View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17554_high_7 (Length: 498)

Name: NF17554_high_7
Description: NF17554
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17554_high_7
NF17554_high_7
[»] chr6 (8 HSPs)
chr6 (1-483)||(2672151-2672633)
chr6 (1-483)||(2568776-2569258)
chr6 (1-483)||(2596335-2596817)
chr6 (1-482)||(2440067-2440548)
chr6 (1-483)||(2592012-2592494)
chr6 (1-471)||(2640991-2641461)
chr6 (1-479)||(2623560-2624038)
chr6 (1-468)||(2450806-2451270)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (36-483)||(17870222-17870672)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (80-136)||(5766109-5766165)
chr2 (76-136)||(5823502-5823562)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 467; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 483
Target Start/End: Original strand, 2672151 - 2672633
Alignment:
Q  1 ttctaaagcatcttgaactaatttctctgattgactatcaagtgcacttgttgcttcatccaaaagcaacacctctggattcttcaatatagctctagct 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2672151 ttctaaagcatcttggactaatttctcagattgactatcaagtgcacttgttgcttcatccaaaagcaacacctctggattcttcaatatagctctagct 2672250  T
Q  101 attgcaattctttgtttttgaccaccactaagttgaactcctctgtcaccacacaaagtatcataaccatcttttaagcttgatataaaatcatgagcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2672251 attgcaattctttgtttttgaccaccactaagttgaactcctctgtcaccacacaaagtatcataaccatcttttaagcttgatataaaatcatgagcat 2672350  T
Q  201 tcgaagcctttgatgcctcgataatctcactctcatcaaccgtatcatcataagctccatatgcaatattttcccttatggtaccactaaacaatgttgg 300  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2672351 ttgaagcctttgatgcctctataatctcactctcatcaaccgtatcatcataagctccatatgcaatattttcccttatggtaccactaaacaatgttgg 2672450  T
Q  301 ttcttgactcacaagggcaatgtgtttcctcaatgacctgagattatatgtctttatgtctctaccgtcaattgtcactatccctttaagtgggtcatag 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2672451 ttcttgactcacaagggcaatgtgtttcctcaatgacctgagattatatgtctttatgtctctaccgtcaattgtcactatccctttaagtgggtcatag 2672550  T
Q  401 aatctctcaattagtcctatgattgtcgattttccagaaccactttcccctaccaaagccgttgattttcctgcatcaatttt 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2672551 aatctctcaattagtcctatgattgtcgattttccagaaccactttcccctaccaaagccgttgattttcctgcatcaatttt 2672633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 483
Target Start/End: Original strand, 2568776 - 2569258
Alignment:
Q  1 ttctaaagcatcttgaactaatttctctgattgactatcaagtgcacttgttgcttcatccaaaagcaacacctctggattcttcaatatagctctagct 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2568776 ttctaaagcatcttggactaatttctcagattgactatcaagtgcacttgttgcttcatccaaaagcaacacctctggattcttcaatatagctctagct 2568875  T
Q  101 attgcaattctttgtttttgaccaccactaagttgaactcctctgtcaccacacaaagtatcataaccatcttttaagcttgatataaaatcatgagcat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2568876 attgcaattctttgtttttgaccaccactaagttgaactcctctatcaccacacaatgtatcataaccatcttttaagcttgatataaaatcatgagcac 2568975  T
Q  201 tcgaagcctttgatgcctcgataatctcactctcatcaaccgtatcatcataagctccatatgcaatattttcccttatggtaccactaaacaatgttgg 300  Q
    | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2568976 ttgcagcctttgatgcctctataatttcactctcatcaaccttatcatcgtaagctccatatgcaatattttcccttatggtaccactaaacaatgttgg 2569075  T
Q  301 ttcttgactcacaagggcaatgtgtttcctcaatgacctgagattatatgtctttatgtctctaccgtcaattgtcactatccctttaagtgggtcatag 400  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2569076 ttcttgactcacaagtgcaatgtgttcccttaatgaccttagattatatgtctttatgtctctaccatcaattgtcactatccctttaagtggatcatag 2569175  T
Q  401 aatctctcaattagtcctatgattgtcgattttccagaaccactttcccctaccaaagccgttgattttcctgcatcaatttt 483  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  2569176 aatctttcaataagtcctatgattgttgattttccagaaccactttcccctaccaaagctgtcgattttccagcatcaatttt 2569258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 483
