View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1746_low_12 (Length: 268)

Name: NF1746_low_12
Description: NF1746
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1746_low_12
NF1746_low_12
[»] chr8 (103 HSPs)
chr8 (1-213)||(11674880-11675092)
chr8 (1-223)||(36325420-36325642)
chr8 (1-215)||(40775647-40775861)
chr8 (1-205)||(44406864-44407068)
chr8 (1-215)||(38845296-38845510)
chr8 (1-222)||(2266678-2266899)
chr8 (1-215)||(3041453-3041667)
chr8 (1-193)||(1425072-1425264)
chr8 (81-213)||(23505051-23505183)
chr8 (1-193)||(12198969-12199161)
chr8 (1-193)||(12443397-12443589)
chr8 (1-193)||(13186276-13186468)
chr8 (1-193)||(23663564-23663756)
chr8 (1-193)||(38955889-38956081)
chr8 (81-213)||(23507722-23507854)
chr8 (1-193)||(40317983-40318175)
chr8 (100-213)||(11674694-11674807)
chr8 (1-174)||(36928693-36928866)
chr8 (25-193)||(16388767-16388935)
chr8 (1-191)||(22915410-22915600)
chr8 (75-215)||(36325231-36325371)
chr8 (25-193)||(40318205-40318373)
chr8 (72-215)||(15230217-15230360)
chr8 (1-193)||(35756799-35756992)
chr8 (72-212)||(44664508-44664648)
chr8 (81-213)||(234035-234167)
chr8 (81-213)||(710446-710578)
chr8 (81-213)||(747658-747790)
chr8 (81-213)||(871553-871685)
chr8 (1-193)||(34685475-34685666)
chr8 (25-193)||(39071695-39071863)
chr8 (1-132)||(4405742-4405873)
chr8 (72-209)||(10445621-10445758)
chr8 (25-193)||(31608754-31608922)
chr8 (25-193)||(13186079-13186247)
chr8 (1-121)||(31608604-31608724)
chr8 (1-135)||(4994734-4994868)
chr8 (75-213)||(38845559-38845697)
chr8 (72-213)||(35634385-35634526)
chr8 (81-213)||(7983427-7983559)
chr8 (81-212)||(15229931-15230062)
chr8 (25-193)||(4405903-4406069)
chr8 (75-215)||(2266489-2266629)
chr8 (25-193)||(36928495-36928663)
chr8 (72-215)||(8997975-8998118)
chr8 (75-213)||(3041716-3041854)
chr8 (72-214)||(25124561-25124703)
chr8 (72-214)||(37542222-37542364)
chr8 (75-212)||(40775910-40776047)
chr8 (75-212)||(44407117-44407254)
chr8 (72-212)||(25124849-25124989)
chr8 (72-214)||(41353859-41354001)
chr8 (72-214)||(42945400-42945542)
chr8 (72-210)||(44664794-44664932)
chr8 (72-209)||(6471693-6471830)
chr8 (100-213)||(35449894-35450007)
chr8 (25-189)||(35756606-35756769)
chr8 (25-193)||(4994898-4995065)
chr8 (72-210)||(21432695-21432833)
chr8 (76-193)||(8316672-8316789)
chr8 (76-193)||(12272937-12273054)
chr8 (76-193)||(38862855-38862972)
chr8 (25-121)||(36186308-36186404)
chr8 (76-194)||(2535842-2535960)
chr8 (8-89)||(31873017-31873099)
chr8 (72-193)||(37542511-37542632)
chr8 (126-209)||(8997859-8997942)
chr8 (25-203)||(31873142-31873318)
chr8 (75-193)||(8316879-8316997)
chr8 (75-193)||(23663805-23663923)
chr8 (53-190)||(9337048-9337185)
chr8 (100-193)||(12273169-12273262)
chr8 (100-193)||(23698560-23698653)
chr8 (76-193)||(39071934-39072050)
chr8 (1-53)||(8316778-8316830)
chr8 (1-53)||(12273043-12273095)
chr8 (53-193)||(20385587-20385727)
chr8 (1-53)||(23698434-23698486)
chr8 (127-215)||(38003747-38003835)
chr8 (81-209)||(41353577-41353705)
chr8 (76-179)||(39474579-39474681)
chr8 (67-189)||(8746347-8746469)
chr8 (76-193)||(23698327-23698445)
chr8 (100-193)||(20386746-20386839)
chr8 (1-53)||(38862814-38862866)
chr8 (72-168)||(42945158-42945254)
chr8 (109-216)||(10749833-10749940)
chr8 (106-193)||(22915680-22915767)
chr8 (166-212)||(6472395-6472441)
chr8 (72-193)||(34061616-34061737)
chr8 (53-121)||(8747533-8747601)
chr8 (105-189)||(11761863-11761947)
chr8 (53-193)||(30711986-30712125)
chr8 (53-193)||(30719763-30719902)
chr8 (1-53)||(39071893-39071945)
chr8 (74-169)||(21432981-21433076)
chr8 (81-174)||(6471985-6472078)
chr8 (1-53)||(16388686-16388738)
chr8 (1-53)||(36186226-36186278)
chr8 (54-193)||(7295197-7295336)
chr8 (81-180)||(38003487-38003586)
chr8 (145-194)||(27500437-27500486)
chr8 (108-193)||(42803542-42803627)
[»] chr3 (104 HSPs)
chr3 (1-213)||(36314297-36314509)
chr3 (1-213)||(48322376-48322588)
chr3 (1-209)||(10770493-10770701)
chr3 (1-205)||(54466609-54466813)
chr3 (1-205)||(8041802-8042006)
chr3 (1-193)||(23457998-23458190)
chr3 (1-193)||(36417905-36418097)
chr3 (1-189)||(19740946-19741134)
chr3 (1-193)||(43384500-43384692)
chr3 (75-213)||(48322637-48322775)
chr3 (75-212)||(36314558-36314695)
chr3 (1-132)||(55052359-55052490)
chr3 (75-209)||(10770751-10770885)
chr3 (1-135)||(46474998-46475132)
chr3 (1-193)||(33689401-33689591)
chr3 (76-212)||(47921466-47921602)
chr3 (72-215)||(37778559-37778702)
chr3 (72-214)||(40788706-40788848)
chr3 (72-217)||(32306419-32306564)
chr3 (25-190)||(33689620-33689785)
chr3 (25-193)||(9294199-9294367)
chr3 (25-193)||(23458220-23458388)
chr3 (26-193)||(36417707-36417874)
chr3 (72-214)||(29118824-29118966)
chr3 (72-217)||(3469195-3469340)
chr3 (80-213)||(13948779-13948912)
chr3 (53-209)||(33156263-33156419)
chr3 (75-213)||(8041615-8041753)
chr3 (72-194)||(35643869-35643991)
chr3 (1-191)||(53756941-53757130)
chr3 (75-205)||(54466430-54466560)
chr3 (82-221)||(10294558-10294697)
chr3 (72-210)||(29685943-29686081)
chr3 (76-214)||(47551491-47551629)
chr3 (82-216)||(52032435-52032569)
chr3 (72-213)||(3469486-3469627)
chr3 (72-209)||(41421975-41422112)
chr3 (72-209)||(52032141-52032278)
chr3 (74-210)||(11910701-11910837)
chr3 (72-209)||(32306710-32306847)
chr3 (25-193)||(40758166-40758331)
chr3 (1-121)||(9294049-9294169)
chr3 (72-215)||(10294845-10294988)
chr3 (29-148)||(26463843-26463962)
chr3 (88-215)||(33506252-33506379)
chr3 (72-210)||(29686226-29686364)
chr3 (24-174)||(43384321-43384471)
chr3 (26-190)||(53756766-53756930)
chr3 (72-215)||(3596106-3596249)
chr3 (75-193)||(2796198-2796316)
chr3 (67-203)||(21185978-21186114)
chr3 (1-65)||(40033637-40033701)
chr3 (25-121)||(41988053-41988148)
chr3 (80-212)||(42855601-42855733)
chr3 (80-210)||(29118529-29118670)
chr3 (100-189)||(1079537-1079626)
chr3 (72-189)||(4323490-4323607)
chr3 (76-193)||(40758402-40758519)
chr3 (72-176)||(10307661-10307765)
chr3 (105-193)||(19741213-19741301)
chr3 (53-189)||(25108364-25108500)
chr3 (53-187)||(9367766-9367900)
chr3 (72-178)||(43998179-43998285)
chr3 (33-193)||(40506036-40506197)
chr3 (77-193)||(26463651-26463767)
chr3 (64-186)||(32431472-32431594)
chr3 (100-190)||(46474837-46474927)
chr3 (100-193)||(40033772-40033865)
chr3 (100-193)||(42342810-42342903)
chr3 (76-193)||(42343023-42343140)
chr3 (1-53)||(2796365-2796417)
chr3 (97-189)||(3849054-3849146)
chr3 (55-215)||(25107210-25107370)
chr3 (100-212)||(33154877-33154989)
chr3 (81-209)||(40788423-40788551)
chr3 (1-53)||(42342982-42343034)
chr3 (83-203)||(47856396-47856516)
chr3 (1-53)||(51994076-51994128)
chr3 (100-203)||(6956257-6956360)
chr3 (165-212)||(13949074-13949121)
chr3 (2-53)||(26463757-26463808)
chr3 (100-194)||(1078555-1078648)
chr3 (71-193)||(51994173-51994295)
chr3 (108-213)||(4322591-4322695)
chr3 (100-189)||(23276299-23276388)
chr3 (165-210)||(33506180-33506225)
chr3 (1-53)||(40758361-40758413)
chr3 (72-203)||(47857533-47857664)
chr3 (105-139)||(8741314-8741348)
chr3 (145-203)||(43607789-43607847)
chr3 (100-194)||(43608798-43608892)
chr3 (105-194)||(9368622-9368711)
chr3 (97-189)||(41558195-41558287)
chr3 (77-121)||(51994042-51994086)
chr3 (146-193)||(34142580-34142627)
chr3 (155-197)||(14634123-14634165)
chr3 (55-89)||(23272946-23272980)
chr3 (25-71)||(42342906-42342952)
chr3 (53-91)||(42854554-42854592)
chr3 (100-174)||(55052564-55052638)
chr3 (76-121)||(2796406-2796451)
chr3 (60-132)||(35712111-35712183)
chr3 (53-89)||(39399361-39399397)
chr3 (25-53)||(40033731-40033759)
[»] chr7 (96 HSPs)
chr7 (1-213)||(32680594-32680806)
chr7 (1-214)||(34928648-34928861)
chr7 (1-219)||(39686527-39686745)
chr7 (1-205)||(30948167-30948371)
chr7 (1-193)||(27991925-27992117)
chr7 (1-193)||(17102206-17102398)
chr7 (1-193)||(2640197-2640389)
chr7 (1-193)||(28469029-28469220)
chr7 (25-193)||(28469249-28469417)
chr7 (1-131)||(22871389-22871519)
chr7 (1-193)||(42731636-42731828)
chr7 (75-213)||(32680855-32680993)
chr7 (1-191)||(48788824-48789014)
chr7 (1-193)||(6253657-6253849)
chr7 (1-193)||(19204675-19204867)
chr7 (1-135)||(32053220-32053354)
chr7 (1-132)||(37657067-37657198)
chr7 (1-170)||(3914355-3914524)
chr7 (1-193)||(10936011-10936203)
chr7 (25-193)||(10935813-10935981)
chr7 (1-193)||(42019616-42019808)
chr7 (25-190)||(23181235-23181400)
chr7 (75-216)||(30948420-30948561)
chr7 (72-209)||(42618197-42618334)
chr7 (25-193)||(42731438-42731606)
chr7 (75-222)||(32934637-32934784)
chr7 (72-209)||(25628481-25628618)
chr7 (72-213)||(43266265-43266406)
chr7 (72-212)||(25453128-25453268)
chr7 (72-212)||(32068382-32068522)
chr7 (25-193)||(40379788-40379956)
chr7 (25-193)||(42019838-42020006)
chr7 (72-214)||(23058715-23058857)
chr7 (72-214)||(28890577-28890719)
chr7 (25-187)||(32053384-32053546)
chr7 (75-213)||(34928910-34929048)
chr7 (75-213)||(39686794-39686932)
chr7 (25-193)||(24388838-24389006)
chr7 (25-193)||(27396836-27397004)
chr7 (72-212)||(42617911-42618051)
chr7 (81-213)||(43266561-43266693)
chr7 (72-209)||(32068099-32068236)
chr7 (72-215)||(32934345-32934488)
chr7 (80-209)||(10600243-10600372)
chr7 (80-213)||(33828268-33828401)
chr7 (1-193)||(45010812-45011013)
chr7 (72-212)||(22081560-22081699)
chr7 (72-212)||(22081845-22081985)
chr7 (84-212)||(23058429-23058557)
chr7 (60-191)||(17885649-17885780)
chr7 (72-203)||(18087626-18087757)
chr7 (80-215)||(25628772-25628907)
chr7 (72-214)||(27138227-27138369)
chr7 (79-209)||(46204424-46204554)
chr7 (25-186)||(2640419-2640580)
chr7 (25-121)||(3914229-3914325)
chr7 (25-158)||(45010652-45010782)
chr7 (100-194)||(18855970-18856064)
chr7 (72-209)||(39274873-39275011)
chr7 (72-209)||(25453414-25453551)
chr7 (25-193)||(37656871-37657037)
chr7 (108-203)||(13050104-13050200)
chr7 (100-203)||(18086298-18086401)
chr7 (53-191)||(13386016-13386154)
chr7 (100-193)||(6571032-6571125)
chr7 (136-212)||(10600026-10600102)
chr7 (105-193)||(22871598-22871686)
chr7 (77-193)||(24389078-24389194)
chr7 (25-160)||(48789044-48789179)
chr7 (75-193)||(17102039-17102157)
chr7 (75-193)||(32298996-32299114)
chr7 (105-203)||(32687406-32687504)
chr7 (72-214)||(46205595-46205737)
chr7 (100-193)||(6253490-6253583)
chr7 (72-193)||(17886778-17886899)
chr7 (100-193)||(19204508-19204601)
chr7 (53-193)||(5457176-5457316)
chr7 (53-193)||(22828087-22828227)
chr7 (72-192)||(32688506-32688626)
chr7 (76-135)||(6571240-6571299)
chr7 (77-194)||(13044690-13044807)
chr7 (1-53)||(6571199-6571251)
chr7 (25-91)||(13311277-13311340)
chr7 (106-193)||(16803967-16804054)
chr7 (98-193)||(42362469-42362564)
chr7 (75-193)||(27991758-27991876)
chr7 (213-251)||(37351215-37351253)
chr7 (139-203)||(23608817-23608881)
chr7 (1-53)||(24389036-24389088)
chr7 (5-53)||(32298895-32298943)
chr7 (54-156)||(12229342-12229444)
chr7 (76-193)||(27396648-27396765)
chr7 (100-193)||(40380000-40380093)
chr7 (53-193)||(18670132-18670272)
chr7 (1-53)||(27396754-27396806)
chr7 (125-189)||(6764203-6764267)
[»] chr1 (114 HSPs)
chr1 (1-213)||(24905166-24905378)
chr1 (1-215)||(28011549-28011768)
chr1 (1-212)||(52134254-52134465)
chr1 (1-212)||(33442594-33442805)
chr1 (1-214)||(31514316-31514529)
chr1 (1-214)||(4716466-4716679)
chr1 (1-193)||(34464468-34464660)
chr1 (1-193)||(183240-183432)
chr1 (1-193)||(6367779-6367971)
chr1 (1-193)||(13914087-13914279)
chr1 (1-193)||(26024609-26024801)
chr1 (1-193)||(30711544-30711736)
chr1 (1-193)||(37578211-37578403)
chr1 (1-193)||(43759039-43759231)
chr1 (1-193)||(47999142-47999334)
chr1 (2-193)||(48779337-48779528)
chr1 (1-193)||(17661871-17662061)
chr1 (1-191)||(32917477-32917667)
chr1 (1-193)||(1103678-1103870)
chr1 (1-193)||(1841676-1841867)
chr1 (25-193)||(6367581-6367749)
chr1 (1-193)||(41098950-41099142)
chr1 (1-193)||(49722944-49723135)
chr1 (29-223)||(7820943-7821137)
chr1 (1-131)||(19017710-19017840)
chr1 (72-213)||(40714443-40714584)
chr1 (1-193)||(23209381-23209572)
chr1 (25-193)||(34464690-34464858)
chr1 (1-132)||(35152560-35152691)
chr1 (1-135)||(7821171-7821305)
chr1 (1-121)||(14879188-14879308)
chr1 (1-193)||(36694301-36694493)
chr1 (1-193)||(36710402-36710594)
chr1 (25-193)||(17662091-17662259)
chr1 (1-193)||(40210389-40210581)
chr1 (76-212)||(49955347-49955483)
chr1 (25-190)||(4960562-4960727)
chr1 (25-190)||(40210611-40210776)
chr1 (72-213)||(49955633-49955774)
chr1 (25-193)||(14878990-14879158)
chr1 (25-193)||(24009782-24009950)
chr1 (25-193)||(37578433-37578601)
chr1 (1-132)||(40772690-40772820)
chr1 (25-191)||(41098754-41098920)
chr1 (72-213)||(40714729-40714870)
chr1 (25-193)||(13914309-13914476)
chr1 (72-212)||(17188954-17189094)
chr1 (81-213)||(20760800-20760932)
chr1 (75-210)||(33442854-33442989)
chr1 (75-209)||(24905427-24905560)
chr1 (72-214)||(31058343-31058485)
chr1 (72-213)||(31050949-31051090)
chr1 (80-213)||(37929417-37929550)
chr1 (25-190)||(1103481-1103648)
chr1 (25-193)||(30711346-30711514)
chr1 (72-215)||(45749839-45749982)
chr1 (1-91)||(19516002-19516092)
chr1 (75-185)||(28011390-28011500)
chr1 (72-217)||(8898512-8898657)
chr1 (25-130)||(19322974-19323079)
chr1 (1-130)||(19323109-19323238)
chr1 (72-213)||(45750128-45750269)
chr1 (25-193)||(19017870-19018038)
chr1 (25-193)||(32917279-32917447)
chr1 (1-131)||(42248690-42248818)
chr1 (75-205)||(31514577-31514707)
chr1 (75-213)||(52134067-52134205)
chr1 (80-213)||(12905953-12906086)
chr1 (72-209)||(35040900-35041037)
chr1 (108-212)||(17189173-17189277)
chr1 (81-213)||(28325099-28325230)
chr1 (72-212)||(30326496-30326636)
chr1 (25-193)||(42248492-42248660)
chr1 (72-214)||(8898803-8898945)
chr1 (72-214)||(28324803-28324944)
chr1 (25-91)||(43758943-43759009)
chr1 (53-210)||(44523405-44523562)
chr1 (25-186)||(46163056-46163217)
chr1 (25-193)||(35152362-35152530)
chr1 (25-91)||(48779238-48779304)
chr1 (72-209)||(7371293-7371430)
chr1 (80-193)||(35473650-35473763)
chr1 (75-193)||(25647903-25648021)
chr1 (25-190)||(1841481-1841646)
chr1 (98-213)||(32558419-32558534)
chr1 (153-215)||(25885360-25885422)
chr1 (97-174)||(32133236-32133313)
chr1 (72-209)||(35038458-35038595)
chr1 (105-205)||(4716758-4716857)
chr1 (53-193)||(34850334-34850474)
chr1 (107-193)||(47999415-47999501)
chr1 (76-188)||(4960801-4960913)
chr1 (75-191)||(26024444-26024560)
chr1 (74-193)||(24009594-24009713)
chr1 (100-193)||(23209643-23209736)
chr1 (71-193)||(34849030-34849152)
chr1 (153-214)||(7371536-7371597)
chr1 (8-53)||(10304048-10304093)
chr1 (100-193)||(40772526-40772619)
chr1 (1-53)||(24009700-24009752)
chr1 (105-193)||(36694569-36694657)
chr1 (105-193)||(36710670-36710758)
chr1 (100-194)||(17691237-17691331)
chr1 (100-193)||(17692501-17692594)
chr1 (100-193)||(19515838-19515931)
chr1 (101-213)||(44522146-44522258)
chr1 (75-174)||(183482-183581)
chr1 (100-203)||(9443581-9443684)
chr1 (72-187)||(32132329-32132444)
chr1 (100-194)||(5734028-5734121)
chr1 (76-193)||(7231541-7231658)
chr1 (168-213)||(25884700-25884745)
chr1 (25-54)||(49722885-49722914)
chr1 (105-189)||(31197088-31197167)
[»] chr6 (65 HSPs)
chr6 (1-214)||(14196613-14196826)
chr6 (19-215)||(362867-363063)
chr6 (1-205)||(28000392-28000596)
chr6 (1-193)||(30337635-30337827)
chr6 (1-193)||(33517751-33517943)
chr6 (80-209)||(25485956-25486085)
chr6 (1-193)||(30725976-30726168)
chr6 (1-135)||(21627790-21627924)
chr6 (1-193)||(30804078-30804270)
chr6 (3-193)||(33647170-33647360)
chr6 (1-193)||(17734215-17734405)
chr6 (4-193)||(3059476-3059665)
chr6 (1-193)||(12080853-12081045)
chr6 (105-211)||(14196905-14197011)
chr6 (25-193)||(21627954-21628122)
chr6 (77-213)||(32593489-32593625)
chr6 (77-223)||(22372950-22373096)
chr6 (100-214)||(25486211-25486325)
chr6 (72-209)||(31407164-31407301)
chr6 (25-193)||(12080655-12080823)
chr6 (25-193)||(33517553-33517721)
chr6 (25-193)||(33646982-33647150)
chr6 (72-214)||(22503060-22503202)
chr6 (72-209)||(7160807-7160944)
chr6 (82-211)||(7905244-7905373)
chr6 (85-214)||(22367423-22367552)
chr6 (25-193)||(3059276-3059444)
chr6 (72-212)||(31406878-31407018)
chr6 (75-214)||(28000645-28000784)
chr6 (25-191)||(30725781-30725946)
chr6 (75-212)||(363090-363227)
chr6 (72-213)||(21836316-21836457)
chr6 (72-209)||(22502777-22502914)
chr6 (72-212)||(6517503-6517642)
chr6 (25-184)||(11392866-11393025)
chr6 (72-209)||(21836035-21836170)
chr6 (25-193)||(30803880-30804048)
chr6 (72-215)||(7905529-7905672)
chr6 (60-193)||(11434821-11434954)
chr6 (72-213)||(15913834-15913975)
chr6 (82-213)||(7161100-7161231)
chr6 (75-193)||(30337468-30337586)
chr6 (128-213)||(10781146-10781231)
chr6 (72-209)||(15913551-15913688)
chr6 (53-193)||(680997-681137)
chr6 (1-57)||(25486084-25486140)
chr6 (59-186)||(24210557-24210684)
chr6 (70-189)||(26463202-26463321)
chr6 (72-193)||(15115358-15115479)
chr6 (57-203)||(28498298-28498444)
chr6 (100-189)||(8089466-8089555)
chr6 (53-193)||(679885-680025)
chr6 (80-190)||(12065242-12065352)
chr6 (105-203)||(141061-141159)
chr6 (105-203)||(149082-149180)
chr6 (72-178)||(10781444-10781550)
chr6 (76-186)||(11393096-11393206)
chr6 (100-194)||(15116548-15116642)
chr6 (135-189)||(26464550-26464604)
chr6 (57-203)||(29810709-29810855)
chr6 (100-193)||(8090243-8090336)
chr6 (100-189)||(13379798-13379887)
chr6 (1-53)||(11393055-11393107)
chr6 (53-121)||(12407599-12407667)
chr6 (72-134)||(20651935-20651997)
[»] chr4 (135 HSPs)
chr4 (1-212)||(4982726-4982937)
chr4 (1-212)||(9400519-9400730)
chr4 (1-213)||(42738030-42738242)
chr4 (1-199)||(33247287-33247484)
chr4 (1-215)||(34837071-34837285)
chr4 (1-205)||(9144773-9144977)
chr4 (1-216)||(22566985-22567187)
chr4 (1-212)||(38012356-38012567)
chr4 (2-213)||(32950329-32950540)
chr4 (1-204)||(27934718-27934907)
chr4 (1-193)||(49879226-49879418)
chr4 (1-193)||(50418687-50418879)
chr4 (1-193)||(7452020-7452212)
chr4 (1-193)||(37248422-37248614)
chr4 (1-193)||(44967088-44967280)
chr4 (1-193)||(46661131-46661323)
chr4 (1-193)||(17355944-17356136)
chr4 (1-193)||(24711297-24711489)
chr4 (1-193)||(35028017-35028209)
chr4 (1-193)||(36008863-36009055)
chr4 (1-193)||(34765399-34765591)
chr4 (5-193)||(43155548-43155736)
chr4 (1-193)||(51692736-51692928)
chr4 (1-193)||(18831534-18831726)
chr4 (1-193)||(23613495-23613687)
chr4 (1-193)||(37976172-37976364)
chr4 (1-131)||(53702029-53702159)
chr4 (75-215)||(27934529-27934669)
chr4 (105-215)||(9400809-9400919)
chr4 (1-121)||(16006024-16006143)
chr4 (78-213)||(51203608-51203743)
chr4 (72-215)||(54858557-54858700)
chr4 (1-131)||(14801953-14802082)
chr4 (25-193)||(14801755-14801923)
chr4 (1-193)||(15507692-15507884)
chr4 (25-193)||(34765621-34765789)
chr4 (1-193)||(52909470-52909662)
chr4 (72-215)||(54858846-54858989)
chr4 (1-131)||(53129587-53129717)
chr4 (75-212)||(4982986-4983123)
chr4 (72-213)||(27068909-27069050)
chr4 (76-212)||(10408179-10408315)
chr4 (105-209)||(33247563-33247667)
chr4 (1-193)||(54086714-54086906)
chr4 (72-214)||(27069196-27069338)
chr4 (75-214)||(42738291-42738430)
chr4 (72-226)||(45463359-45463514)
chr4 (72-215)||(50503822-50503965)
chr4 (72-226)||(50504111-50504265)
chr4 (77-214)||(3032580-3032717)
chr4 (105-222)||(22566789-22566906)
chr4 (72-213)||(27891583-27891724)
chr4 (72-217)||(45463068-45463213)
chr4 (72-213)||(52573227-52573368)
chr4 (75-215)||(9145026-9145166)
chr4 (53-213)||(16605601-16605761)
chr4 (25-193)||(24411377-24411545)
chr4 (1-109)||(24411575-24411683)
chr4 (25-193)||(53701831-53701999)
chr4 (88-214)||(27149298-27149423)
chr4 (60-193)||(13058258-13058391)
chr4 (105-214)||(32950140-32950249)
chr4 (72-209)||(39701195-39701332)
chr4 (25-186)||(54086936-54087097)
chr4 (25-193)||(15507914-15508081)
chr4 (25-193)||(35028239-35028407)
chr4 (83-209)||(11523952-11524078)
chr4 (25-193)||(17356166-17356331)
chr4 (75-213)||(34837334-34837472)
chr4 (80-209)||(5818069-5818198)
chr4 (25-190)||(52909275-52909440)
chr4 (72-212)||(10407889-10408029)
chr4 (105-212)||(38012170-38012277)
chr4 (72-215)||(52573514-52573657)
chr4 (1-131)||(35508322-35508451)
chr4 (72-209)||(39667062-39667199)
chr4 (78-197)||(6237114-6237233)
chr4 (25-188)||(37976394-37976557)
chr4 (82-216)||(22987147-22987281)
chr4 (25-190)||(35508481-35508646)
chr4 (72-213)||(51859692-51859833)
chr4 (56-203)||(30642418-30642565)
chr4 (82-216)||(22717935-22718069)
chr4 (100-197)||(6236846-6236942)
chr4 (25-222)||(53129747-53129944)
chr4 (53-193)||(24349693-24349833)
chr4 (72-186)||(22718225-22718339)
chr4 (72-186)||(22986877-22986991)
chr4 (100-193)||(7451853-7451946)
chr4 (72-189)||(50750910-50751027)
chr4 (53-189)||(41582470-41582606)
chr4 (105-192)||(37248256-37248343)
chr4 (72-186)||(22923164-22923278)
chr4 (72-186)||(22927817-22927931)
chr4 (72-186)||(22984096-22984210)
chr4 (72-186)||(22997684-22997798)
chr4 (75-193)||(23613328-23613446)
chr4 (100-193)||(24711130-24711223)
chr4 (60-193)||(39539194-39539327)
chr4 (71-190)||(1179087-1179206)
chr4 (75-186)||(43155787-43155898)
chr4 (56-158)||(8439496-8439598)
chr4 (72-169)||(9731498-9731595)
chr4 (100-193)||(44967354-44967447)
chr4 (100-193)||(50418953-50419046)
chr4 (53-193)||(10781753-10781893)
chr4 (105-193)||(18831368-18831456)
chr4 (76-148)||(51859471-51859543)
chr4 (56-187)||(56015919-56016049)
chr4 (75-193)||(5368966-5369084)
chr4 (75-193)||(13058056-13058174)
chr4 (53-203)||(29321174-29321324)
chr4 (72-194)||(32063624-32063746)
chr4 (71-189)||(40387490-40387608)
chr4 (67-188)||(8438305-8438425)
chr4 (108-213)||(50751822-50751926)
chr4 (53-189)||(40388375-40388511)
chr4 (81-132)||(1178123-1178174)
chr4 (98-193)||(24350746-24350841)
chr4 (75-174)||(36009104-36009203)
chr4 (72-191)||(39700930-39701049)
chr4 (1-39)||(13058223-13058261)
chr4 (97-203)||(32062598-32062704)
chr4 (71-189)||(41583518-41583636)
chr4 (75-193)||(49879467-49879585)
chr4 (53-159)||(56014778-56014884)
chr4 (100-189)||(148071-148160)
chr4 (98-183)||(5369181-5369266)
chr4 (100-189)||(55867430-55867519)
chr4 (1-41)||(5369133-5369173)
chr4 (105-193)||(10780732-10780820)
chr4 (105-193)||(10974341-10974429)
chr4 (100-203)||(11446279-11446382)
chr4 (100-191)||(54435413-54435504)
chr4 (98-194)||(54713648-54713743)
[»] chr5 (108 HSPs)
chr5 (1-214)||(41930702-41930915)
chr5 (1-201)||(6757876-6758076)
chr5 (1-212)||(31482402-31482613)
chr5 (1-214)||(1506153-1506366)
chr5 (1-213)||(297013-297225)
chr5 (4-193)||(39453519-39453708)
chr5 (1-193)||(3528892-3529084)
chr5 (1-221)||(11761934-11762154)
chr5 (1-193)||(6150637-6150829)
chr5 (1-193)||(19892327-19892519)
chr5 (1-190)||(6301760-6301949)
chr5 (1-193)||(14194442-14194634)
chr5 (1-193)||(27587332-27587524)
chr5 (1-193)||(186636-186828)
chr5 (1-193)||(19517824-19518016)
chr5 (1-191)||(16156876-16157066)
chr5 (1-178)||(38475067-38475244)
chr5 (1-193)||(8322621-8322813)
chr5 (1-193)||(17202616-17202808)
chr5 (1-193)||(28770888-28771080)
chr5 (5-193)||(32242463-32242650)
chr5 (1-188)||(21265167-21265354)
chr5 (75-217)||(6758125-6758267)
chr5 (1-190)||(28269444-28269633)
chr5 (25-193)||(13962883-13963051)
chr5 (1-193)||(5994106-5994298)
chr5 (1-135)||(13362304-13362438)
chr5 (1-174)||(35920266-35920439)
chr5 (1-193)||(5024038-5024230)
chr5 (1-193)||(29646381-29646573)
chr5 (1-193)||(38442284-38442476)
chr5 (75-215)||(41930513-41930653)
chr5 (1-135)||(11047654-11047788)
chr5 (25-193)||(19892549-19892717)
chr5 (25-193)||(32242261-32242429)
chr5 (1-131)||(16083160-16083290)
chr5 (80-213)||(17544342-17544475)
chr5 (25-193)||(5993908-5994076)
chr5 (72-212)||(8875449-8875589)
chr5 (1-121)||(18670382-18670502)
chr5 (25-193)||(35512167-35512335)
chr5 (25-193)||(39453319-39453487)
chr5 (25-193)||(43159055-43159223)
chr5 (25-174)||(6301581-6301730)
chr5 (25-190)||(13362469-13362634)
chr5 (1-130)||(20814217-20814346)
chr5 (25-193)||(20814376-20814544)
chr5 (4-131)||(10684158-10684285)
chr5 (72-215)||(33871624-33871767)
chr5 (75-213)||(1505966-1506104)
chr5 (100-214)||(31482687-31482801)
chr5 (25-190)||(38442090-38442255)
chr5 (25-193)||(5024259-5024427)
chr5 (72-212)||(33871339-33871479)
chr5 (75-214)||(297274-297413)
chr5 (25-193)||(18247105-18247271)
chr5 (25-192)||(11047458-11047624)
chr5 (25-193)||(14194664-14194831)
chr5 (25-193)||(16157096-16157264)
chr5 (25-193)||(17202418-17202586)
chr5 (72-212)||(20152781-20152921)
chr5 (72-218)||(20153204-20153347)
chr5 (25-191)||(186440-186606)
chr5 (27-193)||(20840552-20840718)
chr5 (4-92)||(18247303-18247391)
chr5 (25-87)||(27937260-27937322)
chr5 (105-217)||(24141447-24141559)
chr5 (76-193)||(35512406-35512523)
chr5 (25-149)||(8322467-8322591)
chr5 (25-121)||(10684030-10684126)
chr5 (25-193)||(21265384-21265551)
chr5 (72-190)||(22298564-22298682)
chr5 (137-206)||(8875618-8875687)
chr5 (82-223)||(21287953-21288094)
chr5 (13-177)||(12904789-12904953)
chr5 (25-193)||(29646603-29646770)
chr5 (80-183)||(17544077-17544180)
chr5 (75-193)||(3529133-3529251)
chr5 (25-91)||(4700352-4700418)
chr5 (100-193)||(11761768-11761861)
chr5 (100-193)||(38475315-38475408)
chr5 (1-53)||(24547315-24547367)
chr5 (54-193)||(11740706-11740845)
chr5 (71-193)||(24547412-24547534)
chr5 (65-203)||(40150095-40150233)
chr5 (76-193)||(16082996-16083113)
chr5 (100-193)||(27587167-27587260)
chr5 (1-53)||(13963080-13963132)
chr5 (1-53)||(27937178-27937230)
chr5 (97-189)||(37991222-37991314)
chr5 (67-141)||(5255088-5255162)
chr5 (80-193)||(11741813-11741926)
chr5 (76-193)||(13963121-13963238)
chr5 (100-193)||(28771154-28771247)
chr5 (100-188)||(35920500-35920588)
chr5 (111-214)||(3656743-3656846)
chr5 (100-193)||(18670221-18670311)
chr5 (98-189)||(42067838-42067929)
chr5 (100-194)||(5256328-5256421)
chr5 (100-178)||(42063288-42063366)
chr5 (100-193)||(6150473-6150566)
chr5 (79-135)||(27937130-27937186)
chr5 (82-190)||(30005175-30005283)
chr5 (1-53)||(35512365-35512417)
chr5 (72-143)||(21287812-21287883)
chr5 (76-135)||(24547267-24547326)
chr5 (101-174)||(5835661-5835734)
chr5 (125-193)||(24547196-24547264)
[»] chr2 (77 HSPs)
chr2 (1-221)||(33062041-33062261)
chr2 (1-216)||(1695736-1695951)
chr2 (1-213)||(13995672-13995884)
chr2 (1-213)||(14900495-14900694)
chr2 (1-205)||(41248566-41248770)
chr2 (1-213)||(33739889-33740101)
chr2 (1-193)||(6658064-6658256)
chr2 (1-193)||(10712940-10713132)
chr2 (1-193)||(16099241-16099433)
chr2 (1-193)||(37895366-37895558)
chr2 (1-174)||(11163092-11163265)
chr2 (1-193)||(39498496-39498688)
chr2 (1-193)||(15848305-15848497)
chr2 (1-193)||(36479935-36480127)
chr2 (1-193)||(36755310-36755497)
chr2 (1-193)||(39423732-39423924)
chr2 (14-193)||(34448025-34448204)
chr2 (25-193)||(15848107-15848275)
chr2 (25-193)||(44714002-44714170)
chr2 (1-118)||(22051088-22051205)
chr2 (72-215)||(8710754-8710897)
chr2 (75-216)||(14900743-14900882)
chr2 (25-193)||(10712742-10712910)
chr2 (72-212)||(28226030-28226170)
chr2 (75-215)||(33739700-33739840)
chr2 (25-193)||(36382180-36382348)
chr2 (72-215)||(15604336-15604479)
chr2 (72-214)||(15604625-15604767)
chr2 (75-215)||(33062310-33062450)
chr2 (25-193)||(37895588-37895756)
chr2 (25-193)||(39423534-39423702)
chr2 (72-211)||(11830365-11830504)
chr2 (75-213)||(13995933-13996071)
chr2 (72-209)||(8342190-8342327)
chr2 (25-190)||(36479740-36479905)
chr2 (25-193)||(2318178-2318345)
chr2 (75-213)||(41248819-41248957)
chr2 (1-118)||(2318375-2318492)
chr2 (65-193)||(13692501-13692629)
chr2 (25-193)||(34447832-34447999)
chr2 (100-205)||(1696025-1696130)
chr2 (72-211)||(41588344-41588483)
chr2 (72-214)||(8342465-8342607)
chr2 (25-91)||(36755214-36755280)
chr2 (72-214)||(41587233-41587374)
chr2 (47-191)||(9076330-9076474)
chr2 (108-209)||(6573050-6573150)
chr2 (54-213)||(6573542-6573699)
chr2 (77-193)||(45556340-45556456)
chr2 (100-203)||(202672-202775)
chr2 (72-203)||(39936535-39936665)
chr2 (53-178)||(3653349-3653473)
chr2 (76-193)||(36382419-36382536)
chr2 (75-191)||(16099076-16099192)
chr2 (1-53)||(36382378-36382430)
chr2 (75-193)||(39498329-39498447)
chr2 (100-193)||(11163339-11163432)
chr2 (76-193)||(44713814-44713931)
chr2 (100-193)||(45556131-45556224)
chr2 (1-53)||(44713920-44713972)
chr2 (54-189)||(25231118-25231253)
chr2 (105-203)||(6589680-6589778)
chr2 (75-193)||(6657897-6658015)
chr2 (105-203)||(28228679-28228777)
chr2 (72-193)||(3556297-3556418)
chr2 (72-193)||(6588702-6588823)
chr2 (8-53)||(17266523-17266568)
chr2 (100-189)||(25230125-25230214)
chr2 (100-189)||(44045318-44045407)
chr2 (77-193)||(3555269-3555385)
chr2 (47-191)||(22051257-22051400)
chr2 (108-218)||(25892388-25892498)
chr2 (105-203)||(28230060-28230158)
chr2 (1-53)||(45556298-45556350)
chr2 (145-203)||(199030-199088)
chr2 (60-191)||(6306992-6307125)
chr2 (79-193)||(30729640-30729754)
[»] scaffold0024 (2 HSPs)
scaffold0024 (1-205)||(141601-141805)
scaffold0024 (75-213)||(141854-141992)
[»] scaffold0559 (2 HSPs)
scaffold0559 (1-215)||(1419-1637)
scaffold0559 (75-212)||(1233-1370)
[»] scaffold0205 (3 HSPs)
scaffold0205 (103-217)||(21004-21118)
scaffold0205 (106-212)||(21260-21366)
scaffold0205 (1-53)||(21128-21180)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (1-193)||(1955-2150)
scaffold0007 (75-193)||(1788-1906)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (1-193)||(69182-69374)
scaffold0031 (25-193)||(68984-69152)
[»] scaffold0295 (2 HSPs)
scaffold0295 (1-132)||(2360-2491)
scaffold0295 (25-121)||(2234-2330)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (10-190)||(14451-14631)
scaffold0075 (25-91)||(14670-14736)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (1-193)||(139858-140050)
scaffold0020 (75-193)||(139691-139809)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (1-131)||(37645-37774)
scaffold0005 (25-193)||(37804-37972)
[»] scaffold0388 (1 HSPs)
scaffold0388 (72-209)||(12525-12662)
[»] scaffold0328 (2 HSPs)
scaffold0328 (72-213)||(11426-11567)
scaffold0328 (72-209)||(11143-11280)
[»] scaffold0771 (2 HSPs)
scaffold0771 (80-213)||(919-1052)
scaffold0771 (165-212)||(1214-1261)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (72-213)||(222075-222216)
scaffold0006 (72-209)||(221794-221929)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (74-210)||(2395-2531)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (72-210)||(12066-12204)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (53-203)||(239820-239970)
[»] scaffold0707 (1 HSPs)
scaffold0707 (98-193)||(6393-6488)
[»] scaffold0775 (2 HSPs)
scaffold0775 (72-187)||(4987-5102)
scaffold0775 (72-193)||(6266-6387)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (54-203)||(23240-23389)
[»] scaffold0128 (1 HSPs)
scaffold0128 (105-194)||(19875-19964)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 103)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 11674880 - 11675092
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11674880 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtccaag 11674979  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11674980 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 11675079  T
Q  201 catcattaagcct 213  Q
    |||||||||||||    
T  11675080 catcattaagcct 11675092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 36325420 - 36325642
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36325420 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaagttagtgacgtggcagtgattaagttggtccaag 36325519  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36325520 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagagacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 36325619  T
Q  201 catcattaagcctttataaaatg 223  Q
    ||||||||| ||||| |||||||    
T  36325620 catcattaaacctttgtaaaatg 36325642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 40775861 - 40775647
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  40775861 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgtaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 40775762  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  40775761 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattaacaattacaggaacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 40775662  T
Q  201 catcattaagccttt 215  Q
    ||||| |||||||||    
T  40775661 catcaataagccttt 40775647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 44407068 - 44406864
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  44407068 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 44406969  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  44406968 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 44406869  T
Q  201 catca 205  Q
    |||||    
T  44406868 catca 44406864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 38845510 - 38845296
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  38845510 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtaacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 38845411  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||    
T  38845410 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggttaaaca 38845311  T
Q  201 catcattaagccttt 215  Q
    ||||| ||| |||||    
T  38845310 catcaataaaccttt 38845296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 2266678 - 2266899
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| |||    
T  2266678 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtggaagtgattaatttggtcaaag 2266777  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  2266778 gatcaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 2266877  T
Q  201 catcattaagcctttataaaat 222  Q
    ||||| |||||||||| |||||    
T  2266878 catcaataagcctttagaaaat 2266899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3041667 - 3041453
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  3041667 tattttgtcctcttcttaaggtcaaaattggaattttatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 3041568  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||    
T  3041567 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacatggacgaatttttaaatgccgcttaattgcaagggctaaaca 3041468  T
Q  201 catcattaagccttt 215  Q
    ||||| ||| |||||    
T  3041467 catcaataaaccttt 3041453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1425264 - 1425072
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  1425264 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcaatgattaagttggtcaaag 1425165  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | |||||   | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1425164 gactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 1425072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 81 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23505183 - 23505051
Alignment:
Q  81 agtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgc 180  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23505183 agtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaagggtaaattgccaagattagcaattacatggacgaatttttaaatgacgc 23505084  T
Q  181 ctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23505083 ctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 23505051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12199161 - 12198969
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||    
T  12199161 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggccgtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaaattggtcaaag 12199062  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| | ||||| | |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12199061 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgattatagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 12198969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12443589 - 12443397
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||    
T  12443589 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggccgtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaaattggtcaaag 12443490  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| | ||||| | |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12443489 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgattatagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 12443397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 13186276 - 13186468
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||     
T  13186276 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaacttggtcaaat 13186375  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | |||| | || |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  13186376 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacatgaaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 13186468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23663756 - 23663564
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  23663756 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgaaatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 23663657  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||| ||||| ||  || | | ||||||| | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23663656 gacgaaattttaaatgattaatgatttcaaggttagtttccaaggattaacgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 23663564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 38955889 - 38956081
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||    
T  38955889 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaagttgatcaaag 38955988  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  || | | ||||| | | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  38955989 gactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttacaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 38956081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 81 - 213
Target Start/End: Original strand, 23507722 - 23507854
Alignment:
Q  81 agtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgc 180  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23507722 agtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaagggtaaattgcaaggattagcaattacagggacgtatttttaaatgacgc 23507821  T
Q  181 ctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507822 ctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 23507854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 40318175 - 40317983
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  40318175 tattttgtcctcttcttaagggcaagattggaatttcatgtgtgatagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaat 40318076  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||  ||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | ||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  40318075 gacgcaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagagacaaatttttaaacgacccctaattgcaagga 40317983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 100 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11674807 - 11674694
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatc 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11674807 ggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagggacgaatttttaaacgacgcctaattgcaaggactaatc 11674708  T
Q  200 acatcattaagcct 213  Q
    ||||||||||||||    
T  11674707 acatcattaagcct 11674694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 36928693 - 36928866
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  36928693 tattttgtcctcttcttaaaggcaaaattggaatttcacgtgtgatagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 36928792  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| ||| ||||  ||| ||||||||||    
T  36928793 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcaaatacatagaccaatttttaaa 36928866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 16388767 - 16388935
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  16388767 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 16388866  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16388867 atgcaagggtaaattgccaggattagcaattacatgaaccaatttttaaatgacccctaattgcaagga 16388935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22915600 - 22915410
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||     
T  22915600 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgatttccacgtcatcaaattagtgacgtggcaatgattaaattggtcaaaa 22915501  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaag 191  Q
    ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | |||||| |||| |||||||||||||   |||||||||||    
T  22915500 gacgaaattgtaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgattacatggaccaatttttaaatgatctctaattgcaag 22915410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 36325371 - 36325231
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36325371 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagggacgaatttttaaa 36325272  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 215  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36325271 cgacccctaattgtaaggactaatcacatcattaagccttt 36325231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 40318205 - 40318373
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||  |    
T  40318205 aaattggaatttcatgtatgactgtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtgaggagaaggacgaaattttaaatgattaaaca 40318304  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  40318305 atgcaagggtaaattgccaggattagcgattacatggactaatttttaaacaacccctaattgcaagga 40318373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Original strand, 15230217 - 15230360
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  15230217 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaagattagcgattacagggactaattttt 15230316  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15230317 aaatgacacctaattgcaaggacaaaacacatcattaagccttt 15230360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 35756799 - 35756992
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  35756799 tattttgtcatcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtggtagtgattgtcacgtcatcgtattagtgacgtggcagtgcttaagttggtcaaag 35756898  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatga-cgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| | ||||||| | ||||| ||| |||||||||| || | ||||||||||||||    
T  35756899 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattaacgaatacagagaccaatttttaaacgaccccctaattgcaagga 35756992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 44664648 - 44664508
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  44664648 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaaggttaaattgccaggattaacgattacagggactaattttt 44664549  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  44664548 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacataattaagcc 44664508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 81 - 213
Target Start/End: Original strand, 234035 - 234167
Alignment:
Q  81 agtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgc 180  Q
    ||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  234035 agtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattaacaattacagggactaatttttaaatgatgc 234134  T
Q  181 ctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  234135 ctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 234167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 81 - 213
Target Start/End: Original strand, 710446 - 710578
Alignment:
Q  81 agtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgc 180  Q
    ||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  710446 agtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattaacaattacagggactaatttttaaatgatgc 710545  T
Q  181 ctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  710546 ctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 710578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 81 - 213
Target Start/End: Original strand, 747658 - 747790
Alignment:
Q  81 agtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgc 180  Q
    ||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  747658 agtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattaacaattacagggactaatttttaaatgatgc 747757  T
Q  181 ctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  747758 ctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 747790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 81 - 213
Target Start/End: Original strand, 871553 - 871685
Alignment:
Q  81 agtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgc 180  Q
    ||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  871553 agtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattaacaattacagggactaatttttaaatgatgc 871652  T
Q  181 ctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  871653 ctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 871685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 34685475 - 34685666
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||     
T  34685475 tattttgtcctcttcttaaaggaaaaattagaatttcatatgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaagttggtcaaat 34685574  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||| |||||||  |||| | ||||| | | ||||  ||| |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  34685575 gacgaaattttaaatgattaatgattgtaaggctagtttgcaaggattagcgaataca-agaccaatttttaaacgatccctaattgcaagga 34685666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39071863 - 39071695
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  39071863 aaattggaatttcatttgtgatagtgattgccacgtcgtcaaattagtgacgcggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 39071764  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| ||||||| || ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  39071763 atgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 39071695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 4405873 - 4405742
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||     
T  4405873 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgtcatgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaagttggtcaaat 4405774  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaagg 132  Q
    ||| |||||| |||| |||||  |||||||||    
T  4405773 gacgaaatttaaaataattaatgattgcaagg 4405742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Original strand, 10445621 - 10445758
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||    
T  10445621 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaagacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactaattttt 10445720  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  10445721 aaatgacacctaattgcaaggacgaaacacatcattaa 10445758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 31608754 - 31608922
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgatta-aca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||| |||    
T  31608754 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgccatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattagaca 31608853  T
Q  124 attgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    | ||||||| |||||||| | ||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  31608854 a-tgcaagggtaaattgcaaggattagcgaatacatggaccaatttttaaacgacccttaattgcaagga 31608922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13186247 - 13186079
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |   |  ||| |||||||||||||||||  |    
T  13186247 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcattaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagagacgaaattttaaatgattaaaca 13186148  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| ||||||| || ||||| | |||||| | || |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  13186147 atgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacatgaaccaatttttaaacgatccctaattgcaagga 13186079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 31608724 - 31608604
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  31608724 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatatgtgatagtgattggcacatcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtttgtcaaat 31608625  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaa 121  Q
    ||| ||||||||||| |||||    
T  31608624 gacgaaattttaaattattaa 31608604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 4994868 - 4994734
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||     
T  4994868 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtcattgtcacgtcatcgaattagcgacgtggtagtgattaagttggtcaaaa 4994769  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggcta 135  Q
    ||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  4994768 gacgaaattttaaataattaatgattgcaaggcta 4994734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 213
Target Start/End: Original strand, 38845559 - 38845697
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38845559 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 38845658  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    || ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  38845659 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagcct 38845697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 35634385 - 35634526
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||| | ||||||||||| |||||||    
T  35634385 tgacgtgacagtgattaagttggttaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagggactaattttt 35634484  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  35634485 aaatgacgcttaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 35634526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 81 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 7983559 - 7983427
Alignment:
Q  81 agtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgc 180  Q
    ||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7983559 agtgattaagtttttcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactaatttttaaatgacgc 7983460  T
Q  181 ctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  7983459 ctaattgcaaggacgaaacacataattaagcct 7983427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 81 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15230062 - 15229931
Alignment:
Q  81 agtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgc 180  Q
    ||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15230062 agtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatccaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactaatttttaaatgacgc 15229963  T
Q  181 ctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15229962 ctaattgcaaggacaaaacacatcattaagcc 15229931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 4405903 - 4406069
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  4405903 aaatttgaatttcatgtg--acagtgattgccacgtcttcaaattagtgacgtgacagtgattaagtgggaagagggacgaaattttaaatgattaaaca 4406000  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||| |||| |||| ||||||||||  || ||||||| ||||||    
T  4406001 ttgcaagggtaaattgcaaggattaacaaatacatggaccaatttttaaacaacccctaattacaagga 4406069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2266629 - 2266489
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  2266629 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagagacgaatttttaaa 2266530  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 215  Q
    || ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  2266529 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagccttt 2266489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 36928663 - 36928495
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  36928663 aaattgaaatttcatgtatgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 36928564  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| ||||||| || ||||| | ||||||  ||| |||||||||| ||| | |||||| |||||    
T  36928563 atgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacatagaccaatttttaaacgacccttaattgaaagga 36928495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Original strand, 8997975 - 8998118
