View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17502_high_25 (Length: 245)

Name: NF17502_high_25
Description: NF17502
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17502_high_25
NF17502_high_25
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (22-235)||(54534314-54534525)
chr3 (22-235)||(37698129-37698342)
chr3 (21-235)||(15520128-15520342)
chr3 (29-235)||(38856089-38856295)
chr3 (26-235)||(8042600-8042809)
chr3 (27-235)||(25999382-25999590)
chr3 (26-234)||(42307892-42308100)
chr3 (26-235)||(22174976-22175185)
chr3 (22-235)||(50528918-50529131)
chr3 (27-235)||(25494271-25494479)
chr3 (26-234)||(46452149-46452357)
chr3 (33-235)||(21581042-21581244)
chr3 (30-230)||(32244117-32244317)
chr3 (26-235)||(20842334-20842543)
chr3 (24-234)||(15520627-15520837)
chr3 (24-234)||(24835686-24835896)
chr3 (25-235)||(29445480-29445690)
chr3 (25-235)||(54870160-54870370)
chr3 (26-235)||(12117644-12117853)
chr3 (30-235)||(32359256-32359461)
chr3 (24-235)||(35226438-35226649)
chr3 (24-235)||(38933937-38934147)
chr3 (24-235)||(42104957-42105168)
chr3 (28-234)||(20699144-20699350)
chr3 (23-235)||(44609319-44609531)
chr3 (27-235)||(2895179-2895391)
chr3 (27-234)||(26122808-26123015)
chr3 (23-235)||(53028215-53028419)
chr3 (23-235)||(34700331-34700543)
chr3 (33-235)||(48924989-48925189)
chr3 (54-234)||(44688782-44688961)
chr3 (28-185)||(35643212-35643369)
chr3 (66-235)||(16354379-16354548)
chr3 (33-167)||(50529827-50529961)
chr3 (56-232)||(12915930-12916105)
chr3 (26-161)||(49128042-49128177)
chr3 (147-234)||(24366143-24366230)
chr3 (157-235)||(13696917-13696995)
chr3 (26-83)||(24366085-24366142)
chr3 (187-235)||(50528868-50528916)
chr3 (30-60)||(40240485-40240515)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (26-235)||(6394748-6394957)
chr7 (31-235)||(4477311-4477515)
chr7 (26-235)||(43067963-43068172)
chr7 (21-235)||(7164176-7164390)
chr7 (25-235)||(24792322-24792532)
chr7 (30-235)||(5280861-5281066)
chr7 (26-235)||(30181014-30181223)
chr7 (26-234)||(36890821-36891028)
chr7 (28-235)||(20346487-20346694)
chr7 (26-235)||(42204151-42204361)
chr7 (20-233)||(3511314-3511527)
chr7 (26-235)||(12101168-12101377)
chr7 (26-235)||(42964986-42965195)
chr7 (27-235)||(22649684-22649892)
chr7 (27-235)||(33359080-33359288)
chr7 (32-235)||(1803029-1803232)
chr7 (26-235)||(933282-933491)
chr7 (32-235)||(38866547-38866750)
chr7 (26-235)||(4347270-4347478)
chr7 (30-235)||(9452591-9452796)
chr7 (26-235)||(15655909-15656118)
chr7 (34-233)||(43156718-43156917)
chr7 (21-235)||(25748479-25748693)
chr7 (25-235)||(33846519-33846724)
chr7 (21-235)||(42673457-42673667)
chr7 (27-235)||(12097580-12097788)
chr7 (28-235)||(8630665-8630872)
chr7 (25-235)||(32041538-32041748)
chr7 (29-235)||(46134294-46134500)
chr7 (30-235)||(46891329-46891535)
chr7 (64-233)||(48865665-48865837)
chr7 (21-235)||(16894497-16894701)
chr7 (29-235)||(17753600-17753806)
chr7 (26-235)||(43021570-43021775)
chr7 (26-174)||(19828267-19828415)
chr7 (26-124)||(37704977-37705075)
chr7 (26-231)||(37005805-37006010)
chr7 (26-231)||(43405017-43405223)
chr7 (27-172)||(36849590-36849735)
chr7 (45-123)||(27691428-27691506)
chr7 (27-179)||(30075277-30075426)
chr7 (24-155)||(20163814-20163945)
chr7 (26-179)||(15655458-15655611)
chr7 (21-60)||(22032910-22032950)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (24-232)||(1579033-1579241)
chr5 (24-232)||(1605574-1605782)
chr5 (21-235)||(9008057-9008271)
chr5 (30-235)||(16069356-16069561)
chr5 (27-234)||(5202972-5203179)
chr5 (25-235)||(27679169-27679379)
chr5 (26-231)||(27420857-27421062)
chr5 (25-235)||(8374339-8374548)
chr5 (26-235)||(24105671-24105880)
chr5 (26-235)||(31883143-31883352)
chr5 (26-235)||(33491196-33491405)
chr5 (32-235)||(16737447-16737650)
chr5 (26-235)||(4120936-4121145)
chr5 (24-235)||(33991137-33991348)
chr5 (33-235)||(3386486-3386688)
chr5 (34-232)||(1165604-1165802)
chr5 (21-235)||(3921575-3921789)
chr5 (26-235)||(19358525-19358734)
chr5 (26-235)||(35782644-35782853)
chr5 (26-235)||(20992146-20992355)
chr5 (24-235)||(38598450-38598661)
chr5 (27-232)||(31410476-31410681)
chr5 (64-235)||(26602942-26603113)
chr5 (72-235)||(27025001-27025164)
chr5 (35-168)||(33284642-33284775)
chr5 (17-162)||(20992354-20992503)
chr5 (177-235)||(35420424-35420482)
chr5 (22-179)||(25634577-25634732)
chr5 (39-163)||(31638157-31638281)
chr5 (93-146)||(41818552-41818605)
chr5 (27-59)||(26603108-26603140)
[»] chr8 (41 HSPs)
chr8 (20-235)||(24113166-24113381)
chr8 (23-234)||(39218772-39218983)
chr8 (27-235)||(14422702-14422910)
chr8 (28-235)||(34842365-34842572)
chr8 (24-235)||(39206582-39206793)
chr8 (26-235)||(18594535-18594744)
chr8 (31-235)||(144397-144601)
chr8 (27-235)||(29938060-29938268)
chr8 (24-235)||(10836755-10836966)
chr8 (30-235)||(13110406-13110611)
chr8 (25-235)||(22260630-22260840)
chr8 (32-233)||(2042526-2042727)
chr8 (26-235)||(6144273-6144482)
chr8 (27-235)||(35118031-35118239)
chr8 (26-234)||(4035845-4036053)
chr8 (23-235)||(7791406-7791618)
chr8 (27-235)||(33278399-33278607)
chr8 (33-235)||(34679457-34679659)
chr8 (23-235)||(7774759-7774971)
chr8 (31-234)||(41575516-41575719)
chr8 (27-235)||(5320563-5320771)
chr8 (27-231)||(38167159-38167363)
chr8 (23-235)||(7811990-7812202)
chr8 (21-235)||(34998896-34999110)
chr8 (34-234)||(44804945-44805145)
chr8 (24-184)||(33287076-33287236)
chr8 (22-232)||(28639272-28639484)
chr8 (30-235)||(8021721-8021918)
chr8 (26-235)||(36491155-36491364)
chr8 (32-235)||(42571598-42571798)
chr8 (31-234)||(66180-66384)
chr8 (26-184)||(40117903-40118061)
chr8 (26-167)||(26783801-26783942)
chr8 (107-232)||(9807339-9807464)
chr8 (26-179)||(2322068-2322221)
chr8 (22-155)||(5005160-5005293)
chr8 (30-115)||(9806875-9806960)
chr8 (30-179)||(39220258-39220407)
chr8 (22-124)||(18683704-18683805)
chr8 (22-124)||(18729266-18729367)
chr8 (198-232)||(33287040-33287074)
[»] chr1 (48 HSPs)
chr1 (24-235)||(25897368-25897579)
chr1 (24-235)||(29288143-29288352)
chr1 (24-235)||(39260346-39260557)
chr1 (22-235)||(33510476-33510689)
chr1 (26-234)||(16052092-16052300)
chr1 (23-235)||(52753147-52753359)
chr1 (20-235)||(20089461-20089676)
chr1 (24-235)||(1168497-1168708)
chr1 (29-235)||(26663257-26663463)
chr1 (33-234)||(29078519-29078720)
chr1 (22-235)||(42370795-42371008)
chr1 (27-235)||(970524-970734)
chr1 (24-235)||(26580270-26580481)
chr1 (24-235)||(41928495-41928706)
chr1 (26-235)||(46409431-46409642)
chr1 (25-235)||(1940747-1940957)
chr1 (33-235)||(38829072-38829274)
chr1 (24-235)||(2347650-2347862)
chr1 (27-235)||(12682817-12683025)
chr1 (22-234)||(46760958-46761170)
chr1 (27-235)||(52696788-52696996)
chr1 (21-232)||(1170447-1170658)
chr1 (30-235)||(19715161-19715366)
chr1 (26-235)||(32671575-32671784)
chr1 (24-232)||(2473716-2473924)
chr1 (31-235)||(8120870-8121074)
chr1 (27-235)||(15203109-15203317)
chr1 (21-235)||(17591682-17591893)
chr1 (25-234)||(8079710-8079919)
chr1 (26-235)||(43905650-43905859)
chr1 (29-235)||(5215384-5215590)
chr1 (30-235)||(7145207-7145412)
chr1 (26-235)||(13996723-13996932)
chr1 (26-235)||(49146168-49146377)
chr1 (27-235)||(40092488-40092696)
chr1 (27-235)||(51359217-51359424)
chr1 (27-235)||(23498457-23498665)
chr1 (64-235)||(40149497-40149668)
chr1 (25-235)||(15554152-15554354)
chr1 (46-235)||(17587505-17587694)
chr1 (32-232)||(15717787-15717986)
chr1 (29-230)||(6765458-6765659)
chr1 (28-196)||(29695673-29695842)
chr1 (26-234)||(38171828-38172023)
chr1 (24-152)||(52086261-52086389)
chr1 (44-178)||(23322897-23323031)
chr1 (21-101)||(5675096-5675176)
chr1 (24-179)||(5217840-5217994)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (27-235)||(38055154-38055362)
chr4 (24-235)||(1756752-1756963)
chr4 (28-234)||(37968746-37968952)
chr4 (24-226)||(50055098-50055300)
chr4 (22-235)||(28032700-28032913)
chr4 (26-235)||(45424522-45424731)
chr4 (22-235)||(53717452-53717665)
chr4 (26-235)||(54189541-54189750)
chr4 (27-235)||(19913618-19913826)
chr4 (27-233)||(23776449-23776655)
chr4 (21-235)||(27488636-27488850)
chr4 (26-235)||(15241016-15241225)
chr4 (30-234)||(20877047-20877251)
chr4 (30-235)||(31969681-31969886)
chr4 (24-235)||(2481396-2481607)
chr4 (24-235)||(6611348-6611559)
chr4 (24-235)||(35490761-35490972)
chr4 (21-235)||(54412619-54412833)
chr4 (27-235)||(6688615-6688817)
chr4 (31-235)||(19164961-19165164)
chr4 (26-235)||(37464717-37464926)
chr4 (26-235)||(44784905-44785114)
chr4 (26-235)||(50353797-50354006)
chr4 (28-235)||(40428708-40428915)
chr4 (30-232)||(30423556-30423757)
chr4 (26-235)||(14987788-14987997)
chr4 (24-233)||(48909840-48910049)
chr4 (31-235)||(16700782-16700986)
chr4 (31-235)||(53875658-53875862)
chr4 (28-235)||(11639566-11639773)
chr4 (26-232)||(23704200-23704406)
chr4 (24-235)||(27536092-27536299)
chr4 (25-235)||(44379175-44379385)
chr4 (30-235)||(1617084-1617289)
chr4 (25-232)||(43289951-43290158)
chr4 (26-236)||(8932165-8932375)
chr4 (31-235)||(30171581-30171785)
chr4 (28-235)||(47632032-47632240)
chr4 (24-235)||(15669177-15669388)
chr4 (30-232)||(52139203-52139405)
chr4 (30-235)||(8591080-8591285)
chr4 (34-235)||(27583620-27583821)
chr4 (39-235)||(33703850-33704046)
chr4 (26-234)||(53353051-53353267)
chr4 (33-201)||(28360433-28360602)
chr4 (25-235)||(40680026-40680236)
chr4 (25-235)||(55344813-55345023)
chr4 (29-226)||(44375844-44376041)
chr4 (23-232)||(16703818-16704023)
chr4 (39-235)||(38071314-38071504)
chr4 (24-179)||(50053437-50053592)
chr4 (107-235)||(23269034-23269162)
chr4 (30-115)||(23265865-23265950)
chr4 (148-235)||(53408137-53408225)
chr4 (172-235)||(23261874-23261937)
chr4 (26-179)||(44548185-44548339)
chr4 (96-178)||(51780763-51780845)
chr4 (132-235)||(9595890-9595982)
chr4 (186-235)||(50055301-50055350)
chr4 (37-179)||(17493340-17493482)
chr4 (169-235)||(48748197-48748263)
chr4 (25-84)||(9595974-9596032)
chr4 (201-235)||(55344681-55344715)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (24-235)||(36699-36910)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (25-235)||(6086599-6086809)
chr6 (23-235)||(2837540-2837752)
chr6 (27-235)||(26946876-26947084)
chr6 (31-235)||(34887292-34887496)
chr6 (25-235)||(21893452-21893662)
chr6 (26-235)||(3347523-3347732)
chr6 (27-235)||(26704339-26704547)
chr6 (27-235)||(30691850-30692058)
chr6 (26-235)||(18613536-18613745)
chr6 (24-235)||(17261073-17261284)
chr6 (27-235)||(9459562-9459770)
chr6 (23-235)||(11167235-11167447)
chr6 (24-234)||(35198280-35198489)
chr6 (23-228)||(16307015-16307220)
chr6 (27-235)||(20726790-20726994)
chr6 (25-235)||(28199508-28199719)
chr6 (29-235)||(3955769-3955972)
chr6 (38-235)||(1153603-1153800)
chr6 (24-191)||(52832-52999)
chr6 (32-230)||(30698934-30699132)
chr6 (98-235)||(33464399-33464536)
chr6 (121-235)||(53001-53115)
chr6 (30-106)||(33463703-33463779)
chr6 (24-59)||(34800920-34800956)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (23-235)||(6174828-6175040)
chr2 (26-235)||(33906047-33906256)
chr2 (27-235)||(31517215-31517423)
chr2 (25-235)||(18806884-18807094)
chr2 (27-235)||(3873244-3873452)
chr2 (26-235)||(26323186-26323395)
chr2 (25-235)||(42937714-42937925)
chr2 (24-234)||(39635446-39635656)
chr2 (26-214)||(1108276-1108463)
chr2 (21-235)||(2178769-2178983)
chr2 (30-235)||(28329839-28330042)
chr2 (30-235)||(4016039-4016244)
chr2 (26-235)||(4232142-4232351)
chr2 (26-235)||(5733395-5733604)
chr2 (31-235)||(1482903-1483106)
chr2 (26-230)||(19901143-19901346)
chr2 (43-232)||(19383938-19384127)
chr2 (26-235)||(30270679-30270888)
chr2 (30-235)||(850997-851202)
chr2 (24-233)||(30420181-30420378)
chr2 (25-235)||(16588776-16588986)
chr2 (34-227)||(16066302-16066495)
chr2 (22-235)||(44947549-44947755)
chr2 (31-231)||(429817-430017)
chr2 (25-179)||(42446625-42446779)
chr2 (31-179)||(3585291-3585439)
chr2 (66-172)||(22101210-22101316)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (21-230)||(22956-23165)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (26-235)||(10234-10443)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (30-234)||(145246-145450)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (23-235)||(295-507)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (24-235)||(6-217)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (28-235)||(3708-3915)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (25-235)||(6-217)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 54534525 - 54534314
Alignment:
Q  22 atttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 121  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54534525 atttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 54534426  T
Q  122 tatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcc 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54534425 tatcatggttt-ataagctgcttatgccata-ttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcc 54534328  T
Q  222 ttcgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||||    
T  54534327 ttcgattctctctg 54534314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37698342 - 37698129
Alignment:
Q  22 atttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 121  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37698342 atttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 37698243  T
Q  122 tatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcc 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37698242 tatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 37698143  T
Q  222 ttcgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||||    
T  37698142 ttcgattctctctg 37698129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15520342 - 15520128
Alignment:
Q  21 gatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  15520342 gattaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataac 15520243  T
Q  121 ttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctc 220  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15520242 ttatcatcgtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 15520143  T
Q  221 cttcgattctctctg 235  Q
     ||||||||||||||    
T  15520142 attcgattctctctg 15520128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 29 - 235
Target Start/End: Original strand, 38856089 - 38856295
Alignment:
Q  29 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatg 128  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  38856089 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 38856188  T
Q  129 gtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgatt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  38856189 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgatt 38856288  T
Q  229 ctctctg 235  Q
     ||||||    
T  38856289 atctctg 38856295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 8042600 - 8042809
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8042600 aggccccgtttggatgggcttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtttatc 8042699  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8042700 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 8042799  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  8042800 attctctctg 8042809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Original strand, 25999382 - 25999590
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25999382 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 25999481  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  25999482 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcga 25999581  T
Q  227 ttctctctg 235  Q
    |||||||||    
T  25999582 ttctctctg 25999590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 42308100 - 42307892
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42308100 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggcgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 42308001  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  42308000 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcg 42307901  T
Q  226 attctctct 234  Q
    |||||||||    
T  42307900 attctctct 42307892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22175185 - 22174976
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22175185 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatc 22175086  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22175085 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 22174986  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  22174985 attctctctg 22174976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Original strand, 50528918 - 50529131
Alignment:
Q  22 atttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 121  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  50528918 atttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagct 50529017  T
Q  122 tatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcc 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  50529018 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctcc 50529117  T
Q  222 ttcgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||||    
T  50529118 ttcgattctctctg 50529131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25494479 - 25494271
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25494479 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 25494380  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25494379 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcctgcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcga 25494280  T
Q  227 ttctctctg 235  Q
    |||||||||    
T  25494279 ttctctctg 25494271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 46452357 - 46452149
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46452357 aggccccgtttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 46452258  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46452257 atagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctcaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 46452158  T
Q  226 attctctct 234  Q
    |||||||||    
T  46452157 attctctct 46452149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 33 - 235
Target Start/End: Original strand, 21581042 - 21581244
Alignment:
Q  33 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  21581042 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagttt 21581141  T
Q  133 cataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctct 232  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21581142 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacatccttcgattctct 21581241  T
Q  233 ctg 235  Q
    |||    
T  21581242 ctg 21581244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 30 - 230
Target Start/End: Original strand, 32244117 - 32244317
Alignment:
Q  30 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32244117 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 32244216  T
Q  130 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32244217 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 32244316  T
Q  230 t 230  Q
    |    
T  32244317 t 32244317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20842543 - 20842334
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  20842543 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatc 20842444  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20842443 atagtttcataagctgcttatatcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 20842344  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  20842343 attctctctg 20842334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 24 - 234
Target Start/End: Original strand, 15520627 - 15520837
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  15520627 ttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagctta 15520726  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15520727 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttttgtaacctcctt 15520826  T
Q  224 cgattctctct 234  Q
    |||||||||||    
T  15520827 cgattctctct 15520837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 24 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24835896 - 24835686
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24835896 ttaggccccgtttggattgatttattttgagcttatatagacttatcaactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagctta 24835797  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24835796 ttatagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaactcctt 24835697  T
Q  224 cgattctctct 234  Q
    ||||| |||||    
T  24835696 cgattatctct 24835686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 29445480 - 29445690
Alignment:
Q  25 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29445480 taggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 29445579  T
Q  125 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 224  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29445580 catagtttcataagctgtttatgccctattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 29445679  T
Q  225 gattctctctg 235  Q
     ||||| ||||    
T  29445680 cattctatctg 29445690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 54870370 - 54870160
Alignment:
Q  25 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54870370 taggccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 54870271  T
Q  125 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 224  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54870270 catcgtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 54870171  T
Q  225 gattctctctg 235  Q
    |||||| ||||    
T  54870170 gattctttctg 54870160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12117853 - 12117644
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12117853 aggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatc 12117754  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12117753 atagtttcataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcg 12117654  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  12117653 attctctctg 12117644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Original strand, 32359256 - 32359461
Alignment:
Q  30 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  32359256 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctatttccataagcttttataaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagtttatcatag 32359355  T
Q  130 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32359356 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 32359455  T
Q  230 tctctg 235  Q
    ||||||    
T  32359456 tctctg 32359461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Original strand, 35226438 - 35226649
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  35226438 ttaggccctgtttggattggcctattttgagcttatgtgggcttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaatcagctta 35226537  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35226538 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcctaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 35226637  T
Q  224 cgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||    
T  35226638 cgattctctctg 35226649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Original strand, 38933937 - 38934147
