View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17550_low_16 (Length: 379)

Name: NF17550_low_16
Description: NF17550
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17550_low_16
NF17550_low_16
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (13-340)||(36207122-36207449)
chr1 (12-340)||(2329076-2329401)
chr1 (7-340)||(18148595-18148928)
chr1 (7-340)||(2453096-2453427)
chr1 (7-340)||(16041932-16042265)
chr1 (7-340)||(6310973-6311307)
chr1 (7-340)||(37390131-37390457)
chr1 (7-340)||(48775314-48775647)
chr1 (70-339)||(48238519-48238788)
chr1 (121-340)||(52500576-52500795)
chr1 (12-127)||(48233498-48233613)
chr1 (288-340)||(25074115-25074167)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (7-340)||(25542772-25543105)
chr5 (7-340)||(14192791-14193124)
chr5 (7-340)||(8428553-8428886)
chr5 (7-340)||(37372843-37373176)
chr5 (7-338)||(39883092-39883423)
chr5 (15-340)||(27880991-27881316)
chr5 (7-340)||(3689884-3690217)
chr5 (7-340)||(3876570-3876903)
chr5 (80-340)||(37261222-37261482)
chr5 (7-259)||(17871616-17871868)
chr5 (121-340)||(30346637-30346856)
chr5 (121-340)||(10024970-10025189)
chr5 (121-340)||(24629954-24630173)
chr5 (225-340)||(6089117-6089232)
chr5 (288-340)||(4051713-4051765)
chr5 (288-340)||(15032841-15032893)
chr5 (288-340)||(2261274-2261326)
chr5 (288-340)||(30314104-30314156)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (7-336)||(5239-5567)
[»] chr4 (10 HSPs)
chr4 (7-340)||(1860584-1860917)
chr4 (7-340)||(49710080-49710412)
chr4 (7-340)||(35855814-35856147)
chr4 (7-340)||(38518003-38518336)
chr4 (7-340)||(49786807-49787140)
chr4 (121-340)||(55559131-55559350)
chr4 (7-146)||(13337336-13337475)
chr4 (284-340)||(31921380-31921436)
chr4 (288-340)||(787787-787839)
chr4 (7-74)||(618203-618270)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (12-340)||(10187451-10187779)
chr6 (7-340)||(2202158-2202491)
chr6 (6-339)||(18344033-18344366)
chr6 (7-340)||(29640007-29640341)
chr6 (7-340)||(31510178-31510511)
chr6 (6-340)||(15333550-15333884)
chr6 (7-259)||(30881315-30881567)
chr6 (113-340)||(12517295-12517522)
chr6 (288-340)||(12519514-12519566)
[»] chr7 (9 HSPs)
chr7 (7-340)||(5828534-5828867)
chr7 (7-340)||(21070041-21070374)
chr7 (7-340)||(12785957-12786290)
chr7 (7-340)||(7036627-7036960)
chr7 (7-340)||(12781127-12781461)
chr7 (7-340)||(9001124-9001457)
chr7 (7-259)||(22843792-22844044)
chr7 (121-340)||(42231991-42232210)
chr7 (73-118)||(18939139-18939184)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (7-340)||(24269049-24269382)
chr2 (12-340)||(17683813-17684141)
chr2 (7-338)||(27509283-27509614)
chr2 (7-339)||(27192397-27192729)
chr2 (7-339)||(27842211-27842543)
chr2 (7-337)||(21395280-21395610)
chr2 (7-340)||(28666151-28666484)
chr2 (67-340)||(35609592-35609865)
chr2 (7-340)||(37824985-37825318)
chr2 (7-340)||(41920152-41920485)
chr2 (7-260)||(24245812-24246065)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (7-340)||(17855-18181)
[»] scaffold1139 (1 HSPs)
scaffold1139 (7-337)||(910-1240)
[»] chr8 (9 HSPs)
chr8 (7-340)||(25218544-25218877)
chr8 (7-340)||(21113723-21114056)
chr8 (7-340)||(7821745-7822078)
chr8 (7-340)||(30307084-30307417)
chr8 (50-340)||(31978549-31978839)
chr8 (7-340)||(25209026-25209344)
chr8 (284-340)||(33861636-33861692)
chr8 (333-379)||(30138271-30138317)
chr8 (288-340)||(14714172-14714224)
[»] chr3 (14 HSPs)
chr3 (7-340)||(10110507-10110840)
chr3 (7-340)||(13529946-13530279)
chr3 (7-340)||(10968761-10969093)
chr3 (20-340)||(50410079-50410399)
chr3 (7-340)||(10000314-10000647)
chr3 (17-340)||(10237463-10237785)
chr3 (7-340)||(11368553-11368888)
chr3 (7-340)||(32678-33011)
chr3 (7-319)||(52917994-52918305)
chr3 (7-340)||(11362165-11362499)
chr3 (73-340)||(46912978-46913245)
chr3 (80-340)||(10038547-10038807)
chr3 (101-340)||(47692876-47693115)
chr3 (284-340)||(41763618-41763674)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (12-340)||(18913-19241)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (7-340)||(186464-186794)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (7-340)||(48915-49248)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (7-340)||(321315-321648)
[»] scaffold0073 (2 HSPs)
scaffold0073 (7-340)||(31840-32172)
scaffold0073 (49-340)||(19364-19655)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (49-340)||(16591-16882)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (12-337)||(556-881)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (7-340)||(182718-183051)
scaffold0003 (7-340)||(165437-165771)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (121-340)||(28727-28946)
[»] scaffold0888 (1 HSPs)
scaffold0888 (157-340)||(31-214)
[»] scaffold1424 (1 HSPs)
scaffold1424 (196-323)||(1572-1699)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (288-338)||(97083-97133)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 13 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 36207449 - 36207122
Alignment:
Q  13 tgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36207449 tgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccgacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttgg 36207350  T
Q  113 tgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggtgaagag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  36207349 tgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcgccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagag 36207250  T
Q  213 aaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagct 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36207249 aaagagtatttaagctttgattatgtttgtcgatcgggtgaaaattatgatgtccaaagtgagttgttcacaacggaatttcttaatggtattaagagct 36207150  T
Q  313 ctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||    
T  36207149 ctgaaactccaaatcaccggttgaaact 36207122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 2329401 - 2329076
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2329401 atgaaggtagaaattcctgaagattttctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagac---gtgtatcccgatttgaatgataaccttg 2329305  T
Q  112 gtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggtgaaga 211  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  2329304 gtgatccactattttttcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagtcgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaaga 2329205  T
Q  212 gaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2329204 gaaagagtatttaagctctgattctctttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagagagtggttcacaacggaatttctaaatggtattaagagc 2329105  T
Q  312 tctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||    
T  2329104 tatggaattccaaatcaccggttgaaact 2329076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18148928 - 18148595
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  18148928 gtgaaatgaaggtagaaatttatgaagattttctcatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatcgactttgtgtatctcaatttgaatgataa 18148829  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18148828 ccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcatttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggt 18148729  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18148728 gaagagaaagagtatttaagctcttattctgtttgtcgatcggatgaaaattcttatgtccaaagcaagtggttcacaacggaattccttaatggtatta 18148629  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18148628 agagctctggaattctaaatcaccggttgaaact 18148595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 2453096 - 2453427
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2453096 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcgaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgaattccgatttgaatgataa 2453195  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  2453196 ccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgctttattgagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactaattccaggt 2453295  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||  |||||||||||||||||||    
T  2453296 gaagagaaagagtatttaggctctgattctatttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaaacga--gattcacaatggaatttcttaatggtatta 2453393  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  2453394 agagctctggaattccaaatcaccgattgaaact 2453427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16042265 - 16041932
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16042265 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgttgatgtcgcttatagactttgtgtatcccaatctgaatgataa 16042166  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    |||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| | ||    
T  16042165 ccttggtgcccagctattttgccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaagt 16042066  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16042065 gaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacatcggaatttcttaatggtatta 16041966  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16041965 agagctctggaattccaaatcacaggttgaaact 16041932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 6310973 - 6311307
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6310973 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagattcgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataa 6311072  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  6311073 ccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggt 6311172  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgt-cgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatt 305  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6311173 gaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttgagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtatt 6311272  T
Q  306 aagagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  6311273 aagagctctggaattccaaatcataggttgaaact 6311307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 37390131 - 37390457
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37390131 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataa 37390230  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  37390231 ccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggt 37390330  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||       |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37390331 gaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgt-------gagtggttcacaccagaatttcttaatggtatta 37390423  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  37390424 agagctctggaattccaaatcacaggttgaaact 37390457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 48775314 - 48775647
