View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17523_high_36 (Length: 247)

Name: NF17523_high_36
Description: NF17523
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17523_high_36
NF17523_high_36
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (20-232)||(10142427-10142639)
chr6 (30-232)||(5863302-5863504)
chr6 (21-231)||(12141353-12141563)
chr6 (21-232)||(27534651-27534862)
chr6 (20-232)||(3483832-3484044)
chr6 (25-232)||(32853811-32854018)
chr6 (22-232)||(10187991-10188194)
chr6 (21-232)||(2367293-2367504)
chr6 (21-232)||(27738739-27738950)
chr6 (21-232)||(24225665-24225882)
chr6 (21-168)||(30986284-30986431)
chr6 (21-232)||(32532507-32532718)
chr6 (21-232)||(12309539-12309756)
chr6 (63-232)||(32053055-32053218)
chr6 (21-232)||(14254925-14255135)
chr6 (21-208)||(15498315-15498502)
chr6 (20-195)||(28079605-28079780)
chr6 (60-188)||(9442441-9442568)
chr6 (21-169)||(31496464-31496612)
chr6 (21-169)||(31501850-31501998)
chr6 (81-232)||(12678064-12678215)
chr6 (20-222)||(29341233-29341435)
chr6 (71-232)||(11762412-11762573)
chr6 (60-196)||(256441-256577)
chr6 (20-230)||(24602777-24602975)
chr6 (60-215)||(30816244-30816397)
chr6 (21-232)||(14506053-14506252)
chr6 (21-195)||(20349068-20349242)
chr6 (62-196)||(13769075-13769209)
chr6 (113-196)||(14410857-14410940)
chr6 (52-196)||(18908896-18909040)
chr6 (73-193)||(20610944-20611064)
chr6 (62-195)||(9458667-9458800)
chr6 (87-197)||(9458860-9458970)
chr6 (111-228)||(7393887-7394004)
chr6 (21-191)||(32959868-32960026)
chr6 (21-184)||(34178245-34178402)
chr6 (111-197)||(29199885-29199971)
chr6 (65-216)||(1947746-1947896)
chr6 (93-196)||(19367012-19367115)
chr6 (21-180)||(14034521-14034668)
chr6 (93-196)||(17546884-17546987)
chr6 (99-196)||(5108919-5109016)
chr6 (113-193)||(8320797-8320877)
chr6 (26-224)||(34345926-34346118)
chr6 (115-216)||(9402572-9402672)
chr6 (176-232)||(14032523-14032579)
chr6 (93-186)||(30624428-30624521)
chr6 (52-117)||(30236326-30236391)
[»] chr8 (56 HSPs)
chr8 (21-232)||(20399559-20399770)
chr8 (20-232)||(32303027-32303240)
chr8 (21-232)||(27932380-27932592)
chr8 (21-232)||(24927916-24928127)
chr8 (33-232)||(29108744-29108943)
chr8 (21-232)||(40248281-40248492)
chr8 (21-232)||(17469222-17469421)
chr8 (21-215)||(1012603-1012796)
chr8 (21-232)||(24869934-24870145)
chr8 (30-176)||(4230649-4230795)
chr8 (21-232)||(1063474-1063691)
chr8 (71-232)||(45236032-45236193)
chr8 (25-165)||(5858566-5858706)
chr8 (60-208)||(39445525-39445673)
chr8 (21-232)||(43113536-43113747)
chr8 (21-232)||(34777033-34777238)
chr8 (20-208)||(37960871-37961059)
chr8 (21-232)||(24568905-24569115)
chr8 (21-184)||(35215551-35215713)
chr8 (21-231)||(34139415-34139630)
chr8 (21-186)||(17220725-17220892)
chr8 (21-232)||(11254925-11255129)
chr8 (60-197)||(27777147-27777284)
chr8 (62-202)||(14687396-14687536)
chr8 (20-192)||(15068497-15068668)
chr8 (25-196)||(17084027-17084192)
chr8 (62-216)||(8545301-8545454)
chr8 (19-232)||(14186287-14186488)
chr8 (52-216)||(28345474-28345638)
chr8 (65-176)||(6388470-6388581)
chr8 (61-196)||(14155535-14155670)
chr8 (60-223)||(30481370-30481533)
chr8 (21-150)||(2075744-2075873)
chr8 (73-218)||(27056517-27056662)
chr8 (111-222)||(9642351-9642462)
chr8 (73-196)||(10297461-10297584)
chr8 (52-158)||(15173821-15173927)
chr8 (111-227)||(36131917-36132033)
chr8 (21-188)||(29416097-29416263)
chr8 (21-179)||(32392296-32392454)
chr8 (21-169)||(29089811-29089953)
chr8 (92-232)||(34021444-34021583)
chr8 (142-193)||(2075864-2075915)
chr8 (21-218)||(9475922-9476120)
chr8 (111-195)||(5700360-5700444)
chr8 (122-216)||(30904029-30904123)
chr8 (115-193)||(33631903-33631981)
chr8 (60-208)||(29918598-29918746)
chr8 (109-197)||(40789591-40789679)
chr8 (93-196)||(2183588-2183691)
chr8 (61-216)||(12468171-12468323)
chr8 (93-201)||(36897054-36897161)
chr8 (73-144)||(35139617-35139688)
chr8 (111-208)||(39379581-39379676)
chr8 (184-232)||(2075907-2075955)
chr8 (183-231)||(4230791-4230839)
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (21-232)||(39655183-39655394)
chr3 (21-232)||(4015954-4016165)
chr3 (21-232)||(4557215-4557426)
chr3 (21-232)||(49580031-49580242)
chr3 (20-208)||(7469687-7469875)
chr3 (21-232)||(44953345-44953556)
chr3 (21-232)||(29284303-29284514)
chr3 (24-232)||(22535754-22535962)
chr3 (21-232)||(42758341-42758552)
chr3 (21-232)||(44639241-44639452)
chr3 (21-232)||(48390727-48390938)
chr3 (22-232)||(54317111-54317321)
chr3 (20-232)||(39728638-39728850)
chr3 (20-232)||(44252714-44252926)
chr3 (25-232)||(23580794-23581001)
chr3 (21-232)||(52572576-52572787)
chr3 (21-208)||(23546858-23547039)
chr3 (24-232)||(34025921-34026129)
chr3 (21-232)||(53631871-53632082)
chr3 (30-232)||(34119623-34119825)
chr3 (25-230)||(48305555-48305760)
chr3 (50-232)||(52198122-52198304)
chr3 (21-232)||(6738315-6738515)
chr3 (24-232)||(23153978-23154185)
chr3 (92-232)||(44172593-44172733)
chr3 (92-232)||(44179293-44179433)
chr3 (21-232)||(44106704-44106913)
chr3 (20-227)||(19111706-19111913)
chr3 (22-232)||(830976-831179)
chr3 (21-232)||(43582545-43582755)
chr3 (71-232)||(34154380-34154542)
chr3 (21-230)||(29842277-29842485)
chr3 (20-155)||(10371182-10371323)
chr3 (21-232)||(20086976-20087175)
chr3 (61-196)||(42243390-42243525)
chr3 (71-193)||(10043242-10043364)
chr3 (21-232)||(17146064-17146271)
chr3 (30-232)||(49025648-49025837)
chr3 (74-222)||(30616244-30616392)
chr3 (21-232)||(10823612-10823814)
chr3 (20-110)||(29858484-29858574)
chr3 (55-196)||(3385800-3385941)
chr3 (29-168)||(23910170-23910310)
chr3 (71-195)||(30904778-30904899)
chr3 (60-162)||(3414486-3414588)
chr3 (142-232)||(31126826-31126916)
chr3 (30-114)||(31126750-31126834)
chr3 (73-196)||(1772361-1772484)
chr3 (72-169)||(41936980-41937071)
chr3 (72-176)||(27252588-27252691)
chr3 (93-168)||(2490336-2490411)
chr3 (61-196)||(4553193-4553328)
chr3 (21-148)||(30682871-30682998)
chr3 (93-196)||(35687473-35687576)
chr3 (60-158)||(55438731-55438824)
chr3 (21-90)||(12369103-12369172)
chr3 (111-159)||(1337080-1337128)
chr3 (147-224)||(25302430-25302506)
chr3 (52-148)||(26207318-26207417)
chr3 (127-196)||(40796153-40796222)
chr3 (70-146)||(9220045-9220121)
chr3 (72-160)||(38347605-38347693)
chr3 (21-108)||(31271209-31271296)
chr3 (20-109)||(1337118-1337210)
[»] chr1 (65 HSPs)
chr1 (20-232)||(36187129-36187341)
chr1 (24-232)||(19572425-19572633)
chr1 (21-232)||(24236671-24236882)
chr1 (21-232)||(29936384-29936601)
chr1 (21-232)||(5181013-5181218)
chr1 (21-232)||(17134915-17135126)
chr1 (21-232)||(23490681-23490892)
chr1 (21-232)||(49250683-49250894)
chr1 (21-232)||(18353990-18354201)
chr1 (21-232)||(34673192-34673403)
chr1 (25-207)||(44615389-44615571)
chr1 (25-207)||(44792998-44793180)
chr1 (20-232)||(51421826-51422038)
chr1 (22-232)||(34611041-34611251)
chr1 (21-226)||(16408916-16409120)
chr1 (23-232)||(29871198-29871406)
chr1 (20-229)||(12494981-12495190)
chr1 (21-232)||(45866096-45866306)
chr1 (20-176)||(24710871-24711027)
chr1 (21-232)||(9982800-9983011)
chr1 (21-158)||(23968621-23968758)
chr1 (20-232)||(28297901-28298126)
chr1 (22-232)||(42439581-42439791)
chr1 (21-232)||(40087374-40087584)
chr1 (21-232)||(39616271-39616472)
chr1 (21-232)||(50426565-50426776)
chr1 (31-186)||(35936749-35936904)
chr1 (21-232)||(42707747-42707951)
chr1 (21-232)||(3627907-3628108)
chr1 (20-232)||(16433088-16433285)
chr1 (74-222)||(34085213-34085361)
chr1 (22-232)||(13390381-13390574)
chr1 (73-186)||(19003628-19003741)
chr1 (21-116)||(20774650-20774745)
chr1 (21-147)||(13020646-13020772)
chr1 (70-190)||(10778526-10778646)
chr1 (61-196)||(13798242-13798377)
chr1 (89-176)||(33293509-33293596)
chr1 (91-232)||(17091939-17092080)
chr1 (20-232)||(49740935-49741128)
chr1 (93-196)||(23058470-23058573)
chr1 (62-146)||(2514811-2514896)
chr1 (112-224)||(39219234-39219346)
chr1 (26-187)||(5293321-5293481)
chr1 (59-196)||(16903527-16903664)
chr1 (93-196)||(16237286-16237389)
chr1 (114-216)||(48125686-48125788)
chr1 (111-192)||(34060025-34060106)
chr1 (93-196)||(35069871-35069974)
chr1 (103-196)||(12718764-12718857)
chr1 (119-218)||(44632149-44632248)
chr1 (60-216)||(41476901-41477057)
chr1 (60-196)||(42728895-42729029)
chr1 (154-232)||(23966840-23966919)
chr1 (58-179)||(36617381-36617503)
chr1 (60-216)||(48576061-48576223)
chr1 (22-115)||(34059059-34059152)
chr1 (117-196)||(10450065-10450144)
chr1 (113-209)||(8880439-8880535)
chr1 (114-189)||(38686673-38686748)
chr1 (113-208)||(47644862-47644956)
chr1 (66-188)||(45460010-45460131)
chr1 (24-146)||(49098334-49098455)
chr1 (93-186)||(48312686-48312779)
chr1 (121-177)||(25154837-25154893)
[»] chr2 (57 HSPs)
chr2 (25-232)||(24414046-24414253)
chr2 (20-232)||(37106666-37106872)
chr2 (20-232)||(9632354-9632566)
chr2 (20-232)||(13830704-13830915)
chr2 (21-205)||(30846941-30847125)
chr2 (21-232)||(31942095-31942307)
chr2 (49-232)||(7314586-7314769)
chr2 (21-232)||(8915848-8916058)
chr2 (31-192)||(37472679-37472840)
chr2 (21-232)||(36128016-36128228)
chr2 (20-232)||(13705264-13705482)
chr2 (20-231)||(6027810-6028009)
chr2 (21-232)||(10208341-10208551)
chr2 (49-232)||(44746047-44746230)
chr2 (21-232)||(37999451-37999656)
chr2 (21-229)||(19104747-19104959)
chr2 (20-232)||(10920613-10920818)
chr2 (26-232)||(45115526-45115734)
chr2 (21-232)||(12193736-12193948)
chr2 (21-152)||(12341648-12341779)
chr2 (22-147)||(18106029-18106155)
chr2 (62-196)||(35248336-35248470)
chr2 (83-232)||(45256791-45256940)
chr2 (21-232)||(42797911-42798110)
chr2 (73-222)||(22900772-22900921)
chr2 (93-196)||(38342501-38342604)
chr2 (73-219)||(15546725-15546871)
chr2 (93-196)||(43371557-43371660)
chr2 (26-232)||(14540749-14540956)
chr2 (73-192)||(24051586-24051705)
chr2 (21-162)||(10212444-10212585)
chr2 (73-196)||(14331531-14331648)
chr2 (111-196)||(25210381-25210466)
chr2 (20-176)||(26755764-26755920)
chr2 (59-159)||(40734532-40734632)
chr2 (106-196)||(3547170-3547260)
chr2 (93-196)||(44057886-44057990)
chr2 (111-214)||(18485634-18485737)
chr2 (111-216)||(35965319-35965423)
chr2 (73-196)||(4427928-4428051)
chr2 (52-143)||(13954802-13954893)
chr2 (52-143)||(14096009-14096100)
chr2 (111-186)||(35409167-35409242)
chr2 (110-191)||(6164472-6164553)
chr2 (62-186)||(37309695-37309818)
chr2 (20-107)||(29656664-29656751)
chr2 (139-216)||(4961479-4961556)
chr2 (111-196)||(17845391-17845476)
chr2 (91-208)||(30696916-30697033)
chr2 (133-173)||(16226759-16226799)
chr2 (93-196)||(30978931-30979032)
chr2 (102-177)||(33175252-33175327)
chr2 (35-177)||(34214582-34214723)
chr2 (73-117)||(42102646-42102690)
chr2 (87-121)||(42576667-42576701)
chr2 (101-178)||(35510433-35510510)
chr2 (183-231)||(18106162-18106210)
[»] chr5 (69 HSPs)
chr5 (21-232)||(4920793-4921004)
chr5 (49-232)||(4583086-4583269)
chr5 (20-232)||(5908598-5908810)
chr5 (20-228)||(29245861-29246069)
chr5 (21-232)||(15890174-15890384)
chr5 (21-232)||(40517773-40517984)
chr5 (31-232)||(12834495-12834696)
chr5 (20-184)||(33727911-33728075)
chr5 (30-232)||(12866471-12866673)
chr5 (18-222)||(10127058-10127255)
chr5 (21-232)||(17853204-17853414)
chr5 (25-232)||(22694817-22695023)
chr5 (20-232)||(42987390-42987601)
chr5 (24-195)||(20973410-20973581)
chr5 (21-232)||(30996563-30996773)
chr5 (26-232)||(6092445-6092640)
chr5 (21-232)||(13401915-13402125)
chr5 (21-230)||(6369665-6369873)
chr5 (21-232)||(18206985-18207196)
chr5 (20-195)||(28568931-28569106)
chr5 (21-232)||(6155831-6156040)
chr5 (62-196)||(38972925-38973059)
chr5 (65-232)||(2412681-2412848)
chr5 (21-232)||(35311789-35311991)
chr5 (33-224)||(40187580-40187770)
chr5 (71-232)||(28045623-28045783)
chr5 (62-196)||(2681219-2681353)
chr5 (52-196)||(23044933-23045077)
chr5 (20-196)||(29664974-29665148)
chr5 (21-232)||(35193912-35194111)
chr5 (111-232)||(38006470-38006591)
chr5 (21-189)||(16311204-16311372)
chr5 (20-151)||(39422394-39422525)
chr5 (21-232)||(12447348-12447546)
chr5 (25-142)||(3564655-3564770)
chr5 (21-196)||(12915476-12915650)
chr5 (111-232)||(2985114-2985235)
chr5 (112-232)||(8453376-8453496)
chr5 (31-123)||(42717551-42717643)
chr5 (97-195)||(27900388-27900486)
chr5 (115-192)||(10822531-10822608)
chr5 (142-230)||(1218724-1218812)
chr5 (21-152)||(27088284-27088413)
chr5 (25-147)||(24207736-24207857)
chr5 (52-196)||(32574879-32575024)
chr5 (25-120)||(1218804-1218899)
chr5 (24-196)||(6810161-6810321)
chr5 (114-196)||(12712561-12712643)
chr5 (73-146)||(43523801-43523874)
chr5 (114-196)||(12773825-12773907)
chr5 (73-146)||(18116480-18116553)
chr5 (21-97)||(18451834-18451910)
chr5 (121-232)||(27302746-27302857)
chr5 (157-232)||(30115450-30115525)
chr5 (114-232)||(15564603-15564721)
chr5 (87-196)||(12250973-12251082)
chr5 (172-232)||(27088414-27088474)
chr5 (60-142)||(33420297-33420379)
chr5 (63-108)||(12457596-12457641)
chr5 (102-195)||(20634186-20634279)
chr5 (102-195)||(20650300-20650393)
chr5 (111-159)||(12457557-12457605)
chr5 (123-163)||(30116816-30116856)
chr5 (81-196)||(35167247-35167362)
chr5 (114-216)||(17153152-17153254)
chr5 (120-173)||(8020641-8020694)
chr5 (111-196)||(34259258-34259343)
chr5 (108-189)||(35584126-35584207)
chr5 (20-97)||(38006391-38006468)
[»] chr7 (85 HSPs)
chr7 (22-232)||(10072438-10072648)
chr7 (21-232)||(16866141-16866352)
chr7 (25-232)||(12980348-12980556)
chr7 (20-232)||(30650603-30650815)
chr7 (22-232)||(7779980-7780190)
chr7 (21-232)||(35074441-35074653)
chr7 (21-232)||(45885675-45885886)
chr7 (20-232)||(17885437-17885649)
chr7 (21-232)||(21702631-21702842)
chr7 (21-232)||(18825776-18825993)
chr7 (21-232)||(25905600-25905811)
chr7 (21-232)||(17851826-17852035)
chr7 (49-232)||(38152859-38153041)
chr7 (21-232)||(27850242-27850447)
chr7 (21-232)||(3226856-3227067)
chr7 (24-232)||(18125141-18125349)
chr7 (21-232)||(37182247-37182457)
chr7 (49-232)||(39455953-39456134)
chr7 (33-228)||(37579238-37579432)
chr7 (72-232)||(5377057-5377217)
chr7 (61-232)||(43507417-43507588)
chr7 (30-232)||(16078985-16079187)
chr7 (49-229)||(45380081-45380261)
chr7 (20-232)||(39316967-39317179)
chr7 (21-232)||(44734269-44734478)
chr7 (21-232)||(24753147-24753346)
chr7 (21-232)||(38139702-38139914)
chr7 (30-232)||(41103628-41103824)
chr7 (21-232)||(2630484-2630695)
chr7 (21-224)||(41741360-41741562)
chr7 (111-232)||(3920510-3920631)
chr7 (20-232)||(26004395-26004593)
chr7 (21-206)||(3157081-3157265)
chr7 (111-232)||(26622923-26623044)
chr7 (23-232)||(37195921-37196119)
chr7 (21-162)||(37218047-37218188)
chr7 (21-232)||(24425352-24425551)
chr7 (73-222)||(8906551-8906700)
chr7 (30-147)||(44658386-44658503)
chr7 (71-222)||(27896435-27896586)
chr7 (62-176)||(42907992-42908106)
chr7 (134-232)||(44794051-44794148)
chr7 (87-196)||(22973396-22973505)
chr7 (31-196)||(23475195-23475348)
chr7 (117-229)||(25979923-25980035)
chr7 (21-232)||(16811702-16811899)
chr7 (60-232)||(25782863-25783028)
chr7 (73-218)||(5565269-5565414)
chr7 (87-196)||(18683982-18684091)
chr7 (21-138)||(44785168-44785285)
chr7 (21-196)||(45708781-45708950)
chr7 (73-196)||(27063146-27063269)
chr7 (73-192)||(27063346-27063465)
chr7 (93-196)||(31426016-31426119)
chr7 (106-225)||(46127179-46127297)
chr7 (87-196)||(32546200-32546312)
chr7 (52-196)||(30839074-30839219)
chr7 (73-208)||(33841074-33841208)
chr7 (107-193)||(10995830-10995916)
chr7 (21-180)||(23329012-23329175)
chr7 (73-196)||(29157357-29157482)
chr7 (21-146)||(44985828-44985952)
chr7 (52-192)||(4101554-4101694)
chr7 (89-196)||(44845113-44845220)
chr7 (21-208)||(23533526-23533700)
chr7 (87-196)||(43218291-43218400)
chr7 (71-179)||(10990821-10990929)
chr7 (60-208)||(29855404-29855550)
chr7 (21-196)||(19439932-19440095)
chr7 (70-226)||(5916035-5916185)
chr7 (52-196)||(37103068-37103212)
chr7 (113-196)||(28309500-28309583)
chr7 (21-107)||(23457156-23457242)
chr7 (105-216)||(29292690-29292803)
chr7 (112-196)||(21750790-21750874)
chr7 (88-168)||(29014929-29015009)
chr7 (114-222)||(42005887-42005994)
chr7 (59-178)||(11472663-11472781)
chr7 (158-232)||(44658496-44658570)
chr7 (21-106)||(43550339-43550424)
chr7 (93-162)||(2472025-2472094)
chr7 (60-195)||(3774078-3774214)
chr7 (93-146)||(3909255-3909308)
chr7 (20-97)||(26623046-26623123)
chr7 (117-214)||(48327435-48327532)
[»] chr4 (90 HSPs)
chr4 (20-232)||(47550263-47550475)
chr4 (21-232)||(6382183-6382395)
chr4 (21-232)||(11028045-11028257)
chr4 (25-232)||(7608943-7609150)
chr4 (19-232)||(5902529-5902736)
chr4 (21-232)||(26564804-26565015)
chr4 (20-232)||(31752429-31752641)
chr4 (20-232)||(43893201-43893412)
chr4 (21-232)||(44317507-44317719)
chr4 (21-232)||(11122780-11122991)
chr4 (20-232)||(21423834-21424046)
chr4 (21-232)||(31918469-31918681)
chr4 (20-222)||(15987172-15987374)
chr4 (25-215)||(6481950-6482140)
chr4 (21-232)||(37349096-37349296)
chr4 (21-232)||(55826534-55826746)
chr4 (21-208)||(19882967-19883154)
chr4 (49-232)||(39046925-39047108)
chr4 (21-232)||(48459454-48459665)
chr4 (110-232)||(32596184-32596306)
chr4 (107-232)||(1724307-1724432)
chr4 (21-231)||(7985037-7985242)
chr4 (62-232)||(37107384-37107553)
chr4 (20-232)||(42299764-42299973)
chr4 (73-218)||(10302071-10302216)
chr4 (24-232)||(32585462-32585664)
chr4 (46-215)||(39375268-39375437)
chr4 (93-232)||(47239368-47239507)
chr4 (114-232)||(12825465-12825583)
chr4 (61-201)||(25941142-25941282)
chr4 (21-172)||(7334108-7334258)
chr4 (24-197)||(21956728-21956901)
chr4 (21-149)||(1724181-1724308)
chr4 (62-232)||(19534428-19534592)
chr4 (74-222)||(43309468-43309614)
chr4 (21-197)||(36919131-36919307)
chr4 (93-197)||(14605908-14606012)
chr4 (62-174)||(39086188-39086300)
chr4 (20-176)||(41914906-41915062)
chr4 (19-158)||(19548847-19548985)
chr4 (21-196)||(45065258-45065433)
chr4 (87-196)||(47103747-47103856)
chr4 (21-197)||(1866460-1866636)
chr4 (112-196)||(29527821-29527905)
chr4 (21-216)||(12075543-12075737)
chr4 (49-146)||(12505479-12505577)
chr4 (83-197)||(35304489-35304603)
chr4 (25-190)||(4741132-4741296)
chr4 (20-173)||(30672993-30673146)
chr4 (111-196)||(31782622-31782707)
chr4 (22-176)||(33615241-33615395)
chr4 (111-232)||(39188487-39188608)
chr4 (73-192)||(3737789-3737908)
chr4 (73-196)||(31415894-31416017)
chr4 (111-196)||(21544588-21544673)
chr4 (103-216)||(42907875-42907988)
chr4 (60-196)||(8843755-8843890)
chr4 (60-196)||(8856719-8856854)
chr4 (52-180)||(15733468-15733596)
chr4 (21-109)||(53906249-53906337)
chr4 (111-218)||(9230269-9230376)
chr4 (71-184)||(11696839-11696952)
chr4 (111-196)||(25298834-25298919)
chr4 (151-232)||(53906346-53906427)
chr4 (21-194)||(50375832-50375999)
chr4 (111-196)||(10574420-10574505)
chr4 (111-196)||(30266331-30266416)
chr4 (111-196)||(30285772-30285857)
chr4 (103-195)||(9929160-9929252)
chr4 (61-173)||(25265116-25265227)
chr4 (73-196)||(18423599-18423722)
chr4 (115-174)||(36306816-36306875)
chr4 (93-196)||(50684476-50684579)
chr4 (71-153)||(43553498-43553580)
chr4 (28-181)||(17112940-17113092)
chr4 (20-109)||(39188598-39188687)
chr4 (111-158)||(11173020-11173067)
chr4 (114-224)||(16575093-16575203)
chr4 (24-113)||(425855-425943)
chr4 (71-152)||(4737863-4737944)
chr4 (23-88)||(13768365-13768430)
chr4 (63-146)||(4766283-4766370)
chr4 (111-146)||(24637240-24637275)
chr4 (162-232)||(28695194-28695264)
chr4 (20-97)||(12825385-12825460)
chr4 (73-154)||(29035495-29035576)
chr4 (73-154)||(29047628-29047709)
chr4 (135-196)||(33516097-33516158)
chr4 (120-217)||(33916145-33916242)
chr4 (102-146)||(37246904-37246948)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (20-229)||(33363-33578)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (34-232)||(90564-90756)
[»] scaffold0519 (1 HSPs)
scaffold0519 (21-232)||(10264-10468)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (25-158)||(14098-14230)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (62-232)||(14742-14912)
[»] scaffold0795 (1 HSPs)
scaffold0795 (21-156)||(267-401)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (20-158)||(7738-7875)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (52-196)||(67752-67896)
scaffold0008 (52-196)||(75595-75739)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (93-197)||(211366-211470)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (93-196)||(2972-3075)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (49-146)||(14900-14998)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (93-196)||(128103-128206)
scaffold0013 (93-196)||(105451-105554)
[»] scaffold0189 (1 HSPs)
scaffold0189 (118-232)||(4224-4339)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (101-196)||(70098-70193)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (111-218)||(36135-36242)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (81-224)||(107361-107504)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (113-232)||(197329-197448)
scaffold0007 (21-85)||(197259-197323)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (70-191)||(4541-4661)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (126-196)||(16970-17040)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (106-196)||(55893-55982)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (103-232)||(33554-33690)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (93-186)||(449715-449808)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (114-196)||(20742-20824)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (127-196)||(17471-17540)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Original strand, 10142427 - 10142639
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  10142427 gtaggcatggcaacaaaacccatacttgtggttatccgctcgaaccaaactcaatttggcgggttttcctcgttttgactgggtttgggtatgggtatgg 10142526  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  10142527 gttttccccgatctcaaaaaacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacccaaacctgtcccaaatgtaaaaaattat 10142626  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||    
T  10142627 tttatgttgatat 10142639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 232
Target Start/End: Original strand, 5863302 - 5863504
Alignment:
Q  30 caacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccg 129  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5863302 caacaaaacccatacccgtggttacctgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccg 5863401  T
Q  130 atttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttga 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  5863402 atttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatagatacccacctcgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaatattttatgttga 5863501  T
Q  230 tat 232  Q
    |||    
T  5863502 tat 5863504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12141563 - 12141353
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  12141563 taggcatggcaacaaaacccatacctatggttacccgcccgaaccaaattcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtacgggtatggg 12141464  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||    
T  12141463 ttttccccaatctcaaaacacggatatgggacgggtgacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattatt 12141364  T
Q  221 ttatgttgata 231  Q
    |||||||||||    
T  12141363 ttatgttgata 12141353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27534862 - 27534651
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  27534862 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttaaccgtccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtatgag 27534763  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||| | |||| || |    
T  27534762 ttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaatccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactact 27534663  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  27534662 ttatgttgatat 27534651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Original strand, 3483832 - 3484044
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  3483832 gtaggcatggcaacaaaacccatactcatggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgtgtatgg 3483931  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||     
T  3483932 gttttccccgatctcgaaacacgggtatgggatgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactac 3484031  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    ||||||| |||||    
T  3484032 tttatgtggatat 3484044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32854018 - 32853811
Alignment:
Q  25 catgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggtttt 124  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  32854018 catggcaacaaaacccatacccgtggttatccgaccgaaccaaacccaatttgacgggttttctccgttttgactgggtttggttatgggtatgggtttt 32853919  T
Q  125 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttat 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||    
T  32853918 ccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttat 32853819  T
Q  225 gttgatat 232  Q
    ||||||||    
T  32853818 gttgatat 32853811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 232
Target Start/End: Original strand, 10187991 - 10188194
Alignment:
Q  22 aggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggt 121  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  10187991 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 10188090  T
Q  122 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattt 221  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||    
T  10188091 tttccccgatctcaaaacacgggtatggg-------acgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccatcccaaatgtaaaaaattattt 10188183  T
Q  222 tatgttgatat 232  Q
    |||||||||||    
T  10188184 tatgttgatat 10188194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2367504 - 2367293
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  2367504 taggcatggcaacaaaacccatatccgtggttacccgtccgaaccaaacccaatttgatgggtttttcccgttttgactaggtttgggtatgggtatggg 2367405  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| |    
T  2367404 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataagtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatggaaaaaattact 2367305  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    |||||| |||||    
T  2367304 ttatgtggatat 2367293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27738950 - 27738739
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||| | ||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  27738950 tagggatgtcaacaaaccccatactcgcggttacctgcccgaaccaaattcaatttgatgggtttttcccgttttgactgggtttaggtatgggtatggg 27738851  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| |    
T  27738850 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacagatatatatgtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 27738751  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  27738750 ttatgttgatat 27738739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24225882 - 24225665
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||   ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24225882 taggcatgacaacaaaactcatacccatggttacccgtccgaaccaaattcaatttgacaggttttccccgttttgattgggtttgggtttgggtatggg 24225783  T
Q  121 t------tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaa 214  Q
    |      |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||| | |||    
T  24225782 tatggattttccccgatctcaaaacacggatatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatgcccaaacccgtcccaaatgtaaaaa 24225683  T
Q  215 attattttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24225682 attattttatgttgatat 24225665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 30986431 - 30986284
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  30986431 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgagtttgggtatgggtatggg 30986332  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatata 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30986331 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatata 30986284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32532718 - 32532507
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||  || ||||| |||| | || ||||  ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| || ||||    
T  32532718 taggcatgacaacaaaatccatatctgcggttatccgcccaaatcaaatccaatttgacgggttttttccgttttcattgggtttgagtatgagtatggg 32532619  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  |||||||||| | ||||||| |    
T  32532618 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaatgggtatataggtacccaccccgaacccatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaattact 32532519  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  32532518 ttatgttgatat 32532507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12309756 - 12309539
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttga------ttgggtttgggtatggg 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||      |||||||||||||||||    
T  12309756 taggcatgacaacaaaccccatacccgcggttacccgcccgaaccagacccaatttgacgagttttccccattttgactgggtttgggtttgggtatggg 12309657  T
Q  115 tttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaa 214  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||| | |||    
T  12309656 tatgggtattccctgatttcaaaacacgggtatggaacgggtaacaggtatatatgtacccaccccgaaccgatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaa 12309557  T
Q  215 attattttatgttgatat 232  Q
    |||| |||||||||||||    
T  12309556 attactttatgttgatat 12309539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32053218 - 32053055
Alignment:
Q  63 accaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacggg 162  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  32053218 accaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggttt------tccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaacggg 32053125  T
Q  163 tatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| || |||||||||||||    
T  32053124 tatatatgtacccaccccaaacccatacccaaacccgtccaaaatgtaaaaaaatactttatgttgatat 32053055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14255135 - 14254925
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  14255135 taggcatgctaacaaaatccatactcgtggttacccactcgaatcaaacccattttgacagattttcctcgttttgactgggtttgggtatgggtttgag 14255036  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||| | |||||||||||| | ||| | |    
T  14255035 ttttctctgatttc-aaacacgggtatgggacgtgtaacggaaatataggtacccaccatgaacccatacccaaattcgtcccaaatgcaaataataact 14254937  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  14254936 ttatgttgatat 14254925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15498502 - 15498315
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||  |||||||| |||||||   ||||| |||| |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  15498502 taggcattgcaacaaaatccatactcacggttatccgcccgaatcaaacccaatttaacgggttttctccgttttgaatgggtttgggtatggatatggg 15498403  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||  ||||||||||    
T  15498402 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacaggtaatgggtatataggtacccatcccgaacccacacccaaacccgtcccaaatg 15498315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 195
Target Start/End: Original strand, 28079605 - 28079780
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | || ||||| | |  ||||||| || |||||||||| || |||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  28079605 gtaggcatgacaacaaaacccatacccgcgggtacccacccataccaaacccattttgacgggtatttcccgctttggctgagtttgggtatgggtttgg 28079704  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaa 195  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28079705 gttttccccgatttcaaaacatgggtacgggacgggtaacggggatataggtacccaccccgaacccatacccaaa 28079780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 9442568 - 9442441
Alignment:
Q  60 cgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaac 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9442568 cgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgg-tttgggtatgggtatgggattttcccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaac 9442470  T
Q  160 gggtatataggtacccaccccaaacccat 188  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||    
T  9442469 gggtatagaggtacccactccgaacccat 9442441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 31496612 - 31496464
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  31496612 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgtccaaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgag 31496513  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatag 169  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31496512 ttttccccgatctcgaaacatgggtatgggacgggggacgggtatatag 31496464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 31501998 - 31501850
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  31501998 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgtccaaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgag 31501899  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatag 169  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31501898 ttttccccgatctcgaaacatgggtatgggacgggggacgggtatatag 31501850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 81 - 232
Target Start/End: Original strand, 12678064 - 12678215
Alignment:
Q  81 ggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccacccc 180  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  12678064 ggttttcgccgttttgactgggtttgggtatgagtttgcgttttccccgatttcaagacacaggtatgggacgggtaaagggtatataggtacccaccct 12678163  T
Q  181 aaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
     |||||||||||||||  ||||| |||  ||||||||||||||| |||||||    
T  12678164 gaacccatacccaaacccgtcccgaattgagaaaattattttatattgatat 12678215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29341435 - 29341233
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   | || ||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  29341435 gtaggcatggcaacaaaacccatatccgcgggtactcgctcgaatcaaactcaatttgatgagttttctccgttttgattgggtttggatatgagtttgg 29341336  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
    ||||| ||||||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||    
T  29341335 gtttttcccgattttcaaacatgggcatgagacgggtaacggagatataggtacccatcccaaactcatacccaaacccgtcccgaatgtagaaaatcat 29341236  T
Q  220 ttt 222  Q
    |||    
T  29341235 ttt 29341233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 71 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11762573 - 11762412
Alignment:
Q  71 caatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatagg 170  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11762573 caatttgacgggttttccccatttttactgggtttggatatggatttaggtttttcccgatttctaaacaagggtatgggacgggtaacgggtatatagg 11762474  T
Q  171 tacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    |  ||||||| ||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  11762473 tgtccaccccgaactcatacccaaacccatcccaaatgtagaaaattactttatgttgatat 11762412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 196
Target Start/End: Original strand, 256441 - 256577
Alignment:
Q  60 cgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaac 159  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||     
T  256441 cgaaccaaactcaatttaatggattttccccgctttggttgtgtttgggtatgagtttgagttttccccgatttcaaaacatgggtacgagacgggtaat 256540  T
Q  160 gggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  256541 gggcatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 256577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 230
Target Start/End: Original strand, 24602777 - 24602975
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||            |||||    
T  24602777 gtaggcatgacaacaaaatccatacacgtggttacccacccgaacgaaactcaatttgacggtttttccctgttttgactggg------------tttgg 24602864  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || | |||| |||||||||     
T  24602865 gttttcccagatttcaaaacatgggtatgtgacgggtaacaggtatatagatacccaccccgaacccatacccaaacccatcacgaatgtagaaaattac 24602964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 30816397 - 30816244
Alignment:
Q  60 cgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaac 159  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||     
T  30816397 cgaaccaaacccaatttgatggattttccccgttttgattgggtttggatatgggtttgagttttccccatttt--aaacacgggtatgggatgggtaat 30816300  T
Q  160 gggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaa 215  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||  ||||| |||||| ||||    
T  30816299 gggtatataggaacccaccccgaacccatatccaaacccgtcccgaatgcaaaaaa 30816244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14506252 - 14506053
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||   ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||               
T  14506252 taggcatgacaataaaactcatacccgtggttaaccatccgaacgaaactcaatttgacgggttttccccattttgactgggtttgggt----------- 14506164  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||||| || |    
T  14506163 -tttccccgatttcaaaacacaggtatgggacgggtaacaagtatttaggtacccaccccgaacccatacttaaacccgtcccaaatgcagaaaactact 14506065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20349242 - 20349068
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| || |||||||||| |||||||||     ||  ||| ||| |||| |||| |||||| ||||||     
T  20349242 taggcatgacaataaaactcatacctgtggctacctgcccgaaccaaacccaatttgactataattttccgcttttattgagttttggtatgagtttgga 20349143  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20349142 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgagtaacggggatataggtacccaccccgaactcatacccaaa 20349068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 13769209 - 13769075
Alignment:
Q  62 aaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgg 161  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| | || ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13769209 aaccaaacccaatttcacgggttttactcgctttgactgggtttaggtatgggtttcggttttccccgacttcaaaacatgggtatgggacgggtaacgg 13769110  T
Q  162 gtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
      ||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  13769109 acatataggtacccacccagaacccatatccaaac 13769075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 113 - 196
Target Start/End: Original strand, 14410857 - 14410940
Alignment:
Q  113 ggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14410857 ggtttgagttttcccagatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaac 14410940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 18909040 - 18908896
Alignment:
Q  52 tacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatggga 151  Q
    ||||||| | |||||| ||| ||||||||| |||| |||| | ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18909040 tacccgcccaaaccaacctcgatttgacggatttttcccgatgtgactgagtttgagtatgagtttgggttttccccgatttcaaaatacggatatggga 18908941  T
Q  152 cgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    ||||||||  | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18908940 cgggtaacaaggatatatgtacccaccccaaactcatacccaaac 18908896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 193
Target Start/End: Original strand, 20610944 - 20611064
Alignment:
Q  73 atttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 172  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  20610944 atttgacgggtttttcccgatttaactgggtttaggtatgggtttggggtttccccgatttcaaaatacgggtaggggacgggtaacgggaatatatgta 20611043  T
Q  173 cccaccccaaacccataccca 193  Q
     ||||||| || | |||||||    
T  20611044 tccaccccgaaactataccca 20611064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 9458800 - 9458667
Alignment:
Q  62 aaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgg 161  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| | ||||||    
T  9458800 aaccaacctcgatttgacggattttccccgatttgactgggtttgggtatgagtttgagatttccccaatttcaaaatacgggtacgggacagataacgg 9458701  T
Q  162 gtatataggtacccaccccaaacccatacccaaa 195  Q
    | ||||| ||||||||| | ||| ||||||||||    
T  9458700 ggatatatgtacccacctcgaactcatacccaaa 9458667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9458970 - 9458860
Alignment:
Q  87 ccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaaccc 186  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||      
T  9458970 ccccgatttgactgggtttgggtatgggtctgggttttccccgatttaataatacgggtacgggatgggtaacgggaatatatgtacccaccccgaactt 9458871  T