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||| | |||||| | || |||||||    
T  8997975 tgacgtgacagtgattaagttggtcaaaggacggaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcatgattagcgattacatgaactaattttt 8998074  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  8998075 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagtcttt 8998118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 75 - 213
Target Start/End: Original strand, 3041716 - 3041854
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3041716 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgagtttttaaa 3041815  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    || ||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||    
T  3041816 tgccgcctaattgcaagagctaaacacatcaataagcct 3041854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25124703 - 25124561
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||||    
T  25124703 tgacttggcagtggttaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacatggactaattttt 25124604  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctt 214  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||    
T  25124603 aaatgacgcctaattgcaagaacgaaatacatcattaaacctt 25124561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37542364 - 37542222
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | |||| |||||| |||||||    
T  37542364 tgacttggcggtgattaagttggtcaaagaacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattaaagggactaattttt 37542265  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctt 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  37542264 aaatgacgcctaattgcaaagacgaaacacatcattaaacctt 37542222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Original strand, 40775910 - 40776047
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40775910 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgtcaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 40776009  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
    || |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||    
T  40776010 tgccgcctaattgcaagggttaaacacatcaataagcc 40776047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Original strand, 44407117 - 44407254
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  44407117 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgctaggattagcaattacagggatgaatttttaaa 44407216  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
    || ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  44407217 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagcc 44407254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Original strand, 25124849 - 25124989
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||  |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||  |||| | ||||||| ||| |||||||    
T  25124849 tgacgtggcagtgattaagttgttcaaaggatgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccagaattagcgattacagagactaattttt 25124948  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  25124949 aaatgacacctaattgcaaggacgaaacacatgattaagcc 25124989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 214
Target Start/End: Original strand, 41353859 - 41354001
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| ||| ||||||| || |||||   ||||||||||| |||||||    
T  41353859 tgacgtgacggtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaataatgctagggtaaattgtcaggattagtgattacagggactaattttt 41353958  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctt 214  Q
    |||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||    
T  41353959 aaatgacgcctaattataaggacgaaacacatcattaagcctt 41354001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 214
Target Start/End: Original strand, 42945400 - 42945542
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||||||| || ||||| | |||||||| || |||||||    
T  42945400 tgacttggcagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgtcaggattagcgattacaggaactaattttt 42945499  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctt 214  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  42945500 aaatgacgcctaattgcaagaacgaaacacatcattaaacctt 42945542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 210
Target Start/End: Original strand, 44664794 - 44664932
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||| ||  || |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  44664794 tgacttggcaatgattaagttggtcaaataacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagagactaattttt 44664893  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  44664894 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaag 44664932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6471830 - 6471693
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||||||||||||||||||||  |  || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | |||| || |||  ||||||    
T  6471830 tgacgtggcagtgattaagttgataaaaagacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattatagagactcattttt 6471731  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  6471730 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaa 6471693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 100 - 213
Target Start/End: Original strand, 35449894 - 35450007
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatc 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||      
T  35449894 ggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacatggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggataaat 35449993  T
Q  200 acatcattaagcct 213  Q
    |||||| |||||||    
T  35449994 acatcaataagcct 35450007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 35756769 - 35756606
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgatt-aaca 123  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||| ||||    
T  35756769 aaattggaatttcatatatgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 35756670  T
Q  124 attgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgca 189  Q
    ||| ||||| ||||||| || |||||   |||| |  ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  35756669 att-caaggataaattgtcaggattagtgattata-agaccaatttttaaatgacccctaattgca 35756606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 4994898 - 4995065
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||  |   | |||| |||||| ||||||||||  |    
T  4994898 aaattggaatttcatgtatggtagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatgacatggattaagtggggagagggacgaaatttgaaatgattaaaca 4994997  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| ||||||| || ||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4994998 atgcaagggtaaattgtcaggattagcgattaca-ggaccaatttttaaatgacccctaattgcaagga 4995065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21432833 - 21432695
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||| ||||   ||||||| ||| |||||||    
T  21432833 tgacttgggagtgattaagttagtcaaaagacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaaaattagtgattacagagactaattttt 21432734  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaag 210  Q
    | |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  21432733 atatgacgtctaattgcaaggacgaaacacatcattaag 21432695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8316789 - 8316672
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaat 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||||| | |||| |||| ||||||||||     
T  8316789 gtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattaacgaatacatggaccaatttttaaac 8316690  T
Q  176 gacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  8316689 gacccctaattgcaagga 8316672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12273054 - 12272937
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaat 175  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| | ||||| | ||||||| ||| ||||||||||     
T  12273054 gtggcagtgattaaattggtcaaaggacgaaattttaaatgattaataattgcaaggctagtttgcaaggattagcgattacagagaccaatttttaaac 12272955  T
Q  176 gacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||  ||||||||||||||    
T  12272954 gatccctaattgcaagga 12272937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 193
Target Start/End: Original strand, 38862855 - 38862972
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaat 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | ||||| ||| ||||||||||     
T  38862855 gtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagagaccaatttttaaac 38862954  T
Q  176 gacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  38862955 gacccctaattgcaagga 38862972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 121
Target Start/End: Original strand, 36186308 - 36186404
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||    
T  36186308 aaattggaatttcatgtgtgacactgattgtcacgtcatcaaattagtaatgtggcagtgattaagtagggagagggacgaaattttaaatgattaa 36186404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 76 - 194
Target Start/End: Original strand, 2535842 - 2535960
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaat 175  Q
    |||||||| |||||||  ||| | |||| |||||||||||||||||   ||| |||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2535842 gtggcagtcattaagtgggtcaagggacgaaattttaaatgattaaactttgtaagggtaatttgccaggattaacgattacagggaccaatttttaaat 2535941  T
Q  176 gacgcctaattgcaaggac 194  Q
    ||| |||||||||| ||||    
T  2535942 gacccctaattgcagggac 2535960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 31873099 - 31873017
Alignment:
Q  8 tcctcttcttaa-gggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaa 89  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  31873099 tcctcttcttaaagggaaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacatcatcaaattagtgacgtgacggtgattaa 31873017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 193
Target Start/End: Original strand, 37542511 - 37542632
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||||| | |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||  ||  |||||| || ||||| || |||||||    
T  37542511 tgacgttggagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattatcagaattaacgataacaggaaccaattttt 37542610  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  37542611 aaatgacgcctaattgtaagga 37542632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8997942 - 8997859
Alignment:
Q  126 tgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8997942 tgcaagggtaaattgtcaggattagcgattgcagggactaatttttaaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaa 8997859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 203
Target Start/End: Original strand, 31873142 - 31873318
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |   | | || |||||||||||||||||       
T  31873142 aaattggaatttcatgtgg--caatgattgccacgtcatcaaattagtgatgtagcagtgattaagtgggaagaggaacaaaattttaaatgattaaatt 31873239  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacat 203  Q
    |||  |||  ||||||||||||||||| | || | |||| | |||||||||||| | || ||||| ||||||| |||||    
T  31873240 ttgggagggcaaattgccaagattaacgaataaaaggaccattttttaaatgacccatatttgcagggactaaacacat 31873318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 193
Target Start/End: Original strand, 8316879 - 8316997
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||||||||    
T  8316879 cgtggcagtgattaagtggggagatggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacaaggaccaatttttaaa 8316978  T
Q  175 tgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  8316979 cgacccctaattgcaagga 8316997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 193
Target Start/End: Original strand, 23663805 - 23663923
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| ||| ||||||||||    
T  23663805 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagagaccaatttttaaa 23663904  T
Q  175 tgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  23663905 cgacccctaattgcaagga 23663923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 9337185 - 9337048
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaaca 152  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |  ||  | ||||||| | ||||||||||||   ||| |||| ||| ||||||| ||||||     
T  9337185 tgccacgtaagcaaattagtgacgtggcagtgattaactaggttgagggaccaattcttaaatgattaaactttgaaagggtaatttgccaaaattaacg 9337086  T
Q  153 attacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaa 190  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||  ||||||||||    
T  9337085 attacaaggaccaattttaaaatgacctctaattgcaa 9337048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Original strand, 12273169 - 12273262
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12273169 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgacgggattaacgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 12273262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Original strand, 23698560 - 23698653
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  23698560 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattacaagga 23698653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 193
Target Start/End: Original strand, 39071934 - 39072050
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaat 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | |||| || | ||||||||| ||||||||||     
T  39071934 gtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggatt-acgaatacagggaccaatttttaaac 39072032  T
Q  176 gacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| | | ||||||||||    
T  39072033 gacccttgattgcaagga 39072050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 8316830 - 8316778
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8316830 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgatt 8316778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 12273095 - 12273043
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12273095 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgatt 12273043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20385727 - 20385587
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaaca 152  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |  |  || |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| | ||||| |     
T  20385727 tgccacgtcagctaatcagtgacgtggcagtaattaactgggctcagggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcg 20385628  T
Q  153 attacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20385627 aatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 20385587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 23698486 - 23698434
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23698486 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgatt 23698434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 215
Target Start/End: Original strand, 38003747 - 38003835
Alignment:
Q  127 gcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 215  Q
    |||||| |||||||||| ||||| | ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  38003747 gcaagggtaaattgccaggattagcgattacagagactaatttttaaattacgactaattgcaaggacgaaacacatcattaaaccttt 38003835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 41353705 - 41353577
Alignment:
Q  81 agtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgc 180  Q
    ||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||  | ||||| | |||||||  || ||||||||||||||||    
T  41353705 agtgattaagttgctcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgttaggattagcgattacagaaactaatttttaaatgacgc 41353606  T
Q  181 ctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    ||||||| |||||| || || ||||||||    
T  41353605 ctaattgtaaggacgaaacatatcattaa 41353577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 39474681 - 39474579
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaat 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | |||||| | |  |||||||||||    
T  39474681 gtggcagtgattaagttggtcaaag-acgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaagattagcgattacaagaattaatttttaaat 39474583  T
Q  176 gacg 179  Q
    ||||    
T  39474582 gacg 39474579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8746469 - 8746347
Alignment:
Q  67 attagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaa 166  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||  ||| |  ||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| ||| || ||||||| ||||||| |||  |    
T  8746469 attactgacgtggcggtgattaagtgggtcaagtgacgaaattttaaatgattaaggtttgcaagggtaatttgtcacgattaacgattacagtgaccga 8746370  T
Q  167 tttttaaatgacgcctaattgca 189  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  8746369 tttttaaatgacccctaattgca 8746347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23698445 - 23698327
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaat 175  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||  |||| |  |||| | ||||||||||| ||||||||||     
T  23698445 gtggcagtgattaaattggtcaaaggacgaaattttaactgattaatgattgcaaggctagtttgcaagaattagcgattacagggactaatttttaaac 23698346  T
Q  176 ga-cgcctaattgcaagga 193  Q
    || | ||||||||||||||    
T  23698345 gaccccctaattgcaagga 23698327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Original strand, 20386746 - 20386839
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20386746 ggacgaaattttaaatgattaataattgcgaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 20386839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 38862814 - 38862866
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38862814 tattttgtcctcttcttaagagcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgatt 38862866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 42945254 - 42945158
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatt 168  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | |  |||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||    
T  42945254 tgacttggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatataagggtaaattgtcaggattagcaattacagggactaatt 42945158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 216
Target Start/End: Original strand, 10749833 - 10749940
Alignment:
Q  109 tttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcatta 208  Q
    ||||| ||||||||  |||||||| ||| ||| || ||||||| |||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||  | |    
T  10749833 tttaagtgattaacgtttgcaagggtaatttgacaggattaacgattacatggaccaatttttaaatgatccctaattgcaaggacgaaacacatattaa 10749932  T
Q  209 agccttta 216  Q
    ||||||||    
T  10749933 agccttta 10749940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 193
Target Start/End: Original strand, 22915680 - 22915767
Alignment:
Q  106 aattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||  |||| |||||||||    
T  22915680 aattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaagattagcgattacatggaccaatttttaaacgatccctagttgcaagga 22915767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 212
Target Start/End: Original strand, 6472395 - 6472441
Alignment:
Q  166 atttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  6472395 atttttaaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcc 6472441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 193
Target Start/End: Original strand, 34061616 - 34061737
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||  | |||||||  || |||| | ||||| | | |||| |||  |||||||    
T  34061616 tgacatggcagtgattaacttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaagaatgcaagggcaatttgcaaggattagcgaatacatggatcaattttt 34061715  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||| |||||||||||||    
T  34061716 aaacgacgtctaattgcaagga 34061737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 121
Target Start/End: Original strand, 8747533 - 8747601
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaa 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||  | |||| |||||||||||||||||    
T  8747533 tgccacgtcatcaaattactgacgtggcggtgattaagtgggttaagggacgaaattttaaatgattaa 8747601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 11761947 - 11761863
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgca 189  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||  || ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  11761947 aaattttaaatgattaacgtttgcaggggcaatttgacaagattaacgattacagagacgaatttttaaataatccctaattgca 11761863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 193
Target Start/End: Original strand, 30711986 - 30712125
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaaca 152  Q
    |||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| |  || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| ||    
T  30711986 tgccacgtcagctaatcagtgatgtggcagtaattaactgggttcagggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagca 30712085  T
Q  153 attacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    | |||| |||| |||||||||| | | |||||| |||||||    
T  30712086 aataca-ggaccaatttttaaacggcccctaatcgcaagga 30712125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 193
Target Start/End: Original strand, 30719763 - 30719902
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaaca 152  Q
    |||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| |  || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| ||    
T  30719763 tgccacgtcagctaatcagtgatgtggcagtaattaactgggttcagggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagca 30719862  T
Q  153 attacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    | |||| |||| |||||||||| | | |||||| |||||||    
T  30719863 aataca-ggaccaatttttaaacggcccctaatcgcaagga 30719902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 39071893 - 39071945
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||    
T  39071893 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaattttatatgtggcagtgatt 39071945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 169
Target Start/End: Original strand, 21432981 - 21433076
Alignment:
Q  74 acgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattt 169  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||| | ||| |||||||||||  | ||||||| ||||||| ||| |||||| |||||| |||| |||||    
T  21432981 acgtgtcagtgattaagttggtcaaaggacgacattgtaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaaaattaacgattacatggactaattt 21433076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 174
Target Start/End: Original strand, 6471985 - 6472078
Alignment:
Q  81 agtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||  | |||||| | || ||||||||||    
T  6471985 agtgattaagttggtcaaaggacaaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattggcgattacatgaactaatttttaaa 6472078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 16388738 - 16388686
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16388738 tattgtgtcctcttcttaagtgcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgatt 16388686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 36186278 - 36186226
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  36186278 tattttgtcctcttcttaagtgcaaaattgatatttcatgtgggacagtgatt 36186226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 193
Target Start/End: Original strand, 7295197 - 7295336
Alignment:
Q  54 gccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaa 153  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |  ||| |||||  |||||||||| ||||||  | |||||| |||  |||| | ||||| | |    
T  7295197 gccacgtcatcaaattaatgacgtggcagtcattgactgggtcaaaggatgaaattttaaacgattaaagaatgcaagactagtttgcaaggattagcga 7295296  T
Q  154 ttacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     |||||||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||    
T  7295297 atacagggaccgatttttaaacgatccataattgcaagga 7295336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 38003586 - 38003487
Alignment:
Q  81 agtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgc 180  Q
    |||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||  | | ||||| ||||||| ||  |||| | |||||||  || ||||||||||||||||    
T  38003586 agtgattaagttggtcaaagaacgaaattttaaatgattaaacaatacaaggttaaattgtcataattagcgattacagaaactaatttttaaatgacgc 38003487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 145 - 194
Target Start/End: Original strand, 27500437 - 27500486
Alignment:
Q  145 gattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggac 194  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  27500437 gattaacgattacatggaccaatttttaaatgacccataattgcaaggac 27500486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 193
Target Start/End: Original strand, 42803542 - 42803627
Alignment:
Q  108 ttttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||    |||| |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||    
T  42803542 ttttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccacgattggtgattatagggaccaatttttaaacgacttctaattgcaagga 42803627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 104)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 36314509 - 36314297
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36314509 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtccaag 36314410  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314409 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 36314310  T
Q  201 catcattaagcct 213  Q
    |||||||||||||    
T  36314309 catcattaagcct 36314297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 48322588 - 48322376
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48322588 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtccaag 48322489  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  48322488 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgatgtctaattgcaaggactaatca 48322389  T
Q  201 catcattaagcct 213  Q
    |||||||||||||    
T  48322388 catcattaagcct 48322376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10770701 - 10770493
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  10770701 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacggtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaagttggtccaag 10770602  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10770601 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 10770502  T
Q  201 catcattaa 209  Q
    |||||||||    
T  10770501 catcattaa 10770493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 54466609 - 54466813
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  54466609 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 54466708  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  54466709 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattaccaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 54466808  T
Q  201 catca 205  Q
    |||||    
T  54466809 catca 54466813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 8041802 - 8042006
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  8041802 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgtaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttgttccaag 8041901  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  8041902 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatatttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 8042001  T
Q  201 catca 205  Q
    |||||    
T  8042002 catca 8042006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23458190 - 23457998
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  23458190 tattttgtcctcttcttaagagaaaaattggaatttcatgtgtgatagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 23458091  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  23458090 gacgaaattttaaatgattaattattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccttaattgcaagga 23457998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 36417905 - 36418097
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  36417905 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagtttgtcaaag 36418004  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | |||||| || |||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  36418005 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacaggaaccaatttttaaacgacccctaattacaagga 36418097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19741134 - 19740946
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||    
T  19741134 tattttgtcctcttcttaaaggtaaaattggaatttcatgtgtgccagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcaatgattaaattggtcaaag 19741035  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgca 189  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||    
T  19741034 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgatccctaattgca 19740946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 43384500 - 43384692
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  43384500 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 43384599  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||  |||| | ||||||| | || || ||| |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  43384600 gacgaaattttaaatgactaatgattgcaaggctagtttgcaaggattaacgaatatagagacaaatttttaaacgattcctaattgcaagga 43384692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 75 - 213
Target Start/End: Original strand, 48322637 - 48322775
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48322637 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagggacgaatttttaaa 48322736  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48322737 cgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 48322775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Original strand, 36314558 - 36314695
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314558 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagggacgaatttttaaa 36314657  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314658 cgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 36314695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 55052490 - 55052359
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  55052490 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtttgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 55052391  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaagg 132  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  55052390 gactaaattttaaatgattaatgattgcaagg 55052359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 10770751 - 10770885
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10770751 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagggacgaatttttaaa 10770850  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10770851 tgacgcctaattgtaaggactaatcacatcattaa 10770885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 46474998 - 46475132
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  46474998 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 46475097  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggcta 135  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  46475098 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggcta 46475132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 33689591 - 33689401
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  33689591 tattttgtcctcttcttaagg-caaaattggaatttcatgtgtgatagtgattgtcacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 33689493  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| |  |||| | | ||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  33689492 gacaaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaagaattagcgaataca-tgaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 33689401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 47921602 - 47921466
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaat 175  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47921602 gtggcagtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaat 47921503  T
Q  176 gacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
    | |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||    
T  47921502 gccgcctaattgcaagggttaaacacatcaataagcc 47921466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Original strand, 37778559 - 37778702
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  37778559 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggatgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcaattacagggactaattttt 37778658  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  37778659 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagccttt 37778702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 72 - 214
Target Start/End: Original strand, 40788706 - 40788848
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||  | ||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||    
T  40788706 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaaagattaaacaatgcaagagtaaattgccaggattagcgattacagggactaattttt 40788805  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40788806 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctt 40788848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 72 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 32306564 - 32306419
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||| | |||||| | || |||||||    
T  32306564 tgacgtggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaagattagcgattacatgaactaattttt 32306465  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctttat 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  32306464 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctttat 32306419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 33689620 - 33689785
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  33689620 aaattggaatttcatgtatgacagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaata 33689719  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaa 190  Q
     ||||||| |||||||||| ||||| | |||||| | || |||||||||| ||| |||||||||||    
T  33689720 atgcaagggtaaattgccaggattagcgattacatgaaccaatttttaaacgacccctaattgcaa 33689785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 9294199 - 9294367
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  9294199 aaattggaatttcatgtatggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatgacagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 9294298  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| |||||||||| ||||| | |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9294299 atgcaagggtaaattgccaggattagcgattatagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 9294367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 23458220 - 23458388
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  23458220 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattggcacgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 23458319  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| |||||||| | ||||| | ||||||| ||| |||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  23458320 atgcaagggtaaattgcaaggattagcgattacagagaccaatttttaaacgacccataattgcaagga 23458388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 36417874 - 36417707
Alignment:
Q  26 aattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaat 125  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  ||    
T  36417874 aattggaatttcatgtatgatagtgattgccacatcatcaaattagtgacatgacggtgattaagtttgtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgat 36417775  T
Q  126 tgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||||||||||  |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  36417774 tgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattacaagga 36417707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 72 - 214
Target Start/End: Original strand, 29118824 - 29118966
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||| | |||||||||| ||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  29118824 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaatggtaaattgccaggattagcgattacagtgactaattttt 29118923  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  29118924 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattatgcctt 29118966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3469340 - 3469195
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| |||||   |||||| |||| |||||||    
T  3469340 tgacgtggccgtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagtgattacatggactaattttt 3469241  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctttat 217  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  3469240 aaatgacgcctaattgcaaagacgaaacacatcattaagcctttat 3469195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13948912 - 13948779
Alignment:
Q  80 cagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacg 179  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||| |    
T  13948912 cagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaagattagcgattacatggactaatttttaaatgatg 13948813  T
Q  180 cctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13948812 cctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 13948779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 209
Target Start/End: Original strand, 33156263 - 33156419
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaaca 152  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | || |||| ||||||||||||||||||     
T  33156263 tgccacgtcagctaattagtgacgtggcagtgattaagtggggggagggacgaaattttaaatgattaaacaatgaaagggtaaattgccaagattaacg 33156362  T
Q  153 attacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  33156363 attacaatgactaatttttaaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaa 33156419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8041753 - 8041615
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8041753 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 8041654  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    || ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  8041653 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagcct 8041615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 35643991 - 35643869
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||    
T  35643991 tgacgtggcagtgattaagtttgtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcacgggtaaattgccaggattagcgattacagggactaattttt 35643892  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggac 194  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  35643891 aaatgacgcctaattgcaaggac 35643869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 53756941 - 53757130
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||  |||    
T  53756941 tattttgtcctcttcttcaggga-aaattggaatttcatgtgtggtagtgattgtcacgtcatcgaattagtgacgcggtagtgattaagttggttaaag 53757039  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaag 191  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||| | ||||| | | |||| |||| |||||||||| |||  |||||||||||    
T  53757040 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggttagtttgcaaggattagcgaatacatggaccaatttttaaacgacttctaattgcaag 53757130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 54466560 - 54466430
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54466560 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattaacaattacagggacgaatttttaaa 54466461  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatca 205  Q
    || ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  54466460 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatca 54466430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10294697 - 10294558
Alignment:
Q  82 gtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcc 181  Q
    ||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||  | | ||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10294697 gtgattaagttggttaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatacaagggtaaattgtcatgattagcaattacagggactaatttttaaatgacgcc 10294598  T
Q  182 taattgcaaggactaatcacatcattaagcctttataaaa 221  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||    
T  10294597 taattgcaaggacgaaacacatcattaagccattttaaaa 10294558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29686081 - 29685943
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||| | ||||||||||| |||||||    
T  29686081 tgacgtggcagtgatcaagttggtcaaagaacgaaattttaaatgattaaacaatgcaaggataaattgtcaggattagcgattacagggactaattttt 29685982  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  29685981 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaatacatcattaag 29685943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 47551629 - 47551491
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaat 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  47551629 gtggcagtgattaagttggtcaaaggatgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccagtattagcgattacagggactaatttttaaat 47551530  T
Q  176 gacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctt 214  Q
    |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  47551529 gacatctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctt 47551491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 82 - 216
Target Start/End: Original strand, 52032435 - 52032569
Alignment:
Q  82 gtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcc 181  Q
    ||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||  | ||||||| || ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  52032435 gtgattaagttggtcaaaggaagaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtatattgccaggattagcgattacagggactaatttttaaatgacgtc 52032534  T
Q  182 taattgcaaggactaatcacatcattaagccttta 216  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  52032535 taattgcaaggacgaaacacatcattaagccttta 52032569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 3469486 - 3469627
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | |||||||| || |||||||    
T  3469486 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggacggaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacaggaactaattttt 3469585  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  3469586 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacagatcattaagcct 3469627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 41422112 - 41421975
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||    
T  41422112 tgacgtgacagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgtaagggtaaattgtcaagattaacgattacaggaactaattttt 41422013  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    || |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  41422012 aactgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaa 41421975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 52032278 - 52032141
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| | ||||| | |||||| |||  |||||||    
T  52032278 tgacgtggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgctaggattagcgattacaaggattaattttt 52032179  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  52032178 aaatgacgcctaattgcaaggacaaaacacatcattaa 52032141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11910837 - 11910701
Alignment:
Q  74 acgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaa 173  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| | ||||| | ||||||||||  |||||||||    
T  11910837 acgtggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgctaggattagcgattacagggattaatttttaa 11910738  T
Q  174 atgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaag 210  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  11910737 atgacgtctaattgcaaggacgaaacacatcattaag 11910701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Original strand, 32306710 - 32306847
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||  ||| |||||||    
T  32306710 tgacttggtagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacattgactaattttt 32306809  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  32306810 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaa 32306847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 40758331 - 40758166
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  40758331 aaattgaaatttcatgtgtgacggtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggtagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 40758232  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     |||  || ||||||| || ||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  40758231 atgc--gggtaaattg-caggattagcgattacatggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 40758166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 9294169 - 9294049
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  9294169 tattttgtcatcttcttaacggcaaaattagaatttcatgtgtggtagtgattgccacctccccgtattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaaa 9294070  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaa 121  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  9294069 gacaaaattttaaatgattaa 9294049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Original strand, 10294845 - 10294988
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||  || |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| | ||||| | |||||||| || |||||||    
T  10294845 tgacttggcagtgattaagttggtcaaaaaacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgcgaggattagcgattacaggaactaattttt 10294944  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 215  Q
    |||| ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10294945 aaattacgtctgattgcaaggacgaaacacatcattaagccttt 10294988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 148
Target Start/End: Original strand, 26463843 - 26463962
Alignment:
Q  29 tggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | | |    
T  26463843 tggaatttcatgtgtgacagtgattgccatgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatac 26463942  T
Q  129 aaggctaaattgccaagatt 148  Q
    |||| ||||||| |||||||    
T  26463943 aagggtaaattgtcaagatt 26463962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 88 - 215
Target Start/End: Original strand, 33506252 - 33506379
Alignment:
Q  88 aagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattg 187  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | || |||  |||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  33506252 aagttggtcaaaggacaaaattttaaatgattaaacaatgtaagagtaaattgccaggattagcgattacagggactaatttttaaataacgcctaattg 33506351  T
Q  188 caaggactaatcacatcattaagccttt 215  Q
     |||||| || |||||||||||||||||    
T  33506352 aaaggacgaaacacatcattaagccttt 33506379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 210
Target Start/End: Original strand, 29686226 - 29686364
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| |||||   ||||||  ||| ||||||     
T  29686226 tgacttggtagtgattaagttggtcaaatgacaaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagtgattacaatgactaatttta 29686325  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  29686326 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaag 29686364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 43384471 - 43384321
Alignment:
Q  24 gaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaaca 123  Q
    ||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |   |  ||| |||||||||||||||||      
T  43384471 gaaattggaattttatgtatggtagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatgacagtgattaagtggggagagagacgaaattttaaatgattaaac 43384372  T
Q  124 attgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    | ||||||| ||||||| || ||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  43384371 aatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagggaccaatttttaaa 43384321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 53756930 - 53756766
Alignment:
Q  26 aattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaat 125  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||| |  |   | |||| |||||||||||||||||  |     
T  53756930 aattggaatttcatgtatgatagtgattgccacatcatcaaattagtgacatgacaatgattaaatgggaagatggacgaaattttaaatgattaaacaa 53756831  T
Q  126 tgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaa 190  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||| |||||| | |  |||||||||| ||| |||||||||||    
T  53756830 tgcaagggtaaattactaagattaacgattacatgaatcaatttttaaacgacccctaattgcaa 53756766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3596249 - 3596106
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||  | ||||| | ||||||| || ||||| | ||||||  ||| |||||||    
T  3596249 tgacatggtagtgattaagttggtcaaagaacgaaattttaaatgattaaataatgcaaaggtaaattgtcaggattagcgattacattgactaattttt 3596150  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 215  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  3596149 aaatcacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaaaccttt 3596106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2796316 - 2796198
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  2796316 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaa 2796217  T
Q  175 tgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  2796216 tgacccctaattgcaagga 2796198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 203
Target Start/End: Original strand, 21185978 - 21186114
Alignment:
Q  67 attagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaa 166  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||  ||| | |||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| | || ||    
T  21185978 attactgacgtggcggtgattaagtgggtcaagggacgaaattttaaatgattaaggtttgcaagggtaatttgccaggattaacgattacatgtaccaa 21186077  T
Q  167 tttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacat 203  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| || |||||    
T  21186078 tttttaaatgacccctaattgcatggacaaaacacat 21186114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 40033701 - 40033637
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatca 65  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40033701 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatca 40033637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 41988148 - 41988053
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaa 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||   |  ||| |||||||||||||||||    
T  41988148 aaattggaatttcatgtgtaacagtgattgccacgt-atcaaattagtgatgtggcagtgattaagtgaggagagagacgaaattttaaatgattaa 41988053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 212
Target Start/End: Original strand, 42855601 - 42855733
Alignment:
Q  80 cagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacg 179  Q
    ||||||||||   |||| |||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||  |||| | ||||| | | |||| |||| |||||||||||||||    
T  42855601 cagtgattaaccgagtcaaaggatgaaattttaaatgattaaagaatgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacatggactaatttttaaatgacg 42855700  T
Q  180 cctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  42855701 cctaattgcaagggctaaacacatcattaagcc 42855733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29118670 - 29118529
Alignment:
Q  80 cagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaa-caat----------tgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatt 168  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||          ||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||| ||||    
T  29118670 cagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaaggacaatgcaagggtaaattgccagaattagcgattacagggactaatt 29118571  T
