View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17522_high_4 (Length: 403)

Name: NF17522_high_4
Description: NF17522
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17522_high_4
NF17522_high_4
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (22-384)||(4139046-4139410)
chr7 (22-384)||(24586336-24586698)
chr7 (22-384)||(16745321-16745684)
chr7 (22-376)||(4205363-4205717)
chr7 (22-376)||(31084431-31084786)
chr7 (45-384)||(26509496-26509837)
chr7 (22-384)||(5141135-5141498)
chr7 (22-376)||(26313658-26314011)
chr7 (30-384)||(26441235-26441590)
chr7 (45-384)||(26663713-26664053)
chr7 (45-384)||(26678905-26679245)
chr7 (51-384)||(5164387-5164720)
chr7 (45-384)||(31558195-31558534)
chr7 (45-384)||(26518790-26519127)
chr7 (34-387)||(45393205-45393558)
chr7 (45-376)||(39206948-39207279)
chr7 (45-384)||(5154081-5154419)
chr7 (34-384)||(26268886-26269240)
chr7 (34-376)||(11446874-11447216)
chr7 (45-381)||(45737298-45737636)
chr7 (51-384)||(11418580-11418913)
chr7 (27-376)||(3451297-3451647)
chr7 (45-384)||(2160567-2160908)
chr7 (22-376)||(16047289-16047640)
chr7 (30-384)||(16443804-16444159)
chr7 (45-384)||(2779249-2779582)
chr7 (45-384)||(31129902-31130235)
chr7 (130-384)||(26595750-26596006)
chr7 (22-376)||(10847557-10847915)
chr7 (45-370)||(16512255-16512574)
chr7 (45-376)||(10910735-10911060)
chr7 (45-129)||(26531926-26532010)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (22-384)||(28355827-28356192)
chr8 (22-376)||(29835300-29835653)
chr8 (22-384)||(31483747-31484111)
chr8 (22-384)||(19680425-19680786)
chr8 (45-370)||(33248366-33248690)
chr8 (45-384)||(9360622-9360960)
chr8 (45-384)||(31360528-31360867)
chr8 (45-384)||(18796706-18797046)
chr8 (66-384)||(44567002-44567322)
chr8 (22-376)||(19202260-19202603)
chr8 (45-382)||(18715480-18715819)
chr8 (34-376)||(12086608-12086951)
chr8 (45-384)||(15773574-15773913)
chr8 (51-384)||(21342047-21342381)
chr8 (45-376)||(33264731-33265061)
chr8 (51-384)||(19911039-19911374)
chr8 (34-303)||(16260212-16260480)
chr8 (27-376)||(22074814-22075164)
chr8 (45-376)||(19655232-19655560)
chr8 (22-370)||(27602805-27603146)
chr8 (45-376)||(22138906-22139231)
chr8 (45-370)||(2131159-2131478)
chr8 (45-370)||(19694095-19694416)
chr8 (50-370)||(14569162-14569479)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (22-384)||(31958413-31958777)
chr3 (22-384)||(5603271-5603635)
chr3 (22-384)||(24334113-24334477)
chr3 (22-376)||(28109917-28110276)
chr3 (45-384)||(5717031-5717371)
chr3 (45-384)||(5764087-5764427)
chr3 (45-384)||(5727941-5728281)
chr3 (45-384)||(47029416-47029756)
chr3 (34-384)||(4340634-4340984)
chr3 (27-384)||(32296574-32296932)
chr3 (45-384)||(10649034-10649373)
chr3 (22-370)||(29142726-29143077)
chr3 (22-376)||(28345111-28345464)
chr3 (45-384)||(4790591-4790931)
chr3 (45-384)||(4422881-4423220)
chr3 (34-384)||(29658926-29659276)
chr3 (27-384)||(5590319-5590676)
chr3 (22-370)||(4629725-4630072)
chr3 (45-384)||(10402112-10402450)
chr3 (27-370)||(21680646-21680988)
chr3 (45-384)||(17970824-17971161)
chr3 (45-384)||(5472951-5473289)
chr3 (45-376)||(51787985-51788316)
chr3 (45-384)||(8217595-8217936)
chr3 (34-384)||(18248690-18249040)
chr3 (45-370)||(22381553-22381877)
chr3 (45-376)||(22864814-22865143)
chr3 (45-376)||(22879873-22880202)
chr3 (34-384)||(17978908-17979259)
chr3 (34-384)||(28027243-28027591)
chr3 (45-376)||(18231156-18231487)
chr3 (45-384)||(48471890-48472233)
chr3 (22-384)||(16422123-16422485)
chr3 (51-370)||(18286327-18286645)
chr3 (51-370)||(18301628-18301946)
chr3 (45-384)||(20071996-20072337)
chr3 (53-384)||(11104319-11104651)
chr3 (45-384)||(6536701-6537040)
chr3 (45-384)||(5019676-5020014)
chr3 (34-376)||(20570812-20571154)
chr3 (45-384)||(7079185-7079529)
chr3 (45-370)||(31030217-31030535)
chr3 (22-376)||(16618455-16618813)
chr3 (45-384)||(18057223-18057565)
chr3 (34-370)||(18336580-18336910)
chr3 (51-370)||(6207869-6208184)
chr3 (50-370)||(32445122-32445433)
chr3 (50-376)||(19700454-19700792)
chr3 (51-370)||(4727602-4727915)
chr3 (45-370)||(15735072-15735392)
chr3 (45-376)||(5658097-5658425)
chr3 (45-376)||(4689614-4689939)
chr3 (45-370)||(8283430-8283766)
chr3 (51-370)||(35886733-35887048)
chr3 (45-153)||(15886894-15887004)
chr3 (45-129)||(8002523-8002607)
chr3 (182-376)||(15886707-15886895)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (22-384)||(22922048-22922412)
chr2 (22-384)||(39896043-39896405)
chr2 (22-384)||(19410389-19410753)
chr2 (51-384)||(12661543-12661875)
chr2 (45-384)||(254557-254896)
chr2 (45-384)||(37945770-37946110)
chr2 (45-384)||(27809699-27810040)
chr2 (45-384)||(37383675-37384014)
chr2 (22-384)||(37679796-37680160)
chr2 (22-384)||(37695061-37695425)
chr2 (45-376)||(13930457-13930790)
chr2 (45-384)||(16167476-16167815)
chr2 (22-384)||(21671075-21671440)
chr2 (22-370)||(11629104-11629451)
chr2 (45-384)||(12592808-12593151)
chr2 (45-384)||(3788492-3788830)
chr2 (45-384)||(27122523-27122860)
chr2 (45-376)||(37931370-37931708)
chr2 (45-384)||(9343892-9344231)
chr2 (27-376)||(12710514-12710863)
chr2 (27-370)||(40239489-40239831)
chr2 (44-384)||(34867680-34868019)
chr2 (45-384)||(34160842-34161183)
chr2 (34-376)||(16823250-16823592)
chr2 (34-376)||(16897888-16898230)
chr2 (45-384)||(39045727-39046066)
chr2 (34-376)||(27782219-27782561)
chr2 (45-376)||(32055800-32056130)
chr2 (45-376)||(31882285-31882615)
chr2 (95-384)||(31868691-31868979)
chr2 (27-384)||(21697078-21697438)
chr2 (45-384)||(34297154-34297486)
chr2 (22-376)||(27396298-27396662)
chr2 (45-376)||(34268839-34269165)
chr2 (45-370)||(28888277-28888597)
chr2 (45-370)||(23122497-23122817)
chr2 (45-376)||(27428366-27428690)
chr2 (22-376)||(19450331-19450694)
chr2 (45-370)||(20843910-20844235)
chr2 (244-384)||(23116993-23117133)
chr2 (45-100)||(31887682-31887737)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (45-384)||(3647148-3647487)
chr1 (45-384)||(10968667-10969007)
chr1 (34-376)||(51644211-51644555)
chr1 (52-376)||(10951100-10951425)
chr1 (44-376)||(28591084-28591415)
chr1 (45-384)||(41787224-41787565)
chr1 (45-384)||(28155728-28156069)
chr1 (22-384)||(20334330-20334694)
chr1 (22-384)||(16201942-16202312)
chr1 (22-384)||(20466756-20467126)
chr1 (22-370)||(21891691-21892025)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (44-384)||(18369347-18369687)
chr5 (45-384)||(30174472-30174812)
chr5 (44-384)||(33881132-33881472)
chr5 (22-370)||(6880287-6880636)
chr5 (51-384)||(11555367-11555699)
chr5 (27-384)||(3795527-3795885)
chr5 (22-376)||(9323461-9323814)
chr5 (45-376)||(37746151-37746482)
chr5 (22-376)||(12138160-12138513)
chr5 (34-376)||(37352467-37352809)
chr5 (41-376)||(8659295-8659629)
chr5 (50-384)||(43084270-43084604)
chr5 (66-384)||(18494583-18494900)
chr5 (22-370)||(33298517-33298869)
chr5 (45-384)||(40467368-40467707)
chr5 (45-376)||(13318651-13318981)
chr5 (45-384)||(28655249-28655589)
chr5 (45-384)||(37760989-37761329)
chr5 (44-384)||(11329643-11329985)
chr5 (45-384)||(13436489-13436834)
chr5 (27-370)||(28953609-28953952)
chr5 (45-384)||(13180608-13180943)
chr5 (44-376)||(24729976-24730308)
chr5 (34-376)||(30158030-30158372)
chr5 (45-370)||(41680711-41681037)
chr5 (45-384)||(9544522-9544862)
chr5 (51-384)||(23631982-23632317)
chr5 (22-376)||(26486380-26486723)
chr5 (34-376)||(33522378-33522721)
chr5 (45-370)||(37665315-37665640)
chr5 (34-376)||(31820233-31820573)
chr5 (45-376)||(30035433-30035763)
chr5 (34-384)||(2517061-2517412)
chr5 (22-384)||(22894400-22894761)
chr5 (34-384)||(32590091-32590440)
chr5 (45-376)||(15752681-15753006)
chr5 (45-384)||(34622525-34622865)
chr5 (45-376)||(5643807-5644136)
chr5 (45-370)||(18122245-18122570)
chr5 (45-384)||(31437471-31437803)
chr5 (45-370)||(15652589-15652912)
chr5 (50-384)||(25206289-25206630)
chr5 (50-384)||(25270445-25270786)
chr5 (45-370)||(22992953-22993270)
chr5 (50-376)||(23897886-23898206)
chr5 (45-370)||(33783494-33783814)
chr5 (50-370)||(24975861-24976175)
chr5 (45-367)||(24608252-24608570)
chr5 (45-376)||(30940643-30940968)
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (22-384)||(27284224-27284586)
chr6 (44-384)||(13518056-13518396)
chr6 (22-384)||(8899561-8899923)
chr6 (28-384)||(27623569-27623927)
chr6 (45-384)||(16755817-16756157)
chr6 (45-384)||(4763760-4764099)
chr6 (45-384)||(27063479-27063817)
chr6 (34-384)||(27355973-27356323)
chr6 (45-384)||(28166491-28166831)
chr6 (34-376)||(26110281-26110622)
chr6 (34-384)||(34458370-34458718)
chr6 (34-384)||(27491119-27491469)
chr6 (28-376)||(16937895-16938243)
chr6 (34-376)||(30551870-30552212)
chr6 (34-384)||(33370293-33370643)
chr6 (44-384)||(16680135-16680476)
chr6 (34-370)||(4531274-4531609)
chr6 (34-383)||(27200172-27200522)
chr6 (34-383)||(27248711-27249061)
chr6 (34-376)||(26772499-26772840)
chr6 (51-376)||(29579018-29579342)
chr6 (34-376)||(4539628-4539971)
chr6 (45-370)||(4778877-4779203)
chr6 (45-376)||(26791813-26792144)
chr6 (22-384)||(29555532-29555894)
chr6 (45-384)||(29507413-29507754)
chr6 (34-376)||(28213440-28213783)
chr6 (22-384)||(22928743-22929107)
chr6 (51-366)||(13292831-13293140)
chr6 (45-354)||(26926765-26927073)
chr6 (45-384)||(27013730-27014062)
chr6 (45-384)||(14139262-14139595)
chr6 (45-370)||(27031020-27031342)
chr6 (129-376)||(26666528-26666774)
chr6 (45-384)||(27208901-27209236)
chr6 (45-384)||(27239992-27240327)
chr6 (45-370)||(24869707-24870026)
chr6 (45-367)||(27025142-27025460)
chr6 (45-370)||(24299636-24299956)
chr6 (45-376)||(15406403-15406730)
chr6 (45-376)||(15418190-15418517)
chr6 (88-370)||(20174589-20174881)
chr6 (88-370)||(22161110-22161402)
chr6 (22-124)||(23851450-23851552)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (27-384)||(39856630-39856985)
chr4 (45-384)||(20332337-20332677)
chr4 (45-384)||(40099551-40099891)
chr4 (45-384)||(27157227-27157568)
chr4 (45-384)||(24586276-24586616)
chr4 (27-376)||(5011870-5012220)
chr4 (44-384)||(14104553-14104892)
chr4 (44-384)||(30759774-30760112)
chr4 (44-384)||(33667718-33668056)
chr4 (45-384)||(54839402-54839740)
chr4 (45-384)||(5700551-5700890)
chr4 (34-376)||(18794540-18794882)
chr4 (45-370)||(34182893-34183216)
chr4 (45-370)||(14753423-14753747)
chr4 (34-376)||(21975704-21976046)
chr4 (34-376)||(31120433-31120776)
chr4 (45-370)||(24118674-24118998)
chr4 (45-370)||(36338455-36338772)
chr4 (51-370)||(6575879-6576190)
chr4 (22-384)||(1906240-1906607)
chr4 (34-384)||(15233816-15234170)
chr4 (22-376)||(15276552-15276909)
chr4 (22-376)||(15380161-15380515)
chr4 (51-384)||(1673877-1674213)
chr4 (124-370)||(36324246-36324484)
chr4 (45-370)||(14671027-14671349)
chr4 (45-370)||(17019063-17019384)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (45-384)||(9557-9895)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (22-384)||(3094-3458)
scaffold0159 (188-384)||(17949-18147)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (45-384)||(12036-12374)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (45-384)||(8844-9182)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (45-384)||(18585-18926)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (45-384)||(4518-4860)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (45-384)||(9914-10252)
scaffold0143 (45-370)||(33297-33619)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (22-376)||(1634-1988)
scaffold0322 (22-384)||(12023-12396)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (34-376)||(13938-14281)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (34-384)||(15558-15915)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (22-376)||(25092-25454)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (45-370)||(6066-6388)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (51-370)||(24835-25150)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (34-205)||(366-537)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (22-189)||(26243-26410)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (259-384)||(1-126)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (51-183)||(40759-40898)
scaffold0099 (324-370)||(40559-40606)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4139410 - 4139046
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4139410 catcttcatctgaagcttccgcatttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 4139311  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattt--ttctt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  4139310 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttctt 4139211  T
Q  220 ctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttta 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4139210 ctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 4139111  T
Q  320 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  4139110 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 4139046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24586698 - 24586336
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttt-gggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattt 120  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24586698 catcttcatctgaatcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 24586599  T
Q  121 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||    
T  24586598 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctttcgttt-aagactctatttttcttc 24586500  T
Q  221 tactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaa 320  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24586499 tactttcaaagctatatacaaaacattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 24586400  T
Q  321 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24586399 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 24586336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16745684 - 16745321
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16745684 catcttcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 16745585  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttct 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16745584 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttct 16745486  T
Q  222 actttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttta 319  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16745485 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 16745386  T
Q  320 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  16745385 aaagcaaacctgagcaacagggtatattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatgttgatgtc 16745321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 22 - 376
Target Start/End: Original strand, 4205363 - 4205717
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttt-tgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattt 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4205363 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 4205462  T
Q  121 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4205463 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttc 4205560  T
Q  221 tactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg-aaaattgaaaactttttgtctattttta 319  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  4205561 tattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaaccttttgtctattttga 4205660  T
Q  320 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205661 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 4205717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 22 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 31084786 - 31084431
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aagattaccattt 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  31084786 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 31084687  T
Q  121 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  31084686 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggttgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaattctatttttcttc 31084588  T
Q  221 tactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttta 319  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  31084587 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaatttttttgtctattttga 31084488  T
Q  320 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31084487 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatg 31084431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26509837 - 26509496
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26509837 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 26509738  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26509737 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 26509638  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26509637 cattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 26509538  T
Q  343 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  26509537 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtc 26509496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5141498 - 5141135
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5141498 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 5141399  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttct 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5141398 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttct 5141300  T
Q  222 actttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttt-ta 319  Q
    |||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  5141299 actttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 5141200  T
Q  320 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5141199 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtc 5141135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 22 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 26314011 - 26313658
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttt-gggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattt 120  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26314011 catcttcatctgaagtttctgtacttatgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 26313912  T
Q  121 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  26313911 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttc 26313814  T
Q  221 tactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaa 320  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  26313813 tattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaa 26313714  T
Q  321 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  26313713 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatg 26313658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 30 - 384
Target Start/End: Original strand, 26441235 - 26441590
Alignment:
Q  30 tctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26441235 tctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctatgaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 26441334  T
Q  130 tgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttca 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  26441335 tgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccgccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaaactccattttttcttttactttca 26441434  T
Q  229 aagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaac 328  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26441435 aagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaac 26441534  T
Q  329 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  26441535 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtgtgttgatgtc 26441590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26664053 - 26663713
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26664053 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 26663954  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  26663953 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 26663854  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  26663853 cattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggta 26663754  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  26663753 cattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 26663713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26679245 - 26678905
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679245 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 26679146  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  26679145 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 26679046  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  26679045 cattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggta 26678946  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  26678945 cattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 26678905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 51 - 384
Target Start/End: Original strand, 5164387 - 5164720
Alignment:
Q  51 aattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 150  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164387 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 5164486  T
Q  151 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagc-taaatacaaaacatttt 249  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  5164487 tttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagcctatatacaaaacatttt 5164585  T
Q  250 ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 349  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5164586 ctttctattttgataataacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatcca 5164685  T
Q  350 aatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5164686 aatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 5164720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31558534 - 31558195
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31558534 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 31558435  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  31558434 tcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaatc 31558336  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31558335 attttccttctattttgataatgacaatacttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 31558236  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31558235 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 31558195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 26518790 - 26519127
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518790 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 26518889  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  26518890 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatc 26518987  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtac 344  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26518988 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 26519087  T
Q  345 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  26519088 attcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtc 26519127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 34 - 387
Target Start/End: Original strand, 45393205 - 45393558
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45393205 aagcttatgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 45393304  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45393305 aatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctacttttcttctactttcaaagct 45393403  T
Q  234 aaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctga 332  Q
    | | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45393404 atacacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 45393503  T
Q  333 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtccat 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45393504 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatggtgatgtccat 45393558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 45 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 39207279 - 39206948
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207279 cttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 39207180  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  39207179 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaat 39207081  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39207080 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 39206981  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206980 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 39206948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 5154081 - 5154419
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5154081 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 5154180  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  |||  || |||||||||||||| |||||||||    
T  5154181 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaac 5154279  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtac 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5154280 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 5154379  T
Q  345 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5154380 atccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 5154419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 34 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26269240 - 26268886
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  26269240 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgta 26269141  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||||||    
T  26269140 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctgttttctttttactttcaaagct 26269042  T
Q  234 aaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaac 328  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26269041 atgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaac 26268942  T
Q  329 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26268941 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 26268886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 34 - 376
Target Start/End: Original strand, 11446874 - 11447216
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11446874 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 11446973  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  11446974 aatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaattcta-ttttcttctactttcaaagct 11447071  T
Q  234 aaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctg 331  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11447072 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 11447171  T
Q  332 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  11447172 agcaacagggtacaatcaagtgaaacatgcatgagcgagggtatg 11447216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 45 - 381
Target Start/End: Original strand, 45737298 - 45737636
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45737298 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 45737397  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45737398 tcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 45737495  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45737496 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 45737595  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgat 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45737596 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgat 45737636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 51 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 11418913 - 11418580
Alignment:
Q  51 aattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 150  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11418913 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 11418814  T
Q  151 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttc 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11418813 cttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctactttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttc 11418715  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 349  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11418714 cttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttctgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 11418615  T
Q  350 aatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11418614 aatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtc 11418580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 27 - 376
Target Start/End: Original strand, 3451297 - 3451647
Alignment:
Q  27 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaag 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3451297 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 3451396  T
Q  127 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 226  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  3451397 ttttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagctggtgcttttgtttg-aaattcta-ttttcttctacttt 3451494  T
Q  227 caaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca---ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaag 323  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3451495 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaag 3451594  T
Q  324 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  3451595 caaacctgagcaacagggtacaatcaaatggaacatgcatgagcgagggtatg 3451647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 2160567 - 2160908
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2160567 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 2160666  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac--aaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||   || ||||||||||||||  |||  |||    
T  2160667 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttcctttttactttcaaagctatgtacaaaaa 2160765  T
Q  243 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacaggg 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2160766 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaatctgagcaacaggg 2160865  T
Q  342 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  2160866 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtc 2160908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 22 - 376
Target Start/End: Original strand, 16047289 - 16047640
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16047289 catcttcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 16047388  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttct 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||    
T  16047389 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttg-aaactctactttctttct 16047487  T
Q  222 actttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaa 321  Q
    ||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| ||    
T  16047488 actgtcaaagctatgtacaaaa-attttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcctgaaaattgaaaagtttttgtcta-ttttgaa 16047585  T
Q  322 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16047586 agcaagcctgagcaacaggatacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatg 16047640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 30 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16444159 - 16443804
Alignment:
Q  30 tctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctt 129  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |  |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16444159 tctgaagcttatgtgcttgcgaattcaaagtttctaagaaatgtagtcgttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 16444060  T
