View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17565_high_10 (Length: 400)

Name: NF17565_high_10
Description: NF17565
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17565_high_10
NF17565_high_10
[»] chr4 (55 HSPs)
chr4 (1-319)||(6864074-6864399)
chr4 (4-304)||(37663591-37663898)
chr4 (4-318)||(19089303-19089624)
chr4 (1-356)||(55477738-55478104)
chr4 (1-319)||(35020878-35021207)
chr4 (1-356)||(25184115-25184477)
chr4 (1-319)||(879395-879720)
chr4 (1-319)||(19440495-19440820)
chr4 (1-221)||(1815445-1815665)
chr4 (1-319)||(32912426-32912752)
chr4 (1-319)||(34361338-34361663)
chr4 (1-319)||(50697281-50697606)
chr4 (1-270)||(28002833-28003109)
chr4 (1-283)||(55240952-55241240)
chr4 (1-221)||(3042763-3042983)
chr4 (1-317)||(34947942-34948267)
chr4 (1-356)||(7703519-7703873)
chr4 (1-219)||(17173436-17173654)
chr4 (1-319)||(42199768-42200095)
chr4 (4-357)||(47253750-47254101)
chr4 (1-318)||(17167753-17168077)
chr4 (1-319)||(36493536-36493860)
chr4 (1-270)||(33341487-33341762)
chr4 (1-316)||(25700903-25701226)
chr4 (3-318)||(46888007-46888328)
chr4 (1-319)||(29584047-29584370)
chr4 (1-319)||(37775708-37776022)
chr4 (1-357)||(27396617-27396978)
chr4 (1-211)||(32579600-32579810)
chr4 (1-214)||(17272115-17272328)
chr4 (1-316)||(37287776-37288092)
chr4 (1-316)||(23761114-23761435)
chr4 (49-319)||(38011893-38012169)
chr4 (1-177)||(33816363-33816539)
chr4 (1-218)||(46883961-46884172)
chr4 (1-221)||(30002488-30002699)
chr4 (1-319)||(49376006-49376331)
chr4 (1-270)||(5047813-5048088)
chr4 (1-165)||(7152051-7152215)
chr4 (1-177)||(50764908-50765084)
chr4 (1-221)||(32592237-32592448)
chr4 (1-132)||(4205216-4205348)
chr4 (91-270)||(4934140-4934325)
chr4 (1-221)||(4598136-4598346)
chr4 (91-221)||(35025534-35025663)
chr4 (1-165)||(26896287-26896452)
chr4 (1-221)||(9139389-9139591)
chr4 (1-136)||(39400236-39400372)
chr4 (1-102)||(35025413-35025515)
chr4 (1-85)||(23431834-23431919)
chr4 (159-319)||(39397957-39398115)
chr4 (60-125)||(56050169-56050234)
chr4 (92-221)||(54499177-54499305)
chr4 (253-318)||(4205156-4205221)
chr4 (279-319)||(4396365-4396405)
[»] chr1 (54 HSPs)
chr1 (1-318)||(28564599-28564921)
chr1 (8-319)||(30326775-30327093)
chr1 (1-319)||(32216090-32216415)
chr1 (1-316)||(37451324-37451645)
chr1 (8-319)||(8222166-8222480)
chr1 (1-318)||(30254460-30254783)
chr1 (1-357)||(15752026-15752389)
chr1 (8-319)||(15382968-15383286)
chr1 (1-319)||(238329-238653)
chr1 (1-319)||(32267069-32267394)
chr1 (4-319)||(51128894-51129216)
chr1 (1-319)||(28769688-28770013)
chr1 (1-319)||(10922762-10923087)
chr1 (8-270)||(25160716-25160985)
chr1 (1-318)||(2959784-2960108)
chr1 (1-319)||(19899584-19899910)
chr1 (1-319)||(18422686-18423004)
chr1 (1-270)||(27227301-27227577)
chr1 (1-319)||(16415680-16416006)
chr1 (1-319)||(23999382-23999708)
chr1 (1-319)||(27763126-27763451)
chr1 (4-270)||(7078882-7079155)
chr1 (1-283)||(47279260-47279549)
chr1 (1-319)||(46931446-46931770)
chr1 (1-221)||(4330421-4330641)
chr1 (3-318)||(9902872-9903194)
chr1 (1-356)||(1547285-1547631)
chr1 (13-319)||(37618729-37619037)
chr1 (1-319)||(10181823-10182149)
chr1 (1-319)||(27563721-27564046)
chr1 (1-318)||(34012198-34012517)
chr1 (1-297)||(27267016-27267318)
chr1 (1-319)||(42721074-42721396)
chr1 (1-319)||(14758076-14758392)
chr1 (1-216)||(22170856-22171071)
chr1 (3-221)||(38823354-38823572)
chr1 (1-261)||(15168189-15168456)
chr1 (1-353)||(27532798-27533155)
chr1 (1-269)||(47682310-47682585)
chr1 (1-221)||(3535072-3535283)
chr1 (56-261)||(33725472-33725683)
chr1 (1-318)||(41926199-41926516)
chr1 (1-270)||(39393467-39393744)
chr1 (36-221)||(40884953-40885137)
chr1 (1-356)||(3309146-3309513)
chr1 (1-165)||(48353739-48353902)
chr1 (1-165)||(1359751-1359915)
chr1 (1-164)||(11742184-11742347)
chr1 (1-146)||(21289817-21289960)
chr1 (47-216)||(38759678-38759846)
chr1 (12-221)||(31621376-31621589)
chr1 (98-319)||(48620672-48620890)
chr1 (1-123)||(31962853-31962977)
chr1 (260-318)||(30254894-30254951)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (4-318)||(7927-8248)
[»] chr5 (56 HSPs)
chr5 (8-304)||(5829955-5830249)
chr5 (1-319)||(22255220-22255546)
chr5 (1-356)||(36866764-36867126)
chr5 (1-319)||(22973893-22974218)
chr5 (1-356)||(40133387-40133749)
chr5 (1-319)||(31705423-31705747)
chr5 (1-319)||(27318299-27318623)
chr5 (1-318)||(699190-699514)
chr5 (4-356)||(36860425-36860785)
chr5 (1-318)||(38528048-38528371)
chr5 (1-221)||(22980937-22981157)
chr5 (1-319)||(7208675-7208999)
chr5 (1-319)||(17157842-17158166)
chr5 (1-319)||(31786457-31786782)
chr5 (1-221)||(35504509-35504729)
chr5 (1-319)||(30969135-30969460)
chr5 (1-270)||(21088580-21088853)
chr5 (1-319)||(24886143-24886451)
chr5 (1-319)||(35826297-35826619)
chr5 (1-217)||(12910503-12910719)
chr5 (1-319)||(27330345-27330668)
chr5 (1-221)||(33908377-33908596)
chr5 (1-221)||(35511293-35511508)
chr5 (1-217)||(2888256-2888472)
chr5 (1-319)||(7693269-7693585)
chr5 (3-319)||(9200272-9200586)
chr5 (4-221)||(5837699-5837916)
chr5 (57-318)||(23116090-23116357)
chr5 (1-261)||(23954613-23954867)
chr5 (3-357)||(25500739-25501100)
chr5 (1-270)||(15992351-15992627)
chr5 (4-221)||(19120003-19120220)
chr5 (3-316)||(43308473-43308784)
chr5 (7-210)||(8437120-8437323)
chr5 (1-270)||(8741696-8741973)
chr5 (1-261)||(35933992-35934260)
chr5 (3-221)||(22019776-22019985)
chr5 (1-308)||(39572869-39573175)
chr5 (15-221)||(13956187-13956393)
chr5 (92-318)||(14919431-14919663)
chr5 (1-221)||(15724632-15724852)
chr5 (24-319)||(1428997-1429281)
chr5 (1-150)||(14409152-14409302)
chr5 (1-221)||(42342875-42343085)
chr5 (1-318)||(32563189-32563504)
chr5 (1-214)||(25669737-25669940)
chr5 (1-152)||(25889582-25889734)
chr5 (51-221)||(6824343-6824510)
chr5 (106-319)||(26268113-26268332)
chr5 (1-161)||(8466931-8467090)
chr5 (125-319)||(5112250-5112449)
chr5 (1-104)||(28416362-28416466)
chr5 (1-63)||(43254156-43254219)
chr5 (173-356)||(14409310-14409499)
chr5 (153-221)||(28416490-28416558)
chr5 (8-104)||(26269069-26269166)
[»] chr3 (59 HSPs)
chr3 (4-309)||(42505899-42506211)
chr3 (4-319)||(26941084-26941406)
chr3 (1-356)||(48354934-48355296)
chr3 (1-319)||(46297583-46297908)
chr3 (3-356)||(34132928-34133288)
chr3 (1-317)||(40552080-40552403)
chr3 (1-319)||(47481552-47481878)
chr3 (1-309)||(21009622-21009938)
chr3 (1-266)||(39282735-39283007)
chr3 (1-270)||(53228973-53229249)
chr3 (11-316)||(3655031-3655345)
chr3 (1-319)||(4761469-4761795)
chr3 (1-318)||(37203098-37203423)
chr3 (1-319)||(52040743-52041069)
chr3 (1-319)||(24488783-24489108)
chr3 (1-318)||(37157739-37158063)
chr3 (1-318)||(54505839-54506163)
chr3 (1-221)||(33378606-33378826)
chr3 (1-319)||(3362283-3362610)
chr3 (1-221)||(24707936-24708158)
chr3 (9-266)||(46994490-46994754)
chr3 (1-221)||(22622539-22622759)
chr3 (4-270)||(7327306-7327579)
chr3 (1-318)||(4015491-4015814)
chr3 (5-221)||(33698288-33698504)
chr3 (1-164)||(11357202-11357365)
chr3 (25-221)||(54828547-54828742)
chr3 (1-221)||(21193741-21193962)
chr3 (4-261)||(44891585-44891849)
chr3 (1-217)||(1089832-1090048)
chr3 (13-221)||(32373605-32373813)
chr3 (1-318)||(2007964-2008294)
chr3 (3-269)||(38591778-38592051)
chr3 (1-261)||(22451056-22451323)
chr3 (1-319)||(29099385-29099701)
chr3 (49-221)||(43348392-43348563)
chr3 (65-283)||(11466890-11467114)
chr3 (71-197)||(20373136-20373261)
chr3 (1-319)||(22445886-22446210)
chr3 (8-319)||(25579769-25580087)
chr3 (1-270)||(43975713-43975985)
chr3 (1-219)||(29163955-29164157)
chr3 (1-221)||(36012272-36012494)
chr3 (8-146)||(51212599-51212738)
chr3 (154-356)||(51212955-51213164)
chr3 (1-221)||(14586501-14586711)
chr3 (46-270)||(45174584-45174815)
chr3 (1-147)||(44186338-44186485)
chr3 (46-214)||(11835500-11835662)
chr3 (4-164)||(40936165-40936325)
chr3 (1-145)||(50475021-50475173)
chr3 (1-356)||(27480179-27480562)
chr3 (41-150)||(53811596-53811701)
chr3 (106-319)||(35844356-35844575)
chr3 (184-319)||(20373300-20373442)
chr3 (59-170)||(11357030-11357140)
chr3 (125-270)||(53176133-53176284)
chr3 (167-356)||(44186488-44186684)
chr3 (187-319)||(11357371-11357511)
[»] chr7 (54 HSPs)
chr7 (1-319)||(31578886-31579216)
chr7 (4-318)||(30055542-30055863)
chr7 (1-319)||(32820875-32821200)
chr7 (1-319)||(9355648-9355973)
chr7 (1-319)||(37109886-37110213)
chr7 (1-356)||(18797306-18797666)
chr7 (11-319)||(27283758-27284073)
chr7 (1-319)||(17842406-17842733)
chr7 (1-319)||(24211755-24212081)
chr7 (1-318)||(7334809-7335132)
chr7 (68-319)||(38258559-38258816)
chr7 (1-270)||(11071269-11071542)
chr7 (1-356)||(4582896-4583258)
chr7 (1-219)||(37703320-37703538)
chr7 (11-318)||(10481619-10481934)
chr7 (49-356)||(43686018-43686330)
chr7 (1-270)||(32432515-32432791)
chr7 (1-221)||(15672581-15672804)
chr7 (1-319)||(23111204-23111531)
chr7 (8-308)||(41764907-41765214)
chr7 (1-306)||(10359036-10359348)
chr7 (1-319)||(37347036-37347360)
chr7 (4-319)||(15612584-15612905)
chr7 (7-356)||(5657309-5657665)
chr7 (1-317)||(8861301-8861624)
chr7 (1-221)||(46480951-46481171)
chr7 (1-319)||(21991650-21991966)
chr7 (1-221)||(48928119-48928339)
chr7 (1-270)||(25691366-25691642)
chr7 (1-164)||(29173699-29173861)
chr7 (1-214)||(43925227-43925434)
chr7 (4-221)||(6546638-6546855)
chr7 (1-221)||(26587914-26588126)
chr7 (1-164)||(31520563-31520726)
chr7 (9-221)||(12165871-12166074)
chr7 (48-316)||(33688132-33688406)
chr7 (1-147)||(44411362-44411509)
chr7 (23-221)||(44598785-44598980)
chr7 (5-318)||(22687254-22687566)
chr7 (1-192)||(35353256-35353447)
chr7 (49-319)||(38053500-38053751)
chr7 (109-221)||(37704276-37704387)
chr7 (8-319)||(12390478-12390777)
chr7 (1-134)||(37704387-37704521)
chr7 (4-164)||(26980482-26980642)
chr7 (13-164)||(32593040-32593191)
chr7 (1-123)||(34362000-34362123)
chr7 (91-221)||(48928477-48928606)
chr7 (111-319)||(27421313-27421526)
chr7 (151-221)||(44413351-44413421)
chr7 (184-270)||(29173603-29173696)
chr7 (184-319)||(26980337-26980479)
chr7 (225-356)||(26524380-26524511)
chr7 (184-221)||(31520729-31520766)
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (1-299)||(1149459-1149764)
chr8 (1-319)||(37970346-37970671)
chr8 (1-319)||(23854258-23854583)
chr8 (1-316)||(16446702-16447024)
chr8 (1-356)||(43643422-43643784)
chr8 (1-319)||(1204965-1205290)
chr8 (1-318)||(12876148-12876473)
chr8 (1-270)||(16222950-16223226)
chr8 (1-319)||(10555032-10555354)
chr8 (3-356)||(9864149-9864509)
chr8 (1-318)||(36694793-36695117)
chr8 (4-319)||(11727062-11727384)
chr8 (1-319)||(27082665-27082990)
chr8 (3-270)||(7890786-7891060)
chr8 (1-319)||(6098340-6098670)
chr8 (1-270)||(5299773-5300049)
chr8 (1-319)||(8803643-8803962)
chr8 (3-319)||(31933715-31934038)
chr8 (7-221)||(4132519-4132732)
chr8 (1-318)||(34895006-34895325)
chr8 (1-316)||(38644019-38644341)
chr8 (1-319)||(40862457-40862783)
chr8 (3-319)||(30654412-30654735)
chr8 (6-221)||(33906355-33906568)
chr8 (1-269)||(35459538-35459813)
chr8 (1-217)||(1953815-1954032)
chr8 (1-319)||(465880-466195)
chr8 (1-283)||(39098946-39099235)
chr8 (10-142)||(1149756-1149889)
chr8 (1-214)||(44869647-44869860)
chr8 (49-356)||(13307624-13307936)
chr8 (159-319)||(1150090-1150257)
chr8 (1-137)||(35859160-35859297)
chr8 (91-221)||(41910907-41911035)
chr8 (1-133)||(12587812-12587945)
chr8 (93-219)||(43025847-43025972)
chr8 (1-136)||(34951884-34952020)
chr8 (1-115)||(24823221-24823336)
chr8 (4-104)||(33198061-33198162)
chr8 (4-214)||(18259233-18259439)
chr8 (41-133)||(34463704-34463793)
chr8 (91-164)||(7998478-7998550)
chr8 (1-66)||(43025971-43026037)
chr8 (1-69)||(41362716-41362785)
chr8 (171-219)||(34952028-34952076)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (1-319)||(43648084-43648409)
chr2 (1-319)||(2325217-2325534)
chr2 (1-356)||(4166924-4167286)
chr2 (8-319)||(37905747-37906067)
chr2 (1-318)||(19289162-19289486)
chr2 (1-221)||(41960984-41961204)
chr2 (1-318)||(26357617-26357941)
chr2 (1-319)||(11366219-11366545)
chr2 (1-318)||(3176979-3177303)
chr2 (49-319)||(33550875-33551150)
chr2 (1-221)||(35959041-35959256)
chr2 (1-221)||(44913807-44914031)
chr2 (3-221)||(31861996-31862214)
chr2 (70-319)||(17071646-17071901)
chr2 (1-316)||(33660216-33660529)
chr2 (1-297)||(4763692-4763995)
chr2 (1-221)||(33709071-33709291)
chr2 (1-221)||(41465645-41465865)
chr2 (70-319)||(17054005-17054260)
chr2 (13-319)||(4478408-4478717)
chr2 (3-319)||(27349789-27350102)
chr2 (1-319)||(29241984-29242302)
chr2 (1-270)||(39167208-39167478)
chr2 (30-270)||(44286037-44286283)
chr2 (4-221)||(31570576-31570793)
chr2 (1-164)||(7006777-7006940)
chr2 (1-258)||(18494120-18494383)
chr2 (12-316)||(4263926-4264238)
chr2 (59-221)||(45327864-45328025)
chr2 (4-319)||(19424484-19424792)
chr2 (1-319)||(43770687-43771003)
chr2 (4-319)||(13711503-13711820)
chr2 (59-270)||(36642074-36642293)
chr2 (3-170)||(19500756-19500923)
chr2 (1-221)||(5881683-5881893)
chr2 (91-221)||(18258217-18258346)
chr2 (23-221)||(19313995-19314188)
chr2 (111-304)||(33902120-33902319)
chr2 (91-319)||(41463780-41464014)
chr2 (1-122)||(41051139-41051260)
chr2 (4-83)||(41463432-41463512)
chr2 (184-283)||(7006943-7007049)
chr2 (7-76)||(18257383-18257453)
chr2 (249-319)||(35958948-35959018)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (1-304)||(6091002-6091313)
chr6 (1-319)||(1945873-1946199)
chr6 (1-356)||(3879759-3880121)
chr6 (3-319)||(5627430-5627754)
chr6 (29-319)||(7234884-7235179)
chr6 (1-356)||(4318642-4319005)
chr6 (3-270)||(21016940-21017208)
chr6 (4-318)||(29182203-29182522)
chr6 (7-211)||(20768236-20768440)
chr6 (1-319)||(33892832-33893147)
chr6 (1-356)||(8513235-8513585)
chr6 (106-319)||(7055141-7055360)
chr6 (1-270)||(33618922-33619197)
chr6 (1-159)||(6089109-6089260)
chr6 (78-221)||(30353256-30353398)
chr6 (95-319)||(15491654-15491884)
chr6 (1-111)||(7054592-7054704)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (1-221)||(408250-408470)
scaffold0002 (1-356)||(136-492)
scaffold0002 (1-135)||(93922-94056)
scaffold0002 (127-318)||(94331-94528)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (1-319)||(43996-44320)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (1-319)||(154467-154791)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-316)||(145836-146159)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (47-309)||(267332-267602)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (1-257)||(12010-12272)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (97-143)||(100948-100994)
scaffold0009 (184-221)||(100894-100931)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 55)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 6864399 - 6864074
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6864399 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattattttatc 6864300  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  6864299 gttgtaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtattacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtatgataaa 6864201  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    |||| ||||| |||||||||||       || ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6864200 attaaattaaatgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgctattgtacaaaaagttggatgttattcattaaa 6864101  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6864100 tttttgatgttatagtgataacttcac 6864074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 304
Target Start/End: Original strand, 37663591 - 37663898
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgtt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  37663591 ttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtt 37663690  T
Q  103 ggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaatt 202  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37663691 ggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaatt 37663789  T
Q  203 agattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacattt 295  Q
    |||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| |||||||| ||    
T  37663790 agattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacagtt 37663889  T
Q  296 ttaatgtta 304  Q
    |||||||||    
T  37663890 ttaatgtta 37663898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 318
Target Start/End: Original strand, 19089303 - 19089624
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgtt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  19089303 ttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtt 19089402  T
Q  103 ggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaatt 202  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  19089403 gaaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagggtgttacgcatatagcaaggtaggataaaatt 19089501  T
Q  203 agattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacattt 295  Q
    |||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| |||| |||||| ||| || ||||| |||||||| ||    
T  19089502 agattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggtgttactcattacaatt 19089601  T
Q  296 ttaatgttatagtgataacttca 318  Q
    || || |||||||| ||||||||    
T  19089602 ttgatattatagtgttaacttca 19089624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 55477738 - 55478104
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||    
T  55477738 tgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtactattttatc 55477837  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  55477838 gttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtc-ttcagtgttacacgttgtggggtgttacacttataacaagttaggataaa 55477936  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgt----acaaaaagttggatgttattcat 288  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||    ||||| ||| |  ||||| || |    
T  55477937 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaaacagtggagtgttactcgt 55478036  T
Q  289 tacatttttaatgttatagtgataacttcacnnnnnnnntcattctcgtgactttatcatagaatttt 356  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||        |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  55478037 tacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaatttt 55478104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 35020878 - 35021207
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatg----gtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| |||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  35020878 tgtttgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatatatagtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactattt 35020977  T
Q  96 tatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtagga 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35020978 tatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtagga 35021076  T
Q  196 tacaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcat 288  Q
    || |||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||| || ||| || | |||||||| |||| |||||||| ||| |  ||||| |||     
T  35021077 taaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggacgaaacttttgacgccaatgtacaaacagtggtgtgttactcac 35021176  T
Q  289 tacatttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  35021177 tacatttttgatgttataatgttaacttcac 35021207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25184477 - 25184115
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||     
T  25184477 tgtttgattcatttttaaattgtcgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatt 25184378  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    || ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25184377 gtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaa 25184279  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||| ||||||||||||||       |||| ||||||||| |||||  | |  ||||| |||| ||||||||||| ||| |  ||||| ||||||||    
T  25184278 attagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgttactcattaca 25184179  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcacnnnnnnnntcattctcgtgactttatcatagaatttt 356  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||        |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  25184178 tttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaatagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 25184115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 879395 - 879720
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||     
T  879395 tgtttgattcatttttaaattgttgattacttattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatt 879494  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  879495 gtcagaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc-ttaaatgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaa 879593  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||| ||||||||||||       |||| ||||||||| |||||  | || |||||||||| ||||||||||| | |  | ||||| ||||||||    
T  879594 attagattatgtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattaaacttttgatgtcattgtacaaacaatgaggtgttactcattaca 879693  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||    
T  879694 tttttgatgttatagtgtttacttcac 879720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 19440495 - 19440820
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  19440495 tgtttgattaatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 19440594  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  | ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||| |    
T  19440595 attggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgttataaac-ttaagggttacacgttgtggggtgttacgcttataacaagctaagataaa 19440693  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||  || |  ||||| ||||||||    
T  19440694 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacggtggagtgttaatcattaca 19440793  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  19440794 tttttgatgttatagtgttaacatcac 19440820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1815665 - 1815445
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  1815665 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaattgtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 1815566  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  1815565 gttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacccttaaaacaaggtaggataaa 1815467  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    |||||| ||| |||||||||||    
T  1815466 attagagtaaatgtagtcttgt 1815445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 32912426 - 32912752
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  32912426 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttat 32912525  T
Q  99 cgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatac 198  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  32912526 cgttgaaatctttaacatacaaatagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataa 32912624  T
Q  199 aattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattac 291  Q
    ||||| |||||||||||||||||       || ||||||||||| ||||||  ||  |||||||||  |||| |||||| | | || ||||| |||||||    
T  32912625 aattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatattatgagtgctgaacttttgatatcattctacaaatactagggtgttactcattac 32912724  T
Q  292 atttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  32912725 atttttgatgttatagtgttaacttcac 32912752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 34361338 - 34361663
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  || ||||||||    
T  34361338 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttat 34361437  T
Q  99 cgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatac 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  34361438 cgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatag-ctttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataa 34361536  T
Q  199 aattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattac 291  Q
    ||||| |||||||||| | ||||       |||||||||||||| ||||||  ||  |||||| ||| |||| |||||| ||| || ||||| |||||||    
T  34361537 aattatattaagtgtaattttgttaaccggatgaattgatgatattatgag-gctgaacttttaatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattac 34361635  T
Q  292 atttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34361636 attttttatgttatagtgttaacttcac 34361663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 50697606 - 50697281
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  50697606 tgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttggaattacaggtactattttatc 50697507  T
Q  100 gttggaatctttaacat-gcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatac 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  50697506 gttggaatctttaacattgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctt-aagtgttgcactttgtgtggtgttacgcttataacaaggtaggataa 50697408  T
Q  199 aattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattac 291  Q
    ||||| |||||||||||||||||       |||||||||||||| || ||||| |  |||||||||| |||||||||||  || || ||||| || |||     
T  50697407 aattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttat 50697309  T
Q  292 atttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||    
T  50697308 attttttatgttatagtgtttacttcac 50697281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 28002833 - 28003109
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  28002833 tgttcgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttagcaacatcttggacttacatgtactattttatc 28002932  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  28002933 gttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagt-tttaagtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 28003031  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaa 270  Q
    ||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||| |||||  |||  |||||||||| || ||||||||    
T  28003032 attagattaagtgcagtcttgttaatccgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcactgtacaaa 28003109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 55240952 - 55241240
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  55240952 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaatagtaatttatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 55241051  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| |||| |    
T  55241052 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgacatcatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtatgataaa 55241150  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgtta 283  Q
    ||||||||||||||| |||| |      || ||||||||||| |||| | |||  ||||||||||||| |||||||| ||| || |||||    
T  55241151 attagattaagtgtattcttcttatctgataaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 55241240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3042983 - 3042763
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || || |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  || |||||||||    
T  3042983 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatgttggacttacatgtactattttatc 3042884  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  3042883 gttgaaatctttaacaagcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataataaggtatgataaa 3042785  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    |||| |||||||||| ||||||    
T  3042784 attatattaagtgtaatcttgt 3042763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 34947942 - 34948267
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  34947942 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaacgatcaatagtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatc 34948041  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagt--gttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggata 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| | |||  |||||| |||||||    
T  34948042 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtc-ttaagtacgttacactttgtggggtgttgcactttaaacaagataggata 34948140  T
Q  198 caattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcatta 290  Q
     |||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||| | |||||| ||| || ||||| |||  |    
T  34948141 aaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactttacaaacagtggggtgttactcacaa 34948240  T
Q  291 catttttaatgttatagtgataacttc 317  Q
    || |||| ||||||||||| |||||||    
T  34948241 cacttttgatgttatagtgttaacttc 34948267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 7703873 - 7703519
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  7703873 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgataaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttatc 7703774  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| ||| |    
T  7703773 gttggcatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtc-ttaagtgtgacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtagaataaa 7703675  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgtatgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaa 299  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |  |||||||| |||| | |||  |||||||||| ||  ||||||| ||| || ||||| | |  ||| |||| |    
T  7703674 attagattaagtgtattcttgt-taatctgatgatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactgacaacacttttga 7703576  T
Q  300 tgttatagtgataacttcacnnnnnnnntcattctcgtgactttatcatagaatttt 356  Q
    |||||||||| |||||||||        |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  7703575 tgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgactttaacatagaatttt 7703519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17173654 - 17173436
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  17173654 tgtttgattcatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatc 17173555  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||| |    
T  17173554 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaa 17173456  T
Q  200 attagattaagtgtagtctt 219  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  17173455 attagattaagtgtattctt 17173436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 42200095 - 42199768
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaa-tattatttta 97  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||| ||||| ||||  | | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42200095 tgtttgattaatttttaaattattgattactgattaatgaacagtagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaggtattatttta 42199996  T
Q  98 tcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggata 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  42199995 tcgttggaatctttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgata 42199897  T
Q  198 caattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcatta 290  Q
     ||||| |||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||  ||  |||||| ||| |||| |||||| | | || | ||| ||||||    
T  42199896 aaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaactttttatgtcattctacaaataatggggtattactcatta 42199797  T
Q  291 catttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  42199796 catttttgatgttatagtattaacttcac 42199768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 47254101 - 47253750
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgtt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  || |||||||| |||    
T  47254101 ttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcatgtactattttattgtt 47254002  T
Q  103 ggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaatt 202  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  47254001 ggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 47253903  T
Q  203 agattaagtgtagtcttgtatgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaatgt 302  Q
    | |||||||||| |||||| | |  |||||||| |||||| |||  |||||||||| || |||| ||| |  ||| ||||| |||  ||| |||| |||     
T  47253902 aaattaagtgtattcttgt-taatctgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtataaaca-atgggtgttactcacaacacttttgatga 47253805  T
Q  303 tatagtgataacttcacnnnnnnnntcattctcgtgactttatcatagaattttt 357  Q
    ||||||| |||||||||        |||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  47253804 tatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttt 47253750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 17168077 - 17167753
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| | ||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  17168077 tgtttgattcatttttaaattattgattactaattaatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatc 17167978  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||| |    
T  17167977 gttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaa 17167879  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatat-gagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattac 291  Q
    ||||||||||||||| |||| |       ||||||| |||||| ||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| |||  ||    
T  17167878 attagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagaa-tgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaac 17167780  T
Q  292 atttttaatgttatagtgataacttca 318  Q
    |||||| || ||||| || ||||||||    
T  17167779 atttttgatattataatgttaacttca 17167753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 36493536 - 36493860
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  36493536 tgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaatatcttagacttacagatactattttatc 36493635  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||| ||| |||| |    
T  36493636 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtc-ttaagtgttacactttgtggagt-ttacacttaaaacaatgtatgataaa 36493733  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||| | |||  |||||||||| || |||||||| | | || ||||| ||| || |    
T  36493734 attagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcactata 36493833  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  36493834 tttttgatggtatagtattaacttcac 36493860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 33341762 - 33341487
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  33341762 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttggacttacatgtactattttatc 33341663  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  33341662 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 33341564  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaa 270  Q
    |||| ||||||| || ||||||       |||||||||||||| |||| | |||  ||||||||||||| ||||||||    
T  33341563 attatattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgatgccactgtacaaa 33341487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 25700903 - 25701226
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||| |||||| ||||| || ||||  ||| |||||||||    
T  25700903 tgtttgattcatttttaaattgtacattattgattaatgatcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaaaatcttagatttacggatactattttatc 25701002  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgggg-tgttacgcttataacaaggtaggatac 198  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||     
T  25701003 gttgacttctttaacatgcaaacaaagttgatgatgttatgtgataatc-ttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataa 25701101  T
Q  199 aattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattac 291  Q
    ||||||||| ||||||||| |||       |||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| || |||||||| ||| || ||||| ||| |||    
T  25701102 aattagatttagtgtagtcctgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtagggtgttactcactac 25701201  T
Q  292 atttttaatgttatagtgataactt 316  Q
    | |||| |||||||| || ||||||    
T  25701202 acttttgatgttataatgttaactt 25701226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 46888007 - 46888328
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||  || |||||||||||    
T  46888007 tttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttggatttacaggtactattttatcgt 46888106  T
Q  102 tggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaat 201  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||    
T  46888107 tggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgatagtc--taagtgttacgttttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaat 46888204  T
Q  202 tagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatt 294  Q
    ||||||||||||||| ||||       ||||||| | |||| |||| | |||  ||||||||||||  |||||||| ||| || | ||| ||| |||| |    
T  46888205 tagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattaacgatagtatggggactgaacttttgatgccgctgtacaaatagtggggtattactcactacaat 46888304  T
Q  295 tttaatgttatagtgataacttca 318  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||    
T  46888305 tttgatgttatagtattaacttca 46888328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 29584047 - 29584370
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||  |||||||     
T  29584047 tgtttgattcatttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttatt 29584146  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||| || |||| |||||||||| ||| |    
T  29584147 gttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtc-ttaagtgtgacacttcatggggtgtaacacttaaaacaaggtagaataaa 29584245  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||| |||  |       |||||||||||||| |||||  |||  |||||||||||||||||||||| |||  | ||||| |||  |||    
T  29584246 attagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtgttactca--aca 29584343  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||    
T  29584344 cttttgatgttatagtgttaacttcac 29584370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 37776022 - 37775708
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  37776022 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatc 37775923  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||          ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||| |    
T  37775922 gttggtatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtg----------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaa 37775833  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||| ||  ||      ||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||  |||    
T  37775832 attagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta--aggggggaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaaca 37775735  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||    
T  37775734 tttttaatattatagtgctaacttcac 37775708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27396978 - 27396617
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||   ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |  ||  | ||||||    
T  27396978 tgtttgattcatttttaaattgttgattac--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttataggtaccactttatc 27396881  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  ||||||||||||||||||  |||| |||||| ||| ||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||| |    
T  27396880 gttgacatctttaacatgcaaacagcgttgctgatatcatgcgatggtctt-aagtgtgacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtagaataaa 27396782  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    |||| |||||||||| ||||||       |||||||||||||| |||||| || | |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| |||| |||    
T  27396781 attaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggacgaaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtgttactcataaca 27396682  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcacnnnnnnnntcattctcgtgactttatcatagaattttt 357  Q
     |||||||| |||| || |||||||||        |||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  27396681 cttttaatgctataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttt 27396617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 32579810 - 32579600
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  32579810 tgtttgatttatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 32579711  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| || ||| |||| |||| |||||||||||||| |    
T  32579710 gttgacatttttaacatgcaaacatagttgatgatattataagatagtc-ttaagagttacactttctgaggtcttacacttaaaacaaggtaggataaa 32579612  T
Q  200 attagattaagt 211  Q
    ||||||||||||    
T  32579611 attagattaagt 32579600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17272328 - 17272115
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||     
T  17272328 tgtttgattcatttttaaatcgttcattaccgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatt 17272229  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||| ||||||||| ||||||| | ||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||| |    