Target Start/End: Original strand, 2596335 - 2596817
Alignment:
Q  1 ttctaaagcatcttgaactaatttctctgattgactatcaagtgcacttgttgcttcatccaaaagcaacacctctggattcttcaatatagctctagct 100  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2596335 ttctaaagtatcttggactaatttctctgattgactatcaagtgcacttgttgcttcatccaaaagcaacacctctggattcttcaatatagctctagct 2596434  T
Q  101 attgcaattctttgtttttgaccaccactaagttgaactcctctgtcaccacacaaagtatcataaccatcttttaagcttgatataaaatcatgagcat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  2596435 attgcaattctttgtttttgaccaccactaagttgaactcctctatcaccacacagtgtatcataaccatcttttaagcttgatatgaaatcgtgagcat 2596534  T
Q  201 tcgaagcctttgatgcctcgataatctcactctcatcaaccgtatcatcataagctccatatgcaatattttcccttatggtaccactaaacaatgttgg 300  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  2596535 ttgcagcctttgatgcctctataatctcactctcatcaactttatcatcatatgctccatatacaatattttcttttatggtaccaccaaacaatgttgg 2596634  T
Q  301 ttcttgactcacaagggcaatgtgtttcctcaatgacctgagattatatgtctttatgtctctaccgtcaattgtcactatccctttaagtgggtcatag 400  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2596635 ttcttgactcacaagtgcaatatgtttccttaatgatcgtagattatatgtctttatgtctctaccgtcaattgtcactatccctttaaatggatcatag 2596734  T
Q  401 aatctctcaattagtcctatgattgtcgattttccagaaccactttcccctaccaaagccgttgattttcctgcatcaatttt 483  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2596735 aatctctcaattagtcctataattgtcgattttccagaaccactttcccctaccaaagccgtcgattttcctgcatcaatttt 2596817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 2440548 - 2440067
Alignment:
Q  1 ttctaaagcatcttgaactaatttctctgattgactatcaagtgcacttgttgcttcatccaaaagcaacacctctggattcttcaatatagctctagct 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2440548 ttctaaagcatcttggactaatttctctgattgactatcaagtgcacttgttgcttcatccaaaagcaacacctctggattcttcaatatagctctagct 2440449  T
Q  101 attgcaattctttgtttttgaccaccactaagttgaactcctctgtcaccacacaaagtatcataaccatcttttaagcttgatataaaatcatgagcat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  2440448 attgcaattctttgtttttgaccaccactaagttgaactcctctatcaccacacagtgtatcataaccatcttttaagcttgatatgaaatcgtgagcat 2440349  T
Q  201 tcgaagcctttgatgcctcgataatctcactctcatcaaccgtatcatcataagctccatatgcaatattttcccttatggtaccactaaacaatgttgg 300  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  2440348 ttgcagcctttgatgcctctataatctcactctcatcaactttatcatcatatgctccatatacaatattttctcttatggtaccaccaaacaatgttgg 2440249  T
Q  301 ttcttgactcacaagggcaatgtgtttcctcaatgacctgagattatatgtctttatgtctctaccgtcaattgtcactatccctttaagtgggtcatag 400  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2440248 ttcttgactcacaagtgcaatatgtttccttaatgatcgtagattataagtttttatgtctctaccatcaactgtcactatccctttaagtggatcatag 2440149  T
Q  401 aatctctcaattagtcctatgattgtcgattttccagaaccactttcccctaccaaagccgttgattttcctgcatcaattt 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  2440148 aatctctcaattagtcctatgattgtcgattttccagaaccactttccccaaccaaagccgttgattttccggcgtcaattt 2440067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 2592494 - 2592012
Alignment:
Q  1 ttctaaagcatcttgaactaatttctctgattgactatcaagtgcacttgttgcttcatccaaaagcaacacctctggattcttcaatatagctctagct 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2592494 ttctaaagcatcttggactaatttctctgattgactatcaagtgcacttgttgcttcatccaaaagcaacacctctggattcttcaatatagctctagct 2592395  T
Q  101 attgcaattctttgtttttgaccaccactaagttgaactcctctgtcaccacacaaagtatcataaccatcttttaagcttgatataaaatcatgagcat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2592394 attgcaattctttgtttttgaccaccactaagttgaactcctctatcaccacacagtgtatcataaccatcttttaagcttgatatgaaatcatgagcat 2592295  T
Q  201 tcgaagcctttgatgcctcgataatctcactctcatcaaccgtatcatcataagctccatatgcaatattttcccttatggtaccactaaacaatgttgg 300  Q
    | | ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  2592294 ttgcagcctttgatgcctctataatttcactttcatcaaccttatcatcatatgatccatatgcaatattttctttgatggtaccactaaacaatgttgg 2592195  T
