View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17464_high_13 (Length: 367)

Name: NF17464_high_13
Description: NF17464
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17464_high_13
NF17464_high_13
[»] chr2 (58 HSPs)
chr2 (91-357)||(45726830-45727096)
chr2 (91-357)||(35446885-35447151)
chr2 (93-357)||(1631735-1631999)
chr2 (96-357)||(42288117-42288377)
chr2 (91-316)||(36318010-36318235)
chr2 (91-316)||(36773504-36773729)
chr2 (96-316)||(29867811-29868031)
chr2 (91-316)||(723745-723970)
chr2 (91-316)||(17057370-17057595)
chr2 (91-316)||(17085353-17085578)
chr2 (91-316)||(38312182-38312407)
chr2 (91-316)||(2334418-2334643)
chr2 (91-316)||(34139771-34139997)
chr2 (91-314)||(33162451-33162674)
chr2 (105-316)||(42362294-42362505)
chr2 (99-316)||(14633834-14634052)
chr2 (91-316)||(11151592-11151817)
chr2 (91-316)||(5723256-5723480)
chr2 (98-316)||(11690443-11690661)
chr2 (91-316)||(36988076-36988301)
chr2 (91-315)||(11067248-11067472)
chr2 (91-352)||(24397962-24398226)
chr2 (91-316)||(45099697-45099922)
chr2 (91-357)||(17450491-17450744)
chr2 (91-316)||(4503133-4503358)
chr2 (91-304)||(6595006-6595221)
chr2 (91-316)||(36205665-36205889)
chr2 (91-316)||(4484330-4484556)
chr2 (106-316)||(13121710-13121919)
chr2 (91-316)||(30833288-30833514)
chr2 (91-337)||(33648089-33648340)
chr2 (91-314)||(11049493-11049721)
chr2 (91-283)||(17490149-17490336)
chr2 (156-316)||(24885603-24885763)
chr2 (128-316)||(7815311-7815500)
chr2 (91-258)||(32289565-32289732)
chr2 (91-258)||(6266691-6266859)
chr2 (128-316)||(14202450-14202633)
chr2 (91-264)||(26353178-26353351)
chr2 (91-210)||(7451166-7451284)
chr2 (94-258)||(13656035-13656200)
chr2 (214-316)||(39284827-39284929)
chr2 (91-258)||(12647386-12647555)
chr2 (150-315)||(12123644-12123810)
chr2 (114-298)||(30218068-30218254)
chr2 (91-164)||(39284930-39285003)
chr2 (102-199)||(28671989-28672088)
chr2 (129-237)||(42261524-42261633)
chr2 (116-211)||(42019896-42019994)
chr2 (239-316)||(5700271-5700349)
chr2 (113-159)||(42412117-42412162)
chr2 (150-238)||(34811281-34811370)
chr2 (166-209)||(4561137-4561180)
chr2 (125-238)||(41454254-41454366)
chr2 (114-294)||(7597036-7597217)
chr2 (132-210)||(24197945-24198023)
chr2 (138-238)||(41446159-41446260)
chr2 (287-325)||(24197829-24197867)
[»] chr6 (50 HSPs)
chr6 (91-352)||(21593570-21593831)
chr6 (91-357)||(2972940-2973206)
chr6 (91-357)||(26830124-26830391)
chr6 (91-357)||(3808708-3808975)
chr6 (91-357)||(5043528-5043795)
chr6 (91-357)||(17762890-17763158)
chr6 (91-357)||(603089-603347)
chr6 (91-352)||(22424826-22425089)
chr6 (91-276)||(21588913-21589098)
chr6 (91-316)||(9183032-9183257)
chr6 (91-316)||(28137409-28137634)
chr6 (91-316)||(5406200-5406424)
chr6 (91-316)||(5410525-5410749)
chr6 (91-316)||(2171532-2171756)
chr6 (91-286)||(17757994-17758191)
chr6 (91-316)||(33211186-33211411)
chr6 (91-315)||(26954287-26954510)
chr6 (91-316)||(31404675-31404899)
chr6 (98-316)||(5413401-5413618)
chr6 (93-316)||(30834538-30834762)
chr6 (113-316)||(3038926-3039129)
chr6 (91-316)||(16452329-16452555)
chr6 (91-316)||(33160352-33160579)
chr6 (116-314)||(4045366-4045566)
chr6 (91-258)||(3072759-3072928)
chr6 (91-258)||(412101-412270)
chr6 (91-254)||(16569037-16569189)
chr6 (129-356)||(25073469-25073698)
chr6 (91-211)||(26800634-26800755)
chr6 (91-258)||(27647861-27648028)
chr6 (91-258)||(6097451-6097608)
chr6 (91-258)||(16554869-16555037)
chr6 (91-258)||(16578518-16578686)
chr6 (91-258)||(16616694-16616862)
chr6 (91-258)||(16631425-16631593)
chr6 (91-258)||(16653112-16653280)
chr6 (98-182)||(5409076-5409161)
chr6 (91-258)||(25421305-25421474)
chr6 (91-258)||(6027246-6027415)
chr6 (94-258)||(13153913-13154080)
chr6 (94-258)||(33342108-33342275)
chr6 (94-258)||(34164856-34165023)
chr6 (91-258)||(34167078-34167248)
chr6 (190-316)||(16567148-16567265)
chr6 (114-181)||(9572667-9572735)
chr6 (290-357)||(11660508-11660574)
chr6 (131-211)||(2908505-2908586)
chr6 (145-206)||(26310412-26310472)
chr6 (278-357)||(5740978-5741058)
chr6 (91-155)||(21356041-21356104)
[»] chr1 (85 HSPs)
chr1 (91-357)||(13547090-13547356)
chr1 (91-357)||(11348599-11348865)
chr1 (91-357)||(13549001-13549267)
chr1 (91-357)||(37168198-37168465)
chr1 (91-357)||(29136148-29136415)
chr1 (91-357)||(47255340-47255607)
chr1 (91-357)||(193512-193778)
chr1 (91-357)||(42297975-42298242)
chr1 (91-357)||(47115072-47115340)
chr1 (91-357)||(31925708-31925973)
chr1 (91-357)||(37033072-37033340)
chr1 (91-352)||(7482231-7482494)
chr1 (91-357)||(19754395-19754662)
chr1 (95-357)||(34603476-34603740)
chr1 (91-357)||(19752586-19752853)
chr1 (91-315)||(28265555-28265779)
chr1 (91-316)||(834168-834393)
chr1 (91-316)||(28220227-28220452)
chr1 (91-316)||(31659180-31659405)
chr1 (91-303)||(8550787-8551001)
chr1 (96-321)||(44455097-44455322)
chr1 (91-298)||(49918309-49918517)
chr1 (91-316)||(3156808-3157032)
chr1 (91-316)||(28223422-28223647)
chr1 (91-316)||(4552638-4552863)
chr1 (91-316)||(50167176-50167401)
chr1 (184-357)||(37879005-37879178)
chr1 (91-303)||(37503558-37503768)
chr1 (98-316)||(50169218-50169436)
chr1 (91-316)||(3847122-3847347)
chr1 (91-303)||(13659337-13659550)
chr1 (91-303)||(46064872-46065085)
chr1 (91-316)||(3189273-3189498)
chr1 (91-316)||(3198090-3198315)
chr1 (91-316)||(3206929-3207154)
chr1 (105-313)||(1833467-1833675)
chr1 (91-317)||(41360856-41361081)
chr1 (98-316)||(196915-197134)
chr1 (91-314)||(15820251-15820474)
chr1 (91-316)||(10925165-10925393)
chr1 (91-303)||(37559868-37560083)
chr1 (99-316)||(23555275-23555491)
chr1 (94-316)||(20762614-20762837)
chr1 (91-312)||(13137977-13138196)
chr1 (91-303)||(45644355-45644569)
chr1 (91-258)||(13316352-13316520)
chr1 (91-316)||(927977-928204)
chr1 (91-316)||(30476447-30476674)
chr1 (91-313)||(40122197-40122421)
chr1 (99-294)||(16455585-16455780)
chr1 (91-303)||(51765349-51765565)
chr1 (91-258)||(9987202-9987369)
chr1 (91-258)||(20622237-20622406)
chr1 (91-258)||(40282377-40282545)
chr1 (114-357)||(22079222-22079461)
chr1 (91-258)||(9036417-9036584)
chr1 (116-346)||(6808358-6808595)
chr1 (99-254)||(36683694-36683839)
chr1 (100-316)||(37282701-37282918)
chr1 (94-258)||(21053958-21054123)
chr1 (91-189)||(37876767-37876865)
chr1 (91-181)||(28242382-28242472)
chr1 (102-302)||(8871074-8871259)
chr1 (91-258)||(44203631-44203800)
chr1 (100-314)||(44650172-44650388)
chr1 (262-357)||(28242289-28242385)
chr1 (113-246)||(3460707-3460841)
chr1 (118-208)||(5459956-5460046)
chr1 (114-253)||(13938143-13938281)
chr1 (114-251)||(2926516-2926653)
chr1 (153-273)||(12318585-12318706)
chr1 (150-329)||(1050503-1050683)
chr1 (130-210)||(9109459-9109540)
chr1 (132-221)||(2263016-2263106)
chr1 (153-356)||(41135721-41135926)
chr1 (137-238)||(4535527-4535629)
chr1 (150-325)||(25652018-25652195)
chr1 (150-253)||(16914234-16914338)
chr1 (140-241)||(32471478-32471579)
chr1 (307-357)||(34602557-34602607)
chr1 (174-240)||(35109492-35109557)
chr1 (100-161)||(44646814-44646875)
chr1 (174-311)||(1485855-1485995)
chr1 (91-134)||(31422863-31422906)
chr1 (187-302)||(44646881-44646997)
[»] chr5 (72 HSPs)
chr5 (91-357)||(40147162-40147428)
chr5 (91-357)||(28278217-28278483)
chr5 (91-342)||(213381-213633)
chr5 (91-357)||(5057948-5058212)
chr5 (96-357)||(38746906-38747167)
chr5 (91-357)||(27015433-27015690)
chr5 (93-341)||(27637615-27637865)
chr5 (91-316)||(533711-533936)
chr5 (91-316)||(42428431-42428656)
chr5 (96-316)||(13488145-13488365)
chr5 (91-303)||(32636778-32636991)
chr5 (91-316)||(25412704-25412928)
chr5 (91-316)||(39468550-39468775)
chr5 (96-316)||(28750661-28750881)
chr5 (98-313)||(537970-538185)
chr5 (91-316)||(13239694-13239919)
chr5 (91-313)||(42426236-42426458)
chr5 (91-316)||(33831622-33831847)
chr5 (91-316)||(8565947-8566172)
chr5 (91-316)||(16452023-16452247)
chr5 (91-316)||(13343003-13343228)
chr5 (91-316)||(30182531-30182756)
chr5 (91-316)||(31182915-31183138)
chr5 (91-357)||(16640941-16641208)
chr5 (98-316)||(30682930-30683146)
chr5 (91-316)||(3075659-3075884)
chr5 (91-316)||(36074043-36074270)
chr5 (91-316)||(37439076-37439309)
chr5 (102-313)||(9049354-9049565)
chr5 (91-316)||(16409425-16409643)
chr5 (91-308)||(13695691-13695910)
chr5 (91-316)||(26177833-26178050)
chr5 (102-303)||(42309947-42310149)
chr5 (91-258)||(9789224-9789392)
chr5 (91-258)||(18441648-18441816)
chr5 (91-316)||(19806326-19806530)
chr5 (161-316)||(5887487-5887642)
chr5 (91-258)||(29751160-29751328)
chr5 (91-258)||(22536290-22536457)
chr5 (91-258)||(29720364-29720532)
chr5 (91-258)||(29722524-29722692)
chr5 (91-357)||(316663-316931)
chr5 (91-258)||(10593258-10593426)
chr5 (91-316)||(26170724-26170930)
chr5 (91-258)||(25078120-25078289)
chr5 (91-258)||(25136089-25136258)
chr5 (91-258)||(40380090-40380259)
chr5 (91-258)||(40382301-40382470)
chr5 (91-243)||(33906030-33906184)
chr5 (128-243)||(10054854-10054969)
chr5 (91-183)||(42926966-42927058)
chr5 (150-345)||(35616082-35616278)
chr5 (94-203)||(16546684-16546796)
chr5 (129-238)||(3325933-3326043)
chr5 (199-356)||(4160534-4160690)
chr5 (94-258)||(16544407-16544574)
chr5 (243-313)||(42926838-42926908)
chr5 (114-238)||(10700674-10700796)
chr5 (96-155)||(4160702-4160762)
chr5 (157-209)||(42926916-42926968)
chr5 (153-244)||(30802843-30802934)
chr5 (140-245)||(22097877-22097981)
chr5 (128-209)||(8445764-8445846)
chr5 (166-244)||(14689503-14689581)
chr5 (300-357)||(14689622-14689678)
chr5 (101-199)||(30793195-30793293)
chr5 (151-286)||(6016979-6017115)
chr5 (273-329)||(32576482-32576538)
chr5 (91-134)||(18596881-18596924)
chr5 (91-134)||(38882340-38882383)
chr5 (137-211)||(32576344-32576418)
chr5 (102-142)||(5887446-5887486)
[»] chr8 (64 HSPs)
chr8 (91-357)||(4283425-4283691)
chr8 (91-357)||(42434992-42435258)
chr8 (96-357)||(40221646-40221907)
chr8 (91-357)||(18655302-18655567)
chr8 (91-357)||(11383887-11384152)
chr8 (116-357)||(40328680-40328922)
chr8 (91-316)||(15212728-15212953)
chr8 (91-303)||(27811232-27811445)
chr8 (91-314)||(10930200-10930423)
chr8 (91-316)||(33352092-33352317)
chr8 (91-316)||(43036365-43036590)
chr8 (128-357)||(44353693-44353923)
chr8 (91-316)||(4731600-4731825)
chr8 (97-315)||(18141763-18141981)
chr8 (99-316)||(30143284-30143499)
chr8 (91-314)||(40321024-40321247)
chr8 (91-316)||(42498136-42498362)
chr8 (91-316)||(3303671-3303896)
chr8 (91-303)||(5689225-5689438)
chr8 (91-316)||(17982595-17982821)
chr8 (91-317)||(19491700-19491925)
chr8 (91-303)||(34254331-34254543)
chr8 (91-303)||(1345372-1345585)
chr8 (97-316)||(1292471-1292689)
chr8 (99-316)||(30291547-30291767)
chr8 (91-316)||(31218199-31218425)
chr8 (91-316)||(6598914-6599139)
chr8 (91-316)||(6674367-6674592)
chr8 (91-303)||(34256507-34256719)
chr8 (91-317)||(9765690-9765911)
chr8 (91-316)||(12702635-12702864)
chr8 (91-316)||(44303796-44304023)
chr8 (97-313)||(41366622-41366837)
chr8 (91-315)||(1746219-1746443)
chr8 (91-312)||(8965692-8965914)
chr8 (91-316)||(19945359-19945586)
chr8 (91-316)||(4162442-4162663)
chr8 (91-316)||(4743215-4743429)
chr8 (96-316)||(18106087-18106304)
chr8 (98-285)||(3772164-3772352)
chr8 (93-258)||(2627735-2627902)
chr8 (102-316)||(8153703-8153914)
chr8 (96-220)||(10015119-10015241)
chr8 (139-303)||(10929753-10929907)
chr8 (91-258)||(25689955-25690122)
chr8 (169-316)||(41364926-41365073)
chr8 (91-258)||(3439504-3439671)
chr8 (91-198)||(3073875-3073981)
chr8 (91-180)||(4733784-4733873)
chr8 (98-224)||(7597648-7597776)
chr8 (128-268)||(1822282-1822423)
chr8 (128-268)||(1856727-1856868)
chr8 (114-224)||(11712024-11712135)
chr8 (114-208)||(32902197-32902292)
chr8 (94-258)||(42575327-42575494)
chr8 (95-258)||(15290522-15290688)
chr8 (95-258)||(15470891-15471057)
chr8 (91-316)||(29796320-29796549)
chr8 (149-354)||(10240061-10240264)
chr8 (138-237)||(30909389-30909487)
chr8 (154-237)||(3231859-3231944)
chr8 (141-210)||(11137073-11137146)
chr8 (116-167)||(38863949-38864000)
chr8 (170-244)||(9054788-9054861)
[»] chr4 (93 HSPs)
chr4 (91-357)||(54882921-54883187)
chr4 (91-350)||(40632353-40632612)
chr4 (91-357)||(2209614-2209882)
chr4 (91-357)||(50673848-50674113)
chr4 (94-357)||(41964316-41964580)
chr4 (91-357)||(12073293-12073560)
chr4 (91-357)||(6655857-6656123)
chr4 (95-345)||(8665320-8665571)
chr4 (91-357)||(46703400-46703669)
chr4 (91-339)||(41639345-41639593)
chr4 (91-357)||(379279-379548)
chr4 (99-352)||(35662346-35662600)
chr4 (99-357)||(27416974-27417228)
chr4 (91-357)||(50262701-50262965)
chr4 (91-345)||(8648051-8648306)
chr4 (91-316)||(26175637-26175862)
chr4 (91-316)||(56178637-56178862)
chr4 (91-316)||(5429621-5429846)
chr4 (99-316)||(9927467-9927683)
chr4 (91-303)||(36994478-36994691)
chr4 (91-316)||(52095363-52095588)
chr4 (91-314)||(36463390-36463613)
chr4 (91-318)||(48893639-48893870)
chr4 (91-316)||(34570415-34570640)
chr4 (91-316)||(47038412-47038635)
chr4 (91-316)||(54199908-54200132)
chr4 (91-316)||(48142984-48143211)
chr4 (91-316)||(12739551-12739776)
chr4 (99-316)||(37740568-37740784)
chr4 (91-316)||(52467355-52467581)
chr4 (91-350)||(12119445-12119707)
chr4 (91-316)||(5871762-5871987)
chr4 (91-312)||(31474096-31474318)
chr4 (91-271)||(26364223-26364403)
chr4 (91-316)||(29254436-29254661)
chr4 (91-316)||(37229722-37229949)
chr4 (102-320)||(21688186-21688405)
chr4 (91-316)||(6542180-6542407)
chr4 (130-313)||(12745476-12745659)
chr4 (91-316)||(29999806-30000031)
chr4 (91-316)||(4587900-4588126)
chr4 (91-269)||(46147392-46147570)
chr4 (128-316)||(12747794-12747982)
chr4 (132-316)||(24969053-24969238)
chr4 (91-297)||(3913408-3913614)
chr4 (91-316)||(45687183-45687409)
chr4 (167-357)||(55085442-55085632)
chr4 (91-312)||(5370083-5370308)
chr4 (110-316)||(52082684-52082883)
chr4 (91-245)||(12743926-12744080)
chr4 (91-245)||(12745315-12745469)
chr4 (96-357)||(26699447-26699713)
chr4 (91-313)||(5207843-5208066)
chr4 (91-316)||(13992293-13992511)
chr4 (91-316)||(51337006-51337231)
chr4 (170-314)||(41639207-41639351)
chr4 (99-316)||(13009453-13009657)
chr4 (91-258)||(31495316-31495485)
chr4 (130-238)||(12744087-12744195)
chr4 (116-357)||(33089788-33090021)
chr4 (91-258)||(8393394-8393562)
chr4 (91-258)||(8395603-8395771)
chr4 (99-314)||(29056301-29056518)
chr4 (107-314)||(48142393-48142603)
chr4 (114-357)||(33989762-33989989)
chr4 (98-357)||(22882759-22883021)
chr4 (98-357)||(22934423-22934685)
chr4 (128-357)||(35369483-35369708)
chr4 (136-285)||(53345189-53345340)
chr4 (94-258)||(5136063-5136230)
chr4 (94-258)||(5138288-5138455)
chr4 (154-357)||(32091379-32091583)
chr4 (91-211)||(21703836-21703957)
chr4 (91-253)||(44967829-44967992)
chr4 (114-244)||(5349924-5350052)
chr4 (91-258)||(7124901-7125070)
chr4 (137-324)||(52065530-52065719)
chr4 (131-316)||(6677410-6677597)
chr4 (102-237)||(34112838-34112973)
chr4 (300-357)||(41961311-41961368)
chr4 (91-258)||(7122682-7122851)
chr4 (152-238)||(44570427-44570514)
chr4 (116-205)||(37754986-37755076)
chr4 (137-238)||(16422653-16422755)
chr4 (191-298)||(35370449-35370557)
chr4 (301-357)||(26364166-26364222)
chr4 (166-238)||(34788851-34788923)
chr4 (91-300)||(38811191-38811399)
chr4 (91-136)||(24969787-24969832)
chr4 (170-245)||(39774254-39774329)
chr4 (138-210)||(40975057-40975129)
chr4 (91-155)||(5396700-5396763)
chr4 (170-244)||(37781935-37782008)
[»] chr3 (92 HSPs)
chr3 (91-357)||(34491114-34491379)
chr3 (91-357)||(54593606-54593871)
chr3 (91-355)||(30236028-30236292)
chr3 (91-357)||(6095600-6095866)
chr3 (91-357)||(49199469-49199737)
chr3 (91-357)||(4569852-4570120)
chr3 (91-348)||(46860382-46860642)
chr3 (91-351)||(47304158-47304418)
chr3 (91-352)||(41819523-41819786)
chr3 (91-321)||(43401801-43402033)
chr3 (91-316)||(44700480-44700705)
chr3 (91-314)||(43403744-43403969)
chr3 (91-316)||(40734440-40734665)
chr3 (91-316)||(44331487-44331712)
chr3 (91-316)||(29196387-29196614)
chr3 (96-316)||(40735325-40735545)
chr3 (91-316)||(19683889-19684115)
chr3 (91-316)||(5236458-5236682)
chr3 (98-314)||(22835010-22835226)
chr3 (100-313)||(46173311-46173515)
chr3 (91-316)||(9581225-9581450)
chr3 (91-316)||(45095107-45095331)
chr3 (91-316)||(7762208-7762433)
chr3 (91-316)||(760789-761014)
chr3 (91-316)||(29682301-29682526)
chr3 (123-357)||(36018752-36018987)
chr3 (91-316)||(37408401-37408626)
chr3 (91-321)||(51398751-51398981)
chr3 (91-316)||(29810810-29811035)
chr3 (99-316)||(31314387-31314604)
chr3 (91-303)||(16498984-16499196)
chr3 (91-316)||(39153362-39153587)
chr3 (91-316)||(5258144-5258370)
chr3 (98-321)||(53921511-53921734)
chr3 (91-316)||(29813005-29813230)
chr3 (157-346)||(31340268-31340457)
chr3 (91-316)||(23200138-23200362)
chr3 (91-314)||(9666467-9666692)
chr3 (91-316)||(5260323-5260549)
chr3 (91-316)||(7764410-7764632)
chr3 (98-312)||(32891049-32891264)
chr3 (91-316)||(23197939-23198163)
chr3 (91-357)||(55301972-55302232)
chr3 (91-316)||(23391910-23392135)
chr3 (91-316)||(9636126-9636352)
chr3 (91-316)||(23410330-23410555)
chr3 (114-357)||(5433906-5434145)
chr3 (91-258)||(801091-801260)
chr3 (91-255)||(7780004-7780168)
chr3 (91-255)||(32744437-32744600)
chr3 (91-258)||(6716500-6716667)
chr3 (91-258)||(54635125-54635292)
chr3 (91-199)||(40913352-40913460)
chr3 (141-357)||(26323124-26323343)
chr3 (131-352)||(35138746-35138968)
chr3 (251-356)||(40913241-40913350)
chr3 (91-258)||(45282983-45283154)
chr3 (129-273)||(51352150-51352293)
chr3 (91-258)||(3617449-3617618)
chr3 (94-258)||(25637426-25637592)
chr3 (139-290)||(5373198-5373353)
chr3 (206-300)||(26386597-26386692)
chr3 (114-357)||(39127447-39127693)
chr3 (91-316)||(2075076-2075283)
chr3 (96-253)||(4055769-4055926)
chr3 (94-258)||(4598526-4598693)
chr3 (94-258)||(4600747-4600914)
chr3 (94-258)||(10056217-10056384)
chr3 (94-258)||(10058439-10058606)
chr3 (94-258)||(10060661-10060828)
chr3 (94-258)||(10062883-10063050)
chr3 (94-258)||(10065105-10065272)
chr3 (94-258)||(10211393-10211560)
chr3 (91-246)||(20937668-20937824)
chr3 (114-224)||(33191866-33191974)
chr3 (99-157)||(27305719-27305777)
chr3 (94-258)||(10209173-10209340)
chr3 (124-236)||(25491003-25491114)
chr3 (150-308)||(8166516-8166677)
chr3 (96-253)||(4075476-4075636)
chr3 (137-243)||(3148037-3148144)
chr3 (141-238)||(54739004-54739102)
chr3 (138-313)||(1313852-1314029)
chr3 (153-210)||(2020187-2020245)
chr3 (169-238)||(28253346-28253416)
chr3 (304-357)||(1683388-1683440)
chr3 (170-244)||(4386868-4386941)
chr3 (151-309)||(40519258-40519413)
chr3 (150-239)||(24635276-24635366)
chr3 (137-252)||(1683483-1683597)
chr3 (94-129)||(10067435-10067471)
chr3 (155-183)||(31340242-31340270)
[»] chr7 (80 HSPs)
chr7 (95-357)||(6431872-6432134)
chr7 (91-354)||(22269877-22270140)
chr7 (91-357)||(34310716-34310983)
chr7 (91-357)||(4508707-4508973)
chr7 (96-357)||(2360978-2361238)
chr7 (93-357)||(2390183-2390447)
chr7 (91-357)||(48599335-48599601)
chr7 (93-357)||(29608637-29608902)
chr7 (91-351)||(3258901-3259162)
chr7 (91-357)||(4512391-4512657)
chr7 (91-357)||(4510549-4510815)
chr7 (91-357)||(8359316-8359585)
chr7 (91-315)||(27347760-27347984)
chr7 (91-316)||(31732970-31733195)
chr7 (98-302)||(30024740-30024945)
chr7 (91-316)||(14069834-14070059)
chr7 (91-316)||(14379862-14380087)
chr7 (108-316)||(48491521-48491729)
chr7 (91-316)||(35853857-35854082)
chr7 (98-316)||(47676144-47676362)
chr7 (91-316)||(41317435-41317660)
chr7 (91-316)||(43864186-43864411)
chr7 (99-316)||(47673953-47674169)
chr7 (96-316)||(4586103-4586323)
chr7 (91-316)||(36146409-36146635)
chr7 (91-316)||(8153284-8153509)
chr7 (91-316)||(48489373-48489598)
chr7 (91-313)||(26417261-26417482)
chr7 (91-314)||(23554984-23555208)
chr7 (91-303)||(31105394-31105607)
chr7 (102-316)||(1113599-1113813)
chr7 (91-316)||(18126586-18126811)
chr7 (91-316)||(38671223-38671448)
chr7 (91-316)||(41649012-41649236)
chr7 (91-316)||(29990997-29991221)
chr7 (91-313)||(495984-496206)
chr7 (91-316)||(12097868-12098085)
chr7 (91-226)||(32358055-32358190)
chr7 (91-316)||(19502120-19502346)
chr7 (91-254)||(25615857-25616021)
chr7 (110-316)||(4178717-4178921)
chr7 (98-308)||(23565069-23565280)
chr7 (91-313)||(25766960-25767180)
chr7 (91-316)||(4253529-4253756)
chr7 (91-316)||(48408745-48408972)
chr7 (96-357)||(22328395-22328666)
chr7 (148-300)||(31518752-31518905)
chr7 (91-316)||(39731319-39731537)
chr7 (101-315)||(23343917-23344130)
chr7 (91-232)||(2759198-2759339)
chr7 (98-250)||(31518911-31519063)
chr7 (91-316)||(36574517-36574742)
chr7 (91-258)||(20343897-20344064)
chr7 (91-258)||(43504154-43504323)
chr7 (177-316)||(4538627-4538766)
chr7 (91-211)||(6359953-6360073)
chr7 (251-357)||(6360073-6360179)
chr7 (186-315)||(24525992-24526122)
chr7 (91-258)||(24789841-24790009)
chr7 (96-183)||(24525508-24525595)
chr7 (91-258)||(6592340-6592509)
chr7 (91-258)||(18388760-18388929)
chr7 (91-258)||(18392196-18392365)
chr7 (98-309)||(3904624-3904837)
chr7 (91-258)||(6594558-6594727)
chr7 (227-316)||(2761439-2761528)
chr7 (91-258)||(32060322-32060493)
chr7 (91-237)||(18396338-18396486)
chr7 (91-164)||(30814530-30814603)
chr7 (96-172)||(1560671-1560749)
chr7 (128-237)||(5116625-5116735)
chr7 (194-316)||(5514113-5514236)
chr7 (241-316)||(24514912-24514986)
chr7 (165-357)||(1360226-1360422)
chr7 (91-178)||(5513668-5513755)
chr7 (98-253)||(26639326-26639486)
chr7 (124-238)||(43363507-43363622)
chr7 (294-356)||(2579030-2579091)
chr7 (247-316)||(30843389-30843459)
chr7 (187-258)||(1562103-1562173)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (91-357)||(7229-7494)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (91-357)||(18004-18268)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (91-357)||(11459-11725)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (145-357)||(80338-80550)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (91-303)||(149098-149311)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (91-316)||(114545-114770)
scaffold0016 (175-244)||(102445-102513)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (91-316)||(20416-20641)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (91-285)||(434504-434701)
scaffold0002 (129-237)||(490359-490468)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (91-316)||(859-1083)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (91-316)||(11161-11387)
scaffold0491 (91-316)||(8735-8961)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (91-273)||(10475-10656)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (91-258)||(2604-2773)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (102-314)||(27453-27668)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (137-329)||(24981-25175)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (94-258)||(3729-3895)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (94-258)||(6272-6438)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (284-350)||(1591-1657)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 58)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 45727096 - 45726830
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45727096 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 45726997  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45726996 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataagacactcatgattttcactctccca 45726897  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45726896 aggtgtttacaattgtttcctaaccctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 45726830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Original strand, 35446885 - 35447151
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35446885 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagagtgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 35446984  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35446985 aagaaattagattcaacaagatcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttaccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 35447084  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35447085 aggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 35447151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 93 - 357
Target Start/End: Original strand, 1631735 - 1631999
Alignment:
Q  93 ttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaa 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1631735 ttcactcagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaa 1631834  T
Q  193 gaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaag 292  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1631835 gatattagcttcaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctctcaag 1631934  T
Q  293 gtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1631935 gtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 1631999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 96 - 357
Target Start/End: Original strand, 42288117 - 42288377
Alignment:
Q  96 acccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  42288117 acccagttcggtccaacttgacctaatctgg-ggagagattgatctctccaatccattatcaatgagctcttacaaagaaatacaaatgggttacaataa 42288215  T
Q  196 attagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtg 295  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42288216 attagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaatgcacaagacactcgtgattttcactctcccaaggtg 42288315  T
Q  296 tttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  42288316 tttacaattgtttcccaactctagaatctaaacccgaaaagagaaccaacccttagcctttg 42288377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 36318010 - 36318235
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36318010 tgttgacccagttcggtccaacttgacctactctaagggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 36318109  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  36318110 aataaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 36318209  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||    
T  36318210 aaggtgtttacaa-tatttcccaaccc 36318235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 36773729 - 36773504
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  36773729 tgttgacccagttcggtccaacttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagttac 36773630  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  36773629 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttattcccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 36773530  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36773529 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 36773504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 96 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 29868031 - 29867811
Alignment:
Q  96 acccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29868031 acccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaa 29867932  T
Q  196 attagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggt 294  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  29867931 attagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggt 29867832  T
Q  295 gtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  29867831 gtttacaa-tgtttcccaaccc 29867811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 723745 - 723970
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  723745 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttac 723844  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  723845 aagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccagttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 723944  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  723945 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 723970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 17057370 - 17057595
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  17057370 tgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttac 17057469  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    || ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  17057470 aaaaaattagcttcaacaagcttgcaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 17057569  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||    
T  17057570 aaggtgtttacaa-tatttcccaaccc 17057595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 17085353 - 17085578
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  17085353 tgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttac 17085452  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    || ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  17085453 aaaaaattagcttcaacaagcttgcaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 17085552  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||    
T  17085553 aaggtgtttacaa-tatttcccaaccc 17085578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 38312407 - 38312182
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  38312407 tgttgacccagttcggtccaacttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggttac 38312308  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  38312307 aagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacac 38312208  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  38312207 aaggtgtatacaa-tgtttcccaaccc 38312182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 2334418 - 2334643
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  2334418 tgttcccccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtta 2334517  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  2334518 ctagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaacccttatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 2334616  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2334617 caaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 2334643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 34139771 - 34139997
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-gagatacaaataggtta 189  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||    
T  34139771 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagggatacatatgggtta 34139870  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  34139871 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 34139970  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  34139971 caaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 34139997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 91 - 314
Target Start/End: Original strand, 33162451 - 33162674
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  33162451 tgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctaggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacagagagatacaaatgggttac 33162550  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||    
T  33162551 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcctaatttcaccaatgaacaagacactcgatgattttcaatcaccc 33162650  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaac 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  33162651 aaggtgtttacaa-tgtttcccaac 33162674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 105 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 42362505 - 42362294
Alignment:
Q  105 ggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttc 204  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  42362505 ggtccaacttgacctaatctgggggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagctta 42362406  T
Q  205 aacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 303  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  42362405 aacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa- 42362307  T
Q  304 tgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||    
T  42362306 tgtttcccaaccc 42362294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 99 - 316
Target Start/End: Original strand, 14633834 - 14634052
Alignment:
Q  99 cagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-gagatacaaataggttacaagaaat 197  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  14633834 cagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatctatgagttcttacaaaagggatacaaatgggttacaagaaat 14633933  T
Q  198 tagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgt 296  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14633934 tagcttaaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctacccattttaccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 14634033  T
Q  297 ttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  14634034 ttacaa-tgtttcccaaccc 14634052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 11151592 - 11151817
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  11151592 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaggttgatctctccaatccactatctaagagttcttacaaagtgatacaaatgggttac 11151691  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  11151692 aagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttctacccattttcccaatttcaccaatgaacaagagactcaatgattttcactcaccc 11151791  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  11151792 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 11151817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 5723256 - 5723480
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5723256 tgttcacccagttcggtccaaacttaacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaaaggtta 5723355  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    ||||||||||||||  |||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  5723356 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaagcctaatttctaccc-ttttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 5723453  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5723454 caaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 5723480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 98 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11690661 - 11690443
Alignment:
Q  98 ccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaat 197  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  11690661 ccagttcggtccaacttgacgtaatatgggggagaggttgatctctccaatccactatcaacgatttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaat 11690562  T
Q  198 tagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgt 296  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  11690561 tagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 11690462  T
Q  297 ttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  11690461 ttacaa-tgtttcccaaccc 11690443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 36988076 - 36988301
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  36988076 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtta 36988175  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    ||||||||||| ||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  36988176 caagaaattagttttgacaagctcacatagaacaaccctaatttctacccttttttccaatcccaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 36988274  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||    
T  36988275 caaggtgtttacta-tgtttcccaaccc 36988301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11067472 - 11067248
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11067472 tgttgaccgagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccattataaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 11067373  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  11067372 aagaaattagctttgacaagctcacaaagtacaacactaatttctacccatttttccaatttcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 11067273  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaacc 315  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  11067272 aaggtgtttacaa-tgtttcccaacc 11067248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 24398226 - 24397962
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggtt 188  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  24398226 tgttcagccagttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagggtt 24398127  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccatt-ttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactc 285  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24398126 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccttaacttctaccctttcttcacaatctcaccaatgaacaagacactcattgattttcactc 24398027  T
Q  286 -tcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagc 352  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||   ||||||||||||||||    
T  24398026 ttccaaaggtgtttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaa---agaaccaacccttagc 24397962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 45099922 - 45099697
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||    
T  45099922 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagtta 45099824  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 287  Q
    ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  45099823 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 45099725  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45099724 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 45099697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 17450744 - 17450491
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||| ||||||    
T  17450744 tgttcacctagttcggtccaacttgacctactctgt-ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc------------acaaatgggttac 17450658  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  17450657 aa-aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaagcctaatctctacccatttttcaaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 17450559  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17450558 aaggtgtttgcaaatgtttgccaactctagaatccaacccccaatagagaatcaacccttagcctttg 17450491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 4503133 - 4503358
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||    
T  4503133 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagtta 4503231  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 287  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  4503232 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttttcccaatctctccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 4503330  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4503331 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 4503358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 91 - 304
Target Start/End: Original strand, 6595006 - 6595221
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  6595006 tgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagattcaaaagggtta 6595105  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 287  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||     
T  6595106 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttttcctaatctcaccaatgaacaagacacccaatgattctcactct- 6595204  T
Q  288 ccaaggtgtttacaatt 304  Q
    |||| ||||||||||||    
T  6595205 ccaaagtgtttacaatt 6595221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 36205665 - 36205889
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||   ||||    
T  36205665 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggatagattgaactctccaatccgctgtcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagtta 36205763  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  36205764 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 36205862  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||    
T  36205863 caaggtgtttacca-tgtttcccaaccc 36205889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 4484330 - 4484556
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 188  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  4484330 tgttcacccagttctgtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagggtt 4484429  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactct 286  Q
    |||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||     
T  4484430 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatttcaccaa-gaacaagacactcaatgatttacactc- 4484527  T
Q  287 cccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4484528 accaaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 4484556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 106 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13121919 - 13121710
Alignment:
Q  106 gtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttca 205  Q
    ||||||||| || || | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  13121919 gtccaacttaacatagtttggaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagtttctacaaagagatacaa--aggttacaagaaattatcttca 13121822  T
Q  206 acaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 303  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||     
T  13121821 acaagctcacaaagaacaaaccctaatttcta-ccattttcccagtctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaaa 13121723  T
Q  304 tgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||    
T  13121722 tgtttcccaaccc 13121710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 30833514 - 30833288
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 188  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  30833514 tgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagggtt 30833415  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactct 286  Q
    ||||||||||| |||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||     
T  30833414 acaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgatttacactc- 30833317  T
Q  287 cccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  30833316 accaaagtgtttacaa-tgtttcccaaccc 30833288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 91 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 33648340 - 33648089
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaataggtt 188  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||    
T  33648340 tgtttacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccgctatcaatgagttctttacaaagaaatacaaaagggtt 33648241  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatct-caccaatgaacaagacactc-atgattttcactc 285  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| | |  ||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  33648240 acaggaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaattttta-ccattttctcaatctcctctcatgtacaagacactcaattattttcactc 33648142  T
Q  286 tcccaaggtg-tttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaaga 337  Q
    ||||||| || |||||  || | ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  33648141 tcccaagatgttttacggttatgtcccaactctagaatctaacccccaaaaga 33648089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 91 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11049721 - 11049493
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaataggtta 189  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||||| | || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  11049721 tgtttacccagttcagtccaatttgacctattatgaaggagagattgatcttttcaatctactatcaatgagttcttacaaagagatactaaaagggtta 11049622  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaa---agaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcact 284  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  11049621 taagaaattagcttcaacaagctcacaaattagaacaaaccctaatttata-ccattttcctaatctcaccaaaaaacaagacactcaatgattttcact 11049523  T
Q  285 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 314  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11049522 tacccaaggtgtttacaaatgtttcccaac 11049493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 91 - 283
Target Start/End: Original strand, 17490149 - 17490336
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    
T  17490149 tgtttacccagttcggtccaaattgacctactctaggggagagattgatctctacaatccactatcaatgagttcttacaaagagttacaaaagagttac 17490248  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcac 283  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  17490249 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaataa----aatttcta-ccatttt-ccaatctcaacaatgaacaagacattcaatgattttcac 17490336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 156 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24885763 - 24885603
Alignment:
Q  156 caatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcac 255  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  24885763 caatgagttcttacagaggggtacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctactcattttcccaattttac 24885664  T
Q  256 caatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24885663 aaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 24885603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 128 - 316
Target Start/End: Original strand, 7815311 - 7815500
Alignment:
Q  128 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aacc 226  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||    
T  7815311 ggagagattaatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagcttctaaagaacaaacc 7815410  T
Q  227 ctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  7815411 ctaatttc-aacctttttctcaatctcaccaatgaacaagacacgcaatgattttcacccacctaaggtgtttacaaatgtttctcaaccc 7815500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 32289732 - 32289565
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||    
T  32289732 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatttactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagtt 32289633  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  32289632 acaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc--ttttccaatctcaccaa 32289565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6266859 - 6266691
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  6266859 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 6266761  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||| ||  |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6266760 acaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 6266691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 128 - 316
Target Start/End: Original strand, 14202450 - 14202633
Alignment:
Q  128 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccc 227  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |     
T  14202450 ggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagg-------atgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaaca 14202542  T
Q  228 taatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc---atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |   || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14202543 taatttctacccattttcccaatctcagaaatgaaaaagacacactcaataattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 14202633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 91 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26353351 - 26353178
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||   |||||    
T  26353351 tgtttacccggttcggtccaacttgacctactctaagggagagagtgatctctccaatccactatcaatgagtacttacaaaaagatacaaaagtgttac 26353252  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaaca 264  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||| | ||||  |||||||||||| |||||    
