View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17432_low_12 (Length: 414)

Name: NF17432_low_12
Description: NF17432
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17432_low_12
NF17432_low_12
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (13-398)||(27919304-27919689)
chr4 (17-398)||(16835505-16835880)
chr4 (67-398)||(19584016-19584342)
chr4 (98-395)||(16586868-16587161)
chr4 (13-395)||(10492526-10492893)
chr4 (330-398)||(39045050-39045118)
chr4 (316-381)||(15453049-15453115)
chr4 (345-381)||(15411717-15411753)
[»] chr7 (13 HSPs)
chr7 (13-398)||(1376544-1376926)
chr7 (33-250)||(9986775-9986992)
chr7 (67-378)||(9132039-9132344)
chr7 (276-395)||(9990662-9990781)
chr7 (303-395)||(16775576-16775668)
chr7 (333-395)||(29699725-29699787)
chr7 (336-381)||(11579712-11579757)
chr7 (336-395)||(11518166-11518225)
chr7 (336-395)||(14279248-14279307)
chr7 (336-381)||(11347049-11347094)
chr7 (316-381)||(14205208-14205278)
chr7 (316-381)||(14213898-14213968)
chr7 (330-382)||(12356274-12356326)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (20-378)||(17582696-17583047)
chr6 (17-395)||(24001513-24001887)
chr6 (13-398)||(12475860-12476242)
chr6 (30-398)||(18565268-18565633)
chr6 (163-380)||(10747236-10747446)
chr6 (222-395)||(15935486-15935656)
chr6 (31-247)||(19957289-19957505)
chr6 (272-380)||(20403368-20403473)
chr6 (184-247)||(10747457-10747520)
chr6 (31-130)||(15935693-15935792)
chr6 (316-381)||(23575626-23575692)
chr6 (316-375)||(25925190-25925250)
chr6 (355-393)||(19958814-19958852)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (13-395)||(86233-86615)
[»] chr3 (16 HSPs)
chr3 (85-396)||(14281832-14282139)
chr3 (17-380)||(19455772-19456131)
chr3 (30-398)||(4847845-4848211)
chr3 (83-369)||(8943029-8943310)
chr3 (30-300)||(4854274-4854542)
chr3 (30-300)||(4876007-4876277)
chr3 (31-299)||(14636364-14636630)
chr3 (147-380)||(13606980-13607208)
chr3 (30-231)||(4872333-4872535)
chr3 (154-380)||(20246239-20246458)
chr3 (313-398)||(14637015-14637100)
chr3 (316-381)||(13080490-13080556)
chr3 (316-381)||(14761004-14761070)
chr3 (346-398)||(23296040-23296092)
chr3 (274-347)||(4831065-4831135)
chr3 (17-107)||(23296085-23296176)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (20-398)||(13854-14234)
[»] chr1 (13 HSPs)
chr1 (31-395)||(19818071-19818433)
chr1 (16-327)||(22852276-22852589)
chr1 (17-249)||(23478409-23478641)
chr1 (17-398)||(17495314-17495681)
chr1 (17-398)||(16969673-16970040)
chr1 (32-247)||(21017749-21017965)
chr1 (271-398)||(25974270-25974397)
chr1 (119-248)||(22051578-22051706)
chr1 (86-380)||(19957068-19957350)
chr1 (67-380)||(21982944-21983249)
chr1 (334-391)||(21017563-21017620)
chr1 (316-384)||(22106430-22106499)
chr1 (316-381)||(17613857-17613923)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (13-393)||(41853-42234)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (83-395)||(63644-63952)
[»] scaffold0520 (1 HSPs)
scaffold0520 (13-398)||(7033-7415)
[»] chr2 (6 HSPs)
chr2 (30-378)||(23662599-23662943)
chr2 (220-395)||(24373914-24374085)
chr2 (83-380)||(25906478-25906767)
chr2 (207-398)||(21071902-21072089)
chr2 (150-398)||(18595600-18595824)
chr2 (330-395)||(22670714-22670779)
[»] chr5 (14 HSPs)
chr5 (31-398)||(22441448-22441813)
chr5 (30-398)||(24129625-24129987)
chr5 (30-300)||(19126855-19127122)
chr5 (69-380)||(24670428-24670734)
chr5 (69-380)||(24707203-24707509)
chr5 (69-380)||(24740197-24740503)
chr5 (69-380)||(24752966-24753272)
chr5 (17-398)||(16739165-16739541)
chr5 (17-212)||(19765162-19765353)
chr5 (313-368)||(23374982-23375037)
chr5 (293-357)||(19127307-19127371)
chr5 (330-380)||(25916956-25917006)
chr5 (148-205)||(23987242-23987298)
chr5 (13-61)||(24245996-24246043)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (98-398)||(41835-42132)
[»] chr8 (11 HSPs)
chr8 (33-395)||(14992006-14992363)
chr8 (83-345)||(19236800-19237057)
chr8 (83-345)||(19309984-19310241)
chr8 (274-380)||(16598952-16599058)
chr8 (71-247)||(8365781-8365960)
chr8 (274-345)||(19303901-19303972)
chr8 (316-395)||(24752297-24752377)
chr8 (316-381)||(25190107-25190173)
chr8 (316-381)||(28076180-28076246)
chr8 (318-381)||(24427166-24427230)
chr8 (316-381)||(21318354-21318420)
[»] scaffold0285 (2 HSPs)
scaffold0285 (98-398)||(20130-20428)
scaffold0285 (31-76)||(17999-18044)
[»] scaffold1121 (1 HSPs)
scaffold1121 (39-300)||(1565-1821)
[»] scaffold1485 (1 HSPs)
scaffold1485 (30-300)||(445-713)
[»] scaffold0577 (1 HSPs)
scaffold0577 (274-380)||(509-615)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (31-395)||(96583-96944)
[»] scaffold0767 (1 HSPs)
scaffold0767 (148-378)||(1795-2017)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (272-376)||(12746-12850)
[»] scaffold0043 (2 HSPs)
scaffold0043 (316-398)||(40786-40869)
scaffold0043 (316-398)||(25975-26058)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (106-381)||(6863-7136)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (330-381)||(587-638)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (313-368)||(17428-17483)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (316-381)||(19958-20024)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (316-381)||(69671-69737)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (336-395)||(15225-15284)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (30-63)||(6861-6894)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 382; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 398
Target Start/End: Original strand, 27919304 - 27919689
Alignment:
Q  13 aatatacaaaacttttggacaatttcaaactaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaacacacaatgcatatgaaattgaagaattgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27919304 aatatacaaaacttttggacaatttcaaaccaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaacacacaatgcatatgaaattgaagaattgaa 27919403  T
Q  113 tagatgttgcaatcaattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27919404 tagatgttgcaatcaattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaat 27919503  T
Q  213 tatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27919504 tatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcg 27919603  T
Q  313 ttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttgaata 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27919604 ttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttgaata 27919689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 398
Target Start/End: Original strand, 16835505 - 16835880
Alignment:
Q  17 tacaaaacttttggacaatttcaa-actaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaacacacaatgcatatgaaattgaagaattgaatag 115  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||| | |   || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16835505 tacaaaactttag-acaatttcaatactaaaccaatatgaacaataataccaaactatcaattgaaaacacaatgcatatgaaattgaagaattgaatag 16835603  T
Q  116 atgttgcaatcaattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattat 215  Q
    || ||||||| |||| || ||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16835604 atcttgcaattaattgatctaagcaaatta-ttaaaatctaattcaacgaattagattaacttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattat 16835702  T
Q  216 cctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||   || | |||||| |||| ||  ||| |||||| ||||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||    
T  16835703 cctaacaattattcaattaatcatatgcaa---taatgaaaagtaaagagga-tggggaagagaaataacactgatatttttatagtagttctctctttc 16835798  T
Q  316 tcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttgaata 398  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  16835799 tcgtcatcgctagagctacatctactcttcttgataaattacgccttcaccaaggtcatccactaagtaac-aatgttgaata 16835880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 67 - 398
Target Start/End: Original strand, 19584016 - 19584342
Alignment:
Q  67 aagctatcaattgaacacacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaa 166  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | | |||| |  |||||||||||||||| |||    
T  19584016 aagctatcaattaaaaacacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagaacttgcactcaattgatctgagcaaaattattaaaacctaattcaacgaa 19584115  T
Q  167 ttagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatg 266  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || | |||||| |||| |    
T  19584116 ttagattaacttttgatgaaaaaaaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattcaattaatcatatgcaa---taatgaaaagtaaagagg 19584212  T
Q  267 acagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcacc 366  Q
      |||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| | |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  19584213 ttaggg-aagagagataacaccggtatttttatagtagttcgctctttcacttcctcgctagggctatgtctactattcttgatgaagtaagccttcacc 19584311  T
Q  367 aaggtcatccactatataacaaatgttgaata 398  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  19584312 aaggtcatccactaagtaac-aatgttgaata 19584342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 98 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16587161 - 16586868
Alignment:
Q  98 aattgaagaattgaatagatgttgcaatcaattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttag 197  Q
    ||||||| | |||||||| | |||||||||||| || |||  ||||||    |||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||    
T  16587161 aattgaatatttgaataggttttgcaatcaattgatctaagaaaattataagaaacctaattcaatgaattagattaattttcaatgaaaaacaacttag 16587062  T
Q  198 atcaacactagcaattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatattttt 297  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16587061 atcaacactagcaattattctatcaactattcaattaatcacatgcaatagta---aaaagtaaagaggatattgaa-gagagataacaccgatattttt 16586966  T
Q  298 ataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttga 395  Q
    |||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16586965 atagtagttcgctctttctcatcctcgctagagctacgtctactactcttgatgaagtacgccttcaccaaggtcatccactaagtaacaaatgttga 16586868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 10492893 - 10492526
Alignment:
Q  13 aatatacaaaacttttggacaatttcaaactaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaacacacaatgcatatgaa-attgaagaattga 111  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||  | || ||||||| ||| |||| ||| |||||| ||    
T  10492893 aatatacacaacttttagacaatttcaaaccaaacctatatgaacaatattactaagctatcagatcaaaacacaattcatgtgaatattaaagaataga 10492794  T
Q  112 atagatgttgcaatcaattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaa 211  Q
    ||||||  || ||||| || || ||| ||||| | || ||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10492793 atagattgtgaaatcatttgatctaagcaaatgatttgaaacctaattcaatgaattcgattatttttcaatgaaaaacaactaagatcaacactagcaa 10492694  T
Q  212 ttatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctc 311  Q
    ||||            |||||| |||||||||||| |||   |||||| |||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||   ||| ||||    
T  10492693 ttat------------tcaattgatcacatgcaatggta---aaaagtaaagaggatagggaa-gagatataacaccgatatttttatagttgtttgctc 10492610  T
Q  312 gttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttga 395  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10492609 tttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacaccttcaccaaggtcatccactaagtaacaaatgttga 10492526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 330 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 39045118 - 39045050
Alignment:
Q  330 gctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttgaata 398  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39045118 gctacctctactctacttgatgaattactccttcaccaaagtcatccactatgtaacaaatgttgaata 39045050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Original strand, 15453049 - 15453115
Alignment:
Q  316 tcgtcctcgcta-gagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactat 381  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15453049 tcgtcctcgctaagggctacctctactctacttgatgatatacgccttcaccaaggtcatccactat 15453115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 381