Q  169 tttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaag 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  29118570 tttaaatgacgcataattgcaaggacgaaacacatcattaag 29118529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 189
Target Start/End: Original strand, 1079537 - 1079626
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgca 189  Q
    |||| |||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  1079537 ggacgaaattttaaaagattaaactttgcaaggctaatttgccaggattaacgattacagggaccaatttttaaatgacccctaattgca 1079626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 189
Target Start/End: Original strand, 4323490 - 4323607
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||||||||||| |||||||  || ||  ||| || ||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  4323490 tgacgtggcagtcattaagtgggttcagtgacgaatttttaaatgattaaacaatgcaaggttaatttgccaggattagcgattacagggacgaattttt 4323589  T
Q  172 aaatgacgcctaattgca 189  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  4323590 aaacgacgcctaattgca 4323607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 76 - 193
Target Start/End: Original strand, 40758402 - 40758519
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaat 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| | ||||| | | ||||  ||| |||||||||||    
T  40758402 gtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacatagaccaatttttaaat 40758501  T
Q  176 gacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  40758502 gacccctaattgcaagga 40758519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 176
Target Start/End: Original strand, 10307661 - 10307765
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||||||  |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  10307661 tgacgtgcgagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagagactaattttt 10307760  T
Q  172 aaatg 176  Q
    |||||    
T  10307761 aaatg 10307765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 193
Target Start/End: Original strand, 19741213 - 19741301
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19741213 aaattttaaatgattaaacaatacaagggtaaattgccaagattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 19741301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 189
Target Start/End: Original strand, 25108364 - 25108500
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaaca 152  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |  |   |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||  |  |||||| ||||| ||    
T  25108364 tgccacgtcagctaatcagtgacgtggcagtgattaactgtgatgaaggacgaaattttaaatgattaacgtttgcagggacagtttgccaggattagca 25108463  T
Q  153 attacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgca 189  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  25108464 attacagggaccaaattttaaatgacccctaattgca 25108500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 9367900 - 9367766
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaaca 152  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |   | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| | ||||| |     
T  9367900 tgccacctcatcaaattagtgacgtggcagtgattaattgggatgagggacgaaattttaaatgattaataattgcaaggctagtttgcaaggattagcg 9367801  T
Q  153 attacagggacgaatttttaaatgacgcctaattg 187  Q
    | ||||| ||| | |||||||| ||| ||||||||    
T  9367800 aatacagagaccattttttaaacgacccctaattg 9367766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 43998285 - 43998179
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||  |||||| |||||| |||| |||||||    
T  43998285 tgacttggtagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccagaattaacgattacaaggactaattttt 43998186  T
Q  172 aaatgac 178  Q
    |||||||    
T  43998185 aaatgac 43998179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 193
Target Start/End: Original strand, 40506036 - 40506197
Alignment:
Q  33 atttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaagg 132  Q
    ||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||  |   |  ||| |||||||||||||||||  | || ||||    
T  40506036 atttcatgtatggcaatgattgccacatcatcaaattagttacatgacagtgattaagtgcggagagagacgaaattttaaatgattaaataatgtaagg 40506135  T
Q  133 ctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcc-taattgcaagga 193  Q
     ||||||| || ||||||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||    
T  40506136 gtaaattgtcaggattaacgattacaggaaccaacttttaaatgaccccataattgcaagga 40506197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 26463767 - 26463651
Alignment:
Q  77 tggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatg 176  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| | ||||| | | |||| |||  |||||||||| |    
T  26463767 tggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattaccgaatacaaggatcaatttttaaacg 26463668  T
Q  177 acgcctaattgcaagga 193  Q
    || | ||||||||||||    
T  26463667 acccttaattgcaagga 26463651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 186
Target Start/End: Original strand, 32431472 - 32431594
Alignment:
Q  64 caaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggac 163  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||   ||| | |||| |||||||||||| ||||   |||||||||||| ||| || ||||||| ||| |||||||    
T  32431472 caaattaatgacgtggcaatcattaagcgggtcaagggacgaaattttaaatggttaaactttgcaaggctaatttgtcaggattaacgattgcagggac 32431571  T
Q  164 gaatttttaaatgacgcctaatt 186  Q
     |||||||||||||| |||||||    
T  32431572 caatttttaaatgacccctaatt 32431594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 46474927 - 46474837
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaa 190  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||| | |||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  46474927 ggacaaaattttaaatgattaaacaatgcaatggtaaattgccaagattagcgattacagagaccaatttttaaacgacccctaattgcaa 46474837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Original strand, 40033772 - 40033865
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  || |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  40033772 ggacaaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcaattatagaaaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 40033865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 42342903 - 42342810
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  42342903 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggactagcaattacatggaccaatttttaaacgacccctaattgtaagga 42342810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 193
Target Start/End: Original strand, 42343023 - 42343140
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaat 175  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||| | | |||| |||  ||||||||||     
T  42343023 gtggcactgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatcattgcaagactaatttgcaaagattagcgaatacatggatcaatttttaaac 42343122  T
Q  176 gacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| | ||||| ||||||    
T  42343123 gacccttaattacaagga 42343140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 2796365 - 2796417
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2796365 tattttgtcctcttctaaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgatt 2796417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3849146 - 3849054
Alignment:
Q  97 caaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgca 189  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||  |||| | ||||||| | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  3849146 caaggacgaaattttaaatgattaatgattgcagggctagtttgcaaggattaacgaatacagggaccaatttttaaacgactcctaattgca 3849054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25107370 - 25107210
Alignment:
Q  55 ccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaat 154  Q
    |||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |  |   | |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  || |||||| ||||| | ||    
T  25107370 ccacgtcagctaatcactgacgtggcagtgattaactgtgatgagggacgaaattttaaatgattaacatttgcaggggcaatttgccaggattagcgat 25107271  T
Q  155 tacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 215  Q
    || || ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  || |||||  ||||||||||    
T  25107270 tagagagaccaatttttaaatgacccctaattgcagggatgaaacacatacttaagccttt 25107210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 33154989 - 33154877
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatc 199  Q
    ||||||| | ||||||||||||   || ||||| ||| ||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| || |    
T  33154989 ggaccaattcttaaatgattaaactttacaaggataatttgtcaggattaacgattacagggaccaatttttaaatgacccctaattgcatggacgaaac 33154890  T
Q  200 acatcattaagcc 212  Q
    ||||  |||||||    
T  33154889 acatacttaagcc 33154877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 40788551 - 40788423
Alignment:
Q  81 agtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgc 180  Q
    ||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||||  | ||||| | ||||||| ||  |||| | |||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  40788551 agtgattaagttgatcaaatgacgaaattttaaatgattaaataatgcaaaggtaaattgtcagaattagcgattagagggactaatttttaaataacgc 40788452  T
Q  181 ctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
     ||||||||||||  || |||||||||||    
T  40788451 ttaattgcaaggaagaaacacatcattaa 40788423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 42342982 - 42343034
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  42342982 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcactgatt 42343034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 47856516 - 47856396
Alignment:
Q  83 tgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcct 182  Q
    |||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||   |||||||  ||| ||| || ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| |    
T  47856516 tgattaagttggtcaaatgacaaaattttaaatgattaaactttgcaagagtaatttgtcaggattaacgattacaaggaccaatttttaaacgacgctt 47856417  T
Q  183 aattgcaaggactaatcacat 203  Q
    ||||||| |||| || |||||    
T  47856416 aattgcagggacgaaacacat 47856396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 51994128 - 51994076
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  51994128 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 51994076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6956360 - 6956257
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatc 199  Q
    |||| ||||||||||||||| |   |||||||| ||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||  |||||||||| |||| || |    
T  6956360 ggacgaaattttaaatgatttaagtttgcaagggtaatttgccaggattaacgattatagggactaatttttaaatgatccctaattgcagggacgaaac 6956261  T
Q  200 acat 203  Q
    ||||    
T  6956260 acat 6956257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 212
Target Start/End: Original strand, 13949074 - 13949121
Alignment:
Q  165 aatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13949074 aatttttaaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcc 13949121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 26463808 - 26463757
Alignment:
Q  2 attttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26463808 attttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtatggcagtgatt 26463757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 1078648 - 1078555
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggac 194  Q
    |||| |||||||||||||||||   || ||||| ||| || ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  1078648 ggacgaaattttaaatgattaaactttacaaggttaatttacca-gattaacgattacagggaccaatttttaaatgacccctaattgcatggac 1078555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 193
Target Start/End: Original strand, 51994173 - 51994295
Alignment:
Q  71 gtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | |||| || ||||||||||  |||| | |||||| |||| ||||||    
T  51994173 gtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccagaattagcgattacaaggaccaatttt 51994272  T
Q  171 taaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| ||  ||||||||||||||    
T  51994273 taaacgatccctaattgcaagga 51994295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4322695 - 4322591
Alignment:
Q  108 ttttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcatt 207  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| ||| ||| || ||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||   || |||||||||    
T  4322695 ttttaaatgattaaacaatgcaaggttaatttgtcaggattagcgattacagg-acgaatttttaaacgacgcctaattgcaggggtgaaacacatcatt 4322597  T
Q  208 aagcct 213  Q
    ||||||    
T  4322596 aagcct 4322591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 189
Target Start/End: Original strand, 23276299 - 23276388
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgca 189  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||| | || ||| |||||  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  23276299 ggacaaaattttaaatgattaacgtttgtaggggtaatttgccgggattagcgattacagggaccaatttttaaatgacccctaattgca 23276388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 33506225 - 33506180
Alignment:
Q  165 aatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  33506225 aatttttaaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaag 33506180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 40758361 - 40758413
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40758361 tattttgtcctcttcttaagggcaaagttggaatttcacgtgtggcagtgatt 40758413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 203
Target Start/End: Original strand, 47857533 - 47857664
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| || |||  |||||| ||||||  ||  |||||||    
T  47857533 tgacgtggcattgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaactttgcaaggataatttaccagaattaacgattacaaagatcaattttt 47857632  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacat 203  Q
    ||| ||| ||||||| || |||| || |||||    
T  47857633 aaacgacacctaattacagggacgaaacacat 47857664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 139
Target Start/End: Original strand, 8741314 - 8741348
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaatt 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8741314 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaatt 8741348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 145 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 43607847 - 43607789
Alignment:
Q  145 gattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacat 203  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||    
T  43607847 gattaacgattacagggaccaatttttaaatgacgcttaattgcagggacgaaacacat 43607789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 43608798 - 43608892
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggac 194  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| || | | ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  43608798 ggacgaaattttaaatgattaaactttgcaaggttaatttacgaggattaacgattacagagaccaatttttaaatgatccctaattgcagggac 43608892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 194
Target Start/End: Original strand, 9368622 - 9368711
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggac 194  Q
    |||||||||||||||||  | || |||  ||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  9368622 aaattttaaatgattaaacaatgtaagagtaatttgcaaggattaatgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggac 9368711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 189
Target Start/End: Original strand, 41558195 - 41558287
Alignment:
Q  97 caaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgca 189  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| | ||||| | | |||| |||  |||||||||| ||| ||||||||||    
T  41558195 caaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagcgaatacatggattaatttttaaacgacccctaattgca 41558287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 51994086 - 51994042
Alignment:
Q  77 tggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaa 121  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  51994086 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 51994042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 146 - 193
Target Start/End: Original strand, 34142580 - 34142627
Alignment:
Q  146 attaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  34142580 attaacgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 34142627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 197
Target Start/End: Original strand, 14634123 - 14634165
Alignment:
Q  155 tacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaa 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  14634123 tacagggaccaatttttaaatgacccctatttgcaaggactaa 14634165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 23272980 - 23272946
Alignment:
Q  55 ccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaa 89  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23272980 ccacgtcatcaaatcagtgacgtggcagtgattaa 23272946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 42342952 - 42342906
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattag 71  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||    
T  42342952 aaattggaatttcatgtgtgacattgattgtcatgtcatctaattag 42342906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 42854592 - 42854554
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagt 91  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  42854592 tgccacgtcatcaaattactgaggtggcagtgattaagt 42854554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Original strand, 55052564 - 55052638
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||  | |||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  55052564 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcagaggtaaattgccatgattaacgattacatggaccaatttttaaa 55052638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 76 - 121
Target Start/End: Original strand, 2796406 - 2796451
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaa 121  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  2796406 gtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaactgattaa 2796451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 35712183 - 35712111
Alignment:
Q  60 tcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaagg 132  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||||| |  ||| || ||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  35712183 tcatcagattagtgacctgacagtgattaactgggtcaaaagacgaaattttaaatgattaaacattgcaagg 35712111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 89
Target Start/End: Original strand, 39399361 - 39399397
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaa 89  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39399361 tgccacctcatcagattagtgacgtggcagtgattaa 39399397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 53
Target Start/End: Original strand, 40033731 - 40033759
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40033731 aaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 40033759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 96)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32680806 - 32680594
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32680806 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtccaag 32680707  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32680706 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgtcaggattagcaattacaggaacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 32680607  T
Q  201 catcattaagcct 213  Q
    |||||||||||||    
T  32680606 catcattaagcct 32680594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34928861 - 34928648
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  34928861 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacaatgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 34928762  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  34928761 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 34928662  T
Q  201 catcattaagcctt 214  Q
    ||||| ||||||||    
T  34928661 catcaataagcctt 34928648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39686745 - 39686527
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  39686745 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacggtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 39686646  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||  |    
T  39686645 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggttaaata 39686546  T
Q  201 catcattaagcctttataa 219  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  39686545 catcaataagcctttataa 39686527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 30948371 - 30948167
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  30948371 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtaacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 30948272  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||    
T  30948271 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggttaaaca 30948172  T
Q  201 catca 205  Q
    |||||    
T  30948171 catca 30948167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 27991925 - 27992117
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  27991925 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 27992024  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  27992025 gactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 27992117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 17102206 - 17102398
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  17102206 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcataaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 17102305  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  17102306 gactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgctaggattagcgaatacatggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 17102398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2640389 - 2640197
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  2640389 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 2640290  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| | ||||| | | |||||| || |||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  2640289 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagcgaatacaggtaccaatttttaaacgacccctaattgtaagga 2640197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28469220 - 28469029
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||    
T  28469220 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcacgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacg-ggcaatgattaagttggtcaaag 28469122  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | || | |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  28469121 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaagattagcgaatataaggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 28469029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 28469249 - 28469417
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  28469249 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggtagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 28469348  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  28469349 atgcaagggtaaattgccaggattaacgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 28469417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 22871519 - 22871389
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  22871519 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgttgcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaaattggtcaaag 22871420  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaag 131  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22871419 gacgaaattttaaatgattaataattgcaag 22871389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 42731636 - 42731828
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  42731636 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgggagtgattgccacgtcattgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 42731735  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| | ||||| |   || |||||  |||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  42731736 gacgaaattttaaatgattaataattgcaaagctagcttgcaaggattagcggatatagggatcaatttttaaacgacccctaattacaagga 42731828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 75 - 213
Target Start/End: Original strand, 32680855 - 32680993
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32680855 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacatggacgaatttttaaa 32680954  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32680955 cgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 32680993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 48789014 - 48788824
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||     
T  48789014 tattttgtcctcttcttaagtgcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtgacactgattaagttggtcaaat 48788915  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaag 191  Q
    ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  48788914 gatgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 48788824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 6253657 - 6253849
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  6253657 tattttgtcctctacttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgtcatgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaagttggtcaaag 6253756  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| ||   |||| | ||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  6253757 gactaaattttaaatgattaatgattgcaagacttgtttgcaaggattagcgaatacaaggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 6253849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 19204675 - 19204867
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||     
T  19204675 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaaattggtcaaat 19204774  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||  ||||||||||| |||||  ||||||| ||||  |||| | ||||| | |||||| | || ||||||||||  || |||||||| |||||    
T  19204775 gatgaaattttaaataattaatgattgcaaagctagtttgcaaggattagcgattacatgaaccaatttttaaaccacccctaattgtaagga 19204867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 32053354 - 32053220
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||     
T  32053354 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcaagtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaagttggtcaaaa 32053255  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggcta 135  Q
    ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  32053254 gatgaaattttaaatgattaatgattgcaaggcta 32053220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 37657067 - 37657198
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  37657067 tattttgtcttcttcttaagggcaaaattggaatttcacgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagcgacgtgtcagtgattaagttggtcaaag 37657166  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaagg 132  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  37657167 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagg 37657198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 3914355 - 3914524
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||     
T  3914355 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccatgtcatcgaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaat 3914454  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttt 170  Q
    ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | ||||||||| ||||||    
T  3914455 gatgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttt 3914524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 10936011 - 10936203
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtcc-aa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||    
T  10936011 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtaatgattgtcacgtcatctaattagtgacgcggcaatgattaagtt-gtccaaa 10936109  T
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | |||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  10936110 ggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacaaggaccaatttttaaacaacccctaattgcaagga 10936203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10935981 - 10935813
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      | |||| |||||||||||||||||  |    
T  10935981 aaattggaatttcatgtatggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggagagagggacgaaattttaaatgattaaaca 10935882  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10935881 atgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 10935813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 42019808 - 42019616
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| |||    
T  42019808 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttaatgtgtggtagtgattgccacatcatcgaattagtgacgtagcagtgattaatttggtcaaag 42019709  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     || |||||||||||||||||  ||| ||| ||||  |||| | ||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  42019708 aacgaaattttaaatgattaatgattacaaagctagtttgcaaggattagcgaatacatggaccaatttttaaacgacccttaattgcaagga 42019616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 23181235 - 23181400
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||      | |||| |||||||||||||||||  |    
T  23181235 aaattggaatttcatgtatgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatgacagtgattaagtggagagagggacgaaattttaaatgattaaaca 23181334  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaa 190  Q
     ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| ||| |||||| ||| |||||||||||    
T  23181335 atgcaagggtaaattgccaagattagcgattacatggaccaatatttaaacgacccctaattgcaa 23181400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 216
Target Start/End: Original strand, 30948420 - 30948561
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30948420 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 30948519  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttta 216  Q
    || ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  30948520 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagccttta 30948561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Original strand, 42618197 - 42618334
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | |||||||| || |||||||    
T  42618197 tgacgtgacagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacaggaactaattttt 42618296  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  42618297 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaa 42618334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 42731606 - 42731438
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  42731606 aaattggaatttcatgtatggcagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 42731507  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     |||| || |||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  42731506 atgcaggggtaaattgccaggattagcgattacaaggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 42731438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 222
Target Start/End: Original strand, 32934637 - 32934784
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||| ||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | || |||  ||||||| || ||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  32934637 cgtgacagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgtaagagtaaattgtcaggattagcgattacagggactaatttttaaa 32934736  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctttataaaat 222  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  32934737 tgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctttataaaat 32934784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25628618 - 25628481
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||  ||| |||||||    
T  25628618 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattatcgattacaatgactaattttt 25628519  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  25628518 aaatgacgcctaattgcaagcacgaaacacatcattaa 25628481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 43266406 - 43266265
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||||| |||||| |||| |||||||    
T  43266406 tgacgtgacagtgattaagttggtcaaatgatgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattaacgattacatggactaattttt 43266307  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  43266306 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 43266265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25453268 - 25453128
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||| | |||| |||||| |||||||    
T  25453268 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaataatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattatagggactaattttt 25453169  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  25453168 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcc 25453128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Original strand, 32068382 - 32068522
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||| | ||||||||||  |||||||    
T  32068382 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattggcaggattagcgattacagggattaattttt 32068481  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  32068482 aaatgactcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcc 32068522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 40379956 - 40379788
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  40379956 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcattgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 40379857  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     | ||| | |||||||| | ||||| | | ||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  40379856 atacaaaggtaaattgcaaggattagcgaatacaaagaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 40379788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 42019838 - 42020006
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |  ||| ||||||||||| |||||  |    
T  42019838 aaattggaatttcatgtatgacagtgattaccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtgaggagagagacgaaattttaaataattaaaca 42019937  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||  |||||||||||||||| | |||| ||| || ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  42019938 atgcaagagtaaattgccaagattagcgattataggaaccaatttttaaacaacccctaattgcaagga 42020006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 214
Target Start/End: Original strand, 23058715 - 23058857
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| |||  |||||||    
T  23058715 tgacgtggcagtaattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcgagggtaaattgccaggattaacgattacaaggattaattttt 23058814  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctt 214  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23058815 aaatgacgccgaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctt 23058857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28890719 - 28890577
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| | ||||| | |||||| |||| |||||||    
T  28890719 tgacgtgacagtgattaagttagtcaaaagacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgctaggattagcgattacaaggactaattttt 28890620  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  28890619 aaatgacgtctaattgcaaggacgaaacacatcattaaacctt 28890577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 187
Target Start/End: Original strand, 32053384 - 32053546
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  32053384 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccatgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 32053483  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattg 187  Q
     ||||| | |||||||| | ||||||| |||| ||| || |||||||||| ||  ||||||||    
T  32053484 atgcaatgataaattgctaggattaacgattataggaaccaatttttaaacgatccctaattg 32053546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 75 - 213
Target Start/End: Original strand, 34928910 - 34929048
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34928910 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 34929009  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    || ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  34929010 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagcct 34929048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 75 - 213
Target Start/End: Original strand, 39686794 - 39686932
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39686794 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 39686893  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    || ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  39686894 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagcct 39686932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24389006 - 24388838
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||| |||||||  |    
T  24389006 aaattggaatttcatatgtgacagtgattgccacgtcatcaaattggtgatgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaagtgattaaaca 24388907  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     | ||||| |||||||||| ||||| | | ||||| ||| |||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  24388906 atacaagggtaaattgccatgattagcgaatacagagaccaatttttaaacgacccataattgcaagga 24388838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 27396836 - 27397004
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  27396836 aaattggaatttcatgtgtaacagtgattgacacgtcatcaaattcttgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 27396935  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||  | | ||||| || ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  27396936 atgcagtggtgaattgtcaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 27397004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 42618051 - 42617911
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||| ||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||| | |||| |||||| |||||||    
T  42618051 tgacttggtagtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattaaagggactaattttt 42617952  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  42617951 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcc 42617911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 213
Target Start/End: Original strand, 43266561 - 43266693
Alignment:
Q  81 agtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgc 180  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||  |||| | |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  43266561 agtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcagaattagcgattacatggactaatttttaaatgacgc 43266660  T
Q  181 ctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  43266661 ctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 43266693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32068236 - 32068099
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||||    
T  32068236 tgacttggcattgattaagttggtcaaagtacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacaaggactaattttt 32068137  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  32068136 aaatgacgtctaattgcaaggacgaaacacatcattaa 32068099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 32934488 - 32934345
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  32934488 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagcgactaattttt 32934389  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||| |||||    
T  32934388 aaatgacacctaattgcaaggatgaaacacatcattaaaccttt 32934345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 209
Target Start/End: Original strand, 10600243 - 10600372
Alignment:
Q  80 cagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacg 179  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||| | |||||| |||| |||||||||||||||    
T  10600243 cagtgattaagttggtcaaaggacaaaattttgaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacaaggactaatttttaaatgacg 10600342  T
Q  180 cctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  10600343 cctaattgcaatgacgaaacacatcattaa 10600372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 213
Target Start/End: Original strand, 33828268 - 33828401
Alignment:
Q  80 cagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacg 179  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||     
T  33828268 cagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagagactaatttttaaatgaca 33828367  T
Q  180 cctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  33828368 cctaattgcaaggacgaaactcatcattaagcct 33828401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 45010812 - 45011013
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcag---------tgattaagt 91  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||         |||||||||    
T  45010812 tattttgtcctcttcttaaaggcaaaattggaatttcatgtgtggcaatgattgctacgtcatcaaattagtgacgtggcagacgtggcagtgattaagt 45010911  T
Q  92 tagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaag 191  Q
      |   |  ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| | ||||| | | |||| | || |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  45010912 ggggagagagacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgcaaggattagcgaatacatgaaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 45011011  T
Q  192 ga 193  Q
    ||    
T  45011012 ga 45011013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22081699 - 22081560
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||  |||| | |||| ||| || |||||||    
T  22081699 tgacttggcagtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccagcattagcgattagagg-actaattttt 22081601  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22081600 aaatgacgcataattgcaaggacgaaacacatcattaagcc 22081560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Original strand, 22081845 - 22081985
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | |||||||  || |||||||    
T  22081845 tgacttggcaatgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagaaactaattttt 22081944  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  22081945 aaatgacgcataattgcaaggacgaaacaaatcattaagcc 22081985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 84 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23058557 - 23058429
Alignment:
Q  84 gattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgccta 183  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||| | || ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  23058557 gattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaatggtatattgccaggattagtaattacagggactaatttttaaatgactctta 23058458  T
Q  184 attgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23058457 attgcaaggacgaaacacatcattaagcc 23058429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17885780 - 17885649
Alignment:
Q  60 tcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacag 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | |||||   | |||||    
T  17885780 tcatcaaattagtgacgtggcagtgattaactgggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagagaatacag 17885681  T
Q  160 ggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaag 191  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  17885680 ggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 17885649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 203
Target Start/End: Original strand, 18087626 - 18087757
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||||||||||| |||||||  ||  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| | ||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  18087626 tgacgtggcagtcattaagtgggttaagggacaaaattttaaatgattaataattgcaaggctattttgcaaggattagcgattacagtgaccaattttt 18087725  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacat 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18087726 aaatgacccctaattgcaaggactaaacacat 18087757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 215
Target Start/End: Original strand, 25628772 - 25628907
Alignment:
Q  80 cagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacg 179  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||| | ||||||  ||| |||||||||||||||    
T  25628772 cagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacatagactaatttttaaatgacg 25628871  T
Q  180 cctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 215  Q
    | ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  25628872 cataattgcaaggacgagacacatcattaagtcttt 25628907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 214
Target Start/End: Original strand, 27138227 - 27138369
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||| ||| |  |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||| | |||||| |||| |||||||    
T  27138227 tgacttggcggtgattaagttggtcaaagaaagaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacaaggactaattttt 27138326  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctt 214  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  27138327 aaatgacgcctgattgaaaggacgaaacacatcattaagcctt 27138369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 46204554 - 46204424
Alignment:
Q  79 gcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgac 178  Q
    |||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||| ||  | ||||| | ||||||| || | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  46204554 gcagtgattaagttggtcaatggacgaaattttaaatgataaaataatgcaatggtaaattgtcaggtttagcgattacagggactaatttttaaatgac 46204455  T
Q  179 gcctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  46204454 gcctaattgcaaggacgaaacacatcattaa 46204424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Original strand, 2640419 - 2640580
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |   |  ||| |||||||||||||||||  |    
T  2640419 aaattggaatttcatgtatggcagggattgccacgtcatcaaattagtgacatgacagtgattaagtggggagagagacgaaattttaaatgattaaaca 2640518  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaatt 186  Q
     ||||||| ||||||||||  |||| | ||||||| | | |||||||||| ||| |||||||    
T  2640519 atgcaagggtaaattgccagaattagcgattacagaggccaatttttaaacgacccctaatt 2640580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 3914325 - 3914229
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaa 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   | |||| |||||||||||||||||    
T  3914325 aaattggaatttcatgtatgacagtgattatcacgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaagttggaagagggacgaaattttaaatgattaa 3914229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 45010782 - 45010652
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  45010782 aaattggaatttcatgtgtgacaatgattgcca---catcaaattagtgacttggcagtgattaagtggggagatggacgaaattttaaatgattaaaca 45010686  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattaca 158  Q
     ||||||  |||||||||||||||| | ||||||    
T  45010685 atgcaagcgtaaattgccaagattagcgattaca 45010652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 18855970 - 18856064
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggac 194  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18855970 ggacgaaattttaaatgattaaactttgcaagggtaatttgccaagattaacgattacagggaccaatttttaaatgacccctaattgcagggac 18856064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 39275011 - 39274873
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaa-ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||  | ||||| | |||||| | | ||||| | ||||||| ||| ||||||    
T  39275011 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaaaggtaaattactaggattagcgattacagagactaatttt 39274912  T
Q  171 taaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  39274911 taaataacgccaaattgcaaggacaaaacacatcattaa 39274873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Original strand, 25453414 - 25453551
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||  | ||||||| |||||||| | ||||| | ||| ||||||| |||||||    
T  25453414 tgacgtggcggtgattaagctggtcaaaggacgaaatgttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgctaggattagcgatttcagggactaattttt 25453513  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||    
T  25453514 aaatgacgcttaattacaaagacgaaacacatcattaa 25453551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 37657037 - 37656871
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |   | |||| ||||||||||| | |||  |    
T  37657037 aaattggaatttcatgtg--acagtaattgccacgtcatcaaattagtgacgtgccggtgattaagtggggagagggacgaaattttaaataaataaaca 37656940  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||  |||||||| | ||||| | ||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  37656939 atgcaagcgtaaattgcgaggattagcgattacagagaccaatttttaaacgattcctaattgcaagga 37656871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Original strand, 13050104 - 13050200
Alignment:
Q  108 ttttaaatgattaa-caattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacat 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  13050104 ttttaaatgattaaacaattgcaagggtaaattaccaggattaacgattacagggacgaaatttaaaattacgcctaattgcaaggacgaaacacat 13050200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18086401 - 18086298
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatc 199  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | ||||| |  |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  18086401 ggacgaaattttaagtgattaataattgcaaggctaatttgcaaggattatcgtttacagggaccaatttttaaacgactcctaattgcaaggactaaac 18086302  T
Q  200 acat 203  Q
    ||||    
T  18086301 acat 18086298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 53 - 191
Target Start/End: Original strand, 13386016 - 13386154
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaaca 152  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| |     
T  13386016 tgccacctcatcagattagtgacatggcagtgattaactgggtcaaaggataaaattttaaatgattaaacattgcaaggctagtttgcaaggattagcg 13386115  T
Q  153 attacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaag 191  Q
    | || |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  13386116 aatatagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 13386154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6571125 - 6571032
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  6571125 ggacaaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattaacgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 6571032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10600102 - 10600026
Alignment:
Q  136 aattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  10600102 aattgccaggattaacgattatagggactaatttttaaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcatttagcc 10600026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 193
Target Start/End: Original strand, 22871598 - 22871686
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| | ||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22871598 aaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgcaaggattagctattacagggaccaatttttaaatgacccctaattgcaagga 22871686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 193
Target Start/End: Original strand, 24389078 - 24389194
Alignment:
Q  77 tggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatg 176  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||| | ||||| | | |||| |||| |||||||||| |    
T  24389078 tggcagtgattaagttggtcaaaggacaaaattttaaatgattaatgattgcaatgctagtttgcaaggattagcgaatacatggaccaatttttaaacg 24389177  T
Q  177 acgcctaattgcaagga 193  Q
    || ||||||||||||||    
T  24389178 acccctaattgcaagga 24389194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 160