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  48775314 gtgaaatgaaggtagaaattcccgaagatttgctcatatccgacacaacaaattctttgatgtcactaatacactttgtatatcccgattagaatgataa 48775413  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    | ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  48775414 cattggtgacctgctctttttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttgattcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtaaatgattccaggt 48775513  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48775514 gaagagaaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcaaaaagtctgatgtccagagcgagtggttcacaacggaatttcttaatggtatta 48775613  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  48775614 agagctatggaattccaaatcaccagttgaaact 48775647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 70 - 339
Target Start/End: Original strand, 48238519 - 48238788
Alignment:
Q  70 cacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttga 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | |||||  |||||||||||||    
T  48238519 cacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggcgaccctctatttttccaagaaagaggaatactcgcaccaacgcttgattcagttga 48238618  T
Q  170 gcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  48238619 gcatgttaacgaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaa 48238718  T
Q  270 agcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaac 339  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  48238719 agcgagtatttcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccggttgaaac 48238788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 121 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 52500795 - 52500576
Alignment:
Q  121 tattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggtgaagagaaagagta 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  52500795 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagta 52500696  T
Q  221 tttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaatt 320  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  52500695 tttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaaatgagcggttcacaacggaattccttaatggtattaagagctttggaatt 52500596  T
Q  321 ccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  52500595 ccaaatcaccggttgaaact 52500576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 48233613 - 48233498
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48233613 atgaaggtagaaattcctgaagatttactcatatcgaacacaacaaatccgctgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttg 48233514  T
Q  112 gtgacccgctattttt 127  Q
    | ||||| ||||||||    
T  48233513 gcgaccctctattttt 48233498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 288 - 340
Target Start/End: Original strand, 25074115 - 25074167
Alignment:
Q  288 gaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25074115 gaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaact 25074167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 25542772 - 25543105
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25542772 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagattttctcatatcggacacaacaaatatgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 25542871  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25542872 ccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggt 25542971  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  25542972 gaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattatgatgtccaaagcgagtggttcacaacgaaattccttaatggtatta 25543071  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25543072 agagctctggaattccaaatcaccggttgaaact 25543105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 14192791 - 14193124
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14192791 gtgaaatgaaggtagaaatttctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 14192890  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14192891 ccttggtgatccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttaattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggt 14192990  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  14192991 gaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacgacggaatttcgtaatggtatta 14193090  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14193091 agagctctggaattccaaatcaccggttgaaact 14193124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 8428553 - 8428886
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8428553 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataa 8428652  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| | || ||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  8428653 ccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggt 8428752  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8428753 gaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaatattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtatta 8428852  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  8428853 agagctctggaattccaaatcacaggttgaaact 8428886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 37373176 - 37372843
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37373176 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacataacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataa 37373077  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  37373076 ccttggtgaccaactatttttcgaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaaccaatttatgatgtcactgattccaggt 37372977  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37372976 gaagagaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggtgataattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtatta 37372877  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  37372876 agagctttggaattccaaatcacaggttgaaact 37372843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 39883423 - 39883092
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| ||||||||||| |||||| | ||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39883423 gtgaaatgaaggtagatattcctaaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataa 39883324  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    |||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||    
T  39883323 ccttggtgcccagctattttgccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaagt 39883224  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  39883223 gaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgacaattatgatgtccaaagcgagtggttcacatcggaatttcttaatggtatta 39883124  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaa 338  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  39883123 agagctctggaattccaaatcacatgttgaaa 39883092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27881316 - 27880991
Alignment:
Q  15 aaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtg 114  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || |||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27881316 aaggtagaaactcctgaagatttgctgatatcggacccaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtg 27881217  T
Q  115 acccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggtgaagagaa 214  Q
    |||  |||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||| | ||||||||||    
T  27881216 accaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagctgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaagtgaagagaa 27881117  T
Q  215 agagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctct 314  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  27881116 agagtatttaagctctgattctatttgtagatcgggtgaaaattatgatgtccaaagcgagtggttcacactggaatttcttaatggtattaagagctct 27881017  T
Q  315 agaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
     |||||||||||||| ||||||||||    
T  27881016 ggaattccaaatcacaggttgaaact 27880991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3690217 - 3689884
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3690217 gtgaaatgaaggtagaaattcccaaagatttgctcatatccgatacaacaaattcgttgatgtcactaatggactttgtatatcccgatttgaatgataa 3690118  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||| | |||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  3690117 cattggtgacccactcttttttcaagaaaagtgaatactcgcaccaacgcttgattcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaagt 3690018  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3690017 ggagagaaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaattctgatctctagagcgagtggttcacaacggaatttcttaatggtatta 3689918  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3689917 agagctctggaattccaaatcaccggttgaaact 3689884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 3876570 - 3876903
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3876570 gtgaaatgaaggtagaaattcccaaagatttgctcatatccgatacaacaaattcgttgatgtcactaatggactttgtatatcccgatttgaatgataa 3876669  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    | |||| ||||| || ||||||||||||| | |||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  3876670 cattggggacccactcttttttcaagaaaagtgaatactcgcaccaacgcttgattcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaagt 3876769  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3876770 ggagagaaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaattctgatctctagagcgagtggttcacaacggaatttcttaatggtatta 3876869  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3876870 agagctctggaattccaaatcaccggttgaaact 3876903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 80 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 37261482 - 37261222
Alignment:
Q  80 ctttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaac 179  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  37261482 ctttgtgtatcccaatttgaatgataaccttaatgacccgttattttttcaagaaaggggaatacttgcgccaacacttgattcagttgagcatattaat 37261383  T
Q  180 gaatatatgatgtcattgattctaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggt 279  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  37261382 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattttgatgtccaaagcgaatggt 37261283  T
