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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF1755_high_3 (Length: 595)
Name: NF1755_high_3
Description: NF1755
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF1755_high_3 |
 | |
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Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 9695978 - 9695408
Alignment:
| Q |
10 |
attatactaatagaactatgtacnnnnnnnnnacaatgcattgtaaatttaaatggtttgaataatttgagatattattgaaactacattatatgtatag |
109 |
Q |
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| T |
9695978 |
attatactaatagaactatgtaccttttttttacaatgcattgtaaatttaaatggtttgaataatttgagatattattgaaactacattatatgtatag |
9695879 |
T |
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| Q |
110 |
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209 |
Q |
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| T |
9695878 |
tcttaaggttatttttctcgtacattcagtgatatgtacttctttctttaatcaatgaatatgacaagtaatatgtttttaaataaatcaattaaaaatt |
9695779 |
T |
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| Q |
210 |
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309 |
Q |
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| T |
9695778 |
caagagcacttgtatgaaatagtaagcagtatcttccaacataatcaaaggtctaggtttgaatgtaaccatgaaaatgcatcaatgttaaatctctatg |
9695679 |
T |
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| Q |
310 |
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409 |
Q |
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9695678 |
gatatagctttaccatccattacaattctaccttactcaagggattagtctatgttgttgtgtgcataggataacatgtcctaaccaaaaaacaaaccaa |
9695579 |
T |
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| Q |
410 |
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506 |
Q |
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| T |
9695578 |
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9695479 |
T |
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| Q |
507 |
ttattaatcaatgcttaattatctacaagtggactcatcaatggaagacaattatctaccattctatgtga |
577 |
Q |
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| T |
9695478 |
ttattaatcaaagcttgattatctacaagtggactcatcaatggaagacaattatctaccattctatgtga |
9695408 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 13562355 - 13561785
Alignment:
| Q |
10 |
attatactaatagaactatgtacnnnnnnnnnacaatgcattgtaaatttaaatggtttgaataatttgagatattattgaaactacattatatgtatag |
109 |
Q |
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| T |
13562355 |
attatactaatagaactatgtaccttttttttacaatgcattgtaaatttaaatggtttgaataatttgagatattattgaaactacattatatgtatag |
13562256 |
T |
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| Q |
110 |
tcttaaggttattttgctcgtacattcagtgatatgtacttctttctttaatcaatgaatatgacaagtaatgtgtttttaaataaatcaactaaaaatt |
209 |
Q |
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| T |
13562255 |
tcttaaggttatttttctcgtacattcagtgatatgtacttctttctttaatcaatgaatatgacaagtaatatgtttttaaataaatcaattaaaaatt |
13562156 |
T |
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| Q |
210 |
caagagcacttgtatgaaatagtaagcagtatctgccaacataaccaaaagtctaggtttgaatgcaatcatgtaaatgtatcaatgttaaatctctaag |
309 |
Q |
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13562155 |
caagagcacttgtatgaaatagtaagcagtatcttccaacataatcaaaggtctaggtttgaatgtaaccatgaaaatgcatcaatgttaaatctctatg |
13562056 |
T |
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| Q |
310 |
ggtatagatttaccatccattacaatcctaccttacttaagggattagtctatgttgttgtgtgcataggagaacatgttctaacnnnnnnncaaaacaa |
409 |
Q |
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| T |
13562055 |
gatatagctttaccatccattacaattctaccttactcaagggattagtctatgttgttgtgtgcataggataacatgtcctaaccaaaaaacaaaccaa |
13561956 |
T |
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| Q |
410 |
ttaa---aacaacattaatcacttattcagttgttctaattcaaaatagatctttagtttaatcacctaatgattataatctttcaagcaaaattttgat |
506 |
Q |
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| T |
13561955 |
ctaaaacaacaacattaatcacttattcaattgttctaattcaaaatagatctttagtttaatcacctaatgattataatctttcaagcaaaattttgat |
13561856 |
T |
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| Q |
507 |
ttattaatcaatgcttaattatctacaagtggactcatcaatggaagacaattatctaccattctatgtga |
577 |
Q |
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ttattaatcaaagcttgattatctacaagtggactcatcaatggaagacaattatctaccattctatgtga |
13561785 |
T |
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