View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17481_high_1 (Length: 441)

Name: NF17481_high_1
Description: NF17481
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17481_high_1
NF17481_high_1
[»] scaffold0234 (4 HSPs)
scaffold0234 (1-322)||(2207-2528)
scaffold0234 (1-322)||(11098-11419)
scaffold0234 (358-414)||(2564-2620)
scaffold0234 (358-414)||(11455-11511)
[»] chr7 (57 HSPs)
chr7 (1-322)||(29327784-29328105)
chr7 (1-322)||(11535948-11536269)
chr7 (1-322)||(11542866-11543187)
chr7 (1-320)||(15152445-15152764)
chr7 (1-320)||(18561009-18561328)
chr7 (1-320)||(12750828-12751147)
chr7 (1-316)||(12738542-12738857)
chr7 (8-320)||(18257735-18258047)
chr7 (101-320)||(15148144-15148363)
chr7 (5-316)||(13392157-13392467)
chr7 (104-300)||(2364917-2365112)
chr7 (7-142)||(8464999-8465133)
chr7 (7-151)||(2204543-2204686)
chr7 (7-151)||(18400095-18400238)
chr7 (7-151)||(18407079-18407222)
chr7 (7-151)||(30254129-30254272)
chr7 (7-151)||(48808664-48808807)
chr7 (64-289)||(7396221-7396450)
chr7 (10-120)||(10235364-10235474)
chr7 (11-151)||(19230879-19231018)
chr7 (42-316)||(39111819-39112092)
chr7 (19-184)||(7662569-7662733)
chr7 (7-151)||(15729742-15729885)
chr7 (7-151)||(18139506-18139649)
chr7 (358-415)||(2653275-2653332)
chr7 (358-415)||(12738442-12738499)
chr7 (7-151)||(10669070-10669213)
chr7 (358-414)||(11543223-11543279)
chr7 (9-248)||(3132748-3132986)
chr7 (358-414)||(11536305-11536361)
chr7 (358-414)||(12750733-12750789)
chr7 (358-414)||(15152350-15152406)
chr7 (33-137)||(47833875-47833979)
chr7 (359-414)||(29327690-29327745)
chr7 (7-74)||(41681136-41681203)
chr7 (10-75)||(2365169-2365234)
chr7 (358-414)||(15148049-15148105)
chr7 (15-67)||(16011515-16011567)
chr7 (42-142)||(19859122-19859221)
chr7 (13-67)||(14591924-14591978)
chr7 (8-74)||(19393593-19393659)
chr7 (7-184)||(47167027-47167203)
chr7 (359-414)||(13392030-13392085)
chr7 (11-150)||(19388544-19388682)
chr7 (8-63)||(25845645-25845700)
chr7 (8-63)||(25846064-25846119)
chr7 (8-67)||(34128647-34128706)
chr7 (8-74)||(28130628-28130694)
chr7 (207-272)||(10234179-10234244)
chr7 (8-137)||(24443496-24443624)
chr7 (290-322)||(2653207-2653239)
chr7 (358-414)||(18258087-18258143)
chr7 (12-60)||(31190612-31190660)
chr7 (8-67)||(22969024-22969083)
chr7 (53-108)||(29983179-29983234)
chr7 (35-77)||(7396469-7396511)
chr7 (243-293)||(29982995-29983045)
[»] chr1 (45 HSPs)
chr1 (1-322)||(18252030-18252351)
chr1 (1-322)||(18532400-18532721)
chr1 (1-322)||(27131295-27131616)
chr1 (1-320)||(21171119-21171438)
chr1 (1-320)||(16358921-16359240)
chr1 (1-320)||(27310463-27310782)
chr1 (1-316)||(36816519-36816834)
chr1 (1-322)||(3855805-3856126)
chr1 (2-322)||(22657108-22657429)
chr1 (3-316)||(27277445-27277756)
chr1 (10-288)||(12014179-12014457)
chr1 (33-310)||(9917837-9918106)
chr1 (37-288)||(12006461-12006712)
chr1 (13-184)||(23507038-23507209)
chr1 (7-136)||(28134891-28135019)
chr1 (7-151)||(19706607-19706750)
chr1 (7-151)||(43802533-43802676)
chr1 (1-116)||(22641760-22641871)
chr1 (7-151)||(9456107-9456250)
chr1 (7-151)||(20779813-20779956)
chr1 (7-151)||(22670425-22670568)
chr1 (7-151)||(42817157-42817300)
chr1 (7-151)||(20391407-20391550)
chr1 (358-415)||(18251935-18251992)
chr1 (358-415)||(18532757-18532814)
chr1 (7-151)||(22612483-22612626)
chr1 (33-151)||(47667668-47667785)
chr1 (10-151)||(35930573-35930713)
chr1 (358-414)||(27310821-27310877)
chr1 (7-74)||(634001-634068)
chr1 (8-67)||(8727741-8727800)
chr1 (14-67)||(51997353-51997406)
chr1 (358-414)||(16359280-16359336)
chr1 (8-134)||(26923553-26923678)
chr1 (215-292)||(3403248-3403325)
chr1 (215-292)||(3443494-3443571)
chr1 (358-414)||(21171479-21171535)
chr1 (365-414)||(22657472-22657521)
chr1 (247-316)||(30720625-30720694)
chr1 (365-406)||(36816885-36816926)
chr1 (358-414)||(3856164-3856220)
chr1 (10-74)||(29096789-29096853)
chr1 (8-67)||(21881545-21881604)
chr1 (358-414)||(27131652-27131704)
chr1 (358-414)||(27277800-27277856)
[»] chr4 (72 HSPs)
chr4 (1-322)||(19926646-19926967)
chr4 (1-322)||(55612683-55613004)
chr4 (1-322)||(26970463-26970784)
chr4 (1-322)||(5707320-5707641)
chr4 (1-322)||(26963640-26963961)
chr4 (1-322)||(5713948-5714269)
chr4 (1-322)||(10621219-10621540)
chr4 (1-322)||(10628298-10628619)
chr4 (1-320)||(18262214-18262533)
chr4 (1-322)||(868597-868918)
chr4 (1-320)||(18269070-18269394)
chr4 (5-320)||(4426494-4426808)
chr4 (1-320)||(28393020-28393339)
chr4 (1-310)||(8858179-8858488)
chr4 (1-310)||(8845215-8845524)
chr4 (10-314)||(20311299-20311604)
chr4 (1-316)||(35223576-35223881)
chr4 (1-316)||(5668013-5668327)
chr4 (207-322)||(12357136-12357251)
chr4 (98-316)||(10677538-10677753)
chr4 (98-316)||(10891178-10891393)
chr4 (10-284)||(56516094-56516368)
chr4 (11-296)||(21454035-21454319)
chr4 (13-320)||(5616215-5616523)
chr4 (7-151)||(15461488-15461631)
chr4 (7-151)||(2677004-2677147)
chr4 (7-151)||(15815012-15815155)
chr4 (7-151)||(17300127-17300270)
chr4 (7-151)||(18111211-18111354)
chr4 (7-151)||(34975542-34975685)
chr4 (7-137)||(5870423-5870552)
chr4 (11-120)||(32646697-32646806)
chr4 (7-151)||(3369191-3369334)
chr4 (358-415)||(19927003-19927060)
chr4 (7-151)||(4676151-4676294)
chr4 (358-414)||(5713856-5713912)
chr4 (7-151)||(18163153-18163296)
chr4 (7-151)||(20243928-20244071)
chr4 (7-151)||(26531604-26531747)
chr4 (358-414)||(26963548-26963604)
chr4 (358-414)||(26970371-26970427)
chr4 (60-137)||(24700214-24700291)
chr4 (358-414)||(5707228-5707284)
chr4 (358-414)||(10621576-10621632)
chr4 (358-414)||(12357044-12357100)
chr4 (7-74)||(1941791-1941858)
chr4 (358-412)||(868507-868561)
chr4 (1-67)||(10677468-10677534)
chr4 (1-67)||(10891108-10891174)
chr4 (358-415)||(17142372-17142429)
chr4 (358-414)||(10628655-10628711)
chr4 (358-414)||(55612594-55612650)
chr4 (358-416)||(4426847-4426905)
chr4 (8-74)||(19365586-19365652)
chr4 (360-414)||(28393380-28393434)
chr4 (358-414)||(18268976-18269032)
chr4 (7-74)||(4546147-4546214)
chr4 (7-73)||(32636552-32636618)
chr4 (13-95)||(34777893-34777975)
chr4 (7-67)||(9487625-9487685)
chr4 (207-273)||(39074279-39074346)
chr4 (8-74)||(19362477-19362543)
chr4 (10-67)||(9538033-9538090)
chr4 (358-407)||(55992680-55992729)
chr4 (105-185)||(39074190-39074270)
chr4 (213-272)||(11161913-11161972)
chr4 (43-86)||(33888594-33888637)
chr4 (358-399)||(5668371-5668412)
chr4 (358-406)||(8845118-8845166)
chr4 (358-406)||(8858082-8858130)
chr4 (8-52)||(11421096-11421140)
chr4 (358-398)||(18262136-18262176)
[»] chr3 (68 HSPs)
chr3 (1-322)||(6110064-6110385)
chr3 (1-322)||(10572478-10572799)
chr3 (1-320)||(16482369-16482688)
chr3 (1-322)||(15600770-15601091)
chr3 (1-322)||(15607315-15607636)
chr3 (1-320)||(18522665-18522984)
chr3 (5-316)||(17781008-17781319)
chr3 (1-319)||(13211305-13211623)
chr3 (1-316)||(10579241-10579556)
chr3 (1-322)||(8490488-8490816)
chr3 (1-322)||(13248607-13248928)
chr3 (1-322)||(15357472-15357793)
chr3 (1-320)||(18519980-18520296)
chr3 (1-320)||(13516813-13517132)
chr3 (1-320)||(17200070-17200389)
chr3 (1-316)||(32056785-32057101)
chr3 (5-303)||(15342109-15342407)
chr3 (1-316)||(1647407-1647726)
chr3 (1-322)||(29924971-29925292)
chr3 (1-322)||(29974124-29974445)
chr3 (104-316)||(19089734-19089946)
chr3 (9-320)||(16200434-16200743)
chr3 (1-216)||(17136465-17136674)
chr3 (161-322)||(18640792-18640953)
chr3 (83-320)||(16200128-16200363)
chr3 (18-315)||(24253291-24253589)
chr3 (7-151)||(15846704-15846847)
chr3 (7-151)||(21034229-21034372)
chr3 (7-142)||(14890391-14890525)
chr3 (7-151)||(20147722-20147865)
chr3 (259-320)||(18534758-18534819)
chr3 (7-86)||(21398847-21398926)
chr3 (358-414)||(6109972-6110028)
chr3 (358-414)||(8490396-8490452)
chr3 (358-414)||(13248515-13248571)
chr3 (7-151)||(55427012-55427155)
chr3 (7-151)||(12299902-12300044)
chr3 (358-414)||(13211211-13211267)
chr3 (358-414)||(18640989-18641045)
chr3 (8-151)||(14147012-14147154)
chr3 (365-414)||(10579604-10579653)
chr3 (275-320)||(18510924-18510969)
chr3 (358-414)||(17136137-17136193)
chr3 (7-74)||(11787654-11787721)
chr3 (365-414)||(10572841-10572890)
chr3 (358-414)||(15607672-15607729)
chr3 (365-414)||(17200434-17200483)
chr3 (358-414)||(15351237-15351293)
chr3 (358-414)||(15357829-15357885)
chr3 (358-414)||(16482727-16482782)
chr3 (358-414)||(18519885-18519941)
chr3 (7-74)||(25978896-25978963)
chr3 (57-159)||(9504446-9504548)
chr3 (8-74)||(15317342-15317408)
chr3 (358-415)||(1647768-1647825)
chr3 (358-414)||(15601127-15601184)
chr3 (358-414)||(13516719-13516775)
chr3 (370-414)||(17781370-17781414)
chr3 (370-414)||(19089997-19090041)
chr3 (358-414)||(32057144-32057200)
chr3 (31-117)||(8251933-8252019)
chr3 (11-103)||(28953965-28954058)
chr3 (358-414)||(18510829-18510885)
chr3 (358-414)||(18522570-18522626)
chr3 (358-406)||(18534671-18534719)
chr3 (358-414)||(29924879-29924935)
chr3 (358-414)||(29974032-29974088)
chr3 (9-101)||(32280313-32280405)
[»] scaffold0433 (2 HSPs)
scaffold0433 (1-322)||(7107-7428)
scaffold0433 (358-414)||(7015-7071)
[»] scaffold0390 (4 HSPs)
scaffold0390 (1-322)||(6820-7141)
scaffold0390 (1-322)||(13836-14157)
scaffold0390 (358-414)||(7177-7233)
scaffold0390 (358-414)||(14193-14249)
[»] chr8 (43 HSPs)
chr8 (1-322)||(21940665-21940986)
chr8 (1-320)||(22171491-22171808)
chr8 (1-316)||(6094129-6094444)
chr8 (5-316)||(24642655-24642966)
chr8 (122-320)||(28554885-28555083)
chr8 (10-310)||(38232272-38232570)
chr8 (189-316)||(24636860-24636987)
chr8 (1-98)||(15326422-15326519)
chr8 (1-98)||(15506791-15506888)
chr8 (10-200)||(14983816-14984004)
chr8 (15-292)||(32872741-32873019)
chr8 (7-151)||(21969324-21969467)
chr8 (7-151)||(12562114-12562257)
chr8 (7-151)||(8371421-8371564)
chr8 (7-151)||(22130777-22130920)
chr8 (7-151)||(25611186-25611329)
chr8 (7-151)||(27007685-27007828)
chr8 (7-151)||(27014828-27014971)
chr8 (7-151)||(27880655-27880798)
chr8 (7-151)||(28020836-28020979)
chr8 (11-301)||(2375027-2375322)
chr8 (1-147)||(24797274-24797419)
chr8 (7-151)||(21916667-21916810)
chr8 (7-151)||(45534441-45534584)
chr8 (8-151)||(18835341-18835483)
chr8 (7-74)||(26240551-26240618)
chr8 (358-415)||(22070107-22070164)
chr8 (358-414)||(21940573-21940629)
chr8 (365-414)||(24642556-24642605)
chr8 (358-414)||(6094031-6094087)
chr8 (358-414)||(22171396-22171452)
chr8 (7-74)||(22659662-22659729)
chr8 (358-414)||(28554791-28554847)
chr8 (7-74)||(6430953-6431020)
chr8 (221-284)||(10920234-10920297)
chr8 (9-66)||(8782045-8782102)
chr8 (45-137)||(29645539-29645631)
chr8 (8-74)||(2963105-2963171)
chr8 (43-95)||(10920427-10920479)
chr8 (68-175)||(24535462-24535569)
chr8 (9-68)||(34659059-34659118)
chr8 (35-74)||(36970332-36970371)
chr8 (377-414)||(24636605-24636642)
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (1-322)||(24695352-24695673)
chr5 (1-320)||(19714384-19714703)
chr5 (1-316)||(19707104-19707419)
chr5 (1-322)||(18569747-18570070)
chr5 (11-316)||(22546912-22547217)
chr5 (1-202)||(39538708-39538909)
chr5 (62-317)||(27347425-27347679)
chr5 (10-318)||(17285643-17285935)
chr5 (10-256)||(18806929-18807175)
chr5 (14-318)||(17298798-17299088)
chr5 (213-322)||(39537962-39538071)
chr5 (7-151)||(20941018-20941161)
chr5 (7-151)||(25805553-25805696)
chr5 (7-151)||(31890-32033)
chr5 (7-151)||(23545913-23546056)
chr5 (7-151)||(12789831-12789974)
chr5 (7-151)||(22941241-22941384)
chr5 (7-202)||(12765162-12765356)
chr5 (358-414)||(24695709-24695765)
chr5 (7-151)||(24933474-24933617)
chr5 (213-316)||(31886537-31886640)
chr5 (358-414)||(19714742-19714798)
chr5 (7-151)||(31096807-31096950)
chr5 (8-202)||(7865603-7865796)
chr5 (8-202)||(12704047-12704240)
chr5 (8-190)||(9811906-9812086)
chr5 (358-414)||(19707462-19707518)
chr5 (358-414)||(27347722-27347778)
chr5 (8-151)||(5097642-5097784)
chr5 (207-296)||(33477390-33477479)
chr5 (10-84)||(18829456-18829530)
chr5 (8-151)||(26245093-26245235)
chr5 (8-137)||(20100412-20100540)
chr5 (358-406)||(18570108-18570156)
chr5 (359-414)||(39537870-39537925)
chr5 (207-272)||(11479420-11479486)
chr5 (10-60)||(18806569-18806619)
chr5 (10-60)||(18806749-18806799)
chr5 (8-74)||(26129862-26129928)
chr5 (10-86)||(33477193-33477269)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (1-322)||(18288-18609)
scaffold0220 (358-414)||(18196-18252)
[»] chr6 (50 HSPs)
chr6 (1-322)||(27381138-27381459)
chr6 (1-322)||(27471521-27471842)
chr6 (1-322)||(29308890-29309211)
chr6 (1-322)||(29315850-29316171)
chr6 (1-320)||(17684355-17684674)
chr6 (1-322)||(17691326-17691647)
chr6 (1-320)||(188863-189182)
chr6 (1-320)||(11651725-11652044)
chr6 (52-320)||(16566257-16566525)
chr6 (104-320)||(25537148-25537364)
chr6 (34-320)||(13359188-13359474)
chr6 (13-299)||(27925772-27926062)
chr6 (1-108)||(16394331-16394438)
chr6 (18-283)||(20553492-20553755)
chr6 (12-284)||(17850392-17850663)
chr6 (1-74)||(27296877-27296950)
chr6 (1-76)||(25537077-25537152)
chr6 (7-151)||(18020009-18020152)
chr6 (19-180)||(28172698-28172859)
chr6 (7-151)||(16789062-16789205)
chr6 (7-151)||(22860056-22860199)
chr6 (10-137)||(2669478-2669605)
chr6 (10-303)||(8509941-8510235)
chr6 (7-151)||(1586276-1586419)
chr6 (1-57)||(16559358-16559414)
chr6 (7-135)||(27508515-27508642)
chr6 (7-135)||(27528101-27528228)
chr6 (358-412)||(17691683-17691737)
chr6 (365-414)||(27381502-27381551)
chr6 (365-414)||(27471885-27471934)
chr6 (7-151)||(14074471-14074614)
chr6 (358-414)||(29308798-29308854)
chr6 (358-414)||(29315758-29315814)
chr6 (8-202)||(8612855-8613048)
chr6 (11-284)||(20736501-20736773)
chr6 (358-414)||(17684712-17684768)
chr6 (360-414)||(11651630-11651684)
chr6 (7-120)||(19347092-19347204)
chr6 (358-414)||(25537405-25537461)
chr6 (8-67)||(5758650-5758709)
chr6 (260-315)||(31258065-31258120)
chr6 (8-190)||(22560353-22560534)
chr6 (47-151)||(13995151-13995254)
chr6 (8-74)||(21994655-21994721)
chr6 (358-406)||(13359512-13359560)
chr6 (358-406)||(16566563-16566611)
chr6 (358-416)||(189221-189282)
chr6 (8-74)||(10359219-10359285)
chr6 (39-201)||(19218371-19218531)
chr6 (207-284)||(28605854-28605931)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (1-322)||(21330134-21330455)
chr2 (1-322)||(18796506-18796827)
chr2 (1-320)||(18619807-18620125)
chr2 (10-288)||(36270199-36270478)
chr2 (21-288)||(18822115-18822384)
chr2 (19-258)||(20977956-20978178)
chr2 (23-184)||(22183392-22183552)
chr2 (177-316)||(19692598-19692737)
chr2 (12-202)||(18851956-18852146)
chr2 (10-165)||(19279445-19279600)
chr2 (7-151)||(24250200-24250343)
chr2 (7-151)||(30174368-30174511)
chr2 (10-147)||(6992007-6992146)
chr2 (358-415)||(21330493-21330550)
chr2 (7-151)||(24229383-24229526)
chr2 (33-136)||(36801899-36802003)
chr2 (8-67)||(29800545-29800604)
chr2 (8-74)||(15342171-15342237)
chr2 (33-137)||(28741220-28741323)
chr2 (131-286)||(36802664-36802820)
chr2 (8-67)||(19616509-19616568)
chr2 (8-71)||(28718943-28719006)
chr2 (13-67)||(21626824-21626877)
chr2 (33-74)||(24763751-24763792)
chr2 (358-414)||(19692773-19692829)
chr2 (11-67)||(40301108-40301164)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (1-322)||(25876-26197)
scaffold0186 (359-414)||(26231-26286)
[»] scaffold0657 (2 HSPs)
scaffold0657 (1-322)||(993-1314)
scaffold0657 (358-415)||(900-957)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (1-320)||(5531-5850)
scaffold0063 (358-406)||(5444-5492)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (137-320)||(230363-230545)
scaffold0008 (1-91)||(230277-230367)
scaffold0008 (358-414)||(230584-230640)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (7-151)||(8296-8439)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (7-151)||(174-317)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (19-165)||(90019-90166)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (7-151)||(3843-3986)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (7-151)||(119721-119864)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (7-151)||(130392-130535)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (259-322)||(8447-8510)
scaffold0176 (358-414)||(8546-8602)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (358-414)||(23769-23825)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (7-74)||(67542-67609)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (8-190)||(13118-13299)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (366-414)||(16523-16571)
scaffold0326 (289-322)||(16615-16648)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (8-142)||(40157-40290)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (8-74)||(26609-26675)
[»] scaffold0705 (1 HSPs)
scaffold0705 (358-414)||(41-97)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (358-414)||(8944-9000)
[»] scaffold0767 (1 HSPs)
scaffold0767 (378-419)||(1-42)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (8-67)||(11699-11758)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (8-67)||(83184-83243)
[»] scaffold0565 (2 HSPs)
scaffold0565 (358-412)||(10202-10256)
scaffold0565 (272-303)||(10127-10158)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (12-103)||(45956-46051)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (57-293)||(92194-92432)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (8-65)||(8807-8864)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (8-74)||(53832-53898)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (365-414)||(5878-5927)


Alignment Details
Target: scaffold0234 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 4)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 2207 - 2528
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2207 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 2306  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2307 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 2406  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2407 gtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 2506  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2507 aatcaataaagaaatgccttgt 2528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 11098 - 11419
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11098 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 11197  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11198 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 11297  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11298 gtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 11397  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11398 aatcaataaagaaatgccttgt 11419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 2564 - 2620
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2564 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 2620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 11455 - 11511
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11455 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 11511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 57)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 29328105 - 29327784
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328105 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 29328006  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328005 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 29327906  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327905 gtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaactgactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 29327806  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29327805 aatcaataaagaaatgccttgt 29327784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 11535948 - 11536269
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11535948 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctttgtgaagactggataactctttatccatg 11536047  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11536048 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 11536147  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11536148 ggttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttgtacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 11536247  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11536248 aatcaataaagaaatgccttgt 11536269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 11542866 - 11543187
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11542866 taacatttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatg 11542965  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542966 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 11543065  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11543066 ggttccttatgtttaatggggtctgacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 11543165  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  11543166 aatcaataaagaaatgcattgt 11543187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15152764 - 15152445
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152764 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 15152665  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15152664 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaata 15152565  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15152564 gtttccgtatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaa 15152465  T
Q  301 aatcaataaagaaatgcctt 320  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  15152464 actcaataaagaaatgcctt 15152445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18561328 - 18561009
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561328 taacttttactatgtagtattctcatagagggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 18561229  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18561228 atctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacctctcaataaagcttgactacagatactttaagaata 18561129  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561128 gtttcctaatgtttaacggggtctcacagttaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 18561029  T
Q  301 aatcaataaagaaatgcctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18561028 aatcaataaagaaatgcctt 18561009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 12751147 - 12750828
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12751147 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgagaagaattgataactctttatccatg 12751048  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12751047 atctgtgagatgtgatcatcagtctatccacataatagtctctatgctttaatgatatccaacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaata 12750948  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12750947 gtttctttatgtttaacgaggtctcacaattaagttatacttaatgtttcattaaacggactaactattctagggactttattactttgaaacaaaacaa 12750848  T
Q  301 aatcaataaagaaatgcctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12750847 aatcaataaagaaatgcctt 12750828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12738857 - 12738542
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738857 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattatgagtaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 12738758  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12738757 atctgtgagatgtgatcttcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaata 12738658  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12738657 gtttccttatgtttaacaaggtctcacaattaagttataattaatgtttcattaaacaaactaactattctagggactttattattttgaaacaaaataa 12738558  T
Q  301 aatcaataaagaaatg 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  12738557 aatcaataaagaaatg 12738542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 8 - 320
Target Start/End: Original strand, 18257735 - 18258047
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 107  Q
    ||||||||| |||||| | || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18257735 tactatgtaatattctgacggtgggttaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18257834  T
Q  108 agatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcat 207  Q
    |||||||||||||  |||| | |||||||| ||| ||||| ||| || ||||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||||| |||||| | || |    
T  18257835 agatgtgatcatcaatctatccacataatagtctttatgcattattgttatcctacttaacaaaaaaacttgactacggatactttaagaataatgtcct 18257934  T
Q  208 tatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaat 307  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18257935 tgtgtttaatggggtctcacaattaagtcatacttaatgttccattaaacagactaattattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaat 18258034  T
Q  308 aaagaaatgcctt 320  Q
    |||||||||||||    
T  18258035 aaagaaatgcctt 18258047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 101 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15148363 - 15148144
Alignment:
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15148363 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaata 15148264  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15148263 gtttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttcaatcaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaa 15148164  T
Q  301 aatcaataaagaaatgcctt 320  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  15148163 actcaataaagaaatgcctt 15148144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13392467 - 13392157
Alignment:
Q  5 ttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatct 104  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||     
T  13392467 ttttactatgtaatattcgcatggtgggtcaatccagtataaatatttctcctaatatttattcctatgtgaagacaggataactctttatctatgatcc 13392368  T
Q  105 gtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagttt 204  Q
    ||||||||||||||||  |||||| | | |||| |||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||  |||||||| |||||| | |    
T  13392367 gtgagatgtgatcatcgatctaccaatacaatagtctctatgttttaatgttatcccttttcacaataaagtttgactattgatactttaagaataatgt 13392268  T
Q  205 cattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatc 304  Q
    | ||   |||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13392267 cctttcatttaat-gggtctcacgattaagtcacacttaatgctccattaagcagactaattgttctaggaactttattattttgaaacaaaacaaagtc 13392169  T
Q  305 aataaagaaatg 316  Q
    || |||||||||    
T  13392168 aacaaagaaatg 13392157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 2365112 - 2364917
Alignment:
Q  104 tgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtt 203  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||| |||||||| ||||||| |||| || ||| |||||| | ||||||||| ||| ||| |||||| |     
T  2365112 tgtgagatgtgatcatcagtcgacccacatgatagtctctatgttttaatgttatctcatttcacaataagg-ttgactacgaatattttaagaataatg 2365014  T
Q  204 tcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    |||||  |||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  2365013 tcatttagtttaatgggttctcacgattaagccacacttaatgttccattagaaagactaattattctagagactttattattttgaaacataacaa 2364917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 8465133 - 8464999
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  8465133 ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 8465035  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctc 142  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  8465034 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 8464999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 2204686 - 2204543
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  2204686 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 2204588  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  2204587 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 2204543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 18400238 - 18400095