Target Start/End: Original strand, 48789044 - 48789179
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| || || |||| ||||  |   | |||  |||||||||||||||||  |    
T  48789044 aaattggaatttcatgtatgacagtgatcgccacatcatcaaattagtgacatgacaatgatcaagtggggagagggatgaaattttaaatgattaaaca 48789143  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagg 160  Q
     ||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||    
T  48789144 atgcaagggtaaattgccagaattaacgattacagg 48789179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17102157 - 17102039
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  17102157 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaa 17102058  T
Q  175 tgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  17102057 cgacccctaattgcaagga 17102039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 193
Target Start/End: Original strand, 32298996 - 32299114
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||| |||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  32298996 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttcaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaa 32299095  T
Q  175 tgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  32299096 cgactcctaattgcaagga 32299114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 32687504 - 32687406
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacat 203  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||  || |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||    
T  32687504 aaattttaaatgattaatatttgcaagggcaatttgccaggattaacgattacagggaccaaattttaaatgacccctaattacaaggacaaaacacat 32687406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 214
Target Start/End: Original strand, 46205595 - 46205737
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||||||  |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||| || ||| |||    
T  46205595 tgacgtgatagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaatttgtcaggattaacgattacaggaaccaatcttt 46205694  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctt 214  Q
    ||||||    |||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  46205695 aaatgatcattaattgcaagaacgaaacacatcattaaacctt 46205737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6253583 - 6253490
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  6253583 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 6253490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 193
Target Start/End: Original strand, 17886778 - 17886899
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| | |||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||  |||| | ||||||| | |||| |||  |||||||    
T  17886778 tgacgtggcagtgattaagtgggtcaagggacgaaattttaaatgattaatatttgcaagggtagtttgcaaggattaacgaatacatggatcaattttt 17886877  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  17886878 aaatgatccctaattgcaagga 17886899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19204601 - 19204508
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  19204601 ggacaaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccagaattaacgattacagggaccaatttttaaacgacccctaatttcaagga 19204508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 193
Target Start/End: Original strand, 5457176 - 5457316
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaaca 152  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |  |   | |||| |||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||| | |||||||     
T  5457176 tgccacgtcagctaatcagtgacgtggcagtgattaactgggatgagggacgaaattttaaatgattaaacattgaaagggtaatttgcaaggattaacg 5457275  T
Q  153 attacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  5457276 aatacaaggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 5457316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 193
Target Start/End: Original strand, 22828087 - 22828227
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaaca 152  Q
    |||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||  ||  |  ||  |||||||||||||||||   ||||| || ||| ||| ||||||||||     
T  22828087 tgccacgtcatcaaattactaacatggcggtgattaagtgggttaagtgatgaaattttaaatgattaaggtttgcaggggtaatttgtcaagattaacg 22828186  T
Q  153 attacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22828187 attacaaggaccaatttttaaatgacccctaattacaagga 22828227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 192
Target Start/End: Original strand, 32688506 - 32688626
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| | |||| ||||||||||||||||| | ||||||||  || ||| || ||||| | |||||| |||| || ||||    
T  32688506 tgacgtggcagttattaagtgggtcaagggacgaaattttaaatgattaatatttgcaagggcaatttgtcaggattagcgattacaaggaccaaatttt 32688605  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaagg 192  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  32688606 aaatgacccctaattgcaagg 32688626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 135
Target Start/End: Original strand, 6571240 - 6571299
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggcta 135  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6571240 gtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaataattgcaaggcta 6571299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13044807 - 13044690
Alignment:
Q  77 tggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatg 176  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||| || ||||||||||||||  | ||||| | ||||||| || || || | ||||| |||||||| |||||||||    
T  13044807 tggcagtgattaagtttgttaagggacgaatttttaaatgattaaacaatgcaatggtaaattgtcaggagtagcgattactgggacgaaattttaaatg 13044708  T
Q  177 acgcctaattgcaaggac 194  Q
     |||||||||||||||||    
T  13044707 gcgcctaattgcaaggac 13044690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 6571199 - 6571251
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  6571199 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtggcagtgatt 6571251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 91
Target Start/End: Original strand, 13311277 - 13311340
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagt 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  13311277 aaattggaatttcatgtgtggcagtgattgtcacgtcatcaaatta---atgtggcagtgattaagt 13311340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 193
Target Start/End: Original strand, 16803967 - 16804054
Alignment:
Q  106 aattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| | ||||  | ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16803967 aattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgctaggattggcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 16804054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 42362564 - 42362469
Alignment:
Q  98 aaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||| | ||||||| | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  42362564 aaggacgaaattttaaatgattaaagaatgcaagggtaatttgcaaggattaacgaatacaaggaccaatttttaaacgacacctaattgcaagga 42362469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27991876 - 27991758
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||||||| ||||| | ||||||||||  ||||| ||||    
T  27991876 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccaggattagcgattacagggatcaatttctaaa 27991777  T
Q  175 tgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  27991776 cgacccctaattgcaagga 27991758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 251
Target Start/End: Original strand, 37351215 - 37351253
Alignment:
Q  213 tttataaaatgagtaatggttttgctcatgacaccgtct 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37351215 tttataaaatgagtaatggttttgctcatgacaccgtct 37351253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 23608881 - 23608817
Alignment:
Q  139 tgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacat 203  Q
    ||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  23608881 tgccaggattaagaaatacagggaccaatttttaaatgacccctatttgcaaggactaaacacat 23608817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 24389036 - 24389088
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24389036 tattttgtcatcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtatggcagtgatt 24389088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 32298943 - 32298895
Alignment:
Q  5 ttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  32298943 ttgtcctcttcttaagggcaaaaatggaatttcatgtgtggcagtgatt 32298895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 156
Target Start/End: Original strand, 12229342 - 12229444
Alignment:
Q  54 gccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaa 153  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||  | |||| ||||||| |||||||||   |||||||  ||| ||| || |||||||||    
T  12229342 gccacgtcatcaaattaatgacgtggcagtcattaagtgggttaagggacgaaatttttaatgattaaactttgcaagaataatttgtcaggattaacaa 12229441  T
Q  154 tta 156  Q
    |||    
T  12229442 tta 12229444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27396765 - 27396648
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaat 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| | ||||| | | |||| |||| ||||||||||     
T  27396765 gtggcagtgattaagttggtcaaatgatgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacatggaccaatttttaaac 27396666  T
Q  176 gacgcctaattgcaagga 193  Q
    | | ||||||| ||||||    
T  27396665 ggcccctaattacaagga 27396648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Original strand, 40380000 - 40380093
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||  | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  40380000 ggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattggcgaatacatggaccaatttttaaacgactcctaattgcaagga 40380093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 193
Target Start/End: Original strand, 18670132 - 18670272
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaaca 152  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |  |   | |||||||||||||| |||||||   |||  |||  ||||||| | |||||||     
T  18670132 tgccacgtcagctaatcagtgacgtggcagtaattaaatgggcttagggaccaaattttaagtgattaaactttgggagggcaaattgcaaggattaacg 18670231  T
Q  153 attacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    | ||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  18670232 aatacagggaccattttttaaacgacccctaattgcaagga 18670272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 27396806 - 27396754
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27396806 tattttgtcatcttcttaagggcagaattggaattttatgtgtggcagtgatt 27396754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 6764267 - 6764203
Alignment:
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgca 189  Q
    |||||||| ||| ||| ||| |||||  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  6764267 ttgcaagggtaatttgtcaaaattaatgattacaggaaccaatttttaaatgacccctaattgca 6764203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 114)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24905378 - 24905166
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24905378 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgcgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtccaag 24905279  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905278 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgcaaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 24905179  T
Q  201 catcattaagcct 213  Q
    |||||||||||||    
T  24905178 catcattaagcct 24905166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 28011549 - 28011768
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaattt-----catgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  28011549 tattttgtcctcttcttaagggtaaaattggaatttcatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaagttggt 28011648  T
Q  96 ccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggact 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28011649 ccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggact 28011748  T
Q  196 aatcacatcattaagccttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28011749 aatcacatcattaagccttt 28011768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 52134254 - 52134465
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  52134254 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 52134353  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  52134354 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattaacaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 52134453  T
Q  201 catcattaagcc 212  Q
    ||||| ||||||    
T  52134454 catcaataagcc 52134465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 33442805 - 33442594
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  33442805 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 33442706  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  33442705 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagagacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 33442606  T
Q  201 catcattaagcc 212  Q
    ||||| ||||||    
T  33442605 catcaataagcc 33442594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31514529 - 31514316
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  31514529 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 31514430  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  31514429 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccagaattaacaattacaggaacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 31514330  T
Q  201 catcattaagcctt 214  Q
    ||||| ||| ||||    
T  31514329 catcaataaacctt 31514316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4716679 - 4716466
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  4716679 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 4716580  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  || |||| || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||    
T  4716579 gaccaaattttaaacgattaacaattgccgggttaaaatgtcaggattagcaattacatggacgaatttttaaatgccacctaattgcaagggctaaaca 4716480  T
Q  201 catcattaagcctt 214  Q
    ||||| ||| ||||    
T  4716479 catcaataaacctt 4716466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 34464660 - 34464468
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  34464660 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaat 34464561  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  34464560 gacgaaattttaaatgattaaacattgcaagggtaaattgccaagattagcgattacatggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 34464468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 183432 - 183240
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  183432 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 183333  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  183332 gactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgtaagga 183240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 6367779 - 6367971
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  6367779 tattttgtcctcttcttaagggaaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 6367878  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  6367879 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccttaattgcaagga 6367971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13914279 - 13914087
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  13914279 tattttgtcctcttcttaagggtaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggtagtgattaagttggtcaaag 13914180  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| | ||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  13914179 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagcgaatacatggactaatttttaaacgacccctaattgcaagga 13914087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 26024609 - 26024801
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  26024609 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattagaatttcatgtgtggcagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaaattggtcaaag 26024708  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| | ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26024709 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 26024801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 30711544 - 30711736
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  30711544 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagcgattgcaacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaat 30711643  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | ||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  30711644 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagagaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 30711736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 37578403 - 37578211
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||    
T  37578403 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatagcagtgattaagttggtcaaag 37578304  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     || |||||||||||||||||  |||| |||||||  |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  37578303 aacgaaattttaaatgattaatgattggaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 37578211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 43759039 - 43759231
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||    
T  43759039 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtgacagtggttaagttggtcaaag 43759138  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||  |||| | ||||| | | |||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  43759139 gacgaaattttaaatgattgaagattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccgatttttaaacgacccctaattgcaagga 43759231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 47999334 - 47999142
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||    
T  47999334 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattggtgacgtggcaataattaagttggtcaaag 47999235  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  47999234 gactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgatccctaattgcaagga 47999142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 193
Target Start/End: Original strand, 48779337 - 48779528
Alignment:
Q  2 attttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaagg 101  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  48779337 attttgtcatcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaagg 48779436  T
Q  102 accaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| | ||||| ||| |||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  48779437 acgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcaaatacatggactaatttttaagcgactcctaattgcaagga 48779528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17662061 - 17661871
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  17662061 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgatagtgattgccgcgtcatcgaattagtgacgtggca-tgattaagttggtcaaag 17661963  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||| | ||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  17661962 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaatgctagtttgcaaggattagcgaataca-ggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 17661871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 32917477 - 32917667
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  32917477 tattttgtcctatttttaagggtaaaattggaatttcatatgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcaatgattaagttggtcaaag 32917576  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaag 191  Q
    ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||||| | ||||| ||| |||||||||| ||| | ||||||||||    
T  32917577 gatgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattaacgaatacagagaccaatttttaaacgacccttaattgcaag 32917667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 1103678 - 1103870
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  1103678 tattttgtcctcttcttaagggtaaaattggaatttcatgagtggtagtgattgccacatcatcaaattagtgacgtggcagtgaataagttggtcaaag 1103777  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||| |||   ||||||||||||    
T  1103778 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacctttaattgcaagga 1103870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 1841676 - 1841867
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  1841676 tattttgtcctcttcttaagggcaaaatttgaatttcatgtgtggtagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 1841775  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||| | ||||| | | ||||||||  |||||||||| ||| ||| ||| ||||||    
T  1841776 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaa-gctagtttgcaaggattagcgaatacagggaacaatttttaaacgacccctcattacaagga 1841867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6367749 - 6367581
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  6367749 aaattggagtttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 6367650  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  6367649 atgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 6367581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 41098950 - 41099142
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||     
T  41098950 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcacgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatgacagtgattaagttggtcaaat 41099049  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||| | ||||| | | ||||| ||| |||||||||| |||  ||||||| |||||    
T  41099050 gacgaaattttaaatgattaatgattgtaaggttagtttgcaaggattagcgaatacagagaccaatttttaaacgaccactaattgtaagga 41099142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 49722944 - 49723135
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  49722944 tattttgtcctcttcttaagggcaaaat-ggagtttcatgtgtggtagtgattgccacgttatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 49723042  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||  |||||||||||||||||  |||| |||||||  |||| | ||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  49723043 gatgaaattttaaatgattaatgattgaaaggctagtttgcaaggattagcgaatacatggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 49723135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7821137 - 7820943
Alignment:
Q  29 tggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgc 128  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | |||    
T  7821137 tggattttcatgcgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattacgttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgc 7821038  T
Q  129 aaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctttataaaatg 223  Q
    |||| |||||||  | ||||| | ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||  ||  ||||  ||||||||||| ||||||    
T  7821037 aagggtaaattgtaaggattagcgattacagggactaattattaaaggacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcctttacaaaatg 7820943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 19017840 - 19017710
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  19017840 tattttgtcctcttctcaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacaatgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaacg 19017741  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaag 131  Q
     || |||||||||||||||||  ||||||||    
T  19017740 aacgaaattttaaatgattaatgattgcaag 19017710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 40714584 - 40714443
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  40714584 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattaacgattacagggactaattttt 40714485  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  40714484 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 40714443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23209572 - 23209381
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  23209572 tattttgtcctcttcttaagggaaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgtcacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 23209473  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     || |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||||| | || | | |  |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23209472 aacaaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattaacgaatataagtattaatttttaaacgac-cctaattgcaagga 23209381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 34464690 - 34464858
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  34464690 aaattggaatttcatgtatgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagagggacaaaattttaaatgattaaaca 34464789  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  34464790 ttgcaagggtaaattgccaagattagcgattacatggaccaatttttaaacaacccctaattgcaagga 34464858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 35152560 - 35152691
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||    
T  35152560 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgatgtgacagtgattaagttggtcaaag 35152659  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaagg 132  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  35152660 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagg 35152691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 7821171 - 7821305
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  7821171 tattttgtcctcttcttaagggcaaaaatggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaagttggtcaaag 7821270  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggcta 135  Q
    ||| ||||| |||||||||||  |||||| |||||    
T  7821271 gacgaaattataaatgattaatgattgcacggcta 7821305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 14879188 - 14879308
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  14879188 tattttgtcatcttcttaagggcaaaattggagtttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 14879287  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaa 121  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  14879288 gacgaaattttaaatgattaa 14879308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 36694493 - 36694301
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||| |||    
T  36694493 tattttgtcctcttcttaaaggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgctacgtcatcgaattagtgacttgacagtgattaagttggtcaaag 36694394  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    | | |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| | ||||| | | ||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  36694393 ggcgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacatagaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 36694301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 36710594 - 36710402
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||| |||    
T  36710594 tattttgtcctcttcttaaaggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgctacgtcatcgaattagtgacttgacagtgattaagttggtcaaag 36710495  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    | | |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| | ||||| | | ||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  36710494 ggcgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacatagaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 36710402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 17662091 - 17662259
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  17662091 aaattggaatttcatgtatgtcagtgattgccacttcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtgggaagagggacgaaattttaaatgattaaaca 17662190  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||| || |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  17662191 atgcaagggtaaattgccaggattaacgattaaaggaaccaatttttaaacgaccccaaattgcaagga 17662259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 40210581 - 40210389
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||    
T  40210581 tattttgttctcttcttaagggcaaaattggaatttcacatgtaacagtgattgccatgtcatcaaattaatgtcgtggcagtgattaagttggtcaaag 40210482  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| | ||||| | | ||||  ||| || ||||||| |||  |||||||||||||    
T  40210481 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagtctagtttgcaaggattagcgaatacaaagaccaaattttaaacgaccactaattgcaagga 40210389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 49955483 - 49955347
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaat 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  49955483 gtggcagtgattaagttggtcaaaggacaaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactaatttttaaat 49955384  T
Q  176 gacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  49955383 gatgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcc 49955347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 4960727 - 4960562
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  4960727 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtgggaagagggacgaaattttaaatgattaaaca 4960628  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaa 190  Q
     ||||||| |||||||| | ||||| | | ||||  ||  |||||||||| ||| |||||||||||    
T  4960627 atgcaagggtaaattgcaaggattagcgaatacaaagagcaatttttaaacgacccctaattgcaa 4960562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 40210611 - 40210776
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  40210611 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaatttagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 40210710  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaa 190  Q
     ||||||| ||||||||||  |||| | ||||||  ||| |||||||||| | | |||||||||||    
T  40210711 atgcaagggtaaattgccagaattagcgattacaaagaccaatttttaaacggcccctaattgcaa 40210776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 49955633 - 49955774
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||    
T  49955633 tgacttggcggtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattaacgattacaaagactaattttt 49955732  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  49955733 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 49955774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14879158 - 14878990
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  14879158 aaattggaatttcatgtatctcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatgacagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 14879059  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| |||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  14879058 atgcaagggtaaattgccaagattagcgattacatgaaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 14878990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 24009782 - 24009950
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  24009782 aaattggaatttcatgtgcgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 24009881  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| |||||||||| ||||  | ||||||  ||| |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  24009882 atgcaagggtaaattgccaggattggcgattacaatgaccaatttttaaacgatccctaattgcaagga 24009950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 37578433 - 37578601
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   |  ||| |||||||||||||||||  |    
T  37578433 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagtgacgaaattttaaatgattaatca 37578532  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     || |||| |||||||||| ||||| | ||||||   || |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  37578533 atgtaagggtaaattgccaggattagcgattacaaaaaccaatttttaaacgacccccaattgcaagga 37578601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 40772690 - 40772820
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  40772690 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgggagtgattgccaagtcatcgaattagtgacgt-gcagtgattaagttggtcaaag 40772788  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaagg 132  Q
    ||| |||||| |||| |||||  |||||||||    
T  40772789 gacgaaatttgaaataattaatgattgcaagg 40772820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41098920 - 41098754
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |     |||| |||||||||||||||||  |    
T  41098920 aaattggaatttcatatgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtggtagtgattaagtggggagggggacaaaattttaaatgattaaaca 41098821  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaag 191  Q
     ||||||| ||||||| || ||||| | ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  41098820 atgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagagaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 41098754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 40714729 - 40714870
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||| | |||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||||    
T  40714729 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaaaggtaaattgccaggattagcgattacatggactaattttt 40714828  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  40714829 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 40714870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 13914309 - 13914476
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  13914309 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgc-acgtcatcaaattagtgacgtggcagtgatttagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 13914407  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     | ||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  13914408 atacaagggtaaattgccaggattagcgattacatggaccaatttttaaacaacctctaattgcaagga 13914476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17189094 - 17188954
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||| |||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||    
T  17189094 tgacttggtagtgattaagctggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaataatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactaattttt 17188995  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17188994 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcc 17188954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 81 - 213
Target Start/End: Original strand, 20760800 - 20760932
Alignment:
Q  81 agtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgc 180  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20760800 agtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagagactaatttttaaatgacgc 20760899  T
Q  181 ctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  20760900 ctaattgtaaggacgaaacacatcattaagcct 20760932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 210
Target Start/End: Original strand, 33442854 - 33442989
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33442854 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 33442953  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaag 210  Q
    || ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  33442954 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataag 33442989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 24905427 - 24905560
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  24905427 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggctaaattgccaggattagcaattaca-ggacgaatttttaaa 24905525  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
     ||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905526 cgatccataattgcaaggactaatcacatcattaa 24905560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 214
Target Start/End: Original strand, 31058343 - 31058485
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||  || |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | ||||||  ||| |||||||    
T  31058343 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaatacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaagattatcgattacattgactaattttt 31058442  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctt 214  Q
    |||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31058443 aaatgatgtctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctt 31058485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31051090 - 31050949
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||| | |||||||||| ||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  31051090 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaaaggtaaattgccaggattagcgattacagagactaattttt 31050991  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  31050990 aaataacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 31050949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 37929550 - 37929417
Alignment:
Q  80 cagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacg 179  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | || |||| ||||||| || ||||| | || |||||||| |||||||||||||||    
T  37929550 cagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaataatgtaagggtaaattgtcaggattagcgataacagggactaatttttaaatgacg 37929451  T
Q  180 cctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  37929450 cctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 37929417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 1103648 - 1103481
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  1103648 aaattggaatttcatgtatgacagtgattgccacatcatcaaattagtgacatgacagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 1103549  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacga--atttttaaatgacgcctaattgcaa 190  Q
     ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| |  ||||||||| |||  ||||||||||    
T  1103548 atgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatatttttaaacgacctctaattgcaa 1103481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 30711514 - 30711346
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  | | | |||| |||||||||||||||||  |    
T  30711514 aaattggaatttcatgtatggcagtgattgccacgtcgtcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggcgagggacgaaattttaaatgattaaaca 30711415  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| |||||||| | ||||| | |||| || ||  ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  30711414 atgcaaggataaattgctaggattagcgattatagagatcaatttttaaacaacccctaattgcaagga 30711346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 45749982 - 45749839
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||||||| || ||||||| ||||||  ||| |||||||    
T  45749982 tgacttggtagtgattaagtttgtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagtgtaaattgtcaggattaacgattacaaagactaattttt 45749883  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  45749882 aaatgacgcctaattgcaaggatgaaacacatcattaagccttt 45749839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 19516002 - 19516092
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagt 91  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  19516002 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcacgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcaatgattaagt 19516092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 75 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 28011500 - 28011390
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28011500 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 28011401  T
Q  175 tgacgcctaat 185  Q
     ||| ||||||    
T  28011400 cgacccctaat 28011390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8898657 - 8898512
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||| |||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||  | | ||||  |||||| |||  |||| | ||||||| ||| |||||||    
T  8898657 tgacgtgacagtgattaaattggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatacaagagtaaattaccagaattagcgattacagtgactaattttt 8898558  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctttat 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  8898557 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctttat 8898512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 19323079 - 19322974
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||  |    
T  19323079 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggtagtgattaagttggtcaaagaacgaacttttaaatgattaatga 19322980  T
Q  125 ttgcaa 130  Q
    ||||||    
T  19322979 ttgcaa 19322974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 19323109 - 19323238
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||||| |||| ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||    
T  19323109 tattttatccttttcttgagggtaaaattgaaatttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggtagtgattaagttggtcaaag 19323208  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaa 130  Q
     || || ||||||||||||||  |||||||    
T  19323209 aacgaacttttaaatgattaatgattgcaa 19323238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 45750128 - 45750269
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||  | ||||||  |||||||| | ||||| | ||||||  ||| |||||||    
T  45750128 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaatgatgaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgctaggattagcgattacaaagactaattttt 45750227  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  45750228 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 45750269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 19017870 - 19018038
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  19017870 aaattggaatttcatgcgtggcagtgattgtcacgtcatcaaattagtgatgcggcagtgattaagtgggaagagggacaaaattttaaatgattaaata 19017969  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| |||||||||| ||||| | | |||| |||| |||||||||| |||   ||||||||||||    
T  19017970 atgcaagggtaaattgccaggattagcgaatacatggaccaatttttaaacgacctgtaattgcaagga 19018038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32917447 - 32917279
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |   |  ||| |||||||||||||||||  |    
T  32917447 aaattggaatgtcatgtgtgacagtaattgccacgtcgtcaaattagtgatgtggcagtgattaagtggggagagagacgaaattttaaatgattaaaca 32917348  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||  |||| || || ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  32917347 atgcaagagtaaactgtcaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgattcctaattgcaagga 32917279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 42248690 - 42248818
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||     
T  42248690 tattttgtcatcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgc--cgtcatcgaattagtgacgtgacaatgattaagttggtcaaat 42248787  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaag 131  Q
    | | ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  42248788 gtcgaaattttaaataattaataattgcaag 42248818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 75 - 205
Target Start/End: Original strand, 31514577 - 31514707
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31514577 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaataattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 31514676  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatca 205  Q
    || |||||||||| |||| |||| |||||||    
T  31514677 tgccgcctaattgtaagggctaaacacatca 31514707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 75 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 52134205 - 52134067
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||| ||||||||||| || || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52134205 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaacgattaacaattacagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 52134106  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    |  ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  52134105 taccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagcct 52134067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 213
Target Start/End: Original strand, 12905953 - 12906086
Alignment:
Q  80 cagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacg 179  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||||||||||| |    
T  12905953 cagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacatggactaatttttaaatgatg 12906052  T
Q  180 cctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
     | |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12906053 tcaaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 12906086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Original strand, 35040900 - 35041037
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||| | |||||| |||| |||||||    
T  35040900 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacatggactaattttt 35040999  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    |||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||    
T  35041000 aaatgacggctaattacaaggacgaaacacatcattaa 35041037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 17189173 - 17189277
Alignment:
Q  108 ttttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcatt 207  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  17189173 ttttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactaatttttaaatgacgtctaattgcaaggacgaaacacatcatt 17189272  T
Q  208 aagcc 212  Q
    |||||    
T  17189273 aagcc 17189277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 81 - 213
Target Start/End: Original strand, 28325099 - 28325230
Alignment:
Q  81 agtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgc 180  Q
    |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||  |||||| |||||| | || ||||||||||||||||    
T  28325099 agtgattaagttggtcaaaagacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccataattaacgattacatg-actaatttttaaatgacgc 28325197  T
Q  181 ctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  28325198 ctaattgcaaggccgaaacacatcattaagcct 28325230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30326636 - 30326496
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||| |||||||||||||||  || | | |||||||||||||||||  | ||||||| |||||| |||  |||| | ||||||| ||| |||||||    
T  30326636 tgacttggtagtgattaagttagttaaatgtcgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattaccagaattagcgattacagagactaattttt 30326537  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  30326536 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcc 30326496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 42248660 - 42248492
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  42248660 aaattggaatttcatgtatggtagtgattgccacatcaacaaattagtcacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 42248561  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| |||||||||| ||||| | | ||||  ||| |||||||||| |||  |||||||||||||    
T  42248560 atgcaagggtaaattgccacgattagcgactacaaagaccaatttttaaacgaccactaattgcaagga 42248492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 214
Target Start/End: Original strand, 8898803 - 8898945
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||  ||||   ||||||| ||| |||||||    
T  8898803 tgacttggtagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcagtattagtgattacagagactaattttt 8898902  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctt 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  8898903 aaatgacgcctaattacaaggacgaaacacatcattaagcctt 8898945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28324944 - 28324803
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||| | |||||| | || || ||||    
T  28324944 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaagacgaaattttaaatgattaaataatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacatgaactaa-tttt 28324846  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctt 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  28324845 aaacgacgcctaattgcaaggaggaaacacatcattaagcctt 28324803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 43759009 - 43758943
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagt 91  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43759009 aaattagaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagt 43758943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 210
Target Start/End: Original strand, 44523405 - 44523562
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaaca 152  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    | |||  |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| |     
T  44523405 tgccacgtcagctaattagtgacgtggcagtgattaagtgaagggagggatgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccatgattagcg 44523504  T
Q  153 attacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaag 210  Q
    |||| ||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  44523505 attatagatattaatttttaaatgaggcctaattgcaaggacgaaacacatcattaag 44523562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 46163217 - 46163056
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |   |  ||| |||||||||||||||||  |    
T  46163217 aaattggaatttcatgtatggcagtaattgccacgtcatcaaattagtgacatgacagtaattaagtggggagagagacgaaattttaaatgattaaaca 46163118  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaatt 186  Q
     ||||||| ||||||| || ||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| |||||||    
T  46163117 atgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacatggaccaatttttaaacgacccctaatt 46163056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 35152530 - 35152362
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  35152530 aaattggaatttcatgtatggtagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacattgcagtgattaagtggggagagggacaaaattttaaatgattaaaca 35152431  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     || |||| ||||||| ||  |||| | |||| |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||    
T  35152430 atgtaagggtaaattggcagtattagcgattatagggaccaatttttaaacgacctctaattgcaagga 35152362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 48779304 - 48779238
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagt 91  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48779304 aaattggaatttcatgtatgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagt 48779238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7371430 - 7371293
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||  | ||||||| |||||| |||  || | | |||||||  || |||||||    
T  7371430 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaataattaaacaatgcaaggataaattaccagaatcagcgattacagaaactaattttt 7371331  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||    
T  7371330 aaatgacacctaattgcaaggacgaaacatatcattaa 7371293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 35473763 - 35473650
Alignment:
Q  80 cagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacg 179  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||||  |||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| |||     
T  35473763 cagtgattaagttggtcaaaggacaaaattttaaatgtttaatgattacaaggctagtttgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacc 35473664  T
Q  180 cctaattgcaagga 193  Q
    ||||||||||||||    
T  35473663 cctaattgcaagga 35473650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25648021 - 25647903
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25648021 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaataatgcaggggtaaattgccaggattaacgattacagggaccaatttttaaa 25647922  T
Q  175 tgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  25647921 cgacccctaattgcaagga 25647903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 1841646 - 1841481
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |   |  ||| |||||||||||||||||  |    
T  1841646 aaattggaatttcatatatggcagtgattgtcacatcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagagtgacgaaattttaaatgattaaaca 1841547  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaa 190  Q
