View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17464_low_18 (Length: 322)

Name: NF17464_low_18
Description: NF17464
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17464_low_18
NF17464_low_18
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (16-322)||(45726547-45726853)
chr2 (20-322)||(1631976-1632279)
chr2 (16-322)||(35447128-35447435)
chr2 (20-322)||(42288354-42288655)
chr2 (20-321)||(17450212-17450513)
chr2 (20-256)||(7450921-7451158)
chr2 (48-303)||(33647817-33648075)
chr2 (36-319)||(24397701-24397977)
chr2 (31-318)||(42261859-42262146)
chr2 (31-322)||(30218280-30218570)
chr2 (57-204)||(40935542-40935690)
chr2 (143-203)||(24197643-24197703)
chr2 (146-203)||(34811594-34811651)
chr2 (46-79)||(44750240-44750273)
[»] chr7 (22 HSPs)
chr7 (20-322)||(4512634-4512936)
chr7 (20-322)||(6431592-6431895)
chr7 (20-322)||(34310960-34311264)
chr7 (20-322)||(4508950-4509244)
chr7 (20-322)||(4510792-4511086)
chr7 (31-322)||(2361215-2361507)
chr7 (51-322)||(2389934-2390206)
chr7 (31-322)||(6360156-6360448)
chr7 (31-322)||(29608373-29608660)
chr7 (33-322)||(48599578-48599858)
chr7 (20-322)||(22269595-22269897)
chr7 (20-320)||(3258616-3258916)
chr7 (16-213)||(32358189-32358387)
chr7 (36-322)||(22328643-22328931)
chr7 (55-315)||(5116290-5116551)
chr7 (176-317)||(8359567-8359708)
chr7 (31-139)||(30814397-30814505)
chr7 (116-314)||(43363667-43363863)
chr7 (107-213)||(22552791-22552897)
chr7 (220-318)||(23794074-23794171)
chr7 (156-203)||(23794197-23794244)
chr7 (95-165)||(37545308-37545379)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (15-322)||(40146877-40147185)
chr5 (20-313)||(213089-213384)
chr5 (31-322)||(38746637-38746929)
chr5 (34-322)||(27015168-27015456)
chr5 (16-322)||(5057666-5057971)
chr5 (20-322)||(28277934-28278240)
chr5 (20-322)||(27637858-27638161)
chr5 (20-236)||(16642208-16642424)
chr5 (20-322)||(316380-316686)
chr5 (20-322)||(4160255-4160556)
chr5 (20-239)||(30802562-30802782)
chr5 (20-287)||(35615792-35616060)
chr5 (33-322)||(14689655-14689942)
chr5 (20-239)||(30792861-30793080)
chr5 (104-308)||(33906288-33906491)
chr5 (36-241)||(10055031-10055238)
chr5 (143-322)||(21205897-21206076)
chr5 (20-113)||(33906585-33906678)
chr5 (237-322)||(16641185-16641269)
chr5 (57-255)||(10700948-10701151)
[»] chr4 (42 HSPs)
chr4 (16-322)||(26363882-26364189)
chr4 (20-322)||(8665027-8665331)
chr4 (31-320)||(55085611-55085902)
chr4 (31-322)||(6655588-6655880)
chr4 (31-322)||(50674090-50674382)
chr4 (31-322)||(54882652-54882944)
chr4 (20-322)||(50262942-50263245)
chr4 (31-292)||(40630616-40630878)
chr4 (20-322)||(41964037-41964339)
chr4 (20-322)||(27417205-27417498)
chr4 (48-322)||(12073042-12073316)
chr4 (51-322)||(35662094-35662364)
chr4 (24-322)||(46703126-46703423)
chr4 (49-322)||(379028-379302)
chr4 (38-322)||(33989501-33989785)
chr4 (16-296)||(46569816-46570097)
chr4 (31-322)||(2209340-2209637)
chr4 (122-322)||(8647861-8648062)
chr4 (20-322)||(22882998-22883300)
chr4 (20-322)||(22934662-22934964)
chr4 (20-183)||(8653220-8653384)
chr4 (20-183)||(10071505-10071669)
chr4 (20-322)||(3785711-3786013)
chr4 (31-322)||(35370582-35370874)
chr4 (56-241)||(38811404-38811590)
chr4 (82-322)||(33089582-33089811)
chr4 (31-322)||(35369685-35369971)
chr4 (36-322)||(26699690-26699979)
chr4 (140-322)||(12119281-12119461)
chr4 (91-192)||(10071963-10072065)
chr4 (46-232)||(47514835-47515023)
chr4 (144-322)||(34112357-34112535)
chr4 (31-228)||(25723554-25723752)
chr4 (102-322)||(41961110-41961334)
chr4 (57-309)||(22629147-22629399)
chr4 (52-154)||(32091222-32091326)
chr4 (102-197)||(6719289-6719384)
chr4 (116-291)||(6200139-6200315)
chr4 (115-202)||(43135810-43135896)
chr4 (243-319)||(32091324-32091399)
chr4 (147-216)||(4914167-4914236)
chr4 (16-49)||(41639182-41639215)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (31-322)||(6960-7252)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (20-322)||(11348319-11348622)
chr1 (31-322)||(29135880-29136171)
chr1 (20-322)||(34603197-34603499)
chr1 (20-322)||(47255584-47255881)
chr1 (20-322)||(34602584-34602886)
chr1 (31-322)||(37033317-37033605)
chr1 (24-322)||(42298219-42298518)
chr1 (31-322)||(193244-193535)
chr1 (31-322)||(37879155-37879447)
chr1 (31-322)||(13547333-13547625)
chr1 (31-322)||(13549244-13549536)
chr1 (20-322)||(19754112-19754418)
chr1 (20-322)||(37167917-37168221)
chr1 (20-322)||(7482476-7482778)
chr1 (20-322)||(28242010-28242312)
chr1 (20-322)||(19752307-19752609)
chr1 (52-322)||(47114825-47115095)
chr1 (31-322)||(41135452-41135743)
chr1 (36-322)||(6808083-6808370)
chr1 (181-322)||(31925950-31926091)
chr1 (20-287)||(9109680-9109949)
chr1 (20-167)||(31928208-31928348)
chr1 (20-310)||(22078962-22079233)
chr1 (94-317)||(16216745-16216966)
chr1 (157-322)||(12318726-12318890)
chr1 (138-188)||(3331283-3331333)
chr1 (138-214)||(28318110-28318188)
chr1 (181-257)||(4535783-4535860)
chr1 (69-227)||(6068287-6068447)
chr1 (138-230)||(38747052-38747144)
chr1 (277-318)||(6068472-6068512)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (16-322)||(11383603-11383910)
chr8 (31-322)||(42435235-42435527)
chr8 (20-322)||(44353416-44353716)
chr8 (31-322)||(40221376-40221669)
chr8 (31-322)||(4283178-4283448)
chr8 (16-254)||(22976151-22976389)
chr8 (96-322)||(40328476-40328703)
chr8 (51-263)||(2999823-3000037)
chr8 (20-322)||(40585345-40585648)
chr8 (38-168)||(20686456-20686586)
chr8 (64-259)||(3846126-3846321)
chr8 (85-261)||(40535538-40535713)
chr8 (95-287)||(9633816-9634007)
chr8 (243-314)||(18655246-18655317)
chr8 (61-258)||(3817641-3817840)
chr8 (55-246)||(11136796-11136989)
chr8 (109-188)||(10020150-10020229)
chr8 (138-201)||(10101525-10101588)
chr8 (143-212)||(28461305-28461375)
chr8 (20-93)||(10239709-10239782)
chr8 (214-322)||(33655549-33655655)
[»] chr3 (31 HSPs)
chr3 (31-322)||(49199714-49200007)
chr3 (31-322)||(43402034-43402326)
chr3 (31-322)||(43403977-43404269)
chr3 (20-322)||(34490833-34491137)
chr3 (38-322)||(6095843-6096128)
chr3 (31-322)||(4569583-4569875)
chr3 (20-322)||(30235745-30236049)
chr3 (16-322)||(55302209-55302516)
chr3 (16-322)||(40912954-40913263)
chr3 (16-314)||(54593321-54593621)
chr3 (20-322)||(47303872-47304175)
chr3 (31-322)||(36018482-36018775)
chr3 (49-322)||(46860120-46860396)
chr3 (48-322)||(41819768-41820040)
chr3 (20-270)||(28074238-28074488)
chr3 (36-322)||(5434122-5434410)
chr3 (20-322)||(34795490-34795792)
chr3 (38-258)||(26323821-26324042)
chr3 (57-322)||(1683146-1683411)
chr3 (31-228)||(39127191-39127389)
chr3 (31-292)||(35138980-35139250)
chr3 (31-107)||(31340501-31340577)
chr3 (57-261)||(36796064-36796274)
chr3 (140-183)||(31340460-31340503)
chr3 (172-322)||(20937431-20937580)
chr3 (145-199)||(1737257-1737311)
chr3 (256-322)||(26323320-26323385)
chr3 (31-64)||(20937375-20937408)
chr3 (140-216)||(31004925-31005002)
chr3 (138-213)||(41509996-41510072)
chr3 (109-180)||(50432937-50433006)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (31-322)||(11190-11482)
[»] chr6 (14 HSPs)
chr6 (16-322)||(17762604-17762913)
chr6 (31-319)||(3808955-3809245)
chr6 (16-322)||(21593283-21593588)
chr6 (14-322)||(26830368-26830677)
chr6 (20-322)||(2973183-2973487)
chr6 (20-322)||(5043249-5043551)
chr6 (35-322)||(22425071-22425358)
chr6 (97-322)||(603324-603550)
chr6 (106-309)||(17757789-17757995)
chr6 (31-290)||(25072817-25073076)
chr6 (67-262)||(26800438-26800634)
chr6 (236-317)||(5741040-5741120)
chr6 (30-71)||(26661580-26661621)
chr6 (30-71)||(26767551-26767592)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (33-319)||(80530-80817)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (20-322)||(18245-18547)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (31-318)||(490694-490981)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (20-302)||(1671-1953)
[»] scaffold0263 (1 HSPs)
scaffold0263 (143-214)||(5400-5471)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 16 - 322
Target Start/End: Original strand, 45726547 - 45726853
Alignment:
Q  16 tatgtaagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45726547 tatgtaagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagag 45726646  T
Q  116 tctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttggggaagattcatgggg 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45726647 tctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgggaaagggttggtgccttttggggaagattcatgggg 45726746  T
Q  216 tttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45726747 tttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgg 45726846  T
Q  316 ttctctt 322  Q
    |||||||    
T  45726847 ttctctt 45726853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 1632279 - 1631976
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctt 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1632279 taagcactccatgacctatttgttgtgtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctt 1632180  T
Q  120 tgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttg-ggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttt 218  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  1632179 tgagtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggggaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgtcttttggggaagattcatggggttg 1632080  T
Q  219 ggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1632079 ggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttc 1631980  T
Q  319 tctt 322  Q
    ||||    
T  1631979 tctt 1631976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 35447435 - 35447128
Alignment:
Q  16 tatgtaagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35447435 tatgtaagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagag 35447336  T
Q  116 tctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttg-gagaaccaaaagagggggctcttg-ggaaagggttggtgccttttggggaagattcatgg 213  Q
    | |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35447335 tatttgtgtgaggttcaaagcttcaagatgtgagtcttgagagaaccaaaaga-ggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttgggaaagattcatgg 35447237  T
Q  214 ggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt 313  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35447236 ggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaagatacttagtgaaatcaaaggctaagggtt 35447137  T
Q  314 ggttctctt 322  Q
    |||||||||    
T  35447136 ggttctctt 35447128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 42288655 - 42288354
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctt 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42288655 taagcactctatgacccatttgttaaa-aagctaggtgaatctcatggaaaccaaatgagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctt 42288557  T
Q  120 tgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg-aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttt 218  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  42288556 tgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttgaagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgcctttt-gggaagattcatggggttg 42288458  T
Q  219 ggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42288457 ggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttc 42288358  T
Q  319 tctt 322  Q
    ||||    
T  42288357 tctt 42288354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Original strand, 17450212 - 17450513
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctt 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17450212 taagcacttcatgacccatttgttgggcaaacttagagaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctt 17450311  T
Q  120 tgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttg 219  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | |    
T  17450312 tgagtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccctttgtgaaagattcatggggatgg 17450411  T
Q  220 gaaacacatgagtgga-gagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttc 318  Q
    |||||||||||| | | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  17450412 gaaacacatgagcgaaggagtcaattgtgagaaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcattag-gaaatcaaaggctaagggttgattc 17450510  T
Q  319 tct 321  Q
    |||    
T  17450511 tct 17450513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Original strand, 7450921 - 7451158
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccattt-gttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtct 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  7450921 taagcactccatgacccattttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaacaaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttg-gcgtct 7451019  T
Q  119 ttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctc-ttgggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtt 217  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||    
T  7451020 ttgggtgaggttcaaagcttcaggatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctctttggtaaagggttgatgacttttggagaagatttatggggtt 7451119  T
Q  218 tggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttg 256  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7451120 ggaaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttg 7451158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 48 - 303
Target Start/End: Original strand, 33647817 - 33648075
Alignment:
Q  48 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgt 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  33647817 aagcttggtgaatttcatggaaaccaaaggagagaacttttagagtatttagatactaaaggttgaaggtctttgggtgaggttcaaagtttcaagatgt 33647916  T
Q  147 gaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg-aaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcattt 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||| | ||||| |||||| |||||||||||    
T  33647917 gaatcttggagaatcaaaagaggaggctcttgggaaaagggttggtgccttttgaggagagattcacgaggttggaaaacatatgagtagagagtcattt 33648016  T
Q  245 gtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaag 303  Q
    || ||| |||| || ||||| | | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  33648017 gttagctacttaggcgagtcttataaaaccaaaagagaagatccttagggaaatcaaag 33648075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 36 - 319
Target Start/End: Original strand, 24397701 - 24397977
Alignment:
Q  36 catttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaa 134  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  24397701 catttgttggaaaagcttggtgaatctcatggaaaccaaa--------cttttagggtatttagatactaaaggttgacggtctttgtgtgaggttcaaa 24397792  T
Q  135 gcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg-aaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacacatgagt 232  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| | | ||||||||||||    
T  24397793 gcttcaaaatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttagggagagactcatcgggctggtaaacacatgagt 24397892  T
Q  233 ggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttct 319  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||||||||    
T  24397893 ggagagtcatttgtgaccaatttgggttagtcttgtgaaaccaaaagagaatatccttag-aaagtcaaa-gctaagggttggttct 24397977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 42262146 - 42261859
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagt 129  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  42262146 tgacccatttgttgagcaagcttggtgaatctcatgagaaccaaaggagggagcttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 42262047  T
Q  130 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacacat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||    
T  42262046 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctctttggagagggttggtgcctttaggtgagagattcatgggattgggaaacacat 42261947  T
Q  229 gagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttc 318  Q
     |  |||||||  ||| ||||||||||||| ||||| |  || |||| ||||| | ||| |||| ||||||||| |||| || |||||||    
T  42261946 caaaggagagt-ttttatgagcaacttgggcgagtcttacgagaccaaaagagtatatcattag-gaaatcaaaagctacggattggttc 42261859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 30218570 - 30218280
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagt 129  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||    
T  30218570 tgacctattcgttgggtaatcttggtgaatattatggaactcaaaggagggaacttttagggtatttagatactatatgttgagggtctttgggtgaggt 30218471  T
Q  130 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacacat 228  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||  ||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  30218470 tcaaaacatcaaaatgtgaatcttggacaaccaaaaatgagggcttatgggagagagttagtgccttttggggagagattcatggggttgggaaacacac 30218371  T
Q  229 gagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
     |  ||||| || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| |  ||||||||| ||||||||| |||||   |||||||||||    
T  30218370 caaaggagaatc-tttgtgagcaacttgagtgagtcttgcgaaaccaaaag-ggggatccttag-gaaatcaaaagctaaatattggttctctt 30218280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 40935690 - 40935542
Alignment:
Q  57 gaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttgg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||   ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||  |||||||  || | |||||||||| ||    
T  40935690 gaatctcatggaaaccaaaggagagaccgtttagggaacttagaaactaaaggttgagggcctttgggagagattcaaagtgtccaaatgtgaatctagg 40935591  T
Q  156 agaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttggggaa 204  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40935590 agaaccaaaagatgaggctcttgggaaagggttggtgcctattggggaa 40935542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 203
Target Start/End: Original strand, 24197643 - 24197703
Alignment:
Q  143 atgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24197643 atgtgaatcttggggaaccaaaagaggggactcttgggagagggttggtgccttttgggga 24197703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 34811651 - 34811594
Alignment:
Q  146 tgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  34811651 tgaatcttagagaaccaaaagagggggtttttggaaaaaggttggtgcctttttggga 34811594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 79
Target Start/End: Original strand, 44750240 - 44750273
Alignment:
Q  46 gtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggag 79  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44750240 gtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggag 44750273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 22)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 4512936 - 4512634
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctt 119  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4512936 taagcactccatgacccatttaatgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagattctaaaggttgagggtctt 4512837  T
Q  120 tgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttg 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4512836 tgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttagagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttg 4512737  T
Q  220 gaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttct 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4512736 gaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttagttct 4512637  T
Q  320 ctt 322  Q
    |||    
T  4512636 ctt 4512634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Original strand, 6431592 - 6431895
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctt 119  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6431592 taagcgctccatgacccatttattgggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctt 6431691  T
Q  120 tgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctctt-gggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttt 218  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6431692 tgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttg 6431791  T
Q  219 ggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttc 318  Q
    | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6431792 gaaaacacatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttc 6431891  T
Q  319 tctt 322  Q
    ||||    
T  6431892 tctt 6431895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 34311264 - 34310960
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagagtct 118  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||     
T  34311264 taagtactccatgaccaattttttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggaaggaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtcc 34311165  T
Q  119 ttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggtt 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  34311164 ttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaaggttcatggggat 34311065  T
Q  218 tggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggtt 317  Q
     | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34311064 ggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaaaggttggtt 34310965  T
Q  318 ctctt 322  Q
    |||||    
T  34310964 ctctt 34310960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 4509244 - 4508950
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctt 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  4509244 taagcactctatgacccatttgttgggtaagcttggttaatctcatggaaaccaaaggatggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtttt 4509145  T
Q  120 tgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttg 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4509144 tgggtgaggttcaaagcttcaagatgtga--------gaaccaaaagagggagctcttgggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgg 4509053  T
Q  220 gaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttct 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4509052 gaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaactttggtgagtcttgtgaaaccaaaagataagatccttagtgaaatcaaaggctaaggattggttct 4508953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 4511086 - 4510792
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctt 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  4511086 taagcactctatgacccatttgttgggtaagcttggttaatctcatggaaaccaaaggatggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtttt 4510987  T
Q  120 tgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttg 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4510986 tgggtgaggttcaaagcttcaagatgtga--------gaaccaaaagagggagctcttgggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgg 4510895  T
Q  220 gaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttct 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  4510894 gaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaactttggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaacgattggttct 4510795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 2361507 - 2361215
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagtt 130  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||    
T  2361507 tgacccatttgttgggcaagcttagtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttaggattttagatactaaagattgagggtctttgggtgagatt 2361408  T
Q  131 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatg 229  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2361407 caatccttcaagatgtgaatcttgaagaatcaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatg 2361308  T
Q  230 agtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2361307 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 2361215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 51 - 322
Target Start/End: Original strand, 2389934 - 2390206
Alignment:
Q  51 cttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaat 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2389934 cttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaat 2390033  T
Q  151 cttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgag 249  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  2390034 cttggaaaaccaaaagagggggctattgcgaaaagggttggtggcttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggatagtcttttgtgag 2390133  T
Q  250 caacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2390134 caacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 2390206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 6360448 - 6360156
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagtt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  6360448 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatattaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 6360349  T
Q  131 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttg-ggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatg 229  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||  |||||||||||| |||   |||||||||    
T  6360348 aaaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgagaaaaggaatggtgccttttgaagaagattcatggagttgaaaaacacatg 6360249  T
Q  230 agtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6360248 agtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 6360156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Original strand, 29608373 - 29608660
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagtt 130  Q
    |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  29608373 tgacccatatgttgataaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 29608472  T
Q  131 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttg-ggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatg 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||     ||||||||||||| |||||||||||    
T  29608473 caaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttg-----gattcatggggttgggaaacacatg 29608567  T
Q  230 agtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29608568 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaatagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 29608660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 33 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 48599858 - 48599578
Alignment:
Q  33 acccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttca 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  48599858 acccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttca 48599759  T
Q  133 aagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatgag 231  Q
    |||||||||||||||||          ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  48599758 aagcttcaagatgtgaa----------ccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaaaacatgag 48599669  T
Q  232 tggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48599668 tagagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 48599578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Original strand, 22269595 - 22269897
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagagtct 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||    
T  22269595 taagcacttcatgacccatttgttgggcaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacatttagggtatgtagatactaaagtttgagggtct 22269694  T
Q  119 ttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttt 218  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       
T  22269695 ttgggtgaggttcaaagctacaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggg-ctcttgggaaagagttggtgccttttggggaagattcatggggagg 22269793  T
Q  219 ggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  22269794 ggaaacacatgagtggagagtctattgagagaaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaatagaagatccttagtgaaatcataggctatgggttggttc 22269893  T
Q  319 tctt 322  Q
    ||||    
T  22269894 tctt 22269897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 20 - 320
Target Start/End: Original strand, 3258616 - 3258916
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagagtct 118  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  3258616 taagcactctatgacccatttggtgaaaaaacttggtgaatctcatggaaaccagaggagggaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtct 3258715  T
Q  119 ttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggtt 217  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3258716 ttgggtgaggttcaaagcttcatgatgtgaatcttggagaacaaaaagatggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggat 3258815  T
Q  218 tggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggtt 317  Q
     ||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  3258816 gggaaacatatgagtggagagtcttttattagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaa-cctaagggttggtt 3258913  T
Q  318 ctc 320  Q
    |||    
T  3258914 ctc 3258916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32358387 - 32358189
Alignment:
Q  16 tatgtaagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32358387 tatgtaagcactccatgacccatttgttgaaaaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgaggg 32358288  T
Q  116 tctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttg-ggaaagggttggtgccttttggggaagattcatgg 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32358287 tctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaaaattcatgg 32358189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 36 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 22328931 - 22328643
Alignment:
Q  36 catttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaa 134  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||  || ||| |||    
T  22328931 catttgttaagtaagcttagtgaatctcatggaaaccaaaggagaaaacttttagggtatttagatactaaaggttgaggatctttggtggaggttaaaa 22328832  T
Q  135 gcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctctt-gggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacacatgagt 232  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  22328831 gcttcaagatgtaaatcttggagaaccaaaagagggggctcttaggaaaagagttggtgccttttggggagagattcatagggttgggaaaaacatgagt 22328732  T
Q  233 ggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| | ||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22328731 agagagtcatttgtgagcaacttgggtgaatcttgggaaactaaaagagaatatcctta-tgtaatcaaaagctaagggttggttctctt 22328643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 55 - 315
Target Start/End: Original strand, 5116290 - 5116551
Alignment:
Q  55 gtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatctt 153  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5116290 gtgaatctcatggataccaaaggaggggacttttagggtatttaaatactaaaggttgagggtctttaggtgatgttcaaaacttcaagatgtgaatctt 5116389  T
Q  154 ggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaa 252  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| || || | |||||| | |   ||| |||||||||||  ||    
T  5116390 tgagaaccaaaagagggggctcttgggagagggtcggtgccttttggagagagattcattggattggtaaacacttcaaatgagggtcatttgtgataaa 5116489  T
Q  253 cttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgg 315  Q
    ||| |||||||| || | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||    
T  5116490 cttaggtgagtcttgggtaaccaaaagagaagatcctcag-gaaatcaaaggttaagagttgg 5116551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 176 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8359708 - 8359567
Alignment:
Q  176 ttgggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaacca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  8359708 ttgggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttggatgagtcttgtgaaacca 8359609  T
Q  276 gaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggtt 317  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8359608 aaagagaaaatccttagtgaaatcaaaggctaagagttggtt 8359567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Original strand, 30814397 - 30814505
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagtt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  30814397 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatacttaaggttgagggtctttgggtgaggtt 30814496  T
Q  131 caaagcttc 139  Q
    |||||||||    
T  30814497 caaagcttc 30814505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 43363863 - 43363667
Alignment:
Q  116 tctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggg 214  Q
    |||||||||| | ||||||  || |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||||||| | |||||||  ||    
T  43363863 tctttgggtgcaattcaaatgttgaagatgtgtatcttggagaactaaaagagggagctcttgggacattgttggttccttttgggaagagattca-agg 43363765  T
Q  215 gtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg 314  Q
    |||  ||||||||||||  |||||||  |||||||||| |||||||| || || || |||| ||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  43363764 gttgagaaacacatgagatgagagtc-cttgtgagcaatttgggtgaatcttgagagaccaaaagagaagatctttag-gaaattaaatgctaagggttg 43363667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22552897 - 22552791
Alignment:
Q  107 ggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttggg-gaag 205  Q
    ||||||| ||||||||||||  || ||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||    
T  22552897 ggttgagggtctttgggtgagatttaaagggtcaaaatgtgaatcttagagaaccaaaagagggggctctt-ggaaacggttggtgccttttgggaaaag 22552799  T
Q  206 attcatgg 213  Q
    ||||||||    
T  22552798 attcatgg 22552791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 23794171 - 23794074
Alignment:
Q  220 gaaacacatgagtgga-gagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttc 318  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |  || |||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  23794171 gaaacacatgagcggatgagtc-tttgtgagcaatttgggtgaatcgtaagagaccaaaagaggagatccttaga-aaatcaaaggctaatggttggttc 23794074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 23794244 - 23794197
Alignment:
Q  156 agaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga 203  Q
    |||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  23794244 agaaccaaaagatgaggatcatgggaaagggttggtgccttttgggga 23794197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 37545379 - 37545308
Alignment:
Q  95 ttagatactaaaggttgagag-tctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaa 165  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  37545379 ttagagactaaaagttgagagatctttggataagattcaaaggtttaagatgtgaatcttggagaaccaaaa 37545308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 15 - 322
Target Start/End: Original strand, 40146877 - 40147185
Alignment:
Q  15 atatgtaagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgaga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40146877 atatgtaagcactccatgacccatttgttggttaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagg 40146976  T
Q  115 gtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg-aaagggttggtgccttttggggaagattcatgg 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40146977 gtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaatggttggtgccttttggggaagattcatgg 40147076  T
Q  214 ggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt 313  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40147077 ggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt 40147176  T
Q  314 ggttctctt 322  Q
    |||||||||    
T  40147177 ggttctctt 40147185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 20 - 313
Target Start/End: Original strand, 213089 - 213384
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctt 119  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  213089 taagtactccatgacccattttttgggtaagcttgatgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctt 213188  T
Q  120 tgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatctt-ggagaaccaaaagagggggctcttggg-aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtt 217  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  213189 tgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttgggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggtt 213288  T
Q  218 tggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt 313  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  213289 gggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt 213384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Original strand, 38746637 - 38746929
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagtt 130  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  38746637 tgactcatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 38746736  T
Q  131 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctctt-gggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  38746737 caaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttaagaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacgtg 38746836  T
Q  230 agtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38746837 agtggagagtcatttgcgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttattgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 38746929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 34 - 322
Target Start/End: Original strand, 27015168 - 27015456
Alignment:
Q  34 cccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaa 133  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  27015168 cccatttgt-gggtatgcttggcgaatctaatggaaatcaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggatcaa 27015266  T
Q  134 agcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatgagt 232  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  27015267 agcttcaagatgtgaatcttgaagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagaatcatggggttgggaaacacatgagt 27015366  T
Q  233 ggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27015367 ggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 27015456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 16 - 322
Target Start/End: Original strand, 5057666 - 5057971
Alignment:
Q  16 tatgtaagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5057666 tatgtaagcactccatgacccatttgttaaaga-gctgggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgaggg 5057764  T
Q  116 tctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg-aaagggttggtgccttttggggaagattcatggg 214  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5057765 tctttgggtgaggatcaaagcttcaagatgtgaatctttgagaaccaaaaga-ggggcttttgggaaaaaggttggtgccttttggggaagattcatggg 5057863  T
Q  215 gtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg 314  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5057864 gttggaaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtaaaatcaaaggctaagggttg 5057963  T
Q  315 gttctctt 322  Q
    ||||||||    
T  5057964 gttctctt 5057971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Original strand, 28277934 - 28278240
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttggg--taagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtc 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28277934 taagcacttcatgacccatttgttgaaaataagcttggtgaatctcaaggaaactaaaggaggaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtc 28278033  T
Q  118 tttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaga-gggggctcttggg-aaagggttggtgccttttggggaagattcatgggg 215  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28278034 tttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatgggg 28278133  T
Q  216 tttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgg 315  Q
    || |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  28278134 ttgggaaacacatgagtggagagactattgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagattgttagtgaaatcaaatgctaagggttgg 28278233  T
Q  316 ttctctt 322  Q
     ||||||    
T  28278234 ctctctt 28278240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 27638161 - 27637858
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctt 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27638161 taagcactctatgacccatttgttaaaaaggcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttaaggttttagatactaaaggttgagaatctt 27638062  T
Q  120 tgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg-aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttt 218  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||     