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  18400238 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 18400140  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  18400139 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 18400095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 18407222 - 18407079
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  18407222 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 18407124  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  18407123 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 18407079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 30254272 - 30254129
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  30254272 ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 30254174  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  30254173 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 30254129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 48808664 - 48808807
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  48808664 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 48808762  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  48808763 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 48808807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 7396450 - 7396221
Alignment:
Q  64 tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatctgtctacct---acataatactctctatgctttaatgatatcc 160  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||  |||    |||||||| |||||||||||||||   |||     
T  7396450 tatatttatgtgaatacttgataattctttattcatgatatgtgagatgtgatcatcagttcaccctgcacataatagtctctatgctttaatatcatcg 7396351  T
Q  161 cacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttcca-ttaaacag 259  Q
     | ||| || ||| ||||||||||  ||  ||| |||||| |||  ||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||       
T  7396350 tatttcacactaaggcttgactacatatgttttaagaataattttcttatgtttaatagggtctcaagattaagtcatacttaatgttccatttaaatga 7396251  T
Q  260 actaactattctagggactttattattttg 289  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  7396250 actaactattctagcgacatttttattttg 7396221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 10235474 - 10235364
Alignment:
Q  10 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 109  Q
    |||||||  |||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10235474 ctatgtataattctcatggtgagtcaatccgatataaatattattcctaatatttatacatatgggaacacctgataactctttatcaatgatctgtgag 10235375  T
Q  110 atgtgatcatc 120  Q
    |||||||||||    
T  10235374 atgtgatcatc 10235364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 19231018 - 19230879
Alignment:
Q  11 tatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaga 110  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |||||    
T  19231018 tatgtagtattctcacggtgggtcaatccagtataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgaga 19230920  T
Q  111 tgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    || | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  19230919 tgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 19230879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 39112092 - 39111819
Alignment:
Q  42 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactct 141  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||  |  ||||||||||||||||| || || ||| | | |||  |||||||   |||||| |||    
T  39112092 tataaataatactcctaatatttatgtatatatgaagaaattgtaactctttatccatgacctatgtgatattaccattagtctacccttataatagtct 39111993  T
Q  142 ctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatact 241  Q
    ||||  ||||||| |||  |  ||| |||||||||| ||||  | ||| |||   |||||| || |||||||||| |  ||||    |||||||  ||||    
T  39111992 ctatattttaatgttatttcgtttcacaataaagctggactgtgaatatttttgaaatagtgtccttatgtttaaagatgtcttgtgattaagtcgtact 39111893  T
Q  242 taatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 316  Q
    ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  39111892 taatgtttcattaaacggactcgctattctagggactttatt-ttttgaaataaaacaaaattaataaagaaatg 39111819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Original strand, 7662569 - 7662733
Alignment:
Q  19 attctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatca 118  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||  || |||| ||||||    
T  7662569 attctcatggcgggtcaatctaataaaaatattacttataat-tttatatctatgtgaagacttgataagtttttatacatgattcgtaagatatgatca 7662667  T
Q  119 tctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactac 184  Q
    || || || | |||||||| ||  | | |||||||| ||||| ||||| || |||| |||||||||    
T  7662668 tcagtgtatccacataataatcaatgtactttaatgctatcctacttcacactaaatcttgactac 7662733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 15729885 - 15729742
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  |    
T  15729885 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccat 15729787  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  15729786 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 15729742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 18139506 - 18139649
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||  |||| |||| |  |    
T  18139506 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacctgatatctc-atatctatgacccat 18139604  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  18139605 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 18139649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 415
Target Start/End: Original strand, 2653275 - 2653332
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 415  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2653275 catgatacaaagccaatcccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 2653332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 12738499 - 12738442
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 415  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12738499 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaacat 12738442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 10669070 - 10669213
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  |    
T  10669070 ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccat 10669168  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  10669169 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 10669213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 11543223 - 11543279
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11543223 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 11543279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3132986 - 3132748
Alignment:
Q  9 actatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtga 108  Q
    ||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| |  ||  | |||| |||    
T  3132986 actatgtagtattcttatgacaggtcaatccaatataaatattaa-cataataattatacatatgtgaagacttgatatctcatattcatttatctatga 3132888  T
Q  109 gatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcatt 208  Q
    |||||||||||| |||||   ||||  || ||||||||| ||| |  | | ||| |||  | |||| || || |||  ||||||| | |||| |  | ||    
T  3132887 gatgtgatcatcagtctaatcacattgtagtctctatgcattactatttttccaattccaagtaaaactagattacaaatactttcataataatgacctt 3132788  T
Q  209 atgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgtt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3132787 atgtttaatggggtctcacaattaagttacacttaatgtt 3132748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 11536305 - 11536361
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11536305 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagagtggctattagggcttattccaaca 11536361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 12750789 - 12750733
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12750789 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattagctattagggcttactccaaca 12750733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 15152406 - 15152350
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15152406 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 15152350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 137
Target Start/End: Original strand, 47833875 - 47833979
Alignment:
Q  33 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatctgtctacctaca 132  Q
    |||||| |||||||||||||    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| | | ||||||||     
T  47833875 tcaatcaaatataaatattatgagtaatatttatacctatgtgaaaacttggtaactctttattcatgatcggtgagatctgatcaccagcctacctacg 47833974  T
Q  133 taata 137  Q
    |||||    
T  47833975 taata 47833979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 359 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 29327745 - 29327690
Alignment:
Q  359 atgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29327745 atgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 29327690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Original strand, 41681136 - 41681203
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 74  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  41681136 ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccagtataaatattactcataatatttatacctatgt 41681203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 2365234 - 2365169
Alignment:
Q  10 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 75  Q
    |||||||| ||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2365234 ctatgtagcattttcatggtgggtcaatccaatgtaaatattactcctaatattgatatctatgtg 2365169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 15148105 - 15148049
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15148105 catgatacaaaaccaaacccaattaatatagattggctattagggcttactccaaca 15148049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 16011567 - 16011515
Alignment:
Q  15 tagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 67  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16011567 tagtattctcatggtgggtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 16011515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 19859221 - 19859122
Alignment:
Q  42 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactct 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||    
T  19859221 tataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtct 19859123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 14591978 - 14591924
Alignment:
Q  13 tgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 67  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14591978 tgtagtattctcacggtgggtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 14591924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 74
Target Start/End: Original strand, 19393593 - 19393659
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 74  Q
    |||||||||||||||||| ||  | |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19393593 tactatgtagtattctcacggtcggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 19393659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Original strand, 47167027 - 47167203
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    ||||||||||||||||||| || || || ||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  |    
T  47167027 ttactatgtagtattctcacggtgggtctatctagtataaatattactcataatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccat 47167125  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactac 184  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | |||||| |  ||||| | |||  | ||||||||||||||    
T  47167126 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctaattcatattaaagcttgactac 47167203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 359 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 13392085 - 13392030
Alignment:
Q  359 atgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  13392085 atgatacaaagtcaaacacaatcaatatagattggatattagggcttactccaaca 13392030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 19388682 - 19388544
Alignment:
Q  11 tatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaga 110  Q
    |||||||||||||||||   |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||  | |||| ||| |||  ||| ||||| | ||||||    
T  19388682 tatgtagtattctcatgattgggcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctttgtacaaacttaatatctc-atattcatgacccgtgaga 19388584  T
Q  111 tgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttt 150  Q
    | || |||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  19388583 tatggtcatcaatctatatacataataatctctatgcttt 19388544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 63
Target Start/End: Original strand, 25845645 - 25845700
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatt 63  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25845645 tactatgtagtattctcacggtgtgtcaatccagtataaatattactcctaatatt 25845700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 63
Target Start/End: Original strand, 25846064 - 25846119
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatt 63  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25846064 tactatgtagtattctcacggtgtgtcaatccagtataaatattactcctaatatt 25846119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 34128706 - 34128647
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 67  Q
    ||||||||||||||||||    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34128706 tactatgtagtattctcacaatggatctatccagtataaatattactcctaatatttata 34128647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 28130694 - 28130628
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 74  Q
    ||||||||| ||||||||  | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  28130694 tactatgtaatattctcacagtgggtcaatccagtataaatattactcctgatatttatacctatgt 28130628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10234244 - 10234179
Alignment:
Q  207 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattcta 272  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  10234244 ttatgtttaatggaatctcatgattaagttatatttaatggttcattaaacggactaactattcta 10234179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 24443496 - 24443624
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 107  Q
    |||||||||||| ||||| || || | |||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | |||| ||| || | ||| ||||| |  ||    
T  24443496 tactatgtagtactctcacggtgggttaatctagtataaatattactcctaatattcatacctatgtataaacttaatatct-tatattcatgacccatg 24443594  T
Q  108 agatgtgatcatctgtctacctacataata 137  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  24443595 agatgtggtcatcagtctacatacataata 24443624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 322
Target Start/End: Original strand, 2653207 - 2653239
Alignment:
Q  290 aaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2653207 aaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 2653239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 18258087 - 18258143
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18258087 catgatacaaggccaaaaccaatcaatctagattggctatcagggcttactccaaca 18258143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 60
Target Start/End: Original strand, 31190612 - 31190660
Alignment:
Q  12 atgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaat 60  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  31190612 atgtagtattctcatggtgggtcaatccagtataaatattgctcctaat 31190660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 22969083 - 22969024
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 67  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  22969083 tactatgtagtattctcacggtgggtcaatcttgtataaacattactcctaatatttata 22969024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 29983234 - 29983179
Alignment:
Q  53 ctcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtga 108  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29983234 ctcctaatatttatacatatgtgaaaatttgttaactctttatccatgatccgtga 29983179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 7396511 - 7396469
Alignment:
Q  35 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaa 77  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  7396511 aatccaatataaatattacccataatatttatatttatgtgaa 7396469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29983045 - 29982995
Alignment:
Q  243 aatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaac 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||||    
T  29983045 aatgttccattaaacagattaactgttctaaagactttattactttgaaac 29982995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 45)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 18252351 - 18252030
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252351 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 18252252  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252251 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 18252152  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252151 gtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 18252052  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18252051 aatcaataaagaaatgccttgt 18252030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 18532400 - 18532721
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532400 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 18532499  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532500 atctgtgagatgtgatcatcagtctatctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 18532599  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532600 gtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgaactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 18532699  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18532700 aatcaataaagaaatgccttgt 18532721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 27131295 - 27131616
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131295 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 27131394  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  27131395 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacaaatactttgagaata 27131494  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131495 gtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 27131594  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27131595 aatcaataaagaaatgccttgt 27131616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 21171119 - 21171438
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171119 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 21171218  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21171219 atctgtgagatgttatcatcagtctacccacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaata 21171318  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21171319 gtttccttatgttcaacggggtctcacaattaagttatatttaatgttccatgaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaa 21171418  T
Q  301 aatcaataaagaaatgcctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21171419 aatcaataaagaaatgcctt 21171438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 16358921 - 16359240
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  16358921 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaaggcttgataactctttatccatt 16359020  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  16359021 atctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatattccatttctcaataaagcttgactagggttactttaagaata 16359120  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359121 gtttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttattcttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 16359220  T
Q  301 aatcaataaagaaatgcctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16359221 aatcaataaagaaatgcctt 16359240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 27310463 - 27310782
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27310463 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccata 27310562  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27310563 atctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactactgatactttaagaata 27310662  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27310663 gtttccttatgttcaacgtggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaa 27310762  T
Q  301 aatcaataaagaaatgcctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27310763 aatcaataaagaaatgcctt 27310782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 36816519 - 36816834
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36816519 taacttttactatgtagtattctcatggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgtagacttgataactctttatccatg 36816618  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  36816619 atctgtgagatgtgatcatcagtctatccacataatagtctctatgctttaatggtatcccacttctcaataaagcttgactatggatactttaagaata 36816718  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
     | || |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36816719 atgtccttatgtttaacggagtctcacaattaatttatacttaatgttccattaaacagacgaactattctagggacttcattattttgaaacaaaacaa 36816818  T
Q  301 aatcaataaagaaatg 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  36816819 aatcaataaagaaatg 36816834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 3855805 - 3856126
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3855805 taacctttactatgtagtattctcattgcgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtgaagactttataactctttatccatg 3855904  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| ||| ||||||    
T  3855905 atttgtgagatgtgatcatcagtctacccacgtaatagtctccatgctttaataatatcccacttcacaataaagtttgactacaaatattttaagaata 3856004  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
     | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3856005 atgtccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgggctaactattctagggactttgttattttgaaacaaaacaa 3856104  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||| || |||||||||||||||    
T  3856105 aataaacaaagaaatgccttgt 3856126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Original strand, 22657108 - 22657429
Alignment:
Q  2 aacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatga 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22657108 aacttttactatgtagtattcacatggtgggtcaatctaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttaataactctttatctatga 22657207  T
Q  102 tctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatag 201  Q
     || ||||||||||||||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||  || ||||| ||||| |    
T  22657208 gctatgagatgtgatcatcagtctatccacatgatagtctctatgctttaatgatatctcatttcagaataaagcttgactagagacactttaagaattg 22657307  T
Q  202 tttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaac-aa 300  Q
    | || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  22657308 tgtccttatgtttaaaggggtctcacaattaagttatatttaatgttccattaaacagactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaa 22657407  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  22657408 aatcaataaagaaatgtcttgt 22657429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 27277445 - 27277756
Alignment:
Q  3 acttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgat 102  Q
    |||||||||||| | |||||| |||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  27277445 acttttactatgcaatattcttatggtgggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtgaaaacatgataactctttatctatgat 27277544  T
Q  103 ctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagt 202  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  27277545 ccgtgagatgtgatcatcggtctacccacataatagtctctatgctttaatgttatcccttttcacaataaagcctgactacggatactttaagaataat 27277644  T
Q  203 ttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaa 302  Q
     |||||  | ||||   |||||| | ||||||| | || ||||| ||| |||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27277645 gtcatttcggttaa-aaggtctcgcgattaagtcacac-taatgctccgttaaatggactaattattctagggacgttattattttgaaacaaaacaaaa 27277742  T
Q  303 tcaataaagaaatg 316  Q
     ||| |||||||||    
T  27277743 acaacaaagaaatg 27277756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Original strand, 12014179 - 12014457
Alignment:
Q  10 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 109  Q
    |||||||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  12014179 ctatgtaacattctcatgccgggtcaatccaatattaatattactcttaatatttatatttatgtgaagacttgataactccttatcaatgatccgtgag 12014278  T
Q  110 atgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcatta 209  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||  ||| || ||||||||  |||||| |||| || |||||||| |||||||||  ||| ||||||   ||||||    
T  12014279 atgtgatcatcattctacccacataatggtctttacgctttaatcgtatccctcttcacactaaagcttaactacggatgttttaagaataacatcatta 12014378  T
Q  210 tgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattatttt 288  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  12014379 tgtttaatgggatctaacgattaatttacacttaatattccattaaacggactatgtattctagtgactttattatttt 12014457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Original strand, 9917837 - 9918106
Alignment:
Q  33 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatctgtctacctaca 132  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||   ||||| |||    
T  9917837 tcaatccaatataaatattactca-aatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatccacgagatgtgatcatcaacctaccgaca 9917935  T
Q  133 taatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaatta 232  Q
    || || ||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| ||||  |||| ||| |||||| | || |||| ||||||||  ||||   || |    
T  9917936 tagtattctctatgcttcaatgctatcccacttaacaataaagcttaactatagatattttaagaataatgtccttatatttaatgga-tctcgtgatca 9918034  T
Q  233 agttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 310  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||       || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9918035 agttatacttaatgttcgattaaacaaactaa------aagtgactttattattttgtaacaaaacaaaatcaataaa 9918106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 288
Target Start/End: Original strand, 12006461 - 12006712
Alignment:
Q  37 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataat 136  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||| |||||  || || |||||||||| |||||   ||||||     
T  12006461 tccagtataaatattactcttaatatttatatctgtgcgaacacttgataactccttatcaatgattcgtaagttgtgatcatcagtctatgcacataac 12006560  T
Q  137 actctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagtt 236  Q
    | |||||| | ||||||| |||||| |||| || ||| ||||||||||| ||  ||| | |||| | || |||||||| |||||||||||| ||||||      
T  12006561 aatctctaagttttaatgttatccctcttcacactaaggcttgactacgaatgttttaataataatgtccttatgtttcatggggtctcacgattaaggc 12006660  T
Q  237 atacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattatttt 288  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12006661 acacttaatattccattaaatagactaactattctagggactttattatttt 12006712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23507209 - 23507038
Alignment:
Q  13 tgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatg 112  Q
    ||||| ||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  23507209 tgtagcattctaatggtgggttaatccaatataaatattactcctattatttatatctatgtgaaaacttgataactccttatccatgatccgtgagatg 23507110  T
Q  113 tgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactac 184  Q
    |||||||| ||||| | || | ||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| || |||| | |||||||    
T  23507109 tgatcatcagtctatccaccttatattctatatactttaatgctatcccacttcacactaaatcatgactac 23507038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Original strand, 28134891 - 28135019
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  28134891 ttactatgtagtattctcacggtggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 28134989  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataat 136  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||    