Target Start/End: Original strand, 15411717 - 15411753
Alignment:
Q  345 cttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactat 381  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15411717 cttgatgaagtatgccttcaccaaggtcatccactat 15411753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 13)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 13 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 1376926 - 1376544
Alignment:
Q  13 aatatacaaaacttttggacaatttcaaactaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaacacacaatgcatatgaaattgaagaattgaa 112  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1376926 aatatacaaaacatttagacaatttcaaaccaaacctatatggacagaattgctaagctatcaattgaaaacacaatgcatatgaaactgaagaattgaa 1376827  T
Q  113 tagatgttgcaatcaattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaat 212  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1376826 tagatgttgcaatcaattgatctaagcaaattaggtaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaat 1376727  T
Q  213 tatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcg 312  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||   |||| ||||     
T  1376726 tatcctaacaactattcaattaatcacatgcaatag---taaaaagtaaaggtgataggggaagagagataacaccaatatttttattgtagtttgctct 1376630  T
Q  313 ttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttgaata 398  Q
    |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1376629 ttcttgtcatctctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgccttcaccaaggtcatccactatgtaacaaatgttaaata 1376544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 33 - 250
Target Start/End: Original strand, 9986775 - 9986992
Alignment:
Q  33 aatttcaaactaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaacacacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaattaa 132  Q
    |||||||||| |||||||   |||||||| |  || |||||||| | || ||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||| ||||  |||||| |    
T  9986775 aatttcaaaccaaacctaagggaacaaaaatactatgctatcaaatcaaaacacaatacatgtgtgattgaagaattgaatagattttgctttcaattga 9986874  T
Q  133 tttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattcaat 232  Q
    | ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||   |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9986875 tctaagcaaattatataaaacctaattcaatgaattagatttattttcaatgaaaagcaatttagatcaacactagcaattatcttaaaaattattcaat 9986974  T
Q  233 taatcacatgcaatagta 250  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  9986975 taatcgcatgcaatagta 9986992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 378
Target Start/End: Original strand, 9132039 - 9132344
Alignment:
Q  67 aagctatcaattgaacacacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaa 166  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   |  ||||| || ||| | || || | ||||||||||||||||||    
T  9132039 aagctatcaatcaaaaacacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagaaatccaacccaattgatctaagctaagtact-aaaacctaattcaatgaa 9132137  T
Q  167 ttagattatcttttgatgaaaaa-caacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagat 265  Q
    |||| | | ||||| |  ||||| ||||||||||||| || ||    || ||||||  |||||||||||| || |||||||| |    |||| | ||||     
T  9132138 ttaggtcaacttttaacaaaaaaacaacttagatcaatacaagtttctaacctaaccgttattcaattaa-catatgcaataatc---aaaaataaagaa 9132233  T
Q  266 gacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcac 365  Q
    || | |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  9132234 gataaggaa-gagagataacaccgatatttttatagtagttcgttcttt-tcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacaccttcac 9132331  T
Q  366 caaggtcatccac 378  Q
    |||||||||||||    
T  9132332 caaggtcatccac 9132344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 276 - 395
Target Start/End: Original strand, 9990662 - 9990781
Alignment:
Q  276 gagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatc 375  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  9990662 gagagataacactgatatttttatagtagttcgctctttctcatcctcgctagagctacgtttactcttcttgatgaagtactccttcatcaaggtcatc 9990761  T
Q  376 cactatataacaaatgttga 395  Q
    |||||  |||||||||||||    
T  9990762 cactaagtaacaaatgttga 9990781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 303 - 395
Target Start/End: Original strand, 16775576 - 16775668
Alignment:
Q  303 agttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttga 395  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16775576 agttcgctctttctcgtcctctctagagccacgtctactcttcttgatgaagtacacattcaccaaggtcatccactaagtaacaaatgttga 16775668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 333 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 29699787 - 29699725
Alignment:
Q  333 acgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttga 395  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||    
T  29699787 acgtctactctacttgatgaagtacgccttcaccaaggccatcgactatgtgacaaatgttga 29699725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 381
Target Start/End: Original strand, 11579712 - 11579757
Alignment:
Q  336 tctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactat 381  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11579712 tctactctacttgatgaagtacgccttcaccaaggtcatccactat 11579757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 336 - 395
Target Start/End: Original strand, 11518166 - 11518225
Alignment:
Q  336 tctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttga 395  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||    
T  11518166 tctactctacttgatgaagtacgccttcaccaaggtcatccaatatgtatgaaatgttga 11518225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 336 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 14279307 - 14279248
Alignment:
Q  336 tctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttga 395  Q
    |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  14279307 tctactctacttgatgaagtataccttcaccaaggtcatccactatgtatcaaaagttga 14279248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 381
Target Start/End: Original strand, 11347049 - 11347094
Alignment:
Q  336 tctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactat 381  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  11347049 tctactctacttgatgaagtacacctttaccaaggtcatccactat 11347094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Original strand, 14205208 - 14205278
Alignment:
Q  316 tcgtcctcgcta-gagctacgtctactcttcttgatgaagtacgt----cttcaccaaggtcatccactat 381  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||    
T  14205208 tcgtcctcgctaagggctacctctactctacttgatgaagtatgtacaccttcaccaaggtcatccactat 14205278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Original strand, 14213898 - 14213968
Alignment:
Q  316 tcgtcctcgcta-gagctacgtctactcttcttgatgaagtacgt----cttcaccaaggtcatccactat 381  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||    
T  14213898 tcgtcctcgctaagggctacctctactctacttgatgaagtatgtacaccttcaccaaggtcatccactat 14213968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 330 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 12356326 - 12356274
Alignment:
Q  330 gctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactata 382  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||| | |||||||||    
T  12356326 gctacgtttactcttcttgatgaaaaacgtctccaccaaggacttccactata 12356274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 20 - 378
Target Start/End: Original strand, 17582696 - 17583047
Alignment:
Q  20 aaaacttttggacaatttcaaactaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaacacacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgt 119  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17582696 aaaacttttagaaaatttcaaaccaaacctatatgaacaaaattactaagctatcaattgaaaacacaatgcatatgaaattgaagaattgaacagatgt 17582795  T
Q  120 tgcaatcaattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatccta 219  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  17582796 tgcaatcaattgatctaaacaaattagttaaaacataattcaatgaattagattatcttttaatg-aaaacaacatagatcaacactagcaattaaccta 17582894  T
Q  220 acaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||    
T  17582895 acaattattcaattaatcacatgcaatag---taaaaagtaaagaggatagggaaagagagatgccaccgatatttttatagtagtccgctctttctcgt 17582991  T
Q  320 cctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccac 378  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||    
T  17582992 catcgctagagctacgtctac---tcttgatgaagtacaccttcaagaaggtcatccac 17583047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24001887 - 24001513
Alignment:
Q  17 tacaaaacttttggacaatttcaaactaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaacacacaatgcatatgaaattgaagaattgaataga 116  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  24001887 tacaaagcttttagacaatttcaaaccaaacctatatgaacaaaattactaagctatcaaatcaaaacacaatacatgtgaaattaaagagttgaataga 24001788  T
Q  117 tgttgcaatcaattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatc 216  Q
    | |||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  24001787 ttttgcaatcaattgatctaagcaaattatttgaaacctaattcaatcaattagattatttttcaatgaaaaataacttagatcaacactagcaattgtc 24001688  T
Q  217 ctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttct 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  24001687 ttaacaattattcaattaatcacatgcaatag---taaaaagtaaagaggataggg-aatagagataacaccgatatttttatagtagttcgctctttct 24001592  T
Q  317 cgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttga 395  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24001591 cgtcatcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacaccttcaccaaggtcatccactaagtaacaaatgttga 24001513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 12476242 - 12475860
Alignment:
Q  13 aatatacaaaacttttggacaatttcaaactaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaaca-cacaatgcatatgaaattgaagaattga 111  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||| | || | |||||| ||| || ||||||||||||||    
T  12476242 aatatacaaaatttatagacaatttcaaaccaaacttatatgaacaaaattactaagctatcaaatcaaaaacacaatacatgtgtaattgaagaattga 12476143  T
Q  112 atagatgttgcaatcaattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaa 211  Q
    |||||| |||||||||||| || ||| |||||||  | ||| |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  12476142 atagattttgcaatcaattgatctaagcaaattatatgaaatctaattcaatgaattagattaattttcaatgaaaaacaacttagatcaactctaacaa 12476043  T
Q  212 ttatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctc 311  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||  |||    
T  12476042 ttatccaaacaattattcaattaatcacatgcaatag---taaacagtaaagaggataggg-aagagagataacaccgacatttttatagtagttttctc 12475947  T
Q  312 gttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttgaata 398  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  12475946 tttctcgtcctcgctagagctacctctactcttcttgatgaagtacaccttcaccaaggtcatccattatgtaacaaatgttgaata 12475860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 30 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 18565633 - 18565268
Alignment:
Q  30 gacaatttcaaact-aaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaacacacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaa 128  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||| | | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  18565633 gacaatttcaaaatcaaacctatatgagcaataatatcaaactatcaattgaaaacacaatgcatatgaaattgaagaattgagtagatcttgaaatcaa 18565534  T
Q  129 ttaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattatt 228  Q
    || || ||| ||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  18565533 ttgatctaagcaaattatttgaaacctaattcaataaattatattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagaatttatcctaacagttatt 18565434  T
Q  229 caattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctag 328  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||| |||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||  ||| ||||| ||||||||||    
T  18565433 caattaatcacatgcaatag---taaaaagtaaagaggataggg-aagagagataataccgatatttttatagtagttttctctttctcatcctcgctag 18565338  T
Q  329 agctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttgaata 398  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||    
T  18565337 agctacttctactcttcttgatgaagtacactttcaccaaggtcatccactaagtaattaatgttgaata 18565268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 163 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 10747446 - 10747236
Alignment:
Q  163 tgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaa 262  Q
    |||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||||||| || ||   |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |    |||||| ||    
T  10747446 tgaattaggttaacttttaacgaaaaacaatttagatcaatacaagtttttatcctaacaattattctattaatcatatgcaataatc---aaaagtaaa 10747350  T
Q  263 gatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtctt 362  Q
    || || | |||| |||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10747349 gaggatatggaa-gagagataacaccgatatttttatagtag--cgctcttt-tcatcctcactagagctacgtctactcttcttgatgaagtacggctt 10747254  T
Q  363 caccaaggtcatccacta 380  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10747253 caccaaggtcatccacta 10747236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 222 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 15935656 - 15935486
Alignment:
Q  222 aattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcc 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |  |||| | |||| || ||||||| | ||||||||| | ||||||||||  |||| |||| ||||| |||    
T  15935656 aattattcaattaatcacatgcaata-tcc--aaaattaaagaggatagggaaacaaagataacactgttatttttatagtagtttgctctttctcatcc 15935560  T
Q  322 tcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttga 395  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  15935559 tcgctaaagctacgtctactcttcttgatgaagtacaccttcaccaaggtcatccactaagtaactaatgttga 15935486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 247
Target Start/End: Original strand, 19957289 - 19957505
Alignment:
Q  31 acaatttcaaactaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaaca-cacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaat 129  Q
    ||||| |||||| |||||||| | ||||||| |  || |||||||| | || | |||||||||  || |||||||||||||||| ||  ||||||||| |    
T  19957289 acaatatcaaaccaaacctatgtcaacaaaaatactatgctatcaaatcaaaaacacaatgcaagtgtaattgaagaattgaatggactttgcaatcatt 19957388  T
Q  130 taatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattc 229  Q
    | || ||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||   |||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| |||||||||    
T  19957389 tgatctaagcaaattatttaaaacctaactcaaagaattaggttcattttcaatgaaaaacaacttatatcaatactagccattaacctatcaattattc 19957488  T
Q  230 aattaatcacatgcaata 247  Q
    || |||||||| ||||||    
T  19957489 aa-taatcacaagcaata 19957505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 20403473 - 20403368
Alignment:
Q  272 gaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggt 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||  ||| || |||||||||    
T  20403473 gaaagagagataacaccgatctttttatagtaatttgctatttctcatcctcgctagagctacgtctactctt---ggtgaaaaacgcctccaccaaggt 20403377  T
Q  372 catccacta 380  Q
    |||||||||    
T  20403376 catccacta 20403368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 247
Target Start/End: Original strand, 10747457 - 10747520
Alignment:
Q  184 gaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaata 247  Q
    ||||||||||||||||||| || |||   |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10747457 gaaaaacaacttagatcaatacaagcttctatcttaacaattattcaattaatcatatgcaata 10747520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 15935792 - 15935693
Alignment:
Q  31 acaatttcaaactaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaacacacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaatt 130  Q
    |||||||||||| || ||||||  |||||||||  ||||||||||| | || |||||||  |  |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  15935792 acaatttcaaaccaaccctataaaaacaaaattactaagctatcaaattaaaacacaatataagtgaaattgaataatttaatagatgttgcattcaatt 15935693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Original strand, 23575626 - 23575692
Alignment:
Q  316 tcgtcctcgcta-gagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactat 381  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  23575626 tcgtcctcgctaagggctacctctactctacttgatgaagtacaccttcgccaaggtcatccactat 23575692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 375
Target Start/End: Original strand, 25925190 - 25925250
Alignment:
Q  316 tcgtcctcgcta-gagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatc 375  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  25925190 tcgtcctcgctaagggctacctctactctacttgatgaagtacaccttcaccaaggtcatc 25925250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 393
Target Start/End: Original strand, 19958814 - 19958852
Alignment:
Q  355 tacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgtt 393  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19958814 tacgccttcaccaaggtcatccactatgtaacaaatgtt 19958852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 395
Target Start/End: Original strand, 86233 - 86615
Alignment:
Q  13 aatatacaaaacttttggacaatttcaaactaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaacacacaatgcatatgaaattgaagaattgaa 112  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  86233 aatatataaaacttttagacaatttcaaacaaaacctatatgagcaaaattactaaactatctattgaaaacaaaatgcatgtgaaattgaaaaattgaa 86332  T
Q  113 tagatgttgcaatcaattaatt----taaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactag 208  Q
    ||||| |||||||| || ||||    ||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||    
T  86333 tagattttgcaatcgatcaattgatctaagcaacttatttgaaacctaattcaatgaattagattatcttttatcgaaaaacaacttagatcaatactag 86432  T
Q  209 caattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcg 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||| || || | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  86433 caattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatag---taaaaagtaaagaggatagcg-aagagagataacaccgatatttttatagtagttcg 86528  T
Q  309 ctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttga 395  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  86529 ctctttcttgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaaatactccttcaccaaggtcatccactaagtaacaaatgttga 86615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 16)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 85 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 14282139 - 14281832
Alignment:
Q  85 acaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14282139 acaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttccaatcaattgatctaagaaaattagttaaaacttaattcaatgaattagattatcttttgatg 14282040  T
Q  185 aaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataa 284  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||| |||| || |||| |||||||||||    
T  14282039 aaaaataatttagatcagcactagcaattaacctaacaattattgaattaatcacatgcaatag---taaaaagtgaagaggataggg-aagagagataa 14281944  T
Q  285 caccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatata 384  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||    
T  14281943 caccgatatttttatagtagtttgctctttctcgtcctcgttagagctacgtctactcttcttgatgaagtacaccttcaccaaggtcatccactaagta 14281844  T
Q  385 acaaatgttgaa 396  Q
    ||||||||||||    
T  14281843 acaaatgttgaa 14281832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 380
Target Start/End: Original strand, 19455772 - 19456131
Alignment:
Q  17 tacaaaacttttggacaatttcaaactaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaacacacaatgcatatgaaattgaagaattgaataga 116  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| | || ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  19455772 tacaaaacgtttagacaatttcaaaccaaacctatatgaacaaaattactaagctgtcaaatcaaaacacaatacatgtgaaattgaggaattgaataga 19455871  T
Q  117 tgttgcaatcaattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatc 216  Q
    | |||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19455872 ttttgcaatcaattgatctaagcaaattatttgaaacctaattcaatgaattagattactattcaatgaaaaacaacttaaatcaacactaggaattatc 19455971  T
Q  217 ctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttct 316  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||   |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||  |||||||||||  |||||| || ||||    
T  19455972 ctaacaattattcaattgatcatatgcaatag---taaaaagtaaagaggataggg-aagagagataacactaatatttttatagtagttcgatctttct 19456067  T
Q  317 cgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccacta 380  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||    
T  19456068 cgtcctcgctagagctacgtatactcttcttgatgaagtacacctttaccaacgtcatccacta 19456131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 30 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 4848211 - 4847845
Alignment:
Q  30 gacaatttcaaactaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaaca-cacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaa 128  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||| | || | |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4848211 gacaatttcaaaccaaatctatatgaacaaaattactaagttatcaaataaaaaacacaatacatgtgtaattgaagaattgaatagattttgcattcaa 4848112  T
Q  129 ttaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattatt 228  Q
    || || ||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||   |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4848111 ttgatctaagcaaattatatgaaacctaattcaatgaattagattgattttcaatgaaaaacaacttagatcaacactagaaattatcctaaaaattatt 4848012  T
Q  229 caattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctag 328  Q
    |||||||||||||||||||   || |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  || | |||| ||||||||||| ||||    
T  4848011 caattaatcacatgcaata--tct-aaaagtaaagaggatagggaaagagagatcacaccgatatttttataatagattgctctttctcgtcctctctag 4847915  T
Q  329 agctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttgaata 398  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  4847914 atctacctctactcttcttgattaagtacatcttcaccgagatcatccaccatgtaacaaatgttgaata 4847845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 83 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 8943310 - 8943029
Alignment:
Q  83 acacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttga 182  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  8943310 acacaaggcatatgaatttgaagaattgaatagaacttgcactcaattgatctaaccaaatta-ttaaaacctaattcaacgaattagattaacttttga 8943212  T
Q  183 tgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagat 282  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |    |||||| |||| || |||||| |||||||    
T  8943211 tgaaaaacaacttatatcaacactagcaattatcctaacaattattcaactaatcatatgtaataatg---aaaagtaaagaggatagggaa-gagagat 8943116  T
Q  283 aacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaag 369  Q
    ||| |||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8943115 aaccccgatattttgatagtagttcgctctttctcgtcctcactagagctacttctactcttcttgatgaattacgccttcaccaag 8943029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4854542 - 4854274
Alignment:
Q  30 gacaatttcaaactaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaaca-cacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaa 128  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||| |||||| | || | |||||| ||| || |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  4854542 gacaatttcaaaccaaacctacatgaacaaaattactaagttatcaaatcaaaaacacaatacatgtgtaattgaagaattgaatagatttttcaatcaa 4854443  T
Q  129 ttaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattatt 228  Q
