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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF17561_low_2 (Length: 333)
Name: NF17561_low_2
Description: NF17561
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF17561_low_2 |
 |  |
|
| [»] scaffold0049 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0122 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold1164 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0077 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0083 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0480 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0359 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0011 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0740 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0016 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0447 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0383 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0396 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0008 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0068 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0673 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0310 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0158 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1867 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0160 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0021 (5 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0190 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0240 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0816 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0037 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0022 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0014 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0001 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0035 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0338 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0044 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0117 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0120 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0012 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0554 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0031 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0103 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0876 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0034 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0610 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0075 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0342 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0025 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0589 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0092 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0053 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0095 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0006 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0123 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0456 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0026 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0409 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0700 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0009 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0162 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0138 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0058 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0389 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0091 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0080 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0013 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0010 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0387 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0686 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0195 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0032 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0028 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0483 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0150 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0116 (1 HSPs) |
 |  |
|
Alignment Details
Target: scaffold0049 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:
Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 86 - 333
Target Start/End: Original strand, 20283 - 20530
Alignment:
| Q |
86 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
185 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20283 |
agcataattaaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
20382 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
285 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20383 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
20482 |
T |
 |
| Q |
286 |
attacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20483 |
attacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
20530 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0122 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:
Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 112 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 20065 - 19844
Alignment:
| Q |
112 |
ttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaatta |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20065 |
ttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaatta |
19966 |
T |
 |
| Q |
212 |
gagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacac |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19965 |
gagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacac |
19866 |
T |
 |
| Q |
312 |
taacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19865 |
taacccccttaccttaattatc |
19844 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 112 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24369 - 24148
Alignment:
| Q |
112 |
ttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaatta |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24369 |
ttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaatta |
24270 |
T |
 |
| Q |
212 |
gagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacac |
311 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24269 |
gagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacac |
24170 |
T |
 |
| Q |
312 |
taacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24169 |
taacccccttaccttaattatc |
24148 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1164 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:
Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 88 - 333
Target Start/End: Original strand, 1494 - 1738
Alignment:
| Q |
88 |
cataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattt-tcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1494 |
cataattcaacaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatac--tttgaacatataattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcat |
1591 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1592 |
acatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacataggaacaattaatcaattcacccaattaagcacttatcatccaaataattgaaaa |
1691 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1692 |
ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
1738 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Original strand, 13817624 - 13817862
Alignment:
| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13817624 |
gcataattcaccaattgagcatatttcca-catatacccattttcatacactttgaacatgtaattcaactaacat-aattcaattattcataacttcat |
13817721 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13817722 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgtacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
13817821 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13817822 |
ttacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
13817862 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16182080 - 16181842
Alignment:
| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16182080 |
gcataattcaccaatttggcatattttca-cacatacccattttcatacactttgaacatgtaatttaactaaca-caattcaattattcataacttcat |
16181983 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16181982 |
acatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
16181883 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16181882 |
ttacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16181842 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 317643 - 317405
Alignment:
| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||| || ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
317643 |
gcataattcaccaatttagcatattttca-cacatacccatttttcatac--tttgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttca |
317547 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
285 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
317546 |
tacatctaaacatgtcatcatacttagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
317447 |
T |
 |
| Q |
286 |
attacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
317446 |
attacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
317405 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 19570823 - 19570586
Alignment:
| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19570823 |
gcataattcaccaattgagcatatttcca-catatactcattttcatacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcat |
19570726 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19570725 |
acatctaaacatgtcatcaaaattagagcacaaatttcatcacatatgaaaaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
19570626 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
19570625 |
ttacaaaagtgattatgatgaattctaa-ccccttacctta |
19570586 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16996194 - 16995956
Alignment:
| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
185 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16996194 |
gcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccatttttcatac--tttgaacatacaattcaagtaacaacaattcaatcattcataacttca |
16996098 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
285 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16996097 |
tacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcaccacttatgaataattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
16995998 |
T |
 |
| Q |
286 |
attacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16995997 |
attacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16995956 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22144407 - 22144167
Alignment:
| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22144407 |
gcatacttcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcat |
22144309 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22144308 |
acatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcagttatgaacagttaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaa |
22144209 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttac-aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22144208 |
ttacaaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
22144167 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Original strand, 38527841 - 38528079
Alignment:
| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38527841 |
gcataattcaccaattgagcatattttcc-cacatacccattttcatacactttgaacatgtaattcaactaacat-aattcaattattcataacttcat |
38527938 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
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38527939 |
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38528038 |
T |
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287 |
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327 |
Q |
| |
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| T |
38528039 |
ttacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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Target: chr3; HSP #8
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Target Start/End: Complemental strand, 50112186 - 50111946
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T |
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285 |
Q |
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| T |
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T |
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327 |
Q |
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| T |
50111988 |
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Target: chr3; HSP #9
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T |
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284 |
Q |
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54424320 |
T |
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327 |
Q |
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aattgaaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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Target: chr3; HSP #10
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T |
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| Q |
187 |
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286 |
Q |
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6154367 |
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T |
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| Q |
287 |
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327 |
Q |
| |
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| T |
6154267 |
ttataataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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Target: chr3; HSP #11
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Target Start/End: Complemental strand, 12349675 - 12349434
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Q |
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T |
 |
| Q |
186 |
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285 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
286 |
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327 |
Q |
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| T |
12349476 |
attgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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Target: chr3; HSP #12
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T |
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| Q |
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284 |
Q |
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T |
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| Q |
285 |
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327 |
Q |
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| T |
17100961 |
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T |
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Target: chr3; HSP #13
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Target Start/End: Original strand, 17101449 - 17101689
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agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctat-tttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
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T |
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| Q |
185 |
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284 |
Q |
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| T |
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17101645 |
T |
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| Q |
285 |
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327 |
Q |
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T |
 |
| Q |
186 |
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284 |
Q |
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| T |
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tacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaa |
14298730 |
T |
 |
| Q |
285 |
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327 |
Q |
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| T |
14298731 |
aattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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Target: chr3; HSP #15
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Q |
| |
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| T |
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agcataattcaccaattgagcatattttcaacacgtaaccatat-catacactttgaacatgtaattcaactaaccacaattcaattatccataacttca |
14304257 |
T |
 |
| Q |
186 |
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284 |
Q |
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| T |
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tacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaa |
14304357 |
T |
 |
| Q |
285 |
aattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
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| T |
14304358 |
aattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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Target: chr3; HSP #16
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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285 |
Q |
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tacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcacttaagaacaattaattaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaa |
8632099 |
T |
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| Q |
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327 |
Q |
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8632100 |
attgcaataagtgattatgatgaatcctaacccccttacctta |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
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Q |
| |
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| T |
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gcataattcaccaattgagcatattttaaacacatacccatttt-acatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcatttatccataacttcat |
34439380 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatc-taaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
285 |
Q |
| |
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| T |
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acctcataaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaaacacttttcatacaaataattgaaa |
34439280 |
T |
 |
| Q |
286 |
attacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
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| T |
34439279 |
attacaataagtgattatgatgaattctaatctccttacctta |
34439237 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
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agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
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Q |
| |
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| T |
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agcataattcaccaattgagcatattttcaacacataccc-ttttcatacacttt-aacatgtaattcgactaacaacaattcaattatccataatttca |
35123904 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aa |
284 |
Q |
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| T |
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tacatccaaacacgtcatcataattaaagtacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaa |
35124004 |
T |
 |
| Q |
285 |
aattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
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| T |
35124005 |
aattgcaataatgattatgatgaattctaacccctttacctta |
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Q |
| |
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agcataattcaaccaattgagcatattttcaacatatacc-attttctcatactttgaacatgaatttcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
14295647 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-a |
283 |
Q |
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| T |
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atacattcaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccattttagcacttttcatac-aataattgaa |
14295746 |
T |
 |
| Q |
284 |
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327 |
Q |
| |
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| T |
14295747 |
aaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
14295790 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
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Q |
| |
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| T |
14301176 |
agcataattcaaccaattgagcatattttcaacatatacc-attttctcatactttgaacatgaatttcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
14301274 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-a |
283 |
Q |
| |
|
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| T |
14301275 |
atacattcaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccattttagcacttttcatac-aataattgaa |
14301373 |
T |
 |
| Q |
284 |
aaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
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| T |
14301374 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
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Query Start/End: Original strand, 86 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17523025 - 17522780
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agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatacc-attttgttatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccacatcttca |
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T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aa |
284 |
Q |
| |
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|||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||| || |
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| T |
17522926 |
tacatccaaaactgtcatcataattagagcacgaagttcatcatttatgaacaaataatcaattcacccaaataagcacttctcatac-aataattgaaa |
17522828 |
T |
 |
| Q |
285 |
aattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattat |
332 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
17522827 |
aattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttat |
17522780 |
T |
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Target: chr3; HSP #22
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Target Start/End: Original strand, 17938685 - 17938925
Alignment:
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86 |
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184 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |
|
|
| T |
17938685 |
agcataattcatcaattaagcatattttcaacatatatcaacttctcatac--tttgaacatgcaattcaactaacaacaattcgcttaaccatg-cttt |
17938781 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaa |
284 |
Q |
| |
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||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
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| T |
17938782 |
atacatccaaacatgtcaccataattagagcacgaatttcatcactcaagaacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaa |
17938881 |
T |
 |
| Q |
285 |
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327 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
17938882 |
aattgcaataagtgattatgatgaaccctaacccccttatctta |
17938925 |
T |
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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
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Target Start/End: Complemental strand, 55440974 - 55440803
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195 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
55440974 |
accagttgagcatattttcatcatatatc-attttctcatactttgaacatgaaattccactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaa |
55440876 |
T |
 |
| Q |
196 |
catgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
55440875 |
catgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttat |
55440803 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 87 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 53898590 - 53898440
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| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53898590 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatttaatgcaactaaca-caattcaattattcataacttcat |
53898492 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
238 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
53898491 |
agatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaca |
53898440 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 3578210 - 3578440
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| Q |
96 |
accaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaa |
195 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
3578210 |
accagttgagcatattttcaacatata-ctattttctcatactttgaacatgaaattcaactaataacaattcaattatccataacttcatacat-tcaa |
3578307 |
T |
 |
| Q |
196 |
catgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-a |
293 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||| | |
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|
| T |
3578308 |
catgtcatcataattagagaatgaatatcatcatttatgaacaattaatcaatttacccaattaagcacttattcctac-aataattgaaaattgcaata |
3578406 |
T |
 |
| Q |
294 |
agtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3578407 |
aatgattatgatgaattctaacccgcttacctta |
3578440 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 11061142 - 11060902
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| Q |
86 |
agcataattca-ccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11061142 |
agcataattcaaccaattgagcatattttcaacatatacc-attttctcatactttgaacctgaaattcaactaacaacaatccaattattcataacttc |
11061044 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg- |
282 |
Q |
| |
|
|||||| |||| || | |||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |
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|
| T |
11061043 |
atacatttaaaaat-tgatcataattagagcacgaatttcatcatccattaacaaataattaatt-atccaattaagcacttattcatac-aataattga |
11060947 |
T |
 |
| Q |
283 |
aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
11060946 |
aaaattgcaattatgattatgatgaattccaacccccttacctta |
11060902 |
T |
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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19260972 - 19260839
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| Q |
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ataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcata |
187 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
19260972 |
ataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcata |
19260875 |
T |
 |
| Q |
188 |
catctaaacatgtcatcacaattagagcacgaattt |
223 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19260874 |
catctaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
19260839 |
T |
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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 87 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 6146881 - 6146763
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| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6146881 |
gcatgattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgtaattcaactaa-tacaattcaattattcataacttcat |
6146783 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcac |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6146782 |
acatctaaacatgtcatcac |
6146763 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 223 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 6146769 - 6146664
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223 |
tcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccctt |
321 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6146769 |
tcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaaccccctt |
6146670 |
T |
 |
| Q |
322 |
acctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
6146669 |
acctta |
6146664 |
T |
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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
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Target Start/End: Complemental strand, 14528110 - 14527975
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aaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattaca |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| || |
|
|
| T |
14528110 |
aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacctaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgca |
14528012 |
T |
 |
| Q |
292 |
a-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14528011 |
ataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
14527975 |
T |
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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 142 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 11196400 - 11196291
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| Q |
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241 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11196400 |
aacataaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatatcatcattattagagcacaaatttcatcatccatgaacaatt |
11196301 |
T |
 |
| Q |
242 |
aatcaattca |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
11196300 |
aatcaattca |
11196291 |
T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
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Target Start/End: Complemental strand, 11329097 - 11328859
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86 |
agcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| | | |||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
11329097 |
agcataattcaacaatttgagcatattt-caacatatacc-actttctcatactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattattaacaacttt |
11329000 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattga |
283 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||| |||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
11328999 |
atgca-----acatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc-aattaagcacttattcatacaa-taattga |
11328907 |
T |
 |
| Q |
284 |
aaatt---ac-aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11328906 |
aaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
11328859 |
T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 17139630 - 17139861
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accaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaa |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| | | ||||||||| |||| || |||||||||||||||| | |||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
17139630 |
accaattgagcatattt-caacatatacc-attttctcatagtttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaa |
17139727 |
T |
 |
| Q |
196 |
catgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---a |
291 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||| | || |||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||| | |
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|
| T |
17139728 |
catgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacacttaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaatttacacta |
17139825 |
T |
 |
| Q |
292 |
aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17139826 |
agaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
17139861 |
T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
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Target Start/End: Original strand, 15876250 - 15876341
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| Q |
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aacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaatt |
249 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| | ||| |||| ||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
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15876250 |
aacaacaattcagttatcaacaacatcatgcatttaaacatattatcataattagagcacgaatttcatcatctatgaacaattaatcaatt |
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T |
 |
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Target: chr3; HSP #35
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| Q |
86 |
agcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
14059349 |
agcataattcatcaaattgagcatattt-caacatatgtc-attttctcatactttgaacatgaaatttctctaaaaacaattcaattatcaacaacttc |
14059252 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattga |
283 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| | || ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14059251 |
atgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaatcatgaacaattagtcaatt-agtcaattaagcacttattcatac-aataattga |
14059154 |
T |
 |
| Q |
284 |
aaatt--acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttac |
323 |
Q |
| |
|
||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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aaattgcactaaaatgattatgatgaattataacccccttac |
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T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #36
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actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||| | || ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |
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|
| T |
17191701 |
actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatctatga |
17191800 |
T |
 |
| Q |
236 |
acaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatt |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | |||||||||| || |||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17191801 |
