View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17512_high_2 (Length: 705)

Name: NF17512_high_2
Description: NF17512
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17512_high_2
NF17512_high_2
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (17-686)||(3224-3893)
[»] chr6 (35 HSPs)
chr6 (62-689)||(4461126-4461753)
chr6 (17-689)||(4625909-4626581)
chr6 (65-677)||(4469809-4470421)
chr6 (62-678)||(4613231-4613847)
chr6 (62-688)||(4563714-4564340)
chr6 (61-689)||(4622144-4622770)
chr6 (61-685)||(4259660-4260284)
chr6 (65-689)||(4585642-4586266)
chr6 (61-685)||(4256130-4256742)
chr6 (61-689)||(4266668-4267296)
chr6 (65-688)||(4592237-4592860)
chr6 (62-686)||(4601792-4602416)
chr6 (62-690)||(4514622-4515250)
chr6 (62-688)||(4617025-4617651)
chr6 (62-687)||(4505860-4506485)
chr6 (62-676)||(4480696-4481310)
chr6 (62-678)||(4579435-4580051)
chr6 (62-684)||(4516324-4516946)
chr6 (62-678)||(4557128-4557744)
chr6 (63-689)||(4598175-4598801)
chr6 (61-689)||(3171743-3172371)
chr6 (65-678)||(4570978-4571591)
chr6 (180-689)||(4457715-4458225)
chr6 (339-690)||(4299322-4299673)
chr6 (65-690)||(4489856-4490481)
chr6 (62-689)||(4574311-4574938)
chr6 (62-676)||(4560509-4561121)
chr6 (65-689)||(4503899-4504523)
chr6 (78-688)||(4568072-4568673)
chr6 (62-450)||(4492958-4493346)
chr6 (61-266)||(4299671-4299870)
chr6 (342-464)||(4391850-4391976)
chr6 (63-165)||(4392052-4392154)
chr6 (62-124)||(4606958-4607020)
chr6 (639-689)||(4835517-4835567)
[»] chr7 (3 HSPs)
chr7 (56-689)||(3086417-3087050)
chr7 (354-396)||(41511442-41511484)
chr7 (354-400)||(48532780-48532826)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (60-690)||(4187-4817)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (62-690)||(1674229-1674857)
chr8 (62-688)||(20863346-20863972)
chr8 (62-677)||(16685781-16686396)
chr8 (353-394)||(1969140-1969181)
[»] chr5 (4 HSPs)
chr5 (61-689)||(24103001-24103629)
chr5 (62-545)||(27999745-28000228)
chr5 (354-397)||(20155247-20155290)
chr5 (600-637)||(24106971-24107008)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (62-688)||(1281117-1281743)
[»] scaffold0475 (2 HSPs)
scaffold0475 (213-448)||(3428-3662)
scaffold0475 (439-538)||(3162-3261)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (597-690)||(1-94)


Alignment Details
Target: scaffold0288 (Bit Score: 602; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 602; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 3893 - 3224
Alignment:
Q  17 atcaagaggatatcgatgaatacacaaccacattttaagttaacattgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgacca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3893 atcaagaggatatcgatgaatacacaaccacattttaagttaacattgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgacca 3794  T
Q  117 cctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggccttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3793 cctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactccacggccttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccgtcaattcattgactagcttct 3694  T
Q  217 ccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatctcccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggcca 316  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3693 ccacctcatctctcttcacatccatatcgatttcaagtccaatctcccattcgttgcaaataaatctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggcca 3594  T
Q  317 acaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttct 416  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  3593 acaaagcattggtactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggatcagtacttgctct 3494  T
Q  417 tgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattctcaaattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatga 516  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3493 tgtggacaccagcttgtgattaggcctctatctgaaatttcattctcaaattctgatgacaaaataaacgagccgccaatgacaagatcaggcctaatga 3394  T
Q  517 tccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaattctaacagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaac 616  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3393 tccacaaaaacggtttcttgctatcggccaaaccccaagcaaattctaacagttgatttggagtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaac 3294  T
Q  617 agactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatcttctttccaaagattggaacctaaa 686  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3293 agactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatcttctttccaaagattggaacctaaa 3224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 689
Target Start/End: Original strand, 4461126 - 4461753
Alignment:
Q  62 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 161  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||| || ||||| || | ||||||  |||||||||| || || | | ||    
T  4461126 ttgtttaagcaagacatccttaatgactttgtccaagttcttgtatgaaacacctccaggtctggtatcctcctccaccttcttcttgaattccatgacc 4461225  T
Q  162 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 261  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4461226 ttttgcctcatcttctttccaatctctccaaccatcaattcgttgaccaacttctccacctcatccctcttcacatctttatcgatttcaagtccaatct 4461325  T
Q  262 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 361  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4461326 cccatttgttgcaaataaatctacagtttgctggctgatcaccaaagaatggccaacacaacatcggcactccagcacatatgctttcagtggttgaatt 4461425  T
Q  362 ccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattc 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4461426 ccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgctattaggcctctatctgaaatttcattc 4461525  T
Q  462 tcaaattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaatt 561  Q
     |||| ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  4461526 acaaactcagatgacaaaataaacgagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccataaaaagggtttcttgctatcagccaaaccccaagcaaact 4461625  T
Q  562 ctaacagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatc 661  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||||  | ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  4461626 ctaacagttgatcaggagtcataactgtgatgctgccaaaatttacatagacaacagatcctggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatc 4461725  T
Q  662 ttctttccaaagattggaacctaaagat 689  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||    
T  4461726 ttctttccaaagattggaatttaaagat 4461753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 689
Target Start/End: Original strand, 4625909 - 4626581
Alignment:
Q  17 atcaagaggatatcgatgaatacacaaccacattttaagttaacattgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgacca 116  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| || || ||||| | ||| ||||  ||||||||||||| ||||    
T  4625909 atcaagaggggattgatgaatacacaaccacattttaatctaatattgtttaagcaagacatcattaatcagtttatccatattcatgtatgaacaacca 4626008  T
Q  117 cctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggccttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttct 216  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||| ||||||  || ||||    
T  4626009 ccgggactaatgttctcctctgccttcttcttcaactccatggccttttgcctcatcttctttccgttatctcctgccatcaatgcattgatcagtttct 4626108  T
Q  217 ccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatctcccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggcca 316  Q
    | ||| | || ||||||||||    ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||    
T  4626109 ctaccccctccctcttcacattagcatcgatttccattccaatctcccattcattgcaaatatatctacaatttgttggctgatcagcaaaatttggcca 4626208  T
Q  317 acaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttct 416  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  4626209 acacagcattggaactccagcgcatatgctttcaatggttgagttccatccacaatgagttaagaatccaccaattgaaggatggttcagtactttctct 4626308  T
Q  417 tgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattctcaaattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatga 516  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4626309 tgcggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattctcaaactcggatgacgaaataaatgagccaccaatcacaagatcaggcctaatga 4626408  T
Q  517 tccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaattctaacagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaac 616  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||  || |||||| || ||||||||||||||    
T  4626409 tccacaaaaagggtttcttgctatcagccaaaccccaagcaaactctaacagtttctgtggagtcataactataacgctgccaaagttcacataaacaac 4626508  T
Q  617 agactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatcttctttccaaagattggaacctaaagat 689  Q
    |||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4626509 agactttggttccttgaattcaagccattcaagacaattggtgtcttctttccaaagattggaacctaaagat 4626581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 65 - 677
Target Start/End: Original strand, 4469809 - 4470421
Alignment:
Q  65 tttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggccttt 164  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||| || ||||| || | ||||||  |||||||||| ||||| | |  ||||    
T  4469809 tttaagcaagacatccttaatgactttgtccaagttcttgtatgaaacacctccaggtctggtatcctcctccaccttcttcttgaactccatgatcttt 4469908  T
Q  165 tgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatctccc 264  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4469909 tccctcatcttctttccattctctccaaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctttatcgatttcaagtccaatctccc 4470008  T
Q  265 attcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattcca 364  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4470009 attcattgcaaataaatctacaatttgctagctgatcaccaaagaatggccaacacaacattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgagttcca 4470108  T
Q  365 tccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattctca 464  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  4470109 tccgcaatgagtcaagaatccaccgattgaagggtggttcagtacttgctcttgaggacaccagttcacgattaggcctctatctgaaattccatttaca 4470208  T
Q  465 aattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaattcta 564  Q
    |  ||| |||| ||||  | | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  4470209 atctctgatgagaaaactaccgagccgccaatgacaagatcgggcctaatgatccacaaaaagggttgcttgctatttgccaaaccccaagcaaactcta 4470308  T
Q  565 acagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatcttc 664  Q
    ||||||  |||||||  |||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  4470309 acagtttctctggagacataactgtgacgctgccgaaatttacatagacaacagatcctggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatcttc 4470408  T
