View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17479_high_7 (Length: 215)

Name: NF17479_high_7
Description: NF17479
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17479_high_7
NF17479_high_7
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (1-215)||(29188123-29188336)
chr5 (2-215)||(18777830-18778043)
chr5 (2-215)||(19500100-19500312)
chr5 (2-215)||(22366318-22366532)
chr5 (2-215)||(4199823-4200036)
chr5 (2-179)||(25426829-25427009)
chr5 (2-215)||(12575-12788)
chr5 (2-215)||(21073433-21073646)
chr5 (27-215)||(21932220-21932411)
chr5 (27-215)||(21938390-21938581)
chr5 (27-215)||(35582262-35582453)
chr5 (2-187)||(43443261-43443446)
chr5 (37-215)||(36989609-36989790)
chr5 (1-204)||(27010041-27010244)
chr5 (1-215)||(10777809-10778026)
chr5 (27-215)||(22882923-22883114)
chr5 (1-204)||(17471438-17471644)
chr5 (1-179)||(11211940-11212121)
chr5 (1-204)||(35790947-35791154)
chr5 (26-204)||(7425549-7425729)
chr5 (1-202)||(23514761-23514966)
chr5 (27-178)||(1219396-1219550)
chr5 (105-215)||(11343008-11343118)
chr5 (36-178)||(23328792-23328937)
chr5 (36-178)||(24616396-24616541)
chr5 (36-178)||(24712772-24712917)
chr5 (36-178)||(24745790-24745935)
chr5 (105-215)||(16105967-16106077)
chr5 (1-53)||(34939476-34939528)
chr5 (1-53)||(18531079-18531131)
chr5 (1-53)||(23507164-23507216)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (1-215)||(6774098-6774310)
chr8 (1-215)||(24549181-24549394)
chr8 (27-215)||(271199-271390)
chr8 (27-215)||(644530-644721)
chr8 (27-215)||(830265-830456)
chr8 (36-215)||(15318998-15319180)
chr8 (36-215)||(15499367-15499549)
chr8 (1-205)||(21851813-21852017)
chr8 (27-215)||(22088633-22088824)
chr8 (6-215)||(30120927-30121137)
chr8 (1-205)||(21844420-21844624)
chr8 (6-187)||(16674258-16674439)
chr8 (1-204)||(22006107-22006314)
chr8 (1-204)||(13720777-13720984)
chr8 (1-178)||(16872927-16873107)
chr8 (27-204)||(13662114-13662295)
chr8 (1-178)||(16195431-16195611)
chr8 (65-202)||(17345842-17345985)
chr8 (1-47)||(17345768-17345814)
chr8 (1-53)||(16404987-16405039)
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (2-215)||(2437658-2437873)
chr7 (1-215)||(16478801-16479014)
chr7 (2-215)||(13910862-13911075)
chr7 (27-215)||(7822954-7823145)
chr7 (27-215)||(7830265-7830456)
chr7 (27-215)||(27176659-27176850)
chr7 (2-204)||(10989610-10989814)
chr7 (27-215)||(27101476-27101667)
chr7 (27-215)||(27108824-27109015)
chr7 (27-215)||(38783568-38783759)
chr7 (1-204)||(13572876-13573079)
chr7 (1-204)||(15950641-15950847)
chr7 (1-204)||(18979872-18980077)
chr7 (1-204)||(15759963-15760170)
chr7 (1-204)||(15927768-15927973)
chr7 (1-178)||(13758570-13758750)
chr7 (1-204)||(14250748-14250954)
chr7 (1-136)||(18253761-18253899)
chr7 (56-136)||(15862174-15862257)
chr7 (1-100)||(48622623-48622722)
chr7 (36-102)||(16418732-16418798)
chr7 (36-102)||(10000325-10000391)
chr7 (105-179)||(15516719-15516793)
chr7 (1-53)||(13321215-13321267)
chr7 (1-53)||(47481043-47481095)
chr7 (1-53)||(13037026-13037078)
chr7 (1-53)||(16211965-16212017)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (1-210)||(13169-13377)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (1-214)||(20953-21168)
scaffold0139 (1-214)||(13899-14113)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (2-215)||(31513-31726)
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (2-215)||(27653821-27654034)
chr6 (27-215)||(16376212-16376403)
chr6 (27-215)||(16383536-16383727)
chr6 (27-215)||(10488925-10489116)
chr6 (38-215)||(16555978-16556158)
chr6 (38-215)||(16632534-16632714)
chr6 (36-215)||(19299472-19299654)
chr6 (1-215)||(22225577-22225794)
chr6 (1-215)||(22251405-22251622)
chr6 (2-179)||(25175764-25175945)
chr6 (1-136)||(1650022-1650157)
chr6 (1-215)||(14625968-14626182)
chr6 (1-204)||(16232092-16232297)
chr6 (2-125)||(16825678-16825803)
chr6 (1-204)||(1556205-1556412)
chr6 (1-187)||(18086690-18086879)
chr6 (27-204)||(19610244-19610425)
chr6 (1-178)||(23977969-23978149)
chr6 (36-204)||(29869627-29869797)
chr6 (120-214)||(16814837-16814930)
chr6 (1-136)||(13620712-13620850)
chr6 (1-52)||(27751624-27751675)
chr6 (1-204)||(1657593-1657812)
chr6 (105-178)||(4991396-4991470)
chr6 (1-204)||(15862670-15862889)
chr6 (1-53)||(35009451-35009503)
[»] chr2 (22 HSPs)
chr2 (2-215)||(19886499-19886712)
chr2 (27-215)||(11231177-11231368)
chr2 (27-215)||(22513024-22513215)
chr2 (27-215)||(24685620-24685811)
chr2 (27-215)||(28775646-28775837)
chr2 (1-178)||(8944046-8944226)
chr2 (1-178)||(12728592-12728772)
chr2 (1-204)||(16935793-16936000)
chr2 (1-204)||(17006453-17006660)
chr2 (1-204)||(42177818-42178025)
chr2 (1-175)||(3798482-3798659)
chr2 (1-178)||(12635744-12635924)
chr2 (1-178)||(12641518-12641698)
chr2 (1-178)||(34824675-34824855)
chr2 (1-136)||(23777963-23778101)
chr2 (105-215)||(24826538-24826646)
chr2 (36-178)||(23774371-23774516)
chr2 (36-102)||(5888585-5888651)
chr2 (27-92)||(21142121-21142187)
chr2 (105-178)||(25213372-25213446)
chr2 (1-53)||(25265402-25265454)
chr2 (1-53)||(43642969-43643021)
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (1-215)||(10644419-10644632)
chr4 (2-204)||(47357855-47358057)
chr4 (1-204)||(18169170-18169375)
chr4 (27-204)||(17145506-17145687)
chr4 (1-204)||(7131914-7132121)
chr4 (27-204)||(15287096-15287275)
chr4 (1-178)||(20000923-20001103)
chr4 (27-187)||(15294221-15294384)
chr4 (52-204)||(22351915-22352069)
chr4 (1-136)||(19020686-19020824)
chr4 (36-178)||(26339254-26339399)
chr4 (27-136)||(18248444-18248556)
chr4 (27-127)||(8378377-8378480)
chr4 (1-100)||(22738469-22738568)
chr4 (104-204)||(14996444-14996545)
chr4 (105-204)||(14952085-14952183)
chr4 (64-136)||(9795490-9795564)
chr4 (1-53)||(54118256-54118308)
chr4 (1-53)||(15675101-15675153)
chr4 (1-53)||(33240899-33240951)
[»] chr3 (27 HSPs)
chr3 (1-215)||(49232636-49232853)
chr3 (27-215)||(1467578-1467769)
chr3 (2-204)||(41270276-41270478)
chr3 (2-204)||(55316420-55316622)
chr3 (36-215)||(12812076-12812258)
chr3 (1-202)||(16821339-16821540)
chr3 (1-215)||(12264630-12264848)
chr3 (1-204)||(22275409-22275615)
chr3 (1-136)||(15615033-15615168)
chr3 (36-204)||(15468189-15468361)
chr3 (1-204)||(18911193-18911400)
chr3 (1-204)||(25058939-25059146)
chr3 (1-204)||(18896893-18897100)
chr3 (1-204)||(5228513-5228719)
chr3 (1-136)||(12902008-12902146)
chr3 (1-136)||(15936553-15936691)
chr3 (1-136)||(15938395-15938533)
chr3 (1-178)||(54651657-54651837)
chr3 (4-204)||(14842419-14842622)
chr3 (105-204)||(23492696-23492796)
chr3 (1-92)||(44229185-44229277)
chr3 (104-178)||(8268609-8268683)
chr3 (104-178)||(8275709-8275783)
chr3 (1-53)||(12030159-12030211)
chr3 (1-53)||(13839093-13839145)
chr3 (1-53)||(15859036-15859088)
chr3 (1-53)||(51158030-51158082)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (2-205)||(36294-36498)
scaffold0023 (14-215)||(169748-169951)
scaffold0023 (1-204)||(153856-154063)
scaffold0023 (1-53)||(48797-48849)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (27-215)||(31535-31726)
scaffold0107 (36-90)||(39881-39935)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (27-215)||(39329-39520)
scaffold0076 (1-215)||(43197-43411)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (27-215)||(17004864-17005055)
chr1 (1-215)||(38054930-38055147)
chr1 (1-215)||(18059597-18059814)
chr1 (2-204)||(5072237-5072439)
chr1 (36-215)||(19962338-19962520)
chr1 (1-215)||(17148767-17148985)
chr1 (1-136)||(2116454-2116589)
chr1 (1-175)||(22228008-22228185)
chr1 (1-175)||(22232705-22232882)
chr1 (1-136)||(45051622-45051757)
chr1 (2-118)||(18601052-18601169)
chr1 (2-178)||(46523590-46523768)
chr1 (36-178)||(22035682-22035827)
chr1 (36-178)||(7640810-7640955)
chr1 (105-204)||(15861258-15861358)
chr1 (114-184)||(18598845-18598914)
chr1 (1-53)||(20445878-20445930)
chr1 (1-53)||(20913229-20913281)
chr1 (1-53)||(20931544-20931596)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (2-204)||(1153-1355)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (6-204)||(64372-64570)
scaffold0026 (1-136)||(107946-108084)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (1-204)||(3922-4129)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (1-204)||(235-438)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (1-204)||(3162-3368)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (1-136)||(9266-9401)
scaffold0215 (1-136)||(16164-16299)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (27-204)||(7306-7486)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (27-178)||(10624-10778)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (27-187)||(29388-29551)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-204)||(5061-5268)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (36-204)||(2627-2799)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (1-204)||(1424-1631)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (1-204)||(1363-1570)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (105-215)||(130880-130990)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (36-187)||(6832-6986)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (120-215)||(17131-17226)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (37-204)||(23600-23769)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (27-100)||(54100-54173)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (26-100)||(3638-3712)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (1-100)||(10296-10395)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (36-204)||(34007-34179)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (36-136)||(12045-12148)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (36-102)||(7444-7510)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (112-204)||(154282-154373)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (64-136)||(13268-13342)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (1-136)||(45230-45369)
scaffold0066 (56-136)||(54671-54755)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (1-204)||(814-1020)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (1-53)||(34472-34524)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (1-47)||(41847-41893)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-204)||(5922-6128)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (1-53)||(12312-12364)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (5-53)||(8192-8240)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (1-53)||(13705-13757)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (1-53)||(123176-123228)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (1-53)||(546-598)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (1-53)||(5728-5780)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (1-53)||(9077-9129)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (1-53)||(3594-3646)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (1-53)||(19405-19457)
scaffold0195 (1-53)||(21489-21541)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (1-53)||(41928-41980)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 171; Significance: 5e-92; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 29188336 - 29188123
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29188336 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcgacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 29188237  T
Q  101 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctca 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  29188236 ttacatgattataataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccacttgattcctaa 29188137  T
Q  201 agcttacccttcaac 215  Q
    ||||| |||||||||    
T  29188136 agctt-cccttcaac 29188123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18778043 - 18777830
Alignment:
Q  2 catcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778043 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat 18777944  T
Q  102 t--acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctc 199  Q
    |  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18777943 tacacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttaattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctc 18777845  T
Q  200 aagcttacccttcaac 215  Q
    |||||| |||||||||    
T  18777844 aagctt-cccttcaac 18777830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 19500100 - 19500312
Alignment:
Q  2 catcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500100 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaagtgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat 19500199  T
Q  102 t--acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctc 199  Q
    |  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  19500200 tacacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta-gtcaccc-acttgattcctc 19500297  T
Q  200 aagcttacccttcaac 215  Q
    |||||| |||||||||    
T  19500298 aagctt-cccttcaac 19500312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22366532 - 22366318
Alignment:
Q  2 catcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366532 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgctcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat 22366433  T
Q  102 t--acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctc 199  Q
    |  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||     
T  22366432 tacacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcaactcctaggtcaccccacttgattgcta 22366333  T
Q  200 aagcttacccttcaac 215  Q
    |||||| |||||||||    
T  22366332 aagctt-cccttcaac 22366318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 4200036 - 4199823
Alignment:
Q  2 catcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4200036 catcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattattcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaaat 4199937  T
Q  102 t--acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctc 199  Q
    |  |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  4199936 tacacatgattatgataatccctaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattccta 4199838  T
Q  200 aagcttacccttcaac 215  Q
    |||||| |||||||||    
T  4199837 aagctt-cccttcaac 4199823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Original strand, 25426829 - 25427009
Alignment:
Q  2 catcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426829 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat 25426928  T
Q  102 t--acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaa-cccttgcttcaattcagctcctag 179  Q
    |  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25426929 tacacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaaccccttgcttcaattcagctcctag 25427009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 12575 - 12788
Alignment:
Q  2 catcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12575 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatacaaaat 12674  T
Q  102 t--acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctc 199  Q
    |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  12675 tacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctaacttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattccta 12773  T
Q  200 aagcttacccttcaac 215  Q
    |||||| |||||||||    
T  12774 aagctt-cccttcaac 12788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21073646 - 21073433
Alignment:
Q  2 catcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat 101  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073646 catccattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcattaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat 21073547  T
Q  102 t--acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctc 199  Q
    |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  21073546 tacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattccta 21073448  T
Q  200 aagcttacccttcaac 215  Q