    || || ||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||   |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  4854442 ttgatctaagcaaattatatgaaacctaattcaatgaattagattgattttcaatgaaaaataacttagatcaacactagcaattattctaaaaattatt 4854343  T
Q  229 caattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttata 300  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4854342 caattaatcacatgcaatag--ct-aaaagtaaagaggatagggaaagagagataacaccgatatttttata 4854274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4876277 - 4876007
Alignment:
Q  30 gacaatttcaaactaaa--cctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaaca-cacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatc 126  Q
    ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||  |||| |||||| | || | |||||| ||| || |||||||||||||||||||| || |||||    
T  4876277 gacaatttcaaaccaaaaacctacatgaacaaaattactaagttatcaaatcaaaaacacaatacatgtgtaattgaagaattgaatagatttttcaatc 4876178  T
Q  127 aattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaatta 226  Q
    |||| || ||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||   |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  4876177 aattgatctaagcaaattatatgaaacctaattcaatgaattagattgattttcaatgaaaaataacttagatcaacactagcaattattctaaaaatta 4876078  T
Q  227 ttcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4876077 ttcaattaatcacatgcaatag--ct-aaaagtaaagaggatagggaaagagagataacaccgatatttttata 4876007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 299
Target Start/End: Original strand, 14636364 - 14636630
Alignment:
Q  31 acaatttcaaactaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaaca-cacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaat 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || | || ||| ||| || |||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  14636364 acaatttcaaaccaaacctatatgaacaaaattactaagctatcaaatcaaaaacataatacatgtgtaattgaagaattgaatagattttaaaatcaat 14636463  T
Q  130 taatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattc 229  Q
    | || ||| |||||||  | |||||||||||||  |||||||||   |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14636464 tgatctaagcaaattatatgaaacctaattcaacaaattagattgattttcaatgaaaaacaacttagatcaatactagcaattatcctaacaattattc 14636563  T
Q  230 aattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttat 299  Q
    ||||||| ||||||||| ||  ||||| || |||| || | ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  14636564 aattaataacatgcaatggt--taaaatgtaaagaggata-ggaaaaagagataataccgatatttttat 14636630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 147 - 380
Target Start/End: Original strand, 13606980 - 13607208
Alignment:
Q  147 ttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaat 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  || | |   |||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  13606980 ttaaaacctaattcaacgaattaggttaacttttaacgaaaaacaacttagattattacaaacttctatcctaacaattattgaattaa-catatgcaat 13607078  T
Q  247 agtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttct 346  Q
    | |    |||||| ||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13607079 aatc---aaaagtaaagatggtaaggaa-gagagataacaccgatatttttatggtagttcactctttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttct 13607174  T
Q  347 tgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccacta 380  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  13607175 tgatgaagtacaccttcaccaaggtcatccacta 13607208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4872535 - 4872333
Alignment:
Q  30 gacaatttcaaactaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaaca-cacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaa 128  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||| | || | |||||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4872535 gacaatttcaaaccaaacctatctgaacaaaattactaagttatcaaataaaaaacacaatacatgtgtaattgaagaattgaattgattttgcaatcaa 4872436  T
Q  129 ttaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattatt 228  Q
    || |  ||| |||||||  | || |||||||||||||||||||||   |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4872435 ttgacctaagcaaattatatgaatcctaattcaatgaattagattgattttcaatgaaaaacaacttagatcaacactagaaattatcctaaaaattatt 4872336  T
Q  229 caa 231  Q
    |||    
T  4872335 caa 4872333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 154 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 20246458 - 20246239
Alignment:
Q  154 ctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtacta 253  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||| ||  || |||||| | |        
T  20246458 ctaattcaaggaattagattaa-ttttgatcaaaagcaacttagatcaacacaagtttttatcctaacaattaatcaactag-catatgcaaaaatc--- 20246364  T
Q  254 aaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaa 353  Q
    |||||| |||| || | ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20246363 aaaagtaaagaagataaggaaa-agagatgacaccgatatttttatagtagttcgctcttt-tcgtcctcactagagctacgtctactcttcttgatgaa 20246266  T
Q  354 gtacgtcttcaccaaggtcatccacta 380  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||    
T  20246265 gtacaccttcaccaaagtcatccacta 20246239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 313 - 398
Target Start/End: Original strand, 14637015 - 14637100
Alignment:
Q  313 ttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttgaata 398  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14637015 ttctcgtcctcgctagagttatgtctactcttcttgatgaagtacgctttcacaaaggtcatccactatgtaacaaatgttgaata 14637100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 13080556 - 13080490
Alignment:
Q  316 tcgtcctcgcta-gagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactat 381  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13080556 tcgtcctcgctaagggctacgtctactctacttgatgaagtacgccttcaccaaggtcatccactat 13080490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Original strand, 14761004 - 14761070
Alignment:
Q  316 tcgtcctcgcta-gagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactat 381  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14761004 tcgtcctcgctaaggggtacgtctactctacttgatgaagtacgccttcaccaaggtcatccactat 14761070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 23296092 - 23296040
Alignment:
Q  346 ttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttgaata 398  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23296092 ttgaagaagtacaccttcaccaaggtcatccactatgtaacaaatgttgaata 23296040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Original strand, 4831065 - 4831135
Alignment:
Q  274 aagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttctt 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |   | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4831065 aagagagataacacccatatttttatagtagttcgtt---tttcgtactcgctagagctacgtctactcttctt 4831135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 23296176 - 23296085
Alignment:
Q  17 tacaaaacttttggacaatttcaaactaaacctatatgaac-aaaattgttaagctatcaattgaacacacaatgcatatgaaattgaagaa 107  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| | || ||||||| ||| ||| |||||||||    
T  23296176 tacaaaacttatagacaatttcaaaccaaacctatatgaacaaaaattactaaactatcaaatcaaaacacaatacatgtgagattgaagaa 23296085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 20 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 14234 - 13854
Alignment:
Q  20 aaaacttttggacaatttcaaactaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaaca-cacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatg 118  Q
    ||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || | |||||| ||| || ||||||||||||||||||||     
T  14234 aaaacttatagacaattttaaaccaaacctatatgaacaaaattactaagctatcaaataaaaaacacaatacatgtgtaattgaagaattgaatagatt 14135  T
Q  119 ttgcaatcaattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaa--caacttagatcaacactagcaattatc 216  Q
    ||| |||||||| || ||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  14134 ttgtaatcaattgatctaagcaaattgtataaaacctaattcaatgaattagattaattttcaatgaaaaaaacaacttagatcaacactagaaattatc 14035  T
Q  217 ctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagg--gaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgtt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||| ||  ||   |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||| ||    
T  14034 ctaacaattattcaattaatcacatgcaatag---taaaaagtaaagaggatgggcaaaaagagagataacacccatatttttataatagttctctcttt 13938  T
Q  315 ctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttgaata 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13937 ctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacaccttcaccaaggtcatccactaagtaacaaatgttgaata 13854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 13)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 31 - 395
Target Start/End: Original strand, 19818071 - 19818433
Alignment:
Q  31 acaatttcaaactaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaaca-cacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaat 129  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| |||| | || | || ||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19818071 acaatttcaaaccaaacctatataaacaaaattactaagctgtcaaatcaaaaacataatacatgtgcaattgaagaattgaatagattttgcaatcaat 19818170  T
Q  130 taatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattc 229  Q
    | || ||| |||||||  | |||||||| |||||||||||||||   |||  |||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19818171 tgatctaagcaaattatgtgaaacctaactcaatgaattagattgattttcaatgataaactacttagatcaacactagaaattaacctaacaattattc 19818270  T
Q  230 aattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctaga 329  Q
    |||||||||||||||||||    | ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  19818271 aattaatcacatgcaatag---cataaagtaaagaggatagggaaagagagataacaccgatatttttatagtagttcgctctttcttgtcctcgttaga 19818367  T
Q  330 gctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttga 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19818368 gctacctctactcttcttgatgaagtacaccttcaccaaggtcatccactatgtaacaaatgttga 19818433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 327
Target Start/End: Original strand, 22852276 - 22852589
Alignment:
Q  16 atacaaaacttttggacaatttcaaactaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaacacacaa-----tgcatatgaaattgaagaattg 110  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |   ||     | ||| || ||||||||||||     
T  22852276 atacaaaacttatagacaatttcaaatcaaacctatatgaacaaaattactaagctatcaattgaagaattaaacctatacatgtgtaattgaagaatta 22852375  T
Q  111 aatagatgttgcaatcaattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagca 210  Q
    ||||||  |||||||||||| || ||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22852376 aatagagtttgcaatcaattgatctaagcaaattatatgaaacctaattcaatgaattagattaattttcaataaaaaacaacttagatcaacactagca 22852475  T
Q  211 attatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgct 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   | |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22852476 attatcctaacatttattcaattaatcacatgcaatag---tcaaaagtaaagaggatagggaaagagagataacaccgatatttttatagtagttcgct 22852572  T
Q  311 cgttctcgtcctcgcta 327  Q
    | |||||||||||||||    
T  22852573 ctttctcgtcctcgcta 22852589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23478641 - 23478409
Alignment:
Q  17 tacaaaacttttggacaatttcaaactaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaacacacaatgcatatgaaattgaagaattgaataga 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23478641 tacaaaacttttagacaatttcaaaccaaacctatatgaacaaaattactaagctatcaaatcaaaacacaatacatgtgaaattgaagaagtgaataga 23478542  T
Q  117 tgttgcaatcaattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatc 216  Q
    | |||||||||||| || ||  |||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23478541 ttttgcaatcaattgatctaggcaaattatctgaaacctaattcaatgaactagattatttttcagtgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatc 23478442  T