Q  665 tttccaaagattg 677  Q
    |||||||||||||    
T  4470409 tttccaaagattg 4470421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 4613847 - 4613231
Alignment:
Q  62 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 161  Q
    |||||| ||||  ||||| || || |||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||    
T  4613847 ttgtttcagcagcacctcattgatcactttgtccaagttcatatatgaacaacctcctggtctcgtgtcctcctctgccttcttcttcaactcaattgcc 4613748  T
Q  162 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 261  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||   | || ||||| |  ||||| |    
T  4613747 ttttgcctcattttctttcctttctctcccaccatcaattcattgaccagcttctctacctcatctctcttcacattggtgtcaatttccatcccaattt 4613648  T
Q  262 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 361  Q
    ||||||| ||||| |||  ||| ||||||| |||||||||  | || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  4613647 cccattcattgcatatatatctgcagtttgctggctgatccgcgaaaaatggccaacacaacattggcactccagcacatatgctttcagtggttgagtt 4613548  T
Q  362 ccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattc 461  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4613547 ccatccacaatgagtcaagaatccgccaattgaagggtggtttaatacttgctcttgaggacaccagctcgcgattaggcctctatctgaaatttcattc 4613448  T
Q  462 tcaaattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaatt 561  Q
     |||| ||| ||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  4613447 acaaactctgatgacaaaacaactgagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggttgcttgctattcgccaaaccccaagcaaact 4613348  T
Q  562 ctaacagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatc 661  Q
    |||| ||||  |||| ||| ||||| |  ||||| || ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4613347 ctaatagtttttctgcagtcataacggtcatgctcccaaaattcacataaacaacggacttcggttccttggattcaagccaatcaagacacttggtatc 4613248  T
Q  662 ttctttccaaagattgg 678  Q
    |||||||||||||||||    
T  4613247 ttctttccaaagattgg 4613231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 62 - 688
Target Start/End: Original strand, 4563714 - 4564340
Alignment:
Q  62 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 161  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||| || | ||| ||||| |||||  | |||||||| ||||| |  |||    
T  4563714 ttgtttaagcaaaacctccttgatcactttgtccaagttcatgtatgaacaacctccagctctcgtgttttcctccactttcttcttcaactcaattgcc 4563813  T
Q  162 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 261  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||   |||||||||| |  |||||||    
T  4563814 ttttgccgcatcttctttcctttctctcctgacatcaattcattgacaagtttctccacctcttctctctttacattcgtatcgatttccatcccaatct 4563913  T
Q  262 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 361  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  4563914 cccattcattgtaaataagtctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacacaacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagtt 4564013  T
Q  362 ccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattc 461  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  4564014 ccatccgcaatgagtcaagaatccgccaattgaagggtggttcaatactttctcctgtggacaccaacttgcaattaagcctctatctgaaatttcattc 4564113  T
Q  462 tcaaattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaatt 561  Q
     |||| ||  |||||||||  |   |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4564114 acaaactcagatgacaaaacgactgagccaccaatgacaaggtcaggcctaatgatccacaaaaagggtttattgcaattggccaacccccaagcaaatt 4564213  T
Q  562 ctaacagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatc 661  Q
    | |||||||| | ||| || ||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4564214 ccaacagttgttttggtgtcataactgtaatgcttccaaaattcacataaacaacggatcccggctccttggattcaagccattcaagacacttagtatc 4564313  T
Q  662 ttctttccaaagattggaacctaaaga 688  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  4564314 ttctttccaaaggttggaacctaaaga 4564340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 61 - 689
Target Start/End: Original strand, 4622144 - 4622770
Alignment:
Q  61 attgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggc 160  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||| || || ||  |||| |||||||||| ||| ||||| | |||    
T  4622144 attgtttaagcatgacctccttaataactttgtccaagttgttgtatgaacaaccaccagggctggtcgtctcatctgccttctccttcaactccatggc 4622243  T
Q  161 cttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatc 260  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  || |||  |||||| ||||| |||||||   ||| |||||| | |||||||    
T  4622244 cttttgtctcatcttctttcctttatctcccgacatcaattcattgatcagattcgacacctcctctcttttcacattagtattgatttcgattccaatc 4622343  T
Q  261 tcccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaat 360  Q
    ||||||   ||||| |||  |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4622344 tcccatgaattgcagatatatctacagtttgttggctgatcagcgaaaaatggccaacacagcattgaaactccagcacatatgctttcggtggttgaat 4622443  T
Q  361 tccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcatt 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4622444 tccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgcagggtggttaagtacttcctcttgtggacaccaacctgcgattaggcctctacctgaaatttcatt 4622543  T
Q  461 ctcaaattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaat 560  Q
    |||||| ||  |||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||     
T  4622544 ctcaaactcagatgacaaaataaacgagccgcccatgacaaggtcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctatcagccaaaccccaagcaaac 4622643  T
Q  561 tctaacagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtat 660  Q
    ||||| ||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  4622644 tctaatagttgatctcgagtcatcactgtaatgctgccaaaattcacgtaaaca--agagtcaggttccttggattcaagccactcaagacacttgatat 4622741  T
Q  661 cttctttccaaagattggaacctaaagat 689  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4622742 cttctttccaaagattggaacctagagat 4622770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 61 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 4260284 - 4259660
Alignment:
Q  61 attgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggc 160  Q
    ||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||||  ||| || |||||||||||||||||| |||| ||||| | | |    
T  4260284 attgtttgagcatgacctgcttaataactttgtccaagttcatcaatgaataaccagatggactggtgttctcctctgccttcctcttcaactccatgac 4260185  T
Q  161 cttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatc 260  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||   ||| | ||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||   |||  ||||||| |||||||    
T  4260184 cttttgcctcatcttctttccttcttctcctgacataatttcattgatcagcttcgccacctcatctcttttcacattagtattaatttcaattccaatc 4260085  T
Q  261 tcccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaat 360  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||| ||| | || || ||||||||| ||||||| |    
T  4260084 tcccattcgttacaaataaatctacagtttgttggctgatcagcaaaaaatggccaacacaacattggaacttcggcacaaatgctttcaatggttgagt 4259985  T
Q  361 tccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcatt 460  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  4259984 tccatccgcaatgagttaagaatccaccaactgaagagtggttcagtacttgctcttgcggacaccagctcgcgattaggcctctatccgaaatttcact 4259885  T
Q  461 ctcaaattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaat 560  Q
    |||||| ||  |||||||||||||  |||| ||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  4259884 ctcaaactcagatgacaaaataaaggagccaccaataatgaggtcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaatccccaagcaaac 4259785  T
Q  561 tctaacagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtat 660  Q
    ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||    
T  4259784 tctaaaaattgatctggagtcataactgtaatgctgccaaaattcacgtaaacaacagactcaggttccttaaattcaagccattcaagacatttggtat 4259685  T
Q  661 cttctttccaaagattggaacctaa 685  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4259684 cttctttccaaagattggaacctaa 4259660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 65 - 689
Target Start/End: Original strand, 4585642 - 4586266
Alignment:
Q  65 tttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggccttt 164  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||| ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||  ||||||    
T  4585642 tttaagcaaaacctccttaatcactttttccaagtttatgtatgaacaacctccaggtctcgtgtcctcctccgccttcttcttcaactcgattgccttt 4585741  T
Q  165 tgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatctccc 264  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||   | || | ||| |  ||||||||||    
T  4585742 tgcctcatcttctttccattctctcccaccatcaattcattgaccaacttctccacctcctctctcttcacattggtgtcaacttccatcccaatctccc 4585841  T
Q  265 attcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattcca 364  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  4585842 attcattgcaaataattctacagtttgttggctgatcagcaatgaatggccaacacaacattggcactccagcacatatgctttcagtggttgagttcca 4585941  T
Q  365 tccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattctca 464  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4585942 tccacagtgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcaatacttgctcttgcgggcaccaacccgcgattaggcctctatctgaaatttcattctta 4586041  T
Q  465 aattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaattcta 564  Q
    || ||  |||||||||  ||  | || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4586042 aactcagatgacaaaaccaaggaaccaccaatgacaagatcaggtctaatgatccataaaaaatgttgcttgctattggccaaaccccaagcaaactcta 4586141  T
Q  565 acagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatcttc 664  Q
    | ||||  |||| ||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  4586142 atagtttttctgtagtcataactgttgtgctcccaaaattcacataaacaacggacctcggttcctttgattcaagccaatcaagacacttggtatcctc 4586241  T
Q  665 tttccaaagattggaacctaaagat 689  Q
    |||||||||||| | || |||||||    
T  4586242 tttccaaagatttgtacttaaagat 4586266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 61 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 4256742 - 4256130
Alignment:
Q  61 attgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggc 160  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||| || ||||||| ||||| ||||||||| || || | | |    
T  4256742 attgtttaagcatgacctccttaataactttgtccaagttcatcaatgaatgaccagctgggctggtgttcttctctgtcttcttcttcaattccatgac 4256643  T
Q  161 cttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatc 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||| |||||||    
T  4256642 cttttgcctcatcttctttcctttttctcccgacatcaattcattgatcagattctccacctcatctctcttcacattagtattgatttcaattccaatc 4256543  T