    |||||| |||||||||    
T  21073447 aagctt-cccttcaac 21073433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21932411 - 21932220
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  21932411 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 21932312  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21932311 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaac 21932220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21938581 - 21938390
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  21938581 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 21938482  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21938481 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaac 21938390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Original strand, 35582262 - 35582453
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  35582262 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 35582361  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  35582362 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaac 35582453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 43443446 - 43443261
Alignment:
Q  2 catcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||       
T  43443446 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaatccattttcatataacatgagaatatgcaatta 43443347  T
Q  102 tacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccca 187  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443346 cacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccca 43443261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 36989790 - 36989609
Alignment:
Q  37 agagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataactaacccccttac 133  Q
    ||||||||||| || ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36989790 agagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaattgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttac 36989691  T
Q  134 ctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  36989690 ctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaac 36989609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 27010041 - 27010244
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  27010041 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 27010140  T
Q  100 attacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||     
T  27010141 attacatgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattccta 27010239  T
Q  200 aagct 204  Q
    |||||    
T  27010240 aagct 27010244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10778026 - 10777809
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10778026 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 10777927  T
Q  101 tt---acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 197  Q
     |   |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  10777926 attgtacatgattatgataatcactaccccccttacctttgaagatgattatccttaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccacttgattcc 10777827  T
Q  198 tcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||| |||||||||    
T  10777826 tcaagcttccccttcaac 10777809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22883114 - 22882923
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||| ||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  22883114 catcacagcaagagcacaaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 22883015  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  22883014 acccccttatctttgaagttgattatccctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgatttcccaagctttcccttcaac 22882923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17471644 - 17471438
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||  |||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17471644 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttatcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatacaaaa 17471545  T
Q  101 tt---acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 197  Q
    ||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  17471544 tttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaactcaaactcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcc 17471445  T
Q  198 tcaagct 204  Q
    |||||||    
T  17471444 tcaagct 17471438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11212121 - 11211940
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11212121 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 11212022  T
Q  101 tt---acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctag 179  Q
     |   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11212021 attgaacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctag 11211940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 35791154 - 35790947
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || || ||||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35791154 tcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 35791055  T
Q  101 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 196  Q
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| |||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  35791054 attgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattc 35790955  T
Q  197 ctcaagct 204  Q
    ||||||||    
T  35790954 ctcaagct 35790947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 204
Target Start/End: Original strand, 7425549 - 7425729
Alignment:
Q  26 acatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataact 122  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||    
T  7425549 acatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataact 7425648  T
Q  123 aacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 204  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  7425649 aacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 7425729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 23514761 - 23514966
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23514761 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 23514860  T
Q  101 tt---acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 196  Q
     |   |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| |||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  23514861 attgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattc 23514960  T
Q  197 ctcaag 202  Q
    ||||||    
T  23514961 ctcaag 23514966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 1219550 - 1219396
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||| ||||    
T  1219550 catcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataatcacta 1219451  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta 178  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  1219450 acccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 1219396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 215
Target Start/End: Original strand, 11343008 - 11343118
Alignment:
Q  105 atgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 204  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  11343008 atgattatgataaaaactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaacctctgcttcaattcagctcctaggtcaccccacttgattcctcaagct 11343107  T
Q  205 tacccttcaac 215  Q
    | |||||||||    
T  11343108 ttcccttcaac 11343118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 178
Target Start/End: Original strand, 23328792 - 23328937
Alignment:
Q  36 aagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctta 132  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||   |  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23328792 aagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctta 23328891  T
Q  133 cctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta 178  Q
    |||| ||||  ||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  23328892 ccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 23328937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 178
Target Start/End: Original strand, 24616396 - 24616541
Alignment:
Q  36 aagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctta 132  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||   |  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24616396 aagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctta 24616495  T
Q  133 cctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta 178  Q
    |||| ||||  ||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  24616496 ccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 24616541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 178
Target Start/End: Original strand, 24712772 - 24712917
Alignment:
Q  36 aagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctta 132  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||   |  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24712772 aagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctta 24712871  T
Q  133 cctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta 178  Q
    |||| ||||  ||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  24712872 ccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 24712917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 178
Target Start/End: Original strand, 24745790 - 24745935
Alignment:
Q  36 aagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctta 132  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||   |  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24745790 aagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctta 24745889  T
Q  133 cctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta 178  Q
    |||| ||||  ||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  24745890 ccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 24745935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 215
Target Start/End: Original strand, 16105967 - 16106077
Alignment:
Q  105 atgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 204  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||| |   ||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  16105967 atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaacctaaactcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagct 16106066  T
Q  205 tacccttcaac 215  Q
    | |||||||||    
T  16106067 ttcccttcaac 16106077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 34939476 - 34939528
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||    
T  34939476 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagca 34939528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 18531131 - 18531079
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||| |||||    
T  18531131 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 18531079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 23507164 - 23507216
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||| |||||    
T  23507164 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaaatggagcacgaatttagca 23507216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 6774310 - 6774098
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6774310 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatataacatgagaaaatgcaaaa 6774211  T
Q  101 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctca 200  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  6774210 ttacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta-gtcaccc-acttgattcctca 6774113  T
Q  201 agcttacccttcaac 215  Q
    ||||| |||| ||||    
T  6774112 agcttcccctccaac 6774098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 24549181 - 24549394
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24549181 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 24549280  T
Q  101 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctca 200  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  24549281 ttacatgattatgataatcactaacccccttaccttagaagttgattatccttaaccctagcttcacttcagctcctaggtcaccc-acttgattcctca 24549379  T
Q  201 agcttacccttcaac 215  Q
    ||||| |||| ||||    
T  24549380 agcttcccctccaac 24549394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 271390 - 271199
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  271390 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 271291  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  271290 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaac 271199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Original strand, 644530 - 644721
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  644530 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 644629  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  644630 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaac 644721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Original strand, 830265 - 830456
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  830265 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 830364  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  830365 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaac 830456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 36 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15319180 - 15318998
Alignment:
Q  36 aagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataactaaccccctta 132  Q
    |||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15319180 aagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctta 15319081  T
Q  133 cctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  15319080 cctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagcttttccttcaac 15318998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 36 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15499549 - 15499367
Alignment:
Q  36 aagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataactaaccccctta 132  Q
    |||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15499549 aagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctta 15499450  T
Q  133 cctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  15499449 cctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagcttttccttcaac 15499367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21852017 - 21851813
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  21852017 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccaatttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 21851918  T
Q  100 attacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||| || ||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  21851917 attacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagctccacttcagcttctaggtcaccc-acttgattcctc 21851819  T
Q  200 aagctt 205  Q
    ||||||    
T  21851818 aagctt 21851813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22088824 - 22088633
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| || ||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||| |||||||    
T  22088824 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacacattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgatgataacta 22088725  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22088724 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaac 22088633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 30120927 - 30121137
Alignment:
Q  6 aattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatt--- 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||| |       
T  30120927 aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagattatacaaaaattac 30121026  T
Q  103 acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaag 202  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  30121027 acatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagatgattatctctaacccttacttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaag 30121125  T