Q  217 ctaacaattattcaattaatcacatgcaatagt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23478441 ctaacaattattcaattaatcacatgcaatagt 23478409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 398
Target Start/End: Original strand, 17495314 - 17495681
Alignment:
Q  17 tacaaaacttttggacaatttcaaactaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaaca-cacaatgcatatgaaattgaagaattgaatag 115  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||| | ||||  ||||||||||| | || | |||||| ||| |  ||||||||||||||||||    
T  17495314 tacaaaacttatagacaatttcaaacctaacctatatgaagataattactaagctatcaaatcaaaaacacaatacatgtataattgaagaattgaatag 17495413  T
Q  116 atgttgcaatcaattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattat 215  Q
    || |||||||||||| || ||| |||||||  | |||||||||||||||||| ||||||  |||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17495414 attttgcaatcaattgatctaagcaaattatatgaaacctaattcaatgaatcagattaattttcagtgaaacacaacttagatcaacactagcaattat 17495513  T
Q  216 cctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttc 315  Q
                ||||||||||||||||||| |||   |||||| |||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  17495514 ------------tcaattaatcacatgcaatggta---aaaagtaaagaggataggggaagaaagataacaccgatatttttatagtagttcgctctttc 17495598  T
Q  316 tcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttgaata 398  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  17495599 ttgtcctcgatagagctacctctactcttcttgatgaagtacaccttcaccaaggtcatccaatatgtaacaaatgttgaata 17495681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 16970040 - 16969673
Alignment:
Q  17 tacaaaacttttggacaatttcaaactaaacctatatgaacaaaattgt-taagctatcaattgaacacacaatgcatatgaaattgaagaattgaatag 115  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |   |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||||||    
T  16970040 tacaaaaattttagacaatttcaaaccaaacctacatgaacaaaaatcactaagctatcaattgaaaacacaatgtatatggaattgagtaattgaatag 16969941  T
Q  116 atgttgcaatcaattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatg-aaaaacaacttagatcaacactagcaatta 214  Q
    |  ||||| |||||| || ||| ||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  16969940 aatttgcactcaattgatctaagcaaatta-taaaaacctaattcaacaaattagattaacttttgatggaaaaacaacttagatcaataaaagcaatta 16969842  T
Q  215 tcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgtt 314  Q
    |            |||||||||||||||||||| |    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||    
T  16969841 t------------tcaattaatcacatgcaataatg---aaaagtaaagaggatagggaaagagagataacaccgatatttttatagtagttcgctattt 16969757  T
Q  315 ctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttgaata 398  Q
    ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  16969756 ctcatcctcactagagctacgtatactcttcttgatgaagtacaccttcaccaaggtcatccgctaagtaacaaatgttgaata 16969673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21017965 - 21017749
Alignment:
Q  32 caatttcaaactaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaaca-cacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaatt 130  Q
    ||||||||||| |||||||  ||| |||||||  ||||||||||| | || | |||||||||  || |||||||||||||| ||||  | ||||||||||    
T  21017965 caatttcaaaccaaacctaagtgagcaaaattactaagctatcaaatcaaaaacacaatgcaagtgtaattgaagaattgattagacttagcaatcaatt 21017866  T
Q  131 aatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattca 230  Q
     || ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  21017865 gatctaagcaaattgtgtaaaacctaattcaatgaattaggttaattttcaatgaaaagcaacttagatcaacactaacaattaacctatcaattattca 21017766  T
Q  231 attaatcacatgcaata 247  Q
    |||||||||| ||||||    
T  21017765 attaatcacaagcaata 21017749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 271 - 398
Target Start/End: Original strand, 25974270 - 25974397
Alignment:
Q  271 ggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaagg 370  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25974270 ggaaagggagataacactgaaatttttatagtagttcgctctttctcgtcctcgctagagttacctctactcttcttgatgaagtacaccttcaccaagg 25974369  T
Q  371 tcatccactatataacaaatgttgaata 398  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  25974370 tcatccactacgtaacaaatgttgaata 25974397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 119 - 248
Target Start/End: Original strand, 22051578 - 22051706
Alignment:
Q  119 ttgcaatcaattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcct 218  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||   | |||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22051578 ttgcaatcaattgatctaagcaaattgtatgaaacctaattcaatgaattagattaattttcaatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcct 22051677  T
Q  219 aacaattattcaattaatcacatgcaatag 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22051678 aacaattattcaatt-atcacatgcaatag 22051706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 380
Target Start/End: Original strand, 19957068 - 19957350
Alignment:
Q  86 caatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaattaat-ttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatg 184  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||| | | |||| || |||||||||||| ||||||||||||||  ||       ||| |||||||||    
T  19957068 caatgcatatggaattgaagaactgaatagaaattgaactgaattgatcttaaacaaatta-ttaaaacctaattcgttgg------ttaacttttgatg 19957160  T
Q  185 aaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataa 284  Q
    |||| | ||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |    |||||| | || || | |||| |||||||||    
T  19957161 aaaacccacttagatcaatacaagctactatcctaacaattattcaattaa-catatgtaataatg---aaaagtaaggaggataaggaa-gagagataa 19957255  T
Q  285 caccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccacta 380  Q
    |||| ||||||| | |  |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  19957256 caccaatattttaa-agtagttcgttctttctcgtcctcgctagagttacgtctactcttcttgatgaagtacgccttcatcaaggtcatccacta 19957350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 21983249 - 21982944
Alignment:
Q  67 aagctatcaattgaacacacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaa 166  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| | |||||| || |||    |||| | |||| ||||||||| |||    
T  21983249 aagctatcaatcaaaaacacaatgcatatggaattgaagaattgaatagaaattgaactcaattgatctaaggtgattact-aaaatctaattcaacgaa 21983151  T
Q  167 ttagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatg 266  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |  ||    ||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| |     ||||| || | |    
T  21983150 ttaggttaacttttgacgaaaaacaacttagatcaatataagtttctatcctaacaattattcaattaa-cgtatgtaataatcg---aaagtaaatagg 21983055  T
Q  267 acagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcacc 366  Q
    | |||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||| ||| || || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||   || |||    
T  21983054 ataggga--gatagataacaccgatatttttatagtagttcactcttt-tcttcctctctagagctacgtctacccttcttgatgaagcacacattaacc 21982958  T
Q  367 aaggtcatccacta 380  Q
    ||||||||||||||    
T  21982957 aaggtcatccacta 21982944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 21017620 - 21017563
Alignment:
Q  334 cgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatg 391  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  21017620 cgtctactctacttgatgaagtacgccttcaccaaggttatccactatgtaacaaatg 21017563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 384
Target Start/End: Original strand, 22106430 - 22106499
Alignment:
Q  316 tcgtcctcgcta-gagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatata 384  Q
    |||||||||||| | | ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22106430 tcgtcctcgctaagggttacctctactctacttgatgaagtacgccttcaccaaggtcatccactatata 22106499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 17613923 - 17613857
Alignment:
Q  316 tcgtcctcgcta-gagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactat 381  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||| | |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  17613923 tcgtcctcgctaagggctacctctactttacttgattaagtacgctttcaccaaggtcatccactat 17613857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 393
Target Start/End: Original strand, 41853 - 42234
Alignment:
Q  13 aatatacaaaacttttggacaatttcaaactaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaacacacaatgcatatgaaattgaagaattgaa 112  Q
    |||||||||||||| |  | || ||||||| ||||||||||||| |||||   || ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  41853 aatatacaaaacttataaaaaaattcaaaccaaacctatatgaaaaaaatcactaggctatcaattgcaaacacaatgcatgtgaaattgagaaattgaa 41952  T
Q  113 tagatgttgcaatcaattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatct-tttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaa 211  Q
    ||||| |||||||||||| || ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41953 tagattttgcaatcaattgatctaagcaaattatttgaaacctaattcaatgaattaggttgtctctttaatgaaaaacaacttagatcaacactagcaa 42052  T
Q  212 ttatcctaa----caattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttc 307  Q
     ||||||||    ||||| |||| |||||||||||||||||||   |||||| |||| || | |||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  42053 ctatcctaattaacaattgttcacttaatcacatgcaatagta---aaaagtaaagaggatatggaa-gagagataacactgatatttttatagtagttc 42148  T
Q  308 gctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgtt 393  Q
     ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  42149 actctttctcatcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacaccttcaccaaggtcatccactaagtaacaaatgtt 42234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 83 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 63952 - 63644
Alignment:
Q  83 acacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttga 182  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  63952 acacaaagcatatgaaattgaagaattgaatagattttgcaatcaattgatctaagaaaattatttgaaacctaattcaatgaattagattatcttttga 63853  T
Q  183 tgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagat 282  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| || || | || || | |||||| ||    
T  63852 tgaagaacaacttagatcaacactagcaattattctaacaattattcaattaatcatatgcaatag---taaaaggtaaaaaggatagag-aagagaaat 63757  T
Q  283 aacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactata 382  Q
    ||  || |||||||||||  ||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  63756 aattccaatatttttatagtagttctctctttcttgtcctcgctagagctatgtctactcttcttgatgaagtacgccttcaccaaggtcatccactaag 63657  T
Q  383 taacaaatgttga 395  Q
    |||||||||||||    
T  63656 taacaaatgttga 63644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0520
Description:

Target: scaffold0520; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 7415 - 7033
Alignment:
Q  13 aatatacaaaacttttggacaatttcaaactaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaacacacaatgcatatgaaattgaagaattgaa 112  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||  | | |||||||||||||||| |    
T  7415 aatataaaaaacttttagacaatttcaaaccaaacccctatgaacaaaattactaagctatcaattgaaaacacaacacgtgtgaaattgaagaattgta 7316  T
Q  113 tagatgttgcaatcaattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatctttt-gatgaaaaacaacttagatcaacactagcaa 211  Q
    ||||| || ||||||||| || ||   |||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  7315 tagatttttcaatcaattgatctatgaaaattatttgaaacataatttaatgaattagattatcttttcaatgaaaaacaaattagatcaacactagcat 7216  T
Q  212 ttatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctc 311  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||| ||  ||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||    
T  7215 ttagcctaataattattcaattaatcacatgcaatag---taaaaagaaaagaggattggg-aagagagataacactgatatttttattgtagttctctc 7120  T
Q  312 gttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttgaata 398  Q
     |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7119 tttctcgtcctcgctggagctacatatactcttcttgatgaagtataacttcaccaaggtcatccactatctaacaaatgttgaata 7033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 6)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 30 - 378
