View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17474_high_13 (Length: 410)

Name: NF17474_high_13
Description: NF17474
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17474_high_13
NF17474_high_13
[»] chr3 (77 HSPs)
chr3 (1-394)||(41661613-41662026)
chr3 (1-388)||(43427300-43427709)
chr3 (38-394)||(14814589-14814964)
chr3 (1-264)||(21166867-21167131)
chr3 (4-384)||(33368718-33369097)
chr3 (116-394)||(50313235-50313533)
chr3 (4-312)||(8604974-8605283)
chr3 (15-383)||(38375497-38375866)
chr3 (38-331)||(4162029-4162322)
chr3 (1-205)||(11638555-11638760)
chr3 (169-352)||(31412287-31412469)
chr3 (1-331)||(10913015-10913347)
chr3 (69-382)||(17204760-17205073)
chr3 (69-312)||(13301326-13301567)
chr3 (69-312)||(13311982-13312223)
chr3 (1-176)||(31411424-31411599)
chr3 (213-331)||(6228624-6228742)
chr3 (109-394)||(12953012-12953317)
chr3 (206-384)||(47784758-47784936)
chr3 (171-331)||(15517760-15517921)
chr3 (109-312)||(11882115-11882316)
chr3 (58-331)||(3576282-3576555)
chr3 (4-112)||(50313564-50313674)
chr3 (205-331)||(4145805-4145930)
chr3 (1-137)||(17758393-17758529)
chr3 (1-137)||(19059713-19059849)
chr3 (57-331)||(17191671-17191945)
chr3 (78-309)||(9590619-9590849)
chr3 (264-331)||(11638487-11638554)
chr3 (15-149)||(25103792-25103925)
chr3 (171-318)||(39656669-39656816)
chr3 (15-138)||(40038731-40038852)
chr3 (166-331)||(11515442-11515609)
chr3 (229-308)||(34560052-34560131)
chr3 (53-331)||(12538906-12539187)
chr3 (251-394)||(1990851-1991012)
chr3 (210-331)||(30207346-30207467)
chr3 (38-161)||(6224909-6225032)
chr3 (208-318)||(17139651-17139761)
chr3 (172-331)||(11402719-11402880)
chr3 (321-394)||(11638405-11638478)
chr3 (209-305)||(14080665-14080761)
chr3 (15-138)||(37915094-37915215)
chr3 (208-318)||(14059207-14059317)
chr3 (214-318)||(55440848-55440952)
chr3 (208-331)||(12488720-12488843)
chr3 (210-318)||(17960309-17960417)
chr3 (338-394)||(31412476-31412532)
chr3 (215-318)||(16880266-16880369)
chr3 (101-196)||(34560133-34560227)
chr3 (321-382)||(6228751-6228812)
chr3 (321-394)||(9590880-9590953)
chr3 (214-318)||(15876211-15876315)
chr3 (4-136)||(18970248-18970381)
chr3 (328-382)||(3576571-3576625)
chr3 (320-378)||(14080573-14080631)
chr3 (84-138)||(17393759-17393812)
chr3 (1-81)||(17586716-17586797)
chr3 (321-382)||(11329087-11329148)
chr3 (321-382)||(12560362-12560423)
chr3 (321-381)||(14295499-14295559)
chr3 (321-381)||(14301126-14301186)
chr3 (263-318)||(11329010-11329065)
chr3 (323-382)||(16880183-16880242)
chr3 (331-382)||(17191601-17191652)
chr3 (321-379)||(11061132-11061190)
chr3 (328-382)||(14528145-14528199)
chr3 (328-382)||(17139568-17139622)
chr3 (321-382)||(12488852-12488913)
chr3 (321-382)||(14059339-14059400)
chr3 (261-298)||(14177065-14177102)
chr3 (214-318)||(14295582-14295686)
chr3 (214-318)||(14301209-14301313)
chr3 (261-298)||(48421740-48421777)
chr3 (214-298)||(15550761-15550845)
chr3 (338-382)||(15876128-15876172)
chr3 (232-324)||(51158052-51158142)
[»] scaffold0022 (7 HSPs)
scaffold0022 (1-394)||(131884-132275)
scaffold0022 (22-331)||(67764-68075)
scaffold0022 (171-318)||(102879-103026)
scaffold0022 (230-318)||(109733-109821)
scaffold0022 (331-383)||(68094-68146)
scaffold0022 (321-382)||(109650-109711)
scaffold0022 (321-381)||(103048-103108)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (1-394)||(37606-38019)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (1-394)||(30012-30427)
scaffold0165 (1-394)||(22047-22460)
[»] chr8 (67 HSPs)
chr8 (1-394)||(45464913-45465325)
chr8 (1-331)||(33172358-33172687)
chr8 (1-394)||(45558723-45559136)
chr8 (1-331)||(24552355-24552687)
chr8 (1-328)||(18041317-18041646)
chr8 (4-394)||(38635438-38635847)
chr8 (15-331)||(22497009-22497326)
chr8 (38-394)||(18261297-18261670)
chr8 (61-394)||(19331164-19331513)
chr8 (102-331)||(22742894-22743123)
chr8 (15-331)||(16002127-16002444)
chr8 (38-394)||(27232915-27233266)
chr8 (33-309)||(15933450-15933726)
chr8 (1-154)||(31590310-31590464)
chr8 (33-331)||(5854744-5855041)
chr8 (15-331)||(22887893-22888208)
chr8 (33-331)||(26011624-26011918)
chr8 (33-394)||(33528473-33528853)
chr8 (32-382)||(29306477-29306848)
chr8 (69-333)||(33610909-33611172)
chr8 (208-331)||(37653610-37653733)
chr8 (69-331)||(21198008-21198269)
chr8 (58-331)||(17285334-17285608)
chr8 (1-139)||(17502485-17502623)
chr8 (209-331)||(25296288-25296410)
chr8 (48-149)||(22723492-22723592)
chr8 (58-318)||(23837341-23837601)
chr8 (69-309)||(23149930-23150169)
chr8 (30-293)||(22314239-22314504)
chr8 (209-331)||(25758308-25758430)
chr8 (15-201)||(24239875-24240061)
chr8 (208-297)||(23151827-23151916)
chr8 (321-385)||(22742821-22742885)
chr8 (321-381)||(33172289-33172349)
chr8 (21-119)||(18118095-18118192)
chr8 (57-297)||(20175615-20175857)
chr8 (57-297)||(20220342-20220584)
chr8 (208-318)||(15969964-15970074)
chr8 (321-394)||(20709740-20709813)
chr8 (208-293)||(23158329-23158414)
chr8 (1-139)||(23218201-23218340)
chr8 (321-382)||(22497335-22497396)
chr8 (209-294)||(23226071-23226156)
chr8 (321-382)||(26011554-26011615)
chr8 (1-139)||(4234404-4234542)
chr8 (214-318)||(22981416-22981520)
chr8 (331-394)||(18041668-18041731)
chr8 (331-393)||(24552706-24552768)
chr8 (208-318)||(38533792-38533902)
chr8 (325-382)||(5854674-5854731)
chr8 (321-382)||(38533709-38533770)
chr8 (4-96)||(22745099-22745192)
chr8 (328-382)||(33611186-33611240)
chr8 (321-382)||(15933358-15933419)
chr8 (321-394)||(23226202-23226275)
chr8 (210-298)||(18118285-18118373)
chr8 (338-384)||(37653759-37653805)
chr8 (321-382)||(23837258-23837319)
chr8 (321-382)||(39446892-39446953)
chr8 (321-384)||(16002056-16002118)
chr8 (331-382)||(21198288-21198339)
chr8 (46-139)||(37652248-37652340)
chr8 (216-324)||(6774264-6774370)
chr8 (214-310)||(20573192-20573288)
chr8 (214-298)||(21259499-21259583)
chr8 (216-324)||(24549121-24549227)
chr8 (208-304)||(39446760-39446856)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (1-383)||(14095-14497)
[»] chr7 (73 HSPs)
chr7 (1-394)||(13448612-13449026)
chr7 (1-394)||(28390360-28390762)
chr7 (1-394)||(33559695-33560109)
chr7 (1-331)||(8267513-8267845)
chr7 (1-324)||(9319349-9319673)
chr7 (15-394)||(45149650-45150031)
chr7 (4-331)||(38424349-38424676)
chr7 (1-394)||(46474049-46474465)
chr7 (1-331)||(4446342-4446675)
chr7 (1-331)||(4438913-4439246)
chr7 (38-394)||(31501221-31501595)
chr7 (61-331)||(14935490-14935761)
chr7 (61-331)||(15363083-15363354)
chr7 (38-331)||(28722240-28722533)
chr7 (4-394)||(20583345-20583753)
chr7 (1-394)||(9723590-9724006)
chr7 (61-331)||(15358927-15359195)
chr7 (1-270)||(9250630-9250900)
chr7 (33-382)||(34241026-34241375)
chr7 (38-394)||(4484775-4485142)
chr7 (33-331)||(9611438-9611736)
chr7 (33-331)||(9839009-9839307)
chr7 (35-331)||(48356774-48357069)
chr7 (33-331)||(16914747-16915045)
chr7 (15-298)||(8563147-8563431)
chr7 (205-394)||(17947583-17947791)
chr7 (103-318)||(14271789-14272003)
chr7 (61-195)||(14942269-14942402)
chr7 (61-195)||(15369862-15369995)
chr7 (205-331)||(14940885-14941008)
chr7 (205-331)||(15368478-15368601)
chr7 (15-149)||(18079297-18079430)
chr7 (58-318)||(17223781-17224042)
chr7 (15-146)||(13352269-13352399)
chr7 (208-318)||(13377672-13377782)
chr7 (30-138)||(21537611-21537719)
chr7 (171-382)||(13274847-13275067)
chr7 (4-138)||(16384009-16384143)
chr7 (57-297)||(44304854-44305096)
chr7 (321-390)||(14940807-14940876)
chr7 (321-391)||(4446264-4446333)
chr7 (321-387)||(8267854-8267920)
chr7 (34-151)||(19070175-19070292)
chr7 (48-298)||(15977681-15977933)
chr7 (62-139)||(21675389-21675465)
chr7 (208-304)||(49047668-49047764)
chr7 (321-382)||(9611367-9611428)
chr7 (321-382)||(9838939-9839000)
chr7 (331-384)||(15358855-15358908)
chr7 (321-382)||(16915054-16915115)
chr7 (321-382)||(16919619-16919680)
chr7 (15-139)||(39285978-39286101)
chr7 (330-394)||(38424267-38424331)
chr7 (331-390)||(15368400-15368459)
chr7 (57-156)||(16919836-16919935)
chr7 (321-382)||(28722169-28722231)
chr7 (321-382)||(12248247-12248308)
chr7 (242-331)||(16919689-16919778)
chr7 (321-382)||(48356704-48356765)
chr7 (328-382)||(13377589-13377643)
chr7 (214-299)||(13911028-13911112)
chr7 (214-318)||(26070264-26070368)
chr7 (214-318)||(26094051-26094155)
chr7 (340-382)||(9321181-9321223)
chr7 (331-381)||(14935421-14935471)
chr7 (331-381)||(15363014-15363064)
chr7 (214-299)||(2437621-2437705)
chr7 (321-382)||(13863056-13863117)
chr7 (321-382)||(17224064-17224125)
chr7 (214-295)||(39291517-39291598)
chr7 (321-382)||(49047800-49047861)
chr7 (320-384)||(3049641-3049705)
chr7 (320-384)||(3895083-3895147)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (15-331)||(25476-25795)
[»] chr6 (61 HSPs)
chr6 (15-331)||(17013437-17013756)
chr6 (35-394)||(19854203-19854583)
chr6 (1-394)||(34966915-34967329)
chr6 (15-331)||(23222881-23223198)
chr6 (77-329)||(32352179-32352431)
chr6 (48-331)||(22461931-22462214)
chr6 (34-331)||(23222046-23222345)
chr6 (4-385)||(18629398-18629798)
chr6 (14-331)||(22848145-22848460)
chr6 (88-328)||(31467470-31467712)
chr6 (33-331)||(17083018-17083314)
chr6 (48-378)||(33538205-33538552)
chr6 (126-331)||(29605580-29605785)
chr6 (64-333)||(17556871-17557136)
chr6 (1-256)||(29158170-29158426)
chr6 (48-350)||(16136373-16136676)
chr6 (22-331)||(21931333-21931643)
chr6 (15-331)||(19175280-19175597)
chr6 (101-256)||(14856614-14856770)
chr6 (220-331)||(19672416-19672527)
chr6 (58-331)||(21623298-21623571)
chr6 (1-298)||(22585339-22585638)
chr6 (1-298)||(22590170-22590469)
chr6 (1-139)||(15889499-15889637)
chr6 (58-309)||(22361611-22361860)
chr6 (1-139)||(15004701-15004838)
chr6 (258-394)||(29160347-29160502)
chr6 (237-331)||(25651367-25651461)
chr6 (206-331)||(18381675-18381800)
chr6 (229-331)||(28195108-28195210)
chr6 (321-382)||(17083323-17083384)
chr6 (209-297)||(16887787-16887875)
chr6 (208-311)||(18399088-18399191)
chr6 (209-297)||(33324857-33324944)
chr6 (209-297)||(35136008-35136095)
chr6 (331-386)||(32352103-32352158)
chr6 (48-138)||(18733229-18733318)
chr6 (57-138)||(17374772-17374851)
chr6 (321-382)||(18398998-18399059)
chr6 (321-382)||(25651297-25651358)
chr6 (321-382)||(29605510-29605571)
chr6 (320-384)||(35009579-35009643)
chr6 (208-318)||(15740372-15740482)
chr6 (321-394)||(17013765-17013839)
chr6 (48-138)||(17856292-17856380)
chr6 (321-382)||(22361891-22361952)
chr6 (321-382)||(25367363-25367424)
chr6 (328-382)||(17557149-17557203)
chr6 (330-384)||(23222809-23222863)
chr6 (214-315)||(14626134-14626233)
chr6 (321-382)||(21623228-21623289)
chr6 (331-384)||(23221974-23222027)
chr6 (325-382)||(25919673-25919730)
chr6 (346-394)||(22462247-22462295)
chr6 (33-235)||(25654350-25654551)
chr6 (321-388)||(32276897-32276965)
chr6 (333-382)||(18381821-18381870)
chr6 (214-298)||(15889714-15889798)
chr6 (320-384)||(18777204-18777268)
chr6 (321-388)||(19629384-19629452)
chr6 (1-44)||(32352426-32352470)
[»] chr4 (49 HSPs)
chr4 (1-385)||(13442462-13442866)
chr4 (1-394)||(54398431-54398844)
chr4 (15-328)||(40904733-40905048)
chr4 (1-394)||(50219729-50220139)
chr4 (1-382)||(47468134-47468535)
chr4 (133-394)||(18238075-18238356)
chr4 (1-394)||(41916529-41916925)
chr4 (1-394)||(13589857-13590273)
chr4 (4-331)||(38764839-38765165)
chr4 (38-394)||(41256194-41256568)
chr4 (4-394)||(15013074-15013481)
chr4 (69-394)||(7185701-7186043)
chr4 (4-331)||(7964502-7964828)
chr4 (1-183)||(28428029-28428212)
chr4 (33-331)||(18276564-18276861)
chr4 (1-137)||(10237053-10237190)
chr4 (1-137)||(18235985-18236122)
chr4 (1-143)||(19559679-19559822)
chr4 (212-318)||(47535063-47535169)
chr4 (15-138)||(12133409-12133531)
chr4 (171-331)||(15044958-15045118)
chr4 (109-318)||(13809407-13809614)
chr4 (109-318)||(14901375-14901582)
chr4 (229-318)||(15109364-15109453)
chr4 (15-138)||(49072008-49072130)
chr4 (321-394)||(40905060-40905132)
chr4 (208-331)||(41165940-41166063)
chr4 (321-382)||(7964837-7964898)
chr4 (49-122)||(15213460-15213531)
chr4 (15-99)||(54363093-54363177)
chr4 (214-318)||(52265508-52265612)
chr4 (215-318)||(37957026-37957129)
chr4 (321-382)||(18276494-18276555)
chr4 (323-382)||(19821904-19821963)
chr4 (208-310)||(30232491-30232592)
chr4 (321-382)||(15044888-15044949)
chr4 (332-384)||(38764767-38764819)
chr4 (33-155)||(47534899-47535022)
chr4 (328-382)||(15109482-15109536)
chr4 (321-382)||(13809636-13809697)
chr4 (321-382)||(47535191-47535252)
chr4 (321-382)||(52265634-52265695)
chr4 (320-384)||(12837325-12837389)
chr4 (320-384)||(30232621-30232685)
chr4 (258-305)||(40885613-40885660)
chr4 (321-382)||(14901292-14901353)
chr4 (261-310)||(18494374-18494423)
chr4 (236-297)||(21417471-21417532)
chr4 (320-384)||(21959588-21959652)
[»] chr2 (48 HSPs)
chr2 (1-331)||(16292586-16292918)
chr2 (5-394)||(24277809-24278218)
chr2 (1-394)||(9636793-9637206)
chr2 (1-328)||(25595153-25595482)
chr2 (5-256)||(6094891-6095143)
chr2 (20-331)||(18536885-18537197)
chr2 (1-205)||(9637231-9637435)
chr2 (1-205)||(9637460-9637664)
chr2 (1-205)||(9637689-9637893)
chr2 (58-312)||(19660029-19660281)
chr2 (205-382)||(24884746-24884942)
chr2 (69-305)||(19666684-19666918)
chr2 (130-331)||(24087304-24087505)
chr2 (30-350)||(20279521-20279845)
chr2 (15-139)||(29114693-29114816)
chr2 (109-280)||(23821536-23821705)
chr2 (109-280)||(23830615-23830784)
chr2 (33-331)||(43646023-43646323)
chr2 (171-318)||(722534-722681)
chr2 (208-318)||(68135-68245)
chr2 (282-394)||(6094764-6094895)
chr2 (208-318)||(3241-3351)
chr2 (208-329)||(22775199-22775320)
chr2 (208-329)||(22780577-22780698)
chr2 (109-306)||(19669005-19669201)
chr2 (321-382)||(23821731-23821792)
chr2 (321-382)||(23830810-23830871)
chr2 (321-390)||(25595072-25595141)
chr2 (171-318)||(31146138-31146285)
chr2 (58-255)||(25305637-25305834)
chr2 (332-394)||(33128093-33128155)
chr2 (320-384)||(25265530-25265594)
chr2 (330-393)||(16292936-16292999)
chr2 (261-318)||(24294570-24294627)
chr2 (326-394)||(24560862-24560930)
chr2 (214-318)||(24571292-24571396)
chr2 (321-382)||(68052-68113)
chr2 (321-394)||(19433458-19433531)
chr2 (321-382)||(19666588-19666649)
chr2 (321-382)||(43645953-43646014)
chr2 (321-388)||(28031372-28031440)
chr2 (321-384)||(24571418-24571481)
chr2 (263-318)||(25602167-25602222)
chr2 (331-380)||(18536817-18536866)
chr2 (321-382)||(19669235-19669296)
chr2 (321-382)||(22138220-22138281)
chr2 (321-380)||(25305507-25305567)
chr2 (214-318)||(28974192-28974296)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (1-385)||(67683-68069)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (1-394)||(27545-27958)
scaffold0004 (1-331)||(86487-86818)
scaffold0004 (321-394)||(86405-86478)
[»] chr1 (42 HSPs)
chr1 (1-394)||(5767955-5768368)
chr1 (15-331)||(40436069-40436386)
chr1 (38-333)||(52400759-52401054)
chr1 (4-328)||(49997071-49997395)
chr1 (4-394)||(21195062-21195471)
chr1 (15-331)||(33397482-33397792)
chr1 (22-329)||(25093991-25094296)
chr1 (46-331)||(8537743-8538027)
chr1 (46-331)||(8602982-8603266)
chr1 (24-383)||(20194103-20194464)
chr1 (33-331)||(17609058-17609356)
chr1 (33-331)||(37233680-37233977)
chr1 (58-331)||(20177305-20177578)
chr1 (35-254)||(76238-76458)
chr1 (69-305)||(22143218-22143452)
chr1 (15-149)||(20836741-20836874)
chr1 (60-382)||(13376705-13377027)
chr1 (15-149)||(20822937-20823070)
chr1 (171-318)||(19603240-19603387)
chr1 (21-138)||(18852525-18852641)
chr1 (321-394)||(33397400-33397473)
chr1 (171-318)||(22829382-22829529)
chr1 (215-318)||(38033675-38033778)
chr1 (171-331)||(16656768-16656928)
chr1 (321-394)||(40436395-40436468)
chr1 (171-318)||(16646055-16646202)
chr1 (171-318)||(20955396-20955543)
chr1 (208-318)||(36356287-36356397)
chr1 (209-318)||(27674939-27675048)
chr1 (162-318)||(51627612-51627768)
chr1 (331-384)||(8538046-8538099)
chr1 (331-384)||(8603285-8603338)
chr1 (321-394)||(17608976-17609049)
chr1 (208-310)||(27329750-27329851)
chr1 (321-394)||(49997407-49997481)
chr1 (338-391)||(52400682-52400735)
chr1 (331-381)||(25093920-25093970)
chr1 (328-382)||(37233993-37234047)
chr1 (321-394)||(76499-76572)
chr1 (320-384)||(27329880-27329944)
chr1 (328-379)||(16645975-16646026)
chr1 (321-388)||(20254367-20254435)
[»] scaffold0153 (2 HSPs)
scaffold0153 (1-331)||(8620-8951)
scaffold0153 (342-394)||(1882-1934)
[»] scaffold0670 (1 HSPs)
scaffold0670 (1-394)||(7460-7874)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (1-331)||(26559601-26559932)
chr5 (2-394)||(21109798-21110211)
chr5 (48-331)||(23234315-23234602)
chr5 (1-264)||(5621580-5621844)
chr5 (38-393)||(6456673-6457044)
chr5 (15-331)||(16835099-16835416)
chr5 (4-331)||(29918095-29918423)
chr5 (15-331)||(23417371-23417688)
chr5 (35-289)||(19873933-19874189)
chr5 (87-331)||(24084207-24084451)
chr5 (33-394)||(37983412-37983792)
chr5 (69-331)||(22885772-22886022)
chr5 (15-298)||(11763304-11763588)
chr5 (109-332)||(21310605-21310827)
chr5 (33-318)||(21617159-21617444)
chr5 (103-331)||(19862339-19862567)
chr5 (33-331)||(21222428-21222725)
chr5 (109-318)||(21297071-21297279)
chr5 (109-331)||(432593-432813)
chr5 (214-305)||(23981516-23981607)
chr5 (4-196)||(24225136-24225328)
chr5 (208-331)||(5450837-5450960)
chr5 (171-318)||(32966106-32966253)
chr5 (321-399)||(26559941-26560019)
chr5 (321-382)||(24084137-24084198)
chr5 (171-331)||(28902321-28902481)
chr5 (171-331)||(28938716-28938876)
chr5 (171-318)||(3674005-3674152)
chr5 (171-318)||(7728563-7728710)
chr5 (109-318)||(16595650-16595858)
chr5 (322-391)||(16835426-16835495)
chr5 (331-394)||(22885690-22885753)
chr5 (321-382)||(21617076-21617137)
chr5 (321-385)||(11763631-11763695)
chr5 (321-384)||(23417299-23417362)
chr5 (331-394)||(29918013-29918076)
chr5 (321-382)||(7728480-7728541)
chr5 (321-382)||(19862269-19862330)
chr5 (321-382)||(23493979-23494040)
chr5 (338-394)||(23234628-23234684)
chr5 (323-382)||(21222736-21222795)
chr5 (262-381)||(21906778-21906898)
chr5 (214-298)||(22662683-22662767)
chr5 (331-382)||(23981652-23981703)
chr5 (352-394)||(19873892-19873934)
chr5 (214-324)||(23507104-23507212)
chr5 (321-382)||(3673922-3673983)
chr5 (214-299)||(4199989-4200073)
chr5 (261-310)||(23466588-23466637)
chr5 (321-394)||(24225443-24225516)
chr5 (216-324)||(29188290-29188396)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (38-331)||(786-1079)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (61-394)||(3300-3651)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (46-331)||(108139-108424)
scaffold0020 (333-394)||(108058-108119)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (15-393)||(680-1072)
[»] scaffold0561 (2 HSPs)
scaffold0561 (15-331)||(2572-2889)
scaffold0561 (331-385)||(2908-2962)
[»] scaffold0193 (2 HSPs)
scaffold0193 (61-331)||(4735-5003)
scaffold0193 (331-384)||(4663-4716)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (46-331)||(23506-23789)
scaffold0080 (33-382)||(43617-43985)
scaffold0080 (321-384)||(23798-23861)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (61-394)||(6592-6943)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (69-331)||(31150-31411)
scaffold0010 (321-382)||(31080-31141)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (4-278)||(5595-5868)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (15-331)||(33214-33531)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (33-331)||(69587-69885)
scaffold0009 (30-138)||(244578-244686)
scaffold0009 (321-382)||(69517-69578)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (4-275)||(26781-27051)
[»] scaffold0025 (4 HSPs)
scaffold0025 (170-331)||(85663-85823)
scaffold0025 (103-308)||(53499-53703)
scaffold0025 (331-394)||(85581-85644)
scaffold0025 (342-382)||(53406-53446)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (33-309)||(197073-197348)
scaffold0006 (321-382)||(197379-197440)
[»] scaffold0700 (2 HSPs)
scaffold0700 (33-331)||(2655-2953)
scaffold0700 (321-382)||(2585-2646)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (33-331)||(97018-97315)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (33-331)||(12549-12851)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (60-318)||(76693-76951)
scaffold0053 (321-382)||(76973-77034)
[»] scaffold0253 (4 HSPs)
scaffold0253 (229-333)||(7530-7634)
scaffold0253 (229-333)||(16955-17059)
scaffold0253 (338-394)||(7450-7506)
scaffold0253 (338-394)||(16875-16931)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (4-199)||(2287-2482)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (33-331)||(6843-7142)
scaffold0162 (338-384)||(8335-8381)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (109-318)||(1244-1452)
scaffold0409 (109-318)||(9499-9707)
[»] scaffold0151 (2 HSPs)
scaffold0151 (33-297)||(22241-22505)
scaffold0151 (321-384)||(22548-22611)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (57-382)||(369-698)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (1-138)||(13092-13230)
scaffold0017 (323-394)||(12813-12884)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (206-331)||(6791-6916)
scaffold0483 (321-378)||(6725-6782)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (109-305)||(8166-8361)
scaffold0123 (320-382)||(8070-8132)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (15-139)||(3645-3768)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (58-318)||(35621-35881)
scaffold0013 (15-138)||(6879-7001)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (69-305)||(104480-104714)
scaffold0032 (48-138)||(116008-116097)
scaffold0032 (214-312)||(93773-93871)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (15-138)||(19735-19857)
[»] scaffold0521 (2 HSPs)
scaffold0521 (229-331)||(11224-11326)
scaffold0521 (338-382)||(11154-11198)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (206-331)||(28666-28791)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (1-139)||(43907-44045)
scaffold0063 (214-298)||(44122-44206)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (109-331)||(2213-2433)
scaffold0243 (328-381)||(2449-2502)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (209-305)||(1541-1637)
scaffold0456 (209-305)||(8686-8782)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (15-118)||(11322-11424)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (34-115)||(13494-13575)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (59-214)||(113961-114116)
scaffold0014 (214-316)||(159445-159547)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (209-297)||(22424-22512)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (212-331)||(79669-79788)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (332-394)||(17458-17520)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (48-138)||(12435-12524)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (332-394)||(61371-61433)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (229-298)||(1348-1416)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (209-305)||(10818-10914)
[»] scaffold0084 (2 HSPs)
scaffold0084 (30-138)||(55301-55409)
scaffold0084 (30-122)||(3024-3116)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (58-318)||(116402-116657)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (171-318)||(7948-8095)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (214-318)||(8882-8986)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (15-138)||(2586-2708)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (320-384)||(41707-41771)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (321-384)||(13565-13628)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (109-318)||(3462-3669)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (76-293)||(34319-34537)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (320-380)||(51322-51382)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (35-86)||(180701-180753)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (208-298)||(6046-6136)
scaffold0057 (48-114)||(6216-6281)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (214-316)||(16044-16146)
scaffold0021 (262-316)||(25575-25629)
[»] scaffold0095 (2 HSPs)
scaffold0095 (321-382)||(33854-33915)
scaffold0095 (208-304)||(33722-33818)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (214-318)||(576-680)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (214-318)||(2059-2163)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (214-298)||(1509-1593)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (214-318)||(33805-33909)
[»] scaffold0970 (2 HSPs)
scaffold0970 (331-382)||(2515-2566)
scaffold0970 (215-318)||(2598-2701)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (214-297)||(3128-3210)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (263-318)||(164-219)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (230-297)||(70323-70389)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (230-297)||(89880-89946)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (214-324)||(9353-9461)
scaffold0215 (214-324)||(16251-16359)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (261-298)||(269-306)
[»] scaffold0786 (1 HSPs)
scaffold0786 (321-382)||(4450-4511)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (321-382)||(2983-3044)
scaffold0390 (321-382)||(15967-16028)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (320-381)||(46226-46287)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (216-324)||(13331-13437)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (214-310)||(6093-6189)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (232-324)||(3616-3706)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (321-388)||(5275-5343)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (320-384)||(24853-24917)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 77)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 41662026 - 41661613
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41662026 gttcaagagaagagaaaatggttagaagggagagaagcttgaagactcaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagctttggctaggattatt 41661927  T
Q  100 tgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41661926 tgctaattgaggtaagggggttaaagtttaatcataatcaattaattgtaatttttcattaattgcatgcttaagtgcttatttgattaagtgattattt 41661827  T
Q  200 tgctctagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41661826 tgctctagttgttaaaattcgtgctcttgctatgatgatatgtttgaatacatggaaatgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 41661727  T
Q  300 gtatgtgaaaatgatatattgtgaattg-------------------tgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41661726 gtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgt 41661627  T
Q  381 tgttgagagatatt 394  Q
    ||||||||||||||    
T  41661626 tgttgagagatatt 41661613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 388
Target Start/End: Original strand, 43427300 - 43427709
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  43427300 gttcaagagaagaggaaaagggttagaagggata-aagcttgaagacccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagtttttgctaggattat 43427398  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattatt 198  Q
    | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43427399 t-gctaattgaggtaagggggttagatttcaatcataatcacttagttgtaatttttcct-aattgtatgcataagtgcttaattgaataagtgattatt 43427496  T
Q  199 ttgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaa---tacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgt 294  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43427497 ttgctcttagttgttgaaattcgtgctcttgttatggtgatatgtttgatgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgt 43427596  T
Q  295 tcatagtatgtgaaaatgatatattg-------------------tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgtt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||                   |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  43427597 tcatagtatgtgaaaatgatatattgtaaattgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgagttgtgatgagaatcatgattaattgatgtt 43427696  T
Q  376 gttgttgttgaga 388  Q
    |||||||||||||    
T  43427697 gttgttgttgaga 43427709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 38 - 394
Target Start/End: Original strand, 14814589 - 14814964
Alignment:
Q  38 cttgaagac-taagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataa 136  Q
    ||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||| | ||||| |||||    
T  14814589 cttgaagacctaagaggtggtggtgattctaggagctaaatttaagcttcggctaggatt-tttgctaactaaggtaagggggttagaattcaaccataa 14814687  T
Q  137 tcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgat 235  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |  ||||| |    
T  14814688 tcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaataagtgattattt-gctcatagttgttgaaattcgtgctttaattatggt 14814786  T
Q  236 gatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattg--------------- 320  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
T  14814787 gatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctcaaa 14814886  T
Q  321 ----tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
        |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  14814887 ttgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 14814964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 21166867 - 21167131
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  21166867 gttcaagagaagagaaaagggttagaagggagaaaaacttgaagactcaagatgtgatagagattctaagagatgaattgaagctttggctatgattatt 21166966  T
Q  100 tgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattt 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21166967 -gctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataattaattagttgtaatttttcattaattgcatgcttaagtgcttaattgaataagtgattattt 21167065  T
Q  200 tgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgat 264  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21167066 tgctcatagttgttgaaattcgtgtttttgctatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgat 21167131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 384
Target Start/End: Original strand, 33368718 - 33369097
Alignment:
Q  4 caagagaagag-aaaatggttagaag-ggagagaagcttgaagac-taagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattattt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  33368718 caagagaagaggaaaatggttagaagaggagaga--cttgaagacctaagaggtggtggtgattctaggagctaaattgaagttttggctaggatt-tgt 33368814  T
Q  101 gctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattatttt 200  Q
    |||||   |||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| | |||||||     
T  33368815 gctaacaaaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaattttc-attaattgcatgattaagtgcttatttgaataattaattattt- 33368912  T
Q  201 gctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 299  Q
    | || |||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33368913 gttcatagttgttgaaattcgtgctttaattgtggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgtggttggtgaaattgcatgttcata 33369012  T
Q  300 gtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgtt 384  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  33369013 gtatgtgaaaatgttatactgtgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgtttttgttgtt 33369097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 116 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 50313533 - 50313235
Alignment:
Q  116 ggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaa 214  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  50313533 ggggttagagttcaatcgtaatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgcttaagtgcttaattgagtaagtgattattttgctcatagttgttga 50313434  T
Q  215 aattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgat 314  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50313433 aattcgtgctcttgttataatgatatgtttgagtgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgat 50313334  T
Q  315 atattgtgaattgtgc-------------------tatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    ||||||||||||||||                   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  50313333 atattgtgaattgtgctctaaatgttggattgtgatatgttgttgttgaattgtgatgggaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 50313235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 8605283 - 8604974
Alignment:
Q  4 caagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttg 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8605283 caagagaagaggaaaatggttagaatagag-gaagcttgaagactcaagaggtgttagagaatctaggagctaaattgaagctttggctaggattaattg 8605185  T
Q  102 ctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttg 201  Q
    |||||| |||||| | | ||| ||||||||||||||||  || |||||||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||    
T  8605184 ctaattaaggtaaagag-ttagagttcaatcataatcacatagttgtaatttttccctaattgtatgcttaagtgcttatttgaacaagtcattattttg 8605086  T
Q  202 ctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatag 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8605085 ctcttagttgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtaataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcatag 8604986  T
Q  301 tatgtgaaaatg 312  Q
    ||||||||||||    
T  8604985 tatgtgaaaatg 8604974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 383
Target Start/End: Original strand, 38375497 - 38375866
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  38375497 aaaagggttagaagggaga-aagcttgaagaaccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagcttttgctaggattatt-gcttattgaggta 38375594  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttat-taattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgt 211  Q
    || | |||| | ||||||||||||   ||| || |||||| ||   |||||  |||| |||||||||| |||| | |||||||||||||| || | ||||    
T  38375595 agagagttagatttcaatcataatatcttagtt-taatttcttccctaattctatgcataagtgcttatttgaatgagtgattattttgcacttaattgt 38375693  T
Q  212 taaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat 311  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  38375694 tgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaatttgatgataattgaattgttgtagatgaaattgcatgttcataatttgtgaaaat 38375793  T
Q  312 -gatatattgtgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgt 383  Q
     | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  38375794 gggtatattgtgaattgtgctatgttgttgttgaaatgtggtgagattcatgtttaattgatgttgttgttgt 38375866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 38 - 331
Target Start/End: Original strand, 4162029 - 4162322
Alignment:
Q  38 cttgaagac-taagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataa 136  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  4162029 cttgaagacctaagaggtggtggagattctaggagctaaattgaagtttgggctaggatt-tttgctaactaaggtaagggggttagagttcaaccataa 4162127  T
Q  137 tcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgat 235  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||| |||||||| |||   ||||| |    
T  4162128 tcaattagttgtaatttttcattaaaggcatgattaagtgcttaattgaataagtgattattt-gttcatagttgttgaaattcgtactccaattatggt 4162226  T
Q  236 gatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4162227 gatatgtttgaatacataaaattggtgataattgaattgctgttggtgaaattacaagttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 4162322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11638760 - 11638555
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatt 99  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11638760 gttcaagagaagataaaagggttagaatggagaaaagcttgaaaactcaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagctttggctaggattatt 11638661  T
Q  100 tgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11638660 tgctaattgaggtaagggggttagagttcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaactgcatgcttaagtgcttaattgagtaattgattattt 11638561  T
Q  200 tgctct 205  Q
    ||||||    
T  11638560 tgctct 11638555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 169 - 352
Target Start/End: Original strand, 31412287 - 31412469
Alignment:
Q  169 cttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataat 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31412287 cttaagtgcttaattgaataagtgattattttgctcttagttgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataat 31412386  T
Q  268 tgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctatgttattgttgaattgtgat 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||    
T  31412387 tgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgc--tttaattgttgaattgtgat 31412469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 10913347 - 10913015
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10913347 gttcaagagaagggcaaaagggttagaaaggaga-aagcttgaagaaccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagcttttgctaggattat 10913249  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttat-taattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattat 197  Q
    | ||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||  ||| || |||||| ||   ||| |  |||| ||||||||||  ||| |||||||||||    
T  10913248 t-gcttattgagataagggggttagatttcaatcataatctcttagtt-taatttcttccctaaatctatgcataagtgcttatgtgaataagtgattat 10913151  T
Q  198 tttgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttc 296  Q
    ||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  10913150 ttttcacttagttgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaatttggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgtcc 10913051  T
Q  297 atagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  10913050 ataatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgct 10913015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 69 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 17205073 - 17204760
Alignment:
Q  69 gagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatg 168  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |   || ||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||| || | |||||||||| | |  | | | |    
T  17205073 gagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattccatcataatcattttagtgtaatttttcaattgtggtacg 17204974  T
Q  169 cttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataat 267  Q
       |||||||||||||| ||| |||||| || | || ||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  17204973 aacaagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcatagatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataat 17204875  T
Q  268 tgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaa 367  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||  |||||| |||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17204874 cgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaattatgctatattgttgttgaattgtgataggaatcatgtttaa 17204775  T
Q  368 tggatgttgttgttg 382  Q
    |||||||||||||||    
T  17204774 tggatgttgttgttg 17204760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 69 - 312
Target Start/End: Original strand, 13301326 - 13301567
Alignment:
Q  69 gagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatg 168  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| | | |||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| | || |||||| |||  ||| |||    
T  13301326 gagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gtgatttttcatttgttgtatg 13301423  T
Q  169 cttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataat 267  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| || |||| || ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13301424 attaagtgcttaattgaataagtgattattg-gttcttagatgttgaatttcgtgctctaattatgatggtatgtttgaatacatgaaattggtgataat 13301522  T
Q  268 tgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatg 312  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13301523 tgaattattgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatg 13301567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 69 - 312
Target Start/End: Original strand, 13311982 - 13312223
Alignment:
Q  69 gagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatg 168  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| | | |||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| | || |||||| |||  ||| |||    
T  13311982 gagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gtgatttttcatttgttgtatg 13312079  T
Q  169 cttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataat 267  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| || |||| || ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13312080 attaagtgcttaattgaataagtgattattg-gttcttagatgttgaatttcgtgctctaattatgatggtatgtttgaatacatgaaattggtgataat 13312178  T
Q  268 tgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatg 312  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13312179 tgaattattgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatg 13312223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 31411424 - 31411599
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31411424 gttcaagagaagaggaaaagggttagaagg-agaaaagcttgaagaaccaagaggtgatagagattctaagagttaaattgaagcttttgctaggattat 31411522  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtg 176  Q
    | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  31411523 t-gctaattgaggtaagggggttagatttcaatcataatcaattagttgtaatttttccttaattgtatgcttaagtg 31411599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Original strand, 6228624 - 6228742
Alignment:
Q  213 aaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatg 312  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6228624 aaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcatagtatgtgaaaatg 6228723  T
Q  313 atatattgtgaattgtgct 331  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6228724 atatattgtgaattgtgct 6228742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 109 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 12953317 - 12953012
Alignment:
Q  109 aggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattt-tgctctag 207  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||||||||| | | | || ||| |||||||||||||||| |||||||||| || | |  |||    
T  12953317 aggtaaggggattagaattcaatcataatcaatttagtgtaatttttcaattactgtatgattaagtgcttaattgagtaagtgattaattgttcattag 12953218  T
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 307  Q
    |||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  12953217 ttgttagaattcgtgttctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattagattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatatga 12953118  T
Q  308 aaatg--atatattg-----------------tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgaga 388  Q
    || ||  |||| |||                 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  12953117 aagtgttatatgttgaattatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagatttatgtttaattgatgttgttgttgctaaga 12953018  T
Q  389 gatatt 394  Q
    ||||||    
T  12953017 gatatt 12953012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 206 - 384
Target Start/End: Original strand, 47784758 - 47784936
Alignment:
Q  206 agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgt 305  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  47784758 agttgttataattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatga 47784857  T
Q  306 gaaaatgatatattgtgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgtt 384  Q
    |||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||  | |||| |||||| | | |||||||||||||||    
T  47784858 gaaagtgatatatgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtagtaagaaacatgttcagttgatgttgttgttgtt 47784936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 171 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15517921 - 15517760
Alignment:
Q  171 taagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattg 269  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || | || ||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15517921 taagtgcttaattgagtaagtgattaatt-gttcataaatgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattg 15517823  T
Q  270 aattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| | ||||||||||||||||||    
T  15517822 aattgttgttggtgaaattgcatgttcatggtatgtataaatgggtatattgtgaattgtgct 15517760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 109 - 312
Target Start/End: Original strand, 11882115 - 11882316
Alignment:
Q  109 aggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-ag 207  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| | |||| |||| |||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||    
T  11882115 aggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gtaacttttaatttgttgtatgattaagtgcttaattgaataagtgattattt-gttcttag 11882211  T
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 307  Q
     |||| || ||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11882212 atgttgaatttcatgctctaattatgatggtatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattattgttggtgaaattgaatgttcatagtatgtga 11882311  T
Q  308 aaatg 312  Q
    |||||    
T  11882312 aaatg 11882316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 58 - 331
Target Start/End: Original strand, 3576282 - 3576555
Alignment:
Q  58 agagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaatttttta 157  Q
    |||||| ||| ||| |||| |||||||| |||||||| | | || ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| || | |||||||||| |    
T  3576282 agagatcctaggaggtaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttca 3576381  T
Q  158 ttaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctcta-gttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaa 256  Q
     |  ||| | |  ||||||||||||||| ||| |||||| || | || | ||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||     
T  3576382 attgttgtacgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcaaagttgttataattcgtactctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaag 3576480  T
Q  257 atggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||  |||||| ||||    
T  3576481 ttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaatgtatgagaaagtgatatatattgaattatgct 3576555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 50313674 - 50313564
Alignment:
Q  4 caagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttg 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50313674 caagagaagaggaaaatggttagaagggagagaagcttgaagactcaagaggtgatagagattccaggagctaaattgaagttttggctaggattatttg 50313575  T
Q  102 ctaattgaggt 112  Q
    |||||||||||    
T  50313574 ctaattgaggt 50313564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 205 - 331
Target Start/End: Original strand, 4145805 - 4145930
Alignment:
Q  205 tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 304  Q
    |||||||| |||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4145805 tagttgttgaaattcgtactccaattatggtgatatgtttgaatacatgaat-tggtgataattgaattgttgttgatgaaattacatgttcatagtatg 4145903  T
Q  305 tgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4145904 tgaaaatgatatattgtgaactgtgct 4145930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 17758393 - 17758529
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  17758393 gttcaagagaagaggaaaagggttagaagggaga-aagcttgaagacccaagaggtgatagagattctaggagccaaattgaagcttttgctaggatta- 17758490  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  17758491 ttgctaattgaggtaagggggttagatttcaatcataat 17758529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 19059713 - 19059849
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  19059713 gttcaagagaagaggaaaagggttagaagggaga-aagcttgaagacccaagaggtgatagagattctaggagccaaattgaagcttttgctaggatta- 19059810  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  19059811 ttgctaattgaggtaagggggttagatttcaatcataat 19059849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 57 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 17191945 - 17191671
Alignment:
Q  57 tagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaatttttt 156  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||| || |||||||| |   || ||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||| || | ||||||||||     
T  17191945 tagagatcctaggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcacaatcattttagtgtaatttttc 17191846  T
Q  157 attaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaa 255  Q
    | |  ||| |||   || ||||||||||| ||| |||||| || | || ||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  17191845 aattgttgtatgaacaattgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcatagatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaa 17191747  T
Q  256 aatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||| |||  |||||| ||||    
T  17191746 attgttgataatcgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatttatgttgaattatgct 17191671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 78 - 309
Target Start/End: Original strand, 9590619 - 9590849
Alignment:
Q  78 tgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttat-taattgcatgcttaagtg 176  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||| | |||||||||| ||| | |||| ||||||||| ||| | ||||||||| |  |  ||| ||| |||||||    
T  9590619 tgaagcttgagctaggattaattgctaactaaggtaaggggattagaattca-tcataatcatttagt-gtaatttttcaaattgttgtatgattaagtg 9590716  T
Q  177 cttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgt 275  Q
    ||||||||| |||||| ||| || | || ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  9590717 cttaattgaataagtggttaatt-gttcatagttgttaaaatccgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcattaaattggtgataattgaattgt 9590815  T
Q  276 tgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaa 309  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  9590816 tgttggtgaaacttcatgttcaaagtatgtgaaa 9590849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 264 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 11638554 - 11638487
Alignment:
Q  264 taattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11638554 taattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatggtatattgtgaattgtgct 11638487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 149
Target Start/End: Original strand, 25103792 - 25103925