Q  280 tcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37261282 tcacaaaggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaact 37261222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 259
Target Start/End: Original strand, 17871616 - 17871868
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  17871616 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacattgtgtatctcgatttaaatgataa 17871715  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17871716 ccttggtgacccgctatttttccaagaaagggaaatactcgcaccaacgcttgattctgttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggt 17871815  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 259  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  17871816 gaagagaaagagtatttaagctctggttctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 17871868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 121 - 340
Target Start/End: Original strand, 30346637 - 30346856
Alignment:
Q  121 tattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggtgaagagaaagagta 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  30346637 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacacttgattaagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagta 30346736  T
Q  221 tttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaatt 320  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  30346737 tttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaagtgagtggttcacaacggaattccttaatggtattaagagctctggaatt 30346836  T
Q  321 ccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  30346837 ccaaatcaccggttgaaact 30346856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 121 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10025189 - 10024970
Alignment:
Q  121 tattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggtgaagagaaagagta 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10025189 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcattgattccaagtgaagagaaagagta 10025090  T
Q  221 tttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaatt 320  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  10025089 tttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaagtgagtggttcacaacggaattccttaatggtattaagagctctggtatt 10024990  T
Q  321 ccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10024989 ccaaatcaccggttgaaact 10024970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 121 - 340
Target Start/End: Original strand, 24629954 - 24630173
Alignment:
Q  121 tattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggtgaagagaaagagta 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24629954 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagta 24630053  T
Q  221 tttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaatt 320  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  24630054 tttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaaatgagcggttcacaacggaattccttaatggtattaagagctttggaatt 24630153  T
Q  321 ccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24630154 ccaaatcaccggttgaaact 24630173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 225 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6089232 - 6089117
Alignment:
Q  225 agctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaa 324  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||    
T  6089232 agctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattttaatatccaaggtgagtggttcacaacggaatttcttaatggtattaagagctctgggatttcaa 6089133  T
Q  325 atcaccggttgaaact 340  Q
    |||||  |||||||||    
T  6089132 atcactagttgaaact 6089117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 288 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4051765 - 4051713
Alignment:
Q  288 gaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4051765 gaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaact 4051713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 288 - 340
Target Start/End: Original strand, 15032841 - 15032893
Alignment:
Q  288 gaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15032841 gaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcatcggttgaaact 15032893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 288 - 340
Target Start/End: Original strand, 2261274 - 2261326
Alignment:
Q  288 gaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||    
T  2261274 gaatttcttaatggtattaagagctttggcattccaaatcacaggttgaaact 2261326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 288 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 30314156 - 30314104
Alignment:
Q  288 gaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  30314156 gaatttcttcatggtattaagacctctggaattccaaatcaccgattgaaact 30314104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Original strand, 5239 - 5567
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5239 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatctattgatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataa 5338  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  5339 ccttggtgacccgctattttc-caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgatttcaggt 5437  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5438 gaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaattccttaatggtatta 5537  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttga 336  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5538 agagctctggaattccaaatcaccggttga 5567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 10)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1860917 - 1860584
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1860917 gtgaaatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataa 1860818  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  1860817 ccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattctgggt 1860718  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1860717 gaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgttgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacggaattccttaatggtatta 1860618  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  1860617 agagctatggaattccaaatcaccggttgaaact 1860584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 49710412 - 49710080
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49710412 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatcc-ttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataa 49710314  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  49710313 ccttggtgaccagctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggt 49710214  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  49710213 gaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccggaatttcttaatggtatta 49710114  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  49710113 agagctctggaattccaaatcacaggttgaaact 49710080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 35856147 - 35855814
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35856147 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataa 35856048  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  35856047 ccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggt 35855948  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35855947 gaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtatta 35855848  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  35855847 agagctctggaattccaaatcacaggttgaaact 35855814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 38518336 - 38518003
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  38518336 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctaaatgataa 38518237  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  38518236 ccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggt 38518137  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  38518136 gaagagaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccaaaatttcttaatggtatta 38518037  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  38518036 agagctctggaattccaaatcacaggttgaaact 38518003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 49786807 - 49787140
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  49786807 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatcccgatctgaatgataa 49786906  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| | || ||  |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  49786907 ccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatattaacgaatttatgatgtcgctgattccaggt 49787006  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  49787007 gaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttaacaccagaatttcttaatggtatta 49787106  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  49787107 agagctctggaattccaaatcacagattgaaact 49787140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 121 - 340
Target Start/End: Original strand, 55559131 - 55559350
Alignment:
Q  121 tattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggtgaagagaaagagta 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  55559131 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagta 55559230  T
Q  221 tttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaatt 320  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  55559231 tttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaagtgagtggttcacaactgaattccttaatggtatttagagctctggaatt 55559330  T
Q  321 ccaaatcaccggttgaaact 340  Q
     |||||||||||||||||||    
T  55559331 tcaaatcaccggttgaaact 55559350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 13337475 - 13337336
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13337475 gtgaaatgaaggtagaaattcatgaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgtttatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataa 13337376  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactc 146  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13337375 ccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactc 13337336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 284 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 31921436 - 31921380
Alignment:
Q  284 aacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31921436 aacagaattttttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 31921380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 787839 - 787787
Alignment:
Q  288 gaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  787839 gaatttcttaatggtattaagagctatggaattccaaatcacaggttgaaact 787787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Original strand, 618203 - 618270
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcactt 74  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| || |||||||||    
T  618203 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttcatgtcactt 618270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10187779 - 10187451
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||   |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10187779 atgaaggtagaaattcctgaatatttgctcatattggacacaaaaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttg 10187680  T
Q  112 gtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggtgaaga 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10187679 gtgacccgctatttttccaagaaaagggaatactcgctccaacacttgattcaattgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaaga 10187580  T
Q  212 gaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10187579 gaaagagtatttaagctatgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattttgatgtccaaagtgagtggttcacaacggaatttcttaatggtattaagagc 10187480  T
Q  312 tctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10187479 tcttgaattccaaatcaccggttgaaact 10187451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 2202158 - 2202491
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2202158 gtgaaatgaatgtagaaattcccgaagatttgctcatatcgaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 2202257  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  2202258 ccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttaattcagtagaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggt 2202357  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  2202358 gaagagaaagagtatttaagctctgattctatttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagtgagtggttcacaactgaattccttaatggtattt 2202457  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  2202458 agagctctggaattccaaatcactggttgaaact 2202491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 18344366 - 18344033
Alignment:
Q  6 agtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgata 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18344366 agtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttcatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgata 18344267  T
Q  106 accttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctagg 205  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||  | |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||    
T  18344266 accttggtgaccatctatttttccaagaaaggggaatacttgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttgacgaatatatgatgtcgctgattccagg 18344167  T
Q  206 tgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatt 305  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18344166 cgaagagaaagagtatttaagctttgattctatttgtcgatcgggtgaaaattttgatgtccaaagcgagtatttcacaatagaatttcttaatggtatt 18344067  T
Q  306 aagagctctagaattccaaatcaccggttgaaac 339  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18344066 aagagctctaaaattccaaatcaccagttgaaac 18344033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 29640007 - 29640341
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29640007 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaccacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatcctgatctgaatgataa 29640106  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  29640107 ccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggt 29640206  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaac-agaatttcttaatggtatt 305  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  29640207 gaagagaaagagtatttaacctctaattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccaagaatttcttaatggtatt 29640306  T
Q  306 aagagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  29640307 aagagctctggaattccaaatcacaggttgaaact 29640341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 31510178 - 31510511
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| ||||||||||||||| || | ||||| || ||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  31510178 gtgaaatgaaggtagaaatttcttaagatttgctgatatcaaccacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatcctaatctgaatgataa 31510277  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  31510278 ccttggtgaccaactattttttcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggt 31510377  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31510378 gaagagaaagagtatttaacctctaattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtatta 31510477  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31510478 agagctctggaattccaaatcacaggttgaaact 31510511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15333884 - 15333550
Alignment:
Q  6 agtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgata 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||  | |||||  ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15333884 agtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgttgatatcgtacgtaacaaatccgttgatgtcactaatagactttgtgtatcccgatctgaatgata 15333785  T
Q  106 accttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctagg 205  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||    
T  15333784 accttggtgaccagctatttttccaacaaatgggaatactcgcaccaacacttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccagg 15333685  T
Q  206 tgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatt 305  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  |||||||||||||||||    
T  15333684 tgaagagaaagagtatttaggctctgattctgtttgtagatcaggtgaaaattctgatgtccaaagcgagaggttcatatcgaaatttcttaatggtatt 15333585  T
Q  306 aagagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  15333584 aagagctctggaattccaaatcacaggttaaaact 15333550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 30881567 - 30881315
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  30881567 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacattgtgtatctcgatttaaatgataa 30881468  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  30881467 ccttggtgacccgctatttttccaagaaagggaaatactcgcaccaacgcttgattctgttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggt 30881368  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 259  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  30881367 gaagagaaagagtatttaagctctggttctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 30881315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 113 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12517522 - 12517295
Alignment:
Q  113 tgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggtgaagag 212  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |  | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||    
T  12517522 tgaccagctatttttccaagaaaggggaatatttgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagag 12517423  T
Q  213 aaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagct 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  12517422 aaagagtatttaagctctgattctgtttgatgatggggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacatcggaatttcttaatggtattaagagct 12517323  T
Q  313 ctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
     | |||||||||||||| ||||||||||    
T  12517322 ttggaattccaaatcacaggttgaaact 12517295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 288 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12519566 - 12519514
Alignment:
Q  288 gaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12519566 gaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaact 12519514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 5828534 - 5828867
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5828534 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatcttttgatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataa 5828633  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5828634 ccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacacttgactcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggt 5828733  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  5828734 gaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattatgatgtccaaagcgagtggttcacattgtaatttcttaatggtatta 5828833  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5828834 agagctctggaattccaaatcaccggttgaaact 5828867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 21070041 - 21070374
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21070041 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataa 21070140  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  21070141 ccttggtaacctgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattcctggt 21070240  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21070241 gaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgttgatcgggtgaaaatttagatgtccaaagtgagtggttcacaacggaatttcttaatggtatta 21070340  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21070341 agagctctgaaattccaaatcaccggttgaaact 21070374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 12785957 - 12786290
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  12785957 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatcccgatctgaatgataa 12786056  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| | || ||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  12786057 ccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattctaggt 12786156  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12786157 gaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtatta 12786256  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  12786257 agagctctggaattccaaatcacaggttgaaact 12786290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 7036960 - 7036627