Target Start/End: Original strand, 23662599 - 23662943
Alignment:
Q  30 gacaatttcaa-actaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaacacacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaa 128  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||   |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  23662599 gacaatttcaataccaaacttatatgaacaatgatactaagctatcaattgaaaacacaatgcatatgaatttgaagaattgaatagaacttgcactcaa 23662698  T
Q  129 ttaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattatt 228  Q
    || || ||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23662699 ttgatctaagcaaattatttaaa-cctaattcaacaaattagattaacttttgatgaaaaataaattagatcaacactagcaattatcctaacaattatt 23662797  T
Q  229 caattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctag 328  Q
    ||||||||||||||| |   || | ||||||  ||| || |   ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||    
T  23662798 caattaatcacatgcta---taatgaaaagtatagaggata-aaaaagagagataacaccgatatttttatagtagttcgctctttctcgtcctcacgag 23662893  T
Q  329 agctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccac 378  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23662894 agcgacgtctactcttcttgatgaagtacgccttcaccaaggtcatccac 23662943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 220 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24374085 - 24373914
Alignment:
Q  220 acaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||    
T  24374085 acaattattcaattaatcacatgcaatagta---aaaagtaaagaggatagggaa-gagagataacaccgatatttttatagtagttcactctttctcgt 24373990  T
Q  320 cctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttga 395  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24373989 ccttgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacaccttcaccaaggtcatccactaagtaacaaatgttga 24373914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 380
Target Start/End: Original strand, 25906478 - 25906767
Alignment:
Q  83 acacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttga 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |  ||||| || ||||| || || | |||||||||||||||||||||| |||  |||| |    
T  25906478 acacaatgcatatggaattgaagaattgaatagaacttgaatccaattgatctaaactaagtact-aaaacctaattcaatgaattaggttaatttttaa 25906576  T
Q  183 tgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagat 282  Q
     ||||| ||||||||||||| || ||    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |     ||||| |||| || | |||| |||||||    
T  25906577 cgaaaa-caacttagatcaatacaagtttctatccgaacaattattcaattaa-catatgcaataatcg---aaagtaaagaggataaggaa-gagagat 25906670  T
Q  283 aacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccacta 380  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  25906671 aacaccgatatttttatagtagttcgctcttta-cgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacactttcaccaaggtcatccacta 25906767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 207 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 21072089 - 21071902
Alignment:
Q  207 agcaattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagtt 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||    ||||| || | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  21072089 agcaattatcctaccaattattcagttaatcacatgcacaagta----aaagtaaaaaggatagggaaagagagataacactgatatttttatagtagtt 21071994  T
Q  307 cgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttgaata 398  Q
     |||| |||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21071993 agctctttctcgtccttgatagagctatctctactcttcttgatgaagtacaccttcaccaaggtcatccactatgtaataaatgttgaata 21071902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 150 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 18595824 - 18595600
Alignment:
Q  150 aaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||            ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18595824 aaacctaattcaatgaattagattatatttcaatgaaaaacaacttagatcaatacta------------acaattattcaattaatcagatgctatagt 18595737  T
Q  250 actaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttga 349  Q
    |   |||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||         || ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18595736 a---aaaagtaaagaggatagggaaagagagataacactgatatttttatagtagtccgc---------tcttcgctagagctacctctacttttcttga 18595649  T
Q  350 tgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttgaata 398  Q
    |||| |||  ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18595648 tgaactacaccttcatcaaggtcatcctctatgtaacaaatgttgaata 18595600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 22670779 - 22670714
Alignment:
Q  330 gctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttga 395  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| || |||| |||||    
T  22670779 gctacctctactatacttgatgaagtacaccttcactaaggtcatccactatgtatcaaaagttga 22670714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 14)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 398
Target Start/End: Original strand, 22441448 - 22441813
Alignment:
Q  31 acaatttcaaactaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaaca-cacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaat 129  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| | || | || ||| ||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22441448 acaatttcaaaacaaatctataggaacaaaattactaagctatcaaatcaaaaacataatacatgtgtaattgaagaaatgaatagattttgcaatcaat 22441547  T
Q  130 taatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattc 229  Q
    | || ||| || || |  | ||||||||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||    
T  22441548 tgatctaatcatatcatatgaaacctaattcaacgaattagattgatttttaatgaaaaacaacttagatcattattagaaattatcctaacaattattc 22441647  T
Q  230 aattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctaga 329  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| || || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22441648 aattaatcacatgcaatag--ctaaaa-gtaaaaaggatagggaaagagagataacaccgatatttttatagtagttcgctctttctcatcctcgctaga 22441744  T
Q  330 gctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttgaata 398  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22441745 gctacctctactcttcttgatgaagtacaccttcaccaaggtaatccactatgtaacaaatgttgaata 22441813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 24129987 - 24129625
Alignment:
Q  30 gacaatttcaa-actaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaacacacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaa 128  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||| | |   |||||||||||  || |||||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||| ||||    
T  24129987 gacaatttcaataccaaacctatttgaacaataataccaagctatcaatcaaaaacacaatgcatatagaatttaagaattgaatagaaattgcactcaa 24129888  T
Q  129 ttaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattatt 228  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24129887 tttatgtaagcaaatta-ttaaaacctaattcaacgaattacgttaacttttgatgaaaaacaacttagatcaacacaagcaattattctaacaattatt 24129789  T
Q  229 caattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctag 328  Q
    ||||||| || ||||||   || | |||||| |||| || |||| |||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  24129788 caattaa-catatgcaa---taatgaaaagtaaagaggataggg-aagagagatagcaacgatatttttatagtagttcactctttctcgtcctcgctag 24129694  T
Q  329 agctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttgaata 398  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  24129693 agctacgtatactcttcttgatgaagtacgtcttccccaaggtcatccactaagtaac-aatgttgaata 24129625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 300
Target Start/End: Original strand, 19126855 - 19127122
Alignment:
Q  30 gacaatttcaaactaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaaca-cacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaa 128  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | || | |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19126855 gacaatttcaaaccaaacccatatgaacaaaattactaagctatcaaatcaaaaacacaatacatgtgtaattgaagaattgaatagattttgcaatcaa 19126954  T
Q  129 ttaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattatt 228  Q
    || || ||| |||||||  | |||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19126955 ttgatctaagcaaattatatgaaacttaattcaatgaattagattaatttttaatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcccaacaattatt 19127054  T
Q  229 caattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttata 300  Q
    |||||||||||||| |||||||     |||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19127055 caattaatcacatgaaatagtag----aagtaaagaggatagggaaagagagataacactgatatttttata 19127122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 69 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 24670734 - 24670428
Alignment:
Q  69 gctatcaattgaacacacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaattaat-ttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaat 167  Q
    |||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| | | |||| || |||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  24670734 gctatcaatcaaaaacacaatgcatatggaattgaagaattgaatagaaattgaactgaattgatcttaagcaaatta-taaaaacctaattcaatgaat 24670636  T
Q  168 tagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatga 267  Q
    ||| ||| |||||||||| | |||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    |||||| |||| ||    
T  24670635 taggttaacttttgatgatatacaacttagatcaatacaaactattatcctaacaattattcaattaa-catatgcaatattg---aaaagtaaagagga 24670540  T
Q  268 cagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcacca 367  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  24670539 tagggaa-gagagataacaccgatatttttatagtagttcgctctttgtcgtcctcgctagagctatgtctactcttcttgatgaagtacgccttctcca 24670441  T
Q  368 aggtcatccacta 380  Q
    ||||| |||||||    
T  24670440 aggtcttccacta 24670428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 69 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 24707509 - 24707203
Alignment:
Q  69 gctatcaattgaacacacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaattaat-ttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaat 167  Q
    |||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| | | |||| || |||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  24707509 gctatcaatcaaaaacacaatgcatatggaattgaagaattgaatagaaattgaactgaattgatcttaagcaaatta-taaaaacctaattcaatgaat 24707411  T
Q  168 tagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatga 267  Q
    ||| ||| |||||||||| | |||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    |||||| |||| ||    
T  24707410 taggttaacttttgatgatatacaacttagatcaatacaaactattatcctaacaattattcaattaa-catatgcaatattg---aaaagtaaagagga 24707315  T
Q  268 cagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcacca 367  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  24707314 tagggaa-gagagataacaccgatatttttatagtagttcgctctttgtcgtcctcgctagagctatgtctactcttcttgatgaagtacgccttctcca 24707216  T
Q  368 aggtcatccacta 380  Q
    ||||| |||||||    
T  24707215 aggtcttccacta 24707203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 69 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 24740503 - 24740197
Alignment:
Q  69 gctatcaattgaacacacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaattaat-ttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaat 167  Q
    |||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| | | |||| || |||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  24740503 gctatcaatcaaaaacacaatgcatatggaattgaagaattgaatagaaattgaactgaattgatcttaagcaaatta-taaaaacctaattcaatgaat 24740405  T
Q  168 tagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatga 267  Q
    ||| ||| |||||||||| | |||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    |||||| |||| ||    