T  27638061 tgggtgaggttcaaag-ttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgggaaaagggttggtgcatttt-gggaagattcatggggtta 27637964  T
Q  219 ggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccaga--agagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggt 316  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||    
T  27637963 ggaaacacatgagtgaagagtcttttatgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagagaagatccttagtgaaatcaaagactaaaagtttgt 27637864  T
Q  317 tctctt 322  Q
    ||||||    
T  27637863 tctctt 27637858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16642424 - 16642208
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  16642424 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagcacttttagggtatttagatactaaaggttgatggtct 16642325  T
Q  119 ttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtt 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16642324 ttgggtgaggttcaaagcttcaagaagtgaatcttgaagaaccaaaaga--gggctcttgggaaagggttggtgccttttggggacagattcatggggtt 16642227  T
Q  218 tggaaacacatgagtggag 236  Q
     ||||||||||||||||||    
T  16642226 aggaaacacatgagtggag 16642208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Original strand, 316380 - 316686
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggt------gaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagatactaaaggttga 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||      ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  316380 taagcactccttgacccatttgttgagtaagcttggtaatggtgaatctcatggaaactaaaggagagaacttttattgtacttagatactaaaggttga 316479  T
Q  113 gagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcat 211  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  316480 gggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagggggggctcttgggagagggttggtgccttttggggagagattcat 316579  T
Q  212 ggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaaggg 311  Q
      |||| |||||||||| |   ||||||| |||||||||||||| ||||| || || || |||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  316580 aaggttgggaaacacatcaaaagagagtc-tttgtgagcaactt-ggtgaatcttgggagaccaaaagagaaaatcc-tag-gaaatcaaaggctaaggg 316675  T
Q  312 ttggttctctt 322  Q
    |||||||||||    
T  316676 ttggttctctt 316686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Original strand, 4160255 - 4160556
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtct 118  Q
    |||||||||  | ||| |||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || |    
T  4160255 taagcactctttaacctattttttgagtgagctcggtgaatctcatggaaaccaaatgagagaacatttagggtatttagatactaaagtttgagggt-t 4160353  T
Q  119 ttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtt 217  Q
    |||||||| |||||||| || |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||| |||||||| ||| |    
T  4160354 ttgggtgatgttcaaagtttaaagaagtgaatcctggagaactaaaagagggggctcttgggagagggtaagtgtcttttggggagagattcataggg-t 4160452  T
Q  218 tggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggtt 317  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  4160453 tgggaacacgtaagtggagagtcatttgtgagcaactagggtgaatcttgggaaaccaaaagagaagatccttag-gtaattaaaggctaagggttggtt 4160551  T
Q  318 ctctt 322  Q
    |||||    
T  4160552 ctctt 4160556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 30802562 - 30802782
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtct 118  Q
    |||| ||||| ||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||||    
T  30802562 taagtactccttgatcgatttgttgagtacgcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagggaacttttagggtatttagatattctaggttgagggtct 30802661  T
Q  119 ttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtt 217  Q
    || ||||| ||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30802662 ttaggtgaggttcaaagcttcatgatgt-tatcttagagaaccaaaagaggaggctcttgggaaagggtttgtgccttttggggagagattcatggggtt 30802760  T
Q  218 tggaaacacatgagtggagagt 239  Q
     | |||||||||||||||||||    
T  30802761 agaaaacacatgagtggagagt 30802782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 287
Target Start/End: Original strand, 35615792 - 35616060
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtct 118  Q
    |||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||   ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  35615792 taagcactccttgattaatttgttgcgtaagcttggtgaatctccttgaaaccaaatgaaaaaacttttagagtatttagatactaaaggttgagggtct 35615891  T
Q  119 ttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtt 217  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  35615892 ttgagtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggactcttgggaaaggggtgatgccttttggggagagattcatggagtt 35615991  T
Q  218 tggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatc 287  Q
      ||||||||| |  | |||||| ||||| | |||||| |||||||| || ||||||| ||| |||||||    
T  35615992 gagaaacacataaaagaagagtc-tttgtaatcaactttggtgagtcttgggaaaccaaaagcgaagatc 35616060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 33 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 14689942 - 14689655
Alignment:
Q  33 acccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttc 131  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||| | |||||| || ||||||| |||| ||||    
T  14689942 acccatttgttgagtaggcttggtgaatctcatggaaactaaaggagaaaacttttagggcatttagatagtgaaggttaagggtctttgagtgatgttc 14689843  T
Q  132 aaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatgag 231  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || |  | |||||||||| |     
T  14689842 aaagtttcaagatgtgaattttggagaaccaaaagaaggggttcttgtgaaagggttggtgccttttggag-agattcgtgagaatgggaaacacataaa 14689744  T
Q  232 tggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
     ||||||| ||||||||||||||| | | |||| || || |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14689743 aggagagt-atttgtgagcaacttagataagtcttgggacaccaaaagaaaagatccttag-aaaatcaaaggctaggggttggttctctt 14689655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 30792861 - 30793080
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtct 118  Q
    |||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  30792861 taagcacttcttgacccatttgttaagtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagtaaacttttagggtaattagatactaaaggttgagggtct 30792960  T
Q  119 ttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtt 217  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | | |||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  30792961 ttaggtgatgttcaaagcttcaagatgt-tatcttggagaaccaaaatatgtggct-ttgggaaaaggttggtgccttttggggagatattcatggggtt 30793058  T
Q  218 tggaaacacatgagtggagagt 239  Q
     |||||||||||||| ||||||    
T  30793059 gggaaacacatgagtagagagt 30793080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 104 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 33906491 - 33906288
Alignment:
Q  104 aaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga 203  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33906491 aaaggttgagggtctttgagtgaggttcgaagcctcaaaatgtgaatcttgtagaaccaaaaaagggggctcttgggagagggttggtgccttttgggga 33906392  T
Q  204 -agattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaa 302  Q
     ||||||||||||||  ||||||||| |  |||||| | || |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  33906391 gagattcatggggttgagaaacacatcaaaggagagac-ttagtgagcaacttgggtgagtcttgggaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaa 33906294  T
Q  303 ggctaa 308  Q
    ||||||    
T  33906293 ggctaa 33906288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10055238 - 10055031
Alignment:
Q  36 catttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaa 134  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||| || ||||| ||||| ||  || |||||||||| ||||  || |||||||||  ||||||    
T  10055238 catttgttgagtaagtttggtgaatctcatagaaatcaaatgatggaacatttagagtacttggatactaaagattgaaggtttttgggtgagattcaaa 10055139  T
Q  135 gcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacacatgagtg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  10055138 gcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagagggctcttgggaaaggtttggtgccttatggggagagattcacggggttgggaaacacatgagta 10055039  T
Q  234 gagagtca 241  Q
    ||||||||    
T  10055038 gagagtca 10055031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 143 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 21206076 - 21205897
Alignment:
Q  143 atgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtca 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||  ||| || ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  21206076 atgtgaatcttagagaaccaaaagatggggttctttggaaagggttggtgtctttttcggagaggttcatagggttgggaaacacatgagtgaggagtca 21205977  T
Q  242 tttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    ||||| || || |||||||| |  |  ||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21205976 tttgtcagaaatttgggtgaattttaggaaactaaaagtgaagaacctta-tgaaatcaaagactaaggattggttctctt 21205897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 33906678 - 33906585
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgag 113  Q
    |||||||||| | ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  33906678 taagcactccttaacccatttgttgaacaagcttggtgaatctcat-gaaaccaaagaagagaacttttagggtatttagatattaaaggttgag 33906585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 237 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16641269 - 16641185
Alignment:
Q  237 agtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16641269 agtcaattgtgaacaactttggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatacttaaa-aaatcaaaggctaaaggttggttctctt 16641185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 10701151 - 10700948
Alignment:
Q  57 gaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttgg 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||   |||||   |||  ||| || |||||| |||||  | ||||| ||| | |||||| ||||||    
T  10701151 gaatctcatgaaaaccaaaggagggaaatttaagggaacttagaagataagagttaagggtctttaggtgagatccaaaggttctaaatgtga-tcttgg 10701053  T
Q  156 agaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacacatga----gtggagagtcatttgtgagc 250  Q
    |||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||| |    || |||||||||||||||||    
T  10701052 agaacgtaaaaagggggatcttgagaaagggtttgtaccttttggggagagatttatggggttaagaaacacataaattagtagagagtcatttgtgagc 10700953  T
Q  251 aactt 255  Q
    |||||    
T  10700952 aactt 10700948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 42)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 322
Target Start/End: Original strand, 26363882 - 26364189
Alignment:
Q  16 tatgtaagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26363882 tatgtaagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaagggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgaggg 26363981  T
Q  116 tctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttg-ggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggg 214  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  26363982 cctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggggccttttggagaagattcatggg 26364081  T
Q  215 gtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg 314  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26364082 gttgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttg 26364181  T
Q  315 gttctctt 322  Q
    ||||||||    
T  26364182 gttctctt 26364189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Original strand, 8665027 - 8665331
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccattt-gttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtct 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8665027 taagcactccatgacccattttgttaggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtct 8665126  T
Q  119 ttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg-aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtt 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8665127 ttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtt 8665226  T
Q  218 tggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggtt 317  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  8665227 gggaaacacaggagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggttatgtgttggtt 8665326  T
Q  318 ctctt 322  Q
     ||||    
T  8665327 ttctt 8665331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 31 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 55085902 - 55085611
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagtt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  55085902 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcaatgaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 55085803  T
Q  131 caaagctt-caagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg-aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacat 228  Q
     ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55085802 aaaagctttcaagatgtaaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacat 55085703  T
Q  229 gagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55085702 gagtggagagtcatttgtgagcaacttgtgtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgattctc 55085611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Original strand, 6655588 - 6655880
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  6655588 tgacccatttgttgggtaagcttggtaaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 6655687  T
Q  131 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctctt-gggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatg 229  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6655688 caaaactttaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatg 6655787  T
Q  230 agtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6655788 agtggagagtcatttctgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcattagtaaaatcaaaggctaaaggttgtttctctt 6655880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 50674382 - 50674090
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagtt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||| |||    
T  50674382 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttaaatactaaatgttaagggtctttgggtgaggtt 50674283  T
Q  131 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctct-tgggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  50674282 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctctaatgaaaagggttggtgccttatgggaaagattcatggggttgggaaacacatg 50674183  T
Q  230 agtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50674182 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 50674090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Original strand, 54882652 - 54882944
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagtt 130  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  54882652 tgactcatttgttgggtaagcttagtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 54882751  T
Q  131 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctctt-gggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  54882752 caaagcttcaaaatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttatgaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatg 54882851  T
Q  230 agtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54882852 agtgtagagtcttttgtgagaaacttgggtgagtctcgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 54882944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 50263245 - 50262942
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctt 119  Q
    |||||||||  ||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50263245 taagcactctttgacccatttgttgaaaaagtttggtgaatctcatgaaaaccaaaggagggaacttttagggttttagacactaaaggttgagagtctt 50263146  T
Q  120 tgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgg-gaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttt 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50263145 tgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggaaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttg 50263046  T
Q  219 ggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50263045 ggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacctcggtgactcttgtgaaaccaaaagagaagacccttagtgaaatcaaaggctaatggttggttc 50262946  T
Q  319 tctt 322  Q
    ||||    
T  50262945 tctt 50262942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 31 - 292
Target Start/End: Original strand, 40630616 - 40630878
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  40630616 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 40630715  T
Q  131 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttg-ggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40630716 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagcttttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 40630815  T
Q  230 agtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttag 292  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  40630816 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag 40630878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Original strand, 41964037 - 41964339
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagagtct 118  Q
    ||||||||| |||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  41964037 taagcactctatgacccatttggtgagaaagtttggtgaatctcatggaaatcaaaggagggaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtct 41964136  T
Q  119 ttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggtt 217  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||| |||||||||||||||    
T  41964137 ttgggtgaggttcaaagcttcatgatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttagt--cttttgggaaagattcatggggtt 41964234  T
Q  218 tggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggtt 317  Q
     |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41964235 gggaaacacatgagtagagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggtt 41964334  T
Q  318 ctctt 322  Q
    |||||    
T  41964335 ctctt 41964339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 27417498 - 27417205
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27417498 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatgaaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctt 27417399  T
Q  120 tgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggttt 218  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  27417398 tgggtgaggttcaaagctttaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaaggggctcttgggaaaggggttggtgtcttttggggaagattcatggggttg 27417299  T
Q  219 ggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||| ||          ||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27417298 ggaaacacatgagtggagagtcttt----------ttgggtgagtcttgtaaaaccaaaaaagaagatccttagtgaaatcaaagactaagggttggttc 27417209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 48 - 322
Target Start/End: Original strand, 12073042 - 12073316
Alignment:
Q  48 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  12073042 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgta 12073141  T
Q  148 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg--aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttg 245  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||    
T  12073142 aatcttggagaaccaaaaga-ggggctcttgggaaaaagggttggtgcctttt-gggaagattcatggggttggaaaacacatgagtgaagagtcttttg 12073239  T
Q  246 tgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12073240 tgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctctt 12073316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 51 - 322
Target Start/End: Original strand, 35662094 - 35662364
Alignment:
Q  51 cttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaat 150  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  35662094 cttggtgaatctcatggacaccaaatgagagaacttttaggattttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaatatgtgaat 35662193  T
