||||    
T  1051 gatg 1048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6606 - 6535
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  6606 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8646 - 8485
Alignment:
Q  61 tgttgattatgatgtgatataatgtt---tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatac 157  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||   ||| |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||| |    
T  8646 tgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgc 8547  T
Q  158 tgttt-gtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||||| |  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8546 tgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 170 - 236
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Original strand, 85646 - 85742
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  85646 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 160755 - 160688
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  160755 tactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 501231 - 501100
Alignment:
Q  87 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 184  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  |||||  || || ||| | ||||||||||    
T  501231 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt 501133  T
Q  185 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501132 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 501100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 497494 - 497442
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |||||||||||| ||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  497494 ctgcctatgttgttgttgtatattaactaagctgcatgtgtcggtttaagatg 497442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4841 - 4710
Alignment:
Q  87 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 184  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  |||||  || |||||| | ||||||||||    
T  4841 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 4743  T
Q  185 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4742 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 4710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 82219 - 82072
Alignment:
Q  87 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 184  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || |||| | | ||||||||||    
T  82219 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt 82121  T
Q  185 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  82120 gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 22720 - 22788
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||    
T  22720 tactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaaggtgatgatgt 22788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16946 - 16784
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |  |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||  |||||  || ||||    
T  16946 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 16847  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16846 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40562 - 40400
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  40562 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatact 40463  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  40462 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Original strand, 2856 - 2923
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2856 tactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10869 - 10772
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 234  Q
    ||||||||||||||||||  |||||  || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  10869 ttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6682 - 6611
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6682 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14062 - 13991
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  14062 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15739 - 15664
Alignment:
Q  159 gtttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15739 gtttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1403 - 1339
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  1403 ctgcctatgttgctattgttacttaaacaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 1339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 6173 - 6244
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6173 tactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19335 - 19268
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19335 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 116544 - 116430
Alignment:
Q  119 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||| |||||| || |||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116544 agatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 116446  T
Q  218 atgttgaagatgatga 233  Q
     || | ||||||||||    
T  116445 ttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Original strand, 129021 - 129075
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  129021 tactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 129075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 78391 - 78338
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  78391 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatg 78338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 15827 - 15898
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  15827 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 178961 - 178913
Alignment:
Q  169 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  178961 tgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 178913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 142649 - 142596
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  142649 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtttaagatgt 142596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4408 - 4300
Alignment:
Q  123 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||  || |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4408 gttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 4310  T
Q  221 ttgaagatga 230  Q
     | |||||||    
T  4309 attaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 30028 - 29948
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30028 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 29948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11979
Alignment:
Q  175 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 11979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 162
Target Start/End: Original strand, 3434 - 3575
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtat-aagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaag 120  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||   ||||||  | ||    
T  3434 gttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgag 3533  T
Q  121 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt 162  Q
    |||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  3534 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 3575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 23933 - 24001
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23933 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 232
Target Start/End: Original strand, 14746 - 14814
Alignment:
Q  165 ttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  14746 ttactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6883 - 6828
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6883 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatg 6828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 1084 - 1155
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  1084 tactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12687 - 12584
Alignment:
Q  119 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 216  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12687 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaa 12588  T
Q  217 gatg 220  Q
    ||||    
T  12587 gatg 12584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9300 - 9241
Alignment:
Q  175 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  9300 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Original strand, 2695 - 2762
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  2695 tactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 164 - 106
Alignment:
Q  175 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||    
T  164 tgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4310 - 4214
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||| |||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4310 ttgatattattatgtcatgctggttttgtatactgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 220
Target Start/End: Original strand, 53492 - 53654
Alignment:
Q  61 tgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg 159  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || ||| |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||  ||    
T  53492 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg 53591  T
Q  160 ttt-gtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  53592 ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaagatg 53654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Original strand, 161156 - 161252
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||||||||||||||||||  |||||  || |||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  161156 ttgatattattatgtcattatgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 10591 - 10659
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  10591 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaa---gttgaagatggtgatgt 10659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Original strand, 28819 - 28887
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgt--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  28819 tactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1153 - 1101
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1153 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 235
Target Start/End: Original strand, 12353 - 12413
Alignment:
Q  175 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| |||||    
T  12353 tgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 5714 - 5662
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5714 tactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaag 5662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23907 - 23843
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  23907 ctgcctatggtgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 3700 - 3640
Alignment:
Q  20 gaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatat 80  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  3700 gaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 3640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 7764 - 7704
Alignment:
Q  20 gaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatat 80  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  7764 gaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 217
Target Start/End: Original strand, 27692 - 27851
Alignment:
Q  61 tgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg 159  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| |||  |||| || ||   | |||||||| ||| ||  | |||||||| |||| |||| |||    
T  27692 tgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgctg 27791  T
Q  160 ttt-gtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||| |  |||| ||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27792 ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 27851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13057 - 12942
Alignment:
Q  120 gatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg-tttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||| |||| |||| ||| ||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  13057 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa- 12959  T
Q  218 atgttgaagatgatgatgt 236  Q
      |||||||||||||||||    
T  12958 --gttgaagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 129976 - 129924
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  129976 tactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaag 129924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 220