Q  130 tgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaa 229  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||    
T  16444059 tgtaaatccgtggagtcacgccttcgcctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgttt-aaaactctactttctttctactttcaa 16443961  T
Q  230 agctaaatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctatttttaaaagcaa 326  Q
    |||||  |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||    
T  16443960 agctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtcta-ttttgaaagcaa 16443862  T
Q  327 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  16443861 acctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcatatgttgatgtc 16443804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 2779249 - 2779582
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2779249 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 2779348  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||| |||||||||    
T  2779349 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaac 2779447  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtac 344  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2779448 attttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 2779542  T
Q  345 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2779543 attcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 2779582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 31129902 - 31130235
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31129902 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 31130001  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||| |||||||||    
T  31130002 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaac 31130100  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtac 344  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31130101 attttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 31130195  T
Q  345 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31130196 attcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 31130235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 130 - 384
Target Start/End: Original strand, 26595750 - 26596006
Alignment:
Q  130 tgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttca 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26595750 tgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttca 26595849  T
Q  229 aagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaa 327  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26595850 aagctatatacaacacattttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 26595949  T
Q  328 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  26595950 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 26596006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 376
Target Start/End: Original strand, 10847557 - 10847915
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  10847557 catcttcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccatttt 10847656  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttct 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||   |||    
T  10847657 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtctg-aaactctattttctctct 10847755  T
Q  222 actttcaaagctaaatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa---ctttttgtctatt 315  Q
    |||||||||||||  |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||  |    
T  10847756 actttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaagttttttgtct-gt 10847854  T
Q  316 tttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||    
T  10847855 tttgaaagtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatg 10847915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16512574 - 16512255
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16512574 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 16512475  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||  ||| ||||    
T  16512474 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttaagcctgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaa 16512376  T
Q  244 cattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaatt-gaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||    
T  16512375 cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgataattggaaaagtttttg---------aaaagcaaacctgagcaacagg 16512285  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16512284 gtacattcaaatgaaatatgcatgagcgag 16512255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 45 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10911060 - 10910735
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10911060 cttgcgaatacaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcactaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 10910961  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||  ||| ||||    
T  10910960 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaa 10910862  T
Q  244 cattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacaggg 341  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||       |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  10910861 cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacatgg 10910769  T
Q  342 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  10910768 tacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatg 10910735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 26532010 - 26531926
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctt 129  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26532010 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 26531926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28356192 - 28355827
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttt-gggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattt 120  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28356192 catcttcatctgaatcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 28356093  T
Q  121 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt--ct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  28356092 tccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctatttttttct 28355993  T
Q  219 tctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttt 318  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28355992 tctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg 28355893  T
Q  319 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  28355892 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 28355827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 22 - 376
Target Start/End: Original strand, 29835300 - 29835653
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29835300 catcttcatctgaagcctctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 29835399  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttct 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  29835400 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttgaaaactcca-ttttcttct 29835498  T
Q  222 actttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaa 321  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  29835499 actttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaa 29835598  T
Q  322 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835599 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 29835653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31484111 - 31483747
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| ||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31484111 catcttcatctgaagcttccacatttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 31484012  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattt--ttctt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  31484011 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttctt 31483912  T
Q  220 ctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttta 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  31483911 ctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttga 31483812  T
Q  320 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31483811 aaagcaaacctgagcaacaaggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 31483747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Original strand, 19680425 - 19680786
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttt-gggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattt 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19680425 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 19680524  T
Q  121 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19680525 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttc 19680622  T
Q  221 tactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaa 320  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  19680623 tattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaa 19680722  T
Q  321 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19680723 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtc 19680786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Original strand, 33248366 - 33248690
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248366 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 33248465  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33248466 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 33248564  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtac 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33248565 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 33248664  T
Q  345 attcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  33248665 attcaaatgaaacatgcatgagcgag 33248690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 9360622 - 9360960
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360622 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgtccaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 9360721  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  9360722 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaac 9360820  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtac 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9360821 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 9360920  T
Q  345 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9360921 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 9360960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 31360528 - 31360867
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360528 cttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 31360627  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaa 243  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  31360628 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagttatatacaaaaa 31360726  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31360727 tattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 31360826  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  31360827 cattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 31360867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 18796706 - 18797046
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18796706 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttataaatccgtgga 18796805  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18796806 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 18796904  T
Q  244 -cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggt 342  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18796905 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 18797004  T
Q  343 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18797005 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 18797046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 66 - 384
Target Start/End: Original strand, 44567002 - 44567322
Alignment:
Q  66 ggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44567002 ggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 44567101  T
Q  166 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataa 265  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44567102 actctcatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataa 44567199  T
Q  266 tgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgc 361  Q
    |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44567200 tgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgc 44567299  T
Q  362 atgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    || |||||||||||| |||||||    
T  44567300 ataagcgagagtatgttgatgtc 44567322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 22 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 19202603 - 19202260
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagt-ttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattt 120  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19202603 catcttcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtcttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 19202504  T
Q  121 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||            
T  19202503 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctat-------- 19202413  T
Q  221 tactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaa 320  Q
       ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  19202412 ---tttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaa 19202316  T
Q  321 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19202315 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatg 19202260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 45 - 382
Target Start/End: Original strand, 18715480 - 18715819
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18715480 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 18715579  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18715580 tcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 18715677  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18715678 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 18715777  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatg 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18715778 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatg 18715819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 34 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12086951 - 12086608
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  12086951 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgt 12086852  T
Q  133 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagc 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12086851 gaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagc 12086753  T
Q  233 taaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctg 331  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  12086752 tgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaagcctg 12086653  T
Q  332 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12086652 agcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 12086608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 15773574 - 15773913
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15773574 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 15773673  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||  || |||||||| ||||| |||||||||    
T  15773674 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcagagctatatacaaaac 15773772  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15773773 attttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 15773872  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15773873 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 15773913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 51 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21342381 - 21342047
Alignment:
Q  51 aattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 149  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21342381 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 21342282  T
Q  150 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacatttt 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||  |||  || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21342281 ccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcctgtgcttctgtttgaaa-ctctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacatttt 21342183  T
Q  250 ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 348  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342182 ccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaagcatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 21342083  T
Q  349 aaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21342082 aaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 21342047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 45 - 376
Target Start/End: Original strand, 33264731 - 33265061
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33264731 cttgcgaattcaaagttcctaggaaatgccatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 33264830  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  33264831 tcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacgaaac 33264928  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33264929 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 33265028  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33265029 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 33265061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 51 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 19911374 - 19911039
Alignment:
Q  51 aattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 150  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19911374 aattcaaagtttctaggagatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattacctttttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 19911275  T
Q  151 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac--aaaacattt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||   || ||||||||||||||  |||  |||||||||    
T  19911274 cttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttcctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattt 19911176  T
Q  249 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacatt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19911175 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacatt 19911076  T
Q  348 caaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19911075 caaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtc 19911039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 34 - 303
Target Start/End: Original strand, 16260212 - 16260480
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  16260212 aagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgta 16260311  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16260312 aatccgcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagct 16260410  T
Q  234 aaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 303  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16260411 atatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaatcgaaaac 16260480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 27 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22075164 - 22074814
Alignment:
Q  27 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaag 126  Q
    ||||| ||||||| |||  ||| ||||||||||||| | ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22075164 tcatcagaagcttttgtgtttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttgccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 22075065  T
Q  127 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||| |||  |||||||||    
T  22075064 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctaggcttttgtttg-aaactctactttctttctacttt 22074966  T
Q  227 caaagctaaatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaag 323  Q
    ||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||  |||| ||||    
T  22074965 caaagctatgtacaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacttcttgaaaataaaaaagtttttgtct-gttttgaaag 22074867  T
Q  324 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  22074866 caagcatgagcaacaaggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatg 22074814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 45 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 19655560 - 19655232
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga--ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 142  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19655560 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 19655461  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aa 241  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||  || ||||||||||| ||  ||| ||    
T  19655460 agtctcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctactttctttttactttcaaagttatgtacaaa 19655362  T
Q  242 aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||       ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19655361 aacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaagttt-------tttttgaaagcaaacctgagcaacag 19655269  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||    
T  19655268 ggtacattcaaacaaaacgtgcatgagcgagtgtatg 19655232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 27603146 - 27602805
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27603146 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 27603047  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttct 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||  || |    
T  27603046 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttagacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctgctttcttttt 27602948  T
Q  222 actttcaaagctaaatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttt 318  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||        ||||     
T  27602947 actttcaaagctatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaagtt--------ttttg 27602856  T
Q  319 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27602855 aaaagcaaacctgtgcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgag 27602805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 45 - 376
Target Start/End: Original strand, 22138906 - 22139231
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22138906 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 22139005  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||  ||| |||    
T  22139006 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 22139104  T
Q  243 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||           ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22139105 acattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacgtcttgaaaattgaaaa---------agtttttgaaagcaaacttgagcaacagg 22139195  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22139196 gtacattgaaatgaaacgtgcatgagcgagtgtatg 22139231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 2131478 - 2131159
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2131478 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 2131379  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaa 243  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||  || ||||||||||| ||  ||| ||||    
T  2131378 tcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctactttctttttactttcaaagttatgtacaaaaa 2131280  T
Q  244 cattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacaggg 341  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||        ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2131279 cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ctttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 2131187  T
Q  342 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  2131186 tacattcaaacg-aacatgcatgagcgag 2131159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Original strand, 19694095 - 19694416
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19694095 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 19694194  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||  || ||||||||||| ||  ||| |||    
T  19694195 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 19694293  T
Q  243 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||      |||| ||||||||||||||||||||||    
T  19694294 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 19694387  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19694388 gtacattcaaacg-aacatgcatgagcgag 19694416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 50 - 370
Target Start/End: Original strand, 14569162 - 14569479
Alignment:
Q  50 gaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14569162 gaattcaaagtttttgggaa-tgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 14569260  T
Q  150 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagcta-----aatacaaaac 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||     || | |||||    
T  14569261 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagttatgttcaaaaaaaaac 14569359  T
Q  245 attttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggt 342  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||       |||| |||  |||||||||||||||||||    
T  14569360 attttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaagacaaacctgagcaacagggt 14569452  T
Q  343 acattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14569453 acattcaaacg-aacatgcatgagcgag 14569479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31958777 - 31958413
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31958777 catcttcatctgaagcttccgcatttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 31958678  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattt--ttctt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  31958677 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttctt 31958578  T
Q  220 ctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttta 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  31958577 ctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttga 31958478  T
Q  320 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31958477 aaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 31958413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5603635 - 5603271
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5603635 catcttcatctgaagcttccgcatttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 5603536  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattt--ttctt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  5603535 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttctt 5603436  T
Q  220 ctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttta 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  5603435 ctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttga 5603336  T
Q  320 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5603335 aaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaataaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 5603271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Original strand, 24334113 - 24334477
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24334113 catcttcatctgaagcttccgcatttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 24334212  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattt--ttctt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  24334213 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttctt 24334312  T
Q  220 ctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttta 319  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  24334313 ctactttcaaagctatacacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttga 24334412  T
Q  320 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24334413 aaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 24334477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 22 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 28110276 - 28109917
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttt-gggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattt 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28110276 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 28110177  T
Q  121 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttc 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28110176 tccaagctttatgaatccgtggagtcatgccttgggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttc 28110077  T
Q  221 tactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac----attttgaaaattgaaaactttttgtctattt 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110076 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacgttttttttgaaaattgaaaactttttgtctattt 28109977  T
Q  317 ttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28109976 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 28109917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 5717031 - 5717371
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717031 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 5717130  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-tcttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5717131 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 5717230  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5717231 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 5717330  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  5717331 cattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 5717371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5764427 - 5764087
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764427 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 5764328  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5764327 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 5764228  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5764227 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 5764128  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  5764127 cattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 5764087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 5727941 - 5728281
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5727941 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 5728040  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-tcttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5728041 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 5728140  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5728141 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 5728240  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  5728241 cattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 5728281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 47029416 - 47029756
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029416 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 47029515  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-tcttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47029516 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 47029615  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47029616 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 47029715  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  47029716 cattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 47029756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 34 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4340984 - 4340634