Q  151 cttggagaaccaaaagagggggctctt-gggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgag 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  35662194 cttggagaaccaaaagagggggctcttaggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgaatggagagttctttgtgag 35662293  T
Q  250 caacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35662294 caacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaa-gctaagggttggttctctt 35662364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 24 - 322
Target Start/End: Original strand, 46703126 - 46703423
Alignment:
Q  24 cactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttggg 123  Q
    ||||| || ||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46703126 cactctataacccatttgctgaggaggcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttggg 46703225  T
Q  124 tgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg-aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaa 222  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  46703226 tgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttcgagaatcaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatgggaa 46703325  T
Q  223 acacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    | |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  46703326 a-acatgaatggagagtcttttgtcagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaaaatccttag-gaaatcaaaggctaaaagttggttctctt 46703423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 49 - 322
Target Start/End: Original strand, 379028 - 379302
Alignment:
Q  49 agcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtg 147  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  379028 agcttggtgaatctcgtggaaaccaaaggagagaacttttaggatttgtagatactaaaggttgagggactttgggtgaggttcaaagcttcatgatgtg 379127  T
Q  148 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  379128 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggtcggtgccttttggggaagattcatgagaatgggaaacacatgagtggagagtcatttgt 379227  T
Q  247 gagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  379228 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttag-gaaatcaaaggctaagggttggttctctt 379302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 38 - 322
Target Start/End: Original strand, 33989501 - 33989785
Alignment:
Q  38 tttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagc 136  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33989501 tttgttgggcaagcttggtgaatctcatggaaaccaaagcagataacttttagggtatttagatactaaagtttgagggtctttgggtgaggttcaaagc 33989600  T
Q  137 ttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatgagtggag 236  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  33989601 ttcaagatgtgaatcttgaagaaccaaaatagggggctcttgggagaaggttggtgccttttgggagagattcatgggattgggaaacacatgagtggag 33989700  T
Q  237 agtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||    
T  33989701 agtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttttgaaaccaaaagagaagatccttag-gtaatcaaaggctaaggatttgttctctt 33989785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 46570097 - 46569816
Alignment:
Q  16 tatgtaagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagag 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  46570097 tatgtaagcacaccatgacccatttgttgggcaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaaattttagggttttagatactaaatgttgaagg 46569998  T
Q  116 tctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttg-ggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggg 214  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46569997 tctttaggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaaggattggtgccttttgggaaagattcatggg 46569898  T
Q  215 gtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaa 296  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| || | |||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  46569897 gttgggaaacaaatgagtggaaagtcttttgtgaacaacttaggtgaatcttatgaaaccaaaagagaaggtccttattgaa 46569816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Original strand, 2209340 - 2209637
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  2209340 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaagcaaatgagggaacttttagggttttagatactaaagattgagggtctttgggtgaggtt 2209439  T
Q  131 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg-aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2209440 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaacgaggggactcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 2209539  T
Q  230 agtggagagtca-----tttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    ||||||||||||     | || |       |  | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2209540 agtggagagtcaaaggctatgggttggttctcagcgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctctt 2209637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 322
Target Start/End: Original strand, 8647861 - 8648062
Alignment:
Q  122 ggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggtttgg 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8647861 ggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggg 8647960  T
Q  221 aaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctc 320  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  8647961 aaacacaggagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgttatgtgttggttctc 8648060  T
Q  321 tt 322  Q
    ||    
T  8648061 tt 8648062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 22883300 - 22882998
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtct 118  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  22883300 taagcactccttaacccatttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagggaaattttagggtatttagatactaaaggttgagactat 22883201  T
Q  119 ttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtt 217  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || | |||||||| || ||| |||| |||||    
T  22883200 ttgagtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaacaaaaagagggggctcttgggagagggctgataccttttggagagagactcatagggtt 22883101  T
Q  218 tggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggtt 317  Q
     |||||||||| |   ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |  || |||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||    
T  22883100 aggaaacacatcaaatgagagtc-tttgtgagcaatttgggcgagtcttaggagaccaaaagagaagatccttag-aaaatcaaaggataatggttggtt 22883003  T
Q  318 ctctt 322  Q
    |||||    
T  22883002 ctctt 22882998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 22934964 - 22934662
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtct 118  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  22934964 taagcactccttaacccatttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagggaaattttagggtatttagatactaaaggttgagactat 22934865  T
Q  119 ttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtt 217  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || | |||||||| || ||| |||| |||||    
T  22934864 ttgagtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaacaaaaagagggggctcttgggagagggctgataccttttggagagagactcatagggtt 22934765  T
Q  218 tggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggtt 317  Q
     |||||||||| |   ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |  || |||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||    
T  22934764 aggaaacacatcaaatgagagtc-tttgtgagcaatttgggcgagtcttaggagaccaaaagagaagatccttag-aaaatcaaaggataatggttggtt 22934667  T
Q  318 ctctt 322  Q
    |||||    
T  22934666 ctctt 22934662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 183
Target Start/End: Original strand, 8653220 - 8653384
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccattt-gttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtct 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8653220 taagcactccatgacccattttgttaggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtct 8653319  T
Q  119 ttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8653320 ttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa 8653384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 183
Target Start/End: Original strand, 10071505 - 10071669
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccattt-gttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtct 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10071505 taagcactccatgacccattttgttgggtaatcttggtgaatctcatggaaatcaaaggagggaacttttaaggttttagatactaaaggttgagggtct 10071604  T
Q  119 ttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa 183  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10071605 ttgggtgaggttcaaagctttaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaa 10071669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Original strand, 3785711 - 3786013
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagagtct 118  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |   | |||||||||||||||||||||    
T  3785711 taagcactacttgacccatttgttgagtaagtttggtggatctcatggaaatcaaaggatggaacttttaggatacatggatactaaaggttgagagtct 3785810  T
Q  119 ttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtt 217  Q
    || || ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||     
T  3785811 ttaggcgagattcaaagcttcaagatgtgaatcttgaagaaccaaaagagggggctcttggaaaagggttggtgccttttgaggagagaattatggggtc 3785910  T
Q  218 tggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggtt 317  Q
      | ||||| | |  |||||||| ||||||||||| ||| | ||||| || || |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  3785911 gaggaacacttcaaaggagagtc-tttgtgagcaaattgtgcgagtcttgggagaccaaaagagaatatccttag-gaaatcaaaggctaagagttggtt 3786008  T
Q  318 ctctt 322  Q
    |||||    
T  3786009 ctctt 3786013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 35370874 - 35370582
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagt 129  Q
    |||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  35370874 tgacccatctattgagtaagcttgatgaatctcatggaaatcaaaggagggaacttttaaggtatttagatactaaaggttgagggtctttgggagaggt 35370775  T
Q  130 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaacc-aaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacaca 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |  | ||||||||| ||||   ||| |||    
T  35370774 tcaaagctttaagatgtgaatcttggagaacctaaaagagggggttcttgggagagggttggtcccttttcgaaagagattcatgaggttgataaaaaca 35370675  T
Q  228 tgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtc-atgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    | |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| || |||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35370674 tcaaaggagagtc-tttgtaagcaacttgggtgagtctatg-gataccaaaatagaagat-ctttgggaaatcaaaggctaatggttggttctctt 35370582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 56 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 38811590 - 38811404
Alignment:
Q  56 tgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttg 154  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  38811590 tgaatctcatggaaactaaaggagggaacttttagggtacttagatactaaaggttgagggtatttgggtgaggttcaaagctttaagatgtgaatcttg 38811491  T
Q  155 gagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtca 241  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  38811490 gagaacccaaaga-ggggctcttgggaaagggttggtgtcttttgcggagagattcatgaggttaggaaacacataagtggagagtca 38811404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 82 - 322
Target Start/End: Original strand, 33089582 - 33089811
Alignment:
Q  82 aacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggga 181  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33089582 aacttttaggtatttagatactaaagattgagggtctttgggtgaggttcaaagtttgaagatgtgaatcttggagaatcaaaagagggggctcttggga 33089681  T
Q  182 aagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaaga 280  Q
     |||||||||| ||||||| || |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           || |||| ||||    
T  33089682 gagggttggtgtcttttggagagagattcatggggtcgaaaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgg-----------gagaccaaaaga 33089770  T
Q  281 gaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  33089771 gaagatccttag-aaaatcaaaggctaaaggttggttctctt 33089811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 35369971 - 35369685
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagtt 130  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  35369971 tgacccatctgttgagtaagcttgatgaatctcatggaaattaaaggagggaactttta----tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 35369876  T
Q  131 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaacc-aaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacacat 228  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |  | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  35369875 caaagatttaagatgtgaatcttggagaacctaaaagagggggttcttgggagagggttggtcccttttcgaaagagattcatgaggtttagaaacacat 35369776  T
Q  229 gagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtc-atgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
     |   || |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| || | || || |||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||    
T  35369775 caaaagatagtc-tttgtaagcaacttgggtgagtctatg-gatagcaaaatagaagatcttt--gggaatcaaaggctaagggttggttctctt 35369685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 26699979 - 26699690
Alignment:
Q  36 catttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaa 134  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||    
T  26699979 catttgttgagcaagctttgtgaatctcatggaaaccaaatgagggaacttgtagggcatttagatactaaaggttgaagatctttggttgaggttcaaa 26699880  T
Q  135 gcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaag-agggggctcttgg-gaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacacatgag 231  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||| ||||||  ||||||||||||||||||  | | |||||||||||||  ||| | |||||||    
T  26699879 acttcaagatgtgaatcttagagagccaaatgaagggggatcttggaaaaagggttggtgccttttcagaagagattcatggggtcgggagatacatgag 26699780  T
Q  232 tggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    |||||| ||||| |||| |||||  | |||||| |   |||| | |||||| |||| ||| || ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  26699779 tggagattcattagtgaacaactcagatgagtcttagaaaactaaaagagatgatcttta-tgtaatcaaaggttaaaggttggttctctt 26699690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 140 - 322
Target Start/End: Original strand, 12119281 - 12119461
Alignment:
Q  140 aagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatgagtggagagt 239  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| || |    
T  12119281 aagatatgaatcttggagaattaaaaaagggaactcttgggaaagggttggttcccttttgggaagattcatggggttgcgaaacacattagtggtgaat 12119380  T
Q  240 catttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||| || | |||||||||||||||||    
T  12119381 catttgtgagcaatttgggtgtgtcttgtgaaaccaaaagagaagatcctta-agaaatcgaa-gttaagggttggttctctt 12119461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 91 - 192
Target Start/End: Original strand, 10071963 - 10072065
Alignment:
Q  91 ggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttg-ggaaagggttg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  10071963 ggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaactaaaagagggggctcttgtgaaaagggttg 10072062  T
Q  190 gtg 192  Q
    |||    
T  10072063 gtg 10072065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 46 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 47515023 - 47514835
Alignment:
Q  46 gtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagat 144  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47515023 gtaagcttgtggaatctcatggaaaccaaatgagtgaacttttagggtacttaaacactaaaggttgaaggtcttcgggtgaagttcaaagcttcaagat 47514924  T
Q  145 gtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttg-gggaagattcatggggtttggaaacacatgagt 232  Q
     |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| | ||| || |||||| || ||  | ||| ||||| ||||||||||||||    
T  47514923 atgaatcttggtgaaccaaaagagtggactcttgggaaatgattgatgtcttttgaggaaatgtgcatagggttgggaaacacatgagt 47514835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 322
Target Start/End: Original strand, 34112357 - 34112535
Alignment:
Q  144 tgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcat 242  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  34112357 tgtgaatcttggataacctaaagacgaggctcttagaaaagggttggtgccttttggggagaggttcacggggttggaaaacacatgagtggagagtcat 34112456  T
Q  243 ttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
     |||||||||||||| ||| || ||  ||| || ||  |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  34112457 ctgtgagcaacttggatgaatcttggaaaaacaaaactgaagatccttag-gaaatcaaaggctaaagtttggttctctt 34112535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25723752 - 25723554
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagatactaaaggttgagagtctttgg-gtgaag 128  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||  ||  |||||||| ||||||  ||||||| | || |    
T  25723752 tgacctatttgttaagtaagcttggtgaatttcatggaaaccaaatgagtgaactcttagggtacttcaatactaaatgttgag--tctttggagggagg 25723655  T
Q  129 ttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacaca 227  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||  |||||||||| || || ||| ||||||| |||||||||    
T  25723654 ttcaaagcttcaaaatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttggataatggttaatgccttttggagagagcttcgtggggttgggaaacaca 25723555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 322
Target Start/End: Original strand, 41961110 - 41961334
Alignment:
Q  102 ctaaaggttgagagtctttggg-tgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgg 200  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||  || | |||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||| | ||| ||||| ||||||    
T  41961110 ctaaagggtgagggtctttggggtgagattcaaagtgtccaaatgtgaatcttgtagaaccgaaaaagggggctctagggagaaggtcggtgctttttgg 41961209  T
Q  201 gga-agattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagc-----aacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtg 294  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||| |  |||||||| | |||||||     |||||||||||||| || || |||| || |||| |||||||| |    
T  41961210 ggagagattcat-gggttgggaaacacattaaaggagagtc-tatgtgagcaacgtaacttgggtgagtcttgggagaccaaaaaagaatatccttag-g 41961306  T
Q  295 aaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  41961307 aaatcaaaagctaagggttggttctctt 41961334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 22629399 - 22629147
Alignment:
Q  57 gaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttgg 155  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||   |||||| |||||||||| || |||| |||||||  || |||  |||||||||||||||||||    
T  22629399 gaatctcatagaaaccaaatgagtgaacttttaggaaatttagaaactaaaggttcagtgtctctgggtgagatttaaaagttcaagatgtgaatcttgg 22629300  T
Q  156 agaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaact 254  Q
    |||||||||| ||| |  | |||  ||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||  |||||||||||| ||||||| || | ||||||| |    
T  22629299 agaaccaaaataggagaatattgaaaaatggttagtgccttttgggaagatatttatggggttgagaaacacatgagaggagagt-atctctgagcaatt 22629201  T
Q  255 tgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaag 309  Q
    || |||| || || || ||||  | | |||||||||||  |||||||||||||||    
T  22629200 tgagtgaatcttgggagaccaacataaaagatccttag-aaaatcaaaggctaag 22629147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 154
Target Start/End: Original strand, 32091222 - 32091326
Alignment:
Q  52 ttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt--tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaa 149  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  32091222 ttggtgaatttcatggaaactaaaagagggaatttttaaggtattttggatactaaatgttgagggtctttgagtgaggttcaaaacttcaagatgtgaa 32091321  T
