View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17544_high_14 (Length: 344)

Name: NF17544_high_14
Description: NF17544
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17544_high_14
NF17544_high_14
[»] chr6 (31 HSPs)
chr6 (4-334)||(33682076-33682407)
chr6 (4-334)||(14033115-14033445)
chr6 (4-269)||(23835030-23835295)
chr6 (2-333)||(28359728-28360061)
chr6 (4-334)||(27562412-27562741)
chr6 (31-231)||(12941800-12942000)
chr6 (31-282)||(28290133-28290384)
chr6 (4-242)||(1592730-1592971)
chr6 (4-242)||(22906936-22907178)
chr6 (4-231)||(19726577-19726807)
chr6 (4-242)||(21724725-21724966)
chr6 (50-231)||(21566163-21566346)
chr6 (31-207)||(34647652-34647829)
chr6 (31-231)||(12167237-12167439)
chr6 (31-231)||(19286146-19286348)
chr6 (31-207)||(29615199-29615376)
chr6 (31-207)||(34640978-34641155)
chr6 (31-231)||(19877330-19877532)
chr6 (31-231)||(19883106-19883308)
chr6 (31-207)||(25470691-25470868)
chr6 (31-207)||(24562282-24562459)
chr6 (31-207)||(23837580-23837758)
chr6 (31-231)||(19786847-19787050)
chr6 (4-231)||(937658-937888)
chr6 (70-204)||(29416468-29416605)
chr6 (119-231)||(18788448-18788560)
chr6 (119-231)||(18799428-18799540)
chr6 (119-231)||(19439792-19439904)
chr6 (105-207)||(11289602-11289705)
chr6 (5-231)||(19588556-19588781)
chr6 (4-231)||(14581831-14582056)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (4-334)||(36799349-36799678)
chr8 (4-334)||(1804364-1804695)
chr8 (4-334)||(18681400-18681730)
chr8 (4-334)||(31567709-31568039)
chr8 (4-334)||(31572930-31573260)
chr8 (4-334)||(9273054-9273387)
chr8 (4-242)||(22055690-22055930)
chr8 (6-242)||(22050174-22050412)
chr8 (4-231)||(22177557-22177787)
chr8 (31-207)||(44476236-44476414)
chr8 (31-207)||(44479498-44479676)
chr8 (31-207)||(19902928-19903105)
chr8 (31-207)||(23865434-23865611)
chr8 (4-231)||(22025559-22025791)
chr8 (31-207)||(23825124-23825301)
chr8 (31-231)||(17053597-17053799)
chr8 (31-207)||(25409554-25409731)
chr8 (31-231)||(30766925-30767126)
chr8 (4-231)||(22063562-22063794)
chr8 (31-231)||(14057583-14057784)
chr8 (101-231)||(25110911-25111043)
chr8 (5-231)||(41009433-41009658)
chr8 (31-206)||(18609793-18609969)
chr8 (6-231)||(21326822-21327047)
chr8 (76-231)||(21668901-21669059)
chr8 (166-231)||(21282196-21282261)
chr8 (31-231)||(21322234-21322439)
chr8 (5-113)||(20974118-20974228)
chr8 (5-231)||(10606904-10607136)
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (4-334)||(806872-807201)
chr7 (4-320)||(23201388-23201706)
chr7 (4-320)||(23507515-23507833)
chr7 (4-334)||(18055583-18055913)
chr7 (4-334)||(11631814-11632144)
chr7 (4-334)||(18049104-18049434)
chr7 (4-334)||(20579816-20580145)
chr7 (31-282)||(23665753-23666004)
chr7 (31-282)||(29795730-29795981)
chr7 (31-282)||(29799549-29799800)
chr7 (4-250)||(15338797-15339046)
chr7 (31-231)||(11302852-11303052)
chr7 (4-242)||(15723180-15723421)
chr7 (4-242)||(15710956-15711197)
chr7 (4-242)||(35962701-35962943)
chr7 (4-242)||(14431960-14432201)
chr7 (31-242)||(14281609-14281822)
chr7 (4-269)||(19599813-19600080)
chr7 (4-231)||(1612594-1612825)
chr7 (31-207)||(12591635-12591812)
chr7 (31-207)||(14421354-14421532)
chr7 (31-231)||(13006306-13006508)
chr7 (31-207)||(13123971-13124148)
chr7 (31-231)||(16676192-16676393)
chr7 (31-207)||(4279963-4280140)
chr7 (31-207)||(19616295-19616472)
chr7 (31-207)||(12710900-12711077)
chr7 (31-207)||(13742505-13742682)
chr7 (31-231)||(17650429-17650629)
chr7 (30-206)||(16109067-16109244)
chr7 (104-242)||(14128244-14128383)
chr7 (4-231)||(6411792-6412023)
chr7 (62-231)||(11390302-11390473)
chr7 (62-231)||(20328224-20328395)
chr7 (62-231)||(11383814-11383985)
chr7 (62-231)||(18606896-18607067)
chr7 (76-231)||(21232009-21232167)
chr7 (5-231)||(11220086-11220311)
chr7 (144-231)||(36306034-36306121)
chr7 (31-115)||(37244401-37244484)
[»] chr2 (31 HSPs)
chr2 (4-331)||(12578766-12579092)
chr2 (4-331)||(12572284-12572610)
chr2 (4-334)||(27785668-27785998)
chr2 (4-334)||(27790889-27791219)
chr2 (4-334)||(27295877-27296208)
chr2 (31-334)||(10685498-10685801)
chr2 (31-231)||(20260824-20261024)
chr2 (4-242)||(2105548-2105790)
chr2 (31-207)||(5707014-5707191)
chr2 (31-231)||(23090006-23090207)
chr2 (31-207)||(6482321-6482499)
chr2 (31-207)||(6485788-6485966)
chr2 (31-231)||(23102434-23102635)
chr2 (31-231)||(9241333-9241534)
chr2 (31-207)||(26582675-26582852)
chr2 (31-207)||(23169298-23169475)
chr2 (31-207)||(23580555-23580732)
chr2 (31-207)||(200641-200818)
chr2 (31-231)||(23877838-23878040)
chr2 (31-189)||(27367600-27367760)
chr2 (31-207)||(43693401-43693578)
chr2 (31-207)||(6744324-6744501)
chr2 (51-231)||(22809901-22810084)
chr2 (33-205)||(23263985-23264158)
chr2 (74-231)||(21073954-21074114)
chr2 (76-231)||(19703456-19703615)
chr2 (5-231)||(20724011-20724236)
chr2 (5-231)||(23290904-23291129)
chr2 (74-115)||(24943419-24943460)
chr2 (33-109)||(23269201-23269276)
chr2 (33-109)||(23276070-23276145)
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (4-334)||(635635-635967)
chr4 (4-334)||(42701199-42701529)
chr4 (4-334)||(51601946-51602276)
chr4 (4-334)||(51607827-51608157)
chr4 (4-334)||(41799825-41800155)
chr4 (4-334)||(53748625-53748954)
chr4 (31-231)||(15533786-15533986)
chr4 (4-242)||(23121570-23121812)
chr4 (4-250)||(20940231-20940480)
chr4 (31-231)||(18212138-18212339)
chr4 (4-242)||(14484400-14484642)
chr4 (31-207)||(11847053-11847230)
chr4 (4-242)||(17000131-17000373)
chr4 (31-207)||(8046897-8047074)
chr4 (4-204)||(4831090-4831293)
chr4 (4-204)||(4834385-4834588)
chr4 (4-242)||(11171222-11171464)
chr4 (4-231)||(43284871-43285101)
chr4 (76-231)||(15406955-15407113)
chr4 (74-231)||(14485552-14485713)
[»] chr3 (44 HSPs)
chr3 (4-315)||(13909502-13909813)
chr3 (4-315)||(13946447-13946758)
chr3 (4-334)||(44775174-44775504)
chr3 (4-334)||(44780358-44780688)
chr3 (4-315)||(13939961-13940268)
chr3 (4-334)||(4677137-4677466)
chr3 (4-334)||(41175450-41175779)
chr3 (4-334)||(41180588-41180917)
chr3 (4-269)||(8742848-8743113)
chr3 (4-269)||(8761018-8761283)
chr3 (4-282)||(12200176-12200454)
chr3 (5-242)||(16838466-16838705)
chr3 (4-242)||(14652680-14652921)
chr3 (4-242)||(16382844-16383085)
chr3 (46-231)||(12304763-12304949)
chr3 (5-231)||(13203514-13203743)
chr3 (31-231)||(17157061-17157262)
chr3 (31-207)||(9532849-9533027)
chr3 (31-231)||(24191762-24191963)
chr3 (31-231)||(41456123-41456325)
chr3 (31-231)||(16802425-16802626)
chr3 (8-242)||(14544155-14544394)
chr3 (31-207)||(8583294-8583471)
chr3 (31-207)||(14084531-14084708)
chr3 (31-207)||(14089932-14090109)
chr3 (31-207)||(49399473-49399650)
chr3 (31-207)||(24123203-24123380)
chr3 (31-189)||(13968850-13969010)
chr3 (31-189)||(13974325-13974485)
chr3 (31-186)||(17190836-17190992)
chr3 (4-204)||(34852211-34852414)
chr3 (120-242)||(16829943-16830065)
chr3 (4-231)||(14292674-14292906)
chr3 (5-154)||(16830055-16830206)
chr3 (62-231)||(23174189-23174358)
chr3 (74-231)||(17199015-17199175)
chr3 (142-231)||(31690570-31690659)
chr3 (31-230)||(12961378-12961580)
chr3 (144-231)||(23173876-23173963)
chr3 (73-206)||(17243680-17243815)
chr3 (5-93)||(18719250-18719339)
chr3 (31-92)||(11850780-11850840)
chr3 (142-231)||(12255238-12255326)
chr3 (74-118)||(18889009-18889053)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (4-334)||(21678141-21678469)
chr5 (4-334)||(17264667-17264998)
chr5 (4-334)||(17271149-17271480)
chr5 (4-334)||(22174987-22175320)
chr5 (31-282)||(9775467-9775718)
chr5 (31-231)||(37805292-37805492)
chr5 (4-242)||(758216-758456)
chr5 (4-250)||(22509126-22509374)
chr5 (5-242)||(22312793-22313033)
chr5 (31-207)||(19510999-19511177)
chr5 (7-280)||(20937568-20937845)
chr5 (31-231)||(23527448-23527651)
chr5 (31-231)||(22439701-22439902)
chr5 (31-207)||(21675471-21675648)
chr5 (31-189)||(1857520-1857680)
chr5 (4-204)||(10816746-10816949)
chr5 (4-204)||(23538773-23538976)
chr5 (31-119)||(23112827-23112914)
chr5 (142-231)||(22007896-22007986)
chr5 (31-92)||(24751647-24751707)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (4-334)||(27280165-27280496)
chr1 (5-242)||(3706727-3706967)
chr1 (31-207)||(20438531-20438709)
chr1 (4-242)||(23066665-23066907)
chr1 (31-207)||(21542056-21542233)
chr1 (31-207)||(42095903-42096080)
chr1 (4-231)||(22448244-22448469)
chr1 (4-231)||(20242503-20242735)
chr1 (31-207)||(20045879-20046056)
chr1 (31-231)||(19664105-19664306)
chr1 (4-231)||(32650074-32650304)
chr1 (31-231)||(41110814-41111016)
chr1 (4-130)||(955118-955248)
chr1 (31-231)||(19778434-19778639)
chr1 (5-231)||(29554419-29554645)
chr1 (144-240)||(955032-955128)
chr1 (31-115)||(36614935-36615015)
chr1 (31-115)||(24079551-24079634)
chr1 (31-115)||(24109120-24109203)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (80-334)||(40549-40804)
scaffold0124 (31-231)||(36793-36994)
scaffold0124 (4-76)||(8493-8565)
scaffold0124 (142-233)||(43965-44057)
[»] scaffold0239 (2 HSPs)
scaffold0239 (4-282)||(14421-14702)
scaffold0239 (66-242)||(7178-7356)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (4-282)||(141297-141577)
scaffold0021 (76-204)||(146611-146742)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (4-242)||(265071-265311)
scaffold0005 (4-242)||(258645-258885)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (4-231)||(41902-42132)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (4-231)||(63169-63399)
scaffold0026 (31-208)||(12876-13054)
scaffold0026 (4-231)||(124446-124677)
[»] scaffold0535 (1 HSPs)
scaffold0535 (6-231)||(6006-6235)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (50-231)||(4275-4458)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (50-231)||(15432-15615)
scaffold0025 (97-231)||(71155-71291)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (4-231)||(152332-152562)
scaffold0011 (31-207)||(174561-174738)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (31-231)||(4594-4795)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (4-230)||(50948-51177)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (4-250)||(13979-14228)
scaffold0063 (4-250)||(24180-24429)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (31-231)||(10234-10435)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (31-207)||(110758-110935)
scaffold0029 (31-99)||(116793-116861)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (4-231)||(10312-10543)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (8-242)||(47376-47615)
scaffold0067 (8-242)||(62796-63035)
scaffold0067 (8-242)||(56410-56649)
[»] scaffold0430 (1 HSPs)
scaffold0430 (2-242)||(14536-14778)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (31-207)||(174561-174739)
scaffold0001 (31-207)||(489127-489304)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (31-189)||(9649-9809)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (31-207)||(38401-38578)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (31-207)||(35546-35723)
scaffold0076 (31-189)||(30162-30322)
scaffold0076 (52-231)||(51676-51858)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (31-207)||(46979-47156)
scaffold0028 (31-207)||(52384-52561)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (31-207)||(2566-2743)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (31-231)||(29748-29948)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (4-231)||(5119-5350)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (62-231)||(143-314)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (50-231)||(10217-10400)
[»] scaffold0348 (3 HSPs)
scaffold0348 (4-160)||(15511-15670)
scaffold0348 (166-231)||(3058-3123)
scaffold0348 (175-231)||(15454-15510)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (97-231)||(20493-20629)
[»] scaffold1773 (1 HSPs)
scaffold1773 (50-189)||(1-132)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (4-240)||(17447-17688)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (2-231)||(4981-5216)
[»] scaffold0811 (1 HSPs)
scaffold0811 (31-155)||(5-131)
[»] scaffold1913 (1 HSPs)
scaffold1913 (122-208)||(1-87)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (76-231)||(41592-41750)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (4-92)||(3629-3718)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (31-231)||(8410-8615)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (76-231)||(326816-326975)
scaffold0004 (5-231)||(321040-321266)
scaffold0004 (74-205)||(115778-115911)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (76-231)||(7293-7451)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (74-205)||(102930-103063)
[»] scaffold1615 (1 HSPs)
scaffold1615 (76-231)||(392-550)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (76-231)||(16914-17072)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (31-193)||(27781-27945)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (5-231)||(27840-28065)
[»] scaffold0301 (1 HSPs)
scaffold0301 (5-119)||(13504-13620)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (8-231)||(16021-16250)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (4-44)||(78539-78581)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (142-231)||(55975-56065)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (4-44)||(16913-16954)
scaffold0074 (142-231)||(17006-17095)
[»] scaffold0461 (2 HSPs)
scaffold0461 (142-233)||(1027-1119)
scaffold0461 (142-233)||(7963-8055)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 31)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33682407 - 33682076
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33682407 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggaca 33682308  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33682307 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccaaagctctcccactgttatgtttatgca 33682208  T
Q  204 actaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttccattaag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  33682207 actaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctatacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaactttaagggaattttaattaag 33682108  T
Q  303 tacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  33682107 tacaacgtacattcagtcagcatccattcatc 33682076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Original strand, 14033115 - 14033445
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14033115 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 14033214  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14033215 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgca 14033314  T
Q  204 actaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttccattaa 301  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||  |||||    
T  14033315 actaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattt-aattaa 14033412  T
Q  302 gtacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14033413 atacaacattcattcagtcagcatccattcatc 14033445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 4 - 269
Target Start/End: Original strand, 23835030 - 23835295
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23835030 actccactaagactcctctaaactcccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 23835129  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23835130 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 23835229  T
Q  204 actaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca 269  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  23835230 actaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctatacatatacat-atatatgattcacca 23835295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 28360061 - 28359728
Alignment:
Q  2 ctactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacagga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28360061 ctactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacacctttgtcgaatggttaaagcattctcaacagga 28359962  T
Q  102 cataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatg 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28359961 cataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatg 28359862  T
Q  202 caactaatccccttg-agtatatctacataccaaccaacctaaacatatacata-atatatgagtcaccatccgatttacaactttagggaatttccatt 299  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||  |||||| || | ||||||| ||| |||||||   ||    
T  28359861 caactaatccccttgttgtatatctacataccaacccacctagacatatatatatatatatgtttcaccaaccaacttacaacgttaaggaattttattt 28359762  T
Q  300 aagtacaacatacattcagtcatcatccattcat 333  Q
    || |||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  28359761 aaatacaacattcaatcagtcagcatccattcat 28359728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27562741 - 27562412
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27562741 actccactaaaactcctctaa-cacccatgcatgtggtaccaagaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 27562643  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  27562642 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccgctgttatgttaatgca 27562543  T
Q  204 actaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaactttagggaatttccattaag 302  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| ||| |||||||  |||||     
T  27562542 actaatccccattgagtatatctacatactacccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaacgttaaggaattttaattaaa 27562444  T
Q  303 tacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27562443 cacaacattcattcagtcagcatccattcatc 27562412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 12941800 - 12942000
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact-acaccactttg 129  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12941800 atgcatgtggtacc-aaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 12941898  T
Q  130 agtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacat 229  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || | || ||||||||||||    
T  12941899 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacctgtgtatatctacat 12941998  T
Q  230 ac 231  Q
    ||    
T  12941999 ac 12942000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 31 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28290384 - 28290133
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact-acaccactttg 129  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  28290384 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacatcactttg 28290286  T
Q  130 agtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacat 229  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| | || |||||||||||||||||    
T  28290285 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccactgttatgctcatgcaactgacccacttgagtatatctacat 28290186  T
Q  230 accaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca-tccgatttacaac 282  Q
    || | || |||||| ||||||  | |||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  28290185 acaatcccacctaagcatatatgt-atatatgactcaccactccaatttacaac 28290133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 1592730 - 1592971
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||    
T  1592730 actccactaagactcctctaacaacacctatgcatgtggtacc-aaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtcgaatggttaaagcattcattttcagg 1592828  T
Q  101 acataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  1592829 acataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtactccaccactttgaacgagaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttt 1592928  T
Q  200 tgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 242  Q
    ||||||| | || |||| ||||| |||||||| | ||||||||    
T  1592929 tgcaactgacccacttgtgtatacctacatacaacccaaccta 1592971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 22906936 - 22907178
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||    
T  22906936 actccactaagactcctctaacaacacccatgtatgtggtacc-ataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcagg 22907034  T
Q  101 acataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt 198  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22907035 acataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgctt 22907134  T
Q  199 atgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 242  Q
    ||||| || | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  22907135 atgcagctgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 22907178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Original strand, 19726577 - 19726807
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||    
T  19726577 actccaccaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-ataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcagg 19726675  T
Q  101 acataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  19726676 acataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccacttttatgctta 19726775  T
Q  200 tgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    ||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  19726776 tgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 19726807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21724966 - 21724725
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||| | ||||||||||||||||| |   ||||    
T  21724966 actccactaagactcctctaacaacacccatacatgtggtacc-aaaatcaggaccgtagccctcaccgctatagaatggttaaagcattcattttcagg 21724868  T
Q  101 acataagtcctcaccactac-accactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 199  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   | || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  21724867 acataagtcctcaccactaataccactttgagcaactagtactccaccactttgatctattaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttt 21724768  T
Q  200 tgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 242  Q
    ||||||| | || |||| ||||| |||||||| | ||||||||    
T  21724767 tgcaactgacccacttgtgtatacctacatacaacccaaccta 21724725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21566346 - 21566163
Alignment:
Q  50 tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccacc 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  ||||||    
T  21566346 tcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcatgacataagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccacc 21566247  T
Q  148 actttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
     ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  21566246 gctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctacatac 21566163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 34647829 - 34647652
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  34647829 atgcatgtggtaccgtaattcagggccgtgacccactccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 34647730  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  34647729 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgcaacta 34647652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 12167237 - 12167439
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  12167237 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 12167336  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 228  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  || | || |||||||||||    
T  12167337 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctaca 12167436  T
Q  229 tac 231  Q
    |||    
T  12167437 tac 12167439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 19286146 - 19286348
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  19286146 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 19286245  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 228  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  || | || |||||||||||    
T  19286246 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctaca 19286345  T
Q  229 tac 231  Q
    |||    
T  19286346 tac 19286348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29615376 - 29615199
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  29615376 atgcatgtggtacc-ataaccagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 29615278  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  29615277 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 29615199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 34641155 - 34640978
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  34641155 atgcatgtggtaccgtaattcagggccgtgacccactccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 34641056  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| | | | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  34641055 gaacaactagtgttccaccgctttgaacggcgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgcaacta 34640978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 19877330 - 19877532
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  19877330 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 19877429  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 228  Q
    ||  |||||||  |||||  ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  || | || |||||||||||    
T  19877430 gaacaactagtgttccactgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctaca 19877529  T
Q  229 tac 231  Q
    |||    
T  19877530 tac 19877532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 19883106 - 19883308
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  19883106 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 19883205  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 228  Q
    ||  |||||||  |||||  ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  || | || |||||||||||    
T  19883206 gaacaactagtgttccactgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctaca 19883305  T