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| ||||| |||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  25103792 aaaaaggttaaaagggagaaaa-cttgaagaaccaagaggtgatagagattctatgagctaaattgaagcttttactaggatta-ttgcttattgaggta 25103889  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatcaattaattgta 149  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||    
T  25103890 agggggttagatttcaatcataatcatttagttgta 25103925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 171 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 39656816 - 39656669
Alignment:
Q  171 taagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattg 269  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| || | || || |||||||||| |||||||   |||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  39656816 taagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataattgttaaaatccgtgctccaattatgatgttatgtttgaatttatgaaattggtgataattg 39656718  T
Q  270 aattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatat 318  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  39656717 aattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatat 39656669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 138
Target Start/End: Original strand, 40038731 - 40038852
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||     
T  40038731 aaaagggttacaagggaga-aagcttgaagaactaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagtttttgctaggatta-ttgcttattgaggt- 40038827  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatc 138  Q
    ||||||||| | |||||||||||||    
T  40038828 agggggttagatttcaatcataatc 40038852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 331
Target Start/End: Original strand, 11515442 - 11515609
Alignment:
Q  166 atgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctctagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgata 265  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |  || |||||    
T  11515442 atgcataagtgcttatttgaataagtgattattttcacttagttgttgaaattcgtactcttgttatgatgatatgtttgagtatatggatttgatgata 11515541  T
Q  266 attgaattgttgttg-gtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattgtgct 331  Q
    |||||||||||||||  | |||||||| ||||||  |||||  |||| | ||||||||||||||||||    
T  11515542 attgaattgttgttgattcaaattgcacgttcatgatatgtataaatgggtatattgtgaattgtgct 11515609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 229 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 34560131 - 34560052
Alignment:
Q  229 ttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaa 308  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  34560131 ttataatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaaatatgtgaa 34560052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 53 - 331
Target Start/End: Original strand, 12538906 - 12539187
Alignment:
Q  53 gtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaatt 152  Q
    |||||||| ||| || || ||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||  |||||||||||| | |||| ||||||||  ||| |||||||     
T  12538906 gtgatagatattttaggaactaaattgaagcttttgctaggattatt-gtttattgcagtaagggggttagatttcattcataatctcttagttgtaatc 12539004  T
Q  153 ttttat-taattgcatgcttaagtgcttaattgat-taagtgattattttg--ctctagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaat 248  Q
    | |||| |||||   ||| |||||||| | ||||  |||||||||||| ||  || || ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||| |||| |    
T  12539005 tcttatctaattctttgcataagtgctcatttgagataagtgattattgtgagcttta-ttgttgaaattcgtgctcttgttttagtgatatggttgagt 12539103  T
Q  249 acatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga-tatattgtgaattgtgct 331  Q
    |  ||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  || ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  12539104 atgtgaatttgttgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatgataagtataaatgagtatattgtgaattgtgct 12539187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 251 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 1991012 - 1990851
Alignment:
Q  251 atgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct------------------a 332  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||                  |    
T  1991012 atgaaattggtaataattgaattattgtttgtgaaattgcatgttcatagtagatgaaaatgatatattgtgaattatgctcaaattgtgaattgtgtta 1990913  T
Q  333 tgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  1990912 tgttgttgttgaactgtgatgagaatcatgtttaaatgatgttgttgttgttaagagatatt 1990851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 210 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 30207467 - 30207346
Alignment:
Q  210 gttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaa 309  Q
    |||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||    
T  30207467 gttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatgagaaa 30207368  T
Q  310 atgatatattgtgaattgtgct 331  Q
     ||||||||  |||||| ||||    
T  30207367 gtgatatatgttgaattatgct 30207346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 161
Target Start/End: Original strand, 6224909 - 6225032
Alignment:
Q  38 cttgaagac-taagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataa 136  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| | ||||||| |||||| | ||||| |||||    
T  6224909 cttgaagacctaagaggtggtggagattctaggagctaaattgaagcttgtgttaggatt-tttgctaactaaggtaagagggttagaattcaaccataa 6225007  T
Q  137 tcaattaattgtaattttttattaa 161  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||    
T  6225008 tcaattagttgtaatttttcattaa 6225032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 208 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 17139761 - 17139651
Alignment:
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 307  Q
    |||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||    
T  17139761 ttgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaactatgaga 17139662  T
Q  308 aaatgatatat 318  Q
    ||||| |||||    
T  17139661 aaatggtatat 17139651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 11402880 - 11402719
Alignment:
Q  172 aagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattga 270  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||  || | ||||| |||||||||||| | ||||  |||||||||||| || |||||  || ||||||||||    
T  11402880 aagtgcttatttgaataagtgattattgtgaacttaattgttgaaattcgtgctcatattatagtgatatgtttgagtatatgaatttgatgataattga 11402781  T
Q  271 attgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattgtgct 331  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |  |||  |||| | ||||||||||||||||||    
T  11402780 attgttgttgatgaaatttcatgttcatggggtgtataaataggtatattgtgaattgtgct 11402719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 321 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 11638478 - 11638405
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  11638478 tgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttattcagagatatt 11638405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 14080761 - 14080665
Alignment:
Q  209 tgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgt 305  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  14080761 tgttaaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgtggttagtgaatttgcatgttcaaagtatgt 14080665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 138
Target Start/End: Original strand, 37915094 - 37915215
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaagactaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaa 114  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| ||| | ||||||||||    
T  37915094 aaaagggttagaagggaga-aggcttgaagaacaagaggtgatagttattctaggagctaaattgaagtttttgctatgatta-ttgtttattgaggtaa 37915191  T
Q  115 gggggttaaagttcaatcataatc 138  Q
    |||||||| |  ||||||||||||    
T  37915192 gggggttagatgtcaatcataatc 37915215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 208 - 318
Target Start/End: Original strand, 14059207 - 14059317
Alignment:
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 307  Q
    |||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||| || | |||||| |||||||| |||||| ||    
T  14059207 ttgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgtttttagagaaatttcatgttcaaagtatgaga 14059306  T
Q  308 aaatgatatat 318  Q
    |||||| ||||    
T  14059307 aaatgacatat 14059317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 214 - 318
Target Start/End: Original strand, 55440848 - 55440952
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 313  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||  |   |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  55440848 aaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagtggaatttcatgttcaaagtatgagaaaatga 55440947  T
Q  314 tatat 318  Q
    |||||    
T  55440948 tatat 55440952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 208 - 331
Target Start/End: Original strand, 12488720 - 12488843
Alignment:
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 307  Q
    |||||| ||||| ||||||  |||||||  | |||||| || ||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||    
T  12488720 ttgttagaattcatgctctaattatgatattgtgtttggatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttgatgaaatttcatgttcaaagtatgaga 12488819  T
Q  308 aaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    || ||||||||  |||||| ||||    
T  12488820 aagtgatatatgttgaattatgct 12488843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 318
Target Start/End: Original strand, 17960309 - 17960417
Alignment:
Q  210 gttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaa 309  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||  |||||||| ||  | |||| ||||||||||||| || |||| |||||||||| ||| ||| ||||| |||||    
T  17960309 gttagaattcgtgctcctattatgattttatgtttgtatgtaagaaattggtgataattgattttttgtgggtgaaattgaatgatcaaagtatatgaaa 17960408  T
Q  310 atgatatat 318  Q
    |||||||||    
T  17960409 atgatatat 17960417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 338 - 394
Target Start/End: Original strand, 31412476 - 31412532
Alignment:
Q  338 ttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  31412476 ttgttgaattgtgatgagaattaggtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 31412532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16880369 - 16880266
Alignment:
Q  215 aattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgat 314  Q
    |||||||||||   ||| |||||||||||||||| || |||  || ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||| || |    
T  16880369 aattcgtgctccaattacgatgatatgtttgaatgcaagaagttgttgataattgaattgttgttagtaaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtggt 16880270  T
Q  315 atat 318  Q
    ||||    
T  16880269 atat 16880266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 34560227 - 34560133
Alignment:
Q  101 gctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgatta 196  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| | ||||||||| | | |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  34560227 gctaattaaggtaagggggttagaattcaatcatgatcatttagt-gtaatttttcaattattgtatgattaagtgcttaattgagtaagtgatta 34560133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Original strand, 6228751 - 6228812
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  6228751 tgaattgtgctatgttgttgtcgaattatgatgtggatcatgtttaattgatgttgttgttg 6228812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 394
Target Start/End: Original strand, 9590880 - 9590953
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  9590880 tgaattatgctatgttgttgttgagttctgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaagtgatatt 9590953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 15876315 - 15876211
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 313  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| |||||   || |||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||  |||||| |||| |||    
T  15876315 aaattcgtgctctaattatgataatatgtttaaatgcatgatgttgttgataactgaattgttgttgatgaaattttatgttccaagtatgagaaagtga 15876216  T
Q  314 tatat 318  Q
    |||||    
T  15876215 tatat 15876211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18970381 - 18970248
Alignment:
Q  4 caagagaagag--aaaatggttagaagggagagaagcttgaagac-taagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattattt 100  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||||||| | || |||||||||| | |    
T  18970381 caagagaagaggaaaaagggttagaagagag-gagacttgaagacctaagaggtggtggtgattctaggagctaaattgatgtttgggctaggatt-tgt 18970284  T
Q  101 gctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataa 136  Q
    ||||| | |||||||||||||| | |||||||||||    
T  18970283 gctaactaaggtaagggggttagatttcaatcataa 18970248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 382
Target Start/End: Original strand, 3576571 - 3576625
Alignment:
Q  328 tgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||    
T  3576571 tgctatgttgttgttgaattgtgataagagtcatgtttgattgatgttgttgttg 3576625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14080631 - 14080573
Alignment:
Q  320 gtgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgtt 378  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  14080631 gtgaattgtgctatattgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 14080573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 17393812 - 17393759
Alignment:
Q  84 tttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatc 138  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  17393812 tttggctaggattatt-gcttattgaggtaagggggttagatttcaatcataatc 17393759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 17586716 - 17586797
Alignment:
Q  1 gttcaagagaaga-gaaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaa 81  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  17586716 gttcaagagaagatgaaaatggttagaagagag-gagacttgaagatctaagaggtggtggagattctaggagctaaattgaa 17586797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Original strand, 11329087 - 11329148
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||    
T  11329087 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttg 11329148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Original strand, 12560362 - 12560423
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||||    
T  12560362 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatatgattcatgatcaatggatgttgttgttg 12560423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 14295559 - 14295499
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgtt 381  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  14295559 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgtt 14295499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 14301186 - 14301126
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgtt 381  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  14301186 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgtt 14301126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 263 - 318
Target Start/End: Original strand, 11329010 - 11329065
Alignment:
Q  263 ataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatat 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| || |||||    
T  11329010 ataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtggtatat 11329065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 323 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 16880242 - 16880183
Alignment:
Q  323 aattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||| ||||||    
T  16880242 aattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttattgttg 16880183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 331 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 17191652 - 17191601
Alignment:
Q  331 tatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17191652 tatgttgttgctgaattgtgataagaatcatgtttaattgatgttgctgttg 17191601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 379
Target Start/End: Original strand, 11061132 - 11061190
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttg 379  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||| ||||||||||    
T  11061132 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatagtcatgttcaattgatgttgttg 11061190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 328 - 382
Target Start/End: Original strand, 14528145 - 14528199
Alignment:
Q  328 tgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||    
T  14528145 tgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttg 14528199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 328 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 17139622 - 17139568
Alignment:
Q  328 tgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||    
T  17139622 tgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttg 17139568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Original strand, 12488852 - 12488913
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||    
T  12488852 tgaattatgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttg 12488913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Original strand, 14059339 - 14059400
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||| |||||| ||||||    
T  14059339 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgatgttattgttg 14059400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 298
Target Start/End: Original strand, 14177065 - 14177102
Alignment:
Q  261 tgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 298  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14177065 tgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcat 14177102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 14295686 - 14295582
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgtt-ggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatg 312  Q
    |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||  |||||  |   |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  14295686 aaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaatt-catgttcaaagtatgagaaaatg 14295588  T
Q  313 atatat 318  Q
     |||||    
T  14295587 gtatat 14295582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 14301313 - 14301209
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgtt-ggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatg 312  Q
    |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||  |||||  |   |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  14301313 aaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaatt-catgttcaaagtatgagaaaatg 14301215  T
Q  313 atatat 318  Q
     |||||    
T  14301214 gtatat 14301209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 48421777 - 48421740
Alignment:
Q  261 tgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 298  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  48421777 tgataattgaattgttggtgatgaaattgcatgttcat 48421740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15550845 - 15550761
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 298  Q
    |||||||||||| |||| |  |||||||||||| ||  | ||  || ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  15550845 aaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaatttttgatgatgaaattgcatgttcat 15550761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 338 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 15876172 - 15876128
Alignment:
Q  338 ttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  15876172 ttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttg 15876128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 232 - 324
Target Start/End: Original strand, 51158052 - 51158142
Alignment:
Q  232 tgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaa 324  Q
    |||||||||||||| || ||||||  || ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||||    
T  51158052 tgatgatatgtttgtatgcatgaat-tgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaa 51158142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 7)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 132275 - 131884
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  132275 gttcaagagaagagaaaaaggttagaagggagaaaagcttgaagactcaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagcgttggctatgattatt 132176  T
Q  100 tgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  132175 tgctaattgaggtaagggggttagatttcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgcttaagtgcttaattgagtaagtgattattt 132076  T
Q  200 tgctctagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  132075 t-ctctagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtaaaattgcatgttcgta 131977  T
Q  300 gtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |   | |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||| |||||    
T  131976 gtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctcta--aatgttgaattgtgatgagaatcatgcttaattgttgttgttgttgttaagaaatatt 131884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Original strand, 67764 - 68075
Alignment:
Q  22 ttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaaggggg- 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  67764 ttagaagggaga-aagcttgaagaaccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagcttttgctaggattatt-gcttattgaggtaagggggg 67861  T
Q  120 ttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttat-taattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgttaaaat 217  Q
    ||| | |||||||||||||  ||| || |||||| ||   |||||  |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||  | | ||||| ||||    
T  67862 ttagatttcaatcataatctcttagtt-taatttcttccctaattctatgcataagtgcttatttgaatgagtgattattttgcaattaattgttgaaat 67960  T
Q  218 tcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatat 316  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||    
T  67961 tcgtgttcttgttatgatgatatgtttaagtacatgaatttggtgataattgaattgttgtagatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaatgggtat 68060  T
Q  317 attgtgaattgtgct 331  Q
    |||||||||||||||    
T  68061 attgtgaattgtgct 68075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 171 - 318
Target Start/End: Original strand, 102879 - 103026
Alignment:
Q  171 taagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattg 269  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| || | || || |||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||  |  |||||||||    
T  102879 taagtgcttaattgagtaattgattaatt-gttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagtttttgataattg 102977  T
Q  270 aattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatat 318  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| || |||||    
T  102978 aattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtggtatat 103026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 109821 - 109733
Alignment:
Q  230 tatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatat 318  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| | |||||| |||| || |||||    
T  109821 tatgatgatatgtttgaatccatgaagttgttgataattgaattgttgttaatgaaatttcatgtttaaagtatgagaaagtggtatat 109733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 383
Target Start/End: Original strand, 68094 - 68146
Alignment:
Q  331 tatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgt 383  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  68094 tatgttgttgttgaaatgtggtgagattcatgtttaattgatgttgttgttgt 68146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 109711 - 109650
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | | | |||||||||||||    
T  109711 tgaattttgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcagttgatgttgttgttg 109650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 381
Target Start/End: Original strand, 103048 - 103108
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgtt 381  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||| |||||| |||||    
T  103048 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataacattcatgttcaattgatgttattgtt 103108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 38019 - 37606
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38019 gttcaagagaagagaaaatggttagaagggagaaaagcttgaaaactcaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagctttagctaggattatt 37920  T
Q  100 tgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattt 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37919 tgctaattgaggtaaggaggttagagttcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgcttaagtgcttaattgagtaagtgattattt 37820  T
Q  200 tgctctagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819 tgctctagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgaaaattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 37720  T
Q  300 gtatgtgaaaatgatatattgtgaattg-------------------tgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgt 380  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||                   ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  37719 gtatgtgaaaatggtatattgtgaattgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttattgttgaattgagacgagaatcatgtttaattgatgttgttgt 37620  T
Q  381 tgttgagagatatt 394  Q
    |||| |||||||||    
T  37619 tgttaagagatatt 37606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 30427 - 30012
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatt 99  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  30427 gttcaagacaagagaaaagggttagaagggagagaagcttgaagactcaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagctttgactaggattagt 30328  T
Q  100 tgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaatttttt--attaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30327 tgctaattgaggtaagggggttagagttcaatcataatcaatttgttgtaattttttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgagtaagtgattat 30228  T
Q  198 tttgctctagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 297  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30227 tttgctctagtagttaaaattcgtgctcttactatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgtaggtgaaattgcatgttca 30128  T
Q  298 tagtatgtgaaaatgatatattgtg-------------------aattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgtt 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||                   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30127 tagtatgtgaaaatgatatattgtgaattttgctctaattgttgaattgtgctatgtttttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgtt 30028  T
Q  379 gttgttgagagatatt 394  Q
    |||||| || ||||||    
T  30027 gttgttaagcgatatt 30012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22460 - 22047
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22460 gttcaagagaagagaaaagggttagaagggagaaaagcttgaagactcaagaggtgatagagatcctagaagataaattgaagctttggctaggattatt 22361  T
Q  100 tgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22360 tgctaattgaggtaagggggttagatttcaatcatagtcaattagttgtaattttc-attaattgcatgcttaagtgcttaattgaataagtgattattt 22262  T
Q  200 tgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 298  Q
    | ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22261 ttctcatagttgttgaaattcgtgctcttgctatgatgttatgtttgagtatatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 22162  T
Q  299 agtatgtgaaaatgatatattgtgaattgt-------------------gctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttg 379  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||                   |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22161 agtatgtgaaaatggtatattgtgaattgtgctctaaatgttgaattgggctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttg 22062  T
Q  380 ttgttgagagatatt 394  Q
    ||||| |||||||||    
T  22061 ttgttaagagatatt 22047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 67)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Original strand, 45464913 - 45465325
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45464913 gttcaagagaagagaaaagggttagaagggagaaaagcttgaagactcaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagttttggctaggattatt 45465012  T
Q  100 tgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  45465013 tgctaattgaggtaagggggttagagttcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgcttaaatgcttaattgagtaagtgattattt 45465112  T
Q  200 tgctctagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 299  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45465113 tgct-tagttgttgaaattcgtgctcctgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 45465211  T
Q  300 gtatgtgaaaatgatatattg-------------------tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgt 380  Q
    ||||||||||||| |||||||                   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45465212 gtatgtgaaaatgttatattgtgaattatgctctagatgttgaattgagctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgt 45465311  T
Q  381 tgttgagagatatt 394  Q
    |||| |||||||||    
T  45465312 tgttaagagatatt 45465325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 33172687 - 33172358
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33172687 gttcaagagaagagaaaagggttagaagggagaaaagcttgaagacccaagaggtgatagagattctaaaagctaaattgaagcttttgctaggattatt 33172588  T
Q  100 tgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattt 199  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33172587 -gctaattgaggtaagggggttagatttcaatcataatcaattagttgtaattttccct-aattgtatgcttaagtgcttaattgaataagtgattattt 33172490  T
Q  200 tgctctagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 299  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33172489 tgctctagttgttgaaatttgtactcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 33172390  T
Q  300 gtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33172389 gtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 33172358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Original strand, 45558723 - 45559136
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  45558723 gttcaagagaagagaaaagggttagaagggagaaaagcttgaagacccaagaggtgataaagattctaggagaaaaattgaagctttggctatgattatt 45558822  T
Q  100 tgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattt 199  Q
     ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  45558823 -gctaattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgcttaagtgattatttgaataagtgattattt 45558921  T
Q  200 tgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 298  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45558922 tgctcttagttgttgaaattcatgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 45559021  T
Q  299 agtatgtgaaaatgatatattg-------------------tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||                   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45559022 agtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttg 45559121  T
Q  380 ttgttgagagatatt 394  Q
    ||||| || ||||||    
T  45559122 ttgttaagggatatt 45559136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 24552355 - 24552687
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatgg-ttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  24552355 gttcaagagaagagaaaaagggttagaagggagaaaagcttgaagacccaagaggtgataaagattctaggagctaaattgaagtttttgcaaggattat 24552454  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattatt 198  Q
    | | ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  24552455 t-gttaattaaggtaagggggttagatttcaatcataatcactttgttgtaatttttcattaattgcatgcttaagtgcttatttgaataagtgattatt 24552553  T
Q  199 ttgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 297  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24552554 ttgcttttagttgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 24552653  T
Q  298 tagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24552654 tagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 24552687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 18041317 - 18041646
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  18041317 gttcaaaagaagaggaaaagggttagaagggagaaaagcttgaagacccaagaggtgatagagattctaggagttaaattgaagcttttgctaggattat 18041416  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattatt 198  Q
    | ||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||| ||||||| |||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18041417 t-gcttattgaggtaaggggtttagatttcaatcataatcacttagttgtaatctttccctaattgtatgcttaagtgcttaattgaataagtgattatt 18041515  T
Q  199 ttgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 297  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18041516 ttgctcttagttgctgaaattcgtgctcttgttatgacgatatgtttgagtacaagaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 18041615  T
Q  298 tagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18041616 tagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgt 18041646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 394
Target Start/End: Original strand, 38635438 - 38635847
Alignment:
Q  4 caagagaagagaaaatggttagaagggagagaagcttgaagac-taagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgc 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||| | | ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  38635438 caagagaagagaaaagggttagaagaga-agagacttgaagacctaagaggtggtggtgattctatgagttaaagtgaagctttggctaggattttttgc 38635536  T
Q  103 taattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgc 202  Q
    ||| | |||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||||     
T  38635537 taactaaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaataagtgaat-ctttgt 38635635  T
Q  203 tc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagt 301  Q
    || |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38635636 tcatagttgttgaaattcgtgctctagttatcatgatatgtttgaatacatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcataat 38635735  T
Q  302 atgtgaaaatgatatattg-------------------tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    ||| |||||||||||||||                   ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38635736 atgcgaaaatgatatattgtgaattatactcaaattgttgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 38635835  T
Q  383 ttgagagatatt 394  Q
    || |||||||||    
T  38635836 ttaagagatatt 38635847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 331
Target Start/End: Original strand, 22497009 - 22497326
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  22497009 aaaagggttagaagggagaga-gcttgaagaaccaagatgtgatagagattctatgagctaaattgaaacttttgctaggattatt-gcttattgaggta 22497106  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttat-taattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgt 211  Q
    ||||||| | | |||||||||||||| ||| ||||||| ||||   |||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  22497107 agggggtcagatttcaatcataatcacttagttgtaatcttttccctaattatatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttgcacttagttgt 22497206  T
Q  212 taaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat 311  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22497207 tgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtagatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaat 22497306  T
Q  312 gatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22497307 gatatattgtgaattgtgct 22497326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 38 - 394
Target Start/End: Original strand, 18261297 - 18261670
Alignment:
Q  38 cttgaagac-taagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataa 136  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||||||||| ||| | ||||| |||||    
T  18261297 cttgaagacctaagaggtggtggagattctaggagctaaattgaagcttgagctaggatt-tttgctaactaaggtaagggg-ttagatttcaaccataa 18261394  T
Q  137 tcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgat 235  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| | || |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18261395 tcaattagttgtaattttc-attaattgcatgattaagtgtttaattgaataagtgattcttt-gttcatagttgttgaaattcgtgctctagttatgat 18261492  T
Q  236 gatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattg--------------- 320  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||                   
T  18261493 gatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatcttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctctaa 18261592  T
Q  321 ----tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
        |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18261593 ttgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 18261670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 61 - 394
Target Start/End: Original strand, 19331164 - 19331513
Alignment:
Q  61 gattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttatta 160  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||| |||| | | |||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  19331164 gattctaggaggtaaattgaagcttgagctaggatttttt-ctaactaatgtaagggggttagatttcaatcataatcacttagttgtaatttttcatta 19331262  T
Q  161 attgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatg 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  19331263 attgcatgcttaagtgcttatttgaataagtgattatttttctcttggttgttgaaattcgtgctcttgttatgactatatgtttgaatacatgaaattg 19331362  T
Q  260 gtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaa-------------------ttgtgctatgttattg 340  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   |||||||||||| |||    
T  19331363 gtgataattgaa---ttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattatgctcaaattgttgagttgtgctatgttgttg 19331459  T
Q  341 ttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  19331460 ttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttattgagagatatt 19331513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 102 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22743123 - 22742894
Alignment:
Q  102 ctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttg 201  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||| |    
T  22743123 ctaattaaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaataattgattattt-g 22743025  T
Q  202 ctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatag 300  Q
     || |||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22743024 ttcatagttgttgaaattcgtgctttgattatggtgatatgtttgagtgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatag 22742925  T
Q  301 tatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22742924 tatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 22742894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16002444 - 16002127
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  16002444 aaaagggttagaagggaga-aagcttgaagaactaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagcttttgctaggattatt-gcttattgaggta 16002347  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgc-atgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgt 211  Q
    ||||||||| | |||||||||||||  |||  | |||||| ||   || | | |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  16002346 agggggttagatttcaatcataatctcttagct-taatttcttcccaaattctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttgcacttagttgt 16002248  T
Q  212 taaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat 311  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||  || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  16002247 tgaaattcatgctcttgttatgatgatatgtttgagtatatgaatttgatgataatttaattgttgttgatgaaattgtatgttcatgatatgtgaaaat 16002148  T
Q  312 ga-tatattgtgaattgtgct 331  Q
    || |||||||| |||||||||    
T  16002147 gagtatattgtaaattgtgct 16002127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 38 - 394
Target Start/End: Original strand, 27232915 - 27233266
Alignment:
Q  38 cttgaagac-taagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataa 136  Q
    ||||||||| ||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||| || |||||||||| |||||||| | |||||||||| ||| | ||||| |||||    
T  27232915 cttgaagacctaagaggtggtgaagattctaggagataaattgaagtttgggctaggatt-tttgctaactaaggtaagggg-ttagaattcaaccataa 27233012  T
Q  137 tcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgat 235  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  27233013 tcaattagttgtaatttttcattaattgcatggttaagtgcttaattgaataagtgattatta-gttcatagttgttgaaattcgtgctctaattatgat 27233111  T
Q  236 gatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaa-aatgat--atattgtgaattgtgcta 332  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||       |||   ||||||  ||| |  | ||  ||||||||| ||    
T  27233112 gatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgtttttggtgaaaatg-------atatattgtgaattatgctcaaaatgttgaattgtgtta 27233204  T
Q  333 tgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  27233205 tgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 27233266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 33 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15933726 - 15933450
Alignment:
Q  33 agaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaat 131  Q
    ||||||||||||| | |||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||| | ||||||||   | |||||||| |||||||||||||| | || |||    
T  15933726 agaagcttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaagcctgggctaggaaattgtgctaattaaggtaagggggttagaattaaat 15933627  T
Q  132 cataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgtt 230  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| | | |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| || | || |||||||||||||| |||||||  ||    
T  15933626 cataatcatttagt-gtaatttttcaattattgtatgattaagtgcttaattgagtaagtgattaatt-gttcatagttgttaaaatttgtgctctaatt 15933529  T
Q  231 atgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaa 309  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15933528 atgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaa 15933450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 31590464 - 31590310
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31590464 gttcaagagaagagaaaagggttagaagggagaaaagcttgaagactcaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagctttggcaaggattatt 31590365  T
Q  100 tgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaatttt 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31590364 tgctaattgagataagggggttagagttcaatcataatcaattagttgtaatttt 31590310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 33 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 5855041 - 5854744
Alignment:
Q  33 agaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaat 131  Q
    ||||||||||||| | |||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| | | |||||||| |||||||| ||||| | ||||||    
T  5855041 agaagcttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaat-tgtgctaattaaggtaaggaggttagaattcaat 5854943  T
Q  132 cataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgtt 230  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| | | |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||  ||    
T  5854942 cataatcatttagt-gtaatttttcaattattgtatgattaagtgcttaattgagtaagtgattaatt-gttcatagttgttaaaattcgtgctctaatt 5854845  T
Q  231 atgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgc 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||  |||||| |||    
T  5854844 atgatgatatgtttgaatgcatgaaattggcgataattgaattgttgttggtgaaatagcatgttcaaagtatatgaaagtgttatatgttgaattatgc 5854745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22888208 - 22887893
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||    
T  22888208 aaaagggttagaagggaga-aagcttgaagaaccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagcttttgctagaattatt-gcttattgaggta 22888111  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttat--taattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttg 210  Q
    ||||||||| | || | ||||||||  ||| || |||||| ||    |||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||    
T  22888110 agggggttagattttattcataatcctttagtt-taatttcttcccctaattttatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttgcacttagttg 22888012  T
Q  211 ttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaa 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  || ||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||  |||||  |||    
T  22888011 ttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtatatgaatttgatgatatttgaatt---gttgatgaaattgcatgttcatgatatgtataaa 22887915  T
Q  311 tga-tatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  22887914 tgagtatattgtgaattgtgct 22887893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 33 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26011918 - 26011624
Alignment:
Q  33 agaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaat 131  Q
    ||||||||||||| | |||| ||| |||||||  || ||| |||| |||||||| |||||||| | | |||||||| ||||||||||||||   ||||||    
T  26011918 agaagcttgaagattcaagaagtggtagagatcataggaggtaaagtgaagcttgggctaggaat-tgtgctaattaaggtaagggggtta---ttcaat 26011823  T
Q  132 cataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgtt 230  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| | | |||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||  ||    
T  26011822 cataatcatttagt-gtaatttttcaattattgtatgattaagtgtttaattgagtaagtgattaatt-gttcatagttgttaaaattcgtgctctaatt 26011725  T
Q  231 atgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgc 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||  |||||| |||    
T  26011724 atgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtgaaagtgttatatgttgaattatgc 26011625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 33528853 - 33528473
Alignment:
Q  33 agaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaat 131  Q
    ||||||||||||| | |||| ||  ||||||| ||| |||||||| ||||| ||  ||||||| | | |||||| | |||||||||||||| | ||||||    
T  33528853 agaagcttgaagattcaagaagtagtagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctaggaatttgtgctaactaaggtaagggggttagaattcaat 33528754  T
Q  132 cataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgtt 230  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| || | ||| || |||| || | ||||||||  ||    
T  33528753 cataatcatttagt-gtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgaataagtgattaatt-gttcttagatgttgaattccgtgctctaatt 33528656  T
Q  231 atgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatat------------ 318  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||                
T  33528655 atgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattgaattgttgttgatgaaattgtatcttcttagtatatgaaaatgatatatgttgaattgtgc 33528556  T
Q  319 ------tgt-gaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
          ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  33528555 tctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatatt 33528473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 29306848 - 29306477
Alignment:
Q  32 gagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaag-ggggttaaagttca 129  Q
    |||||||||||||| | |||| ||  |||||||  || |||||||| |||||||| |||||||| | | |||||||| ||||||| ||||||| | ||||    
T  29306848 gagaagcttgaagattcaagaagtcgtagagatcttaggagctaaactgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagaggggttagaattca 29306749  T
Q  130 atcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttg 228  Q
    |||||||||| || | |||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  || | || ||| |||||| |||||||||||      
T  29306748 atcataatcattttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgaataagtgattgatt-gttcatagatgttaatattcgtgctctaa 29306650  T
Q  229 ttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatata--ttg------ 320  Q
     ||||||||||||||  ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||  |||          
T  29306649 ctatgatgatatgttctaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaatttgtatgttcaaagtttgtgaaaatgatatatgttgaattat 29306550  T
Q  321 -----------tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
               |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  29306549 gctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttg 29306477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 69 - 333
Target Start/End: Original strand, 33610909 - 33611172
Alignment:
Q  69 gagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatg 168  Q
    |||||||| | || ||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | ||||||||| |||  ||| |||    
T  33610909 gagctaaagttaaacttgggctaggattaattgctagctaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagt-gtaatttttcatttgttgtatg 33611007  T
Q  169 cttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataat 267  Q
     ||||||| |||||||| |||||||||| || | || |||||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  33611008 tttaagtgattaattgaataagtgattaatt-gttcatagttgttaaaatttgtgctctaactatgatgatatatttgaatgcatgaaattggtgatcat 33611106  T
Q  268 tgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctat 333  Q
    |  |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  33611107 tagattgttgttggtgaaaattcatgttcaaagtatgtgaaagtgatatattgagaattatgctat 33611172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 208 - 331
Target Start/End: Original strand, 37653610 - 37653733
Alignment:
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 307  Q
    ||||| ||||||||||| |  ||||| |||| |||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37653610 ttgttgaaattcgtgctttaattatggtgatgtgtttgtatgcatgaatttggtgataattgaattgttgttgctgaaattgcatgttcatagtatgtga 37653709  T
Q  308 aaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  37653710 aaatgatatattgtgaattgtgct 37653733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 331
Target Start/End: Original strand, 21198008 - 21198269
Alignment:
Q  69 gagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatg 168  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |   || ||||| || ||||||||||| | |||| | ||||||| || | |||||||||| | | |||| |||    
T  21198008 gagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggggttagaattcatt-ataatcattttagtgtaatttttcaattattgtatg 21198106  T
Q  169 cttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataat 267  Q
     |||||||||||||||| ||| |||||| || | || ||| || | |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||    