Target Start/End: Original strand, 60760 - 60821
Alignment:
Q  160 tttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  60760 tttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 60821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 714 - 662
Alignment:
Q  169 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  714 tgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaagatgt 662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11535 - 11464
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  11535 tactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 119 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13247 - 13144
Alignment:
Q  119 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt-gtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 216  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||| |||| |||| |||||| |  |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13247 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 13148  T
Q  217 gatg 220  Q
    ||||    
T  13147 gatg 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2677
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 217
Target Start/End: Original strand, 16150 - 16202
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||| ||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16150 tactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 217
Target Start/End: Original strand, 8117 - 8176
Alignment:
Q  159 gtttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8117 gtttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Original strand, 45842 - 45909
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  45842 tactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 38306 - 38377
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  38306 tactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 236
Target Start/End: Original strand, 17970 - 18148
Alignment:
Q  61 tgttgattatgatgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactg 159  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| | | |||   | ||||||||||| ||||  ||    
T  17970 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg 18069  T
Q  160 tt-tgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    || ||  || ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  18070 ttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 217
Target Start/End: Original strand, 2237 - 2275
Alignment:
Q  179 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2237 gctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaag 2275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 619 - 566
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  619 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12220 - 12064
Alignment:
Q  73 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgttt--gtttact 169  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  12220 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatact 12121  T
Q  170 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    || | ||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12120 gc-tgtgttgctgtt------taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32151 - 32102
Alignment:
Q  183 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  32151 ttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 215
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206624
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12834 - 12766
Alignment:
Q  169 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 236  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||    
T  12834 tgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 232
Target Start/End: Original strand, 10575 - 10639
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  10575 ctgcctatgttgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 232
Target Start/End: Original strand, 15736 - 15796
Alignment:
Q  172 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  15736 ctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 15796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25177 - 25125
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25177 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 25125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 233
Target Start/End: Original strand, 38752 - 38820
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 233  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  38752 tactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 32607 - 32555
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32607 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 32555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 219
Target Start/End: Original strand, 51957 - 51987
Alignment:
Q  189 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51957 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 51987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 69858 - 69794
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  69858 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 200 - 133
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  200 tactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Original strand, 6334 - 6389
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6334 tactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 6389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 220
Target Start/End: Original strand, 13813 - 13843
Alignment:
Q  190 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13813 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 13843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 36517 - 36454
Alignment:
Q  169 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    |||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  36517 tgcctatgctactattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 230
Target Start/End: Original strand, 1347 - 1440
Alignment:
Q  138 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||| | | ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  1347 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-catgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 232
Target Start/End: Original strand, 9016 - 9080
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  9016 ctgcctatgctgctattattatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 9080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 232
Target Start/End: Original strand, 4804 - 4921
Alignment:
Q  117 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatactgtt--tgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 214  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||  |||||  |||   ||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||  | |    
T  4804 taagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcaagctgttgttgtgatctgcctatgctgctattattatttaactaagttgcatgagtcaatat 4903  T
Q  215 aagatgttgaagatgatg 232  Q
    |||||| | |||||||||    
T  4904 aagatgattaagatgatg 4921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20044 - 19980
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  20044 ctgcctatgctactattgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38387 - 38339
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38387 tactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 7499 - 7447
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  7499 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaagatg 7447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14618 - 14566
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14618 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaagatg 14566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3324 - 3272
Alignment:
Q  169 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3324 tgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaagatgt 3272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 10379 - 10323
Alignment:
Q  23 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgata 79  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  10379 gttaataataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 10323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10598 - 10546
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 217  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10598 tactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaag 10546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17572 - 17517
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17572 tactgcctaagttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaagatgt 17517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2746 - 2691
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |||||||||||||||||||  | | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2746 tactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30398 - 30347
Alignment:
Q  169 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30398 tgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaagatg 30347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 97076 - 97021
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  97076 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatg 97021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 106354 - 106299
Alignment:
Q  166 tactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  106354 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatg 106299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 209
Target Start/End: Original strand, 4999 - 5037
Alignment:
Q  171 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4999 cctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtc 5037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 191 - 220
Target Start/End: Original strand, 1874 - 1903
Alignment:
Q  191 taactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1874 taactaagctgcatgagtcggtctaagatg 1903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3935 - 3882
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||| | || | ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  3935 ctgcctatgttgctgttgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtttaagatgt 3882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 44145 - 44104
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 209  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  44145 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 44104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 209
Target Start/End: Original strand, 193029 - 193070
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 209  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  193029 ctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 193070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6159 - 6095
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||  | ||||||| | |||||||||    
T  6159 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 6095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8957 - 8906
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8957 ctgcctatgttgctgttgtatattaa-taagctgcatgtgtcggtctaagatg 8906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 209
Target Start/End: Original strand, 7328 - 7364
Alignment:
Q  173 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7328 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 7364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 209
Target Start/End: Original strand, 16402 - 16442
Alignment:
Q  169 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 209  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16402 tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 57885 - 57834
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 220  Q
    ||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  57885 ctgcctatgttgctgatgtatattaa-taagctgcatgagtcggtctaagatg 57834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18300 - 18236
Alignment:
Q  168 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 232  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  18300 ctgcctatgctgctattgttaattaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 18236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University