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4340984 aagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 4340885  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4340884 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagct 4340786  T
Q  234 aaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctga 332  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  4340785 atatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctga 4340686  T
Q  333 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4340685 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 4340634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 27 - 384
Target Start/End: Original strand, 32296574 - 32296932
Alignment:
Q  27 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaag 126  Q
    ||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32296574 tcatcagaagtttctgcgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 32296673  T
Q  127 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-tcttctactt 225  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  32296674 ctttgtgaatccgtggagtcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttttcttctactt 32296773  T
Q  226 tcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagca 325  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32296774 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 32296873  T
Q  326 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  32296874 aacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 32296932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 10649034 - 10649373
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649034 cttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 10649133  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaa 243  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  10649134 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagttatatacaaaaa 10649232  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10649233 tattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 10649332  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10649333 cattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 10649373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 22 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 29143077 - 29142726
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29143077 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 29142978  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttct 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  29142977 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttttttct 29142878  T
Q  222 actttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttt-- 318  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  29142877 actttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttga 29142778  T
Q  319 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29142777 aaaaacaaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 29142726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 22 - 376
Target Start/End: Original strand, 28345111 - 28345464
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28345111 catcttcatctgaagcttccgcatttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 28345210  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttct 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  28345211 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctatgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttct 28345308  T
Q  222 actttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg-aaaattgaaaactttttgtctatttttaa 320  Q
    | ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  28345309 attttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaaccttttgtctattttgaa 28345408  T
Q  321 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28345409 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatg 28345464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4790931 - 4790591
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4790931 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 4790832  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4790831 ttcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 4790733  T
Q  244 -cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggt 342  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4790732 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 4790633  T
Q  343 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4790632 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 4790591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 4422881 - 4423220
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4422881 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 4422980  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  4422981 tcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaatc 4423079  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4423080 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 4423179  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4423180 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 4423220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 34 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 29659276 - 29658926
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29659276 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 29659177  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29659176 aatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagtt 29659078  T
Q  234 aaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctga 332  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  29659077 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctga 29658978  T
Q  333 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29658977 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 29658926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 27 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5590676 - 5590319
Alignment:
Q  27 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaag 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5590676 tcatctaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagagctgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 5590577  T
Q  127 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 226  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  || ||||||    
T  5590576 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctgttttctttttacttt 5590478  T
Q  227 caaagctaaatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagca 325  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5590477 caaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 5590378  T
Q  326 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  5590377 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 5590319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 22 - 370
Target Start/End: Original strand, 4629725 - 4630072
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4629725 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 4629824  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttct 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4629825 ccaagctttgttaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttct 4629923  T
Q  222 actttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaa 320  Q
    |||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4629924 actttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 4630023  T
Q  321 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4630024 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 4630072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 10402112 - 10402450
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10402112 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 10402211  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10402212 tcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaaattctattttt-ttctactttcaaagctatatacaaaac 10402309  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10402310 attttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 10402409  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10402410 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 10402450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 27 - 370
Target Start/End: Original strand, 21680646 - 21680988
Alignment:
Q  27 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaag 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21680646 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 21680745  T
Q  127 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21680746 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 21680844  T
Q  227 caaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagca 325  Q
    ||||| || |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21680845 caaagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 21680944  T
Q  326 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21680945 aacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 21680988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 17971161 - 17970824
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17971161 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaacgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 17971062  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||       
T  17971061 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaattt 17970964  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtac 344  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17970963 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 17970864  T
Q  345 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17970863 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 17970824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 5472951 - 5473289
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5472951 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 5473050  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5473051 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 5473149  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5473150 attttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 5473248  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5473249 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 5473289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 45 - 376
Target Start/End: Original strand, 51787985 - 51788316
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51787985 cttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 51788084  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  51788085 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaat 51788183  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51788184 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 51788283  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51788284 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 51788316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 8217595 - 8217936
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8217595 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtggatccgtggag 8217694  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaa 243  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  8217695 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagttatatacaaaaa 8217793  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacaggg 341  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8217794 tattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 8217893  T
Q  342 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8217894 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 8217936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 34 - 384
Target Start/End: Original strand, 18248690 - 18249040
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18248690 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccgagctttgtg 18248789  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248790 aatccgtggagtcatgcctttggctgaccatcactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttg-gaactctatttttcttctactttcaaagct 18248888  T
Q  234 aaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctga 332  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18248889 acatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctga 18248988  T
Q  333 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18248989 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 18249040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22381877 - 22381553
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381877 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 22381778  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22381777 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 22381679  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  22381678 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgacagtgta 22381579  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22381578 cattcaaatg-aacatgcatgagcgag 22381553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 45 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22865143 - 22864814
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22865143 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 22865044  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatt-tttcttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22865043 tcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa---ctatgctttcttctactttcaaagctgtatacaaaa 22864947  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22864946 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 22864847  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22864846 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 22864814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 45 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22880202 - 22879873
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22880202 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 22880103  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatt-tttcttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22880102 tcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa---ctatgctttcttctactttcaaagctgtatacaaaa 22880006  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22880005 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 22879906  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22879905 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 22879873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 34 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 17979259 - 17978908
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17979259 aagcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 17979160  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||||||    
T  17979159 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttg-aaactctgttttctttttactttcaaagct 17979061  T
Q  234 aaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttt-taaaagcaaacctg 331  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17979060 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaaagcaaacctg 17978961  T
Q  332 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  17978960 agcaacagggtacattcaaaggaaatatgcatgagcgagggtatgttgatgtc 17978908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 34 - 384
Target Start/End: Original strand, 28027243 - 28027591
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28027243 aagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaactgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 28027342  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  28027343 aatccgtggagtcaggcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaattctatttt-cttctactttcaaagct 28027440  T
Q  234 aaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgag 333  Q
    | ||||||   |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28027441 atatacaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgag 28027540  T
Q  334 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28027541 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 28027591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 45 - 376
Target Start/End: Original strand, 18231156 - 18231487
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  18231156 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagatttgcgaatccgtggag 18231255  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18231256 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgttt-aaaactctgttttctttctactttcaaagctatatacaaaac 18231354  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  18231355 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggta 18231454  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18231455 cagtcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatg 18231487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 48471890 - 48472233
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  48471890 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggag 48471989  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48471990 tcacgccctcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 48472088  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg-----aaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48472089 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttttaaaaattgaaaactttctgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 48472188  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48472189 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 48472233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Original strand, 16422123 - 16422485
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16422123 catcttcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccgg-aaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 16422221  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttct 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||    
T  16422222 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttg-aaactctactttctttct 16422320  T
Q  222 actttcaaagctaaatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctattttt 318  Q
    |||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| || ||||    
T  16422321 actttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtgta-tttt 16422419  T
Q  319 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16422420 gaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtc 16422485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 51 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18286645 - 18286327
Alignment:
Q  51 aattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18286645 aattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 18286546  T
Q  151 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18286545 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 18286448  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18286447 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattc 18286348  T
Q  349 aaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  18286347 aaatg-aacatgcatgagcgag 18286327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 51 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18301946 - 18301628
Alignment:
Q  51 aattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18301946 aattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 18301847  T
Q  151 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18301846 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 18301749  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18301748 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattc 18301649  T
Q  349 aaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  18301648 aaatg-aacatgcatgagcgag 18301628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 20071996 - 20072337
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20071996 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 20072095  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20072096 tcacaccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 20072193  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20072194 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 20072293  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20072294 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 20072337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 53 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 11104651 - 11104319
Alignment:
Q  53 ttcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcct 152  Q
    ||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11104651 ttcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagccacgcct 11104552  T
Q  153 tcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac--attttc 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||| | ||   ||||||    
T  11104551 tcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctattttctttttactttcaaagctaaatatacaatttattttc 11104453  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 350  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104452 cttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 11104353  T
Q  351 atgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11104352 atgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 11104319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 6537040 - 6536701
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6537040 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 6536941  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||| |||||||||    
T  6536940 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaac 6536842  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6536841 attttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 6536742  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  6536741 cattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 6536701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 5019676 - 5020014
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5019676 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 5019775  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  5019776 tcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactcta-ctttcttctactttcaaagctatatacaaatc 5019873  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5019874 attttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 5019973  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5019974 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 5020014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 34 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 20571154 - 20570812
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20571154 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 20571055  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20571054 aatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctattttcaaagct 20570956  T
Q  234 aaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctga 332  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  20570955 atatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctga 20570856  T
Q  333 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20570855 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcaagtgtatg 20570812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 7079185 - 7079529
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7079185 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 7079284  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagc----taaataca 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||| ||||  || ||||||||||||    || |||||    
T  7079285 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctg-aaactctgttttctttttactttcaaagctatatatataca 7079383  T
Q  241 aaacattttctttctatt-ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaatt-gaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaaca 338  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7079384 aaacattttctttctattcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattaaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 7079483  T
Q  339 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7079484 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 7079529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 31030535 - 31030217
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31030535 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 31030436  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31030435 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 31030337  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtac 344  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31030336 attttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 31030242  T
Q  345 attcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  31030241 attcaaatg-aacatgcatgagcgag 31030217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 22 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16618813 - 16618455
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16618813 catcttcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 16618714  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttct 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||    
T  16618713 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctactttctttct 16618615  T
Q  222 actttcaaagctaaatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg---aaaactttttgtctatt 315  Q
    |||||||||||||  |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| |||||||| | |    
T  16618614 actttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaagtttttgtcca-t 16618516  T
Q  316 tttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16618515 tttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatg 16618455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 18057223 - 18057565
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18057223 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 18057322  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||  ||| |||    
T  18057323 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcccgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 18057421  T
Q  243 acattttctttcta-ttttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18057422 acattttccttctatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagg 18057521  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  18057522 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtc 18057565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 34 - 370
Target Start/End: Original strand, 18336580 - 18336910
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgt 132  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18336580 aagctcctatacttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgt 18336679  T
Q  133 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagc 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18336680 aaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagc 18336778  T
Q  233 taaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctga 332  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     |||| ||||||||||||||    
T  18336779 tatatacaaaacattttctttctattatgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctga 18336873  T
Q  333 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18336874 gcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 18336910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 51 - 370
Target Start/End: Original strand, 6207869 - 6208184
Alignment:
Q  51 aattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 149  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6207869 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 6207968  T
Q  150 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacatttt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6207969 ccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttt 6208068  T
Q  250 ctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacatt 347  Q
    | ||||| |||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6208069 ccttctatttttaataatgacaaaggctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatt 6208162  T
Q  348 caaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  6208163 caaatg-aacatgcatgagcgag 6208184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 50 - 370
Target Start/End: Original strand, 32445122 - 32445433
Alignment:
Q  50 gaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 149  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32445122 gaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 32445221  T
Q  150 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacatttt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  32445222 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagttatatacaaaacatttt 32445320  T
Q  250 ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 349  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32445321 ctttctgttttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 32445413  T
Q  350 aatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  32445414 aatg-aacatgcatgagcgag 32445433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 50 - 376
Target Start/End: Original strand, 19700454 - 19700792
Alignment:
Q  50 gaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 149  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19700454 gaattcaaagtttctaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 19700553  T
Q  150 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct-----------aaata 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||           ||| |    
T  19700554 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttaagcctgtgcttttgtttg-aaactctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaaaaaa 19700652  T
Q  239 caaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagca 335  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19700653 aaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtcta-ttttgaaagcaaacctgagca 19700751  T
Q  336 acagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  19700752 acagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatg 19700792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 51 - 370
Target Start/End: Original strand, 4727602 - 4727915
Alignment:
Q  51 aattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 150  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4727602 aattcaaagtttctaggaaatgtgatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 4727701  T
Q  151 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4727702 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttc 4727800  T
Q  251 tttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 348  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4727801 tttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 4727894  T