Q  187 atacccaaact 197  Q
    |||||||||||    
T  9458870 atacccaaact 9458860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 228
Target Start/End: Original strand, 7393887 - 7394004
Alignment:
Q  111 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgca 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  |||  ||||||    
T  7393887 tgggtttggattttccccgatttcaaaacacgagtaagagacggataatgggtatataggtatccaccccgaacccatactcaaactcatcctgaatgca 7393986  T
Q  211 gaaaattattttatgttg 228  Q
     ||| |||||||||||||    
T  7393987 taaatttattttatgttg 7394004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 32960026 - 32959868
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| || || ||||| | |||| |||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||               
T  32960026 taggcatgacaacataactcatacatgcgggtacccacccgaatcaaacctaatttgacggattttcctcgttttgattgggtttgggt----------- 32959938  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacc 191  Q
     ||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  32959937 -tttccctaatttcaaaacacgggtacggaacgggtaacggggatataggtatccaccccgaacccatacc 32959868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 184
Target Start/End: Original strand, 34178245 - 34178402
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||  | || |||||||  |||||| || |||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||       
T  34178245 taggcatggcaataaaactcatacccgcgggtacccgcctgaaccatacccaatttgatgggtgttccccgttttgacagggtttgggtatgggtttc-- 34178342  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaac 184  Q
        ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  34178343 ----ccctgatttcaaaacacgggtacgagacgggtaacaaggatataggtacccaccccaaac 34178402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 111 - 197
Target Start/End: Original strand, 29199885 - 29199971
Alignment:
Q  111 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaact 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  29199885 tgggtttggattttccccgatttcaaaatacgggtacgggacgggtaacagggatatatgtatctaccccgaacccatacccaaact 29199971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 216
Target Start/End: Original strand, 1947746 - 1947896
Alignment:
Q  65 caaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggta 164  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||| ||| | || ||||| ||||| |||  |||||| ||| |    
T  1947746 caaactcaatttgacggattttcttcgttttgactgggttcgggaatgagtttgggttttcaccgctatcgaaacaggggtacggggtgggtaatggg-a 1947844  T
Q  165 tataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaat 216  Q
    |||| |||| || | ||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||    
T  1947845 tatatgtactcatctcaaacccatactcaaactcgttccaaatgtagaaaat 1947896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19367115 - 19367012
Alignment:
Q  93 tttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccataccc 192  Q
    ||||| || |||||| ||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||  | |||||| | |||||| |||||||||||||    
T  19367115 tttgactgagtttggatatgggtatggattttccccaattttaaaacacgggtatgagacgggtaacatgaatatagttgcccacctcaaacccataccc 19367016  T
Q  193 aaac 196  Q
    ||||    
T  19367015 aaac 19367012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14034668 - 14034521
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||   |||||||||| | ||||| |||| || ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||               
T  14034668 taggcatggcaacaaaacccataaccgtggttacccacccgaactaaacccattttgatgggttttacccgttttgactgggtttgagt----------- 14034580  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccacccc 180  Q
     |||||||||||| || ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14034579 -tttccccgattttaagacacaagtatgagacgggtaacgggtatataggtacccacccc 14034521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Original strand, 17546884 - 17546987
Alignment:
Q  93 tttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccataccc 192  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||| || ||||  ||||||||| ||| | ||||||||||| ||| |||| ||    
T  17546884 tttgactgggtttgggtatgggtttggggtttcctcgatttcataatacggatacgggatcggtaacggggatacatgtacccaccccgaactcatatcc 17546983  T
Q  193 aaac 196  Q
    ||||    
T  17546984 aaac 17546987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 196
Target Start/End: Original strand, 5108919 - 5109016
Alignment:
Q  99 tgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |  | || || ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5108919 tgggtttcggtatgggtttgagtttttcccgatttcaaaacatgtgtatgggatgaatgacagggatataagtacccaccccgaactcatacccaaac 5109016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 193
Target Start/End: Original strand, 8320797 - 8320877
Alignment:
Q  113 ggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccataccca 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||| || |||||| || | ||||| ||||||||||||    
T  8320797 ggtttgggttttccccaatttcaaaacacgggtacggaacaggtaacagggatatagatatcgaccccgaacccataccca 8320877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 224
Target Start/End: Original strand, 34345926 - 34346118
Alignment:
Q  26 atgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttc 125  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||  |||||||| ||||||||||  |||||||   | ||||||| | |||| |||      ||||||||     
T  34345926 atgacaacaaaactcatactcgtgggtacccgtccgaaccaagctcaatttgattggttttctttgctttgattagatttgagta------tgggttttt 34346019  T
Q  126 cccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttat 224  Q
    |||||||| |||| ||||||  ||  || |||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||   || || |||| ||||||||| |||||    
T  34346020 cccgattttaaaatacgggttcggagcgagtaacggggatataggtacccaccccgaatctatacccaaatccgttccgaatgtagaaaattaatttat 34346118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9402672 - 9402572
Alignment:
Q  115 tttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaa 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||  ||| ||| ||||||||| ||||| |||| | |||| |||||    
T  9402672 tttgggttttccccgatttcaaaacatgggtacaggacgggtaacatggatataggtgtcca-cccgaacccatactcaaacctgtctcgaatgtagaaa 9402574  T
Q  215 at 216  Q
    ||    
T  9402573 at 9402572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 176 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14032579 - 14032523
Alignment:
Q  176 accccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  14032579 accccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgcataaaattactttatgttgatat 14032523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 30624521 - 30624428
Alignment:
Q  93 tttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaaccc 186  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  | |||  |||| ||||||| ||| | | | ||||||||||| |||||    
T  30624521 tttgactgggtttgggtttgggtttgggttttccccgattttaaaggatgggggtggggcgggtaatggggaaacatgtacccaccccgaaccc 30624428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 117
Target Start/End: Original strand, 30236326 - 30236391
Alignment:
Q  52 tacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggttt 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| |||   ||||||||||| ||||    
T  30236326 tacccgctcgaaccaaattcaatttaacggattttcctcgtttggatcttgtttgggtatgagttt 30236391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 56)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20399770 - 20399559
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20399770 taggcatggcaacaaaaccaatacccgtggttacccgctcgaaccaaacccaatttgacgagttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtttggg 20399671  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||  ||||| |||||| |||||||||    
T  20399670 ttttctccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatagatacccaccccgaacccattcccaaacccgtcccgaatgcaaaaaattatt 20399571  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  20399570 ttatgttgatat 20399559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32303240 - 32303027
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  32303240 gtaggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaacaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgg 32303141  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatg-cagaaaatta 218  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  | |||| ||    
T  32303140 gttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaacta 32303041  T
Q  219 ttttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||||    
T  32303040 ttttatgttgatat 32303027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27932592 - 27932380
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtgg-ttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  27932592 taggcatgacaacaaaactcatacccgcgggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgg 27932493  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |   |||||||||| | ||||||||    
T  27932492 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgagtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatactcatatccgtcccaaatgtaaaaaattat 27932393  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||    
T  27932392 tttatgttgatat 27932380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24928127 - 24927916
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  24928127 taggcatggcaacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 24928028  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||| || |    
T  24928027 ttttccctgatctcgaaacacgggtatgagacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactact 24927928  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    |||||| |||||    
T  24927927 ttatgtggatat 24927916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 33 - 232
Target Start/End: Original strand, 29108744 - 29108943
Alignment:
Q  33 caaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatt 132  Q
    |||||||||||  || |||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  29108744 caaaacccataactgcggttactcgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggtttttcccgatt 29108843  T
Q  133 tcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  29108844 ttaaaacatgggtatgggacgggtaacgggtatatatgtacccaccccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatat 29108943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 40248281 - 40248492
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||  | |||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  |    
T  40248281 taggtatgacaacaaaacccatacccgcggttactcgcctgaaccaaacccaatttgacgggtttttcccgttttgactgggtttgggtatgggtatatg 40248380  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |   |||||||||| | ||||||| |    
T  40248381 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacggataacgggtatataggtacccatcccgaacccatacccatatccgtcccaaatgtaaaaaattact 40248480  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  40248481 ttatgttgatat 40248492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17469421 - 17469222
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||  || ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||               
T  17469421 taggcatggcaacaaaacccatacccgtagttacccacccgaaccaaacccaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggt----------- 17469333  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| || |    
T  17469332 -tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacccgtcccaactgcagaaaactact 17469234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1012796 - 1012603
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||  |||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  1012796 taggcatggcaataaaatccatacccgtggttacccacccgaatcaaacccaatttgacgggttttcctcgttttgattgagtttgggtatgagtttggg 1012697  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaa 215  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  1012696 ttttccccgattt-aaaacatgagtatgggacgggtaatgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaactcgtcccgaatgcaaaaaa 1012603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 24869934 - 24870145
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||| | || |    
T  24869934 taggcatgacaacaaaacccacacccacggttatccgctcgaatcaaatccaatttgacgggtttttcccgttttgactgaatttgggtatggctatgag 24870033  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||  |||||||||| | ||||||| |    
T  24870034 ttttccccgattttaaaacacgggtatgtgacgggtaacgggtatataggtacccaccccgagcccatacctaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 24870133  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  24870134 ttatgttgatat 24870145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 176
Target Start/End: Original strand, 4230649 - 4230795
Alignment:
Q  30 caacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccg 129  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4230649 caacaaaatccatacatgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccg 4230748  T
Q  130 atttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtaccca 176  Q
    || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4230749 atctcaaaacacaggtatgggacgagtaacgggtatataggtaccca 4230795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1063691 - 1063474
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggt------atggg 114  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||      |||||    
T  1063691 taggcatggcaacaaaactcatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccgatttgacgggttttccccgttttgactgggtgtgggtgtgggtatggg 1063592  T
Q  115 tttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaa 214  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    |||||| || | |||    
T  1063591 tatgggtttttcccgatttcaaaacacgggtatgggacggttaacgggtatataagtacccaccccgaactcatacccaaatccatcccaagtgtaaaaa 1063492  T
Q  215 attattttatgttgatat 232  Q
    |||| |||||||||||||    
T  1063491 attactttatgttgatat 1063474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 71 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 45236193 - 45236032
Alignment:
Q  71 caatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatagg 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45236193 caatttgacgggttttccccgttttgactgagtttgagtatgggtatgagttttccctgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaatgggtatatagg 45236094  T
Q  171 tacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  45236093 tacccaccccgaacccatatccatacccgtcccaaatgtaaaaaattaatttatgttgatat 45236032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 165
Target Start/End: Original strand, 5858566 - 5858706
Alignment:
Q  25 catgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggtttt 124  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||||  | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5858566 catggcaacaaaatccatacctgtggttacctacccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggtttt 5858665  T
Q  125 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtat 165  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5858666 tcccgatttaaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtat 5858706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 208
Target Start/End: Original strand, 39445525 - 39445673
Alignment:
Q  60 cgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaac 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39445525 cgaaccaaactcaatttgacggattttccccgttttgactaggtttgggtatgggtatgggtttttcccgatttcaaaacacgggtatgggacaggtaac 39445624  T
Q  160 gggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatg 208  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  39445625 gggtttataggtacccaccccgaactcatacccatacccgtcccaaatg 39445673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 43113536 - 43113747
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| | |||||    
T  43113536 taggcatggcaataaaactcatacccgtggttacccacccgaaccaaacccaatttaacgggttttccctgctttgactgggtttgcgtatgagattggg 43113635  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||   ||| | ||||||||||| || |    
T  43113636 tttttcccgatttcaaaacacgggcatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccccgaactcatacccaaatccgtctcgaatgcagaaaactact 43113735  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    | ||||||||||    
T  43113736 tcatgttgatat 43113747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34777238 - 34777033
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||       
T  34777238 taggcatggcaacaaaactcatacccgtgattacccgtccgaaccaaacccaatttaacgggtttttcccgttttgactgggtttgggtatgggttt--- 34777142  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
       | |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||| | |||||||||    
T  34777141 ---ttcccgatctcaaaacacgggtatggaacgagtaacaggtatttaggtacccaccccgaacccatacccaaatccatcccaaatgtaaaaaattatt 34777045  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  34777044 ttatgttgatat 34777033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 208
Target Start/End: Original strand, 37960871 - 37961059
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    |||||||||||| |||||| ||||   || ||||||| | |||||| |||  ||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  37960871 gtaggcatgacatcaaaactcatatccgtagttacccacccgaaccgaacctaatttgatgggtttttcccgttttgactaggtttgggtatgagtttgg 37960970  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatg 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||  ||||||||||    
T  37960971 gttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacaggtatataggtacacaccccgaactcatacccaaacccgtcccaaatg 37961059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24569115 - 24568905
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||     
T  24569115 taggcatgacaacaaaacacatacatgtgattatctatccgaaccaaacctaatttgacgggttttccccgttt-gattgggtttaggtatgggtatgga 24569017  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||   ||||| |||| |||||| || |    
T  24569016 tttttcccgatttcacaacatgggtatgggacaggtagcgggtatataggtatccaccccgaacccatactcaaatccgtcccgaatggagaaaactact 24568917  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  24568916 ttatgttgatat 24568905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 35215713 - 35215551
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||  ||||||||||||||   |||||||||||  ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||  ||||||    
T  35215713 taggcatagcaacaaaacccatatccgtggttacccgtccgacccaaacccaatttgaccggtttttcccgttttgaccgggtttgggtatgattttggg 35215614  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaac 184  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35215613 ttttccc-gatttcaaaacacgggtatgagacgggtaacgagtatataggtacccaccccaaac 35215551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34139630 - 34139415
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaa------tttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatggg 114  Q
    |||||| ||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  34139630 taggcacgacaacaaaactcatacccgtggttatccgcccgaaccaaactcaaacccaatttgacgggttttcctcgttttgactgggtttgggtatgtg 34139531  T
Q  115 tttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgc-agaa 213  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||| ||||| | ||    
T  34139530 tttgg-ttttccccgatttaaaaacacggatataggacatgtaacaggtatataggtacccaccccgaa-ccatacccaaacccgtcccgaatgcaaaaa 34139433  T
Q  214 aattattttatgttgata 231  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  34139432 aattactttatgttgata 34139415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17220892 - 17220725
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtg--gttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttg 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  | |  ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||    
T  17220892 taggcatgacaacaaaacctatacccgcgcggttacccgcacgaaccaaatccaatttgacgggttttccccattttgactgagtttgggtatgggtatg 17220793  T
Q  119 ggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaaccc 186  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | | || |||||||||||||||||| |||||    
T  17220792 gattttccccgatttcaaaacacgggtatgggatggatgatggttatataggtacccaccccgaaccc 17220725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 11254925 - 11255129
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||       
T  11254925 taggcatgacaacaaaacccatacatgcggttacctgtccgaaccaaatccaatttgacgggttttttccgttttgactaggtttgggtatgggtttt-- 11255022  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
         |||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||| |    
T  11255023 -----cccgctttccaaacacgggtatgggacggataacaggtatataggtacccactacgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattact 11255117  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    || |||||||||    
T  11255118 ttgtgttgatat 11255129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 60 - 197
Target Start/End: Original strand, 27777147 - 27777284
Alignment:
Q  60 cgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaac 159  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  27777147 cgaaccaaacttaatttgacgggttttctccgttttgactgggtttgggtatgtgtttgagtttttcccgatttcaaaacacaggtacgggacaggtaac 27777246  T
Q  160 gggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaact 197  Q
     |  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27777247 agagatacaggtacccaccccgaacccatacccaaact 27777284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14687536 - 14687396
Alignment:
Q  62 aaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgg 161  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |    
T  14687536 aacctaacccaatttggcgggttttccccactttgattgggtttgggtatggatttgggttttccccgatttcaaaacacaggtatgggacgagaaacag 14687437  T
Q  162 gtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcc 202  Q
    | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14687436 ggatatatgtatccaccccgaacccatacccaaactcgtcc 14687396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 192
Target Start/End: Original strand, 15068497 - 15068668
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |   ||| ||||||| | |||||| | | ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  15068497 gtaggcatggcaacaaaacccgtgcccatgggtacccgcccaaaccaaccccgatttgacgggttttccccgatttgactgggtctgggtatgggttcgg 15068596  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccataccc 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  15068597 gttttccccgatttcaaaatacgggtacgggacaggtaacggg-atatatgtatccaccccgaacccataccc 15068668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 196
Target Start/End: Original strand, 17084027 - 17084192
Alignment:
Q  25 catgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggtttt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||      | | ||||||||||    
T  17084027 catgacaacaaaacccatacttgtgggtacccacccgaaccaaattcaagttgacgggttttccccgctttgactgggtt------ttgatttgggtttt 17084120  T
Q  125 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    | ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||| ||||||    
T  17084121 ctccgattttaaaacacgggtacgagacgggtaacggggatatagatacccaccccgaactcatatccaaac 17084192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 216
Target Start/End: Original strand, 8545301 - 8545454
Alignment:
Q  62 aaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgg 161  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||| | | || ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  8545301 aaccaaactcaaattgacgg-ttttctccgctttaacttggattgggtataagtttgggttttctccgatttcaaaacacgggtatggaacgagtaacgg 8545399  T
Q  162 gtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaat 216  Q
    | |||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  8545400 ggatatagatacccaccccgaacccatactcaaactcgtcccaaatgtagaaaat 8545454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14186488 - 14186287
Alignment:
Q  19 cgtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttg 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || || || |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||             
T  14186488 cgtaggcatgacaacaaaactcatactcgtggttactcgttctaatcaaacctgatttgacgggttttctccgttttgattgggtttgagt--------- 14186398  T
Q  119 ggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaatta 218  Q
       ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||  ||||  |||| |||||||||    
T  14186397 ---ttttctcgatttcaaaacacgggtatgggatgggtaacggatatataggtactcaccctgaacccatacccaaacccgtcctgaatgtagaaaatta 14186301  T
Q  219 ttttatgttgatat 232  Q
     |||||||| ||||    
T  14186300 atttatgttaatat 14186287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 52 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28345638 - 28345474
Alignment:
Q  52 tacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatggga 151  Q
    ||||||| |||||||||  |  ||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||  |||    
T  28345638 tacccgcccgaaccaaatcctttttgacgggtttttcccgctttgactgggtttcggtataggtttggattttacccgattccaaaacacgggtacagga 28345539  T
Q  152 cgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaat 216  Q
     |||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  28345538 tgggtaacgaggatataggcacccaccccgaacccatacccaaacttgtcctgaatgtagaaaat 28345474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 176
Target Start/End: Original strand, 6388470 - 6388581
Alignment:
Q  65 caaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggta 164  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||| |    
T  6388470 caaactcaatttgacgggctttctccgttttgactgagtttgggtatgggtttgggtcttccccgattttaaaacacgggtacaagacgggtaacgggga 6388569  T
Q  165 tataggtaccca 176  Q
    ||||||||||||    
T  6388570 tataggtaccca 6388581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 14155670 - 14155535
Alignment:
Q  61 gaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacg 160  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  14155670 gaaccaaacccaatttgacgggttttccccggtatgactgggtttgggtatgagtttgggtttttcccgatttcaaaacacgggtataagatgggtaacg 14155571  T
Q  161 ggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
     | |||||  || ||||||||||  |||||||||||    
T  14155570 aggatatatttatccaccccaaattcatacccaaac 14155535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Original strand, 30481370 - 30481533
Alignment:
Q  60 cgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaac 159  Q
    ||||||||||  || |||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| |||| ||||     
T  30481370 cgaaccaaacctaaattgatggattttccctgttttgattgggtttgagtatgagtttgggtttttcctgatttcaaaatacgagtatgagacgagtaat 30481469  T
Q  160 gggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatttta 223  Q
    | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||| ||||    
T  30481470 gaggatataggtacccaccccgaacccatacccaaactcgtcccgaatgtaaaaaattaattta 30481533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 150
Target Start/End: Original strand, 2075744 - 2075873
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2075744 taggcatggcaacaaaactcatatccgtggttacccgcctgaaccaaacccaatttgacggattttctccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 2075843  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatggg 150  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  2075844 tttttcccgatctcaaaacatgggtatggg 2075873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 73 - 218
Target Start/End: Original strand, 27056517 - 27056662
Alignment:
Q  73 atttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 172  Q
    |||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||  ||||  ||    
T  27056517 atttgacgggttttcctcgctttggctgggtttggttatgggtttgggtttttcccgatttcaaagtacaggtatgggacgggtaacggggttatatcta 27056616  T
Q  173 cccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaatta 218  Q
    |||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| | |||||||    
T  27056617 cccaccccgaacccatacacatactcgtcccaaatgtaaaaaatta 27056662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 111 - 222
Target Start/End: Original strand, 9642351 - 9642462
Alignment:
Q  111 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  || ||| ||| ||||||||| || ||  |||||||||| |    
T  9642351 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacggggttatatatatccatcccgaacccatactcatacccgtcccaaatgta 9642450  T
Q  211 gaaaattatttt 222  Q
     |||||||||||    
T  9642451 aaaaattatttt 9642462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 10297584 - 10297461
Alignment:
Q  73 atttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 172  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||    
T  10297584 atttgacgggttttccctgattttattgggtttggatgtgaatttgggttttccccgatttcaaaatacggggacgggacaggtaacggggatatatgta 10297485  T
Q  173 cccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    || ||||  |||||||||| ||||    
T  10297484 cctaccctgaacccataccaaaac 10297461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 158
Target Start/End: Original strand, 15173821 - 15173927
Alignment:
Q  52 tacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatggga 151  Q
    ||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15173821 tacccgcccaaaccaacctcgatttgacgggttttctctgatttgactgggtttgggtatgtgtttgagtttttcccgatttcaaaatacgggtacggga 15173920  T
Q  152 cgggtaa 158  Q
    |||||||    
T  15173921 cgggtaa 15173927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 227
Target Start/End: Original strand, 36131917 - 36132033
Alignment:
Q  111 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgca 210  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||   ||||| ||||||    
T  36131917 tgggtttgagttttcccctatttcaaaacacgagtatgggatgggtaaagggcatacaggtatccaccccgaactcatacacaaatccgtcccgaatgca 36132016  T
Q  211 gaaaattattttatgtt 227  Q
    |||| ||||||||||||    
T  36132017 gaaagttattttatgtt 36132033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 188
Target Start/End: Original strand, 29416097 - 29416263
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||   || ||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||      
T  29416097 taggcatggcaacaaaattcatactcccgggtacccacccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgagtttgggtatgagtttgac 29416196  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccat 188  Q
    |||| | | |||| |||||||| |||  ||| |||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||    
T  29416197 tttttctctattt-aaaacacgagtaaaggatgggtaacgaggatatatgtacccaccccgaacccat 29416263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 32392296 - 32392454
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| || ||||||  |||| || ||| |||| | |||||||| | |||||||| ||||||| |||| ||| | ||||||| ||||||| ||||||    
T  32392296 taggcatggcagcaaaacttatacatgcggtaacccacccgaaccaaccccaatttgatgggtttttcccgctttaaatgggttttggtatggatttggg 32392395  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccc 179  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||| | ||| | | ||||| ||||||||||    
T  32392396 tttttctcgatttcaaaacacgagtatgggacagataatgagaatatatgtacccaccc 32392454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 29089953 - 29089811
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||| |||||| || ||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| | |      |||||||||||||||| |||| ||    
T  29089953 taggcatggcaacaaagcccatatttatggttacccacccgaatcaaacccaatttgacgggtttttctc------attgggtttgggtatgagtttagg 29089860  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatag 169  Q
    | |||  ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  29089859 tattcttcgatttcaagacacgggtatgagacggataatgggtatatag 29089811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34021583 - 34021444
Alignment:
Q  92 ttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacc 191  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||  ||||||| |||||| |||| |||| ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||     
T  34021583 tttttattgggtttgagtatgagtttaagttttccacgattttaaaatacggatatggaacgagtaacaggaatataggtacacaccccaaaccaataca 34021484  T
Q  192 caaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    || ||| ||||  |||||||||||| | |||||||||||||    
T  34021483 cagactcgtcctgaatgcagaaaatca-tttatgttgatat 34021444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2075915 - 2075864
Alignment:
Q  142 gggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccataccca 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2075915 gggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccataccca 2075864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 218
Target Start/End: Original strand, 9475922 - 9476120
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||| || |||  |||||||||| || ||| ||| ||||| |  |||| |||||  ||||| ||||| | |||     
T  9475922 taggcatgacaacaaaacatatacttctgggtatccgtccgaaccaaacccattttaacgagtttttcttgtttcgattgaatttggatatggatatgga 9476021  T
Q  121 ttttcccc-gatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaatta 218  Q
    |||||||| |||||||||| |||| || |||||  |||||||| |||||  |||||||| | |||||||||||||||   |||| |||| |||||||||    
T  9476022 ttttcccccgatttcaaaaaacggatacgggacaagtaacggggatataaatacccacctcgaacccatacccaaacccatcccgaatgtagaaaatta 9476120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 5700444 - 5700360
Alignment:
Q  111 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaa 195  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  5700444 tgggtttaagtttttcccgatttcaaaacacaggtatgagactggtaacggggatatagatacccacctcgaacccatacccaaa 5700360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30904123 - 30904029
Alignment:
Q  122 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaat 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||   ||||| |||| |||||||    
T  30904123 tttcctcgatttcaaaacacgggtacgagacgggtaatggagatataagtacccaccccatacccatacccaaatcagtcccgaatgtagaaaat 30904029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 193
Target Start/End: Original strand, 33631903 - 33631981
Alignment:
Q  115 tttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccataccca 193  Q
    ||||| |||| || ||| |||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33631903 tttggattttacctgatctcaaaacatgggtatgggacgagtaatggggatataagtacccaccccaaacccataccca 33631981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29918746 - 29918598
Alignment:
Q  60 cgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaac 159  Q
    ||||||||| ||||  ||||| ||||| || | ||||| ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  |||  | |||||||||    
T  29918746 cgaaccaaattcaaactgacgagtttttcctgctttgactggttttgggtatgagtttgagtttttcccgatttcaaaacacatgtacagaacgggtaac 29918647  T
Q  160 gggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatg 208  Q
        ||||| ||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||    
T  29918646 aaagatatatgtacccaccccgaaaccatacacaaacccgtcccaaatg 29918598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 40789679 - 40789591
Alignment:
Q  109 tatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaact 197  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| || |  ||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  40789679 tatgagtttgggttttccccaatttcataatataggtactggacgggtaacagggatatatgtacccaccccgaacctatacccaaact 40789591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Original strand, 2183588 - 2183691
Alignment:
Q  93 tttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccataccc 192  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| | ||  ||||| ||  ||||| ||||||||||| ||| ||||| |    
T  2183588 tttgactgggtttaggtatgagtttggattttctccgatttcaaaatacgggtacgagagaggtaatggagatatatgtacccaccccgaactcatactc 2183687  T
Q  193 aaac 196  Q
    ||||    
T  2183688 aaac 2183691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 216
Target Start/End: Original strand, 12468171 - 12468323
Alignment:
Q  61 gaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacg 160  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||  |||| |    
T  12468171 gaaccaaacccaatttgatgggttt-ctccgttttgactgg-tttgagtatgaatttgggttttcctcgatttcgaaacacgggtacgagacatgtaatg 12468268  T
Q  161 ggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaat 216  Q
    || || |||||||| ||||| ||| ||||| |||| | || || |||| |||||||    
T  12468269 gg-atgtaggtaccaaccccgaactcatactcaaattcgttccgaatgtagaaaat 12468323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 36897161 - 36897054
Alignment:
Q  93 tttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccataccc 192  Q
    ||||||| ||| || |||||  |||| ||||||| ||||||||| |||   |||||| ||||||| | || ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  36897161 tttgattaggtatgagtatgaatttgagttttcctcgatttcaagacatatgtatggaacgggtagcagg-atataggtaaccaccccgaacccataccc 36897063  T
Q  193 aaacttgtc 201  Q
    ||| |||||    
T  36897062 aaatttgtc 36897054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 35139688 - 35139617
Alignment:
Q  73 atttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacggg 144  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| | |||||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  35139688 atttgacgggttttctccgtcttgactaggtttgtgtgttggtttgagtttttcccggtttcaaaacacggg 35139617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 208
Target Start/End: Original strand, 39379581 - 39379676
Alignment:
Q  111 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatg 208  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| | | ||| | ||||||| ||| ||| ||||| |||||| ||||| ||||    
T  39379581 tgggtatgggttttccc-gatctcaaaacacgggtacgggacgggtaatgaggataaaagtaccca-cccgaactcatactcaaactcgtcccgaatg 39379676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 232
Target Start/End: Original strand, 2075907 - 2075955
Alignment:
Q  184 cccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  2075907 cccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatat 2075955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 231
Target Start/End: Original strand, 4230791 - 4230839
Alignment:
Q  183 acccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgata 231  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  4230791 acccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgata 4230839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 39655183 - 39655394
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39655183 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtatggg 39655282  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||| || |    
T  39655283 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacccgtctcaaatgtaaaaaactact 39655382  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  39655383 ttatgttgatat 39655394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 4015954 - 4016165
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4015954 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccacccgaacgaaactcaatttgacgggtttttcccgttttgactaggtttgggtatgggtttggg 4016053  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||      
T  4016054 ttttccccgatttcaaaacatgggtatgggacggataacgggtatataggtacccactccgaacccatacccaaactcgtcccgaatgcagaaaactacc 4016153  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  4016154 ttatgttgatat 4016165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 4557215 - 4557426
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4557215 taggcatgacaacaaaactcatacccgtggttacccacccgaacaaaacccaatttgacgggtttttcccgttttgactgggtttgggtatgggtttggg 4557314  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |    
T  4557315 ttttccccgttttcaaaacatgggtatgggacgggtaacgagtatataggtacccaccccgaacccatacccaaatctatcccgaatgcagaaaattact 4557414  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  4557415 ttatgttgatat 4557426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 49580242 - 49580031
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  49580242 taggcatgacaacaaaacccatacccgtggttatccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 49580143  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||  |||||||||| | ||||||| |    