T  17272228 gttgaaatctttaatatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtc-ttaagtgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaa 17272130  T
Q  200 attagattaagtgta 214  Q
    |||||||||||||||    
T  17272129 attagattaagtgta 17272115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 37288092 - 37287776
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  37288092 tgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgctcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 37287993  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttat-ggggtgttacgcttataacaaggtaggat-a 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||| | |||| ||||| |||| ||||| ||||| | |    
T  37287992 gttggcatcttcaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgctagtc-ttaagtgttacattttgtgggggcgttacacttaaaacaaagtaggttaa 37287894  T
Q  198 caattagattaagtgtagtcttgtatgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacattttt 297  Q
     |||||||||||||||| |||||| | |  | |||||| |||||| | |  ||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||  ||| ||||    
T  37287893 aaattagattaagtgtattcttgt-taatcttatgatattatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacactttt 37287795  T
Q  298 aatgttatagtgataactt 316  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  37287794 gatgttatagtgttaactt 37287776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23761435 - 23761114
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||    
T  23761435 tgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtacaattttatc 23761336  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| |    
T  23761335 gttggtatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtc-ttaaatgtgacactttatgaggtgttacacttaaaacaaggta-gataaa 23761238  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||| |||| | |||  |||||||||| || | |||||| |||  | ||||| |||  |||    
T  23761237 attagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactatacaaacagtgaggtgttactcacaaca 23761138  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataactt 316  Q
     |||| ||||||||||| ||||||    
T  23761137 cttttgatgttatagtgttaactt 23761114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 38012169 - 38011893
Alignment:
Q  49 attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc 148  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38012169 attcatctagtaatatttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatttttaacgtgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 38012070  T
Q  149 tttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatga 241  Q
     ||||| |||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||       |||||||||| ||| ||||     
T  38012069 -ttaagcgttacactttctgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatgg 38011971  T
Q  242 gaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    | |||  |||||||||| ||  ||||||| ||| || || |||||| |||| |||| ||||||||||| | |||||||    
T  38011970 ggactgaacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtgctattcactacacttttgatgttatagtgttgacttcac 38011893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 33816363 - 33816539
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||    
T  33816363 tgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgaactattttatc 33816462  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttac 177  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  33816463 gttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtattac 33816539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 46883961 - 46884172
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  || |||||||||    
T  46883961 tgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc--ggacttaca--tactattttatc 46884056  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
     ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| || | ||||| |||||||||||| || |||| |    
T  46884057 tttggaatttttaacatgcaaacaaaatttatgatattatgtgatag--tttaagtgttacattttgtgagatgtta-gcttataacaagatatgataaa 46884153  T
Q  200 attagattaagtgtagtct 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  46884154 attagattaagtgtagtct 46884172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 30002488 - 30002699
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |  || |||||||||    
T  30002488 tgtttgattcatttttaaattgtttattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttaaatgtactattttatc 30002587  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||          ||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||| |    
T  30002588 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtg----------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 30002677  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  30002678 attagattaagtgtattcttgt 30002699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 49376331 - 49376006
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||  || |||||||||    
T  49376331 tgtttaattcatttttaaattcttgattactgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgctttcaacttcttggacttacatgtactattttatc 49376232  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||    |||| | ||||| || ||| |    
T  49376231 gttgacatctttaacatccaaacaaagttgatgatattatgtgataatc-ttaagtgttacacattgtggggtgtataacttaaatcaaggcagaataaa 49376133  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||       |||||||||||||| |||||  |||  ||||||||||||| |||||||  ||| || ||||| |||  |||    
T  49376132 attagatcaagcgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaagcagtggggtgttactcacgaca 49376033  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
     |||| ||| |||| || |||||||||    
T  49376032 cttttgatgctataatgttaacttcac 49376006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 5047813 - 5048088
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| |||  ||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||  || ||||||||     
T  5047813 tgttcgattcatttttaaattgtttattgttgattactgatcaataataatttatctagtaaaacttgcaacatcttggacttacatgtactattttatt 5047912  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||   |||| |||| |||| |||||||||||||| |    
T  5047913 gttggcatctttaacatgcaaacatagtttatgatatcatgtgatagtc-ttaagtgttaca-ttttgcgggtattacacttaaaacaaggtaggataaa 5048010  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaa 270  Q
    |||||||||| || ||||||||       |||||||||||||| |||| |||||  |||||||||  ||| |||||||    
T  5048011 attagattaaatgcagtcttgttaatctcatgaattgatgatactatgggaactgaacttttgatatcatcgtacaaa 5048088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 7152051 - 7152215
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  || |||||||||    
T  7152051 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacaggtactattttatc 7152150  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacacttt 165  Q
    ||||  || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  7152151 gttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagt-attaagtgttatacttt 7152215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 50765084 - 50764908
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  50765084 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatc 50764985  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttac 177  Q
    ||||  ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| |  || |||||| |||||| |||||||||||    
T  50764984 gttgacatctttaacttgcaaacatagttgctgatatcatgtgataat-attgagtgtttcactttgtggggtgttac 50764908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32592448 - 32592237
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||  || |||||||||    
T  32592448 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaacgatcaatagtaattcatttagtaatgctttcaacatcttgaacttacaggtactattttatc 32592349  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| ||| || || ||          ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  32592348 gtagacatctttaacatgcaaacaaagttgctgaaatcatatg----------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 32592259  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    |||| ||||| |||| ||||||    
T  32592258 attaaattaaatgtattcttgt 32592237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 4205348 - 4205216
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  4205348 tgtttgattcatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 4205249  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4205248 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgatg 4205216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 91 - 270
Target Start/End: Original strand, 4934140 - 4934325
Alignment:
Q  91 tattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaagg 190  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||   |||| |||||||    
T  4934140 tattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtc-ttaagtgttacactttgtgaggtgttggacttaaaacaagg 4934238  T
Q  191 taggatacaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaa 270  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||       ||||| |||||||| |||||| | |  ||||||||||||| ||||||||    
T  4934239 tagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaaatgatgatactatgaggattgaacttttgatgccagtgtacaaa 4934325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4598346 - 4598136
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  4598346 tgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattaatctaataatgcttgcaacatcttggatttaaatgtattattttatc 4598247  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||          ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| | |||||| |    
T  4598246 gttggcatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtg----------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaa-gcaggataaa 4598158  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    |||| |||||||||| ||||||    
T  4598157 attaaattaagtgtattcttgt 4598136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 91 - 221
Target Start/End: Original strand, 35025534 - 35025663
Alignment:
Q  91 tattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaagg 190  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||     
T  35025534 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtc-ttaagtgttacactttctggggtgtgacacttaaaacaaga 35025632  T
Q  191 taggatacaattagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  35025633 taggataaaattatattaaatgcagtcttgt 35025663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 26896452 - 26896287
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatctt-ggacttacaaatattatttta 97  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||||||    
T  26896452 tgttcgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgtttgcaacattttcggacttacaagtactatttta 26896353  T
Q  98 tcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacacttt 165  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  26896352 tcgttgaaat-tttaacatgcaaatagacttgatcatattatgcgatagtc-ttaagtgttacacttt 26896287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9139591 - 9139389
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgttattattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcg 100  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||  ||||||    
T  9139591 tgtttgattcatttttaaattag-attattgattaatgatcaatagtaattcgtctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactacgttatcg 9139493  T
Q  101 ttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||                  |||||||||||||||| | |||||||||  ||| |||||||||||||| ||    
T  9139492 ttggcatctttaacatgcaaacagagtttat-----------------cttaagtgttacactttgtagggtgttacagttaaaacaaggtaggataaaa 9139410  T
Q  201 ttagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9139409 ttagattaagtgtagtcttgt 9139389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 39400372 - 39400236
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |  ||  ||||||||    
T  39400372 tgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtcattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttaaaggtaccattttatc 39400273  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatat 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  39400272 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 39400236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 35025413 - 35025515
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  35025413 tgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 35025512  T
Q  100 gtt 102  Q
    |||    
T  35025513 gtt 35025515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 23431919 - 23431834
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttaca 85  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| | ||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23431919 tgtttgatgcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctactaatgcttgcaacatcttggacttaca 23431834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 39398115 - 39397957
Alignment:
Q  159 acactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgtatgaattgatgataatatgagaactagacttttgatg 258  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| || |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||||||| |  ||  |||  ||||||||||    
T  39398115 acactttgtggggtgttacacttaaaataaggcaggataaaattagattaagtgtattcttgtt--aattgatgatactgagaagactgaacttttgatg 39398018  T
Q  259 ccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
     || |||||||| | | || ||||| |||  ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  39398017 tcactgtacaaacaatggggtgttactcacaacacttttaatgttatagtgttaacttcac 39397957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 56050234 - 56050169
Alignment:
Q  60 aatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaa 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  56050234 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaagtctttaacatgcaaacaaa 56050169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 221
Target Start/End: Original strand, 54499177 - 54499305
Alignment:
Q  92 attttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggt 191  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||  | |||| ||||||||||| ||||  |||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||    
T  54499177 attttatcgttggcat-tttaacatggaaacagagttactaatatcatgtgatagtc-ttaaaagttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggt 54499274  T
Q  192 aggat-acaattagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    | ||| | ||||||||||||| || ||||||    
T  54499275 atgataaaaattagattaagtatattcttgt 54499305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 4205221 - 4205156
Alignment:
Q  253 ttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaatgttatagtgataacttca 318  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || |||||||||  |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  4205221 ttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttattcagaacatttttgatattatagtgttaacttca 4205156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 279 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 4396405 - 4396365
Alignment:
Q  279 tgttattcattacatttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4396405 tgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcac 4396365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 28564599 - 28564921
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  28564599 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtattattttatc 28564698  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| |    
T  28564699 gttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag---ttaagtgttacactttacggggtgttatgcttataacaaggcatgataaa 28564795  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||||||| |||  | ||||| ||||||||    
T  28564796 attagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtaaggtgttactcattaca 28564895  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttca 318  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28564896 tttttgatgttatagtgttaacttca 28564921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 319
Target Start/End: Original strand, 30326775 - 30327093
Alignment:
Q  8 ttcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaa 106  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  30326775 ttcatttttaaattgttgattactgattgatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtattattttatcgttggaa 30326874  T
Q  107 tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagat 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30326875 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagt-tttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagat 30326973  T
Q  207 taagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaa 299  Q
    |||||||||| ||||       |||||||||||||| |||||  |||  ||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||| ||||||||||||| |    
T  30326974 taagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgctattgtacaaacggttgggtattactcattacatttttga 30327073  T
Q  300 tgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||||||||| ||| |||||    
T  30327074 tgttatagtgttaaattcac 30327093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 32216415 - 32216090
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32216415 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 32216316  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  32216315 gttggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 32216217  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||| |||||||| |||| ||||       |||||||||||||| || ||| |||  |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||| ||| ||||    
T  32216216 atttgattaagtttagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactaca 32216117  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  32216116 tttttgatgttatagtgttaacttcac 32216090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 37451645 - 37451324
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  37451645 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatc 37451546  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||  |||| |    
T  37451545 gttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttttgaggtgttacacttataacaaggtcagataaa 37451447  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||       || ||||||||||| || ||| |||  |||||||||| |||||||||||  || || ||||| | ||||||    
T  37451446 attagattaagtgtagtcttgttaatatgataaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttacttattaca 37451348  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataactt 316  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  37451347 tttttgatgttatagtgttaactt 37451324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 8222480 - 8222166
Alignment:
Q  8 ttcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaa 106  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  8222480 ttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaata-taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaa 8222382  T
Q  107 tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagat 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8222381 tctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagt-tttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagat 8222283  T
Q  207 taagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaa 299  Q
    |||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||   ||  ||  | ||||| ||||||||||||| |    
T  8222282 taagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccattgt---aacggtgtggtgttactcattacatttttga 8222186  T
Q  300 tgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  8222185 tgttatagtgttaacttcac 8222166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30254783 - 30254460
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  30254783 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatc 30254684  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  30254683 gttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgttattatgtgacagtc-ttaagtgttacactttatagggtgttatgcttataacaaggtaggataaa 30254585  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    |||||||||||| |||||||||       |||||||||||||| | |||| |||  |||||||||| ||||||||||| || ||  | ||| ||||||||    
T  30254584 attagattaagtctagtcttgttaatctgatgaattgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacag-tgtgtattactcattaca 30254486  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttca 318  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||    
T  30254485 tttttgatgttatattgttaacttca 30254460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15752389 - 15752026
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||    
T  15752389 tgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaaaaattgcaacttcttggacttacatgtattattttgtc 15752290  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  15752289 gttggaatttttaacatgcaaacagagttaatgatattatgtgatactc-ttaagtgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaa 15752191  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||  | ||||| ||| || |    
T  15752190 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtgttactcactata 15752091  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcacnnnnnnnntcattctcgtgactttatcatagaattttt 357  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||        |||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  15752090 ttttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttt 15752026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 15383286 - 15382968
Alignment:
Q  8 ttcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaa 106  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||| || || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  15383286 ttcatttttaaattgttgattgctgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggaa 15383187  T
Q  107 tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagat 206  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15383186 tctttaacatgcatacatagttgatgatattatgtgatagt-tttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagat 15383088  T
Q  207 taagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaa 299  Q
    |||||||||||||||       |||||||||||||| || ||  |||  |||||||||| |||||||||||  || |||||||| ||||||||||||| |    
T  15383087 taagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactacgatgactgaacttttgatgacattgtacaaacggtgggatgttactcattacatttttga 15382988  T
Q  300 tgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||||||||| ||| |||||    
T  15382987 tgttatagtgttaatttcac 15382968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 238329 - 238653
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  238329 tgtttgattcatttttaaattgtggattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatattattttatc 238428  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||| |    
T  238429 gttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaa 238527  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||| ||||||       || ||||| ||||| |||| | |||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||  |||    
T  238528 attagattaagtgtattcttgttagtctgattaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacag-tggatgttactcacaaca 238626  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||    
T  238627 tttttaatactatagtgttaacttcac 238653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 32267394 - 32267069
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||||     
T  32267394 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacctacaggtactattttata 32267295  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32267294 gttggaatatttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc-ttgagtgttacactttgtggagtgttacgcttataacaaggtaggataaa 32267196  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||| ||||||       |||  |||||||||||||||| | |  |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  32267195 attagattaagtgtaatcttgttaatctgatgggttgatgataatatgaggagtgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattaca 32267096  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||    
T  32267095 tttttgatgttatattgttaacttcac 32267069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 51129216 - 51128894
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgtt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  51129216 ttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgtt 51129117  T
Q  103 ggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaatt 202  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  51129116 gaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagt-tttaattgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtatgataaaatt 51129018  T
Q  203 agattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacattt 295  Q
    | |||||||||||||||||       |||||||||||||| ||| |  |||  |||||||||| |||||||||||  || |  ||||| |||||||||||    
T  51129017 atattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacattt 51128918  T
Q  296 ttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    || ||||||||||| |||||||||    
T  51128917 tttatgttatagtgttaacttcac 51128894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 28770013 - 28769688
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  28770013 tgtttgattcatttttaaattgttgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttatc 28769914  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttat-ggggtgttacgcttataacaaggtaggatac 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  28769913 gttgaaatctttaacatgcaaacagaggtgatgatattatgtgatagtc-ttaagcgttacactttgtgggggtgttacgtttataacaaggtatgataa 28769815  T
Q  199 aattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattac 291  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||| ||   || |||||||||||||||| ||| | ||| ||||| |||||||    
T  28769814 aattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggaccgaacctttgatgccattgtac-aaacggtgggtgttactcattac 28769716  T
Q  292 atttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||    
T  28769715 atttttgatgtcatagtgttaacttcac 28769688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 10923087 - 10922762
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||     
T  10923087 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacagatactattttatt 10922988  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  10922987 gtcagaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacagtc-ttaagtgttacactttgtgaggtgttacccttataacaaggtatgataaa 10922889  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    || |||||||||||||||||||       |||| ||||||||| |||||| | |  |||||||||| ||||||||||| ||| || | ||| ||||||||    
T  10922888 ataagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtcttactcattaca 10922789  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10922788 ttttttatgttatagtgttaacttcac 10922762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 25160985 - 25160716
Alignment:
Q  8 ttcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaa 106  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  25160985 ttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaa 25160886  T
Q  107 tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  25160885 tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagt-tttaagtgttatactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaatgagat 25160787  T
Q  207 taagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaa 270  Q
    ||||||||||||| |       |||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  25160786 taagtgtagtcttattaatctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaa 25160716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 2960108 - 2959784
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2960108 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatc 2960009  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||| |||  |||||||||||||| |    
T  2960008 gttggcatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacaatttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggataaa 2959910  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    |||||||||||||| |||||||       |||||||||||| | |||||| |||  |||||||||| || |||||||| ||| |||||||| | | ||||    
T  2959909 attagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgacactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttacttactaca 2959810  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttca 318  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||    
T  2959809 gttttgatgttatagtgttaacttca 2959784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 19899584 - 19899910
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  19899584 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttat 19899683  T
Q  99 cgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatac 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||| ||||     
T  19899684 cgttggaatctttaacatgcaaatagagttggtgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaatgtatgataa 19899782  T
Q  199 aattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattac 291  Q
    ||||| |||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||   |  ||||||||||||||| |||||| |||  | ||||| || ||||    
T  19899783 aattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggttgaacttttgatgccattctacaaacagtgaggtgttactcgttac 19899882  T
Q  292 atttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19899883 atttttgatgttatagtgttaacttcac 19899910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 18423004 - 18422686
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgttattattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||      |||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |  | ||||||||    
T  18423004 tgtttgattcatttttaaattgtt------gattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttggacttacatgtgcttttttatcg 18422911  T
Q  101 ttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18422910 ttggaatctttaacatgcaaacggaggtgatgatattatgtgatagtctt-aagtgttacactttgtggggtgttacgcatataacaaggtaggataaaa 18422812  T
Q  201 ttagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacat 293  Q
    |||||||||||||| ||||||       |||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| |||||||||||  || || ||||| || ||| ||    
T  18422811 ttagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcgttatat 18422712  T
Q  294 ttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||    
T  18422711 ttttgatgttatagtgttaacttcac 18422686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 27227301 - 27227577
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27227301 tgtttaattcatttttaaatggttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatc 27227400  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  27227401 gttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatatcatgtgatagtc-ttaagtgttgcactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 27227499  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaa 270  Q
    ||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||| ||||||||    
T  27227500 attagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaa 27227577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16416006 - 16415680
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  16416006 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 16415907  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | | |||||| |||| |||| |||||||||||||| |    
T  16415906 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtattacaatatgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaa 16415808  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagtt-ggatgttattcattac 291  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||   ||  ||||||||||||| |||||||| | || || ||||| ||| |||    
T  16415807 attagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactatgatggctgaacttttgatgccactgtacaaacatttagggtgttactcactac 16415708  T
Q  292 atttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    | |||| ||| ||||||| |||||||||    
T  16415707 acttttgatgctatagtgttaacttcac 16415680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 23999708 - 23999382
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  23999708 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttat 23999609  T
Q  99 cgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatac 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| ||||     
T  23999608 cgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataa 23999510  T
Q  199 aattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattac 291  Q
    ||||| |||||||||||||||||       |||||||||| ||| ||||||  ||  |||||||||| |||| |||||| ||| || ||||| || |||     
T  23999509 aattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcgttat 23999410  T
Q  292 atttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  23999409 attttttatgttgtagtgttaacttcac 23999382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 27763126 - 27763451
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  27763126 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatatttatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacagatactattttat 27763225  T
Q  99 cgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatac 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| ||||     
T  27763226 cgttggaatctttaacatgcaaatagagttgattatattatgtgatagtc-ttaagtattacactttgtagggtgttacgcttagaactaggtatgataa 27763324  T
Q  199 aattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattac 291  Q
    |||||||||||||||||||||||       || ||||||||||| ||||||  || ||||||||||| |||| ||| |||   ||| ||||| |||||||    
T  27763325 aattagattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatactatgagggctggacttttgatgtcattctac-aaactatgggtgttactcattac 27763423  T
Q  292 atttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27763424 atttttgatgttatagtgttaacttcac 27763451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 270
Target Start/End: Original strand, 7078882 - 7079155
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgtt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  7078882 ttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttagacttacatatactattttatcgtt 7078981  T
Q  103 ggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaatt 202  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  7078982 ggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtc-ttaagtcttatactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 7079080  T
Q  203 agattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaa 270  Q
    |||||||||||| ||||||       |||||||||||||| |||||  |||  |||||||||| |||||||||||    
T  7079081 agattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcattgtacaaa 7079155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 47279549 - 47279260
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  47279549 tgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctaataatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatt 47279450  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |    
T  47279449 gttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcatgtgatagtc-ttaagtgttacactttatgggatgttacaattaaaacaaggtaggataaa 47279351  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgtta 283  Q
    ||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||| |||||| |||  ||||| ||||||| |||||||| ||| || |||||    
T  47279350 attagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttcgatgccactgtacaaacagtggggtgtta 47279260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 46931770 - 46931446
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  46931770 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataatatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttat 46931671  T
Q  99 cgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatac 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||   ||||||||| ||||     
T  46931670 cgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagggtgttacgct--gaacaaggtatgataa 46931574  T
Q  199 aattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattac 291  Q
    ||||| |||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||  ||  | |||||||||| || |||||| ||| || | ||| |||||||    
T  46931573 aattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatattatgagggctgaatttttgatgccgttctacaaacagtggggtattactcattac 46931474  T
Q  292 atttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  46931473 atttttgatgttatagtgttaacttcac 46931446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4330641 - 4330421
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  4330641 tgtttgattcatttttatattgttgattactgattaatgatcaattgtaattcatctagtaatgcttgcaacatattggacttacaagtactattttatc 4330542  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
     |||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  4330541 tttgacatctttaacatgcaaaaagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 4330443  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  4330442 attagattaagtgcagtcttgt 4330421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 318
Target Start/End: Original strand, 9902872 - 9903194
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||   || |||||||||||    
T  9902872 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtagtgcttgcagcatcttggacttactggtactattttatcgt 9902971  T
Q  102 tggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaat 201  Q
    ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||  ||||| ||| |||| |||    
T  9902972 tgtcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaatgtaagataaaat 9903070  T
Q  202 tagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatt 294  Q
    ||||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||| | | |  |||||||||| || |||||||| ||  || ||||| ||| |||| |    
T  9903071 tagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatagtatgtggattgaacttttgatgtcactgtacaaacagcggggtgttactcactacagt 9903170  T
Q  295 tttaatgttatagtgataacttca 318  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||    
T  9903171 tttgatgttatagtgttaacttca 9903194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1547631 - 1547285
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  1547631 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 1547532  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| ||||||        |||| ||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||| |    
T  1547531 gttggtatcttt--------aacagagttgttgatatcatgtgatagt-tttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaa 1547441  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgtatgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaa 299  Q
    ||||||||||||||| | |||| | |  |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||| |  ||||| |||  |||||||| |    
T  1547440 attagattaagtgtatttttgt-taatctgatgatactatgagaactgaacttttgatgccactgcacaaacagtggagtgttactcacaacatttttta 1547342  T
Q  300 tgttatagtgataacttcacnnnnnnnntcattctcgtgactttatcatagaatttt 356  Q
    |||||||||| |||||||||        |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  1547341 tgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 1547285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 319
Target Start/End: Original strand, 37618729 - 37619037
Alignment:
Q  13 ttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatcttt 111  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| | |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  37618729 ttttaaattgttgattattgattaatggtcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatcttt 37618828  T
Q  112 aacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagt 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||          |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37618829 aacatgcaaacagagttgatgatattatatg----------agtgttacactttatgggatgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagt 37618918  T
Q  212 gtagtcttgt-------atgaattgatg--ataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatg--ttattcattacatttttaat 300  Q