Q  349 aaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  4727895 aaatg-aacatgcatgagcgag 4727915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15735392 - 15735072
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735392 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 15735293  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||   |||||| ||||||||||| ||  ||| ||||    
T  15735292 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct-gctttcttttactttcaaagttatgtacaaaaa 15735195  T
Q  244 cattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacaggg 341  Q
    ||||| | ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||     |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15735194 catttcccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 15735100  T
Q  342 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15735099 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 15735072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 45 - 376
Target Start/End: Original strand, 5658097 - 5658425
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5658097 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaacgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 5658196  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatac--atcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aa 241  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||  ||| ||    
T  5658197 tcaggccttcggctgaccaccactcttatacatatcattttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctattttccttttactttcaacgttatgtacaaa 5658295  T
Q  242 aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||  |||      |||| |||||||||||| ||||||||    
T  5658296 aacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttaaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctaagcaacag 5658389  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  5658390 ggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatg 5658425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 45 - 376
Target Start/End: Original strand, 4689614 - 4689939
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4689614 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgcgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagcttcgtaaatccgtgga 4689713  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||   |||||| ||||||| ||| ||  ||| |||    
T  4689714 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactct-gctttcttttactttctaagttatgtacaaaa 4689811  T
Q  243 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       |||| ||||||||||||||||||||||    
T  4689812 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 4689904  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  4689905 gtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatg 4689939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 8283766 - 8283430
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8283766 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 8283667  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa- 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||   |||  || ||||||||||| ||  |||||||     
T  8283666 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcatgtgtttttgtttgaaa-ctccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaa 8283568  T
Q  244 cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa---------ctttttgtctatttttaaaagcaaacctga 332  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||          ||||| | | ||||  |||||||||||||    
T  8283567 cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttttttttttttttttttttttggaaagcaaacctga 8283468  T
Q  333 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8283467 gcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgag 8283430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 51 - 370
Target Start/End: Original strand, 35886733 - 35887048
Alignment:
Q  51 aattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 149  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35886733 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 35886832  T
Q  150 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  35886833 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacattt 35886931  T
Q  249 tctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 346  Q
    || ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  35886932 tccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgtgtaacagggtacat 35887025  T
Q  347 tcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    ||||| | ||||| ||||||||||    
T  35887026 tcaaacg-aacatacatgagcgag 35887048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 15887004 - 15886894
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aagattaccattttccaagctttgt-gaatccgtgg 142  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15887004 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaaatccgtgg 15886905  T
Q  143 agtcacgcctt 153  Q
    |||||||||||    
T  15886904 agtcacgcctt 15886894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 129
Target Start/End: Original strand, 8002523 - 8002607
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctt 129  Q
    |||| |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8002523 cttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 8002607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 182 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15886895 - 15886707
Alignment:
Q  182 ttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac-attttctttctattttga-taatgacaa-tgcttga 278  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||| ||  |||||||  | |||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||    
T  15886895 ttgagcctgtgtttttgtttgaaa-ctctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaatactttccttctatttttaataatgacaaatgctcga 15886797  T
Q  279 aacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    | ||||||| ||||||||||||||  ||||       || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  15886796 agcaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-------ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatg 15886707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22922412 - 22922048
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22922412 catcttcatctgaagcttccgcatttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 22922313  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattt--ttctt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  22922312 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttctt 22922213  T
Q  220 ctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttta 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  22922212 ctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttga 22922113  T
Q  320 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22922112 aaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 22922048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Original strand, 39896043 - 39896405
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttggg-aaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattt 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39896043 catcgtcatctgaagcttctgtacttgagaattcaaagtttttggggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 39896142  T
Q  121 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttc 220  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39896143 tccgagctttgtgaatccgtggagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttc 39896241  T
Q  221 tactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaa 320  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  39896242 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaa 39896341  T
Q  321 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39896342 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 39896405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 19410753 - 19410389
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19410753 catcttcatctgaagcttccgcatttgtgaaatcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 19410654  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattt--ttctt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  19410653 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttctt 19410554  T
Q  220 ctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttta 319  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  19410553 ctactttcaaagctatacacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttga 19410454  T
Q  320 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19410453 aaagcaaacctgagcaacaggataccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 19410389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 51 - 384
Target Start/End: Original strand, 12661543 - 12661875
Alignment:
Q  51 aattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 150  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661543 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 12661642  T
Q  151 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12661643 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 12661741  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 350  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661742 tttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 12661841  T
Q  351 atgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12661842 atgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 12661875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 254896 - 254557
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254896 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 254797  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctat-ttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  254796 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 254697  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  254696 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 254598  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  254597 cattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 254557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 37946110 - 37945770
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37946110 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 37946011  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  37946010 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 37945911  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37945910 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 37945811  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  37945810 cattcaaatgaaacatgcatgagtaagagtatgttgatgtc 37945770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 27809699 - 27810040
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809699 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 27809798  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctaaatacaaa 242  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  27809799 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttttcttctactttcaaagctatatacaaa 27809898  T
Q  243 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  27809899 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggtt 27809998  T
Q  343 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27809999 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 27810040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 37383675 - 37384014
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383675 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 37383774  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37383775 gtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 37383873  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37383874 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 37383973  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37383974 catccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 37384014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 37680160 - 37679796
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattt 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  37680160 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 37680061  T
Q  121 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  37680060 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttc 37679963  T
Q  221 tactttcaaagctaaatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctatttt 317  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  37679962 tactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaatttttttgtctatttt 37679863  T
Q  318 taaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37679862 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 37679796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 37695425 - 37695061
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattt 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  37695425 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 37695326  T
Q  121 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  37695325 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttc 37695228  T
Q  221 tactttcaaagctaaatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctatttt 317  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  37695227 tactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaatttttttgtctatttt 37695128  T
Q  318 taaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37695127 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 37695061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 45 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 13930790 - 13930457
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930790 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 13930691  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaa 243  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  13930690 tcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaa 13930591  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13930590 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 13930491  T
Q  343 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930490 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 13930457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 16167476 - 16167815
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167476 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 16167575  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaa 243  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  16167576 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagttatatacaaaaa 16167674  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16167675 tattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 16167774  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  16167775 cattcaaatgaaacatgcatgagtgagggtatgttgatgtc 16167815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21671440 - 21671075
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aagattaccattt 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21671440 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 21671341  T
Q  121 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  21671340 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttc 21671243  T
Q  221 tactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaa-actttttgtctattt 316  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  21671242 tactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaattttttttgtctattt 21671143  T
Q  317 ttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21671142 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 21671075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 22 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 11629451 - 11629104
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11629451 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 11629352  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttct 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  11629351 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttctttt 11629254  T
Q  222 actttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttta 319  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  11629253 attttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactctttgtctattttga 11629154  T
Q  320 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11629153 aaaacaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 11629104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 12592808 - 12593151
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592808 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 12592907  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12592908 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 12593007  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12593008 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttggaaagcaaacctgagcaacagg 12593107  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  12593108 gtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 12593151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 3788492 - 3788830
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  3788492 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttataaatccgcggag 3788591  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  3788592 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaac 3788690  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtac 344  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3788691 attttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 3788790  T
Q  345 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  3788791 attcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtc 3788830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 27122523 - 27122860
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27122523 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27122622  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  27122623 tcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctttgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaac 27122720  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtac 344  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  27122721 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgagaagcaaacctgagcaacagggtac 27122820  T
Q  345 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27122821 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 27122860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 45 - 376
Target Start/End: Original strand, 37931370 - 37931708
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931370 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 37931469  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta------tttttcttctactttcaaagctaaata 238  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| |||    
T  37931470 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttttttttcttctactttcaaagctatata 37931569  T
Q  239 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaac 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  37931570 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaac 37931669  T
Q  338 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931670 agggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 37931708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9344231 - 9343892
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9344231 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 9344132  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  9344131 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaac 9344033  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9344032 attttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtccattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 9343933  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9343932 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 9343892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 27 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12710863 - 12710514
Alignment:
Q  27 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaag 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12710863 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 12710764  T
Q  127 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  12710763 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaattcta-ttttcttctacttt 12710666  T
Q  227 caaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagc 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12710665 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 12710566  T
Q  325 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12710565 aaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatg 12710514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 27 - 370
Target Start/End: Original strand, 40239489 - 40239831
Alignment:
Q  27 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaag 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40239489 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 40239588  T
Q  127 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40239589 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 40239687  T
Q  227 caaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagca 325  Q
    ||||| || |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40239688 caaagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 40239787  T
Q  326 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40239788 aacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 40239831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 44 - 384
Target Start/End: Original strand, 34867680 - 34868019
Alignment:
Q  44 acttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34867680 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgaaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtaga 34867779  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34867780 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaaa 34867877  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggt 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34867878 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 34867977  T
Q  343 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34867978 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 34868019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 34160842 - 34161183
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34160842 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 34160941  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||| |||||||||    
T  34160942 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaac 34161040  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca---ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacaggg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34161041 attttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 34161140  T
Q  342 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34161141 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 34161183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 34 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16823592 - 16823250
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16823592 aagcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 16823493  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||||||    
T  16823492 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttg-aaactctgttttctttttactttcaaagct 16823394  T
Q  234 aaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctga 332  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16823393 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccga 16823294  T
Q  333 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16823293 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatg 16823250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 34 - 376
Target Start/End: Original strand, 16897888 - 16898230
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16897888 aagcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 16897987  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||||||    
T  16897988 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttg-aaactctgttttctttttactttcaaagct 16898086  T
Q  234 aaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctga 332  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16898087 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccga 16898186  T
Q  333 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16898187 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatg 16898230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 39046066 - 39045727
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||||||||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39046066 cttgcgaattcaaagtttccagaaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccactaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 39045967  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  39045966 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaac 39045868  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39045867 attttctttccattttaataatgacaatacttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 39045768  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39045767 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 39045727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 34 - 376
Target Start/End: Original strand, 27782219 - 27782561
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27782219 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 27782318  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27782319 aatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctattttcaaagct 27782417  T
Q  234 aaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctga 332  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  27782418 atatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctga 27782517  T
Q  333 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27782518 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatg 27782561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 45 - 376
Target Start/End: Original strand, 32055800 - 32056130
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32055800 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 32055899  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32055900 tcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 32055997  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32055998 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 32056097  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056098 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 32056130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 45 - 376
Target Start/End: Original strand, 31882285 - 31882615
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31882285 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 31882384  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31882385 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 31882482  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  31882483 attttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttttctattttgaaaagcaaacttgagcaacggggta 31882582  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31882583 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagaatatg 31882615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 95 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31868979 - 31868691
Alignment:
Q  95 accaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgct 194  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31868979 accaccaaccaataaaattaccatttttcaagcattgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgct 31868880  T
Q  195 tttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaa 293  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31868879 tttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaa 31868782  T
Q  294 aattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  31868781 aattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtgtgttgatgtc 31868691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 27 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21697438 - 21697078
Alignment:
Q  27 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaag 126  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21697438 tcatctaaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 21697339  T
Q  127 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 226  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |  | |||||||    
T  21697338 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctactatcttcctacttt 21697240  T
Q  227 caaagctaaatac--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctatttttaaa 321  Q
    ||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||| |||| ||    
T  21697239 caaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtcta-ttttgaa 21697141  T
Q  322 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21697140 agcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtc 21697078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 34297154 - 34297486
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34297154 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggag 34297253  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||| |||||||||    
T  34297254 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaac 34297352  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtac 344  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||      |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34297353 attttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttcgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 34297446  T
Q  345 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34297447 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 34297486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 376
Target Start/End: Original strand, 27396298 - 27396662
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  27396298 catcttcatcagaagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccatttt 27396397  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttct 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||    
T  27396398 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctactttctttct 27396496  T
Q  222 actttcaaagctaaatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa----------ctttttg 309  Q
    |||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||           ||||||    
T  27396497 actttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatctttataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaaaaagttttttg 27396596  T
Q  310 tctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||  ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  27396597 tc-ctttttgaaagcaaacctaagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatg 27396662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 45 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 34269165 - 34268839