Q  229 tac 231  Q
    |||    
T  19883306 tac 19883308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25470868 - 25470691
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  25470868 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcacctctccacaccgcttt 25470769  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  25470768 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaacta 25470691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 24562282 - 24562459
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 127  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  24562282 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 24562380  T
Q  128 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  24562381 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 24562459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 23837580 - 23837758
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||| ||||    
T  23837580 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagttctcaccgctccacaccgcttt 23837679  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    ||  |||||||  ||||||  |||||| ||| | |  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  23837680 gaacaactagtgttccaccgttttgaacgacaaggtgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatggaacta 23837758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19787050 - 19786847
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  || |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  19787050 atgcatgtggtaccataattcagggccattacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 19786951  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt-atgcaactaatccccttgagtatatctac 227  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||  || | || ||||||||||    
T  19786950 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttaatgcaactaccccacctgtgtatatctac 19786851  T
Q  228 atac 231  Q
    ||||    
T  19786850 atac 19786847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 937888 - 937658
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||| | || |  ||| |||| |||| ||||||||||||||||| |   ||||    
T  937888 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-ataatcatgaccttagccctcacctctgtagaatggttaaagcattcattttcagg 937790  T
Q  101 acataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 199  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||||  |||| |||    
T  937789 acataagtcctcacctctaacaccactttgagcaacgagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccaaagccgaagctctcccacttctatgctta 937690  T
Q  200 tgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    ||||| | | || || | ||||||||||||||    
T  937689 tgcaattgacccactcgtgtatatctacatac 937658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29416605 - 29416468
Alignment:
Q  70 gctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcat 166  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | |       
T  29416605 gctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggtgc 29416506  T
Q  167 tccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29416505 tccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaa 29416468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 231
Target Start/End: Original strand, 18788448 - 18788560
Alignment:
Q  119 acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgag 218  Q
    ||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||| |    
T  18788448 acaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaaagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttgtg 18788547  T
Q  219 tatatctacatac 231  Q
    |||||||||||||    
T  18788548 tatatctacatac 18788560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 231
Target Start/End: Original strand, 18799428 - 18799540
Alignment:
Q  119 acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgag 218  Q
    ||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||| |    
T  18799428 acaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaaagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttgtg 18799527  T
Q  219 tatatctacatac 231  Q
    |||||||||||||    
T  18799528 tatatctacatac 18799540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 231
Target Start/End: Original strand, 19439792 - 19439904
Alignment:
Q  119 acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgag 218  Q
    ||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||| | || |||| |    
T  19439792 acaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccgcttttatgcttatgtaactgacccacttgtg 19439891  T
Q  219 tatatctacatac 231  Q
    |||||||||||||    
T  19439892 tatatctacatac 19439904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11289705 - 11289602
Alignment:
Q  105 aagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgc 202  Q
    ||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  11289705 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgc 11289607  T
Q  203 aacta 207  Q
    |||||    
T  11289606 aacta 11289602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19588781 - 19588556
Alignment:
Q  5 ctccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcaacaggac 102  Q
    ||||||||||||||||||| |     |||||||||||||| | |||||||||||   ||| |||||||  | |||||||||||| |||| |   || |||    
T  19588781 ctccactaagactcctctaca-----atgcatgtggtacc-ataatcagggccgaatccctcaccgctaattgaatggttaaagtattcattttcatgac 19588688  T
Q  103 ataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 200  Q
    ||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||  | || |||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  19588687 ataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgataaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttat 19588588  T
Q  201 gcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 231  Q
    |||||||| ||| || | ||||||||||||||    
T  19588587 gcaactaactccactggtgtatatctacatac 19588556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14582056 - 14581831
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcaacagga 101  Q
    |||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||  ||  |||||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||    
T  14582056 actccactaagactcctctata-----atgcatgtggtaccataa--cagggccgaggccctcaccgctatagaatggttaaagcattctttcatcagga 14581964  T
Q  102 cataagtcctcaccact--acaccactttgagtaac-tagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctc-ccactgttatgtt 197  Q
    ||| ||||||||||  |  ||||| ||||||  ||| | ||  ||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||||  ||| || || ||||| |    
T  14581963 catgagtcctcaccgttaaacaccgctttgaacaacattgtgttcctccactttgaatgacaaggcattccaggaccgaagtcctcaccgctattatgct 14581864  T
Q  198 tatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||| |||||||    
T  14581863 tatgcaactaa-ccccttatgtatatatacatac 14581831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Original strand, 36799349 - 36799678
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36799349 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 36799448  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36799449 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 36799548  T
Q  204 actaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaactttagggaatttccattaag 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| ||| |||||||  ||||||    
T  36799549 actaatccccattgagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaacgttaaggaattt-aattaag 36799646  T
Q  303 tacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  36799647 tacaacattcattcagtcagcatccattcatc 36799678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1804695 - 1804364
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1804695 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 1804596  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1804595 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 1804496  T
Q  204 actaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaac-tttagggaatttccattaa 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | | || |||| || ||| |||||  |||||    
T  1804495 actaatccccattgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacat-atatatgattcaccattcaacttgcaacattaaggaaattttaattaa 1804397  T
Q  302 gtacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
     |||||||| |||||| ||| |||| |||||||    
T  1804396 atacaacattcattcaatcagcatctattcatc 1804364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18681730 - 18681400
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18681730 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 18681631  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18681630 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgca 18681531  T
Q  204 actaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttccattaa 301  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||  |||||    
T  18681530 actaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattt-aattaa 18681433  T
Q  302 gtacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18681432 atacaacattcattcagtcagcatccattcatc 18681400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31568039 - 31567709
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31568039 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 31567940  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31567939 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgca 31567840  T
Q  204 actaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttccattaa 301  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||  |||||    
T  31567839 actaatccccatagagtatatctatataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattt-aattaa 31567742  T
Q  302 gtacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  31567741 atacaacattcattcagtcagcatccattcatc 31567709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31573260 - 31572930
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31573260 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 31573161  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31573160 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgca 31573061  T
Q  204 actaatcc-ccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttccattaa 301  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||  |||||    
T  31573060 actaatcctcatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattt-aattaa 31572963  T
Q  302 gtacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  31572962 atacaacattcattcagtcagcatccattcatc 31572930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 9273387 - 9273054
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  9273387 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcagaaca 9273288  T
Q  104 taagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgc 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9273287 taagtcctcaccactaacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccaagcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgc 9273188  T
Q  203 aactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaac-tttagggaa--tttccatt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||| | ||  |||  |||    
T  9273187 aactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacat-atatatgattcaccatccaacttacaacatttaagtaaatttttaatt 9273089  T
Q  300 aagtacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9273088 aaatacaacatacattcagtcagcatctattcatc 9273054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 22055690 - 22055930
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||    
T  22055690 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-ataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcagg 22055788  T
Q  101 acataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 199  Q
    || ||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22055789 acctaaatcctcaccactaacaccactttaagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgctta 22055888  T
Q  200 tgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 242  Q
    ||||| | | || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22055889 tgcaaatgacccacttgagtatatctacata-caaccaaccta 22055930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Original strand, 22050174 - 22050412
Alignment:
Q  6 tccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggac 102  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||    
T  22050174 tccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-ataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggac 22050272  T
Q  103 ataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatg 201  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22050273 ctaagtcctcaccactaacaccactttaagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccaaagccgaagctctcccactgttatgcttatg 22050372  T
Q  202 caactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 242  Q
    ||| | | || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22050373 caaatgacccacttgagtatatctacata-caaccaaccta 22050412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Original strand, 22177557 - 22177787
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||    
T  22177557 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-ataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcagg 22177655  T
Q  101 acataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 199  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  22177656 acataagtcttcaccactaacaccactttgagcaacttgtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttttgctta 22177755  T
Q  200 tgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    ||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  22177756 tgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 22177787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 44476236 - 44476414
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||  |||    
T  44476236 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgtttt 44476335  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  44476336 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 44476414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 44479498 - 44479676
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||  |||    
T  44479498 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgtttt 44479597  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  44479598 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 44479676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19903105 - 19902928
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  19903105 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 19903006  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  19903005 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccact-tgatatttatgcaacta 19902928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 23865434 - 23865611
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  23865434 atgcatgtggtaccataatccagggccatgacccacaccgctgtcaaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccgctccacaccgcttt 23865533  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23865534 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgcaacta 23865611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22025791 - 22025559
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcaacag 99  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||  |   |||    
T  22025791 actcctctaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-ataatcagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttttcag 22025693  T
Q  100 gacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 197  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| ||||||| |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22025692 gacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgagcaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgct 22025593  T
Q  198 tatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    ||||||||| | || ||||  |||||||||||||    
T  22025592 tatgcaactgacccacttgtctatatctacatac 22025559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 23825124 - 23825301
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 127  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  23825124 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 23825222  T
Q  128 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  23825223 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 23825301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 17053597 - 17053799
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  17053597 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgccgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 17053696  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 228  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||  || | || |||||||||||    
T  17053697 gaacaactagttttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagctgaagctctcccactttgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctaca 17053796  T
Q  229 tac 231  Q
    |||    
T  17053797 tac 17053799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 25409554 - 25409731
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||  ||||| ||||    
T  25409554 atgcatgtggtacc-ataaccagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcatcaccgctccacaccgcttt 25409652  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | ||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  25409653 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgatccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 25409731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30767126 - 30766925
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 127  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  30767126 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcataaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 30767028  T
Q  128 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctac 227  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||| ||  | || ||||||||||    
T  30767027 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ctatgcaactactcaacctgtgtatatctac 30766929  T
Q  228 atac 231  Q
    ||||    
T  30766928 atac 30766925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22063794 - 22063562
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcaacag 99  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| | ||||| | |||||||| ||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||  |   |||    
T  22063794 actcctctaagactcctctaacaacacccatgcatttagtacc-ataatcagggtcgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttttcag 22063696  T
Q  100 gacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 197  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| | || |||| ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22063695 gacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgagcaactagtgctccaccgctttgaacgacaaggcgttccggagccgaagctctcccacttttatgct 22063596  T
Q  198 tatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    ||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  22063595 tatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 22063562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14057784 - 14057583
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccacta--caccacttt 128  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||   ||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||    
T  14057784 atgcatgtggtacc-atattcagggccggagccctcaccgctatcgaatggttaaagcattcttatcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttt 14057686  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 228  Q
    ||  |||||||  |||||  ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||| |||||| ||||    
T  14057685 gaacaactagtgttccactgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatttaca 14057586  T
Q  229 tac 231  Q
    |||    
T  14057585 tac 14057583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 231
Target Start/End: Original strand, 25110911 - 25111043
Alignment:
Q  101 acataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt 198  Q
    ||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  25110911 acataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaagacattccagagccgaagctctcccacttttatgctt 25111010  T
Q  199 atgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  25111011 atgcaactaacccacttgtgtatatctacatac 25111043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41009658 - 41009433
Alignment:
Q  5 ctccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcaacaggac 102  Q
    ||||||||||||||||||| |     |||||||||||||| | |||||||||||  |||| |||||||  | ||||||||||||||||| |   ||||||    
T  41009658 ctccactaagactcctctaca-----atgcatgtggtacc-ataatcagggccgaaaccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggac 41009565  T
Q  103 ataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 200  Q
    ||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  41009564 ataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttat 41009465  T
Q  201 gcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 231  Q
    |||||||| ||| || | ||||||||||||||    
T  41009464 gcaactaactccactggtgtatatctacatac 41009433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 206
Target Start/End: Original strand, 18609793 - 18609969
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||   ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  18609793 atgcatgtggtacc-atattcagggccggagccctcactgctatcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttt 18609891  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaact 206  Q
    ||  |||||||  |||||| |||| || ||| | ||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  18609892 gaacaactagtgttccaccgctttcaacgacaaggcattccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaact 18609969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21327047 - 21326822
Alignment:
Q  6 tccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcaa--caggac 102  Q
    |||||||||||||||||| |     |||||||||||||| | |||||||||||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||     ||||||    
T  21327047 tccactaagactcctctaca-----atgcatgtggtacc-ataatcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttccaggac 21326954  T
Q  103 ataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 200  Q
    ||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||| ||||| || ||||| || | ||||||||    
T  21326953 ataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaggccctcccgctttcatgtttat 21326854  T
Q  201 gcaact-aatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  21326853 gcaactaaatccacttgtgtatatctacatac 21326822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 231
Target Start/End: Original strand, 21668901 - 21669059
Alignment:
Q  76 gaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccaga 172  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||    
T  21668901 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaga 21669000  T
Q  173 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| |||| |  | |||| |||||| |||||||    
T  21669001 gccgaagctctcccgcttttatgcttatgtaactgactcacttgtgtatatatacatac 21669059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 166 - 231
Target Start/End: Original strand, 21282196 - 21282261
Alignment:
Q  166 ttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  21282196 ttccagagccgaagctctcccgcttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctacatac 21282261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21322439 - 21322234
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcaa--caggacataagtcctcaccact--acaccac 125  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| ||  ||||| |    
T  21322439 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattcttttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgc 21322341  T
Q  126 tttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaa-tccccttgagtatatc 224  Q
    |||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||| || |||||  | ||||| || | |||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  21322340 tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagggccgagaccctcccgctttcatgtttatgcaactaactccacttgtgtatatc 21322241  T
Q  225 tacatac 231  Q
    |||||||    
T  21322240 tacatac 21322234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 20974228 - 20974118
Alignment:
Q  5 ctccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcaa-cagga 101  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||   ||| |||||||  | ||||||||||||||||||    |||||    
T  20974228 ctccactaagactcttctacaacactcatgcatgtggtacc-ataatcagggccgaagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattctttttcagga 20974130  T
Q  102 cataagtcctca 113  Q
    ||||||||||||    
T  20974129 cataagtcctca 20974118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 10606904 - 10607136
Alignment:
Q  5 ctccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcaa-cagga 101  Q
    |||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||   ||| |||||||  | ||||||||||||||||||    |||||    
T  10606904 ctccactaagacccttctacaacactcatgcatgtggtacc-ataatcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattctttttcagga 10607002  T