T  24740404 taggttaacttttgatgatatacaacttagatcaatacaaactattatcctaacaattattcaattaa-catatgcaatattg---aaaagtaaagagga 24740309  T
Q  268 cagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcacca 367  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  24740308 tagggaa-gagagataacaccgatatttttatagtagttcgctctttgtcgtcctcgctagagctatgtctactcttcttgatgaagtacgccttctcca 24740210  T
Q  368 aggtcatccacta 380  Q
    ||||| |||||||    
T  24740209 aggtcttccacta 24740197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 69 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 24753272 - 24752966
Alignment:
Q  69 gctatcaattgaacacacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaattaat-ttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaat 167  Q
    |||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| | | |||| || |||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  24753272 gctatcaatcaaaaacacaatgcatatggaattgaagaattgaatagaaattgaactgaattgatcttaagcaaatta-taaaaacctaattcaatgaat 24753174  T
Q  168 tagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatga 267  Q
    ||| ||| |||||||||| | |||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    |||||| |||| ||    
T  24753173 taggttaacttttgatgatatacaacttagatcaatacaaactattatcctaacaattattcaattaa-catatgcaatattg---aaaagtaaagagga 24753078  T
Q  268 cagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcacca 367  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  24753077 tagggaa-gagagataacaccgatatttttatagtagttcgctctttgtcgtcctcgctagagctatgtctactcttcttgatgaagtacgccttctcca 24752979  T
Q  368 aggtcatccacta 380  Q
    ||||| |||||||    
T  24752978 aggtcttccacta 24752966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 398
Target Start/End: Original strand, 16739165 - 16739541
Alignment:
Q  17 tacaaaacttttggacaatttcaa-actaaacctatatgaacaaaattgttaagctatc--aattgaacacacaatgcatatgaaattgaagaattgaat 113  Q
    ||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||| | |   |||||||   ||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  16739165 tacaaaactttag-acaatttcaataccaaacctatatgaacaataataccaagctatattaattgaaaacacaatgcatatgatataaaagaattgaat 16739263  T
Q  114 agatgttgcaatcaattaatttaaac-aaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaat 212  Q
     ||  ||||| |||||| || ||| | |||||| |  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16739264 ggaacttgcactcaattgatctaagctaaattatt--aaacctaattcaacgaattagattaacttttgat-agaaacaacttagatcaacactaccaat 16739360  T
Q  213 tatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcg 312  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |    |||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||     
T  16739361 tatcgtaacaattattcaatttatcatatgcaataatg---aaaagtaaagaggatagggaa-gagagataacaccgatatttttatagtagttcactct 16739456  T
Q  313 ttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttgaata 398  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  16739457 ttcttgtcctcgctagagctatgtctactcttcttgatgaagtacgcattcgccaaggtcatccactaagtaac-aatgttgaata 16739541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19765353 - 19765162
Alignment:
Q  17 tacaaaacttttggacaatttcaaactaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaacacacaatgcatatgaaattgaagaattgaataga 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19765353 tacaaaacttttagacaatttcaaa----acctatatgaacaaaattagtaagttatcaattgaaaacacaatgcatgtgaaattgaagaattgaataga 19765258  T
Q  117 tgttgcaatcaattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaat 212  Q
    | ||| ||| |||| |  ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19765257 ttttgaaataaattgacctaagcaaattatttgaaacctaattcaatgaattagattatcttttaatgaaaaacaacttagatcaacactagcaat 19765162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 368
Target Start/End: Original strand, 23374982 - 23375037
Alignment:
Q  313 ttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaa 368  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23374982 ttctcgtcctctctagagctatgtctactcttcttgatgaagtatgccttcaccaa 23375037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 357
Target Start/End: Original strand, 19127307 - 19127371
Alignment:
Q  293 tttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtac 357  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19127307 tttttatattagttcgctctttctcatccttgcttgagctacctctattcttcttgatgaagtac 19127371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 330 - 380
Target Start/End: Original strand, 25916956 - 25917006
Alignment:
Q  330 gctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccacta 380  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||| || ||||||||||||||||||    
T  25916956 gctacgtctactcttcttggtgaaaaacgcctccaccaaggtcatccacta 25917006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 205
Target Start/End: Original strand, 23987242 - 23987298
Alignment:
Q  148 taaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacac 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||||    
T  23987242 taaaacctaattcaaggaattagatta-attttaatcaaaaagaacttagatcaacac 23987298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 24246043 - 24245996
Alignment:
Q  13 aatatacaaaacttttggacaatttcaaactaaacctatatgaacaaaa 61  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24246043 aatatacaaaacttatagacaatt-caaaccaaacctatatgaacaaaa 24245996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 151; Significance: 9e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 98 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 42132 - 41835
Alignment:
Q  98 aattgaagaattgaatagatgttgcaatcaattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttag 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||  ||| ||  | |||||| ||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| |||    
T  42132 aattgaagaattgaatagattttgcaatcaatagatctaagaaaagtatatgaaaccttattcaatgaattagattaattttcaatgaaaaacaacatag 42033  T
Q  198 atcaacactagcaattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatattttt 297  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| |||| || ||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  42032 atcaatactggcaattatcccaacaattattaaattaatcacatgcaatagta---aaaagtaaagaggaaagggaaagaaagataacaacgacattttt 41936  T
Q  298 ataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttgaat 397  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  41935 atagtagttcgctctttctcgtcctctctagagctacctctactcttcttgatgaagtacgccttcaccaaggtcatccactatgaaacaaatgttgaat 41836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 11)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 33 - 395
Target Start/End: Original strand, 14992006 - 14992363
Alignment:
Q  33 aatttcaaactaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaaca-cacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaatta 131  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||| |  || |||||||| | || | |||||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  14992006 aatttcaaaccaaacctaagtgaacaaaaatactatgctatcaaatcaaaaacacaatacaagtgtaattgaagaattgaatagattttgcaatcaattt 14992105  T
Q  132 atttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattcaa 231  Q
    || ||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||||||    
T  14992106 atctaagcaaattatatgaaacctaattcaatgaattagattaattttcaatgaaaaacaacttatatcaacactagtaattattctataaattattcaa 14992205  T
Q  232 ttaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagc 331  Q
    ||||||||||| |||||   |||||| | |||| || |||| |||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  14992206 ttaatcacatgaaatag---taaaaaataaagaggataggg-aagagagataacactg--atttttatagtagttcgctctttctcgtcctcgctaaaac 14992299  T
Q  332 tacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttga 395  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14992300 tacgtctactcttcttgataaagtactccttcaccaaggtcatccactaagtaacaaatgttga 14992363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19237057 - 19236800
Alignment:
Q  83 acacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaattaat-ttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttg 181  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| | |||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  19237057 acacaatgcatatggaattgaagaatttaatagaaattgaactcaattgatcttaagcaaatta-ttaaaacctaattcaacgaattaggttaacttttg 19236959  T
Q  182 atgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagaga 281  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||   || | |||||| |||| || |||| ||||||||    
T  19236958 atgaaaaacaacttagatcaatacaagctactatcctaaaaattattcaattaa-catatgcaa---taatgaaaagtaaagaggataggg-aagagaga 19236864  T
Q  282 taacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttc 345  Q
    ||||||| |||||||||||  |||| |||| |||| ||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  19236863 taacaccaatatttttatagtagtttgctctttcttgttgtcgctagagctacatctactcttc 19236800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19310241 - 19309984
Alignment:
Q  83 acacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaattaat-ttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttg 181  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| | |||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  19310241 acacaatgcatatggaattgaagaatttaatagaaattgaactcaattgatcttaagcaaatta-ttaaaacctaattcaacgaattaggttaacttttg 19310143  T
Q  182 atgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagaga 281  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||   || | |||||| |||| || |||| ||||||||    
T  19310142 atgaaaaacaacttagatcaatacaagctactatcctaaaaattattcaattaa-catatgcaa---taatgaaaagtaaagaggataggg-aagagaga 19310048  T
Q  282 taacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttc 345  Q
    ||||||| |||||||||||  |||| |||| |||| ||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  19310047 taacaccaatatttttatagtagtttgctctttcttgttgtcgctagagctacatctactcttc 19309984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 16599058 - 16598952
Alignment:
Q  274 aagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtca 373  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |   || |||||||||||    
T  16599058 aagagtgatagcaccgatatttttataatagtttgctctttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttggtgaaaaatacctccaccaaggtca 16598959  T
Q  374 tccacta 380  Q
    |||||||    
T  16598958 tccacta 16598952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 247
Target Start/End: Original strand, 8365781 - 8365960
Alignment:
Q  71 tatcaattgaacacacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaa-tgaatt- 168  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| || |||| |||| ||  ||  ||| | |||  ||||||| |||| ||||||     
T  8365781 tatcaattgaaaacacaatacacatgaaattgaataattgaattgatatttcaattaattgatccaagtaaaattgttttaacctaaatcaaatgaattt 8365880  T
Q  169 agatta-tcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaata 247  Q
    |||||| ||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||  |||||||    
T  8365881 agattaatcttttgagaaaacacaacttatatcaacactagcaattctctaatcaattattcaattaatcaagtgcaata 8365960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19303972 - 19303901
Alignment:
Q  274 aagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19303972 aagagagataacaccgatatttttatagtagttcactctttcttgtcgtcgctagtgctacgtctactcttc 19303901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24752377 - 24752297
Alignment:
Q  316 tcgtcctcgcta-gagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttga 395  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  24752377 tcgtcctcgctaagggctacctctactctacttgatgaagtacaccttcaccaaggtcatccactatgtatcaaaagttga 24752297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 25190173 - 25190107
Alignment:
Q  316 tcgtcctcgcta-gagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactat 381  Q
    |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25190173 tcgtcctcgctaagggctacccctactctacttgatgaagtacgccttcaccaaggtcatccactat 25190107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Original strand, 28076180 - 28076246