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7036960 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagattcgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataa 7036861  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    |||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  7036860 ccttggtgaccaactacttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggt 7036761  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7036760 gaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtatta 7036661  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  7036660 agagctttggaattccaaatcacaggttgaaact 7036627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 12781127 - 12781461
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12781127 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatataagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataa 12781226  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  12781227 ccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggt 12781326  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgt-cgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatt 305  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12781327 gaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttgagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtatt 12781426  T
Q  306 aagagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  12781427 aagagctatggaattccaaatcacaggttgaaact 12781461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 9001124 - 9001457
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||  | |||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  9001124 gtgaaatgaaggtagaaattcttgaagatttgttgatatcggacacaacaaatccgttgatgtctcttatagactttgtttatcccgatctgattgataa 9001223  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  9001224 ccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcactaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattctaggt 9001323  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9001324 gaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccggaatttcttaatggtatta 9001423  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  9001424 agagctctgaaattccaaatcacaggttgaaact 9001457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22844044 - 22843792
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  22844044 gtgaaatgaaggtagaaattcttgaagatttgctcatatctgacacaacaaatctgttgatgtcacttatagacattgtgtatctcgatttaaatgataa 22843945  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22843944 ccttggtgacctgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattctgttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggt 22843845  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 259  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22843844 gaagagaaagagtatttaagttctgtttctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 22843792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 121 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 42232210 - 42231991
Alignment:
Q  121 tattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggtgaagagaaagagta 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  42232210 tatttttccaagaaaggggaatactctcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagta 42232111  T
Q  221 tttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaatt 320  Q
    ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  42232110 tttaaactctgattttgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaagtgagtggttcacaactgaattccttaatggtatttagagctctggaatt 42232011  T
Q  321 ccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  42232010 ccaaatcaccggttgaaact 42231991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 18939184 - 18939139
Alignment:
Q  73 ttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgaccc 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18939184 ttataaactttgtgtatcccgatttgaatgataactttggtaaccc 18939139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 24269049 - 24269382
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24269049 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataa 24269148  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24269149 ccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggt 24269248  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24269249 gaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaagtgagtggttcacaacggaattccttaatggtatta 24269348  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24269349 agagctctggaattccaaatcaccggttgaaact 24269382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Original strand, 17683813 - 17684141
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  |||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17683813 atgaaggtagaaattcctgaatattcgctcatattggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttg 17683912  T
Q  112 gtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggtgaaga 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  17683913 gtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgctccaacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaaga 17684012  T
Q  212 gaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17684013 gaaagagtatttaagctatgattttgtttgtcgatcgggtgaaaattttgatgtccaaagtgagtggttcacaacggaatttcttaatggtattaagagc 17684112  T
Q  312 tctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17684113 tctggaattccaaatcaccggttgaaact 17684141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27509614 - 27509283
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||  ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27509614 gtgagatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcatgtcggacacaacaaattcgttgatatcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 27509515  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27509514 ccttggtgacctgctatttttccaagaaaggggaatactcgcatcaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggt 27509415  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27509414 gaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctaatgtccaaagcgagtggttcacaacggaatttcttaatggtatta 27509315  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaa 338  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27509314 agagctctggaatttcaaatcaccggttgaaa 27509283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 7 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 27192729 - 27192397
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27192729 gtgaaatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 27192630  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27192629 ccttggtgaccctctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcgctgattctaggt 27192530  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27192529 gaagagaaagagtatttaagctctgattctatttgtcgatcgggtgaaatttttgatgtccaaagcgagtatttcacaatagaatttcttaatggtatta 27192430  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaac 339  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27192429 agagctctgaaattccaaatcaccggttgaaac 27192397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 7 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 27842543 - 27842211
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27842543 gtgaaatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 27842444  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27842443 ccttggtgaccctctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcgctgattctaggt 27842344  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27842343 gaagagaaagagtatttaagctctgattctatttgtcgatcgggtgaaatttttgatgtccaaagcgagtatttcacaatagaatttcttaatggtatta 27842244  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaac 339  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27842243 agagctctgaaattccaaatcaccggttgaaac 27842211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21395610 - 21395280
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21395610 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgttgatgtcgcttatagactttgtatatcccgatctgaatgataa 21395511  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  21395510 ccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggt 21395411  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  21395410 gaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacgccggaatttcttaatggtatta 21395311  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaa 337  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  21395310 agagctctggaattccaaatcacaggttgaa 21395280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 28666151 - 28666484
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  28666151 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatcccgatctgaatgataa 28666250  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| | || ||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  28666251 ccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattctaggt 28666350  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28666351 gaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtatta 28666450  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  28666451 agagctctggaattccaaatcacaggttgaaact 28666484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 67 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 35609865 - 35609592
Alignment:
Q  67 tgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagt 166  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||    
T  35609865 tgtcacttatagactttgtgtattccgatttgaatgataacattggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagt 35609766  T
Q  167 tgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtc 266  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35609765 tgagtatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattatgtttgtcgatcgagtgaaaattctgatgtc 35609666  T
Q  267 caaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  35609665 caaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcactggttgaaact 35609592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 37824985 - 37825318
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  37824985 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatcccgatctaaatgataa 37825084  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| | || ||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  37825085 ccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattctaggt 37825184  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37825185 gaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtatta 37825284  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  37825285 agagctctggaattccaaatcacaggttgaaact 37825318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 41920152 - 41920485