Q  261 tcccattcgttgcaaataattctacagtttgttgg-ctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaa 359  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||||||| |||||||     
T  4256542 tcccattcgctacaaataaatctacagtttgttggtctgatcagcaaaaaatggccaacacaacattggaactccggcacaaatgctttcaatggttgag 4256443  T
Q  360 ttccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcat 459  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||          
T  4256442 ttccatcctcaatgagtcaagaatccaccaactgaagagtggttcagtacttgctcttgcggacaccaactctcgattagtcctctatccgaaa------ 4256349  T
Q  460 tctcaaattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaa 559  Q
     ||||       |||||||||||||  |||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4256348 -ctca------gatgacaaaataaaggagccaccaatgacgaggtcaggcctaatgatacacaaaaatggtttcttgctattggccaatccccaagcaaa 4256256  T
Q  560 ttctaacagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggta 659  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4256255 ctctaacagttgatctggagtcataactgtaatgctgccaaaattcacgtaaacaacagactcaggttccttggattcaagccattcaagacacttggta 4256156  T
Q  660 tcttctttccaaagattggaacctaa 685  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  4256155 tcttctttccaaagattggaacctaa 4256130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 61 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 4267296 - 4266668
Alignment:
Q  61 attgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggc 160  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| | | |    
T  4267296 attgtttaagcatgacctccttaataactttgtccaagttcatgtatgaaaaaccaccaggtcttgtgttctcttctgccttcctcttcaactccaagac 4267197  T
Q  161 cttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatc 260  Q
     |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||    
T  4267196 attttgcttcatcatatttcctttctctcccaccatcaattcattgactaacttctcgacgtcatctctcttcacatttgtattgatttcgagtccaatc 4267097  T
Q  261 tcccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaat 360  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4267096 tcccattcatagcaaataaatctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacacaacattggcactccagcacatatgctttcagtggttgaat 4266997  T
Q  361 tccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcatt 460  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  4266996 tccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttcttt 4266897  T
Q  461 ctcaaattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaat 560  Q
       ||| ||  ||||||||| ||   |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  4266896 aaaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgctgttggccaaaccccaagcaaac 4266797  T
Q  561 tctaacagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtat 660  Q
    ||||| || |  ||| | |  |||||||  ||||| || ||||| ||||||||||||||    ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  4266796 tctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtat 4266697  T
Q  661 cttctttccaaagattggaacctaaagat 689  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4266696 cttctttccaaagattggaatttaaagat 4266668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 65 - 688
Target Start/End: Original strand, 4592237 - 4592860
Alignment:
Q  65 tttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggccttt 164  Q
    ||||||||| |||||||| || | |||||||| |||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  4592237 tttaagcaacacctccttgatcaatttgtccaagttcatatatgaacaacctccaggtctcgtgttctcctctgccttcttcttcaactcgattgccttt 4592336  T
Q  165 tgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatctccc 264  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||   |||| ||||| |  ||||||||||    
T  4592337 ttcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgataagtttctccacctcctctctctttacattcgtatcaatttccatcccaatctccc 4592436  T
Q  265 attcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattcca 364  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  4592437 attcattgtaaataagtctacagtttgttggctgatcactaaagaatggccaacacaacattggaattccagcacatatactttcagtggttgagttcca 4592536  T
Q  365 tccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattctca 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  4592537 tccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggtttaatacttgctcttgaggacaccagctcgcgattacgcctctatctgaaatttcattcaca 4592636  T
Q  465 aattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaattcta 564  Q
    || ||  ||||||||| ||    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4592637 aactccgatgacaaaacaattgtgccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaaaggtttattgcaattggccaaaccccaagcaaactcta 4592736  T
Q  565 acagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatcttc 664  Q
    ||| ||  |||  | | ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||  | | |||||| ||||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  4592737 acattttctcttcattcataactgtaaggctgccgaaattcacataaacaacggaacccgattccttcgattcaagccatttaagacactcagtatcttc 4592836  T
Q  665 tttccaaagattggaacctaaaga 688  Q
    |||||| |  |||||||| |||||    
T  4592837 tttccatatgttggaaccaaaaga 4592860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 62 - 686
Target Start/End: Original strand, 4601792 - 4602416
Alignment:
Q  62 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 161  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| | ||||    
T  4601792 ttgtttaagcaacacctccttaataactttgtccaggttcttgtatgaacaaccacctagtctagtgctctcctttgccatcttcttcaactccatggcc 4601891  T
Q  162 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 261  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||| ||||||||  |||||| ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||| |  |||||||    
T  4601892 ttttgcctcatcttcttgcctttatctccggctatcacttcattgatcagcttcgccaactcctctctcttcacatttgtatcgatttccataccaatct 4601991  T
Q  262 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 361  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  4601992 cccattcattacaaataaatctacagtttgttggctgatcggcaaaaaaaggccaacacaacatcggcactccagcacatatgctttcagtggttgagtt 4602091  T
Q  362 ccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattc 461  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  4602092 ccatccacaatgagtcaagaatccgccgatcgaagggtggttcaacactttctcttgtggacaccaacttgctattaggcctctatctgaaatttcattt 4602191  T
Q  462 tcaaattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaatt 561  Q
      ||| ||  |||||||||| |   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||| ||||    
T  4602192 gtaaactcagatgacaaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttatggcaattggccaaaccccaagcgaatt 4602291  T
Q  562 ctaacagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatc 661  Q
    |||| | |||||  || || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  4602292 ctaataattgatggggtgtcataactgtaatgctgccaaaattcacataaacaacggatcccggctccttggattcaagccattcaagacactcagtatc 4602391  T
Q  662 ttctttccaaagattggaacctaaa 686  Q
    ||||||||| || ||||||||||||    
T  4602392 ttctttccagaggttggaacctaaa 4602416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 62 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 4515250 - 4514622
Alignment:
Q  62 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 161  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||| |||||||   || ||  ||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |   ||    
T  4515250 ttgtttaagcaacacctccttgatcactttgtccaagttcaagtatgaagacccgccaagtctagtgtcctcgtctgccttctttttcaactccataacc 4515151  T
Q  162 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 261  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||   |||||||||| |  |||||||    
T  4515150 tttttcctcattttatttcctttctctcccaccatcaattcattgacaagcttttcaacctcctctctcttcacattcatatcgatttcgatcccaatct 4515051  T
Q  262 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 361  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4515050 cccattcattgcaaataaatctacagtttgttggttgatcaccaaagaattgccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctctcagtggttgagtt 4514951  T
Q  362 ccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattc 461  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4514950 ccatccgcaatgagtcaagaatccgccaattgaagggtggttcaaaactttctcttgtggacaccaacttgctattaggcctctatctgcaatttcattc 4514851  T
Q  462 tcaaattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaatt 561  Q
     |||| ||  | |||||||  |   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4514850 acaaactcagacgacaaaaccactgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccataaaaaggttttcttgctattggccaaaccccaagcaaact 4514751  T
Q  562 ctaacagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatc 661  Q
    |||||| ||  || ||||  ||||  |  ||||| || ||||| ||||||||||||||  | | ||| || ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  4514750 ctaacaatttctccggagacataatcgtgatgctaccaaaattaacataaacaacagatcctgattcttttgattcaagccattcaagacatttagtatc 4514651  T
Q  662 ttctttccaaagattggaacctaaagatt 690  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4514650 ttctttccaaagattggaacctaaagatt 4514622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 62 - 688
Target Start/End: Original strand, 4617025 - 4617651
Alignment:
Q  62 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 161  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  4617025 ttgtttaagcaacacatccttaataactttgttcaagttcatgtatgaacaaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttcttcaactccatggcc 4617124  T
Q  162 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 261  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||  | |||| ||||||||  |||||  ||| ||| |||||||||||||   |||||||||| |  |||||||    
T  4617125 ttttgcttcattttctttcctttatctccggctatcacttcattgatcagctttgccaactcctctctcttcacattcgtatcgatttccataccaatct 4617224  T
Q  262 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 361  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| ||  |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4617225 cccattcattacaaataaatctacagtctgttggctggtcggcaaaaaatggccaacacaacattggcactccagcgcatatactttcagtggttgaatt 4617324  T
Q  362 ccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattc 461  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||     
T  4617325 ccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttgtcttgtggacaccaacttgctattaggcctctatctgcaatttcattt 4617424  T
Q  462 tcaaattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaatt 561  Q