Q  102 cataagtcctcaccact--acaccactttgagtaacta-gtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt 198  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | ||||  ||| | ||  |||||| ||||||| ||| | || |||||| |||  ||| ||||| || ||||| ||    
T  10607003 cataagtcctcaccgctaaacaccgcgttgaacaacaaggtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgctt 10607102  T
Q  199 atgcaact-aatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    |||||||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  10607103 atgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 10607136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 807201 - 806872
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  807201 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 807102  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  807101 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 807002  T
Q  204 actaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaactttagggaatttccattaag 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| ||| |||||||  ||||||    
T  807001 actaatccccattgagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaacgttaaggaattt-aattaag 806904  T
Q  303 tacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  806903 tacaacattcattcagtcagcatccattcatc 806872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 4 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23201706 - 23201388
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23201706 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggaca 23201607  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23201606 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctctcacttttatgtttatgca 23201507  T
Q  204 actaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacata-atatatgagtcaccatccgatttacaac-tttagggaatttccattaa 301  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| || |||||||||  |||||    
T  23201506 actaatccccttgagtatatccacataccaaccaacctaaacatatacatatatatatgattcaccatccaacttacaacattaagggaattttaattaa 23201407  T
Q  302 gtacaacatacattcagtc 320  Q
     ||  ||||||||||||||    
T  23201406 ataagacatacattcagtc 23201388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 4 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23507833 - 23507515
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23507833 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggaca 23507734  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23507733 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctctcacttttatgtttatgca 23507634  T
Q  204 actaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacata-atatatgagtcaccatccgatttacaac-tttagggaatttccattaa 301  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| || |||||||||  |||||    
T  23507633 actaatccccttgagtatatccacataccaaccaacctaaacatatacatatatatatgattcaccatccaacttacaacattaagggaattttaattaa 23507534  T
Q  302 gtacaacatacattcagtc 320  Q
     ||  ||||||||||||||    
T  23507533 ataagacatacattcagtc 23507515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18055913 - 18055583
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18055913 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 18055814  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18055813 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 18055714  T
Q  204 actaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttccattaa 301  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||  ||||     
T  18055713 actaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattttaattat 18055615  T
Q  302 gtacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
     ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  18055614 atacaacacaca-tcagtcaacatccattcatc 18055583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 11632144 - 11631814
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11632144 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 11632045  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11632044 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 11631945  T
Q  204 actaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttccattaa 301  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||   |||     
T  11631944 actaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattttatttat 11631846  T
Q  302 gtacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
     ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  11631845 atacaacacaca-tcagtcagcatccattcatc 11631814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18049434 - 18049104
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18049434 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 18049335  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18049334 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccacctctttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 18049235  T
Q  204 actaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttccattaa 301  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||  ||||     
T  18049234 actaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattttaattat 18049136  T
Q  302 gtacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
     ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  18049135 atacaacacaca-tcagtcaacatccattcatc 18049104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20580145 - 20579816
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20580145 actccactaagactcctctaaactcccatgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 20580046  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20580045 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgca 20579946  T
Q  204 actaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttccattaa 301  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| | |||||||  ||||     
T  20579945 actaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaaaggaattt-aattat 20579848  T
Q  302 gtacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
     ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  20579847 atacaacacaca-tcagtcagcatccattcatc 20579816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23666004 - 23665753
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttg 129  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23666004 atgcatgtggtacc-aaaatcagggccgtgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 23665906  T
Q  130 agtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacat 229  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | || |||||||||||||||||    
T  23665905 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgctcatgcaactgacccacttgagtatatctacat 23665806  T
Q  230 accaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca-tccgatttacaac 282  Q
    || | || |||||| ||||||  | |||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  23665805 acaatcccacctaagcatatatgt-atatatgactcaccactccaatttacaac 23665753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 31 - 282
Target Start/End: Original strand, 29795730 - 29795981
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttg 129  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29795730 atgcatgtggtacc-aaaaccagggccgtgacccataccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 29795828  T
Q  130 agtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacat 229  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | || |||||||||||||||||    
T  29795829 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgctcatgcaactgacccacttgagtatatctacat 29795928  T
Q  230 accaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca-tccgatttacaac 282  Q
    || | || |||||| ||||||  | |||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  29795929 acaatcccacctaagcatatatgt-atatatgactcaccactccaatttacaac 29795981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 31 - 282
Target Start/End: Original strand, 29799549 - 29799800
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttg 129  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29799549 atgcatgtggtacc-aaaaccagggccgtgacccataccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 29799647  T
Q  130 agtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacat 229  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | || |||||||||||||||||    
T  29799648 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgctcatgcaactgacccacttgagtatatctacat 29799747  T
Q  230 accaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca-tccgatttacaac 282  Q
    || | || |||||| ||||||  | |||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  29799748 acaatcccacctaagcatatatgt-atatatgactcaccactccaatttacaac 29799800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 250
Target Start/End: Original strand, 15338797 - 15339046
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||    
T  15338797 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-aaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcagg 15338895  T
Q  101 acataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15338896 acataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgctta 15338995  T
Q  200 tgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatata 250  Q
    ||||||| | || |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  15338996 tgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacctatacatata 15339046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 11302852 - 11303052
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttg 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11302852 atgcatgtggtacc-aaaatcagggccgtgacccacacctttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 11302950  T
Q  130 agtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacat 229  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || | || ||||||||||||    
T  11302951 agcaactagtactccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacctgtgtatatctacat 11303050  T
Q  230 ac 231  Q
    ||    
T  11303051 ac 11303052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15723421 - 15723180
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||    
T  15723421 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-aaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcagg 15723323  T
Q  101 acataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15723322 acataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgctta 15723223  T
Q  200 tgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 242  Q
    ||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  15723222 tgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 15723180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15711197 - 15710956
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |   ||||    
T  15711197 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-aaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaatcattcattttcagg 15711099  T
Q  101 acataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  15711098 acataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtactccaccactttgaacgacaaggcgttccagatccgaagctctcccactgttatgctta 15710999  T
Q  200 tgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 242  Q
    ||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  15710998 tgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 15710956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 35962943 - 35962701
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||    
T  35962943 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-aaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcagg 35962845  T
Q  101 acataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt 198  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  35962844 acataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgctt 35962745  T
Q  199 atgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 242  Q
    |||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  35962744 atgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 35962701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 14431960 - 14432201
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||    
T  14431960 actccactaagacccctctaacaacacccatgcatgtggtacc-aaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcagg 14432058  T
Q  101 acataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 199  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  14432059 acctaagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagtcgaagctctcccactgttatgctta 14432158  T
Q  200 tgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 242  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14432159 tgcaactgacccacttgagtatatctacatacaatccaaccta 14432201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14281822 - 14281609
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactt 127  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  14281822 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcatcaccactaaacaccactt 14281724  T
Q  128 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctac 227  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||    
T  14281723 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctac 14281624  T
Q  228 ataccaaccaaccta 242  Q
    |||| | ||||||||    
T  14281623 atacaacccaaccta 14281609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 269
Target Start/End: Original strand, 19599813 - 19600080
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||  |   ||||    
T  19599813 actccactaagactcctctaacaacacccacgcatgtggtacc-ataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcatttattttcagg 19599911  T
Q  101 acataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  19599912 acataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgatccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactattatgctta 19600011  T
Q  200 tgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca 269  Q
    | ||||| | || |||| |||||||||||||| | | ||||||  |||||| || |||||||| ||||||    
T  19600012 tacaactgacccacttgtgtatatctacatacaaccaaacctatgcatatatat-atatatgactcacca 19600080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Original strand, 1612594 - 1612825
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||    
T  1612594 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-ataatcaggaccgtagcccccaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcagg 1612692  T
Q  101 acataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  1612693 acataagtcctcaccactaacaccactttgagcaaatagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgctta 1612792  T
Q  200 tgcaact-aatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    | ||||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  1612793 tccaactgactccacttgtgtatatctacatac 1612825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12591812 - 12591635
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  12591812 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 12591713  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    ||  ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  12591712 gaacaactagtgctccaccgctttgaacgacgaagcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaacta 12591635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 14421354 - 14421532
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  14421354 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 14421453  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    ||  ||||||   |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  14421454 gaacaactagcgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 14421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 13006306 - 13006508
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  13006306 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 13006405  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 228  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  || | || |||||||||||    
T  13006406 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctaca 13006505  T
Q  229 tac 231  Q
    |||    
T  13006506 tac 13006508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13124148 - 13123971
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  13124148 atgcatgtggtaccataatccagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 13124049  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13124048 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgcaacta 13123971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 16676192 - 16676393
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    |||||||||||||| | | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  16676192 atgcatgtggtacc-atattaaggaccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcgacaccgcttt 16676290  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 228  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || || |||  |||||||||||    
T  16676291 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaaccaacccacttatgtatatctaca 16676390  T
Q  229 tac 231  Q
    |||    
T  16676391 tac 16676393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 4279963 - 4280140
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 127  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  4279963 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 4280061  T
Q  128 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  4280062 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 4280140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 19616295 - 19616472
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 127  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  19616295 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 19616393  T
Q  128 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  19616394 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 19616472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12711077 - 12710900
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  12711077 atgcatgtggtaccataatccagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 12710978  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  12710977 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagtcgaagctctcccact-tgatatttatgcaacta 12710900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 13742505 - 13742682
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  13742505 atgcatgtggtaccataatttagggccgttacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 13742604  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  13742605 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccact-tgatgtttatgcaacta 13742682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 17650429 - 17650629
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    |||||||||||||| | | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  17650429 atgcatgtggtacc-atatttaggaccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcgacaccgcttt 17650527  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 228  Q
    ||  |||||||  |||||| | ||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || || |||  |||||||||||    
T  17650528 gaacaactagtgttccaccgc-ttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaaccaacccacttatgtatatctaca 17650626  T
Q  229 tac 231  Q
    |||    
T  17650627 tac 17650629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16109244 - 16109067
Alignment:
Q  30 catgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactt 127  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16109244 catgcatgtggtacc-ataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaacaccactt 16109146  T
Q  128 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaact 206  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16109145 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccacttttatgcttatgcaact 16109067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 242
Target Start/End: Original strand, 14128244 - 14128383
Alignment:
Q  104 taagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgc 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14128244 taagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagtcgaagctctcccactgttatgcttatgc 14128343  T
Q  203 aactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 242  Q
    |||| | || ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14128344 aactgacccacttgagtatatctacatacaatccaaccta 14128383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Original strand, 6411792 - 6412023
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| | |||||||||||   ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |   ||||    
T  6411792 actccactaagactcctctaacaacactcatgcatgtggtacc-ataatcagggccgaagccctcaccgctgtagaattgttaaagcattcattttcagg 6411890  T
Q  101 acataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt 198  Q
    ||||||||||||||| |||  |||  ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  6411891 acataagtcctcaccgctatacactgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaatgcgttccagagccgaagctctcccgcttttatgctt 6411990  T
Q  199 atgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  6411991 atgcaactaaccctcttgtgtatatctacatac 6412023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 62 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11390473 - 11390302
Alignment:
Q  62 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgac 159  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| |||    
T  11390473 cccactccgctgtcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgac 11390374  T
Q  160 taagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
     | || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  11390373 aaggcgttctagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 11390302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 62 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20328395 - 20328224
Alignment:
Q  62 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgac 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| |||    
T  20328395 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgac 20328296  T
Q  160 taagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
     | || | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  20328295 aaggcgtcccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 20328224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11383985 - 11383814
Alignment:
Q  62 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgac 159  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||| |||  |||| ||||||   ||||||  |||||| |||||||  ||    
T  11383985 cccactccgctgtcgaatggttaaagcattcttttcaggacttaagtcctcaccgctaaacaccgctttgaaccactagtgttccaccgctttgaacaac 11383886  T
Q  160 taagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
     | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  11383885 aaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 11383814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 231
Target Start/End: Original strand, 18606896 - 18607067
Alignment:
Q  62 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgac 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||   ||||||  |||||| |||||||  ||    
T  18606896 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattcttttcagaacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaaccactagtgttccaccgctttgaaccac 18606995  T
Q  160 taagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
     | || |||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  18606996 aaggcgttccagagtcgaagctctctcacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 18607067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21232167 - 21232009
Alignment:
Q  76 gaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccaga 172  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||    
T  21232167 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaga 21232068  T
Q  173 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || ||||  |||||||||||||    
T  21232067 gccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtatatatctacatac 21232009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11220311 - 11220086
Alignment:
Q  5 ctccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtc-gaatggttaaagcattc-tcaacaggac 102  Q
    ||||||||||||||||||| |     |||||||||||||| | |||||||||||   ||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |   ||||||    
T  11220311 ctccactaagactcctctaca-----atgcatgtggtacc-ataatcagggccgaagccctcaccgctatttgaatggttaaagcattcattttcaggac 11220218  T
Q  103 ataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 200  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||| |||||||| |||||||| ||||| || |    
T  11220217 ataagtcctcaccgcttaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccacttttatgcttct 11220118  T
Q  201 gcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 231  Q
    |||||||| ||| || | ||||||||||||||    
T  11220117 gcaactaactccactggtgtatatctacatac 11220086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36306121 - 36306034
Alignment:
Q  144 caccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    |||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  36306121 caccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcacacttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctacatac 36306034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 37244484 - 37244401