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  38933937 ttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgg-cttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagctta 38934035  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38934036 tcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagtctaaatttccagtttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 38934135  T
Q  224 cgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||    
T  38934136 cgattctctctg 38934147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 42105168 - 42104957
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  42105168 ttagaccccattaggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacatttttaaaggtgtttggataaaaaaataaaaatagttta 42105069  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42105068 tcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcatgcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 42104969  T
Q  224 cgattctctctg 235  Q
    |||||| |||||    
T  42104968 cgattccctctg 42104957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 234
Target Start/End: Original strand, 20699144 - 20699350
Alignment:
Q  28 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 127  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  20699144 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcat 20699243  T
Q  128 ggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgat 227  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  20699244 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttaggaatttttgtaacctccttcgat 20699343  T
Q  228 tctctct 234  Q
    |||||||    
T  20699344 tctctct 20699350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44609531 - 44609319
Alignment:
Q  23 tttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 122  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  44609531 tttagaccctgtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctacttgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagctt 44609432  T
Q  123 atcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 222  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  44609431 atcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctctt 44609332  T
Q  223 tcgattctctctg 235  Q
    |||||||||||||    
T  44609331 tcgattctctctg 44609319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Original strand, 2895179 - 2895391
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  2895179 ggccccatttgaattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaaattatca 2895278  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagct----tatgaatttatgtgacctcct 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||    
T  2895279 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatatatgaatttatataacctcct 2895378  T
Q  223 tcgattctctctg 235  Q
    |||||||||||||    
T  2895379 tcgattctctctg 2895391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 27 - 234
Target Start/End: Original strand, 26122808 - 26123015
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26122808 ggcccagtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctattcccatgagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatca 26122907  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||||||    
T  26122908 tagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaagtagcttatgaatttacgtaacattcttcga 26123007  T
Q  227 ttctctct 234  Q
    ||||||||    
T  26123008 ttctctct 26123015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 53028215 - 53028419
Alignment:
Q  23 tttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 122  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||        |||||||||||||||| ||    
T  53028215 tttaggccctgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagtctttttagaggt--------aaataaataaaaatagctt 53028306  T
Q  123 atcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 222  Q
    |||||  |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53028307 atcatattttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 53028406  T
Q  223 tcgattctctctg 235  Q
    |||||||||||||    
T  53028407 tcgattctctctg 53028419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 34700331 - 34700543
Alignment:
Q  23 tttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 122  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  34700331 tttaggccccgtttagattggtttattttgagcttatgtgggtttatttacttccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagctt 34700430  T
Q  123 atcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 222  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  34700431 atcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagtttaccctccggcttaagaagaagcttatgaatttatataacctcct 34700530  T
Q  223 tcgattctctctg 235  Q
    | |||| ||||||    
T  34700531 ttgattatctctg 34700543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 33 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 48925189 - 48924989
Alignment:
Q  33 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggttt 132  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48925189 gtttggattggcttatttagagtttatatgggtttatctacttccataagcttttttaaaagt--ttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 48925092  T
Q  133 cataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctct 232  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48925091 cataagctgtttatgtcatattttaataagtctaaatttttagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 48924992  T
Q  233 ctg 235  Q
    |||    
T  48924991 ctg 48924989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 54 - 234
Target Start/End: Original strand, 44688782 - 44688961
Alignment:
Q  54 gcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgcttatgccatat 153  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  44688782 gcttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatg-catat 44688880  T
Q  154 ttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctct 234  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  44688881 tttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgcaacctccttcgattctctct 44688961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 185
Target Start/End: Original strand, 35643212 - 35643369
Alignment:
Q  28 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35643212 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctacttccataagcctttttaaaggtgcttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 35643311  T
Q  128 ggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctcc 185  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35643312 agtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttgagcttaccctcc 35643369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 66 - 235
Target Start/End: Original strand, 16354379 - 16354548
Alignment:
Q  66 ttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcct 165  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  16354379 ttatctacactcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagtttcataagctgctaatgccatgttttaataagcct 16354478  T
Q  166 aaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 235  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  16354479 aaattttcagcttatcctcctgcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctgcgattatctctg 16354548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 33 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 50529961 - 50529827
Alignment:
Q  33 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggttt 132  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  50529961 gtttggattgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 50529862  T
Q  133 cataagctgcttatgccatatttcaataagcctaa 167  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  50529861 cataagctgcttatgccatattttaatgagcctaa 50529827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 56 - 232
Target Start/End: Original strand, 12915930 - 12916105
Alignment:
Q  56 ttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgcttatgccatattt 155  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||    
T  12915930 ttatgtgggcttatttactcc-ataaatctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcataatttcataaactgcttatgtcatattt 12916028  T
Q  156 caataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctct 232  Q
     ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  12916029 aaataagcttaagttttcagcttaccctccggtttaagaaagagtttatgaatttatgtaacccccttcgattctct 12916105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 161
Target Start/End: Original strand, 49128042 - 49128177
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  49128042 aggccccgtttggattgacttattttaaacttatgtgggcttatctactcctataagtctttttaaagatgtttgggtaaatcaataaaaataacttatc 49128141  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataa 161  Q
     |  ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  49128142 gtaatttcataagctgcttatgctatattttaataa 49128177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 147 - 234
Target Start/End: Original strand, 24366143 - 24366230
Alignment:
Q  147 gccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctct 234  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  24366143 gccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttagattctctct 24366230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 157 - 235
Target Start/End: Original strand, 13696917 - 13696995
Alignment:
Q  157 aataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  13696917 aataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttgtgtaacctcctttgattctctctg 13696995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 83
Target Start/End: Original strand, 24366085 - 24366142
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagc 83  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24366085 aggccccttttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagc 24366142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 50528916 - 50528868
Alignment:
Q  187 gcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  50528916 gcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctatctg 50528868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 60
Target Start/End: Original strand, 40240485 - 40240515
Alignment:
Q  30 cccgtttggattgacttattttgagcttatg 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40240485 cccgtttggattgacttattttgagcttatg 40240515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 6394748 - 6394957
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6394748 aggccccgtttagattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatc 6394847  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6394848 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagtttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 6394947  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  6394948 attctctctg 6394957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4477515 - 4477311
Alignment:
Q  31 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggt 130  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4477515 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatggt 4477416  T
Q  131 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattct 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4477415 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattct 4477316  T
Q  231 ctctg 235  Q
    |||||    
T  4477315 ctctg 4477311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43068172 - 43067963
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43068172 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 43068073  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43068072 atagtttcataagcttcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 43067973  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  43067972 attctctctg 43067963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Original strand, 7164176 - 7164390
Alignment:
Q  21 gatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 120  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7164176 gatttagaccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 7164275  T
Q  121 ttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctc 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7164276 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 7164375  T
Q  221 cttcgattctctctg 235  Q
     ||||||||| ||||    
T  7164376 tttcgattctatctg 7164390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24792532 - 24792322
Alignment:
Q  25 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24792532 taggccccgtttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 24792433  T
Q  125 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 224  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24792432 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 24792333  T
Q  225 gattctctctg 235  Q
    |||||||||||    
T  24792332 gattctctctg 24792322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Original strand, 5280861 - 5281066
Alignment:
Q  30 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5280861 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattcacataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 5280960  T
Q  130 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5280961 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 5281060  T
Q  230 tctctg 235  Q
    ||||||    
T  5281061 tctctg 5281066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30181223 - 30181014
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30181223 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 30181124  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  30181123 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacccccttcg 30181024  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  30181023 attctctctg 30181014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36891028 - 36890821
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36891028 aggccccgtttggattgacttattt-gagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 36890930  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36890929 atagtttcataagttgcttatgccatatttcaataagcctaagttttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 36890830  T
Q  226 attctctct 234  Q
    |||||||||    
T  36890829 attctctct 36890821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 20346487 - 20346694
Alignment:
Q  28 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 127  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20346487 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcat 20346586  T
Q  128 ggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgat 227  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20346587 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgaaacctccttcgat 20346686  T
Q  228 tctctctg 235  Q
    ||||||||    
T  20346687 tctctctg 20346694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 42204151 - 42204361
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataag-cttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  42204151 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttat 42204250  T
Q  125 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 224  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  42204251 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttc 42204350  T
Q  225 gattctctctg 235  Q
    |||||||||||    
T  42204351 gattctctctg 42204361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 3511314 - 3511527
Alignment:
Q  20 agatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 119  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3511314 agattaaggtcccgtttggattgtcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatagataaaaatag 3511413  T
Q  120 tttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacct 219  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3511414 cttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 3511513  T
Q  220 ccttcgattctctc 233  Q
    ||||||||||||||    
T  3511514 ccttcgattctctc 3511527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12101377 - 12101168
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12101377 aggccccatttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 12101278  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12101277 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctatggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 12101178  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  12101177 attctctctg 12101168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 42965195 - 42964986
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42965195 aggccccttttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 42965096  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42965095 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 42964996  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  42964995 attctctctg 42964986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22649892 - 22649684
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22649892 ggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 22649793  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22649792 taatttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcga 22649693  T
Q  227 ttctctctg 235  Q
    || ||||||    
T  22649692 ttttctctg 22649684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33359288 - 33359080
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33359288 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 33359189  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33359188 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 33359089  T
Q  227 ttctctctg 235  Q
    |||||||||    
T  33359088 ttctctctg 33359080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 32 - 235
Target Start/End: Original strand, 1803029 - 1803232
Alignment:
Q  32 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtt 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  1803029 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 1803128  T
Q  132 tcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctc 231  Q
    ||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1803129 tcataagctgcttatacgatattttattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 1803228  T
Q  232 tctg 235  Q
    ||||    
T  1803229 tctg 1803232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 933282 - 933491
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933282 aggccctgtttgaattggcttattttgagctcatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 933381  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  933382 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 933481  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    | ||||||||    
T  933482 aatctctctg 933491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 32 - 235
Target Start/End: Original strand, 38866547 - 38866750
Alignment:
Q  32 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtt 131  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38866547 cgtttggatcgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataattttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtt 38866646  T
Q  132 tcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctc 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  38866647 tcataagctgtttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattatc 38866746  T
Q  232 tctg 235  Q
    ||||    
T  38866747 tctg 38866750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 4347270 - 4347478
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  4347270 aggccccgtttggattgacttattttaagcttatgtgggcttatctactcccataaacttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttacc 4347369  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||     
T  4347370 atagtttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttaccctcgagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc-ccttct 4347468  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  4347469 attctctctg 4347478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Original strand, 9452591 - 9452796
Alignment:
Q  30 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  9452591 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctattctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatag 9452690  T
Q  130 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 229  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9452691 tttcataagctgtctatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacactccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 9452790  T
Q  230 tctctg 235  Q
    ||||||    
T  9452791 tctctg 9452796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 15655909 - 15656118
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  15655909 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatc 15656008  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15656009 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcg 15656108  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  15656109 attctctctg 15656118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 34 - 233
Target Start/End: Original strand, 43156718 - 43156917
Alignment:
Q  34 tttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttc 133  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  43156718 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 43156817  T
Q  134 ataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctc 233  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43156818 ataagctgtttatggcaaatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagaacttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 43156917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Original strand, 25748479 - 25748693
Alignment:
Q  21 gatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 120  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||| |  | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25748479 gattttggccccgtttggattggcttaagttgagcttatattagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 25748578  T
Q  121 ttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctc 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25748579 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 25748678  T
Q  221 cttcgattctctctg 235  Q
    |||||||| ||||||    
T  25748679 cttcgattatctctg 25748693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33846724 - 33846519
Alignment:
Q  25 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 124  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33846724 taggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 33846625  T
Q  125 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 224  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33846624 catagtttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagctta-----gggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 33846530  T
Q  225 gattctctctg 235  Q
    |||||||||||    
T  33846529 gattctctctg 33846519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Original strand, 42673457 - 42673667
Alignment:
Q  21 gatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 120  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    || ||     