Q  150 tcttg 154  Q
    |||||    
T  32091322 tcttg 32091326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 6719289 - 6719384
Alignment:
Q  102 ctaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttt 197  Q
    |||||||||||  || || ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||    
T  6719289 ctaaaggttgaaggttttagggtgagattcaaaggttcaagatgtgaatcttggaaaactaaaagagtggattcttgggaaagggttgatgccttt 6719384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 6200315 - 6200139
Alignment:
Q  116 tctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggtt-ggtgccttttgggga-agattcatgg 213  Q
    |||||||||| | ||||||  || |||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||| || ||| ||| ||||||||||| ||||   |||    
T  6200315 tctttgggtgcaattcaaatgttgaagatgtgtatcttggagaactaaaagatggagctcttgggacagagttgggttccttttggggagagatatgtgg 6200216  T
Q  214 ggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatcctta 291  Q
    ||||  ||||||||||||  |||||||  || ||||||| |||| ||| || || || |||| |||||||||||||||    
T  6200215 ggttgagaaacacatgagatgagagtc-cttatgagcaatttggatgaatcttgagataccaaaagagaagatcctta 6200139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 43135896 - 43135810
Alignment:
Q  115 gtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggg 202  Q
    |||||||||||| ||| ||||  || | ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  43135896 gtctttgggtgatgtttaaagtgtccaaatgtgaatcatggtgaaccaaaaga-ggggctcttgagagagggttggtgtcttttgggg 43135810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 319
Target Start/End: Original strand, 32091324 - 32091399
Alignment:
Q  243 ttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttct 319  Q
    |||||| |||||||||| |||  || || |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  32091324 ttgtgaacaacttgggtaagttttgggagaccagaggagaagatccttag-gaaatcaaaggcaaagtgttggttct 32091399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 216
Target Start/End: Original strand, 4914167 - 4914236
Alignment:
Q  147 gaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggt 216  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||| |||| |||||| |||||    
T  4914167 gaatcttgtggaatcaaaagaggggactcttgggatagggttggtttctttttgggatgattcaaggggt 4914236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 49
Target Start/End: Original strand, 41639182 - 41639215
Alignment:
Q  16 tatgtaagcactccatgacccatttgttgggtaa 49  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41639182 tatgtaagcacttcatgacccatttgttgggtaa 41639215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Original strand, 6960 - 7252
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagtt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  6960 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 7059  T
Q  131 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttg-ggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  7060 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatg 7159  T
Q  230 agtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7160 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtaaaatcaaaggctaagggttggttctctt 7252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Original strand, 11348319 - 11348622
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctt 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  11348319 taagtactccatgacccatttgttgggtaagcttagtgaatctcatggaaaccaaaggatggaacttttagggttttagatactaagggttgagggtctt 11348418  T
Q  120 tgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggt-tggtgccttttggggaagattcatggggttt 218  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  11348419 tgggtgaggttcaaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaaggtctggtgccttttggagaagattcatggggttg 11348518  T
Q  219 ggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttc 318  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11348519 gaaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttc 11348618  T
Q  319 tctt 322  Q
    ||||    
T  11348619 tctt 11348622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Original strand, 29135880 - 29136171
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagtt 130  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  29135880 tgacccatttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgagtgaggtt 29135979  T
Q  131 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg-aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29135980 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggactcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatgggg-ttggaaaaacatg 29136078  T
Q  230 agtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29136079 agtggagagttttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttagttctctt 29136171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Original strand, 34603197 - 34603499
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctt 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  34603197 taagcactctatgacccatttgttggaaaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatattaaaggttgaaggtctt 34603296  T
Q  120 tgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg-aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttt 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34603297 tgggtgatgttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttg 34603396  T
Q  219 ggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttc 318  Q
    | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34603397 gaaaacacatgagtgaaaagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaaggctaagggttggttc 34603495  T
Q  319 tctt 322  Q
    ||||    
T  34603496 tctt 34603499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 47255881 - 47255584
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctt 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47255881 taagcacttcatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctt 47255782  T
Q  120 tgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttg 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  47255781 tgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagatggggctcttgggaaa---atggtgccttttggggaagattcat-gggttgg 47255686  T
Q  220 gaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttct 319  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47255685 gaaacacatgattggagagtcttttgtgagcaactt-agtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaagactaagggttggttct 47255587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 34602886 - 34602584
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctt 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  34602886 taagcactctatgacccatttgttggaaaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatattaaaggttgaaggtctt 34602787  T
Q  120 tgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgg-gaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttt 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34602786 tgggtgatgttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttggtaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttg 34602687  T
Q  219 ggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttc 318  Q
    | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34602686 gaaaacacatgagtgaaaagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaaggctaagggttggttc 34602588  T
Q  319 tctt 322  Q
    ||||    
T  34602587 tctt 34602584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 37033605 - 37033317
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagtt 130  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  37033605 tgacccttttgttgagtaagctgggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtttta----ctaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 37033510  T
Q  131 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  37033509 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttgaggaagattcatgaggttgggaaacacatg 37033410  T
Q  230 agtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37033409 agtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctctt 37033317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 24 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 42298518 - 42298219
Alignment:
Q  24 cactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttggg 123  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42298518 cactccctgatccatttgttgggtaagcttggtgaatcccataacaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttggg 42298419  T
Q  124 tgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttg-ggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaa 222  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  42298418 tgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaa 42298319  T
Q  223 acacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42298318 acacatgagtggagagtcatttgcgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcctaagtgaaatcaaaggctaagagttggttctctt 42298219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Original strand, 193244 - 193535
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  193244 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagataacttttagggttttagatattaaaggttgagggtctttcggtgaggtt 193343  T
Q  131 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctctt-gggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatg 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  193344 caaagcttcatgatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaaaggttggtgcctttt-gggaagattcatggggttgggaaacacatg 193442  T
Q  230 agtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
     ||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193443 tgtgaagagtcttttgtgagcaacttggatgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 193535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 37879447 - 37879155
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||    
T  37879447 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaatcaaaggaaggaactgttagggttttagatactaaatgttgaggatctttgggtgaggtt 37879348  T
Q  131 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttg-ggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  37879347 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaacaaaaagagggggctcttgtgaaaaaggttggtgccttttggggaaaattcatggggttgggaaacacatg 37879248  T
Q  230 agtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37879247 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaaggattggttctctt 37879155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 13547625 - 13547333
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagtt 130  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  13547625 tgacccatttgtttggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagagttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 13547526  T
Q  131 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttg-ggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||    
T  13547525 caaagcttcaagatgtgaatcttggataaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggtcggtgccttttgaggaaaattcatggggttggaaaacacatg 13547426  T
Q  230 agtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13547425 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgaatcttgtgaaaccaaaagagaagatacttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 13547333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 13549536 - 13549244
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagtt 130  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  13549536 tgacccatttgtttggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagagttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 13549437  T
Q  131 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttg-ggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||    
T  13549436 caaagcttcaagatgtgaatcttggataaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggtcggtgccttttgaggaaaattcatggggttggaaaacacatg 13549337  T
Q  230 agtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13549336 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgaatcttgtgaaaccaaaagagaagatacttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 13549244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Original strand, 19754112 - 19754418
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  19754112 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttctagatactaaaggttaagggtctt 19754211  T
Q  120 tgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttg-ggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttt 218  Q
    ||||||| |||||||||  || ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19754212 tgggtgaggttcaaagcaccatgatttgaatcttggaaaaccaagagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttg 19754311  T
Q  219 ggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatcctt---agtgaaatcaaaggctaagggttgg 315  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||||||||||||| ||| ||||||    
T  19754312 ggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaaaatccttataagtgaaatcaaaggataatggttgg 19754411  T
Q  316 ttctctt 322  Q
    |||||||    
T  19754412 ttctctt 19754418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Original strand, 37167917 - 37168221
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttggg-taagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtct 118  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |    
T  37167917 taagcactctatgacccatttggtgaaataggcttggggaatctcatggaaatcaaaggagggaacttttacagttttagatactaaaggttgagggttt 37168016  T
Q  119 ttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggtt 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37168017 ttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtt 37168116  T
Q  218 tggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggtt 317  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  37168117 gggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaactaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaaaggttgatt 37168216  T
Q  318 ctctt 322  Q
    |||||    
T  37168217 ctctt 37168221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 7482778 - 7482476
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctt 119  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  7482778 taagcacactatgacccatttagtgaataagtttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggaaacttttagggttttagatactaacggttgagggtctt 7482679  T
Q  120 tgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagag-ggggctcttggg-aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtt 217  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7482678 tgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtt 7482579  T
Q  218 tggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggtt 317  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  7482578 gggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaacaaaaagagaagatccttag-gaaatcaaa-gctaagggttggtt 7482481  T
Q  318 ctctt 322  Q
    |||||    
T  7482480 ctctt 7482476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Original strand, 28242010 - 28242312
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagagtct 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  28242010 taagcactctatgacccatttgttaaa-aagtttggtgaatctcatgaaaaccaaaggagggaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtct 28242108  T
Q  119 ttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggtt 217  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  28242109 ttgggtgaggttcaaagcttcaaaatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggg-aagattcataaggtt 28242207  T
Q  218 tggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggtt 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28242208 gggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaatatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggtt 28242307  T
Q  318 ctctt 322  Q
    |||||    
T  28242308 ctctt 28242312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Original strand, 19752307 - 19752609
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  19752307 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatgaaaaccaaatgagggaatttttagggttttagatactaaaggttgaaggtctt 19752406  T
Q  120 tgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttg 219  Q
    ||||||| |||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  19752407 tgggtgaggttctaagcgtcataatgtgaatcttggagaaccaaaagatggggctcttatgaaaaggttggtgccttttggggaagattcattgagttgg 19752506  T
Q  220 gaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttct 319  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  19752507 gaaacacatgagtggagagtattttgtgagcaacttagatgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaatgattggttct 19752606  T
Q  320 ctt 322  Q
    |||    
T  19752607 ctt 19752609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 52 - 322
Target Start/End: Original strand, 47114825 - 47115095
Alignment:
Q  52 ttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatc 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  47114825 ttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttaaggctttagatattaaagattgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagctgtgaatc 47114924  T
Q  152 ttggagaaccaaaagagggggctcttgggaa-agggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  47114925 ttggagaaccaaaagagggggctcttgggaacagggttggtacctttt-gggaagattcatggggttgggaaacacatgaatggagagtcttttgtgagc 47115023  T
Q  251 aacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47115024 aacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttaatgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 47115095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Original strand, 41135452 - 41135743
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagt 129  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  41135452 tgacccatttgttgaataagcttggttaatctcatggaaaccaaaggagggaaattttaatgtatttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 41135551  T
Q  130 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacacat 228  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | | |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  41135552 tcaaaccttcaagatgtggatcttggagaaccaaaagaggaagattttgggagagggttggtgccttttagggagagattcatggggttgggaaacacat 41135651  T
Q  229 gagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
     |  |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| || | ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  41135652 caaaggagagtc-tttgtgagaaacttgggtgagtcttaggaaaccaaaagagaagatcatttg-gaaattaaaggctaaggattggttctctt 41135743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 36 - 322
Target Start/End: Original strand, 6808083 - 6808370
Alignment:
Q  36 catttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtttt-agatactaaaggttgagag-tctttgggtgaagttcaa 133  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||    
T  6808083 catttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggaaacttttagattttttagatactaaaggttgaggggtctttaggtgaggttcaa 6808182  T
Q  134 agcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacacatgagt 232  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||  || ||| |||||||| | |||||||||||||| | |||||||||| |    
T  6808183 aacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagattgggctcttgg-agagattttgtgtcttttgggaagagattcatggggttggaaaacacatgaat 6808281  T
Q  233 ggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |  | |||||||||||||    
T  6808282 gaagagtcatttgtgagcaactagggtgagtaatggaaaaccaaaagagaagatcatta-tgtaatcaaagacggaaggttggttctctt 6808370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 181 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 31926091 - 31925950
Alignment:
Q  181 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaaga 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  31926091 aaagggttggtgccttttggggaagattcatgggtttgggaaacacgtgagtggagaatcttttgtgagcaacttgggtgagacttgtgaaaccaaaaga 31925992  T