T  49580142 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataggtacccacctcgaacccatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 49580043  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    |||| |||||||    
T  49580042 ttatattgatat 49580031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 208
Target Start/End: Original strand, 7469687 - 7469875
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  7469687 gtaggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgg 7469786  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatg 208  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||    
T  7469787 gttttccctgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacacaaacccgtcccaaatg 7469875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 44953345 - 44953556
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  44953345 taggcatggcaacaaaattcatacccgtggttacccgctcgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtttgggtatggg 44953444  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||  |||||||||| | |||| || |    
T  44953445 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtactcaccccgaactcatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaactact 44953544  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  44953545 ttatgttgatat 44953556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29284514 - 29284303
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  29284514 taggcatggcaacaaaactcatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttctccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 29284415  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| ||| | |||| || |    
T  29284414 tttttcccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccagcccgaacccatacccaaacccgtcccagatgtaaaaaactact 29284315  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  29284314 ttatgttgatat 29284303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 232
Target Start/End: Original strand, 22535754 - 22535962
Alignment:
Q  24 gcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttt 123  Q
    ||||| |||||||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  22535754 gcatggcaacaaaacccatacccgcggttatccgcccgaaccaaactcaatttgatgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgagttt 22535853  T
Q  124 tccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatttta 223  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| || ||| |||| ||||| | ||||||||||||    
T  22535854 tccccaatttcaaaacacggatatgggacgggtaacgggtatacaggcacccaccccgaacccatacacatactcgtcctaaatgtaaaaaattatttta 22535953  T
Q  224 tgttgatat 232  Q
    |||||||||    
T  22535954 tgttgatat 22535962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42758552 - 42758341
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  42758552 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgatccaaacccaatttgacggattttccccgttttaactgggtttgggtatgagtttggg 42758453  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||| || | ||||||||| |    
T  42758452 tttcccccgatttcaaaacacaggtatgggacgggtaacaggtatataggtatgcaccccgaacccatacccaaacccgtcccgaacgaagaaaattact 42758353  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  42758352 ttatgttgatat 42758341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44639452 - 44639241
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||  ||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  44639452 taggcatggcaacaaaactcatatccgtggttacccgtccgaacgaaacccaatttgactggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatggg 44639353  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||| | |||||||||    
T  44639352 ttttcccatatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgttccaaatgtaaaaaattatt 44639253  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  44639252 ttatgttgatat 44639241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 48390727 - 48390938
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  48390727 taggcatggcaacaaaacccatacccgcggttacccgttcgaaccaaatccaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 48390826  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||  ||||| || | | ||||||| |    
T  48390827 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggaatataggtacccatcctgaacccatacccatacccgtcccgaacgtaaaaaattact 48390926  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  48390927 ttatgttgatat 48390938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 54317321 - 54317111
Alignment:
Q  22 aggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggt 121  Q
    ||||||| |||||||| |||||   |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  54317321 aggcatggcaacaaaatccatatccgtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgagtatgtgtttgagt 54317222  T
Q  122 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattt 221  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||| ||    
T  54317221 tttccccgatttcaaaacacaagtataggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccattcccaaacccgtcccaaacgaagaaaattactt 54317122  T
Q  222 tatgttgatat 232  Q
    |||||||||||    
T  54317121 tatgttgatat 54317111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39728850 - 39728638
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | |    
T  39728850 gtaggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgtccgaaccaaatccaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggtatgagtatag 39728751  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||     
T  39728750 gttttcctcgatctcaaaatacgggtatgggatgggtaacgggtatataagtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattac 39728651  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||    
T  39728650 tttatgttgatat 39728638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44252926 - 44252714
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||  |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  44252926 gtaggcatggcaacaaaatccatacccgtggttacccgtccgaatcaaaccaaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgg 44252827  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  | |||| ||     
T  44252826 gttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgtgtaacaggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatataaaaaactac 44252727  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||    
T  44252726 tttatgttgatat 44252714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23581001 - 23580794
Alignment:
Q  25 catgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggtttt 124  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  23581001 catgacaacaaaacacatacctgcggttacctgcccgaattaaattcaatttgacgggtttttcccgttttgactgggtttgggtatgggtatgagtttt 23580902  T
Q  125 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttat 224  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  23580901 ccccaatttcaaaacacgagtatgaaacgggtaacgggtatataggtacccactccgaacccatacccacacttatcccaaatgtaaaaaattattttat 23580802  T
Q  225 gttgatat 232  Q
    ||||||||    
T  23580801 gttgatat 23580794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 52572787 - 52572576
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |    
T  52572787 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttatccgcccgaaccaaactcaatttgacaggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgag 52572688  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||| |  |||||||||| | ||||||| |    
T  52572687 ttttcctcgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatagggacccaccccgaatccatactcaagcccgtcccaaatgtaaaaaattact 52572588  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||| ||||    
T  52572587 ttatgttaatat 52572576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 23546858 - 23547039
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||          
T  23546858 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcatgaaccaaacccaatttaacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatggg------ 23546951  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatg 208  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23546952 ttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaactcgtcccaaatg 23547039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34026129 - 34025921
Alignment:
Q  24 gcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttt 123  Q
    ||||| |||||||||||||||  | |||||||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  34026129 gcatggcaacaaaacccatacccgcggttaccctcccgaaccaaaaccaatttgacggttttttcccgttttgactgggtttggatatgggtatgggttt 34026030  T
Q  124 tccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatttta 223  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||||| ||  |||||||||| | ||||||||||||    
T  34026029 tccccgatttcaaaacacaggtatgggacgggtaacgagtatataggtttccaccccgaactcatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattatttta 34025930  T
Q  224 tgttgatat 232  Q
    |||||||||    
T  34025929 tgttgatat 34025921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 53632082 - 53631871
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |    
T  53632082 taggcatggcaataaaactcatacccgtggttactcgttcgaaccaaacttaatttgacgggttttcctcgttttgaatgggtataggtatgggtttgag 53631983  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    |||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||  ||||||||| |    
T  53631982 ttttcccaaattttaaaacacgtgtatgagacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatactcaaactcgtcccgaatctagaaaattact 53631883  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  53631882 ttatgttgatat 53631871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34119825 - 34119623
Alignment:
Q  30 caacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccg 129  Q
    ||||||||||||| | |||||||| || | |||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  34119825 caacaaaacccatccatgtggttaaccacccgaaccaaatctaatttgacgggttttccccattttgattgggtttgggtatgagtttgagtttttcccg 34119726  T
Q  130 atttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttga 229  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  34119725 attttaaaacacgggtatgagacggataacaggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaatccgtcccaaatgcagaaaactactttgtgttga 34119626  T
Q  230 tat 232  Q
    |||    
T  34119625 tat 34119623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 48305555 - 48305760
Alignment:
Q  25 catgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggtttt 124  Q
    ||||||||||||| ||||||  | |||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| || |||||    
T  48305555 catgacaacaaaatccatacccgcggttacccacccgaaccaaacccaatctgacgggttttccccattttgactgggtttggttatgggtatgagtttt 48305654  T
Q  125 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttat 224  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||| | ||||||| |||||    
T  48305655 ccccaatttcaaaacacgggtatggaacgagtatcgggtatataggtacccaccccgaacctatacccaaacccgttccaaatgtaaaaaattactttat 48305754  T
Q  225 gttgat 230  Q
    ||||||    
T  48305755 gttgat 48305760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 52198304 - 52198122
Alignment:
Q  50 gttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgg 149  Q
    ||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  52198304 gttacccgcccaaaccaaacctaatttgacgggttttttctgttttgactgggtttgggtatgggtatgggtttttcccgatctcaaaacacaggtatgg 52198205  T
Q  150 gacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||| | ||||||| |||| ||||||||    
T  52198204 gacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgttccaaatgtaaaaaattactttacgttgatat 52198122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 6738315 - 6738515
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  6738315 taggcatggcaataaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacaggtttttcccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 6738414  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    |||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||  |||||||||| | ||||||| |    
T  6738415 ttttccccgatttcaaaac-----------acgggtaacgggtatataggtacccaccccaaatccatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaattact 6738503  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  6738504 ttatgttgatat 6738515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 232
Target Start/End: Original strand, 23153978 - 23154185
Alignment:
Q  24 gcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttt 123  Q
    ||||| |||||||| |||||   | ||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| |||||||    
T  23153978 gcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgccggaaccaaccccaatttgacgggtttttcccgttttaactgagtttgggtatgggtatgggttt 23154077  T
Q  124 tccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatttta 223  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| || || | ||||||||| | ||||||| ||||    
T  23154078 tccccgatttc-aaacacgggtatggaacgggtaacgagtatataggtacccactccgaacccatactcatacctatcccaaatgtaaaaaattacttta 23154176  T
Q  224 tgttgatat 232  Q
    |||||||||    
T  23154177 tgttgatat 23154185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 92 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44172733 - 44172593
Alignment:
Q  92 ttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacc 191  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44172733 ttttgactgggtttgagtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataagtacccaccccgaacccatacc 44172634  T
Q  192 caaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    |||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  44172633 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatat 44172593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 92 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44179433 - 44179293
Alignment:
Q  92 ttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacc 191  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44179433 ttttgactgggtttgagtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataagtacccaccccgaacccatacc 44179334  T
Q  192 caaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    |||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  44179333 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatat 44179293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 44106704 - 44106913
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||     
T  44106704 taggcatggcaacaaaacacatacccgtgattacccgcccgaacaaaactcaatttgacgg-ttttccccgttttgactgggtttgggtatgagtatgg- 44106801  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||| |||||  |||||||||| | ||||||| |    
T  44106802 ttttccccaatcttaaaacacgggtatgggacgcgtaacggatatataggtatctaccccgaacccatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 44106901  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||| ||||    
T  44106902 ttatgttaatat 44106913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19111913 - 19111706
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||| | |   |||||||  ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||     
T  19111913 gtaggcatgacaacaaaactcatatccgtggttactcacctaaaccaaatccaatttgacggatttttccctttttgattgggtttgggtatgagtttga 19111814  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  || | ||||| |||||||||     
T  19111813 gtttttcccgatttcaaaacacgggtacgggatggataacgggtatataagtacccaccctaaacccatgcccaaacccgtacaaaatgtagaaaattac 19111714  T
Q  220 tttatgtt 227  Q
    ||||||||    
T  19111713 tttatgtt 19111706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 831179 - 830976
Alignment:
Q  22 aggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggt 121  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |        
T  831179 aggcaagacaacaaaactcatatccgtggttacccgcccaaaccaaaccaaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtat---- 831084  T
Q  122 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattt 221  Q
      | |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||    
T  831083 --ttcccgttttcaaaacacgggtatgagacggataacgagtatat-ggtacccaccctgaacccatacccaaattcgtcccgaatgcagaaaattactt 830987  T
Q  222 tatgttgatat 232  Q
    |||||| ||||    
T  830986 tatgttaatat 830976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43582755 - 43582545
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||  ||||||||||||||   | |||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||| ||||||| | |||||||| ||||| || || |    
T  43582755 taggcattgcaacaaaacccatatccgcggttacccgcccgaaccaaatccaatttgatgggttttctccgtttttactgggtttgagtatgtgtatgag 43582656  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||  || ||  |||||||||| | ||||||| |    
T  43582655 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacgggtaacgtgtatgtaggtaccca-cccgaacccatattcatacccgtcccaaatgtaaaaaattact 43582557  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    |||| |||||||    
T  43582556 ttatattgatat 43582545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 71 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34154542 - 34154380
Alignment:
Q  71 caatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatagg 170  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  | |||||||    
T  34154542 caatttgacggattttccccgttttgactgggtttggatatgggtatgtgttttccccgatttcaaaacatgggtatgaaacgggtaacaagaatatagg 34154443  T
Q  171 tacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatg-cagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||  | ||||||| |||||||||||||    
T  34154442 tacccaccccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaaattactttatgttgatat 34154380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29842485 - 29842277
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |  |||| |||   ||||||||   ||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||| ||| ||||    
T  29842485 taggcatgacaacaaaatccatactcgcagttatccgtctgaaccaaatctaatttgacgggtttttcatgttcggattgggtttgggtataggtatggg 29842386  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||| |||||| | ||||||| |    
T  29842385 ttttccc-gattttaaaacacgggtatgggactggtaacgggaatataggtacccaccccgaacccatactcatacccgtctcaaatgtaaaaaattact 29842287  T
Q  221 ttatgttgat 230  Q
    ||||||||||    
T  29842286 ttatgttgat 29842277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 10371182 - 10371323
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttga------ttgggtttgggtatgg 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||     
T  10371182 gtaggcatgacaacaaaacccagacccgtggttacccgctcgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtttgggtatga 10371281  T
Q  114 gtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacggg 155  Q
    || ||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  10371282 gtatggattttccccaatctcaaaacacgggtatggggcggg 10371323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20087175 - 20086976
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||| ||||||  | ||||||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  20087175 taggcatggcaacaaaatccataccagcggttacctgctggaaccaaatccaatttgacggattttctccgttttgactgggtttggatatgggtatggg 20087076  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||           ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||  |||||||||| | |||||||||    
T  20087075 ttttccccgatttcaaaacacg-----------ggtaatgggtatataggtacccaccccgaaccc-tactcatacccgtcccaaatgtaaaaaattatt 20086988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 61 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 42243525 - 42243390
Alignment:
Q  61 gaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacg 160  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  42243525 gaaccaaacccaatttgacgggttttccccggtttgactgggtttgggtatgagtttgggtttttcccgatttcaatacacgggtatgagatgggtaacg 42243426  T
Q  161 ggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
     | |||||  || ||||||||||  |||||||||||    
T  42243425 aggatatatttatccaccccaaattcatacccaaac 42243390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 71 - 193
Target Start/End: Original strand, 10043242 - 10043364
Alignment:
Q  71 caatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatagg 170  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |    
T  10043242 caatttgacgggttttctccactttgactgggtttgggtatgggtttgggttttccctggtttcaaaacatgggtatgggacgggtaacggggttatatg 10043341  T
Q  171 tacccaccccaaacccataccca 193  Q
     ||||||||| ||||||||||||    
T  10043342 cacccaccccgaacccataccca 10043364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 17146064 - 17146271
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||  | |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||     ||||||||||||| ||||    
T  17146064 taggcatgacaataaaacccatatatgtggtcacccgtccaaaccaaatccaatttgacgggttt-ccccgttttgaca---tttgggtatgggtatggg 17146159  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||  || || |||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||   ||||||||| | ||||||| |    
T  17146160 ttttttccaatctcaaaacatgggtatggaacgggtaacagttatataggtatccaccccgaacccatacacaaacccttcccaaatgtaaaaaattact 17146259  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  17146260 ttatgttgatat 17146271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 49025837 - 49025648
Alignment:
Q  30 caacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccg 129  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||| |||||||            ||||||||||||    
T  49025837 caacaaaatccatacccgtggttacccgcctgaaccaaacccaatttgatgggtttttcctgttttgactgggttt------------gggttttccccg 49025750  T
Q  130 atttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttga 229  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  || |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| ||| ||||||    
T  49025749 atctcaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacaca-tccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttgtgttga 49025651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 222
Target Start/End: Original strand, 30616244 - 30616392
Alignment:
Q  74 tttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtac 173  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||  ||     
T  30616244 tttgaggggtttttcccgttttgactgaatttgagtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacggatatgggacgggtaacgaggttatatataa 30616343  T
Q  174 ccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatttt 222  Q
    ||||||| |||||||||||| ||  |||||||| | | |||||||||||    
T  30616344 ccaccccgaacccatacccatacccgtcccaaacgtaaaaaattatttt 30616392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 10823612 - 10823814
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  || ||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||  || |||||| | |||||||||||||||||       
T  10823612 taggcatggcaacaaaactcatacccgtcgttacccgcccaaaccaaattcaatttgacgagttttttccattttgactaggtttgggtatgggttt--- 10823708  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
       || ||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||| |    
T  10823709 ---tctccgatctcaaaacacgggtatgagattgataacgggtatataagtac---ccccgaacccatacccaaacctctcccaaatgtaaaaaattact 10823802  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  10823803 ttatgttgatat 10823814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 110
Target Start/End: Original strand, 29858484 - 29858574
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggta 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29858484 gtaggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttaacggattttccccgttttgactgggtttgggta 29858574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 196
Target Start/End: Original strand, 3385800 - 3385941
Alignment:
Q  55 ccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgg 154  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||  ||||  || ||||||||||||||||| ||||| |    
T  3385800 ccgcccgaaccaaacccaattcgacgggttttccccgctttgactgggtttaggtatggatttgaatttttacccatttcaaaacacgggtacgggacag 3385899  T
Q  155 gtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    |||||| | ||||||||| ||||| | || ||||||| ||||    
T  3385900 gtaacgaggatataggtagccaccacgaatccataccaaaac 3385941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 168
Target Start/End: Original strand, 23910170 - 23910310
Alignment:
Q  29 acaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttcccc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |  |||| | || |||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| |    
T  23910170 acaacaaaacccatactcgtggttacctgtccgaatcgaattcaatttgacggattttttccgttttgactgggtttgtgtatgagtttgagttttcctc 23910269  T
Q  129 gatttcaaaacacgggtatgggacggg-taacgggtatata 168  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||    
T  23910270 gatttcaaaacacggatatgagatgggttatcgggtatata 23910310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 195
Target Start/End: Original strand, 30904778 - 30904899
Alignment:
Q  71 caatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatagg 170  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| | ||| |||||||||| |||||| ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  30904778 caatttgacgggttt-ccccgcttttactgg-tttgggtatgagtttggcttttttctgatttcaaaacacgggtacgggacgggt-acggggatatagg 30904874  T
Q  171 tacccaccccaaacccatacccaaa 195  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  30904875 tacccaccccgaacccatacccaaa 30904899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 162
Target Start/End: Original strand, 3414486 - 3414588
Alignment:
Q  60 cgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaac 159  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||||    
T  3414486 cgaaccaaacccaattcgataggttttccccgctttgattgggtttggttatgggtttgagtttttcccgattttcaaacacgagtacgggacaggtaac 3414585  T
Q  160 ggg 162  Q
    |||    
T  3414586 ggg 3414588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 232
Target Start/End: Original strand, 31126826 - 31126916
Alignment:
Q  142 gggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || |||||||||    
T  31126826 gggtatgggacgggtaacatgtatataggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgcagaaaactacattgtgttgatat 31126916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Original strand, 31126750 - 31126834
Alignment:
Q  30 caacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatggg 114  Q
    |||||||||||||||  ||||||| || | ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31126750 caacaaaacccatacacgtggttaaccacccgaaccaaacttaaattgatgggttttccccgttttgatttggtttgggtatggg 31126834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 196
Target Start/End: Original strand, 1772361 - 1772484
Alignment:
Q  73 atttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 172  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||  |||||| |||| |||||||  || || |||| | | ||||| |||    
T  1772361 atttgacggattttccccgatttgactgggtctgggtatggttttgggttttcttcgattttaaaatacgggtacagggcgagtaatgcggatatatgta 1772460  T
Q  173 cccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||    
T  1772461 cccaccccgaactcatacacaaac 1772484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 169
Target Start/End: Original strand, 41936980 - 41937071
Alignment:
Q  72 aatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatag 169  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||      ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41936980 aatttgatggattttcctcgttttgattgggtttgagtatggg------ttttccccgattttaaaacacgagtatgagacggataacgggtatatag 41937071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27252691 - 27252588
Alignment:
Q  72 aatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggt 171  Q
    |||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||    
T  27252691 aatttgacgggttttatcggatttgattgggtttgggtatgagtttgagttttctccaatttc-aaacatgggtacgggacggataacagtgatataggt 27252593  T
Q  172 accca 176  Q
    |||||    
T  27252592 accca 27252588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 2490411 - 2490336
Alignment:
Q  93 tttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatata 168  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||| ||| |||||    
T  2490411 tttgactgggtttggatatgggtttgagttttccccgatttcaaaatacgggtacagaacgggtaatggggatata 2490336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 61 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 4553328 - 4553193
Alignment:
Q  61 gaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacg 160  Q
    |||||||||| || || | |||||||| ||| ||||| |||| || |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  || ||||||||      
T  4553328 gaaccaaactgaaatttatgggttttctccgctttgactgggcttaggtatgcgtttgagtttttcccgatttcaaaacatgggtgcggaacgggtaata 4553229  T
Q  161 ggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    || |||||  ||| |||||| ||||||||| |||||    
T  4553228 gggatataaatacacaccccgaacccatactcaaac 4553193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 30682998 - 30682871
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |  ||||  | |||||| |||||| |||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||| |||| | || |    
T  30682998 taggcatgacaacaaaactcatacccgcagttattcactcgaatcaaacttaatttgacaggttttctctgttttgactgggtttgggaatggatatgag 30682899  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatg 148  Q
    |||||||||| || |||| |||| ||||    
T  30682898 ttttccccgacttaaaaatacggatatg 30682871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Original strand, 35687473 - 35687576
Alignment:
Q  93 tttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccataccc 192  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| |  ||||| ||||| | |||||| |||||||     
T  35687473 tttgactgggtttgagtatgagtttgagttttccccgatttcataatacgggtacgagacgggtaactgtgatatatgtacctatcccaaatccatacca 35687572  T
Q  193 aaac 196  Q
    ||||    
T  35687573 aaac 35687576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 158
Target Start/End: Original strand, 55438731 - 55438824
Alignment:
Q  60 cgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 158  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||     | || |||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  55438731 cgaaccaaactcaatttgatgggtttttctcg-----actgagtttgggtatggatttaggttttccccaatttaaaaacacgggtatgggacaggtaa 55438824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 12369172 - 12369103
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttcccc 90  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||  | | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12369172 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttattcacccgaaccaaactcaatttgacggattttcccc 12369103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 1337128 - 1337080
Alignment:
Q  111 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaac 159  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1337128 tgggtttgggttttcaccgatttcaaaacaagtgtatgggacgggtaac 1337080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25302506 - 25302430
Alignment:
Q  147 tgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttat 224  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  25302506 tgggacgagtaacggggatatatgtatccatcccaaacccataccc-aacatgtcccaaatatagaaaattactttat 25302430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 26207417 - 26207318
Alignment:
Q  52 tacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttggg---tatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatg 148  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  | |||||  || || |||   |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  26207417 tacccgctaaaaccaaactcaatttgacgggttatccttgctttgaccggattagggacgtatgagtttggatttttcccgatttcaaaacacgggtatg 26207318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 196
Target Start/End: Original strand, 40796153 - 40796222
Alignment:
Q  127 ccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| | | ||| | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  40796153 ccgatttcaaaatacgggtacgggacgggtaatgaggatacatgtacccaccccaaagtcatacccaaac 40796222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Original strand, 9220045 - 9220121
Alignment:
Q  70 tcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggta 146  Q
    |||||||||||||||||| |   |||||||| ||||| ||||| |||| | |||||||| |||| ||||||||||||    
T  9220045 tcaatttgacgggttttctcaactttgattgagtttgagtatgagtttagattttccccaattttaaaacacgggta 9220121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 38347693 - 38347605
Alignment:
Q  72 aatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacg 160  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| |||  ||||| ||||| | ||||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  38347693 aatttgacggattttctccgttttaattggctttggatataagtttgcgtttttctcgatttcaaaacatgagtatgagatgggtaacg 38347605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Original strand, 31271209 - 31271296
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttggg 108  Q
    |||||||| |||| |||||| |||  | || ||||||  |||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||    
T  31271209 taggcatggcaaccaaacccgtacccgcgggtacccgtccgaatcaaactcaatttgacggatttttcccgctttgactgggtttggg 31271296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 1337210 - 1337118
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggtta----cccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggt 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||||||    |||||  |||| |||| || |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1337210 gtaggcatggcaacaaaacccatacccgtggttaattacccgcctgaactaaacccattttgacggattt-ccccgttttgactgggtttgggt 1337118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 65)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Original strand, 36187129 - 36187341
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  36187129 gtaggcatggcaacaaaacccatacccgtcgttacccgcccgaaccaaactcaatttggcgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgg 36187228  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||    
T  36187229 gttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccctgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaagttat 36187328  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||    
T  36187329 tttatgttgatat 36187341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 232
Target Start/End: Original strand, 19572425 - 19572633
Alignment:
Q  24 gcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttt 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  19572425 gcatggcaacaaaacccatacttgtggttacccgcccgaaccaaacctaatttgacgggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgggttt 19572524  T
Q  124 tccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatttta 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  |||||||||| | ||||||||||||    
T  19572525 ttcccgatttcaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaattatttta 19572624  T
Q  224 tgttgatat 232  Q
    |||||||||    
T  19572625 tgttgatat 19572633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 24236671 - 24236882
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  24236671 taggcatggcaacaaaactcatacccatggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgggtttttcccgttttgactgggtttaggtatgggtatggg 24236770  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| | |||||||||    
T  24236771 ttttccccgatctcaaaacacgggtatggaacggggaacgggtatataggtacccaccccgaacccatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaattatt 24236870  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  24236871 ttatgttgatat 24236882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29936601 - 29936384
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttga------ttgggtttgggtatggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      |||||| || |||||||    
T  29936601 taggcatgacaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactaagtttgggtatgagtatggg 29936502  T
Q  115 tttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaa 214  Q
    | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||    
T  29936501 tatgggttttccccgatctcaaaatacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaa 29936402  T
Q  215 attattttatgttgatat 232  Q
    |||| |||||||||||||    
T  29936401 attactttatgttgatat 29936384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5181218 - 5181013
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  5181218 taggcatggcaacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaattcaatttgacgggttttccccattttgactgggtttaggtatgggtatggg 5181119  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      || ||||||| | |||||||||    
T  5181118 ttttccccgatttcaaaatacgggtatgggacgggtaacgggtatataggcacccaccccaaacccataccc------gttccaaatgtaaaaaattatt 5181025  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  5181024 ttatgttgatat 5181013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17135126 - 17134915
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  17135126 taggcatggcaacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggattttctctgttttgactgggtttgggtgtgggtatggg 17135027  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||| |    
T  17135026 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacgggtaacgggtatataggtaccatccccgaacccatacccatactcgtcccatatgtaaaaaattact 17134927  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  17134926 ttatgttgatat 17134915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 23490681 - 23490892
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23490681 taggcatggcaacaaaacccatactcatagttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggtttttcctgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 23490780  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||| | |||| || |    
T  23490781 ttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccataccaaaacccgtcccaaatgtaaaaaactaat 23490880  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    |||||| |||||    
T  23490881 ttatgtggatat 23490892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 49250683 - 49250894
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  49250683 taggcatgacaacaaaattcatacccgtggttatccgcccgaaccaaattcaatttgacgggttttctccgttttgactgggtttgggtatgggtatgag 49250782  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  |||||||||| | |||| || |    
T  49250783 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaatgggtatataggtatccacctcgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactact 49250882  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  49250883 ttatgttgatat 49250894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 18353990 - 18354201
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  | | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||  ||||||| ||||    
T  18353990 taggcatggcaacaaaacccgtacccgcgattacccgcccgaaccaaattcaatttgacgggtttttcccgttttgactggatttgaatatgggtatggg 18354089  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||| | |||||||||    
T  18354090 ttttccccgatttcaaaacatgggtatgggacgggtaacgggtatataagttcccaccccgaaccgatacccatactcgtcccaaatgtaaaaaattatt 18354189  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  18354190 ttatgttgatat 18354201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 34673192 - 34673403
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  34673192 taggcatgacaacaaaactcataccagtgattacccgcccgaaccaaacccaatttaacggattttccccattttaactgggtttgggtatgggtttggg 34673291  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || || | |||||| || |    
T  34673292 tttttcccaatttcaaaacacgggtatgagactggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacctgttccgaacgaagaaaactact 34673391  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  34673392 ttatgttgatat 34673403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 207
Target Start/End: Original strand, 44615389 - 44615571
Alignment:
Q  25 catgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggtttt 124  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  44615389 catggcaacaaaacccatacccgtggttacccacccagaccaaactcaatttgacgggtttttcccgttttgactgggtttgggtatgagtttgggtttt 44615488  T
Q  125 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaat 207  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  44615489 ccctgatttaaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccccaaactcatacccaaacccgtcccaaat 44615571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 44793180 - 44792998
Alignment:
Q  25 catgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggtttt 124  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  44793180 catggcaacaaaacccatacccgtggttacccacccagaccaaactcaatttgacgggtttttcccgttttgactgggtttgggtatgagtttgggtttt 44793081  T
Q  125 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaat 207  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  44793080 ccctgatttaaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccccaaactcatacccaaacccgtcccaaat 44792998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 51422038 - 51421826
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||   |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||    
T  51422038 gtaggcatggcaataaaatccatatccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgatgggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgg 51421939  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||     
T  51421938 gtttttcccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacatgtatatatgtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattac 51421839  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    | |||||||||||    
T  51421838 tctatgttgatat 51421826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34611251 - 34611041
Alignment:
Q  22 aggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggt 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  34611251 aggcatgacaacaaaatccatacccgtggttacccgcctgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgattgaatttgggtatgggtatgggt 34611152  T
Q  122 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattt 221  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||| | || | || ||    
T  34611151 ttttcccgatctcaaaacacgggtatgggacatgtaacgtgtatataggtactcaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaatactactt 34611052  T
Q  222 tatgttgatat 232  Q
    |||||||||||    
T  34611051 tatgttgatat 34611041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16409120 - 16408916
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16409120 taggcatgacaacaaaacccatacacacggttaccc-ctcgaatcaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 16409022  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||  |  ||||||| | ||||||| |    
T  16409021 ttttccccaatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtatataggtaccgaccccgaacccatagctaaacccgctccaaatgtaaaaaattact 16408922  T
Q  221 ttatgt 226  Q
    ||||||    
T  16408921 ttatgt 16408916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 232
Target Start/End: Original strand, 29871198 - 29871406
Alignment:
Q  23 ggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggtt 122  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||||    
T  29871198 ggcatgacaacaaaactcatactcgtggttatccatccga-ccaaactcaatttgacgggttttcctcgttttgactaagtttgggtatgagtttgggtt 29871296  T
Q  123 ttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatttt 222  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||    
T  29871297 ttctccgatttcaaaacatgggtatgggacaggtaactggtatataggtacccaccctgaactcatacccaaacccgtcccgaatgtagaaaattatttt 29871396  T
Q  223 atgttgatat 232  Q
    ||||||||||    
T  29871397 atgttgatat 29871406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12495190 - 12494981
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |  ||||||||  ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  12495190 gtaggcatgacaacaaaattcatacatgtggttacccacctgaaccaaatccaatttgacggattttccccactttgactgggtttcggtatgggttttg 12495091  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||     
T  12495090 gtttttcccgatttcaaaacacggatatgggacgtgtaacgggtatataggtacccacctcgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtagaaaactac 12494991  T
Q  220 tttatgttga 229  Q
    | ||||||||    
T  12494990 tatatgttga 12494981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 45866096 - 45866306
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||  || ||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  45866096 taggcatggcaacaaaacccatactcgcggttacccgcccgagccaaacctaaattgacgggttttctcc-ttttgactaggtttgggtatgggtatggg 45866194  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||| | ||||||| |    
T  45866195 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacaggtaatgagtatataggtacccaccccaaactcatacccatacccatcccaaatgtaaaaaattact 45866294  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  45866295 ttatgttgatat 45866306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24711027 - 24710871
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||    
T  24711027 gtaggcatgacaacaaaacccacacccgtgattatccacccgaaccaaattcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttggatatgagtatgg 24710928  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtaccca 176  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24710927 gttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtaccca 24710871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 9982800 - 9983011
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  |||||||| | | |||||||||  |||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||      
T  9982800 taggcatggcaacaaaactcatacccgtggttactctcccgaaccaaatccaatttgatggattttctccgttttgactgggtttgggtatgagtttgaa 9982899  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||| |||||||||||||| |    
T  9982900 ttttccccaatttcaaaacacgggaatgggatgggtaacgagtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccatcccgaatgcagaaaattact 9982999  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||| ||||    
T  9983000 ttatgttaatat 9983011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 23968758 - 23968621
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23968758 taggcatggcaacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggattttccccattttgattgggtttgggtatgggtatggg 23968659  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 158  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23968658 ttttccccggtttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 23968621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28298126 - 28297901
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||   |||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  28298126 gtaggcatgtcaacaaaactcatatccgtggttacccacccgaaccaaatccaatttgacgggttttccctgttttgattggatttgggtatgggtatgg 28298027  T
Q  120 gt------------tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaat 207  Q
    ||            |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  28298026 gtatgggtatgagttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaat 28297927  T
Q  208 g-cagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    |  | |||| ||||||||||||||||    
T  28297926 gtaaaaaaactattttatgttgatat 28297901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 232
Target Start/End: Original strand, 42439581 - 42439791
Alignment:
Q  22 aggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggt 121  Q
    ||||||| |||||||| ||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||   ||||  || |||||| || |||||||||||||| ||  |    
T  42439581 aggcatggcaacaaaatccatattcgtggttatccgcccgaaccaaactcaatttgacaaattttttccattttgactgagtttgggtatgggtatgaat 42439680  T
Q  122 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattt 221  Q
    |||  ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||| ||    
T  42439681 tttttccgatctcaaaacatgggtatgggacgagtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatatccaaactcatcccaaatgtaaaaaattactt 42439780  T
Q  222 tatgttgatat 232  Q
    |||||||||||    
T  42439781 tatgttgatat 42439791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 40087374 - 40087584
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  | ||||| |||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| || |    
T  40087374 taggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccgtctgaaccaaattcaatttgacggattttccccgttttgactgagtttgggtatgggtatgag 40087473  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| || ||  |||||||||| | ||||||| |    
T  40087474 ttttccccgatt-caaaacacaggtatgggatgagtaacgggaatataggtacccaccccgaactcatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaattact 40087572  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  40087573 ttatgttgatat 40087584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39616472 - 39616271
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatactt-gtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| || |||    
T  39616472 taggcatgacaacaaaactcataccccgcggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgagttttccccgttttgactgagtttgggtatgagtatgg 39616373  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |     |||| ||||||||||      |||||||||| | ||||||||    
T  39616372 gttttcccctatttcaaaacacgggtataggacgggtaacaagtatataggca-----cccatacccataccc------gtcccaaatgtaaaaaattat 39616284  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||    
T  39616283 tttatgttgatat 39616271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 50426565 - 50426776
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttga------ttgggtttgggtatggg 114  Q
    |||||||| |||||||| ||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||      |||||||||||| ||||    
T  50426565 taggcatggcaacaaaatccatacccgcggttaccggctcgaaccaaacccaatttaacaggttttctccgttttgactgggtttgggtttgggtttggg 50426664  T
Q  115 tttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaa 214  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      |||||||||| | |||    
T  50426665 tatgggctttccctgatttcaaaacacgggtatgagacggataacgggtatataggtacccaccccgaacccataccc------gtcccaaatgtaaaaa 50426758  T
Q  215 attattttatgttgatat 232  Q
     ||| |||||||||||||    
T  50426759 tttactttatgttgatat 50426776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 186
Target Start/End: Original strand, 35936749 - 35936904
Alignment:
Q  31 aacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccga 130  Q
    ||||||| ||||||  || |||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||||| | | |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35936749 aacaaaatccatacccgtagttacctgtccgaaccaaattcaatctgacgggtttttctcattttgacttggtttgggtatgagtttgggttttccccga 35936848  T
Q  131 tttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaaccc 186  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35936849 tttcaaatcacgagtatgggacggataacgggtatataggtacccaccccaaaccc 35936904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 42707747 - 42707951
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||| ||| |||||||||||||| | ||||||| |||  | ||| ||| | |||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||| || || |    
T  42707747 taggtatggcaacaaaacccataatcgtggttatccgtccaaactaaatttaatttgacggatttttcccattttgactgggtttgggtatgagtatgag 42707846  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||| |||||||||||      |||||||||| | |||||||||    
T  42707847 ttttctccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggaatataagtactca-cccgaacccataccc------gtcccaaatgtaaaaaattatt 42707939  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  42707940 ttatgttgatat 42707951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 3627907 - 3628108
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| | |||               
T  3627907 taggcatgacaacaaaactcatacacgcggttacccgcccgaaccaaactcaatttgatgagtttttcccgttttgactgggtataggt----------- 3627995  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatg--cagaaaatta 218  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |  ||||||||||   | |||||||    
T  3627996 -tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatgtaggtacccaccccgaacccatactcattccagtcccaaatgtaaaaaaaatta 3628094  T
Q  219 ttttatgttgatat 232  Q
     |||||||||||||    
T  3628095 ctttatgttgatat 3628108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Original strand, 16433088 - 16433285
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||   ||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||              
T  16433088 gtaggcatggcaataaaacctatatccgtggttacccatccgaaccaaactcaatttgacggattttccccattttgattgggtttgagt---------- 16433177  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||     
T  16433178 --tttctccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacggatatataggtac---ccccgaacccatacccaaacccaccccaaatgcagaaaattac 16433272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 74 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 34085361 - 34085213
Alignment:
Q  74 tttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtac 173  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||| ||||    
T  34085361 tttgacgggttttctccgctttgactgggttaggatatgagtttgggtttttcccgatttcaaaacacgagtatgggatgggtaacggggttatatgtac 34085262  T
Q  174 ccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatttt 222  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||    
T  34085261 ccaccccgaacccatacccatactcgtcctaaatgtaaaaaattatttt 34085213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13390574 - 13390381
Alignment:
Q  22 aggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggt 121  Q
    ||||||| |||||||||||||||    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |    
T  13390574 aggcatggcaacaaaacccatacccacggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttt-ccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgaat 13390476  T
Q  122 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattt 221  Q
    ||||||||||||||||||||                ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  |||||||||| | ||||||| ||    
T  13390475 tttccccgatttcaaaacac----------------acgggtatataggtacccaccccgaactcatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactt 13390392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 186
Target Start/End: Original strand, 19003628 - 19003741
Alignment:
Q  73 atttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 172  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  19003628 atttgacgggttttccccgatttgactaggtttgggtatgggttcgggttttccccgattacaaaatacgggtatgggacggataacggggatatatgta 19003727  T
Q  173 cccaccccaaaccc 186  Q
     |||||||||||||    
T  19003728 tccaccccaaaccc 19003741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 20774745 - 20774650
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtt 116  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20774745 taggcatggcaacaaaacccatactcgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggtatgggtt 20774650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 13020772 - 13020646
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  13020772 taggcatgacaacaaaacctatatctgcggttacctgtccgaaccaaactcaatctgacgggttttctccgtcttgactgggtttggttatgggtatggg 13020673  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtat 147  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13020672 ttttccccgatttcaaaacacgagtat 13020646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 190
Target Start/End: Original strand, 10778526 - 10778646
Alignment:
Q  70 tcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatag 169  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  10778526 tcaatttgacgggttttttccgctttgactgggtttgggtatgagtttaagtttttcccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacggggttatag 10778625  T
Q  170 gtacccaccccaaacccatac 190  Q
     || ||||||| |||||||||    
T  10778626 atatccaccccgaacccatac 10778646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 13798377 - 13798242
Alignment:
Q  61 gaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacg 160  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13798377 gaaccaaacccaatttaacgggttttccccggtatgactgggtttgggtatgagtttgggtttttcccgatttcaaaacacgggtatgagatgggtaacg 13798278  T
Q  161 ggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
     | |||||  || ||||||||||  |||||| ||||    
T  13798277 aggatatatttatccaccccaaattcatacctaaac 13798242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 89 - 176
Target Start/End: Original strand, 33293509 - 33293596
Alignment:
Q  89 ccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtaccca 176  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  33293509 ccgttttgattgggtttgggtatgagtttgggtttttcccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaatggggatataggaaccca 33293596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 91 - 232
Target Start/End: Original strand, 17091939 - 17092080
Alignment:
Q  91 gttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatac 190  Q
    ||||||| || |||||| |||| || || |||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||| |    
T  17091939 gttttgactgagtttggatatgagtatgagttttccccgattttataacacaggtatgggacgcgtaacgggtatataggcactcaccccgaacccatgc 17092038  T
Q  191 ccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    ||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  17092039 ccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatat 17092080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Original strand, 49740935 - 49741128
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||  ||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||              
T  49740935 gtaggcatggcaacaaaatccatacccgtggttatccacttgaaccaaactcaatttgacggattttcccctttttgactgggtttaggt---------- 49741024  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
      ||||||| ||||||||||| || ||||||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||     
T  49741025 --tttccccaatttcaaaacatggatatgggacgg-------gtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactac 49741115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23058573 - 23058470
Alignment:
Q  93 tttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccataccc 192  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||  || ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23058573 tttgactgggtttgagtatgggtttgagttttctccgatttcaaaatgcgagtacgagacgggtaacggggatataggtacccaccccgaacccataccc 23058474  T
Q  193 aaac 196  Q
    ||||    
T  23058473 aaac 23058470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 2514896 - 2514811
Alignment:
Q  62 aaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggttt-gggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggta 146  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2514896 aaccaaacccaacttgatgggttttccccgttttgattgggtttggggtatgagtttgggttttccccaatttcaaaacacgggta 2514811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39219346 - 39219234
Alignment:
Q  112 gggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcag 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||  |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||| ||    
T  39219346 gggtttgggttttccccgattttaaaacacgggtacggaacaagtaacggggatacatgtacccaccccgaacccatacccaaactcgttctaaatgtag 39219247  T
Q  212 aaaattattttat 224  Q
    ||||||| |||||    
T  39219246 aaaattaatttat 39219234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 187
Target Start/End: Original strand, 5293321 - 5293481
Alignment:
Q  26 atgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttc 125  Q
    ||||||||||||| ||||| || || |||||||  |||| |||| |||||| |||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||    
T  5293321 atgacaacaaaacacatacatgcggatacccgcctgaactaaacccaatttaacgggttttctccgctttgactgtgtttgagtatgagtttggg-tttc 5293419  T
Q  126 cccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaaccca 187  Q
     |||||||||||| || ||||  |||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||    
T  5293420 tccgatttcaaaatactggtacaggacggataacagggatatatgtacccactccaaaccca 5293481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 59 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 16903664 - 16903527
Alignment:
Q  59 tcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 158  Q
    ||||||||||  ||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||| |||||||| | |||| ||| |||| |||||||| ||| ||||  |||||    
T  16903664 tcgaaccaaatccaagttgacggattttcctcactttgattgggtttgggcatgggtttagatttttcccaattttaaaacacgagtacgggataggtaa 16903565  T
Q  159 cgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
     ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16903564 tggggatataggtacccaccccgaactcatacccaaac 16903527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Original strand, 16237286 - 16237389
Alignment:
Q  93 tttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccataccc 192  Q
    ||||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||  ||||| |||||||||||    
T  16237286 tttgactgagtttggatatgaatttgggttttccccgatttcaaaatacgggtaagggacgggtaacgaggatatatgtactaaccccgaacccataccc 16237385  T
Q  193 aaac 196  Q
    ||||    
T  16237386 aaac 16237389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 216
Target Start/End: Original strand, 48125686 - 48125788
Alignment:
Q  114 gtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaa 213  Q
    |||||| |||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| ||||    
T  48125686 gtttggatttttcctgattttaaaacacgggtacgggacgggtaacgaggatataggtatccaccccgaacccatacccaaactcgtcgcgaatgtagaa 48125785  T
Q  214 aat 216  Q
    |||    
T  48125786 aat 48125788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 192
Target Start/End: Original strand, 34060025 - 34060106
Alignment:
Q  111 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccataccc 192  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  34060025 tgggtatgagttttcctcgatttcaaaacacgggtatgagacggataacaggtatataggtacccactccgaacccataccc 34060106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Original strand, 35069871 - 35069974
Alignment:
Q  93 tttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccataccc 192  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||   |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  35069871 tttgactggatttgggtatgagtttgagttttccccgatttcataatacgggtacaagacgggtaacagggatatatgtacccaccccgaacccatactc 35069970  T
Q  193 aaac 196  Q
    ||||    
T  35069971 aaac 35069974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 196
Target Start/End: Original strand, 12718764 - 12718857
Alignment:
Q  103 tttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||| ||| | ||||||||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  12718764 tttgggtatgagtttggattttccccgatttcataatacgtgtacgagacgggtaacggaaatatatgtacccaccctgaacccatacccaaac 12718857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 218
Target Start/End: Original strand, 44632149 - 44632248
Alignment:
Q  119 ggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaatta 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||   || ||||| ||||||| |||| |||||  ||||||||    
T  44632149 ggttttctccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtgtatgggtatccaccgtgaatccatatccaaactcgtcctaaatgtcgaaaatta 44632248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 216
Target Start/End: Original strand, 41476901 - 41477057
Alignment:
Q  60 cgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaac 159  Q
    ||||||||||  | ||||| ||||||| |||| ||||| || |||||  |||| |||||||||||   |||||  |||| ||| ||| ||||||| ||||    
T  41476901 cgaaccaaacctattttgatgggtttttcccgctttgactgagtttgaatatgagtttgggtttttttcgattggaaaatacgagtacgggacggataac 41477000  T
Q  160 gggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaat 216  Q
    | | ||||| ||||||||||| || ||||||||||||  ||||| || |||||||||    
T  41477001 gtggatatatgtacccaccccgaatccatacccaaacccgtcccgaaagcagaaaat 41477057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 196
Target Start/End: Original strand, 42728895 - 42729029
Alignment:
Q  60 cgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaac 159  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||   |||| || |     
T  42728895 cgaaccaaacacaatttgacgggttat-cccgctttgatttggtttggatatgggttt-cgtttttcccgatttcaaaacatgggtacaagacgagtgat 42728992  T
Q  160 gggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    ||| |||| |||| | ||||| ||| |||||||||||    
T  42728993 ggggatatgggtaactaccccgaactcatacccaaac 42729029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 154 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23966919 - 23966840
Alignment:
Q  154 ggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatg-cagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||  | ||||||| |||||||||||||    
T  23966919 ggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaaattactttatgttgatat 23966840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 58 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 36617503 - 36617381
Alignment:
Q  58 ctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccg-ttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttc-aaaacacgggtatgggacggg 155  Q
    |||||||||||| | |||| | |||||||||| | |||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||      
T  36617503 ctcgaaccaaacccgatttaa-gggttttccctgcttttgattgggtttagatatgagtttgagttttccacgatttcaaaaacatgggtacgggacgaa 36617405  T
Q  156 taacgggtatataggtacccaccc 179  Q
    ||||| | ||||||||||||||||    
T  36617404 taacgagaatataggtacccaccc 36617381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 216
Target Start/End: Original strand, 48576061 - 48576223
Alignment:
Q  60 cgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttga------ttgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacg 153  Q
    |||||||||  ||| |||| ||||||||||| ||||||      |||||| |||||||||||| | ||||||||| || ||||||||| |||||| ||||    
T  48576061 cgaaccaaatccaaattgatgggttttccccattttgactaggtttgggtatgggtatgggttagagttttccccaatctcaaaacacaggtatgagacg 48576160  T
Q  154 ggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaat 216  Q
    ||||| ||| ||| | || ||||| |  ||||||  || ||||||||||| |||| |||||||    
T  48576161 ggtaatggggataaaagtgcccactctgaacccacgcctaaacttgtcccgaatgaagaaaat 48576223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 115
Target Start/End: Original strand, 34059059 - 34059152
Alignment:
Q  22 aggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggt 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||    ||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| | | |||||||||||||    
T  34059059 aggcatggcaacaaaacccatacccacggttatccgtccgaaccaaattcaatttgacgggttattcccgttttgactagatttgggtatgggt 34059152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 196
Target Start/End: Original strand, 10450065 - 10450144
Alignment:
Q  117 tgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    |||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  10450065 tgggctttccccaattttaaaatacgggtacggggcgggtaacagggatatatgtacccaccccgaactcatacccaaac 10450144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8880535 - 8880439
Alignment:
Q  113 ggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgc 209  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||| |||  |||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||   ||||||||||||||  |||||||||||    
T  8880535 ggtttgggttttcttcgatttaaaaacacgagtacaggacaggtaatggggataaaggtatccaccctggacccatacccaaacccgtcccaaatgc 8880439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 38686748 - 38686673
Alignment:
Q  114 gtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccata 189  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||  |  |||| ||||||||||| ||||||||    
T  38686748 gtttggattttccccgattttaaaatacgggtatgggacgaataacatggttatatgtacccaccccgaacccata 38686673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 208
Target Start/End: Original strand, 47644862 - 47644956
Alignment:
Q  113 ggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatg 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||| ||| ||| | ||||| ||||| ||| |||| ||| ||| ||||| ||||    
T  47644862 ggtttgggttttccccgatctcaaaacacaggtacgggacggataatggg-atagaagtacctaccccgaactcatatccatactcgtcccgaatg 47644956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 188
Target Start/End: Original strand, 45460010 - 45460131
Alignment:
Q  66 aaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtat 165  Q
    ||||||||||| |||| |||| | |  ||||| || ||||| ||||| |||||| |||||| | |||| ||||||| |||  || |||||||| ||| ||    
T  45460010 aaactcaattttacggttttttctcactttgactgagtttgagtatgagtttggattttcctcaattttaaaacacaggtcagg-acgggtaaaggggat 45460108  T
Q  166 ataggtacccaccccaaacccat 188  Q
    |||||| | ||||||||||||||    
T  45460109 ataggtcctcaccccaaacccat 45460131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 49098455 - 49098334
Alignment:
Q  24 gcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttt 123  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||   | |||||| |||   | ||| ||||||||| | | |||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  49098455 gcatgacaacaaaactcatacttatgggtatttgttcgaactaaatctattttaacgggtttttctcattttgattaggtttgggta-gggtttgagttt 49098357  T
Q  124 tccccgatttcaaaacacgggta 146  Q
    |  |||||||||||| |||||||    
T  49098356 tttccgatttcaaaatacgggta 49098334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 93 - 186
Target Start/End: Original strand, 48312686 - 48312779
Alignment:
Q  93 tttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaaccc 186  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  | |||  |||| ||||||| ||| | | | ||||||||||| |||||    
T  48312686 tttgattggatttgggtttggatttgggttttccccgattttaaaggatgggggtggggcgggtaatggggaaacatgtacccaccccgaaccc 48312779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 177
Target Start/End: Original strand, 25154837 - 25154893
Alignment:
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccac 177  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  25154837 tttttcccgatttcaaaacacgagtacgggacgagtaatggggatataagtacccac 25154893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 57)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Original strand, 24414046 - 24414253
Alignment:
Q  25 catgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggtttt 124  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24414046 catggcaacaaaacccatacctgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtatcggtttt 24414145  T
Q  125 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttat 224  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||| || |||||    
T  24414146 ccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttat 24414245  T
Q  225 gttgatat 232  Q
    ||||||||    
T  24414246 gttgatat 24414253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37106872 - 37106666
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  37106872 gtaggcatgacaacaaaactcatactcgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgagtttgggtatgggtatgg 37106773  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||      |||||||||| | |||||||     
T  37106772 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccactccgaacccataccc------gtcccaaatgtaaaaaattac 37106679  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||    
T  37106678 tttatgttgatat 37106666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9632566 - 9632354
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  9632566 gtaggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgggtttttcccgttttgaatgggtttgagtatgggtatgg 9632467  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||     
T  9632466 gttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaatgggtatataggtatccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactac 9632367  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||    
T  9632366 tttatgttgatat 9632354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13830915 - 13830704
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||    
T  13830915 gtaggtatgacaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgg 13830816  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||     
T  13830815 gttttcctcgatctcaaaacacgggtatgggac-ggtaacgggtatataagtacccaccccgaacccatactcaaacctgtcccaaatgtaaaaaattac 13830717  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||    
T  13830716 tttatgttgatat 13830704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 30847125 - 30846941
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  30847125 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 30847026  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaa 205  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  30847025 ttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaa 30846941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 31942095 - 31942307
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  31942095 taggtatgacaacaaaacccatacccgtggttacccgcccaaaccaaactcaatttgatgggtttttcccgctttgactgggtttggatatgggtttggg 31942194  T
Q  121 ttttccccgatttc-aaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
    || ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||     
T  31942195 ttatcctcgatttcaaaaacacgggtatgagacgggtaacaggtatataagtacccaccccaaacccataaccaaacctgtcacaaatgcagaaaactac 31942294  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    |||||| ||||||    
T  31942295 tttatgctgatat 31942307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 232
Target Start/End: Original strand, 7314586 - 7314769
Alignment:
Q  49 ggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatg 148  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  7314586 ggttaaccgcccgaaccaaactcaatttgacggattttccccgttttgactgggtttggatatgggtatgggttttccccgattttaaaatacgagtatg 7314685  T
Q  149 ggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  7314686 ggacgggtaacgggtatataggttcccaccccgaacccatacccacacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatat 7314769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 8915848 - 8916058
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||| | || |||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||||| ||||||| ||||    
T  8915848 taggtatggcaacaaaacccatacctgtggttatccgcccaaatcaaattcaatttgacggatttttcccgttttgactgagtttggatatgggtatggg 8915947  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| | |||||||||    
T  8915948 ttttctc-gatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccccgaacccatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaattatt 8916046  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  8916047 ttatgttgatat 8916058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 192
Target Start/End: Original strand, 37472679 - 37472840
Alignment:
Q  31 aacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccga 130  Q
    ||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  37472679 aacaaaacccatacccgcagttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgagtatggattttccccga 37472778  T
Q  131 tttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccataccc 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||    
T  37472779 tttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatttaggtacccacttcgaacccataccc 37472840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 36128016 - 36128228
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||  ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  36128016 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttactcgtccgaaccaaacctaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgtg 36128115  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatg-cagaaaattat 219  Q
     |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||  | |||| ||     
T  36128116 gtttccccgatctcgaaacacgggtatgggatgggtaacgggtatataggtactcaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactac 36128215  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||    
T  36128216 tttatgttgatat 36128228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Original strand, 13705264 - 13705482
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttga------ttgggtttgggtatgg 113  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||    
T  13705264 gtaggcatggcaacaaaactcatacccatggttacccgtccgaaccatacccaatttgacgggttttccccgttttgacagggtttgggtatgggtatgg 13705363  T
Q  114 gtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaa 213  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||   ||    
T  13705364 gtatgagttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacctaaacccgtcccaaatgtgaaa 13705463  T
Q  214 aattattttatgttgatat 232  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  13705464 aattactttatgttgatat 13705482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Original strand, 6027810 - 6028009
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||    
T  6027810 gtaggcatgacaacaaaacccatactcgtggttatccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgat------------tgggtttgg 6027897  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||||  ||||||||||| |||    
T  6027898 gttttccccgattttaaaacatgggtatgagacgggtaacaggtatataggtacccaccccgaacccatactcatacccgtcctgaatgcagaaaagtat 6027997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 10208341 - 10208551
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  ||| ||| |||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10208341 taggcatggcaacaaaactcatacccgtgattatccgcccgaaccaaagttaatttgacgg-ttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 10208439  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||  |||||||||| | ||||||| |    
T  10208440 ttttccccaatcttaaaacacgggtatgggacgggtaatggatatataggtacctaccccgaacccatactcaaaccagtcccaaatgtaaaaaattact 10208539  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||| ||||    
T  10208540 ttatgttaatat 10208551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 232
Target Start/End: Original strand, 44746047 - 44746230
Alignment:
Q  49 ggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatg 148  Q
    |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  44746047 ggttacccacccgtaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgattgagtttgggtatggatttgggttttccccgatttcaaaacacgaatatg 44746146  T
Q  149 ggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||| | ||||| |||||||    
T  44746147 ggacgggtaatgggtatatatgtacccacttcaaactcatactcaaacccgtcccaaatgtagaaaatcactttatcttgatat 44746230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37999656 - 37999451
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||   |||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||       
T  37999656 taggcatggcaacaaaacccatatccgtggttagtcgcccgaaccaaattcaatttgacgggtttcccccattttgactgggtatgggtatgggttt--- 37999560  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
       |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| | ||||||| |    
T  37999559 ---tccccgatctcaaaacacgggtatgagacgggtaacgggtatataagtacccaccccgaactcatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 37999463  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  37999462 ttatgttgatat 37999451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 19104747 - 19104959
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    |||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19104747 taggcatggcaacaaaacctatacatgtggttaccaatccgaatcaaacccaatttgatgggttttttccgttttgattgggtttgggtatgagtttggg 19104846  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgg----gtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaat 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||    |||||||| | |||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |||||  ||||| ||||||||||||    
T  19104847 ttttccccgatttccaaacacgggcctgtatgggatgtgtaacgggtatataggtatccacctcgaatccatactcaaacccgtcccgaatgcagaaaat 19104946  T
Q  217 tattttatgttga 229  Q
    || ||||||||||    
T  19104947 tactttatgttga 19104959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10920818 - 10920613