T  26353251 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaaccttaatttctacac-ttttttcaatctcaccaaagaaca 26353178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 91 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7451284 - 7451166
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||    
T  7451284 tgttcacccagttcg-tccaacttgacctactgtagaggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgaattac 7451186  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaag 210  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7451185 aagaaattagcttcaacaag 7451166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Original strand, 13656035 - 13656200
Alignment:
Q  94 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| || |||||||    
T  13656035 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggttac 13656133  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||  |||||  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13656134 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 13656200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 214 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 39284929 - 39284827
Alignment:
Q  214 acaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 312  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  39284929 acaaagagcaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagatactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttccca 39284831  T
Q  313 accc 316  Q
    ||||    
T  39284830 accc 39284827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Original strand, 12647386 - 12647555
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatagg 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| || |||    
T  12647386 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagagg 12647484  T
Q  187 ttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12647485 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 12647555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 150 - 315
Target Start/End: Original strand, 12123644 - 12123810
Alignment:
Q  150 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 248  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||   |||||||||||| |||||||||||   || |||||||||| ||||||| ||| |||||| |||    
T  12123644 cactatcattgagttctttacaaaatgatacaaaagagttacaagaaataagcttcaacaaaatcataaagaacaactctaatttatactcatttt-cca 12123742  T
Q  249 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaacc 315  Q
    ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||    
T  12123743 atctctcaaatgaacaagacactcgatgattttcactcatccaaggtgtttataaatgtttcccaacc 12123810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 298
Target Start/End: Original strand, 30218068 - 30218254
Alignment:
Q  114 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagca 212  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||     
T  30218068 tgacttactctgggggagtgattgatcttttcaacccactatcaatgaattatttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagcttcaataagct 30218167  T
Q  213 cacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcac-caatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgttt 298  Q
    | | |||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||   | ||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||    
T  30218168 ctccaagaacaaacctaacttctacccattt-ctcaatctccttccatgaacaagacactcaatgatttccactctgtcaaggtgttt 30218254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 91 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 39285003 - 39284930
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 164  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39285003 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 39284930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 28672088 - 28671989
Alignment:
Q  102 ttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaataggttacaagaaatta 199  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  28672088 ttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactgtcagtgagttctttgtaaagagatacaaaacggtaacaagaaatta 28671989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 129 - 237
Target Start/End: Original strand, 42261524 - 42261633
Alignment:
Q  129 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccc 227  Q
    |||||| ||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |     
T  42261524 gagagaatgatctctccgcttcactatcaatgagtactttacaaagatatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaact 42261623  T
Q  228 taatttctac 237  Q
    ||||||||||    
T  42261624 taatttctac 42261633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 211
Target Start/End: Original strand, 42019896 - 42019994
Alignment:
Q  116 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt---acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagc 211  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||    
T  42019896 acctactatggggaagagattgatctctcaaattcactatcaatgagttttttttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttctacaagc 42019994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 316
Target Start/End: Original strand, 5700271 - 5700349
Alignment:
Q  239 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  5700271 cattttctcaatctctccaatgaacaagacactcaatgtttttcattcacccaaagtgtttacaaatgtttctcaaccc 5700349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 42412162 - 42412117
Alignment:
Q  113 ttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaat 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42412162 ttgacctactctgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaat 42412117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 238
Target Start/End: Original strand, 34811281 - 34811370
Alignment:
Q  150 cactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacc 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||||||| | | |||| ||| | |||||||||||    
T  34811281 cactatcaatgagtttcttacaaagagatataaaagagttacaataaattagcttcaacaagctctctaagagcaatcttaatttctacc 34811370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4561180 - 4561137
Alignment:
Q  166 ttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaa 209  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  4561180 ttacaaagagatacaaaaatgttacaagaaattagcttcaacaa 4561137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 41454366 - 41454254
Alignment:
Q  125 ggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaaca 223  Q
    ||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||| | |||||||   ||| | |||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  41454366 ggaggagaga--gatctgtccacttcactatcaatgagttctttacaaatatatacaaaagagttgctagaaattagcttcaacaagctctcaaaaaaca 41454269  T
Q  224 accctaatttctacc 238  Q
    |  ||||||||||||    
T  41454268 aatctaatttctacc 41454254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 294
Target Start/End: Original strand, 7597036 - 7597217
Alignment:
Q  114 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagca 212  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||  || || |||||||||||| ||||||| |||||||||    |||||||||||||| ||| |||||      
T  7597036 tgacctactctgaaggagaga--gatctctccgttctacaatcaatgagttctttacaaaaagatacaaaagacttacaagaaattagtttcgacaagtt 7597133  T
Q  213 cacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggt 294  Q
    || || |||| || |||||||||||  || |||| |||||||  || |||||||||||||| | |||||||||||| || |||||    
T  7597134 cataaggaacaaaacctaatttctattca-tttctcaatctcttcccatgaacaagacactgagtgattttcactcacctaaggt 7597217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24198023 - 24197945
Alignment:
Q  132 agattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattag-cttcaacaag 210  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24198023 agatagatctctccaatccattatcaaagagtttcttgcaaagagatacaa--gggttacaagaaattagccttcaacaag 24197945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 41446260 - 41446159
Alignment:
Q  138 atctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttcta 236  Q
    ||||||||| | |||| ||||  ||||||| | |||||||||||||  ||||||   |||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||    
T  41446260 atctctccacttcactgtcaaccagttctttataaagagatacaaaagggttacttaaaattagcttcaacaagctctcaaagaacaaacataatttcta 41446161  T
Q  237 cc 238  Q
    ||    
T  41446160 cc 41446159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24197867 - 24197829
Alignment:
Q  287 cccaaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatcta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24197867 cccaaggtgtttacaattgtttcccagccctataatcta 24197829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 50)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 91 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 21593831 - 21593570
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21593831 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 21593732  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21593731 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 21593632  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagc 352  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21593631 aggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagc 21593570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Original strand, 2972940 - 2973206
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2972940 tgttcacctagttcggtcgaacttgacctactcttgaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 2973039  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  2973040 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacacgacacttatgattttcactctccca 2973139  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  2973140 aggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaatccctaaaagagaaccaacccttagcctttg 2973206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Original strand, 26830124 - 26830391
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  26830124 tgttcacccagttcagtcaaacttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatggattac 26830223  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctca-ccaatgaacaagacactcatgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26830224 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaactctaatttctacccatttttccaatctcacccaatgaacaagacactcatgattttcactctccc 26830323  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26830324 aaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 26830391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Original strand, 3808708 - 3808975
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-taggtt 188  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  3808708 tgttcacctagttcggtccaatcatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggtt 3808807  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcc 288  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  3808808 acaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaacaagacacttgtgattttcactctcc 3808907  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3808908 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaa-agaaccaacccttagcctttg 3808975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 5043795 - 5043528
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  5043795 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 5043696  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccc 289  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5043695 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctactcattttctcaatctcacgaatgaacaagacactcatgattttcactctcac 5043596  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5043595 aaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagcctttg 5043528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 17763158 - 17762890
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||    
T  17763158 tgttcacctagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagattgatcactccaatccactatcaatgagttcttccaaaaagatacaaatgagtta 17763059  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatg-attttcactctcc 288  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  17763058 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactctct 17762959  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17762958 caaagtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 17762890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Original strand, 603089 - 603347
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  603089 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatcttggggagagattgatttctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 603188  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  603189 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaacacaaatttcta--------cccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactatccca 603280  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  603281 aggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattagcctttg 603347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 91 - 352
Target Start/End: Original strand, 22424826 - 22425089
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaata--ggt 187  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  22424826 tgttcacccagtacggtccaacaatgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaaatgggt 22424924  T
Q  188 tacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatg-attttcactct 286  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22424925 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaacgaacaagacactcatgaattttcactct 22425024  T
Q  287 cccaaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagc 352  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22425025 cccaaagtgtttacaattgtttcccaactctataatctaaccc-caaaagagaaccaacccttagc 22425089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 91 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 21589098 - 21588913
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21589098 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 21588999  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatga 276  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21588998 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatga 21588913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 9183032 - 9183257
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9183032 tgttgacccagttcggtccaacttgacataatctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 9183131  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  9183132 aagaaattagcttcaacaaattcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 9183231  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  9183232 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 9183257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 28137409 - 28137634
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  28137409 tgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaaatacaaatgggttac 28137508  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  28137509 aagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccattctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 28137608  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  28137609 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 28137634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 5406200 - 5406424
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  5406200 tgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 5406299  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  5406300 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 5406397  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5406398 caaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 5406424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 5410525 - 5410749
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  5410525 tgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 5410624  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  5410625 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 5410722  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5410723 caaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 5410749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 2171532 - 2171756
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  2171532 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-gggtta 2171630  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  2171631 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 2171729  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2171730 caaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 2171756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 91 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 17758191 - 17757994
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17758191 tgttcacctagttcggtccaaacttgaactactctagaggggagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 17758092  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatg-attttcactct 286  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  17758091 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaagaagacactcatgaattttcactct 17757994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 33211186 - 33211411
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  33211186 tgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccattataaatgagttcttacaaagagatacaaatgagctac 33211285  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |  |||    
T  33211286 aagaaattaacttcatcaagctcacaaagaacaaccataatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaaaacactcaatgattttcagtgaccc 33211385  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  33211386 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 33211411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 91 - 315
Target Start/End: Original strand, 26954287 - 26954510
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  26954287 tgttgacctagttcggtccaacttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacagatgagttac 26954386  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  26954387 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttata-ccaatttcccaatctcacatatgaacaagacactcaatgattttcactcccca 26954485  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaacc 315  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  26954486 aaggtgtttacaa-tgtttcccaacc 26954510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 31404675 - 31404899
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  31404675 tgttcacccagttcggtccaaacttggcctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 31404774  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  31404775 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccattttcccaatctcactgatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 31404872  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  31404873 caaggtgtttacaa-tgttttccaaccc 31404899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 98 - 316
Target Start/End: Original strand, 5413401 - 5413618
Alignment:
Q  98 ccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaa 196  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5413401 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaa 5413500  T
Q  197 ttagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtg 295  Q
    |||||||  |||||  | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||    
T  5413501 ttagctttgacaagttcgcaaagaacaaccctaatttcta-cctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaatgtg 5413598  T
Q  296 tttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  5413599 tttacaa-tgtttcccaaccc 5413618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 93 - 316
Target Start/End: Original strand, 30834538 - 30834762
Alignment:
Q  93 ttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttaca 191  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  30834538 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttaca 30834637  T
Q  192 agaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  30834638 agaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-acc 30834736  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
     |||||||||||| |||||| ||||||    
T  30834737 gaggtgtttacaa-tgtttctcaaccc 30834762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 113 - 316
Target Start/End: Original strand, 3038926 - 3039129
Alignment:
Q  113 ttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagca 212  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  3038926 ttgacctaatctgggggagagattaatctctccaatccactattaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagct 3039025  T
Q  213 cacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccc 311  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  3039026 cacaatgaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacattcaatgattttcactcactcaaggtgtttacaa-tgtttccc 3039124  T
Q  312 aaccc 316  Q
    |||||    
T  3039125 aaccc 3039129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 16452329 - 16452555
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  |||||    
T  16452329 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatatgaaagggtta 16452428  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 287  Q
    ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  16452429 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 16452527  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16452528 ccaaggtgtttacaa-tgtttctcaaccc 16452555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 33160352 - 33160579
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  33160352 tgttcacccagtttggtccaaacttgaaatactctggaggagagattgatctctccaatccaccatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtta 33160451  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atga-ttttcactct 286  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||     
T  33160452 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaactctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgatttttcactc- 33160550  T
Q  287 cccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33160551 accaaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 33160579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 116 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4045566 - 4045366
Alignment:
Q  116 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcaca 214  Q
    ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4045566 acctactttggggtagaaattgatctctccaatccactatcaatgagttatttacaaagagatataaaatgattacaagaaattagcttcaacaagctca 4045467  T
Q  215 caaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 312  Q
     ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  4045466 taaagaacaaaccctaatttcta-ccattttcccaatctctccaataaacaagacactcaatgattttcactcaccctaggtgtttacaaatgtttccca 4045368  T
Q  313 ac 314  Q
    ||    
T  4045367 ac 4045366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Original strand, 3072759 - 3072928
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatag-gt 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  3072759 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagt 3072858  T
Q  188 tacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    ||||||||||||| ||  |||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3072859 tacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttcta-ccattttcccaatctcaccaa 3072928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 412270 - 412101
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatag-gt 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  412270 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagt 412171  T
Q  188 tacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    ||||||||||||| ||  | |||  ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  412170 tacaagaaattagatttgataagttcacaatgaacaaccctaatttcta-cctttttcccaatctcaccaa 412101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 91 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16569189 - 16569037
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||    
T  16569189 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaa------------aggttac 16569102  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctca 254  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16569101 aagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatctca 16569037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 129 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25073698 - 25073469
Alignment:
Q  129 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccc 227  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||  |    
T  25073698 gagagattgatttctctaatccactatcaatgagttctttacatagagatacaaaagggttacaataaaatagctttaacaagctcacgaagaataaatc 25073599  T
Q  228 taatttctacccattttcccaatctca-ccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaaccctagaatct 324  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||  || |||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  25073598 taatttctacc-attttttcaatctcctcccatgaacaagatactcaatgattt-cactcacccaagatgtttcccaattgtttcccaactctagaatct 25073501  T
Q  325 aacccgcaaaagagaaccaacccttagccttt 356  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  25073500 aacccccaaaagagaatcaacccttagccttt 25073469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 91 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 26800755 - 26800634
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaataggtt 188  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  26800755 tgttcatccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaattagtt 26800657  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  26800656 acaagaaattagcttcaacaagc 26800634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27648028 - 27647861
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  27648028 tgttcacccagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 27647930  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||||  |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27647929 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 27647861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Original strand, 6097451 - 6097608
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||         ||||    
T  6097451 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-aga---------gtta 6097540  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    ||||||||||| ||  |||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6097541 caagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaatcctaatttcta-ccatttttccaatctcaccaa 6097608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16555037 - 16554869
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaataggt 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  16555037 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggt 16554939  T
Q  188 tacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16554938 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 16554869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Original strand, 16578518 - 16578686
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaataggt 187  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  16578518 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggt 16578616  T
Q  188 tacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16578617 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 16578686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16616862 - 16616694
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaataggt 187  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  16616862 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggt 16616764  T
Q  188 tacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16616763 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 16616694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16631593 - 16631425
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaataggt 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  16631593 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggt 16631495  T
Q  188 tacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16631494 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 16631425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16653280 - 16653112
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaataggt 187  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  16653280 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggt 16653182  T
Q  188 tacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16653181 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttttaccc-ttttcccaatctcaccaa 16653112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 98 - 182
Target Start/End: Original strand, 5409076 - 5409161
Alignment:
Q  98 ccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5409076 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 5409161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 25421474 - 25421305
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatagg 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| || |||    
T  25421474 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagagg 25421376  T
Q  187 ttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25421375 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 25421305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6027415 - 6027246
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatagg 186  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| || |||    
T  6027415 tgttcacccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagagg 6027317  T
Q  187 ttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6027316 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 6027246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13154080 - 13153913
Alignment:
Q  94 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| || ||||||    
T  13154080 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 13153982  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||| |  | |  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13153981 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 13153913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Original strand, 33342108 - 33342275
Alignment:
Q  94 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaagaga-tacaaataggtta 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || ||| || ||||||    
T  33342108 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggagtac-aagaggtta 33342206  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||| |  | |  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33342207 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 33342275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 34165023 - 34164856
Alignment:
Q  94 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| || ||||||    
T  34165023 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 34164925  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||| |  | |  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34164924 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 34164856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 34167248 - 34167078
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatagg 186  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||  |||| || |||    
T  34167248 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaataagttctttacaaaaggaatac-aagagg 34167150  T
Q  187 ttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    ||||||||||||||||| |  | |  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34167149 ttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 34167078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 190 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16567265 - 16567148
Alignment:
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaac-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 287  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||          |||||||||| ||||||||||||| |    
T  16567265 caagaaattagcttaaacaagctcacaaaaaacaaaacctaatttctaaccattttcccaatct----------caagacactcaatgattttcactcac 16567176  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16567175 ccaaggtgtttacaa-tgtttccaaaccc 16567148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 9572735 - 9572667
Alignment:
Q  114 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaa 181  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  9572735 tgacctactctaaagtagagattgatctctgcaatccactatcaatgggttcttaacaaagagttacaa 9572667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 11660574 - 11660508
Alignment:
Q  290 aaggtgtttacaa-ttgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  11660574 aaggtgtttacaaattgtttccgaactctagaatctaaccc-caaaa-tgaaccaacccttagcctttg 11660508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 2908586 - 2908505
Alignment:
Q  131 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagc 211  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||   |||  || |||||| |||||||||||    
T  2908586 gagattgatttcttcaatccactatcaatgagttctttacaataagatacaaaagagttgtaaaaaattatcttcaacaagc 2908505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 206
Target Start/End: Original strand, 26310412 - 26310472
Alignment:
Q  145 caatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaa 206  Q
    ||||||||||| ||| |||  ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26310412 caatccactatgaataagtcttta-aaagagatacaaagaagttacaagaaattagcttcaa 26310472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 357
Target Start/End: Original strand, 5740978 - 5741058
Alignment:
Q  278 tttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||    
T  5740978 tttcactcaccgaaggtgttttccaattgttttccaactttagaatctaaccccccaaaagtaaccaacccttagcctttg 5741058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 155
Target Start/End: Original strand, 21356041 - 21356104
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 155  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  21356041 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagaga-gcagctctccaatccactat 21356104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 85)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Original strand, 13547090 - 13547356
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13547090 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 13547189  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13547190 aagaaaatagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 13547289  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13547290 aggtgtttacaattgtttcccaaatctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 13547356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 11348865 - 11348599
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11348865 tgttcactcagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttagaaagagatacaaatgggttac 11348766  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11348765 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 11348666  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11348665 aggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 11348599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Original strand, 13549001 - 13549267
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13549001 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 13549100  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    | |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13549101 atgaaattaggtttaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 13549200  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13549201 aggtgtttacaattgtttcccaaatctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 13549267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 37168465 - 37168198
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-taggtta 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  37168465 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggtta 37168366  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccc 289  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37168365 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctctc 37168266  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  37168265 aaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaatcaacctttagcctttg 37168198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 29136415 - 29136148
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  29136415 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccacgatcaatgagttcttacaaagaaatacaaatgggttc 29136316  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccc 289  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29136315 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccc 29136216  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29136215 aaggtgtttacaattgtttcacaactctagaatctaacccccaaaagagaactaacccttagcctttg 29136148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Original strand, 47255340 - 47255607
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47255340 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 47255439  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccc 289  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47255440 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccc 47255539  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  47255540 aaggcatttacaattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagtctttg 47255607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 193778 - 193512
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  193778 tgttcacccagttcggtccaacttgacatactctggagaagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgagttac 193679  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  193678 aagaaattagcttcaacaagctaataaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcaccctccca 193579  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  193578 aggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 193512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Original strand, 42297975 - 42298242
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  42297975 tgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 42298074  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccc 289  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42298075 caagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgatttttactctccc 42298174  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  42298175 aaggtgtttacaattgtttcacaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcttagcctttg 42298242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 47115340 - 47115072
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-taggtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  47115340 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggagcagagattgatctctccaatccactatcaatgggtttttacaaagagatacaaaatgggtt 47115241  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcc 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47115240 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcc 47115141  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47115140 caagatgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 47115072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Original strand, 31925708 - 31925973
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31925708 tgttcacctagttcggtccaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 31925807  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31925808 aagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacatccctaatttctacccatttttccactctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 31925907  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  31925908 aggtgtttacaactgctt-ccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattagcctttg 31925973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Original strand, 37033072 - 37033340
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatagg-tt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||    
T  37033072 tgttcacccagttcggtccaaccatgacctactatggagaagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatgcaaaatggatt 37033171  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcc 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37033172 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcc 37033271  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  37033272 caaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaaccccaaaaagagaaccaacccatagcctttg 37033340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 91 - 352
Target Start/End: Original strand, 7482231 - 7482494
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaataggtta 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  7482231 tgttcacctagttcggtccaacttgacctactctgaaggagagattgatctctccaattcactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggtta 7482330  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatg-attttcactctcc 288  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  7482331 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttacccaatctcaccaatgaacaatacactcatgaattttcactttcc 7482430  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagc 352  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7482431 caaggtgtttacaattgcttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagc 7482494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19754662 - 19754395
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19754662 tgttgacccacttcggtccaacttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatcggttac 19754563  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctaccca-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19754562 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttctcaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctctc 19754463  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  19754462 aaggtgtttacgaatgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattatcctttg 19754395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 95 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 34603740 - 34603476
Alignment:
Q  95 cacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-taggttacaag 193  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  34603740 cacctagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccaccatcaatgagttcttacaaagagataaaaaatgggttacaag 34603641  T
Q  194 aaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatg-attttcactctcccaag 292  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  34603640 aaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttttcaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactttcccaag 34603541  T
Q  293 gtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  34603540 gtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacctccaaaagagaaccaacccttagcctttg 34603476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19752853 - 19752586
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19752853 tgttgacctagttcggtccaacttgacctaatatgggagagagattgatctctccaatcctctatcaatgagttcttacaaagagatacaaatcggttac 19752754  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccatttt-cccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19752753 aagaaattagcttcaacaagctcgcaaagaacaaccctaatttctacccattttactcaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctctc 19752654  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  19752653 aaggtgtttacgattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaatcattagcctttg 19752586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 91 - 315
Target Start/End: Original strand, 28265555 - 28265779
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28265555 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttac 28265654  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  28265655 aagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcgccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 28265754  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaacc 315  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  28265755 aaggtgtttacaa-tgtttcccaacc 28265779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 834168 - 834393
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  834168 tgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgggggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttac 834267  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||    
T  834268 aagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcacgcaccc 834367  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  834368 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 834393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 28220227 - 28220452
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28220227 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 28220326  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  28220327 aagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccgaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 28220426  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||    
T  28220427 aaggtgttttcaa-tgcttcccaaccc 28220452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31659405 - 31659180
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31659405 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaatgggttac 31659306  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  31659305 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacagccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 31659206  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  31659205 aaggtgtttacaa-tgtttccgaaccc 31659180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 91 - 303
Target Start/End: Original strand, 8550787 - 8551001
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  8550787 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgagtta 8550886  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  8550887 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 8550986  T
Q  289 caaggtgtttacaat 303  Q
    ||| |||||||||||    
T  8550987 caatgtgtttacaat 8551001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 96 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 44455322 - 44455097
Alignment:
Q  96 acccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaa 195  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  44455322 acccagttcggtcaaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgagttacaagaa 44455223  T