      ||| ||  |||| ||||| |   |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4617425 gtaaactcagatgagaaaatcactgagccaccaatgacaagatcaggccttatgatccacaaaaatgatttcttgcaattggccaaaccccaagcaaatt 4617524  T
Q  562 ctaacagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatc 661  Q
    | |  | ||| || || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  4617525 ccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaattcacataaacaactgatcccggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatc 4617624  T
Q  662 ttctttccaaagattggaacctaaaga 688  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||    
T  4617625 ttctttccaaaggttggaatctaaaga 4617651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 62 - 687
Target Start/End: Original strand, 4505860 - 4506485
Alignment:
Q  62 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 161  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| || | ||||| |||| |||| || ||||| | | ||    
T  4505860 ttgtttaagcaacacctccttaataactttgtccaagttcatgaatgaacaaccaccaggtcttgtatcctcctttgccctctttttcaactccatgacc 4505959  T
Q  162 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 261  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||| || |  ||||| |||||||   |||| ||||| | ||||||||    
T  4505960 tttttcctcatcttgtttcctttctctccaaccataatttcatcgaccagcttctctacattttctctattcacattagtatcaatttcgattccaatct 4506059  T
Q  262 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 361  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4506060 ccaattcattgcaaataaatctacagtttgttggttgatcaccaaagaacggccaacacagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgagtt 4506159  T
Q  362 ccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattc 461  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||  ||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||     
T  4506160 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtgatttaacactttctcttgtgaacaccagcttgctataaggcttctatctgaaatttcattt 4506259  T
Q  462 tcaaattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaatt 561  Q
     |||| ||| | |||||||  |   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4506260 gcaaactctgaagacaaaaccactgagccaccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaact 4506359  T
Q  562 ctaacagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatc 661  Q
    |||| | ||  || ||||  |||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||||  | ||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  4506360 ctaaaaatttctccggagacataattgtgatgcttccaaaattcacataaacaacagaagccggttcttttgattccagccattcgagacatttagtatc 4506459  T
Q  662 ttctttccaaagattggaacctaaag 687  Q
     |||||||||||||| ||| ||||||    
T  4506460 ctctttccaaagatttgaatctaaag 4506485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 62 - 676
Target Start/End: Original strand, 4480696 - 4481310
Alignment:
Q  62 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 161  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||    
T  4480696 ttgtttaagcaagacctccttaatcactttgtccaagttcatgtatgaacaaccaccaggtcttgtgtcctcctctgccatcttcttcaactccatggcc 4480795  T
Q  162 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 261  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||| || |||||||||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  4480796 ttttgcttcatcttctttcctttctctcccaccaacaattcattgattaacctctccacatcttctctcttcacattggtatcgatttcgagtccaatct 4480895  T
Q  262 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 361  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||    
T  4480896 cccattcattgcaaataattctacggttaggtggctgatcggcaaagaatggccaacacaacattggcactccagcacatacactttcagtggttgagtt 4480995  T
Q  362 ccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattc 461  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  4480996 ccatccgcaatgagtcaagaatccgccgattgaagggtggttcaaaactttctcttgtggacaccaacttgctattaggcctctatttgaaatttctttc 4481095  T
Q  462 tcaaattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaatt 561  Q
      | | ||  ||||||| |  |   |||| ||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  4481096 aaatactcagatgacaacaccactgagccaccaatgacaagattagacctaataatccacaaaaagttttttttgctattggcaaaaccccaagcaaact 4481195  T
Q  562 ctaacagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatc 661  Q
    |||| ||||  ||| |||  |||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  4481196 ctaagagtttctcttgagacataattgtgatgctgccaaaatttacataaacaacagatcctggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatc 4481295  T
Q  662 ttctttccaaagatt 676  Q
    |||||||||||||||    
T  4481296 ttctttccaaagatt 4481310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 62 - 678
Target Start/End: Original strand, 4579435 - 4580051
Alignment:
Q  62 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 161  Q
    |||||| || || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||  || || ||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||| |  |||    
T  4579435 ttgtttgagtaacacctccttaatcactttctccaagttcatgtatgaacagcctccaggtctcgtgtcctcctccaccttcttcttcaactcaattgcc 4579534  T
Q  162 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 261  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||   | |||||||||| |||||| |    
T  4579535 ttttgcctcatcttctttgctttctctcccaccatcaattcattaaccagcttctccacctcctctctcttcacattagtgtcgatttcaattccaattt 4579634  T
Q  262 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 361  Q
     ||||   ||||| | |  ||| ||| ||  ||| |||||| | || ||||||||||| | |||||| ||||||||  |||||||||||||| |||| ||    
T  4579635 tccatgtattgcataaatatctgcagcttactgggtgatcagcgaaaaatggccaacacaacattggaactccagcagatatgctttcagtgattgagtt 4579734  T
Q  362 ccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattc 461  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4579735 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgcggacaccagctcgttattaggcctctatctgaaatttcattc 4579834  T
Q  462 tcaaattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaatt 561  Q
     |||| ||  ||||||||| |    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  4579835 acaaactccgatgacaaaacagctgagccgccgatgacaagatcgggcctaatgatccacaaaaagggttgcttgctatttgctaaaccccatgcaaact 4579934  T
Q  562 ctaacagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatc 661  Q
    |||||||||  |||| ||| |||||||  | ||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  4579935 ctaacagtttttctgcagtcataactgtcaagctcccaaaattcacataaacaacagacctaggttccttggattcaagccaataaagacacttggtatc 4580034  T
Q  662 ttctttccaaagattgg 678  Q
    ||||||||||| |||||    
T  4580035 ttctttccaaaaattgg 4580051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 62 - 684
Target Start/End: Original strand, 4516324 - 4516946
Alignment:
Q  62 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 161  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || | ||||    
T  4516324 ttgtttgagcagcacctccttaatcactttttccaagttcacatatgaacaaccacctggtcttgtgtcctcctctgccttcttcttcaattccatggcc 4516423  T
Q  162 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 261  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||   |||| |||||   ||||||||    
T  4516424 ttttgcctcatcttctttcctttatctcccaccattaattcattgatcagcttctccacctcctctctcttcacattggtatcaatttctgctccaatct 4516523  T
Q  262 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 361  Q
    ||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||| ||| |||| || |||||||| | |||||| ||||| || || ||||||||  | || || ||    
T  4516524 cccattcattgcaaatatatctgcaatttgttggctgctcagcaaaaaaaggccaacacaacattggtactccggcacagatgctttccattgtggagtt 4516623  T
Q  362 ccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattc 461  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||  ||||  ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  4516624 ccatccacaatgagtcaagaatcctccaactgaaggatggttcaacactttctcttgcggacaccagcttgctattacgcctctatccgaagtttcattc 4516723  T
Q  462 tcaaattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaatt 561  Q
     |||| ||  |||||||||||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  4516724 acaaaatcggatgacaaaataaccgagccaccaatgacaaggtcaggcctaataatccacaaaaaaggtttcttgctgttggccaaaccccaagcgaact 4516823  T
Q  562 ctaacagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatc 661  Q
    ||||||||||||||||||| || || |  ||||| || |||||||||||||| |||||  |  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||    
T  4516824 ctaacagttgatctggagtcatgaccgtgatgcttccaaaattcacataaactacagaaccttgttccttagattcaagccattcaagacatttcatatc 4516923  T
Q  662 ttctttccaaagattggaaccta 684  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  4516924 ttctttccaaagattagaaccta 4516946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 62 - 678
Target Start/End: Original strand, 4557128 - 4557744
Alignment:
Q  62 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 161  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| |||||| |||| | ||| |    |    
T  4557128 ttgtttaagcaaaacctccttaatcactttttccaaattcatgtatgaacaaccaccaggtctcgtgtcctcctccgccttcgtcttcatctcaattatc 4557227  T
Q  162 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 261  Q
    |||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||   | || ||||| |  |||||||    
T  4557228 tttttccacatcttctttcctttctccccctccatcaattcattgaccaaattctctacctcatctctcttcacattggtgtcaatttccatgccaatct 4557327  T
Q  262 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 361  Q
    |||||   |||||||||  ||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  4557328 cccatgtattgcaaatatatctgcagtttgctggctgatcagcaaaaaatggccaacacaacattggaactccagcagatatgctttcagtggttgagtt 4557427  T
Q  362 ccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattc 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  4557428 ccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaaggatggtttaatacttgctcttgcgggcaccagcccgcgattaggcctctatctgaaatttcattg 4557527  T
Q  462 tcaaattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaatt 561  Q
     |||| ||  ||||||||| ||   |||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  4557528 acaaactccgatgacaaaacaactgagccaccgatgacaagatcgggcctaatgatccacaaaaagggttgcttgctatttgctaaaccccatgcaaact 4557627  T
Q  562 ctaacagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatc 661  Q
    |||||||||  ||||  || |||||||  ||||| || ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||    
T  4557628 ctaacagtttttctgccgtcataactgtcatgctcccaaaattcacataaacaacggacctcggttccttggattcaagccaaccaagacacttgttatc 4557727  T
Q  662 ttctttccaaagattgg 678  Q
    |||||||||||||||||    
T  4557728 ttctttccaaagattgg 4557744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 63 - 689