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34269165 cttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattctccaagctttgtaaatccgtggag 34269066  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||| ||  ||| ||||    
T  34269065 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcatgtgcttttgttt-aaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaa 34268967  T
Q  244 cattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacaggg 341  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||  ||       |||| |||||||||||||||||||||||    
T  34268966 cattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttaaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 34268874  T
Q  342 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  34268873 tacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatg 34268839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Original strand, 28888277 - 28888597
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28888277 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 28888376  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaa 243  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||  ||| ||||    
T  28888377 tcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaa 28888475  T
Q  244 cattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacaggg 341  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28888476 cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 28888569  T
Q  342 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28888570 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 28888597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23122817 - 23122497
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23122817 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgcaaatccgtgga 23122718  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaa 242  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||| ||  ||| |||    
T  23122717 gtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 23122619  T
Q  243 acattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacaggg 341  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23122618 acattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 23122525  T
Q  342 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  23122524 tacattcaaacg-aacatgcatgagcgag 23122497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 45 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27428690 - 27428366
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27428690 cttgtgagttcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27428591  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||| ||  | | ||||    
T  27428590 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactctattttctttttactttcaaagttatgtgcaaaaa 27428492  T
Q  244 cattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||         ||||||||||||||||||||||    
T  27428491 cattttccttctatttttaataatgacaaatgttcgaaacaaacatcttgaaaattgcaaaagtttttg---------aaaagcaaacctgagcaacagg 27428401  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||    
T  27428400 gtacattcaaacg-aacgtgcatgagcgagtgtatg 27428366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 19450694 - 19450331
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19450694 catcttcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccatttt 19450595  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttct 221  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||   |||    
T  19450594 ccaagctttgtaaatccgtggaatcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaattcgagcatgtgcttttgtttg-aaactctattttctctct 19450496  T
Q  222 actttcaaagcta-----aatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg------aaaactttttgt 310  Q
    |||||||||| ||     || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      |||| |||||||    
T  19450495 actttcaaaggtatgtacaaaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaagtttttgt 19450396  T
Q  311 ctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||  |||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||  |||||||| ||| |||||    
T  19450395 ct-gttttgaaagtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaatgtgcatgagtgagcgtatg 19450331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Original strand, 20843910 - 20844235
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20843910 cttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 20844009  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttc-aaagctaaat--aca 240  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||  || ||| ||| |||| ||  |  | |    
T  20844010 gtcacgccttcggctggacaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctactttctttttaccttcaaaagttatgttcaaa 20844108  T
Q  241 aaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaaca 338  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||     |||| ||||||||||||||||||||    
T  20844109 aaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaaca 20844203  T
Q  339 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20844204 gggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgag 20844235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 244 - 384
Target Start/End: Original strand, 23116993 - 23117133
Alignment:
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    ||||||| | |||| || || |||||||||||||||  ||   ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  23116993 cattttcctcctatcttcatcatgacaatgcttgaactaacgtttttgaccattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgggcaacagggta 23117092  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23117093 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 23117133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 31887737 - 31887682
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccacc 100  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  31887737 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccacc 31887682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 3647148 - 3647487
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3647148 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 3647247  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3647248 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 3647347  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtac 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3647348 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 3647447  T
Q  345 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3647448 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 3647487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 10968667 - 10969007
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968667 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcctgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 10968766  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-tcttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10968767 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 10968866  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10968867 tattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 10968966  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10968967 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 10969007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 34 - 376
Target Start/End: Original strand, 51644211 - 51644555
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  51644211 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgta 51644310  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-tttttcttctactttcaaagc 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51644311 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagc 51644410  T
Q  233 taaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctatttttaaaagcaaacctg 331  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  51644411 tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctg 51644510  T
Q  332 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  51644511 agcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatg 51644555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 52 - 376
Target Start/End: Original strand, 10951100 - 10951425
Alignment:
Q  52 attcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcc 151  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  10951100 attcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcatgcc 10951199  T
Q  152 ttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-tcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttc 250  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10951200 tttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 10951299  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 350  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10951300 tttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaacagggtacattcaa 10951399  T
Q  351 atgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||    
T  10951400 acgaaacatgcataagcgagagtatg 10951425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 44 - 376
Target Start/End: Original strand, 28591084 - 28591415
Alignment:
Q  44 acttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591084 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 28591183  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  |||  || |||||||||||||| ||||||||    
T  28591184 gtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 28591282  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28591283 cattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 28591382  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591383 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 28591415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 41787565 - 41787224
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41787565 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggg 41787466  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  41787465 gtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaa 41787368  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41787367 cattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 41787268  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41787267 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 41787224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 28155728 - 28156069
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28155728 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 28155827  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28155828 tcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 28155925  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28155926 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 28156025  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28156026 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 28156069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 20334694 - 20334330
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20334694 catcttcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 20334595  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttct 221  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||| |||||||| |||  ||||    
T  20334594 ccaagccttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaattgtgcttttgtttg-aaactctactttctttct 20334496  T
Q  222 actttcaaagctaaatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctatttt 317  Q
    |||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  20334495 actttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtcta-ttt 20334397  T
Q  318 taaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20334396 tgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtc 20334330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16202312 - 16201942
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||   ||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16202312 catcttcatcagaagctcctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggacatgtagtaattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 16202213  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttct 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || |    
T  16202212 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctattttcttttt 16202114  T
Q  222 actttcaaagcta-----aatacaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa---ctttttgtc 311  Q
    ||||||||||| |     || | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| |||    
T  16202113 actttcaaagccatgtacaaaaaaaaacattttctttctatttttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttcgtc 16202014  T
Q  312 tatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16202013 ta-ttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtc 16201942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Original strand, 20466756 - 20467126
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||| | ||||  |||||||||||| | ||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20466756 catcttcatcagaagcttctatgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtagtcgttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 20466855  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttct 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||  |||     
T  20466856 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctactttctttcc 20466954  T
Q  222 actttcaaagctaaatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaatt--------gaaaactttttgtc 311  Q
    |||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||         |||| ||  ||||    
T  20466955 actttcaaagctatgtacaaaaaccattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatcttcaaaattagaaaaaaaaaaagttcctgtc 20467054  T
Q  312 tatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    || |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  20467055 ta-ttttgaaagcaaacctgagcagcaaggtacattcaaacgaaacatgcgtgagcgagtgtatgttgatgtc 20467126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 22 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21892025 - 21891691
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21892025 catcttcatcagaagcttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 21891926  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-tttttcttc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| | ||     
T  21891925 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctactttcttttt 21891827  T
Q  221 tactttcaaagctaaatacaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttt 318  Q
    ||  ||||           ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||      || | ||||     
T  21891826 tatgttca-----------aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaa----aagttttttttg 21891742  T
Q  319 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21891741 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgag 21891691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 44 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18369687 - 18369347
Alignment:
Q  44 acttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369687 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 18369588  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18369587 gtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaccttcgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 18369488  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18369487 cattttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 18369388  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18369387 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 18369347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 30174472 - 30174812
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174472 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 30174571  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-tcttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30174572 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 30174671  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30174672 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 30174771  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  30174772 cattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 30174812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 44 - 384
Target Start/End: Original strand, 33881132 - 33881472
Alignment:
Q  44 acttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881132 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 33881231  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  33881232 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttttccactttcaaagctatatacaaaa 33881331  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33881332 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 33881431  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33881432 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 33881472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 22 - 370
Target Start/End: Original strand, 6880287 - 6880636
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttt-tgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattt 120  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6880287 catcttcatctgaatcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 6880386  T
Q  121 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6880387 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aagactctatttttcttc 6880485  T
Q  221 tactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttta 319  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6880486 tactttcaaagctatatacaaaacattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 6880585  T
Q  320 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880586 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 6880636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 51 - 384
Target Start/End: Original strand, 11555367 - 11555699
Alignment:
Q  51 aattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 150  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555367 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 11555466  T
Q  151 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11555467 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 11555565  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555566 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttcttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 11555665  T
Q  351 atgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11555666 atgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 11555699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 27 - 384
Target Start/End: Original strand, 3795527 - 3795885
Alignment:
Q  27 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaag 126  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3795527 tcatctaaagcctctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 3795626  T
Q  127 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-tcttctactt 225  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  3795627 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttttcttctactt 3795726  T
Q  226 tcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagca 325  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3795727 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagca 3795826  T
Q  326 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3795827 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 3795885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 22 - 376
Target Start/End: Original strand, 9323461 - 9323814
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttt-gggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattt 120  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9323461 catcttcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 9323560  T
Q  121 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  9323561 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttc 9323658  T
Q  221 tactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaa 320  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  9323659 tattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaa 9323758  T
Q  321 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  9323759 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatg 9323814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 45 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 37746482 - 37746151
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37746482 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 37746383  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||    
T  37746382 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttctttttactttcaaagctatatacaaaac 37746283  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtac 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37746282 attttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 37746183  T
Q  345 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37746182 attcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatg 37746151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 22 - 376
Target Start/End: Original strand, 12138160 - 12138513
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttt-gggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattt 120  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12138160 catcttcatctgaagtttctgtacttatgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 12138259  T
Q  121 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  12138260 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttc 12138357  T
Q  221 tactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaa 320  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  12138358 tattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaa 12138457  T
Q  321 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12138458 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatg 12138513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 34 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 37352809 - 37352467
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37352809 aagcttctgcacttgtggattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 37352710  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37352709 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagct 37352611  T
Q  234 aaatacaaaacattttctttcta-ttttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctga 332  Q
    | ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  37352610 atatacaaaacattttccttccatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctga 37352511  T
Q  333 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352510 gcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 37352467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 41 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 8659629 - 8659295
Alignment:
Q  41 tgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8659629 tgtacttgtgaattcaaagtttc-gggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattcgccaagctttgtgaatccgt 8659531  T
Q  141 ggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaataca 240  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  8659530 ggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgtttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatataca 8659432  T
Q  241 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8659431 aaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacag 8659332  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8659331 ggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 8659295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 50 - 384
Target Start/End: Original strand, 43084270 - 43084604
Alignment:
Q  50 gaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 149  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43084270 gaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 43084369  T
Q  150 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattt 248  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||| |||| ||||    
T  43084370 cctttggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctattttcaaagttatatacaaaaatattt 43084468  T
Q  249 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084469 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaagttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 43084568  T
Q  349 aaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  43084569 aaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtc 43084604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 66 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18494900 - 18494583
Alignment:
Q  66 ggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18494900 ggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggccgaccacc 18494801  T
Q  166 actcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataa 265  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||   | |||||| ||||||||||||    
T  18494800 actctcatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttt-cttctactttcaaagctatatacaatttactttcttcctattttgataa 18494702  T
Q  266 tgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494701 tgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 18494602  T
Q  366 gcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  18494601 gcgagagtatgttgatgtc 18494583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 22 - 370
Target Start/End: Original strand, 33298517 - 33298869
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33298517 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 33298616  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-tttttcttc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  33298617 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttttttc 33298716  T
Q  221 tactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttt- 318  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33298717 tactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttg 33298816  T
Q  319 -aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
     |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298817 aaaaaacaaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 33298869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 40467707 - 40467368
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  40467707 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttataaatccgtggag 40467608  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  40467607 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaac 40467509  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40467508 attttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 40467409  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40467408 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 40467368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 45 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 13318981 - 13318651
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13318981 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgttatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 13318882  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  |||  || |||||||||||||| |||||||||    
T  13318881 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaac 13318783  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtac 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13318782 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 13318683  T
Q  345 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318682 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 13318651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 28655249 - 28655589
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655249 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 28655348  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28655349 tcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 28655446  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaac-tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacaggg 341  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28655447 attttctttctattttaataatgacaatgctcgaaacaaacattttttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 28655546  T
Q  342 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28655547 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 28655589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 37760989 - 37761329
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  37760989 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgcggag 37761088  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37761089 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 37761187  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttt-aaaagcaaacctgagcaacagggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  37761188 attttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaacagggc 37761287  T
Q  343 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37761288 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 37761329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 44 - 384
Target Start/End: Original strand, 11329643 - 11329985
Alignment:
Q  44 acttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329643 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 11329742  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaa--atacaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  11329743 gtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgttttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctaaatatacaa 11329841  T
Q  242 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
       |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11329842 tttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 11329941  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11329942 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 11329985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13436834 - 13436489
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436834 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 13436735  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctaaatacaaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  13436734 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 13436636  T
Q  243 acatttt-ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaac 337  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13436635 acatttttctttctattttgataatggcaacgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 13436536  T
Q  338 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13436535 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 13436489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 27 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 28953952 - 28953609
Alignment:
Q  27 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaag 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28953952 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagagctgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 28953853  T