Q  196 attagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggt 294  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  44455222 attagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatggttttcactcacccaaggt 44455123  T
Q  295 gtttacaattgtttcccaaccctagaa 321  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  44455122 gtttacaa-tgtttcccaacccaagaa 44455097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 49918517 - 49918309
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49918517 tgttgacctagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 49918418  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  49918417 aagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 49918318  T
Q  290 aaggtgttt 298  Q
    |||||||||    
T  49918317 aaggtgttt 49918309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3157032 - 3156808
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3157032 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 3156933  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  3156932 aagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-acc 3156834  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||||    
T  3156833 agggtgtttacaa-tgtttccaaaccc 3156808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 28223422 - 28223647
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28223422 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 28223521  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  28223522 aagaaattagcttcaacaagttcagaaagatcaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 28223621  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||    
T  28223622 aaggtgtcttcaa-tgtttcccaaccc 28223647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 4552638 - 4552863
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  4552638 tgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgagggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttcttacaaagggatacaaaggggttac 4552737  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  4552738 aagaaattagcttcaacaagctcacaaaggacaaacctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttccctcaccc 4552837  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  4552838 aaggtgtttacaa-tgtttctcaaccc 4552863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 50167176 - 50167401
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  50167176 tgttgacctagttcggtccaacttgagctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttac 50167275  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  50167276 aagaaattagctttgacaagctcacaaataacaaccctaatttctactaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 50167375  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  50167376 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 50167401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 184 - 357
Target Start/End: Original strand, 37879005 - 37879178
Alignment:
Q  184 aggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37879005 aggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcac 37879104  T
Q  284 tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  37879105 tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaatccttagcctttg 37879178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 91 - 303
Target Start/End: Original strand, 37503558 - 37503768
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  37503558 tgttgacctagttcgatccaacttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa---ggttac 37503654  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  37503655 aagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 37503754  T
Q  290 aaggtgtttacaat 303  Q
    ||||||||||||||    
T  37503755 aaggtgtttacaat 37503768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 98 - 316
Target Start/End: Original strand, 50169218 - 50169436
Alignment:
Q  98 ccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  50169218 ccagttcggtccaacttgacctaatctaggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagtacttacaaagagatacaaatgagttacaagaaat 50169317  T
Q  198 tagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgt 296  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  50169318 tagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtat 50169417  T
Q  297 ttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  50169418 ttacaa-tgtttcccaaccc 50169436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 3847122 - 3847347
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  3847122 tgttgaccaagttcggtccaacttgacctaatctggggaagagatggatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttac 3847221  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    || || ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  3847222 aaaaatttagcttaaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 3847321  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  3847322 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 3847347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 91 - 303
Target Start/End: Original strand, 13659337 - 13659550
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  13659337 tgttgacccagttcggtccaacttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggtaac 13659436  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  13659437 aagaaattagcttcaacaagcttacaaaaaacaaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactacccc 13659536  T
Q  290 aaggtgtttacaat 303  Q
    ||||||||||||||    
T  13659537 aaggtgtttacaat 13659550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 91 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 46065085 - 46064872
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  46065085 tgtttacccagttcgatccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatgaatgagttcttacaaagagatacacatgagttac 46064986  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  46064985 aagaaattagcttcaacgagctcacaaagaacaaacctaatttttatccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 46064886  T
Q  290 aaggtgtttacaat 303  Q
    ||||||||||||||    
T  46064885 aaggtgtttacaat 46064872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3189498 - 3189273
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||    
T  3189498 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagagtta 3189399  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcc 288  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  3189398 caggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactc-ac 3189300  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  3189299 caaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 3189273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3198315 - 3198090
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||    
T  3198315 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagagtta 3198216  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcc 288  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  3198215 caggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactc-ac 3198117  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  3198116 caaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 3198090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3207154 - 3206929
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||    
T  3207154 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagagtta 3207055  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcc 288  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  3207054 caggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactc-ac 3206956  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  3206955 caaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 3206929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 105 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1833675 - 1833467
Alignment:
Q  105 ggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttc 204  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  1833675 ggtccaatttgacctaatctggtggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaatttagcttc 1833576  T
Q  205 aacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 303  Q
    || |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  1833575 aatagattcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa- 1833477  T
Q  304 tgtttcccaa 313  Q
    ||||||||||    
T  1833476 tgtttcccaa 1833467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 91 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 41361081 - 41360856
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41361081 tgttgacctagttcggtccaatatgacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 41360982  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  41360981 aagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatattttcactcaccca 41360882  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccct 317  Q
    || ||||||| | ||||||||||||||    
T  41360881 agatgtttacga-tgtttcccaaccct 41360856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 98 - 316
Target Start/End: Original strand, 196915 - 197134
Alignment:
Q  98 ccagttcggtccaacttgacctactctggagg-agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  196915 ccagttcggtccaacttgacctaatctggggggagagataaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgagttacaagaaa 197014  T
Q  197 ttagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtg 295  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  197015 ttaacttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtg 197114  T
Q  296 tttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  197115 tttacaa-tgtttcccaaccc 197134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 91 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15820474 - 15820251
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  15820474 tgtttacctagttcgatccaacttgacctactctggatgagagatttatctcttcaatgcactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaatgtgttac 15820375  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  15820374 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttttacccatctttccaatatcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactcaccc 15820275  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaac 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  15820274 aaggtgtttacaa-tgtttcccaac 15820251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10925393 - 10925165
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt---acaaagagatacaaataggt 187  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||  ||    
T  10925393 tgttgacccagttcgatccaactttacctaatctaggggagagattgatttctccaatccactatcaatgaattcttcttacaaagagatacaaatgagt 10925294  T
Q  188 tacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactct 286  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  10925293 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctatccattttttcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 10925194  T
Q  287 cccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10925193 cccaaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 10925165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 91 - 303
Target Start/End: Original strand, 37559868 - 37560083
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactct-ggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37559868 tgttgaccaagttcggtccaacttgacctaatctagggggagagattgatctctccaattcactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 37559967  T
Q  190 caagaaattagc-ttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 287  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  37559968 caagaaattagctttcaacaagttcacaaagaacaactctaatttctacccattttcctaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 37560067  T
Q  288 ccaaggtgtttacaat 303  Q
    | || |||||||||||    
T  37560068 ctaatgtgtttacaat 37560083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 316
Target Start/End: Original strand, 23555275 - 23555491
Alignment:
Q  99 cagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaatt 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  23555275 cagttcgatccaacttgacctactatgg-ggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttataagaaatt 23555373  T
Q  199 agcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtt 297  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||| || |||||||||||    
T  23555374 agtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaaagaataagacactcaataattttcattcacccaaggtgtt 23555473  T
Q  298 tacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  23555474 tacaa-tgtttcccaaccc 23555491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 94 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20762837 - 20762614
Alignment:
Q  94 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaa 192  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  20762837 tcacctagttcggtccaaacttgacctactctgtaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacgaagagatacaaaagggttacaa 20762738  T
Q  193 gaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccca 290  Q
    |||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||    
T  20762737 gaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttctcaatctcaccaatgaacaagatactcaatgattttcactc-acca 20762639  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  20762638 aggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 20762614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 91 - 312
Target Start/End: Original strand, 13137977 - 13138196
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13137977 tgttgacccagttcggtccaatatgacctactctaggggagagattgctctcttcaatccactatcaatgtgttcttacaaagagatgcaaatgggttac 13138076  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  13138077 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacga-cctaatttctatccatttt-tcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 13138174  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttccca 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  13138175 aaggtgtttacaa-tgtttccca 13138196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 91 - 303
Target Start/End: Original strand, 45644355 - 45644569
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  45644355 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagatattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttgc 45644454  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacac-tcatgattttcactctcc 288  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  45644455 aagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctatccattttctcaatctcaccaatgaacaagacacttaatgattttcactcacc 45644554  T
Q  289 caaggtgtttacaat 303  Q
    |||| ||||||||||    
T  45644555 caagatgtttacaat 45644569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Original strand, 13316352 - 13316520
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  13316352 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggtta 13316451  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13316452 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 13316520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 927977 - 928204
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||    
T  927977 tgtttacccagttcggtctaacttgacctaccttggggaagaggttggtctctctaatccactattaatgagtttttacaaagagatccaaaagggttac 928076  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcc 288  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |  |||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  928077 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctatcattttttccaatatcaccaaagaacaagacactcattgattttcactcacc 928176  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  928177 caaggtgtttacaaatgtttcccaaccc 928204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 30476447 - 30476674
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||  | ||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30476447 tgttgacccagttcggtccaacttaacctcatatggggtagagattgatctgtccaatccagtatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 30476546  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa---tgaacaagacactc-atgattttcactct 286  Q
    || |||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||||| |     
T  30476547 aataaattatcttcaacaagttcataaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatattgaacaaga-actcaatgattttcaccca 30476645  T
Q  287 cccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30476646 cccaaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 30476674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 91 - 313
Target Start/End: Original strand, 40122197 - 40122421
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat--caatgagttcttacaaagagatacaaataggtt 188  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  |||    
T  40122197 tgttgacctagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatgagtt 40122296  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 287  Q
    | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||| |    
T  40122297 ataagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttcgacccatttttccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgatttttactcac 40122396  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaa 313  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  40122397 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 40122421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 99 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16455780 - 16455585
Alignment:
Q  99 cagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaatt 198  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16455780 cagtttggtccaatttgaccgactatgggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacacagagatacaaatgggttacaagaaatt 16455681  T
Q  199 agcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggt 294  Q
    ||||||||||||| |||  |||| ||  |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16455680 agcttcaacaagctcac-tagaaaaaatctaatttctcaccattttaccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggt 16455585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 91 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 51765565 - 51765349
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaataggt 187  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||    
T  51765565 tgttcacccagttcggtccaaacttgtcctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaggggt 51765466  T
Q  188 tacaagaaattagcttcaacaagcacacaaa-gaacaaccctaatttctacccattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcact 284  Q
    ||||||||||||||||  |||||  |||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  51765465 tacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatcaaaccaa-gaacaagacactcaatgatttacact 51765367  T
Q  285 ctcccaaggtgtttacaat 303  Q
    |  ||||||||||||||||    
T  51765366 c-accaaggtgtttacaat 51765349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 9987369 - 9987202
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||    
T  9987369 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaatgagttcttgcaaaagggatacaaa-aggtt 9987271  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
     ||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9987270 gcaagaaattagattagacaagttcacaatgaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 9987202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Original strand, 20622237 - 20622406
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac---aaagagatacaaatagg 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| |||||||| |||    
T  20622237 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaaagggatacaaa-agg 20622335  T
Q  187 ttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20622336 ttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 20622406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 40282545 - 40282377
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  40282545 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 40282447  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||| ||  |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40282446 acaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 40282377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 114 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22079461 - 22079222
Alignment:
Q  114 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagca 212  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||     
T  22079461 tgacctactttggaggagaaattgatctctccaatccaatatcaatgagttctttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagctttaacaagct 22079362  T
Q  213 cacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaatgaacaagacactcatgattttcactctcc-caaggtgtttacaattgtttcc 310  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  || ||||||||||     |||  |||||||| ||  ||| | ||  ||||||||||     
T  22079361 cacaaagaacaaacataatttcta-ccatttttccaatctcttcccatgaacaaga----aatg-gtttcactcacctgaagtttttcccaattgtttct 22079268  T
Q  311 caaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22079267 caactctagaatctaacccccaaaagagaa-caatccttagcctttg 22079222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 9036584 - 9036417
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  9036584 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctcgaggagagattgtactcttcaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 9036486  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||||  |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9036485 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 9036417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 116 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 6808595 - 6808358
Alignment:
Q  116 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcaca 214  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||| |     
T  6808595 acctactctgaggaagagattgatctctccaatccactataaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaagttagcttcaacaagctct 6808496  T
Q  215 caaagaac------aaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgt 306  Q
    | ||||||      || ||||||||||| |||||| || |||||| ||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| | | |||    
T  6808495 ccaagaacaaacctaatcctaatttcta-ccatttccctaatctctactcatgaacaagacactcaataattttcactctcccaaagtgtttcccaatgt 6808397  T
Q  307 ttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacc 346  Q
    ||| |||| ||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  6808396 ttctcaactctagaatctaa-cctcgaaagagaaccaacc 6808358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 36683839 - 36683694
Alignment:
Q  99 cagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaatt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||          |||||  |||||||||||||    
T  36683839 cagttcggtctaacttgacctactctgggggagagattgatttctacaatccactatcaatgagttctta----------caaatgagttacaagaaatt 36683750  T
Q  199 agcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctca 254  Q
    ||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36683749 agcttcaacaaactcacaaagaataaacctaatttctacctattttcccaatctca 36683694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 316
Target Start/End: Original strand, 37282701 - 37282918
Alignment:
Q  100 agttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaataggttacaagaaatt 198  Q
    ||||| |||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| | |||||    
T  37282701 agttcagtccaaattgacctactccaaaggagagatttatctctccaatccactactaatgagttctttacaaagagatgcaaaagggttaccataaatt 37282800  T
Q  199 agcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgt 296  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||   ||||||||    
T  37282801 agcttcaacaagctcacaaggaacaaaccctaatttataccattttt--caatctctccaatgaacaagacactcaatggttttcactcatacaaggtgt 37282898  T
Q  297 ttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||| ||  |||| |||||||    
T  37282899 ttaaaaaagttttccaaccc 37282918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21054123 - 21053958
Alignment:
Q  94 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggttaca 191  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  21054123 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttgca 21054025  T
Q  192 agaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    ||||||||| ||  |||||  ||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21054024 agaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacac-ttttcccaatctcaccaa 21053958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 91 - 189
Target Start/End: Original strand, 37876767 - 37876865
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  37876767 tgttcacccagttcggttcaacttgatgtactctggaggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgggtta 37876865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 91 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 28242472 - 28242382
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 181  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28242472 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaa 28242382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 102 - 302
Target Start/End: Original strand, 8871074 - 8871259
Alignment:
Q  102 ttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagc 201  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||              ||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  8871074 ttcggtccaacttggcctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa--------------gagttacaaaatggttacaagaaattagc 8871159  T
Q  202 ttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttac 300  Q
    |||||| | | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||    
T  8871160 ttcaacgaactcacaaagaacaaaccctaatttcta-ccattttccaaatctcacaaaagaacaagacact-atgattttcgctcatccaaggtgtttac 8871257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 44203800 - 44203631
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatagg 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| || |||    
T  44203800 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagagg 44203702  T
Q  187 ttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  44203701 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 44203631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 100 - 314
Target Start/End: Original strand, 44650172 - 44650388
Alignment:
Q  100 agttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaataggttacaagaaatt 198  Q
    |||||||||||| |||||||||| | | | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| |||    |||||| |||||    
T  44650172 agttcggtccaaattgacctacttttgggaagagattgatctcttcaatccactattaatgaattatttacaaagagatataaaagatttacaataaatt 44650271  T
Q  199 agcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgt 296  Q
    ||| | ||||| | |||||||||| |||| |||||| || |  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||    
T  44650272 agcgttaacaaactcacaaagaacaaaccataattttta-catttttctcaatctctccaatgaacaagacactcaataattttcactcacccaaagtgt 44650370  T
Q  297 ttacaattgtttcccaac 314  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  44650371 ttacaaatgttttccaac 44650388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 262 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 28242385 - 28242289
Alignment:
Q  262 acaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  28242385 acaagacactcaagaattttcactctcccaaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaacccctaaaagagaaccaacccatagcctttg 28242289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 3460841 - 3460707
Alignment:
Q  113 ttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagc 211  Q
    |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  3460841 ttgacctactctag-gaagatattgatctctccaatcgactatcaatatgttctttacaaagatatacaaaagggttacaataaattagcttcaacaagc 3460743  T
Q  212 acacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcc 246  Q
     |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  3460742 tcacaaagaacaaactctaatttctaccctttttcc 3460707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 5460046 - 5459956
Alignment:
Q  118 ctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaaca 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  5460046 ctactctagatgagagattgatctctccaatctactatcaatgagttctttacaaagaaatataaa-atgttacaagaaattagcttcaaca 5459956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13938281 - 13938143
Alignment:
Q  114 tgacctac-tctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatac-aaataggttacaagaaattagcttcaacaag 210  Q
    |||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||  |||||    
T  13938281 tgacctacatctgggggagaga--gatctctccaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaaaaggttacaagaaattatattttacaag 13938184  T
Q  211 cacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 253  Q
      | | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13938183 ttctccaagaacaa-cctaatttctaccca-tttcccaatctc 13938143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 2926653 - 2926516
Alignment:
Q  114 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagca 212  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| ||||||      
T  2926653 tgacctactctgcagaagagattgatctctccaatccactaccaatgaattcgtttcaaagagatgcaaaaaggttacaataaattaactttaacaagtt 2926554  T
Q  213 cacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatc 251  Q
    |   ||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2926553 cttcaagcacaaacctaatttcta-ccatttttccaatc 2926516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 273
Target Start/End: Original strand, 12318585 - 12318706
Alignment:
Q  153 tatcaatgagttcttaca-aagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatc 251  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12318585 tatcaatgagttcttaaagaagacatacaaaatggttacaagaaattagcttcaacaagctctccatgaacaaacctaatttctaccca-tttccaaatc 12318683  T
Q  252 tc-accaatgaacaagacactca 273  Q
    || ||| |||||||||| |||||    
T  12318684 tctacccatgaacaagaaactca 12318706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 329
Target Start/End: Original strand, 1050503 - 1050683
Alignment:
Q  150 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 248  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||  ||||||||  ||||| |||||||    
T  1050503 cactatcaacgagttatttacaaagagacacaaaaatgttacaagaaattagcttcaataagctctcgaagaacacacctaattttcaccca-tttccca 1050601  T
Q  249 atctcacca-atgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaaccc 329  Q
    |||||  || |||||||||| |||||  | ||||||||   ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1050602 atctcttcacatgaacaagagactcaataatttcactcattcaatgtgtgtacaaatgtttcccaacccaagaatctcaccc 1050683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 130 - 210
Target Start/End: Original strand, 9109459 - 9109540
Alignment:
Q  130 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaag 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9109459 agagattgatctctccaatacactatcaacgtgttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattaacttcaacaag 9109540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 221
Target Start/End: Original strand, 2263016 - 2263106
Alignment:
Q  132 agattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaa 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  2263016 agattgatctcttcaatccactatcaataagttctttacaaaaagatataaaagggttacaagaaattatcttcaacaagctcaccaagaa 2263106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 41135926 - 41135721
Alignment:
Q  153 tatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatc 251  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||  |   ||||||||  ||||||||||||| |||||  | ||    
T  41135926 tatcaacgagttctttacaaatagatacaaaaggtttacaagaaattaacttcaaaaagttcttcaagaacaaatctaatttctaccctttttct-attc 41135828  T
Q  252 tcacca-atgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgttta-caattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaaccct 348  Q
    ||  || | |||||||| ||||| |||||| | ||| ||||||||||||  ||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  41135827 tcctcacaggaacaagagactcaatgatttcc-ctcacccaaggtgtttttcaaatgtttctcaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaatcct 41135729  T
Q  349 tagccttt 356  Q
    ||||||||    
T  41135728 tagccttt 41135721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 238
Target Start/End: Original strand, 4535527 - 4535629
Alignment:
Q  137 gatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttct 235  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||| |||| | | |||||||| | ||||||||    
T  4535527 gatctctccacttaactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaatgttacaagaaattgacttcaataagctctccaagaacaaacttaatttct 4535626  T
Q  236 acc 238  Q
    |||    
T  4535627 acc 4535629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 25652195 - 25652018
Alignment:
Q  150 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 248  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||  | ||||||||| ||| |||| ||    
T  25652195 cactatcaaagagttctttacaaagagatacaagagagttacaagaaattagcttcaacaaactctcaaataacacacttaatttcta-ccaatttctca 25652097  T
Q  249 at-ctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatcta 325  Q
    ||  |  |  |||||||| | |||| ||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25652096 atattttctcatgaacaaaatactcaatgattttcacacacttaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatcta 25652018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 253
Target Start/End: Original strand, 16914234 - 16914338
Alignment:
Q  150 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaa-ttagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttccc 247  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||| || | | |||||||| | |||||| |||||| ||||||    
T  16914234 cactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttagaagaaacttagcttcaacaggctctccaagaacaaacataatttttaccca-tttccc 16914332  T
Q  248 aatctc 253  Q
    ||||||    
T  16914333 aatctc 16914338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 32471579 - 32471478
Alignment:
Q  140 ctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacc 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||| ||| |||||| ||||||| ||  | |||||||||| |||||||| ||||    
T  32471579 ctctcgaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaagagttgcaataaattaacttcaac-agttctcaaagaacaaacctaatttatacc 32471481  T
Q  239 cat 241  Q
    |||    
T  32471480 cat 32471478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 307 - 357
Target Start/End: Original strand, 34602557 - 34602607
Alignment:
Q  307 ttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  34602557 ttcccaactctagaatctaacctccaaaagagaaccaacccttagcctttg 34602607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 35109557 - 35109492
Alignment:
Q  174 agatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctaccca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  35109557 agatacaaataggttacaagaaattagctt--aaaagctcacaaagaacaaaccttaatttctaccca 35109492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 161
Target Start/End: Original strand, 44646814 - 44646875
Alignment:
Q  100 agttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatga 161  Q
    |||||||||||| |||||||||| | | | |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  44646814 agttcggtccaaattgacctacttttgggaagagattgatctcttcaatccactattaatga 44646875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 311
Target Start/End: Original strand, 1485855 - 1485995
Alignment:
Q  174 agatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttccc-aatctc-accaatgaacaagacact 271  Q
    |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||| | ||||| || |||||||||||| | ||| ||| ||||||  ||  |||  |||| |||    
T  1485855 agatacaaaagggttacaagaaattatattcaacaagcactccaagaaaaatcctaatttctacacttttacccgaatctcttcctgtgacaaagatact 1485954  T
Q  272 c-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccc 311  Q
    | ||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  1485955 caatgattttcactcacttaatgtgtttacaattgtttccc 1485995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 134
Target Start/End: Original strand, 31422863 - 31422906
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagaga 134  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31422863 tgttcacccagctcggtccaaattgacctagtctggaggagaga 31422906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 302
Target Start/End: Original strand, 44646881 - 44646997
Alignment:
Q  187 ttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccc-taatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcact 284  Q
    |||||| |||||||| | ||||| | |||||||||||| || |||||| |||   ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  44646881 ttacaataaattagcgttaacaaactcacaaagaacaaaccataatttttacat-ttttctcaatctctccaatgaacaagacactcaataattttcact 44646979  T
Q  285 ctcccaaggtgtttacaa 302  Q
    |  |||| || |||||||    
T  44646980 catccaaagtatttacaa 44646997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 72)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 40147428 - 40147162
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  40147428 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttac 40147329  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40147328 aagaaattagcttcaacaagctcacgaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgatttccactctccca 40147229  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40147228 aggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 40147162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 28278483 - 28278217
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  28278483 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttac 28278384  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28278383 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 28278284  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||    
T  28278283 atgtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccctaaaagagagccaacccttagcatttg 28278217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 213633 - 213381
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  213633 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 213534  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccc 289  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  213533 caagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccc 213434  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaacc 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  213433 aaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaacc 213381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 5058212 - 5057948
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  5058212 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggatac 5058113  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5058112 aagaaaatagcttcaacaagctcaca--gaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactcttcca 5058015  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5058014 aggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 5057948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 96 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 38747167 - 38746906
Alignment:
Q  96 acccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaa 195  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  38747167 acccagtttggtccaacttgacctgatctgagggagagattgatctctccaatcctctatcaatgagtttttccaaagagatacaaatgggttacaagaa 38747068  T
Q  196 attagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtg 295  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38747067 attagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcattaatgaacaagatactcatgattttcactctcccaaggtg 38746968  T
Q  296 tttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38746967 tttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 38746906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27015690 - 27015433
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       
T  27015690 tgttcacccagttcggtccaacttgacctattttggaggagagattgatctgtacaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggt--- 27015594  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
         |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27015593 -----attagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaccaa-acactcatgattttcactctccca 27015500  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27015499 agatgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 27015433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 93 - 341
Target Start/End: Original strand, 27637615 - 27637865
Alignment:
Q  93 ttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-taggttac 190  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  27637615 ttcacccagttcggtccaacaatgacctactctgcaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttac 27637713  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatg-attttcactctccc 289  Q
    |||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  27637714 aagaaattagtttaaacaagctcataaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactcttcc 27637813  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaac 341  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  27637814 aaggtgttcacaattgtttcccaactctagcatctaacccccaaaagagaac 27637865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 533936 - 533711
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  533936 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 533837  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  533836 aaaaaattagcttcaacaagctcacaaagaccaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacacgcaatgattttcactcaccc 533737  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  533736 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 533711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 42428431 - 42428656
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42428431 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 42428530  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  42428531 aagaaattagcttcaacaagttcacaaagaaaaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 42428630  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||    
T  42428631 aaggtgtttacaa-tatttcccaaccc 42428656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 96 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13488365 - 13488145
Alignment:
Q  96 acccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13488365 acccagttcggtccaacttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaa 13488266  T
Q  196 attagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggt 294  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  13488265 attagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaatgaacaagacactcaataattttcactcacccaaggt 13488166  T
Q  295 gtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  13488165 gtttacaa-tgttttccaaccc 13488145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 91 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 32636991 - 32636778
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32636991 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttac 32636892  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    |||||||||||||  |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  32636891 aagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 32636792  T
Q  290 aaggtgtttacaat 303  Q
    ||||||||||||||    
T  32636791 aaggtgtttacaat 32636778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25412928 - 25412704
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  25412928 tgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 25412829  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  25412828 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 25412731  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  25412730 caaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 25412704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 39468550 - 39468775
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||| |||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39468550 tgttgacccagttcagtccaatttaacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 39468649  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  39468650 aagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcactaatgaacaagacactcaatgattttcactcactc 39468749  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  39468750 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 39468775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 96 - 316
Target Start/End: Original strand, 28750661 - 28750881
Alignment:
Q  96 acccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaa 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  28750661 acccaattcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgggttacaggaa 28750760  T
Q  196 attagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggt 294  Q
    |||| |||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28750761 attaacttcaacaatttcataaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggt 28750860  T
Q  295 gtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||| ||| |||||||||||||    
T  28750861 gttttcaa-tgtttcccaaccc 28750881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 98 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 538185 - 537970
Alignment:
Q  98 ccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  538185 ccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaat 538086  T
Q  198 tagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgt 296  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  538085 tagcttcaacaagctcacaaagagcaaccttaatttctacccattttcccaatctcactaatgaacaagacacgcaatgattttcactcacccaaggtgt 537986  T
Q  297 ttacaattgtttcccaa 313  Q
    |||| | ||||||||||    
T  537985 ttacga-tgtttcccaa 537970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13239919 - 13239694
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaactt-gacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  13239919 tgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtta 13239820  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  13239819 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaaaaaccctaatttctaccattttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 13239721  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13239720 caaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 13239694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 91 - 313
Target Start/End: Original strand, 42426236 - 42426458