    ||||| ||||       |||||||||||  ||| ||||||||||  |||||||||| |||| |||||| ||| || ||  ||| |||||| |||||| ||    
T  37618919 gtagtattgttaatctgatgaattgatgatatactatgagaactgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggtgttttactcattaaatttttgat 37619018  T
Q  301 gttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  37619019 gttatagtgttaacttcac 37619037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 10181823 - 10182149
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaa-tattattttat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  || |||| |||    
T  10181823 tgtttgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaaggtactattgtat 10181922  T
Q  99 cgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatac 198  Q
     ||||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  10181923 tgttgtcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtctt-aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataa 10182021  T
Q  199 aattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattac 291  Q
    |||||||||||||||| ||||||       ||||||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||| |  |||||  || ||     
T  10182022 aattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggcgtgttacgcactat 10182121  T
Q  292 atttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||||| |||||| |||  |||||||||    
T  10182122 attttttatgttacagttttaacttcac 10182149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 27563721 - 27564046
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27563721 tgtttgattcttttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacatatactattttatc 27563820  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||| |||||| |||  |||| |||||||||||||| |    
T  27563821 gtttgcatctttaacatgcaaacagagttgatgaaattatatgatagtc-ttaagtgttcctctttgtggggtattatacttaaaacaaggtaggataaa 27563919  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||| |||  |||||  |||||||||| || | |||||| ||| |  ||||| ||| || |    
T  27563920 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatcggaactgaacttttgatgtcactatacaaacagtggagtgttactcactata 27564019  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  27564020 tttttaaagttatagtgttaacttcac 27564046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 34012198 - 34012517
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  34012198 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatatactattttatc 34012297  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||      |||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||| ||||| |    
T  34012298 gttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt------gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaa 34012391  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||| |||||  |||  ||||||||||||| | |||||| ||| |  ||||| ||| ||||    
T  34012392 attagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggagtgttactcactaca 34012491  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttca 318  Q
     | || ||||||||||| ||||||||    
T  34012492 gtgttgatgttatagtgttaacttca 34012517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 27267016 - 27267318
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| || || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  27267016 tgtttaattcatttttaaattattgattattgattaattatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatc 27267115  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||  |    
T  27267116 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttgcactttgtggggtgttacactcaaaacaaggta-gattaa 27267213  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||   |||  |||||| |||||| |||||||| ||| || ||| | ||| ||||    
T  27267214 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttaatgccactgtacaaacagtggggtgtcactcactaca 27267313  T
Q  293 ttttt 297  Q
    |||||    
T  27267314 ttttt 27267318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 42721396 - 42721074
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| | ||| ||||| ||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  42721396 tgtttgattcatttttaaattattgattactcattaatgatcaatagtaattaatctagtaataattgcaacatcttggacttacatgtaatattttatc 42721297  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||| |    
T  42721296 gttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattacgtgataatctt-aagtgttatactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaa 42721201  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||| | | |  ||||||||||  | |||||||| ||| || ||||| ||| || |    
T  42721200 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgttactgtacaaacagtggggtgttactcactata 42721101  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||| ||| ||||| | |||||||||    
T  42721100 ttttttatgatatagggctaacttcac 42721074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 14758392 - 14758076
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  14758392 tgttcgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 14758293  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||          | ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  14758292 gttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtctt----------aatttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 14758203  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||| ||||||||       |||||||||||| | |||| | |||  |||||||||||||  ||||||| |||||  || || ||| ||||    
T  14758202 attagattaagtgcagtcttgttaatctaatgaattgatgaaactatggggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagttgtgtgctactcactaca 14758103  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
     |||| ||||||||||| | |||||||    
T  14758102 cttttgatgttatagtgttgacttcac 14758076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22171071 - 22170856
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  22171071 tgtttgatttatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaatttatctaataatgtttgcaacatcttagacttacaagaattattttatc 22170972  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||  |||||||||||||  |    
T  22170971 gttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacatttgaaacaaggtaggatgaa 22170873  T
Q  200 attagattaagtgtagt 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  22170872 attagattaagtgtagt 22170856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38823572 - 38823354
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgt 101  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||    
T  38823572 tttgtttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacaggtattattttatcgt 38823473  T
Q  102 tggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaat 201  Q
    ||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| || || |||||||| |||    
T  38823472 tggcatctctaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgttgggtgttacacttaaaataaagtaggataaaat 38823374  T
Q  202 tagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  38823373 tagattaagtgtattcttgt 38823354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 15168456 - 15168189
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  || |||||||||    
T  15168456 tgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttgtacttacatgtactattttatc 15168357  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  15168356 gttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatag-ccttaagtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 15168258  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgcca 261  Q
    |||||||||| || ||||||||       |||||||||||||| |||| | |||  |||||||||||||    
T  15168257 attagattaactgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgcca 15168189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 27532798 - 27533155
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  27532798 tgtttgattcattttt-aattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 27532896  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  27532897 gttggcatctttaacttgcaaacagaattgctgatatcatgtgatagtc-ttgagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 27532995  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||| ||||||||||| ||||||       |||||||||||||| |||| | | |  ||||||||||||| |||||||| ||| || |||||  ||  | |    
T  27532996 att-gattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaagagtgggttgttacccacaata 27533094  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcacnnnnnnnntcattctcgtgactttatcatagaat 353  Q
     |||| ||| ||||||| |||||||||        |||||||| | |||||||||||||||    
T  27533095 cttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcataactttatcatagaat 27533155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 47682310 - 47682585
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  47682310 tgtttaattcttttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 47682409  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| || ||| |    
T  47682410 gttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtc-ttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggcagaataaa 47682508  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaa 269  Q
    ||||| |||| |||||||||||       |||||||||||||| |||||| | |  ||||||||| ||| |||||||    
T  47682509 attagtttaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggaatgaacttttgataccactgtacaa 47682585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3535283 - 3535072
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||    
T  3535283 tgtttgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaggtactattttatc 3535184  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||          ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |    
T  3535183 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatg----------taagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggcaggataaa 3535094  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    |||||||||| |||| ||||||    
T  3535093 attagattaaatgtattcttgt 3535072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 56 - 261
Target Start/End: Original strand, 33725472 - 33725683
Alignment:
Q  56 tagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagt 155  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||  || |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  33725472 tagtaatgtttgcaacattttggtcttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtc-ttaaat 33725570  T
Q  156 gttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactag 248  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||| |||||| |||      
T  33725571 gttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactga 33725670  T
Q  249 acttttgatgcca 261  Q
    |||||||||||||    
T  33725671 acttttgatgcca 33725683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 41926516 - 41926199
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||| ||||||||  || |||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| || ||||||||     
T  41926516 tgtttgattcaattttaaatcattgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttg-aatatcttggacttacaagtactattttatt 41926418  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |       ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||| |||||||| |    
T  41926417 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatttaa-------taagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaagtaggataaa 41926325  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||| |||  | |||  |||| |||||||| |||||||| ||| |||| ||| ||| || |    
T  41926324 attagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttgtgatgccactgtacaaacagtgggatattactcactata 41926225  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttca 318  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  41926224 tttttgatgttatagtattaacttca 41926199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 39393744 - 39393467
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   || |||||||||    
T  39393744 tgttttattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggatttaccggtactattttatc 39393645  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggat-ac 198  Q
     |||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||| || |||||||| |||||||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||| |     
T  39393644 attggcatctttaacatggaaacagagttgctaatatcatatgatagtc-ttaagtgttacactttgtaggatgttacacttaaaacaaggtaggataaa 39393546  T
Q  199 aattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaa 270  Q
    |||||||| ||||||| ||||||       ||||||| |||||| |||| | | || ||||||||||||| ||||||||    
T  39393545 aattagatgaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggattaaacttttgatgccactgtacaaa 39393467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40885137 - 40884953
Alignment:
Q  36 atgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgata 135  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40885137 atgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcatcggcatctttaacatgcaaacatagttgatgata 40885038  T
Q  136 ttatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||  |||||| |||| |||||| ||||||| || ||||||||||| | ||||||    
T  40885037 ttatgcgatagtc-ttaagtgttacacttttcggaatgttacacttaaaacaagataggataaaactagattaagtgcaatcttgt 40884953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3309513 - 3309146
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||   || |||||||||    
T  3309513 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacgggtactattttatc 3309414  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactt----ta-tggggtgttacgcttataacaaggtagg 194  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||    || || ||||||||  ||| ||||| |||||    
T  3309413 gttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatttgatagtc-ttaagtgttacacttagtgtagtgaggtgttacatttaaaacaaagtagg 3309315  T
Q  195 at-acaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattc 286  Q
     | | |||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||| |||||  | |  ||||||||| ||| |||||||| || ||| ||||| ||    
T  3309314 ttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagattgaacttttgataccactgtacaaacag-tgggtgttactc 3309216  T
Q  287 attacatttttaatgttatagtgataacttcacnnnnnnnntcattctcgtgactttatcatagaatttt 356  Q
    |  ||| |||| ||||||||||| |||||| ||        |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3309215 acaacacttttgatgttatagtgttaactttaccagaaaagtcattctcatgactttaccatagaatttt 3309146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 48353902 - 48353739
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  48353902 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacagatactattttatc 48353803  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacacttt 165  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  48353802 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtctt--agtgttacacttt 48353739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 1359751 - 1359915
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||  || |||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||  || |||||||||    
T  1359751 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcgatagtaattcatccagtaatgcttgcaacattttgaacttacaggtactattttatc 1359850  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacacttt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  1359851 gttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgataatc-ttaagtgttacacttt 1359915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 11742184 - 11742347
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  11742184 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 11742283  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactt 164  Q
    ||||  ||||||||||| |||| | ||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11742284 gttgacatctttaacatacaaagagagttgctgatatcatgtgatagtc-ttaattgttacactt 11742347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 21289960 - 21289817
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21289960 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttataagtgttattttatc 21289861  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag 146  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||    
T  21289860 gttggcatctttaatatgcaaacagagt---tgatattatgtgatag 21289817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 38759846 - 38759678
Alignment:
Q  47 taattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag 146  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||  | |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  38759846 taattaatctagtaatgcttgcaacatcttggagttacatatattattttatagttgacacctttaacatgcaaacatagttggtgatattatctgatag 38759747  T
Q  147 tctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagt 216  Q
    || | |||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||| || |||| ||||| ||||| ||||||    
T  38759746 tc-tcaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataagatatgataaaattaaattaaatgtagt 38759678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 31621376 - 31621589
Alignment:
Q  12 tttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatct- 109  Q
    ||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||| ||||     
T  31621376 tttttaaattgttgattgatgattaatgatcaatagtagttcatctactaatgcttgcaacatattgaacttacatgtactattttatcgttggcatctt 31621475  T
Q  110 ----ttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattaga 205  Q
        |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| || |||||| || | |||| |||||||||||||| |||||||    
T  31621476 taacttaacatgcaaacatagttgttgatattatgcgatagtc-ttaagtgtcacac-ttctggggtattgcacttaaaacaaggtaggataaaattaga 31621573  T
Q  206 ttaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||| ||||||||    
T  31621574 ttaagtgcagtcttgt 31621589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 98 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 48620890 - 48620672
Alignment:
Q  98 tcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggata 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||          |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  48620890 tcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga----------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggata 48620801  T
Q  198 caattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcatta 290  Q
     |||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||| || | | |||  |||||||||| || |||||||| ||| || ||||| |||  |    
T  48620800 aaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaa 48620701  T
Q  291 catttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    || |||| |||||||| || |||||||||    
T  48620700 cacttttgatgttatattgttaacttcac 48620672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 31962977 - 31962853
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaa-ttgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||  |||| ||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  31962977 tgtttgatttatttttaaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtagttcatctaataatgcttgcaacatcttaaacttacatatattattttat 31962878  T
Q  99 cgttggaatctttaacatgcaaaca 123  Q
    |||||   |||||||||||||||||    
T  31962877 cgttgatttctttaacatgcaaaca 31962853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30254951 - 30254894
Alignment:
Q  260 cattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaatgttatagtgataacttca 318  Q
    ||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30254951 cattgtacaaacagtggg-tgttatccattacatttttgatgttatagtgttaacttca 30254894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 8248 - 7927
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgtt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  8248 ttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgtt 8149  T
Q  103 ggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaatt 202  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  8148 ggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaagttaggataaaatt 8050  T
Q  203 agattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacattt 295  Q
    |||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| |||||||| ||    
T  8049 agattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacaatt 7950  T
Q  296 ttaatgttatagtgataacttca 318  Q
    || ||||||||||| ||||||||    
T  7949 ttgatgttatagtgttaacttca 7927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 56)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 5830249 - 5829955
Alignment:
Q  8 ttcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaa 106  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  5830249 ttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaa 5830150  T
Q  107 tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagat 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  5830149 tctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagt-tttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagataaaatgagat 5830051  T
Q  207 taagtgtagtcttgtatgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaatgtta 304  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||  || || ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5830050 taagtgtagtcttg--ttaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcattacattttttatgtta 5829955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 22255546 - 22255220
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  22255546 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaaggcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatc 22255447  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||| || |    
T  22255446 gttggaatatttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagt-tttaagtgttacactttgtgtggtgttacgcttataacaaaataggctaaa 22255348  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  || || ||||| ||||||||    
T  22255347 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgataatatgagaactgaacttttgatgccattgtacaaacggtggggtgttactcattaca 22255248  T
Q  293 -tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
     ||||| |||||||| || |||||||||    
T  22255247 ttttttgatgttataatgttaacttcac 22255220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 36867126 - 36866764
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36867126 tgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatccagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 36867027  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  36867026 gttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagt-tttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 36866928  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    |||||||||| |||| ||||||       |||||||| ||||| |||  | |||  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||  | |    
T  36866927 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatcgggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaata 36866828  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcacnnnnnnnntcattctcgtgactttatcatagaatttt 356  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||        ||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  36866827 tttttgatattatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaatttt 36866764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 22973893 - 22974218
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||     
T  22973893 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatt 22973992  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  22973993 gtcgaaatctttaacatgcaaacagagttgataatattatgtaatagtc-ttaagtgttacattttgtgaggtgttacgcttataacaagataggataaa 22974091  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||  |||||||||| ||| |||||||| |||||||     
T  22974092 attagattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgataatatgagaattgaacttttgatgttattgtacaaacagtgggatgttactcattact 22974191  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22974192 tttttgatgttatagtgttaacttcac 22974218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 40133749 - 40133387
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40133749 tgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 40133650  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  40133649 gttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagt-tttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 40133551  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    |||||||||| |||| ||||||       |||||||| ||||| |||| | |||  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||  |||    
T  40133550 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatattatggggactgaacttttgatgccattgtacaaatagtggggtgttactcacaaca 40133451  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcacnnnnnnnntcattctcgtgactttatcatagaatttt 356  Q
    ||||| ||  |||| || |||||||||        ||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  40133450 tttttgatactataatgttaacttcaccacaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 40133387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 31705423 - 31705747
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||    
T  31705423 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatatgtactattttatc 31705522  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||| |||| |    
T  31705523 tttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatggtc-ttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaa 31705621  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| |||||||||||  || || ||||| || |||||    
T  31705622 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactggacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca 31705720  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  31705721 tttttgatgttatagtgttaacttcac 31705747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 27318299 - 27318623
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaa-ttgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    || ||||||||    
T  27318299 tgtttgattcatttttaaaattgttgatttttgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgtttgcaacatcttaaacttatg--tactattttat 27318396  T
Q  99 cgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatac 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||     
T  27318397 cgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctt-aagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataa 27318495  T
Q  199 aattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattac 291  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |  ||||| ||| |||    
T  27318496 aattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactgtgagaactaaacttttgatgtcattgtacaaacagtggtgtgttactcactac 27318595  T
Q  292 atttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  27318596 attttttatgttttagtgttaacttcac 27318623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 699514 - 699190
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  699514 tgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatc 699415  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| |||| || |||||| |||| |    
T  699414 gttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtattacactttgtggagtgttacacttaaaataaggtatgataaa 699316  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||  |||  |||||||||| || |||||||| ||| || ||||| ||| || |    
T  699315 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactaga 699216  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttca 318  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  699215 ttttttatgctatagtgttaacttca 699190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 36860785 - 36860425
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgtt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36860785 ttgattcatttttaaattgttgattactaattcatgattaatagtaattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgtt 36860686  T
Q  103 ggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgctt-ataacaaggtaggatacaat 201  Q
    |  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| |||    
T  36860685 gacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagt-tttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaaaaaaggtaggataaaat 36860587  T
Q  202 tagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatt 294  Q
    |||||||| |||| ||||||       |||||||| ||||| |||| | |||  |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| |||  |||||    
T  36860586 tagattaaatgtactcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatt 36860487  T
Q  295 tttaatgttatagtgataacttcacnnnnnnnntcattctcgtgactttatcatagaatttt 356  Q
    ||| ||  ||||||| |||||||||        ||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  36860486 ttttatactatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaatttt 36860425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 38528048 - 38528371
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  38528048 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatc 38528147  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  |||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||| |    
T  38528148 gttgatatctttaacatgtaaatagatttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaagataaa 38528246  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| || |||| ||| | | || ||||| ||||||||    
T  38528247 attagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag-actgaacttttgatgtcactgtataaacaatggggtgttactcattaca 38528345  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttca 318  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||    
T  38528346 attttgatgttatagtgttaacttca 38528371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22981157 - 22980937
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22981157 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgattgcaacatcttggacttacatatactattttatc 22981058  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  22981057 gttggcatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 22980959  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22980958 attagattaagtgtagtcttgt 22980937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 7208675 - 7208999
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  || |||||||||    
T  7208675 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatacttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatc 7208774  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  7208775 gttggaatctttaacatgcaaacagagttgaaaatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtgaggtgttacgtttataacaaggtaggataaa 7208873  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| || ||| |||  |||||||||| || ||||||||  || || ||||| || || ||    
T  7208874 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtcaatgtacaaacggtagggtgttactcgttgca 7208972  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||| |||||| | || |||||||||    
T  7208973 ttttttatgttacaatgttaacttcac 7208999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 17157842 - 17158166
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  17157842 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttatc 17157941  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  17157942 gttgaaatctttatcatgcaaacagagttgataatattatgtgatggtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataataaggtaagataca 17158040  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    |||| | |||||||||||||||       ||||||| |||||| ||| |  || | |||||||||| |||||||||||  || |  ||||| ||||||||    
T  17158041 attatactaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactataatgacga-acttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattaca 17158139  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17158140 ttttttatgttatagtgttaacttcac 17158166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 31786457 - 31786782
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  31786457 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 31786556  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||| |    
T  31786557 gttggcatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagt-tttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaagataggataaa 31786655  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||| |||||| | |  ||||||||||||| |||||||| ||| ||    |  ||| ||||    
T  31786656 attagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggcagtgctcactaca 31786755  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  31786756 tttttcatgctatagtgttaacttcac 31786782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35504729 - 35504509
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || || ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  35504729 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 35504630  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  35504629 gttgaaatctttaacatgcaaacagatttgataatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataatatggtaggataaa 35504531  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  35504530 attatattaagtgtagtcttgt 35504509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 30969135 - 30969460
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||     
T  30969135 tgtttgattcatttttaaattgtggattactgattaatgattaatagtaactcatctagtaatacttgcagcatcttgaacttatagatactattttatt 30969234  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||| |||||||| |    
T  30969235 gttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaagtaggataaa 30969333  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||| ||| ||| || ||||| |||  |||    
T  30969334 attagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtataaatagtggggtgttactcacaaca 30969433  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||    
T  30969434 cttttgatgttatagtgttaacttcac 30969460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 21088580 - 21088853
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgttattattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  21088580 tgtttgattcatttttaaattg--attatttattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttggatttacagatgttattttatcg 21088677  T
Q  101 ttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaa 200  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||| |     
T  21088678 ttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgataatc-ttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaag 21088776  T
Q  201 ttagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaa 270  Q
    ||||||||| |||| ||||||       |||||||| ||||| |||| | |||  |||||||||| |||||||||||    
T  21088777 ttagattaaatgtattcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaa 21088853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 24886451 - 24886143
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||     
T  24886451 tgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatt 24886352  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||                 ||||||| ||||||||||| |    
T  24886351 gttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttaca-----------------cttataataaggtaggataaa 24886270  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  24886269 attagattaagtgtagtcttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattaca 24886170  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||    
T  24886169 tttttgatgttatagtattaacttcac 24886143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 35826297 - 35826619
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  35826297 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 35826396  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| |    
T  35826397 gttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatta--tgataatc-ttaagggttacactttgtggagtgttacgcttaaaacaatgtagaataaa 35826493  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttg------tatgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacat 293  Q
    |||||||||| ||| || |||      |||||| |||||||| |||||| |||  |||||||||| || |||||||| | |    ||||| ||| |||||    
T  35826494 attagattaaatgtggtattgttaatctatgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatgaagtgttactcagtacat 35826593  T
Q  294 ttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||    
T  35826594 ttttgatgttatagtattaacttcac 35826619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12910719 - 12910503
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||     
T  12910719 tgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattgtatt 12910620  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  12910619 gttggcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 12910521  T
Q  200 attagattaagtgtagtc 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12910520 attagattaagtgtagtc 12910503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 27330668 - 27330345
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||  |||||||     
T  27330668 tgtttgattcatttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttatt 27330569  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||| |    
T  27330568 gttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtc-ttaagtgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaa 27330470  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||| |||  |       |||||||||||||| |||||  |||  |||||||||||||||||||||| |||  | ||||| |||  |||    
T  27330469 attagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccattgtacaaacagtaaggtgttactca--aca 27330372  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||    
T  27330371 cttttgatgttatagtgttaacttcac 27330345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33908596 - 33908377
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  33908596 tgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaatt-atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 33908498  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||| |||| |    
T  33908497 gttggcatctttaacatacaaacatagttgacgatattatgcgatagtc-ttaagtgttacactttctggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaa 33908399  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  33908398 attagattaagtgcagtcttgt 33908377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 35511293 - 35511508
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||  || |||||||||    
T  35511293 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatc 35511392  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||      |||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||| ||||| |    
T  35511393 gttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt------gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaa 35511486  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  35511487 attagattaagtgtagtcttgt 35511508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 2888256 - 2888472
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  || |||||||||    
T  2888256 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttggacttacaggtactattttatc 2888355  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  |||  |||||||||  ||| |    
T  2888356 gttgacatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatctgatagtc-ttaagtgttacactttatggaatgttaaacttgaaacaaggtaaaataaa 2888454  T
Q  200 attagattaagtgtagtc 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2888455 attagattaagtgtagtc 2888472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 7693585 - 7693269
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  7693585 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtattattttatc 7693486  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||          ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| |    
T  7693485 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgctaatatcatgtg----------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaa 7693396  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||| ||| || |||       |||||||||||||| || ||| | |  ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||  |||    
T  7693395 attagattaagcgtattcatgttaatctaatgaattgatgatactaagaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtgggatgttactcacaaca 7693296  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||    