T  21198107 attaagtgcttaattgagtaattgattaatt-gttcatagatgatgaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgtagataat 21198205  T
Q  268 tgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||  |||||| ||||    
T  21198206 tgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaattatgct 21198269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 58 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 17285608 - 17285334
Alignment:
Q  58 agagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaatta-attgtaatttttt 156  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||| || ||||| |   || ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||  | ||||| ||||     
T  17285608 agagatcctaggagctaaagtgaagcttgggttaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttttagtgtaaattttc 17285509  T
Q  157 attaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaa 255  Q
    | |  ||| ||| |||||||||||||||| ||| ||| || || | || || |||||| |||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17285508 aattgttgtatgattaagtgcttaattgaataattgaataatt-gttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttaaatgcatgaa 17285410  T
Q  256 aatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||  |||||| ||||    
T  17285409 gttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaattatgct 17285334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 17502623 - 17502485
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatgg-ttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    |||||||||| ||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  17502623 gttcaagagatgaggaaaaggattagaagggaga-aagcttgaagacccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagcttttgctaggatta- 17502526  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatca 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  17502525 ttgctaattgagataagggggttagatttcaagcataatca 17502485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 209 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25296410 - 25296288
Alignment:
Q  209 tgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaa 308  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  25296410 tgttaaaattcgtgccctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattaatgataattgaattgctgttggtgaaattgcatgttcaaagcttgtgaa 25296311  T
Q  309 aatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||||  |||||| ||||    
T  25296310 aatgatatatgttgaattatgct 25296288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 22723592 - 22723492
Alignment:
Q  48 aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattg 147  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||    
T  22723592 aagaggtgatagagattctagaagctaaattgaagcttttgctaggatta-ttgcttattgaggtaagggggttagatttcaatcataatcatttagttg 22723494  T
Q  148 ta 149  Q
    ||    
T  22723493 ta 22723492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 58 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 23837601 - 23837341
Alignment:
Q  58 agagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaatttttta 157  Q
    |||||| ||| ||| |||| |||| ||| |||||||| |   || ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| || | | ||  |||| |    
T  23837601 agagatcctaggagataaagtgaaccttgggctaggaatcggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttaatatagattttca 23837502  T
Q  158 ttaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaa 256  Q
     |  ||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||| || | || ||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||     
T  23837501 attgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcatagatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttaaatgcatgaag 23837403  T
Q  257 atggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatat 318  Q
     || |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  23837402 ttgttgataattgaattgttgttattgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatat 23837341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 23150169 - 23149930
Alignment:
Q  69 gagctaaattgaagctttgg-ctaggattatttgctaattgaggtaaggggg-ttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgca 166  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| | |||| ||||||||| ||| || |||||||  |||  ||| |    
T  23150169 gagctaaagtgaagctttgggctaggattaattgctaactaaggtaaggggggttataattca-tcataatcatttagtt-taattttc-attg-ttgta 23150074  T
Q  167 tgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgata 265  Q
    ||  ||||||||||||||| ||| |||||| || | || || ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  23150073 tgagtaagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaactagtgata 23149975  T
Q  266 attgaattgttgttggtgaaattgcatg-ttcatagtatgtgaaa 309  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||    
T  23149974 aatgaattgttgttggtgaaatttcatgattcaaaatatgtgaaa 23149930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22314504 - 22314239
Alignment:
Q  30 gagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttc 128  Q
    |||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| | |||    
T  22314504 gagaaaagcttgaagaaccaagaggagctagagattctaggagctaaattgaagctttggctaggatta-ttgcttattgaggtaagggcgttagatttc 22314406  T
Q  129 aatcataatcaattaattgta-attttttattaattgcatgcttaagtgcttaattga-ttaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctc 225  Q
    ||||||||||  ||| |||||  |||||   |||||  |||| |||||||||| ||||  |||||||||||| ||  | || ||||| |||||| |||||    
T  22314405 aatcataatc-tttagttgtagctttttccctaattctatgcataagtgcttatttgagataagtgattattgtgaacttaattgttgaaattcatgctc 22314307  T
Q  226 ttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatg 293  Q
    | ||| |  ||||||||||   ||  ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  22314306 tagttgtagtgatatgtttcggtatgtgaaattgatgataattgaattgttgatgtagaaattgcatg 22314239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 209 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25758430 - 25758308
Alignment:
Q  209 tgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaa 308  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | ||||    
T  25758430 tgttaaaattcgtgccctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattaatgataattgaattgctgttggtgaaattgcatgttcaaagcttttgaa 25758331  T
Q  309 aatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||||  |||||| ||||    
T  25758330 aatgatatatgttgaattatgct 25758308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24240061 - 24239875
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  24240061 aaaagggttagaagggaga-aagcttgaggaaccaagaggtgatagagattcaaggagctaaattgaagcttttgctgggatta-ttgcttattgaggta 24239964  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattt-tttattaattgcatgcttaagtgcttaattg-attaagtgattattttg 201  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||  ||| || |||||| ||   |||||  |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  24239963 agggggttagatttcattcataatcctttagtt-taatttcttccctaattctatgcataagtgcttaattgaaataagtgattattttg 24239875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 208 - 297
Target Start/End: Original strand, 23151827 - 23151916
Alignment:
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 297  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23151827 ttgttaaaattcgtgttccaattatgatgatatatttgaatgcatgaaactagtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 23151916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 321 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 22742885 - 22742821
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttg 385  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22742885 tgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttg 22742821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 321 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 33172349 - 33172289
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgtt 381  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33172349 tgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgtt 33172289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 119
Target Start/End: Original strand, 18118095 - 18118192
Alignment:
Q  21 gttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaaggggg 119  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  18118095 gttaaaagggaga-aagcttgaagaatcaagaggtgatagagattctatgagcttaattgaagcttttgctaggattattt-ctagttgaggtaaggggg 18118192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 297
Target Start/End: Original strand, 20175615 - 20175857
Alignment:
Q  57 tagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaat-tttt 155  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  20175615 tagagattttaggagcttacttgaagcttttgctaggattatt-gcttattgaagtaaaggggttagatttcaatcataatcatttagttgtaatctttt 20175713  T
Q  156 tattaattgcatgcttaagtgcttaattga-ttaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatg 253  Q
       |||||  |||| |||||||||| ||||  |||||||||||| ||  | || ||||| |||||||| |||| ||| |  ||||||||||   ||  ||    
T  20175714 ccctaattctatgcataagtgcttatttgagataagtgattattgtgaacttaattgttgaaattcgtactctagttgtagtgatatgtttcggtatgtg 20175813  T
Q  254 aaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 297  Q
    ||| || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  20175814 aaattgatgataattgaattgttgatgtagaaattgcatgttca 20175857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 297
Target Start/End: Original strand, 20220342 - 20220584
Alignment:
Q  57 tagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaat-tttt 155  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  20220342 tagagattttaggagcttacttgaagcttttgctaggattatt-gcttattgaagtaaaggggttagatttcaatcataatcatttagttgtaatctttt 20220440  T
Q  156 tattaattgcatgcttaagtgcttaattga-ttaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatg 253  Q
       |||||  |||| |||||||||| ||||  |||||||||||| ||  | || ||||| |||||||| |||| ||| |  ||||||||||   ||  ||    
T  20220441 ccctaattctatgcataagtgcttatttgagataagtgattattgtgaacttaattgttgaaattcgtactctagttgtagtgatatgtttcggtatgtg 20220540  T
Q  254 aaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 297  Q
    ||| || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  20220541 aaattgatgataattgaattgttgatgtagaaattgcatgttca 20220584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 208 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 15970074 - 15969964
Alignment:
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 307  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||| |   | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||    
T  15970074 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgtacgaaagaaattggtgataattgatttgttgttggtgaaattgaatgatcaaagtatatga 15969975  T
Q  308 aaatgatatat 318  Q
    |||||||||||    
T  15969974 aaatgatatat 15969964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 321 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20709813 - 20709740
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    ||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  20709813 tgaattgtgctattttgttgttgagttttgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgatgttgagagatatt 20709740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 208 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23158414 - 23158329
Alignment:
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatg 293  Q
    |||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23158414 ttgttaaaattcatgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaactagtgataaatgaattgttgttggtgaaatttcatg 23158329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 23218340 - 23218201
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaa-tggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||  || || || ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||     
T  23218340 gttcaagagaagagaaaaatggttagaagggata-aagcgtgaagacccaatagatgttagagattctaggcgctaaattgaagcttttgctaggatta- 23218243  T
Q  99 ttgctaattgaggt-aagggggttaaagttcaatcataatca 139  Q
    |||||||||||||| || ||||||| | ||||| ||||||||    
T  23218242 ttgctaattgaggtaaaaggggttagatttcaagcataatca 23218201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Original strand, 22497335 - 22497396
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22497335 tgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttg 22497396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 294
Target Start/End: Original strand, 23226071 - 23226156
Alignment:
Q  209 tgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgt 294  Q
    |||||||||| |||||||   |||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23226071 tgttaaaatttgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgagttgttgttggtgaatttgcatgt 23226156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 26011615 - 26011554
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  26011615 tgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttgaattgatgttgttgttg 26011554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 4234542 - 4234404
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||| ||||| ||| ||| ||||||| || || || || ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4234542 gttcaagagaacaggaaaagggttagaagggaga-aagtttgaatactcaagcggtgataaaggttttaggaactaaattgaagcttttgctagggttat 4234444  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatca 139  Q
    | ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||    
T  4234443 t-gctaattgaggtaagggcgttagatttcaagcataatca 4234404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 214 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 22981520 - 22981416
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 313  Q
    ||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||| |||| ||     
T  22981520 aaatttgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgg 22981421  T
Q  314 tatat 318  Q
    |||||    
T  22981420 tatat 22981416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 331 - 394
Target Start/End: Original strand, 18041668 - 18041731
Alignment:
Q  331 tatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  18041668 tatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagatatatt 18041731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 331 - 393
Target Start/End: Original strand, 24552706 - 24552768
Alignment:
Q  331 tatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatat 393  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  24552706 tatgttgttgttaatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatat 24552768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 38533902 - 38533792
Alignment:
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 307  Q
    |||||| ||||||| |||   |||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| | |||||  |||||||| |||||| ||    
T  38533902 ttgttagaattcgtactccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaatctcatgttcaaagtatgaga 38533803  T
Q  308 aaatgatatat 318  Q
    ||||| |||||    
T  38533802 aaatggtatat 38533792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 5854731 - 5854674
Alignment:
Q  325 ttgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  5854731 ttgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttg 5854674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 38533770 - 38533709
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  38533770 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttg 38533709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 22745192 - 22745099
Alignment:
Q  4 caagagaagag-aaaatggttagaag-ggagagaagcttgaagac-taagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggatt 96  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22745192 caagagaagaggaaaagggttagaagaggagaga--cttgaagacctaagaggtggtggtgattctaagagctaaattgaagcttgggctaggatt 22745099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 328 - 382
Target Start/End: Original strand, 33611186 - 33611240
Alignment:
Q  328 tgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  33611186 tgctatgttgttgttgaattgtgttgagaaccatgtttaattgatgttgttgttg 33611240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 15933419 - 15933358
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  15933419 tgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttg 15933358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 394
Target Start/End: Original strand, 23226202 - 23226275
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    |||||| || |||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  23226202 tgaattatgttatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaagtgatatt 23226275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 298
Target Start/End: Original strand, 18118285 - 18118373
Alignment:
Q  210 gttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 298  Q
    ||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||  || || ||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18118285 gttgaaattcgtgctcgtgttatagagatatgtttgcgtatataaatttgatgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcat 18118373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 384
Target Start/End: Original strand, 37653759 - 37653805
Alignment:
Q  338 ttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgtt 384  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37653759 ttgttgaattctgttgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgtt 37653805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 23837319 - 23837258
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  23837319 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttg 23837258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Original strand, 39446892 - 39446953
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||    
T  39446892 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttg 39446953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 321 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16002118 - 16002056
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgtt 384  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  16002118 tgaattgtgctatgttgttgttgatttgtggtg-gatccatgtttaattgatgttgttgttgtt 16002056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 331 - 382
Target Start/End: Original strand, 21198288 - 21198339
Alignment:
Q  331 tatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21198288 tatgttgttgttgaattgtggtaagaatcatgttcaattgatgttgttgttg 21198339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 139
Target Start/End: Original strand, 37652248 - 37652340
Alignment:
Q  46 ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatca 139  Q
    |||||||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||  ||||| ||| | || ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  37652248 ctaagaggtggtgaagattctaggatctaaagtgaagcttgtgctagaatt-tgtgttaattaaggtaagggggttagaattcaatcataatca 37652340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 324
Target Start/End: Original strand, 6774264 - 6774370
Alignment:
Q  216 attcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgata 315  Q
    ||||||||||||  | ||||| |||||||| || ||||||  || ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  6774264 attcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaat-tgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgata 6774361  T
Q  316 tattgtgaa 324  Q
      |||||||    
T  6774362 agttgtgaa 6774370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Original strand, 20573192 - 20573288
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaa 310  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||  |   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||| | ||||||    
T  20573192 aaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaaa 20573288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 298
Target Start/End: Original strand, 21259499 - 21259583
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 298  Q
    |||||||||||| |||| |  |||||||||||| ||  | ||  || ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  21259499 aaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaatttttgatgatgaaattgcatgttcat 21259583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24549227 - 24549121
Alignment:
Q  216 attcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgata 315  Q
    ||||||||||||  | ||||| |||||||| || ||||||  || ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  24549227 attcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaat-tgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgata 24549130  T
Q  316 tattgtgaa 324  Q
      |||||||    
T  24549129 agttgtgaa 24549121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 304
Target Start/End: Original strand, 39446760 - 39446856
Alignment:
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 304  Q
    |||||| ||||| |||||   ||||||||| |||||||||| | ||||  ||  |||||||||||||||||| ||| |||| |||||| | ||||||    
T  39446760 ttgttagaattcatgctccaattatgatgacatgtttgaatgcttgaagttgtggataattgaattgttgttagtggaatttcatgtttaaagtatg 39446856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 14497 - 14095
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatt 99  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14497 gttcatgagaagagaaaagagttagaagggagaaaagcttgaaggctcaagagttgatagagattctaggagctaaattgaagctttggctaggattatt 14398  T
Q  100 tgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14397 tgctaattgaggtaagggggttagagttcaatcataatcaattagttataattcttcattaattgcatgcttaagtgcttaattgagtaagtgattattt 14298  T
Q  200 tgctctagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  14297 tgctctagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattattgctggtgaaattgcatgttcata 14198  T
Q  300 gtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtg-------------------ctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgt 380  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||                   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14197 gtatgtgaaaatggtatattgtgaattgtgctctaaatgttgaattatactacgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgt 14098  T
Q  381 tgt 383  Q
    |||    
T  14097 tgt 14095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 73)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Original strand, 13448612 - 13449026
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13448612 gttcaagagaagagaaaagggttagaagggagaaaaacttgaagactcaagaggtgatagagattctaggagttaaattgaagctttggctaggattatt 13448711  T
Q  100 tgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattt 199  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13448712 tactaattgaggtaagggggttagagttcaaccataatcaataagttgtaatttttcattaattgcatgcttaagtgcttaattgagtaagtgattattt 13448811  T
Q  200 tgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 298  Q
    | ||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13448812 tactcttagttgttgaaattcatgctcttgttatcatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattattgttggtgaaattgcatgttcat 13448911  T
Q  299 agtatgtgaaaatgatatattg-------------------tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13448912 agtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttg 13449011  T
Q  380 ttgttgagagatatt 394  Q
    ||||| |||||||||    
T  13449012 ttgttaagagatatt 13449026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 28390762 - 28390360
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28390762 gttcaagagaagagaaaatggttagaagggagaaaagtttgaagactcaagagatgatagagattctaggagctaaattgaagctttcggtaggattatt 28390663  T
Q  100 tgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattt 199  Q
    |||||||||||||||||            ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28390662 tgctaattgaggtaagg------------aatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgcttaagtgcttaattgagtaagtgattattt 28390575  T
Q  200 tgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 298  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28390574 tgctcttagttgttcaaattcgtgctcttgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattaaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 28390475  T
Q  299 agtatgtgaaaatgatatattgtgaattg-------------------tgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttg 379  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||                   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  28390474 agtatgtgaaaatggtatattgtgaattgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgataatcatgtttaattgatgttgttg 28390375  T
Q  380 ttgttgagagatatt 394  Q
    ||||| |||||||||    
T  28390374 ttgttaagagatatt 28390360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 33560109 - 33559695
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33560109 gttcaagagaagaggaaaagggttagaagggagaaaagcttgaagacccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagctttggctagggttat 33560010  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattatt 198  Q
    | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33560009 t-gctaattgaggtaagggggttagatttcaatcataattaattagttgtaatttttcattaattgcatgcttaagtgcttaattgaataagtgattatt 33559911  T
Q  199 ttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 297  Q
    ||| || ||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33559910 ttgttcatagctgttgaaattcgtcctcttgctatgatgatatgttaaaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 33559811  T
Q  298 tagtatgtgaaaatgatatattgtga-------------------attgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgtt 378  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||                   |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33559810 tagtatgagaaaatgatatattgtgaattgggctctaaatgttgaattgtgttatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgtt 33559711  T
Q  379 gttgttgagagatatt 394  Q
    |||||| |||||||||    
T  33559710 gttgttaagagatatt 33559695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 8267513 - 8267845
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8267513 gttcaagagaagaggaaaagggttagaagggagaaaagcttgaagacccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagcttttgctaggattat 8267612  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattatt 198  Q
    | ||| |||||||||| | ||||| | ||||||||||| || ||| |||||||||||   |||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8267613 t-gcttattgaggtaaagaggttagatttcaatcataaccacttagttgtaatttttccctaattgtatgcataagtgcttatttgaataagtgattatt 8267711  T
Q  199 ttgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 297  Q
    |||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8267712 ttgcacttagttgttgaaatttgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 8267811  T
Q  298 tagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8267812 tagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 8267845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 9319349 - 9319673
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagaga-aaatggttagaagggagagaagcttgaagac-taagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  9319349 gttcaagagaagagagaaagggttagaagggaga-aagcttgaagacctaagaggtgatagagattctagaagctaaattgaagattttgctacgattat 9319447  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattatt 198  Q
    | | |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  9319448 t-gttaattgaggtaaggaggttagatttcaatcataatcaattagttgtaatttttccctaattgtatgcttaagtgcttaattgaataagtgatcatt 9319546  T
Q  199 ttgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 297  Q
    |||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9319547 ttgcgcttagttgttgaaattcgtactcttgttatgatgatatgtttgaatacaagaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 9319646  T
Q  298 tagtatgtgaaaatgatatattgtgaa 324  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  9319647 tagtatgtgaaaatgatatattatgaa 9319673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 45150031 - 45149650
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  45150031 aaaagggttagaagggaga-aagcttgaagaaccaagaagtgatagagattctacgagctaaattgaagtttttgctaggattatt-gcttattgaggta 45149934  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttat-taattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgt 211  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||| ||| ||||||| ||||   |||||  ||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||| || ||||||    
T  45149933 agggggttagatttcattcataatcacttagttgtaatcttttccctaattatatgcacaagtgcttatttgaataagtgattgttttgcacttagttgt 45149834  T
Q  212 taaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat 311  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  45149833 tgaaattcgtgctcttgttataatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtgaaaat 45149734  T
Q  312 -gatatattgtgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
     | ||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  45149733 gggtatattgtgaattgtgctatgatgttgttggtttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 45149650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 38424676 - 38424349
Alignment:
Q  4 caagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaagac-taagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttg 101  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  38424676 caagagaagaggaaaaaggttagaagagag-gagacttgaagacctaagaggtgatggagattctaggagctaaattgaagtttgggctaggatt-tttg 38424579  T
Q  102 ctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttg 201  Q
    |||| | |||||||| ||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  38424578 ctaactaaggtaaggaggttagatttcaaccataaacaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaataagtgattcttt-g 38424480  T
Q  202 ctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatag 300  Q
     || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38424479 ttcatagttgttgaaattcgtgctctggttatgatgatatgtttgaatacataaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatag 38424380  T
Q  301 tatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38424379 tatgtgaaaatgatatattgtgaattatgct 38424349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 46474465 - 46474049
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatgg-ttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  46474465 gttcaagagaagagaaaaagggttagaagggagaaaagcttgaagacccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgtagcttttgctaggattat 46474366  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttat-taattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattat 197  Q
    | ||| |||||| ||| ||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||| ||||   |||||  |||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  46474365 t-gcttattgagataatggggttagatttcaatcataatcacttagttgtaatcttttccctaattatatgcataagtgtttaattgagtaagtgattat 46474267  T
Q  198 tttgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttc 296  Q
    ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46474266 tttactcttagttgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgttagagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttc 46474167  T
Q  297 atagtatgtgaaaatg-atatattg-------------------tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttg 376  Q
    ||| |||||| |||||  |||||||                   |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  46474166 ataatatgtggaaatgtgtatattgttaattgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttg 46474067  T
Q  377 ttgttgttgagagatatt 394  Q
    |||||||| |||||||||    
T  46474066 ttgttgttaagagatatt 46474049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 4446675 - 4446342
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||   |||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  4446675 gttcaagagaggaggaaaagggttagagaagagaaaagcttgaagacacaagaggtggtagagattctatgagctaaattaaagctttggctaggattgt 4446576  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattatt 198  Q
    | |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||  ||| |||||||     
T  4446575 t-gctaatggaggtaagggggttagatttcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaatatcatgattaagtgcttaattggataactgattatg 4446477  T
Q  199 ttgctct-agttgtt-aaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttc 296  Q
    ||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4446476 ttgctcttaattgttgaaaatacgtgctctagttatgatgatatgtttgcacacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttc 4446377  T
Q  297 atagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4446376 atagtatgtgaaaatgatatattatgtattgtgct 4446342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 4439246 - 4438913
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||    |||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4439246 gttcaagagaagaggaaaaaggttagtgaagagaaaagcttgaagacacaagaggtgctagagattctaggagctaaattgaagctttggctaggattgt 4439147  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattatt 198  Q
    | ||||||||||| ||||| |||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||     
T  4439146 t-gctaattgaggcaagggagttagatttcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattgagtgcttaattggataagtgattatg 4439048  T
Q  199 ttgctct--agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttc 296  Q
    |||||||  | |  | |||||||||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4439047 ttgctcttaactgctgaaaattcgtgctatagttatgataatatgtttgcacacatgaaattggtgataattgaattgttattggtgaaattgcatgttc 4438948  T
Q  297 atagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4438947 atagtatgttaaaatgatatattgtgaattgtgct 4438913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 38 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 31501595 - 31501221
Alignment:
Q  38 cttgaagac-taagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataa 136  Q
    ||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||| | |||||  ||||    
T  31501595 cttgaagacctaagaggtggtggacattctaagagctaaattgaagcttgggctaggatt-tttgctaactaaggtaagggggttagaattcaacaataa 31501497  T
Q  137 tcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgat 235  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||| | ||||| ||| |||  ||||||     
T  31501496 tcaattagttgtaattttc-attaattgcatgattaagtgcttaattgaataagtgattattt-gttcatagttgatgaaattagtgatctaattatgaa 31501399  T
Q  236 gatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgt-------------- 321  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
T  31501398 gatatgtttaaatacatgaaattggtgataattgaattgttattggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaataatgctcaaa 31501299  T
Q  322 -----gaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
         ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  31501298 ttgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttatgagatatt 31501221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 61 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 14935761 - 14935490
Alignment:
Q  61 gattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggg--gttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttat 158  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  14935761 gattctaggagctaaattgaagtttgggctaggatt-tttgctaattaaggtaaggggccgttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcat 14935663  T
Q  159 taattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctctagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaat 258  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||| |    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  14935662 taattgcatgattaagtgcttaattgaataagtgaatctttggtcacagttgttgaaattcgtgctctagttatggtgatatgtttgaatgcatgaaatt 14935563  T
Q  259 ggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14935562 ggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattatgct 14935490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 61 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15363354 - 15363083
Alignment:
Q  61 gattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggg--gttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttat 158  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  15363354 gattctaggagctaaattgaagtttgggctaggatt-tttgctaattaaggtaaggggccgttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcat 15363256  T
Q  159 taattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctctagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaat 258  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||| |    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  15363255 taattgcatgattaagtgcttaattgaataagtgaatctttggtcacagttgttgaaattcgtgctctagttatggtgatatgtttgaatgcatgaaatt 15363156  T
Q  259 ggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15363155 ggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattatgct 15363083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 38 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28722533 - 28722240
Alignment:
Q  38 cttgaagac-taagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataa 136  Q
    ||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||| ||||| || |||| |||||||| | ||| | |||||||||||||| | ||||| |||||    
T  28722533 cttgaagacctaagaggtggtggtgattctaggagctaaagtgaagtttgggcttggattatt-gttaactaaggtaagggggttagaattcaaccataa 28722435  T
Q  137 tcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgat 235  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| | ||| | || |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28722434 tcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaaatgcttaattgaataagtgaatcttt-gttcatagttgttgaaattcgtgctctagttatgat 28722336  T
Q  236 gatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28722335 gatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattatgct 28722240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 394
Target Start/End: Original strand, 20583345 - 20583753
Alignment:
Q  4 caagagaagagaaaatggttagaagggagagaagcttgaagac-taagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgc 102  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||| || ||||| || ||||||| |||||    
T  20583345 caagagaagataaaagggttagaagaga-agagacttgaagacctaagaggtggtggtgattctaggagctaaagtgtagcttggggtaggatt-tttgc 20583442  T
Q  103 taattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgc 202  Q
    ||| | |||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |     
T  20583443 taactaaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcctaattgaataagtgattattt-gt 20583541  T
Q  203 tc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagt 301  Q
    || |||||||| |||||  ||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20583542 tcatagttgttgaaatttttgccctaattatgaagatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattattgttgatgaaattgcatgttcatagt 20583641  T
Q  302 atgtgaaaatgatatattg-------------------tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||||||||||||||||                   |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20583642 atgtgaaaatgatatattgtgaattatgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 20583741  T
Q  383 ttgagagatatt 394  Q
    || || ||||||    
T  20583742 ttaagggatatt 20583753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Original strand, 9723590 - 9724006
Alignment:
Q  1 gttcaagagaag-agaaaatgg-ttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggatta 97  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9723590 gttcaagagaaggagcaaatgggttagaagggaga-aagcttgaagaaccaagaggtgataaagattcgaggagctaaattgaagcttttgctaggatta 9723688  T
Q  98 tttgctaattgaggtaaggggg-ttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttat-taattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgatt 195  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||| ||||||| ||||   |||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  9723689 tt-gcttattgaggtaaggggggttagatttcaatcataatcacttagttgtaatattttccctaattatatgcataagtgcttatttgaataagtgatt 9723787  T
Q  196 attttgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgt 294  Q
    ||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  9723788 attttgcacttaattgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgggtacatgaaattggtgataattcaattgatgttgatgaaactgcatgt 9723887  T
Q  295 tcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaa-------------------ttgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgtt 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||                   |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9723888 tcataatatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgtt 9723987  T
Q  376 gttgttgttgagagatatt 394  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  9723988 gttgttgttaagagatatt 9724006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 61 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15359195 - 15358927
Alignment:
Q  61 gattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttatta 160  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||    
T  15359195 gattctaggatctaaattgaagcttgggctaggatt-tgtgctaattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtggtaatttttcatta 15359097  T
Q  161 attgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctctagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatgg 260  Q
    |||||||| |||||| |||| |||| ||| |||||||| | |  |||||||| ||||||||| | |  ||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  15359096 attgcatgattaagtacttagttgaataactgattattgttca-tagttgttgaaattcgtgttttaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattgg 15358998  T
Q  261 tgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15358997 tgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 15358927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 9250900 - 9250630
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagaga-aaatggttagaagggagagaagcttgaagac-taagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  9250900 gttcaagagaagagagaaagggttagaagggaga-aagcttgaagacctaagaggtgatagagattctagaagctaaattgaagattttgctacgattat 9250802  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattatt 198  Q
    | | |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  9250801 t-gttaattgaggtaaggaggttagatttcaatcataatcaattagttgtaatttttccctaattgtatgcttaagtgcttaattgaataagtgatcatt 9250703  T
Q  199 ttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattga 270  Q
    |||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  9250702 ttgcgcttagttgttgaaattcgtactcttgttatgatgatatgtttgaatacaagaaattggtgataattga 9250630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 33 - 382
Target Start/End: Original strand, 34241026 - 34241375
Alignment:
Q  33 agaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaat 131  Q
    ||||||||||||| | |||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| || || || | | |||||| | |||||||||||||| | ||||||    
T  34241026 agaagcttgaagattcaagaagtggtagagatcctatgagctaaagtgaagcttgggttaagaatttgtgctaactaaggtaagggggttagaattcaat 34241125  T
Q  132 cataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgtt 230  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| |||  ||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||| || | || |||||| ||||||||||| | |  ||    
T  34241126 cataatcatttagt-gtaatttttcatttgttgtatgattaagtgattaattgagtaagtgattaatt-gttcatagttgataaaattcgtgttataatt 34241223  T
Q  231 atgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgc 330  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||  |||||||||     
T  34241224 atgatgttatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttaaaagtatgtgaaagtaatatatgttgaattgtgt 34241323  T
Q  331 tatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34241324 tatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 34241375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 38 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 4485142 - 4484775
Alignment:
Q  38 cttgaagac-taagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataa 136  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||      | |||||||||| |||||||| | |||||| ||||||| | ||||| |||||    
T  4485142 cttgaagacctaagaggtggtggagattctaggagctaaatt------tgggctaggatt-tttgctaactaaggtaaaggggttagaattcaaccataa 4485050  T
Q  137 tcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgat 235  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||| ||||||||| || |  ||||||    
T  4485049 tcaattagttgtaattttc-attaatatcatgattaagtgcttaattgaataagtgattattt-gttcatagttgttgaaattcgtg-tcctaatatgat 4484953  T
Q  236 gatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg------------- 322  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||                 
T  4484952 gatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggagaaattgcatgttcattgtatgtgaaaatgatatattgtgaattatgctcaaa 4484853  T
Q  323 ------aattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
          ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  4484852 ttgttgaattgtgctatattgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 4484775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 33 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 9611736 - 9611438
Alignment:
Q  33 agaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaat 131  Q
    ||||||||||||| | |||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||| |||| | |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  9611736 agaagcttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttcggcgaggaatttttgctaattaaggtaagagggttagaattcaat 9611637  T
Q  132 cataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgtt 230  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| | | |||| ||  |||||||||||||||| || ||||||| || | || ||||||||||||||||||||||  ||    
T  9611636 cataatcatttagt-gtaatttttcaattattgtatcattaagtgcttaattgagtacgtgattaatt-gttcatagttgttaaaattcgtgctctaatt 9611539  T
Q  231 atgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgc 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||  |||||| |||    
T  9611538 atgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgttatatgttgaattatgc 9611439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 33 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 9839307 - 9839009
Alignment:
Q  33 agaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaat 131  Q
    ||||||||||||| | |||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||| |||| | |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  9839307 agaagcttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttcggcgaggaatttttgctaattaaggtaagagggttagaattcaat 9839208  T
Q  132 cataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgtt 230  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| | | |||| ||  |||||||||||||||| || ||||||| || | || ||||||||||||||||||||||  ||    
T  9839207 cataatcatttagt-gtaatttttcaattattgtatcattaagtgcttaattgagtacgtgattaatt-gttcatagttgttaaaattcgtgctctaatt 9839110  T
Q  231 atgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgc 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||  |||||| |||    
T  9839109 atgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgttatatgttgaattatgc 9839010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 48357069 - 48356774
Alignment:
Q  35 aagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatca 133  Q
    ||||||||||| | |||| ||| ||||||| ||| ||| |||| |||||||| |||||||| | | |||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  48357069 aagcttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggagttaaagtgaagcttgggctaggaat-tgtgctaattaaggtaagggggttagaattcaatca 48356971  T
Q  134 taatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttat 232  Q
    |||||| ||| | ||||||||| |||  ||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||| || | || |||||||||||||| |||||||  ||||    
T  48356970 taatcatttagt-gtaatttttcattcgttgtatgattaaatgcttaattgagtaagtgattaatt-gttcatagttgttaaaatttgtgctctaattat 48356873  T
Q  233 gatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||  |||||| ||||    
T  48356872 gatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgttatatgttgaattatgct 48356774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 33 - 331
Target Start/End: Original strand, 16914747 - 16915045
Alignment:
Q  33 agaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaat 131  Q
    ||||||||||||| | |||| ||| ||||||| ||| |||||||| ||||| || |||||||| | | | |||||| |||||| ||||||| | ||||||    
T  16914747 agaagcttgaagattgaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaagtttgggctaggaatttgtcctaattaaggtaaaggggttagaattcaat 16914846  T
Q  132 cataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgtt 230  Q
    || ||||| ||| | |||| |||| | | |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||  ||    
T  16914847 cacaatcatttagt-gtaacttttcaattattgtatgattaagtgcttaattgagtaagtgattaatt-gttcatagttgttaaaattcgtgctctaatt 16914944  T
Q  231 atgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgc 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||  |||||| |||    
T  16914945 atgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgttatatgttgaattatgc 16915044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 298
Target Start/End: Original strand, 8563147 - 8563431
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  8563147 aaaagggttagaaggaaga-aagcttgaagaaccaagacgtgatagagattctaggagctaaattgaagcttttgctaggattatt-gcttattgaggta 8563244  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttat-taattgcatgcttaagtgcttaattgat-taagtgattattttgctct-agttg 210  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||  ||| || || ||| ||   |||||  |||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||  || |||||    
T  8563245 agggggttatatttcattcataatctcttagtt-tattttcttccctaattctatgcataagtgcttatttgatataagtgattattgtgaactcagttg 8563343  T