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41920152 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataa 41920251  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| | || ||  |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  41920252 ccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattaagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggt 41920351  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41920352 gaagataaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtatta 41920451  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  41920452 agagctctggaattccaaatcacaggttgaaact 41920485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24246065 - 24245812
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||| |  ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24246065 gtgaaatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcataacggacacaacaaatccgtggatgtcacttatagaccttgtgtatcccgatttgaatgataa 24245966  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24245965 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggt 24245866  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 260  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24245865 gaagagaaagagtatttaagatctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 24245812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 17855 - 18181
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17855 gtgaaatgaaggtagaagttcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 17954  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    ||||||||| |||||       |||||||||||||||||| | |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17955 ccttggtgatccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgatttagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggt 18047  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18048 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgccgatcgggtgaaaattatgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 18147  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18148 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 18181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1139 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold1139
Description:

Target: scaffold1139; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 7 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 1240 - 910
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1240 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 1141  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  1140 ccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttaattcagtcgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaagt 1041  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1040 gaagagaaagagtatttaagctctgattttgtttgtcaatcgggcgaaaattctgatgaccagagcgagtggttcacaacggaatttcttaatggtatta 941  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaa 337  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  940 agagctctggaattccaaatcaccggttgaa 910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 9)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 25218544 - 25218877
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25218544 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataa 25218643  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  25218644 ccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggt 25218743  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  25218744 gaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccggaatttcttaatggtatta 25218843  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25218844 agagctctggaattccaaatcacaggttgaaact 25218877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 21113723 - 21114056
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21113723 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgcttatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatcttgatttgaatgataa 21113822  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21113823 ccttggtgacccgctatttttccaaaaaaggggaatacttgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggt 21113922  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  21113923 gaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaagtgagtggttcacaacgaaattccttaatggtatta 21114022  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21114023 agagctctggaattccaaatcaccggttgaaact 21114056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 7822078 - 7821745
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  7822078 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtattccgatctgaatgataa 7821979  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||  ||||    
T  7821978 ccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgatttcaggt 7821879  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7821878 gaagagaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaattgtatta 7821779  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  7821778 agagctctggaattccaaatcacatgttgaaact 7821745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 30307417 - 30307084
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  30307417 gtgaaatgaatgtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaacgataa 30307318  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  30307317 ccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggt 30307218  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30307217 gaagagaaagagtatttaagctccgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtatta 30307118  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||||||||  |||||||||||||  |||||||||    
T  30307117 agagctctgcaattccaaatcacaagttgaaact 30307084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 50 - 340
Target Start/End: Original strand, 31978549 - 31978839
Alignment:
Q  50 cacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcacc 149  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  31978549 cacaacaaatctgttgatgtcacttataaactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccagctatttttccaagaaaggggaatactcgca 31978648  T
Q  150 ccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgg 249  Q
     ||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31978649 tcaacgcttgattcagttgagcatgtcaacaaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgg 31978748  T
Q  250 gtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31978749 gggaaaattcagatgtccaaagcgagtggttcacatcggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaact 31978839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 25209026 - 25209344
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||               ||||||||    
T  25209026 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatgtcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt---------------aatgataa 25209110  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  25209111 ccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggt 25209210  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25209211 gaagagaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggcgaaaattctgatgtccaaagctagtggttcacaccagaatttcttaatggtatta 25209310  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  25209311 agagctctggtattccaaatcacaggttgaaact 25209344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 284 - 340
Target Start/End: Original strand, 33861636 - 33861692
Alignment:
Q  284 aacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861636 aacagaattttttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 33861692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 379
Target Start/End: Original strand, 30138271 - 30138317
Alignment:
Q  333 ttgaaactttgtttgttttggatatgttgaaggaagaaatcatgaga 379  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30138271 ttgaaactttgtttgttttggatttgttgaaggaagaaatcatgaga 30138317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14714224 - 14714172
Alignment:
Q  288 gaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  14714224 gaatttcttaatggtattaagagctctggcattccaaatcacaggttgaaact 14714172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 14)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10110840 - 10110507
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  || |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10110840 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcagacgcaacaaatctgttgatgtcacttacagactttgtgtatctcgatttgaatgataa 10110741  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10110740 ccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggt 10110641  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  10110640 gaagagaaagagtatttaagctttgattatgtttgttgatcgggtgaaaattctgatgtccaaatcaagtggttcacaacggaattccttaatgatatta 10110541  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10110540 agagctctggaattccaaatcaccggttgaaact 10110507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13530279 - 13529946
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| ||||||||||||||||  || |||||  |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13530279 gtgaaatgaaggtagaaattctagaagatttggtcatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 13530180  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  13530179 ccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacacttcattcagttgagcattttaacgaatatatgatgtcactgagtccaggt 13530080  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13530079 gaagagaaagagtatttaagctctggttctgcttgtcgatcaggtgaaaattttggtgtccaaagcgagtggttcacaacggaatttcttagtggtatta 13529980  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13529979 agagctctggaattccaaatcaccggttgaaact 13529946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 10968761 - 10969093
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968761 gtgaaatgaaggtagaaatttctga-gatttgctgatatcggacacaacaaatccgttgatgccacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 10968859  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