T  7693295 cttttgatgttatagtgttaacttcac 7693269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 9200586 - 9200272
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||    
T  9200586 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttatagatactattttatcgt 9200487  T
Q  102 tggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaat 201  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||          ||||||||||||| |||  |||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  9200486 tggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtg----------agtgttacactttgtggaatgttacacttaaaacaaggtaggataaaat 9200397  T
Q  202 tagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatt 294  Q
    |||||||| |||| ||||||       |||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| || ||||||||  || || ||||| |||  ||| |    
T  9200396 tagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaagaggactaaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttactcacaacact 9200297  T
Q  295 tttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||    
T  9200296 tttgatgttatagtgttaacttcac 9200272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5837916 - 5837699
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgtt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  || |||||| |||||    
T  5837916 ttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttgcaggtactattttgtcgtt 5837817  T
Q  103 ggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaatt 202  Q
    |  |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||| |||||||  ||||    
T  5837816 gtcatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaatgtaggattaaatt 5837718  T
Q  203 agattaagtgtagtcttgt 221  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  5837717 agattaagtgtattcttgt 5837699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 57 - 318
Target Start/End: Original strand, 23116090 - 23116357
Alignment:
Q  57 agtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtg 156  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23116090 agtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtg 23116188  T
Q  157 ttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactaga 249  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||       |||||||||||||| ||||  ||||  |    
T  23116189 ttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatattgttaatctgatgaattgatgatactatgtaaactgaa 23116288  T
Q  250 cttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaatgttatagtgataacttca 318  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||| || || || ||| |||| |||| |||||||| || ||||||||    
T  23116289 cttttgattccactgtacaaacagtggggtgctactcactacagttttgatgttataatgttaacttca 23116357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 23954613 - 23954867
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgttattattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||      |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||     ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23954613 tgtttaattcatttttaaattgtt------gattaatgatcaatagtaattcatcaagtaatgtt-----catcttgcacttacaaatattattttatcg 23954701  T
Q  101 ttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaa 200  Q
    |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  23954702 ttggcat-tttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctt-aagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 23954799  T
Q  201 ttagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgcca 261  Q
    |||||||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||  ||||  |||||||||||||    
T  23954800 ttagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggaaactgaacttttgatgcca 23954867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 357
Target Start/End: Original strand, 25500739 - 25501100
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||||||    
T  25500739 tttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaacagtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgt 25500838  T
Q  102 tggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaat 201  Q
    ||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  25500839 tggcatctttaacatctaaagaaagttgctgatatcatgtgatgatc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaat 25500937  T
Q  202 tagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatt 294  Q
    || ||||||| || ||||||       |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||| || |||||||| |||  | |||||||||  ||| |    
T  25500938 taaattaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggacttaacttttgatggcagtgtacaaacagtgaggtgttattcacaacact 25501037  T
Q  295 tttaatgttatagtgataacttcacnnnnnnnntcattctcgtgactttatcatagaattttt 357  Q
    ||| ||| ||||||| |||||| ||        |||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  25501038 tttgatgctatagtgttaactttaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttt 25501100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 15992351 - 15992627
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   || |||||||||    
T  15992351 tgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccggtactattttatc 15992450  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | || | | |||||||| ||| |    
T  15992451 gttggcatctttaacatgcaaacagagttcctgatatcatgcgatagtc-ttaagtgtgacactttgtggggtgttgcactcaaatcaaggtagaataaa 15992549  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaa 270  Q
    ||||||| ||||||| ||||||       |||||||||||||| |||||  |||  |||||||||| || ||||||||    
T  15992550 attagatcaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcactgtacaaa 15992627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19120220 - 19120003
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgtt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |  || ||||||||||||    
T  19120220 ttgattcatttttaaattgttgatcactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagactttgaggtactattttatcgtt 19120121  T
Q  103 ggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaatt 202  Q
    || |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||    
T  19120120 ggcatctttaacatgcaaacggagttgctgatatcatgtgatagtctt-aagtgttacactttgtggggtgttatacttaaaacaaggtaggataaaatt 19120022  T
Q  203 agattaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||| ||||| || ||||||    
T  19120021 agagtaagtttattcttgt 19120003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 316
Target Start/End: Original strand, 43308473 - 43308784
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgt 101  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||| ||    
T  43308473 tttgattcgtttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttattgt 43308572  T
Q  102 tggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaat 201  Q
     ||||||||||||||||||  | ||||||||||        |||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  43308573 cggaatctttaacatgcaagaagagttgatgat--------atagtc-ttaagtgttacacttttcagggtgttacacttataacaaggtaagataaaat 43308663  T
Q  202 tagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatt 294  Q
    |||||||||| |||| ||||       |||| ||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||    
T  43308664 tagattaagtatagttttgttaagctgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacgaacag-tgggtgttattcattacatt 43308762  T
Q  295 tttaatgttatagtgataactt 316  Q
    ||| |||||||| || ||||||    
T  43308763 tttgatgttataatgttaactt 43308784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8437323 - 8437120
Alignment:
Q  7 attcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgga 105  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||     
T  8437323 attcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggc 8437224  T
Q  106 atctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattaga 205  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||    |||| ||||||| |||||| |||||||    
T  8437223 atctttaacattcaaacagagttgatcatattatgtgataatc-ttaagtgttacacattgtggggtgtataacttaaaacaaggcaggataaaattaga 8437125  T
Q  206 ttaag 210  Q
    |||||    
T  8437124 ttaag 8437120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 8741696 - 8741973
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||  || |||||||||    
T  8741696 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatttcatctagtgatgcttgcaacattttggacttacatgtactattttatc 8741795  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgat-attatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatac 198  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||| | || || ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| || |     
T  8741796 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgctcataatcatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtatgacaa 8741894  T
Q  199 aattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaa 270  Q
    ||||||||||| |||| ||||||       |||||||||||||| ||||   |||  ||||||||||||||||||||||    
T  8741895 aattagattaattgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccattgtacaaa 8741973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 35934260 - 35933992
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||   || ||||||||     
T  35934260 tgtttgaatcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcaactagtaatgcttgcaacatcttggacttaccggtactattttatt 35934161  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggat-ac 198  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |     
T  35934160 gttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 35934062  T
Q  199 aattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgcca 261  Q
    || ||||||||||||| ||||||       |||||||||||||| ||||   ||| ||||||||||||||    
T  35934061 aactagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtgactggacttttgatgcca 35933992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22019985 - 22019776
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22019985 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttagacttacaagtattattttatcgt 22019886  T
Q  102 tggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaat 201  Q
    ||| |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||          ||||||| ||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||| |||    
T  22019885 tggcatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtg----------agtgttatactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaat 22019796  T
Q  202 tagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  22019795 tagattaagtgtattcttgt 22019776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 39573175 - 39572869
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  39573175 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 39573076  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
     |||| ||||||        |||| ||||| |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||| |    
T  39573075 attggcatcttt--------aacagagttgttgatatcatgtgatagtc-tcgagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaa 39572985  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||| ||||||       ||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||| || || ||||| ||| |  ||||| |||  |||    
T  39572984 attagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgcacaaacagtggagtgttactcacaaca 39572885  T
Q  293 tttttaatgttatagt 308  Q
    ||||| || |||||||    
T  39572884 ttttttatattatagt 39572869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Original strand, 13956187 - 13956393
Alignment:
Q  15 ttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaa 113  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||| ||||||||    
T  13956187 ttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactaacaggtactattttatcgttggcatctttaa 13956286  T
Q  114 catgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgt 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||| |||  |||||| ||  ||| ||||||||||||||     
T  13956287 catgcaaacaaatttgatgatattatatgatagtc-ttaagtgttacgctttgtagggtgttacacttgaaacaagataaaataaaattagattaagtga 13956385  T
Q  214 agtcttgt 221  Q
    ||| ||||    
T  13956386 agttttgt 13956393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 92 - 318
Target Start/End: Original strand, 14919431 - 14919663
Alignment:
Q  92 attttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggt 191  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| || |||||||| ||||||| |||||    
T  14919431 attttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtattacaatttgtgaggtgttacacttataataaggt 14919529  T
Q  192 aggatacaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttat 284  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||       |||| ||||||||| |||||| |||  |||||||||| |||| || ||| |||  | |||||     
T  14919530 aggataaaattagattaagtgtagttttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatataaacagtgaggtgttac 14919629  T
Q  285 tcattacatttttaatgttatagtgataacttca 318  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  14919630 tcattacatttttgatgttataatgttaacttca 14919663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15724852 - 15724632
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||| || ||||||||     
T  15724852 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaatattttggacttacaagtactattttata 15724753  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| |||| || ||||||||  || ||||||  |||| || ||||||| ||| |    
T  15724752 gttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtc-ttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaa 15724654  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    |||| |||||||||| ||||||    
T  15724653 attaaattaagtgtattcttgt 15724632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 319
Target Start/End: Original strand, 1428997 - 1429281
Alignment:
Q  24 tattattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaaca 123  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  1428997 tattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaata 1429096  T
Q  124 aagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt-- 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |                 |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||      
T  1429097 aagtttatgatattatgtgatagtctt-aagtgttacacttaa-----------------aacaaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgtta 1429178  T
Q  222 -----atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaatgttatagtgataactt 316  Q
         |||||||||||||| ||||   |||  | ||||||||||| |||||||| ||| || ||||| ||| || |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  1429179 atttgatgaattgatgatactatggagactgaatttttgatgccagtgtacaaacagtggggtgttactcactatatttttgatgctatagtgttaactt 1429278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 14409152 - 14409302
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||  ||| | ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14409152 tgttcgattcatttttaaattgttgattgctgaataatgatcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaagtactattttatc 14409251  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 150  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  14409252 gttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtctt 14409302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 42343085 - 42342875
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |  |||||||||    
T  42343085 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtcctattttatc 42342986  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||          ||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||| ||| |||| |    
T  42342985 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtg----------agtgttacactttgtggtgtattacacttaaaacaa-gtaagataaa 42342897  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  42342896 attagattaagtgtattcttgt 42342875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 32563504 - 32563189
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| |||  ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  32563504 tgtttgattcatttttaaattgttaattgctgattaatgatcaataataatttatctagtaattcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatc 32563405  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||          ||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||| |    
T  32563404 gttggcatctataacatgcaaacagagttgctgatatcatgtg----------agtgttacactttgtgggctgttacacttaaaacaaggtaggataaa 32563315  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||| || | | |||  |||||||||| || |||||| | ||| |  ||||| |||  |||    
T  32563314 attagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgtcactgtacagacagtggagtgttactcacaaca 32563215  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttca 318  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||    
T  32563214 cttttgatgttatagtgttaacttca 32563189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25669940 - 25669737
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||  || |||||||||    
T  25669940 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatc 25669841  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||          |||||||||| || ||| ||||||| |||| ||||| |||||||| |    
T  25669840 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtg----------agtgttacac-ttgtggagtgttacacttaaaacaaagtaggataaa 25669752  T
Q  200 attagattaagtgta 214  Q
    |||||||||||||||    
T  25669751 attagattaagtgta 25669737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 25889734 - 25889582
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||  || ||||||||     
T  25889734 tgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctttcaacatcttggatttacaggtactattttatt 25889635  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttta 152  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25889634 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtcataatcttta 25889582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 51 - 221
Target Start/End: Original strand, 6824343 - 6824510
Alignment:
Q  51 tcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 150  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||||||||||    
T  6824343 tcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtattgttttatc-ttgacatctttaacatgcaaacagagttgct-atatcttgtgatagtctt 6824440  T
Q  151 taagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt 221  Q
     |||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  6824441 -aagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgt 6824510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 26268332 - 26268113
Alignment:
Q  106 atctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattaga 205  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| |||| |||| ||    
T  26268332 atctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgtgatagtctt-aagtgttacactttgtgcggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaatttga 26268234  T
Q  206 ttaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacattttta 298  Q
    |||| |||| ||||||       |||||||||||||| |||| | |||| |||||||||| ||  ||||||| ||| || ||||| |||  ||| ||||     
T  26268233 ttaattgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactcaaaacacttttg 26268134  T
Q  299 atgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||| ||||||| |||||||||    
T  26268133 atgctatagtgttaacttcac 26268113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 8467090 - 8466931
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| | ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8467090 tgtttgattcatttttaaactgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaaataatattttatc 8466991  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttaca 161  Q
    |||   | |||||| ||| ||||| ||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  8466990 gtt-acacctttaatatgtaaacagagttggtgatatcatatgatagtc-ttaagtgttaca 8466931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 319
Target Start/End: Original strand, 5112250 - 5112449
Alignment:
Q  125 agttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt--- 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||| |||||| |||| |||| |||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||       
T  5112250 agttgatgatattatgtgaaagtctt-aagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacatggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaa 5112347  T
Q  222 ----atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaatgttatagtgataacttc 317  Q
        |||||||||||||| |||| | |||  ||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| ||| || |||||| ||||||||||  |||||||    
T  5112348 tttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttc 5112447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 28416362 - 28416466
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  28416362 tgtttgattcttttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatcaagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttatc 28416461  T
Q  100 gttgg 104  Q
    |||||    
T  28416462 gttgg 28416466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 43254219 - 43254156
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatg 63  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  43254219 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatg 43254156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 356
Target Start/End: Original strand, 14409310 - 14409499
Alignment:
Q  173 gttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgt 265  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||  ||    
T  14409310 gttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag-actgaacttttgatgccaccgt 14409408  T
Q  266 acaaaaagttggatgttattcattacatttttaatgttatagtgataacttcacnnnnnnnntcattctcgtgactttatcatagaatttt 356  Q
    |  || ||| || || || ||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||        |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  14409409 attaagagtggggtgctactcactacatttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaatttt 14409499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 221
Target Start/End: Original strand, 28416490 - 28416558
Alignment:
Q  153 agtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||| || ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  28416490 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggcagaataaaattagattaagtgtattcttgt 28416558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 26269166 - 26269069
Alignment:
Q  8 ttcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgg 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| | | |||||| |||||||| || || |||||||||  |||||||  || ||||||||| ||||    
T  26269166 ttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagtaatttatctagtattgcttacaacatcttaaacttacaggtactattttatccttgg 26269069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 59)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 309
Target Start/End: Original strand, 42505899 - 42506211
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgtt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  42505899 ttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtt 42505998  T
Q  103 ggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaatt 202  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  42505999 ggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaatt 42506097  T
Q  203 agattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacattt 295  Q
    |||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||||||| ||| || | ||| |||||||| ||    
T  42506098 agattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtattactcattacaatt 42506197  T
Q  296 ttaatgttatagtg 309  Q
    || |||||||||||    
T  42506198 ttgatgttatagtg 42506211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 319
Target Start/End: Original strand, 26941084 - 26941406
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgtt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  26941084 ttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgtt 26941183  T
Q  103 ggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaatt 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26941184 ggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagt-tttaagtgttacactttatgaggtattacgcttataacaaggtaggataaaatt 26941282  T
Q  203 agattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacattt 295  Q
    |||||||||||||||||||       ||||||| ||||||  ||||| |||  |||||||||| |||| |||||| ||| || ||||| |||||| | ||    
T  26941283 agattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgataccatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggtgttactcattataatt 26941382  T
Q  296 ttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    || || |||||||| |||||||||    
T  26941383 ttgattttatagtgttaacttcac 26941406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 48355296 - 48354934
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  48355296 tgtttgattcatttttaaattgttgcttactgattaatgatcaataataattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacagatactattttatt 48355197  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||| |    
T  48355196 gtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggtatgttacatttataacaaggtaggataaa 48355098  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    |||||| |||||||||||||||       |||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| | | || ||||| ||||||||    
T  48355097 attagactaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgccattgtacaaacaatggggtgttactcattaca 48354998  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcacnnnnnnnntcattctcgtgactttatcatagaatttt 356  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||        |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  48354997 tttttaatattatagtgttaacttcaccataaaaatcattctcatgacttcaccatagaatttt 48354934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 46297583 - 46297908
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46297583 tgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatc 46297682  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  46297683 gttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 46297781  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
     || ||||||||||||| ||||       |||||||||||||| || | | |||  |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||| ||| || |    
T  46297782 gtttgattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacggggactgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactata 46297881  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  46297882 tttttgatgttatagtgttaacttcac 46297908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 34133288 - 34132928
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  34133288 tttgattcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgt 34133189  T
Q  102 tggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaat 201  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  34133188 tggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaat 34133090  T
Q  202 tagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatt 294  Q
    || |||||||||| |||| |       |||||||||||||| |||| | |||  |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| |||  |||||    
T  34133089 tatattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatt 34132990  T
Q  295 tttaatgttatagtgataacttcacnnnnnnnntcattctcgtgactttatcatagaatttt 356  Q
    ||| ||  ||||||| ||| |||||        ||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  34132989 tttgatactatagtgttaatttcaccaaaaaagtcattttcgtgacttcattatagaatttt 34132928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 40552080 - 40552403
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || || ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  || |||||||||    
T  40552080 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcatggacttacatgtactattttatc 40552179  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| || |||| |    
T  40552180 gttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacaatc-ctaagtgttacacgttgtgggatgttacgcttataacaagctaagataaa 40552278  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    |||| |||||||||||| ||||       |||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| |||||||||||  || |  ||||| ||||||||    
T  40552279 attaaattaagtgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattaca 40552378  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttc 317  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||    
T  40552379 tttttgatgttatagtgttaacttc 40552403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 47481878 - 47481552
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  47481878 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaagtactattttat 47481779  T
Q  99 cgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatac 198  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||||  |||     
T  47481778 cgttgaaatctttaatatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaataaggtataataa 47481680  T
Q  199 aattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattac 291  Q
    ||||| |||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| |||| |||||| ||| || ||||| |||||||    
T  47481679 aattatattaagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgatactatgagggctaaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattac 47481580  T
Q  292 atttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  47481579 atttttgatgttatagtgttaacttcac 47481552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 21009622 - 21009938
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  21009622 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttat 21009721  T
Q  99 cgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatac 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||| ||||| |||||| || ||||     
T  21009722 cgttggaatctttaacatgcaaatattgttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagagtgttatgcttagaacaagttatgataa 21009820  T
Q  199 aattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattac 291  Q
    ||||| |||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| |||| |||||| ||| || ||||| |||||||    
T  21009821 aattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgataatatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcattac 21009920  T
Q  292 atttttaatgttatagtg 309  Q
    |||||| |||||||||||    
T  21009921 atttttgatgttatagtg 21009938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 39283007 - 39282735
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||     
T  39283007 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggatttacagatactattttatt 39282908  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |    
T  39282907 gttgacatctttaacaggcaaacatatttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaa 39282809  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgta 266  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  39282808 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatggatgataatatgagaactgaacttttgatgccactgta 39282735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 53228973 - 53229249
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  53228973 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtattattttatc 53229072  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| || ||||||||||| |    
T  53229073 gttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatactatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggagttacacttaaaataaggtaggataaa 53229171  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaa 270  Q
    |||||||||| |||||||||||       |||||||||||||| |||||  |||  ||||||||||| | ||||||||    
T  53229172 attagattaactgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgcaactgtacaaa 53229249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 316
Target Start/End: Original strand, 3655031 - 3655345
Alignment:
Q  11 atttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcat--ctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaat 107  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| || || ||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| ||||||    
T  3655031 atttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatatgtgttattttatcgatggaat 3655130  T
Q  108 ctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagatt 207  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  3655131 ctttaacatgcaaacagagctgatgatatcatgtgatagt-tttaagtgttacattttgtggtgtgttacgcttctaacaaggtaggataaaattagatt 3655229  T
Q  208 aagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaat 300  Q
    ||||||| ||||||       |||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| |||||||||||  || || ||||| ||||||||||||| ||    
T  3655230 aagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttat 3655329  T
Q  301 gttatagtgataactt 316  Q
    ||||||||| ||||||    
T  3655330 gttatagtgttaactt 3655345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 4761469 - 4761795
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||     
T  4761469 tgtttgattcattttcaaattgttgatttctgattaatgattaatagtaattcatctggtaatgtttgcaacattttggacttataggtactattttatt 4761568  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttat-ggggtgttacgcttataacaaggtaggatac 198  Q
    || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||     
T  4761569 gtcggaatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttatactttgtgggggtgttatacttataacaaggtaggataa 4761667  T
Q  199 aattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattac 291  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||||||| |||    ||||| |||||||    
T  4761668 aattagattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaagtgttactcattac 4761767  T
Q  292 atttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||||| || |||||||  |||||||||    
T  4761768 atttttgatattatagtattaacttcac 4761795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 37203423 - 37203098
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||  || |||||||||    
T  37203423 tgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcgatatattggacttacaggtactattttatc 37203324  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaa-agttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatac 198  Q
     |||  ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| || | || |||||||||||     
T  37203323 attgacatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtctt-aagtgttacactttgtggggtgatacactaaaaataaggtaggataa 37203225  T
Q  199 aattagattaagtgtagtcttg-------tatgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattac 291  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| ||| |||    
T  37203224 aattagattaagtgtagtcttgttaatcttatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactac 37203125  T
Q  292 atttttaatgttatagtgataacttca 318  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||    
T  37203124 aattttgatgttatagtgttaacttca 37203098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 52040743 - 52041069
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  52040743 tgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaataatcattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 52040842  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||| |||| |||||||||||||| |    
T  52040843 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactatgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaa 52040941  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagtt-ggatgttattcattac 291  Q
    ||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||| |||||  |||  ||||||||||||| | |||||| | || ||  |||| ||| |||    
T  52040942 attagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactatacaaacatttggggagttactcactac 52041041  T
Q  292 atttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    | |||| ||||||||||  |||||||||    
T  52041042 acttttgatgttatagtattaacttcac 52041069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 24488783 - 24489108
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | | ||||||||     
T  24488783 tgtttgattcatttttaaattattgattattgattcatgattaatagtaatgcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttactgacactattttatt 24488882  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || || |||||||| |||| ||||| ||| |||| |    
T  24488883 gttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattgtgtgatagtc-ttaagtgttacaccttgtgaggtgttacacttaaaacaatgtaagataaa 24488981  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||| ||||||       ||||||||||||||||||| | |||  |||||||||| |||||| |||| ||| | |||||| |||  |||    
T  24488982 attagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgataatatggggactgaacttttgatgtcattgtgcaaacagtggaatgttactcacaaca 24489081  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||||||  ||||||  |||||||||    
T  24489082 tttttaatactatagtcttaacttcac 24489108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 37158063 - 37157739
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||  || |||||||||    
T  37158063 tgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcgacatattggacttacatgtactattttatc 37157964  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaa-agttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatac 198  Q
     |||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||||     
T  37157963 attggcatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaataaggtaggataa 37157865  T
Q  199 aattagattaagtgtagtcttg-------tatgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattac 291  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||||| |||||  |||  ||||||||||||| ||||| || ||| || ||||| ||| |||    
T  37157864 aattagattaagtgtagtcttgttaatcttataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactgtac-aacagtggggtgttactcactac 37157766  T
Q  292 atttttaatgttatagtgataacttca 318  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||    
T  37157765 aattttgatgttatagtgttaacttca 37157739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 54506163 - 54505839
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  54506163 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttataaatactattttat 54506064  T
Q  99 cgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatac 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||| ||||| ||||||||| ||||     
T  54506063 cgttggaatctttaacatgcaaataaagtagatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagagtgttatgcttagaacaaggtatgataa 54505965  T
Q  199 aattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattac 291  Q
    ||||| |||||||||||||||||       ||| ||| |||||| ||||||  ||  | |||||||| |||| || ||| | | || ||||| |||||||    
T  54505964 aattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgtatttatgatactatgag-gctgaatttttgatgtcattctataaataatggggtgttactcattac 54505866  T
Q  292 atttttaatgttatagtgataacttca 318  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  54505865 atttttgatgttatagtgttaacttca 54505839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 33378606 - 33378826
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||    
T  33378606 tgtttgattcatttttaaatcgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatc 33378705  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  33378706 gttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgagattatgcgatagtc-ttaagtattacacttcttggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 33378804  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  33378805 attagattaagtgcagtcttgt 33378826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 3362610 - 3362283
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  || ||  ||||||||    
T  3362610 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatattggacttctaagtacaattttatc 3362511  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||| || ||||||||||| |    
T  3362510 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgtttcacttaaaataaggtaggataaa 3362412  T
Q  200 attagatta--agtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcatta 290  Q
    |||||||||  |||||||||||||       ||||||||||||||  ||||| | |  ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||    