Q  203 cttacccttcaac 215  Q
    ||| |||||||||    
T  30121126 ctt-cccttcaac 30121137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21844624 - 21844420
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  21844624 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccaatttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 21844525  T
Q  100 attacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||| || ||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  21844524 attacatgattgtgataataactaacccccttaccgttgaagttgattatccttaatcctagctccacttcagcttctaggtcaccc-acttgattcctc 21844426  T
Q  200 aagctt 205  Q
    ||||||    
T  21844425 aagctt 21844420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16674439 - 16674258
Alignment:
Q  6 aattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattac 104  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16674439 aattcatgcataaaaacataacatcacagaaagagcacgaatttagcatgaattgttcaacaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaattac 16674340  T
Q  105 atgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16674339 atgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagattaactc-aactcttgcttcaattcagctcataagtcaccca 16674258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22006314 - 22006107
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006314 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 22006215  T
Q  101 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 196  Q
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  22006214 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaactcaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattc 22006115  T
Q  197 ctcaagct 204  Q
    ||||||||    
T  22006114 ctcaagct 22006107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13720984 - 13720777
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13720984 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 13720885  T
Q  101 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 196  Q
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| |||||||||||||||||||| |  | |||| |||||||||    
T  13720884 attgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccccaattgattc 13720785  T
Q  197 ctcaagct 204  Q
    ||||||||    
T  13720784 ctcaagct 13720777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16873107 - 16872927
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || || |||| |||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16873107 tcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 16873008  T
Q  101 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta 178  Q
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  16873007 attgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaactcaaactcttgcttcaatttagctccta 16872927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13662295 - 13662114
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||    
T  13662295 catcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgtttatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataacta 13662196  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct 204  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| |||||||||||||||||||| |  | |||| |||||||||||||||||    
T  13662195 acccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagct 13662114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 16195431 - 16195611
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  |||||  |||||||  | ||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16195431 tcatcaattcatgcacaagaacatagcatcacagcacgagaacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 16195530  T
Q  101 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta 178  Q
        ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| | | ||| |||||||||||||| ||||||    
T  16195531 attgtacatgattatgataataattaacccccttaccttagaagatgattaacccaaactcttgcttcaattcaactccta 16195611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 202
Target Start/End: Original strand, 17345842 - 17345985
Alignment:
Q  65 tcaacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaa--aatta-catgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaaccct 159  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||  ||| | ||||||| |||| |  ||||||||||||||||  ||||  ||||| | | ||| ||    
T  17345842 tcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctaagaagaagattaacccaaactct 17345941  T
Q  160 tgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaag 202  Q
    |||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||    
T  17345942 tgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaag 17345985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 17345768 - 17345814
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaat 47  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||    
T  17345768 tcatcaattcatgcatataaacataacatcacagttagagcacgaat 17345814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 16405039 - 16404987
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||| |||||    
T  16405039 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 16404987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 2437658 - 2437873
Alignment:
Q  2 catcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437658 catcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcattatcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat 2437757  T
Q  102 t--acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctc 199  Q
    |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2437758 tgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccaattgattcctc 2437857  T
Q  200 aagcttacccttcaac 215  Q
    |||||| |||||||||    
T  2437858 aagctttcccttcaac 2437873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16479014 - 16478801
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16479014 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcgcagtaagagcacgaatctaacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 16478915  T
Q  101 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctca 200  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16478914 ttaaatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatccttaaccctagcttcacttcagctcctaggtcaccc-acttgattcctca 16478816  T
Q  201 agcttacccttcaac 215  Q
    ||||| |||| ||||    
T  16478815 agcttcccctccaac 16478801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13911075 - 13910862
Alignment:
Q  2 catcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13911075 catcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaaat 13910976  T
Q  102 t--acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctc 199  Q
    |  |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  13910975 tacacatgattatgataatcaataacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattccta 13910877  T
Q  200 aagcttacccttcaac 215  Q
    |||||| |||||||||    
T  13910876 aagctt-cccttcaac 13910862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Original strand, 7822954 - 7823145
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  7822954 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 7823053  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7823054 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaac 7823145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Original strand, 7830265 - 7830456
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  7830265 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 7830364  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7830365 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaac 7830456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Original strand, 27176659 - 27176850
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  27176659 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 27176758  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27176759 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaac 27176850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 10989610 - 10989814
Alignment:
Q  2 catcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10989610 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaatatgcaaaat 10989709  T
Q  102 --tacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctc 199  Q
      ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  10989710 tatacatgattatgataatcactaacccccatacctttgaagttgattatccctaacccttgcttcaattaagctcctatgtcacctcacttgattcctc 10989809  T
Q  200 aagct 204  Q
    |||||    
T  10989810 aagct 10989814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27101667 - 27101476
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  27101667 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 27101568  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27101567 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaac 27101476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27109015 - 27108824
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  27109015 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 27108916  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27108915 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaac 27108824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 38783759 - 38783568
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  38783759 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 38783660  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  38783659 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaac 38783568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 13572876 - 13573079
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  13572876 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 13572975  T
Q  100 attacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||     
T  13572976 attacatgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattccta 13573074  T
Q  200 aagct 204  Q
    |||||    
T  13573075 aagct 13573079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15950847 - 15950641
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15950847 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 15950748  T
Q  101 tt---acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 197  Q
     |   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  15950747 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcc 15950648  T
Q  198 tcaagct 204  Q
    |||||||    
T  15950647 tcaagct 15950641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18980077 - 18979872
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18980077 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 18979978  T
Q  101 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 197  Q
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  18979977 attgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcc 18979879  T
Q  198 tcaagct 204  Q
    | |||||    
T  18979878 taaagct 18979872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15760170 - 15759963
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15760170 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 15760071  T
Q  101 tt---acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 196  Q
     |   |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| |||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  15760070 attgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacacaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattc 15759971  T
Q  197 ctcaagct 204  Q
    ||||||||    
T  15759970 ctcaagct 15759963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 15927768 - 15927973
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||| |||||||||||| |||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15927768 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgatcatcaatccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 15927867  T
Q  101 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 197  Q
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  15927868 attgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcc 15927966  T
Q  198 tcaagct 204  Q
    | |||||    
T  15927967 taaagct 15927973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 13758570 - 13758750
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || || |||| |||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13758570 tcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 13758669  T
Q  101 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta 178  Q
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  13758670 attgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 13758750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14250954 - 14250748
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  ||| |||| |||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14250954 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 14250855  T
Q  101 tt---acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 196  Q
         ||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||  || || ||| ||| |||||||||||||||||||| |  | |||| |||||||||    
T  14250854 aatgaacatgattacgatgataactaacccccttaccttagaagaaga-taactcaaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccccaattgattc 14250756  T
Q  197 ctcaagct 204  Q
    ||||||||    
T  14250755 ctcaagct 14250748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18253899 - 18253761
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |  |||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18253899 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 18253800  T
Q  101 tt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt 136  Q
     |   |||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  18253799 attgaacatgattataatgataactaacccccttacctt 18253761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 136
Target Start/End: Original strand, 15862174 - 15862257
Alignment:
Q  56 aattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15862174 aattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattatacatgattatgataataactaacccccttacctt 15862257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 48622722 - 48622623
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  48622722 tcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagtaagagcacgaatttagcatcaattgttcatcaacccattttcgtaaaacatgagaaaatgcaaaa 48622623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 102
Target Start/End: Original strand, 16418732 - 16418798
Alignment:
Q  36 aagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatt 102  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16418732 aagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatt 16418798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 10000391 - 10000325
Alignment:
Q  36 aagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatt 102  Q
    |||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  10000391 aagagcacgaatttgacataaattgttcatcaacccatttttatacaacatgagaagatgcaaaatt 10000325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15516793 - 15516719
Alignment:
Q  105 atgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctag 179  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15516793 atgattatgataaagactaacccccttacatttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctag 15516719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 13321215 - 13321267
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||    
T  13321215 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagca 13321267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 47481095 - 47481043
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||    
T  47481095 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagca 47481043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 13037078 - 13037026