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  10920818 gtaggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgataggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgg 10920719  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
     ||||  ||||| |||||||||| |||||||       |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||||| | |||||||     
T  10920718 attttttccgatctcaaaacacgagtatggg-------acggatatataggtatccaccccgaacccatacccaaatccgtcccaaatgtaaaaaattac 10920626  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||    
T  10920625 tttatgttgatat 10920613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 45115734 - 45115526
Alignment:
Q  26 atgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggttt--gggttt 123  Q
    ||||||| |||||||||||  | ||||||  |  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  | ||||    
T  45115734 atgacaataaaacccatacccgcggttacttgtccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatatgagttt 45115635  T
Q  124 tccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatttta 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||   ||||   ||||||||| | |||||||  |||    
T  45115634 tcctcgatttcaaaacacgggtatgagacgggtaacaggtatataggtacccatcccgaacccatagttaaacccatcccaaatgtaaaaaattacatta 45115535  T
Q  224 tgttgatat 232  Q
    |||||||||    
T  45115534 tgttgatat 45115526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 12193736 - 12193948
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtg-gttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    |||||||| |||||||| ||||||  | | ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||| || ||     
T  12193736 taggcatggcaacaaaaaccatacccgcgcgttacccacccgagccaaacccaatttgacgggtttttccgattttgactgggtttgggtatgagtatgt 12193835  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | || ||||| ||| ||  |||||||||| | |||||||     
T  12193836 gtttttcccgatttcagaacacgggtatgggacgggtaatgggtatatagatacccacctcgaatccatatccatacccgtcccaaatgtaaaaaattac 12193935  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||    
T  12193936 tttatgttgatat 12193948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 12341779 - 12341648
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  | ||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  12341779 taggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgagtttgggtatgggtatggg 12341680  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggac 152  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12341679 ttttccccgatttcaaaacacaggtatgggac 12341648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 147
Target Start/End: Original strand, 18106029 - 18106155
Alignment:
Q  22 aggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaattt-gacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  18106029 aggcatgacaacaaaactcatatatgtggttacccgcccgaatcaaactcaattttgacggattttccccgttttgactgggtttggatatgggtatggg 18106128  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtat 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18106129 ttttccccgatctcaaaacacgggtat 18106155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 196
Target Start/End: Original strand, 35248336 - 35248470
Alignment:
Q  62 aaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgg 161  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35248336 aaccaaacccattttgatgggttttcctcactttgattgagtttgggtacgggtttgggttttccacgattacaaaacacgggtatgggacgggtaaagg 35248435  T
Q  162 gtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35248436 ggataaaggtacccaccccgaacccatacccaaac 35248470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 45256940 - 45256791
Alignment:
Q  83 ttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaa 182  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  45256940 tttttcccgttttgactgggtgtggatatgagtatgagttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacggttaatgggtatataagtacccaccccga 45256841  T
Q  183 acccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||    
T  45256840 acccatacctaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttattttgatat 45256791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 42797911 - 42798110
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| |||||| |||       
T  42797911 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaatctaatttgacgggtttttct-gttttgactgggtttgagtatggattt--- 42798006  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatg-cagaaaattat 219  Q
       |||||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||     
T  42798007 ---tcccc------aaaacacgggtatgagacgggtaacgggtatataagtacccaccccgaacccatacacaaacctgtcccaaatgtaaaaaaattac 42798097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 73 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22900921 - 22900772
Alignment:
Q  73 atttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 172  Q
    |||||||||||||||| |  ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||  ||    
T  22900921 atttgacgggttttcctcactttgacttggtctgggtatgggtttgggtttttcccgatttcaaaacacgggtatgggacgagtaacggggttatatata 22900822  T
Q  173 cccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatttt 222  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||  |||||||| | | |||||||||||    
T  22900821 cccaccccgaactcatacccatacccgtcccaaacgtaaaaaattatttt 22900772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Original strand, 38342501 - 38342604
Alignment:
Q  93 tttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccataccc 192  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38342501 tttgattgggtttggatatgggtttgagttttccccgattttaaaatacggatacgggacgggtaacggggatatatgtacccaccccgaacccataccc 38342600  T
Q  193 aaac 196  Q
    ||||    
T  38342601 aaac 38342604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15546871 - 15546725
Alignment:
Q  73 atttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 172  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||  ||    
T  15546871 atttgacgagttttccccgctttgactggatctgggcatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacatggttatatata 15546772  T
Q  173 cccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
    |||||||  |||||||||||| ||   ||||||||| | ||||||||    
T  15546771 cccaccctgaacccatacccatacccttcccaaatgtaaaaaattat 15546725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 43371660 - 43371557
Alignment:
Q  93 tttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccataccc 192  Q
    ||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  43371660 tttgactgagtttgggtattggtttgagttttccccgattttaaaatacgggtacgggacgggtaacggggatatatgtacccaccccaaactcataccc 43371561  T
Q  193 aaac 196  Q
    ||||    
T  43371560 aaac 43371557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14540956 - 14540749
Alignment:
Q  26 atgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaa-actcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggtttt 124  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||   ||  || | ||||||||||| ||||| |  ||||||| ||  ||| ||||||  || | |||||    
T  14540956 atgacaacaaaactcatactcgtggttacccgcctaaattaatattcaatttgacgagtttttcttgttttgactgaattttggtatgaattggagtttt 14540857  T
Q  125 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttat 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |  || |||||| ||||   ||||| || | ||||||||| |||||    
T  14540856 ccccgatttcaaaacacgggtatgagacaggtaacgggtatataggcacccactcggaatccatactcaaatccgtcccgaacgtagaaaattactttat 14540757  T
Q  225 gttgatat 232  Q
    ||||||||    
T  14540756 gttgatat 14540749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 192
Target Start/End: Original strand, 24051586 - 24051705
Alignment:
Q  73 atttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 172  Q
    |||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| || ||||| |||    
T  24051586 atttgatggattttctccgatttaattgggtttgggtatgggtttgggatttctccgattttaaaatacgagtatgggacgggtaacagggatatatgta 24051685  T
Q  173 cccaccccaaacccataccc 192  Q
    || ||||| |||||||||||    
T  24051686 cctaccccgaacccataccc 24051705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 10212585 - 10212444
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||| |  ||| | | | |||||||| ||||| || ||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  10212585 taggcatgacaacaatacccgtacctgtgggtacccgcccatacccaccccgatttgacgagtttttcctgttttgactgggttttggtatgagtttggg 10212486  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacggg 162  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||    
T  10212485 ttttccccgatttccaaacacggttacgggacaggtaacggg 10212444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 14331648 - 14331531
Alignment:
Q  73 atttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 172  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||      ||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  14331648 atttgacgggttttccccggtttgactaggtttgggtatgggttt------tcccctatttaaaaatacaggtatgggacgggtaacggggatatatgta 14331555  T
Q  173 cccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    ||||| || |||||||||||||||    
T  14331554 cccactccgaacccatacccaaac 14331531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 25210466 - 25210381
Alignment:
Q  111 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25210466 tgggtttaggtttttcccgactttaaaacacgggtatgggacgggtaacgaggatatatgtacccaccccaaacccataccaaaac 25210381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 26755920 - 26755764
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||||||||||||||| | |   ||| |||| || | |||||| | | |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26755920 gtaggcatgacaacaaaacccgtgcccatgggtacctgcccaaaccaaccccgatttgacgggtttttcccgatttgactgggtttgggtatgagtttgg 26755821  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtaccca 176  Q
    ||||||  |||||| |||| | |||||| |||||  ||||||| ||||| |||||||    
T  26755820 gttttcttcgattttaaaatatgggtatcggacgattaacggggatatatgtaccca 26755764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 59 - 159
Target Start/End: Original strand, 40734532 - 40734632
Alignment:
Q  59 tcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 158  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  40734532 tcgaaccaaattcaatttgacgggttttatccgctttgatttggtttgggtatgaatttgggttttcagcgattttcaaacacgggtatgagacgggtaa 40734631  T
Q  159 c 159  Q
    |    
T  40734632 c 40734632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 3547260 - 3547170
Alignment:
Q  106 gggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  3547260 gggtatggatttgggtttttaccgatttcaaaatacgggtacgggacgggtaacggagatatatgtacccaccccgaacccatatccaaac 3547170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 44057990 - 44057886
Alignment:
Q  93 tttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtaccca-ccccaaacccatacc 191  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  44057990 tttgactgggtttgggtacgagtttggattttccctgatttcaaaataccggtacgggacgggtaatggggatatatgtacccacccccgaacccatacc 44057891  T
Q  192 caaac 196  Q
    |||||    
T  44057890 caaac 44057886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18485737 - 18485634
Alignment:
Q  111 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgca 210  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  18485737 tgggtttgggttatcctcgattttaaaatacgggtacagtacgggtaacggggatatatgtacccaccctgaacccatacccaaaccttacccaaatgca 18485638  T
Q  211 gaaa 214  Q
    ||||    
T  18485637 gaaa 18485634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35965423 - 35965319
Alignment:
Q  111 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgca 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||| ||| | |||||||| || |||||||||||||||  ||||| |||| |    
T  35965423 tgggtttgagttttccccgatttcaaaacacgggtat-ggatgtgtaatggggatacatgtacccactccgaacccatacccaaacccgtcccgaatgta 35965325  T
Q  211 gaaaat 216  Q
    ||||||    
T  35965324 gaaaat 35965319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 4428051 - 4427928
Alignment:
Q  73 atttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 172  Q
    |||| ||||||||| |||  ||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||| |||||  ||||| | |    
T  4428051 atttaacgggtttttcccaatttgactgaatttgagtatgggtttgggttttccccgacttcataatacgggtaagggacgggcaacggtgatatatgga 4427952  T
Q  173 cccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
     ||||| | |||||||||||||||    
T  4427951 tccacctcgaacccatacccaaac 4427928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 13954893 - 13954802
Alignment:
Q  52 tacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgg 143  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  13954893 tacccgctctaaccaaacgcaaattgacaggttttctacgctttgactgggtttgggtatgtgtttgaattttccccgattttaaaacacgg 13954802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 14096100 - 14096009
Alignment:
Q  52 tacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgg 143  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  14096100 tacccgctctaaccaaacgcaaattgacaggttttctacgctttgactgggtttgggtatgtgtttgaattttccccgattttaaaacacgg 14096009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 186
Target Start/End: Original strand, 35409167 - 35409242
Alignment:
Q  111 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaaccc 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  35409167 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacactagtacgggaaaggtaacgtagatataggtacccaccccaaaccc 35409242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 191
Target Start/End: Original strand, 6164472 - 6164553
Alignment:
Q  110 atgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacc 191  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  6164472 atgggtttgggttttccccaatttcaaaatttgggtacgggacgggtaacggtgatatatgtacccaccccgaactcatacc 6164553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 186
Target Start/End: Original strand, 37309695 - 37309818
Alignment:
Q  62 aaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgg 161  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||| |  ||||||||||| ||||| ||||| | | ||||||| ||| ||||||||||| | |||||     
T  37309695 aaccaaattcaatttgatgggtttttcccgctttgactaagtttgggtatgagtttgagtttttctcaatttcaatacatgggtatgggac-gataacga 37309793  T
Q  162 gtatataggtacccaccccaaaccc 186  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||    
T  37309794 ggatatatgtacccacctcaaaccc 37309818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 107
Target Start/End: Original strand, 29656664 - 29656751
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgg 107  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||| | | |||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  29656664 gtaggcacggcaacaaaactcatacttataggtacccgccagaaccaaactcattttgactggttttccccattttgcttgggtttgg 29656751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Original strand, 4961479 - 4961556
Alignment:
Q  139 cacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaat 216  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||| |||  |||||||    
T  4961479 cacgggtatgggacgtgtaacagggatataggtacacacctcgaacccatacccaaactcgtcccgaatatagaaaat 4961556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 196
Target Start/End: Original strand, 17845391 - 17845476
Alignment:
Q  111 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  17845391 tgggtttgagttttcttcgatttcaaaacacgagtatgagaccggtaatggacatataagtacccacccttaacccatacccaaac 17845476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 30697033 - 30696916
Alignment:
Q  91 gttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatac 190  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||   ||||| |||||| || || | |||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  30697033 gttttgactgggtttgagtatgtgtttaggttttcattgattttaaaacatggatacgagacgggtaacagagatatatgtacccaccccgaactcatac 30696934  T
Q  191 ccaaacttgtcccaaatg 208  Q
    |||||| | |||||||||    
T  30696933 ccaaacctatcccaaatg 30696916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 173
Target Start/End: Original strand, 16226759 - 16226799
Alignment:
Q  133 tcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtac 173  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16226759 tcaaaacaagggtatgggacgggtaacgggtatataggtac 16226799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 30979032 - 30978931
Alignment:
Q  93 tttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccataccc 192  Q
    ||||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||   || ||||| | ||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  30979032 tttgactgggtttgaatatgagtttgggtttttcccgatttcaaaatacgggtacgg--aggataacgaggatatatgtatccaccccgaacccataccc 30978935  T
Q  193 aaac 196  Q
    ||||    
T  30978934 aaac 30978931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 33175327 - 33175252
Alignment:
Q  102 gtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccac 177  Q
    |||||| |||| | || ||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  33175327 gtttggatatgagatttggttttctccgattttaaaacacgggtacgggtcgggtagcgtgtatataggtacccac 33175252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 177
Target Start/End: Original strand, 34214582 - 34214723
Alignment:
Q  35 aaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttc 134  Q
    |||||||||| || || ||| | ||| ||| |||| ||||||||||| |||| || | |||||||||||||  ||||| ||||| ||||| | | |||||    
T  34214582 aaacccatacatgcgggtactcactcaaactaaacccaatttgacggttttttcc-gctttgattgggtttttgtatgagtttgagtttttctcaatttc 34214680  T
Q  135 aaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccac 177  Q
    |||||||||||| |||||  ||| ||| ||||| || ||||||    
T  34214681 aaaacacgggtacgggacatgtatcggttatattggcacccac 34214723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 117
Target Start/End: Original strand, 42102646 - 42102690
Alignment:
Q  73 atttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggttt 117  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42102646 atttgatggattttccccgatttgattgggtttgggtatgggttt 42102690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 42576701 - 42576667
Alignment:
Q  87 ccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggt 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42576701 ccccgatttgattgggtttgggtatgggtttgggt 42576667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 178
Target Start/End: Original strand, 35510433 - 35510510
Alignment:
Q  101 ggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccacc 178  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| | ||   ||||||||| | | ||||||||| |||||    
T  35510433 ggtttgggtaagagtttgggttttccccaatttcaaaacacagatacaagacgggtaatgaggatataggtatccacc 35510510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 231
Target Start/End: Original strand, 18106162 - 18106210
Alignment:
Q  183 acccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgata 231  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18106162 acccatacccgaacctgttccaaatgtaaaaaattattttatgttgata 18106210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 69)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4921004 - 4920793
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  4921004 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttctccgttttgactgggtttggttatgggtatggg 4920905  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| |    
T  4920904 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtatccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 4920805  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  4920804 ttatgttgatat 4920793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 49 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4583269 - 4583086
Alignment:
Q  49 ggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatg 148  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4583269 ggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttggatatgggtatgggttttccccgatttcaaaacacgggtatg 4583170  T
Q  149 ggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  4583169 ggacgggtaacgggtatataggttcccaccccaaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatat 4583086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Original strand, 5908598 - 5908810
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  5908598 gtaggcatggcaacaaaatccatacccgtggttatccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccattttgattgggtttgggtatgggtatga 5908697  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||     
T  5908698 gttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatatgtacacaccccaaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattac 5908797  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||    
T  5908798 tttatgttgatat 5908810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 29245861 - 29246069
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||     
T  29245861 gtagacatgacaacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactaggtttgggtatgggtatga 29245960  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| | ||||||||    
T  29245961 gttttctccgatttcaaaacacgggtatgggacgaataacatgtatataggtacccaccccaaacccatacccatacccatcccaaatgtaaaaaattat 29246060  T
Q  220 tttatgttg 228  Q
    |||||||||    
T  29246061 tttatgttg 29246069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15890384 - 15890174
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||| || ||||    
T  15890384 taggcatgacaacaaaacccatactcgcggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggtttttcccgttttgactaggtttggctatgtgtatggg 15890285  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||| |    
T  15890284 ttttctccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtaccca-cccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattact 15890186  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  15890185 ttatgttgatat 15890174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40517984 - 40517773
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  40517984 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcctgaaccaaattcaatttgacggatttttcccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 40517885  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||  |||||||| | | |||||||||    
T  40517884 ttttccccgatcccaaaacacgggtatgggatgggtaacgggtatatagttacccaccccgaacccatactcaaacccgtcccaaaggtaaaaaattatt 40517785  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  40517784 ttatgttgatat 40517773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 232
Target Start/End: Original strand, 12834495 - 12834696
Alignment:
Q  31 aacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccga 130  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  12834495 aacaaaacccatacatgtggttacccgtccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgggttttctccaa 12834594  T
Q  131 tttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgat 230  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  12834595 tttcaaaacatggatatgggacgggtaacaggtatataggtacctaccccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattaatttatgttgat 12834694  T
Q  231 at 232  Q
    ||    
T  12834695 at 12834696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 184
Target Start/End: Original strand, 33727911 - 33728075
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  33727911 gtaggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggattttccccgttttgattgggtttggatatgggtatgg 33728010  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaac 184  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33728011 attttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaac 33728075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 232
Target Start/End: Original strand, 12866471 - 12866673
Alignment:
Q  30 caacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccg 129  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  12866471 caacaaaacccatacatgtggttacccgtccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgagttttctccg 12866570  T
Q  130 atttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttga 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  12866571 atttcaaaacatgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccgcgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttga 12866670  T
Q  230 tat 232  Q
    |||    
T  12866671 tat 12866673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10127255 - 10127058
Alignment:
Q  18 acgtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggttt 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  10127255 acgtaggcatgacaacaaaatccatacccgtggttatccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtat 10127156  T
Q  118 gggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaatt 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||    
T  10127155 gggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacg-------ggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaatt 10127063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 17853204 - 17853414
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  | |||||||| |  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  17853204 taggcatggcaacaaaacgcatacccgcggttacccacctgaaccaaacctaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatggatatggg 17853303  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||| |    
T  17853304 ttttccccgatttc-aaacacgggtatgggacgggtaacggatatatagatacccactccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattact 17853402  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  17853403 ttatgttgatat 17853414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Original strand, 22694817 - 22695023
Alignment:
Q  25 catgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggtttt 124  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||     
T  22694817 catggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggaattttcccgttttaactgggtttgggtatgggtatgggttt- 22694915  T
Q  125 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  22694916 ccccgatctcaaaatacgggtatgggacgactaacgggtatagaggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattattttat 22695015  T
Q  225 gttgatat 232  Q
    ||||||||    
T  22695016 gttgatat 22695023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Original strand, 42987390 - 42987601
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||| | |||  ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||| |||| |||    
T  42987390 gtaggcatggcaacaaaacccatattcgtggt-atccgtccgaaccaaattcaatttggcgggtttttcccgttttgactgagtttgggtacgggtatgg 42987488  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||    
T  42987489 attttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgtgtaacggatatataggtacccatcccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattat 42987588  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||    
T  42987589 tttatgttgatat 42987601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 195
Target Start/End: Original strand, 20973410 - 20973581
Alignment:
Q  24 gcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttt 123  Q
    ||||| |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  20973410 gcatggcaacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaacccattctgacgggttttccccgttttgactgggtttggttatgggtatgggttt 20973509  T
Q  124 tccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaa 195  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20973510 tccccgattttcaaacacgggtatgggatgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaa 20973581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30996773 - 30996563
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |  ||||| |||  |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  30996773 taggcatggcaacaaaacccatatctacggttatccgtccgaaccaaacccaatttgacggattttccc-gttttgactgggtttgggtatgagtatggg 30996675  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||  |||||||||| | ||||||| |    
T  30996674 ttttctccgattttaaaacacgagtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaacacacacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 30996575  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||| ||||||||    
T  30996574 ttaagttgatat 30996563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 232
Target Start/End: Original strand, 6092445 - 6092640
Alignment:
Q  26 atgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttc 125  Q
    ||||||||||||| |||||    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  6092445 atgacaacaaaactcataccctaggttacccgcccgaaccaaattcaatttaacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtatgggttttt 6092544  T
Q  126 cccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatg 225  Q
    |||||| |||||||           |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||| | ||||||| ||||||    
T  6092545 cccgatctcaaaac-----------acgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaatccgtcccaaatgtaaaaaattactttatg 6092633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 13401915 - 13402125
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| | ||||||||||||||| || |    
T  13401915 taggcatggcaacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggattttttccgttttgactaggtttgggtatgggtatgag 13402014  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||| | ||  |||||||||| | ||||||| |    
T  13402015 tttttcccgattttcaaacacgggtatggaacgggtaacgggtatttaggtacccactccgaaccca-accgatacccgtcccaaatgtaaaaaattact 13402113  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  13402114 ttatgttgatat 13402125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6369873 - 6369665
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||| || |    
T  6369873 taggcatgacaacaaaactcatatttatggttacccgctcgaaccaaacctaatttgacggttttttctcgttttgattgagtttgggcatgggtatgag 6369774  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||   |||  |||| ||||| | ||||||| |    
T  6369773 ttttccctgatttcaaaatacgagtatggga-gggtaacgtgtatatatgtacccaccccgaacccatactttaacccgtccaaaatgtaaaaaattact 6369675  T
Q  221 ttatgttgat 230  Q
    ||||||||||    
T  6369674 ttatgttgat 6369665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18207196 - 18206985
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| | | |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  18207196 taggcatggcaacaaaactcatacccgtggttacccacccaaaccaaacccaatttgacgtgtttttcccgttttgactgggtttgggcatgagtttggg 18207097  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaatta-t 219  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||  ||||| |||| ||||||||| |    
T  18207096 ttttcctcgatttcaaaactcgtgtatgggacaggtaacaggtatataggtaccca-cccgaacccatattcaaacccgtcccgaatgtagaaaattact 18206998  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    | |||||||||||    
T  18206997 tctatgttgatat 18206985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 195
Target Start/End: Original strand, 28568931 - 28569106
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||| || |||| | |||||  ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  28568931 gtaggcatggcaacaaaacccatgttcgtgggtagccgcccaaaccatcctcgatttgacgggttttccctgatttgactgggtttgggtatgagtttgg 28569030  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaa 195  Q
     ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28569031 attttccccgatttcaaaatgcgggtacgggacgggtaacggggatataggtacccaccccgaacccatacccaaa 28569106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 6155831 - 6156040
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| || ||||| || | || ||||||   ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  6155831 taggcatggcaacaaaactcatacctgcggttatccacccgtaccaaatcaaatttaacgggttttcttcgttttgactgggtttgggtatgtgtttggg 6155930  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||||  |||||||| |    
T  6155931 ttttccccgatttcaaaacacgggtataggacaggtaa--ggtatatatgtacccaccccgaacccatacccaaaaccgtcacaaatgttgaaaattact 6156028  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||| ||||    
T  6156029 ttatgtttatat 6156040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 38973059 - 38972925
Alignment:
Q  62 aaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgg 161  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  38973059 aaccaaactcattttgacaggttttccccgttttgactgggtttaggtatgagtttgggtttttcccgatttcaaaacatgggtatgggataggtaacgg 38972960  T
Q  162 gtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  38972959 gaatataggtacccaccccgaacccatactcaaac 38972925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 232
Target Start/End: Original strand, 2412681 - 2412848
Alignment:
Q  65 caaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggta 164  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||    
T  2412681 caaattcaatttgacggattttccccattttgattgagtttgggtatgggtttgaatttttcccaatttcaaaacacgggtatgggataaataacgggta 2412780  T
Q  165 tataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    |||| ||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  2412781 tatatgtacccatcctgaaccaatacccaaactcgtcccgtatgcagaaaattactttatattgatat 2412848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 35311991 - 35311789
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||||||| ||||| ||||   | |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| || |||||||||||| | |       
T  35311991 taggcatgacaataaaactcatatccgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggattttttccgttttgactgagtttgggtatggatat--- 35311895  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| || ||  |||||||||| | |||||||||    
T  35311894 ------ccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacagatatataggtacccactccgaacccatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaattatt 35311801  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  35311800 ttatgttgatat 35311789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Original strand, 40187580 - 40187770
Alignment:
Q  33 caaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatt 132  Q
    |||||| ||||| || || ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| |||    
T  40187580 caaaactcatacctgcgggtacccgtccgaaccaaactcattttgacgggttttcctcgctttgactgggtttggaaatgagtttgggttttccccaatt 40187679  T
Q  133 tcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttat 224  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||  || ||||||| |||||||||||| ||||| |||  ||||||||| |||||    
T  40187680 tcaaaacacgggtgcgagacgggtaacggagatataggtattca-cccaaactcatacccaaactcgtcccgaatatagaaaattaatttat 40187770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 71 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28045783 - 28045623
Alignment:
Q  71 caatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatagg 170  Q
    ||||||||||  |||| ||| |||||| || |||| ||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  28045783 caatttgacgtatttttcccattttgactgtgtttaggtatgggtatgggtttttccctaattcaaaacacgaatatgggacgggtaacgggtatatagg 28045684  T
Q  171 tacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  28045683 taccca-cccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatat 28045623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 62 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 2681353 - 2681219
Alignment:
Q  62 aaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgg 161  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||| ||    
T  2681353 aaccaacctcaatttgacgggttttccccgatttgactgagtttgggcatgagtttgggttttccccgatttcaaaatacaggtacgggatgggtaatgg 2681254  T
Q  162 gtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    | ||||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2681253 ggatatgagtatccaccccgaacccatacccaaac 2681219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 196
Target Start/End: Original strand, 23044933 - 23045077
Alignment:
Q  52 tacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatggga 151  Q
    ||||||| | |||||| | | |||||||||||||| |||  ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  23044933 tacccgcccaaaccaaccccgatttgacgggtttttcccaatttgactgagtttgggtatgggtttaggttttccccgatttcaaaatacgggtacggga 23045032  T
Q  152 cgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
     |||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  23045033 tgggtaacggagatatatgtacccaccccgaacccataccaaaac 23045077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 29665148 - 29664974
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaa-cccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttg 118  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  29665148 gtagacatgacaacaaaaacccatatttgtgggtatccgcttgaaccaaattcaatttgacgggtttttcc-gctttgattgagtttgtgtatgagtttg 29665050  T
Q  119 ggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  29665049 ggttctcc--gatttcaaaacacgggtacatgatgggtaacggggatataggtacccacttcgaactcatacccaaac 29664974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 35193912 - 35194111
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||  ||| |||||||||             
T  35193912 taggtatggcaacaaaactcatactcgtggttacccgcccaaatcaaacccaatttgacggattttttccgttttggctggatttgggtat--------- 35194002  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
       || | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| |||| ||||||||| |    
T  35194003 ---tctctgtttttaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaactcatactcaaacccgtcccgaatgtagaaaattact 35194099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 232
Target Start/End: Original strand, 38006470 - 38006591
Alignment:
Q  111 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgca 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||      
T  38006470 tgggtttgggttttccccaatttcaaaatacgggtatgggacgcgtaacagatatataggtacccaccccgaacccatacccaaatccgtcccgaatgtt 38006569  T
Q  211 gaaaattattttatgttgatat 232  Q
    |||||||| |||||||| ||||    
T  38006570 gaaaattaatttatgttaatat 38006591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Original strand, 16311204 - 16311372
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    ||||||| |||||||||| ||||   | || |||||||  |||||||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||| |    
T  16311204 taggcataacaacaaaactcatatccgcgggtacccgcctgaaccaaacctaatttgacggttttttcccgctttgattgggtttggatatgagtttgag 16311303  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccata 189  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||| | ||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16311304 ttttttccgatttcaaaacacgagtacgagacggataacagggatataggtacccaccccgaacccata 16311372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 39422525 - 39422394
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    |||| |||| ||||||| | ||||| ||||| || |||| ||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  39422525 gtagacatggcaacaaagctcatacctgtgggtaaccgcccgaaccacacccaaattgacaggttttccccgctttgattgggtttggatatgagtttgg 39422426  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatggga 151  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  39422425 gtttttctcgatttcaaaacacgggtatggga 39422394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12447546 - 12447348
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||               
T  12447546 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccacccgaaccaaacccaatttgacggattt-ccccattttgactgggtttgggt----------- 12447459  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
     |||||  ||||  ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||  |||||| || |    
T  12447458 -tttccttgattgtaaaacacaggtatgggacaggtaatgggtatataggtacccaccccgaacctatacccaaacccgtcccaaatatagaaaactact 12447360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 142
Target Start/End: Original strand, 3564655 - 3564770
Alignment:
Q  25 catgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggtttt 124  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  3564655 catgacaacaaaatccatactcgcggtt-cccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccc-gttttgactgggtttgggtatgggtatggatttt 3564752  T