Target Start/End: Original strand, 4598175 - 4598801
Alignment:
Q  63 tgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcct 162  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||| ||  |||| || | |||||| |||||| |||| || || |  | ||    
T  4598175 tgtttaagaaacacctccttaatcactttctctaagttcatgtatgaacaacctccaagtctcgtttcctcctccgccttcatcttcaaatcaattgtct 4598274  T
Q  163 tttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatctc 262  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||   | || ||||  | |||||||||    
T  4598275 tttgcctcattttctttcctttatctcccgacatcaattcgttgaccagcttctccacctcctctctcttcacattagtttcaattttgattccaatctc 4598374  T
Q  263 ccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattc 362  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||| | | |||||||  | || || || ||||| | |||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||    
T  4598375 ccattcattgcaaatatatctgcagttggcttgctgatccgcgaaaaagggacaacacaacattggcactccggcacatatactttcagtggttgagttc 4598474  T
Q  363 catccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattct 462  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||  ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||     
T  4598475 catccgcaatgagttaagaatccaccaattgaaggatggtttaatacttgctcttgcagacaccagcttgcaactaagcctctatctgaaatttcattca 4598574  T
Q  463 caaattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaattc 562  Q
    |||| ||  ||||||||| || | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4598575 caaactccgatgacaaaacaaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaagtc 4598674  T
Q  563 taacagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatct 662  Q
    |||||  |  |||| ||| || || |  ||||| || |||||||||||||||||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4598675 taacaacttttctgcagtcatcaccgttatgctcccaaaattcacataaacaacagaccttggttcattggattcaagccagtcaagacacttggtatct 4598774  T
Q  663 tctttccaaagattggaacctaaagat 689  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4598775 tctttccaaagattggtacctaaagat 4598801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 61 - 689
Target Start/End: Original strand, 3171743 - 3172371
Alignment:
Q  61 attgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggc 160  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||   ||| || | |||||||||||||||||| ||||| | |||    
T  3171743 attgtttaagcaagacctccttaatcactttatccaagttcatgtatgaacaaccaccaaatcttgtatcctcctctgccttcttcttcaactccatggc 3171842  T
Q  161 cttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatc 260  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||| |||||  ||||||| ||||   |||| ||||| |  ||||||    
T  3171843 cctttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcgttgatcagtttctctacctcccctctctttacattggtatcaatttccatcccaatc 3171942  T
Q  261 tcccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaat 360  Q
    | |||||| | |||||||||||||| ||| | ||| |||||| |||| ||||||| ||| | |||||||| |||||| ||||  ||||| |||||||| |    
T  3171943 ttccattcttggcaaataattctactgttaggtggttgatcagcaaaaaatggcctacacaacattggcattccagcacatacactttccgtggttgagt 3172042  T
Q  361 tccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcatt 460  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3172043 tccatccgcagtgagtcaagaatccgccaattgaaggatggttcaacactttctcttgcggacaccaacttgctattaggcctctatctgaaatttcatt 3172142  T
Q  461 ctcaaattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaat 560  Q
    | |||| ||  ||||||||| || | |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  3172143 cacaaactccgatgacaaaacaaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaataatccacaaaaagggtttcttgctgttggctaaaccccaagcaaac 3172242  T
Q  561 tctaacagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtat 660  Q
    ||||| | ||  ||| |||  ||||||   |||||||| ||||| |||||||||||||| |  | ||| || | ||| |||||||||||||| || ||||    
T  3172243 tctaataatttctcttgagacataactatgatgctgccaaaatttacataaacaacagattttgattcttttgtttcaagccattcaagacatttagtat 3172342  T
Q  661 cttctttccaaagattggaacctaaagat 689  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3172343 cttctttccaaagattagaatctaaagat 3172371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 65 - 678
Target Start/End: Original strand, 4570978 - 4571591
Alignment:
Q  65 tttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggccttt 164  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| | ||| |     |||    
T  4570978 tttaagcaaaacctccttaatcactttttccaagttcatgtatgaacaaccaccaggtctcgtgtcctcctccgccttcttcttcatctccattatattt 4571077  T
Q  165 tgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatctccc 264  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| | |||||||||||    
T  4571078 ttcctcatcttctttcctttatctcccaccatcaattcattgaccaaattctccacctcatttctcttcacattagtatcgatttcgattccaatctccc 4571177  T
Q  265 attcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattcca 364  Q
    ||   ||||| |||  ||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||| | |||||| |||||||   |||||||||| || ||||| |||||    
T  4571178 atgtattgcagatatatctacagtttgctggctgatcagcaaaaaatggctaacacaacattggaactccagtagatatgctttcggtcgttgagttcca 4571277  T
Q  365 tccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattctca 464  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| |  ||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4571278 tccacagtgagtcaagaaaccaccaattgaaggatggttcaatactttctcttgcgagcaccaaccagcaattaggcctctatctgaaatttcattcaca 4571377  T
Q  465 aattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaattcta 564  Q
    || ||  ||||||||| ||   |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  4571378 aactccgatgacaaaacaactgagccaccaatgacaagatcgggcctaatgatccacaaaaagagttgcttgctatttgctaaaccccatgcaaactcta 4571477  T
Q  565 acagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatcttc 664  Q
    ||||||  |||| ||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  4571478 acagtttttctgaagtcataactgtcctgctcccaaaattcacataaacaacggacctcggttcctttgattcaagccaatcaagacacttgttatcttc 4571577  T
Q  665 tttccaaagattgg 678  Q
    ||||||||||||||    
T  4571578 tttccaaagattgg 4571591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 180 - 689
Target Start/End: Original strand, 4457715 - 4458225
Alignment:
Q  180 cctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatctcccattcgttgcaaataa 279  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  4457715 cctttttctcccaccatcaattcattgactaacttctccacctcatctctcttcacatttgtatcgatttccatcccaatctctcattcattgcaaataa 4457814  T
Q  280 ttctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccacaatgagtcaa 379  Q
     ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  4457815 atctacaacttgttggcttatcaccaaagaatggccaacgcagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgagtttcatccacaatgagtcaa 4457914  T
Q  380 gaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattctcaaattctaatgacaaa 479  Q
    |||||| || ||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||| |||| ||  ||||||||    
T  4457915 gaatcctccgattgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattaagcctctatcagaagtttcattcacaaaatccgatgacaaa 4458014  T
Q  480 ataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccac-aaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaattctaacagttgatctgga 578  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |  ||| ||    
T  4458015 acaaccgagccaccaatgacaagatcaggcctagttatccacaaaaaaggttttcttgctgttggccaaaacccaagcaaattctaagagcttctcttga 4458114  T
Q  579 gtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatcttctttccaaagattgg 678  Q
    |  |||||||  ||||| || ||||| ||||||| ||||||||  ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  4458115 gacataactgtgatgcttccaaaatttacataaataacagactttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatattctttccaaagattgg 4458214  T
Q  679 aacctaaagat 689  Q
    ||  |||||||    
T  4458215 aatttaaagat 4458225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 339 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 4299673 - 4299322
Alignment:
Q  339 catatgctttcagtggttgaattccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgatta 438  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  4299673 catatgctttcaatggttgagttccatccacagtgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacactagcttgcggtta 4299574  T
Q  439 ggcctctatctgaaatttcattctcaaattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgct 538  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  4299573 ggcctctatttgaaatttcattctcaaactcagatgacaaaataaacaagccgccaatgacaaggtctggcctaatgatccacaaaaatggtttcctgca 4299474  T
Q  539 attggccaaaccccaagcaaattctaacagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcg 638  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||     
T  4299473 attggccaaaccccaagcaatctctaacagttgctctggagtcataactgtaacgctgccaaaattcacataaacaaccgatcccggctccttggattca 4299374  T
Q  639 agccattcaagacacttggtatcttctttccaaagattggaacctaaagatt 690  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4299373 agccattcaagacatttggtatcttctttccaaagattggaacctaaagatt 4299322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 65 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 4490481 - 4489856
Alignment:
Q  65 tttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggccttt 164  Q
    ||||||||  || |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||| |||| |||| ||||||||||||| |||||    ||||||    
T  4490481 tttaagcatgacatccttaatcactttgtccaagttcatgtatgaactaccaccgagtctcgtgtcctccgctgccttcttcttcaactccgtcgccttt 4490382  T
Q  165 tgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatctccc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||| ||||   |||| ||||  |  ||||||||||    
T  4490381 tgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgatcagtttctctacctcttctctctttacattggtatcaattttcatcccaatctccc 4490282  T
Q  265 attcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattcca 364  Q
    |||| | |||||||||||||| | |   ||| |||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||  || |||| |||||    
T  4490281 attcttcgcaaataattctactgctaagtggttgatcagcaaaaaatggccaacacaacattggcactccagcacatatactctccatgattgagttcca 4490182  T
Q  365 tccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattctca 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||  |    
T  4490181 tccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtgattcaataccttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaa 4490082  T
Q  465 aattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaattcta 564  Q