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||| |||||    
T  13037078 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 13037026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 16211965 - 16212017
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||| |||||    
T  16211965 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 16212017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 154; Significance: 7e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13377 - 13169
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13377 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacactaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgaaaaa 13278  T
Q  101 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctca 200  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  13277 ttacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatccttaaccctagcttcacttcagttcctaggtcaccc-acttgattcctca 13179  T
Q  201 agcttaccct 210  Q
    ||||| ||||    
T  13178 agcttcccct 13169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21168 - 20953
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21168 tcatcaattaatggatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 21069  T
Q  101 t--tacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcct 198  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  21068 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaatcctaacccttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcct 20969  T
Q  199 caagcttacccttcaa 214  Q
    ||||||| ||||||||    
T  20968 caagctttcccttcaa 20953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14113 - 13899
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113 tcatcaattcatgcatacagacataacatcacagcaagagcacgatt-tagcaagaattgtgcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 14015  T
Q  101 tt--acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcct 198  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  14014 ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaatcctaacccttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcct 13915  T
Q  199 caagcttacccttcaa 214  Q
    ||||||| ||||||||    
T  13914 caagctttcccttcaa 13899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31726 - 31513
Alignment:
Q  2 catcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31726 catcaattcatgcattcaaacataacatcaccacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaaat 31627  T
Q  102 t--acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctc 199  Q
    |  |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  31626 tacacatgattatgataatcactaacccccttacatttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattccta 31528  T
Q  200 aagcttacccttcaac 215  Q
    |||||| |||||||||    
T  31527 aagctt-cccttcaac 31513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27654034 - 27653821
Alignment:
Q  2 catcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27654034 catcaattcatgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaatccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat 27653935  T
Q  102 t--acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctc 199  Q
    |  |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  27653934 tacacatgattatgataatcactaaccccctcacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattccta 27653836  T
Q  200 aagcttacccttcaac 215  Q
    |||||| |||||||||    
T  27653835 aagctt-cccttcaac 27653821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16376403 - 16376212
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  16376403 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 16376304  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16376303 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaac 16376212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16383727 - 16383536
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  16383727 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 16383628  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16383627 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaac 16383536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Original strand, 10488925 - 10489116
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  10488925 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 10489024  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10489025 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaac 10489116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 38 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16556158 - 16555978
Alignment:
Q  38 gagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataactaacccccttacc 134  Q
    |||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16556158 gagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 16556059  T
Q  135 tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16556058 tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaac 16555978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 38 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16632714 - 16632534
Alignment:
Q  38 gagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataactaacccccttacc 134  Q
    |||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16632714 gagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 16632615  T
Q  135 tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16632614 tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaac 16632534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 36 - 215
Target Start/End: Original strand, 19299472 - 19299654
Alignment:
Q  36 aagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataactaaccccctta 132  Q
    |||||||||||| || ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19299472 aagagcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctta 19299571  T
Q  133 cctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  19299572 cctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcgcccaaattgaatccccaagctttcccttcaac 19299654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22225794 - 22225577
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa- 99  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||  |||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22225794 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagaaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 22225695  T
Q  100 att--acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 197  Q
    |||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225694 attgtacatgattatgataataactaacccccatacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 22225595  T
Q  198 tcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||| || ||||||    
T  22225594 tcaagctttccattcaac 22225577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22251622 - 22251405
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa- 99  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||  |||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22251622 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 22251523  T
Q  100 att--acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 197  Q
    |||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251522 attgtacatgattatgataataactaacccccatacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 22251423  T
Q  198 tcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||| || ||||||    
T  22251422 tcaagctttccattcaac 22251405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Original strand, 25175764 - 25175945
Alignment:
Q  2 catcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgag-aaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25175764 catcaattcatgcatacaaacataacaacacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagaaaaatgcaaaa 25175863  T
Q  101 t--tacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaa-cccttgcttcaattcagctcctag 179  Q
    |  ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25175864 ttatacatgattatggtaatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaaccccttgcttcaattcagctcctag 25175945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1650157 - 1650022
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1650157 tcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 1650058  T
Q  101 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 136  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  1650057 ttacatgattatgataaagactaacccccttacctt 1650022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14626182 - 14625968
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacat--gagaaaatgcaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||  |||| | ||| | | || || || |||||||  |||||  || ||    
T  14626182 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattatccataatcacaatt-caaacaacatttgagaatttgtaa 14626084  T
Q  99 aattac-atgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 197  Q
    | | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14626083 agtgaagatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcc 14625985  T
Q  198 tcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||| |||||||||    
T  14625984 tcaagctt-cccttcaac 14625968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 16232092 - 16232297
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232092 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 16232191  T
Q  101 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 197  Q
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  16232192 attgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcc 16232290  T
Q  198 tcaagct 204  Q
    | |||||    
T  16232291 taaagct 16232297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 16825803 - 16825678
Alignment:
Q  2 catcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825803 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat 16825704  T
Q  102 t--acatgattgtgataataactaac 125  Q
    |  |||||||| ||||||| ||||||    
T  16825703 tacacatgattatgataatcactaac 16825678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 1556205 - 1556412
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1556205 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 1556304  T
Q  101 tt---acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 196  Q
     |   |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| |||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  1556305 attgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacacaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattc 1556404  T
Q  197 ctcaagct 204  Q
    ||||||||    
T  1556405 ctcaagct 1556412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18086879 - 18086690
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18086879 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 18086780  T
Q  101 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccca 187  Q
        ||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18086779 attgtacatgattatactaataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccca 18086690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 204
Target Start/End: Original strand, 19610244 - 19610425
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||    
T  19610244 catcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatacaacatcagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataacta 19610343  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct 204  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| |||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  19610344 acccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagct 19610425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 23977969 - 23978149
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || || |||| |||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23977969 tcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 23978068  T
Q  101 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta 178  Q
        ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  23978069 attgtacatgattatgataataactaacgcccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 23978149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29869797 - 29869627
Alignment:
Q  36 aagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattaca---tgattgtgataataactaaccccctta 132  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |   ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29869797 aagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaattttaaattgattatgataataactaaccccctta 29869698  T
Q  133 cctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 204  Q
    |||| ||||  ||| | | | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  29869697 ccttagaagaagatcaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 29869627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16814930 - 16814837
Alignment:
Q  120 actaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaa 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||| ||||||||    
T  16814930 actaaccctcttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccacttgattgctaaagctt-cccttcaa 16814837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 13620850 - 13620712
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  ||| |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13620850 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 13620751  T
Q  101 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 136  Q
        ||||||||| |||  |  |||||||||||||||||    
T  13620750 attgtacatgattatgaagaagactaacccccttacctt 13620712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 27751624 - 27751675
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagc 52  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27751624 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaatttagc 27751675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1657812 - 1657593
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcat----------caacccattttcatacaaca--tga 88  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||  |||| | |||          |||||||| |||||||||||  |||    
T  1657812 tcatcaattcatgcatccaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaaatga 1657713  T
Q  89 gaaaatgcaa--aatta-catgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcac 184  Q
    |||| |||||  ||| | ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| |||| ||||||||||||||| || | ||    
T  1657712 gaaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgtttcaattcagctcctaagcttac 1657613  T
Q  185 ccaaattgattcctcaagct 204  Q
    || |||||||||||||||||    
T  1657612 cccaattgattcctcaagct 1657593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 178
Target Start/End: Original strand, 4991396 - 4991470
Alignment:
Q  105 atgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctct-aacccttgcttcaattcagctccta 178  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| |||||||||||||||||||||    
T  4991396 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaactcttgcttcaattcagctccta 4991470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 15862670 - 15862889
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcat----------caacccattttcatacaaca--tga 88  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||| |  |||| | |||          |||||||| |||||||||||  |||    
T  15862670 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagtaacaattatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaaatga 15862769  T
Q  89 gaaaatgcaa--aatta-catgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcac 184  Q
    |||| |||||  ||| | ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| |||||||||||||| ||||| || | ||    
