View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17556_high_9 (Length: 421)

Name: NF17556_high_9
Description: NF17556
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17556_high_9
NF17556_high_9
[»] chr5 (11 HSPs)
chr5 (18-411)||(13388994-13389387)
chr5 (24-411)||(13385173-13385560)
chr5 (24-408)||(13419366-13419750)
chr5 (24-403)||(13413021-13413400)
chr5 (24-408)||(13426257-13426641)
chr5 (27-248)||(13393564-13393785)
chr5 (24-406)||(13453870-13454252)
chr5 (24-408)||(13446917-13447301)
chr5 (25-177)||(13378905-13379057)
chr5 (24-193)||(13373108-13373277)
chr5 (360-408)||(13393404-13393452)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (27-411)||(47601191-47601575)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (24-180)||(28430608-28430764)
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (26-85)||(8354109-8354168)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 378; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 13389387 - 13388994
Alignment:
Q  18 acaatcgcaccaaatgctttggcaaatttcacagccatgtgaccaagcccaccaagaccaacaacacctatacgaagaccaggtttatcgagtccataat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13389387 acaatcgcaccaaatgctttggcaaatttcacagccatgtgaccaagcccaccaagaccaacaacacctatacgaagaccaggtttatcgagtccataat 13389288  T
Q  118 atctaagaggactgtacacagtgatcccagcacaaaggagaggtgcagcagcttcaagtggtaatccatcaggaatgtgaaccacgaagttctcatcagc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13389287 atctaagaggactgtacacagtgatcccagcacaaaggagaggtgcagcagcttcaagtggtaatccatcaggaatgtgaaccacgaagttctcatctgc 13389188  T
Q  218 aaccaatgagtcagaataacctccatatgtgctcgttccatcgcgatacttggcaccacatgtgaaagtaaatgtggcacagtaattttcaagattgtca 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13389187 aaccaatgagtcagaataacctccatatgtgctcgttccatcgcgatacttggcaccacatgtgaaagtaaatgtgggacagtaattttcaagattgtca 13389088  T
Q  318 acacaatttttacatgatcgacatgaatctaccatgtagccaacacctactttgtctccaacattgaacttttctactttgcttcccacctttg 411  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13389087 acacaattttgacatgatcgacatgaatcaaccatgtagccaacacctactttgtctccaacattgaacttttctactttgcttcccacctttg 13388994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 13385560 - 13385173
Alignment:
Q  24 gcaccaaatgctttggcaaatttcacagccatgtgaccaagcccaccaagaccaacaacacctatacgaagaccaggtttatcgagtccataatatctaa 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  13385560 gcaccaaaagctttggcaaatttcacagccatgtgaccaagcccaccaagaccaacaacaccgacatgaagaccaggtttgtcgagtccaaagtatctaa 13385461  T
Q  124 gaggactgtacacagtgatcccagcacaaaggagaggtgcagcagcttcaagtggtaatccatcaggaatgtgaaccacgaagttctcatcagcaaccaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  13385460 gaggactgtacacagtgatcccagcacaaaggagaggtgcagcagcttcaagtggtaatccatcaggaatgtgaaccacgaagttctcagccacaaccaa 13385361  T
Q  224 tgagtcagaataacctccatatgtgctcgttccatcgcgatacttggcaccacatgtgaaagtaaatgtggcacagtaattttcaagattgtcaacacaa 323  Q
    |||||||||||||||||| | |||| | |||||||| |||| | || |||||  |||   |||  ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13385360 tgagtcagaataacctccgtgtgtgatggttccatcacgatgcatgccaccaactgtagtagtgtatgcggggcagtaattttcaagattgtcaacacaa 13385261  T
Q  324 tttttacatgatcgacatgaatctaccatgtagccaacacctactttgtctccaacattgaacttttctactttgcttcccacctttg 411  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13385260 ttttgacacgatcgacatgaatcaattatgtagccaacacctactttgtctccaacattgaacttttctactttgcttcccacctttg 13385173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 408
Target Start/End: Original strand, 13419366 - 13419750
Alignment:
Q  24 gcaccaaatgctttggcaaatttcacagccatgtgaccaagcccaccaagaccaacaacacctatacgaagaccaggtttatcgagtccataatatctaa 123  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||   | |||||| || |||||| || ||| || ||    
T  13419366 gcaccgaaagcttttgcaaatttcacagccatatggccaagtccaccaagaccaacaacacctatattcataccaggcttgtcgagttcaaaatgtcgaa 13419465  T