Q  127 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 226  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28953852 ctttgtaaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 28953754  T
Q  227 caaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttt-aaaagc 324  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28953753 caaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgggaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagc 28953654  T
Q  325 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28953653 aaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 28953609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13180943 - 13180608
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13180943 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 13180844  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13180843 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 13180744  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13180743 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 13180649  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13180648 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 13180608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 44 - 376
Target Start/End: Original strand, 24729976 - 24730308
Alignment:
Q  44 acttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24729976 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 24730075  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24730076 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttg-aaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 24730173  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacaggg 341  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24730174 tattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 24730273  T
Q  342 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24730274 tacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatg 24730308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 34 - 376
Target Start/End: Original strand, 30158030 - 30158372
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30158030 aagcttatgtactcgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 30158129  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  30158130 aatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctacctttcttctactttcaaagct 30158228  T
Q  234 aaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctga 332  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30158229 atatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 30158328  T
Q  333 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30158329 gcaacggggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagaatatg 30158372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Original strand, 41680711 - 41681037
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680711 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 41680810  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaa 243  Q
    ||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  41680811 tcgtgcccttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaa 41680910  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttt-aaaagcaaacctgagcaacagggt 342  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41680911 tattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 41681010  T
Q  343 acattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41681011 acattcaaatg-aacatgcatgagcgag 41681037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9544862 - 9544522
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9544862 cttgcgaattcaaagtttcagg-aaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 9544764  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9544763 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 9544666  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9544665 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaacagg 9544566  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9544565 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 9544522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 51 - 384
Target Start/End: Original strand, 23631982 - 23632317
Alignment:
Q  51 aattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 150  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23631982 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagcttcgtgaatccgtggagtcacgc 23632081  T
Q  151 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23632082 cttcggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 23632180  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttt-aaaagcaaacctgagcaacagggtacatt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23632181 tttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatcttgaaaattgaaaaagctttttgtctatttttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacatt 23632280  T
Q  348 caaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23632281 caaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtc 23632317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 22 - 376
Target Start/End: Original strand, 26486380 - 26486723
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttt-tgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattt 120  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26486380 catcttcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattt 26486479  T
Q  121 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||            
T  26486480 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctat-------- 26486570  T
Q  221 tactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaa 320  Q
       ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  26486571 ---tttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaa 26486667  T
Q  321 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  26486668 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatg 26486723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 34 - 376
Target Start/End: Original strand, 33522378 - 33522721
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33522378 aagcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 33522477  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-tcttctactttcaaagc 232  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||| | || ||||||||||||    
T  33522478 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttg-aaactctgttttcttttttactttcaaagc 33522576  T
Q  233 taaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctg 331  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  33522577 tatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccg 33522676  T
Q  332 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33522677 agcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatg 33522721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 37665640 - 37665315
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37665640 cttgcgaattcaaaatttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 37665541  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  37665540 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaac 37665442  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttt-aaaagcaaacctgagcaacagggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37665441 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttaaaaagcaaacctgagcaacagggt 37665342  T
Q  343 acattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37665341 acattcaaatg-aacatgcatgagcgag 37665315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 34 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 31820573 - 31820233
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31820573 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 31820474  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  31820473 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagct 31820376  T
Q  234 aaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgag 333  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31820375 atatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgag 31820276  T
Q  334 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31820275 caacaaggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatg 31820233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 45 - 376
Target Start/End: Original strand, 30035433 - 30035763
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30035433 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 30035532  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30035533 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 30035630  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30035631 attttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 30035730  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30035731 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 30035763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 34 - 384
Target Start/End: Original strand, 2517061 - 2517412
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2517061 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 2517160  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||    
T  2517161 aatccgtggagtcatgccctcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-agattcta-ttttcttctactttcaaagct 2517258  T
Q  234 aaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca---ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacct 330  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2517259 atatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacct 2517358  T
Q  331 gagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  2517359 gagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatgttgatgtc 2517412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Original strand, 22894400 - 22894761
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22894400 catcttcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 22894499  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttct 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||    
T  22894500 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttg-aaactctactttctttct 22894598  T
Q  222 actttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-ctttttgtctatttttaa 320  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||| |    
T  22894599 actttcaaagctatgtacaaaatattttctttctattttgataatgaccatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaggtttttgtcta-ttttga 22894697  T
Q  321 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  22894698 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtatgttgatgtc 22894761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 34 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 32590440 - 32590091
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32590440 aagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 32590341  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    ||| ||||| |||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  32590340 aattcgtggggtcatgcctttggccgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ctttcttctactttcaaagct 32590243  T
Q  234 aaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctga 332  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32590242 atatacaaatcattttctttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctga 32590143  T
Q  333 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32590142 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 32590091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 45 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15753006 - 15752681
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15753006 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 15752907  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15752906 tcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 15752809  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtac 344  Q
    ||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15752808 attttctttc----ttgataatgacaatacttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 15752713  T
Q  345 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752712 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 15752681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 34622525 - 34622865
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34622525 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtgga 34622624  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  |||  || |||||||||||||| ||||||||    
T  34622625 gtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 34622723  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34622724 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 34622823  T
Q  343 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34622824 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 34622865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 45 - 376
Target Start/End: Original strand, 5643807 - 5644136
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5643807 cttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtggag 5643906  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  5643907 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta-ttttcttttactttcaaagctatatacaaaac 5644004  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5644005 attttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacaaacatttttgaaaatcgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 5644104  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5644105 cattcaaatg-aacatgcatgagcgagagtatg 5644136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18122570 - 18122245
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18122570 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 18122471  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-tttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||      
T  18122470 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttttttctactttcaaagctatatacaatt 18122372  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggt 342  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18122371 tattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgagaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 18122272  T
Q  343 acattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18122271 acattcaaatg-aacatgcatgagcgag 18122245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 31437471 - 31437803
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31437471 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 31437570  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||| |||||||||    
T  31437571 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaac 31437669  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtac 344  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31437670 attttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 31437763  T
Q  345 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31437764 attcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 31437803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15652912 - 15652589
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15652912 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 15652813  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||| |||||||||    
T  15652812 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaac 15652714  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtac 344  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| | | |    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15652713 attttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttttttttttaaaaaaaagcaaacctgagcaacagggtac 15652614  T
Q  345 attcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15652613 attcaaatg-aacatgcatgagcgag 15652589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 50 - 384
Target Start/End: Original strand, 25206289 - 25206630
Alignment:
Q  50 gaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcac 148  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25206289 gaattcagagtttataggaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcac 25206388  T
Q  149 gccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac--aaaacat 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||  |||  |||||||    
T  25206389 gccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacat 25206487  T
Q  247 tttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-----ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  25206488 tttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtcta-ttttgaaagcaaacctgaacaacagg 25206586  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25206587 gtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtc 25206630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 50 - 384
Target Start/End: Original strand, 25270445 - 25270786
Alignment:
Q  50 gaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcac 148  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25270445 gaattcagagtttataggaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcac 25270544  T
Q  149 gccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac--aaaacat 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||  |||  |||||||    
T  25270545 gccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacat 25270643  T
Q  247 tttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-----ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  25270644 tttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtcta-ttttgaaagcaaacctgaacaacagg 25270742  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25270743 gtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtc 25270786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22993270 - 22992953
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22993270 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtatcgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 22993171  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||| |||||||||    
T  22993170 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaac 22993072  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtac 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||      |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22993071 attttctttctattttgataatgatgatgctcgaaacaagcattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 22992978  T
Q  345 attcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22992977 attcaaatg-aacatgcatgagcgag 22992953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 50 - 376
Target Start/End: Original strand, 23897886 - 23898206
Alignment:
Q  50 gaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 149  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  23897886 gaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaattcatggagtcacg 23897985  T
Q  150 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac----aaaaca 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||  |||    ||||||    
T  23897986 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaaaaca 23898084  T
Q  246 ttttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtac 344  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||          | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23898085 ttttctttctattttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa----------agttttgaaagcaaacctgagcaacagggtac 23898174  T
Q  345 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  23898175 attcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatg 23898206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Original strand, 33783494 - 33783814
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33783494 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 33783593  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||  ||| ||||    
T  33783594 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaa 33783692  T
Q  244 cattttctttcta--ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    ||||||| |||||  |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33783693 cattttccttctattttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaaccggagcaacagg 33783785  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  33783786 gtacattcaaacg-aacatgcatgagcgag 33783814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 50 - 370
Target Start/End: Original strand, 24975861 - 24976175
Alignment:
Q  50 gaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 149  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24975861 gaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 24975960  T
Q  150 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  24975961 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattt 24976059  T
Q  249 tctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaatt-gaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 345  Q
    || ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||         |||||||||||||||||||||||||||    
T  24976060 tccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattggaaaagtttttg---------aaaagcaaacctgagcaacagggtaca 24976150  T
Q  346 ttcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    |||||| |||| |||||||||||||    
T  24976151 ttcaaacgaaatatgcatgagcgag 24976175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 45 - 367
Target Start/End: Original strand, 24608252 - 24608570
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24608252 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 24608351  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||   |||  || ||||||||||| ||  |||||||    
T  24608352 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcatgtgcttttgtttgaaa-ctccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 24608450  T
Q  244 -cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
     ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24608451 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 24608543  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagc 367  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||    
T  24608544 gtacattcaaacaaaacatgcatgagc 24608570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 45 - 376
Target Start/End: Original strand, 30940643 - 30940968
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  30940643 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagcttcgtaaatccgtgga 30940742  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||  |||  || ||||||||||| ||  |||||||    
T  30940743 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcctgtgcttttgtttgaaat-tctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 30940841  T
Q  244 -cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
     ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |        |||| ||||||||||||||||||||||    
T  30940842 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 30940933  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  30940934 gtacattcaaaag-aacatgcatgagcgagtgtatg 30940968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27284586 - 27284224
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27284586 catcttcatctgaagcttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 27284487  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27284486 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttttcttc 27284388  T
Q  221 tactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaa 320  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27284387 tactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 27284288  T
Q  321 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27284287 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 27284224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 44 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13518396 - 13518056
Alignment:
Q  44 acttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518396 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 13518297  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  13518296 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttttccactttcaaagctatatacaaaa 13518197  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13518196 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 13518097  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13518096 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 13518056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 8899923 - 8899561
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8899923 catcttcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 8899824  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttct 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8899823 ccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttct 8899725  T
Q  222 actttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaa 320  Q
    |||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8899724 actttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaa 8899625  T
Q  321 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8899624 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtc 8899561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 28 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27623927 - 27623569
Alignment:
Q  28 catctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagc 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27623927 catcagaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagc 27623828  T
Q  128 tttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctat-ttttcttctacttt 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27623827 tttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctacttt 27623728  T
Q  227 caaagctaaatacaaaaca-ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagca 325  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27623727 caaagctatatacaaaacatttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 27623628  T
Q  326 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  27623627 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtc 27623569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 16755817 - 16756157
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755817 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 16755916  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16755917 tcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 16756015  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac--attttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16756016 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatattttgacaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 16756115  T
Q  343 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16756116 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 16756157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 4763760 - 4764099
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4763760 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 4763859  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  4763860 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaatc 4763958  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4763959 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 4764058  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4764059 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 4764099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 27063479 - 27063817
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27063479 cttgtgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27063578  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  27063579 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaatc 27063676  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27063677 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 27063776  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27063777 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 27063817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 34 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27356323 - 27355973
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27356323 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 27356224  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356223 aatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagct 27356125  T
Q  234 aaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctga 332  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  27356124 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctga 27356025  T
Q  333 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27356024 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 27355973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 28166491 - 28166831
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166491 cttgcgaatccaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 28166590  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       
T  28166591 tcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaattt 28166689  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggt 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28166690 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 28166789  T
Q  343 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28166790 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 28166831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 34 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 26110622 - 26110281
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26110622 aagcttctgcacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 26110523  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  |||  || |||||||||||||    
T  26110522 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctgctttctttttactttcaaagct 26110424  T
Q  234 aaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgag 333  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  26110423 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgag 26110324  T
Q  334 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110323 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 26110281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 34 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 34458718 - 34458370
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34458718 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 34458619  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  34458618 aatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctattttctaagct 34458520  T
Q  234 aaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgag 333  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34458519 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatggttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgag 34458421  T
Q  334 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  34458420 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 34458370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 34 - 384
Target Start/End: Original strand, 27491119 - 27491469