     ||| |||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| | |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10968860 acttcgtgacctgctatttttctaagcaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagtttagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggt 10968959  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10968960 gaagagaaagagtatttaagctcttattttgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacggaatttcttaatggtatta 10969059  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10969060 agagctctagaatttcaaatcaccggttgaaact 10969093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 50410399 - 50410079
Alignment:
Q  20 agaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccg 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  50410399 agaaattcctgaagattttctcatatcggacacaacaaatccgctgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggcgaccca 50410300  T
Q  120 ctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggtgaagagaaagagt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  50410299 ctattttttcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagtcgagcatgttaacaaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagt 50410200  T
Q  220 atttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaat 319  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  50410199 atttaagctctgattctctttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaatgagagtggttcacagcggaatttctaaatggtattaagagctctggaat 50410100  T
Q  320 tccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| | ||||||||||    
T  50410099 tccaaatcgctggttgaaact 50410079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10000647 - 10000314
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |  |||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10000647 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcagatgcaacaaatctgttgatatcacttacagactttgtgtatctcgatttgaatgataa 10000548  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10000547 ccttggtgacccgctatttttccaagaaagaggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggt 10000448  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| | ||||| |||||    
T  10000447 gaagagaaagagtatttaagctttgattatgtttgttgatcgggtgaaaattctgatgtccaaatcaagtggttcacaacggaattccctaatgatatta 10000348  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10000347 agagctctggaattccaaatcaccggttgaaact 10000314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10237785 - 10237463
Alignment:
Q  17 ggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgac 116  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||  || |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10237785 ggtagaaattcctgaagaattgctcatatcagacgcaacaaatctgttgatgtcacttacagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgac 10237686  T
Q  117 ccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggtgaagagaaag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  10237685 ccgctattttttcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgttactgattccaggtgaagagaaag 10237586  T
Q  217 agtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctag 316  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  10237585 agta-ttaagctttgattatgtttgttgatcgggtgaaaattctgatgtccaaatcaagtggttcacaacggaattccttaatgatattaagagctctgg 10237487  T
Q  317 aattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10237486 aattccaaatcaccggttgaaact 10237463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11368888 - 11368553
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11368888 gtgaaatgaatgtagaaattcccgaagatttgctcatatccgacacaacaaatccgttgatgtcactcatagactttgtatatcccgatttgaatgataa 11368789  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttc-aagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctagg 205  Q
    | ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  11368788 cattggtgacccgctcttttttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttgattcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccagg 11368689  T
Q  206 tgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtg-aaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtat 304  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11368688 tgaagagaaagagtatttaagctctgattcaatttgtcgattgggtgaaaaagtctgatgtccagagcgagtggttcacaacggaatttcttaatggtat 11368589  T
Q  305 taagagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11368588 taagagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 11368553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 33011 - 32678
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33011 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatggactttgtgtatcccgatctgaatgataa 32912  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| | ||    
T  32911 ccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaagt 32812  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  32811 gaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccataatttcttaatggtatta 32712  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  32711 agagctctggaaatccaaatcacaggttgaaact 32678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 52918305 - 52917994
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| |   || |  ||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52918305 gtgaaatgaaggtagaaattcctga-gatttgccgttaccggacacaacaaatctgttgatgccacttatagacttcgtgtatcccgatttgaatgataa 52918207  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  52918206 ccttggtgactcgctatttttccaagaaaggggaatacccgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggt 52918107  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  52918106 gaagagaaagagtatttaagctctgattttgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacggaatttcttaatggtacta 52918007  T
Q  307 agagctctagaat 319  Q
    |||||||| ||||    
T  52918006 agagctctggaat 52917994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11362499 - 11362165
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||  |||||||| || ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11362499 gtgaaatgaagggggaaattcccgaagatttactcatatccgatacaacaaattcgttgatgtcactaatagactttgtatatcccgatttaaatgataa 11362400  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    | |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11362399 cattggtgacccactatttttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttgattcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaggt 11362300  T
Q  207 gaagagaaaga-gtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatt 305  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11362299 gaagagaaagatttttttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaagtctgatgtctagagcgagtggttcacaacggaatttcttaatggtatt 11362200  T
Q  306 aagagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11362199 aagagctctggaattccaaatcaccggttgaaact 11362165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 73 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 46913245 - 46912978
Alignment:
Q  73 ttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagca 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||  ||||||||||||||||    
T  46913245 ttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataactttggcgacccgctatttttccaagaaaggagaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagca 46913146  T
Q  173 tgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  46913145 tgttaacgaatatatgatgtcaccaattccaggtgaagaaaaatagtatttaagctttgattatgtttgtcgatcggggggaaattctgatgtccaaagc 46913046  T
Q  273 gagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  46913045 gagtggttcacaacggaatttcttaatggtattaagagctatggaattcaaaatcaccggttgaaact 46912978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 80 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10038807 - 10038547
Alignment:
Q  80 ctttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaac 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||     
T  10038807 ctttgtgtatcccaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcaattgagcatattaat 10038708  T
Q  180 gaatatatgatgtcattgattctaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggt 279  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  10038707 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatattatttaagctctcattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgcccaaagcgaatggt 10038608  T
Q  280 tcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10038607 tcacaaaggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaact 10038547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 101 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 47693115 - 47692876
Alignment:
Q  101 tgataaccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgatt 200  Q
    |||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  47693115 tgataaccttggtgacccacaattttcccaagaaaggggaatcctcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatacatgatgtcactaatt 47693016  T
Q  201 ctaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatg 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  47693015 ccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctgtttgtcgatcggacgaaaattctgatgtccagagcgagtggttcacaacgaaatttcttaatg 47692916  T
Q  301 gtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47692915 gtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaact 47692876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 284 - 340
Target Start/End: Original strand, 41763618 - 41763674
Alignment:
Q  284 aacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41763618 aacagaattttttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 41763674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19241 - 18913
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19241 atgaaggtagaaatttctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatatgttgatgtcacttatagactttgtgtatcttgatttgaatgataaccttg 19142  T
Q  112 gtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggtgaaga 211  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19141 gtgacccgctatttttccaaaaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaaga 19042  T