Q  301 ttcttgactcacaagggcaatgtgtttcctcaatgacctgagattatatgtctttatgtctctaccgtcaattgtcactatccctttaagtgggtcatag 400  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2592194 ttcttgactcacaagtgcaatgtgtttccttagtgaccttagattataaatttttatgtccctaccatcaattgtcactatccctttaagtggatcatag 2592095  T
Q  401 aatctctcaattagtcctatgattgtcgattttccagaaccactttcccctaccaaagccgttgattttcctgcatcaatttt 483  Q
    || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  2592094 aacctctcaattagtcctatgatcgttgatttcccagaaccactttctcctaccaacgctgttgattttccggcatcaatttt 2592012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 471
Target Start/End: Original strand, 2640991 - 2641461
Alignment:
Q  1 ttctaaagcatcttgaactaatttctctgattgactatcaagtgcacttgttgcttcatccaaaagcaacacctctggattcttcaatatagctctagct 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2640991 ttctaaagcatcttgcactaatttctctgattgactatcaagtgcacttgttgcttcatccaaaagtaacacctttggattcttcaatatagctctagct 2641090  T
Q  101 attgcaattctttgtttttgaccaccactaagttgaactcctctgtcaccacacaaagtatcataaccatcttttaagcttgatataaaatcatgagcat 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  2641091 attgcaatcctttgtttttgaccaccactaagttgaactcctctatcaccacacaatgtatcataaccatcttgtaagcttgatatgaaatcatgagcat 2641190  T
Q  201 tcgaagcctttgatgcctcgataatctcactctcatcaaccgtatcatcataagctccatatgcaatattttcccttatggtaccactaaacaatgttgg 300  Q
    | | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2641191 ttgcagcctttgatgcctgaataatctcactctcatcaactttatcatcataggctccgtatgcaatattttcccttatggtaccaccaaacagtgttgg 2641290  T
Q  301 ttcttgactcacaagggcaatgtgtttcctcaatgacctgagattatatgtctttatgtctctaccgtcaattgtcactatccctttaagtgggtcatag 400  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2641291 ttcttgacttacaagtgcaatgtgtttccttaacgaccttagattataagactttatatcttcaccatcaattgtcactatccctttaattggatcatag 2641390  T
Q  401 aatctctcaattagtcctatgattgtcgattttccagaaccactttcccctaccaaagccgttgattttcc 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2641391 aatctctcaattagtcctatgattgttgatttccctgaaccactttccccgaccaaagccgtcgattttcc 2641461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 2624038 - 2623560
Alignment:
Q  1 ttctaaagcatcttgaactaatttctctgattgactatcaagtgcacttgttgcttcatccaaaagcaacacctctggattcttcaatatagctctagct 100  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  2624038 ttctaaagtgtcttggactaatttctcagattgactatcaagtgcacttgttgcttcatccaaaagcaacacatctggattctttaatatagctctagct 2623939  T
Q  101 attgcaattctttgtttttgaccaccactaagttgaactcctctgtcaccacacaaagtatcataaccatcttttaagcttgatataaaatcatgagcat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2623938 attgcaattctttgtttttgaccaccactaagttgaactcctctgtcaccacacaatgtgtcatatccatcttttaagcttgatatgaaatcatgagcat 2623839  T
Q  201 tcgaagcctttgatgcctcgataatctcactctcatcaaccgtatcatcataagctccatatgcaatattttcccttatggtaccactaaacaatgttgg 300  Q
    | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||| |||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  2623838 ttgcagcctttgatgcctctataatttcactctcatcaacctgatcaccatatgatccatatgcaatattttcttttatggtaccaccaaacaatgttgg 2623739  T
Q  301 ttcttgactcacaagggcaatgtgtttcctcaatgacctgagattatatgtctttatgtctctaccgtcaattgtcactatccctttaagtgggtcatag 400  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  2623738 ttcttgactcacaagtgcaatgtgtttccttaatgaccttagattataagtttttatgtctctgccatcaattgtcactatcccttcaagtggatcatag 2623639  T
Q  401 aatctctcaattagtcctatgattgtcgattttccagaaccactttcccctaccaaagccgttgattttcctgcatcaa 479  Q
    || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  2623638 aacctctcaattagtcctatgatcgttgatttcccagaaccacttttccctaccagagctgtcgattttccagcatcaa 2623560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 2451270 - 2450806
Alignment:
Q  1 ttctaaagcatcttgaactaatttctctgattgactatcaagtgcacttgttgcttcatccaaaagcaacacctctggattcttcaatatagctctagct 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2451270 ttctaaagcatcttgcactaacttctctgattgactatcaagtgcacttgttgcttcatccaaaagcaacacctttggattcttcaatatagctctagct 2451171  T
Q  101 attgcaattctttgtttttgaccaccactaagttgaactcctctgtcaccacacaaagtatcataaccatcttttaagcttgatataaaatcatgagcat 200  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2451170 attgcaatcctttgcttttgaccaccagaaagttgaactcctctatcaccacacaatgtctcataaccatattttaagcttgatataaaatcatgagcat 2451071  T
Q  201 tcgaagcctttgatgcctcgataatctcactctcatcaaccgtatcatcataagctccatatgcaatattttcccttatggtaccactaaacaatgttgg 300  Q
    | | |||||| | ||| || |||||||||||||||||||||   | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2451070 ttgcagccttagctgcatctataatctcactctcatcaacc---ttatcatatgctccatatgcaatattctcccttatggtaccaccaaacaatgttgg 2450974  T
Q  301 ttcttgactcacaagggcaatgtgtttcctcaatgacctgagattatatgtctttatgtctctaccgtcaattgtcactatccctttaagtgggtcatag 400  Q
     |||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||| |||||||| | |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| | ||| |||||     
T  2450973 ctcttgactcacaagtgaaatatgcttccttaatgaccttagattataagactttatatcactaccatcaatcgtcactatcccttttattggatcataa 2450874  T
Q  401 aatctctcaattagtcctatgattgtcgattttccagaaccactttcccctaccaaagccgttgattt 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2450873 aatctctcaattagtcctatgattgtcgattttccagaaccactttccccgaccaaagccgttgattt 2450806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 483
Target Start/End: Original strand, 17870222 - 17870672
Alignment:
Q  36 tatcaagtgcacttgttgcttcatccaaaagcaacacctctggattcttcaatatagctctagctattgcaattctttgtttttgaccaccactaagttg 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| || ||   ||||||    
T  17870222 tatcaagtgcacttgttgcttcatctagaagcaacacctttggattcttcaacatggctctagctattgctatcctttgtttttgcccccctgaaagttg 17870321  T
Q  136 aactcctctgtcaccacacaaagtatcataaccatcttttaagcttgatataaaatcatgagcattcgaagcctttgatgcctcgataatctcactctca 235  Q
     |||||| |||| |||||| | || ||||| |||||||| || ||||  || |||||||||||||| |   |  |||||||||| || |||||| | |||    
T  17870322 cactcctttgtccccacaccatgtctcatacccatctttcaaacttgcaatgaaatcatgagcattggctactcttgatgcctctatgatctcagtttca 17870421  T
Q  236 tcaaccgtatcatcat----aagctccatatgcaatattttcccttatggtaccactaaacaatgttggttcttgactcacaagggcaatgtgtttcctc 331  Q
    || |   | ||| |||      | |||||||||||| || || |||||||| ||| | | ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||     
T  17870422 tcgatgttgtca-catgttgttgttccatatgcaatgttgtctcttatggttccatttatcaatgttggttcttggctcacaagtgctatgtgttttctt 17870520  T
Q  332 aatgacctgagattatatgtctttatgtctctaccgtcaattgtcactatccctttaagtgggtcatagaatctctcaattagtcctatgattgtcgatt 431  Q
    | |||| | || |||||||  ||||||| | |||| || ||||||||  | ||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||    
T  17870521 agtgactttaggttatatgattttatgtttgtaccatctattgtcacatttccttttattggatcatagaatctctctattaatcctatgatggttgatt 17870620  T
Q  432 ttccagaaccactttcccctaccaaagccgttgattttcctgcatcaatttt 483  Q
    | ||||| || |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  17870621 tgccagacccgctttgccccactaatgccgtcgatttccctgcttcaatttt 17870672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 5766165 - 5766109
Alignment:
Q  80 ttcttcaatatagctctagctattgcaattctttgtttttgaccaccactaagttga 136  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||    
T  5766165 ttcttcaatattgccctagcaattgcaattctttgcttttgtccaccagaaagttga 5766109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 5823562 - 5823502
Alignment:
Q  76 tggattcttcaatatagctctagctattgcaattctttgtttttgaccaccactaagttga 136  Q
    ||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||    
T  5823562 tggattcttcaatatggcccttgcaattgcaattctttgcttttgtccaccagaaagttga 5823502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University