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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF17537_high_16 (Length: 328)
Name: NF17537_high_16
Description: NF17537
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF17537_high_16 |
 |  |
|
| [»] chr4 (37 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr3 (43 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr5 (43 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0076 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr8 (36 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr7 (43 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0116 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0026 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr2 (35 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr1 (24 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr6 (34 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0023 (4 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0008 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0139 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0215 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0022 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0369 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0529 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold1711 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0772 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0420 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0498 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0266 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0302 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0049 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0413 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0175 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0025 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0195 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0077 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0075 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0218 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0162 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0125 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0011 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0001 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0132 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0012 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0106 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1542 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0066 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0009 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0761 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0107 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold1500 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0018 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0213 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0383 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0361 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0104 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0191 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold1560 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0467 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0183 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0092 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0028 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0892 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0084 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0017 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0078 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0141 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0124 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0003 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0155 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0516 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0622 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0151 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1666 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0123 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0032 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold1272 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0406 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0243 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0165 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0020 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0006 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0409 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0389 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0700 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0138 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 37)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 10644227 - 10644554
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10644227 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
10644326 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
10644327 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaat |
10644426 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatga |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10644427 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatga |
10644526 |
T |
 |
| Q |
301 |
ttgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10644527 |
ttgtgataataactaacccccttacctt |
10644554 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 47357662 - 47357989
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
47357662 |
atccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca |
47357761 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |
|
|
| T |
47357762 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat |
47357861 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatga |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47357862 |
ccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaggaaatgcaaaattacatga |
47357961 |
T |
 |
| Q |
301 |
ttgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47357962 |
ttgtgataataactaacccccttacctt |
47357989 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13048477 - 13048261
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13048477 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatctaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaaca |
13048378 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
13048377 |
acttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaa |
13048278 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacata |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13048277 |
tcatgcatacaaacata |
13048261 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15675341 - 15675105
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15675341 |
catgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaact |
15675242 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || ||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15675241 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
15675143 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15675142 |
tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
15675105 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 226
Target Start/End: Original strand, 31115640 - 31115861
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
31115640 |
catgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaact |
31115739 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| || | ||| ||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31115740 |
tagga-aaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
31115838 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacag |
226 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
31115839 |
tgcatacaaacatatcatcacag |
31115861 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 61 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10104445 - 10104281
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttg |
160 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
10104445 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg |
10104347 |
T |
 |
| Q |
161 |
aacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacag |
226 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
10104346 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacag |
10104281 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 226
Target Start/End: Original strand, 13246441 - 13246662
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13246441 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact |
13246540 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13246541 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcattaattca |
13246639 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacag |
226 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
13246640 |
tgcatacaaacatatcatcacag |
13246662 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 17145845 - 17145575
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacata-ttt |
159 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
17145845 |
aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatca-aaattcactaattgagtataatt-tcacaacttaacatttatacatacttt |
17145748 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc |
258 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||| | | || ||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17145747 |
gaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgtacaagaaaatagcatcacagtaagagcacgaatttaacatcaattgttcatc |
17145648 |
T |
 |
| Q |
259 |
aatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17145647 |
aactcattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttacctt |
17145575 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 328
Target Start/End: Original strand, 18248286 - 18248556
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacata-ttt |
159 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
18248286 |
aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatta-aaattcactaattgagtataatt-tcatatcttaacatttatacatacttt |
18248383 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc |
258 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| | |||| ||| || ||| |||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18248384 |
gaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatc |
18248483 |
T |
 |
| Q |
259 |
aatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18248484 |
aacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacaagattatgataataactaacccccttacctt |
18248556 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 54118496 - 54118276
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatc-aacaacaac |
102 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
54118496 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaactataacatcaattgaacaagaatcataact-aaatctaacaacaac |
54118398 |
T |
 |
| Q |
103 |
ttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattc |
202 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| || || | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54118397 |
ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaattgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattc |
54118299 |
T |
 |
| Q |
203 |
atgcatacaaacataacatcaca |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
54118298 |
atgcatacaaacatatcatcaca |
54118276 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 18169109 - 18169308
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134 |
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231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18169109 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
18169208 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18169209 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
18169308 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
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Query Start/End: Original strand, 94 - 226
Target Start/End: Original strand, 121990 - 122121
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| Q |
94 |
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193 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
121990 |
aacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattat |
122088 |
T |
 |
| Q |
194 |
catcaattcatgcatacaaacataacatcacag |
226 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
122089 |
catcaattcatgcatacaaacatatcatcacag |
122121 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 7132182 - 7131983
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| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
7132182 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga |
7132083 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7132082 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatataacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
7131983 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 19020625 - 19020824
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19020625 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
19020724 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19020725 |
gcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgacaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatggtaactaacccccttacctt |
19020824 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 20000862 - 20001061
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| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| || |||||||||||||||| | || ||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
20000862 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccagaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaaga |
20000961 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20000962 |
gcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
20001061 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15287362 - 15287163
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| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| || | |||| ||||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15287362 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
15287263 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15287262 |
gcacgaatttagctataattgttcatcatcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
15287163 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40885749 - 40885585
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| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacata-ttt |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| | || |||||||||| || | ||| ||||||||| |||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
40885749 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagca-aagttcaccaattgagcataatt-tcataacttgacatttatacatacttt |
40885652 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacag |
226 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
40885651 |
gaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacag |
40885585 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15294471 - 15294272
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| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| || | |||| ||||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15294471 |
tcataacttaacatttatatatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
15294372 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15294371 |
gcacgaatttagctataattgttcatcatcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
15294272 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 26680209 - 26680447
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| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| | || ||| | || ||| | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
26680209 |
atccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactaca |
26680308 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
|| | | ||||||| | |||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26680309 |
acat--gtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaat |
26680406 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
26680407 |
tcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
26680447 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 292
Target Start/End: Original strand, 22738412 - 22738568
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| Q |
138 |
aacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcac |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
22738412 |
aacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagaacac |
22738511 |
T |
 |
| Q |
236 |
gaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
292 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22738512 |
gaatttaacatcaattgttcctcagcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa |
22738568 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22352086 - 22351982
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caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt |
323 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22352086 |
caagagcatgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt |
22351987 |
T |
 |
| Q |
324 |
acctt |
328 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
22351986 |
acctt |
22351982 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 328
Target Start/End: Original strand, 26339253 - 26339357
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227 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt |
323 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26339253 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt |
26339352 |
T |
 |
| Q |
324 |
acctt |
328 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
26339353 |
acctt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 219 - 319
Target Start/End: Original strand, 8378377 - 8378480
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219 |
catcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataacta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8378377 |
catcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgattatgataataacta |
8378476 |
T |
 |
| Q |
316 |
accc |
319 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
8378477 |
accc |
8378480 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
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Target Start/End: Original strand, 10488702 - 10488809
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| Q |
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tcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagc |
233 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
10488702 |
tcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagc |
10488801 |
T |
 |
| Q |
234 |
acgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
10488802 |
acgaattt |
10488809 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16328049 - 16327942
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagc |
233 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
16328049 |
tcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagc |
16327950 |
T |
 |
| Q |
234 |
acgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
16327949 |
acgaattt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 207
Target Start/End: Original strand, 8374576 - 8374722
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| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacata-ttt |
159 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
8374576 |
aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatta-aaattcactaattgagtataat-ttcataacttaacatttatacatacttt |
8374673 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgca |
207 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
8374674 |
gaagcatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca |
8374722 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
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4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatca |
82 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
111406 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatca |
111484 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
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185 |
tacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
33240891 |
tacaatcatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
33240947 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
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266 |
tttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9795499 |
tttcatacaacatgagaaaatgaaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
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157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
223 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15044990 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca |
15045057 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
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| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
223 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15109434 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca |
15109367 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18238240 - 18238157
Alignment:
| Q |
159 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat-tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18238240 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt |
18238157 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 222
Target Start/End: Original strand, 7850090 - 7850228
Alignment:
| Q |
84 |
atctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatt |
183 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||| | || |||| || || || ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
7850090 |
atctcaattcaacaatcacttagcaaaatttcatcacttgagcacaattttcataacttcacattttcacataattggacatacaattccaccaacaatc |
7850189 |
T |
 |
| Q |
184 |
gtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatc |
222 |
Q |
| |
|
||| || |||||||| ||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7850190 |
acacagttttcatcaatacattcattcaaacataacatc |
7850228 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13442777 - 13442676
Alignment:
| Q |
142 |
taacatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaat |
239 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
13442777 |
taacattttcacatactatgaacatgcaatttcacaaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaat |
13442678 |
T |
 |
| Q |
240 |
tt |
241 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
13442677 |
tt |
13442676 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 13590254 - 13590213
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
102 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
13590254 |
aacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaac |
13590213 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 328
Target Start/End: Original strand, 14996444 - 14996476
Alignment:
| Q |
296 |
catgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14996444 |
catgattatgataataactaacccccttacctt |
14996476 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 101
Target Start/End: Original strand, 18276501 - 18276541
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaa |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
18276501 |
aacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaa |
18276541 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 43)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 16821147 - 16821474
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16821147 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
16821246 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
16821247 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat |
16821346 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatga |
300 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16821347 |
ttatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacggatttgacataaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatga |
16821446 |
T |
 |
| Q |
301 |
ttgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16821447 |
ttgtgataataactaacccccttacctt |
16821474 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 55316227 - 55316555
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
55316227 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaaca |
55316326 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |
|
|
| T |
55316327 |
acttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaat |
55316426 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaaattacatg |
299 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
55316427 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaattacatg |
55316526 |
T |
 |
| Q |
300 |
attgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
55316527 |
attgtgataataactaacccctttacctt |
55316555 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 41270083 - 41270411
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
41270083 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaaca |
41270182 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||| |
|
|
| T |
41270183 |
acttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaattccaccaacaatcatacaactaacatcaat |
41270282 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaaattacatg |
299 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
41270283 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagtagatgcaaaaattacatg |
41270382 |
T |
 |
| Q |
300 |
attgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41270383 |
attgtgataataactaacccccttacctt |
41270411 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 328
Target Start/End: Original strand, 15614845 - 15615168
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
15614845 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaacaataact |
15614944 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15614945 |
tagca-aaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcatcaattca |
15615043 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatgattg |
303 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15615044 |
tgcatacaaatataacaccacagtaagagcacaaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacatgatta |
15615143 |
T |
 |
| Q |
304 |
tgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15615144 |
tgataaagactaacccccttacctt |
15615168 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15936882 - 15936553
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15936882 |
atccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca |
15936783 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15936782 |
acttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat |
15936684 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---aca |
297 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |
|
|
| T |
15936683 |
tcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaaca |
15936584 |
T |
 |
| Q |
298 |
tgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||| | || ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15936583 |
tgattataatgataactaacccccatacctt |
15936553 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15938724 - 15938395
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15938724 |
atccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca |
15938625 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15938624 |
acttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat |
15938526 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---aca |
297 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||| |||| ||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |
|
|
| T |
15938525 |
tcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaaca |
15938426 |
T |
 |
| Q |
298 |
tgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15938425 |
tgattataatgataactaacccccttacctt |
15938395 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14842816 - 14842577
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14842816 |
atccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca |
14842717 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14842716 |
acttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaattatcttcaat |
14842618 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14842617 |
tcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
14842577 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13975977 - 13975738
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
13975977 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgaca |
13975878 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||| |
|
|
| T |
13975877 |
acttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaat |
13975778 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
13975777 |
tcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
13975738 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 45860813 - 45861052
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
45860813 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgaca |
45860912 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||| |
|
|
| T |
45860913 |
acttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaat |
45861012 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
45861013 |
tcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
45861052 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13955145 - 13954906
Alignment:
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1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
13955145 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgaca |
13955046 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||| |
|
|
| T |
13955045 |
acttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaat |
13954946 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
13954945 |
tcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
13954906 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15859276 - 15859040
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4 |
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103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||| |
|
|
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15859276 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaact |
15859177 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15859176 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
15859078 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15859077 |
tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
15859040 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 51158270 - 51158034
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
51158270 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact |
51158171 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51158170 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
51158072 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
51158071 |
tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
51158034 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12030399 - 12030163
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| || |||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
12030399 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaattaacaataact |
12030300 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || |||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12030299 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattca |
12030201 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
12030200 |
tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
12030163 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 61 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 12264981 - 12264710
Alignment:
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159 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | || |||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
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aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaatttcatcaattaagtataat-ctcataacttaacatttatacatacttt |
12264883 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc |
258 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
12264882 |
gaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatc |
12264783 |
T |
 |
| Q |
259 |
aatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12264782 |
aacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
12264710 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 2049821 - 2050057
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
2049821 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaattaacaacaact |
2049920 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || ||||| ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2049921 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattca |
2050019 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
2050020 |
ggcatacaaacatatcgtcacagttggagcacgaattt |
2050057 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 13838905 - 13839141
Alignment:
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4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
13838905 |
catgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaact |
13839004 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13839005 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca |
13839103 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13839104 |
tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
13839141 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17912733 - 17912516
Alignment:
| Q |
4 |
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103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| | ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
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catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcgattgaacatgaatcatagctcaattcaactacaaca |
17912634 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
|| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17912633 |
ta--tcaaattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
17912536 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatca |
223 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17912535 |
tgcatacaaacatatcatca |
17912516 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 49232575 - 49232774
Alignment:
| Q |
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
49232575 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
49232674 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49232675 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
49232774 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 12902207 - 12902008
Alignment:
| Q |
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12902207 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaaga |
12902108 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12902107 |
gcacgaatttagcaaaaattattcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt |
12902008 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 18911132 - 18911331
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| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
18911132 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga |
18911231 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18911232 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 22275348 - 22275547
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| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || || ||||||||||||| |
|
|
| T |
22275348 |
tcatgacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatggcatcacagcaaga |
22275447 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaat---tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22275448 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25058878 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
25058977 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatta---catgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25058978 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtgcatgattatgataataactaacccccttacctt |
25059077 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15468585 - 15468258
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4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||| |||| ||||| | | ||||||||| ||| |||||| |||||||| |||| | ||| |
|
|
| T |
15468585 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaatcaaaaca |
15468486 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaatt |
201 |
Q |
| |
|
|| | || |||| ||||| |||| ||| |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| |
|
|
| T |
15468485 |
tatca-aatttcatcaattaagtataatt-tcatgacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaatt |
15468388 |
T |
 |
| Q |
202 |
catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaat---tacat |
298 |
Q |
| |
|
|||||| | || ||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
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|
| T |
15468387 |
catgcacaagaaaatagcatcatagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcctcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatttgtacat |
15468288 |
T |
 |
| Q |
299 |
gattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15468287 |
gattatgataataactaacccccttacctt |
15468258 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 328
Target Start/End: Original strand, 54651529 - 54651795
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tcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacata-tttg-aa |
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Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| || |
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|
| T |
54651529 |
tcaatggaacatgaattacatctcatttcaacaacaacatatca-aaattcaccaattgagtataatt-tcataacttaacatttatacatactttgcaa |
54651626 |
T |
 |
| Q |
163 |
catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatc |
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Q |
| |
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| T |
54651627 |
catgcaatttcactcacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaacc |
54651726 |
T |
 |
| Q |
263 |
cattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||| |||| | || |||||||||||||| |
|
|
| T |
54651727 |
cattttcatacaacatgagaaattgcaaaaattgaacatgattatgatgaagacaaacccccttacctt |
54651795 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 1467856 - 1467657
Alignment:
| Q |
134 |
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231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1467856 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
1467757 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1467756 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
1467657 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 133 - 328
Target Start/End: Original strand, 5228451 - 5228650
Alignment:
| Q |
133 |
ctcataacttaacatttttacatatttg--aacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaag |
230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
5228451 |
ctcataacttaacatttatacatattttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaaggaaataacatcacagcaag |
5228550 |
T |
 |
| Q |
231 |
agcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacct |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5228551 |
agcacgaatttagcaacaa-tgttcatcaacccattttcataacacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacct |
5228649 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 163 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18897130 - 18896962
Alignment:
| Q |
163 |
catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatc |
262 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |
|
|
| T |
18897130 |
catgtaattccacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttatcaacaattgttcatcaacc |
18897031 |
T |
 |
| Q |
263 |
cattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18897030 |
cattttcatacaacatgagaaaatacaaaacttgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
18896962 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 12811980 - 12812179
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| | || ||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
12811980 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcattacagcaaga |
12812079 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12812080 |
gcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaatatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
12812179 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2449361 - 2449254
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagc |
233 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
2449361 |
tcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagc |
2449262 |
T |
 |
| Q |
234 |
acgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
2449261 |
acgaattt |
2449254 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 276
Target Start/End: Original strand, 44229063 - 44229268
Alignment:
| Q |
71 |
gaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgta |
168 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||||||| || | | |||||| |||| |||| ||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
44229063 |
gaacatgaatcacatctcattttaacaacaacatatca-agattcactaattgagtataatt-tcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgta |
44229160 |
T |
 |
| Q |
169 |
atttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccatttt |
268 |
Q |
| |
|
|||||| | |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
44229161 |
atttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacggatttaacatcaattgttcatcaacccatttt |
44229260 |
T |
 |
| Q |
269 |
catacaac |
276 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
44229261 |
catacaac |
44229268 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11986362 - 11986182
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttg |
160 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| | || || ||||| ||||||||| ||||| |||||| || |
|
|
| T |
11986362 |
aacatcaatggaacatgaatcacatatcttttcaacaacaacttagca-aaattcactatttgagcacaatt-tcataacttgacattaatacatacttt |
11986265 |
T |
 |
| Q |
161 |
aa--catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| || ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
11986264 |
aaaacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaattt |
11986182 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16744238 - 16744131
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagc |
233 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
16744238 |
tcataacttttcatttttacatatttaaaaatgtaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatggatacaaacatatcatcaaagttggagc |
16744139 |
T |
 |
| Q |
234 |
acgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
16744138 |
acgaattt |
16744131 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 106
Target Start/End: Original strand, 47984661 - 47984763
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| Q |
4 |
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103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
47984661 |
catgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaact |
47984760 |
T |
 |
| Q |
104 |
tag |
106 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
47984761 |
tag |
47984763 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 106
Target Start/End: Original strand, 47993948 - 47994050
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| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
47993948 |
catgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaact |
47994047 |
T |
 |
| Q |
104 |
tag |
106 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
47994048 |
tag |
47994050 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
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Target Start/End: Original strand, 48003235 - 48003337
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103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
48003235 |
catgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaact |
48003334 |
T |
 |
| Q |
104 |
tag |
106 |
Q |
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|
||| |
|
|
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48003335 |
tag |
48003337 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 106
Target Start/End: Original strand, 48012521 - 48012623
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| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
48012521 |
catgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaact |
48012620 |
T |
 |
| Q |
104 |
tag |
106 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
48012621 |
tag |
48012623 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 41661729 - 41661812
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| Q |
159 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattc-atgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41661729 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcatttccatgtattcaaacatatcatcatagcaagagcacgaattt |
41661812 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 31412416 - 31412333
Alignment:
| Q |
159 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
31412416 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt |
31412333 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 102
Target Start/End: Original strand, 11638424 - 11638465
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
102 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
11638424 |
aacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaac |
11638465 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 8268683 - 8268651
Alignment:
| Q |
296 |
catgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8268683 |
catgattatgataataactaacccccttacctt |
8268651 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 8275783 - 8275751
Alignment:
| Q |
296 |
catgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8275783 |
catgattatgataataactaacccccttacctt |
8275751 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 105
Target Start/End: Original strand, 15876135 - 15876179
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaactta |
105 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15876135 |
aacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaactta |
15876179 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 47784851 - 47784767
Alignment:
| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatt |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
47784851 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatt |
47784767 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 27009849 - 27010177
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27009849 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaaca |
27009948 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
27009949 |
acttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacactcatacaatcatcatcaat |
27010048 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaaattacatg |
299 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27010049 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaattacatg |
27010148 |
T |
 |
| Q |
300 |
attgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27010149 |
attgtgataataactaacccccttacctt |
27010177 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18778236 - 18777907
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
18778236 |
atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca |
18778137 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |
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| T |
18778136 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat |
18778037 |
T |
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| Q |
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tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt--acat |
298 |
Q |
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| T |
18778036 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacat |
18777937 |
T |
 |
| Q |
299 |
gattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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|||| ||||||| ||||||||||||||||| |
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| T |
18777936 |
gattatgataatcactaacccccttacctt |
18777907 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 25426636 - 25426965
Alignment:
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100 |
Q |
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atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca |
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T |
 |
| Q |
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acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
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| T |
25426736 |
acttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat |
25426835 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt--acat |
298 |
Q |
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| T |
25426836 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacat |
25426935 |
T |
 |
| Q |
299 |
gattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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| T |
25426936 |
gattatgataatcactaacccccttacctt |
25426965 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 43443639 - 43443312
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
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|
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atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagactcacatctcaaatcaacaaca |
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T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
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| T |
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acttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaat |
43443440 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatga |
300 |
Q |
| |
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| T |
43443439 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaatccattttcatataacatgagaatatgcaattacacatga |
43443340 |
T |
 |
| Q |
301 |
ttgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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|
| T |
43443339 |
ttatgataatcactaacccccttacctt |
43443312 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 12382 - 12711
Alignment:
| Q |
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atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
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| T |
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atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca |
12481 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
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| T |
12482 |
acttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat |
12581 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt--acat |
298 |
Q |
| |
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| T |
12582 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatacaaaattacacat |
12681 |
T |
 |
| Q |
299 |
gattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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| T |
12682 |
gattatgataataactaacccccttacctt |
12711 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22366725 - 22366396
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
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| T |
22366725 |
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22366626 |
T |
 |
| Q |
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acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
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| T |
22366625 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat |
22366526 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt--acat |
298 |
Q |
| |
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| T |
22366525 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgctcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacat |
22366426 |
T |
 |
| Q |
299 |
gattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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| T |
22366425 |
gattatgataatcactaacccccttacctt |
22366396 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 19499907 - 19500236
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
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|
| T |
19499907 |
atccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca |
19500006 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
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|
| T |
19500007 |
acttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat |
19500106 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt--acat |
298 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
19500107 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaagtgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacat |
19500206 |
T |
 |
| Q |
299 |
gattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
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| T |
19500207 |
gattatgataatcactaacccccttacctt |
19500236 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21073839 - 21073510
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
21073839 |
atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattgataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca |
21073740 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
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|
| T |
21073739 |
acttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatccat |
21073640 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt--acat |
298 |
Q |
| |
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|
| T |
21073639 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcattaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacat |
21073540 |
T |
 |
| Q |
299 |
gattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21073539 |
gattatgataataactaacccccttacctt |
21073510 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 4200227 - 4199900
Alignment:
| Q |
3 |
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102 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4200227 |
ccatgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
4200128 |
T |
 |
| Q |
103 |
ttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattc |
202 |
Q |
| |
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| T |
4200127 |
ataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattc |
4200028 |
T |
 |
| Q |
203 |
atgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt--acatga |
300 |
Q |
| |
|
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|
| T |
4200027 |
atgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattattcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaaattacacatga |
4199928 |
T |
 |
| Q |
301 |
ttgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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|| ||||||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
4199927 |
ttatgataatccctaacccccttacctt |
4199900 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 45 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 29188483 - 29188201
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atcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaa |
144 |
Q |
| |
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||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| || || || ||| |||||| |
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|
| T |
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atcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttat |
29188385 |
T |
 |
| Q |
145 |
catttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgac |
244 |
Q |
| |
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|
| T |
29188384 |
catttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagc |
29188285 |
T |
 |
| Q |
245 |
atgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29188284 |
atgaattgttcatcgacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacatgattataataatcactaacccccttacctt |
29188201 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 225
Target Start/End: Original strand, 23506976 - 23507196
Alignment:
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Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23506976 |
catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaact |
23507075 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23507076 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
23507174 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcaca |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |
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|
| T |
23507175 |
tgcatacaaacatatcatcaca |
23507196 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18531319 - 18531083
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
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|||||||||| | |||| |||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
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| T |
18531319 |
catgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaact |
18531220 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
18531219 |
tagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
18531121 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
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| T |
18531120 |
tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
18531083 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22054085 - 22053849
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4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
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| T |
22054085 |
catgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaact |
22053986 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
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||| | ||||||||||||| || ||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22053985 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactatcatcaattca |
22053887 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
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| T |
22053886 |
tacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
22053849 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 61 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 35791287 - 35791016
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61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacata-ttt |
159 |
Q |
| |
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| T |
35791287 |
aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaatttcatcaattaagtataat-ctcataacttaacatttatacatacttt |
35791189 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc |
258 |
Q |
| |
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| T |
35791188 |
gaaacatgtaatttcactcacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatc |
35791089 |
T |
 |
| Q |
259 |
aatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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|| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
35791088 |
aacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
35791016 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 61 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11212253 - 11211983
Alignment:
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61 |
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159 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||| | || |||| ||| |||||||||||||||| |||| | ||| |
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|
| T |
11212253 |
aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatta-aaattcactacttgagtataatt-tcataacttaacatttatacacacttt |
11212156 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc |
258 |
Q |
| |
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||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |
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| T |
11212155 |
gaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatc |
11212056 |
T |
 |
| Q |
259 |
aatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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|
|
| T |
11212055 |
aacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttacctt |
11211983 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27182799 - 27182578
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||| |
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| T |
27182799 |
catgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact |
27182700 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
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||| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |
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| T |
27182699 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaattatcatcagttca |
27182601 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacag |
226 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
27182600 |
tgcatacaaacatatcatcacag |
27182578 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 34939289 - 34939524
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| | ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| | ||||| ||| ||| ||| |
|
|
| T |
34939289 |
catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caatgact |
34939387 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | |||| || ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
34939388 |
tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
34939486 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
34939487 |
tgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaattt |
34939524 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 7425463 - 7425662
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
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|
| T |
7425463 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaataacatcacagcaaga |
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T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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gcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
7425662 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 17471705 - 17471506
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
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| T |
17471705 |
tcattacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
17471606 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaat---tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17471605 |
gcacgaatttatcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatacaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
17471506 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 23514700 - 23514899
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
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|
| T |
23514700 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
23514799 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23514800 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt |
23514899 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 1219637 - 1219438
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| ||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1219637 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattaatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
1219538 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1219537 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataatcactaacccccttacctt |
1219438 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 10778087 - 10777888
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
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|
| T |
10778087 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
10777988 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
10777987 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataatcactaccccccttacctt |
10777888 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21932498 - 21932299
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21932498 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
21932399 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21932398 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
21932299 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21938668 - 21938469
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
21938668 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
21938569 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21938568 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
21938469 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 35582175 - 35582374
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
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|
| T |
35582175 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
35582274 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
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|
| T |
35582275 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
35582374 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 36989887 - 36989688
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
36989887 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagctaga |
36989788 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
36989787 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaattgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
36989688 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 22883201 - 22883006
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| | | || ||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22883201 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
22883102 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaaccccctta |
324 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22883101 |
gcacaaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 328
Target Start/End: Original strand, 23328791 - 23328895
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| Q |
227 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt |
323 |
Q |
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|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
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caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt |
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T |
 |
| Q |
324 |
acctt |
328 |
Q |
| |
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||||| |
|
|
| T |
23328891 |
acctt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 328
Target Start/End: Original strand, 24616395 - 24616499
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| Q |
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caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt |
323 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt |
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T |
 |
| Q |
324 |
acctt |
328 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
24616495 |
acctt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 328
Target Start/End: Original strand, 24712771 - 24712875
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| Q |
227 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt |
323 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24712771 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt |
24712870 |
T |
 |
| Q |
324 |
acctt |
328 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
24712871 |
acctt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 328
Target Start/End: Original strand, 24745789 - 24745893
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| Q |
227 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24745789 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt |
24745888 |
T |
 |
| Q |
324 |
acctt |
328 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
24745889 |
acctt |
24745893 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Original strand, 20623109 - 20623216
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagc |
233 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
20623109 |
tcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagc |
20623208 |
T |
 |
| Q |
234 |
acgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
20623209 |
acgaattt |
20623216 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21233651 - 21233544
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagc |
233 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
21233651 |
tcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagc |
21233552 |
T |
 |
| Q |
234 |
acgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
21233551 |
acgaattt |
21233544 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25900529 - 25900422
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagc |
233 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
25900529 |
tcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagc |
25900430 |
T |
 |
| Q |
234 |
acgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
25900429 |
acgaattt |
25900422 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Original strand, 16536337 - 16536444
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagc |
233 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
16536337 |
tcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattataaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagc |
16536436 |
T |
 |
| Q |
234 |
acgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
16536437 |
acgaattt |
16536444 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 241
Target Start/End: Original strand, 32950761 - 32950942
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataac-ttaacatttttacata-tt |
158 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| || || ||||| ||||||| || || ||| |||||| || |
|
|
| T |
32950761 |
aacatcaatggaacatgaatcacatctcttttcaacaacaacatagta-aaattcaccatttgagcacaat-ttcataactttgacctttatacatactt |
32950858 |
T |
 |
| Q |
159 |
tg-aacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||| || || || |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
32950859 |
tgaaacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaattt |
32950942 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Original strand, 37052884 - 37052991
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagc |
233 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
37052884 |
tcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagc |
37052983 |
T |
 |
| Q |
234 |
acgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
37052984 |
acgaattt |
37052991 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23981625 - 23981516
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| | ||| |
|
|
| T |
23981625 |
tcataagttaacatttatacatactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatacaaacatatcatcataattaga |
23981526 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
23981525 |
gcacgaattt |
23981516 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21310794 - 21310709
Alignment:
| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
21310794 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacgaattt |
21310709 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5450928 - 5450861
Alignment:
| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
223 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
5450928 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca |
5450861 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26559898 - 26559815
Alignment:
| Q |
159 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26559898 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatataatcatagcaagagcacgaattt |
26559815 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 241
Target Start/End: Original strand, 19862371 - 19862456
Alignment:
| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
19862371 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
19862456 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 102
Target Start/End: Original strand, 21617083 - 21617124
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
102 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21617083 |
aacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac |
21617124 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0076 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:
Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 43005 - 43333
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
43005 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcacttgaacacgaatcacatctcaaattaacaaca |
43104 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
43105 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat |
43204 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgag-caaatgcaaaattacatg |
299 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43205 |
tcatgcatagaaacataacatcccagcaagagcacgaatttgacatgaattgctcatcaacccattttcatacaacatgagaaaaatgcaaaattacatg |
43304 |
T |
 |
| Q |
300 |
attgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43305 |
tttgtgatagtaactaacccccttacctt |
43333 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 39242 - 39441
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
39242 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
39341 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39342 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
39441 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 5 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21852205 - 21851881
Alignment:
| Q |
5 |
atgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaactt |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21852205 |
atgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacatctcaaattaacaacaactt |
21852106 |
T |
 |
| Q |
105 |
aggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcat |
204 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21852105 |
aggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatttaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcat |
21852006 |
T |
 |
| Q |
205 |
gcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaaattacatgattg |
303 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21852005 |
gcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccaatttcatacaacatgagcaaatgcaaaaattacatgattg |
21851906 |
T |
 |
| Q |
304 |
tgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21851905 |
tgataataactaacccccttacctt |
21851881 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 5 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21844812 - 21844490
Alignment:
| Q |
5 |
atgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaactt |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21844812 |
atgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaattaacaacaactt |
21844713 |
T |
 |
| Q |
105 |
aggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcat |
204 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21844712 |
aggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcat |
21844613 |
T |
 |
| Q |
205 |
gcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaaattacatgattg |
303 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21844612 |
gcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccaatttcatacaacatgagcaaatgcaaaaattacatgattg |
21844513 |
T |
 |
| Q |
304 |
tgataataactaacccccttacc |
326 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21844512 |
tgataataactaacccccttacc |
21844490 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16674636 - 16674308
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
16674636 |
atccatgaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaaca |
16674537 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||| |
|
|
| T |
16674536 |
acttaggagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaat |
16674437 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaaattacatg |
299 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16674436 |
tcatgcataaaaacataacatcacagaaagagcacgaatttagcatgaattgttcaacaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaattacatg |
16674337 |
T |
 |
| Q |
300 |
attgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16674336 |
attgtgataataactaacccccttacctt |
16674308 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 5 - 328
Target Start/End: Original strand, 30120734 - 30121060
Alignment:
| Q |
5 |
atgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaactt |
104 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
30120734 |
atgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaattaacaacaactt |
30120833 |
T |
 |
| Q |
105 |
aggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcat |
204 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| |
|
|
| T |
30120834 |
aggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcat |
30120933 |
T |
 |
| Q |
205 |
gcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgat |
301 |
Q |
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| T |
30120934 |
gcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagattatacaaaaattacacatgat |
30121033 |
T |
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| Q |
302 |
tgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
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| ||||||| ||||||||||||||||| |
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| T |
30121034 |
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T |
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Target Start/End: Complemental strand, 6774498 - 6774175
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T |
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203 |
Q |
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T |
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204 |
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303 |
Q |
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T |
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328 |
Q |
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tgataatcactaacccccttacctt |
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T |
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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 328
Target Start/End: Original strand, 24548993 - 24549316
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Q |
| |
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catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaacaataact |
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T |
 |
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203 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatgattg |
303 |
Q |
| |
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| T |
24549192 |
tgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacatgatta |
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T |
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| Q |
304 |
tgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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24549292 |
tgataatcactaacccccttacctt |
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Q |
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T |
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| Q |
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Q |
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T |
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Target: chr8; HSP #8
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Q |
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T |
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| Q |
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T |
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Target: chr8; HSP #9
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Target Start/End: Complemental strand, 860453 - 860271
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Q |
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atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca |
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T |
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| Q |
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183 |
Q |
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| T |
860353 |
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T |
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Target: chr8; HSP #10
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Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 43373720 - 43373484
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103 |
Q |
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43373720 |
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T |
 |
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203 |
Q |
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T |
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| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
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Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16193968 - 16193732
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| |
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T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
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| | | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |
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tggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttccccaacaatcatacaattatcatcaattca |
16193770 |
T |
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| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
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| T |
16193769 |
tgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
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Target Start/End: Original strand, 16195298 - 16195569
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Q |
| |
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| T |
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16195396 |
T |
 |
| Q |
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gaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc |
258 |
Q |
| |
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gaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaacatagcatcacagcacgagaacgaatttagcaacaattgttcatc |
16195496 |
T |
 |
| Q |
259 |
aatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