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtc--gaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcacc 115  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||   ||| |||||||||   |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  37244484 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 37244401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 31)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Original strand, 12578766 - 12579092
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12578766 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 12578865  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12578866 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 12578965  T
Q  204 actaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaactttagggaatttccattaag 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| ||| |||||||  ||||||    
T  12578966 actaatccccattgagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaacgttaaggaattt-aattaag 12579063  T
Q  303 tacaacatacattcagtcatcatccattc 331  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12579064 tacaacattcattcagtcagcatccattc 12579092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Original strand, 12572284 - 12572610
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12572284 actccgctaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 12572383  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12572384 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 12572483  T
Q  204 actaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaactttagggaatttccattaag 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| ||| |||||||  ||||||    
T  12572484 actaatccccattgagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaacgttaaggaattt-aattaag 12572581  T
Q  303 tacaacatacattcagtcatcatccattc 331  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12572582 tacaacattcattcagtcagcatccattc 12572610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Original strand, 27785668 - 27785998
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27785668 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 27785767  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27785768 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgca 27785867  T
Q  204 actaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttccattaa 301  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||  |||||    
T  27785868 actaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattt-aattaa 27785965  T
Q  302 gtacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27785966 atacaacattcattcagtcagcatccattcatc 27785998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Original strand, 27790889 - 27791219
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27790889 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 27790988  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27790989 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgca 27791088  T
Q  204 actaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttccattaa 301  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||  |||||    
T  27791089 actaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattt-aattaa 27791186  T
Q  302 gtacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27791187 atacaacattcattcagtcagcatccattcatc 27791219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27296208 - 27295877
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27296208 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggaca 27296109  T
Q  104 taagtcctcaccact-acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgc 202  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296108 taagtcctcaccactaacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccgagcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgc 27296009  T
Q  203 aactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaac--tttagggaatttccatta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  || || ||||||  ||||    
T  27296008 aactaatccccttgagtatatctacataccaaccaatct-aacatatacat-atatatgattcaccatccaatttacaacatttaagtgaattttaatta 27295911  T
Q  301 agtacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27295910 aatacaacatacattcagtcagcatctattcatc 27295877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 31 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10685801 - 10685498
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttg 129  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10685801 atgcatgtggtacc-aaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 10685703  T
Q  130 agtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatcccc-ttgagtatatctaca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10685702 agtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctaca 10685603  T
Q  229 taccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaactttagggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatcca 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| ||||| || | ||  ||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  10685602 taccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggagtttaattaaatacaacattcattcagtcagcatcca 10685504  T
Q  329 ttcatc 334  Q
    ||||||    
T  10685503 ttcatc 10685498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 20260824 - 20261024
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact-acaccactttg 129  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20260824 atgcatgtggtacc-aaaatcagggccgtgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 20260922  T
Q  130 agtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacat 229  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || | || ||||||||||||    
T  20260923 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacctgtgtatatctacat 20261022  T
Q  230 ac 231  Q
    ||    
T  20261023 ac 20261024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 2105548 - 2105790
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||    
T  2105548 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataattcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcagg 2105647  T
Q  101 acataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2105648 acataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgctta 2105747  T
Q  200 tgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 242  Q
    ||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  2105748 tgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 2105790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5707191 - 5707014
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  5707191 atgcatgtggtaccgtaattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 5707092  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    ||  ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  5707091 gaacaactagtgctccaccgctttgaacgacgaagcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaacta 5707014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23090207 - 23090006
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    |||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  23090207 atgcatgtggtacc-atattcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 23090109  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 228  Q
    || ||||||||  |||||| |||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  23090108 gaataactagtgttccaccgcttttaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctaca 23090009  T
Q  229 tac 231  Q
    |||    
T  23090008 tac 23090006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 6482321 - 6482499
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  6482321 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 6482420  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  6482421 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 6482499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 6485788 - 6485966
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  6485788 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 6485887  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  6485888 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 6485966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23102635 - 23102434
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  23102635 atgcatgtggtacc-atattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 23102537  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 228  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  23102536 gaaaaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggagttccagagccgaagctctcccacttttaggcttatgcaactaacccacttgtgtatatctaca 23102437  T
Q  229 tac 231  Q
    |||    
T  23102436 tac 23102434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 9241333 - 9241534
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  9241333 atgcatgtggtacc-ataatcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 9241431  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 228  Q
    ||  ||||| |  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||    
T  9241432 gaacaactaatgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagttcttccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 9241531  T
Q  229 tac 231  Q
    |||    
T  9241532 tac 9241534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 26582675 - 26582852
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  26582675 atgcatgtggtacc-ataaccagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 26582773  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  26582774 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 26582852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23169475 - 23169298
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  23169475 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 23169377  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||    
T  23169376 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccactttgatgcttatgcaacta 23169298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23580732 - 23580555
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  23580732 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 23580634  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||    
T  23580633 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccactttgatgcttatgcaacta 23580555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 200641 - 200818
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 127  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  200641 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 200739  T
Q  128 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  200740 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 200818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 23877838 - 23878040
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||    
T  23877838 atgcatgtggtaccatatttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattatcatcaggacataagtcttcaccgctcaacaccgcttt 23877937  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 228  Q
    ||  |||||||  |||||| |||||||  || | || ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| || |||| |||||||||||    
T  23877938 gaacaactagtgttccaccgctttgaactacaaggcgttccaaagccgaagctctcccacttttatgcttatgcgactaacccacttgtgtatatctaca 23878037  T
Q  229 tac 231  Q
    |||    
T  23878038 tac 23878040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 27367760 - 27367600
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 127  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  27367760 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 27367662  T
Q  128 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccact 189  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  27367661 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 27367600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 43693401 - 43693578
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 127  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  43693401 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 43693499  T
Q  128 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  43693500 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 43693578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6744501 - 6744324
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 127  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  6744501 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaaacattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 6744403  T
Q  128 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    |||  ||| |||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  6744402 tgaacaaccagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 6744324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 51 - 231
Target Start/End: Original strand, 22809901 - 22810084
Alignment:
Q  51 cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccacc 147  Q
    |||||||| | ||| ||||||| | ||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||  |||||||  ||||||    
T  22809901 cagggccgaggccctcaccgctatagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgctttgaacaactagtgttccacc 22810000  T
Q  148 actttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
     ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  22810001 gctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcctgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 22810084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 205
Target Start/End: Original strand, 23263985 - 23264158
Alignment:
Q  33 gcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccactttga 130  Q
    |||||||||||| | | |||||||||   ||| |||| || ||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||    
T  23263985 gcatgtggtacc-atattcagggccggagccctcaccactatcgaatgattaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttga 23264083  T
Q  131 gtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaac 205  Q
      |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  23264084 acaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaac 23264158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21074114 - 21073954
Alignment:
Q  74 tcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccag 171  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||| ||  ||||| ||||||  ||| |||  |||||| ||||||| ||| |  | ||||||    
T  21074114 tcgaatggttaaagcattcttttcaggacatgggtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacaagacgttccag 21074015  T
Q  172 agccgaagctctcccactgttatgtttatgcaact-aatccccttgagtatatctacatac 231  Q
     |||||||| ||||| || ||||| |||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||    
T  21074014 ggccgaagccctcccgcttttatggttatgcaattgaatccacttgtgtatatctacatac 21073954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19703615 - 19703456
Alignment:
Q  76 gaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccaga 172  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||  |||||||  |||||| |||||||  || | || ||||||     
T  19703615 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgataaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacaacaaggcgttccagg 19703516  T
Q  173 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 231  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| ||| || | ||||||||||||||    
T  19703515 gccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactaactccactggtgtatatctacatac 19703456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 20724011 - 20724236
Alignment:
Q  5 ctccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcaacaggac 102  Q
    ||||||||||||||||||| |     |||||||||||||| | |||||||||||   ||| |||||||  | ||||||||||||||||| |   ||||||    
T  20724011 ctccactaagactcctctaca-----atgcatgtggtacc-ataatcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggac 20724104  T
Q  103 ataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 200  Q
    || |||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||| || |||||||| ||||| || || || ||||    
T  20724105 atgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagggccgaagccctcccgcttttttgcttat 20724204  T
Q  201 gcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 231  Q
    |||||||| ||| || | ||||||||||||||    
T  20724205 gcaactaactccactggtgtatatctacatac 20724236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 23290904 - 23291129
Alignment:
Q  5 ctccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||| |     |||||||||||||| | | |||||||||   ||| |||||||  |||||||||||||||||||    |||||||    
T  23290904 ctccactaagactcctctaca-----atgcatgtggtacc-atattcagggccggagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattcgtttcaggaca 23290997  T
Q  104 taagtcctcaccacta--caccactttgagtaacta-gtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 200  Q
    |||||||||||| |||  |||| ||||||  ||| | ||  | |||| ||||||| ||| | || |||||| |||| ||| |||||||| || || ||||    
T  23290998 taagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgtttcaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccggagccctcccacttttgtgcttat 23291097  T
Q  201 gcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 231  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  23291098 gcaactaactccacttgtgtatatctacatac 23291129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 115
Target Start/End: Original strand, 24943419 - 24943460
Alignment:
Q  74 tcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcacc 115  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  24943419 tcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcacc 24943460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 109
Target Start/End: Original strand, 23269201 - 23269276
Alignment:
Q  33 gcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtc 109  Q
    |||||||||||| | | |||||||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  23269201 gcatgtggtacc-atattcagggccggagccctcaccgctatcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtc 23269276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 109
Target Start/End: Original strand, 23276070 - 23276145
Alignment:
Q  33 gcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtc 109  Q
    |||||||||||| | | |||||||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  23276070 gcatgtggtacc-atattcagggccggagccctcaccgctatcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtc 23276145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 635967 - 635635
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  635967 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggaca 635868  T
Q  104 taagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgc 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  635867 taagtcctcaccactaacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccaagcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgc 635768  T
Q  203 aactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaac--tttagggaatttccatta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  || || ||||||  ||||    
T  635767 aactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacat-atatatgattcaccatccaatttacaacatttaagtgaattttaatta 635669  T
Q  301 agtacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  635668 aatacaacatacattcagtcagcatctattcatc 635635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Original strand, 42701199 - 42701529
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42701199 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 42701298  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42701299 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgca 42701398  T
Q  204 actaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttccattaa 301  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||  |||||    
T  42701399 actaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacgt-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattt-aattaa 42701496  T
Q  302 gtacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  42701497 atacaacattcattcagtcagcatccattcatc 42701529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 51602276 - 51601946
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51602276 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 51602177  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51602176 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgca 51602077  T
Q  204 actaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttccattaa 301  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||  |||||    
T  51602076 actaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacgt-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattt-aattaa 51601979  T
Q  302 gtacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  51601978 atacaacattcattcagtcagcatccattcatc 51601946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 51608157 - 51607827
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51608157 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 51608058  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51608057 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgca 51607958  T
Q  204 actaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttccattaa 301  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||  |||||    
T  51607957 actaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacgt-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattt-aattaa 51607860  T
Q  302 gtacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  51607859 atacaacattcattcagtcagcatccattcatc 51607827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 41800155 - 41799825
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41800155 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 41800056  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41800055 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgca 41799956  T
Q  204 actaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttccattaa 301  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||| || | ||| | |||| |||||||||  |||||    
T  41799955 actaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacgt-atatatgattcaccaaccaacttatacctttaagggaattt-aattaa 41799858  T
Q  302 gtacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  41799857 atacaacattcattcagtcagcatccattcatc 41799825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 53748954 - 53748625
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53748954 actccactaagactcctctaaactcccatgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 53748855  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53748854 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgca 53748755  T
Q  204 actaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttccattaa 301  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||  ||||     
T  53748754 actaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattt-aattat 53748657  T
Q  302 gtacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
     ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  53748656 atacaacacaca-tcagtcagcatccattcatc 53748625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 15533786 - 15533986
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact-acaccactttg 129  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15533786 atgcatgtggtacc-aaaatcagggccgtgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 15533884  T
Q  130 agtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacat 229  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || | || ||||||||||||    
T  15533885 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacctgtgtatatctacat 15533984  T
Q  230 ac 231  Q
    ||    
T  15533985 ac 15533986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 23121570 - 23121812
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||    
T  23121570 actccactaagactcctctaacaacactcatgcatgtggtacc-aaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcagg 23121668  T
Q  101 acataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt 198  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23121669 acataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacgaggcattccagagccgaagctctcccactgttatgctt 23121768  T
Q  199 atgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 242  Q
    |||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  23121769 atgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 23121812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 250
Target Start/End: Original strand, 20940231 - 20940480
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |   ||||    
T  20940231 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-aaaatcaggaccgtagccctcaccgttgtagaatggttaaagcattcattttcagg 20940329  T
Q  101 acataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  || | || ||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  20940330 acataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacaacaaggcgttccagagctgaagctctcccactgttatgctca 20940429  T
Q  200 tgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatata 250  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||    
T  20940430 tgcaactgacccacttgagtatatctacatacaatcccacctaagcatata 20940480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 18212138 - 18212339