T  3362411 attagattaatagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgataccatgaggagtgaacttttgatgccactgtacaaatagtgggatgttactcacta 3362312  T
Q  291 catttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
     |||| | ||| ||||||| |||||||||    
T  3362311 tatttctgatgctatagtgttaacttcac 3362283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 24707936 - 24708158
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||  || |||||||||    
T  24707936 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaatttatctaataatgcttgcaacttcttggacttacatgtactattttatc 24708035  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |    
T  24708036 gttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgattgt-tttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaa 24708134  T
Q  200 attagat--taagtgtagtcttgt 221  Q
    |||||||   ||||||||||||||    
T  24708135 attagatcaaaagtgtagtcttgt 24708158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Original strand, 46994490 - 46994754
Alignment:
Q  9 tcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaat 107  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  || |||||||| || |||||    
T  46994490 tcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaat 46994589  T
Q  108 ctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagatt 207  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46994590 ctttagcatgcaaacataattgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacattttgtggggcgttacacttataacaaggtaggataaaattagatt 46994688  T
Q  208 aagtgtagtcttg-------tatgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgta 266  Q
    |||||||||||||       ||||| ||||||||| |||||| |||  |||||||||| |||||||    
T  46994689 aagtgtagtcttgttaatcatatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgta 46994754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 22622539 - 22622759
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  22622539 tgtttgattcatttttaaatagttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 22622638  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||| |    
T  22622639 gttgacatctttaacatccaaacagatttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacgctttgtggggtgttacacttgaaacaaggtatgataaa 22622737  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  22622738 attagattaagtgtagttttgt 22622759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 270
Target Start/End: Original strand, 7327306 - 7327579
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgtt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  7327306 ttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgtt 7327405  T
Q  103 ggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaatt 202  Q
    || |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||| || |    
T  7327406 ggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacactagaaagaaggtaggataaaaat 7327504  T
Q  203 agattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaa 270  Q
    | |||||||||| ||||||       |||||||||||||| |||| | |||  |||||||||| || ||||||||    
T  7327505 aaattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaa 7327579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 4015814 - 4015491
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||| |    
T  4015814 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttacc 4015715  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||| |    
T  4015714 gttggcatctttaacatgcaaac-aagttgttgatacaatgcgatagtc-ttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaa 4015617  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    |||||| ||| | || ||||||       |||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| || | |||||| |||||| ||||| |||  |||    
T  4015616 attagactaattatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactctacaaacagttgggtgttactcacaaca 4015517  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttca 318  Q
     |||| ||| ||||||| ||||||||    
T  4015516 cttttgatgctatagtgttaacttca 4015491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33698504 - 33698288
Alignment:
Q  5 tgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttg 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  || |||||||||||||    
T  33698504 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaatatcttagacttacaggtactattttatcgttg 33698405  T
Q  104 gaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaatta 203  Q
    | |||||||||||||||||| |||||  ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  33698404 gcatctttaacatgcaaacagagttgccgatatcatgcgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 33698306  T
Q  204 gattaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  33698305 gattaagtgtattcttgt 33698288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 11357202 - 11357365
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  11357202 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatc 11357301  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactt 164  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11357302 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactt 11357365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 221
Target Start/End: Original strand, 54828547 - 54828742
Alignment:
Q  25 attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaa 124  Q
    |||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||     
T  54828547 attactgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatagttggaatttttaacatacaaacat 54828646  T
Q  125 agttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54828647 agttgatgatattatttgatagt-tttaagtgttacactttgtgggatgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgt 54828742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21193962 - 21193741
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || || ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||   || |||||||||    
T  21193962 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatttagtaatggttgcaacatcttgaacttacggctactattttatc 21193863  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  21193862 gtgagaatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtctttaagtgttatcctttatggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 21193763  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    |||||||||| |||| ||||||    
T  21193762 attagattaaatgtattcttgt 21193741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 44891849 - 44891585
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgtt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |  || ||||||||||||    
T  44891849 ttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgtaggtactattttatcgtt 44891750  T
Q  103 ggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaatt 202  Q
    |  ||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  44891749 gacatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgatagtctt-aagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 44891651  T
Q  203 agattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgcca 261  Q
    |||||||||||| ||||||       || ||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||    
T  44891650 agattaagtgtattcttgttaatctgattaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgcca 44891585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1090048 - 1089832
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |  || |||||||||    
T  1090048 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggattta-atgtactattttatc 1089950  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgggg-tgttacgcttataacaaggtaggatac 198  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||     
T  1089949 gttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatgttatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataa 1089851  T
Q  199 aattagattaagtgtagtc 217  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  1089850 aattagatttaatgtagtc 1089832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32373813 - 32373605
Alignment:
Q  13 ttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatcttt 111  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||  ||||||    
T  32373813 ttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttgacatcttt 32373714  T
Q  112 aacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagt 211  Q
    || ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  32373713 aatatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtc-ttaagtgtcacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagt 32373615  T
Q  212 gtagtcttgt 221  Q
    ||| ||||||    
T  32373614 gtattcttgt 32373605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 2008294 - 2007964
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt--------attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatatta 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||        |||| ||||| ||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  2008294 tgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattactgattaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtacta 2008195  T
Q  93 ttttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggta 192  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||| |||| ||| |||||    
T  2008194 ttttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggagtg-tacacttaaaacgaggta 2008097  T
Q  193 ggatacaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttatt 285  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||       |||||||||||||  |||| | | |  ||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |    
T  2008096 ggataaaattagattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatgctatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttact 2007997  T
Q  286 cattacatttttaatgttatagtgataacttca 318  Q
    ||  ||| |||||| | ||||||| ||||||||    
T  2007996 cacaacacttttaacgctatagtgttaacttca 2007964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 38592051 - 38591778
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||  | || ||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  38592051 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttgtttaataatgcttgcaacatcttggatttacaaatacttttttatcgt 38591952  T
Q  102 tggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaat 201  Q
    ||  |||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||| |||||| |||| |||  |||||| ||||||| |||    
T  38591951 tgtcatctttgacatgcaaatagatttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgtcacgttttgtggggtattacacttgaaacaagataggataaaat 38591853  T
Q  202 tagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||       |||| ||||| |||||||| | |||  |||||||||||||||||||||    
T  38591852 tagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgataataatatgtggacttaacttttgatgccattgtacaa 38591778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22451323 - 22451056
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||  ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||     
T  22451323 tgttcgattcatttttaaatttttgattgctgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatt 22451224  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| | || |    
T  22451223 gttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacgatagt-gttaaatgttacacttactggggtgttacacttaaaacaaggtaaggtaaa 22451125  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgcca 261  Q
    ||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||| |||| | |||  |||||||||||||    
T  22451124 attagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgcca 22451056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 29099701 - 29099385
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||    
T  29099701 tgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaggtactattttatc 29099602  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |          |||||||||| ||||||||||| |||| || |||| | |||| |    
T  29099601 gttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgaaa----------gttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggcacgataaa 29099512  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    |||| |||||||||| ||||||       |||||||||||||| || | | |||  ||||| |||| || |||||||| ||| || ||||| |||  |||    
T  29099511 attaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactgaactttagatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacgaca 29099412  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29099411 ttttttatgttatagtgttaacttcac 29099385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 43348563 - 43348392
Alignment:
Q  49 attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc 148  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||    
T  43348563 attcatttagtaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtc 43348464  T
Q  149 tttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt 221  Q
     |||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  43348463 -ttaagtgtcacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgt 43348392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 65 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11467114 - 11466890
Alignment:
Q  65 ttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactt 164  Q
    |||||||||||| ||||| ||  || |||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  11467114 ttgcaacatcttagacttgcaggtactattttgtcgttggtatcttaaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtctt-aagtgttacactt 11467016  T
Q  165 tatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgat 257  Q
    | |||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||| |||| | |||| |||||||||    
T  11467015 tgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgat 11466916  T
Q  258 gccattgtacaaaaagttggatgtta 283  Q
    |||| |||||||| ||| || |||||    
T  11466915 gccactgtacaaacagtggggtgtta 11466890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 71 - 197
Target Start/End: Original strand, 20373136 - 20373261
Alignment:
Q  71 catcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggg 170  Q
    ||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20373136 catcttggacttatatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagt-tttaagtgttacactttatggg 20373234  T
Q  171 gtgttacgcttataacaaggtaggata 197  Q
     | ||||||||||||||||||||||||    
T  20373235 atattacgcttataacaaggtaggata 20373261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 22445886 - 22446210
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||| |  || |||||||||    
T  22445886 tgtttgattcatatttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaatacttgcaacattttggacttaaaggtactattttatc 22445985  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || ||||||| || || | | ||||||| |||| ||||| |||||||| |    
T  22445986 gttggtatctttaatatgcaaaaatagttgatgatattatatgatagtc-ttgagtgttatacattgt-gagtgttacacttaaaacaatgtaggataaa 22446083  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactag-acttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattac 291  Q
    |||||||||||||||||||| |       |||||||||||||| ||||||   | | ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||| ||     
T  22446084 attagattaagtgtagtcttatttatatgatgaattgatgatactatgagggtttgaacttttgatgccactgtac-aaaagtggggtgttactcactat 22446182  T
Q  292 atttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||||| ||| |||| || |||||||||    
T  22446183 atttttgatgatataatgttaacttcac 22446210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 25580087 - 25579769
Alignment:
Q  8 ttcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaa 106  Q
    ||||||||||||||||| |||   |||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| |  ||   |||||||||||| |    
T  25580087 ttcatttttaaattgttgattgcggattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttagatttataggtacagttttatcgttggca 25579988  T
Q  107 tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagat 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||    
T  25579987 tctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtaatagtctt-aagtgttacactttgtggggtgttacactaaaaacaaggtaggataaaattagat 25579889  T
Q  207 taagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaa 299  Q
    |||||||| | ||||       || || ||||||||||||| | |||  |||||||||| || |||| ||| ||| | ||||||||||  ||| |||| |    
T  25579888 taagtgtatttttgttaatctaataaactgatgataatatggggactgaacttttgatgtcactgtataaatagtagaatgttattcacaacacttttga 25579789  T
Q  300 tgttatagtgataacttcac 319  Q
    || ||||||  |||||||||    
T  25579788 tgctatagtattaacttcac 25579769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 43975713 - 43975985
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  43975713 tgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactattttatc 43975812  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaa---agttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggat 196  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||   |||||||||||||||| |||        ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || |||    
T  43975813 gttggcatctttaacatgtaaacaacatagttgatgatattatgcgat--------agtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaagataagat 43975904  T
Q  197 acaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaa 270  Q
    | |||||||||||||| | | ||||       |||||||||||||| |||||| | || |||||||||| ||| |||||||    
T  43975905 aaaattagattaagtgcaattttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggattaaacttttgatgtcatcgtacaaa 43975985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29164157 - 29163955
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgttattattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||      |||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  29164157 tgtttgatttatttttaaattgtt------gattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttagacttacaagtactattttatcg 29164064  T
Q  101 ttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaa 200  Q
    || | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||          ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  29164063 ttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtg----------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 29163974  T
Q  201 ttagattaagtgtagtctt 219  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  29163973 ttagattaagtgtattctt 29163955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36012494 - 36012272
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    || |||||||||    
T  36012494 tgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcagcattttggacttatcggtactattttatc 36012395  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaa-agttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggat-a 197  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||| || | ||||||||||||| |    
T  36012394 gttggcatctttaacatggaaacaagagttgctgatatcatttgatagtc-ttaagtgttacattttgtgggatgttacactgaaaacaaggtaggataa 36012296  T
Q  198 caattagattaagtgtagtcttgt 221  Q
     |||||||||| ||||| ||||||    
T  36012295 aaattagattaggtgtattcttgt 36012272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 146
Target Start/End: Original strand, 51212599 - 51212738
Alignment:
Q  8 ttcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaa 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||    
T  51212599 ttcatttttaaattgttgatttttaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaa 51212698  T
Q  107 tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51212699 tctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 51212738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 154 - 356
Target Start/End: Original strand, 51212955 - 51213164
Alignment:
Q  154 gtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaact 246  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||       |||| ||||||||| |||||| |||    
T  51212955 gtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggact 51213054  T
Q  247 agacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaatgttatagtgataacttcacnnnnnnnntcattctcgtgactttatc 346  Q
      |||||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||        |||||||| |||||| | |    
T  51213055 caacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatgttacagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcacc 51213154  T
Q  347 atagaatttt 356  Q
    ||||||||||    
T  51213155 atagaatttt 51213164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 14586501 - 14586711
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   || |||||||||    
T  14586501 tgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccg-tactattttatc 14586599  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||  |          ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  14586600 gttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcatacg----------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 14586689  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt 221  Q
     |||||||||||||| ||||||    
T  14586690 gttagattaagtgtattcttgt 14586711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 45174815 - 45174584
Alignment:
Q  46 gtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgata 145  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| || | |||    
T  45174815 gtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgttactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatattata 45174716  T
Q  146 gtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggat-acaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataat 237  Q
    ||| |||||||||||||||| | | ||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||       |||||||||||||| |    
T  45174715 gtc-ttaagtgttacactttgtagagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatact 45174617  T
Q  238 atgagaactagacttttgatgccattgtacaaa 270  Q
    ||| | |||  ||||||||||| | ||||||||    
T  45174616 atggggactgaacttttgatgctactgtacaaa 45174584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 44186338 - 44186485
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |  || |||||||||    
T  44186338 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagacttagaggtactattttatc 44186437  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagt 147  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  44186438 attggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagt 44186485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 11835500 - 11835662
Alignment:
Q  46 gtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgata 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||      |||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  11835500 gtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttaacat------catgcaaatagagttgatgatatcatgtgata 11835593  T
Q  146 gtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca-attagattaagtgta 214  Q
    ||| |||| ||||||||||| | || |||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  11835594 gtc-ttaattgttacactttgtaggttgttacacttaaaacaaggtaggataaatattagattaagtgta 11835662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 40936325 - 40936165
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgtt 102  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||  |||| ||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  || ||||||||||||    
T  40936325 ttgatttatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcatgtactattttatcgtt 40936226  T
Q  103 ggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactt 164  Q
    || |||||||||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  40936225 ggcatctttaacatgcaaacggagttgctaatatcatgtgatagtc-ttaagtgttacactt 40936165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 50475173 - 50475021
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggt-------aattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatatta 92  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||| |       |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  50475173 tgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtatta 50475074  T
Q  93 ttttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgata 145  Q
    ||||||| |||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  50475073 ttttatccttgacatctttaatatgcaaacagatttgatgatattatatgata 50475021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 27480179 - 27480562
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttg----caacatcttggacttacaaatattattt 95  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||   ||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||     ||||| |||||||||||  || |||||    
T  27480179 tgttcgattcatttttaaattgttgatcgctgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgtttgtaattaacattttggacttacatgtactattt 27480278  T
Q  96 tatcgttggaatctttaacatgcaaac----aaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactt-------------tatggggtgttacg 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||             |   |||||||||     
T  27480279 tatcgttggcatctttaacatgcaaacatatatagttgatgatattatgcgatagtc-ttaagtgttacacttctgggtgttacacttctgggtgttaca 27480377  T
Q  179 cttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaa 271  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||| |||| | |||  |||||||||| ||  |||||||     
T  27480378 cttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaac 27480477  T
Q  272 agttggatgttattcattacatttttaatgttatagtgataacttcacnnnnnnnntcattctcgtgactttatcatagaatttt 356  Q
    | ||||||| || |||||| | |||| ||||||||||| | |||| ||        |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  27480478 aattggatgctactcattatacttttgatgttatagtgttgactttaccaaaaatatcattctcatgacttcatcatagaatttt 27480562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 150
Target Start/End: Original strand, 53811596 - 53811701
Alignment:
Q  41 taatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatg 140  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  53811596 taatagtaattcatctaggaatgcctgcaacatcttggacttacgagtattattttatcgttggtatctttaacatg----caaagttgatgatattatg 53811691  T
Q  141 tgatagtctt 150  Q
    ||||||||||    
T  53811692 tgatagtctt 53811701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 35844575 - 35844356
Alignment:
Q  106 atctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggat-acaattag 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||    
T  35844575 atctttaacatggaaacaaagttactgatatcatgtgata-tctt-aagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaactaggtaggataaaaattag 35844478  T
Q  205 attaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacattttt 297  Q
    |||||||||| ||||||       |||||||||||||| |||| | |||| |||||||||| || |||||||| |||  | ||||| |||  ||||||||    
T  35844477 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacattttt 35844378  T
Q  298 aatgttatagtgataacttcac 319  Q
      |||||||||| |||||||||    
T  35844377 gttgttatagtgttaacttcac 35844356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 184 - 319
Target Start/End: Original strand, 20373300 - 20373442
Alignment:
Q  184 aacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttg 276  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  20373300 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgataccatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 20373399  T
Q  277 gatgttattcattacatttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    | ||||| || |||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  20373400 ggtgttactcgttacatttttgatgttatagtattaacttcac 20373442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 59 - 170
Target Start/End: Original strand, 11357030 - 11357140
Alignment:
Q  59 taatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgtt 158  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  11357030 taatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcattggcatatttaacatacaaccagagttgatgatattatatgatagtc-ttgagtgtt 11357128  T
Q  159 acactttatggg 170  Q
    ||||||| ||||    
T  11357129 acactttgtggg 11357140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 53176284 - 53176133
Alignment:
Q  125 agttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt--- 221  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||   ||| ||  |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||       
T  53176284 agttgctgatatcatgtgatagtctt-aagtgttacactttgtggagtgttatatttaaaatgaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaa 53176186  T
Q  222 ----atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaa 270  Q
        |||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||  ||||||||||    
T  53176185 tctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgttattgtacaaa 53176133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 356
Target Start/End: Original strand, 44186488 - 44186684
Alignment:
Q  167 tggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgc 259  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||       |||||||||||||| |||| | |||  ||||||||||     
T  44186488 tggggtgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatttgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgt 44186587  T
Q  260 cattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaatgttatagtgataacttcacnnnnnnnntcattctcgtgactttatcatagaatttt 356  Q
    || |||| ||| ||  || ||||| |||  ||| |||| ||| ||||||| |||||||||        ||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  44186588 cactgtataaacagcggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctctcgacttcatcatagaatttt 44186684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 319
Target Start/End: Original strand, 11357371 - 11357511
Alignment:
Q  187 aaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagt-tgga 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||       |||||||||||||| |||||  |||  ||||||||||| | |||||||| |||  ||     
T  11357371 aaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgcaactgtacaaacagtggggg 11357470  T
Q  279 tgttattcattacatttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||| ||| || | |||| ||| ||||||| |||||||||    
T  11357471 tgttactcactatacttttgatgctatagtgttaacttcac 11357511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 54)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 31578886 - 31579216
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31578886 tgtttgattcatttttaaattattgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatc 31578985  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  31578986 gttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttatagggtgttatacttataacaaggtaggataaa 31579084  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgta-----caaaaagttggatgttattca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||  |||  |||||||||| |||||||      ||| ||| || ||||| |||    
T  31579085 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcattgtataaattaaacagtggggtgttactca 31579184  T
Q  288 ttacatttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  31579185 ttacatttttgatgttatagtgttaacttcac 31579216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30055863 - 30055542
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgtt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  30055863 ttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtt 30055764  T
Q  103 ggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaatt 202  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  30055763 ggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaatt 30055665  T
Q  203 agattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacattt 295  Q
    |||||||||||||||||||       ||||||| |||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| |||||||| ||    
T  30055664 agattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacaatt 30055565  T
Q  296 ttaatgttatagtgataacttca 318  Q
    || || |||||||| ||||||||    
T  30055564 ttgatattatagtgttaacttca 30055542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 32820875 - 32821200
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  32820875 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgatgaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatc 32820974  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  32820975 gttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtc-ttaagtgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaa 32821073  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    | || ||||| |||||||||||       |||||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||| ||| ||||    
T  32821074 actaaattaactgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactaca 32821173  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||    
T  32821174 tttttgatgttatattgttaacttcac 32821200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 9355648 - 9355973
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  9355648 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatc 9355747  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||  |    
T  9355748 gttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagt-tttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggatgaa 9355846  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||| || | ||  ||| ||||    
T  9355847 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaacgataatatgagaactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtattgctcactaca 9355946  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| |||||    
T  9355947 ttttttatgctatagtgttaaattcac 9355973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 37110213 - 37109886
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  37110213 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 37110114  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaagg--taggata 197  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  37110113 gttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtataggata 37110015  T
Q  198 caattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcatta 290  Q
     ||||| |||||||||||||||||       |||||||||||||| ||| |  |||  |||||||||| |||||||||||  || || ||||| ||||||    
T  37110014 aaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcatta 37109915  T
Q  291 catttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  37109914 cattttttatgttatagtgttaacttcac 37109886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18797666 - 18797306
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||     
T  18797666 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatt 18797567  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  18797566 gtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttataacaaggtaggataaa 18797468  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||| |||||| | |  |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  18797467 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattaca 18797368  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcacnnnnnnnntcattctcgtgactttatcatagaatttt 356  Q
    ||||| ||||  ||||| |||||||||        |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  18797367 ttttttatgt--tagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 18797306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 27284073 - 27283758
Alignment:
Q  11 atttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatct 109  Q
    ||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  27284073 atttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatct 27283974  T
Q  110 ttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaa 209  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27283973 ttaacatgcaaacatagttgataatattatgtgatagt-tttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaa 27283875  T
Q  210 gtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaatgt 302  Q
    || |||||||||       || ||||||| ||| |||||| |||  |||||||||  |||||||||||  || || ||||| ||||||||||||| ||||    
T  27283874 gtatagtcttgttaatctgataaattgataatactatgaggactgaacttttgatttcattgtacaaacggtggggtgttactcattacatttttgatgt 27283775  T
Q  303 tatagtgataacttcac 319  Q
    ||||||| |||||||||    
T  27283774 tatagtgttaacttcac 27283758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 17842406 - 17842733
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  17842406 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 17842505  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaagg--taggata 197  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  17842506 gttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtc-ttaagtgttacactttgtgggatgttacgcttataacaaggtataggata 17842604  T
Q  198 caattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcatta 290  Q
     ||||| |||||||||||||||||       |||||||||||||| ||| |  |||   ||||||||| |||||||||||  || || ||||| ||||||    
T  17842605 aaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgagcttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcatta 17842704  T
Q  291 catttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17842705 cattttttatgttatagtgttaacttcac 17842733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 24212081 - 24211755
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  || ||||||||    
T  24212081 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttat 24211982  T
Q  99 cgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatac 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||| ||||     
T  24211981 cgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtc-ttaggtgttacactttgtaggatgttacacttagaacaaggtatgataa 24211883  T
Q  199 aattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattac 291  Q
    ||||| |||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||  ||  ||||||||||||||| || ||| ||| || ||||| |||||||    
T  24211882 aattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccattctataaacagtagggtgttactcattac 24211783  T
Q  292 atttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24211782 atttttgatgttatagtgttaacttcac 24211755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 7335132 - 7334809
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  || ||||||||     
T  7335132 tgtttgattcatttttaaattattgatttctgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatt 7335033  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    || |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  7335032 gtcggaatctttaacattcaaacta-gttgatgatattatctgataatctt-aagtgttacactctgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaa 7334935  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  7334934 attagattaagtgtagtcttgttaagctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattaca 7334835  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttca 318  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||    
T  7334834 tattttatgttatagtgttaacttca 7334809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 68 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 38258816 - 38258559
Alignment:
Q  68 caacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttat 167  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  38258816 caacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgt 38258718  T
Q  168 ggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgcc 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||| |||||| | |  |||||||||| |    
T  38258717 ggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtc 38258618  T
Q  261 attgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||||||||  ||  | ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38258617 attgtacaaacggtgtggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcac 38258559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 11071542 - 11071269
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11071542 tgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaggtattattttatc 11071443  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||| |    
T  11071442 gttg---tctttaacatgcgaacaaagttgatgatattatgtgataatc-ttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaa 11071347  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaa 270  Q
    ||||||||||| ||||| ||||       |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||||||    