     || |||| ||||||| || ||||| | ||||| | ||| |||||||||| ||| | |||||||||    
T  1841546 atgtaagggtaaattgtcaggattagcgattacggagaccaatttttaaacgactcttaattgcaa 1841481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 213
Target Start/End: Original strand, 32558419 - 32558534
Alignment:
Q  98 aaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaa 197  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||  || ||||| | |||| ||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  32558419 aaggacgaaattttaaatgattaaacattacaagggtaaattatcaggattagcgattataggaactaatttttaaatgacgtctaattgtaaggacaaa 32558518  T
Q  198 tcacatcattaagcct 213  Q
     |||||||||||||||    
T  32558519 acacatcattaagcct 32558534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 215
Target Start/End: Original strand, 25885360 - 25885422
Alignment:
Q  153 attacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 215  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25885360 attacaaggactaatttttaaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagccttt 25885422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 174
Target Start/End: Original strand, 32133236 - 32133313
Alignment:
Q  97 caaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    ||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  32133236 caaggacgaaattttaaatgattaaactttgcgaggctaatttgccaagattaacgattacaaggacgaatttttaaa 32133313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 35038595 - 35038458
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | | |||   ||| |||| | ||||||| |||||| |||  |||||||    
T  35038595 tgacgtggcagtgattgagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatacaaaagtaatttgctaggattaacgattacatggatcaattttt 35038496  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    ||||||| | ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  35038495 aaatgacccttaattgcaaggacgaaacacattattaa 35038458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 205
Target Start/End: Original strand, 4716758 - 4716857
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||| || |||| |||||||||||   |||||||||||||| |||| ||||||    
T  4716758 aaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaatttca-ggacaaatttttaaatattgcctaattgcaagggctaaacacatc 4716856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 193
Target Start/End: Original strand, 34850334 - 34850474
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaaca 152  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||  |   | |||  |||||||||||||||||   |||||||| ||| |||| | ||||| |     
T  34850334 tgccacgtcagctaatcagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggatgaaattttaaatgattaaattttgcaagggtaatttgcaaggattagcg 34850433  T
Q  153 attacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  34850434 aatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 34850474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 193
Target Start/End: Original strand, 47999415 - 47999501
Alignment:
Q  107 attttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||||||||||||||  | |||| || |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  47999415 attttaaatgattaaataatgcaggggtaaattgccaagattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattacaagga 47999501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 188
Target Start/End: Original strand, 4960801 - 4960913
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaat 175  Q
    |||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | ||| ||||| ||||||||||     
T  4960801 gtggcagtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacggggaccaatttttaaac 4960900  T
Q  176 gacgcctaattgc 188  Q
    |||  ||||||||    
T  4960901 gacctctaattgc 4960913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26024560 - 26024444
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| || ||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| ||| ||||||||||    
T  26024560 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaacttttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagagaccaatttttaaa 26024461  T
Q  175 tgacgcctaattgcaag 191  Q
     ||| ||||||||||||    
T  26024460 cgacccctaattgcaag 26024444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24009713 - 24009594
Alignment:
Q  74 acgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaa 173  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||  | || | |||||   | |||| |||| |||||||||    
T  24009713 acgtgacagtgattaagttggtcaaaggatgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagttggcaaggattagtgaatacaaggaccaatttttaa 24009614  T
Q  174 atgacgcctaattgcaagga 193  Q
    | ||| ||||||||||||||    
T  24009613 acgacccctaattgcaagga 24009594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Original strand, 23209643 - 23209736
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgatt-aacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23209643 ggacgaaattgtaaatgattgaacaat-gcaagggtaaattgccaggattagcgattacaaggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 23209736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 34849152 - 34849030
Alignment:
Q  71 gtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||   |   | |||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| |||| | ||||| | | ||||||||| ||||||    
T  34849152 gtgacgtggcagtgattaagaggggagagggacgaaattttaaatgattaaattttgcaagggtaatttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttt 34849053  T
Q  171 taaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| ||| ||||||||||||||    
T  34849052 taaaagacccctaattgcaagga 34849030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 214
Target Start/End: Original strand, 7371536 - 7371597
Alignment:
Q  153 attacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctt 214  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  7371536 attacagagactaatttttaaatgacgtctaattgcaaggacgaaacacatcgttaagcctt 7371597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 10304093 - 10304048
Alignment:
Q  8 tcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10304093 tcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgatt 10304048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 40772619 - 40772526
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||||||| || ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  40772619 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgtcaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccataattgcaagga 40772526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 24009752 - 24009700
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||    
T  24009752 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcacacgtgacagtgatt 24009700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 193
Target Start/End: Original strand, 36694569 - 36694657
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||| | ||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  36694569 aaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagagaccaatttttaaacaacacctaattgcaagga 36694657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 193
Target Start/End: Original strand, 36710670 - 36710758
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||| | ||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  36710670 aaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagagaccaatttttaaacaacacctaattgcaagga 36710758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17691331 - 17691237
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggac 194  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||||| |||| |||| | ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||    
T  17691331 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagactaatttgcaaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctacttgtaaggac 17691237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Original strand, 17692501 - 17692594
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||| | ||||| | || ||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  17692501 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaaagctaatttgcaaggattagcgataacagggaccgatttttaaacgacccctaattgcaagga 17692594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19515931 - 19515838
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| ||||||||||| |||||  | ||||||| |||||| |||  |||||| ||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19515931 ggacgaaattttaaataattaaacaatgcaagggtaaatttccagaattaacgattacaaagaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 19515838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 44522258 - 44522146
Alignment:
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    |||||| | ||||||||||||   || ||||| ||| |||| | ||||||| ||||||||| | |||||||||||||  |||||||||| |||| || ||    
T  44522258 gaccaattcttaaatgattaaactttacaaggataatttgctaggattaacgattacagggtccaatttttaaatgatccctaattgcagggacgaaaca 44522159  T
Q  201 catcattaagcct 213  Q
    |||  ||||||||    
T  44522158 catacttaagcct 44522146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 174
Target Start/End: Original strand, 183482 - 183581
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||||| | ||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  183482 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaataatgcaggggtaaattgctaggattagcgattacagggaccaatttttaaa 183581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 9443684 - 9443581
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||  |||  ||| ||||| ||||||  | ||||| ||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  9443684 ggaccaaattttaaatgattaaattttgggaggacaaaatgccaggattaaggaatacagagaccattttttaaatgacccctatttgcaaggactaaac 9443585  T
Q  200 acat 203  Q
    ||||    
T  9443584 acat 9443581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 32132444 - 32132329
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||||||||||| |||||||  ||  | |||| ||||||||| |||||||   ||| |||  ||| |||| | ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  32132444 tgacgtggcagtaattaagtgggtgtagggacgaaattttaattgattaaactttgtaagagtaatttgcaaggattaacgattacatggacgaattttt 32132345  T
Q  172 aaatgacgcctaattg 187  Q
    |||||||  |||||||    
T  32132344 aaatgaccactaattg 32132329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 5734121 - 5734028
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggac 194  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||||| |||| |||| | ||||| | |||||| | || |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5734121 ggacaaaattttaaatgattaaacaatgcaagactaatttgcaaggattagcgattacatg-accaatttttaaacgacccctaattgcaaggac 5734028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 76 - 193
Target Start/End: Original strand, 7231541 - 7231658
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaat 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| |||||  ||| ||| ||||  |||  ||||||||  | ||||| ||  ||||||||||     
T  7231541 gtggcagtgattaagttggtcaaatgacaaaattttaaataattaatgattacaaagctagtttgtaaagattaatgaatacagtgatcaatttttaaac 7231640  T
Q  176 gacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  7231641 gactcctaattacaagga 7231658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25884745 - 25884700
Alignment:
Q  168 ttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  25884745 ttttaaatgacgtctaattgcaatgacgaaacacatcattaagcct 25884700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 49722914 - 49722885
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattg 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49722914 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattg 49722885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31197167 - 31197088
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgca 189  Q
    ||||||||||||||||     ||||||| ||| || ||| ||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31197167 aaattttaaatgatta-----tgcaagggtaattttccaggattaacgaatacagagacaaatttttaaatgacccctaattgca 31197088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 65)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14196826 - 14196613
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14196826 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaagttggtccaag 14196727  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14196726 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaagctaaattgccagaattagcaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 14196627  T
Q  201 catcattaagcctt 214  Q
    ||||||||||||||    
T  14196626 catcattaagcctt 14196613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 363063 - 362867
Alignment:
Q  19 agggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgat 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  363063 agggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaacgat 362964  T
Q  119 taacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 215  Q
    ||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  362963 taacaattgcagggttaaaatgccaggattaacaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagccttt 362867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 28000596 - 28000392
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  28000596 tattttgtcatcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 28000497  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| || || ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  28000496 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgacaggattagcaattaaagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 28000397  T
Q  201 catca 205  Q
    |||||    
T  28000396 catca 28000392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 30337635 - 30337827
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  30337635 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccatgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaaattggtcaaag 30337734  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30337735 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgattacagggaccaatttttaaatgacccctaattgcaagga 30337827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 33517751 - 33517943
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  33517751 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtgtcattgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 33517850  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  33517851 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctactttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 33517943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 80 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25486085 - 25485956
Alignment:
Q  80 cagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacg 179  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25486085 cagtgattaaattggtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgacg 25485986  T
Q  180 cctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25485985 cttaattgcaaggactaatcacatcattaa 25485956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 30725976 - 30726168
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  30725976 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgcaacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 30726075  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  30726076 gacgaaattttaaatgattaatgatttcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 30726168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 21627924 - 21627790
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  21627924 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 21627825  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggcta 135  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21627824 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggcta 21627790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 30804078 - 30804270
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  30804078 tattttgtcctcttcttaagggtaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 30804177  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||| |  |||| | | ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  30804178 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaacgctagtttgcaagaattagcgaatacagggatcaatttttaaacgacccctaattgcaagga 30804270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 193
Target Start/End: Original strand, 33647170 - 33647360
Alignment:
Q  3 ttttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaagga 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  33647170 ttttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcacgtgtggtagtgattgccatgtcatcaaatttgtgacgtggcagtgattaagtttgtcaaagga 33647269  T
Q  103 ccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  33647270 ctaaattttaaatgattaatgattgcaaggttagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 33647360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17734405 - 17734215
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  17734405 tattttgtcctctt--taagggcaaaattgtaatttcatgtgtggcagtaattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaaattggtcaaag 17734308  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| |||||||| | || |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  17734307 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcaattacaagaaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 17734215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Original strand, 3059476 - 3059665
Alignment:
Q  4 tttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggac 103  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||     
T  3059476 tttgtccacttcttaagggcaaaattggaatttcacgtgtggcagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaagat 3059575  T
Q  104 caaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3059576 gaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 3059665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 12080853 - 12081045
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| |||||||| ||| |||    
T  12080853 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgtcacgtcatcgaattagtgacatgacagtaattaagttggtcaaag 12080952  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12080953 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacagggacaaatttttaaacgactcctaattgcaagga 12081045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 105 - 211
Target Start/End: Original strand, 14196905 - 14197011
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14196905 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaacgacgcctaattgcaaggactaatcacatc 14197004  T
Q  205 attaagc 211  Q
    |||||||    
T  14197005 attaagc 14197011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 21627954 - 21628122
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  21627954 aaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacaaaattttaaatgattaaaca 21628053  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| ||||||| || ||||| | ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  21628054 atgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagggaccaatttttaagcgacccctaattgcaagga 21628122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32593625 - 32593489
Alignment:
Q  77 tggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatg 176  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||| | |||| |||||| ||||||||||||    
T  32593625 tggcagtgattaagttggtccaaagacgaaattttaaatgattaacaaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattatagggactaatttttaaatg 32593526  T
Q  177 acgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  32593525 acgcctaattgaaaggactaaacacatcattaagcct 32593489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 77 - 223
Target Start/End: Original strand, 22372950 - 22373096
Alignment:
Q  77 tggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatg 176  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22372950 tggcagtcattaatttggtccaaggatcaaattttaaatgattaacaattgcaggattaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatg 22373049  T
Q  177 acgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctttataaaatg 223  Q
     ||||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||||| ||||    
T  22373050 ccgcctaattgcaagggcaaaaaacatcaataagcctttatataatg 22373096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 214
Target Start/End: Original strand, 25486211 - 25486325
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatc 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |    
T  25486211 ggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccgggattagcaattacagggacgaatttttaaacgacgcttagttgcaaggactaacc 25486310  T
Q  200 acatcattaagcctt 214  Q
    | |||||||||||||    
T  25486311 atatcattaagcctt 25486325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Original strand, 31407164 - 31407301
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||| | ||||||||||| |||||||    
T  31407164 tgacgtgacagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagggactaattttt 31407263  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  31407264 aaatgacgcctaattgcaaggacgaagcacatcattaa 31407301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12080823 - 12080655
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  12080823 aaattggaatttcatatatgacagtgattgccacatcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 12080724  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     |||| || |||||||||| ||||| | ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12080723 atgcaggggtaaattgccatgattagcgattacagggagcaatttttaaacgacccctaattgcaagga 12080655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 33517721 - 33517553
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  33517721 aaattgaaatttcatgtatgacaatgattgccacgtcatcaaattagtgacgtagcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 33517622  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  33517621 atgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgatccctaattacaagga 33517553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 33647150 - 33646982
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |   |  ||| |||||||||||||||||  |    
T  33647150 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaaatggggagagagacgaaattttaaatgattaaata 33647051  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||  | |||||||| ||| | |||||| |||||    
T  33647050 atgcaagggtaaattggcaagattagcgattacagggatcactttttaaacgacccttaattgtaagga 33646982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 214
Target Start/End: Original strand, 22503060 - 22503202
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||| |||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||||    
T  22503060 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaatgacgaaaatttaaatgattaaacaatgcaaggataaattgccaggattagcgattacaaggactaattttt 22503159  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  22503160 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacattattaagcctt 22503202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7160944 - 7160807
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||  |||||||||| ||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  7160944 tgacgtggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgccaggattagcgattacagagactaattttt 7160845  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  7160844 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaa 7160807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 7905373 - 7905244
Alignment:
Q  82 gtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcc 181  Q
    ||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  7905373 gtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaataatgcaagggtaaattgccaggattaacgattacaaggactaatttttaaatgacgcc 7905274  T
Q  182 taattgcaaggactaatcacatcattaagc 211  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  7905273 taattgcaaggacgaaacacatcattaagc 7905244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22367552 - 22367423
Alignment:
Q  85 attaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaa 184  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  22367552 attaatttggtcaaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgctgcctaa 22367453  T
Q  185 ttgcaaggactaatcacatcattaagcctt 214  Q
    |||||||| | ||| |||||| ||||||||    
T  22367452 ttgcaagggcaaataacatcaataagcctt 22367423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3059444 - 3059276
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  3059444 aaattggaatttcatgtgtgacaatgattgccacgtcatcacattagtgacatggcagtgattaagtgaggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 3059345  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| |||||||| | ||||| | |||||| |||| |  ||||||| ||| | ||||||||||||    
T  3059344 atgcaagggtaaattgctaggattagcgattacatggacaatattttaaacgacccttaattgcaagga 3059276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31407018 - 31406878
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | |||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  31407018 tgacttgggagtgattaagtttgtcaaaggacgaaattttaaatgattaaataatgcaaggacaaattaccaggattaacgattacagggactaattttt 31406919  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  31406918 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacattattaagcc 31406878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 214
Target Start/End: Original strand, 28000645 - 28000784
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  28000645 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccagaattagcaattacagagacaaatttttaaa 28000744  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctt 214  Q
    || ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||    
T  28000745 tgccgcctaattgcaagggctaaacagatcaataagcctt 28000784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30725946 - 30725781
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  30725946 aaattggaatttcatgtatggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaaatggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 30725847  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaag 191  Q
     ||||||| ||||||| || ||||| | ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  30725846 gtgcaagggtaaattggcaggattagcgattacagagaccaatttttaaacgac-cctaattgcaag 30725781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Original strand, 363090 - 363227
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  363090 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 363189  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
    || ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  363190 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagcc 363227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 21836316 - 21836457
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||| | |||||| | || |||||||    
T  21836316 tgacttggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacaagaactaattttt 21836415  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  21836416 aaatgacgcctaattgcaaggatgaaacacatcattaagcct 21836457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22502914 - 22502777
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||| | |||||| |||| |||||||    
T  22502914 tgacttggcagttattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacaaggactaattttt 22502815  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22502814 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaa 22502777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6517642 - 6517503
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||  ||| |||||||    
T  6517642 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagg-taaattgccaggattagcgattacaaagactaattttt 6517544  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  6517543 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcc 6517503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 11393025 - 11392866
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   |  ||| |||||||||||||||||  |    
T  11393025 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttgggagatagacgaaattttaaatgattaaaca 11392926  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaa 184  Q
     ||||||| ||||||   | ||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| |||||    
T  11392925 atgcaagggtaaattattaggattagcgattacaaggaccaatttttaaacgactcctaa 11392866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21836170 - 21836035
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | |||||| | || |||||||    
T  21836170 tgacgtggcagtgattaagtt-gtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacaag-actaattttt 21836073  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  21836072 aaatgacgcctaattgcaagaacgaaacacatcattaa 21836035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 30804048 - 30803880
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  30804048 aaattgaaatttcatgtatggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgagatggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 30803949  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     || |||| |||||||||| ||||||| ||||||  ||  |||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  30803948 atgtaagggtaaattgccaggattaacgattacatagatcaatttttaaacgacacctagttgcaagga 30803880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Original strand, 7905529 - 7905672
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||| ||||||||||  | ||||||| ||||||||||  |||| | |||| |||||| ||||| |    
T  7905529 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaatgacgaaatttgaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccagaattagcgattatagggacaaatttat 7905628  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  7905629 aaatgacacctaattgcaaggacgaaacacatcattaaaccttt 7905672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11434954 - 11434821
Alignment:
Q  60 tcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacag 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | ||||     
T  11434954 tcatcaaattagtgacgtggcagtgattaactgggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaacgattagcgaatacat 11434855  T
Q  160 ggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| |||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  11434854 ggaccaatttttaaacgacccttaattgcaagga 11434821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 15913834 - 15913975
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||  | | || || ||| || ||||||||||| |||| | |||| |||||||    
T  15913834 tgacgtgacagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaattattaaacaatacaggggtaattttccaagattaacgattatatggacaaattttt 15913933  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    ||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15913934 aaatgacccttaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 15913975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 82 - 213
Target Start/End: Original strand, 7161100 - 7161231
Alignment:
Q  82 gtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcc 181  Q
    ||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || |||||   |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  7161100 gtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagtgattatagggactaatttttaaatgacgcc 7161199  T
Q  182 taattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    ||||||||||||| ||  | ||||||||||||    
T  7161200 taattgcaaggacgaaatatatcattaagcct 7161231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 30337586 - 30337468
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  30337586 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaccaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaa 30337487  T
Q  175 tgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  30337486 cgacccctaattgcaagga 30337468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10781231 - 10781146
Alignment:
Q  128 caaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    ||||| |||||||||| || |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  10781231 caagggtaaattgccacgaataacgattgcagggactaatttttaaatgacgcctaattgtaaggacgaaacacatcattaagcct 10781146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15913688 - 15913551
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||| ||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||| |||  |||| ||||||||  ||| |||||||    
T  15913688 tgacttggtagtgattaagttgttcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattaccagaattagcaattacaaagactaattttt 15913589  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    |||||||||||||||||||  || || |||||||||||    
T  15913588 aaatgacgcctaattgcaataacgaaacacatcattaa 15913551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 193
Target Start/End: Original strand, 680997 - 681137
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaaca 152  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |  |  || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| |     
T  680997 tgccacgtcagctaatcagtgacgtggcagtaattaactgggctcatggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcg 681096  T
Q  153 attacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    | ||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  681097 aatacagagaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 681137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 25486140 - 25486084
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgcca 57  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25486140 tattttgtccccttcttaagagcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgcca 25486084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 59 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 24210684 - 24210557
Alignment:
Q  59 gtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattaca 158  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |   |   | |||  |||||||||||||||||   |||||||| ||| |||| | ||||||||||||||    
T  24210684 gtcatcaaattagtgacgtggcggtgattaggcggggagagggatgaaattttaaatgattaaactttgcaagggtaatttgctatgattaacaattaca 24210585  T
Q  159 gggacgaatttttaaatgacgcctaatt 186  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||||    
T  24210584 gagaccaatttttaaatgacccctaatt 24210557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 26463321 - 26463202
Alignment:
Q  70 agtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattt 169  Q
    |||||||||||||||||||| |  |   | |||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  26463321 agtgacgtggcagtgattaactgggatgagggacgaaattttaaatgattaaactttgcaagggtaatttgccaggattaacgaatacagggaccaattt 26463222  T
Q  170 ttaaatgacgcctaattgca 189  Q
    ||||| ||| ||||||||||    
T  26463221 ttaaacgacccctaattgca 26463202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15115479 - 15115358
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||||||| ||| |||||||  ||  |||||| |||||||||||||||||   |||||||||||| |||| | ||||||| |||| |||||| |||||||    
T  15115479 tgacgtggtagtaattaagtgggtgtaaggactaaattttaaatgattaaactttgcaaggctaatttgcaaggattaacgattatagggaccaattttt 15115380  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| ||   |||||||||||||    
T  15115379 aaacgatctctaattgcaagga 15115358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 203
Target Start/End: Original strand, 28498298 - 28498444
Alignment:
Q  57 acgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaatta 156  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||| |  |  || ||||||||||||||||||||||   |||  ||| ||  |||||| ||||| | ||||    
T  28498298 acgtcagctaatcagtgacgtggcagtgattaactgggctcagggaccaaattttaaatgattaaactttgggagggtagtttgccaggattagcgatta 28498397  T
Q  157 cagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacat 203  Q
    || |||| |||||||||||||  |||||||||| |||| || |||||    
T  28498398 caaggaccaatttttaaatgagccctaattgcagggacgaaacacat 28498444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8089555 - 8089466
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgca 189  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||| | ||||||| |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  8089555 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaatttgcaaggattaacgattatagggaccaatttttaaacgacccctaattgca 8089466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 680025 - 679885
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaaca 152  Q
    |||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| |  |  || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| |     
T  680025 tgccacgtcagctaatcagtgatgtggcagtaattaactgggctcatggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcg 679926  T
Q  153 attacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    | ||||| ||| |||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  679925 aatacagagaccaatttttaaacgacccttaattgcaagga 679885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 12065352 - 12065242
Alignment:
Q  80 cagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaaca-attgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgac 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| | | | ||||| ||||||||||  |||| | ||||||  ||| |||||||||||||     
T  12065352 cagtgattaagttggtcaaaggtcgaaattttaaatgattaaaacaatacaagggtaaattgccagaattagcgattaca-tgactaatttttaaatgat 12065254  T
Q  179 gcctaattgcaa 190  Q
    ||||||||||||    
T  12065253 gcctaattgcaa 12065242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 203
Target Start/End: Original strand, 141061 - 141159
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacat 203  Q
    |||||||||||||||||   |||||||  ||| |||| | ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||| || |||||    
T  141061 aaattttaaatgattaatttttgcaagagtaatttgcaaggattaacgattacaggaacaaatttttaaataacatctaattgcaaggacgaaacacat 141159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 203
Target Start/End: Original strand, 149082 - 149180
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacat 203  Q
    |||||||||||||||||   |||||||  ||| |||| | ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||| || |||||    
T  149082 aaattttaaatgattaatttttgcaagagtaatttgcaaggattaacgattacaggaacaaatttttaaataacatctaattgcaaggacgaaacacat 149180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 178
Target Start/End: Original strand, 10781444 - 10781550
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||  | | |||||||    
T  10781444 tgacttggtagtgattaagttggtcaaagaacaaaattttaaataattaaacaatgcaaggataaattgtcaggattaacgattacaatggctaattttt 10781543  T
Q  172 aaatgac 178  Q
    |||||||    
T  10781544 aaatgac 10781550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 76 - 186
Target Start/End: Original strand, 11393096 - 11393206
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaat 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||| |||||| ||||||||||  |||||||| |||  |||| | ||||| | | ||| ||||| ||||||||||     
T  11393096 gtggcagtgattaagttggtcaaatgacgaaatttgaaatgattaatgattgcaagtctagtttgcaaggattagcgaatacggggaccaatttttaaac 11393195  T
Q  176 gacgcctaatt 186  Q
    ||| |||||||    
T  11393196 gacccctaatt 11393206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 15116548 - 15116642
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggac 194  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||  |||| | ||||| | |||||  |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15116548 ggaccaatttttaaatgattaaactttgcaaggctagtttgcaaggattagcgattacgaggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggac 15116642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 135 - 189
Target Start/End: Original strand, 26464550 - 26464604
Alignment:
Q  135 aaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgca 189  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  26464550 aaattgccaggattaacaaatacagggaccattttttaaatgacccctaattgca 26464604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 57 - 203
Target Start/End: Original strand, 29810709 - 29810855
Alignment:
Q  57 acgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaatta 156  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||| |  |  || ||||||||||||||||||||||   |||  ||| ||  |||||| |||||   ||||    
T  29810709 acgtcagctaatcagtgacgtggcagtgattaactgggctcagggaccaaattttaaatgattaaactttgggagggtagtttgccatgattagtgatta 29810808  T
Q  157 cagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacat 203  Q
    || |||| |||||||||||||  |||||||||| |||| || |||||    
T  29810809 caaggaccaatttttaaatgagccctaattgcagggacgaaacacat 29810855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Original strand, 8090243 - 8090336
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| |||| | |||||   | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8090243 ggaccaaattttaaatgattaaactttgcaagggtaatttgcaaggattagtgaatacaaggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 8090336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 189
Target Start/End: Original strand, 13379798 - 13379887
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgca 189  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| |  |||| | | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  13379798 ggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaagaattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgca 13379887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 11393055 - 11393107
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  11393055 tattttgccatcttcttaagggcaaaattggaatttcacgtgtggcagtgatt 11393107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 12407667 - 12407599
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaa 121  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||| ||||| |  || || ||||||||||||||||||||||    
T  12407667 tgccacgtgagctaattagtgacgtggcagtaattaactaggttcagggaccaaattttaaatgattaa 12407599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 134
Target Start/End: Original strand, 20651935 - 20651997
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggct 134  Q
    |||||||||||| ||||| |  || || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20651935 tgacgtggcagtaattaactgggttcagggacgaaattttaaatgattaacgattgcaaggct 20651997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 135)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4982937 - 4982726
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  4982937 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgaggcagtgattaagttggtccaag 4982838  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  4982837 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattagcaattacatggacgaatttttaaattacgtctaattgcaaggactaatca 4982738  T
Q  201 catcattaagcc 212  Q
    ||||||||||||    
T  4982737 catcattaagcc 4982726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9400730 - 9400519
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  9400730 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatctgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaagttggtccaag 9400631  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9400630 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgacacctaattgcaaggactaatca 9400531  T
Q  201 catcattaagcc 212  Q
    ||||||||||||    
T  9400530 catcattaagcc 9400519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 42738242 - 42738030
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  42738242 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 42738143  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  42738142 gaccaaattttaaacgattaacaattgcaaggttaaaatgccaggattaacaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 42738043  T
Q  201 catcattaagcct 213  Q
    ||||| |||||||    
T  42738042 catcaataagcct 42738030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 33247484 - 33247287
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33247484 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatctgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtccaag 33247385  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatc 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  33247384 gaccaaa-tttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgacacctaattgcaaggattaatc 33247287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 34837285 - 34837071
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  34837285 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 34837186  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  34837185 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 34837086  T
Q  201 catcattaagccttt 215  Q
    ||||| |||||||||    
T  34837085 catcaataagccttt 34837071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9144977 - 9144773
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  9144977 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 9144878  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  9144877 gaccaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 9144778  T
Q  201 catca 205  Q
    |||||    
T  9144777 catca 9144773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 22566985 - 22567187
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22566985 tattttgtccttttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattattgacgtggcagtgattaagttggtccaag 22567084  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22567085 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaag-------------gattagcaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 22567171  T
Q  201 catcattaagccttta 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  22567172 catcattaagccttta 22567187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 38012356 - 38012567
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  38012356 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacatcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtcaaag 38012455  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  38012456 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 38012555  T
Q  201 catcattaagcc 212  Q
    ||||| ||||||    
T  38012556 catcaataagcc 38012567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 32950329 - 32950540
Alignment:
Q  2 attttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaagg 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  32950329 attttgtcctcttcttaagggcaaaattgtaattttatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaatttggtccaagg 32950428  T
Q  102 accaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcac 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||    
T  32950429 accaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccacctaattgcaagggctaaacac 32950528  T
Q  202 atcattaagcct 213  Q
    |||| |||||||    
T  32950529 atcaataagcct 32950540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 27934718 - 27934907
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27934718 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgc-acgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtccaag 27934816  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27934817 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaag-------------gattagcaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 27934903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 49879418 - 49879226
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||    
T  49879418 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaaattggtcaaag 49879319  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  49879318 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcaattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 49879226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 50418879 - 50418687
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  50418879 tattttgtcctctccttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaaattggtcaaag 50418780  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  50418779 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattaacgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 50418687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 7452020 - 7452212
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  7452020 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 7452119  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | ||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7452120 gactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagagaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 7452212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 37248422 - 37248614
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||    
T  37248422 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcaatgattaaattggtcaaag 37248521  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||| ||||||||||  |||||||| |||  |||| | ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  37248522 gacgaaatttaaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 37248614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 44967280 - 44967088
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  44967280 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 44967181  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||  | ||||| | | ||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  44967180 gactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgtaaggattagcgaatacagagaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 44967088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 46661131 - 46661323
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  46661131 tattttgttctattcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 46661230  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | |||||  || ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  46661231 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcgaggattagtaaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 46661323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17356136 - 17355944
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  17356136 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaat 17356037  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  | |||||| |||  |||| ||||||| | | |||||  || |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  17356036 gacgaaattttaaatgattaatgaatgcaagactagtttgcaaagattagcgaatacagcaaccaatttttaaacgactcctaattgcaagga 17355944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 24711297 - 24711489
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||     
T  24711297 tattttgtcatcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccatgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaaattggtcaaat 24711396  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||||| || ||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24711397 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattaacgatgacatggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 24711489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 35028209 - 35028017
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  35028209 tattttgtcctcttcttaagggcaaagttggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcggtgattaagttggtcaaaa 35028110  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | |||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  35028109 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacaggaaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 35028017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 36009055 - 36008863