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27491119 aagctcctatacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 27491218  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491219 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagct 27491317  T
Q  234 aaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctga 332  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  27491318 gtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctga 27491417  T
Q  333 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27491418 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 27491469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 28 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16938243 - 16937895
Alignment:
Q  28 catctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttt-gggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaag 126  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16938243 catctgaagcttttgtacttgcgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16938144  T
Q  127 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  16938143 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggccgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttctatttt 16938046  T
Q  227 caaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagca 325  Q
    |||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16938045 caaagctatatacaaattattttccttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagca 16937946  T
Q  326 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16937945 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 16937895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 34 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 30552212 - 30551870
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30552212 aagcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 30552113  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||||||    
T  30552112 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttg-aaactctgttttctttttactttcaaagct 30552014  T
Q  234 aaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctga 332  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  30552013 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccga 30551914  T
Q  333 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30551913 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatg 30551870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 34 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 33370643 - 33370293
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33370643 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 33370544  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33370543 aatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagct 33370445  T
Q  234 aaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctga 332  Q
    | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  33370444 atatacaaagcattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaagcgaacctga 33370345  T
Q  333 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  33370344 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 33370293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 44 - 384
Target Start/End: Original strand, 16680135 - 16680476
Alignment:
Q  44 acttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16680135 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgaaaatccgtgga 16680234  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctaaatacaaa 242  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  16680235 gtcacgccgtcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctattttttcttctactttcaaagttatatacaaa 16680333  T
Q  243 ac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacaggg 341  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16680334 aatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgacaggg 16680433  T
Q  342 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16680434 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 16680476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 34 - 370
Target Start/End: Original strand, 4531274 - 4531609
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4531274 aagcttctgtacttgtgaattcgaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 4531373  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4531374 aatccgtggagtcgtgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagct 4531472  T
Q  234 aaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctga 332  Q
      |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4531473 gtatacaaaacattctctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacccga 4531572  T
Q  333 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4531573 gcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 4531609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 34 - 383
Target Start/End: Original strand, 27200172 - 27200522
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  27200172 aagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgt 27200271  T
Q  133 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagc 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27200272 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgatt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagc 27200369  T
Q  233 taaatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacct 330  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27200370 tatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacct 27200469  T
Q  331 gagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgt 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27200470 gagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgt 27200522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 34 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 27249061 - 27248711
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  27249061 aagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgt 27248962  T
Q  133 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagc 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27248961 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgatt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagc 27248864  T
Q  233 taaatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacct 330  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27248863 tatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacct 27248764  T
Q  331 gagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgt 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27248763 gagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgt 27248711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 34 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 26772840 - 26772499
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26772840 aagcttctgcacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 26772741  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  26772740 aatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaattcta-ttttcttctactttcaaagct 26772643  T
Q  234 aaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctga 332  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  26772642 atatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaactttttgtctattttgaaaaacaaacctga 26772543  T
Q  333 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26772542 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatg 26772499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 51 - 376
Target Start/End: Original strand, 29579018 - 29579342
Alignment:
Q  51 aattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 150  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29579018 aattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 29579117  T
Q  151 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  29579118 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaatcattttc 29579215  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg-aaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 349  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29579216 cttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatca 29579315  T
Q  350 aatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  29579316 aatgaaacatgcatgagcgagggtatg 29579342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 34 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4539971 - 4539628
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  4539971 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgt 4539872  T
Q  133 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttct-actttcaaag 231  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  4539871 gaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaa-ctctatttttctttttactttcaaag 4539773  T
Q  232 ctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctg 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  4539772 ctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctg 4539673  T
Q  332 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4539672 agcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 4539628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Original strand, 4778877 - 4779203
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4778877 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 4778976  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttc-aaagctaaatacaaa 242  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||    
T  4778977 gtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaaagctgtatacgaa 4779075  T
Q  243 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacaggg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4779076 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 4779175  T
Q  342 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4779176 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 4779203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 45 - 376
Target Start/End: Original strand, 26791813 - 26792144
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  26791813 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggaa 26791912  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  26791913 tcacgcctttggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaatc 26792011  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26792012 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 26792111  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26792112 caatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatg 26792144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Original strand, 29555532 - 29555894
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29555532 catcttcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 29555631  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttct 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||| ||||  || |    
T  29555632 ccaagctttgtaaatccgtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctg-aaactctgttttcttttt 29555730  T
Q  222 actttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctatttttaa 320  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  29555731 actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttagaaaattaaaagctttttgtctattttgaa 29555830  T
Q  321 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29555831 aagcaaacctgaacaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 29555894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 29507413 - 29507754
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29507413 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 29507512  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctaaatacaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  |||  | || |||||||||||||| |||||||    
T  29507513 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctgctttctttttttactttcaaagctatatacaaa 29507611  T
Q  243 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacaggg 341  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29507612 acattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 29507711  T
Q  342 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29507712 tacattcaaatggaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 29507754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 34 - 376
Target Start/End: Original strand, 28213440 - 28213783
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  28213440 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgt 28213539  T
Q  133 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagc 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28213540 gaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagc 28213638  T
Q  233 taaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctg 331  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||    
T  28213639 tgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtgtgttttgaaaagcaagcctg 28213738  T
Q  332 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28213739 agcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 28213783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22929107 - 22928743
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22929107 catcttcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 22929008  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttct 221  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||    
T  22929007 ccaagctttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctatgcttttgtttg-aaactctactttctttct 22928909  T
Q  222 actttcaaagctaaatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctattttt 318  Q
    |||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22928908 actttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttt 22928809  T
Q  319 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22928808 gaaagcaaacctgagcaatagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtc 22928743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 51 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13293140 - 13292831
Alignment:
Q  51 aattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 150  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13293140 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 13293041  T
Q  151 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13293040 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 13292942  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 350  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13292941 tttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 13292847  T
Q  351 atgaaacatgcatgag 366  Q
    ||||||||||||||||    
T  13292846 atgaaacatgcatgag 13292831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 45 - 354
Target Start/End: Original strand, 26926765 - 26927073
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26926765 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 26926864  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||       
T  26926865 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaattt 26926962  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26926963 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 26927062  T
Q  344 cattcaaatga 354  Q
    |||||||||||    
T  26927063 cattcaaatga 26927073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 27013730 - 27014062
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27013730 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27013829  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||| |||||||||    
T  27013830 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaac 27013928  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtac 344  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27013929 attttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 27014022  T
Q  345 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27014023 attcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 27014062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14139595 - 14139262
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14139595 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 14139496  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||| |||||||||    
T  14139495 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaac 14139397  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtac 344  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  14139396 attttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacatggtac 14139302  T
Q  345 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14139301 attcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 14139262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Original strand, 27031020 - 27031342
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27031020 cttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtattcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27031119  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac--aaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||| ||  |||  |||    
T  27031120 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaa 27031218  T
Q  243 acattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacaggg 341  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||    | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  27031219 acattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt----ttttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 27031314  T
Q  342 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27031315 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 27031342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 129 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 26666774 - 26666528
Alignment:
Q  129 ttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  26666774 ttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-cttctactttca 26666677  T
Q  229 aagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaa 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26666676 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaactttttgtctattttgaaaaacaaa 26666577  T
Q  328 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26666576 cctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatg 26666528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 27208901 - 27209236
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27208901 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27209000  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||  ||| ||||    
T  27209001 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcgtgtgcttttgtttg-aaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaa 27209099  T
Q  244 cattttctttcta---ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    ||||||| |||||   |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       |||| |||||||||| ||||||||||    
T  27209100 cattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacttgagcaacag 27209192  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  27209193 ggtacattcaaatg-aacgtgcatgagcgagagtatgttgatgtc 27209236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27240327 - 27239992
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27240327 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27240228  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||  ||| ||||    
T  27240227 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcgtgtgcttttgtttg-aaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaa 27240129  T
Q  244 cattttctttcta---ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    ||||||| |||||   |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       |||| |||||||||| ||||||||||    
T  27240128 cattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacttgagcaacag 27240036  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  27240035 ggtacattcaaatg-aacgtgcatgagcgagagtatgttgatgtc 27239992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Original strand, 24869707 - 24870026
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24869707 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 24869806  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||  || ||||||||||| ||  ||| ||||    
T  24869807 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctactttctttttactttcaaagttatgtacaaaaa 24869905  T
Q  244 cattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacaggg 341  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24869906 cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 24869998  T
Q  342 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24869999 tacattcaaacg-aacatgcatgagcgag 24870026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 45 - 367
Target Start/End: Original strand, 27025142 - 27025460
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27025142 cttgcgaattcaaagtctctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 27025241  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac--aaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||  |||  |||    
T  27025242 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaa 27025340  T
Q  243 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||       |||| ||||||||||||||||||||||    
T  27025341 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 27025433  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagc 367  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||    
T  27025434 gtacattcaaacgagacatgcatgagc 27025460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 24299956 - 24299636
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24299956 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtatcaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 24299857  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa- 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||  || |||| |||||| ||  |||||||     
T  24299856 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-ctctgctttctttttactctcaaagttatgtacaaaaa 24299758  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggt 342  Q
    | ||| | |||| |||| |||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||     |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  24299757 cgtttcccttcttttttaataatgacaaatgctcggaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagtaacagggt 24299663  T
Q  343 acattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24299662 acattcaaatg-aacatgcataagcgag 24299636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 45 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15406730 - 15406403
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15406730 cttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 15406631  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||  ||| |||    
T  15406630 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagatatgtacaaaa 15406532  T
Q  243 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||   ||      |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15406531 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatctggaaaattggaaaaagtt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 15406438  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  15406437 gtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatg 15406403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 45 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15418517 - 15418190
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15418517 cttgcgaattcaaagttcctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 15418418  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||  ||| |||    
T  15418417 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagatatgtacaaaa 15418319  T
Q  243 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||   ||      |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15418318 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatctggaaaattggaaaaagtt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 15418225  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  15418224 gtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatg 15418190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 88 - 370
Target Start/End: Original strand, 20174589 - 20174881
Alignment:
Q  88 tcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 187  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20174589 tcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagt 20174688  T
Q  188 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttc--tactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttg-aaacaa 283  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  20174689 ctgtgcttttgtttg-aaactctattttttctctttacttccaaagttatgtacaaaaacattttctttctattttgatgatgacaatgcttgaaaacaa 20174787  T
Q  284 acattttgaaa------attgaaaactttt-tgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    ||||| | |||      ||  | || |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20174788 acattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtgaaacatgcatgagcgag 20174881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 88 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22161402 - 22161110
Alignment:
Q  88 tcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 187  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22161402 tcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagt 22161303  T
Q  188 ctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttc--tactttcaaagctaaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttg-aaacaa 283  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22161302 ctgtgcttttgtttg-aaactctattttttctctttacttccaaagttatgtacaaaaacattttctttctattttgatgatgacaatgcttgaaaacaa 22161204  T
Q  284 acattttgaaa------attgaaaactttt-tgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    ||||| | |||      ||  | || |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22161203 acattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtgaaacatgcatgagcgag 22161110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 23851552 - 23851450
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23851552 catcttcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 23851453  T
Q  122 cca 124  Q
    |||    
T  23851452 cca 23851450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 27 - 384
Target Start/End: Original strand, 39856630 - 39856985
Alignment:
Q  27 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaag 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39856630 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 39856729  T
Q  127 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctacttt 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  39856730 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgttt-aaaactct-tttttcttctacttt 39856827  T
Q  227 caaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaa 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39856828 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 39856927  T
Q  327 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39856928 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 39856985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 20332677 - 20332337
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332677 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 20332578  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  20332577 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 20332478  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20332477 tattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 20332378  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20332377 cattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 20332337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 40099891 - 40099551
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099891 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 40099792  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  40099791 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 40099692  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40099691 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 40099592  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  40099591 cattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 40099551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27157568 - 27157227
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157568 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 27157469  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctat-ttttcttctactttcaaagctaaatac-aaa 242  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  27157468 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 27157369  T
Q  243 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggt 342  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27157368 atattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 27157269  T
Q  343 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27157268 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 27157227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24586616 - 24586276
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586616 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 24586517  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24586516 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 24586417  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  24586416 cattttctttctattttgataaggacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaatagggta 24586317  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24586316 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 24586276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 27 - 376
Target Start/End: Original strand, 5011870 - 5012220
Alignment:
Q  27 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aagattaccattttccaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5011870 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 5011969  T
Q  126 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5011970 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctacttttcttctactt 5012068  T
Q  226 tcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagc 324  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  5012069 tcaaagctatatacaaatcattttctttctacttggataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagc 5012168  T
Q  325 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  5012169 aaacctgagcaacagggcacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatg 5012220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 44 - 384
Target Start/End: Original strand, 14104553 - 14104892
Alignment:
Q  44 acttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104553 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 14104652  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14104653 gtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctgttttctttctactttcaaagctatatacaaaa 14104751  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14104752 cattttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 14104851  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  14104852 cattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtc 14104892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 44 - 384