Q  281 gaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31925991 gaagatccttagtgaaatcaaaggctaatggttggttctctt 31925950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 9109949 - 9109680
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagagtct 118  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||| |  | |||||||||| ||||||||| |||| || | ||||||| |||| | || ||||||||||||||| || |    
T  9109949 taagcaatccttgacccatttattgagacaacttggtgaatgtcatggaaatcaaatgatgaaacttttggggtatataaatactaaaggttgagggtat 9109850  T
Q  119 ttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtt 217  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||    
T  9109849 ttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaaggggactcatgggagagggttgatgtcttttggggagagattcatgaggtt 9109750  T
Q  218 tggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatc 287  Q
     ||| |||||| |   ||||||| ||||||||||| |||| |||||| || |||| || || ||||||||    
T  9109749 gggagacacatcaaatgagagtcttttgtgagcaatttggatgagtcttgggaaatcaaaatagaagatc 9109680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 31928348 - 31928208
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttg-ttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtct 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  31928348 taagcactccatgacccatttgattgggtaagcttggtgaatttcatggaaaccaaaggagggaactt--------ttagatactaaaggttgagagtct 31928257  T
Q  119 ttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaga 167  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  31928256 ttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttagaaaaccaaaaga 31928208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 310
Target Start/End: Original strand, 22078962 - 22079233
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaa-gcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtct 118  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||  ||| | ||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| |||       ||| ||||| ||||    
T  22078962 taagcactccttgacccatttgatgattaaagtttggtgaatcttatggaaactaaatgatggaacttttagggtatta-------aagtttgagggtct 22079054  T
Q  119 ttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttt 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||  |||||||||| | ||||||||           |||     
T  22079055 ttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttaaagaaccaaaagagggggcaattgggtgagggttggtgtcgtttgggga-----------gttg 22079143  T
Q  219 ggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagg 310  Q
    |||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||||| || | ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  22079144 ggaaacacatcaagggagagtc-tttgtgagcaacttaggtgagtcttggcaaaccaaaatataagatgctta-tgaaatcaaaggctaagg 22079233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 16216966 - 16216745
Alignment:
Q  94 tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgc 193  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16216966 tttagaaactaaaggttaagggtctttgggtgatattcaaaggttcaagatgtatatcttgaagaaccaaaagagggggctcttcgaaaagggttggtgc 16216867  T
Q  194 cttttgggga-agattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttag 292  Q
     ||||||  | | |||||| | ||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |  ||  ||   | ||||||||||||||||    
T  16216866 attttggatagaaattcat-gtgttggcaaacacatgagaggagagtca-ttgtgagcaacttgagtgaattttgaaaacttaaaagagaagatccttag 16216769  T
Q  293 tgaaatcaaaggctaagggttggtt 317  Q
     |||||||||||||| | |||||||    
T  16216768 -gaaatcaaaggctacgagttggtt 16216745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 12318890 - 12318726
Alignment:
Q  157 gaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttggggaaga-ttcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaactt 255  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| || ||  ||||||||| |  |||||||  ||| ||||||||||    
T  12318890 gaaccaaatgagagggctcttgggagagggttggtgccttttggggagaagttcataggattgagaaacacatcaaaggagagtt-tttatgagcaactt 12318792  T
Q  256 gggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    ||||||||| || || |||| || |||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12318791 gggtgagtcttgggagaccaaaatagaaaatcttttg-gaaatcaaaggctaagggttggttctctt 12318726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 188
Target Start/End: Original strand, 3331283 - 3331333
Alignment:
Q  138 tcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggtt 188  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3331283 tcaagatgtgaatcttagagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggtt 3331333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28318188 - 28318110
Alignment:
Q  138 tcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagag-ggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggg 214  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  28318188 tcaagatgtgaattttggataaccaaaagagaggggttcttgggaaagggttagtgcattttggggagagattcatggg 28318110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 4535860 - 4535783
Alignment:
Q  181 aaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgg 257  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  4535860 aaagggttggtgtcttttgggaatagattcatggggttgaaaaacacatgagtggatagtcgtttgtgagcaacttgg 4535783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 227
Target Start/End: Original strand, 6068287 - 6068447
Alignment:
Q  69 aaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaga 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||   ||| |  ||||| |||||| |||||||| |||  ||||||   | |||| ||||||||  | |||||||||||    
T  6068287 aaccaaaggagagaacttttagggaacttaaaggctaaaagttgagggtctttggatgagattcaaatgatgaagacgtgaatctaagggaaccaaaaga 6068386  T
Q  168 gggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacaca 227  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||  |||| |||||||||    
T  6068387 gggggctcttaggaaaaggttggtgtcttttgggaagagattcataaggttgggaaacaca 6068447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 38747144 - 38747052
Alignment:
Q  138 tcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacacatga 230  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||    
T  38747144 tcaagatatgaatcttagacaaccaaaac-gggggctcttgaaaaagggttggtgccttttggagagaggttcatagggttggaaaacacatga 38747052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 318
Target Start/End: Original strand, 6068472 - 6068512
Alignment:
Q  277 aagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttc 318  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6068472 aagagaagatccttag-gaaatcaaaggctaagagttggttc 6068512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 16 - 322
Target Start/End: Original strand, 11383603 - 11383910
Alignment:
Q  16 tatgtaagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagag 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11383603 tatgtaagcactccatgtcccatttgttaggcaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgaggg 11383702  T
Q  116 tctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttg-ggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggg 214  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11383703 tctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctattgtgaaaagggttggtgccttttgaggaagattcatggg 11383802  T
Q  215 gtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg 314  Q
    ||| ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11383803 gttgggaaatacataagtggaaagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg 11383902  T
Q  315 gttctctt 322  Q
    ||||||||    
T  11383903 gttctctt 11383910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 42435527 - 42435235
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagtt 130  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  42435527 tgacccatttgttcggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 42435428  T
Q  131 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg-aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  42435427 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaaaggttggtgacttttggggaagattcatggggttgggaaacatatg 42435328  T
Q  230 agtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42435327 aatggagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 42435235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Original strand, 44353416 - 44353716
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctt 119  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44353416 taagcaatccatgactcatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctt 44353515  T
Q  120 tgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaa-agggttggtgccttttggggaagattcatggggttt 218  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  44353516 tgggtgaggtttaaaacttcaaga---gaatcttggagaactaaaagagggggctcttgtgaagagggttggtgccttttggagaagattcatggggttg 44353612  T
Q  219 ggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttc 318  Q
    | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44353613 gaaaacacatgagtggagagtcatcggtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttc 44353712  T
Q  319 tctt 322  Q
    ||||    
T  44353713 tctt 44353716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Original strand, 40221376 - 40221669
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggg-aacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagt 129  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||| ||| ||    
T  40221376 tgacccatttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaaccataggaggggaacttttagggtttttgatactaaaggtggaaggtctttggatgaggt 40221475  T
Q  130 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaggg-ttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacat 228  Q
    | | | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40221476 ttagaacttcaagatgtgaatcttcgagaaccaaaatagggggctcttgggaaaggggttagtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacat 40221575  T
Q  229 gagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40221576 gagtggagagtcttttgtgagcaacttaggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaaaggttggttctctt 40221669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Original strand, 4283178 - 4283448
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagtt 130  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  4283178 tgacccatttgttgtgtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 4283277  T
Q  131 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatga 230  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||                     ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4283278 caaagcttcaagatgtggatcttggagaaccaaaagagggggcttttggga---------------------aagattcatggggttgggaaacacatga 4283356  T
Q  231 gtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4283357 gtggaaagtcttttgtgagaaacttggttgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 4283448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 254
Target Start/End: Original strand, 22976151 - 22976389
Alignment:
Q  16 tatgtaagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagag 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  22976151 tatgtaagcactccataacccatttgttgggtaagcttagtgaatctcttcgaaaccaaaggagtgaacttttagagttttagatactaaaggttgaggg 22976250  T
Q  116 tctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgg-gaaagggttggtgccttttggggaagattcatggg 214  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22976251 tctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggaggctcttggaaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggg 22976350  T
Q  215 gtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaact 254  Q
    | ||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  22976351 g-ttgaaaacacatgagtgaagagtctattgtgagcaact 22976389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 96 - 322
Target Start/End: Original strand, 40328476 - 40328703
Alignment:
Q  96 tagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa-gggttggtgcc 194  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  40328476 tagatactaaagatttagggtctttgggtgaggttcaaagcttcatgatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggttcttgggaaaagggttggtgcc 40328575  T
Q  195 ttttggggaagattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtg 294  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  40328576 ttttagggaagattcatggggatgggaaacacatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatctttagtg 40328675  T
Q  295 aaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  40328676 aaatcaaaggctatgagttggttctctt 40328703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 51 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 3000037 - 2999823
Alignment:
Q  51 cttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaa 149  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3000037 cttggtgaatctcatagaaaccaaaggagagaacttttagggaatttagatactaaaggttgagggtctttgggtgatgttcaaagcttcaagatgtgaa 2999938  T
Q  150 tcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggg-aagattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtga 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2999937 tcttggagaaccaaaagagggggttcttgggatatggttggtgtcttttggggaaagattcatggggatgagaaacacatgagtagagagtcaattgtga 2999838  T
Q  249 gcaacttgggtgagt 263  Q
    |||||||||| ||||    
T  2999837 gcaacttgggcgagt 2999823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Original strand, 40585345 - 40585648
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtct 118  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || |||||| | ||||||||| |||||||||||   ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  40585345 taagcactcattgacccatttgttgcgtgagcttgattaatctcatgaaaaccaaaggaaataacttttagagtatttagatactaaaggttaagagtct 40585444  T
Q  119 ttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctc-ttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggt 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| || ||| ||||||| || ||||||| || |||||||||||||    
T  40585445 ttggttgaggttcaaagcttcaagatgtgaatatttgagaatcaaaagagtgggctcttttggagagggttgatgtcttttggtgagagattcatggggt 40585544  T
Q  217 ttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggt 316  Q
    ||| |||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||  | |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  40585545 ttgaaaacacatcaaaggagagtc-tttgtgagcaatttgggtgagtattggtagaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaagactaagggttggt 40585642  T
Q  317 tctctt 322  Q
    ||||||    
T  40585643 tctctt 40585648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20686586 - 20686456
Alignment:
Q  38 tttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagc 136  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  20686586 tttgttgggtaagctcggtgaatctcattgaaaccaaaggagggaactttcagggtacttagatactaaatgttgaggatcttt-ggtgaagttcaaagc 20686488  T
Q  137 ttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagag 168  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20686487 ttcaagatgtgaatcttggataaccaaaagag 20686456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3846321 - 3846126
Alignment:
Q  64 atggaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaacca 162  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||  || || ||||||||||||| ||  ||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  3846321 atggaaaccaaaggagaaaactttcagggtactttgaaactaaaggttgagggttcttgagtgagattcaaaggttcataatgtgaatcttgaagaacca 3846222  T
Q  163 aaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggt 259  Q
    |||||  | |||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| || ||||||||||| ||||||    
T  3846221 aaaga-agagctcttggaaaagagttggtgtcttttggggagagattcatggggttgggaaacacatgagagaagattc-tttgtgagcaaattgggt 3846126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 261
Target Start/End: Original strand, 40535538 - 40535713
Alignment:
Q  85 ttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa 183  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  40535538 ttttagggtatttagatactaaagattgatggtctttgggtg--gttcaaagtttcaagttgtggatcttttagaaccaaaagagggggttcttgagaaa 40535635  T
Q  184 gggttggtgccttttggggaaga-ttcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtga 261  Q
    |||||| ||||||||||  || | |||||| | || | ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  40535636 gggttgatgccttttggataaaagttcatgtgattggaaaacacatgagagaagagtca-ttgtgagcaacttaggtga 40535713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 95 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 9634007 - 9633816
Alignment:
Q  95 ttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgcc 194  Q
    ||||| ||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||  || | |||||||||||| | || ||||||| || |||||||  ||||| ||||| ||    
T  9634007 ttagaaactaaaggtcgaacgtctttgggtgagattcaaagtgtccaaatgtgaatcttgaataatcaaaagatggcgctcttgaaaaagg-ttggtacc 9633909  T
Q  195 ttttggggaagattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatc 287  Q
    |||||||  ||||| |||||||| | |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| | |||||||||    
T  9633908 ttttgggagagattaatggggttggtaaacacataagatgagagtcatttgtgagcaacttgggtgaatcttaggaaaccaaacgagaagatc 9633816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 243 - 314
Target Start/End: Original strand, 18655246 - 18655317
Alignment:
Q  243 ttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg 314  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18655246 ttgtgagcaacttcggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg 18655317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 3817840 - 3817641
Alignment:
Q  61 ctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaa 159  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| || | || || || ||||||| || |||||| || ||||| ||||    
T  3817840 ctcatggaaaccaaaggagaaaacttttagggtacttagaaactaaaggttgagggtttctgagtaaa-ttcaaaggttgaagatgggattcttgaagaa 3817742  T
Q  160 ccaaaagagg--gggctcttgggaaagggttggtgccttttgg-ggaagattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttg 256  Q
    ||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||| |||| || | ||| || ||||||||||| |||    
T  3817741 ccaaaagaattagggctcttggaaaagggttggtgccttttggagaaagattcatggggttggaaaatacataagagaagattc-tttgtgagcaaattg 3817643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 246
Target Start/End: Original strand, 11136796 - 11136989
Alignment:
Q  55 gtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatctt 153  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |  | ||||||||   ||| | ||||||||||| | ||||||||||||  ||||||   || | || ||||| ||    
T  11136796 gtgaatctcatggaaactaaaggatgagatttttagggaacttaaaaactaaaggttgggggtctttgggtgagattcaaattgtccaaatatgaatttt 11136895  T
Q  154 ggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgt 246  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||  ||| | ||||||||||||| || ||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  11136896 ggagaactaaaagagagggctcttggaaattggtcgatgccttttggggagaggttcattgggtaggaaaacacatgagtggagagtcatttgt 11136989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 188
Target Start/End: Original strand, 10020150 - 10020229
Alignment:
Q  109 ttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggtt 188  Q
    ||||| |||||| |||||  ||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10020150 ttgagggtctttaggtgagattcaaatgatcaatatgtgaatcttagagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggtt 10020229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10101588 - 10101525
Alignment:
Q  138 tcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttggg 201  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  10101588 tcaaaatgtgaaccttggagaaccaaaagaggaggctcttgggaaagggttgctgcattttggg 10101525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 212