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  36009055 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggtagtgattaagttggtcaaag 36008956  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  36008955 gactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaatgattagcgaatacagggaccaatttttaaacgatccctaattacaagga 36008863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 34765591 - 34765399
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||    
T  34765591 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaagttgatcaaag 34765492  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | |||| ||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  34765491 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacaaggaccgatttttaaacgacccttaattgcaagga 34765399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 43155736 - 43155548
Alignment:
Q  5 ttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggacc 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||     
T  43155736 ttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtttggcagtgattgccacatcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaatgact 43155637  T
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  43155636 aaattttaaatgattaacgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccttaattgcaagga 43155548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 51692736 - 51692928
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||| |||    
T  51692736 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattagaatttcatgtgtgatagtaattgccacgtcatcgaattagtgacatgacagtgattaagttggtcaaag 51692835  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  51692836 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 51692928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 18831534 - 18831726
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  18831534 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgcgacgtcatcaaataagtgacgtggcggtgattaagttggtcaaat 18831633  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  18831634 gatgaaattttaaatgattaatgattgcaaggttagtttgcaatgattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 18831726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 23613495 - 23613687
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  23613495 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtttggcagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggtagtgattaagttggtcaaag 23613594  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     || ||||||||||||||||   |||||||| |||| |||| | ||||| | | ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23613595 aactaaattttaaatgattagtgattgcaagactaatttgcaaggattagcgaatacagggatcaatttttaaacgacccctaattgcaagga 23613687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 37976364 - 37976172
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  37976364 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatatgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcaatgattaagttggtcaaag 37976265  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| ||||||| | | |||||| || | |||||||| |||  |||||||||||||    
T  37976264 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaagattagcgaatacaggaaccagtttttaaacgacctctaattgcaagga 37976172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 53702029 - 53702159
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||     
T  53702029 tattttgtcctcttcttaagggcagaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcattgattaagttggtcaaat 53702128  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaag 131  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  53702129 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaag 53702159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27934669 - 27934529
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  27934669 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacaaatttttaaa 27934570  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 215  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27934569 cgacccctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 27934529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 215
Target Start/End: Original strand, 9400809 - 9400919
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9400809 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaacgacccctaattgcaaggactaatcacatc 9400908  T
Q  205 attaagccttt 215  Q
    |||||| ||||    
T  9400909 attaagtcttt 9400919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 16006024 - 16006143
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  16006024 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggt-aaag 16006122  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaa 121  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  16006123 gactaaattttaaatgattaa 16006143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 78 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 51203743 - 51203608
Alignment:
Q  78 ggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatga 177  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  51203743 ggcagtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgc 51203644  T
Q  178 cgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  51203643 cgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagcct 51203608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 54858700 - 54858557
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||| | ||||||||||| |||||||    
T  54858700 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagggactaattttt 54858601  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  54858600 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagccttt 54858557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 14801953 - 14802082
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  14801953 tattttgttctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtca-caaattagtgatgtggcagtgattaagttggtcaaag 14802051  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaag 131  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  14802052 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaag 14802082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14801923 - 14801755
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  14801923 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 14801824  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     | ||||| ||||||| || ||||| | ||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  14801823 atacaagggtaaattgtcaggattagcgattacaaagaccaatttttaaacgactcctaattgcaagga 14801755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15507884 - 15507692
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||    
T  15507884 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaattttatatgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgacaatgattaagttggtcaaag 15507785  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||| |||||| |||  |||||| | |||  |||| | ||||| | | || |||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  15507784 gacgaaatttgaaatgaataatgattgcacgactagtttgcaaggattagcgaatatagggaccaatttttaaacgacccttaattgcaagga 15507692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 34765621 - 34765789
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  34765621 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcctcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 34765720  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||| | |||||||||| ||||| | |||||| | || |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  34765721 atgcaaaggtaaattgccaggattagcgattacatgaaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 34765789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 52909470 - 52909662
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  52909470 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggttgtgattgccacatcatcgaatttgtgacgtgacagtgattaagttggtcaaag 52909569  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | ||||  ||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  52909570 gacgaaattttaaataattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacatagaccaatttttaaatgatccataattgcaagga 52909662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Original strand, 54858846 - 54858989
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||    
T  54858846 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattaacgattacatggactaattttt 54858945  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  54858946 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagccttt 54858989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 53129717 - 53129587
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||    
T  53129717 tattttgtcatcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgtcacgtcatcaaattagtgaagttgcagtgattaagttggtcaaag 53129618  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaag 131  Q
     || |||||||||||||||||  ||||||||    
T  53129617 aacgaaattttaaatgattaatgattgcaag 53129587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Original strand, 4982986 - 4983123
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  4982986 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaataattgcaaggctaaattgcgaggattagcaattacaaggatgaatttttaaa 4983085  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4983086 cgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 4983123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27069050 - 27068909
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||    
T  27069050 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactaattttt 27068951  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  27068950 aaatgatgcctaattgcaaggacgaaacacatccttaagcct 27068909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 212
Target Start/End: Original strand, 10408179 - 10408315
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaat 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  10408179 gtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactaatttttaaat 10408278  T
Q  176 gacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  10408279 gacgcctaattgcaaggacgaaacacaacattaagcc 10408315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 105 - 209
Target Start/End: Original strand, 33247563 - 33247667
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  33247563 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacggatttttaaacgatccctaattgcaaggactaatcacatc 33247662  T
Q  205 attaa 209  Q
    |||||    
T  33247663 attaa 33247667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 54086906 - 54086714
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  54086906 tattttatcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatatgtggtagtgattgtcatgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 54086807  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||| |||| |||  ||   | ||||| | | ||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  54086806 gacaaaattttaaatgattaatgattacaagactagctttgaaggattagcgaatacagagaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 54086714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 72 - 214
Target Start/End: Original strand, 27069196 - 27069338
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| |||| |||||||| || ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27069196 tgacttggcggtgattaaattggtcaaaagacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcaattacagggactaattttt 27069295  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27069296 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctt 27069338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 214
Target Start/End: Original strand, 42738291 - 42738430
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42738291 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 42738390  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctt 214  Q
    || ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  42738391 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagcctt 42738430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 45463359 - 45463514
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||  | ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  45463359 tgacgtggtagtgattaagttggtcaaagaacaaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtagattgccaggattagcaattacagggactaattttt 45463458  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc-tttataaaatgagt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || || |||||||||||    
T  45463459 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacatatcattaaaccattaataaaatgagt 45463514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 50503965 - 50503822
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||  ||||||    
T  50503965 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacggaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgctaagattaacgattacatggactgattttt 50503866  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 215  Q
    |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  50503865 aaatgatgcctaattgcgaggacgaaacacatcattaagccttt 50503822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 50504111 - 50504265
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  50504111 tgacttgggagtgattaagtttgtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgcctggattaacgattacagagactaattttt 50504210  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctttataaaatgagt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| || |||| ||||    
T  50504211 aaatgacgcctaattacaaggacgaaacacatcattaagcctataaaaaaagagt 50504265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3032717 - 3032580
Alignment:
Q  77 tggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatg 176  Q
    |||| ||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||||||||||    
T  3032717 tggcggtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacaaggactaatttttaaatg 3032618  T
Q  177 acgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctt 214  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3032617 acgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctt 3032580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22566906 - 22566789
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| |     
T  22566906 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacaggaacgaatttttaaacgatccctaattacaaggactaatcacttt 22566807  T
Q  205 attaagcctttataaaat 222  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  22566806 attaagcctatattaaat 22566789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27891724 - 27891583
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||    
T  27891724 tgacgtgacagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaaaattagcgattacagggactaattttt 27891625  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    |||| | | |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  27891624 aaataatgtctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 27891583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 45463213 - 45463068
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  45463213 tgacttggtagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagagactaattttt 45463114  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctttat 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  45463113 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagtctttat 45463068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 52573368 - 52573227
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | || |||  |||||||||| ||||| | |||||||| || |||||||    
T  52573368 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgtaagagtaaattgccaggattagcgattacaggtactaattttt 52573269  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  52573268 aaatgacgcctaattgcaaagacgaaacacatcattaagcct 52573227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 215
Target Start/End: Original strand, 9145026 - 9145166
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  9145026 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgcatttttaaa 9145125  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 215  Q
    || ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  9145126 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagccttt 9145166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 53 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16605761 - 16605601
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaaca 152  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || | || ||     
T  16605761 tgccacgtcagctaattagtgacgtggcagtgattaagtggggggagggacgaaattttaaatgattaatcaatgcaagggtaaattggcaggtttgacg 16605662  T
Q  153 attacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16605661 attacagggactaatttttaaatgacacctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 16605601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24411545 - 24411377
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |   | |||| ||  |||||||||||||  |    
T  24411545 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgggagtgattaagtgggaagagggacgaatctttaaatgattaaaca 24411446  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| ||||||| || | ||| | ||||||||||| ||||||||||  || ||||||||| ||||    
T  24411445 atgcaagggtaaattgtcagggttagcgattacagggaccaatttttaaactacccctaattgctagga 24411377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 24411575 - 24411683
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  24411575 tattttgtcatcttcttaagggcaaaattggaatttcatgggtggcagtgattgccacatcatcaaattagtgacgtggtagtgattaagttggtcaaag 24411674  T
Q  101 gaccaaatt 109  Q
    ||| |||||    
T  24411675 gacgaaatt 24411683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 53701999 - 53701831
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||  |||||||||||||||||  |    
T  53701999 aaataggaatttcatgtgtgacagtgattaccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggaagaaattttaaatgattaaaca 53701900  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| ||||||| || |||||   ||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  53701899 atgcaaggataaattgtcaggattagagattacagagatcaatttttaaacgacccctaattgcaagga 53701831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 88 - 214
Target Start/End: Original strand, 27149298 - 27149423
Alignment:
Q  88 aagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattg 187  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27149298 aagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcaattacagggactaa-ttttaaatgacgcctaattg 27149396  T
Q  188 caaggactaatcacatcattaagcctt 214  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||    
T  27149397 caaggacgaaacacatcattaagcctt 27149423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 193
Target Start/End: Original strand, 13058258 - 13058391
Alignment:
Q  60 tcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacag 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | |||||    
T  13058258 tcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacag 13058357  T
Q  160 ggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  13058358 ggaccaatttttaaacgaccccttattgcaagga 13058391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 32950249 - 32950140
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  32950249 aaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattactgggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaacacatc 32950150  T
Q  205 attaagcctt 214  Q
    | ||||||||    
T  32950149 aataagcctt 32950140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Original strand, 39701195 - 39701332
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||| | ||||||| |||||||||| ||||||  ||| |||||||    
T  39701195 tgacttggcagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaaaggtaaattgtcaagattaacgattacatagactaattttt 39701294  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  39701295 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaa 39701332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Original strand, 54086936 - 54087097
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  |   |  ||| |||||||||||||||||  |    
T  54086936 aaattgaaatttcatgtatgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatgttagtgattaagtggggagagagacgaaattttaaatgattaaaca 54087035  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaatt 186  Q
     ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  54087036 atgcaagggtaaattgtcatgattaacgattacagggaccaatttttaaacgacccctaatt 54087097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 15507914 - 15508081
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |   |  ||| |||||||||||||||||       
T  15507914 aaattggaatttcatgtgtgatagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgcggcagtgattaagtggggagagagacgaaattttaaatgattaaacc 15508013  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||| | ||||||| || ||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15508014 atgcaatggtaaattgtcaggattagcgattacaaggac-aatttttaaacgacccctaattgcaagga 15508081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 35028239 - 35028407
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   |  ||| |||||||||||||||||  |    
T  35028239 aaattggaatttcatgtgtgaaagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagtgacgaaattttaaatgattaaaca 35028338  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| |||||||| | ||||| | |  | | |||| ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  35028339 atgcaagggtaaattgcaaggattagcgaacatatggaccaatttttaaaatacccctaattgcaagga 35028407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11524078 - 11523952
Alignment:
Q  83 tgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcct 182  Q
    |||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  11524078 tgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtatattgccaggattaacgattacagagactaatttttaaatgacgcct 11523979  T
Q  183 aattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    |||||||||||| || |||||||||||    
T  11523978 aattgcaaggacgaaacacatcattaa 11523952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 17356166 - 17356331
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||| ||  |    
T  17356166 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgcca---catcaaattagtgacgtgacagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgatcaaaca 17356262  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||  |||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||| ||| | |||||| |||||    
T  17356263 atgcaagagtaaattgccaagattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccgtaattggaagga 17356331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 75 - 213
Target Start/End: Original strand, 34837334 - 34837472
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  34837334 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagagacgaatttttaaa 34837433  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    || ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  34837434 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagcct 34837472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 80 - 209
Target Start/End: Original strand, 5818069 - 5818198
Alignment:
Q  80 cagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacg 179  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5818069 cagtgattaagttggtcaaaggatgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgacaggattaacgattacagggactaatttttaaatgacg 5818168  T
Q  180 cctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    ||||||| ||| ||| || |||||||||||    
T  5818169 cctaattacaaagacgaaacacatcattaa 5818198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 52909440 - 52909275
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  52909440 aaattgaaatttcatgtatggcagtgattgccacatcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagatggacgaaattttaaatgattaaaca 52909341  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaa 190  Q
     ||||||| ||||||| || ||||| | ||||||| ||| ||||||| || ||| |||||||||||    
T  52909340 atgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagtgaccaatttttgaacgacccctaattgcaa 52909275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10408029 - 10407889
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||| ||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||| | ||||||||||  |||||||    
T  10408029 tgacttggtagtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagggagtaattttt 10407930  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  10407929 aaatgactcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcc 10407889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38012277 - 38012170
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatc 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||    
T  38012277 aaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctgaacacatc 38012178  T
Q  205 attaagcc 212  Q
    | ||||||    
T  38012177 aataagcc 38012170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Original strand, 52573514 - 52573657
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||||||||||||||||| ||  || ||||||  ||||||||||||||||  | ||||| | |||||||| | |||||   |||||| |||| |||||||    
T  52573514 tgacgtggcagtgattaaattgatcaaaggacggaattttaaatgattaaacaatgcaatggtaaattgctaggattagtgattacatggactaattttt 52573613  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  52573614 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagccttt 52573657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 35508451 - 35508322
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||  |||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| || |||     
T  35508451 tattttgtccgcttcttaagggtaaaattggaatttaatgtgtggtagtgtttgccacgtcttcgaattagtgacgtgacagtgattaagttggt-caaa 35508353  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaag 131  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  35508352 gacaaaattttaaatgattaatgattgcaag 35508322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Original strand, 39667062 - 39667199
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||| || ||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  39667062 tgacgtggcggtgattaagttggtcaaaagacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaatttaccaggattaacgattacagggaccaattttt 39667161  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| || |||||||||||    
T  39667162 aaatgacccgtaattacaaggacgaaacacatcattaa 39667199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Original strand, 6237114 - 6237233
Alignment:
Q  78 ggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatga 177  Q
    |||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||| ||||||||| ||| || ||||||||||    
T  6237114 ggcagtcattaagttggttcaagaaccaaattttaaatgattaacaattgtaagggtaaattctcaggattagcaattacagagactaaattttaaatga 6237213  T
Q  178 cgcctaattgcaaggactaa 197  Q
    |||||||||| ||| |||||    
T  6237214 cgcctaattgtaagaactaa 6237233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Original strand, 37976394 - 37976557
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |   |  ||| |||||||||||||||||  |    
T  37976394 aaattggaatttcatgtatgactgtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagagtgacgaaattttaaatgattaaaca 37976493  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgc 188  Q
     ||||| | ||||||| ||  |||| | ||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||    
T  37976494 atgcaatgataaattgtcagaattagcgattacagggatcaatttttaaacgacccctaattgc 37976557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 216
Target Start/End: Original strand, 22987147 - 22987281
Alignment:
Q  82 gtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcc 181  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  |  |||||| || |||| || ||||| | |||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  22987147 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaaagcaagggtatattgtcaggattagcgattacatggactaatttttaaatgacgtc 22987246  T
Q  182 taattgcaaggactaatcacatcattaagccttta 216  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  22987247 taattgtaaggacgaaacacatcattaagccttta 22987281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 35508481 - 35508646
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |   |   || |||||||||||||||||  |    
T  35508481 aaattggaatttcatgtatggcagtgattgccacgtcatcaaattaatgacatggcagtgattaagtggggagagatacgaaattttaaatgattaaaca 35508580  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaa 190  Q
     ||||||| |||||||  |  |||||| |||||| |||  |||||||||| ||| |||||||||||    
T  35508581 atgcaagggtaaattgttagaattaacgattacaaggattaatttttaaacgacccctaattgcaa 35508646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 51859692 - 51859833
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||| ||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||||| ||||| | ||||||  ||| |||||||    
T  51859692 tgacttgggagtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatacaaggataaattgccaggattagcgattacaaagactaattttt 51859791  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  51859792 aaattacgtctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 51859833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 203
Target Start/End: Original strand, 30642418 - 30642565
Alignment:
Q  56 cacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaatt 155  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||| |||| |||| | ||||||| |||    
T  30642418 cacgtcatcaaattaatgacgtggcagtcattaagtgggtcaagggacgaaattttaaatgattaaactttgcaagactaatttgctaggattaacgatt 30642517  T
Q  156 acagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacat 203  Q
    |||  || ||||||||||||||| | |||||||| |||| || |||||    
T  30642518 acaatgatgaatttttaaatgacccataattgcagggacgaaacacat 30642565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22718069 - 22717935
Alignment:
Q  82 gtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcc 181  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  |  |||||| || |||| || ||||| | |||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  22718069 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaaagcaagggtatattgtcaggattagcgattacatggactaatttttaaatgacgtc 22717970  T
Q  182 taattgcaaggactaatcacatcattaagccttta 216  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||| ||||||    
T  22717969 taattgtaaggacgaaacacatcattaaaccttta 22717935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6236942 - 6236846
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||| ||||||  ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6236942 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaagggtaaattcccgggattaacgattaca-agactaaattttaaatgacgtctaattgcaaggactaa 6236846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 222
Target Start/End: Original strand, 53129747 - 53129944
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||| ||| ||  |    
T  53129747 aaattagaatttcatgtgtgatagtgattgtcacgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaacgatgaaaca 53129846  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctttataaaat 222  Q
     ||| ||| |||||||| | ||||| | |||||  |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||||  ||  ||||  |||||||||| ||||||    
T  53129847 atgcgagggtaaattgcaaggattagcgattacgaggatcaatttttaaacgacccctgattgcaaggatgaaatacatatttaagcctttttaaaat 53129944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24349833 - 24349693
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaaca 152  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |   | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| |     
T  24349833 tgccacctcatcagattagtgacgtggcagtgattaactggggagagggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcg 24349734  T
Q  153 attacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24349733 aatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 24349693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 22718225 - 22718339
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||| | |||||||| || ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||    
T  22718225 tgacgtgtcggtgattaaattggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgccaggattaacaattacagagagtaattttt 22718324  T
Q  172 aaatgacgcctaatt 186  Q
    |||||||||||||||    
T  22718325 aaatgacgcctaatt 22718339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22986991 - 22986877
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||| | |||||||| || ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||    
T  22986991 tgacgtgtcggtgattaaattggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgccaggattaacaattacagagagtaattttt 22986892  T
Q  172 aaatgacgcctaatt 186  Q
    |||||||||||||||    
T  22986891 aaatgacgcctaatt 22986877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 7451946 - 7451853
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7451946 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccaggattaacgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 7451853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 50751027 - 50750910
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||||||||||| |||||||  || ||  ||| || ||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  50751027 tgacgtggcagtcattaagtgggttcagtgacgaatttttaaatgattaaacaatgcaaggttaatttgccaggattagcgattacagggacgaattttt 50750928  T
Q  172 aaatgacgcctaattgca 189  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  50750927 aaacgacgcctaattgca 50750910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 41582606 - 41582470
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaaca 152  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |   | |||| ||||||||||||||||||  ||||| ||  || |||||| |||||||     
T  41582606 tgccatgtcatcaaattagtgacgtggcaatgattaactgtgatgagggacgaaattttaaatgattaacttttgcaggggcaatttgccaggattaacg 41582507  T
Q  153 attacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgca 189  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  41582506 attagagggaccaatttttaaatgacccctgattgca 41582470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 37248343 - 37248256
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagg 192  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  37248343 aaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagg 37248256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22923278 - 22923164
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||| |||||||||| || ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||||||| || ||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  22923278 tgacgtgtcagtgattaaattggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgtcaggattaacgattacagagactaattttt 22923179  T
Q  172 aaatgacgcctaatt 186  Q
    |||||||| ||||||    
T  22923178 aaatgacgtctaatt 22923164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22927931 - 22927817
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||| |||||||||| || ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||||||| || ||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  22927931 tgacgtgtcagtgattaaattggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgtcaggattaacgattacagagactaattttt 22927832  T
Q  172 aaatgacgcctaatt 186  Q
    |||||||| ||||||    
T  22927831 aaatgacgtctaatt 22927817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22984210 - 22984096
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||| |||||||||| || ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||||||| || ||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  22984210 tgacgtgtcagtgattaaattggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgtcaggattaacgattacagagactaattttt 22984111  T
Q  172 aaatgacgcctaatt 186  Q
    |||||||| ||||||    
T  22984110 aaatgacgtctaatt 22984096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22997798 - 22997684
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||| |||||||||| || ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||||||| || ||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  22997798 tgacgtgtcagtgattaaattggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgtcaggattaacgattacagagactaattttt 22997699  T
Q  172 aaatgacgcctaatt 186  Q
    |||||||| ||||||    
T  22997698 aaatgacgtctaatt 22997684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23613446 - 23613328
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||    
T  23613446 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccaagattagcgattacatggaccaatttttaaa 23613347  T
Q  175 tgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  23613346 cgacccctaattgcaagga 23613328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24711223 - 24711130
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||| | |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24711223 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaacggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 24711130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 193
Target Start/End: Original strand, 39539194 - 39539327
Alignment:
Q  60 tcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacag 159  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||| |  ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| |||| |  |||||| ||||||     
T  39539194 tcatcaaattaatgatgtggcagtcattaactgggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaagaatgcaaggctaatttgcaagaattaacgattacat 39539293  T
Q  160 ggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||| |||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  39539294 tgaccaatttttaaacgacccttaattgcaagga 39539327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 190
Target Start/End: Original strand, 1179087 - 1179206
Alignment:
Q  71 gtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttt 170  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | |||| |||| ||||||    
T  1179087 gtgatgtggcagtgattaagttggttaaaggatgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacatggaccaatttt 1179186  T
Q  171 taaatgacgcctaattgcaa 190  Q
    |||| ||| |||||||||||    
T  1179187 taaacgacccctaattgcaa 1179206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 186
Target Start/End: Original strand, 43155787 - 43155898
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  43155787 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaataatgcagggataaattgccaggattaacgattacagggaccaatttttaaa 43155886  T
Q  175 tgacgcctaatt 186  Q
     ||| |||||||    
T  43155887 cgacccctaatt 43155898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 158
Target Start/End: Original strand, 8439496 - 8439598
Alignment:
Q  56 cacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaatt 155  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| | |||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| |||| | ||||||| |||    
T  8439496 cacgtcatcaaattactgacgtggcggtgattaagtgggtcaagggacgaaattttaaatgattaatgtttgcaaggataatttgctaggattaacgatt 8439595  T
Q  156 aca 158  Q
    |||    
T  8439596 aca 8439598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 169
Target Start/End: Original strand, 9731498 - 9731595
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattt 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||  | | ||||| ||||||| || ||||| | |||||||| || |||||    
T  9731498 tgacgtggcagtgattaagttagtcaaagaacgaaattttaaatgattaaacaatacaaggataaattgtcaggattagcgattacaggaactaattt 9731595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Original strand, 44967354 - 44967447
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||    
T  44967354 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacctctaattgcaagga 44967447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Original strand, 50418953 - 50419046
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||| || ||||||| ||||| | |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  50418953 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtagattgccaggattagcgattagagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 50419046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 193
Target Start/End: Original strand, 10781753 - 10781893
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaaca 152  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||| |  |   | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| |     
T  10781753 tgccacctcatcagattagtgacgtgacagtggttaactggggagagggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcg 10781852  T
Q  153 attacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10781853 aatacatggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 10781893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18831456 - 18831368
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  18831456 aaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattaccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgtaagga 18831368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 51859543 - 51859471
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagatt 148  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||    
T  51859543 gtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaataatgcaagggtaaattgccaggatt 51859471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 187
Target Start/End: Original strand, 56015919 - 56016049
Alignment:
Q  56 cacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaatt 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |   |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||  || ||||||  |||| | |||    
T  56015919 cacgtcatcaaatcagtgacgtggcagtgattaactgtgatgaaggacgaaattttaaatgattaacgtttgcagggacaatttgccataattagcgatt 56016018  T
Q  156 acagggacgaatttttaaatgacgcctaattg 187  Q
    | | |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  56016019 atatggaccaatttttaaatgac-cctaattg 56016049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 5369084 - 5368966
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||||||||    
T  5369084 cgtggcagtgattaagtggggagagggacaaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccaggattagcgattacaaggaccaatttttaaa 5368985  T
Q  175 tgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||  ||||||||||||||    
T  5368984 cgatccctaattgcaagga 5368966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13058174 - 13058056
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||| ||| ||||| | ||||||| ||| ||||||||||    
T  13058174 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattaccaggattagcgattacagagaccaatttttaaa 13058075  T
Q  175 tgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  13058074 cgacccctaattgcaagga 13058056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 203
Target Start/End: Original strand, 29321174 - 29321324
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaaca 152  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |  ||  | | ||||| | |||||||||||| | ||| || | ||| ||||||  ||||||     
T  29321174 tgccacgtaagcaaattagtgacgtggcagtgattaactaggttgaggaaccaattcttaaatgattaaaatttgaaaaggtaatttgccagaattaacg 29321273  T
Q  153 attacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacat 203  Q
    |||| ||  || |||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||    
T  29321274 attatagaaaccaatttttaaatgacccttaattgcaaggacgaaacacat 29321324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 194
Target Start/End: Original strand, 32063624 - 32063746
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||||||||| | |||||||  || || ||||  ||||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||  || |||||||    
T  32063624 tgacgtggcaataattaagtgcgtgcagggacggaattttaaatgattaaactttgcaagggtaatttgccagtattaacgattacagaaaccaattttt 32063723  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggac 194  Q
    ||||||| |||||||||| ||||    
T  32063724 aaatgacccctaattgcagggac 32063746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 40387608 - 40387490
Alignment:
Q  71 gtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   | | || ||||||||||||||||||  ||||| ||  || |||||| ||||| | | ||||||||| ||||||    
T  40387608 gtgacgtggcagtgattaagtgagaagaggaacgaaattttaaatgattaacttttgcaggggcaatttgccaggattagcgaatacagggaccaatttt 40387509  T
Q  171 taaatgacgcctaattgca 189  Q
    |||||| | ||||||||||    
T  40387508 taaatggcccctaattgca 40387490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 8438425 - 8438305
Alignment:
Q  67 attagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaa 166  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||  ||| | |||| |||||||||||||||||   |||||||  ||| |||||| ||||||| ||||||  ||| ||    
T  8438425 attactgacgtgacggtgattaagtgggtcaagggacgaaattttaaatgattaaggtttgcaagagtaatttgccaggattaacgattaca-tgaccaa 8438327  T
Q  167 tttttaaatgacgcctaattgc 188  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  8438326 tttttaaatgacccctaattgc 8438305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 213
Target Start/End: Original strand, 50751822 - 50751926
Alignment:
Q  108 ttttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcatt 207  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| ||| ||| || ||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||   || |||||||||    
T  50751822 ttttaaatgattaaacaatgcaaggttaatttgtcaggattagcgattacagg-acgaatttttaaacgacgcctaattgcaggggtgaaacacatcatt 50751920  T
Q  208 aagcct 213  Q
    ||||||    
T  50751921 aagcct 50751926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 189
Target Start/End: Original strand, 40388375 - 40388511
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaaca 152  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |  || |||| ||||||||||||||||||  |||   ||  || |||||| ||||| |     
T  40388375 tgccatgtcatcaaattagtgacgtggcaatgattaactgtgatcagggacgaaattttaaatgattaacttttgttggggcaatttgccaggattagcg 40388474  T
Q  153 attacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgca 189  Q
    |||| |||||| |||||||||||| | | ||||||||    
T  40388475 attagagggaccaatttttaaatggcccttaattgca 40388511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 1178174 - 1178123
Alignment:
Q  81 agtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaagg 132  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1178174 agtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaataattgcaagg 1178123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 193
Target Start/End: Original strand, 24350746 - 24350841
Alignment:
Q  98 aaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||| | ||||| | | | ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24350746 aaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaagctagtttgcaaggattagcgaatgcagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 24350841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 174
Target Start/End: Original strand, 36009104 - 36009203
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36009104 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaatttccaggattaacgattacagggaccaatttttaaa 36009203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 39701049 - 39700930
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||||||  |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| |||||  | || |||| || |||| || ||||| | |||||| |||  |||||||    
T  39701049 tgacgtgagagtgattaagttggtcaaaggatgaaattttaaataattaaataatgtaagggtatattgtcaggattagcgattacatggattaattttt 39700950  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaag 191  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  39700949 aaataacgcctaattgcaag 39700930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 13058223 - 13058261
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcat 39  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13058223 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcat 13058261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 32062704 - 32062598
Alignment:
Q  97 caaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggacta 196  Q
    ||||||| |||||||||||||||||   || ||||||||| ||| || ||||||   ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| || |||| |    
T  32062704 caaggacgaaattttaaatgattaaattttacaaggctaatttgtcaggattaatgtttacaaggaccaatttttaaatgacccctaatttcagggacca 32062605  T
Q  197 atcacat 203  Q
    | |||||    
T  32062604 aacacat 32062598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 71 - 189
Target Start/End: Original strand, 41583518 - 41583636
Alignment:
Q  71 gtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   | |||| ||||||||||||||||||  ||||| ||  || |||||| ||||| | | |||||  |  ||||||    
T  41583518 gtgacgtggcagtgattaagtgagaagagggacgaaattttaaatgattaacttttgcaggggcaatttgccaggattagcgaatacagaaatcaatttt 41583617  T
Q  171 taaatgacgcctaattgca 189  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  41583618 taaatgacccctaattgca 41583636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 75 - 193
Target Start/End: Original strand, 49879467 - 49879585
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||| | ||||||| ||  | ||||||||    
T  49879467 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagagatcagtttttaaa 49879566  T
Q  175 tgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  49879567 cgacccctaattgcaagga 49879585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 53 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 56014884 - 56014778
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaaca 152  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |   | |||| ||||||||||||||||||  ||||| ||  || |||||| ||||| |     
T  56014884 tgccacgtcatcaaatcagtgacgtggcagtgattaactgtgatgagggacgaaattttaaatgattaacgtttgcaggggcaatttgccaggattagcg 56014785  T
Q  153 attacag 159  Q
    |||||||    
T  56014784 attacag 56014778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 189
Target Start/End: Original strand, 148071 - 148160
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgca 189  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| | ||||||| | || |||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  148071 ggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattaacgaataaagggaccaatttttaaacgacccctaattgca 148160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 183
Target Start/End: Original strand, 5369181 - 5369266
Alignment:
Q  98 aaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgccta 183  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||||| | | ||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  5369181 aaggactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattaacgaatgcagggaccaatttttaaacgaccccta 5369266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 189
Target Start/End: Original strand, 55867430 - 55867519
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgca 189  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||  |||| | ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  55867430 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtagtttgcaaggattaacgattacatggaccaatttttaaacgacccctaattgca 55867519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 5369133 - 5369173