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  18212138 atgcatgtggtacc-atattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 18212236  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 228  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||    
T  18212237 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 18212336  T
Q  229 tac 231  Q
    |||    
T  18212337 tac 18212339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 14484400 - 14484642
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |   ||||    
T  14484400 actccactaagactccactaacaacacccatacatgtggtacc-ataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaaacattcattttcagg 14484498  T
Q  101 acataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt 198  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  14484499 acataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgctt 14484598  T
Q  199 atgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 242  Q
    |||||||| | || |||| || ||||||||||| | ||||||||    
T  14484599 atgcaactgacccacttgtgtgtatctacatacaacccaaccta 14484642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 11847053 - 11847230
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  11847053 atgcatgtggtaccataaa-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 11847151  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  11847152 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 11847230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17000373 - 17000131
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   || |||||||||  |||||||||| ||||| |   ||||    
T  17000373 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-aaaatcaggaccgtagtcctcaccgctgtaaaatggttaaaacattcattttcagg 17000275  T
Q  101 acataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt 198  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  17000274 acataagttctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggtgttccagagccgaagctctctcacttttatgctt 17000175  T
Q  199 atgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 242  Q
    |||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  17000174 atgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 17000131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8047074 - 8046897
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | | ||||| ||||    
T  8047074 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcactgctccacaccgcttt 8046975  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  8046974 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgccacta 8046897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4831293 - 4831090
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagga 101  Q
    |||||||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||| | | ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||    
T  4831293 actccactaagactcctcaacaatgcgcatgcatgtggtacc-atattcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcagga 4831195  T
Q  102 cataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 199  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  4831194 cataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgatta 4831095  T
Q  200 tgcaa 204  Q
    |||||    
T  4831094 tgcaa 4831090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4834588 - 4834385
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagga 101  Q
    |||||||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||| | | ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||    
T  4834588 actccactaagactcctcaacaatgcgcatgcatgtggtacc-atattcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcagga 4834490  T
Q  102 cataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 199  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  4834489 cataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgatta 4834390  T
Q  200 tgcaa 204  Q
    |||||    
T  4834389 tgcaa 4834385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11171464 - 11171222
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||| | |||||||| |||  ||| |||||| || ||||||||||||||||| |   ||||    
T  11171464 actccactaagactcctctaataacaaccatgcatgtagtacc-ataatcagggtcgtagccctcaccgccgtagaatggttaaagcattcattttcagg 11171366  T
Q  101 acataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt 198  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||  | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  11171365 acataagtcatcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttaaacgataaggcgttccaaagccgaagctctcccacttttatgttt 11171266  T
Q  199 atgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 242  Q
    |||||||| | || |||| |||||| |||||||||  |||||||    
T  11171265 atgcaactgacccacttgtgtatatatacataccactcaaccta 11171222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43285101 - 43284871
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||| | || |||| ||||||||||| ||||| |   ||||    
T  43285101 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-ataatcaggaccgtagccctctcctctgtagaatggttaaatcattcattttcagg 43285003  T
Q  101 acataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  || | || | |||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  43285002 acataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacaacaaggcgtcccagagccgaagctctcccacttttatgctta 43284903  T
Q  200 tgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    ||||||| | || ||   ||||||||||||||    
T  43284902 tgcaactgacccactcttgtatatctacatac 43284871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 231
Target Start/End: Original strand, 15406955 - 15407113
Alignment:
Q  76 gaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccaga 172  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||    
T  15406955 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccaga 15407054  T
Q  173 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    |||||||||||| | || | |||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  15407055 gccgaagctctctcgctttcatgtttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 15407113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 231
Target Start/End: Original strand, 14485552 - 14485713
Alignment:
Q  74 tcgaatggttaaagcattctcaa-caggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaacta-gtactccaccactttgaatgactaagcattcc 169  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||| |||  |||| ||||||  ||| | ||  |||||| ||||||| ||| | |  ||||    
T  14485552 tcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaatcaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggtgttcc 14485651  T
Q  170 agagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  14485652 agggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 14485713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 44)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 4 - 315
Target Start/End: Original strand, 13909502 - 13909813
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13909502 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggaca 13909601  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13909602 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgca 13909701  T
Q  204 actaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaactt-tagggaatttccattaag 302  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||  ||| |||||  |||||     
T  13909702 actaa-ccccttgagtatatctacataccaaccaacctatacatatacataatatatgattcaccatccaatttaaaacttcaaggaaattttaattaaa 13909800  T
Q  303 tacaacatacatt 315  Q
    |||||||||||||    
T  13909801 tacaacatacatt 13909813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 4 - 315
Target Start/End: Original strand, 13946447 - 13946758
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13946447 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggaca 13946546  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  13946547 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaaactctcccactgttatgttaatgca 13946646  T
Q  204 actaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaactt-tagggaatttccattaag 302  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||| |||||  |||||     
T  13946647 actaa-ccccttgagtatatctacataccaaccaacctatacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaacttcaaggaaattttaattaaa 13946745  T
Q  303 tacaacatacatt 315  Q
    |||||||||||||    
T  13946746 tacaacatacatt 13946758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Original strand, 44775174 - 44775504
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44775174 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 44775273  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44775274 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgca 44775373  T
Q  204 actaatcc-ccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttccattaa 301  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||  |||||    
T  44775374 actaatcctcatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattt-aattaa 44775471  T
Q  302 gtacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  44775472 atacaacattcattcagtcagcatccattcatc 44775504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Original strand, 44780358 - 44780688
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44780358 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 44780457  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44780458 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgca 44780557  T
Q  204 actaatcc-ccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttccattaa 301  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||  |||||    
T  44780558 actaatcctcatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattt-aattaa 44780655  T
Q  302 gtacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  44780656 atacaacattcattcagtcagcatccattcatc 44780688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 4 - 315
Target Start/End: Original strand, 13939961 - 13940268
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13939961 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggaca 13940060  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13940061 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgca 13940160  T
Q  204 actaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaactt-tagggaatttccattaag 302  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||| |||||  |||||     
T  13940161 actaa-ccccttgagtatatctacataccaaccaacct----atatacataatatatgattcaccatccaatttacaacttcaaggaaattttaattaaa 13940255  T
Q  303 tacaacatacatt 315  Q
    |||||||||||||    
T  13940256 tacaacatacatt 13940268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Original strand, 4677137 - 4677466
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4677137 actccactaagactcctctaaactcccatgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 4677236  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4677237 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgca 4677336  T
Q  204 actaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttccattaa 301  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||  ||||     
T  4677337 actaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattt-aattat 4677434  T
Q  302 gtacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
     |||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  4677435 atacaacataca-ccagtcagcatccattcatc 4677466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Original strand, 41175450 - 41175779
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41175450 actccactaagactcctctaaactcccatgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 41175549  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41175550 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgca 41175649  T
Q  204 actaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttccattaa 301  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||  ||||     
T  41175650 actaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattt-aattat 41175747  T
Q  302 gtacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
     ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  41175748 atacaacacaca-tcagtcagcatccattcatc 41175779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Original strand, 41180588 - 41180917
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41180588 actccactaagactcctctaaactcccatgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 41180687  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41180688 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgca 41180787  T
Q  204 actaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttccattaa 301  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||  ||||     
T  41180788 actaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattt-aattat 41180885  T
Q  302 gtacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
     ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  41180886 atacaacacaca-tcagtcagcatccattcatc 41180917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 4 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 8743113 - 8742848
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8743113 actccactaagactcctctaaactcccatgcatgtggtaccaaaattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 8743014  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8743013 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 8742914  T
Q  204 actaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca 269  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  8742913 actaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctatacatatacat-atatatgattcacca 8742848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 4 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 8761283 - 8761018
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8761283 actccactaagactcctctaaactcccatgcatgtggtaccaaaattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 8761184  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8761183 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 8761084  T
Q  204 actaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca 269  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  8761083 actaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctatacatatacat-atatatgattcacca 8761018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 282
Target Start/End: Original strand, 12200176 - 12200454
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12200176 actccactaagactcctgtaaacacccatgcatgtggtacc-aaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggaca 12200274  T
Q  104 taagtcctcaccact-acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgc 202  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12200275 taagttctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaagttgttccagagctgaagctctcccactgttatgcttatgc 12200374  T
Q  203 aactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca-tccgatttacaac 282  Q
    |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  12200375 aacttacccacttgagtatatctacataccaaccaacctaagcatatacgt-atatatgactcaccactccaatttacaac 12200454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16838705 - 16838466
Alignment:
Q  5 ctccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagga 101  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| |||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||    
T  16838705 ctccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-ataatcaggaccgt-agcctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttccagga 16838608  T
Q  102 cataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16838607 cataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttat 16838508  T
Q  201 gcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 242  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16838507 gcaactgacccacttgagtatatctacatacaatccaaccta 16838466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14652921 - 14652680
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||    
T  14652921 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-ataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcagg 14652823  T
Q  101 acataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  14652822 acataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactattatgctta 14652723  T
Q  200 tgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 242  Q
    ||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  14652722 tgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 14652680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16383085 - 16382844
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||    
T  16383085 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-aaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcagg 16382987  T
Q  101 acataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  16382986 acataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgtaatgctta 16382887  T
Q  200 tgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 242  Q
    ||||||| | || |||| ||||||||||| || | ||||||||    
T  16382886 tgcaactgacccacttgtgtatatctacacacaacccaaccta 16382844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 46 - 231
Target Start/End: Original strand, 12304763 - 12304949
Alignment:
Q  46 aaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact-acaccactttgagtaactagtactcc 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12304763 aaaatcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctcc 12304862  T
Q  145 accactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  | | || ||||||||||||||    
T  12304863 accactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgactcacctgtgtatatctacatac 12304949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13203743 - 13203514
Alignment:
Q  5 ctccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagga 101  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |   |||||    
T  13203743 ctccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataaa-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatagttaaagcattcattttcagga 13203645  T
Q  102 cataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 200  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13203644 cctaagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttat 13203545  T
Q  201 gcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  13203544 gcaactaacccacttgagtatatctacatac 13203514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 17157061 - 17157262
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  17157061 atgcatgtggtaccgtat-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 17157159  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 228  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17157160 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccccttgtgtatatctaca 17157259  T
Q  229 tac 231  Q
    |||    
T  17157260 tac 17157262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 9532849 - 9533027
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||    
T  9532849 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccacttt 9532948  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  9532949 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 9533027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 24191762 - 24191963
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||    
T  24191762 atgcatgtggtaccgtat-tcggggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagttctcaccgctcaacaccgcttt 24191860  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 228  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24191861 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccccttgtgtatatctaca 24191960  T
Q  229 tac 231  Q
    |||    
T  24191961 tac 24191963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41456325 - 41456123
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  41456325 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 41456226  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 228  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  || | || |||||||||||    
T  41456225 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaactatcccacctgtgtatatctaca 41456126  T
Q  229 tac 231  Q
    |||    
T  41456125 tac 41456123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16802626 - 16802425
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||    
T  16802626 atgcatgtggtacc-atattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaaacattctcatcaggacataagtcatcaccgctcaacaccgcttt 16802528  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 228  Q
    ||  |||||||  || ||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| || |||| |||||||||||    
T  16802527 gaacaactagtgttctaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcgactaacccacttgtgtatatctaca 16802428  T
Q  229 tac 231  Q
    |||    
T  16802427 tac 16802425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14544394 - 14544155
Alignment:
Q  8 cactaagactcctctaa--acaccca-tgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaa-caggaca 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||    
T  14544394 cactaagactcctctaacaacacccaatgcatgtggtacc-ataatcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattctttttcaggaca 14544296  T
Q  104 taagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatg 201  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||| | || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14544295 taagtcctcaccactaaacaccgctttgagcaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccacttttatgcttatg 14544196  T
Q  202 caactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 242  Q
    ||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  14544195 caactgacccgcttgtgtatatctacatacaacccaaccta 14544155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8583471 - 8583294
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 127  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  8583471 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 8583373  T
Q  128 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  8583372 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 8583294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 14084531 - 14084708
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 127  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  14084531 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 14084629  T
Q  128 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  14084630 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 14084708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 14089932 - 14090109
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 127  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  14089932 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 14090030  T
Q  128 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  14090031 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 14090109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 49399473 - 49399650
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 127  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  49399473 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaccaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 49399571  T
Q  128 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  49399572 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 49399650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24123380 - 24123203
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 127  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  24123380 atgcacgtggtacc-ataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 24123282  T
Q  128 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  24123281 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 24123203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13969010 - 13968850
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 127  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  13969010 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 13968912  T
Q  128 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccact 189  Q
    |||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  13968911 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 13968850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13974485 - 13974325
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 127  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  13974485 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 13974387  T
Q  128 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccact 189  Q
    |||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  13974386 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 13974325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 186
Target Start/End: Original strand, 17190836 - 17190992
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcacc--actacaccacttt 128  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||| ||||    
T  17190836 atgcatgtggtacc-aaattcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgatcaacaccgcttt 17190934  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctccc 186  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||    