T  28134990 gagatgcggtcatcagtctacatacataat 28135019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 19706607 - 19706750
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  19706607 ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 19706705  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  19706706 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 19706750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 43802533 - 43802676
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  43802533 ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 43802631  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  43802632 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 43802676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 22641760 - 22641871
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| | ||||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22641760 taacttttactatgtagt-ttctcatggtgggtcaatctagtataaatattattcctaat---tatatctatgtgaacacttaataactctttatccatg 22641855  T
Q  101 atctgtgagatgtgat 116  Q
    |||| |||||||||||    
T  22641856 atctatgagatgtgat 22641871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 9456250 - 9456107
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  9456250 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 9456152  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  9456151 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 9456107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 20779813 - 20779956
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  20779813 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 20779911  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  20779912 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 20779956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 22670425 - 22670568
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  22670425 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 22670523  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  22670524 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 22670568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 42817157 - 42817300
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  42817157 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 42817255  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  42817256 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 42817300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 20391407 - 20391550
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  20391407 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaacatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 20391505  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  20391506 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 20391550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 358 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 18251992 - 18251935
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 415  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18251992 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 18251935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 358 - 415
Target Start/End: Original strand, 18532757 - 18532814
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 415  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532757 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 18532814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 22612626 - 22612483
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  ||  |||| |||| |  |    
T  22612626 ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaataaaaatattactcccaatatttatatctatgtatagacttgatatatc-atatctatgacccat 22612528  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  22612527 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 22612483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 151
Target Start/End: Original strand, 47667668 - 47667785
Alignment:
Q  33 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatctgtctacctaca 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||| |||||| ||||    
T  47667668 tcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacataca 47667766  T
Q  133 taatactctctatgcttta 151  Q
    ||||| |||| | ||||||    
T  47667767 taatagtctcgacgcttta 47667785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 35930713 - 35930573
Alignment:
Q  10 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 109  Q
    |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||    
T  35930713 ctatgtagtattctcacggtaggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgag 35930615  T
Q  110 atgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    ||| | ||||| |||||  ||||||||| |||| | ||||||    
T  35930614 atgcggtcatcagtctatatacataatagtctcgacgcttta 35930573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 27310821 - 27310877
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27310821 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 27310877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 634068 - 634001
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 74  Q
    ||||||||||||||||||| || || | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  634068 ttactatgtagtattctcacggtgggttaatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 634001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 8727800 - 8727741
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 67  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  8727800 tactatgtagtattctcacggtggatcaatccagtataaatattacttctaatatttata 8727741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 51997406 - 51997353
Alignment:
Q  14 gtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 67  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51997406 gtagtattctcatggtgggtcaatctaatataaatattactcctaatatttata 51997353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 16359280 - 16359336
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16359280 catgatacaaatcctaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 16359336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 134
Target Start/End: Original strand, 26923553 - 26923678
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 107  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||| ||| | ||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||    
T  26923553 tactatgtagtattctcacggtgggtcaattcagtataaatattactcctaatattcataccaatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatg 26923651  T
Q  108 agatgtgatcatctgtctacctacata 134  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  26923652 agatgtggtcatcagtctacatacata 26923678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 3403325 - 3403248
Alignment:
Q  215 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaa 292  Q
    |||| ||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  3403325 aatgtggtctcacatttaagtcacacttaatattccattaatcagactaactattttatagactttattactttgaaa 3403248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 292
Target Start/End: Original strand, 3443494 - 3443571
Alignment:
Q  215 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaa 292  Q
    |||| ||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  3443494 aatgtggtctcacatttaagtcacacttaatattccattaatcagactaactattttatagactttattactttgaaa 3443571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 21171479 - 21171535
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21171479 catgatacaaagccaaactcaatccatatagattggctattagagcttactccaaca 21171535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 365 - 414
Target Start/End: Original strand, 22657472 - 22657521
Alignment:
Q  365 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  22657472 caaagccaaactcaatcaatatatattggctattaaggcttactccaaca 22657521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 316
Target Start/End: Original strand, 30720625 - 30720694
Alignment:
Q  247 ttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 316  Q
    |||||||||||  ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||    
T  30720625 ttccattaaacgaactaattattccaggaactttattattttaaaacaaaataaaaccaataaaaaaatg 30720694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 365 - 406
Target Start/End: Original strand, 36816885 - 36816926
Alignment:
Q  365 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36816885 caaagccaaacccaatcaatatagattgaatattagggctta 36816926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 3856164 - 3856220
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||    
T  3856164 catgatacaaagtcaaacccaatcaagatggattggctattagggcctactccaaca 3856220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 29096853 - 29096789
Alignment:
Q  10 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 74  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  29096853 ctatgtagtattcacacggtggatcaatctagtataaatattattcctaatatgtatacctatgt 29096789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 67
Target Start/End: Original strand, 21881545 - 21881604
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 67  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  21881545 tactatgtagtattctcacggtgggtcaatcttgtataaacattactcctaatatttata 21881604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 27131652 - 27131704
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131652 catgatacaaagccaaacccaac----atagattggctattagggcttattccaaca 27131704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 27277800 - 27277856
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27277800 catgatacaaagtcaaacataattaacatagattggctattagggcttactccaaca 27277856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 72)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 19926646 - 19926967
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19926646 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatttgaagacttgataactctttatccatg 19926745  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926746 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 19926845  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926846 gtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 19926945  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19926946 aatcaataaagaaatgccttgt 19926967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 55613004 - 55612683
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613004 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 55612905  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  55612904 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagagta 55612805  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612804 gtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 55612705  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  55612704 aatcaataaagaaatgccttgt 55612683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 26970784 - 26970463
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970784 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactgctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 26970685  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26970684 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacggatactttgagaata 26970585  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970584 gtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 26970485  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26970484 aatcaataaagaaatgccttgt 26970463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 5707641 - 5707320
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707641 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 5707542  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707541 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 5707442  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707441 gtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 5707342  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5707341 aatcaataaagaaatgccttgt 5707320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 26963961 - 26963640
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963961 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactgctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 26963862  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26963861 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacggatactttgagaata 26963762  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963761 gtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatatttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 26963662  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26963661 aatcaataaagaaatgccttgt 26963640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 5714269 - 5713948
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714269 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 5714170  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714169 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 5714070  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714069 gtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatgggctaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 5713970  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5713969 aatcaataaagaaatgccttgt 5713948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 10621219 - 10621540
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621219 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaaaatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 10621318  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10621319 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaata 10621418  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621419 gtttccttatgtttaatgggctctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattccagggactttattattttgaaacaaaacaa 10621518  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10621519 aatcaataaagaaatgccttgt 10621540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 10628298 - 10628619
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628298 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 10628397  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10628398 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaataatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaata 10628497  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628498 gtttccttatgtttaatgggctctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattccagggactttattattttgaaacaaaacaa 10628597  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10628598 aatcaataaagaaatgccttgt 10628619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18262533 - 18262214
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262533 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 18262434  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262433 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaata 18262334  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18262333 gtttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacgaaacaa 18262234  T
Q  301 aatcaataaagaaatgcctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18262233 aatcaataaagaaatgcctt 18262214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 868918 - 868597
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  868918 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatg 868819  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  868818 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 868719  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868718 gtttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 868619  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  868618 aatcaataaagaaatgtcttgt 868597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18269394 - 18269070
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269394 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 18269295  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269294 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaata 18269195  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaac-- 298  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  18269194 gtttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 18269095  T
Q  299 ---aaaatcaataaagaaatgcctt 320  Q
       ||||||||||||||||||||||    
T  18269094 aacaaaatcaataaagaaatgcctt 18269070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 5 - 320
Target Start/End: Original strand, 4426494 - 4426808
Alignment:
Q  5 ttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426494 ttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatct 4426593  T
Q  105 gtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagttt 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  4426594 gtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatag-tt 4426692  T
Q  205 cattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatc 304  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426693 ccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatc 4426792  T
Q  305 aataaagaaatgcctt 320  Q
    ||||||||||||||||    
T  4426793 aataaagaaatgcctt 4426808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 28393020 - 28393339
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28393020 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 28393119  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  28393120 atatgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaata 28393219  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28393220 gtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattttagggactttattattttgaaacaaatcaa 28393319  T
Q  301 aatcaataaagaaatgcctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28393320 aatcaataaagaaatgcctt 28393339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8858488 - 8858179
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8858488 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatatgaagacttgataactctttatccatg 8858389  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8858388 atctgtgagatgtgatcatcagcctacccacataatagtctctatgctttaatgatatccgacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaata 8858289  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858288 gtttccttatgtttaacgggatctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 8858189  T
Q  301 aatcaataaa 310  Q
    ||||||||||    
T  8858188 aatcaataaa 8858179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8845524 - 8845215
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  8845524 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatataaagaattgataactctttatccatg 8845425  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8845424 atctgtgagatgtgatcatcagcctacccacataatagtctctatgctttaatgatatccgacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaata 8845325  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845324 gtttccttatgtttaacgggatctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 8845225  T
Q  301 aatcaataaa 310  Q
    ||||||||||    
T  8845224 aatcaataaa 8845215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20311604 - 20311299
Alignment:
Q  10 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 109  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  20311604 ctatgtagtattctcatgacaggtcaatccaatataaaaattactcctaatatttacatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatccatgat 20311505  T
Q  110 atgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcatta 209  Q
    |||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||| | || ||| || |||    
T  20311504 atgtgatcatcaatctacccacaaaatagtctctatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgacaacaaatactttaaaaacagtgtcctta 20311405  T
Q  210 tgtttaatggggtctcacaattaagttata-cttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaata 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| | |||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20311404 tgtttaatggggtctcacaattaagttataccttaatgctccattgaacatattaactattataagtactttattattttaaaacaaaacaaaatcaata 20311305  T
Q  309 aagaaa 314  Q
    ||||||    
T  20311304 aagaaa 20311299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 35223881 - 35223576
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  35223881 taacttttactatatagtattctcatggtggttcaatccagtataaatattactcctaatatttatacatatgtaaagacatgataactctttatctatg 35223782  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||   ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35223781 atccgtgagatgtgatcatccgtctacccacataatagtctatatgctttaatgttatccttttttacaataaagcttgactacgaatactttaagaata 35223682  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
     | || ||  |||          | || ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35223681 atgtcctttcgtt----------ttacgattaagtcacacttaatgctccattaaacagactaattattctagggactttattattttaaaacaaaacaa 35223592  T
Q  301 aatcaataaagaaatg 316  Q
    |||||| |||||||||    
T  35223591 aatcaacaaagaaatg 35223576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 5668013 - 5668327
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||| |||    
T  5668013 taacttttactatgtagtattctcatggtgagtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctacgtgaagatatgataactctttatctatg 5668112  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactac--ggatactttgagaa 198  Q
    ||| ||||||  |||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||||||||||||    ||||||| ||||    
T  5668113 atccgtgaga--tgatcatcggtctatccacataatagtctctatgatttaatgttatctcttttcacaataaagcttgactacaaatatactttaagaa 5668210  T
Q  199 tagtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaac 298  Q
    || | || ||   |||||| ||||||||| ||||| | | |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5668211 taatgtcctttcatttaat-gggtctcacgattaaatcacacttaatgctccattaaatagactaattattctagagactttattattttgaaacaaaac 5668309  T
Q  299 aaaatcaataaagaaatg 316  Q
    |||||||| |||||||||    
T  5668310 aaaatcaacaaagaaatg 5668327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 12357251 - 12357136
Alignment:
Q  207 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12357251 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaa 12357152  T
Q  307 taaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||    
T  12357151 taaagaaatgccttgt 12357136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 98 - 316
Target Start/End: Original strand, 10677538 - 10677753
Alignment:
Q  98 atgatctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgaga 197  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| |||||||| |||| || ||| |  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  10677538 atgatccgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctatatactttaatgttatctcatttcac--taaagcttgactacggatactttaaga 10677635  T
Q  198 atagtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaa 297  Q
    ||| | |||||  |||||||||| |||| | ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| | |||||||||||    
T  10677636 ataatatcatttcgtttaatggg-tctcgcgattaagtcatacttaatgctccattatacagactaattattttaggggctttattttattgaaacaaaa 10677734  T
Q  298 caaaatcaataaagaaatg 316  Q
     |||||||||||| |||||    
T  10677735 gaaaatcaataaaaaaatg 10677753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 98 - 316
Target Start/End: Original strand, 10891178 - 10891393
Alignment:
Q  98 atgatctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgaga 197  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| |||||||| |||| || ||| |  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  10891178 atgatccgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctatatactttaatgttatctcatttcac--taaagcttgactacggatactttaaga 10891275  T
Q  198 atagtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaa 297  Q
    ||| | |||||  |||||||||| |||| | ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| | |||||||||||    
T  10891276 ataatatcatttcgtttaatggg-tctcgcgattaagtcatacttaatgctccattatacagactaattattttaggggctttattttattgaaacaaaa 10891374  T
Q  298 caaaatcaataaagaaatg 316  Q
     |||||||||||| |||||    
T  10891375 gaaaatcaataaaaaaatg 10891393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 56516368 - 56516094
Alignment:
Q  10 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 109  Q
    ||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  56516368 ctatgtagtgttctcatagcgagtcaatccaatataaatattactcatgatatttatacgtatgtgaagacttgataactctttatccattatctgtgag 56516269  T
Q  110 atgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagt-ttcatt 208  Q
    || |||||||   ||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||    ||| ||||||||||||||||  |||||||  |||||| | |||  |    
T  56516268 atttgatcattaatctacctacataatagtctctatgttttaatactatcgttattcacaataaagcttgactatagatacttcaagaataatgttctat 56516169  T
Q  209 atgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttatta 284  Q
    ||| ||||||  ||||||||||||||| | | |||||||| |||||  |  || | |||||||| |||||||||||    
T  56516168 atg-ttaatgaagtctcacaattaagtcacaattaatgtttcattactctaaccatctattctaaggactttatta 56516094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 296
Target Start/End: Original strand, 21454035 - 21454319
Alignment:
Q  11 tatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaga 110  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    ||||| |||   ||||    
T  21454035 tatgtagtattctcatggtgggtcaattcaatataaatattactcctaatatttatatgtatgtgaaaacttgatatctc-aagtccattatc-ccgaga 21454132  T
Q  111 tgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcattat 210  Q
      ||||||||  |||||  |||||||| ||| ||||| ||| || |||| || ||| |||||||| |||||||  |||| ||| | |||| | |||||||    
T  21454133 gatgatcatcaatctactcacataataatctttatgcattattgttatctcatttcacaataaagtttgactatagatattttaaaaataatgtcattat 21454232  T
Q  211 gtttaatggggtctcacaattaagttata-cttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaa 296  Q
      ||||||||||||||  ||||||| | |  ||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  21454233 aattaatggggtctcaatattaagtcacattttaatgttccattaatcaaactaactattctaagaactttattactttgaaacaaa 21454319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 5616523 - 5616215
Alignment:
Q  13 tgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatg 112  Q
    ||||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  | |||| | | ||| | ||  |||| |  |||||||    
T  5616523 tgtagtattctcacggttggtcaatccagtataaatattacttctaatatttatacctacgtatatacttaacatctcat-atttatgacccatgagatg 5616425  T
Q  113 tgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagc--ttgactacggatactttgagaatagtttcattat 210  Q
    || |||||  ||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||| |||  |||||| |  ||||| ||||||||||| |||||| | || |       
T  5616424 tggtcatcaatctacatacataatagtctcaatgctttattaatatcccaattcataataaaacctttgacaacggatactttaagaataatgtcctcta 5616325  T
Q  211 gtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 310  Q
    |||||| ||| |||||  ||| ||| | |||||||||||||  ||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5616324 gtttaacgggatctcatgatttagtcagacttaatgttccaagaaatagactaattattttaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatgaataaa 5616225  T
Q  311 gaaatgcctt 320  Q
    ||||||||||    
T  5616224 gaaatgcctt 5616215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 15461631 - 15461488
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  15461631 ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 15461533  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  15461532 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 15461488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 2677147 - 2677004