acaattaatc-atttactcaattaagcaattgttcatac-aacaattgaaaaattacactaaaatgattgtgattgaattctaacccccttaccttaatt |
17191898 |
T |
 |
| Q |
331 |
atc |
333 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
17191899 |
atc |
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T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #37
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actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||| | || ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
17204841 |
actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatctatga |
17204940 |
T |
 |
| Q |
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acaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgat-gaacactaacccccttaccttaatt |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17204941 |
acaattaatc-atttactcaattaagcacttgttcgtac-cacaattgaaaaattacactaaaatgattatgatggaattctaacccccttaccttaatt |
17205038 |
T |
 |
| Q |
331 |
atc |
333 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
17205039 |
atc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
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| Q |
136 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||| | ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| | || ||||| |
|
|
| T |
16880283 |
actttgaacatgaaattttactaacaacaattcaattatcaacaacttcttgcattcaaacatatcatcgtaattggagcacgaattcaaacaattatga |
16880382 |
T |
 |
| Q |
236 |
acaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16880383 |
acaattaatcaatt-actcaattaaacacttgttcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16880477 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
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Query Start/End: Original strand, 158 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 3576503 - 3576325
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| Q |
158 |
aacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaat |
257 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||| |||||||| ||||||| | || | |||||||||||||| || || ||| |
|
|
| T |
3576503 |
aacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagtacgaattataacaactttgaacaattaatcatttactc-aat |
3576405 |
T |
 |
| Q |
258 |
taagcacttat-catacaaataattgaaaa-ttaca--aaagtgattatgat-gaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3576404 |
taagcacttattcgtacaac-aattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatc |
3576325 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
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| Q |
136 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcat-aacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatg |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||| || ||||| ||| |||||| |||||| | || |||||||||||| | || |||| |
|
|
| T |
14080669 |
actttgaacatgcaaattcactaaccacaattcaatta-tcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattttaacatctatg |
14080767 |
T |
 |
| Q |
235 |
aacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14080768 |
cacaattaatc-atttatccaattaaacacttattcatac-catagttgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
14080863 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
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Target Start/End: Original strand, 39656637 - 39656817
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| Q |
86 |
agcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| | |||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
39656637 |
agcataattcaacaatttgagcatattt-caacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaccaatttc |
39656734 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat |
268 |
Q |
| |
|
||| || |||||| ||||| |||| ||||||| |||| | || ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
39656735 |
ataaattcaaacataacatcataattggagcacggattttaacaattatgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttat |
39656817 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
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Query Start/End: Original strand, 156 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 12560303 - 12560131
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| Q |
156 |
ctaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatcca |
255 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| || ||| ||||| |||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
12560303 |
ctaacaaaaattcaagtatcaataacttcaagcattcaatcataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc-a |
12560205 |
T |
 |
| Q |
256 |
attaagcacttat-catacaaataattgaaaa-ttacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12560204 |
attaagcacttattcatacaa-taattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattttaacccccttacctta |
12560131 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
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Target Start/End: Complemental strand, 47784853 - 47784767
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| Q |
136 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatt |
222 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
47784853 |
actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatt |
47784767 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #44
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Target Start/End: Original strand, 7854306 - 7854343
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| Q |
296 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7854306 |
tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatc |
7854343 |
T |
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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 15857194 - 15857157
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| Q |
296 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15857194 |
tgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatc |
15857157 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 33369024 - 33368822
Alignment:
| Q |
126 |
attttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttca |
225 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| ||||||| ||||| || ||| ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
33369024 |
attttcacatactatgaacatgcaatttcaccaaccacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccacaattaaagcacgaatttca |
33368925 |
T |
 |
| Q |
226 |
tcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattat-gatgaacactaaccccctt |
321 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |||| |||| || ||| ||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| || ||||||| | |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
33368924 |
acaactatgaacaaataattaatt-attcaaataagcacttaatcatgcaattaa-tgaaaattacaactaattgattatggttgaattctaaccccctt |
33368827 |
T |
 |
| Q |
322 |
acctt |
326 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
33368826 |
acctt |
33368822 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #47
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Query Start/End: Original strand, 201 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 11882240 - 11882113
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| Q |
201 |
catcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtga |
298 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||| |||| || || |||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| || ||| |
|
|
| T |
11882240 |
catcataattagagcatgaaattcaacatctaagaacaaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaattaaaagttacactaaatga |
11882142 |
T |
 |
| Q |
299 |
ttatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11882141 |
ttatgatgaattctaacccccttacctta |
11882113 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #48
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Target Start/End: Complemental strand, 13301491 - 13301360
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| Q |
201 |
catcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtga |
298 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||| || || |||| | |||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| || ||| |
|
|
| T |
13301491 |
catcataattagagcacgaaattcaacatctaagaaccaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaatcacactaaatga |
13301393 |
T |
 |
| Q |
299 |
ttatgatgaacactaacccccttaccttaatta |
331 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13301392 |
ttatgatgaattctaacccccttaccttaatta |
13301360 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13312147 - 13312016
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| Q |
201 |
catcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtga |
298 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||| || || |||| | |||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| || ||| |
|
|
| T |
13312147 |
catcataattagagcacgaaattcaacatctaagaaccaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaatcacactaaatga |
13312049 |
T |
 |
| Q |
299 |
ttatgatgaacactaacccccttaccttaatta |
331 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13312048 |
ttatgatgaattctaacccccttaccttaatta |
13312016 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 254 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 51961106 - 51961031
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| Q |
254 |
caattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51961106 |
caattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgatgaagactaacccccttacctta |
51961031 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #51
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Query Start/End: Original strand, 193 - 267
Target Start/End: Original strand, 15517848 - 15517921
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| Q |
193 |
aaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta |
267 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || | |||||||||||||| |
|
|
| T |
15517848 |
aaacatatcatcataattagagcacgaattttaacatttatgaacaattaatcactt-actcaattaagcactta |
15517921 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 333
Target Start/End: Original strand, 2844515 - 2844552
Alignment:
| Q |
296 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2844515 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc |
2844552 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 333
Target Start/End: Original strand, 3992874 - 3992911
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| Q |
296 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3992874 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc |
3992911 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 9590784 - 9590648
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| Q |
193 |
aaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac |
290 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| | |||||||||| |||| | || ||||||||||||| || || || |||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||| |
|
|
| T |
9590784 |
aaacatatcatcatagttagagcacggattttaacaactatgaacaattaaccactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaatttgaaaaattac |
9590686 |
T |
 |
| Q |
291 |
aa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
9590685 |
actaaatgattatgatgaattctaatccccttacctta |
9590648 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 17955915 - 17955878
Alignment:
| Q |
296 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17955915 |
tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc |
17955878 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 54038055 - 54038018
Alignment:
| Q |
296 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54038055 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc |
54038018 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 333
Target Start/End: Original strand, 55513194 - 55513231
Alignment:
| Q |
296 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55513194 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc |
55513231 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 333
Target Start/End: Original strand, 15550919 - 15550959
Alignment:
| Q |
293 |
aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15550919 |
aagtgattatgatgaattctaacccccttatcttaattatc |
15550959 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Original strand, 21397204 - 21397444
Alignment:
| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21397204 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcat |
21397302 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21397303 |
acatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaa |
21397402 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21397403 |
ttacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
21397444 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Original strand, 28261633 - 28261867
Alignment:
| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28261633 |
gcataattcaccaattgagcatattttc-acacatat---ttttcat--actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcat |
28261726 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28261727 |
acatctaaacatgtcatcataactagagcacgaatttcaccacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
28261826 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
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| T |
28261827 |
ttacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
28261867 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 86 - 333
Target Start/End: Original strand, 11584165 - 11584411
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185 |
Q |
| |
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| T |
11584165 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccc-ttttcatacacttgaaacatgaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
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T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
285 |
Q |
| |
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| T |
11584264 |
tacatccaaatatgtcatcataaatagagcacgaatttcaccactcatgaacaattaattaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
11584363 |
T |
 |
| Q |
286 |
attacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
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| T |
11584364 |
attacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttaattatc |
11584411 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
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Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Original strand, 4865375 - 4865613
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185 |
Q |
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|
|
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gcataattcaccaattgagcatattttcaccc-atacccatttttcatac--tttgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttca |
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T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
285 |
Q |
| |
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|
| T |
4865472 |
tacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcaccatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
4865571 |
T |
 |
| Q |
286 |
attacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4865572 |
attacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24183268 - 24183027
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agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
185 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
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agcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccc-ttttcatacactttgaacatgtaattcgactaacaacaattcaattatccatgacttca |
24183170 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aa |
284 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
24183169 |
tacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaa |
24183070 |
T |
 |
| Q |
285 |
aattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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| T |
24183069 |
aattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
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Query Start/End: Original strand, 88 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 21646873 - 21646636
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cataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcata |
187 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
21646873 |
cataattcaccaattgaacatattttcat-acatacccattttcatacacttttaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcata |
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T |
 |
| Q |
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catctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaat |
287 |
Q |
| |
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| T |
21646775 |
catctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcacatatgaacatttaatcaattcacccaaataagcacttttcatacaaataattg-aaat |
21646677 |
T |
 |
| Q |
288 |
tacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
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| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |
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| T |
21646676 |
tgcaataagtgattatgatgaattttaacccccttacctta |
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T |
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Target: chr5; HSP #7
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Query Start/End: Original strand, 88 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 11337320 - 11337081
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cataattcaccaattgagcatattttcaacatatatc-tattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11337320 |
cataattcaccaaatgagcatattttcaacatttaccatattctcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
11337223 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaa |
285 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |
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|
| T |
11337222 |
acatccaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaaccaattcatccaattaagcacttattcatac-aataattgaaa |
11337124 |
T |
 |
| Q |
286 |
attacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11337123 |
attgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
11337081 |
T |
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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 1168339 - 1168100
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| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1168339 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatc-attttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaaccattctattatccataacttcat |
1168241 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||| || ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
1168240 |
acatccaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcaccaaaataagcatttttcatacaaataattgaaaa |
1168141 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1168140 |
ttgcaataagtga-tatgatgaattctaacccccttacctta |
1168100 |
T |
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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Original strand, 20712187 - 20712428
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184 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |
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| T |
20712187 |
agcataattcaccaattgagcatattatcaacacatacccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaatcaacaacaattcagttatccataacttc |
20712284 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaa |
284 |
Q |
| |
|
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|
| T |
20712285 |
atacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca-ttatgaacaattaatcaattcactcaattaagcacttttcatacaagtaattgaa |
20712383 |
T |
 |
| Q |
285 |
aattacaa--aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
20712384 |
aattgcaaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
20712428 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 87 - 260
Target Start/End: Original strand, 24475690 - 24475861
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87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24475690 |
gcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattttcatacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcat |
24475787 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaa |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24475788 |
acatctaaacatgtcatcataattagaacacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaa |
24475861 |
T |
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Target: chr5; HSP #11
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Target Start/End: Original strand, 19405662 - 19405891
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aattgagcatattttcaacatataccc-ttttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaataattcaattatccataacttcatacattcaaatat |
19405760 |
T |
 |
| Q |
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gtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aag |
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Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| || |
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|
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gtcatcataattagagcataaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaa |
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T |
 |
| Q |
296 |
tgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19405860 |
tgattatgatgaattctaacccccttacctta |
19405891 |
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Target: chr5; HSP #12
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Q |
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|
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actttgaacatgtaattcaaccaacatcaattcaattatccataacttcatatgtctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatga |
21906958 |
T |
 |
| Q |
236 |
acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaatt |
288 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21906959 |
acaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaatt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
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actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
235 |
Q |
| |
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actttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatacaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcacttatga |
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T |
 |
| Q |
236 |
acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgat |
305 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23981503 |
acaattaatcaatgcactaaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 333
Target Start/End: Original strand, 19862320 - 19862569
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agcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| | ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
19862320 |
agcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttc |
19862417 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattga |
283 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||| ||| | |
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|
| T |
19862418 |
atgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttattcatacaacaaatgaa |
19862516 |
T |
 |
| Q |
284 |
aaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
19862517 |
aaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatc |
19862569 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
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Target Start/End: Complemental strand, 21310819 - 21310603
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211 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||| | ||| |
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|
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ttcaacatatatc-attttcacaaactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatagtta |
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T |
 |
| Q |
212 |
gagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatgatgaa |
308 |
Q |
| |
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| T |
21310720 |
gagcacgaattttaacatttatgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaaatgattatgatgaa |
21310622 |
T |
 |
| Q |
309 |
cactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
21310621 |
ttttaacccccttacctta |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
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156 |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||| || || |||||| |||||| |||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| || | |
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|
| T |
3674042 |
ctaacaacaattcaattatcaacaacttaatgtattcaaacatatcatcataatttgagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc-a |
3674140 |
T |
 |
| Q |
256 |
attaagcacttat-catacaaataattgaaaattaca---aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
3674141 |
attaagcacttattcatacaac-aattgaaaattacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 88 - 327
Target Start/End: Original strand, 16595621 - 16595860
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88 |
cataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcata |
187 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||| ||||||||| | | |||| | ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| |
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|
| T |
16595621 |
cataattcacaatttgagcatattt-caacatatacc-actttctcatactttgaacatgaaatttctctatcaacaattcaattatcaacaacttcatg |
16595718 |
T |
 |
| Q |
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catctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaa |
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Q |
| |
|
||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| | || |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
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| T |
16595719 |
cattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattagtcaattactc-aattaagcacttattcatacaa-taattgaaaa |
16595816 |
T |
 |
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tt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
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Q |
| |
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16595817 |
tttacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16595860 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 21297285 - 21297069
Alignment:
| Q |
112 |
ttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaatta |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| | | |||||| |||||| | ||| |
|
|
| T |
21297285 |
ttcaacatatatc-attttcacaaactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcgttcaaacatatcatcatagtta |
21297187 |
T |
 |
| Q |
212 |
gagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatgatgaa |
308 |
Q |
| |
|
||| |||||||| | || |||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
21297186 |
gaggacgaattttaacatttatgaacaattaatcacttactc-aattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaaataattatgatgaa |
21297088 |
T |
 |
| Q |
309 |
cactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21297087 |
ttctaacccccttacctta |
21297069 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 327
Target Start/End: Original strand, 23466619 - 23466787
Alignment:
| Q |
158 |
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257 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
23466619 |
aacaacaattcaattat-cataacttcttacatacaaacatgttgccataattggagcacgaattctaataattatgaacaattaatcaatt-acacaat |
23466716 |
T |
 |
| Q |
258 |
taagcacttat-catacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23466717 |
taatcacttattcatacaa-taattgaaaattgcaataattgattatgatgaattctaacccccttacctta |
23466787 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 21222703 - 21222497
Alignment:
| Q |
128 |
tttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatc |
227 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| || ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
21222703 |
tttcatatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattctaac |
21222604 |
T |
 |
| Q |
228 |
acatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttac |
323 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || | ||||||| ||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
21222603 |
aactatgaacaattaatcaat--actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaataattatgattgaactctaacccccatac |
21222507 |
T |
 |
| Q |
324 |
cttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
21222506 |
cttaattatc |
21222497 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 327
Target Start/End: Original strand, 23494057 - 23494272
Alignment:
| Q |
113 |
tcaacatatatctatt-ttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaatta |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | || |||||||| ||| |||||||||||| | || |
|
|
| T |
23494057 |
tcaacatatacctattcttcatac--tttgaacataaaattccactaataacaattcaattttccacaacttcatgcattcgaacatgtcatcatagttg |
23494154 |
T |
 |
| Q |
212 |
gagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatga |
307 |
Q |
| |
|
||||||||||| | || |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23494155 |
gagcacgaattctaacaattatgaacaattaattgatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatga |
23494252 |
T |
 |
| Q |
308 |
acactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23494253 |
tttctaacccccttacctta |
23494272 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 5450979 - 5450731
Alignment:
| Q |
86 |
agcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| | ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
5450979 |
agcataattcatcaatttgagcataatt-caacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttc |
5450882 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattga |
283 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| | || | || |||||| |
|
|
| T |
5450881 |
atgcattcaaacataacatcataattggagcatgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcatttatttatgc-aacaattga |
5450784 |
T |
 |
| Q |
284 |
aaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattat |
332 |
Q |
| |
|
||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5450783 |
aaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaattat |
5450731 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 327
Target Start/End: Original strand, 28902373 - 28902545
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| Q |
158 |
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257 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||| || ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
28902373 |
aacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaat |
28902471 |
T |
 |
| Q |
258 |
taagcactta-tcatacaaataattgaaaatta----caaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| || |||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28902472 |
taagcacttattcatac-aacaattgaaaattaacactacaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
28902545 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 327
Target Start/End: Original strand, 28938768 - 28938940
Alignment:
| Q |
158 |
aacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaat |
257 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||| || ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
28938768 |
aacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaat |
28938866 |
T |
 |
| Q |
258 |
taagcactta-tcatacaaataattgaaaatta----caaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| || |||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28938867 |
taagcacttattcatac-aacaattgaaaattaacactacaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
28938940 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 331
Target Start/End: Original strand, 21617168 - 21617374
Alignment:
| Q |
128 |
tttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatt-tcat |
226 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
21617168 |
tttcatatacttggaacatgcaatttcactaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattctaac |
21617267 |
T |
 |
| Q |
227 |
cacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaaccccctta |
322 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21617268 |
aactaatgaacaattaatccctt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaaccccctta |
21617365 |
T |
 |
| Q |
323 |
ccttaatta |
331 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
21617366 |
ccttaatta |
21617374 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 267
Target Start/End: Original strand, 22885792 - 22885932
Alignment:
| Q |
126 |
attttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttca |
225 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22885792 |
attttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattaaagcacgaatttca |
22885891 |
T |
 |
| Q |
226 |
tcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta |
267 |
Q |
| |
|
|| |||||||| | ||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
22885892 |
acaaccatgaacaaattatcaatt-attcaattaagcactta |
22885932 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 327
Target Start/End: Original strand, 432600 - 432815
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| Q |
112 |
ttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaatta |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| | ||||||||||| | || || ||||||||||||||||| | |||| ||| ||| |||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
432600 |
ttcaacatatatc-attttctcatactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactacatgcattcaaacatatcatcataattg |
432698 |
T |
 |
| Q |
212 |
gagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatgatgaa |
308 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| | || ||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| |||| | || ||||| |||||| || || ||||||||||||| |
|
|
| T |
432699 |
gagcgcgaattttaacaattatgatcaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatgc-aacaattgaaaaattgcagtaaatgattatgatgaa |
432796 |
T |
 |
| Q |
309 |
cactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
432797 |
ttctaacccccttacctta |
432815 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 292
Target Start/End: Original strand, 6456852 - 6456937
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| Q |
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aattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa |
292 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| || || ||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
6456852 |
aattagagcacgaatttcaacaactatgaacaaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaa |
6456937 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 327
Target Start/End: Original strand, 7728675 - 7728774
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| Q |
231 |
tatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatta---caaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctt |
326 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
7728675 |
tatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaaatttacaccaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
7728773 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0077 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:
Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 87 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 15606 - 15361
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gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
15606 |
gcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccatttttttatactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattgtccataacttcat |
15508 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
15507 |
acatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcaccacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataatttaaaa |
15408 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15407 |
ttacaaaagtgattatgatgaatgctaacccccttaccttaattatc |
15361 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Original strand, 44865342 - 44865582
Alignment:
| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44865342 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcat |
44865441 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44865442 |
acatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaa |
44865541 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44865542 |
ttacaataagtgattatgatgaa-tctaacccccttacctta |
44865582 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Original strand, 35094928 - 35095166
Alignment:
| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
35094928 |
gcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattttcatatactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaatcattcataacttcat |
35095025 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35095026 |
acatctaaacatgttatcacaattagagcatgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
35095125 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35095126 |
ttacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
35095166 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Original strand, 3895136 - 3895376
Alignment:
| Q |
86 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3895136 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatac--tttgaacatgcaattcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
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T |
 |
| Q |
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atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaa |
284 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3895234 |
atacatctaaacatttcatcagaattagagcatgaatttcatcaattatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaa |
3895333 |
T |
 |
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285 |
aattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
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|
|
| T |
3895334 |
aattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
3895376 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Original strand, 143750 - 143991
Alignment:
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185 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
143750 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattatttataacttca |
143848 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
285 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
143849 |
tacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactttttatacaaataattgaaa |
143948 |
T |
 |
| Q |
286 |
attacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
143949 |
attgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
143991 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 89 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 7284193 - 7283950
Alignment:
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89 |
ataattcaccaattgagcatattttcaacatatatcta-ttttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcata |
187 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | |
|
|
| T |
7284193 |
ataattcaccaattaagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatacaattcaactaataacaattcaatcatccataacttcaca |
7284096 |
T |
 |
| Q |
188 |
catctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaat |
287 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7284095 |
catctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcaccacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatataaataattgaaaat |
7283996 |
T |
 |
| Q |
288 |
tacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7283995 |
tacaaaagtgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatc |
7283950 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 139 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 39046712 - 39046523
Alignment:
| Q |
139 |
ttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39046712 |
ttgaacatacaattcaactaacaataattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
39046613 |
T |
 |
| Q |
239 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39046612 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaaataacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
39046523 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 86 - 331
Target Start/End: Original strand, 47289892 - 47290138
Alignment:
| Q |
86 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
185 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47289892 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttca |
47289990 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aa |
284 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
47289991 |
tatatctaaacatggcatcataattagagctcgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcatttttcatacaaataattgaaa |
47290090 |
T |
 |
| Q |
285 |
aattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaatta |
331 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47290091 |
aattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttaatta |
47290138 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15822567 - 15822327
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| Q |
86 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15822567 |
agcataattcaccatttgagcatattttcaacatatacc-attttcatacattttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttca |
15822469 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
285 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15822468 |
tacatccaa-catgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataactgaaa |
15822370 |
T |
 |
| Q |
286 |
attacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15822369 |
attacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
15822327 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 94 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 45452296 - 45452063
Alignment:
| Q |
94 |
tcaccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatct |
192 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45452296 |
tcacaaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaatccaattatccataacttcatacatct |
45452199 |
T |
 |
| Q |
193 |
aaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa |
292 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
45452198 |
aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaa |
45452099 |
T |
 |
| Q |
293 |
-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45452098 |
taaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
45452063 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 12369975 - 12369735
Alignment:
| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
12369975 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacagatacccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccgtaacttca |
12369878 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
285 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12369877 |
tacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttaatcatttatgaacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaa |
12369778 |
T |
 |
| Q |
286 |
attacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12369777 |
attgcaataaatgataatgatgaaatctaacccccttacctta |
12369735 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Original strand, 11287528 - 11287768
Alignment:
| Q |
86 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatcta-ttttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
11287528 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
11287625 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-a |
283 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | |
|
|
| T |
11287626 |
atacatctaaacatgtcaacataatcagagcactaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaaacacttttcatac-aataattgaa |
11287724 |
T |
 |
| Q |
284 |
aaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11287725 |
aaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
11287768 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13863066 - 13862828
Alignment:
| Q |
86 |
agcataattca-ccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataactt |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13863066 |
agcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataactt |
13862969 |
T |
 |
| Q |
184 |
catacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattga |
283 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
13862968 |
catacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggacaattaatctattcacccaattaagc----ttcatacaaataattga |
13862873 |
T |
 |
| Q |
284 |
aaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13862872 |
aaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
13862828 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Original strand, 12759098 - 12759340
Alignment:
| Q |
86 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
185 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12759098 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccctttttc-acattttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccataacttca |
12759196 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aa |
284 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
12759197 |
tacatctaaacatatcatcataattggagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaaacacttttcatacaaataattgaaa |
12759296 |
T |
 |
| Q |
285 |
aattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12759297 |
aattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
12759340 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 12248257 - 12248015
Alignment:
| Q |
86 |
agcataattca-ccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
12248257 |
agcataattcaaccaattgagcatattttcaacatata-ctattttctcatactttaaacatgaaattcaactaataacaattcaattatccataacttc |
12248159 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattga |
283 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
12248158 |
atacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaagtaatcaatt-atccaattaagcacttattcatacaa-taattga |
12248061 |
T |
 |
| Q |
284 |
aaa-ttacaaaag-tgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||| || ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12248060 |
aaaattgcaatatatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
12248015 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 88 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 26070398 - 26070161
Alignment:
| Q |
88 |
cataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcata |
187 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26070398 |
cataattcaccaattaagcatattttcaacatatacc-attttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcata |
26070300 |
T |
 |
| Q |
188 |
catctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaa |
285 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
26070299 |
catccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaatt-acacaattaagcacttattcatac-cataattgaaaa |
26070202 |
T |
 |
| Q |
286 |
attacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26070201 |
attgcaataatgattatgatgaattctaa-ccccttacctta |
26070161 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 88 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 26094185 - 26093948
Alignment:
| Q |
88 |
cataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcata |
187 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26094185 |
cataattcaccaattaagcatattttcaacatatacc-attttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcata |
26094087 |
T |
 |
| Q |
188 |
catctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaa |
285 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
26094086 |
catccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaatt-acacaattaagcacttattcatac-cataattgaaaa |
26093989 |
T |
 |
| Q |
286 |
attacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26093988 |
attgcaataatgattatgatgaattctaa-ccccttacctta |
26093948 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 86 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16570142 - 16569902
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| Q |
86 |
agcataattca-ccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16570142 |
agcataattcaaccaattgagcatattttccagatatacc-attttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaaatcaattatccataacttc |
16570044 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg- |
282 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
16570043 |
atacatccaaacatgtcatcataatgagagcacgaatttcatcatttatgagcaaataatcaatt-atccaattaagcacttattcatac-aataattga |
16569946 |
T |
 |
| Q |
283 |
aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctt |
326 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16569945 |
aaaattgcaataatgattatgatgaattttaacccccttacctt |
16569902 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 86 - 326
Target Start/End: Original strand, 16595520 - 16595760
Alignment:
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86 |
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184 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16595520 |
agcataattcaaccaattgagcatattttccagatatacc-attttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaaatcaattatccataacttc |
16595618 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg- |
282 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
16595619 |
atacatccaaacatgtcatcataatgagagcacgaatttcatcatttatgagcaaataatcaatt-atccaattaagcacttattcatac-aataattga |
16595716 |
T |
 |
| Q |
283 |
aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctt |
326 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16595717 |
aaaattgcaataatgattatgatgaattttaacccccttacctt |
16595760 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
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Target Start/End: Complemental strand, 14272009 - 14271787
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112 |
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211 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| | || ||||| ||| |||||| ||| || ||||| |
|
|
| T |
14272009 |
ttcaacatatatc-attttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattgaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcaccataatta |
14271911 |
T |
 |
| Q |
212 |
gagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tg |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | || ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || |
|
|
| T |
14271910 |
gagcacgaatttga-caactatgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgattg |
14271814 |
T |
 |
| Q |
307 |
aacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14271813 |
aattctaattcccttaccttaattatc |
14271787 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
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Target Start/End: Complemental strand, 17224025 - 17223824
Alignment:
| Q |
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actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || |||||| | ||| |||||| |||||| |||||||||||||||| | || | ||| |
|
|
| T |
17224025 |
actttgaacatgaaatttcacaaacaacaattcaattatccacaacttcgtgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattataacaactttga |
17223926 |
T |
 |
| Q |
236 |
acaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattac---aaaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaat |
329 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17223925 |
acaattaat-tatttactcaattaagcacttaatcata-aaataattgaaaaattacactaaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaat |
17223828 |
T |
 |
| Q |
330 |
tatc |
333 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
17223827 |
tatc |
17223824 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
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Target Start/End: Complemental strand, 16915015 - 16914866
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| Q |
136 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcat-aacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatg |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| | || |||| |
|
|
| T |
16915015 |
actttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattat-catcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatg |
16914917 |
T |
 |
| Q |
235 |
aacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16914916 |
aacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaa |
16914866 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
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Target Start/End: Original strand, 13274937 - 13275129
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| Q |
136 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||| | ||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| | || ||||| |
|
|
| T |
13274937 |
actttgaacatgaaattttactaacaacaattcaattaccaacaacttcttgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatga |
13275036 |
T |
 |
| Q |
236 |
acaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13275037 |
acaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaaatggcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
13275129 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
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Target Start/End: Original strand, 48356804 - 48357001
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| Q |
136 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||| | || ||||| |
|
|
| T |
48356804 |
actttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttaacaactatga |
48356903 |
T |
 |
| Q |
236 |
acaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
331 |
Q |
| |
|
||||||||||| || | |||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48356904 |
acaattaatcactt-actcaattaagcatttaatcatacaacgaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaatta |
48357001 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr7; HSP #24
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Target Start/End: Original strand, 13377689 - 13377889
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| Q |
136 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| | || ||||| |
|
|
| T |
13377689 |
actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatga |
13377788 |
T |
 |
| Q |
236 |
acaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaatt |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| || ||| || ||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13377789 |
acaattaatcgattactc-aatgaatcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaatt |
13377886 |
T |
 |
| Q |
331 |
atc |
333 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
13377887 |
atc |
13377889 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #25
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Query Start/End: Original strand, 136 - 331
Target Start/End: Original strand, 9611468 - 9611665
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| Q |
136 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| | || ||||| |
|
|
| T |
9611468 |
actttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatga |
9611567 |
T |
 |
| Q |
236 |
acaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
331 |
Q |
| |
|
||||||||||| | | ||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
9611568 |
acaattaatcacgt-actcaattaagcacttaatgatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaaccctcttaccttaatta |
9611665 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr7; HSP #26
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Target Start/End: Original strand, 9839039 - 9839236
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| Q |
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actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| | || ||||| |
|
|
| T |
9839039 |
actttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatga |
9839138 |
T |
 |
| Q |
236 |
acaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
331 |
Q |
| |
|
||||||||||| | | ||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
9839139 |
acaattaatcacgt-actcaattaagcacttaatgatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaaccctcttaccttaatta |
9839236 |
T |
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Back To:
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Target: chr7; HSP #27
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186 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | | || | ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
49047808 |
cataattcaaccaattgagcatattt-caacatatacc-actctctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcat |
49047711 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aa |
284 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| | |||| |||||| |||| | || | ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || |
|
|
| T |
49047710 |
gcattcaaacatgtcattataattggagcacaaattctaacaattctgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcata-taacaattgaaa |
49047613 |
T |
 |
| Q |
285 |
aattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49047612 |
aatggcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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Target: chr7; HSP #28
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attttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttca |
225 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| ||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||||||| || ||| ||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
31501323 |
attttcacatactatgaacatgcaatttcaccaataacaattcaattatcaccaatttcatgtatttaaacatatcttcataattagatcactaatttca |
31501422 |
T |
 |
| Q |
226 |
tcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgatta-tgatgaacactaaccccctt |
321 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |||||| || || ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||| || |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
31501423 |
tcaactatgaacaaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatgcaattaa-tgaaaattacaactaattgattattgttgaattctaaccccctt |
31501520 |
T |
 |
| Q |
322 |
acctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
31501521 |
acctta |
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T |
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Target: chr7; HSP #29
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112 |
ttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaatta |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||| | ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
34241317 |
ttcaacatatat-tactttcacatacttttaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacataacatcataatta |
34241219 |
T |
 |
| Q |
212 |
gagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaa |
308 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||| |||||||||||||||| || | ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| |
|
|
| T |
34241218 |
taacacgaattttatcaactatgaacaattaatcactt-actcaattaatcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaa |
34241120 |
T |
 |
| Q |
309 |
cactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34241119 |
ttctaacccccttacctta |
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T |
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Target: chr7; HSP #30
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333 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
111200 |
tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatc |
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T |
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caattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25124407 |
caattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgatgaagactaacccccttacctta |
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T |
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Target: chr7; HSP #32
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126 |
attttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttca |
225 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
28722260 |
attttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactagagcacgaatttca |
28722359 |
T |
 |
| Q |
226 |
tcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattat-gatgaacactaaccccctt |
321 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| | ||| || || |||||||||| || ||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||| | |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
28722360 |
acaactatgaacaaagattcactt-attcaattaagcatttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaaccccctt |
28722458 |
T |
 |
| Q |
322 |
acctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
28722459 |
acctta |
28722464 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
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333 |
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| |
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|
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
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Q |
| |
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|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
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Q |
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|
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|
|
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25876054 |
gcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattttcatacactttgaacatgtaattcaactaacat-aattcaattattcataacttcat |
25875957 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25875956 |
acatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaaacacttatcatacaaataattgaaaa |
25875857 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25875856 |
ttacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
25875816 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23836840 - 23836601
Alignment:
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186 |
Q |
| |
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| T |
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gcataattcaccaattgagcatatttttcacacatacccattttcatacactttgaacatgtaattccactaaca-caattcaatcattcataacttcat |
23836742 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
23836741 |
acatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatctaattaagcacttatcattcaaataattgaaaa |
23836642 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23836641 |
ttacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
23836601 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Original strand, 32465970 - 32466207
Alignment:
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87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
185 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
32465970 |
gcataattcaccaattgagcatattttca-cacatatccatttttcatac--tttgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttca |
32466066 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
285 |
Q |
| |
|
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|
| T |
32466067 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcattcaaataagcacttatcgtacaaataattaaaa |
32466166 |
T |
 |
| Q |
286 |
attacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
32466167 |
ttttcaaaagtgattatgatgaagactaa-ccccttacctta |
32466207 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 36890821 - 36890581
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| Q |
86 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
185 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
36890821 |
agcataattcaccaattaagcatattttcaacatat-tccattttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttca |
36890723 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
285 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
36890722 |
tacatctaaacatgccatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaaataagcacttttcatac-cataattgaaa |
36890624 |
T |
 |
| Q |
286 |
attacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36890623 |
ataacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
36890581 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 88 - 327
Target Start/End: Original strand, 271283 - 271521
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| Q |
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cataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcata |
187 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
271283 |
cataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-catacactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcata |
271381 |
T |
 |
| Q |
188 |
catctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaa |
286 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |
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|
| T |
271382 |
catccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcttcatttatgaataattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaa |
271480 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
271481 |
ttgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
271521 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 4448269 - 4448028
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| Q |
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agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
185 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | | | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
4448269 |
agcatcattcaccaattgaacatattttcaacacaaacccattt-catacactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttca |
4448171 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aa |
284 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| || |
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|
| T |
4448170 |
tacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcactcaattaagcacttttcatataaataattgaaa |
4448071 |
T |
 |
| Q |
285 |
aattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
4448070 |
aattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
4448028 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Original strand, 25602135 - 25602377
Alignment:
| Q |
86 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattt-tcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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agcataactcaccaattgagcatattttcaacatatatcaatttctcatac--tttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttc |
25602232 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg- |
282 |
Q |
| |
|
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|
| T |
25602233 |
atacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcatccatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttattcatac-aataattga |
25602331 |
T |
 |
| Q |
283 |
aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25602332 |
aaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
25602377 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Original strand, 28974160 - 28974400
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agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
28974160 |
agcataattcgccaaatgagcatattttcaacatatacc-attttctcatactttgaacatgtaattcaattaacaacaattctattatccataacttca |
28974258 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aa |
284 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||| || |
|
|
| T |
28974259 |
tacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcaccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaa |
28974357 |
T |
 |
| Q |
285 |
aattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28974358 |
aattgaaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
28974400 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Original strand, 27261915 - 27262156
Alignment:
| Q |
86 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattt-tcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
27261915 |
agcataattcaccaat-gagcatattttcaacatataccaatttctcatac--tttgaacatgtaattgaactaacaacaattcaattatccataacttt |
27262011 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg- |
282 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
27262012 |
atacatccaaacatgtcatcataattagggcacaaatttcatcatccatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttattcatac-aataattga |
27262110 |
T |
 |
| Q |
283 |
aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27262111 |
aaaattgcaataaatgattatgatgaattctaactcccttacctta |
27262156 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24571428 - 24571188
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agcataattca-ccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||| |||| ||||||||||||||| ||| || |||||| |
|
|
| T |
24571428 |
agcataattcaaccaattgagcatattt-caacatatatc-attttctcataccttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaagtatccacaacttc |
24571331 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattga |
283 |
Q |
| |
|
|| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |
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|
| T |
24571330 |
atgcattcaaacgtgtcatcaaaattagagcacgaatttcatcatctatgaacaattaatcaatt-acccaattaagcatttattcatac-aataattga |
24571233 |
T |
 |
| Q |
284 |
aa-attacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|| ||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
24571232 |
aacattgcaataatgattatgatgaattctaaccccctaacctta |
24571188 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22579998 - 22579758
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| Q |
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agcataattca-ccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||| | || |||| |||| | || || ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22579998 |
agcataattcaaccaattgagcatattt-caacatataacatttttctcataccttgatcataaagtttcaccaacaacaattcaattat-cataacttc |
22579901 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg- |
282 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
22579900 |
atacatacaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-acacaattaagcacttattcatac-aataattga |
22579803 |
T |
 |
| Q |
283 |
aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22579802 |
aaaattgcaatagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
22579758 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 332
Target Start/End: Original strand, 68103 - 68351
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| Q |
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agcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| | |||| | ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
68103 |
agcataattcaacaatttgagcatattt-caacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttc |
68200 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattga |
283 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| | || ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
68201 |
atgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatctattactc-aattaagcacttattcatacaac-aattga |
68298 |
T |
 |
| Q |
284 |
aaatt---ac-aaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattat |
332 |
Q |
| |
|
||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
68299 |
aaatttatactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttat |
68351 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 31146317 - 31146073
Alignment:
| Q |
86 |
agcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| | |||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
31146317 |
agcataattcaacaatttgagcatattt-caacatatatc-actttctcatactttgaacataaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttc |
31146220 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattga |
283 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||| ||||| |||| || |||||||| | || |||| |||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| | |||| |
|
|
| T |
31146219 |
atgcattcaaacataccatcataattggaacacgaattctaacaattatggacaattaatcaatt-actcagttaagcacttattcatacaacaatttga |
31146121 |
T |
 |
| Q |
284 |
aaatt---acaaaag-tgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31146120 |
aaatttacacaaaagatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
31146073 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 327
Target Start/End: Original strand, 722531 - 722742
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115 |
aacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagag |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||| |||||| |||| |||| ||| |
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|
| T |
722531 |
aacatatatc-attttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttcatacattcaaacataatatcataattggag |
722629 |
T |
 |
| Q |
215 |
cacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatgatgaacact |
312 |
Q |
| |
|
||||||||| | || ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||| || |
|
|
| T |
722630 |
cacgaattttaacaattatgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aacaattgcaaattgcactaaatgattatgatgaattct |
722727 |
T |
 |
| Q |
313 |
aacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |
|
|
| T |
722728 |
aacccctttacctta |
722742 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 331
Target Start/End: Original strand, 19666688 - 19666884
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136 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
235 |
Q |
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| T |
19666688 |
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19666787 |
T |
 |
| Q |
236 |
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331 |
Q |
| |
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| T |
19666788 |
acaattaatcactt-attcaattaagcatttattcatacaa-taattgaaaaattacactaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaatta |
19666884 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
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Target Start/End: Complemental strand, 23821713 - 23821534
Alignment:
| Q |
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248 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||||||||| | |||||| | ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| | |
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| T |
23821713 |
aattcaatcaacaacaattcaattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcact |
23821614 |
T |
 |
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249 |
tcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
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| | ||||||||||||| | ||| | |||||||| ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
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| T |
23821613 |
t-actcaattaagcacttaagcatgc-aataattgaaaaattacactaaatgattataatgaaatctaacccccttacctta |
23821534 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23830792 - 23830613
Alignment:
| Q |
149 |
aattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaat |
248 |
Q |
| |
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| T |
23830792 |
aattcaatcaacaacaattcaattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcact |
23830693 |
T |
 |
| Q |
249 |
tcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
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| | ||||||||||||| | ||| | |||||||| ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
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| T |
23830692 |
t-actcaattaagcacttaagcatgc-aataattgaaaaattacactaaatgattataatgaaatctaacccccttacctta |
23830613 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 333
Target Start/End: Original strand, 19660098 - 19660238
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194 |
aacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca- |
291 |
Q |
| |
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| T |
19660098 |
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19660196 |
T |
 |
| Q |
292 |
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333 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19660197 |
taaagtgattatgatgaattctaa-ccccttaccttaattatc |
19660238 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 19669101 - 19669003
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| Q |
231 |
tatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaa-ttaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctt |
326 |
Q |
| |
|
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|
| T |
19669101 |
tatgaacaattaatcattt-atccaattaatcacttattcatacaa-taattgaaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaaccccgttacctt |
19669004 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19794660 - 19794623
Alignment:
| Q |
296 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
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| T |
19794660 |
tgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatc |
19794623 |
T |
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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 333
Target Start/End: Original strand, 25305634 - 25305791
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277 |
Q |
| |
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| T |
25305634 |
aacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattataacaactttgaacaattaatcatttactc-aattaagcacttattcatacaac- |
25305731 |
T |
 |
| Q |
278 |
aattg-aaaattaca--aaagtgattatgat-gaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
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||||| ||||||| | ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
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| T |
25305732 |
aattgtaaaattatactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatc |
25305791 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 140
Target Start/End: Original strand, 6879549 - 6879601
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87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacacttt |
140 |
Q |
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|
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| T |
6879549 |
gcataattcaccaattgagtatattttc-acacatacccattttcatacacttt |
6879601 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 333
Target Start/End: Original strand, 22284279 - 22284316
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tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
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|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
22284279 |
tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc |
22284316 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 333
Target Start/End: Original strand, 15633535 - 15633575
Alignment:
| Q |
293 |
aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
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||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15633535 |
aagtgattatgataaagactaacctccttaccttaattatc |
15633575 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 53704868 - 53704629
Alignment:
| Q |
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gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
185 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
53704868 |
gcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccatttttcatac--tttgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttca |
53704772 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aa |
284 |
Q |
| |
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|
| T |
53704771 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
53704672 |
T |
 |
| Q |
285 |
aattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53704671 |
aataacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
53704629 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 89 - 327
Target Start/End: Original strand, 44346941 - 44347177
Alignment:
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89 |
ataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatac |
188 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
44346941 |
ataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattttcttacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatac |
44347038 |
T |
 |
| Q |
189 |
atctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaatt |
288 |
Q |
| |
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| T |
44347039 |
atctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaatt |
44347138 |
T |
 |
| Q |
289 |
acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
44347139 |
acaaaagtgattatgatgaattctaactcccttacctta |
44347177 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 89 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 55376730 - 55376494
Alignment:
| Q |
89 |
ataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcata |
187 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| || ||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
55376730 |
ataattcaccaattgagtatattttca-cacatacccatttttcatac--ttagaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcata |
55376634 |
T |
 |
| Q |
188 |
catctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaat |
287 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
55376633 |
catctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaat |
55376534 |
T |
 |
| Q |
288 |
tacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55376533 |
ttcaaaagtgattatgatgaagactaacccccttacctta |
55376494 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23270069 - 23269829
Alignment:
| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23270069 |
gcataattcatcaattgagtatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcat |
23269971 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
23269970 |
acatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaaacacttttcatacaaataattgaaaa |
23269871 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23269870 |
ttacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
23269829 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 87 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 8872606 - 8872372
Alignment:
| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
185 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
8872606 |
gcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccatttttcatac--tttgaacatacaattcaactaacaacacttcaatcattcatagcttca |
8872510 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
285 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8872509 |
tacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcaccacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
8872410 |
T |
 |
| Q |
286 |
attacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttac |
323 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8872409 |
attacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttac |
8872372 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Original strand, 44056027 - 44056266
Alignment:
| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
44056027 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacacatattcatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaaa-attcataacttca |
44056123 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
285 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44056124 |
tacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaa |
44056223 |
T |
 |
| Q |
286 |
attacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44056224 |
attacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
44056266 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Original strand, 34395369 - 34395609
Alignment:
| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
34395369 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcattacttcat |
34395467 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
34395468 |
acatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcatttatgaacaattaatcagttcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaa |
34395567 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34395568 |
ttgcaataagtgataatgatgaattctaacccccttacctta |
34395609 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 90 - 327
Target Start/End: Original strand, 30458018 - 30458255
Alignment:
| Q |
90 |
taattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcataca |
189 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
30458018 |
taattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttt-acatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaatttaattatccataacttcataca |
30458116 |
T |
 |
| Q |
190 |
tctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaatta |
289 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
30458117 |
tctaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattcaaaatta |
30458216 |
T |
 |
| Q |
290 |
caa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |
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| T |
30458217 |
caataagtaattatgatgaattctaacccccttacctta |
30458255 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 53907834 - 53907604
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87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
185 |
Q |
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|
| T |
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gcataattcaccaattgggcatattttca-cacatacccatttttcatac--tttgaacatacaatccaactaataacaattcaatcattcataacttca |
53907738 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
285 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53907737 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaatta--------atccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
53907646 |
T |
 |
| Q |
286 |
attacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53907645 |
actacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 12837336 - 12837096
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Q |
| |
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|
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12837239 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaa |
284 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
12837238 |
atacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatatcatcatttatggacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcattcaaa-aattgaa |
12837140 |
T |
 |
| Q |
285 |
aattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12837139 |
aatagcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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Target: chr4; HSP #11
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Target Start/End: Original strand, 16732280 - 16732520
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184 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
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agcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
16732377 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataatt-ga |
283 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
16732378 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-actaattaaa |
16732476 |
T |
 |
| Q |
284 |
aaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||||||||||||| |||||| | |||||||| |
|
|
| T |
16732477 |
aaattgcaataatgattatgatgaattctaacctctttacctta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 136 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 20813634 - 20813442
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235 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
20813634 |
actttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatga |
20813535 |
T |
 |
| Q |
236 |
acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20813534 |
acaattaatcaattcacccaattaagcatttttcatacaaataatttaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
20813442 |
T |
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Target: chr4; HSP #13
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Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 21959599 - 21959359
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184 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |
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| T |
21959599 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatac--tttgag-atgtaattcaatcaacaacaattcaaatatccataacttc |
21959503 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaa |
284 |
Q |
| |
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|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21959502 |
atacatttaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatcaattaattcacccaaataagcacttttcatacaaataattgaa |
21959403 |
T |
 |
| Q |
285 |
aattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21959402 |
aattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
21959359 |
T |
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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 158 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 819996 - 819826
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Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
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aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcaccataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaat |
819897 |
T |
 |
| Q |
258 |
taagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
819896 |
taagcatttttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
819826 |
T |
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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
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Target Start/End: Complemental strand, 45458991 - 45458769
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agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
185 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| | | ||| | | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
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|
| T |
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agcataattcaccaattgaacatatctttaacatata-caaacttctcatattttgagcatgtaattcaactaacaacaattcaattatctatcacttca |
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T |
 |
| Q |
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tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
285 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45458892 |
tacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaa |
45458793 |
T |
 |
| Q |
286 |
attacaa-aagtgattatgatgaa |
308 |
Q |
| |
|
||| ||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
45458792 |
attgcaataaatgattatgatgaa |
45458769 |
T |
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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 52265643 - 52265403
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185 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| | | |||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |
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|
| T |
52265643 |
gcataattcaacaatttgagcatattt-caacatatacc-actttctcatactttgaacataaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttca |
52265546 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-a |
283 |
Q |
| |
|
| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||| |||||||| | |
|
|
| T |
52265545 |
tgcattcaaacataacatcataattagagcacgaatttcatcatctatgaacaattaatcaatt-acccaattaaacacttattcatac-aataattgaa |
52265448 |
T |
 |
| Q |
284 |
aaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
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52265447 |
aaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 327
Target Start/End: Original strand, 27961131 - 27961324
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235 |
Q |
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|
||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||| | || ||||| |
|
|
| T |
27961131 |
actttgaacatgaaattccactaacaacaattcaattattcataacttcatgcattcaaacatgtcatcataattggagcacggattctaacaattatga |
27961230 |
T |
 |
| Q |
236 |
acaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27961231 |
acaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaatttacactaacaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
27961324 |
T |
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Target: chr4; HSP #18
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Target Start/End: Complemental strand, 7185954 - 7185735
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ttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaatta |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
7185954 |
ttcaacatatatc-attttcacatactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataatta |
7185856 |
T |
 |
| Q |
212 |
gagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatgatgaac |
309 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| | || |||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
7185855 |
gagcacaaattttaacaactatgaacaattaatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgatgaat |
7185757 |
T |
 |
| Q |
310 |
actaacccccttaccttaatta |
331 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7185756 |
tctaacctccttaccttaatta |
7185735 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 30232632 - 30232391
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agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| | ||||||| ||| | || || ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
30232632 |
agcataattcaccaattgagcatattttca-cataacccacttttcacatactttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattat-cataacttca |
30232535 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-- |
282 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||||| |||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
30232534 |
tatatacaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-acacaattaagcacttattcatac-cataattgaa |
30232437 |
T |
 |
| Q |
283 |
aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
30232436 |
aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccctcttacctta |
30232391 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 158 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 18494392 - 18494224
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aacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaat |
257 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| | || ||||||||||| ||||||| | |||| |
|
|
| T |
18494392 |
aacaacaattcaattat-cataacttcatacatacgaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattgatcaatt-acacaat |
18494295 |
T |
 |
| Q |
258 |
taagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18494294 |
taagcacctattcatac-cataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
18494224 |
T |
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Target: chr4; HSP #21
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agcataattcacc-aattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
13809646 |
agcataattcaactaattgagcatattt-caacatatacc-attttctcatactttgaacatgaaatctcaccaacaacaattcaattaccaacaacttc |
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T |
 |
| Q |
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atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattga |
283 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
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atgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattactc-aattaagcacttattcatacaa-taattga |
13809451 |
T |
 |
| Q |
284 |
aaatta-caa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||| | ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13809450 |
aaaatggcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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Target: chr4; HSP #22
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Target Start/End: Original strand, 15044939 - 15045181
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Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| | ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||| |
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|
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agcataattcatcaatttgagcataatt-caacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttc |
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T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattga |
283 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||| |
|
|
| T |
15045037 |
atgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattga |
15045134 |
T |
 |
| Q |
284 |
aaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
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15045135 |
gaatttaaactaaaatgattatgatgaaatctaacccccttacctta |
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Target: chr4; HSP #23
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Target Start/End: Complemental strand, 41256466 - 41256263
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attttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttca |
225 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41256466 |
attttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcat-tcaacatttcatcataattagagcacgaatttca |
41256368 |
T |
 |
| Q |
226 |
tcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaaccccctt |
321 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| || || ||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| |
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|
| T |
41256367 |
acaactatgaacaattaatcactt-attcaattaagcacttaaacatacaacaaatgaaaaattacaactaaatgattatgattgaattctaaccccctt |
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T |
 |
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322 |
acctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
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acctta |
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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
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126 |
attttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcat-aacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttc |
224 |
Q |
| |
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||||||| | ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
15013379 |
attttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattat-catcaatttcatgcat-tcaacatatcatcataattagagcacgaattta |
15013282 |
T |
 |
| Q |
225 |
atcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaaccccct |
320 |
Q |
| |
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| || |||||||||||||||| || || ||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
15013281 |
aacaactatgaacaattaatcactt-attcaattaagcacttaaacatac-aacaaatgaaaattacaactaaatgattatgattgaattctaaccccct |
15013184 |
T |
 |
| Q |
321 |
tacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
15013183 |
tacctta |
15013177 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #25
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86 |
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184 |
Q |
| |
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||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| | |||| | ||||||||| | |||| || ||||||||||||||||| || ||| |
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|
| T |
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agcataattcatcaatttgagcatattt-caacatatatc-actttctcatactttgaacttgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttc |
47535104 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatca |
246 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
47535103 |
atgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatca |
47535042 |
T |
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Target: chr4; HSP #26
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182 |
ttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataat |
280 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||||| |
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| T |
14901437 |
ttcatacattcaaacatattgtcataattagagcacgaattataacaaatatgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aataat |
14901534 |
T |
 |
| Q |
281 |
tg-aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|| |||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14901535 |
tgaaaaattgcaataaaatgattatgatgaaatttaacccccttacctta |
14901584 |