T  11071346 attagattaagcgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgtacaaa 11071269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4583258 - 4582896
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  4583258 tgtttaattcatttttaaattgttgatgactgattcatgattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattatttgatc 4583159  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||| |    
T  4583158 gttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagt-tttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaa 4583060  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    |||||||||| |||| ||||||       |||||||| ||||| |||| | |||  |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| |||  |||    
T  4583059 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaaca 4582960  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcacnnnnnnnntcattctcgtgactttatcatagaatttt 356  Q
    ||||| ||  ||||||  |||||||||        ||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  4582959 tttttgatactatagtattaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 4582896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 37703320 - 37703538
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  37703320 tgtttaattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatc 37703419  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||| || ||| || |||| |    
T  37703420 gttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtggtacactttgtgggatgttacacttaaaataagatatgataaa 37703518  T
Q  200 attagattaagtgtagtctt 219  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  37703519 attagattaagtgtagtctt 37703538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 10481934 - 10481619
Alignment:
Q  11 atttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatct 109  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| | ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||    
T  10481934 atttttaaattgttaattactgattaacgatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacggatactattttattgttggaatct 10481835  T
Q  110 ttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaa 209  Q
    || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  10481834 ttgacatgcaaagagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaa 10481736  T
Q  210 gtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagt-tggatgttattcattacatttttaatg 301  Q
    | ||||||||||       |||||||||||||| ||| |  |||  | |||||||| ||||||||||| |||  || ||||| |||||| |||||| |||    
T  10481735 gcgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataaagactgaatttttgatgtcattgtacaaacagtgggggtgttactcattatattttttatg 10481636  T
Q  302 ttatagtgataacttca 318  Q
    |||||||| ||||||||    
T  10481635 ttatagtgttaacttca 10481619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 49 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 43686330 - 43686018
Alignment:
Q  49 attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc 148  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  43686330 attcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagt- 43686232  T
Q  149 tttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatga 241  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||       |||||||| ||||| |||      
T  43686231 tttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatag 43686132  T
Q  242 gaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaatgttatagtgataacttcacnnnnnnnntcattctcgtgact 341  Q
    | |||  |||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||  |||||||| || |||||||| |||||||||        ||||| ||||||||    
T  43686131 ggactgaacttttgatgccattgtacaaacag-tgggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaacttcacccaaaaagtcattttcgtgact 43686033  T
Q  342 ttatcatagaatttt 356  Q
    | | |||||||||||    
T  43686032 tcaccatagaatttt 43686018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 32432791 - 32432515
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || |||||||||    
T  32432791 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgattcatgattaataataattcatctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatc 32432692  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| || ||||||||||| |    
T  32432691 gttggcatctttaatatgcaaacagtgttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 32432593  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaa 270  Q
    |||| ||||| |||| ||||||       |||||||||||||| ||||   |||  |||||||||| |||||||||||    
T  32432592 attatattaactgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgtcattgtacaaa 32432515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 15672581 - 15672804
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttaca---aatattatttt 96  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||   | |||||||||    
T  15672581 tgtttaattcatttttaaattgttgattattgatgcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattatttt 15672680  T
Q  97 atcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggat 196  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  15672681 atcgttggcatctttaacattcaaatagagttgatgatattatgtgatagtctt-aagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggat 15672779  T
Q  197 acaattagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    | |||||||||||||||| ||||||    
T  15672780 aaaattagattaagtgtattcttgt 15672804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 23111531 - 23111204
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||| || ||||||||| || |||||  || |||||||||    
T  23111531 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgatttatgatcaatagtaattcttctagtaatgctttcaacatctttgatttacatgtactattttatc 23111432  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtagg--ata 197  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |  |||    
T  23111431 gttgttatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaagtatgatata 23111333  T
Q  198 caattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcatta 290  Q
     |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| || ||    |  |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||| |||  |    
T  23111332 aaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgatggttgaacttttgatgccattgtacaaatagtggtgtgttactcacaa 23111233  T
Q  291 catttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
     |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  23111232 tatttttgatgttatagtgttaacttcac 23111204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 308
Target Start/End: Original strand, 41764907 - 41765214
Alignment:
Q  8 ttcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaa 106  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| |||  ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||  || ||||| |||||||| |    
T  41764907 ttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaataataattcatccagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatgtactatttcatcgttggca 41765006  T
Q  107 tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagat 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||||    
T  41765007 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtagagtaaaattagat 41765105  T
Q  207 taagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaa 299  Q
    |||||| ||||||||       |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||  ||||||| ||| || || || ||| |||| |||| |    
T  41765106 taagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttga 41765205  T
Q  300 tgttatagt 308  Q
    || ||||||    
T  41765206 tgctatagt 41765214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 10359036 - 10359348
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| || || ||||||    
T  10359036 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaaatcatttagtaatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactaatttatc 10359135  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| |    
T  10359136 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgttgttatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaa 10359234  T
Q  200 attaga-ttaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattac 291  Q
    |||||| ||||||||||||||||       |||||||||||||| ||| || |||  |||||||||| || |||| ||| ||| |||||||| ||| |||    
T  10359235 attagatttaagtgtagtcttgttgatctgatgaattgatgatactatcag-actgaacttttgatgtcactgtataaatagtaggatgttactcactac 10359333  T
Q  292 atttttaatgttata 306  Q
    | |||| ||| ||||    
T  10359334 acttttgatgctata 10359348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 37347360 - 37347036
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  37347360 tgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaatatcttggacttacagatactattttatc 37347261  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||| ||| |||| |    
T  37347260 attggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtc-ttaagtgttacactttgtggagt-ttacacttaaaacaatgtatgataaa 37347163  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    |||||||||||||||||| |||       || ||||||||||| |||||| |||  |||||||||| || |||||||| | | || ||||| |||||| |    
T  37347162 attagattaagtgtagtcctgttaatttaataaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcattata 37347063  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  37347062 tttttgatggtatagtattaacttcac 37347036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 319
Target Start/End: Original strand, 15612584 - 15612905
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgtt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||   ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||||| ||    
T  15612584 ttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaacaataattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcatt 15612683  T
Q  103 ggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaatt 202  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  15612684 ggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 15612782  T
Q  203 agattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacattt 295  Q
    | |||||||||| ||||||       |||||||||||||| |||  | |||  ||||||||||||| | |||||| | | || ||||| |||| |||  |    
T  15612783 aaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatagggactgaacttttgatgccactctacaaacactggggtgttactcataaca-ct 15612881  T
Q  296 ttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    || ||||||||||| |||||||||    
T  15612882 ttgatgttatagtgttaacttcac 15612905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 356
Target Start/End: Original strand, 5657309 - 5657665
Alignment:
Q  7 attcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgga 105  Q
    ||||||||||||||| || |||| | ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||     
T  5657309 attcatttttaaatttttgattactcattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggc 5657408  T
Q  106 atctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattaga 205  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |    
T  5657409 atctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgcgatagtc-ttaagtattacactttgtgggctgttacacttaaaacaaagtaggataaaattaaa 5657507  T
Q  206 ttaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacattttta 298  Q
    ||||||||| | ||||       |||||||||||||| |||||  |||  ||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||  ||| ||||     
T  5657508 ttaagtgtatttttgttaatatgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttg 5657607  T
Q  299 atgttatagtgataacttcacnnnnnnnntcattctcgtgactttatcatagaatttt 356  Q
    ||||||||||| |||||||||        |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  5657608 atgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 5657665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8861624 - 8861301
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  8861624 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatttcatctagtaatgcatgcaacatcttagacttacatgtactattttatc 8861525  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| ||| || |||||||||||||  |||||||||| |||| || ||||||||||| |    
T  8861524 gttggtatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatggtc-ttgagtgttacactttgcggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 8861426  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    |||||||||| |||| | ||||       || ||||||||||| |||| | |||  ||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||| |||    
T  8861425 attagattaaatgtattgttgttaatctgattaattgatgatactatggggacttaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttattcataaca 8861326  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttc 317  Q
     |||| ||| ||||||| |||||||    
T  8861325 cttttgatgctatagtgttaacttc 8861301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 46480951 - 46481171
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  46480951 tgttttatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttagacttacatgtactattttatc 46481050  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||| ||| |    
T  46481051 gttgacatctttaacatgcaaacaaagttaatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttatgagatgttacacttaaaacaatgtagaataaa 46481149  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    |||| || |||| |||||||||    
T  46481150 attacatcaagtatagtcttgt 46481171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 21991966 - 21991650
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    ||| ||| |||||||||||     || |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  21991966 tgtttgattcatttttaaattgttgattaatgat----gatcaatagtaattcatct-----tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatc 21991876  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  21991875 gttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 21991777  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||| |||| | |||  |||||||||| || |||||||| ||| || ||||| ||   |||    
T  21991776 attagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgacactgtacaaacagtggggtgttactcgcaaca 21991677  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
     |||| ||| ||||||| |||||||||    
T  21991676 attttgatgctatagtgttaacttcac 21991650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 48928119 - 48928339
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||    
T  48928119 tgttcgatttatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactatttcatc 48928218  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||| || |||||||| |||| ||||| |||||||| |    
T  48928219 gttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtc-ttaagcattacactttctgaggtgttacacttaaaacaatgtaggataaa 48928317  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||||||||| | ||||||    
T  48928318 attagattaagtgcaatcttgt 48928339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 25691366 - 25691642
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||||||||||    
T  25691366 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacattttgaacttacatgtgttattttatc 25691465  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||   ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||| |    
T  25691466 gttaacatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtc-ttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 25691564  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaa 270  Q
    |||||||||| |||| | ||||       |||||||||| ||| ||| ||||||  ||| ||||||||| ||||||||    
T  25691565 attagattaaatgtatttttgttaatatgatgaattgataatactataagaactgaactgttgatgccactgtacaaa 25691642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 29173861 - 29173699
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  29173861 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatc 29173762  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactt 164  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  29173761 gttggcat-tttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgtaacactt 29173699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 43925434 - 43925227
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||      ||||||||||    
T  43925434 tgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacgta------ttattttatc 43925341  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||| ||| || || || |||||| | |||| ||||||||| |||| |    
T  43925340 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgattgt-attaagtattaaacgttgtgaggtgttgcacttaaaacaaggtatgataaa 43925242  T
Q  200 attagattaagtgta 214  Q
    |||||||||||||||    
T  43925241 attagattaagtgta 43925227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6546855 - 6546638
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgtt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||  || ||||||||||||    
T  6546855 ttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcctcatcttagacttacaggtactattttatcgtt 6546756  T
Q  103 ggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaatt 202  Q
    || ||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||| |  |||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  6546755 ggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgataat-attaagtgttatactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 6546657  T
Q  203 agattaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||| |||| ||||||    
T  6546656 agattaaatgtattcttgt 6546638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 26587914 - 26588126
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26587914 tgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcctgcaacatcttggacttacatgtattattttatc 26588013  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| ||||||        |||| ||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  26588014 gttggcatcttt--------aacagagttgttgatatcatgtgatagtc-ttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 26588104  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  26588105 attagattaagtgtattcttgt 26588126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 31520563 - 31520726
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  31520563 tgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatc 31520662  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactt 164  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31520663 gttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactt 31520726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12166074 - 12165871
Alignment:
Q  9 tcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaat 107  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||  ||    
T  12166074 tcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgtcat 12165975  T
Q  108 ctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagatt 207  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||          ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  12165974 ctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtg----------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagatt 12165885  T
Q  208 aagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||| ||||||    
T  12165884 aagtgtattcttgt 12165871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 316
Target Start/End: Original strand, 33688132 - 33688406
Alignment:
Q  48 aattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagt 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||| |||||| || |||||||    
T  33688132 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctgatatcatatgatagt 33688231  T
Q  148 ctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatat- 239  Q
    ||| || ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||| |||     
T  33688232 cttgaa-tgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaagtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactata 33688330  T
Q  240 gagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaatgttatagtgataactt 316  Q
    ||| |||  ||||||||||||| || ||||| ||| |||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  33688331 gag-actgaacttttgatgccactggacaaacagtaggatgttactcataacacttttgatgttatagtgttaactt 33688406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 44411362 - 44411509
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||| | |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  44411362 tgtttcattcatttttaaattgttgattactgattaatggtcaatattaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagataatattttatc 44411461  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagt 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44411462 gttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagt 44411509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44598980 - 44598785
Alignment:
Q  23 ttattattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaac 122  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||  |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  44598980 ttattattgattaatgatcaatagt--ttcatctagtaatgcttgtaacatcttagacttacatgtattattttatcgttgtcatctttaacatgcaaac 44598883  T
Q  123 aaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    | ||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  44598882 agagttgttgatatcatgtgatagtc-ttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaaatgtattcttgt 44598785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 22687566 - 22687254
Alignment:
Q  5 tgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttg 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  22687566 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctattaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 22687467  T
Q  104 gaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaatta 203  Q
    | ||| ||        |||| ||||| |||||| ||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  22687466 gcatcctt--------aacagagttgttgatatcatgagatagtc-ttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 22687376  T
Q  204 gattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttt 296  Q
    ||||||||||| | ||||       |||||||||||||| |||| | |||  ||||||||| ||| || ||||| ||| |  ||||| |||  |||||||    
T  22687375 gattaagtgtattattgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgataccactgcacaaacagtggagtgttactcacaacatttt 22687276  T
Q  297 taatgttatagtgataacttca 318  Q
    | ||||||||||| ||||||||    
T  22687275 tgatgttatagtgttaacttca 22687254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 35353447 - 35353256
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||    
T  35353447 tgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtgattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtactattttatc 35353348  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggta 192  Q
    ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  35353347 gttgacatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgagatagtc-ttaagtgttacattttctggggtgttacacttaaaacaaggta 35353256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 49 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 38053751 - 38053500
Alignment:
Q  49 attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc 148  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38053751 attcatcaaataatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgttggaatctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 38053652  T
Q  149 tttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgtatgaattgatgataatatgagaactag 248  Q
     ||||||||||||                 |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||| | ||||||||||      
T  38053651 -ttaagtgttaca-----------------cttataacaaagtatgataaaattagattaagtgtagtcttgt-taatttgatgacactatgagaactga 38053571  T
Q  249 acttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  38053570 acttttgatgtcattgtacaaacagtagggttttactcattacattttttatgttatagtattaacttcac 38053500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 109 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37704387 - 37704276
Alignment:
Q  109 tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagatta 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  37704387 tttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagtctt-aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaatta 37704289  T
Q  209 agtgtagtcttgt 221  Q
    |||||||||||||    
T  37704288 agtgtagtcttgt 37704276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 319
Target Start/End: Original strand, 12390478 - 12390777
Alignment:
Q  8 ttcatttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaa 106  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |    
T  12390478 ttcatttttaaattgtcaattactgattaatgataaatagtaattcatctagtaatggttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggca 12390577  T
Q  107 tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagat 206  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |                 || ||||||| ||| ||||||||    
T  12390578 tctttaacatgcaagctgagttgatgatattatgtga--gtctt-aagtgttacacttaa-----------------aagaaggtagaataaaattagat 12390657  T
Q  207 taagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaa 299  Q
    |||||||||||||||       |||||||||| ||| |||| | ||   |||||||||| || || ||||| ||| |||||||| |||||||| |||| |    
T  12390658 taagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggacataacttttgatgtcactgcacaaacagtgggatgttactcattacacttttga 12390757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 37704521 - 37704387
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||| ||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  37704521 tgtttgattcatttgtaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctggtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatc 37704422  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgat 134  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  37704421 gttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgat 37704387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 26980642 - 26980482
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgtt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| ||   ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  26980642 ttgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaacaataattcatctagtaatacttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgtt 26980543  T
Q  103 ggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactt 164  Q
    |  |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26980542 gacatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtc-ttaagtgttacactt 26980482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 164
Target Start/End: Original strand, 32593040 - 32593191
Alignment:
Q  13 ttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatcttt 111  Q
    |||||||||||| |||  ||||| |||||  || |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  || ||||||| |||||  ||||||    
T  32593040 ttttaaattgttgattgctgattaatgatccatagtaatttatctagtaatatttgtaacatcttggacttacatgtactattttaacgttgacatcttt 32593139  T
Q  112 aacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactt 164  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32593140 aacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtc-ttaagtgttacactt 32593191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 34362000 - 34362123
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgttatt-attgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  34362000 tgtttgattcatttttaaattgttaatgactgattaatgatcaaaagtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactattttatc 34362099  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaaca 123  Q
    ||||  || |||||||||||||||    
T  34362100 gttgatatttttaacatgcaaaca 34362123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 91 - 221
Target Start/End: Original strand, 48928477 - 48928606
Alignment:
Q  91 tattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaagg 190  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||| || |||||||| |||| || || |    
T  48928477 tattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtc-ttaagcattacactttctgaggtgttacacttaaaataatg 48928575  T
Q  191 taggatacaattagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  48928576 taggataaaattagattaagtgcaatcttgt 48928606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 319
Target Start/End: Original strand, 27421313 - 27421526
Alignment:
Q  111 taacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaag 210  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  27421313 taacatgcaaacagagttgctgatatcatacgatagtctt-aagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaag 27421411  T
Q  211 tgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaatgtt 303  Q
    |||| ||||||       || |||| |||||| ||| || |||  |||||||||| ||||||||||| ||| |  ||||| |||  ||| |||| |||||    
T  27421412 tgtattcttgttaatctgataaatttatgatattat-aggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatgtt 27421510  T
Q  304 atagtgataacttcac 319  Q
    |||||| |||||||||    
T  27421511 atagtgttaacttcac 27421526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 221
Target Start/End: Original strand, 44413351 - 44413421
Alignment:
Q  151 taagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  44413351 taagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagccttgt 44413421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 29173696 - 29173603
Alignment:
Q  184 aacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaa 270  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| |||||||||||    
T  29173696 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaa 29173603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 26980479 - 26980337
Alignment:
Q  184 aacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttg 276  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||| |||| | |||  ||||||||||||| ||||||||  || |    
T  26980479 aacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgccactgtacaaaccgtgg 26980380  T
Q  277 gatgttattcattacatttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    | ||||| |||  ||| |||| ||| |||| || |||||||||    
T  26980379 ggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaacttcac 26980337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 225 - 356
Target Start/End: Original strand, 26524380 - 26524511
Alignment:
Q  225 aattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaatgttatagtgataacttcacnnnnn 324  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| || ||||| | | |  ||||| |||  |||||||| ||||||||||| |||| ||||         
T  26524380 aattgatgatactatgaggactggacttttgatgccactgcacaaacaatggagtgttagtcacaacatttttgatgttatagtgttaacatcaccagaa 26524479  T
Q  325 nnntcattctcgtgactttatcatagaatttt 356  Q
       |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  26524480 aagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 26524511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 221
Target Start/End: Original strand, 31520729 - 31520766
Alignment:
Q  184 aacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  31520729 aacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgt 31520766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 1149459 - 1149764
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  1149459 tgtttgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatc 1149558  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  1149559 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgataatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagataaa 1149657  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||| |||||| ||   |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  1149658 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggacagaacttttgatgtcattgtacaaacagtgggttgttactcattaca 1149757  T
Q  293 tttttaa 299  Q
    |||||||    
T  1149758 tttttaa 1149764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 37970346 - 37970671
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||     
T  37970346 tgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatt 37970445  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  37970446 gtaaggatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaa 37970544  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttg-------tatgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||  ||  |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  37970545 attagattaagtgtagtcttgttaatcatatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatggcattgtacaaacagtggggtgttactcattaca 37970644  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  37970645 tttttgatgttatagtgttaacttcac 37970671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 23854258 - 23854583
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||     
T  23854258 tgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatt 23854357  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |    
T  23854358 gtcggaatctttaacatgcaagcagagttgatgatattatgtgattgtc-ttaagtgttacactttatgcggtgttacacttataactaggtaagataaa 23854456  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    |||||||||| |||||| ||||       |||| ||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  23854457 attagattaattgtagtattgttaatctaatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgcacaaacagttgggtgttactcattaca 23854556  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  23854557 ttttttatgttatagtgttaacttcac 23854583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 16446702 - 16447024
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  16446702 tgttagattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatc 16446801  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
     |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |    
T  16446802 attggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacgctttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaa 16446900  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    |||| |||||||||||||||||       |||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||| |||||| ||| || ||||| ||| ||||    
T  16446901 attaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatggggactaaacttttgatgccattatacaaacagtggggtgttactcactaca 16447000  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataactt 316  Q
     |||| ||||||||||| ||||||    
T  16447001 attttgatgttatagtgttaactt 16447024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 43643422 - 43643784
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||     
T  43643422 tgtttgattcatttttaaattgtcgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatt 43643521  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    || ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43643522 gtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaa 43643620  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||| ||||||||||||||       |||| ||||||||| |||||  | |  ||||| |||| ||||||||||| ||| |  ||||| ||||||||    
T  43643621 attagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgttactcattaca 43643720  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcacnnnnnnnntcattctcgtgactttatcatagaatttt 356  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||        |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  43643721 tttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaatagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 43643784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 1205290 - 1204965
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  1205290 tgtttgattcatttttaaattgctgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacaggtactattttatc 1205191  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  1205190 gttaaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaagataaa 1205092  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||| ||||||       ||||| |||||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||||||| |||    ||||| ||| ||||    
T  1205091 attagattaagtgtaatcttgttaatatgatgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgatgtgttactcactaca 1204992  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1204991 ttttttatgttatagtgttaacttcac 1204965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 12876473 - 12876148
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| |||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||  || |||||||||    
T  12876473 tgtttgatttattttcaaactgttgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtaatgcctgtaacatcttggacttacatgtactattttatc 12876374  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  12876373 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaa 12876274  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    |||||||||||||||  ||| |       |||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||  |||    
T  12876273 attagattaagtgtatccttcttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagttgggtgttactcacaaca 12876174  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttca 318  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||    
T  12876173 ttttttatattatagtgttaacttca 12876148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 16223226 - 16222950
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  16223226 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatc 16223127  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||| |    
T  16223126 attggaatctttaaaatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatactc-ttaagtgttacactttttggggtgttacgtttaaaacaaggaaggataaa 16223028  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaa 270  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| |||||||||||    
T  16223027 attagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaa 16222950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 10555032 - 10555354
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgttattattgattcatgattaatggt--aattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||  || ||||| ||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  || ||||||||    
T  10555032 tgtttgattcatttttaaattgtt--tattacttaatgatcaatagtgtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttat 10555129  T
Q  99 cgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatac 198  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||     
T  10555130 tgtcggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc---aagtgttacgttttgtgaggtgttgcgcttataacaaggtaggataa 10555226  T
Q  199 aattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattac 291  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||| | |  |||||||||| ||||||||||| ||| |  ||||| |||||||    
T  10555227 aattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcattac 10555326  T
Q  292 atttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10555327 attttttatgttatagtgttaacttcac 10555354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9864509 - 9864149
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  || |||||||||||    
T  9864509 tttgattcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagttattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgt 9864410  T
Q  102 tggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaat 201  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  9864409 tggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaat 9864311  T
Q  202 tagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatt 294  Q
    || |||||||||| |||| |       |||||||||||||| |||| | |||  |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| |||  |||||    
T  9864310 tatattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatt 9864211  T
Q  295 tttaatgttatagtgataacttcacnnnnnnnntcattctcgtgactttatcatagaatttt 356  Q
    ||| ||  ||||||| ||| |||||        ||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  9864210 tttgatactatagtgttaatttcaccaaaaaagtcattttcgtgacttcattatagaatttt 9864149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 36694793 - 36695117
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  36694793 tgtttgatttatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttggatttacatgtactattttatc 36694892  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||| |    