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  2677147 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 2677049  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  2677048 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 2677004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 15815155 - 15815012
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  15815155 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 15815057  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  15815056 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 15815012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 17300127 - 17300270
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  17300127 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 17300225  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  17300226 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 17300270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 18111211 - 18111354
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  18111211 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 18111309  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  18111310 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 18111354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 34975685 - 34975542
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  34975685 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 34975587  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  34975586 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 34975542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 5870552 - 5870423
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  5870552 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 5870454  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataata 137  Q
    |||||| | ||||| |||||| |||||||||    
T  5870453 gagatgcggtcatcagtctacatacataata 5870423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Original strand, 32646697 - 32646806
Alignment:
Q  11 tatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaga 110  Q
    ||||||| ||||| ||||  | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||| ||||||    
T  32646697 tatgtagcattcttatggtaggtcaatccaatgtaaatattattcctaatatttatatctatgtgaagactcgatattcctttatcaatgatccgtgaga 32646796  T
Q  111 tgtgatcatc 120  Q
    ||||||||||    
T  32646797 tgtgatcatc 32646806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 3369191 - 3369334
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  3369191 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 3369289  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  3369290 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 3369334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 358 - 415
Target Start/End: Original strand, 19927003 - 19927060
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 415  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19927003 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 19927060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 4676151 - 4676294
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  |    
T  4676151 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccat 4676249  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  4676250 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 4676294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 5713912 - 5713856
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713912 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 5713856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 18163296 - 18163153
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  |    
T  18163296 ttactatgtagtattctcacagtgggtgaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccat 18163198  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  18163197 gagatgcgatcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 18163153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 20244071 - 20243928
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  |    
T  20244071 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccat 20243973  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  20243972 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 20243928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 26531747 - 26531604
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  26531747 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtatagccttgatatctc-atatctatgacccat 26531649  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  26531648 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 26531604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 26963604 - 26963548
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963604 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 26963548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 26970427 - 26970371
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970427 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 26970371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 24700291 - 24700214
Alignment:
Q  60 tatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataata 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  24700291 tatttatatctatgtgaagacttaatatctctttatccaagatctgtaagatgtgattatcagtctacccacataata 24700214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 5707284 - 5707228
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707284 catgatacaaagccaaacacaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 5707228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 10621576 - 10621632
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621576 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 10621632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 12357100 - 12357044
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12357100 catgatacaaagccaaatccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 12357044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 1941858 - 1941791
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 74  Q
    ||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1941858 ttactatgtagtattctcacggtgggttaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgt 1941791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 868561 - 868507
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  868561 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggtttattccaa 868507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 10677468 - 10677534
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 67  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10677468 taacatttactatgtagtattctcatagtgggtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 10677534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 10891108 - 10891174
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 67  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10891108 taacatttactatgtagtattctcatagtgggtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 10891174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 415
Target Start/End: Original strand, 17142372 - 17142429
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 415  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17142372 catgatacaaagtcaaacccaatcaatatagattggctattagggctttttccaacat 17142429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 10628655 - 10628711
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628655 catgatacaaagtcaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 10628711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 55612650 - 55612594
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  55612650 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggttattagggcttattctaaca 55612594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 416
Target Start/End: Original strand, 4426847 - 4426905
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatt 416  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4426847 catgatacagagccaaacccaatcaatatagattggctattaggacttactccaacatt 4426905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 19365652 - 19365586
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 74  Q
    |||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19365652 tactatgtagtactctcacggtgggtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 19365586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 360 - 414
Target Start/End: Original strand, 28393380 - 28393434
Alignment:
Q  360 tgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28393380 tgatacaaagtcaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 28393434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 18269032 - 18268976
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18269032 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctatttgggcttattccaaca 18268976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 4546214 - 4546147
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 74  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4546214 ttactatgtagtattctcacggtgggtctgtccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 4546147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 32636618 - 32636552
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatg 73  Q
    |||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32636618 ttactatgtagtattctcacattgggtcaatccaatataaatattactcataatatttatacctatg 32636552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 95
Target Start/End: Original strand, 34777893 - 34777975
Alignment:
Q  13 tgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttat 95  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||| | |||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||    
T  34777893 tgtagtattctcatggagggtcaatctaatacaaaaattactcattatatttatacatatttgaagacttgataactttttat 34777975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 9487685 - 9487625
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 67  Q
    ||||||||||||||||||| |  || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9487685 ttactatgtagtattctcacgatgggtctatccagtataaatattactcctaatatttata 9487625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 273
Target Start/End: Original strand, 39074279 - 39074346
Alignment:
Q  207 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttcca-ttaaacagactaactattctag 273  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||    
T  39074279 ttatgtttaatggggtctcatgattaagtcatacttaatgttcaatttaaacggactaattattctag 39074346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 19362543 - 19362477
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 74  Q
    |||||||||||| ||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  19362543 tactatgtagtactctcacgatgggtcaatccagtataaatattactcctaatattaatacctatgt 19362477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 9538090 - 9538033
Alignment:
Q  10 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 67  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  9538090 ctatgtagtattctcacgctgggtcaatccagtataaatattactcctaacatttata 9538033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 55992729 - 55992680
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttat 407  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  55992729 catgatacaaagtcaaacccaatcaatacaaattggctattagggcttat 55992680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 185
Target Start/End: Original strand, 39074190 - 39074270
Alignment:
Q  105 gtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacg 185  Q
    |||||||||||||| |  || ||| || ||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||    
T  39074190 gtgagatgtgatcaacaatcaacccacgtaatagtctccatgctttaatgatatctcacttcacaataaagtatgactacg 39074270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 272
Target Start/End: Original strand, 11161913 - 11161972
Alignment:
Q  213 ttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattcta 272  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  11161913 ttaatggagtctcacaattaagtcacactttgtgttccattaaactgattaactattcta 11161972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 33888637 - 33888594
Alignment:
Q  43 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 86  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33888637 ataaatattacacataatatttatatctatgtgaaaacttgata 33888594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 399
Target Start/End: Original strand, 5668371 - 5668412
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctatta 399  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5668371 catgatacaaaaccaaacacaatcaatatagattggctatta 5668412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 8845166 - 8845118
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 406  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8845166 catgatacaaagtcaaactcaatcaacatagattggctattaggactta 8845118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 8858130 - 8858082
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 406  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8858130 catgatacaaagtcaaactcaatcaacatagattggctattaggactta 8858082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 11421140 - 11421096
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatta 52  Q
    |||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||    
T  11421140 tactatgtagtattctaacggtgggtcaatccaatataaatatta 11421096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 18262176 - 18262136
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctatt 398  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18262176 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctatt 18262136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 68)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 6110385 - 6110064
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110385 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 6110286  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110285 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 6110186  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110185 gtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 6110086  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6110085 aatcaataaagaaatgccttgt 6110064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 10572478 - 10572799
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572478 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 10572577  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572578 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 10572677  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572678 gtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 10572777  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10572778 aatcaataaagaaatgccttgt 10572799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 16482369 - 16482688
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482369 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 16482468  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16482469 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagagta 16482568  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482569 gtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 16482668  T
Q  301 aatcaataaagaaatgcctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16482669 aatcaataaagaaatgcctt 16482688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 15600770 - 15601091
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600770 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 15600869  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600870 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 15600969  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600970 gtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 15601069  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  15601070 aatcaataaagaaatgtcttgt 15601091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 15607315 - 15607636
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607315 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 15607414  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607415 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 15607514  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607515 gtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 15607614  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  15607615 aatcaataaagaaatgtcttgt 15607636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18522984 - 18522665
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522984 taacttttactatgtagtattttcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 18522885  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18522884 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttaaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaata 18522785  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522784 gtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 18522685  T
Q  301 aatcaataaagaaatgcctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18522684 aatcaataaagaaatgcctt 18522665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 5 - 316
Target Start/End: Original strand, 17781008 - 17781319
Alignment:
Q  5 ttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatct 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  17781008 ttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatctatgattt 17781107  T
Q  105 gtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagttt 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781108 gtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagttt 17781207  T
Q  205 cattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatc 304  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781208 ccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatc 17781307  T
Q  305 aataaagaaatg 316  Q
    ||||||||||||    
T  17781308 aataaagaaatg 17781319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 13211623 - 13211305
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211623 taacttttactatgtaatattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 13211524  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211523 atctgtgagttgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 13211424  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211423 gtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 13211324  T
Q  301 aatcaataaagaaatgcct 319  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13211323 aatcaataaagaaatgcct 13211305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 10579241 - 10579556
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579241 taacttttattatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 10579340  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579341 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 10579440  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579441 gtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccatttaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 10579540  T
Q  301 aatcaataaagaaatg 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  10579541 aatcaataaagaaatg 10579556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 8490816 - 8490488
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490816 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 8490717  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataat-------actctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatacttt 193  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||       | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  8490716 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatcgtctgtagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacagatacttt 8490617  T
Q  194 gagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaac 293  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490616 gagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaac 8490517  T
Q  294 aaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490516 aaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 8490488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 13248928 - 13248607
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248928 taacttttactatgtaatattctcatggcgaatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 13248829  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13248828 atctgtgagttgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgttatcccacttctcaacaaagcttgactacgaatactttgagaata 13248729  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248728 gtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 13248629  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13248628 aatcaataaagaaatgccttgt 13248607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 15357472 - 15357793
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15357472 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaacccaatataaatattactcctaatttttatatctatgtgaagactagataactctttatccatg 15357571  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357572 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 15357671  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357672 ggttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactaatctagggactttattattttgaaacaaaacaa 15357771  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  15357772 aatcaataaagaaatgtcttgt 15357793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18520296 - 18519980
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520296 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatcaaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 18520197  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||    
T  18520196 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgga---tttaagaata 18520100  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520099 gtttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 18520000  T
Q  301 aatcaataaagaaatgcctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18519999 aatcaataaagaaatgcctt 18519980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 13517132 - 13516813
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13517132 taacttttactatttagtattctcatggaggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 13517033  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  13517032 atctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctgtgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatc 13516933  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13516932 gtttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccatgaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 13516833  T
Q  301 aatcaataaagaaatgcctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13516832 aatcaataaagaaatgcctt 13516813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 17200070 - 17200389
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17200070 taacttttactatgtagtattctcatagcgggtcaatccaatacaaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccacg 17200169  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17200170 atctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcacacatctcaataaagcttaactacggatactttaagaata 17200269  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200270 gtttcattatgtttaaaggggtatcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 17200369  T
Q  301 aatcaataaagaaatgcctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17200370 aatcaataaagaaatgcctt 17200389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 32056785 - 32057101
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatattt-atatctatgtgaagacttgataactctttatccat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056785 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcataatattttatatctatgtgaagacttgataactctttatccat 32056884  T
Q  100 gatctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaat 199  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  32056885 gatctgtgagatgtgatcattagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagtttgactacggacactttaagaat 32056984  T
Q  200 agtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaaca 299  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056985 agtttctttatgtttaacggggtcttacaataaagttatacttgatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaaca 32057084  T
Q  300 aaatcaataaagaaatg 316  Q
    |||||||||||||||||    
T  32057085 aaatcaataaagaaatg 32057101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 5 - 303
Target Start/End: Original strand, 15342109 - 15342407
Alignment:
Q  5 ttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15342109 ttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatttttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatct 15342208  T
Q  105 gtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagttt 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15342209 gtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggtt 15342308  T
Q  205 cattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 303  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342309 ccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgaacaaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 15342407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 1647407 - 1647726
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1647407 taacttttattatgtagtattctcatggcgagtcaatcaaatataaacattactcctaatatttatatctatgtgtagacttgataactctttatccatg 1647506  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  1647507 atctgtgagatgtgatcatcagtctatccacataatagtctctatgctttaattatatcccttttctcaataaagcttgattacggatactttaaaaata 1647606  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaag----ttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaa 296  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1647607 gtttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttaattatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaa 1647706  T
Q  297 acaaaatcaataaagaaatg 316  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1647707 acaaaatcaataaagaaatg 1647726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 29925292 - 29924971
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  29925292 taacttttactatgcagtattctctaggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttaatgactctttatccatg 29925193  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||| |||||||||||||||  |||| | ||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||    
T  29925192 atctatgagatgtgatcatcgatctatccacataatagcctccatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgactacatatattttaagaata 29925093  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
     | || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29925092 atgtccttatatttaatggggtctcacaattaaattatacttaataatccattaaacggactaactattttaggggctttattattttgaaacaaaacaa 29924993  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  29924992 aatcaataaagaaatgtcttgt 29924971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 29974445 - 29974124
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  29974445 taacttttactatgcagtattctctaggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttaatgactctttatccatg 29974346  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||| |||||||||||||||  |||| | ||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||    