Q  212 gaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19041 gaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgagtgaaaattctgatgtgcaaagcgagtggttcacaacggaattccttaatggtattaagagc 18942  T
Q  312 tctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18941 tctggaattccaaatcaccggttgaaact 18913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 186794 - 186464
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  186794 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcgtacacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 186695  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  186694 ccttggtgacccgctatttttccaataaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagctgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggt 186595  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  186594 gaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtg-aaattctgatgtccaaagcgagtggttctcaacggaattccttaatggtatta 186496  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  186495 agagctctgg--ttccaaatcaccggttgaaact 186464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 48915 - 49248
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  48915 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatcccgatctgaatgataa 49014  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| | || ||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  49015 ccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattctaggt 49114  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49115 gaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtatta 49214  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  49215 agagctctggaattccaaatcacaggttgaaact 49248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 321315 - 321648
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  321315 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacaaaacaaatccgttgatgtcacttatagactttttgtatcccgatctgaatgataa 321414  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| | ||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||  ||||    
T  321415 ccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaatgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatatcgctgatttcaggt 321514  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  321515 gaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacatcagaatttcttaatggtattc 321614  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  321615 agagctctggaattccaaatcacaggttgaaact 321648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 32172 - 31840
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32172 gtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataa 32073  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| ||||    
T  32072 ccttggtgaccagctatttttccaagaaagggga-tacttgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgttgctgattccaggt 31974  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  31973 gaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacatcggaatttcttaatggtatta 31874  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||| || | |||| ||||||||| ||||||||||    
T  31873 agatctttggaatcccaaatcacaggttgaaact 31840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 49 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19655 - 19364
Alignment:
Q  49 acacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcac 148  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  19655 acacaacaaatctgttgatgtcacttataaactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccagctatttttccaagaaaggggaatactcgc 19556  T
Q  149 cccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcg 248  Q
      ||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  19555 atcaacgcttgattcagttgagcatgtcaacaaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcg 19456  T
Q  249 ggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19455 ggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacatcggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaact 19364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 49 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16882 - 16591
Alignment:
Q  49 acacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcac 148  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  16882 acacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataactttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgc 16783  T
Q  149 cccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcg 248  Q
     |||||  || ||| ||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  16782 accaacgcttaatttagtggagtatgttaacgcatatatgatttcactgattctaggtgaagagaaagagtttttaagctatgattctgtttttcaatcg 16683  T
Q  249 ggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16682 agcgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatgaccggttgaaact 16591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 12 - 337
Target Start/End: Original strand, 556 - 881
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  556 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaacccgttgatgtcacttataaactttgtgtatcccgatctaaatgataaccttg 655  T
Q  112 gtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggtgaaga 211  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||| ||||||| |    
T  656 gtgaccagctatttttccaataaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaatgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaaaa 755  T
Q  212 gaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  756 gaaagagtatttaacctctgattctgtttgtagattgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacatcggaatttcttaatggtattaagagc 855  T
Q  312 tctagaattccaaatcaccggttgaa 337  Q
    | | |||||||||||||| |||||||    
T  856 tatggaattccaaatcacaggttgaa 881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 183051 - 182718
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  183051 gtgaaatgaaggtagaaattcccgaagatttgctcatatccgatacaacaaattcgttgatgtcactaatagactttgtatatcccgatttgaatgatat 182952  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    | |||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  182951 cattggtgacccactctttttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttgattcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaagt 182852  T
Q  207 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 306  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| | | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  182851 gaagagaaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaaatctgatggctagagtgagtggttcacaacggaatttcttaatggtatta 182752  T
Q  307 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  182751 agagctctggaatttcaaatcaccggttgaaact 182718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 165771 - 165437
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccaacacaacaaatccattgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 106  Q
    |||| |||||||  |||||||| || ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  165771 gtgaaatgaagggggaaattcccgaagatttactcatatccgatacaacaaattcgttgatgtcactaatagactttgtatatcccgatttaaatgataa 165672  T
Q  107 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggt 206  Q
    | |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  165671 cattggtgacccactatttttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttgattcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaggt 165572  T
Q  207 gaagagaaaga-gtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatt 305  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  165571 gaagagaaagatttttttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaagtctgatgtctagagcgagtggttcacaacggaatttcttaatggtatt 165472  T
Q  306 aagagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  165471 aagagctctggaattccaaatcaccggttgaaact 165437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 121 - 340
Target Start/End: Original strand, 28727 - 28946
Alignment:
Q  121 tattttttcaagaaaggggaatactcaccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggtgaagagaaagagta 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  28727 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaaaagta 28826  T
Q  221 tttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaatt 320  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28827 tttaaactctgattctgtttgtcgcttgggtgaaaattttgatgtccaaagtgagtggttcacaacggaatttcttaatggtattaagagctctggaatt 28926  T
Q  321 ccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28927 ccaaatcaccggttgaaact 28946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0888 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0888
Description:

Target: scaffold0888; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 157 - 340
Target Start/End: Original strand, 31 - 214
Alignment:
Q  157 ttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcattgattctaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaa 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  31 ttgattcagttgagcatgttaacgaatatacgatgtcactgatttcaggtggcgagaaagagtatttaagctctgattttgtatgtcgatcgggtgaaaa 130  T
Q  257 ttctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaact 340  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  131 ttctgatttccaaaacgagtggttcacaatggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccagttgaaact 214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1424 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1424
Description:

Target: scaffold1424; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 196 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 1699 - 1572
Alignment:
Q  196 tgattctaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttct 295  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1699 tgattccaggtgaagagaaagcgtatttaaactctgattatgtttatcgatcgggtgaaaattttgatgtccaaagcgagtggttcacaacggaatttct 1600  T
Q  296 taatggtattaagagctctagaattcca 323  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1599 taatggtattaagagcactagaattcca 1572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 288 - 338
Target Start/End: Original strand, 97083 - 97133
Alignment:
Q  288 gaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaa 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  97083 gaatttcttaatggtattaagagctccagcattccaaatcacaggttgaaa 97133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University