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| |
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tagc-gaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
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T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
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24928844 |
tgcatacaaacatataatcacagttggagcacgaattt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
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| |
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catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataatatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caataact |
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T |
 |
| Q |
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taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
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T |
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| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
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Q |
| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
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 |
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gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
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Q |
| |
|
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|
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||||||| |||| ||||||||| | ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||| | |||||| | |
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|
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T |
 |
| Q |
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taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
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| T |
16405028 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
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|
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 |
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Q |
| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| |
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gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
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| |
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|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
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Q |
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| T |
271477 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
271378 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
271377 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
271278 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 644443 - 644642
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
644443 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
644542 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
644543 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
644642 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 830178 - 830377
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
830178 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
830277 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
830278 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
830377 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13662382 - 13662183
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13662382 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatncattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
13662283 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13662282 |
gcacgaatttagcaacaattgtttatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
13662183 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22088911 - 22088712
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22088911 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacctataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
22088812 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22088811 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacacattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgatgataactaacccccttacctt |
22088712 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15319276 - 15319077
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacatatttg--aacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||| || |||||||||||| ||| | || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15319276 |
tcataactcaacatttatacatacttagaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagtatcacagcaaga |
15319177 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15319176 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
15319077 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15499645 - 15499446
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacatatttg--aacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||| || |||||||||||| ||| | || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15499645 |
tcataactcaacatttatacatacttagaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagtatcacagcaaga |
15499546 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15499545 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
15499446 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22907468 - 22907230
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| | || ||| | || ||| | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
22907468 |
atccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactaca |
22907369 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
|| | | ||||||| | |||| | ||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22907368 |
acat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaat |
22907271 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
22907270 |
tcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
22907230 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Original strand, 5238227 - 5238334
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagc |
233 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
5238227 |
tcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagc |
5238326 |
T |
 |
| Q |
234 |
acgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
5238327 |
acgaattt |
5238334 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24661371 - 24661264
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagc |
233 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
24661371 |
tcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagc |
24661272 |
T |
 |
| Q |
234 |
acgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
24661271 |
acgaattt |
24661264 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Original strand, 43685686 - 43685793
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagc |
233 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
43685686 |
tcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagc |
43685785 |
T |
 |
| Q |
234 |
acgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
43685786 |
acgaattt |
43685793 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 691970 - 691908
Alignment:
| Q |
121 |
tttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatt |
183 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
691970 |
tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt |
691908 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 241
Target Start/End: Original strand, 26011656 - 26011741
Alignment:
| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
26011656 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
26011741 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 102
Target Start/End: Original strand, 5854681 - 5854722
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
102 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
5854681 |
aacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac |
5854722 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 22497389 - 22497348
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
102 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22497389 |
aacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaac |
22497348 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 102
Target Start/End: Original strand, 38533716 - 38533757
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
102 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
38533716 |
aacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac |
38533757 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 45465227 - 45465126
Alignment:
| Q |
142 |
taacatttttacatatt-tgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaat |
239 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||| | || |||||||||| |
|
|
| T |
45465227 |
taacattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaggagcacgaat |
45465128 |
T |
 |
| Q |
240 |
tt |
241 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
45465127 |
tt |
45465126 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 223
Target Start/End: Original strand, 15933443 - 15933527
Alignment:
| Q |
141 |
ttaacatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
223 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
15933443 |
ttaacactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatca |
15933527 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 13572684 - 13573012
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13572684 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaaca |
13572783 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13572784 |
acttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatcatcatcaat |
13572883 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaaattacatg |
299 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
13572884 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaattacatg |
13572983 |
T |
 |
| Q |
300 |
attgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13572984 |
attgtgataataactaacccccttacctt |
13573012 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13911269 - 13910939
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13911269 |
atccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
13911170 |
T |
 |
| Q |
101 |
actt-aggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaa |
199 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| || | |||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
13911169 |
actttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattaacatcaa |
13911070 |
T |
 |
| Q |
200 |
ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt--aca |
297 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |
|
|
| T |
13911069 |
ttcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaaattacaca |
13910970 |
T |
 |
| Q |
298 |
tgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
13910969 |
tgattatgataatcaataacccccttacctt |
13910939 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 10989418 - 10989746
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| | ||||| |
|
|
| T |
10989418 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta-caaca |
10989516 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |
|
|
| T |
10989517 |
acttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaat |
10989616 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaat--tacat |
298 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
10989617 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaatatgcaaaattatacat |
10989716 |
T |
 |
| Q |
299 |
gattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
10989717 |
gattatgataatcactaacccccatacctt |
10989746 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 2437465 - 2437794
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| || ||||||| |
|
|
| T |
2437465 |
atccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcaaatctcatattaacaaca |
2437564 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |
|
|
| T |
2437565 |
acttaggaaaaattcaccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaat |
2437664 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaat--tacat |
298 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2437665 |
tcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcattatcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattgtacat |
2437764 |
T |
 |
| Q |
299 |
gattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2437765 |
gattatgataataactaacccccttacctt |
2437794 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16479205 - 16478879
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| || || | |
|
|
| T |
16479205 |
atccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaaaata |
16479106 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
16479105 |
acttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat |
16479007 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatga |
300 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16479006 |
tcatgcatacaaacataacatcgcagtaagagcacgaatctaacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattaaatga |
16478907 |
T |
 |
| Q |
301 |
ttgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16478906 |
ttatgataatcactaacccccttacctt |
16478879 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18254090 - 18253761
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
18254090 |
atccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca |
18253991 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18253990 |
acttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat |
18253892 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---aca |
297 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |
|
|
| T |
18253891 |
tcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaaca |
18253792 |
T |
 |
| Q |
298 |
tgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18253791 |
tgattataatgataactaacccccttacctt |
18253761 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25292593 - 25292372
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
25292593 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattagtcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacgaca |
25292494 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||||||||||| || |||||| ||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |
|
|
| T |
25292493 |
acctaggag-aattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaat |
25292395 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatca |
223 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25292394 |
tcatacatacaaacatatcatca |
25292372 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 16211777 - 16212013
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| | ||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16211777 |
catgaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaact |
16211876 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16211877 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatcatcaattca |
16211975 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16211976 |
tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
16212013 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 47481283 - 47481047
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
47481283 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaact |
47481184 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| | ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47481183 |
tagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattca |
47481085 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
47481084 |
tgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaattt |
47481047 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 13321025 - 13321263
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaa-caac |
102 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
13321025 |
catgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaatcaac |
13321124 |
T |
 |
| Q |
103 |
ttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
13321125 |
ttagca-aaattcaccaattgagcacaatt-tcataacttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat |
13321222 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13321223 |
tcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaattt |
13321263 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 226
Target Start/End: Original strand, 36052678 - 36052896
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
36052678 |
catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccacaacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaac---t |
36052774 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
36052775 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaattttaccaacaatcatataattatcatcaattca |
36052873 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacag |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
36052874 |
tgcatacaaacgtatcatcacag |
36052896 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11580991 - 11580755
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11580991 |
catgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact |
11580892 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11580891 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
11580793 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11580792 |
tgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaattt |
11580755 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13037266 - 13037030
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13037266 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact |
13037167 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||| | | |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13037166 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaattatcatcaattca |
13037068 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13037067 |
tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
13037030 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 3059977 - 3060213
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| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
3059977 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact |
3060076 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||| || || | ||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
3060077 |
taaca-aaattcaccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacagtattacaattatcatcaattaa |
3060175 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3060176 |
tgcatacaaatatattatcacagttggagcacgaattt |
3060213 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15950908 - 15950709
Alignment:
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134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15950908 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
15950809 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15950808 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
15950709 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18980138 - 18979939
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
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|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |
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|
| T |
18980138 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
18980039 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18980038 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
18979939 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 15927707 - 15927906
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
15927707 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaagcataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga |
15927806 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15927807 |
gcacgaatttagcaacaattgatcatcaatccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
15927906 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 13758509 - 13758708
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13758509 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaaga |
13758608 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13758609 |
gcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
13758708 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15760231 - 15760032
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15760231 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacatatcataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
15760132 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15760131 |
gcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt |
15760032 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 7822867 - 7823066
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7822867 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
7822966 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7822967 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
7823066 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 7830178 - 7830377
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7830178 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
7830277 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7830278 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
7830377 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27101754 - 27101555
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
27101754 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
27101655 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27101654 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
27101555 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27109102 - 27108903
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
27109102 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
27109003 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27109002 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
27108903 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 27176572 - 27176771
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
27176572 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
27176671 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27176672 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
27176771 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 38783846 - 38783647
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
38783846 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
38783747 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38783746 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
38783647 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14251015 - 14250816
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| || |||||||||||||||| | || ||| ||| ||| ||||| |
|
|
| T |
14251015 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccaaaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaaga |
14250916 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14250915 |
gcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaaatgaacatgattacgatgataactaacccccttacctt |
14250816 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 7293025 - 7293263
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| | || ||| | || ||| | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
7293025 |
atccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaacaaca |
7293124 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
|| | | ||||||| | |||| | ||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| |
|
|
| T |
7293125 |
acat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattattaat |
7293222 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
7293223 |
tcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
7293263 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 157 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 48622758 - 48622623
Alignment:
| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttca |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
48622758 |
tttgaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagtaagagcacgaatttagcatcaattgttca |
48622659 |
T |
 |
| Q |
257 |
tcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
292 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| || |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
48622658 |
tcaacccattttcgtaaaacatgagaaaatgcaaaa |
48622623 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Original strand, 11516367 - 11516474
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagc |
233 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
11516367 |
tcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagc |
11516466 |
T |
 |
| Q |
234 |
acgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
11516467 |
acgaattt |
11516474 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15441687 - 15441580
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagc |
233 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
15441687 |
tcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagc |
15441588 |
T |
 |
| Q |
234 |
acgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
15441587 |
acgaattt |
15441580 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30262252 - 30262145
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagc |
233 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
30262252 |
tcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagc |
30262153 |
T |
 |
| Q |
234 |
acgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
30262152 |
acgaattt |
30262145 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 328
Target Start/End: Original strand, 15862174 - 15862257
Alignment:
| Q |
248 |
aattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15862174 |
aattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattatacatgattatgataataactaacccccttacctt |
15862257 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 294
Target Start/End: Original strand, 16418731 - 16418798
Alignment:
| Q |
227 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt |
294 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| |
|
|
| T |
16418731 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatt |
16418798 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 227 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10000392 - 10000325
Alignment:
| Q |
227 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt |
294 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
10000392 |
caagagcacgaatttgacataaattgttcatcaacccatttttatacaacatgagaagatgcaaaatt |
10000325 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 296162 - 296003
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaa-caacaacttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatattt |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||| |||| || ||| |||| | |||||||||| || || ||| | ||||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
296162 |
aacatcaattgaacatgaatcacaacacaattcaaacatcaatttagca-aaattcaccatttggatataatttttataacttctcatttttacataatt |
296064 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataaca |
220 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
296063 |
caacatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacataaca |
296003 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16915013 - 16914928
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| Q |
157 |
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241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
16915013 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
16914928 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
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Alignment:
| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
223 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |
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|
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13377691 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca |
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T |
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Target: chr7; HSP #38
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| Q |
159 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||| | | ||||||||||||| |
|
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| T |
28722274 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactagagcacgaattt |
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T |
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Target: chr7; HSP #39
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Target Start/End: Original strand, 9611470 - 9611555
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| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
9611470 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
9611555 |
T |
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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 9723987 - 9723946
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| Q |
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aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
102 |
Q |
| |
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|||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
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9723987 |
aacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaac |
9723946 |
T |
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Target: chr7; HSP #41
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Query Start/End: Original strand, 157 - 241
Target Start/End: Original strand, 9839041 - 9839126
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| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
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9839041 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
9839126 |
T |
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Target: chr7; HSP #42
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Target Start/End: Original strand, 28390476 - 28390561
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| Q |
159 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttga |
243 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||| |||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
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28390476 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaatttga |
28390561 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 102
Target Start/End: Original strand, 46474068 - 46474109
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| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
102 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
46474068 |
aacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaac |
46474109 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:
Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 4 - 328
Target Start/End: Original strand, 46 - 369
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| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
46 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaact |
145 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
146 |
taggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattca |
245 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatgattg |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatataacatgagc-aatgcaaaattacatgattt |
344 |
T |
 |
| Q |
304 |
tgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
345 |
tgataataactaacccccttacctt |
369 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:
Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 64772 - 64439
Alignment:
| Q |
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atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
64772 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaaca |
64673 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatc--- |
197 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
64672 |
acttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaat |
64573 |
T |
 |
| Q |
198 |
--aattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaaatt |
294 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
64572 |
ataattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaatt |
64473 |
T |
 |
| Q |
295 |
acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
64472 |
acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
64439 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 107755 - 108084
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| Q |
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atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
107755 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca |
107854 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||||| || ||||| | | |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
107855 |
acttatca-aaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat |
107953 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---aca |
297 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |
|
|
| T |
107954 |
tcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaaca |
108053 |
T |
 |
| Q |
298 |
tgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
108054 |
tgattataatgataactaacccccttacctt |
108084 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19886905 - 19886576
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19886905 |
atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca |
19886806 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |
|
|
| T |
19886805 |
acttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat |
19886706 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt--acat |
298 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
19886705 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacat |
19886606 |
T |
 |
| Q |
299 |
gattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19886605 |
gattatgataataactaacccccttacctt |
19886576 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17396908 - 17396669
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| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
17396908 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgaca |
17396809 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |
|
|
| T |
17396808 |
acttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaat |
17396709 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
17396708 |
tcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
17396669 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 462749 - 462985
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| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
462749 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact |
462848 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| | ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
462849 |
tagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattca |
462947 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
462948 |
tgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaattt |
462985 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
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Query Start/End: Original strand, 4 - 226
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Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24341641 |
catgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaact |
24341542 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || ||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24341541 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatataatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
24341443 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacag |
226 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
24341442 |
tgcatacaaacatatcatcacag |
24341420 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19794959 - 19794720
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| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
19794959 |
atccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatcaattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaaca |
19794860 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
19794859 |
acttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaat |
19794761 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
19794760 |
tcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
19794720 |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 36982693 - 36982457
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| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
36982693 |
catgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaact |
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T |
 |
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taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
| | | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36982593 |
tggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccagcaatcttacaattatcatcaattca |
36982495 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
36982494 |
tgaatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
36982457 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20627565 - 20627329
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
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||||||||| || ||||||||||| ||||||||| || || | ||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20627565 |
catgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaaccataaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaattaacaacaact |
20627466 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||||||| || ||||| ||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20627465 |
taaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttggacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcg |
20627367 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20627366 |
tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
20627329 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7508099 - 7507860
Alignment:
| Q |
1 |
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99 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
7508099 |
atccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaatt-aacaac |
7508001 |
T |
 |
| Q |
100 |
aacttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaa |
199 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
7508000 |
aacttagcc-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
7507902 |
T |
 |
| Q |
200 |
ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
7507901 |
ttcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaattt |
7507860 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 8891253 - 8891489
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8891253 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact |
8891352 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
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||| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
8891353 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcgccaacaatcatacaattatcatcaattca |
8891451 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8891452 |
tgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaattt |
8891489 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25265642 - 25265406
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| || |||||| || | || ||||| ||||| | ||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
25265642 |
catgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaaca |
25265543 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || ||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25265542 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
25265444 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |
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| T |
25265443 |
tgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaattt |
25265406 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 43643209 - 43642989
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| | ||||||||| | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
43643209 |
catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaatagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaattaataacaact |
43643110 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43643109 |
aagaa-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
43643011 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcaca |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
43643010 |
tgcatacaaacatatcatcaca |
43642989 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 8943985 - 8944184
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
8943985 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaatataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga |
8944084 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8944085 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
8944184 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 12728531 - 12728730
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12728531 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
12728630 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12728631 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
12728730 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 16935732 - 16935931
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16935732 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacgcacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
16935831 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16935832 |
gcatgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
16935931 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 17006392 - 17006591
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |
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|
| T |
17006392 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacgcacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
17006491 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
17006492 |
gcatgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
17006591 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 23778162 - 23777963
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| | |||| ||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23778162 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgcataagaaaatagcatcacagcaaga |
23778063 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
23778062 |
gcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccctttacctt |
23777963 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 34824614 - 34824813
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
34824614 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
34824713 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34824714 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataatcactaacccccttacctt |
34824813 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 3798720 - 3798521
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
3798720 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaaga |
3798621 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
3798620 |
gcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattatacatgattatgataataactaacccccttacctt |
3798521 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 12635985 - 12635786
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| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||| ||||| |
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|
| T |
12635985 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga |
12635886 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12635885 |
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12635786 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11231455 - 11231256
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| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
11231455 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
11231356 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
11231355 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
11231256 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22513302 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
22513203 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
22513202 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
22513103 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24685898 - 24685699
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| Q |
134 |
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231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24685898 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
24685799 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24685798 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
24685699 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 28775924 - 28775725
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|
| T |
28775924 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
28775825 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28775824 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
28775725 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 12641759 - 12641560
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| | |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
12641759 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcagccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaaga |
12641660 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12641659 |
gcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
12641560 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 42178086 - 42177887
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| || |||||||||||||||| | || ||| ||| ||| ||||| |
|
|
| T |
42178086 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccaaaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaaga |
42177987 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42177986 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
42177887 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 227 - 328
Target Start/End: Original strand, 23774370 - 23774474
Alignment:
| Q |
227 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt |
323 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23774370 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaacttgattatgataataactaaccccctt |
23774469 |
T |
 |
| Q |
324 |
acctt |
328 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
23774470 |
acctt |
23774474 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19689524 - 19689417
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagc |
233 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
19689524 |
tcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagc |
19689425 |
T |
 |
| Q |
234 |
acgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
19689424 |
acgaattt |
19689417 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Original strand, 23820211 - 23820318
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagc |
233 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
23820211 |
tcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagc |
23820310 |
T |
 |
| Q |
234 |
acgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
23820311 |
acgaattt |
23820318 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5888652 - 5888585
Alignment:
| Q |
227 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt |
294 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| |
|
|
| T |
5888652 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatt |
5888585 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14906563 - 14906456
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagc |
233 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
14906563 |
tcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagc |
14906464 |
T |
 |
| Q |
234 |
acgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
14906463 |
acgaattt |
14906456 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 276
Target Start/End: Original strand, 21141973 - 21142178
Alignment:
| Q |
71 |
gaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgta |
168 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||||||| || | | |||||| |||| |||| ||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
21141973 |
gaacatgaatcacatctcattttaacaacaacatatca-agattcactaattgagtataatt-tcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgta |
21142070 |
T |
 |
| Q |
169 |
atttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccatttt |
268 |
Q |
| |
|
|||||| | |||| ||| || ||| |||||||||||| | || ||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21142071 |
atttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccatttt |
21142170 |
T |
 |
| Q |
269 |
catacaac |
276 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
21142171 |
catacaac |
21142178 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Original strand, 20015151 - 20015258
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagc |
233 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
20015151 |
tcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaattattatcaattcatgcatgcaaacatatcatcaaagttggagc |
20015250 |
T |
 |
| Q |
234 |
acgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
20015251 |
acgaattt |
20015258 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 223
Target Start/End: Original strand, 68154 - 68221
Alignment:
| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
223 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
68154 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca |
68221 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 16292981 - 16292940
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
102 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16292981 |
aacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaac |
16292940 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 241
Target Start/End: Original strand, 24884848 - 24884933
Alignment:
| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||| || ||||||| ||||| |
|
|
| T |
24884848 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattccatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacaaattt |
24884933 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5072632 - 5072304
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
5072632 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaaca |
5072533 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |
|
|
| T |
5072532 |
acttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaat |
5072433 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaaattacatg |
299 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
5072432 |
tcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacttgagtaaatgcaaaaattacatg |
5072333 |
T |
 |
| Q |
300 |
attgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5072332 |
attgtgataataactaacccccttacctt |
5072304 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18601362 - 18601052
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
18601362 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaaca |
18601263 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |
|
|
| T |
18601262 |
acttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaat |
18601163 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaaattacatg |
299 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18601162 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcatgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaattacatg |
18601063 |
T |
 |
| Q |
300 |
attgtgataat |
310 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
18601062 |
attgtgataat |
18601052 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 22227817 - 22228146
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22227817 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca |
22227916 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22227917 |
acttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaat |
22228015 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttaca |
297 |
Q |
| |
|
||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
22228016 |
tcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtaca |
22228115 |
T |
 |
| Q |
298 |
tgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22228116 |
tgattatgataataactaacccccttacctt |
22228146 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 22232514 - 22232843
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22232514 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca |
22232613 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22232614 |
acttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaat |
22232712 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttaca |
297 |
Q |
| |
|
||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
22232713 |
tcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtaca |
22232812 |
T |
 |
| Q |
298 |
tgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22232813 |
tgattatgataataactaacccccttacctt |
22232843 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 328
Target Start/End: Original strand, 2116265 - 2116589
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcaca-tctcaaatcaacaacaac |
102 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| | | |||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
2116265 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaaatatcaaattaacaataac |
2116364 |
T |
 |
| Q |
103 |
ttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattc |
202 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||||||||| || || || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2116365 |
ttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattc |
2116463 |
T |
 |
| Q |
203 |
atgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatgatt |
302 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2116464 |
atgcatacaaacataacatcacagtaaaagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccatttttatacaacatgagaaaatgcaaaattacatgatt |
2116563 |
T |
 |
| Q |
303 |
gtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
2116564 |
atgataatcactaacccctttacctt |
2116589 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
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Target Start/End: Original strand, 45051489 - 45051757
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59 |
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158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| | ||||||| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
45051489 |
ataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatt |
45051587 |
T |
 |
| Q |
159 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc |
258 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
45051588 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagaacacgaatctagcatgaattgttcatc |
45051687 |
T |
 |
| Q |
259 |
aatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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|| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45051688 |
aacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatcacatgattatgataaagactaacccccttacctt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