T  17190935 gaacaactagtgttccaccgctttgaaagacaaggcgttccagagccgaagctctccc 17190992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34852414 - 34852211
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagga 101  Q
    |||||||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||| | | ||||||||||  ||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |   |||||    
T  34852414 actccactaagactcctcaacaatgcgcatgcatgtggtacc-atattcagggccgtagccctcaccgttgtagaatggttaaagcattcattttcagga 34852316  T
Q  102 cataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 199  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  34852315 cataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctctcacttttatgatta 34852216  T
Q  200 tgcaa 204  Q
    |||||    
T  34852215 tgcaa 34852211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16830065 - 16829943
Alignment:
Q  120 caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagt 219  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||    
T  16830065 caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgagt 16829966  T
Q  220 atatctacataccaaccaaccta 242  Q
    |||||||||||| | ||||||||    
T  16829965 atatctacatacaatccaaccta 16829943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Original strand, 14292674 - 14292906
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcaacag 99  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| | |||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||  |    ||    
T  14292674 actccactaagactcctctaacaacatccatacatgtggtacc-ataatcagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttttag 14292772  T
Q  100 gacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 197  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| ||||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  14292773 gacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgagcaactagtgctccaacgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgct 14292872  T
Q  198 tatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    ||||||||| | || ||||  ||| |||||||||    
T  14292873 tatgcaactgacccacttgtatatttctacatac 14292906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16830206 - 16830055
Alignment:
Q  5 ctccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagga 101  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| |||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||    
T  16830206 ctccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-ataatcaggaccgt-agcctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttccagga 16830109  T
Q  102 cataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttga 154  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16830108 cataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttga 16830055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 231
Target Start/End: Original strand, 23174189 - 23174358
Alignment:
Q  62 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgact 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| |||     
T  23174189 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcatttttt-caggacataagtcctcaccgctaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgaca 23174287  T
Q  161 aagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    | || ||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  23174288 aggcgttcaagagccgaagctctcccacttttatgcttttgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 23174358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17199175 - 17199015
Alignment:
Q  74 tcgaatggttaaagcattctca-acaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccag 171  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||    
T  17199175 tcgaatggttaaagcattcttttacaggacctaagtcctcaccgctaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 17199076  T
Q  172 agccgaagctctcccactgt-tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||  | || |||| ||||||||||||||    
T  17199075 agccgaagctctcccgctgtatatgactatgcaaccgacccacttgtgtatatctacatac 17199015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31690659 - 31690570
Alignment:
Q  142 tccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  31690659 tccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagccctcccgcttttatgtttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 31690570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12961580 - 12961378
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccact 126  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||  |||| |||||||  | ||||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||||| |||  |||| ||    
T  12961580 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgaaaccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcatcaccgctaaacaccgct 12961482  T
Q  127 ttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatcta 226  Q
    ||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||| |||||||| || || || ||||  |||||||||| | || |||| |||||||||    
T  12961481 ttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagcccttccgcttttatacttatgcaactgacccacttgtgtatatcta 12961382  T
Q  227 cata 230  Q
    ||||    
T  12961381 cata 12961378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 231
Target Start/End: Original strand, 23173876 - 23173963
Alignment:
Q  144 caccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    |||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  23173876 caccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcacacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 23173963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17243815 - 17243680
Alignment:
Q  73 gtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattcca 170  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  ||| |||  |||||| ||||||| ||| |  | ||| |    
T  17243815 gtcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacaagacgttcta 17243716  T
Q  171 gagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaact 206  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  17243715 gggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaact 17243680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 18719339 - 18719250
Alignment:
Q  5 ctccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattct 93  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18719339 ctccactaagactcttctacaacactcatgcatgtggtacc-ataatcagggccgaagccctcaccgcttatcgaatggttaaagcattct 18719250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 11850840 - 11850780
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 92  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  11850840 atgcatgtggtacc-atattcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattc 11850780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 231
Target Start/End: Original strand, 12255238 - 12255326
Alignment:
Q  142 tccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  12255238 tccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagccctcccgct-ttatacttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 12255326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 118
Target Start/End: Original strand, 18889009 - 18889053
Alignment:
Q  74 tcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact 118  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||    
T  18889009 tcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcatcact 18889053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21678469 - 21678141
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678469 actccactaagactcctctaat-acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 21678371  T
Q  104 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678370 taagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgca 21678271  T
Q  204 actaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaactttagggaatttccattaag 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| ||| |||||||  |||||     
T  21678270 actaatccccattgagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaacgttaaggaattt-aattaaa 21678173  T
Q  303 tacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21678172 tacaacattcattcagtcagcatccattcatc 21678141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17264998 - 17264667
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17264998 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggaca 17264899  T
Q  104 taagtcctcaccact-acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgc 202  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17264898 taagtcctcaccactaacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccgagcgttccagagccgaagctctcccactgtgatgtttatgc 17264799  T
Q  203 aactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaac--tttagggaatttccatta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||  || || ||||||  ||||    
T  17264798 aactaatccccttgagtatatctacataccaaccaatct-aacatatac-ttatatatgattcaccatccaatttacaacatttaagtgaattttaatta 17264701  T
Q  301 agtacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17264700 aatacaacatacattcagtcagcatctattcatc 17264667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17271480 - 17271149
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17271480 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgttgaatggttaaagcattctcatcaggaca 17271381  T
Q  104 taagtcctcaccact-acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgc 202  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17271380 taagtcctcaccactaacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccgagcgttccagagccgaagctctcccactgtgatgtttatgc 17271281  T
Q  203 aactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaac--tttagggaatttccatta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||  || || ||||||  ||||    
T  17271280 aactaatccccttgagtatatctacataccaaccaatct-aacatatac-ttatatatgattcaccatccaatttacaacatttaagtgaattttaatta 17271183  T
Q  301 agtacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17271182 aatacaacatacattcagtcagcatctattcatc 17271149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Original strand, 22174987 - 22175320
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22174987 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggaca 22175086  T
Q  104 taagtcctcaccact-acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg-tttatg 201  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22175087 taagtcctaaccactaacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccaagcgttccagagccgaagctctcccactgttatgttttatg 22175186  T
Q  202 caactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaac-tttagggaa--tttccat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||| | ||  |||  ||    
T  22175187 caactaatccccttgagtatatctacataccaaccaatct-aacatatacat-atatatgattcaccatccaacttacaacgtttaagtaaatttttaat 22175284  T
Q  299 taagtacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  22175285 taaatacaacatacattcagtcagcatctattcatc 22175320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 282
Target Start/End: Original strand, 9775467 - 9775718
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttg 129  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9775467 atgcatgtggtacc-aaaatcagggccgtgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 9775565  T
Q  130 agtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacat 229  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | || |||||||||||||||||    
T  9775566 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgctcatgcaactgacccacttgagtatatctacat 9775665  T
Q  230 accaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca-tccgatttacaac 282  Q
    || | || |||||| ||||||  | |||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  9775666 acaatcccacctaagcatatatgt-atatatgactcaccactccaatttacaac 9775718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37805492 - 37805292
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact-acaccactttg 129  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37805492 atgcatgtggtacc-aaaatcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 37805394  T
Q  130 agtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacat 229  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || | || ||||||||||||    
T  37805393 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttacagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacctgtgtatatctacat 37805294  T
Q  230 ac 231  Q
    ||    
T  37805293 ac 37805292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 758456 - 758216
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacagga 101  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    |||||    
T  758456 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-ataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttcagga 758358  T
Q  102 cataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 200  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  758357 cgtaagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttat 758258  T
Q  201 gcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 242  Q
    |||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  758257 gcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 758216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22509374 - 22509126
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacac-ccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagga 101  Q
    |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||| | ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||    
T  22509374 actcaactaagactcctctaacaacaccatgcatgtggtacc-aaaatcaagaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcagga 22509276  T
Q  102 cataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22509275 cataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtactccaccactttgaacgacaaggcgttccagatccgaagctctcccactgttatgcttat 22509176  T
Q  201 gcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatata 250  Q
    |||||| | || |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  22509175 gcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacctatacatata 22509126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22313033 - 22312793
Alignment:
Q  5 ctccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagga 101  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||    
T  22313033 ctccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-ataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcagga 22312935  T
Q  102 cataagtcctcaccact-acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22312934 cataagtcctcaccactgacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagtcgaagctctcccacttttatgcttat 22312835  T
Q  201 gcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 242  Q
    |||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  22312834 gcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 22312793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 19510999 - 19511177
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  19510999 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 19511098  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19511099 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 19511177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Original strand, 20937568 - 20937845
Alignment:
Q  7 ccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |   || ||||    
T  20937568 ccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-ataatcaggaccgtagccctcaccgatgtagaatggttaaagcattcattttcaagaca 20937666  T
Q  104 taagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatg 201  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  20937667 taagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccacagccgaagctctcccacttttatgcttatg 20937766  T
Q  202 caactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca-tccgatttaca 280  Q
    ||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||    
T  20937767 caactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacctatgcatatatat-gtatatgactcaccactccgatttaca 20937845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 23527448 - 23527651
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  23527448 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 23527547  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt-atgcaactaatccccttgagtatatctac 227  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||  || | || ||||||||||    
T  23527548 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttaatgcaactaccccacctgtgtatatctac 23527647  T
Q  228 atac 231  Q
    ||||    
T  23527648 atac 23527651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22439902 - 22439701
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  22439902 atgcatgtggtacc-atattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaaacattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 22439804  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 228  Q
    ||  |||||||  | |||| ||||||| ||| | || ||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||  |||||||||||    
T  22439803 gaacaactagtgtttcaccgctttgaacgacaaggcgttctagagccggagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttatgtatatctaca 22439704  T
Q  229 tac 231  Q
    |||    
T  22439703 tac 22439701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21675648 - 21675471
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 127  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  21675648 atgcatgtggtacc-atattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 21675550  T
Q  128 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    |||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  21675549 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 21675471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1857680 - 1857520
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 127  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  1857680 atgcatgtggtacc-atattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 1857582  T
Q  128 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccact 189  Q
    |||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  1857581 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 1857520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 204
Target Start/End: Original strand, 10816746 - 10816949
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagga 101  Q
    |||||||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||| | | |||| | |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||    
T  10816746 actccactaagactcctcaacaatgcgcatgcatgtggtacc-atattcagtgtcgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcagga 10816844  T
Q  102 cataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 199  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  10816845 cataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccaatttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgatta 10816944  T
Q  200 tgcaa 204  Q
    |||||    
T  10816945 tgcaa 10816949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 204
Target Start/End: Original strand, 23538773 - 23538976
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagga 101  Q
    |||||||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||| | | ||||||||||  ||| ||||||||| | ||||||||||||||| |   |||||    
T  23538773 actccactaagactcctcaacaatgcgcatgcatgtggtacc-atattcagggccgtagccctcaccgctgtagtatggttaaagcattcattttcagga 23538871  T
Q  102 cataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 199  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |  | ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  23538872 cataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaagtcgttccagagccgaagctctctcacttttatgatta 23538971  T
Q  200 tgcaa 204  Q
    |||||    
T  23538972 tgcaa 23538976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 23112914 - 23112827
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccacta 119  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23112914 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgtgaccctcaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta 23112827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22007986 - 22007896
Alignment:
Q  142 tccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactg-ttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    |||||| ||||||| ||| | || |||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  22007986 tccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccacttattatgattatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 22007896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 24751707 - 24751647
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 92  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24751707 atgcatgtggtacc-atattcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattc 24751647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Original strand, 27280165 - 27280496
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27280165 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggaca 27280264  T
Q  104 taagtcctcaccact-acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgc 202  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27280265 taagtcctcaccactaacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccgagcgttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgc 27280364  T
Q  203 aactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaac--tttagggaatttccatta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  || || ||||||  ||||    
T  27280365 aactaatccccttgagtatatctacataccaaccaatct-aacatatacat-atatatgattcaccatccaatttacaacatttaagtgaattttaatta 27280462  T
Q  301 agtacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27280463 aatacaacatacattcagtcagcatctattcatc 27280496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 3706967 - 3706727
Alignment:
Q  5 ctccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagga 101  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||    
T  3706967 ctccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-aaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcagga 3706869  T
Q  102 cataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3706868 cataagtcctcaccactaacaccactttgagcaattagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttat 3706769  T
Q  201 gcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 242  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  3706768 gcaactgacccacttgagtatatctacatacaatccaaccta 3706727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20438709 - 20438531
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  20438709 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 20438610  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20438609 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 20438531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23066907 - 23066665
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  |||  ||| | ||||||| ||||||||||||||||| |   ||||    
T  23066907 actccactaagacaactctaacaacacccatgcatgtggtacc-aaaatcaggatcgtagccctctccgctgtagaatggttaaagcattcattttcagg 23066809  T
Q  101 acataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt 198  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  23066808 acataagtcatcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgctt 23066709  T
Q  199 atgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 242  Q
    |||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  23066708 atgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 23066665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 21542056 - 21542233
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 127  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  21542056 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 21542154  T
Q  128 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  21542155 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 21542233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 42096080 - 42095903
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 127  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  42096080 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 42095982  T
Q  128 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  42095981 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 42095903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22448469 - 22448244
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||    
T  22448469 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-ataatcagggccgtagccctcaccgctgttgaatggttaaagcattcatttacagg 22448371  T
Q  101 acataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 200  Q
    |||||||||||        |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||    
T  22448370 acataagtcct--------caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctcttctacttttatgcttat 22448279  T
Q  201 gcaactaat----ccccttgagtatatctacatac 231  Q
    |||| ||||    || |||| ||||||||||||||    
T  22448278 gcaattaattgacccacttgtgtatatctacatac 22448244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Original strand, 20242503 - 20242735
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcaacag 99  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||   |||  |||||||| ||||| |||| ||||||  |   |||    
T  20242503 actccactaagacttctctaacaacacccatgcatgtggtacc-aaaatcaaggccgaagccctaaccgctgtagaatgattaaggcattcattttccag 20242601  T