Target Start/End: Original strand, 28461305 - 28461375
Alignment:
Q  143 atgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  28461305 atgtgaatcttggagaaccaaaagaggaagctcttaggaaatggttggttccttttggggatagattcatg 28461375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 93
Target Start/End: Original strand, 10239709 - 10239782
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt 93  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  10239709 taagaactccttgacccttttgttgagtaagcttgacgaatctcatggaaatcaatagagggaacttttagggt 10239782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 33655655 - 33655549
Alignment:
Q  214 ggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt 313  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||| |||||||| || |  || | || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  33655655 ggtttggaaacacattaaaggagtgtc-tttgtgagcaatttgggtgaatcttaggagaacaaaagagaagatccttaga-aaatcaaaggttaagggtt 33655558  T
Q  314 ggttctctt 322  Q
    |||||||||    
T  33655557 ggttctctt 33655549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 31)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 49200007 - 49199714
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagtt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  49200007 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 49199908  T
Q  131 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttg-ggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  49199907 caaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctattgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacatatg 49199808  T
Q  230 agtggagagtcatttgtgagcaacttggg-tgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49199807 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggttgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaatggttggttctctt 49199714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 43402326 - 43402034
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagtt 130  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  43402326 tgactcatttgttgggtgagcttggtgaatcttatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 43402227  T
Q  131 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttg-ggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43402226 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgagaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 43402127  T
Q  230 agtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43402126 agtggagaatcatttgtgaacaacttgggtaagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctctt 43402034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 43404269 - 43403977
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagtt 130  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||    
T  43404269 tgacccatttgttgggtgagcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagggaacttttagggttttagatactaaaagttgagggtctttgggtgaggtt 43404170  T
Q  131 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg-aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  43404169 caaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatg 43404070  T
Q  230 agtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43404069 agtggagagtcatttgggagcaacttgggtgagtcttgtgaaactaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctctt 43403977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Original strand, 34490833 - 34491137
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttg-ttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34490833 taagcactccatcacccattttattgtgaaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtct 34490932  T
Q  119 ttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttg-ggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtt 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  34490933 ttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggagtt 34491032  T
Q  218 tggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggtt 317  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34491033 gaaaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggtt 34491132  T
Q  318 ctctt 322  Q
    |||||    
T  34491133 ctctt 34491137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 38 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 6096128 - 6095843
Alignment:
Q  38 tttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagct 137  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  6096128 tttgttgggaaagcttggtgaatctcatggaaatcagaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagct 6096029  T
Q  138 tcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatgagtggag 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6096028 tcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttttgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggag 6095929  T
Q  237 agtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6095928 agtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaaaggttggttctctt 6095843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Original strand, 4569583 - 4569875
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagtt 130  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  4569583 tgacccatttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 4569682  T
Q  131 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg-aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatg 229  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4569683 caaagcttcaagatgtaaatcttggagaatcaaaagagggggctcttgggaaaagggggtgtgcctattggggaagattcatggggttgggaaacacatg 4569782  T
Q  230 agtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4569783 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagatgatctttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 4569875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Original strand, 30235745 - 30236049
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccattt-gttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtct 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30235745 taagcactccatgacccattttgttgggtaagcttggtgaatctcaatgaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtct 30235844  T
Q  119 ttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttg-ggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtt 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30235845 ttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaatattcatggggtt 30235944  T
Q  218 tggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggtt 317  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  30235945 ggaaaacacaagagtggagagtcatttgtgagcaagttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcgaaggctaatgattggtt 30236044  T
Q  318 ctctt 322  Q
    |||||    
T  30236045 ctctt 30236049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 55302516 - 55302209
Alignment:
Q  16 tatgtaagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  55302516 tatgtaagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatttcattgaaaccaaaggaggaaacttttagggttttagatactaaaagttgaggg 55302417  T
Q  116 tctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg-aaagggttggtgccttttggggaagattcatggg 214  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  55302416 tctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgggaaaagggttggtgccttttgggaaaaattcatgag 55302317  T
Q  215 gtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg 314  Q
    ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55302316 gttggaaaacacatgagtggagattcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaggggttg 55302217  T
Q  315 gttctctt 322  Q
    ||||||||    
T  55302216 gttctctt 55302209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 16 - 322
Target Start/End: Original strand, 40912954 - 40913263
Alignment:
Q  16 tatgtaagcactccatgacccatttgttgggtaa-gcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgaga 114  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  40912954 tatgtaagcattctttgacccatttgttgggtaaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggggacttttagggttttagatactaaaggtttagg 40913053  T
Q  115 gtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg-aaagggttggtgcc-ttttggggaagattcatg 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  40913054 gtctttgggtgaggttcaaagcttcaaaatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgcctttttggagaagattcatg 40913153  T
Q  213 gggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggt 312  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  40913154 gggttgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaaattgggtgagtcttgtgaaagcaaaagagaagatccttagtgaaattaaaggttaagggt 40913253  T
Q  313 tggttctctt 322  Q
    ||||||||||    
T  40913254 tggttctctt 40913263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 16 - 314
Target Start/End: Original strand, 54593321 - 54593621
Alignment:
Q  16 tatgtaagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagatactaaaggttgaga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  54593321 tatgtaagcactccatgacccatttgttcgaaaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagg 54593420  T
Q  115 gtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatgg 213  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54593421 gtccttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtaccttttggggaagattcatgg 54593520  T
Q  214 ggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt 313  Q
    || | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54593521 ggatggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaatagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt 54593620  T
Q  314 g 314  Q
    |    
T  54593621 g 54593621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Original strand, 47303872 - 47304175
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccattt-gttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtct 118  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||    
T  47303872 taagcactccacgacccattttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaatcaaaggagagaacttttatggttttagatactaaatgttgaaggtct 47303971  T
Q  119 ttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg-aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtt 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47303972 ttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtt 47304071  T
Q  218 tggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggtt 317  Q
     |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  47304072 gggaaacacatgagtggagagt-ttttgtgagcaacttaggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaatatccttagtgaaatcaaaaactaagggttggtt 47304170  T
Q  318 ctctt 322  Q
    |||||    
T  47304171 ctctt 47304175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Original strand, 36018482 - 36018775
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagt 129  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  36018482 tgacccatttgttggataagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaactttcagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttggatgaggt 36018581  T
Q  130 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  36018582 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagcttttgggaaaagggttggtgccttttggggaagatccatggggatgggaaacacat 36018681  T
Q  229 gagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  36018682 gaatggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatggattggttctctt 36018775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 49 - 322
Target Start/End: Original strand, 46860120 - 46860396
Alignment:
Q  49 agcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  46860120 agcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagagaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcatgatgtg 46860219  T
Q  148 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46860220 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatagggatgggaaacacatgagtggagagtcatttgt 46860319  T
Q  247 gagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggcta--agggttggttctctt 322  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  46860320 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaagactaagagggttggttctctt 46860396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 48 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 41820040 - 41819768
Alignment:
Q  48 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41820040 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagataacttttaggtttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtg 41819941  T
Q  148 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg-aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgt 246  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41819940 aatcttagagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgcctttt-gggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagactcatttgt 41819842  T
Q  247 gagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41819841 gagcaacttgagtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatcttta-tgaaatcaaa-gctaagggttggttctctt 41819768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 20 - 270
Target Start/End: Original strand, 28074238 - 28074488
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctt 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28074238 taagcacttcatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctt 28074337  T
Q  120 tgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttg 219  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  28074338 tgggtgaggttcaaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaatagttggtgcgttttggggaagattcatggggatgg 28074437  T
Q  220 gaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtga 270  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||||| |||||    
T  28074438 gaaacacatgagtggagagtctattgagagaaacttaggtgagtcttgtga 28074488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 36 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 5434410 - 5434122
Alignment:
Q  36 catttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaa 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||| || ||||||| | || ||| |||    
T  5434410 catttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaatcaaaggagggaacttttaggatatttagataccaaaagttaagggtctttgagggaggtttaaa 5434311  T
Q  135 gcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa-gggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacacatgagt 232  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5434310 gcttcaagatgtaaatcttatagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttagtgttttttagggagagattcatggggttaggaaacacatgagt 5434211  T
Q  233 ggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| | ||| |||||||    
T  5434210 ggagagtcttttgtgagcaagttgggtgagtcttgggaaaccaaaagagaagatcctta-tgtaatcaaagactaaagattgattctctt 5434122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Original strand, 34795490 - 34795792
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtct 118  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||  |||     
T  34795490 taagcactctatgacttatttgttgggtaagtttggtgaatcctatgaaaaccaaaggagagatcttttagggtatttagatactaaaggttgatggtcg 34795589  T
Q  119 ttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtt 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||| ||  ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  34795590 ttgggtgatgttcaaagcttcaagatctgaatcttggagaaccagaagagggggttctagggagaggtttcatgccttttgaggagagattcatggggtt 34795689  T
Q  218 tggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggtt 317  Q
     ||| |||||| |  |||||||  ||||| || |||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  34795690 gggatacacatcaaaggagagt-ttttgtaagaaacttgggtgagtcttgggagaccaaaagagaagatccttag-aaaatcaaaggctaagggatggtt 34795787  T
Q  318 ctctt 322  Q
    |||||    
T  34795788 ctctt 34795792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 38 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 26324042 - 26323821
Alignment:
Q  38 tttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagc 136  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  26324042 tttgttgagtaagtttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggaaacttttaagatatttagatactaaaggttgagggtcattgggtgaagttcaaagc 26323943  T
Q  137 ttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacacatgagtgga 235  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  | | ||||||||||||||  ||||||||| |  |||    
T  26323942 ttcaagatgtaaatcttgaagaatcaaaagagagggctattgggaaagggttggtgcattttcagcagagattcatggggttgagaaacacatcaaagga 26323843  T
Q  236 gagtcatttgtgagcaacttggg 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  26323842 gagtc-tttgtgagcaacttggg 26323821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 57 - 322
Target Start/End: Original strand, 1683146 - 1683411
Alignment:
Q  57 gaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaa-gcttcaagatgtgaatcttgg 155  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||| |||  ||   ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| |||||||||||||    
T  1683146 gaatctcatggaaatcaaatgagagaaatttatggaacttagaaactaaaggttgagggtctttgggtgagattcaaatgtttcaa-atgtgaatcttgg 1683244  T
Q  156 agaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaact 254  Q
    |||||||||||||  || | || ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  1683245 agaaccaaaagagaaggtttttcggaaagggttggtgcattttgggaagagattcatggggttggaaaacacatgagtggataatcatttatgagcaact 1683344  T
Q  255 tgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    | |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1683345 ttggtgagtcttgtgagaccaaaagagaagatccttag-aaaatcaaaggctaagggttggttatctt 1683411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 228
Target Start/End: Original strand, 39127191 - 39127389
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagt 129  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||| ||| ||    
T  39127191 tgactcatttgttgagtaagcttagtgaatctcatggaaatcaacggagagaacttttagggtatttacatactaaaggtttggggcctttgg-tgaggt 39127289  T
Q  130 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacacat 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| ||||||| | || ||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  39127290 tcaaagcttcaagatatgaatcttagagaactaaaataggggactcttggaagagagttggtgcctttttgggagagattcatgaggttgggaaacacat 39127389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 35139250 - 35138980
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagt 129  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||| | ||| ||    
T  35139250 tgacccatttgttaagtaagcttggtgaatttcatggaaaccaaaggagggtactttttgggtatttagatactaaacgttgagggtctttagatgaggt 35139151  T
Q  130 tcaaagctt-------caagatgtgaatcttggagaaccaaaag-agggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttgg 220  Q
    ||||| |||        ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |     
T  35139150 tcaaaactttaagatgtaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaaatgggttcttcggaaagggttgatgccttttgaggagagattcatgaggttgga 35139051  T
Q  221 aaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttag 292  Q
    ||||| || |   ||||||| ||| |||||||||||  |||||| || || |||| || |||||||||||||    
T  35139050 aaacaaatcaaatgagagtc-tttatgagcaacttgaatgagtcttgggagaccaaaatagaagatccttag 35138980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 31340577 - 31340501
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31340577 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatcttatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaag 31340501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 261
Target Start/End: Original strand, 36796064 - 36796274