Q  125 ccccgatttcaaaacacg 142  Q
    | ||||||||||||||||    
T  3564753 ctccgatttcaaaacacg 3564770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 12915650 - 12915476
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| | ||||||   | ||||||||| ||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12915650 taggcatgacaacaaaatccatgcttatgggtacccgcccaaaccaacaccgatttgacggattt-ccccgatttgactggggttgggtatgggtttggg 12915552  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    |||| |||||||||| || || || ||||||| ||||| ||| ||| | |||||||| || || ||||||||||||    
T  12915551 tttttcccgatttcataatacaggcatgggacaggtaatggggatacatgtacccactccgaagccatacccaaac 12915476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2985235 - 2985114
Alignment:
Q  111 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgca 210  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||  |||| | |||  |    
T  2985235 tgggtttgagttttctccgatttcaagacatgggtttgggacgggtaacgggtatataggtactcatcccgaaaccatacccaaatctgtctcgaatata 2985136  T
Q  211 gaaaattattttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  2985135 gaaaattattttatattgatat 2985114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 232
Target Start/End: Original strand, 8453376 - 8453496
Alignment:
Q  112 gggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatac-ccaaacttgtcccaaatgca 210  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||  ||||| | ||||| |||||||||| |    
T  8453376 gggtttgggctttccc-gatttcaaaacacgggtatgggatgggtaacagatatataggtacacaccccaaagtcatactcaaaactcgtcccaaatgta 8453474  T
Q  211 gaaaattattttatgttgatat 232  Q
    |||||||| |||||||| ||||    
T  8453475 gaaaattagtttatgttaatat 8453496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 123
Target Start/End: Original strand, 42717551 - 42717643
Alignment:
Q  31 aacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttt 123  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  42717551 aacaaaactcatacctgtggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggtttttcccgttttgactggatttgggtatgggtatgggttt 42717643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 195
Target Start/End: Original strand, 27900388 - 27900486
Alignment:
Q  97 attgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaa 195  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  27900388 attgggtttggatataggtttgagtttttcccgatttcaaaacatgggtatgggacgggtaatgtggatataggtacccatctcgaacccatacccaaa 27900486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 192
Target Start/End: Original strand, 10822531 - 10822608
Alignment:
Q  115 tttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccataccc 192  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10822531 tttgggttttctccgatttcaaaacacgggtataggacgggtaacggggttatatgtacccaccccgaacccataccc 10822608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1218812 - 1218724
Alignment:
Q  142 gggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgat 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  1218812 gggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccactccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgat 1218724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 152
Target Start/End: Original strand, 27088284 - 27088413
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||| ||||||  ||| ||| || | ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| | | |||||||||||| |||| ||    
T  27088284 taggcatggcaacaaaatccatacccgtgattatccacccgaaccaaactcattttgacgg--tttccccgttttaactaggtttgggtatgtgtttagg 27088381  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggac 152  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  27088382 ttttcctcgattttaagacacgggtatgggac 27088413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24207857 - 24207736
Alignment:
Q  25 catgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggtttt 124  Q
    |||| |||||||| ||||||  | || ||||| | ||||||||||| | |||||||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24207857 catggcaacaaaatccatacccgcgggtacccacccgaaccaaactaagtttgacgatttttccc-gctttgattgagtttgggtatgggtttgagtttt 24207759  T
Q  125 ccccgatttcaaaacacgggtat 147  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  24207758 ccccgatttcaaaacacaggtat 24207736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 196
Target Start/End: Original strand, 32574879 - 32575024
Alignment:
Q  52 tacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgat-tgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatggg 150  Q
    |||| ||||||||||||  || |||||| |||||| |||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  32574879 tacctgctcgaaccaaatccattttgacaggtttttcccgctttgacctgggtttggggacaggtttgggttttccccgatttcaaaacacagatacggg 32574978  T
Q  151 acgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    | |||||||  | ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  32574979 atgggtaacatggatatatgtacccatcccgaacccaaacccaaac 32575024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 1218899 - 1218804
Alignment:
Q  25 catgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||  || |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  1218899 catggcaacaaaacccatacccgcggttacccgctcgaaccaaatccaatttgacgagttttttccattttgactgggtttgggtatgggtatggg 1218804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6810321 - 6810161
Alignment:
Q  24 gcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttt 123  Q
    ||||| ||||||||||||||   |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||            ||| ||||||||||    
T  6810321 gcatggcaacaaaacccatatccgtggatacccgtccgaaccaaactcaatttgacggattttttccgctttga------------atgagtttgggttt 6810234  T
Q  124 tccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    |||||||||| | |||||||||| || |||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  6810233 tccccgattttagaacacgggtacggaacgggtaacgaggatataagtactcaccccgaacccatacccaaac 6810161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 196
Target Start/End: Original strand, 12712561 - 12712643
Alignment:
Q  114 gtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  12712561 gtttgggttttctccgatttcaaaatacgggtacgggacggataacggagatatatgtacccacctcgaacccatacccaaac 12712643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 43523874 - 43523801
Alignment:
Q  73 atttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggta 146  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43523874 atttgacggatttttcccgatttgactgagtttgggtatgagtttgggttttccccgatttcaaaatacgggta 43523801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 196
Target Start/End: Original strand, 12773825 - 12773907
Alignment:
Q  114 gtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||    
T  12773825 gtttgggttttctccgatttcaaaatacgggtacgggacggataacggagatatatgtacccacctcgaacccatactcaaac 12773907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 146
Target Start/End: Original strand, 18116480 - 18116553
Alignment:
Q  73 atttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggta 146  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18116480 atttgacggatttttcccgatttgactgagtttgggtatgagtttgggttttctccgatttcaaaatacgggta 18116553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Original strand, 18451834 - 18451910
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttga 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  18451834 taggcatgacaacaaaacccatacacgtgggttcccgtccgaaccaaacccagtttgacgggttttccccgatttga 18451910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 121 - 232
Target Start/End: Original strand, 27302746 - 27302857
Alignment:
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||   |||||||||||||||||| || |||||  || ||  |||||||| | | ||||||| |    
T  27302746 ttttccccgatttcaaaacacggatatgagacggataacaaatatataggtacccaccccgaatccatagtcatacacgtcccaaacgtaaaaaattact 27302845  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||| ||||    
T  27302846 ttatgttaatat 27302857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 157 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30115525 - 30115450
Alignment:
Q  157 aacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  |||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  30115525 aacgggtatattggtacccatcccgaacccatattcaaacccgtcccgaatgcataaaattattttatgttgatat 30115450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15564721 - 15564603
Alignment:
Q  114 gtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaa 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | | | |||||||| |||||||||||||||  |||  || ||| ||| ||||| |||||| ||||| |||| ||||    
T  15564721 gtttgggtttttcccgatttcaagaaatgcgtatgggatgggtaacgggtatatctgtattcatcccgaactcatactcaaactcgtcccgaatgtagaa 15564622  T
Q  214 aattattttatgttgatat 232  Q
    ||||| ||||  |||||||    
T  15564621 aattactttacattgatat 15564603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 12251082 - 12250973
Alignment:
Q  87 ccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaaccc 186  Q
    ||||| ||||| | |||| ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |  ||||| |||||||| |  |||||    
T  12251082 ccccgatttgactaggttcgggtatgggcttggatttttcacgatttcaaaatacgggtaccggacgggtaacagagatatatgtacccactctgaaccc 12250983  T
Q  187 atacccaaac 196  Q
    ||||||||||    
T  12250982 atacccaaac 12250973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 232
Target Start/End: Original strand, 27088414 - 27088474
Alignment:
Q  172 acccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  ||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  27088414 acccaccccgaacccatacccaaacccgtctcgaatgtagaaaattattttatgttgatat 27088474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 142
Target Start/End: Original strand, 33420297 - 33420379
Alignment:
Q  60 cgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacg 142  Q
    ||||||||||  | |||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| || |||||||| |||||    
T  33420297 cgaaccaaacctattttgacgggtatttcccattttgattgggtttgagtatgagtttggatttttcctgatttcaagacacg 33420379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 12457641 - 12457596
Alignment:
Q  63 accaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttggg 108  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  12457641 accaaacccaatttgacggggtttccccgctttgattgggtttggg 12457596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20634279 - 20634186
Alignment:
Q  102 gtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaa 195  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||| |||| |||| |||| |||| |||||||||  || ||||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  20634279 gtttgggtatgagtttcagttttccccaattttaaaatacggatatgagacgggtaatagggatatatgcactcaccccgaacccatacccaaa 20634186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20650393 - 20650300
Alignment:
Q  102 gtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaa 195  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||| |||| |||| |||| |||| |||||||||  || ||||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  20650393 gtttgggtatgagtttcagttttccccaattttaaaatacggatatgagacgggtaatagggatatatgcactcaccccgaacccatacccaaa 20650300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 12457605 - 12457557
Alignment:
Q  111 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaac 159  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12457605 tgggtttggggtttcctcgatttcaaaatacgggtatgggacaggtaac 12457557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 30116856 - 30116816
Alignment:
Q  123 ttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggt 163  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30116856 ttccccgatttcaaaacacgagtatgggacggttaacgggt 30116816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 35167362 - 35167247
Alignment:
Q  81 ggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccacccc 180  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||  ||| |||||||   |||||||||||||||| |   ||| ||||  ||| ||||| || | |||| |    
T  35167362 ggttttccctgttttgattgggtttgaatatgaatttcggttttctatgatttcaaaacacggggacaagacaggtagtggggatatatgtgcgcacctc 35167263  T
Q  181 aaacccatacccaaac 196  Q
    ||||||||||||||||    
T  35167262 aaacccatacccaaac 35167247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17153254 - 17153152
Alignment:
Q  114 gtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaa 213  Q
    ||||| |||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||    ||||| |||| || |||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  17153254 gtttgagttttttccgattttaaaacatgggtacgggacggataactatgatatatgtactcatcccaaacccatacccaaacccgtcccgaatgtagaa 17153155  T
Q  214 aat 216  Q
    |||    
T  17153154 aat 17153152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 120 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 8020694 - 8020641
Alignment:
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtac 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||| || ||||||||||    
T  8020694 gttttccccgatttcaaaacacgggtactgaatgggtaacagggatataggtac 8020641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 34259343 - 34259258
Alignment:
Q  111 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||| | |||||  |||||||||||| | ||||| ||||||||||  |||| ||| ||||||    
T  34259343 tgggtttgaattttcctcgatttcaaaatatgggtaccggacgggtaacgaggatatatgtacccaccctgaacctatatccaaac 34259258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 35584207 - 35584126
Alignment:
Q  108 gtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccata 189  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||  |||  ||| ||||| ||| |||| | |||||||||    
T  35584207 gtatgagtttgggttttccccgttttcaaaacacgggcatgagacaagtattggggatataagtatccactctaaacccata 35584126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 97
Target Start/End: Original strand, 38006391 - 38006468
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttga 97  Q
    |||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||| || ||||||    
T  38006391 gtagtcatggcaacaaaacctatacctgttgttacccgccctaaccaaatccgatttgacgggttttctccattttga 38006468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 85)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10072648 - 10072438
Alignment:
Q  22 aggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggt 121  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  10072648 aggcatggcaacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 10072549  T
Q  122 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||| | ||||||| ||    
T  10072548 tttccccgatttcaaaacacgggtatggaacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccataaccgtcccaaatgtaaaaaattactt 10072449  T
Q  222 tatgttgatat 232  Q
    |||||||||||    
T  10072448 tatgttgatat 10072438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16866352 - 16866141
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  16866352 taggcatggcaacaaaactcatatccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttggttatgggtatggg 16866253  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| |    
T  16866252 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgagtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 16866153  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  16866152 ttatgttgatat 16866141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12980556 - 12980348
Alignment:
Q  25 catgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggtttt 124  Q
    |||| ||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  12980556 catggcaacaaaactcatacccgtggttacccgctagaaccaaactcaatttaacgggttttccccattttgactgggtttgggtatgggttttggtttt 12980457  T
Q  125 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgc-agaaaattatttta 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| | |||| |||||||    
T  12980456 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaatgggtatataagtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgcaaaaaaaatatttta 12980357  T
Q  224 tgttgatat 232  Q
    |||||||||    
T  12980356 tgttgatat 12980348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30650815 - 30650603
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||     
T  30650815 gtaggcatgtcaacaaaactcatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttaggtatgggtatga 30650716  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||| | |||||||     
T  30650715 gttttccccaatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaatccgtcccaaatgtaaaaaattac 30650616  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||    
T  30650615 tttatgttgatat 30650603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7780190 - 7779980
Alignment:
Q  22 aggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggt 121  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  7780190 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccatccgaaccaaactcaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 7780091  T
Q  122 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattt 221  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||    
T  7780090 tttccccgatctcaaaacacgggtatgggacggataatgggtatataggtacccaccccgaacctatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaatttattt 7779991  T
Q  222 tatgttgatat 232  Q
    |||||||||||    
T  7779990 tatgttgatat 7779980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 35074653 - 35074441
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  35074653 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaattagacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 35074554  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatg-cagaaaattat 219  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||  | |||| ||     
T  35074553 ttttccccgatcttaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaacccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactac 35074454  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||    
T  35074453 tttatgttgatat 35074441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 45885675 - 45885886
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  45885675 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgctcgaaccaaacccaatttaacgggttttctccgttttgactgggtttgggtatgggtatgag 45885774  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||||| | ||||||| |    
T  45885775 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacaagtatataggtacccaccccgaacccataccaaaatccgtcccaaatgtaaaaaattact 45885874  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  45885875 ttatgttgatat 45885886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17885649 - 17885437
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||    
T  17885649 gtaggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacctgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgaatatgggtatgg 17885550  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||     
T  17885549 gttttccccgattttaaaacatgggtatgggacgggtaacgggtatataggttccaaccccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattac 17885450  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||    
T  17885449 tttatgttgatat 17885437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21702842 - 21702631
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  21702842 taggcatggcaacaaaacccatatccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggatttttcccgttttgactgggtttgggtatgagtatggg 21702743  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| | |||| || |    
T  21702742 ttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccataccccaacccgtcccaaatgtaaaaaactact 21702643  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  21702642 ttatgttgatat 21702631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 18825776 - 18825993
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggta------tggg 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||   |||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||       ||||    
T  18825776 taggcatggcaacaaaacccatacccatggttaaccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtgagggtgtggg 18825875  T
Q  115 tttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaa 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||   |||||||| ||||||    
T  18825876 tttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccgtacccaaacccatcccaaatacagaaa 18825975  T
Q  215 attattttatgttgatat 232  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  18825976 attattttacgttgatat 18825993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25905811 - 25905600
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  25905811 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgctcgaactaaacccaatttgacaggttttcccctttttgactgggtttgggtatgggtatggg 25905712  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac-ttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||| | ||||||||    
T  25905711 ttttccccaatctcaaaacacaggtatgggacgggtaacgggtacataggta-ccaccccgaactcatacccaaacatcgtcccaaatgtaaaaaattat 25905613  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||    
T  25905612 tttatgttgatat 25905600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17852035 - 17851826
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17852035 taggcatggcaacaaaacccatacttgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgatggattttctccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 17851936  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||| | |||| || |    
T  17851935 ttttccccga--tcttaacacgggtatgggacgggtaacggatatataggtacccatcccgaacccatacccaaacccatcccaaatgtaaaaaactact 17851838  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  17851837 ttatgttgatat 17851826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 38153041 - 38152859
Alignment:
Q  49 ggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatg 148  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38153041 ggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacggattttccc-gttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttccccgatttcaaaacatgggtatg 38152943  T
Q  149 ggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  38152942 gaacggataacggctatataggtacccaccccgaacccatacctaaacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatat 38152859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 27850242 - 27850447
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  27850242 taggcatggcaacaaaactcatatccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggtttttccccgttttgattgggtttgggtatggg------ 27850335  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||| |    
T  27850336 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtgtataggtacccatcccgaacccatacccaaacccgtcccgaatgtagaaaattact 27850435  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||| | ||||||    
T  27850436 ttacgatgatat 27850447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 3226856 - 3227067
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||| |||||| || |||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| | || ||||| |||||||| ||||    
T  3226856 taggcatggcaacaaaatccatacatgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacggattttcctcgttttaactgagtttgagtatgggtatggg 3226955  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| || ||   ||||||||| | |||||||||    
T  3226956 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacaggaatataggtacccaccccgaacccatactcatacacatcccaaatgtaaaaaattatt 3227055  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  3227056 ttatgttgatat 3227067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 232
Target Start/End: Original strand, 18125141 - 18125349
Alignment:
Q  24 gcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttt 123  Q
    ||||||||||||||  ||||   |||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||    
T  18125141 gcatgacaacaaaattcatatccgtggttactcgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgtgtatgagtatgggttt 18125240  T
Q  124 tccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatttta 223  Q
    | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| | |||| || ||||    
T  18125241 ttcccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacgcatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactacttta 18125340  T
Q  224 tgttgatat 232  Q
    |||||||||    
T  18125341 tgttgatat 18125349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37182457 - 37182247
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    ||||| || ||||||||||||||   | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  37182457 taggcgtggcaacaaaacccatatccgcggttacccgcccgaatcaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgagtatggg 37182358  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  || |||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||||     
T  37182357 ttttctccgaattcaaaacacgggtatgggacgggtagcgggtatataggtactca-tccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattatc 37182259  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  37182258 ttatgttgatat 37182247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 232
Target Start/End: Original strand, 39455953 - 39456134
Alignment:
Q  49 ggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatg 148  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39455953 ggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgagttttccccgttttgactgggtttgggtatggatatgggttttccccgatttcaaaacatgggtatg 39456052  T
Q  149 ggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  39456053 ggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaa-ccatactcatacccgtcccaaatgta-aaaattactttatgttgatat 39456134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 33 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37579432 - 37579238
Alignment:
Q  33 caaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatt 132  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  37579432 caaaacccatacgcgtggttacccgcccgaaccaaacccaattagacgggttttccccgttttgactaggtttgggtatgggtttggatttttcccgatt 37579333  T
Q  133 tcaaaacacgggtatggg-acgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttg 228  Q
    || ||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  37579332 tcgaaacacgg--atgggtaagggtaacgggtatataggtacccaccccgaacctatacccaaagctgtctcaaatgcagaaaattactttatgttg 37579238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5377217 - 5377057
Alignment:
Q  72 aatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggt 171  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5377217 aatttaacggatttttcccgttttgattggggttgagtatgagtttgggttttccccgatttcaaaacacaggtatgggacgggtaaagggtatataggt 5377118  T
Q  172 acccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5377117 acccaccccgaacccatacccaaatctgtcccgaatgcagaaaattactttatgttgatat 5377057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 61 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43507588 - 43507417
Alignment:
Q  61 gaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacg 160  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  43507588 gaaccaaacccaatttgatgggttttccccgttttgactgggtttgggtataagtatgggttttccccgatttcaaaacatgggtatgagacgggtaacg 43507489  T
Q  161 ggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  43507488 ggtatataggcacccaccctgaacccatacctatactcgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatat 43507417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16079187 - 16078985
Alignment:
Q  30 caacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccg 129  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||||  | ||||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||    
T  16079187 caacaaaacccatactcgtggttacccgcccgaagcaaacctaatttgacgagttttttcggttttgactgagtttgggtataagtttgggttttctccg 16079088  T
Q  130 atttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttga 229  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||   ||| |||||||||| |||| |||||    
T  16079087 atctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtgcccaccccaaacctatacccaaactcgtcatgaatacagaaaattactttacgttga 16078988  T
Q  230 tat 232  Q
    |||    
T  16078987 tat 16078985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 45380261 - 45380081
Alignment:
Q  49 ggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatg 148  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  45380261 ggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgg-ttttccctgttttgactgggtttggatatgggtatgggtttttcccgatttcaaaatacgggtatg 45380163  T
Q  149 ggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatg-cagaaaattattttatgttga 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  | ||||||| ||||||||||    
T  45380162 ggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacctaaactcgtcccaaatgtaaaaaaattactttatgttga 45380081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39317179 - 39316967
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||     
T  39317179 gtaggcatggcaacaaaattcatactcgcggttatccgcccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttggatatgagtatga 39317080  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||  ||| |||||||| |   ||| |||||| | ||||||||    
T  39317079 gttttcctcgatttcaaaacacgggtatgggacgggtagcgggtatatatgtatccatcctgaactcatacccatatccgtctcaaatgtaaaaaattat 39316980  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||    
T  39316979 tttatgttgatat 39316967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 44734269 - 44734478
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||| || || |    
T  44734269 taggcatggcaacaaaactcatactcgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccc--ttttgactgggtttgggaatgtgtatgtg 44734366  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |   |||||||||| | ||||||| |    
T  44734367 tttttctcgatttcaaaacacgggtatgggaccggtaatgggtatataggtacccaccccgaacccatacacatatccgtcccaaatgtaaaaaattact 44734466  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  44734467 ttatgttgatat 44734478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24753346 - 24753147
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  24753346 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgtccgaaccaaattcaatttgacggattttctccgttttgactgggtttggatatgggtatggg 24753247  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||    
T  24753246 tttt-cccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggt-----------acccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattatt 24753159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 38139702 - 38139914
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||| ||||||||||   | |||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  38139702 taggcatggcaagaaaacccatatccgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgatggattttccccgttttgactgggtttggatatgggtatggg 38139801  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatg-cagaaaattat 219  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||  | ||||||||    
T  38139802 ttttccccaatttcaaaacacgagtatgggacgggtaatgagtatataagtacccaccccgaacccataaccaaacccgtctcaaatgtaaaaaaattat 38139901  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    ||||| |||||||    
T  38139902 tttatattgatat 38139914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41103824 - 41103628
Alignment:
Q  30 caacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccg 129  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||  | ||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||      ||||||    
T  41103824 caacaaaactcatacctgtggttacccgcgcgaaccaaatccgatttgacggatttttcccgttttgactgggtgtgggtatgggttt------tccccg 41103731  T
Q  130 atttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttga 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  41103730 atttcaaaacacgggtatgggacggttaacgggtatataagtacccaccccgaacccatacataaacccgtcctaaatgtaaaaaattattttatgttga 41103631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 2630484 - 2630695
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||| ||||  | | |||||||| |||||||||| ||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  2630484 taggcatgacaacaaaaccgatacccatggatacctacccaaaccaaacccaatttgacgtgttttacccatttttactgggtttgggtatgggtttggg 2630583  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgc-agaaaattat 219  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| | |||| ||     
T  2630584 ttttccccgattt-aaaacatgggtatgggacgggtgacgggtatatagatacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccgaatgcaaaaaaactac 2630682  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||    
T  2630683 tttatgttgatat 2630695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Original strand, 41741360 - 41741562
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| |||| | ||| |||||||||| || ||||    
T  41741360 taggcatggcaacaaaacccatatttgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgatgagttttccccatttttactggatttgggtatgagtatggg 41741459  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||  || ||  |||||||||| | ||||||| |    
T  41741460 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacggataacgggtatgtaggtaccca-cccgaacccatattcatacccgtcccaaatgtaaaaaattact 41741558  T
Q  221 ttat 224  Q
    ||||    
T  41741559 ttat 41741562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 111 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3920631 - 3920510
Alignment:
Q  111 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||| |    
T  3920631 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacactggtatgggacggataacaggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaaactgtcccgaatgta 3920532  T
Q  211 gaaaattattttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3920531 gaaaattattttatgttgatat 3920510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Original strand, 26004395 - 26004593
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||            |||||    
T  26004395 gtaggcatggcaacaaaactcatacccgtggttacccgcccgaaccaaacacaatttgatgggtttttcccgttttgactggg------------tttgg 26004482  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||| | ||| ||||||||||||||     
T  26004483 gttttcctcgatttcaaaacttgggtatgggacgggtaacaggtatatagatacccaccccgaacccatacc--aactcgccccgaatgcagaaaattac 26004580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3157265 - 3157081
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| || |||||  ||||| || || ||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  3157265 taggcatggcaccaaaaatcatacatgcgggtacccgcccgaaccaaacctaatttgtcgg-ttttccccgctttgacttggtttgggtatgggtttagg 3157167  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaa 206  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||  ||||||||    
T  3157166 ttttccccgatttcaaaatatgggtatgggacggataacggggatataggtacccacaccgaacctatacccaaacccgtcccaaa 3157081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 111 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26623044 - 26622923
Alignment:
Q  111 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgca 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||    
T  26623044 tgggtttgggttttccctgatttcaaaacacgggtatgggatgggtaatgggtatataagtacccaccccgaacccatacccaaactcgtttcgaatgca 26622945  T
Q  211 gaaaattattttatgttgatat 232  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  26622944 aaaaattattttatgttgatat 26622923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 232
Target Start/End: Original strand, 37195921 - 37196119
Alignment:
Q  23 ggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggtt 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  37195921 ggcatgacaacaaaatccatacccgtggttatccgcccaaaccaaactcaatttgacggattttccctgttttgattaggtttgggtatgggtatggatt 37196020  T
Q  123 ttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatttt 222  Q
    |||||||||||||||||           || ||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||| | ||||||| |||    
T  37196021 ttccccgatttcaaaac-----------acaggtaatgggtatatagctacccaccccgaatccatacccaaacccgtcataaatgtaaaaaattacttt 37196109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 37218188 - 37218047
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||  | || ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  37218188 taggcatgacaacaaaactcataccagcggatacccacccgaaccaaactcaatttgatgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgagtttgag 37218089  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacggg 162  Q
    ||||  || |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  37218088 ttttatcctatttcaaaacacaggtacgggacgggtaacggg 37218047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24425551 - 24425352
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |               
T  24425551 taggcatggcaacaaaactcatacacgtggttaccagcccgaaccaaacccaatttgacggattttctccgttttgattgggtttgaat----------- 24425463  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
     |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  ||||||  || ||||||||| ||||||| |    
T  24425462 -tttctctgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccctgaccccatttccaaacccgttccaaatgcataaaattact 24425364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 222
Target Start/End: Original strand, 8906551 - 8906700
Alignment:
Q  73 atttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 172  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||  |||| |||    
T  8906551 atttgacgggttttctccgctttgattggatttgggtatgggtttgagttttctccgatttcaaaacacgagtatgagacgaataacggggttatatgta 8906650  T
Q  173 cccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatttt 222  Q
    |||||||| |||||||| ||| || ||| ||||||| | |||||||||||    
T  8906651 cccaccccgaacccatatccatacctgttccaaatgtaaaaaattatttt 8906700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 147
Target Start/End: Original strand, 44658386 - 44658503
Alignment:
Q  30 caacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccg 129  Q
    |||||||||||||||  | ||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  44658386 caacaaaacccatacccgcggttacctgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttcctcgttttgactgggtttgggtatgggtatgagtttttcccg 44658485  T
Q  130 atttcaaaacacgggtat 147  Q
    ||||||||||||||||||    
T  44658486 atttcaaaacacgggtat 44658503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 71 - 222
Target Start/End: Original strand, 27896435 - 27896586
Alignment:
Q  71 caatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatagg 170  Q
    |||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |    
T  27896435 caatttgatgggtttttctcgctttgattgggtttgggtatgggtttgggttttcccttatttcaaaacatgggtatgggacgggtaacggggttatatg 27896534  T
Q  171 tacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatttt 222  Q
     ||| ||||| ||| |||||||| ||  ||||| |||  | |||||||||||    
T  27896535 caccaaccccgaactcatacccatacccgtcccgaatataaaaaattatttt 27896586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 176
Target Start/End: Original strand, 42907992 - 42908106
Alignment:
Q  62 aaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgg 161  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  42907992 aaccaacctcgatttgacggttttttcccaatttgattgggtttgggtatgagtttgggttttccccgatttcaaaatacgggtacgggacgggtaatgg 42908091  T
Q  162 gtatataggtaccca 176  Q
    | ||||| |||||||    
T  42908092 ggatatatgtaccca 42908106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Original strand, 44794051 - 44794148
Alignment:
Q  134 caaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  44794051 caaaacacgggtatgagacgggtaacgagtata-aggtacccaccccgaacccatacccaaacctgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatat 44794148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22973505 - 22973396
Alignment:
Q  87 ccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaaccc 186  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||  ||||||||| | |||||    
T  22973505 ccccgatttgactgggtttgggtatgggtttgggttttccacgatttcaaaatacgggtacgggacgggtaatggggatatctgtacccacctcgaaccc 22973406  T
Q  187 atacccaaac 196  Q
    ||||||||||    
T  22973405 atacccaaac 22973396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 196