T  42673457 gatttatgctccgtttggattgacttatttggagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaa----aacagc 42673552  T
Q  121 ttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctc 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42673553 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 42673652  T
Q  221 cttcgattctctctg 235  Q
    |||||||||||||||    
T  42673653 cttcgattctctctg 42673667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12097788 - 12097580
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12097788 ggccccatttggattggcttaagttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatca 12097689  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12097688 tagtttcataagctacttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 12097589  T
Q  227 ttctctctg 235  Q
    |||||||||    
T  12097588 ttctctctg 12097580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 8630665 - 8630872
Alignment:
Q  28 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 127  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8630665 gccccgtttggatttgtttattttgaggttatgtgggttgatctactcccataagcctttttaaaggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcat 8630764  T
Q  128 ggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgat 227  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  8630765 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaatccccttcgat 8630864  T
Q  228 tctctctg 235  Q
    ||||||||    
T  8630865 tctctctg 8630872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 32041538 - 32041748
Alignment:
Q  25 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32041538 taggccccgtttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 32041637  T
Q  125 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 224  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||    
T  32041638 catagtttcataagctgcttatgtcatattttcataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttataaatttatgtaaccttattc 32041737  T
Q  225 gattctctctg 235  Q
    |||||||||||    
T  32041738 gattctctctg 32041748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 46134500 - 46134294
Alignment:
Q  29 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatg 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  46134500 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcctataactctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttattata 46134401  T
Q  129 gtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgatt 228  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  46134400 gtttcataagctgtttacgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttattaatttatgtaacctcattcgatt 46134301  T
Q  229 ctctctg 235  Q
    |||||||    
T  46134300 ctctctg 46134294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 46891535 - 46891329
Alignment:
Q  30 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagc-ttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatg 128  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  46891535 cccgtttggattggcttattttgagcttatataggcttatctactcctataaaccttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttgtcata 46891436  T
Q  129 gtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgatt 228  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  46891435 gttttataagctgcttatgtcatattttaattagcctaaattttcagcttacccttcagcttaacaaggagcttatgagtttatgtaacctccttcgatt 46891336  T
Q  229 ctctctg 235  Q
     ||||||    
T  46891335 gtctctg 46891329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Original strand, 48865665 - 48865837
Alignment:
Q  64 gcttatctactcccataagc---ttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaata 160  Q
    ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48865665 gcttatctacttccataagccttttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 48865764  T
Q  161 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctc 233  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48865765 agcctaaattttcagcttaacatcaggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 48865837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16894701 - 16894497
Alignment:
Q  21 gatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  16894701 gattaaggccccgtttggattggcttattttgagc----------ttatctactcccataagcttttttaaaggtatttgggtaaacaaataaaaatagt 16894612  T
Q  121 ttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctc 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  16894611 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcaacttaacagggagcttatgaatttatgtaacatc 16894512  T
Q  221 cttcgattctctctg 235  Q
    |||||||||| ||||    
T  16894511 cttcgattctttctg 16894497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 235
Target Start/End: Original strand, 17753600 - 17753806
Alignment:
Q  29 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatg 128  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  17753600 ccccgtttggattagcttattttgagcttatacaagcttatctactcctataagccttttagaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttaacata 17753699  T
Q  129 gtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgatt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  17753700 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttacccttcaacttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcgatt 17753799  T
Q  229 ctctctg 235  Q
    |||||||    
T  17753800 ctctctg 17753806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43021775 - 43021570
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  43021775 aggccccatttggattggcttattttaagtttatgtggacttatctacttcaataagtctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaataacttatt 43021676  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||     | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43021675 atagtttcataagctgcttatggcatatttc----ggtctaaattttcagcttactctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 43021580  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  43021579 attctctctg 43021570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 174
Target Start/End: Original strand, 19828267 - 19828415
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19828267 aggccccgtttgaattggcttattttgagtttatgttggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaatagcttatc 19828366  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttca 174  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  19828367 atagtttcataaattgcttatgccatattttaataagccaaaattttca 19828415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 124
Target Start/End: Original strand, 37704977 - 37705075
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37704977 aggccccgtttgggttgacttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 37705075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37006010 - 37005805
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  37006010 aggctccgtttggattggcttattttaagcttatgtgagtttatctacttctataagtttttttaaaggcgtttgggtaaatcagtaaaaatagcttatc 37005911  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttat-gaatttatgtgacctccttc 224  Q
     |  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||| |||||| |    |||||| || ||||||||| ||||| | | ||||||||||    
T  37005910 gtaatttcataagctgcttatgctatattttaataaggctaattttttagcttaacacaaggcttatcacggagcttatggaattcaag-gacctccttc 37005812  T
Q  225 gattctc 231  Q
    |||||||    
T  37005811 gattctc 37005805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 231
Target Start/End: Original strand, 43405017 - 43405223
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  43405017 aggccccgtttgaattgacttattttaagcttatgttggcttatctactcctataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatc 43405116  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttat-gaatttatgtgacctccttc 224  Q
     |  ||||||||| || || | | |||||| |||||||| || |||| |||||| |    |||||| || ||||||||| ||||| | | ||||||||||    
T  43405117 gtaatttcataagttgtttctactatattttaataagcccaattttttagcttaacacaaggcttatcacggagcttatggaattcaagggacctccttc 43405216  T
Q  225 gattctc 231  Q
    |||||||    
T  43405217 gattctc 43405223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 36849735 - 36849590
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||  |||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||  || ||||||    
T  36849735 ggccccgtttggattgacttattcgaagcttatgtgggtttgtctactaacatatgtttttttaaaggtgtttggataaatcaataaaatcagcttatca 36849636  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaatttt 172  Q
       |||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||  |||||||    
T  36849635 caatttcataaactgtttatgtcatattttaataagctcaaatttt 36849590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 27691506 - 27691428
Alignment:
Q  45 ttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27691506 ttattttgaatttatatgggcttatctactcccataaatctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatatttta 27691428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 30075426 - 30075277
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||  |||||||  ||| | |   |||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  30075426 ggccccgtttggattgacttattttaagcttatgtgagtttatctactaacataagccctttcagatacgtttgggtaaat-aataaaaatagcttat-a 30075329  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagctta 179  Q
    |  |||||||| | |||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||    
T  30075328 t-atttcataaaccgcttataccatattttaataagccataattttgagctta 30075277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 155
Target Start/End: Original strand, 20163814 - 20163945
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||   ||||| | ||| | || | |||||||| ||| ||| ||||||| |||    
T  20163814 ttaggccctttttggattgacttattttgggcttatatgagcttatttaccaacataatcctttgtgaatgcgtttgggtgaattaattaaaatagctta 20163913  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatattt 155  Q
    |||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  20163914 tcacagtttcataagctgcttatagcatattt 20163945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15655611 - 15655458
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||| |||| ||||||  ||||||  ||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  15655611 aggccgcgtttggattggcttattctaaacttatgtgagcttgtctactaacataagtctttttaaaactatttggataaatcaataaaaatagcttacc 15655512  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagctta 179  Q
    |   ||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||||| ||||||    
T  15655511 acaattttataaactgcttataccaaattttaataagctcaaattttgagctta 15655458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 22032950 - 22032910
Alignment:
Q  21 gatttaggccccgtttggattga-cttattttgagcttatg 60  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22032950 gatttaggccccgtttggattgagcttattttgagcttatg 22032910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 24 - 232
Target Start/End: Original strand, 1579033 - 1579241
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1579033 ttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 1579132  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1579133 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 1579232  T
Q  224 cgattctct 232  Q
    |||||||||    
T  1579233 cgattctct 1579241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 24 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1605782 - 1605574
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1605782 ttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 1605683  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1605682 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 1605583  T
Q  224 cgattctct 232  Q
    |||||||||    
T  1605582 cgattctct 1605574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9008271 - 9008057
Alignment:
Q  21 gatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9008271 gattaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 9008172  T
Q  121 ttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctc 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  9008171 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctt 9008072  T
Q  221 cttcgattctctctg 235  Q
    |||||||||||||||    
T  9008071 cttcgattctctctg 9008057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Original strand, 16069356 - 16069561
Alignment:
Q  30 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16069356 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatag 16069455  T
Q  130 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16069456 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 16069555  T
Q  230 tctctg 235  Q
    ||||||    
T  16069556 tctctg 16069561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 27 - 234
Target Start/End: Original strand, 5202972 - 5203179
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5202972 ggccccgtttggattgacttattttgagtttatgttggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 5203071  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  5203072 tagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtcaccttcttcga 5203171  T
Q  227 ttctctct 234  Q
    ||||||||    
T  5203172 ttctctct 5203179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27679379 - 27679169
Alignment:
Q  25 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 124  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27679379 taggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 27679280  T
Q  125 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 224  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  27679279 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttc 27679180  T
Q  225 gattctctctg 235  Q
    |||||||||||    
T  27679179 gattctctctg 27679169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 231
Target Start/End: Original strand, 27420857 - 27421062
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27420857 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagtttatc 27420956  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27420957 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcg 27421056  T
Q  226 attctc 231  Q
    ||||||    
T  27421057 attctc 27421062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8374548 - 8374339
Alignment:
Q  25 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 124  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8374548 taggccccgtttggattgccttattttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 8374449  T
Q  125 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 224  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  8374448 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatg-atttatgtaacctccttc 8374350  T
Q  225 gattctctctg 235  Q
    |||||||||||    
T  8374349 gattctctctg 8374339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24105880 - 24105671
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24105880 aggctccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 24105781  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24105780 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattatcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 24105681  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  24105680 attctctctg 24105671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 31883143 - 31883352
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31883143 aggctccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 31883242  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31883243 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 31883342  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  31883343 attctctctg 31883352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33491405 - 33491196
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33491405 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 33491306  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33491305 atagtttcataagctgcttttgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 33491206  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  33491205 attctctctg 33491196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 32 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16737650 - 16737447
Alignment:
Q  32 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtt 131  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  16737650 cgtttgaattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 16737551  T
Q  132 tcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16737550 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 16737451  T
Q  232 tctg 235  Q
    ||||    
T  16737450 tctg 16737447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 4120936 - 4121145
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4120936 aggccccgtttggaatggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcccttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaataatttatc 4121035  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  4121036 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttg 4121135  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  4121136 attctctctg 4121145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Original strand, 33991137 - 33991348
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33991137 ttaggccccgtttgaattgacttattttgagtttatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 33991236  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  33991237 tcatagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcatt 33991336  T
Q  224 cgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||    
T  33991337 cgattctctctg 33991348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 33 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3386688 - 3386486
Alignment:
Q  33 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggttt 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3386688 gtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 3386589  T
Q  133 cataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctct 232  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  3386588 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcctatgaatttatgtaacctccttcgattatct 3386489  T
Q  233 ctg 235  Q
    |||    
T  3386488 ctg 3386486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 34 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1165802 - 1165604
Alignment:
Q  34 tttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  1165802 tttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 1165703  T
Q  134 ataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctct 232  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1165702 ataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 1165604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Original strand, 3921575 - 3921789
Alignment:
Q  21 gatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 120  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  3921575 gattaaggtcccgtttggattgatttattttgagtttatatgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagc 3921674  T
Q  121 ttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctc 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  3921675 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaaaaaggagcttatgaatttatgtaacctc 3921774  T
Q  221 cttcgattctctctg 235  Q
    |||||||||||||||    
T  3921775 cttcgattctctctg 3921789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 19358525 - 19358734
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19358525 aggccccgtttggattgccttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 19358624  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  19358625 atagtttcataagctgcttatgccatattttagtaagcctaaattttcagcttaccctccaacttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcg 19358724  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  19358725 attctctctg 19358734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35782853 - 35782644
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35782853 aggccccgtttggattgccttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 35782754  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccg-gcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 224  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  35782753 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcctaccctccgtgctta-caaggagcttatgaatttatgtaacctcattc 35782655  T
Q  225 gattctctctg 235  Q
    |||||||||||    
T  35782654 gattctctctg 35782644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20992355 - 20992146
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  20992355 aggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtggtcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcatatc 20992256  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20992255 atagtttcataagctgattatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacccccttcg 20992156  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  20992155 attctctctg 20992146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 38598661 - 38598450
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  38598661 ttaggcccggtttggattggcttactttgaacttatgtgagcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataagtaaaaatagctta 38598562  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  38598561 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttctt 38598462  T
Q  224 cgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||    
T  38598461 cgattctctctg 38598450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 232
Target Start/End: Original strand, 31410476 - 31410681
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  31410476 ggccgcgtttggattgatttattttgagtttatatgggtttatctacccccataagtctttttaaaggtgtttgagtaaacaaataaaaatagcttatca 31410575  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31410576 tagttttataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtgacctccttcga 31410675  T
Q  227 ttctct 232  Q
    ||||||    
T  31410676 ttctct 31410681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 64 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26603113 - 26602942
Alignment:
Q  64 gcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagc 163  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  26603113 gcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataaactgcttatgccatattttaataagc 26603014  T
Q  164 ctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 235  Q
     ||| ||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26603013 ataatttttcagtttactctctggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattctctctg 26602942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 235
Target Start/End: Original strand, 27025001 - 27025164
Alignment:
Q  72 actcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattt 171  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27025001 actcccataagactttttaaagatgttcgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccattttttaataagcctaaattt 27025100  T
Q  172 tcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27025101 tcagcttaccctccggcttaacaaggagtttataaatttatgtaacctccttcgattctctctg 27025164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 35 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 33284775 - 33284642
Alignment:
Q  35 ttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  33284775 ttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttaagtaaataaataaaaatagcttatcatagtttta 33284676  T
Q  135 taagctgcttatgccatatttcaataagcctaaa 168  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33284675 taaactgcttataccatatttcaataagcctaaa 33284642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20992503 - 20992354
Alignment:
Q  17 acaagatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgt----gggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaata 112  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20992503 acaacattaaggccctgtttggattggcttattttgagcttatgtacatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaata 20992404  T
Q  113 aaaatagtttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataag 162  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20992403 aaaatagcatatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataag 20992354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35420482 - 35420424
Alignment:
Q  177 ttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35420482 ttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 35420424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 179
Target Start/End: Original strand, 25634577 - 25634732
Alignment:
Q  22 atttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 121  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | | |||||||||  |||||||| ||| |||   ||||||||||||||   ||||||| |    
T  25634577 atttaggccccgtttagattggcttattttaagcttatgagagtttatctactaacataagctctttcaaatacgtttgggtaaataa--taaaatagct 25634674  T
Q  122 tatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagctta 179  Q
    ||| |   |||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||  |||||| ||||||    
T  25634675 tataacaatttcataagccgcttataccatattttaataaaccataattttgagctta 25634732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 163
Target Start/End: Original strand, 31638157 - 31638281
Alignment:
Q  39 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataag 138  Q
    |||||||||||||  | ||||||| ||||| |||||  ||||||| ||| |||| |||||||| |||||  |||||||||  ||||||   ||| |||||    
T  31638157 attgacttattttatgtttatgtgagcttacctactaacataagcctttgtaaaagtgtttggataaatcgataaaaataacttatcacaattttataag 31638256  T
Q  139 ctgcttatgccatatttcaataagc 163  Q
    || |||||| ||||||| |||||||    
T  31638257 cttcttatgtcatattttaataagc 31638281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 93 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 41818605 - 41818552
Alignment:
Q  93 ggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgcttat 146  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||    
T  41818605 ggtgtttaggtaaattaataaaaatagcttatcatatttttataagctgcttat 41818552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 26603140 - 26603108
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttat 59  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26603140 ggccccgtttggattggcttattttgagcttat 26603108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 41)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24113381 - 24113166
Alignment:
Q  20 agatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24113381 agatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaccctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacag 24113282  T
Q  120 tttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacct 219  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24113281 attatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 24113182  T
Q  220 ccttcgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  24113181 ccttcgattctctctg 24113166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 23 - 234
Target Start/End: Original strand, 39218772 - 39218983
Alignment:
Q  23 tttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39218772 tttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatggttt 39218871  T
Q  123 atcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 222  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39218872 atcatagcttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagctgatgaatttatgtgacctcct 39218971  T
Q  223 tcgattctctct 234  Q
    ||||||||||||    
T  39218972 tcgattctctct 39218983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Original strand, 14422702 - 14422910
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14422702 ggccccgtttggattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 14422801  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14422802 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 14422901  T
Q  227 ttctctctg 235  Q
    |||||||||    
T  14422902 ttctctctg 14422910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34842572 - 34842365
Alignment:
Q  28 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 127  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34842572 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 34842473  T
Q  128 ggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgat 227  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34842472 agtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaatttccagcttacccaccgtcttaacaaggagcttattaatttatgtgacctccttcgat 34842373  T
Q  228 tctctctg 235  Q
    ||||||||    
T  34842372 tctctctg 34842365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Original strand, 39206582 - 39206793
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39206582 ttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 39206681  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39206682 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 39206781  T
Q  224 cgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||    
T  39206782 cgattctctctg 39206793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 18594535 - 18594744
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18594535 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 18594634  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18594635 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 18594734  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  18594735 attctctctg 18594744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Original strand, 144397 - 144601
Alignment:
Q  31 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  144397 ccgtttggattgacttattttgagcatatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagtttatcatagt 144496  T
Q  131 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattct 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  144497 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 144596  T
Q  231 ctctg 235  Q
    |||||    
T  144597 ctctg 144601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Original strand, 29938060 - 29938268
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  29938060 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatca 29938159  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29938160 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 29938259  T
Q  227 ttctctctg 235  Q
    |||||||||    
T  29938260 ttctctctg 29938268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10836966 - 10836755
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10836966 ttaggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 10836867  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  10836866 tcatagtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcttt 10836767  T
Q  224 cgattctctctg 235  Q
    ||||| ||||||    
T  10836766 cgattatctctg 10836755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Original strand, 13110406 - 13110611
Alignment:
Q  30 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  13110406 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatatgcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 13110505  T
Q  130 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 229  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13110506 tttaataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgagtttatgtaacctccttcgattc 13110605  T
Q  230 tctctg 235  Q
    ||||||    
T  13110606 tctctg 13110611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22260840 - 22260630
Alignment:
Q  25 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22260840 taggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttat 22260741  T
Q  125 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 224  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22260740 cctagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 22260641  T
Q  225 gattctctctg 235  Q
    |||||||||||    
T  22260640 gattctctctg 22260630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 32 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2042727 - 2042526
Alignment:
Q  32 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtt 131  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  2042727 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtt 2042628  T
Q  132 tcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctc 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2042627 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 2042528  T
Q  232 tc 233  Q
    ||    
T  2042527 tc 2042526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6144482 - 6144273
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6144482 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccatatgcctttttaacagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 6144383  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6144382 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 6144283  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  6144282 attctctctg 6144273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35118239 - 35118031
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35118239 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 35118140  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  35118139 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcattcga 35118040  T
Q  227 ttctctctg 235  Q
    |||||||||    
T  35118039 ttctctctg 35118031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Original strand, 4035845 - 4036053
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4035845 aggccccgtttggattggtttatttttagcttatatgggcttatctactcccataagttttattaaaggtgtttgggtaaacaaataaaaatagcttatc 4035944  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4035945 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 4036044  T
Q  226 attctctct 234  Q
    |||||||||    
T  4036045 attctctct 4036053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 7791406 - 7791618
Alignment:
Q  23 tttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 122  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7791406 tttagaccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagatt 7791505  T
Q  123 atcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 222  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7791506 atcatagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaactttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 7791605  T
Q  223 tcgattctctctg 235  Q
    |||||||||||||    
T  7791606 tcgattctctctg 7791618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Original strand, 33278399 - 33278607
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33278399 ggccccgtttggattggcttattttgagtttatatggacttatctactttcataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatca 33278498  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33278499 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 33278598  T
Q  227 ttctctctg 235  Q
    |||||||||    
T  33278599 ttctctctg 33278607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 33 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34679659 - 34679457
Alignment:
Q  33 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggttt 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34679659 gtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgaataaataaataaaaatagtttatcatagttt 34679560  T
Q  133 cataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctct 232  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  34679559 cataagctgcttataccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattcttt 34679460  T
Q  233 ctg 235  Q
    |||    
T  34679459 ctg 34679457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 7774759 - 7774971
Alignment:
Q  23 tttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 122  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7774759 tttaggcctcgtttagattggcttattttgagcttatgcgggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagatt 7774858  T
Q  123 atcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 222  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7774859 atcatagtttcataagctgcttatgtcatattttattaagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 7774958  T
Q  223 tcgattctctctg 235  Q
    |||||||||||||    
T  7774959 tcgattctctctg 7774971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 234
Target Start/End: Original strand, 41575516 - 41575719
Alignment:
Q  31 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggt 130  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  41575516 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtagacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaattgcttatcatagt 41575615  T
Q  131 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattct 230  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  41575616 ttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattct 41575715  T
Q  231 ctct 234  Q
    ||||    
T  41575716 ctct 41575719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Original strand, 5320563 - 5320771
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  5320563 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaagttgttttggtaaataaataaaaataatttatca 5320662  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    | |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5320663 tagtttcataagttgcttatgtcatgtttcaataagcctaaattttcaacttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 5320762  T
Q  227 ttctctctg 235  Q
    |||||||||    
T  5320763 ttctctctg 5320771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38167363 - 38167159
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38167363 ggccctgtttggattggcctattttgagtttatgtgggcttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaactagtttatca 38167264  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38167263 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcga 38167164  T
Q  227 ttctc 231  Q
    |||||    
T  38167163 ttctc 38167159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 7811990 - 7812202
Alignment:
Q  23 tttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 122  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7811990 tttaggccccgttttgattggcttattttgagtttatgtgagtttatctacttccattagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagatt 7812089  T
Q  123 atcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 222  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  7812090 atcatagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaattttcagcttactctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcat 7812189  T
Q  223 tcgattctctctg 235  Q
    |||||||||||||    
T  7812190 tcgattctctctg 7812202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34999110 - 34998896
Alignment:
Q  21 gatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 120  Q
    |||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34999110 gattaaggtcccgtatggattggcttattttgagcttatacgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 34999011  T
Q  121 ttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctc 220  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    
T  34999010 ttatcttagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttgccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatttaatctc 34998911  T
Q  221 cttcgattctctctg 235  Q
    |||||||||||||||    
T  34998910 cttcgattctctctg 34998896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 34 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44805145 - 44804945
Alignment:
Q  34 tttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttc 133  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  44805145 tttgaattggcttattttgagcttatgtaggtttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttagataaataaataaaaatagcttatcatagtttc 44805046  T
Q  134 ataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctc 233  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44805045 ataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 44804946  T
Q  234 t 234  Q
    |    
T  44804945 t 44804945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 33287236 - 33287076
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33287236 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccatatgcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagttta 33287137  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctc 184  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33287136 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctc 33287076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 22 - 232
Target Start/End: Original strand, 28639272 - 28639484
Alignment:
Q  22 atttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccata----agcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaat 117  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28639272 atttaggtcccgtttgaattggcttattttaagcttatgtgagcttatctactcctatatacaagcttttttaaaggtgttttggtaaataaataaaaat 28639371  T
Q  118 agtttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgac 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||    
T  28639372 agtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacatagagcttatga--ttatgtaac 28639469  T
Q  218 ctccttcgattctct 232  Q
    |||||||||||||||    
T  28639470 ctccttcgattctct 28639484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Original strand, 8021721 - 8021918
Alignment:
Q  30 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 129  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8021721 cccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 8021820  T
Q  130 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||    
T  8021821 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttca--------tccggcttaacaaggagcttatgagtttatataacctacttcgattc 8021912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 36491155 - 36491364
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  36491155 aggccccatttggattggcttattttaagcttatgtgggattatctaatcgcataagtctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatc 36491254  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || |||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  36491255 atagtttcataacttgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctctttcg 36491354  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  36491355 attctctctg 36491364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 32 - 235
Target Start/End: Original strand, 42571598 - 42571798
Alignment:
Q  32 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtt 131  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  42571598 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaat-aataaaaatagcttatcatagtt 42571696  T
Q  132 tcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctc 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  42571697 tcataagctgcttatgtcatatttcaat--gcctaaatttttagcttacccttcggcttaacaaggaacttatgaatttatgcaacctctttcgattctc 42571794  T
Q  232 tctg 235  Q
    ||||    
T  42571795 tctg 42571798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 66384 - 66180
Alignment:
Q  31 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggt 130  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| || ||    
T  66384 ccgtttagattggcttattttgagtttctgtaggcttatctattcccatatgtctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaataacttataatagt 66285  T
Q  131 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccc-tccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  66284 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagtttaaattttcagcttaccctttcggcttaacaaggagcttatgaatttacgtgacctccttcgattc 66185  T
Q  230 tctct 234  Q
    |||||    
T  66184 tctct 66180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 40118061 - 40117903
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40118061 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 40117962  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctc 184  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40117961 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcttaaattttcagcttaccctc 40117903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 26783942 - 26783801
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  26783942 aggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatc 26783843  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaa 167  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26783842 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaa 26783801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 107 - 232
Target Start/End: Original strand, 9807339 - 9807464
Alignment:
Q  107 taaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatga 206  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9807339 taaataaaaatagcttatcatagcttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatga 9807438  T
Q  207 atttatgtgacctccttcgattctct 232  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||    
T  9807439 atttatgaaacctccttcgtttctct 9807464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2322221 - 2322068
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  2322221 aggccccgtttggattggcttattcggagcttatatggatttatctactaacataagcttttttaaaggtgtttgggtaaatcaataaaaacagcttatc 2322122  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagctta 179  Q
    |   |||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  2322121 acaatttcataagctgcttatatcatattttgataagcctaaattttaagctta 2322068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 155
Target Start/End: Original strand, 5005160 - 5005293
Alignment:
Q  22 atttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 121  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  5005160 atttaggtcctgtttggattggcttatcttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagct 5005259  T
Q  122 tatcatggtttcataagctgcttatgccatattt 155  Q
    |||  |  | |||||| |||||||||| ||||||    
T  5005260 tatgctactctcataaactgcttatgctatattt 5005293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 9806875 - 9806960
Alignment:
Q  30 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9806875 cccgtttggattgacttattttgagtttatatgtgcttatctactcccatatgcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaa 9806960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 179