T  29974345 atctatgagatgtgatcatcgatctatccacataatagcctccatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgactacatatattttaagaata 29974246  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
     | || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29974245 atgtccttatatttaatggggtctcacaattaaattatacttaataatccattaaacggactaactattttaggggctttattattttgaaacaaaacaa 29974146  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  29974145 aatcaataaagaaatgtcttgt 29974124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 104 - 316
Target Start/End: Original strand, 19089734 - 19089946
Alignment:
Q  104 tgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtt 203  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19089734 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgatttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtt 19089833  T
Q  204 tcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 303  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089834 tcattatgtttaaaggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactaatctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 19089933  T
Q  304 caataaagaaatg 316  Q
    |||||||||||||    
T  19089934 caataaagaaatg 19089946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16200743 - 16200434
Alignment:
Q  9 actatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtga 108  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  16200743 actatgtagtattctcatggtgggtcaatccaatatgaatattacacctaatatttgtatctatatgaatacttgataattctttatccatgatctgtaa 16200644  T
Q  109 gatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcatt 208  Q
    ||| |||||||| ||||  | ||| |||| |||  |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | || ||    
T  16200643 gatatgatcatcagtctctccaca-aatagtcttcatgctttaatgacatcccacttcacaataaatcttgactacgaatactttaagaataatgtcctt 16200545  T
Q  209 atgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaata 308  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||      
T  16200544 atgtttattggagtctcacaattaagttatacataatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaataaaa-caacg 16200446  T
Q  309 aagaaatgcctt 320  Q
    ||||||||||||    
T  16200445 aagaaatgcctt 16200434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17136674 - 17136465
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136674 taacttttactatgtagtattctcatggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatat------ctatgtgaagacttgataactctttatccatg 17136581  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17136580 atctgtgaaatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaata 17136481  T
Q  201 gtttcattatgtttaa 216  Q
    ||||| ||||||||||    
T  17136480 gtttccttatgtttaa 17136465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 161 - 322
Target Start/End: Original strand, 18640792 - 18640953
Alignment:
Q  161 cacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacaga 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18640792 cacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatgga 18640891  T
Q  261 ctaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640892 ctaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 18640953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 83 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16200363 - 16200128
Alignment:
Q  83 gataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgact 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||  | ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16200363 gataactctttatccatgatctgtaagatatgatcatcagtctctccaca-aatagtctccatgctttaatgatatcccacttcacaataaatcttgact 16200265  T
Q  183 acggatactttgagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttat 282  Q
    ||| ||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  16200264 acgaatactttaagaataatgtccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacataatgttccattaaacgaactaactattctaaggactttat 16200165  T
Q  283 tattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 320  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  16200164 tattttgaaacaaaataaaa-caacgaagaaatgcctt 16200128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 315
Target Start/End: Original strand, 24253291 - 24253589
Alignment:
Q  18 tattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatc 117  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  24253291 tattctcatggagggtcaaaccaatataaatataactcttaatgtttataagtatgtgaaaacttgataactctttatccataattcgtgagatatgatc 24253390  T
Q  118 atctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcattatgtttaat 217  Q
    ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| || | |||||  |||||||  ||||| ||  ||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  24253391 attagtctaccgacataatagtctctatgctttaatgttacctcactttacaataaattttgaccacatatactttaagaatagtgtccttatgtttgat 24253490  T
Q  218 gggg-tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaat 315  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||  || | |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24253491 ggggatctcacgattaagtcatacttaatgttccatcaaacgaacgagctattctaaggactttattattttgaagtaaaacaaaatcaataaagaaat 24253589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 15846704 - 15846847
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  15846704 ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 15846802  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  15846803 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 15846847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 21034372 - 21034229
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  21034372 ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 21034274  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  21034273 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 21034229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 14890525 - 14890391
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  14890525 ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 14890427  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctc 142  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  14890426 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 14890391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 20147722 - 20147865
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  20147722 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 20147820  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  20147821 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 20147865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 259 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18534819 - 18534758
Alignment:
Q  259 gactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 320  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18534819 gactaactattctatggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18534758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 21398926 - 21398847
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 86  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  21398926 ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttgata 21398847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 6110028 - 6109972
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110028 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 6109972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 8490452 - 8490396
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490452 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 8490396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 13248571 - 13248515
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248571 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 13248515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 55427155 - 55427012
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  |    
T  55427155 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccat 55427057  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  55427056 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 55427012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 12300044 - 12299902
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  12300044 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaacatttatatctatg-atagacttgatatctc-atatctatgacccat 12299947  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  12299946 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 12299902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 13211267 - 13211211
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211267 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 13211211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 18640989 - 18641045
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640989 catgatacaaagccaaacacaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 18641045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 14147154 - 14147012
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 107  Q
    |||||||||| ||||||| ||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  ||||||||| |  ||    
T  14147154 tactatgtagcattctcacggcaggtcaatccagtataaatattcctcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatccatgacccatg 14147056  T
Q  108 agatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    ||||||| ||||| |||||| || |||||| ||||| |||||||    
T  14147055 agatgtggtcatcagtctacatatataatagtctctgtgcttta 14147012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 365 - 414
Target Start/End: Original strand, 10579604 - 10579653
Alignment:
Q  365 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579604 caaagtcaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 10579653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18510969 - 18510924
Alignment:
Q  275 gactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18510969 gactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18510924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 17136193 - 17136137
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17136193 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 17136137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 11787721 - 11787654
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 74  Q
    ||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11787721 ttactatgtagtattctcacggtgggtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 11787654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 414
Target Start/End: Original strand, 10572841 - 10572890
Alignment:
Q  365 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10572841 caaagtcaaacccaatcaatataggttggctattagggcttattccaaca 10572890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 15607672 - 15607729
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaa-tatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607672 catgatacaaagccaaacccaataaaatatagattggctattagggcttattccaaca 15607729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 414
Target Start/End: Original strand, 17200434 - 17200483
Alignment:
Q  365 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17200434 caaagccaaacccaatcaacatagattggctattagggcttactccaaca 17200483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 15351237 - 15351293
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15351237 catgatacaaagccaaaatcaatcattatagattggctattagggcttattccaaca 15351293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 15357829 - 15357885
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357829 catgatacaaagccaaaatcaatcattatagattggctattagggcttattccaaca 15357885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 16482727 - 16482782
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16482727 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattgg-tattagggcttattctaaca 16482782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 18519941 - 18519885
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18519941 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattaggacttactccaaca 18519885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Original strand, 25978896 - 25978963
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 74  Q
    ||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25978896 ttactatgtagtattctcacggtgggtctatccagtataaatattactcctaataattatacctatgt 25978963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 9504548 - 9504446
Alignment:
Q  57 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgat 156  Q
    |||||||| ||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| | |||||||  ||| ||| ||||||| |||||||| | ||||| |||||| |||    
T  9504548 taatatttttatgtatgttaatacttgataactccttatccatgacccgtgagataagattatcagtctacccacataatagtttctatcctttaaagat 9504449  T
Q  157 atc 159  Q
    |||    
T  9504448 atc 9504446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 74
Target Start/End: Original strand, 15317342 - 15317408
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 74  Q
    |||||||||||||||||| || || || ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15317342 tactatgtagtattctcacggtgggtctatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 15317408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 415
Target Start/End: Original strand, 1647768 - 1647825
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 415  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  1647768 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagaccagctattagggcttactccaacat 1647825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 15601127 - 15601184
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaa-tatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15601127 catgatacaaatccaaacccaataaaatatagattggctattagggcttattccaaca 15601184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 13516775 - 13516719
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13516775 catgatacacagccaaactcaatcaacatagattggctattagggcttactccaaca 13516719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 370 - 414
Target Start/End: Original strand, 17781370 - 17781414
Alignment:
Q  370 ccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17781370 ccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 17781414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 370 - 414
Target Start/End: Original strand, 19089997 - 19090041
Alignment:
Q  370 ccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19089997 ccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 19090041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 32057144 - 32057200
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32057144 catgatacaaagtcaaacccaatcaacatagattggctattagagcttactccaaca 32057200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 117
Target Start/End: Original strand, 8251933 - 8252019
Alignment:
Q  31 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatc 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||| || || ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||    
T  8251933 gatcaatcaaatataaatattactcgaaatatgtaaatttatgtaaagatttgataacattttattcatgatccgtaagatgtgatc 8252019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 28954058 - 28953965
Alignment:
Q  11 tatgtagtattctcatggcggatcaatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 103  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||| |  |||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  28954058 tatgtagtattctcatgatgggttaatccaacaacaaatattactcctaatgtgtatacatatgtgaagactttgtaactctttatcaatgatc 28953965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 18510885 - 18510829
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18510885 catgatacaaaatcaaactcaatcaatatagattggatattagggcttactccaaca 18510829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 18522626 - 18522570
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18522626 catgatacaaaatcaaactcaatcaatatagattggatattagggcttactccaaca 18522570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 18534719 - 18534671
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 406  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18534719 catgatacaaaaccaaactcaatcaatatagattgactattagggctta 18534671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 29924935 - 29924879
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  29924935 catgatacaatgtcaaactcaatcaatatagatcgactattagggcttactccaaca 29924879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 29974088 - 29974032
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  29974088 catgatacaatgtcaaactcaatcaatatagatcgactattagggcttactccaaca 29974032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 32280405 - 32280313
Alignment:
Q  9 actatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatga 101  Q
    |||||||| ||||||||| | || |||| | | | ||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  32280405 actatgtattattctcattgtgggtcaaccgagtgtaaatattattcgtaatgattatacctatgtgaagattaaataactctttatccatga 32280313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 2)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 7428 - 7107
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7428 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 7329  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7328 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatacttttagaata 7229  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7228 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttctattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 7129  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  7128 aatcaataaagaaataccttgt 7107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 7071 - 7015
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7071 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 7015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 4)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 6820 - 7141
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6820 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 6919  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6920 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 7019  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020 gtttccttatgtttaatagggtctcacagttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 7119  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7120 aatcaataaagaaatgccttgt 7141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 13836 - 14157
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13836 taacttttattatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctttgtgaagacttgataactctttatccatg 13935  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13936 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaata 14035  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14036 gtttccttatgtttaatggggtctcacagttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattgtagggactttattattttgaaacaaaacaa 14135  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14136 aatcaataaagaaatgccttgt 14157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 7177 - 7233
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7177 catgatacaaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 7233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 14193 - 14249
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14193 catgatacaaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 14249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 43)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 21940986 - 21940665
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940986 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 21940887  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940886 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 21940787  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21940786 gtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaa 21940687  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  21940686 aatcaataaagaaatgcattgt 21940665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 22171808 - 22171491
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171808 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatg 22171709  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171708 atctatgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 22171609  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22171608 gtttc--tatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaataaaacaa 22171511  T
Q  301 aatcaataaagaaatgcctt 320  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  22171510 aatcaataaggaaatgcctt 22171491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6094444 - 6094129
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094444 taacttttactatatagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 6094345  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  6094344 atctgtgagatgtgatcatcactctacccatataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaaaaata 6094245  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094244 gtttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 6094145  T
Q  301 aatcaataaagaaatg 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  6094144 aatcaataaagaaatg 6094129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 5 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24642966 - 24642655
Alignment:
Q  5 ttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatct 104  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642966 ttttactatgtagtattctcatggaggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatct 24642867  T
Q  105 gtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagttt 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24642866 gtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatactttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaatagttt 24642767  T
Q  205 cattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatc 304  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24642766 ccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaacaattctagggactttatgattttgaaacaaaacaaaatc 24642667  T
Q  305 aataaagaaatg 316  Q
    ||||||||||||    
T  24642666 aataaagaaatg 24642655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 122 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 28555083 - 28554885
Alignment:
Q  122 gtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcattatgtttaatgggg 221  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28555083 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 28554984  T
Q  222 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28554983 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattttaggtattttattattttgaaactaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 28554885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 310
Target Start/End: Original strand, 38232272 - 38232570
Alignment:
Q  10 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 109  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  38232272 ctatgtagcattctcacggcggatcaatccaatataaatattacccataatatgtgtatctatgtcaagactggatcactctttatccatgatccgtgag 38232371  T
Q  110 atgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcatta 209  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||| |||| | | ||||||||||   |||| |||||  |||||||| ||||||||  ||||||| |||||| | |  |||    
T  38232372 atgtgattatcagtctacccacaaaatagtttttatgctttaagactatctcactttacaataaagtttgactacaaatactttaagaatactat-ttta 38232470  T
Q  210 tgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataa 309  Q
     ||||||||| || |||  |||||||||||| |||   |  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38232471 cgtttaatggagtgtcatgattaagttatacctaaaaatttattaaacagactaactattctagaga-tttattattttgaaataaaacaaaatcaataa 38232569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 189 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24636987 - 24636860
Alignment:
Q  189 actttgagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattatttt 288  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24636987 actttaagaatagtttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaaaggactaactattctagggactttattatttt 24636888  T
Q  289 gaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 316  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24636887 gaaacaaaacaaaatcaagaaagaaatg 24636860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 15326519 - 15326422
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15326519 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttctcca 15326422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 15506888 - 15506791
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatcca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15506888 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttctcca 15506791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Original strand, 14983816 - 14984004
Alignment:
Q  10 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  14983816 ctatgtagtattctcatggcgggtcattctaatataa-tattactcctaatatctacatctatgtgaagacttgataacactttttccatgatccgtgag 14983914  T
Q  110 atgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    || |||||||  ||||||| |||||||| || |||| | |||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||  |||||||| ||||||    
T  14983915 atatgatcattagtctacccacataatagtccctattc-ttaatgttatcccacttcacaataaattttgattatagatactttaagaata 14984004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 292
Target Start/End: Original strand, 32872741 - 32873019
Alignment:
Q  15 tagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtg 114  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||  | |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |    
T  32872741 tagtattctcatgacagatcaattcaatataaatattattactaatacttatgccgatgtaaagacttgatacctctttattcatgatctgtgagataag 32872840  T
Q  115 atcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcattatgttt 214  Q
    ||| |  ||| | |  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||| ||| | | || | ||| | | ||     
T  32872841 atcgtgagtccagccgcataatagtctctatgctttgatgttatcccacttcacaataaatcttaactacaaatattttaatagtattgtcactcttttc 32872940  T
Q  215 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccat-taaacagactaactattctagggactttattattttgaaa 292  Q
    |||| | |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||  ||  ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  32872941 aatgagatctcacaattaagtcatacttaatgttctatataaatggatgaactattataaggactttattattttgaaa 32873019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 21969467 - 21969324
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| ||||||  |    
T  21969467 ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgatccat 21969369  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  21969368 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 21969324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 12562257 - 12562114
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  12562257 ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 12562159  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  12562158 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 12562114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 8371421 - 8371564