Alignment:
Q  316 tcgtcctcgcta-gagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactat 381  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  28076180 tcgtcctcgctaagggctacctctactctacttgatgaagtacaccttcaccaacgtcatccactat 28076246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 24427230 - 24427166
Alignment:
Q  318 gtcctcgcta-gagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactat 381  Q
    |||||||||| | ||||| |||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24427230 gtcctcgctaagggctacctctactatacttgatgaagtacgcctacaccaaggtcatccactat 24427166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 21318420 - 21318354
Alignment:
Q  316 tcgtcctcgcta-gagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactat 381  Q
    |||||||||||| | | ||| |||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21318420 tcgtcctcgctaagggttacctctactctacctgatcaagtacgccttcaccaaggtcatccactat 21318354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 98 - 398
Target Start/End: Original strand, 20130 - 20428
Alignment:
Q  98 aattgaagaattgaatagatgttgcaatcaattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatga-aaaacaactta 196  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |  | |||  |||||| | ||||||||||   |||  |||| |||| ||||||    
T  20130 aattgaaaaattgaatagattttgcaatcaattgatttaagcaaataatatgaaagataattcgacgaattagattgattttcaatgacaaaaaaactta 20229  T
Q  197 gatcaacactagcaattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttt 296  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| || ||||  | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  20230 gatcaatactagcaattatcctaacaattattcaattaattacatgcaatag--ctaaaa-gtaaagagaatagggaaagagagataacaccaatatttt 20326  T
Q  297 tataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttgaa 396  Q
    ||||  |||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20327 tatagtagtttgctctttctcgtcctcactagagctacctctactcttcttgacgaagtacaccttcaccaaggtcatccactatgtaacaaatgttgaa 20426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 76
Target Start/End: Original strand, 17999 - 18044
Alignment:
Q  31 acaatttcaaactaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaa 76  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17999 acaatttcaaaccaaacctatatgaacaaaattactaagctatcaa 18044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1121 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold1121
Description:

Target: scaffold1121; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 39 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1821 - 1565
Alignment:
Q  39 aaactaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaacacacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaattaatttaaa 138  Q
    |||| |||||||||||||||| | |   || |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||     
T  1821 aaaccaaacctatatgaacaataataccaaactattaattgaaaacacaatgcatacgaaattgaagaattgaatagatcttgcaatgaattgatctaag 1722  T
Q  139 caaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattcaattaatca 238  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1721 caaatta-ttaaaacctaattcaatgaattagattaacttttgatgaaaaaccacttagatcaacactagcaattttcctaacaattattcaattaatca 1623  T
Q  239 catgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttata 300  Q
     ||||||   || | |||||| |||| || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  1622 tatgcaa---taattaaaagtaaagaggataggg-aagagagataacatcgatagttttata 1565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1485 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold1485
Description:

Target: scaffold1485; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 300
Target Start/End: Original strand, 445 - 713
Alignment:
Q  30 gacaatttcaaactaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaaca-cacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaa 128  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||| |||||| | || | |||||| ||| || |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  445 gacaatttcaaaccaaacctacatgaacaaaattactaagttatcaaatcaaaaacacaatacatgtgtaattgaagaattgaatagatttttcaatcaa 544  T
Q  129 ttaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattatt 228  Q
    || || ||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||   |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  545 ttgatctaagcaaattatatgaaacctaattcaatgaattagattgattttcaatgaaaaataacttagatcaacactagcaattattctaaaaattatt 644  T
Q  229 caattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttata 300  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  645 caattaatcacatgcaatag--ct-aaaagtaaagaggatagggaaagagagataacaccgatatttttata 713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0577 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0577
Description:

Target: scaffold0577; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 274 - 380
Target Start/End: Original strand, 509 - 615
Alignment:
Q  274 aagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtca 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  509 aagagagataacaccgatatttttataatagtttgctctttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtaagccttcaccaaggtca 608  T
Q  374 tccacta 380  Q
    |||||||    
T  609 tccacta 615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 395
Target Start/End: Original strand, 96583 - 96944
Alignment:
Q  31 acaatttcaaactaaacctatatgaacaaaattgttaagctatcaattgaaca-cacaatgcatatgaaattgaagaattgaatagatgttgcaatcaat 129  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||  || |||||||| | || | |||||| ||  || || |||||||||||| |||  |||||||||||    
T  96583 acaatttcaaaccaaccctatgtgaacaaaattactatgctatcaaataaaaaacacaatccaagtgtaactgaagaattgaaaagactttgcaatcaat 96682  T
Q  130 taatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattc 229  Q
    | || ||   |||||   ||||| | || |||| || |||| |||  |||  ||||||||||| |||||| | |||| ||||||| |||| |||||||||    
T  96683 tgatctaggaaaattgtgtaaaagcgaactcaaagagttaggttaattttcaatgaaaaacaagttagatgaccacttgcaattaacctatcaattattc 96782  T
Q  230 aattaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgc-tag 328  Q
    ||||||||||| ||||   ||  ||||||| || | || ||||||||||||| ||||| |   | ||||||  ||||| | | || |||||||||| |||    
T  96783 aattaatcacaagcaa---tatcaaaaagtaaaaaggatagggaaagagagagaacactg--gtgtttatagtagttcaccctttttcgtcctcgcttag 96877  T
Q  329 agctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttga 395  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||    
T  96878 ggctacgtctactctacttgatgaagtacaccttaaccaaagttatccactacgtaacaaatgttga 96944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0767
Description:

Target: scaffold0767; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 378
Target Start/End: Original strand, 1795 - 2017
Alignment:
Q  148 taaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacactagcaattatcctaacaattattcaattaatcacatgcaata 247  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||  |||| || |||| |||||||||||||||| ||    |||||||| ||||| |||||||  || ||||||||    
T  1795 taaaacctaattcaaggaattagcttaa-ttttcatcaaaagcaacttagatcaacacaagtttctatcctaataattaatcaattag-catatgcaata 1892  T
Q  248 gtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttctt 347  Q
     |    |||||| |||| || | |||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||  || |  |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  1893 atc---aaaagtaaagaggataaggaa-gagagataactccgatatttttatagtagttcact--tttttatccttgctagagctacgtctaatcttctt 1986  T
Q  348 gatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccac 378  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1987 gatgaagtacaccttcaccaaggtcatccac 2017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 272 - 376
Target Start/End: Original strand, 12746 - 12850
Alignment:
Q  272 gaaagagagataacaccgatatttttataccagttcgctcgttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggt 371  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||  ||| || ||| |||||    
T  12746 gaaagagagataacactaatatttttatagtagttcgctctttctcgtcctcgctagagtcacgtctactcttcttggtgaaaaacgcctccacgaaggt 12845  T
Q  372 catcc 376  Q
    |||||    
T  12846 catcc 12850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 316 - 398
Target Start/End: Original strand, 40786 - 40869
Alignment:
Q  316 tcgtcctcgcta-gagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttgaata 398  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40786 tcgtcctcgctaagggctacgtctactgtacttgatgaagtaccccttcagcaaggtcatccactatgtaacaaatgttgaata 40869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 398
Target Start/End: Original strand, 25975 - 26058
Alignment:
Q  316 tcgtcctcgcta-gagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttgaata 398  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||||||||   |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25975 tcgtcctcgctaagggctacgtctactgtacttaatgaagtacccattcagcaaggtcatccactatgtaacaaatgttgaata 26058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 7136 - 6863
Alignment:
Q  106 aattgaatagatgttgcaatcaattaatttaaacaaattagttaaaacctaattcaatgaattagattatcttttgatgaaaaacaacttagatcaacac 205  Q
    |||||||||||  |||||||||||| || ||| ||||||   | |||||||| |||||||||||| | |  |||  ||||||||||| |||||| || ||    
T  7136 aattgaatagaatttgcaatcaattgatctaagcaaattgtatgaaacctaactcaatgaattaggtcaattttcaatgaaaaacaaattagataaatac 7037  T
Q  206 tagcaattatcctaacaattattcaa---ttaatcacatgcaatagtactaaaaagttaagatgacagggaaagagagataacaccgatatttttatacc 302  Q
    | ||||||| |||| |||||||||||   ||||||||| |||||| |    |||||| || | || ||||||||||||| |||||||  |  ||||||      
T  7036 tggcaattaacctatcaattattcaacaattaatcacaagcaatattg---aaaagtaaaaaggatagggaaagagagagaacaccg--aggtttatagt 6942  T
Q  303 agttcgctcgttctcgtcctcgct-agagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactat 381  Q
    ||||| | | |  | ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  6941 agttcacccttgtttgtcctcgctaagggctacatctactctacttgatg-agtacgccttcaccaaggtcatcgactat 6863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 638 - 587
Alignment:
Q  330 gctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactat 381  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  638 gctacctctactctacttgatgaagtacgccttcaccaaggtcatccactat 587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 17483 - 17428
Alignment:
Q  313 ttctcgtcctcgctagagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaa 368  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17483 ttctcgtcctctctagagctatgtctactcttcttgatgaagtatgccttcaccaa 17428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Original strand, 19958 - 20024
Alignment:
Q  316 tcgtcctcgcta-gagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactat 381  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19958 tcgtcctcgctaagggctacctctactctacttgatgaagtacgccttcaccaaggtcatccgctat 20024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Original strand, 69671 - 69737
Alignment:
Q  316 tcgtcctcgcta-gagctacgtctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactat 381  Q
    |||||||||||| | ||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  69671 tcgtcctcgctaagggctaactctactctacttgatgaagtacgccttcaccaaggtcatccactat 69737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 336 - 395
Target Start/End: Original strand, 15225 - 15284
Alignment:
Q  336 tctactcttcttgatgaagtacgtcttcaccaaggtcatccactatataacaaatgttga 395  Q
    |||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  15225 tctactctgctagatgaagtacaccttcaccaaggtcatccactatgtaccaaaagttga 15284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 63
Target Start/End: Original strand, 6861 - 6894
Alignment:
Q  30 gacaatttcaaactaaacctatatgaacaaaatt 63  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6861 gacaatttcaaaccaaacctatatgaacaaaatt 6894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University