T |
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333 |
Q |
| |
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||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
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tgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatc |
54118162 |
T |
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Target: chr4; HSP #28
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87 |
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122 |
Q |
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820051 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacacata |
820016 |
T |
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Target: chr4; HSP #29
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ttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
238 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||| |||||| |||||||||||| |||| | || |||||||| |
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|
| T |
7964796 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagagcacggattttaacaactatgaaca |
7964697 |
T |
 |
| Q |
239 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||| ||| || | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
7964696 |
attactcactt-actcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta |
7964606 |
T |
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Target Start/End: Original strand, 18276595 - 18276743
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236 |
Q |
| |
|
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| T |
18276595 |
ctttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatatttagagcacgaattttaacaactatgaa |
18276694 |
T |
 |
| Q |
237 |
caattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
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|
|
| T |
18276695 |
caattaatcacat-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaa |
18276743 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0083 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:
Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
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gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14986 |
gcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattttcatacactttgaacatgtaatctaactaaca-caattcaattattcataacttcat |
15083 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
|
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|
| T |
15084 |
acatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacatataattgaaaa |
15183 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15184 |
ttacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
15224 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
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Target Start/End: Original strand, 37611779 - 37612020
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185 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37611779 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattatttataacttca |
37611877 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
285 |
Q |
| |
|
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|
| T |
37611878 |
tacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatctaattaagcacttttcatacaaataattgaaa |
37611977 |
T |
 |
| Q |
286 |
attacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37611978 |
attataataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
37612020 |
T |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22234938 - 22234700
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| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22234938 |
gcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattttcatacactttgagcatgtaattcaactaaca-caattaaattattcataacttcat |
22234841 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22234840 |
acatctaaacacgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcattcaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
22234741 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22234740 |
ttacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
22234700 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 89 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 20573325 - 20573087
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| Q |
89 |
ataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatac |
188 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
20573325 |
ataattcaccaattgagcatattttcaacacataccc-ttttcatacactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatac |
20573227 |
T |
 |
| Q |
189 |
atctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaat |
287 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
20573226 |
attcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaaat |
20573127 |
T |
 |
| Q |
288 |
tacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20573126 |
tgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
20573087 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 19993189 - 19992952
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| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
19993189 |
gcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattttcatacactttgaacaagtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcgt |
19993092 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
19993091 |
acatctaaacatgtcatcataattagagtacggatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattg-aaa |
19992993 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19992992 |
ttacaaaagtgattatgatgaattataacccccttacctta |
19992952 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
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Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Original strand, 41246770 - 41247009
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87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatac-actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| || |||||| | ||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
41246770 |
gcataattcaccaattaagcatattt-catcatatacccatttt--tcctacttttaacatgtaattcaaccaacaacaatttaattattcataacttca |
41246866 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
285 |
Q |
| |
|
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|
| T |
41246867 |
tacatctaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaaaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaactaattgaaa |
41246966 |
T |
 |
| Q |
286 |
attacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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| T |
41246967 |
attacaataagtgattatgatgaactctaacccccttacctta |
41247009 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
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Query Start/End: Original strand, 89 - 327
Target Start/End: Original strand, 20481719 - 20481955
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89 |
ataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcata |
187 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20481719 |
ataattcaccaattgagcatattatcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcata |
20481816 |
T |
 |
| Q |
188 |
catctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |
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|
| T |
20481817 |
cattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatccatgaacaaataatcaatt-atccaattaagcacttattcatac-attaattgaaaa |
20481914 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
20481915 |
ttacaaaagtgattatgatgaattttaacccccttacctta |
20481955 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 20561767 - 20561526
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86 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattt-tcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
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|
| T |
20561767 |
agcataattcaccaattaaacataatttcaacatataccaatttctcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatctataacttc |
20561670 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-a |
283 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |
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|
| T |
20561669 |
atacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaa |
20561570 |
T |
 |
| Q |
284 |
aaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20561569 |
aaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
20561526 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 152 - 327
Target Start/End: Original strand, 25122618 - 25122793
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152 |
tcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattca |
251 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tcaactagcaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattggagcacgaatttgatcatttatgaacaattaatcaattca |
25122717 |
T |
 |
| Q |
252 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25122718 |
tccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattataataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
25122793 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7000624 |
tcatcacatatgaacaattaatcaattcatcctattaagcacttatcatacaaataattgaaaattaaaaaagtgattatgatgaaaactaaccccctta |
7000525 |
T |
 |
| Q |
323 |
c |
323 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
7000524 |
c |
7000524 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 21681124 - 21681356
Alignment:
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96 |
accaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaa |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | || || | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||| |
|
|
| T |
21681124 |
accaattgagcatattttcaacatataccc-ttctctcatactttaaacatgaaattcaactaacaataattcaattatccataaacttatacattcaaa |
21681222 |
T |
 |
| Q |
196 |
catgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa- |
292 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| |
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|
| T |
21681223 |
tatgtcatcataattagatcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattcaacaaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaat |
21681321 |
T |
 |
| Q |
293 |
aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21681322 |
aaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
21681356 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 88 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 21198286 - 21198040
Alignment:
| Q |
88 |
cataattcaccaatt-gagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| | ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
21198286 |
cataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatctacaacttcat |
21198189 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aa |
284 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
21198188 |
gcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatctatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaa |
21198091 |
T |
 |
| Q |
285 |
aattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
21198090 |
aattacactaaaatgattataatgaattctaacccccttatcttaattatc |
21198040 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 233 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 20529843 - 20529748
Alignment:
| Q |
233 |
tgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
20529843 |
tgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattataacccccttacctta |
20529748 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 333
Target Start/End: Original strand, 23837309 - 23837558
Alignment:
| Q |
86 |
agcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| | ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
23837309 |
agcataattcaacaatttgagcatagtt-caacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaatttcaataacaacaattcaattatcaacaacttc |
23837406 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattga |
283 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||| || |||||| |
|
|
| T |
23837407 |
atgcatttaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatctatgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aacaattga |
23837504 |
T |
 |
| Q |
284 |
aaat---tacaaaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
|||| || ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23837505 |
aaatctatattaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatc |
23837558 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Original strand, 22981384 - 22981622
Alignment:
| Q |
86 |
agcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| | | |||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
22981384 |
agcataattcaacaatttgagcatattt-caacatatacc-actttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttc |
22981481 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg- |
282 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| |
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|
| T |
22981482 |
atgcattcaaacataacatcataattagagcacaaatttcat--catctgaacaattaatcaatt-acccaattaagcacttattcatacaa--aattga |
22981576 |
T |
 |
| Q |
283 |
aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22981577 |
aaaattgcaatatatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
22981622 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 39446902 - 39446660
Alignment:
| Q |
86 |
agcataattca-ccaattgagcatattttcaacatatatctatt-ttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataactt |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | || ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
39446902 |
agcataattcaaccaatttagcatattt-caacatataacacttcttcatac--tttaaacatgaaattccactaacaacaattcaattatccacaactt |
39446806 |
T |
 |
| Q |
184 |
catacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg |
282 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||| || ||||| |
|
|
| T |
39446805 |
caagcattcaaacatgtcatcataattggagcatgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcatttattcatac-aacaattg |
39446708 |
T |
 |
| Q |
283 |
aaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39446707 |
aaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
39446660 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 136 - 333
Target Start/End: Original strand, 17285364 - 17285565
Alignment:
| Q |
136 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||| | || ||||| |
|
|
| T |
17285364 |
actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatga |
17285463 |
T |
 |
| Q |
236 |
acaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaat |
329 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17285464 |
acaattattcaatt-attcaattaagcacttaatcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaat |
17285561 |
T |
 |
| Q |
330 |
tatc |
333 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
17285562 |
tatc |
17285565 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 20654041 - 20653944
Alignment:
| Q |
86 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattt-tcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20654041 |
agcataattcaccaattaagcatattttcaatatataccaatttctcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
20653944 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 331
Target Start/End: Original strand, 5854766 - 5854971
Alignment:
| Q |
128 |
tttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatc |
227 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
5854766 |
tttcatatactttgaacatgctatttcaccaacaacaattcaattatcgccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaac |
5854865 |
T |
 |
| Q |
228 |
acatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttac |
323 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
5854866 |
aactatgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacctccttac |
5854963 |
T |
 |
| Q |
324 |
cttaatta |
331 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
5854964 |
cttaatta |
5854971 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 327
Target Start/End: Original strand, 33528562 - 33528778
Alignment:
| Q |
112 |
ttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaatta |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||| | || ||||| ||| |||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
33528562 |
ttcaacatatatc-attttcatatactaagaagatacaatttcatcaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataatta |
33528660 |
T |
 |
| Q |
212 |
gagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaa |
308 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| || || ||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| |
|
|
| T |
33528661 |
gagcacggaattcaacatctaagaacaattaatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaa |
33528759 |
T |
 |
| Q |
309 |
cactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33528760 |
ttctaacccccttacctta |
33528778 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 112 - 331
Target Start/End: Original strand, 29306554 - 29306776
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| Q |
112 |
ttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaatta |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| |||||| | ||| |
|
|
| T |
29306554 |
ttcaacatatatc-attttcacaaactttgaacatacaaattcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattagaacatatcatcatagtta |
29306652 |
T |
 |
| Q |
212 |
gagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatga-tga |
307 |
Q |
| |
|
|||||||||| | | || |||||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
29306653 |
gagcacgaatattaacatctatgaacaatcaatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaaatgattatgattga |
29306751 |
T |
 |
| Q |
308 |
acactaacccc-cttaccttaatta |
331 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
29306752 |
attctaacccctcttaccttaatta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 331
Target Start/End: Original strand, 15933458 - 15933655
Alignment:
| Q |
136 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||| | || ||||| |
|
|
| T |
15933458 |
actttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttaacaactatga |
15933557 |
T |
 |
| Q |
236 |
acaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttacaa-aagtgattatgatg-aacactaacccccttaccttaatta |
331 |
Q |
| |
|
||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15933558 |
acaattaatcacttactc-aattaagcacttaatcatacaa-taattgaaaaattacactaaatgattatgatttaattctaacccccttaccttaatta |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
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| Q |
86 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattt-tcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaa |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20647965 |
agcataattcaccaattaaacataatttcaacatataccaatttctcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
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Query Start/End: Original strand, 136 - 331
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| Q |
136 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| | || ||||| |
|
|
| T |
26011654 |
actttgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatga |
26011753 |
T |
 |
| Q |
236 |
acaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
331 |
Q |
| |
|
||||||||||| || | ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26011754 |
acaattaatcactt-actcaattaaacacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaa---taacccccttaccttaatta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
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Query Start/End: Original strand, 126 - 331
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126 |
attttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttca |
225 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||| || ||| | ||||||||||||| |
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|
| T |
22742914 |
attttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcactcaaacatatcaccataatcaaagcacgaatttca |
22743013 |
T |
 |
| Q |
226 |
tcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattat-gatgaacactaaccccctt |
321 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||| | |||| ||||||||||| |
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|
| T |
22743014 |
acaactatgaacaaataatcaatt-attcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaaccccctt |
22743112 |
T |
 |
| Q |
322 |
accttaatta |
331 |
Q |
| |
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|||||||||| |
|
|
| T |
22743113 |
accttaatta |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
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Q |
| |
|
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|
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Target: chr8; HSP #26
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Q |
| |
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|
| T |
25296295 |
ttcaacatatatc-attttcacaagctttgaacatgcaatttcaccaacagcaattcaattatcattaatttcatgcattcaaacatatcatcatagtta |
25296393 |
T |
 |
| Q |
212 |
gagcacgaatttcatcacatatgaacaattaat |
244 |
Q |
| |
|
| |||||||||| | || |||||||||||||| |
|
|
| T |
25296394 |
gggcacgaattttaacatgtatgaacaattaat |
25296426 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
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Target Start/End: Original strand, 25758315 - 25758446
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112 |
ttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaatta |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||||| | ||| |
|
|
| T |
25758315 |
ttcaacatatatc-attttcaaaagctttgaacatgcaatttcaccaacagcaattcaattatcattaatttcatgcattcaaacatatcatcatagtta |
25758413 |
T |
 |
| Q |
212 |
gagcacgaatttcatcacatatgaacaattaat |
244 |
Q |
| |
|
| |||||||||| | || |||||||||||||| |
|
|
| T |
25758414 |
gggcacgaattttaacatgtatgaacaattaat |
25758446 |
T |
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Target: chr8; HSP #28
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301 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||| |||||| |
|
|
| T |
31194340 |
aattagagcacgaattctaacaatcatgaacaattaatcaattactc-aattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttgcactaaaaatgatta |
31194243 |
T |
 |
| Q |
302 |
tgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31194242 |
tgatgaaaactaacccccttacctta |
31194217 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #29
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128 |
tttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatc |
227 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| ||| || |||||| |||| || ||||||||| | | |
|
|
| T |
23151928 |
tttcatacaatttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcactagtttcatgcattcaaatatatcatcataattggaacacgaattttaac |
23151829 |
T |
 |
| Q |
228 |
acatatgaacaattaatca |
246 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23151828 |
aaatatgaacaattaatca |
23151810 |
T |
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Target: chr8; HSP #30
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| Q |
193 |
aaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta |
267 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||| || || |||||||||||||| |
|
|
| T |
27233120 |
aaacatatcatcataattagagcacgaatttcaacaactatgaactaataatcactt-attcaattaagcactta |
27233047 |
T |
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Target: chr8; HSP #31
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296 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
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|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
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|
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274767 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc |
274804 |
T |
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Target: chr8; HSP #32
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| Q |
296 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
641082 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc |
641045 |
T |
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Target: chr8; HSP #33
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| Q |
296 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
826888 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc |
826851 |
T |
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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24716793 - 24716756
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| Q |
296 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24716793 |
tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc |
24716756 |
T |
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Target: chr8; HSP #35
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140 |
tgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
239 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||| |||| | || |||||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
38635731 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgtattcaaacatatcatgataactagagcacgaatttcaacaactatgaacaa |
38635632 |
T |
 |
| Q |
240 |
ttaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattat-gatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
| ||| || || ||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||| | |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38635631 |
agattcactt-attcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttacctta |
38635541 |
T |
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Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 332
Target Start/End: Original strand, 39115599 - 39115635
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| Q |
296 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattat |
332 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
39115599 |
tgattatgatgaaaactaacacccttaccttaattat |
39115635 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0480 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:
Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
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Target Start/End: Complemental strand, 5378 - 5143
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taattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcataca |
189 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5378 |
taattcaccaattgagcatattttcg-cacatacctattttcatacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcataca |
5281 |
T |
 |
| Q |
190 |
tctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaatta |
289 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5280 |
tctaaacatctcatcataataagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaatta |
5181 |
T |
 |
| Q |
290 |
caaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5180 |
gaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
5143 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 9018 - 8776
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| Q |
86 |
agcataattca-ccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
9018 |
agcataattcaaccaattgagcatatat-caacatatatc-attttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
8921 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattga |
283 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
8920 |
atacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattttcccaattaagcacttattcatac-aataattga |
8822 |
T |
 |
| Q |
284 |
aaat--tacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8821 |
aattgcaccaaaaatgattatgatgaactctaacccccttacctta |
8776 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0359 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:
Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 11789 - 11548
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| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11789 |
gcataattcactaattgagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgtaattcaaccaagaacaattcaattattcataacttcat |
11690 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11689 |
acatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaa |
11590 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11589 |
ttacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
11548 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Original strand, 1428 - 1667
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| Q |
86 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1428 |
agcataattcaccaattaagcatattttcatcacatacccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaaccaccaacaattcaattatccataacttc |
1525 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaa |
284 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
1526 |
atacatctaaacatgtcatcatgattagagcacgaatttcatcatttatacacaattaatcaattcattcaattaaccacttttcatacaaataattg-- |
1623 |
T |
 |
| Q |
285 |
aattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1624 |
aattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttgcctta |
1667 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22403245 - 22403005
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| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22403245 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgtaattcaactaaca-caatttaattattcataacttcat |
22403147 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22403146 |
acatctagacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaa |
22403047 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22403046 |
ttacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
22403005 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 87 - 320
Target Start/End: Original strand, 41212184 - 41212415
Alignment:
| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
185 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| | ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41212184 |
gcataattcactaattgagcatattttta-cacatacccatttttcatac--tttgaacatacagttcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
41212280 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
285 |
Q |
| |
|
||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41212281 |
tacctctaaacaggtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaaacacttatcatacaaataattgaaa |
41212380 |
T |
 |
| Q |
286 |
attacaaaagtgattatgatgaacactaaccccct |
320 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
41212381 |
attacaaaagtgattatgatgaattctaaccccct |
41212415 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 89 - 327
Target Start/End: Original strand, 49967764 - 49968002
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| Q |
89 |
ataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatac |
188 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49967764 |
ataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttt-tataatttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatac |
49967862 |
T |
 |
| Q |
189 |
atctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaatt |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
49967863 |
atctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatgatttttgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatgcaaataattgaaaatt |
49967962 |
T |
 |
| Q |
289 |
acaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49967963 |
acaataagtgattacgatgaattctaacccccttacctta |
49968002 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Original strand, 35054867 - 35055108
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86 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35054867 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
35054964 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaa |
284 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35054965 |
atacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaattaaatcatttatgaacaattaaccaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaa |
35055064 |
T |
 |
| Q |
285 |
aat-tacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
35055065 |
aatagaaataagtgattatgatgaattttaacccccttacctta |
35055108 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 9784200 - 9783959
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86 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatcta-ttttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | || |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
9784200 |
agcataattcaccaattaagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtaattcaatcaacaacaattcaattatccataacttc |
9784103 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaa |
284 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |
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| T |
9784102 |
atacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcacttatgaacaatttatcaattcacccaattaagcacttttcataccaataattgaa |
9784003 |
T |
 |
| Q |
285 |
aattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9784002 |
aattgcagtaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
9783959 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
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Target Start/End: Original strand, 21718339 - 21718537
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184 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21718339 |
agcataattcaccaattgagcatattttgaacacataccaatttctcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
21718436 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaa |
284 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