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  8371421 ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcttaatatttatacctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 8371519  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  8371520 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgatgcttta 8371564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 22130777 - 22130920
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  22130777 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 22130875  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  22130876 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 22130920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 25611329 - 25611186
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  25611329 ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 25611231  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    ||||||   ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  25611230 gagatgcagtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 25611186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 27007685 - 27007828
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  27007685 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 27007783  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  27007784 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 27007828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 27014828 - 27014971
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  27014828 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 27014926  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  27014927 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 27014971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 27880655 - 27880798
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  27880655 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 27880753  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  27880754 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 27880798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 28020836 - 28020979
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  28020836 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 28020934  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  28020935 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 28020979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 2375322 - 2375027
Alignment:
Q  11 tatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaga 110  Q
    ||||||| ||| | |||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||  ||| ||    
T  2375322 tatgtagaattataatggagggtcaatccaatatacatattactcataatatttatatttatgtgaaaatttgataactcattatccatgatacgtgtga 2375223  T
Q  111 tgtgatc-------atctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtt 203  Q
    |||||||       |||  |||||| || ||||| |   ||| |||||||| |||| ||| || ||||||| | |||||||  ||||||| | |||| |     
T  2375222 tgtgatcatgagtgatcaatctacccacttaatagttcatatactttaatgttatctcac-tcgcaataaatcgtgactacatatactttaaaaataata 2375124  T
Q  204 tcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaa 301  Q
    |   |||||||||| |||| |||  ||||||| ||  | ||||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2375123 ttcgtatgtttaat-gggtttcatgattaagtcatcataaatgttccattaaattgactaattattatagggagtttattattttgaaacaaaacaaa 2375027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 24797274 - 24797419
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||| | || ||||||||    
T  24797274 taacttttactatgtagtattctcatggcgggtcaatccagtataaattttactcataatatttatacctacgtgaagacatgatatc-ctatatccatg 24797372  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgc 147  Q
    | |  ||||||||  |||||  | |||  |||||||| |||||||||    
T  24797373 acccatgagatgtagtcatcaatatactcacataatagtctctatgc 24797419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 21916810 - 21916667
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||| ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  21916810 ttacaatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgcatagacttgatatctc-atatctatgacccat 21916712  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  21916711 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 21916667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 45534441 - 45534584
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  |    
T  45534441 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccat 45534539  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  45534540 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 45534584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 18835483 - 18835341
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 107  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||    
T  18835483 tactatgtagtattctcacggtgggtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacttatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatg 18835385  T
Q  108 agatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    ||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  18835384 agatgtggtaatcagtctacatacataatagtctcgatgcttta 18835341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 26240618 - 26240551
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 74  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26240618 ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgt 26240551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 22070164 - 22070107
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 415  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22070164 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 22070107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 21940629 - 21940573
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940629 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 21940573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 365 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 24642605 - 24642556
Alignment:
Q  365 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24642605 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 24642556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 6094087 - 6094031
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6094087 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 6094031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 22171452 - 22171396
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171452 catgatacaaaatcaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 22171396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Original strand, 22659662 - 22659729
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 74  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22659662 ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccagtatacatattactcctaatatttatacctatgt 22659729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 28554847 - 28554791
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28554847 catgatacaaagccaaacccaatcaacaaagattggctattagggcttactccaaca 28554791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 6431020 - 6430953
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 74  Q
    ||||||||||||||||||| || || || ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6431020 ttactatgtagtattctcacggtgggtctatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 6430953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 10920297 - 10920234
Alignment:
Q  221 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttatta 284  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  10920297 gtctcacgattaactcatacttaatgttccattaaacagactaattattctaggaattttatta 10920234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 66
Target Start/End: Original strand, 8782045 - 8782102
Alignment:
Q  9 actatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttat 66  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  8782045 actatgtagtattctcacggtggatcaatcaagtataaatattagtcctaatatttat 8782102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 29645631 - 29645539
Alignment:
Q  45 aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataata 137  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||| ||||| || |||| || |||||    
T  29645631 aaatattactcttaatgtttatatatatgtgaagagttgataaatctttatgcatgaaccatgagatgtggtcatcagtttacccacgtaata 29645539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 74
Target Start/End: Original strand, 2963105 - 2963171
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 74  Q
    |||||||||||||||||  ||  | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2963105 tactatgtagtattctcgcggtaggtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 2963171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 10920479 - 10920427
Alignment:
Q  43 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttat 95  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||    
T  10920479 ataaatattactcataatatttatacatatgtgaatatttgataactctttat 10920427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 24535569 - 24535462
Alignment:
Q  68 tctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttct 167  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || |||| |||||||| || |||  ||| |||| |||| ||| || |||| |||| ||||||     
T  24535569 tctatgtgaaaacttgataactcattattcatgatccgtaagatatgatcatcagtgtactcacaaaataatctcgatgtttcaatgttatctcacttca 24535470  T
Q  168 caataaag 175  Q
    || |||||    
T  24535469 cactaaag 24535462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 34659118 - 34659059
Alignment:
Q  9 actatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatat 68  Q
    ||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  34659118 actatttagtatttgcatggtggataaatccaatataaatattagtcctaatatatatat 34659059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 36970371 - 36970332
Alignment:
Q  35 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 74  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36970371 aatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 36970332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 24636642 - 24636605
Alignment:
Q  377 caatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24636642 caatcaatatagattggctattatggcttactccaaca 24636605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 24695352 - 24695673
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695352 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 24695451  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24695452 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttattgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatacttttagaata 24695551  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695552 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 24695651  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24695652 aatcaataaagaaatgccttgt 24695673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 19714384 - 19714703
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714384 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 19714483  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  19714484 atctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgacttcggatattttaagaata 19714583  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  19714584 gattccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattactttgaaataaaacaa 19714683  T
Q  301 aatcaataaagaaatgcctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19714684 aatcaataaagaaatgcctt 19714703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 19707104 - 19707419
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19707104 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctagtatttatatctatgtgaagatttgataactctttatccatg 19707203  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  19707204 atctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgacttcggatattttaagaata 19707303  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  19707304 gattccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaactgactaactattctagggactttattactttgaaataaaacaa 19707403  T
Q  301 aatcaataaagaaatg 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  19707404 aatcaataaagaaatg 19707419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 18569747 - 18570070
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttat--cca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  18569747 taacttttactatgtagtattctcatggcgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgatatctctttatatcca 18569846  T
Q  99 tgatctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaa 198  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18569847 tgatatgtgagatgtgatcatcagtctaccaacataatagtctttatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagag 18569946  T
Q  199 tagtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaac 298  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569947 tagtttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttcaattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaac 18570046  T
Q  299 aaaatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  18570047 aaaatcaataaagaaatgtcttgt 18570070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 316
Target Start/End: Original strand, 22546912 - 22547217
Alignment:
Q  11 tatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaga 110  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22546912 tatgtagtattctcatggctggtcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatatgaaaacttgataactctttatccatgatttgtgaga 22547011  T
Q  111 tgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcattat 210  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||| |||||||  ||||||| |||| |||||| |||||||| |||||| || ||||||| | |||| | ||  |||    
T  22547012 tgtgatcatcggtctatccacataatagtctctatattttaatgttatctcacttcacaataaagtttgactgcgaatactttaaaaataatgtccatat 22547111  T
Q  211 gtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 310  Q
     ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  22547112 atttaatgagatctcacgattaagttatacttaatgttccattaaaccgactaactattatagcggttttattattttaaaataaaacaaaatgaataaa 22547211  T
Q  311 gaaatg 316  Q
     |||||    
T  22547212 taaatg 22547217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 39538909 - 39538708
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39538909 taacttttactatgtagtattttcatggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 39538810  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||| || ||| |||| ||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||    
T  39538809 atctgtgaaatatgaccatcagtctacccacataatagtcttcatgctttaatgatatcccacttcacaataaagcttaactatggatattttaagaata 39538710  T
Q  201 gt 202  Q
    ||    
T  39538709 gt 39538708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 62 - 317
Target Start/End: Original strand, 27347425 - 27347679
Alignment:
Q  62 tttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatccc 161  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| | ||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27347425 tttatacctatgtgaagacatgataactctttatctatgatctgtgagatgtgatcatcggcctatccacaaaatagtctctatgctttaatgttatccc 27347524  T
Q  162 acttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagac 261  Q
      ||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||| | || ||  ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||     
T  27347525 ttttcacaataaagcttgactacatatactttaagaataatgtcctttcgtttaat-gggtctcacgattaagtcacacttaatgctccattaaacagat 27347623  T
Q  262 taactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgc 317  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27347624 taattattctaaggactttattattttgaatcaaaacaaaatcaacaaagaaatgc 27347679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 318
Target Start/End: Original strand, 17285643 - 17285935
Alignment:
Q  10 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 109  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  17285643 ctatgtagtattctcattgtgggtcaatccaatataaatattactcttaatatttatatctatgtaaagacttgataactctttatccatgacctgtgat 17285742  T
Q  110 atgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcatta 209  Q
    ||||||||||| |||||                |||||||||||  ||||||| ||| |||||||| | ||||| | ||||||| |||||| | |||||     
T  17285743 atgtgatcatcagtcta----------------tatgctttaatactatcccaattcacaataaagatcgactatgaatactttaagaataatgtcattt 17285826  T
Q  210 tgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataa 309  Q
     ||||| | |||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17285827 agtttactagggtttcacgattaagtcacacttaatgttccattaaacagactaactattctctggagattattattttgaaacataacaaaatcaataa 17285926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 256
Target Start/End: Original strand, 18806929 - 18807175
Alignment:
Q  10 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 109  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||     
T  18806929 ctatgtatcattctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatatgaa 18807028  T
Q  110 atgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagt-ttcatt 208  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||| || ||||  ||||| |||||| |||||||||  |||||||| |||||| | | ||||    
T  18807029 atgtgatcatcagtctacccgcataatagtctctatgctttattgttatcttacttcacaataacgcttgactatagatactttaagaataatgtccatt 18807128  T
Q  209 atgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaa 256  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18807129 at-tttaatggtgtctcacgattaagtcacacttaatgttccattaaa 18807175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 318
Target Start/End: Original strand, 17298798 - 17299088
Alignment:
Q  14 gtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaga--t 111  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||| |  |    
T  17298798 gtagtattctcatggtgggtcaatccaatataaatattactcttaatatttatatctatgtgaagatttaataactctttatccatgacccgtgatatgt 17298897  T
Q  112 gtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcattatg 211  Q
    ||||||||| |||||                |||||||||||  ||||||||||  |||||||| | ||||| | ||||||| |||||| | |||||  |    
T  17298898 gtgatcatcagtcta----------------tatgctttaatactatcccacttaacaataaagatcgactatgaatactttaagaataatgtcatttag 17298981  T
Q  212 tttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaag 311  Q
    |||| | |||| |||| |||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||     
T  17298982 tttactagggtttcacgattaagtcgcacttaatgttccattaatcggactaactattctctggatattattatttataaacataacaaaatcaataaat 17299081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 39538071 - 39537962
Alignment:
Q  213 ttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaaga 312  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39538071 ttaatgaggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgaaccaactattctaaggacttaaccattttgaaacaaaacaaaatcattaaaga 39537972  T
Q  313 aatgccttgt 322  Q
    |||| |||||    
T  39537971 aatggcttgt 39537962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 20941161 - 20941018
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  20941161 ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 20941063  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  20941062 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 20941018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 25805553 - 25805696
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  25805553 ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 25805651  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  25805652 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 25805696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 32033 - 31890
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  32033 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 31935  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  31934 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 31890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 23546056 - 23545913
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  23546056 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 23545958  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  23545957 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 23545913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 12789831 - 12789974
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  12789831 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 12789929  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  12789930 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 12789974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 22941384 - 22941241
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  22941384 ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtataaacttgatatctc-atatctatgacccat 22941286  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||  | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  22941285 gagatacggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 22941241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Original strand, 12765162 - 12765356
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  |    
T  12765162 ttactatgtagtattctcacggtgggtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccat 12765260  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatac-tttgagaatagt 202  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| | |||||| |  ||||| | || | | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  12765261 gagatgtggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctaattat-attaaagcttgactacggatacatttaagaatagt 12765356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 24695709 - 24695765
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695709 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 24695765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 24933474 - 24933617
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  |    
T  24933474 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccat 24933572  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  24933573 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 24933617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31886640 - 31886537
Alignment:
Q  213 ttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaaga 312  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||| |||||| ||||||   ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31886640 ttaatggagtctcacgattaagtcgtacttgatgttcaattaaatgaactaattattctaaggactttattaatttgaaacaaaacaaaatcactaaaga 31886541  T
Q  313 aatg 316  Q
    ||||    
T  31886540 aatg 31886537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 19714742 - 19714798
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19714742 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 19714798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 31096950 - 31096807
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  |    
T  31096950 ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctataatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccat 31096852  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  31096851 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 31096807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Original strand, 7865603 - 7865796
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 107  Q
    |||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||    
T  7865603 tactatgtagtattctcacggtgggtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatg 7865701  T
Q  108 agatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatac-tttgagaatagt 202  Q
    ||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | |||||| |  ||||| | || | | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  7865702 agatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctaattat-attaaagcttgactacggatacatttaagaatagt 7865796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Original strand, 12704047 - 12704240
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 107  Q
    |||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||    
T  12704047 tactatgtagtattctcacggtgggtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatg 12704145  T
Q  108 agatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatac-tttgagaatagt 202  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||| || |||| | |||||| |  ||||| | || | | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  12704146 agatgtggtcatcagtctacatacatagtagtctcgacgctttattattatcctaattat-attaaagcttgactacggatacatttaagaatagt 12704240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 190
Target Start/End: Original strand, 9811906 - 9812086
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 107  Q
    |||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||    
T  9811906 tactatgtagtattctcacggtgggtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatg 9812004  T
Q  108 agatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatac 190  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||| || |||| | |||||| |  ||||| | || | | ||||||||||||||||||||    
T  9812005 agatgtggtcatcagtctacatacatagtagtctcgacgctttattattatcctaattat-attaaagcttgactacggatac 9812086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 19707462 - 19707518
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19707462 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 19707518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 27347722 - 27347778
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27347722 catgatacaaagccaaacgcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 27347778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 5097784 - 5097642
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 107  Q
    |||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||    
T  5097784 tactatgtagtattctcacggtgggttaatccaatataaatattactcataatatttatacttatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatg 5097686  T
Q  108 agatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    ||||||  ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  5097685 agatgtagtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 5097642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 296
Target Start/End: Original strand, 33477390 - 33477479
Alignment:
Q  207 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaa 296  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||  | | |||||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  33477390 ttatgattaatgaggtctcacgattagatcacacttaatgatccattaatcagcctaactattgtaaggactttattattttgaaacaaa 33477479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 84
Target Start/End: Original strand, 18829456 - 18829530
Alignment:
Q  10 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttga 84  Q
    |||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  18829456 ctatgtatcattctcatggtgggtcaatccaatataaatattggtcctaatatttatatatatgagaacacttga 18829530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 26245235 - 26245093
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 107  Q
    ||||||| |||||||| |  | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||| |||  |||| |||| |  ||    
T  26245235 tactatgcagtattctgacagtggatcaatcaagtataaatattactcctaatatttatacctatgtataaacttaatatctc-atatctatgacccatg 26245137  T
Q  108 agatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||  |||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  26245136 agatgcaatcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 26245093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 20100412 - 20100540