Q  100 gacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 197  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  20242602 gacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgct 20242701  T
Q  198 tatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    ||||||| | | || |||| ||||||||||||||    
T  20242702 tatgcaaatgacccacttgtgtatatctacatac 20242735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20046056 - 20045879
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  20046056 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtagaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 20045957  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||    
T  20045956 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccgct-tgatgtttatgaaacta 20045879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19664306 - 19664105
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccacta--caccacttt 128  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||   ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||    
T  19664306 atgcatgtggtacc-atattcagggccggagccctcactgctatcgaatggttaaagcattcttatcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttt 19664208  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 228  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  19664207 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttaatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctaca 19664108  T
Q  229 tac 231  Q
    |||    
T  19664107 tac 19664105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Original strand, 32650074 - 32650304
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggac 102  Q
    |||||||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||| | | ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  32650074 actccactaagactcctcaacaatgcgcatgcatgtggtacc-atattcaggaccgtagcccacaccgttgtcgaatggttaaagcattcttttcaggac 32650172  T
Q  103 ataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 200  Q
    ||||||| ||||| |||  |||| ||||||  ||||| |  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  32650173 ataagtcatcaccgctaaacaccgctttgaacaactaatgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgattat 32650272  T
Q  201 gcaact-aatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    |||||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  32650273 gcaactgactccacttgtgtatatctacatac 32650304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 41110814 - 41111016
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||| ||||  || |||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  41110814 atgcatgtgataccataattcagggtcatgacccacaccattgtcgaatggttaaagcattctcagcatgacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 41110913  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 228  Q
    ||   ||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  || | || |||||||||||    
T  41110914 gaacgactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctaca 41111013  T
Q  229 tac 231  Q
    |||    
T  41111014 tac 41111016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 955248 - 955118
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||| |||| ||||||||||||||||| |   ||||    
T  955248 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-aaaatcaggaccgtagccctcaccactgtagaatggttaaagcattcattttcagg 955150  T
Q  101 acataagtcctcaccact--acaccactttga 130  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  955149 acataagccctcaccactaaacaccactttga 955118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19778639 - 19778434
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgt-cgaatggttaaagcattctcaa--caggacataagtcctcaccacta--caccac 125  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||  |||  |    
T  19778639 atgcatgtggtacc-ataatcagggtcgcagccctcaccgctgttcgaatggttaaagcattctttttccaggacataagtcctcaccgctaaacacagc 19778541  T
Q  126 tttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaa-tccccttgagtatatc 224  Q
    |||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | ||||||||| ||||| || ||||| || | |||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  19778540 tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagggccgaggccctcccgctttcatgtttatgcaactaactccacttgtgtatatc 19778441  T
Q  225 tacatac 231  Q
    |||||||    
T  19778440 tacatac 19778434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29554645 - 29554419
Alignment:
Q  5 ctccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcaacaggac 102  Q
    |||||||||||||||||||    || |||||||||||||| | |||||||||||   ||| ||| |||  | ||||||||||||||||| |   ||||||    
T  29554645 ctccactaagactcctcta----ccaatgcatgtggtacc-ataatcagggccgaagccctcactgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggac 29554551  T
Q  103 ataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 200  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||| |||| ||| ||||| || || || ||||    
T  29554550 ataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccggagccctcccgcttttgtgcttat 29554451  T
Q  201 gcaact-aatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    |||||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  29554450 gcaactgactccacttgtgtatatctacatac 29554419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 955128 - 955032
Alignment:
Q  144 caccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacc 240  Q
    |||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||| ||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||    
T  955128 caccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctcttccacttttatgctcatgctactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacc 955032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 115
Target Start/End: Original strand, 36614935 - 36615015
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcacc 115  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||  |||| ||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  36614935 atgcatgtggtaccaaaa--cagggccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataagtcctcacc 36615015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 115
Target Start/End: Original strand, 24079551 - 24079634
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtc--gaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcacc 115  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||   ||| |||||||||   |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  24079551 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 24079634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 24109203 - 24109120
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtc--gaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcacc 115  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||   ||| |||||||||   |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  24109203 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 24109120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 80 - 334
Target Start/End: Original strand, 40549 - 40804
Alignment:
Q  80 ggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaag 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  40549 ggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccaagcattccagagccgaag 40648  T
Q  180 ctctcccactgttatgttt-atgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgattt 277  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||  | | ||    
T  40649 ctcttccactgttatgtttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctatacatatacat-atatatgattcaccaatcaactt 40747  T
Q  278 acaacttt-agggaatttccattaagtacaacatacattcagtcatcatccattcatc 334  Q
    ||| |||| ||| |||||  ||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  40748 acatctttaaggaaattttaattatatacaacacaca-tcagtcaacatccattcatc 40804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36994 - 36793
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  36994 atgcatgtggtacc-ataatcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattcttatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 36896  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 228  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||    
T  36895 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctctcacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 36796  T
Q  229 tac 231  Q
    |||    
T  36795 tac 36793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 8565 - 8493
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcg 76  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8565 actccactaagactcctctaaacccccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcg 8493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 44057 - 43965
Alignment:
Q  142 tccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaa-ctaatccccttgagtatatctacatacca 233  Q
    |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||| ||||| || | ||| |||||||| | | ||| |||| ||||||||||||||||    
T  44057 tccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagccctcccgctttaatgcttatgcaaccgactccacttgtgtatatctacatacca 43965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14702 - 14421
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||    
T  14702 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-ataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcagg 14604  T
Q  101 acataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  14603 acataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgctta 14504  T
Q  200 tgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca-tccgatttacaac 282  Q
    ||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||| ||  ||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  14503 tgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacctatgcatatatat-gtatatgactcaccactccaatttacaac 14421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 66 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 7356 - 7178
Alignment:
Q  66 caccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccactac-accactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaag 163  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | |    
T  7356 caccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaataccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaagg 7257  T
Q  164 cattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 242  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  7256 cgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatccaactgtcccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 7178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 282
Target Start/End: Original strand, 141297 - 141577
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacagga 101  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| |||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||    |||||    
T  141297 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-ataatcaggaccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttcagga 141395  T
Q  102 cataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 200  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  141396 cgtaagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttat 141495  T
Q  201 gcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca-tccgatttacaac 282  Q
    |||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||  ||||||  | |||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  141496 gcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacctatgcatatatgt-atatatgactcaccactccaatttacaac 141577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 204
Target Start/End: Original strand, 146611 - 146742
Alignment:
Q  76 gaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccactaca--ccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccaga 172  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||    
T  146611 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaaaaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccaga 146710  T
Q  173 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaa 204  Q
    | ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  146711 gacgaagctctcccacttttatgattatgcaa 146742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 265071 - 265311
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacagga 101  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||  ||||||||| |||||||||||||||||    || ||    
T  265071 actccactaagactcttctaacaacacccatgcatgtggtacc-ataatcaggaccgtagccttcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttcatga 265169  T
Q  102 cataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  265170 cataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgccccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttat 265269  T
Q  201 gcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 242  Q
    |||||| | || |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  265270 gcaactgacccacttgtgtatatctacataccacccaaccta 265311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 258645 - 258885
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacagga 101  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||  ||||||||| |||||||||||||||||    || ||    
T  258645 actccactaagactcttctaacaacacccatgcatgtggtacc-ataatcaggaccgtagccttcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttcatga 258743  T
Q  102 cataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  258744 catatgtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgccccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttat 258843  T
Q  201 gcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 242  Q
    |||||| | || |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  258844 gcaactgacccacttgtgtatatctacataccacccaaccta 258885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Original strand, 41902 - 42132
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||    
T  41902 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-ataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcagg 42000  T
Q  101 acataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  42001 acataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccacttttatgctta 42100  T
Q  200 tgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    ||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  42101 tgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 42132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 63399 - 63169
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||    
T  63399 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-ataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcagg 63301  T
Q  101 acataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  63300 acataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgataaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgctta 63201  T
Q  200 tgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    ||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  63200 tgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 63169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13054 - 12876
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 128  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  | ||||||| ||||    
T  13054 atgcatgtggtacc-ataatcaggtccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattcttatcaggacctaagtcctcaccgctctacaccgcttt 12956  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaa 208  Q
    ||  |||| ||  |||||| ||||||| ||| | || ||| ||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  12955 gaacaacttgtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagagccgaaactctcccactttgatgcttatgcaactaa 12876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 124677 - 124446
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcaa-cagg 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||    ||||    
T  124677 actccactaagactcctctacaatactcatgcatgtggtacc-ataatcagggccgaagccctcaccgcttatcgaatggttaaagcattctttttcagg 124579  T
Q  101 acataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt 198  Q
    |||| |||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || ||||||  | ||||| ||||| || ||||| ||    
T  124578 acatgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccaggtcagaagccctcccgcttttatgctt 124479  T
Q  199 atgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    |||||||| | || ||||  |||||||||||||    
T  124478 atgcaactgacccacttgtttatatctacatac 124446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0535
Description:

Target: scaffold0535; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6235 - 6006
Alignment:
Q  6 tccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggac 102  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||    
T  6235 tccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-ataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggac 6137  T
Q  103 ataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 200  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6136 ataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttat 6037  T
Q  201 gcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    | |||||| || |||  ||||||||||||||    
T  6036 gtaactaacccacttatgtatatctacatac 6006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4458 - 4275
Alignment:
Q  50 tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccacc 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| || |||  || ||||  ||||||    
T  4458 tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgctgtgaacaattagtgttccacc 4359  T
Q  148 actttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
     ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  4358 gctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaatccacttgtgtatatctacatac 4275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15615 - 15432
Alignment:
Q  50 tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccacc 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  ||||||    
T  15615 tcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccacc 15516  T
Q  148 actttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
     ||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15515 gctttgaatgacaaggcgttccagagtcgaagctctcccacttttatgcttgtgcaactaacccccttgtgtatatctacatac 15432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 231
Target Start/End: Original strand, 71155 - 71291
Alignment:
Q  97 caggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttat 194  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| || ||||    
T  71155 caggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccgcttttat 71254  T
Q  195 gtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    | |||||||||| |  | |||| ||||||||||||||    
T  71255 gcttatgcaactgacacacttgtgtatatctacatac 71291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Original strand, 152332 - 152562
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||| || | |||| |||||||||||||| || |   ||||    
T  152332 actccactaagactcctctaacaacaaccatgcatgtggtacc-ataatcaggaccgtagccctcaacactgtagaatggttaaagcaatcattttcagg 152430  T
Q  101 acataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  152431 acataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgctta 152530  T
Q  200 tgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  152531 tgcaactaacccacttgtgtatatctacatac 152562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 174738 - 174561
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 127  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  174738 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 174640  T
Q  128 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  174639 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 174561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4795 - 4594
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  4795 atgcatgtggtacc-atattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaattgttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 4697  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 228  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||  |||||||||||    
T  4696 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttatgtatatctaca 4597  T
Q  229 tac 231  Q
    |||    
T  4596 tac 4594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 51177 - 50948
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||    
T  51177 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-ataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcgttttcagg 51079  T
Q  101 acataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||  | || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  51078 acataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgataaggcgttctagagccgaagctctcccacttttatgctta 50979  T
Q  200 tgcaactaatccccttgagtatatctacata 230  Q
    ||||||| | |  |||| |||||||||||||    
T  50978 tgcaactgacctacttgtgtatatctacata 50948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 250
Target Start/End: Original strand, 13979 - 14228
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||| |||| | || ||||||||||||||||| |   ||||    
T  13979 actccactaagactccgctaacaacacccatgcatgtggtatcgaaa-tcaggaccgtagccctcacctcggtagaatggttaaagcattcattttcagg 14077  T
Q  101 acataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 199  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14078 acataagtcctcgccactaacaccactttgagcaacgagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccacttctatgttta 14177  T
Q  200 tgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatata 250  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||    
T  14178 tgcaactaacccccttgtgtatatctacatacaacctaacctatacatata 14228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 250
Target Start/End: Original strand, 24180 - 24429
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||  ||| |||| |||| ||||||||||||||||| |   ||||    
T  24180 actccactaagactccgctaacaacacccatgcatctggtacc-ataatcaggaccgtagccctcacctctgtagaatggttaaagcattcattttcagg 24278  T
Q  101 acataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 199  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||| | || ||| |||||||||||||| |||||  |||| |||    
T  24279 acataagtcctcgccactaacaccactttgaggaatgagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctcttccacttctatgctta 24378  T
Q  200 tgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatata 250  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||| |||||| | | |||||| |||||||    
T  24379 tgcaactaaccgccttgtgtatatccacatacaacctaacctatacatata 24429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10435 - 10234
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  10435 atgcatgtggtacc-atattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 10337  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 228  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||  |||||||||||    
T  10336 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagctgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttatgtatatctaca 10237  T
Q  229 tac 231  Q
    |||    
T  10236 tac 10234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 110758 - 110935
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  110758 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcatt 110857  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  110858 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgcaacta 110935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 116793 - 116861
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacag 99  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  116793 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattcttaacag 116861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Original strand, 10312 - 10543
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||    
T  10312 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-ataatcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcagg 10410  T
Q  101 acataagtcctcaccactacac--cactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt 198  Q
    ||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| | || | |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  10411 acataagtcctcatcactaaacatcactttgagcaaccagtgctccaccactttgaacgacaaggcgtcccagagccgaagctctcccacttttatgatt 10510  T
Q  199 atgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    |||||||| | |  || | ||||||||||||||    
T  10511 atgcaactgaccgactcgtgtatatctacatac 10543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 47615 - 47376
Alignment:
Q  8 cactaagactcctctaa--acaccca-tgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaa-caggaca 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||    
T  47615 cactaagactcctctaacaacacccaatgcatgtggtacc-ataatcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattctttttcaggaca 47517  T
Q  104 taagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatg 201  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  47516 taagtcctcaccactaaacaccgctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaaactctcccacttttatgcttatg 47417  T
Q  202 caactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 242  Q
    ||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  47416 caactgacccgcttgtgtatatctacatacaacccaaccta 47376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 63035 - 62796