T  36694893 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaa 36694991  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||| |||| |       |||||||||||||| |||| | |||  |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| |||  |||    
T  36694992 attagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaaca 36695091  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttca 318  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||    
T  36695092 tttttgatattatagtgttaacttca 36695117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 11727384 - 11727062
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgtt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  11727384 ttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatatactattttatcgtt 11727285  T
Q  103 ggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaatt 202  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  11727284 ggcatctttaacattcaaacaaagttgttgatatcatgtgatagtc-ttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatt 11727186  T
Q  203 agattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacattt 295  Q
    ||||||| |||| ||||||       |||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||| | |||||| ||| || ||||| | |  ||| ||    
T  11727185 agattaaatgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactatacaaatagtggggtgttacttacaacactt 11727086  T
Q  296 ttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    || ||||||||||| |||||||||    
T  11727085 ttgatgttatagtgttaacttcac 11727062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 27082665 - 27082990
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  27082665 tgtttaattcatttttaaattgttgattattgattaatgataagtagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 27082764  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  |||| |||| |||| |||| |    
T  27082765 gttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgcggggtgttagacttaaaacatggtaagataaa 27082863  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||| |||  |||||| |||||| || ||||| ||| || ||||| ||| ||||    
T  27082864 attagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttaatgccactgcacaaacagtggggtgttactcactaca 27082963  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
     |||| ||| ||||||| |||||||||    
T  27082964 cttttgatgctatagtgttaacttcac 27082990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 270
Target Start/End: Original strand, 7890786 - 7891060
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||  || |||||||||||    
T  7890786 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgt 7890885  T
Q  102 tggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaat 201  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||     
T  7890886 tggaatctttaacatgcaaccagagttgatgatattatgtgataatc-ttaagtgttacacgttgtggggtgttacgcttataacaaagtaagataaaac 7890984  T
Q  202 tagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaa 270  Q
    |||||| |||||||||||||       |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  7890985 tagattgagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggaccgaacttttgatgccattgtacaaa 7891060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 6098340 - 6098670
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaa-----atattatt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     ||  ||||    
T  6098340 tgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattgtatt 6098439  T
Q  95 ttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtagg 194  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  6098440 gtatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaagatagg 6098538  T
Q  195 atacaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattca 287  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||       ||||||||| |||| |||| | |||  |||||||||| || |||||||| ||| || ||||| |||    
T  6098539 ataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgacgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactca 6098638  T
Q  288 ttacatttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
     || |||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  6098639 ctatatttttgatgctatagtattaacttcac 6098670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 5299773 - 5300049
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  5299773 tgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 5299872  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |    
T  5299873 gttgttatctttaacatgcaaacaaaattgctgatatcatttgataatc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaa 5299971  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaa 270  Q
    ||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||| ||| || |||  ||||||||||||| ||||||||    
T  5299972 attagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactgaacttttgatgccactgtacaaa 5300049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 8803643 - 8803962
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  8803643 tgtttgattcatttttaaattgttcattactgattaatgatcaatagtatattcatctggtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttat 8803742  T
Q  99 cgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatac 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  8803743 cgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagt-attaagtgttacactttttagggtgttacgcttagaacaaggtatgataa 8803841  T
Q  199 aattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattac 291  Q
    ||||| |||||||||||||||||       || |||||||||||   |||       |||||||||| |||| |||||| ||| |  ||||| |||||||    
T  8803842 aattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgataggctga-------acttttgatgtcattctacaaatagtggagtgttactcattac 8803934  T
Q  292 atttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8803935 atttttgatgttatagtgttaacttcac 8803962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Original strand, 31933715 - 31934038
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgt 101  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| || |||||||| ||    
T  31933715 tttgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgtctgcaatatcttagacttacaagtactattttattgt 31933814  T
Q  102 tggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaat 201  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  31933815 tggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataat-tttaagtgttacactttgtgcggtattatgcttataacaaggtatgataaaat 31933913  T
Q  202 tagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatt 294  Q
    ||||||||||||||||||||       |||||||||||||| ||| |  |||  |||||||||| ||||||| ||| ||| || ||||| |||||| |||    
T  31933914 tagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgtataaagagtggggtgttactcattatatt 31934013  T
Q  295 tttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||| || | |||||| |||||||||    
T  31934014 tttgatatcatagtgttaacttcac 31934038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Original strand, 4132519 - 4132732
Alignment:
Q  7 attcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgga 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||   ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||     
T  4132519 attcatttttaaattgttgattacaaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggc 4132618  T
Q  106 atctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattaga 205  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||    
T  4132619 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc-ttatgtgttacactttgtggggtgttacactta-aacaaggtagaataaaattaga 4132716  T
Q  206 ttaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||||||||||||    
T  4132717 ttaagtgtagtcttgt 4132732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 34895325 - 34895006
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||  || |||||| ||    
T  34895325 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttttc 34895226  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||      |||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||| ||||| |    
T  34895225 gttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt------gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaa 34895132  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||  |||  ||||||||||||| | |||||| ||| |  ||||| ||| ||||    
T  34895131 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggagtgttactcactaca 34895032  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttca 318  Q
     | || ||||||||||| ||||||||    
T  34895031 gtgttgatgttatagtgttaacttca 34895006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 38644341 - 38644019
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  38644341 tgtttgatttatttttaaatttttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 38644242  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
     |||  ||||||||| |||||||| ||||| |||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  38644241 attgacatctttaacttgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtc-ttgagtgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 38644143  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||| ||||   |||  ||||||||||||| |  ||||| ||| || ||||| |||  |||    
T  38644142 attagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccactagacaaacagtggggtgttactcacaaca 38644043  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataactt 316  Q
     |||| ||||||||||| ||||||    
T  38644042 cttttgatgttatagtgttaactt 38644019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 40862783 - 40862457
Alignment:
Q  1 tgtttgattcattttt-aaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  40862783 tgtttgattcattttttaaattgtcgattactgatttatgacaaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttat 40862684  T
Q  99 cgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatac 198  Q
    |||||  ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||| ||||||||     
T  40862683 cgttgacatctttaacatacaaacatagttgataatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggagtgttacacttagaacaaagtaggataa 40862585  T
Q  199 aattagattaagtgtagtctt----gtatg---aattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattac 291  Q
    |||||||||||||||| | ||    |||||   |||||||||||  ||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||  ||    
T  40862584 aattagattaagtgtatttttgttagtatgaaaaattgatgataccatgag-actgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaac 40862486  T
Q  292 a-tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||||    
T  40862485 attttttgatattatagtgttaacttcac 40862457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Original strand, 30654412 - 30654735
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| |||  || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  30654412 tttgattcatttt-aaattgttaattactgattaatgatcaataatatattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcg 30654510  T
Q  101 ttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaa 200  Q
    ||| ||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||| | || ||    
T  30654511 ttgaaatttttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaatgtatggtaaaa 30654609  T
Q  201 ttagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacat 293  Q
    ||| |||||||||||||||||       ||||| |||||||| |||||   ||  |||||||||| ||||  ||||| ||| || ||||| |||||||||    
T  30654610 ttaaattaagtgtagtcttgttaacctgatgaagtgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattcaacaaacagtggggtgttactcattacat 30654709  T
Q  294 ttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||    
T  30654710 tttttatgttatagtgttaacttcac 30654735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33906568 - 33906355
Alignment:
Q  6 gattcatttttaaattgttattattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgga 105  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||      
T  33906568 gattcatttttaaatt-tgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgac 33906470  T
Q  106 atctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattaga 205  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  |||||| |||| ||||||||| |||| |||||||    
T  33906469 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtc-ttaagtgttacactttttggaatgttacccttaaaacaaggtatgataaaattaga 33906371  T
Q  206 ttaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||| ||||||||    
T  33906370 ttaagtgcagtcttgt 33906355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 35459538 - 35459813
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||     
T  35459538 tgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacattttggacttacagatactattttatt 35459637  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    || | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||| | | | |||| ||||||  ||||||||| |||||||| |    
T  35459638 gtcgaaatctttaacatacaaacagaattgatgatattatgtaatagtc-ttaagtgttataatctgtgggatgttacatttataacaaagtaggataaa 35459736  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||| |||||| |||  |||||| ||| ||||||||||    
T  35459737 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatattatgaggactgaacttttaatgtcattgtacaa 35459813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 1953815 - 1954032
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||  || |||||||||    
T  1953815 tgtttgattcattttaaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggatttacaggtactattttatc 1953914  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgggg-tgttacgcttataacaaggtaggatac 198  Q
    ||||  | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| ||||     
T  1953915 gttgacaactttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtatgataa 1954013  T
Q  199 aattagattaagtgtagtc 217  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  1954014 aattagatttagtgtagtc 1954032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 466195 - 465880
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  466195 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtattattttatc 466096  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||          ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| |||| |    
T  466095 attggcatctttaacatgcaaacagagttgctgata-tatgtg----------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaa 466007  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||| || | | |||  | ||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||  |||    
T  466006 attagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaatttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaaca 465907  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
     |||| ||||||| ||| |||||||||    
T  465906 cttttgatgttatcgtgttaacttcac 465880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 39098946 - 39099235
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  39098946 tgtttgatgcatttttaaattattgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacatatactattttatc 39099045  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  || ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| | ||||| |||| |||||| |||| |||| |||| |||| |    
T  39099046 gttgacatatttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtc-ttaagtgtgatactttgtgggatgttacacttaaaacagggtaagataaa 39099144  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgtta 283  Q
    ||||||||||||||| | ||||       ||||||||| |||| |||||| |||  ||||||||||| | |||||||| ||| || |||||    
T  39099145 attagattaagtgtatttttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgctagtgtacaaagagtggggtgtta 39099235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 142
Target Start/End: Original strand, 1149756 - 1149889
Alignment:
Q  10 catttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  1149756 catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggaatc 1149855  T
Q  109 tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtg 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1149856 tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtg 1149889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 44869860 - 44869647
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    || |||||||||    
T  44869860 tgtttgattcatttttaaattgttggttactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttatcggtactattttatc 44869761  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggat-ac 198  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||    || |||| ||||||||||||| |     
T  44869760 gttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatttgatagtc-ttaagtgttacactttgtgggg-acaacacttaaaacaaggtaggataaa 44869663  T
Q  199 aattagattaagtgta 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  44869662 aattagattaagtgta 44869647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 49 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13307936 - 13307624
Alignment:
Q  49 attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc 148  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  13307936 attcatcttgtaatgcttgcaacatcttgaacttacgggtactattttatcgttgacat-tttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtc 13307838  T
Q  149 tttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttg-------tatgaattgatgataatatga 241  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||  ||| || || |||||||| |||||||||||||||| |||||        |||||||||| ||| ||||     
T  13307837 tt-aagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgctaatctgatgaattgataatactatgg 13307739  T
Q  242 gaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaatgttatagtgataacttcacnnnnnnnntcattctcgtgact 341  Q
    | |||  |||||||||| || |||||||| |||  | ||||| |||  ||| |||| ||||||||||| |||||||||        |||||||| |||||    
T  13307738 ggactgaacttttgatgtcactgtacaaatagtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgact 13307639  T
Q  342 ttatcatagaatttt 356  Q
    | | |||||||||||    
T  13307638 tcaccatagaatttt 13307624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 159 - 319
Target Start/End: Original strand, 1150090 - 1150257
Alignment:
Q  159 acactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagact 251  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||| |||||  |||  |||    
T  1150090 acactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaact 1150189  T
Q  252 tttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||||| | ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  1150190 tttgatgtcgttgtacaaacagtgggatgttactcattacatttttgatgttatagcgttaacttcac 1150257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 35859297 - 35859160
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| || |||||||||    
T  35859297 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaacatctcgaacttacaagtactattttatc 35859198  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatatt 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35859197 gttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatt 35859160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 91 - 221
Target Start/End: Original strand, 41910907 - 41911035
Alignment:
Q  91 tattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaagg 190  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  41910907 tattttatcgttgca-tctttaacatgcaaacagagttggtgatatcatgtgatagtatt-aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaagg 41911004  T
Q  191 taggatacaattagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  41911005 taggataaaattagattaaatgtattcttgt 41911035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 12587945 - 12587812
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  || |||||||||    
T  12587945 tgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaaatctttgacttacaggtactattttatc 12587846  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatga 133  Q
    ||||  |||||||||||||||| | |||||||||    
T  12587845 gttgacatctttaacatgcaaatagagttgatga 12587812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 43025972 - 43025847
Alignment:
Q  93 ttttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggta 192  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||  ||| || ||||||    
T  43025972 ttttatcgttgacatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagt-tttaagtgttacattttgtggggtgttacagttaaaataaggta 43025874  T
Q  193 ggatacaattagattaagtgtagtctt 219  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  43025873 ggataaaattagattaaatgtattctt 43025847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 34951884 - 34952020
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||   |||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  34951884 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatgtagtaagacttgcaacatcttagacttacatgtactattttatc 34951983  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatat 136  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34951984 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 34952020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 24823221 - 24823336
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  24823221 tgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 24823320  T
Q  100 gttggaatctttaaca 115  Q
    ||||| ||||||||||    
T  24823321 gttggcatctttaaca 24823336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 33198162 - 33198061
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgtt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||  || ||||||||||||    
T  33198162 ttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgtt 33198063  T
Q  103 gg 104  Q
    ||    
T  33198062 gg 33198061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18259439 - 18259233
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgtt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||  |||| ||   ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||    
T  18259439 ttgattcatttttaaattgttgattactcattactgatcaacaataattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgtt 18259340  T
Q  103 ggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaatt 202  Q
    |  || |||||||||||||  || ||| ||||||  |||||      ||| |||||||||||| |||| |||||| |||| || |||||| |||| ||||    
T  18259339 gacatttttaacatgcaaattaaattgctgatatcttgtga-----cttaggtgttacactttgtgggatgttacacttaaaataaggtatgataaaatt 18259245  T
Q  203 agattaagtgta 214  Q
    | ||||| ||||    
T  18259244 aaattaaatgta 18259233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 34463793 - 34463704
Alignment:
Q  41 taatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatga 133  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||   ||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34463793 taatagtaattcatttagtaatgcttgcaacat---ggacttataggtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgatga 34463704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 7998550 - 7998478
Alignment:
Q  91 tattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactt 164  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7998550 tattttatcgttggcatctttaatatagaaacagagttgttgatattatgtgatagt-attaagtgttacactt 7998478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 43026037 - 43025971
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgttt 66  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||    
T  43026037 tgtttgattcatttttaaattgttgatcactgattcatgatcaatagtaatttatctaataatgttt 43025971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 41362785 - 41362716
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgca 69  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  41362785 tgtttaattcatttttaaattgttgattactggttaatgatcaatagtaattcatctagtaatttttgca 41362716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 219
Target Start/End: Original strand, 34952028 - 34952076
Alignment:
Q  171 gtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtctt 219  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  34952028 gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattctt 34952076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 43648084 - 43648409
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  43648084 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcgacatcttggacttacaagtgctattttatc 43648183  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  43648184 gttgaaatctttaacatggaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttatactttgtgtggtgttacacttataacaaggtatgataaa 43648282  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||| |||||  |||  |||||||||| |||| |||||| |||  | ||||| ||||||||    
T  43648283 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcattatacaaacagtgaggtgttactcattaca 43648382  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  43648383 tttttgatgttatagtgttaacttcac 43648409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 2325217 - 2325534
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  2325217 tgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 2325316  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  2325317 gttgtaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaa 2325415  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgtatgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||| |||  ||||||||||||| |||||||| | | || ||||| ||| ||||||| | |    
T  2325416 attagattaagtgtagtcttgt-taatttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccagtgtacaaacaatggggtgttactcaatacatttatga 2325514  T
Q  300 tgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||||| || |||||||||    
T  2325515 tgttatattgttaacttcac 2325534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4167286 - 4166924
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4167286 tgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 4167187  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  4167186 gttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagt-tttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 4167088  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    |||||||||| |||| ||||||       |||||||| ||||| |||| | |||  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||  | |    
T  4167087 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaata 4166988  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcacnnnnnnnntcattctcgtgactttatcatagaatttt 356  Q
    ||||| ||  |||| || |||||||||        ||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  4166987 tttttgatactataatgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 4166924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 37906067 - 37905747
Alignment:
Q  8 ttcatttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaa 106  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||    
T  37906067 ttcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaattcttgcaacatcttggacttacatgtgttattttatcattggaa 37905968  T
Q  107 tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttat--ggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattag 204  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37905967 tctttaacatgcaaacagagttaatgatattatgcgatagt-tttaagtgttacactttgtggggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattag 37905869  T
Q  205 attaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacattttt 297  Q
    |||||||||| ||||||       |||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| |||||||||||  || || ||||| || ||||||||||    
T  37905868 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcgttacattttt 37905769  T
Q  298 aatgttatagtgataacttcac 319  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  37905768 tatgttatagtgttaacttcac 37905747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 19289162 - 19289486
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgttattat-tgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | | ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||     
T  19289162 tgtttaattcatttttaaattgttaatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtattattttatt 19289261  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||| |||||||| |    
T  19289262 gtcggaatctttaacatgcacacagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtgggatgttacatttataacaatgtaggataaa 19289360  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    |||||||||||||||||||| |       |||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||| ||||||||||| | | || ||||| |||||| |    
T  19289361 attagattaagtgtagtcttattaatctgatgagttgatgatactgtgagaacttaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgttactcattata 19289460  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttca 318  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19289461 tttttgatgttatagtgttaacttca 19289486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41961204 - 41960984
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41961204 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatc 41961105  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |    
T  41961104 gttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgataatc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaa 41961006  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  41961005 attagattaagtgtagtcttgt 41960984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 26357941 - 26357617
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26357941 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaaatactattttatc 26357842  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||  |||||||||||||| |    
T  26357841 gttggcatctttaacatgcaaacacatttgataatattatgtgatagt-tttaagtgttacaatttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggataaa 26357743  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||  ||||||       |||||||||| |   ||| ||||||  |||||||||| || |||||||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  26357742 attagattaagtgtgatcttgttaatatgatgaattgataactctataagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttactcactaca 26357643  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttca 318  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||    
T  26357642 gttttgatgttatagtgttaacttca 26357617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 11366219 - 11366545
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  11366219 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttat 11366318  T
Q  99 cgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatac 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| | ||| |||||| || ||||     
T  11366319 cgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagggtgttatgtttagaacaagatatgataa 11366417  T
Q  199 aattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattac 291  Q
    ||||| ||||| |||||||||||       |||||||||||||| ||||||  ||  |||||||||| |||| |||||| |||  ||||||| |||||||    
T  11366418 aattatattaaatgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattatacaaatagtgagatgttactcattac 11366517  T
Q  292 atttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  11366518 atttttgatgttatagtgttaatttcac 11366545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 3177303 - 3176979
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||  || ||||||||     
T  3177303 tgtttgatttattttcaaattgttgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtaatgcttgtaatatcttggacttacatgtactattttata 3177204  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| |    
T  3177203 gttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaa 3177105  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||| |||| |       |||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||||||| |||||  ||||| |||  |||    
T  3177104 attagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagttgcgtgttactcaaaaca 3177005  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttca 318  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||    
T  3177004 tttttgatattatagtattaacttca 3176979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 49 - 319
Target Start/End: Original strand, 33550875 - 33551150
Alignment:
Q  49 attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc 148  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||    
T  33550875 attcatctagtaatgcttgcaacatattggactttcaagtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacg-tagtc 33550973  T
Q  149 tttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatga 241  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||    
T  33550974 -ttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaacgtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga 33551072  T
Q  242 gaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
      ||   |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  33551073 agaccgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcactacatttttgatgttatagtgttaacttcac 33551150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35959256 - 35959041
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |     || |||||||||    
T  35959256 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacatg----tactattttatc 35959161  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35959160 gttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc-ttaactgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggata-a 35959063  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    |||| |||||||| ||||||||    
T  35959062 attatattaagtgcagtcttgt 35959041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44914031 - 44913807
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcat---ctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattatttt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  44914031 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcattttctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactatttt 44913932  T
Q  97 atcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttat-ggggtgttacgcttataacaaggtagga 195  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||| ||| ||    
T  44913931 atcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtgggggtgttacacttaaaacaatgtatga 44913833  T
Q  196 tacaattagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    || |||||||||||||||| ||||||    
T  44913832 taaaattagattaagtgtattcttgt 44913807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31862214 - 31861996
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgt 101  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  31862214 tttgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtctacaatatcttggacttacaagtactattttattgt 31862115  T
Q  102 tggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaat 201  Q
     |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | || |||    
T  31862114 cggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataat-tttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaatgtatgttaaaat 31862016  T
Q  202 tagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31862015 tagattaagtgtagtcttgt 31861996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 70 - 319
Target Start/End: Original strand, 17071646 - 17071901
Alignment:
Q  70 acatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgg 169  Q
    |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  17071646 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtgg 17071744  T
Q  170 ggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccat 262  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||  ||   |||||||||| |||    
T  17071745 ggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaataccgaacttttgatgtcat 17071844  T
Q  263 tgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||||||| | |  ||||||| | | |||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  17071845 tgtacaaataatgagatgttacttactacatttttgttgttatagtgttaacttcac 17071901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 33660216 - 33660529
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||| |||||||||    
T  33660216 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctcagacttacagatactattttatc 33660315  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||           |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  33660316 gttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtg----------ggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 33660405  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||| || |||       |||||||||||||| || ||| |||  ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||  |||    
T  33660406 attagattaagtgtattcctgttaatctaatgaattgatgatactaagaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagttgggtgttactcacaaca 33660505  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataactt 316  Q
     |||| ||||||||||| ||||||    
T  33660506 cttttgatgttatagtgttaactt 33660529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4763995 - 4763692
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||  || |||||||||    
T  4763995 tgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcaactagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttatc 4763896  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||| | |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||  |||||||||| ||| |    
T  4763895 gttagcatctttaacatgcaaaaagaattgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgctacacttgaaacaaggtagaataaa 4763797  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||||| ||||       |||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||| || |||||||| ||| || ||||| ||| ||||    
T  4763796 attagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgattatactatgggaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactaca 4763697  T
Q  293 ttttt 297  Q
     ||||    
T  4763696 gtttt 4763692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 33709071 - 33709291
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  33709071 tgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaagtactattttatc 33709170  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
     |||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  33709171 attgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtc-ttaagtgtgacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 33709269  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  33709270 attagattaagcgtattcttgt 33709291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41465865 - 41465645
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  41465865 tgttcgattcaattttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 41465766  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||| ||| |    
T  41465765 gttggcatctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatagtc-ttaagtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtagaataaa 41465667  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||||||||  ||||||||    
T  41465666 attagattaagttcagtcttgt 41465645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 70 - 319
Target Start/End: Original strand, 17054005 - 17054260
Alignment:
Q  70 acatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgg 169  Q
    |||||||||| |||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  17054005 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaacctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagt-nttaagtgttacactttgtgg 17054103  T
Q  170 ggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccat 262  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||       |||||||||||||| |||||  ||   |||||||||| |||    
T  17054104 ggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaataccgnacttttgatgtcat 17054203  T
Q  263 tgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||||||| | |  ||||||| | | ||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  17054204 tgtacaaacaatgagatgttacttactacatttttgatgttatagtattaacttcac 17054260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 4478717 - 4478408
Alignment:
Q  13 ttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatcttt 111  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  4478717 ttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgatactattttatcattggcatcttt 4478618  T
Q  112 aacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggat-acaattagattaag 210  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||     ||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  4478617 aacatggaaacagagttggtgatatcatgtgatagac-ttaagtgttacacttt-----gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaag 4478524  T