Target Start/End: Original strand, 23475195 - 23475348
Alignment:
Q  31 aacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccga 130  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||             |||||||||||||| |||||    
T  23475195 aacaaaacccatacccgtggataccctctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgctttga------------ctgggtttgggtttttcccga 23475282  T
Q  131 tttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||||    
T  23475283 tttcaaaacacgggtttgggatgggtaatggggatatatgtacccacttcgaacccatacccaaac 23475348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 117 - 229
Target Start/End: Original strand, 25979923 - 25980035
Alignment:
Q  117 tgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    | ||||||| | |||||    
T  25979923 tgggttttccccgatttcaaaacacaggtatgagacgggtaacggatatatatgtacccaccccaaactcatacccaaatcctttccaaatgtaaaaaat 25980022  T
Q  217 tattttatgttga 229  Q
    |||||||||||||    
T  25980023 tattttatgttga 25980035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16811899 - 16811702
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||| || |||||| |               
T  16811899 taggcatggcaacaaaacc-atactcgtggttactcgcccgaacctaactcaatttgacaggttttctccattttgactgagtttggat----------- 16811812  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||   |||||||||| | ||||||| |    
T  16811811 -tttccccgatctcaaaacacgggtatgagacggataatgggtatatagataccca-cccgaacccatacccaaagccgtcccaaatgtaaaaaattact 16811714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 232
Target Start/End: Original strand, 25782863 - 25783028
Alignment:
Q  60 cgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaac 159  Q
    |||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |       ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| |||     
T  25782863 cgaaccaaacccgatttgtcggattttctccgttttgattgggtttag-------tttgggttttctccgattataaaacacgggtatgagacggataat 25782955  T
Q  160 gggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||   ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  25782956 gggtatataggtacccaccccgaactcataccaaaatccgtcccgaatgcagaaaattactttatgttaatat 25783028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 218
Target Start/End: Original strand, 5565269 - 5565414
Alignment:
Q  73 atttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 172  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||||||||  |||| |||    
T  5565269 atttgacggattttccccgctttgactggatttggttataggtttgggttttccctgatttcaaagtacggatatgggatgggtaacggggttatatgta 5565368  T
Q  173 cccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaatta 218  Q
    |||||||| |||||||||||| ||   ||||||||| | |||||||    
T  5565369 cccacccctaacccatacccatacacatcccaaatgtaaaaaatta 5565414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 18684091 - 18683982
Alignment:
Q  87 ccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaaccc 186  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| ||| ||||| | |||||    
T  18684091 ccccgatttgactaggtttgggtatgggttcgggttttccccgatttcaaaatacgggtacgggacgggtaacagggatatatgtatccacctcgaaccc 18683992  T
Q  187 atacccaaac 196  Q
    ||||||||||    
T  18683991 atacccaaac 18683982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 138
Target Start/End: Original strand, 44785168 - 44785285
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  44785168 taggcatggcaacaaaattcatacatgtggttacccgcccgaatcaaacccaatttgacgagttttccccgttttgactaagtttgggtatgggtatggg 44785267  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaa 138  Q
    ||||| ||||| ||||||    
T  44785268 ttttctccgatctcaaaa 44785285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Original strand, 45708781 - 45708950
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||| ||||   ||| ||| |||| |||| ||||  ||||||||  | |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||       
T  45708781 taggcatggcaacaaaactcatatacgtgattatccgcccgaatcaaatccaatttgatagattttcctcgttttgactgggttttggtatgggttt--- 45708877  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
       || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  45708878 ---tctccgatctcaaaacacgggtattggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacctaaac 45708950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 27063269 - 27063146
Alignment:
Q  73 atttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 172  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||  |||||| ||||||| ||||| |||    
T  27063269 atttgacggattttccctgatttgactgggtttgggtatgagtttgagttttcctcgatttcaaaatacgggtacaggacggataacggggatatatgta 27063170  T
Q  173 cccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    | |||||| ||| |||||||||||    
T  27063169 ctcaccccgaactcatacccaaac 27063146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27063465 - 27063346
Alignment:
Q  73 atttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 172  Q
    ||||||||| |||| |||  ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  27063465 atttgacggatttttcccaatttgactgggtttgggtatgggtctcggttttccccgatttaataatacgggtacgggacgggtaacgggaatatatgta 27063366  T
Q  173 cccaccccaaacccataccc 192  Q
    |||||||| ||| |||||||    
T  27063365 cccaccccgaactcataccc 27063346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 31426119 - 31426016
Alignment:
Q  93 tttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccataccc 192  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| |||||||    
T  31426119 tttgactgggttttggtattggtttgggttttccccgatttaaaaatacgggtatgagacgggtaacggggatatatgtatccaccccgaacgcataccc 31426020  T
Q  193 aaac 196  Q
    ||||    
T  31426019 aaac 31426016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 225
Target Start/End: Original strand, 46127179 - 46127297
Alignment:
Q  106 gggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaa 205  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| || | | ||||| |||||  |||||||    
T  46127179 gggtatgggtttggggtttccc-gatttaaaatcacgggtatgggacggataacaggtgtataggtacccacaccgatctcatactcaaacccgtcccaa 46127277  T
Q  206 atgcagaaaattattttatg 225  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  46127278 atgcagaaaattattttatg 46127297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 32546312 - 32546200
Alignment:
Q  87 ccccgttttgattgggtttggg---tatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaa 183  Q
    ||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  32546312 ccccgatttgactgggtttggggcgtatgggtttggatttttcccgatttcaaaatacgggtacggaacgggtaacggggatatatgtacccaccccgaa 32546213  T
Q  184 cccatacccaaac 196  Q
    |||||||||||||    
T  32546212 cccatacccaaac 32546200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 196
Target Start/End: Original strand, 30839074 - 30839219
Alignment:
Q  52 tacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttcc-ccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatggg 150  Q
    ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  30839074 tacccgctcaaaccaaccccgatttgacgggttttcttccgatttgactgggtttgggtatgagtttgagttttccctgatttcaaaatacgggtatggg 30839173  T
Q  151 acgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    ||| |||||| | ||||| ||| | ||||| ||| ||| |||||||    
T  30839174 acgagtaacgtggatatatgtatctaccccgaactcatgcccaaac 30839219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 33841208 - 33841074
Alignment:
Q  73 atttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 172  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||| |||    
T  33841208 atttgacgggtttttcccgctttgactgg-tttgagtatgaatttgagttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacatggttatatgta 33841110  T
Q  173 cccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatg 208  Q
    | |||||| ||||||||| || ||  ||||||||||    
T  33841109 ctcaccccgaacccatactcatacccgtcccaaatg 33841074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 193
Target Start/End: Original strand, 10995830 - 10995916
Alignment:
Q  107 ggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccataccca 193  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  10995830 ggtatgagtttgggttttccccgatttcaagacacgggtatgggacgggtaacagggttatatatacccaccccgaacccataccca 10995916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 23329175 - 23329012
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgt----ggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtt 116  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||   |||| ||||||||| |||    
T  23329175 taggcatgacaacaaaattcatacatgtatctggttatccgcttgaaccaaattcaatttgacgggtttttcctgttttagctgggattgggtatgagtt 23329076  T
Q  117 tgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccacccc 180  Q
    |  ||||| || ||||| ||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  23329075 taagtttttcctgattttaaaacatctgtatgggacgggtagcgggtatataggtactcacccc 23329012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 29157482 - 29157357
Alignment:
Q  73 atttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttc--aaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatagg 170  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || | ||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  29157482 atttgacgggttttcaccaatttgacagggtttgggtatggttttggattttccccgatttcataatatacgggtatgagacgggtaacggggatatatg 29157383  T
Q  171 tacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    || |||||| |||||| |||||||||    
T  29157382 tatccaccctaaacccgtacccaaac 29157357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 146
Target Start/End: Original strand, 44985828 - 44985952
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||  ||||||||| |||||| | ||||||||   |||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  44985828 taggcattgcaacaaaactcatactcgcggttacccatccgaaccaaatctaatttgacggattttctccgttttgattgggtttgggtatggatatggg 44985927  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggta 146  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||    
T  44985928 ttttctccgatttc-aaacacgggta 44985952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 4101694 - 4101554
Alignment:
Q  52 tacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatggga 151  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  |||    
T  4101694 tacccgttcgtaccaaactcaatttgatgggtttttcccgctttgactaggtttggataagggtttgggttttccatgatttcaaaacacaggtacagga 4101595  T
Q  152 cgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccataccc 192  Q
     |||| || || ||||| ||||||| ||  |||||||||||    
T  4101594 tgggttacagggatatatgtacccatcctgaacccataccc 4101554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 89 - 196
Target Start/End: Original strand, 44845113 - 44845220
Alignment:
Q  89 ccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccat 188  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||| | | |||||  |||||||||| |||||||    
T  44845113 ccgttttgactgagttttggtatgggtttgggttttccccgatttcataatacgggtacgggacggttaatgaggatatatttacccaccccgaacccat 44845212  T
Q  189 acccaaac 196  Q
    || |||||    
T  44845213 acacaaac 44845220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 23533526 - 23533700
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  | || ||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||            ||||||    
T  23533526 taggcatgacaacaaaatccatacccgcgggtaccctcccgaaccaaacccaatttgacgggtttttcccgatttgactggg------------tttggg 23533613  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatg 208  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23533614 ttttccccgatttgaaaatacgggtatgcgatgggtaatggg-atatatgtacccacttcgaacccatacccaaactcgtcccgaatg 23533700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 43218400 - 43218291
Alignment:
Q  87 ccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaaccc 186  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |  |||  ||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||| |    
T  43218400 ccccgatttgactgggtttgggtatgggtttgggttttccccaatttcataatataggtgcgggacgggtaacggcgatatatgtactcaccccgaactc 43218301  T
Q  187 atacccaaac 196  Q
    ||||||||||    
T  43218300 atacccaaac 43218291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 179
Target Start/End: Original strand, 10990821 - 10990929
Alignment:
Q  71 caatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatagg 170  Q
    ||||| ||| |||||||||||  |||| || ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||    
T  10990821 caattagacaggttttccccgccttgaatgagtttgagtatgggttgggtttttccccgatttcaaaatacgggtacgggacgggtaatagggatatagg 10990920  T
Q  171 tacccaccc 179  Q
    || ||||||    
T  10990921 tatccaccc 10990929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 208
Target Start/End: Original strand, 29855404 - 29855550
Alignment:
Q  60 cgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaac 159  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||    | |||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  29855404 cgaaccaaactcaaattgatgggtttttat-gctttgattgagtttgggcatgggttttggtttaccc-gatttcaaagcacgagtatgggacgggtaat 29855501  T
Q  160 gggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatg 208  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||  ||| |||||| |||||| ||||    
T  29855502 gggcatataagtacccacaccaaactgataaccaaacctgtcccgaatg 29855550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Original strand, 19439932 - 19440095
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||  | || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||             |||||||| |    
T  19439932 taggcatgtaaacaaaaaccatacccgcgggtaccctctcgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgctttga------------ctgggtttgag 19440019  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||||    
T  19440020 ttttccctgatttgaaaacacgggtttgggatgggtaatggggatatatgtacccacttcgaacccatacccaaac 19440095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 226
Target Start/End: Original strand, 5916035 - 5916185
Alignment:
Q  70 tcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatag 169  Q
    |||||||||||| |||||  |  |||||| |||||||  ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| |||     |||||||||  ||||||     
T  5916035 tcaatttgacggattttcttcaatttgatcgggtttgaatatgaatttggattttctccgatttcaaaacacgagta-----cgggtaacga-tatatat 5916128  T
Q  170 gtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgt 226  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5916129 gtactcaccccgaaccaatacccaaatttgtcccaaattcataaaattattttatgt 5916185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 196
Target Start/End: Original strand, 37103068 - 37103212
Alignment:
Q  52 tacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatggga 151  Q
    ||||||||| ||||||   ||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||| |||  ||||| ||||| || |||||||||| ||||||| ||||    
T  37103068 tacccgctcaaaccaactccaatttgacggatcttctccgatttgattgggtttggatataagtttgtgtttttcctgatttcaaaatacgggtacggga 37103167  T
Q  152 cgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
     |||||||| | ||||| | ||||| ||| ||| |||| ||||||    
T  37103168 agggtaacgaggatatatgcacccatcccgaacacatatccaaac 37103212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 28309583 - 28309500
Alignment:
Q  113 ggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||| |||||||||||    
T  28309583 ggtttgggttctccctgatttcaaaatacgggtacgggacgggtaacgggaatatatgtatctaccccgaactcatacccaaac 28309500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 23457242 - 23457156
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgg 107  Q
    ||||||||  |||||||| |||||  | || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23457242 taggcatgtaaacaaaactcatacccgcgggtaccctctcgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgctttgactgggtttgg 23457156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29292803 - 29292690
Alignment:
Q  105 tgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta--cccaccccaaacccatacccaaacttgtcc 202  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||  | |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||     
T  29292803 tgggtttgggtatggattttccccgatttcaaaacacgggtacgagatgggtaacatggatataggtacgcccaccctaaacccatacctaaactcgtct 29292704  T
Q  203 caaatgcagaaaat 216  Q
    | |||| |||||||    
T  29292703 cgaatgtagaaaat 29292690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 21750874 - 21750790
Alignment:
Q  112 gggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||| |||||||||||    
T  21750874 gggtttaggtttttcccgatttcaaaatacggatatgagacgggtgacggggatatatgtacccacctcgaactcatacccaaac 21750790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 168
Target Start/End: Original strand, 29014929 - 29015009
Alignment:
Q  88 cccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatata 168  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||| |||||    
T  29014929 cccgatttgattgggtttaggtatgagtttgagtttttcccgatttcaaaatacgggtacgggacggatagcggggatata 29015009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 42005994 - 42005887
Alignment:
Q  114 gtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaa 213  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||| |||| ||||||||| ||||| |||  |  |||||||||| | ||    
T  42005994 gtttgggttttcctcaatttcaaaacacgtgtatgggacgggttacggggttatatgtactcaccccaaa-ccataaccattcccgtcccaaatgtaaaa 42005896  T
Q  214 aattatttt 222  Q
    |||||||||    
T  42005895 aattatttt 42005887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 59 - 178
Target Start/End: Original strand, 11472663 - 11472781
Alignment:
Q  59 tcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 158  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  |||||  || || |||    
T  11472663 tcgaaccgaatttaatttgacgggttttaccc-ttttaattggattttggtatgagtttgagtttttcccgatttcaaaacagaggtataagatggataa 11472761  T
Q  159 cgggtatataggtacccacc 178  Q
    |||| |||||||||| ||||    
T  11472762 cgggaatataggtactcacc 11472781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 232
Target Start/End: Original strand, 44658496 - 44658570
Alignment:
Q  158 acgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||  || ||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  44658496 acgggtatataggtacctatcccgaacccatacccaaacccgtaccaaatgtaaaaaaatattttatgttgatat 44658570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 106
Target Start/End: Original strand, 43550339 - 43550424
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttg 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||   ||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43550339 taggcatgacaacaaaactcatatccgtggatacccgtctgaatcaaacctaatttgacgggttttccccattttgattgggtttg 43550424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 2472094 - 2472025
Alignment:
Q  93 tttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacggg 162  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| || |||||||   |||||||||||||    
T  2472094 tttgattgggtttgggtatgagtttgagttttttccgatttcataatacgggtactagacgggtaacggg 2472025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 3774214 - 3774078
Alignment:
Q  60 cgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggt-atgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 158  Q
    ||||||||||  ||||||| || |||| || | ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||| | || | || | ||| | | |||||||||    
T  3774214 cgaaccaaacctaatttgatggatttttcctgctttgactgagtttgggttatgggtttgagttttccccaactttataaaatgggcacgagacgggtaa 3774115  T
Q  159 cgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaa 195  Q
    || | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  3774114 cgaggatataggtacccaccctgaacccatactcaaa 3774078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 93 - 146
Target Start/End: Original strand, 3909255 - 3909308
Alignment:
Q  93 tttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggta 146  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  3909255 tttgattgagtttggatatgagtttgggttttccctaatttcgaaacacgggta 3909308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 26623123 - 26623046
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttga 97  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||| ||| | |  ||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  26623123 gtaggcatgacaacaaaactcatacccgtgtttatcggtccgaaccaaattcattttgtcggattttccccgttttga 26623046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 48327532 - 48327435
Alignment:
Q  117 tgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaa 214  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| || | | ||||  || ||||||||| ||||| | ||| ||||| |||||| |||||  |||||||||    
T  48327532 tgggttttctccgatttcaaaatacgggtacggtatgagtaattgggatataggtatccacctcgaacacatactcaaactcgtcccgtatgcagaaa 48327435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 90)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Original strand, 47550263 - 47550475
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||     
T  47550263 gtaggcatggaaacaaaacccatacatgtggttacccgcccgaaccaaactcaatttggcggattttccccattttgactgggtttgggtataggtatga 47550362  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||    
T  47550363 gttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattat 47550462  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||    
T  47550463 tttatgttgatat 47550475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 6382183 - 6382395
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  6382183 taggcatggcaataaaacccatacccgtggttacccgcccgaatcaaacccaatttgacgggttttccccgctttgactgggtttgggtatgggtatggg 6382282  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatg-cagaaaattat 219  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  | |||| |||    
T  6382283 ttttctccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactat 6382382  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||    
T  6382383 tttatgttgatat 6382395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11028257 - 11028045
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  11028257 taggcatggcaacaaaacccatacacgtggttacccacccgaaccaaacccaatttgacgggttttctccgttttgactggatttgggtatgggtatggg 11028158  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatg-cagaaaattat 219  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||  | |||||||     
T  11028157 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacccaaacctgtcccaaatgtaaaaaaattac 11028058  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    ||||| |||||||    
T  11028057 tttatattgatat 11028045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7609150 - 7608943
Alignment:
Q  25 catgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggtttt 124  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7609150 catggcaacaaaacccatactcgtggttacccacccgaactaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactggatttgggtatgggtatgggtttt 7609051  T
Q  125 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttat 224  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||| || | |||    
T  7609050 ccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactctat 7608951  T
Q  225 gttgatat 232  Q
    ||||||||    
T  7608950 gttgatat 7608943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Original strand, 5902529 - 5902736
Alignment:
Q  19 cgtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttg 118  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        
T  5902529 cgtaggcatggcaacaaaacctatacccgtggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatggg---- 5902624  T
Q  119 ggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaatta 218  Q
      ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||    
T  5902625 --ttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaacta 5902722  T
Q  219 ttttatgttgatat 232  Q
     |||||||||||||    
T  5902723 ctttatgttgatat 5902736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26565015 - 26564804
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||  ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  26565015 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccacccgaaccaaatccaatttgacggattttcttcgttttgactgggtttgggtatgagtttgag 26564916  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||| || |    
T  26564915 ctttccccgatttcaaaacgcgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaaaccatacccaaacccgtcccaaatgcagaaaactact 26564816  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  26564815 ttatgttgatat 26564804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31752641 - 31752429
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  31752641 gtaggcatgacaacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaatcaaatccaatttgacgggtttttaccgttttgattgggtttggatatgggtatgg 31752542  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||     
T  31752541 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacgagtaacgagtatataggttcccaccccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattac 31752442  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||    
T  31752441 tttatgttgatat 31752429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43893412 - 43893201
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  43893412 gtaggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgagccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgg 43893313  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||  |||||||||| | |||| ||     
T  43893312 g-tttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtatccaccccgaattcatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactac 43893214  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||    
T  43893213 tttatgttgatat 43893201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44317719 - 44317507
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||| | |||||||||||||||  |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  44317719 taggcaaggcaacaaaacccatacccgtggttactcgcccgaatcaaacccaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 44317620  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatg-cagaaaattat 219  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  | |||| ||     
T  44317619 ttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactac 44317520  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||    
T  44317519 tttatgttgatat 44317507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 11122780 - 11122991
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  11122780 taggcatggcaacaaaactcatacccgtggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacggattttttccgttttgactgagtttgggtatgggtatggg 11122879  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| | |||| || |    
T  11122880 ttttctccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaactact 11122979  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  11122980 ttatgttgatat 11122991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21424046 - 21423834
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||  |||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  21424046 gtaggcatggcaataaaactcatacccgtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacggatttttcccgttttgactgggtttgggtatgggtatgg 21423947  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| | |||| ||     
T  21423946 gttttccccaatctcgaaacacgggtatgagacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacacaaacccgtcccaaatgtaaaaaactac 21423847  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||    
T  21423846 tttatgttgatat 21423834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 31918469 - 31918681
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||   ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  31918469 taggcatggcaacaaaacccatatccgtggttacctgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgagtatggg 31918568  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatg-cagaaaattat 219  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  | |||| ||     
T  31918569 ttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgagtaatgggtatatagttacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactac 31918668  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||    
T  31918669 tttatgttgatat 31918681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 222
Target Start/End: Original strand, 15987172 - 15987374
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||| |||||||||||| | | | |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||     
T  15987172 gtaggcatggcaacaaaacccacattcgcggttacccacccgaaccaaacccaatttgacgggttttctccattttgattgggtttgggtatgggtatga 15987271  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  | ||||||||    
T  15987272 gttttcccagattttaaaacacgggtatgggatgggtaacgggtatatagatacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatataaaaaattat 15987371  T
Q  220 ttt 222  Q
    |||    
T  15987372 ttt 15987374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 215
Target Start/End: Original strand, 6481950 - 6482140
Alignment:
Q  25 catgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggtttt 124  Q
    |||| |||||||||| ||||  ||||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6481950 catggcaacaaaacctatacccgtggttatccacccgaatcaaactcaatttgacggattttctctgttttgattgggtttgggtatgggtttgggtttt 6482049  T
Q  125 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaa 215  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  6482050 ccccaatttaaaaacacgggtatgggacgagtaaagggtatatatgtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgcaaaaaa 6482140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37349296 - 37349096
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  37349296 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacaggttttccccgttttgactgggtttgggtatgagtttgag 37349197  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||           ||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  37349196 ttttccccgatttcaaaacacg-----------ggtaatgggtatataggtatccaccctgaacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaattatt 37349108  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  37349107 ttatgttgatat 37349096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 55826534 - 55826746
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| || ||||    
T  55826534 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgtccgaaccaaatccaatttgacggattttccctgttttgactgggtttggatatgagtatggg 55826633  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatg-cagaaaattat 219  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||  | |||| ||     
T  55826634 ttttccccgatctcgaaacacaggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatatccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactac 55826733  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||    
T  55826734 tttatgttgatat 55826746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 19882967 - 19883154
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19882967 taggcatggcaacaaaacccatactcgcgaatacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggtttttcccgctttgattgggtttgagtatgagtttggg 19883066  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatg 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||    
T  19883067 ttttccccgattttaaaacacggatacgggaagggtaacggggatataggtatccaccccgaaccgatacacaaactcgtcccgaatg 19883154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 49 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39047108 - 39046925
Alignment:
Q  49 ggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatg 148  Q
    |||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39047108 ggttacccgtccgaatcaaacccaatttgatgggttttctccgttttgactgaatttgagtatgggtatgggttttccccaatttccaaacacgggtatg 39047009  T
Q  149 ggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  39047008 ggacatgtaacgggtatataggtacccactccaaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatat 39046925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 48459665 - 48459454
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||| |||||   | |||||||||  |||| |||||  ||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||| | ||||    
T  48459665 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaatcaaaccaaatttgatgggtttttcccattttgattggatttgagtatggatatggg 48459566  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||||||||| | ||||||| |    
T  48459565 ttttccccgatttcaaaacatgggtatggaacgggtaacaggtatataggtacccaccccgaacccatacccatacccatcccaaatgtaaaaaattact 48459466  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||    
T  48459465 ttatgttgatat 48459454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 110 - 232
Target Start/End: Original strand, 32596184 - 32596306
Alignment:
Q  110 atgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgc 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||     
T  32596184 atgggttggggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtccccacctcaaactcatacccaaacttgtctcgaatgt 32596283  T
Q  210 agaaaattattttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  32596284 agaaaattattttatgttgatat 32596306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 107 - 232
Target Start/End: Original strand, 1724307 - 1724432
Alignment:
Q  107 ggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||    
T  1724307 ggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacatgggtatgggacgggtaacggttatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccgaa 1724406  T
Q  207 tgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    ||||||||| || |||||||||||||    
T  1724407 tgcagaaaactactttatgttgatat 1724432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 231
Target Start/End: Original strand, 7985037 - 7985242
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||     
T  7985037 taggcatgtcaacaaaactcata-ttgtggttatccgcctgaaccaaacccaatttgacgggttttcctggttttgattgggtttgggtataagtttgga 7985135  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    || || |||| || ||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||    
T  7985136 ttttctccgatttcaaaacatgggtatgggacggataac----atgtatgtactcatcccgaacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaagtatt 7985231  T
Q  221 ttatgttgata 231  Q
    |||||||||||    
T  7985232 ttatgttgata 7985242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 62 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37107553 - 37107384
Alignment:
Q  62 aaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgg 161  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37107553 aaccaaatttaatttgacgggtttttcccattttgactgggtttgtgtatgagtttgggttttccca-atttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgg 37107455  T
Q  162 gtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||   ||||| |||  | |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  37107454 gtatataggtacccaccccgaatttataccaaaatatatcccgaatgcagaaaattactttatgttgatat 37107384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42299973 - 42299764
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  || ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| || |||| ||||||||| |||    
T  42299973 gtaggcatgacaacaaaattcatatatgcggttacccatccgaaccaaactcaatttgacgggttttttccggtttgactgagtttaggtatgggtatgg 42299874  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattat 219  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||  |||||||||  | |||| ||     
T  42299873 attttccccgatttcaaaacac-ggtat-ggacgggtaacgggtatataggtacccaccctgaacccatactcaaacacgtcccaaatata-aaaagtac 42299777  T
Q  220 tttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||    
T  42299776 tttatgttgatat 42299764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 73 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10302216 - 10302071
Alignment:
Q  73 atttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 172  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  |||| |||    
T  10302216 atttgatgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttaggttttccccgatttcaaagtacgggtatgagacgggtaacggggttatatgta 10302117  T
Q  173 cccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaatta 218  Q
    |||||||| |||||||||||| |   |||||||||| | |||||||    
T  10302116 cccaccccgaacccatacccatatccgtcccaaatgtaaaaaatta 10302071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32585664 - 32585462
Alignment:
Q  24 gcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttt 123  Q
    ||||| ||||||||| |||||  | ||||| |||| | |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||          
T  32585664 gcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccgcccaaaccaaacccaatttgaccggttttcccctttttgactgggtttgggtatgaattt------ 32585571  T
Q  124 tccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatttta 223  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||| ||||    
T  32585570 tctccgatttcaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccctgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaacttacttta 32585471  T
Q  224 tgttgatat 232  Q
    |||| ||||    
T  32585470 tgtttatat 32585462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 46 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39375437 - 39375268
Alignment:
Q  46 tgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggt 145  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||| || |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  39375437 tgtggttacccgcccgaaccaaattcaatttgacgggtttttcctattttgactgagtttggatatgagtttggcttttccccgatttcaaaatacgggt 39375338  T
Q  146 atgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaa 215  Q
    || ||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||  ||||||| |||| ||||    
T  39375337 ataggacgggtaacgggtatatagatatccaccccaatcacatactcaaacccgtcccaattgcaaaaaa 39375268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 232
Target Start/End: Original strand, 47239368 - 47239507
Alignment:
Q  93 tttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccataccc 192  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  47239368 tttgattggatttggatatgggtatggattttttccgattttaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggttcccaccctgaacccataccc 47239467  T
Q  193 aaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    | || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  47239468 atacctgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatat 47239507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 114 - 232
Target Start/End: Original strand, 12825465 - 12825583
Alignment:
Q  114 gtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||| |||||||||| |||||| | |||||||    
T  12825465 gtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacggatatatacgtacccaccctgaacctatacccaaacctgtcccgagtgcagaa 12825564  T
Q  214 aattattttatgttgatat 232  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  12825565 aattactttatgttgatat 12825583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 61 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 25941282 - 25941142
Alignment:
Q  61 gaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacg 160  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25941282 gaactaaactcaatttaatgggttttccccactttgatttggtttgggcatgtgtttgggtttttcccgatttcaaaacacgggtacgggacaggtaacg 25941183  T
Q  161 ggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtc 201  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  25941182 ggaagataggtacccaccccgaacccatacccaaacatgtc 25941142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 172
Target Start/End: Original strand, 7334108 - 7334258
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || || ||||  |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||     
T  7334108 taggcatggcaacaaaacccatacttgcgggtatccgcctgaaccaaacctaatttgacgggtttttcccgctttgactgggtttgggtatggatttgga 7334207  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 172  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||| |||||||||    
T  7334208 ttttccccgatttcaaaacac-ggtacgggacggataatggggatataggta 7334258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 197