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  42426236 tgttgacctagttcagtccaacttgacctaatcagggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttgc 42426335  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  42426336 aagaaattagcttcaacaatttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaataattttcactcaccc 42426435  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaa 313  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  42426436 aaggtgtttacaa-tgtttcccaa 42426458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33831847 - 33831622
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33831847 tgttgacccagttcagtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 33831748  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  33831747 aagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccatttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcaccc 33831648  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  33831647 aaggtgtttacaa-tgttttccaaccc 33831622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 8565947 - 8566172
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  8565947 tgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctgggtgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacagagggatacaaatgggttac 8566046  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  8566047 aagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaagttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 8566146  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  8566147 aaggtgtttacaa-tgtttccgaaccc 8566172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16452247 - 16452023
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16452247 tgtttacccagttcggtccaacttgacctactctgggggagagatttatctctccaatccactatgaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 16452148  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||    
T  16452147 aagaaattagcttcaacaagctcagaaagaacaaacttaatttctacccatttttccaatctcatcaatgaacaagacactcaatgattgtcact-tacc 16452049  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16452048 aaggtgtttacaa-tgtttccgaaccc 16452023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13343228 - 13343003
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||    
T  13343228 tgttcacccagttcggtccaaacatgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaaggatta 13343130  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 287  Q
    ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  13343129 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 13343031  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13343030 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 13343003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 30182756 - 30182531
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||    
T  30182756 tgttcatccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatagaaaagggtta 30182657  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  30182656 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 30182558  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  30182557 caaggtgtttgcaa-tgtttcccaaccc 30182531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31183138 - 31182915
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  31183138 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagatagatctctccaatccagtatcaatgagttcttacaaagggatacaaat-ggttac 31183040  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  31183039 aagaaattaacttaaacaaactcacaaagaacaatcctaatttctacccatttt-ccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacct 31182941  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  31182940 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 31182915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Original strand, 16640941 - 16641208
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||   ||||     
T  16640941 tgtttacccagttcggccctacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatca---agttcttacaaagagatacaaaagagttat 16641037  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacc--cattttcccaatctcaccaatgaacaagacac-tcatgattttcactct 286  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    ||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||     
T  16641038 cagaaatcagcttcaacaagctcacaaagaacaaacactaatttctaccatttttttctcaatctcgccaatgaacaagacacttaatgaatttcactca 16641137  T
Q  287 cccaaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16641138 ctcaaggtgtttacaaatgttccccaactctagaatctaatccccaaaagagaaccaacctttagcctttg 16641208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 98 - 316
Target Start/End: Original strand, 30682930 - 30683146
Alignment:
Q  98 ccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag--ttcttacaaagagatacaaataggttacaagaa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  30682930 ccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtattcttacaaagaaatacaaaagggttacaagaa 30683029  T
Q  196 attagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggt 294  Q
    |||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  30683030 attagcttcaacaagttcacaaag---aaccctaatttctaccctttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggt 30683125  T
Q  295 gtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||| |||||| ||||||    
T  30683126 gtttacaa-tgtttcgcaaccc 30683146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 3075659 - 3075884
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3075659 tgttcacccaatttggtccaacttgacctactatgagggagagattgatctctccaattcactatcaacgaattcttacaaaaagatacaaatgggttac 3075758  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||  |     
T  3075759 aagaaattagattcagcaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttctcaatctcacaaatgaacgagacactcaatgattttcactcatca 3075858  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  3075859 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 3075884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 36074043 - 36074270
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||    
T  36074043 tgttcatccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagtta 36074141  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctaccc---attttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactc 285  Q
    ||||||||||||||  |||||  | |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36074142 caagaaattagctttgacaagttcgcaaagaacaaccctaatttctacccttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 36074241  T
Q  286 tcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36074242 -accaaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 36074270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 37439309 - 37439076
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  37439309 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtta 37439210  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccatt--------ttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgatttt 280  Q
    |||||||||| |||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||        |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  37439209 caagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccttttatttttccttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgatttt 37439110  T
Q  281 cactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||  |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  37439109 cactc-accaaagtgtttacaa-tgtttcccaaccc 37439076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 102 - 313
Target Start/End: Original strand, 9049354 - 9049565
Alignment:
Q  102 ttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagc 201  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  9049354 ttcggtccaacttcacctactttgggggagatattgatctctccaatccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagc 9049453  T
Q  202 ttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttac 300  Q
    |||||||||| |||||| |  ||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  9049454 ttcaacaagctcacaaaaacaaacactaatttcta-tcattttcccaaactcactaatcaacaagacactcagtgatttttactcacccaaagtgtttac 9049552  T
Q  301 aattgtttcccaa 313  Q
    || ||||||||||    
T  9049553 aaatgtttcccaa 9049565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16409643 - 16409425
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||    
T  16409643 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagtt 16409544  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 287  Q
    |||||||||||| ||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||       |||||||||| |||||||||||||      
T  16409543 acaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc-tttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactc-a 16409453  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16409452 ccaaggtgtttacca-tgtttcccaaccc 16409425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 91 - 308
Target Start/End: Original strand, 13695691 - 13695910
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||| ||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  13695691 tgtttacctagtttggtccaagttgacctactatggaggagagaataatctctctaatccactattaatgagttctttacaaagagatacaaaagggtta 13695790  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 287  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| |||| |||| ||||||||||||| |    
T  13695791 caagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttgtaccc-ttttcccaatctctccaaagaaaaagatactcaatgattttcactcac 13695889  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgttt 308  Q
     |||||||||||||| |||||    
T  13695890 acaaggtgtttacaaatgttt 13695910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26178050 - 26177833
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||    
T  26178050 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagtt 26177951  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 287  Q
    |||||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||       |||||||||| |||||||||||||      
T  26177950 acaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc--ttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactc-a 26177861  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  26177860 ccaaggtgtttacca-tgtttcccaaccc 26177833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 102 - 303
Target Start/End: Original strand, 42309947 - 42310149
Alignment:
Q  102 ttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagc 201  Q
    ||||||| ||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  42309947 ttcggtcaaacttaatctactatgggggagagattgatctcgctaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagc 42310046  T
Q  202 ttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttac 300  Q
    |||||||||| |||||||| ||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||  |||||||    
T  42310047 ttcaacaagctcacaaagatcaaacttgatttctacccaatttctcaatctcaccaatgagcaagacactcaatgattttcacttacccaaaatgtttac 42310146  T
Q  301 aat 303  Q
    |||    
T  42310147 aat 42310149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Original strand, 9789224 - 9789392
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||    
T  9789224 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagtt 9789323  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||| ||  |||||  ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  9789324 acaagaaattagatttgacaagttcacaaggaacaaccttaatttctaccc-tttttccaatctcaccaa 9789392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Original strand, 18441648 - 18441816
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||    
T  18441648 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagtt 18441747  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  18441748 acaagaaattagatttgacaagttcacaaggaacaaccctaatttctaccc-tttttccaatctcaccaa 18441816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19806530 - 19806326
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||                   |||     
T  19806530 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaggagttctt-------------------ttag 19806450  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  19806449 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaacc-taatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatga-tttcactcaccc 19806352  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  19806351 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 19806326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 161 - 316
Target Start/End: Original strand, 5887487 - 5887642
Alignment:
Q  161 agttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatg 260  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  5887487 agttcttacaaagtgatacaaatgggttgcaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttctatccattttctcaatctcacaaatg 5887586  T
Q  261 aacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5887587 aacaagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 5887642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Original strand, 29751160 - 29751328
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  29751160 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 29751258  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||| ||  |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29751259 acaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 29751328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Original strand, 22536290 - 22536457
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  22536290 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactccccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 22536388  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||||  |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22536389 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 22536457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 29720532 - 29720364
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  29720532 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 29720434  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||| ||  |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29720433 acaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 29720364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 29722692 - 29722524
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaactt-gacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  29722692 tgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 29722594  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||| ||  |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29722593 acaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 29722524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 316931 - 316663
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggtt 188  Q
    |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||    
T  316931 tgtttaccaagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatccctccgatccattatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggatt 316832  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatc-tcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactct 286  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |  ||  | ||||||| || | |||| ||||||||     
T  316831 acaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaacctaatttcta-cctttttctcaatcttttcccctaaacaagagacccaatga-tttcactca 316734  T
Q  287 cccaaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    ||| || | ||  ||||||||| |||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  316733 cccgagtttttcccaattgttttccaactttaaaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 316663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10593426 - 10593258
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaataggt 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  10593426 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggt 10593328  T
Q  188 tacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||| | |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  10593327 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttctcccaatctcaccaa 10593258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26170930 - 26170724
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||         ||||    
T  26170930 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-aga---------gtta 26170841  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    ||||||||||| ||  |||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||       |||||||||| |||||||||||||  |    
T  26170840 caagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaatcctaatttctaccc--ttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactc-ac 26170751  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||    
T  26170750 caaggtgtttacca-tgtttcccaaccc 26170724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 25078289 - 25078120
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatagg 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| || |||    
T  25078289 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagagg 25078191  T
Q  187 ttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25078190 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 25078120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 25136258 - 25136089
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatagg 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| || |||    
T  25136258 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagagg 25136160  T
Q  187 ttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25136159 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 25136089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 40380259 - 40380090
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatagg 186  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| || |||    
T  40380259 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagagg 40380161  T
Q  187 ttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||| ||  |||||  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40380160 ttacaagaaattag-tttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 40380090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 40382470 - 40382301
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatagg 186  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| || |||    
T  40382470 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagagg 40382372  T
Q  187 ttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||| | |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  40382371 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaacttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 40382301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 91 - 243
Target Start/End: Original strand, 33906030 - 33906184
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaac-ttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaataggtt 188  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||    
T  33906030 tgtttacccagctcggtccaacattgacctactctagggaagagattgatctttccaatctactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggatt 33906129  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattt 243  Q
    ||||||| |||||||| |||||| | | ||| || | |||||||| |||||||||    
T  33906130 acaagaagttagcttcgacaagctctccaagcactaacctaatttatacccattt 33906184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 128 - 243
Target Start/End: Original strand, 10054854 - 10054969
Alignment:
Q  128 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaacc 226  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |   |||||||| |    
T  10054854 ggagatattgatatctccaatacactatcaatgagttcattacaaagagatacaaa-aggttataagaaattagcttcaacaaactcttcaagaacaaac 10054952  T
Q  227 ctaatttctacccattt 243  Q
     ||||||||||||||||    
T  10054953 ataatttctacccattt 10054969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 42927058 - 42926966
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat 183  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42927058 tgtttacccagttcggtccaacttgacctactatgagagagagatttatttcttcaatccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaat 42926966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 35616278 - 35616082
Alignment:
Q  150 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 248  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||| ||| ||| | | |||||||| |||||||||||| ||||| | ||    
T  35616278 cactatcaatgagttctttacaaagaaatacaaaagggttacaagaaattaacttaaacgagctctccaagaacaaacctaatttctactcattt-ctca 35616180  T
Q  249 atctca-ccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaac 345  Q
    |||||  ||  ||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  35616179 atctcttcccgtgaacaagagactcaatgattt-cactcacccaaggtgtttcctaattgtttccaaactctagaatctaa-ccacaaaagagaatcaac 35616082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16546796 - 16546684
Alignment:
Q  94 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||    
T  16546796 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggtta 16546698  T
Q  190 caagaaattagctt 203  Q
    ||||||||||||||    
T  16546697 caagaaattagctt 16546684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 129 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3326043 - 3325933
Alignment:
Q  129 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccc 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||  |    
T  3326043 gagatattgatctctctaatccaccatcattgagttctttacaaagagatacacaatggttacaagaaattagcttcaacaagctcttcaagaacaaaac 3325944  T
Q  228 taatttctacc 238  Q
    |||||||||||    
T  3325943 taatttctacc 3325933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 199 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4160690 - 4160534
Alignment:
Q  199 agcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacca-atgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtt 297  Q
    ||||||||||||  | | |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||  |  |||| ||| ||| ||||   ||||||||  |||| |||||    
T  4160690 agcttcaacaagttctccaagaacaaacctaatttctacc-attttccaaatctcctctcatgagcaaaacattcattgatttcactcaaccaatgtgtt 4160592  T
Q  298 tacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagccttt 356  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4160591 tacaattgtttctcaactct-gaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagccttt 4160534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16544574 - 16544407
Alignment:
Q  94 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||    
T  16544574 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggtta 16544476  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
      |||||||||||| |  | |  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16544475 tgagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 16544407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 243 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 42926908 - 42926838
Alignment:
Q  243 ttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 313  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  42926908 ttcccaatctcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 42926838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 10700674 - 10700796
Alignment:
Q  114 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagca 212  Q
    ||||||||| ||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||   ||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||     
T  10700674 tgacctactatgggggagaga--gatctctccacttcactatcaatgagttctttttaaagagatacaaaaatgttataagaa-ttagcttcaacaagct 10700770  T
Q  213 cacaaagaacaaccctaatttctacc 238  Q
    | | |||||||| |||||||||||||    
T  10700771 ctctaagaacaaacctaatttctacc 10700796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 4160762 - 4160702
Alignment:
Q  96 acccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 155  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4160762 acccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 4160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 42926968 - 42926916
Alignment:
Q  157 aatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  42926968 aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaa 42926916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30802934 - 30802843
Alignment:
Q  153 tatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 244  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||  | |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  30802934 tatcaacgagttctttacaaatagatacaaaaggattacaataaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacctaa-ttctacccatttt 30802843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22097981 - 22097877
Alignment:
Q  140 ctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacc 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||   ||||| ||||||||| |||||||||   | | ||||||||||||||||||||||    
T  22097981 ctctctaatccactatcaatgagttttttacaaatagatacaag--ggttataagaaattaacttcaacaaattctccaagaacaaccctaatttctacc 22097884  T
Q  239 cattttc 245  Q
    | |||||    
T  22097883 ctttttc 22097877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8445846 - 8445764
Alignment:
Q  128 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaa 209  Q
    ||||||||| |||| || |||| ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  8445846 ggagagattcatctttctaatctactatcaattagttctttataaagaaatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaa 8445764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 244
Target Start/End: Original strand, 14689503 - 14689581
Alignment:
Q  166 ttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 244  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||| | | |||||| | ||||||||||| |||||    
T  14689503 ttacaaagagatacaaaaatattacaaaaaattagcttcaacaagcactccatgaacaaacataatttctaccaatttt 14689581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 300 - 357
Target Start/End: Original strand, 14689622 - 14689678
Alignment:
Q  300 caattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14689622 caattgtttcacaactctagaatctatccc-caaaagagaaccaacccctagcctttg 14689678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 30793293 - 30793195
Alignment:
Q  101 gttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaatt 198  Q
    ||||||||||||  |||| |||||| | |||||||  |||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  30793293 gttcggtccaacaatgacttactctaggggagaga--gatctctccacttcactatcaattagttctttacaaagagatacaaaatggttacaataaatt 30793196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 6017115 - 6016979
Alignment:
Q  151 actatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaataggttacaagaaattag-cttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 248  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |  | ||||||| || ||||||||||||| ||||  |||    
T  6017115 actatcaatgagtttcttacgaagaaataaaaaaaggttacaagaaattagtcttcaacaggttctcaaagaagaa-cctaatttctaccaattt--cca 6017019  T
Q  249 atctca-ccaatgaacaagacactcatg-attttcactct 286  Q
    || ||| | ||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  6017018 atttcatctaatgaacaagagactcaagaattttcactct 6016979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 329
Target Start/End: Original strand, 32576482 - 32576538
Alignment:
Q  273 atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaaccc 329  Q
    |||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  32576482 atgattttcactcatcttaggtgtttacaattgtttcccaacccaagaatctcaccc 32576538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18596924 - 18596881
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagaga 134  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18596924 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagaga 18596881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 38882383 - 38882340
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagaga 134  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38882383 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagaga 38882340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 211
Target Start/End: Original strand, 32576344 - 32576418
Alignment:
Q  137 gatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagc 211  Q
    |||||||| | | |||||| ||| |||||||  |||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  32576344 gatctctcaacttcactattaattagttctttaaaagagatacaaaatggttataagtaattagcttcaacaagc 32576418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 142
Target Start/End: Original strand, 5887446 - 5887486
Alignment:
Q  102 ttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctc 142  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  5887446 ttcggtccaacttgacctaatctgggggagagatagatctc 5887486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 64)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 4283691 - 4283425
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4283691 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctagaggggagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 4283592  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4283591 aagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccta 4283492  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4283491 aggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 4283425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Original strand, 42434992 - 42435258
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42434992 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 42435091  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42435092 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 42435191  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42435192 aagtgtttacaattgtttaccaactctagaatctaaccctcaaaagagaaccaacccttagcctttg 42435258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 96 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 40221907 - 40221646
Alignment:
Q  96 acccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40221907 acccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaa 40221808  T
Q  196 attagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtg 295  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40221807 attagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttaccaatctcaccaaagaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtg 40221708  T
Q  296 tttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40221707 tttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacctttagcctttg 40221646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18655567 - 18655302
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18655567 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactttggaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 18655468  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18655467 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaaaacactcatgattttcactctccca 18655368  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  18655367 aggtgtttacaattgtttcctaagtctagaatctaaccc-caaaagagtatcaacccttagcctttg 18655302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 11384152 - 11383887
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  11384152 tgttcacccagttcggtccaacttaacctactctggaggagagatcgatgtctccaatccagtatcaatgggttcttacaaagagatacaaatgagttac 11384053  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11384052 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctca-taatgaacaagacactcatgattttcactctccca 11383954  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11383953 aggtgtttacaattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 11383887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 116 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 40328922 - 40328680
Alignment:
Q  116 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatag-gttacaagaaattagcttcaacaagcaca 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  40328922 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgagttacaagaaattagtttaaacaagctca 40328823  T
Q  215 caaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40328822 caaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacattcatgattttcactctcccaagatgtttacaattgtttcccaac 40328723  T
Q  315 cctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  40328722 tctagaatctaacccccaaaagagaaccaactcatagcctttg 40328680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15212953 - 15212728
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15212953 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 15212854  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  15212853 aagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacattcaatgattttcactcaccc 15212754  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15212753 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 15212728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 91 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27811445 - 27811232
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27811445 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgggttcttacaaagagatacaaatgggttac 27811346  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  27811345 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 27811246  T
Q  290 aaggtgtttacaat 303  Q
    ||||||||||||||    
T  27811245 aaggtgtttacaat 27811232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 91 - 314
Target Start/End: Original strand, 10930200 - 10930423
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10930200 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgtgttcttacaaagagatataaatgggttac 10930299  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10930300 aagaaattagcttcaacgagctcacaaagagcaaccctaatttctatccattttcccaatctcaccgatgaacaagacactcatgattttcactctccca 10930399  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaac 314  Q
    |  |||||||||||||||||||||    
T  10930400 aaatgtttacaattgtttcccaac 10930423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33352317 - 33352092
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33352317 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 33352218  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||    
T  33352217 aagaaattaggttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcaatcaccc 33352118  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  33352117 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 33352092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43036590 - 43036365
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  43036590 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggaggagagattgatctctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattac 43036491  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  43036490 aagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 43036391  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  43036390 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 43036365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 128 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 44353923 - 44353693
Alignment:
Q  128 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccc 227  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  44353923 ggagagattgatcttttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccc 44353824  T
Q  228 taatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaa 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44353823 taatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagatactcaatgatttttactcacccaatgtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaa 44353724  T
Q  327 cccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44353723 cccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 44353693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4731825 - 4731600
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4731825 tgttgacccaattcggtccaacttgaccgaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 4731726  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  4731725 aagaaattaggttcaacaagctcacaaagagcaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 4731626  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4731625 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 4731600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 97 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18141981 - 18141763
Alignment:
Q  97 cccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaa 196  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18141981 cccagtttggtccaacttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatgggttacaagaaa 18141882  T
Q  197 ttagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtg 295  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18141881 ttagcttcaacaagctcacaaagaacaa-cctaatttctacccattttcacaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcgcccaaggtg 18141783  T
Q  296 tttacaattgtttcccaacc 315  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  18141782 tttacaaatgtttcccaacc 18141763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 99 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 30143499 - 30143284
Alignment:
Q  99 cagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaatt 198  Q
    |||||| || |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30143499 cagttcagttcaacttgaccttatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaatt 30143400  T
Q  199 agcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgttt 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  30143399 agcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctggccaatgaacaagacac-aatgattttcactcacccaatgtgttt 30143301  T
Q  299 acaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||| |||||||||||||    
T  30143300 acaa-tgtttcccaaccc 30143284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 91 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 40321247 - 40321024
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  40321247 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagtttttacaaagagatactaatgggttac 40321148  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || | |    
T  40321147 aagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacctatgaacaagacactcaatgattttcagtcactc 40321048  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaac 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  40321047 aaggtgtttacaa-tgtttcccaac 40321024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 42498362 - 42498136
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  42498362 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaaatacaaaagggtta 42498263  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 287  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  42498262 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 42498164  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  42498163 ccaaggtgtttacaa-cgtttcccaaccc 42498136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 3303671 - 3303896
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  3303671 tgtttacccagttcggtccaacttgacctactgtgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttac 3303770  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| | |    
T  3303771 aagaaattaggttaaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctacccattttcccaatctcaccaataaacaagatactcaatgattttcactcactc 3303870  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  3303871 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 3303896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 91 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 5689438 - 5689225
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5689438 tgttgacccagttcggtccaacttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 5689339  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  5689338 aagaaattagctttgacaagctcacaaagcaccaccttaatttctacccatttttccaatctcattaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 5689239  T
Q  290 aaggtgtttacaat 303  Q
    ||||||||||||||    
T  5689238 aaggtgtttacaat 5689225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17982821 - 17982595
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  17982821 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggtta 17982722  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 287  Q
    |||||||||| |||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  17982721 caagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 17982623  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17982622 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 17982595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 91 - 317
Target Start/End: Original strand, 19491700 - 19491925
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19491700 tgttgacctagttcggtccaatatgacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 19491799  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  19491800 aagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatattttcactcaccca 19491899  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccct 317  Q
    || ||||||| | ||||||||||||||    
T  19491900 agatgtttacga-tgtttcccaaccct 19491925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 91 - 303
Target Start/End: Original strand, 34254331 - 34254543
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  34254331 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaaagggtta 34254430  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    |||||||||| |||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  34254431 caagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 34254528  T
Q  289 caaggtgtttacaat 303  Q
    |||||||||||||||    
T  34254529 caaggtgtttacaat 34254543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 303
Target Start/End: Original strand, 1345372 - 1345585
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  1345372 tgttgacctagttcggtctaacttgacctactctgggggagagattgaactcttcaatccactatcaatgagttctttcaaagagatacatatgggttac 1345471  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  1345472 aagaaattagcttcaataaactcacaaagaacaaccctaatttctacacattttcccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgattttcactcaccc 1345571  T
Q  290 aaggtgtttacaat 303  Q
    ||||||||||||||    
T  1345572 aaggtgtttacaat 1345585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 97 - 316
Target Start/End: Original strand, 1292471 - 1292689
Alignment:
Q  97 cccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1292471 cccagttcggtccaacttgacctactctgg-ggagagatttatttctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaa 1292569  T
Q  197 ttagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtg 295  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  1292570 ttagcttcaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctacccattttctcaatctcaccaaagaacaagacactcaataattttcactcacccaaggtg 1292669  T
Q  296 tttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    || || | |||||||||||||    
T  1292670 ttcac-agtgtttcccaaccc 1292689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 99 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 30291767 - 30291547
Alignment:
Q  99 cagttcggtccaacttgacctactctggagg-agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaat 197  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  30291767 cagttcggtccaacttggcataatctggagggagagattgatctctccaatccactatcaaagaattcttacaaagtgatacaaatgagttacaagaaat 30291668  T
Q  198 tagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtg 295  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  30291667 tagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcaatcacccaaggtg 30291568  T
Q  296 tttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  30291567 tttacaaatgtttcccaaccc 30291547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31218425 - 31218199
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  31218425 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggtta 31218326  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 287  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  31218325 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 31218227  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31218226 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 31218199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6599139 - 6598914
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  6599139 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagtatacaaatgggttac 6599040  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacac-tcatgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| | |    
T  6599039 aagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaacttaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacacttaatgattttcactcactc 6598940  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6598939 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 6598914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6674592 - 6674367
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  6674592 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagtatacaaatgggttac 6674493  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacac-tcatgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| | |    
T  6674492 aagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaacttaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacacttaatgattttcactcactc 6674393  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6674392 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 6674367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 91 - 303
Target Start/End: Original strand, 34256507 - 34256719
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  34256507 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 34256606  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    |||||||||| |||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |    
T  34256607 caagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcacac-ac 34256704  T
Q  289 caaggtgtttacaat 303  Q
    |||||||||||||||    
T  34256705 caaggtgtttacaat 34256719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 91 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 9765911 - 9765690
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9765911 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagc-agctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 9765813  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||    
T  9765812 aagaaattagctttgccaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc---aatttcactcaccca 9765716  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccct 317  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  9765715 aggtgtttacaa-tgtttcccaaccct 9765690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 12702635 - 12702864