Alignment:
Q  57 gaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtt-ttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaa----tc 151  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||   ||||| ||||||||||||  |||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||    |     
T  36796064 gaatctcatggaaatcaaaggagataacttttagggaacttagaaactaaaggttgaaggtctttagatgaggttcaaagcttcaagatgtaaacctctt 36796163  T
Q  152 ttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagc 250  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| | ||| ||| |||   ||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||| ||||||||||||||| || |||    
T  36796164 ttgaagaaccaaaagaggggactctttgaaaaaggtcggttgattttggggagagattcacggggtcgggagacacaagagtggagagtcattggttagc 36796263  T
Q  251 aacttgggtga 261  Q
    |||||||||||    
T  36796264 aacttgggtga 36796274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 31340503 - 31340460
Alignment:
Q  140 aagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31340503 aagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa 31340460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 322
Target Start/End: Original strand, 20937431 - 20937580
Alignment:
Q  172 gctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtga 270  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||   |||||||| |   | ||||| |||||||  ||||||||||| || || ||    
T  20937431 gctcttaggaaaaggttggtgccttttgaggagagattcatgtggttgaaaaacacatcaaaagggagtc-tttgtgacaaacttgggtgattcttggga 20937529  T
Q  271 aaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
     |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  20937530 gaccaaaagagaagattcttag-gaaatcaaaggataaaggttggttctctt 20937580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 1737311 - 1737257
Alignment:
Q  145 gtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttg 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  1737311 gtgaatcttggggaaccaaaagagcggactcttggaaaagggttcgtgtcttttg 1737257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 26323385 - 26323320
Alignment:
Q  256 gggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    ||||||||| || || |||| || |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26323385 gggtgagtcttgggagaccaaaaaagaatatccttag-gaaatcaaaagctaagggttggttctctt 26323320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 64
Target Start/End: Original strand, 20937375 - 20937408
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctca 64  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20937375 tgacccattagttgggtaagcttggtgaatctca 20937408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Original strand, 31004925 - 31005002
Alignment:
Q  140 aagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggt 216  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||    
T  31004925 aagatgtgaatcttcgggaaccaaaagaggaggcttttgcgaaagggtttgtaacttttgaggagggattcatggggt 31005002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 213
Target Start/End: Original strand, 41509996 - 41510072
Alignment:
Q  138 tcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatgg 213  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||| || ||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||    
T  41509996 tcaagatgtgaatattggaaaaccaaaaaagagagcttttaggaaagggttaatgccttttagggagagattcatgg 41510072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 50433006 - 50432937
Alignment:
Q  109 ttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg 180  Q
    ||||| ||||||| ||||  |||||||  |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  50433006 ttgagggtctttgagtgagattcaaagggtcaagaggtgaatcttgga--accaaaagagggggctattggg 50432937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 31 - 322
Target Start/End: Original strand, 11190 - 11482
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagtt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  11190 tgacccatttgttgggtaagcttggtaaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 11289  T
Q  131 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctctt-gggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11290 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagatggggctcttggggaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatg 11389  T
Q  230 agtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  11390 agtggagagtcatttctgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcattagtaaaatcaaaggctaaaggttgtttctctt 11482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 14)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 322
Target Start/End: Original strand, 17762604 - 17762913
Alignment:
Q  16 tatgtaagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagag 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  17762604 tatgtaagcactccatggcccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaacaaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagga 17762703  T
Q  116 tctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttg-ggaaagggttggtgccttttgggg--aagattcatg 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||   |||||||||    
T  17762704 tctttgggtgaagttcaaggcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaaggtttggtgccttttgggggttagattcatg 17762803  T
Q  213 gggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggt 312  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17762804 gggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgggagcaacttgggtgagtcttgtgaaacaaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggt 17762903  T
Q  313 tggttctctt 322  Q
    ||||||||||    
T  17762904 tggttctctt 17762913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 31 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 3809245 - 3808955
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagtt 130  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  3809245 tgacccatttgttgagcaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 3809146  T
Q  131 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagag-ggggctcttg-ggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  3809145 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggggctcttgtgaaaagggttggttccttttggagaagattcatggggttgggaaacacat 3809046  T
Q  229 gagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttct 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3809045 gagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaaaatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttct 3808955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 322
Target Start/End: Original strand, 21593283 - 21593588
Alignment:
Q  16 tatgtaagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagag 115  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  21593283 tatgtaagcactccataacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggttagaacttttagggttttagatactaaatgttgaggg 21593382  T
Q  116 tctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctctt-gggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggg 214  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21593383 tctttgggtgaggttcaaagatttaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggagaagattcatggg 21593482  T
Q  215 gtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttg 314  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  21593483 gttggaaaacacatgagtggagagtcatttttgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaa-gctaagggttg 21593580  T
Q  315 gttctctt 322  Q
    ||||||||    
T  21593581 gttctctt 21593588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 26830677 - 26830368
Alignment:
Q  14 aatatgtaagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgag 113  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26830677 aatatataagcactccatgatccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgag 26830578  T
Q  114 agtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg-aaagggttggtgccttttggggaagattcatg 212  Q
     ||||||| || | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26830577 ggtctttgagtaaggtttaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggagtctcttgggaaaaaggttggtgccttttggagaagattcatg 26830478  T
Q  213 gggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggt 312  Q
    ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26830477 gggttgggaaacagatgagcgcagagtcatttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggt 26830378  T
Q  313 tggttctctt 322  Q
    ||||||||||    
T  26830377 tggttctctt 26830368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 2973487 - 2973183
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagagtct 118  Q
    ||||||||  ||||||||||||||  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  2973487 taagcactttatgacccatttgttaagagaccttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtttgtagatactaaaggttgaaggtct 2973388  T
Q  119 ttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggtt 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2973387 ttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgcttttttgggaagattcatggggtt 2973288  T
Q  218 tggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggtt 317  Q
     |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2973287 gggaaacacatgaatgcagagtcatttgtgaacaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggtt 2973188  T
Q  318 ctctt 322  Q
    |||||    
T  2973187 ctctt 2973183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Original strand, 5043249 - 5043551
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctt 119  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  5043249 taagcactctatgacccatttattaaaggagcttggtgaatctcatggaaatcaaaggagggaacttttagggttttagatactaaagattgagggtctt 5043348  T
Q  120 tgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggg-aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttt 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  5043349 tgggtgaggttcaaagcttcaagatgagaatcttggagaaccaaaagagagggctcttgggaaaagggttggtgcctttt-gggaagattcatggggttg 5043447  T
Q  219 ggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5043448 ggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaatttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtggaatcaaaggctaagagttggttc 5043547  T
Q  319 tctt 322  Q
    ||||    
T  5043548 tctt 5043551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 35 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 22425358 - 22425071
Alignment:
Q  35 ccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaa 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |    
T  22425358 ccatttgttggataagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttt-agggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgtggttcaga 22425260  T
Q  135 gcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggg--ctcttggga-aagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatgag 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  22425259 gcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggggcctcttgggataagggttggtgcattttggggaagattcatggggttgtgaaacacatggg 22425160  T
Q  232 tggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    || ||||||||||  ||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22425159 tgaagagtcatttaagagcaacttcggttagtcttgtgaaaccaaaagagaatatccttag-gaaatcaaa-gctaagggttggttctctt 22425071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 97 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 603550 - 603324
Alignment:
Q  97 agatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttg-ggaaagggttggtgcct 195  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  603550 agatagtaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgaggaaagggttggtgcct 603451  T
Q  196 tttggggaagattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtga 295  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  603450 tttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagtgtcctttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtga 603351  T
Q  296 aatcaaaggctaagggttggttctctt 322  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  603350 aatcaaaggctaatggttggttctctt 603324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 106 - 309
Target Start/End: Original strand, 17757789 - 17757995
Alignment:
Q  106 aggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa-gggttggtgccttttgggga- 203  Q
    |||||||  ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||      
T  17757789 aggttgatggtctttgggtgagattcaaagcttgaagatgtgaatgttggagaaccaaaatagggggctcttgtgaaaagggttggtgcattttgggggt 17757888  T
Q  204 -agattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaa 302  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||    
T  17757889 tagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaacaaaaagagaagatcatcagtgaaatcaaa 17757988  T
Q  303 ggctaag 309  Q
    |||||||    
T  17757989 ggctaag 17757995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 290
Target Start/End: Original strand, 25072817 - 25073076
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagt 129  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  25072817 tgactcatttgttgagtaagcttgatgaatctcatggaaatcaaagaagtgaacttttagggtatttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 25072916  T
Q  130 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacacat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||| | |||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  25072917 tcaaagcttcaagatgtgaatctttgagaacccaaag-gggggctcttggaaaagggattgtgcctcttgggaagagattcatagggtttggaaacacat 25073015  T
Q  229 gagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatcctt 290  Q
     |  |||||||| ||| || | ||||||| |  ||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  25073016 caaaggagagtc-tttatgtgaaacttggataggtcttgggaaaccaaaagagaagatcctt 25073076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 67 - 262
Target Start/End: Original strand, 26800438 - 26800634
Alignment:
Q  67 gaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaa 165  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  26800438 gaaaccaaaggagaaaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtggatcatggataaccaaaa 26800537  T
Q  166 gagggggctcttggg-aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgag 262  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  26800538 gagggggctcttgggaaaaaggttggtgccttttggggaagattcat-gggatgggaaacacatgagtggagagtctattgagagcaacttgggtgag 26800634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 236 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 5741120 - 5741040
Alignment:
Q  236 gagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggtt 317  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5741120 gagtcttttgtgagcaatttgggtgaatcttgagaaacaaaaagtgaagatccttagt-aaatcaaaggctaagggttggtt 5741040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 71
Target Start/End: Original strand, 26661580 - 26661621
Alignment:
Q  30 atgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaac 71  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26661580 atgaccaatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaac 26661621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 71
Target Start/End: Original strand, 26767551 - 26767592
Alignment:
Q  30 atgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaac 71  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26767551 atgaccaatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaac 26767592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 33 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 80817 - 80530
Alignment:
Q  33 acccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagttca 132  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  80817 acccatttgttggaaaatcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactagaggttgagggtctttgggtgaggttca 80718  T
Q  133 aagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctctt-gggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatgag 231  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  80717 aagcttcaagatttgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttatgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgag 80618  T
Q  232 tggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttct 319  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80617 cggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgggaaactaaaagagtagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttct 80530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 18547 - 18245
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctt 119  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  18547 taagcagtccatgacacatttgttgggtaagctgggtgaatctcatggaaaccaaaggagaaaacttatagg-ttttagatactaaaggttgcgggtctt 18449  T
Q  120 tgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa-gggttggtgccttttgggg-aagattcatggggtt 217  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18448 tgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaacaaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttgggggaagattcatgaggtt 18349  T
Q  218 tggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggtt 317  Q
     | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  18348 -gaaaacacatgagtggagagttatttgtgagcaacttgagtgagtcttgtaaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaagactaagagttggtt 18250  T
Q  318 ctctt 322  Q
    |||||    
T  18249 ctctt 18245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 490981 - 490694
Alignment:
Q  31 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagagtctttgggtgaagt 129  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  490981 tgacccatttgttgagcaagcttggtgaatctcatgagaaccaaaggagggagcttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 490882  T
Q  130 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtttggaaacacat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||    
T  490881 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctctttggagagggttggtgcctttaggtgagagattcatgggattgggaaacacat 490782  T
Q  229 gagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttc 318  Q
     |  |||||||  ||| ||||||||||||| ||||| |  || |||| ||||| | ||| |||| ||||||||| |||| || |||||||    
T  490781 caaaggagagt-ttttatgagcaacttgggcgagtcttacgagaccaaaagagtatatcattag-gaaatcaaaagctacggattggttc 490694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 1953 - 1671
Alignment:
Q  20 taagcactccatgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtct 118  Q
    |||||||||| ||||| |||||||  |||| |||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  1953 taagcactccttgacctatttgttaagtaaacttggtgaattttatggaaaccaaatgagagaacttttagggtatttagatactaaaggttgaaggtct 1854  T
Q  119 ttgggtgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggggtt 217  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| |||||| ||| |||||||||  |||    
T  1853 ttgggtgagctccaaagcttcaagatgtgaatcttgaagaaccaaaagaggggactcttgggcgaggcttggtgtcttttgtggagagattcatgtagtt 1754  T
Q  218 tggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccagaagagaagatccttagtgaaatcaaa 302  Q
      ||||||||| |   |||||||| |||||||||||||||| ||||| || || | || |||||||||||||||| |||||||||    
T  1753 gagaaacacatcatatgagagtca-ttgtgagcaacttgggcgagtcttgggagatcaaaagagaagatccttag-gaaatcaaa 1671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0263 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0263
Description:

Target: scaffold0263; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5471 - 5400
Alignment:
Q  143 atgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaagggttggtgccttttgggga-agattcatggg 214  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  5471 atgttaattttggggaaccaaaagagatgactcttgggaaaggg-tggtgccttttgggtagagattcatggg 5400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University