    || ||  ||||||| |      |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  4490081 aaatcagatgacaacacctgtgagccaccaataacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctgttggccaaaccccatgcaaactcta 4489982  T
Q  565 acagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatcttc 664  Q
    | || |  ||| |||  ||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  4489981 atagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagatcctggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttc 4489882  T
Q  665 tttccaaagattggaacctaaagatt 690  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||    
T  4489881 tttccaaagattagagtctaaagatt 4489856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 62 - 689
Target Start/End: Original strand, 4574311 - 4574938
Alignment:
Q  62 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 161  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||| ||| || ||||| |||| | ||||  |||||||||| | ||| | |||     
T  4574311 ttgtttaagcaacacctccttaatcactttctccaagtttgtgtatgaacaacctccaggtctcgtgtccacctccaccttcttcttcagctcaatggct 4574410  T
Q  162 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 261  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||   ||||||||||   ||||||||    
T  4574411 ttttgcctcatcttctttcctttatctccggacatcaattcattgaccagtttctccacctcctccctctttacattagtatcgatttcctttccaatct 4574510  T
Q  262 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 361  Q
    ||||||| |||||||||  ||| ||||||| |||||||||   ||| ||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  4574511 cccattcattgcaaatatatctgcagtttgctggctgatccgaaaaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagtt 4574610  T
Q  362 ccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattc 461  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  4574611 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttc 4574710  T
Q  462 tcaaattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaatt 561  Q
      ||| ||  |||| ||||  | | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  4574711 aaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaact 4574810  T
Q  562 ctaacagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatc 661  Q
    |||  || |  ||| |||  ||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||    ||||| || ||||| | |||||||||||| || |||||    
T  4574811 ctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaatccattcaagacatttagtatc 4574910  T
Q  662 ttctttccaaagattggaacctaaagat 689  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  4574911 ttctttccaaagattagagtctaaagat 4574938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 62 - 676
Target Start/End: Original strand, 4560509 - 4561121
Alignment:
Q  62 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 161  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||| || ||||| |||| | |||| ||||| ||||| | ||| | ||||    
T  4560509 ttgtttaagcaacacctccttaatcactttctccaagttcatgtatgaacaacctccaggtctcgtgtacacctccgcctttttcttcagctccatggcc 4560608  T
Q  162 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 261  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||| || |||||||| || || ||||| |||| | |||| |||||   ||||||||    
T  4560609 ttttgcctcatcttctttcctttatctcaggacatcaattcattgaccagtttctccacgtcctccctctttacatttgtatcaatttcgtttccaatct 4560708  T
Q  262 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 361  Q
     |||||| |||||||||  ||| ||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  4560709 tccattcattgcaaatatatcttcagtttgctggctgatctgcaaaaaatggccaacacaacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagtt 4560808  T
Q  362 ccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattc 461  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  4560809 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgatgggtggttcaatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttc 4560908  T
Q  462 tcaaattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaatt 561  Q
      ||| ||  |||| ||||  | | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  4560909 -aaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccataaaaatggtttcttgctgttggccaaaccccaagcaaact 4561007  T
Q  562 ctaacagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatc 661  Q
    ||||  | |  ||| |||   |||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  4561008 ctaa-ggcttctcttgagacttaacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagatcctggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatc 4561106  T
Q  662 ttctttccaaagatt 676  Q
    |||||||||||||||    
T  4561107 ttctttccaaagatt 4561121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 65 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 4504523 - 4503899
Alignment:
Q  65 tttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggccttt 164  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  4504523 tttaagcaagacgtccttaatcactttgtccaagttcatgtatgaacaaccaccaagtcttgtgtcctcctctgccttcttcttcaactccatggccttt 4504424  T
Q  165 tgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatctccc 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||| ||||| |||||||  ||||    ||| || |  |  ||||||||||    
T  4504423 tgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattaataagtttctctacctcttctctctgtacattggcatcaatcttcatcccaatctccc 4504324  T
Q  265 attcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattcca 364  Q
    |||| | |||||||||  | |  ||   ||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||||||| || |  |||||||||||||| |||||    
T  4504323 attcttcgcaaataatgttgctattaagtggctgatcagaaaaaaatggccaacacaacattggcactccagcacaaacactttcagtggttgagttcca 4504224  T
Q  365 tccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattctca 464  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |  || |||||||  ||| |||||||| ||    
T  4504223 tccacaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctacaagtcctctattagaagtttcattcaca 4504124  T
Q  465 aattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaattcta 564  Q
    || ||  ||||||| |      |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4504123 aaatcagatgacaacacctctgagccaccaataacaagatcaggcctaataatccacaaaaaaggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactcta 4504024  T
Q  565 acagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatcttc 664  Q
    ||| || ||||  ||  ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||  |||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  4504023 acaatttatcttaagacataactgtaatgctgccaaaatttacataaacaacagatcctggttcttttaattcaagccaatcaagacatttagtatcttc 4503924  T
Q  665 tttccaaagattggaacctaaagat 689  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||    
T  4503923 tttccaaagattagagtctaaagat 4503899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 78 - 688
Target Start/End: Original strand, 4568072 - 4568673
Alignment:
Q  78 tccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttcttt---aactcgacggccttttgcctcatct 174  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||  | |||| ||||| |||| || |||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||    
T  4568072 tccttaatcactttgtccaagttcatgtatgaagaatcaccaggtcttgtgtccttctctgccttcttcttcttcaactccacggccttttgcctcatct 4568171  T
Q  175 tctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatctcccattcgttgca 274  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| | ||| |||||| | |  || ||    
T  4568172 tttttcctttctgtcccaccattaattcattcatcagcttctccacctcctctctcttcacatttgtatcaatttcgattccgatctccaacttattaca 4568271  T
Q  275 aataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccacaatga 374  Q
    ||||  ||| |||| ||||||||| |||  ||| || |||||||| | |||||| ||||  || || ||||||||    || || |||||||||||||||    
T  4568272 aatatatctgcagtatgttggctgctcagaaaaaaaaggccaacataacattggtactctggcacaaatgctttccaatgtggagttccatccacaatga 4568371  T
Q  375 gtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattctcaaattctaatg 474  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||| || ||||| |||| ||  |||    
T  4568372 gtcaagaatcgtccaactgaagggtggttcaacacttgctcttgcggacaccagcttgctatttggcctctatccgaagttccattcacaaactcggatg 4568471  T
Q  475 acaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaattctaacagttgatc 574  Q
    |||||||||   |||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || ||||||   || ||    
T  4568472 acaaaataactgagccaccaatgacaagctaaggcctaatgatccacaaaaaaggtttcttgctgttggcaaaacctcaagagaactctaac---tgctc 4568568  T
Q  575 tggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatcttctttccaaaga 674  Q
    |||||| |||||   | |||| || |||||||||||||| |||||  |  ||||||| |         |||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  4568569 tggagtcataaccatagtgcttccaaaattcacataaactacagaaccttgttccttag---------attcaagacatttcatatcttctttccaaaga 4568659  T
Q  675 ttggaacctaaaga 688  Q
    ||||||||||||||    
T  4568660 ttggaacctaaaga 4568673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 62 - 450
Target Start/End: Original strand, 4492958 - 4493346
Alignment:
Q  62 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 161  Q
    |||||||||||| || ||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||   |||| ||||||||||||||| || |||||   |||     
T  4492958 ttgtttaagcaagacatccttgatcactttgtccaagttcatgtatgaacaaccaccaggtactgtgtcctcctctgccttctttttcaactccgtggct 4493057  T
Q  162 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 261  Q
    |||  ||||||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||| || |||||||| |  ||||| || ||||  ||||||||||| | ||||||||    
T  4493058 tttctcctcatcttgtttcctttctctccaaccataatctcattgaccagattctccacattttctctattaacattcctatcgatttctactccaatct 4493157  T
Q  262 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 361  Q
    || |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| || |||||| |||  || ||||| ||    
T  4493158 ccaattcattgcaaatcaatctacagtttgttggctgatcactaaagaaaggccaacacaacattggcactccggcacatatgtttttggtagttgagtt 4493257  T
Q  362 ccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctg 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||  |||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  4493258 ccatccacaatgagtcaagaatccaccaatcgaatggtggttcagcagtttctcttgtggacaccaactagcaattaggcctctatctg 4493346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4299870 - 4299671
Alignment:
Q  61 attgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggc 160  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||      |||||    ||    
T  4299870 attgtttaagcagaacctccttaataactttgtccaagttcatgtacgaacaaccacctggattagtgttctcctctgccttc------aactcccttgc 4299777  T
Q  161 cttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatc 260  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||| |||||| | |||||||||| | |||||||    