Target Start/End: Original strand, 30759774 - 30760112
Alignment:
Q  44 acttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759774 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 30759873  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||     
T  30759874 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaat 30759971  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30759972 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 30760071  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30760072 ctttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 30760112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 44 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 33668056 - 33667718
Alignment:
Q  44 acttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33668056 acttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 33667957  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||     
T  33667956 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaat 33667859  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33667858 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 33667759  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33667758 ctttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 33667718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 54839402 - 54839740
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54839402 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 54839501  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  54839502 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgcttg-aaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaatc 54839599  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  54839600 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggta 54839699  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54839700 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 54839740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 5700551 - 5700890
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700551 cttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 5700650  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5700651 gtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 5700748  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  5700749 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggt 5700848  T
Q  343 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5700849 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 5700890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 34 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18794882 - 18794540
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |   || |||| || || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18794882 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaaaaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 18794783  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18794782 aatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagct 18794684  T
Q  234 aaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctga 332  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18794683 atatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctga 18794584  T
Q  333 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794583 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 18794540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 34183216 - 34182893
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34183216 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 34183117  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34183116 tcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 34183018  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34183017 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 34182919  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  34182918 cattcaaatg-aacatgcatgagcgag 34182893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14753747 - 14753423
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14753747 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 14753648  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14753647 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 14753550  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  14753549 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggt 14753450  T
Q  343 acattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14753449 acattcaaatg-aacatgcatgagcgag 14753423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 34 - 376
Target Start/End: Original strand, 21975704 - 21976046
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21975704 aagcttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 21975803  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||||||    
T  21975804 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgcgcttttgtttg-aaactctgttttctttttactttcaaagct 21975902  T
Q  234 aaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctga 332  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  21975903 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccga 21976002  T
Q  333 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21976003 gcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatg 21976046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 34 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 31120776 - 31120433
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  31120776 aagcttctgtacttgtggattcgaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtg 31120677  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||||||    
T  31120676 aatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttg-aaactctgttttctttttactttcaaagct 31120578  T
Q  234 aaatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttt-aaaagcaaacctg 331  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  31120577 atatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttgaaaagcaaacccg 31120478  T
Q  332 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31120477 agcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatg 31120433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Original strand, 24118674 - 24118998
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24118674 cttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 24118773  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||| ||||  || |||||||||||||| |||||||||    
T  24118774 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctg-aaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaac 24118872  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24118873 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaaccggagcaacagggta 24118972  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24118973 cattcaaatg-aacatgcatgagcgag 24118998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 36338772 - 36338455
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338772 cttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccgccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 36338673  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36338672 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 36338574  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtac 344  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36338573 attttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 36338480  T
Q  345 attcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  36338479 attcaaatg-aacatgcatgagcgag 36338455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 51 - 370
Target Start/End: Original strand, 6575879 - 6576190
Alignment:
Q  51 aattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 150  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6575879 aattcaaagtttctaggaaatgtgatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 6575978  T
Q  151 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6575979 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttc 6576077  T
Q  251 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 350  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||       ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6576078 tttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ctttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 6576171  T
Q  351 atgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  6576172 atg-aacatgcatgagcgag 6576190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Original strand, 1906240 - 1906607
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| ||||||  ||| |||| |||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1906240 catcttcatcagaagctcatgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 1906339  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttct 221  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| | |  ||||    
T  1906340 ccaagctttgtatatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttg-aaactctactatctttct 1906438  T
Q  222 actttcaaagctaaataca----aaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctat 314  Q
    ||||||||||| |  ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||     
T  1906439 actttcaaagccatgtacaaaagaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtcta- 1906537  T
Q  315 ttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  1906538 ttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtc 1906607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 34 - 384
Target Start/End: Original strand, 15233816 - 15234170
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| || || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  15233816 aagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttataggaaatgtagtggttactatgtccaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgta 15233915  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  15233916 aatccgtagagtcacgccttcggctaaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttg-aaactctactttctttctactttcaaagct 15234014  T
Q  234 aaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa------ctttttgtctatttttaaaagcaaa 327  Q
    |  ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||       |||||||||| |||| ||||||||    
T  15234015 atgtacaaaaaaatttctttttatcttgataatgacaatgcttgaagcaaacatcttgaaacttgaaaaagttttttttttgtcta-ttttgaaagcaaa 15234113  T
Q  328 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15234114 cctgggcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtc 15234170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 22 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15276909 - 15276552
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15276909 catcttcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccatttt 15276810  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttct 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||   |||    
T  15276809 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtttg-aaactctattttctctct 15276711  T
Q  222 actttcaaagctaaatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg---aaaactttttgtctattt 316  Q
    |||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| |||||||||  ||    
T  15276710 actttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaagtttttgtct-gtt 15276612  T
Q  317 ttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    || |||| |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||    
T  15276611 ttgaaagtaaacttgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatg 15276552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15380515 - 15380161
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||   ||||||||| || ||   |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15380515 catcttcatccgaagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttcaaggaaatgtagtggttatcgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccatttt 15380416  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttct 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||    
T  15380415 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtttg-aaactctactttctttct 15380317  T
Q  222 actttcaaagctaaatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttta 319  Q
    |||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||| |||||||||  ||||     
T  15380316 actttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaattaaaaaagtttttgtct-gttttg 15380218  T
Q  320 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  15380217 aaagcaagcctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatg 15380161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 51 - 384
Target Start/End: Original strand, 1673877 - 1674213
Alignment:
Q  51 aattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgc 150  Q
    |||||||||||| | ||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  1673877 aattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggtgtcactc 1673976  T
Q  151 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac--aaaacattt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||| |  |||  |||| ||||    
T  1673977 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctactatctttctactttcaaagccatgtacaaaaaatattt 1674075  T
Q  249 tctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 345  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1674076 tctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtcta-ttttgaaagcaaacttgagcaacagggtaca 1674174  T
Q  346 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || || |||||||    
T  1674175 ttcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttgatgtc 1674213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 124 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 36324484 - 36324246
Alignment:
Q  124 aagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctac 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36324484 aagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctac 36324386  T
Q  224 tttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaag 323  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      |||| |||||    
T  36324385 tttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaag 36324292  T
Q  324 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36324291 caaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 36324246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Original strand, 14671027 - 14671349
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14671027 cttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 14671126  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaa-a 242  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||  ||||| |    
T  14671127 gttacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcccgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaga 14671225  T
Q  243 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||| ||||||||||||||||||||||    
T  14671226 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 14671319  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14671320 gtacattcaaacgaaacatgcatgagcgag 14671349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Original strand, 17019063 - 17019384
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17019063 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 17019162  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttc-aaagctaaatac-aa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||| |||||||  ||| ||    
T  17019163 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctatgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaaagctatgtacaaa 17019261  T
Q  242 aacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||      |||| ||||||||||||||||||||||    
T  17019262 aacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgagaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 17019355  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17019356 gtacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 17019384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9895 - 9557
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9895 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggag 9796  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9795 tcacgctttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 9697  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtac 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9696 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 9597  T
Q  345 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9596 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 9557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3458 - 3094
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3458 catcttcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 3359  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt--tctt 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  3358 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttctt 3259  T
Q  220 ctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttta 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  3258 ctactttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttga 3159  T
Q  320 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3158 aaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 3094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 188 - 384
Target Start/End: Original strand, 17949 - 18147
Alignment:
Q  188 ctttgcttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 285  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17949 ctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 18048  T
Q  286 attttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18049 attttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 18147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 12036 - 12374
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||| |||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12036 cttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 12135  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  12136 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatataaaac 12234  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtac 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12235 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 12334  T
Q  345 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12335 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 12374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9182 - 8844
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9182 cttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 9083  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9082 tcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 8985  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  8984 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggta 8885  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8884 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 8844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 18585 - 18926
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18585 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggg 18684  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaa 243  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  18685 gtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaa 18782  T
Q  244 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18783 cattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 18882  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18883 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 18926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4860 - 4518
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaa-ccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 142  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4860 cttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 4761  T
Q  143 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  4760 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 4662  T
Q  242 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4661 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagg 4562  T
Q  341 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  4561 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtc 4518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 9914 - 10252
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 144  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  9914 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgaag 10013  T
Q  145 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatacaaaac 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10014 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaaac 10111  T
Q  245 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggta 343  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10112 attttccttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 10211  T
Q  344 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10212 cattcaaatgaaacatgcataagcgagagtatgttgatgtc 10252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Original strand, 33297 - 33619
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33297 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 33396  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||| ||  ||| |||    
T  33397 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 33495  T
Q  243 acattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacaggg 341  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||    | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33496 acattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt----tttttgtaaaagcaaacctgagcaacaggg 33591  T
Q  342 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33592 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgag 33619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 22 - 376
Target Start/End: Original strand, 1634 - 1988
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattt 120  Q
    |||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||||| |||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1634 catcttcatcagaagtttctgtgcttatgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattt 1733  T
Q  121 tccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttc 220  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  1734 tccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactcta-ttttcttc 1831  T
Q  221 tactttcaaagctaaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttta 319  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  1832 tactttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttactttga 1931  T
Q  320 aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1932 aaagcaaacctgagcaacagggtacgatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 1988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Original strand, 12023 - 12396
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||   ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12023 catcttcatcagaagcttctgtacttgcgaactcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttt 12122  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaa-tttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttc 220  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| | |  |||    
T  12123 ccaagctttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctactatctttc 12221  T
Q  221 tactttcaaagct-----------aaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaacttttt 308  Q
    |||||||||||||           ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  12222 tactttcaaagctatgtaaaaaaaaaaaaaaaaacatttgctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttt 12321  T
Q  309 gtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  12322 gtcta-ttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtc 12396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 34 - 376
Target Start/End: Original strand, 13938 - 14281
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13938 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgt 14037  T
Q  133 gaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagc 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14038 gaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaa-ctctatttttcttctactttcaaagc 14136  T
Q  233 taaatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctg 331  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||    
T  14137 tgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtgtgttttgaaaagcaagcctg 14236  T
Q  332 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14237 agcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 14281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 34 - 384
Target Start/End: Original strand, 15558 - 15915
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15558 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 15657  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagct 233  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15658 aatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagct 15756  T
Q  234 aaatacaaaacattttctttctatttt-gataatgacaatgcttgaaacaaaca------ttttgaaaattgaaaactttttgtctatttt-taaaagca 325  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15757 atatacaaaacattttccttctattttaaacgatgacaatgctcgaaacaaacattttttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaaagca 15856  T
Q  326 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15857 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtc 15915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 376
Target Start/End: Original strand, 25092 - 25454
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  25092 catcttcatcagaagcttctgtgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccatttt 25191  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttct 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||  ||||    
T  25192 ccaagctttgtaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgcgcttttgtttg-aaactctactttctttct 25290  T
Q  222 actttcaaagctaaatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-------ctttttgtc 311  Q
    |||||||||||||  |||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||||||    
T  25291 actttcaaagctatgtacgaaaaaacattatctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaagttttttgtc 25390  T
Q  312 tatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 376  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  25391 t-gttttgaaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatg 25454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 45 - 370
Target Start/End: Original strand, 6066 - 6388
Alignment:
Q  45 cttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 143  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6066 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccagtaaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 6165  T
Q  144 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaat--acaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||| |||  || ||||||||||| ||  |  | ||    
T  6166 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcatattgagcctgtgcttttgtttg-aaactctactttctttttactttcaaagttatgttcaaaa 6264  T
Q  242 aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacag 339  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||       |||| |||||||||||||||||||||    
T  6265 aacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacag 6357  T
Q  340 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6358 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgag 6388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 51 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 25150 - 24835
Alignment:
Q  51 aattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaga-ttaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacg 149  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25150 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgggttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 25051  T
Q  150 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctaaatac-aaaacattt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  25050 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattt 24952  T
Q  249 tctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacat 346  Q
    || ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||      |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24951 tccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaattttt------ttttgaaaagaaaacctgagcaacagggtacat 24858  T
Q  347 tcaaatgaaacatgcatgagcgag 370  Q
    ||||| | ||||||||||||||||    
T  24857 tcaaacg-aacatgcatgagcgag 24835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 34 - 205
Target Start/End: Original strand, 366 - 537
Alignment:
Q  34 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccattttccaagctttgtg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  366 aagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtg 465  T
Q  134 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  466 aatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 26410 - 26243
Alignment:
Q  22 catcatcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataagattaccatttt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||||| || || | ||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  26410 catcttcatcagaagcttctgtgcttgctaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgctcaatgtaccaccaacaaataaaatttccatttt 26311  T
Q  122 ccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcct 189  Q
     |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26310 tcaagctttgtaaatctgtgaagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcct 26243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 259 - 384
Target Start/End: Original strand, 1 - 126
Alignment:
Q  259 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctatttttaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaac 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaac 99  T
Q  358 atgcatgagcgagagtatgatgatgtc 384  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||    
T  100 atgcatgagcaagtgtatgttgatgtc 126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 40898 - 40759
Alignment:
Q  51 aattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgtt-caat-gtaccaccaaccaataaga-ttaccatttt-ccaagcttt-gtgaatccgt-ggag 144  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||    
T  40898 aattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgtttcaattgtaccaccaaccaataaaaattaccatttttccaagcttttgtaaatccgttggag 40799  T
Q  145 tcacgccttcggct-gaccaccactcttatacatcaattt 183  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40798 tcacgccttcggcttgaccaccactcttatacatcaattt 40759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 324 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 40606 - 40559
Alignment:
Q  324 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaa-catgcatgagcgag 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  40606 caaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaataatgcatgagcgag 40559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University