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4 |
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103 |
Q |
| |
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|||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
20931356 |
catgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaatt |
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T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20931456 |
tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattca |
20931554 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20931555 |
tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
20931592 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
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4 |
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103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
20913048 |
catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatca-------aattaacaacaact |
20913140 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
| | | ||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20913141 |
ttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattca |
20913239 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20913240 |
tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
20913277 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
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5 |
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104 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| |||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||| |
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|
| T |
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atgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatctaacaacaactt |
20893778 |
T |
 |
| Q |
105 |
aggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcat |
204 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20893777 |
agca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaattatcatcaattcat |
20893679 |
T |
 |
| Q |
205 |
gcatacaaacataacatcacag |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
20893678 |
gcatacaaacatatcatcacag |
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T |
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Target: chr1; HSP #10
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Query Start/End: Original strand, 1 - 241
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || | ||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| | |
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|
| T |
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atccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaacataacaata |
41394329 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
41394330 |
acttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaacttcaccaacaatcatacaattatcatcaat |
41394428 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
41394429 |
ttatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt |
41394469 |
T |
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Target: chr1; HSP #11
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Target Start/End: Original strand, 20445690 - 20445910
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103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| | | ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20445690 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaact |
20445789 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || ||||| ||| ||||| ||||| | | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20445790 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
20445888 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcaca |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
20445889 |
tgcatacaaacatatcatcaca |
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T |
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Target: chr1; HSP #12
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Target Start/End: Original strand, 20531455 - 20531667
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103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| | | ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20531455 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaact |
20531554 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || ||||| ||| ||||| ||||| | | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20531555 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
20531653 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacata |
217 |
Q |
| |
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|||||||||||||| |
|
|
| T |
20531654 |
tgcatacaaacata |
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Target: chr1; HSP #13
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Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
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tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
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T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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18059775 |
gcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattatacatgattatgataataactaacccccttacctt |
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T |
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Target Start/End: Original strand, 17004777 - 17004976
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Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
17004777 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
17004876 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17004877 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
17004976 |
T |
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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
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Target Start/End: Original strand, 46523528 - 46523726
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| || || | |||||||||||||| | || ||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
46523528 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataacataaacatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga |
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T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46523628 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatggaacatgattatgataataactaacccccttacctt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
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catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| | ||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
37844703 |
catgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact |
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T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactca-taacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattc |
202 |
Q |
| |
|
||| | ||||||| |||| || ||||| ||| || ||| ||||| | | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37844603 |
tagca-aaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattc |
37844505 |
T |
 |
| Q |
203 |
atgcatacaaacataacatca |
223 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37844504 |
atgcatacaaacatatcatca |
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T |
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Target: chr1; HSP #17
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Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||||||| ||| ||||| |
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|
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17148706 |
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T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaaccccc |
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Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| || |||||||||||| ||| | || |||||||||||| || | |
|
|
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38055208 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaataacatcacagtaaaa |
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T |
 |
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232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| | || ||| || |||||||||||| || | || ||| ||| ||||||||| |
|
|
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tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaaacacaagaaaatagcattacagcaaga |
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T |
 |
| Q |
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gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19962516 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
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| |
|
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|
|
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 |
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acctt |
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| |
|
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|
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acctt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
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| Q |
227 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt |
323 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7640956 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt |
7640857 |
T |
 |
| Q |
324 |
acctt |
328 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
7640856 |
acctt |
7640852 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 223
Target Start/End: Original strand, 51452632 - 51452721
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca |
223 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
51452632 |
tcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
51452721 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22143470 - 22143361
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| || ||| |
|
|
| T |
22143470 |
tcataagttaacatttatacatactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcacaaatttcatgcatacaaacacatcatcatagttaga |
22143371 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
22143370 |
gcacgaattt |
22143361 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 102
Target Start/End: Original strand, 25093926 - 25093967
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
102 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
25093926 |
aacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaac |
25093967 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 34)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 25175571 - 25175901
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25175571 |
atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca |
25175670 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |
|
|
| T |
25175671 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat |
25175770 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgag-caaatgcaaaat--taca |
297 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25175771 |
tcatgcatacaaacataacaacacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagaaaaatgcaaaattataca |
25175870 |
T |
 |
| Q |
298 |
tgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||| || |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25175871 |
tgattatggtaatcactaacccccttacctt |
25175901 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27654227 - 27653898
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27654227 |
atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcattggaacaagaatcacaactcaaattaacaaca |
27654128 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |
|
|
| T |
27654127 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat |
27654028 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt--acat |
298 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
27654027 |
tcatgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaatccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacacat |
27653928 |
T |
 |
| Q |
299 |
gattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
27653927 |
gattatgataatcactaaccccctcacctt |
27653898 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 16825998 - 16825678
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16825998 |
atccatgaatatgcataacaaagcaattattcatcaatcataatatcagataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca |
16825899 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatt--gtacaattatcatca |
198 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |
|
|
| T |
16825898 |
aattaggagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattaattacaactaacatca |
16825799 |
T |
 |
| Q |
199 |
attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt--ac |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
16825798 |
attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacac |
16825699 |
T |
 |
| Q |
297 |
atgattgtgataataactaac |
317 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
16825698 |
atgattatgataatcactaac |
16825678 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 1650345 - 1650022
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| | ||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
1650345 |
catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataact |
1650246 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1650245 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
1650147 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatgattg |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1650146 |
tgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattacatgatta |
1650047 |
T |
 |
| Q |
304 |
tgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1650046 |
tgataaagactaacccccttacctt |
1650022 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14626370 - 14626134
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
14626370 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaagttaacaacaact |
14626271 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | || |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14626270 |
tagcataa-ttcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
14626172 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14626171 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
14626134 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 35009691 - 35009455
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| | ||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
35009691 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaaca |
35009592 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || ||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35009591 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
35009493 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
35009492 |
tgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaattt |
35009455 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 23153458 - 23153694
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23153458 |
catgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact |
23153557 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23153558 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
23153656 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23153657 |
tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
23153694 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1657999 - 1657764
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| | ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| | ||||| ||| ||| |||| |
|
|
| T |
1657999 |
catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caataact |
1657901 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | |||| || ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1657900 |
tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
1657802 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1657801 |
tgcatccaaacataacatcacagttagagcacgaattt |
1657764 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 277
Target Start/End: Original strand, 29665941 - 29666157
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacata-ttt |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| | |||| ||| |
|
|
| T |
29665941 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagtacaatt-tcataacttgacatttatgcatacttt |
29666038 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc |
258 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||| |
|
|
| T |
29666039 |
gaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatccatc |
29666138 |
T |
 |
| Q |
259 |
aatccattttcatacaaca |
277 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
29666139 |
accccattttcatacaaca |
29666157 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 16232031 - 16232230
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16232031 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
16232130 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16232131 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
16232230 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 1556144 - 1556343
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1556144 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
1556243 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1556244 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt |
1556343 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 15862484 - 15862718
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| | ||||||||| | || ||||| || || ||||||| ||| ||||| |||||| | ||||| ||| ||| |||| |
|
|
| T |
15862484 |
catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataacataaat-gaacaagaatcataactcaattca-caataact |
15862581 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
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||| | |||| || ||||| || ||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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| T |
15862582 |
tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
15862680 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
15862681 |
tgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaattt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
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Target Start/End: Original strand, 10488838 - 10489037
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231 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
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232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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10488938 |
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10489037 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16376490 - 16376291
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| Q |
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231 |
Q |
| |
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| T |
16376490 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
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T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
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|||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16376390 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
16376291 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16383814 - 16383615
Alignment:
| Q |
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
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|
| T |
16383814 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
16383715 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
16383714 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
16383615 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22225855 - 22225656
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| Q |
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| || |||||||||||||||| | || ||| |||||||| |||| |
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|
| T |
22225855 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagaaaga |
22225756 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
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| T |
22225755 |
gcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccatacctt |
22225656 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18086940 - 18086741
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| Q |
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
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|
| T |
18086940 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaaga |
18086841 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18086840 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatactaataactaacccccttacctt |
18086741 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
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Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 23977908 - 23978107
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
23977908 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaaga |
23978007 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23978008 |
gcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacgcccttacctt |
23978107 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16556256 - 16556057
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| Q |
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16556256 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcagga |
16556157 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16556156 |
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16556057 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16632812 - 16632613
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| Q |
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| || |||||||||||| ||| | || ||| |||||||||| || |
|
|
| T |
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tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcagga |
16632713 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16632712 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
16632613 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 136 - 328
Target Start/End: Original strand, 19610159 - 19610356
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233 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| || | |||| ||||||||| | || ||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
19610159 |
ataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagc |
19610258 |
T |
 |
| Q |
234 |
acgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19610259 |
acgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatacaacatcagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
19610356 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 192 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22251623 - 22251484
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291 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22251623 |
atcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa |
22251524 |
T |
 |
| Q |
292 |
-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22251523 |
gattgtacatgattatgataataactaacccccatacctt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 19299376 - 19299575
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| Q |
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| | || ||| || |||||||||||| || | || ||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
19299376 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaaacacaagaaaatagcattacagcaaga |
19299475 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19299476 |
gcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
19299575 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 227 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 29869798 - 29869694
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| Q |
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caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt |
323 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29869798 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaattttaaattgattatgataataactaaccccctt |
29869699 |
T |
 |
| Q |
324 |
acctt |
328 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
29869698 |
acctt |
29869694 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13620911 - 13620712
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| Q |
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tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||| ||| ||| ||||| |
|
|
| T |
13620911 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgcaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaaga |
13620812 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13620811 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgaagaagactaacccccttacctt |
13620712 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 176
Target Start/End: Original strand, 27740907 - 27741021
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| Q |
62 |
acatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatattt-- |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||| |||||| || |
|
|
| T |
27740907 |
acatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacgacttagca-aaattcaccaattgagcacaat-ttcataacttgacatttatacatacttcg |
27741004 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaacatgtaatttcacc |
176 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
27741005 |
aaacatgtaatttcacc |
27741021 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
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Target Start/End: Original strand, 27751603 - 27751672
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| Q |
172 |
tcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
27751603 |
tcaccaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaattt |
27751672 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16887877 - 16887792
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| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
16887877 |
tttgaacatgcaaattcaccaacaacagttcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatattatcatagttagagcacgaattt |
16887792 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
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159 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19854319 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaattt |
19854402 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18629693 - 18629608
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| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
18629693 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
18629608 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 297 - 328
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297 |
atgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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atgattgtgataataactaacccccttacctt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #32
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| Q |
159 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacata |
217 |
Q |
| |
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|
| T |
29605614 |
tgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaattcatgcattcaaacata |
29605672 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 102
Target Start/End: Original strand, 18399005 - 18399046
Alignment:
| Q |
61 |
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102 |
Q |
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|
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| T |
18399005 |
aacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17083280 - 17083200