T  4299776 cttttgtctcatcttatctcctttctctcccaccatcaattcattgatcagcttttccacctcctctctcctcacatttgtatcgatttcgattccaatc 4299677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 4391976 - 4391850
Alignment:
Q  342 atgctttcagtggttgaattccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcga----tt 437  Q
    ||||||||| ||| ||| || ||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||||| |||||||     |    
T  4391976 atgctttcaatgggtgagtttcatccacaatgcgttaagaatccacaaattcaagggtggttcaatacttgctctttcggacaccatcttgcgactagat 4391877  T
Q  438 aggcctctatctgaaatttcattctca 464  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  4391876 agacctctatctgaaatttcattctca 4391850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 4392154 - 4392052
Alignment:
Q  63 tgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcct 162  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||  |||||| ||||  |||| ||||| |||||||||||| |||||||  ||||    
T  4392154 tgtttaagcaagacctccttaatcagtttgtccaagttcatgaatgaagaaccaccaggtcatgtgtcctcctttgccttcttcttcaactcgatcgcct 4392055  T
Q  163 ttt 165  Q
    |||    
T  4392054 ttt 4392052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4607020 - 4606958
Alignment:
Q  62 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtct 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  4607020 ttgtttaagcaaaaccttcttaatcactttttccaagttcatgtatgaaaaaccacctggtct 4606958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 4835567 - 4835517
Alignment:
Q  639 agccattcaagacacttggtatcttctttccaaagattggaacctaaagat 689  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4835567 agccattcaagacattttgtatcttccttccaaagatcggaacctaaagat 4835517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 689
Target Start/End: Original strand, 3086417 - 3087050
Alignment:
Q  56 ttaacattgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcg 155  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    || |||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  3086417 ttaatattttttaagcaagacctccttaataactttgtccaagttcatgtatgaacaaccaccgatactggtgttctcttctgctttcttctttaactct 3086516  T
Q  156 acggccttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtc 255  Q
     || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||    
T  3086517 gcgacattttgcctcatcttctttcctttatctcccaccatcaattcattgatcagcttctcgacctcctctctcttcacattagtatcgatttcaattc 3086616  T
Q  256 caatctcccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggt 355  Q
    |||||||||||   ||||| |||  |||||||||| |||| ||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||||||||   || |||||||   ||    
T  3086617 caatctcccatatattgcagatatatctacagtttattggttgatctccataaaatggccaacacaacattggcactccagcaagtacgctttcaaccgt 3086716  T
Q  356 tgaattccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatt 455  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3086717 tgagttccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtgattcaatacttgctcttgcggacaccagcttgcgattagacctctatctgaaatt 3086816  T
Q  456 tcattctcaaattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaag 555  Q
    || |||||||| ||  |||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3086817 tctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaag 3086916  T
Q  556 caaattctaacagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacactt 655  Q
    |||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3086917 caaactctaatagttgctcttgagtcataactgtaatgctgccaaaactcacataaacaacagactcaagtccctttgattcaagccattcaagacactt 3087016  T
Q  656 ggtatcttctttccaaagattggaacctaaagat 689  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3087017 ggtatcttctttccaaagattggaacctaaagat 3087050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 354 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 41511484 - 41511442
Alignment:
Q  354 gttgaattccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaag 396  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41511484 gttgaattccaaccacaatgagtcaaaaatccaccaattgaag 41511442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 354 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 48532826 - 48532780
Alignment:
Q  354 gttgaattccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtg 400  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  48532826 gttgaattccatccacaatgtgttaagaatcctccaattgaagggtg 48532780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 60 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 4817 - 4187
Alignment:
Q  60 cattgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacgg 159  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||| |  || ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  4817 cattgtttaagcatgacctccttaatcactttgtccaagttcatgtatgaacagccaccagaactggtgttctcctctgccttcttcttcaactccatgg 4718  T
Q  160 ccttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaat 259  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||  |  |||   ||||  |||||||||||||   |||| ||||| |  ||| |    
T  4717 ccttttgcctcatcttcattcctttatctcccgacatcaattcattgatcatattcgttaccttctctctcttcacattagtatcaatttccataccagt 4618  T
Q  260 ctcccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaa 359  Q
    |||||||   | | | |||   | | ||||||||||||||||  | || ||||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||| |||||||     
T  4617 ctcccatatatgggagatataccgatagtttgttggctgatcggcgaaaaatggccaacacaacattggcactcctacacatatgctttcaatggttgag 4518  T
Q  360 ttccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcat 459  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  4517 ttccatccgcaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgctcttgtggacaccagctcgcaattaggcctctatctgaaatttcat 4418  T
Q  460 tctcaaattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaa 559  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| ||||||||||    
T  4417 tctcaaactcagatgacaaaataaacgagccgccaatgacaaggtcaggcctaatgatccacaaaaaggatttcttacaattggtcaaaacccaagcaaa 4318  T
Q  560 ttctaacagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggta 659  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  4317 ctctaacagttgatctggagtcataactgtaatgcttccaaaattcacataaacaaccgactcaggttccttggatgcaagccactcaagacacttggta 4218  T
Q  660 tcttctttccaaagattggaacctaaagatt 690  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4217 tcttctttccaaagattggaacctaaagatt 4187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 62 - 690
Target Start/End: Original strand, 1674229 - 1674857
Alignment:
Q  62 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 161  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||    
T  1674229 ttgtttaagcaacacttccttaatcactttgtccaagttcatgtatgaacaaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttcttcaattccatggcc 1674328  T
Q  162 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 261  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   | |||||||||||||   |||| ||||| |  |||||||    
T  1674329 ttttgcctcatcttttttccattctctcccaccatcaattcattgataagcttctccaaaccctctctcttcacattcgtatcaatttccataccaatct 1674428  T
Q  262 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 361  Q
     |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1674429 tccattcattacaaataaatctacagtttgttggctgatcagcaaaaaatggccaacacaacattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgagtt 1674528  T
Q  362 ccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattc 461  Q
    |||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  1674529 ccatccgcagtgtgtcaagaatccgccgattgaagggtggttcaacactttctcttgtggacaccaatttgatattaggcctctatctgaaatttctttc 1674628  T
Q  462 tcaaattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaatt 561  Q
      ||| ||  |||||||||  |   |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |    
T  1674629 ataaactcagatgacaaaaccactgagccaccaatgacaagatcaggcctagtgatccacaaaaaaggtttcttgcaatcggccaaaccccaagcaaact 1674728  T
Q  562 ctaacagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatc 661  Q
    | || |||||||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  1674729 ccaatagttgatctggagtcataacaataatgctaccgaaattcacataaacaaccgatcccggttcgttggattcaagccattcaagacactcagtatc 1674828  T
Q  662 ttctttccaaagattggaacctaaagatt 690  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1674829 ttctttccaaaggttggaacctaaagatt 1674857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 62 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 20863972 - 20863346
Alignment:
Q  62 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 161  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||  | ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    | |    
T  20863972 ttgtttaagcaacacctccttaatcactttgtccaagttcatatatgaaccaccttccggtcttgtgtcctcctctgccttcttcttcaactcatttgtc 20863873  T
Q  162 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 261  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||   | || ||||| |  |||||||    
T  20863872 ttttgcctcatcctccttcctttctctcccaccatcaattcatttaccagcatctccacctcctctctcttgacattggtgtcaatttcgatcccaatct 20863773  T
Q  262 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 361  Q
    |||||| |||||||||   ||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||    
T  20863772 cccatttgttgcaaatgtatctgcagtttgtcggctgatcagcaaaaaatggccagcacaacattggcactccagcacatatgctctcaatggttgagtt 20863673  T
Q  362 ccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattc 461  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||  || |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20863672 ccatccacaatgagttagaaatccaccaattgaaggatggttcaacaccttctcttgtggacaccaactcgcgattaggcctctatctgaaatttcattc 20863573  T
Q  462 tcaaattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaatt 561  Q
     ||||  |  |||| ||||| | | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  20863572 acaaacgcagatgaaaaaatcaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctgttggccaaaccccatgcaaact 20863473  T
Q  562 ctaacagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatc 661  Q
    |||||| ||  |||  ||  || ||||   | ||||| ||||| ||||| |||| |||  | ||||| || ||||| |||||| ||||||| |  || ||    
T  20863472 ctaacaatttttctacagacatgactgtggtactgccaaaatttacatatacaatagatcccggttctttcgattcaagccatgcaagacattcagtgtc 20863373  T
Q  662 ttctttccaaagattggaacctaaaga 688  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||    
T  20863372 ttctttccaaagacttgaatctaaaga 20863346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 62 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 16686396 - 16685781
Alignment:
Q  62 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||| | ||  || ||  ||||| | |  |  || |    |    
T  16686396 ttgtttaagcaaaacctccataatcactttttccaagttcatgtatgaacaaccaccaggtctcgggtcttcgtccaccttcatttgcagttcaattatc 16686297  T
Q  162 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 261  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||   | || ||||| |  |||||||    
T  16686296 tttttcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgaccaatttctccacctcatctctcttcacattggtgtcaatttccatgccaatct 16686197  T
Q  262 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 361  Q
    ||||||| |||||||||  ||| || |||| |||||||||| |||| ||||||||||| | |||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| ||    
T  16686196 cccattcattgcaaatatatctgcattttgctggctgatcagcaaaaaatggccaacacaacattggaactccagcatatatactttcagtggttgagtt 16686097  T
Q  362 ccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattc 461  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| ||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  16686096 ccatccacaatgagttaagaatccaccgattgaaggatggtttaatacttgctcttgcgggcaccagctcgcgattaggcttctatctgagatttcattc 16685997  T
Q  462 tcaaattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaatt 561  Q
    | ||| ||  |||||||||  |   | |||| ||| |||||||||| ||||||||||||   |||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  16685996 ttaaactcagatgacaaaaccacggaaccgcaaatgacaagatcagacctaatgatccattgaaaatgttgcttgctattggtcaaaccccaagcaaact 16685897  T
Q  562 ctaacagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacag-actcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtat 660  Q
    |||| ||||  |||| ||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16685896 ctaatagtttttctgcagtcataactgtcatgctcccaaaattcacataaacaacggaactc-ggttccttggattcaagccaatcaagacacttggtat 16685798  T
Q  661 cttctttccaaagattg 677  Q
    ||| |||||||||||||    
T  16685797 cttatttccaaagattg 16685781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 1969181 - 1969140
Alignment:
Q  353 ggttgaattccatccacaatgagtcaagaatccaccaattga 394  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1969181 ggttgaattccagccacaatgagtcaagaatccaccaattga 1969140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 4)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 61 - 689
Target Start/End: Original strand, 24103001 - 24103629
Alignment:
Q  61 attgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggc 160  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | | |    
T  24103001 attgtttaagcatgacctccttaataactttgtccaagttcatgtatgaaaaaccaccagatcttgtgttctcttctgccttcttcttgaactccaagac 24103100  T
Q  161 cttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatc 260  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  24103101 cttttgcttcatcgtctttccgttctctcccaccatcaattcattgactaacttctcgacgtcatctctcttcacatttgtatcgatttcgagtccaatc 24103200  T
Q  261 tcccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaat 360  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  24103201 tcccattcatagcaaataaatctacagtttgttggttgatcaccaaagaatggccaacacaacattggcactccagcacatatgctttcagtggttgagt 24103300  T
Q  361 tccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcatt 460  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  24103301 tccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaagggtggtttaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaacttcttt 24103400  T
Q  461 ctcaaattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaat 560  Q
       ||| ||  ||||||||| ||   |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||     
T  24103401 aaaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatgacaagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgctattggccaaaccccaagcaaac 24103500  T
Q  561 tctaacagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtat 660  Q
    ||||| || |  ||| | |  |||||||  ||||| || ||||| ||||||||||| ||    ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  24103501 tctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctaccaaaatttacataaacaactgatcttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtat 24103600  T
Q  661 cttctttccaaagattggaacctaaagat 689  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  24103601 cttctttccaaagattggaatttaaagat 24103629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 62 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 28000228 - 27999745
Alignment:
Q  62 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 161  Q
    |||||||| ||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||    
T  28000228 ttgtttaaacaacacttccttaatcactttgtccaagttcatgtatgaacaaccacctggtctagtgttctcctctgcctttttcttcaactccatggcc 28000129  T
Q  162 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 261  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  || ||| |||||||||   |||| ||||| |  |||||||    
T  28000128 ttttgcctcatcttttttccattctctcccaccatcaattcattgataagcttctccaaatcctctatcttcacattcatatcaatttccataccaatct 28000029  T
Q  262 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 361  Q
     |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  28000028 tccattcattacaaataaatctacagtttgttggctgatcagcaaaaaatgaccaacacaacattggcactccagcgcatatgctttcggtggttgagtt 27999929  T
Q  362 ccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattc 461  Q
    |||||| || ||||||||||| || |  ||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  27999928 ccatccgcagtgagtcaagaacccgctgattgaagggtggttcaaaactttctcttgtggacaccaatttgatattaggcctctatctgaaatttctttc 27999829  T
Q  462 tcaaattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggcc 545  Q
      ||| ||  |||||||||  |   |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27999828 ctaaactcagatgacaaaaccactgagccaccaatgacaagattaggcctagtgatccacaaaaaaggtttcttgcaattggcc 27999745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 354 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 20155290 - 20155247
Alignment:
Q  354 gttgaattccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagg 397  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20155290 gttgaattccatccacaatgtgtcaagaatcctccaattgaagg 20155247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 600 - 637
Target Start/End: Original strand, 24106971 - 24107008
Alignment:
Q  600 aaattcacataaacaacagactcaggttccttggattc 637  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24106971 aaattcacataaacaacaaactcaggttccttggattc 24107008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 62 - 688
Target Start/End: Original strand, 1281117 - 1281743
Alignment:
Q  62 ttgtttaagcaaaacctccttaataactttgtccaggttcatgtatgaacgaccacctggtctagtgttctcctctgccttcttctttaactcgacggcc 161  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| || || | ||||    
T  1281117 ttgtttaagcaacatttccttaatcactttgtcgaagttcatgtatgaacaaccacccggtctagtgttctcctccgccgccttcttcaattccatggcc 1281216  T
Q  162 ttttgcctcatcttctttcctttctctcccaccatcaattcattgactagcttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatct 261  Q
    ||||  ||||| ||||||||||  || ||  | |||||||||||||  | |||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |  |||||||    
T  1281217 ttttctctcatattctttccttcatccccggctatcaattcattgatcaacttagccacctcctctctcttcacatttgtatcgatttccataccaatct 1281316  T
Q  262 cccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatggccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaatt 361  Q
     |||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  1281317 tccattcattacaaataaatctacagtctgttggctgatcagcaaaaaatggccaacacaacattggcactccagcacatatgctttcagtggttgagtt 1281416  T
Q  362 ccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattc 461  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1281417 ccatccgcaatgagtcaagaatccaccgattgaagggtggttcaacactttctcttgtggacaccaacttgctattaggcctctatctgaaatttcattc 1281516  T
Q  462 tcaaattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaatt 561  Q
     |||| ||  |||||||||| |   |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1281517 gcaaagtcagatgacaaaatcactgagccgccaatgacaagatcaggcctagtgatccacaaaaatggtttcttgctattagccagaccccaagcaaatt 1281616  T
Q  562 ctaacagttgatctggagtaataactgcaatgctgccgaaattcacataaacaacaga-ctcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtat 660  Q
    |    ||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||| | |||    
T  1281617 cctgaagttgctctggagtcataactgtaatgcttccgaaattcacataaacaacagatctc-ggttccttcgattcaagccattgaagacactcgatat 1281715  T
Q  661 cttctttccaaagattggaacctaaaga 688  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1281716 cttctttccaaaggttggaatctaaaga 1281743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 213 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3662 - 3428
Alignment:
Q  213 ttctccacctcatctctcttcacatctctatcgatttcaagtccaatctcccattcgttgcaaataattctacagtttgttggctgatcaccaaagaatg 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    ||| ||||||  ||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||  || ||    || ||||    
T  3662 ttctccacctcctctctcttcacattggaatctatttcacttccaatctcccattcattccaaatgcatctacagtttgttgagtgttcggggaaaaatg 3563  T
Q  313 gccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttg 412  Q
    ||||||  |||||||| |||||||  || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  3562 gccaacgcagcattggaactccagaacaaatgctttcaatggttgagttccatccacaatgagttaagaatccaccaact-aagggtggttcaacacttg 3464  T
Q  413 ttcttgtggacaccagcttgcgattaggcctctatc 448  Q
     ||||  |||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  3463 ctcttacggacaccatcttgcgactaggcctatatc 3428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 439 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 3261 - 3162
Alignment:
Q  439 ggcctctatctgaaatttcattctcaaattctaatgacaaaataaacaagccgccaattacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgct 538  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||  || |||||  | |  | |||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3261 ggcctctatctgaagtttcattctcaaactcatataacaaagcacatgatccgccaatgacaaggtcagacctaatgatccacacaaagggtttcttgct 3162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 58; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 597 - 690
Target Start/End: Original strand, 1 - 94
Alignment:
Q  597 ccgaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatcttctttccaaagattggaacctaaagatt 690  Q
    |||||||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1 ccgaaattcacataaacaaccgatcccggttcgttggattcaagccattcaagacactcagtatcttctttccaaaggttggaacctaaagatt 94  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University