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgt 41  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  5369133 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaattttatgt 5369173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10780820 - 10780732
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | | || |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10780820 aaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatgcatggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 10780732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10974429 - 10974341
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | | || |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10974429 aaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatgcatggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 10974341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 11446382 - 11446279
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatc 199  Q
    |||| |||||||||| ||||||   |||||||| ||| |||||| ||||||| ||| || | || ||||||||||||||  ||||||||| |||| || |    
T  11446382 ggacgaaattttaaaagattaaactttgcaagggtaatttgccaggattaacgattccatgaaccaatttttaaatgacctctaattgcagggacgaaac 11446283  T
Q  200 acat 203  Q
    ||||    
T  11446282 acat 11446279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 191
Target Start/End: Original strand, 54435413 - 54435504
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaag 191  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||| | |||| || |||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  54435413 ggacgaaattttaaataattatcaaatgcaatgctaatttgcaaggattgacgattacatggatcaatttttaaacgacacctaattgcaag 54435504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 54713743 - 54713648
Alignment:
Q  98 aaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggac 194  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | ||||| ||  |||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  54713743 aaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagagattaatttttaaacgac-cccaattgcaaggac 54713648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 108)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 41930702 - 41930915
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  41930702 tattttgtcatcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacctcatcaaattagtgacgtggtagtgattaagttggtccaag 41930801  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41930802 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgcaaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattacaaggactaatca 41930901  T
Q  201 catcattaagcctt 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  41930902 catcattaaacctt 41930915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6758076 - 6757876
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6758076 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtccaag 6757977  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6757976 gaccaaattttaaatgattaacaattgcgagactaaattgccaggattagcaattacagggacaaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 6757877  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  6757876 c 6757876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31482613 - 31482402
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  31482613 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 31482514  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  31482513 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 31482414  T
Q  201 catcattaagcc 212  Q
    ||||| ||||||    
T  31482413 catcaataagcc 31482402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 1506153 - 1506366
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  1506153 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 1506252  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  1506253 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 1506352  T
Q  201 catcattaagcctt 214  Q
    ||||| ||| ||||    
T  1506353 catcaataaacctt 1506366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 297225 - 297013
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  297225 tattttgtcctcttcttgagggcaaaattgtaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaatttggtccaag 297126  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  297125 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaataccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 297026  T
Q  201 catcattaagcct 213  Q
    ||||| |||||||    
T  297025 catcaataagcct 297013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Original strand, 39453519 - 39453708
Alignment:
Q  4 tttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggac 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  39453519 tttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggac 39453618  T
Q  104 caaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39453619 gaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaagattagcgaatacagggaccaatttttaaatgacccctaattgcaagga 39453708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3529084 - 3528892
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  3529084 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgtcacatcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 3528985  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| | ||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3528984 gactaaattttaaatgattaacgattgcaaggctagtttgcaaggattagcaaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 3528892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 11761934 - 11762154
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  11761934 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacatcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 11762033  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||  ||  |    
T  11762034 gactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaata 11762133  T
Q  201 catcattaagcctttataaaa 221  Q
    |||  ||||||||||||||||    
T  11762134 catatttaagcctttataaaa 11762154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 6150637 - 6150829
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  6150637 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaattttatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 6150736  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||||| | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  6150737 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaagattaacgaatacatggactaatttttaaacgacccctaattgcaagga 6150829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19892519 - 19892327
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||    
T  19892519 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgccagtgattgccacgtcatcaaattagttacgtggcagtgattaagttgatcaaag 19892420  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||| | ||||||| | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19892419 gacgaaattttaaatgattaatgattacaaggctagtttgcaaggattaacgaatacatggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 19892327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 6301760 - 6301949
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  6301760 tattttgtcctcttcttaaggccaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaaattggtcaaag 6301859  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaa 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| | ||||||| | |||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  6301860 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattaacgaatacaaggaccaatttttaaacgacccctaattgcaa 6301949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14194634 - 14194442
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  14194634 tattttgtcctcttcttaagggctaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgatgtggcagtgattaagttggtcaaag 14194535  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  14194534 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 14194442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 27587332 - 27587524
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  27587332 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttagcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtagcagtgattaagttggtcaaag 27587431  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  27587432 gactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacaaggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 27587524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 186636 - 186828
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| |||    
T  186636 tattttgtcctcttcttaagggcaaacttgaaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtgacaatgattaagttggtcaaag 186735  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||    
T  186736 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaagattagcaaatacagggaccaatttttaaacgacctctaattgcaagga 186828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 19517824 - 19518016
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||     
T  19517824 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggtatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaa 19517923  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | |||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  19517924 gacaaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaagattagcgaatacatggactaatttttaaactacccctaattgcaagga 19518016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16157066 - 16156876
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  16157066 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgggagtgattgccatgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 16156967  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaag 191  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| | ||||||| | ||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16156966 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattaacgaatacatagaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 16156876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 38475244 - 38475067
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  38475244 tattttgtcctcttcttaagggtaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaat 38475145  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgac 178  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||| | ||||| | | |||| |||| ||||||||||||||    
T  38475144 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggttagtttgcaaggattagcgaatacatggaccaatttttaaatgac 38475067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 8322621 - 8322813
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  8322621 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaattttcatgtgtggtggtgattgccacgtcatcgaattagtgacgcggcagtgattaagttggtcaaag 8322720  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||||| | ||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8322721 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattaacgaatacggggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 8322813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 17202616 - 17202808
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  17202616 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacatcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaat 17202715  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| | ||||| | | |||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  17202716 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacagggaccgatttttaaacgacccctaattgcaagga 17202808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28771080 - 28770888
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  28771080 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatatttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaat 28770981  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||  |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  28770980 gactaaattttaaatgatcaatgattgtaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 28770888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 193
Target Start/End: Original strand, 32242463 - 32242650
Alignment:
Q  5 ttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggacc 104  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||     
T  32242463 ttgtcctcttcgtaagggaaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggaca 32242562  T
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | |||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  32242563 aaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaataca-ggactaatttttaaacaacccctaattgcaagga 32242650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21265354 - 21265167
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  21265354 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgttatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 21265255  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgc 188  Q
    ||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||  |||| | ||||| ||| |||| |||| |||||||||| |||  ||||||||    
T  21265254 gacgaaattttaaataattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcaaatacatggaccaatttttaaacgacctctaattgc 21265167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 75 - 217
Target Start/End: Original strand, 6758125 - 6758267
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6758125 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggttaaattgccagaattaacaattacagggacgaatttttaaa 6758224  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctttat 217  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6758225 cgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctttat 6758267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 28269633 - 28269444
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  28269633 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattaaaatttcatgtgtggtagtgattgtcacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 28269534  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaa 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | ||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  28269533 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatactgggaccaatttttaaacgacccctaattgcaa 28269444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13963051 - 13962883
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  13963051 aaattggaatttcatgtgtgatagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaagtgaggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 13962952  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  13962951 atgcaagggtaaattaccaggattagcaattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 13962883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 5994106 - 5994298
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  5994106 tattttatcctcttcttaagggaaaaattggaatttcatgtgtgatagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaag 5994205  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| | ||||| | | |||| | || |||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  5994206 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacatgaaccaatttttaaacgacccttaattgcaagga 5994298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 13362438 - 13362304
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  13362438 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgtctgtgatttgcacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcagag 13362339  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggcta 135  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13362338 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggcta 13362304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 35920439 - 35920266
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||| ||| |||    
T  35920439 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtgatattgattaagttggtcaaag 35920340  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| | ||||| | | ||||  ||| ||||||||||    
T  35920339 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctaatttgcaaggattagcgaatacattgaccaatttttaaa 35920266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 5024230 - 5024038
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  5024230 tattttgtcttcttcttaacggaaaaattggaatttcacgtatggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 5024131  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||  |||| | ||||| | | |||| | |  |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  5024130 gacaaaattttaaatgattagtgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacatgtatcaatttttaaacgacccctaattgcaagga 5024038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 29646573 - 29646381
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  29646573 tattttgtcctcttcttaagggaaaaattggaatttcatgtgtggtagtgatcgcaacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 29646474  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||  |||||||||||||||||  |||| |||||||  |||| | ||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  29646473 gataaaattttaaatgattaatgattggaaggctagtttgcaaggattagcgaatacatggaccaatttttaaaagacccctaattacaagga 29646381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 38442284 - 38442476
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||    
T  38442284 tattttgtcctcttcttaagggcaaagttggaatttcacgtgtggcagtgattgtcacatcatcaaattagtgatgtgacagtgattaagttggtcaaag 38442383  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||  |||| | ||||||| | |||| | ||  ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  38442384 gacgaaattttaaatggttaatgattgcaaggctagtttgcaaggattaacgaatacaagaacccatttttaaacgacccctaattgcaagga 38442476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41930653 - 41930513
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  41930653 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacaaatttttaaa 41930554  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 215  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41930553 cgacctctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 41930513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 11047654 - 11047788
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  11047654 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgcatggtagtgattgccacgtcattgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 11047753  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggcta 135  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11047754 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggcta 11047788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 19892549 - 19892717
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   || ||| |||||||||||||||||  |    
T  19892549 aaattgggatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagaatgacgaaattttaaatgattaaaca 19892648  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| |||||||  | ||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||  |||||||||||||    
T  19892649 atgcaagggtaaattgttaggattaacgattacagagaccaatttttaaacgacctctaattgcaagga 19892717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32242429 - 32242261
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  32242429 aaattggaatttcgtgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 32242330  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  32242329 atgcaagagtaaattgccatgattagctattacagggatcaatttttaaacgacccctaattgcaagga 32242261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 16083160 - 16083290
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||     
T  16083160 tattttgtcatcttcttaagggcaaaataggaatttcatgtgtgtcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaat 16083259  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaag 131  Q
     || |||||||||||||||||  ||||||||    
T  16083260 aacgaaattttaaatgattaatgattgcaag 16083290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 213
Target Start/End: Original strand, 17544342 - 17544475
Alignment:
Q  80 cagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacg 179  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  17544342 cagtgattaagttggtcaaaggacaaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattaacgattacaggaactaatttttaaatgacg 17544441  T
Q  180 cctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17544442 cctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 17544475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 5994076 - 5993908
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  5994076 aaattggaatttcatgtatggcagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 5993977  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  5993976 atgcaagggtaaattgccagaattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 5993908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8875589 - 8875449
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||  | ||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  8875589 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaagaacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagtgtaaattgccaggattaacgattacagggactaattttt 8875490  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8875489 aaatgacgcttaattgcaaggacgaaacacatcattaagcc 8875449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 18670382 - 18670502
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||     
T  18670382 tattttgtactcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggttaaat 18670481  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaa 121  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  18670482 gacgaaattttaaatgattaa 18670502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 35512335 - 35512167
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  35512335 aaattggaatttcatgtgtgacagggattgtcatgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 35512236  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  35512235 atgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccttaattgcaagga 35512167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39453487 - 39453319
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  39453487 aaattggaatttcatgtatggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatgccagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 39453388  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  39453387 atgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagagaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 39453319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 43159055 - 43159223
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  |    
T  43159055 aaattggaatttcatgtgtggtagtgattatcacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatga 43159154  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||||||||||  |||  | ||||| | | ||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  43159155 ttgcaaggctagtttgtaaggattagcgaatacaacgaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 43159223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6301730 - 6301581
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||| |||||  |    
T  6301730 aaattggaatttcatgtgtggcagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaaattggtcaaaggacgaaattttaaataattaatga 6301631  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    ||||||| |||  |||| | ||||| | | |||| |||| ||||||||||    
T  6301630 ttgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacaaggaccaatttttaaa 6301581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 13362469 - 13362634
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |   |  ||| |||||||||||||||||  |    
T  13362469 aaattggaatttcatgcgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtagcagtgattaagtggggagagagactaaattttaaatgattaaaca 13362568  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaa 190  Q
     ||||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  13362569 atgcaagggtaaattgccatgattagcgattacaaggaccaatttttaaacgacccctaattgcaa 13362634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20814346 - 20814217
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  20814346 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtggtagtgatcgtcacgtgatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggttaaag 20814247  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaa 130  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  20814246 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaa 20814217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 20814376 - 20814544
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  20814376 aaattggaatttcatgtatgacagtgattgtcatgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtagggagagggacaaaattttaaatgattaaaca 20814475  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||  |||||||| | ||||| | ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20814476 atgcaagtgtaaattgctaggattagcgattacagtgaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 20814544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Original strand, 10684158 - 10684285
Alignment:
Q  4 tttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggac 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| || |||    
T  10684158 tttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgttatcaaattagtgatgttacagtgattaagttggtcaaatgac 10684257  T
Q  104 caaattttaaatgattaacaattgcaag 131  Q
     ||| |||||||||||||  ||||||||    
T  10684258 gaaactttaaatgattaatgattgcaag 10684285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Original strand, 33871624 - 33871767
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| |||||   ||||||| ||| |||||||    
T  33871624 tgacgtagcagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattactgattacagagactaattttt 33871723  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  33871724 aaatggcgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagccttt 33871767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 75 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1506104 - 1505966
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1506104 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 1506005  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    || ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  1506004 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagcct 1505966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 214
Target Start/End: Original strand, 31482687 - 31482801
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatc 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |    
T  31482687 ggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacaaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaac 31482786  T
Q  200 acatcattaagcctt 214  Q
    |||||| ||||||||    
T  31482787 acatcaataagcctt 31482801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 38442255 - 38442090
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  38442255 aaattggaatttcatgtatgacagtgattgccacgtcatcaaattagttatgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 38442156  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaa 190  Q
     ||||||  ||||||| || ||||| | ||||||  ||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  38442155 atgcaagagtaaattgtcaggattagcgattacaatgaccaatttttaaataacccctaattgcaa 38442090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 5024259 - 5024427
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |   | | || |||||||||||||||||  |    
T  5024259 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgtcgcgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaagtggggagaggaacgaaattttaaatgattaaaca 5024358  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||| | ||||||| || ||||| | ||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  5024359 atgcaatggtaaattgtcaggattagcgattacaatgaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 5024427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 33871479 - 33871339
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||| |||||||    
T  33871479 tgacttggcggtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccagaattagcgattacagggactaattttt 33871380  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
    ||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  33871379 aaatgacacttaattgcaaggacaaaacacatcattaagcc 33871339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 75 - 214
Target Start/End: Original strand, 297274 - 297413
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  297274 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 297373  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctt 214  Q
    || ||||||||| ||||| |||| ||||||| ||| ||||    
T  297374 tgtcgcctaattacaagggctaaacacatcaataaacctt 297413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18247271 - 18247105
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |   | |||| ||||| |||||||||||  |    
T  18247271 aaattgaaattttatgtatgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcggtgattaagtggggagagggacgaaattctaaatgattaaata 18247172  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| ||||||||||  |||| | |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  18247171 atgcaagggtaaattgcca--attagcgattacatggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 18247105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11047624 - 11047458
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |   |  ||| |||||||||||||||||  |    
T  11047624 aaattgaaattttatgtatggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagagagacgaaattttaaatgattaaaca 11047525  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa-tgacgcctaattgcaagg 192  Q
     ||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  11047524 atgcaagggtaaattgccaagattagcgattac-gggac-aatttttaaactgactcctaattgcaagg 11047458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 14194664 - 14194831
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  14194664 aaattagaatttcatgtatggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatagcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 14194763  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| |||||||||| |||||  ||||||| || | |||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  14194764 atgcaagggtaaattgccaggattagtaattacatgg-ccaatttttaaacgacccctaattacaagga 14194831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 16157096 - 16157264
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||| |||||||||  || ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  16157096 aaattgaaatttcatgcatggcagtgattgctgcgtcatcaaattagtgacatggcagggattaagtggggagagggacaaaattttaaatgattaaaca 16157195  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| ||||||| || ||||||| |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16157196 atgcaagggtaaattgtcaggattaacgattatagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 16157264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17202586 - 17202418
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |     |||| |||||||||||| ||||  |    
T  17202586 aaattggaatttcatgtatggcagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagggggacgaaattttaaatgcttaaaca 17202487  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| ||||||| || ||||| | ||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  17202486 atgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagtgaccaatttttaaacgacccctaattggaagga 17202418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20152921 - 20152781
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||| ||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  20152921 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaatttccaggattagcgattacagagactaattttt 20152822  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
    ||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  20152821 aaatgacgcttaattgcatggacgaaacacatcattaagcc 20152781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 218
Target Start/End: Original strand, 20153204 - 20153347
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||   ||||| | |||||| |||| |||||||    
T  20153204 tgacgtagcagtgattaagttggtcaaaggatgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgc---gattagcgattacaaggactaattttt 20153300  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctttata 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  20153301 aaatgacacctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctatata 20153347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 186606 - 186440
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  186606 aaattggaatttcatgtatggtagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggtagtgattaagtggggggagggacgaaattttaaatgattaaaca 186507  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaag 191  Q
     ||||||| |||||| |||  |||||| ||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  186506 atgcaaggttaaatttccagaattaacgattacaatgactaatttttaaacgacccctaatttcaag 186440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20840718 - 20840552
Alignment:
Q  27 attggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaatt 126  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||| |||||  | |    
T  20840718 attgaaatttcatgtgtggtagtgatcgtcacgtgatcgaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacaaaattttaaatcattaaacaat 20840619  T
Q  127 gcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||||| |||||||| | ||||||| |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20840618 gcaagggtaaattgctaggattaacgattacaggtaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 20840552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Original strand, 18247303 - 18247391
Alignment:
Q  4 tttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtt 92  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18247303 tttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgtcacgtcattgaattaatgacgtggcagtgattaagtt 18247391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 87
Target Start/End: Original strand, 27937260 - 27937322
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgatt 87  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27937260 aaattggaatttcatgtgtgatagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgatt 27937322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24141559 - 24141447
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatc 204  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||     
T  24141559 aaattttaaatgattaaactttgcaaggctaatttgccaggattaacgattacagggaccaatttttaaatgacgtctaattgcagggacgaaacacata 24141460  T
Q  205 attaagcctttat 217  Q
     | ||||||||||    
T  24141459 ttaaagcctttat 24141447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 193
Target Start/End: Original strand, 35512406 - 35512523
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaat 175  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||  | | ||||||||| ||||||||||     
T  35512406 gtggcagtgattaagttagtcaaatgacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattggcgaatacagggaccaatttttaaac 35512505  T
Q  176 gacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  35512506 gacccctaattgcaagga 35512523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 8322591 - 8322467
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  8322591 aaattggaattttatgtatggcagtgattgcaacgtcatcaaattagtgaaatgacagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 8322492  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagatta 149  Q
     ||||||| ||||||||||||||||    
T  8322491 atgcaaggataaattgccaagatta 8322467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 10684126 - 10684030
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaa 121  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||   |  ||| |||||||||||||||||    
T  10684126 aaattggaatttcatgtatggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatgacagtgattaagtgaggaaagtgacaaaattttaaatgattaa 10684030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 21265384 - 21265551
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||  |   |  ||| ||||||||||| |||||  |    
T  21265384 aaattggaatttcatgtatgacagtgattgtcatgtcatcaaattagtgacatagcagtgattaagt--gaagagagacgaaattttaaataattaaaca 21265481  T
Q  125 ttgcaaggct-aaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| || |||||||||| ||| | |||||| |||||    
T  21265482 atgcaagggtaaaattgccacgattagcgattacaggaaccaatttttaaacgacccttaattgtaagga 21265551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22298682 - 22298564
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||  | || |||| |||||||||  ||||| | |||||| |||| |||||||    
T  22298682 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggatgaaattttaaatgattaaacaatgtaagggtaaattgccccgattagcgattacatggactaattttt 22298583  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaa 190  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22298582 aaatgacgcctaattgcaa 22298564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Original strand, 8875618 - 8875687
Alignment:
Q  137 attgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcat 206  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  8875618 attgccaggattaacgattacagggactaatttttaaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcat 8875687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 223
Target Start/End: Original strand, 21287953 - 21288094
Alignment:
Q  82 gtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcc 181  Q
    ||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||  | ||||||| |  ||||||| ||||| | |||||| |||  |||||||||| |||| |    
T  21287953 gtgattaagttggtcaaaggaagaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtgtattgccatgattagcgattacatggattaatttttaaacgacgtc 21288052  T
Q  182 taattgcaaggactaatcacatcattaagcctttataaaatg 223  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||    
T  21288053 taattacaaggacaaaacacatcattaagccaatataaaatg 21288094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12904953 - 12904789
Alignment:
Q  13 ttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaatttta 112  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||| || |||||||||  |   | |||| ||||||||    
T  12904953 ttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtggcagtgattgtaacgttatcaaattagtgacgtgacattgattaagtggggagagggacgaaatttta 12904854  T
Q  113 aatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatga 177  Q
    ||| |||||   |||  |||  |||||| || ||||||| | ||||||||| | |||||||||||    
T  12904853 aattattaaattttgggaggacaaattgtcaggattaacgaatacagggaccattttttaaatga 12904789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 29646603 - 29646770
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  29646603 aaattggaaattcatgtatggtagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatgacagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 29646702  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| ||||||| || ||||| | |||||| | || || ||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  29646703 atgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacatgcaccaa-ttttaaacgactcctaattacaagga 29646770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 17544180 - 17544077
Alignment:
Q  80 cagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacg 179  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  17544180 cagtgattaagttggtcaaatgacaaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgtcaggattagcaattacagggactaatttttaaatcacg 17544081  T
Q  180 ccta 183  Q
    ||||    
T  17544080 ccta 17544077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 193
Target Start/End: Original strand, 3529133 - 3529251
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | || | || |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3529133 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgtaggggtaaattgccaggattaacgattacagggaccaatttttaaa 3529232  T
Q  175 tgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  3529233 cgacccctaattgcaagga 3529251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 91
Target Start/End: Original strand, 4700352 - 4700418
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagt 91  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||    
T  4700352 aaattggaattttatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaatttatgatgtggcagtaattaagt 4700418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11761861 - 11761768
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  11761861 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 11761768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Original strand, 38475315 - 38475408
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  38475315 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattaacgattacatggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 38475408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 24547367 - 24547315
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24547367 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgatt 24547315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11740845 - 11740706
Alignment:
Q  54 gccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaa 153  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |  ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||  |||| | ||||| | |    
T  11740845 gccacgtcatcaaattaatgacgtgacagtcattaactgggtcaaaggacaaaattttaaatgattaaagaatgcaaggctagtttgcaaggattagcga 11740746  T
Q  154 ttacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     || | |||  |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  11740745 atatatggatcaatttttaaacgacccctaattgcaagga 11740706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 193
Target Start/End: Original strand, 24547412 - 24547534
Alignment:
Q  71 gtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttt 170  Q
    |||||||||||||| ||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | |||| | |||| ||||||    
T  24547412 gtgacgtggcagtggttaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattataaggaccaatttt 24547511  T
Q  171 taaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| ||| ||||||||||||||    
T  24547512 taaacgacccctaattgcaagga 24547534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 203
Target Start/End: Original strand, 40150095 - 40150233
Alignment:
Q  65 aaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacg 164  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  ||  | ||||||| | ||||||||||||   ||| |||| ||| || | | ||||||| |||||||||||     
T  40150095 aaattagtgatgtggcagtgattaattaggttgagggaccaattcttaaatgattaaactttgaaagggtaattttctaggattaacgattacagggacc 40150194  T
Q  165 aatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacat 203  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  40150195 aattttaaaatgacccctaattgcaaggacgaaacacat 40150233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16083113 - 16082996
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaat 175  Q
    ||||||||||||||||| |   | | || |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||     
T  16083113 gtggcagtgattaagttgggagaggtacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattatcgattacagggactaatttttaaac 16083014  T
Q  176 gacgcctaattgcaagga 193  Q
     || |||||||| |||||    
T  16083013 aacccctaattggaagga 16082996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27587260 - 27587167
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| |||||||||||||||||    |||| || |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  27587260 ggacgaaattttaaatgattaaacgatgcaggggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 27587167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 13963080 - 13963132
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13963080 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcacgtgtggcagtgatt 13963132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 27937230 - 27937178
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27937230 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgttgcagtgatt 27937178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 37991314 - 37991222
Alignment:
Q  97 caaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgca 189  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||||| | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  37991314 caaggacgaaatttgaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattaacgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgca 37991222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 5255162 - 5255088
Alignment:
Q  67 attagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgc 141  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||    
T  5255162 attagtgacgtgacagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaataaatgcaaggttaatttgc 5255088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 193
Target Start/End: Original strand, 11741813 - 11741926
Alignment:
Q  80 cagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacg 179  Q
    |||||||||| |  ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||  |||| ||||||| | | ||||| |||  |||||||||||||     
T  11741813 cagtgattaactgggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaagaatgcaaggctagtttgcaaagattagcgaatacagagaccgatttttaaatgacc 11741912  T
Q  180 cctaattgcaagga 193  Q
    ||||||| ||||||    
T  11741913 cctaattacaagga 11741926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 193
Target Start/End: Original strand, 13963121 - 13963238
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaat 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| | ||||||| | ||||  ||| ||||||||||     
T  13963121 gtggcagtgattaagttggtcaaagaacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattaacgaatacatagaccaatttttaaac 13963220  T
Q  176 gacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| | ||||| ||||||    
T  13963221 gacccataattacaagga 13963238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Original strand, 28771154 - 28771247
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| |||||||||||||||||  | | || || |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  28771154 ggacgaaattttaaatgattaaacaatacaggggtaaattgccaagattagcgattacatggaccaatttttaaacgacccctaattacaagga 28771247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 188
Target Start/End: Original strand, 35920500 - 35920588
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgc 188  Q
    |||| |||||||||||||||||  | || |||| ||||||| || ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  35920500 ggacgaaattttaaatgattaaacaatggaaggataaattgtcaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgc 35920588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Original strand, 3656743 - 3656846
Alignment:
Q  111 taaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaag 210  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||||  ||  |||| | ||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||    
T  3656743 taaatgattaaacaatgcaaggataaattatcagaattagcgattacaaagactaatttttaaatgacgtctaattgcaaggtcgaaacacatcattaag 3656842  T
Q  211 cctt 214  Q
    ||||    
T  3656843 cctt 3656846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18670311 - 18670221
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||   ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  18670311 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgc---gattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctacttgcaagga 18670221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 189
Target Start/End: Original strand, 42067838 - 42067929
Alignment:
Q  98 aaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgca 189  Q
    |||||| |||||||||||||||||   ||||| ||  |  |||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  42067838 aaggacgaaattttaaatgattaaagtttgcaggggcagtttgccaggattatcaattacagggaccaaattttaaatgacccctaattgca 42067929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 5256328 - 5256421
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggac 194  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||| | |||||   ||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5256328 ggacgaaattttaaatgattaacaaatgtaaggctaatttgcaaggattagtcattacattgaccaatttttaaacgac-cctaattgcaaggac 5256421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 42063366 - 42063288
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgac 178  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  || |||||| ||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  42063366 ggacaaaattttaaatgattaacatttgcaggggcaatttgccaggattagcgattacagagaccaatttttaaatgac 42063288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6150566 - 6150473
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||||| |||||||| || |||||   |||||| | || |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  6150566 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagactaaattgtcaggattagtgattacatgaaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 6150473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 27937186 - 27937130
Alignment:
Q  79 gcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggcta 135  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27937186 gcagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggcta 27937130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 30005283 - 30005175
Alignment:
Q  82 gtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcc 181  Q
    ||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||  | |||||   ||||||| || ||||| |||||| | | || |||||||||||||| ||    
T  30005283 gtgattaagttggtcaaaagataaaattttaaatgattaaataatgcaaatgtaaattgtcaggattagcaattatatgaactaatttttaaatgacacc 30005184  T
Q  182 taattgcaa 190  Q
    |||||||||    
T  30005183 taattgcaa 30005175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 35512365 - 35512417
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  35512365 tattttgtcctcttcttaagggaaaaattagaatttcacgtgtggcagtgatt 35512417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 21287883 - 21287812
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgcca 143  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | | ||||| ||||||||||    
T  21287883 tgacgtggtagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatacaagggtaaattgcca 21287812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 24547326 - 24547267
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggcta 135  Q
    |||||||||||||| || ||| || ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24547326 gtggcagtgattaaattggtcaaatgacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggcta 24547267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 5835734 - 5835661
Alignment:
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||| ||| |||| ||||||||| | |||| | || ||||||||||    
T  5835734 gaccaaattttaaatgattaaactttgcaagggtaatttgcaaagattaacgaatacaagaaccaatttttaaa 5835661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24547264 - 24547196
Alignment:
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||||||||||  |||| | ||||| | ||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  24547264 ttgcaaggctagtttgcaaggattagcgattacagggaccaattttttaacgacccctaattgcaagga 24547196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 77)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33062261 - 33062041
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  33062261 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 33062162  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  33062161 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 33062062  T
Q  201 catcattaagcctttataaaa 221  Q
    ||||| |||||||||| ||||    
T  33062061 catcaataagcctttagaaaa 33062041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1695951 - 1695736
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  1695951 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtcaaag 1695852  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  1695851 gaccaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 1695752  T
Q  201 catcattaagccttta 216  Q
    ||||| ||||||||||    
T  1695751 catcaataagccttta 1695736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13995884 - 13995672
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  13995884 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtcaaag 13995785  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  13995784 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 13995685  T
Q  201 catcattaagcct 213  Q
    ||||| |||||||    
T  13995684 catcaataagcct 13995672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14900694 - 14900495
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  14900694 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggtagtgattaagtttgtccaag 14900595  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||             ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14900594 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaag-------------gattagcaattacagggacgaatttttgaatgacgcctaattgcaaggactaatca 14900508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 41248770 - 41248566
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||    
T  41248770 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaatttggtcaaag 41248671  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  41248670 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggatgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 41248571  T
Q  201 catca 205  Q
    |||||    
T  41248570 catca 41248566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 33739889 - 33740101
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  33739889 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgtaatttcatgtgtgacagtgattgccgcgttatcaaattagtgatgtggcagtgattaatttggtccaag 33739988  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||    
T  33739989 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgtaagggctaaaca 33740088  T
Q  201 catcattaagcct 213  Q
    ||||| |||||||    
T  33740089 catcaataagcct 33740101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 6658064 - 6658256
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  6658064 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 6658163  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||| |||||||  |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||    
T  6658164 gactaaattttaaatgattaatgattgtaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacctctaattgcaagga 6658256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 10712940 - 10713132
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  10712940 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgttgcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 10713039  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||| | | |||||  || |||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  10713040 gacgacattttaaatgattaacgattgcaaggctaatttgcaaggattagcgaatacagaaaccaatttttaaacgacccttaattgcaagga 10713132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 16099241 - 16099433
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  16099241 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcggtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 16099340  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | |||||   | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16099341 gactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 16099433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 37895558 - 37895366
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  37895558 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgttatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 37895459  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  37895458 gatgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccttaattgcaagga 37895366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 11163265 - 11163092
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  11163265 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtttgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 11163166  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| | ||||| | | ||||||||| ||||||||||    
T  11163165 gactaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaa 11163092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 39498496 - 39498688
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  39498496 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcatattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 39498595  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | |||| |||| |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  39498596 gattaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacatggaccaatttttaaacgatccctaattgcaagga 39498688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 15848305 - 15848497
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  15848305 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcacgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 15848404  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||  | || | ||||| | | ||||   || |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15848405 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggttagttcgcaaggattagcgaatacataaaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 15848497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 36479935 - 36480127
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  36479935 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgcgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 36480034  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | || |||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  36480035 gacgaaattttaaattattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatatagggaccaatttttaaacgacccttaattgcaagga 36480127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 36755310 - 36755497
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||     ||||||||||||| ||| |||    
T  36755310 tattttgtcctcttcttaagggagaaattggaatttcatgtgtgccagtgattgccatgtcatcaaattagtga-----cagtgattaagttggtcaaag 36755404  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  36755405 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgattatagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 36755497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 39423732 - 39423924
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  39423732 tattttgtcatcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgggagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 39423831  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| | ||||| | | || |||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  39423832 gacaaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatatagggatcaatttttaaacgacccctaattgcaagga 39423924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Original strand, 34448025 - 34448204
Alignment:
Q  14 tcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaa 113  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  34448025 tcttaaggacaaaattgaaatttcatgtgtgccagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaa 34448124  T
Q  114 atgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||||||||  |||||||| |||  |||| | ||||||| | || |||||| ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  34448125 atgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattaacgaatatagggaccaatttttaaacaacccctaattgcaagga 34448204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15848275 - 15848107
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  15848275 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacatcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 15848176  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| |||||| ||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15848175 atgcaagggtaaattaccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 15848107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 44714002 - 44714170
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  44714002 aaattggaatttcatgtgtgacaatgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 44714101  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  44714102 atgcaagggtaaattgccaggattagcaattacagggactaatttttaaacgacccctaattgcaagga 44714170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 22051205 - 22051088
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  22051205 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgatagtgattgccacatcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 22051106  T
Q  101 gaccaaattttaaatgat 118  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  22051105 gacgaaattttaaatgat 22051088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Original strand, 8710754 - 8710897
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||| | |||||| |||| |||||||    
T  8710754 tgacgtggcagtgataaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacatggactaattttt 8710853  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8710854 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagccttt 8710897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 216
Target Start/End: Original strand, 14900743 - 14900882
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14900743 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaca--tacaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacaaatttttaaa 14900840  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttta 216  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14900841 cgacccctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttta 14900882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10712910 - 10712742
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |   | |||  |||||||||||||||||  |    
T  10712910 aaattggaattttatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggtagtgattaagtggggagagggatgaaattttaaatgattaaaca 10712811  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||  |||| | |||| |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  10712810 atgcaagggtaaattgccaggattaatgattataaggaccaatttttaaacgaaccctaattgcaagga 10712742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Original strand, 28226030 - 28226170
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||    
T  28226030 tgacttggtagtgattaagttggtcaaagtacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactaattttt 28226129  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28226130 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcc 28226170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33739840 - 33739700
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33739840 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 33739741  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 215  Q
    || ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  33739740 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagccttt 33739700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 36382348 - 36382180
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||  |||||||||||||||||  |    
T  36382348 aaattggaattttatgtctgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggatgaaattttaaatgattaaaca 36382249  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| ||||||| || ||||| | |||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  36382248 atgcaagggtaaattgtcaggattagcgattatagggaccaatttttaaacgaaccctaattgcaagga 36382180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15604479 - 15604336
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||| ||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||    
T  15604479 tgacttggtagtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactaattttt 15604380  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15604379 aaatgacacctaattgcaaggacgaaacacatcattaagccttt 15604336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 214
Target Start/End: Original strand, 15604625 - 15604767
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| | |||||    
T  15604625 tgacggggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactagttttt 15604724  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctt 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  15604725 aaatgacacctaattgcaaggacaaaacacatcattaaacctt 15604767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 215
Target Start/End: Original strand, 33062310 - 33062450
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33062310 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattataaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 33062409  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 215  Q
    || ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  33062410 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagccttt 33062450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 37895588 - 37895756
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  37895588 aaattgaaatttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 37895687  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||  |||||||||| ||||| | ||||| || || | |||||||| ||| | ||||||||||||    
T  37895688 atgcaagtgtaaattgccaggattagcgattacgggaaccattttttaaacgacccataattgcaagga 37895756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39423702 - 39423534
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  39423702 aaattggaatttcatgtatgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 39423603  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     | ||||| ||||||||||  |||| | ||||||| ||| |||||||||| ||| | ||||| ||||||    
T  39423602 atacaaggataaattgccagaattagcgattacagagaccaatttttaaacgacccgtaattacaagga 39423534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 11830504 - 11830365
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||  | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11830504 tgacgtggcagtgattgagtttgtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgttaggattagcaattacagggactaattttt 11830405  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagc 211  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  11830404 aaatgacgtctaattgcaaggacgaaacacatcattaagc 11830365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 75 - 213
Target Start/End: Original strand, 13995933 - 13996071
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13995933 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 13996032  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    || ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  13996033 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagcct 13996071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8342327 - 8342190
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||||||    
T  8342327 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaaggataaattgccaggattaccaattacatagactaattttt 8342228  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  8342227 aaatgacgcttaattgcaaggacgaaacacatcattaa 8342190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 36479905 - 36479740
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  36479905 aaattggagtttcatgtatgacagttattgtcacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagatggacgaaattttaaatgattaaaca 36479806  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaa 190  Q
     ||||||| |||| ||| ||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  36479805 atgcaagggtaaaatgctaagattagcgattacatggaccaatttttaaacgacccctaattgcaa 36479740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2318345 - 2318178
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  2318345 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcattaattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 2318246  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| ||||||||||  |||| | ||||||  ||| ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  2318245 atgcaagggtaaattgccagaattagcgattacatagaccaatttttaaactac-cctaattgcaagga 2318178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 75 - 213
Target Start/End: Original strand, 41248819 - 41248957
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41248819 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 41248918  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    || |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||    
T  41248919 tgccgcctaattgcaagggttaaacacatcaataagcct 41248957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 2318375 - 2318492
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||     
T  2318375 tattgtgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgtcacgtcatcaaattaatgatgtggcagtgattaagttggtcaaaa 2318474  T
Q  101 gaccaaattttaaatgat 118  Q
    ||  ||||||||| ||||    
T  2318475 gatgaaattttaagtgat 2318492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 193
Target Start/End: Original strand, 13692501 - 13692629
Alignment:
Q  65 aaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacg 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | |||||||||     
T  13692501 aaattagtgacgtgacagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggacc 13692600  T
Q  165 aatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  13692601 aatttttaaacgacccctaattgcaagga 13692629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 34447999 - 34447832
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |   |  ||| ||| ||||||| |||||  |    
T  34447999 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaagtggggagagagacgaaa-tttaaattattaaaca 34447901  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| ||||||| || ||||  | |||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  34447900 atgcaagggtaaattgtcaggatttgcgattatagggaccaatttttaaatgacccctaattacaagga 34447832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 100 - 205
Target Start/End: Original strand, 1696025 - 1696130
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatc 199  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |    
T  1696025 ggacgaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacaggaacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaac 1696124  T
Q  200 acatca 205  Q
    ||||||    
T  1696125 acatca 1696130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 211
Target Start/End: Original strand, 41588344 - 41588483
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||  | || |||  ||||||||||  |||| | ||||||||||| |||||||    
T  41588344 tgacttggcagtgattaagttggtcaaaggatgaaattttaaatgattaaacaatgtaagtgtaaattgccagaattagcgattacagggactaattttt 41588443  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagc 211  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||    
T  41588444 aaatgacgcctaattgtaaggacgaaacacattattaagc 41588483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 214
Target Start/End: Original strand, 8342465 - 8342607
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||| |||||||||||||||  || |||||| ||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||| || |||||   ||||||| ||| |||||||    
T  8342465 tgacgcggcagtgattaagttgttcaaaggacgaaattttaaataattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattattgattacagagactaattttt 8342564  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctt 214  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||    
T  8342565 aaatgacgcctaattgtaaggacgaaacacatcattaaacctt 8342607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 36755280 - 36755214
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagt 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36755280 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaagt 36755214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41587374 - 41587233
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||||  | ||||||| ||| || ||| ||||||| |||||||| || |||||||    
T  41587374 tgacgtgacagtgattaagttggttaaaggatgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaattttccaggattaacgattacagg-accaattttt 41587276  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctt 214  Q
    ||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  41587275 aaatgactcttaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctt 41587233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 191
Target Start/End: Original strand, 9076330 - 9076474
Alignment:
Q  47 agtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaaga 146  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  || ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| | ||    
T  9076330 agtgattgtcacgtcatcgaattagtgatgtggcagtgattaagttggttaaatgacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaagga 9076429  T
Q  147 ttaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaag 191  Q
    ||||| | ||| | ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  9076430 ttaacgaatacggagaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 9076474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6573150 - 6573050
Alignment:
Q  108 ttttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcatt 207  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  6573150 ttttaaatgattaaacaatgcaagg-taaattgccaagattagcgattacatggacaaatttttaaatgacgcctaattgcagggacgaaacacatcatt 6573052  T
Q  208 aa 209  Q
    ||    
T  6573051 aa 6573050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 6573699 - 6573542
Alignment:
Q  54 gccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaa-caattgcaaggctaaattgccaagattaaca 152  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |   | |||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| |     
T  6573699 gccacgtcagctaattagggacgtggcagtgattaagggggg--agggacaaatttttaaatgattaaacaatt-caagggtaaattgccaggattagcg 6573603  T
Q  153 attacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |||||||||||||||    
T  6573602 attacatggacgaatttttaaatgacgcctaattggagggatgaaacacatcattaagcct 6573542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 193
Target Start/End: Original strand, 45556340 - 45556456
Alignment:
Q  77 tggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatg 176  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | ||||| ||| |||||||||| |    
T  45556340 tggcagtgattaagttggtcaaaggattaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaagattagcgaatacagcgaccaatttttaaacg 45556439  T
Q  177 acgcctaattgcaagga 193  Q
    || ||||||| ||||||    
T  45556440 acccctaattacaagga 45556456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 203
Target Start/End: Original strand, 202672 - 202775
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatc 199  Q
    |||| |||||||||||||||||    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||| || |    
T  202672 ggacgaaattttaaatgattaaactctgcaaggctaatttgccaggattaacgattacatggacgaatttttaaatgacccctaattacagggacaaaac 202771  T
Q  200 acat 203  Q
    ||||    
T  202772 acat 202775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 203
Target Start/End: Original strand, 39936535 - 39936665
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||||||||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| |||| || ||||    
T  39936535 tgacgtggcattgattaaattggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaactttgcaagggtaatttgccaggattaacgattacaaggaccaa-tttt 39936633  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacat 203  Q
    |||  ||||||||||||| |||| || |||||    
T  39936634 aaaccacgcctaattgcagggacgaaacacat 39936665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 178
Target Start/End: Original strand, 3653349 - 3653473
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaaca 152  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| || |   | |||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| ||||| ||||||||     
T  3653349 tgccacctcatcagattagtgacgtggtagtgattaacttggaagagggacgaaattttaaatgattaaactttgcaagggtaatttgcc-agattaacg 3653447  T
Q  153 attacagggacgaatttttaaatgac 178  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||    
T  3653448 attacatggaccaatttttaaatgac 3653473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 193
Target Start/End: Original strand, 36382419 - 36382536
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaat 175  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||   ||||| | | ||||||||| ||||||||||     
T  36382419 gtggcagtgattaagttggccaaaggacgaaattttaaatgattaacgattgcaagactagtttgcatggattagcgaatacagggaccaatttttaaac 36382518  T
Q  176 gacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| | ||||||||||||    
T  36382519 gacccttaattgcaagga 36382536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16099192 - 16099076
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||||||| |||||   ||||||||||| ||||||||||    
T  16099192 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccaggattagtgattacagggaccaatttttaaa 16099093  T
Q  175 tgacgcctaattgcaag 191  Q
    |||| ||||||||||||    
T  16099092 tgacccctaattgcaag 16099076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 36382378 - 36382430
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36382378 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgatt 36382430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39498447 - 39498329
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | || | || |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  39498447 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgtaggggtaaattgccaggattaacgattacagggaccaatttttaaa 39498348  T
Q  175 tgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||| ||||||| ||||||    
T  39498347 cgacccctaattacaagga 39498329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Original strand, 11163339 - 11163432
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||  | |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  11163339 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcagaggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 11163432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 44713931 - 44713814
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaat 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | ||||  ||| ||||||||||     
T  44713931 gtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacattgaccaatttttaaac 44713832  T
Q  176 gacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| | ||||| ||||||    
T  44713831 gacccttaattacaagga 44713814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 45556224 - 45556131
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  45556224 ggacaaaattttaaatgattaaacaatgcagggataaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgatccctaattgcaagga 45556131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 44713972 - 44713920
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  44713972 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcacgtgtggcagtgatt 44713920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 189
Target Start/End: Original strand, 25231118 - 25231253
Alignment:
Q  54 gccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaa 153  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |  | | | |||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| |||| | ||||| | |    
T  25231118 gccacgtcatcatattaatgacgtggcagtcattaactgggacaagggacgaaattttaaatgattaaagtttgcaagggtaatttgctaggattagcga 25231217  T
Q  154 ttacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgca 189  Q
     |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  25231218 atacatggaccaatttttaaacgacccctaattgca 25231253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 203
Target Start/End: Original strand, 6589680 - 6589778
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacat 203  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||  |||||| |||||| |||| |||||||||||||| | |||||||| |||| || |||||    
T  6589680 aaattttaaatgattaaactttgcaagggtaatttgccagaattaacgattacatggaccaatttttaaatgacccttaattgcagggacgaaacacat 6589778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6658015 - 6657897
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||||||| |||||   ||||||||||| ||||||||||    
T  6658015 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccatgattagtgattacagggaccaatttttaaa 6657916  T
Q  175 tgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||| || |||||||||||    
T  6657915 cgaccccaaattgcaagga 6657897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 28228777 - 28228679
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacat 203  Q
    |||||| ||||||||||   ||| |||  ||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||    
T  28228777 aaatttcaaatgattaaactttgaaagagtaatttgccacgattaacgattacagggaccaatttttaaatgacccctaattgcagggacgaaacacat 28228679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 193
Target Start/End: Original strand, 3556297 - 3556418
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||||||||| ||||||  | |||  |||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||  |||| | ||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  3556297 tgacgtggcattgattagctgagttaaaggaggaaattttaaatgattaaagaatgcaaggctagtttgcaaggattaacgattacagagaccaattttt 3556396  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| ||| | ||||||||||||    
T  3556397 aaacgacccataattgcaagga 3556418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6588823 - 6588702
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| |||||||||| || |  ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||  |||| | ||||| | | |||| |||| |||||||    
T  6588823 tgacctggcagtgatcaactgggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaagaatgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacatggaccaattttt 6588724  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  6588723 aaacgacccctaattgcaagga 6588702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 17266568 - 17266523
Alignment:
Q  8 tcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17266568 tcctcttcttaagggcaaaattggaatatcatgtgtgacagtgatt 17266523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 25230214 - 25230125
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgca 189  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  25230214 ggacgaaattttaaatgattagtaattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgca 25230125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 189
Target Start/End: Original strand, 44045318 - 44045407
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgca 189  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  44045318 ggacaaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgca 44045407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3555385 - 3555269
Alignment:
Q  77 tggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatg 176  Q
    ||||||||||||| |  ||  |||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| |||  | || |||| | ||||| ||| |||||||||| |    
T  3555385 tggcagtgattaactgggttaaaggacgaaattttaaatgattaaagaatgcaaggctaatttgtaaggaataacgaatacagagaccaatttttaaacg 3555286  T
Q  177 acgcctaattgcaagga 193  Q
    || ||||||||||||||    
T  3555285 acccctaattgcaagga 3555269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 191
Target Start/End: Original strand, 22051257 - 22051400
Alignment:
Q  47 agtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaaga 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  |    || || |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| | ||    
T  22051257 agtgattgtcacgtcatcaaattagtgatatggcagtgattaggtgggagagag-acgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgctagga 22051355  T
Q  147 ttaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaag 191  Q
    ||| | ||||||| ||| ||||||||||  ||  |||||||||||    
T  22051356 ttagcgattacagagactaatttttaaacaacctctaattgcaag 22051400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25892498 - 25892388
Alignment:
Q  108 ttttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcatt 207  Q
    ||||||||||||||  | || |||| ||| |||||| ||||| | |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||  || |||||||||    
T  25892498 ttttaaatgattaaacaatggaagggtaatttgccaggattagcgattacatggacaaatttttaaatgaagcctaatttcatagatgaaacacatcatt 25892399  T
Q  208 aagcctttata 218  Q
    ||||| |||||    
T  25892398 aagccattata 25892388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 203
Target Start/End: Original strand, 28230060 - 28230158
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacat 203  Q
    |||||||||||||||||   ||| |||| ||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||| || |||| || |||||    
T  28230060 aaattttaaatgattaaactttgaaagggtaatttgctaggattaacgattacagggaccaatttttaaatgacccataattacagggacgaaacacat 28230158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 45556298 - 45556350
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  45556298 tattttgtcatcttcttaaggacaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 45556350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 199088 - 199030
Alignment:
Q  145 gattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacat 203  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||    
T  199088 gattaacgattacaggaactaatttttaaatgatccctaattgcagggactaaacacat 199030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 191
Target Start/End: Original strand, 6306992 - 6307125
Alignment:
Q  60 tcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggacca--aattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattac 157  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  |||| | |||| |||||| |  ||||||||||||||||  | |||| | |||| |||  | ||||||| ||||     
T  6306992 tcattaaattaatgacgtggcagtccttaactaagtcaaaggacgagaaattttaaatgattaaataatgcaggactaatttgtaaggattaacgattat 6307091  T
Q  158 agggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaag 191  Q
    |||||| |||||||||| |||  |||||||||||    
T  6307092 agggaccaatttttaaacgaccactaattgcaag 6307125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 30729754 - 30729640
Alignment:
Q  79 gcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgac 178  Q
    ||||||||||| |  ||| |||||| |||||||||| ||||||  | |||||||  || |||| | ||||| | | || |||||| |||||||||| |||    
T  30729754 gcagtgattaactgggtcaaaggacgaaattttaaacgattaaagaatgcaagggcaatttgcaaggattagcgaatatagggaccaatttttaaacgac 30729655  T
Q  179 gcctaattgcaagga 193  Q
    | |||||||||||||    
T  30729654 gtctaattgcaagga 30729640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 141805 - 141601
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  141805 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaattttatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 141706  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 200  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||    
T  141705 gactaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgtctaattgcaagggctaaaca 141606  T
Q  201 catca 205  Q
    |||||    
T  141605 catca 141601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 75 - 213
Target Start/End: Original strand, 141854 - 141992
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  141854 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggatgaatttttaaa 141953  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    || ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  141954 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagcct 141992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0559 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0559
Description:

Target: scaffold0559; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 1419 - 1637
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  1419 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgtaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 1518  T
Q  101 gaccaaa-ttttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaa-tttttaaatgacgcc-taattgcaaggact-a 196  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||| || |    
T  1519 gaccaaatttttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattaacaattacaggaacgaattttttaaatgccgccttaattgcaagggctaa 1618  T
Q  197 atcacatcattaagccttt 215  Q
    | ||||||| |||||||||    
T  1619 aacacatcaataagccttt 1637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0559; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1370 - 1233
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1370 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgtcaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 1271  T
Q  175 tgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
    || |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||    
T  1270 tgccgcctaattgcaagggttaaacacatcaataagcc 1233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 103 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21118 - 21004
Alignment:
Q  103 ccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcaca 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21118 ccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgcaaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcaca 21019  T
Q  203 tcattaagcctttat 217  Q
    |||||||||||||||    
T  21018 tcattaagcctttat 21004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Original strand, 21260 - 21366
Alignment:
Q  106 aattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatca 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21260 aattttaaatgattaacaattgcaagactaaattgccatgattagcaattacagggacgaatttttaaacgacctctaattgcaaggactaatcacatca 21359  T
Q  206 ttaagcc 212  Q
    |||||||    
T  21360 ttaagcc 21366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 21180 - 21128
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21180 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtgacagtgatt 21128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 1955 - 2150
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtga---cgtggcagtgattaagttagtcc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| || |||     
T  1955 tattttgtcctcttcttaagggaaaaattgaaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtcgtggcagtgattaaattggtca 2054  T
Q  98 aaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| || |||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2055 aagaacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggatagtttgcaaagattagcaatttcagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 2150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1906 - 1788
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaa 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||    
T  1906 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaagattagcgattacagggaccaattttttaa 1807  T
Q  175 tgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  1806 cgacccctaattgcaagga 1788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 69182 - 69374
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||  |||    
T  69182 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgtattagtaacgtggcagtgattaagttggttaaag 69281  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||    
T  69282 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacatctaattgcaagga 69374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 69152 - 68984
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  69152 aaattggaatttcatgtatggcagttattgcaacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 69053  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     ||||||| |||||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  69052 atgcaagggtaaattgccaggattagtgattacagggaccaatttttaaatgacccctaattgcaagga 68984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0295 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0295
Description:

Target: scaffold0295; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 2360 - 2491
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  2360 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaagttggtcaaag 2459  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaagg 132  Q
    | | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2460 ggcgaaattttaaatgattaataattgcaagg 2491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0295; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 2330 - 2234
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||    
T  2330 aaattggaatttcatgtgtgacgatgattgccacgtcatcaaattattgacatggcagtgattaagtggggagagggacaaaattttaaatgattaa 2234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 14631 - 14451
Alignment:
Q  10 ctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaatt 109  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  14631 ctcttcttaagggcaaaattggtatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaaagacaaaatt 14532  T
Q  110 ttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaa 190  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | || |  ||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  14531 ttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaataaatagactaatttttaaacgactcctaattgcaa 14451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 91
Target Start/End: Original strand, 14670 - 14736
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagt 91  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14670 aaattggaatttcatgtatgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagt 14736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 139858 - 140050
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  139858 tattttatcctcttcttaagagcaaaattgaaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagttattaagttggtcaaag 139957  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    ||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||  |||| |  ||||   | ||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  139958 gactaaattttaaataattaatgattgcaaggctagtttgcaagaattagtgaatacagggaccaatttttaaacaacccctaattgcaagga 140050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 139809 - 139691
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaa-caattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  139809 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaatcaatt-catgggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaa 139711  T
Q  174 atgacgcctaattgcaagga 193  Q
    | ||| ||||||||||||||    
T  139710 acgacccctaattgcaagga 139691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 37774 - 37645
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  37774 tattttgttctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtca-caaattagtgatgtggcagtgattaagttggtcaaag 37676  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaag 131  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  37675 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaag 37645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 37804 - 37972
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  37804 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 37903  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
     | ||||| ||||||| || ||||| | ||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  37904 atacaagggtaaattgtcaggattagcgattacaaagaccaatttttaaacgactcctaattgcaagga 37972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0388 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0388
Description:

Target: scaffold0388; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Original strand, 12525 - 12662
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||| || |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12525 tgacgtggcagtgattaagtaggtcaaagaacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattaacgattacagggactaattttt 12624  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12625 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaa 12662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 11426 - 11567
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||    
T  11426 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaagacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattaacgattacatggactaattttt 11525  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  11526 aaatgacgcctaattgcaaggatgaaacacatcattaagcct 11567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11280 - 11143
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | || |||| ||| |||||||    
T  11280 tgacttggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaagattagcgatcacagagactaattttt 11181  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    | |||||| |||||||||| ||| || |||||||||||    
T  11180 agatgacgactaattgcaacgacgaaacacatcattaa 11143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1052 - 919
Alignment:
Q  80 cagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacg 179  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||| |    
T  1052 cagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaagattagcgattacatggactaatttttaaatgatg 953  T
Q  180 cctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  952 cctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 212
Target Start/End: Original strand, 1214 - 1261
Alignment:
Q  165 aatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1214 aatttttaaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcc 1261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 222075 - 222216
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||| | |||||| | || |||||||    
T  222075 tgacttggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacatgtactaattttt 222174  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  222175 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 222216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 221929 - 221794
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | |||||| | || |||||||    
T  221929 tgacgtggcagtgattaagtt-gtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacaag-actaattttt 221832  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaa 209  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  221831 aaatgacgcctaattgcaagaacgaaacacatcattaa 221794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2531 - 2395
Alignment:
Q  74 acgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaa 173  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| | ||||| | ||||||||||  |||||||||    
T  2531 acgtggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgctaggattagcgattacagggattaatttttaa 2432  T
Q  174 atgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaag 210  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  2431 atgacgtctaattgcaaggacgaaacacatcattaag 2395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 210
Target Start/End: Original strand, 12066 - 12204
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| | ||||| | ||||| ||||  |||||||    
T  12066 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgctaggattagcgattactgggattaattttt 12165  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaag 210  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  12166 aaatgacgtttaattgcaaggacgaaacacatcattaag 12204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 203
Target Start/End: Original strand, 239820 - 239970
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaaca 152  Q
    |||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||  ||  | |||| |||||||||||||||||   ||| |||| ||| |||||| ||||| |     
T  239820 tgccacgtcagctaatcagtgatgtggcagtaattaagtgggtgtagggacgaaattttaaatgattaaactttggaagggtaatttgccaggattatcg 239919  T
Q  153 attacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacat 203  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||    
T  239920 attacaggaaccaatttttaaatgacccctaagtgcaaggacgaaacacat 239970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0707 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0707
Description:

Target: scaffold0707; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 193
Target Start/End: Original strand, 6393 - 6488
Alignment:
Q  98 aaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  6393 aaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctactttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 6488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0775 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0775
Description:

Target: scaffold0775; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5102 - 4987
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| | ||||| | | || |||||  |||||||    
T  5102 tgacgtggcagcgattaattaggtcaaaggacgaaattttaaatgattaataattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatatagggatcaattttt 5003  T
Q  172 aaatgacgcctaattg 187  Q
    ||| ||| ||||||||    
T  5002 aaacgacccctaattg 4987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0775; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 193
Target Start/End: Original strand, 6266 - 6387
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaattttt 171  Q
    |||||||||||| |||||||  ||  | | || |||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||| | ||||| | |||| | |||| |||||||    
T  6266 tgacgtggcagtcattaagtgggttaaggaacgaaattttaaatgattaaacattgcaagggtaatttgcaaggattatcgattataaggaccaattttt 6365  T
Q  172 aaatgacgcctaattgcaagga 193  Q
    || |||| ||||||| ||||||    
T  6366 aagtgacccctaatttcaagga 6387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 23389 - 23240
Alignment:
Q  54 gccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaa 153  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |   |   ||||||||||||||||||||   ||| |||| || |||| || |||||||||    
T  23389 gccacgtcagcaaattactgacgtggcagtgattaagtggggggagaaaccaaattttaaatgattaaactttggaaggatagattgacaggattaacaa 23290  T
Q  154 ttacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcacat 203  Q
     ||||  ||| |||||||||||||| | || ||||| |||| || |||||    
T  23289 atacatagaccaatttttaaatgactcatatttgcagggacgaaacacat 23240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0128 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0128
Description:

Target: scaffold0128; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19964 - 19875
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggac 194  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| | ||| |||| | ||||| | || |||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  19964 aaattttaaatgattaaagaatgcaaaggtaatttgcaaggattagcgatcacagggaccaatttttaaacgacccataattgcaaggac 19875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University