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  12702635 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccaatatcaatgagttcttacaaagagacacaaaagggttac 12702734  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctaccc-----attttcccaatctcaccaatgaacaagacac-tcatgattttcact 284  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  12702735 aagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacacttaatgattttcact 12702834  T
Q  285 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12702835 c-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 12702864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 44304023 - 44303796
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||    
T  44304023 tgttcacctagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaaaggatta 44303924  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctaccc--attttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactct 286  Q
    ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  44303923 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccttaatttctaccctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc- 44303825  T
Q  287 cccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44303824 accaaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 44303796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 313
Target Start/End: Original strand, 41366622 - 41366837
Alignment:
Q  97 cccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  41366622 cccagttcggtccaacttgacctaatctag-ggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagggatacaaataggttaaaagaaa 41366720  T
Q  197 ttagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtg 295  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  41366721 ttagcttaaacaagcttacaaagaacaaacataatttctacccattttctcaatctcagtcttgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtg 41366820  T
Q  296 tttacaattgtttcccaa 313  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  41366821 tttacaa-tgtttcccaa 41366837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 91 - 315
Target Start/End: Original strand, 1746219 - 1746443
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  1746219 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagggtta 1746317  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 287  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||   ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  1746318 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctttttttttcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 1746416  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaacc 315  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1746417 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaacc 1746443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 91 - 312
Target Start/End: Original strand, 8965692 - 8965914
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||     
T  8965692 tgtttacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagatttatctctccgatgcactatcaatgagttcttacaaagagatataaaagggttat 8965791  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    ||||||||| ||||||||| | || ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  8965792 aagaaattaacttcaacaaactcataaagaacaaaccctaatttcta-cctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 8965890  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttccca 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  8965891 caaggtgtttacaaatgtttccca 8965914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 19945359 - 19945586
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaataggtt 188  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||    
T  19945359 tgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctcgaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagtggtt 19945458  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactct 286  Q
    |||||||||||||||  |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  19945459 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccataatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc- 19945557  T
Q  287 cccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
     ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19945558 accaaggtgtttacaa-tgtttcccgaccc 19945586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4162663 - 4162442
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  4162663 tgtttacccaattcggtccaacttgacctactcttggggagagattgatatctccaatcc-ctatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttac 4162565  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  4162564 aagaaattagcttcaacaagttctcaaagaacaaacctaacttctacccattttcc---tctcactaatgaacaagacactcaatgattttcactcgctc 4162468  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  4162467 aaggtgtttacaa-tgttttccaaccc 4162442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 4743215 - 4743429
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          | ||||||    
T  4743215 tgttgacccagttcggtccaacttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa----------tgggttac 4743304  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  4743305 aagattttagcttcaacaaacacacaaagaacaaacctaatt-ctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcgctcaccc 4743403  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4743404 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 4743429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 96 - 316
Target Start/End: Original strand, 18106087 - 18106304
Alignment:
Q  96 acccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  18106087 acccagttcggtccaacttgacctattctgg-ggagagattgatctctccaaac-actatcaatgagttcttacaaa-agatacaaatgagttacaagaa 18106183  T
Q  196 attagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggt 294  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||  || |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||    
T  18106184 attagcttcaacaagctcgcaaagaacaactatagtttctatccatttttccaatctcaccgatgaacaagacactcaacaattttcactcacccaaggt 18106283  T
Q  295 gtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  18106284 gtttacaa-tgtttcccaaccc 18106304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 98 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 3772352 - 3772164
Alignment:
Q  98 ccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaat 197  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  3772352 ccagtttggtccaacttgacctactctgagagatagattgatctctccaatccactatcaataaattcttacaaagatatacaaatgagttacaagaaat 3772253  T
Q  198 tagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactc 285  Q
    |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3772252 tagcttaaataagctcacaaagaacaaacctaatttctatcaattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatcattttcactc 3772164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 93 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 2627902 - 2627735
Alignment:
Q  93 ttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttaca-aagagatacaaatag-gtta 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||     
T  2627902 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacacaagagatacaaaaagagttg 2627803  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    ||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2627802 caagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 2627735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 8153914 - 8153703
Alignment:
Q  102 ttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| ||| |||||    
T  8153914 ttcggtccaacttgacctactctgaggaagagattgatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagatatacaaaagagttacacgaatttagc 8153815  T
Q  202 ttcaac-aagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc---atgattttcactctcccaaggtgtt 297  Q
    |||||| |||| || |      |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |   |||||||||||||  |||||||||     
T  8153814 ttcaacaaagctcaga------aaccctaatttcta-ccattttctcaatctcaccaatgaacatgacacactcaatgattttcactcatccaaggtgta 8153722  T
Q  298 tacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  8153721 tacaaatgtttcccaaccc 8153703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 96 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10015241 - 10015119
Alignment:
Q  96 acccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||    
T  10015241 acccagttcggtccaacttgacctactatggag-agagatttatctctccaatccactatcaatgagttccta-aaagagatacaaatgagttacaagaa 10015144  T
Q  196 attagcttcaacaagcacacaaaga 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10015143 attagcttcaacaagcacacaaaga 10015119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 139 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10929907 - 10929753
Alignment:
Q  139 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacc 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  10929907 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagag-----------ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacataatttctacc 10929819  T
Q  239 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaat 303  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  10929818 cattttccatatctcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactaatccaaggtgtttacaat 10929753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 25690122 - 25689955
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  25690122 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 25690024  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||||  |||||  ||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25690023 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cctttttcccaatctcaccaa 25689955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 169 - 316
Target Start/End: Original strand, 41364926 - 41365073
Alignment:
Q  169 caaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagac 268  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    ||||||||||    
T  41364926 caaagggatacaaatgtgttacaagaaattagcttaaacaaactcacaaagaacaaacctaatttctaccaattttcccaatctcagtcttgaacaagac 41365025  T
Q  269 actc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41365026 actcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 41365073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 3439671 - 3439504
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 188  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  3439671 tgttcatccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 3439573  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||||   ||||  || || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3439572 acaagaaattagctt-gccaagttcataatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 3439504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 91 - 198
Target Start/End: Original strand, 3073875 - 3073981
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  3073875 tgtttacccagttcggcccaacttgacctactatgg-ggagagattgatctctccaagccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaaaatgttac 3073973  T
Q  191 aagaaatt 198  Q
    ||||||||    
T  3073974 aagaaatt 3073981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 4733873 - 4733784
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataca 180  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4733873 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagataca 4733784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 98 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7597776 - 7597648
Alignment:
Q  98 ccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaataggttacaagaa 195  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||  | ||| |||||    
T  7597776 ccagttcggtctaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgcattctttacaaagagatacaaaaggattataagaa 7597677  T
Q  196 attagcttcaacaagcacacaaagaacaa 224  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||    
T  7597676 attagcttcaacaagctctccaagaacaa 7597648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 1822423 - 1822282
Alignment:
Q  128 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aac 225  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| || ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  1822423 ggagagattgatctctccaattcactattagtgagttatttacaaatagatataaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaac 1822324  T
Q  226 cctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagac 268  Q
    | ||||||||| || ||||  ||||||| | ||||||||||||    
T  1822323 cataatttctatcc-tttttgcaatctctcaaatgaacaagac 1822282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 1856868 - 1856727
Alignment:
Q  128 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aac 225  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| || ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  1856868 ggagagattgatctctccaattcactattagtgagttatttacaaatagatataaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaac 1856769  T
Q  226 cctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagac 268  Q
    | ||||||||| || ||||  ||||||| | ||||||||||||    
T  1856768 cataatttctatcc-tttttgcaatctctcaaatgaacaagac 1856727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 224
Target Start/End: Original strand, 11712024 - 11712135
Alignment:
Q  114 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagca 212  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||     
T  11712024 tgacctactttgagggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttatttacaaagagatataaaagggtttcaagaaattagcttcaacaagct 11712123  T
Q  213 cacaaagaacaa 224  Q
    | ||| ||||||    
T  11712124 ctcaaggaacaa 11712135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 208
Target Start/End: Original strand, 32902197 - 32902292
Alignment:
Q  114 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaaca 208  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  32902197 tgacctactcagggggagagattgatctctcaaattcactatcaatgaattctttagaaagagatacaaaaaagttacaagaaattagcttcaaca 32902292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Original strand, 42575327 - 42575494
Alignment:
Q  94 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| || ||||||    
T  42575327 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 42575425  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||| |  | |  ||| | |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42575426 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaatccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 42575494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15290688 - 15290522
Alignment:
Q  95 cacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaataggttac 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| || |||||||    
T  15290688 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttac 15290590  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    ||||||||||||| |  | |  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15290589 aagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 15290522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15471057 - 15470891
Alignment:
Q  95 cacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaataggttac 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| || |||||||    
T  15471057 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttac 15470959  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    ||||||||||||| |  | |  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15470958 aagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 15470891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 29796320 - 29796549
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag--ttcttacaaagagatacaaataggt 187  Q
    |||| ||| |||||||||||||  ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  || ||||||| || |||||| | ||    
T  29796320 tgtttaccaagttcggtccaacaatgacctacattgggggagagattgatctctccaatccattataaatgagtttttttacaaataggtacaaaaatgt 29796419  T
Q  188 tacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaatgaacaagacactc-atgattttcact 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||  | | |||||| |||| | |||||||| | |||||||||||||  |  | |||||||| |||| ||||  ||||||    
T  29796420 tacaagaaatcagcttcaacaagttctccaagaacaaaccttgatttctactc-ttttcccaatctcttctcaagaacaagagactcaatga-attcact 29796517  T
Q  285 ctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    | |||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  29796518 cgcccaagatatttacaaatgtttcccaaccc 29796549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 10240264 - 10240061
Alignment:
Q  149 ccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcc 246  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||  | || |||    
T  10240264 ccactatcaatgagttctttacaaagagatccaacatggttacaagaaattagattcaacaagctcacaaagaacaaacccaaatttcta-tctttgtcc 10240166  T
Q  247 caatct-caccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgttt-acaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaa 344  Q
    |||||| | || | |||||||| ||||  || |||| ||| || ||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  10240165 caatctcctcccaagaacaagagactc--ga-tttcgctcacctaagatgtttctcaattgtttcccaaatctagaatctaacc--ccaaagagaaccaa 10240071  T
Q  345 cccttagcct 354  Q
    | ||||||||    
T  10240070 ctcttagcct 10240061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30909487 - 30909389
Alignment:
Q  138 atctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctac 237  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||| | | ||||  || ||||||||||||    
T  30909487 atctctccaattcactatcaacgagtcattacaaagagatacaaaga-gttacaagaaattagtttaaacaagctctccaagagtaaacctaatttctac 30909389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 237
Target Start/End: Original strand, 3231859 - 3231944
Alignment:
Q  154 atcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctac 237  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||    
T  3231859 atcaataagttctttacaaagagatacaaaatggttaaaaaaaattagcttcaacaagctcacgaagaacaaagcctaatttctac 3231944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11137146 - 11137073
Alignment:
Q  141 tctccaatccactatcaatgagttctt----acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaag 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11137146 tctccaattcactatcaatgagtttttttttacaaagagatacaaaacggttataagaaattagcttcaacaag 11137073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 38864000 - 38863949
Alignment:
Q  116 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt 167  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38864000 acctactatgcaggggagattgatctctccaatccactatcaacgagttctt 38863949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9054861 - 9054788
Alignment:
Q  170 aaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccatttt 244  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  | |||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  9054861 aaagtgatacaaagtggttacaagaaattagctt--aaaagcgcacaaagaacaaaatctaatttctacccatttt 9054788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 93)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 54883187 - 54882921
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54883187 tgttgacccagttcggtccaacttgacttaatctggaggagagattgatccctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 54883088  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54883087 aagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 54882988  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54882987 aggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 54882921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 91 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 40632612 - 40632353
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40632612 tgtttacccagttcggtccaacttgacttactttagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 40632513  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40632512 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 40632413  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaaccctta 350  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40632412 aggtgtttacaattgtttctcaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccctta 40632353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 2209882 - 2209614
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-taggtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  2209882 tgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggtt 2209783  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcc 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2209782 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaaaaaccctaatttctacccattttcccaatctcaacaatgaacaagacactcatgattttcactctcc 2209683  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2209682 caaggtgtttacaattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccatagcctttg 2209614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Original strand, 50673848 - 50674113
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  50673848 tgttcacctagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttac 50673947  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50673948 aagaaattagcttcaacaagctcacaaag-acaatcctaatttctactcattttctcaatctcacaaatgaacacgacactcatgattttcactctccca 50674046  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50674047 aggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 50674113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 94 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 41964580 - 41964316
Alignment:
Q  94 tcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaataggttacaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  41964580 tcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaaatgggttacaa 41964481  T
Q  193 gaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatg-attttcactctcccaa 291  Q
     |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  41964480 taaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatttcaccaacgaacaagacactcatgaattttcactttcccaa 41964381  T
Q  292 ggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41964380 ggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaaccc-caaaagagaaccaacccttagcctttg 41964316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 12073560 - 12073293
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  12073560 tgttcacctagttcggtccaacaatgacctactctggaagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 12073461  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccc 289  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  12073460 caataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcaccaataagcaagacactcatgattttcacactccc 12073361  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  12073360 aaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcatttg 12073293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6656123 - 6655857
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  6656123 tgttcacccaattcggtccaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttac 6656024  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6656023 aagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccttaatttctacccattttttcaatctcacaagtgaacaagacactcatgattttcactctccca 6655924  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6655923 aggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaaccccaaaaagagaaacaacctttagcctttg 6655857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 95 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8665571 - 8665320
Alignment:
Q  95 cacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaaga 194  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8665571 cacctagtttggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaaga 8665472  T
Q  195 aattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatg-attttcactctcccaagg 293  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8665471 aattagcttcaacaagctctcaaagaacaaccctaatttctacccattttcccattctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactcttccaagg 8665372  T
Q  294 tgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaac 345  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  8665371 tgtttacaattgtttcccaactccagaatctaacccccaaaagaaaaccaac 8665320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 46703669 - 46703400
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-taggtt 188  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  46703669 tgttcacccaattcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggtt 46703570  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatg-attttcactctc 287  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46703569 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactctc 46703470  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  46703469 ccaaggtgtttacaattgtttcccaacactataatctaacccccaaaagagaaccaacttttagcctttg 46703400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 91 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 41639593 - 41639345
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  41639593 tgttcactcagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcgatgagttcttacaaatagatacaaatgggttac 41639494  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  41639493 aagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaataaacaagacactcgtgattttcactctccta 41639394  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagaga 339  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  41639393 aggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagaga 41639345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 379548 - 379279
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  379548 tgttcatccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaattagttcttacaaagcgatacaaatgggtta 379449  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcat--gattttcactctc 287  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||   ||||||||||||    
T  379448 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagatactaattgaattttcactctc 379349  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  379348 ccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccacaaaagagaaccaacccttagcctttg 379279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 99 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 35662600 - 35662346
Alignment:
Q  99 cagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaatt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  35662600 cagttcggtccaacttgacctactcttgaggagatattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaatt 35662501  T
Q  199 agcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatga-ttttcactctcccaaggtgtt 297  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  35662500 agcttcaacaaactcataaagaacaaccctaatttctacccattttttcaatctcaccaatgaacaagacactcatgatttttcacactctcaaggtgtt 35662401  T
Q  298 tacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagc 352  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  35662400 tacaattgtttcccaactctagaatctaacacccaaaagagaaccaacccttagc 35662346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 99 - 357
Target Start/End: Original strand, 27416974 - 27417228
Alignment:
Q  99 cagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaatt 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27416974 cagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaagaaatt 27417073  T
Q  199 agcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgttt 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  27417074 agcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacacattttaccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccc----tgttt 27417169  T
Q  299 acaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||  ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  27417170 acaattgtttcaaaactcaagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagtctttg 27417228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Original strand, 50262701 - 50262965
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50262701 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatatctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 50262800  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccc 289  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50262801 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccgtaatttcgatccattttcccaatct---caataaacaagacactcatgattttcactctccc 50262897  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  50262898 aaggtatttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattagcctttg 50262965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 91 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8648306 - 8648051
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  8648306 tgttcacccagtttggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccaatatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttat 8648207  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatg-attttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  8648206 aagaaattagcttcaacaaactcacaatgaacaaccctaatttctatccattttcccattctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactcttcc 8648107  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaac 345  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  8648106 aaggtgtttacagttgtttcctaactccagaatctaacccccaaaagagaaccaac 8648051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 26175637 - 26175862
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26175637 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 26175736  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  26175737 aagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctccccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 26175836  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  26175837 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 26175862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 56178637 - 56178862
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  56178637 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 56178736  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  56178737 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 56178835  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  56178836 caaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 56178862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5429846 - 5429621
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  5429846 tgttgacccagttcggtccaacttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatacaaatgggttac 5429747  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  5429746 aagaaattagcttcaacaagctcacgaagaataaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 5429647  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5429646 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 5429621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 99 - 316
Target Start/End: Original strand, 9927467 - 9927683
Alignment:
Q  99 cagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaatt 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9927467 cagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaatt 9927566  T
Q  199 agcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtt 297  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  9927567 agcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataagacactcagtgattttcactc-accaaggtgtt 9927665  T
Q  298 tacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  9927666 tacaa-tgtttcccaaccc 9927683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 91 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 36994691 - 36994478
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  36994691 tgttgacccagttcggtccaacttgatctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttac 36994592  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  36994591 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 36994492  T
Q  290 aaggtgtttacaat 303  Q
    ||||||||||||||    
T  36994491 aaggtgtttacaat 36994478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 52095363 - 52095588
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtcc-aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  52095363 tgttcacccagttcggtccaaacttg-cctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaaagatttcttacaaagagatacaaatgggtta 52095461  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  52095462 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 52095561  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  52095562 caaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 52095588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 91 - 314
Target Start/End: Original strand, 36463390 - 36463613
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36463390 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactgtcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttac 36463489  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  36463490 aagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacagccctaatttctatccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgaatttcactcaccc 36463589  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaac 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  36463590 aaggtgtttacaa-tgtttcccaac 36463613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 91 - 318
Target Start/End: Original strand, 48893639 - 48893870
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  48893639 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagttac 48893738  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaa----gaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactc 285  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48893739 aagaaattagcttcaacaagctcacaaacaatgaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 48893838  T
Q  286 tcccaaggtgtttacaattgtttcccaacccta 318  Q
     |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  48893839 acccaaggtgtttacaa-tgtttccaaacccta 48893870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 34570415 - 34570640
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  34570415 tgttgacccagttcgatccaacttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaattgggttac 34570514  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  34570515 aagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 34570614  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  34570615 aagatgttttcaa-tgtttcccaaccc 34570640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 47038412 - 47038635
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||    
T  47038412 tgttgacccagttcggtccaacttgacttactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtccttacaaacagatacaaat-gattac 47038510  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  47038511 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt-ccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 47038609  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||| || |||||||||||||    
T  47038610 aaggtgtttataa-tgtttcccaaccc 47038635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 54199908 - 54200132
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54199908 tgttgacccagttcg-tccaacttgacctaatctgggggagagaatgatctctctaattcactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 54200006  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  54200007 aagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 54200106  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    || |||||||||| |||||||||||||    
T  54200107 aatgtgtttacaa-tgtttcccaaccc 54200132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48143211 - 48142984
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||    
T  48143211 tgttcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttatgaagagatacaaaagggtta 48143112  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 287  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  48143111 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcac 48143012  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48143011 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 48142984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 12739551 - 12739776
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  12739551 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcatacaaatagatacaaatgggttac 12739650  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    |||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||     
T  12739651 aagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttccactcacct 12739750  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12739751 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 12739776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 99 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 37740784 - 37740568
Alignment:
Q  99 cagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaatt 198  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37740784 cagttcggtccaacttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaatt 37740685  T
Q  199 agcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtt 297  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  37740684 agcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactc-accaaggtgtt 37740586  T
Q  298 tacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  37740585 tacaa-tgtttcccaaccc 37740568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 52467355 - 52467581
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  52467355 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaaaaagttattacaaagtgatacaaatgggttac 52467454  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  52467455 aagatattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaacctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 52467554  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  52467555 aaggtgtttacaaatgtttcccaaccc 52467581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 91 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12119707 - 12119445
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggtt 188  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  12119707 tgttcacctagttcggtccaacaatgacctactcttg-ggagagattgatctctccaatccactataaatgagttctttacaaagagatacaaaagggtt 12119609  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccc-taatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcat-gattttcactct 286  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| || |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12119608 acaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaacaaaccataatttctactcttttttccaatctcacctatgaacaagacactcattgattttcactct 12119509  T
Q  287 cccaaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaaccctta 350  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12119508 cccaaggtatttacaattgtttcccaactctataatctaacccccaaaagagaaccaaccctta 12119445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5871987 - 5871762
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||| ||||||    
T  5871987 tgttgacccagttcggtcaaacttgacctaatctgggggagagattgatctctctaatccactatcaaagagttcttgcaaagtgataaaaatgggttac 5871888  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  5871887 aagaaatttgcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 5871788  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5871787 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 5871762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 91 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 31474318 - 31474096
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  31474318 tgtttacccagttcggtccaacttgatctactctggtggagagatttatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttac 31474219  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  31474218 aagaaattagcttcaacaaactcaaaaagaacaagacctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 31474119  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttccca 312  Q
    ||| |||||||||| |||||||||    
T  31474118 caaagtgtttacaa-tgtttccca 31474096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 26364403 - 26364223
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  26364403 tgttgacccagttcagtcaaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactattaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttac 26364304  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacact 271  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26364303 aagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacact 26364223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 29254661 - 29254436
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  29254661 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggagagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagacacaaatgggttgc 29254562  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||    
T  29254561 aagaaattaacttcaacaagctcataaaaaacaactctaatttctacccaatttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcattcaccc 29254462  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    || |||||||||| |||||||||||||    
T  29254461 aatgtgtttacaa-tgtttcccaaccc 29254436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 37229722 - 37229949
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaata-ggtta 189  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  37229722 tgtttacctagttcggtccaacttgacctactatgagggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatataaaaagggtta 37229821  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaaca-accctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctc 287  Q
    ||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  37229822 caacaaatttgctttaacaagctcacaaagaacacaccctaatttcta-ccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcattgattttcactcac 37229920  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  37229921 ccaaggtgtttacaaatgttttccaaccc 37229949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 102 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 21688405 - 21688186
Alignment:
Q  102 ttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagc 201  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| |||||||     
T  21688405 ttcggtctaacttgacctaatctaggggagggattgatctctccaattcattatcaatgagttcttccgaagagatacaaatgagttacaaaaaattagt 21688306  T
Q  202 ttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctaccca-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttac 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  21688305 ttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttctcaatctcaccgatgaacaagacactcatgattttcactcccccaaggtgtttag 21688206  T
Q  301 aattgtttcccaaccctaga 320  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  21688205 aattgtttcccaactctaga 21688186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 6542180 - 6542407
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | | ||    
T  6542180 tgtttacccagttcggtccaacttgacctaccctgggggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaaaggctaac 6542279  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 287  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  6542280 aagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaatcctaatttctaccattttttcccaatctccccaatgaacaagacactcaataattttcactcac 6542379  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6542380 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 6542407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 130 - 313
Target Start/End: Original strand, 12745476 - 12745659
Alignment:
Q  130 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaacccta 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||||    
T  12745476 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaacaacccta 12745575  T
Q  230 atttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 313  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  12745576 atttctacccattttcctaatctcgccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac-attgtttcccaa 12745659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 29999806 - 30000031
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   |||    
T  29999806 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaaagatacaaaagagtt 29999905  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 287  Q
    |||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||      
T  29999906 acaagaaattagctttgacatgttcacaaagaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaacgattttcactc-a 30000003  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  30000004 ccaaggtgtttacaa-tgtttccaaaccc 30000031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4588126 - 4587900
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  4588126 tgtttacccagtttggtccaacttcacctattatgggggagagattgttctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttac 4588027  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| || | |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  4588026 aagaaattagcttcaacaagcttacaaagaacaaatcttaatttctaccttttttcccaatttcaccaatgaacatgacactcaatgattttcactcacc 4587927  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  4587926 caaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 4587900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 91 - 269
Target Start/End: Original strand, 46147392 - 46147570
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  46147392 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatgtctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagttac 46147491  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 269  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  46147492 aagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccgatgaacaagaca 46147570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 128 - 316
Target Start/End: Original strand, 12747794 - 12747982
Alignment:
Q  128 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  12747794 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcatacaaatagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccc 12747893  T
Q  228 taatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12747894 taatttctatccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttccactcacctaaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 12747982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 132 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24969238 - 24969053
Alignment:
Q  132 agattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaat 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  24969238 agatttatctctccaatccactatcaattagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaatctaat 24969139  T
Q  232 ttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24969138 ttctacccatttttccaatctcaccaaagaacaagactctcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaaccc 24969053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 91 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 3913614 - 3913408
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| |||||||||| | |||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  3913614 tgttgacccagttcgatacaactttacatactctag-ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagatatacaaatgggttaa 3913516  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  3913515 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacagctctaatttctactcattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 3913416  T
Q  290 aaggtgtt 297  Q
    ||||||||    
T  3913415 aaggtgtt 3913408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 45687183 - 45687409
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||     
T  45687183 tgttgacccagttcggtccaacttgacataatatggaggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatacaaatgagttat 45687282  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  | |||||||| ||    
T  45687283 aagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttcttcccattttcccaatctcaccaatgaacaagacaatcaaaaaatttcactcacc 45687382  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  45687383 caaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 45687409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 167 - 357
Target Start/End: Original strand, 55085442 - 55085632
Alignment:
Q  167 tacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaag 266  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  55085442 tacaaagagatacaaatggtttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacctattttcc-aatctcaccaatgaacaag 55085540  T
Q  267 acactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  55085541 acagtcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaattgtttccgaactctagaatctaacccccaaaggagaatcaacccttagcctttg 55085632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 91 - 312
Target Start/End: Original strand, 5370083 - 5370308
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  5370083 tgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctagtccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 5370182  T
Q  190 caagaaattagc-ttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacc---cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcact 284  Q
    |||||||||||| ||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5370183 caagaaattagcttttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctcttttttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 5370282  T
Q  285 ctcccaaggtgtttacaattgtttccca 312  Q
    |  |||| |||||||||| |||||||||    
T  5370283 c-accaaagtgtttacaa-tgtttccca 5370308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 110 - 316
Target Start/End: Original strand, 52082684 - 52082883
Alignment:
Q  110 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||    
T  52082684 aacttgacctactctggaggagagaatgatctc-------cactatcaaagatttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaa 52082776  T
Q  210 gcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgttt 308  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  52082777 gttcacaaagaacaaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacagtcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaa-tgttt 52082875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 91 - 245
Target Start/End: Original strand, 12743926 - 12744080
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12743926 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 12744025  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttc 245  Q
    |||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12744026 aagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctattttc 12744080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 91 - 245
Target Start/End: Original strand, 12745315 - 12745469
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12745315 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 12745414  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttc 245  Q
    |||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12745415 aagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctattttc 12745469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 96 - 357
Target Start/End: Original strand, 26699447 - 26699713
Alignment:
Q  96 acccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaag 193  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||    
T  26699447 acccagttcggtccaacaatgacctactctgggatagagattgatctctccaatccattataaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaag 26699546  T
Q  194 aaattagcttcaacaagcacacaaagaacaa-ccctaatttctacccatt-ttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctccca 290  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||| || |||  |||||| | ||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  26699547 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatctataccctttcttctgaatctctctaataaacaagacattcaatgattttcactcaccca 26699646  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    | ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26699647 aagtgtttacaattgtttcccaactttataatctaacccctaaaagagaaccaacctttaacctttg 26699713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 91 - 313
Target Start/End: Original strand, 5207843 - 5208066
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |  |||| |    
T  5207843 tgtttacccaattcagtccaaattgacctactctgggagagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatatacaagggttgc 5207942  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacact-catgattttcactctcc 288  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||    
T  5207943 aataaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaaccctaatttctaccc-tttttccaatcactccaatgaacaagtcactaaatgattttcactcacc 5208041  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaa 313  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  5208042 caaggtgtttacaaatgtttcccaa 5208066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 13992293 - 13992511
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||    
T  13992293 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aagagatacaaaagagtta 13992391  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 287  Q
    ||||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||| |||||||||||||      
T  13992392 caagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactc-a 13992483  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13992484 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 13992511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 51337231 - 51337006
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||     
T  51337231 tgtttacccagttcggtccaacttgacctaatgtgtgggagagattgatctctctaatacactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaaagggttat 51337132  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaa--ccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 287  Q
    || |||||| |||  | |||| ||||||||||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  51337131 aataaattatctt--aaaagctcacaaagaacaaatccgtaatttctaccctttttctcaatctcaccaatgaacaggacactcaatgattttcactcac 51337034  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  51337033 ccaaggtgtttacaa-tgttttccaaccc 51337006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 170 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 41639351 - 41639207
Alignment:
Q  170 aaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 269  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  41639351 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagtttacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaataaacaagaca 41639252  T
Q  270 ctcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaac 314  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  41639251 ctcgtgattttcactctcctaaggtgtttacaattgttacccaac 41639207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 99 - 316
Target Start/End: Original strand, 13009453 - 13009657
Alignment:
Q  99 cagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaatt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||      
T  13009453 cagttcggtctaacttgacctaatttggaggagagatcgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgttttacaagaaa-- 13009550  T
Q  199 agcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtt 297  Q
               || ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  13009551 -----------gctcacgaagaacaaacctaatttctacccattttcacaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtt 13009639  T
Q  298 tacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  13009640 tacaa-tgtttcccaaccc 13009657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Original strand, 31495316 - 31495485
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatag-gt 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  31495316 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatcaactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagt 31495415  T
Q  188 tacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    ||||||||||||| ||  |||||  ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31495416 tacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaatcctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 31495485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Original strand, 12744087 - 12744195
Alignment:
Q  130 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaacccta 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||    
T  12744087 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaacccta 12744186  T
Q  230 atttctacc 238  Q
    |||||||||    
T  12744187 atttctacc 12744195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 116 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 33090021 - 33089788
Alignment:
Q  116 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcaca 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||| |     
T  33090021 acctactctagaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttctttacagagagatacaaaatggttataataaattagcttcaacaagctct 33089922  T
Q  215 caaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccca 312  Q
    | |||||||| | |||||||||  || | || |||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||          |||||||||    
T  33089921 ccaagaacaaacataatttctattca-tctctcaatctcttcccatgaacaagacactcaatgattttcactcttccaagg----------tgtttccca 33089833  T
Q  313 accctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    || ||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  33089832 actctataatctaacctccaaaagagaaccaacctttagcctttg 33089788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8393562 - 8393394
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaataggt 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  8393562 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggt 8393464  T
Q  188 tacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    ||||||||||||||||  ||| |  ||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8393463 tacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 8393394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8395771 - 8395603
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaataggt 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  8395771 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggt 8395673  T
Q  188 tacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    ||||||||||||||||  ||| |  ||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8395672 tacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 8395603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29056518 - 29056301
Alignment:
Q  99 cagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaat 197  Q
    |||||||||| || | ||||||| ||||  ||||||| | |||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||  | || ||||||||    
T  29056518 cagttcggtcaaaatggacctacactgggtgagagataggtctctctaatccattatcaatgaggttgttacaaagagatataaaaggattgcaagaaat 29056419  T
Q  198 tagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtg 295  Q
    ||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29056418 tagttctaacaagcacacaaagaacaaactctaattccta-ccattttcccaatctctctaatgaacaaaacactcaatgatttttactcacccaaggtg 29056320  T
Q  296 tttacaattgtttcccaac 314  Q
    ||| ||| |||||||||||    
T  29056319 tttccaaatgtttcccaac 29056301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 314
Target Start/End: Original strand, 48142393 - 48142603
Alignment:
Q  107 tccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat--caatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagctt 203  Q
    ||||| |||||||||| | | |||||||||||||| || |||| |||||  |||||||||||| ||||||||||| | |  |||||||||||| ||||||    
T  48142393 tccaaattgacctactgtag-ggagagattgatctttcaaatctactatatcaatgagttctttacaaagagatatacaagggttacaagaaactagctt 48142491  T
Q  204 caacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttaca 301  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||| |    
T  48142492 caacaagctcacaaagaacaaaccctaatttcta-tcatgttcccaatctcatcaatgggcaagacactcaatgattttcactcacccgaagtgtttaaa 48142590  T
Q  302 attgtttcccaac 314  Q
    | |||||||||||    
T  48142591 aatgtttcccaac 48142603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 33989989 - 33989762
Alignment:
Q  114 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagca 212  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |     
T  33989989 tgacctactctggtggagagattgatctctccaatccactattaacgagttatttacaaagagatacaaaaggattacaagaaattagcttcaacaaact 33989890  T
Q  213 cacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccc 311  Q
    | | |||||||| |||| ||||| |||                  |||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  33989889 ctctaagaacaaacctagtttcttccc------------------atgaacaaaacactcaataatttttactcaaccaaggtgtttacagttgtttccc 33989808  T
Q  312 aaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||    
T  33989807 aactctagaatctaacctccaaaagagaacaaatccttagcctttg 33989762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 98 - 357
Target Start/End: Original strand, 22882759 - 22883021
Alignment:
Q  98 ccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaa 195  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| || |||||  ||||| |||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||    
T  22882759 ccagttcggtccaacaatgacctactccgggggaga--ttgatttctctaatccactaccaatgagttctttacgaagagatacaaaagggttacaagaa 22882856  T
Q  196 attagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaagg 293  Q
    |||||||||||||| | | | |||||||| |||||||| || |||||||  |||||||   | ||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| |    
T  22882857 attagcttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttttatccatttt-tcaatctctttccatgaacaaggcactcaatgattttcactttctcaaag 22882955  T
Q  294 tgtttac-aattgtttcccaaccctagaatctaa-cccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
     |||  | |||||||| ||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22882956 cgttacctaattgttttccaattctagaatctaaccccccaaaagagaaccaaccattatcctttg 22883021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 98 - 357
Target Start/End: Original strand, 22934423 - 22934685
Alignment:
Q  98 ccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaa 195  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| || |||||  ||||| |||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||    
T  22934423 ccagttcggtccaacaatgacctactccgggggaga--ttgatttctctaatccactaccaatgagttctttacgaagagatacaaaagggttacaagaa 22934520  T
Q  196 attagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaagg 293  Q
    |||||||||||||| | | | |||||||| |||||||| || |||||||  |||||||   | ||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| |    
T  22934521 attagcttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttttatccatttt-tcaatctctttccatgaacaaggcactcaatgattttcactttctcaaag 22934619  T
Q  294 tgtttac-aattgtttcccaaccctagaatctaa-cccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
     |||  | |||||||| ||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22934620 cgttacctaattgttttccaattctagaatctaaccccccaaaagagaaccaaccattatcctttg 22934685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 128 - 357
Target Start/End: Original strand, 35369483 - 35369708
Alignment:
Q  128 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaacc 226  Q
    |||||||| || |||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |     |||  |||||||||| |||| ||||| ||| |||||||| |    
T  35369483 ggagagatcgacctcttcaattcaccatcaatgagttctttacaaagagataga-----gttttaagaaattagtttcatcaagctcaccaagaacaaac 35369577  T
Q  227 ctaatttctacccattttcccaatctc-accaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgttt-acaattgtttcccaaccctagaatc 323  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||  ||| ||||    
T  35369578 ctaatttctactca-tttcccaatgtcttgcaatgaacaagacactcaatgattttcactct-acaaggtgtttcccaattgtttcccaattctataatc 35369675  T
Q  324 taacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35369676 caaccc-caaaagagaaccaacccttagcctttg 35369708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 53345340 - 53345189
Alignment:
Q  136 tgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaa-caaccctaattt 233  Q
    ||||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  53345340 tgatccctacaatccaatattaatgagttctttacaaaaagatataaaagggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaatcaaccttaattt 53345241  T
Q  234 ctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactc 285  Q
    |||  ||||||| ||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||    
T  53345240 cta-tcattttctcaatctctccgataaacaagacactcaatgattttcactc 53345189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5136230 - 5136063
Alignment:
Q  94 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| || ||||||    
T  5136230 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 5136132  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||| |  | |  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5136131 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 5136063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5138455 - 5138288
Alignment:
Q  94 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| || ||||||    
T  5138455 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 5138357  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||| |  | |  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5138356 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 5138288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 32091583 - 32091379
Alignment:
Q  154 atcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatc- 251  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||| | | | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||     
T  32091583 atcaatgtgttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagtttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttcta-gcattttcccaatct 32091485  T
Q  252 tcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgttt-acaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaaccctt 349  Q
    || || |||||||||| |||| |||| |||| ||| ||||| ||||||  ||||||||||| |||  |||||||| |||| ||||| ||||||||| |||    
T  32091484 tctcccatgaacaagagactcaatga-tttcgctcacccaatgtgtttctcaattgtttccaaactttagaatcttaccc-caaaaaagaaccaacactt 32091387  T
Q  350 agcctttg 357  Q
     |||||||    
T  32091386 tgcctttg 32091379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 211
Target Start/End: Original strand, 21703836 - 21703957
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaataggtt 188  Q
    |||| ||||||||||||| |||  ||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |    
T  21703836 tgtttacccagttcggtcaaacaatgacctactatgg-ggatagattgatatctccaatccactgtcaatgagttctttacaaaaagatacaaaaagggt 21703934  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagc 211  Q
    ||||||||| | |||||||||||    
T  21703935 acaagaaatcatcttcaacaagc 21703957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 253
Target Start/End: Original strand, 44967829 - 44967992
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaataggtt 188  Q
    |||| |||||| ||||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  44967829 tgtttacccaggtcggtccaacagtgacttattctgggggagagattgatccctctaatctactctcaacgagttttttacaaagagatacaaat-ggtt 44967927  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 253  Q
    |||||||||| |||||| ||||| | | |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44967928 acaagaaattggcttcagcaagctctccaagagcaaaacctaatttcta-ccattttcccaatctc 44967992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5350052 - 5349924
Alignment:
Q  114 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagca 212  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||  | || |||||| |||||||| |||||||||||||||   | |||||| |||||||||| |||||      
T  5350052 tgacctactctgg-ggagaga--gatctctccgcttcattatcaacgagttctttacaaagagatacaaacgagctacaaggaattagcttcgacaagtt 5349956  T
Q  213 cacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 244  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5349955 cacaaagaacaaacctaatttctacccatttt 5349924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 7125070 - 7124901
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatagg 186  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| || |||    
T  7125070 tgttcacccagttcggtctttgcttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagagg 7124972  T
Q  187 ttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||| ||  |||||  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7124971 ttacaagaaattag-tttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 7124901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 52065719 - 52065530
Alignment:
Q  137 gatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaatagg-ttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttc 234  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||  || |||||  ||| ||||||||| |||| | | |||||||||| |||||||    
T  52065719 gatctctccacttcactatcaatgagtttctaacaaagagatacaaaaggggttacagaaaaatagcttcaataagctctctaagaacaacc-taatttc 52065621  T
Q  235 tacccattttcccaatctca-ccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatct 324  Q
    ||||  ||| |||||| ||  ||  ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  52065620 tacctgttt-cccaatatcttccgttgatcaagagactcgatgattttcactcacccaaggggttcacaattgtttcccaacccaagaatct 52065530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6677597 - 6677410
Alignment:
Q  131 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaag--aacaaccc 227  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| || ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | | |||  || || ||    
T  6677597 gagattgatctctcaaatccattatcaaagacttctttacaaagatatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaaaaaaaacc 6677498  T
Q  228 taatttctacccattttcccaatctc-accaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||  || | |||||||| |||||    ||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  6677497 taatttcta-ccatttt-ccaatttcttcccaagaacaagagactcaattatttcactcatccaatgtgtttacaaatgtttcccaaccc 6677410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34112973 - 34112838
Alignment:
Q  102 ttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaatta 199  Q
    |||||||||||  ||||||||| | | |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||| |||||||    
T  34112973 ttcggtccaacaatgacctactataggggagaga--gatctctccacttcactatcaatgagttctttacaaagagatgcaaaagggttacatgaaatta 34112876  T
Q  200 gcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctac 237  Q
    |||||||||||| | |  ||||||| | ||||||||||    
T  34112875 gcttcaacaagctctcctagaacaaacataatttctac 34112838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 300 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 41961368 - 41961311
Alignment:
Q  300 caattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  41961368 caattgtttcccaactctagaatctaaccctcaaaagagaaccaacccttagcttttg 41961311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 7122851 - 7122682
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatagg 186  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| || |||    
T  7122851 tgttcacccagttcggtctttgcttgacctactatggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagagg 7122753  T
Q  187 ttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||| ||  |||||  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7122752 ttacaagaaattag-tttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 7122682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 238
Target Start/End: Original strand, 44570427 - 44570514
Alignment:
Q  152 ctatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacc 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| | | || ||||| | |||||||||||    
T  44570427 ctatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaatgttacaagaaattagtttcaacaagctctccaacaacaaacataatttctacc 44570514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 205
Target Start/End: Original strand, 37754986 - 37755076
Alignment:
Q  116 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttca 205  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  37754986 acctactatgggggagagattgatctcttcaaaccattatcaatgagttttttagaaagagataaaaaaaggttacaagaaattatcttca 37755076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 238
Target Start/End: Original strand, 16422653 - 16422755
Alignment:
Q  137 gatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttct 235  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||| | ||||||||||||||| |||| | |||| ||||| | ||||||||    
T  16422653 gatctctccacttcactatccatgagttcattacaaagatatacaaaagggtttctagaaattagcttcaaaaagctctcaaaaaacaaacataatttct 16422752  T
Q  236 acc 238  Q
    |||    
T  16422753 acc 16422755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 298
Target Start/End: Original strand, 35370449 - 35370557
Alignment:
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||   ||||||||||||||||| || |||||||||||      
T  35370449 aagaaattagtttcatcaagctcaccaagaacaaacctaatttctactca-tttcccaatgtcttgcaatgaacaagacactcaataattttcactctta 35370547  T
Q  289 caaggtgttt 298  Q
    ||||||||||    
T  35370548 caaggtgttt 35370557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 301 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 26364222 - 26364166
Alignment:
Q  301 aattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26364222 aattgtttcccaactctaaaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcatttg 26364166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 166 - 238
Target Start/End: Original strand, 34788851 - 34788923
Alignment:
Q  166 ttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacc 238  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||| | | |||| ||| |||||||||||||    
T  34788851 ttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattaacttcaacaagctctccaagagcaatcctaatttctacc 34788923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 300
Target Start/End: Original strand, 38811191 - 38811399
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggtt 188  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  |||||||||  | ||||||||||||||  || ||||||| |||||||  |||     
T  38811191 tgtttacccagttcggtccaacaatgacctactcttggggagaga--gatctctccgcttcactatcaatgagtcatttacaaaga-atacaaaatggtc 38811287  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcac-caatgaacaagacactca-tgattttcactct 286  Q
    || ||||||||  |||||||| | | | |||||||| | |||||| ||||||||| | |||||||   | |||||||||| ||||| |||||| |||||     
T  38811288 actagaaattaaattcaacaaactctccaagaacaaacttaatttgtacccattt-ctcaatctctttctatgaacaagagactcaatgattt-cactca 38811385  T
Q  287 cccaaggtgtttac 300  Q
    ||||||||||||||    
T  38811386 cccaaggtgtttac 38811399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 24969832 - 24969787
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagatt 136  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  24969832 tgtttacccagttcggtccaacttgacctactctgggggatagatt 24969787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39774329 - 39774254
Alignment:
Q  170 aaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaag-aacaa-ccctaatttctacccattttc 245  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||    
T  39774329 aaagtgatacaaataggttacaagaaattagctt--aaaagctcacaaagaaacaagacctaatttctaccaattttc 39774254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 210
Target Start/End: Original strand, 40975057 - 40975129
Alignment:
Q  138 atctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatag-gttacaagaaattagcttcaacaag 210  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  40975057 atctctctaatctactatcaaagagtcattacaaagagatac-aatagagttaccagaaattaacttcaacaag 40975129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 5396763 - 5396700
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 155  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  5396763 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagaga-gcagctctccaatccactat 5396700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 244
Target Start/End: Original strand, 37781935 - 37782008
Alignment:
Q  170 aaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccatttt 244  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | || | |||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  37781935 aaagtgatacaaagaggttacaagaaattagctt--aaaaactcacaaagaacaaatcttaatttctacccatttt 37782008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 92)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 34491379 - 34491114
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  34491379 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttac 34491280  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||    
T  34491279 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataacacactca-gaatttcactctccca 34491181  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34491180 aggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 34491114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 54593871 - 54593606
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54593871 tgttcacccagtttggtccaacttgacatactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 54593772  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54593771 aataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctgcacattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 54593672  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  54593671 aggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaa-caacccttagcctttg 54593606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 91 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 30236292 - 30236028
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30236292 tgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 30236193  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30236192 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcatcaatgaacaagacactcatgattttcactatccca 30236093  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  30236092 aggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaatcattagcctt 30236028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Original strand, 6095600 - 6095866
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6095600 tgttcacacagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 6095699  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    ||||||||| |||||| |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6095700 aagaaattaacttcaagaagtttacaaagaacaaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaataagacactcatgattttcactctccca 6095799  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6095800 aggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacctttagcatttg 6095866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Original strand, 49199469 - 49199737
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-taggtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  49199469 tgttcacccagttcggtccaaccatgacctagtctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggtt 49199568  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcc 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49199569 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaacgaacaagacactcatgattttcactctcc 49199668  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  49199669 caaagtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccattagcctttg 49199737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 4570120 - 4569852
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  4570120 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 4570021  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  4570020 caagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacc 4569921  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4569920 caaggtgtttacaattgttttccaactctagaatctaaccaccaaaagagaaccaacccttagcctttg 4569852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 91 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 46860642 - 46860382
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  46860642 tgttcatccaattcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgggtta 46860543  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcat--gattttcactctc 287  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  46860542 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcattgaattttcactctc 46860443  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaaccct 348  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46860442 ccaaggtgtttacaattgtttctcaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccct 46860382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 91 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 47304418 - 47304158
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  47304418 tgttgacccagttcggtcaaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacgaagagatacagatgggttac 47304319  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47304318 aagatattaacttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 47304219  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttag 351  Q
     |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47304218 gggtgtttaaaattgttttccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttag 47304158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 91 - 352
Target Start/End: Original strand, 41819523 - 41819786
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-taggtt 188  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  41819523 tgttcacccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatgtctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgggtt 41819621  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatg-attttcactctc 287  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41819622 acaagaaattagcttagacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactctc 41819721  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagc 352  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  41819722 ccaaggtgtttacaattatttcccaactctagaatctaaccgctaaaagagaaccaacccttagc 41819786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 91 - 321
Target Start/End: Original strand, 43401801 - 43402033
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatag-gtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||    
T  43401801 tgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatttctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaaaatgcgtt 43401900  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcc 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43401901 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcc 43402000  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaa 321  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  43402001 caaggtgtttacaatcgtttcccaactctagaa 43402033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 44700480 - 44700705
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44700480 tgttgacctagttcggtccaacttgacctaatgtgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaataggttac 44700578  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  44700579 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 44700678  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  44700679 aaggtgtttacaaatgtttcccaaccc 44700705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 91 - 314
Target Start/End: Original strand, 43403744 - 43403969
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa-ataggtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||    
T  43403744 tgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaacatgagtt 43403843  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcc 288  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43403844 acaagaaatgagcttcaacaagctcacaaagaacaagcctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcc 43403943  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaac 314  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  43403944 caaagtgtttacaattgtttcccaac 43403969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 40734665 - 40734440
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  40734665 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgtgttac 40734566  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  40734565 aagaaattaggttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 40734466  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  40734465 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 40734440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 44331712 - 44331487
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  44331712 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaatggcttac 44331613  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  44331612 aagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcctaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 44331513  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  44331512 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 44331487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 29196387 - 29196614
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  29196387 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttcc 29196486  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  29196487 aagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 29196586  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  29196587 caaggtgtttacaaatgtttcccaaccc 29196614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 96 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 40735545 - 40735325
Alignment:
Q  96 acccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  40735545 acccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaactggttacaataa 40735446  T
Q  196 attagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggt 294  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  40735445 attagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcacttttccaaggt 40735346  T
Q  295 gtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||| ||||||| |||||    
T  40735345 gtttacaa-tgtttcctaaccc 40735325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 19683889 - 19684115
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  19683889 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 19683988  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  19683989 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgattttcactcacc 19684088  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19684089 caaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 19684115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 5236458 - 5236682
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5236458 tgttgacccagtttggtccaaattgacctaatctgg-ggaaagattgatctctcgaatccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 5236556  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  5236557 aagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 5236656  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5236657 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 5236682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 98 - 314
Target Start/End: Original strand, 22835010 - 22835226
Alignment:
Q  98 ccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22835010 ccagttcggtccaacttgacctaatatggcggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaat 22835109  T
Q  198 tagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgt 296  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||     
T  22835110 tagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtga 22835209  T
Q  297 ttacaattgtttcccaac 314  Q
    |||||| |||||||||||    
T  22835210 ttacaa-tgtttcccaac 22835226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 100 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 46173515 - 46173311
Alignment:
Q  100 agttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaatta 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46173515 agttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaatta 46173416  T
Q  200 gcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgttta 299  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46173415 gcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaatttt---------accaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgttta 46173325  T
Q  300 caattgtttcccaa 313  Q
    ||||||||||||||    
T  46173324 caattgtttcccaa 46173311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9581450 - 9581225
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9581450 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtta 9581351  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
     ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  9581350 aaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctaccca-tttccgaatcccacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 9581252  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  9581251 caaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 9581225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 45095331 - 45095107
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  45095331 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 45095232  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  45095231 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 45095134  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  45095133 caaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 45095107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7762433 - 7762208
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  7762433 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtta 7762334  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |    
T  7762333 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttctcaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactc-ac 7762235  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||    
T  7762234 caaggtgttcacaa-tatttcccaaccc 7762208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 761014 - 760789
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  761014 tgttaacccatttcagtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttac 760915  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  760914 aagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacagacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcatcc 760815  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||| || |||||||||||||    
T  760814 aaggtgtttataa-tgtttcccaaccc 760789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 29682526 - 29682301
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  29682526 tgttgacccagttcggtccaacttgatctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtgac 29682427  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  29682426 aagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacataatttctacccattttcccaatctcacaaataaacaagacactcaatgattttcactcaccc 29682327  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  29682326 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 29682301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 123 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 36018987 - 36018752
Alignment:
Q  123 ctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatag-gttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaa 221  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  36018987 ctgggggagagattgacctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgagttacaagaaattaacttcaacaagctcacaaagaa 36018889  T
Q  222 caaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccctaga 320  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36018888 caaccctaatttcaacccattttcccaatttcaccaatgaacaagtcactcgttaattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctaga 36018789  T
Q  321 atctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||| || |||||||||||||| || |||||||||    
T  36018788 atctaaaccccaaaagagaaccaatccatagcctttg 36018752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 37408626 - 37408401
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  37408626 tgttcacccagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 37408527  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |    
T  37408526 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaataattttcactc-ac 37408428  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||    
T  37408427 taaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 37408401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 91 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 51398981 - 51398751
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  51398981 tgttgaccaagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagataaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttac 51398882  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  51398881 aagaaattagcttcaacaagttcactaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcatcaatgaacaagacactcaatgattttcactcatcc 51398782  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaa 321  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  51398781 aaggtgtttacaa-tatttcccaacccaagaa 51398751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 29811035 - 29810810