T  15862770 gaaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcacctcctaagcttac 15862869  T
Q  185 ccaaattgattcctcaagct 204  Q
    || |||||||||||||||||    
T  15862870 cccaattgattcctcaagct 15862889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 35009503 - 35009451
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||| |||||    
T  35009503 tcatcaattcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagca 35009451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 22)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19886712 - 19886499
Alignment:
Q  2 catcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886712 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat 19886613  T
Q  102 t--acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctc 199  Q
    |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  19886612 tacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagtttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattccta 19886514  T
Q  200 aagcttacccttcaac 215  Q
    |||||| |||||||||    
T  19886513 aagctt-cccttcaac 19886499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11231368 - 11231177
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  11231368 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 11231269  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  11231268 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaac 11231177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22513215 - 22513024
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  22513215 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 22513116  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22513115 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaac 22513024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24685811 - 24685620
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  24685811 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 24685712  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24685711 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaac 24685620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28775837 - 28775646
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  28775837 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 28775738  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  28775737 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaac 28775646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 8944046 - 8944226
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8944046 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 8944145  T
Q  101 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta 178  Q
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  8944146 attgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 8944226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 12728592 - 12728772
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12728592 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 12728691  T
Q  101 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta 178  Q
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  12728692 attgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 12728772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 16935793 - 16936000
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||  ||||||| |||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16935793 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcatgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 16935892  T
Q  101 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 196  Q
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| ||| |||||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  16935893 attgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactctttcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattc 16935992  T
Q  197 ctcaagct 204  Q
    ||||||||    
T  16935993 ctcaagct 16936000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 17006453 - 17006660
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||  ||||||| |||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17006453 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcatgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 17006552  T
Q  101 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 196  Q
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| ||| |||||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  17006553 attgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactctttcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattc 17006652  T
Q  197 ctcaagct 204  Q
    ||||||||    
T  17006653 ctcaagct 17006660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 42178025 - 42177818
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  ||| |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42178025 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 42177926  T
Q  101 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 196  Q
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |   ||| |||||||||||||||| ||| |  | |||| |||||||||    
T  42177925 attgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacctaaactcttgcttcaattcagcccctaatcttaccccaattgattc 42177826  T
Q  197 ctcaagct 204  Q
    ||||||||    
T  42177825 ctcaagct 42177818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 3798659 - 3798482
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || || |||| |||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3798659 tcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 3798560  T
Q  101 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctc 175  Q
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| |||||||||||| |||||    
T  3798559 attatacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctc 3798482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12635924 - 12635744
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12635924 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacctattttcatacaacatgaggaaatgcaaaa 12635825  T
Q  101 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta 178  Q
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  12635824 attgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 12635744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12641698 - 12641518
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || || |||| |||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12641698 tcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 12641599  T
Q  101 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta 178  Q
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  12641598 attgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 12641518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 34824675 - 34824855
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34824675 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 34824774  T
Q  101 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta 178  Q
        ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  34824775 attgtacatgattatgataatcactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 34824855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23778101 - 23777963
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||  || ||  |||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23778101 tcatcaattcatgcataagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 23778002  T
Q  101 tt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt 136  Q
     |   |||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  23778001 attgaacatgattatgatgataactaacccctttacctt 23777963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24826646 - 24826538
Alignment:
Q  105 atgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 204  Q
    |||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  24826646 atgattatgatgatgactaacccctttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagct 24826548  T
Q  205 tacccttcaac 215  Q
    | |||||||||    
T  24826547 t-cccttcaac 24826538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 178
Target Start/End: Original strand, 23774371 - 23774516
Alignment:
Q  36 aagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctta 132  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23774371 aagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaacttgattatgataataactaaccccctta 23774470  T
Q  133 cctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta 178  Q
    |||| ||||  ||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  23774471 ccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 23774516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 5888651 - 5888585
Alignment:
Q  36 aagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatt 102  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5888651 aagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatt 5888585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 92
Target Start/End: Original strand, 21142121 - 21142187
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 92  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21142121 catcacaacaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 21142187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 178
Target Start/End: Original strand, 25213372 - 25213446
Alignment:
Q  105 atgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctct-aacccttgcttcaattcagctccta 178  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| |||||||||||||||||||||    
T  25213372 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaactcttgcttcaattcagctccta 25213446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 25265454 - 25265402
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||| |||||    
T  25265454 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagca 25265402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 43643021 - 43642969
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||| ||| |||||    
T  43643021 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacaaatttagca 43642969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 139; Significance: 6e-73; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 10644419 - 10644632
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10644419 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 10644518  T
Q  101 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  10644519 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctaacttcacttcagctcctagatcaccc-acttgattcctca 10644617  T
Q  201 agcttacccttcaac 215  Q
    ||||| |||| ||||    
T  10644618 agcttcccctccaac 10644632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 47357855 - 47358057
Alignment:
Q  2 catcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47357855 catcaatccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaggaaatgcaaaat 47357954  T
Q  102 tacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| |||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||| |    
T  47357955 tacatgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagattaac-ccaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctta 47358053  T
Q  201 agct 204  Q
    ||||    
T  47358054 agct 47358057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 18169170 - 18169375
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18169170 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 18169269  T
Q  101 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 197  Q
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| | ||||  |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  18169270 attgtacatgattatgataataactaacccccttacc-ttgaagaagattaaccctaattcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcc 18169368  T
Q  198 tcaagct 204  Q
    |||||||    
T  18169369 tcaagct 18169375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17145687 - 17145506
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataacta 123  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| ||||||||||||    
T  17145687 catcacagtaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgataataacta 17145588  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct 204  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| ||| |||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  17145587 acccccttaccttagaagaagattaacacaaactcttacttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagct 17145506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7132121 - 7131914
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7132121 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatataacatgagaaaatgcaaaa 7132022  T
Q  101 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 196  Q
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||   | ||| |||||||||||||||||||| |  | |||| |||||||||    
T  7132021 attgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaatccaaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccccaattgattc 7131922  T
Q  197 ctcaagct 204  Q
    ||||||||    
T  7131921 ctcaagct 7131914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15287275 - 15287096
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| ||||||||||||    
T  15287275 catcacagcaagagcacgaatttagctataattgttcatcatcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataacta 15287176  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 204  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  15287175 acccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 15287096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 20000923 - 20001103
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || || |||| |||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20000923 tcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 20001022  T
Q  101 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta 178  Q
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  20001023 attgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 20001103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15294384 - 15294221
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| ||||||||||||    
T  15294384 catcacagcaagagcacgaatttagctataattgttcatcatcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataacta 15294285  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccca 187  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15294284 acccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccca 15294221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22352069 - 22351915
Alignment:
Q  52 catgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattaca---tgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgatta 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |   ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  22352069 catgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagatta 22351970  T
Q  149 tctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 204  Q
     | | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  22351969 acccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 22351915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 19020686 - 19020824
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19020686 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgacaaaatgcaaaa 19020785  T
Q  101 tt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt 136  Q
     |   |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  19020786 attgaacatgattatgatggtaactaacccccttacctt 19020824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 178
Target Start/End: Original strand, 26339254 - 26339399
Alignment:
Q  36 aagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctta 132  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||   |  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  26339254 aagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctta 26339353  T
Q  133 cctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta 178  Q
    |||| ||||  ||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  26339354 ccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 26339399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 18248444 - 18248556
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||| |||| ||||||||||||    
T  18248444 catcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacaagattatgataataacta 18248543  T
Q  124 acccccttacctt 136  Q
    |||||||||||||    
T  18248544 acccccttacctt 18248556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Original strand, 8378377 - 8378480
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||| ||||||||||||    
T  8378377 catcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataacta 8378476  T
Q  124 accc 127  Q
    ||||    
T  8378477 accc 8378480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 22738469 - 22738568
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||  |||| ||||||| || ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738469 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagaacacgaatttaacatcaattgttcctcagcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 22738568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 204
Target Start/End: Original strand, 14996444 - 14996545
Alignment:
Q  104 catgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaag 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||  ||||| | | ||| |||||||||||||||||||| |  | |||| |||||||||||||||    
T  14996444 catgattatgataataactaacccccttaccttaaaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaaacttaccccaattgattcctcaag 14996543  T
Q  203 ct 204  Q
    ||    
T  14996544 ct 14996545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 204
Target Start/End: Original strand, 14952085 - 14952183
Alignment:
Q  105 atgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 204  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  14952085 atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 14952183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 136
Target Start/End: Original strand, 9795490 - 9795564
Alignment:
Q  64 atcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt 136  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  9795490 atcaacccattt-catacaacatgagaaaatgaaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 9795564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 54118308 - 54118256
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||| |||||    
T  54118308 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagca 54118256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 15675153 - 15675101
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||| |||||    
T  15675153 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 15675101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 33240899 - 33240951
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||| |||||    
T  33240899 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 33240951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 139; Significance: 6e-73; HSPs: 27)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 49232636 - 49232853
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa- 99  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||  |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  49232636 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 49232735  T
Q  100 att--acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 197  Q
    |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49232736 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcataggtcacccaaattgattcc 49232835  T
Q  198 tcaagcttacccttcaac 215  Q
     ||||||| |||||||||    
T  49232836 ccaagctttcccttcaac 49232853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1467769 - 1467578
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  1467769 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 1467670  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1467669 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaac 1467578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 41270276 - 41270478
Alignment:
Q  2 catcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  41270276 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagtagatgcaaaaa 41270375  T
Q  101 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |    
T  41270376 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaa 41270474  T
Q  201 agct 204  Q
    ||||    
T  41270475 agct 41270478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 55316420 - 55316622
Alignment:
Q  2 catcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  55316420 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaa 55316519  T
Q  101 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |    
T  55316520 ttacatgattgtgataataactaacccctttacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaa 55316618  T
Q  201 agct 204  Q
    ||||    
T  55316619 agct 55316622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 36 - 215
Target Start/End: Original strand, 12812076 - 12812258
Alignment:
Q  36 aagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataactaaccccctta 132  Q
    |||||||||||| || ||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12812076 aagagcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaatatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctta 12812175  T
Q  133 cctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  12812176 cctttaaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaac 12812258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 16821339 - 16821540
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16821339 tcatcaatttatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacggatttgacataaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 16821438  T
Q  101 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||    
T  16821439 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagaagattaacacaaactcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcttca 16821538  T
Q  201 ag 202  Q
    ||    
T  16821539 ag 16821540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12264848 - 12264630
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12264848 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 12264749  T
Q  101 tt---acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtca-cccaaattgattc 196  Q
     |   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12264748 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaatcccaacctttgcttcaattcagctcctaggtcaccccaaattgattc 12264649  T
Q  197 ctcaagcttacccttcaac 215  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  12264648 ctcaagctttcccttcaac 12264630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 22275409 - 22275615
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||| |||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22275409 tcatcaattcatgcacaagaaaatggcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 22275508  T
Q  101 tt---acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 197  Q
    ||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||  ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  22275509 tttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccttaacttttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcc 22275608  T
Q  198 tcaagct 204  Q
    |||||||    
T  22275609 tcaagct 22275615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 15615033 - 15615168
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15615033 tcatcaattcatgcatacaaatataacaccacagtaagagcacaaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 15615132  T
Q  101 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 136  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  15615133 ttacatgattatgataaagactaacccccttacctt 15615168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15468361 - 15468189
Alignment:
Q  36 aagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat---tacatgattgtgataataactaaccccctta 132  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15468361 aagagcacgaatttagcaacaattgttcctcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatttgtacatgattatgataataactaaccccctta 15468262  T
Q  133 cctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct 204  Q
    |||||||||  ||||| | ||||  |||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  15468261 cctttgaagaagattaaccctaattcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagct 15468189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 18911193 - 18911400
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18911193 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 18911292  T
Q  101 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 196  Q
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| |||||||||||||||||||| |  | |||| |||||||||    
T  18911293 attgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccccaattgattc 18911392  T
Q  197 ctcaagct 204  Q
    ||||||||    
T  18911393 ctcaagct 18911400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 25058939 - 25059146
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25058939 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 25059038  T
Q  101 tta---catgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 196  Q
     |    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||   ||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  25059039 attgtgcatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaatttttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattc 25059138  T
Q  197 ctcaagct 204  Q
    ||||||||    
T  25059139 ctcaagct 25059146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18897100 - 18896893
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||  |||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18897100 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttatcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatacaaaa 18897001  T
Q  101 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 196  Q
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| |||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  18897000 cttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttggaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattc 18896901  T
Q  197 ctcaagct 204  Q
    ||||||||    
T  18896900 ctcaagct 18896893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 5228513 - 5228719
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |   | || ||||||||  |||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  5228513 tcatcaattcatgcacaaggaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaacaat-gttcatcaacccattttcataacacatgagaaaatgcaaaa 5228611  T
Q  101 tt---acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 196  Q
     |   |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| |||| ||||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  5228612 attgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgtttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattc 5228711  T
Q  197 ctcaagct 204  Q
    ||||||||    
T  5228712 ctcaagct 5228719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12902146 - 12902008
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || || ||||||||  |||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902146 tcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaaaattattcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 12902047  T
Q  101 tt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt 136  Q
     |   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12902046 attgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 12902008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 15936691 - 15936553
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |  |||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15936691 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 15936592  T
Q  101 tt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt 136  Q
     |   |||||||| | || ||||||||||||| ||||||    
T  15936591 attgaacatgattataatgataactaacccccatacctt 15936553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 15938533 - 15938395
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    |||||||||||||  |||||||||  ||| ||| |  ||||||| || ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15938533 tcatcaattcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 15938434  T
Q  101 tt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt 136  Q
     |   |||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  15938433 attgaacatgattataatgataactaacccccttacctt 15938395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 54651657 - 54651837
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||  |||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54651657 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaacccattttcatacaacatgagaaattgcaaaa 54651756  T
Q  101 tt---acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta 178  Q
     |   |||||||| |||| |  || |||||||||||||| || | |||||| | | |||  ||||||||||| ||||||||    
T  54651757 attgaacatgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatgattaacccaaacttttgcttcaattaagctccta 54651837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14842622 - 14842419
Alignment:
Q  4 tcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacat--gagaaaatgcaaaat 101  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||| |||||  |||| | ||| | | || || ||||||||||  |||||  |||||| |    
T  14842622 tcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaatt-catacaacatttgagaatttgcaaagt 14842524  T
Q  102 tac-atgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctc 199  Q
     |  |||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||| | ||||| |||||||||||||||||||| || | |||| ||||||| ||||    
T  14842523 gaagatgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgatccctc 14842424  T
Q  200 aagct 204  Q
    |||||    
T  14842423 aagct 14842419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 204
Target Start/End: Original strand, 23492696 - 23492796
Alignment:
Q  105 atgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagc 203  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  23492696 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttacccaaattgattcctcaagc 23492795  T
Q  204 t 204  Q
    |    
T  23492796 t 23492796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 44229185 - 44229277
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 92  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||| ||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44229185 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacggatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 44229277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 8268683 - 8268609
Alignment:
Q  104 catgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  8268683 catgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 8268609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 8275783 - 8275709
Alignment:
Q  104 catgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  8275783 catgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 8275709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 12030211 - 12030159
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||| |||||    
T  12030211 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 12030159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 13839093 - 13839145