21718437 |
atacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatccatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaa |
21718535 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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248 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
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|
| T |
35522426 |
aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaat |
35522327 |
T |
 |
| Q |
249 |
tcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
35522326 |
tcacccaattaagcccttttcatacaaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaactcccttacctta |
35522247 |
T |
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Target: chr1; HSP #8
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acaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaatt |
258 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| | |||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| | |||| |
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|
| T |
13376923 |
acaacaatttaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgattctcatcatctatgaacaattaatcaatt-actaaatt |
13376825 |
T |
 |
| Q |
259 |
aagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13376824 |
aagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatc |
13376746 |
T |
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Target: chr1; HSP #9
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Target Start/End: Original strand, 19603238 - 19603449
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acatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagc |
215 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||| |||||| ||||| |||| |||| |
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| T |
19603238 |
acatatatc-attttcatatactttgatcattcaatttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttcatacattcaaacataacatcataattggagc |
19603336 |
T |
 |
| Q |
216 |
acgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacac |
311 |
Q |
| |
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|||||||| | || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| | |
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| T |
19603337 |
acgaattttaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aataattgaaaatttgcactaaa-tgattatgatgaattc |
19603433 |
T |
 |
| Q |
312 |
taacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19603434 |
tagcccccttacctta |
19603449 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
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Target Start/End: Original strand, 20177286 - 20177535
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86 |
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184 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| | ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||| |
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| T |
20177286 |
agcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttc |
20177383 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg- |
282 |
Q |
| |
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| ||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| |||||||| |
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| T |
20177384 |
gtgcattaaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttaaacatac-aataattga |
20177481 |
T |
 |
| Q |
283 |
aaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20177482 |
aaaattacactaaaatgattatgattgaattctaaccccattaccttaattatc |
20177535 |
T |
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Target: chr1; HSP #11
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Target Start/End: Complemental strand, 22143448 - 22143256
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actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| | || ||||| |
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|
| T |
22143448 |
actttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcacaaatttcatgcatacaaacacatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatga |
22143349 |
T |
 |
| Q |
236 |
acaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |
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|
| T |
22143348 |
acaattaatc-atttatccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaa-ccccttacctta |
22143256 |
T |
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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27329891 - 27329757
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agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| | ||||||| ||| | || || ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
27329891 |
agcataattcaccaattgagcatattttca-cataacccacttttcacatactttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattat-cataacttca |
27329794 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatt |
222 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27329793 |
tatatacaaacatgtcatcataattggagcacgaatt |
27329757 |
T |
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Target: chr1; HSP #13
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Target Start/End: Original strand, 21195164 - 21195368
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| Q |
126 |
attttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttca |
225 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
21195164 |
attttcacatactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaatttta |
21195263 |
T |
 |
| Q |
226 |
tcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaaccccctt |
321 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| || || ||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| || ||||||||| |||| |||| |||||| |
|
|
| T |
21195264 |
acaactatgaacaattaatcactt-attcaattaagcacttaaacatacaacaaatgaaaaattacaactaaatgattatgattgaattctaaacccctt |
21195362 |
T |
 |
| Q |
322 |
acctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
21195363 |
acctta |
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T |
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Target: chr1; HSP #14
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aacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaat |
257 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||| || ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
16656820 |
aacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaat |
16656918 |
T |
 |
| Q |
258 |
taagcactta-tcatacaaataattgaaaatta----caaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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taagcacttattcatac-aacaattgaaaattaacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16656992 |
T |
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Target: chr1; HSP #15
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| Q |
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actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| || |||| ||||| |||||| | |||||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| | || ||||| |
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|
| T |
16646072 |
actttgaacatgaaattttaccaacatcaattaaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatga |
16646171 |
T |
 |
| Q |
236 |
acaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16646172 |
acaattaatcaattactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16646266 |
T |
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Target: chr1; HSP #16
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ttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaatta |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||| || || |
|
|
| T |
37233970 |
ttcaacatatatc-actttcatatactttgaacatgcaattttaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataacta |
37233872 |
T |
 |
| Q |
212 |
gagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tga |
307 |
Q |
| |
|
|||||||||| | || ||| |||||||| ||| || | ||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| |
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|
| T |
37233871 |
aagcacgaattctaacaactattaacaattactcactt-actcaattaagcacttaataatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattga |
37233774 |
T |
 |
| Q |
308 |
acactaacccccttaccttaatta |
331 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37233773 |
attctaacccccttaccttaatta |
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T |
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Target: chr1; HSP #17
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attttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttca |
225 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |
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|
| T |
8538007 |
attttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataatcaaagcacgaatttca |
8537908 |
T |
 |
| Q |
226 |
tcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaaccccctt |
321 |
Q |
| |
|
|| |||||| | ||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
8537907 |
acaaccatgaacgaataatcaatt-attcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaattctaactccctt |
8537809 |
T |
 |
| Q |
322 |
acctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
8537808 |
acctta |
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T |
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Target: chr1; HSP #18
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126 |
attttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttca |
225 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
8603246 |
attttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataatcaaagcacgaatttca |
8603147 |
T |
 |
| Q |
226 |
tcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaaccccctt |
321 |
Q |
| |
|
|| |||||| | ||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
8603146 |
acaaccatgaacgaataatcaatt-attcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaattctaactccctt |
8603048 |
T |
 |
| Q |
322 |
acctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
8603047 |
acctta |
8603042 |
T |
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Target: chr1; HSP #19
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tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
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Q |
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|
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tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
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Q |
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|
|
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tgatcatgatgaaaactaacccccttaccttaattatc |
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tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
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| Q |
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tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
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Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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Target: scaffold0011 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
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Q |
| |
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|
|
| T |
254949 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgtaattcaacta-caacaattcaattattcataacttcat |
254851 |
T |
 |
| Q |
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acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
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Q |
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| T |
254850 |
acatctaagcatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattcatccaattaaacacttatcatacaaataattg-aaa |
254752 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
254751 |
ttacaataagtgattatgatgaattatatcccccttacctta |
254710 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 261555 - 261316
Alignment:
| Q |
87 |
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186 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
261555 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgtaattcaacta-ctacaattcaattattcataacttcat |
261457 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
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|
| T |
261456 |
acatctaagcatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattcatccaattaaacacttatcatacaaataattg-aaa |
261358 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
261357 |
ttacaataagtgattatgatgaattatatcccccttacctta |
261316 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0740 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0740
Description:
Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Original strand, 4397 - 4635
Alignment:
| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
4397 |
gcataattcaccaattgaacatattttca-cacatacccattttcatacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataatttgat |
4494 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
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|
| T |
4495 |
acatctaaacatgtcattataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
4594 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4595 |
ttacaaacgtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
4635 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 4)
Name: scaffold0016
Description:
Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Original strand, 164327 - 164565
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| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
164327 |
gcataattcaccaattgagcatatcttca-cacatacccattttcatacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcat |
164424 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
164425 |
acatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcacttatgaaaaattaatcaattcatccaattaagcacttaccatacaattaattgaaaa |
164524 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
164525 |
ttacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
164565 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 162109 - 162072
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296 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
162109 |
tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatc |
162072 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 166195 - 166158
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| Q |
296 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
166195 |
tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatc |
166158 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 291 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 116487 - 116445
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| Q |
291 |
aaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
116487 |
aaaaatgattatgatgaaatctaacccccttaccttaattatc |
116445 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0447 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:
Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Original strand, 4674 - 4913
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| Q |
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agcataattca-ccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataactt |
183 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
4674 |
agcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataactt |
4771 |
T |
 |
| Q |
184 |
catacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattga |
283 |
Q |
| |
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|
|
| T |
4772 |
catacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattga |
4871 |
T |
 |
| Q |
284 |
aaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
4872 |
aaattac--aagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
4913 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Original strand, 9288 - 9527
Alignment:
| Q |
86 |
agcataattca-ccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataactt |
183 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
9288 |
agcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataactt |
9385 |
T |
 |
| Q |
184 |
catacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattga |
283 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
9386 |
catacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattga |
9485 |
T |
 |
| Q |
284 |
aaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9486 |
aaattac--aagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
9527 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0383 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:
Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Original strand, 7283 - 7522
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| Q |
86 |
agcataattca-ccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataactt |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7283 |
agcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataactt |
7380 |
T |
 |
| Q |
184 |
catacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattga |
283 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
7381 |
catacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattga |
7480 |
T |
 |
| Q |
284 |
aaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7481 |
aaattac--aagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
7522 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0396 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:
Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 11843 - 11603
Alignment:
| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatcta-ttttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
185 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11843 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaactaatacccatttttcat--actttgaacatgtaattcatccaacaacaattcaattattcataacttca |
11746 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
285 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
11745 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagtacaaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
11646 |
T |
 |
| Q |
286 |
attacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
11645 |
attacaataagtgattatgatgaattctaacccccttagctta |
11603 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:
Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Original strand, 22803 - 23043
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| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22803 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcaaaacttca |
22900 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
285 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22901 |
tacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttgatacaaataattgaaa |
23000 |
T |
 |
| Q |
286 |
attacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23001 |
attacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
23043 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Original strand, 18570390 - 18570630
Alignment:
| Q |
86 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
18570390 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatac--tttgaacatgtaatttaactaataacaattcaattatccataacatc |
18570487 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaa |
284 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18570488 |
atacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaa |
18570587 |
T |
 |
| Q |
285 |
aattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18570588 |
aattacaaaattgattatgatgaattctaacccccttacctta |
18570630 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Original strand, 32898902 - 32899142
Alignment:
| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32898902 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
32898999 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
285 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
32899000 |
tacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcaccaaattaagcacttttcataccaataattgaaa |
32899099 |
T |
 |
| Q |
286 |
attacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32899100 |
attacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
32899142 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Original strand, 22441046 - 22441285
Alignment:
| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
185 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||| ||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22441046 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaactcatacccatttttcatac--ttttaacatgtaattcaccccatcacaattcaattattcataacttca |
22441143 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
285 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22441144 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagtacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattcactcaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
22441243 |
T |
 |
| Q |
286 |
attacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22441244 |
attgcaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
22441285 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13014844 - 13014603
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| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13014844 |
gcataattcaccaattgagcatatttccaactcatacccatttttcatac---ttcaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttca |
13014748 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaa--ataattga |
283 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
13014747 |
tacatctaaacatgtcatcataattaaagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaatttagcacttttcatacaaacataattga |
13014648 |
T |
 |
| Q |
284 |
aaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13014647 |
aaattacaataagtgattatgataaattctaacccccttacctta |
13014603 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 89 - 327
Target Start/End: Original strand, 16086131 - 16086369
Alignment:
| Q |
89 |
ataattcaccaattgagcatattttcaacatatatcta-ttttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcata |
187 |
Q |
| |
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|||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | ||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
16086131 |
ataattcaccaattaagcatattttcaacacatacccatttttcgt--actttgaacatgtaattcaacaaacaacaattcaattatccataacttcata |
16086228 |
T |
 |
| Q |
188 |
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287 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16086229 |
catctaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaattaattgaaaat |
16086328 |
T |
 |
| Q |
288 |
tacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16086329 |
tgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16086369 |
T |
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Target: chr6; HSP #6
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Target Start/End: Original strand, 16106630 - 16106868
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187 |
Q |
| |
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|||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16106630 |
ataattcaccaattaagcatattttcaacacatactcatttttcatac--tttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccataacttcata |
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T |
 |
| Q |
188 |
catctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaat |
287 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16106728 |
catctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttacgaacaattaattaattcactcaattaagcacttttcatacaattaattgaaaat |
16106827 |
T |
 |
| Q |
288 |
tacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16106828 |
tgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16106868 |
T |
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Target: chr6; HSP #7
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Target Start/End: Original strand, 18432754 - 18432994
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184 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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agcataattcaccaattaagcatattttcaacatacacccatttttcatac--ttttaacatgtaattcaatcaacaacaattcaagtattcataacttc |
18432851 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaa |
284 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18432852 |
atacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaaataatcaattcacccaattaagctcttttcatac-aataattgaa |
18432950 |
T |
 |
| Q |
285 |
aa-ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|| || ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18432951 |
aatttgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
18432994 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Original strand, 18777257 - 18777481
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86 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18777257 |
agcataattcaccaattgaacatattttcaacacatacccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
18777354 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaa |
284 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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atacatctaaacatgtcatcataattagaacacgaatttcatcttttatgaa-----------------caattaagcacttttcatacaaataattgaa |
18777437 |
T |
 |
| Q |
285 |
aattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18777438 |
aattccaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
18777481 |
T |
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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 86 - 260
Target Start/End: Original strand, 31628379 - 31628552
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| Q |
86 |
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184 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
31628379 |
agcataattcaccaattaagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatcaataacttc |
31628476 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaa |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
31628477 |
atacatctaaacatgtaatcataattcgaatacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaa |
31628552 |
T |
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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Original strand, 18399049 - 18399290
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184 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
18399049 |
agcataattcaacaatttgagcatattt-caacatata-ctattttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttc |
18399146 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattga |
283 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| | || |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18399147 |
atgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattagtcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aataattga |
18399244 |
T |
 |
| Q |
284 |
aaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18399245 |
aatttacactaaaatgattatgaagaattctaacccccttacctta |
18399290 |
T |
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Target: chr6; HSP #11
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Target Start/End: Complemental strand, 22361830 - 22361654
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| Q |
158 |
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257 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | || ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| || | |||| |
|
|
| T |
22361830 |
aacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttatcatctatgaacaattaatcatttgct-caat |
22361732 |
T |
 |
| Q |
258 |
taagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| || ||||| |||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22361731 |
taagcacttattcatac-aacaattgaaaaattactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatc |
22361654 |
T |
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Target: chr6; HSP #12
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Query Start/End: Original strand, 112 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 17083307 - 17083093
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| Q |
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ttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaatta |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| || | ||||| ||| |||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
17083307 |
ttcaacatatatc-attttcacatactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattat-caccaattcatgcattcaaacatatcatcataatta |
17083210 |
T |
 |
| Q |
212 |
gagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatgatgaac |
309 |
Q |
| |
|
|||||||||| | | || |||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || |||||| ||||| |
|
|
| T |
17083209 |
gagcacgaatattaacaactatgaacaattaatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattaaaatgaat |
17083111 |
T |
 |
| Q |
310 |
actaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17083110 |
tctaacccccttacctta |
17083093 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 327
Target Start/End: Original strand, 33324874 - 33325046
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aacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaat |
257 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | || ||||| ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
33324874 |
aacaacaattcaattatcaacaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcaatt-atccaat |
33324972 |
T |
 |
| Q |
258 |
taagcactta-tcatacaaataattgaa--aattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||| | |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33324973 |
taatcacttattcatac-attaattgaaataattacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
33325046 |
T |
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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
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Target Start/End: Complemental strand, 18629695 - 18629502
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234 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| | || |||| |
|
|
| T |
18629695 |
actttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattat-catcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatg |
18629597 |
T |
 |
| Q |
235 |
aacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18629596 |
aacaattaatcactt-attcaattaaacacttaatcatacaacaaataaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta |
18629502 |
T |
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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 17557104 - 17556909
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actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| | || ||||| |
|
|
| T |
17557104 |
actttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatc-aaacatatcatcataattagagcacgaattt-aacaactatga |
17557007 |
T |
 |
| Q |
236 |
acaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaaaag-tgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
331 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| || ||||||||||||| || || ||| |||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17557006 |
acaaataatcaatt-attcaattaagcacttaataatgcaattaatgaaaaattacactagatgattatgattgaattctaacccccttaccttaatta |
17556909 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 333
Target Start/End: Original strand, 21623279 - 21623528
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agcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| | ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
21623279 |
agcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatc-actttctcatactttgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaacttc |
21623376 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattga |
283 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||| |
|
|
| T |
21623377 |
atgcattcaaacataccatcataattggagcacgaattctaacatttatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattga |
21623474 |
T |
 |
| Q |
284 |
-aaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21623475 |
gaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatc |
21623528 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
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Target Start/End: Complemental strand, 25367280 - 25367130
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aacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaat |
277 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
25367280 |
aacttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattgctc-aattaagcacttattcatacaa-t |
25367183 |
T |
 |
| Q |
278 |
aattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25367182 |
aattgaaaatttacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
25367130 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 35136078 - 35135906
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158 |
aacaacaattcaattattcat-aacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||| || |
|
|
| T |
35136078 |
aacaacaattcaattat-catcaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcaatt-atctaa |
35135981 |
T |
 |
| Q |
257 |
ttaagcactta-tcatacaaataattg--aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35135980 |
ttaatcacttattcatac-aataattgaaaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
35135906 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 21411185 - 21410944