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||| ||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29811035 tgttgacccaattcggtttaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 29810936  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||    
T  29810935 aagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaactctaatttctacatattttcctaatctcaccaatgaataagacattcaatgattttcactcaccc 29810836  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  29810835 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 29810810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 99 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31314604 - 31314387
Alignment:
Q  99 cagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaatt 198  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  31314604 cagttcggtccaacttgacctaatatgggggagatattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaagatacaaatgggttacaagaaatt 31314505  T
Q  199 agcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtt 297  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  31314504 agcttcaacaagatcacaatgaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcacctatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtgtt 31314405  T
Q  298 tacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  31314404 tacaa-tgtttcccaaccc 31314387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 91 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16499196 - 16498984
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  16499196 tgttgacccagttcggtccaacttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggtaac 16499097  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  16499096 aagaaattagcttcaacaagcttacaaa-aacaaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactacccc 16498998  T
Q  290 aaggtgtttacaat 303  Q
    ||||||||||||||    
T  16498997 aaggtgtttacaat 16498984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 39153362 - 39153587
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||    
T  39153362 tgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagagattgttctctccaatccactatcaatgagttcttataaagggatacaaatgagttac 39153461  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| || |||    
T  39153462 aagaaattagcttaaacaagctcacaatgaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacacatgaacaagacactcaatgattttcattcaccc 39153561  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  39153562 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 39153587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 5258144 - 5258370
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  5258144 tgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggagaagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggtta 5258243  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 287  Q
    ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  5258244 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 5258342  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5258343 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 5258370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 98 - 321
Target Start/End: Original strand, 53921511 - 53921734
Alignment:
Q  98 ccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaat 197  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||    
T  53921511 ccagttcggtcaaacttgatctactccgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaatgatacaaatgagttacaagaaat 53921610  T
Q  198 tagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgt 296  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  53921611 tagctttaacaagctcacaaacaacaaacctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggttt 53921710  T
Q  297 ttacaattgtttcccaaccctagaa 321  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||    
T  53921711 ttacaa-tgttttccaacccaagaa 53921734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 29813230 - 29813005
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29813230 tgttgacccagttcggtccaacatgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatgcaaatgggttac 29813131  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||| |||    
T  29813130 aagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctatttttccaatctcaccaattaacaagcccctcaatgattttcactcaccc 29813031  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    || |||||||||| || ||||||||||    
T  29813030 aatgtgtttacaa-tgcttcccaaccc 29813005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 157 - 346
Target Start/End: Original strand, 31340268 - 31340457
Alignment:
Q  157 aatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacc 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  31340268 aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacatgaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaacctcaatttctaccaattttcccaatctcacc 31340367  T
Q  257 aatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacc 346  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| | |||||||    
T  31340368 aatgaacaaaacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccctaaaagggcaccaacc 31340457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 23200138 - 23200362
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  23200138 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggtta 23200237  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  23200238 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgattttcactc-ac 23200335  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  23200336 caaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 23200362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 91 - 314
Target Start/End: Original strand, 9666467 - 9666692
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||  |||||    
T  9666467 tgttgacccagttcggtccaactttacctaatctgggggagagatcaatctctccaatccactatcaaagaattcttacaaagaggtataaatgagttac 9666566  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  9666567 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaatctaatttctacccatttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 9666666  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaac 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  9666667 caaggtgtttacaaatgtttcccaac 9666692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 5260323 - 5260549
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  5260323 tgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactttggagaagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggtta 5260422  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 287  Q
    ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||      
T  5260423 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattttcactc-a 5260521  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5260522 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 5260549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7764632 - 7764410
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaactt-gacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  7764632 tgttcacccagttcggtctaaatttgacctactctggaggagagattcatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtta 7764533  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  7764532 caagaaattagctttaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc-ttttccc--tctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 7764437  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  7764436 caaggtgtttacaa-tgtttcctaaccc 7764410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 98 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 32891264 - 32891049
Alignment:
Q  98 ccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaat 197  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  32891264 ccagttcggtccaacatgacctactccgggggagagatttatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaat 32891165  T
Q  198 tagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtg 295  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  32891164 tagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctacccattttctcaatctcaccgaagaacaagacactcaatgatttttactcacccaaggtg 32891065  T
Q  296 tttacaattgtttccca 312  Q
    ||||||| |||||||||    
T  32891064 tttacaa-tgtttccca 32891049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 23197939 - 23198163
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  23197939 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggtta 23198038  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    ||||||||||||||  |||||  |||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  23198039 caagaaattagctttgacaagttcacaaaaaacaactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgattttcactc-ac 23198136  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  23198137 caaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 23198163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Original strand, 55301972 - 55302232
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggt-- 187  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  55301972 tgttcaccaagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatacaaataggtta 55302071  T
Q  188 -------tacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgatttt 280  Q
           |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||                |||||||||||||||||||||||    
T  55302072 caagaaatacaagaaattagcttcaacaaacttacaaagaacaaccctaatttctacccat----------------atgaacaagacactcatgatttt 55302155  T
Q  281 cactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  55302156 cactctcccaaggtatttacaattgtttcccaactctataatctaacctacaaaagagaaccaacccctagcctttg 55302232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 23391910 - 23392135
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  23391910 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagatttatctctacaatccactatcaaagagttcttgcaaagtgatacaaatgggttac 23392009  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacact-catgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||    
T  23392010 aagaaattatcttaaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctactcattttcccaaactcaccaatgaaaaagacactaaatgattttcactcaccc 23392109  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23392110 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 23392135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 9636126 - 9636352
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  9636126 tgttcacccagttcggttcaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggtta 9636225  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 287  Q
    ||||||||||| ||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||      
T  9636226 caagaaattagttttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattttcactc-a 9636324  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  9636325 ccaaggtgtttacaa-tatttcccaaccc 9636352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 23410330 - 23410555
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  23410330 tgttgacccaattcgttccaacttgacctaatttgggggagagatttatctctccaatccattatctaagagttcttacaaagtgatacaaatgggttat 23410429  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    | ||||||||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  23410430 acgaaattagcttaaacaagctcacaaagaataaacataatttctacccattttccaaatttcactaatgaacaagacactcaatgattttcactcactc 23410529  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23410530 aaggtgtttacaa-tgttttccaaccc 23410555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 114 - 357
Target Start/End: Original strand, 5433906 - 5434145
Alignment:
Q  114 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagca 212  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||         |||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||     
T  5433906 tgacctactatggaggagagattgatctctccaatccaccg-------gttctttacaaagagatataaaagggttacaagaaattagctttaacaagct 5433998  T
Q  213 cacaaagaacaa-ccctaatttctacccattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttc 309  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  5433999 cacaaagaacaaaccctaatttctaccattttctcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaattgtttc 5434097  T
Q  310 ccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||| | |||| |||||    
T  5434098 ccaactctataatctaacccccaaaagagaatcaatctttagtctttg 5434145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 801260 - 801091
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatag-gt 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  801260 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagt 801161  T
Q  188 tacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    ||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  801160 tacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 801091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 91 - 255
Target Start/End: Original strand, 7780004 - 7780168
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 188  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  7780004 tgttcacccactttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaa-aggtt 7780102  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcac 255  Q
    |||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7780103 acaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 7780168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 91 - 255
Target Start/End: Original strand, 32744437 - 32744600
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  32744437 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggatagatttatctcttcaatccactatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatgagttac 32744536  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcac 255  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  32744537 aagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaa-actaatttctacccattttttcaatctcac 32744600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6716667 - 6716500
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  6716667 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 6716569  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||||  |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6716568 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 6716500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 54635292 - 54635125
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  54635292 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 54635194  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||||  |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54635193 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 54635125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 91 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 40913460 - 40913352
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  40913460 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcgatgagttcttacaaagagatacaaatgagttac 40913361  T
Q  191 aagaaatta 199  Q
    |||||||||    
T  40913360 aagaaatta 40913352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 141 - 357
Target Start/End: Original strand, 26323124 - 26323343
Alignment:
Q  141 tctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctaccc 239  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |   || ||||| |||||||| |||||    
T  26323124 tctccacttcactatcaatgagttttttaccaagatatacaaaaaggttacaagaaattagcttcaacaaactcttcaaaaacaaacctaatttttaccc 26323223  T
Q  240 attttcccaatctca-ccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaag 336  Q
     ||||| |||||||| || |||||||||||||| | |||| ||||||| | |||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  26323224 -ttttctcaatctcatcccatgaacaagacacttaatgatgttcactcactcaaggtgtttcccaattgtttcccaactctaaaatctaaccctcaaaag 26323322  T
Q  337 agaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  26323323 agaaccaacccttagcttttg 26323343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 131 - 352
Target Start/End: Original strand, 35138746 - 35138968
Alignment:
Q  131 gagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaacccta 229  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| | ||| |||||||| | ||    
T  35138746 gagattgttctcttccatccactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttgcaagaaattaacttcaacaaactcaccaagaacaaacata 35138845  T
Q  230 atttctacccattttcccaatctcac-caatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgttt-acaattgtttcccaaccctagaatctaa 326  Q
    |||||||||||||| | |||||||   | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||| |||    
T  35138846 atttctacccattt-ctcaatctctttccatgaacaagacactcaatgattttcactctcccaaggtgtttcacaattgttt-ccaactttaaaatttaa 35138943  T
Q  327 cccgcaaaagagaaccaacccttagc 352  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||    
T  35138944 ccc-caaaagagaattaacccttagc 35138968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 251 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 40913350 - 40913241
Alignment:
Q  251 ctcaccaatgaacaagacactcatgattttcac----tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacc 346  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40913350 ctcaccaatgaacaagacactcataattttcacgtactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacc 40913251  T
Q  347 cttagccttt 356  Q
    |||| |||||    
T  40913250 cttaaccttt 40913241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 45283154 - 45282983
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac----aaagagatacaaata 184  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    |||| |||||||| |    
T  45283154 tgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaaaagggatacaaa-a 45283056  T
Q  185 ggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||||||||  |||||  ||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45283055 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 45282983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 129 - 273
Target Start/End: Original strand, 51352150 - 51352293
Alignment:
Q  129 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccc 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| || |||| ||||| |||| |||||    
T  51352150 gagagattgatctctcaaatccactctcaatgagttattacaaagaaatacaaat-ggttacaagaaattaactttaaaaagctcacaatgaacaaaccc 51352248  T
Q  228 taatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca 273  Q
    ||| |||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  51352249 taacttcta-tcattttcctaatctcaccaataaacaagacactca 51352293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 3617618 - 3617449
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatagg 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| || |||    
T  3617618 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagagg 3617520  T
Q  187 ttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3617519 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 3617449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 25637592 - 25637426
Alignment:
Q  94 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||    
T  25637592 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggtta 25637494  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25637493 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 25637426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 5373353 - 5373198
Alignment:
Q  139 tctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttcta 236  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||    
T  5373353 tctctccaatccattggcaatgagttccttacaaagagatataaaagggttacaataaattagcttcaacaagctcaaaaagaacaaagcctaatttcta 5373254  T
Q  237 ccc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccca 290  Q
    |||  |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  5373253 cccttttttcccaatctcttcaatgaacaagacactcaatgattttccctcaccca 5373198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 206 - 300
Target Start/End: Original strand, 26386597 - 26386692
Alignment:
Q  206 acaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttac 300  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||    
T  26386597 acaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtatttac 26386692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 39127693 - 39127447
Alignment:
Q  114 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccact-atcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagc 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| || || || ||||||||| |   || |||||||||||||||||||||    
T  39127693 tgacctgctctggaggagagattgatctttcaaatccatttatcaatgagttatttacgaaaagatacaaaaaaactataagaaattagcttcaacaagc 39127594  T
Q  212 acacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc-accaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggt-gtttacaattgttt 308  Q
     ||| |||||||| | |||||| |||  | |||| |||||||  |  ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||    
T  39127593 tcaccaagaacaaacataatttatactta-tttctcaatctcttctcatgaataagacgctcaatgattttcactcttccaaggtattttccaattgttt 39127495  T
Q  309 cccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    || ||| ||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  39127494 ccaaactctagaatttaa-ccacaaaagagaactaacccttagcctttg 39127447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 2075076 - 2075283
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||                ||| || |||    
T  2075076 tgtttacccagttcgatccaacttgacctactctcggggagagattgatctctcaaatccactatcaattagtt----------------aat-gggtac 2075158  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaa-caaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    || ||||||||||  | |||| ||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||       
T  2075159 aataaattagctt--aaaagctcacaaagaaccaactctaattactaccatttttcccaatatcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ag 2075255  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||    
T  2075256 caaggtgtttataaatgtttcccaaccc 2075283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 253
Target Start/End: Original strand, 4055769 - 4055926
Alignment:
Q  96 acccagttcggtccaact-tgacctac-tctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatac-aaataggttaca 191  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  4055769 acccagttcggcccaacaatgacctacatctgggggagaga--gatctcttcaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaagaggttaca 4055866  T
Q  192 agaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 253  Q
    |||||||| |||  |||||  | | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4055867 agaaattaacttttacaagttctccaagaacaa-cctaatttctaccca-tttcccaatctc 4055926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Original strand, 4598526 - 4598693
Alignment:
Q  94 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| || ||||||    
T  4598526 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 4598624  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||| |  | |  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4598625 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 4598693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Original strand, 4600747 - 4600914
Alignment:
Q  94 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||| ||||||    
T  4600747 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaa-aggtta 4600845  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||| |  | |  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4600846 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 4600914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10056384 - 10056217
Alignment:
Q  94 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| || ||||||    
T  10056384 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 10056286  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||| |  | |  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10056285 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 10056217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10058606 - 10058439
Alignment:
Q  94 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| || ||||||    
T  10058606 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 10058508  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||| |  | |  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10058507 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 10058439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10060828 - 10060661
Alignment:
Q  94 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| || ||||||    
T  10060828 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 10060730  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||| |  | |  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10060729 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 10060661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10063050 - 10062883
Alignment:
Q  94 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| || ||||||    
T  10063050 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 10062952  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||| |  | |  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10062951 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 10062883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10065272 - 10065105
Alignment:
Q  94 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| || ||||||    
T  10065272 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 10065174  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||| |  | |  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10065173 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 10065105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10211560 - 10211393
Alignment:
Q  94 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| || ||||||    
T  10211560 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 10211462  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||| |  | |  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10211461 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 10211393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20937824 - 20937668
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctta-caaagagatacaaataggtt 188  Q
    |||| ||| ||||| |||||||| |||| |||| ||| |||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||    
T  20937824 tgtttacctagttctgtccaactatgacatactttgggggaacgattgatctctccaatcta-tatcaatgagttcttttcaaagagatacaaaagggtt 20937726  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcc 246  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | | || ||||| | ||||||||||| |||||||    
T  20937725 acaagaaattaacttcaacaagctctccaaaaacaaacataatttctacctattttcc 20937668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33191974 - 33191866
Alignment:
Q  114 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagca 212  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||     
T  33191974 tgacctcctctggag-agagattgatctctctaatccactatcaatgagttctttacaaagacata-aaat-ggttacaagaacttagcttcaacaagct 33191878  T
Q  213 cacaaagaacaa 224  Q
    | | ||||||||    
T  33191877 ctctaagaacaa 33191866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 157
Target Start/End: Original strand, 27305719 - 27305777
Alignment:
Q  99 cagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatca 157  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27305719 cagttcggtccaaattgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatca 27305777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10209340 - 10209173
Alignment:
Q  94 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaagaga-tacaaataggtta 189  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || ||| || ||||||    
T  10209340 tcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggactac-aagaggtta 10209242  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||| |  | |  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10209241 caagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 10209173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 236
Target Start/End: Original strand, 25491003 - 25491114
Alignment:
Q  124 tggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac 222  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |  || ||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  25491003 tggaggagaga--gatctctccacttcactatcaatgatttctttacaaagagatacaaaaggagtataagaaatcagcttcaacaagctctcaaagaac 25491100  T
Q  223 aaccctaatttcta 236  Q
    || |||||||||||    
T  25491101 aaacctaatttcta 25491114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 308
Target Start/End: Original strand, 8166516 - 8166677
Alignment:
Q  150 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 248  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| | | | |||||||| |||||||||||| || |||  ||    
T  8166516 cactatcaacaagttctttacaaagagatacaaaaaggttataagatattaacttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttctactca-tttatca 8166614  T
Q  249 atctcaccaatgaacaagacactc---atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgttt 308  Q
    |||||  | ||||||||||||| |   ||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||    
T  8166615 atctcttccatgaacaagacacactcaatgattttcacccacccaatgtgtttacaaatgttt 8166677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 253
Target Start/End: Original strand, 4075476 - 4075636
Alignment:
Q  96 acccagttcggtccaact-tgacctac-tctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatac-aaataggttaca 191  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  4075476 acccagttcggcccaacaatgacctacatctgggggagag--tgatctctccaatccactatcaaagagtttcttacaaagtgatacaaaagaggttaca 4075573  T
Q  192 agaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaacc--ctaatttctacccattttcccaatctc 253  Q
    |||||||| |||  |||||  | | ||||||| ||   ||||||||||||| ||||||||||||    
T  4075574 agaaattaacttttacaagttctctaagaacagcctaataatttctaccca-tttcccaatctc 4075636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 243
Target Start/End: Original strand, 3148037 - 3148144
Alignment:
Q  137 gatctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttct 235  Q
    ||||||| || | ||| ||||||||| |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| || ||||||||||    
T  3148037 gatctctgcacttcacaatcaatgagattcttacaaacaaatacaataaggttacaagaaattagcttcaacaagctcttcaagaagaaacctaatttct 3148136  T
Q  236 acccattt 243  Q
    | ||||||    
T  3148137 atccattt 3148144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 238
Target Start/End: Original strand, 54739004 - 54739102
Alignment:
Q  141 tctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||   ||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  54739004 tctccaatccactatcaatgagttctttacagagagatataaaagagttac-ataaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacactaatttctacc 54739102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 313
Target Start/End: Original strand, 1313852 - 1314029
Alignment:
Q  138 atctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttct 235  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||  | || |||||||||||||| ||||||| | | |||||| || | |||||| |    
T  1313852 atctctctaatccaatatcaatgagttcttttcaaagatatacaaaaggcttgcaagaaattagctttaacaagctctccaagaacaaaacataattttt 1313951  T
Q  236 acccattttcccaatctc-accaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaa 313  Q
    |||| ||||| |||||||  |  | ||| |||| |||||  | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1313952 accc-ttttctcaatctcttctcaagaataagagactcaataatttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaa 1314029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2020245 - 2020187
Alignment:
Q  153 tatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaag 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2020245 tatcaatgagttctttacaaagaaatacaaaacggttataagaaattagcttcaacaag 2020187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 238
Target Start/End: Original strand, 28253346 - 28253416
Alignment:
Q  169 caaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacc 238  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28253346 caaagaaatacaaaatcgttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacgaaccctaatttctacc 28253416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 304 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 1683440 - 1683388
Alignment:
Q  304 tgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  1683440 tgtttcccaactctagattctaaccc-caaaagataaccaacccttagcctttg 1683388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4386941 - 4386868
Alignment:
Q  170 aaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccatttt 244  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  | |||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  4386941 aaagtgatacaaatgggttacaagaaattagctt--aaaagctcacaaagaacaaaacctaatttctactcatttt 4386868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 309
Target Start/End: Original strand, 40519258 - 40519413
Alignment:
Q  151 actatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttccca 248  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    | ||||||| ||| ||||||||||    |||||| |    
T  40519258 actatcaatgagttctttacaaagagatacaaa-atattacaagaaattaacttcaacaa----ataaagaacaaactctaatttcta-ttgttttccta 40519351  T
Q  249 atctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttc 309  Q
    || || |||||||| |||||| || ||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||    
T  40519352 atatctccaatgaataagacattcaatgattttcactcacaaaaaatgtttacaattgtttc 40519413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24635366 - 24635276
Alignment:
Q  150 cactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctaccc 239  Q
    |||||||||||| ||  ||| |||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| | | | |||||||| | ||||||||||||    
T  24635366 cactatcaatgaattgattataaagagatacaaaatagttacaaaaaattagcttcaacaaactctccaagaacaaacttaatttctaccc 24635276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 1683597 - 1683483
Alignment:
Q  137 gatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttct 235  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| | | |||||||||||||| |||| |||| | | |||||| | | ||||||||    
T  1683597 gatctctccacttcactataaatgagttctttacaaagagattaaaa-acgatacaagaaattagcatcaataagctctcgaagaacgaacttaatttct 1683499  T
Q  236 acccattttcccaatct 252  Q
    | |||||||| ||||||    
T  1683498 a-ccattttctcaatct 1683483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 10067471 - 10067435
Alignment:
Q  94 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggagg 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10067471 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggagg 10067435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 183
Target Start/End: Original strand, 31340242 - 31340270
Alignment:
Q  155 tcaatgagttcttacaaagagatacaaat 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31340242 tcaatgagttcttacaaagagatacaaat 31340270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 80)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 95 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6432134 - 6431872
Alignment:
Q  95 cacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaaga 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6432134 cacccagttcggtccaacttgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaaga 6432035  T
Q  195 aattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggt 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6432034 aattagcttcaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctacccattttcccaatctaaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaatgt 6431935  T
Q  295 gtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  6431934 gtttacaattgtttcccaactctagaatctaaccctcaaaagagaaccaacccttagcatttg 6431872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 91 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 22270140 - 22269877
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22270140 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatcagttcttacaaagagatacaaatgggttac 22270041  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatg-attttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22270040 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactctccc 22269941  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcct 354  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22269940 aaggtgtttagaattgttt-ccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccatagcct 22269877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Original strand, 34310716 - 34310983
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  34310716 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgtgtta 34310815  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34310816 caagaaattagcttcaacaatttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccc 34310915  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  34310916 aaggtgtttacaattatttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacctttagcctttg 34310983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Original strand, 4508707 - 4508973
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4508707 tgttcacccagttcggtccaacttaacctactctgaagaagagattgatctctccaatccactctcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 4508806  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4508807 aagaaattagcttcaataagctcacaaagaacaaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatcaacaagacactcatgattttcactctccca 4508906  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  4508907 aggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccataaaagagaaccaatccttagcctttg 4508973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 96 - 357
Target Start/End: Original strand, 2360978 - 2361238
Alignment:
Q  96 acccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaa 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2360978 acccagttcggttcaacttgacctaatctgggggagagattgatatctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaa 2361077  T
Q  196 attagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtg 295  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2361078 attagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtg 2361177  T
Q  296 tttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  2361178 tttacaattgtttcccaactctagaatctaa-cctcaaaagagaaccaacccttagcctttg 2361238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 93 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 2390447 - 2390183
Alignment:
Q  93 ttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaa 192  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  2390447 ttcacctagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatatatgagttattacaaagagatacaaatgggttacaa 2390348  T
Q  193 gaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaag 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2390347 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttcgaatttcaccaatgaacaagacacttatgattttcgctctcccaag 2390248  T
Q  293 gtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2390247 gtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 2390183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Original strand, 48599335 - 48599601
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||    
T  48599335 tgttcacccagttcggtccaacttgatctgctctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagctcttccaaagagatacaaatgagttac 48599434  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  48599435 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatatcaccaatgaacaagacaatcatgattttcactcctcca 48599534  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48599535 aggtgtttacaattgtttcccaactctagaatataacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 48599601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 93 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 29608902 - 29608637
Alignment:
Q  93 ttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaa 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  29608902 ttcactcagttcggtccaacttgacctactctggaggagtgattgatatctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaa 29608803  T
Q  193 gaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatg-attttcactctcccaa 291  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||| |||    
T  29608802 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaaagaacaagacactcatgaagtttcgctctctcaa 29608703  T
Q  292 ggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29608702 ggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 29608637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 91 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3259162 - 3258901
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  3259162 tgttcacccagttcggttcaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgggtttttacaaagagatacaaatgagttac 3259063  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatg-attttcactctccc 289  Q
    || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3259062 aataaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgaattttcactttccc 3258963  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttag 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3258962 aaggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaatgagaaccaacccttag 3258901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Original strand, 4512391 - 4512657
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4512391 tgttcacccagtacggtccaacttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatgggttac 4512490  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4512491 aagaaattagcttcaataaactcacaaagaacaaccttaatttctacccattttccaaatctcaccaatcaacaaggcactcatgattttcactctccca 4512590  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  4512591 aggtgtttacaattgtttcccaactctagaatataacccccaaaagagaactaacccttagcctttg 4512657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Original strand, 4510549 - 4510815
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4510549 tgttcacccagtacggtccaacttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatgggttac 4510648  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4510649 aagaaattagcttcaataaactcacaaagaacaaccttaatttctacccattttccaaatctcaccaatcaacaaggcactcatgattttcactctccca 4510748  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||    
T  4510749 aggtgtttacaattgtttcccaactctagaatctaacccataaaagagaaccaatcgttagcctttg 4510815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Original strand, 8359316 - 8359585
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-taggtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  8359316 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggtt 8359415  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcc 288  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8359416 acaagaaattagtttaaacaagctcacaaagaaaaaccctaatttctacccattttcccaatctccccaatgaacaagacactcatgattttcactctct 8359515  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatct-aacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  8359516 caaggtgtttacaattgttttccaactcaagaatctaaacccccaaaaaataaccaactcttagcctttg 8359585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 91 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27347984 - 27347760
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27347984 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 27347885  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  27347884 aagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaatcctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 27347785  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaacc 315  Q
    || |||||||||| ||||||||||||    
T  27347784 aatgtgtttacaa-tgtttcccaacc 27347760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 31732970 - 31733195
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31732970 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccagtatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 31733069  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  31733070 aagaaattagcttcaccaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcagtctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 31733169  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  31733170 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 31733195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 98 - 302
Target Start/End: Original strand, 30024740 - 30024945
Alignment:
Q  98 ccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30024740 ccagttcggtccaacttgacctactctgggggagtgattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaat 30024839  T
Q  198 tagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgt 296  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  30024840 tagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgt 30024939  T
Q  297 ttacaa 302  Q
    ||||||    
T  30024940 ttacaa 30024945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 14069834 - 14070059
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14069834 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 14069933  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  14069934 aagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 14070033  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  14070034 aaggtgtttacaa-tgttacccaaccc 14070059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 14379862 - 14380087
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14379862 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 14379961  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  14379962 aagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 14380061  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  14380062 aaggtgtttacaa-tgttacccaaccc 14380087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 108 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48491729 - 48491521
Alignment:
Q  108 ccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaac 207  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48491729 ccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctttcaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaac 48491630  T
Q  208 aagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgt 306  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  48491629 aagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtgtttacaa-tgt 48491531  T
Q  307 ttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||    