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 107  Q
    ||||||||||| |||||| |  || |||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||| |  |||||| ||| |||  ||| ||||| |  ||    
T  20100412 tactatgtagttttctcacgttgggtcaagccagtataagtattactcctaatattgatacctatctatagacttaatatctc-atattcatgacccatg 20100510  T
Q  108 agatgtgatcatctgtctacctacataata 137  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20100511 agatgtgatcatcagtctacatacataata 20100540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 406
Target Start/End: Original strand, 18570108 - 18570156
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 406  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  18570108 catgatacaaagccaaacccaattaatatagattagctattagagctta 18570156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 359 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 39537925 - 39537870
Alignment:
Q  359 atgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    ||||| |||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39537925 atgatacaaagctaaactcagtcaacatagattggctattagggcttaatccaaca 39537870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11479486 - 11479420
Alignment:
Q  207 ttatgtttaatg-gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattcta 272  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||| || ||||||||| ||||| |||||||    
T  11479486 ttatgtttaatgagggtctcacaatcaagtcacacttaatatttcattaaacacactaattattcta 11479420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 18806569 - 18806619
Alignment:
Q  10 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaat 60  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18806569 ctatgtatcattctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaat 18806619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Original strand, 18806749 - 18806799
Alignment:
Q  10 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaat 60  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18806749 ctatgtatcattctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaat 18806799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 74
Target Start/End: Original strand, 26129862 - 26129928
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 74  Q
    |||||||| ||||| ||| || || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  26129862 tactatgtggtattttcacggtgggtcaatccagtataaatattactcataatatttgtatatatgt 26129928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 86
Target Start/End: Original strand, 33477193 - 33477269
Alignment:
Q  10 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 86  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| || ||| ||||||    
T  33477193 ctatgtagtattcttatggcagatcaattatgtataaatattactcttaatattaatatttatttgtagatttgata 33477269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 18609 - 18288
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18609 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 18510  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18509 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 18410  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18409 gtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttcaattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 18310  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18309 aatcaataaagaaatgccttgt 18288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 18252 - 18196
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 18196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 50)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 27381138 - 27381459
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381138 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 27381237  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27381238 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactatggatactttgagaata 27381337  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381338 gtttccatatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 27381437  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27381438 aatcaataaagaaatgccttgt 27381459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 27471521 - 27471842
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471521 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 27471620  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27471621 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactatggatactttgagaata 27471720  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471721 gtttccatatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 27471820  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27471821 aatcaataaagaaatgccttgt 27471842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 29309211 - 29308890
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309211 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 29309112  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309111 atatgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 29309012  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309011 gtttccttatgtttaatgggctctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 29308912  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29308911 aatcaataaagaaatgccttgt 29308890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 29316171 - 29315850
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316171 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 29316072  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316071 atatgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 29315972  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29315971 gtttccttatgtttaatgggctctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 29315872  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29315871 aatcaataaagaaatgccttgt 29315850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 17684355 - 17684674
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684355 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 17684454  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684455 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaata 17684554  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684555 gtttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 17684654  T
Q  301 aatcaataaagaaatgcctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17684655 aatcaataaagaaatgcctt 17684674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 17691326 - 17691647
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691326 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 17691425  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17691426 atatgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcactaaagcttgactacggatactttaagaata 17691525  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17691526 gtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaagaaaacaa 17691625  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17691626 aatcaataaagaaatgccttgt 17691647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 188863 - 189182
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188863 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 188962  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  188963 atatgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacaaatactttaagaata 189062  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  189063 gtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaa 189162  T
Q  301 aatcaataaagaaatgcctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  189163 aatcaataaagaaatgcctt 189182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 11652044 - 11651725
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652044 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 11651945  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11651944 atctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactactgatacttttagaata 11651845  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11651844 gtttccttatttttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattttagggactttattattttgaaacaaatcaa 11651745  T
Q  301 aatcaataaagaaatgcctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11651744 aatcaataaagaaatgcctt 11651725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 52 - 320
Target Start/End: Original strand, 16566257 - 16566525
Alignment:
Q  52 actcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16566257 actcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 16566356  T
Q  152 atgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttcca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566357 atgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttcca 16566456  T
Q  252 ttaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 320  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566457 ttaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 16566525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 104 - 320
Target Start/End: Original strand, 25537148 - 25537364
Alignment:
Q  104 tgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtt 203  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  25537148 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaatagtt 25537247  T
Q  204 tcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 303  Q
    || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537248 tccttatgtttaacggggtctcacaataaagttatacttaatgttccattaaacggactaattattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 25537347  T
Q  304 caataaagaaatgcctt 320  Q
    |||||||||||||||||    
T  25537348 caataaagaaatgcctt 25537364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 34 - 320
Target Start/End: Original strand, 13359188 - 13359474
Alignment:
Q  34 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatctgtctacctacat 133  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | | ||    
T  13359188 caattcaatataaatactacttctaatacttatatctaagtgaagatttgataactttttatccatgatttgcgagatgtgatcatcagtctatccatat 13359287  T
Q  134 aatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaattaa 233  Q
    |||| |||||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||| | |  ||||||||||||| || |||| |||||    
T  13359288 aatagtctctacgctttaatgttgtcccatttcacaataaaggttgactacggatactttaaaaataatgtttttatgtttaatggagtttcacgattaa 13359387  T
Q  234 gttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 320  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13359388 gttatacttaatgctccattaagcgaactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaataaataaataaatgcctt 13359474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27926062 - 27925772
Alignment:
Q  13 tgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatg 112  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27926062 tgtagtattatcatggcgagtcaattcaatataaatattattcctaat-ttaatatctatgtgaaaacttcataaatctttatccatgatccgtgagatg 27925964  T
Q  113 tgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcattatgt 212  Q
     ||||||| || || | |||||||| ||| | ||||| |||| ||| |||||||  ||||||| |||||||  |||||||| |||||| |||  ||  ||    
T  27925963 agatcatcagtttatccacataatagtctttgtgcttcaatgctataccacttccaaataaagtttgactagagatactttaagaataattttctttagt 27925864  T
Q  213 ttaatggggtctcacaattaagt--tatactta---atgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaaca 299  Q
    ||||||| ||||||| |||||||   | |||||   ||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27925863 ttaatggagtctcacgattaagtcacacacttaattatgttccgttaaacatactagttattctaaggactttattattttgaaacaaaaca 27925772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 16394331 - 16394438
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16394331 taacttttactacgtagtattctcatggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactgtttatccatg 16394430  T
Q  101 atctgtga 108  Q
    || |||||    
T  16394431 atatgtga 16394438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 283
Target Start/End: Original strand, 20553492 - 20553755
Alignment:
Q  18 tattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatc 117  Q
    ||||||||||  || |||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||   ||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20553492 tattctcatgatgggtcaatc-aatataaatattattcttaatatt-atatctatgtgaatgtttgatatttctttatcgatgatatgtgagatgtgatc 20553589  T
Q  118 atctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcattatgtttaat 217  Q
    ||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||  |||| |||||| |||||||  || ||||||||| |||| |||||| | |  |||| ||||||    
T  20553590 atcagtctaccaacataaaaatctttatgctttaattttatctcacttcacaataaaaattcactacggatgctttaagaataatattcttatatttaat 20553689  T
Q  218 ggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttatt 283  Q
    ||| |||||| |||||||  |||||||| || |||||||| ||||| |||| |||| |||||||||    
T  20553690 gggatctcacgattaagtcgtacttaatatttcattaaacggactagctatcctagagactttatt 20553755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 284
Target Start/End: Original strand, 17850392 - 17850663
Alignment:
Q  12 atgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagat 111  Q
    |||||||||||| | || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||| || || ||||||| | ||||    
T  17850392 atgtagtattcttaaggagggtcaatccaatatatatattactcataatatttatacctatgtgaatacacgataactcgttgtcaatgatctataagat 17850491  T
Q  112 gtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcattatg 211  Q
     |||||||| ||||||| | |||||| ||| ||| ||| |||| |||   ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||| || || |     
T  17850492 atgatcatcagtctacccatataatagtctatatacttgaatgttatttgacttcacaa-aaagcttgactatggataatttaagaatagtgtccttgtt 17850590  T
Q  212 tttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttatta 284  Q
    |||||| || | ||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  17850591 tttaattggatatcacaattaagtcttacataatgttccaacaaacaaactagctattatagggactttatta 17850663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 27296950 - 27296877
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27296950 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatcaatgt 27296877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Original strand, 25537077 - 25537152
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtga 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25537077 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatgacacctaatatttatatctatgtga 25537152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 18020009 - 18020152
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  18020009 ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 18020107  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  18020108 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 18020152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 28172859 - 28172698
Alignment:
Q  19 attctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatca 118  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||    
T  28172859 attctcatggagggtcaatccaatataaacactacccttaatatttatatctatgtaaagacttgataactttttaacaatgatctgtaagatgtgatca 28172760  T
Q  119 tctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttga 180  Q
    || ||| |   |||||||| | ||||| ||| | || ||||||||||| || |||| |||||    
T  28172759 tcagtccattcacataataatttctattcttcagtgttatcccacttcacactaaaacttga 28172698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 16789205 - 16789062
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  16789205 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 16789107  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  16789106 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 16789062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 22860056 - 22860199
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  22860056 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 22860154  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  22860155 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 22860199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 2669605 - 2669478
Alignment:
Q  10 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 109  Q
    |||||||||||| |||||  |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||   ||||    
T  2669605 ctatgtagtattttcatgatgtgtcaatcaaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaatacatgataactcttaatcaatgattcatgag 2669506  T
Q  110 atgtgatcatctgtctacctacataata 137  Q
    |||||||||||  |||||| | ||||||    
T  2669505 atgtgatcatcaatctacccatataata 2669478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 8510235 - 8509941
Alignment:
Q  10 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttat-atctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtga 108  Q
    |||||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||  ||||||||  ||| || |||| |||      
T  8510235 ctatgtagtattatcattgtaggtcaatcaaatataaatattacttctaatattttttatctatatgaagaaatgataactacttacccgtgatatgtac 8510136  T
Q  109 gatgtgat-catctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcat 207  Q
    ||||| || ||||| |  ||  |||||||| ||| |||| ||||||| |||| || |||  |||||||||| |||||  ||||||| | ||||   || |    
T  8510135 gatgttatacatcttt--acgcacataatagtctttatgttttaatgctatctcatttcataataaagcttaactacatatactttaataatatcatcct 8510038  T
Q  208 tatgtttaatgggg-tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 303  Q
     || |||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8510037 catatttaatgggggtctcataattaagtcgtacataatgttccatcaaatagactaattattctatagactttattattttaaaacaaaataaaat 8509941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 1586276 - 1586419
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  |    
T  1586276 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccat 1586374  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  1586375 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 1586419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 16559358 - 16559414
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcct 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559358 taacttttactatgtagtattctcatggtggatcaatccaatataaatattactcct 16559414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 135
Target Start/End: Original strand, 27508515 - 27508642
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  27508515 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 27508613  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataa 135  Q
    |||||| | ||||| |||||| |||||||    
T  27508614 gagatgcggtcatcagtctacatacataa 27508642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 135
Target Start/End: Original strand, 27528101 - 27528228
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  27528101 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 27528199  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataa 135  Q
    |||||| | ||||| |||||| |||||||    
T  27528200 gagatgcggtcatcagtctacatacataa 27528228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 358 - 412
Target Start/End: Original strand, 17691683 - 17691737
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 412  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691683 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 17691737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 365 - 414
Target Start/End: Original strand, 27381502 - 27381551
Alignment:
Q  365 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381502 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 27381551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 365 - 414
Target Start/End: Original strand, 27471885 - 27471934
Alignment:
Q  365 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471885 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 27471934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 14074614 - 14074471
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  |    
T  14074614 ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccattataaatattactcccaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccat 14074516  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  14074515 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 14074471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 29308854 - 29308798
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29308854 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 29308798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 29315814 - 29315758
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29315814 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 29315758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 8613048 - 8612855
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 107  Q
    |||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||    
T  8613048 tactatgtagtattctcacggtgggtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatg 8612950  T
Q  108 agatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatac-tttgagaatagt 202  Q
    ||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | |||||| |  ||||| | || | | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  8612949 agatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctaattat-attaaagcttgactacggatacatttaagaatagt 8612855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 284
Target Start/End: Original strand, 20736501 - 20736773
Alignment:
Q  11 tatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaga 110  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |  | |||| ||| |||  |||| || |    |||||    
T  20736501 tatgtagtattctcacgatggatcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctat-tataaacttaatatctc-atatctataacacatgaga 20736598  T
Q  111 tgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatac-tttgagaatagt-ttcatt 208  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||| |||| | |||||| |  ||||||| |||| | |||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||| ||    
T  20736599 tgtggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcccagttcttattaaagcttgactacagatacatttaagaataatgttcttt 20736698  T
Q  209 atgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttatta 284  Q
    ||| ||||||   |||||  ||||||| | ||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||| |||||||||    
T  20736699 atg-ttaatgtaatctcatgattaagtcaaacttaatataccattacacgaactatctattctaggaactttatta 20736773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 17684712 - 17684768
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684712 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctattagggcttattccaaca 17684768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 360 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 11651684 - 11651630
Alignment:
Q  360 tgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11651684 tgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 11651630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 120
Target Start/End: Original strand, 19347092 - 19347204
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| || |||||||| | ||||| ||||||  |||||||| || ||| ||||||||||| ||||| |||    
T  19347092 ttactatgtagtattctaatggcagttcaatccattacaaatatta-ttctaatgtttatacttatgtgaaaacatgacaactctttatcaatgatatgt 19347190  T
Q  107 gagatgtgatcatc 120  Q
    ||||| || |||||    
T  19347191 gagatatggtcatc 19347204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 25537405 - 25537461
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25537405 catgatacaaagccaaactcagtcaatatagattggctattagggcttaatccaaca 25537461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 67
Target Start/End: Original strand, 5758650 - 5758709
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 67  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5758650 tactatgtagtattctcacagtggatctatccagtataaatattactcctaatatttata 5758709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 315
Target Start/End: Original strand, 31258065 - 31258120
Alignment:
Q  260 actaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaat 315  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31258065 actaattattttagagactttattattttgaaacaaaacaaaagcaataaagaaat 31258120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 190
Target Start/End: Original strand, 22560353 - 22560534
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 107  Q
    ||||||||||| ||||||| |  | ||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||  | |||| ||| |||  ||||||||| |  ||    
T  22560353 tactatgtagtgttctcatagtaggtcaatacagtataaatattactcctaatatttaaacctatgtataaacttaatatctc-atatccatgacccatg 22560451  T
Q  108 agatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatac 190  Q
    ||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||  |||||| |  ||||||| ||   | ||||||||||||| ||||||    
T  22560452 agatgtggtcatcggtctacatgcataatagtctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagcttgactatggatac 22560534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 151
Target Start/End: Original strand, 13995151 - 13995254
Alignment:
Q  47 atattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | |    
T  13995151 atattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacg 13995249  T
Q  147 cttta 151  Q
    |||||    
T  13995250 cttta 13995254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 21994721 - 21994655
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 74  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  21994721 tactatttagtattctcatggtgggtcattccagtataaatattactcgtaatgtttatagctatgt 21994655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 406
Target Start/End: Original strand, 13359512 - 13359560
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 406  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  13359512 catgatacaaagtcaaacccaatgaatatagattggctattaggactta 13359560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 406
Target Start/End: Original strand, 16566563 - 16566611
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 406  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16566563 catgatacaaagtcaaactcaatcaacatagattggctattagggctta 16566611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 416
Target Start/End: Original strand, 189221 - 189282
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaata---tagattggctattagggcttattccaacatt 416  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  189221 catgatacaaagccaaacccaatcaatatactagattgattattagggcttactccaacatt 189282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 74
Target Start/End: Original strand, 10359219 - 10359285
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 74  Q
    |||||||||||||| ||| || || || ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  10359219 tactatgtagtattttcacggtgggtcgatccagtataaatattacctataatatttatatctatgt 10359285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19218531 - 19218371
Alignment:
Q  39 caatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatac 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  ||| ||||| |  |||| |||| ||||| |||||| |||||||||     
T  19218531 caatataaattttactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atattcatgacccatgaggtgtggtcatcagtctacatacataatag 19218433  T
Q  139 tctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatag 201  Q
    ||||||  ||||| |  |||||| |||   | |||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  19218432 tctctacactttattattatccc-ctttatattaaagcttgactactgatgctttaagaatag 19218371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28605931 - 28605854
Alignment:
Q  207 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttatta 284  Q
    |||| ||||| | |||||||||||| ||| | |||||| || |||||||||| | ||||||||||||  |||||||||    
T  28605931 ttatctttaacgaggtctcacaatttagtcacacttaaagtcccattaaacaaaataactattctagatactttatta 28605854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 21330134 - 21330455
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330134 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 21330233  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330234 atctgtgagatgtgatcatcagtccacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 21330333  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330334 gtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 21330433  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  21330434 aatcaataaagaaatgtcttgt 21330455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 18796827 - 18796506
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796827 taacttttactatgtagtattctcatagaggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 18796728  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  18796727 atctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctcaatgctttaatgatataccacttcacaataaagcttgactacagataatttaagaata 18796628  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
     | || ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18796627 atatccttatgttaaaagaggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttgttattttgaaacaaaacaa 18796528  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||| || ||| |||| ||||||    
T  18796527 aataaacaaataaattccttgt 18796506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18620125 - 18619807
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  18620125 taacttttactatgtagtattctcatggtgggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtgaagacatgataactctttatctatg 18620026  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    ||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||||  ||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  18620025 atccgtgagatgtgatcatcggcctacccacataatagtctatatgctttaatattatcccttttcacaataaagtttgaccacagatactttaagaata 18619926  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
     | || || |||||||| |||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18619925 atatccttttgtttaat-gggtctcataattaagtcacacttaatgctccattaaacagactaattattatagggactttattattttgaaacaaaacaa 18619827  T
Q  301 aatcaataaagaaatgcctt 320  Q
    |||||| |||||||| ||||    
T  18619826 aatcaacaaagaaattcctt 18619807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 36270478 - 36270199
Alignment:
Q  10 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 109  Q
    |||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||||   |||||    
T  36270478 ctatgtaacattctcatggcgagtcaatccaatataaatattactcctaatatttaaatcgaagtgaaaacttgataactctttctctatgactcgtgag 36270379  T
Q  110 atgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcatta 209  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||| |||||||| |||||| |||| || |||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||     
T  36270378 atgtgatcatcagtctacccacacaatagtctttatactttaatgttatccctcttcacactaaagcttgattacggatgttttaagaatagtgtcattg 36270279  T
Q  210 tgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttcca-ttaaacagactaactattctagggactttattatttt 288  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| | ||||||  || || ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36270278 tgtttaatgatgtctcacgattaagtcacacttaacatttcatttaagtaaactaactattctagggactttattatttt 36270199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18822384 - 18822115
Alignment:
Q  21 tctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatc 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  18822384 tctcatggcagatcaatccaatataaatattaccattaatatttatatctatgtgaaaagttgataactccttatcaatgatccgtgatatgtgatcatc 18822285  T
Q  121 tgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcattatgtttaatggg 220  Q
     |||||   |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||  ||  ||| |||||||| || || ||||||||||     
T  18822284 agtctattgacataataatctatctgctttaatgatatcccacttcaaactaaagcttgattacatatgttttaagaatagtgtccttgtgtttaatggt 18822185  T
Q  221 gtctcacaattaagttatacttaa-tgttcca-ttaaacagactaactattctagggactttattatttt 288  Q
    ||||||| ||||||  | |||||| | ||||| ||||||  |||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  18822184 gtctcacgattaagccacacttaatttttccatttaaacgaactaacaattctatagactttattatttt 18822115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20978178 - 20977956
Alignment:
Q  19 attctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatca 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||                
T  20978178 attctcatggcgggtcaatccaatataaatattactcataataattatatctcggtgaagacttgataactctttatccatgatctgt------------ 20978091  T
Q  119 tctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcattatgtttaatg 218  Q
         ||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||  ||| |||||| |||| |||| |||||||    
T  20978090 -----ctatccacataatagtctctatgctttagtgatatctcacttcacattaaagcttgactacggatgttttaagaataatttccttatttttaatg 20977996  T
Q  219 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaaca 258  Q
    || |||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20977995 ggatctcatgattaaattattcttaatgttccattaaaca 20977956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 184
Target Start/End: Original strand, 22183392 - 22183552
Alignment:
Q  23 tcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatctg 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||      
T  22183392 tcatggcgggtcaatccaatataa-tattactcttaatatttatatctatgtgaagacttgataactccttatcaaagatctgtgagatttgatcatcaa 22183490  T
Q  123 tctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactac 184  Q
    |||||| || ||||| ||||||| |||||||| |||||   ||| || ||||||||||||||    
T  22183491 tctacccacgtaatagtctctatactttaatgttatccattttcacactaaagcttgactac 22183552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 177 - 316
Target Start/End: Original strand, 19692598 - 19692737
Alignment:
Q  177 ttgactacggatactttgagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctaggga 276  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||| ||  |||||||| | |||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19692598 ttgactaaggatactttaagaataatttcctttagtttaatgagatctcatgattaagtcaggcttaatgttccattaaacagactaattattctaggga 19692697  T
Q  277 ctttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 316  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19692698 cttcattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 19692737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 202
Target Start/End: Original strand, 18851956 - 18852146
Alignment:
Q  12 atgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagat 111  Q
    ||||| |||||| || |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18851956 atgtaatattcttatagcgagtcaatccaatataaatattactcttaatatttatacatatttgaagacttgataactctttattcatgatccgtgagat 18852055  T
Q  112 gtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagt 202  Q
    | ||||||  ||||||| |||||||| ||| ||   ||||||| ||||| ||||| |||||||| | ||||||  ||||||| ||||||||    
T  18852056 gggatcattagtctaccgacataatagtctatacaatttaatgttatcctacttcacaataaagttggactacatatactttaagaatagt 18852146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 19279600 - 19279445
Alignment:
Q  10 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 109  Q
    |||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  19279600 ctatgtggtattctcatgacgtgtcaatccaatataaatattactccaaatatctatatctatctgaaaacttgataactttttatccatgatacgtgag 19279501  T
Q  110 atgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccactt 165  Q
    ||||||||||  ||| ||   ||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||    
T  19279500 atgtgatcattagtcaactcgcataatagtctttatgctttaaagttatcccactt 19279445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 24250200 - 24250343
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  24250200 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 24250298  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  24250299 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 24250343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 30174511 - 30174368
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  30174511 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 30174413  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  30174412 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 30174368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 147
Target Start/End: Original strand, 6992007 - 6992146
Alignment:
Q  10 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaag--acttgataactctttatccatgatctgtg 107  Q
    ||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||  || |||||||    
T  6992007 ctatgtagcgttcttatggaggatcaatccaatataaatattactcctgagatttatacctatgtgaagatacttgataaatctttatttataatctgtg 6992106  T
Q  108 agatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgc 147  Q
    |||| |||||||  ||||||| | |||||| ||| |||||    
T  6992107 agatatgatcattagtctacccatataataatctttatgc 6992146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 358 - 415
Target Start/End: Original strand, 21330493 - 21330550
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 415  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330493 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 21330550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 24229383 - 24229526
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  |    
T  24229383 ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgaaccat 24229481  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  24229482 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 24229526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 136
Target Start/End: Original strand, 36801899 - 36802003
Alignment:
Q  33 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatct-atgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatctgtctacctac 131  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||    
T  36801899 tcaattcaatataaatattacccttaatatttatattttatgcgaagacttgataactcattatcaatgatttgtgaggtgtgatcatcagtctactcac 36801998  T
Q  132 ataat 136  Q
    |||||    
T  36801999 ataat 36802003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 29800604 - 29800545
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 67  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29800604 tactatgtagtattctcacggtgggtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 29800545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 74
Target Start/End: Original strand, 15342171 - 15342237
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 74  Q
    |||||||||||||| ||| || || | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15342171 tactatgtagtattttcacggtgggttaatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 15342237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 137
Target Start/End: Original strand, 28741220 - 28741323
Alignment:
Q  33 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatctgtctacctaca 132  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||| |||  ||| |||||    ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28741220 tcaatccggtataaatattactcctaatatttatacctatgtacatacttaatatctc-atattcatgacgcatgagatgtgatcatcagtctacataca 28741318  T
Q  133 taata 137  Q
    |||||    
T  28741319 taata 28741323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 286
Target Start/End: Original strand, 36802664 - 36802820
Alignment:
Q  131 cataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaat 230  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||  || | || ||||| |||||||  ||| |||||| | ||||| |||||||||   |||  ||||    
T  36802664 cataataatctatatgctttaatgttatcccactttacactgaatcttgattacggatgttttaagaataatgtcattgtgtttaatgatatcttgcaat 36802763  T
Q  231 taagttatacttaatgttcca-ttaaacagactaactattctagggactttattatt 286  Q
    ||||| | | ||||| ||||| ||||||  | ||||||||| | |||||||||||||    
T  36802764 taagtaacatttaatattccatttaaacgaattaactattcaaaggactttattatt 36802820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 19616568 - 19616509
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 67  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  19616568 tactatgtagtattctcacggtgggtcaattcagaataaatgttactcctaatatttata 19616509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 71
Target Start/End: Original strand, 28718943 - 28719006
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatcta 71  Q
    |||| ||||||||||||| |  |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28718943 tactgtgtagtattctcacgatgagtcaatcaagtataaatattactcctaatatttatatcta 28719006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 21626877 - 21626824
Alignment:
Q  13 tgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 67  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21626877 tgtagtattctcatggtgg-tcaattcaatataaatattactcatattatttata 21626824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Original strand, 24763751 - 24763792
Alignment:
Q  33 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 74  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24763751 tcaatccagtataaatattactcataatatttatacctatgt 24763792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 19692773 - 19692829
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19692773 catgatacaaaaccaaacctaataaatacagattggctattaaggcttactccaaca 19692829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Original strand, 40301108 - 40301164
Alignment:
Q  11 tatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 67  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  40301108 tatgtagtattctcatggtgggtcaatctggtataaatattacttctaatatgtata 40301164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 25876 - 26197
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25876 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagtcttgataactctttatccatg 25975  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25976 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtcgctatgctttaatgatatcccacttttcaataaagcttgactacggatactttgagaata 26075  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26076 gtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatatttaatgttccattaaatggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaa 26175  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  26176 aatcaataaagaaatgtcttgt 26197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 359 - 414
Target Start/End: Original strand, 26231 - 26286
Alignment:
Q  359 atgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26231 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattgactattagggcttattccaaca 26286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 2)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 1314 - 993
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  1314 taacttttactatgtagtattctcatggcagatcaatccaatataaatattactcttaatatttatatctatggcaagacttgataactttttatccatg 1215  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1214 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaata 1115  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1114 gtttctttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgtttcattaaacggactaactattttagggactttattattttgaaacaaaacaa 1015  T
Q  301 aatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  1014 aatcaataaagaaatgtcttgt 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 358 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 957 - 900
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 415  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  957 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 5850 - 5531
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5850 taacttttactatgtagtattcacatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 5751  T
Q  101 atctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 200  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  5750 acctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacatatactttaagaata 5651  T
Q  201 gtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 300  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  5650 atttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaaata 5551  T
Q  301 aatcaataaagaaatgcctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5550 aatcaataaagaaatgcctt 5531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 5492 - 5444
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 406  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5492 catgatacaaagccaaacccaaacaatatagattggctattagggctta 5444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 136; Significance: 9e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 137 - 320
Target Start/End: Original strand, 230363 - 230545
Alignment:
Q  137 actctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagtt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  230363 actctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacaaatactttaagaatggtttccttatgtttaa-ggggtctcacaattaagtt 230461  T
Q  237 atacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230462 atacttaatgttccattaaacggactaactattataagaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 230545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 230277 - 230367
Alignment:
Q  1 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactct 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230277 taacttttactatgtagtattctcatggcagatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactct 230367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 230584 - 230640
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  230584 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattattgcttactccaaca 230640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 8439 - 8296
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  8439 ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 8341  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  8340 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 8296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 317 - 174
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  317 ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 219  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||||| ||||| ||| || ||||||||| |||| | ||||||    
T  218 gagatgtggtcatcagtcgacatacataatagtctcgacgcttta 174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 165
Target Start/End: Original strand, 90019 - 90166
Alignment:
Q  19 attctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactc-tttatccatgatctgtgagatgtgatc 117  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||     
T  90019 attctcatcgcgtgtcaatccaatataaatgttatacgtaatatttatatctatgtgaagtgttgataactcttttacccatgatccgtgagatgtgatt 90118  T
Q  118 atctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccactt 165  Q
    ||| ||||| ||||||| || ||| |||||||||||  ||||||||||    
T  90119 atcagtctatctacatagtagtctttatgctttaatattatcccactt 90166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 3843 - 3986
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  3843 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 3941  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  3942 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 3986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 119864 - 119721
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  119864 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 119766  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  119765 gagatgcggtcatcagtctacgtacataatagtctcgacgcttta 119721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 130392 - 130535
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 106  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |    
T  130392 ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccat 130490  T
Q  107 gagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttta 151  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  130491 gagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 130535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 259 - 322
Target Start/End: Original strand, 8447 - 8510
Alignment:
Q  259 gactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8447 gactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 8510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 8546 - 8602
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8546 catgatacaaagccgaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 8602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 23769 - 23825
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23769 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 23825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Original strand, 67542 - 67609
Alignment:
Q  7 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 74  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  67542 ttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgt 67609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 190
Target Start/End: Original strand, 13118 - 13299
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 107  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||  |||| |  ||    
T  13118 tactatgtagtattctcacggtgggtcaatccggtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatatatgacccatg 13216  T
Q  108 agatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatac 190  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| | |||||| |  ||||||| ||   | ||||||||||||| ||||||    
T  13217 agatgtggtcatcggtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcccaattaatattaaagcttgactatggatac 13299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 366 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 16571 - 16523
Alignment:
Q  366 aaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16571 aaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 16523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 289 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16648 - 16615
Alignment:
Q  289 gaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16648 gaancaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 16615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 142
Target Start/End: Original strand, 40157 - 40290
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||  | || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  ||||||||| |  ||    
T  40157 tactatgtagtattctcacagtgggtcaatccggtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatccatgacccatg 40255  T
Q  108 agatgtgatcatctgtctacctacataatactctc 142  Q
    |||||||  |||| |||||| ||||||||| ||||    
T  40256 agatgtggccatcagtctacatacataatagtctc 40290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 26675 - 26609
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 74  Q
    |||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26675 tactatatagtattctcaaggtgggtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 26609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0705 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0705
Description:

Target: scaffold0705; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Original strand, 41 - 97
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41 catgatacaaagccaaaatcaatcattatagattggctattagggcttattccaaca 97  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 9000 - 8944
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9000 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctatttgggcttattccaaca 8944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0767
Description:

Target: scaffold0767; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 378 - 419
Target Start/End: Original strand, 1 - 42
Alignment:
Q  378 aatcaatatagattggctattagggcttattccaacattggt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1 aatcaatatagattggctattagggcttattccaacagtggt 42  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 67
Target Start/End: Original strand, 11699 - 11758
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 67  Q
    ||||||||||||||||||  | || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11699 tactatgtagtattctcacagtgggtctatccagtataaatattactcctaatatttata 11758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 67
Target Start/End: Original strand, 83184 - 83243
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 67  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  83184 tactatgtagtattctcattgtgggtcaatccagtataaatattacttctgatatttata 83243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 412
Target Start/End: Original strand, 10202 - 10256
Alignment:
Q  358 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 412  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10202 catgatacaaagtcaaactcaatcaatatagattggctattagagcttactccaa 10256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 303
Target Start/End: Original strand, 10127 - 10158
Alignment:
Q  272 agggactttattattttgaaacaaaacaaaat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10127 agggactttattattttgaaacaaaacaaaat 10158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 46051 - 45956
Alignment:
Q  12 atgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactccta----atatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 103  Q
    |||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| |||| | |||| |||| |||||||||||||    
T  46051 atgtagcattctaatggtgggtcaattcaatataaatattactcataatatatatttatatctatatgaatatttgacaactttttatccatgatc 45956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 92432 - 92194
Alignment:
Q  57 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatctgtctacctacataatactctctatgcttt-aatga 155  Q
    |||||||||||| | || || |||||||||| || ||||||||||   |||| |||| |||||| ||||| | | |||||| | |||| | ||| || |     
T  92432 taatatttatatatgtgcgatgacttgataattccttatccatgactcgtgacatgtaatcatcagtctagccatataatagtttctaagattttaaagt 92333  T
Q  156 tatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttcca-tta 254  Q
    |||||| || | || ||||||||||||||| ||  ||| |||||| |  | |  |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  92332 tatccctctccacactaaagcttgactacgaatgttttaagaataatgccttgctgtttattgctgtctcacgattaagttatacttaatgttccattta 92233  T
Q  255 aacagactaactattctagggactttattattttgaaac 293  Q
    ||   ||||  |||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  92232 aaataactagatattctagagactttattactttaaaac 92194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 8864 - 8807
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatattta 65  Q
    ||||| ||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  8864 tactaagtagtattctcattgggggtcaatctagtataaatattactcctaatattta 8807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 53898 - 53832
Alignment:
Q  8 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 74  Q
    |||||||||||||||||| || || |||| ||| | | |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  53898 tactatgtagtattctcacggtgggtcaacccagtgtgaatattactcttaatatttatacctatgt 53832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 5927 - 5878
Alignment:
Q  365 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 414  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  5927 caaagtcaaactcaatcaatatagattggctattatgacttactccaaca 5878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University