Q  211 ttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 298  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8563344 ttgaaatttgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtatatgaatttgatgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcat 8563431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 205 - 394
Target Start/End: Original strand, 17947583 - 17947791
Alignment:
Q  205 tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 304  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||    
T  17947583 tagttgttgaaatacgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggttaaactgaatgtgcatagtatg 17947682  T
Q  305 tgaaaatgatatattg-------------------tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttg 385  Q
    ||||||||||||||||                   |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  17947683 tgaaaatgatatattgtaaattgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgtta 17947782  T
Q  386 agagatatt 394  Q
    |||||||||    
T  17947783 agagatatt 17947791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 103 - 318
Target Start/End: Original strand, 14271789 - 14272003
Alignment:
Q  103 taattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgc 202  Q
    ||||| |||||||||  ||| | |||||||||||||| || | |||||||||| | | |||| |||  ||||||||||||||| ||| ||||||  |||     
T  14271789 taattaaggtaagggaattagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattattgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgatta-attgt 14271887  T
Q  203 tc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagt 301  Q
    || |||||| | |||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14271888 tcatagttg-tcaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattcaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 14271986  T
Q  302 atgtgaaaatgatatat 318  Q
    |||||||||||||||||    
T  14271987 atgtgaaaatgatatat 14272003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14942402 - 14942269
Alignment:
Q  61 gattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttatta 160  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14942402 gattctaggagctaaattgtagcttgggctaggatt-tttgctaattaaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcatta 14942304  T
Q  161 attgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgatt 195  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  14942303 attgcatgattaagtgcttaattgaataagtgatt 14942269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15369995 - 15369862
Alignment:
Q  61 gattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttatta 160  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15369995 gattctaggagctaaattgtagcttgggctaggatt-tttgctaattaaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcatta 15369897  T
Q  161 attgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgatt 195  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  15369896 attgcatgattaagtgcttaattgaataagtgatt 15369862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 205 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 14941008 - 14940885
Alignment:
Q  205 tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 304  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  14941008 tagttgttgaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaatttgtgataattaaattgttg---gtgaaattgcatgttcatagtatg 14940912  T
Q  305 tgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14940911 tgaaaatgatatattgtgaattatgct 14940885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 205 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15368601 - 15368478
Alignment:
Q  205 tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 304  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  15368601 tagttgttgaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaatttgtgataattaaattgttg---gtgaaattgcatgttcatagtatg 15368505  T
Q  305 tgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15368504 tgaaaatgatatattgtgaattatgct 15368478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 149
Target Start/End: Original strand, 18079297 - 18079430
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  18079297 aaaagggttagaaggaaga-aagcttgaagaaccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaaggttttgctaggatta-ttgcttattgaggta 18079394  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatcaattaattgta 149  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||    
T  18079395 agggggttagatttcaatcataatcacttagttgta 18079430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 318
Target Start/End: Original strand, 17223781 - 17224042
Alignment:
Q  58 agagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaatta-attgtaatttttt 156  Q
    |||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||| || |   || ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||  | ||||||||||     
T  17223781 agagatcctacgaggtaaagtgaagcttgggctaagaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttttagtgtaatttttc 17223880  T
Q  157 attaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctcta-gttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaa 255  Q
    | | |||  ||| |||||||||||||||| ||| | |||| || | || | ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||    
T  17223881 aattattttatgattaagtgcttaattgagtaaataattaatt-gttcaaagttgttataattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcacgaa 17223979  T
Q  256 aatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatat 318  Q
      ||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  17223980 gttgtggataattgaattgttgtttgtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatat 17224042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 13352399 - 13352269
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  13352399 aaaagggttagaagggaga-aagcttgaagacccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgtagctttttctaggatta-ttgcttattgaggta 13352302  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatcaattaatt 146  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||    
T  13352301 agggggttagatttcaagcataatcacttaatt 13352269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 208 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 13377782 - 13377672
Alignment:
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 307  Q
    |||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  13377782 ttgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 13377683  T
Q  308 aaatgatatat 318  Q
    || ||||||||    
T  13377682 aagtgatatat 13377672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 138
Target Start/End: Original strand, 21537611 - 21537719
Alignment:
Q  30 gagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttc 128  Q
    |||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21537611 gagaaaagcttgaagaaccaagaggagctagagattctaggagcttaattgaagctttggctagggtta-ttgcttattgaggtaagggggttaaatttc 21537709  T
Q  129 aatcataatc 138  Q
    ||||||||||    
T  21537710 aatcataatc 21537719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 171 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 13275067 - 13274847
Alignment:
Q  171 taagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattg 269  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| || | || || |||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| || |||  || || ||||||    
T  13275067 taagtgcttaattgagtaattgattaatt-gttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcaagaagttgttggtaattg 13274969  T
Q  270 aattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatat-------attg--tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatca 360  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||| || |||       ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  13274968 aattgttgttagtaaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtggtatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattca 13274869  T
Q  361 tgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    || | ||| |||||||||||||    
T  13274868 tgatcaattgatgttgttgttg 13274847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 16384143 - 16384009
Alignment:
Q  4 caagagaaga-gaaaatggttagaagggagagaagcttgaagac-taagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttg 101  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16384143 caagagaagaagaaaagggttagaagagag-gagacttgaagacctaagaggtggtggagattctaggagctaaattgaagcttgggctaggatt-tttg 16384046  T
Q  102 ctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatc 138  Q
    ||||   |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16384045 ctaaccaaggtaagggggttagatttcaatcataatc 16384009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 297
Target Start/End: Original strand, 44304854 - 44305096
Alignment:
Q  57 tagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaat-tttt 155  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  44304854 tagagattttaggagcttacttgaagcttttgctaggattatt-gcttattgaagtaaaggggttagatttcaatcataatcatttagttgtaatctttt 44304952  T
Q  156 tattaattgcatgcttaagtgcttaattga-ttaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatg 253  Q
       |||||  |||| |||||||||| ||||  |||||||||||| ||  | || ||||| |||||||| |||| ||| |  ||||||||||   ||  ||    
T  44304953 ccctaattctatgcataagtgcttatttgagataagtgattattgtgaacttaattgttgaaattcgtactctagttgtagtgatatgtttcggtatgtg 44305052  T
Q  254 aaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 297  Q
    ||| || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  44305053 aaattgatgataattgaattgttgatgtagaaattgcatgttca 44305096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 321 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 14940876 - 14940807
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagaga 390  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  14940876 tgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaaatgatgttgttgttgttaagaga 14940807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 321 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 4446333 - 4446264
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagat 391  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  4446333 tgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatg-ttaattgatgttgttgttgataagagat 4446264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 321 - 387
Target Start/End: Original strand, 8267854 - 8267920
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgag 387  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  8267854 tgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagaattatgtttaattgatgatgttgttgttgag 8267920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 19070292 - 19070175
Alignment:
Q  34 gaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatc 132  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  19070292 gaagcttgaagaatcaagaggtgatagaaattctaggagttaaattgaagtttttgctaggatta-ttaccaattgaggtaagggggttagatttcattc 19070194  T
Q  133 ataatcaattaattgtaat 151  Q
    |||||  |||| |||||||    
T  19070193 ataatttattagttgtaat 19070175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 48 - 298
Target Start/End: Original strand, 15977681 - 15977933
Alignment:
Q  48 aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattg 147  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | || | ||||||||||||   ||| |||    
T  15977681 aagaggagttagagattctaggagcttaattgaagctttggctaggatta-ttgcttattgaagtaagggagatagatttcaatcataatattttagttg 15977779  T
Q  148 taattttttat-taattgcatgcttaagtgcttaattga-ttaagtgattattttgctctagttg-ttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgttt 244  Q
    ||  || || | |||||  || | |||||||||||||||  |||||||||||| ||  |||  || || |||||| |||||| ||| |  ||||||||||    
T  15977780 tagcttcttctctaattctatacataagtgcttaattgagataagtgattattatgaactaaatgtttgaaattcatgctctagttgtagtgatatgttt 15977879  T
Q  245 gaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 298  Q
    || ||  | ||  || ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  15977880 gagtatgttaatttgttgataattgaattattgatgatgaaattgcatgttcat 15977933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 139
Target Start/End: Original strand, 21675389 - 21675465
Alignment:
Q  62 attctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatca 139  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21675389 attctaggagctaaattgaagcttttgctaggatta-ttgcttattgatgtaagggggttagaattcaatcataatca 21675465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 208 - 304
Target Start/End: Original strand, 49047668 - 49047764
Alignment:
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 304  Q
    |||||| |||| ||||||   |||| |||| |||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  49047668 ttgttagaatttgtgctccaattataatgacatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 49047764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 9611428 - 9611367
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  9611428 tgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttg 9611367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 9839000 - 9838939
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  9839000 tgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttg 9838939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 15358908 - 15358855
Alignment:
Q  331 tatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgtt 384  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15358908 tatgttgttgttgaattgtgatgggaatcatgtttaattgatgttgttgttgtt 15358855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Original strand, 16915054 - 16915115
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  16915054 tgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttg 16915115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 16919680 - 16919619
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16919680 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcgtgtttaattgatgttgttgttg 16919619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 139
Target Start/End: Original strand, 39285978 - 39286101
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||| | |||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||    
T  39285978 aaaagggttagaagggagaaaa-cttgaagaaccaagaggagctacagattctaggagcttaattgaagctttggctagaatta-ttgctttttgaggta 39286075  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatca 139  Q
    ||||||| | | ||||| ||||||||    
T  39286076 agggggtaagatttcaagcataatca 39286101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 330 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 38424331 - 38424267
Alignment:
Q  330 ctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  38424331 ctatgttgttgttgaattatgatgagaattatgtttaagtgatgttgttgttgttaagagatatt 38424267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 15368459 - 15368400
Alignment:
Q  331 tatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagaga 390  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  15368459 tatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaaatgatgttgttgttgttaagaga 15368400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16919935 - 16919836
Alignment:
Q  57 tagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaatttttt 156  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |   || ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||    
T  16919935 tagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggggttaaaattcaatcataatcattttagtgtaatttttt 16919836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 28722231 - 28722169
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaa-tcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||    
T  28722231 tgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaattcatgtttaaatgaagttgttgttg 28722169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Original strand, 12248247 - 12248308
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  12248247 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaatggatgttgttgttg 12248308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16919778 - 16919689
Alignment:
Q  242 tttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| | |||| |||| ||||||||  |||||| ||||    
T  16919778 tttgaatgcatgaaattgttgataatcgaattgttattggtgaaatttcatgttcaaaatatgagaaagtgatatatgttgaattatgct 16919689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 48356765 - 48356704
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  48356765 tgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttg 48356704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 13377643 - 13377589
Alignment:
Q  328 tgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  13377643 tgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttg 13377589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 299
Target Start/End: Original strand, 13911028 - 13911112
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||| || || || |||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  13911028 aaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcata 13911112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 318
Target Start/End: Original strand, 26070264 - 26070368
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 313  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||  |||||  |   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||| |||||||     
T  26070264 aaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaaatgg 26070363  T
Q  314 tatat 318  Q
    |||||    
T  26070364 tatat 26070368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 318
Target Start/End: Original strand, 26094051 - 26094155
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 313  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||  |||||  |   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||| |||||||     
T  26094051 aaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaaatgg 26094150  T
Q  314 tatat 318  Q
    |||||    
T  26094151 tatat 26094155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 382
Target Start/End: Original strand, 9321181 - 9321223
Alignment:
Q  340 gttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  9321181 gttgaattgtgatgagaattatatttaattgatgttgttgttg 9321223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 331 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 14935471 - 14935421
Alignment:
Q  331 tatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgtt 381  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  14935471 tatgttgttgttgaattatgatgagaatcatttttaaatgatgttgttgtt 14935421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 331 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 15363064 - 15363014
Alignment:
Q  331 tatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgtt 381  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  15363064 tatgttgttgttgaattatgatgagaatcatttttaaatgatgttgttgtt 15363014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 2437705 - 2437621
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||  || || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  2437705 aaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaat-tgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcata 2437621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Original strand, 13863056 - 13863117
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||| | |||||||||||    
T  13863056 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgttgttgttgttg 13863117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Original strand, 17224064 - 17224125
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  17224064 tgaattatgctatgttgttgttgaattgttgtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttg 17224125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 295
Target Start/End: Original strand, 39291517 - 39291598
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgtt 295  Q
    |||||||||||| |||| |  |||||||||||| ||  | ||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  39291517 aaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgtt 39291598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Original strand, 49047800 - 49047861
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||    
T  49047800 tgaattatgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttg 49047861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 320 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3049705 - 3049641
Alignment:
Q  320 gtgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgtt 384  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||  ||||| | ||| |||||||||||||||    
T  3049705 gtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 3049641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 320 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3895147 - 3895083
Alignment:
Q  320 gtgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgtt 384  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||  ||||| | ||| |||||||||||||||    
T  3895147 gtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 3895083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 15 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25795 - 25476
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25795 aaaagggttagaagggagaaaagcttgaagactcaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagctttggctaggattagttgctaattgaggta 25696  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaatttttt-attaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgt 211  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25695 agggagttagagttcaaccataatcaattagttgtaattttttcattaattgcatgcttaagtgcttaattgagtaagtgattattttgctcttagttgt 25596  T
Q  212 taaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat 311  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25595 tgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgaaaattgaattgttgttggtgaaattgcctgttcatagtatgtgaaaat 25496  T
Q  312 gatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  25495 gatatattgtgaattgtgct 25476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 61)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 15 - 331
Target Start/End: Original strand, 17013437 - 17013756
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17013437 aaaagggttagaagggagaaaagcttgaagactcaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagctttggctaggattagttgctaattgaggta 17013536  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaatttttt-attaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgt 211  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17013537 agggagttagagttcaaccataatcaattagttgtaattttttcattaattgcatgcttaagtgcttaattgagtaagtgattattttgctcttagttgt 17013636  T
Q  212 taaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat 311  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17013637 tgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgaaaattgaattgttgttggtgaaattgcctgttcatagtatgtgaaaat 17013736  T
Q  312 gatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17013737 gatatattgtgaattgtgct 17013756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 35 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 19854583 - 19854203
Alignment:
Q  35 aagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatca 133  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19854583 aagcttgaagactcaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattaaggtaagggggttagagttcaatca 19854484  T
Q  134 taatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttat 232  Q
     ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  19854483 caatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgcttaagtgcttaattgagtaagtgattattttgctcttagctgttgaaattcgtgctcttgttat 19854384  T
Q  233 gatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattg------------ 320  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||                
T  19854383 gatgttatgtttgagtacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatggtatattgtgagttgtgctc 19854284  T
Q  321 -------tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  19854283 taaataatgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatatt 19854203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 34967329 - 34966915
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  34967329 gttcaagagaagaggaaaatggttagaagggagaaaagcttgaagacccaagaggtgatagagattctatgagctaaattgaagcttttgctaagattat 34967230  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattatt 198  Q
    | ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34967229 t-gcttattgaggtaagggggttagatttcaatcataatcacttagttgtaatttttccctaattgtatgcttaagtgcttaattgaataagtgattatt 34967131  T
Q  199 ttgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 297  Q
    || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34967130 tttctcttagttgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttcgtgaaattgcatgttca 34967031  T
Q  298 tagtatgtgaaaatgatatattgtgaattg-------------------tgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgtt 378  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||                   ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34967030 tagtatgtgaaaaagatatattgtgaattgtactctaattgttgaattatgctatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgtt 34966931  T
Q  379 gttgttgagagatatt 394  Q
    |||||| |||||||||    
T  34966930 gttgttaagagatatt 34966915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23223198 - 23222881
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  23223198 aaaagggttagaagggaga-aagcctaaagaaccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagcttttgctaggattatt-gcttattgaggta 23223101  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttat-taattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgt 211  Q
    |||| |||| | |||||||||||||| ||| ||||||| ||||   ||||   |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  23223100 agggtgttagatttcaatcataatcacttagttgtaatcttttccctaatcatatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttgcacttagttgt 23223001  T
Q  212 taaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat 311  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23223000 tgaaattcgtgctctttttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaat 23222901  T
Q  312 gatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23222900 gatatattgtgaattgtgct 23222881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 77 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 32352431 - 32352179
Alignment:
Q  77 ttgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtg 176  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32352431 ttgaagctttggctatgattatt-gctaattgaggcgaggaggttagatttcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgcttaagtg 32352333  T
Q  177 cttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgt 275  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32352332 cttaattgaataagtgattattttgctcatagttgttgaaattcatgctctttctatgatggtatatttgaatacatgaaattggtgataattgaattgt 32352233  T
Q  276 tgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtg 329  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32352232 ttatggtgaaattgtatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtg 32352179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 48 - 331
Target Start/End: Original strand, 22461931 - 22462214
Alignment:
Q  48 aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattg 147  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||| |||    
T  22461931 aagaggtgatagagattctaggagcaaaattgaagcttttgctaggattatt-gcttattgaggtaagggggttagatttcaataataatcacttagttg 22462029  T
Q  148 taattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttga 246  Q
    ||||||||   |||||| |||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| | || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22462030 taatttttccctaattgtatgcataagtgcttatttgaataagttattatttttcacttagttgttgaaattcgttctcttgttatgatgatatgtttga 22462129  T
Q  247 atacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  22462130 gtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaagtggtatattgtgaattttgct 22462214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 34 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23222345 - 23222046
Alignment:
Q  34 gaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatc 132  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23222345 gaagcttgaagaaccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagcttttgctaggattatt-gtttattgaggtaagggtgttaaatttcaatc 23222247  T
Q  133 ataatcaattaattgtaattttttat-taattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgtt 230  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||   |||||  |||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | || | | ||| ||||||||  |||||||    
T  23222246 ataatcacttagttgtaatcttttccctaattatatgcataagtgattaattgaataagtgattattttacacttaatagttgaaattcgtaatcttgtt 23222147  T
Q  231 atgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgc 330  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  23222146 atgatgatatgttagagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaatggtatattgtgaattatgc 23222047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 385
Target Start/End: Original strand, 18629398 - 18629798
Alignment:
Q  4 caagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttg 101  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||| ||||| ||||||| | |||| ||| || |||| ||| ||| |||| |||||||| |||||||| | | ||    
T  18629398 caagagaagaggaaaatggtttgagggga-agaagtttgaagattcaagaagtggtatagatcctaggaggtaaagtgaagcttgggctaggaatttgtg 18629496  T
Q  102 ctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttg 201  Q
    |||| | |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||| || |    
T  18629497 ctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagt-gtaattttttatttgttgtatgattaagtgtttaattgaataagtgattaatt-g 18629594  T
Q  202 ctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatag 300  Q
     || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18629595 ttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaag 18629694  T
Q  301 tatgtgaaaatgatatattg-------------------tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgtt 381  Q
    ||||||||| || |||||||                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18629695 tatgtgaaagtggtatattgtgaattatgctctgaatgttgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgtt 18629794  T
Q  382 gttg 385  Q
    ||||    
T  18629795 gttg 18629798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22848460 - 22848145
Alignment:
Q  14 gaaaatggttagaag-ggagagaagcttgaagac-taagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgagg 111  Q
    ||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| | ||||| || |||    
T  22848460 gaaaagggttagaagaggagaga--cttgaagacctaagaggtggtggtgattctaggagctaaattgaagcttggactaggatt-tgtgctatttaagg 22848364  T
Q  112 taagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctctagttgt 211  Q
    ||||||  ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| | |  |||||||    
T  22848363 taagggaattagaattcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgtttaagtgcttagttgaataattgattattgttca-tagttgt 22848265  T
Q  212 taaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat 311  Q
    | ||||||||||  |  |||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22848264 tgaaattcgtgcattaattatgatgatatgtttaaatgcaagaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcatagtatgtgaaaat 22848165  T
Q  312 gatatattgtgaattgtgct 331  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  22848164 gttatattgtgaattgtgct 22848145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 88 - 328
Target Start/End: Original strand, 31467470 - 31467712
Alignment:
Q  88 gctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttat-taattgcatgcttaagtgcttaattgat 186  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||     
T  31467470 gctaggatt-tttgctaactaaggtaagggggttagatttcaatcataatcacttagttgtaatttttttcctaattgtatgcttaagtgcttaattgaa 31467568  T
Q  187 taagtgattattttgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaa 285  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  31467569 taagtgattattttgctcttagttgttgaaattcatgctcttattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttaatgaa 31467668  T
Q  286 attgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattgt 328  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| | |||||||||||||||    
T  31467669 attgcatgttcatggtatgtataaatgggtatattgtgaattgt 31467712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 33 - 331
Target Start/End: Original strand, 17083018 - 17083314
Alignment:
Q  33 agaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaat 131  Q
    ||||||||||||| | ||||  || ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | |||| |    
T  17083018 agaagcttgaagatttaagaattggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttcggctaggattaattgctaactaaggtaagggggttagaattcatt 17083117  T
Q  132 cataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgtt 230  Q
      |||||| ||| | ||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| || | || |||||||||| |||||||||||  ||    
T  17083118 t-taatcatttagt-gtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgaataagtgattaatt-gttcatagttgttaatattcgtgctctaatt 17083214  T
Q  231 atgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgc 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17083215 atgatgatatgtttgaatgcatgaat-tggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtgaaaatgatatatgttgaattgtgc 17083313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 378
Target Start/End: Original strand, 33538205 - 33538552
Alignment:
Q  48 aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattg 147  Q
    |||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| | | ||| || | |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | |    
T  33538205 aagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgcgaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagt-g 33538303  T
Q  148 taattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttga 246  Q
    |||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||   |||| |||||| |||||    
T  33538304 taatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagtaagtgattaatt-gttcatagttgttaaaattcgtgctctaactatggtgatatatttga 33538402  T
Q  247 atacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattg-------------------tgaattg 327  Q
    || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||                   |||||||    
T  33538403 atgcatgaaattggtga-aattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgatatgttgtgaattatgctctaaaggttgaattg 33538501  T
Q  328 tgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgtt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33538502 tgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgtt 33538552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 126 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 29605785 - 29605580
Alignment:
Q  126 ttcaatcataatcaattaa-ttgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgc 223  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  29605785 ttcaaccataatcaattaagttgtaatttctcattaaatgcatgattaagtgcttaattgaataagtgattattt-gttcatagttgttgaaattcgtgc 29605687  T
Q  224 tcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtga 323  Q
    |||  ||||| |||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29605686 tctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaat-tagtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcatagtatgtgaaaatgaaatattgtga 29605588  T
Q  324 attgtgct 331  Q
    ||||||||    
T  29605587 attgtgct 29605580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 64 - 333
Target Start/End: Original strand, 17556871 - 17557136
Alignment:
Q  64 tctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaatt 163  Q
    |||| ||| |||| |||||||| |||||||||| |  ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||  || | ||||||||| |||||||    
T  17556871 tctaggagataaagtgaagcttaggctaggatt-tgagctaattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatctagt-gtaatttttcattaatt 17556968  T
Q  164 gcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtg 262  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  17556969 gcattattaagtgcttaattgaataattgattattt-gttcatagttgttaaa-ttcgtgctctaattatgatgatatgtttga-tgcatgaaattggtg 17557065  T
Q  263 ataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||  |||||| ||||||    
T  17557066 ataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgttatatgttgaattatgctat 17557136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 29158170 - 29158426
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||| | ||||    
T  29158170 gttcaagagaagaggaaaagggttagaaggaaga-aagcttgaagaaccaagaggtggtagagattctaggagataaattgaagtttttgctatggttat 29158268  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattatt 198  Q
    | | | ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||| ||| || ||||||||   |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  29158269 t-gtttattgaagtaagagggttagatttcaatcataatcatttagttctaatttttccctaattgtatgcttaagtgcttatttgaataagtgattatt 29158367  T
Q  199 ttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaa 256  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29158368 ttgctcttagttgttgatattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaa 29158426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16136676 - 16136373
Alignment:
Q  48 aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattg 147  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| | |||||| ||||||  ||| ||     
T  16136676 aagaggagctagagattctaggagcttaattgaagcttttgctaggattatt-gcttattgaggtaagggagttagatttcaatgataatctcttagtt- 16136579  T
Q  148 taattttttat-taattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttg 245  Q
    || |||  |   |||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16136578 tagtttcatccctaattctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttgcacttagttgttgaaattcgtgctcttgttatgataatatgtttg 16136479  T
Q  246 aatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattgtgctatgttattgttga 344  Q
    |||| |||||| || |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||  |||||  | || | |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16136478 aatatatgaaattgatgataattgaatagtttttgatgaaattgcatgttcatgatatgtatagatgggtatattgtaaattgtgctatgttgttgttga 16136379  T
Q  345 attgtg 350  Q
     |||||    
T  16136378 tttgtg 16136373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21931643 - 21931333
Alignment:
Q  22 ttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggt 120  Q
    |||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  21931643 ttagaagggaga-aagcgtgaagaaccaagaggtgatagatattctaggagctaaattgaagcttttgctaggattatt-gcttactgaggtaagggggt 21931546  T
Q  121 taaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttat-taattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgttaaaatt 218  Q
    || | |||||||||||||   || || || ||| ||   |||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||  ||| |||||    
T  21931545 tagatttcaatcataatctcctagtt-tagtttcttccctaattctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttgcacttagaagttgaaatt 21931447  T
Q  219 cgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatata 317  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||| | ||||    
T  21931446 tgtactcttgttaagatgatatgtttgaatatatgaaattgatgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcatgatatgtataaatgggtata 21931347  T
Q  318 ttgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||| ||||    
T  21931346 ttgtgaattatgct 21931333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 19175597 - 19175280
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| ||||||||| |||| || |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  19175597 aaaagggttagaagagagaaaa-cttgaagaaccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagcttttgctaggattatt-gcttattgaggta 19175500  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttat-taattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgt 211  Q
    ||||| ||| | |||| ||||||||  | | || || ||| ||   |||||  |||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||  | ||||||    
T  19175499 aggggattagatttcattcataatctctcagtt-tagtttcttccctaattctatgcatatgtgcttatttgaaaaagtgattattttgcagttagttgt 19175401  T
Q  212 taaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat 311  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||  ||||    
T  19175400 tgaaatttgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtatataaaattgatgataattgaattgttgttgataaaattgcatgttcatgatatgtataaat 19175301  T
Q  312 ga-tatattgtgaattgtgct 331  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  19175300 gagtatattgtgaattgtgct 19175280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 101 - 256
Target Start/End: Original strand, 14856614 - 14856770
Alignment:
Q  101 gctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattatttt 200  Q
    ||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  14856614 gctaattaaggtaatggggttagaattcaatcataatcaattagttgtaatttttccttaattgcatgtttgagtgtttaattgaataagtgattatttt 14856713  T
Q  201 gctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaa 256  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  14856714 gctcatagttgttgaaatttgtgctcttgttacgacgatatgtttgaatacaagaaa 14856770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 220 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 19672527 - 19672416
Alignment:
Q  220 gtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatatt 319  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19672527 gtgctcttattatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttaatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaatgatatatt 19672428  T
Q  320 gtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||||||    
T  19672427 gtgaattgtgct 19672416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 58 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21623571 - 21623298
Alignment:
Q  58 agagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaatttttta 157  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |   || ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| || | |||||||| | |    
T  21623571 agagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttctca 21623472  T
Q  158 ttaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaa 256  Q
     |  ||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||| || | || ||  ||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||||     
T  21623471 attgttgtatgaataagtgcttaattgagtaattgattaatt-gttcataaatgttagaattcgtgctccaattatgatggtatgtttgaatgcatgaag 21623373  T
Q  257 atggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||  |||||| ||||    
T  21623372 ttgttgataattgaattgttgttgctgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaattatgct 21623298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Original strand, 22585339 - 22585638
Alignment:
Q  1 gttcaagagaaga-gaaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  22585339 gttcaagagaagatgaaaagggttagaagggagaaaa-cttgaagacccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagtttttgctaggatta- 22585436  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttat---taattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgatt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| |  || ||| || |   |  ||  |||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  22585437 ttgctaattgaggtaagggggttagatttcaagcataatcacttagt--tagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgatt 22585534  T
Q  196 attttg-ctctagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgt 294  Q
    ||||||   | | |  || |||||||||||| |||| |  |||||||||||| ||  | ||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  22585535 attttgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtattttaatttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgt 22585634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Original strand, 22590170 - 22590469
Alignment:
Q  1 gttcaagagaaga-gaaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  22590170 gttcaagagaagatgaaaagggttagaagggagaaaa-cttgaagacccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagtttttgctaggatta- 22590267  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttat---taattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgatt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| |  || ||| || |   |  ||  |||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  22590268 ttgctaattgaggtaagggggttagatttcaagcataatcacttagt--tagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgatt 22590365  T
Q  196 attttg-ctctagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgt 294  Q
    ||||||   | | |  || |||||||||||| |||| |  |||||||||||| ||  | ||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  22590366 attttgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtattttaatttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgt 22590465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 15889499 - 15889637
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatgg-ttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||    
T  15889499 gttcaagagaagagaaaaagggttagaagggaga-aagcttgaagacccaagatgtgatagagattctatgagctaaattgaagcttttgcaagaattat 15889597  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatca 139  Q
    | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  15889598 t-gctaattgaggtaagggggttagatttcaatcataatca 15889637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 309
Target Start/End: Original strand, 22361611 - 22361860
Alignment:
Q  58 agagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaatttttta 157  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||| | |||||| |   || ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| || |  ||||||||| |    
T  22361611 agagatcctaggagctaaagtgaagcttggcctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttta--gtaatttttca 22361708  T
Q  158 ttaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaa 256  Q
     |  ||| |||  |||||||||||||||  || |||||| || | || ||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22361709 attgttgtatgaataagtgcttaattgagcaaatgattaatt-gttcatagatgataaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaa 22361807  T
Q  257 atggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaa 309  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  22361808 ttgttgataattgaattgttgttgctgaaatttcatgttcaaagtatgagaaa 22361860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 15004701 - 15004838
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||| ||     
T  15004701 gttcaagagaagaggaaaatggttagaagggaga-aagcttgaagacccaagaggtgatagagattttaggagctaaattgaagtttttgctagga-taa 15004798  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatca 139  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  15004799 ttgctaattgaggtaa-ggggttaaatttcaagcataatca 15004838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 258 - 394
Target Start/End: Original strand, 29160347 - 29160502
Alignment:
Q  258 tggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattg-------------------tgaattgtgctatgttat 338  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||                   |||||||||||||||| |    
T  29160347 tggtgataattgaattgttgttagtgaaattgcatgttcatggtatgtgaaaatgatatattgtgagttgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgt 29160446  T
Q  339 tgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  29160447 tgttgatttgcgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 29160502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 237 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25651461 - 25651367
Alignment:
Q  237 atatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||  |||||| ||||    
T  25651461 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgttatatgttgaattatgct 25651367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 206 - 331
Target Start/End: Original strand, 18381675 - 18381800
Alignment:
Q  206 agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgt 305  Q
    |||||||| |||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  18381675 agttgttataatttgtgctctaattatgatgatatttttgaatacatgaagttgttgataattgaatggttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatga 18381774  T
Q  306 gaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    |||| ||||||||  |||||| ||||    
T  18381775 gaaagtgatatatgttgaattatgct 18381800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 229 - 331
Target Start/End: Original strand, 28195108 - 28195210
Alignment:
Q  229 ttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgt 328  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||  || ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||    
T  28195108 ttatgatgatatgtttgaatgtatgaagttgttgataattgaattgttgttagtaaaatttcatgttcatagtatgagaaaatggtatatgatgaaatgt 28195207  T
Q  329 gct 331  Q
    |||    
T  28195208 gct 28195210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Original strand, 17083323 - 17083384
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  17083323 tgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttg 17083384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 297
Target Start/End: Original strand, 16887787 - 16887875
Alignment:
Q  209 tgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 297  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| ||||||||| || ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16887787 tgttaaaattcgtgctctaactatgataatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaactgttgttggtgaatttgcatgttca 16887875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 208 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18399191 - 18399088
Alignment:
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 307  Q
    |||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||| ||    
T  18399191 ttgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgaga 18399092  T
Q  308 aaat 311  Q
    ||||    
T  18399091 aaat 18399088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 33324944 - 33324857
Alignment:
Q  209 tgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 297  Q
    ||||||||||||||||||   || ||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33324944 tgttaaaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaaattgttgataattgaattgttgtt-gtgaatttgcatgttca 33324857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 297
Target Start/End: Original strand, 35136008 - 35136095
Alignment:
Q  209 tgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 297  Q
    ||||||||||||||||||   || ||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  35136008 tgttaaaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgtt-gtgaatttgcatgttca 35136095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 331 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 32352158 - 32352103
Alignment:
Q  331 tatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttga 386  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32352158 tatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttga 32352103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 18733318 - 18733229
Alignment:
Q  48 aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatc 138  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||| || || |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  18733318 aagaggagctagagattctaggagcttaattgaagcctttgctaggatta-ttccttattgaggtaagggggttagatttcaatcataatc 18733229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 138
Target Start/End: Original strand, 17374772 - 17374851
Alignment:
Q  57 tagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatc 138  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  17374772 tagagattctatgagcttaattgaagctttggctaggatta-ttgtttattgaggtaa-ggggttagatttcaatcataatc 17374851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 18399059 - 18398998
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  18399059 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttg 18398998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 25651358 - 25651297
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  25651358 tgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttg 25651297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 29605571 - 29605510
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  29605571 tgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgtgaatcatgcttaattgatgttgttgttg 29605510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 384
Target Start/End: Original strand, 35009579 - 35009643
Alignment:
Q  320 gtgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgtt 384  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  35009579 gtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgtt 35009643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 15740482 - 15740372
Alignment:
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 307  Q
    |||||| | |||||||||   |||||||| |||||||| ||  | |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||| ||||| | |    
T  15740482 ttgttagatttcgtgctccaattatgatgctatgtttgtatgtaagaaattggtgataattgattggttgttggtgaaattgaatgatcaaagtatataa 15740383  T
Q  308 aaatgatatat 318  Q
    |||||||||||    
T  15740382 aaatgatatat 15740372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 394
Target Start/End: Original strand, 17013765 - 17013839
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatg-ttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| || ||| |||||    
T  17013765 tgaattgtgctatgttcttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgattgttgttattaagaaatatt 17013839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 48 - 138
Target Start/End: Original strand, 17856292 - 17856380
Alignment:
Q  48 aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatc 138  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||| ||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  17856292 aagaggtgatagagattctaggagcttaattgaagtttttgttaggatta-ttgtttattgaggt-agggggttagatttcaatcataatc 17856380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Original strand, 22361891 - 22361952
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||    
T  22361891 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgaaattcatgttcaattgatgttgttgttg 22361952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Original strand, 25367363 - 25367424
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  25367363 tgaattgtgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttg 25367424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 382
Target Start/End: Original strand, 17557149 - 17557203
Alignment:
Q  328 tgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||    
T  17557149 tgctatgttgttgttgaattgtgattataatcatatttaattgatgttgttgttg 17557203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23222863 - 23222809
Alignment:
Q  330 ctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgtt 384  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23222863 ctatgttgttgtttatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgtt 23222809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 315
Target Start/End: Original strand, 14626134 - 14626233
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 313  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||| || || ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  14626134 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatga 14626231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 21623289 - 21623228
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||  || |||||||||||||    
T  21623289 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagaatcatgttctattgatgttgttgttg 21623228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23222027 - 23221974
Alignment:
Q  331 tatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgtt 384  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23222027 tatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatattgttgttgtt 23221974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 325 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 25919730 - 25919673
Alignment:
Q  325 ttgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  25919730 ttgtgatatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttg 25919673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 394
Target Start/End: Original strand, 22462247 - 22462295
Alignment:
Q  346 ttgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  22462247 ttgtgatgagattcatgtttaaatgatgttgttgttgttaagagatatt 22462295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25654551 - 25654350
Alignment:
Q  33 agaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaat 131  Q
    ||||||||||||| | |||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||| |||  ||||||| | | |||||||| |||||||||||||| | ||   |    
T  25654551 agaagcttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaaacttgcgctaggaatctgtgctaattaaggtaagggggttagaatt-tgt 25654453  T
Q  132 cataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgtt 230  Q
      ||||| ||| | |||||||||| | | |||| ||| |||||||||||||||| || |||||||  ||| ||  |||||||||||||||||||||  ||    
T  25654452 gctaatc-atttagtgtaatttttcaattattgtatgattaagtgcttaattgagtaggtgatta-attgttcagagttgttaaaattcgtgctctaatt 25654355  T
Q  231 atgat 235  Q
    |||||    
T  25654354 atgat 25654350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 388
Target Start/End: Original strand, 32276897 - 32276965
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgttt-aatggatgttgttgttgttgaga 388  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  32276897 tgaattgtgacatgttattgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgaga 32276965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 382
Target Start/End: Original strand, 18381821 - 18381870
Alignment:
Q  333 tgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  18381821 tgttgttgttgaattgtgataagagtcatgttcaattgatgttgttgttg 18381870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 298
Target Start/End: Original strand, 15889714 - 15889798
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 298  Q
    |||||||||||| |||| |  |||||||||||| ||  | ||  || |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  15889714 aaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgatttgttgatgatgaaattgcatgttcat 15889798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 320 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18777268 - 18777204
Alignment:
Q  320 gtgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgtt 384  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||    
T  18777268 gtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatgaatgttgttgttgtt 18777204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 19629452 - 19629384
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatg-tttaatggatgttgttgttgttgaga 388  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||    
T  19629452 tgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagatttaattgatgttgttgttgctgaga 19629384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 32352470 - 32352426
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaag 44  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32352470 gttcaagagaataggaaaatggttagaagggagaaaagcttgaag 32352426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 49)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 13442462 - 13442866
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatt 99  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442462 gttcaagagaagagaaaaggattagaagggagaaaaacttgaaaactcaagagatgataaagattctaggagctaaattgaagctttggctaggattatt 13442561  T
Q  100 tgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattt 199  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13442562 tactaattgaggtaagggggttagagttcaatcataatcaattagttgtaattttt-attaattgcatgcttaagtgcttaattgagtaagtgattattt 13442660  T
Q  200 tgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 298  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13442661 tgctcttagttgttgaaattcgtgctcttgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgtttgtgaaattgcatgttcat 13442760  T
Q  299 agtatgtgaaaatgatatattg-------------------tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttg 379  Q
    |||||||||||||| |||||||                   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13442761 agtatgtgaaaatgttatattgtgaattatgctctaaatgttgaattgtgttatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttg 13442860  T
Q  380 ttgttg 385  Q
    ||||||    
T  13442861 ttgttg 13442866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 54398844 - 54398431
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  54398844 gttcaagagaagagaaaagggttagaagggagaaaagcttgaagacccaagaggtgatagagattctatgagctaaattgaagtttttgctaggattatt 54398745  T
Q  100 tgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattt 199  Q
     |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  54398744 -gctaattgaggtaagggggttagatctcaatcataatcacttagttgtaatttttctctaattgtatgcttaagtgcttaattgaataagggattattt 54398646  T
Q  200 tgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 298  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54398645 tgctcttagtttttgaaattcgtgctcttgttatgttgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcat 54398546  T
Q  299 agtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgc-------------------tatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttg 379  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||                   |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54398545 agtatatgaaaataatatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgttatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttg 54398446  T
Q  380 ttgttgagagatatt 394  Q
    ||||| |||||||||    
T  54398445 ttgttaagagatatt 54398431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 15 - 328
Target Start/End: Original strand, 40904733 - 40905048
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  40904733 aaaagggttagaagggagagaagcttgaagactcaagaggtgatagagaatctaggagctaaattgaagctttgactaggattatttgctacttcaggta 40904832  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgtt 212  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  40904833 agggggttagatttcaaccataatcaattagttgtaatttttcaataattgcatggttaagtgcttaattgaataaatgattactttgttcatagttgtt 40904932  T
Q  213 aaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatg 312  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40904933 gaaattcgtgctctagttatgatgatatgtttgaatacatgaaattgctgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatg 40905032  T
Q  313 atatattgtgaattgt 328  Q
    ||  ||||||||||||    
T  40905033 atgcattgtgaattgt 40905048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Original strand, 50219729 - 50220139
Alignment:
Q  1 gttcaagagaaga-gaaaatggttagaagggagagaagcttgaagac-taagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  50219729 gttcaagagaagatgaaaagggttagaagggaga-aagcttgaagacctaagaggtgatatagattctaggagttaaattgaagtttttgctaggattat 50219827  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattatt 198  Q
    | | |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50219828 t-gttaattgaggtaagggggttagatttcgatcataatcaattagttgtaatttttccctaattgtatgcttaagtgcttaattgaataagtgattatt 50219926  T
Q  199 ttgctctagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 298  Q
    ||| |  ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50219927 ttgtt--agttgttgaaatttgtgctcttgttacgatgatatgtttgagtacatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 50220024  T
Q  299 agtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctat-------------------gttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |                   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50220025 agtatgtgaaaatgatatattttgaattgtgctctaaatgttgaattgtgttgtgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttg 50220124  T
Q  380 ttgttgagagatatt 394  Q
    ||||| |||||||||    
T  50220125 ttgttaagagatatt 50220139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 382
Target Start/End: Original strand, 47468134 - 47468535
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  47468134 gttcaagagaagaggaaaagggttagaagggata-aagcttgaagacccaagaggtaatagagattgtaggagctaaattgaaacttttgctaggattat 47468232  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattatt 198  Q
    | ||| |||||||||||  ||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47468233 t-gcttattgaggtaagatggttagatttcaaccataatcaattagttgtaattttcccctaattgcatgcttaagtgcttaattgaataagtgattatt 47468331  T
Q  199 ttgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 297  Q
    ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47468332 ttgctcttagctgttgtaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttca 47468431  T
Q  298 tagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct-------------------atgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgtt 378  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||                   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47468432 tagtatgtgaaaatgatatagtgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgttatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgtt 47468531  T
Q  379 gttg 382  Q
    ||||    
T  47468532 gttg 47468535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 133 - 394
Target Start/End: Original strand, 18238075 - 18238356
Alignment:
Q  133 ataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgtta 231  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18238075 ataatcaattagttgtaatttttccttaattgtatgcttaagtgcttaattgaataggtgattattttgctcttagttgttgaaattcgtgctcttgtta 18238174  T
Q  232 tgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattg----------- 320  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  18238175 tgatgatatgtttgaatacatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 18238274  T
Q  321 --------tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
            |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18238275 ctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 18238356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Original strand, 41916529 - 41916925
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatt 99  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| | ||||||||||    
T  41916529 gttcaagagaagagaaaaggaatagaagggagaaaagtttgaagacccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaaatttttgttaggattatt 41916628  T
Q  100 tgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattt 199  Q
     |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||                |||    
T  41916629 -gctaattgaggtaagggg-ttagatttcaatcataatcaattagttgtaattttttcctaattgtatgcttaagtgctta----------------ttt 41916710  T
Q  200 tgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 298  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41916711 tgctcttagttgttgaaattcgtactcttgttatgatgatatgtttgaatacataaaattggtgataatataattgttgttggtgaaattgcatgttcat 41916810  T
Q  299 agtatgtgaaaatgatatattg-------------------tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttg 379  Q
    |||||||||| |||||||||||                   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  41916811 agtatgtgaagatgatatattgtgagttgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaactgatgttgttg 41916910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Original strand, 13589857 - 13590273
Alignment:
Q  1 gttcaagagaag-agaaaatgg-ttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggatta 97  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13589857 gttcaagagaaggagcaaatgggttagaagggaga-aagcttgaagaaccaagaggtgataaagattcgaggagctaaattgaagcttttgctaggatta 13589955  T
Q  98 tttgctaattgaggtaaggggg-ttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttat-taattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgatt 195  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||| ||||||| ||||   |||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  13589956 tt-gcttattgaggtaaggggggttagatttcaatcataatcacttagttgtaatattttccctaattatatgcataagtgcttatttgaataagtgatt 13590054  T
Q  196 attttgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgt 294  Q
    ||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  13590055 attttgcacttaattgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgggtacatgaaattggtgataattcaattgatgttgatgaaactgcatgt 13590154  T
Q  295 tcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaa-------------------ttgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgtt 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||                   |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13590155 tcataatatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgtt 13590254  T
Q  376 gttgttgttgagagatatt 394  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  13590255 gttgttgttaagagatatt 13590273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 38765165 - 38764839
Alignment:
Q  4 caagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaagac-taagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttg 101  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| || ||||| |||| | ||    
T  38765165 caagagaagagcaaaaaggttagaagaga-agagacttgaagacctaagaggtggtggtgattctaggagctaaattgaagtttgggctatgatt-tgtg 38765068  T
Q  102 ctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttg 201  Q
    |||||| ||||||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||||||     
T  38765067 ctaattaaggtaagagggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgataaagtgcttagttgaataattgattattttt 38764968  T
Q  202 ctctagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagt 301  Q
    |  |||||||| ||||||||||| |  |||||  |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38764967 ca-tagttgttgaaattcgtgctttaattatggggatatgtttgaatgaatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcatagt 38764869  T
Q  302 atgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38764868 atgtgaaaatgttatattgtgaattgtgct 38764839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 38 - 394
Target Start/End: Original strand, 41256194 - 41256568
Alignment:
Q  38 cttgaagac-taagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataa 136  Q
    ||||||||| ||||||||| |  |||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||| | || ||| | |||||||||||||| | |||||||||||    
T  41256194 cttgaagacctaagaggtggtgaagattctaggagttaaattaaagcttgggctaggatt-tgtgttaactaaggtaagggggttagaattcaatcataa 41256292  T
Q  137 tcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgat 235  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| || | || |||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  41256293 tcatttagttgtaatttttcatttgttgtatgtttaagtgcttaattgaataagtgattaatt-gttcatagttgttgaaattcgtgctctaattatgat 41256391  T
Q  236 gatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattg--------------- 320  Q
    || ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
T  41256392 gaaatgtt-gaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattatgctcaaa 41256490  T
Q  321 ----tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
        |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  41256491 ttgttgaattgtgctaggttgttgttgaattgtgatgagaaccatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 41256568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 394
Target Start/End: Original strand, 15013074 - 15013481
Alignment:
Q  4 caagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaagac-taagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttg 101  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||| | ||    
T  15013074 caagagaagaggaaaagggttagaagagag-gagacttgaagacctaagaggtggtgaagattctaggagctaaagtgaagcttgagctaggatt-tgtg 15013171  T
Q  102 ctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttg 201  Q
    |||| | |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||  |||  ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| || |    
T  15013172 ctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagttgtaattttc-atttgttgtatgtttaagtgcttaattgaataagtgattaatt-g 15013269  T
Q  202 ctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatag 300  Q
     || |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15013270 ttcatagttgtttaaattcgtgctctaattatgatgatatgtt-gaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatag 15013368  T
Q  301 tatgtgaaaatgatatattg-------------------tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgtt 381  Q
    ||||||||||||| ||||||                   |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15013369 tatgtgaaaatgacatattgtgaattatgctcaaattgttgaattgtgctaggttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatattgttgtt 15013468  T
Q  382 gttgagagatatt 394  Q
    ||| |||||||||    
T  15013469 gttaagagatatt 15013481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 69 - 394
Target Start/End: Original strand, 7185701 - 7186043
Alignment:
Q  69 gagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatg 168  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| | | |||||||| |||||||| ||||| | |||| ||||||||| ||| | ||||||||| |||  ||| |||    
T  7185701 gagctaaagtgaagtttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaaggaggttagaattca-tcataatcatttagt-gtaatttttcatttgttgtatg 7185798  T
Q  169 cttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataat 267  Q
     |||||||||||||||| |||||||||| || | || |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  7185799 attaagtgcttaattgaataagtgattaatt-gttcatagttgttaaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattagtgataat 7185897  T
Q  268 tgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatata--ttg-----------------tgaattgtgctatgttattgttgaattg 348  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||                 |||||||||||||||| |||||||||||    
T  7185898 tgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtgaaaatgatatatgttgaattgtgcactaaatgatgaattgtgctatgttgttgttgaattg 7185997  T
Q  349 tgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  7185998 tgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatatt 7186043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Original strand, 7964502 - 7964828
Alignment:
Q  4 caagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttg 101  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| | || ||||||||||||| | |||| ||| ||||||| ||| |||||||| ||||| || ||| |||| | | ||    
T  7964502 caagagaagaggaaaagggttagaggaga-agaagcttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaagtttgggcaaggaatttgtg 7964600  T
Q  102 ctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttg 201  Q
    |||| | |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | ||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||||| || || |    
T  7964601 ctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagt-gtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagtaagtgagtaatt-g 7964698  T
Q  202 ctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatag 300  Q
     || ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7964699 ttcatagttgttaaaatccgtgctctaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca-ag 7964797  T
Q  301 tatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||| || |||||  |||||| ||||    
T  7964798 tatgtgaaagtgttatatgttgaattatgct 7964828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 28428212 - 28428029
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatt 99  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| || |||||||||  |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  28428212 gttcaagagaagatagaagggttagaagggagaaaaacttgaagacccaagaggtgatggagattctaggagttaaattgaagttttagctaggattatt 28428113  T
Q  100 tgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaatt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  28428112 tgctaattgaggtaagggggttagagttcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatatttaagtgcttaatt 28428029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 33 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18276861 - 18276564
Alignment:
Q  33 agaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaat 131  Q
    ||||||||||||| | |||| ||| || |||| ||| |||||||| ||||||||  ||||||| | | | |||||| |||||| ||||||| | ||||||    
T  18276861 agaagcttgaagattcaagaagtggtacagatcctaggagctaaagtgaagcttgagctaggaat-tgtactaattaaggtaacggggttagaattcaat 18276763  T
Q  132 cataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgtt 230  Q
    |||||||| ||| | |  |||||| | | |||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| || | || ||||||||||||||||||||||   |    
T  18276762 cataatcatttagt-gcgatttttcaattattgtatgattaagtgcttaattgagtatgtgattaatt-gttcatagttgttaaaattcgtgctctaaat 18276665  T
Q  231 atgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgc 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||  |||||| |||    
T  18276664 atgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattaaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagcatgtgaaagtgttatatgttgaattatgc 18276565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 10237053 - 10237190
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  10237053 gttcaagagaagaggaaaatggttagaagggagaaaagcttgaagactcaagaggtgatagagattctaggacctaaattgaagcttttgctaggatt-t 10237151  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  10237152 ttgctaattgaggtaagggggttagatttcaatcataat 10237190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 18235985 - 18236122
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  18235985 gttcaagagaagaggaaaagggttagaagggagaaaagcttgcagacccaagacgtgatagagattctagaagctaaattgaagcttttgctaggatt-t 18236083  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18236084 ttgctaattgaggtaagggggttagatttcaatcataat 18236122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19559822 - 19559679
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttgg-ctaggatta 97  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||    
T  19559822 gttcaagagaagaggaaaagggttagaagggaga-aagcttgaagactcaagagatgatagagattctaagaggtaaattgaagcttttttctaggatta 19559724  T
Q  98 tttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaatta 143  Q
    || |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  19559723 tt-gctaattgaggtaagggggttagatttcaagcataatcaatta 19559679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 318
Target Start/End: Original strand, 47535063 - 47535169
Alignment:
Q  212 taaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat 311  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| |    
T  47535063 taaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcaagttcaaagtatgagaaagt 47535162  T
Q  312 gatatat 318  Q
    |||||||    
T  47535163 gatatat 47535169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 138
Target Start/End: Original strand, 12133409 - 12133531
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||||| | || |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  12133409 aaaagggttagaagggataaaa-cttgaagaaccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagcttttgctaggatta-ttgcttattgaggta 12133506  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatc 138  Q
    ||||||||| | |||||||||||||    
T  12133507 agggggttagatttcaatcataatc 12133531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 171 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15045118 - 15044958
Alignment:
Q  171 taagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattg 269  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| || | || || |||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||    
T  15045118 taagtgcttaattgagtaattgattaatt-gttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattg 15045020  T
Q  270 aattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||  |||||| ||||    
T  15045019 aattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaattatgct 15044958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 318
Target Start/End: Original strand, 13809407 - 13809614
Alignment:
Q  109 aggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tag 207  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| |||  |||||| | | |||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||| || | || ||     
T  13809407 aggtaagggggttagaattca-tcataatcattta-ttgccatttttcaattattgtatgaataagtgcttaattgagtaattgattaatt-gttcataa 13809503  T
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 307  Q
    |||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||    
T  13809504 ttgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgagatttcatgttcaaagtatgaga 13809603  T
Q  308 aaatgatatat 318  Q
    ||||| |||||    
T  13809604 aaatggtatat 13809614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 14901582 - 14901375
Alignment:
Q  109 aggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tag 207  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||| ||||||| | | |||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||| || | || ||     
T  14901582 aggtaagggggttaaatttca-tcataatcattttattgcaatttttcaattattgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcatat 14901485  T
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 307  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||  |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||    
T  14901484 ttgttataattcgtgctctaattatgacaatatgtttgaatgtatgaaattgttgaaaattga-ttgttgttggtgaaatttcatgtttgaagtatgaga 14901386  T
Q  308 aaatgatatat 318  Q
    || ||||||||    
T  14901385 aagtgatatat 14901375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 229 - 318
Target Start/End: Original strand, 15109364 - 15109453
Alignment:
Q  229 ttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatat 318  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  15109364 ttatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatat 15109453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 49072130 - 49072008
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||    
T  49072130 aaaagggttagaagggaga-aagcttgaagaaccaagaggtgttagagattctaggagcttaattgaagcttttgctacgatta-ttgcttattgaggta 49072033  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatc 138  Q
     |||||||| | ||||| |||||||    
T  49072032 ggggggttagatttcaagcataatc 49072008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 321 - 394
Target Start/End: Original strand, 40905060 - 40905132
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  40905060 tgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatg-ttaattgatgttgttgttgctaagagatatt 40905132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 208 - 331
Target Start/End: Original strand, 41165940 - 41166063
Alignment:
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 307  Q
    |||||| |||| ||||||   ||||||| |||| ||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||    
T  41165940 ttgttagaatttgtgctccaattatgataatatatttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 41166039  T
Q  308 aaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    || ||||||||  |||||| ||||    
T  41166040 aagtgatatatgttgaattatgct 41166063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Original strand, 7964837 - 7964898
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  7964837 tgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgattttgttgttg 7964898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 122
Target Start/End: Original strand, 15213460 - 15213531
Alignment:
Q  49 agaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggtta 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15213460 agaggtgatagagattctaggagctaaattgaagcttt-tctaggatta-ttgcttattgaggtaagggggtta 15213531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 99
Target Start/End: Original strand, 54363093 - 54363177
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatt 99  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54363093 aaaagggttagaaggggga-aagcttgaagaaccaagaggtgatagagattttaggagctaaattgaagcttttgctaggattatt 54363177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 214 - 318
Target Start/End: Original strand, 52265508 - 52265612
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 313  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||| |||||| |||| ||     
T  52265508 aaattcgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaattttatgttcaaagtatgagaaagtgg 52265607  T
Q  314 tatat 318  Q
    |||||    
T  52265608 tatat 52265612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 318
Target Start/End: Original strand, 37957026 - 37957129
Alignment:
Q  215 aattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgat 314  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||  | |||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||    
T  37957026 aattcgtgctcctattatgatgttatgtttgtatgtaagaaattggtggtaattgattagttgttggtgaaattgaatgatcaaagtatatgaaaatgat 37957125  T
Q  315 atat 318  Q
    ||||    
T  37957126 atat 37957129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 18276555 - 18276494
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  18276555 tgaattgtgctatattgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttg 18276494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 382
Target Start/End: Original strand, 19821904 - 19821963
Alignment:
Q  323 aattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  19821904 aattgtgatatgttattgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttg 19821963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 310
Target Start/End: Original strand, 30232491 - 30232592
Alignment:
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 307  Q
    |||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||| ||| |||||  |  |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||    
T  30232491 ttgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatatatgaagtta-tgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgtga 30232589  T
Q  308 aaa 310  Q
    |||    
T  30232590 aaa 30232592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 15044949 - 15044888
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  15044949 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttg 15044888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 332 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 38764819 - 38764767
Alignment:
Q  332 atgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgtt 384  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38764819 atgttgttgttcaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgtt 38764767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 155
Target Start/End: Original strand, 47534899 - 47535022
Alignment:
Q  33 agaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaat 131  Q
    ||||||||||||| | ||||  || ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||| |||| |   || ||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  47534899 agaagcttgaagattcaagaattggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggcgaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaat 47534998  T
Q  132 cataatcaattaattgtaattttt 155  Q
    |||||||| || | ||||||||||    
T  47534999 cataatcattttagtgtaattttt 47535022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 382
Target Start/End: Original strand, 15109482 - 15109536
Alignment:
Q  328 tgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  15109482 tgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttg 15109536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Original strand, 13809636 - 13809697
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||    
T  13809636 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttg 13809697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Original strand, 47535191 - 47535252
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  47535191 tgaattatgctatgttgttgttgaattatgataagaatcatgttcaattgacgttgttgttg 47535252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Original strand, 52265634 - 52265695
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  52265634 tgaattatgcaatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttg 52265695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 384
Target Start/End: Original strand, 12837325 - 12837389
Alignment:
Q  320 gtgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgtt 384  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||||||||    
T  12837325 gtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatggtcaatggatgttgttgttgtt 12837389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 384
Target Start/End: Original strand, 30232621 - 30232685
Alignment:
Q  320 gtgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgtt 384  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||||||||    
T  30232621 gtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgtt 30232685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 258 - 305
Target Start/End: Original strand, 40885613 - 40885660
Alignment:
Q  258 tggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgt 305  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  40885613 tggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgt 40885660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 14901353 - 14901292
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||| | |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  14901353 tgaattatgatatgttattattgaattgtggtaagaatcatattcaattgatgttgttgttg 14901292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 310
Target Start/End: Original strand, 18494374 - 18494423
Alignment:
Q  261 tgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaa 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||| |||||    
T  18494374 tgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgagaaaa 18494423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21417532 - 21417471
Alignment:
Q  236 gatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 297  Q
    ||||||||||||||  ||||  || ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  21417532 gatatgtttgaatatgtgaatttgttgataattgaattgttgatgatgaaatttcatgttca 21417471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 320 - 384
Target Start/End: Original strand, 21959588 - 21959652
Alignment:
Q  320 gtgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgtt 384  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||  ||||| | ||| |||||||||||||||    
T  21959588 gtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtt 21959652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 48)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 16292586 - 16292918
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16292586 gttcaagagaagagaaaagggttagaagggagaaaagcttgaagactcaagaggtgttagagattctaggagctaaattgaagttttggctaggattatt 16292685  T
Q  100 tgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16292686 tgctaattgaggtaagggggttagagttcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgcttaagtgcttaattaagtaagtgattattt 16292785  T
Q  200 tgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 298  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16292786 tgctcttagttgttgaaatttgtgctattgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaactgttgttggtgaaattgcatgttcat 16292885  T
Q  299 agtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  16292886 agtatgcgaaaatggtatattgtcaattgtgct 16292918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 24278218 - 24277809
Alignment:
Q  5 aagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgc 102  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24278218 aagagaagaggaaaagggttagaagggagaaaagcttgaagacccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagctttggctaggattattt-c 24278120  T
Q  103 taattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgc 202  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  24278119 taattaaggtaagggggttagatttcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgcttaagtgcttaattgaataagtgattatttttc 24278020  T
Q  203 tct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagt 301  Q
    ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24278019 tcttagttgtgaaa-ttcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgatattggtgacaattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagt 24277921  T
Q  302 atgtgaaaatgatatattgtgaattgtgc-------------------tatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||                   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24277920 atgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgttatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaaatgatgttgttgttg 24277821  T
Q  383 ttgagagatatt 394  Q
    || |||||||||    
T  24277820 ttaagagatatt 24277809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 9637206 - 9636793
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatt 99  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||  || |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9637206 gttcaagagaagataaaagggttagaagggaggaaaacttgaagacccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagcttttgctaggattatt 9637107  T
Q  100 tgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattt 199  Q
     |||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  9637106 -gctaattgaggtaaggggataagatttcaatcataatcaattagttgtaattttttcctaattgtatgcttaagtgcttatttgaataagtgattattt 9637008  T
Q  200 tgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 298  Q
    |||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9637007 tgctcttagttgttgaaatttgtactcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 9636908  T
Q  299 agtatgtgaaaatgatatattgtg-------------------aattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||                   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9636907 agtatgtgaaaatgatatattgtgaattatgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttg 9636808  T
Q  380 ttgttgagagatatt 394  Q
    ||||| |||||||||    
T  9636807 ttgttaagagatatt 9636793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 25595482 - 25595153
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25595482 gttcaagagaagggcaaaaaggttagaagggagaaaa-cttgaagaaccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagcttttgctaggattat 25595384  T
Q  99 ttgctaattgaggtaaggggg-ttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttat-taattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgatta 196  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||| || |||||| ||   |||||  |||| ||||||||||  ||| ||||||||||    
T  25595383 t-gcttattgaggtaaggggggttagatttcaatcataatctcttagtt-taatttcttccctaattctatgcataagtgcttatgtgactaagtgatta 25595286  T
Q  197 ttttgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgtt 295  Q
    |||||| || ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  25595285 ttttgcacttagttgttgaaatttgggctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaatttggtgataaatgaattgttgttgatgaaattgcatgtc 25595186  T
Q  296 catagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgt 328  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  25595185 cataatatgtgaaaatggtatattgtgaattgt 25595153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 6095143 - 6094891
Alignment:
Q  5 aagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgc 102  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||    
T  6095143 aagagaagaggaaaagggttagaagggaga-aagcttgaggaaccaagaggtgatagagattctacgagctaaattgaaatttttgctaggattatt-gc 6095046  T
Q  103 taattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgc 202  Q
    | |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||   |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  6095045 ttattgaggtaagggggttagatttcaatcataatcacttagttgtaatttttccctaattgtatgcttaagtgcttatttgaataagtgattattttgc 6094946  T
Q  203 tc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaa 256  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6094945 tcttagttgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaa 6094891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18537197 - 18536885
Alignment:
Q  20 ggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggg 118  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  18537197 ggttagaagggaga-aagtttgaagaaccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagtttttgctaggattatt-gcttattgaggtaagggg 18537100  T
Q  119 gttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttat-taattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgttaaaa 216  Q
    |||| | |||||||||||||  ||| || |||||| ||   |||||  |||| |||||||||| |||| | |||||||||||| | || | ||||  |||    
T  18537099 gttagatttcaatcataatctcttagtt-taatttcttccctaattctatgcataagtgcttatttgaatgagtgattatttttcacttaattgtcgaaa 18537001  T
Q  217 ttcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  18537000 ttcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaatttggtgataattaaattgctgtagatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaatgggta 18536901  T
Q  316 tattgtgaattgtgct 331  Q
    |||||| |||||||||    
T  18536900 tattgtaaattgtgct 18536885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9637435 - 9637231
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatt 99  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||  || |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9637435 gttcaagagaagataaaagggttagaagggaggaaaacttgaagacccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagcttttgctaggattatt 9637336  T
Q  100 tgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattt 199  Q
     |||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  9637335 -gctaattgaggtaaggggataagatttcaatcataatcaattagttgtaattttttcctaattgtatgcttaagtgcttatttgaataagtgattattt 9637237  T
Q  200 tgctct 205  Q
    ||||||    
T  9637236 tgctct 9637231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9637664 - 9637460
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatt 99  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||  || |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9637664 gttcaagagaagataaaagggttagaagggaggaaaacttgaagacccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagcttttgctaggattatt 9637565  T
Q  100 tgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattt 199  Q
     |||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  9637564 -gctaattgaggtaaggggataagatttcaatcataatcaattagttgtaattttttcctaattgtatgcttaagtgcttatttgaataagtgattattt 9637466  T
Q  200 tgctct 205  Q
    ||||||    
T  9637465 tgctct 9637460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9637893 - 9637689
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatt 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  9637893 gttcaagagaagagaaaaaggttataagggaggaaaacttgaagacccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaaacttttgctaggataatt 9637794  T
Q  100 tgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattt 199  Q
     |||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  9637793 -gctaattgaggtaaggggataagatttcaatcataatcaattagttgtaattttttcctaattgtatgcttaagtgcttatttgaataagtgattattt 9637695  T
Q  200 tgctct 205  Q
    ||||||    
T  9637694 tgctct 9637689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 58 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19660281 - 19660029
Alignment:
Q  58 agagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaatttttta 157  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |   || ||||| |||||||||| ||| | |||| ||||||||| || | |||||||||| |    