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||| |||||    
T  13839093 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 13839145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 15859088 - 15859036
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||| |||||    
T  15859088 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 15859036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 51158082 - 51158030
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||| |||||    
T  51158082 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 51158030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 205
Target Start/End: Original strand, 36294 - 36498
Alignment:
Q  2 catcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  36294 catcaattcatacatacaaacataacatcactacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccagtttcatacaacatgagaatatgcaaaat 36393  T
Q  102 t--acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctc 199  Q
    |  |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  36394 tacacatgattatgataatcattaacccccttacctttgaagttgattatccctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattccta 36492  T
Q  200 aagctt 205  Q
    ||||||    
T  36493 aagctt 36498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 169951 - 169748
Alignment:
Q  14 catacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat--tacatgattg 111  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  169951 catacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattatacatgatta 169852  T
Q  112 tgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttaccctt 211  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||  ||||    
T  169851 tgataatcactaacccccttacttttgaagatgattatcactaacccttgcttcaattcagctcttatgtcaccccacttgattcctcaagcttcgcctt 169752  T
Q  212 caac 215  Q
    ||||    
T  169751 caac 169748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 154063 - 153856
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  154063 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 153964  T
Q  101 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 196  Q
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  153963 attgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaactcaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattc 153864  T
Q  197 ctcaagct 204  Q
    ||||||||    
T  153863 ctcaagct 153856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 48797 - 48849
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||| |||||    
T  48797 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 48849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 133; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Original strand, 31535 - 31726
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  31535 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 31634  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31635 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaac 31726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 90
Target Start/End: Original strand, 39881 - 39935
Alignment:
Q  36 aagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaga 90  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39881 aagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaga 39935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 133; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Original strand, 39329 - 39520
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  39329 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 39428  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  39429 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaac 39520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 43197 - 43411
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaa-tgcaaa 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  |||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43197 tcatcaattcatgcatagaaacataacatcccagcaagagcacgaatttgacatgaattgctcatcaacccattttcatacaacatgagaaaaatgcaaa 43296  T
Q  100 attacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctc 199  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  43297 attacatgtttgtgatagtaactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcacttcagctcctagatcaccc-acttgattcctc 43395  T
Q  200 aagcttacccttcaac 215  Q
    |||||| |||| ||||    
T  43396 aagcttcccctccaac 43411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 133; Significance: 2e-69; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Original strand, 17004864 - 17005055
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  17004864 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 17004963  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  17004964 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaac 17005055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 38055147 - 38054930
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa- 99  Q
    ||||||||||| ||| |  || || |||||||| ||| ||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  38055147 tcatcaattcaagcacaagaaaataacatcacagtaaaagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaagatgcaaag 38055048  T
Q  100 att--acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 197  Q
    |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055047 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 38054948  T
Q  198 tcaagcttacccttcaac 215  Q
     ||||||| |||||||||    
T  38054947 ccaagctttcccttcaac 38054930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18059814 - 18059597
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa- 99  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||  |||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18059814 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaag 18059715  T
Q  100 atta--catgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcc 197  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18059714 attatacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccaattgattcc 18059615  T
Q  198 tcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||| |||||||||    
T  18059614 tcaagctttcccttcaac 18059597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5072439 - 5072237
Alignment:
Q  2 catcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  5072439 catcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacttgagtaaatgcaaaaa 5072340  T
Q  101 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||| | |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |    
T  5072339 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaatctttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaa 5072241  T
Q  201 agct 204  Q
    ||||    
T  5072240 agct 5072237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 36 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19962520 - 19962338
Alignment:
Q  36 aagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataactaaccccctta 132  Q
    |||||||||||| || ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19962520 aagagcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctta 19962421  T
Q  133 cctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  19962420 cctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcgcccaaattgaatccccaagctttcccttcaac 19962338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 17148767 - 17148985
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || || |||| |||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17148767 tcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 17148866  T
Q  101 tt---acatgattgtgataataactaacccc-cttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattc 196  Q
     |   |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  17148867 attgtacatgattatgataataactaaccccccttacctttgaagttgattatccccaacccttgcttcaattcagctcctatgtcaccccacttgattc 17148966  T
Q  197 ctcaagcttacccttcaac 215  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  17148967 ctcaagctttcccttcaac 17148985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 2116454 - 2116589
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2116454 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaaaagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccatttttatacaacatgagaaaatgcaaaa 2116553  T
Q  101 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 136  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  2116554 ttacatgattatgataatcactaacccctttacctt 2116589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 22228008 - 22228185
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || || ||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22228008 tcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 22228107  T
Q  101 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctc 175  Q
        ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  22228108 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctc 22228185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 22232705 - 22232882
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || || ||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22232705 tcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 22232804  T
Q  101 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctc 175  Q
        ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  22232805 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctc 22232882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 45051622 - 45051757
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45051622 tcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagaacacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 45051721  T
Q  101 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 136  Q
    | |||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  45051722 tcacatgattatgataaagactaacccccttacctt 45051757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 18601169 - 18601052
Alignment:
Q  2 catcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18601169 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcatgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaa 18601070  T
Q  101 ttacatgattgtgataat 118  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18601069 ttacatgattgtgataat 18601052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Original strand, 46523590 - 46523768
Alignment:
Q  2 catcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat 101  Q
    |||||||||||||| |  || ||  |||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46523590 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaat 46523689  T
Q  102 --tacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta 178  Q
       |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| ||||||| |||| | ||||||    
T  46523690 ggaacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgctttaatttatctccta 46523768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 178
Target Start/End: Original strand, 22035682 - 22035827
Alignment:
Q  36 aagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctta 132  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   |  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22035682 aagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctta 22035781  T
Q  133 cctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta 178  Q
    |||| ||||  ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||    
T  22035782 ccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctccta 22035827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 7640955 - 7640810
Alignment:
Q  36 aagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctta 132  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||   |  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7640955 aagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctta 7640856  T
Q  133 cctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta 178  Q
    |||| ||||  ||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  7640855 ccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 7640810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15861358 - 15861258
Alignment:
Q  105 atgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctag-gtcacccaaattgattcctcaagc 203  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||  | | || ||||||||||||||||    
T  15861358 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctagacttatcccaattgattcctcaagc 15861259  T
Q  204 t 204  Q
    |    
T  15861258 t 15861258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18598914 - 18598845
Alignment:
Q  114 ataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcac 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18598914 ataataactaacccccttaccttagaagaagattaac-ccaactcttgcttcaattcagctcctaagtcac 18598845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 20445878 - 20445930
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||| |||||    
T  20445878 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagca 20445930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 20913229 - 20913281
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||| |||||    
T  20913229 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 20913281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 20931544 - 20931596
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||| |||||    
T  20931544 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 20931596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1355 - 1153
Alignment:
Q  2 catcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1355 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagtaaatgcaaaaa 1256  T
Q  101 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |    
T  1255 ttacatgattgtgataataactaacccccctacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttcaattcagctcctaagtca-ccaacttgattcctaa 1157  T
Q  201 agct 204  Q
    ||||    
T  1156 agct 1153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 112; Significance: 8e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 64570 - 64372
Alignment:
Q  6 aattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgc-aaaattac 104  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  64570 aattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaattac 64471  T
Q  105 atgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  64470 atgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattccttaagct 64372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 107946 - 108084
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |  |||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107946 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 108045  T
Q  101 tt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt 136  Q
     |   |||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  108046 attgaacatgattataatgataactaacccccttacctt 108084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 3922 - 4129
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3922 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 4021  T
Q  101 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 196  Q
        ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  4022 attgtacatgattatgataataactaaaccccttaccttagaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattc 4121  T
Q  197 ctcaagct 204  Q
    ||||||||    
T  4122 ctcaagct 4129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 235 - 438
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  235 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatataacatgag-caatgcaaaa 333  T
Q  101 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctc 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||   | ||| || ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||    