Target Start/End: Original strand, 39220258 - 39220407
Alignment:
Q  30 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||||| |  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||         
T  39220258 cccgtttgaattgacttattttgagcttatatgaacttatctacatccatatgtctttttaaaggtgtttgagtaaatcaataaaaatagcttattccaa 39220357  T
Q  130 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagctta 179  Q
    |||||||||||||| || | |||||| |||||||  ||||||| ||||||    
T  39220358 tttcataagctgctcatactatattttaataagctcaaattttgagctta 39220407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 124
Target Start/End: Original strand, 18683704 - 18683805
Alignment:
Q  22 atttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 121  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||  |||||||| ||| |||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  18683704 atttaagcctcgtttggactgacttattttaagcttattggagcttatctactaacataagctctttcaaatacgtttgggtaaat-aataaaaatagtt 18683802  T
Q  122 tat 124  Q
    |||    
T  18683803 tat 18683805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 124
Target Start/End: Original strand, 18729266 - 18729367
Alignment:
Q  22 atttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 121  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||  |||||||| ||| |||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  18729266 atttaagcctcgtttggactgacttattttaagcttattggagcttatctactaacataagctctttcaaatacgtttgggtaaat-aataaaaatagtt 18729364  T
Q  122 tat 124  Q
    |||    
T  18729365 tat 18729367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33287074 - 33287040
Alignment:
Q  198 agcttatgaatttatgtgacctccttcgattctct 232  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33287074 agcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 33287040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 48)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Original strand, 25897368 - 25897579
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25897368 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcatatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 25897467  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25897468 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 25897567  T
Q  224 cgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||    
T  25897568 cgattctctctg 25897579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Original strand, 29288143 - 29288352
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29288143 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 29288242  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  29288243 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaa--tatgtaacctcctt 29288340  T
Q  224 cgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||    
T  29288341 cgattctctctg 29288352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39260557 - 39260346
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39260557 ttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 39260458  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39260457 tcatagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 39260358  T
Q  224 cgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||    
T  39260357 cgattctctctg 39260346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Original strand, 33510476 - 33510689
Alignment:
Q  22 atttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 121  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33510476 atttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtt 33510575  T
Q  122 tatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcc 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33510576 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 33510675  T
Q  222 ttcgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||||    
T  33510676 ttcgattctctctg 33510689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Original strand, 16052092 - 16052300
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16052092 aggccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 16052191  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16052192 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctgaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 16052291  T
Q  226 attctctct 234  Q
    |||||||||    
T  16052292 attctctct 16052300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 52753359 - 52753147
Alignment:
Q  23 tttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52753359 tttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctt 52753260  T
Q  123 atcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 222  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52753259 atcatagtttcataagctacttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 52753160  T
Q  223 tcgattctctctg 235  Q
    |||||||||||||    
T  52753159 tcgattctctctg 52753147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 20089461 - 20089676
Alignment:
Q  20 agatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20089461 agattaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatag 20089560  T
Q  120 tttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacct 219  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20089561 cttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 20089660  T
Q  220 ccttcgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  20089661 ccttcgattctctctg 20089676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Original strand, 1168497 - 1168708
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1168497 ttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 1168596  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  1168597 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctcctt 1168696  T
Q  224 cgattctctctg 235  Q
     |||||||||||    
T  1168697 tgattctctctg 1168708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 235
Target Start/End: Original strand, 26663257 - 26663463
Alignment:
Q  29 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatg 128  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  26663257 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcata 26663356  T
Q  129 gtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgatt 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26663357 gtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 26663456  T
Q  229 ctctctg 235  Q
    |||||||    
T  26663457 ctctctg 26663463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 33 - 234
Target Start/End: Original strand, 29078519 - 29078720
Alignment:
Q  33 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggttt 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  29078519 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 29078618  T
Q  133 cataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctct 232  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29078619 cataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 29078718  T
Q  233 ct 234  Q
    ||    
T  29078719 ct 29078720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 42371008 - 42370795
Alignment:
Q  22 atttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  42371008 attttggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaact 42370909  T
Q  122 tatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcc 221  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42370908 tatcatagtttcataagctgcttgtgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 42370809  T
Q  222 ttcgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||||    
T  42370808 ttcgattctctctg 42370795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 970734 - 970524
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc- 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  970734 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatca 970635  T
Q  126 -atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 224  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  970634 tatagtttcataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttc 970535  T
Q  225 gattctctctg 235  Q
    |||||||||||    
T  970534 gattctctctg 970524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26580481 - 26580270
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  26580481 ttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagctta 26580382  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26580381 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 26580282  T
Q  224 cgattctctctg 235  Q
    ||||| ||||||    
T  26580281 cgattatctctg 26580270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41928706 - 41928495
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41928706 ttaggccccgtttggattggcttattttgaacttatgtggacttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 41928607  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  41928606 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttctt 41928507  T
Q  224 cgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||    
T  41928506 cgattctctctg 41928495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 46409431 - 46409642
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46409431 aggctccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctaatctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 46409530  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggc--ttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46409531 atagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttacccttcgacaattaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 46409630  T
Q  224 cgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||    
T  46409631 cgattctctctg 46409642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1940957 - 1940747
Alignment:
Q  25 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 124  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1940957 taggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 1940858  T
Q  125 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 224  Q
    ||| |||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1940857 catagtttcataagttgtttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 1940758  T
Q  225 gattctctctg 235  Q
     ||||||||||    
T  1940757 aattctctctg 1940747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 33 - 235
Target Start/End: Original strand, 38829072 - 38829274
Alignment:
Q  33 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggttt 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  38829072 gtttggattggcttattttgagcttatgtcggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 38829171  T
Q  133 cataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctct 232  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  38829172 cataagctgcttgtgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccatcgattctct 38829271  T
Q  233 ctg 235  Q
    |||    
T  38829272 ctg 38829274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Original strand, 2347650 - 2347862
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2347650 ttaggccccgtttggatttgtttattttgagtttatgcgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 2347749  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccata-tttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  2347750 tcatagtttcataagctgcttatgtcatatttttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctcct 2347849  T
Q  223 tcgattctctctg 235  Q
    |||||||||||||    
T  2347850 tcgattctctctg 2347862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Original strand, 12682817 - 12683025
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12682817 ggccctgtttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 12682916  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12682917 tagtttcataagctgcttatgccatattttcataagcctaaatctttagcttaccctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcga 12683016  T
Q  227 ttctctctg 235  Q
    |||||||||    
T  12683017 ttctctctg 12683025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 46760958 - 46761170
Alignment:
Q  22 atttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 121  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46760958 atttaggtcccgtttggattgacttattttgaacttatatgagcttatctacttgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 46761057  T
Q  122 tatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcc 221  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  46761058 tatcatagtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacttcc 46761157  T
Q  222 ttcgattctctct 234  Q
    |||||||||||||    
T  46761158 ttcgattctctct 46761170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Original strand, 52696788 - 52696996
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  52696788 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatca 52696887  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52696888 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 52696987  T
Q  227 ttctctctg 235  Q
    || ||||||    
T  52696988 ttatctctg 52696996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1170658 - 1170447
Alignment:
Q  21 gatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  1170658 gattcaggccccgtttggattggcttattttgagcttttgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagc 1170559  T
Q  121 ttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctc 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  1170558 ttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccatccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctc 1170459  T
Q  221 cttcgattctct 232  Q
    ||||||||||||    
T  1170458 cttcgattctct 1170447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19715366 - 19715161
Alignment:
Q  30 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 129  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  19715366 cccgtttggattggtttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcattg 19715267  T
Q  130 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19715266 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 19715167  T
Q  230 tctctg 235  Q
    ||||||    
T  19715166 tctctg 19715161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 32671575 - 32671784
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32671575 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 32671674  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  32671675 atagtttcataagctacttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacccccttcg 32671774  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  32671775 attctctctg 32671784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 24 - 232
Target Start/End: Original strand, 2473716 - 2473924
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2473716 ttaggtcccgtttggatcggtttattttgagcttatgtgggcttatctacgcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 2473815  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2473816 ttatagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctcctacttaacaaggagcttatgaatttatgttacctcctt 2473915  T
Q  224 cgattctct 232  Q
    ||| |||||    
T  2473916 cgagtctct 2473924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Original strand, 8120870 - 8121074
Alignment:
Q  31 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggt 130  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  8120870 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagt 8120969  T
Q  131 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattct 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8120970 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcttaaattttcagtttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 8121069  T
Q  231 ctctg 235  Q
    |||||    
T  8121070 ctctg 8121074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Original strand, 15203109 - 15203317
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15203109 ggccccgtttgaattgacttattttaagcttttgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgttagggtaaataaataaaaatagcttatca 15203208  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15203209 tagtttcataagctgtttatgccatatttcaataagcctaaattttcagccaaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcga 15203308  T
Q  227 ttctctctg 235  Q
    |||||||||    
T  15203309 ttctctctg 15203317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Original strand, 17591682 - 17591893
Alignment:
Q  21 gatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  17591682 gatttaggccccgtttggattggcttatt--gagcttatgtgg-cttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagc 17591778  T
Q  121 ttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctc 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17591779 ttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttccagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 17591878  T
Q  221 cttcgattctctctg 235  Q
    |||||||||||||||    
T  17591879 cttcgattctctctg 17591893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8079919 - 8079710
Alignment:
Q  25 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 124  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8079919 taggtcccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 8079820  T
Q  125 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 224  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||     
T  8079819 catagtttcataagctacttatgccatattttaataagcctaagttttcagcttaccctctggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctccttt 8079720  T
Q  225 gattctctct 234  Q
    ||||||||||    
T  8079719 gattctctct 8079710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 43905650 - 43905859
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43905650 aggctccgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 43905749  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  43905750 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagtttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttacgtaacctccttcg 43905849  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||| ||||||    
T  43905850 attgtctctg 43905859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 29 - 235
Target Start/End: Original strand, 5215384 - 5215590
Alignment:
Q  29 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatg 128  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||     
T  5215384 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactttcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcata 5215483  T
Q  129 gtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgatt 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5215484 gtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaacttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 5215583  T
Q  229 ctctctg 235  Q
     ||||||    
T  5215584 atctctg 5215590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Original strand, 7145207 - 7145412
Alignment:
Q  30 cccgtttggattgacttatttt-gagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatg 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||     
T  7145207 cccgtttggattgacttatttttgagcttatgtgtatttatctactcccataagcctttttaaaagtgtt-gggtaaataaacaaaaatagtttatcata 7145305  T
Q  129 gtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgatt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7145306 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 7145405  T
Q  229 ctctctg 235  Q
    |||||||    
T  7145406 ctctctg 7145412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13996932 - 13996723
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  13996932 aggccctgtttggattggcttattttgaaattatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttata 13996833  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  13996832 atggtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctcattcg 13996733  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  13996732 attctctctg 13996723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 49146168 - 49146377
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  49146168 aggctccgtttggattggtttattttgagcttatgtggatttatatactcccataagtttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatc 49146267  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||    
T  49146268 atagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcatcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacgtcattcg 49146367  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  49146368 attctctctg 49146377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Original strand, 40092488 - 40092696
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  40092488 ggccctgtttggattgacttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatatcttatca 40092587  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  40092588 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctttttcga 40092687  T
Q  227 ttctctctg 235  Q
    || ||||||    
T  40092688 ttttctctg 40092696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 51359424 - 51359217
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  51359424 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatttactgccataagccttcttaaaggt-tttgggtaaataattaaaaatagcttatca 51359326  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  51359325 tagtttcataaggtgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctccttcga 51359226  T
Q  227 ttctctctg 235  Q
    |||||||||    
T  51359225 ttctctctg 51359217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Original strand, 23498457 - 23498665
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23498457 ggccctgtttgaattggcttattttaagcttatgtgggcttatctacttccacaagcctttttcaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttcatca 23498556  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    | |||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23498557 tagtttcataagttgcttatatcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcga 23498656  T
Q  227 ttctctctg 235  Q
    |||||||||    
T  23498657 ttctctctg 23498665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 64 - 235
Target Start/End: Original strand, 40149497 - 40149668
Alignment:
Q  64 gcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  40149497 gcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataatttatcatagttttataagctgcttatgtcatattttaataagc 40149596  T
Q  164 ctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 235  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40149597 ctaaattttcagtttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 40149668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15554354 - 15554152
Alignment:
Q  25 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  15554354 taggccccgtttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag----- 15554260  T
Q  125 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 224  Q
    |||   ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15554259 cat---ttcataaactgctgatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 15554163  T
Q  225 gattctctctg 235  Q
    |||||||||||    