T  19660281 agagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg-ttagaattca-tcataatcactttagtgtaatttttca 19660184  T
Q  158 ttaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaa 256  Q
    ||  ||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||| | ||| || |||| || ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19660183 tttgttgtatgattaagtgtttaatggaataagtgattattt-gttcttagatgttgaatttcgtgctctaattatgatgatatgttcgtatacatgaaa 19660085  T
Q  257 atggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatg 312  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19660084 ttggtgataattgaattattgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatg 19660029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 205 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 24884942 - 24884746
Alignment:
Q  205 tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 304  Q
    |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24884942 tagttgttaaaatttgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatggaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatg 24884843  T
Q  305 tgaaaatgatatattg-------------------tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    ||||| ||||||||||                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24884842 tgaaagtgatatattgtgagttatgctctaaatgttgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttg 24884746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 69 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19666918 - 19666684
Alignment:
Q  69 gagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatg 168  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| | | |||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| | ||||||||| | | |||| |||    
T  19666918 gagctaaagtgaagtttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gtaatttttcaattattgtatg 19666821  T
Q  169 cttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataat 267  Q
      ||| ||||||||||| |||||||||| || | || ||||||||||||||| ||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19666820 aataaatgcttaattgaataagtgattaatt-gttcatagttgttaaaattcatgctctaactataatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataat 19666722  T
Q  268 tgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgt 305  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19666721 tgaattgtttttggtgaatttgcatgttcaaagtatgt 19666684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 331
Target Start/End: Original strand, 24087304 - 24087505
Alignment:
Q  130 atcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctctagttgttaaaattcgtgctcttgt 229  Q
    |||||||||| || | |||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||     ||  |||||||||||| |||||  |    
T  24087304 atcataatcattttagtgtaatttttcattg-ttgtatgattaagtgcttaattgagtaagtgattaattattcataaatgttaaaattcgggctctaat 24087402  T
Q  230 tatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattgt 328  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| | |||||| ||||||||    
T  24087403 tatgatgatatgtttgagcacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatggtatgtataaatgggtatattatgaattgt 24087502  T
Q  329 gct 331  Q
    |||    
T  24087503 gct 24087505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20279845 - 20279521
Alignment:
Q  30 gagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttc 128  Q
    |||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||    
T  20279845 gagagaagcttgaagaaccaaggggagatagagattctcggagcttaattgaagcttttgctaggattatt-gcttattgaggtaaggggattagatttc 20279747  T
Q  129 aatcataatcaattaattgtaattttttat-taattgcatgcttaagtgcttaattgat-taagtgattattttgctct-agttgttaaaattcgtgctc 225  Q
    | ||||||||  ||| |||||  || ||   |||||| |||   ||||||||||||||  |||||||||||  ||  || | | ||| ||||||||||||    
T  20279746 attcataatcttttagttgtagcttcttccctaattgtatgtaaaagtgcttaattgaaataagtgattatggtgaacttaatcgttgaaattcgtgctc 20279647  T
Q  226 ttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaa 324  Q
     ||||||   ||||||||||  || |||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||| | |||||||||||    
T  20279646 atgttatagagatatgtttgggtatatgaatttgatgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcatgatatgtataaatgggtatattgtgaa 20279547  T
Q  325 ttgtgctatgttattgttgaattgtg 350  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||    
T  20279546 ttgtgctatgttgatgttgatttgtg 20279521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 29114816 - 29114693
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  29114816 aaaagggttagaaggaaga-aagcttgaagacccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagcttttgctaggatta-ttgcttattgaggta 29114719  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatca 139  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  29114718 agggggttagatttcaagcataatca 29114693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 109 - 280
Target Start/End: Original strand, 23821536 - 23821705
Alignment:
Q  109 aggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tag 207  Q
    |||||||||||||| | |||| | ||||||| ||| | ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | || |||    
T  23821536 aggtaagggggttagatttcatt-ataatcatttagt-gtaatttttcaattattgcatgcttaagtgcttaattgagtaagtgattaatt-gttcatag 23821632  T
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttg 280  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || |||  || ||||||||||||||||||||    
T  23821633 ttgttaaaattcgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcaggaagttgttgataattgaattgttgttg 23821705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 109 - 280
Target Start/End: Original strand, 23830615 - 23830784
Alignment:
Q  109 aggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tag 207  Q
    |||||||||||||| | |||| | ||||||| ||| | ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | || |||    
T  23830615 aggtaagggggttagatttcatt-ataatcatttagt-gtaatttttcaattattgcatgcttaagtgcttaattgagtaagtgattaatt-gttcatag 23830711  T
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttg 280  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || |||  || ||||||||||||||||||||    
T  23830712 ttgttaaaattcgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcaggaagttgttgataattgaattgttgttg 23830784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 43646323 - 43646023
Alignment:
Q  33 agaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaat 131  Q
    ||||||||||||| | ||||  || ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |   || ||||| |||||||||||||| | |||| |    
T  43646323 agaagcttgaagattcaagaattggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcagt 43646224  T
Q  132 cataatcaatta-attgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctcta-gttgttaaaattcgtgctcttgt 229  Q
    |||||||| ||  | ||||| |||  | |  ||| |||  |||||| |||||||| ||| |||||| || | || | ||||||| ||||||||||||  |    
T  43646223 cataatcatttttagtgtaaatttccaattgttgtatgaataagtgtttaattgagtaaatgattaatt-gttcaaagttgttataattcgtgctctaat 43646125  T
Q  230 tatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtg 329  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||  |||||| ||    
T  43646124 tatgttgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattggattgttgttggtgaaatttcatgtttaaagtatgagaaagtgatatatgttgaattatg 43646025  T
Q  330 ct 331  Q
    ||    
T  43646024 ct 43646023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 171 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 722681 - 722534
Alignment:
Q  171 taagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattg 269  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| || | || || ||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  722681 taagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatattatgtttgaatgtatgaaattggtgataattg 722583  T
Q  270 aattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatat 318  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  722582 atttgttgttggtgaaattgaatgatcaaagtatatgaaaatgatatat 722534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 208 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 68245 - 68135
Alignment:
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 307  Q
    |||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  68245 ttgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 68146  T
Q  308 aaatgatatat 318  Q
    || ||||||||    
T  68145 aagtgatatat 68135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 282 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 6094895 - 6094764
Alignment:
Q  282 tgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgc-------------------tatgttattgttgaattgtgatgagaatcatg 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  6094895 tgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgttatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatg 6094796  T
Q  363 tttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  6094795 tttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 6094764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 208 - 318
Target Start/End: Original strand, 3241 - 3351
Alignment:
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 307  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||  | |||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||    
T  3241 ttgttagaattcgtgctcctattatgatgttatgtttgtatgtaagaaattgatgataattgatttgttgttggtgaaattgaatgatcaaagtatatga 3340  T
Q  308 aaatgatatat 318  Q
    |||||||||||    
T  3341 aaatgatatat 3351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 208 - 329
Target Start/End: Original strand, 22775199 - 22775320
Alignment:
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 307  Q
    |||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||    
T  22775199 ttgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatgaga 22775298  T
Q  308 aaatgatatattgtgaattgtg 329  Q
    || | ||||||  |||||||||    
T  22775299 aagttatatatgttgaattgtg 22775320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 208 - 329
Target Start/End: Original strand, 22780577 - 22780698
Alignment:
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 307  Q
    |||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||    
T  22780577 ttgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatgaga 22780676  T
Q  308 aaatgatatattgtgaattgtg 329  Q
    || | ||||||  |||||||||    
T  22780677 aagttatatatgttgaattgtg 22780698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 306
Target Start/End: Original strand, 19669005 - 19669201
Alignment:
Q  109 aggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tag 207  Q
    |||||| ||||||| | |||| ||||||||| || | |||||||||| | | |||| |||  |||||| |||||||  ||| |||||| || | || |||    
T  19669005 aggtaacggggttagaattca-tcataatcattttagtgtaatttttcaattattgtatgaataagtgattaattggataaatgattaatt-gttcatag 19669102  T
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtg 306  Q
     ||||||||| | ||||||   |||| ||||||||||| || ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19669103 atgttaaaatccatgctctaactatggtgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgagttgttgttggtgaaattgcatgttctaagtatgtg 19669201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Original strand, 23821731 - 23821792
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  23821731 tgaattgtgctatgttattgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttg 23821792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Original strand, 23830810 - 23830871
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  23830810 tgaattgtgctatgttattgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttg 23830871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 321 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 25595141 - 25595072
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagaga 390  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25595141 tgaattgtgctatgttgtttttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttaagaga 25595072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 318
Target Start/End: Original strand, 31146138 - 31146285
Alignment:
Q  171 taagtgcttaattgattaagtgattattttgctctagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattga 270  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||| ||  |  || |||||| |||||||| ||   |||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||    
T  31146138 taagtgcttaactgagtaattgattaattgtccataattgttagaattcgtgttccaattatgatggtatgtttgaatgcatgaagttgttgataattga 31146237  T
Q  271 attgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatat 318  Q
    ||||||||| | ||||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  31146238 attgttgttagagaaattttatgttcaaagtatgagaaagtgatatat 31146285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 25305834 - 25305637
Alignment:
Q  58 agagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaatttttta 157  Q
    |||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||| || |   || ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| || | | |||||||  |    
T  25305834 agagatcctaggagttaaagtgaagcttgggctatgaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtataattttaca 25305735  T
Q  158 ttaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctcta-gttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaa 255  Q
     |  ||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||| || | || | ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  25305734 attgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcaaagttgttataattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaa 25305637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 332 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 33128155 - 33128093
Alignment:
Q  332 atgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||    
T  33128155 atgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatattgttgtggttaagagatatt 33128093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 384
Target Start/End: Original strand, 25265530 - 25265594
Alignment:
Q  320 gtgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgtt 384  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  25265530 gtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgtt 25265594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 393
Target Start/End: Original strand, 16292936 - 16292999
Alignment:
Q  330 ctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatat 393  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  16292936 ctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttattaagagatat 16292999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 318
Target Start/End: Original strand, 24294570 - 24294627
Alignment:
Q  261 tgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatat 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  24294570 tgataattgatttgttgttggtgaaattgaatgatcaaagtatatgaaaatgatatat 24294627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 394
Target Start/End: Original strand, 24560862 - 24560930
Alignment:
Q  326 tgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  24560862 tgtggtatgttgttgttgaaatgtggtgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttatgagatatt 24560930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 318
Target Start/End: Original strand, 24571292 - 24571396
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 313  Q
    |||||||||||||  || |||||| | |||||||| ||||||  ||  |||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||  ||||| ||||||||    
T  24571292 aaattcgtgctctaattttgatgacacgtttgaatgcatgaagttgtggatacttgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaggtatgagaaaatga 24571391  T
Q  314 tatat 318  Q
    |||||    
T  24571392 tatat 24571396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 68113 - 68052
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  68113 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 68052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 394
Target Start/End: Original strand, 19433458 - 19433531
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||||  | ||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  19433458 tgaattatgctatgttgttattgaattgttgtaagaatcatgttcaattgatgttgttgttgctaagagatatt 19433531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 19666649 - 19666588
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  19666649 tgaattatgctatgttgttattgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttg 19666588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 43646014 - 43645953
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  43646014 tgaattatgctatgttgttgttgaactgtggtaagaatcatgttcaattgatgttgttgttg 43645953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 388
Target Start/End: Original strand, 28031372 - 28031440
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgttt-aatggatgttgttgttgttgaga 388  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  28031372 tgaattatgatatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttgttgaga 28031440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 321 - 384
Target Start/End: Original strand, 24571418 - 24571481
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgtt 384  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||| | ||| |||||||||||||||    
T  24571418 tgaattatgctatgtttttgttgaattgtgttaagattcatgatcaattgatgttgttgttgtt 24571481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 263 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 25602222 - 25602167
Alignment:
Q  263 ataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatat 318  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  25602222 ataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgagaaattgatatat 25602167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 18536866 - 18536817
Alignment:
Q  331 tatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgt 380  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18536866 tatgttgttgttgaaatgtggtgagattcatgtttaattgatgttgttgt 18536817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Original strand, 19669235 - 19669296
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  19669235 tgaattatgatatgttgttgttgaattatgatgtgaaccatgttcaattgatgttgttgttg 19669296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 22138281 - 22138220
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||| | || ||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  22138281 tgaattatgctatgatgtttttgaattatgaagagaaccatgtttaattgatgttgttgttg 22138220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 25305567 - 25305507
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgtt-attgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgt 380  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  25305567 tgaattatgctatgttgattgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgt 25305507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 28974296 - 28974192
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 313  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||  |   |||||| |||||||||||  |  |||| |||||||| |||||| |||||||     
T  28974296 aaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataatagaattgttgttaattgaattacatgttcaaagtatgagaaaatgg 28974197  T
Q  314 tatat 318  Q
    |||||    
T  28974196 tatat 28974192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 67683 - 68069
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatt 99  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  67683 gttcaagagtagagataagggttagaagggagaaaagcttgaagacgcaagaggtgatagatattctaggtgctaaattgaagcttttgctaggatt-tt 67781  T
Q  100 tgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||   |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  67782 tgctaattgaggtaagggggttagatttcaaacataaccaattagttgtaatttttccctaattgtatgcttaagtgattaattgaataagtgattactt 67881  T
Q  200 tgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 298  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67882 tgctcttagttgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacgtgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 67981  T
Q  299 agtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgt-tgttgttgttg 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  67982 agtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagaattatatttaattgatgtatgttgttgttg 68069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27958 - 27545
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatt 99  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  27958 gttcaagggaagagaaaagggttagaagggagaaaaacttaaagacccaagaggtgatagagattctaggatctaaattgcagctttggctaggattatt 27859  T
Q  100 tgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattt 199  Q
     ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27858 -gctaattaaggtaagggggttagatttcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgcttaagtgcttaattgaataaatgattattt 27760  T
Q  200 tgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 298  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27759 tgctcatagttgttgaaatttgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcat 27660  T
Q  299 agtatgtgaaaatgatatattgtgaatt-------------------gtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  27659 agtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgccctaaatgttgaattgtgctatattgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgatgttg 27560  T
Q  380 ttgttgagagatatt 394  Q
    ||||| |||||||||    
T  27559 ttgttaagagatatt 27545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 86818 - 86487
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaa-tggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||| | |||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  86818 gttcaagagaagagaaaaatggttaaaagggagaaaagtttgaagatccaagatgtgatagagaatctaggagctaaattgaaacttttgttaggattat 86719  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattatt 198  Q
    | ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  86718 t-gctaattaaggtaagggggttagatttcaatcataatcaattagttgtaattttccct-aattgcatgcttaagtgcttaattgaataagtgattatt 86621  T
Q  199 ttgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 297  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  86620 ttgctcttagttgttgaaatccgtgctcttgttatgttgatatgtttgagtacatgaaatttgtgataattgaatttttgttggtgaaattggatgttca 86521  T
Q  298 tagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  86520 tagtatgtgaaaatgttatattgtgaattgtgct 86487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 321 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 86478 - 86405
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  86478 tgaattgtgctatgttatagttcaattgtgatgataatcatgtttaattgatgtttttgttgttaagagatatt 86405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 42)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Original strand, 5767955 - 5768368
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| ||    
T  5767955 gttcaagagaagaggaaaagggttagaagggaga-aagcttgaagacccaagaagtgatagagattctaggagctaaattaaagtttttgctaggat-at 5768052  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattatt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5768053 ttgctaattgaggtaagggggttagatttcaatcataatcaattagttgtaattttttcctaattgcatgcttaagtgcttaattgaataagtgattatt 5768152  T
Q  199 ttgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 297  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5768153 ttgctcttagttgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttca 5768252  T
Q  298 tagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct-------------------atgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgtt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||                   ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5768253 tagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgttatgttgttgttaatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgtt 5768352  T
Q  379 gttgttgagagatatt 394  Q
    |||||| |||||||||    
T  5768353 gttgttaagagatatt 5768368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 331
Target Start/End: Original strand, 40436069 - 40436386
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||    
T  40436069 aaaagggttagaagggaga-aagcttgaagaaccaagaggtgatagagattctatgagctaaattgaaacttttgctaggattatt-gtttattgaggta 40436166  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaatttttta-ttaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgt 211  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||| |||||| |||| ||||  ||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  40436167 agggggttagatttcaatcacaatcacttaattataatcttttccttaattatatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttgcacttagttgt 40436266  T
Q  212 taaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat 311  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40436267 tgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatatatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaat 40436366  T
Q  312 gatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  40436367 gatatattgtgaattgtgct 40436386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 38 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 52401054 - 52400759
Alignment:
Q  38 cttgaagac-taagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataa 136  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||| |||||| | ||||| |||||    
T  52401054 cttgaagacctaagaggtggtggagattctaggagctaaattgaagcttgggctaggatt-tttgctaactaaggtaagagggttagaattcaaccataa 52400956  T
Q  137 tcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgat 235  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||| |  ||||||||||  ||||| |    
T  52400955 tcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaataagtgattattt-gttcatagttgttgactttcgtgctctaattatggt 52400857  T
Q  236 gatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctat 333  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52400856 gatatgtttgaatacatgaaattggtgatagttgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctat 52400759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 328
Target Start/End: Original strand, 49997071 - 49997395
Alignment:
Q  4 caagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaagac-taagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttg 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||| ||||    
T  49997071 caagagaagaggaaaatggttagaagaga-agatacttgaagacctaagaggtggtggtgattctaggagctaaattgaagtttgagctaggatt-tttg 49997168  T
Q  102 ctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttg 201  Q
    |||| | |||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  49997169 ctaactaaggtaagggggttagaattcaaacataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaataagtgattattt-g 49997267  T
Q  202 ctctag-ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatag 300  Q
     ||  | ||||| ||||| |||| || |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49997268 ttcatgattgttgaaatttgtgccctagttatggtgatatgtttgaatatatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatag 49997367  T
Q  301 tatgtgaaaatgatatattgtgaattgt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49997368 tatgtgaaaatgatatattgtgaattgt 49997395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 21195471 - 21195062
Alignment:
Q  4 caagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaagac-taagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttg 101  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| | ||    
T  21195471 caagagaagaggaaaagggttagaagaga-agagacttgaagacctaagaggtgatggtgattctaggagctaaagtgaagcttgggctaggatt-tgtg 21195374  T
Q  102 ctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttg 201  Q
    |||| | |||||||||| ||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| || |    
T  21195373 ctaactaaggtaaggggtttagaattcaatcataatcatttagttgtaatttttcatttgttgtatgtttaagtgcttaattgaataagtgattaatt-g 21195275  T
Q  202 ctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatag 300  Q
     || ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21195274 ttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatag 21195175  T
Q  301 tatgtgaaaatgatatattgtg-------------------aattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgtt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||                   |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21195174 tatgtgaaaatgatatattgtgaattatgctcaaattgttgaattgtgctaggttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattaatgttgttgtt 21195075  T
Q  382 gttgagagatatt 394  Q
    ||| |||||||||    
T  21195074 gttaagagatatt 21195062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 33397792 - 33397482
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  33397792 aaaagggttagaagggaga-aagcttgaggaaccaagaggtgatagagattctaggagctaaatcgaaccttttgctaggattatt-gcttattgaggta 33397695  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaatttttta-ttaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctctagttgtt 212  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||| || |||| ||||  ||||||  |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||   | |||      
T  33397694 agggggttagatttcaatcataatcacttagttataatcttttccttaattatatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttgc---atttg-- 33397600  T
Q  213 aaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatg 312  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  33397599 -aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgagttgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaata 33397501  T
Q  313 atatattgtgaattgtgct 331  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33397500 atatattgtgaattgtgct 33397482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 25094296 - 25093991
Alignment:
Q  22 ttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggt 120  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25094296 ttagaatggaga-aagcttgaagaaccaagaagtgatagagattctaggagctaaattgaagcttttgctaggattatt-gcttattgaggtaagggggt 25094199  T
Q  121 taaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgttaaaattc 219  Q
    || | |||||||||||||| ||| ||||||| |||   ||  |  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| || |  |||| ||||||    
T  25094198 tagatttcaatcataatcacttagttgtaatctttccctatct--atgcataagtgcttatttgaataagtgattattttgcacttaactgttgaaattc 25094101  T
Q  220 gtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatatt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  25094100 gtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaatttggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgtccataatatgagaaaatgatatatt 25094001  T
Q  320 gtgaattgtg 329  Q
    ||||||||||    
T  25094000 gtgaattgtg 25093991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 46 - 331
Target Start/End: Original strand, 8537743 - 8538027
Alignment:
Q  46 ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaat 145  Q
    |||||||||| |  |||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||| | |||||| | ||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |    
T  8537743 ctaagaggtggtgaagattctaggagttaaagtgaagcttgggctaggatt-tgtgctaactaaggtaagggagttagaattcaatcataatcaattagt 8537841  T
Q  146 tgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgttt 244  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||  | || | |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  8537842 tgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaataattgattattc-gttcatggttgttgaaattcgtgctttgattatgatgatatgttt 8537940  T
Q  245 gaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8537941 gaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgttatattgtgaattgtgct 8538027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 46 - 331
Target Start/End: Original strand, 8602982 - 8603266
Alignment:
Q  46 ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaat 145  Q
    |||||||||| |  |||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||| | |||||| | ||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |    
T  8602982 ctaagaggtggtgaagattctaggagttaaagtgaagcttgggctaggatt-tgtgctaactaaggtaagggagttagaattcaatcataatcaattagt 8603080  T
Q  146 tgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgttt 244  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||  | || | |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  8603081 tgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaataattgattattc-gttcatggttgttgaaattcgtgctttgattatgatgatatgttt 8603179  T
Q  245 gaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8603180 gaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgttatattgtgaattgtgct 8603266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 20194464 - 20194103
Alignment:
Q  24 agaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggtta 122  Q
    |||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||    
T  20194464 agaagggaga-aagcttgaagaaccatgaggtgatagagattctaggagctaaattgaagcttttgctaggattatt-gcttattgaggtaaggaagtta 20194367  T
Q  123 aagttcaatcataatcaattaattgtaattttttat-taattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgttaaaattcg 220  Q
     | |||||||||||||| ||| ||||||| ||||   |||||  |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  20194366 gacttcaatcataatcacttagttgtaatcttttccctaattctatgcataagtgcttatttgaataaatgattattttgcacttagttgttgaaattcg 20194267  T
Q  221 tgctcttgttatgatgatatgttt-gaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatat 318  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||    
T  20194266 tgctcttgttatgatgatatgttttgagtatatgaatttggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgataatgggtatat 20194167  T
Q  319 tgtgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgag-aatcatgtttaatggatgttgttgttgt 383  Q
    ||||||||||||  | | |||||||||||||| |  |   ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20194166 tgtgaattgtgc--tctaattgttgaattgtgttacgttgtcatgtttaattgatgttgttgttgt 20194103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 33 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 17609356 - 17609058
Alignment:
Q  33 agaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaat 131  Q
    ||||||||||||| | |||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| || ||||| | | |||||| | |||||||||||||| | ||||||    
T  17609356 agaagcttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggttaggaatttgtgctaactaaggtaagggggttagaattcaat 17609257  T
Q  132 cataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgtt 230  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| | | |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| || | || ||||||||| ||||||||||||  ||    
T  17609256 cataatcatttagt-gtaatttttcaattattgtatgattaagtgcttaattgagtaagtgattagtt-gatcatagttgttagaattcgtgctctaatt 17609159  T
Q  231 atgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgc 330  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||  |||||| |||    
T  17609158 atgatgatatatttgaatgcatgaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatatgaaagtgttatatgttgaattatgc 17609059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 33 - 331
Target Start/End: Original strand, 37233680 - 37233977
Alignment:
Q  33 agaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaat 131  Q
    ||||||||||||| | |||| ||| ||||||| ||| ||| |||| |||||||| |||||||| | | |||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  37233680 agaagcttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggaggtaaagtgaagcttgggctaggaat-tgtgctaattaaggtaagggggttagaattcaat 37233778  T
Q  132 cataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctctagttgttaaaattcgtgctcttgtta 231  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| | | |||| ||  |||||||||||||||| ||||||| || ||     ||||||||| |||||||||| | ||||    
T  37233779 cataatcatttagt-gtaatttttcaattattgtattattaagtgcttaattgagtaagtgagtaattgttaatagttgttagaattcgtgctttagtta 37233877  T
Q  232 tgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||| ||||    
T  37233878 tgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtaaaattgcatgttcaaagtatatgaaagtgatatatgttgaattatgct 37233977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 58 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20177578 - 20177305
Alignment:
Q  58 agagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaatttttta 157  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |   || ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||| || | |||||||||| |    
T  20177578 agagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaatggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttca 20177479  T
Q  158 ttaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaa 256  Q
     | |||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||| || | || || |||||| |||||||||||   |||||||||||||||| ||| || |||     
T  20177478 attattgtatgtttaagtgcttaattgagtaattgattaatt-gttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgttttaatgcacgaag 20177380  T
Q  257 atggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||  |||||| ||||    
T  20177379 ttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaattatgct 20177305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 254
Target Start/End: Original strand, 76238 - 76458
Alignment:
Q  35 aagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatca 133  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  76238 aagcttgaagaaccaagaggtgatagagattctaggagttaaattgaagcttttgctatgatta-ttgcttattgaggtaagggggttagatttcaatca 76336  T
Q  134 taatcaattaattgtaattt-tttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgtta 231  Q
    |||||  ||| || |||||| ||   |||||  | || ||| |||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  76337 taatctcttagtt-taatttcttccctaattctaagcataattgcttatttgaataagtgattattttgcactaagttgttgaaattcgtgcttttgtta 76435  T
Q  232 tgatgatatgtttgaatacatga 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  76436 tgatgatatgtttgagtacatga 76458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 69 - 305
Target Start/End: Original strand, 22143218 - 22143452
Alignment:
Q  69 gagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatg 168  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||| | |||| ||||||||| || | |||||||||| | | |||| |||    
T  22143218 gagctaaagtgaagcttgggctaggattaattgctaactaaggtaagggg-ttagaattca-tcataatcattttagtgtaatttttcaattattgtatg 22143315  T
Q  169 cttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataat 267  Q
      ||||||||||||||  ||| |||||| || | || ||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| || ||||||| | ||||||||    
T  22143316 aataagtgcttaattggataaatgattaatt-gttcatagatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatgtgtttgtatgcatgaaatttgtgataat 22143414  T
Q  268 tgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgt 305  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22143415 tgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatgt 22143452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 20836874 - 20836741
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  20836874 aaaagggttagaagggaga-aagcttgaagaacgaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagcttttgctaggatta-ttgcttattgaggta 20836777  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatcaattaattgta 149  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||    
T  20836776 agggggttagatttcaatcataatcacttagttgta 20836741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 60 - 382
Target Start/End: Original strand, 13376705 - 13377027
Alignment:
Q  60 agattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttatt 159  Q
    |||| ||| |||||||| ||||| || |||||||| |   || ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| || | |||||||||| | |    
T  13376705 agatcctaggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaat 13376804  T
Q  160 aattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaat 258  Q
     |||| ||| |||||||||||||| | ||| |||||| || | || ||| || | | | |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  13376805 tattgtatgattaagtgcttaatttagtaattgattaatt-gttcatagatgatgagaatcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagtt 13376903  T
Q  259 ggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaat 358  Q
    | |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||   || || |||||  |||||| || |||||| |||||||||| || ||| | |    
T  13376904 gttgataattaaattgttgtcgttgaaatttcatgttcaaagtatgaagaagtggtatatgttgaattatgttatgttgttgttgaattatggtgaaagt 13377003  T
Q  359 catgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||| | ||| |||||||||||||    
T  13377004 catgctcaattgatgttgttgttg 13377027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 20823070 - 20822937
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||    
T  20823070 aaaagggttagaagggaga-aagcttgaagaaccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagcttttgcaaggatta-ttgcttattgaggta 20822973  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatcaattaattgta 149  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||    
T  20822972 agggggttagatttcaatcataatcacttagttgta 20822937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 171 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 19603387 - 19603240
Alignment:
Q  171 taagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattg 269  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| || | || || ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  19603387 taagtgcttaattgagtaattgattaatt-gttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgtatgaaattggtgataattg 19603289  T
Q  270 aattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatat 318  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  19603288 atttgttgttggtgaaattgaatgatcaaagtatatgaaaatgatatat 19603240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 138
Target Start/End: Original strand, 18852525 - 18852641
Alignment:
Q  21 gttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaaggggg 119  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  18852525 gttagaagggaga-aagtttgaagaaccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagcttttgctaggatta-ttgtttattgaggtaaggggg 18852622  T
Q  120 ttaaagttcaatcataatc 138  Q
    ||| | |||||||||||||    
T  18852623 ttagatttcaatcataatc 18852641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 321 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 33397473 - 33397400
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  33397473 tgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatcttgttgttgttaagagatatt 33397400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 171 - 318
Target Start/End: Original strand, 22829382 - 22829529
Alignment:
Q  171 taagtgcttaattgattaagtgattattttgctctagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattga 270  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||     || |||||| |||||||||||   |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  22829382 taagtgcttaattgagtaattgattaattattcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgtatgaaactggtgataattga 22829481  T
Q  271 attgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatat 318  Q
     |||||||| ||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||    
T  22829482 tttgttgttagtgaaattgaatggtcaaagcatatgaaaatgatatat 22829529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 215 - 318
Target Start/End: Original strand, 38033675 - 38033778
Alignment:
Q  215 aattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgat 314  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||    
T  38033675 aattcgtgctcctattatgatgttatgtttgtatgtaagaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgaatgatcaaagtatatgaaaatgat 38033774  T
Q  315 atat 318  Q
    ||||    
T  38033775 atat 38033778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16656928 - 16656768
Alignment:
Q  171 taagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattg 269  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| || | || || |||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||| ||  || |||||||||    
T  16656928 taagtgcttaattgagtaattgattaatt-gttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattg 16656830  T
Q  270 aattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||| |||||| |||| ||||||||  |||||| ||||    
T  16656829 aattgttgttggtgaaacttcgtgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaattatgct 16656768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 321 - 394
Target Start/End: Original strand, 40436395 - 40436468
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  40436395 tgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagaattatgtttaattgatgttgttgtttttaagagatatt 40436468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16646202 - 16646055
Alignment:
Q  171 taagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattg 269  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| || | || || |||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||     
T  16646202 taagtgcttaattgagtaattgattaatt-gttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattt 16646104  T
Q  270 aattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatat 318  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  16646103 aattgatgttggtaaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatat 16646055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 318
Target Start/End: Original strand, 20955396 - 20955543
Alignment:
Q  171 taagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattg 269  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| || | || || |||||| |||| ||||||   |||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  20955396 taagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataattgttagaatttgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgtatgaaattggtgataattg 20955494  T
Q  270 aattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatat 318  Q
    |  ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||    
T  20955495 atctgttgttggtgaaattgaatgatcaaagtatatgagaatgatatat 20955543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 208 - 318
Target Start/End: Original strand, 36356287 - 36356397
Alignment:
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 307  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||  | |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||| ||||| |||    
T  36356287 ttgttagaattcgtgctcctattatgatgttatgtttgtatgtaagaaattgatgataattgaaatgttgttggtgaaattgaaggatcaaagtatatga 36356386  T
Q  308 aaatgatatat 318  Q
    |||||||||||    
T  36356387 aaatgatatat 36356397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 27675048 - 27674939
Alignment:
Q  209 tgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaa 308  Q
    ||||| |||||||||||   |||||||| |||||||||||  | |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| || |    
T  27675048 tgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgtaagaaattggtgataattgatttgttattggtgaaattgaatgatcaaagtatatgga 27674949  T
Q  309 aatgatatat 318  Q
    ||||||||||    
T  27674948 aatgatatat 27674939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 318
Target Start/End: Original strand, 51627612 - 51627768
Alignment:
Q  162 ttgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatgg 260  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||| | || || | |||| |||| ||||||   ||||||||||||| |||||| ||||||  ||     
T  51627612 ttgcatgaataagtgcttaattgagtaattgattattt-gttcataatcgttagaatttgtgctccaattatgatgatatgcttgaatgcatgaatttgt 51627710  T
Q  261 tgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatat 318  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  51627711 tgatgattgaattgttgttagtgaaacttcatgttcaaagtatgagaaaatggtatat 51627768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 384
Target Start/End: Original strand, 8538046 - 8538099
Alignment:
Q  331 tatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgtt 384  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8538046 tatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgtt 8538099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 384
Target Start/End: Original strand, 8603285 - 8603338
Alignment:
Q  331 tatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgtt 384  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8603285 tatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgtt 8603338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 17609049 - 17608976
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| || ||||||    
T  17609049 tgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgttgttgttgttgttaagtgatatt 17608976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 310
Target Start/End: Original strand, 27329750 - 27329851
Alignment:
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 307  Q
    |||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||| ||| |||||  |  |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||    
T  27329750 ttgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatatatgaagtta-tgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgtga 27329848  T
Q  308 aaa 310  Q
    |||    
T  27329849 aaa 27329851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 394
Target Start/End: Original strand, 49997407 - 49997481
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg-ttgagagatatt 394  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||    
T  49997407 tgaattgtgctatgttgttgttgaattaaggtgagaatcatgtttaactgatgttgttgttgcttaagagatatt 49997481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 52400735 - 52400682
Alignment:
Q  338 ttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagat 391  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  52400735 ttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgacgttgttgttgctgagagat 52400682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 25093970 - 25093920
Alignment:
Q  331 tatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgtt 381  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25093970 tatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgtt 25093920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 382
Target Start/End: Original strand, 37233993 - 37234047
Alignment:
Q  328 tgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  37233993 tgctatgttgtggttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttg 37234047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 394
Target Start/End: Original strand, 76499 - 76572
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || | ||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||  ||||||||    
T  76499 tgaattgtgctatgttgttgttgaaatgcggtgagattcatgtttaattgatattgttgttattatgagatatt 76572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 384
Target Start/End: Original strand, 27329880 - 27329944
Alignment:
Q  320 gtgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgtt 384  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||||||||    
T  27329880 gtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgtt 27329944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 328 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16646026 - 16645975
Alignment:
Q  328 tgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttg 379  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  16646026 tgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttg 16645975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 20254435 - 20254367
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatg-tttaatggatgttgttgttgttgaga 388  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||    
T  20254435 tgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttgttgctgaga 20254367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 8951 - 8620
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatt 99  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  8951 gttcaagagaagataaaagggttagaagggagagaagcttgaagacttaagaagtgatagagattataggagctcaattgaagcttttgctaggattatt 8852  T
Q  100 tgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattt 199  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8851 -gctaattgaggtaagggggttagatttcaatcataatcaattagttgtaatttttccttaattgtatgcttaagtgcttaattgaataagtgattattt 8753  T
Q  200 tgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 298  Q
    || ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8752 tgttcttagttattgaaattcgtgctcttgttgtgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcat 8653  T
Q  299 agtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8652 agtatgtgaaaatgatatattatgaattgtgct 8620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 1934 - 1882
Alignment:
Q  342 tgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  1934 tgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgatgttgttaagagatatt 1882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0670 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:

Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Original strand, 7460 - 7874
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7460 gttcaggagaagaggaaaatggttagaagggagaaaagcttgaagacccaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagcttttgctaggattat 7559  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattatt 198  Q
    | ||| ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||   |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7560 t-gcttattgaggaaaggggtttagatttcaatcataatcacttagttgtaatttttccctaattgtatgcttaagtgcttatttgaataagtgattatt 7658  T
Q  199 ttgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 297  Q
    ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7659 ttgttcttagttgttgaaatttgtgctcttgttatgatgatatgtttgactacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 7758  T
Q  298 tagtatgtgaaaatgatatattg-------------------tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgtt 378  Q
    |||||||||||||||||||||||                   |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7759 tagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgtt 7858  T
Q  379 gttgttgagagatatt 394  Q
    |||||| |||||||||    
T  7859 gttgttaagagatatt 7874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 26559601 - 26559932
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatgg-ttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  26559601 gttcaagagaagataaaaagggttagaagggagaaaagcttgaagacccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgatgttttagctaggattat 26559700  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattatt 198  Q
    | |||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  26559701 t-gctaattgaggtaagggg-ttagatttcaattataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgtttaagtgcttaattgaataaatgattatt 26559798  T
Q  199 ttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 297  Q
    ||  || |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26559799 ttaatcatagttgttgaaattcgtgctcttgctatgattatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 26559898  T
Q  298 tagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26559899 tagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 26559932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 21110211 - 21109798
Alignment:
Q  2 ttcaagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21110211 ttcaagagaagaggaaaatggttagaagggggaaaagcttgaagacccaagaggtgacagagattctaggagctaaattgaagctttggctaggattatt 21110112  T
Q  100 tgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattt 199  Q
     |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||   |||||| ||||||||||||||| || |  || | |||||||    
T  21110111 -gctaattgaggtaaggaggttagatttcaatcataatcacttagttgtaatttttccctaattgtatgcttaagtgcttatttaaacaaattattattt 21110013  T
Q  200 tgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 298  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21110012 tgctcttagttgttgaaattcgtgctcttgttctgatgatatgtttgagtacatgaaattggtaataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 21109913  T
Q  299 agtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgc-------------------tatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||                   |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21109912 agtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgttatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttg 21109813  T
Q  380 ttgttgagagatatt 394  Q
    ||||| |||||||||    
T  21109812 ttgttaagagatatt 21109798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 48 - 331
Target Start/End: Original strand, 23234315 - 23234602
Alignment:
Q  48 aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattg 147  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||| |||    
T  23234315 aagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagcttttgctaggattatt-gcttattgaggtaaggggatttgatttcaatcataatcacttagttg 23234413  T
Q  148 taattttttatt----aattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgt 242  Q
    ||||||||| ||    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23234414 taatttttttttttctaattgtatgcttaagtgcttatttgaataagtgattattttgctcttagttgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgt 23234513  T
Q  243 ttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23234514 ttaagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgtaattgcatgtttatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 23234602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 5621580 - 5621844
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagagaaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatt 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  5621580 gttcaagagaagagaaaagggttagaagggagaaaaacttgaagactcaagatgtgatagagattctaagagatgaattgaagctttggctatgattatt 5621679  T
Q  100 tgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattt 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5621680 -gctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataattaattagttgtaatttttcattaattgcatgcttaagtgcttaattgaataagtgattattt 5621778  T
Q  200 tgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgat 264  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5621779 tgctcatagttgttgaaattcgtgtttttgctatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgat 5621844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 38 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 6457044 - 6456673
Alignment:
Q  38 cttgaagac-taagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataa 136  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| | || ||||||||||| | ||||| |||||    
T  6457044 cttgaagacctaagaggtggtggagattctaggagctaaattgaagcttgggttaggatt-tttgctaactaagataagggggttagatttcaaccataa 6456946  T
Q  137 tcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgat 235  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||  ||||||     
T  6456945 tcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaataagtgatta-tttgttcatagttgttgaaattcgtgctctaattatgaa 6456847  T
Q  236 gatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattg--------------- 320  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
T  6456846 gatacgtttgaatacatgaaattggcgataattgaa---ttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattatgctcaaa 6456750  T
Q  321 ----tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatat 393  Q
        ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  6456749 ttgttgaattgtgttatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatat 6456673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 331
Target Start/End: Original strand, 16835099 - 16835416
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| || | |||||||    
T  16835099 aaaagggttagaagggaga-aagcttgaagaaccgagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagcttttgttaggattattt-cttactgaggta 16835196  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttat-taattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgt 211  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||| ||||   |||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  16835197 agggggttagatttcaatcataatcacttagttgtaatcttttccctaattatatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttgcacttagttgt 16835296  T
Q  212 taaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat 311  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16835297 tgaaatttgtgctcttgttatgatgatatgtttgggtacatgaaattggtgataattgatttgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaat 16835396  T
Q  312 gatatattgtgaattgtgct 331  Q
      ||||||||||||||||||    
T  16835397 agtatattgtgaattgtgct 16835416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 29918423 - 29918095
Alignment:
Q  4 caagagaagag-aaaatggttagaagggagagaag-cttgaagac-taagaggtgatagagatt-ctaagagctaaattgaagctttggctaggattatt 99  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||| | |||||||||||||||| || |||||||||  ||    
T  29918423 caagagaagaggaaaagggttagaag--agagaagacttgaagacctaagaggtggtggagatttccaagagctaaattgaagtttgggctaggatg-tt 29918327  T
Q  100 tgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattt 199  Q
      |||| | |||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  29918326 cactaactaaggtaagggggttagatttcaaccataatcaattagttgtaacttttcattaattgcatgattaaatgcttaattgaataagtgatt-ttt 29918228  T
Q  200 tgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 298  Q
    || || |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29918227 tgttcatagttgttgaaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 29918128  T
Q  299 agtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  29918127 agtatgtgaacaggatatattgtgaattatgct 29918095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23417688 - 23417371
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  23417688 aaaagggttagaagggaga-aagcttgaagaaccaagaggtgataaagattcgaggagctaaattgaagtttttgctaggattattt-cttattgaggta 23417591  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttat-taattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgt 211  Q
    ||||||||| | |||||||||||||  ||| || |||||| ||   |||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| || | ||||    
T  23417590 agggggttatatttcaatcataatctcttagtt-taatttcttccctaattctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttgcacttaattgt 23417492  T
Q  212 taaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaa- 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  23417491 tgaaattcgtgctcttgttatgatgatttgtttgagtacatgaatttggtgatgattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaat 23417392  T
Q  311 tgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  23417391 tggtatattgtgaattgtgct 23417371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 19874189 - 19873933
Alignment:
Q  35 aagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatca 133  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  19874189 aagcttgaagaaccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagcttttgctaggattatt-gtttattgaggtaagggggttagatttccatca 19874091  T
Q  134 taatcaattaattgtaattttttat-taattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgtta 231  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||   |||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19874090 taatcacttagttgtaatcttttccctaattatatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttgcacttagttgttgaaattcgtgctcttgtta 19873991  T
Q  232 tgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattg 289  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19873990 tgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattg 19873933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 87 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24084451 - 24084207
Alignment:
Q  87 ggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgat 186  Q
    |||||||||| ||| |||| | |||||||||| ||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  24084451 ggctaggatttttt-ctaactaaggtaaggggattagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaa 24084353  T
Q  187 taagtgattattt-tgctctagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaa 285  Q
    ||||||||||||| | |  || ||| | | |||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24084352 taagtgattatttgttcattaattggtgacattcgtgccctaattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtaaa 24084253  T
Q  286 attgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24084252 attacatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 24084207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 33 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 37983792 - 37983412
Alignment:
Q  33 agaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaat 131  Q
    ||||||||||||| | |||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||| | | | |||||| | |||||||||||||| | ||||||    
T  37983792 agaagcttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctagaaatttgtgctaactaaggtaagggggttagaattcaat 37983693  T
Q  132 cataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgtt 230  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| || | || |||||||||||||| |||||||   |    
T  37983692 cataatcatttagt-gtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagtaagtgattaatt-gttcatagttgttaaaatttgtgctctatct 37983595  T
Q  231 atgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg-------- 322  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||            
T  37983594 atggtgatatatttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatattcaaagtatgtgaaagtgatatattgtgaattatgc 37983495  T
Q  323 -----------aattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
               ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  37983494 tctaaatgttgaattgtgctatgttattgttgaattgtaatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagtgatatt 37983412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 69 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22886022 - 22885772
Alignment:
Q  69 gagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatg 168  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||        |||     
T  22886022 gagctaaattgaagcttaggctaggatt-tgtgctaattgaggtaagggggttagatttcaaccataatcaattagttgtaatttttt--------cat- 22885933  T
Q  169 cttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataat 267  Q
      ||||||||||||||| ||| |||| |||| | || | |||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22885932 --taagtgcttaattgaataattgataattt-gttcatggttgttgaaattcgtgctttaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataat 22885836  T
Q  268 tgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22885835 tgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgttatattgtgaattgtgct 22885772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 298
Target Start/End: Original strand, 11763304 - 11763588
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||    
T  11763304 aaaagggttagaagggaga-aagcttgaagaaccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagcttttgctaggatt-gttgcttattgaggta 11763401  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttat--taattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttg 210  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||  ||| || |||||| || |  |||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  11763402 agggggttagatttcattcataatcctttagtt-taatttcttctcctaattatatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttgcacttagttg 11763500  T
Q  211 ttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 298  Q
    || ||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||  || |||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  11763501 ttgaaatttgtgctcttgttacgatgatatgtttgagtagatgaatttgatgataattgagttgatgttgatgaaatttcatgttcat 11763588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 109 - 332
Target Start/End: Original strand, 21310605 - 21310827
Alignment:
Q  109 aggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tag 207  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| || | |||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| || | || ||     
T  21310605 aggtaagggggttaaaattca-tcataatcattttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagtaagtgattaatt-gttcataa 21310702  T
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 307  Q
     ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  21310703 atgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtttgtga 21310802  T
Q  308 aaatgatatattgtgaattgtgcta 332  Q
    |||||||||||  |||||| |||||    
T  21310803 aaatgatatatgttgaattatgcta 21310827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 33 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21617444 - 21617159
Alignment:
Q  33 agaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaat 131  Q
    ||||||||||||| | |||| ||| ||||||| ||| |||||||| ||||| || |||||||| | | |||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  21617444 agaagcttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaaggttgggctaggaat-tgtgctaattaaggtaagggggttagaattcaat 21617346  T
Q  132 cataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattt-tgctctagttgttaaaattcgtgctcttgtt 230  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| | | |||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||| || | |  ||||||||| ||||||||||||  ||    
T  21617345 cataatcatttagt-gtaatttttcaattattgtatgattaagtgcttaattgagtaagggattaattgttcattagttgttagaattcgtgctctaatt 21617247  T
Q  231 atgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatat 318  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| || |||||    
T  21617246 atgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattggattgttgttagtgaaattgcatgttccaagtatatgaaagtgttatat 21617159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 103 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 19862567 - 19862339
Alignment:
Q  103 taattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgc 202  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| || | |||||||||| |||  ||| |||  ||||||||||||||| |||||||||| || |     
T  19862567 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcatttgttgtatgaataagtgcttaattgagtaagtgattaatt-gt 19862469  T
Q  203 tc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagt 301  Q
    || ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  19862468 tcatagatgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 19862369  T
Q  302 atgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||| |||| ||||||||  |||||| ||||    
T  19862368 atgagaaagtgatatatgttgaattatgct 19862339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 331
Target Start/End: Original strand, 21222428 - 21222725
Alignment:
Q  33 agaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaat 131  Q
    ||||||||||||| | ||||  || ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |   || ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  21222428 agaagcttgaagattcaagaattggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtatgggggttagagttcaat 21222527  T
Q  132 cataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgtt 230  Q
    |||||| | ||| | ||||||||| | | |||| ||| |||||||||||||||| ||  |||||| || | || ||||||||| ||||||||||||  ||    
T  21222528 cataattatttagt-gtaatttttcaattattgtatgattaagtgcttaattgagtat-tgattaatt-gttcatagttgttagaattcgtgctctaatt 21222624  T
Q  231 atgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgc 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||  |||||| |||    
T  21222625 atgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattaaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatatgaaagtgttatatgttgaattatgc 21222724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 109 - 318
Target Start/End: Original strand, 21297071 - 21297279
Alignment:
Q  109 aggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tag 207  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||| | || | |||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| || | || ||     
T  21297071 aggtaagggggttagaattca-tcataattattttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagtaagtgattaatt-gttcataa 21297168  T
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 307  Q
     ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  21297169 atgttaaaattcgtcctctaactatgatgatatgtttgaacgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtttgtga 21297268  T
Q  308 aaatgatatat 318  Q
    |||||||||||    
T  21297269 aaatgatatat 21297279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 109 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 432813 - 432593
Alignment:
Q  109 aggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tag 207  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| | | ||||||| | |  |||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| || | || ||     
T  432813 aggtaagggggttagaattca-tcataatcatttact-gcaatttttcaattgttgcatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gatcataa 432717  T
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 307  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||    
T  432716 ttgttaaaattcgcgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgtagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatgaga 432617  T
Q  308 aaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    |||||||||||  |||||| ||||    
T  432616 aaatgatatatgttgaattatgct 432593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 214 - 305
Target Start/End: Original strand, 23981516 - 23981607
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgt 305  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  23981516 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgtatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatgt 23981607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Original strand, 24225136 - 24225328
Alignment:
Q  4 caagagaagag--aaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattattt 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||| | || ||||||||||||| | |||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| | | |    
T  24225136 caagagaagaggaaaaatggttagaggaga-agaagcttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaat-tgt 24225233  T
Q  101 gctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgatta 196  Q
    ||||| | ||||||||| |||| | |||||||||||||| ||| | ||||||||| | || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24225234 gctaactaaggtaagggagttagaattcaatcataatcatttagt-gtaatttttcactagttgtatggttaagtgcttaattgattaagtgatta 24225328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 208 - 331
Target Start/End: Original strand, 5450837 - 5450960
Alignment:
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 307  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  5450837 ttgttagaattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 5450936  T
Q  308 aaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    || ||||||||  |||||| ||||    
T  5450937 aagtgatatatgttgaattatgct 5450960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 171 - 318
Target Start/End: Original strand, 32966106 - 32966253
Alignment:
Q  171 taagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattg 269  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| || | || || ||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||  | |||| ||||||||||||    
T  32966106 taagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgttggaatgtaagaaattggtgataattg 32966204  T
Q  270 aattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatat 318  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| ||||||    
T  32966205 atttgttgttggtgaaattgaatgatcaaagtatatgaaaataatatat 32966253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 321 - 399
Target Start/End: Original strand, 26559941 - 26560019
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatattcttgg 399  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  26559941 tgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagaattatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatattgttgg 26560019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 24084198 - 24084137
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  24084198 tgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgtgaatcatgtttaattgatgttgttgttg 24084137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28902481 - 28902321
Alignment:
Q  171 taagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattg 269  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| || | || || |||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||| ||  || |||||||||    
T  28902481 taagtgcttaattgagtaattgattaatt-gttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattg 28902383  T
Q  270 aattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||| |||||| |||| ||||||||  |||||| ||||    
T  28902382 aattgttgttggtgaaacttcgtgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaattatgct 28902321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28938876 - 28938716
Alignment:
Q  171 taagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattg 269  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| || | || || |||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||| ||  || |||||||||    
T  28938876 taagtgcttaattgagtaattgattaatt-gttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattg 28938778  T
Q  270 aattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||| |||||| |||| ||||||||  |||||| ||||    
T  28938777 aattgttgttggtgaaacttcgtgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaattatgct 28938716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 3674152 - 3674005
Alignment:
Q  171 taagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattg 269  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| || | || || |||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||    
T  3674152 taagtgcttaattgagtaattgattaatt-gttcataattgttagaattcgtgctcaaattatgatgatatgtttgaatacattaagttgttgataattg 3674054  T
Q  270 aattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatat 318  Q
    |||||||||| | |||||| |||| ||| |||||| |||| || |||||    
T  3674053 aattgttgttagggaaatttcatgatcaaagtatgagaaagtggtatat 3674005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 7728710 - 7728563
Alignment:
Q  171 taagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattg 269  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| || | || || |||||| ||||||| |||   |||||| | ||| |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  7728710 taagtgcttaattgagtaattgattaatt-gttcataattgttagaattcgtactccaattatgaagttatatttgaatggatgaaattggtgataattg 7728612  T
Q  270 aattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatat 318  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  7728611 atttgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatat 7728563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16595858 - 16595650
Alignment:
Q  109 aggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tag 207  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||| || | ||||| |||| | | |||| |||  ||||||||||||||| ||| ||| || || | || ||     
T  16595858 aggtaagggggttagaattca-tcataatcattttagtgtaaattttcaattattgtatgaataagtgcttaattgagtaattgactaatt-gttcataa 16595761  T
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 307  Q
    |||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||| | | |||||| |||||||| |||||| ||    
T  16595760 ttgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgatagagaaatttcatgttcaaagtatgaga 16595661  T
Q  308 aaatgatatat 318  Q
    || || |||||    
T  16595660 aagtggtatat 16595650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 391
Target Start/End: Original strand, 16835426 - 16835495
Alignment:
Q  322 gaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagat 391  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  16835426 gaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattaatgttgttgttgttaagagat 16835495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 331 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22885753 - 22885690
Alignment:
Q  331 tatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22885753 tatgttgttgttgaattatgttgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 22885690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 21617137 - 21617076
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  21617137 tgaattgttctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttg 21617076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 385
Target Start/End: Original strand, 11763631 - 11763695
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttg 385  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  11763631 tgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgggattcatgtttaattgttgttgttgttgttg 11763695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23417362 - 23417299
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgtt 384  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23417362 tgaattgtgctatgttgttgttgatttgtggtgacattcatgtttaattgatgttgttgttgtt 23417299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 29918076 - 29918013
Alignment:
Q  331 tatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||    
T  29918076 tatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaactgatgttgttgttgctaagagatatt 29918013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 7728541 - 7728480
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  7728541 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttg 7728480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 19862330 - 19862269
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  19862330 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcatgtgcaattgatgttgttgttg 19862269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 23494040 - 23493979
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  23494040 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttg 23493979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 394
Target Start/End: Original strand, 23234628 - 23234684
Alignment:
Q  338 ttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  23234628 ttgttgattagtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttattgttaagagatatt 23234684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 323 - 382
Target Start/End: Original strand, 21222736 - 21222795
Alignment:
Q  323 aattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||    
T  21222736 aattgtgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattaatgttgttgttg 21222795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 21906898 - 21906778
Alignment:
Q  262 gataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattg-tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatca 360  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||| |||||||| ||||||  || ||| |  |||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||  |||    
T  21906898 gataattgaattgatgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaatatgttcaattgatgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttca 21906799  T
Q  361 tgtttaatggatgttgttgtt 381  Q
    || | ||| ||||||||||||    
T  21906798 tgatcaattgatgttgttgtt 21906778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 298
Target Start/End: Original strand, 22662683 - 22662767
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 298  Q
    |||||||||||| |||| |  |||||| ||||||||  | ||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22662683 aaattcgtgctcatgttgtagtgatatatttgaatatgttaatttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcat 22662767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 331 - 382
Target Start/End: Original strand, 23981652 - 23981703
Alignment:
Q  331 tatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  23981652 tatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttg 23981703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 19873934 - 19873892
Alignment:
Q  352 tgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  19873934 tgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 19873892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 23507212 - 23507104
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 313  Q
    ||||||||||||   || |||||||||||||| || ||||||  || ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  23507212 aaattcgtgctccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaat-tgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatga 23507115  T
Q  314 tatattgtgaa 324  Q
    ||  |||||||    
T  23507114 taagttgtgaa 23507104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 3673983 - 3673922
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||| | ||| |||||||||||||    
T  3673983 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 3673922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 299
Target Start/End: Original strand, 4199989 - 4200073
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||  || || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  4199989 aaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaat-tgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcata 4200073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23466637 - 23466588
Alignment:
Q  261 tgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaa 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||| |||||    
T  23466637 tgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgagaaaa 23466588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 394
Target Start/End: Original strand, 24225443 - 24225516
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||| ||  | ||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||    
T  24225443 tgaattgtgctattttgttgttgatttgtggtggaattcatgtttaattgatgttattgttgttatgagatatt 24225516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 324
Target Start/End: Original strand, 29188290 - 29188396
Alignment:
Q  216 attcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgata 315  Q
    ||||||||||||  | ||||| |||||||| || ||||||  || ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  29188290 attcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaat-tgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgata 29188387  T
Q  316 tattgtgaa 324  Q
      |||||||    
T  29188388 agttgtgaa 29188396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 38 - 331
Target Start/End: Original strand, 786 - 1079
Alignment:
Q  38 cttgaagac-taagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataa 136  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| | |||||||||||||| | |||||||||||    
T  786 cttgaagacctaagaggtggtggagattctatgagctaaattgaagcttgggctaggatttttt-ctaactaaggtaagggggttagatttcaatcataa 884  T
Q  137 tcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgat 235  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  885 tcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattaaataagtgattattt-gttcatagttgttaaaattcgtgttctaattatgat 983  T
Q  236 gatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  984 gatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgggaattgtgct 1079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 61 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 3651 - 3300
Alignment:
Q  61 gattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttatta 160  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||   ||    
T  3651 gattctaggagttaaagtgaagcttgggctaggatt-tgagctaattaaggcaagggggttagaattcaatcataatcaattagttgtaatttttcccta 3553  T
Q  161 attgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatg 259  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3552 atttcatgcttaagtgcttaattgaataagtgattattttgctcatagttgttgaaattcgtgcgcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaattg 3453  T
Q  260 gtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtga-------------------attgtgctatgttattg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||| |||    
T  3452 gtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgggctctaattgttgaattgtgctatgttgttg 3353  T
Q  341 ttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  3352 ttgaattgtgatga-aatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatt 3300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 46 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 108424 - 108139
Alignment:
Q  46 ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaat 145  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||| |||| |||||||| | |||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |    
T  108424 ctaagaggtggtagtgattctaggagataaattgacgcttgggctacgatt-tttgctaactaaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagt 108326  T
Q  146 tgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgttt 244  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  108325 tgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaataagtgattattttgctcttacatgttgaaattcgtgctcttgttatgatgttatgttt 108226  T
Q  245 gaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  108225 gagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatggtatattatgaattatgct 108139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 108119 - 108058
Alignment:
Q  333 tgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  108119 tgttattgttgaattgtgatgaagatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagatatatt 108058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 393
Target Start/End: Original strand, 680 - 1072
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  680 aaaagggttagaagggaga-aagcttgaagaaccaagaggagatagagattctaggagctaaattgaagcttttgctaggattatt-gcttattgaggta 777  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttatt-aattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgt 211  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||| ||||    ||||  || | |||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  778 agggggttagatttcaatcataatcacttagttgtaatcttttccccaattctatacataagtgcttatttgaataagtgattattttgcacttagttgt 877  T
Q  212 taaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat 311  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  878 tgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtaaatgaatttggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaat 977  T
Q  312 -gatatattg------------tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatat 393  Q
     | | |||||            |||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  978 gggtgtattgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaaatgtggggagattcatgtttaattgatgttgttgttgttatgagatat 1072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 331
Target Start/End: Original strand, 2572 - 2889
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||    
T  2572 aaaagggttagaagggaga-aagcttgaagaaccaagaggtgatagagattataggagctaaattgaagcttttgctaggattatt-gcttgttgaggta 2669  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttat-taattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgt 211  Q
     |||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||| ||||   |||||  |||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  2670 cgggggttatatttcaatcataatcacttagttgtaatcttttccctaattatatgcataactgcttatttgaataagtgattattttgcacttagttgt 2769  T
Q  212 taaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat 311  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  2770 tgaaattcgtactcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaatcgttgttgataaaattgcattttcataatatgtgaaaat 2869  T
Q  312 gatatattgtgaattgtgct 331  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  2870 ggtatattgtgaattgtgct 2889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 385
Target Start/End: Original strand, 2908 - 2962
Alignment:
Q  331 tatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttg 385  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  2908 tatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaatttatgttgttgttgttg 2962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 61 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 5003 - 4735
Alignment:
Q  61 gattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttatta 160  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||    
T  5003 gattctaggatctaaattgaagcttgggctaggatt-tgtgctaattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtggtaatttttcatta 4905  T
Q  161 attgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctctagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatgg 260  Q
    |||||||| |||||| |||| |||| ||| |||||||| | |  |||||||| ||||||||| | |  ||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  4904 attgcatgattaagtacttagttgaataactgattattgttca-tagttgttgaaattcgtgttttaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattgg 4806  T
Q  261 tgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4805 tgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 4735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4716 - 4663
Alignment:
Q  331 tatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgtt 384  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4716 tatgttgttgttgaattgtgatgggaatcatgtttaattgatgttgttgttgtt 4663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 46 - 331
Target Start/End: Original strand, 23506 - 23789
Alignment:
Q  46 ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaat 145  Q
    |||||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||| | ||| |    
T  23506 ctaagaggtggtgaagattctaggagctaaagtgaagcttgggctaggatt-tttgctaattaagataagggggttagaattcaatcataatga-ttagt 23603  T
Q  146 tgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgttt 244  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||| | || |||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||||    
T  23604 tgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaataattgattattt-gttcatagttgttgaaattcgtgctttaattatggtgatatgttt 23702  T
Q  245 gaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    | |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23703 gtatacatgaaatttttgataattgaattgttgttggagaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 23789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 33 - 382
Target Start/End: Original strand, 43617 - 43985
Alignment:
Q  33 agaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaat 131  Q
    ||||||||||||| | |||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| | | |||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  43617 agaagcttgaagatttaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcaat 43716  T
Q  132 cataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgtt 230  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| | |  ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| || | || ||||||||||||||  ||||||  ||    
T  43717 cataatcatttagt-gtaatttttcaattgttgtatgattaagtgcttaattgagtaagtgattaatt-gttcatagttgttaaaattaatgctctaatt 43814  T
Q  231 atgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaatt---- 326  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||  ||||||        
T  43815 atgatgctatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaaggatatgaaagtgatatatgttgaattgggt 43914  T
Q  327 ---------------gtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
                   |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43915 tctaaatgtcaaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 43985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 321 - 384
Target Start/End: Original strand, 23798 - 23861
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgtt 384  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23798 tgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgacgttgttgttgtt 23861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 61 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 6943 - 6592
Alignment:
Q  61 gattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttatta 160  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| | |||||||||||||| | || || ||||| ||||||  |||||||||| ||||    
T  6943 gattctaggagctaaattgaagcttgggctatgatt-tttgctaactaaggtaagggggttagaatttaaccataaccaattaggtgtaatttttcatta 6845  T
Q  161 attgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatg 259  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||| | ||||| ||| |||  ||||| |||||||||| |||||||| || ||    
T  6844 attgcatgattaagtgcttaattgaataagtgattattt-gttcatagttgatgaaatttgtgttctaattatggtgatatgtttaaatacatggaattg 6746  T
Q  260 gtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattg-------------------tgaattgtgctatgttattg 340  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   |||||||||||||||| |||    
T  6745 gtgataattgaattgttattggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgagttatactcaaattgttgaattgtgctatgttgttg 6646  T
Q  341 ttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||    
T  6645 ttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgatgttgttgctaagagatatt 6592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 69 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 31411 - 31150
Alignment:
Q  69 gagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatg 168  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| | | |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | ||||||||| | | |||| |||    
T  31411 gagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagt-gtaatttttcaattattgtatg 31313  T
Q  169 cttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataat 267  Q
     |||||||||||||||| |||||||||| || | || ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31312 attaagtgcttaattgagtaagtgattaatt-gttcatagttgttagaattcgtgctctaattatgatgatatatttgaatgcatgaaattggtgataat 31214  T
Q  268 tgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||| ||||    
T  31213 tggattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaagtgttatatgttgaattatgct 31150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 31141 - 31080
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  31141 tgaattgtgctatgttcttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttg 31080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 5868 - 5595
Alignment:
Q  4 caagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaagac-taagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttg 101  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  5868 caagagaagaggaaaagggttagaagagag-gagacttgaagacctaagaggtggtggtgattctaggagctaaattgaagcttgggctaggatt-tttg 5771  T
Q  102 ctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttg 201  Q
    |||| | |||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  5770 ctaactaaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaattttttattaattccatg-ttaagtgcttaattgaataagtgatta-tttg 5673  T
Q  202 ctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgt 278  Q
     || |  || || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5672 ttcatcatttttgaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgt 5595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 331
Target Start/End: Original strand, 33214 - 33531
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  33214 aaaagggttagaagggaga-aagcttgaagaaccaagaggtgatatagattctaggaactaaattgaagcttttgctaggattattt-cttattgaggta 33311  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattt-tttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgt 211  Q
    ||||||||| | |||||||||||||  ||| || |||||| ||   |||||  |||| |||||||||| |||| | |||||||||||||  | || || |    
T  33312 agggggttagatttcaatcataatctcttagtt-taatttcttccctaattctatgcataagtgcttatttgaatgagtgattattttgtacttaatttt 33410  T