Q  124 gaggactgtacacagtgatcccagcacaaaggagaggtgcagcagcttcaagtggtaatccatcaggaatgtgaaccacgaagttctcatcagcaaccaa 223  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | ||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||| ||| |||| ||| || |||||||     
T  13419466 gaggactatacactgtgattccagcgcaaagaagaggaccggcagcatcaagaggtaagctatcaggaatgcgaatcacaaagtgctcgtctgcaaccat 13419565  T
Q  224 tgagtcagaataacctccatatgtgctcgttccatcgcgatacttggcaccacatgtgaaagtaaatgtggcacagtaattttcaagattgtcaacacaa 323  Q
    |||||| || |||||||||||||||   || ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||| |  |||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13419566 tgagtcggagtaacctccatatgtgacggtgccatcacgatactttgcaccacatgtgactgtaaatgttgggcagtaattctcaagatcgtcagcacaa 13419665  T
Q  324 tttttacatgatcgacatgaatctaccatgtagccaacacctactttgtctccaacattgaacttttctactttgcttcccacct 408  Q
    ||||  ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  13419666 ttttggcatgaacgacatgaatcaaccatgtatcccacaccaactttgtctccaactttaaacttttctactttgcttccaacct 13419750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 403
Target Start/End: Original strand, 13413021 - 13413400
Alignment:
Q  24 gcaccaaatgctttggcaaatttcacagccatgtgaccaagcccaccaagaccaacaacacctatacgaagaccaggtttatcgagtccataatatctaa 123  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||| || ||| ||    
T  13413021 gcaccgaaagctttggcaaatttcacagccatatggccaagtccaccaagaccaacaacacctatatgtaaaccaggcttatcgagtccaaaaaatcgaa 13413120  T
Q  124 gaggactgtacacagtgatcccagcacaaaggagaggtgcagcagcttcaagtggtaatccatcaggaatgtgaaccacgaagttctcatcagcaaccaa 223  Q
    ||||||| || || ||||  |||||||||||||||||  |||||  |||||| ||||     ||||||||| ||| ||| |||| ||| || |||||||     
T  13413121 gaggactatatacggtgacaccagcacaaaggagaggaccagcaaattcaagaggtatgttgtcaggaatgcgaatcacaaagtgctcgtctgcaaccat 13413220  T
Q  224 tgagtcagaataacctccatatgtgctcgttccatcgcgatacttggcaccacatgtgaaagtaaatgtggcacagtaattttcaagattgtcaacacaa 323  Q
    |||||| || ||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||    |||| |||  |||||||| ||||||||||||  ||||    
T  13413221 tgagtcggagtaacctccataagtgacggttccatcacgatacttggcaccacatgtgactacaaatttggggcagtaattctcaagattgtcattacaa 13413320  T
Q  324 tttttacatgatcgacatgaatctaccatgtagccaacacctactttgtctccaacattgaacttttctactttgcttcc 403  Q
    | ||  ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  13413321 tcttggcatgatcgacatgaatcaatcaagtagccaacacctactttgtctccaactttaaacttctccactttgcttcc 13413400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 408
Target Start/End: Original strand, 13426257 - 13426641
Alignment:
Q  24 gcaccaaatgctttggcaaatttcacagccatgtgaccaagcccaccaagaccaacaacacctatacgaagaccaggtttatcgagtccataatatctaa 123  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||   | |||||| || ||||||  | |||  | ||    
T  13426257 gcaccaaaagctttggcgaatttcacagccatatgaccaagtccaccaagaccaacaacgcctatattcataccaggcttgtcgagttgaaaatgacgaa 13426356  T
Q  124 gaggactgtacacagtgatcccagcacaaaggagaggtgcagcagcttcaagtggtaatccatcaggaatgtgaaccacgaagttctcatcagcaaccaa 223  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |||||  | ||| | ||||| ||||| | |||||||||| ||| ||| |||| |||||| |||||||     
T  13426357 gaggactatacactgtgactccagcgcaaagaagaggaccggcaacatcaagaggtaagctatcaggaatgcgaatcacaaagtgctcatctgcaaccat 13426456  T
Q  224 tgagtcagaataacctccatatgtgctcgttccatcgcgatacttggcaccacatgtgaaagtaaatgtggcacagtaattttcaagattgtcaacacaa 323  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    | ||||| |||||||| ||||||||||| |  ||   |  ||  |||||||| |||||||  ||  |||||    
T  13426457 tgagtcggaataacctccatatgtgacgctgccatcacgatacttagcaccacatgtaactgtttgttgggggcagtaattctcaagatcttccgcacaa 13426556  T
Q  324 tttttacatgatcgacatgaatctaccatgtagccaacacctactttgtctccaacattgaacttttctactttgcttcccacct 408  Q
    ||||  ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  13426557 ttttcgcatgaacgacatgaatcaaccatgtatcccactcctactttgtctccaactttaaacttttctactttgcttccaacct 13426641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13393785 - 13393564