T  15554162 gattctctctg 15554152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 46 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17587694 - 17587505
Alignment:
Q  46 tattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgctta 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||    
T  17587694 tattttgagcttatgtgagcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaacagcttatcatattttcataagctgctta 17587595  T
Q  146 tgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  17587594 tgccatattttaataagcctaaattttcagcttacactctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctttctg 17587505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 32 - 232
Target Start/End: Original strand, 15717787 - 15717986
Alignment:
Q  32 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtt 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||    
T  15717787 cgtttggattgacttattttgagtttatgttggcctatctaatttcataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagctt-tcatagtt 15717885  T
Q  132 tcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctc 231  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  15717886 tcataagctgcttatgccataatttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgattttatgtaacctccttcaattctc 15717985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 230
Target Start/End: Original strand, 6765458 - 6765659
Alignment:
Q  29 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatg 128  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||||||||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6765458 ccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgaatttatctacttttataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcata 6765557  T
Q  129 gtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgatt 228  Q
     |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  6765558 ttttcatgagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctccttcgatt 6765657  T
Q  229 ct 230  Q
    ||    
T  6765658 ct 6765659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 196
Target Start/End: Original strand, 29695673 - 29695842
Alignment:
Q  28 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagctttt-ttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  29695673 gccctgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcccataatttttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaataatttatca 29695772  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaag 196  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29695773 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaag 29695842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Original strand, 38171828 - 38172023
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  38171828 aggctccgtttgcattgacttattttgaatttatgtgaacttatctactcacataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagtttatc 38171927  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || |||||||||||||||||||              |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38171928 atagtttcataagctgcttatg-------------tgcctaaattttcagcttatcctccggcttaagaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcg 38172014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 152
Target Start/End: Original strand, 52086261 - 52086389
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||    
T  52086261 ttaggccctgtttggattgacttattttaagcttatgtgggtttatctgctcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaatcagtaaaaataactta 52086360  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccata 152  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  52086361 tcataatttcataagctgcttatgccata 52086389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23323031 - 23322897
Alignment:
Q  44 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgct 143  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23323031 cttattttgagcttatataggcttatctactcccataaactttttttaaggcgtttgaataaatcaataaaaatagtttatcataatttcataagctgct 23322932  T
Q  144 tatgccatatttcaataagcctaaattttcagctt 178  Q
    |||| |||| || |||||||  ||||||| |||||    
T  23322931 tatgtcatactttaataagcgcaaattttaagctt 23322897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 101
Target Start/End: Original strand, 5675096 - 5675176
Alignment:
Q  21 gatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgg 101  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||    
T  5675096 gattaaggccccgtttggattggcttattttaagcttatgttagcttatctactaacataagctttttgaaagatgtttgg 5675176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 5217994 - 5217840
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||  |||||||| ||| |||    ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  5217994 ttaggcctcgtttggattggcttattttaagcttatgagagcttatctactaacataagctctttcaaatacatttgggtaaat-aataaaaatagctta 5217896  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagctta 179  Q
    |     |||||||||| |||||| ||||||||  |||||||  |||||| ||||||    
T  5217895 taccaatttcataagccgcttataccatatttttataagccataattttgagctta 5217840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Original strand, 38055154 - 38055362
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38055154 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatca 38055253  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  38055254 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttactctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccatcga 38055353  T
Q  227 ttctctctg 235  Q
    |||||||||    
T  38055354 ttctctctg 38055362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1756963 - 1756752
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1756963 ttagaccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagatta 1756864  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  1756863 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcttt 1756764  T
Q  224 cgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||    
T  1756763 cgattctctctg 1756752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 37968952 - 37968746
Alignment:
Q  28 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 127  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37968952 gccccatttagattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 37968853  T
Q  128 ggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgat 227  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37968852 agtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgat 37968753  T
Q  228 tctctct 234  Q
    |||||||    
T  37968752 tctctct 37968746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 24 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 50055300 - 50055098
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  50055300 ttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagctta 50055201  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50055200 tcatggtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 50055101  T
Q  224 cga 226  Q
    |||    
T  50055100 cga 50055098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28032913 - 28032700
Alignment:
Q  22 atttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 121  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28032913 atttaggccctgtttagattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 28032814  T
Q  122 tatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcc 221  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28032813 tatcatagtatcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 28032714  T
Q  222 ttcgattctctctg 235  Q
    ||||||| ||||||    
T  28032713 ttcgattatctctg 28032700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 45424731 - 45424522
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45424731 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 45424632  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45424631 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 45424532  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||| ||||    
T  45424531 attctttctg 45424522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 53717665 - 53717452
Alignment:
Q  22 atttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 121  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  53717665 atttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagct 53717566  T
Q  122 tatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcc 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53717565 tatcatagtttcataagctgcttatgccctattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 53717466  T
Q  222 ttcgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||||    
T  53717465 ttcgattctctctg 53717452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 54189541 - 54189750
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54189541 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 54189640  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54189641 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 54189740  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  54189741 attctctctg 54189750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19913826 - 19913618
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  19913826 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaattaaaacagcttatca 19913727  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19913726 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 19913627  T
Q  227 ttctctctg 235  Q
    |||||||||    
T  19913626 ttctctctg 19913618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 27 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23776655 - 23776449
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23776655 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 23776556  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  23776555 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggatcttatgaatttatgtaaccttcttcga 23776456  T
Q  227 ttctctc 233  Q
    |||||||    
T  23776455 ttctctc 23776449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27488850 - 27488636
Alignment:
Q  21 gatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27488850 gatttaggccccgtttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 27488751  T
Q  121 ttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctc 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  27488750 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctc 27488651  T
Q  221 cttcgattctctctg 235  Q
    |||||||||||||||    
T  27488650 cttcgattctctctg 27488636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15241225 - 15241016
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15241225 aggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatc 15241126  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15241125 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 15241026  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  15241025 attctctctg 15241016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 30 - 234
Target Start/End: Original strand, 20877047 - 20877251
Alignment:
Q  30 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 129  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20877047 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 20877146  T
Q  130 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  20877147 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatggatttacgtaacctccttagattc 20877246  T
Q  230 tctct 234  Q
    |||||    
T  20877247 tctct 20877251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Original strand, 31969681 - 31969886
Alignment:
Q  30 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 129  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31969681 cccgtttgaattgatttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 31969780  T
Q  130 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31969781 tttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 31969880  T
Q  230 tctctg 235  Q
    ||||||    
T  31969881 tctctg 31969886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2481607 - 2481396
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  2481607 ttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagctta 2481508  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2481507 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagccaaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 2481408  T
Q  224 cgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||    
T  2481407 cgattctctctg 2481396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6611559 - 6611348
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6611559 ttaggccccgtttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 6611460  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  6611459 tcatagtttcataagctgtttatgtcatattttgataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctcctt 6611360  T
Q  224 cgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||    
T  6611359 cgattctctctg 6611348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35490972 - 35490761
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  35490972 ttaggtcccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatccactctcataagcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagctta 35490873  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  35490872 tcatagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccacctt 35490773  T
Q  224 cgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||    
T  35490772 cgattctctctg 35490761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Original strand, 54412619 - 54412833
Alignment:
Q  21 gatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 120  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  54412619 gatttagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagc 54412718  T
Q  121 ttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctc 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  54412719 ttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattctaataagtctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcatatgaatttatgtaacctc 54412818  T
Q  221 cttcgattctctctg 235  Q
    |||||||||||||||    
T  54412819 cttcgattctctctg 54412833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6688817 - 6688615
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6688817 ggccccgtttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 6688718  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    | ||||      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6688717 tagttt------ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 6688624  T
Q  227 ttctctctg 235  Q
    |||||||||    
T  6688623 ttctctctg 6688615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19165164 - 19164961
Alignment:
Q  31 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataag-cttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19165164 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 19165065  T
Q  130 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  19165064 tttcataagctgcttatgccatattt-aataagcctaaattttcagcttaccct-cggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgtttt 19164967  T
Q  230 tctctg 235  Q
    ||||||    
T  19164966 tctctg 19164961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 37464717 - 37464926
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37464717 aggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatc 37464816  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37464817 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagtttaccctccggtttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcg 37464916  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  37464917 attctctctg 37464926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44785114 - 44784905
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  44785114 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttgtaaaagtgtttgggtaaacaaataaaaatagcttatc 44785015  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44785014 atagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaactttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcg 44784915  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  44784914 attctctctg 44784905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 50353797 - 50354006
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  50353797 aggccccgtttggattggcttattttgagcttctgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatg 50353896  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50353897 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaatttttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 50353996  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||| ||||||    
T  50353997 attatctctg 50354006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40428915 - 40428708
Alignment:
Q  28 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 127  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40428915 gccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 40428816  T
Q  128 ggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgat 227  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40428815 agtttcataagctgcttataccatattttgataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 40428716  T
Q  228 tctctctg 235  Q
    ||||||||    
T  40428715 tctctctg 40428708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30423757 - 30423556
Alignment:
Q  30 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  30423757 cccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 30423658  T
Q  130 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  30423657 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcataaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagctta-gaatttatgtaacctccttcgattc 30423559  T
Q  230 tct 232  Q
    |||    
T  30423558 tct 30423556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 14987788 - 14987997
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14987788 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagccattttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 14987887  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14987888 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcttgcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcg 14987987  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||| ||||    
T  14987988 attctttctg 14987997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 24 - 233
Target Start/End: Original strand, 48909840 - 48910049
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  48909840 ttaggccctgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagctta 48909939  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  48909940 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaacaaacctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctcctt 48910039  T
Q  224 cgattctctc 233  Q
    ||||||||||    
T  48910040 cgattctctc 48910049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Original strand, 16700782 - 16700986
Alignment:
Q  31 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggt 130  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  16700782 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagt 16700881  T
Q  131 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattct 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  16700882 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctagcttaacaaggagcttataaatttatgtaacctccttcgattct 16700981  T
Q  231 ctctg 235  Q
    |||||    
T  16700982 ctctg 16700986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Original strand, 53875658 - 53875862
Alignment:
Q  31 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggt 130  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  53875658 ccgtttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatatactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 53875757  T
Q  131 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattct 230  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  53875758 tttataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcgattct 53875857  T
Q  231 ctctg 235  Q
    |||||    
T  53875858 ctctg 53875862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11639773 - 11639566
Alignment:
Q  28 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 127  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11639773 gccccgtttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 11639674  T
Q  128 ggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgat 227  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  11639673 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcttttgat 11639574  T
Q  228 tctctctg 235  Q
    ||||||||    
T  11639573 tctctctg 11639566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23704406 - 23704200
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23704406 aggccctgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcacataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 23704307  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  23704306 atagtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcatttg 23704207  T
Q  226 attctct 232  Q
    |||||||    
T  23704206 attctct 23704200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27536299 - 27536092
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27536299 ttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatacgggctta----ctcccataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 27536204  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27536203 tcatagtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 27536104  T
Q  224 cgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||    
T  27536103 cgattctctctg 27536092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44379385 - 44379175
Alignment:
Q  25 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 124  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44379385 taggccctgtttggattgacttattttgagtttatataggcttatctacttccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 44379286  T
Q  125 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 224  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  44379285 catagtttcataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttc 44379186  T
Q  225 gattctctctg 235  Q
    |||||||||||    
T  44379185 gattctctctg 44379175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Original strand, 1617084 - 1617289
Alignment:
Q  30 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  1617084 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatag 1617183  T
Q  130 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 229  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1617184 tttcataagctgcttgtgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 1617283  T
Q  230 tctctg 235  Q
    ||||||    
T  1617284 tctctg 1617289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43290158 - 43289951
Alignment:
Q  25 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 124  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  43290158 taggctccgtttggattggcttattttgagcttttatgtgcttatctactcacataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttat 43290059  T