Target Start/End: Original strand, 21956728 - 21956901
Alignment:
Q  24 gcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttt 123  Q
    |||||||||||||||||||||    || ||||||| |||||||||   |||||||| |||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21956728 gcatgacaacaaaacccataccaacgggtacccgcccgaaccaaatcaaatttgacaggtttttcccattttaattggatttgggtatgagtttgggttt 21956827  T
Q  124 tccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaact 197  Q
    |  ||||||| |||||||||||| || | | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  21956828 tttccgattttaaaacacgggtacggaatgagtaacggggatataggtgcccaccccgaacccatacccaaact 21956901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 149
Target Start/End: Original strand, 1724181 - 1724308
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    ||||||||  |||||||| |||||  ||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  1724181 taggcatggtaacaaaactcatacccgtgtttacccacccgaaccaaactcaatttgacgtgttttccccgttt-gactgggtttgggtatgggtttggg 1724279  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgg 149  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  1724280 tttttcccgatttcaaaacatgggtatgg 1724308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19534592 - 19534428
Alignment:
Q  62 aaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgg 161  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||      || ||||||| ||||   |||||||||||||||||| |    
T  19534592 aaccaaatccaatttgacgggttttctccgttttcattgggtttgggtatgagttt------tctccgattttaaaatctgggtatgggacgggtaacag 19534499  T
Q  162 gtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||  ||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19534498 gtatataggtacccacctcgaactcatacccaaacccgtcacgaatgtagaaaattattttatgttgatat 19534428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 43309614 - 43309468
Alignment:
Q  74 tttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtac 173  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |    
T  43309614 tttgacgggttttctccgctttgactgggtttgagtatgagtttgggtttttcccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacggggttatatgtgc 43309515  T
Q  174 ccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatttt 222  Q
    |||  |  |||||||||||| || |||| |||||| | |||||||||||    
T  43309514 cca--ctgaacccatacccatacctgtctcaaatgtaaaaaattatttt 43309468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 36919307 - 36919131
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | || ||| |   ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| | |||||||||||||| ||||| |    
T  36919307 taggcatgacaacaaaactcatactcgcgggtacgcatccgaaccaaactcaatttgacgggtttttctcgctttaactgggtttgggtatgagtttgag 36919208  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaact 197  Q
    |||||||||| || |||||| | |||| ||||| |||||| | ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||    
T  36919207 ttttccccgactttaaaacatgtgtataggacgagtaacgtggatataggtatccatccttaacccatacccaaact 36919131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 197
Target Start/End: Original strand, 14605908 - 14606012
Alignment:
Q  93 tttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccataccc 192  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14605908 tttgactgagtttgggtatgggtttgggttttctccgatttcaaaatacgggtacgagacgggtaacagggatatatgtacccaccccgaacccataccc 14606007  T
Q  193 aaact 197  Q
    |||||    
T  14606008 aaact 14606012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 39086300 - 39086188
Alignment:
Q  62 aaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgg 161  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| |||| ||||  || |||||||||||    
T  39086300 aaccaaactcaatttgacggattttctccgttttgattgggtttggatatgagtttgagttttctccgatttcacaacatgggtgcggtacgggtaacgg 39086201  T
Q  162 gtatataggtacc 174  Q
    | |||||||||||    
T  39086200 ggatataggtacc 39086188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 176
Target Start/End: Original strand, 41914906 - 41915062
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| |   ||| || |||| | |||||| | | |||||| || ||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  41914906 gtaggcatgacaacaaaacccatgcccatgggtaaccgcccaaaccaaccccgatttgatggattttccccgatttgactgggttcgggtatgagtttgg 41915005  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtaccca 176  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  41915006 gttttccccgatttcaaaatatgggtacgggaagggtaacggggatatatgtaccca 41915062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 158
Target Start/End: Original strand, 19548847 - 19548985
Alignment:
Q  19 cgtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttg 118  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| | ||| ||||  | |||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||| |  |    
T  19548847 cgtagacatgacaacaaaactcatacctatgggtacctacccgaaccaaacccaatttgacgg-ttttcccctctttgactgggtttgggtatggataag 19548945  T
Q  119 ggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 158  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  19548946 ggttttccccgatttcaaaacacaggtacgggacgggtaa 19548985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 45065433 - 45065258
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||| ||||||||||| | |   ||| ||||||| | |||||| | | |||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  45065433 taggcatggcaacaaaacccgtgcccatgggtacccgcccaaaccaaccccgatttgacgagttttccccaatttgactgggtttgggtataggtttagg 45065334  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  45065333 ttttcctcgatttcaaaatacgggtacgggacgagtaacagggatatatgtacccatcccgaacgcatacccaaac 45065258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 47103856 - 47103747
Alignment:
Q  87 ccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaaccc 186  Q
    ||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||    
T  47103856 ccccgatttgactgggtttttgtatgggtttgggttttccccaatttcaaaatacgggtacggggcgggtaacgcggatatatgtacccaccccgaaccc 47103757  T
Q  187 atacccaaac 196  Q
    ||||||||||    
T  47103756 atacccaaac 47103747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 197
Target Start/End: Original strand, 1866460 - 1866636
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||| ||||||||||||| | |  |||| ||| ||| | |||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| || ||||    
T  1866460 taggcaagacaacaaaacccgtgcacgtgggtactcgcccaaaccaaccccgatttgacggattttccccgatttgactaggtctgggtatgagtatggg 1866559  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaact 197  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1866560 tttttcccgatttcaaaatacgggtacgagacgggtaatgcggatatatgtatccaccccgaacccatacccaaact 1866636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 112 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 29527905 - 29527821
Alignment:
Q  112 gggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29527905 gggtttgggttttccccgatttcaaaatacgggtacgtgacgggtaacggggatatatgtacccaccccgaacccatacccaaac 29527821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 216
Target Start/End: Original strand, 12075543 - 12075737
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |  |||  |||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  12075543 taggcatgacaataaaacccatatatgtgggtacctgtccgattcaaactcaatttgacgggtttttcc-gctttgatcgggtttgggtatgagtttgag 12075641  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaat 216  Q
    ||||  || ||||||||||||||||| | ||| |||||  || | ||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||  |||| |||||||    
T  12075642 ttttttccaatttcaaaacacgggtacgtgacaggtaatagggagatatgtacccaccccaaactcgtactcaaactcgtccggaatgtagaaaat 12075737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 146
Target Start/End: Original strand, 12505479 - 12505577
Alignment:
Q  49 ggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggttt-gggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggta 146  Q
    |||||||| | ||||||||| | || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12505479 ggttaccctcccgaaccaaatttaaattgacgggttttctccgctttgattgggtttagggtatgagtttgggttttccccgatttcaaaacacgggta 12505577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Original strand, 35304489 - 35304603
Alignment:
Q  83 ttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaa 182  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||| ||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  35304489 ttttctccgttttgattggatttggatatgggtttgggttttctctaattttaaaacataagtacgggacgggtaacggggatataggtacctaccccaa 35304588  T
Q  183 acccatacccaaact 197  Q
    || ||||||||||||    
T  35304589 actcatacccaaact 35304603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 4741132 - 4741296
Alignment:
Q  25 catgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggtttt 124  Q
    |||||||||||||| ||||| || || || |||  ||||||||||  || |||||  ||||||||||||| || || |||||| |||| ||||| |||||    
T  4741132 catgacaacaaaactcatacatgcgggtatccgtccgaaccaaacataaattgacaagttttccccgttt-gactgagtttggatatgagtttgagtttt 4741230  T
Q  125 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatac 190  Q
    || |||||| |||||| ||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4741231 cctcgattttaaaacatgggtatgggacggataacagggatataagtacccaccccgaacccatac 4741296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 30673146 - 30672993
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||     ||| || |||  | |||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  30673146 gtaggcatgacaacaaaacccatgtccatgggtatccgtccaaaccaaccacaatttgacgggttttccctgatttgattgggtttgggtatgagtttgg 30673047  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtac 173  Q
     ||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| ||| ||||| ||||    
T  30673046 attttctccgattttaaaatacgggtacgggacggataatggggatatatgtac 30672993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 31782707 - 31782622
Alignment:
Q  111 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  31782707 tgggtttgggttttccccgatttcaaaatacgggtacggtacaggtaacggggatatatgtacccaccccaaactcatacccaaac 31782622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Original strand, 33615241 - 33615395
Alignment:
Q  22 aggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggt 121  Q
    |||||||||||| |||||||||   | || |||||   |||||||||| | ||||||| | |||| || | || ||||||||||||||||||||||  ||    
T  33615241 aggcatgacaactaaacccatatccgcgggtacccatccgaaccaaacccgatttgacagattttacctgcttagattgggtttgggtatgggtttaagt 33615340  T
Q  122 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtaccca 176  Q
    ||||| |||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33615341 tttcctcgatttaataaaacaggtatgggacgggtaacggggatataggtaccca 33615395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39188608 - 39188487
Alignment:
Q  111 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacggg-taacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgc 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||  |||| |||||    
T  39188608 tgggtttgggttttccctgattttaaaacacgtctatggaacggggtaacggatatataggtacc-accccaaacccatgtccaaactcatcccgaatgc 39188510  T
Q  210 agaaaattattttatgttgatat 232  Q
    | |||||| ||||||||||||||    
T  39188509 ataaaattgttttatgttgatat 39188487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3737908 - 3737789
Alignment:
Q  73 atttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 172  Q
    ||||||||| ||||  ||| ||||| | ||||| ||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||    
T  3737908 atttgacggattttttccgctttgacttggtttaggtgtgggttagggtttttcccaatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgaggttatatgta 3737809  T
Q  173 cccaccccaaacccataccc 192  Q
    |||| ||| |||||||||||    
T  3737808 cccatcccgaacccataccc 3737789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 196
Target Start/End: Original strand, 31415894 - 31416017
Alignment:
Q  73 atttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 172  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||| || |||| || ||||| |||    
T  31415894 atttaacgggttttccccgatttgactgggtttaggtataagtttggattttctccgatttcaaaatacgggtacgggatggataacagggatatatgta 31415993  T
Q  173 cccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    |||||||| |||||| || |||||    
T  31415994 cccaccccgaacccacactcaaac 31416017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 21544673 - 21544588
Alignment:
Q  111 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21544673 tgggtttggatttttcccgatttcaaaatacgggtacgggacaggtaatggggatatatgtacccaccccgaacccatacccaaac 21544588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 103 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42907988 - 42907875
Alignment:
Q  103 tttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcc 202  Q
    ||||||||||  | || |||||| |||| |||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  42907988 tttgggtatgattatgagttttctccgaattcaaaacacggatacgggacgagtaatggggatataggtacccaccccgagcccatacccaaactcgtcc 42907889  T
Q  203 caaatgcagaaaat 216  Q
    | |||| |||||||    
T  42907888 cgaatgtagaaaat 42907875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 196
Target Start/End: Original strand, 8843755 - 8843890
Alignment:
Q  60 cgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaac 159  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||| |||| |||||  |||| |||||||| ||||||| |||  |||||||||| |    
T  8843755 cgaaccaaattaaatttgacgggttttccgtgctttgactgggtttggatatgtgtttgaatttttcccgattttaaaacacaggtgcgggacgggtagc 8843854  T
Q  160 gggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    ||| |||||| |||||| ||| ||| |||||||||||    
T  8843855 ggggatatagataccca-cccgaactcatacccaaac 8843890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 196
Target Start/End: Original strand, 8856719 - 8856854
Alignment:
Q  60 cgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaac 159  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||| |||| |||||  |||| |||||||| ||||||| |||  |||||||||| |    
T  8856719 cgaaccaaattaaatttgacgggttttccgtgctttgactgggtttggatatgtgtttgaatttttcccgattttaaaacacaggtgcgggacgggtagc 8856818  T
Q  160 gggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    ||| |||||| |||||| ||| ||| |||||||||||    
T  8856819 ggggatatagataccca-cccgaactcatacccaaac 8856854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 180
Target Start/End: Original strand, 15733468 - 15733596
Alignment:
Q  52 tacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatggga 151  Q
    ||||||| | |||||| | | ||||||  ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||    
T  15733468 tacccgcccaaaccaaccccgatttgataggttttccccgattttattaggtttgggtatggatatgagttttcctcgatttcaaaatacgggtacgaga 15733567  T
Q  152 cgggtaacgggtatataggtacccacccc 180  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  15733568 cgggtaacggagatatatgtacccacccc 15733596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 109
Target Start/End: Original strand, 53906249 - 53906337
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||    ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  53906249 taggcatggcaacaaaacccatacccacggttatccgcccgaaccaaacccaatttgacgggtttttcccgttttgactgggtttgggt 53906337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9230376 - 9230269
Alignment:
Q  111 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgca 210  Q
    |||||||||||||| ||| | || | ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||    
T  9230376 tgggtttgggtttttcccaaatttataacacgggtataggacggataacgagtatataggtatccatcccaaactcataaccaaacccgtcccgaatgca 9230277  T
Q  211 gaaaatta 218  Q
    ||||||||    
T  9230276 gaaaatta 9230269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 11696952 - 11696839
Alignment:
Q  71 caatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatagg 170  Q
    ||||||||  |||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||  ||||||    ||||||     
T  11696952 caatttgataggttttcttcgtgttgactgggtttgggtatgggtttaggttttctccgatttcaaaacaccggtatgagataggtaacaatgatataga 11696853  T
Q  171 tacccaccccaaac 184  Q
    ||||||||||||||    
T  11696852 tacccaccccaaac 11696839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 196
Target Start/End: Original strand, 25298834 - 25298919
Alignment:
Q  111 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||    
T  25298834 tgggtttgggtttttccggatttcaaaacacgggtacgggatgggtaatggggatatagctgtccaccccgaacccatacccaaac 25298919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Original strand, 53906346 - 53906427
Alignment:
Q  151 acgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| | ||||||| || ||||||||||    
T  53906346 acgggtaacaggtatataggtacccaccccgaacccatatctaaactcgtcccaaatgtaaaaaattacttcatgttgatat 53906427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Original strand, 50375832 - 50375999
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||   | || || |||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||| |      ||||    
T  50375832 taggcatgacaacaaaacc-ataaccgcgggtaaccgcccgaaccaaactcaattcgacggatttttcccgctttgattgggtttgggca------tggg 50375924  T
Q  121 ttttccccga-tttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaa 194  Q
    |||||||| | ||||||||||  |||||| ||||||||||  | |||||  ||| |||||||||| |||||||||    
T  50375925 ttttccccaattttcaaaacataggtatgagacgggtaacatgaatatatatactcaccccaaactcatacccaa 50375999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 196
Target Start/End: Original strand, 10574420 - 10574505
Alignment:
Q  111 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| |||||||||||    
T  10574420 tgggtttgaattttccccgatttcataatacaggtacgggacgggtaacggggatatatgtacccgccccgaactcatacccaaac 10574505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 196
Target Start/End: Original strand, 30266331 - 30266416
Alignment:
Q  111 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30266331 tgggtttggtttttttccgatttcataatacgggtacaggacgggtaacggggatatatgtatccaccccgaacccatacccaaac 30266416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 30285857 - 30285772
Alignment:
Q  111 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30285857 tgggtttggtttttttccgatttcataatacgggtacaggacgggtaacggggatatatgtatccaccccgaacccatacccaaac 30285772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 195
Target Start/End: Original strand, 9929160 - 9929252
Alignment:
Q  103 tttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaa 195  Q
    ||||||||||||| || ||||| || |||||||||| |||||||| | |||||||||  | ||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  9929160 tttgggtatgggtatgagtttttcctgatttcaaaatacgggtatagtacgggtaacatggatataggtacccaccccgaactcttacccaaa 9929252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 173
Target Start/End: Original strand, 25265116 - 25265227
Alignment:
Q  61 gaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacg 160  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||  ||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||||    
T  25265116 gaactaaacttaatttgacgggttttttccgctttgactgcgtttgggtatggctt-gggttttccccgattttaaaacatgggtacgggataggtaacg 25265214  T
Q  161 ggtatataggtac 173  Q
     | || |||||||    
T  25265215 tggatgtaggtac 25265227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 18423722 - 18423599
Alignment:
Q  73 atttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggta 172  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||| |||||||  || |||||| || |||| || ||||||||||||| | ||||| |||    
T  18423722 atttgacaggttttcccctatttgattgggtttgagtataagttcgggttttttccaatttcataatacggatacgggacgggtaacgaggatatatgta 18423623  T
Q  173 cccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    | || ||| |||||||||| ||||    
T  18423622 ctcatcccgaacccatacctaaac 18423599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 36306875 - 36306816
Alignment:
Q  115 tttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacc 174  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  36306875 tttggattttctccgatttcaaaacacgggtatgagacggttaacggggatataggtacc 36306816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 50684579 - 50684476
Alignment:
Q  93 tttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccataccc 192  Q
    ||||| |||||||| ||||| | |||||||| ||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||  |||||| |||||| ||  ||| |||||||    
T  50684579 tttgagtgggtttgagtatgagcttgggtttaccccgattttaaaatacggatacgggacgggtaacggagatatagatacccatccggaactcataccc 50684480  T
Q  193 aaac 196  Q
    ||||    
T  50684479 aaac 50684476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 43553580 - 43553498
Alignment:
Q  71 caatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacg 153  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||  ||| | ||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  43553580 caatttgacgggttttctccgctttgactgagtttgggtatgcatttcgatttttttcgatttcaaaacacgggtatgggacg 43553498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Original strand, 17112940 - 17113092
Alignment:
Q  28 gacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccc 127  Q
    |||||||||||| |||| ||||  ||| |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||| || ||||||| ||| |||| | ||||| |    
T  17112940 gacaacaaaacctatacatgtgagtactcgcttgaatcaaacacaatttgacggattttctccgctttgactgagtttgggaatgagttt-gattttctc 17113038  T
Q  128 cgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccacccca 181  Q
    |||||  |||||||||||| |  ||||||||  |  ||||||| ||||||||||    
T  17113039 cgattctaaaacacgggtacgatacgggtaaaagagatataggcacccacccca 17113092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 39188687 - 39188598
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggt 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||  |  ||||| |||| |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  39188687 gtaggcatgacaacaaaactcatacacgtggttacttgtccgaactaaacccaatttgatgggttttttctgttttgattgggtttgggt 39188598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 11173067 - 11173020
Alignment:
Q  111 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  11173067 tgggtttgggttttccccgatttcaaaatacgggtacgggacaggtaa 11173020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16575203 - 16575093
Alignment:
Q  114 gtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaa 213  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| |||| || ||||| | ||||| |||||||| || |||| ||||||||||| |||  ||||| | ||    
T  16575203 gtttgggtattcctcgattttaaaacgcgggtacgggatggataacgaggatataagtacccactccgaacctatacccaaactcgtcttaaatgtaaaa 16575104  T
Q  214 aattattttat 224  Q
    ||||| |||||    
T  16575103 aattaatttat 16575093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 425943 - 425855
Alignment:
Q  24 gcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgg 113  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  |||||| |||  ||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  425943 gcatgacaacaaaactcatactcgtggttatccgtccgaacctaacctaatttg-ggggtttttcccgttttgactgggtttggatatgg 425855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 152
Target Start/End: Original strand, 4737863 - 4737944
Alignment:
Q  71 caatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggac 152  Q
    ||||| || |||||||||||  ||||| | ||||||  |||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  4737863 caattcgatgggttttcccccctttgacttggtttgaatatgagtttgggttttcctcgattttaaaacatgggtatgggac 4737944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 88
Target Start/End: Original strand, 13768365 - 13768430
Alignment:
Q  23 ggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttcc 88  Q
    |||||| |||||||||| ||||   ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13768365 ggcatggcaacaaaaccgatacccatggttacccacccgaatcaaactcaatttgacgggttttcc 13768430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 146
Target Start/End: Original strand, 4766283 - 4766370
Alignment:
Q  63 accaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgg------gtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggta 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   |||||| |||||||||      |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4766283 accaaacttaatttgacgggttttcct--ttttgaatgggtttggatatgggtatgggtataggttttccccgaattcaaaacacgggta 4766370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 24637275 - 24637240
Alignment:
Q  111 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggta 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24637275 tgggtttgggttttccccgatttcaaaatacgggta 24637240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 232
Target Start/End: Original strand, 28695194 - 28695264
Alignment:
Q  162 gtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||  || |||||  |||||||||||||    
T  28695194 gtatataggtactcaccccgaactcatacccaaactcgtctcaaatataggaaattgctttatgttgatat 28695264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 97
Target Start/End: Original strand, 12825385 - 12825460
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttga 97  Q
    ||||| |||||||||||||||||||   || ||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12825385 gtaggtatgacaacaaaacccatacccttgattacccg-tcgaacaaaacttaatttgacgtgtttt-cccgttttga 12825460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 154
Target Start/End: Original strand, 29035495 - 29035576
Alignment:
Q  73 atttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgg 154  Q
    |||||| |||| || |||||||||| || ||||  ||||||||||||| ||||| | |||| ||||||| |||| |||||||    
T  29035495 atttgatgggtatttcccgttttgactgtgtttcagtatgggtttgggctttcctcaattttaaaacaccggtacgggacgg 29035576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 154
Target Start/End: Original strand, 29047628 - 29047709
Alignment:
Q  73 atttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgg 154  Q
    |||||| |||| || |||||||||| || ||||  ||||||||||||| ||||| | |||| ||||||| |||| |||||||    
T  29047628 atttgatgggtatttcccgttttgactgtgtttcagtatgggtttgggctttcctcaattttaaaacaccggtacgggacgg 29047709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 196
Target Start/End: Original strand, 33516097 - 33516158
Alignment:
Q  135 aaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    |||||||||||| | || ||||||| || ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  33516097 aaaacacgggtacgagatgggtaacagggatataagtacccaccccgaacctatacccaaac 33516158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 33916242 - 33916145
Alignment:
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaatt 217  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| || | ||||| |||  || ||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||    
T  33916242 gttttcccggatttcaaatcacggatacgagacggataatagggatataagtacctacccaaaactcatacccaaactcatcccaaatgtaaaaaatt 33916145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 37246948 - 37246904
Alignment:
Q  102 gtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggta 146  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  37246948 gtttgggtatgtgtttggattttcctcgattttaaaacacgggta 37246904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33578 - 33363
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgat------tgggtttgggtatgg 113  Q
    ||||||||| |||||||||| |||   |||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||      |||||||||||||||    
T  33578 gtaggcatggcaacaaaacctatatccgtggttacccacctgaactaaactcaatttgacgggttttacccgttttgatcgggtttgggtttgggtatgg 33479  T
Q  114 gtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  33478 gtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatatgtacccaccccgaacccatacccaaactcgtcccgaatgcagaa 33379  T
Q  214 aattattttatgttga 229  Q
    || || ||||||||||    
T  33378 aactactttatgttga 33363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 90756 - 90564
Alignment:
Q  34 aaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgattt 133  Q
    ||||| |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||      ||||||||||    
T  90756 aaaactcatacccgtggttacccgcccgaactaaactcaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggtatgggttt------tccccgattt 90663  T
Q  134 caaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  90662 caaaacacgggtatgagacggttaacgggtatattggtaccctccccgaacccatacacaaattcgtcctgaatgcagaaaattattttatgttgatat 90564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0519 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0519
Description:

Target: scaffold0519; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10468 - 10264
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||       
T  10468 taggcatgacaacaaaacccatacatgcggttacctgtccgaaccaaatccaatttgacgggttttttccgttttgactaggtttgggtatgggtttt-- 10371  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattatt 220  Q
         |||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||| |    
T  10370 -----cccgctttccaaacacgggtatgggacggataacaggtatataggtacccactacgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattact 10276  T
Q  221 ttatgttgatat 232  Q
    || |||||||||    
T  10275 ttgtgttgatat 10264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 14098 - 14230
Alignment:
Q  25 catgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggtttt 124  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14098 catgacaacaaaactcatactcgtggttacccacccaaaccaaacccaatttgacgggtttttcccgttttgtttgggtttgggtatgagtttgagtttt 14197  T
Q  125 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 158  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  14198 ccccgattt-aaaacacgggtatggaacgggtaa 14230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14912 - 14742
Alignment:
Q  62 aaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgg 161  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||  | ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||| ||| ||    
T  14912 aaccaaatttaatttgacggggtttttcagttttcactggatttgggtatgagtttgggttttctccgatttcaaaacacatgcatgggacggataatgg 14813  T
Q  162 gtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    |||||||||||||||||   ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14812 gtatataggtacccaccttgaacacatacccaaactcgtcccaaatgtagaaaattatttaatgttgatat 14742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0795 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0795
Description:

Target: scaffold0795; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 401 - 267
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttggg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |  |    
T  401 taggcatgacaacaaaacccatatccgtgattacccgccagaaccaaactcaatt-gacgggttttctccgttttgactgagtttgggtatgggtatcag 303  T
Q  121 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggt 156  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  302 ttttcctcaatctcaaaacacgggtatgggacgggt 267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 7875 - 7738
Alignment:
Q  20 gtaggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgg 119  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |    
T  7875 gtaggcatgccaacaaaatccatacccgtggttacccacccgaactaaatttaatttgacgggttttccccgttttgattgagtttgggtatgtg-ttag 7777  T
Q  120 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 158  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7776 attttctccaatttcaaaacacgggtatgagacgggtaa 7738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 67896 - 67752
Alignment:
Q  52 tacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatggga 151  Q
    ||||||| | |||||| | | ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| || ||||    
T  67896 tacccgcccaaaccaaccccgatttgacaggttttccccgatttgactgggtttgagtatgggtttggattttccccgattttaaaatacggatacggga 67797  T
Q  152 cgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||||||||| | || ||||||||||    
T  67796 cggataacggggatatatgtacccaccccgagcctatacccaaac 67752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 75739 - 75595
Alignment:
Q  52 tacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatggga 151  Q
    ||||||| | |||||| | | ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| || ||||    
T  75739 tacccgcccaaaccaaccccgatttgacaggttttccccgatttgactgggtttgagtatgggtttggattttccccgattttaaaatacggatacggga 75640  T
Q  152 cgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||||||||| | || ||||||||||    
T  75639 cggataacggggatatatgtacccaccccgagcctatacccaaac 75595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 211470 - 211366
Alignment:
Q  93 tttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccataccc 192  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  211470 tttgactgagtttgggtatgggtttgggttttctccgatttcaaaatacgggtacgagacgggtaacagggatatatgtacccaccccgaacccataccc 211371  T
Q  193 aaact 197  Q
    |||||    
T  211370 aaact 211366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 3075 - 2972
Alignment:
Q  93 tttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccataccc 192  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  3075 tttgactgggtttgggtatgagtttgggttttccccgatttcaaaatacgggtacaggacggataactgggatatatgtacccaccccgaacccatactc 2976  T
Q  193 aaac 196  Q
    ||||    
T  2975 aaac 2972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 14998 - 14900
Alignment:
Q  49 ggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggttt-gggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggta 146  Q
    |||||||| | ||||||||| | || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14998 ggttaccctcccgaaccaaatttaaattgacgggttttctccgctttgattgggtttagggtatgagtttgggttttccccgatttcaaaacacgggta 14900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Original strand, 128103 - 128206
Alignment:
Q  93 tttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccataccc 192  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||  || |||||| || ||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  128103 tttgattgggtttgagtatgagtttgggttttttccaatttcataatacgggtacgggacgggtaatggggatatatgtacccaccccgaacccataccc 128202  T
Q  193 aaac 196  Q
    ||||    
T  128203 aaac 128206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Original strand, 105451 - 105554
Alignment:
Q  93 tttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccataccc 192  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||  ||||||||  || ||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  105451 tttgattgggtttgagtatgggattggattttttccgatttcttaatacgggtacgggacgggtaacagggatatatgtacccaccccgaacccataccc 105550  T
Q  193 aaac 196  Q
    ||||    
T  105551 aaac 105554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:

Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4339 - 4224
Alignment:
Q  118 gggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatg-cagaaaat 216  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||     
T  4339 gggtttttctcgatttcaaaacacgggtatgagactggtaacgagtatatttgtacccacttcaaacccatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaaaa 4240  T
Q  217 tattttatgttgatat 232  Q
    || |||||||||||||    
T  4239 tactttatgttgatat 4224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 70193 - 70098
Alignment:
Q  101 ggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    |||||| ||||| |||||| |||| || ||||||| || ||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  70193 ggtttgagtatgagtttggatttttcctgatttcataatacgggtacgggacgggtaacgaggatatatgtacccaccccaaacccatacccaaac 70098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 36242 - 36135
Alignment:
Q  111 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgca 210  Q
    |||||||||||||| ||| | || | ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||    
T  36242 tgggtttgggtttttcccaaatttataacacgggtataggacggataacgagtatataggtatccatcccaaactcataaccaaacccgtcccgaatgca 36143  T
Q  211 gaaaatta 218  Q
    ||||||||    
T  36142 gaaaatta 36135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 224
Target Start/End: Original strand, 107361 - 107504
Alignment:
Q  81 ggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccacccc 180  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |    ||||| |||||||||||    
T  107361 ggttttccccactttgattgggtttaggtataggtttgagtttttctcgatttcaaaacacaggtatgggacgggtagcatagatataagtacccacccc 107460  T
Q  181 aaacccatacccaaacttgtcccaaatgcagaaaattattttat 224  Q
     ||| ||||  |||||| || || ||||  |||||||| |||||    
T  107461 gaactcatattcaaactcgttccgaatgttgaaaattactttat 107504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 232
Target Start/End: Original strand, 197329 - 197448
Alignment:
Q  113 ggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacttgtcccaaatgcaga 212  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||  ||||| || |||||||||||||  || || | ||||||||||  ||||| ||||||||    
T  197329 ggtttgagtttttccctatttcaaaacacggatatgagacaagtaacaggcatataggtacccaaaccgaatctatacccaaacccgtcccgaatgcaga 197428  T
Q  213 aaattattttatgttgatat 232  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  197429 aaattactttatgttgatat 197448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 85
Target Start/End: Original strand, 197259 - 197323
Alignment:
Q  21 taggcatgacaacaaaacccatacttgtggttacccgctcgaaccaaactcaatttgacgggttt 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |  |||| |||||  ||||||||||||||    
T  197259 taggcatgacaacaaaactcatacatgtggttatctgtccgaatcaaacctaatttgacgggttt 197323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 191
Target Start/End: Original strand, 4541 - 4661
Alignment:
Q  70 tcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatag 169  Q
    |||||||||  ||||||  ||||||| | || ||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  4541 tcaatttgattggttttatccgttttaactgagtttgagtatgagtttgg-ttttccccaatttcaaaatacgggtatgggacaggtaacagggatatag 4639  T
Q  170 gtacccaccccaaacccatacc 191  Q
     |||||||| | ||||||||||    
T  4640 ctacccaccacgaacccatacc 4661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 17040 - 16970
Alignment:
Q  126 cccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  17040 cccgatttcaaaatacgtgtatgggacgggtgacggggatatatgtacccaccccgaactcatatccaaac 16970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 196
Target Start/End: Original strand, 55893 - 55982
Alignment:
Q  106 gggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||  ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  55893 gggtatggatttgggttttccccaatttcaaaatatgggtacagga-gggtaacagggatatatgtacccaccccgaatccatacccaaac 55982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33690 - 33554
Alignment:
Q  103 tttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaa-cacgggtatgggacgggtaacgggtatat------aggtacccaccccaaacccatacccaaa 195  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||  ||||||      | || | ||||||||||||||| |||||    
T  33690 tttggatataggtttgggttttctccgatttaaaaaacacgggtatgagacgggtaacatgtatatgtatataagtcctcaccccaaacccataaccaaa 33591  T
Q  196 cttgtcccaaatgcagaaaattattttatgttgatat 232  Q
    |  ||| ||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  33590 cccgtcacaaatgcagaaaactactttatgatgatat 33554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 449808 - 449715
Alignment:
Q  93 tttgattgggtttgggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaaccc 186  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  | |||  |||| ||||||| ||| | | | ||||||||||| |||||    
T  449808 tttgactgggtttgggtttgggtttgggttttccccgattttaaaggatgggggtggggcgggtaatggggaaacatgtacccaccccgaaccc 449715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 196
Target Start/End: Original strand, 20742 - 20824
Alignment:
Q  114 gtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||| |||||  || ||||| | ||||||||| |||||    
T  20742 gtttggatttttcccgatttcaaaactcgagtatgagacgggtaatggggatataaatatccacctcgaacccatactcaaac 20824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 196
Target Start/End: Original strand, 17471 - 17540
Alignment:
Q  127 ccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaac 196  Q
    |||||||||||||| || ||  ||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||    
T  17471 ccgatttcaaaacatggatacaggaagggtaacggggatataggtatccatcccaaacccttatccaaac 17540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University