Alignment:
Q  8 cactaagactcctctaa--acaccca-tgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaa-caggaca 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||    
T  63035 cactaagactcctctaacaacacccaatgcatgtggtacc-ataatcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattctttttcaggaca 62937  T
Q  104 taagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatg 201  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  62936 taagtcctcaccactaaacaccgctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaaactctcccacttttatgcttatg 62837  T
Q  202 caactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 242  Q
    ||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  62836 caactgacccgcttgtgtatatctacatacaacccaaccta 62796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 56649 - 56410
Alignment:
Q  8 cactaagactcctctaa--acaccca-tgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaa-caggaca 103  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||    
T  56649 cactaagactcctctaacaacacccaatgcatgtggtacc-ataatcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattctttttcaggaca 56551  T
Q  104 taagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatg 201  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  56550 taagtcctcaccactaaacaccgctttgagcaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaatctctcccacttttatgcttatg 56451  T
Q  202 caactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 242  Q
    ||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  56450 caactgaccctcttgtgtatatctacatacaacccaaccta 56410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0430 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0430
Description:

Target: scaffold0430; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14778 - 14536
Alignment:
Q  2 ctactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | | | ||||| ||||  ||  || |||||| ||||||||||| |||||    |||    
T  14778 ctactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtatc-atattcaggaccgtagccatcatcgctgtagaatggttaaaacattcatttcag 14680  T
Q  100 gacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14679 gacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccactgttatgctt 14580  T
Q  199 atgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 242  Q
    || ||||| |  | |||  |||||||||||||| | ||||||||    
T  14579 attcaactgactcacttatgtatatctacatacaacccaaccta 14536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 174739 - 174561
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  174739 atgcatgtggtaccataattcttggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 174640  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
     |  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  174639 taacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 174561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 489127 - 489304
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  || |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  489127 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaacactgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 489226  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  489227 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgcaacta 489304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 9809 - 9649
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  9809 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaataggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 9710  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccact 189  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  9709 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 9649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 38401 - 38578
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 127  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  38401 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 38499  T
Q  128 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  38500 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 38578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 35723 - 35546
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 127  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  35723 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 35625  T
Q  128 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  35624 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 35546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 30322 - 30162
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 127  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  30322 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 30224  T
Q  128 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccact 189  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  30223 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 30162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 51858 - 51676
Alignment:
Q  52 agggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccacca 148  Q
    ||||||| | ||| ||||||| | ||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||| |||  |||| ||||||  ||||| |  ||||||     
T  51858 agggccgaggccctcaccgctatagaatggttaaagcattcattttcaggacataagccctcaccgctaaacaccgctttgaacaactactgttccaccg 51759  T
Q  149 ctttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  51758 ctttgaatgacaaggcgttccaaagccgaagctctcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 51676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 47156 - 46979
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 127  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  47156 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 47058  T
Q  128 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  47057 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 46979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 52561 - 52384
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 127  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  52561 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 52463  T
Q  128 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  52462 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 52384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 2566 - 2743
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  2566 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 2664  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 207  Q
    ||  |||| ||  |||||| ||||||| ||| | || ||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  2665 gaacaactggtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccactttgatgcttatgcaacta 2743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 29748 - 29948
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  29748 atgcatgtggtacc-ataatcagggccgtaacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccacttt 29846  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 228  Q
    ||  ||| |||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  ||||| | || |||| |||||||||||    
T  29847 gaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccaaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 29945  T
Q  229 tac 231  Q
    |||    
T  29946 tac 29948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Original strand, 5119 - 5350
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||| ||||||    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||    
T  5119 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-ataattagggccaaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcagg 5217  T
Q  101 acataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt 198  Q
    ||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  5218 acataagtcctcaccgctatacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccgcttttatgctt 5317  T
Q  199 atgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  5318 atgcaactaaccctcttgtgtatatctacatac 5350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 314 - 143
Alignment:
Q  62 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgac 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| |||    
T  314 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgac 215  T
Q  160 taagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
     | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  214 aaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Original strand, 10217 - 10400
Alignment:
Q  50 tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccacc 147  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  || |||    
T  10217 tcagggccgtgacccactccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttctacc 10316  T
Q  148 actttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
     ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||  ||| ||||||| ||||||    
T  10317 gctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcacacttttatgcttatgcgactaacccatttgtgtatatccacatac 10400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15670 - 15511
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |   ||||    
T  15670 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-ataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaagcattcattttcagg 15572  T
Q  101 acataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgact 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15571 acataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgact 15511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 231
Target Start/End: Original strand, 3058 - 3123
Alignment:
Q  166 ttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  3058 ttccagagccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctacatac 3123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15510 - 15454
Alignment:
Q  175 cgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || || | ||||||||||||||    
T  15510 cgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccactcgtgtatatctacatac 15454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20629 - 20493
Alignment:
Q  97 caggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20629 caggacataagtcctcaccactaaacaccgcgttgagcaactagtactccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttat 20530  T
Q  195 gtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    | |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  20529 gcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 20493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1773 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1773
Description:

Target: scaffold1773; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 189
Target Start/End: Original strand, 1 - 132
Alignment:
Q  50 tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccac 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        |||| ||||||  |||||||  ||||||||    
T  1 tcaggaccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcct--------caccgctttgaacaactagtgttccaccac 92  T
Q  150 tttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccact 189  Q
    |||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  93 tttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 240
Target Start/End: Original strand, 17447 - 17688
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaaacaccc---atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacag 99  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||   |||||||||||||| | |||| ||||||   ||| || |||||| ||||||||||||||||| |   |||    
T  17447 actccactaagactcttctaatcaaccctcatgcatgtggtacc-ataatcggggccgaagccctcatcgctgtagaatggttaaagcattcattttcag 17545  T
Q  100 gacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 197  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||| |||| || ||||| |    
T  17546 gacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgctccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctttcccgcttttatgct 17645  T
Q  198 tatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacc 240  Q
    ||||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||    
T  17646 tatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacc 17688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5216 - 4981
Alignment:
Q  2 ctactccactaagactcctctaaacaccc---atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaac 97  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||   |||||||||||||| | |||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |    
T  5216 ctactccactaagattcctctaatcaaccctcatgcatgtggtacc-ataatcagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttc 5118  T
Q  98 aggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaacta-gtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttat 194  Q
    ||||||| |||||||||| |||  |||| ||||||  ||| | || ||||||| ||||||| ||| | ||||||||| |||||||| ||||| || ||||    
T  5117 aggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgctccaccgctttgaacgacaaggcattccagggccgaagccctcccgcttttat 5018  T
Q  195 gtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    | |||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  5017 gcttatgcaactaacccacttgtgtatatctacatac 4981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0811
Description:

Target: scaffold0811; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 131 - 5
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 128  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  131 atgcatgtggtaccataatccagggccgtgatccacaccgctgtcgaatggttaaagcattatcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 32  T
Q  129 gagtaactagtactccaccactttgaa 155  Q
    ||  |||||||  |||||| |||||||    
T  31 gaacaactagtgttccaccgctttgaa 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1913 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1913
Description:

Target: scaffold1913; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 208
Target Start/End: Original strand, 1 - 87
Alignment:
Q  122 ccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaa 208  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1 ccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaagcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaa 87  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41750 - 41592
Alignment:
Q  76 gaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccaga 172  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| |||| || ||| | || |||||||    
T  41750 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgcttttaacgacaaggcgttccaga 41651  T
Q  173 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  41650 gccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 41592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Original strand, 3629 - 3718
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 92  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3629 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-aaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattc 3718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 231
Target Start/End: Original strand, 8410 - 8615
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgt-cgaatggttaaagcattctcaa--caggacataagtcctcaccacta--caccac 125  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||  |||  |    
T  8410 atgcatgtggtacc-ataatcagggtcgcagccctcaccgctgttcgaatggttaaagcattctttttccaggacataagtcctcaccgctaaacacagc 8508  T
Q  126 tttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaa-tccccttgagtatatc 224  Q
    |||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | ||||||||| ||||| || ||||| || | |||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  8509 tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagggccgaggccctcccgctttcatgtttatgcaactaactccacttgtgtatatc 8608  T
Q  225 tacatac 231  Q
    |||||||    
T  8609 tacatac 8615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 76 - 231
Target Start/End: Original strand, 326816 - 326975
Alignment:
Q  76 gaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccaga 172  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||| ||     
T  326816 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagg 326915  T
Q  173 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 231  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  326916 gccgaagccctcccacttttgtgcttatgcaactaactccccttgtgtatatctacatac 326975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 321040 - 321266
Alignment:
Q  5 ctccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcaacaggac 102  Q
    ||||||||||||||||||| | |    ||||||||||||| | |||||||||||   ||| |||||||  | ||||||||||||||||| |   ||||||    
T  321040 ctccactaagactcctctacaaa----tgcatgtggtacc-ataatcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggac 321134  T
Q  103 ataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 200  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||| |||||||| |||||| | || || ||||    
T  321135 ataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccatttttgtgcttat 321234  T
Q  201 gcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 231  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  321235 gcaacaaactccccttgtgtatatctacatac 321266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 205
Target Start/End: Original strand, 115778 - 115911
Alignment:
Q  74 tcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccag 171  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||  ||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||    
T  115778 tcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacgggtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 115877  T
Q  172 agccgaagctctcccactgttatgtttatgcaac 205  Q
     | |||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  115878 ggtcgaagccctcccgcttttatgcttatgcaac 115911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 231
Target Start/End: Original strand, 7293 - 7451
Alignment:
Q  76 gaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccaga 172  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||| ||||||||| |||||||  |||| |||||| || |||||  |||||| || |||| ||| | || |||||||    
T  7293 gaatggttaaagcattcattttcaggatataagtccttaccactaaacaccgctttgaatatctagtgttccaccgctatgaacgacaaggcgttccaga 7392  T
Q  173 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  7393 gccgaagctctcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 7451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 103063 - 102930
Alignment:
Q  74 tcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccag 171  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| |  | ||||||    
T  103063 tcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaactcgttccag 102964  T
Q  172 agccgaagctctcccactgttatgtttatgcaac 205  Q
     |||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  102963 ggccgaagctctcccgcttttatgcttatgcaac 102930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1615 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1615
Description:

Target: scaffold1615; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 550 - 392
Alignment:
Q  76 gaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccactacac--cactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccaga 172  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||| | ||| ||  | ||||||  |||||||  ||||||  |||||| ||| | || |||||||    
T  550 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcatcgctaaactccgctttgaacaactagtgttccaccgatttgaacgacaaggcgttccaga 451  T
Q  173 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  450 gccgaagctctcccactttaatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17072 - 16914
Alignment:
Q  76 gaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccactacaccac--tttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccaga 172  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||| ||| ||  |  |||||  |||||||  |||||  ||||||| ||| | || |||||||    
T  17072 gaatggttaaagcattcattttcaggacataaggcctcaccgctaaactccgttttgaacaactagtgttccactgctttgaacgacaaggcgttccaga 16973  T
Q  173 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  16972 gccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 16914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27945 - 27781
Alignment:
Q  31 atgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgt-cgaatggttaaagcattctca-acaggacataagtcctcaccacta-caccactt 127  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| | ||| |||| |||    
T  27945 atgcatgtggtacc-ataatcagggccggagccctcaccgctattcgaatggttaaagcattcttttataggacataagtcctcatcgctaacaccgctt 27847  T
Q  128 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgtta 193  Q
    |||  |||| ||  |||||||||||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27846 tgaacaactcgtgttccaccactttgaacgacaagccgttccagagccgaagctctcccgctgtta 27781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 27840 - 28065
Alignment:
Q  5 ctccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcaacaggac 102  Q
    ||||||||||||||||||| |     |||||||||||||| | |||||||||||   ||| |||||||  | ||||||||||||||||| |   ||||||    
T  27840 ctccactaagactcctctaca-----atgcatgtggtacc-ataatcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggac 27933  T
Q  103 ataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 200  Q
    || |||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  27934 atgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagggccgaagccctcccgcttttatgcttat 28033  T
Q  201 gcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 231  Q
    |||||||| ||| || | ||||||||||||||    
T  28034 gcaactaactccactggtgtatatctacatac 28065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 13620 - 13504
Alignment:
Q  5 ctccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcaa-cagga 101  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||   ||| |||||||  | ||||||||||||||||||    |||||    
T  13620 ctccactaagactcttctacaacactcatgcatgtggtacc-ataatcagggccgaagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattctttttcagga 13522  T
Q  102 cataagtcctcaccacta 119  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13521 cataagtcctcaccacta 13504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16250 - 16021
Alignment:
Q  8 cactaagactcctctaaaca--cccatgcatgtggtaccgaaaatcagggccgtgacccacaccgctgt-cgaatggttaaagcattctcaacaggacat 104  Q
    |||||||||||||||| | |  | ||||||||||||||| | | ||||||||||  ||| ||||||| | |||||| ||||||||||||   ||||||||    
T  16250 cactaagactcctctacaaatgctcatgcatgtggtacc-atattcagggccgtagccctcaccgctattcgaatgcttaaagcattcttttcaggacat 16152  T
Q  105 aagtcctcaccact--acaccactttgagtaac-tagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatg 201  Q
    ||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||  |||  |||||| ||||||| ||| | || |||||| |||| ||| ||||  || || || |||||    
T  16151 aagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccggagccctcctgcttttgtgcttatg 16052  T
Q  202 caact-aatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    ||||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  16051 caactgactccacttgtgtatatctacatac 16021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 78581 - 78539
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtacc 44  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  78581 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc 78539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 231
Target Start/End: Original strand, 55975 - 56065
Alignment:
Q  142 tccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 231  Q
    |||||| ||||||| ||| | || |||||| |||| ||| ||||| || || ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  55975 tccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccggagccctcccgcttttgtgtttatgcaactaactccacttgtgtatatctacatac 56065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 44
Target Start/End: Original strand, 16913 - 16954
Alignment:
Q  4 actccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtacc 44  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16913 actccactaagactcctctacaacactcatgcatgtggtacc 16954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 231
Target Start/End: Original strand, 17006 - 17095
Alignment:
Q  142 tccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 231  Q
    |||||| ||||||| ||| | || |||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||| | || ||||  |||||||||||||    
T  17006 tccaccgctttgaacgacaaggcgttccagcgccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtatatatctacatac 17095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1119 - 1027
Alignment:
Q  142 tccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaa-tccccttgagtatatctacatacca 233  Q
    |||||| ||||||| ||| | || |||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||  | ||| |||| ||||||||||||||||    
T  1119 tccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaaccgactccacttgtgtatatctacatacca 1027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8055 - 7963
Alignment:
Q  142 tccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaa-tccccttgagtatatctacatacca 233  Q
    |||||| ||||||| ||| | || |||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||  | ||| |||| ||||||||||||||||    
T  8055 tccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaaccgactccacttgtgtatatctacatacca 7963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University