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86 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| | | |||| | ||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
21411185 |
agcataattcacaatttgagcatattt-caacatatacc-actttctcatactttgaacatgaaatttatttaacaaccattcaattatcaacaacttca |
21411088 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaa |
284 |
Q |
| |
|
| ||| | |||| ||||| |||| |||||| |||| | | |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||| |
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|
| T |
21411087 |
tgcattcatacataacatcataattggagcacaaattctaacgattatgaacaattagtcaattcctc-aattaagcacttattcatacaa-taattgaa |
21410990 |
T |
 |
| Q |
285 |
aatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21410989 |
aatttacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
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Query Start/End: Original strand, 134 - 327
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acactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcat-aacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacata |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| | || ||||||| ||||||||| ||| || ||||| ||| |||||| | |||| | ||||||||||||||| | || || |
|
|
| T |
16887881 |
acactttgaacatgcaaattcaccaacaacagttcaattat-catcaatttcatgcatacaaacatattatcatagttagagcacgaattttaacatcta |
16887783 |
T |
 |
| Q |
233 |
tgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
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Q |
| |
|
|||||||||||||| || || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16887782 |
tgaacaattaatcattt-attcaattaatcacttattcatacaa-taattgaaaaattatactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16887685 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
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Target Start/End: Complemental strand, 15079797 - 15079606
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233 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| | || ||| |
|
|
| T |
15079797 |
acactttgaacatgcaatttcac-aacaacaattcaattatcctcaacttcatgcat-acaacatatcatcctagttagagcacgaattt-aacatctat |
15079701 |
T |
 |
| Q |
234 |
gaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| |||||||||| | |||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15079700 |
gaataattaatcaatt-atccaattaatcccttattcata-aaataattgaaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaa-ccccttacctta |
15079606 |
T |
 |
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Target: chr6; HSP #22
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Query Start/End: Original strand, 296 - 333
Target Start/End: Original strand, 18583641 - 18583678
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Q |
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T |
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Target: chr6; HSP #23
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Target Start/End: Original strand, 29605632 - 29605739
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257 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| || || |||| |
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|
| T |
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aacaacaattcaattatcactaa-ttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaatttcaacaactatgaacaaataatcactt-attcaat |
29605729 |
T |
 |
| Q |
258 |
taagcactta |
267 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
29605730 |
taagcactta |
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T |
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Target: chr6; HSP #24
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| Q |
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tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
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Q |
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T |
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Target: chr6; HSP #25
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209 |
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305 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| | |
|
|
| T |
33538384 |
ttagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgatt |
33538286 |
T |
 |
| Q |
306 |
gaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33538285 |
gaattctaacccccttacctta |
33538264 |
T |
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Target: chr6; HSP #26
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| Q |
296 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
35015088 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc |
35015051 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
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Query Start/End: Original strand, 155 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28195161 - 28195101
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| Q |
155 |
actaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagc |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||| |||| |
|
|
| T |
28195161 |
actaacaacaattcaattatcaacaacttcatacattcaaacatatcatcataattggagc |
28195101 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0068 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:
Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
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Target Start/End: Original strand, 48260 - 48496
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cataattcaccaattgagcatattttcaacatatatcta-ttttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
48260 |
cataattcaccaattgagcatatttt-aacacatacccatttttcat--actttgaacataaaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcat |
48356 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48357 |
acatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
48456 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
48457 |
ttacaaaagtgattatgataaattctaa-ccccttacctta |
48496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 88 - 327
Target Start/End: Original strand, 61708 - 61944
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| Q |
88 |
cataattcaccaattgagcatattttcaacatatatcta-ttttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
61708 |
cataattcaccaattgagcatatttt-aacacatacccatttttcat--actttgaacataaaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcat |
61804 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
61805 |
acatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
61904 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
61905 |
ttacaaaagtgattatgataaattctaa-ccccttacctta |
61944 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0673 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:
Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 957 - 717
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| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatcta-ttttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
185 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
957 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaactcatacccatttttcat--actttgaacatgtaattcatctaacaacaatccaattattcataacttca |
860 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
285 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
859 |
tacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacatatgaacaatcaatcaattcactcaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
760 |
T |
 |
| Q |
286 |
attacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
759 |
attacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
717 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 87 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 6980 - 6749
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| Q |
87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
6980 |
gcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattttcatacactctgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaactattcataacttcat |
6882 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6881 |
acatctaaacatgtcctcgtaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactgatcatacaaataattgaaaa |
6782 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttacaa-aagtgattatgatgaacactaacccc |
318 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
6781 |
ttgcaataagtgattatgatgaattctaacccc |
6749 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0310 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:
Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 88 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 248 - 4
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| Q |
88 |
cataattcaccaattgagcatattttcaacatatatcta-ttttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | | || |||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
248 |
cataattcacgaattaagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtatttcaactaacaacaatccaattatccataacttcat |
151 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
150 |
acatctaaacatgtcatcataaatatagcacgaatttcatcatttattaacatttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
51 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50 |
ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
4 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 88 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6542 - 6298
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| Q |
88 |
cataattcaccaattgagcatattttcaacatatatcta-ttttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | | || |||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6542 |
cataattcacgaattaagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtatttcaactaacaacaatccaattatccataacttcat |
6445 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6444 |
acatccaaacatgtcatcataaatatagcacgaatttcatcatttatgaacagttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
6345 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6344 |
ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
6298 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0158 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:
Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 88 - 327
Target Start/End: Original strand, 25324 - 25563
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| Q |
88 |
cataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcata |
187 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25324 |
cataattcaccaattgagcatattttcaacatataccc-ttttcctacacttgaaacatgaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttcata |
25422 |
T |
 |
| Q |
188 |
catctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaat |
287 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25423 |
catccaaacatgtcatcataaatagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaat |
25522 |
T |
 |
| Q |
288 |
tacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25523 |
tgcaataagtgattatgatgaagactaacccccttacctta |
25563 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 88 - 228
Target Start/End: Original strand, 25071 - 25210
Alignment:
| Q |
88 |
cataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcata |
187 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25071 |
cataattcaccaattgagcatattttcaacatataccc-ttttcctacacttgaaacatgaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttcata |
25169 |
T |
 |
| Q |
188 |
catctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatca |
228 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25170 |
catccaaacatgtcatcataaatagagcacaaatttcatca |
25210 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1867 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:
Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Original strand, 255 - 496
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| Q |
86 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
185 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
255 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccc-ttttcatacacttgaaacatgaatttcaaccaacaacaattcaattattcataacttca |
353 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
285 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
354 |
tacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaa |
453 |
T |
 |
| Q |
286 |
attacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
454 |
attgcaataagtgattatgattaattctaacccccttacctta |
496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0160 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:
Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Original strand, 132 - 370
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86 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattt-tcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
132 |
agcataattcacgaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatac--tttgaacatgcaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttc |
229 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaa |
284 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
230 |
atacatctaaacatgtcatc---attagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaa |
326 |
T |
 |
| Q |
285 |
aattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
327 |
aattgcaataagtgattatgatgaagactaacccccttacctta |
370 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:
Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 132385 - 132144
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87 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
132385 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatac--tttgaacatataattcaacaaacaacaattcaattatccataacttca |
132288 |
T |
 |
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186 |
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284 |
Q |
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132188 |
T |
 |
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327 |
Q |
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| T |
132187 |
aattgcaataagtgattatgatgaattccaacccccttacctta |
132144 |
T |
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184 |
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| |
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88483 |
T |
 |
| Q |
185 |
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284 |
Q |
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| T |
88484 |
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88583 |
T |
 |
| Q |
285 |
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331 |
Q |
| |
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| T |
88584 |
aatagcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctttatta |
88631 |
T |
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Target: scaffold0021; HSP #3
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184 |
Q |
| |
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11798 |
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11896 |
T |
 |
| Q |
185 |
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283 |
Q |
| |
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| T |
11897 |
atacattgaaacatgtcatcataattagagcacgaaattcatcatttatgaacaattaatcaattgacccaattaagcacttattcatac-aataattga |
11995 |
T |
 |
| Q |
284 |
aaat--tacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|| | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |
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|
| T |
11996 |
aattgcaccaaaaatgattatgatgaattctaaccaccttacctta |
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T |
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Q |
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| T |
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caatggagcatattttcaactcatatc-attttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaaca |
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T |
 |
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293 |
Q |
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| T |
16121 |
tgtcatcataattagagcacggatttcatcatttatgaacaaattaatcaattcacccaattaagcacttgttcatac-aataattgaaattgcaccaaa |
16219 |
T |
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| Q |
294 |
agtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
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| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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| T |
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aatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16253 |
T |
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caattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaaca |
197 |
Q |
| |
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| T |
25553 |
caatggagcatattttcaactcatatc-attttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattaaaaca |
25651 |
T |
 |
| Q |
198 |
tgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaac-aattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaat--tacaaa |
293 |
Q |
| |
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| T |
25652 |
tgtcatcataattagagcacggatttcatcatttatgaacaaattaatcaattcacccaattaagcacttgttcatac-aataattgaaattgcaccaaa |
25750 |
T |
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| Q |
294 |
agtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
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| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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| T |
25751 |
aatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
25784 |
T |
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Target: scaffold0190; HSP #1
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Q |
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T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
285 |
Q |
| |
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| T |
10147 |
tacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaagaattgaaa |
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T |
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| Q |
286 |
a-ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
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| || ||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
10247 |
atttgcaataatgattattatgaattctaacccccttacctta |
10289 |
T |
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Target: scaffold0240; HSP #1
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Q |
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gcataattcaccaattgagcatattttcatcatatacccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatttataacttca |
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T |
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| Q |
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tacatctaaacat-gtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaa |
284 |
Q |
| |
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| T |
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tacatctaaacataggcatcataattagatcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaa |
7878 |
T |
 |
| Q |
285 |
aattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |
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|
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7879 |
aattacaataagtaattatgatgaattctaacccccttacctta |
7922 |
T |
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Target: scaffold0816; HSP #1
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Q |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
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|
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attcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcatttatcata |
3016 |
T |
 |
| Q |
273 |
caaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3015 |
caaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
2961 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
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Target: scaffold0037; HSP #1
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184 |
Q |
| |
|
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| T |
24864 |
agcataattcaccaattgagcatatgttcaacacatacccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaatttaattatcaataacttc |
24767 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaa |
284 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
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| T |
24766 |
atacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatggacaattaatcaattcacctaattaagcacttttcatacaaataattgaa |
24667 |
T |
 |
| Q |
285 |
aattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24666 |
aatttcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
24623 |
T |
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Target: scaffold0022; HSP #1
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184 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
112681 |
agcataattcactaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattgttcataacttc |
112584 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-a |
283 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||| |||||||| | |
|
|
| T |
112583 |
atacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaaataagtacttttcatac-aataattgaa |
112485 |
T |
 |
| Q |
284 |
aaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
112484 |
aaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
112441 |
T |
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Target: scaffold0022; HSP #2
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Target Start/End: Complemental strand, 103009 - 102815
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actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| | || ||||| |
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|
| T |
103009 |
actttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaaaaacttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatga |
102910 |
T |
 |
| Q |
236 |
acaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
102909 |
acaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacacaaaaaatgattatgatgaattataaaccccttacctta |
102815 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
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Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
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Target Start/End: Original strand, 85443 - 85683
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agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattt-tcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
85443 |
agcataattcaccaattaagcatattttcaatatataccaatttctcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
85540 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-a |
283 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | |
|
|
| T |
85541 |
atacatccaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttataaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaa |
85639 |
T |
 |
| Q |
284 |
aaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
85640 |
aaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
85683 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014; HSP #2
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agcataattca-ccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
159410 |
agcataattcaaccaattgagcataatttcaactcatatc-attttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaatgccattatccataacttc |
159508 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-a |
283 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||| | |
|
|
| T |
159509 |
atacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcgtac-aataattgaa |
159607 |
T |
 |
| Q |
284 |
aaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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| T |
159608 |
aaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
159651 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 60917 - 61159
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agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |
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| T |
60917 |
agcataattcaccaattaagtatatttttaacacatacccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacatc |
61014 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-a |
283 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |
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|
| T |
61015 |
atacatctaaacatgttatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaa |
61114 |
T |
 |
| Q |
284 |
aaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
61115 |
aaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
61159 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 87 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 70757 - 70552
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
70757 |
gcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacctacttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaataaatcaattattcattaacttc |
70660 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaa |
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Q |
| |
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| T |
70659 |
atacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaactcatccaaataagcacttttcttacaaataattgaa |
70560 |
T |
 |
| Q |
285 |
aattacaa |
292 |
Q |
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|
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70559 |
aattacaa |
70552 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #3
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Query Start/End: Original strand, 188 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 79925 - 79785
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287 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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catctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaat |
79826 |
T |
 |
| Q |
288 |
tacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
79825 |
tacaatgagtgattatgatcaattctaacccccttagctta |
79785 |
T |
 |
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Target: scaffold0035 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:
Target: scaffold0035; HSP #1
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184 |
Q |
| |
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|
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118099 |
agcataattcaccaattgaacatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
118002 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-- |
282 |
Q |
| |
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| T |
118001 |
atacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcagccaattaagcacttttcatac-aataattgaa |
117903 |
T |
 |
| Q |
283 |
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327 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
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117902 |
aaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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Target: scaffold0035; HSP #2
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184 |
Q |
| |
|
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|
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agcataattcaccaatttatcatattttcaatatataccaatttctcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
109501 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-- |
282 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
109500 |
atacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcagccaattaagcacttttcatac-aataattgaa |
109402 |
T |
 |
| Q |
283 |
-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
109401 |
aaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
109356 |
T |
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Target: scaffold0338 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:
Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Original strand, 9098 - 9339
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184 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
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| T |
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agcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
9195 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-- |
282 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
9196 |
atacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaaaattaatcaattcactcaattaagcacttttcatac-aataattgaa |
9294 |
T |
 |
| Q |
283 |
aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9295 |
aaaattgcaataatgattatgataaattctaacccccttacctta |
9339 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:
Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
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Target Start/End: Original strand, 38410 - 38650
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186 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| | | |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38410 |
gcataattcgccaattgagcatattttcaacatatacccatttctcttc-ctttgaacatgtaattcaaccaacaaaaattcaattattcataaattcat |
38508 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
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| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
38509 |
aaatctaaacatgtcatcataattagagcgcgtatttcatcatttatgaacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaa |
38608 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38609 |
ttgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
38650 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0117 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:
Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 11704 - 11464
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86 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
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|
| T |
11704 |
agcataattcaccaattaagcatattttcaacacatacccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaatcaacaacaattcaattatccataacttc |
11607 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaa |
284 |
Q |
| |
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| T |
11606 |
atacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca-acaattaaacacttttcatacaaataattaaa |
11508 |
T |
 |
| Q |
285 |
aattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
11507 |
aattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccatacctta |
11464 |
T |
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Back To:
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Target: scaffold0120 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:
Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Original strand, 21623 - 21862
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185 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
21623 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatacc-attttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaatccaattat-cataacttca |
21720 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aa |
284 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
21721 |
tacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcgcccaattaagcctttttcatac-aataattgaaa |
21819 |
T |
 |
| Q |
285 |
aattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
21820 |
aattgcaataatgattatgatgaattataacccccttacctta |
21862 |
T |
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Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 89 - 327
Target Start/End: Original strand, 31325 - 31561
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89 |
ataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatac |
188 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31325 |
ataatttaccaattgagcatattttcaacatatacc-attttctcatactttgaacatttaattcaactaacaacaatccaattat-cataacttcatac |
31422 |
T |
 |
| Q |
189 |
atctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaat |
287 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
31423 |
atccaaacatgtcatcataattagatcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcgcccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaat |
31521 |
T |
 |
| Q |
288 |
tacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31522 |
tgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
31561 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 218 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 47554 - 47445
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| Q |
218 |
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316 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
47554 |
gaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcgcccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacc |
47456 |
T |
 |
| Q |
317 |
cccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
47455 |
cccttacctta |
47445 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:
Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
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Target Start/End: Complemental strand, 253125 - 252903
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184 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
253125 |
agcatgattcaccaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatac--tttgaaaatgtaattcaactaacaacaattcaattatccctaacttc |
253028 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaa |
284 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
253027 |
atacatccaaacatgtcatcataatcaaagcacgaattttatcatttatgcacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaa |
252928 |
T |
 |
| Q |
285 |
aattacaa-aagtgattatgatgaa |
308 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
252927 |
aattgcaataagtgattatgatgaa |
252903 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0554 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
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Target: scaffold0554; HSP #1
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agcataattca-ccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
2026 |
agcataattcaaccaattgagcatattttcatcatatacc-attttcgcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
2124 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-a |
283 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | |
|
|
| T |
2125 |
atacattcaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgagcaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaa |
2223 |
T |
 |
| Q |
284 |
aaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttac |
323 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2224 |
aaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttac |
2263 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:
Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
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Target Start/End: Original strand, 70724 - 70964
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agcataattca-ccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
70724 |
agcataattcaaccaattaagcatattttcaacatat-tccattttctcatactttgaacatg-aattcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
70821 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaa |
284 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
70822 |
atacatccaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttataaactattaattaattcacccaattaagcacttttcatac-aataactgaa |
70920 |
T |
 |
| Q |
285 |
aattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
70921 |
aattacaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
70964 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 99 - 286
Target Start/End: Original strand, 31168 - 31352
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198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
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31168 |
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T |
 |
| Q |
199 |
gtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
31266 |
gtcatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaaataatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaa |
31352 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0103 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:
Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Original strand, 33773 - 34014
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agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattt-tcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
33773 |
agcataattcaccaattaaacataatttcaacatataccaatttctcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatctataacttc |
33870 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattga |
283 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
33871 |
atacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttacgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttaatcatac-agtaattga |
33969 |
T |
 |
| Q |
284 |
aaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
33970 |
aaattgcaataaatgattatgatgaattctaatccccttacctta |
34014 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0876 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:
Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 210 - 333
Target Start/End: Original strand, 8 - 131
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210 |
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309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8 |
tagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaac |
107 |
T |
 |
| Q |
310 |
actaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
108 |
actaacccccttaccttaattatc |
131 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:
Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
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Target Start/End: Original strand, 46276 - 46521
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agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaatt-caactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| | ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
46276 |
agcataattcaccaattgagcatattttca-cataacccacttttcacatactttgatcatgaagtttcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
46374 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaa |
284 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || |
|
|
| T |
46375 |
atacatctaaacatgtcatcaaaattagagtacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattaaa |
46473 |
T |
 |
| Q |
285 |
aattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaatta |
331 |
Q |
| |
|
|||| ||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
46474 |
aattgcaataaatgattatgatgaattataaccctcttaccttaatta |
46521 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Original strand, 40769 - 41010
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86 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaatt-caactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| | ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
40769 |
agcataattcaccaattgagcatattttca-cataacccacttttcacatactttgatcatgaagtttcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
40867 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaa |
284 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || |
|
|
| T |
40868 |
atacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactattcatac-aataattaaa |
40966 |
T |
 |
| Q |
285 |
aattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
40967 |
aattgcaataaatgattatgatgaattataacccccttacctta |
41010 |
T |
 |
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Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
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Target Start/End: Original strand, 80188 - 80225
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| Q |
296 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
80188 |
tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc |
80225 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0610 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:
Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 712 - 471
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86 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
185 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
712 |
agcataattcaccaaatgagcatattttcaacatatacc-attttctcatactttgaacatgtaattcaattaacaacaattctattatccataatttca |
614 |
T |
 |
| Q |
186 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaa |
284 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
613 |
tacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttattcatac-aataattgaa |
515 |
T |
 |
| Q |
285 |
aatta-caa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|| || ||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
514 |
aaatagcaataaatga-tatgatgaattctaacccccttacctta |
471 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0075 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:
Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 88 - 266
Target Start/End: Original strand, 5054 - 5231
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88 |
cataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattt-tcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | || |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
5054 |
cataattcaccaattaagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tgtgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcat |
5151 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
5152 |
acatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaattaattcacccaattaagcactt |
5231 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0342 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:
Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 96 - 286
Target Start/End: Original strand, 6062 - 6251
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| Q |
96 |
accaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaa |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
6062 |
accaattgagcatattttcaacatataccatttttctcatactttgaacatgaaattctaccaacaacaatccaattatccataacttcatacattcaaa |
6161 |
T |
 |
| Q |
196 |
catgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
286 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
6162 |
catgtcgtcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcaccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaa |
6251 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:
Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 86 - 223
Target Start/End: Original strand, 146712 - 146848
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| Q |
86 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
146712 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacagttcaattatacataacttc |
146809 |
T |
 |
| Q |
185 |
atacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaattt |
223 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
146810 |
atacatctaaacatgtcatcataattaaagcatgaattt |
146848 |
T |
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Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 263
Target Start/End: Original strand, 85683 - 85818
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| Q |
126 |
attttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttca |
225 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
85683 |
attttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcat-taaacatatcatcataattagagcacgaatttca |
85781 |
T |
 |
| Q |
226 |
tcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagca |
263 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
85782 |
acaactatgaacaattaatcactt-attcaattaagca |
85818 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 331
Target Start/End: Original strand, 53506 - 53703
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| Q |
136 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||| |||||| ||||||||| ||||| | || ||||| |
|
|
| T |
53506 |
actttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgcattcaaacatatcatcattattagagcatgaattctaacaactatga |
53605 |
T |
 |
| Q |
236 |
acaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttacaa-aagtgattatgat-gaacactaacccccttaccttaatta |
331 |
Q |
| |
|
||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53606 |
acaattaatcacttactc-aattaagcacttaatcatacaa-taattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaatta |
53703 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0589 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:
Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 7927 - 8157
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| Q |
96 |
accaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaa |
195 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||| | | |||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
7927 |
accaattgagcatattttca-catatacc-actttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattataaataacttcatgcattcaaa |
8024 |
T |
 |
| Q |
196 |
catgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa- |
292 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
8025 |
cataacatcataattggagcacgaattctaacaaatatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aataattgtaaaattgcaat |
8122 |
T |
 |
| Q |
293 |
aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8123 |
aaatgattacgatgaattctaacccccttacctta |
8157 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0092 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:
Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 3441 - 3671
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| Q |
96 |
accaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaa |
195 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||| | | |||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
3441 |
accaattgagcatattttca-catatacc-actttctcatactttgaacattaaatttctctaacaacaattcaattataaataacttcatgcattcaaa |
3538 |
T |
 |
| Q |
196 |
catgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa- |
292 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
3539 |
cataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aataattgtaaaattgcaat |
3636 |
T |
 |
| Q |
293 |
aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3637 |
aaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
3671 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0053 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:
Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 76934 - 76734
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| Q |
136 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | || ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
76934 |
actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcatgaatttcatcatctatga |
76835 |
T |
 |
| Q |
236 |
acaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatt |
330 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | |||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
76834 |
acaattactcaatt-actcaattaagtacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaatt |
76737 |
T |
 |
| Q |
331 |
atc |
333 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
76736 |
atc |
76734 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0095 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:
Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 33864 - 33622
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| Q |
86 |
agcataattca-ccaattgagcatattttcaacatatatctatt-ttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataactt |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | || ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
33864 |
agcataattcaaccaatttagcatattt-caacatataacacttcttcatac--tttaaacatgaaattccactaacaacaattcaattatccacaactt |
33768 |
T |
 |
| Q |
184 |
catacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg |
282 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||| || ||||| |
|
|
| T |
33767 |
caagcattcaaacatgtcatcataattggagcatgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcatttattcatac-aacaattg |
33670 |
T |
 |
| Q |
283 |
aaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33669 |
aaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
33622 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:
Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 136 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 197340 - 197143
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| Q |
136 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
235 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| |||| || || || |
|
|
| T |
197340 |
actttgaacttgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatacattcaaacatatcatcataattagagcccgaaattcaacatctaaga |
197241 |
T |
 |
| Q |
236 |
acaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
331 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
197240 |
acaattaatcactt-atccaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaatta |
197143 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0123 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:
Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 136 - 327
Target Start/End: Original strand, 8170 - 8363
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| Q |
136 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcat-aacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatg |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| |||||| |||||| | ||||||||||||||| | || |||| |
|
|
| T |
8170 |
actttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattat-catcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatg |
8268 |
T |
 |
| Q |
235 |
aacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8269 |
aacaattaatc-atttatccaattaatcacttattcatac-aataattgaaaaattacattaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
8363 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0456 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:
Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 1611 - 1440
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158 |
aacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaat |
257 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
1611 |
aacaacaattcaattatcactaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatc-atttatccaat |
1513 |
T |
 |
| Q |
258 |
taagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1512 |
taagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaataattatgatgaattctaaaccccttacctta |
1440 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 8756 - 8585
Alignment:
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158 |
aacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaat |
257 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
8756 |
aacaacaattcaattatcactaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatc-atttatccaat |
8658 |
T |
 |
| Q |
258 |
taagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8657 |
taagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaataattatgatgaattctaaaccccttacctta |
8585 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:
Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 89952 - 89760
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acactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcat-aacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacata |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||| |||||| |||||| | || |||||||||||| | || || |
|
|
| T |
89952 |
acactttgaacatacaaattcac-aacaacaattcaagtat-catcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttaa-catcta |
89856 |
T |
 |
| Q |
233 |
tgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
89855 |
tgaacaattaatcaatt-atccaattaatcacttattcatacaa-taattgaaaattacactaaaaagattatgatgaattctaacccccttacctta |
89760 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0409 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:
Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
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Target Start/End: Complemental strand, 1458 - 1242
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| Q |
112 |
ttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaatta |
211 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||| || || || ||| |||||| |||||| | ||| |
|
|
| T |
1458 |
ttcatcatatatc-attttcacatactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagtta |
1360 |
T |
 |
| Q |
212 |
gagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgatga |
307 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
1359 |
gagcacgaattttaacatctatgaacaattaatc-atttatccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattacactaatatgattatgatga |
1262 |
T |
 |
| Q |
308 |
acactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1261 |
attctaacccccttacctta |
1242 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 112 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 9713 - 9497
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112 |
ttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaatta |
211 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||| || || || ||| |||||| |||||| | ||| |
|
|
| T |
9713 |
ttcatcatatatc-attttcacatactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagtta |
9615 |
T |
 |
| Q |
212 |
gagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgatga |
307 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
9614 |
gagcacgaattttaacatctatgaacaattaatc-atttatccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattacactaatatgattatgatga |
9517 |
T |
 |
| Q |
308 |
acactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9516 |
attctaacccccttacctta |
9497 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0700 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:
Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
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tttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatc |
227 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
2677 |
tttcatatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatccaaacatatcatcataattagagcacgaattttaac |
2776 |
T |
 |
| Q |
228 |
acatatgaacaattaatca |
246 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
2777 |
aactatgaacaattaatca |
2795 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:
Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
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258 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || | ||||| |
|
|
| T |
69640 |
acaacaattcaattataaccaatttcatgcatttaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcactttct-caatt |
69738 |
T |
 |
| Q |
259 |
aagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
331 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
69739 |
aagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttatcttaatta |
69814 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:
Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 7112 - 6912
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136 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
7112 |
actttgaacattaaatttcactaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttgacaattatga |
7013 |
T |
 |
| Q |
236 |
acaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
331 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||| | |||||||||||||| |||||||| | | ||||||||| ||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7012 |
acaacaaatc-atttactcaattaagcacttattcatacaacgattgaaaaattacattaaaatgattataattgaattctaacccccttaccttaatta |
6914 |
T |
 |
| Q |
332 |
tc |
333 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
6913 |
tc |
6912 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
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Target: scaffold0138; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 22518 - 22323
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acactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcat-aacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacata |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| | || || |
|
|
| T |
22518 |
acactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattat-catcaatttcatgcatacaaacatattatcctagttagagcacgaattttaacatcta |
22420 |
T |
 |
| Q |
233 |
tgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatta---caaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22419 |
tgaacaatcaatcaat-catccaattaatcacttattcatacaa-taattaaaaaataacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
22323 |
T |
 |
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Target: scaffold0058 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
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Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
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tatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt--acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || || |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
70298 |
tatgaacaattaatcaatt-atacatttaatcacttattcatacaa-taattgaaaatttcacaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
70201 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0389 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:
Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 327
Target Start/End: Original strand, 10879 - 11014
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aaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaattaca |
291 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| | ||||||||||||| | || |||||||||||||| | || |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
10879 |
aaacatatcatcatagatagagcacgaattataacatctatgaacaattaattattt-atccaattaatcacttattcatacaa-taattgaaaattata |
10976 |
T |
 |
| Q |
292 |
--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10977 |
ctaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
11014 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0091 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:
Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
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Target Start/End: Original strand, 32316 - 32373
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88 |
cataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacat |
146 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32316 |
cataattcaccaattgagcatattttcaa-acatacccattttcatacactttgaacat |
32373 |
T |
 |
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Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 41987 - 41930
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| Q |
88 |
cataattcaccaattgagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacat |
146 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41987 |
cataattcaccaattgagcatattttcaa-acatacccattttcatacactttgaacat |
41930 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0080 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:
Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
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| Q |
112 |
ttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaatta |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
43908 |
ttcaacatatatc-actttcatatcctttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatagcatcataatta |
43810 |
T |
 |
| Q |
212 |
gagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttacaa-aagtgattatgat-ga |
307 |
Q |
| |
|
||||| ||||| | || |||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| || |
|
|
| T |
43809 |
gagcattaattttaacaactatgaacaattaatcacttactc-aattaagcacttaatcatacaac-aattgaaaaattacactaaatgattatgattga |
43712 |
T |
 |
| Q |
308 |
acactaacccccttaccttaatta |
331 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43711 |
attctaacccccttaccttaatta |
43688 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0080; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 158 - 331
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| Q |
158 |
aacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaat |
257 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | || ||||| || |||||| ||| || ||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| || ||| |
|
|
| T |
23737 |
aacaacaattcaattatcaaaaatttcatgtatacaaacatatcaccataattaaagcacgaatttcaacaactatgaacaaataatcaatt-attcaac |
23639 |
T |
 |
| Q |
258 |
taagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
331 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
23638 |
taagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaatcattatgattgaattctaacccccttatcttaatta |
23562 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0013 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:
Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
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136 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| | | | ||| |
|
|
| T |
35638 |
actttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaataacttcatgcattcaaacatatcatcatgattggagcacgaattataagaactttga |
35737 |
T |
 |
| Q |
236 |
acaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatt |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||| || | ||||||||||| || |||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35738 |
acaattaatc-ttttactcaattaagcacctattcatac-aacaattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaatt |
35835 |
T |
 |
| Q |
331 |
atc |
333 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
35836 |
atc |
35838 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Description:
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200 |
tcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttacaa-aagt |
296 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || | |
|
|
| T |
31244 |
tcatcataattagagcacgaattctaacaactatgaacaattaatcacttactc-aattaagcacttaatcatacaa-taattgaaaaattacactaaat |
31341 |
T |
 |
| Q |
297 |
gattatgat-gaacactaacccccttaccttaatta |
331 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31342 |
gattatgattgaattctaacccccttaccttaatta |
31377 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Description:
Target: scaffold0387; HSP #1
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126 |
attttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttca |
225 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||| |||||| ||||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
1059 |
attttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagaacacgaatttta |
960 |
T |
 |
| Q |
226 |
tcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatgat-gaacactaaccccctt |
321 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |||||| || || ||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
959 |
acaactatgaacaaataatcactt-atttaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaaccccctt |
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T |
 |
| Q |
322 |
acctta |
327 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
860 |
acctta |
855 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0686 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:
Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 5808 - 5771
Alignment:
| Q |
296 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5808 |
tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatc |
5771 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6014 - 5977
Alignment:
| Q |
296 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6014 |
tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatc |
5977 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:
Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 654 - 617
Alignment:
| Q |
86 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatatat |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
654 |
agcataattcaccaaatgagcatattttcaacatatat |
617 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:
Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 93860 - 93728
Alignment:
| Q |
136 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttc-atcacatatg |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||| |||| ||||||||||||| | || |||| |
|
|
| T |
93860 |
actttgaacatgaaatttctctaacaaccattcaattatcaaaaacttcatgcatacatacatatcatcataattggagcacgaatttctaacagttatg |
93761 |
T |
 |
| Q |
235 |
aacaattaatcaattcatccaattaagcacttat |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
93760 |
aacaattaat-aatttacccaattaagcacttat |
93728 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:
Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 327
Target Start/End: Original strand, 79756 - 79891
Alignment:
| Q |
193 |
aaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattac |
290 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| | |||| |||||||||| | || ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
79756 |
aaacatatcatcatagttagtgcacgaattttagcatctatgaacaattaatc-atttatccaattaatcacttattcatac-aataattgaaaaattac |
79853 |
T |
 |
| Q |
291 |
a--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
327 |
Q |
| |
|
| ||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
79854 |
actaaaataattatgatgaattctaa-ccccttacctta |
79891 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0483 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:
Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 222
Target Start/End: Original strand, 6821 - 6907
Alignment:
| Q |
136 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatt |
222 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6821 |
actttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattatagcacgaatt |
6907 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0150 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:
Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 221
Target Start/End: Original strand, 28649 - 28781
Alignment:
| Q |
88 |
cataattcaccaatt-gagcatattttcaacatatatctattttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcat |
186 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| | |||||||||||| |||| || |||||||||||| |||| | || ||||| |
|
|
| T |
28649 |
cataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatc-actttctcatactttgaacatataatttcaccaacaacaattcagttatcaacaagttcat |
28746 |
T |
 |
| Q |
187 |
acatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaat |
221 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
28747 |
gcattcaaacatatcatcataattagagcacgaat |
28781 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:
Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 333
Target Start/End: Original strand, 30418 - 30455
Alignment:
| Q |
296 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
333 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30418 |
tgattatgatgaaaaataacccccttaccttaattatc |
30455 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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