T  48491530 ttcccaaccc 48491521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 35854082 - 35853857
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  35854082 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 35853983  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  35853982 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 35853884  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  35853883 caaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 35853857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 98 - 316
Target Start/End: Original strand, 47676144 - 47676362
Alignment:
Q  98 ccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47676144 ccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccattccactatcattgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaat 47676243  T
Q  198 tagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgt 296  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  47676244 tagcttcaacaaattcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcattgattttcactcacccaaggtgt 47676343  T
Q  297 ttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  47676344 ttacaa-tgtttcccaaccc 47676362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 41317435 - 41317660
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  41317435 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatggattac 41317534  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||    
T  41317535 aagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagagactcaatgattttcactcatcc 41317634  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  41317635 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 41317660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43864411 - 43864186
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  43864411 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaattagtttttacaaagagatacaaatgggttac 43864312  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  43864311 aggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccacttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 43864212  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  43864211 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 43864186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 99 - 316
Target Start/End: Original strand, 47673953 - 47674169
Alignment:
Q  99 cagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaatt 198  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47673953 cagttcggtccaacttgacttaatatgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaatt 47674051  T
Q  199 agcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtt 297  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  47674052 agcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtt 47674151  T
Q  298 tacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||| ||||| |||||||    
T  47674152 tacaa-tgttttccaaccc 47674169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 96 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4586323 - 4586103
Alignment:
Q  96 acccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaa 195  Q
    |||||||||||||||| ||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  4586323 acccagttcggtccaagttgacataatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaaatgggttacaaaaa 4586224  T
Q  196 attagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggt 294  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  4586223 attagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttacactcacccaaggt 4586124  T
Q  295 gtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  4586123 gtttacaa-tgtttcccaaccc 4586103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 36146409 - 36146635
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36146409 tgttgacctagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 36146508  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  36146509 -agaaattagcttcaacaagctcacaaataacaaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 36146607  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  36146608 caaggtgtttacaaatgtttcccaaccc 36146635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 8153509 - 8153284
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  8153509 tgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgagttac 8153410  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  8153409 aagaaattagctttgacaatctcacaaagaacaaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 8153310  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    || |||||||||| |||||||||||||    
T  8153309 aatgtgtttacaa-tgtttcccaaccc 8153284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48489598 - 48489373
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  48489598 tgtttacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatgaatgagttattgcaaagagatacaaatgggttac 48489499  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagaca-ctcatgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  48489498 aagaaattagcttcaacaagttttcaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacatttaatgattttcactcaccc 48489399  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  48489398 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 48489373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 91 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26417482 - 26417261
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26417482 tgttgacccagtttggtccaatttgacctaacctgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 26417384  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |    
T  26417383 aagaaattatcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcacccgctc 26417284  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaa 313  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  26417283 aaggtgtttacaa-tgtttcccaa 26417261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 91 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23555208 - 23554984
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||    
T  23555208 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaggtacaaaagtgtta 23555109  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacc-cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 287  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  23555108 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 23555010  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaac 314  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23555009 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaac 23554984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 91 - 303
Target Start/End: Original strand, 31105394 - 31105607
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31105394 tgtttacccagttcggtccaacttgatctactcttggggagagatttatctctccaatccaccatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgggttac 31105493  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  31105494 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaaaaaatctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 31105593  T
Q  290 aaggtgtttacaat 303  Q
    ||||||||||||||    
T  31105594 aaggtgtttacaat 31105607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 102 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 1113813 - 1113599
Alignment:
Q  102 ttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagc 201  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1113813 ttcggtcaaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttataagaaattagc 1113714  T
Q  202 ttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttac 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1113713 ttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaagttgtttac 1113614  T
Q  301 aattgtttcccaaccc 316  Q
    || |||||||||||||    
T  1113613 aa-tgtttcccaaccc 1113599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18126811 - 18126586
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18126811 tgttgacccaggtcggtcaaacttgacctagtctgggggagagattgattcctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 18126712  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  18126711 aagaaattagcttgaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacacatttttccaatctcaccaatgaacaaaacactcaatgattttcactcaccc 18126612  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  18126611 aagttgtttacaa-tgtttcccaaccc 18126586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 38671223 - 38671448
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  38671223 tgttgacccagttcggtccaacttgacctattttgggggatagatttatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagtgatacaaatgtgttac 38671322  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  38671323 aataaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcgctcaccc 38671422  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  38671423 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 38671448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 41649012 - 41649236
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  41649012 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttac 41649111  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  41649112 aagaaattagc-taaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctaccaatttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcacttaccc 41649210  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  41649211 aaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 41649236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 29991221 - 29990997
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||    
T  29991221 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattagaaagagatacaaaagggtta 29991122  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    ||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  29991121 caagaaattagctttgacaagttcacaaataacaaccctaatttctatcc-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 29991024  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  29991023 caaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 29990997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 91 - 313
Target Start/End: Original strand, 495984 - 496206
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  495984 tgttgacccggttctgtccaacttgacctactataggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatgggttgc 496083  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacact-catgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||    
T  496084 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaactaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaattaacaaaacactaaatgattttcactcaccc 496183  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaa 313  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||    
T  496184 aaggtttttacaa-tgtttcccaa 496206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 12097868 - 12098085
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||       |||||||||||| ||||||    
T  12097868 tgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattcatctctccaatccacta-caaagagtt-------agagatacaaatgggttac 12097959  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  12097960 aagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctaaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccc 12098059  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  12098060 aagatgtttacaa-tgtttcccaaccc 12098085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 91 - 226
Target Start/End: Original strand, 32358055 - 32358190
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32358055 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 32358154  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaacc 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  32358155 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagcacaacc 32358190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19502346 - 19502120
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  19502346 tgttcacccacttcgttccaaacttgacttactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagtta 19502247  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttct-acccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 287  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||      
T  19502246 caagaaattagctttgacaagctcacaaaaaacaaccttaatttctaaccttttttcgcaatctcaccactgaacaagacactcaatgattctcactc-a 19502148  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19502147 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 19502120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 91 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25616021 - 25615857
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  25616021 tgttcgcccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaatgatacaaatgggtta 25615922  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctca 254  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25615921 caagaaattagcttaaacaagcgcacatagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctca 25615857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 110 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4178921 - 4178717
Alignment:
Q  110 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaa 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||   |||    
T  4178921 aacttgacctgctctggaggagagattgaactgttcaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttcccaa 4178823  T
Q  210 gcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgttt 308  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  4178822 gttcacaaagaacaaccctaatttctaccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgttt 4178725  T
Q  309 cccaaccc 316  Q
    ||||||||    
T  4178724 cccaaccc 4178717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 98 - 308
Target Start/End: Original strand, 23565069 - 23565280
Alignment:
Q  98 ccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaat 197  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  23565069 ccagttcagtccaacttgacctactctaggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaat 23565168  T
Q  198 tagcttcaacaagcacacaaagaacaa-ccctaatttctaccca--ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggt 294  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||  | || ||||||| ||||||||    
T  23565169 tagtttcaacaagctcacaaagaacaagacctaatttctacctattttttcctaatctcaccaatgaacaagacact--tcatgttcactcacccaaggt 23565266  T
Q  295 gtttacaattgttt 308  Q
    |||||||| |||||    
T  23565267 gtttacaaatgttt 23565280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 91 - 313
Target Start/End: Original strand, 25766960 - 25767180
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaataggtt 188  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  ||||    
T  25766960 tgttcacccagttcggtctaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttcaaaagagatacaaaaggggtt 25767059  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 287  Q
    |||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  25767060 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttccaatct---caatgaacaagacactcaatgattttcactc-a 25767155  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaa 313  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25767156 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaa 25767180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 4253529 - 4253756
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||  |||||    
T  4253529 tgtttacctagttcggtccaaattgacctactctgtgggagagattgatctctctaatccattatcaatgagttctttccaaagagatataaaagggtta 4253628  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 287  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  4253629 catgaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttcta-ccattttaccaatttcaccaatgaacaagaaactcaatgattttcactcac 4253727  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    | ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  4253728 ctaaggtgtttacaaatgttttccaaccc 4253756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48408972 - 48408745
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-gagatacaaatagg-t 187  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||  || |    
T  48408972 tgttcacccagttcggtctaaacttgacatactctggaggagagattaaactctccaatccactatcaatgagttatttcaaaagagatacaaaaggggt 48408873  T
Q  188 tacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactct 286  Q
    ||||||||||||||||  |||||   ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  48408872 tacaagaaattagctttgacaagtttacaaagaacaacattaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc- 48408774  T
Q  287 cccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48408773 accaaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 48408745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 357
Target Start/End: Original strand, 22328395 - 22328666
Alignment:
Q  96 acccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaataggttacaag 193  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||   ||||||||    
T  22328395 acccagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatctctcaaatccactattaatgacttccttgcaaagagatacaaaagagttacaag 22328494  T
Q  194 aaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccatt-ttcccaatctcaccaatg----aacaagacactc-atgattttcactct 286  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| || || ||||||||||| | ||||    |||||||||||| |||||||||| ||     
T  22328495 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttctaacctttcttcccaatctctctaatgaacaaacaagacactcaatgattttcattcc 22328594  T
Q  287 cccaaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaa-cccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22328595 ctcaaggtgtttacaattgtttcccaactttaggatctaaccccccaaaagagaaccaacccttagcttttg 22328666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 148 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 31518905 - 31518752
Alignment:
Q  148 tccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttccc 247  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31518905 tccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaactagcttcaataagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttccc 31518806  T
Q  248 aatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31518805 aatctcaccaatgaacaagacactcgatgattttcactcacccaaggtgtttac 31518752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 39731537 - 39731319
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||    
T  39731537 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagtt 39731438  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 287  Q
    |||||||||||| |   |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||       |||||||||| |||||||||||||      
T  39731437 acaagaaattagatctgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc-tttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactc-a 39731347  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39731346 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 39731319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 101 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23344130 - 23343917
Alignment:
Q  101 gttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  23344130 gttcggtccaacttgacctactctgg--gagagattaatttctccaatctattatcaatgagttctcacaaagatatactaaagggttacaagaaattag 23344033  T
Q  201 cttcaacaagcacacaaagaa-caaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgttt 298  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  23344032 cttcaacaagctcacaaagaataaaccttaatttctaccc-ttttccaaatctcaccaatgaactagacattcaatgattttcactcacccaaggtgttt 23343934  T
Q  299 acaattgtttcccaacc 315  Q
      || ||||||| ||||    
T  23343933 tgaaatgtttccaaacc 23343917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 91 - 232
Target Start/End: Original strand, 2759198 - 2759339
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  2759198 tgttgaccaagttcggtccaacttgacctaatctggggaagagattgatatctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgagttac 2759297  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatt 232  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  2759298 aagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatt 2759339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 98 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31519063 - 31518911
Alignment:
Q  98 ccagttcggtccaacttgacctactctggag-gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  31519063 ccagttcggtccaacttgacctactctggggagagagattgatctctccaatccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaag-aa 31518965  T
Q  197 ttagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaat 250  Q
     ||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  31518964 ctagcttcaataagctcacagagaacaaacctaatttctacctattttcccaat 31518911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 36574517 - 36574742
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||    
T  36574517 tgtttacccagtttggtccaaattgacctactctag-ggatggattgatctctccaaaccactatcaatgagttctttacaaagagatataaaagggtta 36574615  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 287  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| || | |||||||||||  ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||| |    
T  36574616 caagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaatcttaatttctacc--tttccccaatctctccaataaacaagacactcgataattttcactcac 36574713  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    | ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  36574714 ctaaggtgtttacaaatgttttccaaccc 36574742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20344064 - 20343897
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  20344064 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 20343966  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||||  |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20343965 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 20343897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Original strand, 43504154 - 43504323
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatag-gt 187  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  43504154 tgttcacccagttcgatccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagt 43504253  T
Q  188 tacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    ||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43504254 tacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 43504323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 177 - 316
Target Start/End: Original strand, 4538627 - 4538766
Alignment:
Q  177 tacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atg 275  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || ||   || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4538627 tacaaatgggttacaagaaattagcttaaaaaatttcataaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatg 4538726  T
Q  276 attttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4538727 attttcactcacccaaggtgtttacaatt-tttcccaaccc 4538766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 91 - 211
Target Start/End: Original strand, 6359953 - 6360073
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6359953 tgttgacccagttcgatccaacttgacctaatatggggaagagattgatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 6360052  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagc 211  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6360053 aagaaattagcttcaacaagc 6360073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 251 - 357
Target Start/End: Original strand, 6360073 - 6360179
Alignment:
Q  251 ctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaaccctta 350  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6360073 ctcaccaatgaacaagtcactcatgattttcattctcccaaggtgtttaaaattgtttcccaactctagaatctaacccccaaaagagaaccaaccctta 6360172  T
Q  351 gcctttg 357  Q
    |||||||    
T  6360173 gcctttg 6360179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 186 - 315
Target Start/End: Original strand, 24525992 - 24526122
Alignment:
Q  186 gttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaac-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcac 283  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24525992 gttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttcccaatttcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 24526091  T
Q  284 tctcccaaggtgtttacaattgtttcccaacc 315  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24526092 tcacccaaggtgtttacaa-tgtttcccaacc 24526122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 24790009 - 24789841
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| | |||    
T  24790009 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatagtactctccaatccactatcaaagagtttttacaaaagggatacaaa-atgtt 24789911  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||||  |||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  24789910 acaagaaattagctttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttttaccc-ttttcccaatcttaccaa 24789841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 183
Target Start/End: Original strand, 24525508 - 24525595
Alignment:
Q  96 acccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat 183  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24525508 acccagttccgtccaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat 24525595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Original strand, 6592340 - 6592509
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatagg 186  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| || |||    
T  6592340 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagagg 6592438  T
Q  187 ttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6592439 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccca-tttcccaatctcaccaa 6592509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Original strand, 18388760 - 18388929
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatagg 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| || |||    
T  18388760 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagagg 18388858  T
Q  187 ttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18388859 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 18388929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Original strand, 18392196 - 18392365
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatagg 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| || |||    
T  18392196 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagagg 18392294  T
Q  187 ttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18392295 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 18392365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 98 - 309
Target Start/End: Original strand, 3904624 - 3904837
Alignment:
Q  98 ccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaa 195  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||   ||||||||||    
T  3904624 ccagttcggtccaacaatgacctactctgagggagagattgatctctctgatc-actatcaatgagttctttacaaagagatgcaaaagtgttacaagaa 3904722  T
Q  196 attagcttcaacaagcacacaaagaacaac-cctaatttctacccattttcccaatctca-ccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaag 292  Q
    ||||  ||||| | || | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  || | |||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  3904723 attacattcaataggctctcaaagaacaaaacctaatttctacc-attttcccaatctcttcctaagaacaagagactcaatgattt-cactcgcccaag 3904820  T
Q  293 gtgtttacaattgtttc 309  Q
    |||||||||| ||||||    
T  3904821 gtgtttacaaatgtttc 3904837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Original strand, 6594558 - 6594727
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatagg 186  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| || |||    
T  6594558 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagagg 6594656  T
Q  187 ttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6594657 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 6594727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 227 - 316
Target Start/End: Original strand, 2761439 - 2761528
Alignment:
Q  227 ctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  2761439 ctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcgatgattttcactcacccaatgtgtttacaa-tgtttcccaaccc 2761528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Original strand, 32060322 - 32060493
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttacaaa---gagatacaaata 184  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||   | ||||| || |    
T  32060322 tgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaaggggatac-aaga 32060420  T
Q  185 ggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||||||||  |||||  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  32060421 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 32060493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 91 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18396486 - 18396338
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaac-ttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaataggtt 188  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| | |||    
T  18396486 tgtttacccagttcggtccaccattgacctactcttgaggagagattgatctctccaatcctctatcaatgaattctttataaagagatacaaa-atgtt 18396388  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctac 237  Q
    |||| ||| ||| |||||||| | | | |||||| || ||||||||||||    
T  18396387 acaaaaaaataggttcaacaaactctccaagaacaaaacctaatttctac 18396338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 91 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 30814603 - 30814530
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 164  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30814603 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 30814530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 172
Target Start/End: Original strand, 1560671 - 1560749
Alignment:
Q  96 acccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 172  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1560671 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 1560749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 128 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5116735 - 5116625
Alignment:
Q  128 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaacc 226  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||| |||||| ||||||||| |   | |||||||| |    
T  5116735 ggagagatttatctctccaattcactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggtttacaataaattatcttcaacaaactatccaagaacaaac 5116636  T
Q  227 ctaatttctac 237  Q
    |||||||||||    
T  5116635 ctaatttctac 5116625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 194 - 316
Target Start/End: Original strand, 5514113 - 5514236
Alignment:
Q  194 aaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccc-taatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaa 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||| | |||| | |||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||  | ||    
T  5514113 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacataatttctactcttttttc-aatctctcaaatgaacaagaaactcaatgattttcactcatcgaa 5514211  T
Q  292 ggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  5514212 ggtgtttacaagtgtttcccaaccc 5514236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 316
Target Start/End: Original strand, 24514912 - 24514986
Alignment:
Q  241 ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24514912 ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-accaaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 24514986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 357
Target Start/End: Original strand, 1360226 - 1360422
Alignment:
Q  165 cttacaaagagatacaaata--ggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctca-ccaatga 261  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||  | | ||||  || ||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||    
T  1360226 cttacaaagagatacaaaaaagggttacaagaaattcgcttcaacaagttctccaagacaaaacctaatttcta-cctttttcccaatctcattccatga 1360324  T
Q  262 acaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgttt-acaattgtttcccaaccctagaatctaa-cccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||| |||| |||| |||||||| || |||||||||  |||||||||  |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  1360325 acaagagactcaatga-tttcactcaccaaaggtgtttcccaattgtttttcaactctagaatctaaccccccaaaagagaaccaatccatatcctttg 1360422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 178
Target Start/End: Original strand, 5513668 - 5513755
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagata 178  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||    
T  5513668 tgtttacccagttcagtccaaattgacctactctggaggtgagattgat-tctccaattcagtgtcaatgagttctttacaaagagata 5513755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26639486 - 26639326
Alignment:
Q  98 ccagttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaa----agagatacaaataggttaca 191  Q
    |||||||||| ||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||  ||||||    | | |||||||  |||||||    
T  26639486 ccagttcggtacaacaatgacatactatggaggagagattgatctctctaatccattatcaaagagttatttacaatgatatatatacaaaagggttaca 26639387  T
Q  192 agaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 253  Q
    |||||||| | ||||||| | | | |||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  26639386 agaaattaacatcaacaaactctccaagaacatacctaatttcta-ccattttcacaatctc 26639326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 238
Target Start/End: Original strand, 43363507 - 43363622
Alignment:
Q  124 tggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaa--gagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaaga 220  Q
    |||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||||| || |||||  ||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||| | | ||||    
T  43363507 tggaggagaga--gatctatccacttcactatcaatgagttatttacaaatagagatacaaaagagttacaataaattagtttcaacaagctctccaaga 43363604  T
Q  221 acaaccctaatttctacc 238  Q
    |||| |||||||||||||    
T  43363605 acaaacctaatttctacc 43363622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 356
Target Start/End: Original strand, 2579030 - 2579091
Alignment:
Q  294 tgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagccttt 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||  | ||||||||||||||||    
T  2579030 tgtttacaattgtttcccaaccctagaatttatcccg-aaaaggaacccaacccttagccttt 2579091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 316
Target Start/End: Original strand, 30843389 - 30843459
Alignment:
Q  247 caatctcaccaatgaacaagacactca-tgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||  | ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  30843389 caatctctccaatgaacaagatactcaatgattttaactcatctaaggtgtttacaaatgtttctcaaccc 30843459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 258
Target Start/End: Original strand, 1562103 - 1562173
Alignment:
Q  187 ttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1562103 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 1562173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 7494 - 7229
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7494 tgttcacccagttcggtccaacttaacctactctagaggagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac 7395  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 290  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7394 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccca 7295  T
Q  291 aggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7294 aggtgtttacaattgttt-ccagctctagaatctaacccccaaaagagaaccaacccttagcctttg 7229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Original strand, 18004 - 18268
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  18004 tgttcacccagttcgatccaaacttgacctaccctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-ttacaaagagatacaaatgagtta 18102  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctccc 289  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18103 caagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctaccaattttcccactctcaccaatgaacaaaacactcatgattttcactctccc 18202  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    || |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18203 aaagtgtttacaattgttt-ccaactctataatctaaccc-caaaagagaaccaactcttagtctttg 18268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 91 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 11725 - 11459
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  11725 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagtta 11626  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  11625 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 11527  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaacccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11526 caaggtgtttacaa-tgtttcccaactctagaatctaaccccaaaaagagaaacaacctttagcctttg 11459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 145 - 357
Target Start/End: Original strand, 80338 - 80550
Alignment:
Q  145 caatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 244  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80338 caattcactatctatgagttcttacaaaaagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 80437  T
Q  245 cccaatctcaccaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaa 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  80438 cccaatctcagcaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgttcacaattgtttcctaactctagaatctaacccccaaaatagaaccaa 80537  T
Q  345 cccttagcctttg 357  Q
    |||||||||||||    
T  80538 cccttagcctttg 80550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 91 - 303
Target Start/End: Original strand, 149098 - 149311
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  149098 tgttgacccagttcggtccaacttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggtaac 149197  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  149198 aagaaattagcttcaacaagcttacaaaaaacaaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactacccc 149297  T
Q  290 aaggtgtttacaat 303  Q
    ||||||||||||||    
T  149298 aaggtgtttacaat 149311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 114770 - 114545
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  114770 tgttcatccagttcggtctaaacttaacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagcgtta 114671  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcc 288  Q
    ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  114670 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccttaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc-ac 114572  T
Q  289 caaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  114571 caaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 114545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 102513 - 102445
Alignment:
Q  175 gatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaa-ccctaatttctacccatttt 244  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  102513 gatacaaagaggttacaagaaattatcttaaa--agctcacaaaaaacaaaccctaatttctacccatttt 102445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 20416 - 20641
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20416 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccaatatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttac 20515  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctccc 289  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||| |||    
T  20516 aagaaattagcttcaacaagttcacaaaaaacaaacctaatttctgctcattttcccaatctcaccaatgaataataaactcaatgattttcactcaccc 20615  T
Q  290 aaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20616 aaggtgtttacaa-tgtctcccaaccc 20641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 434701 - 434504
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  434701 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtta 434602  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccatttt-cccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactc 285  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  434601 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttccccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 434504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 129 - 237
Target Start/End: Original strand, 490359 - 490468
Alignment:
Q  129 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccc 227  Q
    |||||| ||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |     
T  490359 gagagaatgatctctccgcttcactatcaatgagtactttacaaagatatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaact 490458  T
Q  228 taatttctac 237  Q
    ||||||||||    
T  490459 taatttctac 490468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 1083 - 859
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggtta 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||    
T  1083 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttgtt-caaagagatacaaaagggtta 985  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctc 287  Q
    ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||      
T  984 caagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgattttcactc-a 887  T
Q  288 ccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  886 ccaaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 11161 - 11387
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  11161 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaagggtt 11260  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactct 286  Q
    |||||||||||| ||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||     
T  11261 acaagaaattagattttacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgatttacactc- 11358  T
Q  287 cccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11359 accaaggtgtttacaa-tgtttcccaaccc 11387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 91 - 316
Target Start/End: Original strand, 8735 - 8961
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  8735 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaagggtt 8834  T
Q  189 acaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttctacccattt-tcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactct 286  Q
    |||||||||||| ||  | |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||     
T  8835 acaagaaattagattttataagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatggtttacactc- 8932  T
Q  287 cccaaggtgtttacaattgtttcccaaccc 316  Q
     ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8933 accaaggtctttacaa-tgtttcccaaccc 8961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 91 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10656 - 10475
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttac 190  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  10656 tgtttacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaaatggttac 10557  T
Q  191 aagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactca 273  Q
    || ||||||||  |||  ||| |||||||||| ||||||||||| || |  |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  10556 aataaattagc-acaa-gagctcacaaagaacaaaccctaatttatatctttttttccaatctcacaaatgaacaagacactca 10475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Original strand, 2604 - 2773
Alignment:
Q  91 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaatagg 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| || |||    
T  2604 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagagg 2702  T
Q  187 ttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2703 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 2773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 314
Target Start/End: Original strand, 27453 - 27668
Alignment:
Q  102 ttcggtccaact-tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaataggttacaagaaatta 199  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  27453 ttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaataagttatttacaaagagatacaaatgagttacaagaaatta 27552  T
Q  200 gcttcaacaagcacacaaagaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctc-accaatgaacaagacactcatgattttcactctcccaaggtgtt 297  Q
    |||||||||||| |   ||||||||  | |||||||||| | ||||| |||||||  ||   |||||||| |||||    ||||||||  ||||||||||    
T  27553 gcttcaacaagctcttcaagaacaatacataatttctactc-ttttcacaatctcttccctagaacaagagactcaaagatttcactcatccaaggtgtt 27651  T
Q  298 tacaattgtttcccaac 314  Q
    ||||| |||||||||||    
T  27652 tacaaatgtttcccaac 27668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 137 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 25175 - 24981
Alignment:
Q  137 gatctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaagaacaaccctaatttct 235  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||  ||| |||||    
T  25175 gatctctctacttcactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaaggttacaagaaattaccttcaacaaactctcaaagaacaaaactagtttct 25076  T
Q  236 acccattttccc-aatctcacca-atgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtgtttacaattgtttcccaaccctagaatctaaccc 329  Q
    | |||||||||| |||||   ||  ||| ||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  25075 a-ccattttcccgaatcttgtcatgtgatcaacagactcaatga-tttcactctcccaaggtgtttacaattgtttccaaacccaagaatctcaccc 24981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Original strand, 3729 - 3895
Alignment:
Q  94 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||| || ||||||    
T  3729 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggtta 3827  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    ||||||||||||||  ||| |  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3828 caagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 3895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6438 - 6272
Alignment:
Q  94 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc-ttac-aaagagatacaaataggtta 189  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  | |||    
T  6438 tcacccagttcggtccaaacttaacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagggctta 6340  T
Q  190 caagaaattagcttcaacaagcacacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 258  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6339 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 6272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 350
Target Start/End: Original strand, 1591 - 1657
Alignment:
Q  284 tctcccaaggtgtttac-aattgtttcccaaccctagaatctaacccgcaaaagagaaccaaccctta 350  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  1591 tctcccaaggtgttttctaattgtttcccaactctagaatctaaccc-caaaagagaaccaacactta 1657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University