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159 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaat |
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Q |
| |
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|
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| T |
17083280 |
tgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaat |
17083200 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:
Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 36101 - 36430
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atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
36101 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataacatctattgaacatgaatcacatctcaaattaacaaca |
36200 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |
|
|
| T |
36201 |
acttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaat |
36300 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt--acat |
298 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||| |
|
|
| T |
36301 |
tcatacatacaaacataacatcactacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccagtttcatacaacatgagaatatgcaaaattacacat |
36400 |
T |
 |
| Q |
299 |
gattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
36401 |
gattatgataatcattaacccccttacctt |
36430 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 48609 - 48845
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||| | ||||| | |||||||| |
|
|
| T |
48609 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctagcaacaact |
48708 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||| | || ||||| ||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48709 |
tagca-aaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
48807 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
48808 |
tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
48845 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 206 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 169951 - 169830
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| Q |
206 |
catacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaat--tacatgattg |
303 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
169951 |
catacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattatacatgatta |
169852 |
T |
 |
| Q |
304 |
tgataataactaacccccttac |
325 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
169851 |
tgataatcactaacccccttac |
169830 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 154124 - 153925
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
154124 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaacttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
154025 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
154024 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
153925 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:
Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 31920 - 31593
Alignment:
| Q |
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atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31920 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
31821 |
T |
 |
| Q |
101 |
actt-aggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaa |
199 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| || | |||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |
|
|
| T |
31820 |
actttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaa |
31721 |
T |
 |
| Q |
200 |
ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt--aca |
297 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |
|
|
| T |
31720 |
ttcatgcattcaaacataacatcaccacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaaattacaca |
31621 |
T |
 |
| Q |
298 |
tgattgtgataataactaacccccttac |
325 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
31620 |
tgattatgataatcactaacccccttac |
31593 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 128420 - 128200
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
128420 |
catgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacc |
128322 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
|| | |||||| |||||| || ||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
128321 |
taaca-aaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattca |
128223 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacag |
226 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
128222 |
tgcatacaaacatatcatcacag |
128200 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0139 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:
Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21359 - 21031
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21359 |
atccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattcataacatcaattgaacaagaatccaatctcaaattaacaaca |
21260 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
21259 |
acttagga-aaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaat |
21161 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaat--tacat |
298 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21160 |
taatggatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattgtacat |
21061 |
T |
 |
| Q |
299 |
gattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21060 |
gattatgataataactaacccccttacctt |
21031 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14304 - 13977
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
14304 |
atccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattcataacattaattgaacaagaatccaatctcaaattatcaaca |
14205 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
14204 |
acttagga-aaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttcaacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaat |
14106 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaat--tacat |
298 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14105 |
tcatgcatacagacataacatcacagcaagagcacg-atttagcaagaattgtgcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattgtacat |
14007 |
T |
 |
| Q |
299 |
gattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14006 |
gattatgataataactaacccccttacctt |
13977 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0215 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:
Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 9589 - 9266
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||| |||| || |||||| ||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
9589 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataact |
9490 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || || || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9489 |
tagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
9391 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatgattg |
303 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
9390 |
tgcatacaaacataacatcacagcaaaagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatgattg |
9291 |
T |
 |
| Q |
304 |
tgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9290 |
tgataataactaacccccttacctt |
9266 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16487 - 16164
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||| |||| || |||||| ||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
16487 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataact |
16388 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || || || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16387 |
tagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
16289 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatgattg |
303 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16288 |
tgcatacaaacataacatcacagcaaaagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaattacatgattg |
16189 |
T |
 |
| Q |
304 |
tgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16188 |
tgataataactaacccccttacctt |
16164 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:
Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5458 - 5130
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
5458 |
atccatgaatatgcaa-cccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca |
5360 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
||| || | ||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
5359 |
actcagca-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat |
5261 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttaca |
297 |
Q |
| |
|
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| T |
5260 |
tcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaagaattgttcatcaacccattttcatacaacgtgagaaaatgcaaaaattgtaca |
5161 |
T |
 |
| Q |
298 |
tgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
5160 |
tgattatgataataactaactcccttacctt |
5130 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0369 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:
Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 3730 - 4060
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
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|
|
| T |
3730 |
atccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca |
3829 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttt-tacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaa |
199 |
Q |
| |
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|||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
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| T |
3830 |
acttagca-aaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
3928 |
T |
 |
| Q |
200 |
ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttac |
296 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
3929 |
ttcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtac |
4028 |
T |
 |
| Q |
297 |
atgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
4029 |
atgattatgataataactaaaccccttacctt |
4060 |
T |
 |
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Target: scaffold0529 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:
Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
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Target Start/End: Original strand, 2973 - 3299
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4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaa-catgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
102 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||| | ||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
2973 |
catgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaacaacaac |
3072 |
T |
 |
| Q |
103 |
ttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattc |
202 |
Q |
| |
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|||| | ||||||||||||| || ||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3073 |
ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattc |
3171 |
T |
 |
| Q |
203 |
atgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaat--tacatga |
300 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
3172 |
atggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaattgtacataa |
3271 |
T |
 |
| Q |
301 |
ttgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
3272 |
ttatgataataattaacccccttacctt |
3299 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1711 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
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Description:
Target: scaffold1711; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 1450 - 1220
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Q |
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|
|||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |
|
|
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1450 |
caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatca |
1351 |
T |
 |
| Q |
199 |
attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgc-aaaattaca |
297 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1350 |
attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagtaaatgcaaaaattaca |
1251 |
T |
 |
| Q |
298 |
tgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1250 |
tgattgtgataataactaacccccctacctt |
1220 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0772 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:
Target: scaffold0772; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 5551 - 5776
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115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
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5551 |
aacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattc |
5650 |
T |
 |
| Q |
116 |
accaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaaca |
215 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5651 |
accaattgagcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaaca |
5750 |
T |
 |
| Q |
216 |
taacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||||||| |
|
|
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taacatcaaagttggagcacgaattt |
5776 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0420 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:
Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
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aaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtaca |
188 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| || || || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13480 |
aaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcataca |
13382 |
T |
 |
| Q |
189 |
attatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgc |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13381 |
attatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacactaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatga |
13282 |
T |
 |
| Q |
289 |
aaaattacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13281 |
aaaattacatgattatgataatcactaacccccttacctt |
13242 |
T |
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Target: scaffold0498 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:
Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 225
Target Start/End: Original strand, 8889 - 9109
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103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8889 |
catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaact |
8988 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8989 |
taaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcgattca |
9087 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcaca |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9088 |
tgcatacaaacataacatcaca |
9109 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0266 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:
Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3837 - 3598
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100 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
3837 |
atccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca |
3738 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||| ||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
3737 |
acttagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat |
3639 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3638 |
tcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
3598 |
T |
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Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 1135 - 1371
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| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
1135 |
catgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaact |
1234 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1235 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattca |
1333 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
1334 |
tgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
1371 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0302 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:
Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 12123 - 12360
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| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||| |
|
|
| T |
12123 |
atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt--acaaca |
12220 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12221 |
acttaaca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttaaacatgtattttcaccaacaatcatacaattatcatcaat |
12319 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12320 |
tcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaattt |
12360 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0049 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:
Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 48195 - 48434
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atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
48195 |
atccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatctataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaaca |
48294 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
48295 |
acttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat |
48393 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
48394 |
tcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaattt |
48434 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0413 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:
Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
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atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
6318 |
atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaaca |
6220 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||||| || ||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
6219 |
acttagca-aaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat |
6121 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
6120 |
tcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
6080 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0175 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:
Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
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| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| ||||||| |||| | ||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
1210 |
atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaataaaatctcaatt-aacaaca |
1112 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||| ||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
1111 |
acttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaat |
1013 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1012 |
tcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
972 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:
Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 226
Target Start/End: Original strand, 148732 - 148953
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4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||| ||||||||| || || |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
148732 |
catgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaact |
148831 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
148832 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattca |
148930 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacag |
226 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
148931 |
tgcatacaaacatatcatcacag |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 8860 - 9096
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catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
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| |
|
|||||||||| | ||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8860 |
catgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataacatcaattgaacattaatcatatctcaattcaacaacaact |
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T |
 |
| Q |
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taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || ||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8960 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
9058 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
9059 |
tgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaattt |
9096 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:
Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 19217 - 19453
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
19217 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaact |
19316 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19317 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattca |
19415 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
19416 |
tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
19453 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 21301 - 21537
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21301 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaact |
21400 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21401 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattca |
21499 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21500 |
tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
21537 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0077 (Bit Score: 114; Significance: 8e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:
Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 37165 - 36929
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||| ||||||||||| || ||| | ||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
37165 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacgtcaattgaacaagattcataactcaatccaaccacaact |
37066 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | |||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37065 |
tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaagcttacaattatcatcaattca |
36967 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
36966 |
tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
36929 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0075 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:
Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 34716 - 34476
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaa-catgaatcacatctcaaatcaacaac |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
34716 |
atccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaacaac |
34617 |
T |
 |
| Q |
100 |
aacttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaa |
199 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||| ||| || ||||| ||| ||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
34616 |
aacttagca-aaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaa |
34518 |
T |
 |
| Q |
200 |
ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
34517 |
ttcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaattt |
34476 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0218 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:
Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5313 - 5092
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| |
|
|
| T |
5313 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaact |
5214 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
| | | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5213 |
ttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaacaatcttacaattatcatcaattca |
5115 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacag |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
5114 |
cgcatacaaacatatcgtcacag |
5092 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:
Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26663 - 26431
Alignment:
| Q |
8 |
aatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttagg |
107 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
26663 |
aatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaacttagc |
26564 |
T |
 |
| Q |
108 |
agaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgca |
207 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
26563 |
a-aaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaataatcttacaattatcatcaattcacgca |
26465 |
T |
 |
| Q |
208 |
tacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
26464 |
tacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
26431 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8327 - 8196
Alignment:
| Q |
110 |
aaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcata |
209 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8327 |
aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgtaatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcata |
8228 |
T |
 |
| Q |
210 |
caaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8227 |
caaacataacatcacagttagagcacgaattt |
8196 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0125 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:
Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 41659 - 41895
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||| ||||| | ||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
41659 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaaca |
41758 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41759 |
tagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
41857 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
41858 |
tgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaattt |
41895 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 123416 - 123196
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| |||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | || || |||||||||| |
|
|
| T |
123416 |
catgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataacttaatctaacaacaact |
123317 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
123316 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
123218 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcaca |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
123217 |
tgcatacaaacatatcatcaca |
123196 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 226
Target Start/End: Original strand, 171916 - 172137
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
171916 |
catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact |
172015 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | |||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
172016 |
tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca |
172114 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacag |
226 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
172115 |
tccatacaaacatatcatcacag |
172137 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 226
Target Start/End: Original strand, 177619 - 177840
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
177619 |
catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact |
177718 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | |||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
177719 |
tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca |
177817 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacag |
226 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
177818 |
tccatacaaacatatcatcacag |
177840 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0132 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:
Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 13517 - 13753
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||| | ||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
13517 |
catgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaaca |
13616 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||| ||||| || ||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13617 |
tagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca |
13715 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
13716 |
tgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaattt |
13753 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:
Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 247694 - 247458
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
247694 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact |
247595 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||| ||||||| || ||||| ||| |||||| ||||| | | |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
247594 |
tagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattca |
247496 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
247495 |
tgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaattt |
247458 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 34346 - 34076
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacata-ttt |
159 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
34346 |
aacattaatggaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacatatcc-aaattcatcaattaagtataact-tcataacttaacatttatacatacttt |
34249 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc |
258 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||| | ||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |
|
|
| T |
34248 |
gaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttagcaacaatttttcatc |
34149 |
T |
 |
| Q |
259 |
aatccattttcatacaac-atgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||| |||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34148 |
aaccca-tttcatacaacaatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctt |
34076 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0106 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:
Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 41740 - 41976
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||| |||||||| | || | ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
41740 |
catgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaacaattaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact |
41839 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| || ||||| ||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41840 |
tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcatttttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcatcaattca |
41938 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
41939 |
tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
41976 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1542 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:
Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 784 - 550
Alignment:
| Q |
6 |
tgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaactta |
105 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||| |||||| | || || |||| |||||| |
|
|
| T |
784 |
tgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccataacatcaattaaacaagaatcataacttaatctaacagtaactta |
685 |
T |
 |
| Q |
106 |
ggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatg |
205 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||| | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
684 |
gca-aaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatg |
586 |
T |
 |
| Q |
206 |
catacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
585 |
catacaaacatatcatcacagttggagcacgaattt |
550 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0066 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:
Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 328
Target Start/End: Original strand, 45098 - 45369
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacata-ttt |
159 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
45098 |
aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatca-aaattcaccaattgagtacaatt-tcaaaacttgacatttatacatacttt |
45195 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc |
258 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||| |||| |||||||||| ||| |||| |||||| |
|
|
| T |
45196 |
gaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgcacatcaaaatagcatcacaacaagggcacgaatttaacaacaattattcatc |
45295 |
T |
 |
| Q |
259 |
aatccattttcatacaac-atgagcaaatgcaa-aatt--acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45296 |
aacccattttcatacaacaatgagaaattgcaataattgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctt |
45369 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 277
Target Start/End: Original strand, 54484 - 54700
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacata-ttt |
159 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
54484 |
aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatca-aaattcaccaattgagtacaatt-tcataacttgacatttatacatacttt |
54581 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatc |
258 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||| |
|
|
| T |
54582 |
gaaacatgcaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaggacacgaatttaacaacaattattcatc |
54681 |
T |
 |
| Q |
259 |
aatccattttcatacaaca |
277 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
54682 |
aacccattttcatacaaca |
54700 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:
Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 226
Target Start/End: Original strand, 272036 - 272257
Alignment:
| Q |
4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaact |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||| | ||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
272036 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaact |
272135 |
T |
 |
| Q |
104 |
taggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca |
203 |
Q |
| |
|
||| | |||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
272136 |
tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatcaattca |
272234 |
T |
 |
| Q |
204 |
tgcatacaaacataacatcacag |
226 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
272235 |
ttcatacaaacatatcattacag |
272257 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 102
Target Start/End: Original strand, 69524 - 69565
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaac |
102 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
69524 |
aacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac |
69565 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0761 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:
Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 1692 - 1493
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1692 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagt |
1593 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1592 |
gcacgattttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttacctt |
1493 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0107 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:
Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 31448 - 31647
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| || |||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31448 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
31547 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31548 |
gcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
31647 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 281
Target Start/End: Original strand, 39785 - 39934
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
39785 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaaaataccataatcatcaattcatgcacaggaaaatagaatcacagcaaga |
39884 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgag |
281 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39885 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgag |
39934 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1500 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:
Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 1631 - 1432
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| || |||||||||||||||| | || ||| ||| ||| ||||| |
|
|
| T |
1631 |
tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaaga |
1532 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1531 |
gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
1432 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0018 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:
Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 111 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 51328 - 51198
Alignment:
| Q |
111 |
aattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatac |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51328 |
aattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatac |
51229 |
T |
 |
| Q |
211 |
aaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
51228 |
aaatatatcatcacagttggagcacgaattt |
51198 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0213 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:
Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 29301 - 29500
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| | || || || |||| ||||||| ||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
29301 |
tcataacttaacatttacacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataacataatcaacaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaaga |
29400 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29401 |
gcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt |
29500 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0383 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:
Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 2531 - 2731
Alignment:
| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| || | |||||||||||||| | || ||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
2531 |
tcatgacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataagcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacggcaaga |
2630 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa----ttacatgattgtgataataactaacccccttacct |
327 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2631 |
gcacgaattgagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacct |
2730 |
T |
 |
| Q |
328 |
t |
328 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
2731 |
t |
2731 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0361 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:
Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 241
Target Start/End: Original strand, 3257 - 3437
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacata-ttt |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||| ||||||||| | |||| |||||| ||| |
|
|
| T |
3257 |
aacatcaattgaacaataatcacatatcctctcaacaacaacttagca-aaattcaccatttgagtacaatt-tcataacttgatatttatacatacttt |
3354 |
T |
 |
| Q |
160 |
gaac-atgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
3355 |
gaaatatgtaatttcaccaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaattt |
3437 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0104 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:
Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 48522 - 48620
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaac |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
48522 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaagtgaacaagaatcaaatctcaaattaacaac |
48620 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0191 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:
Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 71 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 7634 - 7374
Alignment:
| Q |
71 |
gaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgta |
168 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||||||| || | | |||||| |||| |||| ||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
7634 |
gaacatgaatcacatctcattttaacaacaacatatca-agattcactaattgagtataatt-tcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgta |
7537 |
T |
 |
| Q |
169 |
atttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccatttt |
268 |
Q |
| |
|
|||||| | |||| ||| || ||| |||||||||||| | || ||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
7536 |
atttcatccacaaacataccataatcttcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagtaataattgttcatcaacccatttt |
7437 |
T |
 |
| Q |
269 |
catacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7436 |
catacaacatgagaaaatgcaaaaatggaacatgattatgataataactaacccccttacctt |
7374 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1560 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:
Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 107 - 9
Alignment:
| Q |
1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaac |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||| || |||||| |||||| |
|
|
| T |
107 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataatatcatttgaacaagaatcaaatatcaaattaacaac |
9 |
T |
 |
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231 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
10456 |
tcataacttagcatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagcaaga |
10357 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
292 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
10356 |
gcacgaatttagcaacaattattcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa |
10296 |
T |
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Target: scaffold0183; HSP #1
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227 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctt |
323 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6831 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctt |
6930 |
T |
 |
| Q |
324 |
acctt |
328 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
6931 |
acctt |
6935 |
T |
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219 |
catcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa---ttacatgattgtgataataacta |
315 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
10778 |
catcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataacta |
10679 |
T |
 |
| Q |
316 |
acccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
10678 |
acccccttacctt |
10666 |
T |
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Target: scaffold0028; HSP #1
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210 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
89600 |
aattcaccaattgagcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac |
89501 |
T |
 |
| Q |
211 |
aaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
89500 |
aaatatatcatcacagttggagcacgaattt |
89470 |
T |
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157 |
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256 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| | | || | |||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
3577 |
tttgaacatgtaatttcacccacaatcataccataatcatcaattcatggacaagaaaacaacatcacagtaagagcactaatttagcatcaattgttca |
3676 |
T |
 |
| Q |
257 |
tcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
292 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
3677 |
tcaacccattttcataaaacatgagaaaatgcaaaa |
3712 |
T |
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61 |
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160 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||| || || ||||| ||||||||| |||||| |||||| || |
|
|
| T |
56295 |
aacatcaatggaacatgaatcacatatcttttcaacaacaacttagca-aaattcaccatttgagcacaatt-tcataacttgacatttatacatacttt |
56198 |
T |
 |
| Q |
161 |
aa--catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
56197 |
aaaacatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaattt |
56115 |
T |
 |
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Name: scaffold0017
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Target: scaffold0017; HSP #1
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157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttca |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || | | |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
54038 |
tttgaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaacagcatcacagtaagagcacgaatttagcatcaattgttca |
54137 |
T |
 |
| Q |
257 |
tcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaa |
292 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
54138 |
tcaacccattttcataaaacatgagaaaatgcaaaa |
54173 |
T |
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Target: scaffold0078 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
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Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
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Target Start/End: Complemental strand, 37320 - 37082
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1 |
atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaaca |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| | || ||| | || ||| | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| |||| ||| |
|
|
| T |
37320 |
atccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatccaactaca |
37221 |
T |
 |
| Q |
101 |
acttaggagaaattcaccaatttagtacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaat |
200 |
Q |
| |
|
|| | | ||||||| | |||| | ||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
37220 |
acat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaat |
37123 |
T |
 |
| Q |
201 |
tcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
37122 |
tcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt |
37082 |
T |
 |
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Target: scaffold0141 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
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Target: scaffold0141; HSP #1
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| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagc |
233 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
22680 |
tcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagc |
22779 |
T |
 |
| Q |
234 |
acgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
22780 |
acgaattt |
22787 |
T |
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Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
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| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagc |
233 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
26935 |
tcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagc |
27034 |
T |
 |
| Q |
234 |
acgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
27035 |
acgaattt |
27042 |
T |
 |
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Target: scaffold0124; HSP #1
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| Q |
134 |
tcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagc |
233 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |
|
|
| T |
1705 |
tcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagc |
1606 |
T |
 |
| Q |
234 |
acgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
1605 |
acgaattt |
1598 |
T |
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Target: scaffold0003 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
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Target: scaffold0003; HSP #1
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| Q |
227 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt |
294 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| |
|
|
| T |
7443 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatt |
7510 |
T |
 |
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Target: scaffold0155; HSP #1
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229 |
agagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccctta |
324 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23769 |
agagcacgaatttgacatgagttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgaatatgataataactaaccccctta |
23671 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0516 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
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Target: scaffold0516; HSP #1
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| Q |
227 |
caagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaatccattttcatacaa-catgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaaccccct |
322 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12149 |
caagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgag-aaatgaaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccct |
12051 |
T |
 |
| Q |
323 |
tacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
12050 |
tacctt |
12045 |
T |
 |
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Target: scaffold0622 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
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Target: scaffold0622; HSP #1
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4 |
catgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatca |
82 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9393 |
catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatca |
9471 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0151 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
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Target: scaffold0151; HSP #1
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61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaattt-agtacaatactcataacttaacatttttacatattt |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | || |||| ||||| || | ||| |||||| ||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22602 |
aacatcaattaaacatgattcacatctcaattcaacaacaacatagcacaa-ttcaataatttgagcataat--tcataagttagcatttatacatattt |
22506 |
T |
 |
| Q |
160 |
-gaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
22505 |
tgaacatgcaaattcaccaacaacaattaaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatatttagagcacgaattt |
22422 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Description:
Target: scaffold1666; HSP #1
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134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| | || ||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
113 |
tcataacttaacatttacacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcctcacagcaaga |
14 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
13 |
gcacgaattt |
4 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0123; HSP #1
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157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
8172 |
tttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt |
8257 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Description:
Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
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266 |
tttcatacaacatgagcaaatgcaaaatt---acatgattgtgataataactaacccccttacctt |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13333 |
tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt |
13268 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 134 - 241
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134 |
tcataacttaacatttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattca-tgcatacaaacataacatcacagcaaga |
231 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||| |||||| ||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| || ||| |
|
|
| T |
104732 |
tcataagttagcatttatacatactttgaacctgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttaatgcatacaaacatatcatcatagttaga |
104633 |
T |
 |
| Q |
232 |
gcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
||| |||||| |
|
|
| T |
104632 |
gcatgaattt |
104623 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1272 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:
Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 223
Target Start/End: Original strand, 456 - 523
Alignment:
| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
223 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
456 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaatataattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca |
523 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0406 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:
Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 14200 - 14283
Alignment:
| Q |
159 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
14200 |
tgaacatgcaatttcaccagcaataattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaattt |
14283 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0243 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:
Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2401 - 2334
Alignment:
| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatca |
223 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
2401 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatca |
2334 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0165 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:
Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 22163 - 22246
Alignment:
| Q |
159 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22163 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatatactcaaacataacatcatagcaagagcacgaattt |
22246 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0020 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:
Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Original strand, 108173 - 108256
Alignment:
| Q |
159 |
tgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
108173 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaattt |
108256 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:
Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 197433 - 197386
Alignment:
| Q |
61 |
aacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttagga |
108 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
197433 |
aacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagga |
197386 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0409 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:
Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1446 - 1348
Alignment:
| Q |
145 |
catttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattc-atgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
1446 |
cattttcacatactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt |
1348 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9701 - 9603
Alignment:
| Q |
145 |
catttttacata-tttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaattc-atgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
9701 |
cattttcacatactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt |
9603 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0389 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:
Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 240
Target Start/End: Original strand, 10854 - 10908
Alignment:
| Q |
187 |
caattatcatcaatt-catgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatt |
240 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
10854 |
caattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagatagagcacgaatt |
10908 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0700 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:
Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 241
Target Start/End: Original strand, 2687 - 2772
Alignment:
| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
2687 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatccaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
2772 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:
Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22514 - 22453
Alignment:
| Q |
157 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaattgtacaattatcatcaa-ttcatgcatacaaacata |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22514 |
tttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacata |
22453 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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