Q  125 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 224  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43290058 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 43289959  T
Q  225 gattctct 232  Q
    ||||||||    
T  43289958 gattctct 43289951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8932375 - 8932165
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  8932375 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttaac 8932276  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8932275 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttacccttcagcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacctccttcg 8932176  T
Q  226 attctctctgc 236  Q
    |||||||||||    
T  8932175 attctctctgc 8932165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Original strand, 30171581 - 30171785
Alignment:
Q  31 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggt 130  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  30171581 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatcttattccataagcttttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatcatagt 30171680  T
Q  131 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattct 230  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  30171681 ttcataagctgcttataccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccttccggtttaacaaggagcttatgaatttatttaacctccttcgattct 30171780  T
Q  231 ctctg 235  Q
    |||||    
T  30171781 ctctg 30171785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 47632032 - 47632240
Alignment:
Q  28 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaa-ggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  47632032 gccccgtttggattggcttattttgagtttatgtggacttatctactctcataaacctttttaaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttctca 47632131  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  47632132 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcaa 47632231  T
Q  227 ttctctctg 235  Q
    |||||||||    
T  47632232 ttctctctg 47632240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Original strand, 15669177 - 15669388
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  15669177 ttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctaatcacataagactttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagctta 15669276  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  15669277 tcatagtttcataagctgcttatgtcatactttaataagcctaaattttcagcttaccgtccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctcctt 15669376  T
Q  224 cgattctctctg 235  Q
    | ||||||||||    
T  15669377 ccattctctctg 15669388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 232
Target Start/End: Original strand, 52139203 - 52139405
Alignment:
Q  30 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 129  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| | | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  52139203 cccgtttggattggcttattttgaacttatgtgggtttatctatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 52139302  T
Q  130 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52139303 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 52139402  T
Q  230 tct 232  Q
    |||    
T  52139403 tct 52139405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8591285 - 8591080
Alignment:
Q  30 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 129  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  8591285 cccgtttgacttggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttctataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 8591186  T
Q  130 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  8591185 tttcataagctgcttatgccatatgttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcggttc 8591086  T
Q  230 tctctg 235  Q
    ||||||    
T  8591085 tctctg 8591080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 34 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27583821 - 27583620
Alignment:
Q  34 tttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttc 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| |    
T  27583821 tttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaagatgtttggataaataaataaaaataacttatcatagttgc 27583722  T
Q  134 ataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctc 233  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  27583721 ataagctgcttatgccatattttcataagcctaaatttttagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcaattctctc 27583622  T
Q  234 tg 235  Q
    ||    
T  27583621 tg 27583620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 39 - 235
Target Start/End: Original strand, 33703850 - 33704046
Alignment:
Q  39 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataag 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||    
T  33703850 attgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatcatagtttcataag 33703949  T
Q  139 ctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 235  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33703950 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 33704046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Original strand, 53353051 - 53353267
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagctta----tgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53353051 aggccccgtttggattggcttattttgagcttaattatatgggcttatctactcccatatgtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 53353150  T
Q  122 tatcatggtttcataagctgcttatgccatatttca----ataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgac 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  53353151 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaatatataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatggatttatgtaac 53353250  T
Q  218 ctccttcgattctctct 234  Q
    |||||||||||||||||    
T  53353251 ctccttcgattctctct 53353267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 33 - 201
Target Start/End: Original strand, 28360433 - 28360602
Alignment:
Q  33 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28360433 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttttctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 28360532  T
Q  133 cataagctgcttatgcca-tatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagct 201  Q
     ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28360533 tataagctgcttatgccattatttttataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagct 28360602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40680236 - 40680026
Alignment:
Q  25 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 124  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  40680236 taggcccgctttggattgacttattttgaatttatgtgagcttatctacttccataagtctttttaaaggtatttggataaataaataaaaatagcttat 40680137  T
Q  125 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 224  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  40680136 catagtttcataagctgcttatgccatattttcataagcctaaatttttagcttacccttcggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcattc 40680037  T
Q  225 gattctctctg 235  Q
    |||||||||||    
T  40680036 gattctctctg 40680026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 55345023 - 55344813
Alignment:
Q  25 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55345023 taggccccgtttgaattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 55344924  T
Q  125 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 224  Q
    |||  || ||| || || |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  55344923 catatttgcatgagttgtttataccatattttaataagccaaaattttcagcttaccatccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttt 55344824  T
Q  225 gattctctctg 235  Q
    |||||||||||    
T  55344823 gattctctctg 55344813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Original strand, 44375844 - 44376041
Alignment:
Q  29 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatg 128  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||  | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  44375844 ccccgtttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatctattccaatagccatttttataggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcata 44375943  T
Q  129 gtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44375944 gtttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaaaaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcga 44376041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 232
Target Start/End: Original strand, 16703818 - 16704023
Alignment:
Q  23 tttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 122  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16703818 tttaggcctcgtttggattgactta----gagcttatgtgaacttatctacttccataagcttttttaaagttgtttgaataaataaataaaaatagttt 16703913  T
Q  123 atcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 222  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||    
T  16703914 atcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagtttatcctccggcttaacaaggagcctataaatttatgtaaccccct 16704013  T
Q  223 tcgattctct 232  Q
    ||||||||||    
T  16704014 tcgattctct 16704023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 39 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 38071504 - 38071314
Alignment:
Q  39 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataag 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38071504 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataatcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 38071405  T
Q  139 ctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||    
T  38071404 ctgcttatgccatattttaataagcctgaattttcagtttac---ggggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa---ccttcgattctctctg 38071314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 179
Target Start/End: Original strand, 50053437 - 50053592
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  50053437 ttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatatggacttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggcaaataaataaaaatagctta 50053536  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagctta 179  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  50053537 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcatctta 50053592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 107 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23269162 - 23269034
Alignment:
Q  107 taaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatga 206  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23269162 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatga 23269063  T
Q  207 atttatgtgacctccttcgattctctctg 235  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  23269062 atttatgtaatctccttcgattctctctg 23269034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 23265950 - 23265865
Alignment:
Q  30 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23265950 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 23265865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 235
Target Start/End: Original strand, 53408137 - 53408225
Alignment:
Q  148 ccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccct-ccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 235  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53408137 ccatattttattaagcctaaattttcagcttacccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 53408225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23261937 - 23261874
Alignment:
Q  172 tcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23261937 tcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 23261874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 44548339 - 44548185
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgac-ttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 124  Q
    |||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||    
T  44548339 aggccccgtttgaattggccttatttggagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttggataaatcaataaaaacatcttat 44548240  T
Q  125 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagctta 179  Q
    ||   ||| ||||| || ||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  44548239 cacaattttataagttgtttatgccctattttattaagcccaaattttaagctta 44548185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 51780845 - 51780763
Alignment:
Q  96 gtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagctt 178  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  51780845 gtttggataaatcaataaaaatagcttatcataatttcataagctgcttatgccatattttaataagcccaaattttaagctt 51780763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9595982 - 9595890
Alignment:
Q  132 tcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctc 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||           || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9595982 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaa-----------actctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 9595894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 235
Target Start/End: Original strand, 50055301 - 50055350
Alignment:
Q  186 ggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50055301 ggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 50055350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 179
Target Start/End: Original strand, 17493340 - 17493482
Alignment:
Q  37 ggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcata 136  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||  | |||||||||| |||||| ||||||| || ||||| |||||| ||||||||||  ||||  |  ||| |||    
T  17493340 ggattgacttattttgaatttatatgaacatatctactcctataagcatttttaagggcgtttgagtaaatcaataaaaatatcttattctaattttata 17493439  T
Q  137 agctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagctta 179  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||  ||||||| ||||||    
T  17493440 agctgcttataccatgttttaataagctcaaattttgagctta 17493482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 235
Target Start/End: Original strand, 48748197 - 48748263
Alignment:
Q  169 ttttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 235  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  48748197 ttttcagcataccctccgtcttaataaggagcttatgaatttatgtaatctccttcaattctctctg 48748263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 9596032 - 9595974
Alignment:
Q  25 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagct 84  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9596032 taggccccgtttggattggcttattt-gagtttatgtgggcttatctactctcataagct 9595974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 55344715 - 55344681
Alignment:
Q  201 ttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55344715 ttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 55344681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Original strand, 36699 - 36910
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36699 ttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 36798  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36799 tcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 36898  T
Q  224 cgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||    
T  36899 cgattctctctg 36910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6086809 - 6086599
Alignment:
Q  25 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 124  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6086809 taggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 6086710  T
Q  125 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 224  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6086709 catagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 6086610  T
Q  225 gattctctctg 235  Q
    |||||||||||    
T  6086609 gattctctctg 6086599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 2837540 - 2837752
Alignment:
Q  23 tttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2837540 tttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctt 2837639  T
Q  123 atcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 222  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2837640 atcatagtttcatgagctgctcatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 2837739  T
Q  223 tcgattctctctg 235  Q
    |||||||||||||    
T  2837740 tcgattctctctg 2837752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26947084 - 26946876
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26947084 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 26946985  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26946984 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 26946885  T
Q  227 ttctctctg 235  Q
    |||||||||    
T  26946884 ttctctctg 26946876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34887496 - 34887292
Alignment:
Q  31 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  34887496 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctcctcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 34887397  T
Q  131 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattct 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34887396 ttcataagctgtttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagctaatgaatttatgtgacctccttcgattct 34887297  T
Q  231 ctctg 235  Q
    |||||    
T  34887296 ctctg 34887292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 21893452 - 21893662
Alignment:
Q  25 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 124  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  21893452 taggccccgtttggatcgatttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatatataaaaatagcttat 21893551  T
Q  125 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 224  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21893552 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaatttttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 21893651  T
Q  225 gattctctctg 235  Q
    |||||||||||    
T  21893652 gattctctctg 21893662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3347732 - 3347523
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  3347732 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagcttatc 3347633  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3347632 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 3347533  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  3347532 attctctctg 3347523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26704547 - 26704339
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26704547 ggccccgtttggattggtttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 26704448  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26704447 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 26704348  T
Q  227 ttctctctg 235  Q
    |||||||||    
T  26704347 ttctctctg 26704339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Original strand, 30691850 - 30692058
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30691850 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 30691949  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30691950 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 30692049  T
Q  227 ttctctctg 235  Q
    |||||||||    
T  30692050 ttctctctg 30692058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 18613536 - 18613745
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18613536 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgcggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatc 18613635  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18613636 atagttccataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 18613735  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  18613736 attctctctg 18613745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17261284 - 17261073
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17261284 ttaggtcccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttctaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 17261185  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    | ||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  17261184 taatattttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacctcctt 17261085  T
Q  224 cgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||    
T  17261084 cgattctctctg 17261073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Original strand, 9459562 - 9459770
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9459562 ggccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagcttatctatttccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatca 9459661  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9459662 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtatcctccttcga 9459761  T
Q  227 ttctctctg 235  Q
    |||||||||    
T  9459762 ttctctctg 9459770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 11167235 - 11167447
Alignment:
Q  23 tttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11167235 tttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgtgcttatttattttcataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctt 11167334  T
Q  123 atcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 222  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11167335 atcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccaccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 11167434  T
Q  223 tcgattctctctg 235  Q
    |||||||||||||    
T  11167435 tcgattctctctg 11167447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 24 - 234
Target Start/End: Original strand, 35198280 - 35198489
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35198280 ttaggccccgtttgaattggcttattttgaacttatgtgggcttatctacttccataagctttt-taaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 35198378  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||    
T  35198379 tcatagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagtttactctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtgatctcatt 35198478  T
Q  224 cgattctctct 234  Q
    |||||||||||    
T  35198479 cgattctctct 35198489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16307220 - 16307015
Alignment:
Q  23 tttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  16307220 tttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttggataaataaataaaaacagctt 16307121  T
Q  123 atcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 222  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16307120 atcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcat 16307021  T
Q  223 tcgatt 228  Q
    ||||||    
T  16307020 tcgatt 16307015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Original strand, 20726790 - 20726994
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||||||    
T  20726790 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa----taaaaataacttatca 20726885  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20726886 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 20726985  T
Q  227 ttctctctg 235  Q
    |||||||||    
T  20726986 ttctctctg 20726994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28199719 - 28199508
Alignment:
Q  25 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatc---tactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28199719 taggtcccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactcc-ataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 28199621  T
Q  122 tatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcc 221  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28199620 tatcatagtttcatatgctgcttatgccat-tttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 28199522  T
Q  222 ttcgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||||    
T  28199521 ttcgattctctctg 28199508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3955972 - 3955769
Alignment:
Q  29 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatg 128  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  3955972 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 3955873  T
Q  129 gtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgatt 228  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||    
T  3955872 gtttcataaactgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa---ccttcgatt 3955776  T
Q  229 ctctctg 235  Q
    |||||||    
T  3955775 ctctctg 3955769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 1153603 - 1153800
Alignment:
Q  38 gattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataa 137  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1153603 gattggcttattttaagcttatgttggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagattatcatagtttcataa 1153702  T
Q  138 gctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  1153703 gctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggtgcttatgtatttatgtaacctccttcgtttctctctg 1153800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Original strand, 52832 - 52999
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52832 ttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 52931  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggctta 191  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52932 tcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggctta 52999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30699132 - 30698934
Alignment:
Q  32 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtt 131  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| || | | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  30699132 cgtttggattgacttattatgagtttatgtgagcttatttatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 30699033  T
Q  132 tcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattct 230  Q
    | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30699032 ttattagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 30698934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 98 - 235
Target Start/End: Original strand, 33464399 - 33464536
Alignment:
Q  98 ttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaagg 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33464399 ttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaagg 33464498  T
Q  198 agcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33464499 agcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 33464536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 121 - 235
Target Start/End: Original strand, 53001 - 53115
Alignment:
Q  121 ttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctc 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53001 ttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 53100  T
Q  221 cttcgattctctctg 235  Q
    |||||||||||||||    
T  53101 cttcgattctctctg 53115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 106
Target Start/End: Original strand, 33463703 - 33463779
Alignment:
Q  30 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaa 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33463703 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa 33463779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 59
Target Start/End: Original strand, 34800920 - 34800956
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattga-cttattttgagcttat 59  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34800920 ttaggccccgtttggattgagcttattttgagcttat 34800956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6175040 - 6174828
Alignment:
Q  23 tttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6175040 tttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatatttt 6174941  T
Q  123 atcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 222  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6174940 atcatagtttcataagctgcttatgtcatatttcattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttacgtgacctcct 6174841  T
Q  223 tcgattctctctg 235  Q
    |||||||||||||    
T  6174840 tcgattctctctg 6174828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33906256 - 33906047
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33906256 aggccctgtttggattgacttattttgaacttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 33906157  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33906156 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 33906057  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||| ||||||    
T  33906056 attatctctg 33906047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31517423 - 31517215
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31517423 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 31517324  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31517323 tagtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 31517224  T
Q  227 ttctctctg 235  Q
    |||||||||    
T  31517223 ttctctctg 31517215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18807094 - 18806884
Alignment:
Q  25 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 124  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18807094 taggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 18806995  T
Q  125 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 224  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18806994 catagtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 18806895  T
Q  225 gattctctctg 235  Q
    |||||||||||    
T  18806894 gattctctctg 18806884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3873452 - 3873244
Alignment:
Q  27 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 126  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3873452 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatca 3873353  T
Q  127 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 226  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  3873352 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatataacctcattcga 3873253  T
Q  227 ttctctctg 235  Q
    |||||||||    
T  3873252 ttctctctg 3873244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26323395 - 26323186
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26323395 aggccccgtttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagtctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatc 26323296  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26323295 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcg 26323196  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  26323195 attctctctg 26323186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 42937714 - 42937925
Alignment:
Q  25 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 124  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42937714 taggctccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 42937813  T
Q  125 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaat-aagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42937814 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataaagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 42937913  T
Q  224 cgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||    
T  42937914 cgattctctctg 42937925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 24 - 234
Target Start/End: Original strand, 39635446 - 39635656
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  39635446 ttaggccccgtttggattagcttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagctta 39635545  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  39635546 tcatagtttcataagctgcttatgtcatattttattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaacgagcttatcaatttatgtaacctcctt 39635645  T
Q  224 cgattctctct 234  Q
    |||||||||||    
T  39635646 cgattctctct 39635656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 214
Target Start/End: Original strand, 1108276 - 1108463
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1108276 aggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 1108374  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgt 214  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1108375 atagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgt 1108463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2178983 - 2178769
Alignment:
Q  21 gatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  2178983 gatttaggccccgtttggattgatttattttaagtttatgtggacttatctattcgcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagc 2178884  T
Q  121 ttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctc 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2178883 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 2178784  T
Q  221 cttcgattctctctg 235  Q
    |||||||||||||||    
T  2178783 cttcgattctctctg 2178769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28330042 - 28329839
Alignment:
Q  30 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  28330042 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacacccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 28329943  T
Q  130 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28329942 tttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccct--agcttaacaaggagcatatgaatttatgtaacctccttcgattc 28329845  T
Q  230 tctctg 235  Q
    | ||||    
T  28329844 tttctg 28329839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Original strand, 4016039 - 4016244
Alignment:
Q  30 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| |    
T  4016039 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaataacgtatcatag 4016138  T
Q  130 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4016139 tttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 4016238  T
Q  230 tctctg 235  Q
    ||||||    
T  4016239 tctctg 4016244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4232351 - 4232142
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4232351 aggccccgtttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 4232252  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4232251 atagtttcataagctgcttatgccatattttcacaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctcattcg 4232152  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||| ||||||    
T  4232151 attatctctg 4232142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 5733395 - 5733604
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||    
T  5733395 aggccccatttagattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatcagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaacaacttatc 5733494  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5733495 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcg 5733594  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  5733595 attctctctg 5733604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1483106 - 1482903
Alignment:
Q  31 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggt 130  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||    
T  1483106 ccgttttgattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcc-ataagcttttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattattgt 1483008  T
Q  131 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattct 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  1483007 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagtttacccttcgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacatccttcgattct 1482908  T
Q  231 ctctg 235  Q
    |||||    
T  1482907 ctctg 1482903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19901346 - 19901143
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19901346 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttctctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataa-taaaaatagcttatc 19901248  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19901247 atagtttcataaactgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcccacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcg 19901148  T
Q  226 attct 230  Q
    |||||    
T  19901147 attct 19901143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19384127 - 19383938
Alignment:
Q  43 acttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgc 142  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  19384127 acttattttgagtttatatgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagttgt 19384028  T
Q  143 ttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctct 232  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19384027 ttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 19383938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30270888 - 30270679
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  30270888 aggccccgtttggattggcttattttaagcttatatgagtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttggataaataaaataaaatagtttatc 30270789  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  30270788 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcg 30270689  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||| ||||||    
T  30270688 attatctctg 30270679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Original strand, 850997 - 851202
Alignment:
Q  30 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 129  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||      
T  850997 cccgtttggatttgcttattttaagcttatgtaggcttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaatagagcttatcataa 851096  T
Q  130 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 229  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  851097 ttttataagctgcttatgccatattttaataagcttaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 851196  T
Q  230 tctctg 235  Q
    ||||||    
T  851197 tctctg 851202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30420378 - 30420181
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30420378 ttagtccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 30420279  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30420278 tcataggttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcag------------cttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccccctt 30420191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16588986 - 16588776
Alignment:
Q  25 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 124  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16588986 taggctccgtttggattggcttattttgtgtttatgtgggcttatctactttcataagtctttttaaagaagtttgggtaaataaataaaaatagcttat 16588887  T
Q  125 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 224  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  16588886 tatagtttcataagctgcttatgccatattttcataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaataaggagcttatgaattaatgtaacctccgtc 16588787  T
Q  225 gattctctctg 235  Q
    |||| ||||||    
T  16588786 gattatctctg 16588776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16066495 - 16066302
Alignment:
Q  34 tttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataag-cttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggttt 132  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16066495 tttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctttcataagtcttttttaaag-tgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 16066397  T
Q  133 cataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgat 227  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16066396 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctgatttaataaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 16066302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44947755 - 44947549
Alignment:
Q  22 atttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 121  Q
    ||||| ||||| |||| |||| |||||||||| |||||||| | ||||||| | |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  44947755 atttaagccccatttgtattggcttattttgatcttatgtgagtttatctagtgccataagcatttttaaaagtgtttggataaataaataaaaatagtt 44947656  T
Q  122 tatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcc 221  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  44947655 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattt-------gctaaattttcagtttaccctccggcttaacaagaagtttatgaatttatgtaacctcc 44947563  T
Q  222 ttcgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||||    
T  44947562 ttcgattctctctg 44947549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 429817 - 430017
Alignment:
Q  31 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggt 130  Q
    ||||||| |||  ||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  429817 ccgtttgaattcccttattttgaatttatgtggatttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcataat 429916  T
Q  131 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattct 230  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  429917 ttcataagttgcttatgcgatattttaataagcctaaattttcaacttacaattcgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattct 430016  T
Q  231 c 231  Q
    |    
T  430017 c 430017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 42446779 - 42446625
Alignment:
Q  25 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||    
T  42446779 taggccccgtttggattggcttattcggagtttatgcgaacttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttaggtaaatcaataaaaacaacttat 42446680  T
Q  125 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagctta 179  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||| ||||||    
T  42446679 cacaatttcataagctgcttatgccatattttaataagatcaaattttaagctta 42446625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 179
Target Start/End: Original strand, 3585291 - 3585439
Alignment:
Q  31 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggt 130  Q
    |||||||||| | ||||||   |||||||||||  ||||| |||  ||||| | || ||||| |||||| ||||||| |||||||| | |||||||   |    
T  3585291 ccgtttggatcggcttattcaaagcttatgtggatttatccactaacataaaccttattaaatgtgttttggtaaattaataaaaacaatttatcacaat 3585390  T
Q  131 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagctta 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  3585391 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctgaattatgagctta 3585439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 22101316 - 22101210
Alignment:
Q  66 ttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcct 165  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |  ||||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  22101316 ttatctactaacataagcctttttaaaggtatttgtataaatcaataaaaacaacttatcacaatttcataagctgcttatgtcatattttaataagccc 22101217  T
Q  166 aaatttt 172  Q
    |||||||    
T  22101216 aaatttt 22101210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23165 - 22956
Alignment:
Q  21 gatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 120  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23165 gatttgggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 23066  T
Q  121 ttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctc 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23065 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 22966  T
Q  221 cttcgattct 230  Q
    ||||||||||    
T  22965 cttcgattct 22956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 10234 - 10443
Alignment:
Q  26 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10234 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggtttatctactctcataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 10333  T
Q  126 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 225  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10334 atagtttcataagctgcttataccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 10433  T
Q  226 attctctctg 235  Q
    ||||||||||    
T  10434 attctctctg 10443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 30 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 145450 - 145246
Alignment:
Q  30 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  145450 cccgtttggattgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 145351  T
Q  130 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  145350 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttataaatttatgtaacctccttcgattc 145251  T
Q  230 tctct 234  Q
    |||||    
T  145250 tctct 145246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 507 - 295
Alignment:
Q  23 tttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 122  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  507 tttagaccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagatt 408  T
Q  123 atcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 222  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  407 atcatagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaactttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 308  T
Q  223 tcgattctctctg 235  Q
    |||||||||||||    
T  307 tcgattctctctg 295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 217 - 6
Alignment:
Q  24 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 123  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  217 ttaggccccgtttgtattggcttaagttgagtttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 118  T
Q  124 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  117 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataatcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 18  T
Q  224 cgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||    
T  17 cgattctctctg 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Original strand, 3708 - 3915
Alignment:
Q  28 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 127  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3708 gccccgtttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 3807  T
Q  128 ggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgat 227  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  3808 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcttttgat 3907  T
Q  228 tctctctg 235  Q
    ||||||||    
T  3908 tctctctg 3915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 217 - 6
Alignment:
Q  25 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatc---tactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  217 taggtcccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactcc-ataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 119  T
Q  122 tatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcc 221  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  118 tatcatagtttcatatgctgcttatgccat-tttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 20  T
Q  222 ttcgattctctctg 235  Q
    ||||||||||||||    
T  19 ttcgattctctctg 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University