T  334 ttacatgattttgataataactaacccccttaccttagaagaagattaatccaaactctcgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctc 433  T
Q  200 aagct 204  Q
    |||||    
T  434 aagct 438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 3162 - 3368
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3162 tcatcaattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 3261  T
Q  101 t--tacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcc 197  Q
    |  ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| |   ||| |||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||     
T  3262 ttgtacataattatgataataattaacccccttaccttagaagaagattaaccgaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattct 3361  T
Q  198 tcaagct 204  Q
    |||||||    
T  3362 tcaagct 3368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 9401 - 9266
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9401 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaaagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 9302  T
Q  101 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9301 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 9266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16299 - 16164
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16299 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaaagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa 16200  T
Q  101 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16199 ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt 16164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7486 - 7306
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| ||||||||||||    
T  7486 catcacaacaagagcacgaatttagtaataattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaatggaacatgattatgataataacta 7387  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| | ||||  |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  7386 acccccttacctttgaagaagattaaccctaattcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagct 7306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 10778 - 10624
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||    
T  10778 catcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataacta 10679  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta 178  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10678 acccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctccta 10624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 187
Target Start/End: Original strand, 29388 - 29551
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataacta 123  Q
    |||||||  |||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  29388 catcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 29487  T
Q  124 acccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  29488 acccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcacttcagctcctaggtcaccca 29551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5268 - 5061
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||  |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5268 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaagaattgttcatcaacccattttcatacaacgtgagaaaatgcaaaa 5169  T
Q  101 tt---acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 196  Q
     |   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  5168 attgtacatgattatgataataactaactcccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattc 5069  T
Q  197 ctcaagct 204  Q
     |||||||    
T  5068 ttcaagct 5061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 92; Significance: 7e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 204
Target Start/End: Original strand, 2627 - 2799
Alignment:
Q  36 aagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatt----acatgattgtgataataactaaccccctt 131  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2627 aagagcacgaattgagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaatttgtacatgattatgataataactaaccccctt 2726  T
Q  132 acctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 204  Q
    ||||| ||||  ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  2727 accttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagct 2799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1631 - 1424
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||  ||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1631 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagtgcacgattttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 1532  T
Q  101 tt---acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 196  Q
     |   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | |||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  1531 attgaacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaacccttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattc 1432  T
Q  197 ctcaagct 204  Q
    ||||||||    
T  1431 ctcaagct 1424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1570 - 1363
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  ||| |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1570 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 1471  T
Q  101 ---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 196  Q
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |   ||| |||||||||||||||||||| |  | |||| |||||||||    
T  1470 attgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacctaaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccccaattgattc 1371  T
Q  197 ctcaagct 204  Q
    ||||||||    
T  1370 ctcaagct 1363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 215
Target Start/End: Original strand, 130880 - 130990
Alignment:
Q  105 atgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 204  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  130880 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattatgcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccaattgattcctcaagct 130979  T
Q  205 tacccttcaac 215  Q
    | |||||||||    
T  130980 ttcccttcaac 130990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 77; Significance: 6e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 187
Target Start/End: Original strand, 6832 - 6986
Alignment:
Q  36 aagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctta 132  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   |  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6832 aagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctta 6931  T
Q  133 cctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccca 187  Q
    |||| ||||  ||||| | | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6932 ccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccca 6986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17226 - 17131
Alignment:
Q  120 actaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagcttacccttcaac 215  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  17226 actaacccccttaccttagaagattattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccaattgattcctcaagctttcctttcaac 17131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23769 - 23600
Alignment:
Q  37 agagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttac 133  Q
    ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   |  ||| | |||||||||||||||||||||     
T  23769 agagcacgaatttgacatgagttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgaatatgataataactaacccccttaa 23670  T
Q  134 ctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 204  Q
    ||| ||||  ||||| | | ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  23669 cttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagttcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 23600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 100
Target Start/End: Original strand, 54100 - 54173
Alignment:
Q  27 catcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54100 catcacagtaagagcacgaatttagcatcaattgttcatcaacccattttcataaaacatgagaaaatgcaaaa 54173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 100
Target Start/End: Original strand, 3638 - 3712
Alignment:
Q  26 acatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3638 acatcacagtaagagcactaatttagcatcaattgttcatcaacccattttcataaaacatgagaaaatgcaaaa 3712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 52; Significance: 5e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 10395 - 10296
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||  |||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10395 tcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 10296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34179 - 34007
Alignment:
Q  36 aagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaaca-tgagaaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt 131  Q
    |||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |   |||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  34179 aagagcacgaatttagcaacaatttttcatcaacccattt-catacaacaatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgaagactaaccccctt 34081  T
Q  132 acctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct 204  Q
    ||||| || |  ||||| | | ||| |||||||||||| ||||||| || | || | |||||||||||||||||    
T  34080 accttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacgccaattgattcctcaagct 34007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12148 - 12045
Alignment:
Q  36 aagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt 131  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12148 aagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgag-aaatgaaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt 12050  T
Q  132 acctt 136  Q
    |||||    
T  12049 acctt 12045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 102
Target Start/End: Original strand, 7444 - 7510
Alignment:
Q  36 aagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatt 102  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  7444 aagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatt 7510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 112 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 154373 - 154282
Alignment:
Q  112 tgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  154373 tgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 154282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 13342 - 13268
Alignment:
Q  64 atcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt 136  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  13342 atcaacccattt-catacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 13268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 45230 - 45369
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaac-atgagaaaatgcaa- 98  Q
    ||||||||||||||| |  || ||  |||||||| ||| |||||||| || ||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  45230 tcatcaattcatgcacatcaaaatagcatcacaacaagggcacgaatttaacaacaattattcatcaacccattttcatacaacaatgagaaattgcaat 45329  T
Q  99 aatt--acatgattgtgataataactaacccccttacctt 136  Q
    ||||  |||||||| |||| |  |||||||||||||||||    
T  45330 aattgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctt 45369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 136
Target Start/End: Original strand, 54671 - 54755
Alignment:
Q  56 aattgttcatcaacccattttcatacaac-atgagaaaatgcaa-aatt--acatgattgtgataataactaacccccttacctt 136  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| |||| |  ||||||| |||||||||    
T  54671 aattattcatcaacccattttcatacaacaatgagaaattgcaataattgaacatgattatgatgaagactaaccaccttacctt 54755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1020 - 814
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||| |||||  |||| | ||| | | ||  |||||||||||  ||||||  || ||    
T  1020 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcaca-attcatacaacatttgagaatttgtaa 922  T
Q  99 aat-tacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 196  Q
    | |  | |||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| |||| ||||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  921 agtgaagatgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaaccccaactcttgattcaattcagctcctaagcttaccccaattgattc 822  T
Q  197 ctcaagct 204  Q
    ||||||||    
T  821 ctcaagct 814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 34524 - 34472
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||    
T  34524 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagca 34472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 41847 - 41893
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaat 47  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  41847 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaat 41893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6128 - 5922
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||| |||||  |||| | ||| | | ||  |||||||||||  ||||||  |||||    
T  6128 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcaca-attcatacaacatttgagaatttgcaa 6030  T
Q  99 aat-tacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattc 196  Q
    | |  | |||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||    |||||   ||||| |||||||||||||||||||| || | || | |||||||||    
T  6029 agtgaaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatagagattaatcctaactcttgcttcaattcagctcctaagcttactctaattgattc 5930  T
Q  197 ctcaagct 204  Q
    ||||||||    
T  5929 ctcaagct 5922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 12312 - 12364
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||| |||||    
T  12312 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatttagca 12364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 8240 - 8192
Alignment:
Q  5 caattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||    
T  8240 caattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagca 8192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 13705 - 13757
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||| |||||    
T  13705 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagca 13757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 123228 - 123176
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||| |||||    
T  123228 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagca 123176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 598 - 546
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||| |||||    
T  598 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 5728 - 5780
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | |  |||||||||| |||||    
T  5728 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttggagcacgaatttagca 5780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 9077 - 9129
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||| |||||    
T  9077 tcatcgattcatgcatacaaacataacatcacaaatggagcacgaatttagca 9129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 3646 - 3594
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||| |||||    
T  3646 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 3594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 19405 - 19457
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||| |||||    
T  19405 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 19457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 21489 - 21541
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||| |||||    
T  21489 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 21541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 41928 - 41980
Alignment:
Q  1 tcatcaattcatgcatacaaacatgacatcacaataagagcacgaatctagca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||| |||||    
T  41928 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagca 41980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University