Q  212 taaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat 311  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  33411 tgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaatttggtgataattaaattgatgtagatgaaattgaatgttcataatatgagaaaat 33510  T
Q  312 -gatatattgtgaattgtgct 331  Q
     | |||||| | |||||||||    
T  33511 aggtatattataaattgtgct 33531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 33 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 69885 - 69587
Alignment:
Q  33 agaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaat 131  Q
    ||||||||||||| | |||| ||| ||||||| ||| ||| |||| |||||||| |||||||| | | |||||||| || ||||||||||| | ||||||    
T  69885 agaagcttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggagttaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaagataagggggttagaattcaat 69786  T
Q  132 cataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgtt 230  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| | | |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||  ||    
T  69785 cataatcatttagt-gtaatttttcaattattgtatgattaagtgcttaattgagaaagtgattaatt-gttcatagttgttaaaattcgtgctctaatt 69688  T
Q  231 atgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgc 330  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||  |||||| |||    
T  69687 atgatgatatgtttaaatgcatgaaattggttataattgaattgttgtaggtgaaattgcatgtttaaagtatgtgaaagtgttatatgttgaattatgc 69588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 138
Target Start/End: Original strand, 244578 - 244686
Alignment:
Q  30 gagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttc 128  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||   || | |||    
T  244578 gagagaagcttgaagaactaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagcttttgctaggatta-ttgcttatttaggtaagggaactagatttc 244676  T
Q  129 aatcataatc 138  Q
    ||||||||||    
T  244677 aatcataatc 244686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 69578 - 69517
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  69578 tgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttg 69517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Original strand, 26781 - 27051
Alignment:
Q  4 caagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaagac-taagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttg 101  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  26781 caagagaagaggaaaagggttagaagagag-gagacttgaagacctaagaggtggtggtgattctaggagctaaattgaagcttgtgctaggatt-tttg 26878  T
Q  102 ctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttg 201  Q
    |||| | |||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  26879 ctaactaaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattccatg-ttaagtgcttaattgaataagtgatta-tttg 26976  T
Q  202 ctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgt 275  Q
     || |  ||||| ||| ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26977 ttcatcattgttgaaaatcgtgctataattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgt 27051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 170 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 85823 - 85663
Alignment:
Q  170 ttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataatt 268  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| || | || |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  85823 ttaaatgcttaattgaataagtgattaatt-gttcatagttgttgaaattcgtgctctaattatgatgatatgttt-aatgcatgaaattggtgataatt 85726  T
Q  269 gaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  85725 gaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattatgct 85663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 103 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 53703 - 53499
Alignment:
Q  103 taattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgc 202  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | ||||||||| | | |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| || |     
T  53703 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagt-gtaatttttcaattattgtatgattaagtgcttaattgagtaagtgattaatt-gt 53606  T
Q  203 tc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagt 301  Q
    || ||||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  53605 tcatagttgttagaattcatgctctaataatgatgatatgtttgaatgcatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 53506  T
Q  302 atgtgaa 308  Q
    |||||||    
T  53505 atgtgaa 53499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 331 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 85644 - 85581
Alignment:
Q  331 tatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||    
T  85644 tatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaagtgatattgttgttgctaagagatatt 85581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 53446 - 53406
Alignment:
Q  342 tgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  53446 tgaattgtgatgagattcatgttcaatggatgttgttgttg 53406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 33 - 309
Target Start/End: Original strand, 197073 - 197348
Alignment:
Q  33 agaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaat 131  Q
    ||||||||||||| | |||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| | | |||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  197073 agaagcttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaat-tgtgctaattaaggtaagggggttagaattcaat 197171  T
Q  132 cataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctct-agttgttaaaattcgtgctcttgtt 230  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| || | ||| || |||| || |||| |||||  ||    
T  197172 cataatcatttagt-gtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattggataagtgattaatt-gttcttagatgttgaatttcgggctctaatt 197269  T
Q  231 atgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaa 309  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  197270 atgatgatatgtttgaatgtatgaaattgttgataattgaattgttgttggtgaaattgcaagttcaaagtatgtgaaa 197348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Original strand, 197379 - 197440
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  197379 tgaattgtcctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttg 197440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 2953 - 2655
Alignment:
Q  33 agaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaat 131  Q
    ||||||||||||| | |||| ||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||  ||||||| | |||||||| | ||||||| |||||| | ||||||    
T  2953 agaagcttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctaggaatttttgctaactaaggtaagcgggttagaattcaat 2854  T
Q  132 cataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgtt 230  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| |||  ||| | | |||  || |||||| | |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||  ||    
T  2853 cataatcatttagt-gtaatttttcatttgttgtaagattagatgattaattcagtaagtgattaatt-gttcatagttgttaaaattcgtgctctaatt 2756  T
Q  231 atgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgc 330  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||  |||||| |||    
T  2755 atgatgatatgtttggatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatatgaaagtgttatatgttgaattatgc 2656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 2646 - 2585
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  2646 tgaattatgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttg 2585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 33 - 331
Target Start/End: Original strand, 97018 - 97315
Alignment:
Q  33 agaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaat 131  Q
    ||||||||||||| | ||||  || |||||||  || ||| |||| |||||||| |||||||| | | |||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  97018 agaagcttgaagattcaagaaatggtagagatcgtaggaggtaaagtgaagcttgggctaggaat-tgtgctaatgaaggtaagggggttagaattcaat 97116  T
Q  132 cataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgtt 230  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| | | |||| ||| || |||| |||||||| | |||||||| || | || |||||||||| |||||||||||  ||    
T  97117 cataatcatttagt-gtaatttttcaattattgtatgatttagtgtttaattgagtgagtgattaatt-gttcatagttgttaagattcgtgctctaatt 97214  T
Q  231 atgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgc 330  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||  |||||| |||    
T  97215 atgatgatatgtttgaatgcataaaattggtgataattgaattgttgttggtggaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgttatatgttgaattatgc 97314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 331
Target Start/End: Original strand, 12549 - 12851
Alignment:
Q  33 agaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaat 131  Q
    ||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  12549 agaagcttgaagaaccaagaggagctagagattctaagggctaaatggaagcttttgttaggattatt-gcttattgaggtaagggggttagatttcaat 12647  T
Q  132 cataatcaattaattgtaattttttat-taattgcatgcttaagtgcttaa-ttgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttg 228  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| | |||||   ||| ||||| ||||| |||  |||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||||| |    
T  12648 cataatcacttagttgtaatcttttctctaattctttgcataagtccttaatttggataagtgattattgtgagcttatttgttgaaattcgtgctctag 12747  T
Q  229 ttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat-gatatattgtgaattg 327  Q
    || |  ||||||||||||  | |||||| |  | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  12748 ttttagtgatatgtttgaggatatgaaattattcataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcataatatgttaaaatggatatgttgtgaattg 12847  T
Q  328 tgct 331  Q
    ||||    
T  12848 tgct 12851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 318
Target Start/End: Original strand, 76693 - 76951
Alignment:
Q  60 agattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttatt 159  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |   || ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| || | |||||||||| | |    
T  76693 agatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattgctgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaat 76792  T
Q  160 aattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaat 258  Q
     |||| ||| |||||| ||||||||| ||| ||| || || | || ||| || | |||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  76793 tattgtatgattaagtacttaattgagtaattgagtaatt-gttcatagatgatgaaattcatgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaatt 76891  T
Q  259 ggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatat 318  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  76892 gttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatat 76951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Original strand, 76973 - 77034
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  76973 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtgagattcatgttcaattgatgttgttgttg 77034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 229 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 7634 - 7530
Alignment:
Q  229 ttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7634 ttatgatgatatgtttgaatacatgaaattagtgataattgaattattgttggtgaaattgcattctcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgt 7535  T
Q  329 gctat 333  Q
    |||||    
T  7534 gctat 7530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 229 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 17059 - 16955
Alignment:
Q  229 ttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17059 ttatgatgatatgtttgaatacatgaaattagtgataattgaattattgttggtgaaattgcattctcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgt 16960  T
Q  329 gctat 333  Q
    |||||    
T  16959 gctat 16955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 7506 - 7450
Alignment:
Q  338 ttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||    
T  7506 ttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttggtgttgctaagagatatt 7450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16931 - 16875
Alignment:
Q  338 ttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||    
T  16931 ttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttggtgttgctaagagatatt 16875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 2482 - 2287
Alignment:
Q  4 caagagaagagaaaatgg-ttagaagggagagaagcttgaagac-taagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttg 101  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  2482 caagagaagagaaaaagggttagaagagag-gagacttgaagacctaagaggtggtggtgattctaggaactaaattgaagcttgggctaggatt-tttg 2385  T
Q  102 ctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattt 199  Q
    |||| | |||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  2384 ctaactaaggtaagggggttagatttcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttcattgaataaatgattattt 2287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 331
Target Start/End: Original strand, 6843 - 7142
Alignment:
Q  33 agaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaat 131  Q
    ||||||||||||| | ||||  || ||||||| ||| ||| |||| |||||||| |||||||| |   || ||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  6843 agaagcttgaagattcaagaattggtagagatcctaggagttaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaat 6942  T
Q  132 cataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgtt 230  Q
     ||||||| || | |||||||||| | |  ||| |||  ||||||||||||||| ||| ||||| | ||| || || |||| ||||||||||||||  ||    
T  6943 tataatcattttaatgtaatttttcaatcgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgatt-tgttgttcataattgtcaaaattcgtgctctaatt 7041  T
Q  231 atgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgc 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||  |||||| |||    
T  7042 atgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagtgaaatttaatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaattatgc 7141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 338 - 384
Target Start/End: Original strand, 8335 - 8381
Alignment:
Q  338 ttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgtt 384  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  8335 ttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgtt 8381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 109 - 318
Target Start/End: Original strand, 1244 - 1452
Alignment:
Q  109 aggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tag 207  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||  | | |||||||||| | | |||| |||  ||||||||||||||  ||| |||||| || | || |||    
T  1244 aggtaagggggttagaattca-tcataatcatattagtgtaatttttcaattattgtatgaataagtgcttaattggataaatgattaatt-gttcatag 1341  T
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 307  Q
     ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  1342 atgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatggtcaaagtatgtga 1441  T
Q  308 aaatgatatat 318  Q
    |||||||||||    
T  1442 aaatgatatat 1452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 109 - 318
Target Start/End: Original strand, 9499 - 9707
Alignment:
Q  109 aggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tag 207  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||  | | |||||||||| | | |||| |||  ||||||||||||||  ||| |||||| || | || |||    
T  9499 aggtaagggggttagaattca-tcataatcatattagtgtaatttttcaattattgtatgaataagtgcttaattggataaatgattaatt-gttcatag 9596  T
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 307  Q
     ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  9597 atgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatggtcaaagtatgtga 9696  T
Q  308 aaatgatatat 318  Q
    |||||||||||    
T  9697 aaatgatatat 9707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 297
Target Start/End: Original strand, 22241 - 22505
Alignment:
Q  33 agaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaat 131  Q
    ||||||||||||| | ||||  || ||||||| ||| |||||||| ||||| || |||||||||||  |||||| | |||||||||||||| | ||||||    
T  22241 agaagcttgaagattcaagaattggtagagatcctaggagctaaagtgaagtttgggctaggattaactgctaactaaggtaagggggttagaattcaat 22340  T
Q  132 cataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgtt 230  Q
    |||||||| ||| | ||||||| | |||  ||| ||   ||| |||||||| || ||||||| || || | || ||||||||||||||||||||||   |    
T  22341 cataatcatttagt-gtaatttctcatttgttgtattaataaatgcttaatagaataagtgaataatt-gttcatagttgttaaaattcgtgctctaaat 22438  T
Q  231 atgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 297  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22439 atgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataatttaattgttgttggtgaatttgcatgttca 22505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 321 - 384
Target Start/End: Original strand, 22548 - 22611
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgtt 384  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22548 tgaattgtgctatgttgttgttgaattgagatgtgaatcatgtttaattgatgttgttgttgtt 22611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 698 - 369
Alignment:
Q  57 tagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaatta-attgtaattttt 155  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |   || |||||  ||||||||||||| | || ||||||||||| ||  | ||||| ||||    
T  698 tagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattagtgataattatggtaagggggttagaattgaatcataatcatttttagtgtaaatttt 599  T
Q  156 tattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctctagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaa 255  Q
     | |  ||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||| || | || |||||||| ||||||| || |  |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  598 caattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcaagttgttataattcgtcctataattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 500  T
Q  256 aatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaa--atgat-atattg-tgaattgtgctatgttattgttgaattgtga 351  Q
      || ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||   || | | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  499 gttgttgataattatattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgttgaattttgctcaaattgttgaattatgctatgttattgttgaattgtgg 400  T
Q  352 tgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    | ||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  399 taagagtcatgttcaattgatgttgttgttg 369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 13230 - 13092
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  13230 gttcaagagaagaggaaaagggttagaagggagaaaagcttgaagaaccaagaggagctagagattctaggagcttaagtgaagcttttgctaggattat 13131  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatc 138  Q
    | ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  13130 t-gcttattgaggtaagggggttagatttcaatcataatc 13092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 323 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 12884 - 12813
Alignment:
Q  323 aattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  12884 aattgtgctatgttgttgttgatttgtggtggaattcatgtttaattgatgttgttgttgttatgagatatt 12813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 206 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6916 - 6791
Alignment:
Q  206 agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgt 305  Q
    |||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  6916 agttgttataattcgtgctataattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatga 6817  T
Q  306 gaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    |||| ||||||||  |||||| ||||    
T  6816 gaaagtgatatatgttgaattttgct 6791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6782 - 6725
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgtt 378  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||    
T  6782 tgaattatgctatgctattgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgtt 6725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 109 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 8361 - 8166
Alignment:
Q  109 aggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tag 207  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||| || | |||||||||| | | |||| |||  |||||| |||||||  ||| |||||| || | || |||    
T  8361 aggtaagggggttagaattca-tcataatcattttaatgtaatttttcaattattgtatgaataagtgattaattggataaatgattaatt-gttcatag 8264  T
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgt 305  Q
     ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  8263 atgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatgt 8166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 8132 - 8070
Alignment:
Q  320 gtgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  8132 gtgaattatgctatgttgttgtggaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttg 8070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 139
Target Start/End: Original strand, 3645 - 3768
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  3645 aaaagggttagaagggaga-aagcttgaagacccaagaggtgatagagattctatgagctaaattgaagcttttgttaggatta-ttgctaattgaggta 3742  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatca 139  Q
    | ||||||| | ||||| ||||||||    
T  3743 aaggggttagatttcaagcataatca 3768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 35881 - 35621
Alignment:
Q  58 agagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaatttttta 157  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |   || ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| || | |||||||||| |    
T  35881 agagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttca 35782  T
Q  158 ttaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctcta-gttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaa 256  Q
     |  ||| |||  || |||||||||||| |||  ||||| || | || | ||| ||| |||||||||||   | |||||||||||||||||| ||||||     
T  35781 attgttgtatgaataggtgcttaattgagtaaaagattaatt-gttcaaagttcttataattcgtgctccaatcatgatgatatgtttgaatgcatgaag 35683  T
Q  257 atggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatat 318  Q
     |  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  35682 ttattgataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatat 35621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 138
Target Start/End: Original strand, 6879 - 7001
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||| | || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  6879 aaaagggttagaagggata-aagcttgaagaaccaaaaggtgatagagatcctaggagctaaattgaagcttttgctaggatta-ttgcttattgaggta 6976  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatc 138  Q
    | ||||||| | |||||||||||||    
T  6977 aaggggttatatttcaatcataatc 7001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 305
Target Start/End: Original strand, 104480 - 104714
Alignment:
Q  69 gagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatg 168  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || | | |||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||| ||| | ||||||||| | |  ||| |||    
T  104480 gagctaaagtgaagcttgggctaagaatttgtgctaattaaggtaagtgggttagaattca-tcataatcatttagt-gtaatttttcaattgttgtatg 104577  T
Q  169 cttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataat 267  Q
      ||| ||||||||||| |||||||||| || | || ||| ||||||||||| ||||||   |||||||||||||||| || ||| ||| || |||||||    
T  104578 aataattgcttaattgagtaagtgattaatt-gttcatagatgttaaaattcatgctctaactatgatgatatgtttgtatgcattaaattgatgataat 104676  T
Q  268 tgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgt 305  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  104677 tgaattgttgttggtgaatttgcaggttcaaagtatgt 104714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 48 - 138
Target Start/End: Original strand, 116008 - 116097
Alignment:
Q  48 aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatc 138  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  116008 aagaggagctagagattctaggagcataattgaagcttttgctagggtta-ttgcttattgaggtaaaggggttagatttcaatcataatc 116097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 312
Target Start/End: Original strand, 93773 - 93871
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatg 312  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||| || || ||||||  |  |||||||||||| |||||| | |||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  93773 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtatgtatgcatgaagtttttgataattgaatggttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgagaaaatg 93871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 138
Target Start/End: Original strand, 19735 - 19857
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  19735 aaaagggttagaagggaga-aagcttgaaaaaccaagaggtaatagagattctaggagctaaattgaagtttttgctaggatt-tttgcttattgaggta 19832  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatc 138  Q
    ||||||||| | |||||||||||||    
T  19833 agggggttagatttcaatcataatc 19857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 229 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 11326 - 11224
Alignment:
Q  229 ttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgt 328  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||| |    
T  11326 ttatgatgatatgtttgaatgcatgaaactagtgataattgaattgttgtttgtgaaatttcatgttcaaagtgtgtgaaagtgatatatgttgaattat 11227  T
Q  329 gct 331  Q
    |||    
T  11226 gct 11224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 338 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 11198 - 11154
Alignment:
Q  338 ttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  11198 ttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttg 11154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 206 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28791 - 28666
Alignment:
Q  206 agttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgt 305  Q
    ||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||     
T  28791 agttgttatcattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaacttgttgataactgaattgttgttggtgaaattatatgttcaaagtatga 28692  T
Q  306 gaaaatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    |||| ||||||||  |||||| ||||    
T  28691 gaaagtgatatatgttgaattatgct 28666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 43907 - 44045
Alignment:
Q  1 gttcaagagaagag-aaaatggttagaagggagagaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattat 98  Q
    ||||||||||| || |||| ||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||| | ||| |||||||||||    
T  43907 gttcaagagaaaaggaaaagggtcagaagggaaa-aagcttgaagactcaagaggtgatagagattttaggagttaaattgaggtttttgctaggattat 44005  T
Q  99 ttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatca 139  Q
    | |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  44006 t-gctaattgaggtaacggggttagatttcaatcataatca 44045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 298
Target Start/End: Original strand, 44122 - 44206
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 298  Q
    |||||||||||| |||| |  |||||||||||| ||  | ||  || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  44122 aaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatggtaattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcat 44206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 331
Target Start/End: Original strand, 2213 - 2433
Alignment:
Q  109 aggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctctagt 208  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||| || | || ||||||| |||  ||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||| ||     || |    
T  2213 aggtaagggggttagaattca-tcataatcattttagtgcaatttttaattg-ttgtatgaataagtgcttaattgagtaattgattaattaatcataat 2310  T
Q  209 tgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaa 308  Q
    | ||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||    
T  2311 tattagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaa 2410  T
Q  309 aatgatatattgtgaattgtgct 331  Q
    | ||| ||||  |||||| ||||    
T  2411 agtgacatatgttgaattatgct 2433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 381
Target Start/End: Original strand, 2449 - 2502
Alignment:
Q  328 tgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgtt 381  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  2449 tgctatgttgttgttgaattatgataagactcatgttcaattgatgttgttgtt 2502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 209 - 305
Target Start/End: Original strand, 1541 - 1637
Alignment:
Q  209 tgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgt 305  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||    
T  1541 tgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaatttgcttgttaaaagtatgt 1637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 209 - 305
Target Start/End: Original strand, 8686 - 8782
Alignment:
Q  209 tgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgt 305  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||    
T  8686 tgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaatttgcttgttaaaagtatgt 8782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 11424 - 11322
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||    
T  11424 aaaagggttagaagggaga-aagcttgaggaaccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagcttttgctaagatta-ttgcttattgaggta 11327  T
Q  114 agggg 118  Q
    |||||    
T  11326 agggg 11322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 13575 - 13494
Alignment:
Q  34 gaagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaag 115  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  13575 gaagcttgaagaatcaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagcttttgctaggatta-tcgctaattgaggtaag 13494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 59 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 114116 - 113961
Alignment:
Q  59 gagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaat-ttttta 157  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | || ||||| ||||||||||  |||||| | |||||||||||||| ||| || |||| ||||      
T  114116 gagattctaggagctaaattgaagcttttgctagaaata-ttgcttattgaggtaa-cgggttagatttcaatcataatcacttagttataatcttttcc 114019  T
Q  158 ttaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaa 214  Q
    ||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  114018 ttaattatatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttgcacttagttgttaa 113961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 159547 - 159445
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 313  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||  |   |||||| | ||||||||| ||  |||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  159547 aaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataatggcattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaaaatga 159448  T
Q  314 tat 316  Q
    |||    
T  159447 tat 159445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 297
Target Start/End: Original strand, 22424 - 22512
Alignment:
Q  209 tgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 297  Q
    ||||||||||||||||||   || ||| ||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22424 tgttaaaattcgtgctctaactaggataatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttca 22512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 79788 - 79669
Alignment:
Q  212 taaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat 311  Q
    |||||||||||| ||   |||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||| || |    
T  79788 taaaattcgtgcactaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgagttgttggtggtgaaattgcatgttctaagtatgtgtaagt 79689  T
Q  312 gatatattgtgaattgtgct 331  Q
    | ||  ||||||||| ||||    
T  79688 gttaacttgtgaattatgct 79669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 332 - 394
Target Start/End: Original strand, 17458 - 17520
Alignment:
Q  332 atgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  17458 atgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgtggttaagagatatt 17520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 48 - 138
Target Start/End: Original strand, 12435 - 12524
Alignment:
Q  48 aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatc 138  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  12435 aagaggagctagagattctaggagcttaattgaagcttttgctaggatta-ttgcttattgaggtaatggggttagatttcaatcataatc 12524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 332 - 394
Target Start/End: Original strand, 61371 - 61433
Alignment:
Q  332 atgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgttgagagatatt 394  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  61371 atgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgtggttaagagatatt 61433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 229 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 1416 - 1348
Alignment:
Q  229 ttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  1416 ttatgatgatatgtttga-tacatgaaattagtgataattgagttgttgttggggaaattgcatgttcat 1348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 10914 - 10818
Alignment:
Q  209 tgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgt 305  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||||||    
T  10914 tgttataattcgtgctctatctatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgagttgttgtcggagaatttgcatgttcaaagtatgt 10818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 55409 - 55301
Alignment:
Q  30 gagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttc 128  Q
    |||| ||||||||||| | |||||| | | ||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||    
T  55409 gagaaaagcttgaagaaccaagaggagctggagattctaggagcttaattgaagatttttctaggattatt-gcttattgaggtaagggggttagatttc 55311  T
Q  129 aatcataatc 138  Q
    ||||||||||    
T  55310 aatcataatc 55301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 3116 - 3024
Alignment:
Q  30 gagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggtta 122  Q
    |||| ||||||||||| | |||||| | | |||||| || ||||| |||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  3116 gagaaaagcttgaagaacgaagaggagctggagattttaggagcttaattgaagcttatgctaggatta-ttgtttattgaggtaagggggtta 3024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 318
Target Start/End: Original strand, 116402 - 116657
Alignment:
Q  58 agagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaatta-attgtaatttttt 156  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |   || ||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||  | ||||| ||||     
T  116402 agagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagatttca-tcataatcatttttagtgtaaattttg 116500  T
Q  157 attaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaa 255  Q
    | |  ||| |||  ||||||||||||||| ||| | |||| || |||| || |||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||  ||||||    
T  116501 aatggttgtatgaataagtgcttaattgagtaaattattaatt-gctcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaaggcatgaa 116599  T
Q  256 aatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatat 318  Q
    | || |||||||||||||| ||| |||    || |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  116600 attgttgataattgaattg-tgtgggt----tttcatgttcaaagtatgagaaaatgatatat 116657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 8095 - 7948
Alignment:
Q  171 taagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattg 269  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| || | || || |||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||||  |  | |||||||    
T  8095 taagtgcttaattgagtaattgattaatt-gttcatatttgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttatttataattg 7997  T
Q  270 aattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatat 318  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||| |||||| |||| || |||||    
T  7996 aattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtggtatat 7948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 318
Target Start/End: Original strand, 8882 - 8986
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 313  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||  |   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  8882 aaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaaaatga 8981  T
Q  314 tatat 318  Q
    |||||    
T  8982 tatat 8986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 138
Target Start/End: Original strand, 2586 - 2708
Alignment:
Q  15 aaaatggttagaagggagagaagcttgaaga-ctaagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggta 113  Q
    |||| |||||||||||| | ||| ||||||| | |||| | ||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||| |||| ||||| |||||||||    
T  2586 aaaagggttagaagggaaa-aagtttgaagaaccaagacgggatagagattctaggagctaaattaaagtttttgctagaatta-ttgcttattgaggta 2683  T
Q  114 agggggttaaagttcaatcataatc 138  Q
    || |||||| | |||||||||||||    
T  2684 agtgggttagatttcaatcataatc 2708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 41771 - 41707
Alignment:
Q  320 gtgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgtt 384  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  41771 gtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgtt 41707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13628 - 13565
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgtt 384  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  13628 tgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgtt 13565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 3669 - 3462
Alignment:
Q  109 aggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgtaattttttattaattgcatgcttaagtgcttaattgattaagtgattattttgctc-tag 207  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| ||| ||||||  | | |||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||| || | || ||     
T  3669 aggtaagggggttagaattca-tcataatcattta-ttgcaattttacaattattgtatgaataagtgcttaattgagtaattgattaatt-gttcataa 3573  T
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 307  Q
    |||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||||  |  | ||||||||||||||||| | ||||||  ||||||| |||||| ||    
T  3572 ttgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttatttataattgaattgttgttagagaaatttaatgttcaaagtatgaga 3473  T
Q  308 aaatgatatat 318  Q
    || || |||||    
T  3472 aagtggtatat 3462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 293
Target Start/End: Original strand, 34319 - 34537
Alignment:
Q  76 attgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaagggggttaaagttcaatcataatcaattaattgta-attttttattaattgcatgcttaag 174  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||||  || ||   |||||  |||| ||||    
T  34319 attggagcttttgctaggattatt-gcttattgaggtaagggggttagatttcaatcataatc-tttagttgtagcttcttccctaattctatgcataag 34416  T
Q  175 tgcttaattga-ttaagtgattattttgctc-tagttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaat 272  Q
    |||||| ||||  |||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||| ||  ||||| || |||||| ||||     
T  34417 tgcttatttgagataagtgattattgtgaacttaattgttgaaattcgtgctctagttgtagtgatatgtttgagtatgtgaaattgatgataactgaac 34516  T
Q  273 tgttgttggtgaaattgcatg 293  Q
    ||||| ||  |||||||||||    
T  34517 tgttgatgtggaaattgcatg 34537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 380
Target Start/End: Original strand, 51322 - 51382
Alignment:
Q  320 gtgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgt 380  Q
    ||||||| || |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51322 gtgaattatgttatgtggttgatgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgt 51382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 86
Target Start/End: Original strand, 180701 - 180753
Alignment:
Q  35 aagcttgaagact-aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagcttt 86  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  180701 aagcttgaagacccaagaggtgatagagattctaggagctaaattgaagcttt 180753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 6136 - 6046
Alignment:
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 298  Q
    ||||| ||||| |||||| |||| |  |||||||||||| ||  | ||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  6136 ttgttgaaatttgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaaattgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcat 6046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 6281 - 6216
Alignment:
Q  48 aagaggtgatagagattctaagagctaaattgaagctttggctaggattatttgctaattgaggtaa 114  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6281 aagaggagctagagattctaggagcttaattgaagcttttgctaggatta-ttgcttattgaggtaa 6216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16146 - 16044
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 313  Q
    |||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||  |   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  16146 aaatccgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaaaatga 16047  T
Q  314 tat 316  Q
    |||    
T  16046 tat 16044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25629 - 25575
Alignment:
Q  262 gataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatat 316  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  25629 gataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaaaatgatat 25575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Original strand, 33854 - 33915
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||    
T  33854 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttg 33915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 304
Target Start/End: Original strand, 33722 - 33818
Alignment:
Q  208 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 304  Q
    |||||| ||||| |||||   ||||||||| |||||||||| | ||||  ||  |||||||||||||||||| ||| |||| |||||| | ||||||    
T  33722 ttgttagaattcatgctccaattatgatgacatgtttgaatgcttgaagttgtggataattgaattgttgttagtggaatttcatgtttaaagtatg 33818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 318
Target Start/End: Original strand, 576 - 680
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 313  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||| |   |||||| |||||||||||  |  |||| |||||||| |||||| |||||||     
T  576 aaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaaattatggataatagaattgttgttaattgaattacatgttcaaagtatgagaaaatgg 675  T
Q  314 tatat 318  Q
    |||||    
T  676 tatat 680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 2163 - 2059
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 313  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||  |   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||| |||||||     
T  2163 aaatttgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgcgaaaatgg 2064  T
Q  314 tatat 318  Q
    |||||    
T  2063 tatat 2059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 298
Target Start/End: Original strand, 1509 - 1593
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 298  Q
    |||||||||||| |||| |  |||||||||||| ||  | ||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1509 aaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcat 1593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 33909 - 33805
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 313  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||  |   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||| |||| ||     
T  33909 aaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatagataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaattgg 33810  T
Q  314 tatat 318  Q
    |||||    
T  33809 tatat 33805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 331 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 2566 - 2515
Alignment:
Q  331 tatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  2566 tatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttg 2515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 215 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 2701 - 2598
Alignment:
Q  215 aattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgat 314  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||    |||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||| ||| ||| ||| | ||||||||||    
T  2701 aattcgtgctcctattatgatggtatgtttgtatgtgagaaattggtgataattggttggttgttggagaaattgaatgatcaaagtgtatgaaaatgat 2602  T
Q  315 atat 318  Q
    ||||    
T  2601 atat 2598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 214 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 3210 - 3128
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 297  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||| || || ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  3210 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 3128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 263 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 219 - 164
Alignment:
Q  263 ataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatat 318  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||| || |||||    
T  219 ataattgaattgttgttggttgaattgcatgttcaaagtatgagaaattggtatat 164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 70323 - 70389
Alignment:
Q  230 tatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 297  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  70323 tatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattcaattattgtt-gtgaatttgcatgttca 70389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 89880 - 89946
Alignment:
Q  230 tatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 297  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  89880 tatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgatacttgaattgttgtt-gtgaatttgtatgttca 89946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Original strand, 9353 - 9461
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 313  Q
    ||||||||||| ||| | ||||| |||||||| || ||||||  || ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  9353 aaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat-tgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatga 9450  T
Q  314 tatattgtgaa 324  Q
    ||  |||||||    
T  9451 taagttgtgaa 9461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Original strand, 16251 - 16359
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 313  Q
    ||||||||||| ||| | ||||| |||||||| || ||||||  || ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  16251 aaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat-tgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatga 16348  T
Q  314 tatattgtgaa 324  Q
    ||  |||||||    
T  16349 taagttgtgaa 16359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 306 - 269
Alignment:
Q  261 tgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcat 298  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  306 tgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcat 269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0786
Description:

Target: scaffold0786; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Original strand, 4450 - 4511
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||| | || ||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4450 tgaattatgctatgatgtttttgaattatgaagagaaccatgtttaattgatgttgttgttg 4511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Original strand, 2983 - 3044
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||| | || ||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  2983 tgaattatgctatgatgtttttgaattatgaagagaaccatgtttaattgatgttgttgttg 3044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Original strand, 15967 - 16028
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttg 382  Q
    |||||| ||||||| | || ||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  15967 tgaattatgctatgatgtttttgaattatgaagagaaccatgtttaattgatgttgttgttg 16028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 46287 - 46226
Alignment:
Q  320 gtgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgtt 381  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||    
T  46287 gtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgtt 46226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 324
Target Start/End: Original strand, 13331 - 13437
Alignment:
Q  216 attcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgata 315  Q
    ||||||||||||  | ||||| |||||||| || ||||||  || ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  13331 attcgtgctcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatgaat-tgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgata 13428  T
Q  316 tattgtgaa 324  Q
      |||||||    
T  13429 agttgtgaa 13437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6189 - 6093
Alignment:
Q  214 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaa 310  Q
    |||||||||||||  |||||| || ||||||||||  |||||  |   |||||||| ||||||||||||  |||| |||||||| |||||| |||||    
T  6189 aaattcgtgctctaattatgacgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattggattgttgttggtagaatttcatgttcaaagtatgagaaaa 6093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 232 - 324
Target Start/End: Original strand, 3616 - 3706
Alignment:
Q  232 tgatgatatgtttgaatacatgaaaatggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaa 324  Q
    |||||||||||||| || ||||||  || ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||  |||||||    
T  3616 tgatgatatgtttgtatgcatgaat-tgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgataagttgtgaa 3706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 5343 - 5275
Alignment:
Q  321 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatg-tttaatggatgttgttgttgttgaga 388  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||    
T  5343 tgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagatttaattgatgttgttgttgctgaga 5275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 320 - 384
Target Start/End: Original strand, 24853 - 24917
Alignment:
Q  320 gtgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaatggatgttgttgttgtt 384  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||  ||||| | ||| |||||||||||||||    
T  24853 gtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 24917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University