Alignment:
Q  27 ccaaatgctttggcaaatttcacagccatgtgaccaagcccaccaagaccaacaacacctatacgaagaccaggtttatcgagtccataatatctaagag 126  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||   | |||||| || ||||||||| |||||| |||||    
T  13393785 ccaaaagcttttgcaaacttcacacccaagtgaccaagtccaccaagaccaacaatacctatattcataccaggcttgtcgagtccaaaatatcgaagag 13393686  T
Q  127 gactgtacacagtgatcccagcacaaaggagaggtgcagcagcttcaagtggtaatccatcaggaatgtgaaccacgaagttctcatcagcaaccaatga 226  Q
    |||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||| ||||||| |||    
T  13393685 gactatacacagtaataccggcacaaaggagaggagcagcagattcaagtggtaagccatcaggaatgtgaactataaagtgctcatctgcaaccattga 13393586  T
Q  227 gtcagaataacctccatatgtg 248  Q
    |||||| || ||||||||||||    
T  13393585 gtcagagtaccctccatatgtg 13393564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 406
Target Start/End: Original strand, 13453870 - 13454252
Alignment:
Q  24 gcaccaaatgctttggcaaatttcacagccatgtgaccaagcccaccaagaccaacaacacctatacgaagaccaggtttatcgagtccataatatctaa 123  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||   | | |||| || ||||||||| ||| || ||    
T  13453870 gcaccgaaagctttggcgaatttcacggccatatggccaagtccaccaagaccaacaacacctatattcatatcaggcttgtcgagtccaaaatgtcgaa 13453969  T
Q  124 gaggactgtacacagtgatcccagcacaaaggagaggtgcagcagcttcaagtggtaatccatcaggaatgtgaaccacgaagttctcatcagcaaccaa 223  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||   ||| |||||| ||| ||| |||| ||| || | |||||     
T  13453970 gaggactatatacggttatcccagcacaaaggagaggagcagctgcatcaagaggtaactgatctggaatgcgaaacacaaagtgctcgtcggaaaccat 13454069  T
Q  224 tgagtcagaataacctccatatgtgctcgttccatcgcgatacttggcaccacatgtgaaagtaaatgtggcacagtaattttcaagattgtcaacacaa 323  Q
    |||||||||  | |||||||  ||||| |||||||| |  || |||| ||||   ||||  || |||  || ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13454070 tgagtcagagaagcctccatgagtgctggttccatcactgtatttggaaccatcagtgagtgtcaattggggacagtaattctcaagattatcaacacaa 13454169  T
Q  324 tttttacatgatcgacatgaatctaccatgtagccaacacctactttgtctccaacattgaacttttctactttgcttcccac 406  Q
    |||| ||||||  |||| ||||| |||| | | || ||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  13454170 ttttgacatgagtgacaagaatcaaccaagcatcccacacctactctgtctccaactttgaactttttcactttgcttcccac 13454252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 408
Target Start/End: Original strand, 13446917 - 13447301
Alignment:
Q  24 gcaccaaatgctttggcaaatttcacagccatgtgaccaagcccaccaagaccaacaacacctatacgaagaccaggtttatcgagtccataatatctaa 123  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||   | |||||| || ||||||||| ||| || ||    
T  13446917 gcaccaaaagctttagcaaatttcacagccatatgaccaagtccaccaagaccaacaactcctatattcataccaggcttgtcgagtccaaaatgtcgaa 13447016  T
Q  124 gaggactgtacacagtgatcccagcacaaaggagaggtgcagcagcttcaagtggtaatccatcaggaatgtgaaccacgaagttctcatcagcaaccaa 223  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |||||  | ||| | ||||| ||||| | |||||||||| ||| ||| |||| ||| || |||||||     
T  13447017 gaggactatacactgtgactccagcgcaaagaagaggaccggcaccatcaagaggtaagctatcaggaatgcgaatcacaaagtgctcgtctgcaaccat 13447116  T
Q  224 tgagtcagaataacctccatatgtgctcgttccatcgcgatacttggcaccacatgtgaaagtaaatgtggcacagtaattttcaagattgtcaacacaa 323  Q
    |||||| ||  |||||||||| ||| | || ||||| ||| ||||  ||    ||||   |||| || |||  |||||||| |||| || |||  |||||    
T  13447117 tgagtcggagaaacctccataggtgatagtgccatcacgagacttaccattgaatgtttgagtatatttggtgcagtaattctcaatatcgtcggcacaa 13447216  T
Q  324 tttttacatgatcgacatgaatctaccatgtagccaacacctactttgtctccaacattgaacttttctactttgcttcccacct 408  Q
    ||||  || || ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  13447217 ttttcgcaagaacgacatgaatcaaccatgtatcccacccctactttgtctccaactttaaacttttttactttgcttcccacct 13447301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 177
Target Start/End: Original strand, 13378905 - 13379057
Alignment:
Q  25 caccaaatgctttggcaaatttcacagccatgtgaccaagcccaccaagaccaacaacacctatacgaagaccaggtttatcgagtccataatatctaag 124  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||| | || |||||||| || | |||| ||| | | |     
T  13378905 caccaaaggctttggcgaacttcacagccatatgacctaatccaccaagaccaaccacacctatatgcagtccaggtttgtcaaatccaaaatgtttcat 13379004  T
Q  125 aggactgtacacagtgatcccagcacaaaggagaggtgcagcagcttcaagtg 177  Q
     || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  13379005 tgggctatacactgtgatcccagcacaaaggagaggagcggcagcatcaagtg 13379057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 193
Target Start/End: Original strand, 13373108 - 13373277
Alignment:
Q  24 gcaccaaatgctttggcaaatttcacagccatgtgaccaagcccaccaagaccaacaacacctatacgaagaccaggtttatcgagtccataatatctaa 123  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| | | | | |||||| || |  |||||| ||||| | |    
T  13373108 gcaccaaaagctttggtaaatttcacagccatatgacctaatccaccaagaccaaccacacccacatgtaaaccaggcttgttaagtccaaaatatttca 13373207  T
Q  124 gaggactgtacacagtgatcccagcacaaaggagaggtgcagcagcttcaagtggtaatccatcaggaat 193  Q
     ||| || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||  ||||||||||    
T  13373208 aagggctatatactgtgatccccgcacaaagaagaggagcagcggcatcaagtggtaaggcatcaggaat 13373277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 360 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 13393452 - 13393404
Alignment:
Q  360 acacctactttgtctccaacattgaacttttctactttgcttcccacct 408  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13393452 acacccactttgtctccaattttgaacttctctactttgcttcctacct 13393404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 27 - 411
Target Start/End: Original strand, 47601191 - 47601575
Alignment:
Q  27 ccaaatgctttggcaaatttcacagccatgtgaccaagcccaccaagaccaacaacacctatacgaagaccaggtttatcgagtccataatatctaagag 126  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  47601191 ccaaaagctttagcaaacttaacagccatgtgaccaagtccaccaagaccaacaacacctatatgcataccaggtttatcgagtccaaaatatcgaagag 47601290  T
Q  127 gactgtacacagtgatcccagcacaaaggagaggtgcagcagcttcaagtggtaatccatcaggaatgtgaaccacgaagttctcatcagcaaccaatga 226  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||  |||||| |||    
T  47601291 gactatacactgtgataccggcacaaagaagaggagcagtagcttcaagtggcaaaccatcgggaatgtgaaccacaaagtgctcgtctacaaccattga 47601390  T
Q  227 gtcagaataacctccatatgtgctcgttccatcgcgatacttggcaccacatgtgaaagtaaatgtggcacagtaattttcaagattgtcaacacaattt 326  Q
    |||||| |||||||| |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||   |||||    | ||| ||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  47601391 gtcagagtaacctccgtatgtggtggtgccatcacgatatttggcaccacatgtggctgtaaagcgaggacaataactttcaagattttcagcacaattt 47601490  T
Q  327 ttacatgatcgacatgaatctaccatgtagccaacacctactttgtctccaacattgaacttttctactttgcttcccacctttg 411  Q
    | ||| ||||  |||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47601491 tgacacgatctgcatgaatcgatcatgaagccaacacccactttgtctccaactttgaacttttctactttgcttcccacttttg 47601575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 28430764 - 28430608
Alignment:
Q  24 gcaccaaatgctttggcaaatttcacagccatgtgaccaagcccaccaagaccaacaacacctatacgaagaccaggtttatcgagtccataatatctaa 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||   | |    ||||||||| |||||| ||||| | |    
T  28430764 gcaccaaaagctttggcaaatttcacagccatatgaccaagtccaccaagaccaaccacacctaattgcaagttaggtttatcaagtccaaaatatttca 28430665  T
Q  124 gaggactgtacacagtgatcccagcacaaaggagaggtgcagcagcttcaagtggta 180  Q
     ||| || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  28430664 aagggctatacaccgtgatcccggcgcagaggagaggagctgcagcatcaagaggta 28430608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 8354168 - 8354109
Alignment:
Q  26 accaaatgctttggcaaatttcacagccatgtgaccaagcccaccaagaccaacaacacc 85  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||    
T  8354168 accaaatgctttaccaaattttacagccatgtgaccaagtcctcccaaaccaacaacacc 8354109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University