Q  211 tgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaatgtt 303  Q
    |||| ||||||       |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| | | |  ||||| |||  ||| |||| |||||    
T  4478523 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactgtacaaacaatggagtgttactcacaacacttttgatgtt 4478424  T
Q  304 atagtgataacttcac 319  Q
    |||||| |||||||||    
T  4478423 atagtgttaacttcac 4478408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Original strand, 27349789 - 27350102
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  27349789 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgt 27349888  T
Q  102 tggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaat 201  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| |||||          ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||    
T  27349889 tggaatctttaacttgcaaacagagttcctgatatcatgtg----------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaat 27349978  T
Q  202 tagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatt 294  Q
    ||||||||||||| ||||||       |||||||||||||| || | | |||  |||||||||| || |||||||| |||  | ||||| |||  |||||    
T  27349979 tagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaag-ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgtggtgttactcacaacatt 27350077  T
Q  295 tttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||||    
T  27350078 tttgatgctatagtgttaacttcac 27350102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 29241984 - 29242302
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||| | ||| |||||||||||||||||        |||||||||||||||  || |||| ||||    
T  29241984 tgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatt-------catcttggacttacaggtactattgtatc 29242076  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  29242077 gttgacatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtctt-aggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 29242175  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||| |||||  |||  ||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||  || || |    
T  29242176 attagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgataccactgtacaaacagtggggtgttacgcactata 29242275  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||    
T  29242276 ttttttatgttatagttttaacttcac 29242302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 39167208 - 39167478
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||  || |||||||||    
T  39167208 tgttttattcatttttaaattgttgattactgattcataattaatagtaattcatctagtaatgctagcaacaatttggacttacatgtactattttatc 39167307  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||  ||| |    
T  39167308 gttgacatctttaacatacaaacagagttgatgatattatgtgatagt-------tgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtataataaa 39167400  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaa 270  Q
    |||||| |||||||| ||||||       |||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| |||||||||||    
T  39167401 attagaataagtgtattcttgttactctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaa 39167478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 44286283 - 44286037
Alignment:
Q  30 tgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttg 129  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  44286283 tgattaatgatcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttagcatatttaacatgcaaacaaagttg 44286184  T
Q  130 atgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt-------a 222  Q
     |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||       |    
T  44286183 ttgatatcatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattattgttaatctga 44286085  T
Q  223 tgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaa 270  Q
    |||||| |||||| |||| | |||| ||||||||||||| | ||||||    
T  44286084 tgaatttatgatactatgtggactaaacttttgatgccactatacaaa 44286037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 221
Target Start/End: Original strand, 31570576 - 31570793
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgtt 102  Q
    |||||||||||||||||  || |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||    
T  31570576 ttgattcatttttaaatatttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgtt 31570675  T
Q  103 ggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaatt 202  Q
    || |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||    
T  31570676 ggcatctttaacatgtaaacagagttgttgatatcatgtgacagtc-ttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaatt 31570774  T
Q  203 agattaagtgtagtcttgt 221  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  31570775 agattaagtgtattcttgt 31570793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 7006777 - 7006940
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  7006777 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatc 7006876  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactt 164  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  7006877 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatattc-ttaagtgttacactt 7006940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 18494120 - 18494383
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  18494120 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttacaacatcttggacttacatgtactattttatc 18494219  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||| |||||||| || |||| || ||| |||| ||||  ||||||||||||| |    
T  18494220 gttggcatctttaacatgcaaacagagtcgttgatatcatgtgatagtc-ttaagtgtgactctttgtgaggt-ttacacttaatacaaggtaggataaa 18494317  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatg 258  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||       |||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||    
T  18494318 attagatcaagtgtattctagtgaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 18494383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 316
Target Start/End: Original strand, 4263926 - 4264238
Alignment:
Q  12 tttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctt 110  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||| |||  || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |  || |||||||| ||||| |||||    
T  4263926 tttttaaattgttgattactgatcaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttatatgtactattttattgttggcatctt 4264025  T
Q  111 taacatgcaaacaaagttgatgatattatg-tgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaa 209  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  4264026 taacatgcaaacagagttgctgatatcatgttgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttaaacttaaaacaaggtaggataaaattagattaa 4264124  T
Q  210 gtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaatgt 302  Q
    ||||| |||| |       |||||||||| ||| ||||   |||  |||||||||| || |||||||| ||| |||||||| |||  ||| |||| |||     
T  4264125 gtgtattcttcttaatatgatgaattgataatactatggagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttactcacaacacttttgatgc 4264224  T
Q  303 tatagtgataactt 316  Q
    ||||||| ||||||    
T  4264225 tatagtgttaactt 4264238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 45328025 - 45327864
Alignment:
Q  59 taatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgtt 158  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  45328025 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgcgatagtc-ttatgtgtt 45327927  T
Q  159 acactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  45327926 acactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgt 45327864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 319
Target Start/End: Original strand, 19424484 - 19424792
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgtt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  || |||             
T  19424484 ttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcaggtactat--------- 19424574  T
Q  103 ggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaatt 202  Q
         |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||    
T  19424575 -----ctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaaa-tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaatt 19424668  T
Q  203 agattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacattt 295  Q
    |||||||| ||| ||||||       |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| | || ||| | | || ||||| |||  ||| ||    
T  19424669 agattaagcgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactatataaacaatggggtgttactcacaacactt 19424768  T
Q  296 ttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    || ||||||||||| |||||||||    
T  19424769 ttgatgttatagtgttaacttcac 19424792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 43770687 - 43771003
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  | ||| ||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||     
T  43770687 tgtttgattcatttttaaattgttgatttctaattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttaaagatactattttatt 43770786  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||          ||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| |||||| |    
T  43770787 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtg----------agtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggcaggataaa 43770876  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    |||| ||||||| || ||||||       |||||||||||||| || | | |||  ||||||||||||| |||| ||| ||| || ||||| |||  |||    
T  43770877 attaaattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgccactgtataaacagtggggtgttactcacaaca 43770976  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||    
T  43770977 cttttgatgttatagtgttaacttcac 43771003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 13711820 - 13711503
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgtt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||| |    
T  13711820 ttgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtattgtttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgct 13711721  T
Q  103 ggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaatt 202  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| |||||| |||| | ||| ||||||||||||||||| |||| |||     | |||| ||||    
T  13711720 ggcatctttaacatgcatacagagttgctgatatcatgtcatagtc-ttaactattatactttatggggtgttacacttaaaac-----atgataaaatt 13711627  T
Q  203 agattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacattt 295  Q
    ||||||| |||| ||||||       ||||||||||||||  ||| | |||| |||||||||| || ||||||||  || || ||||| |||  ||| ||    
T  13711626 agattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgataccatgtggactaaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttactcacaacactt 13711527  T
Q  296 ttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    || ||| |||| || |||||||||    
T  13711526 ttgatgctataatgttaacttcac 13711503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 59 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 36642293 - 36642074
Alignment:
Q  59 taatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgtt 158  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||   || |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||| |||||||||    
T  36642293 taatgcttgcaacatcttgaacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctggtatcatgtgatagtc-ttaagtgtt 36642195  T
Q  159 acactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggat--acaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactaga 249  Q
    ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||| |||||| |||  |    
T  36642194 acactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaa 36642095  T
Q  250 cttttgatgccattgtacaaa 270  Q
    ||||||||| || ||||||||    
T  36642094 cttttgatgtcactgtacaaa 36642074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 170
Target Start/End: Original strand, 19500756 - 19500923
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||  || |||||||||||    
T  19500756 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaaattacatgtactattttatcgt 19500855  T
Q  102 tggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggg 170  Q
    |   |||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  19500856 taacatctttaacatgtaaatagagttgataatattatgtgatagtc-ttaagtgttacattttgtggg 19500923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5881893 - 5881683
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||||     
T  5881893 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgaataatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatt 5881794  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||          ||||||||||||| || ||| |||| |||| ||||||||| |||| |    
T  5881793 gttgacatctttaacatgcaaacaaaattgttgatatcatgtg----------agtgttacactttgtgaggtattacacttaaaacaaggtatgata-a 5881705  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    |||||||||| |||| ||||||    
T  5881704 attagattaaatgtattcttgt 5881683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 91 - 221
Target Start/End: Original strand, 18258217 - 18258346
Alignment:
Q  91 tattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaagg 190  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || || |    
T  18258217 tattttatcgttgggatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtctt-aagtgttacactttatggggtgttacacttaaaaaaatg 18258315  T
Q  191 taggatacaattagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  18258316 taggataaaattagattaagtttattcttgt 18258346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19314188 - 19313995
Alignment:
Q  23 ttattattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaa---tattattttatcgttggaatctttaacatgca 119  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||    || |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  19314188 ttattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttataacatgtactattttatcgctgacatctttaacatgca 19314089  T
Q  120 aacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtctt 219  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||        ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  19314088 aacatagttgctgatatcatgtgat--------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattcgattaagtgtattctt 19313997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 33902319 - 33902120
Alignment:
Q  111 taacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaag 210  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||     
T  33902319 taacatggaaacagagttaatgatattatgtgatactatt-aagtgttacactttgtggggtgctacccttaaaacaaggtaggataaaattcgattaaa 33902221  T
Q  211 tgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaatgtt 303  Q
    | |||||||||       ||||| |||||||| | |||| |||  |||||||||| |||| |||||| ||| || | ||| ||| ||||||||| |||||    
T  33902220 tatagtcttgttaatctgatgaactgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggtattactcactacattttttatgtt 33902121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 319
Target Start/End: Original strand, 41463780 - 41464014
Alignment:
Q  91 tattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaagg 190  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||| || ||||||||  ||| ||||| |    
T  41463780 tattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtc-ttaaatgttacattttgtgaggtgttacaattaaaacaaag 41463878  T
Q  191 taggatacaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgtta 283  Q
    || |||| ||||| |||||  ||| ||||||       |||||||||||||| |||||| | |  ||||||||||||| |||||||| |||  | |||||    
T  41463879 tatgataaaattatattaaaagtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtgaggtgtta 41463978  T
Q  284 ttcattacatttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
     |||  ||| |||| || |||||||  |||||||||    
T  41463979 ctcacaacacttttgattttatagtattaacttcac 41464014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 41051139 - 41051260
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||   ||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||  || |||||||||    
T  41051139 tgtttgattcatttttgaattgttgattattgattaatgatcaataacaattcatctagcaatgcttacaacatcttgaacttacaggtactattttatc 41051238  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaac 122  Q
     |||| || ||||||||||||||    
T  41051239 cttggcat-tttaacatgcaaac 41051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 41463432 - 41463512
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggactta 83  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  41463432 ttgattcatttttaaattattaattattgattaatgatcaatagtaatttatctattaatgtttacaacatcttagactta 41463512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 184 - 283
Target Start/End: Original strand, 7006943 - 7007049
Alignment:
Q  184 aacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttg 276  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||       || ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| | |||||||| ||| |    
T  7006943 aacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatcttataaattgatgatactatgggaactaaacttttgatgctactgtacaaacagtgg 7007042  T
Q  277 gatgtta 283  Q
    |||||||    
T  7007043 gatgtta 7007049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 76
Target Start/End: Original strand, 18257383 - 18257453
Alignment:
Q  7 attcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatctt 76  Q
    ||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18257383 attcattttaaaattgtcgattactgattaatgataaataataattcatctagtaatgcttgcaacatctt 18257453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 249 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 35959018 - 35958948
Alignment:
Q  249 acttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||| || ||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  35959018 acttttaatgtcattgtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatgttatagtggcaacttcac 35958948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 6091002 - 6091313
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  6091002 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatc 6091101  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  6091102 gtttgaatctttaatatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgttgggtgttacgcttaaaacaaggtatgataaa 6091201  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||| || ||| |||  |||||||||| ||||||||||| | | |  ||||| ||| ||||    
T  6091202 attagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgagtactgaacttttgatggcattgtacaaacaatggtgtgttactcactaca 6091301  T
Q  293 tttttaatgtta 304  Q
    ||||| ||||||    
T  6091302 ttttttatgtta 6091313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 1946199 - 1945873
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||  || ||||||||    
T  1946199 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctaataatgcttgtaacatcttggacttacatgtactattttat 1946100  T
Q  99 cgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatac 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  1946099 cgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataa 1946001  T
Q  199 aattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattac 291  Q
    ||||| |||||||||||||||||       ||||||| |||||| ||||||  ||  |||||||||| |||| |||||| ||| || ||||| |||||||    
T  1946000 aattatattaagtgtagtcttgttaacttgatgaattcatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattac 1945901  T
Q  292 atttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1945900 atttttgatgttatagtgttaacttcac 1945873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 3879759 - 3880121
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  3879759 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatc 3879858  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| |    
T  3879859 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtaggataaa 3879957  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    |||||| ||||| || ||||||       |||||||||||||| |||| | | |  |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| |||  |||    
T  3879958 attagaataagtatattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtgttactcacaaca 3880057  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcacnnnnnnnntcattctcgtgactttatcatagaatttt 356  Q
     |||| ||  |||| || |||||||||        ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3880058 cttttgatactataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcgtgacttcaccatagaatttt 3880121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 5627754 - 5627430
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  5627754 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcacctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcg 5627655  T
Q  101 ttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaa 200  Q
    ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| |||| ||    
T  5627654 ttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtattacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaa 5627556  T
Q  201 ttagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacat 293  Q
    ||| |||||||||||||||||       |||||||||| ||| ||||||  ||  |||||||||| |||| |||||| ||| || ||||| |||||| ||    
T  5627555 ttatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcattatat 5627456  T
Q  294 ttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||    
T  5627455 tttttatgttatagtgttaacttcac 5627430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 319
Target Start/End: Original strand, 7234884 - 7235179
Alignment:
Q  29 ttgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagtt 128  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  7234884 ttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagtt 7234983  T
Q  129 gatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt------- 221  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||           
T  7234984 gatgatattatgcgatagtc-ttaagcgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctg 7235082  T
Q  222 atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||  |||||||||| ||  ||||||| ||| || || || ||| |||| |||| ||||||||||| | |||||||    
T  7235083 atgaattgataatactatgag-actgaacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcac 7235179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 4318642 - 4319005
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |   || ||||| |||    
T  4318642 tgtttgatttatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactttcccgtactatttcatc 4318741  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggat-ac 198  Q
    ||||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |     
T  4318742 gttgacatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtgatagtc-ttaagtgttacactttatagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 4318840  T
Q  199 aattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattac 291  Q
    |||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||| |||| |   |  |||||||||| || |||||||| ||| || ||||| |||| ||    
T  4318841 aattagattaagtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgggggttgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcataac 4318940  T
Q  292 atttttaatgttatagtgataacttcacnnnnnnnntcattctcgtgactttatcatagaatttt 356  Q
    | |||| ||||||||||| |||||||||        |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  4318941 acttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 4319005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 270
Target Start/End: Original strand, 21016940 - 21017208
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgt 101  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||      |||||||||||    
T  21016940 tttgattcatttataaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacgtac------tattttatcgt 21017033  T
Q  102 tggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaat 201  Q
    ||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| || || |||||||| |||    
T  21017034 tgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataacgtaggataaaat 21017132  T
Q  202 tagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaa 270  Q
    |||||||||| || ||||||       |||||||||||||| |||| | |||  ||||||||||||||||||||||    
T  21017133 tagattaagtttattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaa 21017208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 29182522 - 29182203
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgtt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |   |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  29182522 ttgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatca---gtaattcatctagtaatacttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgtt 29182426  T
Q  103 ggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttat-ggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaat 201  Q
    || ||||||||| |||||| | ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| || | ||||||||| |||    
T  29182425 ggcatctttaacctgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtc-ttaagtgttacactttatgggggtgttacacttaaaatatggtaggataaaat 29182327  T
Q  202 tagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatt 294  Q
    ||||||||||||| |||| |       |||||||||||||||||||   |||  |||||||||| || |||| ||| ||| || ||||| |||  ||| |    
T  29182326 tagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgataatatggagactgaacttttgatgacactgtataaacagtggggtgttactcacaacact 29182227  T
Q  295 tttaatgttatagtgataacttca 318  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||    
T  29182226 tttgatgttatagtgttaacttca 29182203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 20768440 - 20768236
Alignment:
Q  7 attcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgga 105  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  20768440 attcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttgac 20768341  T
Q  106 atctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattaga 205  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||    
T  20768340 atctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatgatc-ttaagtgttacactttatgggatgttacacttaaaacaaagtaggataaaattaga 20768242  T
Q  206 ttaagt 211  Q
    ||||||    
T  20768241 ttaagt 20768236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 33892832 - 33893147
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||     
T  33892832 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatt 33892931  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||          ||||||||||||| ||||||||||  | || |||||||||||||| |    
T  33892932 gttggcatctttaacatgcaaactgagttgctgatatcatgtg----------agtgttacactttgtggggtgttatacataaaacaaggtaggataaa 33893021  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||| || | | |||  |||||| ||  ||||||||||| ||| || ||||| |||  |||    
T  33893022 attagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaag-ggactgaacttttaatatcattgtacaaatagtggggtgttactcacaaca 33893120  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||    
T  33893121 cttttgatgttatagtgttaacttcac 33893147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8513585 - 8513235
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgttattattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||      |||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||   || |||||||||     
T  8513585 tgtttgattcatttttaaattgtt------gattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaagattttggacttaccggtactattttatca 8513492  T
Q  101 ttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggat-aca 199  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||      ||| ||||||||||||| | |    
T  8513491 ttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagggtg------ttaaaacaaggtaggataaaa 8513399  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    ||||||| ||||||| ||||||       |||||||||||||| |||| | |||  |||||||||| || |||||||| ||| || ||||| |||  |||    
T  8513398 attagatcaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaaca 8513299  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcacnnnnnnnntcattctcgtgactttatcatagaatttt 356  Q
     |||| || |||||||| |||||||||        |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  8513298 cttttgatattatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 8513235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 319
Target Start/End: Original strand, 7055141 - 7055360
Alignment:
Q  106 atctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattaga 205  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| |||| ||||||||| |||| ||||| |    
T  7055141 atctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagt-tttaagtgttacactttgtagcgtgttacacttagaacaaggtatgataaaattata 7055239  T
Q  206 ttaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacattttta 298  Q
    ||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||  ||  |||||||||| |||| |||||| |||  | ||||| | |||| ||||||     
T  7055240 ttaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtgaggtgttactaattatatttttt 7055339  T
Q  299 atgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  7055340 atgttatagtgttaacttcac 7055360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 33619197 - 33618922
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgat---tcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattatttt 96  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||  ||||   | ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  || ||||||    
T  33619197 tgttcgattcatttttaaattgttgattgctgatcattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatattggacttacatgtactatttt 33619098  T
Q  97 atcgttggaatct-----ttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggt 191  Q
    |||||||| ||||     |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||| |||| || | ||||||||| ||        |||    
T  33619097 atcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatactc-ttaagtgtcacac-ttctagggtgttacact--------ggt 33619008  T
Q  192 aggatacaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaa 270  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||  |||||||    
T  33619007 aggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccaccgtacaaa 33618922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 6089260 - 6089109
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgttattattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||      |||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||   || ||||||||||    
T  6089260 tgtttgattcatttttaaattgtt------gattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacattttggacttactggtactattttatcg 6089167  T
Q  101 ttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgtta 159  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6089166 ttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatagtc-ttaagtgtta 6089109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 78 - 221
Target Start/End: Original strand, 30353256 - 30353398
Alignment:
Q  78 gacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttac 177  Q
    ||||||||  || |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  30353256 gacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtctt-aagtgttacactttgtgggatgttac 30353354  T
Q  178 gcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt 221  Q
     |||| ||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  30353355 acttaaaacaaggcatgataaaattagattaagtgtattcttgt 30353398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 95 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 15491884 - 15491654
Alignment:
Q  95 ttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtagg 194  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||| | ||| |||||| |||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| || ||||||||    
T  15491884 ttatcgttagcatctttaacatccaaacagaattgctgatatcatgtgatatt-tttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtagg 15491786  T
Q  195 atacaattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattca 287  Q
    ||| |||||||||||||| | ||||||       |||||||||||||| ||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||    
T  15491785 ataaaattagattaagtgcattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccactgtacaaatagtggggtgttactca 15491686  T
Q  288 ttacatttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
      ||| |||| |||||| | || |||||||||    
T  15491685 caacacttttgatgttacaatgttaacttcac 15491654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 7054592 - 7054704
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  7054592 tgtttgattcatctttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacagttactattttat 7054691  T
Q  99 cgttggaatcttt 111  Q
    |||||||||||||    
T  7054692 cgttggaatcttt 7054704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 408250 - 408470
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  408250 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 408349  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  408350 gttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattgtgtgatagtc-ttaagtgttccactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaa 408448  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  408449 attagattaagtgtagtcttgt 408470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 492 - 136
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||      |||||||||    
T  492 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacgtac------tattttatc 399  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |    
T  398 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttatggggtgttacacttaaaataagataggataaa 300  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    |||||||||| |||| ||||||       |||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||| |||  |||    
T  299 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggagtgttactcacaaca 200  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcacnnnnnnnntcattctcgtgactttatcatagaatttt 356  Q
    ||||| ||  || |||| |||||||||        ||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  199 ttttttatactacagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 93922 - 94056
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  93922 tgtttgattca-ttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatc 94020  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgata 135  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  94021 gttgacatctttaacatgcaaacaaatttgatgata 94056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 318
Target Start/End: Original strand, 94331 - 94528
Alignment:
Q  127 ttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt----- 221  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||         
T  94331 ttgatgatattatgtaatagtctt-aagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaagctagaataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatc 94429  T
Q  222 --atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattacatttttaatgttatagtgataacttca 318  Q
      |||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| ||| |||| |||| |||||||| || ||||||||    
T  94430 tcatgaattgatgatagtatggggaccaaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttataatgttaacttca 94528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 44320 - 43996
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||  || |||||||||    
T  44320 tgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcattcagtaatgcttgcaacaacttggacttacatgtactattttatc 44221  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||| |    
T  44220 gttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag--cttaagtgttacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgataaa 44123  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    |||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||||| |||||| |||  |||||| ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||||    
T  44122 attatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcattaca 44023  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||| || |||||| | |||||||||    
T  44022 tttttgatattatagcgttaacttcac 43996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 154467 - 154791
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||  || |||||||||    
T  154467 tgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcattcagtaatgcttgcaacaacttggacttacatgtactattttatc 154566  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||| |    
T  154567 gttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag--cttaagtgttacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgataaa 154664  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattaca 292  Q
    |||| ||||| ||||||||| |       |||||||||||||| |||||| |||  |||||| ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||||    
T  154665 attatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcattaca 154764  T
Q  293 tttttaatgttatagtgataacttcac 319  Q
    ||||| || |||||| | |||||||||    
T  154765 tttttgatattatagcgttaacttcac 154791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 145836 - 146159
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  145836 tgtttaattcatttttaaattttttattactgattaatgatcaattgtatattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacagacactattttat 145935  T
Q  99 cgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatac 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| ||||     
T  145936 cgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataa 146034  T
Q  199 aattagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgatgccattgtacaaaaagttggatgttattcattac 291  Q
    ||||| |||||||||||||||||       |||||||||||||| |||||   ||  |||||||||| |||| |||||| | | || ||||| |||||||    
T  146035 aattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattctacaaataatggggtgttactcattac 146134  T
Q  292 atttttaatgttatagtgataactt 316  Q
    |||||| |||||||| || ||||||    
T  146135 attttttatgttataatgttaactt 146159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 47 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 267602 - 267332
Alignment:
Q  47 taattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag 146  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  267602 taattcatctagtaattcttgcagcatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag 267503  T
Q  147 tctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttg-------tatgaattgatgataatat 239  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||||||||||| |||    
T  267502 tctttaagtgttacactttgtgggatgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgctaatctaatgaattgatgatattat 267403  T
Q  240 -gagaactagacttttgatgccattgtacaaaa-agttggatgttattcattacatttttaatgttatagtg 309  Q
     ||| |||  |||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||| || |||||| ||| |||||||    
T  267402 agag-actgaacttttgatgacactgtacaaaacagttggatgttactcactatatttttgatgctatagtg 267332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12272 - 12010
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  12272 tgtttgatt-atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatc 12174  T
Q  100 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatggggtgttacgcttataacaaggtaggataca 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||| |    
T  12173 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtc-ttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaacaagataggataaa 12075  T
Q  200 attagattaagtgtagtcttgt-------atgaattgatgataatatgagaactagacttttgat 257  Q
    ||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||| |||||| |||  |||||||||    
T  12074 attagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgat 12010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 100994 - 100948
Alignment:
Q  97 atcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  100994 atcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtga 100948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 100931 - 100894
Alignment:
Q  184 aacaaggtaggatacaattagattaagtgtagtcttgt 221  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  100931 aacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgt 100894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University